TW387939B - Cloning and expression of xylanase B - Google Patents

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TW387939B TW083100222A TW83100222A TW387939B TW 387939 B TW387939 B TW 387939B TW 083100222 A TW083100222 A TW 083100222A TW 83100222 A TW83100222 A TW 83100222A TW 387939 B TW387939 B TW 387939B
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Ooyen Albert Johannes Jos Van
Graaff Leendert H De
Den Broeck Heniette C Van
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Gist Brocades Nv
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Description

A7 B7____ 五、發明說明(1 ) 本發明係關於分子生物的範格。特別是,本發明關於 選殖及過度表現一段D N A序列其密碼代表有 iLubigensis木聚糖酶B (XYL B)蛋白質活性的蛋白 •質。本發明也提供生產的方法及使用單一木聚糖酶的方法 其木聚糖酶爲一種無其他木聚糖酶及其他一般酵素的型式 〇 本發明的背景知識 植物細胞壁的組成物既複雜之多變。多醣大多爲長鏈 纖維素(植物細胞壁的主要結構成分),半木纖維素(包 括多種/3 -木聚素鏈)及果膠。植物細胞壁多醣的發生, 分布及構造形貌由下列因素決定小植物種類:(2)變異 性:(3)組織類型,(4)生長條件;(5)年齡及( 6)生長前的植物物料處理。 單子葉植物(如穀類及青草)和雙子葉植物(如苜蓿 ,油菜籽及大豆)間及植物種子和營養部分間是有其本差 別的(Chesson, 1987; Gerr’e 及Brillouet, 1986) ’ 單子葉植物特徵在有阿拉伯膠木聚糖錯合物爲主要的半木 纖維素骨架。在雙子葉植物主要的半木纖維素構造爲木聚 糖葡萄糖錯合物》而且,在雙子葉植物中果膠濃度比單子 葉植物高。種子的果膠質通常很高而纖維質很低。三種以 上或以下交互作用的多醣結構可於細胞壁中辨認出: (1 )中央板形成外層細胞壁。其也做爲各別細胞在 植物組織基質中相互連結的點。中央板包含的主要是高度 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ------- 訂| 線 經濟部智慧財產局員工消t合作社印製 一 4 - 經濟部智慧財產局員工消費合作杜印製 A7 B7 五、發明說明(2 ) 酯化的果膠鈣塩; (2 )初級壁就在中央板之內。其爲纖維素原纖維插 入果膠,苯酚酯及蛋白質構成的無定形的基質中; (3 )次級壁在植物成熟時形成。在植物生長及老化 過程中,纖維素做原纖維,半木纖維及木質素會沈積。 成熟,代謝活躍的植物細胞之初級細胞壁(如葉肉及 表皮)對於酵素水解的抗力比次級細胞壁低,次級細胞壁 在此階級已髙度木質化。 在細胞壁中有纖維素*半木纖維素及果膠的高度交互 作用。這些相當有韌性的交互連結多醣構造的酵素分解並 非一個容易的過程。舉例說,至少要五種酵素才能完全分 解阿拉伯膠木聚糖。內分解使用內切一 yS ( 1 — 4) — D 一木聚糖酶。外切(1— 4 ) 一 D —木聚糖酶由多醣的非 還原端放大木聚糖單元。其他三種酵素(α -葡萄糖醛酸 酯,α-L —阿拉伯膠五環糖酶及乙醯酯酶)攻擊木.聚糖 上的取代基。選擇特殊的酵素當然依欲分解的特殊半木纖 維素而定(McCleary 及 Matheson, 1 986 )。 然而,對某些應用而言,使整個半木纖維素完全分解 成單體是不必要又不想要的。例如在阿拉伯膠木聚糖液化 時,只需簡單地把木聚糖主幹切成較短的單元。這可以內 切-木聚糖酶達成,其最,造成的是木聚糖單體及寡體如 木聚二糖及木聚三糖。這些較短的次單元足夠在所欲使用 時溶解。況且,特殊的木聚糖酶酵素每個不同。因這些酵 素對阿拉伯膠木聚糖受質的作用造成各種不同形式的木聚 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公;S ) -丨丨Ί---------Q--------訂ί (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 5 經濟部智慧財產局S工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(3 ) 糖單體及寡體。(Kormel ink, F.,1 9 9 2 )。 絲狀真菌以其分泌大量不同的水解酵素而聞名,如α 一澱粉酶,蛋白酶及澱粉葡萄糖酶及各種分解植物細胞壁 ,的酵素如纖維素酶,半木纖維素酶及果膠酶。在這些當中 多種木聚糖分解酵素已被找出,其具有多種生化及物理性 質。木聚糖酶功能的不同使可選擇最適合所欲應用的所欲 木聚糖酶。(見Wong等著,(198.8) ,Wood ward ( 1 9 8 4 )及 D e k k e r 及 R i c h a r d s ( 1 9 7 7 ) ) 〇 不同分子量的多種木聚糖酶由微生物製造如黑麴菌( Aspergillus n i ger ) , Aspergillus t n h i g e n s i s C1ostr i d i um thermoce11um , Tr i chnd erma reesei.
Pen i c i 1 1 i um iarthinel lum,還有桿菌靥(Bacillus) 及鏈徽菌科Str eptomvces。例如,在A · tub i gens i s發現 了三種不同的木聚糖酶(XYLA,B及C)。 在自然中,微生物的木聚糖酶總和其他有多醣分解活 性的酵素一般製造出來,如外切-阿拉伯膠糖酶,乙醯酯 酶及纖維素酶。對某些應用而言,如木質纖維果肉的分解 ,這些酵素活性是不需要或不想要的》 已知醱酵狀況可以改變以利於想要的酵素製造。也和 道選殖密碼代表所欲酵素的基因及其於其天然宿主或相容 的其他可表現宿主中之過度表現,會使所欲酵素的製造加 強。後者的方法當所欲酵素想以無其他不想要酵素活性的 形式獲得時特別有用。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) ,, --------訂---------^11 <請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
A7 B7 五、發明說明(4 ) 選殖A. tubigensi s.基因密碼代表木聚糖酶A ( (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) X Y L A )酵素在 Van den Broeck等著(1 9 9 2 )的 著作中已有描述。請參照參考文獻。 然而 A. tubigensis 的 X Y L B 酵素比 XYL A 酵素有較高的最適P Η及溫度。對某些應用如木質纖維素 果肉的切斷,有較高最適Ρ Η及溫度的木聚糖酶較好,特 別是那些只有少許或沒有嫌維素酶活性的木聚糖酶酵素製 備。 不幸地,A. tnhigensis產生XYL B酵素比 XYL A或XYL C蛋白質的童都低·並伴隨了一個 事實即XYL B酵素比其他酵素更難從經傳統醱酵培養 A. tnhipensis^產XYL B的培養液中分離且純化技 術無法省錢。 經濟部智慧財產局貝工消费合作社印製 由麴菌選殖xlnB基因(其密碼代XYL B酵素 )用如描述於van den Broeck著作(1 9 9 2 )中雜交 X y 1 A基因的方法的話無法產生正的訊號。這表示不能 用異源(heterologous)雜交至X 1 η A基因的方法來分 離X 1 η B基因。 然而,得到密碼代表有A. tubigensis XYL B 酵素活性的酵素且可於其他高產量微生物表現的宿主中表 現的基因是很重要的。在此條件下,製造及使用含 A. tubigensis XYL B酵素的酵素(可選擇性地缺 乏不想要的活性)可使工業應用更經濟。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 « 297公釐) -7 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 ____B7_ 五、發明說明(5 ) 本發明的概要 本發明提供純化及分離之真菌來源的D N A序列’其 密碼代表有A . tub i gens i 聚糖酶B (XYL B)酵 .素活性的蛋白質。這些DNA序列包括密碼代表木聚糖酶 的序列且最好還有鄰近的5 /及3 >調節序列。 本發明的另一目的是提供序列的微生物過度表現之建 構使用其原來的調節序列或,在其他作法中,密碼代表木 聚糖酶的序列連結於所選的調節序列如起動子( promo tor),分泌帶領序列及結束訊號其可使X Y L B蛋白質於適當的表現宿主中引導過度表現》 本發明進一步目的是提供微生物表現宿主,其和本發 明之表現建構一同轉殖,並可過度表現,若想要的話’還 可分泌XYL B蛋白質。 本發明更進一步的目的是生產XYL B酵素其可便 利且經濟地用於工業用途。 附圖之簡還IT明 圖1 : P I Ml 7 0之部份限制酶圖譜(restriction map )。粗線代表次選殖於pEMB LI 8之H i η D III 片段。x 1 nB基因之位置及方向都有指出。 圖2 : 麴菌X 1 η B基因之核酸序列及其衍生的胺基酸序列 。Ν端胺基酸序列之決定乃因酵素是由第一行之核酸序列 本紙張尺度適用t國國家標準(CNS〉A4规格(210 X 297公釐) ^ --------t-------- (請先Μ讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 __B7____ 五、發明說明(6 ) 1 2 4位子至1 8 0位子開始的。在本序列中有一段推斷 的插入子(intron),位於2 9 0至3 5 7位子,以( )表示* 本發明之詳細內容 本發明描述一段純化且分離的D N A序列其密碼代表 有A· tubigensis木聚糖酶B (XYL B)酵素活性之 蛋白質。此後DNA序列最好包括密碼代表XYL B之 序列及鄰近的5 >及3 >調節序列。遺傳上的變化包括含 有X Y L B密碼代表序列的調節序列一起的組合式 D N A序列,調節序列如起動子,分泌及結束訊號,可來 自同種或異種之生物。遺傳上的變化也包括密碼代表 X Y L B蛋白質之DNA序列而密碼的選擇可使所選的 表現宿主可辨識。本發明也包括可以在嚴苛(stringent )狀況下和密碼代表XYL B之DNA序列及上述遺傳 上之變化序列雜交之DNA序列•但其在密碼序列上因遺 傳密碼之變化或種間之變異而有所不同。 本發明也提供可在所欲表現宿主中表現密碼代表 X Y L B蛋白質的基因之DNA建構》這些表現建構包 括密碼代表XYL B之區域連結至調節區,如起動子, 分泌及結束訊號由同源或異源的生物而來,這些調節區可 以引導密碼代表XYL B酵素之基因於適當的宿主內過 度表現。最好該表現建構可以內插入所選的表現宿主之基 因組中。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) .Γ. .II.------------------^---------MUI. (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -9 - A7
