TWI676620B - 離胺酸特異性去甲基酶-１之抑制劑 - Google Patents

離胺酸特異性去甲基酶-１之抑制劑 Download PDF

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洋Ｋ 陳
Young K. Chen
陶菲克 卡諾尼
Toufike Kanouni
史蒂芬Ｗ 卡爾多
Stephen W. Kaldor
傑佛瑞 艾倫 史戴佛
Jeffrey Alan Stafford
詹姆士 馬文 費爾
James Marvin Veal
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美商賽基昆堤塞爾研發公司
Celgene Quanticel Research Inc.
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Abstract

本發明大體上係關於用於治療癌症及新生贅瘤疾病之組合物及方法。本文提供經取代之雜環衍生化合物及包含該等化合物之醫藥組合物。該等主題化合物及組合物可用於抑制離胺酸特異性去甲基酶-1。此外，該等主題化合物及組合物可用於治療癌症。

Description

離胺酸特異性去甲基酶-1之抑制劑 交叉參考
本申請案主張2014年5月1日申請之美國臨時申請案第61/987,354號之權利，該案之內容以全文引用的方式併入本文中。
此項技術中存在有效治療癌症及新生贅瘤疾病之需求。
本文提供經取代之雜環衍生化合物及包含該等化合物之醫藥組合物。該等主題化合物及組合物可用於抑制離胺酸特異性去甲基酶-1(LSD-1)。此外，該等主題化合物及組合物可用於治療癌症，諸如急性骨髓性白血病(AML)、急性淋巴母細胞白血病(ALL)、小細胞肺癌(SCLC)、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、小圓藍細胞瘤、神經膠質母細胞瘤、前列腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌及/或黑色素瘤等。本文所述經取代之雜環衍生化合物係基於中心雜環環系統，諸如嘧啶酮或類似物。該嘧啶酮環系統另外經4-氰基苯基及其他基團如芳基、雜芳基或雜環基團取代。
一實施例提供一種具有式(I)結構之化合物或其醫藥上可接受之鹽，
Figure TWI676620B_D0001
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、-CN、視情況經取代之烷基、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基、視情況經取代之環烷基或視情況經取代之環烷基烷基；Z係視情況經取代之選自以下之基團：烷基、碳環基、C-附接雜環基、N-附接雜環基、雜環基烷基、雜環基烯基、-O-雜環基、-N(R)-雜環基、-O-雜環基烷基、-N(R)-雜環基烷基、-N(R)(C1-C4伸烷基)-NR2、-O(C1-C4伸烷基)-NR2；且R係氫或C1-C4烷基。
一實施例提供一種具有式(Ia)結構之化合物或其醫藥上可接受之鹽，
Figure TWI676620B_D0002
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、-CN、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基、視情況經取代之環烷基或視情況經取代之環烷基烷基；且Z係視情況經取代之選自以下之基團：N-附接雜環基、-O-雜環基烷基、-N(H)-雜環基、-N(Me)-雜環基、-N(H)-雜環基烷基或-N(Me)-雜環基烷基。
一實施例提供一種具有式(Ib)結構之化合物或其醫藥上可接受之 鹽，
Figure TWI676620B_D0003
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基或視情況經取代之環烷基；且Z係視情況經取代之選自以下之基團：N-雜環基、-O-雜環基烷基、-N(H)-雜環基烷基或-N(Me)-雜環基烷基。
一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(I)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(Ia)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。
一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(I)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(Ia)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(Ib)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。
一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(I)化合物或其醫藥上可接受之鹽。一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(Ia)化合 物或其醫藥上可接受之鹽。一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(Ib)化合物或其醫藥上可接受之鹽。
以引用之方式併入
本說明書中所提及之所有公開案、專利案及專利申請案係以引用之方式併入本文中，其程度如同已特定地及個別地將各個公開案、專利案或專利申請案以引用之方式併入一般。
如本文及隨附申請專利範圍中所使用，除非上下文另有明確規定，否則單數形式「一(a)」、「一個(an)」、及「該」包括複數指涉物。因此，例如，提及「一種製劑」包括複數個此等製劑，且提及「該細胞」包括提及一或多個細胞(或複數個細胞)及其為熟習此項技術者所知之等效物，等等。當本文針對物理性質(諸如分子量)或化學性質(諸如化學式)使用範圍時，意欲包括所有範圍組合及子組合以及其中具體實施例。當提及數值或數值範圍時，術語「約」意指該所提及之數值或數值範圍係在實驗可變性內(或在統計實驗誤差內)之近似值，且因此，在一些情形下，該數值或數值範圍將在所述數值或數值範圍之1%與15%間變動。術語「包含(comprising)」(及相關術語諸如包含(comprise)或包含(comprises)或具有(having)或包括(including))意不在於排除在其他特定實施例中，例如，本文所述物質、組合物、方法或製程或類似物之任何組成之一實施例「由所述特徵組成」或「大體上由其組成」。
定義
如本說明書及隨附申請專利範圍中所用，除非有相反指示，否 則以下術語具有下文所指明含義。
「胺基」係指-NH2基。
「氰基」係指-CN基。
「硝基」係指-NO2基。
「氧雜」係指-O-基。
「側氧基」係指=O基。
「側硫基」係指=S基。
「亞胺基」係指=N-H基。
「肟基」係指=N-OH基。
「肼基」係指=N-NH2基。
「烷基」係指僅由碳及氫原子組成，不含不飽和，具有一至十五個碳原子之直鏈或分支鏈烴鏈基(例如，C1-C15烷基)。在某些實施例中，烷基包括一至十三個碳原子(例如，C1-C13烷基)。在某些實施例中，烷基包括一至八個碳原子(例如，C1-C8烷基)。在其他實施例中，烷基包括一至五個碳原子(例如，C1-C5烷基)。在其他實施例中，烷基包括一至四個碳原子(例如，C1-C4烷基)。在其他實施例中，烷基包括一至三個碳原子(例如，C1-C3烷基)。在其他實施例中，烷基包括一至兩個碳原子(例如，C1-C2烷基)。在其他實施例中，烷基包括一個碳原子(例如，C1烷基)。在其他實施例中，烷基包括五至十五個碳原子(例如，C5-C15烷基)。在其他實施例中，烷基包括五至八個碳原子(例如，C5-C8烷基)。在其他實施例中，烷基包括二至五個碳原子(例如，C2-C5烷基)。在其他實施例中，烷基包括三至五個碳原子(例如，C3-C5烷基)。在其他實施例中，烷基係選自甲基、乙基、1-丙基(正丙基)、1-甲基乙基(異丙基)、1-丁基(正丁基)、1-甲基丙基(第二丁基)、2-甲基丙基(異丁基)、1,1-二甲基乙基(第三丁基)、1-戊基(正戊基)。烷基係藉由單鍵附接至分子之其餘部分。除非說明書中另有明確說 明，否則烷基視情況經以下取代基中之一或多者取代：鹵基、氰基、硝基、側氧基、側硫基、亞胺基、肟基、三甲基矽烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-S(O)tORa(其中t係1或2)、-S(O)tRa(其中t係1或2)及-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、碳環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)。
「烷氧基」係指透過式-O-烷基之氧原子鍵結之基團，其中烷基係如上所定義之烷基鏈。
「烯基」係指僅由碳及氫原子組成，包含至少一個碳-碳雙鍵，且具有二至十二個碳原子之直鏈或分支鏈烴鏈基團。在某些實施例中，烯基包括二至八個碳原子。在其他實施例中，烯基包括二至四個碳原子。烯基係藉由單鍵附接至分子之其餘部分，例如乙烯基(ethenyl)(亦即乙烯基(vinyl))、丙-1-烯基(亦即烯丙基)、丁-1-烯基、戊-1-烯基、戊-1,4-二烯基等。除非說明書中另有明確說明，否則烯基視情況經以下取代基中之一或多者取代：鹵基、氰基、硝基、側氧基、側硫基、亞胺基、肟基、三甲基矽烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、- S(O)tORa(其中t係1或2)、-S(O)tRa(其中t係1或2)及-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、碳環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)。
「炔基」係指僅由碳及氫原子組成，包含至少一個碳-碳三鍵，且具有二至十二個碳原子之直鏈或分支鏈烴鏈基團。在某些實施例中，炔基包括二至八個碳原子。在其他實施例中，炔基包括二至六個碳原子。在其他實施例中，炔基包括二至四個碳原子。炔基係藉由單鍵附接至分子之其餘部分，例如乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基等。除非說明書中另有明確說明，否則炔基視情況經以下取代基中之一或多者取代：鹵基、氰基、硝基、側氧基、側硫基、亞胺基、肟基、三甲基矽烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-S(O)tORa(其中t係1或2)、-S(O)tRa(其中t係1或2)及-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、碳環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基 或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)。
「伸烷基」或「伸烷基鏈」係指將分子之其餘部分鍵聯至基團之直鏈或分支鏈二價烴鏈，其僅由碳及氫組成，不包含不飽和且具有一至十二個碳原子，例如亞甲基、伸乙基、伸丙基、伸正丁基等。伸烷基鏈係透過單鍵附接至分子之其餘部分及透過單鍵附接至基團。伸烷基鏈至分子之其餘部分及至基團之附接點係透過伸烷基鏈中之一個碳或透過鏈內之任何兩個碳。在某些實施例中，伸烷基包括一至八個碳原子(例如，C1-C8伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括一至五個碳原子(例如，C1-C5伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括一至四個碳原子(例如，C1-C4伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括一至三個碳原子(例如，C1-C3伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括一至兩個碳原子(例如，C1-C2伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括一個碳原子(例如，C1伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括五至八個碳原子(例如，C5-C8伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括二至五個碳原子(例如，C2-C5伸烷基)。在其他實施例中，伸烷基包括三至五個碳原子(例如，C3-C5伸烷基)。除非說明書中另有明確說明，否則伸烷基鏈視情況經以下取代基中之一或多者取代：鹵基、氰基、硝基、側氧基、側硫基、亞胺基、肟基、三甲基矽烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-S(O)tORa(其中t係1或2)、-S(O)tRa(其中t係1或2)及-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、碳環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳 基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)。
「伸炔基」或「伸炔基鏈」係指將分子之其餘部分鍵聯至基團之直鏈或分支鏈二價烴鏈，其僅由碳及氫組成，包含至少一個碳-碳三鍵，且具有二至十二個碳原子。伸炔基鏈係透過單鍵附接至分子之其餘部分及透過單鍵附接至基團。在某些實施例中，伸炔基包括二至八個碳原子(例如，C2-C8伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括二至五個碳原子(例如，C2-C5伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括二至四個碳原子(例如，C2-C4伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括二至三個碳原子(例如，C2-C3伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括兩個碳原子(例如，C2伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括五至八個碳原子(例如，C5-C8伸炔基)。在其他實施例中，伸炔基包括三至五個碳原子(例如，C3-C5伸炔基)。除非說明書中另有明確說明，否則伸炔基鏈視情況經以下取代基中之一或多者取代：鹵基、氰基、硝基、側氧基、側硫基、亞胺基、肟基、三甲基矽烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-S(O)tORa(其中t係1或2)、-S(O)tRa(其中t係1或2)及-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、碳環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷 基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)。
「芳基」係指藉由移除環碳原子之氫原子衍生自芳族單環或多環烴環系統之基團。該芳族單環或多環烴環系統僅包含氫及五至十八個碳原子之碳，其中該環系統中之至少一個環係完全不飽和，亦即，根據休克爾(Hückel)理論，其包含環狀非定域(4n+2)π-電子系統。衍生出芳基之環系統包括(但不限於)諸如苯、茀、1,2-二氫化茚、茚、四氫化萘及萘之基團。除非說明書中另有明確說明，否則術語「芳基」或前綴「芳(ar-)」(諸如在「芳烷基」中)意在包括視情況經一或多個獨立地選自以下之取代基取代之芳基基團：烷基、烯基、炔基、鹵基、氟烷基、氰基、硝基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之芳烷基、視情況經取代之芳烯基、視情況經取代之芳炔基、視情況經取代之碳環基、視情況經取代之碳環基烷基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之雜環基烷基、視情況經取代之雜芳基、視情況經取代之雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t係1或2)及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、環烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、環烷基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經 鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)，各Rb獨立地為直接鍵結或者直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且Rc係直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且其中，除非另有指示，否則以上各取代基係未經取代。
「芳烷基」係指式-Rc-芳基之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈，例如亞甲基、伸乙基等。芳烷基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所述經取代。芳烷基基團之芳基部分視情況如上文針對芳基所述經取代。
