TWI793070B - 二氫吲哚類似物及其用途 - Google Patents

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Abstract

本發明提供用作EWS-FLI1轉錄因子抑制劑之二氫吲哚衍生物化合物。亦提供該等二氫吲哚衍生物之醫藥組合物、合成該等衍生物之方法、使用該等衍生物之治療方法,及用於鑑別EWS-FLI1致癌蛋白抑制劑之分析。

Description

二氫吲哚類似物及其用途
本發明提供用作EWS-FLI1轉錄因子抑制劑之二氫吲哚類似物化合物。亦提供二氫吲哚類似物之醫藥組合物、合成該等類似物之方法、使用該等類似物之治療方法及用於鑑別EWS-FLI1致癌蛋白抑制劑之分析。
各種各樣之尤恩氏肉瘤腫瘤家族(Ewing’s sarcoma family of tumors,ESFT)中所存在之EWS-FLI轉錄因子已在十多年前進行表徵。在治療尤恩氏肉瘤(兒童及青少年中第二最常見之骨腫瘤)方面之進展已改良患有局部腫瘤之患者之存活。然而,具有轉移之患者仍然情況不佳且療法具有短期及長期毒性。尤恩氏肉瘤腫瘤家族(ESFT)之特徵在於產生EWS-FLI1 (致癌融合轉錄因子)之染色體易位,據信EWS-FLI1之持續表現對於ESFT細胞存活至關重要(Balamuth, NJ, Womer, RB,Lancet Oncology 11, 184-192 (2010))。 活體外及活體內研究已展示,抑制致癌蛋白EWS-FLI1與RNA解旋酶A (RHA)之結合使得ESFT細胞系之增殖減少且腫瘤體積減少。EWS-FLI1缺少酶活性,然而,且因此RNA解旋酶A (RHA)與EWS-FLI1調節之腫瘤形成之間之蛋白質-蛋白質相互作用係維持腫瘤生長所需的(Hyariye N Erkizan等人,Nature Medicine 15(7) 750-756 (2009))。破壞關鍵蛋白質相互作用之範例可用於治療疾病,其包括具有類似易位之肉瘤及具有MLL易位之白血病((Helman LJ、Meltzer P.,Mechanisms of sarcoma development. Nat Rev Cancer 2003;3(9):685-94);及Pui CH等人,N Engl J Med 2004;350(15):1535-48)。此外,基於其固有生物化學性質,無序蛋白質可係優良治療靶標(Cheng Y、LeGall T、Oldfield CJ等人,Trends Biotechnol 2006;24(10):435-42)。
儘管對於針對EWS-FLI1之反義及siRNA已進行多年的活體外及異種移植物研究,但迄今為止基於不適當之遞送及穩定性,該等作為人類療法均不實際。因此,業內需要治療諸如ESFT之病症之改良療法。 FLI-1係ETS家族轉錄因子之成員,其通常在發育中之胚胎中有活性,但出生後則無活性。此轉錄因子家族有29個成員,其中之4個成員FLI-1、ETV1、ETV4及ERG與多種癌症相關。 靶向抑制FLI1、ETV1、ETV4或ERG之致癌融合蛋白或轉錄因子自身之結合之治療性化合物可用於治療包括以下之癌症:尤恩氏肉瘤腫瘤家族、胰臟癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、非小細胞肺癌及其他若干種癌症。較佳實施例滿足該等需要,且亦提供其他優點。 本文中所揭示之一些實施例係關於本文中所闡述之式(I)-(VII)化合物,包括(例如)以下形式:立體異構物、游離形式、其醫藥上可接受之鹽或酯、溶劑合物或此等形式之組合。 本文中所揭示之一些實施例係關於治療哺乳動物中癌症之方法,其包含向該哺乳動物投與有效量之一或多種式(I)-(VII)化合物,包括(例如)立體異構物、游離形式或其醫藥上可接受之鹽之形式;或包括一或多種式(I)-(VII)化合物之醫藥組合物,其包括(例如)立體異構物、游離形式或其醫藥上可接受之鹽之形式。本文中所闡述之其他實施例係關於使用一或多種式(I)-(VII)化合物、包括(例如)立體異構物、游離形式或其醫藥上可接受之鹽之形式用於製造用於治療癌症之藥劑。 本文中所闡述之其他實施例係關於用於治療癌症之式(I)-(VII)化合物,包括(例如)立體異構物、游離形式或其醫藥上可接受之鹽之形式,其中該癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌、前列腺癌及子宮癌。下文更詳細地闡述該等及其他實施例。
以引用方式併入之相關申請案 本申請案主張於2016年3月31日提出申請之美國臨時申請案第62/316,156號及於2016年11月4日提出申請之美國臨時申請案第62/417,621號之權益。上文所提及之申請案中之每一者均係以全文引用的方式併入本文中,且在此各自明確地作為本說明書之一部分。 以下闡述及實例詳細地說明本發明之較佳實施例。熟習此項技術者將認識到,本發明之範圍涵蓋本發明之多種變化形式及修改。因此,較佳實施例之描述不應視為限制本發明之範圍。 產生致癌轉錄因子之染色體易位係多種腫瘤之標誌,包括許多肉瘤。尤恩氏肉瘤腫瘤家族(ESFT)之特徵在於t(11;22)(q24;q12)易位產生尤恩氏肉瘤斷裂點區1及弗雲德白血病病毒整合1 (Friend leukemia virus integration 1,EWS-FLI1)融合轉錄因子,其為此腫瘤之高度惡性表型負責。EWS-FLI1之持續表現據信對於ESFT細胞存活至關重要。EWS-FLI1由於其惡性細胞特異性而係有吸引力之針對尤恩氏肉瘤之治療靶標。此外,實驗證據指示EWS/FLI表現對於尤恩氏肉瘤腫瘤細胞必不可少。利用反義寡去氧核苷酸及RNA干擾(RNAi)活體外靶向EWS-FLI1抑制尤恩氏肉瘤細胞存活率、生長及致癌性轉化,此支持EWS-FLI1減弱作為潛在治療方式。較佳實施例之治療劑對於較大群組之腫瘤具有較寬之適用性,且可用作用於治療其他致癌轉錄因子相關惡性腫瘤(例如耐化學療法之肉瘤及白血病)及難以治療之腫瘤(例如尤恩氏肉瘤)之治療劑。定義 除非另有定義,否則本文中所使用之所有技術及科學術語均具有與熟習此項技術者所通常理解之含義相同之含義。除非另有說明,否則本文中所提及之所有專利、申請案、公開申請案及其他出版物均係以全文引用的方式併入本文中。除非另有說明,否則對於本文中之一個術語存在複數種定義時,以此部分中之定義為准。 如本文中所使用,任何「R」基團(例如但不限於R1 、R2 、R3 、R4 、R5 、R6 、R7 、R8 、R9 、R10 、R11 及R12 )表示可附接至指示原子之取代基。R基團可經取代或未經取代。若將兩個「R」基團闡述為「一起」,則R基團及其所附接之原子可形成環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環。舉例而言(但不限於),若將NRa Rb 基團之Ra 及Rb 指示為「一起」,則此意指其彼此共價鍵結以形成環:
Figure 02_image003
另外,若將兩個「R」基團闡述為與其所附接之原子「一起」形成環作為替代方式,則R基團可不限於先前所定義之變量或取代基。 如本文中所使用,「烷基」係指包含完全飽和(無雙鍵或三鍵)之烴基團之直鏈或具支鏈烴鏈。烷基可具有1至20個碳原子(在本文中出現時,諸如「1至20」之數值範圍係指給定範圍內之每一整數;例如「1至20個碳原子」意指烷基可由1個碳原子、2個碳原子、3個碳原子等(最多且包括20個碳原子)組成,但本定義亦涵蓋未指定數值範圍之術語「烷基」之出現)。烷基亦可為具有1至10個碳原子之中等大小之烷基。烷基亦可為具有1至6個碳原子之低碳數烷基。化合物之烷基可指定為「C1 -C6 烷基」或類似指定。僅舉例而言,「C1 -C6 烷基」指示在烷基鏈中存在1至6個碳原子,即,烷基鏈係選自甲基、乙基、丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基及第三丁基、戊基(直鏈及具支鏈)及己基(直鏈及具支鏈)。典型烷基包括(但決不限於)甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、第三丁基、戊基(直鏈及具支鏈)及己基(直鏈及具支鏈)。烷基可經取代或未經取代。 如本文中所使用,「環烷基」係指完全飽和(無雙鍵或三鍵)之單環或多環烴環系統。當由兩個或更多個環構成時,該等環可以稠合方式接合在一起。環烷基可含有3至10個環原子或3至8個環原子。環烷基可未經取代或經取代。典型環烷基包括(但決不限於)環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基及環辛基。 如本文中所使用,「芳基」係指遍及所有環均具有完全非定域化之π電子系統之碳環(均為碳)單環或多環芳香族環系統(包括其中兩個碳環共用化學鍵之稠合環系統)。芳基中之碳原子數可有所變化。舉例而言,芳基可為C6 -C14 芳基、C6 -C10 芳基或C6 芳基。芳基之實例包括(但不限於)苯、萘及甘菊藍。芳基可經取代或未經取代。 如本文中所使用,「雜芳基」係指含有一或多個雜原子(例如,1至5個雜原子(即除碳以外之元素,包括(但不限於)氮、氧及硫))之單環或多環芳香族環系統(具有完全非定域化之π-電子系統之環系統)。雜芳基之環中之原子數可有所變化。舉例而言,雜芳基可含有4至14個環原子、5至10個環原子或5至6個環原子。此外,術語「雜芳基」包括稠合環系統,其中兩個環(例如至少一個芳基環及至少一個雜芳基環或至少兩個雜芳基環)共用至少一個化學鍵。雜芳基環之實例包括(但不限於)呋喃、呋呫、噻吩、苯并噻吩、酞嗪、吡咯、噁唑、苯并噁唑、1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、噻唑、1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、苯并噻唑、咪唑、苯并咪唑、吲哚、吲唑、吡唑、苯并吡唑、異噁唑、苯并異噁唑、異噻唑、三唑、苯并三唑、噻二唑、四唑、吡啶、噠嗪、嘧啶、吡嗪、嘌呤、喋啶、喹啉、異喹啉、喹唑啉、喹喔啉、㖕啉及三嗪。雜芳基可經取代或未經取代。 如本文中所使用,雜環烷基係指3員、4員、5員、6員、7員、8員、9員、10員、最多18員單環、二環及三環系統,其中碳原子與1至5個雜原子一起構成該環系統。雜環可視情況含有一或多個不飽和鍵,然而,該等不飽和鍵之定位使得在遍及所有環中並不出現完全非定域化之π-電子系統。雜原子係除碳以外之元素,包括(但不限於)氧、硫及氮。雜環可進一步含有一或多個羰基或硫代羰基官能基以使得定義包括側氧基系統及硫代系統,例如內醯胺、內酯、環狀亞醯胺、環狀硫代亞醯胺及環狀胺基甲酸酯。當由兩個或更多個環構成時,該等環可以稠合方式接合在一起。另外,雜環烷基中之任何氮可經四級銨化。雜環烷基可未經取代或經取代。此等雜環烷基之實例包括(但不限於) 1,3-二氧雜環己烯、1,3-二噁烷、1,4-二噁烷、1,2-二氧雜環戊烷、1,3-二氧雜環戊烷、1,4-二氧雜環戊烷、1,3-氧硫雜環己烷、1,4-氧硫雜環己二烯、1,3-氧硫雜環戊烷、1,3-二硫雜環戊二烯、1,3-二硫戊環、1,4-氧硫雜環己烷、四氫-l,4-噻嗪、2H-1,2-噁嗪、馬來醯亞胺、琥珀醯亞胺、巴比妥酸(barbituric acid)、硫代巴比妥酸、二側氧基六氫吡嗪、乙內醯脲、二氫尿嘧啶、三噁烷、六氫-1,3,5-三嗪、咪唑啉、咪唑啶、異噁唑啉、異噁唑啶、噁唑啉、噁唑啶、噁唑啶酮、噻唑啉、噻唑啶、嗎啉、環氧乙烷、六氫吡啶N-氧化物、六氫吡啶、六氫吡嗪、吡咯啶、吡咯啶酮(pyrrolidone)、吡咯啶酮(pyrrolidinone)、4-六氫吡啶酮、吡唑啉、吡唑啶、2-側氧基吡咯啶、四氫吡喃、4H-吡喃、四氫硫代吡喃、硫代嗎啉、硫代嗎啉亞碸、硫代嗎啉碸及其苯并稠合類似物(例如苯并咪唑啶酮、四氫喹啉及3,4-亞甲基二氧基苯基)。 術語「醫藥上可接受之鹽」係指不會對其投與之有機體造成明顯刺激且不會消除該化合物之生物活性及性質之化合物之鹽。在一些實施例中,鹽係化合物之酸加成鹽。醫藥鹽可藉由使化合物與無機酸反應來獲得,該等無機酸係(例如)氫鹵酸(例如鹽酸或氫溴酸)、硫酸、硝酸及磷酸。醫藥鹽亦可藉由使化合物與諸如脂肪族或芳香族羧酸或磺酸之有機酸反應來獲得,該有機酸係(例如)甲酸、乙酸、琥珀酸、乳酸、蘋果酸、酒石酸、檸檬酸、抗壞血酸、菸鹼酸、甲磺酸、乙磺酸、對甲苯磺酸、柳酸或萘磺酸。醫藥鹽亦可藉由使化合物與鹼反應以形成諸如以下之鹽來獲得:銨鹽;鹼金屬鹽,例如,鈉鹽或鉀鹽;鹼土金屬鹽,例如,鈣鹽或鎂鹽;諸如二環己基胺、N-甲基-D-葡萄糖胺、參(羥甲基)甲胺、C1 -C7 烷基胺、環己基胺、三乙醇胺、乙二胺之有機鹼之鹽及與諸如精胺酸及離胺酸之胺基酸之鹽。 應理解,在本文中所闡述具有一或多個手性中心之任一化合物中,若未明確指示絕對立體化學,則每一中心可獨立地為R構形或S構形或其混合物。因此,本文中所提供之化合物可為鏡像異構純、鏡像異構富集、外消旋混合物、非鏡像異構純、非鏡像異構富集或立體異構混合物。另外,應理解,在本文中所闡述具有一或多個雙鍵(產生可定義為E或Z之幾何異構體)之任一化合物中,每一雙鍵可獨立地為E或Z或其混合物。 應理解,倘若本文中所揭示之化合物具有未填充之化合價,則將用氫或其同位素(例如,氫-1 (氕)、氫-2 (氘)及氫-3 (氚))填充該等化合價。在本文中所呈現之任何化學式中,應理解,H表示氕、D表示氘且T表示氚。 應理解,本文中所闡述之化合物可經同位素標記。使用諸如氘之同位素進行取代由於更大代謝穩定性從而可提供某些治療優點,例如延長活體內半衰期或減小劑量需求。如化合物結構中所表示之每一化學元素均可包括該元素之任何同位素。舉例而言,在化合物結構中,氫原子可明確地揭示或理解為存在於該化合物中。在可存在氫原子之化合物之任一位置處,氫原子可為氫之任一同位素,包括(但不限於)氫-1 (氕)、氫-2 (氘)及氫-3 (氚)。類似地,亦涵蓋碳之同位素,例如碳-12 (12 C)、碳-13 (13 C)及碳-14 (14 C)。因此,除非上下文另外明確地指明,否則本文所提及之化合物涵蓋所有可能之同位素形式。 應理解,本文中所闡述之方法及組合包括結晶形式(亦稱為多晶型,其包括化合物之相同元素組成之不同晶體堆疊佈置)、非晶相、鹽、溶劑合物及水合物。在一些實施例中,本文中所闡述之化合物以與醫藥上可接受之溶劑(例如水、乙醇或諸如此類)之溶劑合物形式存在。在其他實施例中,本文中所闡述之化合物以非溶劑合物形式存在。溶劑合物含有化學計量或非化學計量量之溶劑,且可在與醫藥上可接受之溶劑(例如水、乙醇或諸如此類)之結晶過程期間形成。當溶劑為水時形成水合物,或當溶劑為醇時形成醇合物。另外,本文中所提供之化合物可以非溶劑合物形式以及溶劑合物形式存在。通常,出於本文中所提供之化合物及方法之目的,溶劑合物形式視為等同於非溶劑合物形式。 在提供值範圍之情形下,應理解,該範圍之上限及下限及上限與下限之間之每一中間值均涵蓋於實施例內。化合物 在第一態樣中,提供具有式(I)之化合物:
Figure 02_image005
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;且其中R7 、R8 、R9 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基。 在第一態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第一態樣之實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第一態樣之實施例中,A係-OH。 在第一態樣之實施例中,R7 、R8 、R10 及R11 係H。 在第一態樣之實施例中,R9 係-OCH3 。 在第一態樣之實施例中,化合物具有式(I-12):
Figure 02_image007
在第二態樣中,提供具有式(II)之化合物:
Figure 02_image009