經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 五、發明說明(7 ) 本發明進一步提供載體(vectors),最好是質體, 經由進入D N A建構之微生物宿主而能表現密碼代表 X Y L B蛋白質之基因》 此外,本發明也關於轉殖了上述DNA建構的同源或 異源宿主。微生物表現宿主可由細菌,酵母或真菌中選擇 〇 在本發明之內文中,a同源'表示對密碼代表 XY L B蛋白質爲天然(native)之所有東西,包括其 調節區。同源之宿主定義爲可分離出這樣的DNA序列的 種。 t異源〃這個字因而定義爲對密碼代表XYL B蛋 白質本身非天然之所有東西,包括調節區域。%異源〃宿 主定義爲任可微生物種但其不能分離列密碼代表X Y L B蛋白質之基因》 在本發明之範圍內,密碼代表有XYL B活性之蛋 白質的基因可由麴菌科得到,特別是黑麴菌6 Aspergi Ί 1 - us n i ge r ),青森麴菌(Aanergi 1 lus-awamori ),
Asnerei 1 Ins aculeatusS. A . t u b i g e n s i..§。最好的是由 A . t π h i g e n s i s Wff來之x 1 η B基因,於嚴苛狀況下雜交 至A . tuhi gensis χ 1 nB基因之DMA序列及密碼代 表有XYL B活性之蛋白質的DNA序列’但其密碼的 選擇應選成在所選表現宿主中最好辨識的° 根據本發明,在嚴苛狀況下的A. tubigens^s., X1nB基因雜交之DNA序列的雜交狀況應至少嚴苛得 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公楚) I in---I ^---------^(^1 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -10 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 B7 五、發明說明(8 ) 如下列雜交程序一般: 在 6x SSC,0. 5%SDS ’ 5x 丹哈得液( Denhardt’s solvtion)及 1 〇 〇 Μ 2 Θ 加熱變性之 .鮭魚精子DNA中,6 0°C之下預先雜交2小時。雜交於 6 0。0之下進行1 8小時的van den Broeck著作中所述 ,歐洲專利由請9 1 205944. 5 (出版號碼 〇 4 6 3 7 0 6 A 子 2.1 及 7· 1)。雜 交後,濾器在 4x S S C » 〇 . 5 % SDS,0. 1. %二磷酸鈉中於6 0eC洗3 0分鏟兩次,再於2 x SSC,0. 1 % SDS 60 eC下洗30分鏟兩次。 所欲之內切木聚糖酶可用分析方法確認但對本發明不 很重要,如點測驗(spot test )分析。依此方法,由培 養引導(如,用燕麥木質素)其生產內切木聚糖酶之微生 物的濾片可用來試驗內切木聚酶活性是否存在。流洗收集 的部分分別滴在含有檸檬酸-磷酸內緩衝液及燕麥木聚糖 之洋菜膠片上(見實施例1. 1於下)。然後浸浴膠片。 若內切木聚糖酶活性存在,於洋菜膠上各別的水滴看來透 明。 —旦所欲之木聚糖酶辨識之後,這種木聚糖酶的密碼 代表D N A序列便可由絲狀真菌獲得,培養真菌於含木聚 糖的培養基其會自然製造,分離出所欲的木聚糖酶可用熟 知的方法如管柱層析並可決定一部分純化的蛋白質之胺基 酸序列。 依據本發明,A. tuhig⑼sis生長於3 %燕麥木質素 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) : --------^- — — 1 —----^ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
11 A7 _____B7_____ 五、發明說明(9 ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 培養基以引導木聚糖酶mRNA之合成。聚A + mRNA CDNA用寡(dT) —纖維素層析法分離。 由此聚 A+ mRNA,cDNA 可用 ZAPTM — •cDNA合成套劑合成。約3x1 〇 4個組合噬菌體在連 結c DNA於載體且轉殖入大腸桿菌後獲得。從這可 c DNA序,用p CR技術可得到X 1 η Β專一之選殖》 源自Ν端胺基酸的核苷酸和聚Α+專一之寡核苷酸結合用 於PCR反應。得到〇· 7Kb的DNA片段其根據 XYL B蛋白質的分子量推測這正是所預期的長度。用 該段0. 7kb之DNA片段來篩選A. tubjgensi.^基 因庫。得到六個正反應的雜交斑(plagues)以限制酶作 用來分析。含xl nB基因之5. 5 k b Hind
I I I基因DNA片段次選殖(subclone)入載體 PEMBL18 ·所造成之質體叫p IM170並放入大 腸桿菌於1 9 9 2年1 2月1 4日放入Centraal Bureau voor Schimmelcultures 於 Baarn,荷蘭,編號 C B S 6 2 9 9 2。 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 爲了方便把含有密碼代表木聚糖酶序列之D N A片段 插入含一個以上異源調節區的表現建構中,可用聚合酶連 鎖反應(PCR) (Ehrlich, H.A.(編者),1989) 把適當的限制酶區引入密碼代表木聚糖酶之5 /及3 >端 。選擇限制酶切的區域視表現載體之DNA序列而定,如 在D N A分子內其他限制酶區的存在與否。 爲了在原來(同源)的生產種類或其他真菌株中得到 本紙張尺度適用辛國國家標準(CNS)A4規格(210x297公釐) -12 -
經濟部智慧財產局員工消费合作社印S A7 ____ B7_ 五、發明說明(i〇 ) X Y L B蛋白質之過度表現,把完整的X Y L B密碼 代表基因包括其5 >及3 >調節區,或替換地,密碼代表 成熟XYL B蛋白質之序列融合其他基因之調節區,引 入所選的表現宿主中以增加基因之複製數(copy humber ),結果當然也使蛋白質表現增加。 若想用異源的表現宿主,且選用酵母或細菌株,要用 一段無打斷(無插入子)的DNA序列去建構異源的表現 載體以免在基因片段旁之接叠(splice)的號不被異源宿 主辨識。這段無打斷的D N A序列可由細菌分得之 mRNA所建構之c DNA庫中獲得,引導而合成木聚糖 酶。這個庫可用前述所得之寡核苷酸或c DNA探針篩選 。另一方面,無打斷的DNA序列可以聚合酶連鎖反應獲 得其使用適當的5 >及3 /寡核旮酸於木聚糖酶誘導細胞 RNA合成之c DNA之第一股。 於本發明之內文內,過度表現定義爲編碼XYL B 蛋白質之DN A序列表現程度在一般同源原株(wild-type ) 生物之上。 在相同 說明中 ,過度表現也表示 密碼代 表XYL B蛋白質至DNA序列於異源生物正常下不會 產生除非將密碼代表XYL B蛋白質的DNA序列引入 異源表現宿主中。這些表現宿主之後代,當然,也包含於 本發明中。 成熟XYL B蛋白質的過度表現也可以選擇異源調 節區如起動子,分泌領導子及結束區,的方式達成,其可 增加表現,且若想要的話,增加所欲蛋白質由所選的表現 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公芨) · —0^--------訂---------m'lji (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 13 - 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(11 ) 宿主分泌之程度及/或基因表現之誘發性控制》 除了天然的X 1 η B基因起動子,其他起動子也可用 來引導其表現。起動子可因其於所欲表現宿主引導 _XYL Β之表現效率而選擇。 在其他作法中,可選用必要的(constitutive)起動 子去引導XYL B之表現,會減少很多不想要的酵素活 性。這樣的表現建構更加有用因爲共可避免在含固體木聚 糖爲誘導物之培養基培養表現宿主之需要^ 常用於真菌表現之強的必要性及/或誘發性起動子爲 AT P-合成酶(synthetase) ’ 次單元 9 (subunit 9, oli C),磷酸三醣異化酶(tri ose phosphate isomerase tpi),乙醇去氫酶(alcohol dehydrogenase, adh A), α —灘粉酶(amy ),澱粉葡萄糖酶(AG),乙醯胺酶 (acetamidase , amds)及甘油酸三磷酸去氫酶( glyceraldehyde -3-phosphate dehydrogenase ( gpd )起動 子》 酵母菌的強起動子的例子有α -澱粉酶及Sn〇2起動子 及由胞外蛋白酶基因來的起動子。 使用組合(hybrid)的起動子對於改善表現建構的誘 發性調節也很方便。 依本發明常用的起動子是由澱粉葡萄糖酶(AG)基 因及天然木聚糖起動子而來》 通常想要的狀況是成熟的XYL B蛋白質由表現宿 主分泌至培養基中從那兒可更容易地得到酵素》 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 11.1----------------訂·-------IA1- (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) ' 14 - 經濟部智慧財產局貝工消费合作社印製 A7 _____B7___ 五、發明說明(12 ) 依本發明,對X 1 η B基因因爲天然的分泌領導序列 可用於影響成熟蛋白質的分泌。 然而,木聚糖酶表現的增加有時造成蛋白質產生超過 •表現宿主能夠改造(processing),分泌,於細胞中建造 一個完好的蛋白質產物的能力因爲運送蛋白質穿過細胞壁 會遇到瓶頸。因此,本發明也提供異源的領導序列以使 木聚糖酶可由所選的表現宿主中有效地分泌。 依據本發明,分泌領導序列可依所欲的表現宿主而選 。異源的分泌領導序列可以選成和其他表現建構上的調節 區爲同源的。例如,髙分泌量的澱粉葡萄糖酶蛋白質可如 澱粉葡萄糖酶起動子本身一起使用,也可和其他起動子一 起用。組合之訊號序列在本發明的內容中也很好使用。 常用之異源分泌領導序列的例子是那些由澱粉葡萄糖 酶基因(真菌),α —因子基因(酵母菌)或α —澱粉酶 (桿菌)而來的。 依據本發明最常用的分泌領導序列爲那些由澱粉葡萄 糖酶(AG)基因及天然木聚糖酶領導序列而來的, —般而言,結束子(terminators)對基因之過度表 現並不被認爲是重要的。若想要的話,結束子可由和起動 子相同的基因中選出,或者,可用同源的結束子》 除了上述的基因片段之外,轉殖的DNA也可包含選 擇標藤(selection marker)以在一群未轉殖的細胞中區 別出包含有所欲基因的細胞。這個選擇標籤帶有適當的 5 /及3 >調節序列可在含有所欲基因之DNA上也可另 本紙張尺度適用令國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) Γ — — — — — — · I I---! --I--I (請先M讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 ___B7___ 五、發明說明(13 ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 外分開。若爲後者,必須可以協同轉殖(co-transformation) 。 表現載體 / 選擇載體 的比例要調整成在高比例的 選擇殖株之中仍能把密碼代表XYL B之表現建構包含 •進去》 最適合於工業用微生物的選擇系統是那些由選擇標籤 群形成而不必宿主生物有變異的。真菌的選擇標籤例子有 乙醯胺酶(amd S),ATP合成酶,次單元9 (oli C)及 抗苯農(beromyl resistanse, ben A)基因。非真菌選擇 標籤的例子有抗G418基因(酵母),抗安披西林( ampicillin)基因(大腸桿菌)及抗新徽素基因(桿菌靥 )β —旦所欲的表現建構組合好後,便將其轉殖入合適的 選殖宿主好大腸桿菌以繁殖此建構。