「芳烯基」係指式-Rd-芳基之基團，其中Rd係如上所定義之伸烯基鏈。芳烯基基團之芳基部分視情況如上文針對芳基所述經取代。芳烯基基團之伸烯基部分視情況如上文針對伸烯基所定義經取代。
「芳炔基」係指式-Re-芳基之基團，其中Re係如上所定義之伸炔基鏈。芳炔基基團之芳基部分視情況如上文針對芳基所述經取代。芳炔基基團之伸炔基部分視情況如上文針對伸炔基鏈所定義經取代。
「芳烷氧基」係指透過式-O-Rc-芳基之氧原子鍵結之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈，例如亞甲基、伸乙基等。芳烷基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所述經取代。芳烷基基團之芳基部分視情況如上文針對芳基所述經取代。
「碳環基」係指僅由碳及氫原子組成之穩定非芳族單環或多環烴基團，其包括稠合或橋聯環系統，具有三至十五個碳原子。在某些實施例中，碳環基包括三至十個碳原子。在某些實施例中，碳環基包括五至七個碳原子。碳環基係藉由單鍵附接至分子之其餘部分。碳環基係飽和(亦即僅包含單一C-C鍵)或不飽和(以及包含一或多個雙鍵或 三鍵)。完全飽和碳環基基團亦稱為「環烷基」。單環環烷基之實例包括(例如)環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基及環辛基。不飽和碳環基基團亦稱為「環烯基」。單環環烯基之實例包括(例如)環戊烯基、環己烯基、環庚烯基及環辛烯基。多環碳環基基團包括(例如)金鋼烷基、降莰烷基(以及，二環[2.2.1]庚基)、降冰片烯基、十氫萘基、7,7-二甲基-二環[2.2.1]庚基等。除非說明書中另有明確說明，否則術語「碳環基」意在包括視情況經一或多個獨立地選自以下之取代基取代之碳環基基團：烷基、烯基、炔基、鹵基、氟烷基、側氧基、側硫基、氰基、硝基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之芳烷基、視情況經取代之芳烯基、視情況經取代之芳炔基、視情況經取代之碳環基、視情況經取代之碳環基烷基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之雜環基烷基、視情況經取代之雜芳基、視情況經取代之雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t係1或2)及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、環烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、環烷基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)，各Rb獨立地為直接鍵結或者直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且Rc係直鏈或 分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且其中，除非另有指示，否則以上各取代基係未經取代。
「碳環基烷基」係指式-Rc-碳環基之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。伸烷基鏈及碳環基基團視情況如上所定義經取代。
「碳環基炔基」係指式-Rc-碳環基之基團，其中Rc係如上所定義之伸炔基鏈。伸炔基鏈及碳環基基團視情況如上所定義經取代。
「碳環基烷氧基」係指透過式-O-Rc-碳環基之氧原子鍵結之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。伸烷基鏈及碳環基基團視情況如上所定義經取代。
如本文所定義，「羧酸生物電子等排體」係指呈現與羧酸部分類似之物理、生物及/或化學性質之官能基或部分。羧酸生物電子等排體之實例包括(但不限於)
Figure TWI676620B_D0004
「鹵基」或「鹵素」係指溴、氯、氟或碘取代基。
「氟烷基」係指經一或多個如上所定義之氟基團取代之如上所定義之烷基基團，例如三氟甲基、二氟甲基、氟甲基、2,2,2-三氟乙基、1-氟甲基-2-氟乙基等。在一些實施例中，氟烷基基團之烷基部分視情況如上文針對烷基所定義經取代。
「雜環基」係指包含二至十二個碳原子及一至六個選自氮、氧及硫之雜原子之穩定3-至18-員非芳族環基團。除非說明書中另有明確說明，否則雜環基基團係視情況包含稠合或橋聯環系統之單環、雙環、三環或四環環系統。雜環基基團中之雜原子視情況經氧化。若存在，一或多個氮原子視情況經四級化。該雜環基基團係部分或完全飽 和。雜環基係透過環之任何原子附接至分子之其餘部分。此等雜環基基團之實例包括(但不限於)二氧雜環戊烷基、噻吩基[1,3]二噻烷基、十氫異喹啉基、咪唑啉基、咪唑啶基、異噻唑啶基、異噁唑啶基、嗎啉基、八氫吲哚基、八氫異吲哚基、2-側氧基哌嗪基、2-側氧基哌啶基、2-側氧基吡咯啶基、噁唑啶基、哌啶基、哌嗪基、4-哌啶酮基、吡咯啶基、吡唑啶基、奎寧環基、噻唑啶基、四氫呋喃基、三噻烷基、四氫哌喃基、硫嗎啉基(thiomorpholinyl)、硫嗎啉基(thiamorpholinyl)、1-側氧基-硫嗎啉基及1,1-二側氧基-硫嗎啉基。除非說明書中另有明確說明，否則術語「雜環基」意在包括視情況經一或多個選自以下之取代基取代之如上所定義之雜環基基團：烷基、烯基、炔基、鹵基、氟烷基、側氧基、側硫基、氰基、硝基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之芳烷基、視情況經取代之芳烯基、視情況經取代之芳炔基、視情況經取代之碳環基、視情況經取代之碳環基烷基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之雜環基烷基、視情況經取代之雜芳基、視情況經取代之雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t係1或2)及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、環烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、環烷基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況 經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)，各Rb獨立地為直接鍵結或者直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且Rc係直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且其中，除非另有指示，否則以上各取代基係未經取代。
「N-雜環基」或「N-附接雜環基」係指含至少一個氮且其中雜環基基團至分子之其餘部分之附接點係透過該雜環基基團中之氮原子的如上所定義之雜環基基團。N-雜環基基團視情況如上文針對雜環基基團所述經取代。此等N-雜環基基團之實例包括(但不限於)1-嗎啉基、1-哌啶基、1-哌嗪基、1-吡咯啶基、吡唑啶基、咪唑啉基及咪唑啶基。
「C-雜環基」或「C-附接雜環基」係指含至少一個雜原子且其中雜環基基團至分子之其餘部分之附接點係透過該雜環基基團中之碳原子的如上所定義之雜環基基團。C-雜環基基團視情況如上文針對雜環基基團所述經取代。此等C-雜環基基團之實例包括(但不限於)2-嗎啉基、2-或3-或4-哌啶基、2-哌嗪基、2-或3-吡咯啶基等。
「雜環基烷基」係指式-Rc-雜環基之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。若雜環基係含氮雜環基，則雜環基視情況在氮原子處附接至烷基基團。雜環基烷基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所定義經取代。雜環基烷基基團之雜環基部分視情況如上文針對雜環基所定義經取代。
「雜環基烷氧基」係指透過式-O-Rc-雜環基之氧原子鍵結之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。若雜環基係含氮雜環基，則雜環基視情況在氮原子處附接至烷基基團。雜環基烷氧基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所定義經取代。雜環基烷氧基基團之雜環基部分視情況如上文針對雜環基所定義經取代。
「雜芳基」係指衍生自包含二至十七個碳原子及一至六個選自 氮、氧及硫之雜原子之3-至18-員芳族環基團之基團。如本文所使用，該雜芳基基團係單環、雙環、三環或四環環系統，其中該環系統中之至少一個環係完全不飽和，亦即，根據休克爾理論，其包含環狀非定域(4n+2)π-電子系統。雜芳基包括稠合或橋聯環系統。雜芳基基團中之雜原子視情況經氧化。若存在，一或多個氮原子視情況經四級化。雜芳基係透過環之任何原子附接至分子之其餘部分。雜芳基之實例包括(但不限於)氮呯基、吖啶基、苯并咪唑基、苯并吲哚基、1,3-苯并二氧雜環戊烯基、苯并呋喃基、苯并噁唑基、苯并[d]噻唑基、苯并噻二唑基、苯并[b][1,4]二氧雜環庚基、苯并[b][1,4]噁嗪基、1,4-苯并二噁烷基、苯并萘并呋喃基、苯并噁唑基、苯并二氧雜環戊烯基、苯并二氧雜環己烯基、苯并哌喃基、苯并哌喃酮基、苯并呋喃基、苯并呋喃酮基、苯并噻吩基(benzothienyl)(苯并噻吩基(benzothiophenyl))、苯并噻吩并[3,2-d]嘧啶基、苯并三唑基、苯并[4,6]咪唑并[1,2-a]吡啶基、咔唑基、噌啉基、環戊烷并[d]嘧啶基、6,7-二氫-5H-環戊烷并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、5,6-二氫苯并[h]喹唑啉基、5,6-二氫苯并[h]噌啉基、6,7-二氫-5H-苯并[6,7]環庚烷并[1,2-c]噠嗪基、二苯并呋喃基、二苯并噻吩基、呋喃基、呋喃酮基、呋喃并[3,2-c]吡啶基、5,6,7,8,9,10-六氫環辛烷并[d]嘧啶基、5,6,7,8,9,10-六氫環辛烷并[d]噠嗪基、5,6,7,8,9,10-六氫環辛烷并[d]吡啶基、異噻唑基、咪唑基、吲唑基、吲哚基、吲唑基、異吲哚基、吲哚啉基、異吲哚啉基、異喹啉基、吲嗪基、異噁唑基、5,8-甲橋-5,6,7,8-四氫喹唑啉基、萘啶基、1,6-萘啶酮基、噁二唑基、2-側氧基氮呯基、噁唑基、環氧乙基、5,6,6a,7,8,9,10,10a-八氫苯并[h]喹唑啉基、1-苯基-1H-吡咯基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩噁嗪基、酞嗪基、蝶啶基、嘌呤基、吡咯基、吡唑基、吡唑并[3,4-d]嘧啶基、吡啶基、吡啶并[3,2-d]嘧啶基、吡啶并[3,4-d]嘧啶基、吡嗪基、嘧啶基、噠嗪 基、吡咯基、喹唑啉基、喹喔啉基、喹啉基、異喹啉基、四氫喹啉基、5,6,7,8-四氫喹唑啉基、5,6,7,8-四氫苯并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、6,7,8,9-四氫-5H-環庚烷并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、5,6,7,8-四氫吡啶并[4,5-c]噠嗪基、噻唑基、噻二唑基、三唑基、四唑基、三嗪基、噻吩并[2,3-d]嘧啶基、噻吩并[3,2-d]嘧啶基、噻吩并[2,3-c]吡啶基(pridinyl)及噻吩基(thiophenyl)(亦即噻吩基(thienyl))。除非說明書中另有明確說明，否則術語「雜芳基」意在包括視情況經一或多個選自以下之取代基取代之如上所定義之雜芳基基團：烷基、烯基、炔基、鹵基、氟烷基、鹵烯基、鹵炔基、側氧基、側硫基、氰基、硝基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之芳烷基、視情況經取代之芳烯基、視情況經取代之芳炔基、視情況經取代之碳環基、視情況經取代之碳環基烷基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之雜環基烷基、視情況經取代之雜芳基、視情況經取代之雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t係1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t係1或2)及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t係1或2)，其中各Ra獨立地為氫、烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、氟烷基、環烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、環烷基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、芳烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜環基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)、雜芳基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)或雜芳基烷基(視情況經鹵素、羥基、甲氧基或三氟甲基取代)，各Rb獨立地為直接鍵結或 者直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且Rc係直鏈或分支鏈伸烷基或伸烯基鏈，且其中，除非另有指示，否則以上各取代基係未經取代。
「N-雜芳基」係指含至少一個氮且其中雜芳基基團至分子之其餘部分之附接點係透過該雜芳基基團中之氮原子的如上所定義之雜芳基基團。N-雜芳基基團視情況如上文針對雜芳基基團所述經取代。
「C-雜芳基」係指如上所定義且其中雜芳基基團至分子之其餘部分之附接點係透過該雜芳基基團中之碳原子之雜芳基基團。C-雜芳基基團視情況如上文針對雜芳基基團所述經取代。
「雜芳基烷基」係指式-Rc-雜芳基之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。若雜芳基係含氮雜芳基，則雜芳基視情況在氮原子處附接至烷基基團。雜芳基烷基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所定義經取代。雜芳基烷基基團之雜芳基部分視情況如上文針對雜芳基所定義經取代。
「雜芳基烷氧基」係指透過式-O-Rc-雜芳基之氧原子鍵結之基團，其中Rc係如上所定義之伸烷基鏈。若雜芳基係含氮雜芳基，則雜芳基視情況在氮原子處附接至烷基基團。雜芳基烷氧基基團之伸烷基鏈部分視情況如上文針對伸烷基鏈所定義經取代。雜芳基烷氧基基團之雜芳基部分視情況如上文針對雜芳基所定義經取代。
在一些實施例中，本文所揭示之化合物包含一或多個非對稱中心，且因此產生對映異構體、非對映異構體及依據絕對立體化學定義為(R)-或(S)-的其他立體異構形式。除非另有說明，否則希望本發明涵蓋本文所揭示化合物之所有立體異構形式。當本文所述化合物包含烯烴雙鍵時，且除非另外指出，否則希望本發明包括E及Z幾何異構體(例如，順式或反式)。同樣，亦希望包括所有可能異構體以及其外消旋及光學純淨形式、及所有互變異構形式。術語「幾何異構體」係指烯烴雙鍵之E或Z幾何異構體(例如，順式或反式)。術語「位置異構 體」係指圍繞中央環之結構異構體，諸如圍繞苯環之鄰位、間位及對位異構體。
「互變異構體」係指其中質子可自分子之一個原子遷移至相同分子之另一原子之分子。在某些實施例中，本文所呈現之化合物呈互變異構體存在。在可能存在互變異構化之情形下，將存在互變異構體之化學平衡。互變異構體之確切比率取決於若干因素，包括物理狀態、溫度、溶劑及pH。互變異構平衡之一些實例包括：
Figure TWI676620B_D0005
「視情況的」或「視情況地」意指隨後描述的事件或情況可能出現或可能不出現，且該描述包括出現該事件或情況之情形及不出現該事件或情況之情形。例如，「視情況經取代之芳基」意指芳基基團可能經取代或可能不經取代，且該描述包括經取代之芳基基團及不具有取代之芳基基團。
「醫藥上可接受之鹽」包括酸及鹼加成鹽兩種。本文所述任一經取代之雜環衍生化合物之醫藥上可接受之鹽意欲涵蓋任何及所有醫藥上適宜的鹽形式。本文所述化合物之較佳醫藥上可接受之鹽係醫藥上可接受之酸加成鹽及醫藥上可接受的鹼加成鹽。
「醫藥上可接受的酸加成鹽」係指彼等保留游離鹼之生物有效性及性質，並非生物學上或其他方面非所需，且與無機酸(諸如鹽 酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、氫碘酸、氫氟酸、亞磷酸等)形成之鹽。亦包括與有機酸形成之鹽，諸如脂族單羧酸及二羧酸、經苯基取代之烷酸、羥基烷酸、烷二酸、芳族酸、脂族及芳族磺酸等，且包括(例如)乙酸、三氟乙酸、丙酸、乙醇酸、丙酮酸、草酸、馬來酸、丙二酸、琥珀酸、富馬酸、酒石酸、檸檬酸、苯甲酸、肉桂酸、杏仁酸、甲磺酸、乙磺酸、對甲苯磺酸、水楊酸等。因此，示例性鹽包括硫酸鹽、焦硫酸鹽、硫酸氫鹽、亞硫酸鹽、亞硫酸氫鹽、硝酸鹽、磷酸鹽、磷酸氫鹽、磷酸二氫鹽、偏磷酸鹽、焦磷酸鹽、氯化物、溴化物、碘化物、乙酸鹽、三氟乙酸鹽、丙酸鹽、辛酸鹽、異丁酸鹽、草酸鹽、丙二酸鹽、琥珀酸鹽、辛二酸鹽、癸二酸鹽、富馬酸鹽、馬來酸鹽、杏仁酸鹽、苯甲酸鹽、氯苯甲酸鹽、甲基苯甲酸鹽、二硝基苯甲酸鹽、苯二甲酸鹽、苯磺酸鹽、甲苯磺酸鹽、苯乙酸鹽、檸檬酸鹽、乳酸鹽、蘋果酸鹽、酒石酸鹽、甲磺酸鹽等。亦涵蓋胺基酸之鹽，諸如精胺酸鹽、葡萄糖酸鹽及半乳糖醛酸鹽(參見例如Berge S.M.等人，「Pharmaceutical Salts」,Journal of Pharmaceutical Science,66：1-19(1997)，其全文以引用的方式併入本文中)。在一些實施例中，鹼性化合物之酸加成鹽係如下製備：根據熟練技術人員熟悉之方法及技術，藉由使游離鹼形式與足量期望酸接觸來產生鹽。
