TWI583392B

TWI583392B - 感染的治療或預防

Info

Publication number: TWI583392B
Application number: TW100106637A
Authority: TW
Inventors: 艾立克Ｃ雷諾得
Original assignee: 口腔健康澳洲私人有限公司
Priority date: 2010-02-26
Filing date: 2011-02-25
Publication date: 2017-05-21
Also published as: SG183376A1; BR112012021383A2; KR20170109685A; MX342832B; JP5977677B2; RU2617399C2; US9125853B2; CA2790219A1; AU2011220335A1; CA2790219C; EP2538970A4; WO2011103633A1; CN104689308A; AU2011220335B2; US20130129768A1; EP3260135A1; CN102883744A; NZ601890A; CN104689308B; RU2012136724A

Description

感染的治療或預防

發明領域

本發明係有關於治療或預防一個體中的疾病或病況，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯，及尤其但非僅僅有關於治療或預防牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)相關疾病或病況。

發明背景

口腔是主要的感染部位。感染可導致令人衰弱的口腔組織疾病，及亦已在口腔組織感染與其他生理構造房室的疾病或病況之間觀察到明顯的關聯性。

慢性牙周炎係口腔組織疾病之一實例。其係牙齒支持組織的一種炎性疾病及導致齒槽骨的吸收作用及最終牙齒脫落。該疾病係所有社會中的重要公共衛生問題，估計影響高達15%的成年人口及5至6%罹患嚴重形式。

慢性牙周炎的發生與進程係與牙齦下的牙菌斑中之特定革蘭氏陰性細菌相關聯。在牙齦下的牙菌斑中存在牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)，係與疾病具有強烈的關聯性。

曾報導牙周炎病患之牙齦下的牙菌斑在治療(潔牙與牙根整平術)後所持續存在的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)，係與進行性齒槽骨質流失顯著相關。而且，已顯示牙齦下的牙菌斑中之牙齦紫質單胞菌(P. gingiva1is)細胞數目之增加，係與藉由附連喪失、牙周囊袋深度及探測時的出血現象所測量之疾病嚴重性相關。

在小鼠、大鼠及非人類靈長類動物中，已顯示口腔感染牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)誘發牙周骨質流失。此外，牙周病及牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染與心血管疾病及特定癌症之連結性增加。

許多其他微生物病原體包括其他細菌、真菌、病毒及原生動物已與口腔組織疾病相關聯，及部分的該等病原體亦經由口腔組織感染而在其他生理構造房室中引發疾病。前者的實例包括齒垢密螺旋體(T. denticola)與福賽斯坦納菌(T. forsythia)。A群鏈球菌(Streptococcus)感染係風濕熱與風濕性心臟病之一病原因素。

所面臨的一個問題係在於一直不清楚如何在黏膜組織已慢性發炎或因手術或其他牙科介入而發生黏膜組織急性發炎之情況下，獲致對於一特定微生物病原體之強力保護性反應。

說明書中對於任何先前技術之參考，並非及不應視為認知或以任何形式暗示該先前技術構成澳洲或其他任何管轄區域的一般常識之一部分或可合理地預期該先前技術係經嫻熟技藝者確認、瞭解及視為相關。

發明概要

在特定的實施例中，提供在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性之一種方法，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯，該方法包括：

-治療一個體，藉此提供用於移除該個體口腔組織之實質上所有微生物或其片段之條件；其後

-在該個體中提供一抗體，該抗體係用於保護該個體對抗一微生物病原體，在口腔組織中存在該微生物病原體係與一疾病或病況相關聯；

藉此在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性。

在一實施例中，藉由對於該個體投予一種免疫原而在該個體中提供抗體，該免疫原係用於保護該個體對抗一微生物病原體。

在一實施例中，提供在一個體中降低一種牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)相關疾病或病況的發病率或嚴重性之一種方法，該方法包括：

-治療一個體，藉此移除該個體口腔組織之實質上所有微生物或其片段；其後

-對於該個體投予用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一種嵌合或融合蛋白，該蛋白包括直接或經由一連接子而與第二肽連接之第一肽，其中：

(A)該第一肽包括：

(i)與序列辨識編號：1中所示序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(ii)與序列辨識編號：2中所示序列相同或同源之一序列的部分或全部；及

(B)該第二肽包括：

(i)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的離胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(ii)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的精胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(iii)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)之HagA黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部。

藉此在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性。

在其他實施例中，提供一組成物或套組，其包括：

-用於移除該個體口腔組織之實質上所有微生物或其片段之抗微生物劑；

-用於免疫接種該個體對抗一微生物病原體之一種免疫原，在口腔組織中存在該微生物病原體係與一疾病或病況相關聯；

該組成物或套組係用於上述的一種方法中。

-在一個體的口腔組織進行一手術療程；其後

-治療該個體，藉此提供用於移除該個體口腔組織之實質上所有微生物或其片段之條件；

藉此在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性。

在一實施例中，該手術療程係一牙科療程。牙科療程的實例包括清創術、潔牙及/或牙根整平術。

在一實施例中，本發明提供用於在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性之一組成物，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯，該組成物包括如在此所述的一種抗微生物劑與如在此所述的一種免疫原。

就另一方面而言，本發明提供本發明的一組成物在製備用於在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性之一藥物之用途，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯。該等疾病的非限制性實例包括牙菌斑、牙齦炎、牙周炎、慢性牙周炎、蛀牙、骨質流失、齒槽骨質流失及冠狀動脈疾病。

在另一實施例中，本發明提供用於治療或預防牙周病(及/或在此所指出之適於治療的其他病況)之一組成物，其係由在此所述的抗微生物劑與在此所述的免疫原之一有效成分所組成。

在另一實施例中，本發明提供用於在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性之一組成物，其包含在此所述的抗微生物劑與在此所述的一種免疫原，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯。

在另一實施例中，本發明提供如在此所述的一組成物，其係使用作為一藥物。

在另一實施例中，本發明提供一藥學組成物，其包含一有效量之本發明的一組成物作為一主要成分。

在一實施例中，提供用於形成對於一個體的口腔病原體之一種抗體反應或用於形成一種Th2反應之一種方法，其步驟包括：

-提供一個體，在其體內待形成對抗一口腔病原體之一種抗體或Th2反應；

-檢查該個體，以判定該個體的口腔組織是否發炎；

-在檢查揭露該個體的口腔組織未發炎之情況下，以一種口腔病原體免疫接種該個體，藉此形成對於該個體的口腔病原體之一種抗體反應或Th2反應。

在一實施例中，在口腔組織發炎的一個體中用於形成對於一口腔病原體之一種抗體反應或形成一種Th2反應之一免疫方法中，提供對於該個體投予一消炎劑之步驟，藉此在用於形成對於一口腔病原體的一種抗體反應或Th2反應之該個體的免疫接種作用之前，減少口腔組織的發炎或消除發炎。

在另一實施例中，提供用於調節口腔組織發炎的一個體之一種方法，以在該病原體的免疫接種作用之際對於一口腔病原體形成一種抗體反應或形成一種Th2反應，該方法的步驟包括對於該個體投予一消炎劑，藉此在以一病原體免疫接種該個體而形成對於一口腔病原體的一種抗體反應或形成一種Th2反應之前，減少口腔組織的發炎或消除發炎。

在又一實施例中，提供在口腔組織發炎的一個體中形成對於一口腔病原體的一種抗體反應或形成一種Th2反應之一種方法，其步驟包括：

-提供口腔組織發炎的一個體；

-對於該個體施用一治療，藉此消除口腔組織的發炎；其後；

-以一口腔病原體免疫接種該個體，藉此在該個體中形成對於該病原體的一種抗體反應或形成一種Th2反應。

在上述實施例中，在口腔組織未發炎或當發炎係亞臨床性或無症狀性之時點，提供免疫作用。

在免疫接種作用之際所形成的一免疫反應，通常主要是一種Th2反應，雖然其可能含有Th1反應之可偵測組分。

相關炎症通常為慢性牙周炎，尤其是與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染相關聯之牙周炎。

當牙周炎係與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染相關聯時，用於免疫接種作用的一種免疫原通常為牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)細胞、片段、代謝物或自其所衍生的重組產物，諸如在此所述的嵌合肽(尤其是KAS1-KsA1、KAS2-KLA1)。

如在此所界定之消炎劑或抗微生物劑，通常包括或由消炎化合物、抗生素及抗生物膜劑中之一或多者所組成，在此更詳細地說明其實例。

除非上下文另有要求，如用於此之“包含”一詞及該詞的變體，諸如“包含(comprising)”、“包含(comprises)”及“包含(comprised)”，並非意欲排除其他添加劑、組分、整數或步驟。

圖式簡單說明

第1圖顯示重組Kgp蛋白之SDS-PAGE凝膠的考馬斯(Coomassie)藍染色。第1道為KAS2-KLA1，第2道為KLA1，第3道為KsA1，第4道為KAS1-KsA1。分子量標準係以千道爾頓表示。

第2圖顯示抗體對於KAS2肽與福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞之辨識作用。(A)在ELISA中，KAS2肽係以對抗福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(FK-W50)、重組蛋白KAS1-KsA1、KAS2-KLA1及合成的KAS2-DT接合物及PBS之抗血清探測。(B)在ELISA中，福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞係以對抗福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(FK-W50)、重組蛋白KAS1-KsA1、KAS2-KLA1、KLA1及PBS之抗血清探測。抗體反應係以所得的ELISA力價OD₄₁₅減去二倍背景水平之形式表示，而各力價代表三個數值的平均值±標準偏差。

第3圖顯示在經重組蛋白與重組嵌合蛋白、福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)及僅佐劑(PBS、IFA)免疫接種的小鼠或非口腔感染型(非刺激型)小鼠中，牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)所誘發之大臼齒的水平骨質流失。在該圖中，KAS2-KLA1係示為AS2-LA1，KLA1係示為LA1，KAS1-KsA1係示為AS1-sA1，KsA1係示為sA1。骨質流失之測量值係自左側與右側上頜骨之各大臼齒頰側的牙骨質釉質交界(CEJ)至齒槽骨嵴(ABC)所測得的面積之平均值，及以平方毫米(mm2)為單位。藉由李文(Levene)變異數同質性檢定測得數據為常態分佈，及係以平方毫米為單位之平均值(n=12)形式呈現，及使用單因子變異數分析與唐奈特氏(Dunnett) T3檢定加以分析。*係指骨質流失顯著(P<0.001)低於對照(感染)組之組別。係指骨質流失顯著(P<0.001)高於AS2-LA1組之組別。

第4圖顯示在牙周炎模式中之經免疫接種小鼠的血清抗體亞型反應。血清係來自小鼠；經重組蛋白KsA1、KLA1、KAS1-KsA1與KAS2-KLA1免疫接種之A(口腔接種作用之前)與B(口腔接種作用之後)及福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50係用於ELISA中，及以福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50作為所吸附的抗原。抗體反應IgG(黑色線條)、IgG1(灰色線條)、IgG2a(白色線條)、IgG2b(橫紋線條)、IgG3(斜紋線條)，係以所得的ELISA力價(log2)減去背景水平之形式表示，而各力價代表三個數值的平均值±標準偏差。

第5圖顯示肽特異性抗體對於代表KAS2肽序列433至468的重疊肽之反應性之PEPSCAN分析。(A)以KAS1-KsA1(白色線條)、KAS2-KLA1(黑色線條)抗血清探測之KAS2重疊肽(偏移1，重疊7)。(B)以KAS2-DT接合抗血清探測之KAS2重疊肽(偏移，重疊7)。各線條係顯示抗體反應性(於415奈米的光學密度[OD])。

第6圖。在辨識牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)全細胞與RgpA-Kgp複合體之遠交品系小鼠中，嵌合體AS2-LA1誘發一種抗體反應。CD1遠交品系小鼠係以嵌合體AS2-LA1(50毫克/小鼠)免疫接種，及所收集的血清係與AS2-LA1(A)、福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50(B)用於ELISA中，及以RgpA-Kgp複合體(C)作為所吸收的抗原。在該圖中，KAS2-KLA1係示為AS2-LA1。測定各同型免疫球蛋白對於各抗原之力價，及數據係以所得ELISA力價(‘000)減去二倍背景水平之形式表示，而各力價代表三個數值的平均值±標準偏差。

第7圖。Kgp蛋白酶之蛋白模式。KAS2[天冬醯胺酸433至離胺酸468](A)，KAS4[天門冬胺酸388至纈胺酸395](B)，KAS5[天冬醯胺酸510至天門冬胺酸516](C)及KAS6[異白胺酸570至色胺酸580](D)。

較佳實施例之詳細說明

現在將詳細參照本發明的特定實施例。雖然本發明係連同實施例說明，將瞭解其意圖並非將本發明侷限於該等實施例。反之，本發明係意欲涵蓋由申請專利範圍所界定之本發明的範圍內可包括之所有任擇方案、改質作用及等效物。

嫻熟技藝者將認知與在此所述者類似或等效之可用於施行本發明的多種方法與材料。本發明絕非受限於所述之方法與材料。

將瞭解在本說明書中所揭露與界定之本發明，係擴及二或多個所提及或自內文或圖式中明顯可見的個別特性之所有任擇組合。所有的該等不同組合構成本發明的各種任擇部分。

本案發明者發現，在組織中提供免疫力的授受性轉移之前，或在組織中引起一免疫反應之際，藉由移除口腔組織的實質上所有炎性刺激，可改善對於感染之反應，尤其是改善抗體反應。在提供用於預防及/或治療口腔組織的疾病及推而廣之用於預防及/或治療因口腔組織被微生物病原體感染而在其他生理構造房室所發生之疾病方面，該項發現特別有用。

因此在特定的實施例中，提供在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性之一種方法，該疾病或病況係與一個體的口腔組織中存在一種微生物病原體相關聯，該方法包括：

-治療一個體，藉此提供用於移除該個體口腔組織中的實質上所有微生物與其片段之條件；其後

藉此在一個體中降低一疾病或病況的發病率或嚴重性。

在一實施例中，以協同性有效量提供一種用於治療一個體的抗微生物劑組成物與免疫原，藉此提供用於移除該個體口腔組織中的實質上所有微生物與其片段之條件。

該個體在此通常係指一動物，尤其是一哺乳類動物。在一實施例中，該哺乳類動物係人類。在特定的實施例中，該哺乳類動物可為一家畜或農場動物。家畜或農場動物之實例包括馬、山羊、豬及家畜諸如牛與羊。在特定的實施例中，該動物係一種伴侶動物，諸如狗、貓、兔或天竺鼠。

1.定義

‘移除口腔組織的實質上所有微生物與其片段’之用語，一般係指提供在該組織中所耗乏的微生物或片段或其代謝物之一量係足以耗乏該組織的炎性刺激之條件，藉此將該組織的一或多種發炎症狀實質上減少或降至最低。當相關個體患有源自慢性感染之慢性組織發炎時正是如此。一般而言，焦點係在於將組織發炎降至最低。因此，將瞭解在相關治療步驟之後，可能仍留存一些微生物、片段及其代謝物。