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;R7 、R8 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基;且其中R12 係經取代或未經取代之C1-6 烷基。 在第二態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第二態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第二態樣之實施例中,A係-OH。 在第二態樣之實施例中,R7 、R8 、R10 及R11 係H。 在第二態樣之實施例中,R12 係-CH3 。 在第二態樣之實施例中,化合物具有式(II-13):
Figure 02_image011
在第三態樣中,提供具有式(III)之化合物:
Figure 02_image013
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;其中R7 、R8 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基;且其中R12 及R13 獨立地係經取代或未經取代之C1-6 烷基。 在第三態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第三態樣之實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第三態樣之實施例中,R7 、R8 、R10 及R11 係H。 在第三態樣之實施例中,R12 及R13 係-CH3 。 在第三態樣之實施例中,化合物具有式(III-14):
Figure 02_image015
在第四態樣中,提供具有式(IV-A)、(IV-B)、(IV-C)或(IV-D)之化合物:
Figure 02_image017
Figure 02_image019
,或
Figure 02_image021
, 或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;且其中R8 、R9 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基。 在第四態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第四態樣之實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第四態樣之實施例中,A係-OH。 在第四態樣之實施例中,R8 、R10 及R11 係H。 在第四態樣之實施例中,R9 係H。 在第二態樣之實施例中,化合物具有式(IV-15)、(IV-16)、(IV-17)或(IV-18):
Figure 02_image023
,或
Figure 02_image025
在第五態樣中,提供具有式(V)之化合物:
Figure 02_image027
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;且其中R7 、R8 、R9 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基。 在第五態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第五態樣之實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第五態樣之實施例中,A係-OH。 在第五態樣之實施例中,R7 、R8 、R10 及R11 係H。 在第五態樣之實施例中,R9 係-OCH3 。 在第五態樣之實施例中,化合物具有式(V-19):
Figure 02_image029
在第六態樣中,提供具有式(VI)之化合物:
Figure 02_image031
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;且其中R7 、R8 、R10 及R11 係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、鹵素、CN、CF3 、C1-6 烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2 H、-CO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (C1-6 烷基)、-NHSO2 (芳基)、-NHCONH(C1-6 烷基)、-NHCON(C1-6 烷基)2 、-N(C1-6 烷基)CONH2 、-N(C1-6 烷基)CONH(C1-6 烷基)、-N(C1-6 烷基)CON(C1-6 烷基)2 、-SO2 (C1-6 烷基)、-SO2 NH2 、-SO2 NH(C1-6 烷基)、-SO2 N(C1-6 烷基)2 、C3-8 環烷基及C3-8 雜環烷基。 在第六態樣之實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第六態樣之實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第六態樣之實施例中,A係-OH。 在第六態樣之實施例中,R7 、R8 、R10 及R11 係H。 在第六態樣之實施例中,化合物具有式(VI-20):
Figure 02_image033
在第七態樣中,提供具有式(VII)之化合物:
Figure 02_image035
或其立體異構物、醫藥上可接受之鹽或溶劑合物,其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2 ;其中R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3 、C1-6 烷基、C1-6 烷氧基、-C(=O)NH2 、-NO2 、-NH2 及-OH;且其中G係選自由以下組成之群:
Figure 02_image037
。 在第七態樣之一個實施例中,R1 、R2 、R3 及R4 係獨立地選自由H及Cl組成之群。 在第七態樣之一個實施例中,R1 及R4 係Cl且R2 及R3 係H。 在第七態樣之一個實施例中,A係-OH。 在第七態樣之一個實施例中,化合物具有式(VII-20-21):
Figure 02_image039
在第八態樣中,提供醫藥組合物,其包含第一直至第六態樣中任一者或其任一實施例之化合物及醫藥上可接受之載劑。 在第九態樣中,提供醫藥組合物,其包含第一直至第六態樣中任一者或其任一實施例之化合物及醫藥上可接受之賦形劑。 在第十態樣中,提供醫藥組合物,其包含第一直至第六態樣中任一者或其任一實施例之化合物及至少一種額外醫藥活性劑。 在第十一態樣中,提供治療癌症之方法,其包含向需要其之個體投與有效量之第一態樣或其任一實施例之化合物。 在第十一態樣之一個實施例中,個體係哺乳動物。 在第十一態樣之一個實施例中,個體係人類。 在第十一態樣之一個實施例中,癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。 在第十二態樣中,提供一種殺死或抑制贅瘤細胞生長之方法,其包含使該細胞與有效量之第一態樣或其任一實施例之化合物接觸。 在第十二態樣之一個實施例中,細胞係哺乳動物。 在第十二態樣之一個實施例中,細胞係人類。 在第十二態樣之一個實施例中,細胞係在活體外。 在第十二態樣之一個實施例中,細胞係在活體內。 在第十二態樣之一個實施例中,細胞係癌細胞,癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。 在第十三態樣中,一種抑制細胞增殖之方法,其中該細胞過度表現ETS基因或包含ETS融合基因,該方法包含使該細胞與有效量之第一態樣或其任一實施例之化合物接觸。 在第十三態樣之一個實施例中,ETS基因或ETS融合基因係選自由以下組成之群:FLI1、ERG、ETV1及ETV4。 在第十三態樣之一個實施例中,細胞係哺乳動物。 在第十三態樣之一個實施例中,細胞係人類。 在第十三態樣之一個實施例中,細胞係在活體外。 在第十三態樣之一個實施例中,細胞係在活體內。 在第十三態樣之一個實施例中,細胞係癌細胞,癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。 第一直至第十三態樣之實施例之任何特徵均適用於本文中所鑑別之所有態樣及實施例。此外,第一直至第十三態樣之實施例之任何特徵可以任何方式獨立地部分或全部地與本文中所闡述之其他實施例組合,例如,一個、兩個或三個或更多個實施例可全部或部分地組合。此外,第一直至第十三態樣之實施例之任何特徵對於其他態樣或實施例係可選的。方法之任何態樣或實施例可使用另一態樣或實施例之化合物或組合物來實施,且化合物或組合物之任何態樣或實施例可用於實施另一態樣或實施例之方法。合成方法 本文中所闡述之式(I)-(VII)化合物可以各種方式來製備。本文中顯示並闡述至式(I)-(VII)化合物之一般合成途徑。本文中所顯示並闡述之途徑僅為說明性且並不意欲或其不應解釋為以任一方式限制申請專利範圍之範圍。熟習此項技術者將能夠認識到所揭示合成之修改並基於本文之揭示內容來設計替代途徑;所有此等修改及替代途徑均在申請專利範圍之範圍內。 (I) 化合物 式(I)化合物可藉由以下合成途徑來製備。該合成途徑係以下中所闡述途徑之修改:Thompson等人,「Tyrosine Kinase Inhibitors. 1. Structure- Activity Relationships for Inhibition of Epidermal Growth Factor Receptor Tyrosine Kinase Activity by 2,3-Dihydro-2-thioxo-1H -indole-3-alkanoic Acids and 2,2’-Dithiobis(1H -indole-3-alkanoic acids)」 J. Med. Chem. 1993, 36, 2459-2469,該文之全部內容係以引用的方式併入本文中。
Figure 02_image041
(II) 化合物 式(II)化合物可藉由以下合成途徑來製備。該合成途徑係以下中所闡述途徑之修改:Al-Rawi, H.、Williams,A.,Journal of the American Chemical Society,第99卷,(1977),第2671 - 2678頁;Kulkarni、Naik、Tandel、Rajappa、Tetrahedron,第47卷,第7期,(1991),第1249 - 1256頁;Deshpande, Sunita R.、Likhite, Anjali P.、Rajappa, Srinivasachari、Tetrahedron,第50卷,第34期,(1994),第10367 - 10370頁;Al Sabbagh, Mohamed Mowafak、Calmon, Michelle、Calmon, Jean-Pierre,Bulletin de la Societe Chimique de France,第2卷,第3-4期,(1983),第73 - 77頁;Iwakura、Nabeya,Journal of Organic Chemistry,第26卷,(1961),第4384,4387頁;Iwakura、Nabeya,Journal of Organic Chemistry,第26卷,(1961),第4384,4387頁;Schwezowa-Schilowskaja等人,J. Gen. Chem. USSR (Engl. Transl.),第33卷,(1963),第2109,2054頁;及美國專利第4,376,731號;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。
Figure 02_image043
(III) 化合物 式(II)化合物可藉由以下合成途徑來製備。該合成途徑係以下中所闡述途徑之修改:美國專利第3,631,177號;美國專利第3,592,813號;美國專利第3,435,034號;及Kobayashi等人,「Studies on Indole Derivatives. I. Synthesis of 3-Phenyl-9H -pyridazino[3,4-b ]indole Derivatives」 Chemical & Pharmaceutical Bulletin 12(10), 1964年10月, 1129-1135;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。
Figure 02_image045
(IV) 化合物 式(IV)化合物可藉由以下合成途徑來製備。 (IV-A) 化合物 可採用兩種替代途徑來製備式(IV-A )化合物。在一種方法中,在合成順序之最後一步中經由分子內置換倒數第二中間體(IV-15A) 之氟原子形成吲唑。然而,可需要升高之溫度,且此可導致第三羥基消除從而產生E/Z烯烴。
Figure 02_image047
替代合成方法涉及使用可由不同方法產生之有機金屬吲唑試劑作為藉由直接去質子化或鹵素交換產生之Li或Mg有機金屬。在打開環氧化物時,亦可使用銅酸鹽,如以下中所闡述:WO2004/18441;WO2006/135826;Lipshutz等人,Journal of Organic Chemistry,第49卷,第21期,(1984),第3928 - 3938頁;Sone等人,Journal of the American Chemical Society,第130卷,第31期,(2008),第10078 - 10079頁;WO2012/177603;Chen等人,Journal of Organic Chemistry,第62卷,第13期,(1997),第4349 - 4357頁;Yadav等人,Tetrahedron Letters,第42卷,第13期,(2001),第2557 - 2559頁;Archelas、Furstoss,Journal of Organic Chemistry,第64卷,第16期,(1999),第6112 - 6114頁;Fujisawa等人,Chemistry Letters,(1988),第59 - 62頁;US5057529;Wakabayashi等人,Journal of Organic Chemistry,第75卷,第13期,(2010),第4337 - 4343頁;Kireenko等人,Dalton Transactions,第44卷,第26期,(2015),第11963 - 11976頁;Bawden等人,European Journal of Medicinal Chemistry,第18卷,第1期,(1983),第91 - 96頁;Coppola等人,Journal of Heterocyclic Chemistry,第18卷,(1981),第31 - 35頁;EP613890;US4935436;Cristol等人,Journal of the American Chemical Society,第73卷,(1951),第816頁;Lipshutz等人,Journal of the American Chemical Society,第104卷,第8期,(1982),第2305 - 2307頁;US2016/75712;Lam等人,Chemistry - A European Journal,第22卷,第13期,(2016),第4440 - 4446頁;Buchstaller等人,Synthesis,第19期,(2011),第3089 - 3098頁,文章編號:T48411SS;Lynch等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,第23卷,第9期,(2013),第2793 - 2800頁;Youngsaye等人,Beilstein Journal of Organic Chemistry,第9卷,(2013),第1501 - 1507頁;Slade等人,Journal of Organic Chemistry,第74卷,第16期,(2009),第6331 - 6334頁;Lukin等人,Journal of Organic