術語「醫藥上可接受之鹼加成鹽」係指彼等保留游離酸之生物有效性及性質，並非生物學上或其他方面非所需的鹽。此等鹽係自無機鹼或有機鹼與游離酸之加成而製備。在一些實施例中，醫藥上可接受之鹼加成鹽係與金屬或胺(諸如鹼金屬及鹼土金屬或有機胺)所形成。衍生自無機鹼之鹽包括(但不限於)鈉鹽、鉀鹽、鋰鹽、銨鹽、鈣鹽、鎂鹽、鐵鹽、鋅鹽、銅鹽、錳鹽、鋁鹽等。衍生自有機鹼之鹽包括(但不限於)以下物質之鹽：一級、二級及三級胺、經取代之胺(包括天然經取代之胺)、環狀胺及鹼性離子交換樹脂，例如異丙胺、三甲 胺、二乙胺、三乙胺、三丙胺、乙醇胺、二乙醇胺、2-二甲基胺基乙醇、2-二乙基胺基乙醇、二環己基胺、離胺酸、精胺酸、組胺酸、咖啡因(caffeine)、普魯卡因(procaine)、N,N-二苄基乙二胺、氯普魯卡因(chloroprocaine)、海巴明(hydrabamine)、膽鹼、甜菜鹼(betaine)、乙二胺、二苯胺基乙烷(ethylenedianiline)、N-甲基葡糖胺、葡糖胺、甲基葡糖胺、可可鹼、嘌呤、哌嗪、哌啶、N-乙基哌啶、聚胺樹脂等。參見上文Berge等人。
如本文所使用，「治療(treatment)」或「治療(treating)」或「減輕(palliating)」或「改善(ameliorating)」可互換使用。此等術語係指獲得有益或期望結果(包括(但不限於)治療益處及/或預防益處)之方法。所謂「治療益處」意指根治或改善正在治療之潛在病症。還有，治療益處係以如下達成：根治或或改善一或多種與潛在病症相關聯之生理症狀，以使得在患者中觀察到改良，儘管患者仍罹患該潛在病症。就預防益處而言，在一些實施例中，將組合物投與至具有發展特定疾病風險之患者或報告有疾病之一或多種生理症狀，但尚未確診該疾病之患者。
「前藥」意指在一些實施例中在生理條件下或藉由溶劑分解轉化為本文所述生物活性化合物之化合物。因此，術語「前藥」係指醫藥上可接受之生物活性化合物之前體。當投與至個體時，前藥通常無活性，但在活體內(例如藉由水解)轉化為活性化合物。前藥化合物通常在哺乳動物生物中提供溶解性、組織相容性或延遲釋放之優勢(參見例如，Bundgard,H.,Design of Prodrugs(1985)，第7至9頁、第21至24頁(Elsevier,Amsterdam)。
Higuchi,T.等人「Pro-drugs as Novel Delivery Systems,」A.C.S.Symposium Series，第14卷及Bioreversible Carriers in Drug Design，Edward B.Roche編，American Pharmaceutical Association and Pergamon Press,1987中提供前藥之論述，二者全部以引用的方式併入本文中。
術語「前藥」亦意在包括任何以共價鍵結合之載體，其在將此等前藥投與至哺乳動物個體時在活體內釋放活性化合物。如本文所述活性化合物之前藥係藉由以如下方式修飾存在於活性化合物中之官能基而製備：修飾以常規操作或在活體內裂解而得到母體活性化合物。前藥包括其中羥基、胺基或驗基鍵結至在將活性化合物之前藥投與至哺乳動物個體時會裂解分別形成游離羥基、游離胺基或游離巰基之任何基團之化合物。前藥之實例包括(但不限於)活性化合物中之醇或胺官能基之乙酸鹽、甲酸鹽及苯甲酸鹽衍生物等。
經取代之雜環衍生化合物
本文描述經取代之雜環衍生化合物，其係離胺酸特異性去甲基酶-1抑制劑。此等化合物及包含此等化合物之組合物可用於治療癌症及新生贅瘤疾病。
一實施例提供一種具有式(I)結構之化合物或其醫藥上可接受之鹽,
Figure TWI676620B_D0006
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、-CN、視情況經取代之烷基、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基、視情況經取代之環烷基或視情況經取代之環烷基烷基； Z係視情況經取代之選自以下之基團：烷基、碳環基、C-附接雜環基、N-附接雜環基、雜環基烷基、雜環基烯基、-O-雜環基、-N(R)-雜環基、-O-雜環基烷基、-N(R)-雜環基烷基、-N(R)(C1-C4伸烷基)-NR2、-O(C1-C4伸烷基)-NR2；且R係氫或C1-C4烷基。
一實施例提供一種具有式(Ia)結構之式(I)化合物或其醫藥上可接受之鹽，
Figure TWI676620B_D0007
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、-CN、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基、視情況經取代之環烷基或視情況經取代之環烷基烷基；且Z係視情況經取代之選自以下之基團：N-附接雜環基、-O-雜環基烷基、-N(H)-雜環基、-N(Me)-雜環基、-N(H)-雜環基烷基或-N(Me)-雜環基烷基。
一實施例提供一種具有式(Ib)結構之式(I)或(Ia)化合物或其醫藥上可接受之鹽，
Figure TWI676620B_D0008
其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔 基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基或視情況經取代之環烷基；且Z係視情況經取代之選自以下之基團：N-雜環基、-O-雜環基烷基、-N(H)-雜環基烷基或-N(Me)-雜環基烷基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中W係C-H。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中W係C-F。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中W係N。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係氫。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係鹵素。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之炔基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之碳環基炔基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之芳基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之苯基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之雜芳基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係係選自視情況經取代之吡啶基、視情況經取代之吡唑基或視情況經取代之吲唑基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係氫。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之環烷基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之烷基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之C1-C3烷基。另 一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之C1烷基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係甲基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-O-雜環基烷基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(H)-雜環基烷基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(Me)-雜環基烷基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-O-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且Rc係視情況經取代之C1-C3伸烷基鏈。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-O-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1伸烷基鏈。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-O-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該雜環基係視情況經取代之含氮4-、5-、6-或7-員雜環基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(H)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1-C3伸烷基鏈。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(H)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1伸烷基鏈。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(H)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該雜環基係視情況經取代之含氮4-、5-、6-或7-員雜環基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係 視情況經取代之-N(Me)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1-C3伸烷基鏈。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(Me)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1伸烷基鏈。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(Me)-雜環基烷基，且該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該雜環基係視情況經取代之含氮4-、5-、6-或7-員雜環基。
另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之N-雜環基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之4-、5-、6-或7-員N-雜環基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之6-員N-雜環基。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之哌啶。另一實施例提供式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之4-胺基哌啶。
在一些實施例中，式(I)、(Ia)或(Ib)中所述經取代之雜環衍生化合物具有表1中所提供之結構。
在一些實施例中，本文所述經取代之雜環衍生化合物具有表2中所提供之結構。
製備經取代之雜環衍生化合物
根據熟習此項技術者所知之有機合成技術，自市售化學品及/或化學文獻中所述化合物製造用於本文所述反應中之化合物。「市售化合物」係得自標準商業來源，包括Acros Organics(Pittsburgh,PA)、 Aldrich Chemical(Milwaukee,WI，其包括Sigma Chemical及Fluka)、Apin Chemicals Ltd.(Milton Park,UK)、Avocado Research(Lancashire,U.K.)、BDH Inc.(Toronto,Canada)、Bionet(Cornwall,U.K.)、Chemservice Inc.(West Chester,PA)、Crescent Chemical Co.(Hauppauge,NY)、Eastman Organic Chemicals、Eastman Kodak Company(Rochester,NY)、Fisher Scientific Co.(Pittsburgh,PA)、Fisons Chemicals(Leicestershire,UK)、Frontier Scientific(Logan,UT)、ICN Biomedicals,Inc.(Costa Mesa,CA)、Key Organics(Cornwall,U.K.)、Lancaster Synthesis(Windham,NH)、Maybridge Chemical Co.Ltd.(Cornwall,U.K.)、Parish Chemical Co.(Orem,UT)、Pfaltz & Bauer,Inc.(Waterbury,CN)、Polyorganix(Houston,TX)、Pierce Chemical Co.(Rockford,IL)、Riedel de Haen AG(Hanover,Germany)、Spectrum Quality Product,Inc.(New Brunswick,NJ)、TCI America(Portland,OR)、Trans World Chemicals,Inc.(Rockville,MD)及Wako Chemicals USA,Inc.(Richmond,VA)。
一般技術者已知之方法係透過各種參考書及資料庫確定。詳述可用於製備本文所述化合物之反應物之合成法或提供描述製法之文章之參考的適宜參考書及論文包括(例如)「Synthetic Organic Chemistry」,John Wiley & Sons,Inc.,New York；S.R.Sandler等人，「Organic Functional Group Preparations」，第2版，Academic Press,New York,1983；H.O.House,「Modern Synthetic Reactions」，第2版，W.A.Benjamin,Inc.Menlo Park,Calif.1972；T.L.Gilchrist,「Heterocyclic Chemistry」，第2版，John Wiley & Sons,New York,1992；J.March,「Advanced Organic Chemistry：Reactions,Mechanisms and Structure」，第4版，Wiley-Interscience,New York,1992。詳述可用於製備本文所述化合物之反應物之合成法或提供描述 製法之文章之參考的其他適宜參考書及論文包括(例如)Fuhrhop,J.及Penzlin G.「Organic Synthesis：Concepts,Methods,Starting Materials」，第二修正增補版(1994)John Wiley & Sons ISBN：3-527-29074-5；Hoffman,R.V.「Organic Chemistry,An Intermediate Text」(1996)Oxford University Press,ISBN 0-19-509618-5；Larock,R.C.「Comprehensive Organic Transformations：A Guide to Functional Group Preparations」第2版(1999)Wiley-VCH,ISBN：0-471-19031-4；March,J.「Advanced Organic Chemistry：Reactions,Mechanisms,and Structure」第4版(1992)John Wiley & Sons,ISBN：0-471-60180-2；Otera,J.(編輯)「Modern Carbonyl Chemistry」(2000)Wiley-VCH,ISBN：3-527-29871-1；Patai,S.「Patai's 1992 Guide to the Chemistry of Functional Groups」(1992)Interscience ISBN：0-471-93022-9；Solomons,T.W.G.「Organic Chemistry」第7版(2000)John Wiley & Sons,ISBN：0-471-19095-0；Stowell,J.C.,「Intermediate Organic Chemistry」第2版(1993)Wiley-Interscience,ISBN：0-471-57456-2；「Industrial Organic Chemicals：Starting Materials and Intermediates：An Ullmann's Encyclopedia」(1999)John Wiley & Sons,ISBN：3-527-29645-X，分8卷；「Organic Reactions」(1942-2000)John Wiley & Sons，分超過55卷；及「Chemistry of Functional Groups」John Wiley & Sons，分73卷。
