TW202430638A - Apol1表現之調節劑 - Google Patents

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蘇珊 M 弗瑞爾
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美商Ionis製藥公司
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本發明實施方式提供了有用於抑制APOL1表現的方法、化合物、和組成物,該等方法、化合物、和組成物可用於治療、預防、或緩解與APOL1相關的疾病。

Description

APOL1表現之調節劑
本實施方式提供了可用於抑制APOL1(載脂蛋白L,1)表現,並且在某些情況下減少細胞或動物中APOL1蛋白的量的方法、化合物、以及組成物,該等方法、化合物、以及組成物可以用於治療、預防、或緩解與APOL1相關的疾病。 背景技術
終末期腎病(ESKD)影響美國超過50萬個體。在美國,非洲血統的個體發展ESKD的可能性大約是其他種族血統患者中觀察到的兩倍(McClellan W.等人 Am. J. Kidney Dis.[美國腎病雜誌] 1988. 12: 285-290;Cowie CC.等人 新英格蘭醫學雜誌 [N. Engl. J. Med.] 1989. 321: 1074-1079)。絕大多數腎病沒有特定的療法。已發現抗高血壓和抗炎症治療可減緩某些類型慢性腎病(CKD)患者中的進展並減輕症狀,但它們既不會導致疾病消退,也不能完全阻止疾病進展。
最近的數據表明,非洲血統患者APOL1的最後一個外顯子中兩種常見變體(G1和G2)與發展CKD的風險增加之間的關聯(Kao WH等人 Nat. Genet.[自然遺傳學] 2008. 40: 1185-1192;Lipkowitz MS等人 Kidney Int.[國際腎臟] 2013. 83: 114-120;Genovese G.等人 Science.[科學] 2010. 329: 841-845;Tzur等人 Hum Genet.[人類遺傳學] 2010;Kopp等人 J Am Soc Nephrol.[美國腎臟學會雜誌] 2011)。在2013年的研究中,與其他種族血統組相比,不管糖尿病狀態如何,APOL1中的G1和G2風險變體與非洲血統患者中觀察的ESKD較高發生率和CKD進展相關(Parsa A等人 N. Engl. J. Med.[新英格蘭醫學期刊] 2013. 369: 2183-2196)。大約50%的非洲血統受試者在 APOL1中攜帶一個風險等位基因,而大約13%的非洲血統受試者(約500萬個體)在 APOL1中攜帶兩個風險等位基因,其中很大一部分將發展為APOL1相關的CKD  。對具有兩個 APOL1風險等位基因的非洲血統受試者的研究證明針對發展多種形式的腎病的優勢比增加,包括但不限於局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)(OR = 10.5),高血壓歸因的ESKD(OR = 7.3),HIV相關的腎病(HIVAN)(OR = 29),鐮狀細胞腎病(OR = 3.4)和膜性狼瘡腎病(OR = 5.4)(Genovese等人 Science [科學], 2010;Tzur等人 Hum Genet.[人類遺傳學] 2010;Kopp等人 J Am Soc Nephrol.[美國腎臟學會雜誌] 2011)。
本文提供的某些實施方式係用於減少APOL1 mRNA的量或降低其活性、並且在某些實施方式中減少細胞或動物中APOL1蛋白的量的化合物和方法。在某些實施方式中,該動物具有APOL1相關的腎病,包括例如HIV相關的腎病、局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病(collapsing nephropathy)、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化(arterionephro-sclerosis)、狼瘡性腎炎、高血壓相關的腎病和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病。在某些實施方式中,該疾病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)。在某些實施方式中,該疾病係CKD。在某些實施方式中,該疾病係良性小動脈腎硬化。在某些實施方式中,該疾病係狼瘡性腎炎。在某些實施方式中,該疾病係高血壓歸因的CKD。在某些實施方式中,該疾病係終末期腎病(ESRD)。在某些實施方式中,該疾病係HIV相關的腎病。在某些實施方式中,該疾病係鐮狀細胞腎病。在某些實施方式中,該疾病係膜性狼瘡腎病。
本文提供的某些實施方式針對用於抑制APOL1表現的強效且可耐受的化合物和組成物,該等化合物和組成物可以用於治療、預防、緩解APOL1相關的腎病,或減緩其進展。本文提供的某些實施方式針對相比公開揭露的化合物更強效或具有更高治療價值的化合物和組成物。
序列表
本申請連同電子格式的序列表一起提交。該序列表被提供為創建於2018年5月1日的、標題為BIOL0316USLSEQ_ST25.txt的文件,其大小係464 kb。將電子格式的序列表的資訊藉由引用以其全文結合在此。
應理解的是,前面的概述和下面的詳述兩者都只是示例性和說明性的,並且不限制如所要求的實施方式。在本文中,單數的使用包括複數,除非另外明確說明。如本文使用的,「或」的使用意指「和/或」,除非另外說明。此外,術語「包括(including)」以及其他形式(如「包括」(includes)和「包括」(included))的使用沒有限制性。
本文使用的章節標題只是出於組織的目的,而不應被解釋為限制所描述的主題。在本申請中引用的所有文獻、或文獻的部分(包括但不限於專利案、專利申請案、文章、書籍、論文、以及GenBank和NCBI參考序列記錄)都針對本文討論的文獻的部分並且以其全文藉由引用而清楚地特此結合。
應理解的是,本文包含的實例中的每個SEQ ID NO中列出的序列獨立於對糖部分、核苷間連接、或核鹼基的任何修飾。因此,由SEQ ID NO定義的化合物可以獨立地包含對糖部分、核苷間連接、或核鹼基的一種或多種修飾。藉由ION/ISIS編號描述的化合物指示核鹼模體列、化學修飾、和模體的組合。 定義
除非另外指明,以下術語具有以下含義:
「2'-去氧核苷」意指包含2'-H(H)呋喃糖基糖部分的核苷,如在天然存在的去氧核糖核酸(DNA)中發現的。在某些實施方式中,2'-去氧核苷可以包含修飾的核鹼基或者可以包含RNA核鹼基(尿嘧啶)。
「2'-O-甲氧基乙基」(亦稱2'-MOE)係指2'-O(CH 2) 2-OCH 3)代替核糖基環的2'-OH基團。2'-O-甲氧基乙基修飾的糖係修飾的糖。
「2'-MOE核苷」(亦是2'-O-甲氧基乙基核苷)意指包含2'-MOE修飾的糖部分的核苷。
「2'-取代的核苷」或「2-修飾的核苷」意指包含2'-取代的或2'-修飾的糖部分的核苷。如本文使用的,關於糖部分的「2'-取代的」或「2-修飾的」意指包含除H或OH之外的至少一種2'-取代基基團的糖部分。
「3'靶位點」係指與特定化合物的最3'核苷酸互補的靶核酸的核苷酸。
「5'靶位點」係指與特定化合物的最5'核苷酸互補的靶核酸的核苷酸。
「5-甲基胞嘧啶」意指具有附接至5位的甲基基團的胞嘧啶。
「約」意指在某值的 ± 10%內。例如,如果指出「該等化合物影響APOL1的約70%抑制」,則暗示APOL1水平被抑制在60%和80%的範圍內。
「給予(administration)」或「給予(administering)」係指將本文提供的化合物或組成物引入個體體內以執行其預定功能的途徑。可以使用的給予途徑的實例包括但不限於胃腸外給予,如皮下、靜脈內、或肌內注射或輸注。
「同時給予」或「共給予」意指以任何方式給予兩種或更多種化合物,以此方式兩者的藥理作用在患者體內顯現。同時給予不要求以單個藥物組成物、以相同劑型、藉由相同給予途徑、或同時給予兩種化合物。兩種化合物的作用本身不需要同時顯現出來。該等作用僅需重疊一段時間並且不需同延。同時給予或共給予涵蓋並行地或順序地給予。
「緩解」係指相關疾病、障礙、或病症的至少一種指標、體征、或症狀的改善或減輕。在某些實施方式中,緩解包括病症或疾病的一種或多種指標的進展或嚴重性的延遲或減緩。指標的進展或嚴重性可以藉由熟悉該項技術者已知的主觀或客觀量度來確定。
「動物」係指人或非人動物,包括但不限於小鼠、大鼠、兔、狗、貓、豬、以及非人靈長類動物(包括但不限於猴和黑猩猩)。
「反義活性」意指可歸因於反義化合物與其靶核酸的雜交的任何可檢測的和/或可測量的活性。在某些實施方式中,反義活性係與不存在靶標的反義化合物的情況下的靶核酸水平或由這樣的靶核酸編碼的蛋白相比,該靶核酸或該靶蛋白水平的量或表現的降低。
「反義化合物」意指包含寡核苷酸和視情況一種或多種另外的特徵(如軛合物(conjugate)基團或端基)的化合物。反義化合物的實例包括單股的和双股的化合物,如寡核苷酸、核糖酶、siRNA、shRNA、ssRNA、以及基於佔用的化合物。
「反義抑制」意指與不存在與靶核酸互補的反義化合物的情況下的靶核酸水平相比,在存在該反義化合物的情況下的靶核酸水平的降低。
「反義機制」係涉及化合物與靶核酸的雜交的所有那些機制,其中雜交的結果或作用係靶標降解或靶標佔用,同時伴隨涉及例如轉錄或剪接的細胞機器的停轉。
「反義寡核苷酸」意指具有與靶核酸或其區域或區段互補的核鹼模體列的寡核苷酸。在某些實施方式中,反義寡核苷酸可特異性地與靶核酸或其區域或區段雜交。
「APOL1」意指APOL1的任何核酸或蛋白。「APOL1核酸」意指編碼APOL1的任何核酸。例如,在某些實施方式中,APOL1核酸包括編碼APOL1的DNA序列、從編碼APOL1的DNA(包括含有內含子和外顯子的基因組DNA)轉錄的RNA序列、以及編碼APOL1的mRNA序列。「APOL1 mRNA」意指編碼APOL1蛋白的mRNA。靶標可以用大寫字母或小寫字母來表示。
「APOL1特異性抑制劑」係指能夠在分子水平上特異性抑制APOL1 RNA和/或APOL1蛋白表現或活性的任何試劑。例如,APOL1特異性抑制劑包括能夠抑制APOL1 RNA和/或APOL1蛋白的表現的核酸(包括反義化合物)、肽、抗體、小分子、以及其他試劑。
「二環核苷」或「BNA」意指包含二環糖部分的核苷。「二環糖」或「二環糖部分」意指包含兩個環的經修飾的糖部分,其中第二環經由連接第一環中的原子中的兩個的橋而形成,由此形成二環結構。在某些實施方式中,二環糖部分的第一環係呋喃糖基部分。在某些實施方式中,該二環糖部分不包括呋喃糖基部分。
「分支基團」意指具有至少3個以下位置的一組原子,該等位置能夠與至少3個基團形成共價連接。在某些實施方式中,分支基團提供了用於經由軛合物接頭和/或可切割的部分將系鏈配位基連接至寡核苷酸的多個反應性位點。
「靶向細胞的部分」意指能夠結合至一種特定細胞類型或多種特定細胞類型的軛合物基團或軛合物基團的部分。
「cEt」或「受約束的乙基」意指核糖基二環糖部分,其中該二環糖的第二環經由連接4'-碳和2'-碳的橋形成,其中該橋具有式:4'-CH(CH 3)-O-2',並且其中該橋的甲基基團係 S組態。
「cEt核苷」意指包含cEt修飾的糖部分的核苷。
化合物中的「化學修飾」描述了相對於這樣的單位的初始狀態,藉由該化合物中的任何單位的化學反應的取代或改變。「修飾的核苷」意指獨立地具有修飾的糖部分和/或修飾的核鹼基的核苷。「修飾的寡核苷酸」意指包含至少一種修飾的核苷間連接、修飾的糖、和/或修飾的核鹼基的寡核苷酸。
「化學上不同的區域」係指化合物的在某種程度上來說與同一化合物的另一個區域在化學上不同的區域。例如,具有2'-O-甲氧基乙基核苷酸的區域在化學上不同於具有沒有2'-O-甲氧基乙基修飾的核苷酸的區域。
「嵌合反義化合物」意指具有至少2個化學上不同的區域的反義化合物,每個位置具有多個亞單位。
「可切割的鍵」意指能夠被分離的任何化學鍵。在某些實施方式中,可切割的鍵選自:醯胺、聚醯胺、酯、醚、磷酸二酯的一個酯或兩個酯、磷酸酯、胺基甲酸酯、二硫化物、或肽。
「可切割的部分」意指在例如細胞、動物或人內的生理條件下被切割的原子的鍵或基團。
關於寡核苷酸的「互補」意指當將兩個核鹼模體列在相反方向上進行比對時,這樣的寡核苷酸或其一個或多個區域的核鹼模體列匹配另一個寡核苷酸或核酸或其一個或多個區域的核鹼模體列。如本文描述的,核鹼基匹配或互補核鹼基限於以下鹼基對:腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)和尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)、以及5-甲基胞嘧啶( mC)和鳥嘌呤(G),除非另外說明。互補寡核苷酸和/或核酸無需在每個核苷處都具有核鹼基互補性,並且可以包括一個或多個核鹼基誤配。相比之下,關於寡核苷酸的「完全互補」或「100%互補」意指此類寡核苷酸在每個核苷處都具有核鹼基匹配而沒有任何核鹼基誤配。
「軛合物基團」意指附接至寡核苷酸的一組原子。軛合物基團包括軛合物部分和將軛合物部分附接至寡核苷酸的軛合物接頭。
「軛合物接頭」意指包含將軛合物部分連接至寡核苷酸的至少一個鍵的一組原子。
「軛合物部分」意指藉由軛合物接頭附接至寡核苷酸的一組原子。
在寡核苷酸的背景下,「連續」係指彼此緊鄰的核苷、核鹼基、糖部分、或核苷間連接。例如,「連續核鹼基」意指在序列中彼此緊鄰的核鹼基。
「設計」或「被設計為」係指設計與所選核酸分子特異性雜交的化合物的過程。
「稀釋劑」意指組成物中缺少藥理活性,但是在藥學上係必需的或所希望的成分。例如,注射組成物中的稀釋劑可以是液體,例如鹽水溶液。
「不同修飾的」意指彼此不同的化學修飾或化學取代基,包括不存在修飾。因此,例如,MOE核苷和未經修飾的DNA核苷係「不同修飾的」,雖然該DNA核苷係未經修飾的。同樣地,DNA和RNA係「不同修飾的」,即使兩者都是天然存在的未經修飾的核苷。除包含不同的核鹼基以外相同的核苷不是不同修飾的。例如,包含2'-OMe修飾的糖和未經修飾的腺嘌呤核鹼基的核苷與包含2'-OMe修飾的糖和未經修飾的胸腺嘧啶核鹼基的核苷不是不同修飾的。
「劑量」意指在單次給予中、或在指定的時間段內提供的化合物或藥劑的指定量。在某些實施方式中,劑量可以按兩個或更多個大丸劑、片劑或注射劑形式給予。例如,在某些實施方式中,在希望皮下給予的情況下,所希望的劑量可以要求不是藉由單次注射容易地提供的體積。在此類實施方式中,可以使用兩次或更多次注射達到所希望的劑量。在某些實施方式中,劑量可以按兩次或更多次注射給予,以使個體體內的注射部位反應最小化。在其他實施方式中,經延長的時間段或連續地藉由輸注給予化合物或藥劑。可以將劑量指明為每小時、每天、每週或每月的藥劑的量。
「給藥方案」係被設計為實現一種或多種所希望的效果的劑量的組合。
「双股的反義化合物」意指包含兩種寡聚化合物的反義化合物,這兩種寡聚化合物彼此互補並且形成双股體,並且其中這兩種所述寡聚化合物之一包括寡核苷酸。
「有效量」意指足以在對化合物有需要的個體體內實現所希望的生理學結果的化合物的量。有效量在個體之間可以取決於有待治療的個體的健康和身體狀況、有待治療的個體的分類群、組成物的配方、個體的醫學症狀的評估、以及其他相關因素而變化。
「功效」意指產生所希望的效果的能力。
「表現」包括借此以將基因的編碼資訊轉變成存在於細胞中並且在細胞中運轉的結構的所有功能。此類結構包括但不限於轉錄和翻譯的產物。
「缺口體(Gapmer)」意指寡核苷酸,該寡核苷酸包含多個核苷的內部區域,該等核苷支持被定位在具有一個或多個核苷的外部區域之間的RNA酶H切割,其中該等包含內部區域的核苷在化學上不同於包含外部區域的該一個核苷或多個核苷。內部區域可以被稱作「缺口(gap)」並且外部區域可以被稱作「翼(wing)」。
「雜交」意指寡核苷酸和/或核酸的退火。雖然不局限於具體的機制,但最常見的雜交機制涉及可以是在互補核鹼基之間的沃森-克裡克(Watson-Crick)、胡斯坦(Hoogsteen)或反向胡斯坦(Hoogsteen)氫鍵合的氫鍵合。在某些實施方式中,互補核酸分子包括但不限於反義化合物和核酸靶標。在某些實施方式中,互補核酸分子包括但不限於寡核苷酸和核酸靶標。
「緊鄰」意指在相同種類的緊鄰元件之間不存在間插元件(例如在緊鄰核鹼基之間沒有間插核鹼基)。
「個體」意指選擇用於治療或療法的人或非人動物。
「抑制表現或活性」係指相對於未經處理的或對照樣品中的表現或活性,表現或活性的降低或阻斷,並且不一定指示表現或活性的徹底消除。
「核苷間連接」意指在寡核苷酸中的相鄰核苷之間形成共價連接的基團或鍵。「修飾的核苷間連接」意指除天然存在的、磷酸酯核苷間連接之外的任何核苷間連接。非磷酸酯鍵本文意指修飾的核苷間連接。
「加長的寡核苷酸」係相對於本文揭露的寡核苷酸(例如母體寡核苷酸)具有一個或多個另外的核苷的那些。
「連接的核苷」意指藉由核苷間連接而連接在一起的相鄰核苷。
「接頭-核苷」意指將寡核苷酸連接至軛合物部分的核苷。接頭-核苷位於化合物的軛合物接頭內。不認為接頭-核苷係化合物的寡核苷酸部分的一部分(即使它們與寡核苷酸鄰接)。
「誤配」或「非互補」意指當將第一和第二寡核苷酸進行比對時,該第一寡核苷酸的核鹼基不與該第二寡核苷酸或靶核酸的相應核鹼基互補。例如,核鹼基(包括但不限於通用核鹼基、肌苷、和次黃嘌呤)能夠與至少一個核鹼基雜交,但是相對於它所雜交的核鹼基仍係誤配的或非互補的。作為另一個實例,當將第一和第二寡核苷酸進行比對時,不能夠雜交到該第二寡核苷酸或靶核酸的相應核鹼基上的該第一寡核苷酸的核鹼基係誤配或非互補核鹼基。
「調節」係指改變或調整細胞、組織、器官或生物體中的特徵。例如,調節APOL1 RNA可以意指升高或降低APOL1 RNA和/或APOL1蛋白在細胞、組織、器官或生物體中的水平。「調節劑」在該細胞、組織、器官或生物體中實現該改變。例如,APOL1化合物可以是降低細胞、組織、器官或生物體中的APOL1 RNA和/或APOL1蛋白的量的調節劑。
「MOE」意指甲氧基乙基。
「單體」係指寡聚體的單個單位。單體包括但不限於核苷和核苷酸。
「模體」意指未經修飾的和/或修飾的糖部分、核鹼基、和/或核苷間連接在寡核苷酸中的模式。
「天然的」或「天然存在的」意指在自然界中發現的。
「非-二環修飾的糖」或「非二環修飾的糖部分」意指修飾的糖部分,該糖部分包含不形成該糖的兩個原子之間的橋從而形成第二環的修飾(如取代)。
「核酸」係指由單體核苷酸組成的分子。核酸包括但不限於核糖核酸(RNA)、去氧核糖核酸(DNA)、單股核酸、以及双股核酸。
「核鹼基」意指能夠與另一個核酸的鹼基配對的雜環部分。如本文使用的,「天然存在的核鹼基」係腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)、和鳥嘌呤(G)。「修飾的核鹼基」係經化學修飾的天然存在的核鹼基。「通用鹼基」或「通用核鹼基」係除了天然存在的核鹼基和修飾的核鹼基之外的核鹼基,並且能夠與任何核鹼基配對。
「核鹼模體列」意指在核酸或寡核苷酸中獨立於任何糖或核苷間連接的連續核鹼基的順序。
「核苷」意指包含核鹼基和糖部分的化合物。核鹼基和糖部分各自獨立地是未經修飾的或修飾的。「修飾的核苷」意指包含修飾的核鹼基和/或修飾的糖部分的核苷。修飾的核苷包括缺少核鹼基的無鹼基核苷。
「寡聚化合物」意指包含單個寡核苷酸和視情況一種或多種另外的特徵(如軛合物基團或端基)的化合物。
「寡核苷酸」意指連接的核苷的聚合物,該等核苷中的每個核苷都可以彼此獨立地被修飾或不被修飾。除非另有說明,寡核苷酸由8-80個連接的核苷組成。「修飾的寡核苷酸」意指寡核苷酸,其中至少一個糖、核鹼基、或核苷間連接係被修飾的。「未經修飾的寡核苷酸」意指不包含任何糖、核鹼基、或核苷間修飾的寡核苷酸。
「母體寡核苷酸」意指其序列被用作具有類似的序列但不同的長度、模體、和/或化學的更多的寡核苷酸的設計基礎的寡核苷酸。新設計的寡核苷酸可以具有與母體寡核苷酸相同的或重疊的序列。
「胃腸外給予」意指藉由注射或輸注給予。胃腸外給予包括皮下給予、靜脈內給予、肌內給予、動脈內給予、腹膜內給予、或顱內給予(例如鞘內或腦室內給予)。
「藥學上可接受的載體或稀釋劑」意指適合於在給予個體中使用的任何物質。例如,藥學上可接受的載體可以是無菌水溶液,如PBS或注射用水。
「藥學上可接受的鹽」意指化合物(如寡聚化合物或寡核苷酸)的生理學和藥學上可接受的鹽,即保留母體化合物的所希望的生物學活性並且不對其賦予不希望的毒理學效應的鹽。
「藥劑」意指當給予至個體時提供治療益處的化合物。
「藥物組成物」意指適合給予個體的物質的混合物。例如,藥物組成物可以包括一種或多種化合物或其鹽和無菌水溶液。
「硫代磷酸酯連接」意指修飾的磷酸酯連接,其中非橋氧原子之一被硫原子替換。硫代磷酸酯核苷間連接係修飾的核苷間連接。
「磷部分」意指包含磷原子的一組原子。在某些實施方式中,磷部分包括單-、二-、或三-磷酸酯、或硫代磷酸酯。
「部分」意指核酸的限定數目的連續(即,連接的)核鹼基。在某些實施方式中,一個部分係靶核酸的限定數目的連續核鹼基。在某些實施方式中,一個部分係寡聚化合物的限定數目的連續核鹼基。
「預防」係指在從數分鐘到無限期的時間段內,延遲或預先阻止疾病、病症或病狀的發病、發展或進展。
「前驅藥」意指處於身體外形式的化合物,當給予至個體時,被代謝為其身體或細胞內的另一種形式。在某些實施方式中,代謝形式係該化合物(例如,藥物)的活性、或更具活性形式。通常,藉由存在於細胞或組織中的一種或多種酶(例如內源性或病毒性酶)或一種或多種化學物質的作用,和/或藉由生理條件促進前驅藥在體內的轉化。
「減少」意味著降低程度、規模、數量或數目。
「RefSeq No.」係分配給序列的字母和數字的唯一組合,從而表示該序列係針對特定靶轉錄物(例如,靶基因)。關於靶基因的這種序列和資訊(統稱為基因記錄)可以在遺傳序列數據庫中找到。遺傳序列數據庫包括NCBI參考序列數據庫、GenBank、歐洲核苷酸存文件、和日本DNA數據庫(後三者形成國際核苷酸序列數據庫合作或INSDC)。
「區域」被定義為具有至少一種可辨認的結構、功能、或特徵的靶核酸部分。
「RNAi化合物」意指至少部分地藉由RISC或Ago2而非藉由RNA酶H起作用以調節靶核酸和/或由靶核酸編碼的蛋白的反義化合物。RNAi化合物包括但不限於双股siRNA、單股RNA(ssRNA)、和微小RNA(包括微小RNA模擬物)。
「區段」被定義為核酸內的更小的區域或區域的子部分。
「副作用」意指除所希望的作用以外的可歸因於治療的生理疾病和/或病症。在某些實施方式中,副作用包括注射部位反應、肝功能測試異常、腎功能異常、肝毒性、腎毒性、中樞神經系統異常、肌肉疾病、以及不適。例如,血清中的轉胺酶水平增加可以指示肝毒性或肝功能異常。例如,膽紅素增加可以指示肝毒性或肝功能異常。
關於化合物的「單股的」意指該化合物僅具有一種寡核苷酸。「自我互補」意指寡核苷酸至少部分地與其自身雜交。由一種寡核苷酸組成的化合物(其中該化合物的寡核苷酸係自我互補的)係單股化合物。單股的化合物可以能夠結合至互補化合物,以形成双股體。
「位點」被定義為靶核酸內的獨特核鹼基位置。
「可特異性雜交」係指寡核苷酸在該寡核苷酸與靶核酸之間具有足夠的互補性程度以誘導所希望的效應,同時對非靶核酸展現出最小效應或沒有效應。在某些實施方式中,特異性雜交在生理條件下發生。
關於靶核酸的「特異性抑制」意指,當對非靶核酸展示出較少、最低、或無影響時,減少或阻斷靶核酸的表現。減少並不一定表明完全消除了靶核酸的表現。
「標準細胞測定」意指在實例中描述的一種或多種測定及其合理變化。
「標準體內實驗」意指一個或多個實例中描述的一個或多個程序及其合理變化。
在具有同一分子式的分子群體的背景下,「立體隨機手性中心(Stereorandom chiral center)」係指具有隨機立體化學組態的手性中心。例如,在包含立體隨機手性中心的分子群體中,具有立體隨機手性中心的( S)組態的分子的數量可以是但不一定與具有立體隨機手性中心的( R)組態的分子的數量相同。當手性中心的立體化學組態係未設計用於控制立體化學組態的合成方法的結果時,其被認為係隨機的。在某些實施方式中,立體隨機手性中心係立體隨機硫代磷酸酯核苷間連接。
「糖部分」意指未經修飾的糖部分或經修飾的糖部分。「未經修飾的糖部分」或「未經修飾的糖」意指如在RNA中發現的2'-OH(H)核糖基部分(「未經修飾的RNA糖部分」)或如在DNA中發現的2'-H(H)部分(「未經修飾的DNA糖部分」)。「修飾的糖部分」或「修飾的糖」意指修飾的呋喃糖基糖部分或糖代用品。「修飾的呋喃糖基糖部分」意指呋喃糖基糖,其包含代替未經修飾的糖部分的至少一個氫或羥基的非氫取代基。在某些實施方式中,修飾的呋喃糖基糖部分係2'-取代的糖部分。此類修飾的呋喃糖基糖部分包括二環糖和非二環糖。
「糖代用品」意指具有不同於呋喃糖基部分的修飾的糖部分,該修飾的糖部分可以將核鹼基連接至另一個基團(如寡核酸中的核苷間連接、軛合物基團、或端基)。包含糖代用品的修飾的核苷可以摻入到寡核苷酸內的一個或多個位置,並且此類寡核苷酸能夠與互補化合物或核酸雜交。
「協同作用(synergy)」「或」「起協同作用(synergize)」係指組合的效果大於在相同劑量下單獨各組分的作用的相加。
「靶基因」係指編碼靶標的基因。
「靶向」意指化合物與靶核酸的特異性雜交以便引起所希望的效果。
「靶核酸」、「靶RNA」、「靶RNA轉錄物」以及「核酸靶標」全部意指能夠被本文描述的化合物靶向的核酸。
「靶區域」意指一種或多種化合物所靶向的靶核酸部分。
「靶區段」意指化合物所靶向的靶核酸的核苷酸序列。「5'靶位點」係指靶區段的最5'核苷酸。「3'靶位點」係指靶區段的最3'核苷酸。
「端基」意指共價地連接至寡核苷酸的末端的化學基團或一組原子。
「治療有效量」意指為個體提供治療益處的化合物、藥劑、或組成物。
「治療」係指向動物給予化合物或藥物組成物,以便實現該動物的疾病、障礙或病症的改變或改善。 某些實施方式
某些實施方式提供了用於抑制APOL1(APOL1)表現的方法、化合物和組成物。
某些實施方式提供了靶向APOL1核酸的化合物。在某些實施方式中,APOL1核酸具有在RefSeq或GENBANK登錄號NM_003661.3(藉由引用併入,本文揭露為SEQ ID NO: 1)、從核苷酸15986452至16001905截短的NT_011520.9(SEQ ID NO: 2)、NM_001136541.1(SEQ ID NO: 3)、NM_001136540.1(SEQ ID NO: 4)、NM_145343.2(SEQ ID NO: 5)、DC339680.1(SEQ ID NO: 6)、AK309143.1(SEQ ID NO: 7)、從核苷酸17543446至17543655截短的NT_011520.13(SEQ ID NO: 8)、或從核苷酸36250001至36271000截短的NC_000022.11(SEQ ID NO: 9)中列出的序列。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的。
某些實施方式提供了包含修飾的寡核苷酸之化合物,該修飾的寡核苷酸長8至80個連接的核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長10至30個連接的核苷。
某些實施方式提供了化合物,該化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長12至80個連接的核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少12個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長12至30個連接的核苷。
在某些實施方式中,該化合物包含長16個連接的核苷的修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。
某些實施方式提供了包含修飾的寡核苷酸之化合物,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的。
某些實施方式提供了包含修飾的寡核苷酸之化合物,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一者的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,該化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的。
在某些實施方式中,化合物靶向APOL1核酸的核苷酸5849-5907、5853-5869、5855-5873、8145-8180、8168-8216、8306-8321、8320-8338、8723-8847、8743-8760、8829-8847、8755-8840、14342-14390、和14342-14370。在某些實施方式中,化合物靶向具有SEQ ID NO: 2的核鹼模體列的APOL1核酸的核苷酸5849-5907、5853-5869、5855-5873、8145-8180、8168-8216、8306-8321、8320-8338、8723-8847、8743-8760、8829-8847、8755-8840、14342-14390、和14342-14370內。在某些實施方式中,化合物具有至少8、9、10、11、12、13、14、15或16個連續核鹼基部分,該部分與具有SEQ ID NO: 2的核鹼模體列的APOL1核酸的核苷酸5849-5907、5853-5869、5855-5873、8145-8180、8168-8216、8306-8321、8320-8338、8723-8847、8743-8760、8829-8847、8755-8840、14342-14390、和14342-14370內的等長部分互補。在某些實施方式中,該等化合物係反義化合物、寡聚化合物、或寡核苷酸。
在某些實施方式中,化合物靶向具有SEQ ID NO: 2的核鹼模體列的APOL1核酸的核苷酸5849-5907、5853-5869、5855-5873、8145-8180、8168-8216、8306-8321、8320-8338、8723-8847、8743-8760、8829-8847、8755-8840、14342-14390、和14342-14370內的區域。在某些實施方式中,化合物靶向上述核鹼基區域內的至少8、9、10、11、12、13、14、15、或16個連續核鹼基。在某些實施方式中,該等化合物係反義化合物、寡聚化合物、或寡核苷酸。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長10至30個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長12至30個連接的核苷並且在SEQ ID NO: 2的核苷酸5854-5869、5855-5870、8164-8179、8306-8321、8321-8336、8744-8759、8829-8844、或14342-14357中是互補的。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長12至30個連接的核苷並且具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項的至少8、9、10、11、12、13、14、15、或16個連續核鹼基部分的核鹼模體列。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長12至30個連接的核苷並且具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。
在某些實施方式中,上述修飾的寡核苷酸中任一種包括至少一種修飾的核苷間連接、至少一種修飾的糖、和/或至少一種修飾的核鹼基。
在某些實施方式中,上述修飾的寡核苷酸中任一種包括至少一種修飾的糖。在某些實施方式中,至少一種修飾的糖包括2'-O-甲氧基乙基基團。在某些實施方式中,至少一種修飾的糖係二環糖,如4'-CH(CH3)-O-2'基團、4'-CH2-O-2'基團、或4'-(CH2)2-O-2'基團。
在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸包括至少一種修飾的核苷間連接,如硫代磷酸酯核苷間連接。
在某些實施方式中,上述修飾的寡核苷酸中任一種包括至少一種修飾的核鹼基,如5-甲基胞嘧啶。
在某些實施方式中,上述修飾的寡核苷酸中的任一種包括: 由連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由連接的核苷組成的5'翼區段;和 由連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間並且其中每個翼區段的每個核苷都包括修飾的糖。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16至80個連接的核苷,並具有包含在SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項中列舉的序列的核鹼模體列。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含在SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項中列舉的序列的核鹼模體列。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16個連接的核苷,並具有由在SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項中列舉的序列組成的核鹼模體列。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸或由其組成,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核鹼基並且具有包含在SEQ ID NO: 13、1095、1730、76、1326、和81中任一項中列舉的序列的核鹼模體列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由十個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;和 由三個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間,其中該5'翼區段與該3'翼區段包含cEt核苷;其中每個核苷間連接都是硫代磷酸酯連接;並且其中每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-80個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸或由其組成,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核鹼基,具有包含SEQ ID NO: 1164和1925中任一項中列舉的序列或由其組成的核鹼模體列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由九個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;和 由四個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間;其中該5'翼區段包含cEt核苷;其中該3'翼區段在5'到3'方向上包含cEt核苷、cEt核苷、cEt核苷和2'-O-甲氧基乙基核苷;其中每個核苷間連接都是硫代磷酸酯連接;並且其中每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸或由其組成,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核鹼基,具有包含SEQ ID NO: 1164中列舉的序列或由其組成的核鹼模體列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由九個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;和 由四個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間;其中該5'翼區段包含cEt核苷;其中該3'翼區段在5'到3'方向上包含cEt核苷、cEt核苷、cEt核苷和2'-O-甲氧基乙基核苷;其中每個核苷間連接都是硫代磷酸酯連接;並且其中每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16個連接的核苷。
在某些實施方式中,化合物包含下式或由其組成:Tks Tks Tks Tds Gds Tds Ads Ads Gds Tds Gds mCds Aks Aks mCks mCe,其中, A = 腺嘌呤, mC = 5-甲基胞嘧啶 G = 鳥嘌呤, T = 胸腺嘧啶, e = 2'-O-甲氧基乙基修飾的核苷, k = cEt修飾的核苷, d = 2'-去氧核苷,並且 s = 硫代磷酸酯核苷間連接。
在某些實施方式中,化合物包含ION 972190或其鹽,或由ION 972190或其鹽組成,該ION 972190或其鹽具有以下化學結構:
在某些實施方式中,化合物包含ION 972190的鈉鹽或由其組成,該ION 972190的鈉鹽具有以下化學結構:
在上述實施方式的任一項中,該化合物或寡核苷酸可以與編碼APOL1的核酸係至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%、或100%互補的。
在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股的。在某些實施方式中,該化合物包括去氧核糖核苷酸。在某些實施方式中,該化合物係双股的。在某些實施方式中,該化合物係双股的並且包括核糖核苷酸。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在上述實施方式的任一項中,該化合物的長度可以是8至80、10至30、12至50、13至30、13至50、14至30、14至50、15至30、15至50、16至30、16至50、17至30、17至50、18至22、18至24、18至30、18至50、19至22、19至30、19至50、或20至30個連接的核苷。在某些實施方式中,該化合物包括寡核苷酸或由其組成。
在某些實施方式中,本文提供的化合物或組成物包括該修飾的寡核苷酸的藥學上可接受的鹽。在某些實施方式中,該鹽係鈉鹽。在某些實施方式中,該鹽係鉀鹽。
在某些實施方式中,如本文描述的化合物或組成物係可高度耐受的,如藉由具有相對於經鹽水處理的動物丙胺酸轉胺酶(ALT)或天冬胺酸轉胺酶(AST)值不超過4倍、3倍、或2倍的增加,或與對照處理的動物相比肝、脾、或腎重量不超過30%、20%、15%、12%、10%、5%、或2%的增加中至少一者所證明的。在某些實施方式中,如本文描述的化合物或組成物係可高度耐受的,如藉由相對於對照處理的動物ALT或AST沒有增加所證明的。在某些實施方式中,如本文描述的化合物或組成物係可高度耐受的,如藉由相對於對照動物肝、脾、或腎重量沒有增加所證明的。
某些實施方式提供了組成物,該組成物包含前述提及的實施方式項中任一項所述之化合物或其任一種藥學上可接受的鹽以及至少一種藥學上可接受的載體或稀釋劑。在某些實施方式中,該組成物具有小於約40厘泊(cP)、小於約30厘泊(cP)、小於約20厘泊(cP)、小於約15厘泊(cP)、或小於約10厘泊(cP)的黏度。在某些實施方式中,具有前述提及的黏度中任一種的組成物包含處於約100 mg/mL、約125 mg/mL、約150 mg/mL、約175 mg/mL、約200 mg/mL、約225 mg/mL、約250 mg/mL、約275 mg/mL、或約300 mg/mL濃度的本文提供的化合物。在某些實施方式中,具有前述提及的黏度和/或化合物濃度中任一種的組成物具有的溫度為室溫或約20°C、約21°C、約22°C、約23°C、約24°C、約25°C、約26°C、約27°C、約28°C、約29°C、或約30°C。 某些適應症
本文提供的某些實施方式涉及抑制APOL1表現的方法,藉由給予靶向APOL1的化合物,該方法可以用於在個體中治療、預防、或緩解與APOL1相關的疾病。在某些實施方式中,該化合物可以是APOL1特異性抑制劑。在某些實施方式中,該化合物可以是靶向APOL1的反義化合物、寡聚化合物、或寡核苷酸。
與本文提供的方法可治療,可預防和/或可改善的APOL1相關的疾病的實例包括APOL-1相關的腎病、局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、ESKD、腎小球損傷、ESRD、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病。
在某些實施方式中,在個體中治療、預防、或緩解與APOL1相關的疾病的方法包括給予該個體包含APOL1特異性抑制劑的化合物,從而治療、預防、或緩解該疾病。在某些實施方式中,該個體被鑒定為患有與APOL1相關的疾病或具有患該病的風險。在某些實施方式中,該疾病係APOL1相關的腎病。在某些實施方式中,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190、和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,將該化合物胃腸外地給予至該個體。在某些實施方式中,給予化合物改善、保持或預防水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷和腎衰竭。
在某些實施方式中,治療、預防或改善水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷和腎衰竭的方法包括給予個體包含APOL1特異性抑制劑的化合物,從而治療、預防或改善水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷和腎衰竭。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,將該化合物胃腸外地給予至該個體。在某些實施方式中,給予化合物改善、保持或預防水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷和腎衰竭。在某些實施方式中,該個體被鑒定為患有與APOL1相關的疾病或具有患該病的風險。
在某些實施方式中,在患有與APOL1相關的疾病或具有患該病的風險的個體中抑制APOL1表現的方法包括給予個體包含APOL1特異性抑制劑的化合物,從而抑制APOL1在個體中的表現。在某些實施方式中,給予該化合物抑制腎中APOL1的表現。在某些實施方式中,該疾病係APOL1相關的腎病。在某些實施方式中,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該個體患有水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷、或腎衰竭或該等症狀的組合,或具有患上該等的風險。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,將該化合物胃腸外地給予至該個體。在某些實施方式中,給予化合物改善、保持或預防水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷和腎衰竭。
在某些實施方式中,抑制細胞中APOL1表現的方法包括使該細胞與包含APOL1特異性抑制劑的化合物接觸,從而抑制細胞中APOL1的表現。在某些實施方式中,該細胞係腎小球。在某些實施方式中,該細胞在腎中。在某些實施方式中,該細胞在患有APOL1相關的腎病或具有APOL1相關的腎病風險的個體的腎中。在某些實施方式中,ESKD,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在某些實施方式中,在患有或具有患APOL1相關疾病風險的個體的腎中降低或抑制水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷或腎衰竭的方法包括給予個體包含APOL1特異性抑制劑的化合物,從而降低或抑制個體中的水腫、蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷或腎衰竭。在某些實施方式中,該個體患有APOL1相關的腎病或具有患APOL1相關的腎病的風險。在某些實施方式中,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,將該化合物胃腸外地給予至該個體。在某些實施方式中,該個體被鑒定為患有與APOL1相關的疾病或具有患該病的風險。
撰寫某些實施方式涉及包含APOL1特異性抑制劑的化合物,該化合物用於在治療與APOL1相關的疾病中使用。在某些實施方式中,該疾病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD或其他形式的APOL1相關的蛋白尿病。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,將該化合物胃腸外地給予至該個體。
撰寫某些實施方式涉及包含APOL1特異性抑制劑的化合物,該化合物用於在患有或具有患APOL1相關的腎病風險的個體中降低或抑制水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷或腎衰竭中使用。在某些實施方式中,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
撰寫某些實施方式涉及包含APOL1特異性抑制劑的化合物用於生產或製備用於治療與APOL1相關的疾病的藥物的用途。撰寫某些實施方式涉及包括APOL1特異性抑制劑的用於製備用於治療與APOL1相關的疾病的藥物的化合物的用途。在某些實施方式中,該疾病係APOL1相關的腎病。在某些實施方式中,該疾病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
撰寫某些實施方式涉及包含APOL1特異性抑制劑的化合物用於生產或製備藥物的用途,該藥物係用於在患有或具有患與APOL1相關的APOL1相關的腎病風險的個體中降低或抑制水腫、蛋白尿、清蛋白尿、GFR下降、高脂質水平、高膽固醇水平、腎病綜合症、高血液壓力(high blood pressure)或高血壓(hypertension)、腎損傷、腎小球損傷或腎衰竭。在某些實施方式中,APOL1相關的腎病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。撰寫某些實施方式涉及包括APOL1特異性抑制劑的化合物用於製備藥物的用途,該藥物用於治療與APOL1相關的疾病。在某些實施方式中,該疾病係局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、CKD、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、ESKD和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病之一。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的反義化合物。在某些實施方式中,該化合物包括靶向APOL1的寡核苷酸。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的核鹼模體列中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸由SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列組成。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸長16至30個連接的核苷,並具有包含SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730和1925中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物包含修飾的寡核苷酸,該修飾的寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 1164、13、76、81、1095、1326、1730、和1925中任一項組成的核鹼模體列。在某些實施方式中,化合物係ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是單股或双股的。在上述實施方式的任一項中,該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在上述方法或用途的任一項中,該化合物可以靶向APOL1。在某些實施方式中,該化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成,例如修飾的寡核苷酸長8至80個連接的核苷、10至30個連接的核苷、12至30個連接的核苷、或16個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸與SEQ ID NO: 1-9中列舉的核鹼模體列中任一項係至少80%、85%、90%、95%、或100%互補的。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸包括至少一種修飾的核苷間連接、至少一種修飾的糖和/或至少一種修飾的核鹼基。在某些實施方式中,該修飾的核苷間連接係硫代磷酸酯核苷間連接,該修飾的糖係二環糖或2'-O-甲氧基乙基,並且該修飾的核鹼基係5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸包括由連接的去氧核苷組成的缺口區段;由連接的核苷組成的5'翼區段;和由連接的核苷組成的3'翼區段,其中該缺口區段被定位成緊鄰該5'翼區段和該3'翼區段並且位於它們之間,並且其中每個翼區段的每個核苷都包括修飾的糖。
在任何上述實施方式中,該修飾的寡核苷酸長12至30、15至30、15至25、15至24、16至24、17至24、18至24、19至24、20至24、19至22、20至22、16至20、或17至20個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸與SEQ ID NO: 1-9所列舉的核鹼模體列中任一項係至少80%、85%、90%、95%或100%互補。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸包括至少一種修飾的核苷間連接、至少一種修飾的糖和/或至少一種修飾的核鹼基。在某些實施方式中,該修飾的核苷間連接係硫代磷酸酯核苷間連接,該修飾的糖係二環糖或2'-O-甲氧基乙基,並且該修飾的核鹼基係5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸包括由連接的2'-去氧核苷組成的缺口區段;由連接的核苷組成的5'翼區段;和由連接的核苷組成的3'翼區段,其中該缺口區段被定位成緊鄰該5'翼區段和該3'翼區段並且位於它們之間,並且其中每個翼區段的每個核苷都包括修飾的糖。
在上述方法或用途的任一項中,該化合物包含修飾的寡核苷酸或由其組成,該寡核苷酸長16至30個連接核苷並且具有包含SEQ ID NO: 13-1941的任一項中的核鹼模體列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由連接的2'-去氧核苷組成的缺口區段; 由連接的核苷組成的5'翼區段;和 由連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間並且其中每個翼區段的每個核苷都包括修飾的糖。
在上述方法或用途的任一項中,該化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核鹼基,具有如下核鹼模體列,該核鹼模體列包含在SEQ ID NO: 13、1095、1730、76、1326和81中任一項列舉的序列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由十個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;和 由三個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間,其中該5'翼區段與該3'翼區段包含cEt核苷;其中每個核苷間連接都是硫代磷酸酯連接;並且其中每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核苷。
在上述方法或用途的任一項中,該化合物包含修飾的寡核苷酸或由其組成,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核鹼基,具有包含SEQ ID NO: 1164和1925中任一項中列舉的序列或由其組成的核鹼模體列,其中該修飾的寡核苷酸包含: 由九個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;和 由四個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間;其中該5'翼區段包含cEt核苷;其中該3'翼區段在5'到3'方向上包含cEt核苷、cEt核苷、cEt核苷和2'-O-甲氧基乙基核苷;其中每個核苷間連接都是硫代磷酸酯連接;並且其中每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16-30個連接的核苷。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸長16個連接的核苷。
在上述方法或用途的任一項中,該化合物包括ION 972190或其鹽,或由ION 972190或其鹽組成,該ION 972190或其鹽具有以下化學結構:
在上述方法或用途的任一項中,該化合物包括ION 972190的鈉鹽或其組成,該ION 972190的鈉鹽具有以下化學結構:
在上述方法或用途的任一項中,可以將該化合物胃腸外地給予。例如,在某些實施方式中可以將該化合物藉由注射或輸注給予。胃腸外給予包括皮下給予、靜脈內給予、肌內給予、動脈內給予、腹膜內給予、或顱內給予(例如鞘內或腦室內給予)。 某些化合物
在某些實施方式中,本文描述的化合物可以是反義化合物。在某些實施方式中,該反義化合物包括寡聚化合物或由其組成。在某些實施方式中,該寡聚化合物包括修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸具有與靶核酸的核鹼模體列互補的核鹼模體列。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸具有與靶核酸的核鹼模體列互補的核鹼模體列。
在某些實施方式中,化合物或反義化合物係單股的。這樣的單股化合物或反義化合物包括寡聚化合物或由其組成。在某些實施方式中,這樣的寡聚化合物包括寡核苷酸或由其組成,並且視情況軛合物基團。在某些實施方式中,該寡核苷酸係反義寡核苷酸。在某些實施方式中,該寡核苷酸被修飾。在某些實施方式中,單股反義化合物或寡聚化合物的寡核苷酸包括自我互補的核鹼模體列。
在某些實施方式中,化合物係双股的。此類双股化合物包括具有與靶核酸互補的區域的第一修飾的寡核苷酸以及具有與第一修飾的寡核苷酸互補的區域的第二修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,該修飾的寡核苷酸係RNA寡核苷酸。在此類實施方式中,在修飾的寡核苷酸中的胸腺嘧啶核鹼基被尿嘧啶核鹼基替換。在某些實施方式中,化合物包括軛合物基團。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸中的一種係綴合的。在某些實施方式中,兩種修飾的寡核苷酸均係綴合的。在某些實施方式中,第一修飾的寡核苷酸係綴合的。在某些實施方式中,第二修飾的寡核苷酸係綴合的。在某些實施方式中,第一修飾的寡核苷酸長12-30個連接的核苷,並且第二修飾的寡核苷酸長12-30個連接的核苷。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸中的一種具有包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的至少8個連續核鹼基的核鹼模體列。
在某些實施方式中,反義化合物係双股的。此類双股反義化合物包括具有與靶核酸互補的區域的第一寡聚化合物以及具有與第一寡聚化合物互補的區域的第二寡聚化合物。此類双股的反義化合物的第一寡聚化合物通常包括修飾的寡核苷酸和視情況軛合物基團,或由修飾的寡核苷酸和視情況軛合物基團組成。此類双股反義化合物的第二寡聚化合物的寡核苷酸可以是修飾的或未修飾的。双股反義化合物的任一寡聚化合物或兩種寡聚化合物可以包括軛合物基團。双股反義化合物的該等寡聚化合物可以包括非互補突出的核苷。
單股的和双股的化合物的實例包括但不限於寡核苷酸、siRNA、靶向寡核苷酸的微小RNA、以及單股RNAi化合物,如小髮夾RNA(shRNA)、單股siRNA(ssRNA)、和微小RNA模擬物。
在某些實施方式中,本文描述的化合物具有以下核鹼模體列,當按5'至3'方向編寫時,該核鹼模體列包括所靶向的靶核酸的靶區段的反向互補序列。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長10至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長12至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長12至22個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長14至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長14至20個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長15至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長15至20個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長16至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長16至20個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長17至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長17至20個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長18至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長18至21個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長18至20個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長20至30個連接的亞單位的寡核苷酸。換言之,此類寡核苷酸分別長12至30個連接的亞單位、14至30個連接的亞單位、14至20個亞單位、15至30個亞單位、15至20個亞單位、16至30個亞單位、16至20個亞單位、17至30個亞單位、17至20個亞單位、18至30個亞單位、18至20個亞單位、18至21個亞單位、20至30個亞單位、或12至22個連接的亞單位。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長14個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長16個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長17個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長18個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長19個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些實施方式中,本文描述的化合物包括長20個連接的亞單位的寡核苷酸。在其他實施方式中,本文描述的化合物包括長8至80、12至50、13至30、13至50、14至30、14至50、15至30、15至50、16至30、16至50、17至30、17至50、18至22、18至24、18至30、18至50、19至22、19至30、19至50、或20至30個連接的亞單位的寡核苷酸。在某些這樣的實施方式中,本文描述的化合物包括長8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、或80個連接的亞單位,或由以上值中任兩個所限定的範圍的寡核苷酸。在一些實施方式中,該連接的亞單位係核苷酸、核苷、或核鹼基。
在某些實施方式中,該化合物可以進一步包括另外的附接至該寡核苷酸的特徵或元件,如軛合物基團。在某些實施方式中,此類化合物係反義化合物。在某些實施方式中,此類化合物係寡聚化合物。在軛合物基團包括核苷(即將該軛合物基團連接至該寡核苷酸的核苷)的實施方式中,該軛合物基團的核苷未被算在該寡核苷酸的長度中。
在某些實施方式中,化合物可以被縮短或截短。例如,可以從5'端(5'截短)、或可替代地從3'端(3'截短)刪除單個亞單位。靶向APOL1核酸的經縮短的或經截短的化合物可以從該化合物的5'端刪除兩個亞單位,或可替代地,可以從該化合物的3'端刪除兩個亞單位。可替代地,被刪除的核苷可以分散遍及該化合物。
當單個的另外的亞單位存在於加長的化合物中時,該另外的亞單位可以位於該化合物的5'或3'端。當兩個或更多個另外的亞單位存在時,所添加的亞單位可以彼此相鄰,例如,在向該化合物的5'端(5'添加)、或可替代地向3'端(3'添加)添加了兩個亞單位的化合物中。可替代地,經添加的亞單位可以分散遍及該化合物。
增加或減少化合物(如寡核苷酸)的長度和/或引入誤配鹼基而不消除活性係可能的(Woolf等人 Proc. Natl. Acad. Sci. USA[美國國家科學院院刊] 1992, 89:7305-7309; Gautschi等人 J. Natl. Cancer Inst.[美國國立癌症研究所雜誌] 2001年3月, 93:463-471 Maher和Dolnick Nuc. Acid. Res.[核酸研究] 1998, 16:3341-3358)。然而,表面上看來,寡核苷酸序列、化學和模體中的小變化可以在臨床開發所需的許多特性的一者或多者中造成較大的差異(Seth等人 J. Med. Chem.[藥物化學雜誌] 2009, 52, 10;Egli等人 J. Am. Chem. Soc.[美國化學會誌] 2011, 133, 16642)。
在某些實施方式中,本文描述的化合物係干擾RNA化合物(RNAi),這包括双股RNA化合物(也稱為短干擾RNA或siRNA)和單股RNAi化合物(或ssRNA)。此類化合物至少部分地藉由RISC途徑起作用,以降解和/或螯合靶核酸(因此,包括微小RNA/微小RNA模擬化合物)。如本文使用的,術語siRNA意在與用於描述能夠介導序列特異性RNAi的核酸分子的其他術語係等效的,該等核酸分子係例如短干擾RNA(siRNA)、双股RNA(dsRNA)、微小RNA(miRNA)、短髮夾RNA(shRNA)、短干擾寡核苷酸、短干擾核酸、短干擾修飾的寡核苷酸、化學修飾的siRNA、轉錄後基因沈默RNA(ptgsRNA)、以及其他。另外,如本文使用的,術語RNAi意在與用於描述序列特異性RNA干擾(如轉錄後基因沈默、翻譯抑制、或表觀遺傳學)的其他術語係等效的。
在某些實施方式中,本文描述的化合物可以包括靶向本文描述的APOL1的寡核苷酸序列中的任一個。在某些實施方式中,該化合物可以是双股的。在某些實施方式中,該化合物包括第一鏈和第二鏈,該第一鏈包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基部分。在某些實施方式中,該化合物包括第一鏈和第二鏈,該第一鏈包含SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物包括核糖核苷酸,在該等核糖核苷酸中第一鏈具有代替SEQ ID NO: 13-1941的任一項中的胸腺嘧啶(T)的尿嘧啶(U)。在某些實施方式中,該化合物包括 (i) 第一鏈,其包含與APOL1上的SEQ ID NO: 13-1941中任一項所靶向的位點互補的核鹼模體列,和 (ii) 第二鏈。在某些實施方式中,該化合物包括一個或多個修飾的核苷酸,在該等核苷酸中糖中的2'位包含鹵素(如氟基團;2'-F)或包含烷氧基基團(如甲氧基基團;2'-OMe)。在某些實施方式中,該化合物包括至少一個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾。在某些實施方式中,對於沿著該dsRNA化合物的鏈的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基而言,該至少一個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾被安排成交替模式。在某些實施方式中,該化合物在相鄰核苷酸之間包括除天然存在的磷酸二酯連接之外的一種或多種連接。此類連接的實例包括磷醯胺、硫代磷酸酯、和二硫代磷酸酯連接。該等化合物還可以是化學修飾的核酸分子,如在美國專利號6,673,661中所傳授的。在其他實施方式中,該化合物包含一條或兩條加帽鏈,如由例如2000年4月19日提交的WO 00/63364。
在某些實施方式中,該化合物的第一鏈係siRNA引導鏈,並且該化合物的第二鏈係siRNA過客鏈。在某些實施方式中,該化合物的第二鏈與第一鏈互補。在某些實施方式中,該化合物的每條鏈長16、17、18、19、20、21、22、或23個連接的核苷。在某些實施方式中,該化合物的第一鏈或第二鏈可以包括軛合物基團。
在某些實施方式中,本文描述的化合物可以包括靶向本文描述的APOL1的寡核苷酸序列中的任一個。在某些實施方式中,該化合物係單股的。在某些實施方式中,這樣的化合物係單股RNAi(ssRNAi)化合物。在某些實施方式中,該化合物包括SEQ ID NO: 13-1941中任一項的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基部分。在某些實施方式中,該化合物包括SEQ ID NO: 13-1941中任一項的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物包括核糖核苷酸,在該等核糖核苷酸中尿嘧啶(U)代替SEQ ID NO: 13-1941的任一項中的胸腺嘧啶(T)。在某些實施方式中,該化合物包括與APOL1上的SEQ ID NO: 13-1941中任一項所靶向的位點互補的核鹼模體列。在某些實施方式中,該化合物包括一個或多個修飾的核苷酸,在該等核苷酸中糖中的2'位包含鹵素(如氟基團;2'-F)或包含烷氧基基團(如甲氧基基團;2'-OMe)。在某些實施方式中,該化合物包括至少一個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾。在某些實施方式中,對於沿著該化合物的鏈的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基而言,該至少一個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾被安排成交替模式。在某些實施方式中,該化合物在相鄰核苷酸之間包括除天然存在的磷酸二酯連接之外的一種或多種連接。此類連接的實例包括磷醯胺、硫代磷酸酯、和二硫代磷酸酯連接。該等化合物還可以是化學修飾的核酸分子,如在美國專利號6,673,661中所傳授的。在其他實施方式中,該化合物包含加帽鏈,如由例如2000年4月19日提交的WO 00/63364所揭露的。在某些實施方式中,該化合物由16、17、18、19、20、21、22、或23個連接的核苷組成。在某些實施方式中,該化合物可以包括軛合物基團。 某些機制
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成。在某些實施方式中,本文描述的化合物係反義化合物。在某些實施方式中,化合物包括寡聚化合物。在某些實施方式中,本文描述的化合物能夠雜交到靶核酸上,從而產生至少一種反義活性。在某些實施方式中,本文描述的化合物選擇性地影響一個或多個靶核酸。此類化合物包括雜交到一個或多個靶核酸上的核鹼模體列,從而產生一種或多種所希望的反義活性,並且不雜交到一個或多個非靶核酸上或不以產生顯著所不希望的反義活性的這樣一種方式雜交到一個或多個非靶核酸上。
在某些反義活性中,本文描述的化合物與靶核酸的雜交導致募集切割該靶核酸的蛋白。例如,本文描述的某些化合物致RNase H介導的靶核酸切割。RNase H係一種切割RNA : DNA双股體的RNA鏈的細胞內切核酸酶。這樣的RNA : DNA双股體中的DNA不必是未經修飾的DNA。在某些實施方式中,本文描述的化合物足夠「像DNA(DNA-like)」以引起RNase H活性。進一步地,在某些實施方式中,在缺口體的缺口中耐受一個或多個非DNA樣核苷。
在某些反義活性中,將本文描述的化合物或化合物的一部分載入到RNA誘導沈默複合體(RISC)中,從而最終導致靶核酸的切割。例如,本文描述的某些化合物導致該靶核酸被Argonaute切割。載入到RISC中的化合物係RNAi化合物。RNAi化合物可以是双股(siRNA)或單股(ssRNA)的。
在某些實施方式中,本文描述的化合物與靶核酸的雜交不導致募集切割該靶核酸的蛋白。在某些這樣的實施方式中,該化合物與靶核酸的雜交導致該靶核酸的剪接的改變。在某些實施方式中,該化合物與靶核酸的雜交導致該靶核酸與蛋白或其他核酸之間的結合相互作用的抑制。在某些這樣的實施方式中,該化合物與靶核酸的雜交導致該靶核酸的翻譯的改變。
可以直接地或間接地觀察到反義活性。在某些實施方式中,反義活性的觀察或檢測涉及觀察或檢測靶核酸或由這樣的靶核酸編碼的蛋白的量的變化、核酸或蛋白的剪接變體的比率的變化、和/或細胞或動物中的表型變化。 靶核酸、靶區域以及核苷酸序列
在某些實施方式中,本文描述的該等化合物包括以下寡核苷酸或由其組成,該寡核苷酸包含與靶核酸互補的區域。在某些實施方式中,該靶核酸係內源RNA分子。在某些實施方式中,該靶核酸編碼蛋白。在某些這樣的實施方式中,該靶核酸選自:mRNA和前mRNA,包括內含子區、外顯子區和非翻譯區。在某些實施方式中,該靶RNA係mRNA。在某些實施方式中,該靶核酸係前mRNA。在某些這樣的實施方式中,該靶區域整個在內含子內。在某些實施方式中,該靶區域跨內含子/外顯子接點。在某些實施方式中,該靶區域的至少50%在內含子內。
編碼APOL1的核苷酸序列包括但不限於以下:RefSEQ號NM_003661.3(藉由引用併入,本文揭露為SEQ ID NO: 1),從核苷酸15986452至16001905截短的NT_011520.9(SEQ ID NO: 2)、NM_001136541.1(SEQ ID NO: 3)、NM_001136540.1(SEQ ID NO: 4)、NM_145343.2(SEQ ID NO: 5)、DC339680.1(SEQ ID NO: 6)、AK309143.1(SEQ ID NO: 7)、從核苷酸17543446至17543655截短的NT_011520.13(SEQ ID NO: 8)、或從核苷酸36250001至36271000截短的NC_000022.11(SEQ ID NO: 9)中列出的序列。 雜交
在一些實施方式中,雜交發生在本文揭露的化合物與APOL1核酸之間。最常見的雜交機制涉及核酸分子的互補核鹼基之間的氫鍵合(例如,沃森-克裡克(Watson-Crick)、胡斯坦(Hoogsteen)或反向胡斯坦氫鍵合)。
雜交能在不同的條件下發生。雜交條件係序列依賴性的,並且由待雜交的核酸分子的性質和組成決定。
測定序列是否可與靶核酸特異性地雜交的方法係本領域熟知的。在某些實施方式中,本文提供的化合物與APOL1核酸特異性地雜交。 互補性
當將兩個核鹼模體列在相反方向上進行比對時,這樣的寡核苷酸或其一個或多個區域的核鹼模體列匹配另一個寡核苷酸或核酸或其一個或多個區域的核鹼模體列,則寡核苷酸被說成與另一個核酸互補。如本文描述的,核鹼基匹配或互補核鹼基限於以下鹼基對:腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)和尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)、以及5-甲基胞嘧啶(mC)和鳥嘌呤(G),除非另外說明。互補寡核苷酸和/或核酸無需在每個核苷處都具有核鹼基互補性,並且可以包括一個或多個核鹼基誤配。當此類寡核苷酸在每個核苷處都具有核鹼基匹配而沒有任何核鹼基誤配時,寡核苷酸係完全互補的或100%互補的。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成。在某些實施方式中,本文描述的化合物係反義化合物。在某些實施方式中,化合物包括寡聚化合物。化合物與靶核酸之間的非互補核鹼基可以被接受,只要該化合物仍然能夠與APOL1核酸特異性地雜交。此外,化合物可以雜交到APOL1核酸的一個或多個區段上,使得間插或相鄰區段不涉及在雜交事件中(例如,環結構、誤配或髮夾結構)。
在某些實施方式中,本文提供的化合物、或其指定部分與、至少與、或至多與APOL1核酸、其靶區域、靶區段、或指定部分係70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%,、或100%互補的。在某些實施方式中,本文提供的化合物、或其指定部分與APOL1核酸、其靶區域、靶區段、或指定部分係70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%、95%至100%、或該等範圍之間的任何數字互補的。化合物與靶核酸的百分比互補性可以使用常規方法測定。
例如,在化合物的20個核鹼基中有18個與靶區域互補並且因此特異性雜交的化合物代表90%互補性。在這個實例中,剩餘的非互補核鹼基可以與互補核鹼基成簇或散佈,並且不需要彼此連續或與互補核鹼基連續。因此,長18個核鹼基、具有由與靶核酸完全互補的兩個區域側接的四個非互補核鹼基的化合物與靶核酸具有77.8%的總體互補性。使用本領域已知的BLAST程式(基本局部比對搜索工具)和PowerBLAST程式(Altschul等人, J. Mol. Biol.[分子生物學雜誌], 1990, 215, 403 410;Zhang和Madden,Genome Res.[基因組研究],, 1997, 7, 649 656)可以常規地確定化合物與靶核酸區域的互補性百分比。可以藉由例如使用Smith和Waterman的演算法(Adv. Appl. Math.[應用數學進展], 1981, 2, 482 489)的Gap程式(威斯康辛序列分析套裝軟體(Wisconsin Sequence Analysis Package),用於Unix的版本8,遺傳學電腦集團(Genetics Computer Group),威斯康辛州麥迪森大學科技園(University Research Park, Madison Wis.)),使用默認設置確定百分比同源性、序列同一性或互補性。
在某些實施方式中,本文描述的化合物或其指定部分與靶核酸、或其指定部分完全互補(即100%互補)。例如,化合物可以與APOL1核酸、或其靶區域、或靶區段或靶序列完全互補。如本文使用的,「完全互補」意指化合物的每個核鹼基與靶核酸的對應核鹼基係互補的。例如,只要400個核鹼基長的靶核酸中存在與20個核鹼基的化合物完全互補的相應的20個核鹼基部分,則該化合物與該靶序列完全互補。完全互補也可以關於第一和/或第二核酸的指定部分來使用。例如,30個核鹼基化合物的20個核鹼基部分可以與400個核鹼基長的靶序列「完全互補」。30個核鹼基的化合物的20個核鹼基部分與該靶序列完全互補,如果該靶序列具有相應的20個核鹼基部分、其中每個核鹼基與該化合物的20個核鹼基部分互補的話。同時,整個30個核鹼基的化合物可以完全或可以不完全與該靶序列互補,這取決於該化合物的剩餘10個核鹼基是否也與該靶序列互補。
在某些實施方式中,相對於該靶核酸,本文描述的化合物包括一個或多個誤配的核鹼基。在某些這樣的實施方式中,針對該靶標的反義活性被此類誤配降低,但是針對非靶標的活性被降低更大的量。因此,在某些這樣的實施方式中,該化合物的選擇性得以改進。在某些實施方式中,該誤配特異性地位於具有缺口體模體的寡核苷酸內。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離該缺口區域的5'-端的位置1、2、3、4、5、6、7、或8處。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離該缺口區域的3'-端的位置9、8、7、6、5、4、3、2、1處。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離該翼區域的5'-端的位置1、2、3、或4處。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離該翼區域的3'-端的位置4、3、2、或1處。在某些實施方式中,該誤配特異性地位於不具有缺口體模體的寡核苷酸內。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離寡核苷酸的5'-端的位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12處。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離寡核苷酸的3'-端的位置2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12處。
非互補核鹼基的位置可以在該化合物的5'端或3'端。可替代地,非互補核鹼基或核鹼基可以在該化合物的內部位置處。當存在兩個或更多個非互補核鹼基時,它們可以是連續的(即連接的)或不連續的。在一個實施方式中,非互補核鹼基位於缺口體寡核苷酸的翼區段中。
在某些實施方式中,長、或長達11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個核鹼基的本文描述的化合物相對於靶核酸(如APOL1核酸)或其指定部分包括不超過4、不超過3、不超過2、或不超過1個非互補核鹼基。
在某些實施方式中,長、或長達11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、或30個核鹼基的本文描述的化合物相對於靶核酸(如APOL1核酸)或其指定部分包括不超過6、不超過5、不超過4、不超過3、不超過2、或不超過1個非互補核鹼基。
在某些實施方式中,本文描述的化合物還包括與靶核酸的一部分互補的那些。如本文使用的,「部分」係指靶核酸的區域或區段內確定數目的連續的(即連接的)核鹼基。「部分」也可以指化合物的確定數目的連續核鹼基。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少8個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少9個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少10個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少11個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少12個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少13個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少14個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少15個核鹼基部分互補。在某些實施方式中,該等化合物與靶區段的至少16個核鹼基部分互補。還考慮了與靶區段的至少9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個核鹼基部分、或由該等值中任兩個所限定的範圍互補的化合物。 同一性
本文提供的該等化合物也可以與特定核苷酸序列、SEQ ID NO、或由特定ION編號代表的化合物、或其部分具有確定的百分比同一性。在某些實施方式中,本文描述的化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,本文描述的化合物係修飾的寡核苷酸。如本文使用的,如果化合物具有與本文揭露的序列相同的核鹼基配對能力,則該反義化合物與本文揭露的序列係相同的。例如,代替揭露的DNA序列中的胸腺嘧啶而包含尿嘧啶的RNA被認為與該DNA序列係相同的,因為尿嘧啶和胸腺嘧啶兩者均與腺嘌呤配對。還考慮了本文描述的化合物的縮短和加長形式以及相對於本文提供的化合物具有非同一鹼基的化合物。該等非同一鹼基可以彼此相鄰或分散遍及該化合物。化合物的百分比同一性根據相對於與它正在進行比較的序列具有同一鹼基配對的鹼基數來計算。
在某些實施方式中,本文描述的化合物或其部分與本文揭露的化合物或SEQ ID NO、或其部分的一個或多個係,或至少係70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%相同的。在某些實施方式中,本文描述的化合物與特定核苷酸序列、SEQ ID NO、或由特定ION編號代表的化合物、或其部分係約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%同一性,或該等值之間的任何百分比,其中該等化合物包括具有一個或多個誤配的核鹼基的寡核苷酸。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離寡核苷酸的5'-端的位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12處。在某些這樣的實施方式中,該誤配在離寡核苷酸的3'-端的位置2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12處。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括反義化合物或由其組成。在某些實施方式中,將該反義化合物的一部分與該靶核酸的相同長度部分進行比較。在某些實施方式中,將8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25個核鹼基的部分與該靶核酸的相同長度部分進行比較。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸或由其組成。在某些實施方式中,將該寡核苷酸的一部分與該靶核酸的等長部分進行比較。在某些實施方式中,將8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25個核鹼基的部分與該靶核酸的相同長度部分進行比較。 某些修飾的化合物
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸或由其組成,該寡核苷酸由連接的核苷組成。寡核苷酸可以是未經修飾的寡核苷酸(RNA或DNA)或可以是修飾的寡核苷酸。相對於未經修飾的RNA或DNA,修飾的寡核苷酸包括至少一種修飾(即,包括至少一種修飾的核苷(包含修飾的糖部分和/或修飾的核鹼基)和/或至少一種修飾的核苷間連接)。 A. 修飾的核苷
修飾的核苷包括修飾的糖部分或修飾的核鹼基或同時包括修飾的糖部分和修飾的核鹼基。 1. 修飾的糖部分
在某些實施方式中,糖部分係非二環修飾的糖部分。在某些實施方式中,修飾的糖部分係二環的或三環的糖部分。在某些實施方式中,修飾的糖部分係糖代用品。此類糖代用品可以包括對應於修飾的糖部分其他類型的那些的一個或多個取代。
在某些實施方式中,修飾的糖部分係非二環修飾的呋喃糖基糖部分,該等非二環修飾的呋喃糖基糖部分包含一個或多個非環狀取代基(包括但不限於2'、4'、和/或5'位處的取代基)。在某些實施方式中,該呋喃糖基糖部分係核糖基糖部分。在某些實施方式中,非二環修飾的糖部分的一個或多個無環取代基係支鏈的。適合非二環修飾的糖部分的2'-取代基基團的實例包括但不限於:2'-F、2'-OCH 3(「OMe」或「O-甲基」)和2'-O(CH 2) 2OCH 3(「MOE」)。在某些實施方式中,2'-取代基基團選自:鹵素、烯丙基、胺基、疊氮基、SH、CN、OCN、CF 3、OCF 3、O-C 1-C 10烷氧基、O-C 1-C 10取代的烷氧基、O-C 1-C 10烷基、O-C 1-C 10取代的烷基、S-烷基、N(R m)-烷基、O-烯基、S-烯基、N(R m)-烯基、O-炔基、S-炔基、N(R m)-炔基、O-伸烷基-O-烷基、炔基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基、O-芳烷基、O(CH 2) 2SCH 3、O(CH 2) 2ON(R m)(R n)或OCH 2C(=O)-N(R m)(R n),其中每個R m和R n獨立地是H、胺基保護基團、或取代的或未取代的C 1-C 10烷基,以及描述於Cook等人,U.S. 6,531,584;Cook等人,U.S. 5,859,221;和Cook等人,U.S. 6,005,087的2'-取代基基團。該等2'-取代基基團的某些實施方式可以進一步被獨立地選自以下項的一個或多個取代基基團取代:羥基、胺基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基(NO 2)、硫醇基、硫代烷氧基、硫代烷基、鹵素、烷基、芳基、烯基以及炔基。適用於線性非雙環修飾的糖部分的4'-取代基的實例包括但不限於烷氧基(例如甲氧基)、烷基和描述於Manoharan等人,WO 2015/106128中的那些。適於非二環修飾的糖部分的5'-取代基基團的實例包括但不限於:5'-甲基(R或S)、5'-乙烯基、和5'-甲氧基。在某些實施方式中,非雙環修飾的糖包含超過一個非橋接糖取代基,例如2'-F-5'-甲基糖部分,和描述於Migawa等人,WO 2008/101157和Rajeev等人,US 2013/0203836中的修飾的糖部分和修飾的核苷。
在某些實施方式中,2'-取代的核苷或2'-非二環修飾的核苷包括包含選自以下項的線性2'-取代基基團的糖部分:F、NH 2、N 3、OCF 3 OCH 3、O(CH 2) 3NH 2、CH 2CH=CH 2、OCH 2CH=CH 2、OCH 2CH 2OCH 3、O(CH 2) 2SCH 3、O(CH 2) 2ON(R m)(R n)、O(CH 2) 2O(CH 2) 2N(CH 3) 2、以及N-取代的乙醯胺(OCH 2C(=O)-N(R m)(R n)),其中每個R m和R n獨立地是H、胺基保護基團、或取代的或未取代的C 1-C 10烷基。
在某些實施方式中,2'-取代的核苷或2'-非二環修飾的核苷包括包含選自以下項的線性2'-取代基基團的糖部分:F、OCF 3、OCH 3、OCH 2CH 2OCH 3、O(CH 2) 2SCH 3、O(CH 2) 2ON(CH 3) 2、O(CH 2) 2O(CH 2) 2N(CH 3) 2、以及OCH 2C(=O)-N(H)CH 3(「NMA」)。
在某些實施方式中,2'-取代的核苷或2'-非二環修飾的核苷包括包含選自以下項的線性2'-取代基基團的糖部分:F、OCH 3、和OCH 2CH 2OCH 3
包含修飾的糖部分(如非二環修飾的糖部分)的核苷藉由該核苷的糖部分上的一個或多個取代的位置來提及。例如,包含2'-取代的或2-修飾的糖部分的核苷被稱為2'-取代的核苷或2-修飾的核苷。
某些修飾的糖部分包括形成第二環的橋接糖取代基,從而產生二環糖部分。在某些這樣的實施方式中,該二環糖部分在4'與2'呋喃糖環原子之間包括橋。在某些這樣的實施方式中,呋喃糖環係核糖環。此類4'到2'橋接糖取代基的實例包括但不限於:4'-CH 2-2'、4'-(CH 2) 2-2'、4'-(CH 2) 3-2'、4'-CH 2-O-2'(「LNA」)、4'-CH 2-S-2'、4'-(CH 2) 2-O-2'(「ENA」)、4'-CH(CH 3)-O-2'(當處於 S組態時,被稱作「受約束的乙基」或「cEt」)、4'-CH 2-O-CH 2-2'、4'-CH 2-N(R)-2'、4'-CH(CH 2OCH 3)-O-2'(「受約束的MOE」或「cMOE」)及其類似物(參見例如,Seth等人,U.S. 7,399,845,Bhat等人,U.S. 7,569,686,Swayze等人,U.S. 7,741,457,和Swayze等人,U.S. 8,022,193)、4'-C(CH 3)(CH 3)-O-2'及其類似物(參見例如,Seth等人,U.S. 8,278,283)、4'-CH 2-N(OCH 3)-2'及其類似物(參見例如,Prakash等人,U.S. 8,278,425)、4'-CH 2-O-N(CH 3)-2'(參見例如,Allerson等人,U.S. 7,696,345和Allerson等人,U.S. 8,124,745)、4'-CH 2-C(H)(CH 3)-2'(參見例如,Zhou等人, J. Org. Chem.[有機化學雜誌] 2009, 74, 118-134)、4'-CH 2-C(=CH 2)-2'及其類似物(參見例如,Seth等人,U.S. 8,278,426)、4'‑C(R aR b)-N(R)-O-2'、4'-C(R aR b)-O-N(R)-2'、4'-CH 2-O-N(R)-2'、和4'-CH 2-N(R)-O-2',其中每個R、R a、和R b獨立地是H、保護基團、或C 1-C 12烷基(參見例如,Imanishi等人,U.S. 7,427,672)。
在某些實施方式中,此類4'至2'橋獨立地包括從1至4個獨立地選自以下項的連接的基團:-[C(R a)(R b)] n-、-[C(R a)(R b)] n-O-、‑C(R a)=C(R b)-、‑C(R a)=N-、C(=NR a)-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(R a) 2-、-S(=O) x-、以及‑N(R a)-; 其中: x係0、1、或2; n係1、2、3、或4; 每個R a和R b獨立地是H、保護基團、羥基、C 1-C 12烷基、取代的C 1-C 12烷基、C 2-C 12烯基、取代的C 2-C 12烯基、C 2-C 12炔基、取代的C 2-C 12炔基、C 5-C 20芳基、取代的C 5-C 20芳基、雜環基、取代的雜環基、雜芳基、取代的雜芳基、C 5-C 7脂環基、取代的C 5-C 7脂環基、鹵素、OJ 1、NJ 1J 2、SJ 1、N 3、COOJ 1、醯基(C(=O)-H)、取代的醯基、CN、磺醯基(S(=O) 2-J 1)、或次硫酸基(sulfoxyl,S(=O)-J 1);並且每個J 1和 J 2獨立地是H、C 1-C 12烷基、取代的C 1-C 12烷基、C 2-C 12烯基、取代的C 2-C 12烯基、C 2-C 12炔基、取代的C 2-C 12炔基、C 5-C 20芳基、取代的C 5-C 20芳基、醯基(C(=O)-H)、取代的醯基、雜環基、取代的雜環基、C 1-C 12胺基烷基、取代的C 1-C 12胺基烷基、或保護基團。
另外的二環糖部分在本領域是已知的,參見例如:Freier等人, Nucleic Acids Research[核酸研究], 1997, 25( 22),4429-4443,Albaek等人, J. Org. Chem.[有機化學雜誌] 2006, 71, 7731-7740,Singh等人, Chem. Commun.[化學通訊] 1998, 4, 455-456;Koshkin等人, Tetrahedron[四面體快報] 1998, 54, 3607-3630;Wahlestedt等人, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.[美國國家科學院院刊] 2000, 97, 5633-5638;Kumar等人, Bioorg. Med. Chem. Lett.[生物有機化學與醫藥化學快報],1998, 8, 2219-2222;Singh等人, J. Org. Chem. [有機化學雜誌], 1998, 63, 10035-10039;Srivastava等人, J. Am. Chem. Soc. [美國化學會誌], 2007, 129,8362-8379;Elayadi等人, Curr. Opinion Invens. Drugs,[研究藥物的最新觀點] 2001, 2, 558-561;Braasch等人, Chem. Biol.,[化學生物學] 2001, 8, 1-7;Orum等人, Curr. Opinion Mol. Ther.[分子療法的最新觀點] ,2001, 3, 239-243;Wengel等人,U.S. 7,053,207,Imanishi等人, U.S. 6,268,490,Imanishi等人, U.S. 6,770,748,Imanishi等人, U.S. RE44,779;Wengel等人, U.S. 6,794,499,Wengel等人, U.S. 6,670,461;Wengel等人, U.S. 7,034,133,Wengel等人, U.S. 8,080,644;Wengel等人, U.S. 8,034,909;Wengel等人, U.S. 8,153,365;Wengel等人, U.S. 7,572,582;和Ramasamy等人, U.S. 6,525,191,Torsten等人, WO 2004/106356,Wengel等人, WO 1999/014226;Seth等人, WO 2007/134181;Seth等人, U.S. 7,547,684;Seth等人, U.S. 7,666,854;Seth等人, U.S. 8,088,746;Seth等人, U.S. 7,750,131;Seth等人, U.S. 8,030,467;Seth等人, U.S. 8,268,980;Seth等人, U.S. 8,546,556;Seth等人, U.S. 8,530,640;Migawa等人, U.S. 9,012,421;Seth等人, U.S. 8,501,805;Allerson等人, US2008/0039618;和Migawa等人, US2015/0191727。
在某些實施方式中,二環糖部分和摻入此類二環糖部分的核苷進一步藉由同分異構組態來定義。例如,LNA核苷(本文描述的)可以處於α-L組態或處於β-D組態。
α-L-亞甲基氧基(4'-CH 2-O-2')或α-L-LNA二環核苷已經被摻入顯示反義活性的寡核苷酸中(Frieden等人, Nucleic Acids Research[核酸研究],2003, 21 6365-6372)。本文,二環核苷的概述包括兩種同分異構組態。當在此處的示例實施方式中鑒定具體二環核苷(例如,LNA或cEt)的位置時,它們處於β-D組態,除非另外說明。
在某些實施方式中,修飾的糖部分包括一個或多個非橋接糖取代基和一個或多個橋接糖取代基(例如,5'-取代的和4'-2'橋接的糖)。
在某些實施方式中,修飾的糖部分係糖代用品。在某些這樣的實施方式中,該糖部分的氧原子被例如硫、碳或氮原子替換。在某些這樣的實施方式中,此類修飾的糖部分還包括本文描述的橋接和/或非橋接取代基。例如,某些糖代用品包括4'-硫原子和在2'-位(參見,例如Bhat等人, U.S. 7,875,733和Bhat等人, U.S. 7,939,677)和/或5'位處的取代。
