UA123682C2 - Вірус качиного ентериту та його застосування - Google Patents

Вірус качиного ентериту та його застосування Download PDF

Info

Publication number
UA123682C2
UA123682C2 UAA201900802A UAA201900802A UA123682C2 UA 123682 C2 UA123682 C2 UA 123682C2 UA A201900802 A UAA201900802 A UA A201900802A UA A201900802 A UAA201900802 A UA A201900802A UA 123682 C2 UA123682 C2 UA 123682C2
Authority
UA
Ukraine
Prior art keywords
gene
oem
deletion
nucleic acid
virus
Prior art date
Application number
UAA201900802A
Other languages
English (en)
Inventor
Саекі Юкарі
Саеки Юкари
Original Assignee
Сева Санте Анімаль
Сева Санте Анималь
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сева Санте Анімаль, Сева Санте Анималь filed Critical Сева Санте Анімаль
Publication of UA123682C2 publication Critical patent/UA123682C2/uk

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12Viral antigens
    • A61K39/145Orthomyxoviridae, e.g. influenza virus
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12Viral antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/39Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the immunostimulating additives, e.g. chemical adjuvants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/465Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from birds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • C12N15/869Herpesviral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/525Virus
    • A61K2039/5258Virus-like particles
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/54Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/545Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/55Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the host/recipient, e.g. newborn with maternal antibodies
    • A61K2039/552Veterinary vaccine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/16011Herpesviridae
    • C12N2710/16311Mardivirus, e.g. Gallid herpesvirus 2, Marek-like viruses, turkey HV
    • C12N2710/16334Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/16011Herpesviridae
    • C12N2710/16311Mardivirus, e.g. Gallid herpesvirus 2, Marek-like viruses, turkey HV
    • C12N2710/16341Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2710/16343Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/16011Herpesviridae
    • C12N2710/16311Mardivirus, e.g. Gallid herpesvirus 2, Marek-like viruses, turkey HV
    • C12N2710/16361Methods of inactivation or attenuation
    • C12N2710/16362Methods of inactivation or attenuation by genetic engineering
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2720/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsRNA viruses
    • C12N2720/00011Details
    • C12N2720/10011Birnaviridae
    • C12N2720/10034Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Винахід стосується вірусу качиного ентериту (DEV) і його застосування для вакцинації для вакцинації або імунізації домашньої птиці проти пташиних патогенів. 2

Description

(57) Реферат:
Винахід стосується вірусу качиного ентериту (ОЕМ) і його застосування для вакцинації для вакцинації або імунізації домашньої птиці проти пташиних патогенів.
Даний винахід стосується нових вірусів і їх застосування. Більш конкретно, винахід стосується нових конструкцій вірусу качиного ентериту і їх застосування для експресії або доставки поліпептидів, які представляють інтерес, тваринам, особливо домашнім птахам.
Винахід особливо підходить для вакцинації домашньої птиці проти патогенів птахів.
Рівень техніки
М'ясо та яйця птиці є важливими джерелами їжі, споживання яких постійно зростає через зростання чисельності населення і високого співвідношення ціни і якості. Недавня епідемія пташиного грипу звернула громадську думку на здоров'я птахів, а також на безпеку і збереження харчових продуктів, а технологія вакцинації птахів стала загальносвітовою проблемою.
Як вакцини для домашньої птиці проти цільових патогенів зазвичай застосовуються рекомбінантні віруси, які експресують білки патогенів. Вакцини, які містять такі віруси, викликають експресію чужорідних білків патогена або їх фрагментів в інфікованих клітинах, які згодом можуть індукувати специфічний і захисний гуморальний імунітет, а також клітинний імунітет.
У зв'язку з цим був розроблений цілий ряд вірусів, у які був вбудований чужорідний ген з патогена, для застосування в якості вакцин на основі вірусних векторів. Ці вірусні вектори (або рекомбінантні віруси) зазвичай грунтуються на авіпоксвірусах типу вірусу віспи птахів (ЕР-А- 0,517,292), герпесвірусах, зокрема НМТ (наприклад, УУО-А-87/04463, 5,980,906, 5,853,733), вірусі хвороби Н'юкасл (МОМ ) або пташиних аденовірусах. Ці рекомбінантні віруси птахів виявляють різні рівні захисту в залежності від захворювання та/або тварини.
Наприклад, оскільки поксвірусів, МОМ і аденовіруси не персистують у курей, вони вважаються не найкращими кандидатами для тривалого імунітету у курей. Рекомбінантні НМТ, які експресують антигени, проявляли переваги і в даний час комерційно доступні для вакцинації курей (наприклад, Месіогтипе? ІВО, Месіотптпипе? МО або Месіогтипе? І Т).
Однак, з огляду на дедалі зростаючу кількість і різноманітність патогенів та безперервне зростання споживання домашньої птиці, існує потреба в альтернативних стратегіях і/або системах вакцинації, які можна використовувати для вироблення ефективного захисного імунітету у домашніх птахів. Зокрема, існує потреба в ефективних системах для забезпечення
Зо імунітету у дуже молодих тварин (З дні або менше) або іп омо.
У зв'язку з цим вивчалися нові серотипи вірусів з метою пошуку альтернативних сумісних вірусних векторів для поліпшення вакцинації тварин, особливо свійських птахів, що забезпечують стабільну експресію білка і ефективний захист.
УМО 2014/0036735 обговорюється можливе застосування вірусу качиного ентериту у курей.
У природі ОЕМ інфікує качок або гусей, але не має ніякого відомого тропізму для курей. У цьому документі передбачається, що конструкції з ОЕМ можна вводити внутрішньом'язово 1-тижневим курчатам. Однак в цьому документі повідомляється тільки про пізнє введення.
Проте, при проведенні подальших експериментів з ОЕМ автори винаходу виявили, що такий вірус летальний при введенні молодим курчатам (3 дні або менше) або іп омо. Несподівано, хоча введення курчатам ОЕМ дикого типу (або конструкції ОЕМ, що містить всі нативні гени, як запропоновано в УМО 2014/0036735) через 1 тиждень після вилуплення начебто добре переноситься, однак введення такої конструкції в 1-й день після вилуплення або іп омо викликає масову загибель тварин (тобто від 80 до 10095). Ще більш несподівано автори винаходу змогли модифікувати структуру ОЕМ і отримати такі конструкції ОЕМ, які можуть використовуватися у домашніх птахів, в тому числі на дуже ранній стадії (З дні або менше) або іп омо, причому вони можуть викликати істотну експресію білка іп мімо на ранній стадії. Отже, такі віруси є новими потужними векторами для вакцинації домашньої птиці.
Сутність винаходу
Винаходом передбачені нові вірусні конструкції, придатні для експресії генів або білків іп мімо у тварин, особливо у домашньої птиці, в тому числі на дуже ранній стадії (тобто на 3-й день після вилуплення або раніше, а також іп омо). Зокрема, винаходом передбачені нові ОЕМ, отримані шляхом інактивації генів 054 і О55, і показано, що такі ОЕМ (ї) піддаються атенуації іп мімо, особливо у курей, і (ії) є стабільними і здатні експресувати чужорідні гени відповідним чином для формування захисного імунітету. Крім того, ці дефектні і атенуйовані ОЕМ зберігають високу швидкість росту, що дозволяє їх отримувати з високим титром. Оскільки такі ОЕМ не володіють ніяким відомим природним тропізмом, наприклад, для курей, то застосування таких конструкцій ОЕМ для вакцинації курчат не пов'язане з ризиком поширення або зараження невакцинованих тварин. Крім того, у курей не виробляються материнські антитіла або імунітет проти ОЕМ, і віруси винаходу можуть застосовуватися для вироблення дуже раннього імунітету бо у вакцинованих тварин. Несподівано, як уже сказано раніше, хоча ОЕМ дикого типу летальний для молодих курчат або іп омо, однак віруси ОЕМ за винаходом безпечні і можуть ефективно експресувати гени, які представляють інтерес, іп мімо. Отже, такі нові ОЕМ є дуже потужними векторами для вакцинації тварин, особливо свійських птахів, і для вироблення раннього захисного імунітету.
Більш конкретно, предметом винаходу є такий вірус качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени 054 і 055. Так, винахід показав, що при інактивації цих генів можуть бути отримані життєздатні, стабільні і реплікативні ОЕМ, причому такі віруси можуть застосовуватися для отримання рекомбінантних ОЕМ шляхом введення чужорідного генетичного матеріалу.
Результати також показують, що такий чужорідний генетичний матеріал експресується на високому рівні у таких вірусів при інфікуванні клітин, причому така експресія залишається стабільною в часі. Більше того і неочікувано, хоча нативні ОЕМ, а також багато інших конструкції
РЕМ з делеціями, отримані авторами винаходу, виявилися патогенними або летальними для молодих курчат (на 3-й день після вилуплення або раніше) і іп омо, однак при інактивації О54 і 055 виникають атенуйовані віруси, які можна безпечно використовувати для експресії білків і антигенів у молодих тварин, в тому числі іп омо. Такий результат був цілком несподіваним і дає даним вірусам великі переваги і застосовність.
Іншим предметом винаходу є такий вірус качиного ентериту (ОЕМ), який має неактивні гени 054 і Ш55 і містить чужорідну нуклеїнову кислоту.
Відповідно до конкретних втілень, гени Ш54 і 055 піддавалися мутації або делеції або перериванню; і/або замість всіх або частини послідовностей генів 054 і 0055 розташовується чужорідна нуклеїнова кислота, причому чужорідна нуклеїнова кислота кодує пташиний патоген.
В іншому конкретному втіленні ОЕМ за винаходом додатково містить неактивний ген ЦІ 4,
ОІ23 або 057.
Наступним предметом винаходу є молекули нуклеїнової кислоти, які містять геном ОЕМ з неактивними генами БА і 055.
Винахід також стосується клітин господаря, які містять ОЕМ або нуклеїнову кислоту, як визначено вище.
Винаходом також передбачений спосіб отримання або реплікації ОЕМ, як визначено вище, що включає інфікування компетентних клітин молекулою нуклеїнової кислоти або самим ОЕМ, як визначено вище, і видалення ОЕМ.
Винахід також стосується способу отримання рекомбінантного ОЕМ, який включає вставку чужорідної нуклеїнової кислоти замість всіх або щонайменше 2095 послідовностей генів 054 і 55.
Винаходом також передбачені композиції, які містять ОЕМ, нуклеїнову кислоту або клітини господаря, як визначено вище, фармацевтично або ветеринарно прийнятний ексципієнт або носій і, необов'язково, ад'ювант.
Винаходом також передбачені вакцини, які містять ОЕМ, нуклеїнову кислоту або клітини господаря, як визначено вище, фармацевтично або ветеринарно прийнятний ексципієнт або носій і, необов'язково, ад'ювант.
Наступним предметом винаходу є композиції, ОЕМ, нуклеїнові кислоти або клітини господаря, як визначено вище, для застосування для вакцинації або імунізації птахів, особливо домашніх птахів, більш конкретно курей, більш конкретно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо).
Наступним предметом винаходу є композиції, ОЕМ, нуклеїнові кислоти або клітини господаря, як визначено вище, для застосування для формування захисного імунітету у птахів, особливо домашніх птахів, більш конкретно курей, більш конкретно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо).
Винахід також стосується способу вакцинації тварин, особливо домашніх птахів, більш конкретно курей, більш конкретно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо), що включає введення даним тваринам композиції або вірусу, як визначено вище.
Кращим предметом винаходу є спосіб вакцинації домашніх птахів, який включає введення іп омо композиції або вірусу, як визначено вище.
Іншим переважним предметом винаходу є спосіб вакцинації домашніх птахів, який включає введення композиції або вірусу, як визначено вище, в день 1 (тобто приблизно в межах 24 годин) після вилуплення.
У наступному аспекті винаходом передбачений спосіб вироблення імуногенної або захисної відповіді у тварин проти одного або декількох патогенів птахів, що включає введення даним тваринам, особливо домашнім птахам, більш конкретно курям, більш конкретно молодим птахам (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо) композиції, вакцини або вірусу, як (516) визначено вище.
Віруси або композиції винаходу можна вводити будь-яким способом. Переважно їх вводять іп омо або підшкірно (наприклад, п/ш) через 1 або 2 дні після вилуплення, щоб імунітет вироблявся дуже рано.
Крім того, винаходом передбачені вакцинаційні набори для імунізації птахів, які включають такі компоненти: а) ефективна кількість композиції, як зазначено вище, і р) засіб для введення даної композиції даним птахам.
Винахід може застосовуватися для експресії поліпептидів у будь-яких тварин, переважно для вакцинації птахів, причому він підходить для експресії одного або декількох поліпептидів або пептидів, особливо імуногенних пептидів з патогенів птахів.
Короткий опис фігур
На Фіг. 1 представлена схематична діаграма генома вірусу качиного ентериту (ОЕМ) і розташування генів 05.
На Фіг. 2 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
ОЕМ і структури геномів рОС18-КАРЕМАС-О54055деІ-ВасмР2 і рЕМ/54И55де|/ВасмР2.
Показано розташування з'єднувальної ділянки (стику) 1, стику 2 і стику 3, які використовуються для ампліфікації при реакціях ПЛР.
На Фіг. З представлена експресія МР2 в клітинах СЕК, інфікованих ОЕМ/О54055ае!/Васмга2, при аналізі методом чорних бляшок.
На Фіг. 4 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
ОЕМ ії структури геномів риС18-КАРЕМАС-О54ИО55деІ і ОЕМ/ЛЗ4И055деї. Показано розташування стику 1, використовуваного для ампліфікації при реакціях ПЛР.
На Фіг. 5 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
РЕМ ї структури геномів рОС18-КАРЕМАС-ШІ 23деІ-Соаб5МР2 і ОЕМ/ОЗ4ОО5Б5аейІ 23/СоабУ РО.
Показано розташування стику 1, стику 2 і стику 3, які використовуються для ампліфікації при реакціях ПЛР.
На Фіг. 6 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
РЕМ їі структури геномів рОС18-КАРЕМАС-0О! 26-Соа5МР2 і СЕМ/ЛЗ4О5Б5ЯЙейІІ 26/Соаб5МРа2.
Показано розташування стику 1, стику 2 і стику 3, які використовуються для ампліфікації при
Зо реакціях ПЛР.
На Фіг. 7 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
РЕМ їі структури геномів рОС18-КАРЕМАС-ОІ 45-Соаб5МР2 і СЕМ/ЛОЗ4ИОО55децйі 45/Соаб5МУРа2.
Показано розташування стику 1, стику 2 і стику 3, які використовуються для ампліфікації при реакціях ПЛР.
На Фіг. 8 представлені схематичні діаграми розташування сайту вставки в вихідному геномі
РЕМ ї структури геномів рОС18-КАРЕМАС-ОЇ 50-Соа5МР2 і СЕМ/ЛОЗ4И55аДемцШІ 50/СоабМРа2.
Показано розташування стику 1, стику 2 і стику 3, які використовуються для ампліфікації при реакціях ПЛР.
На Фі,0 9 представлена експресія МР2 в клітинах СЕР, інфікованих
РЕМ/ОЗ4О55аеиЦІ 23/Соаб М Р, РЕМ/ЛІОЗ4О55аеиЦІ 26/СоабМУ Р2, рЕМ/В4И55дей ШІ 45/Соа5МР2 або РЕМ/ЛІ54И55дейШІ 50/Соаб5МР2, при аналізі методом чорних бляшок.
На Фіг. 10 представлений аналіз методом вестерн-блот експресії білка МР2 вірусом
РЕМ/ОЗ4О55аецицІ 23/Соаб У Р, РЕМ/ЛІЗ4О55аєиШІ 26/Соаб МР, рЕМЛЗ4И55ає!иШІ 45/
Соаб5МР2 або бЕМ/І54И55дейШІ|50/Соаб5МР2. 1 - ОЕМ/Л54О55деи123/Соаб5МР2 2 -
РЕМ/О54О55адеЦ1 26/СоабМР2; З - ОЕМ/О54О55йе/0145/СоабМР2; 4 - ОЕМ/ЛО54О55ае1/
МОГ 50/СоаБ5М Р2; 5 - вихідний ОЕМ; 6 - СЕРН.
