某些本發明化合物為結晶。結晶學技術中已熟知，對於任何既定結晶形態，由於由諸如晶體形態及習性之因素所產生之較佳取向，繞射峰之相對強度可能有變化。在存在較佳取向之效應之情況下，峰強度會改變，但多晶型物之特徵峰位置不變。參見(例如) U. S. Pharmacopeia 38 - National Formulary 35 第＜941＞章Characterization of crystalline and partially crystalline solids by X-ray powder diffraction (XRPD) Official，2015年5月1日。此外，在結晶學技術中亦熟知，對於任何既定結晶形式，角峰位置可略有變化。舉例而言，峰位置可能由於分析樣品時之溫度或濕度變化、樣品移位或內標準物之存在或不存在而有位移。在本發明之情況下，2θ之± 0.2之峰位置變化將視為此等潛在變化，不妨礙明確鑑別所指示結晶形式。可基於有區別之峰(以°2θ為單位)(通常為較顯著之峰)之任何獨特組合來確認結晶形式。在環境溫度及相對濕度下收集之晶形繞射圖將依據出現在8.85及26.77°2θ之NIST 675標準峰調整。 如本文中所用，「治療(treat/treating/treatment)」係指遏制、減緩、終止或逆轉現有症狀或病症之進展或嚴重程度。 如本文所使用，術語「患者」指諸如罹患特定疾病、病症或病狀之溫血動物，如：哺乳動物，詳言之，人類。 一般熟習此項技術者將理解，本發明之化合物及某些中間物可呈互變異構形成存在。當在本申請案中任何提及本發明化合物之一種特定互變異構體時，應理解為涵蓋互變異構形式及其所有混合物。 本文中所揭示本發明之一些中間物或化合物可能具有一或多個對掌性或立體中心。預期本發明之所有此等前述化合物或中間物之所有個別立體異構體、對映異構體及非對映異構體以及對映異構體與非對映異構體之混合物，包括外消旋體。較佳的係，含有至少一個對掌性中心之本文中所揭示之本發明之化合物或中間物以單一對映異構體或非對映異構體之形式存在。可以對掌性試劑開始或藉由立體選擇性或立體特異性的合成技術(如製劑及實例中所說明)來製備單一對映異構體或非對映異構體。替代地，可藉由標準對掌性層析(如製劑及實例中所說明)或結晶技術將單一對映異構體或非對映異構體與混合物分離。熟練的業內人士將理解，在一些情況下，歸因於不同層析柱及移動相，對映異構體或非對映異構體之溶離次序可不同。 化合物名稱中之「異構體1」之命名表示在一對對映異構體之混合物藉由對掌性層析法分離時，本發明之對應中間物或化合物為兩個溶離對映異構體中之第一個。化合物名稱中之「異構體2」之命名表示在一對對映異構體之混合物藉由對掌性層析法分離時，本發明之對應中間物或化合物為兩個溶離對映異構體中之第二個。 化合物名稱中之「異構體A」之命名表示本發明之對應中間物或化合物為來自未知絕對構型之對掌性合成的單一異構體。 如本文所使用，「LY3300054」為結合人類PD-L1 (SEQ ID NO: 1)之抗體，其包含輕鏈(LC)及重鏈(HC)，其中輕鏈包含輕鏈可變區(LCVR)且重鏈包含重鏈可變區(HCVR)，且其中LCVR包含輕鏈互補決定區LCDR1、LCDR2及LCDR3，其中LCDR1之胺基酸序列為SGSSSNIGSNTVN (SEQ ID NO: 5)，LCDR2之胺基酸序列為YGNSNRPS (SEQ ID NO: 6)，且LCDR3之胺基酸序列為QSYDSSLSGSV (SEQ ID NO: 7)，且其中HCVR包含重鏈互補決定區HCDR1、及HCDR3，其中分別地，HCDR1之胺基酸序列為KASGGTFSSYAIS (SEQ ID NO: 2)，HCDR2之胺基酸序列為GIIPIFGTANYAQKFQG (SEQ ID NO: 3)，且HCDR3之胺基酸序列為ARSPDYSPYYYYGMDV (SEQ ID NO: 4)。 在LY3300054之一些實施例中，LY3300054結合至人類PD-L1，且包含輕鏈(LC)及重鏈(HC)，其中輕鏈包含輕鏈可變區(LCVR)且重鏈包含重鏈可變區(HCVR)，其中LCVR之胺基酸序列為SEQ ID NO: 9，且HCVR之胺基酸序列為SEQ ID NO: 8。在LY3300054之一些實施例中，LY3300054結合至人類PD-L1，其包含輕鏈(LC)及重鏈(HC)，其中LC之胺基酸序列為SEQ ID NO:10且HC具有在SEQ ID NO: 11中給定之胺基酸序列。在LY3300054之實施例中，LY3300054包含兩個輕鏈及兩個重鏈，其中各輕鏈具有在SEQ ID NO: 11中給定之胺基酸序列，且各重鏈具有在SEQ ID NO:10中給定之胺基酸序列。 如本文所使用，術語「輕鏈可變區」或「LCVR」意謂包括CDR及FR之胺基酸序列的抗體分子之輕鏈的一部分。 如本文所使用，術語「重鏈可變區」(「HCVR」)意謂包括CDR及FR之胺基酸序列的抗體分子之重鏈的一部分。 如本文所使用，術語「互補決定區」及「CDR」意謂在抗體或其抗原結合片段之LC及HC多肽的可變區中發現之非相鄰組合抗原結合部位。此等特定區域已由其他人描述，包括Kabat等人，Ann.NY Acad. Sci. 190:382-93 (1971)；Kabat 等人, J. Biol. Chem. 252:6609-6616 (1977)；Kabat等人, Sequences of Proteins of Immunological Interest，第五版本，U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242 (1991)；Chothia,等人，J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)；MacCallum等人，J. Mol. Biol., 262:732-745 (1996)；及North,等人，J. Mol. Biol., 406, 228-256 (2011)，其中該等定義包括在彼此相比較時胺基酸殘基之重疊或子集。 CDR與稱為構架區(「FR」)之更保守區域穿插。各LCVR及HCVR由三個CDR及四個FR組成，其按以下次序自胺基端至羧基端排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3 、FR4。輕鏈之三個CDR稱為「LCDR1、LCDR2及LCDR3」，且重鏈之三個CDR稱為「HCDR1、HCDR2及HCDR3」。CDR含有大部分與抗原形成特異性相互作用之殘基。LCVR區及HCVR區內之CDR胺基酸殘基之編號及定位係根據已知慣例(例如Kabat (1991) Chothia (1987)及/或North (2011))。在本發明之不同實施例中，LY3300054之FR可與人類生殖系序列一致或可經天然或人工修飾。 如本文所使用，術語「K
D
」意謂特定抗體抗原或抗體片段-抗原相互作用之平衡解離常數。 如本文所使用，術語「結合」意謂用於人類PD-L1的抗體之親和力意欲意謂除非另有指示，否則如此項技術中已知之常見方法(包括藉由如本文描述在基本上37℃處使用表面電漿子共振(SPR)生物感測器)判定之小於約1 × 10
-6
M，較佳地小於約1 × 10
-9
M之K
D
。 如本文所使用，以下術語具有所指示之含義：「ACN」係指乙腈；「APCI」係指大氣壓化學電離；「BTI」係指[雙(三氟乙醯氧基)碘]苯；「CDI」係指羰基二咪唑；「DCM」係指二氯甲烷；「DMSO」係指二甲亞碸；「DMF」係指N,N-二甲基甲醯胺；「DPBS」係指經杜爾貝科氏磷酸鹽緩衝之生理食鹽水；「ES」係指電噴霧電離；「EtOAc」係指乙酸乙酯；「EtOH」係指乙醇；「FBS」係指胎牛血清；「HPLC」係指高效液相層析；「iPrOH」係指異丙醇；「LC/MS-MS」係指液相層析聯合質譜；「L-犬尿胺酸-d4」係指(2S)-2-胺基-4-(2-胺基-3,4,5,6-四氘-苯基)-4-側氧基-丁酸；「MES」係指2-(N-嗎啉基)乙磺酸；「MS」係指質譜；「MeOH」係指甲醇；「PBS」係指經磷酸鹽緩衝之生理食鹽水；「TFA」係指三氟乙酸；「TEA」係指三乙胺；「THF」係指四氫呋喃；「SFC」係指超臨界流體層析；且「UVW」係指紫外線波長。 可根據以下流程、製劑及實例藉由此項技術中所熟知及理解的方法製備本發明之化合物。用於此等製劑及實例之步驟的合適反應條件為此項技術中所熟知的，且溶劑及輔試劑之適當取代物在此項技術之技能內。同樣地，熟習此項技術者應理解，可視需要或期望藉由熟知技術分離及/或純化合成中間物，且時常將可能在伴隨少量或無純化之後續合成步驟中直接使用各種中間物。此外，熟練的業內人士將理解，在一些情況下，引入部分之次序不重要。如熟練的化學工作者所充分理解，產生本發明之化合物所需步驟之特定次序取決於所合成之特定化合物、起始化合物及經取代部分的相對傾向。除非另有指示，否者所有取代基均如先前所定義，且所有試劑在此項技術中已熟知且已瞭解。 本發明之化合物可如以下流程中所說明來合成，其中R1a、R1b、R1c、R2、R2a及R3a如先前所定義。
流程 1 ： 式 ( I ) 化合物之合成
流程1說明式I化合物的一般合成，R2為H。在步驟1中，使2,3-二氫-1H-吲哚(化合物1)與諸如酸氯化物之適當的經活化羧酸在合適的鹼(諸如TEA)之存在下及在合適的溶劑(諸如DCM或二氯乙烷(DCE))中於諸如0℃至回流之適當溫度下反應。熟練的業內人士將理解，存在許多經活化羧酸及許多原位活化羧酸以實現步驟1之反應的方法。隨後，在諸如EtOH之極性質子溶劑中於諸如室溫至回流之適當溫度下用羥胺處理步驟1之所得酮(化合物2)，得到作為E異構體與Z異構體之混合物的肟(化合物3)。步驟3展示肟(化合物3)至胺(化合物4)之還原。熟練的業內人士將理解，存在許多可用於影響此轉變之方法。舉例而言，使肟(化合物3)與諸如RANEY®鎳之適當催化劑在諸如MeOH或EtOH之適當溶劑中於諸如PARR®震盪器之適當反應器中接觸。隨後，使該混合物在諸如室溫至50℃之適當溫度下經受諸如100至500 kPa之氫壓力，持續諸如1至24小時之適當時間。流程1之步驟4描繪胺(化合物4)與諸如酸氯化物之適當的經活化羧酸在合適的鹼(諸如TEA)之存在下及在合適的溶劑(諸如DCM或DCE)中於諸如0℃至回流之合適溫度下進行醯胺偶合，得到式I化合物。熟練的業內人士將理解，存在許多經活化羧酸及許多原位活化羧酸以實現步驟4之反應的方法。熟練的業內人士將進一步理解，流程1之步驟3及步驟4產生具有對掌性中心之產物。個別對映異構體可由一般熟習此項技術者在本發明之化合物之合成中於任何適宜時刻藉由諸如選擇性結晶技術或對掌性層析之方法之分離或離析(參見(例如)J. Jacques等人，「Enantiomers, Racemates, and Resolutions」, John Wiley and Sons, Inc., 1981,及E.L. Eliel 及 S.H. Wilen,「Stereochemistry of Organic Compounds」, Wiley-Interscience, 1994)。
流程 2 ： 式 I 化合物之合成
流程2說明式I化合物之替代性一般合成，R2為H。在步驟1中，使酮(化合物2)與適當之對掌性亞磺醯胺在適當之路易斯酸(諸如乙醇鈦(IV))之存在下在適當之溶劑(諸如THF)中於諸如室溫至回流之適當溫度下反應，持續諸如1至24小時之適當時間，得到對掌性亞乙基亞磺醯胺(化合物5)。熟練的業內人士將理解，試劑可用於產生亞磺醯胺(化合物5)之對映異構體
。
在步驟2中描繪自亞乙基亞磺醯胺(化合物5)產生乙基亞磺醯胺
(
化合物6
) 之
對掌性還原，且為清楚起見，星號用以指示對掌性中心。舉例而言，藉由使適當釕試劑(諸如二氯(異丙基甲苯)釕(II)二聚體)與適當胺基乙醇(諸如2-胺基-2-甲基-1-丙醇)在諸如4Å分子篩之水清除劑之存在下在諸如iPrOH之適當溶劑中於諸如室溫至回流之適當溫度下混合諸如五分鐘至大致一小時之適當時間而預形成適當催化劑。將預形成之催化劑反應物冷卻至諸如室溫至50℃之適當溫度，並用亞乙基亞磺醯胺(化合物5)及諸如第三丁醇鉀之適當鹼處理。將反應物保持在諸如室溫至50℃之適當溫度，持續諸如1至24小時之適當時間。熟練的業內人士將理解，存在許多將影響同一轉變之催化及化學計量方法，且此等方法可取決於基體之性質及所使用之試劑引起非對映體增濃，直至(並包括)單一非對映異構體之產生。乙基亞磺醯胺(化合物6)之酸水解可受以下影響：在適當溶劑(諸如二噁烷、iPrOH、EtOAc或MeOH)中於諸如0℃至室溫之適當溫度下用諸如氫氯酸(HCl)之適當的酸處理諸如一至八小時之適當時間，得到胺(化合物4)
。
熟練的業內人士將理解，許多用於分離之方法為已知的且此等方法可引起胺(化合物4)之鹽或游離鹼之分離。步驟4描繪類似於以上流程1之步驟4的胺(化合物4)與適當的經活化羧酸進行醯胺偶合，得到式I化合物。
流程 3 ： 式 I 化合物之合成
流程3描繪式I化合物之替代性一般合成，R2為H。步驟1描繪羧酸(化合物7)與N,O-鹽酸二甲基羥胺進行醯胺偶合，得到魏因勒蔔醯胺(Weinreb amide) (化合物8)
。
熟練的業內人士將理解，存在許多影響此轉變之方法。舉例而言，可在適當的鹼(諸如N,N-二異丙基乙胺)之存在下，在諸如DMF之適當溶劑中用適當的偶合試劑(諸如1-[雙(二甲胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓六氟磷酸鹽-3-氧化物(HATU))處理羧酸(化合物7)，持續諸如五至十分鐘之適當時間。隨後，用N,O-鹽酸二甲羥胺處理該混合物，並於諸如室溫至100℃之適當溫度下攪拌該混合物諸如3至18小時之適當時間。隨後在步驟2中，用適當的格林納(Grignard)、烷基鋰或烷基鋅試劑處理所得魏因勒蔔醯胺(化合物8)，得到酮(化合物9)
。
熟練的業內人士將理解，存在大量可用以影響此轉變之方法。舉例而言，在諸如THF之適當溶劑中於諸如0℃至-78℃之適當溫度下用諸如溴化乙基鎂之適當烷基金屬試劑處理魏因勒蔔醯胺(化合物8)。在添加之後繼續反應諸如1至18小時之適當時間，得到酮(化合物9)
。
為清楚起見而呈現流程3之步驟3、4及5。該等方法類似於流程1之步驟2、3及4中分別呈現之彼等方法。熟習此項技術者將理解，化合物11含有對掌性中心，且可對化合物11執行對掌性純化或可產生外消旋混合物，並在任一後續步驟之後執行分離。步驟6描繪使胺基甲酸酯(化合物12)之第三丁氧基羰基保護基脫除保護，得到胺(化合物13)。熟練的業內人士將理解，可在酸、鹼或熱條件下進行此轉變。舉例而言，使胺基甲酸酯