在其他實施例中，當該個體的組織並未發炎時，‘移除口腔組織的實質上所有微生物與其片段’之用語，係指提供實質上預防微生物、片段及其代謝物累積至將引起發炎的一量之條件。當進行治療的個體係正常或在其他情況下並無一疾病或病況的症狀時正是如此。當手術或牙科介入已移除微生物，及目標在於確保提供實質上預防微生物累積至將引起發炎的一量之條件時，亦是如此。在該等實施例中，當焦點在於避免微生物量累積至可能引發炎症時，將瞭解在相關治療步驟之後，可能仍有一些微生物、片段及其代謝物累積。

‘降低疾病或一病況之發病率’之用語，一般係指將一正常或無症狀個體或具有早期形式的一疾病或病況之一個體惡化至該疾病或病況的完全活躍形式之可能性降至最低。在特定的實施例中，該用語係指預防一特定個體惡化至一疾病或病況的完全活躍形式。

‘降低疾病或一病況之嚴重性’之用語，一般係指將一或多種症狀或徵象或一疾病或病況降至最低。在特定的實施例中，該用語係指治療罹患一疾病或病況之一個體。

‘免疫原’一般係指可產生或引起對於抗原的一免疫反應之一分子，較佳為一種荷爾蒙或抗體反應，例如，一種Th2反應。免疫原的實例包括肽與相關蛋白。

‘協同性有效量’之用語，一般係指一種抗微生物性組成物與免疫原的量所提供之一種治療或預防性或保護性效應，係大於當組成物或免疫原各單獨使用時所能達成的效應。在一實施例中，該抗微生物性組成物與免疫原的協同性有效量支撐該組成物與免疫原之間的一種新穎的作用相互關係，藉此該免疫原的保護性或治療性效用係遠大於當免疫原單獨施用至發炎組織時所能達成者。相較於當單獨使用免疫原時所能達成者，微生物組成物與免疫原之協同性有效量通常提供對於微生物病原體之較高力價及/或較高的親和性抗體反應。

‘治療有效量’之用語一般係指本發明的一化合物之一量，其(i)治療該特定疾病、病況或疾患，(ii)減緩、改善或消弭該特定疾病、病況或疾患的一或多種症狀，或(iii)延緩在此所述之特定疾病、病況或疾患的一或多種症狀之初發。

‘治療’或‘治療作用’等詞係指治療性療法，其中之目的係減緩(減輕)一種非所欲的生理變化或疾患。就本發明的目的而言，有益或期望的臨床結果包括但不限於緩和症狀、縮小疾病範圍、穩定(亦即非惡化)疾病狀況、延遲或減緩疾病進程、改善或緩和疾病狀況及緩解(不論是部分或全面)，不論是可檢測或不可檢測者。‘治療’亦可指延長存活時間，相較於若未接受治療之存活時間而言。治療可能未必完全清除感染，但可將感染的併發症與副作用及感染進程減少或降至最低。可藉由該個體的身體檢查、細胞病理學、血清DNA或mRNA檢測技術，監測該治療之成功與否。

‘預防’與‘預防作用’等詞，一般係指用於保護或預防尚未患有一特定感染的相關併發症之一個體惡化至該併發症之預防性或阻止性措施。需要預防作用之個體係包括該等患有一感染者。

‘藥學上可接受的’之用語，係指該物質或組成物必需在化學上及/或毒物學上與構成一調配物之其他成分及/或經其治療的哺乳類動物相容。

‘仿單’一詞係用於指在治療性產品的商品包裝中所習慣包括之說明書，其包含有關適應症、用途、劑量、投藥、使用該治療性產品的禁忌及/或警示之資訊。

Th1反應一般係指涉及細胞介素諸如干擾素γ與TNF之一反應。

Th2反應一般係指涉及細胞介素諸如介白素-4、介白素-5、介白素-6、介白素-10、介白素-13等之一反應。

2.治療方法

本發明的方法係適用於廣範圍的個體，包括該等並無該疾病或病況的症狀者。該等個體的口腔或其他組織可能不具有疾病症狀。更詳細地，該等個體的黏膜或其他口腔組織可能並未發炎。在一實施例中，就隨機選擇的個體世代而言，該等個體的口腔可能正常具有相當多的微生物病原體。

在其他實施例中，該個體的口腔組織或其他生理構造房室表現出一疾病或病況的亞臨床或臨床症狀。

該疾病或病況的症狀可在該個體的口腔組織中表現。可能存在的急性發炎標記，係包括血漿與白血球自血液進入損傷組織之移動增加。亦可能存在之牙齦急性感染的臨床徵候包括發紅(rubor)、發熱(calor)、腫脹(tumor)、疼痛(dolor)及功能喪失(functiolaesa)。慢性發炎的特徵可在於白血球細胞(單核白血球、巨噬細胞、淋巴球、血漿細胞)浸潤作用。可能觀察到組織與骨質之流失。炎症的實例包括唇炎(cheilits)、牙齦炎、舌炎及口炎。

在一實施例中，該個體的黏膜或其他口腔組織可能發炎。例如，該個體可能患有急性口腔組織發炎。該等個體的實例包括該等曾進行牙科或口腔手術包括清創術、潔牙與牙根整平術者。

在其他實施例中，該個體可能患有慢性口腔組織發炎。在一實施例中，該個體可能患有牙齦炎、齒槽骨吸收作用，及最終牙齒因進行性喪失牙齒與齒槽骨的膠原蛋白附連而脫落。亦可能發生黏膜或相關口腔組織的其他損傷。

在一實施例中，該疾病或病況係口腔組織的一疾病或病況。慢性牙周炎係一個特別重要的實例。其他的疾病與病況包括特徵在於損傷口腔黏膜者，如猩紅熱、鵝口瘡、化膿性肉芽腫、白喉、結核病、梅毒、放線菌病、念珠菌病、疱疹性口炎。

將瞭解該疾病或病況可為口腔組織以外的一組織之一疾病或病況，諸如一器官或系統，例如心血管系統。在一實施例中，該疾病或病況係心血管疾病。

本發明可適用於一範圍之微生物病原體，尤其是感染口腔組織的該等微生物病原體。在一實施例中，該病原體係選自由細菌、病毒及真菌所組成之群組。

細菌係特佳選自由牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)、齒垢密螺旋體(Treponema dentico1a)、福賽斯坦納菌(Tannerella forsythia)所組成之群組。

病原體的其他實例係示於下列第A表中。

在一實施例中，對於該個體投予形成一種抗微生物劑之一組成物，藉此移除該個體口腔組織之實質上所有微生物或其片段。如下進一步討論實例。

在一實施例中，例如藉由對於該個體投予一種免疫原而在個體中提供一抗體，其係在藉由機械清創術及/或施用如在此所界定之一或多種抗微生物劑治療一受感染位址一至二個星期之後發生。

可藉由檢測或測量來自一微生物的一種蛋白或其片段，而測定微生物、其片段或代謝物之水平或存在與否。

在另一實施例中，可藉由自該個體取一試樣及測定一特定蛋白存在與否或該試樣中之一特定蛋白的表現水平，而測定一口腔組織中之微生物、其片段或代謝物的水平或存在與否。可藉由任意數量的分析法檢測一蛋白之存在與否或其水平。實例包括免疫分析、層析法及質譜法。特佳的免疫分析法之一實例為FACS。

可用於檢測一標的蛋白是否存在於一試樣中之各種分析法包括：

酵素結合免疫吸附分析法(ELISA)：該方法涉及將含有一標的蛋白、肽或其片段之一試樣，例如唾液或口腔組織，固定至一表面諸如一微量滴定盤的一孔上。施用與一酵素偶合之具標的蛋白特異性的抗體，及讓其與標的蛋白、肽或其片段結合。藉由使用與該抗體偶合的酵素之一比色反應，檢測與量化該抗體之存在。在該方法中所常用的酵素包括辣根過氧化酶與鹼性磷酸酶。若校正良好及位於反應的線性範圍內，該試樣中之標的蛋白、肽或其片段的存在量係與所產生的顏色量成正比。一般使用標的蛋白、肽或其片段標準品，以增進定量準確性。

西方墨點法：該方法涉及藉由丙烯醯胺凝膠將一標的蛋白、肽或其片段與其他蛋白分離，接著將該蛋白、肽或其片段轉移至一膜(如尼龍或PVDF)。藉由對於該標的蛋白、肽或其片段具特異性之抗體檢測該標的蛋白、肽或其片段之存在，該抗體則藉由抗體結合試劑檢測。抗體結合試劑例如可為蛋白A或其他抗體。抗體結合試劑可經放射性標記或如上述與酵素結合。可藉由自動放射攝影、比色反應或化學發光作用進行檢測。該方法係藉由電泳期間在丙烯醯胺凝膠中的遷移距離所示之在該膜上的相對位置，得以定量標的蛋白、肽或其片段之量及判定其身分。

放射免疫分析(RIA)：在一形式中，該方法係涉及使用固定在一種可沉澱性載體諸如瓊脂珠上的一種特異性抗體與經放射性標記的抗體結合蛋白(如經碘¹²⁵標記的蛋白A)，將所欲的標的蛋白、肽或其片段沉澱。所沉澱的丸狀物中的計數數值，係與標的蛋白、肽或其片段的量成正比。

在RIA的另一形式中，使用一種經標記的標的蛋白、肽或其片段與一種未標記的抗體結合蛋白。含有未知量之一標的蛋白、肽或其片段之一試樣係以不同的量添加。來自經標記的標的蛋白、肽或其片段之沉澱計數之降低，係與所添加的試樣中之標的蛋白、肽或其片段的量成正比。

螢光激活細胞分選技術(FACS)：該方法係涉及藉由具標的蛋白、肽或其片段特異性之抗體，而在細胞中原位檢測一標的蛋白、肽或其片段。具標的蛋白、肽或其片段特異性之抗體係與螢光團連結。藉由一種細胞分選機器，讀取各細胞通過一光束時所發出的光之波長，而進行檢測。該方法可同時使用二或多種抗體。

免疫組織化學分析：該方法係涉及藉由具標的蛋白、肽或其片段特異性之抗體，在固定式細胞中原位檢測一標的蛋白、肽或其片段。具標的蛋白、肽或其片段特異性之抗體可與酵素結合或與螢光團連結。藉由顯微技術與主觀或自動評估作用進行檢測。若使用酵素結合型抗體，則可能需要一種比色反應。將瞭解在免疫組織化學法之後，通常使用例如蘇木素或姬姆薩氏(Giemsa)染劑進行細胞核的對比染色。

原位活性分析：依據該方法，在含有一活性酵素的細胞上施用一種發色受質，及該酵素催化一反應，其中該受質分解而產生藉由一光學或螢光顯微鏡可見之一種發色產物。

試管內活性分析：在該等方法中，在自該細胞所萃取的一種蛋白混合物中，測量一種特定酵素的活性。該活性可在分光光譜儀中使用比色方法測量，或可在非變性丙烯醯胺凝膠(亦即活性凝膠)中測量。在電泳之後，將該凝膠浸泡在含有一受質與比色試劑之一溶液中。所產生的染色帶狀係對應於所感興趣的蛋白之酵素活性。若校正良好及位於反應的線性範圍內，該試樣中所存在的酵素量所產生的顏色量成正比。一般使用一酵素標準品，以增進量化準確性。

此外，可藉由定量PCR測定細菌DNA的量，俾作為一口腔組織中之微生物的存在與否或其水平之一指標。

可測定一蛋白或來自牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)、齒垢密螺旋體(Treponema denticola)、福賽斯坦納菌(Tannerella forsythia)的DNA之存在與否或其水平，及顯示已移除一個體口腔組織中的實質上所有微生物或其片段。

該抗微生物劑及/或免疫原可以全身方式投藥，或直接投藥至口腔組織，尤其直接地投藥至口腔黏膜。

在一實施例中，該個體之治療係移除該個體口腔組織的實質上所有微生物或其片段，藉此將該個體口腔組織的發炎降至最低。在另一實施例中，該個體之治療係移除該個體口腔組織的實質上所有微生物或其片段，藉此將該個體口腔組織的免疫反應降至最低。

可在用以移除該個體口腔組織的實質上所有微生物與其片段之該個體的治療作用之後，對於該個體投予免疫原。

一般而言，如本發明，相關口腔組織並未發炎；或者即使炎症存在，在免疫作用之際亦為無症狀性或亞臨床性。

在免疫作用之後，該個體主要展現一種Th2反應，其大體上是一種荷爾蒙反應，及該個體具有可檢測水平的保護性抗體。

3.組成物

在特定的實施例中，提供一組成物，其包括：

-用於移除該個體口腔組織的實質上所有微生物與其片段之抗微生物劑；

該組成物可用於上述的一種方法中。

3.組成物

在特定的實施例中，提供一組成物，其包括：

該組成物可用於上述的一種方法中。

3.(a)抗微生物劑

抗微生物劑可為其投藥效應係用以耗乏炎性刺激之任一藥劑。單獨或組合使用該等藥劑，在短期抑制發炎、牙周病原體的再度出現例如生物膜形成作用及/或牙周骨吸收作用方面具有效用。可單獨或組合施用該等藥劑，例如在可能曾進行手術介入的一牙周位址局部施用一種緩釋型牙周凝膠調配物，以預備該病患的免疫系統接受對抗牙周病原體的疫苗接種。

在不受任一理論或作用模式約束之下，在受感染的牙周位址之機械清創術與清潔作用之際，施用例如位於一種牙周凝膠調配物中之在此所界定的一種抗微生物劑，據信有助於預備免疫系統而容許產生一種傾向Th2的反應。傾向Th2的該反應造成保護性抗體之產生，及預防牙周病原體再度出現與預防疾病惡化。

在這種情況下，下列可為抗微生物劑：抗生素、免疫抑制劑及殺菌劑。在特定的實施例中，該藥劑可為一種消炎劑。消炎劑包括非類固醇類消炎藥(NSAID)。NSAID的實例包括抑制一種環氧化酶之化合物。特定NSAID的實例包括阿斯匹靈、布洛芬(ibuprofen)及拿百疼(naproxen)。消炎劑的其他實例包括PAR-2拮抗劑，及其包括但不限於結合PAR-2的抗體與抗體片段、與PAR-2結合及抑制其活性之其他多肽、抑制PAR-2活性或表現作用之其他化合物及包括與PAR-2編碼核酸交互作用的小型有機化合物與抑制性核酸。可封阻或置換一種內源性配體與PAR-2的結合作用及/或經由PAR-2的訊號傳導作用之例示性拮抗劑，包括該等述於WO 2004/002418與WO 2006/023844者(如具有胺基酸序列LIGK或LIGKV之肽)。與PAR-2結合及阻止作用為一繫留配體的PAR-2區域之蛋白分解性切開作用之拮抗劑，係例示於WO 2007/092640中。

