WO1999039191A1 - Vorrichtung und verfahren zur kapillarelektrophorese - Google Patents

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WO1999039191A1
WO1999039191A1 PCT/EP1999/000587 EP9900587W WO9939191A1 WO 1999039191 A1 WO1999039191 A1 WO 1999039191A1 EP 9900587 W EP9900587 W EP 9900587W WO 9939191 A1 WO9939191 A1 WO 9939191A1
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separation
capillaries
detector
samples
electrophoresis device
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PCT/EP1999/000587
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Christoph Heller
Holger Eickhoff
Sven Behr
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MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V.
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    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/26—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/416—Systems
    • G01N27/447—Systems using electrophoresis
    • G01N27/44756—Apparatus specially adapted therefor
    • G01N27/44782—Apparatus specially adapted therefor of a plurality of samples

Definitions

  • the invention relates to a device for capillary electrophoresis with a plurality of separation capillaries and an optical detection system and a method for using such a device.
  • the electrophoretic separation of substances and substance mixtures is an analytical process that is particularly widespread in biochemistry and molecular biology.
  • the substances to be separated are separated under the action of an electrical field in a separation medium and are separately detected.
  • the separation medium is in a capillary (inner diameter typically ⁇ 150 ⁇ m).
  • the separation process takes place in the capillary; detection can take place both inside and at the end of the capillary. This is particularly advantageous in terms of speed, resolution and minimizing the amount of sample.
  • an extremely large number of different samples e.g. 10 to 10 7 ).
  • the amount of light that can be coupled in is limited, so that the sensitivity of the fluorescence detection is also limited.
  • the system is unsuitable for routine operation, since the maintenance effort for the capillary arrangement (difficult exchange of capillaries) with the optical fibers is considerable.
  • a multiplex capillary electrophoresis system in which a CCD detector is optically connected to the capillaries in such a way that the inside of a capillary is imaged in each case on a pixel of the CCD detector.
  • This system is disadvantageous because the detector arrangement is a complex, highly specialized system that requires the use of specially adapted optical components and is therefore only compatible to a limited extent with existing laboratory systems for fluorescence detection. There is also an increased risk of "crosstalk" from one capillary to another if the concentration differences of the analytes are very large.
  • the object of the invention is furthermore to process 4 to indicate how to use such a device.
  • the invention is based on the idea of arranging a large number of separation capillaries, each having a detection area, in such a way that the samples in all detection areas are exposed to simultaneous and uniform illumination or excitation and a detector device simultaneously captures the images of all detection areas.
  • a generic multi-capillary separation device with a storage reservoir with a large number of samples, a corresponding large number of separation capillaries (each with a detection area), which are attached to a common mounting device, a collecting device and a measuring system with a lighting device and a detector device following measures (individually or together) realized.
  • the holding device represents a support for the separation capillaries, on which the separation capillaries are aligned so that the detection areas form a straight row.
  • the detection areas are, for example, detection windows on each of the separating capillaries, which are otherwise provided with protective or shielding layers.
  • the holder can also provide "optical isolation” between the capillaries, thereby avoiding "crosstalk” between the capillaries.
  • the holder has a modular structure (eg 6 holders for 16 capillaries each), ie it enables the replacement of smaller capillary bundles without having to disassemble the overall arrangement.
  • the lighting device preferably forms 5
  • the detector device is based on the detection of the light emerging in the detection areas through the capillary wall. With a suitable imaging device, all detection areas are imaged simultaneously on a detector camera. Depending on the analysis requirements, the detector device comprises an image on a single row of detectors or on a plurality of rows of detectors which form a two-dimensional matrix of detector elements. In the latter case, at least one dispersion element can be provided in the detector device, which, in addition to the simultaneous detection of the detector areas, allows an analysis of the spectral properties of the light emanating from the detection areas.
  • the separation capillaries open into a common collecting device, which fulfills a double function.
  • the collection device contains the carrier medium for loading the separation capillaries.
  • the separated substances are collected together at the collection facility.
  • the collecting device preferably contains a collecting device for the molecules of the samples to be separated.
  • This trap (or "molecular trap") is a semi-permeable wall element that separates the ends of the separation capillaries from the high voltage supply to generate the molecular motions in the separation capillaries. 6
  • the molecules are drawn through the porous wall element to the electrode and thus accumulate in the molecule trap. Passive back diffusion through the wall element is severely hampered because the pores are very small.
  • a pressure of up to 5 bar is applied to the collecting device (storage vessel), but in the area outside the molecular trap. This prevents molecules that have already been analyzed from being pushed back into the capillaries and disturbing the subsequent separations.
  • An important feature of the procedure according to the invention is that both the illumination or excitation of the samples to be separated is carried out in the detection areas and the detection of the light emanating from the samples through the capillary wall from the outside into the capillary interior or vice versa.
  • thin-walled capillaries with a wall thickness of approx. 35 to 50 ⁇ m used.
  • larger designs are also possible.
  • Other forms of the detection area are also possible, for example by coupling the capillaries into a cuvette or into a microstructure with channels.
  • the construction of the detection unit by means of lenses and lenses allows a simple change of the imaging scale (for optimal imaging of the detection area on the detector elements) and thus greater flexibility with regard to the design of the detection area.
  • the separation device according to the invention is preferably operated with a low-viscosity separation medium. This reduces the feed pressure to be applied to the collecting device (or the outlet vessel) and increases the feed rate.
  • the simple replacement of the separation medium allows the capillaries to be rinsed sufficiently (either with the separation medium itself or with a cleaning agent beforehand) and thereby increases the life of the capillaries.
  • the invention has the following advantages.
  • the separator has a compact structure with no moving parts. Illumination and detection are compatible with available laboratory setups and with currently used dye markings. This means advantages on the one hand in routine operation by not highly trained personnel and on the other hand in maintenance. For the first time, the invention enables a fully automated analysis process, the details of which are explained below. For example, approx.
  • the system has a high degree of multiplexing. Both the sample supply (preferably with common formats, for example from microtiter plates) and the illumination and detection take place simultaneously in all channels, which are each formed by a separating capillary. Special detection setups, such as a "sheath flow" cuvette, are not required.
  • the holding device for the separating capillaries has a robust design, prevents stray radiation between the capillaries and allows bundling of the capillaries to simplify maintenance.
  • the loading pressure of the carrier medium can vary from approx. 70 bar with conventional carrier media (e.g. 2% hydroxyethyl cellulose, viscosity: approx. 1000 centiStokes) to approx. 5 bar if carrier media with viscosities of 100 centiStokes (e.g. 10-15% dextran or 4-8% polydimethylacrylamide) are used.
  • FIG. 2 a partial view of a mounting device which is part of a separating device according to FIG. 1;
  • FIG. 4 a further overview illustration to illustrate the spectrally resolved detection according to the invention
  • FIG. 6 shows a schematic side view of a collecting device which is part of a separating device according to FIG. 1;
  • Fig. 11 Curves to illustrate experimental results with a separator according to the invention.
  • the invention is described below with reference to a preferred embodiment, in which an electrophoretic separation of samples stored in microtiter plates is carried out by detecting the migration of sample components through separation capillaries with a carrier medium under the action of a high voltage.
  • the invention is not limited to the alignment of the capillary inlet ends with respect to a microtiter plate or certain separation media or a certain separation effect, but rather can be implemented in all electrophoresis capillary systems with a large number of separation capillaries.
  • FIG. 1 shows an electrophoresis device according to the invention, in which a large number of separation capillaries 10 are mounted on a common holding device 50, the details of which are explained below with reference to FIG. 2.
  • the separating capillaries 10 are aligned in such a way that detection areas, for example in the form of detection windows, form a straight row 13.
  • An illumination device 60 with a light source 61 and imaging optics 62 forms a line-shaped illumination field 63, which coincides with the row 13 of the detection windows of the capillary 10.
  • a detector device 40 is also provided, which contains an imaging device 41, a detector camera 42 and a dispersion element 43.
  • the dispersion element 43 is an optional assembly that can be omitted in certain applications, as explained below.
  • the detector camera 42 is connected to a control and data storage device 44, for example in the form of a computer and control electronics 45.
  • the separating capillaries 10 lead from an inlet reservoir 20 (sample (21) or reservoir (24) reservoir) to a collecting device 70.
  • the electrophoretic separation paths are formed by using electrodes 11 and 71 between the inlet and 10 reservoir 20 and the collecting device 70 a high voltage is applied.
  • the inlet reservoir 20 is connected to ground potential and the collecting device 70 is connected to a high-voltage supply device 72.
  • This high-voltage supply device can supply DC voltage or - for special purposes - a modulated voltage (eg pulses, sinusoidal form, etc.) and is controlled by the unit 44, 45.
  • the inlet reservoir 20 is a sample reservoir 21 (during injection) or a reservoir 24 (during separation).
  • the sample reservoir 21 is preferably a flat substrate with a plurality of samples arranged in a predetermined manner, which are to be subjected to the electrophoretic separation in parallel (or simultaneously).
  • This substrate is preferably a microtiter plate with a common format (for example 96-hole, 384-hole or 1536-hole plate).
  • the sample reservoir is arranged on a transport device 22, with which, depending on predetermined control signals from the unit 44, 45, a desired sample reservoir 21 can be moved from a storage device 23 into the operating position at the inlet ends of the separation capillaries .
  • the transport device 22 and / or storage device 23 are equipped with appropriate adjusting means and position sensors.
  • the transport device 22 is further provided to replace the sample reservoir 21 by a supply reservoir 24 after loading the inlet ends of the separation capillaries, so that the circuit is closed again.
  • the inlet ends 11 of the separation capillaries 10 are aligned such that they correspond to the positions of the samples to be separated on the substrate or the sample reservoir 21.
  • the separation capillaries 10 have, for example, an outer diameter of 11
  • capillaries with an outer diameter of 375 ⁇ m and an inner diameter of 100 ⁇ m, and capillaries with an outer diameter of 200 ⁇ m and an inner diameter in the range from 50 to 100 ⁇ m or capillaries with an outer diameter of 150 ⁇ m and an inner diameter of 75 ⁇ m.
  • the capillary wall thickness can, however, also assume any other value that allows reproducible detection with the lighting and detection devices described below.
  • the total length of the separating capillaries is approx. 40 to 50 cm, although the length can be modified depending on the application.
  • the separating capillaries essentially form a flat 2-dimensional ("brush-like") fan on the input side, the dimensions of which correspond approximately to those of the sample reservoir 21.
  • the separating capillaries are brought together towards the holding device 50 in such a way that they lie closely together at least over the length in which the respective detection areas are arranged as a row 13 (see FIG. 2).
  • a temperature control device can be provided in the area in which the separation capillaries are brought together in front of the holding device 50.
  • the temperature control device is designed, for example, to flow around the separation capillaries with a temperature-controlled medium (e.g. air) and is set up to thermostate the separation capillaries.
  • a temperature in the range from 10 ° C. to 60 ° C. is preferably set.
  • the illuminating device 60 is provided to illuminate the row of the detection areas of the separating capillaries on the holding device 50 as evenly as possible, so that the sample components that pass through the detection areas during the separating process each have essentially the same amounts of light 12