(
化合物12
)
與諸如HCl之適當的酸在適當溶劑(諸如二噁烷或DCM或其混合物)中於諸如0℃至回流之適當溫度下接觸諸如1至18小時之適當時間，得到胺(化合物13)。熟練的業內人士將理解，存在將胺分離為鹽或游離鹼之方法。步驟7描繪胺(化合物13)與經活化羧酸進行醯胺偶合，得到式I化合物。該等條件類似於流程1之步驟1中呈現之彼等條件。
流程 4 ： 式 I 化合物之合成
流程4描繪式I化合物之替代性一般合成。步驟1描繪用胺基甲酸苯甲酯保護基保護胺(化合物11)，得到胺基甲酸酯(化合物14)。熟練的業內人士將理解，存在許多可用的胺保護基，其將為與化合物14上之第三丁氧基羰基正交的保護基。在一實例程序中，使胺(化合物11)與氯甲酸苯甲氧酯在諸如DCM之適當溶劑中及在諸如N,N-二異丙基乙胺之合適的鹼之存在下於諸如0℃至室溫之適當溫度下接觸諸如1至18小時之適當時間。利用類似於流程3之步驟6所描述之彼等方法的方法選擇性地使化合物14之第三丁氧基羰基保護基脫除保護，得到胺(化合物15)。隨後，藉由類似於流程1之步驟1中之彼等方法的方法使所得胺(化合物15)經受與經活化羧酸的醯胺偶合反應，得到醯胺(化合物16)
。
步驟4描繪使化合物16之胺基甲酸苯甲氧酯保護基脫除保護，得到胺(化合物4)
。
熟練的業內人士將理解，有多種方法可用以影響此轉變。舉例而言，利用諸如氫氧化鈀之適當催化劑使化合物16在諸如EtOH之適當溶劑中於諸如100至500 kPa之適當氫壓力下經受催化氫化作用持續諸如一至八小時之適當時間，得到胺(化合物4)
。
最後，胺(化合物4)至式I化合物之轉換正如流程1之步驟4中所描述。
流程 5 ： 式 I 化合物之合成
流程5描繪式I化合物之替代性一般合成。步驟1描繪胺(化合物17)與經活化羧酸進行醯胺偶合，得到醯胺(化合物18)。該等條件類似於流程1之步驟1中呈現之彼等者。步驟2描繪經由溴化物(化合物18)與烯醇酸酯(ester enolate)之催化交叉偶合而形成α芳基酯(化合物19)。熟練的業內人士將理解可影響此轉變之範圍廣泛的條件。舉例而言，用諸如正丁基鋰之適當的鋰鹼於諸如0℃至-78℃之適當溫度下處理諸如二環己基胺之適當的二烷基胺於諸如甲苯之適當溶劑中的溶液持續諸如10分鐘至1小時之適當時間。用諸如2-甲基丙酸甲酯之適當的酯於諸如甲苯之適當溶劑中之溶液處理此溶液，並在諸如0℃至-40℃之適當溫度下將所得混合物攪拌諸如10分鐘至1小時之適當時間。隨後，用諸如二-m-溴雙(三第三丁基膦
)
二鈀(I)之適當鈀催化劑處理所得混合物，並於諸如0℃至室溫之適當溫度下將該混合物攪拌諸如1至18小時之適當時間，得到α芳基酯(化合物19)。酯(化合物19)可藉由此項技術中所熟知之方法水解成酸(化合物20)。舉例而言，使酯(化合物19)與諸如三甲基矽醇化鉀之合適的鹼在諸如THF之適當溶劑中於諸如室溫至回流之適當溫度下接觸諸如一至七天之適當時間。步驟4描繪羧酸(化合物20)與氨進行醯胺偶合，得到甲醯胺(化合物21)
。
熟練的業內人士將理解許多可用以活化羧酸以及引入氨源的方法。舉例而言，使羧酸(化合物20)與1,1'-羰基二咪唑在適當溶劑(諸如DCM或DMF或其混合物)中於諸如0℃至回流之適當溫度下接觸諸如30分鐘至8小時之適當時間。添加氫氧化銨至該混合物，並該反應另外持續諸如1至18小時之時間。步驟21描繪甲醯胺(化合物21)至胺(化合物4)之何夫曼重組反應(Hoffman rearrangement)。熟練的業內人士將理解多種可影響此轉變的試劑及條件。舉例而言，於諸如室溫至回流之適當溫度下用[雙(三氟乙醯氧基)碘基]苯處理甲醯胺(化合物21)於諸如ACN與水之混合物的適當溶劑中之溶液諸如1至18小時之適當時間。最後，胺(化合物4)至式I化合物之轉化描述於流程1之步驟4中
。 製劑 1 1- [ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙酮之合成
向1-吲哚啉-5-基乙酮(20.0 g，124.1 mmol)於DCM (496mL)中之混合物添加TEA (51.9 mL，372.2 mmol)及四氫哌喃-4-氯化碳(22.1 g，148.9 mmol)。在室溫下將所得混合物攪拌兩小時。用DCM (500 mL)稀釋反應混合物，並用碳酸氫鈉飽和水溶液洗滌。分離有機層，並用DCM (500 mL)萃取水層兩次。經合併之有機層用氯化鈉飽和水溶液洗滌、經無水硫酸鈉乾燥、過濾，且濃縮濾液，以定量地得到呈淡黃色固體之標題化合物。ES/MS (m/z): 274.0 (M+H)。 替代分離程序： 用庚烷處理該產物並濃縮。重複該處理及濃縮第二次。用庚烷處理並冷卻至0至5℃。藉由過濾收集產物，並用庚烷沖洗及乾燥，得到標題化合物。
製劑 2 [ 5 -( N - 羥基乙醯亞胺基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮之合成
向1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙酮(製劑1) (33.9 g，124.0 mmol)於EtOH(1240 mL)中之混合物添加羥胺(於水中為50質量%，22.8 mL，372 mmol)
。
在室溫下將所得混合物攪拌三天。濃縮反應混合物以定量地得到為E/Z異構體之混合物的標題化合物。ES/MS (m/z): 289.0 (M+H)。
製劑 3 外消旋 [ 5 -( 1 胺基乙基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮之合成
添加RANEY®鎳(EtOH中之漿料，60 g)至2250 mL PARR®震盪瓶並用氮氣吹掃。添加含2M氨之MeOH (700 mL)，並接著添加[5-(N-羥基乙醯亞胺基)-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮(製劑2) (35.8 g，124.0 mmol)於含2M氨之MeOH (700 mL)中之溶液。必要時，將可能發熱的混合物冷卻至室溫，密封，用氮氣吹掃，接著用氫氣吹掃。在氫氣(60 psi或414 kPa)下在室溫下攪拌四小時。濾除固體並濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用7-26% (含7M氨之MeOH)/EtOAc來純化，得到呈灰白色固體之標題化合物(26.5 g，78%)。ES/MS (m/z): 275.0 (M+H)。
製劑 4A 及 B [ 5 -( 1 - 胺基乙基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮 ( 異構體 1) 與 [ 5 -( 1 胺基乙基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮 ( 異構體 2) 之分離
藉由對掌性SFC純化外消旋[5-(1-胺基乙基)-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮(製劑3)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。ES/MS (m/z): 275.0 (M+H)。純化條件：CHIRALPAK® AD-H，50×150 cm管柱；移動相:40% EtOH (含0.5% N,N-二甲基乙胺)/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：300 g/min； UVW：260 nm。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：1.35分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H， 4.6×150 mm；移動相:40% EtOH (含0.5% N,N-二甲基乙胺)/CO
2
；流速：5 mL/min；UVW：260 nm)或藉由對掌性分析性HPLC (97.4% ee，R
t
：6.48分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6 mm×150 mm；移動相：100% EtOH (含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離對映異構體(異構體2)。ES/MS (m/z): 275.1 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC (97.2% ee，R
t
：1.85分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% EtOH (含0.5% N,N-二甲基乙胺)/CO
2
；流速：5 mL/min；UVW：260 nm)或藉由對掌性分析性HPLC (97.6% ee，R
t
：5.31分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6 mm×150 mm；移動相：100% EtOH (含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
. 製劑 5 ( R )- 2 - 甲基 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )-2, 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 亞乙基 } 丙烷 - 2 - 亞磺醯胺之合成
向1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙酮(製劑1) (3.0 g，11.0 mmol)及(R)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺(1.6 g，13.2 mmol)於THF (43.9 mL)中之混合物添加乙醇鈦(IV) (5.0 g，21.9 mmol)。回流所得混合物24小時。冷卻反應混合物至室溫。用EtOAc (100 mL)及氯化鈉飽和水溶液(40 mL)稀釋該混合物並劇烈攪拌15分鐘。分離有機層，並用EtOAc (100 mL)萃取水層兩次。經合併之有機層用氯化鈉飽和水溶液洗滌、經無水硫酸鈉乾燥、過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用10-100% ACN/DCM純化，得到呈淡黃色固體之標題化合物(3.7 g，87%)。ES/MS (m/z): 377.0 (M+H)。 替代分離程序： 代替冷卻反應物至室溫，冷卻反應混合物至10℃並隨後過濾。用甲苯沖洗固體，並乾燥以得到標題化合物。
製 劑 6 ( R )- 2 - 甲基 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )-2, 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 丙烷 - 2 - 亞磺醯胺 ( 異構體 A) 之合成
加熱二氯(異丙基甲苯)釕(II)二聚體(0.021 g，0.033 mmol)、2-胺基-2-甲基-1-丙醇(0.006 g，0.066 mmol)及分子篩(4Å，0.5g)於iPrOH (2 mL)中之混合物至回流並隨後冷卻至50℃。添加(R)-2-甲基-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]亞乙基}丙烷-2-亞磺醯胺(製劑5) (0.5g，1.33 mmol)於iPrOH (8.8 mL)中之溶液及第三丁醇鉀(0.019 g，0.17 mmol)於iPrOH (1.6 mL)中之溶液。於55℃下加熱所得混合物兩小時。隨後，加熱二氯(異丙基甲苯)釕(II)二聚體(0.021 g，0.033 mmol)，2-胺基-2-甲基-1-丙醇(0.06 g，0.66 mmol)及分子篩(4Å，0.5 g)於iPrOH (2 mL)之額外混合物至回流，冷卻至50℃並添加至以上反應混合物。添加第三丁醇鉀(0.019 g，0.17 mmol)於iPrOH (1.6 mL)中之溶液至以上反應混合物。於55℃下加熱該混合物20分鐘。冷卻反應物至室溫且攪拌隔夜。用DCM (20 mL)稀釋反應物並經由矽藻土墊過濾。用5% MeOH/DCM洗滌該墊並濃縮濾液以定量地得到標題化合物。ES/MS (m/z): 379.0 (M+H)。 替代分離程序： 代替冷卻反應物至室溫，冷卻反應混合物至28至32℃並隨後經由矽藻土過濾。用二氯甲烷沖洗過濾之固體且濃縮，得到標題化合物。
製劑 7A 及 7B [ 5 -( 1 - 胺基乙基 )-2, 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮 ( 異構體 1) 之合成
向(R)-2-甲基-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}丙烷-2-亞磺醯胺(異構體A) (製劑6) (503 mg，1.33 mmol)於MeOH (6.6 mL)中之混合物添加氫氯酸(在1,4-二噁烷中為4 M，1.66 mL，6.64 mmol)。在室溫下將所得混合物攪拌一小時。藉由逆相層析法(Redisep Rf Gold高效能C18逆相管柱，0至100% ACN/10 mM碳酸氫銨水溶液)濃縮且純化殘留物。濃縮以得到標題化合物(265 mg，73%)。藉由對掌性分析性HPLC (98.8% ee，R
t
：6.40分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6 mm×150 mm；移動相：100% EtOH (含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認對映異構性增濃。確認為製劑4A (異構體1)。ES/MS (m/z): 275.0 (M+H)。
鹽酸 [ 5 -( 1 - 胺基乙基 )-2, 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮 ( 異構體 1) 之合成