亦可透過由美國化學學會的化學文摘服務(Chemical Abstract Serviceof the American Chemical Society)所製之已知化學品目錄來確定具體及類似反應物，該等目錄可在大多數公共及大學圖書館以及透過線上資料庫獲得(就更多細節而言，聯繫美國化學學會(American Chemical Society),Washington,D.C)。目錄中已知但無法獲得之化學品可藉由定製化學合成室製備，其中許多標準化學供應室(例如，彼 等上文所列者)提供定製合成服務。關於製備及篩選本文所述經取代之雜環衍生化合物之醫藥鹽的參考文獻係P.H.Stahl及C.G.Wermuth「Handbook of Pharmaceutical Salts」,Verlag Helvetica Chimica Acta,Zurich,2002。
該等經取代之雜環衍生化合物係藉由下文反應圖1中所述之一般合成途徑製備。
Figure TWI676620B_D0040
參考反應圖1，化合物A經選擇性水解得到化合物B。化合物C係由化合物B與各種烷基鹵化物R1-X之N-烷基化得到。三氯化物化合物C與各種胺HN(R2)(R2’)在鹼性條件下進行選擇性置換，形成化合物D。化合物E係在鈀介導之交叉偶合條件下由化合物D與
Figure TWI676620B_D0041
酸(例如R3-B(OH)2)或
Figure TWI676620B_D0042
酸酯製得。化合物F係在鈀介導之交叉偶合條件下由化合物E與
Figure TWI676620B_D0043
酸(例如R3-B(OH)2)或
Figure TWI676620B_D0044
酸酯製得。
經取代之雜環衍生化合物之醫藥組合物
在某些實施例中，如本文所述經取代之雜環衍生化合物係呈純化學品投與。在其他實施例中，如本文所述經取代之雜環衍生化合物係與基於如(例如)Remington：The Science and Practice of Pharmacy(Gennaro，第21版，Mack Pub.Co.,Easton,PA(2005))(其揭示內容以全文引用的方式併入本文中)中所述之選定投與途徑及標準醫藥實務選擇之醫藥上適宜或可接受之載劑(本文亦稱為醫藥上適宜(或可接受)之賦形劑、生理上適宜(或可接受)之賦形劑或生理上適宜(或可接受) 之載劑)組合。
本文提供一種醫藥組合物，其包含至少一種經取代之雜環衍生化合物或其立體異構體、醫藥上可接受之鹽、水合物、溶劑化物或N-氧化物連同一或多種醫藥上可接受之載劑。若載劑(或賦形劑)與組合物之其他成分相容且對該組合物之接受者(亦即，個體)不會造成傷害，則該載劑係可接受或適宜。
一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(I)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(Ia)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。一實施例提供一種醫藥組合物，其包含式(Ib)化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。
在某些實施例中，如由式(I)描述之經取代之雜環衍生化合物係實質上純淨，其包含少於約5%、或少於約1%、或少於約0.1%之其他有機小分子，諸如(例如)合成方法之一或多個步驟中產生之未反應中間物或合成副產物。
適宜的口服劑型包括(例如)錠劑、丸劑、藥囊(sachet)、或者硬明膠或軟明膠、甲基纖維素或另一易溶解於消化道中之適宜材料之膠囊。在一些實施例中，使用適宜的無毒性固體載劑，其包括(例如)醫藥級甘露醇、乳糖、澱粉、硬脂酸鎂、糖精鈉、滑石、纖維素、葡萄糖、蔗糖、碳酸鎂等。(參見，例如Remington：The Science and Practice of Pharmacy(Gennaro，第21版，Mack Pub.Co.,Easton,PA(2005))。
包含至少一種如本文所述經取代之雜環衍生化合物之組合物之劑量依據患者(例如，人類)狀況(亦即疾病階段、一般健康狀態、年齡及熟習醫療技術者將用以確定劑量之其他因素)而不同。
醫藥組合物係由熟習醫療技術者決定以適於待治療(或預防)疾病 之方式投與。適宜劑量以及適宜之持續投與時間及投與頻率將由以下因素確定，諸如患者狀況、患者疾病之類型及嚴重性、活性成分之特定形式及投與方法。一般而言，適宜劑量及治療方案所提供之用量足以提供治療及/或預防效益(例如，改良之臨床結果，諸如更頻繁之完全或部分緩解、或更長之無疾病及/或總存活期、或減輕症狀嚴重性)之組合物。最佳劑量通常係使用實驗模型及/或臨床試驗確定。最佳劑量取決於患者之體質量、體重或血容量。
口服劑量通常介於約1.0mg至約1000mg之範圍內，每天一至四次或更多次。
經取代之雜環衍生化合物之用途
表觀遺傳學(Epigenetics)研究基因表現中由不同於潛在DNA序列之機制引起之可遺傳變化。在表觀遺傳調節中起重要作用之分子機制包括DNA甲基化及染色質/組蛋白修飾。
真核生物之基因組在細胞核內高度組織化。將人類基因組之30億核苷酸封裝在細胞核中需要進行極大壓縮。染色質係構成染色體之DNA及蛋白質之複合物。組蛋白係染色質之主要蛋白質組分，其充當DNA所纏繞之線軸(spool)。染色質結構之變化受到組蛋白蛋白之共價修飾及非組蛋白結合蛋白之影響。已知幾類可修飾組蛋白各位點之酶。
總共有六類組蛋白(HI、H2A、H2B、H3、H4及H5)，組成兩組：核心組蛋白(H2A、H2B、H3及H4)連接組蛋白(HI及H5)。染色質之基本單元係核小體，其係由繞核心組蛋白八聚體纏繞之約147個鹼基對之DNA組成，核心組蛋白八聚體係由兩個各由核心組蛋白H2A、H2B、H3及H4組成之複本組成。
然後基本核小體單元進一步組織化並藉由核小體之聚集及折疊縮合，以形成高度縮合的染色質結構。可能存在一系列不同縮合狀 態，且染色質結構之緊密性在細胞週期期間有所不同，在細胞分化過程中最為緊湊。
染色質結構在調節基因轉錄方面起重要作用，高度縮合的染色質無法有效進行基因轉錄。染色質結構受到一系列對組蛋白蛋白之轉譯後修飾(特別係組蛋白H3及H4，且在延伸超過核心核小體結構之組蛋白尾部最為常見)控制。此等修飾為乙醯化、甲基化、磷酸化、核糖基化、類泛素化(sumoylation)、泛素化、瓜胺酸化、去亞胺化及生物素化。組蛋白H2A及H3之核心亦可經修飾。組蛋白修飾對各種生物過程如基因調節、DNA修復及染色體縮合係必不可少。
組蛋白甲基化係其中最重要染色質標記之一；此等在轉錄調節、DNA損傷反應、異染色質形成及維持、及X染色體去活化方面起重要作用。最近的發現亦揭示，組蛋白甲基化藉由影響剪接調節子之募集而影響前體-mRNA之剪接結果。組蛋白甲基化包括離胺酸之單-、二-及三-甲基化、及精胺酸之單-、對稱二-及不對稱二-甲基化。此等修飾可係活化或抑制標記，端視甲基化之位點及程度而定。
組蛋白去甲基酶
如本文所提及之「去甲基酶」或「蛋白質去甲基酶」係指會移除多肽之至少一個甲基之酶。去甲基酶包括JmjC結構域，且可係甲基-離胺酸或甲基-精胺酸去甲基酶。一些去甲基酶作用於組蛋白，例如充當組蛋白H3或H4去甲基酶。例如，H3去甲基酶可使H3K4、H3K9、H3K27、H3K36及/或H3K79中之一或多者去甲基化。或者，H4去甲基酶可使組蛋白H4K20去甲基化。已知去甲基酶可使單-、二及/或三-甲基化受質去甲基化。另外，組蛋白去甲基酶可作用於甲基化核心組蛋白受質、單核小體受質、二核小體受質及/或寡聚核小體受質、肽受質及/或染色質(例如，在基於細胞之分析中)。
初次發現的離胺酸去甲基酶係離胺酸特異性去甲基酶1 (LSD1/KDM1)，其利用黃素作為輔助因子使單-及二-甲基化H3K4或H3K9去甲基化。預測有第二類含Jumonji C(JmjC)結構域之組蛋白去甲基酶，且在使用甲醛釋放分析發現H3K36去甲基酶時得到確認，將其命名為含JmjC結構域之組蛋白去甲基酶1(JHDM1/KDM2A)。
後續確定更多含JmjC結構域之蛋白質，且其等可以系統發生方式歸為七個子家族：JHDM1、JHDM2、JHDM3、JMJD2、JARID、PHF2/PHF8、UTX/UTY及僅有JmjC結構域。
LSD-1
離胺酸特異性去甲基酶1(LSD1)係特異性使單甲基化及二甲基化組蛋白H3在K4去甲基化，且亦使二甲基化組蛋白H3在K9去甲基化之組蛋白離胺酸去甲基酶。雖然LSD1之主要標靶似乎係單-及二-甲基化組蛋白離胺酸，具體言之H3K4及H3K9，但文獻中存在LSD1可使非組蛋白蛋白如p53、E2F1、Dnmt1及STAT3上之甲基化離胺酸去甲基化之證據。
LSD1與聚胺氧化酶及單胺氧化酶具有相當程度之結構類似性及胺基酸一致性/同源性，其全部(亦即MAO-A、MAO-B及LSD1)係黃素相依性胺氧化酶，會催化氮-氫鍵及/或氮-碳鍵氧化。LSD1亦包括N端SWRIM結構域。存在兩種由替代性剪接所產生之LSD1轉錄變異體。
在一些實施例中，本文所揭示化合物能夠藉由使生物樣本與如本文所揭示之經取代之雜環化合物接觸而抑制該生物樣本中之LSD1活性。在一些實施例中，如本文所揭示之經取代之雜環化合物能夠調控生物樣本中之組蛋白4離胺酸3甲基化之水平。在一些實施例中，如本文所揭示之經取代之雜環化合物能夠調控生物樣本中之組蛋白-3離胺酸-9甲基化水平。
本文所揭示之經取代之雜環化合物缺乏顯著MAO-A或MAO-B抑制活性。在一些實施例中，如本文所揭示之經取代之雜環化合物抑制 LSD1抑制活性之程度大於MAO-A及/或MAO-B抑制活性。
一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(I)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(Ia)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。一實施例提供一種調節細胞中之基因轉錄之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至式(Ib)化合物來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。
治療方法
本文揭示一般意義上或者就一或多種特定靶基因而言之調控細胞或個體之去甲基化的方法。調控去甲基化以控制各種細胞功能，包括(但不限於)：分化；增殖；細胞凋亡；腫瘤形成、白血病形成或其他致癌轉化事件；脫髮；或性別分化。
一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(I)化合物或其醫藥上可接受之鹽。一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(Ia)化合物或其醫藥上可接受之鹽。一實施例提供一種為有此需要之患者治療癌症之方法，其包括向該患者投與式(Ib)化合物或其醫藥上可接受之鹽。
在另一實施例中係用於治療個體之癌症之方法，其中該癌症係選自前列腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌或黑色素瘤。在另一實施例中係用於治療個體之癌症之方法，其中該癌症係選自急性骨髓性白血病(AML)、急性淋巴母細胞白血病(ALL)、小細胞肺癌(SCLC)、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、小圓藍細胞瘤或神經膠質母細胞瘤。
熟習此項技術者根據本發明將知曉其他實施例及用途。提供以 下實例僅係說明各種實施例，且不應視為以任何方式限制本發明。
實例
I.化學合成
除非另有說明，否則試劑及溶劑係以自商業供應商接收時之狀態使用。針對對水分及/或氧氣敏感之合成轉化使用無水溶劑及烘乾玻璃器皿。產率並非最佳化。反應時間係近似值，且並非最佳化。除非另有說明，否則管柱層析及薄層層析(TLC)係在矽膠上進行。光譜係以ppm(δ)給出，且偶合常數J係以赫茲(Hertz)記錄。就質子光譜而言，使用溶劑峰作為參照峰。
製備1A：2,5,6-三氯嘧啶-4-醇
Figure TWI676620B_D0045
向2,4,5,6-四氯嘧啶(5g，22.9mmol)含於THF(50mL)之溶液逐滴添加1N NaOH(31mL，31.2mmol)，並在RT下攪拌該混合物過夜。用1N HCl使該溶液酸化，並用DCM(3x)萃取。合併有機物，乾燥並在真空中濃縮。在RT下，使固體在Et2O中成漿30min，過濾，用Et2O清洗，並乾燥得到3.0g(66%)標題化合物。C4HCl3N2O之[M+H]計算值201；實測值201。
製備1B：2,5,6-三氯-3-甲基-3-氫嘧啶-4-酮
Figure TWI676620B_D0046
在0℃下，向2,5,6-三氯嘧啶-4-醇(1g，5.0mmol)及K2CO3(759mg，5.5mmol)含於THF(50mL)之混合物逐滴添加碘甲烷(714mg，5.0mmol)，並在RT下攪拌該反應過夜。用乙酸乙酯(EA)稀釋反應混合物。用鹽水清洗有機相，乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析 (10：1，PE：EA)純化殘餘物，得到760mg(71%)標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 3.74(s,3 H)。C5H3Cl3N2O之[M+H]計算值213；實測值213。
製備1C：N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-側氧基(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](第三丁氧基)甲醯胺
Figure TWI676620B_D0047
在120℃下加熱2,5,6-三氯-3-甲基-3-氫嘧啶-4-酮(426mg，2.0mmol)、DIEA(536mg，4.0mmol)及哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯(400mg，2mmol)含於DMF(10mL)之溶液1h。在真空中移除溶劑，並藉由矽膠層析(1：1，PE：EA)純化殘餘物，得到550mg(73%)標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.45(s,9H),1.50-1.58(m,2H),2.06-2.10(m,2H),2.98-3.05(m,2H),3.48(s,3 H),3.53-3.56(m,2H),3.70(s,1H),4.52(s,1H)。C15H22Cl2N4O3之[M+H]計算值213；實測值213。
製備1D：1-(5-氯-4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0048
用氮氣沖洗N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-側氧基(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](第三丁氧基)甲醯胺(500mg，1.3mmol)、4-氰基苯基
Figure TWI676620B_D0049
酸(195mg，1.3mmol)、[1,1'-雙(二第三丁基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II)(81mg，0.13mmol)及K2CO3(359mg，2.6mmol)含於DMF(10mL)之混 合物，並在85℃下攪拌2h。添加水，並用EA(3x)萃取混合物。合併有機物，用水清洗，用鹽水清洗，乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析(1：1，EA：PE)純化殘餘物，得到250mg(40%)標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.45(s,9H),1.54-1.61(m,2H),2.05-2.10(m,2H),2.99-3.05(m,2H),3.48-3.56(s,5H),3.70(s,1H),4.56(s,1H),7.73(d,J=8.0Hz,2H),7.93(d,J=8.0Hz,2H)。C22H26ClN5O3之[M+H]計算值444；實測值444。
製備1E：1-(4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0050
用氮氣沖洗1-(5-氯-4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.45mmol)、對甲苯基
Figure TWI676620B_D0051
酸(123mg，0.90mmol)、[1,1'-雙(二第三丁基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II)(28mg，0.045mol)及K2CO3(124mg，0.90mmol)含於DMF(10mL)之混合物，並在85℃下攪拌2h。添加水，並用EA(3x)萃取混合物。合併有機物，用水清洗，用鹽水清洗，乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析(1：1，EA：PE)純化殘餘物，得到50mg(22%)標題化合物。C29H33N5O3之[M+H]計算值500；實測值500。