Розкриття суті винаходу
Даний винахід в цілому стосується атенуйованих вірусів ОЕМ, які містять послідовності чужорідних генів. Цей винахід також стосується композицій, які містять такі ОЕМ, а також їх застосування для вакцинації тварин, особливо домашніх птахів, більш конкретно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо).
Даний опис стане більш зрозумілим з урахуванням наступних визначень.
Визначення
Термін "вірус" означає, зокрема, вірусні частинки, які містять молекулу нуклеїнової кислоти (наприклад, геном), інкапсульовану в капсиді або капсулі. Термін "вірус" також означає вірусний вектор або виділений вірусний геном.
Термін "рекомбінантний" означає молекули, які були створені, розроблені або модифіковані з використанням генетичних технологій. Відносно вірусів термін "рекомбінантний" більш бо конкретно позначає віруси, у яких геном (або геном предка) був модифікований шляхом вставки або делеції щонайменше однієї послідовності нуклеїнової кислоти.
Термін "чужорідна нуклеїнова кислота" по відношенню до вірусів означає нуклеїнові кислоти, які в природі не зустрічаються в геномі вірусу або ж зустрічаються в природі в даному геномі, але в іншій формі або в іншому положенні.
У цьому описі термін "нуклеїнова кислота" або "нуклеїнові кислоти" означає будь-які молекули або послідовності нуклеїнових кислот типу дезоксирибонуклеотидів (ДНК) або рибонуклеотидів (РНК), які можуть бути, наприклад, одноланцюговими або дволанцюговими.
Нуклеїнові кислоти можуть містити ОКЕ або ні. Молекули нуклеїнової кислоти можуть бути отримані методами, відомими рег 5е в даній області, як--о методами штучного синтезу, рекомбінантними методами, ензиматичними методами, реплікації в клітинах господаря або їх комбінаціями. "Ген" означає молекулу або послідовність нуклеїнової кислоти, яка містить відкриту рамку зчитування, що кодує продукт типу поліпептиду (наприклад, пептид, білок і т.д.) або РНК.
У контексті винаходу ОЕМ, який містить "неактивний" ген, означає такий ОЕМ, який не може експресувати функціональний білок або РНК, кодованих даним геном. Так, неактивний ген 054 означає ген 54 з мутацією, делецією і/або перериванням, який не може кодувати білок 054 дикого типу. Неактивний ген 055 означає ген 55 з мутацією, делецією і/або перериванням, який не може кодувати білок 055 дикого типу. Якщо ген Ш55 містить послідовність, яка кодує 555 і 3'О55, то неактивний 055 означає ген 055 з мутацією, делецією і/або перериванням, який не може кодувати будь-який білок дикого типу, який кодується зазначеними послідовностями 5'Ш55 і 3'О55 , наприклад, 555 і 3'О55 обидва містять мутацію, делецію або переривання (розрив).
Термін "атенуйований" в цьому винаході означає такий вірус, який практично не викликає захворювання на моделі у тварин. Атенуйований вірус зазвичай може реплікуватися у господаря, не викликаючи його загибелі. Більш конкретно, атенуйований вірус означає такий вірус, який не є вірулентним у ембріонів при ін'єкції в дозі 1х103 бляшкоутворюючих одиниць (рі) на яйце. Найбільш бажані атенуйовані віруси безпечні в дозі 1х103 рі на 1 яйце щонайменше у 7095 ін'єктованих яєць, більш переважно щонайменше у 8095 ін'єктованих яєць, ще більш переважно щонайменше у 9095, 9595 9795, 9895, 9995 або більше. Атенуйовані віруси за винаходом також безпечні для введення після вилуплення, в тому числі в день 0 (тобто між 0,1 ї 48 годинами після вилуплення).
Термін "пташиний" повинен охоплювати всі види птахів типу птахів з класу Аме5, тобто хребетних тварин, які є пернатими, крилатими, двоногими, ендотермічними і яйцекладними. У контексті винаходу птахи або види птахів, зокрема, означають птахів, які представляють економічний і/або агрономічний інтерес типу домашніх птахів, більш переважно курей і індиків; або декоративних птахів типу лебедів і папуг.
Термін "вакцина" в цьому винаході означає засоби, які можуть застосовуватися для вироблення, стимуляції або посилення імунної відповіді у організму. "Імунна відповідь" означає розвиток у господаря клітинної та/або антитільної імунної реакції на певну композицію або вакцину. Зазвичай "імунна відповідь" включає вироблення антитіл, В- клітин, хелперних Т-клітин і/або цитотоксичних Т-клітин, спрямованих конкретно на антиген або антигени, включені в дану композицію або вакцину. Переважно імунна відповідь є захисною, тобто повинна підвищуватися стійкість до нової інфекції та/або зменшуватися клінічна тяжкість захворювання.
Термін введення або ін'єкція "іп омо" зазвичай означає інокуляцію або ін'єкцію в ембріон, який міститься в яйці. Введення іп омо переважно проводять в будь-який час між 5-м і 1-м днем до вилуплення.
Вірус качиного ентериту
Вірус качиного ентериту (ОЕМ), також відомий як вірус качиного вірусного ентериту (ОМЕМ), в природі інфікує качок і гусей. Повна нуклеотидна послідовність ОЕМ вже встановлена і доступна онлайн (наприклад, див. 90673560). Вірусний геном містить приблизно 162 т.н., які кодують близько 80 різних білків. Було виділено кілька серотипів і штамів ОЕМ, як-то штам
Уапзеп, штам С5С, штам СНм, штам МАС і штам 2085. Повні послідовності декількох штамів
РЕМ доступні в СепрапК, як-то штаму МАС - ІЮ ЕОО82088.2; ізоляту Апайй С-КСЕ - ІО
КЕе263690.1; штаму Апайа СНм - ІЮ 90647509.1; штаму Апайа 2085 - ІЮ дУРг999965; штаму Апаїіа
СМ - ІО КОб549663.1 або штаму Апайа СС - ІЮ 20673560.1.
ОЕМ залишається погано вивченим, а його застосування в якості вектора для експресії генів не піддавалося глибокому вивченню. Наприклад, І ім еї аї. (2013) ї УМО 2014/0036735 намагалися використовувати рекомбінантний МЕМ для експресії генів у курей. Вони використовували бо конструкцію ОЕМ, в якій нуклеїнова кислота була клонована між генами 057 і 058 вірусного генома без зміни експресії нативних генів. Хоча і повідомлялося, що така конструкція може передаватися при внутрішньом'язовій ін'єкції 1-тижневим курчатам, проте в цьому документі або в будь-якому іншому документі попереднього рівня техніки не розкрите якесь можливе застосування ОЕМ для вакцинації іп омо домашніх птахів або для вакцинації молодих птахів, т.б. в день З після вилуплення або раніше, особливо в день 1 або день 2 після вилуплення.
При проведенні подальших експериментів з ОЕМ автори винаходу виявили, що даний вірус летальний при введенні молодим курчатам (3 дні або менше) або іп омо. Несподівано, хоча введення курчатам СЕМ дикого типу (або конструкції ОЕМ, яка містить всі нативні гени, як запропоновано в УМО 2014/0036735) через 1 тиждень після вилуплення начебто добре переноситься, однак введення такої конструкції в 1-й день після вилуплення або іп омо викликає масову загибель тварин (тобто від 80 до 10095), як зазначено в прикладі 1.
Ще більш несподівано автори винаходу змогли модифікувати структуру ОЕМ і отримати такі конструкції ОЕМ, які можуть застосовуватися у домашніх птахів, в тому числі на дуже ранній стадії (З дні або менше) або іп омо, причому вони можуть викликати істотну експресію білка іп мімо на ранній стадії. Зокрема, автори винаходу провели подальші дослідження з ОЕМ і отримали різні рекомбінанти з різними делеціями або змінами генів. Автори винаходу несподівано виявили, що при інактивації обох генів 054 і 055 можна отримати такі рекомбінантні ОЕМ, які (ї) піддаються атенуації іп мімо, особливо у курей, і (ії) стабільні і здатні експресувати чужорідні гени відповідним чином для формування захисного імунітету.
Результати також показують, що такий чужорідний генетичний матеріал сильно експресується такими вірусами при інфікуванні клітин, причому така експресія залишається стабільною в часі.
Більш того і несподівано, при інактивації 054 ії 055 виходять атенуйовані ОЕМ, які можна безпечно використовувати для експресії білків або антигенів у молодих домашніх птахів і іп омо, тоді як ОЕМ з одним лише неактивним геном 054 або одним лише неактивним геном 055 залишаються патогенними або летальними для молодих курчат (у віці менше З днів або іп омо).
Оскільки такі ОЕМ не володіють ніяким відомим природним тропізмом, наприклад, для курей, то застосування конструкцій ОЕМ за винаходом для вакцинації курчат не пов'язане з ризиком поширення або зараження невакцинованих тварин. Крім того, у курей не виробляються материнські антитіла або імунітет проти ОЕМ, і віруси винаходу можуть застосовуватися для
Зо формування дуже раннього імунітету у вакцинованих тварин.
Отже, предметом винаходу є такий вірус качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени 054 ії 055.
Іншим предметом винаходу є такий вірус качиного ентериту (ОЕМ), який має неактивні гени 054 і Ш55 і містить чужорідну нуклеїнову кислоту.
Віруси ОЕМ за винаходом можуть бути отримані з будь-яких видів або штамів ОЕМ.
Повідомлялося про ряд штамів ОЕМ, які доступні з загальнодоступних колекцій, як--о штам
Уапзеп, штам МАС (ІЮ ЕШШО82088.2), штам С-КСЕ (ІЮ КЕ263690.1), штам СНм (0 90647509.1), штам 2085 (0 У6999965), штам СМ (ІЮ КО549663.1) або штам СС (І 920673560.1).
У кращому втіленні ОЕМ за винаходом походить або отриманий з вихідного штаму, обраного з штаму Уапзеп або штаму С5С, або будь-якого штаму ОЕМ, ідентичного послідовності штаму
Уапхзеп або штаму С5С щонайменше на 9095, більш переважно щонайменше на 9595, щонайменше на 9695, щонайменше на 9795, щонайменше на 9895 або щонайменше на 9995.
Винахід показав, що при інактивації (тобто перетворення в нефункціональні або видаленні) генів 054 ії 055 можна отримати атенуйовані ОЕМ, які безпечні навіть при введенні іп омо або молодим птахам і можуть реплікуватися і експресувати білки у домашніх птахів. Зокрема, як показано в прикладах, конструкції ОЕМ з неактивними генами 054 і 055 є стабільними, можуть реплікуватися в культурі і їх можна безпечно вводити в яйця домашніх птахів або молодим птахам. Отже, такі віруси можна використовувати для отримання рекомбінантних ОЕМ, що містять чужорідний матеріал нуклеїнової кислоти, зокрема генів, які кодують антигени, для експресії таких генів у домашніх птахів.
У контексті винаходу ЮЕМ з неактивним геном означає такий ОЕМ, який не може експресувати функціональний білок або РНК, які кодуються даним геном. Таким чином, неактивний ген, зокрема, означає ген з мутацією, делецією і/або перериванням, який не може кодувати білок дикого типу.
В одному конкретному втіленні ген неактивний внаслідок однієї або кількох мутацій в послідовності, що кодує, особливо точкових мутацій в послідовності, що кодує, що запобігають експресію повнорозмірного білка. Такі мутації можуть вводити стоп-кодони або нонсенс-кодони в послідовність або викликати заміни залишків незамінних амінокислот в кодованому білку, при цьому виходить неактивний білок. бо В іншому втіленні ген неактивний внаслідок делеції щонайменше частини (кодуючої)
послідовності даного гена, переважно щонайменше 2095 (кодуючої) послідовності гена, більш переважно щонайменше 3095, щонайменше 4095, щонайменше 50956, щонайменше 6095, щонайменше 7095, щонайменше 8095 або щонайменше 8595 і аж до 10095. У кращому прикладі
ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 300 п.н. з (кодуючої послідовності) гена, який підлягає інактивації. При такій делеції видаляється кодуюча послідовність і тим самим запобігається експресія білка дикого типу або навіть будь-якого білка.
В цьому відношенні одне конкретне втілення винаходу стосується такого вірусу качиного ентериту (ОЕМ), який має делеції генів 054 і 055, зокрема, кодуючої послідовності генів 054 і 55.
Передбачається, що гени Ш54 і 055 вірусу ОЕМ кодують білки. Однак дійсна функція цих генів залишається неясною. Аж до цього винаходу здатність отримувати подвійно дефектні за 054-055 віруси ОЕМ була відома, а здатність таких вірусів ОЕМ реплікуватися і експресувати чужорідні гени без летальності у птахів була повністю невідома.
Ген 054 зазвичай складається з 1380 пар основ генома ОЕМ і кодує білок, що містить приблизно 459 амінокислотних залишків. 054 сильно консервативний між штамами ОЕМ.
Звертаючись до штаму С5С, ген 054 відповідає нт. 141123-142502 в геномі. Передбачається, що фахівці в цій галузі зможуть легко встановити точне місце розташування гена 054 у будь- якого штаму ОЕМ, використовуючи інформацію, яка міститься в цій заявці і загальні знання, або ж шляхом поєднання послідовностей. У переважного ОЕМ за винаходом делеція становить щонайменше 2095 (кодуючої) послідовності гена 054, більш переважно щонайменше 3095, щонайменше 4095, щонайменше 5095, щонайменше 6095, щонайменше 7095, щонайменше 8095, щонайменше 9095 і аж до 10095. У кращому прикладі ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 500 п.н. з (кодуючої) послідовності гена 54, більш переважно щонайменше 600, 700, 800, 900, 1000 або більше. В одному конкретному втіленні ОЕМ за винаходом має делецію, що охоплює щонайменше нт. 200-1000 послідовності гена 054, більш переважно щонайменше нт. 150-1150, ще більш переважно щонайменше нт. 100-1300. В одному конкретному прикладі
РЕМ за винаходом має делецію від нт. 51 до нт. 1330 (тобто більше 9095) послідовності гена
О54. В іншому конкретному втіленні ОЕМ за винаходом має делецію всієї послідовності гена 54 (нт. 1-1380).
Зо Ген 055 вірусу ОЕМ кодує глікопротеїн, функція якого залишається невідомою. У більшості штамів ОЕМ (наприклад, МАС, СС, С-КСЕ, СНум, СМ) ген О55 складається приблизно з 1620 п.н. ї кодує білок приблизно з 539 амінокислотних залишків. У деяких штамів ОЕМ типу штаму 2085 і штаму дапзеп (або Каремас) ген О55 містить дві коротші кодуючі області: 5055 приблизно в 396 п.н. і 3'ШЮБЗ5 приблизно в 1197 п.н., розділені невеликою міжгенною ділянкою приблизно в 25 п.н. (Див. Фіг. 1). Звертаючись до штаму СС, ген 055 відповідає нт. 142662- 144281 в геномі. Передбачається, що фахівці в цій галузі зможуть легко встановити точне місце розташування гена 055 у будь-якого штаму ОЕМ, використовуючи інформацію, яка міститься в цій заявці і загальні знання, або ж шляхом поєднання послідовностей. У переважного ОЕМ за винаходом делеція становить щонайменше 2095 (кодуючої) послідовності гена 055, більш переважно щонайменше 309565, щонайменше 4095, щонайменше 5095, щонайменше 6090, щонайменше 7095, щонайменше 8095, щонайменше 9095 і аж до 10095. У кращому прикладі ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 500 п.н. з (кодуючої) послідовності гена 055, більш переважно щонайменше 600, 700, 800, 900, 1000 або більше. В одному конкретному втіленні
ОЕМ за винаходом має делецію, що охоплює щонайменше нт. 200-1000 послідовності гена 055, більш переважно щонайменше нт. 100-1100, ще більш переважно щонайменше нт. 80-1120.