抑制、降低或封阻PAR-2的表現作用之拮抗劑，係包括抑制性核酸，其包括但不限於核酶、三螺旋型寡核苷酸(TFO)、促進藉由核糖核酸酶P的切開作用之外源指導序列(EGS)，肽鏈核酸、反訊息DNA、siRNA及對於編碼PAR-2的核酸具特異性之微型核糖核酸。

“間接型拮抗劑”係藉由拮抗在正常情況下切開PAR-2而造成其活化作用之蛋白酶活性，而可間接地抑制PAR-2。可切開PAR-2之蛋白酶包括牙齦菌蛋白酶、胰蛋白酶、類胰蛋白酶及嗜中性白血球蛋白酶-3。適用於本發明的一種方法或可用於本發明的一組成物中之間接型拮抗劑的實例，係包括WO 93/14779中所揭露之胰蛋白酶抑制劑及WO 02/47762中所揭露之類胰蛋白酶抑制劑。

在一個特佳的實施例中，該抗微生物劑係一種抗生素。實例包括選自由巨環類、四環黴素類、盤尼西林類、反丁烯二酸還原酶抑制劑及抗微生物肽所組成之群組之抗生素，如下列第B表中所示。

在一實施例中，該抗微生物劑係選自一或多種反丁烯二酸還原酶抑制劑。適宜的抑制劑包括天然產物，其包括但不限於紫花前胡素、verticipyrone、paecilaminol、來自鏈黴菌屬(Streptomyces)菌種之5-烯基-3,3(2H)-呋喃酮類、奈氟瑞林(nafuredin)、甲反丁烯二酸、魚藤酮及其天然、半合成與合成類似物。就另一方面而言，抑制劑可為合成化合物，其包括但不限於：2-取代4,6-二硝苯酚類；巰基吡啶N-氧化物；L-092,201(默沙東(Merck Sharpe and Dohme)公司)；硝基咪唑類諸如非昔硝唑(fexindazole)、美加唑(megazol)、苄硝唑、MK-436、L-634,549、米索硝唑(misonidazole)；或苯并咪唑類諸如阿苯達唑(albendazole)、坎苯達唑(cambendazole)甲苯達唑(mebendazole)、奧吩達唑(oxfendazole)、帕苯達唑(parebendazole)及噻苯達唑(thiabendazole)；或甲嘧烯酚或莫侖太爾(morantel)。較佳的抑制劑為甲嘧烯酚、莫侖太爾(morantel)或噻苯達唑(thiabendazole)。特佳的抑制劑為甲嘧烯酚。

嫻熟技藝者將瞭解抑制劑的選擇係依決定該抑制劑是否適用於臨床環境之數項臨床因子而定。

抗生素對於該微生物病原體可直接具有細胞毒性。在其他實施例中，抗生素係間接具有細胞毒性，例如抗生素可為微生物生物膜製造作用或其他一些代謝作用之抑制劑。

在一實施例中，該抗生素係一種抗微生物肽。實例係示於下列第C表中。

在一個特佳的實施例中，該抗微生物劑係微生物的生物膜製造作用之一種抑制劑。其他較佳藥劑為反丁烯二酸還原酶抑制劑。

在特定的實施例中，該抗微生物劑可為一種抗體。該抗體可為一種多株或單株抗體。可使用的例示性單株抗體係導向牙周病原體的分子(如蛋白酶與黏連蛋白)或宿主以抑制發炎[如單獨或組合對抗腫瘤壞死因子(TNFα)、介白素-1(IL-1)、尿激酶型血纖維蛋白溶酶原活化劑(u-PA)、顆粒性白血球巨噬細胞集落刺激因子(GM-CSF)、巨噬細胞集落刺激因子(M-CSF)及RANK配體(RANKL)之抗體]。該抗體較佳係導向對抗不同病原體抗原與宿主發炎介質之單株抗體的混合物。待用於靶向牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)的較佳單株抗體，係該等導向Kgp與RgpA蛋白酶的活性位址者及該等導向Kgp與RgpA蛋白酶之Al黏連蛋白的結合基序者。

在一實施例中，該抗微生物劑係一種抗體模擬物。該抗體模擬物可具有或不具有免疫球蛋白域的三級結構(如Dimitrov於2009年期刊“MAbs”第1期第26-28頁乙文)。抗體模擬物可具有與一特定分子結合之特異性。抗體模擬物之一實例係與人類載脂蛋白(lipocalin)相關之分子家族，其稱作抗運轉蛋白(anticalin)(如Skerra於2007年期刊“Current Opinions in Biotechnology”第18期第295-304頁乙文)。抗運轉蛋白較佳導向來自牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)的一蛋白，或特異性地與其結合。在一個較佳實施例中，抗運轉蛋白係導向一種離胺酸-X-蛋白酶或精胺酸-X-蛋白酶諸如Kgp與RgpA蛋白酶的活性位址，或特異性地與其結合。可使用抗運轉蛋白代替單株抗體，但約小8倍及其尺寸約為180個胺基酸及質量約為20千道爾頓。抗運轉蛋白的組織滲透作用係優於抗體，及在高達70℃的溫度安定。不同於抗體之處，係其等可在細菌細胞如大腸桿菌(E. coli)中大量生產。

在特定的實施例中，抗微生物劑亦可為可抑制、降低或阻止細菌生物膜形成或發育之一種抗生物膜劑。抗生物膜劑可能具有生物膜碎裂活性，及可能造成生物膜粉碎。”生物膜碎裂活性”在此係用於說明一組成物或藥劑造成細菌自該生物膜釋出之性質。該組成物或藥劑亦可但未必降低一生物膜中的細菌之存活性。細菌自生物膜之”釋出”，係包括將來自一生物膜的細菌成為浮游狀態之數目增加，藉此增加來自一生物膜的細菌對於殺細菌劑之感受性。殺細菌劑在此係用於說明直接降低細菌存活性的一組成物、藥劑、化合物、擬肽或肽之性質。

因此，在不受任一理論或作用模式約束之下，展現生物膜碎裂活性之組成物或藥劑據信未必降低一生物膜中的細菌之存活性，反之造成或引發細菌細胞自該生物膜釋出。在特定的實施例中，該等組成物或藥劑可造成或引發一生物膜中的更多細菌成為浮游狀態。在其他實施例中，該組成物或藥劑可抑制或降低生物膜形成作用。在特定的實施例中，該組成物或藥劑可抑制或降低生物膜生長。在其他實施例中，本發明的抗微生物劑可抑制或降低生物膜所展現之啟動或促進一個體的一疾病或病況之任一特性。在特定的實施例中，該肽或組成物可抑制或降低生物膜所展現之啟動或促進一個體的一疾病或病況之任一特性，而毋需殺滅該生物膜中的細菌。

在特定的實施例中，一種抗微生物性組成物或藥劑係指預防、抑制或降低一生物膜的一種可測量性參數之能力。一生物膜的可測量性參數之非限制性實例，可為該生物膜之總生物質量、平均厚度、表面相對於生物體積的比例、粗糙係數或細菌組成物及其等的存活性。

3.(b)免疫原

所選擇的免疫原引起一種免疫反應，較佳是對於所關切的微生物病原體之一種保護性抗體反應。

在一實施例中，該免疫原係以肽的形式提供，例如一種重組肽。

在特別有關於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染及相關疾病與病況之一實施例中，該重組肽可為用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一種嵌合或融合蛋白，該蛋白包括直接或經由一連接子而與第二肽連接之第一肽，其中：

(A)該第一肽包括：

(B)該第二肽包括：

如用於此之“肽”一詞係用於指一胺基酸序列，其具有至多約40個胺基酸殘基及較佳自5至40個胺基酸殘基。

在一實施例中，使用一種多肽以替代“第二肽”，或換言之並非使用“第二肽”。“多肽”一詞係用於指具有至少約40個胺基酸殘基之一胺基酸序列。

因此，就另一方面而言，提供用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一種嵌合或融合蛋白，該蛋白包括直接或經由一連接子而與一多肽連接之一肽，其中：

(A)該肽包括：

(B)該多肽包括：

(i)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的離胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(ii)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的精胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(iii)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)之HagA黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部。

就另一方面而言，本發明提供用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一肽，及其係選自由所下列組成之群組：

(i)與序列辨識編號：64至66中之一者所示序列相同或同源之一序列；及

(ii)與序列辨識編號：67或68所示序列相同或同源之一序列。

就本發明的一方面而言，當該肽具有序列辨識編號：64至68之一序列時，該肽可以一種嵌合或融合蛋白的形式提供，其中該肽係直接或經由一連接子而與第二肽連接。在一實施例中，該嵌合或融合蛋白的第二肽包括：

在上述實施例中，使用一種多肽以替代第二肽，或換言之並非使用第二肽。因此，就另一方面而言，提供用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一種嵌合或融合蛋白，該蛋白包括直接或經由一連接子而與一多肽連接之一肽，其中：

(A)該肽包括：

(i)與序列辨識編號：64至66中之一者所示序列相同或同源之一序列；或

(ii)與序列辨識編號：67或68所示序列相同或同源之一序列；及

(B)該多肽包括：

如用於此之一肽或多肽的一“同源物”，係指當藉由一種BLAST演算法進行比較時，一肽或多肽所具有的一胺基酸序列係與首述肽或多肽的胺基酸序列具同源性或與其同源，或具有一致性，較佳至少90%的序列一致性，更佳至少95%及甚至更佳至少98%的序列一致性，其中該演算法的參數之選擇，係使得在個別的參考序列全長之個別序列之間獲致最多的相符配對。序列一致性係指所比較之二個序列的胺基酸之間完全相符。該同源物可衍生自牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的離胺酸-X-蛋白酶或精胺酸-X-蛋白酶之一種天然存在的變異體或分離物。任擇地，其可為來自牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的離胺酸-X-蛋白酶或精胺酸-X-蛋白酶之一種肽或多肽的“保留性取代”變異體，其中已改變一或多個胺基酸殘基及未更改該肽或多肽的整體構形與功能，包括但絕非限於以一性質相近者置換一胺基酸。性質相近的胺基酸係技藝中眾所周知。例如，可互換的極性/親水性胺基酸包括天冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、半胱胺酸、蘇胺酸、離胺酸、精胺酸、組胺酸、天冬胺酸及麩胺酸；可互換的非極性/疏水性胺基酸包括甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸及甲硫胺酸；可互換的酸性胺基酸包括天冬胺酸及麩胺酸、及可互換的鹼性胺基酸包括組胺酸、離胺酸及精胺酸。該等保留性取代變異體所具有的胺基酸變更較佳少於20個，更佳少於15個，更佳少於10個及最佳少於5個。

可遵循說明書在此之教導，尤其有關於例示用於預測出現在牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)上之供離胺酸-X-蛋白酶所用之催化性位址的三維構形之方法之第7圖與第9例，而測定牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素中之界定該酵素中用於切開肽鍵的一位址之一區域，該胰蛋白酶樣酵素尤其是一種離胺酸-X-蛋白酶(Kgp)或精胺酸-X-蛋白酶(RgpA)。第10例提供用於精胺酸-X-蛋白酶的三維構形模式化之方法論。

在特定的實施例中，該嵌合或融合蛋白或其第一或第二肽組分可自一擬肽形成。擬肽係模擬一特定肽的一或多種特性例如構形之一分子，及其係由胺基酸殘基所組成，其中的一些胺基酸殘基可能並非天然存在者。

在辨識該催化性位址的免疫原區之後，本案發明者已測定可引起荷爾蒙反應之各種肽免疫原的序列。尤其，側臨或以其他方式界定該催化性位址之‘六’個區域係界定如下：KAS1/RAS1、KAS2/RAS2、KAS3/RAS3、KAS4/RAS4、KAS5/RAS5及KAS6(見第1表)。在獲得該資訊後，本案發明者已可查詢蛋白序列資料庫，以判定與側臨一催化性位址的區域及因此代表牙齦紫質單胞菌(P.gingivalis)上所發現的免疫原性抗原決定基之胺基酸序列具同源性之肽。藉由下列結構式辨識該等肽的序列：

本案發明者發現包括該等肽之嵌合蛋白具有數種效用。例如，如在此所述，其中一些產生具高度保護性之荷爾蒙反應，而可用於治療或預防在慢性牙周炎中所觀察到的骨質流失。在診斷分析中亦可使用該等肽，其中其等可檢測或監測一個體血清中的特性，藉此顯示該個體是否受到感染，若受到感染則是否需要治療，及若接受治療則所提供的該等治療是否有效。

將瞭解在牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素中，位於離胺酸或精胺酸的C端之用於界定該酵素中用於切開肽鍵的一位址之一區域，並未包含離胺酸-X-蛋白酶或精胺酸-X-蛋白酶的完整序列。

如用於此之“異源蛋白”或“嵌合或融合蛋白”一詞係用於指一蛋白，其係由衍生自不同來源之胺基酸的功能單元、域、序列或區所組成，或衍生自相同來源及經組合所具有的一組織係與該單元、域、序列或區域自其所衍生或相關之一分子中所觀察到者不同。本發明的嵌合或融合蛋白之共同特性，係在於其等所含有的至少一肽係具有與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素用於界定用於切開肽鍵的一位址之一序列相同或具同源性之一胺基酸序列。

在一個較佳實施例中，其中第一肽包含來自Kgp[432-468]區之一肽，其較佳為(i)包含選自VSFANYT與VGFAN YT的一序列及更佳選自GVSFANYT、GVGFANYT、VSFANYTA及VGFANYTA的一序列之一肽；或(ii)包含選自ETAWAD、ETSWAD、TAWADP及TSWADP的一序列及較佳選自SETAWAD、SETSWAD、ETAWADP、ETSWADP、TAWADPL及TSWADPL的一序列及更佳選自GSETAWAD、GSETSWAD、SETAWADP、SETSWADP、ETAWADPL、ETSWADPL、TAWADPLL及TSWADPLL的一序列之一肽。該肽更佳選自示於第1表中之KAS1[432-454]、KAS2[433-468]及KAS3[436-455]肽。任擇地，第一肽可為PAS1K[432-453]肽，亦稱作PAS1(K48)，如第PCT/AU98/00311號國際專利申請案(WO98/049192)所揭露。對應於該等肽的序列識別號係示於第3表。

同樣地，在另一個較佳的實施例中，其中第一肽包含來自RgpA[426-462]區之一肽，該肽較佳選自示於第1表中之RAS1[426-448]、RAS2[427-462]及RAS3[430-449]肽。任擇地，第一肽可為PAS1R[426-446]肽，亦稱作PAS1(R45)，如第PCT/AU98/00311號國際專利申請案(WO98/049192)所揭露。

在本發明的嵌合或融合蛋白中，第二肽可為來自一種牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素諸如離胺酸-X-蛋白酶(Kgp)或精胺酸-X-蛋白酶(RgpA)或HagA的黏連蛋白域之一肽(見第2表)。該等域有時亦稱作血球凝集素。在離胺酸-X-蛋白酶中，較佳的域係如第2表中所示之KA1、KA2、KA3、KA4、KA5。在精胺酸-X-蛋白酶中，較佳的域係如第2表中所示之RA1、RA2、RA3及RA4。在HagA中，較佳的域為HagA1、HagA1*及HagA1**。