  • a laser light source 61 is preferably combined with an optical system 62, which forms a line-shaped illumination field (so-called "line generator") in order to achieve a sufficient illumination or excitation intensity.
  • the laser 61 is selected as a function of the spectral properties of the fluorescent marking used (for example: Ar laser with a power of around 50 to 200 mW) and can also be controlled via the control unit 44, 45.
  • the optics 62 form the line-shaped illumination field.
  • the optics can be formed, for example, by a mirror which vibrates or rotates at high speed, but this may be disadvantageous for the stability of the arrangement. It is also possible to use a cylindrical lens, which advantageously avoids moving parts, but must be dimensioned such that, despite the Gaussian-distributed intensity of the illumination field, a cylindrical lens enables a sufficiently homogeneous irradiation of the capillary row.
  • the optics 62 are therefore implemented with a so-called Powell lens (manufacturer: OZ Optics, Canada), which enables homogeneous illumination and optimal utilization of the laser power (see FIG. 8).
  • the Powell lens can also be connected directly to the laser 61 via an optical fiber 63, as a result of which a robust and portable structure is achieved in which no moving parts such as rotating mirrors or the like. are included and which ensures that, apart from the line-shaped lighting field, no coherent or highly focused light emerges (user safety).
  • the optical fiber 64 also allows easy replacement of the laser (for example to adapt to other fluorescent labels 13
  • the light intensity of the illumination field of the Powell lens is evenly distributed in the direction of the line extension and is real-Gaussian (i.e. in a direction parallel to the alignment of the separating capillaries).
  • the parameters of the Powell lens and the arrangement in relation to the detector windows are chosen so that line focusing to a line width of approx. 1 mm or less. The narrower the illumination field, the higher the resolution of the separating device that can be achieved.
  • FIG. 2 shows a section of a holder device 50 as a schematic perspective view to illustrate the planar, parallel attachment of the separating capillaries on the upper side of the holder device (lower part of FIG. 2) and an enlarged perspective view with a capillary section in phantom view (upper part of FIG. 2) ).
  • the holding device comprises at least the illustrated capillary holder 51, which gives the separating capillaries 10 mechanical support in the focal plane of the illuminating device and ensures optical isolation between the separating capillaries.
  • a plurality of capillary holders can be provided for, for example, 16 capillaries each, the total holder 50 then being constructed in modules and individual capillary holders being interchangeable as modules.
  • the separation capillaries are provided with protective layers, which may be opaque, except in the detection areas. In the detection areas 10a, the separation capillaries are coating-free.
  • the capillary holder 14 shows a section of a holder device 50 as a schematic perspective view to illustrate the planar, parallel attachment of
  • the detection areas or detection windows of the separation capillaries form with a separation capillary length of approx. 50 cm a straight row, which is a vertical distance of approx. 5 to 20 cm, preferably 10 cm.
  • a separation capillary length of approx. 50 cm a straight row which is a vertical distance of approx. 5 to 20 cm, preferably 10 cm.
  • the capillary holder is a block with guide grooves 52, in which the separating capillaries are inserted.
  • the partition walls 53 serve for the optical separation between the detection areas of the individual separation capillaries.
  • the partitions are formed by possibly thin webs 53 in order to enable a tight packing of the capillaries and to avoid the formation of shadows of the illuminating or excitation light radiated from above in the operating position.
  • Fastening means (not shown, for example, clamps) for releasably fastening the separating capillaries 10 in the grooves 52 are also provided on the holding device. It can be provided that the holding device also separates the separation capillaries in length sections outside the detection 15
  • temperature control devices can also be provided in this section in order to allow the separation process to take place under predetermined temperature conditions.
  • the invention advantageously simultaneously provides excellent spectral and spatial resolution by imaging the row of detection windows onto a two-dimensional detector matrix with spectral and spatial resolution corresponding to the two matrix dimensions.
  • This is shown schematically in FIG. 3.
  • the arrangement of separating capillaries 10 with the detection window row 13, which is shown vertically different from the operating position, is imaged on a CCD matrix 42 using an imaging device (not shown) and the dispersion element 43.
  • the dispersion element 43 is symbolically represented by a prism, but can be formed by any wavelength-dispersive structure with high spatial resolution.
  • the mapping on the CCD matrix takes place in such a way that the spatial resolution in the y direction and the in the x direction 16
  • the matrix thus contains illuminated rows of pixels, the number of which corresponds to the number of separating capillaries.
  • Each pixel supplies a detector signal depending on the amount of light incident on it, so that the detector signal curve of each x-row corresponds to the spectral curve of the light emanating from a separating capillary. It can be provided that, depending on the fluorescent dye or marker used, only a partial region of one or more x-rows is read out which corresponds precisely to the expected wavelength emission region of the fluorescent dye or marker.
  • the spectral resolution is designed for measurement in at least three spectral ranges.
  • the row of detection windows 13 is imaged onto a gap 412 with a first objective 411.
  • a second, inverted lens 413 transmits the light from the gap through the dispersion element 43.
  • One or more filters 414 for masking the excitation light can either be in front of the lens 411 (as shown) or between the inverted lens 413 and the dispersion element 43.
  • the dispersion element 43 is either a classic spectral device with prisms and / or gratings (disadvantage: change in the imaging direction, reduced local resolution) or preferably through a straight-vision prism 431 (so-called Amici prism, FIG.
  • the entire structure of objectives, slit, filter and dispersion element can be arranged in a tube shielded from scattered light, which can even be designed to be mobile as a "portable spectrometer".
  • the imaging scale can be selected in a wide range, so that there is a high degree of flexibility with regard to the number and diameter of the separating capillaries.
  • the light passing through the dispersion element 43 is imaged onto the camera 42 with an objective 415.
  • the CCD chip 421 of the camera 42 has, for example, 500 * 500 pixels, from which, depending on the application (in particular depending on the number and size of the separating capillaries to be detected), pixel groups are selected which are read out during the analysis process.
  • a pixel size of, for example, 24 * 24 ⁇ m the slightest misadjustments (eg displacements of the separating capillaries) can cause a shift in the image on the CCD matrix.
  • a search algorithm is carried out according to the invention, in the result of which the named pixel groups are determined which are to be read out.
  • control device 44 automatically selects the desired pixels of the spectrally and spatially resolved image of the row of detection windows.
  • a suitable algorithm from image data processing is used as the algorithm for reading out, for example the so-called watershed algorithm (see S. Wegner et al. In “Spectrum of Science", 1997, p. 113) or the so-called chain code algorithm, which is explained below with reference to FIG. 5. 18th
  • the pixels of the groups must be summarized (so-called “binning") and read out correlated.
  • the pixel groups are defined in a predetermined manner or automatically determined in a first test phase using the data processing algorithm.
  • direction codes As shown, for example, eight direction codes can be provided which relate to the eight pixels which surround a pixel under consideration. By specifying a number sequence according to the numbered directions, all pixels belonging to a pixel group can be clearly identified. This information is insensitive to slight image shifts (offset in the left part of the illustration) and advantageously allows a reduction in the memory requirement required to characterize a group.
  • FIG. 6 shows a schematic side view of details of the collecting device (or the outlet vessel) 70 (see FIG. 1).
  • the collecting device 70 consists of a pressure vessel 73 with a pH-buffered carrier medium 74.
  • the pressure vessel 73 is connected via a pressure line 75 to a pump device 77, which provides compressed air for loading the separating capillaries 10 projecting into the carrier medium with the outlet ends.
  • the pump device is controlled via the unit 44, 45.
  • An electrode 71 also projects into the carrier medium and is connected to a high-voltage supply device (not shown).
  • a dashed molecular trap 76 is provided between the electrode 71 and the outlet ends of the separating capillaries 10 and is set up to collect the separated samples. Under the action of an electric field, the separated samples emerge from the capillary ends and 19
  • the electrode 71 to the electrode 71. They meet the molecular trap in the form of a porous partition (e.g. a membrane or a gel) with pores of a characteristic size of approx. 10 to 100 nm diameter.
  • a porous partition e.g. a membrane or a gel
  • the collection of the separated samples or molecules is carried out according to one of the following principles.
  • the probability of molecules passing through the molecular trap from the electrode to the outlet ends during a high voltage switch-off time becomes very low. In this case it is not necessary to select the pore size within particularly precisely defined limits.
  • the separated samples consist of field-dependent stretched molecules (polyelectrolytes), which relatively easily pass through the pores under the action of the electric field in a stretched form, but can only pass through the pores with difficulty after the field has been switched off .
  • the electrodes are attached directly to the capillaries on the input side, as is shown schematically in FIG. 7.
  • the inlet ends of the separating capillaries have an outer metal coating 14 (for example made of silver or platinum), which simultaneously fulfills the electrode function. This allows a significant reduction in the minimum injection volume.
  • the electrical contact is made via a contact device (e.g. clip) 15.
  • a high voltage is applied to the separation capillaries for sample loading for a certain loading time in order to inject the smallest sample amounts into the inlet ends.
  • the loading time and the high voltage are selected such that the first millimeters of the separation capillaries are filled with the samples to be separated. This is the case, for example, for the above-mentioned capillaries with internal diameters in the range from 50 to 100 ⁇ m when using conventional solvents with a loading time in the range from 1 to 20 seconds and a high voltage of approx. 100 V / cm - 400 V / cm (preferably approx kV) reached.
  • the sample reservoir 21 is replaced by the storage reservoir 24 with a buffer solution (electrolyte solution) with which the inlet ends of the separation capillaries are connected during the subsequent separation process.
  • a buffer solution electrophilyte solution
  • the high voltage is again applied for a separation time selected depending on the application, which can be in the range from 10 to 30 minutes or even in the hour range.
  • the samples to be separated migrate towards the outlet ends of the separation capillaries.
  • a “selection” takes place through the separation medium, ie the small molecules reach the respective detection windows faster than the large molecules, so that the spatially and spectrally resolved detection means 21
  • sample composition can be carried out in each individual section window depending on the time.
  • separation of the molecules can also be done by other mechanisms, e.g. through so-called "endlabeled free solution electrophoresis".
  • FIG. 8 shows a comparison of the illumination of the detection area by means of a cylindrical lens and by means of a “line generator” (the “noisy” signal is here achieved by using a “multimode” optical fiber instead of a “monomode” optical fiber).
  • the cylindrical lens creates a so-called Gaussian profile, whereas the line generator creates a plateau-shaped profile and thus produces a more homogeneous illumination.
  • Fig. 9 shows a curve to illustrate the practically excluded crosstalk ("cross-talk") between different separation channels (separation capillaries). The three maxima correspond to the detector signals from pixel groups that are assigned to neighboring separation capillaries.
  • the crosstalk between adjacent capillaries is less than 1%, so that a clear and reproducible assignment of the detector signals to the separation channels is possible.
  • the capillaries were arranged side by side without a partition.
  • the optical separation of the capillary holder makes crosstalk far less.
  • Fig. 10 illustrates the choice according to the invention of a low-viscosity carrier medium (separation matrix).
  • the curves show the dependence of the separating medium viscosity on the respective separating medium concentration. The concentration is selected so that the viscosity is 100 centiStokes (mm 2 / s) (corresponding to approximately ⁇ 100 cP).
  • Fig. 11 shows a control experiment to demonstrate the reproducibility of the separation device according to the invention. 96 identical DNA samples were separated at the same time. The detector signals from eight capillaries over a detection time of approx. Shown accumulated for 30 minutes. There is an excellent agreement of the separation results in the different capillaries.