之後,把表現建構引 入合適的表現宿主中最好使表現建構可以插入基因群中。 某些宿主如桿菌颺可當作選殖兼表現的宿主因而不必額外 的轉殖步驟。 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 依據本發明,很多種表現宿主可用來做XYL Β蛋 白質之過度表現。一種作法是用同源的表現宿主。這作法 是把所欲的表現建.構引回分離得密碼代表XYL Β之 D Ν Α序列之菌株,這樣可爲加基因複製數’或使其受異 源調節區之控制,或二者都有。在另一種作法中,XYL B可在異源宿主如細菌,酵母或真菌中引入並表現密碼代 表成熟XYL B蛋白質之DNA建構’在適當的調節區 控制之下。爲了此目的,密碼代表XYL B之DNA序 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公爱) 16 - A7 B7 五、發明說明(14) 列最好在異源宿主而來之起動子及結束子之下表現》此外 ,可能需要換掉X 1 η B基因天然的分泌領導序列而用和 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 表現宿主同源的領導序列以使產物能最有效地表現並分泌 〇 革蘭陰性的大腸桿菌經常當作異源基因表現之宿主, 但也經常在細胞內堆積大量的異源蛋白質。由大腸桿菌細 胞內堆積的一大堆蛋白質中要純化到所欲之蛋白質有時很 難。 相較於大腸桿菌,桿菌靥的細菌就很適合當異源宿主因 爲它們會分泌蛋白質到培養基中。 另一方面,由酵母或真菌群中選的異源宿主也常用》 一般來說,酵母細胞比真菌細胞好因爲它們較容易繁殖。 然而,一些蛋白質不是很少由醇母細胞分泌就是在某些情 況下改造得不對(如,在醚母中過度醣化),在這些例子 中,則應使用真菌宿主。 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 異源宿主也可以選成在表現XYL Β時不會有其他 分解多醣的酵素的,即選擇正常狀況下不會分泌這種酵素 之宿主如 Klvveromvces lactis 。 本發明範圍內較常用之表現宿主的例子有真菌,如麴 菌屬(描述於EP 184. 438及EP 2 8 4.6 0 3 )及Trichoderma屬,細菌如桿菌屬(描述 於 EP 1 3 4.0. 48)及酵母菌如 K 1 vvvermvces 屬( 描述於EP 96. 430及EP 30. 670)和糖 菌靥(Saccharomvces ) ° 本紙張尺度適用t國國家標準(CNSM4規格<210 X 297公釐) A7 B7 五、發明說明(15 ) 特別常用的表現宿主可由黑麴菌,青森麴菌, Aspergillus acu1eatus ,米麴菌,Asperg i1 1 n g tub i gens i s,Trichoderma reesei,枯草桿菌(β a c j 1 1 u s • su bt i 1 i s ),地夜芽孢桿菌(Bac i 1 1 u s 1 i r;h ρ η ι· f n r m j。、 ,Kluvveromvces 1 act i 5¾.啤酒酵母菌(Sachrharomvcea cerevisiae ) ° X Y L B之過度表現爲表現宿主之培養所影響,宿 主是已用密碼代表XYL B之表現建構轉殖後培養在傳 統營養醱酵培養基中的。 醱酵培養基包括了普通的培養基含碳源(如葡萄糖, 麥芽糖,糖蜜等),氮源(如硫酸銨,硝酸銨,氯化銨等 ),有機氮源(如酵母萃取物,麥芽萃取物,消化蛋白質 等)及無機營養源(如磷、錳、鉀、鋅、鐵等)。有時視 需要可加入誘導物(如燕麥木聚糖)。 選擇適當的培養基可依宿主選擇或/及表現建構之調 節需要而定》這樣的培養基是技術上熟知的。若有需要, 培養基可含附加成分使轉殖的表現宿主強過其他可能存在 的污染微生物。 醱酵在溫度0至45°C且pH2至1 0之間分批或整 批(fed-batch)進行0 . 5 — 2 0天。較好的醱酵狀況 是溫度在20至37°間且pH在3至9之間。合適的狀 況依表現宿主的選擇而定。 在醱酵之後,用離心或過濾之方法把細胞由醱酵液 移出。細胞移出後。XYL B蛋白質可回收(recover 本紙張尺度適用中國國家螵準(CNS)A4規格(210x 297公爱) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 丨n^•丨 ---- - 訂 -------- *1^ 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 -18 - A7 B7 五、發明說明(16 ) ),且若有需要,可依傳統方法分離並純化。 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 產物在液態或乾態都可穩定成形。在某些應用上,可 能會把酵素固定在固體基質上。 以本發明之方法製得之XYL B酵素可單獨使用, 或在很多需要木聚糖分解酵素的方法中和其他選擇的酵素 —起作用。 XYL B (或內切木聚糖酶I I )酵素用於兩個試 驗系統,通常用在造紙及紙線工業。這些爲完全無氯( T 〇 t a 1 C h 1 〇 r i n e F r e e , T C F )及無氯兀素(E 1 e m e n t a n y Chlorine Free, ECF)系統。令人驚異的是X Y L B酵 素會特別增加軟木紙漿的亮度。對硬木頭此酵素的效果也 比內切木聚糖酶I及Lyx — 6 8 (如,內切木聚糖酶I 及內切澱粉葡萄糖酶I I之混合物)好。而且,黏性很驚 訝地並未受影響。 因此XYL B酵素便於用來除去牛皮紙漿中之木質 素因而使漂白更方便因爲可減少製備紙製品之氯用量,特
別是和其他麴菌木聚糖酶如XYL A(內切木聚糖酶I 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 )酵素比較時XYL B較高的最適溫度及pH都較便利 〇 依據本發明,經由本發明製之XYL B酵素可用在 麵包烘烤以改進麵團的品質也可加入富含阿拉伯膠木聚糖 及葡木聚糖之動物飼物之中。當加入單胃動物(如家禽或 猪)的飼料(包括青貯飼料)中,其含有穀類如大麥、小 麥、玉米、黑麥或燕麥或者穀類副產品如麥麩或玉米殼, 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) A7 B7_ 五、發明說明(17 ) 此酵素可有效促進植物細胞的分解使動物更能好好利用植 物養分。結果,生長率及/或餓養轉換率(feed cenver-sion)都改善了。而且XYL B蛋白質可用於減少含木 •聚糖酶的飼料黏性。 若用預先濕透或濕餵食時XYL B酵素可預先加入 飼料或青貯飼料中。更方便的是,由本發明製造之 XYL B酵素在加入飼料時在活體的飼料內仍可繼續分 解木聚糖。 由本發明生產之XYL B酵素在蘋果釀酒廢料生物 轉換成微生物性生物量(biomass)之過程中對改善過濾 及去除汁液中之有機物質也很有效。 而且根據本發明,有改良過濾性及/或較低黏性的葡 萄糖漿可由不純的穀類澱粉經α —澱粉酶作用,再經本發 明所生之XYL Β作用最後水解產生。類似情況, X Y L Β也可用於啤酒釀造以改善麥芽汁之過濾性。 此外,由本發明製得之XYL Β可用在其他製程如 水果或蔬菜汁的製造上,甜菜漿的酵素水解,其水解部分 可用作微生物培養基;用在農作殘餘物如玉米穗,麥桿及 堅果殼;和一些可循環再生的物質如廢紙。 下列實施例是爲了給一般技術上熟知的一個完整的揭 示及說明如何使用本發明但不限制發明者視爲其發明之範 圍之物件。所用之數據(如量,溫度,pH等)都盡力確 定正確性仍含有一些實驗錯誤及偏差。除非有特別標明, 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ------訂--------- 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -20 - A7 B7 五、發明說明(is ) 溫度以攝氏表示而壓力是在大氣壓或近大氣壓。 實施例1 •內切木聚糖醅B (XYL B)之部分純化 黑麴菌D S 1 6 8 1 3之內切木聚糖酶,其後來重新 歸類爲更可能屬於 A. tubigensis ( Kusters-van Someren 等著,(1991),於1990年7月20曰置於 Centraa 1 Bureau voor Schimmelcultures, Baarn, The Netherlands 並編號爲 CBS 3 2 3. 9 0 ),培養並 以歐洲專利申請91205944. 5 (出版號 0 463 706 A1)之例子1.1中所述方法純 化,詳細內容可參照參考文獻。 純化得三個內切木聚糖酶,XYL A於K峰,通常 叫做XYL 2之XYL B於F峰而XYL C於B峰 啻施例2 XYL B胺某酸序列之定序 於12. 5 % SDS -聚乙醯胺電泳膠片上加入1 -2 nm 〇芡之XYL B作電泳,然後電點印(elec tr-oblot)至 Immobilon-P膜(Millipore公司)’此乃依照 Matsudaira (1987)之方法。含有主帶之膜部分主帶分子 量(S D S - page)爲2 2 k D a ’拿膜做序列分析用氣 相定序(Amons,1987)(Son facility, Leiden) ° 得到 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 297公爱) (請先閲讀背面之沒意事項再填寫本頁) -10¾--------訂---------線、". 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -21 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 B7 五、發明說明〇9 ) 下列序列:
(S) — Τ _ P 一 S — S — T — G — E — N — ( N ) — G -F-Y-Y - (S) - (F) - (W? ) ( T ) - ( D ) (式 1 ) N序列之定序重覆一次以確認所得序列,得下列序列 (G)/S-T/(G)-P/(G)-S-S — T-G / (T) - E- N- (N) - X- F- Y- Y- (S) -F-X - (T) - (D) - (G) (式2 ) 實施例3 密碼代表XYL B之xlnB基因的分下選殖及分析 實施例3 . 1 : c DNA表現庫之建構 實施例3 . 1 . 1 : m RNA的引入及分離 A_:__tub i gens i s DS 1 6 8 1 3 於含有 3 6 燕麥爲 碳原之最少管養培養基培養2 Ο,2 8及4 4小時,之後 以過濾收菌絲並用無菌塩水清洗。之後菌絲於液態氮凍結 再以Microdismembrator(Braun)磨成粉。根據Cathala等 著(1 9 8 3 )之單硫氰酸胍/L i C 1步驟由菌絲粉末 本紙張尺度適用_國國家楳準(CNS)A4規格(210x297公釐) Μ--11111.--n^i — — — — — — ^--I I I I (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