Chemistry,第71卷,第21期,(2006),第8166 - 8172頁;Tung等人,Journal of Medicinal Chemistry,第54卷,第8期,(2011),第3076 - 3080頁;WO2012/3418;Wheeler等人,Organic Process Research and Development,第15卷,第3期,(2011),第565 - 569頁;WO2014/152144;Tono-Oka等人,Bulletin of the Chemical Society of Japan,第58卷,第1期,(1985),第309 - 315頁;Vernekar等人,Journal of Medicinal Chemistry,第53卷,第5期,(2010),第2324 - 2328頁;Shimada等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry,第16卷,第4期,(2008),第1966 - 1982頁;Senwar等人,European Journal of Medicinal Chemistry,第102卷,(2015),第413 - 424頁,文章編號:8053;Hajra等人,Organic Letters,第17卷,第14期,(2015),第3430 - 3433頁;Gorokhovik等人,Organic Letters,第13卷,第20期,(2011),第5536 - 5539頁;Pace等人,Advanced Synthesis and Catalysis,第358卷,第2期,(2016),第172 - 177頁;Kennewell等人,Journal of Chemical Research, Miniprint,第10期,(1995),第2380 - 2388頁;Chouhan等人,Green Chemistry,第13卷,第9期,(2011),第2553 - 2560頁;Li等人,Organic Letters,第17卷,第5期,(2015),第1098 - 1101頁;Allous等人,European Journal of Organic Chemistry,第27期,(2011),第5303 - 5310頁;Wille, S.,Synthesis,第5期,(2001),第759 - 762頁;Aikawa等人,European Journal of Organic Chemistry,第1期,(2011),第62 - 65頁;Vyas等人,Journal of Organic Chemistry,第75卷,第19期,(2010),第6720 - 6723頁;Banerjee等人,RSC Advances,第4卷,第63期,(2014),第33236 - 33244頁;Sabahi等人,Angewandte Chemie國際版,第45卷,第26期,(2006),第4317 - 4320頁;Noole等人,Chemistry - A European Journal,第18卷,第47期,(2012),第14929 - 14933頁;Li等人,Angewandte Chemie國際版,第52卷,第17期,(2013),第4628 - 4632頁;Quintavalla等人,Journal of Organic Chemistry,第78卷,第23期,(2013),第12049 - 12064頁;Badiola等人,Journal of the American Chemical Society,第136卷,第51期,(2014),第17869 - 17881頁;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。6-甲氧基-1H -吲唑可自6-羥基吲唑或2-氟-4-甲氧基-苯甲醛製備。
Figure 02_image049
Figure 02_image051
(IV-B) 化合物 式(IV-B)化合物可使用如以下中所闡述之反應之修改來製備:US2008/194661;WO2006/109933;Lebouvier等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,第17卷,第13期,(2007),第3686 - 3689頁;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。5-甲氧基-1H -吲唑可自2-氟-5-甲氧基-苯甲醛製備(參見Lukin,JOC, 2006, 第8166頁)。
Figure 02_image053
(IV-C) 化合物 式(IV-C)化合物可使用如以下中所闡述之反應之修改來製備:US5538984;Chen等人,Organic Letters,第13卷,第23期,(2011),第6300 - 6303頁;Villalobos等人,Journal of Medicinal Chemistry,第37卷,第17期,(1994),第2721 - 2734頁;Sahasrabudhe等人,Indian Journal of Chemistry, Section B: Organic Chemistry Including Medicinal Chemistry,第22卷,第12期,(1983),第1266 - 1267頁;US5856503;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。6-甲氧基-3-甲基苯并[d]異噁唑可自2-羥基-4-甲氧基-苯乙酮製備。
Figure 02_image055
(IV-D) 化合物 式(IV-D)化合物可使用如以下中所闡述之反應之修改來製備:Villalobos等人,Journal of Medicinal Chemistry,第37卷,第17 期,(1994),第2721 - 2734頁;Buchwald,S.、Watson,B.T.、Lum,R.T.,Journal of the American Chemical Society,第109卷,(1987),第7137頁;McKinnon, David M.、Lee, Kingsley R.,Canadian Journal of Chemistry,第66卷,(1988),第1405 - 1409頁;Devarie-Baez, Nelmi O.、Xian, Ming,Organic Letters,第12卷,第 4期,(2010),第752 - 754頁;Creed、Leardini、McNab、Nanni、Nicolson、Reed,Journal of the Chemical Society. Perkin Transactions 1,第 9期,(2001),第1079 - 1085頁;Clarke,K.等人,Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions 1: Organic and Bio-Organic Chemistry (1972-1999),(1973),第356 - 359頁;Carrington,D.E.L.等人,Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions 1: Organic and Bio-Organic Chemistry (1972-1999),(1972),第3006 - 3010頁;US5856503;WO2010/33643;Lou, Zhen-Bang、Pang, Xin-Long、Chen, Chao、Wen, Li-Rong、Li, Ming,Chinese Chemical Letters,第26卷,第 10期,(2015),第1231 - 1235頁;Chen, Qiang、Huo, Xing、Zheng, Huaiji、She, Xuegong,Synlett,第23卷,第 9期,(2012),第1349 - 1352頁;Wang, Feijun、Zhang, Yong Jian、Wei, Hao、Zhang, Jiaming、Zhang, Wanbin,Tetrahedron Letters,第48卷,第 23期,(2007),第4083 - 4086頁;Wang, Feijun、Zhang, Yong Jian、Yang, Guoqiang、Zhang, Wanbin,Tetrahedron Letters,第48卷,第 24期,(2007),第4179 - 4182頁;Pump, Eva、Poater, Albert、Zirngast, Michaela、Torvisco, Ana、Fischer, Roland、Cavallo, Luigi、Slugovc, Christian,Organometallics,第33卷,第 11期,(2014),第2806 - 2813頁;Moreno-Sanz, Guillermo、Duranti, Andrea、Melzig, Laurin、Fiorelli, Claudio、Ruda, Gian Filippo、Colombano, Giampiero、Mestichelli, Paola、Sanchini, Silvano、Tontini, Andrea、Mor, Marco、Bandiera, Tiziano、Scarpelli, Rita、Tarzia, Giorgio、Piomelli, Daniele,Journal of Medicinal Chemistry,第56卷,第 14期,(2013),第5917 - 5930頁;WO2011/30955;US2012/214991;Oki,Bulletin of the Chemical Society of Japan,第26卷,(1953),第331,334頁;Zara-Kaczian, Erzsebet、Deak, Gyula、Gyoergy, Lajos,Acta Chimica Hungarica,第126卷,第 4期,(1989),第441 - 454頁;Bartoli, Giuseppe、Bosco, Marcella、Marcantoni, Enrico、Massaccesi, Massimo、Rinaldi, Samuele、Sambri, Letizia,Tetrahedron Letters,第43卷,第 36期,(2002),第6331 - 6333頁;US2010/4159;Zhang, Xiaohong、Lou, Cong、Li, Ningbo、Xu, Xinhua、Qiu, Renhua、Yin, Shuangfeng,Journal of Organometallic Chemistry,第749卷,(2014),第241 - 245頁;Tan, Lay Pheng、Wu, Hao、Yang, Peng-Yu、Kalesh, Karunakaran A.、Zhang, Xiaohua、Hu, Mingyu、Srinivasan, Rajavel、Yao, Shao Q.,Organic Letters,第11卷,第 22期,(2009),第5102 - 5105頁;其全部內容均係以引用的方式併入本文中。6-甲氧基-3-甲基苯并[d]異噻唑可自2-氟-4-甲氧基-苯乙酮或2-溴-4-甲氧基-苯乙酮製備。
Figure 02_image057
(V) 化合物 式(V)化合物可藉由以下合成途徑並使用如以下中所闡述之反應之修改來製備:Dubinski等人,Diazirine based photoaffinity labeling, Bioorganic & Medicinal Chemistry 20 (2012) 554-570,其全部內容係以引用的方式併入本文中。
Figure 02_image059
(VI) 化合物 式(VI)化合物可藉由以下合成途徑來製備。1-(4-疊氮基苯基)乙-1-酮可自4-胺基-苯乙酮製備。
Figure 02_image061
亦可採用替代途徑。
Figure 02_image063
(VII) 化合物 式(VII)化合物可使用4,7-二氯靛紅與適宜甲基-芳基酮之間之標準縮合條件來製備。舉例而言,參見:
Figure 02_image065
可採用以下合成途徑:
Figure 02_image067
可適用於製備式(VII)化合物之合成途徑之闡述包括以下:Reck等人,Journal of Medicinal Chemistry,第50卷,第 20期,(2007),第4868 - 4881頁;W098/46605;WO2005/116022;WO2005/116023;Markevitch等人,33,19,2003,3285 - 3290;Fosso等人,Organic and Biomolecular Chemistry,第13卷,第 36期,(2015),第9418 - 9426頁;WO2008/108988;Jo等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry,第12卷,第 22期,(2004),第5909 - 5915頁;Abarca等人,Tetrahedron,第64卷,第 17期,(2008),第3794 - 3801頁;Huo等人,Dalton  Transactions,第40卷,第 29期,(2011),第7534 - 7540頁;WO2015/27021;WO2012/21467;US2014/249132;WO2008/91681;US2010/16298;WO2013/144224;WO2013/91096;Matulenko等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry,第13卷,第 11期,(2005),第3705 - 3720頁;Karlsson, Olle,Synthetic Communications,第11卷,第 1期,(1981),第29 - 34頁;Sun等人,Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,第21卷,第 19期,(2011),第5849 - 5853頁;US9138427;Stamford等人,ACS Medicinal Chemistry Letters,第3卷,第 11期,(2012),第897 - 902頁;US2003/114666;WO2014/31784;Stanetty等人,Monatshefte fuer Chemie,第120卷,(1989),第53 - 63頁;Sharf等人,Chemistry of Heterocyclic Compounds (New York, NY, United States),第18卷,第 2期,(1982),第130 - 133頁;Khimiya Geterotsiklicheskikh Soedinenii,第18卷,第 2期,(1982),第171 - 175頁;Molander等人,Journal of Organic Chemistry,第73卷,第 19期,(2008),第7481 - 7485頁;WO2015/134701。鹽形式 端視所存在之取代基而定,小分子抑制劑可呈醫藥上可接受之鹽形式。如本文中所使用之術語「醫藥上可接受之鹽」係廣義術語且將給予其對於熟習此項技術者而言常用及習用含義(且不限於特定或專用含義),且係指(但不限於)自醫藥上可接受之無毒酸或鹼製備之鹽。適宜醫藥上可接受之鹽包括金屬鹽,例如鋁、鋅之鹽;鹼金屬鹽,例如鋰鹽、鈉鹽及鉀鹽;鹼土金屬鹽,例如鈣鹽及鎂鹽;有機鹽,例如離胺酸、N,N’-二苄基乙二胺、氯普魯卡因(chloroprocaine)、膽鹼、二乙醇胺、乙二胺、葡甲胺(N-甲基葡萄糖胺)、普魯卡因及tris之鹽;游離酸及鹼之鹽;無機鹽,例如硫酸鹽、鹽酸鹽及氫溴酸鹽;及當前廣泛用於醫藥用途並列示於熟習此項技術者所熟知來源(例如The Merck Index)中之其他鹽。可選擇任何適宜成份來製造本文中所論述之治療劑之鹽,條件係其無毒且實質上不干擾所期望之活性。異構形式 較佳實施例之化合物可包括異構物、外消旋物、光學異構物、鏡像異構物、非鏡像異構物、互變異構物及順式/反式構象異構物。所有此等異構形式均包括於較佳實施例內,包括其混合物。如上文所論述,較佳實施例之化合物可具有手性中心,例如,其可含有不對稱碳原子且因此可以鏡像異構物或非鏡像異構物及其混合物之形式(例如,外消旋物)存在。不對稱碳原子可存在於(R)-或(S)-構形中,或可作為(R)-及(S)-形式之混合物存在。以下係式(I)-(VII)化合物之異構形式:
Figure 02_image069
Figure 02_image071
Figure 02_image073
Figure 02_image075
化合物可呈非晶形式或呈結晶形式。較佳實施例之化合物之結晶形式可作為多晶型物存在,其包括於較佳實施例中。另外,較佳實施例之一些化合物亦可與水或其他有機溶劑形成溶劑合物。類似地,此等溶劑合物包括於較佳實施例之範圍內。某些醫藥組合物 通常較佳以靜脈內或皮下單位劑型投與較佳實施例之抑制劑;然而,亦預期其他投與途徑。預期投與途徑包括(但不限於)經口、非經腸、靜脈內及皮下。較佳實施例之抑制劑可調配為(例如)用於經口投與之液體製劑。適宜形式包括懸浮液、糖漿、酏劑及諸如此類。用於經口投與之尤佳單位劑型包括錠劑及膠囊。經構形用於每天一次投與之單位劑型尤佳;然而,在某些實施例中,可期望使單位劑型經構形用於每天兩次或更多次投與。 較佳實施例之醫藥組合物較佳地與接受者之血液或其他體液等滲。組合物之等滲性可使用酒石酸鈉、丙二醇或其他無機或有機溶質來達到。氯化鈉尤佳。可採用緩衝劑,例如乙酸及鹽、檸檬酸及鹽、硼酸及鹽及磷酸及鹽。非經腸媒劑包括氯化鈉溶液、林格氏右旋糖(Ringer’s dextrose)、右旋糖及氯化鈉、乳酸林格氏液或不揮發性油。靜脈內媒劑包括流體及營養補充劑、電解質補充劑(例如基於林格氏右旋糖之彼等)及諸如此類。 可使用醫藥上可接受之增稠劑將醫藥組合物之黏度維持在所選擇之程度。甲基纖維素較佳,此乃因其可容易地並經濟地獲得且易於使用。其他適宜增稠劑包括(例如)黃原膠、羧甲基纖維素、羥丙基纖維素、卡波姆(carbomer)及諸如此類。增稠劑之較佳濃度將取決於所選擇之增稠劑。較佳使用將達成所選擇黏度之量。黏性組合物通常藉由添加此等增稠劑自溶液製備。 可採用醫藥上可接受之防腐劑來增加醫藥組合物之儲放壽命。苄醇可係適宜的,但亦可採用包括(例如)以下之各種防腐劑:對羥基苯甲酸酯、硫柳汞、氯丁醇或氯化苄烷銨。基於組合物之總重量,防腐劑之適宜濃度通常係約0.02%至約2%,但端視所選試劑,可期望更大或更小之量。如上文所述,還原劑可有利地用於維持調配物之良好儲放壽命。 端視於投與途徑及所期望之製劑,較佳實施例之抑制劑可與適宜載劑、稀釋劑或賦形劑(例如無菌水、生理鹽水、葡萄糖或諸如此類)混合且可含有輔助物質(例如潤濕劑或乳化劑、pH緩衝劑、膠凝劑或黏度增強添加劑、防腐劑、矯味劑、色彩及諸如此類)。例如,參見「Remington: The Science and Practice of Pharmacy」, Lippincott Williams & Wilkins;第20版(2003年6月1日)及「Remington’s Pharmaceutical Sciences,」 Mack Pub.Co.;第18版及第19版(分別1985年12月及1990年6月)。此等製劑可包括錯合劑、金屬離子、聚合化合物(例如聚乙酸、聚乙醇酸、水凝膠、聚葡萄糖及諸如此類)、脂質體、微乳液、膠束、單層或多層囊泡、紅血球血影或球芽。用於脂質體調配物之適宜脂質包括(但不限於)單甘油酯、二甘油酯、硫脂、溶血卵磷脂、磷脂、皂素、膽汁酸及諸如此類。此等額外組份之存在可影響物理狀態、溶解性、穩定性、活體內釋放速率及活體內清除速率,且因此根據預期應用進行選擇使得載劑之特性適於所選擇之投與途徑。 對於經口投與而言,醫藥組合物可作為以下來提供:錠劑、水性或油性懸浮液、可分散之粉末或顆粒、乳液、硬質或軟質膠囊、糖漿或酏劑。意欲用於經口使用之組合物可根據業內已知之用於製造醫藥組合物之任何方法來製備,且可包括以下試劑之一或多者:甜味劑、矯味劑、著色劑及防腐劑。水性懸浮液可含有活性成份與適於製造水性懸浮液之賦形劑之混合物。 用於經口使用之調配物亦可作為硬質明膠膠囊提供,其中一或多種活性成份與惰性固體稀釋劑(例如碳酸鈣、磷酸鈣或高嶺土(kaolin))混合或作為軟質明膠膠囊提供。在軟質膠囊中,抑制劑可溶解於或懸浮於諸如水或油介質之適宜液體中,例如花生油、橄欖油、脂肪油、液體石蠟或液體聚乙二醇。亦可使用調配用於經口投與之穩定劑及微球體。膠囊可包括由明膠製成之推合式膠囊以及由明膠及塑化劑(例如甘油或山梨醇)製成之軟質密封膠囊。推合式膠囊可含有活性成份與填充劑(例如乳糖)、黏合劑(例如澱粉)及/或潤滑劑(例如滑石或硬脂酸鎂)及視情況穩定劑之混合物。 錠劑可未經包衣或藉由已知方法包衣以延遲在胃腸道中之崩解及吸收並藉此提供較長時期內之持續作用。舉例而言,可使用延時材料(例如單硬脂酸甘油酯)。當以固體形式(例如錠劑形式)投與時,固體形式通常包含約0.001 wt. %或更少至約50 wt. %或更多之活性成份,較佳地約0.005 wt. %、0.01 wt. %、0.02 wt. %、0.03 wt. %、0.04 wt. %、0.05 wt. %、0.06 wt. %、0.07 wt. %、0.08 wt. %、0.09 wt. %、0.1 wt. %、0.2 wt. %、0.3 wt. %、0.4 wt. %、0.5 wt. %、0.6 wt. %、0.7 wt. %、0.8 wt. %、0.9 wt. %或1 wt. %至約2 wt. %、3 wt. %、4 wt. %、5 wt. %、6 wt. %、7 wt. %、8 wt. %、9 wt. %、10 wt. %、15 wt. %、20 wt. %、25 wt. %、30 wt. %、35 wt. %、40 wt. %或45 wt. %。 錠劑可含有活性成份與無毒之醫藥上可接受之賦形劑(包括惰性材料)混合。舉例而言,錠劑可視情況與一或多種另外成份一起壓製或模製來製備。壓製錠劑可藉由在適宜機器中壓製呈自由流動形式(例如粉末或顆粒)之活性成份,視情況與黏合劑、潤滑劑、惰性稀釋劑、表面活性劑或分散劑混合來製備。模製錠劑可藉由在適宜機器中模製經惰性液體稀釋劑濕潤之粉末狀抑制劑之混合物來製得。 較佳地,每一錠劑或膠囊含有約1 mg或更少至約1,000 mg或更多之較佳實施例之抑制劑,更佳地約10 mg、20 mg、30 mg、40 mg、50 mg、60 mg、70 mg、80 mg、90 mg或100 mg至約150 mg、200 mg、250 mg、300 mg、350 mg、400 mg、450 mg、500 mg、550 mg、600 mg、650 mg、700 mg、750 mg、800 mg或900 mg。最佳地,錠劑或膠囊係以容許投與分次劑量之劑量範圍內提供。因此,可方便地選擇適合於患者之劑量及每天投與之劑數。在某些實施例中,較佳地可將兩種或更多種欲投與之治療劑併入單一錠劑或其他劑型中(例如在組合療法中);然而,在其他實施例中,較佳可以各別劑型提供治療劑。 適宜惰性材料包括稀釋劑,例如碳水化合物、甘露醇、乳糖、無水乳糖、纖維素、蔗糖、經修飾之聚葡萄糖、澱粉及諸如此類;或無機鹽,例如三磷酸鈣、磷酸鈣、磷酸鈉、碳酸鈣、碳酸鈉、碳酸鎂及氯化鈉。調配物中可包括崩解劑或造粒劑,例如澱粉(例如玉米澱粉)、海藻酸、羧基乙酸澱粉鈉、安伯來特(Amberlite)、羧甲基纖維素鈉、超支鏈澱粉(ultramylopectin)、海藻酸鈉、明膠、橙皮、酸羧甲基纖維素、天然海綿及膨潤土、不溶性陽離子交換樹脂、粉末狀樹膠(例如瓊脂、刺梧桐膠(karaya)或黃蓍膠),或海藻酸或其鹽。 可使用黏合劑以形成硬錠劑。黏合劑包括來自天然產物之材料,例如阿拉伯樹膠、黃蓍膠、澱粉及明膠、甲基纖維素、乙基纖維素、羧甲基纖維素、聚乙烯吡咯啶酮、羥丙基甲基纖維素及諸如此類。 錠劑調配物中可包括潤滑劑,例如硬脂酸或其鎂鹽或鈣鹽、聚四氟乙烯、液體石蠟、植物油及蠟、月桂基硫酸鈉、月桂基硫酸鎂、聚乙二醇、澱粉、滑石、熱解(pyrogenic)二氧化矽、水合矽鋁酸鹽及諸如此類。 亦可採用表面活性劑,例如陰離子清潔劑(例如月桂基硫酸鈉、磺基琥珀酸二辛基酯鈉及磺酸二辛基酯鈉)、陽離子清潔劑(例如氯化苄烷銨或氯化本索寧(benzethonium chloride)或非離子清潔劑(例如聚氧乙烯氫化蓖麻油、單硬脂酸甘油酯、聚山梨醇酯、蔗糖脂肪酸酯、甲基纖維素或羧甲基纖維素)。 可採用控制釋放調配物,其中將阿米福汀(amifostine)或其類似物併入至容許藉由擴散或浸出機制釋放之惰性基質中。緩慢降解基質亦可併入至調配物中。其他遞送系統可包括定時釋放、延遲釋放或持續釋放遞送系統。 可使用諸如以下塗層:非腸溶性材料,例如甲基纖維素、乙基纖維素、羥基乙基纖維素、甲基羥基-乙基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基-甲基纖維素、羧基-甲基纖維素鈉、聚維酮(providone)及聚乙二醇,或腸溶性材料,例如苯二甲酸酯。可添加染料或顏料用於鑑別或表徵不同抑制劑劑量之組合。 當以液體形式經口投與時,可將諸如水、石油、動物或植物來源之油(例如花生油、礦物油、大豆油或芝麻油或合成油)之液體載劑添加至活性成份。生理鹽水溶液、右旋糖或其他醣溶液或二醇(例如乙二醇、丙二醇或聚乙二醇)亦係適宜液體載劑。醫藥組合物亦可呈水包油乳液形式。油相可為植物油(例如橄欖油或花生油)、礦物油(例如液體石蠟)或其混合物。適宜乳化劑包括天然樹膠,例如阿拉伯樹膠及黃蓍樹膠;天然磷脂,例如大豆卵磷脂;衍生自脂肪酸及己糖醇酐之酯或偏酯,例如去水山梨醇單油酸酯;及該等偏酯與環氧乙烷之縮合產物,例如聚氧乙烯去水山梨醇單油酸酯。乳液亦可含有甜味劑及矯味劑。 亦可採用經肺遞送。化合物在吸入時遞送至肺並穿過肺上皮內層至血液流。可採用設計用於經肺遞送治療產品之多種機械裝置,包括(但不限於)霧化器、定劑量吸入器及粉末吸入器,所有該等為熟習此項技術者所熟悉。該等裝置採用適於分配化合物之調配物。通常,每一調配物對於所採用之裝置類型具有特異性,且可包括使用除可用於療法中之稀釋劑、佐劑及/或載劑以外之適當推進劑材料。 化合物及/或其他可選活性成份有利地以平均粒徑為0.1 mm或更小至10 mm或更大,更佳地約0.2 mm、0.3 mm、0.4 mm、0.5 mm、0.6 mm、0.7 mm、0.8 mm、或0.9 mm至約1.0 mm、1.5 mm、2.0 mm、2.5 mm、3.0 mm、3.5 mm、4.0 mm、4.5 mm、5.0 mm、5.5 mm、6.0 mm、6.5 mm、7.0 mm、7.5 mm、8.0 mm、8.5 mm、9.0 mm或9.5 mm之微粒形式製備用於經肺遞送。用於經肺遞送抑制劑之醫藥上可接受之載劑包括碳水化合物,例如海藻糖、甘露醇、木糖醇、蔗糖、乳糖及山梨醇。用於調配物中之其他成份可包括DPPC、DOPE、DSPC及DOPC。可使用天然或合成表面活性劑,包括聚乙二醇及聚葡萄糖(例如環糊精)。亦可使用膽汁鹽及其他相關增強劑,以及纖維素及纖維素衍生物及胺基酸。亦可採用脂質體、微膠囊、微球體、包合錯合物及其他類型之載劑。 適於與噴射霧化器或超音霧化器一起使用之醫藥調配物通常包含以以下濃度溶解於或懸浮於水中之抑制劑:約0.01 mg或更少至100 mg或更多之抑制劑/mL溶液,較佳地約0.1 mg/mL溶液、1 mg/mL溶液、2 mg/mL溶液、3 mg/mL溶液、4 mg/mL溶液、5 mg/mL溶液、6 mg/mL溶液、7 mg/mL溶液、8 mg/mL溶液、9 mg/mL溶液或10 mg至約15 mg/mL溶液、20 mg/mL溶液、25 mg/mL溶液、30 mg/mL溶液、35 mg/mL溶液、40 mg/mL溶液、45 mg/mL溶液、50 mg/mL溶液、55 mg/mL溶液、60 mg/mL溶液、65 mg/mL溶液、70 mg/mL溶液、75 mg/mL溶液、80 mg/mL溶液、85 mg/mL溶液或90 mg/mL溶液。調配物亦可包括緩衝劑及簡單糖(例如,用於蛋白質穩定化及調節滲透壓)。霧化器調配物亦可含有表面活性劑,以減少或防止由在形成氣溶膠時溶液霧化所引起之表面誘導之抑制劑聚集。 用於與定劑量吸入器裝置一起使用之調配物通常包含含有借助於表面活性劑懸浮於推進劑中之活性成份之精細粉末。推進劑可包括習用推進劑,例如氯氟碳化物、氫氯氟碳化物、氫氟碳化物及烴。較佳推進劑包括三氯氟甲烷、二氯二氟甲烷、二氯四氟乙醇、1,1,1,2-四氟乙烷及其組合。適宜表面活性劑包括去水山梨醇三油酸酯、大豆卵磷脂及油酸。 用於自粉末吸入器裝置分配之調配物通常包含含有抑制劑之精細乾粉末,視情況包括增積劑,例如乳糖、山梨醇、蔗糖、甘露醇、海藻糖或木糖醇,其量有助於粉末自裝置分散,通常為調配物之約1 wt. %或更少至99 wt. %或更多,較佳為調配物之約5 wt. %、10 wt. %、15 wt. %、20 wt. %、25 wt. %、30 wt. %、35 wt. %、40 wt. %、45 wt. %或50 wt. %至約55 wt. %、60 wt. %、65 wt. %、70 wt. %、75 wt. %、80 wt. %、85 wt. %或90 wt. %。 當較佳實施例之化合物係藉由靜脈內、非經腸或其他注射投與時,其較佳呈不含熱原之非經腸可接受之水溶液或油性懸浮液形式。懸浮液可根據業內熟知之方法使用適宜分散或潤濕劑及懸浮劑來調配。具有適宜pH、等滲性、穩定性及諸如此類之可接受之水溶液之製備為業內所已知。用於注射之較佳醫藥組合物較佳含有等滲媒劑,例如1,3-丁二醇、水、等滲氯化鈉溶液、林格氏溶液、右旋糖溶液、右旋糖與氯化鈉溶液、乳酸林格氏溶液或業內已知之其他媒劑。另外,通常可採用無菌不揮發油作為溶劑或懸浮介質。出於此目的,可採用任何溫和不揮發性油,包括合成單甘油酯或二甘油酯。另外,諸如油酸之脂肪酸可同樣用於可注射製劑之形成中。醫藥組合物亦可含有穩定劑、防腐劑、緩衝劑、抗氧化劑或熟習此項技術者已知之其他添加劑。 注射之持續時間可端視各種因素進行調整,且可包含經幾秒或更短之時程投與之單一注射至0.5小時、0.1小時、0.25小時、0.5小時、0.75小時、1小時、2小時、3小時、4小時、5小時、6小時、7小時、8小時、9小時、10小時、11小時、12小時、13小時、14小時、15小時、16小時、17小時、18小時、19小時、20小時、21小時、22小時、23小時或24小時或更久之連續靜脈內投與。 較佳實施例之化合物可額外地以業內已確立之方式及以業內已確立之含量採用通常見於醫藥組合物中之附加組份。因此,舉例而言,組合物可含有用於組合療法之額外相容之醫藥活性材料(例如補充抗微生物劑、止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑、抗炎劑、還原劑、化學治療劑及諸如此類),或可含有可用於物理調配較佳實施例之各種劑型之材料,例如賦形劑、染料、增稠劑、穩定劑、防腐劑或抗氧化劑。可與較佳實施例之化合物組合使用之抗癌劑包括(但不限於)長春花生物鹼,例如長春鹼及長春新鹼;蒽環,例如多柔比星(doxorubicin)、道諾黴素(daunorubicin)、泛艾黴素(epirubicin);蒽,例如比生群(bisantrene)及米托蒽醌(mitoxantrone);表鬼臼毒素(epipodophyllo-toxin),例如依託泊苷(etoposide)及替尼泊苷(teniposide);及其他抗癌藥物,例如放線菌素D、絲裂黴素C、光神黴素(mitramycin)、胺甲喋呤、多西他賽(docetaxel)、依託泊苷(VP-16)、太平洋紫杉醇、多西他賽及阿德力黴素(adriamycin);及免疫抑制劑(例如,環孢素A、他克莫司(tacrolimus))。在一些實施例中,本文中所提供之化合物、組合物及方法可與以下各項組合:組織蛋白去乙醯酶抑制劑(HDAC)、極光激酶抑制劑、去甲基化劑(例如5-氮雜胞苷)、利用天然殺手細胞之免疫療法、IGF-IR抗體、尤恩抗原抗體、免疫抑制藥物及羥基脲。組織蛋白去乙醯酶抑制劑之實例包括伏立諾他(vorinostat)、羅米地辛(romidepsin)、帕比司他(panobinostat)、丙戊酸、貝林司他(belinostat)、莫賽替諾司他(mocetinostat)、吉維司他(givinostat)及曲古抑菌素A (trichostatin A)。