Коли ген 055 містить дві ОКЕ, то переважно обидві ОКЕ є неактивними. В цьому відношенні, якщо ОЕМ отримують з вірусного штаму з послідовністю гена 055, що містить одну ОКЕ, то ОЕМ переважно має делецію щонайменше 9095 даної ОКЕ типу делеції щонайменше від нт. 51 до нт.1570 послідовності гена 055, більш переважно делецію всього гена 55. Якщо ОЕМ отримують з вірусного штаму з послідовністю гена 055, що містить дві ОКЕ, то ОЕМ переважно має делецію щонайменше 9095 кожної з цих ОКЕ, більш переважно делецію, що включає щонайменше 9095 першої ОКР, всю міжгенну ділянку і щонайменше 9095 другої ОКЕ.
В одному конкретному втіленні ОЕМ за винаходом містить делецію безперервної області, що охоплює щонайменше частину гена 054, всю міжгенну ділянку 054-055 і частину гена О55.
В іншому конкретному втіленні ОЕМ містить делецію нуклеотидної області, що включає щонайменше 5095 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном Ш55 і щонайменше 5095 гена 055.
У більш кращому втіленні ОЕМ містить делецію нуклеотидної області, що включає весь ген 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 055 і весь ген 055. Конкретним прикладом бо такої конструкції є, наприклад, ОЕМ/О54055/Васмра.
Як зазначено вище, ОЕМ за винаходом можуть містити одну або кілька чужорідних нуклеїнових кислот, які представляють інтерес. Як правило, чужорідна нуклеїнова кислота знаходиться під контролем транскрипційного промотора. Переважно промотор клонують з чужорідною нуклеїновою кислотою. Промотором може бути будь-який природний або синтетичний промотор, отриманий з клітинних або вірусних генів. Приклади відповідних промоторів включають, наприклад, промотор р-актину курки (Вас) або його похідні типу Соа5, промотор Рес, найраніший промотор (іє)ї цитомегаловірусу миші (Мстм), промотор цитомегаловірусу людини (Неіту), промотор мавпячого вірусу (5М)40 і промотор вірусу саркоми
Рауса (К5М) або такі їх фрагменти, які зберігають активність промотора. В одному варіанті чужорідна нуклеїнова кислота клонується нижче і під транскрипційним контролем промотора транскрипції, присутнього в геномі ОЕМ.
В одному конкретному втіленні чужорідна нуклеїнова кислота розташовується в послідовності гена 054 вірусного генома ОЕМ, або на додаток до існуючої послідовності гена 054 (що робить ген неактивним шляхом переривання послідовності гена), або замість видаленої послідовності гена 054, або в мутованій послідовності гена 054. В альтернативному втіленні чужорідна нуклеїнова кислота розташовується в послідовності гена 055 вірусного генома ОЕМ, або на додаток до існуючої послідовності гена 055 (що робить ген неактивним шляхом переривання послідовності гена), або замість видаленої послідовності гена 055, або в мутованій послідовності гена 055.
У кращому втіленні ОЕМ за винаходом має делецію в послідовності генів 054 і 055 і містить чужорідну нуклеїнову кислоту, розташовану замість вилучених нуклеотидів.
В альтернативному втіленні ОЕМ за винаходом має неактивні гени 054 і 055 і містить чужорідну нуклеїнову кислоту, розташовану в іншому сайті клонування типу сайту, обраного з гена ЦІ 4, гена ЦІ 44, міжгенної ділянки ШІ 27-01 26, гена 0123, міжгенної ділянки ЦІ 45-01 46, міжгенної ділянки ШІ 50-01 51, гена 057, міжгенної ділянки 57-58 або гена 0510. В цьому випадку чужорідна нуклеїнова кислота може бути клонована з заміною всього або частини зазначеного гена або може бути вставлена в даний ген.
Крім того, ОЕМ5 винаходу можуть містити кілька чужорідних нуклеїнових кислот. При цьому кілька чужорідних нуклеїнових кислот можуть бути вставлені в одне і те ж положення у вірусу, наприклад, в області О54/055, як описано вище, під контролем одного або декількох різних промоторів. З іншого боку, чужорідні нуклеїнові кислоти можуть бути вставлені в різні сайти клонування вірусу, як-то одна в районі ОЗА/ЛІ55, як описано вище, і щонайменше одна в іншій ділянці, переважно обраній з гена Ш14, гена ЦІ 44, міжгенної ділянки ШІ 27-Ш1 26, гена ШІ 23, міжгенної ділянки ШІ.45-01 46, міжгенної ділянки ШОЇ 50-ШІ 51, гена 057, міжгенної ділянки 0О57- 058 або гена 0510, як правило, з заміною всього або частини ендогенного гена або ділянки.
Ген ШІ 4 зазвичай складається з 717 пар основ генома ОЕМ. Звертаючись до штаму СС, ген ЦІ 4 відповідає нт. 142662-144281 в геномі. Передбачається, що фахівці в цій галузі зможуть легко встановити точне місце розташування гена ЦІ 4 у будь-якого штаму ОЕМ, використовуючи інформацію, яка міститься в цій заявці і загальні знання, або ж шляхом поєднання послідовностей. В одному конкретному втіленні винахід стосується такого вірусу качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени 054, 055 і 0/4. Більш переважно винахід стосується такого вірусу ОЕМ, який має неактивні гени 054, 055 і ЦІ 4 і містить першу чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в гени 0054/0055 або в ген Ш14, переважно з заміною щонайменше 2095 даного гена. У переважного ОЕМ за винаходом делеція становить щонайменше 2095 послідовності гена 0/4, більш переважно щонайменше 3095, щонайменше 4095, щонайменше 5095, щонайменше 60956, щонайменше 7095, щонайменше принаймні 80905, щонайменше 9095 і аж до 10095. У кращому прикладі ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 500 п.н. з послідовності гена ШІ 4, більш переважно щонайменше 600, 700, 800, 900, 1000 або більше.
Ген ШІ 23 зазвичай складається з 1077 пар основ генома ОЕМ. Звертаючись до штаму СС, ген ШІ 23 відповідає нт. 77997-79073 в геномі. Передбачається, що фахівці в цій галузі зможуть легко встановити точне місце розташування гена 123 у будь-якого штаму ОЕМ, використовуючи інформацію, що міститься в цій заявці і загальні знання, або ж шляхом поєднання послідовностей. В одному конкретному втіленні винахід стосується такого вірусу качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени 054, Ш5Б5 ії 023. Більш переважно винахід стосується такого вірусу ОЕМ, який має неактивні гени 054, 55 і ШІ 23 і містить першу чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в гени 54/55 або в ген ШІ 23, переважно з заміною щонайменше 2095 даного гена. У переважного ОЕМ за винаходом делеція становить щонайменше 2095 послідовності гена ШІ 23, більш переважно щонайменше 3095, щонайменше 60 4095, щонайменше 5095, щонайменше 60956, щонайменше 7095, щонайменше, принаймні 80905,
щонайменше 9095 і аж до 10095. У кращому прикладі ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 500 п.н. з послідовності гена ШІ 23, більш переважно щонайменше 600, 700, 800, 900, 1000 або більше. В одному конкретному втіленні ОЕМ за винаходом має делецію, що охоплює щонайменше нт. 200-900 з послідовності гена ШІ 23, більш переважно щонайменше нт. 100-1000, ще більш переважно щонайменше нт. 80-1000. В одному конкретному прикладі ОЕМ за винаходом має делецію від нт. 51 до нт. 1027 (тобто близько 9095) з послідовності гена ЦІ 23.
Ген 057 зазвичай складається з 1116 пар основ генома ОЕМ. Звертаючись до штаму С5С, ген 057 відповідає нт. 145769-146884 в геномі. Передбачається, що фахівці в цій галузі зможуть легко встановити точне місце розташування гена 057 у будь-якого штаму ОЕМ, використовуючи інформацію, що міститься в цій заявці і загальні знання, або ж шляхом поєднання послідовностей. В одному конкретному втіленні винахід стосується такого вірусу качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени О54, О55 і 057. Більш переважно винахід стосується такого вірусу ОЕМ, який має неактивні гени 054, 055 ії 057 і містить першу чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в гени И054/)55 або в ген 57, переважно з заміною щонайменше 2095 даного гена. У переважного ОЕМ за винаходом делеція становить щонайменше 2095 послідовності гена 057, більш переважно щонайменше 3095, щонайменше 4095, щонайменше 5095, щонайменше 60956, щонайменше 7095, щонайменше принаймні 80905, щонайменше 9095 і аж до 10095. У кращому прикладі ОЕМ за винаходом має делецію щонайменше 500 п.н. з послідовності гена 057, більш переважно щонайменше 600, 700, 800, 900, 1000 або більше.
Винахід також стосується такого вірусу ОЕМ, який містить першу чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в гени 54/55, і другу чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в міжгенну ділянку, розташовану між генами ШІ 27 ії ШІ 26, переважно з заміною щонайменше 2095 даного гена. Винахід також стосується такого вірусу ОЕМ, який містить неактивні гени 054 і О55 і при цьому містить чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в міжгенну ділянку, розташовану між генами ШІ 27 і Ш0/ 26. Звертаючись до штаму С5С, міжгенна ділянка, розташована між ЦІ 27 і 0126, відповідає нт. 72195-72646 в геномі. Клонування може проводитися в будь-якому положенні в межах цього району, більш переважно між нт.72300-72500, більш переважно між нт. 72350-72450. В одному конкретному втіленні клонування проводиться між нт. 72431-72432.
Зо Винахід також стосується такого вірусу ОЕМ, який містить неактивний ген ЦІ 4 і при цьому містить чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в міжгенну ділянку, розташовану між генами 57 ї 058 або між генами Ші 45 і ЦІ 46 або між генами ШІ 50 і ШІ 51. Звертаючись до штаму СС, міжгенна ділянка, розташована між 145 і ЦО 46, відповідає нт. 25132-25352 в геномі.
Клонування може проводитися в будь-якому положенні в межах цього району, більш переважно між нт. 25200-25300. В одному конкретному втіленні клонування проводиться між нт. 25275- 25276. Звертаючись до штаму СЗС, міжгенна ділянка, розташована між ШІ 50 і ЦІ 51, відповідає нт. 15914-16063 в геномі. Клонування може проводитися в будь-якому положенні в межах цього району, більш переважно між нт. 15970-16010. В одному конкретному втіленні клонування проводиться між нт. 15979-15980.
Конструювання і клонування вірусів може здійснюватися методами, відомими рег 5е в даній області. Клонування генів і конструювання плазмід добре відомо пересічним фахівцям в даній області і може в основному проводитися стандартними методами молекулярної біології (Моїіеєсшціаг Сіопіпуд: А ІГарогаюту Мапиаї. 4 Еайоп, Сода 5рііпд Нагбогі арогаюгу, Соїд 5ргіпа
Нагрог , Мем/ Мого, ОСОБА , 2012). Як правило, рекомбінантні віруси отримують шляхом гомологічної рекомбінації між вірусним геномом і конструкцією (наприклад, гомологічною плазмідою), що містить нуклеїнову кислоту для вставки, фланковану нуклеотидами з сайту вставки для забезпечення рекомбінації. Клонування може здійснюватися з вилученням або без вилучення ендогенних послідовностей. У конкретному втіленні рекомбінантна послідовність клонується з заміною принаймні частини послідовності генома типу щонайменше 50 нуклеотидів або більше. Така делеція підвищує клонуючу здатність вірусу.
Для конструювання послідовність, яка містить цільову ділянку вставки, зазвичай спочатку клонують у відповідний вектор, отримуючи вектор з гомологією. Приклади векторів включають плазміди типу РВК322, рВК325, рВК327, рВЕ328, рОсС18, рОсС19, рОсС7, рОсС8 або рисо; такі фаги, як фаг лямбда і фаг М13; або косміди типу рРНС79. Послідовність цільової ділянки вбудовують у вектор стандартними методами клонування. Переважно послідовність цільової ділянки, що використовується, має достатню довжину з тим, щоб забезпечити подальшу гомологічну рекомбінацію іп мімо з вірусним геномом СЕМ. Переважно послідовність цільової ділянки, яку клонують, повинна мати довжину щонайменше в 100 нуклеотидів, зазвичай більше 300, як-то від 500 до 2000 нуклеотидів. Потім в цільову ділянку, клоновану в вектор, вставляють бо чужорідну нуклеїнову кислоту (яка зазвичай містить ген і промотор). Вставка переважно проводиться таким чином, щоб на кожній стороні від клонованої вставки залишалася частина послідовності цільової ділянки з довжиною, достатньою для забезпечення гомологічної рекомбінації (наприклад, щонайменше 50 нуклеотидів, переважно щонайменше 100 нуклеотидів). Чужорідна нуклеїнова кислота вводиться в клоновану цільову ділянку класичними методами, як-то за допомогою рестрикційних ферментів та процедури лігування. За необхідності в певний сайт цільової ділянки можна вводити мутації для створення нового сайту розщеплення для рестрикційного ферменту. Для цієї мети можна використовувати стандартні методи мутагенезу, добре відомі фахівцям в даній області, такі, наприклад, як мутагенез іп міго або ПЛР. Потім вектори з гомологією, у яких в цільову ділянку була вставлена чужорідна нуклеїнова кислота, можна вводити в інфіковані СЕМ клітини або клітини, трансфіковані геномом ОЕМ, використовуючи такі відомі методи, як електропорація, фосфат кальцію, метод на основі ліпофектину і т.п. При цьому в даних клітинах при рекомбінації між вірусом і вектором виникають рекомбінантні віруси. Отримані рекомбінантні віруси можна піддати відбору за генотипом або за фенотипом за допомогою відомих методів, наприклад, за допомогою гіоридизації, секвенування, ПЛР або функціонального аналізу для виявлення будь-яких продуктів, що кодуються чужорідної нуклеїнової кислотою, як описано в прикладах. Обраний рекомбінантний вірус можна культивувати в великому обсязі в клітинній культурі, після чого можна виділити рекомбінантні віруси.
Чужорідний ген
РЕМ за винаходом може містити будь-яку чужорідну нуклеїнову кислоту, переважно будь- який чужорідний ген. Чужорідний ген може кодувати будь-який продукт, який представляє інтерес, як-то РНК або біологічно активні і/або імуногенні (наприклад, антигенні) білки, поліпептиди або пептиди. У кращому втіленні чужорідний ген кодує антиген, ще більш переважно пептид або поліпептид, який походить з антигену патогенного організму, здатного викликати інфекції у тварин, особливо птахів. Приклади патогенів, що викликають інфекції у птахів, включають віруси, бактерії, грибки, найпростіші і т.д. Імуногенний (полі) пептид переважно може (походити з) поверхневого білка, білка, що секретується або структурного білка даного патогена або їх фрагментів. Поліпептид може походити з будь-якого джерела, наприклад, вірусного, прокаріотичного, еукаріотичного або синтетичного.
Зо У кращому втіленні чужорідний ген кодує антигенний пептид збудника хвороби птахів.
Конкретні приклади збудників хвороб включають, без обмеження, вірус пташиного грипу, пташиний параміксовірус типу 1, який також називають вірусом хвороби Мем/сазЦе (МОМ), пташиний метапневмовірус, вірус хвороби Марека, вірус хвороби Ситброго, який також називають вірусом інфекційного бурситу (ІВОМ), вірус інфекційного ларинготрахеїту (І-ТМ), вірус інфекційного бронхіту (ІВМ), Езспегіспіа соїї, Заітопеїйа 5р., РавівигеМПйа тийосіда, КіетегейПа апаїйрезійег, Огіййтобрасієгішт пПіпоїгаспєаіє, Мусоріазєта даїЇїзеріїсит, Мусоріаєта 5упоміає, різні мікоплазми, що інфікують птахів, або кокцидії.
Переважно чужорідний ген кодує антиген, обраний з Е-білка МОМ, білка НМ МОМ, білка МР2
ІВОМ, білка 98 І-ТУ, білка 40К Мусоріахта даїїзеріїсит або поверхневого білка гемаглютиніну (НА) вірусу пташиного грипу або їх імуногенних фрагментів. У контексті винаходу термін "фрагмент" білка переважно означає фрагмент, що містить щонайменше 5 послідовних амінокислотних залишків даного білка, ще більш переважно від 5 до 100. В кращому втіленні такий фрагмент містить щонайменше один епітоп і/або є імуногенним іп мімо, тобто може викликати вироблення антитіл, що зв'язують повнорозмірний білок.