Abstract

Eine Elektrophoreseeinrichtung enthält eine Vielzahl von Trennkapillaren (10), die jeweils einen Detektionsbereich (10a) aufweisen, und eine Detektoreinrichtung (40) mit einer Abbildungseinrichtung (41) und einer Detektorkamera (42), wobei die Trennkapillaren so an einer gemeinsamen Halterungseinrichtung (50) angebracht sind, daß die Detektionsbereiche (10a) eine gerade Reihe (13) bilden, die mit der Abbildungseinrichtung auf die Detektorkamera abgebildet wird.

Description

Vorrichtung und Verfahren zur Kapillarelektrophorese
Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung zur Kapillarelektrophorese mit einer Vielzahl von Trennkapillaren und einem optischen Detektionssystem und ein Verfahren zur Verwendung einer derartigen Vorrichtung.
Die elektrophoretische Trennung von Substanzen und Substanzge- mischen ist ein analytisches Verfahren, das insbesondere in der Biochemie und Molekularbiologie weit verbreitet ist. Die zu trennenden Substanzen werden unter Wirkung eines elektrischen Feldes in einem Trennmedium getrennt und separat detek- tiert. Bei der Kapillarelektrophorese befindet sich das Trennmedium in einer Kapillare (Innendurchmesser typischerweise < 150 μm) . Der Trennvorgang erfolgt in der Kapillare; die De- tektion kann sowohl im Inneren als auch am Ende der Kapillare erfolgen. Dies ist insbesondere hinsichtlich der Geschwindigkeit, des Auflösungsvermögens und der Minimierung der Probenmenge vorteilhaft. Zur Analyse komplexer biochemischer Reaktionen oder molekularbiologischer Vorgänge (z.B. zur Analyse komplexer Genome oder Proteinen) ist es erforderlich, eine äußerst große Anzahl verschiedener Proben (z.B. 10 bis 107) zu analysieren .
Es besteht daher ein Interesse an Einrichtungen zur multiplen Kapillarelektrophorese mit hohem Probendurchsatz und hochgradig parallel ablaufenden Analysen. Hierzu sind die im folgenden beispielhaft genannten Vielkanal- oder Multiplex-Anord- nungen bekannt, die zwar eine hochparallele Verarbeitung erlauben, in der Regel jedoch so kompliziert aufgebaut sind, daß ein Einsatz im Routinebetrieb nur beschränkt möglich ist. So wird in US-A-5 498 324 ein Multiplex-Fluoreszenzdetektorsystem für die Kapillarelektrophorese beschrieben, bei dem die Kapillaren jeweils mit optischen Fasern verbunden sind, über die das Anregungslicht separat in die Kapillaren geführt wird. Die Fluoreszenzdetektion erfolgt durch ein Mikroskop mit einer CCD-Kamera. Dieser Aufbau ist wegen der Ankopplung optischer Fasern an die Kapillaren kompliziert und störanfällig. Die einkoppelbare Lichtmenge ist beschränkt, so daß auch die Empfindlichkeit der Fluoreszenzdetektion begrenzt ist. Das System ist für den Routinebetrieb ungeeignet, da vor allem der Wartungsaufwand für die Kapillaranordnung (schwieriger Austausch von Kapillaren) mit den optischen Fasern erheblich ist.
Aus US-A-5 582 705 ist ein Multiplex-Kapillarelektrophorese- system bekannt, bei dem ein CCD-Detektor derart mit den Kapillaren optisch verbunden ist, daß das Innere einer Kapillare jeweils auf einen Pixel des CCD-Detektors abgebildet wird. Dieses System ist nachteilig, da die Detektoranordnung ein kompliziert aufgebautes, hochspezialisiertes System darstellt, das den Einsatz speziell angepaßter optischer Komponenten erfordert und somit nur beschränkt kompatibel mit bestehenden Laborsystemen zur Fluoreszenzdetektion ist. Außerdem besteht eine erhöhte Gefahr des "Übersprechens" von einer Kapillare zur anderen, falls die Konzentrationsunterschiede der Analyten sehr groß sind.
In US-A-5 584 982 und US-A-5 567 294 werden Mehrkapillarsysteme mit einer sogenannten "Sheath Flow"-Küvette beschrieben, mit der zwar eine Steigerung der Detektionsempfindlichkeit erzielt wird, die jedoch in nachteiliger Weise einen komplizierten Aufbau ohne die für den Routine-Laborbetrieb erforderliche Robustheit darstellt. Insbesondere ist bei einer solchen Kü- vette der Einsatz von ersetzbaren Trennmedien schwierig. Beim Ersetzen des Mediums kann die Küvette verunreinigt werden und es besteht die Gefahr, daß während der Trennung das Trennmedium langsam ausfließt.
Schließlich ist aus US-A-5 675 155 ein Raster- oder Scanning- System bekannt, bei dem die Fluoreszenzsignale einer koplanar angeordneten Kapillargruppe mit einem Scanner-Detektor erfaßt werden. Bei diesem Detektor wird das Anregungs- bzw. Meßlicht mit einem beweglichen Spiegel aufeinanderfolgend auf die einzelnen Trennkapillaren gerichtet. Dieser Aufbau ist wegen der Störanfälligkeit durch den Einsatz beweglicher Teile und durch die begrenzte Auslesegeschwindigkeit nachteilig. Bei einer Kapillarelektrophorese ist es möglich, daß die getrennt zu de- tektierenden Proben so schnell laufen, daß eine zuverlässige Erfassung während eines Rasterdurchlaufs nicht möglich ist. Insbesondere die Kapillaren am Rand des Kapillarbündels werden nicht in gleichmäßigen Zeitabständen abgescannt. Schließlich sind die Scanning-Systeme für Routineanwendungen nicht genügend robust aufgebaut.
Bei der multiplen Kapillarelektrophorese besteht nicht nur ein Interesse an Stabilität und Parallelität der Verarbeitung sondern auch an einer Automatisierbarkeit des Gesamtanalyseablaufs beginnend bei der Beschickung eines Vorsatzreservoirs über die eigentlichen Trennvorgänge bis hin zur Reinigung der Trennkapillaren. Die Automatisierung von Kapillartrennanordnungen ist bisher aufgrund der genannten Nachteile bei Mehrka- pillar-Systemen nicht erreicht worden, sondern nur für Einzel- kapillar-Systeme realisiert.
Es ist die Aufgabe der Erfindung eine verbesserte Vorrichtung zur Kapillarelektrophorese anzugeben, die sich durch einen vereinfachten, stabilen Aufbau auszeichnet und eine Automatisierbarkeit der parallelen Trennung einer Vielzahl von Proben ermöglicht. Die Aufgabe der Erfindung ist es ferner, Verfah- 4 rensweisen zur Verwendung einer derartigen Vorrichtung anzugeben.
Diese Aufgabe wird durch eine Elektrophoreseeinrichtung mit den Merkmalen gemäß Patentanspruch 1 bzw. ein Verfahren mit den Merkmalen gemäß Patentanspruch 17 gelöst. Vorteilhafte Ausführungsformen ergeben sich aus den abhängigen Ansprüchen.
Die Erfindung basiert auf der Idee, eine Vielzahl von Trennkapillaren, die jeweils einen Detektionsbereich aufweisen, so anzuordnen, daß die Proben in allen Detektionsbereichen einer simultanen und gleichmäßigen Beleuchtung oder Anregung ausgesetzt sind und eine Detektoreinrichtung gleichzeitig die Abbildungen aller Detektionsbereiche erfaßt. Hierzu werden vorzugsweise bei einer gattungsgemäßen Mehrkapillartrenneinrich- tung mit einem Vorratsreservoir mit einer Vielzahl von Proben, einer entsprechenden Vielzahl von Trennkapillaren (jeweils mit einem Detektionsbereich) , die an einer gemeinsamen Halterungseinrichtung angebracht sind, einer Sammeleinrichtung und einem Meßsystem mit einer Beleuchtungseinrichtung und einer Detektoreinrichtung die folgenden Maßnahmen (einzeln oder gemeinsam) realisiert.
Die Halterungseinrichtung stellt für die Trennkapillaren einen Träger dar, auf dem die Trennkapillaren so ausgerichtet sind, daß die Detektionsbereiche eine gerade Reihe bilden. Die Detektionsbereiche sind beispielsweise Detektionsfenster an jeder der im übrigen mit Schutz- oder Abschirmschichten versehenen Trennkapillaren. Die Halterung kann außerdem eine "optische Isolierung" zwischen den Kapillaren bieten, wodurch ein "Übersprechen" ( "crosstalk" ) zwischen den Kapillaren vermieden wird. Zusätzlich ist die Halterung modular aufgebaut (z.B. 6 Halter für je 16 Kapillaren), d.h. sie ermöglicht das Auswechseln kleinerer Kapillarbündel, ohne die Gesamtanordnung zerlegen zu müssen. Die Beleuchtungseinrichtung bildet vorzugsweise 5
ein strichförmiges, gleichmäßiges Beleuchtungsfeld, dessen Form an die Reihe der Detektionsbereiche angepaßt ist. Es ist ein besonderer Vorteil der Erfindung, daß die Beleuchtung oder Anregung der Proben in den Kapillaren unmittelbar durch Beleuchtung der Kapillarwand im Bereich des jeweiligen Detek- tionsbereiches von außen erfolgt. Es sind keine zusätzlichen Einkoppeleinrichtungen erforderlich und die Justierung wird durch die positionsfeste, jedoch lösbare Anbringung auf der Halterungseinrichtung realisiert .
