TWI819024B - 結合至ilt4的抗體 - Google Patents

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Abstract

本申請案係關於特異性結合於免疫球蛋白樣轉錄物4 (ILT4)之抗體,其亦稱為LILRB2、LIR2、MIR10及CD85d;以及對應核酸、宿主細胞、組合物及用途。在一些實施例中,該等抗體特異性結合於人類ILT4,但不顯著結合於ILT2、ILT3或ILT5、或LILRA或LILRB家族之其他成員。

Description

結合至ILT4的抗體
本申請案係關於特異性結合於ILT4且抑制ILT4之抗體,以及其在癌症治療中之用途。
ILT4 (免疫球蛋白樣轉錄物4;亦稱為LILRB2、LIR2、MIR10及CD85d)表現於骨髓細胞上,諸如單核球、巨噬細胞及樹突狀細胞。ILT4為結構上相關之受體之家族的一部分,該家族亦包括蛋白LILRA1、LILRA2、LILRA3、LILRA4、LILRA5、LILRA6、ILT2、ILT3、ILT5及LIR8。
此家族中之蛋白質之細胞外域含有若干免疫球蛋白樣重複序列,而其細胞質尾區含有若干基於酪胺酸之抑制基元(ITIM),其補充酪胺酸磷酸酶。
本發明之某些實施例概述於本發明結尾處之申請專利範圍中。舉例而言,本發明包括以下實施例以及在本文之正文之其他部分以及圖式及序列中所描述之其他實施例。
實施例1:一種特異性結合於人類ILT4 (hILT4或ILT4)之經分離抗體,該抗體包含重鏈及輕鏈,且進一步包含以下特徵中之一或多者: - 例如以10-8 M或更低、或10-9 M或更低之KD 特異性結合於hILT4 (例如包含SEQ ID NO:108、109、111、112或119之胺基酸序列); - 不特異性結合於hILT2、hILT3及/或hILT5; - 不特異性結合於LILRA及/或LILRB家族之一或多個成員; - 例如在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中刺激T細胞活化,如藉由增加之T細胞增殖或IFN-γ分泌所量測,例如如實例中所描述之分析中所示; - 刺激單核球分化或活化成巨噬細胞,例如刺激單核球分化成促炎性巨噬細胞,例如如該等實例中所描述之分析所示; - 促進CD83及CD86於人類單核球衍生之未成熟樹突狀細胞(Mo-iDC)上之表現,例如如該等實例中所描述之分析中所示; - 在巨細胞病毒(CMV)溶胞物分析中增強在抗原刺激後之IFN-γ分泌,例如如該等實例中所描述之分析中所示; - 在同種異體混合淋巴細胞反應(MLR)分析中增強在CD3刺激後藉由CD4+及CD8+ T細胞之IFN-γ及TNF-α分泌,例如如該等實例中所描述之分析中所示; - 抑制HLA-A及/或HLA-B與ILT4之結合; - 結合於70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122),如藉由氫氘交換(HDX)所測定,例如如該等實例中所描述之HDX分析中所示; - 與本文所描述之抗體競爭結合於hILT4; - 特異性結合於包含SEQ ID NO:118之食蟹獼猴ILT4,例如如該等實例中所描述之結合分析中所示; - 抑制人類ILT4 (hILT4)與ILT4結合搭配物,諸如MHC I類分子,諸如HLA-A及HLA-B之結合(例如,抑制hILT4與HLA-A及HLA-B兩者之結合); - 具有圖28中所示之HLA-A及HLA-B結合概況; - 促進巨噬細胞朝向M1巨噬細胞之促炎性極化; - 具有如圖27中所示之結合概況; - 不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化; - 結合於hILT4之以下區域:(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),且若結合於(i)或(ii),則視情況不顯著結合於ILT4之細胞外域之其他區域,諸如位於胺基酸I70之N端的區域或殘基,其中hILT4之該胺基酸編號為未成熟hILT4 (亦即包含其天然信號序列之ILT4)之編號。
實施例2:如實施例1之經分離抗體,其包含重鏈及輕鏈,其中該重鏈包含以下抗ILT4抗體之VH CDR1、CDR2及CDR3:9G4 (SEQ ID No:125-127)、9C8 (SEQ ID No:131-133)、2H2 (SEQ ID No:137-139)、2E5 (SEQ ID No:143-145)、24E5 (SEQ ID No:149-151)、21D9 (SEQ ID No:155-157)、21A5 (SEQ ID No:161-163)或10F10 (SEQ ID No:167-169)。
實施例3:如實施例1或2之經分離抗體,其包含重鏈及輕鏈,其中該輕鏈包含以下抗ILT4抗體之VL CDR1、CDR2及CDR3:9G4 (SEQ ID No:128-130)、9C8 (SEQ ID No:134-136)、2H2 (SEQ ID No:140-142)、2E5 (SEQ ID No:146-148)、24E5 (SEQ ID No:152-154)、21D9 (SEQ ID No:158-160)、21A5 (SEQ ID No:164-166)或10F10 (SEQ ID No:170-172)。
實施例4:如實施例2之經分離抗體,其中該重鏈包含以下抗ILT4抗體之VH CDR1、CDR2及CDR3以及VL CDR1、CDR2及CDR3:9G4 (SEQ ID No:143-148)、24E5 (SEQ ID No:149-154)、21D9 (SEQ ID No:155-160)、21A5 (SEQ ID No:161-166)或10F10 (SEQ ID No:167-172)。
實施例5:如實施例1至4中任一項之經分離抗體,其包含: - 包含9G4之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:125-127)的VH,及包含9G4之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:128-130)的VL; - 包含9C8之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:131-133)的VH,及包含9C8之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:134-136)的VL; - 包含2H2之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID NO:137-139)的VH,及包含2H2之VL CDR1、CDR2及CDR3 (SEQ ID NO:140-142)的VL; - 包含2E5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:143-145)的VH,及包含2E5之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:146-148)的VL; - 包含24E5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:149-151)的VH,及包含24E5之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:152-154)的VL; - 包含21D9之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:158-160)的VL; - 包含21D9.b之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.b之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:158-160)的VL; - 包含21D9.c之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.c之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:158-160)的VL; - 包含21D9.d之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.d之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:158-160)的VL; - 包含21D9.e之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.e之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:158-160)的VL; - 包含21A5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:161-163)的VH,及包含21A5之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:164-166)的VL; - 包含21A5.a之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:161-163)的VH,及包含21A5.a之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:164-166)的VL; - 包含10F10之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:170-172)的VL; - 包含10F10.1之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10.1之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:170-172)的VL; - 包含10F10.3之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10.3之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:170-172)的VL;或 - 包含10F10.4之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10.4之VL CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列(SEQ ID No:170-172)的VL。
實施例6:如實施例1至5中任一項之經分離抗體,其中該抗體重鏈包含胺基酸序列與以下各者之VH之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH:9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135)、9C8 (SEQ ID NO:55)、2H2 (SEQ ID NO:58)、2E5 (SEQ ID NO:63)、24E5 (SEQ ID NO:67)、21D9 (SEQ ID NO:71)、21D9.b (SEQ ID NO:74)、21D9.c (SEQ ID NO:75)、21D9.d (SEQ ID NO:78)、21D9.e (SEQ ID NO:80)、21A5 (SEQ ID NO:83)、21A5.a (SEQ ID NO:87)、10F10 (SEQ ID NO:91)、10F10.1 (SEQ ID NO:91)、10F10.3 (SEQ ID NO:91)或10F10.4 (SEQ ID NO:91)。
實施例7:如實施例1至6中任一項之經分離抗體,其中該抗體輕鏈包含胺基酸序列與以下各者之VL之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VL:9G4 (SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)、9C8 (SEQ ID NO:54)、2H2 (SEQ ID NO:59)、2E5 (SEQ ID NO:62)、24E5 (SEQ ID NO:66)、21D9 (SEQ ID NO:70)、21D9.b (SEQ ID NO:70)、21D9.c (SEQ ID NO:70)、21D9.d (SEQ ID NO:70)、21D9.e (SEQ ID NO:70)、21A5 (SEQ ID NO:82)、21A5.a (SEQ ID NO:86)、10F10 (SEQ ID NO:90)、10F10.1 (SEQ ID NO:94)、10F10.3 (SEQ ID NO:96)或10F10.4 (SEQ ID NO:114)。
實施例8:如實施例1至7中任一項之經分離抗體,其中該抗體重鏈包含胺基酸序列與以下之VH之胺基酸序列相比包含1、2、3、4或5個胺基酸取代、保守性取代或回復取代的VH:9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135)、9C8 (SEQ ID NO:55)、2H2 (SEQ ID NO:58)、2E5 (SEQ ID NO:63)、24E5 (SEQ ID NO:67)、21D9 (SEQ ID NO:71)、21D9.b (SEQ ID NO:74)、21D9.c (SEQ ID NO:75)、21D9.d (SEQ ID NO:78)、21D9.e (SEQ ID NO:80)、21A5 (SEQ ID NO:83)、21A5.a (SEQ ID NO:87)、10F10 (SEQ ID NO:91)、10F10.1 (SEQ ID NO:91)、10F10.3 (SEQ ID NO:91)或10F10.4 (SEQ ID NO:91)。
實施例9:如實施例1至8中任一項之經分離抗體,其中該抗體輕鏈包含胺基酸序列與以下之VL之胺基酸序列相比包含1、2、3、4或5個胺基酸取代、保守性取代或回復取代的VL:9G4 (SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)、9C8 (SEQ ID NO:54)、2H2 (SEQ ID NO:59)、2E5 (SEQ ID NO:62)、24E5 (SEQ ID NO:66)、21D9 (SEQ ID NO:70)、21D9.b (SEQ ID NO:70)、21D9.c (SEQ ID NO:70)、21D9.d (SEQ ID NO:70)、21D9.e (SEQ ID NO:70)、21A5 (SEQ ID NO:82)、21A5.a (SEQ ID NO:86)、10F10 (SEQ ID NO:90)、10F10.1 (SEQ ID NO:94)、10F10.3 (SEQ ID NO:96)或10F10.4 (SEQ ID NO:114)。
實施例10:如實施例1至9中任一項之經分離抗體,其中該重鏈包含以下抗ILT4抗體之VH:9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135)、9C8 (SEQ ID NO:55)、2H2 (SEQ ID NO:58)、2E5 (SEQ ID NO:63)、24E5 (SEQ ID NO:67)、21D9 (SEQ ID NO:71)、21D9.b (SEQ ID NO:74)、21D9.c (SEQ ID NO:75)、21D9.d (SEQ ID NO:78)、21D9.e (SEQ ID NO:80)、21A5 (SEQ ID NO:83)、21A5.a (SEQ ID NO:87)、10F10 (SEQ ID NO:91)、10F10.1 (SEQ ID NO:91)、10F10.3 (SEQ ID NO:91)或10F10.4 (SEQ ID NO:91)。
實施例11:如實施例1至10中任一項之經分離抗體,其中該輕鏈包含以下抗ILT4抗體之VL:9G4 (SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)、9C8 (SEQ ID NO:54)、2H2 (SEQ ID NO:59)、2E5 (SEQ ID NO:62)、24E5 (SEQ ID NO:66)、21D9 (SEQ ID NO:70)、21D9.b (SEQ ID NO:70)、21D9.c (SEQ ID NO:70)、21D9.d (SEQ ID NO:70)、21D9.e (SEQ ID NO:70)、21A5 (SEQ ID NO:82)、21A5.a (SEQ ID NO:86)、10F10 (SEQ ID NO:90)、10F10.1 (SEQ ID NO:94)、10F10.3 (SEQ ID NO:96)或10F10.4 (SEQ ID NO:114)。
實施例12:如實施例1至11中任一項之經分離抗體,其包含以下抗ILT4抗體之VH及VL:9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135及SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:54)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:59)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:62)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:66)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:70)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:70)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:70)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:70)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:70)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:82)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:86)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:90)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:94)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:96)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:114)。
實施例13:如實施例1至11中任一例之經分離抗體,其包含:- 包含9G4之VH之VH CDR(SEQ ID NO:125-127)的VH,及包含9G4之VL CDR(SEQ ID NO:128-130)的VL,以及與9G4之VH及VL (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135及SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含9C8之VH之VH CDR (SEQ ID NO:131-133)的VH,及包含9C8之VL CDR (SEQ ID NO:134-136)的VL,以及與9C8之VH及VL (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:54)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含2H2之VH之VH CDR (SEQ ID NO:137-139)的VH,及包含2H2之VL CDR (SEQ ID NO:140-142)的VL,以及與2H2之VH及VL (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:59)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含2E5之VH之VH CDR (SEQ ID NO:143-145)的VH,及包含2E5之VL CDR (SEQ ID NO:146-148)的VL,以及與2E5之VH及VL (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:62)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含24E5之VH之VH CDR (SEQ ID NO:149-151)的VH,及包含24E5之VL CDR (SEQ ID NO:152-154)的VL,以及與24E5之VH及VL (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:66)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21D9之VH之VH CDR (SEQ ID NO:155-157)的VH,及包含21D9之VL CDR (SEQ ID NO:158-160)的VL,以及與21D9之VH及VL (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:70)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21D9.b之VH之VH CDR (SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.b之VL CDR (SEQ ID No:158-160)的VL,以及與21D9.b之VH及VL (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:70)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21D9.c之VH之VH CDR (SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.c之VL CDR (SEQ ID No:158-160)的VL,以及與21D9.c之VH及VL (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:70)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21D9.d之VH之VH CDR (SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.d之VL CDR (SEQ ID No:158-160)的VL,以及與21D9.d之VH及VL (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:70)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21D9.e之VH之VH CDR (SEQ ID No:155-157)的VH,及包含21D9.e之VL CDR (SEQ ID No:158-160)的VL,以及與21D9.e之VH及VL (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:70)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21A5之VH之VH CDR (SEQ ID No:161-163)的VH,及包含21A5之VL CDR (SEQ ID No:164-166)的VL,以及與21A5之VH及VL (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:82)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含21A5.a之VH之VH CDR (SEQ ID No:161-163)的VH,及包含21A5.a之VL CDR (SEQ ID No:164-166)的VL,以及與21A5.a之VH及VL (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:86)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含10F10之VH之VH CDR (SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10之VL CDR (SEQ ID No:170-172)的VL,以及與10F10之VH及VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:90)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含10F10.1之VH之VH CDR (SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10.1之VL CDR (SEQ ID No:170-172)的VL,以及與10F10.1之VH及VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:94)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;- 包含10F10.3之VH之VH CDR (SEQ ID NO:167-169)的VH,及包含10F10.3之VL CDR (SEQ ID NO:170-172)的VL,以及與10F10.3之VH及VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:96)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;或- 包含10F10.4之VH之VH CDR (SEQ ID No:167-169)的VH,及包含10F10.4之VL CDR (SEQ ID No:170-172)的VL,以及與10F10.4之VH及VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:114)至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列。
實施例14:如實施例1至13中任一項之經分離抗體,其包含: - 包含9G4之VH之胺基酸序列(SEQ ID NO:51殘基20-135)的VH及包含9G4之VL之胺基酸序列(SEQ ID NO:50殘基19-125)的VL; - 包含9C8之VH之胺基酸序列的VH及包含9C8之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:54); - 包含2H2之VH之胺基酸序列的VH及包含2H2之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:59); - 包含2E5之VH之胺基酸序列的VH及包含2E5之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:62); - 包含24E5之VH之胺基酸序列的VH及包含24E5之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:66); - 包含21D9之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:70); - 包含21D9.b之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.b之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:70); - 包含21D9.c之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.c之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:70); - 包含21D9.d之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.d之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:70); - 包含21D9.e之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.e之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:70); - 包含21A5之VH之胺基酸序列的VH及包含21A5之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:82); - 包含21A5.a之VH之胺基酸序列的VH及包含21A5.a之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:86); - 包含10F10之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:90); - 包含10F10.1之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.1之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:94); - 包含10F10.3之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.3之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:96);或 - 包含10F10.4之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.4之VL之胺基酸序列的VL (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:114)。
實施例15:如實施例1至14中任一例之經分離抗體,其為IgG抗體。
實施例16:如實施例15之經分離抗體,其為IgG1、IgG2或IgG4抗體,其中該IgG4視情況包含S228P取代(EU編號)。
實施例17:如實施例1至16中任一項之經分離抗體,其中該抗體為無效應子抗體。
實施例18:如實施例17之經分離抗體,其中該重鏈恆定區包含另一野生型人類重鏈恆定區中之1、2、3、4或5個突變,該等突變使該抗體之效應功能與無該1、2、3、4或5個突變但具有相同胺基酸序列之抗體相比有所降低。
實施例19:如實施例1至18中任一項之經分離抗體,其中該抗體之該重鏈恆定區包含IgG1.3重鏈恆定區、IgG1.1重鏈恆定區,或具有P238K (EU編號)取代之IgG1重鏈恆定區,或包含SEQ ID NO:98、100、102、103或104中之任一者之胺基酸序列的IgG1重鏈恆定區。
實施例20:如實施例1至16或19中任一項之經分離抗體,其中該抗體具有效應功能。
實施例21:如實施例20之經分離抗體,其中該抗體為去岩藻糖基化抗體(例如去岩藻糖基化IgG1抗體)。
實施例22:如實施例20或21之經分離抗體,其中該重鏈恆定區包含另一野生型人類重鏈恆定區中之1、2、3、4或5個突變,該等突變使該抗體之該效應功能與無該1、2、3、4或5個突變但有相同胺基酸序列之抗體相比有所增強。
實施例23:如實施例1至22中任一項之經分離抗體,其包含抗ILT4抗體9G4、9C8、2H2、2E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1或10F10.3之HC,其中該HC之該恆定區為IgG1 (例如9G4.IgG1等)、IgG1.3 (例如9G4.IgG1.3等)、IgG1.1f (例如9G4.IgG1.1f等)、IgG4 (例如9G4.IgG4等)或IgG4 S228P (EU編號) (例如9G4.IgG4_S228P)。
實施例24:如實施例23之經分離抗體,其中該抗體包含如下HC胺基酸序列: - IgG1,例如9G4.IgG1,9G4 (SEQ ID NO:2)、9C8 (SEQ ID NO:4)、2H2 (SEQ ID NO:6)、2E5 (SEQ ID NO:8)、24E5 (SEQ ID NO:10)、21D9 (SEQ ID NO:12)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:98)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:98)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:98)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:98)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:98)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:98)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98), - IgG1,例如9G4.IgG1,9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:102)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:102)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:102)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:102)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:102)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:102)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:102)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:102)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:102)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:102)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:102)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:102)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102), - IgG1.3 (例如9G4.IgG1.3等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:100)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:100)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:100)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:100)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:100)、21D9 ((i) SEQ ID NO:113或(ii) SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:100)、21D9.b (SEQ ID NO:36)、21D9.c (SEQ ID NO:38)、21D9.d (SEQ ID NO:40)、21D9.e (SEQ ID NO:13)、21A5 (SEQ ID NO:15)、21A5.a (SEQ ID NO:17)、10F10 (SEQ ID NO:19)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100); - IgG1.1f (例如9G4.IgG1.1f等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:103)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:103)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:103)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:103)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:103)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:103)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:103)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:103)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:103)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:103)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:103)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:103)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103), - IgG1fa.P238K (例如9G4.IgG1fa.P238K等) 9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:104)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:104)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:104)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:104)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:104)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:104)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:104)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:104)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:104)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:104)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:104)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:104)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104),或 - IgG4 S228P (例如9G4.IgG4 S228P等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:179)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:179)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:179)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:179)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:179)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:179)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:179)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:179)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:179)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:179)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:179)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:179)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)。