Конкретні приклади імуногенних пептидів включають, наприклад, пептид, що містить амінокислотні залишки 1-453 з МР2, 1-469 з 98 або 1-540 з Е-білка.
Переважні віруси ОЕМ
Переважні ОЕМ за винаходом містять делецію цілих генів 054 і 055.
Певні ОЕМ за винаходом містять делецію безперервної області, що включає щонайменше 5095 послідовності нуклеотидів гена 054, всю міжгенну ділянку 054-055 і щонайменше 5095 послідовності нуклеотидів гена 055.
Інші кращі ОЕМ за винаходом містять делецію безперервної області, що включає всю послідовність нуклеотидів гена 054, всю міжгенну ділянку 054-055 і всю послідовність нуклеотидів гена 055.
У бажаних ОЕМ за винаходом чужорідна нуклеїнова кислота кодує пташиний антиген, більш переважно УР2, НМ або Р-білок або його імуногенний фрагмент.
Інші кращі ОЕМ за винаходом містять неактивні гени 054 і 055 і щонайменше ще одну делецію, обрану з: - делеції щонайменше нт. 100-1000 з послідовності гена 057, 60 - делеції щонайменше нт. 1000-1200 з послідовності гена ЦІ 4 і/або
- делеції щонайменше нт. 100-1000 з послідовності гена ЦІ 23.
Інші кращі СЕМ за винаходом містять неактивні гени 054 і 055 і щонайменше одну чужорідну нуклеїнову кислоту, клоновану в окрему ділянку, переважно обрану з гена ЦІ 4, гена
ЦІ 44, міжгенної ділянки ШІ.27-01 26, гена ЦІ 23, міжгенної ділянки ОІ45-ЦІ 46, міжгенної ділянки
ШІ 50-ЦІ 51, гена 057, міжгенної ділянки 57-58 або гена 0510.
Нуклеїнові кислоти
Винахід також стосується молекул нуклеїнової кислоти, що містить геном ОЕМ з неактивними генами 054 і 055. Така нуклеїнова кислота може бути одноланцюговою або дволанцюговою, ДНК або РНК. У кращому втіленні нуклеїнова кислота представлена молекулою ДНК, яка містить геном ОЕМ, як визначено вище.
Нуклеїнова кислота може перебувати у вільному вигляді або у векторі типу плазміди, ВАС і т.п. Нуклеїнова кислота може бути виділеною або міститься в клітинах господаря.
Клітинні культури
Рекомбінантні віруси цього винаходу можна розмножувати в будь-яких культурах компетентних клітин. Після досягнення необхідного зростання вірусів клітини можна відокремити від лунок за допомогою скребка або трипсину, а інфіковані клітини виділити з супернатанта центрифугуванням.
Приклади компетентних клітин включають СЕР, яйця з ембріонами, ниркові клітини курей і т.п. Клітини або віруси можна культивувати в культуральному середовищі типу середовища
МЕМ Ігля, середовища І еїром/й»-І-15/МсеСоу 5А (суміш 1:1) за температури близько 37" протягом 3-6 днів. Інфіковані клітини зазвичай суспендують в культуральному середовищі, що містить 1095 диметилсульфоксиду (ОМ50О), і зберігають в замороженому вигляді в рідкому азоті.
Композиції та вакцини
Винахід також стосується композицій типу вакцин, що містять один або кілька ОЕМ за винаходом.
Композиції та вакцини винаходу можуть містити ОЕМ в фармацевтично або ветеринарно прийнятному носії або наповнювачі. Крім того, композиції та вакцини також можуть містити відповідний ад'ювант.
Композиції та вакцини відповідно до даного винаходу можуть містити відповідний розчинник, такий, наприклад, як водний буфер або фосфатний буфер. Переважно композиції і вакцини також містять добавки, як-то стабілізуючі речовини, консерванти, барвники, поверхнево-активні речовини та ін.
Наприклад, композиції або вакцини винаходу можуть бути складені з однією або декількома додатковими добавками для підтримки |ізотонічності, фізіологічного рН і стабільності, наприклад, з таким буфером, як фізіологічний сольовий розчин (0,8595), фізрозчин з фосфатним буфером (РВ5) цитратний буфер, трис(гідроксиметиламінометан) (ТКІ5), фізрозчин з трис- буфером і т.п., або з антибіотиком, наприклад, неоміцином або стрептоміцином і т.п.).
В одному конкретному втіленні композиція даного винаходу містить консервант.
В іншому конкретному втіленні композиція даного винаходу містить солюбілізуючий засіб.
В іншому конкретному втіленні композиція даного винаходу містить ад'ювант. Ад'юванти можуть бути отримані з цілого ряду джерел, включаючи різні білки і пептиди, що походять з тварин (наприклад, гормони, цитокіни, костимулюючі фактори), і нові нуклеїнові кислоти, що походять з вірусів і інших джерел (наприклад, двохланцюгової РНК, Сро) і т.п., які самі по собі або в комбінації достатні для посилення імунної відповіді.
Композиції винаходу можуть бути рідкими (розчини, суспензії, емульсії) або твердими (порошки, гелі, пасти, олії) і можуть бути складені для будь-якого способу введення. Переважно вони складаються для ін'єкцій типу ін'єкцій іп омо або ж, наприклад, для внутрішньовенного, підшкірного, внутрішньом'язового, внутрішньоглазного, внутрішньоочного, внутрішньошкірного іМабо внутрішньочеревного введення. З іншого боку, вони можуть бути складені для перорального, очного (наприклад, за допомогою очних крапель), інтраназального або окуло- назального введення, наприклад, за допомогою аерозолю або спрею.
Кожна доза вакцини може містити відповідну дозу, достатню для вироблення захисного імунітету у даного виду птахів. Оптимізація таких доз добре відома в даній області. Кількість антигену на 1 дозу може бути встановлено відомими методами з використанням реакцій антиген/антитіло, наприклад, методом ЕГІЗА.
Вакцини винаходу можна вводити у вигляді одноразових або багаторазових доз, в залежності від методики вакцинації.
В одному конкретному втіленні винахід стосується вакцин, що містять вірус, нуклеїнових кислот або клітини, як визначено вище, і відповідний ексципієнт або ад'ювант. бо В іншому конкретному втіленні винахід стосується вакцин, що містять рідкі композиції вірусу,
нуклеїнової кислоти або клітин, як визначено вище, і відповідний ексципієнт або ад'ювант.
Цей винахід також стосується застосування вірусів, композицій, вакцин, нуклеїнової кислоти або клітин, як описано вище, для імунізації птахів типу домашніх птахів, і способу імунізації птахів шляхом введення імунологічно ефективної кількості вірусу, композиції, вакцини, нуклеїнової кислоти або клітин, як описано вище.
Наступним предметом винаходу є композиції, ОЕМ, нуклеїнові кислоти або клітини господаря, як визначено вище, для застосування для вакцинації або імунізації птахів, особливо домашніх птахів, більш переважно курей, більш переважно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше) або іп омо.
Наступним предметом винаходу є композиції, вакцини, ОЕМ, нуклеїнові кислоти або клітини господаря, як визначено вище, для застосування для вироблення захисного імунітету у птахів, особливо домашніх птахів, більш переважно курей, більш переважно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше) або іп омо.
Винахід також стосується способу вакцинації тварин, особливо свійських птахів, більш переважно курей, більш переважно молодих птахів (на 3-й день після вилуплення або раніше або іп омо), що включає введення даним тваринам композиції вакцини, ОЕМ, нуклеїнової кислоти або клітин господаря, як визначено вище.
Кращим предметом винаходу є спосіб вакцинації домашніх птахів, який включає введення композиції, вакцини, ОЕМ, нуклеїнової кислоти або клітин господаря, як визначено вище, іп омо.
Іншим переважним предметом винаходу є спосіб вакцинації домашніх птахів, що включає введення композиції, вакцини, ОЕМ, нуклеїнової кислоти або клітин господаря, як визначено вище, в 1-й день або на 2-й день після вилуплення.
У наступному аспекті винаходу передбачений спосіб вироблення імуногенної або захисної відповіді у тварин проти одного або декількох пташиних патогенів, що включає введення даним тваринам, особливо домашнім птахам, більш переважно курям, більш переважно молодим птахам (на 3-й день після вилуплення або раніше) або іп омо композиції, вакцини, ОЕМ, нуклеїнової кислоти або клітин господаря, як визначено вище.
Як зазначено в експериментальному розділі, віруси за винаходом особливо вигідні для вакцинації молодих птахів (в 1 день, 2 день або З день після вилуплення) або для вакцинації іп
Зо омо. Так, несподівано винахід показав, що віруси за винаходом безпечні при такому ранньому введенні, тоді як нативний ОЕМ або ЮЕМ дикого типу летальний. Таке раннє введення, в поєднанні з раннім виникненням імунітету, викликаного цими вірусами, особливо вигідно для вироблення раннього захисного імунітету ще до того, як домашня птиця може піддатися значному впливу патогенів.
В цьому відношенні, в більш загальному аспекті винахід також стосується способу вакцинації або імунізації птахів, переважно домашніх птахів, більш переважно курей, який включає введення даним птахам іп омо атенуйованого ОЕМ, що кодує антиген. Винахід також стосується способу експресії чужорідного гена у птахів, переважно домашніх птахів, більш переважно курей, який включає введення даним птахам іп омо атенуйованого ОЕМ, що містить даний чужорідний ген. Винахід також стосується застосування атенуйованого ОЕМ, що містить чужорідний ген, для експресії даного гена у птахів шляхом введення даного ОЕМ іп омо. Винахід також стосується атенуйованих ОЕМ, що кодують антигени, для застосування для індукції імунної відповіді або для вакцинації птахів шляхом введення даного ОЕМ іп омо. ОЕМ переважно містить неактивний ендогенний ген, що робить даний ОЕМ атенуйованим і який добре переноситься при ін'єкції іп омо.
Цей винахід також стосується вакцинаційних наборів для імунізації птахів, які містять ефективну кількість полівалентної вакцини, як описано вище, і засіб для введення даних компонентів даному виду птахів. Наприклад, такий набір містить ін'єкційний пристрій, наповнений вакциною за винаходом, а також інструкції для внутрішньошкірного, підшкірного, внутрішньом'язового введення або введення іп омо. В якості альтернативи набір містить пристрій для розпилення/аерозолю або очних крапель, заповнений вакциною за винаходом, а також інструкції з окуло-назального введення, перорального або мукозального введення.
Інші аспекти і переваги винаходу будуть розкриті в наступному експериментальному розділі, який розкриває заявлений винахід.
ПРИКЛАДИ
Приклад 1. Вірулентність ОЕМ дикого типу у яєць або молодих птахів
Проводили клінічне дослідження для вивчення патогенності або вірулентності ОЕМ у курчат при введенні за різними часовими схемами. Зокрема, проводили введення іп омо (за З дні до вилуплення), в день 1 після вилуплення або в день 4 після вилуплення. Використовували ОЕМ бо дикого типу штаму Уапзеп. Доза, що вводиться становила 100 чи 1000 ри на 1 дозу. В якості контролю вводили розчин РВ5. Патогенність визначали шляхом вимірювання смертності кожен день після вилуплення.
Результати представлені в наступній таблиці.
Смерт-
Група | Вакцина Доза спосіб | день! | п ність сім) со от|ог (оз оч ов ов ог|оеіеовг То 1 | РВ5 | - |іпомоЇ З |17Ї0|0 0|0|010|01010 2 | 12 2 | ОЕМ | т100 |іпомо| З |16Ї3|219|1/171-/-1-1/-1 - | оо
З | ОЕМ |т1000 | іпомо| З |17/|5|219|1/-1-1-1-1/-1 - | 00 4 | ОЕМ |т1000|Ї пк | 1 |(17Г0|0 0|0/|01/6|4|21|1 1 | 82
І 5 | ОЕМ |т000| пк | 4 |17Їо0|о0|0|0|0/0|0|0|0|/о0| о (1) Вік у днях при інокуляції (2) Кількість загиблих птахів у віці від 9 до 19 днів
Наведені вище результати показують, що введення МЕМ дикого типу в день 4 після вилуплення безпечне при 10095 виживання (див. Групу 5). На відміну від цього, після введення
РЕМ іп омо 10095 птахів загинули в віці до 4 днів, тоді як введення РВЗ іп омо було безпечним.
Ці результати показують, що, хоча ОЕМ дикого типу може підходити для введення дорослим тваринам, але несподівано він виявився летальним для молодих тварин (3-й день або менше після вилуплення) або при введенні іп омо.
Приклад 2. Вірулентність ОЕМ з неактивним геном 54 або 055 2.41. Конструювання ОЕМ, що містять неактивний ген 054 або ген 055
Прагнучи зменшити вірулентність для курячих ембріонів, конструювали ОЕМ з неактивним 054 або 055.
Конструювання касети гр5іІ пео-О5Неаг2
Конструювали фрагмент ДНК в 2,8 т.н. з касети гр5І пео-Ю5Кеа2 за допомогою реакцій ПЛР.
Якщо коротко, проводили три реакції ПЛР. Першу реакцію ПЛР проводили за допомогою пари праймерів ЗЕО ІЮ МО: 1 (5-СсСсСОСстаатТаАтТаАта,аСсацпАТСаТттатАТ-3) і ЗЕО ІЮ МО: 2 (5- сСсАТОСТаИСТаСастСАпААСААСТОСТСА-3) з матрицею з синтезованого фрагмента гро пео (5ЕО ІЮ МО: 3). Другу реакцію ПЛР проводили за допомогою пари праймерів 5ЕО ІЮ
МО: 4 (5-АСЯАДСсТтоттотадаСаСАасСАССАТассос-3) і 5ЕО ІЮ МО: 5 (5-ТсОсСОАаааАаас
САТССТТАДОадастатТААТ-3) з матричною плазмідою рі типу вектора для ссавців, що експресує (Рготеда, кат. Ме Е1721). Третю реакцію ПЛР проводили за допомогою пари праймерів 5ЕО ІЮ МО: 6 (Б-ТАСАаСТоТтТААдапАтТас!сстосСтТоСОаАСцА-3) і 5ЕО І МО: 7 (5- ,САСТаАААААДААТастТТТАТТТИатТОаАААТ-3) з матричною плазмідою рікЕ52-О5Неаг2
Зо (Сіопіесі, кат. Мо 632420). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів
ПЛР з першої і другої реакції ПЛР як матрицю і 5ЕО ІО МО: 1 ії БЕО ІЮО МО: 5 в якості праймерів.
Цей продукт ПЛР змішували з продуктом ПЛР з третьої реакції і використовували для останньої реакції ПЛР з парою праймерів ЗЕО ІЮ МО: 1 ії 5ЕО ІЮ МО: 7, отримуючи касету гр5іпео- реВедг.
Конструювання касети зі вставкою
Конструювали фрагмент ДНК з касети гр5іІ пео-О5Кеа2 з додаванням гомологічних 5'- і 3'- кінців області 054 або 055 ОЕМ послідовностей (по 50 пар основ) на обидва кінці за допомогою реакцій ПЛР. Реакції ПЛР проводили, використовуючи касету гр5Ї пео-О5Кеа2 як матрицю.
Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІЮ МО: 8 (5'АТайСААСААТаАТАОаСТОа теаататтаатттта,асаадсасатттА,аасасстаатаАтаАтааСОа(соа-3) і 5ЕО ІЮО МО: 9 (5-ТТАААСТААТасААаСасСса тТтавААТТТСААХатоттааСасССАААСАТтСИ,аСАсСТААААдДАА
ТаСтТТТА-3) для ОЕМ з онеактивним 54 і ЗЕБЕО ОО МО: 10 (5-АТаТАТАСАСа
АСатТтТАСОЯСатсАТИаТОСО!тТАа,аССа,стТаАТТТТАТТТАСТАТОСССТОСТОАТаА тТасСОаоаа-3) і
ЗЕБЕО І МО: 11 (5-ТСАТАССАТАСААДАпасАТАаИТАСАаСССАС АпИатТТААААДАСАААСАдДА
ССАСТОаААААдДААТасттТтТА-3) для ОЕМ з неактивним 55. Отримані ПЛР-фрагменти (касети
О5А-трзі пео-О5Кеа2 і О55-гроі пео-О5Кеаг) піддавали електрофорезу і очищали.