/JOX 線„ -22 - A7 _______B7___ 五、發明說明(2〇 ) 分離全部的RNA。但在溶解緩衝液中不加SD S »用寡 (dT)—繊維素層析洗由img全部RNA中分到A + (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) R N A ( Aviv 及 Leder 1972,Sambrook 等著 1 9 8 9 )但 有下列改變:用10mM HEDES p Η 7 . 6爲緩 衝液,在所有溶液中都去掉S D S,而加入之緩衝液添加 9% (v/v)二甲亞碾。 實施例3 . 1 . 2 : c D N A庫之建立 cDNA 由 5mg 多 A+ RNA 合成,用 ZAPTM -c D N A合成套劑(stratagene)依使用指示而用,並 連接至噬菌體λ Uni-ZAPXR。在連結cDNA λ Uni-ZAP XR載體臂(vector-arm)後,噬菌體 D ΝΑ 用 packeg-eneTM extracfs(Promega)包裝(package)。於 1 M g 載體 臂中連結200ng cDNA且反應混合物之五分之一 有接續的包裝造成有3 X 1 04個組合噬菌體的初級基因 庫。這個基因庫用大腸桿菌PLK - F /放大·計數並於 4 °C保存。 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 眚施例3 . 2 :用PCR增加cDNA片段 被辨識爲XYL B之N端胺基酸序列用於寡核苷酸 混合物之設計。由X Y L B源生出下列混合物: • . 5’ACI GGI GAR AAY GGI TTY ΤΑ 3' (式 3 ) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -23 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 ___B7___ 五、發明說明(21 )
其中R代表A或G : A代表C或T,I代表肌核替, N代表A,G,C或T。這般寡核苷酸由XYL B N 端胺基酸序列之第6個胺基酸(7 )至第1 3個胺基酸Y •。第1 0個位下N之密碼在此序列因不確定所以省略掉。 這個寡核苷酸混合物在P C R上和另一段寡核苷酸 5,GAG GAT CCG TCG ACT ACT GAC 3’(式 4 )—起其是照 實施例3·1用cDNA合成但第一股是用寡 5’ GAG GAT CCG TCG ACT ACT GAC TTT TTT TTT TTT TTT TTT 3’(式5 )做引子e 所得cDNA 1卩5和1010x反應緩衝 液(l〇〇mM Tris-HCl »pH8. 3; 5 Ο 0 m Μ Κ C 1 ; 1 5 m Μ Μ g C 1 2 ; Ο . 0 1 %白明膠),1. 25mM四種三磷酸去氧核糖核酸各 1 6^5及各種寡核苷酸各使終體積爲1 〇〇从5 用於PCR。反應混合物混合並加入1 TAQ聚合 酶(5 U / m 夂)(HTBI0TECHN0L0GY) » D Ν Α 於 9 0 °0約3分鐘接下來是2 5回約1分鐘9 0°C,1分鐘3 6 °(;及1分鐘7 2°C地加熱變性,在2 5回後混合物於7 2 °C熱5分鐘。 分析反應產物發現有用源自XYL B之寡核苷酸( 式3)之0. 7kb片段。依XYL B之分子量22 kDa計算,應會有約〇. 7kb之片段。 眚施例3 . 3 :飾選黑麴菌變種A- tubigensis基因庫找 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) Γ 0^--------^---------^ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 __B7_ 五、發明說明(22 )
出編碼X Y L B之基因X 1 π B 實施例3 . 3' 1 :鋪選黑麴菌變種A. t.lhicxpnc-c^基因 庫找出X 1 η B基因 A · t.nhi gensis之基因庫依歐洲專利申請 91205944.5(出版號0463 706 A 1 )所建構,節選此基因庫找X 1 η B基因首先每盤 1 04P f u植於N ZY CM上層洋菜膠其含有〇 · 7% 洋菜置於直徑8 5mm之NEY CM ( 1 . 2%洋菜)盤 如 Mariatis 等著(1 9 8 2) p p . 6 4)所述。 用硝化嫌維嫌紙(Schleiger & Schull)複製之斑點 (plaque)如下處理;1 〇4P f u和大腸菌 LE 3 9 2細胞一起植於0. 6%上層洋膠液培養盤於 3 7 °C隔夜每盤用硝化纖維濾紙做兩個複製如Man i at is等 著,1982所述(PP. 320-321)。減紙浸濕 後於6 8 °C預雜交(prehybridized)兩小時於預雜交緩 衝液中,液含6XSSC,0. 5 % SDS,5x丹哈 得液(Denhardt’s solution) ( ( 1 0 0 xDenhardt’s (請先M讀背面之注意事項再填寫本頁) · 11-----訂---------線 經濟部智慧財產局貝工消t合作社印製 so 1 u t i on 含有 ••每 5 0 0 m又 • 1 0 g Ficol1-400 : 1 0 g 聚 乙烯社 咯啶酮 :1 0 g 小牛血清 (Pentax Fr a c t i on V) (200 x S sc 每1000m芡有 1 7 5 3 g N a C 1*10 7 1 g 檸檬酸鈉, 5 .5 Η 20 . ρ Η 7 . 0 )) 及 10 0 // g / m j?熱變 性 之鲱 魚 精子D Ν A ( Boehringer Mannh e i m )。兩小時 本紙張尺度適用_國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -25 - 經濟部智慧財產局貝工消費合作社印製 A7 __B7___ 五、發明說明(23 ) 預雜交後預雜交緩衝液以雜交緩衝液替換,此液類似預雜 交緩衝液但此緩衝液含p c R所得之32 P標籤的片段,分 離及標籤之方法如歐洲專利申請91205944. 5所 •.述(出版號0 463 7 0 6 Al)(實施例2.1 及7. 1)。濾紙雜交18小時。於6 8 °C。在雜交後濾 紙於68 °C洗2次30分鐘於5x SSC/0. 5% SDS,0. 1%二磷酸接著於30分鐘內洗兩次,於 68°(:,用2乂 SSC/0. 1 % SDS» 空氣乾燥 的濂紙貼在Whatman 3 MM紙上,用放射性墨水標示然 後用Saran Wrap包住Whatman紙及濾紙》於室溫曝光在柯 達(Kodak XAR X —光底片4小時便可見雜交斑點。 於複製濾紙上有雙份雜交斑點:桃六甲正反應斑點。 用巴斯德微量吸管由盤中挑起各個正反應斑點插於1 m 5 SM緩衝液(SM緩衝液每1000mj?:5. 8g N a C 1 ,2. 0 g MgS04· 7H20 * 50m^ 1 M Tris/HCl p H 7 . 5,5mj?20% 白 明膠)含2 0 // i?氮仿由洋菜流洗出噬菌體,如Man i at i-s等者(1982,pp64)。所得噬菌體重覆上述步 驟純化用含分離噬菌體的斑點5 0 - 1 0 0個之盤複製到 的濾紙。 在純化後噬菌體植5 X 1 03個於NZYCM培養基C NZYCM 培養基每 1000m5 : l〇g NZ 胺,5G N a C 1 ,5 g酵母萃取1 g酸胺基酸(Casamino acid ),2g MgS04-7H20 p Η 7 . 0;盤用 12 本紙張尺度適用中國國家棵準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 1 ----1---llri-------*5^ ί Γ (請先閱讀背面之.注意事項再填寫本頁) -26 - A7 ___B7_____ 五、發明說明(24 ) g洋菜,上屑洋菜膠用7g洋菜膠)。於37°C隔夜培養 得到同生長期(con fluent )盤,加5mj? SM緩衝液 並存放盤2小時於4 °C,適當搖晃可流洗出噬菌體。用微 量吸管收集上清後,用離心4 0 0 X g 1 0分鐘’於4 °C 去掉細菌。加0 · 3%氯仿至上清液使用決定P f u數, 如歐洲專利申請91205944. 5之例2. 4(出版 號0 463 7 0 6 A1)。這些噬菌體株包含近 1 0 1 ° pfu/mi?。 窗施例3 . 3 . 2 :限制酶分析含X 1 η B之噬菌體 如歐洲專利申請91205944. 5(出版號 0 463 706 Α1)例33之方法分離正反應噬 菌體的DN Α以南方分析(Southern Analysis)法分析 。D ΝΑ於3 7 °C於下列溶液組成之反應混合物中分解三 小時:(〜l//g) DNA溶液;適當之 10x反應緩衝液(BRL) ; 10U限制酶(BRL) 及無菌水總體積爲5〇Mi2。在分解後加〇. 1 v ο 1 , 3 M NaAc及2vol酒精把DMA沈澱下 來。10分鐘離心(14, OOOxg)於室溫收集 DNA。上清液抽氣去除,剝下的沈澱於真空短暫乾燥胃 散入無菌水中。加入DNA負載緩衝液 (0. 25%(w/v)溴酚藍,0. 25%(w 1) 氰二甲苯,1 5% (w/v ) Ficoll type4 0 0 溶於水 本紙張尺度適用中a國家標準<CNS)A4規格(210 X 297公釐〉 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) .0¾--------訂---------線' 經濟部智慧財產局霣工消费合作社印製 -27 - 經濟部智慧財產局貝工消费合作社印製 A7 B7 五、發明說明(25 )
),樣本浸浴於65 °C 10分鐘然後迅速冷卻於水上,再 把樣本放入浸於TAE緩衝液(50x TAE緩衝液每 1000m5:242. 0g Trizma base (Sigma)' •57. Im5 冰醋酸,lOOm^ 0. 5 M EDTA pH8.0)之0.6%洋菜膠。DNA片段以電泳25 V 15-18小時分開。 電泳後D ΝΑ用驗真空墨點法(alkaline vacuum blotting,VacuGene XL, Pharmacia LKB)轉印並變性至尼 龍膜上(Gene Bind 45 , Pharmacia LKB)如使用手冊所 指示(PP25 - 26),接著用32P標籤的片段預雜交 及雜交,雜交條件的實施例3. 3.1所述。在室溫曝光 於柯達XAR - 5 X光底片2小時得雜交的形貌( pattern) ° 所得的限制酶形貌用於建構X 1 η B基因的部分限制 酶圖譜。 窗施例3 . 3 . 3 :麵菌xlnB基因的次選殖 · 一段5 · 5 k b之H i n D I I I片段用於次選殖以 確認表現中所選之x1nB基因。分解噬菌體DMA並在 洋菜膠電泳上分離出此片段。由洋菜膠上切下此段,然後 用電流洗(electroelvtion)由洋菜膠片中取出。電流洗 用ISCO cups 如歐洲專利申請 91205944. 5之例3. 5(出版號 〇 463 706 A1)所述。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) --------- ----------I--^---------線(1 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -28 - 經濟部智慧財產局貝工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(26 ) 所得片段連結入經H i n D I I I分解之載體 PEMBL18準備如下:1仁又(l#g/m又) PEMBL18 和 1 Ο X React 2 ( B R L ) N s i_I ’ 1 仁 j? ( 1 〇 u κ ^ j? ) X b a I及1 6 μ 5無菌水混合。載體由 〇. 6%洋菜膠分離出來如上所述。 5 . 5 k b H i η D I I I片段連結至質體 P IM1 7 0中,此載體先做下列處理:1 OOmg PEMBL18 片段和 lOOmg 5 . 5 k b
H_i n D I I I / X b a I片段及5連結緩衝液 (組成爲 500mM Tr i s-HCl ,pH7. 6 ; 1 0 0 m M MgCl2:10mM ATP ; 1 0 m M 二硫化間苯二酚;25% PEG-6000)混合並加 入 又(1. 2U/mi2) T4DNA 連結酶(BRL )於混合物中使終體稹爲2 0 # i?。在1 4°C浸浴1 6 小時後混合物以無菌水稀釋至1 0 0 A j?。1 〇 //又稀釋 的混合物用於轉殖大腸桿菌DH 5 α可轉殖細胞,其單備 如下:隔液預先培養的2 0 0 μ 5大腸桿菌DH 5 α用於 接種入200m又 LB培養基(LB培養基每1000 mj? : 10g胰蛋白酶消化蛋白(BBL) ,5g酵母萃 取物(BBL) ,l〇g NaCl ,〇. 5 m Μ