向(R)-2-甲基-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}丙烷-2-亞磺醯胺(異構體A) (162.3 g，364 mmol)於EtOAc (1.2 L)中之5℃漿液逐滴添加氫氯酸(在iPrOH中為5.5 M，400 mL，2.20 mol)，伴隨頂置式機械攪拌。在添加100 mL酸溶液之後移除冷卻浴。繼續添加並在室溫下攪拌所得混合物三小時。冷卻至3℃並過濾。用1至1.5 L之EtOAc沖洗濾餅，直至洗液澄清為止。在室內真空烘箱中於60℃下乾燥所收集之固體，得到呈灰白色固體之標題化合物(96.4 g，82.5%)。藉由對掌性分析性HPLC( 98% ee，R
t
：6.45分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6 mm×150 mm；移動相：100% EtOH (含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認對映異構性增濃。確認為製劑4A (異構體1)。ES/MS (m/z): 275.0 (M+H)。確認為製劑4A (異構體1)。ES/MS (m/z): 275.1 (M+H)。 基本上類似於製劑1來製備以下化合物。
製劑 10 5- 乙醯基 - 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 之合成
經20分鐘用二碳酸二第三丁酯(1.97g，9.03 mmol)於甲苯(12 mL)中之溶液逐滴處理1-吲哚啉-5-基乙酮(1.00 g，6.02 mmol)於甲苯(12 mL)中之100℃溶液。繼續加熱該混合物30分鐘。濃縮反應混合物。藉由矽膠管柱層析用15至35% (1:1 EtOAc:DCM)/己烷純化，得到呈白色固體之標題化合物(1.52 g，97%)。 ES/MS (m/z): 262.0 (M+H)。
製劑 11 5 -[ 甲氧基 ( 甲基 ) 胺甲醯基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 之合成
用1-[雙(二甲胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓六氟磷酸鹽-3-氧化物(23.3 g，61.1 mmol)處理1-(第三丁氧基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-羧酸(14.0 g，53.2 mmol)於DMF (200 mL)及N,N-二異丙基乙胺(28.0 mL，161 mmol)中之溶液。在室溫下將所得混合物攪拌五分鐘。添加N,O-鹽酸二甲基羥胺(7.26 g，74.4 mmol)。在室溫下將所得混合物攪拌隔夜。用EtOAc稀釋反應混合物且用碳酸氫鈉飽和水溶液洗滌。分離有機層並用EtOAc萃取水層兩次。用水洗滌經合併之有機層兩次，添加氯化鈉飽和水溶液以促進相分離。有機層經無水硫酸鈉乾燥，過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用10-32%丙酮/己烷純化，得到定量產量的呈澄清、無色、稠油狀物之標題化合物。ES/MS (m/z): 307.0 (M+H)。
製劑 12 5- 丙醯基 - 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 之合成
冷卻5-[甲氧基(甲基)胺甲醯基]-2,3-二氫-1H-吲哚-1-羧酸第三丁酯(製劑11) (14.3 g，46.7 mmol)於THF (311 mL，無水)中之溶液至0℃。經25分鐘逐滴添加溴化乙基鎂(二乙醚中為3M，39.0 mL，117 mmol)。在於0℃下攪拌1.5小時之後，用氯化銨飽和水溶液謹慎地淬滅反應混合物。用EtOAc萃取三次。經合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥，過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用15-30% (1:1 EtOAc:DCM)/己烷純化，得到呈白色固體之標題化合物(11.7g，91%)。ES/MS (m/z): 276.0 (M+1)。 除製劑14之外基本上類似於製劑2來製備以下化合物，其中於70℃下加熱增加反應速率。
基本上類似於製劑3來製備以下化合物。
製劑 17A 及 17B 5 -[ 1 - 胺基丙基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 ( 異構體 1) 及 5 -[ 1 - 胺基丙基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 ( 異構體 2) 之分離 ( 用於對掌性分離 )
藉由對掌性層析純化外消旋5-[1-胺基丙基]-2,3-二氫-1H-吲哚-1-羧酸第三丁酯(製劑16)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。MS (m/z): 260.0 (M-NH2)
+
。純化條件：CHIRALPAK® AD，8×33.5 cm管柱；移動相：100% MeOH (含0.2% N,N-二甲基乙胺)；流速：400毫升/分鐘；UVW：240 nm。藉由對掌性分析性HPLC(＞99% ee，R
t
：9.2分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD -H，4.6 mm×150 mm；移動相：100% MeOH (含0.2% N,N-二甲基乙胺)；流速：0.6毫升/分鐘；UVW：280 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離對映異構體(異構體2)。ES/MS (m/z): 260.0 (M-NH2)
+
。藉由對掌性分析性HPLC (99% ee，R
t
：14.7分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：100% MeOH (含0.2% N,N-二甲基乙胺)；流速：0.6毫升/分鐘；UVW：280 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
製劑 18 外消旋 5 { 1 -[( 4- 氟苯甲醯基 ) 胺基 ] 乙基 }- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 之合成
用N,N-二異丙基乙胺(4.0 mL，57.2 mmol)處理外消旋5-[1-胺基乙基]-2,3-二氫-1H-吲哚-1-羧酸第三丁酯(製劑15) (3.00 g，11.4 mmol)於DCM (57 mL)中之溶液。添加4-氯化氟苯甲醯(1.52 mL，12.6 mmol)並攪拌隔夜。用水淬滅反應混合物並添加碳酸氫鈉飽和水溶液。分離各層且用DCM萃取兩次。經合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥，過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用50-75% (含10%丙酮之DCM)/己烷純化，得到呈淡黃色固體之標題化合物(4.29 g，98%)。ES/MS (m/z): 407.0 (M+Na)
+
, 383.0 (M-H)
-
。 基本上類似於製劑18來製備以下化合物。
製劑 20 5 -[ 1 -{[( 苯甲氧基 ) 羰基 ] 胺基 } 丙基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 羧酸 第三丁 酯 ( 異構體 A) 之合成
在室溫下用N,N-二異丙基乙胺(4.53 mL，25.9 mmol)處理5-[1-胺基丙基]-2,3-二氫-1H-吲哚-1-羧酸第三丁酯(異構體2) (製劑17B) (3.25 g，11.8 mmol)於DCM (47.0 mL)中之溶液。添加氯甲酸苯甲酯(2.12 mL，14.1 mmol)且攪拌隔夜。用額外N,N-二異丙基乙胺(2.06 mL，11.8 mmol)及氯甲酸苯甲酯(0.707 mL，4.70 mmol)處理反應混合物。攪拌30分鐘。用水淬滅反應混合物並添加碳酸氫鈉飽和水溶液。分離各層且用DCM萃取水層兩次。經合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥，過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用5-35%丙酮/己烷梯度之溶離純化，得到呈白色發泡體之標題化合物(4.47 g，93%)。ES/MS (m/z): 433.2 (M+Na)
+
, 409.0 (M-H)
-
。
製劑 21 外消旋 N -[ 1 -( 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ) 乙基 ]- 4 - 氟苯甲醯胺之合成
向外消旋5{1-[(4-氟苯甲醯基)胺基]乙基}-2,3-二氫-1H-吲哚-1-羧酸第三丁酯(製劑18) (4.29 g，11.2 mmol)於DCM (112 mL)之混合物添加含4M氫氯酸之1,4-二噁烷(27.9 L，112 mol)。於40℃下加熱所得混合物六小時。用2N NaOH水溶液中和。添加4:1 CHCl
3
:IPA以溶解膠質固體且分離各層。用鹽水洗滌該有機層，經無水硫酸鈉乾燥，過濾且濃縮該濾液。藉由矽膠管柱層析用30-60% (25%丙酮/DCM)/己烷梯度之溶離純化，得到呈淺灰白色泡沫之標題化合物(2.48g，78%)。ES/MS (m/z): 285.0 (M+H)。 基本上類似於製劑21來製備以下化合物。
製劑 24A 及 24B N -[ 1 -( 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ) 乙基 ]- 4 - 氟苯甲醯胺 ( 異構體 1 ) 及 N -[ 1 -( 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ) 乙基 ]- 4 - 氟苯甲醯胺 ( 異構體 2 ) 之分離 ( 用於對掌性分離 )
藉由對掌性SFC純化外消旋N-[1-(2,3-二氫-1H-吲哚-5-基)乙基]-4-氟苯甲醯胺(製劑21)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。ES/MS (m/z): 285.0 (M+H)。純化條件：CHIRALPAK® AS-H，5×15 cm管柱；移動相：15% iPrOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：300公克/分鐘；UVW：250 nm。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：1.47分鐘；管柱：CHIRALPAK® AS-H，4.6×150 mm；移動相：25% iPrOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：300 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離對映異構體(異構體2)。ES/MS (m/z): 285.0 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC (98.5% ee，R
t
：2.08分鐘；管柱：CHIRALPAK® AS-H，4.6×150 mm；移動相：25% iPrOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：300 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
製劑 25 { 5 -[ 1 - 胺基丙基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 }( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮 ( 異構體 A ) 之合成
在PARR®震盪瓶中，向20%碳上氫氧化鈀(2.12 g)於EtOH(35 mL)中之經氮氣吹掃之懸浮液添加{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]丙基}胺基甲酸苯甲酯(異構體A) (製劑9) (2.12 g，5.02 mmol)於EtOH (35 mL)中之溶液。密封，用氮氣吹掃，接著用氫氣吹掃。在414 kPa (60 psi)之氫氣氛圍下於室溫下震盪3.6小時。經由矽藻土過濾反應混合物並濃縮濾液，得到呈淺灰白色固體之標題化合物(1.36 g，94%)。ES/MS (m/z): 289.2 (M+H), 272.0 (M-NH2)
+
。
製劑 26 2 - 甲基 - 2 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙酸甲酯之合成
在氮氣下向二環己胺(1.9 mL，9.6 mmol)於甲苯(25 mL)中之經攪拌的0℃溶液添加正丁基鋰(3.6mL，8.9 mmol，在己烷中為2.2 M)，並攪拌20分鐘。向先前製備之混合物逐滴添加異丁酸甲酯(0.83 g，8.2 mmol)於甲苯(5 mL)中之溶液，且在0℃下攪拌30分鐘。添加[5-溴-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮 (製劑8) (2.3 g，7.4 mmol)，並用氮氣對所得混合物脫氣。添加二-µ-溴雙(三第三丁基膦)二鈀(I) (50 mg，0.06 mmol)且允許所得混合物在氮氣下升溫至室溫。兩小時後，添加二-µ-溴雙(三第三丁基膦)二鈀(I) (50 mg，0.06 mmol)之第二部分且於室溫下在氮氣下攪拌隔夜。用EtOAc及1 N HCl水溶液稀釋並攪拌10分鐘。過濾，且用EtOAc沖洗固體。分隔濾液層，並用碳酸氫鈉飽和水溶液及鹽水洗滌有機層。有機層經無水硫酸鈉乾燥，過濾，且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用20-60% EtOAc/己烷純化，得到呈白色固體之標題化合物(2.3g，94%產量，89%純度)。ES/MS (m/z): 332.2 (M+H)。