實施例25:如實施例23之經分離抗體,其中該抗體之該HC無C端離胺酸殘基。
實施例26:如實施例23之經分離抗體,其中該抗體之該HC包含SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之任一者之重鏈恆定區胺基酸序列。
實施例27:如請求項1至26中任一項之經分離抗體,其包含抗ILT4抗體9G4、9C8、2H2、2E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4之LC。
實施例28:如實施例27之經分離抗體,其中該輕鏈恆定區為人類κ輕鏈恆定區。
實施例29:如實施例27之經分離抗體,其中該LC包含以下之序列:9G4 (SEQ ID NO:1)、9C8 (SEQ ID NO:3)、2H2 (SEQ ID NO:5)、2E5 (SEQ ID NO:7)、24E5 (SEQ ID NO:9)、21D9 (SEQ ID NO:11)、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5 (SEQ ID NO:14)、21A5.a (SEQ ID NO:16)、10F10 (SEQ ID NO:18)、10F10.1 (SEQ ID NO:20)、10F10.3 (SEQ ID NO:21)或10F10.4 (SEQ ID NO:116)。
實施例30:如實施例1至29中任一項之經分離抗體,其包含抗ILT4抗體9G4、9C8、2H2、2E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4之HC及LC,其中該HC之該恆定區為IgG1 (例如9G4.IgG1等)、IgG1.3 (例如9G4.IgG1.3等)、IgG1.1f (例如9G4.IgG1.1f等)、IgG4 (例如9G4.IgG4等)或IgG4 S228P (EU編號) (例如9G4.IgG4_S228P)。
實施例31:如實施例30之經分離抗體,其包含: - 包含9G4之重鏈之胺基酸序列((i)SEQ ID NO:2,或(ii)SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈(HC),及包含9G4之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:1)的輕鏈(LC); - 包含9C8之重鏈之胺基酸序列((i)SEQ ID NO:4或(ii)SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含9C8之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:3)的輕鏈; - 包含2H2之該重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:6或(ii) SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含2H2之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:5)的輕鏈; - 包含2E5之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:8或(ii) SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含2E5之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:7)的輕鏈; - 包含24E5之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:10或(ii) SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含24E5之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:9)的輕鏈; - 包含21D9之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:12或113,或(ii)SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21D9之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:11)的輕鏈; - 包含21D9.b之重鏈之胺基酸序列(SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21D9.b之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:11)的輕鏈; - 包含21D9.c之重鏈之胺基酸序列(SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21D9.c之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:11)的輕鏈; - 包含21D9.d之重鏈之胺基酸序列(SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21D9.d之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:11)的輕鏈; - 包含21D9.e之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:13、176、177或178;或(ii) SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21D9.e之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:11)的輕鏈; - 包含21A5之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:15或(ii) SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21A5之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:14)的輕鏈; - 包含21A5.a之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:17或(ii) SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含21A5.a之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:16)的輕鏈; - 包含10F10之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:19或(ii) SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含10F10之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:18)的輕鏈; - 包含10F10.1之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:19或(ii) SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含10F10.1之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:20)的輕鏈; - 包含10F10.3之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:19或(ii) SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含10F10.3之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:21)的輕鏈;或 - 包含10F10.4之重鏈之胺基酸序列((i) SEQ ID NO:19或(ii) SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中之一者)的重鏈,及包含10F10.4之輕鏈胺基酸序列(SEQ ID NO:116)的輕鏈。
實施例32:一種特異性結合於人類ILT4之經分離抗體,其包含有包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列的重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈胺基酸序列的輕鏈。
實施例33:一種特異性結合於人類ILT4之經分離抗體,其包含有包含SEQ ID NO:176之胺基酸序列的重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈胺基酸序列的輕鏈。
實施例34:一種特異性結合於人類ILT4之經分離抗體,其包含有包含SEQ ID NO:177之胺基酸序列的重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈胺基酸序列的輕鏈。
實施例35:一種特異性結合於人類ILT4之經分離抗體,其包含有包含SEQ ID NO:178之胺基酸序列的重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈胺基酸序列的輕鏈。
實施例36:如實施例32至35中任一項之經分離抗體,其中該抗體具有如實施例1之抗體之一或多種特性。
實施例37:如實施例1至36中任一項之經分離抗體,其為全長抗體。
實施例38:如實施例1至14中任一項之經分離抗體,其為抗體片段。
實施例39:如實施例1至38中任一項之經分離抗體,其為多聚(例如二聚或三聚)抗體。
實施例40:如實施例1至39中任一項之經分離抗體,其連接(例如共價連接)至另一分子。
實施例41:如實施例40之經分離抗體,其中該另一分子為標記。
實施例42:如實施例40之經分離抗體,其中該另一分子為肽。
實施例43:如請求項40之經分離抗體,其為抗體藥物複合體(ADC)。
實施例44:一種經分離核酸,其編碼如實施例1至43中任一項之抗體。
實施例45:一種經分離核酸,其編碼如實施例1至43中任一項之抗體之重鏈及/或輕鏈。
實施例46:一種至少兩種經分離核酸之集合,其編碼如實施例1至43中任一項之抗體之重鏈及輕鏈。
實施例47:一種組合物,其包含編碼如實施例1至43中任一項之抗體之重鏈的核酸及編碼如實施例1至43中任一項之抗體之輕鏈的核酸。
實施例48:一種細胞,其包含如實施例44至46中任一項之經分離核酸或如實施例47之組合物。
實施例49:一種製備抗體之方法,其包含在表現該抗體之條件下培養如實施例48之細胞。
實施例50:一種組合物,其包含如實施例1至49中任一項之經分離抗體、核酸、組合物或細胞及醫藥學上可接受之載劑。
實施例51:如實施例50之組合物,其包含第二治療劑。
實施例52:如實施例51之組合物,其中該第二治療劑為免疫刺激劑。
實施例53:如實施例52之組合物,其中該免疫刺激劑為免疫抑制分子之拮抗劑,例如PD-1/PD-L1、CTLA-4及LAG-3,或免疫刺激分子之促效劑,例如GITR及OX40。
實施例54:一種治療患有癌症之個體的方法,其包含向該個體投與治療有效量之如實施例50至53中任一項之組合物或如實施例1至43中任一項之經分離抗體,其刺激免疫反應及/或為ILT-4拮抗劑。
實施例55:如實施例54之方法,其中該方法進一步包含投與第二療法。
實施例56:如實施例55之方法,其中該第二療法為放射線療法、手術或投與第二藥劑。
實施例57:如實施例55之方法,其中該第二療法為第二藥劑,且該第二藥劑為免疫刺激劑。
實施例58:如實施例57之方法,其中該免疫刺激劑為免疫抑制分子之拮抗劑,例如PD-1/PD-L1、CTLA-4及LAG-3,或免疫刺激分子之促效劑,例如GITR及OX40。
實施例60:一種治療個體之傳染病(例如病毒性疾病)之方法,其包含向該個體投與治療有效量之如實施例50至53中任一項之組合物或如實施例1至43中任一項之經分離抗體,其刺激免疫反應及/或為ILT4拮抗劑。
實施例61:一種偵測樣本中之ILT4之方法,其包含使該樣本與如實施例1至43中任一項之ILT4抗體接觸。
實施例62:如實施例1至43中任一項之經分離抗體,其具有以下特徵: a. 例如以10-8 M或更低、或10-9 M或更低之KD 特異性結合於hILT4 (例如包含SEQ ID NO:108、109、111、112或119之胺基酸序列); b. 刺激單核球分化或活化成巨噬細胞,例如刺激單核球分化成促炎性巨噬細胞,例如如該等實例中所描述之分析所示; c. 具有如圖27中所示之結合概況;及 d. 結合於hILT4之Ig樣域1、2或1及2,諸如包含hILT4之以下區域:(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),且不顯著結合於ILT4之細胞外域之其他區域,諸如位於胺基酸I70之N端的區域或殘基,其中hILT4之該胺基酸編號為未成熟hILT4 (亦即包含其天然信號序列之ILT4)之編號。
實施例63:如實施例1至43中任一項之經分離抗體,其具有以下特徵: a. 例如以10-8 M或更低、或10-9 M或更低之KD 特異性結合於hILT4 (例如包含SEQ ID NO:108、109、111、112或119之胺基酸序列); b. 不特異性結合於hILT2、hILT3及/或hILT5; c. 不特異性結合於LILRA及/或LILRB家族之一或多個成員; d. 例如在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中刺激T細胞活化,如藉由增加之T細胞增殖或IFN-γ分泌所量測,例如如實例中所描述之分析中所示; e. 刺激單核球分化或活化成巨噬細胞,例如刺激單核球分化成促炎性巨噬細胞,例如如該等實例中所描述之分析所示; f. 抑制hILT4與HLA-A及HLA-B之結合; g. 具有如圖27中所示之結合概況; h. 結合於hILT4之Ig樣域1、2或1及2,諸如包含hILT4之以下區域:(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122),且不顯著結合於ILT4之細胞外域之其他區域,諸如位於胺基酸I70之N端的區域或殘基;其中hILT4之該胺基酸編號為未成熟hILT4 (亦即具有其信號序列之ILT4)之編號; i. 促進巨噬細胞朝向M1巨噬細胞之促炎性極化; j. 不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化;及 k. 在於25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質,及/或在於40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。
實施例64:如實施例1至43中任一項之經分離抗體,其具有以下特徵: a. 促進CD83及CD86於人類單核球衍生之未成熟樹突狀細胞(Mo-iDC)上之表現,例如如該等實例中所描述之分析中所示; b. 在巨細胞病毒(CMV)溶胞物分析中增強在抗原刺激後之IFN-γ分泌,例如如該等實例中所描述之分析中所示; c. 在同種異體混合淋巴細胞反應(MLR)分析中增強在CD3刺激後藉由CD4+及CD8+ T細胞之IFN-γ及TNF-α分泌,例如如該等實例中所描述之分析中所示; d. 抑制HLA-A及/或HLA-B與ILT4之結合; e. 結合於hILT4之Ig樣域1、2或1及2,諸如包含以下之區域:(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),如藉由氫氘交換(HDX)所測定,例如如該等實例中所描述之HDX分析中所示; f. 與本文所描述之抗體競爭結合於hILT4;及 g. 特異性結合於包含SEQ ID NO:118之食蟹獼猴ILT4,例如如該等實例中所描述之結合分析中所示。
定義
除非另有定義,否則結合本發明使用之科學與技術術語將具有一般熟習此項技術者通常理解之含義。此外,除非上下文另有需要,否則單數術語應包括複數且複數術語應包括單數。
在本申請案中,除非另有說明,否則使用「 」意謂「及/或」。在多個附屬項的情形下,「或」之使用僅以替代方式重新提及超過一個前述獨立項或附屬項。術語「包含 」、「包括 」及「具有 」可在本文中互換使用。根據本發明,「經分離 」分子係已自其天然環境移出之分子。因此,術語「經分離」不一定反映分子得以純化之程度。
術語「多肽 」係指胺基酸殘基之聚合物,且不限於最小長度。「蛋白質 」可包含一或多個多肽。此類胺基酸殘基之聚合物可含有天然或非天然胺基酸殘基,且包括(但不限於)胺基酸殘基構成之肽、寡肽、二聚體、三聚體及多聚體。全長蛋白質及其片段皆由該定義涵蓋。該等術語亦包括多肽之表現後修飾,例如糖基化、唾液酸化、乙醯化、磷酸化及其類似修飾。此外,出於本發明之目的,「多肽」或「蛋白質」係指分別包括天然序列之諸如缺失、添加及取代(一般實質上為保守取代)之修飾的多肽或蛋白質,只要該蛋白質維持所要活性即可。此等修飾可為有意的,如經由定點突變誘發,或可為偶然的,諸如經由產生蛋白質之宿主的突變或因PCR擴增所致的錯誤。蛋白質可包含兩個或更多個多肽。蛋白質名稱前方的字母「h」表示本文中之天然人類蛋白質,例如「hILT4」。
除非另有特別指示(例如小鼠ILT4、食蟹獼猴ILT4等),否則術語「ILT4 」、「人類 ILT4 」、「hILT4 」、「免疫球蛋白樣轉錄物 4 」、「Ig 轉錄物 4 」、「白血球免疫球蛋白樣受體 B2 」、「LIR2 」、「LILRB2 」、「MIR10 」及「CD85d 」皆可互換使用且係指天然人類ILT4。該術語包括全長未處理ILT4以及處理細胞所產生之任何形式之ILT4。該術語涵蓋天然存在之人類ILT4之變異體,例如剪接變異體或對偶基因變異體。在一些實施例中,ILT4包含SEQ ID NO:107 (前驅體,具有信號肽)或SEQ ID NO:108 (成熟,無信號肽)之胺基酸序列或由其組成。在一些實施例中,ILT4包含SEQ ID NO:110 (前驅體,具有信號肽)或SEQ ID NO:111 (成熟,無信號肽)之胺基酸序列。
如本文所用,術語「ILT4 片段 」係指具有自全長ILT4之N端及/或C端缺失的一或多個殘基的ILT4。該ILT4片段可包括或可不包括N端信號肽,但保留結合於T細胞之能力。如本文所用,術語「ILT4 變異體 」係指含有天然存在之胺基酸添加、缺失及取代,但保留結合於T細胞之能力的ILT4。
術語「拮抗劑 」係以最廣泛含義使用,且包括任何部分或完全抑制或中和諸如ILT4之多肽之生物活性的分子。例示性拮抗劑分子包括拮抗劑抗體。術語「ILT4 拮抗劑 」係指藉由例如阻斷或抑制ILT4與目標細胞(例如T細胞)及/或目標分子之間的相互作用來抑制或阻斷ILT4之生物活性的分子。例示性ILT4拮抗劑包括阻斷ILT4與目標細胞(例如T細胞)及/或目標分子之結合的抗體。當ILT4拮抗劑在細胞結合分析中將ILT4與目標細胞(例如T細胞)及/或目標分子中之至少一者的可偵測結合量降低至少50%時,認為ILT4拮抗劑「阻斷 ILT4 目標細胞或目標分子之結合 」。在一些實施例中,ILT4拮抗劑將可偵測結合量降低至少60%、至少70%、至少80%或至少90%。在一些此等實施例中,據稱拮抗劑將配位體結合阻斷至少50%、至少60%、至少70%等。ILT4與目標細胞(例如T細胞)之結合阻斷可例如藉由在拮抗劑存在或不存在下經ILT4轉染之細胞(例如ILT4 ECD及跨膜域)或重組ILT4 Fc融合蛋白(例如重組ILT4 ECD Fc融合蛋白)於諸如T細胞之細胞上的結合來展現。
術語「抑制 」係指任何表型特徵減少、降低或停止,或該特徵之發生率、程度或可能性減小、降低或停止。在一些實施例中,「降低」或「抑制」意謂減小20%或更多之能力。在另一實施例中,「降低」或「抑制」意謂減小50%或更多之能力。在又一實施例中,「降低」或「抑制」意謂總體減小75%、85%、90%、95%或更多之能力。
術語「增強 T 細胞 活性 」或「T 細胞 活性之增強 」係指增強或提高個體之T細胞活化、細胞介素分泌(諸如干擾素-γ (IFN-γ)分泌)或T細胞增殖中之至少一者。「增強T細胞活性」可藉由使用作為T細胞活性之促效劑的藥劑及/或作為抑制T細胞活性之機制之拮抗劑(亦即抑制或阻斷)的藥劑來實現。T細胞活性之變化可藉由例如實例中所描述之例如T細胞增殖分析或IFN-γ ELISA來量測。
如本文所用之術語「ILT4 抗體 」或「hILT4 抗體 」或「 ILT4 抗體 」或「 hILT4 抗體 」或「結合 ILT4 之抗體 」係指結合於ILT4且諸如藉由阻斷或抑制ILT4與目標細胞(諸如T細胞)或目標分子之結合來視情況抑制ILT4之生物活性的抗體。在一些實施例中,如例如藉由SPR (Biacore®)或在放射免疫分析(RIA)中所量測,ILT4抗體與不相關非ILT4蛋白質之結合程度小於該抗體與ILT4之結合的10%。在一些實施例中,如例如藉由SPR或在放射免疫分析(RIA)中所量測,ILT4抗體與其他ILT家族蛋白質(諸如LILRA)之結合程度小於該抗體與ILT4之結合的20%、小於其10%、小於其5%。在一些實施例中,ILT4抗體結合ILT4但不結合選自ILT2、ILT3及ILT5之至少一種蛋白質。
術語「前導肽 」或「前導序列 」或「信號肽 」或「信號序列 」係指位於多肽之N端處有助於多肽自哺乳動物細胞之分泌的肽或胺基酸殘基序列。前導序列可在自哺乳動物細胞輸出多肽時裂解形成成熟蛋白。前導序列可為天然或合成的,且其可與其所連接之蛋白質異源或同源。
本文中之術語「抗體 」或「Ab 」係以最廣泛含義使用且涵蓋各種抗體結構,包括(但不限於)單株抗體、多株抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及抗體片段,只要其展現所要抗原結合活性即可。如本文所用,該術語係指包含至少重鏈之互補決定區(CDR) 1、CDR2及CDR3及至少輕鏈之CDR1、CDR2及CDR3的分子,其中該分子能夠結合於抗原。術語抗體亦包括(但不限於)嵌合抗體、人類化抗體、人類抗體及諸如小鼠、食蟹獼猴等各種物種之抗體。術語「抗體片段 」包括(但不限於)能夠結合抗原,諸如Fv、單鏈Fv (scFv)、Fab、Fab'及(Fab')2 之片段。
術語「重鏈 」或「HC 」係指包含至少重鏈可變區、具有或不具有前導序列之多肽。在一些實施例中,重鏈包含重鏈恆定區的至少一部分。術語「全長重鏈 」係指包含重鏈可變區及重鏈恆定區、具有或不具有前導序列及具有或不具有C端離胺酸(K)之多肽。術語「成熟全長重鏈 」係指包含重鏈可變區及重鏈恆定區、具有或不具有前導序列及具有或不具有C端離胺酸(K)之多肽。
術語「重鏈可變區 」或「VH 」係指包含重鏈之重鏈互補決定區(CDR) 1、構架區(FR) 2、CDR2、FR3及CDR3之區域。在一些實施例中,重鏈可變區亦包含FR1的至少一部分及/或FR4的至少一部分。在一些實施例中,重鏈CDR係如本文中,諸如下文序列表中或圖1至圖12中所指定。如本文所用,VH CDR1、CDR2及CDR3為如例如圖1至圖12中所提供之Kabat CDR。
術語「輕鏈 」或「LC 」係指包含至少一個輕鏈可變區、具有或不具有前導序列之多肽。在一些實施例中,輕鏈包含輕鏈恆定區的至少一部分。術語「全長輕鏈 」係指包含輕鏈可變區及輕鏈恆定區、具有或不具有前導序列之多肽。術語「成熟全長輕鏈 」係指包含輕鏈可變區及輕鏈恆定區、具有或不具有前導序列之多肽。
術語「輕鏈可變區 」或「VL 」係指包輕鏈CDR1、FR2、HVR2、FR3及HVR3之區域。在一些實施例中,輕鏈可變區亦包含FR1及/或FR4。在一些實施例中,輕鏈CDR如本文中,諸如下文序列表中或圖1至圖12中所指定。如本文所用,VL CDR1、CDR2及CDR3為如例如圖1至圖12中所提供之Kabat CDR。
嵌合抗體 」係指重鏈及/或輕鏈之一部分來源於特定來源或物種,而重鏈及/或輕鏈之其餘部分來源於不同來源或物種之抗體。在一些實施例中,嵌合抗體係指包含至少一個來自第一物種(諸如小鼠、大鼠、食蟹獼猴等)之可變區及至少一個來自第二物種(諸如人類、食蟹獼猴等)之恆定區的抗體。在一些實施例中,嵌合抗體包含至少一個小鼠可變區及至少一個人類恆定區。在一些實施例中,嵌合抗體包含至少一個食蟹獼猴可變區及至少一個人類恆定區。在一些實施例中,嵌合抗體之所有可變區來自第一物種且嵌合抗體之所有恆定區來自第二物種。
人類化抗體 」係指非人類可變區之構架區中的至少一個胺基酸已由來自人類可變區之對應胺基酸置換的抗體。在一些實施例中,人類化抗體包含至少一個人類恆定區或其片段。在一些實施例中,人類化抗體為Fab、scFv、(Fab')2 等。
如本文所用之「人類抗體 」係指人類中產生的抗體、非人類動物中產生的包含人類免疫球蛋白基因之抗體,諸如XenoMouse®,及使用活體外方法(諸如噬菌體呈現)選擇之抗體,其中抗體庫係基於人類免疫球蛋白序列。
在一些實施例中,與特定指定序列相比,本文中之抗體可含有一或多個「保守性取代 」。本文中之「保守胺基酸取代」係指用具有類似側鏈之一胺基酸殘基取代一胺基酸殘基。具有類似側鏈之胺基酸殘基之家族包括具有鹼性側鏈之胺基酸(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、具有酸性側鏈之胺基酸(例如天冬胺酸、麩胺酸)、具有不帶電極性側鏈之胺基酸(例如甘胺酸、天冬醯胺、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、具有非極性側鏈之胺基酸(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、具有β分支側鏈之胺基酸(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及具有芳族側鏈之胺基酸(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。在某些實施例中,本文中之抗體中的預測非必需胺基酸殘基經來自同一側鏈家族之另一胺基酸殘基(例如鹼性、酸性、β分支鏈、芳族、不帶電極性)置換。鑑別不消除抗原結合之核苷酸及胺基酸保守性取代之方法已描述於例如Brummell等人,Biochem . 32:1180-1187 (1993); Kobayashi等人Protein Eng . 12(10):879-884 (1999);及Burks等人Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:412-417 (1997))中。
在一些實施例中,本文中之抗體可含有一或多個「回復取代 (reversion substitution) 」。實例描繪於本文中之圖13至圖15中。回復取代為返回衍生出抗體重鏈或輕鏈之生殖系胺基酸序列的突變。
抗體與蛋白質(例如ILT4)之結合的「KD 」或「解離常數」為該抗體與該蛋白質(例如ILT4)之親和力或特異性結合的量度。與較高KD 相比,較低KD 指示提高之結合或親和力。KD 由抗體及多肽之「解離速率」或koff 或kd 與「締合速率」或kon 或ka 之間的比率構成。
術語「特異性結合 」或類似術語表示諸如抗體及其多肽目標之兩種多肽結合之KD 小於相同條件下存在之兩種無規多肽之間的情況。換言之,KD 小於系統中由於多肽之非特異性聚集所致之情況。
如本文所用之「腫瘤模型 」係指可以用於研究ILT4抗體之生物活性的活體內臨床前分析,且包括異種移植或天然小鼠腫瘤分析系統。在一些情況下,腫瘤模型可允許追蹤用抗體處理時之腫瘤尺寸或生長,及/或追蹤腫瘤中諸如特定類型之T細胞或NK細胞之免疫細胞之存在,以確定抗體是否觸發或增強免疫反應。
如本文所用之術語「免疫刺激劑 」係指藉由充當免疫刺激分子(包括共刺激分子)之促效劑或充當免疫抑制分子(包括共抑制分子)之拮抗劑來刺激免疫系統的分子。免疫刺激分子或免疫抑制分子可為免疫檢查點調節劑,諸如檢查點抑制劑或檢查點刺激劑。免疫刺激劑可為生物製劑,諸如抗體或抗體片段、其他蛋白質或疫苗,或可為小分子藥物。「免疫刺激分子」包括用以增強、刺激、誘導或以其他方式「開啟」免疫反應之受體或配體。如本文所定義的免疫刺激分子包括共刺激分子。「免疫抑制分子」包括作用為減少、抑制、抑止或以其他方式「關閉」免疫反應的受體或配體。如本文所定義之免疫抑制分子包括共抑制分子。此類免疫刺激及免疫抑制分子可為例如免疫細胞(諸如T細胞)上所發現或涉及先天免疫之細胞(諸如NK細胞)上所發現的受體或配體。
相對於肽、多肽或抗體序列之「胺基酸序列一致性百分比 (%) 」、「一致性 % 」、「胺基酸序列同源性百分比 」及「同源性 % 」意謂在必要時比對序列且引入間隙以達成最大序列一致性百分比且不將任何保守性取代考慮為序列一致性之部分之後,候選序列中之胺基酸殘基與特定肽或多肽序列中之胺基酸殘基一致的百分比。出於測定胺基酸序列一致性百分比之目的的比對可以在此項技術之技能範圍內的各種方式達成,例如使用公開可用之電腦軟體,諸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或MEGALIGNTM (DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可測定用於量測比對之適當參數,包括用於達成所比較序列之全長內之最大比對所需的任何演算法。
如本文所用之「治療 」涵蓋用於疾病之治療劑在人類中的任何投與或施用,且包括抑制疾病之疾病進展或一或多種疾病症狀,減緩疾病或其進展或其症狀中之一或多者,遏制其發展,部分或完全緩解疾病或其症狀中之一或多者,或預防疾病之一或多種症狀復發。
除非另有具體說明,否則術語「個體 」及「患者 」在本文中可互換使用以指代人類。
術語「有效量 」或「治療有效量 」係指對治療個體之疾病或病症有效,以便部分或完全緩解一或多種症狀之藥物的量。在一些實施例中,有效量係指在給藥時有效且持續必要時段以達成所要治療或預防結果的量。
本文所用之術語「癌症 」係指展現異常高水準之增殖及生長的細胞群。癌症可為良性(亦稱為良性腫瘤)、癌前或惡性的。癌細胞可為實體癌細胞或白血病癌細胞。本文所用之術語「腫瘤生長 」係指導致癌症尺寸或程度相應增加的包含癌症之一或多個細胞的增殖或生長。
適用於本文中之治療方法之癌症的實例包括(但不限於)癌瘤、淋巴瘤、母細胞瘤、肉瘤及白血病。此類癌症之更特定非限制性實例包括鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、垂體癌、食道癌、星形細胞瘤、軟組織肉瘤、非小細胞肺癌(包括鱗狀細胞非小細胞肺癌)、肺腺癌、肺部鱗狀癌瘤、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌、胰臟癌、神經膠母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝腫瘤、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜或子宮癌、唾液腺癌瘤、腎癌、腎細胞癌瘤、肝癌、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝臟癌瘤、腦癌、子宮內膜癌、睪丸癌、膽管癌、膽囊癌瘤、胃癌、黑素瘤及各種類型之頭頸癌(包括頭頸部鱗狀細胞癌)。
與一或多種其他治療劑「組合 」投與包括同時(並行)及以任何次序連續(依序)投與。
醫藥學上可接受之載劑 」係指此項技術中習知的無毒固體、半固體或液體填補劑、稀釋劑、囊封材料、調配助劑或載劑,其與治療劑一起使用,一起構成「醫藥組合物」以供投與個體。醫藥學上可接受之載劑在所用劑量及濃度下對接受者無毒且與調配物之其他成分相容。醫藥學上可接受之載劑適於所用調配物。舉例而言,若治療劑打算經口投與,則載劑可為凝膠膠囊。若治療劑打算皮下投與,則載劑理想地對於皮膚不具刺激性且不引起注射部位反應。