Конструювання рекомбінантного ОЕМ, що несе ген гр5І пео-О5Неаг
Конструювання рекомбінантного ОЕМ, що несе ген гр5і пеоб5Кед2 в районі 054 або 055, проводили шляхом гомологічної рекомбінації в несучому геном ОЕМ штамі Б. сої, трансфікованому 0,5 мкг О54-трзі пеорзВеа2 або 055-гроЇ пеор5Кеаг. Трансфекцію проводили методом електропорації за допомогою Сепе Риїзег Хсеї! (Віо-Кай І арогайфогіе5) при 1,75 кВ, 25 мкФ і 200 Ом. Після трансфекції Е. соїї висівали на чашки з агаром І ига-Вегіапі (І В) і інкубували протягом ночі при 30"С. Клони БЕ. соїї, які несуть відповідну вставку, що містить ген гр5і пео-
реікеді2 в районі 054 або 055, ідентифікували методом ПЛР за допомогою пари праймерів, яка ампліфікує ділянку між геном гро5і пео-О5Кеа2 і районом сайту вставки в геномі ОЕМ (стик 1).
Використовували праймери ЗЕО ІЮО МО: 12 (5-ААСТатТАТАААТТАСАСААатАаТастАТаса-з» і
ЗЕО ІЮ МО: 13 (5-ТСАСААПААСТСИТСААСААОас-3) для ОЕМ з неактивним 054 і 5ЕО ІЮ
МО: 13 ї ЗЕО ІЮ МО: 14 (9-Я4ТТТАТАТТІАСасСацсААТаттаАс-3 для ОЕМ з неактивним 55. З клонів Е. соїї, що несуть відповідні вставки, виділяли ДНК ОЕМ і трансфікували в клітини СЕБЕ за допомогою Мисіеотесіог І (опа, ВазеіІ, Швейцарія). Трансфіковані клітини вносили в середовище І еібомії»"5 І -15 (І їе Тесппоїодієз Согр., кат. Мо 41300-39) із середовищем МеСоу 5
БА (Ге ТесппоїЇодіє5з Согр., кат. Мо 21500-061) (1:1) ї 495 телячої сироватки (середовище І М (5), висівали в 96-ямкові планшети для тканинних культур, а потім інкубували при 37"С в 4-595 СО» протягом 5-7 днів, поки не проявлявся цитопатичний ефект (СРЕ) ОЕМ. Після цього виділяли рЕМ5, що несуть ген гро пео-О5Кейд2 в районі 54 або 055 (ОЕМ/О54/гріі пео-ЮО5Кед2 або
РЕМ/О55/грзі пео-О5Неаг).
Перевірка структури генома
Структуру генома у рекомбінантного ЮЕМ/ЛІЗА/грзі пео-О5Кей2 або ОЕМ/О55/гр5і пео- рзКед2 перевіряли за допомогою трьох реакцій ПЛР, які ампліфікують стикувальні ділянки (стик 1, стик 2 і стик 3) на кожному кінці вставленого гена. Пари праймерів, що використовувалися в реакціях ПЛР для стику 1, описані вище. У реакціях ПЛР з ОЕМ/О54/грзі пео-О5Неадг2 використовували пари праймерів 5ЕБО ОО МО: 6 і 5БО ІЮ МО: 15 (5-
САТТТТААСССОТТТААаИтСААСАТТОСОС-3) для стику 2 і 5ЕО ІЮ МО: 12 і ЗЕО ІЮО МО: 15 для стику 3. У реакціях ПЛР з ОЕМ/О55/гріІ пео-О5Кеа2 використовували пари праймерів ЗЕО ІЮ
МО: 6 і БЕО ІЮ МО: 16 (3-АСТаАаАТаТТапАССАТАССАТСАААТОСТИ-3) для стику 2 і БЕО ІЮ
МО: 14 ії 5ЕО ІО МО : 16 для стику 3. Спостерігалися очікувані розміри продуктів ПЛР, що підтверджують, що ОЕМ/О54/гтрзіпео-О5Кеа?2 ії ОЕМ/55/гтріІі пео-Ю5Кед2 мають очікувані структури генома. 2.2. Експресія чужорідного гена рекомбінантними ОЕМ з неактивним геном 54 або 055
Експресію білка О5Кеа2 у ОЕМ/О5З4/рзіпео-О5Кей2 або ОЕМ/ЗБ5/гтрзі пео-О5Недг2 перевіряли по флуоресценції О5Кеа2. Збудження флуоресценції О5Кед2 проводили на клітинах
СЕР, інфікованих ЮЕМ/О54/трзі пео-Ю5Кеа2 або ОЕМ/О55/гроіІ пео-О5Кеа2. Якщо коротко,
Зо клітини СЕБЕ в б-лунковому планшеті інфікували за допомогою ОЕМ/ОБ4/р5і пео-ЮО5Невдг,
РЕМ/О55/грзЇ пео-Ю5Кейд2 або вихідного штаму ОЕМ при множинності зараження приблизно 0,01. Через З дні після інокуляції клітини збуджували при 563 нм і спостерігали червону флуоресценцію в бляшках рекомбінантних ОЕМ/О5А4/гтроі пео-О5Кей2 або ЮЕМ/О55/грзі пео- рехкед2, що підтверджує дійсність експресії білка рекомбінантними СЕМ. 2.3. Життєздатність і стабільність рекомбінантних ОЕМ з неактивним геном 054 або 055
РЕМ/О54/гтрзЇ пео-О5Кед2 або ОЕМ/О5З5/грзі пео-О5Кед2 пасеровали в клітинах СЕЕ по 15 разів і перевіряли стабільність вбудованого гена гр5і пео-О5Кеа2. Пересівання проводили через кожні 3-4 дні. Після кожних 5 пасажів бляшки ОЕМ/О54/гтрзЇ пео-О5Кеа?2 або ОЕМ/ОЗ5/грзІі пео- рзКед2 перевіряли на червону флуоресценцію під флуоресцентним мікроскопом і перевіряли структуру їх генома методом ПЛР, ампліфікуючи стикувальні ділянки (стик 1, стик 2 і стик З) за допомогою праймерів, наведених в прикладі 2. У всіх досліджуваних вірусів спостерігалася червона флуоресценція і очікувані розміри продуктів ПЛР, підтверджуючи, що ген грзіпео-
О5Кед2 зберігався у ОЕМ/О54/грзіпео-О5Кеа?2 ії ОЕМ/О55/грзі пео-О5Кед2 протягом щонайменше 15 пасажів. 2.4. Вірулентність ОЕМ з неактивним геном 054 або 055 при введенні іп омо
Інокулювали ОЕМ/ОЗ4/грзі пео-ЮО5Кей2 або ОЕМ/ЛОЗ5/грзі пео-О5Нед2 18-денним ембріонам курчат 5РЕ для дослідження їх патогенності або вірулентності для курячих ембріонів. В курячі ембріони вводили іп мо приблизно 1000 р в 0,1 мл ОЕМ/54/гтрзі пео-О5Вевд2,
РЕМ/О55/грзі пео-О5Кед2, вихідного ОЕМ або 0,1 мл РВЗ через голку 20 розміру в 1,5 дюйма.
Курчат спостерігали щодня на наявність пов'язаних з ОЕМ клінічних ознак типу депресії і смерті протягом 11 днів. Результати представлені в наступній таблиці. вилуп.| ро |0р11|0р2/|031| 04 05 | 506 | ність (95)
РАЗ 77777 / 122| 2 | 0 10101012 0|о0 1 5 щ 78
ОЕМ/ОБА/рзіпео-ОзВеа2 |22| 5 | з | 11 6|51|21|-| - | оо
ОЕМ/О5Б/рзіпео-ОзВеа2 |22| 2 | 6 | 06 4|4|- | - | оо
ОЕМ 77777777 7 122| 0 | 611 81|4|21|0| 01 56 (1) Кількість загиблих птахів у віці від Є до 11 днів
Всі курчата, інокульовані іп омо ОЕМ з неактивним 054 або Ш55, померли через 4 дні після вилуплення, тоді як померли 9595 курчат, інокульованих вихідним ОЕМ. Ці результати показують, що ОЕМ з неактивним 054 або 55 як і раніше володіє патогенністю і вірулентністю для курячих ембріонів при введенні іп омо.
Приклад 3. Конструювання ОЕМ, що містять неактивні гени 054 і 055
Для отримання ОЕМ з неактивними 054 і 055 спочатку конструювали вектор з гомологією, який потім використовували для отримання вірусу шляхом гомологічної рекомбінації в Е. соїї.
Плазмідні конструкції і маніпуляції з ДНК в основному проводилися у відповідності зі стандартними методами молекулярної біології (Моїесшіаг Сіопіпд: А Габрогагу Мапиаї. 4
Едіоп, Соїа 5рііпд Нагбог І абогаїогу, Соїд 5ргіпд Нагбог, Мем Моїк, ОА, 2012).
Клонували фрагмент ДНК в 1,1 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени О5З ії 056, за допомогою реакцій ПЛР з додаванням сайту розпізнавання 51 у місці вставки. Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР. Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІЮ МО: 17 (5-ЯСасАТасСтТАаСтТаАТСТААСТТТАС-3) і 5БЕО ІЮ
МО: 18 (5-240ТаССААТААДаИаСсСТОаАСОсссСААТАТОТ-3), ЗЕБЕО ОО МО: 19 (5-
ТСАддсснанйдассАС САИСТАСАСАдСИ-3) і ЗЕО ІО МО: 20 (5- асСаААТТССАТТААТТСТОССОААСтТИ,ИТтТО-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і 5ЕО ІЮ МО: 17 ії 5ЕО ІЮО МО: 20 в якості праймерів. Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор РОС18 (СепВапК Асс. 109136) після розщеплення ЕсоК! і 5рпІ, отримуючи риС18-КАРЕМАС-
О5АИББаве!-5й, який містить частину області 053 ії 056 з генома ОЕМ. Потім, використовуючи плазміду рРОС18-КАРЕМАС-ОБ4И55ає!І-5ЯІ, конструювали вектор з гомологією, що містить промотор і ген МР2 ІВОМ зі стандартного провокуючого штаму (МР2-5Т7С). Спочатку розщіпляли рОоС18-КАРЕМАС-ОБ4И55аєІ!-5ИІ за допомогою 51 і дефосфорилювали рекомбінантною лужною фосфатазою 5181 з Зпеулапеїїа 5р. (РАР) (Рипакозпі, Ме ОЕ110). Потім отримували промотор р-актину (Вас) курки (ЗЕБЕО ІЮ МО: 21) ії гени МР2-5ТС шляхом розщеплення раб/46расуР2-5ТО Ж 11 (05 Раї. Мо. 6,764,684) за допомогою ВОоїІ. Нарешті, цю касету з промотором Вас і МР2-5ТС вставляли в розщеплену 5ІИїЇ рОС18-КАРЕМАС-О54И55ае!1-5ГЇ, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-О54055де!І-ВасуРа2в5іс (Фіг. 2). Цю плазміду - рОС18-КАРЕМАС-
Зо О55Б5авєІ-Васурагзвіс використовували для конструювання ОЕМЛІЗ4И5З5аеі!/Васура2з5іс (фіг. 2).
Конструювання ОБМЛОЗ4ОЗ5ае!/Васмур2
Конструювання ОЕМ, що несе ген ВасМмР2 в області 054-055, проводили шляхом гомологічної рекомбінації в несучому геном ОЕМ штамі Е. соїї, трансфікованому 0,5 мкг рОС18-
КАРЕМАС-О54055ае!І-ВасмРа2з5іс. Умови трансфекції були описані в прикладі 2. Клони Е. сої, які несуть відповідну вставку, що містить ген ВасУурР2, ідентифікували методом ПЛР за допомогою пари праймерів, ампліфікуючих ділянку між геном ВасмРа і районом сайту вставки в геномі ОЕМ (стик 1, фіг. 2). Використовували праймери ЗЕО ІО МО: 22 (5- аТоСАСТАТаССАТИаАСАТАССИТОИ-3) і ЗЕО ІЮ МО: 23 (-(ЯАаСААСттсаАасСтТаАТОС-3. З клонів Е. сої, які несуть відповідну вставку, виділяли ДНК ОЕМ і трансфікували в клітини СЕР.
Трансфіковані клітини інкубували до тих пір, поки не проявлявся цитопатичний ефект (СРЕ)
ОЕМ. При цьому отримували ОЕМ/О54055ае!/ВасмРа з нокаутом генів 054 і ЮО55, який містить ген Васмгр2.
Перевірка структури генома
Структуру генома ОЕМ/І54И55аеі/ВасМмР2 перевіряли за допомогою З реакцій ПЛР, які ампліфікують стикувальні ділянки (стик 1, стик 2 і стик З; Фіг. 2) на кожному кінці вставленого гена. Пари праймерів, які використовувалися в реакціях ПЛР для стику 1, описані вище. У реакціях ПЛР для стику 2 використовували пару праймерів 5ЕБО ІО МО: 24 (5- аоСАс,асААТССАсСацпАААААСсАС-3 і ЗЕО ІЮО МО: 12. Для стику З використовували ЗЕО ІЮ
МО: 22 і БЕО ІЮО МО: 12. Спостерігалися очікувані розміри продуктів ПЛР, які підтверджують, що рЕМЛИ54О55де/ВасуРа має очікувану структуру геному.
Приклад 4. Експресія гена МР2 за допомогою ОЕМ/ОЗ4О55аєе!/ВасуР2
Експресію білка МР2 рекомбінантним ОЕМ/О54О55ае!/ВасуР2 перевіряли методом чорних бляшок. Якщо коротко, інфіковані ОЕМ/О5455де!/ВасмР2 клітини СЕРЕ фіксували сумішшю метанол: ацетон (1:2) і інкубували з моноклональним антитілом Кб63 проти МР2 ІВОМ (АТС Мо
НВ-9490). Потім інкубували з біотинільованим антитілом проти ДС миші (Месіог І арогайогіев, кат. Мо ВА-9200), а потім з набором МЕСТАЗТАЇІМ АВС-АР (Месіог І абогаїогіе5, кат. Мо АК-5000), і фарбували бляшки, які експресують білок УР2, додаванням розчину МВТ/ВСІР (РКосне Арріїєй зЗсіепсе, кат. Мо 1681451). Як видно з Фіг. 3, в інфікованих ОЕМ/О54О55ае|!/Васмра2 клітинах спостерігалася експресія білка МР2. 60 Приклад 5. Введення ОЕМ/О54О55ае1/ВасмР2 іп омо
Інокулювали ОЕМ/І5455ає|/ВасуРа2 18-денним ембріонам курчат 5РРЕ. Всі групи ембріонів вакцинували іп омо приблизно по 1000 ріи в 0,1 мл рекомбінантного ПОЕМ/ОЗ4О55аде!/ВасмР2, вихідного ОЕМ або 0,1 мл РВЗ через голки 20 калібру в 1,5 дюйма. Курчат спостерігали щодня на наявність пов'язаних з ОЕМ клінічних ознак типу депресії і смерті протягом 35 днів. Через 5 тижнів після вилуплення курчат перевіряли на надбавку у вазі, розтинали і обстежували на наявність макроскопічних пошкоджень. Результати представлені в наступній таблиці.
Не Смерт- | Птахи з | Серед- нмкин піни рот ог б се оо ої МС дете тра
Рв5 и 62 о ж о1010 ее ого о7о00 жо іи588 зоввосувасург 7 1010000 1101 | 0 ме | о яв
ОЕМ (71 7 140161 -1-1-1-| - | 000; - | - (1) Кількість загиблих птахів у віці від З до 8 днів (2) Кількість загиблих птахів у віці від 12 до 35 днів
Смертність у птахів, інокульованих ОЕМ/О54О55ае!/ВасуР2 з нокаутом обох генів 054 і 55, склала 11,895, тоді як смертність при вихідному ОЕМ склала 10095, що свідчить про те, що вірулентність і патогенність ОЕМ істотно знижувалася при інактивації (наприклад, делеції) обох генів 054 їі 055. Крім того, середня вага тіла у тих птахів, що вижили, інокульованих рРЕМ/Л54О55ає!/ВасМмР2, був порівнянний з вагою при РВ5. Ці результати свідчать про ефективність ОЕМ за винаходом для вакцинації іп омо.