在某些實施方式中,糖代用品包括具有不同於5個原子的環。例如,在某些實施方式中,糖代用品包括六元四氫哌喃(「THP」)。此類四氫哌喃可以被進一步修飾或取代。包含此類修飾的四氫哌喃的核苷包括但不限於己糖醇核酸(「HNA」)、安尼妥(anitol)核酸(「ANA」)、甘露醇核酸(「MNA」)(參見例如Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem.[生物有機化學與醫藥化學] 2002, 10, 841-854)、氟HNA: (「F-HNA」,參見例如,Swayze等人,U.S. 8,088,904;Swayze等人, U.S. 8,440,803;和Swayze等人,U.S. 9,005,906,F-HNA還可以稱為F-THP或3'-氟四氫哌喃)、以及包含另外的具有下式的修飾的THP化合物的核苷: 其中,獨立地,對於所述修飾的THP核苷中的每者: Bx係核鹼基部分; T 3和T 4各自獨立地是將該修飾的THP核苷連接至寡核苷酸的剩餘部分的核苷間連接基團,或T 3和T 4之一係將該修飾的THP核苷連接至寡核苷酸的剩餘部分的核苷間連接基團,並且T 3和T 4中另一者係H、羥基保護基團、連接的軛合物基團、或5'或3'-端基;q 1、q 2、q 3、q 4、q 5、q 6和q 7各自獨立地是H、C 1-C 6烷基、取代的C 1-C 6烷基、C 2-C 6烯基、取代的C 2-C 6烯基、C 2-C 6炔基、或取代的C 2-C 6炔基;並且 每個R 1和R 2獨立地選自:氫、鹵素、取代的或未取代的烷氧基、NJ 1J 2、SJ 1、N 3、OC(=X)J 1、OC(=X)NJ 1J 2、NJ 3C(=X)NJ 1J 2、、和CN,其中X係O、S或NJ 1,並且每個J 1、J 2、和J 3獨立地是H或C 1-C 6烷基。
在某些實施方式中,提供了修飾的THP核苷,其中q 1、q 2、q 3、q 4、q 5、q 6和q 7各自係H。在某些實施方式中,q 1、q 2、q 3、q 4、q 5、q 6和q 7中至少一個不同於H。在某些實施方式中,q 1、q 2、q 3、q 4、q 5、q 6和q 7中至少一個係甲基。在某些實施方式中,提供了修飾的THP核苷,其中R 1和R 2之一係F。在某些實施方式中,R 1係F,並且R 2係H。在某些實施方式中,R 1係甲氧基,並且R 2係H,並且在某些實施方式中,R 1係甲氧基乙氧基,並且R 2係H。
在某些實施方式中,糖代用品包括具有超過5個原子和超過一個雜原子的環。例如,已經報導了包含𠰌啉基糖部分的核苷及其在寡核苷酸中的使用(參見,例如,Braasch等人,Biochemistry [生物化學], 2002, 41, 4503-4510和Summerton等人,U.S. 5,698,685;Summerton等人,U.S. 5,166,315;Summerton等人,U.S. 5,185,444;以及Summerton等人,U.S. 5,034,506)。如本文使用的,術語「𠰌啉基」意指具有以下結構的糖代用品:
在某些實施方式中,可以例如藉由添加或改變來自以上𠰌啉基結構的不同取代基基團來修飾𠰌啉基。此類糖代用品本文被稱為「修飾的𠰌啉基」。
在某些實施方式中,糖代用品包括非環狀部分。包含此類非環狀糖代用品的核苷和寡核苷酸的實例包括但不限於:肽核酸(「PNA」)、非環狀丁基核酸(參見,例如,Kumar等人, Org. Biomol. Chem.[有機化學與生物分子化學],2013, 11, 5853-5865),並且核苷和寡核苷酸描述於Manoharan等人,US2013/130378中。
在本領域中已知許多其他可以用於修飾的核苷中的二環和三環糖和糖代用品環系統。 2. 修飾的核鹼基
核鹼基(或鹼基)修飾或取代在結構上可與天然存在的或合成的未經修飾的核鹼基區別,但是在功能上可與其互換。天然的和修飾的核鹼基兩者都能夠參與氫鍵合。此類核鹼基修飾可以賦予反義化合物以核酸酶穩定性、結合親和力或一些其他有益的生物學特性。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個包含未經修飾的核鹼基的核苷。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個包含經修飾的核鹼基的核苷。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個不包含核鹼基的核苷(被稱為無鹼基核苷)。
在某些實施方式中,修飾的核鹼基選自:5-取代的嘧啶、6-氮雜嘧啶、烷基或炔基取代的嘧啶、烷基取代的嘌呤、以及N-2、N-6和O-6取代的嘌呤。在某些實施方式中,修飾的核鹼基選自:2-胺丙基腺嘌呤、5-羥甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、6-N-甲基鳥嘌呤、6-N-甲基腺嘌呤、2-丙基腺嘌呤、2-硫尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-丙炔基 (C≡C-CH3) 尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、6-偶氮胞嘧啶、6-偶氮胸腺嘧啶、5-核糖基尿嘧啶 (假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-鹵代、8-胺基、8-硫醇基、8-硫代烷基、8-羥基、8-氮雜和其他8-取代的嘌呤、5-鹵代、(特別是5-溴、5-三氟甲基、5-鹵代尿嘧啶、和5-鹵代胞嘧啶、7-甲基鳥嘌呤、7-甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-胺基腺嘌呤、7-去氮雜鳥嘌呤、7-去氮雜腺嘌呤、3-去氮雜鳥嘌呤、3-去氮雜腺嘌呤、6-N-苯甲醯基腺嘌呤、2-N-異丁醯基鳥嘌呤、4-N-苯甲醯基胞嘧啶、4-N-苯甲醯基尿嘧啶、5-甲基 4-N-苯甲醯基胞嘧啶、5-甲基 4-N-苯甲醯基尿嘧啶、通用鹼基,疏水性鹼基,混雜的鹼基,大小擴大的鹼基,以及氟化的鹼基。另外的修飾的核鹼基包括三環嘧啶,如1,3-二氮雜吩㗁𠯤-2-酮、1,3-二氮雜吩噻𠯤-2-酮和9-(2-胺基乙氧基)-1,3-二氮雜吩㗁𠯤-2-酮(G-鉗)。修飾的核鹼基還可以包括其中的嘌呤或嘧啶鹼基被其他雜環替換的那些,例如7-去氮雜-腺嘌呤、7-去氮雜鳥苷、2-胺基吡啶和2-吡啶酮。另外的核鹼基包括揭露於Merigan等人, U.S. 3,687,808中的那些,揭露於The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering [高分子科學與工程簡明百科],Kroschwitz, J.I., 編輯, John Wiley & Sons [約翰·威利父子公司出版社], 1990, 858-859;Englisch等人, Angewandte Chemie [應用化學], 國際版, 1991, 30, 613;Sanghvi, Y.S., 第15章,Antisense Research and Applications [反義研究與應用], Crooke, S.T.和Lebleu, B.,編輯,CRC出版社, 1993, 273-288中的那些;和揭露於Antisense Drug Technology [反義藥物技術] 第6和第15章, Crooke S.T., 編輯, CRC出版社, 2008, 163-166和442-443中的那些。
傳授了上文指出的修飾的核鹼基中的某些以及其他修飾的核鹼基的製備的公開物包括但不限於Manoharan等人, US2003/0158403,Manoharan等人, US2003/0175906;Dinh等人, U.S. 4,845,205;Spielvogel等人, U.S. 5,130,302;Rogers等人, U.S. 5,134,066;Bischofberger等人, U.S. 5,175,273;Urdea等人, U.S. 5,367,066;Benner等人, U.S. 5,432,272;Matteucci等人, U.S. 5,434,257;Gmeiner等人, U.S. 5,457,187;Cook等人, U.S. 5,459,255;Froehler等人, U.S. 5,484,908;Matteucci等人, U.S. 5,502,177;Hawkins等人, U.S. 5,525,711;Haralambidis等人, U.S. 5,552,540;Cook等人, U.S. 5,587,469;Froehler等人, U.S. 5,594,121;Switzer等人, U.S. 5,596,091;Cook等人, U.S. 5,614,617;Froehler等人, U.S. 5,645,985;Cook等人, U.S. 5,681,941;Cook等人, U.S. 5,811,534;Cook等人, U.S. 5,750,692;Cook等人, U.S. 5,948,903;Cook等人, U.S. 5,587,470;Cook等人, U.S. 5,457,191;Matteucci等人, U.S. 5,763,588;Froehler等人, U.S. 5,830,653;Cook等人, U.S. 5,808,027;Cook等人, U.S. 6,166,199;和Matteucci等人, U.S. 6,005,096。
在某些實施方式中,靶向APOL1核酸的化合物包含一個或多個修飾的核鹼基。在某些實施方式中,該修飾的核鹼基係5-甲基胞嘧啶。在某些實施方式中,每個胞嘧啶都是5-甲基胞嘧啶。 修飾的核苷間連接
RNA和DNA的天然存在的核苷間連接係3'至5'磷酸二酯連接。在某些實施方式中,由於所希望的特性,例如像,增強的細胞攝取、對靶核酸的增強的親和力、和在核酸酶存在下增加的穩定性,具有一個或多個修飾的(即,非天然存在的)核苷間連接的本文描述的化合物被選擇為優於具有天然存在的核苷間連接的化合物。
具有手性中心的代表性的核苷間連接包括但不限於烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。包含具有手性中心的核苷間連接的修飾的寡核苷酸可以製備為包含立體隨機核苷間連接的修飾的寡核苷酸群體,或者製備為包含以特定的立體化學組態的硫代磷酸酯連接的修飾寡核苷酸群體。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸群體包含硫代磷酸酯核苷間連接,其中所有硫代磷酸酯核苷間連接係立體隨機的。可以使用合成方法產生這種修飾的寡核苷酸,該合成方法導致每個硫代磷酸酯連接的立體化學組態的隨機選擇。儘管如此,如熟悉該項技術者所熟知的,每個單獨的寡核苷酸分子的每個單獨的硫代磷酸酯具有確定的立體組態。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸群體富含以下修飾的寡核苷酸:該修飾的寡核苷酸包含以特定的、獨立選擇的立體化學組態的一個或多個特定的硫代磷酸酯核苷間連接。在某些實施方式中,特定硫代磷酸酯連接的特定組態存在於群體中至少65%的分子中。在某些實施方式中,特定硫代磷酸酯連接的特定組態存在於群體中至少70%的分子中。在某些實施方式中,特定硫代磷酸酯連接的特定組態存在於群體中至少80%的分子中。在某些實施方式中,特定硫代磷酸酯連接的特定組態存在於群體中至少90%的分子中。在某些實施方式中,特定硫代磷酸酯連接的特定組態存在於群體中至少99%的分子中。這種手性富集的修飾的寡核苷酸群體可以使用本領域已知的合成方法產生,例描述於Oka等人, JACS125, 8307 (2003), Wan等人 Nuc. Acid. Res.[核酸研究] 42, 13456 (2014),和WO 2017/015555的方法。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸群體富含具有至少一個以( Sp)組態的指示的硫代磷酸酯的修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸群體富含具有至少一個以( Rp)組態的硫代磷酸酯的修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,包含( Rp)和/或( Sp)硫代磷酸酯的修飾的寡核苷酸分別包含下式中的一個或多個,其中「B」指示核鹼基:
除非另有說明,否則本文所述的修飾的寡核苷酸的手性核苷間連接可以是立體隨機的或以特定的立體化學組態。
在某些實施方式中,靶向APOL1核酸的化合物包含一個或多個修飾的核苷間連接。在某些實施方式中,該修飾的核苷間連接係硫代磷酸酯連接。在某些實施方式中,反義化合物的每個核苷間連接均為硫代磷酸酯核苷間連接。
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸。具有修飾的核苷間連接的寡核苷酸包括保留磷原子的核苷間連接以及不具有磷原子的核苷間連接。代表性的含磷核苷間連接包括但不限於磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯、以及硫代磷酸酯。製備含磷連接和非含磷連接的方法係熟知的。
在某些實施方式中,可以使用任何核苷間連接將修飾的寡核苷酸的核苷連接在一起。藉由存在或不存在磷原子來定義兩類主要的核苷間連接基團。代表性的含磷核苷間連接包括但不限於包含磷酸二酯鍵(「P=O」)的磷酸酯(也被稱為未經修飾的或天然存在的連接)、磷酸三酯、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯、以及硫代磷酸酯(「P=S」)和二硫代磷酸酯(「HS-P=S」)。代表性的非含磷核苷間連接基團包括但不限於亞甲基甲亞胺基(-CH2-N(CH3)-O-CH2-)、硫代二酯、硫胺酯(-O-C(=O)(NH)-S-);矽氧烷(-O-SiH2-O-);以及N,N'-二甲基肼(-CH2-N(CH3)-N(CH3)-)。與天然存在的磷酸酯連接相比,修飾的核苷間連接可以用於改變(典型地是增加)寡核苷酸的核酸酶抗性。在某些實施方式中,具有手性原子的核苷間連接可以被製備為外消旋混合物,或製備為單獨的鏡像異構物。代表性的手性核苷間連接包括但不限於烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。製備含磷核苷間連接和非含磷核苷間連接的方法係熟悉該項技術者所熟知的。
中性核苷間連接包括但不限於磷酸三酯、甲基膦酸酯、MMI(3'-CH2-N(CH3)-O-5')、醯胺-3(3'-CH2-C(=O)-N(H)-5')、醯胺-4(3'-CH2-N(H)-C(=O)-5')、縮甲乙醛(formacetal)(3'-O-CH2-O-5')、甲氧丙基、以及硫代縮甲乙醛(3'-S-CH2-O-5')。另外的中性核苷間連接包括包含矽氧烷(二烷基矽氧烷)、羧酸酯、羧醯胺、硫化物、磺酸酯和醯胺的非離子連接(參見例如:Carbohydrate Modifications in Antisense Research [反義研究中的碳水化合物修飾];Y.S. Sanghvi和P.D. Cook, 編輯, ACS Symposium Series 580 [ACS研討會文集580];第3和第4章, 40-65)。另外的中性核苷間連接包括包含混合的N、O、S和CH2組成部分的非離子連接。
在某些實施方式中,寡核苷酸包括沿著該寡核苷酸或其區域安排成限定模式或修飾的核苷間連接模體的修飾的核苷間連接。在某些實施方式中,核苷間連接被安排成帶缺口的模體。在這樣的實施方式中,兩個翼區域的每個中的核苷間連接與缺口區域中的核苷間連接係不同的。在某些實施方式中,翼中的核苷間連接係磷酸二酯,並且缺口中的核苷間連接係硫代磷酸酯。獨立地選擇核苷模體,所以具有帶缺口的核苷間連接模體的此類寡核苷酸可以具有或可以沒有帶缺口的核苷模體,並且如果它的確具有帶缺口的核苷模體,則翼和缺口長度可以相同或可以不相同。
在某些實施方式中,寡核苷酸包括具有交替的核苷間連接模體的區域。在某些實施方式中,寡核苷酸包括一致修飾的核苷間連接的區域。在某些這樣的實施方式中,該寡核苷酸包括藉由硫代磷酸酯核苷間連接均勻地連接的區域。在某些實施方式中,該寡核苷酸藉由硫代磷酸酯均勻地連接。在某些實施方式中,該寡核苷酸的每個核苷間連接都選自磷酸二酯和硫代磷酸酯。在某些實施方式中,該寡核苷酸的每個核苷間連接選擇磷酸二酯和硫代磷酸酯,並且至少一種核苷間連接係硫代磷酸酯。
在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少6個硫代磷酸酯核苷間連接。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少8個硫代磷酸酯核苷間連接。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少10個硫代磷酸酯核苷間連接。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少6個連續硫代磷酸酯核苷間連接的至少一個嵌段。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少8個連續硫代磷酸酯核苷間連接的至少一個嵌段。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少10個連續硫代磷酸酯核苷間連接的至少一個嵌段。在某些實施方式中,該寡核苷酸包括至少一種12個連續硫代磷酸酯核苷間連接的至少一個嵌段。在某些這樣的實施方式中,至少一個此類嵌段位於該寡核苷酸的3'端。在某些這樣的實施方式中,至少一個此類嵌段位於該寡核苷酸的3'端的3個核苷內。
在某些實施方式中,寡核苷酸包括一個或多個甲基膦酸酯連接。在某些實施方式中,具有缺口體核苷模體的寡核苷酸包括包含除一個或兩個甲基膦酸酯連接之外的所有硫代磷酸酯連接的連接模體。在某些實施方式中,一個甲基膦酸酯連接在具有缺口體核苷模體的寡核苷酸的中心缺口中。
在某些實施方式中,令人希望的是將硫代磷酸酯核苷間連接和磷酸二酯核苷間連接的數目安排成維持核酸酶抗性。在某些實施方式中,令人希望的是將硫代磷酸酯核苷間連接的數目和位置以及磷酸二酯核苷間連接的數目和位置安排成維持核酸酶抗性。在某些實施方式中,可以減少硫代磷酸酯核苷間連接的數目,並且可以增加磷酸二酯核苷間連接的數目。在某些實施方式中,可以減少硫代磷酸酯核苷間連接的數目,並且可以增加磷酸二酯核苷間連接的數目,同時仍維持核酸酶抗性。在某些實施方式中,令人希望的是減少硫代磷酸酯核苷間連接的數目,同時保留核酸酶抗性。在某些實施方式中,令人希望的是增加磷酸二酯核苷間連接的數目,同時保留核酸酶抗性。 3. 某些模體
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸。寡核苷酸可以具有模體,例如未經修飾的和/或修飾的糖部分、核鹼基、和/或核苷間連接的模式。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個修飾的核苷,該等核苷包含修飾的糖。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個修飾的核苷,該等核苷包含修飾的核鹼基。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括一個或多個修飾的核苷間連接。在這樣的實施方式中,修飾的寡核苷酸的修飾的、未經修飾的、和不同修飾的糖部分、核鹼基、和/或核苷間連接限定了模式或模體。在某些實施方式中,糖部分、核鹼基、和核苷間連接的模式係各自彼此獨立的。因此,修飾的寡核苷酸可以由其糖模體、核鹼基模體和/或核苷間連接模體來描述(如本文使用的,獨立於核鹼基的序列,核鹼基模體描述了對該等核鹼基的修飾)。 a. 某些糖模體
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸。在某些實施方式中,寡核苷酸包括一種或多種類型的沿著該寡核苷酸或其區域安排成限定模式或糖模體的修飾的糖和/或未經修飾的糖部分。在某些情況下,此類糖模體包括但不限於本文討論的糖修飾中的任一種。
在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括具有缺口體模體的區域或由其組成,該缺口體模體包括兩個外部區域或「翼」和中心或內部區域或「缺口」。缺口體模體的這三個區域(5'-翼、缺口、和3'-翼)形成連續序列的核苷,其中該等翼中每者的核苷的糖部分中的至少一些不同於該缺口的核苷的糖部分中的至少一些。具體地,至少每個翼的核苷的離缺口最近的糖部分(5'-翼的最3'核苷和3'-翼的最5'核苷)不同於相鄰缺口核苷的糖部分,因此在翼與缺口之間限定了邊界(即,翼/缺口接點)。在某些實施方式中,缺口內的糖部分彼此相同。在某些實施方式中,該缺口包括一個或多個具有以下糖部分的核苷,該糖部分不同於該缺口的一個或多個其他核苷的糖部分。在某些實施方式中,這兩個翼的糖模體彼此相同(對稱缺口體)。在某些實施方式中,5'-翼的糖模體不同於3'-翼的糖模體(不對稱缺口體)。
在某些實施方式中,缺口體的翼包括1-5個核苷。在某些實施方式中,缺口體的翼包括2-5個核苷。在某些實施方式中,缺口體的翼包括3-5個核苷。在某些實施方式中,缺口體的核苷全部係修飾的核苷。
在某些實施方式中,缺口體的缺口包括7-12個核苷。在某些實施方式中,缺口體的缺口包括7-10個核苷。在某些實施方式中,缺口體的缺口包括8-10個核苷。在某些實施方式中,缺口體的缺口包括10個核苷。在某個實施方式中,缺口體的缺口的每個核苷都是未經修飾的2'-去氧核苷。
在某些實施方式中,該缺口體係去氧缺口體。在這樣的實施方式中,每個翼/缺口接點的缺口側上的核苷係未經修飾的2'-去氧核苷,並且每個翼/缺口接點的翼側上的核苷係修飾的核苷。在某些這樣的實施方式中,該缺口的每個核苷都是未經修飾的2'-去氧核苷。在某些這樣的實施方式中,每個翼的每個核苷都是修飾的核苷。
在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸具有完全修飾的糖模體,其中修飾的寡核苷酸的每個核苷包含修飾的糖部分。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括具有完全修飾的糖模體的區域,或由該區域組成,其中該區域的每個核苷包含修飾的糖部分。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括具有完全修飾的糖模體的區域或由其組成,其中該完全修飾的區域內的每個核苷都包括相同的修飾的糖部分,本文被稱為一致修飾的糖模體。在某些實施方式中,完全修飾的寡核苷酸係一致修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,一致修飾的寡核苷酸的每個核苷都包括相同的2'-修飾。 b. 某些核鹼基模體
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸。在某些實施方式中,寡核苷酸包括沿著該寡核苷酸或其區域安排成限定模式或模體的修飾的和/或未經修飾的核鹼基。在某些實施方式中,每個核鹼基都被修飾。在某些實施方式中,該等核鹼基都未被修飾。在某些實施方式中,每個嘌呤或每個嘧啶被修飾。在某些實施方式中,每個腺嘌呤被修飾。在某些實施方式中,每個鳥嘌呤被修飾。在某些實施方式中,每個胸腺嘧啶被修飾。在某些實施方式中,每個尿嘧啶被修飾。在某些實施方式中,每個胞嘧啶被修飾。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸中的一些或全部胞嘧啶核鹼基係5-甲基胞嘧啶。
在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸包括修飾的核鹼基的嵌段。在某些這樣的實施方式中,該嵌段在該寡核苷酸的3'-端處。在某些實施方式中,該嵌段在該寡核苷酸的3'-端的3個核苷內。在某些實施方式中,該嵌段在該寡核苷酸的5'-端處。在某些實施方式中,該嵌段在該寡核苷酸的5'-端的3個核苷內。
在某些實施方式中,具有缺口體模體的寡核苷酸包括包含修飾的核鹼基的核苷。在某些這樣的實施方式中,包含修飾的核鹼基的一個核苷在具有缺口體模體的寡核苷酸的中心缺口中。在某些這樣的實施方式中,該核苷的糖部分係2'-去氧核糖基部分。在某些實施方式中,該修飾的核鹼基選自:2-硫代嘧啶和5-丙炔嘧啶。 c. 某些核苷間連接模體
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括寡核苷酸。在某些實施方式中,寡核苷酸包括沿著該寡核苷酸或其區域安排成限定模式或模體的修飾的和/或未經修飾的核苷間連接。在某些實施方式中,基本上每個核苷間連接基團都是磷酸酯核苷間連接(P=O)。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸的每個核苷間連接基團都是硫代磷酸酯(P=S)。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸的每個核苷間連接基團獨立地選自硫代磷酸酯和磷酸酯核苷間連接。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸的糖模體係缺口體,並且該缺口內的核苷間連接全部係修飾的。在某些這樣的實施方式中,該等翼中的一些或所有核苷間連接係未經修飾的磷酸酯連接。在某些實施方式中,末端核苷間連接係修飾的。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸的糖模體係缺口體,並且核苷間連接模體在至少一個翼中包含至少一個磷酸二酯核苷間連接,其中該至少一個磷酸二酯連接不是末端核苷間連接,並且剩餘的核苷間連接係硫代磷酸酯核苷間連接。在某些這樣的實施方式中,所有硫代磷酸酯連接都是立體隨機的。在某些實施方式中,翼中的所有硫代磷酸酯連接係( Sp)硫代磷酸酯,並且缺口包含至少一個 Sp、 Sp、 Rp模體。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸群體富含包含此類核苷間連接模體的修飾的寡核苷酸。 4. 某些修飾的寡核苷酸
在某些實施方式中,本文描述的化合物包括修飾的寡核苷酸。在某些實施方式中,將以上該等修飾(糖、核鹼基、核苷間連接)摻入修飾的寡核苷酸中。在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸藉由其修飾、模體、和總長度來表徵。在某些實施方式中,此類參數各自彼此獨立。因此,除非另外指明,具有缺口體糖模體的寡核苷酸的每個核苷間連接都可以是修飾的或未經修飾的,並且可以或可以不遵循該等糖修飾的缺口體修飾模式。例如,糖缺口體的翼區域內的核苷間連接可以彼此相同或不同,並且可以與糖模體的缺口區域的核苷間連接相同或不同。同樣地,獨立於該等糖修飾的缺口體模式,此類缺口體寡核苷酸可以包括一個或多個修飾的核鹼基。此外,在某些情況下,藉由總長度或範圍並且藉由兩個或更多個區域(例如,具有指定糖修飾的核苷的區域)的長度或長度範圍來描述寡核苷酸,在這種情況下,可以選擇針對具有超出指定範圍的總長度的寡核苷酸的每個範圍的數值。在此類情況下,兩種因素必需滿足。例如,在某些實施方式中,修飾的寡核苷酸由15-20個連接的核苷組成並具有由三個區域(A、B、和C)組成的糖模體,其中區域A由具有指定糖模體的2-6個連接的核苷組成,區域B由具有指定糖模體的6-10個連接的核苷組成,並且區域C由具有指定糖模體的2-6個連接的核苷組成。此類實施方式不包括修飾的寡核苷酸,其中A和C各自由6個連接的核苷組成,並且B由10個連接的核苷組成(即使核苷的那些數量在A、B、和C的要求內允許),因為這樣的寡核苷酸的總長度係22,該長度超過修飾的寡核苷酸的總長度的上限(20)。本文,如果相對於一個或多個參數寡核苷酸的描述係未提及的,則這樣的參數不受限。因此,僅被描述為具有缺口體糖模體而沒有進一步描述的修飾的寡核苷酸可以具有任何長度、核苷間連接模體、和核鹼基模體。除非另外指明,所有修飾都獨立於核鹼模體列。 某些綴合的化合物
在某些實施方式中,本文描述的該等化合物包括寡核苷酸(修飾的或未修飾的)以及視情況一個或多個軛合物基團和/或端基或由其組成。軛合物基團由一個或多個軛合物部分和軛合物接頭組成,該軛合物接頭將軛合物部分連接至寡核苷酸。軛合物基團可以附接至寡核苷酸的任一端或兩端和/或附接在任何內部位置處。在某些實施方式中,軛合物基團附接至修飾的寡核苷酸的核苷的2'-位。某些實施方式中,附接至寡核苷酸的任一端或兩端的軛合物基團係端基。在某些這樣的實施方式中,軛合物基團或端基附接在寡核苷酸的3'和/或5'-端處。在某些這樣的實施方式中,軛合物基團(或端基)附接在寡核苷酸的3'-端處。在某些實施方式中,軛合物基團附接在寡核苷酸的3'-端附近。在某些實施方式中,軛合物基團(或端基)附接在寡核苷酸的5'-端處。在某些實施方式中,軛合物基團附接在寡核苷酸的5'-端附近。
在某些實施方式中,該寡核苷酸被修飾。在某些實施方式中,化合物的寡核苷酸具有與靶核酸互補的核鹼模體列。在某些實施方式中,寡核苷酸與信使RNA(mRNA)互補。在某些實施方式中,寡核苷酸與有義轉錄物互補。
端基的實例包括但不限於軛合物基團、加帽基團、磷酸酯部分、保護基團、修飾的或未經修飾的核苷、以及兩個或更多個獨立地修飾的或未經修飾的核苷。 A. 某些軛合物基團
在某些實施方式中,寡核苷酸共價地附接至一個或多個軛合物基團。在某些實施方式中,軛合物基團修飾該附接的寡核苷酸的一種或多種特性,包括但不限於藥效學、藥物動力學 、穩定性、結合、吸收、組織分佈、細胞分佈、細胞攝取、電荷以及清除率。在某些實施方式中,軛合物基團賦予附接的寡核苷酸新的特性,例如能夠檢測寡核苷酸的螢光團或報告基團。
先前已經描述了某些軛合物基團和軛合物部分,例如:膽固醇部分(Letsinger等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA [美國國家科學院院刊], 1989, 86, 6553-6556)、膽酸(Manoharan等人, Bioorg. Med. Chem.Lett.[生物有機化學與醫藥化學快報], 1994, 4, 1053-1060)、硫醚,例如己基-S-三苯甲基硫醇(Manoharan等人, Ann. N.Y. Acad. Sci.[紐約科學院年鑒], 1992, 660, 306-309;Manoharan等人, Bioorg. Med. Chem.Lett.[生物有機化學與醫藥化學快報] ,1993, 3, 2765-2770)、巰基膽固醇(Oberhauser等人, Nucl. Acids Res.[核酸研究], 1992, 20, 533-538)、脂肪鏈,例如十二烷二醇或十一烷基殘基(Saison-Behmoaras等人, EMBO J.[歐洲分子生物學學會雜誌], 1991, 10, 1111-1118;Kabanov等人, FEBS Lett.[歐洲生化學會聯合會快報], 1990, 259, 327-330;Svinarchuk等人, Biochimie[生物化學], 1993, 75, 49-54)、磷脂例如二-十六烷基-外消旋-丙三醇或三乙基­銨 1,2-二-O-十六烷基-外消旋-丙三基-3-H-磷酸酯(Manoharan等人, Tetrahedron Lett.[四面體快報], 1995, 36, 3651-3654;Shea等人, Nucl. Acids Res.[核酸研究], 1990, 18, 3777-3783)、聚胺或聚乙二醇鏈(Manoharan等人, Nucleosides & Nucleotides[核苷 & 核苷酸], 1995, 14, 969-973)、或金剛烷乙酸,棕櫚基部分(Mishra等人, Biochim. Biophys. Acta[生物化學與生物物理學學報], 1995, 1264 ,229-237)、十八胺或己基胺基-羰基-羥膽固醇部分(Crooke等人, J. Pharmacol. Exp. Ther.[藥理學和實驗治療學雜誌] ,1996, i, 923-937)、生育酚基團(Nishina等人, Molecular Therapy Nucleic Acids[分子治療-核酸], 2015 , 4, e220;doi:10.1038/mtna.2014.72和Nishina等人, Molecular Therapy[分子治療] ,2008, 16, 734-740)、或GalNAc簇(例如,WO 2014/179620)。 1. 軛合物部分
軛合物部分包括但不限於,嵌入劑、報告分子、聚胺、聚醯胺、肽、碳水化合物(例如,GalNAc)、維生素部分、聚乙二醇、硫醚、聚醚、膽固醇、巰基膽固醇、膽酸部分、葉酸、脂質、磷脂、生物素、吩嗪、菲啶、蒽醌、金剛烷、吖啶、螢光素、羅丹明、香豆素、螢光團、以及染料。
在某些實施方式中,軛合物部分包括活性藥品,例如,阿司匹林、華法令、保泰松、布洛芬、舒洛芬、芬布芬、酮洛芬、( S)-(+)-普拉洛芬、卡洛芬、丹肌胺酸、2,3,5-三碘苯甲酸、芬戈莫德、氟芬那酸、亞葉酸、苯并噻二𠯤、氯噻𠯤、二氮呯、吲哚美辛、巴比妥、頭孢菌素、磺胺類藥物、抗糖尿病藥、抗菌藥或抗生素。 2. 軛合物接頭
軛合物部分藉由軛合物接頭附接至寡核苷酸。在某些化合物中,軛合物基團係單一化學鍵(即,藉由單鍵,軛合物部分經軛合物接頭附接至寡核苷酸)。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括鏈結構(如烴基鏈),或重複單位(如乙二醇、核苷、或胺基酸單位)的寡聚體。
在某些實施方式中,軛合物接頭包括一個或多個選自以下項的基團:烷基、胺基、側氧基、醯胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚、以及羥基胺基。在某些這樣的實施方式中,該軛合物接頭包括選自以下項的基團:烷基、胺基、側氧基、醯胺以及醚基。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括選自烷基和醯胺基團的基團。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括選自烷基和醚基的基團。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括至少一個磷部分。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括至少一個磷酸酯基團。在某些實施方式中,該軛合物接頭包括至少一個中性連接基團。
在某些實施方式中,軛合物接頭(包括上文描述的軛合物接頭)係雙功能連接部分,例如本領域中已知的有用於將軛合物基團附接至母體化合物(如本文提供的寡核苷酸)的那些。通常,雙功能連接部分包括至少兩個官能基。官能基之一被選擇為結合至化合物上的特定位點,並且另一官能基被選擇為結合至軛合物基團。用於雙功能連接部分中的官能基的實例包括但不限於用於與親核基團反應的親電子試劑和用於與親電子基團反應的親核試劑。在某些實施方式中,雙功能連接部分包括一個或多個選自以下項的基團:胺基、羥基、羧酸、硫醇基、烷基、烯基、以及炔基。
軛合物接頭的實例包括但不限於吡咯啶、8-胺基-3,6-二氧雜辛酸(ADO)、琥珀醯亞胺基 4-(N-馬來醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯(SMCC)和6-胺基己酸(AHEX或AHA)。其他軛合物接頭包括但不限於取代的或未取代的C 1-C 10烷基、取代的或未取代的C 2-C 10烯基或取代的或未取代的C 2-C 10炔基,其中較佳的取代基基團的非限制性列表包括羥基、胺基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基、硫醇基、硫代烷氧基、鹵素、烷基、芳基、烯基以及炔基。
在某些實施方式中,軛合物接頭包括1-10個接頭-核苷。在某些實施方式中,此類接頭-核苷係修飾的核苷。在某些實施方式中,此類接頭-核苷包括修飾的糖部分。在某些實施方式中,接頭-核苷係修飾的。在某些實施方式中,接頭-核苷包括選自以下項的視情況受保護的雜環鹼基:嘌呤、取代的嘌呤、嘧啶或取代的嘧啶。在某些實施方式中,可切割的部分係選自以下項的核苷:尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、4-N-苯甲醯基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、4-N-苯甲醯基-5-甲基胞嘧啶、腺嘌呤、6-N-苯甲醯基腺嘌呤、鳥嘌呤以及2-N-異丁醯基鳥嘌呤。通常理想的是接頭-核苷在其到達靶組織後從該化合物上被切割下來。因此,接頭-核苷通常藉由可切割鍵彼此連接並與化合物的剩餘部分連接。在某些實施方式中,此類可切割的鍵係磷酸二酯鍵。
本文,不認為接頭-核苷係該寡核苷酸的一部分。因此,在以下實施方式中,其中化合物包括由指定數目或範圍的連接的核苷組成的和/或與參考核酸指定的百分比互補性的寡核苷酸,並且該化合物還包括包含軛合物接頭的軛合物基團,該軛合物接頭含有接頭-核苷,那些接頭-核苷不計入寡核苷酸的長度並且不用於確定寡核苷酸對於參考核酸的百分比互補性。例如,化合物可以包括 (1) 由8-30個核苷組成的修飾的寡核苷酸,和 (2) 包含1-10個接頭-核苷的軛合物基團,該等接頭-核苷與修飾的寡核苷酸的核苷鄰接。在這樣的化合物中的連續連接的核苷的總數超過30個。可替代地,化合物可以包括修飾的寡核苷酸,該寡核苷酸由8-30個核苷組成並且沒有軛合物基團。在這樣的化合物中的連續連接的核苷的總數不超過30個。除非另有說明,軛合物接頭包括不超過10個接頭-核苷。在某些實施方式中,軛合物接頭包括不超過5個接頭-核苷。在某些實施方式中,軛合物接頭包括不超過3個接頭-核苷。在某些實施方式中,軛合物接頭包括不超過2個接頭-核苷。在某些實施方式中,軛合物接頭包括不超過1個接頭-核苷。
在某些實施方式中,理想的是軛合物基團從寡核苷酸上切割下來。例如,在某些情況下,包含特定軛合物部分的化合物被特定細胞類型更好地吸收,但是一旦化合物被吸收,則理想的是軛合物基團被切割以釋放未綴合的或母體寡核苷酸。因此,某些軛合物可以包含一個或多個可切割部分,典型地在軛合物接頭內。在某些實施方式中,可切割的部分係可切割的鍵。在某些實施方式中,可切割的部分係包含至少一個可切割的鍵的一組原子。在某些實施方式中,可切割的部分包括具有一個、兩個、三個、四個、或超過四個可切割的鍵的一組原子。在某些實施方式中,可切割的部分被選擇性地在細胞或亞細胞區室(如溶酶體)內切割。在某些實施方式中,可切割的部分被內源酶(如核酸酶)選擇性地切割。
在某些實施方式中,可切割的鍵選自:醯胺、酯、醚、磷酸二酯的一個酯或兩個酯、磷酸酯、胺基甲酸酯、或二硫化物。在某些實施方式中,可切割的鍵係磷酸二酯的一個酯或兩個酯。在某些實施方式中,可切割的部分包括磷酸酯或磷酸二酯。在某些實施方式中,該可切割的部分係寡核苷酸與軛合物部分或軛合物基團之間的磷酸酯連接。
在某些實施方式中,可切割的部分包括一個或多個接頭-核苷或由其組成。在某些這樣的實施方式中,一個或多個接頭-核苷藉由可切割的鍵彼此連接和/或與化合物的剩餘部分連接。在某些實施方式中,此類可切割的鍵係未經修飾的磷酸二酯鍵。在某些實施方式中,可切割的部分係2'-去氧核苷,該去氧核苷藉由磷酸酯核苷間連接附接至寡核苷酸的3’或5'-末端核苷並且藉由磷酸酯或硫代磷酸酯連接共價地附接至軛合物接頭或軛合物基團的剩餘部分。在某些這樣的實施方式中,該可切割的部分係2'-去氧腺苷。 組成物和用於配製藥物組成物的方法
可以將本文描述的化合物與藥學上可接受的活性或惰性物質混合以製備藥物組成物或配製品。組成物和用於配製藥物組成物的方法取決於多個標準,包括但不限於給藥途徑、疾病程度、或待給予的劑量。
某些實施方式提供了包含一種或多種化合物或其鹽的藥物組成物。在某些實施方式中,該等化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該等化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成。在某些這樣的實施方式中,該藥物組成物包括適合的藥學上可接受的稀釋劑或載體。在某些實施方式中,藥物組成物包括無菌鹽溶液和一種或多種化合物。在某些實施方式中,這樣的藥物組成物由無菌鹽溶液和一種或多種化合物組成。在某些實施方式中,該無菌鹽水係藥用級鹽水。在某些實施方式中,藥物組成物包括一種或多種化合物和無菌水。在某些實施方式中,藥物組成物由一種化合物和無菌水組成。在某些實施方式中,該無菌水係藥用級水。在某些實施方式中,藥物組成物包括一種或多種化合物和磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。在某些實施方式中,藥物組成物由一種或多種化合物和無菌PBS組成。在某些實施方式中,該無菌PBS係藥用級PBS。組成物和用於配製藥物組成物的方法取決於多個標準,包括但不限於給藥途徑、疾病程度、或待給予的劑量。
可以在藥物組成物中利用靶向APOL1核酸的本文描述的化合物,這係藉由將該化合物與適合的藥學上可接受的稀釋劑或載體組合。在某些實施方式中,藥學上可接受的稀釋劑係水,如適於注射的無菌水。因此,在一個實施方式中,本文描述的方法中採用的是包含靶向APOL1核酸的化合物和藥學上可接受的稀釋劑的藥物組成物。在某些實施方式中,該藥學上可接受的稀釋劑係水。在某些實施方式中,該化合物包括本文提供的修飾的寡核苷酸或由其組成。
包含本文提供的化合物的藥物組成物涵蓋任何藥學上可接受的鹽、酯、或此類酯的鹽、或任何其他寡核苷酸,它們在被給予動物(包括人)後能夠提供(直接地或間接地)生物上具有活性的代謝物或其殘餘物。在某些實施方式中,該等化合物係反義化合物或寡聚化合物。在某些實施方式中,該化合物包括修飾的寡核苷酸或由其組成。因此,例如,還撰寫本揭露涉及化合物的藥學上可接受的鹽、前驅藥、該等前驅藥的藥學上可接受的鹽、以及其他生物等效物。適合的藥學上可接受的鹽包括但不限於鈉鹽和鉀鹽。
前驅藥可以包括在化合物的一端或兩端摻入另外的核苷,該核苷在體內被內源核酸酶切割,以形成活性化合物。
在某些實施方式中,該等化合物或組成物進一步包括藥學上可接受的載體或稀釋劑。 某些選擇的化合物
在若干細胞類型中在體外對具有各種長度、化學成分、和模體的大約1930種新設計的化合物和幾種先前揭露的化合物測試其對人類APOL1 mRNA的影響(實例1)。在體外以單劑量針對效力測試的1930種化合物中,在A431細胞中針對劑量依賴性抑制測試373種選擇的化合物(實例2)。由劑量響應測定測試的373種化合物中,在齧齒動物中針對體內功效和耐受性選擇86種寡核苷酸。
在體內齧齒動物耐受性模型中測量體重和器官重量、肝功能標記物(如丙胺酸轉胺酶、天冬胺酸轉胺酶和膽紅素),血液學標記物(如HCT、白細胞計數、血小板計數、RBC計數、MCH和MCHC)和腎功能標記物(例如BUN和肌酸酐)。在hAPOL1轉基因小鼠模型中,測量了hAPOL1 mRNA的體內減少。
測試了ION # 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163在食蟹猴中的活性、藥物動力學 特徵和耐受性(實例9)。用一些化合物治療引起肝組織中APOL1 mRNA表現的減少。具體地,與PBS對照相比,用與APOL1食蟹猴基因序列具有交叉反應性的ION 904763和ION 972190治療導致肝組織中APOL1 mRNA表現的顯著降低。與PBS對照相比,指出ION 972190導致APOL1 mRNA表現的最高降低。在該等猴子中用該等化合物的治療係耐受良好的,尤其是用ION 972190的治療。
因此,本文提供的是具有一種或多種改進特性中任一種的化合物。在某些實施方式中,如本文描述的該等化合物係強效和可耐受的。 實例
以下實例描述了用於鑒定靶向APOL1的先導化合物的篩選過程。例如,ION 793406、904763、905469、905505、905634、905665、972190和972163導致高效力和耐受性。ION 972190展現出高效力和耐受性。 非限制性揭露和藉由引用結合
雖然本文件所附序列表將每個序列根據需要鑒定為「RNA」或「DNA」,但實際上那些序列可以用化學修飾的任何組合進行修飾。熟悉該項技術者應容易地意識到,如「RNA」或「DNA」這樣的名稱描述修飾的寡核苷酸在某些情況下是任意的。例如,包含含有2'-OH糖部分和胸腺嘧啶鹼基的核苷的寡核苷酸可以被描述為具有修飾的糖(針對DNA的天然2'-H為2'-OH)的DNA或具有修飾的鹼基(針對RNA的天然尿嘧啶為胸腺嘧啶(甲基化的尿嘧啶))的RNA。
因此,本文提供的核酸序列(包括但不限於在序列表中的那些)旨在涵蓋含有任何組合的天然或修飾的RNA和/或DNA的核酸,包括但不限於具有修飾的核鹼基的此類核酸。作為另外的實例而非限制,具有核鹼模體列「ATCGATCG」的寡核苷酸涵蓋具有這樣的核鹼模體列的任何寡核苷酸,無論是修飾的還是未經修飾的,包括但不限於包含RNA鹼基的此類化合物,如具有序列「AUCGAUCG」的那些以及具有一些DNA鹼基和一些RNA鹼基如「AUCGATCG」的那些,以及具有其他修飾的核鹼基例如「AT mCGAUCG」的化合物(其中 mC表示含有在5-位置處的甲基基團的胞嘧啶鹼)。
本文描述的某些化合物(例如,修飾的寡核苷酸)具有一個或多個不對稱中心並且因此產生鏡像異構物、非鏡像異構物、和其他立體異構組態,就絕對立體化學而言,它們可以被定義為 (R) 或 (S),或定義為α或β(如針對糖異頭物),或定義為 (D) 或 (L) (如針對胺基酸)等。本文提供的被撰寫或描述為具有某些立體異構組態的化合物僅包括所示化合物。用未定義的立體化學撰寫或描述的本文提供的化合物包括所有該等可能的異構物,包括它們的立體隨機和光學純形式。同樣地,除非另有說明,否則包括本文提供的化合物的所有互變異構形式。除非另有說明,否則本文描述的寡聚化合物和修飾的寡核苷酸旨在包括相應的鹽形式。
本文描述的化合物包括其中一個或多個原子被表明元素的非放射性同位素或放射性同位素替換的變體。例如,包含氫原子的本文的化合物涵蓋對於每個 1H氫原子的所有可能的氘取代。由本文的化合物涵蓋的同位素取代包括但不限於: 2H或 3H代替 1H、 13C或 14C代替 12C、 15N代替 14N、 17O或 18O代替 16O、以及 33S、 34S、 35S、或 36S代替 32S。
儘管本文描述的某些化合物、組成物和方法已經根據某些實施方式具體地進行了描述,但以下實例僅用以說明本文描述的化合物並不旨在限制它們。在本申請中引用的各個參考文獻藉由引用以其全文結合在此。 實例 1 A431 細胞中的人類 APOL1 的反義抑制
設計靶向APOL1核酸的具有各種化學模體的反義寡核苷酸並且針對其在體外對APOL1 mRNA的作用進行測試。 3-10-3 cEt 缺口體
將下表中的新設計的嵌合反義寡核苷酸設計為3-10-3 cEt缺口體。該等缺口體長16個核苷,其中中心缺口區段由十個2'-去氧核苷構成並且在5'方向和3'方向上側接翼區段,每個翼區段包括三個核苷。5'翼區段中的每個核苷和3'翼區段中的每個核苷都具有cEt修飾。遍及每個缺口體的核苷間連接都是硫代磷酸酯(P=S)連接。遍及每個缺口體的所有胞嘧啶殘基都是5-甲基胞嘧啶。
「起始位點」指示缺口體所靶向的人類基因序列中的最5'核苷。「終止位點」指示缺口體所靶向的人類基因序列中的最3'核苷。下表中所列的每個缺口體都靶向人類APOL1 mRNA(本文指定為SEQ ID NO: 1(GENBANK登錄號NM_003661.3))或人類APOL1基因組序列(本文指定為SEQ ID NO: 2(從核苷酸15986452至16001905截短的GENBANK登錄號NT_011520.9))。‘n/a’指示反義寡核苷酸並未以100%互補性靶向該特定基因序列。
在一系列具有類似培養條件的實驗中對該等反義寡核苷酸進行測試。將每個實驗的結果呈現在如下所示的單獨的表中。藉由自由攝取用4,000 nM反義寡核苷酸以每孔10,000個細胞的密度轉染培養的A431細胞。在大約24小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。人類引物探針組RTS35962(正向序列GCTACTCCTGCTGACTGATAATG,在本文指定為SEQ ID NO: 10;反向序列AAGGTTGTCCAGAGCTTTACG,在本文指定為SEQ ID NO: 11;探針序列TGCCCAGGAATGAGGCAGATGAG,在本文指定為SEQ ID NO: 12)用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。在後面的實驗中篩選表28中列出的寡核苷酸。 [表1] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 83 13
903425 23 38 516 531 AAGATATACCGAGGAA 24 14
903457 124 139 617 632 TCCCCTGGCAGAGACT 54 15
903489 250 265 4543 4558 TCGCTCCAGCTTCCTC 55 16
903521 302 317 4777 4792 TTACTTTGAGGATCTC 48 17
903617 559 574 12650 12665 ACTGCTGGCCTTTATC 76 18
903649 628 643 12719 12734 GGAGCCTTCTTATGTT 8 19
903681 669 684 12760 12775 GGTGCCTTTGTGGACC 0 20
903713 740 755 12831 12846 AGACCCATGCCGACGA 30 21
903745 810 825 12901 12916 AGCGGCTGTGATTCCC 46 22
903777 849 864 12940 12955 CTTTCCGTAGTCCATG 17 23
903809 930 945 13021 13036 ACCCAAAAACTCCCTC 82 24
903841 1007 1022 13098 13113 GCACGGATGTCCTTCC 57 25
903873 1083 1098 13174 13189 GATTGGCTCAGTGACC 59 26
903905 1126 1141 13217 13232 TGGGTTCATTAACCCT 3 27
903937 1211 1226 13302 13317 ACGAGGTAGACTACAT 76 28
903969 1344 1359 13435 13450 TTCTTGGTCCGCCTGC 84 29
904001 1719 1734 13810 13825 AATGTTTGCATTTGGG 98 30
904033 1798 1813 13889 13904 GTGCTCAGCTATGGAA 90 31
904065 1925 1940 14016 14031 TAGTCTAAAGTAAACT 26 32
904097 2283 2298 14374 14389 GCTGGTTCCTTCAAGC 25 33
904129 2412 2427 14503 14518 CATTCTTCGGAGGACA 78 34
904161 2510 2525 14601 14616 TCAGGAAGCCGCTGCC 58 35
904193 2599 2614 14690 14705 ACCTGCCCTTCAGTGT 52 36
904225 2723 2738 14814 14829 CTGTTTACTTACCGGG 83 37
904257 2804 2819 14895 14910 TCAATCCTGGGCGGCG 85 38
904321 N/A N/A 1373 1388 CATGATTGCAAAGCTG 89 39
904353 N/A N/A 836 851 GCTTTGTGAACCCATC 58 40
904385 N/A N/A 2479 2494 CAAGCCCAGTCCAATT 23 41
904417 N/A N/A 2988 3003 GATGTTTGTCTTCTGG 88 42
904449 N/A N/A 4339 4354 GCCAGTGTGTATTGCA 40 43
904481 N/A N/A 4711 4726 ACAAATTGTGGGATCA 0 44
904513 N/A N/A 5057 5072 CTAGGTGCCAGGGTAG 47 45
904545 N/A N/A 5114 5129 CCCCCCCCCCGCTGAT 9 46
904577 N/A N/A 5292 5307 GGGCCACTCAGAGCAA 0 47
904609 N/A N/A 5357 5372 GTGGCAAAGGACAGAC 72 48
904641 N/A N/A 5489 5504 CCCTATTGTGTGGCAG 66 49
904673 N/A N/A 5681 5696 TTTTTCTTTGACCGGG 74 50
904705 N/A N/A 5765 5780 CGAAGCCTCCTCCAGT 65 51
904737 N/A N/A 5806 5821 CACCCGATAAACCTTG 67 52
904769 N/A N/A 5861 5876 AGGCAGTTTTGTAAGT 76 53
904801 N/A N/A 5932 5947 ATTCGGAGACCTCCCT 5 54
904833 N/A N/A 5964 5979 CCTGGGCAAGGCTAAG 35 55
904865 N/A N/A 6137 6152 TTACTCCACACCTTAA 39 56
904897 N/A N/A 6205 6220 TTTGGTACAAAACTGC 71 57
904929 N/A N/A 6260 6275 TGTCTCACTAAACCCC 69 58
904961 N/A N/A 6328 6343 GACCAGTGAGATCCAA 85 59
904993 N/A N/A 6401 6416 ACCACCTGTAGGGACA 50 60
905025 N/A N/A 6541 6556 GGGTACTTCTGTTAGA 82 61
905057 N/A N/A 6599 6614 CAGCTGTAACCCCCTG 44 62
905089 N/A N/A 6647 6662 CAGCCCTGAAACATTC 13 63
905121 N/A N/A 6793 6808 GCGATTGTCTTGTTTT 93 64
905153 N/A N/A 6878 6893 GCCGTGGCAACTCTGT 0 65
905185 N/A N/A 6994 7009 GGGTCGGCTGAGTGCT 61 66
905217 N/A N/A 7156 7171 ACCTCCATGTTGCCTC 42 67
905249 N/A N/A 7243 7258 GCTGGTCTTGGGCACT 34 68
905281 N/A N/A 7338 7353 CTTATAGCTTACCTGT 27 69
905313 N/A N/A 7474 7489 GAGTCACCGCCCAAAA 59 70
905345 N/A N/A 7842 7857 TTGCCGTGCACACACA 19 71
905377 N/A N/A 7937 7952 GTTTGCAGGGATCTGG 86 72
905409 N/A N/A 8000 8015 CAAAGAACTCAAGTCA 85 73
905441 N/A N/A 8087 8102 ACTGCTCCCTGTAATC 38 74
905473 N/A N/A 8174 8189 TGTGTTTAGGCATTCA 87 75
905505 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG 96 76
905537 N/A N/A 8385 8400 ATGCCTGTTGGGTCAA 64 77
905569 N/A N/A 8455 8470 GCACCAACATGAAGTG 71 78
905601 N/A N/A 8625 8640 ACCCTTTTGGCACCTT 94 79
905633 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA 94 80
905665 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG 93 81
905697 N/A N/A 8890 8905 GTTTTATGGAGTCATT 95 82
905729 N/A N/A 8959 8974 GTGCATAACAGCCATT 19 83
[表2] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 85 13
903424 22 37 515 530 AGATATACCGAGGAAT 3 84
903456 79 94 572 587 GGATCCCACCTCCAGT 9 85
903488 227 242 4520 4535 ACTCCCACACCAAGGA 27 86
903520 301 316 4776 4791 TACTTTGAGGATCTCC 65 87
903616 558 573 12649 12664 CTGCTGGCCTTTATCG 0 88
903648 627 642 12718 12733 GAGCCTTCTTATGTTA 27 89
903680 668 683 12759 12774 GTGCCTTTGTGGACCT 24 90
903712 739 754 12830 12845 GACCCATGCCGACGAG 46 91
903744 809 824 12900 12915 GCGGCTGTGATTCCCA 0 92
903776 848 863 12939 12954 TTTCCGTAGTCCATGG 20 93
903808 914 929 13005 13020 ACCTCCTTCAATTTGT 61 94
903840 1006 1021 13097 13112 CACGGATGTCCTTCCC 69 95
903872 1082 1097 13173 13188 ATTGGCTCAGTGACCC 88 96
903904 1125 1140 13216 13231 GGGTTCATTAACCCTC 22 97
903936 1210 1225 13301 13316 CGAGGTAGACTACATC 63 98
903968 1343 1358 13434 13449 TCTTGGTCCGCCTGCA 66 99
904000 1717 1732 13808 13823 TGTTTGCATTTGGGTC 99 100
904032 1797 1812 13888 13903 TGCTCAGCTATGGAAA 77 101
904064 1924 1939 14015 14030 AGTCTAAAGTAAACTG 18 102
904096 2282 2297 14373 14388 CTGGTTCCTTCAAGCC 77 103
904128 2411 2426 14502 14517 ATTCTTCGGAGGACAT 71 104
904160 2508 2523 14599 14614 AGGAAGCCGCTGCCTG 0 105
904192 2596 2611 14687 14702 TGCCCTTCAGTGTTCA 47 106
904224 2722 2737 14813 14828 TGTTTACTTACCGGGT 91 107
904256 2803 2818 14894 14909 CAATCCTGGGCGGCGA 79 108
904320 N/A N/A 1372 1387 ATGATTGCAAAGCTGG 75 109
904352 N/A N/A 828 843 AACCCATCTGAGCTGT 34 110
904384 N/A N/A 2476 2491 GCCCAGTCCAATTGTG 14 111
904416 N/A N/A 2970 2985 ACTCCATGCAGCAAGG 71 112
904448 N/A N/A 4322 4337 GTCTGCGATGTGCAGA 21 113
904480 N/A N/A 4705 4720 TGTGGGATCAAATGTG 0 114
904512 N/A N/A 5056 5071 TAGGTGCCAGGGTAGG 68 115
904544 N/A N/A 5113 5128 CCCCCCCCCGCTGATT 16 116
904576 N/A N/A 5291 5306 GGCCACTCAGAGCAAA 0 117
904608 N/A N/A 5355 5370 GGCAAAGGACAGACCG 9 118
904640 N/A N/A 5466 5481 CCAGGCCAGGTAGCCG 21 119
904672 N/A N/A 5666 5681 GGGTATTTTAGATGAC 76 120
904704 N/A N/A 5764 5779 GAAGCCTCCTCCAGTT 68 121
904736 N/A N/A 5805 5820 ACCCGATAAACCTTGT 73 122
904768 N/A N/A 5860 5875 GGCAGTTTTGTAAGTG 81 123
904800 N/A N/A 5931 5946 TTCGGAGACCTCCCTA 33 124
904832 N/A N/A 5963 5978 CTGGGCAAGGCTAAGT 1 125
904864 N/A N/A 6136 6151 TACTCCACACCTTAAT 18 126
904896 N/A N/A 6204 6219 TTGGTACAAAACTGCA 68 127
904928 N/A N/A 6259 6274 GTCTCACTAAACCCCA 71 128
904960 N/A N/A 6327 6342 ACCAGTGAGATCCAAC 87 129
904992 N/A N/A 6377 6392 GGATGGGCCCACAGGA 39 130
905024 N/A N/A 6540 6555 GGTACTTCTGTTAGAT 37 131
905056 N/A N/A 6598 6613 AGCTGTAACCCCCTGA 54 132
905088 N/A N/A 6646 6661 AGCCCTGAAACATTCC 39 133
905120 N/A N/A 6792 6807 CGATTGTCTTGTTTTT 96 134
905152 N/A N/A 6877 6892 CCGTGGCAACTCTGTA 22 135
905184 N/A N/A 6992 7007 GTCGGCTGAGTGCTCT 35 136
905216 N/A N/A 7152 7167 CCATGTTGCCTCTGTC 62 137
905248 N/A N/A 7242 7257 CTGGTCTTGGGCACTC 25 138
905280 N/A N/A 7336 7351 TATAGCTTACCTGTGG 59 139
905312 N/A N/A 7472 7487 GTCACCGCCCAAAACC 51 140
905344 N/A N/A 7840 7855 GCCGTGCACACACAAG 29 141
905376 N/A N/A 7929 7944 GGATCTGGGAATTATG 65 142
905408 N/A N/A 7999 8014 AAAGAACTCAAGTCAG 91 143
905440 N/A N/A 8085 8100 TGCTCCCTGTAATCAC 55 144
905472 N/A N/A 8173 8188 GTGTTTAGGCATTCAG 72 145
905504 N/A N/A 8318 8333 ATGAAATTATTGGTTC 82 146
905536 N/A N/A 8384 8399 TGCCTGTTGGGTCAAA 43 147
905568 N/A N/A 8454 8469 CACCAACATGAAGTGA 0 148
905600 N/A N/A 8624 8639 CCCTTTTGGCACCTTC 95 149
905632 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG 57 150
905664 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA 62 151
905696 N/A N/A 8887 8902 TTATGGAGTCATTAGT 79 152
905728 N/A N/A 8958 8973 TGCATAACAGCCATTG 0 153
[表3] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 81 13
903428 26 41 519 534 CCCAAGATATACCGAG 24 154
903460 130 145 623 638 GAATCTTCCCCTGGCA 55 155
903492 255 270 N/A N/A CACCCTCGCTCCAGCT 44 156
903524 322 337 4797 4812 CAGCCCAGTCACCGAG 14 157
903620 562 577 12653 12668 TGTACTGCTGGCCTTT 68 158
903652 631 646 12722 12737 CACGGAGCCTTCTTAT 31 159
903684 672 687 12763 12778 GGTGGTGCCTTTGTGG 0 160
903716 743 758 12834 12849 GCCAGACCCATGCCGA 39 161
903748 813 828 12904 12919 CAAAGCGGCTGTGATT 21 162
903780 852 867 12943 12958 CTTCTTTCCGTAGTCC 32 163
903812 936 951 13027 13042 GTTCTCACCCAAAAAC 20 164
903844 1011 1026 13102 13117 GAGGGCACGGATGTCC 39 165
903876 1086 1101 13177 13192 TGAGATTGGCTCAGTG 64 166
903908 1129 1144 13220 13235 TGCTGGGTTCATTAAC 6 167
903940 1231 1246 13322 13337 GTAAGTGCTTTGATTC 93 168
903972 1347 1362 13438 13453 CAGTTCTTGGTCCGCC 79 169
904004 1743 1758 13834 13849 TCACCCTCTTTATCCC 76 170
904036 1801 1816 13892 13907 GCTGTGCTCAGCTATG 35 171
904068 1929 1944 14020 14035 TCTTTAGTCTAAAGTA 0 172
904100 2336 2351 14427 14442 TAACTCTTGGGCTTTC 73 173
904132 2415 2430 14506 14521 CTTCATTCTTCGGAGG 34 174
904164 2513 2528 14604 14619 TCATCAGGAAGCCGCT 73 175
904196 2613 2628 14704 14719 GGCCATGGCCCACCAC 0 176
904228 2766 2781 14857 14872 AGCTTCCTCCCAATGC 24 177
904260 2807 2822 14898 14913 AGGTCAATCCTGGGCG 58 178
904324 N/A N/A 1376 1391 TCTCATGATTGCAAAG 69 179
904356 N/A N/A 871 886 GTCTCAGCAGTCAAAA 62 180
904388 N/A N/A 2518 2533 TTGGTTCCTAGAAGAA 36 181
904420 N/A N/A 3414 3429 ACTGAGGGTATATGAA 82 182
904452 N/A N/A 4361 4376 GTGTGATAACTAGCTG 86 183
904484 N/A N/A 4738 4753 TTTTGTTGCACCCTTG 83 184
904516 N/A N/A 5065 5080 GTCATTTGCTAGGTGC 90 185
904548 N/A N/A 5173 5188 TGGTCAACCTCCTCTC 0 186
904580 N/A N/A 5305 5320 ATACATTCCCACAGGG 22 187
904612 N/A N/A 5393 5408 AGGGAGGTAAGGAGCG 26 188
904644 N/A N/A 5492 5507 AGGCCCTATTGTGTGG 0 189
904676 N/A N/A 5694 5709 ATTGGGCCTCAGATTT 57 190
904708 N/A N/A 5768 5783 GCACGAAGCCTCCTCC 60 191
904740 N/A N/A 5809 5824 ATTCACCCGATAAACC 47 192
904772 N/A N/A 5870 5885 AACCCAAACAGGCAGT 69 193
904804 N/A N/A 5935 5950 TGTATTCGGAGACCTC 47 194
904836 N/A N/A 5967 5982 AAACCTGGGCAAGGCT 23 195
904868 N/A N/A 6141 6156 ATGCTTACTCCACACC 75 196
904900 N/A N/A 6211 6226 CCCATGTTTGGTACAA 54 197
904932 N/A N/A 6263 6278 CCTTGTCTCACTAAAC 73 198
904964 N/A N/A 6332 6347 CTAAGACCAGTGAGAT 58 199
904996 N/A N/A 6404 6419 GAAACCACCTGTAGGG 53 200
905028 N/A N/A 6544 6559 GATGGGTACTTCTGTT 88 201
905060 N/A N/A 6605 6620 TTAGAACAGCTGTAAC 50 202
905092 N/A N/A 6684 6699 GGGCTGGTGGATATAA 0 203
905124 N/A N/A 6796 6811 CGAGCGATTGTCTTGT 76 204
905156 N/A N/A 6881 6896 GTTGCCGTGGCAACTC 21 205
905188 N/A N/A 7039 7054 GAGTTTTTCCTCAGTC 49 206
905220 N/A N/A 7161 7176 GAGGCACCTCCATGTT 41 207
905252 N/A N/A 7260 7275 CAAAGGAGATTCCTCC 35 208
905284 N/A N/A 7342 7357 CTCCCTTATAGCTTAC 62 209
905316 N/A N/A 7477 7492 CGAGAGTCACCGCCCA 72 210
905348 N/A N/A 7845 7860 TTCTTGCCGTGCACAC 10 211
905380 N/A N/A 7943 7958 CGTGTGGTTTGCAGGG 72 212
905412 N/A N/A 8008 8023 TAGGTCTACAAAGAAC 71 213
905444 N/A N/A 8090 8105 TGGACTGCTCCCTGTA 13 214
905476 N/A N/A 8177 8192 AGATGTGTTTAGGCAT 96 215
905508 N/A N/A 8330 8345 CATCATTGGGTTATGA 37 216
905540 N/A N/A 8388 8403 CACATGCCTGTTGGGT 48 217
905572 N/A N/A 8466 8481 TTTTCAGCTCAGCACC 49 218
905604 N/A N/A 8633 8648 AGACTCCAACCCTTTT 53 219
905636 N/A N/A 8746 8761 TAATTCTATTAGAGGG 83 220
905668 N/A N/A 8833 8848 TGAAGCTTTAAACTCA 18 221
905700 N/A N/A 8895 8910 GACTTGTTTTATGGAG 87 222
905732 N/A N/A 8962 8977 GGAGTGCATAACAGCC 0 223
[表4] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 85 13
903429 27 42 520 535 CCCCAAGATATACCGA 0 224
903461 131 146 624 639 GGAATCTTCCCCTGGC 51 225
903493 256 271 N/A N/A GCACCCTCGCTCCAGC 24 226
903525 323 338 4798 4813 GCAGCCCAGTCACCGA 0 227
903621 563 578 12654 12669 CTGTACTGCTGGCCTT 87 228
903653 632 647 12723 12738 GCACGGAGCCTTCTTA 33 229
903685 673 688 12764 12779 TGGTGGTGCCTTTGTG 0 230
903717 744 759 12835 12850 TGCCAGACCCATGCCG 48 231
903749 817 832 12908 12923 CGGTCAAAGCGGCTGT 71 232
903781 853 868 12944 12959 ACTTCTTTCCGTAGTC 6 233
903813 940 955 13031 13046 ATATGTTCTCACCCAA 77 234
903845 1012 1027 13103 13118 TGAGGGCACGGATGTC 67 235
903877 1090 1105 13181 13196 CAGCTGAGATTGGCTC 19 236
903909 1130 1145 13221 13236 ATGCTGGGTTCATTAA 28 237
903941 1233 1248 13324 13339 ATGTAAGTGCTTTGAT 74 238
903973 1348 1363 13439 13454 ACAGTTCTTGGTCCGC 92 239
904005 1744 1759 13835 13850 CTCACCCTCTTTATCC 50 240
904037 1827 1842 13918 13933 CTGCCATCTGCATTAA 54 241
904069 1942 1957 14033 14048 CCCCCCAATATATTCT 67 242
904101 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC 90 243
904133 2416 2431 14507 14522 ACTTCATTCTTCGGAG 27 244
904165 2514 2529 14605 14620 ATCATCAGGAAGCCGC 92 245
904197 2614 2629 14705 14720 TGGCCATGGCCCACCA 10 246
904229 2767 2782 14858 14873 GAGCTTCCTCCCAATG 0 247
904261 2839 2854 14930 14945 ATGAGTAGGTGAGTTT 84 248
904325 N/A N/A 1378 1393 AATCTCATGATTGCAA 70 249
904357 N/A N/A 872 887 TGTCTCAGCAGTCAAA 69 250
904389 N/A N/A 2519 2534 TTTGGTTCCTAGAAGA 25 251
904421 N/A N/A 3417 3432 ACAACTGAGGGTATAT 80 252
904453 N/A N/A 4366 4381 AGCATGTGTGATAACT 88 253
904485 N/A N/A 4818 4833 TACCTGGGTCCATGGT 6 254
904517 N/A N/A 5067 5082 GAGTCATTTGCTAGGT 90 255
904549 N/A N/A 5175 5190 GCTGGTCAACCTCCTC 40 256
904581 N/A N/A 5306 5321 GATACATTCCCACAGG 60 257
904613 N/A N/A 5394 5409 AAGGGAGGTAAGGAGC 15 258
904645 N/A N/A 5493 5508 GAGGCCCTATTGTGTG 13 259
904677 N/A N/A 5695 5710 TATTGGGCCTCAGATT 17 260
904709 N/A N/A 5769 5784 AGCACGAAGCCTCCTC 60 261
904741 N/A N/A 5813 5828 TCATATTCACCCGATA 76 262
904773 N/A N/A 5872 5887 TAAACCCAAACAGGCA 76 263
904805 N/A N/A 5936 5951 CTGTATTCGGAGACCT 54 264
904837 N/A N/A 5970 5985 CAAAAACCTGGGCAAG 56 265
904869 N/A N/A 6142 6157 TATGCTTACTCCACAC 57 266
904901 N/A N/A 6213 6228 TGCCCATGTTTGGTAC 7 267
904933 N/A N/A 6265 6280 CTCCTTGTCTCACTAA 50 268
904965 N/A N/A 6333 6348 GCTAAGACCAGTGAGA 67 269
904997 N/A N/A 6405 6420 TGAAACCACCTGTAGG 38 270
905029 N/A N/A 6545 6560 AGATGGGTACTTCTGT 89 271
905061 N/A N/A 6607 6622 CTTTAGAACAGCTGTA 57 272
905093 N/A N/A 6698 6713 TTCTTGATGTGGTGGG 92 273
905125 N/A N/A 6797 6812 GCGAGCGATTGTCTTG 59 274
905157 N/A N/A 6882 6897 GGTTGCCGTGGCAACT 0 275
905189 N/A N/A 7043 7058 GGGAGAGTTTTTCCTC 14 276
905221 N/A N/A 7162 7177 TGAGGCACCTCCATGT 0 277
905253 N/A N/A 7261 7276 GCAAAGGAGATTCCTC 61 278
905285 N/A N/A 7343 7358 TCTCCCTTATAGCTTA 71 279
905317 N/A N/A 7478 7493 GCGAGAGTCACCGCCC 0 280
905349 N/A N/A 7846 7861 TTTCTTGCCGTGCACA 17 281
905381 N/A N/A 7957 7972 AGCTGCCACCAAAACG 25 282
905413 N/A N/A 8009 8024 GTAGGTCTACAAAGAA 79 283
905445 N/A N/A 8091 8106 CTGGACTGCTCCCTGT 20 284
905477 N/A N/A 8178 8193 CAGATGTGTTTAGGCA 97 285
905509 N/A N/A 8331 8346 ACATCATTGGGTTATG 82 286
905541 N/A N/A 8389 8404 CCACATGCCTGTTGGG 1 287
905573 N/A N/A 8472 8487 GAATCCTTTTCAGCTC 63 288
905605 N/A N/A 8634 8649 CAGACTCCAACCCTTT 49 289
905637 N/A N/A 8747 8762 CTAATTCTATTAGAGG 35 290
905669 N/A N/A 8835 8850 GCTGAAGCTTTAAACT 7 291
905701 N/A N/A 8899 8914 GTGGGACTTGTTTTAT 72 292
905733 N/A N/A 8963 8978 GGGAGTGCATAACAGC 30 293
[表5] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 85 13
903430 28 43 521 536 TCCCCAAGATATACCG 0 294
903462 132 147 625 640 AGGAATCTTCCCCTGG 0 295
903494 257 272 N/A N/A TGCACCCTCGCTCCAG 6 296
903526 324 339 4799 4814 AGCAGCCCAGTCACCG 0 297
903622 564 579 12655 12670 TCTGTACTGCTGGCCT 46 298
903654 633 648 12724 12739 GGCACGGAGCCTTCTT 13 299
903686 674 689 12765 12780 ATGGTGGTGCCTTTGT 0 300
903718 745 760 12836 12851 GTGCCAGACCCATGCC 32 301
903750 818 833 12909 12924 CCGGTCAAAGCGGCTG 0 302
903782 854 869 12945 12960 CACTTCTTTCCGTAGT 0 303
903814 941 956 13032 13047 GATATGTTCTCACCCA 94 304
903846 1013 1028 13104 13119 CTGAGGGCACGGATGT 65 305
903878 1091 1106 13182 13197 TCAGCTGAGATTGGCT 0 306
903910 1131 1146 13222 13237 GATGCTGGGTTCATTA 0 307
903942 1235 1250 13326 13341 TCATGTAAGTGCTTTG 85 308
903974 1349 1364 13440 13455 CACAGTTCTTGGTCCG 89 309
904006 1747 1762 13838 13853 TACCTCACCCTCTTTA 66 310
904038 1828 1843 13919 13934 ACTGCCATCTGCATTA 0 311
904070 1943 1958 14034 14049 GCCCCCCAATATATTC 29 312
904102 2341 2356 14432 14447 TGTTCTAACTCTTGGG 90 313
904134 2417 2432 14508 14523 GACTTCATTCTTCGGA 85 314
904166 2515 2530 14606 14621 CATCATCAGGAAGCCG 88 315
904198 2615 2630 14706 14721 ATGGCCATGGCCCACC 0 316
904230 2768 2783 14859 14874 TGAGCTTCCTCCCAAT 35 317
904262 2840 2855 14931 14946 GATGAGTAGGTGAGTT 82 318
904326 N/A N/A 1379 1394 GAATCTCATGATTGCA 68 319
904358 N/A N/A 919 934 AGATGGGCACCCCCAA 3 320
904390 N/A N/A 2533 2548 TTCCGGGAAGTGACTT 27 321
904422 N/A N/A 3539 3554 AACACCAATTAGTACA 64 322
904454 N/A N/A 4384 4399 CAATGACCAGGGCCTG 30 323
904486 N/A N/A 4822 4837 AGCCTACCTGGGTCCA 0 324
904518 N/A N/A 5068 5083 TGAGTCATTTGCTAGG 48 325
904550 N/A N/A 5194 5209 GAGGTGACAGGTCGGG 33 326
904582 N/A N/A 5307 5322 CGATACATTCCCACAG 29 327
904614 N/A N/A 5406 5421 ATGGTACAGGAGAAGG 89 328
904646 N/A N/A 5494 5509 GGAGGCCCTATTGTGT 10 329
904678 N/A N/A 5696 5711 CTATTGGGCCTCAGAT 49 330
904710 N/A N/A 5771 5786 ATAGCACGAAGCCTCC 72 331
904742 N/A N/A 5814 5829 TTCATATTCACCCGAT 66 332
904774 N/A N/A 5873 5888 GTAAACCCAAACAGGC 71 333
904806 N/A N/A 5937 5952 CCTGTATTCGGAGACC 66 334
904838 N/A N/A 5972 5987 ATCAAAAACCTGGGCA 75 335
904870 N/A N/A 6143 6158 TTATGCTTACTCCACA 71 336
904902 N/A N/A 6214 6229 ATGCCCATGTTTGGTA 0 337
904934 N/A N/A 6266 6281 CCTCCTTGTCTCACTA 0 338
904966 N/A N/A 6334 6349 AGCTAAGACCAGTGAG 21 339
904998 N/A N/A 6406 6421 CTGAAACCACCTGTAG 47 340
905030 N/A N/A 6546 6561 CAGATGGGTACTTCTG 41 341
905062 N/A N/A 6609 6624 GCCTTTAGAACAGCTG 23 342
905094 N/A N/A 6700 6715 ATTTCTTGATGTGGTG 98 343
905126 N/A N/A 6798 6813 GGCGAGCGATTGTCTT 84 344
905158 N/A N/A 6883 6898 TGGTTGCCGTGGCAAC 0 345
905190 N/A N/A 7059 7074 ATCATCTTGTTTTGGG 80 346
905222 N/A N/A 7163 7178 TTGAGGCACCTCCATG 0 347
905254 N/A N/A 7263 7278 ATGCAAAGGAGATTCC 28 348
905286 N/A N/A 7344 7359 TTCTCCCTTATAGCTT 33 349
905318 N/A N/A 7479 7494 AGCGAGAGTCACCGCC 4 350
905350 N/A N/A 7847 7862 GTTTCTTGCCGTGCAC 22 351
905382 N/A N/A 7960 7975 GTCAGCTGCCACCAAA 76 352
905414 N/A N/A 8010 8025 GGTAGGTCTACAAAGA 78 353
905446 N/A N/A 8095 8110 GAGGCTGGACTGCTCC 0 354
905478 N/A N/A 8179 8194 CCAGATGTGTTTAGGC 87 355
905510 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT 92 356
905542 N/A N/A 8390 8405 GCCACATGCCTGTTGG 0 357
905574 N/A N/A 8481 8496 GAGAGGAATGAATCCT 37 358
905606 N/A N/A 8644 8659 GAGTCCTCCCCAGACT 0 359
905638 N/A N/A 8750 8765 GCTCTAATTCTATTAG 0 360
905670 N/A N/A 8836 8851 TGCTGAAGCTTTAAAC 13 361
905702 N/A N/A 8900 8915 TGTGGGACTTGTTTTA 64 362
905734 N/A N/A 8965 8980 GTGGGAGTGCATAACA 0 363
[表6] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 80 13
903431 29 44 522 537 GTCCCCAAGATATACC 2 364
903463 135 150 628 643 CCAAGGAATCTTCCCC 53 365
903495 258 273 N/A N/A TTGCACCCTCGCTCCA 25 366
903527 329 344 4804 4819 GTGCCAGCAGCCCAGT 0 367
903623 565 580 12656 12671 TTCTGTACTGCTGGCC 15 368
903655 634 649 12725 12740 GGGCACGGAGCCTTCT 0 369
903687 675 690 12766 12781 GATGGTGGTGCCTTTG 0 370
903719 746 761 12837 12852 GGTGCCAGACCCATGC 0 371
903751 819 834 12910 12925 CCCGGTCAAAGCGGCT 0 372
903783 855 870 12946 12961 CCACTTCTTTCCGTAG 51 373
903815 946 961 13037 13052 AGTTGGATATGTTCTC 81 374
903847 1014 1029 13105 13120 TCTGAGGGCACGGATG 24 375
903879 1092 1107 13183 13198 TTCAGCTGAGATTGGC 49 376
903911 1132 1147 13223 13238 GGATGCTGGGTTCATT 41 377
903943 1236 1251 13327 13342 CTCATGTAAGTGCTTT 81 378
903975 1351 1366 13442 13457 GTCACAGTTCTTGGTC 54 379
904007 1748 1763 13839 13854 TTACCTCACCCTCTTT 64 380
904039 1829 1844 13920 13935 CACTGCCATCTGCATT 57 381
904071 1944 1959 14035 14050 GGCCCCCCAATATATT 0 382
904103 2342 2357 14433 14448 CTGTTCTAACTCTTGG 93 383
904135 2418 2433 14509 14524 AGACTTCATTCTTCGG 69 384
904167 2516 2531 14607 14622 CCATCATCAGGAAGCC 87 385
904199 2620 2635 14711 14726 GGACCATGGCCATGGC 0 386
904231 2772 2787 14863 14878 GATCTGAGCTTCCTCC 44 387
904263 2841 2856 14932 14947 TGATGAGTAGGTGAGT 81 388
904327 N/A N/A 1380 1395 TGAATCTCATGATTGC 75 389
904359 N/A N/A 1002 1017 GTGTGGCCTGGCCATA 0 390
904391 N/A N/A 2544 2559 CGGTTGGTCAATTCCG 0 391
904423 N/A N/A 3741 3756 CAGAGGCTATCAACAA 90 392
904455 N/A N/A 4391 4406 GTTCTGACAATGACCA 50 393
904487 N/A N/A 4830 4845 AGGAGGTGAGCCTACC 0 394
904519 N/A N/A 5069 5084 TTGAGTCATTTGCTAG 47 395
904551 N/A N/A 5196 5211 GGGAGGTGACAGGTCG 36 396
904583 N/A N/A 5309 5324 CCCGATACATTCCCAC 50 397
904615 N/A N/A 5407 5422 CATGGTACAGGAGAAG 32 398
904647 N/A N/A 5495 5510 GGGAGGCCCTATTGTG 14 399
904679 N/A N/A 5697 5712 TCTATTGGGCCTCAGA 15 400
904711 N/A N/A 5772 5787 CATAGCACGAAGCCTC 70 401
904743 N/A N/A 5815 5830 TTTCATATTCACCCGA 87 402
904775 N/A N/A 5874 5889 GGTAAACCCAAACAGG 54 403
904807 N/A N/A 5938 5953 ACCTGTATTCGGAGAC 58 404
904839 N/A N/A 5974 5989 GCATCAAAAACCTGGG 52 405
904871 N/A N/A 6144 6159 CTTATGCTTACTCCAC 85 406
904903 N/A N/A 6215 6230 TATGCCCATGTTTGGT 51 407
904935 N/A N/A 6268 6283 ACCCTCCTTGTCTCAC 37 408
904967 N/A N/A 6335 6350 CAGCTAAGACCAGTGA 65 409
904999 N/A N/A 6407 6422 GCTGAAACCACCTGTA 66 410
905031 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT 89 411
905063 N/A N/A 6610 6625 GGCCTTTAGAACAGCT 0 412
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG 98 413
905127 N/A N/A 6799 6814 GGGCGAGCGATTGTCT 16 414
905159 N/A N/A 6884 6899 TTGGTTGCCGTGGCAA 6 415
905191 N/A N/A 7060 7075 GATCATCTTGTTTTGG 51 416
905223 N/A N/A 7164 7179 CTTGAGGCACCTCCAT 35 417
905255 N/A N/A 7264 7279 CATGCAAAGGAGATTC 0 418
905287 N/A N/A 7345 7360 ATTCTCCCTTATAGCT 15 419
905319 N/A N/A 7480 7495 CAGCGAGAGTCACCGC 0 420
905351 N/A N/A 7848 7863 TGTTTCTTGCCGTGCA 34 421
905383 N/A N/A 7963 7978 GAAGTCAGCTGCCACC 87 422
905415 N/A N/A 8011 8026 TGGTAGGTCTACAAAG 76 423
905447 N/A N/A 8109 8124 GACCATTCCCAGCAGA 65 424
905479 N/A N/A 8180 8195 TCCAGATGTGTTTAGG 83 425
905511 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA 85 426
905543 N/A N/A 8404 8419 GATCACTTCCATCTGC 0 427
905575 N/A N/A 8492 8507 ATGGTGCTTTGGAGAG 5 428
905607 N/A N/A 8649 8664 CAAGAGAGTCCTCCCC 57 429
905639 N/A N/A 8751 8766 GGCTCTAATTCTATTA 0 430
905671 N/A N/A 8862 8877 GGAATTGTGTGCCCCC 43 431
905703 N/A N/A 8902 8917 GATGTGGGACTTGTTT 82 432
905735 N/A N/A 8966 8981 TGTGGGAGTGCATAAC 0 433
[表7] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 86 13
903432 30 45 523 538 AGTCCCCAAGATATAC 0 434
903464 142 157 N/A N/A GCCTCCTCCAAGGAAT 9 435
903496 259 274 N/A N/A GTTGCACCCTCGCTCC 13 436