除了增進對於本發明的一肽諸如KAS1、KAS2、KAS3、KAS4、KAS5及KAS6或者當在一種嵌合或融合蛋白中包括該肽時之RAS1、RAS2與RAS3、RAS4與RAS5之荷爾蒙反應之外，該黏連蛋白域亦含有免疫性抗原決定基，因此導致產生多重特異性而引發一種保護性免疫原性反應。當以本發明的嵌合或融合蛋白形式提供時，有關黏連蛋白域的免疫性抗原決定基係保留趨近牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素中的一形式之發現，係未預期到的。

將瞭解在本發明的該等實施例中，該嵌合或融合蛋白可含有選自KAS1/RAS1、KAS2/RAS2、KAS3/RAS3、KAS4/RAS4、KAS5/RAS5及KAS6/RAS6之任一或多種肽以及一種牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素的任一或多種黏連蛋白域，尤其具有任一或多種的離胺酸-X-蛋白酶黏連蛋白域(KA1、KA2、KA3、KA4及KA5)或精胺酸-X-蛋白酶黏連蛋白域(RA1、RA2、RA3及RA4)或HagA域HagA1、HagA1*及HagA1**。

亦將瞭解該黏連蛋白域並非必定如一種牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素中所觀察到的一個完整域。例如該黏連蛋白域可為該域的一片段；尤其，較佳的片段係離胺酸-X-蛋白酶A1域的KsA1與KLA1域片段(見第2表)。當該域係一黏連蛋白域的一片段時，其一般含有一或多種黏連蛋白域特異性抗原決定基。

對應於黏連蛋白相關肽的序列識別號，係示於第3表。

在一實施例中，第二肽或多肽係包括序列辨識編號：69至79中之一或多者或83至85中之一或多者所示之一序列。

本發明的嵌合或融合蛋白亦可包括選自離胺酸-X-蛋白酶的Kgp[432-468]區之一或多種附加的肽及/或選自精胺酸-X-蛋白酶的RgpA[426-462]區之一或多種附加的肽。

在本發明的較佳實施例中，該嵌合或融合蛋白包括KAS1、KAS2、KAS3、KAS4、KAS5及KAS6中之一或多者或RAS1、RAS2、RAS3、RAS4及RAS5中之一或多者以及KsA1或KLA1。

因此在特定的實施例中，該嵌合或融合蛋白可包括至少另一種肽，其中該另一種肽包括：

(ii)與序列辨識編號：2中所示序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(iii)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的離胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(iv)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的精胺酸-X-蛋白酶之黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部；或

(v)與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)之HagA黏連蛋白域的序列相同或同源之一序列的部分或全部。

可包括在此述之一種嵌合或融合蛋白中的域、單元、序列或區之其他實例，係包括用於與受體或配體結合之域諸如Fc結合區或Fc受體、用於增進半衰期之域諸如白蛋白或用於促進該嵌合或融合蛋白的表現作用或純化作用之域。

就又一方面而言，本發明提供用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一肽，其包括序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示之序列。在一實施例中，該肽具有與序列辨識編號：17、18、25及26中之一者同源之一序列。該肽的長度可為5至40個胺基酸。

就又一方面而言，本發明提供一核酸，其所編碼之一肽係具有序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示的一序列。

就又一方面而言，本發明提供具有序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示的一序列之一肽，或所編碼之一肽具有序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示的一序列之一核酸，在製造用於誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之一種嵌合或融合蛋白之用途。

就又一方面而言，本發明提供具有序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示的一序列之一肽，或所編碼之一肽具有序列辨識編號：17、18、25及26中之一者所示的一序列之一核酸，在誘發對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的免疫反應之用途。在一實施例中，該肽係與第二肽同時或依序投予，該第二肽包括：

在本發明的嵌合或融合蛋白中，第一肽的C端殘基可與一黏連蛋白域多肽的N端殘基共價連結，或第一肽的N端殘基可與一黏連蛋白域多肽的C端殘基共價連結。在該配置中，第一肽係與黏連蛋白域多肽“直接地連結”或“相鄰”。

在其他實施例中，該嵌合或融合蛋白包括用於連結第一肽與一黏連蛋白域多肽之一連接子。連接子可為可連接一肽與一多肽之任一連接子，包括胺基酸與非胺基酸連接子。該連接子較佳為非免疫原性。適宜的連接子之長度可高達15個胺基酸，雖然較佳少於5個胺基酸。連接子之作用可使得第一肽與黏連蛋白域多肽所處的空間配置，係比一般在一種牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)胰蛋白酶樣酵素中所觀察到者更靠近。任擇地，其可將第一肽與黏連蛋白域多肽隔開。

可藉由重組表現系統(諸如重組DNA技術)或藉由化學合成作用(諸如固相肽合成作用)，製造本發明的嵌合或融合蛋白。該等技術係技藝中眾所周知。

該異源或嵌合蛋白係特別有利，因其增進所得的荷爾蒙反應而優於單獨使用該嵌合或融合蛋白的第一或第二肽組分所得者。

本案發明者發現包括該等肽之嵌合蛋白具有數種效用。例如，如在此所述，其中一些產生具高度保護性之荷爾蒙反應，而可用於治療或預防在慢性牙周炎中所觀察到的骨質流失。在診斷分析中亦可使用該等肽，其等可檢測或監測一個體血清中的特性，藉此顯示該個體是否受到感染，若受到感染則是否需要治療，及若接受治療則所提供的該等治療是否有效。

在一實施例中，該嵌合或融合蛋白引發一種保護性免疫反應，通常為至少降低或限制在其他情況下與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染相關聯的結締組織損傷之一反應。在一實施例中，該保護性反應至少降低或限制牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)所誘發的骨質流失。在此論及一模式系統，其係用於測量牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染所媒介的骨質流失。通常，該保護性免疫反應主要是一種荷爾蒙反應。在特定的實施例中，該保護性免疫反應亦包括一種細胞反應。

本發明亦提供包括如上所概述的一種嵌合或融合蛋白之一組成物。該組成物通常為抗原性或免疫原性。更詳細地，本發明提供適用於引發對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染的一保護性或治療性免疫反應之一組成物，其包括該嵌合或融合蛋白，及選擇性地組合一佐劑。該組成物亦可包括用於調節或增效該免疫反應之另一組分。在一實施例中，該組成物係一疫苗之形式。

一種較佳的組成物係包括對於牙周病原體牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)、齒垢密螺旋體(Treponema denticola)及福賽斯坦納菌(Tannerella forsythia)產生一免疫反應之免疫原。免疫原可為減毒的全細胞疫苗，或一種純化抗原疫苗，或更佳為一種重組抗原疫苗；其中該組成物含有對抗該三種牙周病原體中的一或多者之抗原。可形成與牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)、齒垢密螺旋體(T. denticola)及福賽斯坦納菌(T. forsythia)感染相關的免疫原之適宜的肽之其他實例，係示於第D至F表。

已知與疫苗組成物一起使用之各種佐劑。該佐劑所提供之助益，係藉由調節免疫反應及使用比該疫苗抗原單獨投予時較少的疫苗抗原量或較小劑量而達到更持久與較高的免疫力水平。佐劑的實例包括佛氏(Freund)不完全佐劑(IFA)；佐劑65(含有花生油、單油酸二縮甘露醇酯及單硬脂酸鋁)；油乳化液；里比(Ribi)佐劑；普朗尼克(pluronic)多元醇類；聚胺類；阿夫立定(Avridine)；奎爾(Quil) A；皂素；MPL；QS-21；礦物凝膠類諸如鋁鹽與鈣鹽；奈米粒子諸如羥磷石灰、磷酸鈣、鋁鹽；寡聚糖與聚糖諸如聚甘露糖、聚葡萄胺糖。其他實例包括水中油乳化液，諸如SAF-1、SAF-0、MF59、賽比克(Seppic) ISA720；及其他特定佐劑諸如ISCOMs^TM與ISCOM matrix^TM。其他的佐劑實例之廣泛但非窮舉的清單，係列於Cox與Coulter於1992年乙文[美國佛州博卡拉頓(Bocca Raton)的CRC出版公司於1992出版之Wong WK所編輯的“動物寄生蟲防治使用技術(Animals parasite control utilizing technology)”乙書第49-112頁]中。除了佐劑之外，當適宜時，該疫苗組成物可包括習用之藥學上可接受的載劑、賦形劑、填料、緩衝劑或稀釋劑。可預防性地投予含有佐劑的該疫苗組成物之一或多個劑量，以預防牙周炎；或治療性地投藥用於治療現存的牙周炎。在一實施例中，所用佐劑之選擇，係用以促進一種傾向Th-2的反應之產生。其中一實例為十二水合硫酸鋁鉀(Alum)。

在一種較佳組成物中，該嵌合或融合蛋白係與一種黏膜佐劑組合，及經由口、頰或鼻途徑投藥。黏膜佐劑的實例為奈米粒子、霍亂毒素與不耐熱性大腸桿菌(E. coli)毒素、該等毒素的無毒性B次單元、該等毒素之毒性較低的基因突變體。可用於經口/頰/鼻的方式輸送抗原性蛋白之其他方法，係包括藉由微膠囊化作用將該蛋白納入或吸收至生物可降解性聚合物(諸如丙烯酸酯類或聚酯類)顆粒或奈米粒子(諸如羥磷石灰)之中或之上，以協助自胃腸道或其他黏膜表面攝取該微球體及保護該等蛋白免於降解作用。脂質體、ISCOMs^TM、水凝膠類係其他可能方法之實例，可藉由納入用於將該抗原性蛋白輸送至黏膜免疫系統之靶向分子諸如LTB、CTB或凝集素，而進一步增進該等方法。除了抗原性蛋白與黏膜佐劑或輸送系統之外，當適宜時，該疫苗組成物可包括習用之藥學上可接受的載劑、賦形劑、填料、膜衣、分散介質、抗細菌或抗真菌劑及緩衝劑或稀釋劑。

已知用於將一疫苗組成物投藥至一個體之多種方法，包括但不限於皮內、肌內、腹膜內、靜脈內、皮下、鼻內、舌下、頰及口服投藥作用。該等投藥途徑係特別適用於疫苗接種。

就另一方面而言，本發明提供一核酸分子，其所包括的一核苷酸序列係編碼如上所廣泛說明之一種嵌合或融合蛋白，及選擇性地在運作上與至少一種調控元素連結。在一實施例中，該核酸係以分離或實質上純化形式提供。

該核酸分子例如可嵌插至一種適宜的表現載體中，及藉由將該表現載體置入一原核或真核宿主細胞，而用於製造一種重組蛋白形式的嵌合蛋白。若要成功地表現該重組蛋白，則該表現載體需含有轉錄作用與轉譯作用所需的調控元素，及該等調控元素係用於表現的特定宿主細胞系統所相容及所辨識。可使用多種宿主細胞系統來表現該重組蛋白，其等包括但不限於以一種噬菌體載體、質體載體或黏接質體DNA轉形的細菌；含有酵母菌載體的酵母菌；含有真菌載體的真菌；受病毒(如桿狀病毒)感染的昆蟲細胞系；及經質體或病毒表現載體轉染或受重組病毒感染(如牛痘病毒、腺病毒、腺相關病毒、反轉錄病毒等)的哺乳類動物細胞系。

使用分子生物學技藝中所知的方法，可在表現載體中納入各種的啟動子與增強子，以增加重組蛋白的表現作用；前提在於所增加之胺基酸序列表現作用，係與所用的特定宿主細胞系統相容(例如無毒性)。

啟動子之選擇將依所用的表現系統而定。啟動子的強度亦即促進轉錄作用的能力不同。一般而言，最好使用一種強力啟動子，以獲致高水平的編碼核苷酸序列轉錄作用及重組蛋白表現作用。例如，在包含lac啟動子、trp啟動子、recA啟動子、核糖體RNA啟動子、P_R與P_L啟動子、lacUV5、ompF、bla、lpp等之包括大腸桿菌(E. coli)在內的一種宿主細胞系統中，已觀察到技藝中所知之細菌、噬菌體或質體啟動子的高轉錄水平，及其等可用於提供所嵌插之編碼胺基酸序列的核苷酸序列之轉錄作用。

供有效率的轉錄或轉譯作用所用之其他控制元素，係包括增強子及調節訊息。增強子序列係DNA元素，其似乎以與其等鄰近的一編碼核苷酸序列之相對位置及定向相對無關的一方式增加轉錄效率。因此，依所用的宿主細胞表現載體系統而定，一增強子可置於所嵌插的編碼序列之上游或下游，以增加轉錄效率。其他調節位址，諸如轉錄或轉譯起始訊息，可用於調節該編碼序列的表現作用。

在另一實施例中，該載體可為一種病毒或細菌疫苗載體，及用於提供一種重組病毒疫苗、重組細菌疫苗、重組減毒細菌疫苗或不活化重組病毒疫苗。牛痘病毒係技藝中最著名的感染性病毒實例，其經設計而表現衍生自其他生物體的疫苗抗原。經減毒或以其他方式處理而藉此其本身不引發疾病之重組型活牛痘病毒，係用以免疫接種宿主。該重組病毒在宿主內的後續複製作用，提供疫苗抗原對於免疫系統的持續刺激作用，藉此提供長效免疫力。

其他的活疫苗載體包括：腺病毒、細胞巨大病毒及較佳痘病毒諸如牛痘[Paoletti與Panicali於第4,603,112號美國專利]及減毒沙門桿菌(Salmonella)菌株[Stocker等人於第5,210,035號、第4,837,151號及第4,735,801號美國專利；及Curtiss等人於1988年期刊“Vaccine”第6期第155-160頁乙文]。活疫苗係特別有利的，因其等持續地刺激免疫系統而可賦予實質上長效的免疫力。當該免疫反應係保護免於後續的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染時，活疫苗本身可用於一種預防性疫苗中，以對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)。尤其，該活疫苗可以片利共生式棲居於口腔中的一細菌為基礎。可使用具有重組嵌合蛋白的一載體將該細菌轉形，然後用於植入口腔及尤其口腔黏膜中。一旦植入口腔黏膜中之後，該重組蛋白之表現將刺激黏膜相關淋巴組織產生中和抗體。為進一步說明該實施例，使用技藝中眾所周知的分子生物技術，將編碼本發明的嵌合蛋白之核苷酸序列嵌插至牛痘病毒基因體DNA中，其嵌插位址係容許抗原決定基的表現作用，但不損及牛痘病毒載體的生長或複製作用。所得的重組病毒可使用作為一疫苗調配物中的免疫原。除了重組病毒係不活化之外，該相同方法可用於建構一種不活化重組病毒疫苗調配物，諸如藉由技藝中所知的化學方式，及其係在使用作為一種免疫原之前及實質上不影響所表現的免疫原之免疫原性。該不活化重組疫苗可調配一種適宜的佐劑，以增強對於疫苗抗原的免疫反應。