Tris-HCl Ρ Η 7 . 5)。此含菌培養基浸浴於 3 7 °C常道搖晃器(orbital shaker)至密度達 0. D. βο。之 0· 15 — 0· 2。用 4°C 離心 500 本紙張尺度適用令國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) , I II--------—訂 ---------線 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -29 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 B7__ 五、發明說明(27 ) r p m收集細菌。去掉上清液後細胞存於冰上。細菌沈澱 的清洗是用 lOOmM M g C 1 > 5 m Μ T r i s - H C 1 p H 7 . 4,將這些細胞加入然後離 .心如上述lOOmM C a C 1 a * 5 m Μ Τ r i s - Η C 1 ρ Η 7 . 4’重覆此步驟》最 後細胞再散入2mj? lOOmM C a C 1 2 * 5 m M Tris— HC1 pH7. 4,14%甘油。取酌量( 50μβ)若不馬上用於轉殖則要冰於一 7〇°C。 大腸桿菌DH5 α可轉殖細胞用在轉殖實驗,將5 0 #艾細胞懸浮液的1 0 # 連結混合物加在—起。放冰上 三十分鐘後於4 2°C培養3 - 5分鐘。然後加1 me L B培養液,細胞於3 7 °C培養1小時••細胞用短暫的離 心濃縮再放入2 0 0 μ j? L B培養液。所得細胞懸浮液植 於含200仁g/m芡安披西林,50仁g/mj? X -gal及又 ID TG的LB培養基。 所得菌落選六個隔夜培養於含2 0 0 # g/m 5安披 西林之L B培養基。用鹸分解方法由培養基分離質體 DNA 如 Maniatis 等著(1 9 8 2,Ρ P · 3 6 8 — 369),鹼分解用於阻制酶分析以選擇含有所欲質體 ρ I Ml 7 0之菌落。以含安披西林的L B培養基培養之 大腸桿菌DH5a含有pIM170 ’由500m又此類 培養基大量分離質體DNA (Maniatis等著,1 9 8 2 ’ ρ. 86)。質體用CsCl離心,加酚’酒精沈澱並溶 於 4 0 0 β 又 ΤΕ (ΤΕ 溶液=10mM Tris/ 本紙張尺度適用t國國家標準(CNS)A4規格<210 «297公釐) --I------------— — — — — -------^ (請先閲讀背面之注意事項再填窝本頁) ' 30 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 ____B7_____ 五、發明說明(28 ) H C 1 ρ Η 8 . 0,lmM EOTA)來純化。,產 量約5 0 0 μ g 。 質體pIMl 70進一步以限制酶分析得到如圖1之 部分限制酶圖譜。 含有ρ IM170之大腸桿菌DH5a於1992年
1 2 月 1 4 日放入 C e n t r a a 1 B u r e a u v ο 〇 r S c h i m m e 1 culture's in Bearn, the Netherlands, 編 號碼爲 C B S 6 2 9. 9 2。 眚施例3 . 3 : x 1 η B基因之一級結構 啻施例 3 . 4 . 1 : A. t.uhigensis x 1 η B 基因之序 列分析 麴菌的X 1 η B基因的一級結構,部分起動子/調節 區,基因之密碼轉錄部分及結束區的決定乃定序由 ΡΙΜ170而來的5. 5 k b Hindi I I片段並 在定序反應用特殊的寡核苷酸爲引子。 在核Μ酸序列分析中限制酶片段以實施例2 . 2 . 4 之方法分離然後殖入以適當限制酶處理過的p EMB L 1 8 / 1 9載體。核μ酸序列用二去氧核苷酸結束鏈方法 (Sanger 等著,1 9 7 7 )用Pharmacia 公司的 Τ 7 D N A聚合酶定序套劑。用p C /G E N G軟體做電腦分 析。 全部的核苷酸序列都定出列於圖2 (式4,序列編號 ·· 7 )。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) --------訂 —
線V -31 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 B7 五、發明說明(29 ) 實施例3 . 4 . 2 : X 1 η B基因之描述 所得序列包含有1581 bp,263bp在5一 ’非轉錄區,576bp在3 >非轉錄區。在5 /上游區有 推測之TATA盒在位子1 3 8至1 4 5及1 7 3至 177 »在位子1〇〇至1〇6表現7bp區其爲 A. tubigensis X 1 nA基因一級結構中三重重覆序列 的一部分(歐洲專利申請91205944. 5 (出版號 0 463 706 A1),例4. 2)。於位子86 至 97 發現 12bp 序列(CGGCAGBGTCTC ’ 式6),由位子111重覆至位子122。 X 1 η B基因的轉錄區有7 4 2 b p長且爲一推測的 6 7 b p插入子(inton)打斷。由轉錄區衍生的多胜肽 長225個胺基酸。在實施例2. 2確定的N端序列爲 3 7個胺基酸長的前胜狀(.prepropeptide)。成熟蛋白 質大小爲1 8 7個胺基酸推測分子量爲2 0 kD a而理論 1 E P 爲 4 . 3。 窗施例4 選殖之X 1 η B某因於黑麴菌的表現 質體ρ ΙΜ1 70和黑麴菌Ν5 9 3協同轉殖以在 pGW6 3 5質體上之黑麴菌p y r A基因當作選擇標 示而質體ρ I Μ 1 7 0當協同轉殖質體(Goosen等著, 1 9 8 7 )。 本紙張尺度適用申國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公;S ) -\·Ι- /*·ι>-?Γ —------------------訂---------錄ο* (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -32 - 經濟部智慧財產局貝工消费合作社印製 A7 ___ _B7___ 五、發明說明(3〇 ) 原生質體由菌絲抽出,菌絲培養於最少營養之培養基 內有0· 5%酵母萃取物,0_ 2%酪胺基酸(〇3 33 111丨11- oacid) ’5 0mM葡萄糖及10mM脲嘧啶於3 0°C養 • 2 0小時。原生質體的製備及轉殖步驟如G〇〇sen等著( 1 9 8 7 ),用 leg PGW635 及 50mg PIM170 (最少營養培養基每ΙΟΟΟιηβ : 6. 0 g NaN03,l. 5 g KH2P04,〇. 5 g
MgS04· 7H20 · 0. 5 g KC1 ,lm 芡非氏耐 克溶液,碳源如所述的,pH6 . 0 ;非氏耐克(Vinsn - iac)溶液(Visniac 及 Santer, 1957) ;10g EDTA,4. 4 g ZnS04· 7H20 - 1. 〇 g MnC 12· 4H20 - 〇. 3 2 g CoC12-6H20 ,0 . 3 2 g CuS04· 5H20 * 0. 2 2 g ( NH4) βΜ07024· 4 H a 0 . 1 . 47 g Ca C 12· 2 H 2 Ο · 1. 〇 g F e S04* 7H20 · p H 4 . 0 )° 所得之PYR+轉殖株分析其x1nB基因的表現’ 用S D S _ P A G E分析菌落的濾紙於轉殖株在三十小時 最少營養培養基生長後,培養基含3 %燕麥木聚糖爲碳源 。在菌落濾紙上之全部蛋白質用SDS — PAGE分析並 以 Coomassie Brilliant Blue偵測’當可見 XYL B 時用西方墨點法(Western blotting)抗體抗部分純化的 XYL B,如歐洲專利申請91205944. 5 (出 版號0 463 706 A1)。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS>A4規格(210 X 297公釐) I---------0^--------訂---------C (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -33 - A7 B7_ 五、發明說明(31 ) 分析減紙及Coomassie Brilliant Blue染色顯示在轉 殖株中有X 1 η B基因的明顯過度表現。在這些轉殖株中 發現有一個分子量明顯應對於XYL Β蛋白質的且和原 株墨麴菌株ΝΗ〇2比較有較多的產量。轉殖株Ν 5 9 3 :170 — 2製造最多的XYL Β,轉殖株Ν593 : 1 70 — 7,8,9 ,10及1 1也有增加的產量。 實施例5 用木聚糖酯依T C F及E C F程序將氧預先去太質化之牛 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 皮紙奬关木質化 本實驗所用之紙漿性質 硬木材 樺樹80% 軟木材 雲杉,20¾松樹 I I I I I訂 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 亮度,%IS0 50. 8 35.8 K數 11.0 16.7 黏度,dm3/kg 979 1003 耗,ppm 1900 26〇〇 銅,ppm 0.3 0.6 鉄,ppm 5.1 11 鎂,ppm 210 270 猛,ppm 25 70 由黑麴菌製備三種酵素,木聚糖酶內切I ( End0 I ,歐洲專利申請EP 4 6 3 706),木聚糖酿內切
I I 本紙張尺度適用_國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公« ) -34 - A7 B7
五、發明說明(32 ) I I ( Endo I I ,二木聚糖酶 B)及 Lyx 6 8 , _ 種含木聚糖酶內切I及內切I I之之市售製備品,於全無 氯(tc F)漂白程序中測試,以表示,係指下 ,列步驟: 酵素分解(X ) 清洗(W ) 接合(Chelating,Q) 過氧化物漂白(P ) 測置K還原及黏度爲亮度表現之指標。 亮度是很重要的測量因爲紙越、白"^越有價值。K還 原是測量某些化合物之釋放並不一定和亮度有關。紙漿的 黏度是測量由紙漿製的紙的強度。 應注意構成上列漂白程序一部分的Q P程序先前於歐 洲專利申請E P 4 0 2 2 3 5 (申請人Eka Nobel)中 提過。 下列的步驟在本實驗進行: 酵素步驟’溫度,°C (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) --------訂---------線 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製
X
時間,分鐘 堅固度 pH 用量,Un i ts/g紙娥 50 120 10 4 ± 0 . 5 (內切 I ) 5 ± 0. 5(內切 I I ) 4. 5 ± 0. 5(Lyx68) 50 ^紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公« ) 一 35 - A7 B7 五、發明說明(33 ) 清洗步驟 溫度°c Q階段
時間,分鐘 堅固度· % P Η 溫度,°C 時間,分鐘 堅固定,% pH 室溫 10 3.5 如$既成狀態 鹼性(7-11) 90 60 10 -7 用量* kg EDTA/噸紙漿 及 P步驟 溫度,°C 時間,分鐘 堅固度,%