化學治療劑 」為適用於治療癌症之化合物。可以本文中之方法投與待化學治療劑之實例包括(但不限於):烷基化劑,諸如噻替派(thiotepa)及Cytoxan® 環磷醯胺;磺酸烷基酯,諸如硫酸布他卡因(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan);氮丙啶,諸如苯唑多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米特多巴(meturedopa)及尤利多巴(uredopa);伸乙亞胺及甲基三聚氰胺,包括六甲蜜胺(altretamine)、三伸乙基蜜胺(triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺(trietylenephosphoramide)、三伸乙基硫代磷醯胺(triethiylenethiophosphoramide)及三羥甲基三聚氰胺(trimethylolomelamine);多聚乙醯(尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone));喜樹鹼(camptothecin)(包括合成類似物拓朴替康(topotecan));苔蘚抑素(bryostatin);海洋抑素(callystatin);CC-1065 (包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物);念珠藻素(cryptophycin)(尤其念珠藻素1及念珠藻素8);海兔毒素(dolastatin);倍癌黴素(duocarmycin)(包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1);艾榴素(eleutherobin);水鬼蕉鹼(pancratistatin);沙考地汀(sarcodictyin);海綿抑素(spongistatin);氮芥(nitrogen mustard),諸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺、雌氮芥(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、甲氮芥(mechlorethamine)、氧化甲氮芥鹽酸鹽、美法侖(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯芥膽甾醇(phenesterine)、潑尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard);亞硝基脲,諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲黴素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimnustine);抗生素,諸如烯二炔抗生素(例如卡奇黴素(calicheamicin),尤其卡奇黴素γ1I及卡奇黴素ωI1 (參見例如Agnew,Chem Intl. Ed. Engl. , 33:183-186 (1994))、包括達內黴素A之達內黴素(dynemicin)、諸如氯屈膦酸鹽(clodronate)之雙膦酸鹽、埃斯培拉黴素(esperamicin)以及新抑癌蛋白(neocarzinostatin)發色團及相關色素蛋白烯二炔抗生素發色團、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、偶氮絲胺酸(azaserine)、博來黴素(bleomycin)、放線菌素C (cactinomycin)、卡柔比星(carabicin)、洋紅黴素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素D (dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-側氧基-L-正白胺酸、Adriamycin® 小紅莓(包括N-嗎啉基-小紅莓、氰基-N-嗎啉基-小紅莓、2-吡咯啉基-小紅莓及去氧小紅莓)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、艾達黴素(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、諸如絲裂黴素C之絲裂黴素(mitomycin)、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾加黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、潑非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、奎那黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑菌素(streptonigrin)、鏈脲菌素(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、左柔比星(zorubicin);抗代謝物,諸如甲胺喋呤及5-氟尿嘧啶(5-FU);葉酸類似物,諸如迪諾特寧(denopterin)、甲胺喋呤(methotrexate)、蝶羅呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate);嘌呤類似物,諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine);嘧啶類似物,諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二去氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷;雄激素,諸如卡魯睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾內酯(testolactone);抗腎上腺劑,諸如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);葉酸補充劑,諸如亞葉酸;乙醯葡醛酯;醛磷醯胺醣苷;胺基乙醯丙酸;恩尿嘧啶(eniluracil);安吖啶(amsacrine);貝斯布西(bestrabucil);比生群(bisantrene);依達曲沙(edatraxate);得弗伐胺(defofamine);地美可辛(demecolcine);地吖醌(diaziquone);艾弗鳥胺酸(elfornithine);依利醋銨(elliptinium acetate);埃博黴素(epothilone);依託格魯(etoglucid);硝酸鎵;羥基脲;磨菇多糖(lentinan);氯尼達明(lonidainine);美登醇(maytansinoid),諸如美登素(maytansine)及安絲菌素(ansamitocin);丙脒腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫比達摩(mopidanmol);二胺硝吖啶(nitraerine);噴司他汀(pentostatin);苯來美特(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基醯肼;丙卡巴肼(procarbazine);PSK® 多醣複合物(JHS Natural Products, Eugene, OR);雷佐生(razoxane);根瘤菌素(rhizoxin);西佐喃(sizofiran);螺旋鍺;細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid);三亞胺醌;2,2',2"-三氯三乙胺;單端孢黴烯(trichothecene)(尤其T-2毒素、疣孢菌素A(verracurin A)、桿孢菌素A (roridin A)及蛇形菌素(anguidine));尿烷;長春地辛(vindesine);達卡巴嗪(dacarbazine);甘露醇氮芥(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴衛矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);加西托星(gacytosine);阿拉伯糖苷(arabinoside)(「Ara-C」;環磷醯胺;噻替派;紫杉烷類(taxoid),例如Taxol® 太平洋紫杉醇(Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)、Abraxane® 太平洋紫杉醇之無十六醇聚氧乙烯醚白蛋白經工程改造之奈米粒子調配物(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,Illinois)及Taxotere® 多西他賽(Rhône-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥(chloranbucil);Gemzar® 吉西他濱(gemcitabine);6-硫鳥嘌呤;巰基嘌呤(mercaptopurine);甲胺喋呤(methotrexate);鉑類似物,諸如順鉑(cisplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin)及卡鉑(carboplatin);長春鹼(vinblastine);鉑;依託泊苷(etoposide)(VP-16);異環磷醯胺(ifosfamide);米托蒽醌(mitoxantrone);長春新鹼(vincristine);Navelbine® 長春瑞賓(vinorelbine);米托蒽醌;替尼泊苷(teniposide);依達曲沙(edatrexate);柔紅黴素(daunomycin);胺基喋呤(aminopterin);截瘤達(xeloda);伊班膦酸鹽(ibandronate);伊立替康((irinotecan)(Camptosar,CPT-11)(包括伊立替康與5-FU及甲醯四氫葉酸之治療方案);拓樸異構酶抑制劑RFS 2000;二氟甲基鳥胺酸(DMFO);類視黃素,諸如視黃酸;卡培他濱(capecitabine);康柏斯達汀(combretastatin);甲醯四氫葉酸(LV);奧沙利鉑,包括奧沙利鉑治療方案(FOLFOX);減少細胞增殖的PKC-α、Raf、H-Ras、EGFR(例如埃羅替尼(erlotinib)(Tarceva® ))及VEGF-A抑制劑;以及以上中之任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。
可在本文中之方法中投與之其他非限制性例示性化學治療劑包括用於調節或抑制對癌症之激素作用的抗激素劑,諸如抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑(SERM),包括例如他莫昔芬(tamoxifen)(包括Nolvadex® 他莫昔芬)、雷洛昔芬(raloxifene)、曲洛昔芬(droloxifene)、4-羥基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、那洛昔芬(keoxifene)、LY117018、奧那司酮(onapristone)及Fareston® 托瑞米芬(toremifene);抑制芳香酶之芳香酶抑制劑,其調節腎上腺中之雌激素生產,諸如4(5)-咪唑、胺魯米特、Megase® 乙酸甲地孕酮、Aromasin® 依西美坦(exemestane)、福美斯坦(formestanie)、法屈唑(fadrozole)、Rivisor® 伏羅唑(vorozole)、Femara® 來曲唑(letrozole)及Arimidex® 阿那曲唑(anastrozole);及抗雄激素,諸如氟他胺(flutamide)、尼魯胺(nilutamide)、比卡魯胺(bicalutamide)、亮丙立德(leuprolide)及戈舍瑞林(goserelin);以及曲沙他濱(troxacitabine)(1,3-二氧雜環戊烷核苷胞嘧啶類似物);反義寡核苷酸,尤其抑制異常細胞增殖中涉及之信號傳導路徑中之基因表現的彼等反義寡核苷酸,諸如PKC-α、Ralf及H-Ras;核糖核酸酶,諸如VEGF表現抑制劑(例如Angiozyme® 核糖核酸酶)及HER2表現抑制劑;疫苗,諸如基因療法疫苗,例如Allovectin® 疫苗、Leuvectin® 疫苗及Vaxid® 疫苗;Proleukin® rIL-2;Lurtotecan® 拓樸異構酶1抑制劑;Abarelix® rmRH;及以上中之任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。
抗血管生成劑 」或「血管生成抑制劑 」係指直接或間接抑制血管生成、血小管生成或非所要血管通透性的小分子量物質、聚核苷酸(包括例如抑制性RNA (RNAi或siRNA))、多肽、經分離蛋白質、重組蛋白、抗體或其結合物或融合蛋白。應理解,抗血管生成劑包括結合及阻斷血管生成因子或其受體之血管生成活性的彼等藥劑。舉例而言,可在本文中之方法中投與之抗血管生成劑可包括血管生成劑之抗體或其他拮抗劑,例如VEGF-A之抗體(例如貝伐單抗(bevacizumab) (Avastin® ))或VEGF-A受體(例如KDR受體或Flt-1受體)之抗體;抗PDGFR抑制劑,諸如Gleevec® (甲磺酸伊馬替尼(Imatinib Mesylate));阻斷VEGF受體信號傳導之小分子(例如PTK787/ZK2284、SU6668、Sutent® /SU11248(蘋果酸舒尼替尼(sunitinib malate))、AMG706或例如國際專利申請案WO 2004/113304中描述之彼等小分子)。抗血管生成劑亦包括天然血管生成抑制劑,例如血管生長抑素(angiostatin)、內皮生長抑素(endostatin)等。參見例如Klagsbrun及D'Amore (1991)Annu. Rev. Physiol. 53:217-39;Streit及Detmar (2003)Oncogene 22:3172-3179 (例如列舉惡性黑素瘤抗血管生成療法之表3);Ferrara及Alitalo (1999)Nature Medicine 5(12):1359-1364;Tonini等人, (2003)Oncogene 22:6549-6556 (例如列舉已知抗血管生成因子之表2);及Sato (2003)Int. J. Clin. Oncol. 8:200-206 (例如列舉臨床試驗中所用之抗血管生成劑之表1)。
如本文所用之「生長抑制劑 」係指活體外或活體內抑制細胞(諸如表現VEGF之細胞)之生長道化合物或組合物。因此,可在本文中之方法中投與之生長抑制劑可為顯著降低S期中之細胞(諸如表現VEGF之細胞)之百分比的生長抑制劑。生長抑制劑之實例包括(但不限於)阻斷細胞週期進程(除S期以外的時候)之藥劑,諸如誘導G1阻滯及M期阻滯之藥劑。經典M期阻斷劑包括長春花(vincas) (長春新鹼及長春鹼(vinblastine))、紫杉烷(taxane)及II型拓樸異構酶抑制劑,諸如小紅莓、表柔比星、道諾黴素、依託泊苷及博萊黴素。阻滯G1之彼等藥劑亦深入到S期阻滯,例如DNA烷基化劑,諸如他莫西芬、潑尼松、達卡巴嗪、甲氮芥、順鉑、甲胺喋呤、5-氟尿嘧啶及ara-C。其他資訊可見於Mendelsohn及Israel編,The Molecular Basis of Cancer , 第1章, 標題為「Cell cycle regulation, oncogenes, and antineoplastic drugs」,Murakami等人(W.B. Saunders, Philadelphia, 1995), 例如第13頁。紫杉烷(太平洋紫杉醇及多西他賽)為皆來源於紫杉樹之抗癌藥物。多西他賽(Taxotere®, Rhone-Poulenc Rorer)來源於歐洲紫杉,為太平洋紫杉醇(Taxol®, Bristol-Myers Squibb)之半合成類似物。太平洋紫杉醇及多西他賽促進微管自微管蛋白二聚體組裝且藉由防止解聚合穩定微管,其促成細胞中之有絲分裂之抑制。
術語「抗贅生性組合物 」係指適用於治療癌症的包含至少一種活性治療劑之組合物。治療劑之實例包括(但不限於)例如化學治療劑、生長抑制劑、細胞毒性劑、用於放射療法之藥劑、抗血管生成劑、癌症免疫治療劑、細胞凋亡劑、抗微管蛋白劑及治療癌症之其他藥劑,諸如抗HER-2抗體、抗CD20抗體、表皮生長因子受體(EGFR)拮抗劑(例如酪胺酸激酶抑制劑)、HER1/EGFR抑制劑(例如埃羅替尼(Tarceva® )、血小板衍生生長因子抑制劑(例如Gleevec® (甲磺酸伊馬替尼))、COX-2抑制劑(例如塞內昔布(celecoxib))、干擾素、CTLA4抑制劑(例如抗CTLA抗體伊匹單抗(ipilimumab)(YERVOY®))、PD-1或PD-L1抑制劑(例如OPDIVO®、KEYTRUDA®、TECENTRIQ®、BAVENCIO®、IMFINZI®)、TIM3抑制劑(例如抗TIM3抗體)、LAG-3抑制劑、細胞介素、結合於以下目標ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-β、BlyS、APRIL、BCMA、CTLA4、TIM3或VEGF受體中之一或多者的拮抗劑(例如中和抗體)、TRAIL/Apo2,以及其他生物活性及有機化學藥劑等。其組合亦包括於本發明中。特異性結合於 ILT4 抗體
以下序列表分別提供具有或不具有信號肽之人類ILT4之胺基酸序列(參見SEQ ID NO:107-108及110-111)。細胞外域(ECD)包含SEQ ID NO:109及112中所示之胺基酸殘基。耦接至His-Avi標籤的例示性ECD包含SEQ ID NO:119之胺基酸序列。
抗ITL4抗體(Ab)可特異性結合於ILT4-ECD或其片段(參見SEQ ID NO:109及112以及119)。
本文提供以例如在25℃下或在37℃下量測的為10-6 M或更低、10-7 M或更低、10-8 M或更低、10-9 M或更低或者10-10 或更低之KD 結合於ILT4的Ab。
測定Ab結合於ILT4蛋白之程度可使用若干不同方法進行。舉例而言,藉由表面電漿子共振(SPR),諸如藉由BIACORE®分析進行。例示性SPR分析包含於含有固定化捕捉試劑之CM4感測器晶片上捕捉一種或若干種抗體(例如使用Biacore®抗人類Fc捕捉套組,GE Healthcare目錄號# BR-1008-39,或Biacore®抗小鼠捕捉套組,GE Healthcare目錄號#BR-1008-39),及使ILT4抗原(例如ILT4 ECD)作為分析物以一濃度系列流動以確定在運行緩衝液中的結合動力學及親和力。在一個實施例中,ILT4係以0.1 nM至500 nM (例如0.1 nM、1 nM、10 nM、100 nM、500 nM)範圍內之兩至五個濃度,以30 μL/min之流速注射的,持續達四分鐘之締合時間及達十分鐘解離時間。在結合週期之間,捕捉表面遵循關於各別捕捉套組之製造商之說明書再生。所有資料均使用參考流槽及空白注射雙重參考。使用Biacore® T200評估軟體用質量轉移將具有簡單1:1動力學之資料擬合至朗格繆爾結合模型。亦可使用實例中所描述之SPR方法。
Ab對於ILT4 ECD多肽之親和力可使用於其表面上表現ILT4多肽之細胞測定,該方法包含流動式細胞測量術。例示性流動式細胞測量術分析包含以下:將T細胞或異位表現ILT4之其他細胞再懸浮於緩衝液中,其中之Ab已自大約20 µg/mL經連續稀釋且在4℃下與再懸浮細胞一起培育30分鐘。隨後用相同緩衝液洗滌細胞兩次,維持所要緩衝液條件,且與識別初級抗體(例如人類IgG)的結合螢光團之二級抗體一起培育。細胞隨後如前所述洗滌且在無固定之情況下即刻經BD Fortessa®或其他流式細胞儀獲取。Ab對於ILT4多肽之親和力可如實例中所描述測定。
在某些實施例中,結合於ILT4之Ab阻斷ILT4與目標細胞(諸如T細胞)之結合。抑制或阻斷可為100%或至少99%、95%、90%、85%、80%、75%或50%。
ILT4與ILT4結合細胞(諸如T細胞)之間的結合抑制可藉由量測存在及不存在該抗體下ILT4所結合之細胞的結合抑制來測定。可用以確定抗體是否抑制ILT4與ILT4結合細胞之結合的例示性實驗為流動式細胞測量術分析,例如包含以下之分析:將來自供體血液之人類末梢血液單核細胞、白血球層或白血球(leukopak)再懸浮於由HBSS+1% BSA組成之緩衝液中。隨後在4℃下用20 µg /mL例如ILT4 ECD或與人類IgG1 Fc融合之ILT4 ECD融合蛋白且以變化濃度之候選ILT4阻斷抗體或對照抗體將細胞培育30分鐘。隨後將細胞在相同緩衝液中洗滌兩次並在4℃下與識別ILT4的結合螢光團之二級抗體而非候選阻斷抗體或對照抗體一起再培育30分鐘。細胞隨後如前所述洗滌且在無固定之情況下即刻經BD Fortessa®或其他流式細胞儀獲取。亦可例如如實例中所描述測定結合抑制。例示性 ILT4 結合 Ab
本文提供特異性地結合於ILT4,例如ILT4 ECD之Ab。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR1、CDR2及/或CDR3的重鏈可變區(「VH」)。除非另有規定,否則本文中之VH CDR為如本文中圖1、圖3、圖5、圖7、圖9及圖11中所示的Kabat CDR (例如AbM CDR1等)。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR1、CDR2及/或CDR3的VH。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、2E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH CDR1、CDR2及/或CDR3 (亦即9G4 (SEQ ID No:125-127)、9C8 (SEQ ID No:131-133)、2H2 (SEQ ID No:137-139)、2E5 (SEQ ID No:143-145)、24E5 (SEQ ID No:149-151)、21D9 (SEQ ID No:155-157)、21D9.b (SEQ ID No:155-157)、21D9.c (SEQ ID No:155-157)、21D9.d (SEQ ID No:155-157)、21D9.e (SEQ ID No:155-157)、21A5 (SEQ ID No:161-163)、10F10 (SEQ ID No:167-169)、10F10.1 (SEQ ID No:167-169)、10F10.3 (SEQ ID No:167-169)或10F10.4 (SEQ ID No:167-169))的VH。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR1、CDR2及CDR3的VH。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH CDR1、CDR2及CDR3的VH。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR1、CDR2及/或CDR3的VH以及包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之CDR1、CDR2及/或CDR3的VL。除非另有規定,否則本文中之VL CDR為如本文中圖2、圖4、圖6、圖8、圖10及圖12中所示的Kabat CDR (例如AbM CDR1等)。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR1、CDR2及CDR3的VH以及包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之CDR1、CDR2及CDR3的VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH CDR1、CDR2及/或CDR3的VH以及包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VL CDR1、CDR2及/或CDR3的VL (亦即9G4 (SEQ ID No:128-130)、9C8 (SEQ ID No:134-136)、2H2 (SEQ ID No:140-142)、2E5 (SEQ ID No:146-148)、24E5 (SEQ ID No:152-154)、21D9 (SEQ ID No:158-160)、21D9.b (SEQ ID No:158-160)、21D9.c (SEQ ID No:158-160)、21D9.d (SEQ ID No:158-160)、21D9.e (SEQ ID No:158-160)、21A5 (SEQ ID No:164-166)、10F10 (SEQ ID No:170-172)、10F10.1 (SEQ ID No:170-172)、10F10.3 (SEQ ID No:170-172)或10F10.4 (SEQ ID No:170-172))。
在一些實施例中,ILT4 Ab可包含: (a) 包含9G4之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含9G4之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (b) 包含9C8之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含9C8之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (c) 包含2H2之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含2H2之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (d) 包含25E5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含25E5之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (e) 包含24E5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含24E5之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (f) 包含21D9之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21D9之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (g) 包含21D9.b之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21D9.b之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (h) 包含21D9.c之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21D9.c之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (i) 包含21D9.d之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21D9.d之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (j) 包含21D9.e之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21D9.e之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (k) 包含21A5之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21A5之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (l) 包含21A5.a之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含21A5.a之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (m) 包含10F10之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含10F10之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (n) 包含10F10.1之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含10F10.1之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL; (o) 包含10F10.3之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含10F10.3之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL;或 (p) 包含10F10.4之VH CDR1、CDR2及CDR3之胺基酸序列的VH,及包含10F10.4之VL CDR1、CDR2及CDR3的VL。
再次,下文序列表提供上文所列之抗體之重鏈及輕鏈可變區序列及全長重鏈及輕鏈序列。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH之胺基酸序列的VH。本發明提供之特定抗體物種之個別VH序列列舉於序列表中。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH之胺基酸序列(亦即9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135)、9C8 (SEQ ID NO:55)、2H2 (SEQ ID NO:58)、2E5 (SEQ ID NO:63)、24E5 (SEQ ID NO:67)、21D9 (SEQ ID NO:71)、21D9.b (SEQ ID NO:74)、21D9.c (SEQ ID NO:75)、21D9.d (SEQ ID NO:78)、21D9.e (SEQ ID NO:80)、21A5 (SEQ ID NO:83)、21A5.a (SEQ ID NO:87)、10F10 (SEQ ID NO:91)、10F10.1 (SEQ ID NO:91)、10F10.3 (SEQ ID NO:91)或10F10.4 (SEQ ID NO:91)中之任一者)的VH。
在一些實施例中,ILT4 Ab包含有任何9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的,但在VH序列之構架區中具有1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守性取代的VH。在一些實施例中,ILT4 Ab包含有任何9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的,但在VH序列之構架區中具有1、2、3、4或5個回復取代的VH。
在一些實施例中,ILT4 Ab包含本文所描述之任一種ILT4 Ab之VH及VL CDR,其中該等CDR在所有CDR之中包含1、2或3個胺基酸添加、取代(例如保守性取代)或缺失。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR之胺基酸序列的VH CDR1、CDR2及CDR3且包含與本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含與以下中之任一者之VH之胺基酸序列至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的胺基酸序列的VH:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4。在某些實施例中,該抗體之VH歸因於VH序列之構架區中的1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守性取代)而不同於序列表中所示之VH序列的VH。在某些實施例中,該抗體之VH歸因於VH序列之構架區中的1、2、3、4或5個回復取代而不同於序列表中所示之VH序列之VH。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含由本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH之胺基酸序列組成的VH。在某些實施例中,ILT4 Ab包含由9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH之胺基酸序列組成的VH。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL之胺基酸序列的VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VL之胺基酸序列(亦即9G4 (SEQ ID NO:50,胺基酸19-125)、9C8 (SEQ ID NO:54)、2H2 (SEQ ID NO:59)、2E5 (SEQ ID NO:62)、24E5 (SEQ ID NO:66)、21D9 (SEQ ID NO:70)、21D9.b (SEQ ID NO:70)、21D9.c (SEQ ID NO:70)、21D9.d (SEQ ID NO:70)、21D9.e (SEQ ID NO:70)、21A5 (SEQ ID NO:82)、21A5.a (SEQ ID NO:86)、10F10 (SEQ ID NO:90)、10F10.1 (SEQ ID NO:94)、10F10.3 (SEQ ID NO:96)或10F10.4 (SEQ ID NO:114))的VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL CDR之胺基酸序列的VL CDR1、CDR2及CDR3且包含與本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含與以下中之任一者之VL之胺基酸序列至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的胺基酸序列的VL:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4。在某些實施例中,該抗體之VL歸因於VL序列之構架區中的1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守性取代)而不同於序列表中所示之VL序列的VL。在某些實施例中,該抗體之VL歸因於1、2、3、4或5個回復取代而不同於序列表中所示之VL序列之VL。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有由本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL之胺基酸序列組成的VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含由9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VL之胺基酸序列組成的VL。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH之胺基酸序列的VH且包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL之胺基酸序列的VL。在此等實施例中之某些中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH之胺基酸序列的VH以及包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VL之胺基酸序列的VL。
然而,在某些實施例中,該抗體之VH為9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的,但在VH序列之構架區中具有1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守性取代)的VH,且VL為來自上文清單之相同物種中之任一者的VL。然而,在某些實施例中,該抗體之VH為9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的,但在VH序列之構架區中具有1、2、3、4或5個回復取代的VH。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的VH及VL之胺基酸序列的VH及VL。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH CDR之胺基酸序列的VH CDR1、CDR2及CDR3以及包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之VL CDR之胺基酸序列的VL CDR1、CDR2及CDR3,且亦包含各與本文所提供之任一種ILT4 Ab之對應VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL。在某些實施例中,該抗體之VH及VL歸因於序列之構架區中的1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守性取代或諸如1、2、3、4或5個回復取代)而不同於序列表中所示之VH及VL序列。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含由本文所提供之任一種ILT4 Ab之VH及VL之胺基酸序列組成的VH及VL。在某些實施例中,ILT4 Ab包含各由9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者的VH及VL之胺基酸序列組成的VH及VL。
一種ILT4 Ab可包含: (a) 包含9G4之VH之胺基酸序列的VH及包含9G4之VL之胺基酸序列的VL; (b) 包含9C8之VH之胺基酸序列的VH及包含9C8之VL之胺基酸序列的VL; (c) 包含2H2之VH之胺基酸序列的VH及包含2H2之VL之胺基酸序列的VL; (d) 包含25E5之VH之胺基酸序列的VH及包含25E5之VL之胺基酸序列的VL; (e) 包含24E5之VH之胺基酸序列的VH及包含24E5之VL之胺基酸序列的VL; (f) 包含21D9之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9之VL之胺基酸序列的VL; (g) 包含21D9.b之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.b之VL之胺基酸序列的VL; (h) 包含21D9.c之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.c之VL之胺基酸序列的VL; (i) 包含21D9.d之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.d之VL之胺基酸序列的VL; (j) 包含21D9.e之VH之胺基酸序列的VH及包含21D9.e之VL之胺基酸序列的VL; (k) 包含21A5之VH之胺基酸序列的VH及包含21A5之VL之胺基酸序列的VL; (l) 包含21A5.a之VH之胺基酸序列的VH及包含21A5.a之VL之胺基酸序列的VL; (m) 包含10F10之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10之VL之胺基酸序列的VL; (n) 包含10F10.1之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.1之VL之胺基酸序列的VL; (o) 包含10F10.3之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.3之VL之胺基酸序列的VL;或 (p) 包含10F10.4之VH之胺基酸序列的VH及包含10F10.4之VL之胺基酸序列的VL。