製劑 27 2 - 甲基 - 2 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙酸之合 成
將2-甲基-2-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]丙酸甲酯(製劑26) (2.2 g，6.6 mmol)溶於THF (66 mL)中且添加三甲基矽醇化鉀(1.1 g，86 mmol)。在室溫下攪拌四天。過濾固體並用THF洗滌。將固體溶於水中並用5N HCl水溶液酸化。於冷凍機中冷卻30分鐘。過濾以收集呈白色固體之標題化合物(1.20 g，57%)。ES/MS (m/z): 318.0 (M+H)。
製劑 28 2 - 甲基 - 2 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙醯胺之合成
向2-甲基-2-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]丙酸(製劑27) (202 mg，0.636 mmol)於DCM (6.4 mL)之經攪拌溶液添加1,1'-羰基二咪唑(126 mg，0.763 mmol)且於室溫下在氮氣下攪拌45分鐘。添加氫氧化銨(1 mL，9.55 mmol，於水中為25% w/v)且於室溫下在氮氣下攪拌90分鐘。添加DMF (3 mL)以促進可溶性且繼續在室溫下攪拌兩小時。濃縮且藉由矽膠管柱層析用0-10% EtOH/DCM純化，獲得呈白色固體之標題化合物(180 mg，89%)。ES/MS (m/z): 317.0 (M+H)。
製劑 29 [ 5 -( 1 - 胺基 - 1 - 甲基乙基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 1 - 基 ]( 四氫哌喃 - 4 - 基 ) 甲酮之合成
向2-甲基-2-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]丙醯胺(製劑28) (81 mg，0.26 mmol)於ACN (0.25 mL)及水(0.25 mL)中之經攪拌混合物添加[雙(三氟乙醯氧基)碘]苯(115 mg，0.26 mmol)且於室溫下在氮氣下攪拌隔夜。濃縮以獲得呈淡粉色固體之標題化合物(140 mg，94%，50%純材料)。ES/MS (m/z): 289.2 (M+H), 272.0 (M-NH2)
+
。
製劑 30 4 - 氟 - 2 -[( 2 - 羥基乙基 ) 胺基 ] 苯甲酸甲酯之合成
加熱甲基-2-胺基-4-氟苯甲酸酯(2.81 g，15.9 mmol)及2-碘乙醇(0.879 mL，11.2 mmol)之混合物至90℃持續六小時，接著冷卻至室溫。將淨混合物溶於EtOAc中，用1N NaOH水溶液接著用鹽水洗滌三次。有機層經無水硫酸鎂乾燥，過濾，且濃縮濾液，獲得2.94 g淡褐色油狀物。添加2-碘乙醇(1.26 mL，15.9 mmol)且於100℃下加熱該混合物隔夜。添加額外2-碘乙醇(0.314 mL，3.99 mmol)且於100℃下繼續加熱兩小時。冷卻至室溫。將淨混合物溶於EtOAc中，用1N NaOH水溶液接著用鹽水洗滌三次。有機層經無水硫酸鎂乾燥，過濾，且濃縮濾液，獲得2.50 g棕色固體。藉由矽膠管柱層析用20-40% EtOAc/己烷純化，得到呈白色固體之標題化合物(1.12 g，33%)。ES/MS (m/z): 214.0 (M+H)。
製劑 31 4 - 氟 - 2 -[( 2 - 羥基乙基 ) 胺基 )] 苯甲酸之合成
向4-氟-2-[(2-羥基乙基)胺基]苯甲酸甲酯(製劑30) (104 mg，0.488 mmol)於1,4-二噁烷(2.4 mL)中之經攪拌溶液添加氫氧化鈉(0.49 mL，2.4 mmol，於水中為5M)。在室溫下，加蓋攪拌30分鐘，接著加熱至70℃持續兩小時。濃縮且用1N HCl水溶液酸化至大約pH 1-2，用DCM萃取兩次。經合併之有機層經無水硫酸鎂乾燥，過濾，且濃縮濾液，獲得呈棕褐色固體之標題化合物(89 mg，92%)。ES/MS (m/z): 200.0 (M+H)。
參考製劑 1 1 -( 2 , 4 - 二氟苯基 )- 3 -( 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基甲基 ) 脲之合成
攪拌5-(胺基甲基)吲哚啉-1-羧酸第三丁酯(4.1 g，17 mmol)及2,4-二氟-1-異氰酸酯基苯(3 mL，24 mmol)於DCM (100 mL)中之混合物一小時。用MeOH及水淬滅反應物且濃縮。將殘留物溶於DCM (30 mL)中且添加TFA (15 mL)，且允許在室溫下靜置兩小時。濃縮並添加碳酸氫鈉飽和水溶液。用MeOH/DCM (1/5，v/v)萃取混合物。有機層經無水硫酸鎂乾燥，過濾，且濃縮濾液。自EtOH再結晶，得到兩個產物。合併產物，得到標題化合物(3.5 g，68%)。ES/MS (m/z): 304.0 (M+H)。
參考製劑 2 1 -( 2 , 4 - 二氟苯基 )- 3 -{[ 1 -( 3 , 4 , 5 - 三溴 苯甲醯基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 甲基 } 脲 之合成
使1-(2,4-二氟苯基)-3-(2,3-二氫-1H-吲哚-5-基甲基)脲(參考製劑1)( 70 mg，0.23 mmol)、3,4,5-三溴苯甲酸(170 mg，0.24 mmol)及1-[雙(二甲胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓六氟磷酸鹽-3-氧化物(134 mg，0.35 mmol)於DMF (2 mL)中之溶液脫氣(N
2
)。添加TEA (0.08 mL，0.6 mmol)且在室溫下攪拌一小時。藉由逆相純化(管柱：Redisep Rf Gold高效能C18逆相管柱；溶離劑：A:含10 mM碳酸氫銨之水及5% MeOH(pH 10)，B：ACN；梯度：40%的B，持續5分鐘，接著40-95%的B超過15分鐘；流速60毫升/分鐘，UVW 219/254 nM)直接地純化反應混合物，且藉由凍乾分離產物，得到標題化合物(149 mg，54%)。ES/MS (m/z,
79
Br/
81
Br): 644.0/646.0 (M+H)。
實例 1 外消旋 4 - 氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 將外消旋[5-(1-胺基乙基)-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮(製劑3) (420 mg，1.53 mmol)與4-氟苯甲酸(257 mg，1.84 mmol)合併於DCM (15 mL)中。向攪拌溶液添加N,N-二異丙基乙胺(534 μL，3.06 mmol)及1-[雙(二甲胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓六氟磷酸鹽-3-氧化物(890 mg，2.30 mmol)。在室溫下將所得混合物攪拌16小時。蒸發溶劑且藉由逆相管柱層析(Redisep Rf Gold高效能C18逆相管柱，25-100% ACN/ 10 mM碳酸氫銨水溶液)純化，得到標題化合物(372 mg，61%)。ES/MS (m/z): 397.2 (M+H)。
1
H NMR (d
6
-DMSO) δ 8.73 (d, J=8 Hz, 1H), 7.98 (d, J=8 Hz, 1H), 7.93-7.89 (m, 2H), 7.28-7.23 (m, 2H), 7.22 (s, 1H), 7.12 (d, J=8 Hz, 1H), 5.07 (quin, J=8 Hz, 1H), 4.14 (t, J=8 Hz, 2H), 3.85 (m, 2H), 3.36 (m, 2H), 3.09 (t, J=8 Hz, 2H), 2.80 (m, 1H), 1.57-1.66 (m, 4H), 1.41 (d, J=7 Hz, 3H)。
實例 1A 4 - 氟 - N -{( 1R )- 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 合成方法 1 ： 藉由對掌性SFC純化外消旋4-氟-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺(實例1)，得到第一溶離對映異構體作為標題化合物。ES/MS (m/z): 397.0 (M+H)。純化條件：CHIRALPAK® AD-H，21×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：70公克/分鐘；UVW：225 nm。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：1.72分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。
1
H NMR (d
6
-DMSO) δ 8.73 (d, J=8 Hz, 1H), 7.98 (d, J=8 Hz, 1H), 7.93-7.89 (m, 2H), 7.28-7.23 (m, 2H), 7.22 (s, 1H), 7.12 (d, J=8 Hz, 1H), 5.07 (quin, J=8 Hz, 1H), 4.14 (t, J=8 Hz, 2H), 3.85 (m, 2H), 3.36 (m, 2H), 3.09 (t, J=8 Hz, 2H), 2.80 (m, 1H), 1.57-1.66 (m, 4H), 1.41 (d, J=7 Hz, 3H)。
合成方法 2 ：
在0℃下，向[5-(1-胺基乙基)-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮(異構體1) (製劑4A) (9.65 g，35.2 mmol)於DCM (176 mL)中之溶液添加TEA (9.8 mL，70.3 mmol)且接著添加4-氯化氟苯甲醯(5.85 g，36.9 mmol)。允許所得混合物升溫至室溫且攪拌隔夜。用EtOAc (300mL)稀釋反應混合物，經由矽膠墊過濾且用EtOAc洗滌。濃縮濾液且藉由矽膠管柱層析用25-30% ACN/DCM之梯度純化，得到呈灰白色固體之標題化合物(9.4g，67.1%)。MS (m/z): 397.2 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：1.74分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認對映異構性增濃。
1
H NMR (d
6
-DMSO) δ 8.73 (d, J=8 Hz, 1H), 7.98 (d, J=8 Hz, 1H), 7.93-7.89 (m, 2H), 7.28-7.23 (m, 2H), 7.22 (s, 1H), 7.12 (d, J=8 Hz, 1H), 5.07 (quin, J=8 Hz, 1H), 4.14 (t, J=8 Hz, 2H), 3.85 (m, 2H), 3.36 (m, 2H), 3.09 (t, J=8 Hz, 2H), 2.80 (m, 1H), 1.57-1.66 (m, 4H), 1.41 (d, J=7 Hz, 3H)。
合成方法 3 ：
於0至5℃下，向鹽酸[5-(1-胺基乙基)-2,3-二氫-1H-吲哚-1-基](四氫-2H-哌喃-4-基)甲酮(異構體1) (製劑7B) (70 g，225 mmol)於DCM (700 mL)中之混合物添加TEA (65 mL，468 mmol)。逐滴添加4-氯化氟苯甲醯(37.85 g，239 mmol)。使該混合物升溫至室溫且攪拌兩小時。以保持溫度低於30℃之一速率逐滴添加水且於20至30℃下攪拌混合物一小時。分離各層且用18% H
2
SO
4
水溶液洗滌有機層。分離各層且用7% NaHCO
3
水溶液洗滌有機層。分離各層且用水洗滌有機層。分離各層且接著使有機溶液通過碳過濾器。用SI-硫醇(7 g)處理該溶液且加熱混合物至40℃。攪拌所得混合物12小時。冷卻該混合物至室溫且經由矽藻土過濾該混合物。濃縮有機層至200 mL(~3體積)。添加丙酮(140 mL，2體積)且濃縮所得混合物至200 mL (~3體積)。用額外丙酮(280 mL，4體積)及水(280 mL，4體積)處理。於65℃下加熱兩小時直至反應物為澄清溶液。經三小時緩慢冷卻至30℃。於30℃下攪拌一小時。逐滴添加水(140 mL，2體積)且於30℃下繼續攪拌一小時。經大約兩小時緩慢冷卻至3至8℃。在此溫度下攪拌6小時。過濾且用水(140 mL，2體積)沖洗固體。於55℃下乾燥固體四至六小時。獲得所期望的呈白色固體之產物(55 g，61.6%)。
用於實例 1A 之 X 射線粉末繞射 收集程序
在配備有CuKa源(λ = 1.54060 Å)及Vantec偵測器之Bruker D4 Endeavor X射線粉末繞射儀上，以35 kV及50 mA操作，獲得結晶固體之XRD圖。在2θ處於4°與40°之間，以2θ之步長0.0087°及掃描速率0.5秒/步，及發散度0.6 mm、固定抗散射5.28 mm及偵測器狹縫9.5 mm來掃描樣品。在石英樣品架上填充乾粉，且使用玻璃載片獲得光滑表面。在環境溫度及相對濕度下收集結晶形繞射圖。
用於 1A 方法 3 之 X 射線粉末繞射 收集程序
實例1A (合成方法3)之製備樣品使用CuKa輻射藉由XRD圖表徵為具有如下表1中所描述之繞射峰(2-θ值)。具體而言，該圖含有在17.38°處之峰以及一或多個選自由12.51°、15.65°、16.37°、17.56°、21.48°及25.23°組成之群的峰，其中繞射角之公差為0.2度(2θ±0.2°)。 表1：實例1A方法3之X射線粉末繞射峰
實例 1A 之絕對構型之判定