極光激酶抑制劑之實例包括ZM447439、禾比瑞丁(hesperadin)及VX-680。去甲基化劑之實例包括5-氮雜胞苷、5-氮雜去氧胞苷及普魯卡因。免疫抑制藥物之實例包括6-巰基嘌呤及硫唑嘌呤。某些套組 較佳實施例之化合物可以套組形式提供給投與醫師或其他健康護理專業人員。套組係容納含有於適宜醫藥組合物中之該等化合物之容器及用於將該醫藥組合物投與個體之說明書之包裝。套組視情況亦可含有一或多種額外治療劑,例如當前用於治療本文中所闡述之肉瘤之化學治療劑。舉例而言,可提供含有一或多種包含較佳實施例之化合物與一或多種額外化學治療劑組合之組合物之套組,或可提供含有較佳實施例之抑制劑及額外治療劑之分開醫藥組合物。套組亦可含有用於連續或依序投與之分開劑量之較佳實施例之化合物。套組可視情況含有一或多種診斷工具及使用說明書。套組可含有適宜遞送裝置(例如注射器及諸如此類)以及用於投與抑制劑及任何其他治療劑之說明書。套組可視情況含有所包括之任何或所有治療劑之儲存、重構(若適用)及投與說明書。套組可包括複數個反映欲給予個體之投與數量之容器。使用方法 本文中所提供之一些實施例係關於治療尤恩氏肉瘤腫瘤家族(ESFT)之方法。ESFT含有獨特融合蛋白EWS-FLI1。ESFT影響3歲與40歲之間之患者,其中大多數病例發生在11歲-20歲。儘管自其衍生ESFT之胚胎細胞類型未知,但腫瘤通常緊密接近於骨生長,且可作為軟組織塊發生。超過40%存在局部腫瘤之患者將發展復發性疾病且該等中之大多數將死於ESFT,而75 - 80%存在轉移性ESFT之患者即使在高劑量化學療法後仍將在5年內死亡(Grier HE、Krailo MD、Tarbell NJ等人,Addition of ifosfamide and etoposide to standard chemotherapy for Ewing’s sarcoma and primitive neuroectodermal tumor of bone. N Engl J Med 2003;348(8):694-701)。即使在劑量增強化學療法後,該等存活率在過去20年未得以改良。為改良存活並降低療法相關之發病率,可採用如較佳實施例中所提供之治療ESFT患者之新穎靶向策略。 ESFT之特徵在於,在95%之腫瘤中,位於染色體22上之EWS基因(尤恩氏肉瘤)之中樞外顯子與ets 家族基因之中樞外顯子之間發生易位;該ets 家族基因係位於染色體11上之FLI1(弗雲德白血病插入) t(11;22),或位於染色體21上之ERG t(21;22)。EWS-FLI1融合轉錄物編碼具有兩個主要結構域之55 kDa蛋白質(電泳移動度為大約68 kD)。EWS結構域係強效轉錄活化劑,而FLI1結構域含有高度保守之ets DNA結合結構域 (May WA、Lessnick SL、Braun BS等人,The Ewing’s sarcoma EWS/FLI-1 fusion gene encodes a more potent transcriptional activator and is a more powerful transforming gene than FLI-1. Mol Cell Biol 1993;13(12):7393-8);所得EWS-FLI1融合蛋白作為異常轉錄因子。小鼠纖維母細胞之EWS-FLI1轉化需要EWS及FLI1二者之功能性結構域均完整(May WA、Gishizky ML、Lessnick SL等人,Ewing sarcoma 11;22 translocation produces a chimeric transcription factor that requires the DNA-binding domain encoded by FLI1 for transformation. Proc Natl Acad Sci U S A 1993;90(12):5752-6)。 由於EWS-FLI1僅在腫瘤細胞中表現且為維持ESFT細胞系之生長所必需,因此其係出色之治療靶標。使用反義寡去氧核苷酸(ODN) (Toretsky JA、Connell Y、Neckers L、Bhat NK,Inhibition of EWS-FLI-1 fusion protein with antisense oligodeoxynucleotides. J Neurooncol 1997;31(1-2):9-16;Tanaka K、Iwakuma T、Harimaya K、Sato H、Iwamoto Y,EWS-Fli1 antisense oligodeoxynucleotide inhibits proliferation of human Ewing’s sarcoma and primitive neuroectodermal tumor cells. J Clin Invest 1997;99(2):239-47)或小干擾RNA (siRNA) (Ouchida M、Ohno T、Fujimura Y、Rao VN、Reddy ES,Loss of tumorigenicity of Ewing’s sarcoma cells expressing antisense RNA to EWS-fusion transcripts. Oncogene 1995;11(6):1049-54;Maksimenko A、Malvy C、Lambert G等人,Oligonucleotides targeted against a junction oncogene are made efficient by nanotechnologies. Pharm Res 2003;20(10):1565-7;Kovar H、Aryee DN、Jug G等人,EWS/FLI-1 antagonists induce growth inhibition of Ewing tumor cells in vitro. Cell Growth Differ 1996;7(4):429-37)降低EWS-FLI1之表現程度造成裸小鼠中ESFT細胞系增殖減少且腫瘤消退。奈米技術之近期進展已改良siRNA之遞送及控制釋放,然而在人類中利用當前技術反義ODN或siRNA降低EWS-FLI1仍不可能(Maksimenko A、Malvy C、Lambert G等人,Oligonucleotides targeted against a junction oncogene are made efficient by nanotechnologies. Pharm Res 2003;20(10):1565-7;Lambert G、Bertrand JR、Fattal E等人,EWS FLI-1 antisense nanocapsules inhibits Ewing sarcoma-related tumor in mice. Biochem Biophys Res Commun 2000;279(2):401-6)。EWS-FLI1靶向之一種感興趣方法使用siRNA降低之EWS-FLI1與小分子文庫之間之比較表現,此導致利用Ara-C之臨床試驗(Stegmaier K、Wong JS、Ross KN等人,Signature-based small molecule screening identifies cytosine arabinoside as an EWS/FLI modulator in Ewing sarcoma. PLoS medicine 2007;4(4):e122)。此鑑別Ara-C之方法亦指示多柔比星及嘌呤黴素將降低EWS-FLI1含量。多柔比星目前作為標準療法用於ESFT患者,然而存活遠不能接受(Grier HE、Krailo MD、Tarbell NJ等人,Addition of ifosfamide and etoposide to standard chemotherapy for Ewing’s sarcoma and primitive neuroectodermal tumor of bone. N Engl J Med 2003;348(8):694-701)。Ara-C在ESFT患者中之使用目前正在II期試驗中進行評估。雖然希望此代表所需要之臨床突破,但其的確展示小分子靶向EWS-FLI1之重要性。較佳實施例提供自關鍵蛋白質配偶體破壞EWS-FLI1之小分子蛋白質-蛋白質相互作用抑制劑(SMPPII),藉此達成腫瘤特異性及更精確之EWS-FLI1靶向。 EWS-FLI1係極佳之治療靶標,此乃因其僅在腫瘤細胞中表現;然而,靶向此腫瘤特異性致癌基因之能力在先前並未成功。小分子發展之挑戰之一係EWS-FLI1缺少任何已知之酶結構域,且酶結構域一直認為對於靶向治療至關重要。另外,EWS-FLI1係無序蛋白質,此指示其不展現可用於基於結構之藥物設計之剛性結構(Uren A、Tcherkasskaya O、Toretsky JA,Recombinant EWS-FLI1 oncoprotein activates transcription. Biochemistry 2004;43(42):13579-89)。實際上,EWS-FLI1之無序性質對於其轉錄調控至關重要(Ng KP、Potikyan G、Savene RO、Denny CT、Uversky VN、Lee KA,Multiple aromatic side chains within a disordered structure are critical for transcription and transforming activity of EWS family oncoproteins. Proc Natl Acad Sci U S A 2007;104(2):479-84)。無序蛋白質特別地由於其生物化學無序性質而視為小分子蛋白質-蛋白質相互作用抑制劑更有吸引力之靶標(Cheng Y、LeGall T、Oldfield CJ等人,Rational drug design via intrinsically disordered protein. Trends Biotechnol 2006; 24(10):435-42)。 EWS-FLI1在活體外及活體內結合RNA解旋酶A。據信,EWS-FLI1之蛋白質-蛋白質相互作用可促成其致癌潛力;因此,已尋求與EWS-FLI1直接相互作用並功能性調節EWS-FLI1之新穎蛋白質。轉錄活性之重組EWS-FLI1 (Uren A、Tcherkasskaya O、Toretsky JA,Recombinant EWS-FLI1 oncoprotein activates transcription. Biochemistry 2004;43(42):13579-89)用作篩選商業肽噬菌體展示文庫之靶標。自噬菌體定序鑑別出28種差異結合至EWS-FLI1之新穎肽。搜索與該等肽同源之人類蛋白質之國家生物技術資訊中心(National Center for Biotechnology Information)資料庫鑑別出與人類RNA解旋酶A (RHA,基因庫登錄號A47363)之aa 823-832同源之肽(Toretsky JA、Erkizan V、Levenson A等人,Oncoprotein EWS-FLI1 activity is enhanced by RNA helicase A. Cancer Res 2006;66(11):5574-81)。 雖然EWS-FLI1對於ESFT細胞係非常特異的,但EWS及RHA普遍表現。EWS-FLI1與RHA之間之區域係由可具有特異性之分子治療劑靶向;此乃因EWS-FLI1僅在腫瘤細胞中表現且與RHA之相互作用點可係唯一的。本文中提供治療劑(即,小分子蛋白質-蛋白質相互作用抑制劑)以抑制EWS-FLI1功能。 大多數易位融合蛋白肉瘤預示預後不良,包括ESFT。產生獨特及關鍵融合蛋白EWS-FLI1之染色體易位t(11;22)係完美之癌症靶標。許多其他肉瘤共享類似易位變體(表2. Helman LJ、Meltzer P,Mechanisms of sarcoma development. Nat Rev Cancer 2003;3(9):685-94)。 在胰臟之固狀偽乳頭狀腫瘤中已報導EWS-FLI1易位(Maitra A等人,Detection of t(11;22)(q24;q12) translocation and EWS-FLI-1 fusion transcript in a case of solid pseudopapillary tumor of the pancreas. Pediatr Dev Pathol 2000;3:603-605),然而EWS-FLI1在所有固狀偽乳頭狀腫瘤中之作用仍有待解決(Katharina Tiemann等人,Solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas are associated with FLI-1 expression, but not withEWS/FLI-1 translocation)。 EWS或FLI1同系物在多種肉瘤及白血病中發生之易位中係配偶體。EWS 或其同系物TLS FUS 涉及以下之染色體易位:明亮細胞肉瘤、黏液樣脂肪肉瘤、促結締組織增生性小圓細胞瘤、軟骨肉瘤及急性骨髓性白血病。FLI1ets 基因家族。在大約10%之尤恩氏肉瘤及20%之急性骨髓性白血病中FLI1 同系物ERG 易位。此表明EWS-FLI1可作為可影響一系列影響大量患者之疾病(涉及易位配偶體)之模型系統(Uren A、Tcherkasskaya O及Toretsky J.A.,Recombinant EWS-FLI1 oncoprotein activates transcription. Biochemistry 43(42) 13579-89 (2004))。ERG 在前列腺癌中亦易位,其中TMPRSS2:ERG融合提示可定義疾病進展風險之不同分子亞型(F. Demichelis等人,TMPRSS2:ERG gene fusion associated with lethal cancer in a watchful waiting cohort.Oncogene (2007)26, 4596-4599)。已在其中觀察到EWS或FLI1家族成員易位之其他疾病包括前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌 (Janknecht, Ralf、Shin, Sook及Oh, Sangphil,ETV1, 4 and 5: An Oncogenic Subfamily of ETS Transcription Factors. Biochim. Biophys. Acta 1826 (1), 1-12 (2012))。 因此,較佳實施例之治療劑具有應用於許多其他腫瘤中之潛力。更廣泛而言,一些最頑固之白血病亦具有涉及混合譜系白血病基因(MLL,11q23)之易位產生之融合蛋白,且本發明可作為極耐治療之癌症群組之範例(Pui CH、Chessells JM、Camitta B等人,Clinical heterogeneity in childhood acute lymphoblastic leukemia with 11q23 rearrangements. Leukemia 2003;17(4):700-6.)。因此,實施例包括其中發生易位之癌症。易位融合基因列示於表1中。 表1
Figure 106110666-A0304-0001
多種病症包括ETS基因之過度表現或ETS基因融合(即,包括ETS基因之基因易位)。此等ETS基因之實例包括FLI1、ERG、ETV1及ETV4。融合基因之實例包括EWS-FLI、TMPRSS2-ERG。表2列示其中一或多種ETS基因家族成員過度表現及/或重排之若干種癌症。   表2
Figure 106110666-A0304-0002