903528 331 346 4806 4821 TGGTGCCAGCAGCCCA 0 437
903624 566 581 12657 12672 TTTCTGTACTGCTGGC 64 438
903656 635 650 12726 12741 AGGGCACGGAGCCTTC 0 439
903688 676 691 12767 12782 CGATGGTGGTGCCTTT 0 440
903720 747 762 12838 12853 GGGTGCCAGACCCATG 5 441
903752 820 835 12911 12926 TCCCGGTCAAAGCGGC 0 442
903784 856 871 12947 12962 ACCACTTCTTTCCGTA 23 443
903816 947 962 13038 13053 AAGTTGGATATGTTCT 74 444
903848 1015 1030 13106 13121 GTCTGAGGGCACGGAT 37 445
903880 1093 1108 13184 13199 TTTCAGCTGAGATTGG 56 446
903912 1133 1148 13224 13239 AGGATGCTGGGTTCAT 66 447
903944 1237 1252 13328 13343 CCTCATGTAAGTGCTT 70 448
903976 1353 1368 13444 13459 TGGTCACAGTTCTTGG 89 449
904008 1751 1766 13842 13857 ACTTTACCTCACCCTC 80 450
904040 1830 1845 13921 13936 GCACTGCCATCTGCAT 23 451
904072 1945 1960 14036 14051 CGGCCCCCCAATATAT 0 452
904104 2343 2358 14434 14449 ACTGTTCTAACTCTTG 90 453
904136 2419 2434 14510 14525 AAGACTTCATTCTTCG 23 454
904168 2517 2532 14608 14623 ACCATCATCAGGAAGC 82 455
904200 2621 2636 14712 14727 GGGACCATGGCCATGG 74 456
904232 2773 2788 14864 14879 AGATCTGAGCTTCCTC 9 457
904264 2842 2857 14933 14948 TTGATGAGTAGGTGAG 93 458
904328 N/A N/A 1381 1396 TTGAATCTCATGATTG 48 459
904360 N/A N/A 1049 1064 TGTTGCCCCCATTGGG 3 460
904392 N/A N/A 2549 2564 TCTGCCGGTTGGTCAA 18 461
904424 N/A N/A 3753 3768 GAATGAGCAGGTCAGA 95 462
904456 N/A N/A 4392 4407 GGTTCTGACAATGACC 37 463
904488 N/A N/A 4831 4846 GAGGAGGTGAGCCTAC 35 464
904520 N/A N/A 5070 5085 CTTGAGTCATTTGCTA 63 465
904552 N/A N/A 5197 5212 CGGGAGGTGACAGGTC 41 466
904584 N/A N/A 5310 5325 GCCCGATACATTCCCA 16 467
904616 N/A N/A 5409 5424 CTCATGGTACAGGAGA 56 468
904648 N/A N/A 5496 5511 AGGGAGGCCCTATTGT 14 469
904680 N/A N/A 5698 5713 TTCTATTGGGCCTCAG 90 470
904712 N/A N/A 5773 5788 CCATAGCACGAAGCCT 72 471
904744 N/A N/A 5816 5831 GTTTCATATTCACCCG 95 472
904776 N/A N/A 5875 5890 AGGTAAACCCAAACAG 59 473
904808 N/A N/A 5939 5954 CACCTGTATTCGGAGA 16 474
904840 N/A N/A 5975 5990 AGCATCAAAAACCTGG 88 475
904872 N/A N/A 6145 6160 CCTTATGCTTACTCCA 92 476
904904 N/A N/A 6216 6231 GTATGCCCATGTTTGG 34 477
904936 N/A N/A 6269 6284 TACCCTCCTTGTCTCA 54 478
904968 N/A N/A 6336 6351 TCAGCTAAGACCAGTG 89 479
905000 N/A N/A 6409 6424 TTGCTGAAACCACCTG 74 480
905032 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC 94 481
905064 N/A N/A 6611 6626 AGGCCTTTAGAACAGC 26 482
905096 N/A N/A 6714 6729 CACTAAATCTGTGTAT 8 483
905128 N/A N/A 6800 6815 TGGGCGAGCGATTGTC 87 484
905160 N/A N/A 6885 6900 CTTGGTTGCCGTGGCA 27 485
905192 N/A N/A 7076 7091 CTGTTATTAAACCACA 67 486
905224 N/A N/A 7165 7180 CCTTGAGGCACCTCCA 35 487
905256 N/A N/A 7265 7280 CCATGCAAAGGAGATT 68 488
905288 N/A N/A 7346 7361 CATTCTCCCTTATAGC 42 489
905320 N/A N/A 7481 7496 ACAGCGAGAGTCACCG 78 490
905352 N/A N/A 7849 7864 TTGTTTCTTGCCGTGC 57 491
905384 N/A N/A 7964 7979 TGAAGTCAGCTGCCAC 79 492
905416 N/A N/A 8012 8027 ATGGTAGGTCTACAAA 64 493
905448 N/A N/A 8115 8130 ATTCCTGACCATTCCC 75 494
905480 N/A N/A 8181 8196 ATCCAGATGTGTTTAG 86 495
905512 N/A N/A 8334 8349 AACACATCATTGGGTT 27 496
905544 N/A N/A 8405 8420 TGATCACTTCCATCTG 0 497
905576 N/A N/A 8493 8508 CATGGTGCTTTGGAGA 40 498
905608 N/A N/A 8659 8674 CATAAGCCAGCAAGAG 40 499
905640 N/A N/A 8752 8767 GGGCTCTAATTCTATT 0 500
905672 N/A N/A 8863 8878 GGGAATTGTGTGCCCC 24 501
905704 N/A N/A 8903 8918 TGATGTGGGACTTGTT 92 502
905736 N/A N/A 8967 8982 GTGTGGGAGTGCATAA 0 503
[表8] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 80 13
903433 31 46 524 539 CAGTCCCCAAGATATA 24 504
903465 144 159 N/A N/A GGGCCTCCTCCAAGGA 0 505
903497 260 275 N/A N/A TGTTGCACCCTCGCTC 42 506
903529 332 347 4807 4822 ATGGTGCCAGCAGCCC 0 507
903625 567 582 12658 12673 GTTTCTGTACTGCTGG 72 508
903657 636 651 12727 12742 AAGGGCACGGAGCCTT 61 509
903689 677 692 12768 12783 GCGATGGTGGTGCCTT 32 510
903721 748 763 12839 12854 AGGGTGCCAGACCCAT 0 511
903753 821 836 12912 12927 ATCCCGGTCAAAGCGG 0 512
903785 857 872 12948 12963 CACCACTTCTTTCCGT 22 513
903817 949 964 13040 13055 GAAAGTTGGATATGTT 83 514
903849 1016 1031 13107 13122 CGTCTGAGGGCACGGA 15 515
903881 1094 1109 13185 13200 CTTTCAGCTGAGATTG 57 516
903913 1134 1149 13225 13240 CAGGATGCTGGGTTCA 76 517
903945 1238 1253 13329 13344 CCCTCATGTAAGTGCT 67 518
903977 1354 1369 13445 13460 GTGGTCACAGTTCTTG 0 519
904009 1752 1767 13843 13858 AACTTTACCTCACCCT 87 520
904041 1838 1853 13929 13944 TCCTTGCTGCACTGCC 94 521
904073 1946 1961 14037 14052 CCGGCCCCCCAATATA 3 522
904105 2345 2360 14436 14451 CAACTGTTCTAACTCT 74 523
904137 2482 2497 14573 14588 GCCCCCAGGAGGACAA 5 524
904169 2518 2533 14609 14624 GACCATCATCAGGAAG 79 525
904201 2672 2687 14763 14778 CACATACTCTCTGGGA 47 526
904233 2774 2789 14865 14880 GAGATCTGAGCTTCCT 88 527
904265 2843 2858 14934 14949 CTTGATGAGTAGGTGA 78 528
904361 N/A N/A 1052 1067 TTCTGTTGCCCCCATT 68 529
904393 N/A N/A 2558 2573 CTGGGCGAGTCTGCCG 0 530
904425 N/A N/A 3756 3771 GTAGAATGAGCAGGTC 97 531
904457 N/A N/A 4426 4441 AGAGTCTATACACAGA 75 532
904489 N/A N/A 4851 4866 GAGTAGGAACCAGCAG 84 533
904521 N/A N/A 5071 5086 ACTTGAGTCATTTGCT 85 534
904553 N/A N/A 5198 5213 GCGGGAGGTGACAGGT 33 535
904585 N/A N/A 5311 5326 GGCCCGATACATTCCC 0 536
904617 N/A N/A 5410 5425 TCTCATGGTACAGGAG 75 537
904649 N/A N/A 5497 5512 TAGGGAGGCCCTATTG 14 538
904681 N/A N/A 5699 5714 ATTCTATTGGGCCTCA 89 539
904713 N/A N/A 5775 5790 CACCATAGCACGAAGC 90 540
904745 N/A N/A 5817 5832 AGTTTCATATTCACCC 95 541
904777 N/A N/A 5877 5892 CAAGGTAAACCCAAAC 30 542
904809 N/A N/A 5940 5955 TCACCTGTATTCGGAG 32 543
904841 N/A N/A 6017 6032 CTAAAAGCTGATTTGC 52 544
904873 N/A N/A 6146 6161 TCCTTATGCTTACTCC 93 545
904905 N/A N/A 6219 6234 CATGTATGCCCATGTT 61 546
904937 N/A N/A 6270 6285 ATACCCTCCTTGTCTC 39 547
904969 N/A N/A 6337 6352 TTCAGCTAAGACCAGT 89 548
905001 N/A N/A 6410 6425 GTTGCTGAAACCACCT 64 549
905033 N/A N/A 6549 6564 TATCAGATGGGTACTT 66 550
905065 N/A N/A 6612 6627 GAGGCCTTTAGAACAG 0 551
905097 N/A N/A 6715 6730 GCACTAAATCTGTGTA 24 552
905129 N/A N/A 6801 6816 CTGGGCGAGCGATTGT 61 553
905161 N/A N/A 6886 6901 ACTTGGTTGCCGTGGC 27 554
905193 N/A N/A 7077 7092 CCTGTTATTAAACCAC 81 555
905225 N/A N/A 7166 7181 TCCTTGAGGCACCTCC 32 556
905257 N/A N/A 7266 7281 ACCATGCAAAGGAGAT 30 557
905289 N/A N/A 7347 7362 GCATTCTCCCTTATAG 75 558
905321 N/A N/A 7482 7497 GACAGCGAGAGTCACC 29 559
905353 N/A N/A 7850 7865 ATTGTTTCTTGCCGTG 55 560
905385 N/A N/A 7967 7982 TCCTGAAGTCAGCTGC 56 561
905417 N/A N/A 8013 8028 AATGGTAGGTCTACAA 85 562
905449 N/A N/A 8116 8131 TATTCCTGACCATTCC 77 563
905481 N/A N/A 8182 8197 AATCCAGATGTGTTTA 81 564
905513 N/A N/A 8336 8351 TCAACACATCATTGGG 88 565
905545 N/A N/A 8406 8421 GTGATCACTTCCATCT 84 566
905577 N/A N/A 8494 8509 CCATGGTGCTTTGGAG 4 567
905609 N/A N/A 8660 8675 CCATAAGCCAGCAAGA 53 568
905641 N/A N/A 8753 8768 AGGGCTCTAATTCTAT 0 569
905673 N/A N/A 8864 8879 AGGGAATTGTGTGCCC 11 570
905705 N/A N/A 8904 8919 GTGATGTGGGACTTGT 80 571
905737 N/A N/A 8968 8983 AGTGTGGGAGTGCATA 0 572
[表9] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 83 13
903434 32 47 525 540 CCAGTCCCCAAGATAT 31 573
903466 152 167 2362 2377 TCGCTGCAGGGCCTCC 26 574
903498 261 276 N/A N/A TTGTTGCACCCTCGCT 61 575
903530 343 358 N/A N/A TCTCTGGGTCCATGGT 0 576
903626 568 583 12659 12674 AGTTTCTGTACTGCTG 58 577
903658 637 652 12728 12743 CAAGGGCACGGAGCCT 1 578
903690 678 693 12769 12784 GGCGATGGTGGTGCCT 17 579
903722 756 771 12847 12862 CTCTGTGAAGGGTGCC 39 580
903754 822 837 12913 12928 AATCCCGGTCAAAGCG 21 581
903786 858 873 12949 12964 CCACCACTTCTTTCCG 48 582
903818 966 981 13057 13072 ATTGCCAGCTAAGGAA 51 583
903850 1030 1045 13121 13136 GATTGGCTCTGGCTCG 56 584
903882 1095 1110 13186 13201 GCTTTCAGCTGAGATT 6 585
903914 1152 1167 13243 13258 GACTCCTCTGCTCATT 84 586
903946 1239 1254 13330 13345 CCCCTCATGTAAGTGC 43 587
903978 1359 1374 13450 13465 GCCCTGTGGTCACAGT 31 588
904010 1753 1768 13844 13859 AAACTTTACCTCACCC 71 589
904042 1840 1855 13931 13946 TCTCCTTGCTGCACTG 92 590
904074 1947 1962 14038 14053 CCCGGCCCCCCAATAT 0 591
904106 2346 2361 14437 14452 CCAACTGTTCTAACTC 89 592
904138 2484 2499 14575 14590 ATGCCCCCAGGAGGAC 29 593
904170 2522 2537 14613 14628 CAATGACCATCATCAG 45 594
904202 2673 2688 14764 14779 TCACATACTCTCTGGG 79 595
904234 2775 2790 14866 14881 AGAGATCTGAGCTTCC 74 596
904266 2844 2859 14935 14950 GCTTGATGAGTAGGTG 54 597
904298 N/A N/A 2349 2364 TCCTCCTTGAGCAGGA 29 598
904362 N/A N/A 1077 1092 TGAACTCCTTGTACCT 51 599
904394 N/A N/A 2565 2580 GTCCTCCCTGGGCGAG 33 600
904426 N/A N/A 3793 3808 CCACATTTGAGATTAT 88 601
904458 N/A N/A 4457 4472 CGGGCAGCCATCTGAT 0 602
904490 N/A N/A 4870 4885 CACCCTCCATTCTAAG 0 603
904522 N/A N/A 5072 5087 CACTTGAGTCATTTGC 84 604
904554 N/A N/A 5199 5214 AGCGGGAGGTGACAGG 34 605
904586 N/A N/A 5312 5327 AGGCCCGATACATTCC 26 606
904618 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA 65 607
904650 N/A N/A 5498 5513 TTAGGGAGGCCCTATT 6 608
904682 N/A N/A 5700 5715 AATTCTATTGGGCCTC 64 609
904714 N/A N/A 5776 5791 TCACCATAGCACGAAG 86 610
904746 N/A N/A 5819 5834 GCAGTTTCATATTCAC 96 611
904778 N/A N/A 5887 5902 GATTTTCCAACAAGGT 84 612
904810 N/A N/A 5941 5956 CTCACCTGTATTCGGA 27 613
904842 N/A N/A 6020 6035 GCACTAAAAGCTGATT 70 614
904874 N/A N/A 6150 6165 GAAATCCTTATGCTTA 69 615
904906 N/A N/A 6220 6235 CCATGTATGCCCATGT 79 616
904938 N/A N/A 6271 6286 CATACCCTCCTTGTCT 21 617
904970 N/A N/A 6339 6354 AATTCAGCTAAGACCA 77 618
905002 N/A N/A 6411 6426 AGTTGCTGAAACCACC 68 619
905034 N/A N/A 6550 6565 ATATCAGATGGGTACT 74 620
905066 N/A N/A 6613 6628 CGAGGCCTTTAGAACA 19 621
905098 N/A N/A 6716 6731 GGCACTAAATCTGTGT 0 622
905130 N/A N/A 6802 6817 GCTGGGCGAGCGATTG 39 623
905162 N/A N/A 6887 6902 GACTTGGTTGCCGTGG 79 624
905194 N/A N/A 7078 7093 GCCTGTTATTAAACCA 52 625
905226 N/A N/A 7167 7182 ATCCTTGAGGCACCTC 64 626
905258 N/A N/A 7268 7283 CTACCATGCAAAGGAG 38 627
905290 N/A N/A 7348 7363 TGCATTCTCCCTTATA 19 628
905322 N/A N/A 7483 7498 AGACAGCGAGAGTCAC 1 629
905354 N/A N/A 7851 7866 AATTGTTTCTTGCCGT 41 630
905386 N/A N/A 7973 7988 GATTACTCCTGAAGTC 53 631
905418 N/A N/A 8015 8030 ATAATGGTAGGTCTAC 87 632
905450 N/A N/A 8117 8132 ATATTCCTGACCATTC 72 633
905482 N/A N/A 8183 8198 GAATCCAGATGTGTTT 80 634
905514 N/A N/A 8337 8352 ATCAACACATCATTGG 62 635
905546 N/A N/A 8407 8422 AGTGATCACTTCCATC 0 636
905578 N/A N/A 8495 8510 GCCATGGTGCTTTGGA 0 637
905610 N/A N/A 8663 8678 CTTCCATAAGCCAGCA 48 638
905642 N/A N/A 8754 8769 TAGGGCTCTAATTCTA 32 639
905674 N/A N/A 8865 8880 GAGGGAATTGTGTGCC 58 640
905706 N/A N/A 8905 8920 TGTGATGTGGGACTTG 82 641
905738 N/A N/A 8969 8984 AAGTGTGGGAGTGCAT 0 642
[表10] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 84 13
903435 39 54 532 547 AGGTCCTCCAGTCCCC 0 643
903467 153 168 2363 2378 GTCGCTGCAGGGCCTC 4 644
903499 262 277 N/A N/A TTTGTTGCACCCTCGC 91 645
903531 345 360 N/A N/A GCTCTCTGGGTCCATG 8 646
903627 569 584 12660 12675 CAGTTTCTGTACTGCT 14 647
903659 638 653 12729 12744 GCAAGGGCACGGAGCC 0 648
903691 679 694 12770 12785 TGGCGATGGTGGTGCC 0 649
903723 757 772 12848 12863 CCTCTGTGAAGGGTGC 24 650
903755 823 838 12914 12929 TAATCCCGGTCAAAGC 18 651
903787 861 876 12952 12967 TGTCCACCACTTCTTT 49 652
903819 967 982 13058 13073 TATTGCCAGCTAAGGA 33 653
903851 1031 1046 13122 13137 AGATTGGCTCTGGCTC 87 654
903883 1096 1111 13187 13202 CGCTTTCAGCTGAGAT 0 655
903915 1156 1171 13247 13262 GCTTGACTCCTCTGCT 6 656
903947 1240 1255 13331 13346 CCCCCTCATGTAAGTG 25 657
903979 1380 1395 13471 13486 ATCTCTCCTGGTGGCT 82 658
904011 1754 1769 13845 13860 TAAACTTTACCTCACC 65 659
904043 1841 1856 13932 13947 TTCTCCTTGCTGCACT 89 660
904075 1948 1963 14039 14054 ACCCGGCCCCCCAATA 13 661
904107 2347 2362 14438 14453 TCCAACTGTTCTAACT 66 662
904139 2485 2500 14576 14591 TATGCCCCCAGGAGGA 24 663
904171 2525 2540 14616 14631 CCCCAATGACCATCAT 27 664
904203 2678 2693 14769 14784 GGTTCTCACATACTCT 96 665
904235 2776 2791 14867 14882 TAGAGATCTGAGCTTC 43 666
904267 2845 2860 14936 14951 AGCTTGATGAGTAGGT 0 667
904299 N/A N/A 2352 2367 GCCTCCTCCTTGAGCA 0 668
904363 N/A N/A 1086 1101 GATGACCTCTGAACTC 65 669
904395 N/A N/A 2566 2581 GGTCCTCCCTGGGCGA 7 670
904427 N/A N/A 3795 3810 GCCCACATTTGAGATT 23 671
904459 N/A N/A 4461 4476 AGGACGGGCAGCCATC 9 672
904491 N/A N/A 4871 4886 CCACCCTCCATTCTAA 11 673
904523 N/A N/A 5073 5088 CCACTTGAGTCATTTG 89 674
904555 N/A N/A 5200 5215 GAGCGGGAGGTGACAG 16 675
904587 N/A N/A 5313 5328 CAGGCCCGATACATTC 8 676
904619 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG 92 677
904651 N/A N/A 5499 5514 CTTAGGGAGGCCCTAT 3 678
904683 N/A N/A 5701 5716 AAATTCTATTGGGCCT 19 679
904715 N/A N/A 5777 5792 TTCACCATAGCACGAA 24 680
904747 N/A N/A 5826 5841 CCTTACTGCAGTTTCA 91 681
904779 N/A N/A 5889 5904 GGGATTTTCCAACAAG 42 682
904811 N/A N/A 5942 5957 TCTCACCTGTATTCGG 28 683
904843 N/A N/A 6021 6036 TGCACTAAAAGCTGAT 21 684
904875 N/A N/A 6152 6167 CAGAAATCCTTATGCT 25 685
904907 N/A N/A 6221 6236 TCCATGTATGCCCATG 77 686
904939 N/A N/A 6279 6294 CACTCAATCATACCCT 43 687
904971 N/A N/A 6340 6355 CAATTCAGCTAAGACC 54 688
905003 N/A N/A 6413 6428 GGAGTTGCTGAAACCA 35 689
905035 N/A N/A 6551 6566 CATATCAGATGGGTAC 65 690
905067 N/A N/A 6614 6629 ACGAGGCCTTTAGAAC 49 691
905099 N/A N/A 6720 6735 CTCTGGCACTAAATCT 38 692
905131 N/A N/A 6803 6818 GGCTGGGCGAGCGATT 44 693
905163 N/A N/A 6888 6903 TGACTTGGTTGCCGTG 67 694
905195 N/A N/A 7079 7094 GGCCTGTTATTAAACC 2 695
905227 N/A N/A 7168 7183 GATCCTTGAGGCACCT 4 696
905259 N/A N/A 7269 7284 ACTACCATGCAAAGGA 38 697
905291 N/A N/A 7379 7394 CTCCTTATGTTTTGAA 81 698
905323 N/A N/A 7484 7499 CAGACAGCGAGAGTCA 22 699
905355 N/A N/A 7852 7867 AAATTGTTTCTTGCCG 46 700
905387 N/A N/A 7974 7989 GGATTACTCCTGAAGT 33 701
905419 N/A N/A 8016 8031 AATAATGGTAGGTCTA 82 702
905451 N/A N/A 8118 8133 TATATTCCTGACCATT 63 703
905483 N/A N/A 8184 8199 GGAATCCAGATGTGTT 86 704
905515 N/A N/A 8338 8353 TATCAACACATCATTG 37 705
905547 N/A N/A 8408 8423 CAGTGATCACTTCCAT 38 706
905579 N/A N/A 8516 8531 ACATTGAAACACCAGG 92 707
905611 N/A N/A 8664 8679 GCTTCCATAAGCCAGC 35 708
905643 N/A N/A 8755 8770 GTAGGGCTCTAATTCT 56 709
905675 N/A N/A 8866 8881 AGAGGGAATTGTGTGC 78 710
905707 N/A N/A 8906 8921 CTGTGATGTGGGACTT 91 711
905739 N/A N/A 8970 8985 AAAGTGTGGGAGTGCA 0 712
[表11] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 93 13
903414 12 27 505 520 AGGAATTCGAAAGGGA 0 713
903446 52 67 545 560 ATAATAACCAGACAGG 48 714
903478 206 221 N/A N/A GCACTCATCCAGATGC 29 715
903510 288 303 4763 4778 TCCAGTATCTGTCCCA 57 716
903542 397 412 9060 9075 GTGTGCTCACTTTTTC 91 717
903638 615 630 12706 12721 GTTATCCTCAAGCTCA 81 718
903670 656 671 12747 12762 ACCTTCTGAACCCCAT 85 719
903702 729 744 12820 12835 GACGAGGGTCAGGATG 51 720
903734 789 804 12880 12895 CATCCCAGGTTCCAAG 63 721
903766 836 851 12927 12942 ATGGTACTGCTGGTAA 76 722
903798 873 888 12964 12979 GGCTTGGGCTTGTGTC 57 723
903830 982 997 13073 13088 GTGTGAGTTGGTAAGT 98 724
903862 1047 1062 13138 13153 ATGCGGTACTGACTGA 92 725
903894 1107 1122 13198 13213 CACCTGTTCACCGCTT 94 726
903926 1169 1184 13260 13275 GCCACATCCGTGAGCT 25 727
903958 1333 1348 13424 13439 CCTGCAGAATCTTATA 0 728
903990 1393 1408 13484 13499 CCCTGCCAGGCATATC 20 729
904022 1779 1794 13870 13885 CCAAAGTCCCTAACAC 74 730
904054 1866 1881 13957 13972 TATTGCAGGCTCCAAT 18 731
904086 2256 2271 14347 14362 TCTTCCGTCAATATAT 79 732
904118 2383 2398 14474 14489 TGGGTCTGTAGTGGAG 76 733
904150 2498 2513 14589 14604 TGCCTGACTGAGATAT 64 734
904182 2542 2557 14633 14648 CCATCACATGACAACC 83 735
904214 2712 2727 14803 14818 CCGGGTAAGAGCGATG 29 736
904246 2793 2808 14884 14899 CGGCGACAAGACAGCT 53 737
904278 N/A N/A 448 463 AGCAAACACGCTCCCC 32 738
904310 N/A N/A 1333 1348 GCAACGCACCCTTCTC 67 739
904374 N/A N/A 1715 1730 ACAGGCTTCATCATCT 72 740
904406 N/A N/A 2624 2639 AGCCTCTGCTGAATAT 25 741
904438 N/A N/A 3956 3971 GATCTTGCCAGATGCC 38 742
904470 N/A N/A 4584 4599 ATCACTGAGCCCCCAT 55 743
904502 N/A N/A 5016 5031 TCACCCTAAGGAGAGG 68 744
904534 N/A N/A 5095 5110 ACTTCCCCAAGGATGT 25 745
904566 N/A N/A 5217 5232 AGGGTCAGCTTGGAGC 73 746
904598 N/A N/A 5332 5347 GTTAAGCTGGAAGCTG 41 747
904630 N/A N/A 5455 5470 AGCCGTGTTATATTTG 88 748
904662 N/A N/A 5580 5595 TGCCCTAACACAGCTG 8 749
904694 N/A N/A 5742 5757 TTCCCAATTCAGCAAT 54 750
904726 N/A N/A 5793 5808 TTGTCTCCGACACTTT 43 751
904758 N/A N/A 5849 5864 AAGTGCAACCAATCAA 94 752
904790 N/A N/A 5918 5933 CTAAACTCACACTGGC 67 753
904822 N/A N/A 5953 5968 CTAAGTTCCGGTCTCA 87 754
904854 N/A N/A 6090 6105 ACTCCACTGGGCCCGA 16 755
904886 N/A N/A 6191 6206 GCATTGCCCTCCCAAT 57 756
904918 N/A N/A 6233 6248 CACCACAGCCGTTCCA 26 757
904950 N/A N/A 6305 6320 CTGGGTCTGACCCACG 0 758
904982 N/A N/A 6366 6381 CAGGATCCTGACAAAC 0 759
905014 N/A N/A 6437 6452 CAGGTTCACATGACAG 77 760
905046 N/A N/A 6582 6597 AACTGCAAGCTATGGG 91 761
905078 N/A N/A 6628 6643 GACAGGCAATACCTAC 6 762
905110 N/A N/A 6733 6748 GGATGGAAGGAACCTC 91 763
905142 N/A N/A 6821 6836 TGAACGCAATGCTGAC 97 764
905174 N/A N/A 6981 6996 GCTCTCGGCTTCTAAT 21 765
905206 N/A N/A 7111 7126 CGGCTCTCCACTGTCA 46 766
905238 N/A N/A 7232 7247 GCACTCTCAGATGGGC 20 767
905270 N/A N/A 7284 7299 ACAGCATTGAGTACAA 96 768
905302 N/A N/A 7456 7471 ATCAAGCAGGAAGCTC 70 769
905334 N/A N/A 7527 7542 CCGGCCACCTCATTCT 16 770
905366 N/A N/A 7889 7904 CCAGTATGTATTTGTG 52 771
905398 N/A N/A 7986 8001 CAGTACAGAGCAGGAT 96 772
905430 N/A N/A 8064 8079 CACATGTTTCAACAGT 78 773
905462 N/A N/A 8145 8160 TTTAGAAAGGACACGG 94 774
905494 N/A N/A 8268 8283 AATATCAGAGTGTACC 94 775
905526 N/A N/A 8373 8388 TCAAACACTTTATACC 63 776
905558 N/A N/A 8424 8439 GGAAGTGGAAACATCC 50 777
905590 N/A N/A 8561 8576 GTTGAAGTCACCCAGC 48 778
905622 N/A N/A 8692 8707 GACTGTGTGAGCACAC 25 779
905654 N/A N/A 8809 8824 CATTTGGAGATCTGGC 90 780
905686 N/A N/A 8877 8892 ATTAGTGCTATAGAGG 87 781
905718 N/A N/A 8945 8960 TTGCATAAGAGATGAC 84 782
[表12] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 89 13
903415 13 28 506 521 GAGGAATTCGAAAGGG 47 783
903447 54 69 547 562 GTATAATAACCAGACA 30 784
903479 207 222 N/A N/A TGCACTCATCCAGATG 15 785
903511 289 304 4764 4779 CTCCAGTATCTGTCCC 70 786
903671 658 673 12749 12764 GGACCTTCTGAACCCC 20 787
903703 730 745 12821 12836 CGACGAGGGTCAGGAT 53 788
903735 790 805 12881 12896 CCATCCCAGGTTCCAA 51 789
903767 837 852 12928 12943 CATGGTACTGCTGGTA 83 790
903799 891 906 12982 12997 TTTGATGACCAGGTCG 74 791
903831 983 998 13074 13089 CGTGTGAGTTGGTAAG 86 792
903863 1048 1063 13139 13154 CATGCGGTACTGACTG 44 793
903895 1108 1123 13199 13214 CCACCTGTTCACCGCT 92 794
903927 1171 1186 13262 13277 GGGCCACATCCGTGAG 0 795
904023 1780 1795 13871 13886 GCCAAAGTCCCTAACA 87 796
904087 2257 2272 14348 14363 TTCTTCCGTCAATATA 91 797
904119 2385 2400 14476 14491 GCTGGGTCTGTAGTGG 88 798
904151 2499 2514 14590 14605 CTGCCTGACTGAGATA 86 799
904183 2543 2558 14634 14649 CCCATCACATGACAAC 85 800
904215 2713 2728 14804 14819 ACCGGGTAAGAGCGAT 76 801
904247 2794 2809 14885 14900 GCGGCGACAAGACAGC 24 802
904311 N/A N/A 1336 1351 TCTGCAACGCACCCTT 54 803
904343 N/A N/A 631 646 TTACCAAGGAATCTTC 42 804
904375 N/A N/A 1885 1900 CGCCTCCTTCAACCTT 68 805
904407 N/A N/A 2637 2652 GACCCTGACCTGGAGC 48 806
904439 N/A N/A 4015 4030 GCACTGGACAGCCTGT 41 807
904471 N/A N/A 4590 4605 TTGTCTATCACTGAGC 66 808
904503 N/A N/A 5017 5032 GTCACCCTAAGGAGAG 40 809
904535 N/A N/A 5104 5119 GCTGATTCCACTTCCC 66 810
904567 N/A N/A 5221 5236 CCCCAGGGTCAGCTTG 48 811
904599 N/A N/A 5333 5348 AGTTAAGCTGGAAGCT 18 812
904631 N/A N/A 5456 5471 TAGCCGTGTTATATTT 73 813
904663 N/A N/A 5650 5665 TGAACTCAGCCCCTGC 43 814
904695 N/A N/A 5743 5758 TTTCCCAATTCAGCAA 63 815
904727 N/A N/A 5794 5809 CTTGTCTCCGACACTT 81 816
904759 N/A N/A 5850 5865 TAAGTGCAACCAATCA 92 817
904791 N/A N/A 5919 5934 CCTAAACTCACACTGG 47 818
904823 N/A N/A 5954 5969 GCTAAGTTCCGGTCTC 87 819
904855 N/A N/A 6091 6106 AACTCCACTGGGCCCG 0 820
904887 N/A N/A 6194 6209 ACTGCATTGCCCTCCC 80 821
904919 N/A N/A 6234 6249 GCACCACAGCCGTTCC 37 822
904983 N/A N/A 6367 6382 ACAGGATCCTGACAAA 8 823
905047 N/A N/A 6583 6598 AAACTGCAAGCTATGG 71 824
905079 N/A N/A 6630 6645 TGGACAGGCAATACCT 1 825
905143 N/A N/A 6822 6837 ATGAACGCAATGCTGA 96 826
905175 N/A N/A 6982 6997 TGCTCTCGGCTTCTAA 65 827
905207 N/A N/A 7112 7127 ACGGCTCTCCACTGTC 58 828
905239 N/A N/A 7233 7248 GGCACTCTCAGATGGG 13 829
905271 N/A N/A 7285 7300 CACAGCATTGAGTACA 88 830
905303 N/A N/A 7459 7474 ACCATCAAGCAGGAAG 90 831
905335 N/A N/A 7528 7543 CCCGGCCACCTCATTC 0 832
905367 N/A N/A 7890 7905 ACCAGTATGTATTTGT 75 833
905399 N/A N/A 7987 8002 TCAGTACAGAGCAGGA 96 834
905431 N/A N/A 8065 8080 ACACATGTTTCAACAG 70 835
905463 N/A N/A 8146 8161 TTTTAGAAAGGACACG 93 836
905495 N/A N/A 8269 8284 AAATATCAGAGTGTAC 75 837
905527 N/A N/A 8374 8389 GTCAAACACTTTATAC 52 838
905559 N/A N/A 8442 8457 GTGAGCCTTCCAGGCC 0 839
905591 N/A N/A 8564 8579 GATGTTGAAGTCACCC 60 840
905623 N/A N/A 8694 8709 AAGACTGTGTGAGCAC 54 841
905655 N/A N/A 8811 8826 TACATTTGGAGATCTG 95 842
905687 N/A N/A 8878 8893 CATTAGTGCTATAGAG 76 843
905719 N/A N/A 8946 8961 ATTGCATAAGAGATGA 83 844
[表13] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 79 13
903416 14 29 507 522 CGAGGAATTCGAAAGG 22 845
903448 55 70 548 563 TGTATAATAACCAGAC 27 846
903480 208 223 N/A N/A GTGCACTCATCCAGAT 0 847
903512 291 306 4766 4781 ATCTCCAGTATCTGTC 20 848
903544 403 418 9066 9081 GATTCTGTGTGCTCAC 90 849
903640 617 632 12708 12723 ATGTTATCCTCAAGCT 47 850
903672 659 674 12750 12765 TGGACCTTCTGAACCC 6 851
903704 731 746 12822 12837 CCGACGAGGGTCAGGA 25 852
903736 793 808 12884 12899 ACTCCATCCCAGGTTC 20 853
903768 838 853 12929 12944 CCATGGTACTGCTGGT 0 854
903800 892 907 12983 12998 TTTTGATGACCAGGTC 57 855
903832 997 1012 13088 13103 CCTTCCCAATGCCTCG 78 856
903864 1049 1064 13140 13155 GCATGCGGTACTGACT 4 857
903896 1109 1124 13200 13215 TCCACCTGTTCACCGC 78 858
903928 1200 1215 13291 13306 TACATCCAGCACAAGA 72 859
903960 1335 1350 13426 13441 CGCCTGCAGAATCTTA 63 860
903992 1395 1410 13486 13501 GCCCCTGCCAGGCATA 20 861
904024 1781 1796 13872 13887 TGCCAAAGTCCCTAAC 83 862
904056 1872 1887 13963 13978 TTCCCTTATTGCAGGC 77 863
904088 2258 2273 14349 14364 ATTCTTCCGTCAATAT 77 864
904120 2386 2401 14477 14492 GGCTGGGTCTGTAGTG 66 865
904152 2500 2515 14591 14606 GCTGCCTGACTGAGAT 33 866
904184 2544 2559 14635 14650 ACCCATCACATGACAA 80 867
904216 2714 2729 14805 14820 TACCGGGTAAGAGCGA 84 868
904248 2795 2810 14886 14901 GGCGGCGACAAGACAG 58 869
904280 N/A N/A 450 465 ACAGCAAACACGCTCC 18 870
904312 N/A N/A 1338 1353 ATTCTGCAACGCACCC 61 871
904344 N/A N/A 642 657 CTGTCCCCAACTTACC 7 872
904376 N/A N/A 1887 1902 TCCGCCTCCTTCAACC 45 873
904408 N/A N/A 2680 2695 CACCCTGGATCCCATC 26 874
904440 N/A N/A 4044 4059 CTCTTCATCTTGGTGA 69 875
904472 N/A N/A 4599 4614 CCAGATTGTTTGTCTA 62 876
904504 N/A N/A 5018 5033 TGTCACCCTAAGGAGA 36 877
904536 N/A N/A 5105 5120 CGCTGATTCCACTTCC 17 878
904568 N/A N/A 5222 5237 ACCCCAGGGTCAGCTT 25 879
904600 N/A N/A 5334 5349 CAGTTAAGCTGGAAGC 18 880
904632 N/A N/A 5457 5472 GTAGCCGTGTTATATT 73 881
904664 N/A N/A 5652 5667 ACTGAACTCAGCCCCT 50 882
904696 N/A N/A 5744 5759 GTTTCCCAATTCAGCA 64 883
904728 N/A N/A 5795 5810 CCTTGTCTCCGACACT 88 884
904760 N/A N/A 5851 5866 GTAAGTGCAACCAATC 98 885
904792 N/A N/A 5920 5935 CCCTAAACTCACACTG 28 886
904824 N/A N/A 5955 5970 GGCTAAGTTCCGGTCT 48 887
904856 N/A N/A 6092 6107 AAACTCCACTGGGCCC 9 888
904888 N/A N/A 6195 6210 AACTGCATTGCCCTCC 72 889
904920 N/A N/A 6236 6251 CCGCACCACAGCCGTT 26 890
904952 N/A N/A 6307 6322 CGCTGGGTCTGACCCA 22 891
904984 N/A N/A 6368 6383 CACAGGATCCTGACAA 0 892
905016 N/A N/A 6439 6454 AGCAGGTTCACATGAC 78 893
905048 N/A N/A 6587 6602 CCTGAAACTGCAAGCT 41 894
905080 N/A N/A 6631 6646 CTGGACAGGCAATACC 24 895
905112 N/A N/A 6735 6750 TTGGATGGAAGGAACC 75 896
905144 N/A N/A 6823 6838 AATGAACGCAATGCTG 83 897
905176 N/A N/A 6983 6998 GTGCTCTCGGCTTCTA 59 898
905208 N/A N/A 7113 7128 CACGGCTCTCCACTGT 30 899
905240 N/A N/A 7234 7249 GGGCACTCTCAGATGG 44 900
905272 N/A N/A 7286 7301 CCACAGCATTGAGTAC 58 901
905304 N/A N/A 7460 7475 AACCATCAAGCAGGAA 70 902
905336 N/A N/A 7532 7547 AGTGCCCGGCCACCTC 37 903
905368 N/A N/A 7892 7907 GGACCAGTATGTATTT 34 904
905400 N/A N/A 7988 8003 GTCAGTACAGAGCAGG 96 905
905432 N/A N/A 8066 8081 CACACATGTTTCAACA 48 906
905464 N/A N/A 8156 8171 ATTTCCACTATTTTAG 59 907
905496 N/A N/A 8271 8286 GAAAATATCAGAGTGT 94 908
905528 N/A N/A 8375 8390 GGTCAAACACTTTATA 58 909
905560 N/A N/A 8443 8458 AGTGAGCCTTCCAGGC 11 910
905592 N/A N/A 8565 8580 AGATGTTGAAGTCACC 67 911
905624 N/A N/A 8704 8719 GGGACACAAGAAGACT 23 912
905656 N/A N/A 8812 8827 CTACATTTGGAGATCT 62 913
905688 N/A N/A 8879 8894 TCATTAGTGCTATAGA 91 914
905720 N/A N/A 8947 8962 CATTGCATAAGAGATG 19 915
[表14] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 82 13
903417 15 30 508 523 CCGAGGAATTCGAAAG 12 916
903449 56 71 549 564 CTGTATAATAACCAGA 47 917
903481 209 224 N/A N/A AGTGCACTCATCCAGA 0 918
903513 292 307 4767 4782 GATCTCCAGTATCTGT 28 919
903641 618 633 12709 12724 TATGTTATCCTCAAGC 52 920
903673 660 675 12751 12766 GTGGACCTTCTGAACC 0 921
903705 732 747 12823 12838 GCCGACGAGGGTCAGG 11 922
903737 794 809 12885 12900 AACTCCATCCCAGGTT 0 923
903769 839 854 12930 12945 TCCATGGTACTGCTGG 0 924
903801 893 908 12984 12999 CTTTTGATGACCAGGT 60 925
903833 999 1014 13090 13105 GTCCTTCCCAATGCCT 28 926
903865 1050 1065 13141 13156 GGCATGCGGTACTGAC 37 927
903897 1110 1125 13201 13216 CTCCACCTGTTCACCG 57 928
903929 1201 1216 13292 13307 CTACATCCAGCACAAG 72 929
903961 1336 1351 13427 13442 CCGCCTGCAGAATCTT 91 930
903993 1405 1420 13496 13511 TTTTGTCCTGGCCCCT 83 931
904025 1782 1797 13873 13888 ATGCCAAAGTCCCTAA 96 932
904057 1873 1888 13964 13979 TTTCCCTTATTGCAGG 77 933
904089 2259 2274 14350 14365 TATTCTTCCGTCAATA 50 934
904121 2401 2416 14492 14507 GGACATTGAACCTGGG 86 935
904153 2501 2516 14592 14607 CGCTGCCTGACTGAGA 58 936
904185 2545 2560 14636 14651 GACCCATCACATGACA 59 937
904217 2715 2730 14806 14821 TTACCGGGTAAGAGCG 76 938
904249 2796 2811 14887 14902 GGGCGGCGACAAGACA 82 939
904281 N/A N/A 451 466 CACAGCAAACACGCTC 30 940
904313 N/A N/A 1339 1354 CATTCTGCAACGCACC 54 941
904345 N/A N/A 651 666 GCAGGTCAACTGTCCC 0 942
904377 N/A N/A 1888 1903 ATCCGCCTCCTTCAAC 17 943
904409 N/A N/A 2706 2721 ATTCCCCCGACACTTG 62 944
904441 N/A N/A 4045 4060 ACTCTTCATCTTGGTG 73 945
904473 N/A N/A 4607 4622 AACCTAAACCAGATTG 0 946
904505 N/A N/A 5019 5034 GTGTCACCCTAAGGAG 29 947
904537 N/A N/A 5106 5121 CCGCTGATTCCACTTC 35 948
904569 N/A N/A 5233 5248 CAGGTGGAAACACCCC 1 949
904601 N/A N/A 5335 5350 CCAGTTAAGCTGGAAG 4 950
904633 N/A N/A 5458 5473 GGTAGCCGTGTTATAT 74 951
904665 N/A N/A 5653 5668 GACTGAACTCAGCCCC 57 952
904697 N/A N/A 5745 5760 TGTTTCCCAATTCAGC 67 953
904729 N/A N/A 5796 5811 ACCTTGTCTCCGACAC 71 954
904761 N/A N/A 5852 5867 TGTAAGTGCAACCAAT 85 955
904793 N/A N/A 5921 5936 TCCCTAAACTCACACT 18 956
904825 N/A N/A 5956 5971 AGGCTAAGTTCCGGTC 35 957
904857 N/A N/A 6093 6108 CAAACTCCACTGGGCC 16 958
904889 N/A N/A 6196 6211 AAACTGCATTGCCCTC 64 959
904921 N/A N/A 6237 6252 CCCGCACCACAGCCGT 44 960
904953 N/A N/A 6308 6323 GCGCTGGGTCTGACCC 0 961
904985 N/A N/A 6369 6384 CCACAGGATCCTGACA 14 962
905017 N/A N/A 6512 6527 TAAAGCCAGCTGACAG 47 963
905049 N/A N/A 6588 6603 CCCTGAAACTGCAAGC 32 964
905081 N/A N/A 6632 6647 CCTGGACAGGCAATAC 0 965
905113 N/A N/A 6736 6751 TTTGGATGGAAGGAAC 71 966
905145 N/A N/A 6824 6839 AAATGAACGCAATGCT 65 967
905177 N/A N/A 6984 6999 AGTGCTCTCGGCTTCT 39 968
905209 N/A N/A 7114 7129 ACACGGCTCTCCACTG 55 969
905241 N/A N/A 7235 7250 TGGGCACTCTCAGATG 25 970
905273 N/A N/A 7289 7304 ACTCCACAGCATTGAG 4 971
905305 N/A N/A 7461 7476 AAACCATCAAGCAGGA 63 972
905337 N/A N/A 7829 7844 ACAAGAGACCTCATTC 48 973
905369 N/A N/A 7893 7908 GGGACCAGTATGTATT 21 974
905401 N/A N/A 7990 8005 AAGTCAGTACAGAGCA 94 975
905433 N/A N/A 8067 8082 CCACACATGTTTCAAC 62 976
905465 N/A N/A 8158 8173 GAATTTCCACTATTTT 74 977
905497 N/A N/A 8307 8322 GGTTCAAAAGCAGCAT 96 978
905529 N/A N/A 8376 8391 GGGTCAAACACTTTAT 78 979
905561 N/A N/A 8444 8459 AAGTGAGCCTTCCAGG 30 980
905593 N/A N/A 8566 8581 CAGATGTTGAAGTCAC 56 981
905625 N/A N/A 8723 8738 CCTATTGTAAGAACAG 58 982
905657 N/A N/A 8820 8835 TCAGGTGACTACATTT 89 983
905689 N/A N/A 8880 8895 GTCATTAGTGCTATAG 95 984
905721 N/A N/A 8948 8963 CCATTGCATAAGAGAT 84 985
[表15] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 86 13
903418 16 31 509 524 ACCGAGGAATTCGAAA 22 986
903450 59 74 552 567 CGTCTGTATAATAACC 37 987
903482 210 225 N/A N/A AAGTGCACTCATCCAG 50 988
903514 293 308 4768 4783 GGATCTCCAGTATCTG 15 989
903642 619 634 12710 12725 TTATGTTATCCTCAAG 67 990
903674 661 676 12752 12767 TGTGGACCTTCTGAAC 16 991
903706 733 748 12824 12839 TGCCGACGAGGGTCAG 42 992
903738 795 810 12886 12901 CAACTCCATCCCAGGT 37 993
903770 841 856 12932 12947 AGTCCATGGTACTGCT 21 994
903802 894 909 12985 13000 GCTTTTGATGACCAGG 87 995
903834 1000 1015 13091 13106 TGTCCTTCCCAATGCC 38 996
903866 1052 1067 13143 13158 GAGGCATGCGGTACTG 53 997
903898 1111 1126 13202 13217 TCTCCACCTGTTCACC 63 998
903930 1204 1219 13295 13310 AGACTACATCCAGCAC 81 999
903962 1337 1352 13428 13443 TCCGCCTGCAGAATCT 76 1000
903994 1406 1421 13497 13512 ATTTTGTCCTGGCCCC 64 1001
904026 1787 1802 13878 13893 TGGAAATGCCAAAGTC 97 1002
904058 1884 1899 13975 13990 CAGTTCCCATTTTTCC 93 1003
904090 2260 2275 14351 14366 CTATTCTTCCGTCAAT 67 1004
904122 2402 2417 14493 14508 AGGACATTGAACCTGG 65 1005
904154 2502 2517 14593 14608 CCGCTGCCTGACTGAG 81 1006
904186 2546 2561 14637 14652 GGACCCATCACATGAC 55 1007
904218 2716 2731 14807 14822 CTTACCGGGTAAGAGC 49 1008
904250 2797 2812 14888 14903 TGGGCGGCGACAAGAC 74 1009
904282 N/A N/A 457 472 ACCAAGCACAGCAAAC 0 1010
904314 N/A N/A 1341 1356 ACCATTCTGCAACGCA 68 1011
904346 N/A N/A 655 670 GGAGGCAGGTCAACTG 5 1012
904378 N/A N/A 2051 2066 TGACCACCTGTCTTGG 0 1013
904410 N/A N/A 2716 2731 GGTGCCTCGGATTCCC 9 1014
904442 N/A N/A 4052 4067 GTGCTCAACTCTTCAT 76 1015
904474 N/A N/A 4615 4630 CCAAGACCAACCTAAA 29 1016
904506 N/A N/A 5020 5035 CGTGTCACCCTAAGGA 51 1017
904538 N/A N/A 5107 5122 CCCGCTGATTCCACTT 36 1018
904570 N/A N/A 5234 5249 TCAGGTGGAAACACCC 11 1019
904602 N/A N/A 5336 5351 TCCAGTTAAGCTGGAA 0 1020
904634 N/A N/A 5460 5475 CAGGTAGCCGTGTTAT 41 1021
904666 N/A N/A 5654 5669 TGACTGAACTCAGCCC 43 1022
904698 N/A N/A 5747 5762 GCTGTTTCCCAATTCA 57 1023
904730 N/A N/A 5797 5812 AACCTTGTCTCCGACA 46 1024
904762 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA 76 1025
904794 N/A N/A 5925 5940 GACCTCCCTAAACTCA 13 1026
904826 N/A N/A 5957 5972 AAGGCTAAGTTCCGGT 47 1027
904858 N/A N/A 6104 6119 GACAAGAACCCCAAAC 0 1028
904890 N/A N/A 6197 6212 AAAACTGCATTGCCCT 72 1029
904922 N/A N/A 6238 6253 ACCCGCACCACAGCCG 12 1030
904954 N/A N/A 6320 6335 AGATCCAACTCGGCGC 7 1031
904986 N/A N/A 6370 6385 CCCACAGGATCCTGAC 25 1032
905018 N/A N/A 6514 6529 CTTAAAGCCAGCTGAC 25 1033
905050 N/A N/A 6590 6605 CCCCCTGAAACTGCAA 34 1034
905082 N/A N/A 6633 6648 TCCTGGACAGGCAATA 32 1035
905114 N/A N/A 6739 6754 AGGTTTGGATGGAAGG 90 1036
905146 N/A N/A 6825 6840 GAAATGAACGCAATGC 87 1037
905178 N/A N/A 6985 7000 GAGTGCTCTCGGCTTC 47 1038
905210 N/A N/A 7115 7130 TACACGGCTCTCCACT 73 1039
905242 N/A N/A 7236 7251 TTGGGCACTCTCAGAT 8 1040
905274 N/A N/A 7290 7305 AACTCCACAGCATTGA 53 1041
905306 N/A N/A 7466 7481 GCCCAAAACCATCAAG 3 1042
905338 N/A N/A 7830 7845 CACAAGAGACCTCATT 15 1043
905370 N/A N/A 7917 7932 TATGGAATTGCAGATA 85 1044
905402 N/A N/A 7991 8006 CAAGTCAGTACAGAGC 93 1045
905434 N/A N/A 8068 8083 CCCACACATGTTTCAA 58 1046
905466 N/A N/A 8159 8174 AGAATTTCCACTATTT 82 1047
905498 N/A N/A 8308 8323 TGGTTCAAAAGCAGCA 90 1048
905530 N/A N/A 8377 8392 TGGGTCAAACACTTTA 63 1049
905562 N/A N/A 8445 8460 GAAGTGAGCCTTCCAG 60 1050
905594 N/A N/A 8567 8582 CCAGATGTTGAAGTCA 76 1051
905626 N/A N/A 8724 8739 TCCTATTGTAAGAACA 54 1052
905658 N/A N/A 8821 8836 CTCAGGTGACTACATT 87 1053
905690 N/A N/A 8881 8896 AGTCATTAGTGCTATA 90 1054
905722 N/A N/A 8949 8964 GCCATTGCATAAGAGA 29 1055
[表16] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
903419 17 32 510 525 TACCGAGGAATTCGAA 13 1056
903451 73 88 566 581 CACCTCCAGTTATGCG 51 1057
903483 211 226 N/A N/A AAAGTGCACTCATCCA 71 1058
903515 294 309 4769 4784 AGGATCTCCAGTATCT 24 1059
903643 620 635 12711 12726 CTTATGTTATCCTCAA 81 1060
903675 662 677 12753 12768 TTGTGGACCTTCTGAA 58 1061
903707 734 749 12825 12840 ATGCCGACGAGGGTCA 49 1062
903739 801 816 12892 12907 GATTCCCAACTCCATC 10 1063
903771 842 857 12933 12948 TAGTCCATGGTACTGC 4 1064
903803 896 911 12987 13002 AGGCTTTTGATGACCA 24 1065
903835 1001 1016 13092 13107 ATGTCCTTCCCAATGC 32 1066
903867 1053 1068 13144 13159 TGAGGCATGCGGTACT 88 1067
903899 1115 1130 13206 13221 ACCCTCTCCACCTGTT 41 1068
903931 1205 1220 13296 13311 TAGACTACATCCAGCA 72 1069
903963 1338 1353 13429 13444 GTCCGCCTGCAGAATC 82 1070
903995 1701 1716 13792 13807 AAAAGCGATGGCTCAC 57 1071
904027 1791 1806 13882 13897 GCTATGGAAATGCCAA 90 1072
904059 1886 1901 13977 13992 TCCAGTTCCCATTTTT 90 1073
904091 2264 2279 14355 14370 CTCTCTATTCTTCCGT 92 1074
904123 2404 2419 14495 14510 GGAGGACATTGAACCT 62 1075
904155 2503 2518 14594 14609 GCCGCTGCCTGACTGA 48 1076
904187 2589 2604 14680 14695 CAGTGTTCAAGCAGGG 83 1077
904219 2717 2732 14808 14823 ACTTACCGGGTAAGAG 49 1078
904251 2798 2813 14889 14904 CTGGGCGGCGACAAGA 39 1079
904283 N/A N/A 458 473 GACCAAGCACAGCAAA 0 1080
904315 N/A N/A 1342 1357 CACCATTCTGCAACGC 74 1081
904347 N/A N/A 767 782 CAATCAGACTCAAGCC 19 1082
904379 N/A N/A 2053 2068 CGTGACCACCTGTCTT 16 1083
904411 N/A N/A 2721 2736 GAGCTGGTGCCTCGGA 30 1084
904443 N/A N/A 4081 4096 CCTCATTGCAAATCCT 96 1085
904475 N/A N/A 4648 4663 GCTCTGCAAATCTCTC 15 1086
904507 N/A N/A 5021 5036 CCGTGTCACCCTAAGG 54 1087
904539 N/A N/A 5108 5123 CCCCGCTGATTCCACT 16 1088
904571 N/A N/A 5235 5250 CTCAGGTGGAAACACC 34 1089
904603 N/A N/A 5337 5352 GTCCAGTTAAGCTGGA 9 1090
904635 N/A N/A 5461 5476 CCAGGTAGCCGTGTTA 74 1091
904667 N/A N/A 5655 5670 ATGACTGAACTCAGCC 32 1092
904699 N/A N/A 5757 5772 CCTCCAGTTTGCTGTT 48 1093
904731 N/A N/A 5798 5813 AAACCTTGTCTCCGAC 66 1094
904763 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA 96 1095
904795 N/A N/A 5926 5941 AGACCTCCCTAAACTC 8 1096
904827 N/A N/A 5958 5973 CAAGGCTAAGTTCCGG 64 1097
904859 N/A N/A 6106 6121 AAGACAAGAACCCCAA 68 1098
904891 N/A N/A 6198 6213 CAAAACTGCATTGCCC 50 1099
904923 N/A N/A 6242 6257 ACCCACCCGCACCACA 16 1100
904955 N/A N/A 6321 6336 GAGATCCAACTCGGCG 11 1101
904987 N/A N/A 6371 6386 GCCCACAGGATCCTGA 0 1102
905051 N/A N/A 6592 6607 AACCCCCTGAAACTGC 65 1103
905083 N/A N/A 6634 6649 TTCCTGGACAGGCAAT 31 1104
905115 N/A N/A 6740 6755 CAGGTTTGGATGGAAG 74 1105
905147 N/A N/A 6826 6841 GGAAATGAACGCAATG 91 1106
905179 N/A N/A 6986 7001 TGAGTGCTCTCGGCTT 62 1107
905211 N/A N/A 7116 7131 GTACACGGCTCTCCAC 7 1108
905243 N/A N/A 7237 7252 CTTGGGCACTCTCAGA 44 1109
905275 N/A N/A 7291 7306 AAACTCCACAGCATTG 30 1110
905307 N/A N/A 7467 7482 CGCCCAAAACCATCAA 44 1111
905339 N/A N/A 7833 7848 ACACACAAGAGACCTC 0 1112
905371 N/A N/A 7918 7933 TTATGGAATTGCAGAT 93 1113
905403 N/A N/A 7992 8007 TCAAGTCAGTACAGAG 92 1114
905435 N/A N/A 8070 8085 CACCCACACATGTTTC 49 1115
905467 N/A N/A 8160 8175 CAGAATTTCCACTATT 85 1116
905499 N/A N/A 8309 8324 TTGGTTCAAAAGCAGC 92 1117
905531 N/A N/A 8378 8393 TTGGGTCAAACACTTT 69 1118
905563 N/A N/A 8448 8463 CATGAAGTGAGCCTTC 56 1119
905595 N/A N/A 8568 8583 GCCAGATGTTGAAGTC 34 1120
905627 N/A N/A 8725 8740 GTCCTATTGTAAGAAC 24 1121
905659 N/A N/A 8822 8837 ACTCAGGTGACTACAT 71 1122
905691 N/A N/A 8882 8897 GAGTCATTAGTGCTAT 92 1123
905723 N/A N/A 8951 8966 CAGCCATTGCATAAGA 46 1124
[表17] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 84 13
903420 18 33 511 526 ATACCGAGGAATTCGA 5 1125
903452 74 89 567 582 CCACCTCCAGTTATGC 70 1126
903484 212 227 4505 4520 AAAAGTGCACTCATCC 65 1127
903516 295 310 4770 4785 GAGGATCTCCAGTATC 60 1128
903644 623 638 12714 12729 CTTCTTATGTTATCCT 90 1129
903676 663 678 12754 12769 TTTGTGGACCTTCTGA 76 1130
903708 735 750 12826 12841 CATGCCGACGAGGGTC 25 1131
903740 805 820 12896 12911 CTGTGATTCCCAACTC 66 1132
903772 843 858 12934 12949 GTAGTCCATGGTACTG 15 1133
903804 897 912 12988 13003 AAGGCTTTTGATGACC 64 1134
903836 1002 1017 13093 13108 GATGTCCTTCCCAATG 29 1135
903868 1054 1069 13145 13160 CTGAGGCATGCGGTAC 78 1136
903900 1116 1131 13207 13222 AACCCTCTCCACCTGT 48 1137
903932 1206 1221 13297 13312 GTAGACTACATCCAGC 63 1138
903964 1339 1354 13430 13445 GGTCCGCCTGCAGAAT 70 1139
903996 1706 1721 13797 13812 GGGTCAAAAGCGATGG 94 1140
904028 1792 1807 13883 13898 AGCTATGGAAATGCCA 62 1141
904060 1888 1903 13979 13994 TCTCCAGTTCCCATTT 73 1142
904092 2270 2285 14361 14376 AGCCTCCTCTCTATTC 49 1143
904124 2405 2420 14496 14511 CGGAGGACATTGAACC 89 1144
904156 2504 2519 14595 14610 AGCCGCTGCCTGACTG 54 1145
904188 2590 2605 14681 14696 TCAGTGTTCAAGCAGG 92 1146
904220 2718 2733 14809 14824 TACTTACCGGGTAAGA 47 1147
904252 2799 2814 14890 14905 CCTGGGCGGCGACAAG 53 1148
904284 N/A N/A 459 474 TGACCAAGCACAGCAA 10 1149
904316 N/A N/A 1343 1358 GCACCATTCTGCAACG 29 1150
904348 N/A N/A 801 816 TCTATAGTTTAAGAGC 6 1151
904380 N/A N/A 2437 2452 TCCCGCCTCAGGGCTC 22 1152
904412 N/A N/A 2788 2803 ACACCATCTCATGAGC 59 1153
904444 N/A N/A 4200 4215 GTTTTTACAATAGTGC 97 1154
904476 N/A N/A 4667 4682 GCTTGCTTGAGCAGCC 16 1155
904508 N/A N/A 5022 5037 GCCGTGTCACCCTAAG 65 1156
904540 N/A N/A 5109 5124 CCCCCGCTGATTCCAC 43 1157
904572 N/A N/A 5236 5251 CCTCAGGTGGAAACAC 0 1158
904604 N/A N/A 5338 5353 GGTCCAGTTAAGCTGG 12 1159
904636 N/A N/A 5462 5477 GCCAGGTAGCCGTGTT 61 1160
904668 N/A N/A 5656 5671 GATGACTGAACTCAGC 63 1161
904700 N/A N/A 5760 5775 CCTCCTCCAGTTTGCT 50 1162
904732 N/A N/A 5799 5814 TAAACCTTGTCTCCGA 87 1163
904764 N/A N/A 5855 5870 TTTTGTAAGTGCAACC 94 1164
904796 N/A N/A 5927 5942 GAGACCTCCCTAAACT 26 1165
904828 N/A N/A 5959 5974 GCAAGGCTAAGTTCCG 97 1166
904860 N/A N/A 6108 6123 CAAAGACAAGAACCCC 68 1167
904892 N/A N/A 6199 6214 ACAAAACTGCATTGCC 50 1168
904924 N/A N/A 6254 6269 ACTAAACCCCACACCC 6 1169
904956 N/A N/A 6322 6337 TGAGATCCAACTCGGC 65 1170
904988 N/A N/A 6372 6387 GGCCCACAGGATCCTG 0 1171
905020 N/A N/A 6536 6551 CTTCTGTTAGATACAA 93 1172
905052 N/A N/A 6593 6608 TAACCCCCTGAAACTG 61 1173
905084 N/A N/A 6635 6650 ATTCCTGGACAGGCAA 62 1174
905116 N/A N/A 6741 6756 CCAGGTTTGGATGGAA 73 1175
905148 N/A N/A 6827 6842 GGGAAATGAACGCAAT 89 1176
905180 N/A N/A 6987 7002 CTGAGTGCTCTCGGCT 77 1177
905212 N/A N/A 7117 7132 GGTACACGGCTCTCCA 29 1178
905244 N/A N/A 7238 7253 TCTTGGGCACTCTCAG 80 1179
905276 N/A N/A 7298 7313 ATGTCTCAAACTCCAC 90 1180
905308 N/A N/A 7468 7483 CCGCCCAAAACCATCA 58 1181
905340 N/A N/A 7835 7850 GCACACACAAGAGACC 13 1182
905372 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA 90 1183
905404 N/A N/A 7994 8009 ACTCAAGTCAGTACAG 87 1184
905436 N/A N/A 8077 8092 GTAATCACACCCACAC 50 1185
905468 N/A N/A 8162 8177 TTCAGAATTTCCACTA 92 1186
905500 N/A N/A 8310 8325 ATTGGTTCAAAAGCAG 85 1187
905532 N/A N/A 8379 8394 GTTGGGTCAAACACTT 71 1188
905564 N/A N/A 8449 8464 ACATGAAGTGAGCCTT 88 1189
905596 N/A N/A 8620 8635 TTTGGCACCTTCACCT 53 1190
905628 N/A N/A 8738 8753 TTAGAGGGCTAGTGTC 82 1191
905660 N/A N/A 8823 8838 AACTCAGGTGACTACA 68 1192
905692 N/A N/A 8883 8898 GGAGTCATTAGTGCTA 82 1193
905724 N/A N/A 8952 8967 ACAGCCATTGCATAAG 50 1194
[表18] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 87 13
903421 19 34 512 527 TATACCGAGGAATTCG 23 1195
903453 75 90 568 583 CCCACCTCCAGTTATG 45 1196
903485 217 232 4510 4525 CAAGGAAAAGTGCACT 33 1197
903517 296 311 4771 4786 TGAGGATCTCCAGTAT 69 1198
903613 527 542 12618 12633 TTCATGATCATTTGTC 88 1199
903645 624 639 12715 12730 CCTTCTTATGTTATCC 82 1200
903677 664 679 12755 12770 CTTTGTGGACCTTCTG 74 1201
903709 736 751 12827 12842 CCATGCCGACGAGGGT 25 1202
903741 806 821 12897 12912 GCTGTGATTCCCAACT 59 1203
903773 844 859 12935 12950 CGTAGTCCATGGTACT 25 1204
903805 898 913 12989 13004 CAAGGCTTTTGATGAC 88 1205
903837 1003 1018 13094 13109 GGATGTCCTTCCCAAT 46 1206
903869 1079 1094 13170 13185 GGCTCAGTGACCCGGG 17 1207
903901 1119 1134 13210 13225 ATTAACCCTCTCCACC 27 1208
903933 1207 1222 13298 13313 GGTAGACTACATCCAG 59 1209
903965 1340 1355 13431 13446 TGGTCCGCCTGCAGAA 83 1210
904029 1793 1808 13884 13899 CAGCTATGGAAATGCC 86 1211
904061 1890 1905 13981 13996 ACTCTCCAGTTCCCAT 88 1212
904093 2272 2287 14363 14378 CAAGCCTCCTCTCTAT 81 1213
904125 2407 2422 14498 14513 TTCGGAGGACATTGAA 19 1214
904157 2505 2520 14596 14611 AAGCCGCTGCCTGACT 48 1215
904189 2591 2606 14682 14697 TTCAGTGTTCAAGCAG 92 1216
904253 2800 2815 14891 14906 TCCTGGGCGGCGACAA 92 1217
904317 N/A N/A 1344 1359 GGCACCATTCTGCAAC 28 1218
904349 N/A N/A 807 822 CAACCCTCTATAGTTT 12 1219
904381 N/A N/A 2448 2463 GGAGCCCTCCCTCCCG 0 1220
904413 N/A N/A 2821 2836 TGTGTGATCCCCTAGG 22 1221
904445 N/A N/A 4206 4221 GCCAGTGTTTTTACAA 72 1222
904477 N/A N/A 4691 4706 TGAGCCACCAGTGGAC 0 1223
904541 N/A N/A 5110 5125 CCCCCCGCTGATTCCA 31 1224
904573 N/A N/A 5238 5253 AGCCTCAGGTGGAAAC 53 1225
904605 N/A N/A 5339 5354 GGGTCCAGTTAAGCTG 14 1226
904669 N/A N/A 5658 5673 TAGATGACTGAACTCA 79 1227
904701 N/A N/A 5761 5776 GCCTCCTCCAGTTTGC 34 1228
904733 N/A N/A 5801 5816 GATAAACCTTGTCTCC 65 1229
904765 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC 73 1230
904797 N/A N/A 5928 5943 GGAGACCTCCCTAAAC 33 1231
904829 N/A N/A 5960 5975 GGCAAGGCTAAGTTCC 91 1232
904861 N/A N/A 6111 6126 CAGCAAAGACAAGAAC 53 1233
904893 N/A N/A 6201 6216 GTACAAAACTGCATTG 31 1234
904925 N/A N/A 6255 6270 CACTAAACCCCACACC 26 1235
904957 N/A N/A 6323 6338 GTGAGATCCAACTCGG 77 1236
904989 N/A N/A 6374 6389 TGGGCCCACAGGATCC 4 1237
905021 N/A N/A 6537 6552 ACTTCTGTTAGATACA 95 1238
905053 N/A N/A 6594 6609 GTAACCCCCTGAAACT 45 1239
905085 N/A N/A 6638 6653 AACATTCCTGGACAGG 31 1240
905117 N/A N/A 6742 6757 CCCAGGTTTGGATGGA 49 1241
905149 N/A N/A 6828 6843 AGGGAAATGAACGCAA 86 1242
905181 N/A N/A 6988 7003 GCTGAGTGCTCTCGGC 57 1243
905213 N/A N/A 7118 7133 GGGTACACGGCTCTCC 38 1244
905245 N/A N/A 7239 7254 GTCTTGGGCACTCTCA 89 1245
905277 N/A N/A 7300 7315 TAATGTCTCAAACTCC 90 1246
905309 N/A N/A 7469 7484 ACCGCCCAAAACCATC 57 1247
905341 N/A N/A 7836 7851 TGCACACACAAGAGAC 0 1248
905373 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC 98 1249
905405 N/A N/A 7995 8010 AACTCAAGTCAGTACA 81 1250
905437 N/A N/A 8081 8096 CCCTGTAATCACACCC 71 1251
905501 N/A N/A 8311 8326 TATTGGTTCAAAAGCA 87 1252
905533 N/A N/A 8381 8396 CTGTTGGGTCAAACAC 41 1253
905565 N/A N/A 8450 8465 AACATGAAGTGAGCCT 88 1254
905597 N/A N/A 8621 8636 TTTTGGCACCTTCACC 76 1255
905629 N/A N/A 8739 8754 ATTAGAGGGCTAGTGT 73 1256
905661 N/A N/A 8824 8839 AAACTCAGGTGACTAC 75 1257
905693 N/A N/A 8884 8899 TGGAGTCATTAGTGCT 91 1258
905725 N/A N/A 8953 8968 AACAGCCATTGCATAA 10 1259
[表19] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 74 13
903426 24 39 517 532 CAAGATATACCGAGGA 0 1260
903458 125 140 618 633 TTCCCCTGGCAGAGAC 3 1261
903490 253 268 N/A N/A CCCTCGCTCCAGCTTC 61 1262
903522 303 318 4778 4793 CTTACTTTGAGGATCT 68 1263
903618 560 575 12651 12666 TACTGCTGGCCTTTAT 59 1264
903650 629 644 12720 12735 CGGAGCCTTCTTATGT 30 1265
903682 670 685 12761 12776 TGGTGCCTTTGTGGAC 0 1266