一種ILT4 Ab可包含: (a) 包含9G4之VH之VH CDR的VH及包含9G4之VL CDR的VL,以及與9G4之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (b) 包含9C8之VH之VH CDR的VH及包含9C8之VL CDR的VL,及與9C8之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (c) 包含2H2之VH之VH CDR的VH及包含2H2之VL CDR的VL,以及與2H2之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (d) 包含25E5之VH之VH CDR的VH及包含25E5之VL CDR的VL,以及與25E5之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (e) 包含24E5之VH之VH CDR的VH及包含24E5之VL CDR的VL,以及與24E5之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (f) 包含21D9之VH之VH CDR的VH及包含21D9之VL CDR的VL,以及與21D9之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (g) 包含21D9.b之VH之VH CDR的VH及包含21D9.b之VL CDR的VL,以及與21D9.b之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (h) 包含21D9.c之VH之VH CDR的VH及包含21D9.c之VL CDR的VL,以及與21D9.c之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (i) 包含21D9.d之VH之VH CDR的VH及包含21D9.d之VL CDR的VL,以及與21D9.d之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (j) 包含21D9.e之VH之VH CDR的VH及包含21D9.e之VL CDR的VL,以及與21D9.e之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (k) 包含21A5之VH之VH CDR的VH及包含21A5之VL CDR的VL,以及與21A5之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (l) 包含21A5.a之VH之VH CDR的VH及包含21A5.a之VL CDR的VL,以及與21A5.a之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (m) 包含10F10之VH之VH CDR的VH及包含10F10之VL CDR的VL,以及與10F10之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (n) 包含10F10.1之VH之VH CDR的VH及包含10F10.1之VL CDR的VL,以及與10F10.1之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列; (o) 包含10F10.3之VH之VH CDR的VH及包含10F10.3之VL CDR的VL,以及與10F10.3之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列;或 (p) 包含10F10.4之VH之VH CDR的VH及包含10F10.4之VL CDR的VL,以及與10F10.4之VH及VL至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的VH及VL胺基酸序列。 在一些以上實施例中,VH及/或VL可由於存在1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守取代)而與物種(a)至(p)中之每一者之序列不同。在一些實施例中,VH可包含1、2、3、4或5個回復取代。
一種ILT4 Ab可包含: (a) 由9G4之VH之胺基酸序列組成的VH及由9G4之VL組成的VL; (b) 由9C8之VH之胺基酸序列組成的VH及由9C8之VL組成的VL; (c) 由2H2之VH之胺基酸序列組成的VH及由2H2之VL組成的VL; (d) 由25E5之VH之胺基酸序列組成的VH及由25E5之VL組成的VL; (e) 由24E5之VH之胺基酸序列組成的VH及由24E5之VL組成的VL; (f) 由21D9之VH之胺基酸序列組成的VH及由21D9之VL組成的VL; (g) 由21D9.b之VH之胺基酸序列組成的VH及由21D9.b之VL組成的VL; (h) 由21D9.c之VH之胺基酸序列組成的VH及由21D9.c之VL組成的VL; (i) 由21D9.d之VH之胺基酸序列組成的VH及由21D9.d之VL組成的VL; (j) 由21D9.e之VH之胺基酸序列組成的VH及由21D9.e之VL組成的VL; (k) 由21A5之VH之胺基酸序列組成的VH及由21A5之VL組成的VL; (l) 由21A5.a之VH之胺基酸序列組成的VH及由21A5.a之VL組成的VL; (m) 由10F10之VH之胺基酸序列組成的VH及由10F10之VL組成的VL; (n) 由10F10.1之VH之胺基酸序列組成的VH及由10F10.1之VL組成的VL; (o) 由10F10.3之VH之胺基酸序列組成的VH及由10F10.3之VL組成的VL;或 (p) 由10F10.4之VH之胺基酸序列組成的VH及由10F10.4之VL組成的VL。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含上文及本文別處所描述之抗體的可變區及/或可變區CDR 1至3中之任一者,諸如: (1)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (2)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (3)以下之VH:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (4)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者以及VL CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (5)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3以及VL CDR1、CDR2及CDR3:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (6)以下之VH及VL:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; 或 (7)例外情況為在以下之VH及/或VL中具有1、2、3、4或5個回復或保守性取代的VL及VH:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4;且該ILT4 Ab亦為IgG抗體,諸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4抗體或如以下部分中所描述的其經修飾形式。在一些實施例中,恆定區具有效應功能,且在一些實施例中,恆定區無效應。在某些實施例中,恆定區為IgG1.3或IgG1.1f之恆定區或本文所描述之另一恆定區,例如IgG1及IgG1.238K。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含上文及本文別處所描述之抗體的可變區及/或可變區CDR 1至3中之任一者,諸如: (1)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (2)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (3)以下之VH:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (4)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者以及VL CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (5)以下之VH CDR1、CDR2及CDR3以及VL CDR1、CDR2及CDR3:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; (6)以下之VH及VL:9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4; 或 (7)9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4之VL及VH,例外為在VH及/或VL中具有1、2、3、4或5個回復或保守性取代; 且 該抗體進一步包含以下特徵中之一或多者: - 例如以10-8 M、10-9 M或更低之KD 特異性結合於hILT4; - 不特異性結合於hILT2、hILT3、hILT5; - 不特異性結合於LILRA及/或LILRB家族之一或多個成員; - 例如在MLR中刺激T細胞活化,如藉由增加之T細胞增殖或IFN-g分泌所量測,例如如實例中所描述之分析中所示; - 刺激單核球分化或活化成巨噬細胞,例如刺激單核球分化成促炎性巨噬細胞,例如如實例中所描述之分析所示; - 促進CD83及CD86於人類單核球衍生之未成熟樹突狀細胞(Mo-iDC)上之表現,例如如實例中所描述之分析中所示; - 在CMV溶胞物分析中增強在抗原刺激後之IFN-γ分泌,例如如實例中所描述之分析中所示; - 藉由CD4+及CD8+ T細胞在同種異體混合淋巴細胞反應(同種異體MLR)分析中增強在CD3刺激後之IFN-γ及TNF-α分泌,例如如實例中所描述之分析中所示; - 不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化; - 抑制HLA-A及/或HLA-B與ILT4之結合; - 具有如圖27或圖37C中所示之與hILT4之結合概況; - 結合於hILT4之Ig樣域1、2或1及2(其分別對應於SEQ ID NO:107之胺基酸27-110及111-229),諸如結合於包含以下之區域:(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),如藉由氫氘交換(HDX)所測定,例如如實例中所描述之HDX分析中所示; - 不顯著結合於ILT4之細胞外域之其他區域,諸如位於胺基酸I70之N端的區域或殘基;其中hILT4之胺基酸編號為未成熟hILT4 (亦即具有其信號序列之ILT4)之胺基酸編號; - 與本文所描述之抗體競爭結合於hILT4; - 特異性結合於包含SEQ ID NO:118之食蟹獼猴ILT4,例如如實例中所描述之結合分析中所示; - 促進巨噬細胞朝向M1巨噬細胞之促炎性極化; - 不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化;及 - 在於25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質,及/或在於40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之重鏈之胺基酸序列的重鏈(HC)。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有包含如下文在序列表中所示9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之重鏈之胺基酸序列(亦即如該表所提供之完整HC序列,或抗體之VH序列與HC恆定區序列的複合序列,諸如如該表中所提供之SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179)的重鏈。
因此,舉例而言,在一些實施例中,該抗體可包含以下類型中之一者之HC胺基酸序列,包含如下胺基酸序列: a. IgG1,例如9G4.IgG1,9G4 (SEQ ID NO:2)、9C8 (SEQ ID NO:4)、2H2 (SEQ ID NO:6)、2E5 (SEQ ID NO:8)、24E5 (SEQ ID NO:10)、21D9 (SEQ ID NO:12)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:98)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:98)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:98)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:98)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:98)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:98)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:98), b. IgG1,例如9G4.IgG1,9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:102)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:102)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:102)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:102)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:102)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:102)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:102)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:102)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:102)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:102)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:102)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:102)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:102), c. IgG1.3 (例如9G4.IgG1.3等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:100)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:100)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:100)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:100)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:100)、21D9 ((i) SEQ ID NO:113,或(ii) SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:100)、21D9.b (SEQ ID NO:36)、21D9.c (SEQ ID NO:38)、21D9.d (SEQ ID NO:40)、21D9.e (SEQ ID NO:13)、21A5 (SEQ ID NO:15)、21A5.a (SEQ ID NO:17)、10F10 (SEQ ID NO:19)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:100); d. IgG1.1f (例如9G4.IgG1.1f等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:103)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:103)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:103)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:103)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:103)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:103)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:103)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:103)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:103)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:103)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:103)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:103)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:103), e. IgG1fa.P238K (例如9G4.IgG1fa.P238K等) 9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:104)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:104)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:104)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:104)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:104)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:104)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:104)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:104)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:104)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:104)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:104)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:104)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:104),或 f. IgG4 S228P (例如9G4.IgG4 S228P等),9G4 (SEQ ID NO:51,胺基酸20-135,及SEQ ID NO:179)、9C8 (SEQ ID NO:55及SEQ ID NO:179)、2H2 (SEQ ID NO:58及SEQ ID NO:179)、2E5 (SEQ ID NO:63及SEQ ID NO:179)、24E5 (SEQ ID NO:67及SEQ ID NO:179)、21D9 (SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:179)、21D9.b (SEQ ID NO:74及SEQ ID NO:179)、21D9.c (SEQ ID NO:75及SEQ ID NO:179)、21D9.d (SEQ ID NO:78及SEQ ID NO:179)、21D9.e (SEQ ID NO:80及SEQ ID NO:179)、21A5 (SEQ ID NO:83及SEQ ID NO:179)、21A5.a (SEQ ID NO:87及SEQ ID NO:179)、10F10 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)、10F10.1 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)、10F10.3 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)或10F10.4 (SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:179)。
在某些實施例中,ILT4 Ab包含有:包含本文所提供之任一種ILT4 Ab之重鏈之胺基酸序列的重鏈,其包含IgG1.3重鏈恆定區;及本文所提供之任一種ILT4 Ab之輕鏈之胺基酸序列。在某些實施例中,ILT4 Ab包含有:包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之VH之胺基酸序列的重鏈,其包含IgG1.3 HC恆定區(其由命名9G4.IgG1.3等表示);及包含9G4、9C8、2H2、25E5、24E5、21D9、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10、10F10.1、10F10.3或10F10.4中之任一者之輕鏈之胺基酸序列的輕鏈。在一些實施例中,輕鏈為包含如下胺基酸序列之κ輕鏈:9G4 (SEQ ID NO:1)、9C8 (SEQ ID NO:3)、2H2 (SEQ ID NO:5)、2E5 (SEQ ID NO:7)、24E5 (SEQ ID NO:9)、21D9 (SEQ ID NO:11)、21D9.b、21D9.c、21D9.d、21D9.e、21A5 (SEQ ID NO:14)、21A5.a (SEQ ID NO:16)、10F10 (SEQ ID NO:18)、10F10.1 (SEQ ID NO:20)、10F10.3 (SEQ ID NO:21)或10F10.4 (SEQ ID NO:116)。
一種ILT4 Ab可包含: (a) 包含9G4之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含9G4之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (b) 包含9C8之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含9C8之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (c) 包含2H2之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含2H2之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (d) 包含25E5之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含25E5之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (e) 包含24E5之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含24E5之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (f) 包含9G4之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21D9之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (g) 包含21D9.b之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21D9.b之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (h) 包含21D9.c之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21D9.c之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (i) 包含21D9.d之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21D9.d之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (j) 包含21D9.e之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21D9.e之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (k) 包含21A5之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21A5之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (l) 包含21A5.a之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含21A5.a之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (m) 包含10F10之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含10F10之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (n) 包含10F10.1之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含10F10.1之輕鏈胺基酸序列的輕鏈; (o) 包含10F10.3之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含10F10.3之輕鏈胺基酸序列的輕鏈;或 (p) 包含10F10.4之重鏈之胺基酸序列的重鏈及包含10F10.4之輕鏈胺基酸序列的輕鏈。
一種ILT4 Ab可包含: (a) 包含9G4之HC之HC CDR的重鏈(HC)及包含9G4之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與9G4之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (b) 包含9C8之HC之HC CDR的HC及包含9C8之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與9C8之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (c) 包含2H2之HC之HC CDR的HC及包含2H2之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與2H2之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (d) 包含25E5之HC之HC CDR的HC及包含25E5之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與25E5之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (e) 包含24E5之HC之HC CDR的HC及包含24E5之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與24E5之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (f) 包含21D9之HC之HC CDR的HC及包含21D9之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21D9之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (g) 包含21D9.b之HC之HC CDR的HC及包含21D9.b之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21D9.b之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (h) 包含21D9.c之HC之HC CDR的HC及包含21D9.c之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21D9.c之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (i) 包含21D9.d之HC之HC CDR的HC及包含21D9.d之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21D9.d之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (j) 包含21D9.e之HC之HC CDR的HC及包含21D9.e之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21D9.e之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (k) 包含21A5之HC之HC CDR的HC及包含21A5之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21A5之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (l) 包含21A5.a之HC之HC CDR的HC及包含21A5.a之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與21A5.a之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (m) 包含10F10之HC之HC CDR的HC及包含10F10之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與10F10之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (n) 包含10F10.1之HC之HC CDR的HC及包含10F10.1之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與10F10.1之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列; (o) 包含10F10.3之HC之HC CDR的HC及包含10F10.3之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與10F10.3之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列;或 (p) 包含10F10.3之HC之HC CDR的HC及包含10F10.4之LC CDR的輕鏈(LC),以及分別與10F10.4之HC及LC至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致的HC及LC胺基酸序列。
在一些以上實施例中,HC及/或LC可由於存在1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個保守取代)而與物種(a)至(p)中之每一者之序列不同。在一些以上實施例中,HC及/或LC可由於存在1、2、3、4或5個胺基酸取代(諸如1、2、3、4或5個回復取代)而不同於物種(a)至(p)中之每一者之序列。
在一些實施例中,ILT4 Ab可包含: (a) 由9G4之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由9G4之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (b) 由9C8之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由9C8之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (c) 由2H2之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由2H2之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (d) 由25E5之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由25E5之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (e) 由24E5之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由24E5之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (f) 由21D9之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21D9之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (g) 由21D9.b之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21D9.b之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (h) 由21D9.c之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21D9.c之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (i) 由21D9.d之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21D9.d之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (j) 由21D9.e之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21D9.e之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (k) 由21A5之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21A5之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (l) 由21A5.a之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由21A5.a之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (m) 由10F10之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由10F10之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (n) 由10F10.1之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由10F10.1之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈; (o) 由10F10.3之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由10F10.3之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈;或 (p) 由10F10.4之重鏈之胺基酸序列組成的重鏈及由10F10.4之輕鏈之胺基酸序列組成的輕鏈。