本發明亦提供包括編碼本發明的一種嵌合或融合蛋白之一核苷酸序列之一核酸分子直接作為疫苗調配物之用途。可直接導入與一或多種調控元素運作連結之編碼該嵌合蛋白的核苷酸序列，以接種一個體(“直接基因轉移”)對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的病原性菌株。藉由技藝中的技術，諸如藉由靜脈內注射一種表現質體：陽離子性脂質體複合體[Zhu等人於1993年期刊“Science”第261期第209-211頁乙文]，已證實在一個經接種的個體中之直接基因轉移作用，造成經接種個體的細胞諸如血管內皮細胞以及主要器官的組織表現該基因物質。用於將載體DNA輸送進入一標的細胞中之其他有效方法係技藝中所知。在一實施例中，已使用含有病毒基因的純化重組質體DNA來接種(不論以非經腸方式、黏膜方式或經由基因槍免疫作用)疫苗，以誘發一種保護性免疫反應[Fynan等人於1993年期刊“Proc Natl Acad Sci USA”第90期第11478-11482頁乙文]。在另一實例中，可藉由技藝中所知的標準程序，將自一個體所移除的細胞轉染或電穿孔，而將重組載體DNA引入標的細胞中。然後可使用技藝中所知的方法，諸如藉由使用該載體所表現的一選擇標記，挑選含有該重組載體DNA的細胞，然後可將所挑選的細胞再度導入該個體中，以表現該重組蛋白。

在其他實施例中，提供包括如上述的一種抗微生物劑與免疫原之一藥學組成物。該組成物可進一步包括稀釋劑、賦形劑或載劑或用於治療與口腔感染相關的一病況或疾病之化學治療劑，及可適用於口服投藥。可將本發明的組成物納入含片或納入口香糖或其他產物中，如藉由攪拌置入溫熱的原膠中或塗覆一原膠的外表面，其等的例證為杰路頓(jelutong)膠、膠乳、乙烯基樹脂等，最好連同習用的塑化劑或軟化劑、糖或其他甜味劑或諸如葡萄糖、山梨糖醇等。

可製備本發明之含有上述藥學組成物的口服組成物，及以可施用至口腔的各種形式使用，諸如潔齒劑包括牙膏、牙粉及液態潔齒劑、漱口水、糖錠、口香糖、牙科用糊劑、牙齦按摩膏、漱口錠劑、乳製品及其他食物。依特定口服組成物之類型與形式而定，如本發明之一種口服組成物可進一步包括眾所周知的附加成分。

在本發明的一些較佳形式中，該口服組成物可為實質上液態性質，諸如一種漱口水或漱洗液。在該種製劑中，載劑通常為一種水-酒精混合物，及有利地包括如後述的一種保濕劑。水相對於酒精的重量比係一般位於約1：1至約20：1之範圍。在該類型製劑中的水-酒精混合物之總量，係通常位於該製劑之約70至約99.9重量%的範圍。該酒精通常為乙醇或異丙醇。其中較佳為乙醇。

本發明的液劑與其他製劑之pH值，係一般位於約5至約9之範圍，及通常約5.0至7.0。能以酸(如檸檬酸或苯甲酸)或鹼(如氫氧化鈉)控制pH值，或加以緩衝(如以檸檬酸鈉、苯甲酸鈉、碳酸鈉或碳酸氫鈉、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉等)。

在本發明的其他有利形式中，該藥學組成物可為實質上固態或糊狀性質，諸如牙粉、一種牙科用錠劑或一種牙膏(牙科用乳膏劑)或凝膠式潔齒劑。該固態或糊狀口服製劑之載劑，係一般含有牙科上可接受的拋光物質。

在牙膏中，該液態載劑可包含水與保濕劑，其量通常為該製劑之約10重量%至約80重量%。甘油、丙二醇、山梨糖醇及聚丙二醇係例示性的適宜保濕劑/載劑。水、甘油及山梨糖醇的液態混合物亦為有利的。在透明凝膠情況下，折射率係一重要考量，及較佳使用約2.5至30%重量/重量的水、0至約70%重量/重量的甘油及約20至80%重量/重量的山梨糖醇。

牙膏、乳膏劑及凝膠通常含有一種天然或合成的增稠劑或膠凝劑，其比例係約0.1至約10及較佳約0.5至約5%重量/重量。一種適宜的增稠劑係合成水輝石、一種合成的膠態鎂鹼金屬矽酸鹽複合體黏土及其例如能以拉波特工業(Laporte Industries Limited)有限公司所銷售之拉波奈特(Laponite)(如CP、SP2002、D)形式取得。拉波奈特D包含約為58.00重量%的二氧化矽、25.40重量%的氧化鎂、3.05重量%的氧化鈉、0.98重量%的氧化鋰及一些水與微量金屬。其真比重為2.53，及其在8%濕度之表觀總體密度為1.0克/毫升。

其他的適宜增稠劑包括愛爾蘭紅藻、角叉菜膠、黃著樹膠、澱粉、聚乙烯吡咯啶酮、羥基乙基丙基纖維素、羥基丁基甲基纖維素、羥基丙基甲基纖維素、羥基乙基纖維素(如能以納丘索(Natrosol)形式取得)、羧甲基纖維素鈉及膠態氧化矽諸如細磨型席洛德(Syloid)(如244)。亦可包括助溶劑，諸如保濕劑多元醇類諸如丙二醇、二丙二醇及己二醇；賽璐蘇(cellosolve)類諸如甲基賽璐蘇與乙基賽璐蘇；在一直鏈中含有至少約12個碳之植物油類與蠟類，諸如橄欖油、蓖麻油；及石蠟脂與酯類諸如乙酸戊酯、乙酸乙酯及苯甲酸苄酯。

將瞭解依據慣例，該口服製劑通常在經適宜標示的包裝中販售或以其他方式銷售。因此，一瓶的口腔漱洗液實際上將具有說明其作為口腔漱洗液或漱口水之標示，及具有使用說明；及牙膏、乳膏劑或凝膠將通常置於一種可擠軟管中，通常為鋁管、有襯裡的鉛管或塑膠管或用於調節控制內容物之其他擠壓、泵送或加壓分配器，其等實際上具有說明其作為牙膏、凝膠或牙科用乳膏劑之標示。

可在本發明的組成物中使用有機表面活性劑，以增加預防性作用，協助達成該活性劑在整個口腔中之徹底與完全的分散作用，及使得該等組成物之美觀上的可接受度更高。有機表面活性物質的性質較佳為陰離子性、非離子性或兩性，及較佳不與活性劑交互作用。較佳使用賦予該組成物清潔與發泡性質之一種清潔劑物質，作為表面活性劑。陰離子性表面活性劑的適宜實例為高級脂肪酸單甘油酯單硫酸鹽的水溶性鹽類，諸如氫化椰子油脂肪酸的單硫酸化單甘油酯之鈉鹽；高級烷基硫酸鹽類，諸如月桂基硫酸鈉；烷基芳基磺酸鹽類，諸如十二基苯磺酸鈉；高級烷基磺乙酸酯類；1,2-二羥基丙烷磺酸酯的高級脂肪酸酯類；及低級脂族胺基羧酸化合物之實質上飽和的高級脂族醯基醯胺類，諸如該等在脂肪酸、烷基或醯基自由基等中具有12至16個碳者。最後所提及的醯胺類之實例，係應實質上無皂之N-月桂醯基肌胺酸及N-月桂醯基、N-肉豆蔻醯基或N-棕櫚醯基肌胺酸的鈉、鉀與乙醇胺鹽類或類似的高級脂肪酸物質。適用的水溶性非離子性表面活性劑之實例，係環氧乙烷與具有長疏水鏈(如具有約12至20個碳原子的脂族鏈)的各種反應性含氫化合物之縮合產物，該縮合產物(“ethoxamers”)含有親水性聚氧乙烯部分，諸如聚(環氧乙烷)與脂肪酸類、脂肪醇類、脂肪醯胺類、多元醇類(如單硬脂酸去水山梨醇酯)及聚環氧丙烷(如普朗尼克物質)之縮合產物。

表面活性劑的存在量通常約為0.1至5重量%。值得注意之處在於表面活性劑可能有助於溶解本發明的活性劑，及藉此減少助溶性保濕劑的所需量。

在本發明的口服製劑中可納入各種其他物質，諸如增白劑、防腐劑、聚矽氧類、葉綠素化合物及/或氨化物質諸如尿素、磷酸二銨及其混合物。當該等佐劑存在時，其等在該製劑中的納入量係實質上不損及所期望性質與特性。

亦可使用任一適宜的調味劑或甜化物質。適宜的調味組分之實例為調味油類，如綠薄荷、薄荷、冬青、黃樟、丁香、鼠尾草、桉葉、馬鬱蘭、肉桂、檸檬與橘子的油及柳酸甲酯。適宜的甜味劑包括蔗糖、乳糖、麥芽糖、山梨糖醇、木糖醇、環己胺磺酸鈉、紫蘇糖、AMP(天冬胺醯基苯基丙胺酸甲基酯)、糖精等。適宜地，調味劑與甜味劑可各自或一起構成該製劑之約0.1%至5%以上。

可依據技藝中所知用於製造藥學組成物之任一方法，製備規劃供口服用的組成物，及該組成物可含有選自由甜味劑、調味劑、著色劑及防腐劑所組成之群組之一或多種作用劑，以提供藥學上優質與適口的製劑。錠劑含有與適用於製造錠劑之藥學上可接受的無毒性賦形劑摻合之有效成分。該等賦形劑可為例如惰性稀釋劑，諸如碳酸鈣、碳酸鈉、乳糖、磷酸鈣或磷酸鈉；粒化與崩解劑例如玉米澱粉或褐藻酸；黏合劑例如澱粉、明膠或阿拉伯膠；及潤滑劑例如硬脂酸鎂、硬脂酸或滑石。該等錠劑可未經塗覆或可藉由已知技術塗覆，以延緩在胃腸道或牙周囊袋中的崩解與吸收作用，及藉此提供長時間的持續作用。例如可使用一種延時物質，諸如單硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯。

供口服用的調配物亦可能以硬質明膠膠囊的形式存在，其中該有效成分係與一種惰性固態稀釋劑例如碳酸鈣、磷酸鈣或高嶺土混合；或以軟質明膠膠囊形式存在，其中該有效成分係與水或一種油介質例如花生油、液態石蠟或橄欖油混合。

含水的懸液劑係含有活性物質及摻合適用於製造含水懸液劑的賦形劑。該等賦形劑為懸浮劑，例如羧甲基纖維素鈉、甲基纖維素、羥丙基甲基纖維素(hydropropyl methylcellulose)、褐藻酸鈉、聚乙烯吡咯啶酮、黃著樹膠及阿拉伯膠；分散劑或濕潤劑可為一種天然存在的磷脂，例如卵磷脂；或一種環氧烷與脂肪酸的縮合產物，例如聚氧乙烯硬脂酸酯；或環氧乙烷與長鏈脂族醇類的縮合產物，例如十七碳乙烯氧鯨蠟醇；或環氧乙烷與衍生自脂肪酸與己糖醇的偏酯之縮合產物，諸如聚氧乙烯山梨糖醇單油酸酯；或環氧乙烷與衍生自脂肪酸與己糖醇酐的偏酯之縮合產物，例如聚乙烯去水山梨醇單油酸酯。

含水的懸液劑亦可含有一或多種防腐劑或抗微生物劑，例如苯甲酸酯類諸如乙基或正丙基對-羥基苯甲酸酯，另一實例為葡萄糖酸氯已啶；一或多種著色劑、一或多種調味劑及一或多種甜味劑諸如蔗糖或糖精。

可藉由將有效成分懸浮於一種植物油類例如花生油、橄欖油、芝麻油或椰子油中，或懸浮於一種礦物油諸如液態石蠟中，而配製含油懸液劑。該含油懸液劑可含有增稠劑，例如蜂蠟、硬石蠟或鯨蠟醇。甜味劑係如上所說明者，及可添加調味劑以提供適口性口服製劑。可藉由添加抗氧化劑諸如抗壞血酸，而保存該等組成物。

4.套組

在特定的實施例中，提供一套組，其包括：

-用於移除該個體口腔組織的實質上所有微生物或其片段之抗微生物劑；

該套組係適用於上述方法中。

該套組可包括：

-以一種抗微生物劑與免疫原中之一或多者的形式裝有一治療組成物之一容器；

-具有使用說明之一標籤或仿單。

在特定的實施例中，當用於此述的一種方法或用途時，提供一套組。

在特定的實施例中，該套組可包含用於治療一疾病或病況之一或多種其他活性要素或成分。

該套組可包含一容器及置於該容器上或伴隨該容器的一標籤或仿單。適宜的容器包括例如瓶、管形瓶、注射器、氣泡包裝等。該等容器可自多種物質諸如玻璃或塑膠形成。該容器裝有一種有效用於治療該病況的治療組成物，及可具有一個無菌存取孔(例如該容器可為具有皮下注射針頭可刺穿的塞子之一種靜脈內溶液袋或一管形瓶)。該標籤或仿單表明該治療組成物係用於治療所選擇的病況。在一實施例中，該標籤或仿單包括使用說明及表明該治療組成物可用於治療特定疾病或病況。

該套組可包含(a)一治療組成物；及(b)其中含有一種第二活性要素或成分之第二容器。本發明的該實施例中之套組可進一步包含一仿單，其表明該活性要素與其他活性要素可用於治療源自一特定感染之一疾患或預防一併發症。任擇地或附加地，該套組可進一步包括一個第二(或第三)容器，其中包含一種藥學上可接受的緩衝劑，諸如注射用的抑菌水(BWFI)、經磷酸鹽緩衝的食鹽水、林格氏(Ringer)溶液及右旋葡萄糖溶液。其可進一步包括自商業與使用者觀點而言有利的其他物質，包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針頭及注射器。

藉由下列實例進一步說明本發明，該等實例之納入係為了例證而非限制本發明。

第1例

方法與材料

細菌菌株與生長條件。牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)W50的冷凍乾燥培養物，係在增補5微克/毫升的氯高鐵血紅素、0.5微克/毫升的半胱胺酸之溶胞馬血瓊脂平皿上，以厭氧方式於37℃生長(HB瓊脂，<10繼代培養)。在3至4天後，使用菌落接種含有5微克/毫升的氯高鐵血紅素、0.5微克/毫升的半胱胺酸之腦心浸出物培養基(1)。批式培養物係以厭氧方式在MK3厭氧工作站(Anaerobic Workstation)(澳洲阿德萊德(Adelaide)的唐惠特利科技(Don Whitley Scientific Ltd.)有限公司)中生長。在厭氧工作站中，在指數生長期之期間，藉由離心作用(於4℃與7500 g進行30分鐘)採收細胞，及以PG緩衝液清洗二次(50 mM Tris鹽酸鹽、150 mM氯化鈉、5 mM氯化鈣及5 mM半胱胺酸-鹽酸，pH 8.0)。使用一種分光光譜儀(珀金埃爾默(Perkin-Elmer)公司之型號295E)，在650奈米監測批式培養物之生長。藉由格蘭氏(Gram)染色法、顯微鏡檢查及依據Slots(2)使用多種生物化學試驗，例行地檢驗培養物純度。