903714 741 756 12832 12847 CAGACCCATGCCGACG 37 1267
903746 811 826 12902 12917 AAGCGGCTGTGATTCC 60 1268
903778 850 865 12941 12956 TCTTTCCGTAGTCCAT 14 1269
903810 931 946 13022 13037 CACCCAAAAACTCCCT 59 1270
903842 1008 1023 13099 13114 GGCACGGATGTCCTTC 48 1271
903874 1084 1099 13175 13190 AGATTGGCTCAGTGAC 91 1272
903906 1127 1142 13218 13233 CTGGGTTCATTAACCC 0 1273
903938 1212 1227 13303 13318 CACGAGGTAGACTACA 56 1274
903970 1345 1360 13436 13451 GTTCTTGGTCCGCCTG 62 1275
904002 1741 1756 13832 13847 ACCCTCTTTATCCCCC 91 1276
904034 1799 1814 13890 13905 TGTGCTCAGCTATGGA 84 1277
904066 1926 1941 14017 14032 TTAGTCTAAAGTAAAC 44 1278
904098 2284 2299 14375 14390 TGCTGGTTCCTTCAAG 76 1279
904130 2413 2428 14504 14519 TCATTCTTCGGAGGAC 73 1280
904162 2511 2526 14602 14617 ATCAGGAAGCCGCTGC 52 1281
904194 2609 2624 14700 14715 ATGGCCCACCACCTGC 0 1282
904226 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG 96 1283
904258 2805 2820 14896 14911 GTCAATCCTGGGCGGC 63 1284
904322 N/A N/A 1374 1389 TCATGATTGCAAAGCT 20 1285
904354 N/A N/A 837 852 AGCTTTGTGAACCCAT 10 1286
904386 N/A N/A 2482 2497 GCCCAAGCCCAGTCCA 0 1287
904418 N/A N/A 3410 3425 AGGGTATATGAAAGTT 77 1288
904450 N/A N/A 4340 4355 AGCCAGTGTGTATTGC 83 1289
904482 N/A N/A 4733 4748 TTGCACCCTTGAGGAG 0 1290
904514 N/A N/A 5058 5073 GCTAGGTGCCAGGGTA 78 1291
904546 N/A N/A 5115 5130 CCCCCCCCCCCGCTGA 16 1292
904578 N/A N/A 5303 5318 ACATTCCCACAGGGCC 0 1293
904610 N/A N/A 5361 5376 GGATGTGGCAAAGGAC 54 1294
904642 N/A N/A 5490 5505 GCCCTATTGTGTGGCA 0 1295
904674 N/A N/A 5682 5697 ATTTTTCTTTGACCGG 64 1296
904706 N/A N/A 5766 5781 ACGAAGCCTCCTCCAG 55 1297
904738 N/A N/A 5807 5822 TCACCCGATAAACCTT 82 1298
904770 N/A N/A 5868 5883 CCCAAACAGGCAGTTT 57 1299
904802 N/A N/A 5933 5948 TATTCGGAGACCTCCC 5 1300
904834 N/A N/A 5965 5980 ACCTGGGCAAGGCTAA 52 1301
904866 N/A N/A 6138 6153 CTTACTCCACACCTTA 72 1302
904898 N/A N/A 6206 6221 GTTTGGTACAAAACTG 0 1303
904930 N/A N/A 6261 6276 TTGTCTCACTAAACCC 21 1304
904962 N/A N/A 6330 6345 AAGACCAGTGAGATCC 50 1305
904994 N/A N/A 6402 6417 AACCACCTGTAGGGAC 69 1306
905026 N/A N/A 6542 6557 TGGGTACTTCTGTTAG 62 1307
905058 N/A N/A 6600 6615 ACAGCTGTAACCCCCT 13 1308
905090 N/A N/A 6680 6695 TGGTGGATATAAAAGC 39 1309
905122 N/A N/A 6794 6809 AGCGATTGTCTTGTTT 72 1310
905154 N/A N/A 6879 6894 TGCCGTGGCAACTCTG 6 1311
905186 N/A N/A 7037 7052 GTTTTTCCTCAGTCCC 69 1312
905218 N/A N/A 7159 7174 GGCACCTCCATGTTGC 0 1313
905250 N/A N/A 7244 7259 TGCTGGTCTTGGGCAC 17 1314
905282 N/A N/A 7339 7354 CCTTATAGCTTACCTG 64 1315
905314 N/A N/A 7475 7490 AGAGTCACCGCCCAAA 58 1316
905346 N/A N/A 7843 7858 CTTGCCGTGCACACAC 10 1317
905378 N/A N/A 7939 7954 TGGTTTGCAGGGATCT 56 1318
905410 N/A N/A 8001 8016 ACAAAGAACTCAAGTC 55 1319
905442 N/A N/A 8088 8103 GACTGCTCCCTGTAAT 0 1320
905474 N/A N/A 8175 8190 ATGTGTTTAGGCATTC 81 1321
905506 N/A N/A 8327 8342 CATTGGGTTATGAAAT 48 1322
905538 N/A N/A 8386 8401 CATGCCTGTTGGGTCA 46 1323
905570 N/A N/A 8460 8475 GCTCAGCACCAACATG 0 1324
905602 N/A N/A 8631 8646 ACTCCAACCCTTTTGG 10 1325
905634 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT 85 1326
905666 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG 62 1327
905698 N/A N/A 8893 8908 CTTGTTTTATGGAGTC 97 1328
905730 N/A N/A 8960 8975 AGTGCATAACAGCCAT 9 1329
[表20] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 74 13
903427 25 40 518 533 CCAAGATATACCGAGG 12 1330
903459 129 144 622 637 AATCTTCCCCTGGCAG 13 1331
903491 254 269 N/A N/A ACCCTCGCTCCAGCTT 50 1332
903523 306 321 4781 4796 GGGCTTACTTTGAGGA 0 1333
903619 561 576 12652 12667 GTACTGCTGGCCTTTA 47 1334
903651 630 645 12721 12736 ACGGAGCCTTCTTATG 34 1335
903683 671 686 12762 12777 GTGGTGCCTTTGTGGA 0 1336
903715 742 757 12833 12848 CCAGACCCATGCCGAC 49 1337
903747 812 827 12903 12918 AAAGCGGCTGTGATTC 29 1338
903779 851 866 12942 12957 TTCTTTCCGTAGTCCA 38 1339
903811 932 947 13023 13038 TCACCCAAAAACTCCC 72 1340
903843 1010 1025 13101 13116 AGGGCACGGATGTCCT 3 1341
903875 1085 1100 13176 13191 GAGATTGGCTCAGTGA 69 1342
903907 1128 1143 13219 13234 GCTGGGTTCATTAACC 6 1343
903939 1230 1245 13321 13336 TAAGTGCTTTGATTCG 89 1344
903971 1346 1361 13437 13452 AGTTCTTGGTCCGCCT 52 1345
904003 1742 1757 13833 13848 CACCCTCTTTATCCCC 85 1346
904035 1800 1815 13891 13906 CTGTGCTCAGCTATGG 73 1347
904067 1928 1943 14019 14034 CTTTAGTCTAAAGTAA 16 1348
904099 2334 2349 14425 14440 ACTCTTGGGCTTTCTC 91 1349
904131 2414 2429 14505 14520 TTCATTCTTCGGAGGA 63 1350
904163 2512 2527 14603 14618 CATCAGGAAGCCGCTG 23 1351
904195 2612 2627 14703 14718 GCCATGGCCCACCACC 0 1352
904227 2744 2759 14835 14850 GCTTTCATGCTAATTT 40 1353
904259 2806 2821 14897 14912 GGTCAATCCTGGGCGG 58 1354
904323 N/A N/A 1375 1390 CTCATGATTGCAAAGC 69 1355
904355 N/A N/A 869 884 CTCAGCAGTCAAAACC 24 1356
904387 N/A N/A 2515 2530 GTTCCTAGAAGAAGCC 25 1357
904419 N/A N/A 3411 3426 GAGGGTATATGAAAGT 59 1358
904451 N/A N/A 4351 4366 TAGCTGGTGATAGCCA 27 1359
904483 N/A N/A 4735 4750 TGTTGCACCCTTGAGG 23 1360
904515 N/A N/A 5064 5079 TCATTTGCTAGGTGCC 84 1361
904547 N/A N/A 5172 5187 GGTCAACCTCCTCTCC 3 1362
904579 N/A N/A 5304 5319 TACATTCCCACAGGGC 23 1363
904611 N/A N/A 5379 5394 CGCCAGGTCACACAGA 69 1364
904643 N/A N/A 5491 5506 GGCCCTATTGTGTGGC 0 1365
904675 N/A N/A 5683 5698 GATTTTTCTTTGACCG 95 1366
904707 N/A N/A 5767 5782 CACGAAGCCTCCTCCA 38 1367
904739 N/A N/A 5808 5823 TTCACCCGATAAACCT 69 1368
904771 N/A N/A 5869 5884 ACCCAAACAGGCAGTT 2 1369
904803 N/A N/A 5934 5949 GTATTCGGAGACCTCC 25 1370
904835 N/A N/A 5966 5981 AACCTGGGCAAGGCTA 21 1371
904867 N/A N/A 6140 6155 TGCTTACTCCACACCT 65 1372
904899 N/A N/A 6210 6225 CCATGTTTGGTACAAA 61 1373
904931 N/A N/A 6262 6277 CTTGTCTCACTAAACC 30 1374
904963 N/A N/A 6331 6346 TAAGACCAGTGAGATC 41 1375
904995 N/A N/A 6403 6418 AAACCACCTGTAGGGA 42 1376
905027 N/A N/A 6543 6558 ATGGGTACTTCTGTTA 79 1377
905059 N/A N/A 6604 6619 TAGAACAGCTGTAACC 48 1378
905091 N/A N/A 6682 6697 GCTGGTGGATATAAAA 0 1379
905123 N/A N/A 6795 6810 GAGCGATTGTCTTGTT 89 1380
905155 N/A N/A 6880 6895 TTGCCGTGGCAACTCT 0 1381
905187 N/A N/A 7038 7053 AGTTTTTCCTCAGTCC 56 1382
905219 N/A N/A 7160 7175 AGGCACCTCCATGTTG 11 1383
905251 N/A N/A 7256 7271 GGAGATTCCTCCTGCT 0 1384
905283 N/A N/A 7340 7355 CCCTTATAGCTTACCT 64 1385
905315 N/A N/A 7476 7491 GAGAGTCACCGCCCAA 65 1386
905347 N/A N/A 7844 7859 TCTTGCCGTGCACACA 26 1387
905379 N/A N/A 7940 7955 GTGGTTTGCAGGGATC 82 1388
905411 N/A N/A 8006 8021 GGTCTACAAAGAACTC 42 1389
905443 N/A N/A 8089 8104 GGACTGCTCCCTGTAA 17 1390
905475 N/A N/A 8176 8191 GATGTGTTTAGGCATT 84 1391
905507 N/A N/A 8329 8344 ATCATTGGGTTATGAA 15 1392
905539 N/A N/A 8387 8402 ACATGCCTGTTGGGTC 48 1393
905571 N/A N/A 8461 8476 AGCTCAGCACCAACAT 22 1394
905603 N/A N/A 8632 8647 GACTCCAACCCTTTTG 19 1395
905635 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC 80 1396
905667 N/A N/A 8832 8847 GAAGCTTTAAACTCAG 83 1397
905699 N/A N/A 8894 8909 ACTTGTTTTATGGAGT 30 1398
905731 N/A N/A 8961 8976 GAGTGCATAACAGCCA 9 1399
[表21] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 84 13
903436 41 56 534 549 ACAGGTCCTCCAGTCC 37 1400
903468 154 169 2364 2379 TGTCGCTGCAGGGCCT 35 1401
903500 263 278 12661 12676 TTTTGTTGCACCCTCG 84 1402
903532 346 361 N/A N/A TGCTCTCTGGGTCCAT 8 1403
903628 570 585 N/A N/A CCAGTTTCTGTACTGC 23 1404
903660 642 657 12733 12748 ATCTGCAAGGGCACGG 39 1405
903692 680 695 12771 12786 TTGGCGATGGTGGTGC 0 1406
903724 758 773 12849 12864 CCCTCTGTGAAGGGTG 0 1407
903756 824 839 12915 12930 GTAATCCCGGTCAAAG 41 1408
903788 862 877 12953 12968 GTGTCCACCACTTCTT 18 1409
903820 968 983 13059 13074 GTATTGCCAGCTAAGG 94 1410
903852 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT 74 1411
903884 1097 1112 13188 13203 CCGCTTTCAGCTGAGA 39 1412
903916 1158 1173 13249 13264 GAGCTTGACTCCTCTG 5 1413
903948 1241 1256 13332 13347 GCCCCCTCATGTAAGT 11 1414
903980 1382 1397 13473 13488 ATATCTCTCCTGGTGG 69 1415
904012 1755 1770 13846 13861 ATAAACTTTACCTCAC 62 1416
904044 1842 1857 13933 13948 CTTCTCCTTGCTGCAC 84 1417
904076 1949 1964 14040 14055 CACCCGGCCCCCCAAT 36 1418
904108 2348 2363 14439 14454 ATCCAACTGTTCTAAC 64 1419
904140 2486 2501 14577 14592 ATATGCCCCCAGGAGG 40 1420
904172 2527 2542 14618 14633 CACCCCAATGACCATC 63 1421
904204 2679 2694 14770 14785 TGGTTCTCACATACTC 91 1422
904236 2777 2792 14868 14883 CTAGAGATCTGAGCTT 14 1423
904268 2846 2861 14937 14952 CAGCTTGATGAGTAGG 21 1424
904300 N/A N/A 2354 2369 GGGCCTCCTCCTTGAG 2 1425
904364 N/A N/A 1115 1130 AAGTTGGTGCTCAGAC 8 1426
904396 N/A N/A 2572 2587 ACAGCGGGTCCTCCCT 60 1427
904428 N/A N/A 3809 3824 TCGCATAAAACTTTGC 43 1428
904460 N/A N/A 4464 4479 CAGAGGACGGGCAGCC 0 1429
904492 N/A N/A 4914 4929 AGTCCATCCGGGTTCT 27 1430
904524 N/A N/A 5074 5089 CCCACTTGAGTCATTT 67 1431
904556 N/A N/A 5201 5216 AGAGCGGGAGGTGACA 25 1432
904588 N/A N/A 5314 5329 TCAGGCCCGATACATT 0 1433
904620 N/A N/A 5415 5430 ATTATTCTCATGGTAC 73 1434
904652 N/A N/A 5500 5515 CCTTAGGGAGGCCCTA 16 1435
904684 N/A N/A 5702 5717 AAAATTCTATTGGGCC 0 1436
904716 N/A N/A 5779 5794 TTTTCACCATAGCACG 87 1437
904748 N/A N/A 5828 5843 GTCCTTACTGCAGTTT 95 1438
904780 N/A N/A 5891 5906 CAGGGATTTTCCAACA 77 1439
904812 N/A N/A 5943 5958 GTCTCACCTGTATTCG 34 1440
904844 N/A N/A 6022 6037 TTGCACTAAAAGCTGA 62 1441
904876 N/A N/A 6153 6168 CCAGAAATCCTTATGC 35 1442
904908 N/A N/A 6223 6238 GTTCCATGTATGCCCA 85 1443
904940 N/A N/A 6280 6295 ACACTCAATCATACCC 64 1444
904972 N/A N/A 6341 6356 CCAATTCAGCTAAGAC 73 1445
905004 N/A N/A 6414 6429 AGGAGTTGCTGAAACC 69 1446
905036 N/A N/A 6553 6568 GTCATATCAGATGGGT 92 1447
905068 N/A N/A 6616 6631 CTACGAGGCCTTTAGA 23 1448
905100 N/A N/A 6721 6736 CCTCTGGCACTAAATC 40 1449
905132 N/A N/A 6804 6819 TGGCTGGGCGAGCGAT 38 1450
905164 N/A N/A 6889 6904 CTGACTTGGTTGCCGT 60 1451
905196 N/A N/A 7080 7095 GGGCCTGTTATTAAAC 0 1452
905228 N/A N/A 7169 7184 TGATCCTTGAGGCACC 28 1453
905260 N/A N/A 7270 7285 AACTACCATGCAAAGG 38 1454
905292 N/A N/A 7380 7395 ACTCCTTATGTTTTGA 94 1455
905324 N/A N/A 7485 7500 CCAGACAGCGAGAGTC 78 1456
905356 N/A N/A 7862 7877 GCATGATGTAAAATTG 6 1457
905388 N/A N/A 7975 7990 AGGATTACTCCTGAAG 0 1458
905420 N/A N/A 8017 8032 AAATAATGGTAGGTCT 77 1459
905452 N/A N/A 8120 8135 GGTATATTCCTGACCA 25 1460
905484 N/A N/A 8185 8200 TGGAATCCAGATGTGT 65 1461
905516 N/A N/A 8340 8355 AATATCAACACATCAT 82 1462
905548 N/A N/A 8409 8424 CCAGTGATCACTTCCA 78 1463
905580 N/A N/A 8517 8532 AACATTGAAACACCAG 94 1464
905612 N/A N/A 8665 8680 AGCTTCCATAAGCCAG 12 1465
905644 N/A N/A 8756 8771 GGTAGGGCTCTAATTC 60 1466
905676 N/A N/A 8867 8882 TAGAGGGAATTGTGTG 61 1467
905708 N/A N/A 8907 8922 GCTGTGATGTGGGACT 89 1468
905740 N/A N/A 8971 8986 GAAAGTGTGGGAGTGC 8 1469
[表22] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 82 13
903437 42 57 535 550 GACAGGTCCTCCAGTC 14 1470
903469 155 170 2365 2380 ATGTCGCTGCAGGGCC 18 1471
903533 349 364 N/A N/A TACTGCTCTCTGGGTC 33 1472
903629 571 586 12662 12677 ACCAGTTTCTGTACTG 4 1473
903661 643 658 12734 12749 CATCTGCAAGGGCACG 43 1474
903693 681 696 12772 12787 ATTGGCGATGGTGGTG 27 1475
903725 759 774 12850 12865 TCCCTCTGTGAAGGGT 0 1476
903757 827 842 12918 12933 CTGGTAATCCCGGTCA 63 1477
903789 863 878 12954 12969 TGTGTCCACCACTTCT 39 1478
903821 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG 98 1479
903853 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC 91 1480
903885 1098 1113 13189 13204 ACCGCTTTCAGCTGAG 10 1481
903917 1159 1174 13250 13265 TGAGCTTGACTCCTCT 6 1482
903949 1242 1257 13333 13348 TGCCCCCTCATGTAAG 46 1483
903981 1384 1399 13475 13490 GCATATCTCTCCTGGT 81 1484
904013 1764 1779 13855 13870 CTCAGTTCCATAAACT 87 1485
904045 1844 1859 13935 13950 GCCTTCTCCTTGCTGC 57 1486
904077 1950 1965 14041 14056 ACACCCGGCCCCCCAA 49 1487
904109 2349 2364 14440 14455 TATCCAACTGTTCTAA 68 1488
904141 2487 2502 14578 14593 GATATGCCCCCAGGAG 84 1489
904173 2528 2543 14619 14634 CCACCCCAATGACCAT 67 1490
904205 2680 2695 14771 14786 TTGGTTCTCACATACT 84 1491
904237 2778 2793 14869 14884 TCTAGAGATCTGAGCT 20 1492
904269 2847 2862 14938 14953 CCAGCTTGATGAGTAG 30 1493
904365 N/A N/A 1116 1131 CAAGTTGGTGCTCAGA 0 1494
904397 N/A N/A 2583 2598 TCAACTAGGATACAGC 82 1495
904429 N/A N/A 3817 3832 ATCCTTCTTCGCATAA 80 1496
904461 N/A N/A 4467 4482 AATCAGAGGACGGGCA 5 1497
904493 N/A N/A 4916 4931 CTAGTCCATCCGGGTT 49 1498
904525 N/A N/A 5075 5090 CCCCACTTGAGTCATT 57 1499
904557 N/A N/A 5202 5217 CAGAGCGGGAGGTGAC 24 1500
904589 N/A N/A 5315 5330 ATCAGGCCCGATACAT 0 1501
904621 N/A N/A 5436 5451 CTCAAGACAACATGGG 43 1502
904653 N/A N/A 5501 5516 CCCTTAGGGAGGCCCT 13 1503
904685 N/A N/A 5721 5736 CTTACTCAATTAACTC 77 1504
904717 N/A N/A 5782 5797 ACTTTTTCACCATAGC 94 1505
904749 N/A N/A 5829 5844 TGTCCTTACTGCAGTT 82 1506
904781 N/A N/A 5892 5907 CCAGGGATTTTCCAAC 69 1507
904813 N/A N/A 5944 5959 GGTCTCACCTGTATTC 32 1508
904845 N/A N/A 6023 6038 TTTGCACTAAAAGCTG 67 1509
904877 N/A N/A 6154 6169 CCCAGAAATCCTTATG 37 1510
904909 N/A N/A 6224 6239 CGTTCCATGTATGCCC 93 1511
904941 N/A N/A 6281 6296 CACACTCAATCATACC 22 1512
904973 N/A N/A 6343 6358 GGCCAATTCAGCTAAG 7 1513
905069 N/A N/A 6617 6632 CCTACGAGGCCTTTAG 59 1514
905101 N/A N/A 6722 6737 ACCTCTGGCACTAAAT 59 1515
905133 N/A N/A 6805 6820 TTGGCTGGGCGAGCGA 61 1516
905165 N/A N/A 6890 6905 GCTGACTTGGTTGCCG 10 1517
905197 N/A N/A 7081 7096 TGGGCCTGTTATTAAA 14 1518
905229 N/A N/A 7170 7185 CTGATCCTTGAGGCAC 72 1519
905261 N/A N/A 7271 7286 CAACTACCATGCAAAG 53 1520
905293 N/A N/A 7381 7396 AACTCCTTATGTTTTG 89 1521
905325 N/A N/A 7486 7501 TCCAGACAGCGAGAGT 83 1522
905357 N/A N/A 7863 7878 GGCATGATGTAAAATT 33 1523
905389 N/A N/A 7977 7992 GCAGGATTACTCCTGA 10 1524
905421 N/A N/A 8053 8068 ACAGTGAAACAAGCAA 93 1525
905453 N/A N/A 8121 8136 TGGTATATTCCTGACC 35 1526
905485 N/A N/A 8201 8216 CCTTAATGTAAATTCC 90 1527
905517 N/A N/A 8345 8360 ATGTGAATATCAACAC 74 1528
905549 N/A N/A 8410 8425 CCCAGTGATCACTTCC 78 1529
905581 N/A N/A 8518 8533 GAACATTGAAACACCA 93 1530
905613 N/A N/A 8666 8681 CAGCTTCCATAAGCCA 30 1531
905645 N/A N/A 8767 8782 GAGATCACAAGGGTAG 98 1532
905677 N/A N/A 8868 8883 ATAGAGGGAATTGTGT 45 1533
905709 N/A N/A 8908 8923 AGCTGTGATGTGGGAC 63 1534
905741 N/A N/A 8978 8993 GTTGGAGGAAAGTGTG 19 1535
905773 N/A N/A 9795 9810 TCTGACATAAGCCCAG 0 1536
905805 N/A N/A 10425 10440 AGAACCACCTATATAA 60 1537
[表23] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 88 13
903422 20 35 513 528 ATATACCGAGGAATTC 7 1538
903454 77 92 570 585 ATCCCACCTCCAGTTA 49 1539
903486 218 233 4511 4526 CCAAGGAAAAGTGCAC 47 1540
903518 297 312 4772 4787 TTGAGGATCTCCAGTA 55 1541
903614 543 558 12634 12649 GTGCCAGTTTTTGTCT 0 1542
903646 625 640 12716 12731 GCCTTCTTATGTTATC 30 1543
903678 665 680 12756 12771 CCTTTGTGGACCTTCT 71 1544
903710 737 752 12828 12843 CCCATGCCGACGAGGG 11 1545
903742 807 822 12898 12913 GGCTGTGATTCCCAAC 28 1546
903774 845 860 12936 12951 CCGTAGTCCATGGTAC 11 1547
903806 902 917 12993 13008 TTGTCAAGGCTTTTGA 69 1548
903838 1004 1019 13095 13110 CGGATGTCCTTCCCAA 23 1549
903870 1080 1095 13171 13186 TGGCTCAGTGACCCGG 31 1550
903902 1122 1137 13213 13228 TTCATTAACCCTCTCC 74 1551
903934 1208 1223 13299 13314 AGGTAGACTACATCCA 40 1552
903966 1341 1356 13432 13447 TTGGTCCGCCTGCAGA 64 1553
903998 1708 1723 13799 13814 TTGGGTCAAAAGCGAT 92 1554
904030 1794 1809 13885 13900 TCAGCTATGGAAATGC 93 1555
904062 1921 1936 14012 14027 CTAAAGTAAACTGCTT 63 1556
904094 2279 2294 14370 14385 GTTCCTTCAAGCCTCC 92 1557
904126 2408 2423 14499 14514 CTTCGGAGGACATTGA 70 1558
904158 2506 2521 14597 14612 GAAGCCGCTGCCTGAC 78 1559
904190 2594 2609 14685 14700 CCCTTCAGTGTTCAAG 89 1560
904222 2720 2735 14811 14826 TTTACTTACCGGGTAA 22 1561
904254 2801 2816 14892 14907 ATCCTGGGCGGCGACA 84 1562
904318 N/A N/A 1345 1360 AGGCACCATTCTGCAA 29 1563
904350 N/A N/A 820 835 TGAGCTGTTTCCCCAA 39 1564
904382 N/A N/A 2474 2489 CCAGTCCAATTGTGCA 43 1565
904414 N/A N/A 2828 2843 TGTTCACTGTGTGATC 74 1566
904446 N/A N/A 4306 4321 GCCTCTTACATGTGTC 52 1567
904478 N/A N/A 4693 4708 TGTGAGCCACCAGTGG 0 1568
904510 N/A N/A 5024 5039 GGGCCGTGTCACCCTA 8 1569
904542 N/A N/A 5111 5126 CCCCCCCGCTGATTCC 19 1570
904574 N/A N/A 5241 5256 ACCAGCCTCAGGTGGA 12 1571
904606 N/A N/A 5353 5368 CAAAGGACAGACCGGG 64 1572
904638 N/A N/A 5464 5479 AGGCCAGGTAGCCGTG 9 1573
904670 N/A N/A 5659 5674 TTAGATGACTGAACTC 75 1574
904702 N/A N/A 5762 5777 AGCCTCCTCCAGTTTG 32 1575
904734 N/A N/A 5802 5817 CGATAAACCTTGTCTC 44 1576
904766 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA 97 1577
904798 N/A N/A 5929 5944 CGGAGACCTCCCTAAA 12 1578
904830 N/A N/A 5961 5976 GGGCAAGGCTAAGTTC 56 1579
904862 N/A N/A 6112 6127 CCAGCAAAGACAAGAA 87 1580
904894 N/A N/A 6202 6217 GGTACAAAACTGCATT 78 1581
904926 N/A N/A 6256 6271 TCACTAAACCCCACAC 0 1582
904958 N/A N/A 6325 6340 CAGTGAGATCCAACTC 40 1583
904990 N/A N/A 6375 6390 ATGGGCCCACAGGATC 0 1584
905022 N/A N/A 6538 6553 TACTTCTGTTAGATAC 92 1585
905054 N/A N/A 6595 6610 TGTAACCCCCTGAAAC 17 1586
905086 N/A N/A 6641 6656 TGAAACATTCCTGGAC 85 1587
905118 N/A N/A 6743 6758 ACCCAGGTTTGGATGG 33 1588
905150 N/A N/A 6875 6890 GTGGCAACTCTGTAAG 10 1589
905182 N/A N/A 6989 7004 GGCTGAGTGCTCTCGG 60 1590
905214 N/A N/A 7119 7134 AGGGTACACGGCTCTC 45 1591
905246 N/A N/A 7240 7255 GGTCTTGGGCACTCTC 79 1592
905278 N/A N/A 7301 7316 ATAATGTCTCAAACTC 77 1593
905310 N/A N/A 7470 7485 CACCGCCCAAAACCAT 25 1594
905342 N/A N/A 7838 7853 CGTGCACACACAAGAG 0 1595
905374 N/A N/A 7923 7938 GGGAATTATGGAATTG 83 1596
905406 N/A N/A 7996 8011 GAACTCAAGTCAGTAC 73 1597
905438 N/A N/A 8083 8098 CTCCCTGTAATCACAC 40 1598
905470 N/A N/A 8168 8183 TAGGCATTCAGAATTT 71 1599
905502 N/A N/A 8313 8328 ATTATTGGTTCAAAAG 35 1600
905534 N/A N/A 8382 8397 CCTGTTGGGTCAAACA 45 1601
905566 N/A N/A 8452 8467 CCAACATGAAGTGAGC 79 1602
905598 N/A N/A 8622 8637 CTTTTGGCACCTTCAC 83 1603
905630 N/A N/A 8740 8755 TATTAGAGGGCTAGTG 55 1604
905662 N/A N/A 8825 8840 TAAACTCAGGTGACTA 60 1605
905694 N/A N/A 8885 8900 ATGGAGTCATTAGTGC 85 1606
905726 N/A N/A 8954 8969 TAACAGCCATTGCATA 6 1607
[表24] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 87 13
903423 21 36 514 529 GATATACCGAGGAATT 17 1608
903455 78 93 571 586 GATCCCACCTCCAGTT 29 1609
903487 220 235 4513 4528 CACCAAGGAAAAGTGC 3 1610
903519 300 315 4775 4790 ACTTTGAGGATCTCCA 66 1611
903615 544 559 12635 12650 CGTGCCAGTTTTTGTC 0 1612
903647 626 641 12717 12732 AGCCTTCTTATGTTAT 44 1613
903679 666 681 12757 12772 GCCTTTGTGGACCTTC 77 1614
903711 738 753 12829 12844 ACCCATGCCGACGAGG 19 1615
903743 808 823 12899 12914 CGGCTGTGATTCCCAA 19 1616
903775 846 861 12937 12952 TCCGTAGTCCATGGTA 5 1617
903807 907 922 12998 13013 TCAATTTGTCAAGGCT 94 1618
903839 1005 1020 13096 13111 ACGGATGTCCTTCCCA 40 1619
903871 1081 1096 13172 13187 TTGGCTCAGTGACCCG 44 1620
903903 1124 1139 13215 13230 GGTTCATTAACCCTCT 39 1621
903935 1209 1224 13300 13315 GAGGTAGACTACATCC 29 1622
903967 1342 1357 13433 13448 CTTGGTCCGCCTGCAG 42 1623
903999 1709 1724 13800 13815 TTTGGGTCAAAAGCGA 89 1624
904031 1796 1811 13887 13902 GCTCAGCTATGGAAAT 77 1625
904063 1923 1938 14014 14029 GTCTAAAGTAAACTGC 88 1626
904095 2281 2296 14372 14387 TGGTTCCTTCAAGCCT 35 1627
904127 2409 2424 14500 14515 TCTTCGGAGGACATTG 64 1628
904159 2507 2522 14598 14613 GGAAGCCGCTGCCTGA 80 1629
904191 2595 2610 14686 14701 GCCCTTCAGTGTTCAA 47 1630
904223 2721 2736 14812 14827 GTTTACTTACCGGGTA 83 1631
904255 2802 2817 14893 14908 AATCCTGGGCGGCGAC 79 1632
904319 N/A N/A 1347 1362 ACAGGCACCATTCTGC 38 1633
904351 N/A N/A 825 840 CCATCTGAGCTGTTTC 30 1634
904383 N/A N/A 2475 2490 CCCAGTCCAATTGTGC 34 1635
904415 N/A N/A 2885 2900 TTGCTGTAAGGGACAA 53 1636
904447 N/A N/A 4310 4325 CAGAGCCTCTTACATG 47 1637
904479 N/A N/A 4694 4709 ATGTGAGCCACCAGTG 46 1638
904511 N/A N/A 5025 5040 TGGGCCGTGTCACCCT 9 1639
904543 N/A N/A 5112 5127 CCCCCCCCGCTGATTC 43 1640
904575 N/A N/A 5243 5258 GGACCAGCCTCAGGTG 0 1641
904607 N/A N/A 5354 5369 GCAAAGGACAGACCGG 32 1642
904639 N/A N/A 5465 5480 CAGGCCAGGTAGCCGT 22 1643
904671 N/A N/A 5660 5675 TTTAGATGACTGAACT 69 1644
904703 N/A N/A 5763 5778 AAGCCTCCTCCAGTTT 23 1645
904735 N/A N/A 5803 5818 CCGATAAACCTTGTCT 67 1646
904767 N/A N/A 5859 5874 GCAGTTTTGTAAGTGC 43 1647
904799 N/A N/A 5930 5945 TCGGAGACCTCCCTAA 25 1648
904831 N/A N/A 5962 5977 TGGGCAAGGCTAAGTT 49 1649
904863 N/A N/A 6135 6150 ACTCCACACCTTAATT 36 1650
904895 N/A N/A 6203 6218 TGGTACAAAACTGCAT 66 1651
904927 N/A N/A 6257 6272 CTCACTAAACCCCACA 29 1652
904959 N/A N/A 6326 6341 CCAGTGAGATCCAACT 70 1653
904991 N/A N/A 6376 6391 GATGGGCCCACAGGAT 2 1654
905023 N/A N/A 6539 6554 GTACTTCTGTTAGATA 66 1655
905055 N/A N/A 6597 6612 GCTGTAACCCCCTGAA 85 1656
905087 N/A N/A 6645 6660 GCCCTGAAACATTCCT 20 1657
905119 N/A N/A 6744 6759 AACCCAGGTTTGGATG 40 1658
905151 N/A N/A 6876 6891 CGTGGCAACTCTGTAA 41 1659
905183 N/A N/A 6991 7006 TCGGCTGAGTGCTCTC 63 1660
905215 N/A N/A 7120 7135 CAGGGTACACGGCTCT 40 1661
905247 N/A N/A 7241 7256 TGGTCTTGGGCACTCT 76 1662
905279 N/A N/A 7335 7350 ATAGCTTACCTGTGGG 38 1663
905311 N/A N/A 7471 7486 TCACCGCCCAAAACCA 29 1664
905343 N/A N/A 7839 7854 CCGTGCACACACAAGA 0 1665
905375 N/A N/A 7928 7943 GATCTGGGAATTATGG 62 1666
905407 N/A N/A 7997 8012 AGAACTCAAGTCAGTA 92 1667
905439 N/A N/A 8084 8099 GCTCCCTGTAATCACA 35 1668
905471 N/A N/A 8172 8187 TGTTTAGGCATTCAGA 86 1669
905503 N/A N/A 8317 8332 TGAAATTATTGGTTCA 6 1670
905535 N/A N/A 8383 8398 GCCTGTTGGGTCAAAC 60 1671
905567 N/A N/A 8453 8468 ACCAACATGAAGTGAG 72 1672
905599 N/A N/A 8623 8638 CCTTTTGGCACCTTCA 93 1673
905631 N/A N/A 8741 8756 CTATTAGAGGGCTAGT 78 1674
905663 N/A N/A 8827 8842 TTTAAACTCAGGTGAC 64 1675
905695 N/A N/A 8886 8901 TATGGAGTCATTAGTG 81 1676
905727 N/A N/A 8955 8970 ATAACAGCCATTGCAT 14 1677
[表25] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT 95 13
903501 264 279 N/A N/A GTTTTGTTGCACCCTC 98 1678
903543 402 417 9065 9080 ATTCTGTGTGCTCACT 98 1679
903545 405 420 9068 9083 CAGATTCTGTGTGCTC 98 1680
903556 419 434 9082 9097 GTCAGCAGGAGTAGCA 65 1681
903557 421 436 9084 9099 CAGTCAGCAGGAGTAG 84 1682
903558 422 437 9085 9100 TCAGTCAGCAGGAGTA 92 1683
903564 429 444 9092 9107 CTCATTATCAGTCAGC 94 1684
903567 434 449 9097 9112 CAGGCCTCATTATCAG 40 1685
903568 435 450 9098 9113 CCAGGCCTCATTATCA 52 1686
903569 436 451 9099 9114 TCCAGGCCTCATTATC 69 1687
903570 437 452 9100 9115 TTCCAGGCCTCATTAT 55 1688
903571 438 453 9101 9116 GTTCCAGGCCTCATTA 74 1689
903572 439 454 9102 9117 CGTTCCAGGCCTCATT 97 1690
903573 440 455 9103 9118 CCGTTCCAGGCCTCAT 81 1691
903574 441 456 9104 9119 TCCGTTCCAGGCCTCA 85 1692
903575 443 458 9106 9121 AATCCGTTCCAGGCCT 52 1693
903576 444 459 9107 9122 GAATCCGTTCCAGGCC 55 1694
903577 445 460 9108 9123 CGAATCCGTTCCAGGC 45 1695
903578 446 461 9109 9124 ACGAATCCGTTCCAGG 43 1696
903579 447 462 9110 9125 CACGAATCCGTTCCAG 61 1697
903581 449 464 9112 9127 GCCACGAATCCGTTCC 35 1698
903582 450 465 9113 9128 AGCCACGAATCCGTTC 53 1699
903583 451 466 9114 9129 CAGCCACGAATCCGTT 47 1700
903584 452 467 9115 9130 GCAGCCACGAATCCGT 40 1701
903585 453 468 9116 9131 AGCAGCCACGAATCCG 82 1702
903586 469 484 N/A N/A TCCTGGGCAGTTCAGC 53 1703
903587 471 486 N/A N/A ATTCCTGGGCAGTTCA 89 1704
903589 473 488 N/A N/A TCATTCCTGGGCAGTT 74 1705
903592 501 516 12592 12607 GTCCAGAGCTTTACGG 65 1706
903595 504 519 12595 12610 GTTGTCCAGAGCTTTA 94 1707
903596 505 520 12596 12611 GGTTGTCCAGAGCTTT 98 1708
903597 506 521 12597 12612 AGGTTGTCCAGAGCTT 83 1709
903598 507 522 12598 12613 AAGGTTGTCCAGAGCT 80 1710
903599 508 523 12599 12614 CAAGGTTGTCCAGAGC 91 1711
903600 509 524 12600 12615 GCAAGGTTGTCCAGAG 90 1712
903606 515 530 12606 12621 TGTCTTGCAAGGTTGT 98 1713
903607 516 531 12607 12622 TTGTCTTGCAAGGTTG 96 1714
903639 616 631 12707 12722 TGTTATCCTCAAGCTC 76 1715
903959 1334 1349 13425 13440 GCCTGCAGAATCTTAT 65 1716
903991 1394 1409 13485 13500 CCCCTGCCAGGCATAT 71 1717
903997 1707 1722 13798 13813 TGGGTCAAAAGCGATG 96 1718
904055 1867 1882 13958 13973 TTATTGCAGGCTCCAA 96 1719
904221 2719 2734 14810 14825 TTACTTACCGGGTAAG 57 1720
904279 N/A N/A 449 464 CAGCAAACACGCTCCC 23 1721
904509 N/A N/A 5023 5038 GGCCGTGTCACCCTAA 46 1722
904637 N/A N/A 5463 5478 GGCCAGGTAGCCGTGT 46 1723
904951 N/A N/A 6306 6321 GCTGGGTCTGACCCAC 0 1724
905005 N/A N/A 6415 6430 AAGGAGTTGCTGAAAC 75 1725
905015 N/A N/A 6438 6453 GCAGGTTCACATGACA 88 1726
905019 N/A N/A 6534 6549 TCTGTTAGATACAAAC 92 1727
905037 N/A N/A 6570 6585 TGGGAAACTCAACTGG 77 1728
905111 N/A N/A 6734 6749 TGGATGGAAGGAACCT 73 1729
905469 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC 98 1730
905837 N/A N/A 11345 11360 CCCACCATTGATGGGT 30 1731
905869 N/A N/A 12150 12165 TCACTATCGATCAAAT 53 1732
[表26] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
905758 N/A N/A 9461 9476 CACTTTACATGCACGA 90 1733
905867 N/A N/A 12079 12094 TCATCATAGATACTCC 87 1734
972204 N/A N/A 9219 9234 GGAGGTGTGCCTGTCA 49 1735
972206 N/A N/A 9311 9326 GCTACTCACTGCCAGC 0 1736
972208 N/A N/A 9356 9371 AGAAATGACCCTGTTC 31 1737
972210 N/A N/A 9450 9465 CACGATCTCATTTTTC 79 1738
972212 N/A N/A 9453 9468 ATGCACGATCTCATTT 5 1739
972214 N/A N/A 9455 9470 ACATGCACGATCTCAT 48 1740
972216 N/A N/A 9458 9473 TTTACATGCACGATCT 66 1741
972218 N/A N/A 9460 9475 ACTTTACATGCACGAT 89 1742
972220 N/A N/A 9481 9496 GTGTCAGTCATTATGC 79 1743
972222 N/A N/A 9501 9516 GTTAACTGTGCACCTA 25 1744
972224 N/A N/A 9519 9534 AGCTTGTAAGATGTTA 44 1745
972226 N/A N/A 9551 9566 GAAGATCCTTAACCCT 46 1746
972228 N/A N/A 9622 9637 ACATTGGTTAGGTCAG 82 1747
972230 N/A N/A 9624 9639 ACACATTGGTTAGGTC 55 1748
972232 N/A N/A 9672 9687 GGAATTCCTCAGATGA 15 1749
972234 N/A N/A 9678 9693 GTTTATGGAATTCCTC 95 1750
972236 N/A N/A 9689 9704 GGTCCTGCCGTGTTTA 29 1751
972238 N/A N/A 9846 9861 TCCTATCACATTGAGT 37 1752
972240 N/A N/A 9869 9884 TGCCTCTAAGGCCTTC 10 1753
972242 N/A N/A 9904 9919 ATCTTGGTGTTGGTTC 68 1754
972244 N/A N/A 10059 10074 TTAAGTTTCAAGCCCT 77 1755
972246 N/A N/A 10072 10087 GTTCATGACCTCCTTA 76 1756
972248 N/A N/A 10083 10098 GTCCTCTGCAAGTTCA 65 1757
972250 N/A N/A 10125 10140 GATCATCCAGACAGGG 27 1758
972252 N/A N/A 10196 10211 GAACTTGCCAGTTCCA 32 1759
972254 N/A N/A 10257 10272 TGCTTGTCAATGTCAG 72 1760
972256 N/A N/A 10265 10280 AGACATACTGCTTGTC 0 1761
972258 N/A N/A 10285 10300 TACTATGAAAATGGTC 11 1762
972260 N/A N/A 10297 10312 AGCAACTAATTCTACT 47 1763
972262 N/A N/A 10307 10322 ACAAATTGGCAGCAAC 81 1764
972264 N/A N/A 10309 10324 ACACAAATTGGCAGCA 72 1765
972266 N/A N/A 10420 10435 CACCTATATAAATTGC 39 1766
972268 N/A N/A 10464 10479 GCAATTTTATGGAACC 94 1767
972270 N/A N/A 10507 10522 CTTAGTAGTGACAGCT 40 1768
972272 N/A N/A 10521 10536 AGCCTAACTGATGCCT 14 1769
972274 N/A N/A 10543 10558 GGTCTCACTCGCAGGT 52 1770
972276 N/A N/A 10623 10638 GGCTATTCATTCTGGC 0 1771
972278 N/A N/A 10631 10646 GGAGATCTGGCTATTC 71 1772
972280 N/A N/A 10669 10684 GCTACTGGTTCTGGCC 0 1773
972282 N/A N/A 10774 10789 GAGTACTTTGAATTCA 0 1774
972284 N/A N/A 10788 10803 GTCTGGCTATCTCTGA 49 1775
972286 N/A N/A 10798 10813 AGACATTGCAGTCTGG 22 1776
972288 N/A N/A 10835 10850 TAAATTTGCAGGTGGT 96 1777
972290 N/A N/A 10837 10852 CTTAAATTTGCAGGTG 89 1778
972292 N/A N/A 10852 10867 GGATTTAGAAATCCCC 7 1779
972294 N/A N/A 10944 10959 TGTGTTCTTTCCGTGT 48 1780
972296 N/A N/A 11017 11032 GACAATGAAGCTTCAC 60 1781
972298 N/A N/A 11097 11112 TTAACTGGGTGAGCTT 27 1782
972300 N/A N/A 11122 11137 TAATGTGATTCACAGG 98 1783
972302 N/A N/A 11126 11141 GGTTTAATGTGATTCA 90 1784
972304 N/A N/A 11148 11163 CCTGAAAAAAGGCTTC 55 1785
972306 N/A N/A 11160 11175 TGTAACAACAATCCTG 61 1786
972308 N/A N/A 11196 11211 TTACTATATTTGGAGC 33 1787
972310 N/A N/A 11264 11279 TGTCTCCTATCAGTCC 36 1788
972312 N/A N/A 11291 11306 CAATTTAGCAGGAACC 36 1789
972314 N/A N/A 11361 11376 GATTATGCTCTTCACC 59 1790
972316 N/A N/A 11366 11381 TATCTGATTATGCTCT 78 1791
972318 N/A N/A 11380 11395 TGATTACGCTTTGCTA 15 1792
972320 N/A N/A 11382 11397 TCTGATTACGCTTTGC 79 1793
972322 N/A N/A 11582 11597 AGATACTCTGGACACT 50 1794
972324 N/A N/A 11606 11621 GGCAGCTTGTGATCCA 0 1795
972326 N/A N/A 11731 11746 CCGTATAGGAATCTGA 37 1796
972328 N/A N/A 11749 11764 GGTGATTTGGCCACGG 56 1797
972330 N/A N/A 11804 11819 AGTGATCTCCAGGCCC 25 1798
972332 N/A N/A 11956 11971 GTGACTGCCAAAGTGT 22 1799
972334 N/A N/A 11996 12011 TTGATAAAGATGCCTC 76 1800
972336 N/A N/A 12011 12026 TTTCATGGTAGGTGTT 76 1801
972338 N/A N/A 12070 12085 ATACTCCTCAATATTT 41 1802
972340 N/A N/A 12073 12088 TAGATACTCCTCAATA 56 1803
972342 N/A N/A 12078 12093 CATCATAGATACTCCT 88 1804
972344 N/A N/A 12081 12096 GTTCATCATAGATACT 26 1805
972346 N/A N/A 12180 12195 GATCTCTATCCTGTGT 36 1806
972348 N/A N/A 14951 14966 GACTCGAACAAGTCCA 1 1807
972350 N/A N/A 15111 15126 CTTCATCGGTCCATCG 30 1808
972352 N/A N/A 15298 15313 TCCAGGTACCCTTCTA 2 1809
972354 N/A N/A 15311 15326 AGACATCACCTTGTCC 1 1810
[表27] 靶向SEQ ID NO: 1和2的3-10-3 cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 % 抑制 SEQ ID NO
905758 N/A N/A 9461 9476 CACTTTACATGCACGA 88 1733
905867 N/A N/A 12079 12094 TCATCATAGATACTCC 85 1734
972205 N/A N/A 9277 9292 ATTCTTCCTGGAGTGC 50 1811
972207 N/A N/A 9315 9330 TGAGGCTACTCACTGC 0 1812
972209 N/A N/A 9390 9405 GTAACTGGCAAAGTTC 3 1813
972211 N/A N/A 9452 9467 TGCACGATCTCATTTT 29 1814
972213 N/A N/A 9454 9469 CATGCACGATCTCATT 23 1815
972215 N/A N/A 9456 9471 TACATGCACGATCTCA 83 1816
972217 N/A N/A 9459 9474 CTTTACATGCACGATC 55 1817
972219 N/A N/A 9462 9477 GCACTTTACATGCACG 63 1818
972221 N/A N/A 9483 9498 GTGTGTCAGTCATTAT 94 1819
972223 N/A N/A 9502 9517 CGTTAACTGTGCACCT 50 1820
972225 N/A N/A 9546 9561 TCCTTAACCCTGGTTC 21 1821
972227 N/A N/A 9558 9573 TCAAGAAGAAGATCCT 48 1822
972229 N/A N/A 9623 9638 CACATTGGTTAGGTCA 82 1823
972231 N/A N/A 9626 9641 ACACACATTGGTTAGG 75 1824
972233 N/A N/A 9675 9690 TATGGAATTCCTCAGA 40 1825
972235 N/A N/A 9681 9696 CGTGTTTATGGAATTC 71 1826
972237 N/A N/A 9841 9856 TCACATTGAGTTGCTA 85 1827
972239 N/A N/A 9868 9883 GCCTCTAAGGCCTTCA 7 1828
972241 N/A N/A 9899 9914 GGTGTTGGTTCCCCAC 31 1829
972243 N/A N/A 9937 9952 GCTGATCCCGGTCTCT 42 1830
972245 N/A N/A 10062 10077 TCCTTAAGTTTCAAGC 31 1831
972247 N/A N/A 10077 10092 TGCAAGTTCATGACCT 41 1832
972249 N/A N/A 10107 10122 GAAATATCCCTCTCCC 23 1833
972251 N/A N/A 10148 10163 CCCTATATGCCCATGA 75 1834
972253 N/A N/A 10197 10212 AGAACTTGCCAGTTCC 0 1835
972255 N/A N/A 10264 10279 GACATACTGCTTGTCA 0 1836
972257 N/A N/A 10272 10287 GTCACTAAGACATACT 8 1837
972259 N/A N/A 10296 10311 GCAACTAATTCTACTA 80 1838
972261 N/A N/A 10306 10321 CAAATTGGCAGCAACT 61 1839
972263 N/A N/A 10308 10323 CACAAATTGGCAGCAA 91 1840
972265 N/A N/A 10419 10434 ACCTATATAAATTGCT 22 1841
972267 N/A N/A 10461 10476 ATTTTATGGAACCTCT 72 1842
972269 N/A N/A 10495 10510 AGCTTCACCTGTGTGC 10 1843
972271 N/A N/A 10510 10525 TGCCTTAGTAGTGACA 34 1844
972273 N/A N/A 10539 10554 TCACTCGCAGGTGTCA 30 1845
972275 N/A N/A 10622 10637 GCTATTCATTCTGGCT 0 1846
972277 N/A N/A 10624 10639 TGGCTATTCATTCTGG 22 1847
972279 N/A N/A 10664 10679 TGGTTCTGGCCACTGC 37 1848
972281 N/A N/A 10732 10747 GGAGTTCACTTTGCCT 0 1849
972283 N/A N/A 10783 10798 GCTATCTCTGAGTACT 13 1850
972285 N/A N/A 10797 10812 GACATTGCAGTCTGGC 46 1851
972287 N/A N/A 10800 10815 TCAGACATTGCAGTCT 0 1852
972289 N/A N/A 10836 10851 TTAAATTTGCAGGTGG 92 1853
972291 N/A N/A 10839 10854 CCCTTAAATTTGCAGG 19 1854
972293 N/A N/A 10853 10868 TGGATTTAGAAATCCC 13 1855
972295 N/A N/A 11012 11027 TGAAGCTTCACACTTA 29 1856
972297 N/A N/A 11019 11034 AGGACAATGAAGCTTC 50 1857
972299 N/A N/A 11100 11115 TCCTTAACTGGGTGAG 25 1858
972301 N/A N/A 11125 11140 GTTTAATGTGATTCAC 88 1859
972303 N/A N/A 11127 11142 TGGTTTAATGTGATTC 90 1860
972305 N/A N/A 11159 11174 GTAACAACAATCCTGA 69 1861
972307 N/A N/A 11195 11210 TACTATATTTGGAGCT 40 1862
972309 N/A N/A 11200 11215 GTCTTTACTATATTTG 77 1863
972311 N/A N/A 11290 11305 AATTTAGCAGGAACCC 53 1864
972313 N/A N/A 11307 11322 GAGAATCCTGTTAGGC 51 1865
972315 N/A N/A 11362 11377 TGATTATGCTCTTCAC 36 1866
972317 N/A N/A 11368 11383 GCTATCTGATTATGCT 18 1867
972319 N/A N/A 11381 11396 CTGATTACGCTTTGCT 33 1868
972321 N/A N/A 11572 11587 GACACTAAGGCATGGG 77 1869
972323 N/A N/A 11584 11599 GCAGATACTCTGGACA 46 1870
972325 N/A N/A 11699 11714 GGGCTATTTGGTGTCT 22 1871
972327 N/A N/A 11747 11762 TGATTTGGCCACGGGA 58 1872
972329 N/A N/A 11767 11782 GAACATCTGTCTTTGC 42 1873
972331 N/A N/A 11856 11871 AGCATGAACTTTACCC 53 1874
972333 N/A N/A 11968 11983 CAGGTCAACACCGTGA 0 1875
972335 N/A N/A 11998 12013 GTTTGATAAAGATGCC 77 1876
972337 N/A N/A 12069 12084 TACTCCTCAATATTTA 66 1877
972339 N/A N/A 12071 12086 GATACTCCTCAATATT 37 1878
972341 N/A N/A 12077 12092 ATCATAGATACTCCTC 93 1879
972343 N/A N/A 12080 12095 TTCATCATAGATACTC 87 1880
972345 N/A N/A 12168 12183 GTGTAAATTGCAGAGC 82 1881
972347 N/A N/A 12199 12214 TGTGAAATGAGCTCCA 78 1882
972349 N/A N/A 14953 14968 ATGACTCGAACAAGTC 38 1883
972351 N/A N/A 15116 15131 TGGAACTTCATCGGTC 5 1884
972353 N/A N/A 15310 15325 GACATCACCTTGTCCA 16 1885
972355 N/A N/A 15432 15447 GGAAGTCAGGCACCCA 16 1886
[表28] 靶向SEQ ID NO: 1和2的缺口體
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 SEQ ID NO
904628 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kkk-d10-kkk 1887
905141 N/A N/A 6820 6835 GAACGCAATGCTGACT kkk-d10-kkk 1888
905269 N/A N/A 7283 7298 CAGCATTGAGTACAAC kkk-d10-kkk 1889
905521 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kkk-d10-kkk 1890
905582 N/A N/A 8520 8535 GAGAACATTGAAACAC kkk-d10-kkk 1891
905684 N/A N/A 8875 8890 TAGTGCTATAGAGGGA kkk-d10-kkk 1892
905757 N/A N/A 9457 9472 TTACATGCACGATCTC kkk-d10-kkk 1893
969419 N/A N/A 9460 9475 ACTTTACATGCACGAT kk-d9-ekeke 1742
905758 N/A N/A 9461 9476 CACTTTACATGCACGA kkk-d10-kkk 1733
969219 N/A N/A 9461 9476 CACTTTACATGCACGA kk-d10-keke 1733
971984 N/A N/A 9461 9476 CACTTTACATGCACGA kk-d9-kekek 1733
905808 N/A N/A 10462 10477 AATTTTATGGAACCTC kkk-d10-kkk 1894
971987 N/A N/A 12076 12091 TCATAGATACTCCTCA kkk-d10-kkk 1895
905867 N/A N/A 12079 12094 TCATCATAGATACTCC kkk-d10-kkk 1734
904016 1772 1787 13863 13878 CCCTAACACTCAGTTC kkk-d10-kkk 1896
904084 2253 2268 14344 14359 TCCGTCAATATATTCT kkk-d10-kkk 1897
904212 2709 2724 14800 14815 GGTAAGAGCGATGGGA kkk-d10-kkk 1898
去氧、 MOE cEt 缺口體
將下表中的新設計的嵌合反義寡核苷酸設計為去氧、MOE和cEt缺口體。該等去氧、MOE和cEt寡核苷酸具有MOE糖修飾、(S)-cEt糖修飾、或去氧修飾的核苷。「化學」欄描述了每個寡核苷酸的糖修飾。「k」指示(S)-cEt糖修飾;「d」指示去氧核糖;並且「e」指示MOE修飾。遍及每個缺口體的核苷間連接都是硫代磷酸酯(P=S)連接。遍及每個缺口體的所有胞嘧啶殘基都是5-甲基胞嘧啶。缺口體的糖模體示出於下表的化學欄中,其中「k」意指cEt糖;「e」意指2'-MOE糖;「d」意指去氧糖,並且「d」後的數字指示去氧核苷的數量。
「起始位點」指示缺口體所靶向的人類基因序列中的最5'核苷。「終止位點」指示缺口體所靶向的人類基因序列中的最3'核苷。下表中所列的每個缺口體都靶向人類APOL1 mRNA(本文指定為SEQ ID NO: 1(GENBANK登錄號NM_003661.3))或人類APOL1基因組序列(本文指定為SEQ ID NO: 2(從核苷酸15986452至16001905截短的GENBANK登錄號NT_011520.9))。‘n/a’指示反義寡核苷酸並未以100%互補性靶向該特定基因序列。
在一系列具有類似培養條件的實驗中對該等反義寡核苷酸進行測試。將每個實驗的結果呈現在如下所示的單獨的表中。藉由自由攝取用2,000 nM反義寡核苷酸以每孔5,000個細胞的密度轉染培養的A431細胞。在大約24小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。 [表29] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
793406 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kkk-d10-kkk 90 13
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 99 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 93 1899
905634 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kkk-d10-kkk 95 1326
969064 N/A N/A 6700 6715 ATTTCTTGATGTGGTG k-d10-kekek 96 343
969084 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC k-d10-kekek 95 1900
969094 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG k-d10-kekek 73 76
969104 1031 1046 13122 13137 AGATTGGCTCTGGCTC k-d9-kekeke 23 654
969114 N/A N/A 8162 8177 TTCAGAATTTCCACTA k-d9-kekeke 62 1186
969124 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT k-d9-kekeke 33 13
969134 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA k-d9-kekeke 48 1577
969144 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA k-d9-kekeke 34 80
969154 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kek-d9-eekk 86 243
969164 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kek-d9-eekk 98 1249
969184 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d10-keke 89 411
969194 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d10-keke 94 80
969204 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d10-keke 99 1283
969214 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d10-keke 96 1899
969224 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d8-eeeekk 88 1901
969234 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d8-eeeekk 64 1902
969244 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d8-kekekk 70 151
969254 N/A N/A 6816 6831 GCAATGCTGACTTGGC kk-d8-kekekk 91 1903
969274 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d8-kekekk 71 1904
969294 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d8-kekekk 87 1095
969304 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d8-kekekk 87 1890
969314 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d9-eeekk 93 1900
969324 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d9-eeekk 86 356
969334 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d9-eeekk 81 1480
969344 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d9-eeekk 87 1905
969354 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kk-d9-eeekk 95 1327
969364 N/A N/A 6549 6564 TATCAGATGGGTACTT kk-d9-eeekk 70 550
969384 N/A N/A 5452 5467 CGTGTTATATTTGATC kk-d9-eeekk 74 1906
969394 N/A N/A 8335 8350 CAACACATCATTGGGT kk-d9-eeekk 80 1907
969404 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d9-ekeke 96 1900
969414 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d9-ekeke 81 356
969424 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d9-ekeke 64 1480
969434 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d9-ekeke 92 1919
969444 N/A N/A 8832 8847 GAAGCTTTAAACTCAG kk-d9-ekeke 62 1397
969454 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC kk-d9-ekeke 86 1230
969464 N/A N/A 8368 8383 CACTTTATACCAGTGT kk-d9-ekeke 0 1908
969474 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d9-kdkdk 96 1909
969484 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d9-kdkdk 47 1910
969494 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d9-kdkdk 70 1911
969504 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d9-kdkdk 87 413
971924 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d9-kekek 82 411
971934 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d9-kekek 53 80
971944 2738 2753 14829 14844 ATGCTAATTTTCTGAC kk-d9-kekek 97 1912
971954 N/A N/A 8166 8181 GGCATTCAGAATTTCC kk-d9-kekek 46 1913
971964 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d9-kekek 60 13
971974 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d9-kekek 66 481
971994 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kkk-d8-kdkdk 51 1480
972004 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d8-kdkdk 92 413
972014 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kkk-d8-kdkdk 93 81
972024 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kkk-d8-kekek 35 1025
972034 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kkk-d8-kekek 76 1914
972044 2253 2268 14344 14359 TCCGTCAATATATTCT kkk-d8-kekek 95 1897
972054 N/A N/A 6820 6835 GAACGCAATGCTGACT kkk-d8-kekek 48 1888
972074 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kkk-d8-kekek 63 1095
972084 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kkk-d8-kekek 76 1890
972094 N/A N/A 5413 5428 TATTCTCATGGTACAG kkk-d9-keke 68 1915
972104 N/A N/A 8238 8253 TGAGTATTGTTTTTGT kkk-d9-keke 92 1916
972114 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kkk-d9-keke 63 1911
972124 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d9-keke 98 413
972144 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kkk-d9-kkke 96 1917
972154 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kkk-d9-kkke 51 150
972164 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kkk-d9-kkke 58 243
972174 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kkk-d9-kkke 92 1730
972184 971 986 13062 13077 TAAGTATTGCCAGCTA kkk-d9-kkke 65 1918
972194 N/A N/A 6819 6834 AACGCAATGCTGACTT kkk-d9-kkke 91 1919
[表30] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
793444 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kkk-d10-kkk 68 1920
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 99 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969055 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA k-d10-kekek 77 151
969065 N/A N/A 6816 6831 GCAATGCTGACTTGGC k-d10-kekek 85 1903
969085 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT k-d10-kekek 79 1887
969095 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA k-d10-kekek 47 426
969105 N/A N/A 5410 5425 TCTCATGGTACAGGAG k-d9-kekeke 55 537
969115 N/A N/A 8235 8250 GTATTGTTTTTGTGGG k-d9-kekeke 70 1921
969125 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA k-d9-kekeke 25 1911
969135 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC k-d9-kekeke 43 481
969145 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT k-d9-kekeke 34 1326
969155 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kek-d9-eekk 94 1283
969165 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kek-d9-eekk 89 1730
969175 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d10-keke 91 81
969185 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d10-keke 99 1904
969195 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d10-keke 87 151
969205 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d10-keke 95 677
969215 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d10-keke 68 76
969225 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d8-eeeekk 80 607
969235 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d8-eeeekk 85 1922
969245 968 983 13059 13074 GTATTGCCAGCTAAGG kk-d8-kekekk 74 1410
969255 N/A N/A 7920 7935 AATTATGGAATTGCAG kk-d8-kekekk 35 1923
969265 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d8-kekekk 50 81
969275 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d8-kekekk 60 1924
969285 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d8-kekekk 16 1920
969295 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d8-kekekk 18 1577
969305 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d8-kekekk 34 1326
969315 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d9-eeekk 83 1025
969325 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d9-eeekk 88 1914
969335 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d9-eeekk 81 1925
969345 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d9-eeekk 99 1249
969355 N/A N/A 8307 8322 GGTTCAAAAGCAGCAT kk-d9-eeekk 95 978
969365 N/A N/A 6703 6718 TGTATTTCTTGATGTG kk-d9-eeekk 87 1926
969385 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC kk-d9-eeekk 83 1230
969395 N/A N/A 8368 8383 CACTTTATACCAGTGT kk-d9-eeekk 0 1908
969405 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d9-ekeke 87 1025
969415 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d9-ekeke 90 1914
969425 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d9-ekeke 90 1925
969435 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d9-ekeke 97 1249
969445 N/A N/A 8308 8323 TGGTTCAAAAGCAGCA kk-d9-ekeke 82 1048