Приклад 6. Конструювання ОЕМ/Соаб5МР2, що містять неактивні гени 054 і 0055
В цьому розділі конструювали ОЕМ з делецією обох генів 054 і 055, які містять ген МР2, керований центральною частиною промотора Вас (промотор Соаб5; 5ЕБО ІЮ МО: 25). Для конструювання цих ОЕМ спочатку конструювали вектори з гомологією, які потім використовували для отримання вірусів шляхом гомологічної рекомбінації в Е. соїї.
Конструювання рОС18-КАРЕМАС-О54И055аеї
Клонували фрагмент ДНК в 1,1 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени О5З ії 056, за допомогою реакцій ПЛР (Фіг. 4). Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР. Використовували наступні пари праймерів: зЕО ІЮО МО: 17 і
ЗБО І МО: 26 (5-20СТттататласСстааттаАСОассСААТАТО-3), ЗЕБО І МОЇ 27 (5-
САТАТТаССаТСААССАССТАСАСАДОС-3) і БО ІЮ МО: 20 (5-дсСпААТТССАТТААТТСТО
ССОААСТатТтТа-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з
З0 двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і 5ЕО ІО МО: 17 ї БЕО ІЮ МО: 20 в якості праймерів.
Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор рОС18 після розщеплення ЕсоКіІ і 5рП|, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-О54И55аеї (Фіг. 4).
Конструювання ОЕМ/О54О55аеї
Конструювання рекомбінантного ЮЕМ/О54И55де! з делецією обох генів Ш54 і И55, проводили шляхом гомологічної рекомбінації в несучих геном ОЕМ клітинах БЕ. сої, трансфікованих 0,5 мкг рОС18-КАРЕМАС-О54055деіІ, Клони Е. соїї, які несуть відповідну делецію (ОНТОВ/0ЕМ/І54И55аеї), ідентифікували методом ПЛР за допомогою пари праймерів, які ампліфікують ділянку між Ш5З ії 056 (стик 1, Фіг. 4). Використовували праймери 5ЕО ІЮ МО: 221 5БО ІО МО: 20. З клонів Е. соїї виділяли ДНК ОЕМ і трансфікували в клітини СЕК, отримуючи
РЕМ/О54О55авеІ.
Конструювання рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 23деІ-СоабУ Р2
Клонували фрагмент ДНК в 1,0 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени ШІ 24 ї 122, за допомогою реакцій ПЛР з додаванням сайту розпізнавання 51 в місці вставки (Фіг. 5). Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР.
Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІО МО: 28 (5- вСаСАТаССААТТаТСТААТТССАС-3) і 5ЕО МО: 29 (Е-СССпСаССААТААСасССАСАСПСААдДАА сСсаса-3), 5ЕО І МО: зо (ї5-статаасСсттАТТ,ааСсСасаАтТСтТааААС-3) і 5ЕО ІО МО: 31 (5-аспААТТСАТатТастТАСасСсССАС-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і 5ЕО ІО МО: 28 і 5ЕО ІЮ МО: 31 в якості праймерів. Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор рИиС18 після розщеплення
ЕсокіІ і 5рпї, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 23ае!1-51. Потім, використовуючи плазміду РОС18-
КАРЕМАС-ЦШІ 23авє!І-51І, конструювали вектор з гомологією, що містить промотор і МР2-516.
Спочатку розщіплювали рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 23авє!-е1їіЇ за допомогою ЗІ і дефосфорилювали за допомогою РАР. Промотор Соаб5 отримували з плазміди рОІСОА (05 Раї. Мо. 6,866,852) шляхом розщеплення Ваїї! ї Храї і лігували з фрагментом ХраїІ!-ЕсокКіІ (6,3 т.н.) і фрагментом
ЕсоВІ-Вай (0,1 тн) з р45/46бБбасмР2-5ТС Ж 11 (05 Раї Мо. 6764684), отримуючи ріб/46СОАБМУР2-БТС Ж 11. Потім з р45/46СОА5МР2-5ТС й 11 вирізали касету з промотором
Соаб5 і МР2-5ТС шляхом розщеплення Ва і лігували з розщепленою 51ї руС18-КАРЕМАС-
ПІ 23ае!І-5ІЇ, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 23деІ-Соаб5МР2. Цю плазміду використовували для конструювання ОЕМ/О540О55аейШІ 23/Соаб УР.
Конструювання рОоС18-КАРЕМАС-ШІ 26-Соаб у Р2
Клонували фрагмент ДНК в 1,0 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени ШІ 26 ї ШІ 27, за допомогою реакцій ПЛР з додаванням сайту розпізнавання 51! в місці вставки (Фіг. б). Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР.
Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІО МО: 32 (5- с,естопАСАСТоССАсСасатаААдас-3) і БЕО ІЮ МО: 33 (5-ССЧСОаССААТААааССААСААТасСА ттОавасо-3), 5ЕО ІЮ МО: 34 (5-ТсЯаСсСсттТАТТВвСССасССаИатАТОаААТТасас-3) і 5ЕО ІЮ МО: 35 (5-2СХ2сПАаСТоСтТасСсААССАСАСЦАССОС-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і 5ЕО ІЮ МО: 32 і 5БЕО ІЮО МО: 35 в якості праймерів. Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор рРОС18 після розщеплення заї ії Засі, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ШІ 26-51І. Потім, використовуючи плазміду РОС18-КАРЕМАС-ЦІ 26-51її, конструювали вектор з гомологією, який містить промотор і ген МР2 ІВОМ зі стандартного провокуючого штаму. Спочатку розщіплювали руС18-КАРЕМАС-
ОЇ 26-51ї за допомогою 51 і дефосфорилювали за допомогою РАР. Потім з РОС18-КАРЕМАС-
ПІ 23аві-Соаб5МР2 вирізали касету з промотором Соа5 і МР2-5ТСО шляхом розщеплення 9ІЇ і лігували з розщепленою 50 рОС18-КАРЕМАС-ШІ 26-51, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 26-
Соаб5МР2. Цю плазміду використовували для конструювання ПОЕМ/ОЗ4О55аеймйиїі 26/СоабзмР2.
Конструювання рОоС18-КАРЕМАС-ШІ 45-СоабУ Р2
Клонували фрагмент ДНК в 1,0 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени ЦІ 45 ї ЦІ 46, за допомогою реакцій ПЛР з додаванням сайту розпізнавання 51їЇ в місці вставки (Фіг. 7). Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР.
Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІО МО: 36 (5-
Коо) Сс,естоаАСАТАСААСасСастТСАТСТАА-3) і ЗЕО ІЮ МО: 37 (5- ТаОВССААТААаСОССИтТтТАТТ
СТТТАТТАТ-39), 5ЕО ІЮ МО: 38 (5-ССИасСсСТтТАТТааССААТСТаАтТТСАТСОССАА-3) і БЕО ІЮ МО: за (5-асадастоСасстТААТСАСААТССИатАТТОИ-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і ЗЕО ІЮ МО: 36 ії 5ЕО ІО МО: 39 в якості праймерів. Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор РОС18 після розщеплення заї ії Засі, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ШІ 45-511І. Потім, використовуючи плазміду РОС18-КАРЕМАС-ЦІ 45-51її, конструювали вектор з гомологією, який містить промотор і ген МР2 ІВОМ зі стандартного провокуючого штаму. Спочатку розщіплювали рОС18-КАРЕМАС-
М 45-51 за допомогою 51 і дефосфорилювали за допомогою РАР. Потім з РОС18-КАРЕМАС-
ПІ 23аві-Соаб5МР2 вирізали касету з промотором Соа5 і МР2-5ТС шляхом розщеплення 5ІЇ і лігували з розщепленою 50 рОС18-КАРЕМАС-ШІ 45-51, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ЦІ 45-
Соаб5МР2. Цю плазміду використовували для конструювання ПОЕМ/ОЗ4О55аемйиі 45/Соаб5мР2.
Конструювання рОоС18-КАРЕМАС-ШІ 50-Соаб у Р2
Клонували фрагмент ДНК в 1,0 т.н. з генома ОЕМ, який фланкує гени ШІ 50 і 01 51, за допомогою реакцій ПЛР з додаванням сайту розпізнавання 51 в місці вставки (Фіг. 8). Якщо коротко, використовуючи ДНК, виділену з ОЕМ як матрицю, проводили 2 реакції ПЛР.
Використовували наступні пари праймерів: ЗЕО ІО МО: 40 (5- сСаСАТаСасСААСТАТАТАТИТОССОССТ 0-3) і 5ЕБЕО ІЮ МО: 41 (5-00Б0ССААТААСааССС
ААДАдДСаИТАСАТТТТИат-3), ЗЕО ІЮ МО: 42 (5-СЧКСОаССТТАТТаасСсСсСААТТТАТТТАСТАТТ-3) і БЕО
ІО МО: 43 (5-ЯССПСААТТСТаспйАТАТОАТАТАСССИЯТТО,С-3). Проводили ще одну реакцію ПЛР, використовуючи суміш продуктів ПЛР з двох попередніх реакцій ПЛР як матрицю і 5ЕО ІЮ МО: 40 ії 5ЕО ІЮО МО: 43 в якості праймерів. Отриманий ПЛР-фрагмент клонували в вектор РОС18 після розщеплення ЕсокіІ і ЗрІїЇ, отримуючи руС18-КАРЕМАС-ИЦІ 50-51їІ. Потім, використовуючи плазміду РОС18-КАРЕМАС-ЦІ 50-51їЇ, конструювали вектор з гомологією, який містить промотор і ген МР2 ІВОМ зі стандартного провокуючого штаму. Спочатку розщіплювали рОС18-КАРЕМАС-
МІ 50-51 за допомогою 51 і дефосфорилювали за допомогою РАР. Потім з РОС18-КАРЕМАС-
ПІ 23аві-Соаб5МР2 вирізали касету з промотором Соа5 і МР2-5ТСО шляхом розщеплення 9ІЇ і лігували з розщепленою 501 рОС18-КАРЕМАС-ШІ 50-51ї, отримуючи рОС18-КАРЕМАС-ШІ 50-
СоабБМРа2. Цю плазміду використовували для конструювання ОБМ/О54О55аемиШІ 50/СоабУ РО.
Конструювання ОБМ/І54О55аеі/СоабвМР2іс
Конструювання рекомбінантних ОЕМ з делецією генів 054 і О55 і несучих ген Соаб5МРа2 в районі Ш123, Ц0126/0127, ЦП145/0146 або 1150/0151 проводили шляхом гомологічної рекомбінації в штамі Е. соїї, трансфікованому ЮЕМ/О54И55аеї і 0,5 мкг однією з рисС18-
КАРЕМАС-ЦІ 23авІ-СоабУР2, рОоС18-КАРЕМАС-ЦІ 26-Соаб УР, роС18-КАРЕМАС-ЦІ 45-
Соаб5МР2 або рОоС18-КАРЕМАС-ОІ 50-Соаб5МР2. Умови трансфекції були описані в прикладі 2.
Після трансфекції клони Е. соїї, які несуть відповідні вставки, що містять ген Соаб5МР2 , ідентифікували методом ПЛР за допомогою пари праймерів, які ампліфікують ділянку між геном
СоабмМРа і районом сайту вставки в геномі ОЕМ (стик 1, Фіг. 5-8). Використовували праймери
ЗЕО ІЮО МО: 23 і 5ЕО ІЮ МО: 28 для сайту вставки Ш/ 23, 5ЕО ІЮ МО: 32 для сайту вставки 0126/0127, 5ЕО ІЮО МО: 36 для сайту вставки ШІ 45/01 46 або 5ЕО ІЮ МО: 40 для сайту вставки
ШО 50/01 51. З клонів Е. соїї, які несуть відповідні вставки, виділяли модифіковані ДНК ОЕМ і трансфікували в клітини СЕРЕ за допомогою Мисіеотесіог ІЇ. Трансфіковані клітини вносили в середовище ІМ (5), висівали в 96-ямкові планшети для тканинних культур, а потім інкубували при 37"С в 4-595 СбО»2г протягом 5-7 днів, поки не проявлявся цитопатичний ефект (СРЕ) ОЕМ.
Після цього виділлли ЮОЕМ5 з неактивними генами 054 і 055, які несуть ген Соаб5МР2 (БЕМ/І54И55аеЦІ 23/СоабУ РО, рЕМ/Л5З4ОО55аєйІ 26/СоабУ Р, рЕМЛБ4И55аецй 45/Соаб5УР2 і ВЕМ/О54О55дейиі 50/СоабМУРа).
Перевірка структури генома
Структури геномів у 0ЕМ/Л54И55дейШІ 23/Соаб5МР2, рЕМ/ІВ4И55аейІ 26/СоабУ РО, рЕМЛІБ4И55децйі 45/Соаб5МР2 і СЕМ/ЛОЗ4О55аеиОІ 50/Соа5МР2 перевіряли за допомогою З реакцій ПЛР, які ампліфікують стикувальні ділянки (стик 1, стик 2 і стик З; Фіг. 5-8) на кожному кінці вставлених генів. Пари праймерів, які використовувалися в реакціях ПЛР для стику 1, описані вище. У реакціях ПЛР для стику 2 використовували пари праймерів ЗЕО ІЮО МО: 24 ії
ЗЕО ІЮО МО: 31 (сайт вставки 023), 5ЕО ІЮО МО: 35 (сайт вставки ШІ 26/0127), 5ЕО ІЮО МО: 39 (сайт вставки 0145/0146 ) або 5ЕО ІЮ МО: 43 (сайт вставки ШІ 50/51). Для стику З використовували пари праймерів 5ЕО ІЮ МО: 28/5БО ІО МО: 31 (сайт вставки ПІ 23), 5ЕО І
МО: 32/5БО ІЮО МО: 35 (сайт вставки ШІ 26/01 27), 5ЕО ІЮ МО: 36/56 ІЮО МО: 39 (сайт вставки
ШІ 45/0146) або 5ЕО ІЮО МО: 40/5ЕБО ІЮ МО: 43 (сайт вставки ШІ 50/01 51). Спостерігалися
Зо очікувані розміри продуктів ПЛР, які підтверджують, що ОЕМ/І54О55ае/Ш1 23/СоабМРа, реЕМЛБ4Ив5аециі 26/Соаб5МУРа, рЕМИЗ4И55демйі 45/СоабМР2 і рЕМ/ЛЗ4О55децЦШІ 50/Соаб5УРаІ2 мають очікувані структури генома.
Приклад 7. Експресія гена МР2 за допомогою ОЕМ/Соаб5МУРІ2, що містять неактивні гени 54 і 55
Експресію білка МР2 під дією рЕМ/ИБВ4И55демйі 23/Соаб5МРаг, рЕМЛБВ4О55дей ШІ 26/Соа5МР2, ОЕМ/ЛО5З4И55аеи0145/Соа5МР2 ої 0 бЕМЛЗ4О55аешйиі 50/
Соа5МРІ2 перевіряли методом чорних бляшок і методом вестерн-блот. Метод чорних бляшок був описаний в прикладі 4. Як видно 3 Фіг 9, в клітинах, інфікованих рЕМ/54О55аемцицІ 23/СоабУ РО, рЕМ/ЛЗ4ОО55аєйІ 26/СоабУ Р, рЕМ/5З4ОО55аєйші 45/
Соаб5МР2 або ОЕМ/О54И55дейШІ 50/Соаб5МР2, спостерігалася експресія білка МР2. Вестерн- блот проводили, використовуючи клітини СЕР, інфіковані ОЕМ/І54О55дециШІ 23/Соаб5МР2, рЕМЛІБ4И55аецйі 26/Соа5МР2, ЕМО З4ИО55аецйШІ 45/Соа5МР2 або БЕМ/ИЗ4И55аейиші 50/
Соаб5МР2, і моноклональне антитіло Кб3 проти МР2 ІВОМ. Якщо коротко, СЕЕ в 12-ямкових планшетах інфікували одним з рекомбінантних вірусів або вихідним ОЕМ. Через 4 дні після інокуляції клітини збирали за допомогою трипсину і центрифугували при 913хд протягом 5 хвилин. Осад промивали РВЗ і ресуспендували в 25 мкл РВ5. Після додавання такого ж обсягу буфера для зразка 2х505 (130 мМ трис-СІ (рн 6,8), 695 5ОБ5, 2095 гліцерину, 1095 2- меркаптоетанолу і 0,0195 бромфенолового синього) клітинну суспензію кип'ятили протягом 5 хв.