含有黏連蛋白序列與N端添加Kgp蛋白酶序列的黏連蛋白序列之pET28建構物的建構作用。代表活性位址(AS)與KgpA1黏連蛋白(A1)域的肽與嵌合肽之Kgp殘基，係使用pET表現載體(諾凡基(Novagen)公司)而在大腸桿菌(E. coli)中以具有六組胺酸標籤的重組(r)蛋白形式過度表現。所表現的r-蛋白為rKAS2與rKLA1，及r-嵌合蛋白為rKAS2-KLA1、RKAS1-KsA1及rKAS4-KAS3-KAS5-KAS6-KLA1(亦稱作多重KAS-KLA1)。代表不同的A1與AS域之胺基酸序列，係述於第1與2表中。

使用第4表中所列之引子、TaqDNA聚合酶(英杰(Invitrogene)公司)及一種PC-960熱循環器(柯貝特(Corbett Research Technologies)公司)，分別自pNS1(pUC18中之3.5kb的BamHI lys片段)或牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)基因體DNA，擴增kgp基因的各種KAS與KA1域。採用下列的反應條件，使用引子對KAS2-FOR與KAS2-REV及KLA1-FOR與KLA1-REV，而分別產生編碼KAS2與KLA1的PCR片段：於94℃達3分鐘；接著28個於94℃達45秒(變性)、於62℃達40秒(黏合)及於72℃達20秒(延伸)之循環；接著一個於72℃達5分鐘之最終循環。

藉由如下之重疊延伸的基因剪接法(SOEing)，產生KAS2-KLA1嵌合PCR產物：採用上述條件，使用引子對KAS2-FOR與KAS2-KLA1-嵌合體-REV及KAS2-KLA1-嵌合體-FOR與KLA1-REV，產生PCR產物。然後將PCR產物黏合，及以引子KAS2-FOR與KLA1-REV進行最終的PCR(於94℃達2分鐘，接著28個於94℃達30秒、於50℃達30秒及於72℃達40秒之循環，接著一個於72℃達5分鐘之最終循環。

為製備KAS1-KsA1 PCR產物，接連使用KAS1-KsA1-REV引子與KAS1-KsA1-FOR引子1與2中之各者，而進行二個連續的PCR(反應條件係於94℃達2分鐘及接著35個於94℃達15秒、於63℃達30秒及於72℃達2分鐘之循環)，以產生KAS1-KsA1 PCR產物。KAS1-KsA1-FOR1與KAS1-KsA1-FOR2引子具有重疊前一個PCR產物的5’之3’延伸作用。

為製備多重KAS-KLA1 PCR片段，接連使用多重REV引子與多重FOR引子1、2、3及4中的各者，進行4個連續的PCR(反應條件係於95℃達2分鐘及接著35個於95℃達20秒、於68℃達1.5分鐘之循環)，以產生多重KAS-KLA1 PCR產物。各個多重FOR引子具有重疊前一個PCR產物的5’之3’延伸作用。

依照製造廠商的操作程序，使用PCR純化管柱(凱傑(Qiagen)公司)將編碼KAS2、KLA1、KAS2-KLA1、KAS1-KsA1及多重KAS-KLA1的所有PCR片段純化，接合至TA選殖載體pGem-T Easy(普洛麥格(Promega)公司)中，及轉形至大腸桿菌(E. coli)JM109中。依照製造廠商之說明，以NcoI與XhoI分解純化後的重組pGemT-Easy建構物，及定向植入經NcoI/XhoI分解的pET28b(諾凡基(Novagen)公司)中，及轉形至非表現型大腸桿菌(E. coli)JM109[DH5α]中。將重組pET28建構物純化及轉形至大腸桿菌(E. coli)表現宿主BL21(DE3)[HMS174(DE3)](諾凡基(Novagen)公司)中，及在含有50微克的康黴素之LB上進行篩選。藉由DNA序列分析，確認各嵌插物之完整性。

寡核苷酸引子(第4表)係經設計在需要之處納入限制酵素位址、終止密碼子及六組胺酸標籤。用於rKAS2、RKLA1及rKAS2-KLA1的引子之設計，係限制r-蛋白中所納入的外來編碼序列不超過三個胺基酸加上該六組胺酸標籤。rKAS1與rKLA1之設計係分別在N端與C端含有一個六組胺酸標籤，藉此其等可直接與在N端與C端均具有一個六組胺酸標籤之rKAS2-KLA1比較。在rKAS1-KsA1與多重KAS-KLA1中，組胺酸標籤係位於C端。

重組蛋白之表現作用與純化作用。藉由異丙基β-D-硫代半乳糖苷酶(IPTG)的誘導作用，自pET28::KLA1(KAS2、KAS2-LA1、KAS1-SA1、多重KAS-KLA1)建構物表現重組蛋白。所產生的所有重組蛋白係6-組胺酸標籤融合蛋白之形式，及在變性條件下，以鎳-NTA純化系統(英杰(Invitrogene)公司)純化。簡而言之，在37℃，使用大腸桿菌(E. coli)(DE3)單菌落轉形體，接種含有50微克/毫升的康黴素之20毫升的盧瑞亞-貝爾塔尼(LuriaBertani)(LB)培養基，及置於軌道式振盪器上過夜。然後使用該接種體接種含有50微克/毫升的康黴素之1公升LB。讓該培養物的OD₆₀₀達到0.5至0.7(對數中期)，然後在37℃及200 rpm的振盪作用下，以0.1 mM的異丙基IPTG誘發蛋白表現作用2小時。採收(7,500g)細胞及再懸浮於一種變性結合緩衝液(8M尿素、pH 8.0的20 mM磷酸鈉及500 mM氯化鈉)中，及使用微端設定為3之一種必能信(Branson)超音波(Sonifier) 250型細胞破碎機(美國康乃迪克州丹伯里(Danbury)之必能信超音波(Branson Ultronics)公司)，在冰上以30秒間隔進行3x15秒破裂之音波處理，然後在4℃及39,000 g離心30分鐘。藉由將上清液添加至一個預先平衡的鎳-NTA瓊脂管柱，然後以變性清洗緩衝液(8M尿素、pH 6.0的20 mM磷酸鈉及500 mM氯化鈉)清洗而洗提出未結合的蛋白，藉此自上清液純化重組蛋白。然後使用10倍體積的結合緩衝液B清洗該管柱，及以變性洗提緩衝液(8M尿素、pH 6.0的20 mM磷酸鈉、500 mM氯化鈉及0.5M咪唑)洗提該重組蛋白。以2M尿素-PBS透析經純化的蛋白，及儲存於-80℃。

重組蛋白試樣係藉由SDS-PAGE分析，及使用線上的ProtParam(http://au.expasy.org/tools/protparam.html)測定其等的分子質量。藉由使用BSA作為一標準品之伯瑞(Bio-Rad)蛋白分析法，測定所有試樣的蛋白質濃度。

免疫作用與小鼠牙周炎模式。如先前所述(3)進行小鼠牙周炎實驗，及獲得墨爾本大學的動物實驗倫理委員會之核准。安置在微隔離箱之6至8星期大的BALB/c小鼠(每組12隻小鼠)，係以皮下(皮下注射100微升)方式，以50微克之重組蛋白或RgpA-Kgp複合體中之一者、2x10⁹個牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50的福馬林殺死型細胞或PBS進行免疫接種；各抗原係在佛氏(Freund)不完全佐劑(IFA)中乳化。30天之後，在小鼠中補強抗原(皮下注射位於IFA中的乳化形式)，然後在12天後自延髓後血管叢放血。在第二次免疫接種之4天後，對於小鼠投予置於隨意取用的去離子水中之1毫克/毫升的康黴素(澳洲新南威爾斯的西克瑪艾爾迪希(Sigma-Aldrich)公司)達7天。在抗生素治療之3天後(放血之2天後)，每隔2天以位於含有2%(重量/體積)羧甲基纖維素(CMC；澳洲新南威爾斯的西克瑪艾爾迪希公司)的PG緩衝液(50 mM Tris鹽酸鹽、150 mM氯化鈉、5 mM氯化鈣及5 mM半胱胺酸鹽酸鹽，pH8.0)中之1x10¹⁰個活的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50(25微升)接種小鼠四次，及一對照組係以僅含有2%(重量/體積)CMC的PG緩衝液假感染。在厭氧操作箱中製備接種體，及立即施用至大臼齒的牙齦緣。二個星期之後，小鼠領受另外4個劑量(間隔2天)之位於含有2%(重量/體積)CMC的PG緩衝液中之1x10¹⁰個活的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(25微升)。藉由在血液瓊脂上之計數，而驗證各接種體中的活菌數目。小鼠係餵食一種軟質粉狀飼料(澳洲的巴拉斯多(Barastock)公司)，及安置在裝配有提高的金屬絲網底部以避免接觸襯墊之籠中。在最後劑量之4個星期後，小鼠自延髓後血管叢放血及犧牲，及移除上頜骨及將其對切，其中一半(右半)係用於測量齒槽骨質流失，及另一半(左半)係用於即時PCR。

在去離子水中蒸煮右半邊的上頜骨(1分鐘)，以機械方式除肉，及浸泡於2%(重量/體積)的氫氧化鉀(於25℃達16小時)。然後清洗半邊的上頜骨(以去離子水清洗二次)，及浸泡於3%(重量/體積)的過氧化氫(於25℃達6小時)。半邊的上頜骨在清洗(以去離子水清洗二次)之後，以0.1%(重量/體積)的含水甲基藍染色，及使用奧立西亞(OLYSIA)第3.2版生物報導(BioReport)軟體(澳洲新南威爾斯之澳洲奧林巴斯(Olympus)私人有限公司)，以裝在解剖顯微鏡上的奧林巴斯(Olympus) DP12數位相機拍攝各半邊上頜骨的頰面觀之數位影像，以評估水平骨質流失。水平骨質流失係發生在垂直於齒槽骨嵴(ABC)的水平面，而造成嵴高度降低之流失。將各半邊的上頜骨對齊，藉此將各牙齒影像的大臼齒頰阜與舌阜重疊；及該影像係在框上的微米尺度存在下拍攝，藉此可標準化各影像之測量。使用奧立西亞(OLYSIA)第3.2版生物報導(BioReport)軟體的成像軟體，測量各大臼齒自牙骨質釉質交界至ABC之面積。骨質流失測量係由單一審查人使用一種隨機化盲式操作程序測定二次。

藉由ELISA測定亞型抗體。以三重複方式進行酵素結合免疫吸附分析法(ELISA)而測定小鼠血清的亞型抗體反應，其係使用位於含有0.1%(體積/體積)妥文(Tween)20(PBST)及pH 7.0的經磷酸鹽緩衝的食鹽水(PBS)(0.01M磷酸氫二鈉、1.5 mM磷酸二氫鉀、0.15M氯化鈉)中之福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis) W50的5微克/毫升溶液，塗佈平底式聚乙烯基微量滴定盤的孔(美國維吉尼亞州麥克林(McLean)的戴納泰克實驗室(Dynatech Laboratories)公司)。在移除該塗佈溶液之後，在孔中添加含有2%(重量/體積)脱脂奶粉之PBST，以在室溫中封阻未塗佈的塑料1小時。以PBST清洗各孔四次之後，在各孔中添加小鼠血清在含有0.5%(重量/體積)脱脂奶(SK-PBST)的PBST中之系列稀釋液，及於室溫中培養16小時。以PBST清洗各孔六次之後，在SK-PBST中添加經1/2,000稀釋作用之對抗小鼠IgM、IgA、IgG1、IgG2a、IgG2b或IgG3的山羊IgG(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及讓其在室溫中結合2小時。以PBST清洗平皿六次，在各孔中添加位於SK-PBST中之經1/5,000稀釋作用的辣根過氧化酶接合型兔抗山羊免疫球蛋白(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及在室溫中培養1小時。以PBST清洗各孔六次之後，藉由在各孔中添加100微升的ABTS受質[pH 4.0之位於含有0.005%(體積/體積)過氧化氫的80 mM檸檬酸中之0.9 mM的2,2’-聯氮基-雙-(3-乙基苯并噻唑啉-6)磺酸]，而檢測結合抗體。使用一種微量平皿讀數器(伯瑞(Bio-Rad)微量平皿讀數器型號450)，測量在415奈米的光學密度。

SDS-PAGE凝膠電泳及西方墨點法。使用XCell Surelock小型槽式電泳系統，分析重組蛋白(10微克)。重組蛋白係與20微升的還原型試樣緩衝液(10%[重量/體積]SDS、0.05%[重量/體積]溴酚藍、25%[體積/體積]甘油及0.05%[體積/體積]2-巰基乙醇)混合。以1.5M Tris鹽酸鹽將pH值調整至pH 8.0，然後該溶液在100℃加熱5分鐘。將重組蛋白(10微克/道)添加至諾維科斯(Novex) 12%(重量/體積)Tris-甘胺酸預製小型凝膠上，及使用一種諾維科斯(Novex)電泳系統(美國加州聖地牙哥的諾維科斯(Novex)公司)，使用30至50毫安培的電流及125伏特的電位差進行電泳。使用0.25%重量/體積的考馬斯(Coomassie)藍R250，而使蛋白顯現。

Kgp蛋白酶活性位址肽(KAS-2)序列之抗原決定基分析。藉由使用Fmoc化學之準固相肽合成程序，在一種多中心型肽合成作用系統(澳洲墨爾本的開隆技術(Chiron Technologies)公司)上，合成N端生物素化的重疊性八殘基肽(偏移一個殘基及重疊七個殘基)(澳洲墨爾本的開隆技術公司)，而測定用於具離胺酸特異性的蛋白酶活性位址肽KAS2(序列辨識編號：28的433至468)之抗體結合位址。位於pH 7.4的0.1M PBS中之生物素化肽(5微克/毫升)，係於4℃與經鏈黴卵白素塗佈的平皿(澳洲新南威爾斯的能肯(Nunc)公司)結合過夜。以PBST清洗各孔四次之後，依據開隆技術公司之說明，使用位於含有0.1%體積/體積妥文(Tween) 20(SK-PBST)之pH 7.4的0.1M PBS之1%重量/體積的無脂肪脱脂奶粉中之經1：1000稀釋作用的小鼠血清，藉由ELISA進行平皿結合型肽的抗原決定基之圖譜製作。以PBST清洗各孔六次之後，在SK-PBST中添加經1/2,000稀釋作用之對抗小鼠IgG的山羊IgG(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及讓其在室溫中結合2小時。以PBST清洗平皿六次，在各孔中添加位於SK-PBST中之經1/5,000稀釋作用的辣根過氧化酶接合型兔抗山羊免疫球蛋白(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及在室溫中培養1小時。以PBST清洗各孔六次之後，藉由在各孔中添加100微升的ABTS受質[pH 4.0之位於含有0.005%(體積/體積)過氧化氫的80 mM檸檬酸中之0.9 mM的2,2’-聯氮基-雙-(3-乙基苯并噻唑啉-6)磺酸]，而檢測結合抗體。使用一種微量平皿讀數器(伯瑞(Bio-Rad)微量平皿讀數器型號450)，測量在415奈米的光學密度。