藉由使10 mg 4-氟-N-{(1R)-1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺懸浮於1:1 EtOH/庚烷(1.75mL)中及在迴轉式震盪器上漿化三天來製備4-氟-N-{(1R)-1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺之單一晶體。使用4-氟-N-{(1R)-1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺之無色葉片式樣本(大致尺寸為0.020 mm×0.080 mm×0.300 mm)用於X射線結晶分析。使用Iµ CuKα輻射源(λ= 1.54178 Å)及裝備有光子100 SL面積偵測器之Bruker D8 Venture系3圓測角計繞射儀量測X射線強度數據。收集總共8840個框架(frame)。藉由Bruker SAINT套裝軟體使用窄框架演算法整合框架。使用單斜單位晶胞整合數據產生總共7242個反射至68.28°之最大θ角(0.83Å離析)，其中3059個為獨立的(平均冗餘2.367，完整性=95.9%，Rint=5.83%，Rsig=6.58%)且2893個(94.57%)大於2σ (F
2
)。a=5.5831(13)Å、b=5.1082(9)Å、c=35.013(6)Å、β=90.578(17)°，體積=998.5(3)Å
3
之最終晶胞常數係基於在20 σ(I)上之6280個反射之XYZ質心之優化，其中10.09°＜2θ＜136.8°。使用多重掃描方法(SADABS)校正吸收效應之數據。最小與最大表觀透射的比率為0.784。所計算之最小與最大透射係數(基於晶體大小)為0.8020及0.9850。使用Bruker SHELXTL套裝軟體、使用空間群P 2
1
來解析結構及優化，對於化學式單位C
23
H
25
FN
2
O
3
，Z=2。對F2進行最終各向異性全矩陣最小平方優化，其中264個變數針對所觀測以R1=9.17%會聚且針對所有數據以wR2=23.48%會聚。擬合優度為1.141。最終差異電子密度合成的最大峰為0.506 e-/Å
3
且最大電洞為0.358 e-/Å
3
，其中RMS偏差為0.088 e-/Å
3
。基於最終模型，所計算之密度為1.319 g/cm
3
及F(000)，420 e-。絕對結構參數優化至0.12(16)，檢驗對掌性中心之立體化學。絕對結構經測定為立體中心處之R-構型。
實例 1B 4 - 氟 - N -{( 1S )- 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 2) 藉由對掌性層析純化外消旋4-氟-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺(實例1)，得到第二溶離對映異構體作為標題化合物。ES/MS (m/z): 397.0 (M+H)。純化條件：管柱：CHIRALPAK® AD-H，21×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：70公克/分鐘；UVW：225 nm。藉由對掌性分析性SFC (98.3% ee，R
t
：2.37分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
1
H NMR (d
6
-DMSO) δ 8.73 (d, J=8 Hz, 1H), 7.98 (d, J=8 Hz, 1H), 7.93-7.89 (m, 2H), 7.28-7.23 (m, 2H), 7.22 (s, 1H), 7.12 (d, J=8 Hz, 1H), 5.07 (quin, J=8 Hz, 1H), 4.14 (t, J=8 Hz, 2H), 3.85 (m, 2H), 3.36 (m, 2H), 3.09 (t, J=8 Hz, 2H), 2.80 (m, 1H), 1.57-1.66 (m, 4H), 1.41 (d, J=7 Hz, 3H)。 基本上類似於實例1使用來自製劑3之起始物質來製備實例2。
實例 2A 及 2B 4 - 氯 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 1 ) 及 4 - 氯 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 2 ) 藉由對掌性SFC純化外消旋4-氯-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺(實例2)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。ES/MS (m/z): 413.0 (M+H)。純化條件：CHIRALPAK® AD-H，21×150 mm；移動相：40% iPrOH/CO
2
；流速：70公克/分鐘；UVW：260 nm。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
=1.97分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD -H，4.6×150 mm；移動相：40% iPrOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離對映異構體(異構體2)。ES/MS (m/z): 413.0 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC(＞99% ee，R
t
：3.04分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% iPrOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。 基本上類似於實例1使用來自製劑3之起始物質來製備實例3至實例9。
實例 9A 及 9 B 2 , 4 - 二氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 1 ) 及 2 , 4 - 二氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 2 ) 藉由對掌性SFC純化外消旋2,4-二氟-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺(實例9)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。ES/MS (m/z): 415.0 (M+H)。 純化條件：CHIRALPAK® AD-H，21×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：70公克/分鐘；UVW：225 nm。藉由對掌性分析性SFC (98.6% ee，R
t
：1.72分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相： MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離物(異構體2)。ES/MS (m/z): 415.2 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC (98.5% ee，Rt：2.60分鐘；管柱：CHIRALPAK® AD-H，4.6×150 mm；移動相：40% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。 基本上類似於實例1使用來自製劑7之起始物質來製備實例10至實例13。
基本上類似於實例1A之合成方法2來製備實例14及15。
實例 16 非對映異構 4 - 氟 - N -[ 1 -{ 1 -[ 四氫 - 2H - 哌喃 - 3 - 基羰基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 } 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 2 個 非對映異構體之混合 ) 用1-[雙(二甲胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓六氟磷酸鹽-3-氧化物(304 mg，0.791 mmol)處理N-[1-(2,3-二氫-1H-吲哚-5-基)乙基]-4-氟苯甲醯胺(異構體1) (製劑24A)(150 mg，0.528 mmol)，外消旋四氫哌喃-3-羧酸(100 mg，0.739 mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.277 mL，1.58 mmol)於DCM (5.28 mL)中之混合物。在室溫下攪拌45分鐘。用DCM稀釋反應混合物。添加水及碳酸氫鈉飽和水溶液。分離各層且用DCM萃取水層兩次。使經合併之有機層通過疏水性玻璃料(ISOLUTE®相分離器濾筒)且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用20-55%丙酮/己烷梯度之溶離純化，得到呈白色固體之標題化合物(184mg，88%)。ES/MS (m/z): 397.2 (M+H)。
實例 16A 及 16B 4 - 氟 - N -[ 1 -{ 1 -[ 四氫 - 2H - 哌喃 - 3 - 基羰基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 } 乙基 ] 苯甲醯胺
(
異構體 1
)
及 4 - 氟 - N -[ 1 -{ 1 -[ 四氫 - 2H - 哌喃 - 3 - 基羰基 ]- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 } 乙基 ] 苯甲醯胺
(
異構體 2
)
藉由對掌性層析純化非對映異構4-氟-N-[1-{1-[四氫-2H-哌喃-3-基羰基]-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基}乙基]苯甲醯胺(實例16)，得到第一溶離非對映異構體(異構體1)。MS (m/z): 397.2 (M+H)。純化條件：CHIRALCEL® OJ-H，30×250 mm；移動相：100% MeOH；流速：30毫升/分鐘；UVW：225 nm。藉由對掌性分析性HPLC (＞99% de，R
t
：3.42分鐘；管柱：CHIRALCEL® OJ-H，4.6×150 mm ；移動相：100% MeOH(含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離物(異構體2)。 ES/MS (m/z): 397.2 (M+H)。藉由對掌性分析性HPLC (97.8%de，R
t
：4.66分鐘；管柱：CHIRALCEL® OJ-H，4.6×150 mm ；移動相：100% MeOH (含0.2%異丙胺)；流速：1毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
實例 17 4 - 氟 - 2 - 羥基 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 乙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 A ) 向2-(苯甲氧基)-4-氟-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]乙基}苯甲醯胺(異構體A)於乙醇(2 mL)中之經氮氣沖洗的溶液(實例12) (96.0 mg，0.19 mmol)添加10% Pd/C (10 mg)且在室溫下用1 atm (101 kPa)之氫氣氫化一小時。經矽藻土過濾且濃縮濾液，獲得呈白色固體之所需化合物(66 mg，84%)。ES/MS (m/z): 413.0 (M+H)。
實例 18 外消旋 4 - 氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙基 } 苯甲醯胺 用N,N-二異丙基乙胺(0.228 mL，1.30 mmol)處理外消旋N-[1-(2,3-二氫-1H-吲哚-5-基)丙基]-4-氟苯甲醯胺於DCM (6.5 mL)中之混合物(製劑22) (200 mg，0.650 mmol)。添加四氫哌喃-4-氯化碳(110 mg，0.715 mmol)且攪拌30分鐘。用DCM稀釋反應混合物。添加水及碳酸氫鈉飽和水溶液。分離各層且用DCM萃取水層兩次。使經合併之有機層通過疏水性玻璃料(ISOLUTE®相分離器濾筒)且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析用20-60% 丙酮/己烷梯度之溶離純化，得到呈桃紅色發泡體之標題化合物(244 mg，91%)。ES/MS (m/z): 411.2 (M+H)。
實例 18A 及 18B 4 - 氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 1 ) 及 4 - 氟 - N -{ 1 -[ 1 -( 四氫 - 2H - 哌喃 - 4 - 基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 丙基 } 苯甲醯胺 ( 異構體 2 ) 藉由對掌性SFC層析純化外消旋4-氟-N-{1-[1-(四氫-2H-哌喃-4-基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]丙基}苯甲醯胺(實例18)，得到第一溶離對映異構體(異構體1)。ES/MS (m/z): 411.2 (M+H)。純化條件：CHIRALPAK® AS-H，21×150 mm管柱；移動相：25% MeOH/CO
2
；管柱溫度：40℃；流速：80公克/分鐘；UVW：260 nm。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：0.92分鐘；管柱：CHIRALPAK® AS-H，4.6×150 mm；移動相：25% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體1之對映異構性增濃。 以上純化亦產生第二溶離對映異構體(異構體2)。ES/MS (m/z): 411.2 (M+H)。藉由對掌性分析性SFC (＞99% ee，R