Die Detektoreinrichtung basiert auf der Detektion des in den Detektionsbereichen durch die Kapillarwand nach außen tretenden Lichts. Mit einer geeigneten Abbildungseinrichtung werden sämtliche Detektionsbereiche simultan auf eine Detektorkamera abgebildet. Je nach den Analyseanforderungen umfaßt die Detektoreinrichtung eine Abbildung auf eine einzelne Detektorreihe oder auf eine Vielzahl von Detektorreihen, die eine zweidimen- sionale Matrix aus Detektorelementen bilden. Im letzteren Fall kann in der Detektoreinrichtung mindestens ein Dispersionselement vorgesehen sein, das zusätzlich zur simultanen Erfassung der Detektorbereiche eine Analyse der spektralen Eigenschaften des von den Detektionsbereichen ausgehenden Lichtes erlaubt.
Die Trennkapillaren münden in eine gemeinsame Sammeleinrichtung, die eine Doppelfunktion erfüllt. Erstens enthält die Sammeleinrichtung das Trägermedium zur Beschickung der Trennkapillaren. Zweitens werden die getrennten Substanzen an der Sammeleinrichtung gemeinsam aufgenommen. Hierzu enthält die Sammeleinrichtung vorzugsweise eine Auffangvorrichtung für die Moleküle der zu trennenden Proben. Diese Auffangvorrichtung (oder "Molekülfalle") ist ein halbdurchlässiges Wandelement, das die Enden der Trennkapillaren von der Hochspannungsversorgung zur Erzeugung der Molekülbewegungen in den Trennkapillaren separiert. 6
Während der elektrophoretischen Trennung werden die Moleküle durch das poröse Wandelement zur Elektrode gezogen und sammeln sich somit in der Molekülfalle an. Die passive Rück-Diffusion durch das Wandelement ist stark behindert, da die Poren sehr klein sind. Nach Beendigung der Analyse wird ein Druck von bis zu 5 bar an die Sammeleinrichtung (Vorratsgefäß) gelegt, jedoch in den Bereich außerhalb der Molekülfalle. Dadurch wird verhindert, daß bereits analysierte Moleküle in die Kapillaren zurückgedrückt werden und die nachfolgenden Trennungen stören.
Ein wichtiges Merkmal der erfindungsgemäßen Verfahrensweise besteht darin, daß sowohl die Beleuchtung bzw. Anregung der zu trennenden Proben in den Detektionsbereichen als auch die De- tektion des von den Proben ausgehenden Lichts durch die Kapillarwand von außen in das Kapillarinnere bzw. umgekehrt erfolgt. Zur Verringerung von Hintergrundsignalen werden hierzu vorzugsweise dünnwandige Kapillaren mit einer Wanddicke-von rd. 35 bis 50 μm eingesetzt. Es sind jedoch auch größere Bauformen (dickwandigere Kapillaren) möglich. Weiterhin sind andere Formen des Detektionsbereichs möglich, z.B. durch Einkoppeln der Kapillaren in eine Küvette oder in eine Mikro- struktur mit Kanälen. Der Aufbau der Detektionseinheit mittels Linsen und Objektiven erlaubt eine einfache Änderung des Abbildungsmaßstabes (zur optimalen Abbildung des Detektionsbereichs auf die Detektorelemente) und damit eine größere Flexibilität bezüglich der Bauform des Detektionsbereiches . Der Betrieb der Trenneinrichtung gemäß der Erfindung erfolgt vorzugsweise mit einem niedrigviskosen Trennmedium. Damit wird der an der Sammeleinrichtung (oder dem Auslaßgefäß) aufzubringende Beschickungsdruck verringert und die Beschickungsgeschwindigkeit erhöht. Das einfache Ersetzen des Trennmediums erlaubt ein ausreichendes Spülen der Kapillaren (entweder mit dem Trennmedium selbst oder zuvor mit einem Reinigungsmittel) und erhöht dadurch die Lebensdauer der Kapillaren. Die Erfindung besitzt die folgenden Vorteile. Die Trenneinrichtung besitzt einen kompakten Aufbau ohne bewegliche Teile. Die Beleuchtung und die Detektion sind kompatibel mit verfügbaren Laboraufbauten und mit derzeit verwendeten Farbstoffmarkierungen. Dies bedeutet Vorteile einerseits beim Routinebetrieb durch nicht hochspeziell geschultes Personal und andererseits bei der Wartung. Die Erfindung ermöglicht erstmalig einen vollständig automatisierbaren Analysevorgang, dessen Einzelheiten unten erläutert werden. Es können beispielsweise rd. 15000 verschiedene Proben analysiert werden, bevor erstmals ein Eingriff durch einen Bediener erforderlich wird. Das System besitzt einen hohen Multiplexgrad. Sowohl die Probenzufuhr (vorzugsweise mit gängigen Formaten, z.B. aus Mikrotiter- platten) als auch die Beleuchtung und Detektion erfolgt in allen Kanälen, die jeweils durch eine Trennkapillare gebildet werden, gleichzeitig. Spezielle Detektionsaufbauten, wie z.B. eine "Sheath-Flow"-Küvette sind nicht erforderlich. Die Halterungseinrichtung für die Trennkapillaren ist robust aufgebaut, verhindert eine Streustrahlung zwischen den Kapillaren und erlaubt zur Vereinfachung der Wartung eine bündelweise Anbringung der Kapillaren. Der Beschickungsdruck des Trägermediums kann von rd. 70 bar bei herkömmlichen Trägermedien (z.B. 2% Hydroxyethylcellulose, Viskosität: rd. 1000 centiStokes) auf rd. 5 bar gesenkt werden, falls Trägermedien mit Viskositäten von 100 centiStokes (beispielsweise 10-15% Dextran oder 4-8% Polydimethylacrylamid) verwendet werden.
Weitere Vorteile und Einzelheiten der Erfindung werden im folgenden unter Bezug auf die beigefügten Zeichnungen beschrieben. Es zeigen:
Fig. 1: eine schematische Übersichtsdarstellung des Aufbaus einer Elektrophoreseeinrichtung gemäß der Erfindung; 8
Fig. 2: eine Teilansicht einer Halterungseinrichtung, die Teil einer Trenneinrichtung gemäß Fig. 1 ist;
Fig. 3: eine Übersichtsdarstellung zur Illustration der spektral aufgelösten Detektion gemäß der Erfindung;
Fig. 4: eine weitere Übersichtsdarstellung zur Illustration der spektral aufgelösten Detektion gemäß der Erfindung;
Fig. 5: eine Illustration der Erfassung von Detektorsignalen;
Fig. 6: eine schematische Seitenansicht einer Sammeleinrichtung, die Teil einer Trenneinrichtung gemäß Fig. 1 ist;
Fig. 7: eine spezielle Kapillarform, die zur elektrophoreti- schen Trennung gemäß der Erfindung verwendet wird, wobei die Kapillare am Ende metallisch beschichtet ist und gleichzeitig als Elektrode dient;
Fig. 8: eine Kurvendarstellung zur Illustration der gleichmäßigen Ausleuchtung durch den Liniengenerator;
Fig. 9: eine Kurvendarstellung zur Illustration von Detektorsignalen von drei zueinander benachbarten Trennkapillaren;
Fig. 10: Kurvendarstellungen zur Illustration der Konzentrationsabhängigkeit der Trennmedienviskosität; und
Fig. 11: Kurvendarstellungen zur Illustration von experimentellen Ergebnissen mit einer Trenneinrichtung gemäß der Erfindung. Die Erfindung wird im folgenden unter Bezug auf eine bevorzugte Ausführungsform beschrieben, bei der eine elektrophoreti- sche Trennung von in Mikrotiterplatten gelagerten Proben durch Erfassung der Wanderung von Probenbestandteilen durch Trennkapillaren mit einem Trägermedium unter Wirkung einer Hochspannung erfolgt. Die Erfindung ist jedoch nicht auf die Ausrichtung der Kapillareintrittsenden in Bezug auf eine Mikrotiter- platte oder bestimmte Trennmedien oder eine bestimmte Trennwirkung beschränkt, sondern vielmehr in allen Elektrophorese- Kapillarsystemen mit einer Vielzahl von Trennkapillaren realisierbar.
Fig. 1 zeigt eine Elektrophoreseeinrichtung gemäß der Erfindung, bei der eine Vielzahl von Trennkapillaren 10 auf einer gemeinsamen Halterungseinrichtung 50 angebracht sind, deren Einzelheiten unten unter Bezug auf Fig. 2 erläutert werden. Die Trennkapillaren 10 sind so ausgerichtet, daß Detektionsbereiche beispielsweise in Form von Detektionsfenstern eine gerade Reihe 13 bilden. Eine Beleuchtungseinrichtung 60 mit einer Lichtquelle 61 und einer Abbildungsoptik 62 bildet ein strichförmiges Beleuchtungsfeld 63, das mit der Reihe 13 der Detektionsfenster der Kapillare 10 zusammenfällt. Es ist ferner eine Detektoreinrichtung 40 vorgesehen, die eine Abbildungseinrichtung 41, eine Detektorkamera 42 und ein Dispersionselement 43 enthält. Das Dispersionselement 43 ist eine fakultative Baugruppe, auf die bei bestimmten Anwendungen verzichtet werden kann, wie unten erläutert wird. Die Detektorkamera 42 ist mit einer Steuer- und Datenspeichereinrichtung 44, beispielsweise in Form eines Computers und einer Steuerelektronik 45 verbunden.