統計分析。使用單因子變異數分析(ANOVA)與唐奈特氏(Dunnett) T3檢定(供視窗(Windows)使用之SPSS第12版)，進行骨質流失數據之統計分析。使用採用SPSS軟體(供視窗使用之SPSS第12版)之學生t檢定，統計分析IgA、IgM及IgG亞型抗體力價。

第2例

重組蛋白(KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及KAS2-KLA1)之特徵分析與純化作用。為進行Kgp黏連蛋白A1域片段及嵌合體Kgp蛋白酶與Kgp黏連蛋白A1域片段對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)感染的保護能力之特徵分析，吾等表現與純化下列重組蛋白：KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及KAS2-KLA1。使用鎳螯合親和力層析法，自包涵體純化重組蛋白(KsA1與KLA1)及組嵌合體蛋白(KAS1-KsA1與KAS2-KLA1)；及藉由SDS-PAGE分析純化後的蛋白(第1圖)。各個純化後的重組蛋白係構成具有對應於KAS2-KLA1、KLA1、KsA1及KAS1-KsA1的分子量40、36、31及32千道爾頓之一個主要的蛋白帶狀，及該等重量係對應於使用ProtParam所計算之組胺酸標籤重組蛋白的分子質量。為進行重組蛋白的免疫原性之特性分析，使用KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及KAS2-KLA1免疫接種小鼠，及使用血清來探測經KAS2肽塗佈的平皿及經福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞塗佈的平皿(第2圖)。發現重組嵌合體蛋白KAS1-KsA1與KAS2-KLA1抗血清辨識KAS2肽(第2A圖)，及其水平係與KAS2特異性抗血清(KAS2-白喉類毒素接合物)以及福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞相近(第2B圖)。然而，對抗重組蛋白KLA1的抗血清僅辨識殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(第2B圖)。

第3例

重組蛋白(KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及KAS2-KLA1)的免疫接種作用在小鼠牙周炎模式中對於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)所誘發的齒槽骨質流失之效應。使用以Baker 等人的報導(4)為基礎之一種牙周骨質流失的改良式小鼠模式，使用重組蛋白KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及 KAS2-KLA1、福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50及RgpA-Kgp複合體，以測定與比較所引發對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)誘發型齒槽骨質流失之保護作用。以重組蛋白KsA1、KLA1、KAS1-KsA1或KAS2-KLA1、RgpA-Kgp複合體或福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50(FK-W50)細胞或僅PBS佐劑免疫接種小鼠(第0天與第30天)，然後以口服方式進行活的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis) W50之刺激。以重組抗原、RgpA-Kgp複合體及FK-W50細胞中之所有者所進行之免疫接種作用，保護BALB/c小鼠免於牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)所誘發的齒槽骨質流失，因該等動物所展現的骨質流失係顯著(p<0.001)低於經PBS免疫接種組(第3圖)。然而，經KAS2-KLA1免疫接種的小鼠之骨質流失，係顯著低於經KLA1(p<0.01)、KsA1(p<0.001)、RgpA-Kgp複合體(p<0.001)、FK-W50細胞(p<0.001)免疫接種的小鼠及非刺激型小鼠(p<0.001)。經KAS2-KLA1與KAS1-KsA1免疫接種的小鼠之間，其等的骨質流失並無顯著差異。而且，經KAS1-KsA1免疫接種的小鼠所展現之骨質流失，係顯著低於非刺激型小鼠(p<0.01)與經RgpA-Kgp複合體免疫接種的小鼠(p<0.05)，但與經KsA1、KLA1與FK-W50免疫接種的小鼠並無顯著不同。在經KsA1、KLA1、RgpA-Kgp複合體及FK-W50免疫接種的小鼠之間，其等的骨質流失並無顯著不同。

第4例

在小鼠牙周炎模式中藉由重組蛋白(KsA1、KLA1、KAS1-KsA1及KAS2-KLA1)的免疫接種作用所引發的抗體亞型反應。在口腔接種活的牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)細胞之刺激之前與之後，將小鼠放血及藉由離心作用收集血清。第4圖顯示在小鼠牙周炎模式中，就各免疫原(KsA1、KLA1、KAS1-KsA1或KAS2-KLA1或福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50(FK-W50)細胞)而言之對於福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞的抗體亞型反應性。所有的保護性免疫原皆誘發對於FK-W50的高IgG抗體力價。而且，各保護性免疫原所誘發的主要抗體亞型為IgG1，及僅微弱的免疫反應性IgG2a、IgG2b及IgG3 FK-W50-特異性抗體(第4圖)。各免疫原在口腔接種之前(第4A圖)與口腔接種之後(第4B圖)所誘發的主要抗體亞型為IgG1。

第5例

KAS2(433-468)之抗原決定基圖譜製作。合成用於KAS2(433至468)的重疊性生物素化八殘基肽(偏移一個殘基及重疊七個殘基)，及用於塗覆經鏈黴卵白素塗佈的平皿。然後使用來自經KAS1-KsA1、KAS2-KLA1及KAS2-白喉類毒素接合物免疫接種的小鼠之抗血清，辨識抗體結合抗原決定基(第5圖)。將光學密度(415奈米)高於背景之二倍增加，視為陽性抗體反應(OD閾值)。抗血清係辨識衍生自序列辨識編號28的下列肽序列：即KAS1-KsA1辨識肽435-442、436-443、445-452、446-453及447-454(OD閾值=0.07，第5A圖)，而KAS2-KLA1辨識肽435-442、447-454及448-455(閾值ID=0.07，第5A圖)。其暗示辨識數個最小抗原決定基，即肽436-442(VSFANYT及其變異體VGFAN YT)、肽447-452(ETAWAD及其變異體ETSWAD)及肽448-453(TAWADP及其變異體TSWADP)。包含肽436-442抗原決定基之肽係包括GVSFANYT、GVGFANYT、VSFANYTA及VGFANYTA。包含肽447-452及/或448-453抗原決定基之肽係包括SETAWAD、SETSWAD、ETAWADP、ETSWADP、TAWADPL及TSWADPL，更詳細地GSETAWAD、GSETSWAD、SETAWADP、SETSWADP、ETAWADPL、ETSWADPL、TAWADPLL及TSWADPLL。

第6例

用於與一蛋白接合的KAS與RAS肽之合成作用

肽係以手動方式或使用一種CEM微波肽合成器合成。全程使用供Fmoc化學所用之標準固相肽合成程序。使用林克(Rink)連接子所衍生的AM-sure樹脂(美國肯塔基州的愛波泰克(AAPPTEC)公司)，將肽組合成羧基醯胺形式。使用4當量的Fmoc-胺基酸與6當量的DIPEA，藉由HBTU/HOBt活化作用而完成偶合作用。藉由位於1M HOBt/DMF中的20%哌啶移除Fmoc基。

帶有KAS或RAS肽之樹脂係在DMF中膨脹，及藉由位於含有2%體積/體積的哌啶之DMF中之2%體積/體積的DBU，移除N端Fmoc基。然後使用5當量的SAMA-Opfp與5當量的HOBt，以S-乙醯基巰基乙酸(SAMA)基衍生N端胺基。藉由三硝基苯磺酸(TNBSA)試驗監測該反應。當TNBSA試驗為陰性時，清洗樹脂(5xDMF、3xDCM及3x二乙醚)。然後在真空中乾燥樹脂。依肽的精胺酸含量而定，使用TFA：苯酚：TIPS：EDT：水(92：2：2：2：2)切開雞尾酒2.5小時或4小時，而將肽自樹脂載體切開。在切開之後，藉由過濾作用移除樹脂，及在氮氣流下將濾液濃縮至約1毫升。肽產物在冷的乙醚中沉澱之後，將其等離心及清洗三次。將肽沉澱物溶於含有0.1%體積/體積的TFA之5至10毫升的水中，及藉由離心移除不溶性殘餘物。藉由RP-HPLC純化該等肽。

可使用數種不同的化學部分而衍生用於與蛋白接合之肽，其等將引入反應性基團諸如鹵化物(溴代基、氯代基及碘代基)、馬來醯亞胺基、琥珀醯亞胺基、肼基、肟、硫醇，其等然後可經由其本有的半胱胺酸殘基或已衍生具有之容許化學接合作用進行的互補性反應基團，將所衍生的肽與一蛋白諸如KgpA1接合，而形成一種肽-蛋白接合物。

SAMA-肽與KA1之接合作用。在含有位於經磷酸鹽緩衝的食鹽水(0.1M磷酸鈉、0.9%氯化鈉及pH 7.4)中之10毫克/毫升之RgpA-Kgp複合體的重組KA1或其他黏連蛋白域之一溶液中，添加0.1毫升之位於DMF中的間-馬來醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯(MBS)之1%重量/體積溶液。在30分鐘後，移除未反應的MBS，及使用在接合緩衝液(0.1M磷酸鈉、5 mM EDTA及pH 6.0)中平衡之一個PD10管柱(澳洲新南威爾斯的法瑪西亞(Pharmacia)公司)，藉由凝膠過濾作用收集經MBS改質的KA1。將純化後的SAMA-肽(1.3微莫耳)溶於含有0.5M Tris及pH 6.0的2 mM EDTA之200微升的6M鹽酸胍中；及以800微升的MilliQ水稀釋，及藉由添加溶於MilliQ水中之25微升的2M羥胺(40當量)而在原地進行去保護作用。所收集的MBS-KA1立即與經去保護的SAMA-肽反應，及在室溫攪拌1小時。使用在pH 7.4的PBS中平衡之一個PD10管柱，藉由凝膠過濾作用將肽-KA1接合物與未反應的肽分離，及加以冷凍乾燥。使用愛爾曼氏(Ellmans)試驗監測該反應。

第7例

抗體之製備作用。藉由皮下投予的蛋白之免疫接種作用，在小鼠中產生對於重組蛋白之多株抗血清。在第0天以佛氏(Freund)不完全佐劑中的25微克蛋白及在第30天以佛氏(Freund)不完全佐劑中的25微克蛋白免疫接種小鼠。使用標準程序進行免疫接種作用。獲得具有對抗該蛋白的高力價之多株抗血清。若需要，則使用標準程序獲得以特異性方式對抗重組蛋白之單株抗體。

第8例

用於產生抗體之免疫作用。6至8星期大的BALB/c小鼠或CD1(瑞士遠交系小鼠)(每組10隻小鼠)，係以皮下方式投予(皮下注射100微升)的50微克KAS2-LA1嵌合體免疫接種，及抗原係在佛氏(Freund)不完全佐劑(IFA)中乳化。30天之後，在小鼠中補強抗原(皮下注射位於IFA中的乳化形式)，及在12天犧牲小鼠及自心臟放血而收集血清。

藉由ELISA測定亞型抗體。以三重複方式進行酵素結合免疫吸附分析法(ELISA)而測定小鼠血清的亞型抗體反應，其係使用位於含有0.1%(體積/體積)妥文(Tween) 20(PBST)及pH 7.0的經磷酸鹽緩衝的食鹽水(PBS)(0.01M磷酸氫二鈉、1.5 mM磷酸二氫鉀、0.15M氯化鈉)中之KAS2-LA1嵌合體或福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis) W50或RgpA-Kgp複合體的5微克/毫升溶液，塗佈平底式聚乙烯基微量滴定盤的孔(美國維吉尼亞州麥克林(McLean)的戴納泰克實驗室(Dynatech Laboratories)公司)。在移除該塗佈溶液之後，在孔中添加含有2%(重量/體積)脱脂奶粉之PBST，而在室溫中封阻未塗佈的塑料1小時。以PBST清洗各孔四次之後，在各孔中添加小鼠血清在含有0.5%(重量/體積)脱脂奶(SK-PBST)的PBST中之系列稀釋液，及於室溫中培養16小時。以PBST清洗各孔六次之後，在SK-PBST中添加經1/2,000稀釋作用之對抗小鼠IgM、IgA、IgG1、IgG2a、IgG2b或IgG3的山羊IgG(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及讓其在室溫中結合2小時。以PBST清洗平皿六次，在各孔中添加位於SK-PBST中之經1/5,000稀釋作用的辣根過氧化酶接合型兔抗山羊免疫球蛋白(澳洲新南威爾斯的西克瑪公司)，及在室溫中培養1小時。以PBST清洗各孔六次之後，藉由在各孔中添加100微升的ABTS受質[pH 4.0之位於含有0.005%(體積/體積)過氧化氫的80 mM檸檬酸中之0.9 mM的2,2’-聯氮基-雙-(3-乙基苯并噻唑啉-6)磺酸]，而檢測結合抗體。使用一種微量平皿讀數器(伯瑞(Bio-Rad)微量平皿讀數器型號450)，測量在415奈米的光學密度。

藉由重組蛋白KAS2-KLA1的免疫接種作用所誘發之抗體亞型反應。CD1(瑞士)小鼠係經KAS2-LA1嵌合體免疫接種，放血及藉由離心收集血清。第6圖顯示對於KAS2-LA1嵌合體、福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis) W50細胞及RgpA-Kgp複合體之抗體亞型反應性。KAS2-LA1嵌合體誘發強力的IgG抗體及其主要的IgG1抗體反應係辨識KAS2-LA1嵌合體，及與福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis) W50細胞及RgpA-Kgp複合體強烈地交叉反應(第6圖)。而且，KAS2-LA1嵌合體僅誘發弱的免疫反應性IgG2a、IgG2b及IgG3抗原特異性抗體(第6圖)。

第9例

建立Kgp結構模式及識別可達活性位址表面之序列

吾等的研究已顯示Kgp蛋白酶活性位址肽係具有高度免疫原性，及引發對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)所誘發的骨質流失之高水平保護作用。為試圖識別出作為疫苗候選者之其他蛋白酶活性位址肽，使用Sybyl7.3內的Orchestrar軟體組，建立Kgp的催化域模式(第7圖)。該模式係以來自牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)之RgpB蛋白酶的PDB結構1crv為基礎，該蛋白所具有的成對一致性為23.58%及Z分數為25.09(一種高信賴度模式)。Meta-PPisp蛋白交互作用伺服器預測Kgp的二個蛋白-蛋白交互作用表面：受質結合表面(如在RgpB中者)及Kgp所特有的第二表面。RgpB與Kgp模式之間的主要差異，係在於在Kgp中無法模式化之構成第二交互作用表面的環及一個具有19個殘基的間隙(纈胺酸526至苯丙胺酸545)係落在第二交互作用表面內。第7圖顯示Kgp模式，其中較厚的帶狀係顯示Kgp之蛋白酶活性位址周圍的可達表面序列，發現該等可達表面序列係天門冬胺酸388-麩醯胺394、白胺酸421-丙胺酸423、丙胺酸443-麩胺酸447與丙胺酸451、天冬醯胺酸510-色胺酸513及異白胺酸570-甘胺酸577與酪胺酸580。自該模式(第6圖)明顯可見，連同KAS2(A)的其他三種序列KAS4(天門冬胺酸388-纈胺酸395)(B)、KAS5(天冬醯胺酸510-天門冬胺酸516)(C)及KAS6(異白胺酸570-色胺酸580)(D)係顯著的，及其長度足以作為疫苗標的。因此，可產生一種重組嵌合體蛋白，其依序具有該等肽中的各者及連接至KLA1的N端，以產生多重KAS-KLA1，其可用於引發一免疫反應及因此保護對抗牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)的相關疾病或病況。