適應症 本文中所提供之某些化合物、組合物及方法可用於治療多種病症,例如包含易位基因融合(例如表1中所列示之彼等)之腫瘤或腫瘤細胞、尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。本文中所提供方法之一些實施例包括抑制細胞增殖之方法。在一些實施例中,細胞過度表現ETS基因。在一些實施例中,過度表現之ETS基因可包括FLI1、ERG、ETV1或ETV4。在一些實施例中,細胞包含ETS融合基因。在一些實施例中,ETS融合基因可包括ETS基因,例如FLI1、ERG、ETV1及ETV4。 ETS家族之轉錄因子對於發育、分化、增殖至關重要,且在細胞凋亡及組織重塑中起重要作用。因過度表現、基因融合及藉由RAS/MAPK及PI3K信號傳導之調節造成之ETS蛋白質失調之轉錄後果與正常細胞功能之改變相關,且導致增殖增加、血管產生持續、侵襲及轉移。過度表現之ETS蛋白質及ETS家族融合蛋白在急性骨髓性白血病(AML)及瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)中已有報導。在DLBCL中,11q24.3區域已鑑別為復發性病灶及疾病發病機制之促成因素,導致ETS家族成員ETS1及FLI之失調。另外,在AML中,ERG (ETS家族成員)之過度表現及易位已顯示與複雜或正常核型中之不良預後相關。 式(I)-(VII)化合物可直接結合EWS-FLI1抑制ETS家族轉錄因子致癌蛋白之生物活性且可用於治療患有尤恩氏肉瘤之患者。EWS1-FLI1係已顯示為尤恩氏肉瘤(ES)之驅動因素之融合蛋白。式(I)-(VII)化合物可阻斷EWS-FLI1與RNA解旋酶A之間之結合,在經EWS-FLI1反應啟動子轉染之COS7細胞中可顯示轉錄減少(EC50 < 100 nM)且可以奈莫耳濃度抑制A4573細胞之增殖(表現EWS-FLI1之尤恩氏肉瘤細胞系) (EC50 < 200 nM)。 式(I)-(VII)化合物在具有失調ETS家族成員之AML及DLBCL細胞系中亦可具有抗增殖效應,可引起細胞週期阻滯且可誘導細胞凋亡。在骨髓細胞系(例如,HL60、Kasumi-1、ML-2、MOLM-13及MOLM-16)中可觀察到FLI1及/或ERG ETS家族成員之上調。利用式(I)-(VII)化合物之治療在48小時時可顯示細胞存活率降低及誘導之劑量依賴性細胞凋亡。在DLBLC細胞系(例如,TMD8、HBL1、U2932、DOHH2、WSUDLCL2及OCI-Ly18)中,利用式(I)-(VII)化合物之治療可使得細胞增殖減少且細胞凋亡增加。DLBCL之異種移植模型中之活體內效能研究可指示抗腫瘤活性,且可藉由靶向促成疾病發病機制之ETS家族之轉錄因子中之異常表現及易位來確認式(I)-(VII)化合物在治療AML及DLBCL中之效用及效能。實例 製備具有如式(I)-(VII)化合物中結構之多種類似物。使用NMR、質譜分析及藉由UPLC及LCMS之層析純化來鑑別化合物。結構符合NMR分析。該等類似物之結構、源自質譜分析之質量「[M+H]+ 」、藉由UPLC之層析純度(wt. %)及藉由LCMS之層析純度(wt. %)提供於表3中。 表3
Figure 106110666-A0304-0003
實例 - 細胞生長研究 使用使用CCK-8套組(Sigma-Aldrich;St Louis, MO)之改良四唑鎓鹽分析來量測人類腫瘤細胞生長之抑制。將腫瘤細胞(5000-7500個/孔)添加至96孔板並容許附著4-5小時。將化合物連續稀釋並以0.02 μM至5 μM之濃度一式三份添加。包括DMSO作為媒劑對照。將細胞在化合物存在下培育3天。培育後,將CCK-8試劑添加至每一孔並培育2-4小時。在450 nm波長下用分光光度法定量活細胞。如下自A450值計算每一樣品之存活率百分比:存活率% = (A450 nm樣品/ A450 nm DMSO處理之細胞× 100)。IC50 定義為導致細胞存活率50%抑制之濃度。使用SKES (2型,7/5)細胞(尤恩氏肉瘤細胞系)、TC71 (1型,7/6)細胞(尤恩氏肉瘤細胞系)及A4573 (3型,10/6)細胞(尤恩氏肉瘤細胞系)測定特定化合物之IC50 活性。小分子YK-4-279 (4,7-二氯-3-羥基-3-(2-(4-甲氧基苯基)-2-側氧基乙基)二氫吲哚-2-酮)抑制EWS1-FLI1融合蛋白至RHA之結合同時在尤恩氏肉瘤細胞中生長阻滯且細胞凋亡,並展現活體外抗淋巴瘤活性。TK-216係針對患有復發性或難治性尤恩氏肉瘤患者之1期YK-4-279臨床衍生物。在淋巴瘤模型中已對TK-216進行臨床前測試。將類似物之測試結果與TK-216及YK-4-279之測試結果進行比較。結果匯總於表4中。 表4
Figure 106110666-A0304-0004
儘管已在圖式及前述描述中詳細說明並闡述本揭示內容,但此說明及闡述應視為說明性或例示性而非限制性。本揭示內容並不限於所揭示之實施例。熟習此項技術者自對圖式、本揭示內容及隨附申請專利範圍之研究在實踐所主張揭示內容時可理解並實現所揭示實施例之變化形式。 本文中及附錄中所引用之所有參考文獻均係以全文引用的方式併入本文中。在以引用方式併入之出版物及專利或專利申請案與本說明書中所含揭示內容矛盾之意義上,說明書意欲取代及/或優先於任何此矛盾材料。 除非另有定義,否則所有術語(包括技術及科學術語)均將給予其對於熟習此項技術者而言常用及習用含義,且除非在本文中明確定義,否則其並不限於特定或專用含義。應注意,在闡述本揭示內容之某些特徵或態樣時特定術語之使用不應視為暗示該術語在本文中重新定義而限於包括與該術語有關之本揭示內容特徵或態樣之任何具體特性。 在提供值範圍之情形下,應理解,該範圍之上限及下限及上限與下限之間之每一中間值均涵蓋於實施例內。 除非另有明確說明,否則本申請案中所用之術語及片語及其變化形式(尤其在隨附申請專利範圍中)應解釋為有無限多而非限制性。作為上述之實例,術語「包括」應理解為意指「包括(但不限於)(including, without limitation)」、「包括(但不限於) (including but not limited to)」或諸如此類;如本文中所使用之術語「包含」係與「包括」、「含有」或「以......為特徵」同義,且其係包括式或開放式,且不排除其他未陳述之要素或方法步驟;術語「具有」應解釋為「至少具有」;術語「包括」應解釋為「包括(但不限於)」;術語「實例」係用以為所論述物項提供例示性例證而非其窮盡性或限制性列表;諸如「已知」、「正常」、「標準」及類似含義之術語之形容詞不應解釋為將所闡述物項限於給定時間段或可用於給定時間之物項,而係應理解為涵蓋可在當前或將來任一時間可用或已知之已知、正常或標準技術;且諸如「較佳地」、「較佳」、「期望(desired或desirable)」及類似含義之詞語之術語之使用不應理解為暗示某些特徵對於本發明之結構或功能而言至關重要、必需或甚至重要,而係僅意欲強調替代或其他特徵可或可不用於本發明之特定實施例中。同樣,除非另有明確說明,否則與連詞「及」結合之物項群不應理解為需要彼等物項中之每一者均存在於該群中,而係應理解為「及/或」。類似地,除非另有明確說明,否則與連詞「或」結合之物項群不應理解為需要在該群中相互排斥,而係應理解為「及/或」。 相對於本文中之實質上任何複數及/或單數術語之使用,熟習此項技術者可在適於上下文及/或應用時自複數至單數及/或自單數至複數轉譯。為清晰起見,可明確地陳述各種單數/複數排列。不定冠詞「一(a或an)」並不排除複數個。在互不相同之附屬申請專利範圍中陳述某些措施之單純事實本身並不指示無法有利地使用該等措施之組合。申請專利範圍中之任何參考符號均不應解釋為限制該範圍。 熟習此項技術者將進一步理解,若指定具體數目之所引入申請專利範圍陳述,則此一意圖將在申請專利範圍中明確陳述,而在無此陳述之情形下,則不存在此意圖。舉例而言,作為理解之輔助,以下隨附申請專利範圍可含有使用引入性片語「至少一個」及「一或多個」以引入申請專利範圍陳述。然而,此等片語之使用不應解釋為暗示由不定冠詞「一(a或an)」引入之申請專利範圍陳述將含有此引入申請專利範圍陳述之任一特定申請專利範圍限制為僅含有一個此陳述物之實施例,即使當相同申請專利範圍包括引入性片語「一或多個」或「至少一個」及諸如「一(a或an)」之不定冠詞(例如,「一(a及/或an)」通常應解釋為意指「至少一個」或「一或多個」)時亦如此;對於用於引入申請專利範圍陳述之定冠詞之使用亦如此。另外,即使明確地陳述所引入申請專利範圍陳述之具體數目,但熟習此項技術者亦將認識到,此陳述通常應解釋為意指至少 所陳述之數目(例如,「兩個陳述」之無修飾陳述(而無其他修飾語)通常意指至少 兩個陳述或兩個或更多個 陳述)。此外,在其中使用類似於「A、B及C等中之至少一者」之習語之彼等情況中,一般而言,此一構造意欲指熟習此項技術者將理解該習語(例如,「具有A、B及C中至少一者之系統」將包括(但不限於)僅具有A、僅具有B、僅具有C、同時具有A及B、同時具有A及C、同時具有B及C及/或同時具有A、B及C等之系統)。在其中使用類似於「A、B或C等中之至少一者」之習語之彼等情況中,一般而言,此一構造意欲指熟習此項技術者將理解該習語(例如,「具有A、B或C中至少一者之系統」將包括(但不限於)僅具有A、僅具有B、僅具有C、同時具有A及B、同時具有A及C、同時具有B及C及/或同時具有A、B及C等之系統)。熟習此項技術者將進一步理解,實質上表示兩個或更多個替代術語之任一轉折字及/或片語(無論在說明書中、申請專利範圍中亦或在圖式中)均應理解為涵蓋包括該等術語中之一者、該等術語中之任一者或兩個術語之可能性。舉例而言,片語「A或B」應理解為包括「A」或「B」或「A及B」之可能性。 本說明書中用於表示成份數量、反應條件等之所有數值在所有情況下均應理解為受術語「約」修飾。因此,除非指示與此相反,否則本文中所述之數值參數係近似值,其可端視尋求獲得之期望性質而變化。無論如何,且並非試圖限制主張本申請案之優先權之任一申請案中任何申請專利範圍之範疇之等效項原則的應用,每一數值參數均應根據有效數位之數目及普通舍入方法來解釋。 此外,儘管已出於清晰性及理解之目的藉助說明及實例方式相當詳細地闡述了前文,但熟習此項技術者應明瞭,可進行某些改動及修改。因此,闡述及實例不應解釋為將本發明之範圍限於本文中所闡述之具體實施例及實例,而係亦涵蓋屬本發明之真實範圍及精神內之所有修改及替代。
圖1A-C提供TK216-2關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖1A提供不同濃度之TK216-2對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖1B提供暴露於不同濃度之TK216-2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)。圖1C提供不同濃度之TK216-2對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖2A-C提供YK-4-279關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖2A提供不同濃度之YK-4-279對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖1B提供暴露於不同濃度之YK-4-279之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)。圖2C提供不同濃度之YK-4-279對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖3A-C提供TK100-OCD3關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖3A提供不同濃度之TK100-OCD3對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖3B提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)。圖3C提供不同濃度之TK100-OCD3對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖4A-C提供TK類似物6關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖4A提供不同濃度之TK類似物6對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖4B提供暴露於不同濃度之TK類似物6之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖4C提供不同濃度之TK類似物6對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖5A-C提供TK類似物7關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖5A提供不同濃度之TK類似物7對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖5B提供暴露於不同濃度之TK類似物7之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖5C提供不同濃度之TK類似物7對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖6A-C提供TK類似物8關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖6A提供不同濃度之TK類似物8對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖6B提供暴露於不同濃度之TK類似物8之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖6C提供不同濃度之TK類似物8對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖7A-C提供TK216-2關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖7A提供不同濃度之TK216-2對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖7B提供暴露於不同濃度之TK216-2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖7C提供不同濃度之TK216-2對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖8A-C提供TK類似物9關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖8A提供不同濃度之TK類似物9對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖8B提供暴露於不同濃度之TK類似物9之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖8C提供不同濃度之TK類似物9對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖9A-C提供TK類似物10關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖9A提供不同濃度之TK類似物10對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖9B提供暴露於不同濃度之TK類似物10之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖9C提供不同濃度之TK類似物10對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖10A-C提供TK類似物11關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖10A提供不同濃度之TK類似物11對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖10B提供暴露於不同濃度之TK類似物11之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖10C提供不同濃度之TK類似物11對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖11A-C提供TK216-2關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖11A提供不同濃度之TK216-2對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖11B提供暴露於不同濃度之TK216-2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖11C提供因不同濃度之TK216-2所致之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖12A-C提供TK類似物2關於細胞存活率之數據。