969455 N/A N/A 5860 5875 GGCAGTTTTGTAAGTG kk-d9-ekeke 75 123
969465 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kk-d9-ekeke 79 1396
969475 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d9-kdkdk 93 1900
969485 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d9-kdkdk 79 356
969495 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d9-kdkdk 79 1480
969505 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d9-kdkdk 85 1905
971915 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d9-kekek 86 81
971925 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d9-kekek 97 1904
971935 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d9-kekek 82 151
971945 N/A N/A 5414 5429 TTATTCTCATGGTACA kk-d9-kekek 47 1927
971955 N/A N/A 8239 8254 GTGAGTATTGTTTTTG kk-d9-kekek 88 1928
971965 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d9-kekek 62 1911
971975 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d9-kekek 75 413
971995 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kkk-d8-kdkdk 95 1925
972005 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kkk-d8-kdkdk 70 1905
972025 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kkk-d8-kekek 77 1917
972035 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kkk-d8-kekek 23 150
972045 2342 2357 14433 14448 CTGTTCTAACTCTTGG kkk-d8-kekek 88 383
972055 N/A N/A 7924 7939 TGGGAATTATGGAATT kkk-d8-kekek 56 1929
972065 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kkk-d8-kekek 64 1920
972075 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kkk-d8-kekek 87 1577
972085 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kkk-d8-kekek 37 1326
972095 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kkk-d9-keke 71 1887
972105 N/A N/A 8322 8337 GGTTATGAAATTATTG kkk-d9-keke 88 1930
972115 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kkk-d9-keke 75 1480
972125 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kkk-d9-keke 87 1905
972145 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kkk-d9-kkke 82 411
972155 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kkk-d9-kkke 85 80
972165 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kkk-d9-kkke 92 1283
972175 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d9-kkke 88 1899
972185 1034 1049 13125 13140 TGAAGATTGGCTCTGG kkk-d9-kkke 61 1931
972195 N/A N/A 7923 7938 GGGAATTATGGAATTG kkk-d9-kkke 77 1596
[表31] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
903822 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kkk-d10-kkk 90 1911
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969056 968 983 13059 13074 GTATTGCCAGCTAAGG k-d10-kekek 93 1410
969066 N/A N/A 7920 7935 AATTATGGAATTGCAG k-d10-kekek 52 1923
969076 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT k-d10-kekek 95 1920
969086 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA k-d10-kekek 99 1095
969096 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT k-d10-kekek 89 1890
969106 N/A N/A 5447 5462 TATATTTGATCCTCAA k-d9-kekeke 75 1932
969116 N/A N/A 8331 8346 ACATCATTGGGTTATG k-d9-kekeke 76 286
969126 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC k-d9-kekeke 21 1480
969136 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG k-d9-kekeke 87 413
969146 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG k-d9-kekeke 67 81
969156 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kek-d9-eekk 96 677
969166 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kek-d9-eekk 90 1899
969176 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d10-keke 86 1479
969186 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d10-keke 96 1924
969206 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d10-keke 92 1887
969216 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d10-keke 72 426
969226 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d8-eeeekk 91 1909
969236 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d8-eeeekk 35 1910
969246 1031 1046 13122 13137 AGATTGGCTCTGGCTC kk-d8-kekekk 18 654
969256 N/A N/A 8162 8177 TTCAGAATTTCCACTA kk-d8-kekekk 58 1186
969266 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d8-kekekk 34 1479
969276 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d8-kekekk 61 1183
969286 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d8-kekekk 34 13
969296 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d8-kekekk 45 481
969316 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d9-eeekk 94 1917
969326 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d9-eeekk 67 150
969336 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kk-d9-eeekk 91 243
969346 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d9-eeekk 78 1730
969356 971 986 13062 13077 TAAGTATTGCCAGCTA kk-d9-eeekk 79 1918
969366 N/A N/A 6819 6834 AACGCAATGCTGACTT kk-d9-eeekk 82 1919
969376 N/A N/A 8832 8847 GAAGCTTTAAACTCAG kk-d9-eeekk 72 1397
969386 N/A N/A 5860 5875 GGCAGTTTTGTAAGTG kk-d9-eeekk 80 123
969396 N/A N/A 8746 8761 TAATTCTATTAGAGGG kk-d9-eeekk 59 220
969406 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d9-ekeke 91 1917
969416 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d9-ekeke 67 150
969426 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kk-d9-ekeke 78 243
969436 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d9-ekeke 87 1730
969446 972 987 13063 13078 GTAAGTATTGCCAGCT kk-d9-ekeke 69 1933
969456 N/A N/A 6550 6565 ATATCAGATGGGTACT kk-d9-ekeke 27 620
969466 N/A N/A 8746 8761 TAATTCTATTAGAGGG kk-d9-ekeke 46 220
969476 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d9-kdkdk 74 1025
969486 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d9-kdkdk 81 1914
969496 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d9-kdkdk 91 1925
969506 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d9-kdkdk 89 1249
971916 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d9-kekek 65 1479
971926 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d9-kekek 83 1924
971946 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kk-d9-kekek 78 1934
971956 N/A N/A 8323 8338 GGGTTATGAAATTATT kk-d9-kekek 84 1935
971966 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d9-kekek 48 1480
971976 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d9-kekek 79 1905
971996 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kkk-d8-kdkdk 73 243
972006 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kkk-d8-kdkdk 76 1249
972026 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kkk-d8-kekek 50 411
972036 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kkk-d8-kekek 42 80
972046 2738 2753 14829 14844 ATGCTAATTTTCTGAC kkk-d8-kekek 95 1912
972056 N/A N/A 8166 8181 GGCATTCAGAATTTCC kkk-d8-kekek 20 1913
972066 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kkk-d8-kekek 24 13
972076 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kkk-d8-kekek 54 481
972096 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kkk-d9-keke 96 1981
972106 N/A N/A 8334 8349 AACACATCATTGGGTT kkk-d9-keke 21 496
972116 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kkk-d9-keke 94 1925
972126 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kkk-d9-keke 55 1249
972136 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kkk-d9-kkke 74 81
972146 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kkk-d9-kkke 99 1904
972156 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kkk-d9-kkke 59 151
972166 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kkk-d9-kkke 93 677
972176 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kkk-d9-kkke 96 76
972186 2252 2267 14343 14358 CCGTCAATATATTCTT kkk-d9-kkke 98 1936
972196 N/A N/A 8165 8180 GCATTCAGAATTTCCA kkk-d9-kkke 95 1937
[表32] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
904082 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kkk-d10-kkk 94 1925
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969057 1031 1046 13122 13137 AGATTGGCTCTGGCTC k-d10-kekek 40 654
969067 N/A N/A 8162 8177 TTCAGAATTTCCACTA k-d10-kekek 87 1186
969077 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT k-d10-kekek 79 13
969087 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA k-d10-kekek 92 1577
969097 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA k-d10-kekek 45 80
969107 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA k-d9-kekeke 39 1909
969117 N/A N/A 8364 8379 TTATACCAGTGTCTTC k-d9-kekeke 82 1938
969127 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT k-d9-kekeke 96 1925
969137 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG k-d9-kekeke 72 1905
969157 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kek-d9-eekk 99 1900
969167 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kek-d9-eekk 90 76
969177 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d10-keke 65 1411
969187 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d10-keke 92 1183
969207 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d10-keke 92 1095
969217 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d10-keke 97 1890
969227 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d8-eeeekk 69 1900
969237 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d8-eeeekk 54 356
969247 N/A N/A 5410 5425 TCTCATGGTACAGGAG kk-d8-kekekk 26 537
969257 N/A N/A 8235 8250 GTATTGTTTTTGTGGG kk-d8-kekekk 39 1921
969267 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d8-kekekk 2 1411
969277 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d8-kekekk 57 1902
969287 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d8-kekekk 27 1911
969297 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d8-kekekk 52 413
969317 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d9-eeekk 88 411
969327 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d9-eeekk 87 80
969337 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d9-eeekk 94 1283
969347 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d9-eeekk 97 1899
969357 1034 1049 13125 13140 TGAAGATTGGCTCTGG kk-d9-eeekk 82 1931
969367 N/A N/A 7923 7938 GGGAATTATGGAATTG kk-d9-eeekk 86 1596
969377 N/A N/A 8308 8323 TGGTTCAAAAGCAGCA kk-d9-eeekk 93 1048
969387 N/A N/A 6550 6565 ATATCAGATGGGTACT kk-d9-eeekk 52 620
969407 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d9-ekeke 91 411
969417 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d9-ekeke 85 80
969427 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d9-ekeke 88 1283
969437 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d9-ekeke 98 1899
969447 1035 1050 13126 13141 CTGAAGATTGGCTCTG kk-d9-ekeke 53 1939
969457 N/A N/A 6704 6719 GTGTATTTCTTGATGT kk-d9-ekeke 94 1940
969467 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kk-d9-ekeke 95 1327
969477 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d9-kdkdk 91 1917
969487 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d9-kdkdk 68 150
969497 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kk-d9-kdkdk 90 243
969507 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d9-kdkdk 84 1730
971917 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d9-kekek 37 1411
971927 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d9-kekek 51 1183
971947 N/A N/A 5452 5467 CGTGTTATATTTGATC kk-d9-kekek 88 1906
971957 N/A N/A 8335 8350 CAACACATCATTGGGT kk-d9-kekek 43 1907
971967 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d9-kekek 94 1925
971977 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d9-kekek 82 1249
971997 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kkk-d8-kdkdk 93 1283
972007 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kkk-d8-kdkdk 88 1730
972017 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kkk-d8-kekek 68 81
972027 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kkk-d8-kekek 95 1904
972037 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kkk-d8-kekek 40 151
972047 N/A N/A 5414 5429 TTATTCTCATGGTACA kkk-d8-kekek 53 1927
972057 N/A N/A 8239 8254 GTGAGTATTGTTTTTG kkk-d8-kekek 85 1928
972067 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kkk-d8-kekek 47 1911
972077 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d8-kekek 73 413
972097 N/A N/A 5855 5870 TTTTGTAAGTGCAACC kkk-d9-keke 98 1164
972107 N/A N/A 8367 8382 ACTTTATACCAGTGTC kkk-d9-keke 65 1941
972117 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kkk-d9-keke 66 243
972127 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kkk-d9-keke 86 1730
972137 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kkk-d9-kkke 89 1479
972147 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kkk-d9-kkke 94 1924
972167 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kkk-d9-kkke 89 1887
972177 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kkk-d9-kkke 59 426
972187 2341 2356 14432 14447 TGTTCTAACTCTTGGG kkk-d9-kkke 89 313
972197 N/A N/A 8238 8253 TGAGTATTGTTTTTGT kkk-d9-kkke 95 1916
[表33] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
904619 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kkk-d10-kkk 97 677
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969058 N/A N/A 5410 5425 TCTCATGGTACAGGAG k-d10-kekek 61 537
969068 N/A N/A 8235 8250 GTATTGTTTTTGTGGG k-d10-kekek 77 1921
969078 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA k-d10-kekek 54 1911
969088 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC k-d10-kekek 73 481
969098 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT k-d10-kekek 45 1326
969108 N/A N/A 5852 5867 TGTAAGTGCAACCAAT k-d9-kekeke 67 955
969118 N/A N/A 8741 8756 CTATTAGAGGGCTAGT k-d9-kekeke 34 1674
969128 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC k-d9-kekeke 77 243
969138 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC k-d9-kekeke 88 1249
969158 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kek-d9-eekk 94 1887
969168 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kek-d9-eekk 87 426
969178 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d10-keke 98 1901
969188 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d10-keke 88 1902
969198 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d10-keke 94 1920
969208 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d10-keke 94 1577
969218 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d10-keke 78 1326
969228 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d8-eeeekk 70 1025
969238 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d8-eeeekk 89 1914
969248 N/A N/A 5447 5462 TATATTTGATCCTCAA kk-d8-kekekk 77 1932
969258 N/A N/A 8331 8346 ACATCATTGGGTTATG kk-d8-kekekk 70 286
969268 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d8-kekekk 71 1901
969278 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d8-kekekk 66 1922
969288 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d8-kekekk 10 1480
969298 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d8-kekekk 72 1905
969308 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d9-eeekk 91 81
969318 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d9-eeekk 99 1904
969328 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d9-eeekk 92 151
969338 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d9-eeekk 92 677
969348 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d9-eeekk 54 76
969358 2252 2267 14343 14358 CCGTCAATATATTCTT kk-d9-eeekk 98 1936
969368 N/A N/A 8165 8180 GCATTCAGAATTTCCA kk-d9-eeekk 98 1937
969378 972 987 13063 13078 GTAAGTATTGCCAGCT kk-d9-eeekk 89 1933
969388 N/A N/A 6704 6719 GTGTATTTCTTGATGT kk-d9-eeekk 96 1940
969398 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d9-ekeke 92 81
969408 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d9-ekeke 99 1904
969418 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d9-ekeke 91 151
969428 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d9-ekeke 95 677
969438 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d9-ekeke 68 76
969448 2253 2268 14344 14359 TCCGTCAATATATTCT kk-d9-ekeke 97 1897
969458 N/A N/A 6820 6835 GAACGCAATGCTGACT kk-d9-ekeke 95 1888
969478 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d9-kdkdk 88 411
969488 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d9-kdkdk 87 80
969498 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d9-kdkdk 93 1283
969508 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d9-kdkdk 92 1899
971918 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d9-kekek 83 1901
971928 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d9-kekek 76 1902
971938 N/A N/A 8832 8847 GAAGCTTTAAACTCAG kk-d9-kekek 84 1397
971948 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC kk-d9-kekek 88 1230
971958 N/A N/A 8368 8383 CACTTTATACCAGTGT kk-d9-kekek 14 1908
971968 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kk-d9-kekek 61 243
971978 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d9-kekek 76 1730
971998 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kkk-d8-kdkdk 81 677
972008 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d8-kdkdk 54 1899
972018 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kkk-d8-kekek 66 1479
972028 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kkk-d8-kekek 68 1924
972048 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kkk-d8-kekek 75 1934
972058 N/A N/A 8323 8338 GGGTTATGAAATTATT kkk-d8-kekek 73 1935
972068 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kkk-d8-kekek 16 1480
972078 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kkk-d8-kekek 71 1905
972088 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kkk-d9-keke 84 1327
972098 N/A N/A 5859 5874 GCAGTTTTGTAAGTGC kkk-d9-keke 60 1647
972108 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kkk-d9-keke 73 1326
972118 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kkk-d9-keke 93 1283
972128 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d9-keke 81 1899
972138 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kkk-d9-kkke 35 1411
972148 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kkk-d9-kkke 90 1183
972168 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kkk-d9-kkke 56 1095
972178 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kkk-d9-kkke 95 1890
972188 N/A N/A 5413 5428 TATTCTCATGGTACAG kkk-d9-kkke 79 1915
972198 N/A N/A 8322 8337 GGTTATGAAATTATTG kkk-d9-kkke 91 1930
[表34] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
904627 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kkk-d10-kkk 100 1900
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969059 N/A N/A 5447 5462 TATATTTGATCCTCAA k-d10-kekek 89 1932
969069 N/A N/A 8331 8346 ACATCATTGGGTTATG k-d10-kekek 89 286
969079 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC k-d10-kekek 44 1480
969089 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG k-d10-kekek 92 413
969099 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG k-d10-kekek 92 81
969109 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC k-d9-kekeke 73 1230
969119 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG k-d9-kekeke 37 150
969129 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG k-d9-kekeke 88 1283
969139 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC k-d9-kekeke 58 1730
969149 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kek-d9-eekk 82 1920
969159 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kek-d9-eekk 99 1095
969169 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kek-d9-eekk 95 1890
969179 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d10-keke 78 607
969189 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d10-keke 91 1922
969199 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d10-keke 89 13
969209 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d10-keke 83 481
969229 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d8-eeeekk 94 1917
969239 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d8-eeeekk 44 150
969249 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d8-kekekk 69 1909
969259 N/A N/A 8364 8379 TTATACCAGTGTCTTC kk-d8-kekekk 68 1938
969269 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d8-kekekk 20 607
969279 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d8-kekekk 63 1910
969289 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d8-kekekk 95 1925
969299 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d8-kekekk 74 1249
969309 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d9-eeekk 86 1479
969319 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d9-eeekk 88 1924
969339 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d9-eeekk 87 1887
969349 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d9-eeekk 51 426
969359 2341 2356 14432 14447 TGTTCTAACTCTTGGG kk-d9-eeekk 97 313
969369 N/A N/A 8238 8253 TGAGTATTGTTTTTGT kk-d9-eeekk 87 1916
969379 1035 1050 13126 13141 CTGAAGATTGGCTCTG kk-d9-eeekk 54 1939
969389 N/A N/A 6820 6835 GAACGCAATGCTGACT kk-d9-eeekk 95 1888
969399 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d9-ekeke 78 1479
969409 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d9-ekeke 94 1924
969429 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d9-ekeke 94 1887
969439 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d9-ekeke 64 426
969449 2342 2357 14433 14448 CTGTTCTAACTCTTGG kk-d9-ekeke 97 383
969459 N/A N/A 7924 7939 TGGGAATTATGGAATT kk-d9-ekeke 78 1929
969469 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d9-kdkdk 96 81
969479 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d9-kdkdk 97 1904
969489 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d9-kdkdk 89 151
969499 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d9-kdkdk 84 677
969509 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d9-kdkdk 71 76
971919 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d9-kekek 76 607
971929 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d9-kekek 75 1922
971939 N/A N/A 8308 8323 TGGTTCAAAAGCAGCA kk-d9-kekek 68 1048
971949 N/A N/A 5860 5875 GGCAGTTTTGTAAGTG kk-d9-kekek 65 123
971959 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kk-d9-kekek 56 1396
971969 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d9-kekek 96 1283
971979 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d9-kekek 90 1899
971999 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kkk-d8-kdkdk 92 1900
972009 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kkk-d8-kdkdk 91 76
972019 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kkk-d8-kekek 23 1411
972029 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kkk-d8-kekek 61 1183
972049 N/A N/A 5452 5467 CGTGTTATATTTGATC kkk-d8-kekek 82 1906
972059 N/A N/A 8335 8350 CAACACATCATTGGGT kkk-d8-kekek 30 1907
972069 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kkk-d8-kekek 94 1925
972079 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kkk-d8-kekek 66 1249
972089 N/A N/A 8307 8322 GGTTCAAAAGCAGCAT kkk-d9-keke 70 978
972099 N/A N/A 6549 6564 TATCAGATGGGTACTT kkk-d9-keke 37 550
972109 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kkk-d9-keke 82 1396
972119 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kkk-d9-keke 94 677
972129 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kkk-d9-keke 93 76
972139 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kkk-d9-kkke 99 1901
972149 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kkk-d9-kkke 89 1902
972159 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kkk-d9-kkke 82 1920
972169 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kkk-d9-kkke 92 1577
972179 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kkk-d9-kkke 85 1326
972189 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kkk-d9-kkke 94 1934
972199 N/A N/A 8334 8349 AACACATCATTGGGTT kkk-d9-kkke 58 496
[表35] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
904763 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kkk-d10-kkk 98 1095
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969060 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA k-d10-kekek 82 1909
969070 N/A N/A 8364 8379 TTATACCAGTGTCTTC k-d10-kekek 82 1938
969080 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT k-d10-kekek 90 1925
969090 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG k-d10-kekek 71 1905
969110 N/A N/A 6546 6561 CAGATGGGTACTTCTG k-d9-kekeke 23 341
969120 N/A N/A 8827 8842 TTTAAACTCAGGTGAC k-d9-kekeke 43 1675
969130 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG k-d9-kekeke 51 677
969140 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG k-d9-kekeke 94 1899
969150 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kek-d9-eekk 89 13
969160 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kek-d9-eekk 96 1577
969170 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kek-d9-eekk 94 80
969180 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d10-keke 96 1909
969190 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d10-keke 63 1910
969200 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d10-keke 73 1911
969210 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d10-keke 98 413
969230 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d8-eeeekk 78 411
969240 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d8-eeeekk 76 80
969250 N/A N/A 5852 5867 TGTAAGTGCAACCAAT kk-d8-kekekk 43 955
969260 N/A N/A 8741 8756 CTATTAGAGGGCTAGT kk-d8-kekekk 25 1674
969270 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d8-kekekk 43 1900
969280 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d8-kekekk 34 356
969290 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kk-d8-kekekk 52 243
969300 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d8-kekekk 57 1730
969310 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d9-eeekk 63 1411
969320 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d9-eeekk 94 1183
969340 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d9-eeekk 99 1095
969350 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d9-eeekk 96 1890
969360 N/A N/A 5413 5428 TATTCTCATGGTACAG kk-d9-eeekk 71 1915
969370 N/A N/A 8322 8337 GGTTATGAAATTATTG kk-d9-eeekk 61 1930
969380 2253 2268 14344 14359 TCCGTCAATATATTCT kk-d9-eeekk 96 1897
969390 N/A N/A 7924 7939 TGGGAATTATGGAATT kk-d9-eeekk 63 1929
969400 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d9-ekeke 66 1411
969410 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d9-ekeke 95 1183
969430 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d9-ekeke 97 1095
969440 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d9-ekeke 98 1890
969450 2738 2753 14829 14844 ATGCTAATTTTCTGAC kk-d9-ekeke 95 1912
969460 N/A N/A 8166 8181 GGCATTCAGAATTTCC kk-d9-ekeke 93 1913
969470 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d9-kdkdk 69 1479
969480 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d9-kdkdk 94 1924
969500 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d9-kdkdk 86 1887
969510 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d9-kdkdk 57 426
971920 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d9-kekek 91 1909
971930 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d9-kekek 82 1910
971940 972 987 13063 13078 GTAAGTATTGCCAGCT kk-d9-kekek 53 1933
971950 N/A N/A 6550 6565 ATATCAGATGGGTACT kk-d9-kekek 21 620
971960 N/A N/A 8746 8761 TAATTCTATTAGAGGG kk-d9-kekek 34 220
971970 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d9-kekek 76 677
971980 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d9-kekek 83 76
972000 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kkk-d8-kdkdk 66 1887
972010 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kkk-d8-kdkdk 48 426
972020 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kkk-d8-kekek 90 1901
972030 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kkk-d8-kekek 56 1902
972040 N/A N/A 8832 8847 GAAGCTTTAAACTCAG kkk-d8-kekek 47 1397
972050 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC kkk-d8-kekek 59 1230
972060 N/A N/A 8368 8383 CACTTTATACCAGTGT kkk-d8-kekek 11 1908
972070 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC kkk-d8-kekek 37 243
972080 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kkk-d8-kekek 65 1730
972090 971 986 13062 13077 TAAGTATTGCCAGCTA kkk-d9-keke 78 1918
972100 N/A N/A 6703 6718 TGTATTTCTTGATGTG kkk-d9-keke 71 1926
972110 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kkk-d9-keke 85 1920
972120 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kkk-d9-keke 98 1900
972130 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kkk-d9-keke 58 426
972140 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kkk-d9-kkke 44 607
972150 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kkk-d9-kkke 89 1922
972160 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kkk-d9-kkke 80 13
972170 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kkk-d9-kkke 88 481
972190 N/A N/A 5855 5870 TTTTGTAAGTGCAACC kkk-d9-kkke 98 1164
972200 N/A N/A 8367 8382 ACTTTATACCAGTGTC kkk-d9-kkke 58 1941
[表36] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
904766 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kkk-d10-kkk 97 1577
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 99 413
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 93 1899
969061 N/A N/A 5852 5867 TGTAAGTGCAACCAAT k-d10-kekek 81 955
969071 N/A N/A 8741 8756 CTATTAGAGGGCTAGT k-d10-kekek 28 1674
969081 2340 2355 14431 14446 GTTCTAACTCTTGGGC k-d10-kekek 28 243
969091 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC k-d10-kekek 92 1249
969111 N/A N/A 6700 6715 ATTTCTTGATGTGGTG k-d9-kekeke 81 343
969131 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC k-d9-kekeke 60 1900
969141 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG k-d9-kekeke 77 76
969151 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kek-d9-eekk 88 1911
969161 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kek-d9-eekk 91 481
969171 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kek-d9-eekk 77 1326
969181 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d10-keke 97 1900
969191 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d10-keke 77 356
969201 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kk-d10-keke 70 1480
969211 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kk-d10-keke 89 1905
969221 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kk-d8-eeeekk 95 81
969231 N/A N/A 6701 6716 TATTTCTTGATGTGGT kk-d8-eeeekk 96 1904
969241 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA kk-d8-eeeekk 88 151
969251 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC kk-d8-kekekk 62 1230
969261 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d8-kekekk 25 150
969271 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d8-kekekk 54 1025
969281 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d8-kekekk 51 1914
969291 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kk-d8-kekekk 71 1283
969301 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kk-d8-kekekk 85 1899
969311 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d9-eeekk 83 1901
969321 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d9-eeekk 77 1902
969331 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d9-eeekk 93 1920
969341 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d9-eeekk 92 1577
969351 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d9-eeekk 70 1326
969361 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kk-d9-eeekk 98 1934
969371 N/A N/A 8334 8349 AACACATCATTGGGTT kk-d9-eeekk 43 496
969381 2342 2357 14433 14448 CTGTTCTAACTCTTGG kk-d9-eeekk 93 383
969391 N/A N/A 8166 8181 GGCATTCAGAATTTCC kk-d9-eeekk 97 1913
969401 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d9-ekeke 90 1901
969411 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d9-ekeke 87 1902
969421 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d9-ekeke 92 1920
969431 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d9-ekeke 91 1577
969441 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d9-ekeke 25 1326
969451 N/A N/A 5414 5429 TTATTCTCATGGTACA kk-d9-ekeke 51 1927
969461 N/A N/A 8239 8254 GTGAGTATTGTTTTTG kk-d9-ekeke 93 1928
969471 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d9-kdkdk 65 1411
969481 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d9-kdkdk 82 1183
969501 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d9-kdkdk 99 1095
969511 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d9-kdkdk 92 1890
971921 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kk-d9-kekek 80 1900
971931 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kk-d9-kekek 74 356
971941 1035 1050 13126 13141 CTGAAGATTGGCTCTG kk-d9-kekek 45 1939
971951 N/A N/A 6704 6719 GTGTATTTCTTGATGT kk-d9-kekek 95 1940
971961 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kk-d9-kekek 48 1327
971971 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d9-kekek 81 1887
971981 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d9-kekek 50 426
971991 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kkk-d8-kdkdk 74 1920
972001 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kkk-d8-kdkdk 71 1095
972011 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kkk-d8-kdkdk 87 1890
972021 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kkk-d8-kekek 54 607
972031 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kkk-d8-kekek 55 1922
972041 N/A N/A 8308 8323 TGGTTCAAAAGCAGCA kkk-d8-kekek 57 1048
972051 N/A N/A 5860 5875 GGCAGTTTTGTAAGTG kkk-d8-kekek 32 123
972061 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kkk-d8-kekek 41 1396
972071 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG kkk-d8-kekek 88 1283
972081 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d8-kekek 56 1899
972091 1034 1049 13125 13140 TGAAGATTGGCTCTGG kkk-d9-keke 54 1931
972101 N/A N/A 6819 6834 AACGCAATGCTGACTT kkk-d9-keke 83 1919
972121 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kkk-d9-keke 49 1095
972131 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kkk-d9-keke 94 1890
972141 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kkk-d9-kkke 96 1909
972151 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kkk-d9-kkke 85 1910
972161 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kkk-d9-kkke 49 1911
972171 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d9-kkke 98 413
972191 N/A N/A 5859 5874 GCAGTTTTGTAAGTGC kkk-d9-kkke 76 1647
972201 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kkk-d9-kkke 70 1396
[表37] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 100 413
905139 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kkk-d10-kkk 94 1905
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 94 1899
969062 N/A N/A 5856 5871 GTTTTGTAAGTGCAAC k-d10-kekek 92 1230
969072 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG k-d10-kekek 42 150
969082 2736 2751 14827 14842 GCTAATTTTCTGACTG k-d10-kekek 98 1283
969092 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC k-d10-kekek 67 1730
969102 N/A N/A 8828 8843 CTTTAAACTCAGGTGA k-d9-kekeke 70 151
969112 N/A N/A 6816 6831 GCAATGCTGACTTGGC k-d9-kekeke 45 1903
969132 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT k-d9-kekeke 51 1887
969142 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA k-d9-kekeke 36 426
969152 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kek-d9-eekk 87 1480
969162 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kek-d9-eekk 99 413
969172 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kek-d9-eekk 93 81
969182 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d10-keke 81 1025
969192 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d10-keke 84 1914
969202 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kk-d10-keke 87 1925
969212 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kk-d10-keke 40 1249
969222 969 984 13060 13075 AGTATTGCCAGCTAAG kk-d8-eeeekk 59 1479
969232 N/A N/A 6817 6832 CGCAATGCTGACTTGG kk-d8-eeeekk 68 1924
969252 N/A N/A 6546 6561 CAGATGGGTACTTCTG kk-d8-kekekk 10 341
969262 N/A N/A 8827 8842 TTTAAACTCAGGTGAC kk-d8-kekekk 16 1675
969272 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d8-kekekk 84 1917
969282 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kk-d8-kekekk 26 80
969292 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kk-d8-kekekk 34 677
969302 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kk-d8-kekekk 86 76
969312 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d9-eeekk 86 607
969322 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d9-eeekk 90 1922
969332 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d9-eeekk 86 13
969342 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d9-eeekk 67 481
969362 N/A N/A 5855 5870 TTTTGTAAGTGCAACC kk-d9-eeekk 99 1164
969372 N/A N/A 8367 8382 ACTTTATACCAGTGTC kk-d9-eeekk 91 1941
969382 2738 2753 14829 14844 ATGCTAATTTTCTGAC kk-d9-eeekk 88 1912
969392 N/A N/A 8239 8254 GTGAGTATTGTTTTTG kk-d9-eeekk 92 1928
969402 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d9-ekeke 79 607
969412 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d9-ekeke 89 1922
969422 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d9-ekeke 82 13
969432 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d9-ekeke 73 481
969452 N/A N/A 5451 5466 GTGTTATATTTGATCC kk-d9-ekeke 96 1934
969462 N/A N/A 8323 8338 GGGTTATGAAATTATT kk-d9-ekeke 88 1935
969472 2735 2750 14826 14841 CTAATTTTCTGACTGT kk-d9-kdkdk 84 1901
969482 N/A N/A 8163 8178 ATTCAGAATTTCCACT kk-d9-kdkdk 79 1902
969492 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d9-kdkdk 86 1920
969502 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d9-kdkdk 95 1577
969512 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d9-kdkdk 74 1326
971922 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kk-d9-kekek 69 1025
971932 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kk-d9-kekek 89 1914
971942 2253 2268 14344 14359 TCCGTCAATATATTCT kk-d9-kekek 94 1897
971952 N/A N/A 6820 6835 GAACGCAATGCTGACT kk-d9-kekek 78 1888
971972 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA kk-d9-kekek 98 1095
971982 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT kk-d9-kekek 86 1890
971992 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kkk-d8-kdkdk 23 13
972002 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kkk-d8-kdkdk 93 1577
972012 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kkk-d8-kdkdk 78 80
972022 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kkk-d8-kekek 92 1909
972032 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kkk-d8-kekek 86 1910
972042 972 987 13063 13078 GTAAGTATTGCCAGCT kkk-d8-kekek 73 1933
972052 N/A N/A 6550 6565 ATATCAGATGGGTACT kkk-d8-kekek 28 620
972062 N/A N/A 8746 8761 TAATTCTATTAGAGGG kkk-d8-kekek 41 220
972072 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG kkk-d8-kekek 70 677
972082 N/A N/A 8321 8336 GTTATGAAATTATTGG kkk-d8-kekek 79 76
972092 2252 2267 14343 14358 CCGTCAATATATTCTT kkk-d9-keke 97 1936
972102 N/A N/A 7923 7938 GGGAATTATGGAATTG kkk-d9-keke 63 1596
972122 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kkk-d9-keke 92 1577
972132 N/A N/A 8743 8758 TTCTATTAGAGGGCTA kkk-d9-keke 91 80
972142 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kkk-d9-kkke 98 1900
972152 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kkk-d9-kkke 78 356
972162 1033 1048 13124 13139 GAAGATTGGCTCTGGC kkk-d9-kkke 70 1480
972172 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kkk-d9-kkke 88 1905
972182 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kkk-d9-kkke 72 1327
972192 N/A N/A 6549 6564 TATCAGATGGGTACTT kkk-d9-kkke 69 550
[表38] 靶向SEQ ID NO: 1和2的去氧、MOE和cEt缺口體對APOL1 mRNA的抑制
化合物編號 SEQ ID: 1 起始位點 SEQ ID: 1 終止位點 SEQ ID: 2 起始位點 SEQ ID: 2 終止位點 序列 化學 % 抑制 SEQ ID NO
905095 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kkk-d10-kkk 99 413
905469 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kkk-d10-kkk 94 1730
905491 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG kkk-d10-kkk 93 1899
969063 N/A N/A 6546 6561 CAGATGGGTACTTCTG k-d10-kekek 44 341
969073 N/A N/A 8827 8842 TTTAAACTCAGGTGAC k-d10-kekek 45 1675
969083 N/A N/A 5412 5427 ATTCTCATGGTACAGG k-d10-kekek 83 677
969093 N/A N/A 8237 8252 GAGTATTGTTTTTGTG k-d10-kekek 90 1899
969103 968 983 13059 13074 GTATTGCCAGCTAAGG k-d9-kekeke 70 1410
969113 N/A N/A 7920 7935 AATTATGGAATTGCAG k-d9-kekeke 55 1923
969123 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT k-d9-kekeke 52 1920
969133 N/A N/A 5854 5869 TTTGTAAGTGCAACCA k-d9-kekeke 95 1095
969143 N/A N/A 8366 8381 CTTTATACCAGTGTCT k-d9-kekeke 92 1890
969153 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kek-d9-eekk 93 1925
969163 N/A N/A 6818 6833 ACGCAATGCTGACTTG kek-d9-eekk 91 1905
969183 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d10-keke 92 1917
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969213 N/A N/A 8164 8179 CATTCAGAATTTCCAC kk-d10-keke 84 1730
969223 1032 1047 13123 13138 AAGATTGGCTCTGGCT kk-d8-eeeekk 55 1411
969233 N/A N/A 7921 7936 GAATTATGGAATTGCA kk-d8-eeeekk 95 1183
969253 N/A N/A 6700 6715 ATTTCTTGATGTGGTG kk-d8-kekekk 69 343
969273 N/A N/A 6547 6562 TCAGATGGGTACTTCT kk-d8-kekekk 62 411
969293 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kk-d8-kekekk 46 1887
969303 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kk-d8-kekekk 20 426
969313 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d9-eeekk 96 1909
969323 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d9-eeekk 39 1910
969333 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d9-eeekk 63 1911
969343 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d9-eeekk 97 413
969363 N/A N/A 5859 5874 GCAGTTTTGTAAGTGC kk-d9-eeekk 79 1647
969373 N/A N/A 8745 8760 AATTCTATTAGAGGGC kk-d9-eeekk 73 1396
969383 N/A N/A 5414 5429 TTATTCTCATGGTACA kk-d9-eeekk 48 1927
969393 N/A N/A 8323 8338 GGGTTATGAAATTATT kk-d9-eeekk 77 1935
969403 N/A N/A 5448 5463 TTATATTTGATCCTCA kk-d9-ekeke 96 1909
969413 N/A N/A 8320 8335 TTATGAAATTATTGGT kk-d9-ekeke 74 1910
969423 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kk-d9-ekeke 49 1911
969433 N/A N/A 6702 6717 GTATTTCTTGATGTGG kk-d9-ekeke 96 413
969453 N/A N/A 5452 5467 CGTGTTATATTTGATC kk-d9-ekeke 76 1906
969463 N/A N/A 8335 8350 CAACACATCATTGGGT kk-d9-ekeke 80 1907
969473 N/A N/A 5411 5426 TTCTCATGGTACAGGA kk-d9-kdkdk 89 607
969483 N/A N/A 8236 8251 AGTATTGTTTTTGTGG kk-d9-kdkdk 72 1922
969493 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kk-d9-kdkdk 73 13