第10例

用於模式化精胺酸-X-蛋白酶來識別側臨催化性位址的免疫原性區域之方法

依據Eichinger A、Beisel HG、Jacob U、Huber R、Medrano FJ、Banbula A、Potempa J、Travis J、Bode W.於1999年10月15日期刊“EMBO J.”第18(20)期第5453-62頁之“牙齦菌蛋白酶R之晶體結構：具有一種凋亡蛋白酶樣摺疊之一種精胺酸特異性細菌半胱胺酸蛋白酶(Crystal structure of gingipain R: an Arg-specific bacterial cysteine proteinase with a caspase-like fold)”乙文中之方法，測定精胺酸-X蛋白酶的三維結構。

第11例

下列係一種含有抗體的牙膏調配物之一實例。

第12例

下列係一種牙膏調配物之一實例。

第13例

下列係一種牙膏調配物之一實例。

第14例

下列係一種牙膏調配物之一實例。

第15例

下列係一種液態牙膏調配物之一實例。

第16例

下列係一種漱口水調配物之一實例。

第17例

下列係一種漱口水調配物之一實例。

第18例

下列係一種含片調配物之一實例。

第19例

下列係一種牙齦按摩膏調配物之一實例。

第20例

下列係一種口香糖調配物之一實例。

第21例

下列係一種藥學調配物之一實例。

第22例

下列係一種牙周凝膠調配物之一實例。

第23例

下列係一種牙周凝膠調配物之一實例。

應瞭解雖然在此已詳細說明本發明，該等實例僅用於說明之目的。該等嫻熟分子生物學、牙科診斷及相關學科技藝者所顯而易見之本發明實施例的其他改質作用，係意欲涵蓋於本發明的範圍內。

參考文獻

1.　McKee,A. S.,A. S. McDermid,A. Baskerville,A. B. Dowsett, D. C. Ellwood, and P. D. Marsh. 1986. Effect of hemin on the physiology and virulence of Bacteroides gingivalis W50. Infect. Immun. 52:349-355.

2.　Slots,J. 1982. Importance of black-pigmented Bacteroides in human periodontal disease. Host parasite interactions in periodontαl diseases. American Society for Microbiology.

3. O'Brien-Simpson,N. M.,R. Pathirana,R. A. Paolini,Y.-Y. Chen,P. D. Veith,T. V.,R. N. Pike,N. Alley,and E. C. Reynolds. 2005. An immune response directed to proteinase and adhesin functional epitopes protects against Porphyromonas gingivalis-induced bone loss. Journal of Immunology 175:3980-3989.

4. Baker,P. J.,R. T. Evans,and D. C. Roopenian. 1994. Oral infection with Porphyromonas gingivalis and induced alveolar bone loss in immunocompetent and severe combined immunodeficient mice. Arch Oral Biol 39:1035-1040.

第2圖顯示抗體對於KAS2肽與福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞之辨識作用。(A)在ELISA 中，KAS2肽係以對抗福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(FK-W50)、重組蛋白KAS1-KsA1、KAS2-KLA1及合成的KAS2-DT接合物及PBS之抗血清探測。(B)在ELISA中，福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞係以對抗福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)W50細胞(FK-W50)、重組蛋白KAS1-KsA1、KAS2-KLA1、KLA1及PBS之抗血清探測。抗體反應係以所得的ELISA力價OD₄₁₅減去二倍背景水平之形式表示，而各力價代表三個數值的平均值±標準偏差。

第6圖。在辨識牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)全細胞與RgpA-Kgp複合體之遠交品系小鼠中，嵌合體AS2-LA1誘發一種抗體反應。CD1遠交品系小鼠係以嵌合體AS2-LA1(50毫克/小鼠)免疫接種，及所收集的血清係與AS2-LA1(A)、福馬林殺死型牙齦紫質單胞菌(P. gingivalis)菌株W50(B)用於ELISA中，及以RgpA-Kgp複合體(C)作為所吸收的抗原。在該圖中，KAS2-KLA1係示為AS2-LA1。測定各同型免疫球蛋白對於各抗原之力價，及數據係以所得ELISA力價(‘000)減去二倍背景水平之形式表示，而各力價代表三個數值的平均值±標準偏差。

<110>　口腔健康澳洲(Oral Health Australia)私人有限公司

<120>　感染的治療或預防(Treatment or prevention of infection)

<130>　81860014TPG

<150>　AU2010900846

<151>　2010-02-26

<160>　90

<170>　Patentln(第3.5版)

<210>　1

<211>　37

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(6)..(6)-

<223>　X可為G或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(18)..(18)

<223>　X可為S或A

<220>

<221>　其他特性

<222>　(23)..(23)

<223>　X可為S或L

<220>

<221>　其他特性

<222>　(24)..(24)

<223>　X可為L或V

<220>

<221>　其他特性

<222>　(26)..(26)

<223>　X可為A或T

<220>

<221>　其他特性

<222>　(27)..(27)

<223>　X可為T或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(29)..(29)

<223>　X可為V或L

<220>

<221>　其他特性

<222>　(36)..(36)

<223>　X可為D或N

<400>　1

<210>　2

<211>　37

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(8)..(8)

<223>　X可為V或A

<400>　2

<210>　3

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　3

<210>　4

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　4

<210>　5

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　5

<210>　6

<211>　8

<212>　PRT

<400>　6

<210>　7

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　7

<210>　8

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　8

<210>　9

<211>　6

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　9

<210>　10

<211>　6

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　10

<210>　11

<211>　6

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　11

<210>　12

<211>　6

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　12

<210>　13

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　13

<210>　14

<211>　7

<212>　PRT

<213>牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　14

<210>　15

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　15

<210>　16

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　16

<210>　17

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　17

<210>　18

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　18

<210>　19

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　19

<210>　20

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　20

<210>　21

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　21

<210>　22

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　22

<210>　23

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　23

<210>　24

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　24

<210>　25

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　25

<210>　26

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　26

<210>　27

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(6)..(6)

<223>　X可為G或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(18)..(18)

<223>　X可為S或A

<220>

<221>　其他特性

<222>　(23)..(23)

<223>　X可為S或L

<400>　27

<210>　28

<211>　36

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(5)..(5)

<223>　X可為G或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(17)..(17)

<223>　X可為S或A

<220>

<221>　其他特性

<222>　(22)..(22)

<223>　X可為S或L

<220>

<221>　其他特性

<222>　(23)..(23)

<223>　X可為L或V

<220>

<221>　其他特性

<222>　(25)..(25)

<223>　X可為A或T

<220>

<221>　其他特性

<222>　(26)..(26)

<223>　X可為T或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(28)..(28)

<223>　X可為V或L

<220>

<221>　其他特性

<222>　(35)..(35)

<223>　X可為D或N

<400>　28

<210>　29

<211>　20

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(2)..(2)

<223>　X可為G或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(14)..(14)

<223>　X可為S或A

<220>

<221>　其他特性

<222>　(19)..(19)

<223>　X可為S或L

<220>

<221>　其他特性

<222>　(20)..(20)

<223>　X可為L或V

<400>　29

<210>　30

<211>　22

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　30

<210>　31

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(8)..(8)

<223>　X可為V或A

<400>　31

<210>　32

<211>　36

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(7)..(7)

<223>　X可為V或A

<400>　32

<210>　33

<211>　20

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(4)..(4)

<223>　X可為V或A

<400>　33

<210>　34

<211>　21

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　34

<210>　35

<211>　362

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　35

<210>　36

<211>　231

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　36

<210>　37

<211>　306

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　37

<210>　38

<211>　362

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　38

<210>　39

<211>　141

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　39

<210>　40

<211>　119

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　40

<210>　41

<211>　133

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　41

<210>　42

<211>　120

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　42

<210>　43

<211>　185

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　43

<210>　44

<211>　119

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　44

<210>　45

<211>　131

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　45

<210>　46

<211>　275

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　46

<210>　47

<211>　49

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　47

<210>　48

<211>　36

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　48

<210>　49

<211>　31

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　49

<210>　50

<211>　27

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　50

<210>　51

<211>　41

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　51

<210>　52

<211>　37

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　52

<210>　53

<211>　51

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　53

<210>　54

<211>　62

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　54

<210>　55

<211>　25

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　55

<210>　56

<211>　53

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　56

<210>　57

<211>　52

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　57

<210>　58

<211>　52

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　58

<210>　59

<211>　52

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　59

<210>　60

<211>　52

<212>　DNA

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　60

<210>　61

<211>　1706

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　61

<210>　62

<211>　1732

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　62

<210>　63

<211>　2164

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　63

<210>　64

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(2)..(2)

<223>　X可為S或Y

<220>

<221>　其他特性

<222>　(3)..(3)

<223>　X可為Y或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(6)..(6)

<223>　X可為P或S

<220>

<221>　其他特性

<222>　(7)..(7)

<223>　X可為K或Q

<220>

<221>　其他特性

<222>　(8)..(8)

<223>　X可為I或V

<400>　64

<210>　65

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　65

<210>　66

<211>　11

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(4)..(4)

<223>　X可為V或I

<400>　66

<210>　67

<211>　8

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　67

<210>　68

<211>　7

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(1)..(1)

<223>　X可為N或D

<220>

<221>　其他特性

<222>　(3)..(3)

<223>　X可為S或Y

<220>

<221>　其他特性

<222>　(6)..(6)

<223>×可為S或P

<400>　68

<210>　69

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　69

<210>　70

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　70

<210>　71

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　71

<210>　72

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　72

<210>　73

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　73

<210>　74

<211>　23

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　74

<210>　75

<211>　24

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　75

<210>　76

<211>　27

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　76

<210>　77

<211>　27

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　77

<210>　78

<211>　28

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　78

<210>　79

<211>　16

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<220>

<221>　其他特性

<222>　(6)..(7)

<223>　X可為NP或NPNP或NPNPNP或NPNPNPNP或NPNPNPNPNP或NPNPNPNPNPNP

<400>　79

<210>　80

<211>　325

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　80

<210>　81

<211>　260

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　81

<210>　82

<211>　258

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　82

<210>　83

<211>　15

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　83

<210>　84

<211>　15

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　84

<210>　85

<211>　17

<212>　PRT

<213>　牙齦紫質單胞菌(Porphyromonas gingivalis)

<400>　85

<210>　86

<211>　13

<212>　PRT

<213>　歐洲牛(Bos taurus)

<400>　86

<210>　87

<211>　17

<212>　PRT

<213>　歐洲牛(bos taurus)

<400>　87

<210>　88

<211>　29

<212>　PRT

<213>　歐洲牛(Bos taurus)

<400>　88

<210>　89

<211>　13

<212>　PRT

<213>　歐洲牛(bos taurus)

<400>　89

<210>　90

<211>　21

<212>　PRT

<213>　歐洲牛(Bos taurus)

<400>　90

Claims

一種誘發對牙齦紫質單胞菌(P.gingivalis)之免疫反應的免疫原於製造一醫藥品的用途，該醫藥品係用於治療一個已經接受下列藥劑之個體的疾病或病況：(i)一消炎劑以使得該個體口腔組織之發炎作用降到最低，及/或(ii)一抗微生物劑以自該個體口腔組織去除微生物或其片段；其中該個體的該疾病或病況是一種與在該個體之口腔組織中存在有牙齦紫質單胞菌相關者，以及其中該免疫原是在該消炎劑及/或該抗微生物劑之後投藥。
一種誘發對牙齦紫質單胞菌(P.gingivalis)之免疫反應之免疫原，其用於治療一種與在一個體之口腔組織中存在有牙齦紫質單胞菌相關的疾病或病況，其中該治療包含對該個體用一消炎劑投藥以使得該個體口腔組織之發炎作用降到最低，及/或用一抗微生物劑投藥以自該個體口腔組織去除微生物或其片段，然後接著投予該免疫原。
如請求項1之用途，其中該免疫原是在該藥劑投藥後1到2週投藥。
一種組成物，其包含：(i)一種誘發對牙齦紫質單胞菌(P.gingivalis)之免疫反應之免疫原；(ii)一種用以使得該個體口腔組織之發炎作用降到最低之消炎劑，以及/或一種用以自該個體口腔組織去除微生物或其片段的抗微生物劑；該組成物係用於治療一種與在該個體之口腔組織中存在有牙齦紫質單胞菌相關的疾病或病況，其中該治療包含在對該個體投予該消炎劑及/或該抗微生物劑後，對該個體投予該免疫原。
一種套組，其包含：(iii)一種組成物，其包含誘發對牙齦紫質單胞菌(P.gingivalis)之免疫反應之免疫原；(iv)一種組成物，其包含一種用以使得該個體口腔組織之發炎作用降到最低之消炎劑，以及/或一種用以自該個體口腔組織去除微生物或其片段的抗微生物劑；該套組係用於治療一種與在該個體之口腔組織中存在有牙齦紫質單胞菌相關的疾病或病況，其中該治療包含在對該個體投予該消炎劑及/或該抗微生物劑後，對該個體投予該免疫原。
如請求項1之用途，其中該藥劑是一消炎劑。
如請求項1之用途，其中該藥劑是一抗微生物劑。
如請求項7之用途，其中該抗微生物劑是一種反丁烯二酸還原酶之抑制劑。
如請求項7之用途，其中該抗微生物劑是甲嘧烯酚(oxantel)、莫侖太爾(morantel)或噻苯達唑(thiabendazole)。
如請求項1之用途，其中該免疫原是牙齦紫質單胞菌細胞、片段、代謝物或自其所衍生的重組產物。
如請求項10項之用途，其中該自牙齦紫質單胞菌所衍生的重組產物為嵌合型或融合型蛋白質。
如請求項11項之用途，其中該嵌合型或融合型蛋白質是選自於下列群組中：KAS1-KsA1與KAS2-KLA1。
如請求項1之用途，其中該免疫原以及/或該藥劑是系統性投藥。
如請求項1之用途，其中該免疫原及/或該藥劑是直接投藥到口腔組織。
如請求項14之用途，其中該免疫原以及/或該藥劑是直接投藥到口腔黏膜。
如請求項1之用途，其中該治療進一步包含有牙科療程。
如請求項16之用途，其中該牙科療程包括清創術、潔牙及/或牙根整平術。