實例1：4-(2-(4-胺基哌啶-1-基)-1-甲基-6-側氧基-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-4-基)苯甲腈鹽酸鹽
Figure TWI676620B_D0052
向1-(4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯(50mg，0.1mmol)含於EA(10mL)之溶液添加含於EA(5mL)之4N HCl溶液，並在RT下攪拌該混合物2h。在真空中濃縮溶劑，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到20mg(46%)呈鹽酸鹽之標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.74-1.79(m,2H),2.00-2.04(m,2H),2.21(s,3H),2.96-3.03(m,2H),3.29-3.03(m,1H),3.48(s,3H),3.71-3.74(m,2H),6.89(d,J=8.0Hz,2H),6.99(d,J=8.0Hz,2 H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),7.44(d,J=8.4Hz,2H)。C24H25N5O之[M+H]計算值400；實測值400。
實例2：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0053
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率5%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.74-1.78(m,2H),2.00-2.03(m,2H),2.98-3.02(m,2H),3.26-3.00(m,1H),3.48(s,3H),3.69(s,3H),3.70-3.73(m,2H),6.72(d,J=8.8Hz,2H),6.93(d,J=8.4Hz,2H),7.39(d,J=8.0Hz,2H),7.46(d,J=8.0Hz,2H)。C24H25N5O2之[M+H]計算值416；實測值416。
實例3：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0054
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總 產率11%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ.87-1.95(m,2H),2.14-2.17(m,2H),3.15-3.24(m,2H),3.43-3.48(m,1H),3.62(s,3H),3.93-3.98(m,2H),4.23(s,3H),7.46(d,J=9.2Hz,1H),7.63(d,J=8.0Hz,2H),7.71(d,J=8.4Hz,2H),8.12(dd,J=8.8,1.6Hz,1H),8.28(d,J=2.0Hz,1H)。C23H24N6O2之[M+H]計算值417；實測值417。
實例4：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-1-甲基-5-(6-甲基-吡啶-3-基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0055
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率4%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.79-1.80(m,2H),2.03-2.05(m,2H),2.66(s,3H),3.04-3.09(m,2H),3.30-3.34(m,1H),3.50(s,3H),3.83-3.88(m,2H),7.48(d,J=8.4Hz,2H),7.58(d,J=8.4Hz,2H),7.64(d,J=8.4Hz,1H),8.00(dd,J=8.4,2.0Hz,1H),8.54(d,J=8.0Hz,1H)。C23H24N6O之[M+H]計算值401；實測值401。
實例5：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0056
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率7%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.89-1.95(m,2H),2.15-2.18(m,2H),3.14-3.18(m,2H),3.44-3.46(m,1H),3.60(s,3H),3.88-3.90(m,5H),6.79(d,J=8.4Hz,1H),6.96-7.02(m,2H),7.54(d,J=8.0 Hz,2H),7.64(d,J=8.0Hz,2H)。C24H24FN5O2之[M+H]計算值434；實測值434。
實例6：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0057
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率5%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.83-1.89(m,2H),2.10-2.13(m,2H),3.05-3.11(m,2H),3.35-3.38(m,1H),3.55(s,3H),3.76(s,3H),3.77-3.82(m,2H),6.84(d,J=8.8Hz,2H),7.04(d,J=8.8Hz,2H),7.21(d,J=8.0Hz,1H),7.35(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.56(m,1H)。C24H24FN5O2之[M+H]計算值434；實測值434。
製備7A：1-(5-氯-4-(3-氟-4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0058
用氮氣沖洗N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-側氧基(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](第三丁氧基)甲醯胺(150g，0.40mol)、3-氟-4-氰基苯基
Figure TWI676620B_D0059
酸(65.8g，0.40mol)、Pd(Ph3P)4(9.3g，8mmol)及0.4N Na2CO3(2L，0.80mol)含於ACN(4L)之混合物，並在85℃下攪拌2h。添加水，並用EA(3x)萃取混合物。合併有機物，用水清洗，用鹽水清洗，乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析(1：1，EA：PE)純化殘餘物，得到95g(57%)標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.45(s,9 H),1.54- 1.61(m,2H),2.05-2.13(m,2H),2.99-3.08(m,2H),3.53-3.58(s,5H),3.70(s,1H),4.54(d,J=6.0Hz,1H),7.68-7.80(m,3 H)。
製備7B：N-[1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-側氧基嘧啶-2-基]哌啶-4-基]胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0060
用氮氣沖洗(第三丁氧基)-N-{1-[5-氯-6-(4-氰基-3-氟苯基)-3-甲基-4-側氧基(3-氫嘧啶-2-基)](4-哌啶基)}甲醯胺(1g，2.169mmol)、3-氟-4-甲氧基苯
Figure TWI676620B_D0061
酸(740mg，4.338mmol)、Pd(dppf)Cl2(480mg，0.651mmol)及Na2CO3(690mg，6.51mmol)含於二噁烷：H2O(3：1，15mL)之混合物，蓋帽，並在145℃下於微波中攪拌2h。濃縮反應混合物，並藉由FC(1：1，EA：PE)純化殘餘物，得到800mg(71%)標題化合物。C29H31F2N5O4之[M+H]計算值552；實測值552。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ ppm 1.46(s,9 H),1.60(d,J=10.11Hz,2 H),2.11(d,J=11.62Hz,2 H),3.06(t,J=12.00Hz,2 H),3.54(s,3 H),3.60(d,J=13.64Hz,2 H),3.72(br.s.,1 H),3.88(s,3 H),4.52(br.s.,1 H),6.79-6.89(m,2 H),6.97(d,J=12.38Hz,1 H),7.13(d,J=8.34Hz,1 H),7.31(d,J=9.85Hz,1 H),7.42(br.s.,1 H)。
實例7：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(3-氟-4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0062
向N-[1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-側氧基嘧啶-2-基]哌啶-4-基]胺基甲酸第三丁酯(5.2g，9.44mmol)含於EA(20mL)之溶液添加含於EA(30mL)之1N HCl。在RT下攪拌該混合物2h。在真空中濃縮溶劑，得到呈鹽酸鹽之標題產物(4.05g，88%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.77-1.79(m,2H),2.02-2.04(m,2H),2.99-3.04(m,2H),3.26-3.00(m,1H),3.38(s,3H),3.73(s,3H),3.73-3.75(m,2H),6.67-6.68(m,1H),6.84-6.95(m,2 H),7.12-7.14(m,1H),7.24-7.36(m,1H),7.46-7.50(m,1H)。C24H23F2N5O2之[M+H]計算值452；實測值452。
實例8：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0063
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率6%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.79-1.83(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.04-3.11(m,2H),3.21-3.22(m,1H),3.49(s,3H),3.81-3.85(m,2H),4.12(s,3H),7.22-7.24(m,1H),7.38(d,J=9.2Hz,1H),7.49(d,J=9.2Hz,1H),7.57-7.61(m,1H),8.04-8.07(m,1H),8.21(s,1H)。C23H23FN6O2之[M+H]計算值435；實測值435。
實例9：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0064
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率8%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.92-1.96(m,2H),2.16-2.19(m,2H),2.80(s,3H),3.19-3.25(m,2H),3.45-3.49(m,1H),3.62(s,3H),3.96-3.99(m,2H),7.34(d,J=8.0Hz,1H),7.60(d,J=7.2Hz,1H),7.71(t,J=7.6Hz,1H),7.80(d,J=8.4Hz,1H),8.18(d,J=8.4Hz,1H),8.71(s,1H)。C23H23FN6O之[M+H]計算值419；實測值419。
實例10：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(6-乙基-吡啶-3-基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0065
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率7%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.30(t,J=4.0Hz,3H),1.83-1.88(m,2H),2.06-2.09(m,2H),2.96-2.99(m,2H),3.09-3.16(m,2H),3.26-3.31(m,1H),3.51(s,3H),3.86-3.89(m,2H),7.35(d,J=8.0Hz,2H),7.61(d,J=8.0Hz,2H),7.71(d,J=8.4Hz,1H),8.08(d,J=8.4Hz,1H),8.57(s,1H)。C24H26N6O之[M+H]計算值415；實測值415。
實例11：2-氟-4-[5-(4-甲氧基-苯基)-1-甲基-2-(4-甲基胺基-哌啶-1-基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0066
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率7%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.80-1.90(m,2H),2.19-2.23(m,2H),2.75(s,3H),3.06-3.12(m,2H),3.32-3.36(m,1H),3.56(s, 3H),3.76(s,3H),3.84-3,87(m,2H),6.84(d,J=8.4Hz,2H),7.04(d,J=8.4Hz,2H),7.22(d,J=8.0Hz,1H),7.36(d,J=10.8Hz,1H),8.54-7.58(m,1H)。C25H26FN5O2之[M+H]計算值448；實測值448。
實例12：2-氟-4-[5-(3-氟-4-甲氧基-苯基)-1-甲基-2-(4-甲基胺基-哌啶-1-基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0067
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率7%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.78-1.88(m,2H),2.17-2.20(m,2H),2.73(s,3H),3.05-3.11(m,2H),3.30-3.35(m,1H),3.54(s,3H),3.82(s,3H),3.83-3.86(m,2H),6.76(d,J=8.4Hz,1H),6.93-6.99(m,2H),7.20(d,J=8.4Hz,1H),7.38(d,J=10.4Hz,1H),8.55-7.589(m,1H)。C25H25F2N5O2之[M+H]計算值466；實測值466。
製備13A：2,6-二氯-3-乙基-3H-嘧啶-4-酮
Figure TWI676620B_D0068
在RT下攪拌2,6-二氯-嘧啶-4-醇(1.0g，6.1mmol)及K2CO3(1.1g，7.9mmol)含於DMF(10mL)之溶液15min。將反應混合物冷卻至0℃，並逐滴添加碘乙烷(1.1mL，6.7mmol)。在RT下攪拌過夜後，並用EA稀釋反應混合物，用鹽水清洗，乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮。藉由矽膠層析(20：1，EA：PE)純化殘餘物，得到330mg(28%)標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.37(t,J=7.6Hz,3H),4.76(q,J=6.8Hz,2H),6.67(s,1H)。C6H6Cl2N2O之[M+H]計算值193、195、197；實測值193、195、197。
製備13B：[1-(4-氯-1-乙基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0069
將2,6-二氯-3-乙基-3H-嘧啶-4-酮(320mg，1.64mmol)、DIEA(423mg，3.28mmol)及(第三丁氧基)-N-(4-哌啶基)甲醯胺(328mg，1.64mmol)含於DMF(10mL)之溶液加熱至120℃，持續1h。在真空中濃縮溶劑，並藉由矽膠層析(1：5，EA：PE)純化殘餘物，得到210mg(36%)呈黃色固體之標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.25-1.32(m 2H),1.35(t,J=7.2Hz,3H),1.96-2.02(m,2H),2.98-3.06(m,2H),3.70(br,1H),4.30(q,J=5.2Hz,2H),4.44(br,1H),4.57-4.61(m,2H),5.95(s,1H)。C16H25ClN4O3之[M+H]計算值357、359；實測值357、359.