Зразки поділяли методом 505-РАСЕ в 12,595 поліакриламідному гелі і переносили на РМОБ- мембрану (ІттобБіоп-Р, Мійїроге). Мембрану повністю висушували, а потім інкубували з моноклональним антитілом К63. Після відмивання антитіла К63 додавали біотинільоване антитіло проти ДС миші, а потім за допомогою набору МЕСТАЗТАІЇМ АВС-АР. Білок, який зв'язався з моноклональним антитілом Кб3, візуалізували додаванням розчину МВТ/ВСІР. На всіх доріжках з рекомбінантними клітинами спостерігалися смуги білка в 40 кД, що є очікуваним розміром білка УРА (Фіг. 10), підтверджуючи, що клітини, інфіковані рекомбінантними вірусами, експресують білок МР2.
Приклад 9. Стабільність ОЕМ/Соа5УРа, що містять неактивні гени 054 і 0055 рЕМ/О54И055деи01 23/Соаб5МР2, бЕМ/О540055деиШ1 26/Соаб5МР2, / ВЕМ/О54О55аеййшІ 45/
Соаб5МР2 і ОЕМ/О54ИО5Б5аеицІ 50/Соаб5МР2 пасували в клітинах СЕРЕ по 15 разів і перевіряли бо стабільність вбудованого гена ВасуР2. Пересівання проводили через кожні 3-4 дні. Після кожних 5 пасажів клітини, інфіковані рЕМИВ4О55аеїШІ 23/Соаб5МРа, рЕМЛБ4И55дейі 26/Соа5МР2, ЕМО З4ИО55аецйШІ 45/Соа5МР2 або БЕМ/ИЗ4И55аєиШІ 50/
Соа5МУРа, перевіряли на експресію гена МР2 методом чорних бляшок і перевіряли структуру їх генома методом ПЛР, ампліфікуючи стикувальні ділянки (стик 1, стик 2 і стик З; Фіг. 5-8) за допомогою праймерів, наведених в прикладі 7. При цьому не спостерігалося реверсії генів 054 і 55 і делеції за геном Соаб5МУРа , що свідчить, що ці віруси стабільні в клітинах СЕР.
Приклад 10. Введення іп омо ОЕМ/Соаб5МР, які містять неактивні гени 054 і 055
У цьому дослідженні вивчали безпеку і ефективність захисту іп омо від вірулентного ІВОМ.
Інокулювали рРЕМ/ЛІЗ4И55аеййцІ 23/Соаб5МР2, рРЕМ/ЛІЗ4И55аемйиїІ 26/СоабмМР2, рЕМ/ЛБВ4И55дей ШІ 45/Соа5уР2 або РЕМ/ЛІ5З4И55аемйОІ 50/Соа5МР2 або вихідний ОЕМ 18- денним ембріонам курчат 5РРЕ. Всі групи ембріонів вакцинували іп омо приблизно по 1000 ріи в 0,1 мл рекомбінантних вірусів, вихідного ОЕМ або 0,1 мл РВ5 через голки 20 калібру в 1,5 дюйма. Курчат спостерігали щодня на наявність пов'язаних з ОЕМ клінічних ознак типу депресії і смерті протягом 42 днів. Щотижня у віці від 1 до 5 тижнів у них брали кров і перевіряли вагу для оцінки гуморального імунітету проти ІВОМ і для перевірки вірулентності вірусів. Визначали антитіла проти ІВОМ за допомогою комерційного набору ІВОМ ЕГІЗА КИ (0 5СКЕЕМ ІВО МР;
ІОМеб). Всім курчатам, крім групи 1, вводили перорально 103 середніх інфекційних доз для ембріонів (ЕІЮ5о) стандартного провокуючого штаму (ЗТС) вірулентного вірусу ІВОМ. Курчат спостерігали щодня на наявність пов'язаних з ІВО клінічних ознак типу депресії і смерті. Через 7 днів після зараження курчат розтинали і обстежували на наявність макроскопічних пошкоджень бурси типу набряку, зміни забарвлення, атрофії, крововиливу і жовтих або желатинозних ексудатів. Також під час розтину вимірювали вагу тіла і бурси для розрахунку індексу В/В, тобто співвідношення між вагою бурси і вагою тіла у заражених птахів, поділеного на таке ж співвідношення у птахів, які не піддавалися зараженню.
Результати цього дослідження свідчать про безпеку, стабільність і ефективність експресії іп мімо.
ПЕРЕЛЕК ПОСЛІДОВНОСТЕЙ
«110» СЕВА САНТЕ АНІМАЛЬ «1905 ВІРУС КАЧИНОГО ЕНТЕРИТУ ТА ЙОГО ЗАСТОСУВАННЯ «1305 ва270 «1650» 43 «1705 Патентна версія 3,3 «2105 1 «11» 30 «212» ДНК «213» Штучна «ей» «23» праймер «4005 1 адсстастоаа счасодсово ахсуєтотахт 30 «2105 2 «211» 30 «212: ДНК «213» Штучна «220» «2235 праймер «4005 2 ссатадсяст дсостсадаа даастсоаєса зо «2105 3. «1» 1319 «212» ДНК «2135 Штучна ке» «ві» грі пео «4005 3
Чдасстдотоа гдасдодсодо аїсастостат атттсттоас ассттттсдо сассдссста 60 ааватстссадсо ЕсСстсатате атотаадоас чзЕКЕсаттас отасттасоа аосазаааст 120 аааассадода дстатіїаає досаасадії зассадстод тасодсавзасс асагастсос 180 заазастдсда ааадосаасої дсстдсосто даадсасодсс сосавазасо тодсататот 240 астсакоатає акастассасє ссстаааааа ссовастссо соастосоїаа аотатоассакт 300 дсссоєстоа стазасоосїу сдааотоасті ссстасаєсо асодтоаадоа їсасаасста 360 саадзасаст ссукдатсся дахсссатоос одаїсогоста аадасстссс додіЧЕтсох 420 тассасассо тгасотодіос асттдастос сссуодсоста аадассотаа осадостсуї 480 їссазостату асосодадоасо їсстаацасє Сладоаздасє аассаєдатс даасаачату 540 чдастасасас заціхсстссо ассасстоаао тасзоаваст аєтсаостатє дастадасас 600 засадчасаат садстоастст сатассоссо гаттссддст дссаососац доачсасссудЯ 560 сто ї саацассдас стутссоаота сесестоватоаа астосадцдас садасаайсоає 720 чзастатсата зстдоссасо асаддосаєтс сттосоасаяас сатастсуас пастоссаста 780 задсооадаза одастдастоа статстоддоса азасоссода осаддчатстс стоссатстс 840 ассстасесс єдссуасаза утіаєссаєса єододстдасоає аатосддсЯдо стосатасаає 900 їтдасссодс тасстоассса ттсоассасс ааосоузааса гсосаїтсуад суаосасята 9650 сісодаатада адссосатстє ассдаєсасво атоасстода судавалосає саодчадстсо 1020 сассадссда аскотєсосс апддсссаваод сосоосатосс содасоадсдад датсксотсо 10850 тдасссатад садатодасстос гсоссдаата Ксатостодда ааатодссоє сеттІстодат 1140 тсатсааста гадссочсто дасасодсоч ассастаєтса доадсатадся седастассс 1200 дкдататєттос хаааозвастт досадосоааат саастодсса сЕтсстсоата стттасадта 1260 тїсассасесс содасесасад сосатсасст тстатсасст єсттоасовЯа тІсттістра 1319 «210» 4 -21ї1 30 «2125 ДНК «2132 Штучна «вгйх «га3» праймер «40025 4 асчаастстє седдадсоасад сассаєсдчасс 30 «21025 5 «211: 30 «212» ДНК «213з Штучна «220» «223» праймер «4005 5 їсодадчачу ссаїссстїаа дзастотаахє 30 «-210з: 6 «211» 30 -2122 ДНК «213» Штучна «ай»
«223» праймер «-400» 6 тасадстстє азаодатодсс тсстссоваа 30 «2105 7 «211» 30 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «40025 7 дсадсдазаа ааатосттта сттотадаааї 30 «2105 8 -2115 Д70 «21255 ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4300» 8 атаддсаасаа тадааївоастаЯає датастадеє тттгтоддас асосєттаса пдасстадєда 60 таасчасадва 70 «-2105. 3 «2115 70 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4005 39 їїааастаат одудаасосутт доаасттсаа дЕсттдосас ссааасаїсо дсадтдаааа 60 азатасттта 70 «2105 10 «2115 70 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер -400» 10 акоасатасад асустасдає сасосодуста оссоєдчасстї таттсєастат досстодасда 60 тдаєсвасаад 70
«2115 Д 7/0 «2125 ДНК «213» Штучна «20» «2232 праймер «414005 їсатассава сааадосата доасасадссс асадуїтсааа аасааадава осадідаааа 60 азатоасттта 70 «2105 12 «11» 30 «212з ДНК «213» Штучна «20 «223» праймер «4005 12 аадтдсатаа аєтазаоасава садстатаса 30 -2105. ВЗ «211» 23 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4005 13 їсадзадвас тсотсавода ддс 23 «2105 14 «11» 25 «212з3 ДНК «213» Штучна «20» «223» праймер «00» 14 діссатаєтто асосодзато тдас 25 «2105 15 «2115 29 «212» ДНК «2135 Штучна «220» «223» праймер «й002» 15 саттттаасс от тєаауіса асатсссо9с 23
«21025 16 «211» 27 «2122» ДНК «213» Штучна «20» «223» праймер «400» 16 астдачцатає годассатса аатсста 7 «2105 17 «2115 26 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4005 17 дсодсатаста дстдасстаа стІтас 26 «210» 18 «211» 30 «212» ДНК «2135 Штучна «20» «223» праймер «-4005 18 чоасЧдассваї аавосстдас дасаатаєтох 30 «2105. 19 «211» З «217» ДНК «213» Штучна «20» «223» праймер «1005 19 тсавдасстта гЕдассасса Ядстасасаза 30 «2105 20 «211» 30 «212 ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «00» 20 чдсаааттссда їсааттстсс соаастотта 30
«21025 21 «211» 1505 «212» ДНК «213» Штучна «220» «23» рготогег «300» 21 тасадстсад тасатдсаєд стсаєтуссс аїсостаєсс стдсстстсс гастадсЯасю 60 ссссдададчу їдастїсавоа дадассусад дассасстса чдадосоодао дапддастаса 120 сасусадасс ссусієсссс тссссаасаа адсастутдо ааїсазавад дододадодо 180 ддасодачод дсосуєсаса сссссудсссс асассстсас стсуаоотоа дссссасаєє 240 стоастїсасі сессссаїсі ссессссстс сссассссса аїтітотаїєї гатістатттк 300 тсааттаєтт гогосадсоа тодадосооо додадодо99 дсодсососса досододсоя 360 чосадодсса дочасодадс додасоадос доададотос досдосадсс аассададся 420 дсасастссо дзаадстїссії тстаєдаєча дусодсодаса озсдосадесс татаааавоє 480 дааосасоса осодасдода дісостасас дстдссссо ссссдтоссс састссоєсо 540 ссассвсосЯ ссоасссодєсс содстстдає тдассоасоагє астсссасад дсоадсодас 600 часасадссс тЕсСтсстссо дастосаатт адсоусстсодє їтаакддасою стсоттсстє 660 їхстосоадсе дсоєдаааос стсазаддяс хссодоваао ссстксотос додододаос 720 досссдад99 стосотосої дсатосогос охддудоваосо ссососусад стссосастя 780 сссдосадсеі акозасусто содасосодос дсода99св дтдсостссо садтоотасосє 840 дачадчаасо судссддо99 содтуссссо сдоасосодоа ододастосда одододоОаасава 900 ддстоасасос бодаєогосоа сотаад9999 созосадозча отосодасоас досодісода 960 стЧтаасссс ссесстусаєс сесстссссо ааойхєтусєтда дсасоддсссо асттсадато 1020 садодстссо тасодадсЯає дасоасодоаЯс тсоссососс ддодсододад досоддсадо 1080 тадовасосс ддосадуосо ддассасстс додоссодода чдадсесо999 дадодосасо 1140 дсоддссссса дадсодссадс адстоаєсоаад осусаасоао ссдсзоссає госстсттає 1200 часаатсока соачадудсо сачадастсс стєтаасссса заєстотосо дадссоазає 1260 стаддачоасо ссдссосасс сестстадсо восасоддос даадсодчкос дососсодса 1320 дуаадчазаї дддосддоадад сдсстсато сдісоссоса ссассокссс сткстссатс 13850 тссадсстсо одостдтссо сададудасо дстасстсса одддадоасод досаддвасод 1440 даттсдоаст седосотато ассодсодаод тттататстт сесттсстоа єтсстссоса 1500 чесссс 1506 «2105 22 «211» 24 «212» ДНК «213» Штучна «220х «223» праймер «4005 22 зЕссастата ссатоасата дао 24 «9105 23 «211» 20 «212» ДНК «2135 штучна «220» «23» праймер «4005 23 чвадсаастсс дадстдатсс 20 «2105» 24 -2115 Б24 «2125 ДНК -2135 штучна «220» «223» праймер «4005 24 дссаддазаї ссзоддааза адас 24 «2105 25 «2115 Д 274 «21225 ДНК «213» штучна «220» «223» рготостег «А0О» 25 стаксстотос адсдатоддо зсадодод99 до99да9со9с9 сассадосод досодддасоа4я 60 засдачддас дадосоодос дадусодада дотосоодсад садссаатса дадсодсося 120 стссдавачі тІссттттаї досоадоасод содасодсодас чассстатаа ааадсдазоє 180 зсасоадсодоа саодааісос тосоасоастоє стїсудссссу бассссосіс сассоссуєс 0 240 тсдсассосс сассссодсІ стдастдасс дсох 274
«2105 25 «2115 28 «212» днк «213» Штучна «2205 «223» праймер «400» 26 І чсттосотад стодіїтдасо асаатата 28 «2105 27 «211» 25 «2125 ДНК «213» штучна «220» «223» праймер «3002 27 сахтаєсоассЯ Есаассадся асасаддс 28 «2105 28 «211» 25 «2125 ДНК «2132» Штучна «220» «223» праймер «400» 28 асасатасса аттосстаатї їссад 25 «210» 29 «2115 30 «212» ДНК «2135 Штучна «220» «223» праймер «400» 29 сссдассааїє азодссасадч ааазачсасо зо «2102 30 «211» 29 «2123 ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «40025 30 стдтдосстї аттодссодо асстоддаас 29
«2105 31 «211» 23 «212» ДНК «213» штучна «220» «223» праймер «-4005 31 чзсдааєссає одсастасосс сад 23 «2105 32 «2115 25 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4005 32 садІсдасасє тсссаддоді даавас 25 «2105 33 «211» 30 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «400» 33 сдассаатаа доссаадаає осастсасс 30 «210» 34 -2115. 30 «2125 ДНК 2135 Штучна «220» «2232 праймер «-4005 34 каассттасс доссодссота соааєтосос 30 «23105 35 -2115. Д Ц25 «92122 ДНК «213» Штучна «20» «2232 праймер «4005 35 дсоадстсст дсаассасєва ассас 25
«2105 36 «2115 28 «212» ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «4005 36 счассдасат адзасасост тсатстаа 28 «2105 37 «-2115 30 «212» днк «2135 Штучна «220» «223» праймер «4005 37 тддссаатаа садссоатїтат тотітаттах 30 «2105 38 «2115 30 «212: ДНК «213» Штучна «20» «223» праймер «4005 38 садассттасє дассаатсто астсасссагй 0 «2105 39 «211» 30 «212з ДНК «213» Штучна «220» «223» праймер «400» 39 дсдадстссо сстаатсаса ассоддтатто 30 «2105 40 «2115 27 «2122 ДНК «2135 Штучна «220» «223» праймер «4005 40 ссодсатасос застататат дісчаєс 27
«210» 41 «2115 30 «2125 ДНК -213» Штучна «220» Й квгЗ3» праймер «400» 41 дудссааєза дасссадаац тасастетах зо «210» 42 «211» 30 «212» ДНК «2132 Штучна «220» , «223» праймер «400» 42 чдодссттасі доасссваїії атттастатії 30 «2105 43 «211» 28 «212» ДНК «213» Штучна «гг» «223» праймер «-400з 43 чдсдааттсто датаєдатат ассаттос 28

Claims (26)

ФОРМУЛА ВИНАХОДУ
1. Вірус качиного ентериту (ОЕМ), який містить неактивні гени 054 і 055.