在一些實施例中,ILT4 Ab可包含有包含本文中之抗體物種之VH胺基酸序列的重鏈胺基酸序列,而非如本文序列表中之HC序列中所提供(且參見SEQ ID NO:100)之IgG1.3重鏈恆定區,該抗體可包含不同重鏈恆定區序列,諸如人類野生型IgG1恆定區,諸如SEQ ID NO:98及102-104中所提供之彼等恆定區,或IgG4重鏈恆定區,或具有S228P取代(EU編號)之IgG4恆定區,或以下關於恆定區之部分中所描述之其他重鏈恆定區中之任一者。
在一些實施例中,此類經修飾ILT4 Ab具有以下特徵中之一或多者: - 例如以10-8 M或更低、或10-9 M或更低之KD 特異性結合於hILT4; - 不特異性結合於hILT2、hILT3、hILT5中之一者、兩者或全部三者; - 不特異性結合於LILRA及/或LILRB家族之一或多個成員; - 例如在MLR分析中刺激T細胞活化,如藉由增加之T細胞增殖或IFN-γ分泌所量測;且 刺激單核球分化或活化成巨噬細胞。
在一些實施例中,該抗體結合於hILT4之Ig樣域1、2或1及2,其對應於序列SEQ ID NO:107上之胺基酸27-110 (域1)及彼序列上之胺基酸111-229 (域2),在該等部位包含70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),如藉由氫氘交換(HDX)所測定,例如如實例中所描述之HDX分析中所示。(參見圖27。)例示性抗體恆定區
在一些實施例中,本文所描述之抗體包含一或多個人類恆定區。在一些實施例中,人類重鏈恆定區屬於選自IgA、IgG及IgD之同型。在一些實施例中,人類輕鏈恆定區屬於選自κ及λ之同型。在一些實施例中,本文所描述之抗體包含人類IgG恆定區,諸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。在一些實施例中,本文所描述之抗體包含人類IgG4重鏈恆定區。在一些此類實施例中,本文所描述之抗體包含人類IgG4恆定區中之S241P突變。在一些實施例中,本文所描述之抗體包含人類IgG4恆定區及人類κ輕鏈。
重鏈恆定區之選擇可決定抗體是否將具有活體內效應功能。在一些實施例中,此類效應功能包括抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)及/或補體依賴性細胞毒性(CDC),且可導致殺死抗體所結合之細胞。在一些治療方法中,包括治療一些癌症之方法中,例如當抗體結合於支援腫瘤維持或生長的細胞時,可能需要殺死細胞。可支援腫瘤維持或生長的例示性細胞包括(但不限於)腫瘤細胞本身、幫助將血管募集至腫瘤之細胞及提供支援或促進腫瘤生長或腫瘤存活的配體、生長因子或反受體之細胞。在一些實施例中,當需要效應功能時,選擇包含人類IgG1重鏈或人類IgG3重鏈之抗體。
在某些實施例中,改變本文所提供之抗體以增加或減少抗體糖基化之程度。在抗體上添加糖基化位點或使抗體缺失糖基化位點可藉由改變胺基酸序列以便產生或移除一或多個糖基化位點來便利地實現。
在抗體包含Fc區之情況下,可改變連接於其上之碳水化合物。由哺乳動物細胞產生之天然抗體通常包含分支鏈雙觸角寡醣,其通常藉由N鍵連接至Fc區之CH2域之Asn297。參見例如Wright等人,TIBTECH 15:26-32 (1997)。寡醣可包括各種碳水化合物,例如甘露糖、N-乙醯基葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖及唾液酸,以及連接至雙觸寡醣結構之「主幹」中之GlcNAc的岩藻糖。在一些實施例中,可對本發明抗體中之寡醣進行修飾以便形成具有某些改良特性之抗體。舉例而言,在一些實施例中,抗體可例如藉由使通常經含有岩藻糖之糖基化或經由其他手段糖基化之諸如Asn297之殘基突變來去岩藻糖基化。在一些實施例中,本文中之抗體可包含去岩藻糖基化人類IgG1恆定區。
抗體進一步具備等分寡醣,例如其中連接至抗體之Fc區的雙觸寡醣由GlcNAc等分。此類抗體可具有減少之岩藻糖基化及/或改良之ADCC功能。此類抗體之實例描述於例如WO 2003/011878 (Jean-Mairet等人);美國專利第6,602,684號(Umana等人);及US 2005/0123546 (Umana等人)中。亦提供寡醣中之至少一個半乳糖殘基與Fc區連接之抗體。此類抗體可具有改良之CDC功能。此類抗體描述於例如WO 1997/30087 (Patel等人);WO 1998/58964 (Raju, S.);及WO 1999/22764 (Raju, S.)中。
亦提供具有胺基端前導序列延伸部分之抗體。舉例而言,胺基端前導序列之一或多個胺基酸殘基存在於抗體之任何一或多個重鏈或輕鏈之胺基端。例示性胺基端前導序列延伸部分包含三個胺基酸殘基VHS或由其組成,該三個胺基酸殘基存在於抗體之一個或兩個輕鏈上。
可例如在投與具有變異Fc區之多肽的轉殖基因小鼠、人類或非人類靈長類動物中分析人類FcRn高親和力結合多肽之活體內或血清半衰期。亦參見例如Petkova等人International Immunology 18(12):1759-1769 (2006)。
在本發明之一些實施例中,與包含岩藻糖之親本抗體相比,去岩藻糖基化抗體在人類效應細胞存在下更有效介導ADCC,通常,ADCC活性可使用如本文中揭示之活體外ADCC分析測定,但涵蓋例如在動物模型等中測定ADCC活性之其他分析或方法。
在某些實施例中,Fc區藉由用不同胺基酸殘基置換至少一個胺基酸殘基來改變,以改變抗體之效應功能。舉例而言,一或多個選自胺基酸殘基234、235、236、237、297、318、320、322、330及/或331之胺基酸可經不同胺基酸殘基置換,以使得抗體對效應子配體之親和力改變,但保留親本抗體之抗原結合能力。親和力改變之效應子配體可為例如Fc受體或補體之C1組分。此方法進一步詳細描述於Winter等人之美國專利第5,624,821號及第5,648,260號中。
在一些實例中,一或多個選自胺基酸殘基329、331及322之胺基酸可經不同胺基酸殘基置換,以使得抗體具有改變之C1q結合及/或降低或消除之補體依賴性細胞毒性(CDC)。此方法進一步詳細描述於Idusogie等人之美國專利第6,194,551號中。
在一些實例中,改變胺基酸位置231及239內之一或多個胺基酸殘基,由此改變抗體固定補體之能力。此方法進一步描述於例如Bodmer等人之PCT公開案WO 94/29351中。在一些實例中,Fc區可藉由修飾以下位置之一或多個胺基酸而經修飾以減小抗體依賴性細胞毒性(ADCC)及/或減小與Fcγ受體之親和力:234、235、236、238、239、240、241 、243、244、245、247、248、249、252、254、255、256、258、262、263、264、265、267、268、269、270、272、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、298、299、301、303、305、307、309、312、313、315、320、322、324、325、326、327、329、330、331、332、333、334、335、337、338、340、360、373、376、378、382、388、389、398、414、416、419、430、433、434、435、436、437、438或439。例示性取代包括236A、239D、239E、268D、267E、268E、268F、324T、332D及332E。例示性變異體包括239D/332E、236A/332E、236A/239D/332E、268F/324T、267E/268F、267E/324T及267E/268F/324T。可針對Fcs進行之其他Fc修飾為降低或消除與FcγR及/或補體蛋白之結合的彼等修飾,由此降低或消除Fc介導之效應功能,諸如ADCC、ADCP及CDC。例示性修飾包括(但不限於)位置234、235、236、237、267、269、325、328、330及/或331 (例如330及331)處之取代、插入及缺失,其中編號根據EU索引進行。例示性取代包括(但不限於)234A、235E、236R、237A、267R、269R、325L、328R、330S及331S (例如330S及331S),其中編號根據EU索引進行。Fc變異體可包含236R/328R。用於減少FcγR與補體相互作用之其他修飾包括取代297A、234A、235A、237A、318A、228P、236E、268Q、309L、330S、331S、220S、226S、229S、238S、233P及234V,以及位置297之糖基化藉由突變或酶方式移除或藉由在不使蛋白質糖基化之生物體(諸如細菌)中產生來移除。此等及其他修飾綜述於Strohl, 2009,Current Opinion in Biotechnology 20:685-691中。舉例而言,人類IgG1.3 Fc恆定區含有L234A、L235E及G237A取代。IgG1fa.P238K (或IgG1.P238K)含有P238K取代。IgG1.1f包含L234A、L235E、G237A、A330S及P331S取代。
亦可使用增強對抑制性受體FcγRIIb之親和力之Fc變異體。此類變異體可提供具有與FcγRIIb細胞,包括例如B細胞及單核球相關之免疫調節活性的Fc融合蛋白。在一個實施例中,Fc變異體提供相對於一或多種活化受體,選擇性增強之對FcγRIIb之親和力。用於改變與FcγRIIb之結合之修飾包括在選自由以下組成之群的位置處之一或多個修飾:根據EU索引之234、235、236、237、239、266、267、268、325、326、327、328、330、331及332。用於增強FcγRllb親和力之例示性取代包括(但不限於) 234A、234D、234E、234F、234W、235D、235E、235F、235R、235Y、236D、236N、237A、237D、237N、239D、239E、266M、267D、267E、268D、268E、327D、327E、328F、328W、328Y、330S、331S及332E。例示性取代包括235Y、236D、239D、266M、267E、268D、268E、328F、328W及328Y。用於增強與FcγRIIb之結合之其他Fc變異體包括235Y/267E、236D/267E、239D/268D、239D/267E、267E/268D、267E/268E及267E/328F。
用於增強FcγR與補體相互作用之其他修飾包括(但不限於)取代298 A、333A、334A、326A、2471、339D、339Q、280H、290S、298D、298V、243L、292P、300L、396L、3051及396L。此等及其他修飾綜述於Strohl, 2009, Current Opinion in Biotechnology 20:685-691中。增加與Fcγ受體之結合的Fc修飾包括在Fc區之以下胺基酸位置中之任一者或多者處的胺基酸修飾:238、239、248、249、252、254、255、256、258、265、267、268、269、270、272、279、280、283、285、298、289、290、292、293、294、295、296、298、301、303、305、307、312、315、324、327、329、330、335、337、338、340、360、373、376、379、382、388、389、398、414、416、419、430、434、435、437、438或439,其中Fc區中之殘基之編號為如專利公開案第WO 00/42072號中之EU索引之編號。
視情況,Fc區可包含熟習此項技術者已知之額外及/或替代位置處之非天然存在之胺基酸殘基(參見例如美國專利第5,624,821號、第6,277,375號、第6,737,056號、第6,194,551號、第7,317,091號、第8,101,720號;PCX專利公開案WO 00/42072、WO 01/58957、WO 02/06919、WO 04/016750、WO 04/029207、WO 04/035752、WO 04/074455、WO 04/099249、WO 04/063351、WO 05/070963、WO 05/040217, WO 05/092925及WO 06/020114)。
Fc區對其配體之親和力及結合特性可藉由此項技術中已知之多種活體外分析方法(基於生物化學或免疫之分析)測定,該等方法包括(但不限於)平衡方法(例如酶聯免疫吸附分析(ELISA)或放射免疫分析(RIA))或動力學(例如BIACORE分析)及其他方法,諸如間接結合分析、競爭性抑制分析、螢光共振能量轉移(FRET)、凝膠電泳及層析(例如凝膠過濾)。此等及其他方法可利用所檢驗之組分中之一或多者上的標記及/或採用多種偵測方法,包括(但不限於)顯色、螢光、發光或同位素標記。結合親和力及動力學之詳細描述可見於Paul, W. E.編, Fundamental Immunology, 第4版, Lippincott-Raven, Philadelphia (1999),其聚焦於抗體-免疫原相互作用。
在某些實施例中,抗體經修飾以延長其生物半衰期。各種方法皆可行。舉例而言,此舉可藉由增加Fc區對FcRn之結合親和力實現,例如,以下殘基中之一或多者可發生突變:252、254、256、433、435、436,如美國專利第6,277,375號中所描述。特定例示性取代包括以下中之一或多者:T252L、T254S及/或T256F。或者,為了延長生物半衰期,抗體可在CH1或CL區內改變以含有獲自IgG之Fc區之CH2域之兩個環的救助受體結合抗原決定基,如Presta等人之美國專利第5,869,046號及第6,121,022號中所描述。增加與FcRn之結合及/或改良藥物動力學特性的其他例示性變異體包括位置259、308、428及434處之取代,包括例如2591、308F、428L、428M、434S、4341 1.434F、434Y及434X1。增加Fc與FcRn之結合的其他變異體包括:250E、250Q、428 L、428F、250Q/428L (Hinton等人 2004,J. Biol. Chem. 279(8):6213-6216,Hinton等人 2006Journal of Immunology 176:346-356)、256A、272A、286A、305A、307A、307Q、311A、312A、376A、378Q、380A、382A、434A (Shields等人,Journal of Biological Chemistry , 2001, 276(9):6591-6604)、252F、252T、252Y、252W、254T、256S、256R、256Q、256E、256D、256T、309P、311S、433R、433S、4331、433P、433Q、434H、434F、434Y、252Y/254T/256E、433K/434F/436H、308T/309P/311S (Dall Acqua等人Journal of Immunology , 2002, 169:5171-5180,Dall 'Acqua等人, 2006,Journal of Biological Chemistry 281:23514-23524)。用於調節FcRn結合之其他修飾描述於Yeung等人, 2010,J Immunol , 182:7663-7671中。
在某些實施例中,可使用具有特定生物學特徵之雜交IgG同型。舉例而言,IgG1/IgG3雜交變異體可藉由用來自兩種同型不同之位置處之IgG3的胺基酸取代CH2及/或CH3區中之IgG1位置來構築。因此,可構築包含一或多個取代,例如274Q、276K、300F、339T、356E、358M、384S、392N、397M、4221、435R及436F之雜交變異IgG抗體。在本文所描述之一些實施例中,IgG1/IgG2雜交變異體可藉由用來自兩種同型不同之位置處之IgG1的胺基酸取代CH2及/或CH3區中之IgG2位置來構築。因此,可構築包含一或多個取代,例如以下胺基酸取代中之一或多者的雜交變異IgG抗體:233E、234L、235L、-236G (係指在位置236處插入甘胺酸)及327A。
此外,人類IgG1上之針對FcγRI、FcγRII、FcγRIII及FcRn之結合位點已經定位且具有改良之結合的變異體已有描述(參見Shields, R.L.等人(2001),J. Biol. Chem. 276:6591-6604)。顯示位置256、290、298、333、334及339之特異性突變改良與FcγRIII之結合。另外,顯示以下組合突變體改良FcγRIII結合:T256A/S298A、S298A/E333A、S298A/K224A及S298A/E333A/K334A,已顯示其展現增強之FcγRIIIa結合及ADCC活性(Shields等人, 2001)。已鑑別強烈增強與FcγRIIIa之結合的其他IgG1變異體,包括具有S239D/I332E及S239D/I332E/A330L突變之變異體,其顯示對FcγRIIIa之親和力的最大增加、FcγRIIb結合之減小及在食蟹獼猴中之強烈細胞毒性活性(Lazar等人, 2006)。將三重突變引入至諸如阿侖單抗(alemtuzumab)(CD52特異性)、曲妥珠單抗(trastuzumab)(HER2/neu特異性)、利妥昔單抗(rituximab)(CD20特異性)及西妥昔單抗(cetuximab)(EGFR特異性)之抗體中轉化成活體外ADCC活性大大增強,且S239D/I332E變異體顯示在猴中耗乏B細胞之能力增強(Lazar等人, 2006)。另外,已鑑別在B細胞惡性病及乳癌之模型中在表現人類FcγRIIIa之轉殖基因小鼠中的含有L235V、F243L、R292P、Y300L及P396L突變之IgG1突變體,其展現與FcγRIIIa之增強結合及伴隨之增強ADCC活性(Stavenhagen等人,2007;Nordstrom等人, 2011)。可使用之其他Fc突變體包括:S298A/E333A/L334A、S239D/I332E、S239D/I332E/A330L、L235V/F243L/R292P/Y300L/ P396L及M428L/N434S。
在某些實施例中,選擇與FcγRs之結合減少的Fc。具有減少之FcγR結合的例示性Fc,例如IgG1 Fc包含以下三個胺基酸取代:L234A、L235E及G237A。
在某些實施例中,選擇補體結合減少之Fc。具有減少之補體結合之例示性Fc,例如IgG1 Fc具有以下兩個胺基酸取代:A330S及P331S。
在某些實施例中,選擇基本上不具有效應功能之Fc,亦即其與FcγR之結合減少且補體結合減少。無效應之例示性Fc,例如IgG1 Fc包含以下五個突變:L234A、L235E、G237A、A330S及P331S。
當使用IgG4恆定域時,其可包括取代S228P,其模擬IgG1中之鉸鏈序列且由此使IgG4分子穩定。
亦可使用WO 2017/087678或WO2016081746中所描述之Fc修飾。
在某些實施例中,抗體之糖基化經修改。舉例而言,可產生非糖基化抗體(亦即,缺乏糖基化之抗體)。可改變糖基化以例如增加抗體對抗原之親和力。此類碳水化合物修飾可藉由例如改變抗體序列內之一或多個糖基化位點來實現。舉例而言,可進行一或多個胺基酸取代,從而排除一或多個可變區構架糖基化位點,以藉此消除彼位點之糖基化。此類非糖基化可增加抗體對抗原之親和力。此方法進一步詳細描述於Co等人之美國專利第5,714,350號及第6,350,861號中。
N297上恆定區之糖基化可藉由使N297殘基突變為例如N297A之另一殘基,及/或藉由使例如298之相鄰胺基酸突變來阻止,由此降低N297上之糖基化。
另外地或替代地,可產生糖基化類型改變之抗體,諸如岩藻糖基殘基量降低之低岩藻糖基化抗體或等分GlcNac結構增加之抗體。已證實此類改變之糖基化模式會提高抗體之ADCC能力。此類碳水化合物修飾可藉由例如在糖基化機制改變之宿主細胞中表現抗體來實現。糖基化機制改變之細胞已描述於此項技術中,且可用作表現本文所描述之重組抗體以藉此產生糖基化改變之抗體的宿主細胞。舉例而言,Hanai等人之EP 1,176,195描述一種細胞株,其中編碼岩藻糖基轉移酶之FUT8基因在功能上被破壞,使得此細胞株中所表現之抗體展現低岩藻糖基化。Presta之PCT公開案WO 03/035835描述一種變異CHO細胞株Led 3細胞,其使岩藻糖連接至Asn(297)所連接碳水化合物之能力降低,亦導致該宿主細胞中所表現之抗體發生低岩藻糖基化(亦參見Shields, R.L.等人, (2002)J. Biol. Chem . 277:26733-26740)。Umana等人之PCT公開案WO 99/54342描述一種細胞株,其經工程改造以表現醣蛋白修飾之糖基轉移酶{例如β(1,4)-N-乙醯葡萄糖胺基轉移酶III (GnTIII)),使得在經工程改造之細胞株中表現的抗體展現增加之等分GlcNac結構,引起抗體之ADCC活性增加(亦參見Umana等人(1999)Nat. Biotech. 17:176-180)。
本文所描述之抗體之另一修飾為聚乙二醇化。抗體可經聚乙二醇化以例如延長抗體之生物(例如血清)半衰期。為使抗體發生聚乙二醇化,通常使抗體或其片段與聚乙二醇(PEG)(諸如PEG之反應性酯或醛衍生物)在使一或多個PEG基團連接至抗體或抗體片段的條件下反應。在一些實施例中,聚乙二醇化經由與反應性PEG分子(或類似反應性水溶性聚合物)之醯化反應或烷基化反應進行。如本文所用,術語「聚乙二醇」意欲涵蓋已用於衍生得到其他蛋白質之任一種PEG形式,諸如單(CI-CIO)烷氧基-或芳氧基-聚乙二醇或聚乙二醇-順丁烯二醯亞胺。在某些實施例中,待聚乙二醇化之抗體為去糖基化抗體。蛋白質聚乙二醇化方法為此項技術中已知且可應用於本文所描述之抗體。參見例如Nishimura等人之EP 0 154 316及Ishikawa等人之EP 0 401 384。
本文中之特定例示性抗體實施例進一步列舉於以下部分中。與抗體 21D9.e 相關之實施例:
實施例1:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體(「Ab」),其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL。
實施例2:結合於人類ILT4之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該抗體例如刺激T細胞活化(或加強T細胞反應),(i)在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中,如例如藉由增強之T細胞增殖或IFN-γ分泌或TNF-α產生所證明,或(ii)在T細胞:CHO-OKT3-ILT4分析中(例如如實例5中所描述)。
實施例3:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab在單核球:T細胞同種異體MLR中增強T細胞活化。
實施例4:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab在巨細胞病毒(CMV)溶胞物分析中增強在抗原刺激後自PBMC之IFN-γ分泌。
實施例5:一種結合於人類ILT4之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該抗體加強自巨噬細胞,例如經分化巨噬細胞之TNF-α分泌。
實施例6:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該抗體增加CD83及/或CD86於單核球衍生之樹突狀細胞(MoDC)上之表現。
實施例7:一種結合於人類ILT4之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該抗體抑制hILT4與T細胞及/或結合搭配物(例如HLA-A及/或HLA-B)之結合。
實施例8:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab結合於hILT4之Ig樣域2及/或hILT4之包含(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121)及/或70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122)的區域,如藉由HDX所測定。
實施例9:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab抑制包含有包含SEQ ID NO:13之HC及包含SEQ ID NO:11之輕鏈的抗體(或與其競爭)與hILT4之結合及/或抑制包含21D9.IgG1及/或21D9.e.IgG1.3之VH及VL的抗體與hILT4之結合。
實施例10:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab以10-8 M或10-9 M或更低之KD結合於hILT4。
實施例11:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab以10-7 M或10-8 M或更低之KD結合於食蟹獼猴ILT4及/或促進CD80、CD83及/或CD86於食蟹獼猴單核球衍生之樹突狀細胞上之表現。
實施例12:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab不顯著結合於人類蛋白質LILRA1、LILRA2、LILRA3、LILRA4、LILRA6、ILT2、ILT3、ILT5或LIR8。
實施例13:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab促進巨噬細胞向M1巨噬細胞之促炎性極化。
實施例14:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化。
實施例15:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中包含該Ab之組合物在於25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質,及/或在於40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。
實施例16:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL,其中該Ab包含IgG重鏈恆定區,例如IgG1 (例如SEQ ID NO:98或102)、IgG1.1f (SEQ ID NO:103)、IgG1.3 (SEQ ID NO:100)、IgGP238K (SEQ ID NO:104)、IgG4或IgG4.S228P (SEQ ID NO:179)。
實施例17:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:13之重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例18:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含:兩個重鏈,各重鏈包含SEQ ID NO:13;及兩個輕鏈,各輕鏈包含SEQ ID NO:11,其中視情況,重鏈中之一者或兩者包含C端離胺酸。
實施例19:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:13之重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈,其中視情況,該重鏈包含C端離胺酸,且其中該Ab包含至少一個連接重鏈之二硫鍵。
實施例20:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:176之重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例21:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:177之重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例22:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:178之重鏈及包含SEQ ID NO:11之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例23:一種編碼如實施例1至22中任一項之抗體的經分離核酸或核酸集合。
實施例24:一種用於產生實施例1至22之抗體中之任一者的宿主細胞,例如包含如實施例23之經分離核酸或核酸集合。
實施例25:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之如實施例1至22中任一項之抗體或結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3;(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL;及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:13且輕鏈包含SEQ ID NO:11。
實施例26:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之: (A)(1)如實施例1至19中任一項之抗體或(2)結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3;(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL;及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:13且輕鏈包含SEQ ID NO:11,及 (B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1之拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗(pembrolizumab)、賽咪單抗(cemiplimab)、特瑞普利單抗(toripalimab)、辛替單抗(sintilimab)、阿特珠單抗(atezolizumab)、德瓦魯單抗(durvalumab)或阿維魯單抗。
實施例27:一種組合物,其包含: (A)(1)如實施例1至19中任一項之抗體或(2)結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:155、156及157之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:158、159及160之VL CDR1、CDR2及CDR3;(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:80之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:70之VL;及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:13且輕鏈包含SEQ ID NO:11,及 (B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1之拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗、賽咪單抗、特瑞普利單抗、辛替單抗、阿特珠單抗、德瓦魯單抗或阿維魯單抗。
與抗體 21D5.a 相關之實施例:
實施例1:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL。
實施例2:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該抗體刺激T細胞活化(或加強T細胞反應),例如(i)在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中,如例如藉由增強之T細胞增殖或IFN-γ分泌或TNF-α產生所證明,或(ii)在T細胞:CHO-OKT3-ILT4分析中(例如如實例5中所描述)。
實施例3:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab在單核球:T細胞同種異體MLR中增強T細胞活化。
實施例4:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab在CMV溶胞物分析中增強在抗原刺激後自PBMC之IFN-γ分泌。
實施例5:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該抗體加強自巨噬細胞,例如經分化巨噬細胞之TNF-α分泌。
實施例6:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該抗體增加CD83及/或CD86於單核球衍生之樹突狀細胞(Mo-DC)上之表現。
實施例7:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該抗體抑制hILT4與T細胞及/或結合搭配物(例如HLA-A及/或HLA-B)之結合。
實施例8:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab結合於hILT4之Ig樣域2及/或hILT4之區域,包含:154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),如藉由HDX所測定。
實施例9:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab抑制包含有分別包含SEQ ID NO:13或17之HC及包含SEQ ID NO:11或16之輕鏈的抗體(或與其競爭)與hILT4之結合及/或抑制包含21D5或21D5.a之VH及VL的抗體與hILT4之結合。
實施例10:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab以10-8 M或10-9 M或更低之KD結合於hILT4。
實施例11:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab以10-7 M或10-8 M或更低之KD結合於食蟹獼猴ILT4及/或促進CD80、CD83及/或CD86於食蟹獼猴單核球衍生之樹突狀細胞上之表現。
實施例12:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab不顯著結合於人類蛋白質LILRA1、LILRA2、LILRA4、LILRA5、LILRA6、ILT2、ILT3、ILT5或LIR8。
實施例13:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab促進巨噬細胞向M1巨噬細胞之促炎性極化。
實施例14:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化。
實施例15:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中包含該Ab之組合物在於25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質,及/或在於40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。
實施例16:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,其中該Ab包含IgG重鏈恆定區,例如IgG1 (例如SEQ ID NO:98或102)、IgG1.1f (SEQ ID NO:103)、IgG1.3 (SEQ ID NO:100)、IgGP238K (SEQ ID NO:104)、IgG4或IgG4.S228P (SEQ ID NO:179)。
實施例17:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:17之重鏈及包含SEQ ID NO:16之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例18:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含:兩個重鏈,各重鏈包含SEQ ID NO:17;及兩個輕鏈,各輕鏈包含SEQ ID NO:16,其中視情況,重鏈中之一者或兩者包含C端離胺酸。
實施例19:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:17之重鏈及包含SEQ ID NO:16之輕鏈,其中視情況,該重鏈包含C端離胺酸,且其中該Ab包含至少一個連接重鏈之二硫鍵。
實施例20:一種編碼如實施例1至19中任一項之抗體的經分離核酸或核酸集合。
實施例21:一種用於產生實施例1至19之抗體中之任一者的宿主細胞,例如包含如實施例20之經分離核酸或核酸集合。
實施例22:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:17且輕鏈包含SEQ ID NO:16。