pH 用置,kg/EDTA/噸紙漿 90 240 10 10.6-11.8 25 —1-----------------t---------^ C (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 實驗對硬木材及軟木材進行。於對照組進行相同步驟 但沒有加酵素•在步驟施行後測紙漿黏度並製造手製紙裝 然後量K還原,亮度及黏度。得下列結果·· 硬木材: 衣紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公楚) -36 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 五、發明說明(34 ) A7 _____B7 % I S D亮度 K還原 黏度 對照組 81.1 38 89 1 內切I 83.3 50 968 內切I I 83.9 43 89 1 L y X 6 8 82. 2 48 885 軟木材: % ISD亮度 K還原 黏度 對照組 71.7 55 900 內切I 73.0 59 914 內切I I 75.7 61 859 Ly X 6 8 74.6 62 888 上述結果表示用內切I I於T c F過程使軟木材及硬 木材紙漿的亮度增加不少。在軟木材是4 · 0 %效果比硬 木材的2· 8%好。而且比用內切I或Lyx — 6 8好。
此外,又測試內切II(十 XYL B)於無氣元 素(ECF)漂白程序之效用,使用XD100ED漂白程 序其表示酵素分解(X),二氧化氯(D)及鹸抽取(E )階段。加含內切I及內切I I之Lyx — 68於只有內 切I I有活性的狀況(pH8. 5)作用。內切I於pH 5. 5所餘之活性少於10%。在上述漂白程序後,量亮 度並比較酵素作用約漂白程序。使用下列酵素濃度:0, 100, 175, 250· 400, 500, 1100 本紙張尺度適用尹國國家標準(CNS〉A4規格(210*297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -o^---- 訂---------線 -37 - A7 B7 五、發明說明(35 ) u / g紙漿。 所用之紙漿K數爲2 2 m P a · S .。 使用下列步驟: 4黏度爲2 1 . 2 酵素步驟 (E )
清洗步驟 W D i。。步驟 溫度,。C 時間,分鐘 堅固度,% pH 溫度,°C 時間,分鐘 堅固定,% pH 溫度,°C 時間,分鐘 堅固度,% pH(最終的) 51 120 10 5. 室溫 10 3. 10 50 40 3.2. 用量,Cl〇2於紙漿之% 1.87 . ---------------- (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂» - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 E階段
溫度,°C 時間,分鐘 堅固度,% pH 70 60 10 10.6-11 用量 :aOH(於紙漿之%) 0 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 一 38 - A7 B7 五、發明說明(36 ) D步驟 溫度,。C 時間,分鐘 堅固度,% pH(最終的) 70 180 10 3 用量,Cl〇2於紙漿之% 2 得到下列結果: 加入酵素(丨丨/g紙漿) 0 100 175 250 400 550 1100 XDmnED後的亮度ISD) 80. 1 83.1 83.5 84.0 84. 0 83.6 84.7 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) /IV Γ -^m iBi ϋ ·_1 1> I ^ ^ ϋ 1 1· 1 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 再一次可結論內切II對紙漿亮度有相當大的影響 合適的用量是1 75 — 550 ϋ/g紙漿。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -39 - 經 濟 部 智 慧 財 產 局 具 工 消 費 合 社 印 製 A7 ______B7___ 五、發明說明(37 ) 參者文獻
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X / 關 鍵 • 胜 肽 : ( 1 1 0 ,1 5 » 1 6, 1 7 * 1 8 ,1 9 ) 之 一 資 料 • / 標 籤= =X / 附 註 = X爲下 列 最 可 能之情 況 ; 1 S e r · 1 0 == Asn » 1 5 = S e ] 一, 9 1 6 = Ρ h e * 1 7 = Τ Γ P f 18 = Τ h r 9 1 9 = A S P 0 序 列 I D ] L號 Gly Glu Asn Xaa Gly Rie 10 Xaa Xaa 15 請 先 閱 讀 背 面 之 注 意 事 項|Q 頁I 一 I I I I I I 訂
Xaa 1
Pro Ser Ser 5
Xaa Xaa Xaa I I I I Ik. 經濟部智慧財產局ar Η消费合作社印製
2 特 列 D序 I ) 列i 序 C 料 資 之 號
C 酸 基 胺 個酸 型質 ο 基股線白無 2 胺單直蛋: • * · * * * 丨 *4 : 度式數態型理 徵長型股形類測 格 規 A4 s) N (c ϊ 標 家 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 B7 五、發明說明(u) (V )片段形式:N端 (v i i )直接來源 (B )菌落:式2 (i X )特性: (A)名稱/關鍵:胜肽 (8)位子:(1,2,3,7,10, 15,18,19,20)之 (C)其他資料:/標籤=χ /附註=%替換情況位子;1: G 1 y,2 : G 1 y, 3 :Gly,7 :ThreX 之 可能情況:10=Asn,15 = Ser ’ 1 8 = T h r,1 9 = Asp,20 = Gly, (x i )序列描述:序列I D 2號
Ser Thr Pro Ser Ser Hir Gly Glu Asn Xaa Xaa Phe Ίγτ Tyr Xaa Phe 1 5 10 15
Xaa Xaa Xaa Xaa 20 ^ (2 )序列I D 3號之資料 (i )序列特徵: (A)長度:20對垴基 本紙張尺度適用中國國家標準<CNS)A4規格(210 X 297公釐〉 4 --------訂---------線 w/ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 44 A7 B7_ 五、發明說明(42 ) (B )型式:核苷酸 (C )股數:單股 (D )形態:直線型 (i i )分子類型:DNA (基因組的) (i i i )推測理論:無 (v i i )直接來源 (B )菌落:式3 (i X )特性: (A) 名稱/關鍵:混合型態 (B) 位子:(3,6,15)之一
(C) 其他資料:/標籤=N /附註=於位子3,6及 1 5爲肌核苷* (X i )序列描述:序列I D 3號 ACNGGNGARA AYGGNTTYTA 20 (2 )序列I D 4號之資料 (i )序列特徵:’ (A )長度:2 1對塩基 (B )型式:核酸 (C )股數:單股 (D )形態:直線型 (i i )分子類型:DNA (基因組的) (i i i )推測理論:無 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS>A4規格(210 X 297公;S ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ---------訂---------線 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 -45 - A7 _B7_ 五、發明說明(43 ) (V i i )直接來源 (B )菌落:式4 (X i )序列描述:序列I D 4號 GAGGATCC3GT OGACIACrGA C 21 (2)序列ID 5號之資料 (i )序列特徵: (A)長度:39對塩基 (B )型式:核酸 (C )股數:單股 (D )形態:直線型 (i i )分子形式:DNA (基因組的) (i i i )推測理論:無 (v i i )直接來源: (B )菌落:式5 (X i )序列描述:序列I D 5號 GAGGATCCDGT OGACTACTGA ΟΓΠΊΤΠΤΓ ΤΙΤΠΤ1ΊΤ 39 (2)序列ID 6號之資料 (i )序列特徵: (A )長度:1 2對塩基 (B )類型:核酸 (C )股數:單股 本紙張尺度適用t國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) --------訂---------線 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 -46 - 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 A7 _B7_;_ 五、發明說明(44 ) (D )形態:直線型 (i i )分子類型:DNA (基因組的) (i i i )推測理論:無 (v i i )直接來源 (B )菌落:式6 (X i )序列描述:序列I D 6號 CGGCAGGGTC TC 12 (2 )序列I D 7號之資料 (i )序列特徵: (A) 長度:2222對塩基 (B )型式:核酸 (C )股數:雙股 (E )形態:直線型 (i i)分子形式:DNA (基因組的) (i i i )推測理論:無 (v i )直接來源 (A )生物:Asnergi 1 lus tubigensis (B) 菌落:DS 16813 (i x )特性: (A )名稱/關鍵:轉錄區(exon ) (B)位子:905. . 1 1 8 2 (i x )特性: 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210>< 297 公¾) ,------II — - I----— It----I I I I J (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -47 - A7 _ B7_ 五、發明說明(45 ) (A) 名稱/關鍵:插入子(intron) (B) 位子:1183. . 1 2 4 9 (i X )特性: (A) 名稱/關鍵:轉錄區 (B) 位子:1250. · 16 4 6 (i X )特性:
(A) 名稱/關鍵:CDS (B) 位子:連接(905. . 1 0 1 8 2 *1 2 5 0. . 1 6 4 6 ) (C) 其他資料:/密碼起始=9 0 5 /產物="^木聚糖酶B之前趨物 '/ 基因=、X 1 η B # (X i )序列描述:序列I D 7號: ------------------訂---------線 I (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消费合作社印製 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -48 ~ A7 B7
五、發明說明(46) CACTATTGGC GCCCCACCCA GTGGAGACIT ATACTACAAG CTATOGGGOG GCTATCTGAG
TAGCCnCTT CIACnTCCA GATAGTA3TA