Die Trennkapillaren 10 führen von einem Einlaßreservoir 20 (Proben (21)- oder Vorrats (24 ) -Reservoir) zu einer Sammeleinrichtung 70. Die elektrophoretischen Trennstrecken werden gebildet, indem über Elektroden 11 bzw. 71 zwischen das Einlaß- 10 reservoir 20 und die Sammeleinrichtung 70 eine Hochspannung angelegt wird. Hierzu wird beispielsweise das Einlaßreservoir 20 mit Massepotential und die Sammeleinrichtung 70 mit einer Hochspannungsversorgungseinrichtung 72 verbunden. Diese Hochspannungsversorgungseinrichtung kann Gleichspannung oder - für spezielle Zwecke - eine modulierte Spannung (z.B. Pulse, Sinusform etc.) liefern und wird über die Einheit 44, 45 gesteuert. Das Einlaßreservoir 20 ist ein Probenreservoir 21 (während der Injektion) oder ein Vorratsreservoir 24 (während der Trennung) .
Das Probenreservoir 21 ist vorzugsweise ein ebenes Substrat mit einer Vielzahl von in vorbestimmter Weise angeordneten Proben, die parallel (oder simultan) der elektrophoretischen Trennung unterzogen werden sollen. Dieses Substrat ist vorzugsweise eine Mikrotiterplatte mit einem üblichen Format (beispielsweise 96-Loch-, 384-Loch- oder 1536-Loch-Platte) . Zur durchgängigen Automatisierung der Trennung beginnend mit der Probenzufuhr ist das Probenreservoir auf einer Transportvorrichtung 22 angeordnet, mit der in Abhängigkeit von vorbestimmten Steuersignalen aus der Einheit 44, 45 ein gewünschtes Probenreservoir 21 aus einer Lagereinrichtung 23 in die Betriebsposition an den Einlaßenden der Trennkapillaren bewegt werden kann. Hierzu sind die Transporteinrichtung 22 und/oder Lagereinrichtung 23 mit entsprechenden Stellmitteln und Positionsgebern ausgerüstet. Die Transporteinrichtung 22 ist ferner dazu vorgesehen, nach Beschickung der Einlaßenden der Trennkapillaren das Probenreservoir 21 durch ein Vorratsreservoir 24 zu ersetzen, so daß der Stromkreis erneut geschlossen wird.
Die Einlaßenden 11 der Trennkapillaren 10 sind so ausgerichtet, daß sie den Positionen der zu trennenden Proben auf dem Substrat bzw. dem Probenreservoir 21 entsprechen. Die Trennkapillaren 10 besitzen beispielsweise einen Außendurchmesser von 11
100 μm bis 400 μm. Bevorzugte Bauformen sind Kapillaren mit einem Außendurchmesser von 375 μm und einem Innendurchmesser von 100 μm, sowie Kapillaren mit einem Außendurchmesser von 200 μm und einem Innendurchmesser im Bereich von 50 bis 100 μm oder Kapillaren mit einem Außendurchmesser von 150 μm und einem Innendurchmesser von 75 μm. Die Kapillarwanddicke kann jedoch auch jeden anderen Wert einnehmen, der eine reproduzierbare Detektion mit den unten beschriebenen Beleuchtungs- und Detektionseinrichtungen erlaubt. Die Gesamtlänge der Trennkapillaren beträgt bei der dargestellten Ausführungsform rd. 40 bis 50 cm, wobei die Länge jedoch anwendungsabhängig modifiziert werden kann.
Die Trennkapillaren bilden eingangsseitig im wesentlichen einen ebenen 2-dimensionalen ("bürstenartigen") Fächer, dessen Dimensionen etwa denen des Probenreservoirs 21 entspricht. Zu der Halterungseinrichtung 50 hin werden die Trennkapillaren derart zusammengeführt, daß sie zumindest auf der Länge, in der die jeweiligen Detektionsbereiche als Reihe 13 angeordnet sind, dicht beieinanderliegen (s. Fig. 2).
In dem Bereich, in dem die Trennkapillaren vor der Halterungseinrichtung 50 zusammengeführt werden, kann eine Temperierungseinrichtung vorgesehen sein. Die Temperierungseinrichtung ist beispielsweise zum Umströmen der Trennkapillaren mit einem temperierten Medium (z.B. Luft) ausgelegt und dazu eingerichtet, die Trennkapillaren zu thermostatisieren. Es wird vorzugsweise eine Temperatur im Bereich von 10°C bis 60°C eingestellt .
Die Beleuchtungseinrichtung 60 ist dazu vorgesehen, die Reihe der Detektionsbereiche der Trennkapillaren auf der Halterungseinrichtung 50 möglichst gleichmäßig zu beleuchten, so daß die Probenbestandteile, die beim Trennvorgang die Detektionsbereiche passieren, jeweils im wesentlichen denselben Lichtmengen 12
ausgesetzt sind. Da sich die Reihe 13 der Detektionsbereiche beispielsweise über eine Breite der Kapillargruppe von rd. 5 cm erstreckt, wird zur Erzielung einer genügenden Beleuchtungs- oder Anregungsintensität vorzugsweise eine Laser-Lichtquelle 61 mit einer Optik 62 kombiniert, die ein strichförmi- ges Beleuchtungsfeld bildet (sogenannter "Line-Generator"). Der Laser 61 ist in Abhängigkeit von den Spektraleigenschaften der verwendeten Fluoreszenzmarkierung ausgewählt (beispielsweise: Ar-Laser mit einer Leistung von rd. 50 bis 200 mW) und kann ebenfalls über die Steuereinheit 44, 45 angesteuert werden.
Die Optik 62 bildet das strichförmige Beleuchtungsfeld. Die Optik kann beispielsweise durch einen mit hoher Geschwindigkeit schwingenden oder rotierenden Spiegel gebildet werden, was jedoch gegebenenfalls nachteilig für die Stabilität der Anordnung ist. Es ist auch der Einsatz einer Zylinderlinse möglich, die vorteilhafterweise bewegliche Teile vermeidet, jedoch so bemessen sein muß, daß trotz der Gauß-verteilten Intensität des Beleuchtungsfelds eine Zylinderlinse eine genügend homogene Bestrahlung der Kapillarreihe ermöglich wird. Die Optik 62 wird daher gemäß einer bevorzugten Ausführungsform der Erfindung mit einer sogenannten Powell-Linse (Hersteller: OZ Optics, Kanada) realisiert, die eine homogene Ausleuchtung und optimale Ausnutzung der Laserleistung ermöglicht (s. Fig. 8). Die Powell-Linse kann ferner direkt über eine Lichtleitfaser 63 mit dem Laser 61 verbunden werden, wodurch ein robuster und transportabler Aufbau erzielt wird, in dem keine beweglichen Teile wie Drehspiegel oder dgl . enthalten sind und der sicherstellt, daß abgesehen von dem strichförmi- gen Beleuchtungsfeld kein kohärentes oder hochfokussiertes Licht austritt (Benutzersicherheit) .
Die Lichtleitfaser 64 erlaubt zudem ein leichtes Auswechseln des Lasers (z.B. zur Anpassung an andere Fluoreszenzmarkierun- 13
gen) oder - in Kombination mit speziellen Kopplern - die Durchleitung des Lichts zweier verschiedener Laser auf das gleiche Beleuchtungsfeld.
Die Lichtintensität des Beleuchtungsfeldes der Powell-Linse ist in Richtung der Linienerstreckung gleichmäßig verteilt und senkecht dazu (d.h. in einer Richtung parallel zur Ausrichtung der Trennkapillaren) Gauß-verteilt . Die Parameter der Powell- Linse und der Anordnung in Bezug auf die Detektorfenster werden so gewählt, daß eine Strichfokussierung auf eine Strichbreite von rd. 1 mm oder weniger erfolgt. Je schmaler das Beleuchtungsfeld ist, desto höher ist die erzielbare Auflösung der Trennvorrichtung.
Einzelheiten der Detektionseinrichtung 40 und der Sammeleinrichtung 70 werden unten unter Bezug auf die Fign. 3, 4 und 5 erläutert .
Fig. 2 zeigt einen Ausschnitt einer Halterungseinrichtung 50 als schematische Perspektivansicht zur Illustration der ebenen, parallelen Anbringung der Trennkapillaren auf der Oberseite der Halterungseinrichtung (unterer Teil von Fig. 2) und eine vergrößerte Perspektivansicht mit einem Kapillarabschnitt in Phantomansicht (oberer Teil von Fig. 2). Die Halterungseinrichtung umfaßt mindestens den dargestellten Kapillarhalter 51, der den Trennkapillaren 10 mechanische Unterstützung in der Fokusebene der Beleuchtungseinrichtung gibt und eine optische Isolierung zwischen den Trennkapillaren sicherstellt. Es können mehrere Kapillarhalter für je beispielsweise 16 Kapillaren vorgesehen sein, wobei die Gesamthalterung 50 dann modulweise aufgebaut ist und einzelne Kapillarhalter als Module austauschbar sind. Die Trennkapillaren sind außer in den Detektionsbereichen mit Schutzschichten versehen, die gegebenenfalls lichtundurchlässig sind. In den Detektionsbereichen 10a sind die Trennkapillaren beschichtungsfrei . Der Kapillarhalter 14