t
：1.53分鐘；管柱：CHIRALPAK® AS-H，4.6×150 mm；移動相：25% MeOH/CO
2
；流速：5毫升/分鐘；UVW：225 nm)確認異構體2之對映異構性增濃。
參考實例 1 1 -( 2 , 4 - 二氟苯基 )- 3 -{[ 1 -( 3 , 4 , 5 - 三 氚 苯甲醯基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 甲基 } 脲 在氚化燒瓶中，在氚之3Ci下將1-(2,4-二氟苯基)-3-{[1-(3,4,5-三溴苯甲醯基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]甲基}脲(3 mg，0.005 mmol)，鈀(在碳上10%，3 mg)及N,N-二異丙基乙胺(10 μM，0.06 mmol)於DMF (1 mL)中攪拌三小時。過濾反應物且用EtOH共同蒸發濾液以移除不穩定氚。將殘留物溶於EtOH中且藉由逆相管柱層析法(管柱：GEMINI® C18 250×10 mm；移動相：A：水/TFA (1000:1)，B：ACN/TFA (1000:1)；梯度：經60分鐘，20至70% B；流速3毫升/分鐘)純化，得到溶於EtOH中之標題化合物。MS: 414.19 (M+H)及74 Ci/mmol。
參考實例 2 1 -( 2 , 4 - 二氟苯基 )- 3 -{[ 1 -( 苯基羰基 )- 2 , 3 - 二氫 - 1H - 吲哚 - 5 - 基 ] 甲基 } 脲 將1-(2,4-二氟苯基)-3-(2,3-二氫-1H-吲哚-5-基甲基)脲(300 mg，0.99 mmol)溶於DCM (20 mL)中，且添加氯化苯甲醯(0.13 mL，1.1 mmol)及TEA (0.27 mL，1.9 mmol)。在室溫下攪拌反應混合物兩小時。濃縮殘留物且藉由逆相純化(管柱：Redisep Rf Gold高效能C18逆相管柱；移動相：A：0.1% 甲酸水溶液，B：ACN ；梯度：經30分鐘，0-80% B；流速：60毫升/分鐘，UVW：219/254 nm)純化殘留物，並藉由凍乾分離產物，得到標題化合物(403 mg，79%)。ES/MS (m/z): 408.2 (M+H)。 免疫系統為遏制腫瘤發展之重要核查點。同樣地，癌症已演進出許多避開、抑止或以其他方式破壞免疫系統的機制。儘管色胺酸對癌細胞生長而言係絕對必要的，但經由藉由癌細胞自身(本質)抑或藉由微環境或腫瘤引流淋巴結(TDLN) (外質)中之細胞的吲哚胺2,3二加氧酶(IDO1)之表現而選擇色胺酸之降解用於廣泛之癌症。腫瘤微環境中之IDO1的選擇性活化在抵消快速細胞生長的同時為腫瘤提供避免免疫監視、癌症發展中之重要核查點及治療抗性的有效策略。IDO1之免疫抑止活性為色胺酸之局部消減及所伴隨的犬尿胺酸之產生的直接結果，兩者均為免疫抑止性的。 IDO1活性之免疫抑止作用影響多種細胞類型，包括細胞抑止[T- cells (Frumento等人(2002) J Exp Med 196(4): 459-468；Terness等人(2002) J Exp Med 196(4): 447-457)及NK cells (Della Chiesa等人(2006) Blood 108(13): 4118-4125)]，細胞發展[regulatory T-cells (Sharma等人(2007) J Clin Invest 117(9): 2570-2582；Chen等人(2008) J Immunol 181(8): 5396-5404；Baban等人(2009) J Immunol 183(4): 2475-2483)]及抑止性抗原呈遞細胞[suppressive dendritic cells and macrophages (Munn，等人(2004) J Clin Invest 114(2): 280-290；Munn等人(2005) Immunity 22(5): 633-642；Sharma等人2007) J Clin Invest 117(9): 2570-2582)]，及募集及擴張 [myeloid-derived suppressor cells (Yu等人2014) J Immunol 193(5): 2574-2586；Holmgaard等人(2015) Cell Rep 13(2): 412-424)]。IDO1活性經由腫瘤、腫瘤微環境及TDLN中之色胺酸之消減及所伴隨的犬尿胺酸之增加而展現出此等效應。 藉由腫瘤微環境中或TDLN中之IDO1表現的色胺酸之消減及犬尿胺酸之產生支援Tregs之發展及活化(Sharma等人(2007) J Clin Invest 117(9): 2570-2582), MDSCs (Holmgaard，等人(2015) Cell Rep 13(2): 412-424)，及調節樹突狀細胞(Sharma,等人(2007) J Clin Invest 117(9): 2570-2582)，其全部均起支援腫瘤生長之免疫抑止作用。色胺酸之消減經由壓力反應激酶GCN2之活化支援Treg發展，壓力反應激酶GCN2係回應於不帶電的tRNA之積聚而受刺激。缺少GCN2之T細胞對增殖的IDO1介導之抑制或無免疫性表現型之誘導不敏感 (Munn等人(2005) Immunity 22(5): 633-642)。除了色胺酸消減之外，IDO1活性產生高濃度之下游代謝物犬尿胺酸：重要的免疫抑止分子。類似於色胺酸消減，藉由犬尿胺酸活化芳香烴受體(AHR)對調節T細胞之產生係必要的(Mezrich等人(2010) J Immunol 185(6): 3190-3198)，且提高的犬尿胺酸之產生及AHR之表現與人類腦癌的不良預後相關(Opitz等人(2011) Nature 478(7368): 197-203)。犬尿胺酸阻斷T細胞及NK細胞增殖(Boyland等人(1956) Biochem J 64(3): 578-582)，且犬尿胺酸為AHR受體之促效劑(Mezrich等人(2010) J Immunol 185(6): 3190-3198；Opitz等人(2011) Nature 478(7368): 197-203)、調節諸如IL-1β，IL-6及IL-21之細胞介素的天然免疫介導產生之轉錄因子，且在若干癌症中過度表現，其中認為犬尿胺酸促成腫瘤進展及治療抗性 (Julliard等人(2014) Front Immunol 5: 458)。實際上，IDO1在癌症中之本質表現部分地藉由AHR-IL-6-STAT3信號傳導迴路之犬尿胺酸介導之活化調節，該信號傳導迴路加強IDO1之表現並抑制T細胞增殖。IDO1信號傳導軸線之表現係與肺癌患者之無復發存活率之減少相關聯(Litzenburger等人(2014) Oncotarget 5(4): 1038-1051)。IDO1介導之IL-6產生亦在支援原致癌MDSC之發展及IDO1減少之IL-6產生、衰減之MDSC抑止活性、延遲之腫瘤生長及增加的KRAS誘發之肺癌模型的存活率之破壞中起重要作用(Smith等人(2012) Cancer Discov 2(8): 722-735)。色胺酸之IDO1依賴性消減及AHR之犬尿胺酸依賴性活化之間的聯繫提供解釋為何色胺酸代謝與免疫逃逸(遏制癌症進展之重要核查點)緊密相關聯的關鍵。 在腫瘤微環境中IDO1表現之調節為複雜的。IDO1為所發現之第一個IFN-γ調節之基因(Yoshida等人(1981) Proc Natl Acad Sci USA 78(1): 129-132)。實際上，IFN-γ與遍及所有癌症組織結構的IDO1表現之間存在較強相關性(http://cancergenome.nih.gov/)。另外，IDO1表現藉由I型干擾素、TLR配體、TNF、IL-1、CTLA-4、CD200、GITR、CD40及TGF-β上調，其全部均在免疫系統及癌症發展、進展及治療反應中起重要作用。如藉由IDO1表現、色胺酸消減及/或犬尿胺酸增加所量測之高IDO1活性已在廣泛多種腫瘤類型之不良預後、減少之存活率及增加之轉移潛能中表明。因而，犬尿胺酸之血清含量之增加與所伴隨之色胺酸的減少在乳癌、結腸直腸癌、頭頸癌、肺癌及前列腺癌中得到證實(Liu等人 (2010) Blood 115(17): 3520-3530)。此外，IDO1在癌症患者中經慢性活化(Schrocksnadel等人 (2006) Clin Chim Acta 364(1-2): 82-90)，與廣泛性疾病相關聯(Huang 等人(2002) Br J Cancer 86(11): 1691-1696)，在若干種癌症中對標準化學療法之預後及/或抗性不良，該若干種癌症包括黑素瘤(Weinlich等人 (2007) Dermatology 214(1): 8-14)、急性骨髓白血病(Chamuleau等人(2008) Haematologica 93(12): 1894-1898；Corm等人 (2009) Leuk Res 33(3): 490-494)，乳癌及子宮頸癌(Inaba等人 (2010) Gynecol Oncol 117(3): 423-428；Yu等人 (2011) Clin Dev Immunol 2011: 469135；Yu等人 (2013) J Immunol 190(7): 3783-3797；Chen等人 (2014) Breast Cancer Res 16(4): 410): Clin Cancer Res. 2007 Dec 1;13(23):6993-7002； Trott等人(2016). Oncotarget, 7(41), 66540-66557)、結腸直腸癌、腎細胞癌、皮膚黑素瘤、彌漫性大B細胞淋巴瘤、子宮內膜癌、胃癌、神經膠質瘤、肝細胞癌、霍奇金氏淋巴瘤、喉部鱗狀細胞癌、肺癌、多發性骨髓瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、食道及口腔鱗狀細胞癌、骨肉瘤、卵巢癌、胰腺導管癌、T細胞白血病及甲狀腺癌瘤。IFN-γ為分泌自經活化之NK及T細胞的重要效應細胞介素。參與全身性(CTLA-4)或局部(PD-L1/L2)遏制T細胞活性的負調節電路目前經批准用作抗癌劑，其中該等負調節電路增強T細胞介導之腫瘤生長抑制。諸如CTLA-4、PD-1或PD-L1之核查點的基因剔除引起IFN-γ產物之顯著增加(Latchman等人. (2004) Proc Natl Acad Sci USA 101(29): 10691-10696；Pandiyan等人 (2007) J Immunol 178(4): 2132-2140)，IFN-γ產物可接合免疫抑止性IFN-γ至IDO1軸線。藉由小鼠黑素瘤模型中之1-甲基色胺酸抑制本質IDO1表現顯著改良伊派利單抗(Ipilimumab)之功效，伊派利單抗即一種CTLA-4阻斷抗體 (Holmgaard等人 (2013) J Exp Med 210(7): 1389-1402)。伊派利單抗之此經增強功效與CD8效應細胞之增加及Treg之減少相關聯。此等觀測擴展至其他靶向PD1、PD-L1及GITR的抗體，其中IDO1之抑制增強其抗癌活性。在機理上，展示IDO1經由Treg之誘導以及MDSC之後續募集從而在腫瘤處產生免疫抑止性環境來妨礙此等核查點抑制劑之功效(Holmgaard等人(2015) Cell Rep 13(2): 412-424)。治療癌症之諸如IFN-γ本身之免疫治療方法、諸如CpG-ODN、抗4-1BB (CD137)、抗OX40、抗PD-1/PD-L1/PD-L2、抗CTLA 4之天然免疫活化劑均有可能活化IDO1表現，從而遏制其在臨床中之長期功效。因此，在組合IDO1抑制劑與此等藥劑中可存在顯著治療潛能。具體而言，IDO1抑制劑與抗PD1抗體(皮立珠單抗(pidilizumab)、納武單抗(nivolumab)、派立珠單抗(pembrolizumab))、抗PD-L1抗體(德瓦魯單抗(durvalumab)、阿特珠單抗(atezolizumab)、艾維路單抗(avelumab))、抗CTLA-4抗體(伊派利單抗)、抗OX40抗體(MEDI6469、KHK4083)及抗4-1BB(CD137)抗體(PF-05082566)之組合在廣泛範圍之腫瘤類型中有顯著治療潛能。 綜合而言，此等數據表明色胺酸消減及所伴隨的犬尿胺酸之產生的抑制劑(諸如IDO1抑制劑)可在未經治療以及難治性癌症患者中以單一藥劑或以組合形式用於多種癌症類型。此效用已藉由諸如艾帕斯塔(epacadostat) (INCB024360)及NLG919之已知IDO1抑制劑證實。已知艾帕斯塔結合至IDO1且阻斷色胺酸之代謝及犬尿胺酸之後續活體外及活體內產生。另外，艾帕斯塔在臨床前小鼠模型(CT26及PAN02)中已證實單一藥劑功效：一種取決於T細胞之存在的效應。(Yue等人(2009) J Med Chem 52(23): 7364-7367；Koblish等人(2010) Mol Cancer Ther 9(2): 489-498；Liu等人(2010) Blood 115(17): 3520-3530；Jochems等人(2016) Oncotarget, Advance Publications)。艾帕斯塔之臨床前功效已轉換成人類臨床試驗結果(NCT01195311)。 以下分析法之結果證實本文中所例示之化合物可用作諸如IDO1抑制劑之犬尿胺酸產生抑制劑且可用於治療癌症的證據。此外，以下分析法之結果證實某些例示化合物結合至IDO1且所例示化合物抑制在癌細胞中於活體外及活體內色胺酸至犬尿胺酸之轉化。
IDO1 之 結合分析法
此分析法之目的為證實某些例示化合物於活體外結合至IDO1。具體而言，此分析法評定測試化合物與氚化間諜分子1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲競爭之能力，並允許計算結合親和力IC
50
。
1 -( 2 , 4 - 二氟苯基 )- 3 -[[ 1 -( 3,4 , 5 - 三 氚 苯甲醯基 ) 吲哚啉 - 5 - 基 ] 甲基 ] 脲至 IDO1 之競爭性結合
將在DPBS中稀釋之300 nM His
6