969503 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kk-d9-kdkdk 78 481
971923 N/A N/A 5857 5872 AGTTTTGTAAGTGCAA kk-d9-kekek 81 1917
971933 N/A N/A 8742 8757 TCTATTAGAGGGCTAG kk-d9-kekek 52 150
971943 2342 2357 14433 14448 CTGTTCTAACTCTTGG kk-d9-kekek 88 383
971953 N/A N/A 7924 7939 TGGGAATTATGGAATT kk-d9-kekek 87 1929
971963 N/A N/A 8830 8845 AGCTTTAAACTCAGGT kk-d9-kekek 87 1920
971973 N/A N/A 5858 5873 CAGTTTTGTAAGTGCA kk-d9-kekek 91 1577
971983 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kk-d9-kekek 46 1326
971993 970 985 13061 13076 AAGTATTGCCAGCTAA kkk-d8-kdkdk 54 1911
972003 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kkk-d8-kdkdk 79 481
972013 N/A N/A 8744 8759 ATTCTATTAGAGGGCT kkk-d8-kdkdk 78 1326
972023 N/A N/A 5449 5464 GTTATATTTGATCCTC kkk-d8-kekek 66 1900
972033 N/A N/A 8332 8347 CACATCATTGGGTTAT kkk-d8-kekek 58 356
972043 1035 1050 13126 13141 CTGAAGATTGGCTCTG kkk-d8-kekek 36 1939
972053 N/A N/A 6704 6719 GTGTATTTCTTGATGT kkk-d8-kekek 84 1940
972063 N/A N/A 8831 8846 AAGCTTTAAACTCAGG kkk-d8-kekek 16 1327
972073 N/A N/A 5450 5465 TGTTATATTTGATCCT kkk-d8-kekek 59 1887
972083 N/A N/A 8333 8348 ACACATCATTGGGTTA kkk-d8-kekek 32 426
972093 2341 2356 14432 14447 TGTTCTAACTCTTGGG kkk-d9-keke 88 313
972103 N/A N/A 8165 8180 GCATTCAGAATTTCCA kkk-d9-keke 84 1937
972113 N/A N/A 8306 8321 GTTCAAAAGCAGCATT kkk-d9-keke 85 13
972123 N/A N/A 6548 6563 ATCAGATGGGTACTTC kkk-d9-keke 85 481
972133 N/A N/A 8829 8844 GCTTTAAACTCAGGTG kkk-d9-keke 82 81
972143 N/A N/A 5853 5868 TTGTAAGTGCAACCAA kkk-d9-kkke 78 1025
972153 N/A N/A 8365 8380 TTTATACCAGTGTCTT kkk-d9-kkke 80 1914
972163 2251 2266 14342 14357 CGTCAATATATTCTTT kkk-d9-kkke 95 1925
972173 N/A N/A 7922 7937 GGAATTATGGAATTGC kkk-d9-kkke 65 1249
972183 N/A N/A 8307 8322 GGTTCAAAAGCAGCAT kkk-d9-kkke 74 978
972193 N/A N/A 6703 6718 TGTATTTCTTGATGTG kkk-d9-kkke 87 1926
實例 2 A431細胞中的人類APOL1的劑量依賴性反義抑制
選擇從實例1展示顯著APOL1 mRNA體外抑制的缺口體,並且在A431細胞中以不同劑量進行測試。在一系列具有類似培養條件的實驗中對該等反義寡核苷酸進行測試。將每個實驗的結果呈現在如下所示的單獨的表中。
將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的3-10-3 cEt缺口體自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量PCSK9 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表39] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 19 60 83 93 0.2
903830 54 85 95 97 < 0.1
903862 49 69 88 93 < 0.1
903894 41 67 87 94 0.1
904119 49 70 82 85 < 0.1
904758 36 63 83 92 0.1
904760 75 93 99 99 < 0.1
904823 50 74 85 91 < 0.1
905142 32 74 90 95 0.1
905143 52 76 92 97 < 0.1
905270 44 78 90 94 < 0.1
905271 44 66 86 91 0.1
905398 59 82 94 96 < 0.1
905462 42 73 90 95 0.1
905463 42 67 85 94 0.1
905494 51 73 84 91 < 0.1
905654 57 74 92 94 < 0.1
905655 61 80 90 94 < 0.1
[表40] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 15 58 82 88 0.3
903544 46 72 87 92 < 0.1
904026 62 88 96 98 < 0.1
904058 62 83 94 98 < 0.1
904121 50 78 86 90 < 0.1
904216 32 64 78 82 0.2
904761 19 46 78 92 0.3
905114 36 73 88 91 0.1
905144 35 50 75 82 0.2
905146 42 71 87 97 0.1
905401 52 79 89 94 < 0.1
905402 57 82 94 96 < 0.1
905496 29 68 90 93 0.1
905497 78 91 95 96 < 0.1
905498 60 84 94 94 < 0.1
905657 47 67 84 93 0.1
905688 25 71 86 92 0.2
905689 68 87 93 94 < 0.1
905690 57 78 88 92 < 0.1
[表41] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 10 57 83 92 0.3
903644 35 72 85 92 0.1
903996 50 79 88 97 < 0.1
904027 28 61 81 88 0.2
904443 54 84 96 98 < 0.1
904444 74 91 96 98 < 0.1
904763 70 91 97 98 < 0.1
904764 47 84 95 99 < 0.1
904828 79 92 97 97 < 0.1
905020 46 73 90 95 < 0.1
905147 37 71 87 93 0.1
905148 22 60 83 94 0.2
905276 29 63 83 92 0.2
905370 8 46 74 84 0.4
905371 38 67 86 94 0.1
905372 59 82 92 95 < 0.1
905468 40 67 87 94 0.1
905499 72 87 92 93 < 0.1
905691 53 77 85 92 < 0.1
[表42] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 12 56 81 92 0.3
903613 47 68 81 88 < 0.1
903805 28 58 75 82 0.2
903998 56 86 93 96 < 0.1
904029 34 58 79 88 0.2
904030 45 78 92 96 < 0.1
904253 46 74 85 92 < 0.1
904766 96 98 99 99 < 0.1
904829 41 75 84 89 0.1
905021 38 73 90 95 0.1
905022 47 76 92 97 < 0.1
905149 38 65 85 93 0.1
905277 24 50 80 92 0.3
905373 74 93 98 99 < 0.1
905404 27 58 77 88 0.2
905501 29 67 86 92 0.1
905565 20 49 73 89 0.3
905757 18 56 78 86 0.3
905758 26 65 85 92 0.2
[表43] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 36 64 85 94 0.1
903807 46 78 90 95 < 0.1
903872 38 72 88 94 0.1
903999 32 66 83 91 0.1
904000 90 98 99 100 < 0.1
904001 95 99 100 100 < 0.1
904063 24 65 81 89 0.2
904223 47 75 84 89 < 0.1
904224 60 86 91 94 < 0.1
904254 35 62 82 86 0.1
904862 9 49 64 89 0.4
905086 28 55 80 89 0.2
905120 70 90 97 98 < 0.1
905374 48 70 80 88 < 0.1
905407 38 67 86 93 0.1
905408 23 61 83 92 0.2
905471 59 82 86 86 < 0.1
905600 52 81 94 98 < 0.1
905631 32 52 71 83 0.2
[表44] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 17 59 83 91 0.2
903874 44 70 87 95 0.1
903939 64 87 94 97 < 0.1
904002 53 82 92 97 < 0.1
904003 47 76 90 96 < 0.1
904034 41 70 88 94 0.1
904226 77 95 98 99 < 0.1
904675 80 95 99 99 < 0.1
905121 64 87 93 95 < 0.1
905123 62 85 92 95 < 0.1
905473 47 61 65 61 < 0.1
905475 43 71 90 96 0.1
905505 58 87 95 97 < 0.1
905601 49 79 92 96 < 0.1
905633 51 81 92 94 < 0.1
905634 54 82 91 96 < 0.1
905665 30 76 91 94 0.1
905697 51 78 92 96 < 0.1
905698 85 97 99 99 < 0.1
[表45] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 73 85 92 95 < 0.1
903940 64 83 92 96 < 0.1
904101 74 85 92 94 < 0.1
904102 75 88 94 96 < 0.1
904420 22 40 58 62 0.8
904452 78 88 93 96 < 0.1
904484 76 87 92 96 < 0.1
904515 43 72 85 91 0.1
904517 78 89 92 93 < 0.1
905028 63 82 90 93 < 0.1
905029 85 88 93 96 < 0.1
905093 58 82 91 95 < 0.1
905094 95 99 99 99 < 0.1
905476 54 85 95 97 < 0.1
905477 78 93 96 98 < 0.1
905510 65 84 90 94 < 0.1
905636 17 45 69 78 0.4
905667 41 65 82 89 0.1
905700 75 88 92 95 < 0.1
[表46] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 68 81 90 95 < 0.1
903976 80 90 95 97 < 0.1
904103 61 79 87 91 < 0.1
904104 85 92 95 97 < 0.1
904264 72 81 85 85 < 0.1
904424 41 75 91 95 0.1
904680 74 87 94 96 < 0.1
904743 46 68 86 93 0.1
904744 82 92 97 98 < 0.1
904840 66 81 89 93 < 0.1
904871 64 75 90 95 < 0.1
904872 68 82 93 96 < 0.1
904968 53 78 89 94 < 0.1
905031 38 66 83 89 0.1
905032 53 78 89 93 < 0.1
905095 83 95 97 98 < 0.1
905479 82 89 94 95 < 0.1
905511 54 75 87 90 < 0.1
905704 61 84 93 96 < 0.1
[表47] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 21 63 83 93 0.2
904009 35 68 88 95 0.1
904041 67 88 95 97 < 0.1
904202 24 62 77 88 0.2
904425 84 97 99 99 < 0.1
904426 37 72 90 95 0.1
904522 37 73 86 94 0.1
904619 49 83 94 98 < 0.1
904681 28 62 86 94 0.2
904713 23 53 72 82 0.3
904745 58 83 94 97 < 0.1
904746 75 92 98 99 < 0.1
904778 54 80 92 96 < 0.1
904873 50 80 93 97 < 0.1
904969 35 71 88 95 0.1
905128 42 70 83 88 0.1
905418 42 78 90 95 < 0.1
905513 38 73 90 95 0.1
905706 32 70 84 89 0.1
[表48] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 12 55 80 90 0.3
903820 56 85 94 98 < 0.1
903821 63 89 97 98 < 0.1
904523 40 72 90 95 0.1
904716 33 63 85 92 0.1
904717 53 82 93 97 < 0.1
904718 39 73 88 95 0.1
904747 47 79 91 94 < 0.1
904748 60 83 93 95 < 0.1
905036 52 77 91 95 < 0.1
905292 46 75 91 95 < 0.1
905419 41 71 84 88 0.1
905422 19 59 88 97 0.2
905485 32 61 80 92 0.2
905580 35 71 89 96 0.1
905581 39 70 89 95 0.1
905582 19 65 86 94 0.2
905707 50 76 89 91 < 0.1
905867 33 67 84 92 0.1
[表49] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 15 56 79 91 0.3
903825 72 89 94 95 < 0.1
903856 68 75 89 N/A < 0.1
904209 61 89 96 96 < 0.1
904210 65 90 97 98 < 0.1
904720 31 70 92 95 0.1
905456 48 85 91 94 < 0.1
905457 45 70 84 89 < 0.1
905520 36 68 96 97 0.1
905521 30 65 88 97 0.1
905712 25 60 86 94 0.2
905808 37 74 90 92 0.1
[表50] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 9 59 85 94 0.3
903826 47 81 93 97 < 0.1
903956 48 74 88 94 < 0.1
904082 56 84 93 95 < 0.1
904083 82 95 97 98 < 0.1
904084 83 96 98 98 < 0.1
904114 48 71 86 89 < 0.1
904211 62 88 96 98 < 0.1
904212 79 93 97 98 < 0.1
904242 33 61 81 89 0.2
904626 25 55 82 93 0.2
904627 86 93 99 99 < 0.1
904628 67 90 98 99 < 0.1
905139 54 83 94 97 < 0.1
905140 35 71 88 95 0.1
905490 66 85 91 92 < 0.1
905491 74 91 95 96 < 0.1
905586 35 63 81 88 0.1
905684 57 86 95 97 < 0.1
還將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。人類引物探針組HTS7376(正向序列GGCAGCCTTGTACTCTTGGAA,在本文指定為SEQ ID NO: 1942;反向序列GCTGGTAATCCCGGTCAAAG,在本文指定為SEQ ID NO: 1943;探針序列CTGGGATGGAGTTGGGAATCACAGCCX,在本文指定為SEQ ID NO: 1944)用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表51] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 73 84 90 95 < 0.1
903807 59 83 91 95 < 0.1
903872 69 76 86 90 < 0.1
903999 76 85 93 94 < 0.1
904000 83 94 96 97 < 0.1
904001 95 97 98 98 < 0.1
904063 71 83 89 92 < 0.1
904223 38 48 63 74 0.3
904224 83 91 93 95 < 0.1
904254 28 50 72 72 0.3
904862 0 30 55 74 1.0
905086 8 32 65 72 0.7
905120 79 88 94 96 < 0.1
905374 59 67 77 82 < 0.1
905407 62 83 88 93 < 0.1
905408 68 82 90 94 < 0.1
905471 37 55 64 47 0.4
905600 73 88 93 97 < 0.1
905631 19 39 51 69 0.8
[表52] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 71 83 91 95 < 0.1
903874 27 52 76 87 0.2
903939 82 92 96 97 < 0.1
904002 39 65 81 91 0.1
904003 62 82 90 94 < 0.1
904034 55 74 87 90 < 0.1
904226 60 85 91 93 < 0.1
904675 81 94 98 99 < 0.1
905121 78 89 93 95 < 0.1
905123 83 92 95 96 < 0.1
905473 82 86 86 88 < 0.1
905475 72 83 91 95 < 0.1
905505 42 73 87 91 0.1
905601 49 76 89 95 < 0.1
905633 40 72 84 86 0.1
905634 53 76 88 91 < 0.1
905665 61 79 89 93 < 0.1
905697 34 70 84 88 0.1
905698 91 97 99 99 < 0.1
[表53] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 64 83 91 94 < 0.1
903501 65 82 95 95 < 0.1
903543 65 80 92 95 < 0.1
903596 100 84 91 95 < 0.1
903639 37 35 62 61 0.6
903991 22 42 44 44 > 4.0
903997 25 54 77 85 0.2
904055 39 47 76 89 0.2
904509 51 45 52 43 0.1
904629 30 58 83 86 0.2
905005 32 48 63 63 0.4
905015 39 58 72 81 0.1
905019 34 63 78 86 0.1
905037 42 63 69 75 0.1
905111 3 44 36 70 1.2
905141 14 50 76 92 0.3
905269 38 58 84 92 0.1
905469 56 81 90 95 < 0.1
905685 54 76 95 95 < 0.1
[表54] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
62.5 nM 250 nM 1,000 nM 4,000 nM
793406 18 54 78 84 0.3
903545 51 68 75 86 < 0.1
903557 30 54 65 72 0.3
903558 55 69 70 83 < 0.1
903564 57 65 64 79 < 0.1
903572 40 60 82 90 0.1
903573 48 66 65 80 < 0.1
903574 29 44 58 56 0.8
903585 40 66 63 70 0.1
903587 37 43 58 81 0.3
903595 56 72 79 88 < 0.1
903597 51 60 69 66 < 0.1
903598 28 27 65 62 0.8
903599 31 58 64 79 0.2
903600 43 61 61 79 0.1
903606 57 73 84 91 < 0.1
903607 55 69 85 82 < 0.1
903639 17 0 23 39 > 4.0
905037 0 21 3 37 > 4.0
在另一個測定中,將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表55] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
4.8 nM 19.5 nM 78.1 nM 312.5 nM 1,250 nM 5,000 nM
793406 0 0 24 53 75 87 0.2
793444 0 0 4 21 31 53 0.9
903822 49 0 27 53 74 88 0.2
904082 1 14 57 87 91 90 0.1
904101 5 15 28 67 80 86 0.2
904226 11 22 71 94 98 99 0.1
904628 8 21 59 87 96 98 0.1
904763 13 17 46 85 95 98 0.1
905032 17 16 60 87 95 97 0.1
[表56] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
4.8 nM 19.5 nM 78.1 nM 312.5 nM 1,250 nM 5,000 nM
905139 0 0 48 82 91 96 0.2
905373 10 20 74 93 98 99 0.1
905469 11 0 38 73 88 96 0.2
905505 18 27 74 94 96 98 0.1
905521 13 2 35 75 88 95 0.2
905633 20 38 79 96 98 99 0.1
905634 14 22 60 90 96 98 0.1
905665 0 15 40 74 88 94 0.1
905758 31 0 30 61 85 89 0.2
在另一個測定中,將細胞以每孔11,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表57] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
8 nM 40 nM 200 nM 1000 nM 5000 nM
969157 kek-d9-eekk 0 31 83 98 99 0.07
969162 kek-d9-eekk 20 70 98 99 99 0.02
969210 kk-d10-keke 12 64 96 98 99 0.03
969361 kk-d9-eeekk 13 52 94 98 99 0.04
969408 kk-d9-ekeke 10 53 91 98 99 0.04
969433 kk-d9-ekeke 8 58 92 96 96 0.03
969437 kk-d9-ekeke 14 47 91 97 98 0.04
969502 kk-d9-kdkdk 5 41 87 95 95 0.05
971997 kkk-d8-kdkdk 1 34 79 93 94 0.07
972002 kkk-d8-kdkdk 12 57 86 92 92 0.04
972116 kkk-d9-keke 14 53 90 96 96 0.04
972139 kkk-d9-kkke 20 59 94 99 99 0.03
972163 kkk-d9-kkke 20 65 94 96 96 0.02
972190 kkk-d9-kkke 19 38 84 97 99 0.05
972268 kkk-d10-kkk 15 42 81 91 93 0.05
在另一個測定中,將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表58] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
905095 kkk-d10-kkk 39 87 98 99 < 0.01
905491 kkk-d10-kkk 37 66 88 94 0.03
905634 kkk-d10-kkk 31 55 86 94 0.04
969064 k-d10-kekek 22 50 80 91 0.1
969084 k-d10-kekek 26 56 78 92 0.1
969164 kek-d9-eekk 23 63 90 97 0.05
969194 kk-d10-keke 26 56 81 92 0.1
969204 kk-d10-keke 11 47 82 94 0.1
969214 kk-d10-keke 33 75 91 96 0.02
969314 kk-d9-eeekk 2 31 67 89 0.1
969354 kk-d9-eeekk 15 48 76 92 0.1
969404 kk-d9-ekeke 8 37 69 64 0.2
969474 kk-d9-kdkdk 15 44 76 93 0.1
971944 kk-d9-kekek 25 59 84 93 0.05
971984 kk-d9-kekek 21 38 69 89 0.1
972014 kkk-d8-kdkdk 18 54 81 93 0.1
972044 kkk-d8-kekek 30 57 84 94 0.04
972124 kkk-d9-keke 50 80 96 97 < 0.01
972144 kkk-d9-kkke 15 60 87 94 0.1
[表59] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
905095 kkk-d10-kkk 38 88 98 99 < 0.01
969155 kek-d9-eekk 13 42 69 87 0.1
969175 kk-d10-keke 6 35 67 85 0.1
969185 kk-d10-keke 10 59 87 96 0.1
969205 kk-d10-keke 18 46 74 90 0.1
969254 kk-d8-kekekk 5 12 44 80 0.3
969345 kk-d9-eeekk 8 38 84 96 0.1
969355 kk-d9-eeekk 21 60 86 94 0.1
969434 kk-d9-ekeke 6 23 59 80 0.2
969435 kk-d9-ekeke 23 62 89 97 0.05
969475 kk-d9-kdkdk 9 38 68 89 0.1
971925 kk-d9-kekek 44 77 92 96 < 0.01
971995 kkk-d8-kdkdk 23 61 84 93 0.1
972004 kkk-d8-kdkdk 24 59 82 86 0.1
972104 kkk-d9-keke 16 47 74 90 0.1
972146 kkk-d9-kkke 45 78 95 98 < 0.01
972165 kkk-d9-kkke 2 46 76 87 0.1
972174 kkk-d9-kkke 5 25 64 82 0.2
972194 kkk-d9-kkke 3 24 54 80 0.2
[表60] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
905095 kkk-d10-kkk 63 94 99 99 < 0.01
969056 k-d10-kekek 29 50 70 87 0.1
969076 k-d10-kekek 14 46 80 92 0.1
969086 k-d10-kekek 24 58 86 96 0.1
969156 kek-d9-eekk 0 37 76 90 0.1
969157 kek-d9-eekk 37 71 91 98 0.02
969186 kk-d10-keke 11 44 80 93 0.1
969206 kk-d10-keke 33 59 81 92 0.04
969226 kk-d8-eeeekk 0 30 61 87 0.2
969316 kk-d9-eeekk 10 49 79 93 0.1
969336 kk-d9-eeekk 20 35 65 85 0.1
969406 kk-d9-ekeke 25 53 79 91 0.1
972046 kkk-d8-kekek 26 46 68 88 0.1
972096 kkk-d9-keke 24 66 89 95 0.04
972116 kkk-d9-keke 35 72 90 95 0.03
972166 kkk-d9-kkke 17 48 72 88 0.1
972176 kkk-d9-kkke 21 56 85 93 0.1
972186 kkk-d9-kkke 36 70 92 96 0.02
972196 kkk-d9-kkke 33 73 90 92 0.03
[表61] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
904082 kkk-d10-kkk 38 62 87 93 0.03
905095 kkk-d10-kkk 63 93 98 99 < 0.01
969087 k-d10-kekek 0 52 79 91 0.1
969127 k-d9-kekeke 0 46 78 90 0.1
969187 kk-d10-keke 17 38 75 86 0.1
969207 kk-d10-keke 36 46 78 91 0.1
969217 kk-d10-keke 14 41 74 92 0.1
969337 kk-d9-eeekk 35 62 81 92 0.03
969347 kk-d9-eeekk 38 72 91 96 0.02
969377 kk-d9-eeekk 41 68 85 91 0.02
969437 kk-d9-ekeke 40 78 92 97 0.02
969457 kk-d9-ekeke 36 65 83 92 0.03
969467 kk-d9-ekeke 20 58 84 92 0.1
971967 kk-d9-kekek 20 41 75 90 0.1
971997 kkk-d8-kdkdk 40 66 85 93 0.02
972027 kkk-d8-kekek 17 61 80 89 0.1
972097 kkk-d9-keke 21 67 89 97 0.05
972147 kkk-d9-kkke 34 61 83 92 0.04
972197 kkk-d9-kkke 43 69 88 94 0.02
[表62] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
904619 kkk-d10-kkk 24 50 84 93 0.1
905095 kkk-d10-kkk 74 94 99 100 < 0.01
969158 kek-d9-eekk 31 40 70 89 0.1
969167 kek-d9-eekk 14 43 64 84 0.1
969178 kk-d10-keke 27 56 80 93 0.1
969198 kk-d10-keke 31 53 79 92 0.1
969318 kk-d9-eeekk 37 78 94 98 0.02
969358 kk-d9-eeekk 28 61 86 96 0.04
969368 kk-d9-eeekk 39 72 91 97 0.02
969388 kk-d9-eeekk 18 51 79 91 0.1
969407 kk-d9-ekeke 8 30 61 86 0.2
969408 kk-d9-ekeke 36 66 90 96 0.03
969428 kk-d9-ekeke 40 41 71 90 0.1
969448 kk-d9-ekeke 33 61 86 96 0.04
969458 kk-d9-ekeke 19 40 74 92 0.1
969477 kk-d9-kdkdk 16 34 72 85 0.1
969497 kk-d9-kdkdk 3 28 59 75 0.2
971987 kkk-d10-kkk 8 17 51 80 0.2
972178 kkk-d9-kkke 19 54 78 91 0.1
[表63] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
905095 kkk-d10-kkk 65 94 99 99 < 0.01
969159 kek-d9-eekk 21 46 84 96 0.1
969169 kek-d9-eekk 22 41 69 89 0.1
969208 kk-d10-keke 25 53 84 89 0.1
969219 kk-d10-keke 16 35 66 87 0.1
969289 kk-d8-kekekk 3 36 70 88 0.1
969328 kk-d9-eeekk 19 40 61 85 0.1
969338 kk-d9-eeekk 13 34 72 90 0.1
969359 kk-d9-eeekk 24 61 84 93 0.05
969389 kk-d9-eeekk 20 42 77 92 0.1
969398 kk-d9-ekeke 14 41 62 86 0.1
969449 kk-d9-ekeke 43 64 83 92 0.02
969469 kk-d9-kdkdk 25 63 83 94 0.05
969479 kk-d9-kdkdk 40 71 91 96 0.02
969498 kk-d9-kdkdk 10 40 71 87 0.1
969508 kk-d9-kdkdk 17 34 70 88 0.1
971969 kk-d9-kekek 28 63 86 92 0.04
972118 kkk-d9-keke 10 42 70 87 0.1
972139 kkk-d9-kkke 35 69 88 96 0.03
[表64] 使用去氧、 MOE cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
15.6 nM 62.5 nM 250 nM 1,000 nM
905095 kkk-d10-kkk 68 93 99 99 < 0.01
969160 kek-d9-eekk 39 73 92 96 0.02
969180 kk-d10-keke 7 38 74 92 0.10
969210 kk-d10-keke 59 89 97 99 < 0.01
969229 kk-d8-eeeekk 4 23 80 91 0.10
969340 kk-d9-eeekk 23 60 87 98 0.05
969350 kk-d9-eeekk 12 46 74 92 0.10
969380 kk-d9-eeekk 27 59 84 93 0.05
969409 kk-d9-ekeke 22 48 80 93 0.10
969419 kk-d9-ekeke 8 25 58 84 0.20
969429 kk-d9-ekeke 17 41 71 85 0.10
969430 kk-d9-ekeke 29 59 83 96 0.05
969440 kk-d9-ekeke 29 60 82 95 0.04
972069 kkk-d8-kekek 25 55 84 93 0.10
972119 kkk-d9-keke 15 41 73 83 0.10
972120 kkk-d9-keke 32 65 88 96 0.03
972129 kkk-d9-keke 9 42 75 85 0.10
972189 kkk-d9-kkke 32 63 84 91 0.04
972190 kkk-d9-kkke 38 71 93 98 0.02
實例 3 BALB/c 小鼠中靶向人 APOL1 的修飾的寡核苷酸的耐受性
BALB/c小鼠係多重目的的小鼠模型,頻繁用於安全性和功效測試。用從以上描述的研究中選擇的反義寡核苷酸治療小鼠,並且評估不同血漿化學標記物的水平中的變化。 治療
用200 mg/kg的修飾的寡核苷酸對6至7週齡雄性小鼠組皮下注射一次。一組雄性BALB/c小鼠注射PBS。在單劑量之後72-96小時,使小鼠安樂死,並且收穫血漿用於進一步分析。 研究1
為評估修飾的寡核苷酸對肝功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(貝克曼庫爾特公司(Beckman Coulter)AU480,佈雷亞(Brea),加利福尼亞州)測量轉胺酶的血漿水平。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的轉胺酶的水平變化的修飾的寡核苷酸在進一步研究中排除。化合物ID 793406、903807、903822、903853、904016、904063、904082、904084、904101、904212、904223、904224、904226、904424、904426、904443、904444、904619、904627、904628、904763、904766、905031、905032、905036、905095、905121、905123、905139、905141、905143、905146、905147、905269、905373、905408、905418、905469、905471、905491、905496、905505、905510、905511、905521、905581、905582、905633、905634、905636、905654、905655、905665、905684、905688、905690、905697、905700、905758和905867在此研究中被認為係可耐受的,並且被選擇用於進一步評估。 研究2
在第二個研究中,為評估修飾的寡核苷酸對肝功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(貝克曼庫爾特公司(Beckman Coulter)AU480,佈雷亞(Brea),加利福尼亞州)測量轉胺酶的血漿水平。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的轉胺酶的水平變化的修飾的寡核苷酸在進一步研究中排除。化合物ID 969157、969160、969162、969210、969214、969231、969318、969347、969361、969362、969408、969433、969437、969479、969501、969502、971925、971973、971997、972002、972116、972139、972163、972190、972268和972288在此研究中被認為係可耐受的,並且被選擇用於進一步評估。 實例 4 在轉基因小鼠模型中 hAPOL1 的反義抑制的作用
使用福斯質粒ABC12-49114000M18(消化以產生僅含有具有5 Kb上游和12 Kb下游的APOL1基因的的31.6 Kb片段)開發轉基因小鼠模型。藉由原核注射將基因片段插入來自C57BL/6NTAc小鼠的卵子中以產生兩個創始系。系1用於本文描述的實驗。人類APOL1轉錄物主要在肝中可檢測到,hAPOL1蛋白在該等小鼠的血漿中可穩健地檢測到。在該模型中評估了修飾的寡核苷酸的功效。
將轉基因小鼠保持在12小時光暗循環,並以任意量餵養正常的Purina小鼠食物。在開始實驗之前,動物在研究設備中適應至少7天。在緩衝鹽水(PBS)中製備反義寡核苷酸(ASO)並通過0.2微米過濾器過濾滅菌。將寡核苷酸溶解於PBS中用於注射。 研究1
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組2-4隻小鼠的組。各組接受以25 mg/kg,每週三次的劑量皮下注射修飾的寡核苷酸,持續一週,總共3劑量。一組小鼠接受25 mg/kg,每週三次的劑量皮下注射對照寡核苷酸549148(GGCTACTACGCCGTCA,指定為SEQ ID NO: 1948;3-10-3 cEt缺口體,沒有已知靶標),持續一週,總共3劑量。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週三次,持續一週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。
在第7天,處死動物並從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。在類似條件下進行兩個單獨的實驗,並在單獨的表中呈現。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。 [表65] 相對於PBS對照,轉基因小鼠中3-10-3 cEt缺口體對APOL1的抑制百分比
化合物ID %抑制(肝) %抑制(腎)
549148 15 5
793406 83 29
903853 82 37
904016 64 21
904063 49 0
904082 93 46
904212 69 24
904223 66 10
904224 65 15
904226 89 28
904424 59 13
904426 43 27
904443 75 16
904444 65 26
904627 96 50
904628 77 43
905031 86 15
905032 92 38
905036 80 23
905141 90 1
905143 75 0
905146 76 20
905147 79 0
905269 54 8
905373 86 46
905408 78 10
905418 67 20
905471 87 32
905496 71 21
905505 95 16
905511 92 40
905521 86 31
905581 55 6
905582 51 0
905633 79 32
905636 22 0
905655 63 18
905688 81 3
905690 74 21
905697 81 7
905758 85 44
905867 83 31
[表66] 相對於PBS對照,轉基因小鼠中3-10-3 cEt缺口體對APOL1的抑制百分比
化合物ID %抑制(肝) %抑制(腎)
549148 10 7
793406 73 37
903807 51 32
903822 93 50
904084 87 43
904619 86 48
904763 88 56
904766 82 65
905095 92 69
904101 58 47
905121 93 66
905123 74 49
905139 87 51
905469 83 56
905491 95 69
905510 95 61
905634 60 46
905654 53 40
905665 85 47
905684 52 33
905700 79 45
研究2
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組4隻小鼠的組。各組接受以25 mg/kg,每週兩次的劑量皮下注射修飾的寡核苷酸,持續1週,總共3劑量。一組小鼠接受以25 mg/kg,每週三次的劑量皮下注射對照寡核苷酸549148,持續一週,總共3劑量。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週三次,持續1週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。
在第7天,處死動物並從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現測量的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。 [表67] 相對於PBS對照,轉基因小鼠中缺口體對APOL1的抑制百分比
化合物ID 化學 %抑制(肝) %抑制(腎)
549148 kkk-d10-kkk 2 0
793406 kkk-d10-kkk 88 32
969157 kek-d9-eekk 85 41
969160 kek-d9-eekk 78 41
969162 kek-d9-eekk 92 56
969210 kk-10-keke 88 35
969214 kk-d10-keke 89 45
969231 kk-d8-eeeekk 57 29
969318 kk-d9-eeekk 64 17
969347 kk-d9-eeekk 75 22
969361 kk-9-eeekk 61 38
969362 kk-d9-eeekk 74 21
969408 kk-d9-ekeke 84 40
969433 kk-d9-ekeke 84 37
969437 kk-d9-ekeke 94 44
969479 kk-d9-kdkdk 74 23
969501 kk-d9-kdkdk 80 30
969502 kk-9-kdkdk 83 43
971925 kk-d9-kekek 78 39
971973 kk-d9-kekek 82 26
971997 kkk-d8-kdkdk 76 36
972002 kkk-d8-kdkdk 81 54
972116 kkk-d9-keke 80 46
972139 kkk-d9-kkke 88 56
972163 kkk-d9-kkke 91 52
972190 kkk-d9-kkke 90 46
972268 kkk-d10-kkk 50 46
972288 kkk-d10-kkk 64 28
研究3:反義抑制APOL1對蛋白尿小鼠的作用
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組3-4隻小鼠的組。各組接受以50 mg/kg,每週一次的劑量皮下注射修飾的寡核苷酸972190,持續4週。一組小鼠接受以50 mg/kg,每週一次的劑量皮下注射對照寡核苷酸549148,持續4週。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週一次,持續4週。在最後一次寡核苷酸劑量後一天,以1.125 x 10 7U/kg給予單劑量的IFNγ,以誘導小鼠的蛋白尿。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。
收集尿並在IFNγ給予後48小時處死動物。從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現測量的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。還如下表所示的,與給藥IFNγ的對照動物相比,用972190治療導致尿白蛋白和血漿ALT水平顯著降低。結果表明,用靶向APOL1的修飾的寡核苷酸治療保護APOL1轉基因小鼠免於蛋白尿並且降低血漿ALT水平的升高。 [表68] 相對於PBS對照,轉基因小鼠中缺口體情況下APOL1的表現百分比
治療 IFNγ治療
PBS 179 120
549148 76 133
140 142
972190 41 7
47 3
[表68] 相對於對照,轉基因小鼠中缺口體對APOL1抑制的作用
治療 IFNγ治療 尿白蛋白(µg/mg肌酸酐) 血漿ALT(IU/L)
PBS 41 163
727 211
549148 77 207
980 225
972190 56 63
50 61
實例 5 CD1 小鼠中靶向 hAPOL1 的修飾的寡核苷酸的耐受性。
CD1®小鼠(查理斯河實驗室(Charles River),麻塞諸塞州)係多重目的的小鼠模型,頻繁用於安全性和功效測試。用從以上描述的研究中選擇的3-10-3 cEt缺口體寡核苷酸治療小鼠,並且評估不同血漿化學標記物的水平的變化。 治療
將7-8週齡雄性CD1小鼠的組用25 mg/kg的ISIS寡核苷酸每週兩次(50 mg/kg/週劑量)進行皮下注射持續六週。將一組雄性CD1小鼠用PBS每週兩次進行皮下注射持續6週。在最後給藥之後48小時,使小鼠安樂死,並且收穫器官和血漿用於進一步分析。在類似條件下進行兩個單獨的研究,並在每個終點分析的單獨的表中呈現。 研究1 血漿化學標記物
為評估ISIS寡核苷酸對肝和腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(貝克曼庫爾特公司(Beckman Coulter)AU480,佈雷亞(Brea),加利福尼亞州)測量轉胺酶、白蛋白、膽紅素、肌酸酐、和BUN的血漿水平。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝或腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表68] 在第6週CD1小鼠血漿中的血漿化學標記物
化合物ID ALT(IU/L) AST(IU/L) 白蛋白(g/dL) BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) T.Bil(mg/dL)
PBS 26 43 2.7 21.3 0.05 0.3
793406 42 75 2.6 21.7 0.04 0.3
903853 413 470 2.5 22.8 0.06 0.3
904082 33 54 2.6 21.4 0.07 0.2
904226 40 74 2.4 21.1 0.05 0.2
904627 1122 1245 2.4 19.6 0.06 0.2
904628 41 75 2.5 22.5 0.02 0.2
905032 106 84 2.5 23.6 0.04 0.2
905373 81 88 2.4 22.4 0.05 0.1
905505 62 88 2.2 21.1 0.05 0.1
905511 303 159 2.2 20.3 0.05 0.1
905521 120 117 2.5 22.0 0.06 0.1
905633 31 40 2.5 23.1 0.06 0.1
905758 68 92 2.3 19.0 0.04 0.1
905867 168 199 2.3 24.0 0.03 0.1
血液測定
將從所有小鼠組獲得的血液送至IDEXX BioResearch進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC、淋巴細胞、單核細胞和血小板。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表69] CD1小鼠中的血液標記物
化合物ID HCT(%) LYM(10 3/µL) MON(10 3/µL) PLT(10 3/µL) RBC(10 6/µL) WBC(10 3/µL)
PBS 43 4.4 0.2 1225 9.3 5.5
793406 44 5.7 0.4 892 9.6 7.5
903853 44 5.9 0.4 673 9.1 7.4
904082 41 5.4 0.3 1009 9.0 6.5
904226 41 4.3 0.3 624 9.2 5.2
904627 44 3.8 0.5 764 9.3 6.1
904628 42 2.7 0.1 765 9.2 4.0
905032 38 2.3 0.2 861 8.1 3.1
905373 42 4.7 0.4 922 8.8 6.1
905505 39 4.4 0.3 1252 8.3 6.1
905511 44 7.0 0.7 858 9.2 9.9
905521 42 3.1 0.3 734 8.8 4.1
905633 44 3.6 0.3 853 9.4 4.6
905758 40 3.2 0.3 628 8.5 4.0
905867 40 5.0 0.5 833 8.6 7.3
研究2 血漿化學標記物
為評估ISIS寡核苷酸對肝和腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量轉胺酶、膽紅素、肌酸酐、和BUN的血漿水平。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝或腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表70] 在第6週CD1小鼠血漿中的血漿化學標記物
化合物ID ALT(IU/L) AST(IU/L) 白蛋白(g/dL) BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) T.Bil(mg/dL)
PBS 248 213 2.7 21.3 0.11 0.19
793444 51 73 2.4 23.4 0.11 0.14
903822 68 171 2.6 23.8 0.13 0.15
904101 39 62 2.5 19.5 0.10 0.15
904619 590 466 2.1 17.2 0.06 0.14
904763 90 87 2.5 24.0 0.08 0.16
904766 297 262 2.3 19.3 0.07 0.16
905095 246 294 2.2 18.5 0.07 0.19
905139 92 95 2.4 18.3 0.09 0.16
905469 60 72 2.5 19.1 0.10 0.17
905491 972 989 1.9 22.4 0.06 0.20
905634 42 71 2.3 17.1 0.08 0.13
905665 182 118 2.1 20.8 0.07 0.13
血液測定
將從所有小鼠組獲得的血液送至IDEXX BioResearch進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC、淋巴細胞、單核細胞和血小板。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表71] CD1小鼠中的血液標記物
化合物ID HCT(%) LYM(10 3/µL) MON(10 3/µL) PLT(10 3/µL) RBC(10 6/µL) WBC(10 3/µL)
PBS 50 2.8 0.3 824 10.7 6.2
793444 46 3.0 0.2 831 10.5 4.0
903822 44 4.0 0.2 525 10.1 5.4
904101 47 7.7 0.9 733 10.3 10.9
904619 42 21.0 1.2 686 9.5 26.5
904763 49 3.5 0.2 950 11.2 4.3
904766 51 7.9 0.9 603 11.5 10.3
905095 46 8.2 0.7 645 10.2 11.2
905139 49 4.2 0.4 997 10.7 6.2
905469 52 4.2 0.2 614 11.8 5.4
905491 43 7.8 2.4 495 9.6 23.1
905634 43 3.2 0.3 716 9.6 4.2
905665 41 4.7 0.3 686 8.6 6.6
研究3 身體重量和器官重量
研究結束時評估ISIS寡核苷酸對測量的動物健康、體重和器官重量的作用。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何重量的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表72] 第6週時CD1小鼠血漿的體重和器官重量
體重
PBS 2.1 0.6 0.1 41.6
969157 2.4 0.6 0.2 39.0
969160 2.2 0.5 0.2 36.7
969162 2.2 0.6 0.2 40.8
969210 2.2 0.6 0.2 41.0
969214 2.1 0.6 0.2 41.0
969361 2.2 0.5 0.2 40.3
969408 2.4 0.6 0.2 42.4
969433 2.6 0.6 0.2 43.3
969437 2.5 0.6 0.2 41.3
969502 2.4 0.6 0.2 37.9
971925 2.5 0.7 0.2 41.5
971997 2.2 0.5 0.1 40.1
972002 2.7 0.5 0.2 40.4
972116 2.1 0.5 0.2 38.8
972139 2.4 0.5 0.2 40.3
972163 2.1 0.5 0.2 41.1
972190 2.3 0.6 0.1 41.0
972268 3.1 0.6 0.3 46.0
血漿化學標記物
為評估ISIS寡核苷酸對肝和腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(貝克曼庫爾特公司(Beckman Coulter)AU480,佈雷亞(Brea),加利福尼亞州)測量轉胺酶、白蛋白、膽紅素、肌酸酐、和BUN的血漿水平。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝或腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表73] 在第6週CD1小鼠血漿中的血漿化學標記物
ALT(IU/L) AST(IU/L) 白蛋白(g/dL) BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) T.Bil(mg/dL)
PBS 31 77 3.1 26.4 0.2 0.2
969157 818 1083 2.9 23.2 0.2 0.3
969160 482 715 2.8 22.4 0.2 0.2
969162 68 141 2.6 21.5 0.1 0.2
969210 87 166 2.6 25.5 0.2 0.2
969214 456 502 2.6 23.9 0.1 0.2
969361 70 147 2.8 23.0 0.1 0.2
969408 76 138 2.6 23.3 0.1 0.1
969433 84 136 2.6 20.0 0.1 0.2
969437 240 281 2.4 21.5 0.1 0.1
969502 184 217 2.7 23.1 0.1 0.1
971925 114 168 2.8 23.6 0.1 0.2
971997 52 101 2.9 22.1 0.1 0.1
972002 147 192 2.5 21.2 0.1 0.1
972116 75 107 3.0 21.1 0.1 0.1
972139 61 115 2.7 22.2 0.1 0.1
972163 86 124 3.0 20.4 0.1 0.2
972190 70 93 2.8 20.5 0.1 0.2
972268 41 79 2.6 19.1 0.1 0.1
血液測定
將從所有小鼠組獲得的血液送至IDEXX BioResearch進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC、淋巴細胞、單核細胞和血小板。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表74] CD1小鼠中的血液標記物
嗜中性粒細胞(%) WBC(K/µL) RBC(M/µL) 淋巴細胞(%) HCT(%) 血小板計數(K/µL) 淋巴細胞(/µL) 單核細胞(/µL)
PBS 16 4 10 54 47 1152 2185 144
969157 23 6 10 65 48 1338 4078 543
969160 20 13 10 69 46 974 7953 1425
696162 16 8 10 74 46 1002 6067 641
969210 20 7 10 70 48 920 5322 524
969214 17 5 10 69 44 1076 3781 687
969361 16 9 9 75 43 931 6617 599
969408 35 7 9 58 42 1069 4416 506
969433 25 6 10 70 46 1054 3900 182
969437 23 7 11 69 47 1316 4780 526
969502 14 8 10 75 44 1075 5845 651
971925 18 5 10 74 44 961 3529 312
971997 18 4 9 73 43 1216 2646 239
972002 27 7 9 67 41 1069 4781 286
972116 23 6 10 69 44 1141 4415 336
972139 19 5 9 77 37 877 3947 224
972163 10 6 10 81 43 925 5197 437
972190 15 7 10 77 47 1453 5281 400
972268 39 7 10 54 46 1468 3891 406
實例 6 在斯 - 道二氏大鼠中靶向 hAPOL1 的修飾的寡核苷酸的耐受性
斯-道二氏大鼠係用於安全性和功效測試的多重目的的模型。用來自以上實例中描述的研究中的3-10-3 cEt缺口體寡核苷酸治療大鼠,並且評估不同血漿化學標記物水平方面的變化。 治療
將雄性斯-道二氏大鼠保持在12小時光暗循環中,並以任意量餵養正常的Purina大鼠食物,飲食5001。用50 mg/kg的ISIS寡核苷酸皮下注射每組4隻的斯-道二氏大鼠,每週一次,持續6週。在最後給藥之後48小時,使大鼠安樂死,並且收穫器官和血漿用於進一步分析。在類似條件下進行了兩個獨立的研究。 研究1 肝功能
為評估ISIS寡核苷酸對肝功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量轉胺酶的血漿水平。測量ALT(丙胺酸轉胺酶)和AST(天冬胺酸轉胺酶)的血漿水平,並且將該等結果呈現在下表中,以IU/L表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表75] 在斯-道二氏大鼠中的肝功能標記物
化合物ID ALT(IU/L) AST(IU/L)
PBS 45 66
793406 31 56
904082 67 114
904226 125 251
904628 42 87
905032 195 293
905373 54 90
905505 66 94
905521 41 67
905633 83 114
905758 85 144
腎功能
為了評估ISIS寡核苷酸對腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量血尿素氮(BUN)和肌酸酐的血漿水平。結果呈現在下表中,以mg/dL表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表76] 在斯-道二氏大鼠中的腎功能標記物
化合物ID 白蛋白(g/dL) BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) T.Bil(mg/dL)
PBS 3.7 16.0 0.3 0.2
793406 2.9 23.1 0.4 0.2
904082 4.0 27.0 0.4 0.2
904226 2.8 26.6 0.4 0.2
904628 3.2 18.9 0.4 0.1
905032 3.5 21.0 0.5 0.2
905373 3.1 19.9 0.4 0.1
905505 3.4 18.2 0.4 0.2
905521 1.9 78.0 1.1 0.1
905633 3.3 20.6 0.4 0.1
905758 3.1 37.5 0.4 0.2
血液測定
將從所有大鼠組獲得的血液送至Antech Diagnostics進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC和總血紅蛋白含量。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表77] 在斯-道二氏大鼠中的血液標記物
化合物ID HCT(%) LYM(10 3/µL) MON(10 3/µL) EOS(10 3/µL) BAS(10 3/L NEU(10 3/L RET(10 3/L)
PBS 51 9 0.5 88 15 1.2 263
793406 47 14 2.1 101 53 3.3 156
904226 33 11 1.4 0 54 0.6 99
904628 42 21 3.0 18 167 1.3 176
905032 48 19 1.7 54 56 1.2 112
905373 43 19 1.4 18 49 0.9 216
905505 46 13 1.3 15 58 0.6 119
905521 44 11 1.3 17 24 2.5 37
905633 47 8 0.8 55 17 0.8 149
905758 50 24 3.7 37 74 2.1 128
[表78] 在斯-道二氏大鼠中的血液標記物
化合物ID MCH(pg) MCHC(g/dL) MCV(fL) PLT(10 3/µL) HGB RBC(10 6/µL) WBC(10 3/µL)
PBS 19 32 59 747 16 9 11
793406 18 33 55 625 15 9 20
904226 18 33 55 145 11 6 13
904628 18 32 55 220 13 8 26
905032 18 33 54 684 16 9 22
905373 17 32 55 619 14 8 21
905505 18 33 55 590 15 9 15
905521 17 34 52 799 15 9 15
905633 19 34 54 658 16 9 10
905758 18 33 53 559 17 10 30
器官重量
在研究結束時測量肝、脾和腎的重量,並且呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的器官重量的任何變化的ISIS寡核苷酸從進一步的研究中排除。 [表79] 器官重量(g)
化合物ID 肝(g) 腎(g) 脾(g)
PBS 14.8 2.7 0.8
793406 13.5 2.5 1.0
904082 13.8 3.6 1.7
904226 13.4 3.2 2.2
904628 15.6 2.7 3.2
905032 10.6 2.6 1.2
905373 14.7 2.4 1.9
905505 14.0 2.6 1.5
905521 11.7 3.4 0.8
905633 13.3 2.3 1.2
905758 12.9 2.7 2.1
研究2 肝功能
為評估ISIS寡核苷酸對肝功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量轉胺酶的血漿水平。測量ALT(丙胺酸轉胺酶)和AST(天冬胺酸轉胺酶)的血漿水平,並且將該等結果呈現在下表中,以IU/L表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表80] 在斯-道二氏大鼠中的肝功能標記物
化合物ID ALT(IU/L) AST(IU/L)
PBS 44 65
793444 59 89
903822 46 148
904101 55 89
904763 66 96
905139 212 447
905469 41 78
905634 135 112
905665 82 105
腎功能
為了評估ISIS寡核苷酸對腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量血尿素氮(BUN)和肌酸酐的血漿水平。結果呈現在下表中,以mg/dL表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表81] 在斯-道二氏大鼠中的腎功能標記物
化合物ID 白蛋白(g/dL) BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) T.Bil(mg/dL)
PBS 3.5 17.5 0.3 0.2
793444 3.3 18.7 0.3 0.2
903822 3.0 16.7 0.3 0.3
904101 3.5 21.4 0.4 0.2
904763 3.4 19.1 0.4 0.2
905139 4.0 21.0 0.4 2.5
905469 3.4 16.7 0.3 0.1
905634 3.5 19.3 0.4 0.2
905665 2.9 20.0 0.4 0.2
血液測定
將從所有大鼠組獲得的血液送至Antech Diagnostics進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC和總血紅蛋白含量。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。N.d.指示沒有測量該特定寡核苷酸的參數。 [表82] 在斯-道二氏大鼠中的血液標記物
化合物ID WBC(K/µL) RBC(M/µL) 淋巴細胞(/µL) HCT(%) 單核細胞(/µL) 血小板計數(K/µL)
PBS 11 8.4 7781 53 30 687
793444 16 9.5 n.d. 55 n.d. 559
903822 13 6.5 12446 40 462 670
904101 13 8.7 11510 51 35 680
904763 10 8.3 8612 49 n.d. 785
905139 20 7.9 14922 46 274 769
905469 12 7.8 n.d. 49 n.d. 592
905634 12 8.6 10853 51 0 668
905665 13 9.1 6794 56 79 814
器官重量
在研究結束時測量肝、脾和腎的重量,並且呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的器官重量的任何變化的ISIS寡核苷酸從進一步的研究中排除。 [表83] 器官重量(g)
化合物ID 肝(g) 腎(g) 脾(g)
PBS 18.7 3.0 0.9
793444 13.4 2.7 1.0
903822 16.0 3.2 2.9
904101 16.6 2.9 1.4
904763 18.0 2.6 1.2
905139 16.9 3.4 1.9
905469 18.4 2.9 1.9
905634 20.3 2.8 1.4
905665 16.5 3.0 1.4
研究3 肝功能
為評估ISIS寡核苷酸對肝功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量轉胺酶的血漿水平。測量ALT(丙胺酸轉胺酶)和AST(天冬胺酸轉胺酶)的血漿水平,並且將該等結果呈現在下表中,以IU/L表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何肝功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表84] 在斯-道二氏大鼠中的肝功能標記物
ALT(IU/L) AST(IU/L) 膽紅素(mg/dL)
PBS 34 58 0.2
969162 41 119 0.2
972139 35 94 0.2
972002 41 83 0.2
972163 37 81 0.2
972116 31 59 0.1
972190 62 93 0.1
972268 336 286 0.8
969408 104 132 0.2
969361 240 386 0.4
969433 31 99 0.1
971997 50 84 0.2
969210 32 87 0.2
腎功能
為了評估ISIS寡核苷酸對腎功能的影響,使用自動臨床化學分析儀(日立奧林巴斯AU400e,梅爾維爾,紐約)測量血尿素氮(BUN)和肌酸酐的血漿水平。結果呈現在下表中,以mg/dL表示。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何腎功能標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。 [表85] 斯-道二氏大鼠中腎標記物的血漿水平
BUN(mg/dL) 肌酸酐(mg/dL) 白蛋白(g/dL)
PBS 17 0.2 3.3
969162 21 0.3 2.8
972139 67 0.8 2.8
972002 23 0.3 2.7
972163 19 0.3 2.9
972116 19 0.3 2.9
972190 19 0.3 3.0
972268 16 0.3 3.0
969408 19 0.3 3.2
969361 24 0.4 2.8
969433 21 0.3 2.7
971997 21 0.3 2.9
969210 19 0.3 3.1
[表86] 斯-道二氏大鼠中腎標記物的尿水平
肌酸酐(mg/dL) 蛋白(mg/dL) 蛋白/肌酸酐比率
PBS 121 113 1.0
969162 101 452 4.2
972139 61 283 4.0
972002 110 895 7.4
972163 96 394 4.0
972116 105 405 3.8
972190 109 261 2.4
972268 52 214 4.1
969408 51 147 3.0
969361 48 255 5.2
969433 51 224 4.3
971997 67 268 4.3
969210 86 338 3.9
血液測定
將從所有大鼠組獲得的血液送至Antech Diagnostics進行血細胞比容(HCT)測量和分析,以及測量各種血細胞,例如WBC、RBC和總血紅蛋白含量。結果呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的任何血液標記物的水平變化的ISIS寡核苷酸在進一步的研究中排除。N.d.指示沒有測量該特定寡核苷酸的參數。 [表87] 在斯-道二氏大鼠中的血液標記物
化合物ID WBC(K/µL) RBC(M/µL) 淋巴細胞(/µL) HCT(%) 單核細胞(/µL) 血小板計數(K/µL)
PBS 8 9 7035 51 252 725
969162 23 6 20273 36 2219 144
972139 20 6 16184 34 2500 427
972002 18 7 13972 43 1946 547
972163 25 8 22377 43 2302 556
972116 26 7 22581 42 1973 325
972190 9 8 8171 48 791 703
972268 20 8 16780 48 2237 737
969408 15 8 11733 46 1840 685
969361 32 7 25970 43 4802 230
969433 22 5 17649 31 2434 112
971997 24 7 20272 38 2077 458
969210 34 6 27724 37 3880 294
器官重量
在研究結束時測量肝、脾和腎的重量以及體重,並且呈現在下表中。將導致超出反義寡核苷酸的預期範圍的重量的任何變化的ISIS寡核苷酸從進一步的研究中排除。 [表88] 重量(g)
BW
PBS 17 3.1 0.8 412
969162 17 3.3 3.3 358
972139 16 4.5 2.8 322
972002 24 3.8 2.5 365
972163 16 3.1 2.2 351
972116 17 3.5 2.8 357
972190 16 3.0 1.4 342
972268 17 2.9 1.4 355
969408 15 2.6 1.4 359
969361 17 2.6 2.9 344
969433 20 4.0 4.1 365
971997 16 2.6 2.3 355
969210 16 3.5 2.7 378
實例 7 在轉基因小鼠模型中 hAPOL1 的劑量依賴性抑制
將以上描述的轉基因小鼠hAPOL1小鼠保持在12小時光暗循環,並以任意量餵養正常的Purina小鼠食物。在開始實驗之前,動物在研究設備中適應至少7天。在緩衝鹽水(PBS)中製備反義寡核苷酸(ASO)並通過0.2微米過濾器過濾滅菌。將寡核苷酸溶解於0.9% PBS中用於注射。 研究1
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組4隻小鼠的組。各組接受5、15或50 mg/kg,每週一次的劑量皮下注射3-10-3 cEt缺口體,持續四週,總共4劑量,如下表所示。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週一次,持續4週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。 RNA 分析
在最後給藥後48小時,處死小鼠並從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現測量的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。在類似條件下進行兩個單獨的實驗,並在單獨的表中呈現。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。 [表89] 相對於PBS對照,轉基因小鼠腎中hAPOL1 mRNA的抑制百分比(實驗1)
每週的劑量 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED 50(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL1
793406 0 20 35 > 50
793444 6 17 38 > 50
903822 1 21 32 > 50
904101 0 0 17 > 50
904763 7 20 49 > 50
905139 0 21 35 > 50
905469 11 25 50 > 50
905634 0 0 39 > 50
905665 0 23 39 > 50
[表90] 相對於PBS對照,轉基因小鼠肝中hAPOL1 mRNA的抑制百分比(實驗2)
每週的劑量 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED 50(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL
793406 6 68 92 11.8
793444 9 29 73 26.5
903822 24 78 95 8.5
904101 0 19 70 32.8
904763 36 83 92 6.8
905139 39 73 93 7.0
905469 39 75 96 9.3
905634 13 72 93 9.3
905665 2 71 92 10.5
研究2
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組4隻小鼠的組。各組接受5、15或50 mg/kg,每週一次的劑量皮下注射3-10-3 cEt缺口體,持續四週,總共4劑量,如下表所示。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週一次,持續4週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。 RNA 分析
在最後給藥後48小時,處死小鼠並從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現測量的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。在類似條件下進行兩個單獨的實驗,並在單獨的表中呈現。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。 [表91] 相對於PBS對照,轉基因小鼠腎中hAPOL1 mRNA的抑制百分比(實驗1)
每週的劑量 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED50(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL1
793406 22 42 51 40.6
904082 33 50 61 18.1
904226 17 36 59 31.7
904628 33 41 50 >50
905032 22 15 45 >50
905373 26 50 35 >50
905505 22 52 57 23.6
905521 25 46 53 21.4
905633 18 16 48 >50
905758 27 27 49 >50
[表92] 相對於PBS對照,轉基因小鼠肝中hAPOL1 mRNA的抑制百分比(實驗2)
每週的劑量 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED 50(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL1
793406 19 60 94 11.7
904082 54 81 94 4.4
904226 32 73 96 8.0
904628 57 70 91 3.7
905032 65 92 96 3.3
905373 39 84 35 >50
905505 28 83 92 7.6
905521 0 68 95 12.3
905633 0 18 79 21.9
905758 0 60 81 11.8
研究3
將hAPOL1轉基因小鼠分成每組4隻小鼠的組。各組接受1.5、5、15或50 mg/kg,每週一次的劑量皮下注射修飾的寡核苷酸,持續四週,總共4劑量,如下表所示。使一組小鼠接受PBS皮下注射,每週一次,持續4週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。 RNA 分析
在最後給藥後48小時,處死小鼠並從腎和肝中提取RNA用於hAPOL1 mRNA表現測量的即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照,用RIBOGREEN ®標準化的mRNA變化的百分比。如下表中所示的,與PBS對照相比,用反義寡核苷酸的治療導致hAPO1 mRNA的顯著降低。 [表93] 相對於PBS對照,轉基因小鼠腎中hAPOL1 mRNA的抑制百分比
每週的劑量 1.5 mg/kg 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED 40(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL1
793406 0 33 43 60 13.7
904763 19 29 52 62 9.3
905469 20 26 34 59 15.9
905505 28 23 45 47 >50
905634 9 16 27 45 >50
905665 12 30 45 56 13.2
972163 0 32 45 60 13.5
972190 13 27 46 57 13.1
[表94] 相對於PBS對照,轉基因小鼠肝中hAPOL1 mRNA的抑制百分比
每週的劑量 1.5 mg/kg 5 mg/kg 15 mg/kg 50 mg/kg ED 50(mg/kg/週)
化合物ID %抑制hAPOL1
793406 4 58 61 96 6.4
904763 17 42 72 93 5.4
905469 31 37 61 96 7.0
905505 15 45 78 95 5.7
905634 2 32 48 72 15.8
905665 3 43 79 91 5.4
972163 14 60 85 93 4.2
972190 18 48 83 92 5.1
實例 8 確認A431細胞中靶向APOL1的人類先導化合物的劑量依賴性反義抑制
選自上述研究的缺口體在A431細胞中以不同劑量進行測試。 研究1
將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表95] 使用 3-10-3 cEt 缺口體進行的多劑量測定
化合物編號 % 抑制 IC 50 µM
8 nM 40 nM 200 nM 1000 nM 5000 nM
905505 22 69 92 97 97 0.02
905373 13 55 92 98 98 0.03
905634 10 41 86 97 98 0.05
793406 6 15 53 84 93 0.19
905633 21 68 94 98 98 0.02
904763 11 37 81 96 97 0.06
研究2
將細胞以每孔10,000個細胞的密度鋪板,並用如下表所指定的不同濃度的反義寡核苷酸自由攝取轉染。在大約16小時的處理期之後,從細胞中分離RNA,並且藉由定量即時PCR測量APOL1 mRNA水平。將人類引物探針組RTS35962用於測量mRNA水平。如藉由RIBOGREEN ®的測量,根據總RNA含量調整APOL1 mRNA水平。將結果呈現為相對於未經處理的對照細胞的APOL1抑制百分比。
還呈現了每個寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC 50)。在反義寡核苷酸處理的細胞中APOL1 mRNA水平以劑量依賴性方式顯著降低。 [表96] 多劑量測定以確認先導化合物
化合物編號 化學 % 抑制 IC 50 µM
8 nM 40 nM 200 nM 1000 nM 5000 nM
793406 kkk-10-kkk 4 11 41 72 88 0.34
904763 kkk-10-kkk 6 23 63 93 98 0.12
905469 kkk-10-kkk 9 15 48 81 94 0.22
905505 kkk-10-kkk 0 35 81 95 98 0.07
905634 kkk-10-kkk 7 18 59 86 93 0.15
905665 kkk-10-kkk 7 11 56 82 93 0.19
972163 kkk-9-kkke 2 36 85 95 95 0.06
972190 kkk-9-kkke 2 24 69 94 99 0.10
實例 9 在食蟹猴中靶向人類 APOL1 ISIS 反義寡核苷酸的作用
用從以上實例中描述的研究中選擇的ISIS反義寡核苷酸治療食蟹猴。評估反義寡核苷酸的功效和可耐受性,以及肝和腎中它們的藥物動力學 曲線。據報導食蟹猴具有APOL1假基因。
所測試的人類反義寡核苷酸與食蟹猴基因組序列(從核苷酸15021761至15036414截短的基因庫登錄號NC_022281.1的互補體,本文指定為SEQ ID NO: 1949)具有交叉反應性。人類寡核苷酸與食蟹猴序列之間的互補性越高,人類寡核苷酸越有可能可以與食蟹猴序列交叉反應。SEQ ID NO: 1949的每種寡核苷酸的起始位點和終止位點呈現在下表中。「起始位點」指示缺口體所靶向的食蟹猴基因序列中的最5'核苷酸。「誤配」指示人類寡核苷酸沿其長度與食蟹猴基因序列誤配的核鹼基數目。 [表97] 與食蟹猴APOL1基因組序列(SEQ ID NO: 1949)互補的反義寡核苷酸
化合物ID 靶起始位點 誤配 化學 SEQ ID NO
793406 9979 1 kkk-d10-kkk 13
904763 8065 0 kkk-d10-kkk 1095
905469 9836 2 kkk-d10-kkk 1730
905505 9999 3 kkk-d10-kkk 76
905634 10424 2 kkk-d10-kkk 1326
905665 10821 3 kkk-d10-kkk 81
972190 8066 0 kkk-d9-kkke 1164
972163 15761, 16086 2 kkk-d9-kkke 1925
治療
在研究之前,將猴保持隔離,在此期間每天觀察該等動物的一般健康狀況。該等猴年齡係2-4歲,並且每個重2-4 kg。8組每組4隻隨機分配的雄性食蟹猴,每個給予30 mg/kg的修飾的寡核苷酸或PBS。每週一次,持續12週。一組猴每週一次接受一劑量鹽水,持續12週。將鹽水注射的組作為對照組,將寡核苷酸處理的組與其進行比較。在最後給藥之後大約48小時,處死猴並收集組織用於分析。
耐受性的評估基於臨床觀察、體重、食物消耗和臨床病理學。完成屍檢,進行記錄任何肉眼可見的異常。在第85天進行終末屍檢。記錄器官重量。此外,收集血液、CSF和組織(在屍檢時)用於毒代動力學評價。在該實例中描述的方案得到了研究機構動物護理和使用委員會(IACUC)的批准。 靶標減少 RNA 分析
從肝中提取RNA用於cynoAPOL1的mRNA表現的即時PCR分析。RTS35787(正向序列:CTCCTGCTGAGTGACCATAAAG(SEQ ID NO: 1945);反向序列:GGACTTCTTCGAGCCAGTTT(SEQ ID NO: 1946);探針序列:AGAGTGGTGGCTACTGCTGAACTG(SEQ ID NO: 1947))用於檢測食蟹猴APOL1。結果呈現為相對於鹽水對照,用猴親環素A標準化的mRNA變化的百分比。如下表中所示的,與一些寡核苷酸的PBS對照相比,用修飾的寡核苷酸治療導致食蟹猴APOL1 mRNA的減少。 [表98] 與PBS對照相比,食蟹猴APOL1的抑制
化合物ID 與食蟹猴序列的誤配 %抑制
793406 1 40
904763 0 74
905469 2 0
905505 3 0
905634 2 91
905665 3 0
972163 2 0
972190 0 93
可耐受性研究 身體重量和器官重量測量值
為評估ISIS寡核苷酸對該等動物的整體健康狀況的影響,測量體重和器官重量。第84天測量體重,並且呈現在下表中。安樂死後測量器官重量,並且還將數據呈現在下表中。該等結果表明用反義寡核苷酸治療對體重和器官重量的影響係在反義寡核苷酸的預期範圍內。具體地,就猴的體重和器官重量而言,用ISIS 972190治療係良好耐受的。 [表99] 用修飾的寡核苷酸處理12週後食蟹猴的體重和器官重量
體重(g) 心臟(g) 腎(g) 脾(g) 胸腺(g) 肝和膽囊(g)
PBS 2473 9.7 12.6 2.3 3.5 50
793406 2419 9.1 11.9 3.5 3.0 53
904763 2511 9.5 14.3 2.9 4.0 56
905469 2395 9.3 16.0 3.5 2.5 59
905505 2550 9.4 12.9 4.7 4.5 65
905634 2488 9.8 14.7 3.6 3.2 61
905665 2462 9.8 14.2 3.9 4.1 56
972163 2606 10.8 14.8 3.3 4.2 68
972190 2666 11.0 14.6 3.0 3.6 64
肝功能
為了評價ISIS寡核苷酸對肝功能的作用,從所有研究組收集血液樣品。在給藥後48 hr經由股靜脈穿刺收集血液樣品。在血液收集之前,使猴禁食過夜。將血液收集在含有K 2-EDTA抗凝劑的管中,將其離心以獲得血漿。使用Toshiba 200FR NEO化學分析儀(東芝公司,日本)測量各種肝功能標記物的水平。測量ALT和AST的血漿水平,並且將該等結果呈現在下表中,以IU/L表示。膽紅素(肝功能標記物)類似地測量並呈現在下表中,以mg/dL表示。該等結果表明反義寡核苷酸對肝功能沒有超過反義寡核苷酸的預期範圍的影響。具體地,就猴的肝功能而言,用ISIS 972190治療具有良好的耐受性。 [表100] 食蟹猴血漿中的肝功能標記物
ALT(IU/L) AST(IU/L) 膽紅素(mg/dL) 白蛋白(g/dL)
PBS 37 57 0.3 4.3
793406 59 55 0.3 4.3
904763 50 48 0.3 4.4
905469 54 68 0.2 3.9
905505 46 54 0.2 4.1
905634 566 417 0.5 4.1
905665 57 80 0.3 4.3
972163 58 81 0.2 4.1
972190 47 46 0.2 4.2
腎功能
為了評價ISIS寡核苷酸對腎功能的作用,從所有研究組收集血液樣品。在給藥後48 hr經由股靜脈穿刺收集血液樣品。在血液收集之前,使猴禁食過夜。將血液收集在含有K 2-EDTA抗凝劑的管中,將其離心以獲得血漿。使用Toshiba 200FR NEO化學分析儀(東芝公司,日本)測量BUN和肌酸酐的水平。結果呈現在下表中,以mg/dL表示。
在使用COBAS U 411分析儀,Combur 10 Test M尿棒(羅氏公司(Roche),德國)和Toshiba 120 FR自動化學分析儀(東芝公司(Toshiba Co.),日本)在處死前進行尿分析。測試尿中的鉀(U-K)、微量蛋白(UTP)、肌酸酐(UCRE)、白蛋白(UALB)、氯(Cl)、鈉(Na),並計算蛋白/肌酸酐比率(P/C)。結果呈現在下表中。
血漿和尿化學數據表明大多數ISIS寡核苷酸對腎功能不具有超過反義寡核苷酸預期範圍的任何影響。具體地,就猴的腎功能而言,用ISIS 972190治療具有良好的耐受性。 [表101] 食蟹猴中的血漿BUN和肌酸酐水平(mg/dL)
BUN 肌酸酐
鹽水 25 0.7
793406 24 1.0
904763 25 0.7
905469 28 0.8
905505 27 0.9
905634 27 1.0
905665 24 0.8
972163 30 0.8
972190 20 0.8
[表102] 食蟹猴中的尿水平
P/C (比率) 肌酸酐(mg/dL) 白蛋白(mg/dL)
鹽水 0.08 84 0.3
793406 0.14 71 1.7