實施例23:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之:(A)結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:17且輕鏈包含SEQ ID NO:16,及(B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1在拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗、賽咪單抗、特瑞普利單抗、辛替單抗、阿特珠單抗、德瓦魯單抗或阿維魯單抗。
實施例24:一種組合物,其包含(A)結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:161、162及163之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:164、165及166之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:87之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:86之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:17且輕鏈包含SEQ ID NO:16,及(B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1之拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗、賽咪單抗、特瑞普利單抗、辛替單抗、阿特珠單抗、德瓦魯單抗或阿維魯單抗。
與抗體 10F10 10F10.1 10F10.3 10F10.4 相關之實施例
實施例1:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL。
實施例2:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該抗體刺激T細胞活化(或加強T細胞反應),例如(i)在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中,如例如藉由增強之T細胞增殖或IFN-γ分泌或TNF-α產生所證明,或(ii)在T細胞:CHO-OKT3-ILT4分析中(例如如實例5中所描述)。
實施例3:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab在單核球:T細胞同種異體MLR中增強T細胞活化。
實施例4:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab在CMV溶胞物分析中增強在抗原刺激後自PBMC之IFN-γ分泌。
實施例5:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該抑制hILT4與T細胞及/或與結合搭配物(例如HLA-A及/或HLA-B)之結合。
實施例6:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該抗體加強自巨噬細胞,例如經分化巨噬細胞之TNF-α分泌。
實施例7:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該抗體增加CD83及/或CD86於單核球衍生之樹突狀細胞(MoDC)上之表現。
實施例8:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該抗體
實施例9:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab結合於hILT4之區域,包含Ig樣域1及2,且尤其結合於區域(i)70 ITRIRPEL77 (SEQ ID NO:120)及/或78 VKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:121);(ii)70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122);或(iii)154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123)及/或425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124),如藉由HDX所測定。
實施例10:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab抑制包含有分別包含SEQ ID NO:13或17之HC及包含SEQ ID NO:11或16之輕鏈的抗體(或與其競爭)與hILT4之結合及/或抑制包含10F10、10F10.1、10F10.3及/或10F10.4之VH及VL的抗體與hILT4之結合。
實施例11:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab以10-8 M或10-9 M或更低之KD結合於hILT4。
實施例12:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab以10-7 M或10-8 M或更低之KD結合於食蟹獼猴ILT4及/或促進CD80、CD83及/或CD86於食蟹獼猴單核球衍生之樹突狀細胞上之表現。
實施例13:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab促進巨噬細胞向M1巨噬細胞之促炎性極化。
實施例14:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab不誘導(或觸發)嗜鹼性球活化。
實施例15:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中包含該Ab之組合物在於25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質,及/或在於40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。
實施例16:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab不顯著結合於人類蛋白質LILRA1、LILRA2、LILRA3、LILRA4、LILRA5、LILRA6、ILT2、ILT3、ILT5或LIR8。
實施例17:一種結合於人類ILT4 (hILT4)之經分離抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,其中該Ab包含IgG重鏈恆定區,例如IgG1 (例如SEQ ID NO:98或102)、IgG1.1f (SEQ ID NO:103)、IgG1.3 (SEQ ID NO:100)、IgGP238K (SEQ ID NO:104)、IgG4或IgG4.S228P (SEQ ID NO:179)。
實施例18:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:19之重鏈及包含SEQ ID NO:18、20、21或116之輕鏈,其中視情況,重鏈包含C端離胺酸。
實施例19:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含包含SEQ ID NO:19之重鏈及包含SEQ ID NO:18、20、21或116之輕鏈,其中視情況,重鏈中之一者或兩者包含C端離胺酸。
實施例20:一種結合於hILT4之經分離抗體,其中該Ab包含有包含SEQ ID NO:19之重鏈及包含SEQ ID NO:18、20、21或116之輕鏈,其中視情況,該重鏈包含C端離胺酸,且其中該Ab包含至少一個連接重鏈之二硫鍵。
實施例21:一種編碼如實施例1至20中任一項之抗體的經分離核酸或核酸集合。
實施例22:一種用於產生實施例1至20之抗體中之任一者的宿主細胞,例如包含如實施例21之經分離核酸或核酸集合。
實施例23:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:19且輕鏈包含SEQ ID NO:18、20、21或116。
實施例24:一種治療個體之癌症之方法,其包含向該個體投與治療有效劑量之結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:19且輕鏈包含SEQ ID NO:18、20、21或116,及(B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1在拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗、賽咪單抗、特瑞普利單抗、辛替單抗、阿特珠單抗、德瓦魯單抗或阿維魯單抗。
實施例25:一種組合物,其包含(A)結合於人類ILT4 (hILT4)之抗體,其中該Ab包含重鏈及輕鏈,其中(i)重鏈包含有分別包含SEQ ID NO:167、168及169之VH CDR1、CDR2及CDR3,且輕鏈包含有分別包含SEQ ID NO:170、171及172之VL CDR1、CDR2及CDR3,及/或(ii)重鏈包含有包含SEQ ID NO:91之VH且輕鏈包含有包含SEQ ID NO:90、94、96或114之VL,及/或(iii)重鏈包含SEQ ID NO:19且輕鏈包含SEQ ID NO:18、20、21或116,及(B)PD-1或PD-L1之拮抗劑,諸如結合於人類PD-1或人類PD-L1之拮抗劑抗體,例如納武單抗、派立珠單抗、賽咪單抗、特瑞普利單抗、辛替單抗、阿特珠單抗、德瓦魯單抗或阿維魯單抗。核酸及宿主細胞
亦提供編碼抗體或其重鏈或輕鏈或其部分之核酸。例示性核酸提供於序列表中。本文中涵蓋與序列表中之核酸至少80%、85%、90%、95%、97%、98%或99%一致之任何核酸。亦涵蓋包含編碼本文所提供之抗體之核酸的組合物,亦涵蓋包含此等組合物之細胞及用於製備抗體之方法,該等方法包含培養經編碼ILT4抗體之核酸轉型的細胞及自培養基或細胞分離抗體。使用 ILT4 結合 Ab 治療方法及相關醫藥組合物
本文所描述之抗體可用於例如治療癌症。在一些實施例中,提供治療癌症之方法,其包含向患者投與有效量之本文所描述之抗體。在一些實施例中,Ab可觸發或增強患者之免疫反應,諸如抗原特異性免疫反應。在一些實施例中,Ab可刺激T細胞活性。在一些實施例中,Ab可抑制患者之至少一個腫瘤之生長。
本文提供治療患有癌症之個體的方法,其包含向個體投與治療有效量之本文所描述之ILT4抗體,從而治療個體。ILT4抗體可單獨使用。或者,ILT4抗體可結合如下文進一步描述之另一藥劑使用。
癌症可為具有實體腫瘤或血液惡性病(液體腫瘤)之癌症。
治療之癌症之非限制性實例包括鱗狀細胞癌(squamous cell carcinoma)、小細胞肺癌(small-cell lung cancer)、非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer)、鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)、非鱗狀NSCLC、神經膠質瘤、胃腸癌、腎癌(例如透明細胞癌瘤)、卵巢癌、肝癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、腎臟癌(例如腎細胞癌(renal cell carcinoma;RCC))、前列腺癌(例如激素性難治性前列腺癌(hormone refractory prostate adenocarcinoma))、甲狀腺癌、神經母細胞瘤、胰臟癌、神經膠母細胞瘤(多形性神經膠母細胞瘤)、子宮頸癌、胃癌(stomach cancer)、膀胱癌、肝腫瘤、乳癌、結腸癌及頭頸癌(或癌瘤);胃癌(gastric cancer)、生殖細胞腫瘤、兒科肉瘤(pediatric sarcoma)、鼻腔鼻竇自然殺手(sinonasal natural killer)、黑素瘤(例如轉移性惡性黑素瘤,諸如皮膚或眼內惡性黑素瘤)、骨癌、皮膚癌、子宮癌、肛門區癌(cancer of the anal region)、睪丸癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌瘤、陰道癌瘤、外陰癌瘤、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、兒童實體腫瘤、尿管癌、腎盂癌瘤、中樞神經系統(CNS)贅瘤、原發性CNS淋巴瘤、腫瘤血管生成(tumor angiogenesis)、脊椎腫瘤(spinal axis tumor)、腦癌、腦幹神經膠質瘤、垂體腺瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi 's sarcoma)、表皮樣癌(epidermoid cancer)、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境誘發之癌症(包括由石棉誘發之彼等癌症)、病毒相關癌症或病毒性來源之癌症(例如人類乳頭狀瘤病毒(HPV-相關或HPV引起之腫瘤))及來源於兩個主要血球譜系(亦即骨髓細胞株(其產生粒細胞、紅血球、血小板、巨噬細胞及肥大細胞)或淋巴細胞株(其產生B、T、NK及漿細胞))中之任一者的血液科惡性病,諸如所有類型之白血病、淋巴瘤及骨髓瘤,例如急性、慢性、淋巴球性及/或骨髓性白血病,諸如急性白血病(ALL)、急性骨髓白血病(AML)、慢性淋巴球性白血病(CLL)及慢性骨髓性白血病(CML)、未分化AML(MO)、骨髓母細胞白血病(myeloblastic leukemia)(M1)、骨髓母細胞白血病(M2;細胞成熟)、前髓細胞性白血病(promyelocytic leukemia)(M3或M3變化形式[M3V])、骨髓單核球性白血病(myelomonocytic leukemia)(含嗜酸性球增多症(eosinophilia)之M4或M4變化形式[M4E])、單核球性白血病(M5)、紅血球性白血病(erythroleukemia)(M6)、巨核母細胞白血病(megakaryoblastic leukemia)(M7)、分離之粒細胞肉瘤及綠色瘤(chloroma);淋巴瘤,諸如霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin 's lymphoma;HL)、非霍奇金氏淋巴瘤(non - Hodgkin 's lymphoma;NHL)、B細胞惡性血液病(例如B細胞淋巴瘤)、T細胞淋巴瘤、淋巴漿細胞樣淋巴瘤(lymphoplasmacytoid lymphoma)、單核球樣B細胞淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織(MALT)淋巴瘤、多形性(例如Ki 1+)大細胞淋巴瘤(anaplastic large-cell lymphoma)、成人T細胞淋巴瘤/白血病(adult T-cell lymphoma)、套細胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma)、血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤(angio immunoblastic T-cell lymphoma)、血管中心性淋巴瘤(angiocentric lymphoma)、腸道T細胞淋巴瘤、原發性縱隔B細胞淋巴瘤(primary mediastinal B-cell lymphoma)、前驅體T淋巴母細胞淋巴瘤(precursor T-lymphoblastic lymphoma)、T淋巴母細胞淋巴瘤/白血病(T-Lbly/T-ALL)、周邊T細胞淋巴瘤(peripheral T-cell lymphoma)、淋巴母細胞淋巴瘤、移植後淋巴增生病(post-transplantation lymphoproliferative disorder)、真性組織細胞淋巴瘤(true histiocytic lymphoma)、原發性中樞神經系統淋巴瘤(primary central nervous system lymphoma)、原發性滲出性淋巴瘤(primary effusion lymphoma)、B細胞淋巴瘤、淋巴母細胞淋巴瘤(LBL)、淋巴譜系之造血性腫瘤、急性淋巴母細胞白血病、彌漫性大型B細胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt 's lymphoma)、濾泡性淋巴瘤(follicular lymphoma)、彌漫性組織細胞淋巴瘤(diffuse histiocytic lymphoma;DHL)、免疫母細胞大細胞淋巴瘤(immunoblastic large cell lymphoma)、前驅體B淋巴母細胞淋巴瘤(precursor B-lymphoblastic lymphoma)、皮膚T細胞淋巴瘤(cutaneous T-cell lymphoma;CTLC)(亦被稱作蕈樣黴菌病(mycosis fungoides)或塞紮萊症候群(Sezary syndrome))及含瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血症(Waldenstrom 's macroglobulinemia)之淋巴漿細胞樣淋巴瘤(LPL);骨髓瘤,諸如IgG骨髓瘤、輕鏈骨髓瘤(light chain myeloma)、非分泌性骨髓瘤(nonsecretory myeloma)、和緩性骨髓瘤(smoldering myeloma)(亦被稱作惰性骨髓瘤)、孤立性漿細胞瘤(solitary plasmocytoma)及多發性骨髓瘤、慢性淋巴球性白血病(CLL)、毛細胞淋巴瘤(hairy cell lymphoma);骨髓譜系之造血性腫瘤、間葉細胞來源之腫瘤,包括纖維肉瘤(fibrosarcoma)及橫紋肌肉瘤(rhabdomyoscarcoma);精原細胞瘤(seminoma)、畸胎上皮癌(teratocarcinoma)、中心及外周神經腫瘤(包括星形細胞瘤(astrocytoma)、神經鞘瘤(schwannomas));間葉細胞來源之腫瘤,包括纖維肉瘤、橫紋肌肉瘤及骨肉瘤;及其他腫瘤,包括黑素瘤、著色性乾皮病(xeroderma pigmentosum)、角化棘皮瘤(keratoacanthoma)、精原細胞瘤、甲狀腺濾泡癌及畸胎上皮癌;淋巴譜系之造血性腫瘤,例如T細胞及B細胞腫瘤,包括(但不限於)諸如T前淋巴球性白血病(T-PLL)之T細胞病症,包括小細胞及腦細胞類型;T細胞類大顆粒淋巴球性白血病(large granular lymphocyte leukemia;LGL);a/d T-NHL肝脾淋巴瘤(a/d T-NHL hepatosplenic lymphoma);胸腺周邊/後T細胞淋巴瘤(peripheral/post-thymic T cell lymphoma)(多形性及免疫母細胞亞型);血管中心性(鼻部)T細胞淋巴瘤;頭頸癌症、腎癌、直腸癌、甲狀腺癌;急性骨髓淋巴瘤;以及該等癌症之任何組合。本文所描述之方法亦可用於治療轉移性癌症、不可切除之難治性癌症(例如難以用先前免疫療法,例如用阻斷CTLA-4或PD-1抗體治療之癌症)及/或復發性癌症。
在某些實施例中,向患有展現對先前治療之不充分反應或有進展之癌症之患者投與本文所描述之抗體,該先前治療係例如使用免疫腫瘤學或免疫療法藥物之先前治療。在一些實施例中,癌症具難治性或對先前治療有抗性,固有難治性或抗性(例如難以用PD-1路徑拮抗劑治療)或獲得性抗性或難治性狀態。舉例而言,可向對第一療法無反應或反應不充分或在例如單獨的或與另一療法(例如與抗PD-1路徑拮抗劑療法)組合的抗PD-1路徑拮抗劑治療之治療後具有疾病進展之個體投與本文所描述之抗體。在其他實施例中,向先前未接受腫瘤免疫劑(例如PD-1路徑拮抗劑)(亦即用其治療)之患者投與本文所描述之抗體。與免疫刺激劑之組合
在一些實施例中,如本文所描述之抗體,例如本文所描述之ILT4抗體與至少一種免疫刺激劑組合投與。舉例而言,治療劑可一起輸注或在大致相同的時間注射。在一些實施例中,依序投與抗體及至少一種免疫刺激劑。舉例而言,在一些實施例中,在至少一種免疫刺激劑之前或之後依序投與抗體,以使得兩種治療劑相隔30分鐘、60分鐘、90分鐘、120分鐘、3小時、6小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、5天、7天或兩週投與。
在一些實施例中,在投與至少一種免疫刺激劑之前,投與至少一次、至少兩次、至少三次劑量、至少五次劑量或至少十次劑量之抗體。在一些實施例中,在投與抗體之前,投與至少一次、至少兩次、至少三次劑量、至少五次劑量或至少十次劑量之至少一種免疫刺激劑。在一些實施例中,在投與第一劑量之抗體,最後一次劑量之免疫刺激劑經投與至少一、二、三、五天或十天,或一、二、三、五、十二或二十四週。在一些實施例中,在投與第一劑量之至少一種免疫刺激劑之前,最後一次劑量之抗體經投與至少一、二、三、五天或十天、或一、二、三、五、十二或二十四週。在一些實施例中,個體已接受或正接受使用至少一種免疫刺激劑之療法,且將ILT4抗體添加至治療方案。
在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含諸如T細胞之免疫細胞之活化抑制劑之拮抗劑,而在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含諸如T細胞之免疫細胞之活化刺激劑之促效劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含CTLA4、LAG-3、PD-1、PD-L1、半乳糖凝集素1、半乳糖凝集素9、CEACAM-1、BTLA、CD25、CD69、TIGIT、CD113、GPR56、VISTA、B7-H3、B7-H4、2B4、CD48、GARP、PD1H、LAIR1、TIM1、TIM3、TIM4、IL-6、IL-10、TGFβ、VEGF、KIR、腺苷A2A受體、PI3Kδ或IDO之拮抗劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含B7-1、B7-2、CD28、4-1BB (CD137)、4-1BBL、ICOS、ICOS-L、OX40、OX40L、GITR、GITRL、CD27、CD40、CD40L、DR3、CD28H、IL-2、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21、IFNα、STING之促效劑,或鐸樣受體促效劑,諸如TLR2/4促效劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含結合於膜結合蛋白B7家族之另一成員(諸如B7-1、B7-2、B7-H2 (ICOS-L)、B7-H3、B7-H4及B7-H6)的藥劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含結合於TNF受體家族成員的藥劑或結合於TNF受體家族成員的共刺激或共抑制分子,該TNF受體家族成員係諸如CD40、CD40L、OX40、OX40L、GITR、GITRL、CD70、CD27L、CD30、CD30L、4-1BBL、CD137 (4-1BB)、TRAIL/Apo2-L、TRAILR1/DR4、TRAILR2/DR5、TRAILR3、TRAILR4、OPG、RANK、RANKL、TWEAKR/Fn14、TWEAK、BAFFR、EDAR、XEDAR、EDA1、EDA2、TACI、APRIL、BCMA、LTβR、LIGHT、DeR3、HVEM、VEGL/TL1A、TRAMP/DR3、TNFR1、TNFβ、TNFR2、TNFα、1β2、FAS、FASL、RELT、DR6、TROY或NGFβ。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含拮抗或抑制對T細胞活化進行抑制之細胞介素(諸如IL-6、IL-10、TGFβ、VEGF)的藥劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含刺激T細胞活化之細胞介素(諸如IL-2、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21及IFNα)的促效劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含趨化細胞素(諸如CXCR2、CXCR4、CCR2或CCR4)之拮抗劑。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑包含抗體。在一些實施例中,至少一種免疫刺激劑可包含疫苗,諸如間皮素靶向疫苗或減毒的李斯特菌(listeria)癌症疫苗,諸如CRS-207。
舉例而言,本文所描述之ILT4抗體可與以下藥劑中之一或多者一起投與:
(1)抑制T細胞活化之蛋白質之拮抗劑(抑制劑或阻斷劑) (例如免疫檢查點抑制劑),諸如CTLA-4、PD-1、PD-L1、PD-L2及LAG-3、半乳糖凝集素9、CEACAM-1、BTLA、CD69、半乳糖凝集素-1、TIGIT、CD113、GPR56、B7-H3、B7-H4、2B4、CD48、GARP、PD1H、LAIR1、TIM-1、TIM-3及TIM-4;及/或(2)刺激T細胞活化之蛋白質之促效劑,諸如B7-1、B7-2、CD28、4-1BB (CD137)、4-1BBL、GITR、ICOS、ICOS-L、OX40、OX40L、CD70、CD27、CD40、DR3及CD28H。
可與本文所描述之ILT4抗體組合用於治療癌症的例示性藥劑包括:YERVOY® (伊匹單抗)或曲美單抗(Tremelimumab)(針對CTLA-4)、加利昔單抗(galiximab) (針對B7.1)、BMS-936558 (針對PD-1)、MK-3475 (針對PD-1)、阿特珠單抗(TECENTRIQ® )、阿維魯單抗、德瓦魯單抗、AMP224 (針對B7DC)、BMS-936559 (針對B7-H1)、MPDL3280A (針對B7-H1)、MEDI-570 (針對ICOS)、AMG557 (針對B7H2)、MGA271 (針對B7H3)、IMP321 (針對LAG-3)、BMS-663513 (針對CD137)、PF-05082566 (針對CD137)、CDX-1127 (針對CD27)、抗OX40 (Providence Health Services)、huMAbOX40L (針對OX40L)、阿塞西普(Atacicept) (針對TACI)、CP-870893 (針對CD40)、魯卡木單抗(Lucatumumab) (針對CD40)、達西珠單抗(Dacetuzumab) (針對CD40)、莫羅莫那-CD3 (Muromonab-CD3) (針對CD3);抗GITR抗體MK4166、TRX518、Medi1873、INBRX-110、LK2-145、GWN-323、GITRL-Fc或其任何組合。
可與ILT4抗體組合用於治療癌症之其他分子包括NK細胞上之抑制受體之拮抗劑,或NK細胞上之活化受體之促效劑,例如KIR之拮抗劑(例如利瑞路單抗(lirilumab))。
T細胞活化亦可藉由可溶性細胞介素調節。在一些實施例中,ILT4抗體可與用於抑制T細胞活化之細胞介素之拮抗劑或刺激T細胞活化中細胞介素之促效劑組合投與。舉例而言,ILT4抗體可與以下組合使用:(i)抑制T細胞活化之IgSF家族或B7家族或TNF家族之蛋白質之拮抗劑(或抑制劑或阻斷劑),或抑制T細胞活化之細胞介素(例如IL-6、IL-10、TGF-β、VEGF;「免疫抑制細胞介素」)之拮抗劑及/或(ii) IgSF家族、B7家族或TNF家族之刺激受體或刺激T細胞活化之細胞介素之促效劑。
用於組合療法之其他藥劑包括抑制或耗乏巨噬細胞或單核球之藥劑,包括(但不限於):CSF-1R拮抗劑,諸如CSF-1R拮抗劑抗體,包括RG7155 (WO11/70024、WO11/107553、WO11/131407、W013/87699、W013/119716、WO13/132044)或FPA-008 (WO11/140249、W013169264、WO14/036357)。
ILT4抗體亦可與抑制TGF-β信號傳導之藥劑一起投與。
可與ILT4抗體組合之額外藥劑包括增強腫瘤抗原呈現之藥劑,例如樹突狀細胞疫苗、GM-CSF分泌細胞疫苗、CpG寡核苷酸及咪喹莫特(imiquimod),或增強腫瘤細胞之免疫原性之療法(例如蒽環黴素)。
可與ILT4抗體組合之其他療法包括耗乏或阻斷Treg細胞之療法,例如特異性結合於CD25之藥劑。
可與ILT4抗體組合之另一療法為抑制諸如吲哚胺雙加氧酶(IDO)、雙加氧酶、精胺酸酶或氧化氮合成酶之新陳代謝酶之療法。
可與ILT4抗體一起使用之另一類藥劑包括抑制腺苷形成之藥劑,例如CD73抑制劑,或抑制腺苷A2A受體之藥劑。
可與ILT4抗體組合用於治療癌症之其他療法包括逆轉/防止T細胞無反應性(anergy)或耗竭(exhaustion)之療法及在腫瘤位點處觸發先天性免疫活化及/或發炎之療法。
可與ILT4抗體組合用於治療癌症之其他療法包括例如使用HuMax®-IL8阻斷IL-8之療法。
ILT4抗體可與超過一種腫瘤免疫劑組合且可例如與用於靶向免疫路徑之多個元件的組合方法組合,該組合方法係諸如以下中之一或多者:增強腫瘤抗原呈現之療法(例如樹突狀細胞疫苗、GM-CSF分泌細胞疫苗、CpG寡核苷酸、咪喹莫特);例如藉由抑制CTLA-4及/或PD1/PD-L1/PD-L2路徑及/或耗乏或阻斷Treg或其他免疫抑制細胞來抑制負向免疫調節的療法;例如使用刺激CD-137、OX-40及/或CD40或GITR路徑及/或刺激T細胞效應功能之促效劑來刺激正向免疫調節的療法;全身性提高抗腫瘤T細胞之出現率的療法;例如使用CD25之拮抗劑(例如達利珠單抗)或藉由離體抗CD25珠粒耗乏來耗乏或抑制Treg (諸如腫瘤中之Treg)的療法;影響腫瘤中之抑制因子骨髓細胞之功能的療法;增強腫瘤細胞之免疫原性之療法(例如蒽環黴素);授受性T細胞或NK細胞轉移,包括經基因修飾之細胞,例如由嵌合抗原受體修飾之細胞(CAR-T療法);抑制諸如吲哚胺雙加氧酶(IDO)、雙加氧酶、精胺酸酶或氧化氮合成酶之新陳代謝酶的療法;逆轉/防止T細胞無反應性或耗竭的療法;在腫瘤位點處觸發先天性免疫活化及/或發炎的療法;免疫刺激性細胞介素之投與;或免疫抑制細胞介素之阻斷。
本文所描述之ILT4抗體可與以下中之一或多者一起使用:接合陽性共刺激受體之促效劑;減弱經由抑制受體之信號傳導的阻斷劑;拮抗劑;及全身性提高抗腫瘤T細胞之出現率的一或多種藥劑;克服腫瘤微環境內之不同免疫抑制路徑(例如阻斷抑制性受體接合(例如PD-L1/PD-1相互作用)、耗乏或抑制Treg (例如使用抗CD25單株抗體(例如達利珠單抗)或藉由離體抗CD25珠粒耗盡)、抑制諸如IDO之代謝酶或逆轉/防止T細胞無反應性或耗竭)的藥劑;及在腫瘤位點處觸發先天性免疫活化及/或發炎的藥劑。
在某些實施例中,若個體為BRAF V600突變陽性的,則向個體投與ILT4抗體以及BRAF抑制劑。
適用於本文所描述之組合療法的PD-1拮抗劑包括(但不限於)配體、抗體(例如單株抗體及雙特異性抗體)及多價藥劑。在一個實施例中,PD-1拮抗劑為融合蛋白,例如Fc融合蛋白,諸如AMP-244。在一個實施例中,PD-1拮抗劑為抗PD-1或抗PD-L1抗體。
例示性抗PD-1抗體為納武單抗(BMS-936558)或WO 2006/121168中所描述之包含抗體17D8、2D3、4H1、5C4、7D3、5F4及4A11中之一者的CDR或可變區的抗體。在某些實施例中,抗PD-l抗體為WO2012/145493中所描述之MK-3475 (拉立珠單抗(Lambrolizumab));WO 2012/145493中所描述之AMP-514;或PDR001。其他已知之PD-1抗體及其他PD-1抑制劑包括WO 2009/014708、WO 03/099196、WO 2009/114335、WO 2011/066389、WO 2011/161699、WO 2012/145493、美國專利第7,635,757號及第8,217,149號以及美國專利公開案第2009/0317368號中所描述之PD-1抗體及PD-1抑制劑。亦可使用WO2013/173223中所揭示之任一抗PD-1抗體。與此等抗體中之一者競爭結合及/或結合於與此等抗體中之一者相同的PD-1上之抗原決定基的抗PD-L1抗體亦可用於組合治療中。
在一些實施例中,適用於組合療法之抗PD-L1抗體為BMS-936559 (在WO 2007/005874及美國專利第7,943,743號中稱為12A4),或包含3G10、12A4、10A5、5F8、10H10、1B12、7H1、11E6、12B7及13G4之CDR或可變區之抗體,其描述於PCT公開案WO 07/005874及美國專利第7,943,743號中。在某一實施例中,抗PD-L1抗體為MEDI4736 (亦稱為德瓦魯單抗及抗B7-H1)、MPDL3280A (亦稱為阿特珠單抗及RG7446)、MSB0010718C (亦稱為阿維魯單抗;WO2013/79174)或rHigM12B7。亦可使用WO2013/173223、WO2011/066389、WO2012/145493、美國專利第7,635,757號及第8,217,149號及美國公開案第2009/145493號中所揭示之任一抗PD-L1抗體。與任一此等抗體競爭及/或結合於與任一此等抗體相同之抗原決定基的抗PD-L1抗體亦可用於組合治療中。
在某些實施例中,本發明之ILT4抗體可與CTLA-4拮抗劑(例如抗CTLA-4抗體)一起使用。在一個實施例中,抗CTLA-4抗體為選自以下之群的抗體:YERVOY® (伊匹單抗或抗體10D1,描述於PCT公開案WO 01/14424中)、曲美單抗(先前之替西單抗(ticilimumab),CP-675,206)、以下公開案中之任一者中所描述之單株抗體或抗CTLA-4抗體:WO 98/42752;WO 00/37504;美國專利第6,207,156號;Hurwitz等人 (1998)Pro. Natl. Acad. Sci . USA 95(17):10067-10071;Camacho等人 (2004)J. Clin. Oncology 22(145):Abstract No. 2505 (抗體CP-675206);及Mokyr等人 (1998)Cancer Res . 58:5301-5304。亦可使用WO2013/173223中所揭示之任一抗CTLA-4抗體。
在一些實施例中,本發明之ILT4抗體與LAG3拮抗劑組合使用。抗LAG3抗體之實例包括包含美國專利公開案第US 2011/0150892號、第WO10/19570號及第WO2014/008218號中所描述之抗體25F7、26H10、25E3、8B7、11F2或17E5之CDR或可變區的抗體。在一個實施例中,抗LAG-3抗體為BMS-986016。可使用之其他領域公認之抗LAG-3抗體包括US 2011/007023、WO08/132601及WO09/44273中所描述之IMP731及IMP-321。與任一此等抗體競爭及/或結合於與任一此等抗體相同之抗原決定基的抗LAG-3抗體亦可用於組合治療中。
在一些實施例中,本發明之ILT4抗體可與CD137 (4-1BB)促效劑(諸如促效性CD137抗體)組合投與。適合的CD137抗體包括例如優瑞路單抗(urelumab)及PF-05082566 (W012/32433)。
在一些實施例中,ILT4抗體可與OX40促效劑(諸如促效性OX40抗體)組合投與。適合的OX40抗體包括例如MEDI-6383、MEDI-6469或MOXR0916 (RG7888;WO06/029879)。
在一個實施例中,ILT4抗體與CD40促效劑(諸如促效性CD40抗體)組合投與。在某些實施例中,腫瘤免疫劑為CD40拮抗劑,諸如拮抗性CD40抗體。適合的CD40抗體包括例如魯卡木單抗(HCD122)、達西珠單抗(SGN-40)、CP-870,893或Chi Lob 7/4。
在一個實施例中,ILT4抗體與CD27促效劑(諸如促效性CD27抗體)組合投與。適合的CD27抗體包括例如瓦里木單抗(varlilumab)(CDX-1127)。
在某些實施例中,ILT4抗體係與抗GITR抗體一起投與,抗GITR抗體係例如具有6C8之CDR序列的抗體,例如具有6C8之CDR的人類化抗體,如例如WO2006/105021中所描述;WO2011/028683中所描述之包含抗GITR抗體之CDR的抗體;JP2008278814中所描述之包含抗GITR抗體之CDR的抗體;WO2015/031667、WO2015/187835、WO2015/184099、WO2016/054638、WO2016/057841或WO2016/057846中所描述之包含抗GITR抗體之CDR的抗體;或本文中描述或提及之其他抗GITR抗體。
在一些實施例中,ILT4抗體與MGA271 (針對B7H3)(WO11/109400)組合投與。
在一些實施例中,ILT4抗體與KIR拮抗劑(諸如利瑞路單抗)組合投與。
在一些實施例中,ILT4抗體與IDO拮抗劑組合投與。適合的IDO拮抗劑包括例如INCB-024360 (WO2006/122150、WO07/75598、WO08/36653、WO08/36642)、因多莫得(indoximod)、NLG-919 (WO09/73620、WO09/1156652、WO11/56652、WO12/142237)或F001287。
在一些實施例中,ILT4抗體與鐸樣受體促效劑組合投與,該鐸樣受體促效劑係例如TLR2/4促效劑(例如卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin);TLR7促效劑(例如希托洛(Hiltonol)或咪喹莫特);TLR7/8促效劑(例如雷西莫特(Resiquimod));或TLR9促效劑(例如CpG7909)。
在一個實施例中,ILT4與TGF-β抑制劑(例如GC1008、LY2157299、TEW7197或IMC-TR1)組合投與。額外組合療法
本文中之Ab亦可在其他模式之治療(例如手術、化學療法、放射療法)或投與生物製劑(諸如另一治療性抗體)之前、基本上同時或之後提供。在一些實施例中,癌症在選自手術、化學療法及放射療法或其組合之療法之後復發或進展。舉例而言,當存在可存在微小轉移灶之風險時及/或為了降低復發風險,如本文所描述之ILT4抗體可以輔助療法形式投與。