圖12A提供暴露於不同濃度之TK類似物2之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖12B提供暴露於不同濃度之TK類似物2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖12C提供暴露於不同濃度之TK類似物2之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖13A-C提供TK類似物3關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖13A提供不同濃度之TK類似物3對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖13B提供暴露於不同濃度之TK類似物3之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖13C提供不同濃度之TK類似物3對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖14A-C提供TK類似物4關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖14A提供不同濃度之TK類似物4對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖14B提供暴露於不同濃度之TK類似物4之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖14C提供不同濃度之TK類似物4對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖15A-C提供TK類似物5關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖15A提供不同濃度之TK類似物5對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖15B提供暴露於不同濃度之TK類似物5之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖15C提供不同濃度之TK類似物5對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖16A-C提供TK216-2關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖16A提供不同濃度之TK216-2對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖16B提供暴露於不同濃度之TK216-2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖16C提供不同濃度之TK216-2對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖17A-C提供TK類似物16關於細胞存活率之數據。圖17A提供暴露於不同濃度之TK類似物16之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖17B提供暴露於不同濃度之TK類似物16之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖17C提供暴露於不同濃度之TK類似物16之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖18A-C提供TK類似物16A關於細胞存活率之數據。圖18A提供暴露於不同濃度之TK類似物16A之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖18B提供暴露於不同濃度之TK類似物16A之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖18C提供暴露於不同濃度之TK類似物16A之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖19A-C提供TK類似物17關於細胞存活率之數據。圖19A提供暴露於不同濃度之TK類似物17之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖19B提供暴露於不同濃度之TK類似物17之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖19C提供暴露於不同濃度之TK類似物17之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖20A-C提供TK類似物18關於細胞存活率之數據。圖20A提供暴露於不同濃度之TK類似物18之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖20B提供暴露於不同濃度之TK類似物18之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖20C提供暴露於不同濃度之TK類似物18之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖21A-C提供TK類似物19關於細胞存活率之數據。圖21A提供暴露於不同濃度之TK類似物19之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖21B提供暴露於不同濃度之TK類似物19之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖21C提供暴露於不同濃度之TK類似物19之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖22A-C提供TK類似物20關於細胞存活率之數據。圖22A提供暴露於不同濃度之TK類似物20之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖22B提供暴露於不同濃度之TK類似物20之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖22C提供暴露於不同濃度之TK類似物20之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖23A-C提供TK類似物21關於細胞存活率之數據。圖23A提供暴露於不同濃度之TK類似物21之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖23B提供暴露於不同濃度之TK類似物21之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖23C提供暴露於不同濃度之TK類似物21之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖24A-C提供TK類似物22關於細胞存活率之數據。圖24A提供暴露於不同濃度之TK類似物22之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖24B提供暴露於不同濃度之TK類似物22之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖24C提供暴露於不同濃度之TK類似物22之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖25A-C提供TK類似物23關於細胞存活率之數據。圖25A提供暴露於不同濃度之TK類似物23之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖25B提供暴露於不同濃度之TK類似物23之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖25C提供暴露於不同濃度之TK類似物23之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖26A-C提供TK類似物24關於細胞存活率之數據。圖26A提供暴露於不同濃度之TK類似物24之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖26B提供暴露於不同濃度之TK類似物24之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖26C提供暴露於不同濃度之TK類似物24之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖27A-C提供外消旋TK類似物2關於細胞存活率之數據。圖27A提供暴露於不同濃度之TK類似物2之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖27B提供暴露於不同濃度之TK類似物2之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖27C提供暴露於不同濃度之TK類似物2之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖28A-C提供TK類似物2-1 (鏡像異構物1)關於細胞存活率之數據。圖28A提供暴露於不同濃度之TK類似物2-1 (鏡像異構物1)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖28B提供暴露於不同濃度之TK類似物2-1 (鏡像異構物1)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖28C提供暴露於不同濃度之TK類似物2-1 (鏡像異構物1)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖29A-C提供TK類似物2-2之鏡像異構物(鏡像異構物2)關於細胞存活率之數據。圖29A提供暴露於不同濃度之TK類似物2-2 (鏡像異構物2)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖29B提供暴露於不同濃度之TK類似物2-2 (鏡像異構物2)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖29C提供暴露於不同濃度之TK類似物2-2 (鏡像異構物2)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖30A-C提供外消旋TK類似物7關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖30A提供不同濃度之TK類似物7對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖30B提供暴露於不同濃度之TK類似物7之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖30C提供不同濃度之TK類似物7對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖31A-C提供TK類似物7 (鏡像異構物1)關於細胞存活率之數據。圖31A提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物1)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖31B提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物1)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖31C提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物1)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖32A-C提供TK類似物7 (鏡像異構物2)關於細胞存活率之數據。圖32A提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物2)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖32B提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物2)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖32C提供暴露於不同濃度之TK類似物7 (鏡像異構物2)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖33A-C提供外消旋TK類似物10關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖33A提供不同濃度之TK類似物10對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖33B提供暴露於不同濃度之TK類似物10之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖33C提供不同濃度之TK類似物10對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖34A-C提供TK類似物10 (鏡像異構物1)關於細胞存活率之數據。圖34A提供暴露於不同濃度之TK類似物10 (鏡像異構物1)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖34B提供暴露於不同濃度之TK類似物10 (鏡像異構物1)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖34C提供暴露於不同濃度之TK類似物10 (鏡像異構物1)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖35A-C提供TK類似物10之鏡像異構物(鏡像異構物2)關於細胞存活率之數據。