CAATOGGATC TTCTIAAGCC ACAGGCIAAT ATCAAAACAC I I TTrATTTGAC aTTDGGGAAG CaSGTTCTGC ACAACCITTI1 ATIAGGITTC ATGOGAAGGA TCrCAAITGG C^CCTTCCIT TCCTCAAATT TAAOGOGGCG GTGGCACTCT GCTAAGTCAC TAACGGGAGG AGACACTCCC TCAAGTTAGC ACACGCIAGC ΑΓΙΓΓΟΙΤΤΟ TIAACTAGGT AGAAGCAGTA (XTCTCOGTC TAGATTCCAG TAGAATTATA ATqAITGTrA AAGTEAGTMA CACTCTCATA AATCGITITA GAGAGCCAAC CAATCCGTCT TAOGTAATGG ACAATGAAGC AAOGCAGCAA GAGTCAGGCT ACACAGGTCG TCAGAACCGT AAATCIAGAC CCITGAAGCT CCACTCCCTA TTOGAACAGG TCAGGATGTC TGCAGGACCC TAGAAGGOGA TTTAGGCTGT TTCGGAGATC O^AATCGCC CAOGGATGCT CCACCGACIA GGCTAAACCC CATCACAGCG GACGTITCAG GTAOGGCAGG GTCTCACATT TAGGGCCIOG GCAGGGTCTC GGCAGGTACC CITCITAAIA AAGGCTAAAT AGCTTCTGCA GAATCATGGG TMATCAGGA AOGTCTCCTC GACCITCTCr aXJTTACrCCC AGTCCCATTG AATCAACTCC TCAAGCCAAG CATG ATG CIT ACC AAG AAC CIT CTC CTC TOG TTC GCC GCA GCT AAG GCT Met Leu Thr Lys Asn Leu Leu Leu Ser Phe Ala Ala Ala Lys Ala 15 10 15 GTT CTG GCC GIT CCC CAC GAC TCT GTC GTC GAG OGT TCC GAT GCC TIG Val Leu Ala Val Pro His Asp Ser Val Val Glu Arg Ser Asp Ala Lau 20 25 30 CAC AAG CTC TCT GAG OGT TOG ACX: COG AGC TCG ACC GGC GAG MC AAC
經濟部智慧財產局貝工消費合作社印製 GGC His Lys Leu Ser Glu Arg Ser Thr Pro Ser Ser ΊΤιτ Gly Glu Asn Asn 35 40 45 GGC TTC TAC TAC TCC TTC TGG ACC GAC GGC GGT GGT GAT GTTG ACC TAC Gly Phe Tyr iyr Ser Phe T3rp Thr Asp Gly Gly Gly Asp Val Thr Ί^τ 50 55 60 ACC AAC GGT GAC GOT GGC TOG TAC ACC CTC GAG TCG TCC AAC GTT GGC Thr Asn Gly Asp Ala Gly Ser Tyr Thr Val Glu Trp Ser Asn Val Gly-? 65 70 75 !' AAC TIT GTT GGT GGA AAG GGC TGG AAC CCr GGA ACT GCG CA Asn Phe Val Gly Gly Lys Gly Trp Asn Pro Gly Ser Ala Gin 80 85 90 60 120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 ' 720 780 840 900 949 997 1045 1093 1141 1182 GTAAGTl'AAC CITTCCGAAG CTGTCCCTCr AGGGTATTCA GTGAAACAAA TGCTCACATA 1242 ACTTCAG G GAC ATC ACC TAC AGC GGC ACC TTC ACC CCT AGC GGC AAC Asp lie Thr Tyr Ser Gly Thr Phe Thr Ργό Ser Gly Asn 95 100 105 1289 (請先IH讀背面之注意事項再填寫本頁) -1 --------t---------^oillr 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公;* ) 49 A7 B7 i、發明說明 GGC TAC CTC TCC GTC TAT GGC TCG ACC ACT GAC CCC CTG ATC GAG TAC 1337.
Gly iyr Lsu Ser Val T^r Gly Trp Bir Thr Asp Prx> Leu lie Glu Tyr 110 115 120 TAC ATC GTC GAG TCC TAC GGC GAC TAC AAC CCC GGC AGT GGA GGC ACC 1385
Tyr 工le Val Glu Ser Tyr Gly Asp Tyr Asn Pro Gly Ser Gly Gly Thr 125 130 135 TAC AAG GGC ACX: GTC ACC TCC GAT GGA TCC GTC TAC GAT ATC TAC AOG 1433
Lys Gly Thr Val Thr Ser Asp Gly Ser Val Tyr A^) lie Ίγτ Thr 140 145 150 GCT ACC GGC ACq AAC GCC GCT TCC ATC CftA GGA ACC GCT ACC TTC ACC 1481
Ala Thr Arg Thr Asn Ala Ala Ser lie Gin Gly Thr Ala Thr Hie Thr 155 160 165 170 CAG TAC TGG TCC GIT CGC CAG AAC AAG AGA GTC GGA GGA ACT GTT ACC 1529
Gin Tyr Trp Ser Val Arg Gin Asn Lys Arg Val Gly Gly Thr Val Thr 175 180 185 ACT TCC AAC CAC TTC AAC GCT TGG GCT AAG CTG GGC ATG AAC CTG GGT 1577
Thr Ser Asn His Hie Asn Ala Trp Ala Lys Leu Gly Met Asn Leu Gly 190 195 200 ACT CAC AAC TAC CAG ATC GTG GCT ACC GAG GGC TAC CAG AGC AGC GGA 1625
Thr His Asn iyr Gin lie Val Ala Thr Glu Gly Tyr Gin Ser Ser Gly 205 210 215 TCT TCC TCC ATC ACT GTT CAG TGAGCITGQA IXJTCCAACTG TGCITGCAGG 1676
Ser Ser Ser lie Thr Val Gin 220 225 GATTGGGTGG ATCTGGGAAA TGAGTGOGAT GGTCCTTGGA AATATB3AGC AATCATATGA 1736 TGTGTGAAAC AATTAGTIGC TCGCTATCAA TGCACITGTC GTTGGAATCT ATCAAGCCAT 1796 CIAGTGTAGT ATCCITCATA CTCCGAGAAT AGTACATIAC AGACTATCTC GGCAGATCGA 1856 GGOGCACCAC TATCOGAGGG ATACCTCnT TGGTCTAGTr GTAGCAGTCT GTGACAITAA 1916 CATCAAGTAT TATGCGTGCT AGCTCCXX3TC ATATTGTAGC AGTCATTCCG GAGTAGAOGA 1976 CACCGGTTGG TCGAGCCAAA CTAAATGAGC TATAATITCA ACAGCAGGAG TCCGGA?CGC 2036 GTCTGACCTC AGTGATTCCA GTAGGCATCT TCTTTTACAC GTTAGAGAAT GTCTO^ATIT 2096 CAGACAACCA GCAATTATTC ACATTCGGGA TGTCCCACIT ATCTCITAIO ATCCTTCAAC 2156
_ V ACGTCTACCA ATGAAAGCCA dTlTTACTA TGTEAACTAAA AATCGACAAG CCCGTCAGCG 2216 CCATGG 2222 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁)
Ό-----------------II 經濟部智慧財產局貝工消费合作社印製 A7 B7 五、發明説明(奸) (2)序列ID 8號之資料 (i )序列特徵: (A)長度:225個胺基酸 (B )型式:胺基酸 (E )形態:直線型 (ii)分子類型:蛋白質 (X i )序列描述:序列I D 8號 (请先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(2丨0'〆297公釐) A7 B7 五、發明說明(〇)
Met Leu Thr Lys Asn Leu Leu Leu Ser Phe Ala Ala Ala lys Ala Val 15 j Ser· Asp Ala Leu His 30 r Gly Glu Asn Asn Gly 45 10
Ijbu Ala Val Pro His Asp Ser Val Val Glu 20 Lys Leu Ser Glu Arg Ser 35 25 Ser Ser 40
Phe Tyr 50 Asn Gly 65
Ser Phe Trp 55
Asp Gly Gly Gly Asp Val Thr Tyr 60
Ala Gly Ser Tyr Thr Val Glu Trp * Ser Asn Val Gly Asn 70 75 80
Fhe. Val Gly Gly Lys Gly Trp Asn Pro Gly Ser Ala Gin Asp lie 85 90 95
Ser Gly Thr Phe 100
Gly Trp Thr Thr Asp Pro Leu lie Glu 115 120
Ser Gly· Asn Gly Ί^τ Leu Ser Val Tyr 105 110 r Tyr lie Val Glu Ser Tyr 125
Gly Asp Tyr Asn Pro Gly Ser Gly Gly Thr 130 135 Ser Asp Gly Ser Val Asp lie Thr 145 150 Ala Ser lie Gin Gly Thr Ala Thr Phe Thr 165 170 Gin Asn Lys Arg Val Gly Gly Thr Val Thr 180 185
Tyr Lys Gly 140 Ala Thr Arg 155
Val
Asn Ala 160
Gin Tyr Trp Ser Val Arg 175 Thr Ser Asn His Phe Asn 190 -J.---«.----p-------------^-------11^ <請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -/aav- 經濟部智慧財產局MR工消费合作杜印製
Ala Trp Ala Lys Leu Gly Met Asn Leu Gly Thr His Asn Tyr Gin lie 195 200 205 Val Ala Thr Glu Gly Tyr Gin Ser Ser Gly Ser Ser Ser lie Thr Val 210 215 220
Gin .225 K紙張尺度適用t國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) -ϋ H ϋ _ -I n

Claims (1)

  1. 、申請專利範圍 附件 -A