對於癌症治療,組合可結合一或多種額外抗癌劑(諸如化學治療劑、生長抑制劑、抗癌疫苗(諸如基因療法疫苗)、抗血管生成劑及/或抗贅生性組合物)投與。可與本發明之抗體組合使用的化學治療劑、生長抑制劑、抗癌疫苗、抗血管生成劑及抗贅生性組合物之非限制性實例在本文中提供於「定義」下方。
在一些實施例中,消炎藥(諸如類固醇或非類固醇消炎藥(NSAID))可與該組合一起投與。在需要結合使用本文所描述之ILT4抗體之治療或在使用該抗體之治療前使異常增殖細胞休眠的情況下,亦可向患者投與激素及類固醇(包括合成類似物),諸如17a-炔雌醇、己烯雌酚、睪固酮、潑尼松(Prednisone)、氟甲睾酮(Fluoxymesterone)、丙酸屈他雄酮(Dromostanolone propionate)、睾內酯(Testolactone)、甲地孕酮乙酸鹽(Megestrolacetate)、甲基潑尼松龍(Methylprednisolone)、甲基-睪固酮(Methyl-testosterone)、潑尼松龍(Prednisolone)、曲安西龍(Triamcinolone)、氯三芳乙烯(Chlorotrianisene)、羥基孕酮(Hydroxyprogesterone)、胺魯米特(Aminoglutethimide)、雌氮芥(Estramustine)、甲羥孕酮乙酸鹽(Medroxyprogesteroneacetate)、亮丙立德(Leuprolide)、氟他胺(Flutamide)、托瑞米芬(Toremifene)、ZOLADEX® 。當採用本文所描述之方法或組合物時,亦可按需要投與在臨床環境中調節腫瘤生長或轉移所用之其他藥劑,諸如止吐劑。
本文所描述之抗體亦可與免疫原性劑,諸如癌細胞、純化腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞組合(He等人,(2004)J. Immunol ., 173:4919-28)。可使用之腫瘤疫苗的非限制性實例包括黑素瘤抗原之肽,諸如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MART1及/或酪胺酸酶之肽,或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞(下文進一步論述)。
本文所描述之ILT4抗體亦可與疫苗接種方案組合。已設計許多用於針對腫瘤之疫苗接種的實驗策略(參見Rosenberg, S., 2000, Development of Cancer Vaccines, ASCO Educational Book Spring:60-62;Logothetis, C., 2000, ASCO Educational Book Spring:300-302;Khayat, D. 2000, ASCO Educational Book Spring:414-428;Foon, K. 2000, ASCO Educational Book Spring:730-738;亦參見Restifo, N.及Sznol, M., Cancer Vaccines, 第61章, 第3023-3043頁, DeVita, V.等人 (編), 1997, Cancer:Principles and Practice of Oncology. 第五版)。在此等策略中之一者中,使用自體或同種異體腫瘤細胞製備疫苗。已顯示此等細胞疫苗在腫瘤細胞經轉導以表現GM-CSF時最有效。已顯示GM-CSF為用於腫瘤疫苗接種之抗原呈遞之強力活化劑(Dranoff 等人 (1993)Proc. Natl. Acad. Sci .U.S.A . 90:3539-43)。
各種腫瘤中之基因表現及大規模基因表現模式之研究已產生對所謂的腫瘤特異性抗原進行定義(Rosenberg, S A (1999)Immunity 10:281-7)。在許多情況下,此等腫瘤特異性抗原為在腫瘤中及出現腫瘤之細胞中表現的分化抗原,例如黑色素細胞抗原gp100、MAGE抗原及Trp-2。更重要地,可顯示許多此等抗原為宿主中發現之腫瘤特異性T細胞的目標。ILT4抑制可與表現於腫瘤中之一組重組蛋白及/或肽結合使用以便產生針對此等蛋白質之免疫反應。此等蛋白質通常經免疫系統觀測為自抗原且因此對其具耐受性。腫瘤抗原可包括蛋白質端粒酶,其為合成染色體之端粒所需的且表現於大於85%之人類癌症中且僅表現於有限數目之體細胞組織中(Kim等人 (1994)Science 266:2011-2013)。腫瘤抗原亦可為因體細胞突變而在癌細胞中表現之「新抗原」,該等突變改變蛋白質序列或在兩個不相關序列之間產生融合蛋白(亦即,費城染色體中之bcr-abl),或為來自B細胞腫瘤之個體基因型。
其他腫瘤疫苗可包括人類癌症中所牽涉之病毒的蛋白質,該等病毒係諸如人類乳頭狀瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV及HCV)及卡波西氏疱疹肉瘤病毒(KHSV)。可結合ILT4 Ab使用之另一形式之腫瘤特異性抗原為自腫瘤組織自身分離之純化熱休克蛋白(HSP)。此等熱休克蛋白含有來自腫瘤細胞之蛋白質片段且此等HSP高效遞送至抗原呈遞細胞以引發腫瘤免疫性(Suot及Srivastava (1995)Science 269:1585-1588;Tamura等人 (1997)Science 278:117-120)。
樹突狀細胞(DC)為可用於引發抗原特異性反應之強力抗原呈現細胞。DC可離體產生且負載有各種蛋白質及肽抗原以及腫瘤細胞提取物(Nestle等人(1998)Nature Medicine 4:328-332)。DC亦可藉由基因方法轉導以亦表現此等腫瘤抗原。DC亦已出於免疫接種之目的而與腫瘤細胞直接融合(Kugler等人 (2000)Nature Medicine 6:332-336)。作為一種疫苗接種方法,DC免疫接種可與ILT4抑制組合以活化更強力之抗腫瘤反應。傳染病治療
本文所描述之方法亦可用於治療已暴露於特定毒素或病原體之患者。因此,本發明亦涵蓋治療個體之傳染病之方法,其包含向個體投與如本文所描述之抗體,例如ILT4抗體,從而治療個體之傳染病。類似於其如上文所論述之針對腫瘤之應用,抗體介導之ILT4抑制可單獨的或以佐劑形式與疫苗組合使用,以刺激對病原體、毒素及自抗原之免疫反應。此治療方法可能尤其適用之病原體之實例包括當前無有效疫苗之病原體,或習知疫苗不完全有效之病原體。此等病原體包括(但不限於)HIV、肝炎(A、B及C)、流感、疱疹、梨形鞭毛蟲(Giardia)、瘧疾、利什曼原蟲(Leishmania)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、綠膿桿菌(Pseudomonas Aeruginosa)。ILT4抑制可適用於諸如HIV之在感染過程中呈現改變之抗原的藉由藥劑確定的感染。
引起可藉由本文所描述之方法治療之感染之病原性病毒的一些實例包括HIV、肝炎(A、B或C)、疱疹病毒(例如VZV、HSV-1、HAV-6、HSV-II及CMV、埃-巴二氏病毒(Epstein Barr virus))、腺病毒、流感病毒、黃病毒(flaviviruses)、埃可病毒(echovirus)、鼻病毒(rhinovirus)、科沙奇病毒(coxsackie virus)、冠狀病毒(coronavirus)、呼吸道融合細胞病毒(respiratory syncytial virus)、腮腺炎病毒(mumps virus)、輪狀病毒(rotavirus)、麻疹病毒(measles virus)、風疹病毒(rubella virus)、細小病毒(parvovirus)、痘瘡病毒(vaccinia virus)、HTLV病毒、登革熱病毒(dengue virus)、乳突狀瘤病毒(papillomavirus)、軟疣病毒(molluscum virus)、脊髓灰白質炎病毒(poliovirus)、狂犬病病毒(rabies virus)、JC病毒及蟲媒腦炎病毒(arboviral encephalitis virus)。
引起可藉由本文所描述之方法治療之感染的病原性細菌的一些實例包括披衣菌(chlamydia)、立克次體細菌(rickettsial bacteria)、分枝桿菌(mycobacteria)、葡萄球菌(staphylococci)、鏈球菌(streptococci)、肺炎球菌(pneumonococci)、腦膜炎球菌(meningococci)及淋球菌(conococci)、克雷伯氏菌(klebsiella)、變形桿菌(proteus)、沙雷氏菌(serratia)、假單胞菌(pseudomonas)、軍團桿菌(legionella)、白喉(diphtheria)、沙門氏菌(salmonella)、桿菌(bacilli)、霍亂(cholera)、破傷風(tetanus)、肉毒桿菌症(botulism)、炭疽病(anthrax)、瘟疫(plague)、鉤端螺旋體病(leptospirosis)及萊姆病細菌(Lymes disease bacteria)。
引起可藉由本文所描述之方法治療之感染的病原性真菌之一些實例包括念珠菌(Candida)(白色念珠菌(albicans)、克魯斯氏念珠菌(krusei)、光滑念珠菌(glabrata)、熱帶念珠菌(tropicalis)等)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)、曲黴菌(Aspergillus)(菸麯黴(fumigatus)、黑麴菌(niger)等)、毛黴菌屬(Mucorales)(白黴菌(mucor)、犁頭黴(absidia)、根黴菌(rhizophus))、申克氏胞絲菌(Sporothrix schenkii )、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis )、巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis )、粗球孢子菌(Coccidioides immitis )及莢膜組織胞漿菌(Histoplasma capsulatum )。
引起可藉由本文所描述之方法治療之感染之病原性寄生蟲的一些實例包括溶組織內阿米巴(Entamoeba histolytica )、大腸纖毛蟲(Balantidium coli )、福氏耐格里阿米巴原蟲(Naegleriafowleri )、棘阿米巴蟲屬(Acanthamoeba sp. )、蘭比亞梨形鞭毛蟲(Giardia lambia )、隱胞子蟲屬(Cryptosporidium sp. )、肺炎肺囊蟲(Pneumocystis carinii )、間日瘧原蟲(Plasmodium vivax )、微小巴倍蟲(Babesia microti )、布氏錐蟲(Trypanosoma brucei )、克氏錐蟲(Trypanosoma cruzi )、杜氏利什曼原蟲(Leishmania donovani )、弓形蟲(Toxoplasma gondi )及巴西日圓線蟲(Nippostrongylus brasiliensis )。
在所有以上方法中,ILT4抑制可與其他形式之免疫療法,例如本文所描述之彼等療法,諸如細胞介素治療(例如干擾素、GM-CSF、G-CSF、IL-2)或雙特異性抗體療法組合,該等療法可提供腫瘤抗原之增強呈現(參見例如Holliger (1993)Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448;Poljak (1994)Structure 2:1121-1123)。投與途徑及載劑
在各種實施例中,抗體可藉由多種途徑活體內投與,該等途徑包括(但不限於)靜脈內(i.v.)、皮下、經口、動脈內、非經腸、鼻內、肌肉內、心內、心室內、氣管內、經頰、經直腸、腹膜內、皮內、局部、經皮及鞘內,或藉由植入或吸入。本發明組合物可調配成呈固體、半固體、液體或氣態形式的製劑;包括(但不限於)錠劑、膠囊、散劑、顆粒、軟膏、溶液、栓劑、灌腸劑、注射劑、吸入劑及噴霧劑。編碼抗體之核酸分子可塗佈至金微粒上且如文獻中所描述藉由粒子轟擊裝置或「基因槍」皮內遞送(參見例如Tang等人,Nature 356:152-154 (1992))。適當調配物及投與途徑可根據預期應用選擇。
在各種實施例中包含抗體之組合物與多種醫藥學上可接受之載劑一起提供於調配物中(參見例如Gennaro,Remington The Science and Practice of Pharmacy with Facts and Comparisons Drugfacts Plus , 第20版. (2003);Ansel等人,Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems , 第7版, Lippencott Williams and Wilkins (2004);Kibbe等人,Handbook of Pharmaceutical Excipients , 第3版, Pharmaceutical Press (2000))。可用各種醫藥學上可接受之載劑,包括媒劑、佐劑及稀釋劑。此外,亦可用各種醫藥學上可接受之輔助物質,諸如pH調整及緩衝劑、張力調整劑、穩定劑、潤濕劑及其類似者。非限制性例示性載劑包括鹽水、緩衝鹽水、右旋糖、水、丙三醇、乙醇及其組合。
在各種實施例中,可藉由在水性或非水性溶劑中溶解、懸浮或乳化來調配包含抗體之組合物以用於注射(包括皮下投與),該溶劑諸如植物油或其他油、合成脂族酸甘油酯、較高碳數脂族酸之酯、或丙二醇;且視需要使用習知添加劑,諸如增溶劑、等張劑、懸浮劑、乳化劑、穩定劑及防腐劑。在各種實施例中,組合物可例如使用可接受之加壓推進劑,諸如二氯二氟甲烷、丙烷、氮氣及其類似物調配以用於吸入。在各種實施例中,組合物亦可諸如使用可生物降解或不可生物降解聚合物調配成持續釋放型微膠囊。非限制性例示性可生物降解調配物包括聚乳酸-乙醇酸聚合物。非限制性例示性非可生物降解調配物包括聚甘油脂肪酸酯。製備此類調配物之某些方法描述於例如EP 1 125 584 A1中。
亦提供包含一或多個容器之醫藥封裝及套組,其各自含有一或多個劑量之抗體或抗體組合。在一些實施例中,提供單位劑量,其中單位劑量含有預定量之包含抗體或抗體組合且具有或不具有一或多種額外藥劑之組合物。在一些實施例中,此類單位劑量供應於注射用之單次使用預裝藥注射器中。在各種實施例中,單位劑量中所含有之組合物可包含鹽水、蔗糖或其類似物;緩衝液,諸如磷酸鹽或其類似物;及/或在穩定及有效Ph範圍內調配。或者,在一些實施例中,組合物可以凍乾粉末形式提供,該凍乾粉末可在添加適當液體(例如無菌水)時復原。在一些實施例中,組合物包含一或多種抑制蛋白質聚集之物質,包括(但不限於)蔗糖及精胺酸。在一些實施例中,本發明之組合物包含肝素及/或蛋白聚糖。
醫藥組合物以有效治療或預防特定適應症之量投與。治療有效量通常取決於所治療個體之體重、其生理或健康狀況、所治療病況之延伸或所治療個體之年齡。一般而言,抗體可以每次給藥約10微克/公斤體重至約100毫克/公斤體重範圍內的量投與。在一些實施例中,抗體可以每次給藥約50微克/公斤體重至約5毫克/公斤體重範圍內的量投與。在一些實施例中,抗體可以每次給藥約100微克/公斤體重至約10毫克/公斤體重範圍內的量投與。在一些實施例中,抗體可以每次給藥約100微克/公斤體重至約20毫克/公斤體重範圍內的量投與。在一些實施例中,抗體可以每次給藥約0.5毫克/公斤體重至約20毫克/公斤體重範圍內的量投與。
需要時,可向個體投與抗體組合物。可由熟習此項技術者,諸如主治醫師,基於所治療病況、所治療個體之年齡、所治療病況之嚴重度、所治療個體之一般健康狀況及其類似因素的考慮因素來決定投與頻率。在一些實施例中,一或多次向個體投與有效劑量之抗體。在各種實施例中,每月一次、少於每月一次(諸如每兩個月一次或每三個月一次)向個體投與有效劑量之抗體。在其他實施例中,超過每月一次(諸如每三週一次、每兩週一次或每週一次)投與有效劑量之抗體。在一些實施例中,每1、2、3、4或5週一次投與有效劑量之抗體。在一些實施例中,每週兩次或三次投與有效劑量之抗體。至少一次向個體投與有效劑量之抗體。在一些實施例中,可多次投與有效劑量之抗體,包括持續至少一個月、至少六個月或至少一年之時間段。
在某些實施例中,本文所論述之ILT4抗體與第二藥劑之組合可作為單一組合物在醫藥學上可接受之載劑中同時投與,或作為含ILT4抗體及第二藥劑之單獨的組合物在醫藥學上可接受之載劑中同時投與。在一個實施例中,ILT4抗體與第二藥劑之組合可依序投與。兩種藥劑之投與可例如相隔30分鐘、60分鐘、90分鐘、120分鐘、3小時、6小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、5天、7天或一或多週之時間開始,或第二藥劑之投與可在投與第一藥劑之後例如30分鐘、60分鐘、90分鐘、120分鐘、3小時、6小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、5天、7天或一或多個週開始。實例
下文所論述之實例僅意欲例示本發明,且不應視為以任何方式限制本發明。該等實例不意欲表示以下實驗為所進行之所有實驗或唯一實驗。已努力確保關於所使用之數量(例如量、溫度等)的準確性,但應當考量存在一些實驗性誤差及偏差。除非另有指示,否則份數為重量份,分子量平均分子量平均分子量,溫度係以攝氏度計,且壓力為大氣壓或接近大氣壓。實例 1 :結合於人類 ILT4 之抗體的產生
使用表現人類抗體基因之轉殖基因小鼠產生抗人類ILT4單株抗體(ILT4抗體或hILT4抗體)。藉由對2種類型之人類免疫球蛋白轉殖基因動物進行免疫接種來產生針對人類ILT4之全人類單株抗體。用由hILT4之細胞外部分與C端小鼠Fc標籤構成之hILT4-mFc重組蛋白對KM [M/K]小鼠進行免疫接種。將抗原與Ribi佐劑1:1混合,且每隔一週對小鼠進行腹膜內及皮下免疫接種。用由hILT4之胞外部分與C端之his標籤構成的hILT4-his標記重組蛋白對HCo42:01 [J/K]品系進行免疫接種。將抗原與Ribi佐劑1:1混合,且每隔一週在腳掌處對小鼠進行免疫接種。在四次及六次注射後監測兩者類型之小鼠之血清效價。小鼠在最終收集之前接受最終增強免疫。取決於免疫接種途徑,收集引流淋巴結及脾臟以供後續融合。
自經免疫接種小鼠分離小鼠淋巴細胞。藉由使用Cyto Pulse Hybrimmune大型腔室細胞融合電穿孔器(BTX/Harvard Apparatus)藉由基於電場之電融合與小鼠骨髓瘤融合搭配物融合來產生融合瘤。將來自經免疫接種小鼠之淋巴細胞的單細胞懸浮液與等量的P3X63 Ag8.6.53(ATCC)非分泌性小鼠骨髓瘤細胞融合(融合編號4865及6951)。將所得細胞塗鋪於補充有胺基喋呤之培養基E(StemCell Technologies)中之平底微量滴定盤中以供選擇融合瘤(Sigma)。
在培養10至12天之後,使用均質HTRF分析針對人類IgG/人類κ輕鏈(hIgG/hK)抗體之存在篩檢個別孔。藉由FACS或藉由FMAT測試來自hIgG/hK呈陽性之孔的融合瘤上清液,以結合於經hILT4轉染之細胞或對照CHO細胞。進一步表徵與hILT4特異性相互作用之以下抗體:9C8.A6、24E5.A7、2H2.H3、21D9.H11、2E5.A11及9G4。自稍後之免疫接種分離抗體21A5及10F10。
使用NGS高通量定序方法對來自融合瘤之抗體進行定序。簡言之,針對96孔盤之孔中之各融合瘤純系,使用唯一DNA條碼進行VH區及VL區之PCR擴增以鑑別各孔。使5' PCR引物與前導區雜交,從而獲得整個可變區序列。藉由匹配條碼及盤上之純系之位置來鑑別特定融合瘤抗體序列。
抗ILT4抗體9G4、9C8、2H2、2E5、24E5、21D9、21A5及10F10在IgG1、IgG1.1或IgG1.3重鏈恆定區之情形下以重組方式表現,且亦認為提供於表1中。HC、LC、VH及VL之胺基酸序列及編碼其之核苷酸序列提供於圖1至圖12及下文序列表中。各CDR之位置提供於諸圖中且藉由在序列表之可變區序列中加底線來指示,且亦在接近序列表結尾處包括單獨SEQ ID NO形式之CDR。
抗體21D9、21A5、2H2及10F10之可變域之胺基酸序列之分析指示不存在於任何人類生殖系中之某些構架胺基酸殘基。為了減少將此等抗體投與人類時之前在免疫原性問題,產生此等ILT4抗體之生殖系回復突變體。
對於抗體21D9,鑑別出重鏈可變區中相對於生殖系序列之四個構架突變(V2G、G10D、A24T及V48I)且展示於圖13中。在此等4個回復突變之各種組合中,產生四個回復突變(21D9.b、21D9.c、21D9.d及21D9.e) (參見圖13)且針對與hILT4之結合進行測試。所有4個回復突變體包含N端EGQ至EVQ(或G2V)突變,其不大可能影響與ILT4之結合。除此取代以外,突變體21D9.b、21D9.c及21D9.d各自包含圖13中所展示之額外取代中之一者(D10G;I24A;及/或I48V),且21D9.e包含全部三個取代(參見圖13)。在IgG1.3重鏈恆定區之情形產生四個突變體以降低效應功能,該IgG1.3重鏈恆定區為包含胺基酸取代L234A、L235E及G237A之IgG1恆定區。該等突變體被稱為21D9.b.hIgG1.3 (「21D9.VH-G2V/D10G8V.IgG1.3」)、21D9.c.hIgG1.3 (「21D9.VH-G2V/ T24A.IgG1.3」)、21D9.d.hIgG1.3 (「21D9.VH-G2V/I48V」)及21D9.e.hIgG1.3 (「21D9.VH-G2V/D10G/T24A/I48V.IgG1.3」)且包含21D9之輕鏈。未對輕鏈進行生殖系回復。
對於抗體21A5,在重鏈(T70I)及輕鏈(V3A)可變區中之每一者中鑑別出一個構架突變,如圖14中所示。由於顯示於A3V處的κ輕鏈中之N端回復不大可能影響結合,在IgG1.3 (21A5.a.IgG1.3,亦稱為「21A5.VH-I70T.VK-A3V.IgG1.3」之情形下)產生且測試一個包含重鏈(I70T)及輕鏈(A3V)回復突變兩者之突變體(具有21A5.1輕鏈之21A5.a)。
對於抗體10F10,在輕鏈可變區中鑑別出兩個構架突變(Y36F及S63T),且展示於圖15中。重鏈可變區中未發現構架突變。由於在位置36處之F至Y回復為微小差異,在IgG1.3 (10F10.3.IgG1.3,亦稱為「10F10.VK-F36Y/T63S.IgG1.3」)之情形下產生且測試包含輕鏈回復突變F36Y及T63S兩者之雙重突變體(10F10.3)。亦在IgG1.3 (10F10.1.IgG1.3,亦稱為「10F10.VK-F36Y.IgG1.3」)之情形下產生且測試僅具有回復突變F36Y之突變體。兩種回復突變體Ab皆包含10F10之重鏈。表1列舉本文所描述之重組抗體之替代名稱。 1 :重組抗 hILT4 抗體之替代名稱 實例 2 hILT4 抗體與可溶性 hILT4 之結合
使用Biacore® T200儀器經由表面電漿子共振(SPR)量測本抗體及生殖系reversion突變體抗hILT4抗體(在IgG1.3之情形下)之結合動力學。分析溫度為37℃,且運行緩衝液為補充有0.05% Tween-20之PBS pH 7.4。於含有預固定蛋白A/G之CM4晶片(Pierce Thermo Scientific目錄號21186)上捕獲所有抗hILT4抗體。將不同的三批21D9用作對照。將單體人類ILT4作為分析物注入。將適當濃度用於分析:對於10F10.1及10F10.3 a,分析hILT4最高濃度為1.4 µM的3倍稀釋系列。對於10F10,分析兩個獨立hILT4稀釋系列:1.4 µM最高濃度5倍稀釋液及470 nM 3倍稀釋液。對於所有其他抗體,使用94 nM之hILT4最高濃度及5倍稀釋系列。用於此實驗中的包含連接至His-Avi標籤之hILT4細胞外區的hILT4由以下胺基酸序列組成:QTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRLYREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRARWSELSDPLVLVMTGAYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSESSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKAGAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVSGPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGSPGGGSGGGSEQKLISEEDLGHHHHHHGLNDIFEAQKIEWHE (hILT4-His-Avi標籤;SEQ ID NO:119)。
結果展示於表2及圖16中。 2 hILT4 抗體與 hILT4 之結合動力學
結果顯示21D9之4個回復突變體具有類似動力學及親和力。21A5及其回復突變體21A5.a亦具有類似動力學及親和力。然而,兩個10F10回復突變體10F10.1及10F10.3具有比其親本10F10略快之解離速率,導致總體親和力之約3倍損失。10F10.1及10F10.3之解離速率過快以至於不能以高置信度測定。實例 3 hILT4 抗體與 hILT4 表現細胞之結合
此實例描述抗hILT4抗體與經hILT4轉染之CHO細胞及與表現hILT4之人類單核球之結合特徵。
CHO細胞經hILT4轉染且經藉由3倍連續稀釋自20 µg/ml滴定的個別抗hILT4抗體2H2、10F10 (「10F10 WT」)、21A5 (「21A5 WT」)、21A5.a, 21D9 (「21D9 WT」)及21D9e (皆在IgG1.3之情形下)染色,且隨後經PE結合二級抗人類IgG處理。使用用於幾何平均螢光強度(GMFI)之FACS分析測定EC50
結合曲線及EC值展示於圖17及圖18A中。
在圖18B中,將選自正常健康供體之末梢血液之單核球用與Alexa67結合之個別抗ILT4抗體染色。抗體藉由3倍連續稀釋自20 μg/mL滴定,且藉由用於計算EC50(圖表下方之表格中所示)之FACS分析測定GMFI。實例 4 ILT4 抗體針對 LILRA/B 家族成員之選擇性
ILT4為相關受體家族,亦稱為LILRA及LILRB家族之成員。在此實例中,量測hILT4抗體與各種LILRA/LILRB家族成員之結合。
個別ILT家族成員過度表現於293T細胞中。各轉染物經20 µg/ml之抗ILT4抗體及隨後之1 µg/ml抗人類IgG二級mAb染色。藉由流動式細胞測量術來量測抗體與各轉染物之結合。在第二實驗中,將LILRA1、LILRA3及ILT4轉染物與各種濃度之21A5及21A5.a一起培育。
展示於圖19A及圖19B以及表3中之結果指示,相對於其他LILRA及LILRB家族成員,抗hILT4抗體主要選擇性結合於hILT4。LILRA3為LILRA/B家族中之唯一分泌蛋白質。更特定言之,21D9及21D9.e並未顯著結合於LILRA1、LILRA2、LILRA3、LILRA4、LILRA6、ILT2、ILT3、ILT5及LIR8,且僅較弱地結合於LILRA5。 3 20 µg/ml 下之抗 ILT4 抗體之選擇性概況
表3中之「親本」係指表現LILRA或LILRB分子之親本細胞株。
如下進一步測試針對LILRA之其他家族成員的交叉反應性。進行抗體滴定流動式細胞測量術結合分析以測定21D9、21D9.e、21A5及21A5.a與hILT4及其各別交叉反應ILT分子之結合效力。使用來自GraphPad Prism®軟體之非線性回歸公式測定EC50
展示於表4及圖20中之結果顯示,抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5及21A5.a顯示與LILRA之其他家族成員的較弱交叉反應性:21D9及21D9.e與LILRA5以及21A5及21A5.a與LILRA1及LILRA3之較弱交叉反應性。 4- ILT4 抗體與 ILT 交叉反應之 EC50 結合效力之概述 (µg/ml) 21D9及21D9.e以高親和力結合於hILT4,丁並未顯著結合於hLILRA1、hLILRA2、hLILRA3、hLILRA4、hLILRA6、hILT2、hILT3、hILT5及hLIR8,且僅微弱地結合於hLILRA5。因此,相比與ILT5 (LILRB3)及LILRA6交叉反應之其他抗ILT4抗體,諸如來自R&D系統之純系287219,21D9及21D9.e結合於hILT4之特異性相對於其他hLILRA及hLIRB家族成員大得多。實例 5 hILT4 抗體強化 T 細胞 反應
如下測定抗hILT4抗體對T細胞反應(尤其T細胞增殖及干擾素γ (IFNγ)T細胞分泌)之作用。細胞質截短hILT4經轉染至表現低水準之抗CD3抗體單鏈可變片段的CHO細胞(CHO-OKT3細胞)中。經轉染細胞株稱為CHO-OKT3-ILT4。將自人類PBMC分離之全部T細胞與經輻照(生長停滯)CHO-OKT3-ILT4細胞以4:1比率共培養。抗ILT4抗體21D9 (「21D9 WT」)、21D9.e、21A5 (「21A5 WT」)、21A5.a及10F10 (「10F10 WT」)係藉由5倍連續稀釋自20 µg/ml滴定,且在37℃下培育3天。收集上清液以藉由ELISA評定IFNγ水準,且培養盤經3 H胸苷脈衝隔夜以藉由胸苷摻入評定增殖。
展示於圖21A至圖21D中之結果指示,抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5、21A5.a及10F10以劑量依賴方式刺激T細胞增殖及IFNγ分泌。在此分析中未發現此等抗體之間的顯著活性差異。實例 6 在分化期間用抗 ILT4 抗體預處理單核球產生對同種異體 T 細胞 更具刺激性的單核球衍生之樹突狀細胞 (MoDC)
使用StemCell EasySep®人類單核球分離套組自人類PBMC分離CD14+單核球,以1000000個細胞/毫升進行塗鋪,且在補充有50 ng/mL GM-CSF及100 ng/mL IL-4之RPMI培養基中分化成單核球衍生之未成熟DC (Mo-iDC),持續六或七天。在分化期間,將該等細胞與抗ILT4或同型抗體一起培育或保持不處理。在將細胞分化成Mo-iDC之後,將其洗滌以移除抗ILT4抗體、GM-CSF及IL-4,且在50 ng/mL之CD40促效抗體存在下進一步活化成成熟樹突狀細胞(DC(Mo-mDC)。藉由將其與T細胞以1:10比率 (Mo-mDC:T)共培養5天來製備成熟DC (Mo-mDC)以用於同種異體混合白血球反應分析(同種異體MLR)。在同種異體MLR結束時收集細胞上清液以用於藉由ELISA量測IFNγ,且藉由最終16小時之3 H-胸苷摻入評定T細胞增殖。
展示於圖22中的單獨之分析之結果指示,當在抗ILT4抗體21A5.a或21D9.e存在下自單核球分化MoDC時,同種異體MLR與MoDC分析中之CD4+ T細胞增殖(圖22A及圖22C)及IFNγ分泌(圖22B及圖22D)增強。將來自兩種不同供體之單核球用於單獨之分析。實例 7 自抗 ILT4 抗體預塗單核球分化之單核球衍生之樹突狀細胞 (MoDC) 增加共刺激或成熟分子之表現
使用StemCell EasySep®人類單核球分離套組自人類PBMC分離CD14+單核球,以1000000個細胞/毫升進行塗鋪,且在抗ILT4抗體21D9.e、21A5.a、21A5、10F10、21D9、2H2或同型抗體存在下在補充有50 ng/mL GM-CSF及100 ng/mL IL-4之RPMI培養基中分化成單核球衍生之未成熟DC (Mo-iDC),持續六或七天,或保持不處理。隨後收集Mo-iDC以對細胞表面標記物CD86及CD83染色。
展示於圖23中之結果指示,當在單核球分化成Mo-iDC期間存在抗ILT4抗體時,CD86及CD83 (共刺激及成熟分子)分別在Mo-iDC上之表現增加。此等結果與實例6之結果一起顯示,在單核球分化成MoDC期間用抗hILT4抗體處理單核球如所展示藉由上調CD83及CD86促進MoDC之促炎(圖23A至圖23D),其因此觸發同種異體MLR分析中自同種異體T細胞之T細胞增殖及IFNγ產生增強(圖22)。藉由增強T細胞功能,用抗hILT4抗體處理可提供增強之抗癌免疫反應。實例 8 ILT4 抗體強化自活體外分化巨噬細胞之 TNFα 分泌
自人類PBMC分離之單核球在M-CSF存在下分化成巨噬細胞,持續5天。在10 ng/ml之LPS (圖24A)或5 µg/ml之2'3'-cGAMP STING促效劑(圖24B)存在下用指定濃度(緊鄰其名稱且以ng/ml形式)之抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5、21A5.a、2H2及10F10或同型對照處理巨噬細胞。處理後24小時藉由ELISA來量測TNFα產生,且緊靠曲線標註在各抗體存在下之EC50值。
展示於圖24中的結果指示,ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5、21A5.a、2H2及10F10之存在藉由LPS或STING促效劑增強活體外分化之巨噬細胞之TNFα分泌。因此,免疫抑制巨噬細胞在ILT4經阻斷時顯示向更具促炎性表現型之轉變,其可潛在地提供增強之抗癌免疫反應。此等結果表明,抗ILT4抗體促進針對M1巨噬細胞之促炎性極化。實例 9 ILT4 抗體促進巨噬細胞 CD4+T 細胞 同種異體 MLR 中之 CD4 T 細胞 反應
用M-CSF處理自末梢PBMC分離之單核球5天以分化成巨噬細胞。隨後將巨噬細胞與自不同供體之PBMC分離且經CFSE染料標記之同種異體CD4+ T細胞共培養。同種異體MLR共培養中包括1 µg/ml之指定抗體(同型對照、抗ILT4或抗PDL1)。在第6天,收集上清液用於分析IFNγ及D4+ T細胞增殖,且藉由基於CFSE稀釋之FACS進行評定。
展示於圖25A至圖25B中之結果指示,抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5或21A5.a在活體外分化巨噬細胞及CD4+ T細胞之同種異體MLR中之存在促進CD4+ T細胞增殖(圖25A)及IFNγ產生(圖25B)。此等結果表明,抗ILT4抗體經由調節巨噬細胞中之ILT4抑制信號傳導或阻斷其在T細胞中之直接抑制活性來促進T細胞活化。實例 10 ILT4 及抗 PD-L1 在巨噬細胞 CD4 T 細胞 同種異體 MLR 中之組合作用
用M-CSF處理自末梢PBMC分離之單核球5天以分化成巨噬細胞,隨後將其與自同種異體供體之PBMC分離之同種異體CD4+ T細胞共培養。同種異體MLR共培養中包括以10 µg/ml單獨或一起添加之抗ILT4抗體21D9及抗PD-L1抗體(同型對照、抗ILT4、抗PD-L1或組合之抗ILT4及抗PD-L1)。在第6天,收集上清液用於分析IFN。
展示於圖26中之結果指示,抗ILT4抗體21D9與抗PD-L1抗體之組合相對於單獨的各抗體刺激IFNγ自巨噬細胞:CD4+ T細胞同種異體MLR之增強產生。實例 11 hILT4 Ab 21D9 2H2 Fab HDX 抗原決定基定位
HDX-MS用於鑑別抗hILT4抗體21D9及2H2所結合的hILT4之區域。
HDX-MS藉由監測主鏈醯胺氫原子之氘交換之速率及程度來探測溶液中之蛋白質構形及構形動力學(Huang及Chen (2014) Analytical and Bioanalytical Chem. 406:6541以及Wei等人 (2014) Drug Discovery Today 19:95)。HDX之水準視主鏈醯胺氫原子之溶劑可接近性及蛋白質氫鍵而定。可藉由MS精確量測蛋白質在HDX後之質量增加。當將此技術與酶消化相結合時,可在肽層面上解析結構特徵,使得表面暴露之肽與摺疊於內部之該等肽,或與蛋白質-蛋白質複合物界面處螯合之該等肽相區別。通常,進行氘標記及後續淬滅實驗,接著進行酶消化、肽分離及MS分析。
在抗原決定基定位實驗之前,進行非氘化實驗以產生用於重組人類ILT4 (15 µM)之共同肽及具有Fab 21D9及2H2 (1:1莫耳比)之ILT4之蛋白質複合物的清單。在HDX-MS實驗中,將5 µL各樣品(具有Fab之ILT4或ILT4)稀釋至55 µL之D2 O緩衝液(10 mM磷酸鹽緩衝液,D2 O,pH 7.0)中以起始標記反應。反應進行不同時段:1 min、10 min及240 min。在各標記反應時段結束時,藉由添加淬滅緩衝液(6 M脲,1 M TCEP,pH 2.5,1:1,v/v)淬滅反應且將50 µL經淬滅之樣本注入Waters HDX-MS系統中進行分析。在不存在/存在Fab 21D9及2H2下監測常見胃酶解肽之氘攝取量。
人類ILT4 (hILT4)經組胺酸標記且與21D9或2H2 Fab以1:1比率混合,且進行HDX 1分鐘、10分鐘或4小時。藉由胃蛋白酶對hILT4之序列覆蓋展示於圖27A中。與各Fab結合的hILT4 (或hILT4肽)之區域展示於圖27B及圖27C中。特定言之,HDX-MS實驗提供對人類ILT4之85%序列覆蓋。
對人類ILT4中之21D9及2H2之HDX-MS資料分析指示,21D9之抗原決定基由人類ILT4之一個區域(殘基數目對應於天然人類ILT4序列):Ig域2中之區域70 ITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQY100 (SEQ ID NO:122)構成。(參見圖27B,上圖。)
HDX-MS資料分析指示,2H2之抗原決定基由人類ILT4之五個區域與為主要抗原決定基之區域2及5構成: 區域1:127 SAQPSPVVTSGGRVTL142 (SEQ ID NO:173) 區域2:154 ILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIF181 (SEQ ID NO:123) 區域3:182 SVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDL213 (SEQ ID NO:174) 區域4:378 QAEFPMSPVTSAHAG392 (SEQ ID NO:175) 區域5:425 SSPPPTGPIS434 (SEQ ID NO:124) (參見圖27B,下圖。)實例 12 ILT4 抗體阻斷 ILT4 I MHC 分子之結合