904763 0.04 44 0.03
905469 0.10 52 0.2
905505 0.02 77 0.1
905634 0.06 106 0.5
905665 0.04 124 0.4
972163 0.01 69 0.2
972190 0.03 34 0.01
血液學
為評估在食蟹猴中ISIS寡核苷酸對血液學參數的任何影響,將從可用的研究動物中的每一種中採集的大約1.3 mL血液的血液樣品置於含有K 2-EDTA的管中。使用ADVIA120血液學分析儀(拜耳公司,美國)針對紅細胞(RBC)計數、白細胞(WBC)計數、各個白血細胞計數,例如單核細胞、中性粒細胞、淋巴細胞,並且針對血小板計數、血紅蛋白含量和血細胞比容對樣品進行分析。將數據呈現在下表中。
數據指示該等寡核苷酸沒有導致超出在這個劑量下的反義寡核苷酸的預期範圍的血液學參數的任何變化。具體地,就猴的血液參數的而言,用ISIS 972190治療具有良好的耐受性。 [表103] 食蟹猴中的血細胞計數
RBC (x 10 6/µL) 血小板 (x 10 3/µL) WBC (x 10 3/µL) 中性粒細胞(x 10 3/µL) 淋巴細胞(x 10 3/µL) 單核細胞(x 10 3/µL)
鹽水 5.9 380 8.7 2.5 5.8 0.2
793406 6.8 437 11.1 4.4 6.2 0.3
904763 6.1 412 10.6 5.2 5.0 0.2
905469 5.6 483 9.8 6.1 3.4 0.2
905505 5.8 400 13.2 5.5 7.0 0.4
905634 6.3 340 9.9 4.0 5.2 0.3
905665 6.0 440 8.3 2.8 5.0 0.2
972163 5.9 377 11.5 5.4 5.5 0.3
972190 6.0 392 10.5 4.5 5.6 0.3
[表104] 食蟹猴中的血液學參數
血紅蛋白(g/dL) HCT(%)
鹽水 14 44
793406 15 47
904763 14 45
905469 12 41
905505 13 42
905634 14 46
905665 13 43
972163 13 44
972190 13 43
C- 反應蛋白和 C3 活化
為了評價ISIS寡核苷酸在食蟹猴中的任何炎症效應,採集血液樣品用於分析。在血液收集之前,使猴禁食過夜。將來自每隻動物的大約1.5 mL的血液收集並放進沒有抗凝劑的管中,用於血清分離。將該等管在室溫下保持最少90 min,並然後在室溫下以3,000 rpm離心10 min以獲得血清。測量C3水平以評價由於寡核苷酸治療引起的任何補體活化。使用Toshiba 200FR NEO化學分析儀(東芝公司(Toshiba Co.),日本)測量在肝中合成並作為炎症標記物的C-反應蛋白(CRP)。結果表明用ISIS 972190治療不會引起猴的任何炎症。 [表105] 食蟹猴血漿中的C-反應蛋白水平(mg/L)
CRP
鹽水 1.7
793406 1.4
904763 2.4
905469 8.4
905505 4.1
905634 6.7
905665 10.7
972163 4.7
972190 9.5
寡核苷酸濃度分析
進行不同器官中每種反義寡核苷酸濃度的定量分析。大多數寡核苷酸在肝和腎中具有可接受的藥物動力學 特徵。 [表106] 反義寡核苷酸濃度(µg/g組織)
ISIS編號
793406 349 1253
904763 296 982
905469 288 2636
905505 547 1712
905634 516 2307
905665 392 942
972163 553 2054
972190 978 2654
大體上,該研究的該等結果表明ISIS 972190係那些所測試的化合物中用於抑制APOL1的最強效的並且耐受良好的化合物,並且是用於治療APOL1相關的疾病的重要的候選物。

          <![CDATA[<110>  美商IONIS製藥公司(Ionis Pharmaceuticals, Inc.)]]>
          <![CDATA[<120>  APOL1表現之調節劑]]>
          <![CDATA[<130>  BIOL0316US.L]]>
          <![CDATA[<150>  US62/674,865]]>
          <![CDATA[<151>  2018-05-22]]>
          <![CDATA[<160>  1949  ]]>
          <![CDATA[<170>  PatentIn版本3.5]]>
          <![CDATA[<210>  1]]>
          <![CDATA[<211>  2885]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  智人]]>
          <![CDATA[<400>  1]]>
          gactttcact ttccctttcg aattcctcgg tatatcttgg ggactggagg acctgtctgg       60
          ttattataca gacgcataac tggaggtggg atccacacag ctcagaacag ctggatcttg      120
          ctcagtctct gccaggggaa gattccttgg aggaggccct gcagcgacat ggagggagct      180
          gctttgctga gagtctctgt cctctgcatc tggatgagtg cacttttcct tggtgtggga      240
          gtgagggcag aggaagctgg agcgagggtg caacaaaacg ttccaagtgg gacagatact      300
          ggagatcctc aaagtaagcc cctcggtgac tgggctgctg gcaccatgga cccagagagc      360
          agtatcttta ttgaggatgc cattaagtat ttcaaggaaa aagtgagcac acagaatctg      420
          ctactcctgc tgactgataa tgaggcctgg aacggattcg tggctgctgc tgaactgccc      480
          aggaatgagg cagatgagct ccgtaaagct ctggacaacc ttgcaagaca aatgatcatg      540
          aaagacaaaa actggcacga taaaggccag cagtacagaa actggtttct gaaagagttt      600
          cctcggttga aaagtgagct tgaggataac ataagaaggc tccgtgccct tgcagatggg      660
          gttcagaagg tccacaaagg caccaccatc gccaatgtgg tgtctggctc tctcagcatt      720
          tcctctggca tcctgaccct cgtcggcatg ggtctggcac ccttcacaga gggaggcagc      780
          cttgtactct tggaacctgg gatggagttg ggaatcacag ccgctttgac cgggattacc      840
          agcagtacca tggactacgg aaagaagtgg tggacacaag cccaagccca cgacctggtc      900
          atcaaaagcc ttgacaaatt gaaggaggtg agggagtttt tgggtgagaa catatccaac      960
          tttctttcct tagctggcaa tacttaccaa ctcacacgag gcattgggaa ggacatccgt     1020
          gccctcagac gagccagagc caatcttcag tcagtaccgc atgcctcagc ctcacgcccc     1080
          cgggtcactg agccaatctc agctgaaagc ggtgaacagg tggagagggt taatgaaccc     1140
          agcatcctgg aaatgagcag aggagtcaag ctcacggatg tggcccctgt aagcttcttt     1200
          cttgtgctgg atgtagtcta cctcgtgtac gaatcaaagc acttacatga gggggcaaag     1260
          tcagagacag ctgaggagct gaagaaggtg gctcaggagc tggaggagaa gctaaacatt     1320
          ctcaacaata attataagat tctgcaggcg gaccaagaac tgtgaccaca gggcagggca     1380
          gccaccagga gagatatgcc tggcaggggc caggacaaaa tgcaaacttt tttttttttc     1440
          tgagacagag tcttgctctg tcgccaagtt ggagtgcaat ggtgcgatct cagctcactg     1500
          caagctctgc ctcccgtgtt caagcgattc tcctgccttg gcctcccaag tagctgggac     1560
          tacaggcgcc taccaccatg cccagctaat ttttgtattt ttaatagaga tggggtttca     1620
          ccatgttggc caggatggtc tcgatctcct gacctcttga tctgcccacc ttggcctccc     1680
          aaagtgctgg gattacaggc gtgagccatc gcttttgacc caaatgcaaa cattttatta     1740
          gggggataaa gagggtgagg taaagtttat ggaactgagt gttagggact ttggcatttc     1800
          catagctgag cacagcaggg gaggggttaa tgcagatggc agtgcagcaa ggagaaggca     1860
          ggaacattgg agcctgcaat aagggaaaaa tgggaactgg agagtgtggg gaatgggaag     1920
          aagcagttta ctttagacta aagaatatat tggggggccg ggtgtagtgg ctcatgcctg     1980
          taatccgagc actttgggag gccaaggcgg gcggatcacg aggtcaggag atcgagacca     2040
          tcctggctaa cacagtgaaa ccccgtctct actaaaaata caaaaaatta gccgggcatg     2100
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          agcgagactc catctcaaaa aaaaaaaaaa aaagaatata ttgacggaag aatagagagg     2280
          aggcttgaag gaaccagcaa tgagaaggcc aggaaaagaa agagctgaaa atggagaaag     2340
          cccaagagtt agaacagttg gatacaggag aagaaacagc ggctccacta cagacccagc     2400
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          ctttccagca tccactctcc cttgtcctcc tgggggcata tctcagtcag gcagcggctt     2520
          cctgatgatg gtcattgggg tggttgtcat gtgatgggtc ccctccaggt tactaaaggg     2580
          tgcatgtccc ctgcttgaac actgaagggc aggtggtggg ccatggccat ggtccccagc     2640
          tgaggagcag gtgtccctga gaacccaaac ttcccagaga gtatgtgaga accaaccaat     2700
          gaaaacagtc ccatcgctct tacccggtaa gtaaacagtc agaaaattag catgaaagca     2760
          gtttagcatt gggaggaagc tcagatctct agagctgtct tgtcgccgcc caggattgac     2820
          ctgtgtgtaa gtcccaataa actcacctac tcatcaagct ggaaaaaaaa aaaaaaaaaa     2880
          aaaaa                                                                 2885
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          agaaccagct actcaggagg ctgaggtggg gggatggctt aagcccaggg gtttgaagct       60
          gctgtgcgcg atgactgtgg cactgcaatt cagtcttggt gacagactga gaccctgtct      120
          caaaaacata accaaaataa ccccaacggc attacaataa atatacaata agcatccaca      180
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          gctgggaagt tgtgactttc actttccctt tcgaattcct cggtatatct tggggactgg      540
          aggacctgtc tggttattat acagacgcat aactggaggt gggatccaca cagctcagaa      600
          cagctggatc ttgctcagtc tctgccaggg gaagattcct tggtaagttg gggacagttg      660
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          gttcagatag acaggaaagt agcggcaaag cctggatttg cacccaggct tgagtctgat      780
          tgcttcccct ctcctgctgg gctcttaaac tatagagggt tggggaaaca gctcagatgg      840
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          ctgtggggaa actgaggccc tgggagcgga atgacttgcc cagggtcccg tgtcaggagg     1200
          ctgagcaggt agatcatagg actccacgtc tctggccctc acctctgtcc ctctgttcag     1260
          acttctgggg tgatggagaa gaaacaggct gtgctgtgtc cctaatggga aacgtggctg     1320
          agacagggga gtgagaaggg tgcgttgcag aatggtgcct gtggcatgat gccagctttg     1380
          caatcatgag attcaaaagc cacactgtgg aattgtgagt ataactacag gagtgagagc     1440
          ttagatctct gtgttcatag aaggagaatc aaacctggaa acttttggat tattaaaatc     1500
          aaacattttt gcttcaatat tagagtcaca agggcagatg ttggcctccc ctctgccctc     1560
          caagagctgt gtgactctgg gaaattcacc tcccctccca gcctgagtat tttcccctgt     1620
          aaaaaacctg atagagctgc caaaagtcca tgaaatcagg ggggtaattt ctgtgaaatc     1680
          tgagtcatgg tcttatttgt tcttcaccaa aaagagatga tgaagcctgt aaccccagtg     1740
          ctgtgggagg cagaggcggg aggatgactt gaggccagga gttcaagaca gcctgggaaa     1800
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          gtacctgtag tcccagctac tcagaaggtt gaaggaggcg gatcacttga gcccaacaga     1920
          tctaggctgc aatgagctag gatggtgtca aagccctgca gcctgggtga cagagcaaaa     1980
          ctgtttatta aaaactaaac gaaaggccgg gcgcggtggc tcacgcctgt aatcccagca     2040
          ctttgggagg ccaagacagg tggtcacgag gtcaggatat cgagaccatc ctggctaaca     2100
          tggtgaaacc ctgtctctac taaaaataca aaaaaattag ccgggtgtcg tggcgggcac     2160
          ctgtagtccc agctactcgg gaggctgagg caggagaatg gcgtgaaccc gggaggcaga     2220
          gcttgtagcg agcctagatc gccccactgc actccagcct gggtgataga gcgagactcc     2280
          atttcaaaaa aaaaatgaaa tgaaaatggt gatttctcag gaggagcaca ctgtctcaac     2340
          ccctcttttc ctgctcaagg aggaggccct gcagcgacat ggagggagct gctttgctga     2400
          gagtctctgt cctctgcatc tggtgagctt ggctcagagc cctgaggcgg gagggagggc     2460
          tccctgtctg ggctgcacaa ttggactggg cttgggctgg gccagggcca tctgggcttc     2520
          ttctaggaac caaagtcact tcccggaatt gaccaaccgg cagactcgcc cagggaggac     2580
          ccgctgtatc ctagttgagg ctaacggtca atatccggcc tcaatattca gcagaggctc     2640
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          cctcacaagt gtcgggggaa tccgaggcac cagctctctc taccctcctg ctcctctgct     2760
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          atctgtgtgt ctgaaccctg agacaaaggc aggaaaggga aagagggagg cgagtggctt     3060
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          atcttatttg taccctccct ctatctctcc tctccacctt ttcctaacat tctatcacca     3360
          gttttatgtc ttccattagc aactttgtag ctgtaaataa tttacttaca actttcatat     3420
          accctcagtt gtacccagta tttcttaact tccctcttta aaaaaatgat aatattaatc     3480
          ctccttctcc ttcgttcagt gcttcacatc ccaactgcta cctttgtgct ttaaattttg     3540
          tactaattgg tgttgataac aagtatattt agttctcata tttatatgtt gtgtatatgt     3600
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          gcatcttcat atactgctag tttgagtgtg aattggtaca atttgcctgc agtgtggctc     3720
          taggtataaa gccttttgag ttgttgatag cctctgacct gctcattcta ctcctacaaa     3780
          tatcttaagg aaataatctc aaatgtgggc aaagttttat gcgaagaagg atgttctttg     3840
          tagcataatt tatatgagga attagaaaca ccctgaggtc catcagctag ggaaagacag     3900
          cagaggggac agggcagcac caggagggct tggcagccac agcaggggct gggctggcat     3960
          ctggcaagat ccaggtcttt gtgggacaaa gaatcttaga gaagcaacgg ggacacaggc     4020
          tgtccagtgc agcaccagtg aattcaccaa gatgaagagt tgagcacaga gtgtgagaca     4080
          aggatttgca atgaggagtc atttaccatg agcgtgtata catgactcaa tattgtatat     4140
          ttaagggagt agagcacagt cattgaaaac atggggttga agcagaagtc ctggctctag     4200
          cactattgta aaaacactgg caagttccct aacttttgtg gattcctctg tgtttgaatg     4260
          ggaaagtggt acccatctcc tggcctgtgt gtgatcatcg aatgagacac atgtaagagg     4320
          ctctgcacat cgcagacatg caatacacac tggctatcac cagctagtta tcacacatgc     4380
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          tgtagtttct gtaatgatca gatggctgcc cgtcctctga ttatcttctc ctcatacccc     4500
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          tgagtgtctg caaatagcag atgatggggg ctcagtgata gacaaacaat ctggtttagg     4620
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          cgaagggctg ggctggggga ctgaggaaaa actctccccc caaaacaaga tgatctgtgg     7080
          tttaataaca ggcccagctg ggtccagagg tgacagtgga gagccgtgta ccctgagacc     7140
          agcctgcaga ggacagaggc aacatggagg tgcctcaagg atcagtgctg agggtcccgc     7200
          ccccatgccc cgtcgaagaa ccccctccac tgcccatctg agagtgccca agaccagcag     7260
          gaggaatctc ctttgcatgg tagttgtact caatgctgtg gagtttgaga cattattttt     7320
          aaactttaaa tagccccaca ggtaagctat aagggagaat gcagagacca caggcatttt     7380
          caaaacataa ggagttttaa tgttaaggag tttaaggaga atgtcaaaga aacattggcc     7440
          ttggagtcaa atcctgagct tcctgcttga tggttttggg cggtgactct cgctgtctgg     7500
          attttacttt cttcatctgt gaattaagaa tgaggtggcc gggcactgtg gctcacgcct     7560
          gtaatcccaa catttgggag gccgaggcgg gcagatcaca aggtcaggag atcgagacga     7620
          tcctgtctaa cacgatgaaa ccctgtctct actaaaaata caaaaaaaat taccaggcct     7680
          ggtggcaggc gcctgtagtc ccagctactc aggaggctga ggcaggagaa tggcatgaac     7740
          ccaggaggca gagcttgcag tgagccaaga tcgcaccact gcactccagc ctgggtgaga     7800
          gagcaagact ccatcccccc aaaaaaaaga atgaggtctc ttgtgtgtgc acggcaagaa     7860
          acaattttac atcatgcctc agtgcacaca caaatacata ctggtcccca gttccttatc     7920
          tgcaattcca taattcccag atccctgcaa accacacgtt ttggtggcag ctgacttcag     7980
          gagtaatcct gctctgtact gacttgagtt ctttgtagac ctaccattat tttttacatt     8040
          taatgtgaat atttgcttgt ttcactgttg aaacatgtgt gggtgtgatt acagggagca     8100
          gtccagcctc tgctgggaat ggtcaggaat ataccatatg caccccgtgt cctttctaaa     8160
          atagtggaaa ttctgaatgc ctaaacacat ctggattcca ggaatttaca ttaagggata     8220
          tatatttgaa ataacccaca aaaacaatac tcacccctgc tacgcttggt acactctgat     8280
          attttcaaat tgattttctt tttaaaatgc tgcttttgaa ccaataattt cataacccaa     8340
          tgatgtgttg atattcacat tttgaagaca ctggtataaa gtgtttgacc caacaggcat     8400
          gtggcagatg gaagtgatca ctgggatgtt tccacttcct tggcctggaa ggctcacttc     8460
          atgttggtgc tgagctgaaa aggattcatt cctctccaaa gcaccatggc actcccctgg     8520
          tgtttcaatg ttctcaggct gccatagtaa aatatcacag gctgggtgac ttcaacatct     8580
          ggcttttatt ttctcacaga tccagaggca agaagtccaa ggtgaaggtg ccaaaagggt     8640
          tggagtctgg ggaggactct cttgctggct tatggaagct gcctttgcac tgtgtgctca     8700
          cacagtcttc ttgtgtccct ttctgttctt acaataggac actagccctc taatagaatt     8760
          agagccctac ccttgtgatc tcattcagtc ttaattgctt ccttaaaggc cagatctcca     8820
          aatgtagtca cctgagttta aagcttcagc atatgaattt tgggggcaca caattccctc     8880
          tatagcacta atgactccat aaaacaagtc ccacatcaca gctgtccagg aaaattaaca     8940
          tgtagtcatc tcttatgcaa tggctgttat gcactcccac actttcctcc aaccttatcc     9000
          tttcttcttt ccaactagag agcagtatct ttattgagga tgccattaag tatttcaagg     9060
          aaaaagtgag cacacagaat ctgctactcc tgctgactga taatgaggcc tggaacggat     9120
          tcgtggctgc tgctgaactg cccaggtaag ctccatgggg ttacctccat tgggcactcc     9180
          ggcgatgcca cccagctctc ccctgggcta gttttccctg acaggcacac ctcctccagg     9240
          cagccccctc tgctgggctt gaggatgacc ttcttggcac tccaggaaga atatttcctc     9300
          catgtccttc gctggcagtg agtagcctca ggctgagggg ataggaagcc cacaggaaca     9360
          gggtcatttc tgccatctgc tggtgatggg aactttgcca gttactttct cactttcagc     9420
          ctttcttcat caatggagtt ttattgtgag aaaaatgaga tcgtgcatgt aaagtgctta     9480
          gcataatgac tgacacacag taggtgcaca gttaacgtta acatcttaca agcttggtgg     9540
          aaacagaacc agggttaagg atcttcttct tgaagatggg agcccagcag gacttgacct     9600
          ttgggacaag tcagaaaaat cctgacctaa ccaatgtgtg ttcctgggga tgctggctgg     9660
          agcccttttt ctcatctgag gaattccata aacacggcag gacccttctg ctggtccagg     9720
          atgccgagag gctggagtgg agttgcacag cgctgggtct ctttccagct ctgtctgtgt     9780
          ccagtccctg ggctctgggc ttatgtcaga gactggaaac tgtcatcagt ctaataggaa     9840
          tagcaactca atgtgatagg agtgtggtga aggccttaga ggcaactcca ggtcaaaggt     9900
          ggggaaccaa caccaagatc ctgcccaaag gcccagagag accgggatca gcgtcagagc     9960
          ctggagtcag gatggagcaa gagtcagcct tggttgtagg acaagcagga aggctggggc    10020
          accagggctg ggactagggt gtggaaagag aggcaccaag ggcttgaaac ttaaggaggt    10080
          catgaacttg cagaggacat gtgagtggga gagggatatt tcttccctgt ctggatgatc    10140
          ccaacactca tgggcatata gggtcatggt tgcctgtgtc tctcacacca cgccttggaa    10200
          ctggcaagtt ctgggctacc ctttgagacc ttcttctctt ctacacagag aaacccctga    10260
          cattgacaag cagtatgtct tagtgaccat tttcatagta gaattagttg ctgccaattt    10320
          gtgtaatttc agggatactg agcagactca caacttccca accaaggagg aaaacacttc    10380
          ctctaccatc ttgtccaaat tcaggtcttt tcagcattag caatttatat aggtggttct    10440
          gaaagtgttt tgaatcttct agaggttcca taaaattgca aatggccttg gtgtgcacac    10500
          aggtgaagct gtcactacta aggcatcagt taggctggtg acacctgcga gtgagacctg    10560
          gaaggttggg ggtgcaggtg gtaggtcagg aggcagtaag gtggctggag cgtccatgtg    10620
          gagccagaat gaatagccag atctcccact ccagtcagct ggggcagtgg ccagaaccag    10680
          tagccttcag ccaggtgaaa gggcatgagg cattggaagg gagcagatgc caggcaaagt    10740
          gaactcctgt ctctccgggg ttttgttttt gtttgaattc aaagtactca gagatagcca    10800
          gactgcaatg tctgagggca cccttacctt tgacaccacc tgcaaattta aggggatttc    10860
          taaatccatc ctttgatttt gtaattcact ggaaggactc acataactca ctgaaaactg    10920
          ctatttcaca attgtggttg atcacacgga aagaacacag attaaaatca gcctaagaaa    10980
          gagacacacg gggcagagtt tgggagggtt ttaagtgtga agcttcattg tcctcaggac    11040
          gctgtgttct cctgtgtgaa tgtgggacaa aacacatgcg gtgttgccaa ccagggaagc    11100
          tcacccagtt aaggaaaaat tcctgtgaat cacattaaac cagaaatgaa gccttttttc    11160
          aggattgttg ttacagggga gggagactga gcccagctcc aaatatagta aagacagagg    11220
          gggagtcaca gccaacacca gggtgggggc gggagatgga acaggactga taggagacac    11280
          cagagtgggg ggttcctgct aaattggcct aacaggattc tcactaaagg caggtcagac    11340
          actcacccat caatggtggg ggtgaagagc ataatcagat agcaaagcgt aatcagacag    11400
          caagggggga agaccctccc taaactgact tggggagatt cttgctgagc tgggtggtgc    11460
          aggtccagca agcagtgggt ggctgtggaa ggccaaggtc ggcgcctagt ggagaagagg    11520
          ctcagaagag cccagctgga gttggtcaag gagaaagtcc ttctttctca acccatgcct    11580
          tagtgtccag agtatctgct ggggctggat cacaagctgc cctcatggct gacctggagt    11640
          ctccagcccc tccctgaggt ctaacccctt tagtccccgg gtcctctggg atcaggaaag    11700
          acaccaaata gccccaaacc ccatcatcca tcagattcct atacggtccc gtggccaaat    11760
          caccaggcaa agacagatgt tcctaccagg caggacattc caggggcctg gagatcactt    11820
          cccaggagct gaggacaaag ggaaggcctc tctttgggta aagttcatgc ttcactttcc    11880
          tgccatcctg ggaataaggt ctctttgtct cactctcact gctctttgtt catctgcaga    11940
          gttttccctc tccaaacact ttggcagtca cggtgttgac ctgcccttga atgaggaggc    12000
          atctttatca aacacctacc atgaaagagc atctgagatg cctttaagat atttatttcc    12060
          atatggaata aatattgagg agtatctatg atgaacaaaa tgtgtttgag tttgaaagat    12120
          aattaattcc atttgtaaaa tttgtttcta tttgatcgat agtgaaagct ctgcaattta    12180
          cacaggatag agatcacatg gagctcattt cacagacagg gaaactgcat ttcttttttt    12240
          tttttttttt tttgagttgg agtcttgctc tgtcgcccaa gctggagtgc agtggcgcga    12300
          tctcggctca ctgcaagctc tgcctcccgg ttcaagcaat tctcctgcct cagcctcctg    12360
          agtagctggg actacaggcg cccaccacca cgcccggcta attttttgaa tttttggtag    12420
          agacagggtt tcaccgtatt agtcaggatg gtctcaatct cctgaccttg tgatccaccc    12480
          gccttggcct cccaaagtgc tgggattaca ggtgtgagcc accacaccga gccaaaactg    12540
          catttcttaa tcctttaacc tttccttgtg caggaatgag gcagatgagc tccgtaaagc    12600
          tctggacaac cttgcaagac aaatgatcat gaaagacaaa aactggcacg ataaaggcca    12660
          gcagtacaga aactggtttc tgaaagagtt tcctcggttg aaaagtgagc ttgaggataa    12720
          cataagaagg ctccgtgccc ttgcagatgg ggttcagaag gtccacaaag gcaccaccat    12780
          cgccaatgtg gtgtctggct ctctcagcat ttcctctggc atcctgaccc tcgtcggcat    12840
          gggtctggca cccttcacag agggaggcag ccttgtactc ttggaacctg ggatggagtt    12900
          gggaatcaca gccgctttga ccgggattac cagcagtacc atggactacg gaaagaagtg    12960
          gtggacacaa gcccaagccc acgacctggt catcaaaagc cttgacaaat tgaaggaggt    13020
          gagggagttt ttgggtgaga acatatccaa ctttctttcc ttagctggca atacttacca    13080
          actcacacga ggcattggga aggacatccg tgccctcaga cgagccagag ccaatcttca    13140
          gtcagtaccg catgcctcag cctcacgccc ccgggtcact gagccaatct cagctgaaag    13200
          cggtgaacag gtggagaggg ttaatgaacc cagcatcctg gaaatgagca gaggagtcaa    13260
          gctcacggat gtggcccctg taagcttctt tcttgtgctg gatgtagtct acctcgtgta    13320
          cgaatcaaag cacttacatg agggggcaaa gtcagagaca gctgaggagc tgaagaaggt    13380
          ggctcaggag ctggaggaga agctaaacat tctcaacaat aattataaga ttctgcaggc    13440
          ggaccaagaa ctgtgaccac agggcagggc agccaccagg agagatatgc ctggcagggg    13500
          ccaggacaaa atgcaaactt tttttttttt ctgagacaga gtcttgctct gtcgccaagt    13560
          tggagtgcaa tggtgcgatc tcagctcact gcaagctctg cctcccgtgt tcaagcgatt    13620
          ctcctgcctt ggcctcccaa gtagctggga ctacaggcgc ctaccaccat gcccagctaa    13680
          tttttgtatt tttaatagag atggggtttc accatgttgg ccaggatggt ctcgatctcc    13740
          tgacctcttg atctgcccac cttggcctcc caaagtgctg ggattacagg cgtgagccat    13800
          cgcttttgac ccaaatgcaa acattttatt agggggataa agagggtgag gtaaagttta    13860
          tggaactgag tgttagggac tttggcattt ccatagctga gcacagcagg ggaggggtta    13920
          atgcagatgg cagtgcagca aggagaaggc aggaacattg gagcctgcaa taagggaaaa    13980
          atgggaactg gagagtgtgg ggaatgggaa gaagcagttt actttagact aaagaatata    14040
          ttggggggcc gggtgtagtg gctcatgcct gtaatccgag cactttggga ggccaaggcg    14100
          ggcggatcac gaggtcagga gatcgagacc atcctggcta acacagtgaa accccgtctc    14160
          tactaaaaat acaaaaaatt agccgggcat ggtggcgggc gcctgtagtt ccagctaact    14220
          gggcggctga ggcaggagaa tggcgtgaac ctgggaggtg gagcttgcag tgagccgaga    14280
          tatcgccact gcactccagc ctgggtgaca gagcgagact ccatctcaaa aaaaaaaaaa    14340
          aaaagaatat attgacggaa gaatagagag gaggcttgaa ggaaccagca atgagaaggc    14400
          caggaaaaga aagagctgaa aatggagaaa gcccaagagt tagaacagtt ggatacagga    14460
          gaagaaacag cggctccact acagacccag ccccaggttc aatgtcctcc gaagaatgaa    14520
          gtctttccct ggtgatggtc ccctgccctg tctttccagc atccactctc ccttgtcctc    14580
          ctgggggcat atctcagtca ggcagcggct tcctgatgat ggtcattggg gtggttgtca    14640
          tgtgatgggt cccctccagg ttactaaagg gtgcatgtcc cctgcttgaa cactgaaggg    14700
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          agtaaacagt cagaaaatta gcatgaaagc agtttagcat tgggaggaag ctcagatctc    14880
          tagagctgtc ttgtcgccgc ccaggattga cctgtgtgta agtcccaata aactcaccta    14940
          ctcatcaagc tggacttgtt cgagtcattc tttggtctct cagctctttc caagctttgg    15000
          gggccatcag tctcaagttt ttctcgtaat ggtggtgatg gtggttgtga tggcagcaga    15060
          gtggtggggg ccttggcaag tggtcggtgc tcttccagac caggggacac cgatggaccg    15120
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          accccgcttg tggtcacgag acctcgcctc tctgagcctc agtttcctca tcagctgtag    15300
          aagggtacct ggacaaggtg atgtctcagg tccacccagc tctccccatc ttgtgtcctg    15360
          gagacttggg tccaatcagc actgactgat ggctgtgcct ttgtggtgcc gatggaggct    15420
          cccctgggct ctgggtgcct gacttccctt cctc                                15454
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          <![CDATA[<213>  智人]]>
          <![CDATA[<400>  3]]>
          gactttcact ttccctttcg aattcctcgg tatatcttgg ggactggagg acctgtctgg       60
          ttattataca gacgcataac tggaggtggg atccacacag ctcagaacag ctggatcttg      120
          ctcagtctct gccaggggaa gattccttgg aggaggccct gcagcgacat ggagggagct      180
          gctttgctga gagtctctgt cctctgcatc tgggtgcaac aaaacgttcc aagtgggaca      240
          gatactggag atcctcaaag taagcccctc ggtgactggg ctgctggcac catggaccca      300
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          ctgcccagga atgaggcaga tgagctccgt aaagctctgg acaaccttgc aagacaaatg      480
          atcatgaaag acaaaaactg gcacgataaa ggccagcagt acagaaactg gtttctgaaa      540
          gagtttcctc ggttgaaaag tgagcttgag gataacataa gaaggctccg tgcccttgca      600
          gatggggttc agaaggtcca caaaggcacc accatcgcca atgtggtgtc tggctctctc      660
          agcatttcct ctggcatcct gaccctcgtc ggcatgggtc tggcaccctt cacagaggga      720
          ggcagccttg tactcttgga acctgggatg gagttgggaa tcacagccgc tttgaccggg      780
          attaccagca gtaccatgga ctacggaaag aagtggtgga cacaagccca agcccacgac      840
          ctggtcatca aaagccttga caaattgaag gaggtgaggg agtttttggg tgagaacata      900
          tccaactttc tttccttagc tggcaatact taccaactca cacgaggcat tgggaaggac      960
          atccgtgccc tcagacgagc cagagccaat cttcagtcag taccgcatgc ctcagcctca     1020
          cgcccccggg tcactgagcc aatctcagct gaaagcggtg aacaggtgga gagggttaat     1080
          gaacccagca tcctggaaat gagcagagga gtcaagctca cggatgtggc ccctgtaagc     1140
          ttctttcttg tgctggatgt agtctacctc gtgtacgaat caaagcactt acatgagggg     1200
          gcaaagtcag agacagctga ggagctgaag aaggtggctc aggagctgga ggagaagcta     1260
          aacattctca acaataatta taagattctg caggcggacc aagaactgtg accacagggc     1320
          agggcagcca ccaggagaga tatgcctggc aggggccagg acaaaatgca aacttttttt     1380
          tttttctgag acagagtctt gctctgtcgc caagttggag tgcaatggtg cgatctcagc     1440
          tcactgcaag ctctgcctcc cgtgttcaag cgattctcct gccttggcct cccaagtagc     1500
          tgggactaca ggcgcctacc accatgccca gctaattttt gtatttttaa tagagatggg     1560
          gtttcaccat gttggccagg atggtctcga tctcctgacc tcttgatctg cccaccttgg     1620
          cctcccaaag tgctgggatt acaggcgtga gccatcgctt ttgacccaaa tgcaaacatt     1680
          ttattagggg gataaagagg gtgaggtaaa gtttatggaa ctgagtgtta gggactttgg     1740
          catttccata gctgagcaca gcaggggagg ggttaatgca gatggcagtg cagcaaggag     1800
          aaggcaggaa cattggagcc tgcaataagg gaaaaatggg aactggagag tgtggggaat     1860
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          <![CDATA[<213>  ]]>智人
          <![CDATA[<400>  8]]>
          tggactgaag gtggagggga gcgtgtttgc tgtgcttggt catgagctgc tgggaagttg       60
          tgactttcac tttccctttc gaattcctcg gtatatcttg gggactggag gacctgtctg      120
          gttattatac agacgcataa ctggaggtgg gatccacaca gctcagaaca gctggatctt      180
          gctcagtctc tgccagggga agattccttg                                       210
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          <![CDATA[<213>  智人]]>
          <![CDATA[<400>  9]]>
          caaaagaaac tagagaatgc ctgttattgg attctagctt tctccattgt tttctagccg       60
          tattgtttgt ccacagttta tctggactac atactgaatt ctttcctggc cacaagtctc      120
          caaactaata ttttgctttt ctttttctct catttttctg acttggaatc accagaaatc      180
          caaactgtgc ttttcttaaa gtcctgcaaa ctgaagcttg aaaactgtgt tatagtgaag      240
          gaagagaaag accctctcat attattttta tattgttttg tactcagtac ctgttttaag      300
          aaaaaacaac aaggaagtaa aaccaaagac aggcagcccg gcgccaggcc cgaaaccagg      360
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          agaattcaga ccaaactcgt gaccagagac tcatttgctt ctacagtgtt ttgtccaaaa      780
          gatgttgaag aacggccagg cgcagtggct cacgcctgta atcccagcgc tttcggaggc      840
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          aaaaaaaaaa agttgttgaa gaacaaggag aaaacgtgaa aggaaaatca aatcttggga     1140
          ccccaaaact cactggaaac agttaagctt agaaacggag tcactccaaa acctgccttt     1200
          gtttttgctt ctaagcagat atttgcgaag acaaaaggca acatgttccc caggtagcct     1260
          ccttcacaaa ttgctcacaa ggaaactcct tgtgggtccc agcagttttt accctgaggc     1320
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          ataaataaca agacttctgc ccaccctcag aaaaatgcac atatgcctgc ttcctctact     1440
          ctatgttcat ttttatctta tataaaatgt agacgaactg tgcatgagac gaatgaataa     1500
          ttgactgttc ctctaccccc tcctttcata gacaacctgt ggattcaagg agggctaatc     1560
          aaagcttcac aagaatgtga ccactcacct cattacctat cctgtctttt ttcctttcct     1620
          ccttccactc ctgcctgatt ttacacattt aaatactgga ggcctcaaaa ccctctgtga     1680
          aaaacgagtg gaccccagaa cctcctgtga cttgtgtgac tttttcctgg gtgcatcctc     1740
          aaccttggca gagtaaacat ctaaactgac tgagacgtgt cccagaccct ctttggttta     1800
          caagtcttgc ctcctccctg agttgctgga tgaaagcaac gtcctctctt cttgcctcag     1860
          tttcctcatc tgcaaaatca gatcataatc ctggcccatt gaggggatga ttataaaact     1920
          caatcaaatg gagaagcatt tgcaaatgga atgtattgca aagtgtattg tgcagtccct     1980
          gtgtaatcac cattctcttc ctgcctcata agctggtgtg tgtgtgtgta tgggtggggt     2040
          gaggtggaca cgatgccccc agagatgttt gctcaggatg aaataggccc ccatggaagg     2100
          gtcaggttgg cttctgtggt ttagctgcct ttgaggccct tctgcctggg gcaaagcaca     2160
          aaagtccaat agcaatctgg ttgcatgact tcctagtcat ggaagtgtgg ctgagcagtg     2220
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          ggggaggatg ctgggggatc tctgaaagga ggcaatgcct gattttgtca ctgaacgatg     2340
          agcatgattt ttccaggcgg tggaagcagg tgctcccggc agaagacccc atataagcaa     2400
          atatctagaa gccacaaggc atggccttca acaagagcag gcctggtgcg gtggctcatg     2460
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          gcaccatctc taatataatt tttttaaaaa ttagctgggt ggttggctga tacctgtaga     2580
          accagctact caggaggctg aggtgggggg atggcttaag cccaggggtt tgaagctgct     2640
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          gaatgtggat gcacgggagg atggggagta atctgcaggg tcccatagta tgtcagtggc     2880
          aggtctttct ccttgagacc acagcagacc cccagccctg aggatgcgag gcaggtgggt     2940
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          gtggaggaga ggaggtgacc cagatcccag cctgttctta tggccaggcc acaccaaggc     3600
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          aggagttcag aggtcatctc acccaccctg agtctgagca ccaacttgtg ccaggccctg     3720
          tggggaaact gaggccctgg gagcggaatg acttgcccag ggtcccgtgt caggaggctg     3780
          agcaggtaga tcataggact ccacgtctct ggccctcacc tctgtccctc tgttcagact     3840
          tctggggtga tggagaagaa acaggctgtg ctgtgtccct aatgggaaac gtggctgaga     3900
          caggggagtg agaagggtgc gttgcagaat ggtgcctgtg gcatgatgcc agctttgcaa     3960
          tcatgagatt caaaagccac actgtggaat tgtgagtata actacaggag tgagagctta     4020
          gatctctgtg ttcatagaag gagaatcaaa cctggaaact tttggattat taaaatcaaa     4080
          catttttgct tcaatattag agtcacaagg gcagatgttg gcctcccctc tgccctccaa     4140
          gagctgtgtg actctgggaa attcacctcc cctcccagcc tgagtatttt cccctgtaaa     4200
          aaacctgata gagctgccaa aagtccatga aatcaggggg gtaatttctg tgaaatctga     4260
          gtcatggtct tatttgttct tcaccaaaaa gagatgatga agcctgtaac cccagtgctg     4320
          tgggaggcag aggcgggagg atgacttgag gccaggagtt caagacagcc tgggaaacac     4380
          aggagatgct gtctctatga aatcaaaaat taacaaatta gcccagcatg gtagtgtgta     4440
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          aggctgcaat gagctaggat ggtgtcaaag ccctgcagcc tgggtgacag agcaaaactg     4560
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          tagtcccagc tactcgggag gctgaggcag gagaatggcg tgaacccggg aggcagagct     4800
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          tcaaaaaaaa aatgaaatga aaatggtgat ttctcaggag gagcacactg tctcaacccc     4920
          tcttttcctg ctcaaggagg aggccctgca gcgacatgga gggagctgct ttgctgagag     4980
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          tgtgtgtctg aaccctgaga caaaggcagg aaagggaaag agggaggcga gtggcttttg     5640
          aggagggggc tttagtatga gagctggagg atggaacccc atcagggggc ccgggaacca     5700
          ctgagctgtt aaaataaagt ctgcaaacaa agaccagctg ctggaagtgg gtgtgccagg     5760
          gagtgcgcag agacacacgg tgagaaaaga acaatggtaa tgcttggagc cgcccctaac     5820
          tgggatgggc ctgaaatggt attgttatta tttatagtat cattattagt cattttcatc     5880
          ttatttgtac cctccctcta tctctcctct ccaccttttc ctaacattct atcaccagtt     5940
          ttatgtcttc cattagcaac tttgtagctg taaataattt acttacaact ttcatatacc     6000
          ctcagttgta cccagtattt cttaacttcc ctctttaaaa aaatgataat attaatcctc     6060
          cttctccttc gttcagtgct tcacatccca actgctacct ttgtgcttta aattttgtac     6120
          taattggtgt tgataacaag tatatttagt tctcatattt atatgttgtg tatatgtttt     6180
          ggtttttttt tgtcttaaac aagagactac tgagagccag taagactgaa agaaagggca     6240
          tcttcatata ctgctagttt gagtgtgaat tggtacaatt tgcctgcagt gtggctctag     6300
          gtataaagcc ttttgagttg ttgatagcct ctgacctgct cattctactc ctacaaatat     6360
          cttaaggaaa taatctcaaa tgtgggcaaa gttttatgcg aagaaggatg ttctttgtag     6420
          cataatttat atgaggaatt agaaacaccc tgaggtccat cagctaggga aagacagcag     6480
          aggggacagg gcagcaccag gagggcttgg cagccacagc aggggctggg ctggcatctg     6540
          gcaagatcca ggtctttgtg ggacaaagaa tcttagagaa gcaacgggga cacaggctgt     6600
          ccagtgcagc accagtgaat tcaccaagat gaagagttga gcacagagtg tgagacaagg     6660
          atttgcaatg aggagtcatt taccatgagc gtgtatacat gactcaatat tgtatattta     6720
          agggagtaga gcacagtcat tgaaaacatg gggttgaagc agaagtcctg gctctagcac     6780
          tattgtaaaa acactggcaa gttccctaac ttttgtggat tcctctgtgt ttgaatggga     6840
          aagtggtacc catctcctgg cctgtgtgtg atcatcgaat gagacacatg taagaggctc     6900
          tgcacatcgc agacatgcaa tacacactgg ctatcaccag ctagttatca cacatgctcc     6960
          caggccctgg tcattgtcag aaccttcctc cccatctcta tttctgtgta tagactctgt     7020
          agtttctgta atgatcagat ggctgcccgt cctctgatta tcttctcctc ataccccaac     7080
          aggatgagtg cacttttcct tggtgtggga gtgagggcag aggaagctgg agcgaggtga     7140
          gtgtctgcaa atagcagatg atgggggctc agtgatagac aaacaatctg gtttaggttg     7200
          gtcttggtgt ttgcttccac cccagagaga tttgcagagc cccggctgct caagcaagcc     7260
          tccctctgtc cactggtggc tcacatttga tcccacaatt tgttttctcc tcctcaaggg     7320
          tgcaacaaaa cgttccaagt gggacagata ctggagatcc tcaaagtaag cccctcggtg     7380
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          ctcgcactta gaatggaggg tggcacctcc acagctgagt gagccccaga agaacccgga     7500
          tggactagga ggccaatgag tctgcccaaa gcagcagaag aggtcacgtg gagtcccccg     7560
          acccaggggt ctgggggtca tctgcatcct gacctctcct tagggtgaca cggcccaggt     7620
          gcccacttcc tccctaccct ggcacctagc aaatgactca agtggggcag gacatccttg     7680
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          gagggctggg agaggaggtt gaccagcagc cccgacctgt cacctcccgc tctgctccaa     7800
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          tagccccttt gctctgagtg gccctgtggg aatgtatcgg gcctgattca gcttccagct     7920
          taactggacc ccggtctgtc ctttgccaca tcccctctgt gtgacctggc gctccttacc     7980
          tcccttctcc tgtaccatga gaataatatt tccccatgtt gtcttgagga tcaaatataa     8040
          cacggctacc tggcctggcc agtgcctgcc acacaatagg gcctccctaa gggctggttc     8100
          ccatcccctc tactggtccc ctgttgattc caggtggaag ccaccccgtc cccccccagc     8160
          tgtgttaggg cacccgccct gccctgccca tcacaagcac ctgcttacca gggatgactg     8220
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          cccaatagaa ttttaaagag ttaattgagt aagaaaggat tgctgaattg ggaaacagca     8340
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          tatgaaactg cagtaaggac attatttgat tggttgcact tacaaaactg cctgtttggg     8460
          tttaccttgt tggaaaatcc ctggtcacgt tggtgccagt gtgagtttag ggaggtctcc     8520
          gaatacaggt gagaccggaa cttagccttg cccaggtttt tgatgctgaa gagagaaaaa     8580
          agtcaaagca aaagcaaatc agcttttagt gcaaaacaga agtgcaggct caggggtggg     8640
          agtgcaggcg gactcagaag agccagtcgg gcccagtgga gtttggggtt cttgtctttg     8700
          ctggtttatt aaattaaggt gtggagtaag cataaggatt tctgggaaga ggtggggatt     8760
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          acgtgggtca gacccagcgc cgagttggat ctcactggtc ttagctgaat tggccacttc     8940
          ctgtttgtca ggatcctgtg ggcccatccc ctccccctgt ccctacaggt ggtttcagca     9000
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          agggctgggc tgggggactg aggaaaaact ctccccccaa aacaagatga tctgtggttt     9660
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          catgccccgt cgaagaaccc cctccactgc ccatctgaga gtgcccaaga ccagcaggag     9840
          gaatctcctt tgcatggtag ttgtactcaa tgctgtggag tttgagacat tatttttaaa     9900
          ctttaaatag ccccacaggt aagctataag ggagaatgca gagaccacag gcattttcaa     9960
          aacataagga gttttaatgt taaggagttt aaggagaatg tcaaagaaac attggccttg    10020
          gagtcaaatc ctgagcttcc tgcttgatgg ttttgggcgg tgactctcgc tgtctggatt    10080
          ttactttctt catctgtgaa ttaagaatga ggtggccggg cactgtggct cacgcctgta    10140
          atcccaacat ttgggaggcc gaggcgggca gatcacaagg tcaggagatc gagacgatcc    10200
          tgtctaacac gatgaaaccc tgtctctact aaaaatacaa aaaaaattac caggcctggt    10260
          ggcaggcgcc tgtagtccca gctactcagg aggctgaggc aggagaatgg catgaaccca    10320
          ggaggcagag cttgcagtga gccaagatcg caccactgca ctccagcctg ggtgagagag    10380
          caagactcca tccccccaaa aaaaagaatg aggtctcttg tgtgtgcacg gcaagaaaca    10440
          attttacatc atgcctcagt gcacacacaa atacatactg gtccccagtt ccttatctgc    10500
          aattccataa ttcccagatc cctgcaaacc acacgttttg gtggcagctg acttcaggag    10560
          taatcctgct ctgtactgac ttgagttctt tgtagaccta ccattatttt ttacatttaa    10620
          tgtgaatatt tgcttgtttc actgttgaaa catgtgtggg tgtgattaca gggagcagtc    10680
          cagcctctgc tgggaatggt caggaatata ccatatgcac cccgtgtcct ttctaaaata    10740
          gtggaaattc tgaatgccta aacacatctg gattccagga atttacatta agggatatat    10800
          atttgaaata acccacaaaa acaatactca cccctgctac gcttggtaca ctctgatatt    10860
          ttcaaattga ttttcttttt aaaatgctgc ttttgaacca ataatttcat aacccaatga    10920
          tgtgttgata ttcacatttt gaagacactg gtataaagtg tttgacccaa caggcatgtg    10980
          gcagatggaa gtgatcactg ggatgtttcc acttccttgg cctggaaggc tcacttcatg    11040
          ttggtgctga gctgaaaagg attcattcct ctccaaagca ccatggcact cccctggtgt    11100
          ttcaatgttc tcaggctgcc atagtaaaat atcacaggct gggtgacttc aacatctggc    11160
          ttttattttc tcacagatcc agaggcaaga agtccaaggt gaaggtgcca aaagggttgg    11220
          agtctgggga ggactctctt gctggcttat ggaagctgcc tttgcactgt gtgctcacac    11280
          agtcttcttg tgtccctttc tgttcttaca ataggacact agccctctaa tagaattaga    11340
          gccctaccct tgtgatctca ttcagtctta attgcttcct taaaggccag atctccaaat    11400
          gtagtcacct gagtttaaag cttcagcata tgaattttgg gggcacacaa ttccctctat    11460
          agcactaatg actccataaa acaagtccca catcacagct gtccaggaaa attaacatgt    11520
          agtcatctct tatgcaatgg ctgttatgca ctcccacact ttcctccaac cttatccttt    11580
          cttctttcca actagagagc agtatcttta ttgaggatgc cattaagtat ttcaaggaaa    11640
          aagtgagcac acagaatctg ctactcctgc tgactgataa tgaggcctgg aacggattcg    11700
          tggctgctgc tgaactgccc aggtaagctc catggggtta cctccattgg gcactccggc    11760
          gatgccaccc agctctcccc tgggctagtt ttccctgaca ggcacacctc ctccaggcag    11820
          ccccctctgc tgggcttgag gatgaccttc ttggcactcc aggaagaata tttcctccat    11880
          gtccttcgct ggcagtgagt agcctcaggc tgaggggata ggaagcccac aggaacaggg    11940
          tcatttctgc catctgctgg tgatgggaac tttgccagtt actttctcac tttcagcctt    12000
          tcttcatcaa tggagtttta ttgtgagaaa aatgagatcg tgcatgtaaa gtgcttagca    12060
          taatgactga cacacagtag gtgcacagtt aacgttaaca tcttacaagc ttggtggaaa    12120
          cagaaccagg gttaaggatc ttcttcttga agatgggagc ccagcaggac ttgacctttg    12180
          ggacaagtca gaaaaatcct gacctaacca atgtgtgttc ctggggatgc tggctggagc    12240
          cctttttctc atctgaggaa ttccataaac acggcaggac ccttctgctg gtccaggatg    12300
          ccgagaggct ggagtggagt tgcacagcgc tgggtctctt tccagctctg tctgtgtcca    12360
          gtccctgggc tctgggctta tgtcagagac tggaaactgt catcagtcta ataggaatag    12420
          caactcaatg tgataggagt gtggtgaagg ccttagaggc aactccaggt caaaggtggg    12480
          gaaccaacac caagatcctg cccaaaggcc cagagagacc gggatcagcg tcagagcctg    12540
          gagtcaggat ggagcaagag tcagccttgg ttgtaggaca agcaggaagg ctggggcacc    12600
          agggctggga ctagggtgtg gaaagagagg caccaagggc ttgaaactta aggaggtcat    12660
          gaacttgcag aggacatgtg agtgggagag ggatatttct tccctgtctg gatgatccca    12720
          acactcatgg gcatataggg tcatggttgc ctgtgtctct cacaccacgc cttggaactg    12780
          gcaagttctg ggctaccctt tgagaccttc ttctcttcta cacagagaaa cccctgacat    12840
          tgacaagcag tatgtcttag tgaccatttt catagtagaa ttagttgctg ccaatttgtg    12900
          taatttcagg gatactgagc agactcacaa cttcccaacc aaggaggaaa acacttcctc    12960
          taccatcttg tccaaattca ggtcttttca gcattagcaa tttatatagg tggttctgaa    13020
          agtgttttga atcttctaga ggttccataa aattgcaaat ggccttggtg tgcacacagg    13080
          tgaagctgtc actactaagg catcagttag gctggtgaca cctgcgagtg agacctggaa    13140
          ggttgggggt gcaggtggta ggtcaggagg cagtaaggtg gctggagcgt ccatgtggag    13200
          ccagaatgaa tagccagatc tcccactcca gtcagctggg gcagtggcca gaaccagtag    13260
          ccttcagcca ggtgaaaggg catgaggcat tggaagggag cagatgccag gcaaagtgaa    13320
          ctcctgtctc tccggggttt tgtttttgtt tgaattcaaa gtactcagag atagccagac    13380
          tgcaatgtct gagggcaccc ttacctttga caccacctgc aaatttaagg ggatttctaa    13440
          atccatcctt tgattttgta attcactgga aggactcaca taactcactg aaaactgcta    13500
          tttcacaatt gtggttgatc acacggaaag aacacagatt aaaatcagcc taagaaagag    13560
          acacacgggg cagagtttgg gagggtttta agtgtgaagc ttcattgtcc tcaggacgct    13620
          gtgttctcct gtgtgaatgt gggacaaaac acatgcggtg ttgccaacca gggaagctca    13680
          cccagttaag gaaaaattcc tgtgaatcac attaaaccag aaatgaagcc ttttttcagg    13740
          attgttgtta caggggaggg agactgagcc cagctccaaa tatagtaaag acagaggggg    13800
          agtcacagcc aacaccaggg tgggggcggg agatggaaca ggactgatag gagacaccag    13860
          agtggggggt tcctgctaaa ttggcctaac aggattctca ctaaaggcag gtcagacact    13920
          cacccatcaa tggtgggggt gaagagcata atcagatagc aaagcgtaat cagacagcaa    13980
          ggggggaaga ccctccctaa actgacttgg ggagattctt gctgagctgg gtggtgcagg    14040
          tccagcaagc agtgggtggc tgtggaaggc caaggtcggc gcctagtgga gaagaggctc    14100
          agaagagccc agctggagtt ggtcaaggag aaagtccttc tttctcaacc catgccttag    14160
          tgtccagagt atctgctggg gctggatcac aagctgccct catggctgac ctggagtctc    14220
          cagcccctcc ctgaggtcta acccctttag tccccgggtc ctctgggatc aggaaagaca    14280
          ccaaatagcc ccaaacccca tcatccatca gattcctata cggtcccgtg gccaaatcac    14340