-IDO1 (Proteros，SwissProtID P14902，目錄號PR-0278，批次19/59，25 mM MES (pH 6.5)中為98 mg/mL，150 mM KCl，純度＞95%)裝至塗鎳培養盤之各槽(Sigma，目錄號S5563)，並於4℃下培育隔夜。在BIOTEK®微定量盤式洗滌器中，藉由用300 µL DPBS洗滌盤四次來移除非結合蛋白質。每槽添加100 µL阻斷緩衝液(0.05% TWEEN® 20/DPBS)且在室溫下培育一小時以減少非特異性結合。在阻斷培養盤時，藉由在DPBS中稀釋來製備50 nM 1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲(Biocair，目錄號TRQ41455)，並在DMSO中連續2.5倍稀釋未標記之母液，產生十一點稀釋曲線。添加5 µL連續稀釋之未標記化合物至95 µL之50 nM 1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲，添加混合物至培養盤中之槽，並伴隨著平緩震盪在室溫下培育四個小時。為測定氚化間諜分子(1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲)之最大移位，添加過量的未標記之1-(2,4-二氟苯基)-3-{[1-(苯基羰基)-2,3-二氫-1H-吲哚-5-基]甲基}脲(ChemDiv，目錄號G714-0242)及100 µM至50 nM之1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲並添加至培養盤中之非特異性結合對照槽。在四小時培育之後，使用MultiMek96抽吸槽且使用BIOTEK®微定量盤式洗滌器用300 µL冰冷DPBS快速洗滌培養盤一次。向各槽添加100 µL含100 mM咪唑之PBS (pH 7.5)，並在室溫下培育10分鐘以自塗鎳培養盤移位IDO1配體錯合物。傳送經移位IDO1配體錯合物至含有200 µL Microscint-20 (Perkin Elmer，目錄號6013621)之96槽白色清底盤(Costar，目錄號3632)，每槽使用一個MultiMek96。使用Trilux Microbeta計數器定量1-(2,4-二氟苯基)-3-[[1-(3,4,5-三氚苯甲醯基)吲哚啉-5-基]甲基]脲配體之總界限及非特異性結合(NSB)。使用全界限及NSB值以使用GraphPad Prism中之非線性迴歸分析計算用於未標記化合物的IC
50
。此分析法之結果證實某些例示化合物結合至IDO1。舉例而言，實例1A及1B展現小於1.5 μM之IC
50
值。具體而言，實例1A之IC
50
為0.033μM±0.0028 (n=2)。
犬尿胺酸產生分析法 ( SKOV3 )
此分析法之目的為評價表現癌細胞之IDO1中之犬尿胺酸、N-甲醯基-犬尿胺酸之產生、及色胺酸之消減之抑制，並評定化合物是否對此等細胞明顯有毒。測試用於抑制SKOV3 (ATCC，目錄號HTB-77)中之IDO1活性之例示性化合物，SKOV3即一種本質上表現IDO1之卵巢癌細胞株。歸因於IDO1表現，SKOV3細胞使色胺酸降解，同時伴隨著產生犬尿胺酸，並測試化合物抑制犬尿胺酸、N-甲醯基-犬尿胺酸之產生及色胺酸之消減的能力。視情況，可藉由監控細胞存活率評定化合物之明顯毒性。
內標準物之合成
N-甲醯基L-犬尿胺酸-d4之合成 (2S)-2-胺基-4-側氧基-4-(2,3,4,5-四氘-6-甲醯胺基-苯基)丁酸
向L-犬尿胺酸-d4 (56 mg，0.264 mmol)於甲酸(0.132 mL)中之混合物添加乙酸酐(0.026 mL，0.264 mmol)於甲酸(0.052 mL，1.32 mmol)中之預先形成的混合物。於室溫下在氮氣下攪拌所得混合物兩小時。用ACN稀釋反應混合物且在氮氣流下濃縮。藉由逆相HPLC (管柱：PHENOMENEX® LUNA® 5 μU C18 (2) 100Å AXIA，30×75 mm；溶離劑：A：0.1% 甲酸水溶液，B：0.1% 甲酸/ACN；梯度：0% B，持續2分鐘，接著經5分鐘梯度至22% B；流動：於UVW 231/214 nm下85毫升/分鐘)純化殘留物，以在凍乾之後得到呈蓬鬆白色固體之標題化合物29 mg。ES/MS (m/z): 241.0 (M+H)。
細胞處理及細胞存活率
將含有補充有非必需氨基酸(Gibco，目錄號11140-050)、1 mM丙酮酸鈉(Gibco，目錄號11360-070)及10%胎牛血清的100 µL之McCoys 5A培養基 (完全培養基) (Gibco，目錄號16600-082)中之SKOV3細胞(IDO1表現卵巢癌細胞株)以每槽20,000個細胞塗在96槽組織培養盤(BD Biosciences)中。接著，在37℃培育箱中用5% CO
2
培育細胞16小時。在DMSO中自10 mM儲備測試化合物製備化合物連續稀釋液。於DMSO中連續3倍稀釋母液，並將送5 µL 化合物轉移至含有95 µL完全培養基之中間物給藥盤，產生最終化合物濃度範圍自1 µM至0.5 pM或10 µM至0.5 nM的十點稀釋曲線。自含有細胞的培養盤傾析培養基且墨點塗覆至紙巾上。用每槽90 µL完全培養基洗滌盤兩次，並用90 µL完全培養基替代最終洗滌。洗滌之後，自中間物給藥盤添加10 µL連續稀釋之化合物至培養盤之各槽，且在37℃培育箱中用5% CO
2
培育18小時。該分析法中之最終DMSO濃度為0.5%。在18小時培育結束時，自各槽轉移50 µL培養基至96槽v-底盤(Thermo Scientific)，密封該盤，並於-80℃下儲存用於犬尿胺酸、N-甲醯基-犬尿胺酸及色胺酸之後續基於質譜的量測。視情況，將原始盤返回至培育器另24小時，且藉由添加等體積之CELLTITER-GLO® (Promega)量測細胞之存活率，並量測PERKIN ELMER® EnVision盤式分析儀中之螢光。
色胺酸、 N - 甲醯基 - 犬尿胺酸及犬尿胺酸之質譜 ( MS ) 量測
取基於SKOV3細胞的分析法收集之樣本於冰上解凍，並藉由離心盤於4℃及3220xg下一分鐘，以清除任何細胞碎片。添加12.5 µL內標準物，其由2.5 µg/mL L-色胺酸-2',4',5',6',7'-d5 (CDN Isotopes，目錄號D- 1522)、L-犬尿胺酸硫酸鹽-環-d4,3,3-d2 (Cambridge Isotope Laboratories，目錄號DLM-7842-0.01)及內部製備之N-甲醯基L-犬尿胺酸-d4組成。用易撕型封口(Easy Peel seals，ThermoScientific)熱密封所有盤，且渦轉混合1至2分鐘，接著於4℃與3220xg下離心一分鐘。藉由將各者溶於水中以得到最終濃度1 mg/mL而產生用於定量犬尿胺酸及N-甲醯基犬尿胺酸之標準校準溶液。自其各別1 mg/mL母液中取等分20.8 µL犬尿胺酸及23.6 µL N-甲醯基犬尿胺酸，且使用McCoys 5A培養基稀釋至1 mL，得到用於各標準物的最終濃度100 µM。在完全培養基中連續2倍稀釋校準溶液，獲得最終濃度為5 µM至0.313 µM (犬尿胺酸)及2 µM至0.125 µM (N-甲醯基犬尿胺酸)的5點標準曲線。取1 µL培養基樣本(未知)或標準校準溶液注入LC/MS-MS系統上，該LC/MS-MS系統由SHIMADZU® Prominence 30A HPLC系統及AB SCIEX® 5500三段式四極質譜儀組成。在保持在35℃下之XBridge™ C18管柱，2.1×50 mm，3.5 µm (Waters，目錄號186003021)上以0.7毫升/分鐘之移動相流速來分離分析物。移動相A為0.1% 甲酸水溶液，且移動相B為甲醇。梯度量變曲線為：0分鐘，0.5% B；0.8分鐘，98% B；1.10分鐘，98% B；1.11分鐘，0.5% B；1.7分鐘，然後停止。以APCI正離子型多重反應監控模式操作質譜儀。使用來自標準曲線樣本之數據，且使用MultiQuan™軟體產生各分析物之線性擬合校準曲線。使用所產生之標準曲線以計算未知物之分析物濃度。 使用含有500 µM參考標準物之培養基作為100抑制百分比，及以無化合物但含DMSO作為零抑制百分比，由犬尿胺酸之質譜量測值計算化合物IC
50
值。藉由顯示犬尿胺酸及N-甲醯基-犬尿胺酸之產量與所伴隨的色胺酸含量減少之間的直接關係，採用N-甲醯基-犬尿胺酸及色胺酸之量測值來評定所產生數據之有效性。 此分析法之結果證實，所有例示化合物均在表現癌細胞之IDO1中抑制犬尿胺酸及N-甲醯基-犬尿胺酸產生，其抑制犬尿胺酸及N-甲醯基-犬尿胺酸兩者之IC
50
值小於0.9 mM，且在細胞存活率方面所測試之彼等化合物(實例1-9)中，所有化合物確實如此，且在高達至少1 mM下仍不會對細胞有顯著毒性。舉例而言，實例1A之用於抑制犬尿胺酸及N-甲醯基-犬尿胺酸的IC
50
分別為0.007 μM±0.002 (n=6)及0.007 μM±0.002 (n=6)。此外，實例1A在高達10 μM下不會抑制細胞增殖。
活體內靶標抑制分析法
此分析法之目的為評價對活體內癌細胞中之犬尿胺酸產生及色胺酸消減之抑制。SKOV3X (Indiana University Research and Technology Center)，一種卵巢癌細胞株，本質上表現IDO1且容易在 Athymic Nude-Foxn1
nu
小鼠(Harlan)之腹膜腔中形成腫瘤。由於IDO1表現，SKOV3X腫瘤在腫瘤微環境中局部消減色胺酸，同時伴隨產生高含量犬尿胺酸。此分析法之目的為量測測試化合物抑制藉由腫瘤中之犬尿胺酸含量之明顯減少證實之IDO1之能力。
活性相位
在補充有非必需氨基酸(Gibco，目錄號11140-050)，1 mM丙酮酸鈉(Gibco，目錄號11360-070)及10% FBS之McCoys 5A培養基(Gibco，目錄號16600-082)中培養SKOV3X且於37℃下在5% CO
2
中培育。將來自培養基之細胞以胰蛋白酶處理並分離，且將細胞再懸浮於漢克式平衡鹽溶液(HBSS)中。植入2×10
6
個SKOV3X細胞至各Athymic Nude-Foxn1
nu
小鼠(Harlan)之腹膜內腔中。植入後大致三週，觸診動物以確保腫瘤形成，且將患腫瘤之小鼠隨機分成媒劑對照組及化合物處理組。藉由經口胃管灌食法投與以含有1%羥基乙基纖維素(HEC)及0.025% TWEEN® 80以及0.05%消泡劑之媒劑或單獨媒劑調配之化合物。藉由以單一劑量給藥患腫瘤之動物產生時程抑制量變曲線，並收集給藥後2、4、8、12及24小時之血漿、肝及腫瘤樣本。將血液收集至含EDTA之採血管(Greiner bio-one，目錄號450474)中且以2365xg離心、分離血漿，並於-80℃下凍結。分離肝及腫瘤片段，記錄重量並急速凍結且於-80℃下儲存。
標準曲線之產生、組織處理及靶標抑制
藉由首先產生剝離基質來製備用於L-犬尿胺酸及L-色胺酸之校準標準，該等剝離基質為藉由透析消減L-犬尿胺酸及L-色胺酸之血漿及組織勻漿。隨後，用已知量之L-犬尿胺酸及L-色胺酸強化剝離基質。藉由添加10 mL經EDTA處理之小鼠血漿(BioreclamationIVT，目錄號MSEPLEDTA3)至 SPECTRA/POR® FLOAT-A-LYZER® G2 (Spectrum Labs，目錄號 G235063)及將透析器件置放於1000 mL磷酸鹽緩衝鹽水中來產生經剝離小鼠血漿，並透析隔夜。然後，將此器件轉移至1000 mL新製磷酸鹽緩衝鹽水且重複透析。將經剝離小鼠血漿轉移至乾淨容器且於-20℃下儲存以供將來使用。藉由針對每公克對照小鼠肝添加3 mL MeOH水溶液(1:1，v/v)來製備對照肝組織勻漿，並用超音波探針均質化。除使用組織磨碎器均質化腫瘤組織之外，以相同方式製備對照腫瘤勻漿。添加10 mL對照組織勻漿、肝及腫瘤至分開的SPECTRA/POR® FLOAT-A-LYZER® G2器件且將各者在1000 mL MeOH水溶液(1:1，v/v)中透析隔夜，隨後將各者轉移至1000 mL新製MeOH水溶液(1:1，v/v)且重複透析。將將剝離組織勻漿轉移至分開的容器且於-20℃下儲存以供將來使用。 製備溶於ACN水溶液(1:1，v/v)中之L-犬尿胺酸-硫酸鹽(Sigma Aldrich，目錄號K3750)及溶於N-甲基-2-吡咯啶酮水溶液(4：1，v/v)中之L-色胺酸(Sigma Aldrich)之標準母液，得到濃度為1 mg/mL之最終游離鹼。取等分50 μL各別母液並用MeOH水溶液(1:1，v/v)稀釋，產生經合併之50 μg/mL工作溶液。藉由連續稀釋50,000 ng/mL溶液以MeOH水溶液(1:1，v/v)製備六份額外校準工作溶液，獲得最終濃度為25 ng/mL至50 μg/mL之7點校準曲線。 將自測試個體獲得之肝樣本與MeOH水溶液(1:1，v/v)以1公克組織與3 mL溶劑之比例混合且用超音波探針均質化。使用組織磨碎器以相同的MeOH水溶液(1:1，v/v)之比例均質化腫瘤樣本。解凍來自測試個體之血漿樣品且為了均質性而進行混合。 藉由將25 µL各樣本轉移至96槽盤之分開的槽來執行校準工作溶液(L-犬尿胺酸及L-色胺酸之7點稀釋系列)之萃取，並根據測試樣本之起源組織而添加25 µL之適當經剝離對照基質(血漿、肝或腫瘤勻漿)至此等槽。添加25 µL MeOH水溶液(1:1，v/v)至分開的槽，接著添加25 µL各別測試樣本。接下來，添加180 µL 含有250 ng/mL-色胺酸-2',4',5',6',7'-d5 (Sigma Aldrich，目錄號615862)及L-犬尿胺酸硫酸鹽-環-d4,3,3-d2 (Cambridge Isotope Laboratories，目錄號DLM-7842-0.005)之ACN/MeOH (1:1，v/v)至所有槽且混合以沈澱樣本中之蛋白質。離心96槽盤以使所沈澱之蛋白質材料結粒，接著用水/TFA (100:2, v/v)至少10倍稀釋各清液層之一部分。取10 µL各萃取樣本及校準標準物注入至LC/MS-MS系統上，該LC/MS-MS系統由具有SHIMADZU® LC-10AD
vp