進行基於流動式細胞測量術之抗體阻斷分析以測定抗ILT4抗體阻斷rhILT4-Fc與過度表現HLA-A或HLA-B之CHO細胞之結合的能力。產生含有鼠類Fc尾區之rhILT4-Fc融合蛋白。在固定30 µg/ml濃度之rhILT4-Fc存在下滴定抗hILT4抗體21D9、2H2、10F10及21A5。將抗體及rhILT4-Fc混合物於冰上培育30分鐘,且隨後添加至經工程改造以過度表現HLA-A或HLA-B之CHO細胞。將CHO細胞於冰上染色30分鐘,洗滌,且隨後用抗小鼠Ig二級抗體染色以偵測結合之rhILT4-Fc。
展示於圖28A至圖28D中之結果指示,抗體21D9、2H2、10F10及21A5分別抑制hILT4與HLA-A及HLA-B之結合。實例 13 21D9e.IgG1.3T 增強藉由 T 細胞之 IFN-g TNF-a 分泌
此實例展示,21D9e.IgG1.3增強單核球及T細胞之自體混合淋巴細胞反應(MLR)中的T細胞之IFN-γ及TNF-α分泌。
自末梢血液單核細胞(PBMC)分離T細胞及單核球且在20 ng/mL抗CD3抗體(純系:OKT3,BioLegend)存在下以1:1比率共培養。以10 ug/mL添加21D9e.IgG1.3及同型對照(DT-1D12-g1.3f)。進行細胞內染色以在88小時培育時間段之後使用結合螢光染料之IFN-γ抗體(純系# B27,BioLegend)及TNF-α抗體(純系# MAb11,BioLegend)測定各樣本中表現IFN-γ及TNF-α之T細胞之出現率。樣本係在Cytoflex®細胞計數器(Beckmen Coulter)上獲取且用FlowJo™軟體(Tree Star, Inc, Ashland,OR)分析。
展示於圖29A至圖29D中之結果指示,21D9e.IgG1.3在自體同種異體MLR中增強在抗CD3刺激後藉由CD4+及CD8+ T細胞之IFN-γ及TNF-α分泌兩者。實例 14 ILT4 抗體在 CMV 溶胞物分析中增強在抗原刺激後之 IFN-g 分泌
在0.3 µg/mL之巨細胞病毒(CMV)溶胞物(CMV抗原2,Microbix Cat# EL-02-01-001)存在下將來自CMV反應性供體之末梢血液單核細胞(PBMC)以200,000個細胞每孔進行塗鋪。用在20 µg/mL下起始的抗ILT4抗體21D9.IgG1.3及21A5.IgG1.3之8點、5倍滴定處理細胞。以1 µg/mL添加納武單抗,作為陽性對照。以20 µg/mL添加21D9-Fab及DT-1D12-g1.3。收集來自各樣本之上清液,且在培育6天之後藉由ELISA (人類IFN-γ ELISA套組,BD OptEIA Cat.555142)量測IFN-γ水準。
展示於圖30中之結果指示,抗ILT4抗體21D9.IgG1.3、21D9-Fab及21A5.IgG1.3在CMV溶胞物分析中增強在抗原刺激後之IFN-γ分泌。實例 15 ILT4 拮抗作用增強單核球 T 同種異體 MLR 中之 T 細胞活化
將來自一個供體之T細胞(100,000)及同種異體單核球在96孔U形底培養盤中以每孔2:1之比率共培養。將抗ILT4抗體2H2.IgG1.1f、2H2 Fab、21D9.IgG1.1f及21D9 Fab添加於以對於全長抗體為30 µg/mL或對於Fab抗體為80 µg/mL之濃度起始之4倍、7點滴定中。以30 µg/mL添加抗KLH-g1.1f (抗血氰蛋白抗體),作為同型對照。培育細胞培養物6天。在最後16小時之培養期間藉由3 H-胸苷摻入評定細胞增殖。
展示於圖31中之結果指示,全長抗ILT4抗體21D9.IgG1.1f及2H2.IgG1.1f及其各別Fab片段皆誘導T細胞增殖。實例 16 hILT4 抗體與食蟹獼猴 ILT4 之結合
經由PCR自食蟹獼猴獲得若干ILT家族成員。由於此等蛋白質之序列分析未清楚指示其與hILT4最匹配,因此進行表現剖析及功能性分析。此等分析將名為「9152」之純系鑑別為在表現剖析及功能特性方面與hILT4最匹配 包括His-Avi標籤的9152之細胞外區之胺基酸序列如下: QAGILPKPMLWAEPDRVITQGSPVTLRCQGNLEARGYHLYRERKSASWITLIRPELVKKGQFPIPSITWEDAGRYRCQYYSHSWWSEHSDPLELVVTGAYRKPTLSALPSPVVASGGNVTLQCDSRVALDGFILCKEGEDEHSQRLNSQPRTRGSSRAVFSVGPVSPSRRWSYRCYGYELHSRYVWSLPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAGGDKLTLQCGSDAGYDRFALYKEGERDFLQRPGQQLQAGLAQANFTLDPVRGSHGGQYRCYGAHNLSSEWSAPSDPLDILISAGPHSGLRRECDPAVSVTGMDGHFLSDQGGSSSPGGGSGGGSEQKLISEEDLGHHHHHHGLNDIFEAQKIEWHE (SEQ ID NO:118)。對於與hILT4之結合,使用實例2中所描述之hILT4-His-Avi標籤之細胞外區(ECD);SEQ ID NO:119。
在比較SPR分析中分析使用以上ILT4構築體結合於食蟹獼猴及人類ILT4之21D9.e抗體之動力學。於Proteon XPR36儀器(BioRad)中將抗體胺偶聯至GLC感測器晶片。將人類ILT4及食蟹獼猴ILT4 9152以1 µM最大濃度(1.6 nM 最小濃度)作為分析物注入5員、5倍稀釋系列中。所有資料使用由Karlsson等人(Karlsson等人(2005) Analytical Biochem. 349:136)描述之動力學滴定模型用BIAevaluation軟體4.1.1進行雙重參考、導出及分析。運行緩衝液由10mM HEPES pH 7.4、150mM NaCl及0.05%Tween-20組成。分析溫度為37℃。
展示於表5中之結果顯示,相比人類ILT4,21D9.e以弱大約11倍之親和力結合食蟹獼猴ILT4 9152 (食蟹獼猴之KD 值為3.5nM,且人類ILT4之KD 值為0.33 nM)。類似地,相比人類ILT4,親本抗體21D9以弱大約12倍之親和力結合食蟹獼猴ILT4。差異係由食蟹獼猴ILT4之較快解離速率常數引起(食蟹獼猴之KD 值為4.0 nM,且人類ILT4之KD 值為0.32 nM)。 5 實例 17 ILT4 抗體活體外促進共刺激分子及活化標記物於食蟹獼猴單核球衍生之樹突狀細胞上的表現
此實例顯示,ILT4抗體21D9.e.IgG1.3 (圖32中之ILT4.8;參見表1)及9G4. hIgG1.3 (圖32中之ILT4.1;參見表1)刺激CD80、CD83及CD86於單核球衍生之樹突狀細胞上之表現。
在62.5 U/mL重組人類GM-CSF (Peprotech)及125 U/mL重組人類IL-4 (Peprotech)存在下培養自食蟹獼猴PBMC (非人類靈長類動物CD14微珠,Miltenyi)分離之單核球5天。在設置培養時,以10 ug/mL將抗ILT4抗體添加至培養物。使用抗CD86 (純系#IT2.2,BioLegend)、抗CD80 (純系#L307)及抗CD83 (純系#HIB15e)對細胞染色以測定CD86、CD80及CD83在其表面之表現量。樣本係在Cytoflex®細胞計數器(Beckmen Coulter)上獲取且用FlowJo™軟體(Tree Star, Inc, Ashland,OR)分析。
展示於圖32A至圖32C中之結果指示,ILT4抗體21D9.e.IgG1.3 (亦稱為ILT4.8.IgG1.3;圖中之「ILT4.8」)及9G4.IgG1.3 (亦稱為ILT4.1.IgG1.3;圖中之「ILT4.1」)促進共刺激分子CD80及CD86以及樹突狀細胞成熟標記物CD83於單核球衍生之DC中之表現,如藉由樹突狀細胞上之CD80、CD83及CD86之上調所證明。實例 18 經修飾抗 ILT4 抗體 10F10.4
10F10.1及10F10.3之輕鏈中之F36Y中的酪胺酸(參見實例2)位於hILT4及10F10抗體之模型化中之重鏈CDR3附近。因此,用Y取代F36可引起與重鏈CDR3中之異白胺酸抵觸,如10F10.1及10F10.3相對於10F10之較快解離速率所證明(參見實例2)。產生另一突變體,其中輕鏈之F36未突變且10F10中產生之唯一輕鏈構架區突變為T63S。重鏈未突變,且因此為10F10之重鏈。此經修飾之抗體稱為10F10.4,且其輕鏈之胺基酸序列在序列表中列舉為SEQ ID NO:116。
在37℃下使用Biacore® T200儀器測定10F10.4之結合動力學。運行緩衝液為補充有0.05% Tween-20及1 g/L BSA之10 mM HEPES pH 7.4。在含來自Southern Biotech (目錄號2081-01)之預固定抗人類Fc捕捉抗體之CM4晶片上捕獲所有抗ILT4抗體。以1.2 μM (僅對於10F10、10F10.4及一個1E5 ILT4.15之複本)、405 nM、81 nM(一式兩份地)、16 nM、3 nM及0.6 nM注入人類ILT4 (實例2中所描述之hILT4-His-Avi標籤)。所有資料經雙重參考且使用Biacore T200評估軟體版本3.1用質量輸送擬合至1:1朗繆爾模型。
展示於表6中之結果指示,10F10.4之結合動力學與10F10之結合動力學極其類似。包括21A5、21A5a、21D9及21D9.e作為對照。絕對值略微不同於表2中所示之值,其係因此分析中使用不同捕獲試劑所致。 6
顯示10F10.4藉由增強自活體外分化之巨噬細胞之TNFα分泌而具功能活性。此係藉由如實例8中所描述將10F10.4與自PBMC單核球分化之巨噬細胞一起培育來證實。亦包括21D9.e以及同型對照。展示於圖33A及圖33B中之結果指示,在單核球藉由LPS或STING促效劑活體外分化成巨噬細胞期間,ILT4抗體10F10.4之存在增強TNFα分泌。實例 19 21D9.e IgG1 IgG4 IgG1.3 之情形下具有類似效力
此實例顯示21D9.e之效力在IgG1、IgG4 (S228P)及IgG1.3重鏈之情形下類似。
21D9.e抗體係在IgG1、IgG4 (具有S228P)或IgG1.3 (分別為SEQ ID NO:176、178及13)之情形下選殖的且用於如下進行之量測分泌之分析中。
展示於圖34中之結果指示,對於21D9.e.IgG1、21D9.e.IgG4.S228P及21D9.e.IgG1.3,分泌類似量之TNFα。因此,21D9.e可變區在此等不同Fc區之情形下具有類似功能性效力。DT-1D12為同型對照。實例 20 21D9e 結合於 hILT4 對偶基因
此實例描述用於確定21D9.e是否結合於hILT4之替代性對偶基因的分析。
僅考慮出現率超過1%之彼等對偶基因。進一步考慮在區域D1及D2中具有胺基酸變化之兩個對偶基因:E161D及R103H (根據SEQ ID NO:107編號,亦即具有信號序列之ILT4)。由於3維模型化顯示,兩個胺基酸殘基不靠近具有I類MHC之結合界面,所以預期此等殘基處之胺基酸變化不影響抗體與hILT4之結合。為證實此情況,進行具有取代E161D及R103H之hILT4蛋白(hILT4 E161D/R103H)且經由Octet BLI測試其與21D9.e. IgG1.3及21A5.a. IgG1.3 (ILT4.9.IgG1.3;參見表1)之結合。發現兩種蛋白質類似地結合於hILT4 E161D/R103H及hILT4 E161/R103。實例 21 21D9e.IgG1.3 不顯著觸發嗜鹼性球活化
用於藉由抗ILT4抗體偵測嗜鹼性球活化之分析涉及以下步驟。通常如下藉由使用用於Flow CAST©嗜鹼性球活化測試中之Buhlmann實驗室AG方法進行分析。使用抗Ccr3偵測來源於供體血液之人類嗜鹼性球。CD63用作嗜鹼性球活化之指示物。將刺激緩衝液及抗體添加至全血。在培育之後,向血液中添加染色試劑;且在抗體培育之後,將紅血球溶解且在BD FACS Canto II上離心、洗滌及分析樣品。
基於此分析,來自8個供體之Ccr3+CD63+活化之嗜鹼性球係在與21D9.e. IgG1.3 (ILT4.8. IgG1.3;參見表1)、21.5Aa.IgG1.3 (ILT4.9.IgG1.3)或抗DT以4.5、45.45或454.55 µg/mL一起培育180分鐘之後藉由FACS量測。陽性對照包括抗FcƐRI及fMLP (N-甲醯甲硫胺酸-白胺醯基-苯丙胺酸)。陰性對照為DT1DT12-IgG1.3,其靶向不相關之抗原白喉毒素。
展示於圖36中之結果指示,21D9.e.IgG1.3 (ILT4.8.IgG1.3)及21.5Aa.IgG1.3 (ILT4.9.IgG1.3)在所測試條件下未誘導嗜鹼性球活化。缺乏嗜鹼性球活化代表一種重要安全性特徵。實例 22 ILT4 抗體 21D9.e.IgG1.3 穩定的
此實例描述用抗ILT4抗體21D9.e.IgG1.3 (亦稱為ILT4.8.IgG1.3)進行之3個月穩定性研究,其資料顯示抗體至少在3個月內係穩定的。
在25或40℃下以150 mg/mL之濃度培育21D9.e.IgG1.3之樣本。將樣本用移動相(40 mM NaH2PO4,60 mM Na2HPO4,0.1 M Na2SO4,pH 6.8)稀釋至1 mg/mL,且使用Agilent 1200系列HPLC系統(Agilent Technologies,Santa Clara,CA)使用TSKgel Super3000SW管柱(4.6mm ID×30cm,4µm,Tosoh Bioscience,King of Prussia,PA)以等度梯度(0.1 M磷酸鈉,0.1M硫酸鈉,pH 6.8,以0.2 mL/min)分析四十微升。UV偵測設定為280 nM。
展示於圖35中之結果指示,21D9.e.IgG1.3 (ILT4.8)抗體組合物在25℃下培育3個月之後包含少於5%之高分子量及低分子量物質且在40℃下培育3個月之後包含少於10%之高分子量及低分子量物質。實例 23 藉由抗 ILT4 單株抗體交叉阻斷 2H2 21D9
首先將過度表現ILT4之CHO細胞與未結合抗ILT4抗體10F10.IgG1.3及21A5.IgG1.3之連續稀釋液(3倍,12點,以40 µg/mL起始)一起預培育。添加抗KLH-g1.1f (抗血氰蛋白抗體)作為同型對照,同時以40 µg/mL添加未結合2H2.IgG1.1f或21D9.IgG1.1f作為陽性對照以證實阻斷活性。30分鐘培育時間段之後,以1.5 µg/mL摻入結合PE之2H2.IgG1.1f或21D9.IgG1.1f且再與細胞一起培育30分鐘。洗滌後,樣本係在FACSCanto™細胞計數器(BD Bioscience,San Jose)上獲取且用Flowjo™軟體(Tree Star, Inc, Ashland, OR)分析。
結果展示於圖37A (2H2交叉阻斷)及圖37B (21D9交叉阻斷)中。結果指示,10F10及21A5交叉阻斷2H2(或與其競爭)結合於hILT4 (圖37A),且10F10而非21A5交叉阻斷21D9 (或與其競爭)結合於hILT4 (圖37B)。因此,(i) 21A5及2H2處於同一劃分組中(亦即其彼此競爭結合於hILT4);(ii) 21D9與21A5/2H2處於單獨的劃分組中;且(iii) 10F10與21D9及2H2/21A5競爭結合於hILT4。 展示hILT4之晶體結構上的抗體之hILT4結合區的圖展示於圖37C中。Ig樣域1對應於SEQ ID NO:107之胺基酸殘基27-110,而Ig樣域2對應於SEQ ID NO:107之胺基酸殘基111-229。此等兩個域以帶狀形式展示於圖37C中。此等實驗之結果指示,抗體21D9結合於Ig樣域1,抗體2H2及21A5結合於Ig樣域2,且抗體10F10結合於位於Ig樣域1與2之間且與其中之每一者之部分重疊的區域。預期僅由於生殖系突變而不同於此等實驗中所使用之抗體的抗體(例如21D9.e、29A5.a以及10F10.3及10F10.4)結合與其親本抗體(分別為21D9、29A5及10F10)相同之區域。序列表
以下為本申請案中提及之某些序列之表格。下文多個序列亦提供於圖1至圖15中,且抗體之VH及VL CDR標示於圖1至圖15中。在下文所提供之LC及HC序列內,組分VL及VH序列加底線且加粗。在以下VL及VH序列內,CDR加底線且加粗,亦如圖1至圖12中所描繪,且在某些VH及VL序列內,描繪回復突變。(回復突變之描述亦參見圖13至圖15。) 在一些情況下,回復突變經加陰影,或為粗體且加底線並加灰色陰影。
本申請案含有至少一個彩製圖式。在請求及付清所需費用後且在此未公開臨時申請案日後將變得可供公眾使用的情況下,專利局將提供含彩圖之此專利或專利申請案之複本。
1 展示抗hILT4抗體9G4之重鏈可變區(「VH」)之核苷酸及胺基酸序列,指示VH Cmdr之位置。
2 展示抗hILT4抗體9G4之輕鏈可變區(「VL」)之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
3 展示抗hILT4抗體9C8之VH之核苷酸及胺基酸序列,指示VH CDR之位置。
4 展示抗hILT4抗體9C8之VL之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
5 展示抗hILT4抗體2H2之VH之核苷酸及胺基酸序列,指示VH CDR之位置。
6 展示抗hILT4抗體2H2之VL之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
7 展示抗hILT4抗體2E5之VH之核苷酸及胺基酸序列,指示VH CDR之位置。
8 展示抗hILT4抗體2E5之VL之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
9 展示抗hILT4抗體24E5之VH之核苷酸及胺基酸序列,指示VH CDR之位置。
10 展示抗hILT4抗體24E5之VL之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
11 展示抗hILT4抗體21D9之VH之核苷酸及胺基酸序列,指示VH CDR之位置。
12 展示抗hILT4抗體21D9之VL之核苷酸及胺基酸序列,指示VL CDR之位置。
13A 13C 展示ILT4抗體21D9之重鏈可變域(VH) ( 13A )及輕鏈可變域(VH) ( 13C )之胺基酸序列分別與生殖系免疫球蛋白序列hIGHV3-23*01及hIGKV3-20*01之比對。箭頭指向生殖系突變。AbM VH CDR1及Kabat VH CDR2、VH CDR3及VL CDR1-3序列以淺色文字展示。 13B 展示具有IgG1.3重鏈恆定區(亦即,21D9.b-.e hIgG1.3)之四個生殖系回復突變體21D9.b、21D9.c、21D9.d及21D9.e之VH胺基酸序列。 13B 中以大寫字母表示之胺基酸殘基為生殖系回復取代。
14A 14B 展示ILT4抗體21A5之重鏈及輕鏈可變域之胺基酸序列分別與生殖系免疫球蛋白序列hIGHV1-46*01 (圖14A)及hIGKV3-20*01 (圖14B)之比對。AbM VH CDR1及Kabat VH CDR2、VH CDR3及VL CDR1-3序列以淺色文字展示。箭頭指向生殖系回復突變。
15 展示ILT4抗體10F10之重鏈及輕鏈可變域之胺基酸序列分別與生殖系免疫球蛋白序列hIGHV3-30*01 (頂部3個線條)及hIGKV1-13*02 (底部3個線條)之比對。AbM VH CDR1及Kabat VH CDR2、VH CDR3及VL CDR1-3序列以淺色文字展示。箭頭指向生殖系回復突變。
16 展示指定抗hILT4抗體與hILT4之結合之感測圖譜。所用之方法示意圖展示於感測器圖譜畫面上。
17 展示抗hILT4抗體2H2、10F10野生型(WT,亦即親本抗體)、21A5.a、21A5 WT、21D9 WT、21D9e及同型對照hIgG1.3與經hILT4轉染之CHO細胞的結合,其隨抗體濃度而變且藉由流式細胞測量術測定。EC50 值提供於結合資料圖表下方。
18A 展示指定抗hILT4抗體及同型對照與經hILT4轉染之CHO細胞的結合,其隨抗體濃度而變且藉由流式細胞測量術測定。EC50 值提供於結合資料圖表右側。 18B 展示抗hILT4抗體與自正常健康供體之末梢血液分離的人類單核球之結合。緊鄰圖表列舉抗體物種,且EC50值提供於圖表下方緊挨之表格中。
19A 展示抗hILT4抗體21D9、21D9.e、21A5、21A5.a、10F10及2H2 (自左至右)與人類LILRA1、人類LILRA2、人類LILRA3、人類LILRA4、人類LILRA5、人類LILRA6、人類ILT2、人類ILT3、人類ILT4、人類ILT5及人類LIR8 (自上至下)之結合的流動式細胞測量術圖式。 19B 展示抗hILT4抗體21A5及生殖系回復突變體21A5.a與人類LIRA1、LIRA3及ILT4之結合的流動式細胞測量術圖式。
20A 及圖 20B 展示指定抗體21D9 (「21D9 IgG1.1」)及21D9.e ( 20A )以及21A5 (「21A5WT」)及21A5.a ( 20B )與指定人類LILRA/LILRB家族成員(圖20A中之LILRA5、ILT4及圖20B中之LILRA1、LILRA3及ILT4)之最大結合百分比,其隨抗體濃度而變,指示抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5及21A5.a顯示與其他LILRA家族成員之較弱交叉反應性。
21A 至圖 21D 展示抗hILT4抗體之T細胞活性。 21A 為與經hILT4及OKT3轉染之CHO細胞共培養之T細胞的3 H胸苷摻入之直方圖,該等T細胞(在x軸上自左至右)不與抗體、與同型對照hIgG1.3抗體及抗體21D9 (「21D9 WT」)、21D9.e、21A5 (「21A5 WT」)、21A5.a及10F10 (「10F10 WT」)一起培育,該3 H胸苷摻入隨抗體濃度(20、4、0.8、0.16、0.032及0.0064 µg/ml)而變。 21B 提供相關EC50值。 21C 展示抗hILT4抗體之T細胞活性。圖21C為與經hILT4及OKT3轉染之CHO細胞共培養之T細胞的IFNγ產生之直方圖,該等T細胞(在x軸上自左至右)不與抗體、與同型對照hIgG1.3抗體及抗體21D9 (「21D9 WT」)、21D9.e、21A5 (「21A5 WT」)、21A5.a及10F10 (「10F10 WT」)一起培育,該IFNγ產生隨抗體濃度(20、4、0.8、0.16、0.032及0.0064 µg/ml)而變。 21D 提供相關EC50值。
22A 至圖 22D 展示與T細胞共培養之單核球衍生之樹突狀細胞(MoDC)的同種異體MLR (混合淋巴細胞反應)中T細胞之增殖( 22A 及圖 22C )及IFNγ產生( 22B 及圖 22D )。在單核球分化成MoDC期間添加抗hILT4抗體21A5.a或21D9.e (圖22A 及圖22B )、或者2H2或21D9 (圖22C 及圖22D )、或者同型對照或不添加抗體(「未處理」),且在同種異體MLR分析期間不添加各抗體。
23A 至圖 23D 展示CD83及CD86在單核球衍生之樹突狀細胞(MoDC)上之表現量。在單核球分化成MoDC期間培育抗hILT4抗體21D9.e、21A5.a ( 23A )、21A5、10F10、21D9 ( 23B )、2H2 ( 23C 及圖 23D )或同型對照或不進行處理(無抗體)。
24A 及圖 24B 展示自藉由脂多醣(LPS) ( 24A )或STING促效劑2'3'-cGAMP ( 24B )活化之活體外分化巨噬細胞分泌的TNF-α之水準。在活化期間包括抗ILT4抗體21D9、21D9.e、21A5、21A5.a、2H2及10F10或同型對照。
25A 及圖 25B 展示在抗hILT4抗體21D9、21D9.e、21A5或21A5.a或抗PD-L1抗體或同型對照抗體存在下,CD4 T細胞增殖之百分比( 25A )及自與活體外分化之巨噬細胞共培養的CD4 T細胞之同種異體MLR產生的IFN-γ之量( 25B )。 25A 基於CFSE稀釋藉由FACS分析展示CD4 T細胞增殖之百分比,且 25B 展示藉由Alphalisa量測之IFNγ產生,兩者隨ILT4抗體或對照而變。
26A 及圖 26B 展示在巨噬細胞:CD4 T細胞同種異體MLR中,與單獨的各抗體相比,抗ILT4抗體21D9與抗PD-L1抗體純系29E.2A3之組合將IFNγ之產生增強至較高水準。圖26A 展示一個巨噬細胞:CD4 T同種異體對之一個實驗。 26B 展示多個同種異體對之反應,其中每一線條表示一個同種異體對之一個實驗。使用非參數單向ANOVA多重比較(弗里德曼測試;Friedman test)進行統計分析。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,****p<0.0001。
27A 、圖 27B 及圖 27C 展示抗hILT4 Ab 21D9及2H2 Fab之HDX抗原決定基定位。圖27A展示胃蛋白酶對hILT4序列之覆蓋度。圖27B展示21D9及2H2 Fab之不同HDX。在圖式中標示之序列部分中,加底線之彼等部分的HDX保護比未加底線之彼等部分少,如圖示下方亦加以標註。圖27C展示定位至hILT4之線性序列的兩個Fab之HDX抗原決定基。抗體21D9之抗原決定基係藉由單底線展示。抗體2H2之抗原決定基係以雙底線及序列之加陰影/加影線底線部分展示。
28A 、圖 28B 、圖 28C 及圖 28D 展示抗體21D9 (圖28A)、2H2 (圖28B)、10F10 (圖28C)及21A5 (圖28D)對hILT4與HLA-A及HLA-B之結合的抑制。
29A 之圖 29D 展示21D9e.IgG1.3增強藉由CD4+及CD8+ T細胞之IFN-γ及TNF-α兩者之分泌,如藉由細胞內IFN-γ及TNF-α染色所測定。 29A 展示CD4+ T細胞中之IFN-γ分泌; 29B 展示CD4+ T細胞中之TNF-α分泌; 29C 展示CD8+ T細胞中之IFN-γ分泌;且 29D 展示CD8+ T細胞中之TNF-α分泌。
30 展示抗ILT4抗體21D9、21A5、21D9 Fab在CMV溶胞物分析中增強在抗原刺激後之IFN-g分泌。納武單抗(Nivolumab)係用作陽性對照,且無抗體(「無Ab」)及同型對照係用作陰性對照。抗ILT4抗體之濃度自左至右為:0.00128 µg/ml;0.0064 µg/ml;0.032 µg/ml;0.16 µg/ml;0.8 µg/ml;4 µg/ml;及20 µg/ml (各濃度之條形展示於直方圖中)。抗體及對照係以與直方圖右側所展示相同之次序自左至右展示(例如「無Ab」對應於左側之條形,且「Nivo」對應於右側之條形)。
31 展示IgG1.1f或Fab形式之抗ILT4抗體2H2及21D9在單核球:T同種異體MLR中增強T細胞增殖(藉由3 H摻入量測)。
32A 至圖 32C 展示抗ILT4抗體21D9e.IgG1.3 (圖中之「ILT4.8」)及9G4.IgG1.3 (「ILT4.1」) (抗體之命名法參見表1)活體外促進共刺激分子CD86( 32A) 與CD80( 32B) 及樹突狀細胞活化標記物CD83( 32C) 於食蟹獼猴單核球衍生之樹突狀細胞上之表現。在食蟹獼猴單核球分化成單核球衍生之樹突狀細胞(DC)期間添加各抗體。
33A 及圖 33B 展示自藉由脂多醣(LPS) ( 33A )或STING促效劑2'3'cGAMP ( 33B )活化之活體外分化巨噬細胞分泌的TNF-α之水準。在活化期間包括抗ILT4抗體21D9.e及10F10.4或同型對照。
34 展示在IgG1、IgG4或IgG1.3之情形下由與21D9.e一起培育之活體外分化巨噬細胞分泌的TNF-α之水準類似。
35 展示在25℃或40℃下0、1、2及3個月之後,21D9.e.IgG1.3之單體物質、高分子量(HMW)物質及低分子量(LMW)物質的百分比。單體物質、HMW物質及LMW物質分別對應於直方圖中之各條形的底部部分、中間部分及頂部部分。
36 展示總共8種供體在與21D9e.IgG1.3 (圖中之「ILT4.8」)、21A5.a.IgG1.3 (「ILT4.9」)、同型對照抗體「抗DT」、抗FcƐRI或N-甲醯甲硫胺酸-白胺醯基-苯丙胺酸(fMLP)一起培育之後的經活化嗜鹼性球之百分比,展示21D9e.IgG1.3 (ILT4.8)及21A5.a.IgG1.3 (「ILT4.9」)不具有嗜鹼性球活化。
37A 至圖 37C 展示用以確定某些抗體之抗原決定基的實驗之結果。 37A 及圖 37B 藉由表現於CHO細胞表面上的hILT4之10F10及21A5抗體展示2H2 (圖37A)及21D9 (圖37B)之競爭(或交叉阻斷)分析結果。 37C 為展示含有Ig樣域1及2之位置且指示抗體21D9、29A5、2H2及10F10所結合之hILT4區域的hILT4之三維表示的圖式。
 
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Claims (36)

  1. 一種特異性結合於人類ILT4(hILT4)之抗體,該抗體包含重鏈及輕鏈,其中該重鏈包含重鏈可變區(VH),該重鏈可變區包含:分別包含SEQ ID NO:155、156及157之胺基酸序列的VH互補決定區1(CDR1)、CDR2及CDR3,且其中該輕鏈包含輕鏈可變區(VL),該輕鏈可變區包含:分別包含SEQ ID NO:158、159及160之胺基酸序列的VL CDR1、CDR2及CDR3。
  2. 如請求項1之抗體,其中:a.該VH包含與SEQ ID NO:71之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列;b.該VH包含與SEQ ID NO:74之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列;c.該VH包含與SEQ ID NO:75之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列;d.該VH包含與SEQ ID NO:78之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列;或e.該VH包含與SEQ ID NO:80之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸 序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少90%一致的胺基酸序列。
  3. 如請求項1或2之抗體,其中:a.該VH包含與SEQ ID NO:71之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列;b.該VH包含與SEQ ID NO:74之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列;c.該VH包含與SEQ ID NO:75之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列;d.該VH包含與SEQ ID NO:78之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列;或e.該VH包含與SEQ ID NO:80之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列,且該VL包含與SEQ ID NO:70之胺基酸序列至少95%一致的胺基酸序列。
  4. 如請求項1或2之抗體,其中:a.該VH包含SEQ ID NO:71之胺基酸序列;b.該VH包含SEQ ID NO:74之胺基酸序列; c.該VH包含SEQ ID NO:75之胺基酸序列;d.該VH包含SEQ ID NO:78之胺基酸序列;或e.該VH包含SEQ ID NO:80之胺基酸序列。
  5. 如請求項1或2之抗體,其中該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列。
  6. 如請求項1或2之抗體,其中:a.該VH包含SEQ ID NO:71之胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列;b.該VH包含SEQ ID NO:74之胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列;c.該VH包含SEQ ID NO:75之胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列;d.該VH包含SEQ ID NO:78之胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列;或e.該VH包含SEQ ID NO:80之胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列。
  7. 如請求項1或2之抗體,其中該VH包含SEQ ID NO:80之胺基酸序列。
  8. 一種特異性結合於hILT4之抗體,該抗體包含:包含SEQ ID NO:80 之胺基酸序列的VH,及包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列的VL。
  9. 如請求項1、2及8中任一項之抗體,其中該重鏈包含SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:177或SEQ ID NO:178之胺基酸序列。
  10. 如請求項1、2及8中任一項之抗體,其中該重鏈包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列。
  11. 如請求項1、2及8中任一項之抗體,其中:(a)該重鏈包含SEQ ID NO:12之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(b)該重鏈包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(c)該重鏈包含SEQ ID NO:36之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(d)該重鏈包含SEQ ID NO:38之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(e)該重鏈包含SEQ ID NO:40之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(f)該重鏈包含SEQ ID NO:176之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,(g)該重鏈包含SEQ ID NO:177之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列,或(h)該重鏈包含SEQ ID NO:178之胺基酸序列,且該輕鏈包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列。
  12. 一種特異性結合於hILT4之抗體,該抗體包含:包含SEQ ID NO:80 之胺基酸序列的VH,包含SEQ ID NO:70之胺基酸序列的VL,及包含SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈恆定區。
  13. 一種特異性結合於hILT4之抗體,該抗體包含:包含SEQ ID NO:13之胺基酸序列的重鏈,及包含SEQ ID NO:11之胺基酸序列的輕鏈。
  14. 如請求項13之抗體,其包含:由SEQ ID NO:13之胺基酸序列所組成的重鏈,及由SEQ ID NO:11之胺基酸序列所組成的輕鏈。
  15. 如請求項13或14之抗體,其包含:由SEQ ID NO:13之胺基酸序列及C端離胺酸所組成的重鏈,及由SEQ ID NO:11之胺基酸序列所組成的輕鏈。
  16. 如請求項1、2及8中任一項之抗體,其為IgG抗體。
  17. 如請求項16之抗體,其為IgG1、IgG2或IgG4抗體。
  18. 如請求項17之抗體,其中該抗體為包含S228P取代(EU編號)的人類IgG4抗體。
  19. 如請求項1、2、8及12至14中任一項之抗體,其包含缺乏C端離胺酸殘基之重鏈。
  20. 如請求項1、2、8及12至14中任一項之抗體,其為包含重鏈的全長抗體,該重鏈包含或不包含C端離胺酸殘基。
  21. 如請求項1、2、8及12至14中任一項之抗體,其包含重鏈恆定區,該重鏈恆定區包含SEQ ID NO:98、100、102、103、104或179中任一者之胺基酸序列。
  22. 如請求項21之抗體,其中該重鏈恆定區包含SEQ ID NO:100之胺基酸序列。
  23. 如請求項21之抗體,其中該重鏈恆定區進一步包含C端離胺酸殘基。
  24. 如請求項1、2及8中任一項之抗體,其為抗體片段。
  25. 如請求項1、2、8及12至14中任一項之抗體,其連接(例如共價連接)至另一分子。
  26. 如請求項25之抗體,其中該另一分子為標記或肽,或其中該抗體為抗體藥物複合體(ADC)。
  27. 一種核酸,其編碼如請求項1至24中任一項之抗體。
  28. 一種細胞,其包含如請求項27之核酸。
  29. 一種製備抗體之方法,其包含在表現該抗體之條件下培養如請求項28之細胞。
  30. 一種組合物,其包含如請求項1至28中任一項之抗體、核酸、組合物或細胞,及醫藥學上可接受之載劑。
  31. 一種如請求項30之組合物或如請求項1至26中任一項之抗體的用途,其係用於製備治療個體之癌症的藥物。
  32. 如請求項31之用途,其中該個體經投與第二療法。
  33. 如請求項32之用途,其中該第二療法為放射線療法、手術或投與第二藥劑。
  34. 如請求項33之用途,其中該第二藥劑為免疫刺激劑。
  35. 如請求項34之用途,其中該免疫刺激劑為免疫抑制分子之拮抗劑,或免疫刺激分子之促效劑。
  36. 如請求項35之用途,其中該免疫刺激劑為PD-1/PD-L1、CTLA-4或LAG-3之拮抗劑,或GITR或OX40之促效劑。
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