51 unterstützt die Trennkapillaren mindestens in einem Längenabschnitt, in dem sich die Detektionsbereiche befinden. In bezug auf die Gesamtlänge der Trennkapillaren ist dies vom Einlaßende her gesehen im hinteren Viertel oder hinteren Drittel der Länge der Trennkapillaren. So bilden die Detektionsbereiche oder Detektionsfenster der Trennkapillaren bei einer Trennkapillarenlänge von rd. 50 cm eine gerade Reihe, die von den Auslaßenden der Kapillaren einen senkrechten Abstand von rd. 5 bis 20 cm, vorzugsweise 10 cm, besitzt. Generell besteht zur Erhöhung des Auflösungsvermögens ein Interesse daran, die Detektionsfenster möglichst weit stromabwärts in bezug auf die Wanderungsrichtung der zu trennenden Proben anzubringen.
Der Kapillarhalter ist ein Block mit Führungsnuten 52, in die die Trennkapillaren eingelegt sind. Die Trennwände 53 dienen der optischen Trennung zwischen den Detektionsbereichen der einzelnen Trennkapillaren. Die Trennwände werden durch mög- lich-rt dünne Stege 53 gebildet, um so eine enge Packung der Kapillaren zu ermöglichen und die Bildung von Schatten des in Betriebsposition von oben aufgestrahlten Beleuchtungs- oder Anregungslichtes zu vermeiden. Ersatzweise ist es auch möglich, den Kapillarhalter 51 ohne Nuten auszuführen und die Kapillaren aneinandergrenzend flach auf die Oberseite des Kapillarhalters aufzulegen. Dies erfordert jedoch, daß anstelle der Trennwände 53 als optische Isolierungseinrichtungen auch in den Detektionsbereichen lichtundurchlässige Beschichtungen auf den jeweils zu benachbarten Trennkapillaren weisenden Seiten der Trennkapillaren vorgesehen sind, oder eine exakte optische Abbildung.
An der Halterungseinrichtung sind ferner nicht dargestellte Befestigungsmittel (beispielsweise Klemmen) zur lösbaren Befestigung der Trennkapillaren 10 in den Nuten 52 vorgesehen. Es kann vorgesehen sein, daß die Halterungseinrichtung die Trennkapillaren auch in Längenabschnitten außerhalb der Detektions- 15
bereiche unterstützt. In der Regel ist es jedoch ausreichend, daß die Trennkapillare vom Einlaßreservoir 20 zur Halterungseinrichtung 50 (s. Fig. 1) durch Luft geführt werden. Es können aber auch Temperiereinrichtungen in diesem Abschnitt vorgesehen sein, um den Trennvorgang unter vorbestimmen Temperaturbedingungen ablaufen zu lassen.
Im folgenden wird unter Bezug auf die Fign. 3 und 4 das Prinzip der spektral aufgelösten Multiplex-Detektion erläutert. Während es bei einfachen Analyseaufgaben, bei denen nur ein Fluoreszenzmarker erfaßt werden muß, ausreicht, an der Abbildungseinrichtung 41 der Detektoreinrichtung 40 (s. Fig. 1) geeignete Filter zur Abschirmung des Anregungslichts bei Fluoreszenzmessung anzubringen, ist bei komplizierteren Analyseaufgaben eine spektrale Trennung des von den Detektionsbereichen ausgehenden Lichtes erforderlich. Dies ist beispielsweise bei der DNA-Sequenzierung der Fall, wenn Nukleotide spezifisch mit Fluoreszenzmarkern versehen sind und dementsprechend selektiv beispielsweise als vier getrennte Fluoreszenzbanden de- tektiert werden sollen.
Die Erfindung liefert vorteilhafterweise simultan eine hervorragende Spektral- und Ortsauflösung, indem eine Abbildung der Detektionsfensterreihe auf eine zweidimensionale Detektormatrix mit Spektral- und Ortsauflösung entsprechend den zwei Matrixdimensionen abgebildet wird. Dies ist schematisch in Fig. 3 dargestellt. Die abweichend von der Betriebsposition vertikal dargestellte Anordnung von Trennkapillaren 10 mit der Detektionsfensterreihe 13 wird mit einer Abbildungseinrichtung (nicht dargestellt) und dem Dispersionselement 43 auf eine CCD-Matrix 42 abgebildet. Das Dispersionselement 43 ist symbolisch durch ein Prisma dargestellt, kann jedoch durch jeden wellenlängendispersiven Aufbau mit hoher Ortsauflösung gebildet werden. Die Abbildung auf der CCD-Matrix erfolgt derart, daß in y-Richtung die Ortsauflösung und in x-Richtung die 16
Spektralauflösung realisiert wird. Die Matrix enthält somit beleuchtete Pixelreihen, deren Zahl der Zahl der Trennkapillaren entspricht. Jedes Pixel liefert ein Detektorsignal in Abhängigkeit von der eingefallenen Lichtmenge, so daß der Detektorsignalverlauf jeder x-Reihe dem Spektralverlauf des von einer Trennkapillare ausgehenden Lichtes entspricht. Es kann vorgesehen sein, daß je nach dem eingesetzten Fluoreszenzfarbstoff oder -marker nur ein Teilbereich einer oder mehrere x- Reihen ausgelesen wird, der gerade dem erwarteten Wellenlängenemissionsbereich des Fluoreszenzfarbstoffs oder -markers entspricht. Die spektrale Auflösung ist zur Messung in mindestens drei Spektralbereichen ausgelegt.
Einzelheiten der spektral- und ortsaufgelösten Detektion sind in Fig. 4 gezeigt. Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform wird die Detektionsfensterreihe 13 mit einem ersten Objektiv 411 auf einen Spalt 412 abgebildet. Ein zweites, invertiertes Objektiv 413 sendet das Licht vom Spalt durch das Dispersionselement 43. Ein oder mehrere Filter 414 zur Ausblendung des Anregungslichtes können sich entweder vor dem Objektiv 411 (wie dargestellt) oder zwischen dem invertierten Objektiv 413 und dem Dispersionselement 43 befinden. Das Dispersionselement 43 ist entweder ein klassisches Spektralgerät mit Prismen und/oder Gittern (Nachteil: Änderung der Abbildungsrichtung, verminderte örtliche Auflösung) oder vorzugsweise durch ein Geradsichtprisma 431 (sogenanntes Amici-Prisma, Fig. 4A) oder durch eine Prisma-Gitter-Prisma-Kombination 432 (Fig. 4B) oder durch eine L-förmige Anordnung mit einem holographischen Transmissionsgitter 433 (Fig. 4C) gebildet. Beim letztgenannten Beispiel gemäß Fig. 4C wird das Licht in einem bestimmten Winkel über einen Spiegel 434 auf das Transmissionsgitter 433 eingestrahlt. Das Geradsichtprisma 431 oder die Kombination 432 oder der L-förmige Aufbau mit dem Transmissionsgitter 433 besitzen den Vorteil eines kompakten Aufbaus und einer erhöhten Robustheit. Störungen durch Aberrationen und Astigmatismus sind weitgehend ausgeschlossen. Ferner wird ein hoher Lichtdurchsatz bei gleichzeitig geringer Fokuslänge gewährleistet. Bei den ersten beiden Gestaltungen bleibt eine gerade optische Achse von den Detektionsfenstern zur Detektorkamera erhalten. Bei dieser Gestaltung kann der gesamte Aufbau aus Objektiven, Spalt, Filter und Dispersionselement in einem gegen Streulicht abgeschirmten Tubus angeordnet werden, der als "tragbares Spektrometer" sogar mobil gestaltet werden kann. Durch geeignete Wahl der Abbildungsparameter der Objektive und des Dispersionselements ist der Abbildungsmaßstab in weiten Bereichen wählbar, so daß sich eine hohe Flexibilität in bezug auf die Zahl und Durchmesser der Trennkapillaren ergibt.
Das durch das Dispersionselement 43 durchtretende Licht wird mit einem Objektiv 415 auf die Kamera 42 abgebildet. Der CCD- Chip 421 der Kamera 42 besitzt beispielsweise 500 * 500 Pixel, aus denen anwendungsabhängig (insbesondere in Abhängigkeit von der Zahl und Größe der zu erfassenden Trennkapillaren) Pixelgruppen ausgewählt werden, die beim Analysevorgang ausgelesen werden. Bei einer Pixelgröße von beispielsweise 24 * 24 μm können geringste DeJustierungen (z.B. Verschiebungen der Trennkapillaren) eine Verschiebung der Abbildung auf der CCD- Matrix verursachen. Zur Vermeidung dieser Erscheinung wird erfindungsgemäß ein Suchalgorithmus durchgeführt, in dessen Ergebnis die genannten Pixelgruppen festgelegt werden, die ausgelesen werden sollen. Dies bedeutet, daß die Steuereinrichtung 44 automatisch die gewünschten Bildpunkte des spektral- und ortsaufgelösten Bildes der Detektionsfensterreihe auswählt. Als Algorithmus für das Auslesen wird ein geeigneter Algorithmus aus der Bilddatenverarbeitung verwendet, so z.B. der sogenannte Wasserscheidenalgorithmus (s. S. Wegner et al . in "Spektrum der Wissenschaft", 1997, S. 113) oder der sogenannte Chain-Code-Algorithmus, der im folgenden unter Bezug auf Fig. 5 erläutert wird. 18
Bei Verwendung von beispielsweise 100 Kapillaren und n Fluoreszenzemissionen werden auf dem CCD-Chip 100 * n Pixelgruppen
("Regions of Interest") gebildet. Die Pixel der Gruppen müssen zusammengefaßt (sogenanntes "binning") und korreliert ausgelesen werden. Die Pixelgruppen werden in vorbestimmter Weise definiert oder mit dem Datenverarbeitungsalgorithmus in einer ersten Versuchsphase automatisch ermittelt. Beim Chain-Code