圖35A提供暴露於不同濃度之TK類似物10 (鏡像異構物2)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖35B提供暴露於不同濃度之TK類似物10 (鏡像異構物2)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖35C提供暴露於不同濃度之TK類似物10之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖36A-C提供外消旋TK100-OCD3關於細胞生長抑制及細胞存活率之數據。圖36A提供不同濃度之TK100-OCD3對TC71 (1型,7/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。圖36B提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖36C提供不同濃度之TK100-OCD3對A4573 (3型,10/6)細胞生長抑制之數據(較低之吸光度數值與較大之生長抑制相關)。 圖37A-C提供TK100-OCD3 (鏡像異構物1)關於細胞存活率之數據。圖37A提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物1)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖37B提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物1)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖37C提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物1)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖38A-C提供TK100-OCD3之鏡像異構物(鏡像異構物2)關於細胞存活率之數據。圖38A提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物2)之TC71 (1型,7/6)細胞之細胞存活率(%)數據。圖38B提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物2)之SKES (2型,7/5)細胞之細胞存活率(%)數據。圖38C提供暴露於不同濃度之TK100-OCD3 (鏡像異構物2)之A4573 (3型,10/6)細胞之細胞存活率(%)數據。 圖39提供比較各種化合物及類似物關於細胞凋亡之活性作為TK-216-2活性百分比之數據,18小時處理,CASP-3螢光受質裂解。 圖40提供比較各種化合物及類似物關於細胞凋亡之活性正規化至TK-216-2活性之數據,18小時處理,CASP-3螢光受質裂解。 圖41提供1 µM及3 µM濃度之各種化合物及類似物之EWS/Fli1活性(螢火蟲螢光素酶單位/ µg蛋白質溶解產物)。
Figure 106110666-11-01

Claims (40)

  1. 一種具有式(IV-A)、(IV-B)、(IV-C)或(IV-D)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0081-1
    其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2;其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3、C1-6烷基、C1-6烷氧基、-C(=O)NH2、-NO2、-NH2及-OH;且其中R8、R9、R10及R11係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、CN、CF3、C1-6烷基、芳基、雜芳基、-OCH3、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2H、-CO2(C1-6 烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)、-NHSO2(芳基)、-NHCONH(C1-6烷基)、-NHCON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)CONH2、-N(C1-6烷基)CONH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)CON(C1-6烷基)2、-SO2(C1-6烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、C3-8環烷基及C3-8雜環烷基,其中該芳基係C6-C14芳基;及該雜芳基係含有1至5個選自氮、氧及硫之雜原子且包括4至14個環原子之單環或多環芳香族環系統。
  2. 如請求項1之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由H及Cl組成之群。
  3. 如請求項1或2之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1及R4係Cl且R2及R3係H。
  4. 如請求項1或2之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中A係-OH。
  5. 如請求項1或2之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R8、R10及R11係H。
  6. 如請求項1或2之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R9係H。
  7. 如請求項1之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中該化合物具有式(IV-15)、(IV-16)、(IV-17)或(IV-18):
    Figure 106110666-A0305-02-0083-14
  8. 一種具有式(V)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0083-5
    其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2;其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3、C1-6烷 基、C1-6烷氧基、-C(=O)NH2、-NO2、-NH2及-OH;且其中R7、R8、R9、R10及R11係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、CN、CF3、C1-6烷基、芳基、雜芳基、-OCH3、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2H、-CO2(C1-6烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)、-NHSO2(芳基)、-NHCONH(C1-6烷基)、-NHCON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)CONH2、-N(C1-6烷基)CONH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)CON(C1-6烷基)2、-SO2(C1-6烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、C3-8環烷基及C3-8雜環烷基,其中該芳基係C6-C14芳基;及該雜芳基係含有1至5個選自氮、氧及硫之雜原子且包括4至14個環原子之單環或多環芳香族環系統。
  9. 如請求項8之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由H及Cl組成之群。
  10. 如請求項8或9之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1及R4係Cl且R2及R3係H。
  11. 如請求項8或9之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中A係-OH。
  12. 如請求項8或9之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R7、R8、R10及R11係H。
  13. 如請求項8或9之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R9係-OCH3
  14. 一種具有式(V-19)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0085-6
  15. 一種具有式(VI)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0085-7
    其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2;其中R1、 R2、R3及R4係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3、C1-6烷基、C1-6烷氧基、-C(=O)NH2、-NO2、-NH2及-OH;且其中R7、R8、R10及R11係獨立地選自由以下組成之群:H、D、F、Cl、CN、CF3、C1-6烷基、芳基、雜芳基、-O(芳基)、-O(雜芳基)、-CO2H、-CO2(C1-6烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)、-NHSO2(芳基)、-NHCONH(C1-6烷基)、-NHCON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)CONH2、-N(C1-6烷基)CONH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)CON(C1-6烷基)2、-SO2(C1-6烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、C3-8環烷基及C3-8雜環烷基,其中該芳基係C6-C14芳基;及該雜芳基係含有1至5個選自氮、氧及硫之雜原子且包括4至14個環原子之單環或多環芳香族環系統。
  16. 如請求項15之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由H及Cl組成之群。
  17. 如請求項15或16之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1及R4係Cl且R2及R3係H。
  18. 如請求項15或16之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中A係-OH。
  19. 如請求項15或16之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽, 其中R7、R8、R10及R11係H。
  20. 一種具有式(VI-20)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0087-13
  21. 一種具有式(VII)之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure 106110666-A0305-02-0087-10
    其中A係選自由以下組成之群:-OH、D、H、F及-NH2;其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由以下組成之群:H、Cl、-CN、-CF3、C1-6烷基、C1-6烷氧基、-C(=O)NH2、-NO2、-NH2及-OH;且其中G係選自由以下組成之群:
    Figure 106110666-A0305-02-0088-11
  22. 如請求項21之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1、R2、R3及R4係獨立地選自由H及Cl組成之群。
  23. 如請求項21或22之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中R1及R4係Cl且R2及R3係H。
  24. 如請求項21或22之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中A係-OH。
  25. 如請求項21之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽,其中該化合物具有選自以下所組成之群之式:
    Figure 106110666-A0305-02-0088-12
  26. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽及醫藥上可接受之載劑或醫藥上可接受之賦形劑。
  27. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽及至少一種另外醫藥活性劑。
  28. 一種如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其係用於製備治療癌症之藥物。
  29. 如請求項28之用途,其中該癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤(Ewing’s sarcoma)、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。
  30. 一種如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其係用於製備殺死或抑制贅瘤細胞生長之藥物。
  31. 如請求項30之用途,其中該贅瘤細胞係哺乳動物贅瘤細胞。
  32. 如請求項31之用途,其中該贅瘤細胞係人類贅瘤細胞。
  33. 一種殺死或抑制贅瘤細胞生長之活體外方法,其包含使贅瘤細胞與 有效量之如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽接觸。
  34. 如請求項30至32中任一項之用途,其中該細胞係癌症細胞,該癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。
  35. 一種如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其係用於製備抑制細胞增殖之藥物,其中該細胞過度表現ETS基因或包含ETS融合基因。
  36. 如請求項35之用途,其中該ETS基因或該ETS融合基因係選自由以下組成之群:FLI1、ERG、ETV1及ETV4。
  37. 如請求項35之用途,其中該細胞係哺乳動物細胞。
  38. 如請求項36之用途,其中該細胞係人類細胞。
  39. 一種抑制細胞增殖之活體外方法,其包含使該細胞與有效量之如請求項1至25中任一項之化合物、其立體異構物或其醫藥上可接受之鹽接觸,其中該細胞過度表現ETS基因或包含ETS融合基因。
  40. 如請求項35至38中任一項之用途,其中該細胞係癌症細胞,該癌症係選自由以下組成之群:尤恩氏肉瘤、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、急性骨髓性白血病、乳癌、頭頸癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌及子宮癌。
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