製備13C：{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-乙基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0070
在90℃及N2氣氛下攪拌[1-(4-氯-1-乙基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]-胺基甲酸第三丁酯(210mg，0.59mmol)含於CH3CN(10mL)、3-氟-4-氰基苯基
Figure TWI676620B_D0071
酸(126mg，0.77mmol)、Pd(PPh)4(14mg，0.012mmol)及0.4M Na2CO3(4.5mL，1.77mmol)之混合物過夜。在真空中濃縮有機物，並用DCM(2x)萃取水相。用鹽水清洗合併的有機物，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由矽膠層析(1：2，EA：PE)純化 殘餘物，得到185mg(64%)呈黃色固體之標題化合物。C23H28FN5O3之[M+H]計算值442；實測值442。
實例13：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-1-乙基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0072
向{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-乙基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(180mg，0.41mmol)含於EA(5mL)之混合物添加含於EA(3mL)之4M HCl溶液。攪拌反應混合物30min。在真空中蒸發溶劑，得到150mg呈黃色固體之標題化合物(97%)(鹽酸鹽)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.28(t,J=7.2Hz,1H),1.48-1.52(m,2H),1.99-2.02(m,2H),2.94-3.01(m,2H),3.33-3.38(m,1H),6.81(q,J=6.8Hz,2H),4.85-4.88(m,2H),6.95(s,1H),7.73(t,J=8.0Hz,1H),7.90-7.95(m,2H)。C18H20FN5O之[M+H]計算值342；實測值342。
製備14A：{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-環戊基乙炔基-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0073
在95℃下，於密封管中攪拌1-(5-氯-4-(3-氟-4-氰基苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.43mmol)、乙炔基-環戊烷(82mg，0.87mmol)、Pd(MeCN)2Cl2(4.5mg，0.017mmol)、X-Phos(10mg，0.022mmol)及K2CO3(120mg， 0.87mmol)含於ACN(15mL)之混合物過夜。將反應混合物冷卻至RT，並在真空中濃縮溶劑。藉由矽膠層析(1：2，EA：PE)純化殘餘物，得到100mg(45%)標題化合物。C29H34FN5O3之[M+H]計算值519；實測值519。
實例14：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-環戊基乙炔基-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0074
根據用於製備實例1之一般程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，總產率70%。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.50-1.74(m,8H),1.94-1.99(m,4H),2.88-3.01(m,4H),3.51(s,3H),3.60(d,J=13.2Hz,2H),7.63-7.67(m,1H),8.07-8.11(m,2H)。C24H26FN5O之[M+H]計算值419；實測值419。
製備15A：(2,4,5-三氯-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基)-乙酸甲酯
Figure TWI676620B_D0075
在0℃下，向2,5,6-三氯-3H-嘧啶-4-酮(20.0g，0.1mol)含於DMF(150mL)之溶液逐份添加NaH(60%含於礦物油，6.0g，0.12mol)，並攪拌該混合物30min。然後添加溴乙酸甲酯(18.3g，0.12mol)，並在RT下攪拌反應混合物過夜。用水(800mL)稀釋溶液，並用EA(200mL，3x)萃取。用水(800mL，3x)清洗合併的有機物，用鹽水(500mL)清洗，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由矽膠層析(1：50，EA：PE)純化殘餘物，得到6.0g標題產物(22%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 3.80(s,3H),5.04(s,2H)。C7H5Cl3N2O3之[M+H]計算值271；實測值271。
製備15B：[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4,5-二氯-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯
Figure TWI676620B_D0076
在RT下，向(2,4,5-三氯-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基)-乙酸甲酯(6.0g，22.4mmol)及哌啶-4-基-胺基甲酸第三丁酯(4.9g，24.4mmol)含於DMF(50mL)之溶液逐滴添加DIPEA(5.7g，44.3mmol)，並攪拌該混合物過夜。用水(500mL)稀釋反應混合物，並藉由過濾收集固體。然後將固體溶解於DCM(100mL)中，用水(100mL，3x)清洗，用鹽水(100mL)清洗，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由矽膠層析(1：2至1：1，DCM：PE)純化殘餘物，得到6.3g標題產物(64%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.22-1.34(m,2H),1.45(s,9H),1.97-2.03(m,2H),2.96-3.09(m,2H),3.68-3.69(m,1H),3.75(s,3H),4.42-4.44(m,3H),4.84(s,2H)。C17H24Cl2N4O5之[M+H]計算值435；實測值435。
製備15C：[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯
Figure TWI676620B_D0077
在65℃及氮氣氣氛下攪拌[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4,5-二氯-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯(5.76g，13.2mmol)、4-氰基-3-氟苯
Figure TWI676620B_D0078
酸(2.24g，16.1mmol)、Pd(PPh3)4(306mmol，0.26 mmol)及Na2CO3(2.8g，26.5mmol)含於DMF：H2O(50mL：10mL)之混合物過夜。濃縮反應混合物，並藉由矽膠層析(1：20或1：0，EA：PE)純化殘餘物，得到2.4g標題產物(43%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 1.27-1.37(m,2H),1.45(s,9H),1.99-2.02(m,2H),2.99-3.06(m,2H),3.68-3.76(m,1H),3.78(s,3H),4.42-4.52(m,3H),4.90(s,2H),7.63-7.66(m,1H),7.67-7.71(m,2H)。C24H27ClFN5O5之[M+H]計算值520；實測值520。
製備15D：[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯
Figure TWI676620B_D0079
在145℃及氮氣氣氛下攪拌[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯(2.2g，4.2mmol)、對甲氧基
Figure TWI676620B_D0080
酸(1.9g，12.7mmol)、Pd-118(274mg，0.42mmol)及K2CO3(1.2g，8.4mmol)含於DMF(50mL)之溶液6h。用水稀釋反應混合物，並用EA(3x)萃取。用水清洗合併的有機物，用鹽水清洗，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到600mg標題產物(24%)。C31H34FN5O6之[M+H]計算值592；實測值592。
製備15E：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-1-環丙基甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0081
向[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸甲酯(600mg，1.02mmol)含於MeOH(10mL)之溶液添加2N NaOH溶液(5mL)。反應完全後，用1N HCl使該溶液酸化，並用EA(3x)萃取。用鹽水清洗合併的有機物，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到240mg呈黃色固體之標題產物(41%)。C30H32FN5O6之[M+H]計算值578；實測值578。
實例15：[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸
Figure TWI676620B_D0082
向[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸(100mg，0.15mmol)含於EA(10mL)之溶液添加含於EA(5mL)之5N HCl溶液。在RT下攪拌反應混合物2h，並在真空中濃縮溶劑。藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到25mg呈鹽酸鹽之標題產物(32%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.53-1.56(m,2H),2.00-2.03(m,2H),3.00-3.07(m,2H),3.35-3.39(m,1H),3.67(s,3H),4.70(s,2H),4.76-4.77(m,2H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),6.96(d,J=8.8Hz,2 H),7.17(d,J=8.4Hz,1H),7.26(d,J=10.0Hz,1H),7.50(dd,J=7.2,8.0Hz,1H)。C25H24FN5O4之[M+H]計算值478；實測值478。
製備16A：{1-[1-胺甲醯基甲基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0083
向[2-(4-第三丁氧基羰基胺基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙酸(120mg，0.2mmol)含於DMF(5mL)之溶液添加NH4Cl(17mg，0.3mmol)、HATU(95mg，0.25mmol)及DIEA(25mg，0.4mmol)。反應完全後，用H2O稀釋該溶液，並用DCM萃取(3x)。乾燥(Na2SO4)合併的有機物並濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到50mg呈黃色固體之標題產物(43%)。C30H33FN6O5之[M+H]計算值577；實測值577。
實例16：2-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-6H-嘧啶-1-基]-乙醯胺
Figure TWI676620B_D0084
根據用於製備實例15之程序製備呈鹽酸鹽之標題化合物，產率96%。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.49-1.53(m,2H),1.98-2.01(m,2H),2.97-3.04(m,2H),3.33-3.36(m,1H),3.68(s,3H),4.69(s,2H),4.75-4.78(m,2H),6.75(d,J=8.4Hz,2H),6.99(d,J=8.8Hz,2 H),7.16(dd,J=1.2,8.0Hz,1H),7.25(dd,J=0.8,10.4Hz,1H),7.49(dd,J=7.2,8.0Hz,1H)。C25H25FN6O3之[M+H]計算值477；實測值477。
製備17A：2,6-二氯-3-(3-甲氧基-丙基)-3H-嘧啶-4-酮
Figure TWI676620B_D0085
向2,6-二氯-3H-嘧啶-4-酮(600mg，3.65mmol)含於DMF(10mL) 之溶液添加K2CO3(1.0g，7.3mmol)，並在RT下攪拌該混合物10min。然後在0℃下，逐滴添加1-溴-3-甲氧基-丙烷(101mg，7.3mmol)，並在RT下攪拌該混合物過夜。在真空中濃縮DMF，並藉由矽膠層析純化殘餘物，得到400mg標題產物(47%)。C8H10Cl2N2O2之[M+H]計算值237；實測值237。
製備17B：{1-[4-氯-1-(3-甲氧基-丙基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0086
在85℃下攪拌2,6-二氯-3-(3-甲氧基-丙基)-3H-嘧啶-4-酮(400mg，1.68mmol)、哌啶-4-基-胺基甲酸第三丁酯(405mg，2mmol)及DIEA(260mg，2.0mmol)含於DMF(20mL)之溶液2h。濃縮溶劑，並藉由矽膠層析純化殘餘物，得到500mg標題化合物(75%)。C18H29ClN4O4之[M+H]計算值400；實測值400。
製備17C：{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-(3-甲氧基-丙基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0087
在85℃下攪拌{1-[4-氯-1-(3-羥基-丙基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.5mmol)、4-氰基-3-氟苯基硼酸(107mg，0.65mmol)、Pd(PPh3)4(12mg，0.01mmol)及0.4M Na2CO3溶液(4mL)含於ACN之混合物過夜。用水稀釋反應混合物，並用EA(3x)萃取。在RT下攪拌反應混合物2h，並在真空中濃縮溶劑。藉由矽膠層析純化殘餘物，得到240mg標題產物(99%)。 C25H32FN5O4之[M+H]計算值485；實測值485。
實例17：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-1-(3-羥基-丙基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0088