(s. Fig. 5) wird nur ein Startpunkt der Matrixkoordinaten aufgezeichnet, und die übrigen, zu einer Gruppe gehörigen Pixel werden mit vorbestimmten Richtungscodes erfaßt und ausgelesen. Es können beispielsweise wie dargestellt acht Richtungscodes vorgesehen sein, die sich auf die acht Pixel beziehen, die ein betrachtetes Pixel umgeben. Durch Angabe einer Nummernfolge entsprechend den durchnumerierten Richtungen können alle zu einer Pixelgruppe gehörigen Pixel eindeutig angegeben werden. Diese Angabe ist gegenüber geringen Bildverschiebungen (Versetzung im linken Teil der Abbildung) unempfindlich und-er- laubtr in vorteilhafter Weise eine Verringerung des zur Charakterisierung einer Gruppe erforderlichen Speicherbedarfs.
Fig. 6 zeigt in schematischer Seitenansicht Einzelheiten der Sammeleinrichtung (oder des Auslaßgefäßes) 70 (s. Fig. 1). Die Sammeleinrichtung 70 besteht aus einem Druckgefäß 73 mit einem pH-gepufferten Trägermedium 74. Das Druckgefäß 73 ist über eine Druckleitung 75 mit einer Pumpeinrichtung 77 verbunden, die Druckluft zur Beschickung der mit den Auslaßenden in das Trägermedium ragenden Trennkapillaren 10 bereitstellt. Die Pumpeinrichtung wird über die Einheit 44, 45 gesteuert. In das Trägermedium ragt außerdem eine Elektrode 71, die mit einer (nicht dargestellten) Hochspannungsversorgungseinrichtung verbunden ist. Zwischen der Elektrode 71 und den Auslaßenden der Trennkapillaren 10 ist eine gestrichelt dargestellte Molekülfalle 76 vorgesehen, die zum Auffangen der getrennten Proben eingerichtet ist. Unter der Wirkung eines elektrischen Feldes treten die getrennen Proben aus den Kapillarenden aus und wan- 19
dern zur Elektrode 71. Dabei treffen sie auf die Molekülfalle in Form einer porösen Trennwand (z.B. eine Membran oder ein Gel) mit Poren einer charakteristischen Größe von rd. 10 bis 100 nm Durchmesser. Das Auffangen der getrennten Proben oder Moleküle wird nach einem der folgenden Prinzipien realisiert.
Da die Geschwindigkeit der Wanderung unter Wirkung eines elektrischen Feldes wesentlich höher als die Geschwindigkeit einer Diffusionswanderung ist, wird die Wahrscheinlichkeit für einen Durchtritt von Molekülen durch die Molekülfalle von der Elektrode zu den Auslaßenden während einer Abschaltzeit der Hochspannung sehr gering. In diesem Fall ist es nicht erforderlich, die Porengröße in besonders genau festgelegten Grenzen auszuwählen. Gemäß einem alternativen Mechanismus wird davon ausgegangen, daß die getrennten Proben aus feldabhängig gestreckten Molekülen (Polyelektrolyte) bestehen, die unter Wirkung des elektrischen Feldes in gestreckter Form relativ leicht die Poren passieren, nach Abschalten des Feldes in Kugelform jedoch nur schwer durch die Poren hindurchtreten können.
Gemäß einer bevorzugten Ausführung der Erfindung sind die Elektroden eingangsseitig unmittelbar an den Kapillaren angebracht, wie dies schematisch in Fig. 7 dargestellt ist. Hierzu tragen die Einlaßenden der Trennkapillaren eine äußere Metall- beschichtung 14 (beispielsweise aus Silber oder Platin) , wodurch simultan die Elektrodenfunktion erfüllt wird. Dies erlaubt eine erhebliche Verringerung des minimalen Injektionsvolumens. Über eine Kontakteinrichtung (z.B. Klammer) 15 wird der elektrische Konstakt hergestellt.
Im folgenden wird der Ablauf einer Trennanalyse unter Verwendung der oben beschriebenen Trenneinrichtung (s. Fig. 1) beschrieben. Zuerst wird zur Trägermedienbeschickung eine leere Platte oder ein Gefäß unter die Einlaßenden der Trennkapilla- ren gefahren und das Druckgefäß 73 der Sammeleinrichtung 70 mit einem Druck derart beaufschlagt, daß das Trägermedium 74 in die Auslaßenden der Trennkapillaren eintritt und durch diese bis an die Einlaßenden läuft. Der Druck wird abgesetzt, sobald genügend Trennmedium durch die Kapillaren geflossen ist. Bei einem sich anschließenden Vorlageschritt wird das Probenreservoir 21 von unten an die Einlaßenden der Trennkapillaren gefahren, so daß die Einlaßenden in die auf dem Vorratsreservoir angeordneten Probenmengen eintauchen. Anschließend wird zur Probenbeschickung für eine bestimmte Beschickungszeit eine Hochspannung an die Trennkapillaren gelegt, um in die Einlaßenden kleinste Probenmengen zu injizieren. Die Beschickungszeit und die Hochspannung werden derart ausgewählt, daß jeweils die ersten Millimeter der Trennkapillaren mit den zu trennenden Proben gefüllt sind. Dies wird beispielsweise bei den obengenannten Kapillaren mit Innendurchmessern im Bereich von 50 bis 100 μm bei Einsatz üblicher Lösungsmittel mit einer Beschickungszeit im Bereich von 1 bis 20 Sekunden und einer Hochspannung von ca. 100 V/cm - 400 V/cm (vorzugsweise rd. 10 kV) erreicht. Nach der Probenbeschickung wird das Probenreservoir 21 durch das Vorratsreservoir 24 mit einer Pufferlösung (Elektrolytlösung) ersetzt, mit der während des sich anschließenden Trennvorgangs die Einlaßenden der Trennkapillaren in Verbindung stehen. Für den eigentlichen Trennvorgang wird wieder die Hochspannung für eine anwendungsabhängig gewählte Trennzeit angelegt, die im Bereich von 10 bis 30 Minuten oder aber auch im Stundenbereich liegen kann.
Während des gesamten, mit der Steuereinrichtung 44 automatisch steuerbaren Trennvorganges wandern die zu trennenden Proben (Moleküle, DNA-Abschnitte, Proteine oder dgl . ) hin zu den Auslaßenden der Trennkapillaren. Durch das Trennmedium erfolgt eine "Selektion", d.h. die kleinen Moleküle erreichen die jeweiligen Detektionsfester schneller als die großen Moleküle, so daß durch die orts- und spektralaufgelöste Detektion an 21
jedem einzelnen Sektionsfenster in Abhängigkeit von der Zeit eine vollständige Analyse der Probenzusammensetzung vorgenommen werden kann. Die Trennung der Moleküle kann auch durch andere Mechanismen erfolgen, z.B. durch sogenannte "endlabeled free solution electrophoresis" .
Experimentelle Ergebnisse der erfindungsgemäßen Trenneinrichtung sind in den Fign. 8 bis 11 dargestellt. Fig. 8 zeigt einen Vergleich der Ausleuchtung des Detektionsbereichs mittels einer Zylinderlinse und mittels eines "Linien-Generators" (Das "verrauschte" Signal kommt hier durch die Verwendung einer "multimode"-Lichtfaser statt einer "monomode"-Lichtfaser zustande) . Die Zylinderlinse erzeugt ein sog. Gauß-förmiges Profil, wogegen der line-generator ein plateauförmiges Profil, und damit eine homogenere Ausleuchtung erzeugt. Fig. 9 zeigt einen Kurvenverlauf zur Illustration des praktisch ausgeschlossenen Übersprechens ( "Cross-Talk") zwischen verschiedenen Trennkanälen (Trennkapillaren) . Die drei Maxima entsprechen den Detektorsignalen aus Pixelgruppen, die benachbarten Trennkapillaren zugeordnet sind. Das Übersprechen zwischen benachbarten Kapillaren ist geringer als 1%, so daß eine eindeutige und reproduzierbare Zuordnung der Detektorsignale zu den Trennkanälen möglich ist. Im gezeigten Beispiel waren die Kapillaren ohne Trennwand nebeneinander angeordnet. Durch die optische Trennung des Kapillarhalters wird das Übersprechen nocht weit geringer.
Fig. 10 illustriert die erfindungsgemäße Wahl eines niedrigviskosen Trägermediums (Trennmatrix) . Die Kurvenverläufe zeigen die Abhängigkeit der Trennmedien-Viskosität von der jeweiligen Trennmedien-Konzentration. Die Konzentration wird so ausgewählt, daß die Viskosität 100 centiStokes (mm2/s) (entsprechend ungefähr < 100 cP) ist. Fig. 11 zeigt ein Kontrollexperiment zur Demonstration der Reproduzierbarkeit der erfindungsgemäßen Trenneinrichtung. Es wurden 96 identische DNA-Proben gleichzeitig getrennt. Es sind beispielhaft die Detektorsignale von acht Kapillaren über eine Detektionszeit von rd. 30 Minuten akkumuliert gezeigt. Es zeigt sich eine hervorragende Übereinstimmung der Trennergebnisse in den verschiedenen Kapillaren.
Die Erfindung wird oben unter Bezug auf Fluoreszenzmessungen erläutert. Es sind jedoch in analoger Weise auch optische De- tektionen realisierbar, die auf Absorptions-, Reflexions- oder Transmissionsmessungen beruhen.