HPLC泵之SHIMADZU® SCL-10A控制器、CTC-PAL自動取樣器及AB SCIEX® 4000三段式四極質譜儀組成。在保持於環境條件下之Advantage™ Echelon™ C18管柱，2.1×20 mm，4 µm (Analytical Sales and Service,目錄號Sprite AE1822)上以1.5毫升/分鐘之移動相流速來分離分析物。移動相A為水/TFA/1 M碳酸氫銨，(1000:4:1，v/v/v)，且移動相B為ACN/TFA/1 M碳酸氫銨(1000:4:1，v/v/v)。梯度量變曲線為:0分鐘，0.3% B；0.03至0.2分鐘，7% B；0.3至0.4分鐘，36% B；0.41分鐘，98% B，然後在0.7分鐘停止以恢復至原始條件。用TURBOIONSPRAY®正離子型多重反應監控模式操作質譜儀。使用來自校準標準曲線樣本之數據，且使用Analyst™軟體產生各分析物之二次擬合校準曲線。使用所產生之標準曲線來計算研究樣本之分析物濃度。 使用來自不患腫瘤的動物之經媒劑處理之犬尿胺酸的肝濃度作為犬尿胺酸之最大抑制率或最低含量。使用來自患腫瘤之小鼠的經媒劑處理之犬尿胺酸之SKOV3X腫瘤濃縮作為犬尿胺酸之最小抑制率或最高含量。相對於在經載劑處理之腫瘤中的最小IDO1抑制計算化合物處理組的抑制百分比。此分析法之結果證實，實例1A抑制表現活體內癌細胞之IDO1中之犬尿胺酸及N-甲醯基-犬尿胺酸之產生。具體而言，以75 mg/kg、25 mg/kg及5 mg/kg給藥之實例1A在給藥12小時之後分別產生79%、59%及37%之抑制率。
用於結腸癌之小鼠同基因型結腸 26 模型中之實例 1A 以及所建立之 L55 人類化小鼠模型中之 LY3300054 之抗腫瘤效應 小鼠同基因型結腸 26 模型 ：
在補充有10 mM HEPES、1 nM丙酮酸鈉及10%胎牛血清之RPMI 1640培養基中生長小鼠BALB/c衍生之結腸26結腸癌細胞株。用胰蛋白酶採集亞匯合細胞且用無血清之完全生長培養基沖洗兩次。藉由將再懸浮於HBSS中之1×10
6
個細胞注入免疫勝任BALB/c小鼠之後肋而引發皮下腫瘤(Envigo, Indianapolis, IN)。腫瘤植入後六天，基於體重將動物隨機分組且如所指示使用每組動物的數目置放其至各別處理組。
L55 人類化腫瘤模型 ， hPBMC 攻擊及處理 ：
在補充有10%胎牛血清之RPMI 1640培養基中生長人類NSCLC細胞株L55。用胰蛋白酶收集亞匯合細胞且用無血清之生長培養基沖洗兩次。藉由將HBSS及MATRIGEL® (BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ)的1:1混合物中之5×10
6
個細胞注入通常被稱為NOD重度聯合免疫缺陷(scid)γ鏈基因剔除小鼠(NSG)小鼠(The Jackson Laboratory, Bar Harbour, Maine)之NOD.Cg-
Prkdcscid
Il2rgtm1Wjl
/SzJ小鼠之後肋中而引發皮下腫瘤之生長，該等小鼠缺失T細胞、B細胞、NK細胞且缺乏細胞介素信號傳導。當平均腫瘤體積達到大約200至300 mm
3
時，依據腫瘤大小及體重將動物隨機分組且如所指示置放其至各別處理組中。隨機分組之後，用單獨PBS (無 PBMC)或用含1×10
7
個人類PBMC之PBS於受體之尾靜脈中攻擊患腫瘤之小鼠。
數據擷取、化合物調配及媒劑對照 ( 兩個模型 )
使用研究引向器擷取腫瘤大小及體重。藉由使用下式：V=0.536 × L × W
2
估算腫瘤體積(V)，其中L=較大量測直徑且W=垂直直徑中之較小者。將腫瘤體積數據轉變成對數尺度以將時間及處理組之差異等化。用雙向重複量測差異分析，使用SAS軟體(版本9.2)中之MIXED程序依據時間及處理分析對數體積數據。用於重複量測之相關模型為Spatial Power。在各時間點將處理組與對照組相比較。MIXED程序亦單獨用於各處理組以計算在各時間點之經調節之平均值及標準誤差。兩個分析均解釋各動物內之自相關性及在自早期研究中移除具有較大腫瘤之動物時發生之數據損失。使用在最接近用實例1A給藥之最後一天進行的腫瘤體積量測，用式%T/C = 100 × ΔT/ΔC來計算腫瘤體積之相對變化(%T/C)，其中T =化合物處理組之平均腫瘤體積，ΔT =化合物處理組之平均腫瘤體積減基線日之平均腫瘤體積，C =對照(媒劑)組之平均腫瘤體積，且ΔC =對照組之平均腫瘤體積減基線日之平均腫瘤體積。若ΔT ＜0，則計算腫瘤消退值而非%T/C，從而迴歸%= 100 × ΔT/T
initial
以使得T
initial
=基線日之平均腫瘤體積。 在研究過程期間藉由一週兩次之三維測徑規量測法量測腫瘤體積來評定實例1A及LY3300054單獨或以組合形式之抗腫瘤功效。在研究過程期間每週兩次量測體重作為耐受度之一般指標。 實例1A及LY3300054之調配：每週於1% HEC/0.25% Tween 80/0.05%消泡劑中調配實例1A且儲存於4℃下。將LY3300054溶於磷酸鹽緩衝鹽水中且儲存於4℃下。 對照組：對於單一藥劑功效研究，單獨投與實例1A之媒劑。對於組合研究，根據各化合物的相同時程分別投與用於實例1A及LY3300054之兩個媒劑。對於組合功效研究中之單一療法組，用不按未給藥化合物之時程給藥的所需化合物及化合物之媒劑來處理動物。
結腸 26 同基因型模型 ， 處理及結果 ： 單一療法實例 1A
藉由經口胃管灌食法以10、50及100 mg/kg之劑量用實例1A對患結腸26腫瘤之雌性BALB/c小鼠(n=10)每天兩次處理，持續21天。腫瘤植入後六天開始投與實例1A，且一週兩次監控腫瘤生長及體重，持續整個處理週期。
結果 ：
用10、50及100 mg/kg實例1A處理引起對腫瘤生長之劑量反應效應，其中僅50及100 mg/kg劑量展示在第20天之統計學上(p＜0.001)相關的生長抑制。在第20天觀測到的腫瘤體積(%T/C)之變化分別針對10、50及100 mg/kg劑量為17.5%、31.2%及62.6%。與經媒劑處理之小鼠相比，在用實例1A測試之任何劑量下不存在相對於處理過程內之體重變化的顯著耐受度問題。量測體重損失作為在各組之腫瘤植入後之基線6天記錄的平均體重之百分比改變。在第20天，經媒劑處理之小鼠與基線相比展示平均5.5%之體重減少，其中10、50及100 mg/kg給藥組分別展示2.5%、8%及2.5%減少。雖然存在關於劑量之體重損失之劑量依賴性趨勢，但其在統計學上與經媒劑處理之小鼠不同。
L55 人類化腫瘤模型 ， 處理及結果 ： 對 L55 腫瘤生長之 hPBMC 效應
L55 NCLC人類癌細胞株本質上對與hPBMC之注入相關聯的同種異體反應具有抵抗性。此等研究之目標係評定化合物強化同種異體反應從而允許人類T細胞達到靶標及限制人類L55腫瘤在缺失適應性免疫系統之小鼠(NSG小鼠)中生長的能力。為評定hPBMC對L55腫瘤之腫瘤生長抑制之作用，向患有所確定之已達到大致250 mm
3
之L55腫瘤的NSG小鼠(n=10)模擬注入缺少hPBMC之PBS或含有1×10
7
hPBMC之PBS。一週兩次量測腫瘤體積及體重，持續整個處理週期。
結果 ：
當與在研究過程中未接受hPBMC的動物相比時，不存在L55腫瘤生長之統計學上的顯著抑制。在由當與基線相比時缺乏顯著體重損失(在第41天比在基準低0.1%)所證實之研究過程中，在注入人類PBMC之情況下未觀測到顯著耐受度問題。
單一療法實例 1A
為評定實例1A增強由hPBMC介導之L55腫瘤生長抑制的能力，向患有所確定之已達到大致250 mm
3
之L55腫瘤的NSG小鼠(n=10)模擬注入缺少hPBMC之PBS，並向另一組(n=10)模擬注入含有1×10
7
hPBMC之PBS。藉由經口胃管灌食法用75 mg/kg實例1A每天兩次處理兩個組，持續21天。一週兩次量測腫瘤體積及體重，持續整個處理週期。
結果 ：
當與不含PBMC之單獨媒劑相比時，在不存在hPBMC之情況下用實例1A處理L55腫瘤在處理過程中並未引起顯著腫瘤生長抑制。當與缺乏hPBMC之媒劑對照組相比時，在hPBMC之存在下用實例1A處理患L55腫瘤之動物引起腫瘤生長抑制。腫瘤生長之統計學上相關抑止於隨後時間點最明顯，於第41天(P＜0.001) ，%T/C為47.6%。在由當與基線量測相比時缺乏體重損失之統計學上的顯著降低所證實之利用hPBMC、實例1A或其組合之研究過程中，不清楚顯著耐受度問題。
單一療法 LY3300054
為評定LY3300054增強由hPBMC介導之L55腫瘤生長抑制的能力，向兩組患有所確定之已達到大致250 mm
3
之L55腫瘤的NSG小鼠(n=10/組)注入含有hPBMC之PBS。藉由一週一次腹膜內注入用10 mg/kg IgG效應零(IgG-EN)對照抗體處理一組並用10 mg/kg LY3300054處理另一組，持續4週。一週兩次量測腫瘤體積及體重，持續整個處理週期。
結果 ：
當與含有或不含hPBMC之單獨媒劑相比時，用10 mg/kg IgG-EN處理注入有hPBMC之患L55腫瘤之小鼠不會改變腫瘤生長或進展。當與含有或缺失hPBMC的經媒劑處理之對照組相比時，用10 mg/kg LY3300064處理已注入有hPBMC之患L55腫瘤的動物引起統計學上顯著的腫瘤生長抑制。當與缺失PBMC之單獨媒劑(第37天)相比時，在給藥週期結束時觀測到的腫瘤體積(%T/C)之改變為75.7%。在由當與基線量測相比時缺乏體重損失之統計學上的顯著降低所證實之利用含有或不含hPBMC之LY3300054之研究過程中，不清楚顯著耐受度問題。
實例 1A 及 LY3300054 之組合
藉由經口胃管灌食法向患有已達到大致250 mm
3
之L55腫瘤之NSG小鼠(n=10)注入hPBMC且用75 mg/kg實例1A一天兩次處理，持續21天，並藉由腹膜內注入用10 mg/kg LY3300054一週一次處理，持續4週。一週兩次量測腫瘤體積及體重，持續整個處理週期。
結果 ：
當僅與單一療法組相比時，75 mg/kg實例1A及10 mg/kg LY3300054之經組合處理引起抗腫瘤功效之改良。腫瘤體積顯著地第一僅有媒劑組，其缺失PBMC或經注入有hPBMC (在所有量測下，P＜0.001)。第30、34、37及41天之腫瘤體積分別為 9.6 %T/C、19.8 %T/C、13.3 %T/C及27.3% T/C。與組合組相比之單一療法組之間的抗腫瘤功效差異在統計學上顯著(p＜0.001)。為評定該組合為加成性抑或協同性的，基本上如下分析數據：
統計分析 ( 兩個模型 )
對腫瘤體積數據之統計分析開始於數據轉變至對數尺度以將時間及處理組之差異等化。用藉由時間及處理之雙向重複量測差異分析，使用SAS軟體(版本9.3)之MIXED程序分析對數體積數據。用於重複量測之相關模型為Spatial Power。在各時間點將處理組與對照組相比較。MIXED程序亦單獨用於各處理組以計算在各時間點之經調節之平均值及標準誤差。兩個分析均解釋各動物內之自相關性及在自早期研究移除具有較大腫瘤之動物時發生之數據損失。繪製各處理組與時間的經調節之平均值及標準誤差(s.e.)。
組合分析方法 ( 用於 IVEF 研究之布利斯 (Bliss) 獨立性 ) ：
利用重複測量分析之結果，對比陳述用以於各時間點測試相互作用效應，從而比較媒劑及組合組之平均值與兩個單一藥劑組之平均值。此等效於用於測試相加性之布利斯獨立性方法。於腫瘤體積尺度上將組合的預期之加成性反應(EAR)計算為：EAR體積=V1*V2/V0，其中V0、V1及V2分別為媒劑對照、單獨處理1及單獨處理2之經估計的平均腫瘤體積。若相互作用測試顯著，則宣告組合效應在統計學上大於加成性或小於加成性，其視所觀測到的組合平均體積小於或大於EAR體積而定。否則，統計結論為加成性的。 使用此分析方法，直至第34天及第37天腫瘤生長抑制才會比加成性好，其中腫瘤生長抑制為協同性的，其中分別地，P＜0.008及p＜0.001。在由當與基線量測相比時缺乏體重損失之統計學上的顯著降低所證實之利用實例1A及LY3300054之組合之研究過程中，不清楚顯著耐受度問題。 較佳將本發明之化合物調配為經多種途徑投與之醫藥組合物。最佳地，該等組合物用於經口或靜脈內投藥。此類醫藥組合物及其製備方法為此項技術中所熟知的。參見(例如) REMINGTON: THE SCIENCE AND PRACTICE OF PHARMACY (D. Troy等人編，第21次編， Lippincott Williams & Wilkins, 2005)。 如本文中所使用，術語「有效量」係指當向患者投與單一或多次劑量時，在診斷或治療下於患者中提供所需效應之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽的量或劑量。 有效量可易於由作為熟習此項技術者之主治診斷醫師藉由使用已知技術且藉由觀測在類似情況下得到之結果確定。在判定用於患者之有效量中，主治診斷醫師考慮多個因素，其包括(但不限於)：哺乳動物之種類；其大小、年齡及一般健康狀況；所涉及之特定疾病或病症；涉及程度或疾病或病症之嚴重程度；個別患者之反應；所投與之特定化合物；投與模式；所投與之製劑之生物可用性特性；所選擇之劑量方案；伴隨藥療之使用；及其他相關情況。 本發明之化合物在寬劑量範圍內通常為有效的。舉例而言，劑量/天正常處於每天約0.05至1000 mg範圍內。較佳地，該等劑量處於每天0.1-500 mg範圍內。更佳地，該等劑量處於每天1-200 mg範圍內。在一些情況下，低於前述範圍之下限之劑量可能已過量，而在其他情況下，可採用仍更大的劑量而並不導致任何有害副作用，且因此以上劑量範圍並不意欲以任何方式限制本發明之範疇。應瞭解，實際上投與之化合物之量將由醫師根據相關情況(包括待治療之病狀、所選投與途徑、所投與之一或多個實際化合物、個別患者之年齡、重量及反應及患者症狀之嚴重程度)來判定。
序列表 胺基酸及核苷酸序列
SEQ ID NO: 1 (人類PD-L1)
SEQ ID NO: 2 (LY3300054之HCDR1)
SEQ ID NO: 3 (LY3300054之HCDR2)
SEQ ID NO: 4 (LY3300054之HCDR3)
SEQ ID NO: 5 (LY3300054之LCDR1)
SEQ ID NO: 6 (LY3300054之LCDR2)
SEQ ID NO: 7 (LY3300054之LCDR3)
SEQ ID NO: 8 (LY3300054之HCVR)
SEQ ID NO: 9 (LY3300054之LCVR)
SEQ ID NO: 10 (LY3300054之HC)
SEQ ID NO: 11 (LY3300054之LC)
SEQ ID NO: 12 (LY3300054之HC之DNA)
SEQ ID NO: 13 (LY3300054之LC之DNA)