    專利申請案 範圍修正本 民國88年12月修正 DNA序列;其編碼具有 X Y L B酵素活性之多肽, 第 83 1 00222號 (請先閔讀背面之注意事項再填寫本頁) 中文申請專利 1種純化並分離之 r g i 1 1 η .ς t η b i gens i s 其特徵爲此D N A序列是: a )如下所示真菌來源的D N A序列 tgttc6sagAtcmttcgg0ttcca/Utc0cccacggat0ctccaccgactaggctaaac 丨 • I ,CCATCACAGCGGACGTTTCAGGTACGGCAGGGTCTCACATTTAGGGCCTCGGCAGGGTC ! • _ · * · m I TCGGCAGGTACCCTTCTTMTAMGGCTAMTAGCTTCTGCAGAATCATGGGTATATCAG | I · GAACGTCTCCTCCGTCGCTGCAGACCTTCTCTTCTTACTCCCAGTCCCAfTGAATCAACT-i cctcaagccmgtctctttcmcatgcttaccmgaaccttctcctctcgttcgccgcag MLTKNL. LLSFAAA CTAAGGCTGTTCTGGCCGTTCCCCACGACTCTGTCGTCGAGCGTTCCGAfGCCTTGCACA KAV. LAVPHOSVVEfl SOALHK AGCTCTCTGAGCGTTCGACCCCGAGCTCGACCGGCGAGAACMCGGCTTCTACTACTCCT lserstpsstgenngfyysf TCTGGACCGACGGCGGTGGTGATGTGACCTACACCAACGGTGACGCTGGCTCGTACACCG WTDGGGO'VTYTNGDAGSYTV 今1 /s.\- TCGAGTGGTCCAACGTTGGCAACTTTGTTGGTGGAMGGGCTGGMCCCTGGAAGTGCGC [ EWSNVGNFVGGKGWNPGSAQI 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 AACrrcrAaGGACATCACCTACAGCGGCACCTTCACCCCTAGCGGCAACGGCTACCTCTCC 一“一"d itys gtftpsgngyls 砉 _ GTCTATGGCTGGACCACTGACCCCCTGATCGAGTACTACATCGTCGAGTCCTACGGCGAC VYGWTTOPLieYYI VESYG O tacaaccccggcagtggaggcacctacmgggcaccgtcacctccgatggatccgtctac YNPGSGGTYKGTVTSOGSVY GATATCTACACGGCTACCCGCACCAACGCCGCTTCCATCCAAGGAACCGCTACCTTCACC OIYTATRT .NAAS I.QQTATFT CAGTACTGGicCGTTCGCcAGAACAACAGAGTCGGAGGAAcTGTTACCA0TTCCMCCA0 QYWSVflQNKRVGGTVTTS NH TTCAACGCTTGGGCTMGCTGGGCATGAACCTGGGTACTCACAACTACCAGATCGTGGCT fnawaklgmnlgthhyqiva accgagggctaccagagcagcggatcttcctccatcactqttcagtgagcttggatgtcc TeaYassosss itvq«· 本紙張尺度逋用中國國家椹準(CNS ) A4说格(210X297公釐) -1
    、申請專利範圍 附件 -A
    專利申請案 範圍修正本 民國88年12月修正 DNA序列;其編碼具有 X Y L B酵素活性之多肽, 第 83 1 00222號 (請先閔讀背面之注意事項再填寫本頁) 中文申請專利 1種純化並分離之 r g i 1 1 η .ς t η b i gens i s 其特徵爲此D N A序列是: a )如下所示真菌來源的D N A序列 tgttc6sagAtcmttcgg0ttcca/Utc0cccacggat0ctccaccgactaggctaaac 丨 • I ,CCATCACAGCGGACGTTTCAGGTACGGCAGGGTCTCACATTTAGGGCCTCGGCAGGGTC ! • _ · * · m I TCGGCAGGTACCCTTCTTMTAMGGCTAMTAGCTTCTGCAGAATCATGGGTATATCAG | I · GAACGTCTCCTCCGTCGCTGCAGACCTTCTCTTCTTACTCCCAGTCCCAfTGAATCAACT-i cctcaagccmgtctctttcmcatgcttaccmgaaccttctcctctcgttcgccgcag MLTKNL. LLSFAAA CTAAGGCTGTTCTGGCCGTTCCCCACGACTCTGTCGTCGAGCGTTCCGAfGCCTTGCACA KAV. LAVPHOSVVEfl SOALHK AGCTCTCTGAGCGTTCGACCCCGAGCTCGACCGGCGAGAACMCGGCTTCTACTACTCCT lserstpsstgenngfyysf TCTGGACCGACGGCGGTGGTGATGTGACCTACACCAACGGTGACGCTGGCTCGTACACCG WTDGGGO'VTYTNGDAGSYTV 今1 /s.\- TCGAGTGGTCCAACGTTGGCAACTTTGTTGGTGGAMGGGCTGGMCCCTGGAAGTGCGC [ EWSNVGNFVGGKGWNPGSAQI 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 AACrrcrAaGGACATCACCTACAGCGGCACCTTCACCCCTAGCGGCAACGGCTACCTCTCC 一“一"d itys gtftpsgngyls 砉 _ GTCTATGGCTGGACCACTGACCCCCTGATCGAGTACTACATCGTCGAGTCCTACGGCGAC VYGWTTOPLieYYI VESYG O tacaaccccggcagtggaggcacctacmgggcaccgtcacctccgatggatccgtctac YNPGSGGTYKGTVTSOGSVY GATATCTACACGGCTACCCGCACCAACGCCGCTTCCATCCAAGGAACCGCTACCTTCACC OIYTATRT .NAAS I.QQTATFT CAGTACTGGicCGTTCGCcAGAACAACAGAGTCGGAGGAAcTGTTACCA0TTCCMCCA0 QYWSVflQNKRVGGTVTTS NH TTCAACGCTTGGGCTMGCTGGGCATGAACCTGGGTACTCACAACTACCAGATCGTGGCT fnawaklgmnlgthhyqiva accgagggctaccagagcagcggatcttcctccatcactqttcagtgagcttggatgtcc TeaYassosss itvq«· 本紙張尺度逋用中國國家椹準(CNS ) A4说格(210X297公釐) -1 A8 _387939 ?! 六、申請專利範圍 MCTGTGCTTGCAGGGATTGGGTGGATCTGGGAAATGAGTGCGATGGTCCTTGGAAATAT TGAGCAATCATATGATGTGTGAAACAATTAGTTGCTCGcfATCAATGCACTTGTCGTTGQ MTCTATCAAGCCATCTAGTGTAGTATCCTTCATACTCCGAGAATAGTACATTACAGAcf ATCTCGGCAGATCGAGGCGCACCACTATCCGAGGGATACCTCTTTTGGTCTAGTTGTAGC AGTCTGTGACATTMCATCMGTATTATGCGTGCTAGCTCCCGTCATATTGfAGCAGTCA TTCCGGAGTAGACGACACCGGTTGGTCGAGCCAAACTAAATGAGCTATMTTTCAACAGC > 1 AGGAGTCCGGACGGCGTCTGACCTCAGTGATTCCAGTAGGCATCTTCTTTTACACGTTAG agaatgtctcaatttcagacaaccagcaattattcacattcgggatgtcccacttatctc j TTATGATCCTTCAACACGTCTACCMTGAMGCCACTTTTTACTATGTMGTAAAMTCG '! ACAAGCCCGTCAGCGCCATGG ------------- ••或 b )包括木聚糖酶編碼序列之D N A序列,其長度不 包括終止密碼係介於6 6 0個及6 9 0個核替酸之間,且 在如下嚴苛之雜交條件下,可與上述a )項序列雜交:於 6 8°C之6XSSC中雜交1 8小時,再於30分鐘內完 成於6 8°C之5XSSC/0 . 5%SDS中清洗兩次, 然後在30分鐘內完成於68°C之2XSSC/0. 5% SDS中清洗兩次》 2. —種製備含有如申請專利範圖第1項之DNA序 列之表現構築體的方法,包括: a )單離如申請專利範圍第1項之D N A序列,及 b )將能引導多肽過度表現之調節區連接至該DM A 序列上,該多肽在經此表現構築體嵌入之絲狀真菌中具有 木聚糖酶活性。 3. 如申請專利範圍第2項之方法,其進一步特徵在 於該調節區包括一種或一種以上的下列特性:一個起動子 ,其係選自下列包括澱粉葡萄糖酶(amyloglucosidase) -2 - (請先M讀背面之注意事項再填寫本頁) L·. —l·— nfvn/v ότι!---ir------終 經濟部智慧財產局員工消#合作社印製 本紙張尺度逋用中國國家橾率(CNS ) Μ规格(210Χ297公釐) SSV939 ?? D8 六、申請專利範圍 基因衍生的起動子及對木聚糖酶基因爲天然的起動子;一 個分泌領導序列,其係選自下列包括源自澱粉葡萄糖酶基 因的分泌領導序列及對木聚糖酶基因爲天然的分泌領導序 列。 4 . 一種獲得能夠高度表現多肽之微生物宿主的方法 ,該多肽(木聚糖酶B)係由如申請專利範圍第1項之 D N A序列編碼,其特徵在於該宿主細胞係以如申請專利 範圍第2項之方法獲得的表現構築體予以轉形,且該微生 物宿主是特別常用的表現宿主是黑麴菌(Aspergi 11ns n i ger ),青森麴菌(Aspergi 1 1 es awamor i ), Aspergillus acu 1 eatus ,米麴菌(Aspergillus or vzap ) 'Aspergi 1 lus tub i gens i s ’ 及Trichoderma reesei ° 5 . —種高度表現具有木聚糖酶B活性之多肽的方法 ,該多肽是由申請專利範圔第1項之DNA序列編碼,該 方法之特徵爲下列步驟: a) 培養如申請專利範圍第4項之方法製得之微生物 宿主,在可引導編碼有XYL B活性之多肽的基因表現 的條件下;且 b) 回收自有XYL B活性的多肽。 6 . —種完全無氣(X_〇tally C_hlorine E_ree,TCF)之 漂白方法,以XWQ P表示,其特徵爲下列步驟: 酵素分解(incubation,X),清洗(W ),螯合( Chelating,Q)及過氧化物漂白(P ),其中用於步驟的酵 素爲如申請專利範圍第5項之方法製得之多肽。 本纸張尺度適用中國a家揲準(CNS )八4洗格(210X297公釐) J—J 卜— Γ9 (請先閱讀背面之注意事項再填窝本頁) 訂. '4:.y /IV 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 ?s __ 」__D8 ______ 六、申請專利範圍 7 -—種無氣 7ϋ 素(EJementary C_h 1 o r i π e £_r e e, ECF)之漂白方法,以XDl〇〇ED 表示,其特徵爲酵素分解 (X):二氧化氯(D)及鹼萃取(E),其中用於步驟 X之酵素是如申請專利範圍第5項之方法製得之多肽· (请先Μ讀背面之注意事項再填窝本買) 經濟部智慧財羞局f'工消費合作社印製 本纸張尺度逍用中國國家«準(CNS >八4洗格(2丨0X297公釐)
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