2. ОЕМ за п. 1, в якому гени 054 і 055, незалежно один від одного, піддавалися мутації, делеції або перериванню.
3. ОЕМ за п. 1 або 2, в якому є делеція щонайменше 20 95 кодуючої послідовності Кожного з генів 054 ії Ш55, більш переважно щонайменше 50 95, щонайменше 60 95, щонайменше 70 95, щонайменше принаймні 80 95 або щонайменше 90 965.
4. ОЕМ за будь-яким з пп. 1-3, в якому є делеція міжгенної ділянки між генами Ш54 і О55.
5. ОЕМ за будь-яким з попередніх пунктів, який містить делецію нуклеотидної області, яка включає щонайменше 50 95 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 55 і щонайменше 50 95 гена 055.
6. ОЕМ за будь-яким з попередніх пунктів, який додатково містить неактивний ген ШІ 23, 057 і/або ЦІ 4.
7. ОБМ за п. 6, який містить: (ї) делецію нуклеотидної області, яка включає щонайменше 50 95 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 055 і щонайменше 50 95 гена 055, а також (і) делецію щонайменше 50 95 послідовності гена ЦІ 23.
8. ОЕМ за п. 6, який містить: (ї) делецію нуклеотидної області, яка включає щонайменше 50 95 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 055 і щонайменше 50 95 гена 055, а також (і) делецію щонайменше 50 95 послідовності гена О57.
9. ОЕМ за п. 6, який містить: (ї) делецію нуклеотидної області, яка включає щонайменше 50 95 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 055 і щонайменше 50 95 гена 055, а також (ії) делецію щонайменше 50 95 послідовності гена ЦІ 4.
10. ОЕМ за будь-яким з попередніх пунктів, який додатково містить чужорідну нуклеїнову кислоту.
11. ОЕМ за п. 10, в якому чужорідна нуклеїнова кислота розташовується в неактивному гені 054 або 055.
12. ОЕМ за п. 11, який містить делецію нуклеотидної області, яка включає щонайменше 50 95 гена 054, всю міжгенну ділянку між геном 054 і геном 055 і щонайменше 50 95 гена 055, а чужорідна нуклеїнова кислота розташовується на місці делеції даної області.
13. ОЕМ за п. 10, в якому чужорідна нуклеїнова кислота розташовується в сайті вставки, вибраному з гена ЦІ 4, гена ЦІ 44, міжгенної ділянки ШІ 27-01 26, гена ЦІ 23, міжгенної ділянки ШІ 45-ЦІ 46, міжгенної ділянки ШІ. 50-Ц1І 51, гена 057, міжгенної ділянки 057-058 або гена 0510.
14. ОЕМ за будь-яким з пп. 10-13, в якому чужорідна нуклеїнова кислота кодує антиген або молекулу імуностимулятора, переважно антиген з пташиного патогена.
15. ОЕМ за п. 14, в якому антигеном є антигенний білок або пептид пташиного параміксовірусу типу 1, переважно Е-білок вірусу хвороби Мем/сазЦе (МОМ) або його фрагмент, антигенний пептид вірусу хвороби зитброго, переважно білок УР2 вірусу інфекційного бурситу (ІВОМ) або його фрагмент, антигенний пептид вірусу інфекційного ларинготрахеїту (І-ТМ), переважно білок 98 або його фрагмент, антигенний пептид Мусоріазта даїїзеріїсит, переважно білок 40К або його фрагмент, або антигенний пептид вірусу пташиного грипу, переважно поверхневий білок гемаглютинін (НА) або його фрагмент.
16. ОЕМ за п. 15, в якому антигенним пептидом є білок МР2 ІВОМ або його імуногенний фрагмент або білок гемаглютинін (НА) вірусу грипу або його імуногенний фрагмент.
17. Молекула нуклеїнової кислоти, яка містить геном ОЕМ за будь-яким з попередніх пунктів.
18. Клітина хазяїна, яка містить ОЕМ за будь-яким з пп. 1-16 або молекулу нуклеїнової кислоти зап. 17.
19. Спосіб отримання або реплікації ОЕМ за будь-яким з пп. 1-16, який включає інфікування компетентних клітин молекулою нуклеїнової кислоти за п. 17 або вірусом ОЕМ за п. 1 і витягання рем.
20. ОЕМ за будь-яким з пп. 1-16 або нуклеїнова кислота за п. 17, призначені для вакцинації або імунізації домашніх птахів, переважно курчат.
21. ОЕМ за будь-яким з пп. 1-16 або нуклеїнова кислота за п. 17, призначені для вироблення захисного імунітету у домашніх птахів, переважно у курчат.
22. ОЕМ за п. 20 або 21, який вводиться за допомогою ін'єкції.
23. ОЕМ за будь-яким з пп. 20-22, який вводиться іп омо або в 1-й день, або на 2-й день після Зо вилуплення.
24. Композиція, яка містить ОЕМ за будь-яким з пп. 1-16, нуклеїнову кислоту за п. 17 або клітину- хазяїна за п. 18 і фармацевтично або ветеринарно прийнятний ексципієнт або носій.
25. Композиція за п. 24, яка додатково містить ад'ювант.
26. Вакцинаційний набір для імунізації птахів, який включає наступні компоненти: а) ефективну кількість композиції за п. 24 або 25 і р) засіб для введення композиції птахам. нн птериту: іл. їга ія ТВ ша он ооо ння Мн Штам МБО ПЕК п5е НН те 5? Штам СКК пн ОО НН Штам си нин Штам си це ща ж щя 3Зудя вк Пт Штам КАРЕМАС пн а и а ПН Фіг, 1 Зо
Вірує качиного ентериту пн п їх рон В Як Іо Пі нини син ВОСТВЧКАРЕУАЄ ОВ ХК ВеемРя СУХУ ово пон: НИК ВИЗ е УР Проектор ВАЄ «М, ме ца? ОПО дое ВК п В В С С С кс І ОХ УРо Промотор аю й ння і нн я Стик її о Єлик: Стик Фіг 2 ВЕПЕНИНИ КК о г п Я МЕН КК но: п ОО КЕ КВ МЕТИ по Ж У ОО в еВ
Фіг. З Вірус хачиного ентериту нин пн ке ех їв зв паль ШШЕШШШШТТТТТТ ТТ ТТТТьтуьуьхтхоММИЙ я ПП ТД ння ИСТЕ КАРКАС ен КОТ рення сн ВА сен МВ доню сен ее нн вн нн і звивини чі І стик фіг. 4 їх ЩЕ їх ТНХ їх в ЩІ Вірус вачиного ентериту СТ ТТ МВ Бан) Іе тн хх доза зрза ще
МИ... каже пи АЖ псесрснннн ПИИН в еесетннс и КАреУАЄч ов аю ПОП ОМ ІМ ЖРХ ірнжвклою сот МІХ о ПЕ. М. ДА ПЕУД ВВ СИХ окон й ЗЛИМ, о. св ет В а НН ВО ПИ с на ЗА МЕМ Ка ШБУ УРХ Провина сові Стик сляка уттте яння яти. ст ; г а іх КЕ Вірус хачиного ентериту нн нн І аВлех що ЧК вм са; по ХХХ їх дн дн, вче КАРЕМАЮЬМЯ УР ПОТ КК НХР 0 Прожоторсюве МІЯ Я ШИ СМ Же МК КУА и сов, пон Кан і НА о ся, ен нн С ОХ пос НН с я ПИВ НВ В поки ких ТУЮ ЄтА: 0 Промо сов бутик ї Стик? фТи Стик
Фіг. б : (З Кк» ї5 Та фа лтльно нн нн нн аЖЯТ. 00 Ше 0000 В ВЕНА Мк Зе КАТЕ нях ОО БИ УРИ: Промотор-стюх пежваияни с «аЕ СІ СБ хх НВ тя хе Нео СТ У З ПІІ с пе он ПО О ОО не нн ЗУ УВІ рюрното ОВО діючяжнннхм. Жетеинннннніння блмкї лика «ВЕУ ллилалотототтн ниж їтик З пом Ех, їде зЖ че МкаеКАНЕеАЄЗ ЯВНУ УтІ КОЛІТ ОВ ек я БУ СРХ 0 Промотор СО Он нн З о о НН НН прохамуєа ШО УКХ Промотов СМ і сфтнннню думу Стикоі Стик фену стик а
Фіг. 8 ОКО КВ КОКО ХВО Ва ЗО ово в що п ВИН ВЕД ПЕжАНЕИ Пила панна жУвЕ ЗПлеилаАТУКУ ДИНІ ДлЛленратуви фіг. З І 2 3 й 5 6 59 кДа -- т і кДа Я ПИШИ ПЕ Кх фіг, 10
UAA201900802A 2016-06-29 2017-06-28 Вірус качиного ентериту та його застосування UA123682C2 (uk)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP16176834.6A EP3263129A1 (en) 2016-06-29 2016-06-29 Duck enteritis virus and the uses thereof
PCT/EP2017/065987 WO2018002133A1 (en) 2016-06-29 2017-06-28 Duck enteritis virus and the uses thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
UA123682C2 true UA123682C2 (uk) 2021-05-12

Family

ID=56321768

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
UAA201900802A UA123682C2 (uk) 2016-06-29 2017-06-28 Вірус качиного ентериту та його застосування

Country Status (11)

Country Link
US (1) US10821170B2 (uk)
EP (2) EP3263129A1 (uk)
JP (1) JP6990814B2 (uk)
CN (1) CN109789199B (uk)
BR (1) BR112018077210A8 (uk)
CA (1) CA3029108A1 (uk)
MX (1) MX2018016306A (uk)
PE (1) PE20190397A1 (uk)
RU (1) RU2771165C2 (uk)
UA (1) UA123682C2 (uk)
WO (1) WO2018002133A1 (uk)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PE20180463A1 (es) 2015-06-30 2018-03-06 Ceva Sante Animale Virus de la enteritis del pato y usos del mismo
CN113249340B (zh) * 2020-08-19 2022-07-19 浙江省农业科学院 一株双色荧光蛋白标记鸭瘟病毒及其构建方法和应用
CN112852760A (zh) * 2021-03-04 2021-05-28 温氏食品集团股份有限公司 重组鸭肠炎病毒及其应用
CN114196639B (zh) * 2021-11-18 2023-09-19 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心) 表达3型鸭甲型肝炎病毒p1和3c基因的重组鸭瘟病毒及其构建方法和用途
CN114480301B (zh) * 2022-01-21 2024-04-19 中国农业大学 预防或治疗禽病毒感染症的疫苗

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU623333B2 (en) 1986-01-27 1992-05-14 Syntro Corporation Attenuated herpesviruses, herpesviruses which include foreign dna encoding an amino acid sequence and vaccine containing same
BE1004877A3 (fr) 1991-05-27 1993-02-16 Solvay Virus de l'avipox recombinant, culture de cellules infectees par ce virus et vaccins pour la volaille derives de ce virus.
US5853733A (en) 1993-02-26 1998-12-29 Syntro Corporation Recombinant herpesvirus of turkeys and uses thereof
FR2728795B1 (fr) 1994-12-30 1997-03-21 Rhone Merieux Vaccin vivant recombinant aviaire, utilisant comme vecteur un virus herpes aviaire
FR2757061B1 (fr) 1996-12-16 1999-03-26 Rhone Merieux Vaccin vivant recombinant aviaire, utilisant comme vecteur le virus de la laryngotracheite infectieuse aviaire
AU2002307749A1 (en) 2001-05-09 2002-11-25 M's Science Corporation Composition and method for treating cancer using herpes virus
US6764684B2 (en) 2001-09-28 2004-07-20 Zeon Corporation Avian herpesvirus-based recombinant infectious bursal disease vaccine
US6866852B2 (en) 2002-01-31 2005-03-15 Zeon Corporation Recombinant herpesvirus of turkeys and use thereof
ES2417019T3 (es) * 2003-11-13 2013-08-05 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Procedimiento de caracterización del virus de la enfermedad de la bursitis infecciosa
JP2005287422A (ja) 2004-03-31 2005-10-20 Nippon Zeon Co Ltd 組み換えヘルペスウイルス及び多価ワクチン
CN102657861A (zh) * 2010-08-16 2012-09-12 郑州金森生物科技工程有限公司 单纯疱疹病毒ⅰ型基因重组减毒活疫苗及其制备方法
CN102373180B (zh) * 2011-09-26 2013-06-19 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 表达禽流感病毒血凝素(ha)基因的重组鸭病毒性肠炎病毒疫苗株及其构建方法和应用
CN102732545B (zh) 2012-05-08 2014-09-24 四川农业大学 鸭瘟病毒转移载体pUC-ΔgC-EGFP及gC缺失重组株DPV-ΔgC-EGFP
WO2014036735A1 (zh) 2012-09-10 2014-03-13 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 鸭病毒性肠炎病毒疫苗株作为表达载体在制备预防鸡形目禽类疾病的重组病毒疫苗中的应用
AR097029A1 (es) * 2013-07-26 2016-02-17 Intervet Int Bv Aceleración de la respuesta inmune inducida por virus vectorial en aves, composición, uso, método para la vacunación y método para acelerar la respuesta inmune
CN104312982A (zh) 2014-09-17 2015-01-28 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 表达增强型绿色荧光蛋白基因的鸭瘟病毒重组疫苗株rDEVTK-EGFP及其构建方法和应用
CN104480142A (zh) * 2014-12-16 2015-04-01 青岛蔚蓝生物股份有限公司 一种鸭瘟病毒基因缺失转移载体及其应用
PE20180463A1 (es) 2015-06-30 2018-03-06 Ceva Sante Animale Virus de la enteritis del pato y usos del mismo
CN105385663A (zh) 2015-11-26 2016-03-09 中国兽医药品监察所 鸭肠炎病毒gE、gI双基因缺失病毒株的构建及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN109789199A (zh) 2019-05-21
JP2019524154A (ja) 2019-09-05
RU2019102170A3 (uk) 2020-09-08
US10821170B2 (en) 2020-11-03
WO2018002133A1 (en) 2018-01-04
MX2018016306A (es) 2019-08-29
EP3263129A1 (en) 2018-01-03
EP3478318A1 (en) 2019-05-08
CA3029108A1 (en) 2018-01-04
RU2019102170A (ru) 2020-07-29
CN109789199B (zh) 2022-11-18
US20190151439A1 (en) 2019-05-23
BR112018077210A8 (pt) 2022-05-17
JP6990814B2 (ja) 2022-01-12
RU2771165C2 (ru) 2022-04-27
BR112018077210A2 (pt) 2019-04-09
PE20190397A1 (es) 2019-03-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11730807B2 (en) Multivalent recombinant avian herpes viruses and vaccines for immunizing avian species
UA123682C2 (uk) Вірус качиного ентериту та його застосування
US10711255B2 (en) Duck enteritis virus and the uses thereof
KR20200002834A (ko) 이종 조류 병원체 항원을 암호화하는 재조합 갈리드 헤르페스바이러스 3형 백신
US20230372474A1 (en) Recombinant hvt and uses thereof
RU2714423C2 (ru) Рекомбинантные вирусы mdv1 и их применение