Claims

23PATENTANSPRÜCHE
1. Elektrophoreseeinrichtung mit einer Vielzahl von Trennkapillaren (10), die jeweils einen Detektionsbereich (10a) aufweisen, und einer Detektoreinrichtung (40) mit einer Abbildungseinrichtung (41) und einer Detektorkamera (42), wobei die Trennkapillaren so an einer gemeinsamen Halterungseinrichtung
(50) angebracht sind, daß die Detektionsbereiche (10a) eine gerade Reihe (13) bilden, die mit der Abbildungseinrichtung auf die Detektorkamera abgebildet wird.
2. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 1, bei der eine Beleuchtungseinrichtung (60) zur gleichmäßigen, simultanen Beleuchtung der Reihe der Detektionsbereiche vorgesehen ist.
3. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 2, bei der die Beleuchtungseinrichtung eine Lichtquelle (61) und eine Optik (62) umfaßt, die ein strichförmiges Beleuchtungsfeld bildet.
4. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 3, bei der die Optik (62) eine Powell-Linse ist.
5. Elektrophoreseinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Detektorkamera (42) mindestens eine Reihe von Detektorelementen umfaßt, auf die die Reihe (13) der Detektionsbereiche abgebildet ist.
6. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 5, bei der die Detektoreinrichtung ein Dispersionselement (43) enthält und die Detektorkamera (42) eine zweidimensionale Detektormatrix umfaßt, auf die die Reihe der Detektionsbereiche in einer 24 ersten Richtung ortsaufgelöst und in einer zweiten Richtung spektralaufgelöst abgebildet wird.
7. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Halterungseinrichtung (50) ein Kapillarhalter (51) ist, der Führungsnuten (52) zur Aufnahme von Trennkapillaren mit gegenseitiger optischer Isolation aufweist .
8. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 7, bei der die Führungsnuten durch Stege (53) auf einer Oberfläche des Kapillarhalters gebildet werden, deren Abstände im wesentlichen gleich dem Außendurchmesser der Trennkapillaren ist.
9. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Sammeleinrichtung (70) einen Vorrat des Trennmediums zur Beschickung der Trennkapillaren unter Wirkung eines Beschickungsdruckes enthält.
10. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Sammeleinrichtung eine Molekülfalle
(76) enthält.
11. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Einlaßenden der Trennkapillaren (10) eine gegenseitige Ausrichtung wie Proben auf einem Probenreservoir (21) besitzen.
12. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 10, bei der das Probenreservoir eine Mikrotiterplatte ist.
13. Elektrophoreseeinrichtung gemäß Anspruch 12, bei der die Mikrotiterplatte (21) 96,384 oder 1536 Vertiefungen zur Aufnahme von Proben enthält. 25
14. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Viskosität des Trennmediums geringer als oder gleich 100 cP ist.
15. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der eine automatische Probenzuführung vorgesehen ist.
16. Elektrophoreseeinrichtung gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Detektoreinrichtung (40) dazu vorgesehen ist, mindestens 96 Detektionsbereiche (10a) simultan orts- und spektralaufgelöst zu erfassen.
17. Verfahren zur kapillarelektrophoretischen Probentrennung, bei dem eine Vielzahl von Trennkapillaren gleichzeitig von den Auslaßenden her mit einem Trennmedium und anschließend von den Einlaßenden her mit zu trennenden Proben beschickt werden und anschließend ein Trennvorgang derart erfolgt, daß der Vorbeitritt der zu trennenden Proben an einer Vielzahl von Detektionsbereichen gleichzeitig zeit-, orts- und spektralaufgelöst detektiert wird.
18. Verfahren gemäß Anspruch 17, bei dem die Detektion mit einer zweidimensionalen Detektorkamera mit matrixartig angeordneten Detektorelementen erfolgt, wobei die Detektorelemente gruppenweise entsprechend vorbestimmten, interessierenden Spektralbereichen ausgelesen werden.
19. Verfahren gemäß Anspruch 18, bei der die auszulesenden Detektorelemente unter Verwendung eines Chain-Code-Algorithmus ermittelt werden.
20. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 17 bis 19, bei dem die einzelnen Schritte vollautomatisch gesteuert ablaufen. 26
21. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 17 bis 20, bei dem die zu trennenden Proben in Probenreservoiren angeordnet sind und mit diesen zu den Einlaßenden der Trennkapillaren zugeführt werden.
22. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 17 bis 21, bei dem der Trennvorgang und die Detektion ohne eine Bewegung von mechanischen Bauteilen oder Flüssigkeiten erfolgt.
23. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 17 bis 22, bei dem die kapillarelektrophoretische Probentrennung mit der Anordnung von Proben in Probenreservoiren, der Beschickung der Trennkapillaren mit den Proben, der elektrophoretischen Trennung und einem Ersetzen des Trennmediums für alle Proben in den Probenreservoiren und für alle Trennkapillaren simultan vollautomatisch durchgeführt wird.
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Cited By (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1089073A2 (de) * 1999-09-29 2001-04-04 Hitachi, Ltd. Kapillar-Elektrophoresegerät und Kapillar-Arrayvorrichtung
EP1096257A2 (de) * 1999-10-29 2001-05-02 Markus Sauer Verfahren, Vorrichtung und farbstoffmarkiertes Peptid zum Nachweis eines Moleküls
WO2001038583A2 (en) * 1999-11-22 2001-05-31 Diversa Corporation Capillary array-based sample screening
JP2003532074A (ja) * 2000-04-25 2003-10-28 セビア 固体／固体温度調節による多数の毛細管を備えた改良電気泳動サンプル分析装置
WO2003098200A1 (de) * 2002-05-15 2003-11-27 Evotec Oai Ag Vorrichtung und verfahren zur untersuchung chemischer und/oder biologischer proben
US6794127B1 (en) 1997-06-16 2004-09-21 Diversa Corporation Capillary array-based sample screening
US6972183B1 (en) 1997-06-16 2005-12-06 Diversa Corporation Capillary array-based enzyme screening
CN100394172C (zh) * 2005-01-25 2008-06-11 中国科学院化学研究所 显微毛细管电泳仪
CN102879361A (zh) * 2011-07-12 2013-01-16 上海理工大学 毛细管电泳成像检测系统
WO2023014367A1 (en) * 2021-08-05 2023-02-09 Agilent Technologies, Inc. Capillary array window holder related systems and methods

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP4265851B2 (ja) * 2000-02-07 2009-05-20 富士フイルム株式会社 蛍光撮像装置
JP6361516B2 (ja) * 2015-01-19 2018-07-25 株式会社島津製作所 キャピラリ電気泳動装置及びそれに用いるキャピラリカセット

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5498324A (en) * 1993-02-05 1996-03-12 Iowa State University Research Foundation, Inc. Multiplexed fluorescence detector system for capillary electrophoresis
US5567294A (en) * 1996-01-30 1996-10-22 Board Of Governors, University Of Alberta Multiple capillary biochemical analyzer with barrier member
US5584982A (en) * 1993-06-03 1996-12-17 The Governors Of The University Of Alberta Multiple capillary biochemical analyzer

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5675155A (en) * 1995-04-26 1997-10-07 Beckman Instruments, Inc. Multicapillary fluorescent detection system
US5582705A (en) * 1995-05-19 1996-12-10 Iowa State University Research Foundation, Inc. Multiplexed capillary electrophoresis system

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5498324A (en) * 1993-02-05 1996-03-12 Iowa State University Research Foundation, Inc. Multiplexed fluorescence detector system for capillary electrophoresis
US5584982A (en) * 1993-06-03 1996-12-17 The Governors Of The University Of Alberta Multiple capillary biochemical analyzer
US5567294A (en) * 1996-01-30 1996-10-22 Board Of Governors, University Of Alberta Multiple capillary biochemical analyzer with barrier member

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KYOJI UENO: "SIMULTANEOUS MONITORING OF DNA FRAGMENTS SEPARATED BY ELECTROPHORESIS IN A MULTIPLEXED ARRAY OF 100 CAPILLARIES", ANALYTICAL CHEMISTRY, vol. 66, no. 9, 1994, WASHINGTON, DC, US, pages 1424 - 1431, XP000446027 *
TAKAHASHI S ET AL: "MULTIPLE SHEATH-FLOW GEL CAPILLARY-ARRAY ELECTROPHORESIS FOR MULTICOLOR FLUORESCENT DNA DETECTION", ANALYTICAL CHEMISTRY, vol. 66, no. 7, 1 April 1994 (1994-04-01), pages 1021 - 1026, XP000442478 *

Cited By (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6794127B1 (en) 1997-06-16 2004-09-21 Diversa Corporation Capillary array-based sample screening
US6972183B1 (en) 1997-06-16 2005-12-06 Diversa Corporation Capillary array-based enzyme screening
US6866824B2 (en) 1997-06-16 2005-03-15 Diversa Corporation Capillary array-based sample screening
US7662269B2 (en) 1999-09-29 2010-02-16 Hitachi, Ltd. Capillary electrophoretic instrument and capillary array assembly
US7014746B2 (en) 1999-09-29 2006-03-21 Hitachi, Ltd. Capillary electrophoretic instrument and capillary array assembly
EP1089073A2 (de) * 1999-09-29 2001-04-04 Hitachi, Ltd. Kapillar-Elektrophoresegerät und Kapillar-Arrayvorrichtung
EP1089073A3 (de) * 1999-09-29 2003-05-21 Hitachi, Ltd. Kapillar-Elektrophoresegerät und Kapillar-Arrayvorrichtung
EP1096257A3 (de) * 1999-10-29 2003-01-15 Markus Sauer Verfahren, Vorrichtung und farbstoffmarkiertes Peptid zum Nachweis eines Moleküls
EP1096257A2 (de) * 1999-10-29 2001-05-02 Markus Sauer Verfahren, Vorrichtung und farbstoffmarkiertes Peptid zum Nachweis eines Moleküls
WO2001038583A3 (en) * 1999-11-22 2001-10-11 Diversa Corp Capillary array-based sample screening
WO2001038583A2 (en) * 1999-11-22 2001-05-31 Diversa Corporation Capillary array-based sample screening
JP2003532074A (ja) * 2000-04-25 2003-10-28 セビア 固体／固体温度調節による多数の毛細管を備えた改良電気泳動サンプル分析装置
WO2003098200A1 (de) * 2002-05-15 2003-11-27 Evotec Oai Ag Vorrichtung und verfahren zur untersuchung chemischer und/oder biologischer proben
CN100394172C (zh) * 2005-01-25 2008-06-11 中国科学院化学研究所 显微毛细管电泳仪
CN102879361A (zh) * 2011-07-12 2013-01-16 上海理工大学 毛细管电泳成像检测系统
WO2023014367A1 (en) * 2021-08-05 2023-02-09 Agilent Technologies, Inc. Capillary array window holder related systems and methods

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Publication number Publication date
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CA2284195A1 (en) 1999-08-05
DE19803753C1 (de) 1999-12-02
JP2001518197A (ja) 2001-10-09

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