在-78℃下，向{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-(3-甲氧基-丙基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.41mmol)含於DCM之溶液添加1M BBr3(4mL)。在RT下攪拌混合物2h，並在0℃下用MeOH驟冷。用飽和NaHCO3水溶液清洗溶液。乾燥有機層並濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到35mg呈鹽酸鹽之標題產物(23%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：1.65-1.69(m,2H),1.97-2.19(m,4H),3.13-3.22(m,2H),3.48-3.55(m,1H),3.73(t,J=8.0Hz,2H),4.55(t,J=8.0Hz,2H),4.94-4.95(m,2H),6.71(s,1H),7.88-8.05(m,3H)。C19H22FN5O2之[M+H]計算值371；實測值371。
製備18A：{1-[5-苯并呋喃-5-基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0089
在N2氣氛下，使{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.45mmol)、苯并呋喃-5-
Figure TWI676620B_D0090
酸(120mg，0.68mmol)、Pd(PPh3)4(26mg，0.05mmol)及2M Na2CO3(0.9mL)含於1,4-二噁烷(200mL)之混合物回流過夜。用水稀釋反應混合物，並用EA(3x)萃取。用鹽水清洗合併 的有機物，乾燥(Na2SO4)並濃縮。藉由矽膠層析純化殘餘物，得到100mg標題產物(42%)。C30H30FN5O4之[M+H]計算值543；實測值543。
實例18：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-苯并呋喃-5-基-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
Figure TWI676620B_D0091
向製劑18A(60mg，0.11mmol)含於EA(20mL)之溶液添加含於EA(10mL)之4M HCl溶液。在RT下攪拌混合物2h。在真空中濃縮溶劑，得到43mg呈鹽酸鹽之標題產物(53%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：1.85-1.92(m,2H),2.13-2.18(m,2H),3.10(t,J=4.0Hz,2H),3.31-3.33(m,1H),3.61(s,3H),3.87(d,J=13.2Hz,2H),6.65-7.21(m,3H),7.38-7.76(m,4H),7.76(s,1H)。C25H22FN5O2之[M+H]計算值443；實測值443。
製備19A：{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
Figure TWI676620B_D0092
在150℃及N2氣氛下攪拌{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(460mg，1mmol)、Zn(CN)2(175mg，1.5mmol)及Pd(PPh3)4(116mg，0.0.1mmol)含於DMF(5mL)之混合物4h。將該反應混合物冷卻至RT並過濾。在真空中濃縮濾液，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到150 mg呈黃色固體之標題產物(33%)。C23H25FN6O3之[M+H]計算值453；實測值453。
實例19：2-(4-胺基-哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-5-甲腈
Figure TWI676620B_D0093
向{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(150mg，0.33mmol)含於EA(5mL)之溶液添加含於EA(5mL)之5N HCl溶液。在RT下攪拌該反應混合物2h，並在真空中濃縮溶劑，得到120mg呈鹽酸鹽之標題產物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。C18H17FN6O之[M+H]計算值353；實測值353。
實例20：4-[2-(4-胺基哌啶-1-基)-5-氯-1-甲基-6-側氧基嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
Figure TWI676620B_D0094
向{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(150mg，0.33mmol)含於EA(5mL)之溶液添加含於EA(5mL)之5N HCl溶液。在RT下攪拌該反應混合物2h，並在真空中濃縮溶劑，得到120mg呈鹽酸鹽之標題產物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06 (m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。C18H17FN6O之[M+H]計算值353；實測值353。1H NMR(400 MHz,甲醇-d 4)：δ ppm 1.73-1.91(m,2 H),2.18(d,J=12.13Hz,2 H),3.06(t,J=12.76Hz,2 H),3.33-3.40(m,1 H),3.57(s,3 H),3.83(d,J=13.14Hz,2 H),7.75-7.93(m,3 H)。
製備120A：[1-(5-氯-4-氰基-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]-胺基甲酸第三丁酯
在130℃及N2氣氛下攪拌N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-側氧基(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](第三丁氧基)甲醯胺(2.4g，6.38mmol)、Zn(CN)2(388mg，3.32mmol)及Pd(PPh3)4(740mg，0.64mmol)含於DMF(20mL)之混合物5h。將該反應混合物冷卻至RT並過濾。在真空中濃縮濾液，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到200mg標題產物(9%)。C16H22ClN5O3之[M+H]計算值368；實測值368。
製備120B：{1-[4-氰基-5-(3-氟-4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
用N2使[1-(5-氯-4-氰基-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]-胺基甲酸第三丁酯(200mg，0.54mmol)、3-氟-4-甲氧基苯 酸(278mg，1.63mmol)、Pd(dppf)2Cl2(119mg，0.16mmol)及Na2CO3(173mg，1.63mmol)含於二噁烷(5mL)及H2O(1mL)之混合物脫氣，並在145℃下於微波中攪拌2h。將反應混合物冷卻至RT並過濾。在真空中濃縮濾液，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到110mg期望產物(45%)。C23H28FN5O4之[M+H]計算值458；實測值458。
實例120：2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(3-氟-4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-甲腈
向{1-[4-氰基-5-(3-氟-4-甲氧基-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(100mg，0.23mmol)含於EA(5mL)之混合物添加含於EA(5mL)之5N HCl溶液，並在RT下攪拌2h。在真空中濃縮溶劑，得到85mg呈鹽酸鹽之標題產物(93%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.71-1.75(m,2H),1.89-2.03(m,2H),2.96-3.02(m,2H),3.27-3.31(m,1H),3.42(s,3H),3.69-3.73(m,2H),3.83(s,3H),7.06(t,J=8.0Hz,1H),7.17-2.01(m,2H)。C18H20FN5O2之[M+H]計算值358；實測值358。
製備121A：{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
在150℃及N2氣氛下攪拌{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(460mg，1mmol)、Zn(CN)2(175mg，1.5mmol)及Pd(PPh3)4(116mg，0.0.1
mmol)含於DMF(5mL)之混合物4h。將該混合物冷卻至RT並過濾。在真空中濃縮濾液，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到150mg呈黃色固體之標題產物(33%)。C23H25FN6O3之[M+H]計算值453；實測值453。
實例121：2-(4-胺基-哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-5-甲腈
向{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟-苯基)-1-甲基-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(150mg，0.33mmol)含於EA(5mL)之混合物添加含於EA(5mL)之5N HCl溶液，並在RT下攪拌混合物2h。在真空中濃縮溶劑，得到120mg呈鹽酸鹽之標題產物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。C18H17FN6O之[M+H]計算值353；實測值353。
製備122A：4-氰基-3-氟-苯甲醯氯
使4-氰基-3-氟-苯甲酸(2.0g，12.12mmol)含於SOCl2(20mL)之混合物回流2h，並在真空中移除SOCl2，得到4-氰基-3-氟-苯甲醯氯(2.2g，99%)。粗物質無需進一步純化繼續用於下一步驟中。
製備122B：3-(4-氰基-3-氟-苯基)-2-(4-甲氧基-苯基)-3-側氧基-丙酸甲酯
在-78℃下，添加(4-甲氧基-苯基)-乙酸(2.18g，12.12mmol)含於THF(20mL)之溶液添加LiHMDS(18.2mL，18.18mmol)，並攪拌該混合物30min。在-78。℃下，逐滴添加4-氰基-3-氟-苯甲醯氯(2.2g，12mmol)含於THF之溶液；並使反應混合物溫至RT，並攪拌過夜。添加NH4Cl水溶液，並用EA(3x)萃取水層。在真空中濃縮合併的有機物，並藉由矽膠管柱層析(1：5，EA：PE)純化殘餘物，得到1.8g(45%)標題化合物。C18H14FNO4之[M+H]計算值328；實測值328。
製備122C：{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯
使3-(4-氰基-3-氟-苯基)-2-(4-甲氧基-苯基)-3-側氧基-丙酸甲酯(1.8g，5.5mmol)、(1-甲脒基-哌啶-4-基)-胺基甲酸第三丁酯(2.6g，9.2mmol)、DIEA(2.4g，18.3mmol)含於甲苯(50mL)之混合物回流過夜。在真空中濃縮溶劑。將殘餘物懸浮於MeOH中，並過濾固體，得到100mg(4%)標題化合物。C28H30FN5O4之[M+H]計算值520；實測值520。
實例122：4-[2-(4-胺基-哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-4-基]-2-氟-苯甲腈
向{1-[4-(4-氰基-3-氟-苯基)-5-(4-甲氧基-苯基)-6-側氧基-1,6-二氫-嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}-胺基甲酸第三丁酯(50mg，0.096mmol)含於EA(10mL)之溶液添加含於EA之5M HCl溶液，並在RT下攪拌該混合物2h。在真空中移除溶劑，並藉由製備型HPLC純化殘餘物，得到18mg(40%)呈鹽酸鹽之標題化合物。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ 1.81-1.87(m,2H),2.22-2.25(m,2H),3.34-3.38(m,2H),3.56-3.60(m,1H),3.78(s,3H),4.61-4.64(m,2H),6.86(d,J=7.2Hz,2H),7.08(d,J=8.4Hz,2H),7.37-7.38(m,1H),7.51-7.53(m,1H),7.74(s,1H)。C23H22EN5O2之[M+H]計算值420；實測值420。
II.生物學評估
實例1a：活體外酶抑制分析-LSD-1
此分析測定測試化合物抑制LSD1去甲基酶活性之能力。表現人類全長LSD1之大腸桿菌(E.coli)(寄存號O60341)係自Active Motif(目錄號31334)購得。
LSD1活性之酶學分析係基於時差式螢光共振能量轉移(TR-FRET)檢測。化合物對LSD1之抑制性質係按照以下反應條件在384孔板格式中測定：0.1至0.5nM LSD1，50nM H3K4mel-生物素標記肽(Anaspec目錄號64355)，2μM FAD含於50mM HEPES(pH 7.3)、10mM NaCl、0.005% Brij35、0.5mM TCEP、0.2mg/ml BSA之分析緩衝液中。在LANCE檢測緩衝液(PerkinElmer)中，在LSD1抑制劑(諸如1.8mM反苯環丙胺鹽酸鹽(2-PCPA))存在下，添加檢測試劑Phycolink鏈黴抗生物素蛋白-別藻藍蛋白(Prozyme)及銪-抗-未經修飾組蛋白H3離胺 酸4(H3K4)抗體(PerkinElmer)至最終濃度分別為12.5nM及0.25nM後，藉由TR-FRET定量測定反應產物。
根據以下程序進行分析反應：向板之各孔添加2μL 150nM H3K4me1-生物素標記肽混合物與2μL含於3% DMSO之11-點連續稀釋測試化合物，隨後添加2μL 0.3nM LSD1及6μM FAD，以起始反應。然後在室溫下培育反應混合物一小時，並藉由添加6μL含於LANCE檢測緩衝液(其含25 nM Phycolink鏈黴抗生物素蛋白-別藻藍蛋白及0.5nM銪-抗-未經修飾H3K4抗體)之1.8mM 2-PCPA終止。若板中使用0.5 LSD1酶，則酶反應在15分鐘內終止。在室溫下培育1小時後，藉由EnVision多標記讀取器以TR-FRET模式(在320nm下激發，在615nm及665nm下發射)讀取板。計算各孔之比率(665/615)，並擬合以確定抑制常數(IC50)。
量化本文所揭示化合物抑制LSD1活性之能力，並確定各別IC50值。表3提供本文所揭示各經取代之雜環化合物之IC50值。
注意：生化分析IC50數據指定在以下範圍內：
A：0.10μM
B：>0.10μM至1.0μM
C：>1.0μM至10μM
D：>10μM
實例2：活體外酶抑制分析-MAO選擇性
獲得人類重組單胺氧化酶蛋白MAO-A及MAO-B。MAO催化一級、二級及三級胺之氧化去胺化。為監測MAO酶活性及/或其由受關注抑制劑之抑制率，進行基於螢光(抑制劑)-篩選分析。選擇3-(2-胺基苯基)-3-側氧基丙胺(犬尿胺(kynuramine)二氫溴酸鹽，Sigma Aldrich)(一種非螢光化合物)作為受質。犬尿胺係兩種MAO活性之非特異性受質。雖然藉由MAO活性進行氧化去胺化，但犬尿胺被轉化為4-羥基喹啉(4-HQ)，一種所得螢光產物。
藉由測定犬尿胺至4-羥基喹啉之轉化率來估算單胺氧化酶之活性。在具有透明底之96孔黑色板(Corning)中以100μl之最終體積進行分析。分析緩衝液為100mM HEPES，pH 7.5。在相同實驗中，各實驗以三次重複進行。
簡而言之，在冰上，在不存在及/或存在各種濃度(例如，0至50 μM，端視抑制劑強度而定)之如本文所揭示化合物下，在反應緩衝液中培育固定量之MAO(就MAO-A而言為0.25μg，且就MAO-B而言為0.5μg)15分鐘。使用反苯環丙胺(Tranylcypromine)(Biomol International)作為抑制對照。
在讓酶與測試化合物相互作用後，分別向MAO-B及MAO-A之各反應添加60至90μM犬尿胺，並使反應在37℃黑暗中靜置1小時。藉由添加50μl 2N NaOH使受質之氧化去胺化停止。使用微量分析盤讀取器(Infinite 200,Tecan)，藉由螢光(在320nm下激發，在360nm下發射)監測犬尿胺至4-羥基喹啉之轉化率。使用任意單位來測量在不存在及/或存在測試化合物下所產生之螢光水平。
藉由測量在不存在測試化合物下由犬尿胺去胺化所形成之4-羥基喹啉之量得到氧化去胺化活性之最大值，並針對背景螢光進行校正。在Vmax/2下測得各抑制劑之Ki(IC50)。在上述分析中測試化學合成實例1至94、101至106、108至117及120至122，且發現具有大於2微莫耳之IC50。
實例3：LSD1 CD11b細胞分析
為分析LSD1抑制劑在細胞中之功效，進行CD11b流式細胞測定法分析。LSD1抑制作用誘導THP-1(AML)細胞中之CD11b表現，其係藉由流式細胞測定法測量。在24孔板中，以100,000個細胞/孔將THP-1細胞接種於含10%胎牛血清之RPMI 1640培養基中，最終體積為500μL/孔。將LSD1測試化合物連續稀釋於DMSO中。據此向各孔添加稀釋液，至0.2% DMSO之最終濃度。將細胞培育在37℃及5% CO2中4天。將各孔之250μL轉移至96孔圓底板之孔中。該板在4℃下於Beckman Coulter Alegra 6KR離心機中以1200rpm離心5分鐘。移除培養基，將細胞留在孔底部。在100μL冷HBSS(漢克氏(Hank’s)平衡鹽溶液)加2% BSA(牛血清白蛋白)溶液中清洗細胞，並在4℃下以1200 rpm離心5分鐘。移除清洗液。再將細胞懸浮於100μL含APC共軛小鼠抗-CD11b抗體(BD Pharmingen目錄號555751)之1：15稀釋液之HBSS加2% BSA中，並在冰上培育25分鐘。將細胞離心，並在100μl HBSS加2% BSA中清洗兩次。最後旋轉後，再將細胞懸浮於100μL含有1μg/mL DAPI(4',6-二甲脒基-2-苯基吲除)之HBSS加2% BSA中。然後藉由流式細胞測定法於BD FACSAria機器中分析細胞。分析細胞之CD11b表現。使用各抑制劑濃度之CD11b表現細胞之百分比來確定各分析化合物之IC50曲線。
表4提供本文所揭示各經取代之雜環化合物之細胞IC50值。
注意：細胞分析IC50數據指定在以下範圍內：
A：0.10μM
B：>0.10μM至1.0μM
C：>1.0μM至10μM
D：>10μM
實例4：Kasumi-1 AML細胞系增殖分析(細胞-MTS分析)
比色細胞分析評估LSD-1小分子抑制劑影響確立AML癌細胞系Kasumi-1之增殖之能力。
分析背景
已顯示，LSD-1蛋白在各種癌症類型(包括SCLC及AML)之生物學中起到關鍵作用。為證實LSD-1之小分子抑制作用係潛在抗癌症療法，實施分析，以測量確立AML癌細胞系中之增殖抑制程度。
分析原理
此細胞-MTS分析係基於7-天板之比色分析，其量化在存在及不存在測試化合物下新產生之NADH之量。使用此等NADH水平代表癌細胞增殖之量化。
分析方法
具有核實p53突變之確立癌細胞系Kasumi-1係購自美國模式菌種保藏中心(American Type Culture Collection)(ATCC)，並根據ATCC公開方案進行常規繼代。就常規分析而言，此等細胞係以20,000個細胞/96孔之密度接種。接種24小時後，細胞接受測試化合物之11點稀釋液，最終濃度範圍為100μM至2.0nM。細胞係在化合物存在下，在37℃及5% CO2下培育168小時。在此化合物培育期結束時，移除80μl培養基，並添加20μL CellTiter 96® AQueous非放射性細胞增殖分析溶液(Promega)。培育細胞，直至OD490>0.6。用IDBS XLfit軟體包計算IC50值，且包括減去背景之OD490值，並針對DMSO對照進行標準化。
表5提供本文所揭示各經取代之雜環化合物之Kasumi-1細胞IC50值。
實例5：活體內異種移植研究-MCF-7異種移植
將含0.72mg 17-β雌二醇之定時釋放丸粒皮下植入nu/nu小鼠中。在5% CO2及37℃下使MCF-7細胞生長於含10% FBS之RPMI中。使細胞離心沉降，並以1×107個細胞/mL再懸浮於50% RPMI(無血清)及50%基質膠(Matrigel)中。在植入丸粒2至3天後，在右脅腹皮下注射(100μL/隻動物)MCF-7細胞，並兩週一次監測腫瘤體積(長度x寬度2/2)。當腫瘤平均體積達到約200mm3，將動物隨機分組，並開始處理。每日用媒劑或化合物處理動物，持續4週。在整個研究期間，每兩週一次監測腫瘤體積及體重。在處理期結束時，獲取血漿及腫瘤樣本，以分別進行藥物動力學及藥效動力學分析。
實例6：活體內異種移植研究-LNCaP異種移植
藉由皮下注射將具有穩定LSD1基因敲除(knockdown)之LNCaP細胞(shLSD1細胞)或對照細胞(諸如shNTC細胞)接種於裸小鼠之背部脅腹(諸如3 x 106個細胞，含於100μl 50% RPMI 1640/BD基質膠)。每週一次測量小鼠體重及腫瘤尺寸，並用公式(7i/6)(LxW)估算腫瘤體積，其中L=腫瘤長度，且W=腫瘤寬度。進行兩樣本t檢驗，以確定兩組間平均腫瘤體積之統計差異。
藉由皮下注射將未經修飾之LNCaP細胞接種於裸小鼠之背部脅腹(諸如3 x 106個細胞，含於100μl 50% RPMI 1640/BD基質膠)。三週後，給小鼠腹膜內注射水(對照)、巴吉林(pargyline)(0.53mg或1.59mg；1或3mM最終濃度，假定70%生物利用率)或XB154(4或20μg；1 或5μM最終濃度，假定70%生物利用率)，每天一次，或者用測試化合物(每週5mg/kg，或每週10mg/kg)處理。處理持續三週，在此期間，如上測量小鼠體重及腫瘤體積。
如上將shLSD1 LNCaP細胞或對照細胞注射於裸小鼠中。三週後，用2.6μg絲裂黴素C(mitomycinC)(預期最終濃度1μM，假定40%生物利用率)、奧拉帕利(olaparib)(例如，約0.5mg/kg至25mg/kg)或媒劑經腹膜內處理小鼠，每天一次，持續三週。在其他實例中，如上將未經修飾之LNCaP細胞注射於裸小鼠中。
三週後，如上用測試化合物或媒劑處理小鼠，外加MMC或奧拉帕利。處理持續三週，在此期間，如上測量小鼠體重及腫瘤體積。
與對照相比，注射shLSD1細胞之小鼠之腫瘤體積減小，其表明LSD1抑制作用在活體內減少腫瘤生長。
類似地，與對照相比，注射LNCaP細胞且用本文所揭示之化合物處理之小鼠之腫瘤體積減小，其表明LSD1抑制作用在活體內減少腫瘤生長。最後，與單獨用本文所揭示之化合物處理之小鼠相比，注射LNCaP細胞且用本文所揭示之化合物外加奧拉帕利處理之小鼠之腫瘤體積減小，其表明LSD1之抑制作用加上PARP之抑制作用在活體內減少腫瘤生長。
檢查所收穫異種移植組織的LSD1抑制之證據。此係用西方墨點法評估，以檢查2MK4及2MK9組蛋白標記之總水平、FA/BRCA基因之表現、FANCD2泛素化及LSD1蛋白水平(在shRNA細胞之情形下)。此等參數中一或多者下降表明有效抑制LSD1。此外，藉助H2AX竈染色來評估對DNA損傷修復之影響。
III.製備醫藥劑型
實例1：口服錠劑
藉由混合48重量%之式(I)化合物或其醫藥上可接受之鹽、45重量 %之微晶纖維素、5重量%之經低取代之羥丙基纖維素及2重量%硬脂酸鎂製備錠劑。錠劑係藉由直接壓錠製備。壓製錠之總重量維持在250至500mg。

Claims (41)

  1. 一種具有式(I)結構之化合物或其醫藥上可接受的鹽：
    Figure TWI676620B_C0001
    其中，W係N、C-H或C-F；X係氫、鹵素、-CN、視情況經取代之烷基、視情況經取代之炔基、視情況經取代之碳環基炔基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；Y係氫、視情況經取代之烷基、視情況經取代之環烷基或視情況經取代之環烷基烷基；Z係視情況經取代之選自以下之基團：烷基、碳環基、C-附接雜環基、N-附接雜環基、雜環基烷基、雜環基烯基、-O-雜環基、-N(R)-雜環基、-O-雜環基烷基、-N(R)-雜環基烷基、-N(R)(C1-C4伸烷基)-NR2、-O(C1-C4伸烷基)-NR2；且R係氫或C1-C4烷基。
  2. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中W係C-H。
  3. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中W係C-F。
  4. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係氫。
  5. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係鹵素。
  6. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之炔烴。
  7. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之碳環基炔基。
  8. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基。
  9. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之芳基。
  10. 如請求項9之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之芳基係視情況經取代之苯基。
  11. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中X係視情況經取代之雜芳基。
  12. 如請求項11之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之雜芳基係選自視情況經取代之吡啶基、視情況經取代之吡唑基或視情況經取代之吲唑基。
  13. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-O-雜環基烷基。
  14. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(H)-雜環基烷基。
  15. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之-N(Me)-雜環基烷基。
  16. 如請求項13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1-C3伸烷基鏈。
  17. 如請求項13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該Rc係視情況經取代之C1伸烷基鏈。
  18. 如請求項13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該雜環基烷基具有式-Rc-雜環基，且該雜環基係視情況經取代之含氮4-、5-、6-或7-員雜環基。
  19. 如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Z係視情況經取代之N-附接雜環基。
  20. 如請求項19之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之N-附接雜環基係4-、5-、6-或7-員N-附接雜環基。
  21. 如請求項19之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之N-附接雜環基係6-員N-附接雜環基。
  22. 如請求項19之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之N-附接雜環基係視情況經取代之哌啶。
  23. 如請求項22之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之哌啶係4-胺基哌啶。
  24. 如請求項1至3及13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係氫。
  25. 如請求項1至3及13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之環烷基。
  26. 如請求項1至3及13至15中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中Y係視情況經取代之烷基。
  27. 如請求項26之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之烷基係視情況經取代之C1-C3烷基。
  28. 如請求項26之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之烷基係視情況經取代之C1烷基。
  29. 如請求項26之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其中該視情況經取代之烷基係甲基。
  30. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0002
  31. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0003
  32. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0004
  33. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0005
  34. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0006
  35. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0007
  36. 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受的鹽，其具有以下結構：
    Figure TWI676620B_C0008
  37. 一種醫藥組合物，其包含如請求項1至36中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽及醫藥上可接受的賦形劑。
  38. 一種細胞中基因轉錄之活體外調節之方法，其包括藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至如請求項1至36中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽來抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性。
  39. 一種如請求項1至36中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽之用途，其係用於製備治療有此需要之患者之癌症的藥劑。
  40. 如請求項39之用途，其中該癌症係急性骨髓性白血病(AML)、急性淋巴母細胞白血病(ALL)、小細胞肺癌(SCLC)、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、小圓藍細胞瘤、神經膠質母細胞瘤、前列腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌及/或黑色素瘤。
  41. 一種如請求項1至36中任一項之化合物或其醫藥上可接受的鹽之用途，其係用於製備抑制離胺酸特異性去甲基酶1活性的藥劑，藉由將離胺酸特異性去甲基酶1酵素曝露至該藥劑，以在細胞中調節基因轉錄。
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