          caggcaaaga cagatgttcc taccaggcag gacattccag gggcctggag atcacttccc    14400
          aggagctgag gacaaaggga aggcctctct ttgggtaaag ttcatgcttc actttcctgc    14460
          catcctggga ataaggtctc tttgtctcac tctcactgct ctttgttcat ctgcagagtt    14520
          ttccctctcc aaacactttg gcagtcacgg tgttgacctg cccttgaatg aggaggcatc    14580
          tttatcaaac acctaccatg aaagagcatc tgagatgcct ttaagatatt tatttccata    14640
          tggaataaat attgaggagt atctatgatg aacaaaatgt gtttgagttt gaaagataat    14700
          taattccatt tgtaaaattt gtttctattt gatcgatagt gaaagctctg caatttacac    14760
          aggatagaga tcacatggag ctcatttcac agacagggaa actgcatttc tttttttttt    14820
          tttttttttt gagttggagt cttgctctgt cgcccaagct ggagtgcagt ggcgcgatct    14880
          cggctcactg caagctctgc ctcccggttc aagcaattct cctgcctcag cctcctgagt    14940
          agctgggact acaggcgccc accaccacgc ccggctaatt ttttgaattt ttggtagaga    15000
          cagggtttca ccgtattagt caggatggtc tcaatctcct gaccttgtga tccacccgcc    15060
          ttggcctccc aaagtgctgg gattacaggt gtgagccacc acaccgagcc aaaactgcat    15120
          ttcttaatcc tttaaccttt ccttgtgcag gaatgaggca gatgagctcc gtaaagctct    15180
          ggacaacctt gcaagacaaa tgatcatgaa agacaaaaac tggcacgata aaggccagca    15240
          gtacagaaac tggtttctga aagagtttcc tcggttgaaa agtgagcttg aggataacat    15300
          aagaaggctc cgtgcccttg cagatggggt tcagaaggtc cacaaaggca ccaccatcgc    15360
          caatgtggtg tctggctctc tcagcatttc ctctggcatc ctgaccctcg tcggcatggg    15420
          tctggcaccc ttcacagagg gaggcagcct tgtactcttg gaacctggga tggagttggg    15480
          aatcacagcc gctttgaccg ggattaccag cagtaccatg gactacggaa agaagtggtg    15540
          gacacaagcc caagcccacg acctggtcat caaaagcctt gacaaattga aggaggtgag    15600
          ggagtttttg ggtgagaaca tatccaactt tctttcctta gctggcaata cttaccaact    15660
          cacacgaggc attgggaagg acatccgtgc cctcagacga gccagagcca atcttcagtc    15720
          agtaccgcat gcctcagcct cacgcccccg ggtcactgag ccaatctcag ctgaaagcgg    15780
          tgaacaggtg gagagggtta atgaacccag catcctggaa atgagcagag gagtcaagct    15840
          cacggatgtg gcccctgtaa gcttctttct tgtgctggat gtagtctacc tcgtgtacga    15900
          atcaaagcac ttacatgagg gggcaaagtc agagacagct gaggagctga agaaggtggc    15960
          tcaggagctg gaggagaagc taaacattct caacaataat tataagattc tgcaggcgga    16020
          ccaagaactg tgaccacagg gcagggcagc caccaggaga gatatgcctg gcaggggcca    16080
          ggacaaaatg caaacttttt tttttttctg agacagagtc ttgctctgtc gccaagttgg    16140
          agtgcaatgg tgcgatctca gctcactgca agctctgcct cccgtgttca agcgattctc    16200
          ctgccttggc ctcccaagta gctgggacta caggcgccta ccaccatgcc cagctaattt    16260
          ttgtattttt aatagagatg gggtttcacc atgttggcca ggatggtctc gatctcctga    16320
          cctcttgatc tgcccacctt ggcctcccaa agtgctggga ttacaggcgt gagccatcgc    16380
          ttttgaccca aatgcaaaca ttttattagg gggataaaga gggtgaggta aagtttatgg    16440
          aactgagtgt tagggacttt ggcatttcca tagctgagca cagcagggga ggggttaatg    16500
          cagatggcag tgcagcaagg agaaggcagg aacattggag cctgcaataa gggaaaaatg    16560
          ggaactggag agtgtgggga atgggaagaa gcagtttact ttagactaaa gaatatattg    16620
          gggggccggg tgtagtggct catgcctgta atccgagcac tttgggaggc caaggcgggc    16680
          ggatcacgag gtcaggagat cgagaccatc ctggctaaca cagtgaaacc ccgtctctac    16740
          taaaaataca aaaaattagc cgggcatggt ggcgggcgcc tgtagttcca gctaactggg    16800
          cggctgaggc aggagaatgg cgtgaacctg ggaggtggag cttgcagtga gccgagatat    16860
          cgccactgca ctccagcctg ggtgacagag cgagactcca tctcaaaaaa aaaaaaaaaa    16920
          agaatatatt gacggaagaa tagagaggag gcttgaagga accagcaatg agaaggccag    16980
          gaaaagaaag agctgaaaat ggagaaagcc caagagttag aacagttgga tacaggagaa    17040
          gaaacagcgg ctccactaca gacccagccc caggttcaat gtcctccgaa gaatgaagtc    17100
          tttccctggt gatggtcccc tgccctgtct ttccagcatc cactctccct tgtcctcctg    17160
          ggggcatatc tcagtcaggc agcggcttcc tgatgatggt cattggggtg gttgtcatgt    17220
          gatgggtccc ctccaggtta ctaaagggtg catgtcccct gcttgaacac tgaagggcag    17280
          gtggtgggcc atggccatgg tccccagctg aggagcaggt gtccctgaga acccaaactt    17340
          cccagagagt atgtgagaac caaccaatga aaacagtccc atcgctctta cccggtaagt    17400
          aaacagtcag aaaattagca tgaaagcagt ttagcattgg gaggaagctc agatctctag    17460
          agctgtcttg tcgccgccca ggattgacct gtgtgtaagt cccaataaac tcacctactc    17520
          atcaagctgg acttgttcga gtcattcttt ggtctctcag ctctttccaa gctttggggg    17580
          ccatcagtct caagtttttc tcgtaatggt ggtgatggtg gttgtgatgg cagcagagtg    17640
          gtgggggcct tggcaagtgg tcggtgctct tccagaccag gggacaccga tggaccgatg    17700
          aagttccagg ggaacttgaa gtgctgtgtt ggaaagaggt taatttggga agaaaggaaa    17760
          aatgaaagga gatgccagga acaggtcaag gaaccttgag gtgtgtccag gagttcaacc    17820
          ccgcttgtgg tcacgagacc tcgcctctct gagcctcagt ttcctcatca gctgtagaag    17880
          ggtacctgga caaggtgatg tctcaggtcc acccagctct ccccatcttg tgtcctggag    17940
          acttgggtcc aatcagcact gactgatggc tgtgcctttg tggtgccgat ggaggctccc    18000
          ctgggctctg ggtgcctgac ttcccttcct catgatcctt cttccagggt ctcgggaaac    18060
          gaggcttcca tggcccctcc tgcttgctca ctggactctc actttcccag ctggtcattt    18120
          ccctgagacc tcaaaacccc accaacccca ctggggcacc cacagaaagc ttgtacatgt    18180
          ctggctctgg ctgagcacag gtgtggtttc catctgcgag tcagagcccg ggattgacat    18240
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          gagtaataga ggggcaaaga gggacatcca gacagcaaac acccccatcc agtctgtcct    18360
          cacgttttgc ccagactcct gcaagaactt ccagaatggt cttccatgtg caactgcccg    18420
          tccctgccca tgtcctggat cattctccac actgcgccag gttgggcttt aacaagatca    18480
          tgttttgggt ttttgggggt tttttgtttg tttgtttggt ctcactctgt tgtgaggctg    18540
          gcgtcccgtg gcatgagcat ggctcactgc atcttggacc tcccggcctc aaactaccct    18600
          tccaccttga ccccctgagt agctgggacc atccgtgtgt gccacattgc ccaggctggt    18660
          ctcaaactcc tgagttcagg tgatctgttc gccttggcat tccaatgggc tgcaattaca    18720
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          ttcaatggct tcccattact cttagcacaa agatgtaggc catgatgctg cctaaagtag    18840
          cctgttgcgg cctggggtcc tgtgaaggaa gagccagagg caacgttctg gtgcagaggg    18900
          tttctaggaa gtgattctag gagcagaact gaggatccag gagggaagga ggaaacgttg    18960
          atacaagaag tttttgaatg ggccatccat atgggcaatg agaccttctg aggtgccttc    19020
          aaggagcgtc ctcagaatct ttgtttccag ggaggagaca tggaggcctt tatccactgc    19080
          tttagctgtg tcccaggggt tctggtacat tgtgtctttg ttctcattgg tttcaaagaa    19140
          cttcttgatt tctgccttaa ttttgttatt tacccagtaa tcattcagga acacgttgtt    19200
          caatttccat gtagttgtgc ggtttttagt gagtttctta atcctgagtt ctaatttgat    19260
          tgcactgtgg tctgagacac tgtttgttat gatttccatt cttttgcatt tgctgaggaa    19320
          tgttttactt ccaattatgt ggtcgacttt agaataagtg ttatacggtg ctgagaagaa    19380
          agtatattct gttgatttgg gacggagagt tctgtagatg tctgttaggt ccactcagtc    19440
          cagggctgag ttcaagtcct gaacatcctt gttaattttc tgtctcgttg acctgtctaa    19500
          tattgacagt ggggtgttaa agtctcccac tgctattgtg tgggagtcta agtctctttg    19560
          taggtctcta agaacttgtt ttatgaatct gcgtgctccc gtattgggtg catatatatt    19620
          taggatagtt agctcttctt gttgcactga tgtttgttgg tttaaaagat cttttttgat    19680
          ctttgttggt ttaaagtctg ttttatcaga gactaggatt gcaacccctg cttttttgtt    19740
          tgtttgtttg tttgtttgtt ttgctttcca tttgcttggt aaatgttcct ccatcccttt    19800
          attttcagcc tatgtgtgtt tttgcacatg agatgggtct cctgaataca gtacatcaac    19860
          gggtcttgac tttatccaat ttgccagtct gtctgtttta attggggcat ttagcccatt    19920
          tacatttaag gttcatattg ttatgtgtga atttgatcct gtcatcatga tgctagctga    19980
          ttattttgca cattagttga tgcagtttct tcatggtatc attggtcttt atattttggt    20040
          gtggttttgc agtgtctggt actggttttt cctttccata tttagtgctt ccttcaggag    20100
          ctcatgtaag gccggcctgg tggtgacaaa atccctcagc atttgcttgt ctggaaagga    20160
          ttttatttct cctttgctta tgaagcttag tttggctgga tatgaaattc tgggttgaaa    20220
          attcttttct ttaagaatgt tgaatattgg tccccactct cttccagctt atatagggtt    20280
          tctgcagaga gatccactgt tagtctgatg ggcttccctt cgtaggtaac gtgatctttc    20340
          tctctggctg cccttaacat tttttccttc gtttcaacct tggagaatct gatgattatg    20400
          tgtcttgggg ttgctcttct tgaagagtat cttagtggtg ttctctgtat ttcctgaatt    20460
          tgaatgttgg cctggcttgc tggttgggga agttctcctg gataatatcc taaagtgtgt    20520
          tttccagctt gtttccgttc tccccatcac tttcaggtac accaatcaat tgtaggttta    20580
          atcttttcac atagtcccat atttcttgga ggctttattt gttccattgt cattcttttt    20640
          tctctaattt tgtcttcaca cattgtttca gtaagttgat cttcaatctt tgatattccg    20700
          cttgatcaat ttggctattg atagttgtgt atccttcacg aagttctcat gctgtgtttt    20760
          tcagctccat caggtcattt acgttcttct ctaaactggt tattctagtt agcagctcct    20820
          gtaacctttc atcaaggttc ttagcttcct tgcattgggt tacaacatgc tcctttagct    20880
          cagaggagtt tctcattacc catcttctga agcctacttc tgtcaattcg tcaaattcat    20940
          tctccatcca gttttgtgcc cttgctggag aggagttgca atcatttgga gaagagacat    21000
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          <![CDATA[<211>  23]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  10]]>
          gctactcctg ctgactgata atg                                               23
          <![CDATA[<210>  11]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  11]]>
          aaggttgtcc agagctttac g                                                 21
          <![CDATA[<210>  12]]>
          <![CDATA[<211>  23]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  探針]]>
          <![CDATA[<400>  12]]>
          tgcccaggaa tgaggcagat gag                                               23
          <![CDATA[<210>  13]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  13]]>
          gttcaaaagc agcatt                                                       16
          <![CDATA[<210>  14]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  14]]>
          aagatatacc gaggaa                                                       16
          <![CDATA[<210>  15]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  15]]>
          tcccctggca gagact                                                       16
          <![CDATA[<210>  16]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  16]]>
          tcgctccagc ttcctc                                                       16
          <![CDATA[<210>  17]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  17]]>
          ttactttgag gatctc                                                       16
          <![CDATA[<210>  18]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  18]]>
          actgctggcc tttatc                                                       16
          <![CDATA[<210>  19]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  19]]>
          ggagccttct tatgtt                                                       16
          <![CDATA[<210>  20]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  20]]>
          ggtgcctttg tggacc                                                       16
          <![CDATA[<210]]>>  21]]&gt;
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;211&gt;  16]]&gt;
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;212&gt;  DNA]]&gt;
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;213&gt;  人工序列]]&gt;
          <br/>
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;220&gt;]]&gt;
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;223&gt;  合成寡核苷酸]]&gt;
          <br/>
          <br/>&lt;![CDATA[&lt;400&gt;  21]]&gt;
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          <![CDATA[<210>  22]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  22]]>
          agcggctgtg attccc                                                       16
          <![CDATA[<210>  23]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  23]]>
          ctttccgtag tccatg                                                       16
          <![CDATA[<210>  24]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  24]]>
          acccaaaaac tccctc                                                       16
          <![CDATA[<210>  25]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  25]]>
          gcacggatgt ccttcc                                                       16
          <![CDATA[<210>  26]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  26]]>
          gattggctca gtgacc                                                       16
          <![CDATA[<210>  27]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  27]]>
          tgggttcatt aaccct                                                       16
          <![CDATA[<210>  28]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  28]]>
          acgaggtaga ctacat                                                       16
          <![CDATA[<210>  29]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  ]]>29
          ttcttggtcc gcctgc                                                       16
          <![CDATA[<210>  30]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  30]]>
          aatgtttgca tttggg                                                       16
          <![CDATA[<210>  31]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  31]]>
          gtgctcagct atggaa                                                       16
          <![CDATA[<210>  32]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  32]]>
          tagtctaaag taaact                                                       16
          <![CDATA[<210>  33]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  33]]>
          gctggttcct tcaagc                                                       16
          <![CDATA[<210>  34]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  34]]>
          cattcttcgg aggaca                                                       16
          <![CDATA[<210>  35]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  35]]>
          tcaggaagcc gctgcc                                                       16
          <![CDATA[<210>  36]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  36]]>
          acctgccctt cagtgt                                                       16
          <![CDATA[<210>  37]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  37]]>
          ctgtttactt accggg                                                       16
          <![CDATA[<210>  38]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  38]]>
          tcaatcctgg gcggcg                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212> ]]> DNA
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  39]]>
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          gctttgtgaa cccatc                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          acaaattgtg ggatca                                                       16
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          gggccactca gagcaa                                                       16
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          ccctattgtg tggcag                                                       16
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          tttttctttg accggg                                                       16
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          aggcagtttt gtaagt                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
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          attcggagac ctccct                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  59]]>
          gaccagtgag atccaa                                                       16
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          <![CDATA[<400>  63]]>
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          <br/>&lt;![CDATA[&lt;212&gt;  DNA]]&gt;
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          <br/>
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          gctggtcttg ggcact                                                       16
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          cttatagctt acctgt                                                       16
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          ttgccgtgca cacaca                                                       16
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          caaagaactc aagtca                                                       16
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          tgtgtttagg cattca                                                       16
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          acccttttgg cacctt                                                       16
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          ttctattaga gggcta                                                       16
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          gttttatgga gtcatt                                                       16
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          tttccgtagt ccatgg                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          acctccttca atttgt                                                       16
          <![CDATA[<210>  95]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          cacggatgtc cttccc                                                       16
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  97]]>
          gggttcatta accctc                                                       16
          <![CDATA[<210>  98]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<400>  98]]>
          cgaggtagac tacatc                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  99]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          agtctaaagt aaactg                                                       16
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          ctggttcctt caagcc                                                       16
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          gaaaccacct gtaggg                                                       16
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          gatgggtact tctgtt                                                       16
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          tgtgggactt gtttta                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          cccggccccc caatat                                                       16
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          tccatgtatg cccatg                                                       16
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          cactcaatca taccct                                                       16
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          caattcagct aagacc                                                       16
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          tgacttggtt gccgtg                                                       16
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          gtgtgctcac tttttc                                                       16
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          gttatcctca agctca                                                       16
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          cccacaggat cctgac                                                       16
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          ccccctgaaa ctgcaa                                                       16
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          gaaatgaacg caatgc                                                       16
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          gagtgctctc ggcttc                                                       16
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          tacacggctc tccact                                                       16
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          ttgggcactc tcagat                                                       16
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          gcccaaaacc atcaag                                                       16
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          tatggaattg cagata                                                       16
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          caagtcagta cagagc                                                       16
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          cccacacatg tttcaa                                                       16
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          agaatttcca ctattt                                                       16
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          tgggtcaaac acttta                                                       16
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          aaagtgcact catcca                                                       16
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          aggatctcca gtatct                                                       16
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          ttgtggacct tctgaa                                                       16
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          tccagttccc attttt                                                       16
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          <![CDATA[<400>  1074]]>
          ctctctattc ttccgt                                                       16
          <![CDATA[<210>  1075]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          ggaggacatt gaacct                                                       16
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          ctttgtggac cttctg                                                       16
          <![CDATA[<210>  1202]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1202]]>
          ccatgccgac gagggt                                                       16
          <![CDATA[<210>  1203]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1203]]>
          gctgtgattc ccaact                                                       16
          <![CDATA[<210>  1204]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1204]]>
          cgtagtccat ggtact                                                       16
          <![CDATA[<210>  1205]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1205]]>
          caaggctttt gatgac                                                       16
          <![CDATA[<210>  1206]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1206]]>
          ggatgtcctt cccaat                                                       16
          <![CDATA[<210>  1207]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  1207]]>
          ggctcagtga cccggg                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  1208]]>
          attaaccctc tccacc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1209]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  1209]]>
          ggtagactac atccag                                                       16
          <![CDATA[<210>  1210]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          tggtccgcct gcagaa                                                       16
          <![CDATA[<210>  1211]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          cagctatgga aatgcc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1212]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
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          actctccagt tcccat                                                       16
          <![CDATA[<210>  1213]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          caagcctcct ctctat                                                       16
          <![CDATA[<210>  1214]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1214]]>
          ttcggaggac attgaa                                                       16
          <![CDATA[<210>  1215]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1215]]>
          aagccgctgc ctgact                                                       16
          <![CDATA[<210>  1216]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
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          ttcagtgttc aagcag                                                       16
          <![CDATA[<210>  1217]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1217]]>
          tcctgggcgg cgacaa                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1218]]>
          ggcaccattc tgcaac                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1219]]>
          caaccctcta tagttt                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          gccagtgttt ttacaa                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
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          <![CDATA[<210>  1224]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          ccccccgctg attcca                                                       16
          <![CDATA[<210>  1225]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
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          agcctcaggt ggaaac                                                       16
          <![CDATA[<210>  1226]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1226]]>
          gggtccagtt aagctg                                                       16
          <![CDATA[<210>  1227]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1227]]>
          tagatgactg aactca                                                       16
          <![CDATA[<210>  1228]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1228]]>
          gcctcctcca gtttgc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1229]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>]]>  1229
          gataaacctt gtctcc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1230]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1230]]>
          gttttgtaag tgcaac                                                       16
          <![CDATA[<210>  1231]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1231]]>
          ggagacctcc ctaaac                                                       16
          <![CDATA[<210>  1232]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1232]]>
          ggcaaggcta agttcc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1233]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
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          cagcaaagac aagaac                                                       16
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          cggagccttc ttatgt                                                       16
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          cagacccatg ccgacg                                                       16
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          atttttcttt gaccgg                                                       16
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          tcacccgata aacctt                                                       16
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          cttgttttat ggagtc                                                       16
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          aggattactc ctgaag                                                       16
          <![CDATA[<210>  1459]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          aaataatggt aggtct                                                       16
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          ggtatattcc tgacca                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          tggaatccag atgtgt                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          agcttccata agccag                                                       16
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          gatatgcccc caggag                                                       16
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          aactccttat gttttg                                                       16
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          ggcatgatgt aaaatt                                                       16
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          gcaggattac tcctga                                                       16
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          tggtatattc ctgacc                                                       16
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          ccttaatgta aattcc                                                       16
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          cccagtgatc acttcc                                                       16
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          gaacattgaa acacca                                                       16
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          cagcttccat aagcca                                                       16
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          gagatcacaa gggtag                                                       16
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          atagagggaa ttgtgt                                                       16
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          gttggaggaa agtgtg                                                       16
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          agaaccacct atataa                                                       16
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          atataccgag gaattc                                                       16
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          atcccacctc cagtta                                                       16
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          gccttcttat gttatc                                                       16
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          cccatgccga cgaggg                                                       16
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          <![CDATA[<211>  16]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  1935]]>
          gggttatgaa attatt                                                       16
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          ccgtcaatat attctt                                                       16
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          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1937]]>
          gcattcagaa tttcca                                                       16
          <![CDATA[<210>  1938]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1938]]>
          ttataccagt gtcttc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1939]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1939]]>
          ctgaagattg gctctg                                                       16
          <![CDATA[<210>  1940]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1940]]>
          gtgtatttct tgatgt                                                       16
          <![CDATA[<210>  1941]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1941]]>
          actttatacc agtgtc                                                       16
          <![CDATA[<210>  1942]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  1942]]>
          ggcagccttg tactcttgga a                                                 21
          <![CDATA[<210>  1943]]>
          <![CDATA[<211>  20]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  1943]]>
          gctggtaatc ccggtcaaag                                                   20
          <![CDATA[<210>  1944]]>
          <![CDATA[<211>  26]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  探針]]>
          <![CDATA[<400>  1944]]>
          ctgggatgga gttgggaatc acagcc                                            26
          <![CDATA[<210>  1945]]>
          <![CDATA[<211>  22]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  1945]]>
          ctcctgctga gtgaccataa ag                                                22
          <![CDATA[<210>  1946]]>
          <![CDATA[<211>  20]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引物]]>
          <![CDATA[<400>  1946]]>
          ggacttcttc gagccagttt                                                   20
          <![CDATA[<210>  1947]]>
          <![CDATA[<211>  24]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  探針]]>
          <![CDATA[<400>  1947]]>
          agagtggtgg ctactgctga actg                                              24
          <![CDATA[<210>  1948]]>
          <![CDATA[<211>  16]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成寡核苷酸]]>
          <![CDATA[<400>  1948]]>
          ggctactacg ccgtca                                                       16
          <![CDATA[<210>  1949]]>
          <![CDATA[<211>  14654]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  食蟹猴]]>
          <![CDATA[<400>  1949]]>
          catgccagca gggaagggga gctggcatgt caatggtaag catgggaaca agaggaggga       60
          ggcagagctc tcacactctt ttaaacaatc agatgttgca tgaattgagt caaaactcac      120
          tcagctccaa ggggatgacg ctcagccatt catgaggaat ctgcccccat gatccaatac      180
          ctcccactag gcccccttcc aatgctgaag gtcacatttc ctcatgaagt ttgaagggga      240
          cacatattca aatcatatca ttcaacacaa cccccccatc acatgttctt ctcacattgc      300
          aaaacacagt catcccttcc caggggtctc ccaaagtcat aatttgttcc aacctcaagt      360
          ccaaagttct aaatcacatt caaagacccc tccttccagc taggggcctg taaaatcaaa      420
          acaagttact ccaggataaa atggtggcat agacattgca taaacactcc cattccaaaa      480
          gaaagaagtc ggccaaaaga aagaggcaac atgcccccat gcaagtccca aacccagcag      540
          ggcagacgtg aaactttaac tctccagaac aatctttgaa tccatgtccc atacctaggg      600
          cacgctggca caagtgttgg tcccccgagg ctttgagcag ctctgcccct gtggcttttc      660
          agggggcagc tgctgtggct gctgctacag atggattaca gttgagtgca tgtggccttt      720
          ccaggctcag gatggaagct actcgtggct ctaaaattac gggatctgga gggtgactgc      780
          cctcttccca cagcctcact aggtagtgcc ctggtgggga ctctgtgtag gcgctcctac      840
          cctacctttc ccctcagcac tgtcctagta gattatctct gtggggaatt tgtcctgctg      900
          caggcttcta cctgggcacc caggcttttc cacaaaccct ctgaaatcta gatagaagct      960
          accaagtctc cttcactctt gaattctgca cacctgaaga cctaaaccat atacggaagc     1020
          tgccaaggtg gcttgcaccc tctggggcgg tgtcccaagc cacctttaaa ctgagggtgt     1080
          aactggagca accagtaggt gaggagcagg gtcctgaggc tgagaagggg accaacatcc     1140
          caaagctggg cccttaaatc atttttcctc tctgagttgt tggatgaaag caacttcctc     1200
          tcctcttgct tcggtttcct catcagcaaa atcagatcat aatcctggcc cattgagggg     1260
          atgattataa aactcaatca aatggagaag tatttgcaaa tggaatgtat tgcaacgtgt     1320
          attgtgcagt ccctgtgtaa tcaccttttt gttcctgcct cacaagctgg gttatgtgtg     1380
          taggggtggg gggaggtggc cacgatgccc ccagagatgt ttgctgagga tgaaataggc     1440
          ttccatgaaa gggtcagttt ggcttctgtg gttcagctgt ctttgaggcc cttctgcctg     1500
          gggcaaagca caaaagtcca acagcaatct ggttgcctga cttcttagcc atggaagtgt     1560
          ggtgagcagt ggtctctagt ccctccaccc agtgtgcctc gggagtggaa catggggcgg     1620
          tggcctctgc tggggaggat gctgggggtt ctctgaaagg aggcaatgcc tgattttgtc     1680
          attgaaggat gagcatgatt tttccagatg gtggaagcag gtgcttctgg cagaagaccc     1740
          cacataagca aatgtgtaaa atccacaagg catggccttc aacaagagca ggtctggggc     1800
          ggtggctcat gtcaaggtgg gaggctcact tgaggccagg agttcaagag tagcccagtc     1860
          aatatagtga gatcccatct ctaacatatt ttttcaaaaa attagctggg tggctggatc     1920
          atgcctgtag aaccagctac tcaggaggct gaggtgggag gatggcttga gcccaggagt     1980
          ttgaagctgt agttcgctgt gattgtggca ctgcacttca gccttggcta cagagtgaga     2040
          ccctgtctcc aaaacataaa caaaataacc ccaacagcat tacaataaat atacaataag     2100
          catccacacg gcatgtgtgg gagactgtgc ttatgctgat ggcatgggca ggaggaaggc     2160
          aggcatctgg ggagtgtggg tgcacgggag gacagggagg gtcccacagg ctgtcagtgg     2220
          caggtctttc ttcctgaaga ccactgcaga cccccaaccc tgaggatgcg aggcaggtgg     2280
          gttggatgag agggacctgg gtgtttcgtc tgcggctgct cctctaagta caacagcaaa     2340
          gagggtgggc ctggactgaa ggtggtgctg gggagcagcc tgtttgctgt gcttgatcac     2400
          gagttgctgg gaagttgtga cattcacctt ccctttccaa tttcatagtt atctgggagg     2460
          ccagaggacg tgtctggtta ttacacaggt gcacagctgg agatgggatc cacaaagctc     2520
          ggaacagctg gatcttgctc agtctctgtc aggggaagat tcctcggtaa gtcggggacc     2580
          gttgacctgc ccccatctcc ttattctcaa caatagctcc atgaaggaag gatcattccg     2640
          cttttgtaga taagttcaga gacgttagta actggttcag atcagacagg aaagcagtag     2700
          cagagtcggg atttgcaccc aggcttgagt ctgatgctcc ctccctcctg ctgtgccctt     2760
          aaacagtaga gagaggccgg gaaacaggtc agatgggttc acaaagctcc ctgggctcag     2820
          ctctggttta gactgtggag acacagctgg gggaccccag aaggaaggtc tgtgttgggg     2880
          gtgcctgact ctttaggaaa tttgaaggaa ccaaagaagg tggaggtggg gaggtgaccc     2940
          ggactctggt ctgtccttat ggcctggaaa cacccaggct ggccccaggg tgctgctgct     3000
          gaggcccaat gggaacgaca aatttatttt gagatacaag gaacctagag gtcatctcac     3060
          cacccccccc tccaagtctg agcaccaact tgtgccaggc cctgtgggga aactgaggcc     3120
          ctgggagggg agtgacttgc ccagggtcct gtgtctggag gctgagcagg tagctcgtag     3180
          gactccacgt ctctggccct cacctctgtc cctctcttca gacctctggg gggatggaga     3240
          agaaacaggc tgtgctgtgt ccctaatggg aaacgtggct gagacagggg agtgagaagg     3300
          gcgtgctgtg gaatagtgtc tgtggcatga tgccagcttt gcaatcaaga gattcaagaa     3360
          ccacactgtg gaattgtgga tataactaca ggagtgacag cttagatctc tgtgtttgta     3420
          gaagcagaat caaacctgga aactcttgga ttatcaaaat tatacatttt tgcttctata     3480
          tcagagtcat aaggccagat gttggcctcc cctctgccct ccaagagctg tgtgactctg     3540
          ggcaagtcac ctccgctctc agcctgagta ttctcccctc tcaaaaacct gatagagctg     3600
          ccaaaagtac atgaaatcgg ggggaaattt ctgtgaaatc tgagtcatgg tcttcttttt     3660
          cttcactaag aagagatgcc cgtcaagata gaaagcacta tggctgtggc ttgtaacccc     3720
          agtgctgtgg gaggtagagg cgggaggatc actagaggct gggagttcaa gacagcctgg     3780
          aaaacacagg agatgctgtc tctatgaaat taaaaatgaa caaattagcc cagcatggtg     3840
          gcgtgcacct gtagtcccag ctactcagag ggttgaagga ggaggatctc ttgagcccag     3900
          tagatctagg ctgcaatgag ctaggatggc gccaaagcac tccagcctgg gtgacagagc     3960
          aaaaccgttt ctcaaaaatg aaatgaaaat ggtgatttct caggaggacc acactgtgtc     4020
          gaccctctat tcctgcccaa ggaggaggcc ccgcagtgac atggagggtg ctgctttgct     4080
          gagactcttt gtcctctgca tctggtgagc ttggctcaga gtgctgaggt gggagggagg     4140
          tccccggtct gggctgcaca gttgggcagg gcttgggctg ggcctgggcc atctgggttt     4200
          ctttcaggaa ccaaagtccc ttcccagaat tgaccaacca gcagactcgc ccagggagaa     4260
          cctgctgtat cctagtcaag gctaacgggc aatatccagc ctcaattctc agcagaggcc     4320
          ccagatcagg gtctgagcca ggccaacaat gaccaaagag gatgggatcc tgggtgcagc     4380
          tcctcacaag tgtcgggcga gtctgaggcc tcagctctct ctgccctcct gctcctctgc     4440
          tctctcctgg tcctcctgtg tcctcatgga tcatgagatg gctgtcctgg cccagggggt     4500
          catacagtga gcaaagcagg aacaagggga agggaacccc ctctcctgtc acccctgtcc     4560
          cttatagcaa gaagcaccca gacacccctc tgcatactgc cctggtgaac tgctgcccag     4620
          gactgggtcc cccttctacc cttgctgcgt ggggtcccag aagacagaca tctgtgtgtc     4680
          tgaaccctgg gataaaggca ggaaggggaa agagggaggc gagtggcttt tgagaggggg     4740
          cttttgtatg agagctggag gatggaaccc catcaggggg cccggaaacc actgagctgt     4800
          taaaataaag gctgcaaaca aagaccagct gctggaagtg ggtgtgccag ggagggagca     4860
          gagacacacg gtgagaaaag agaaatggta atgcctggag ccgcccctga ctgcgatggg     4920
          cctgaagccg tattattagt agtaattata gtatcattat tagtcatttt catcttattt     4980
          gtatcctccg tctatctctc ctctccacct tttcctaaca ttctatcacc agttttatgt     5040
          cttccattag caactttgta gctgtaaaca gtttacttac aactttctca tgccctcagt     5100
          agtacccagt atttcttgac ttctctcttt aaaaaatgac gatattaatc ttccttctcc     5160
          ttccttcagt gtttcacatc ccaactgcta cctttgtgct ttaaattttg tactaattgg     5220
          tattagtaac aagtatattt agttctcaca tttacatgtt gtgtatatgg ttttttgtcc     5280
          taaagaagag actactgaga accagtgaga ctgagagaat gggcatcttc acgtactgct     5340
          agtttgagtg tgaatttggt acaatgtgca tacagtgtgg ctgtaggtat aaaacctaat     5400
          tctactccta cgaatatctt aaggaaataa tctcaaatgt gagcaaagtt ttaggagaag     5460
          gaggatgttc tttgtagcat aaattacatg aagaattaga aataccctaa ggtccatcag     5520
          ccagagagga cagcagaggg gacagggcag caccaggagg gctcggcagc cacagcaggg     5580
          gctgcgccgg catctggcag gatccaggtc tttgtgggac agaggacctt agagaagcga     5640
          cggggacaca ggctgtccgc tgcagcagca gtgaattcac caagacgaag agttgagcac     5700
          agagtgtgag acacggattt gcaatgagga gtcatttccc atgagcgtgt atacatgact     5760
          caatattgta tattgaaggg agtagagcac agtcattgaa gacatggggt tgaagcagaa     5820
          gtcctggctc tagcactatt gtgaaaacac gggcaggttc cctaactttt gtggattcct     5880
          ctgtgtttga aagggaaggt ggtacccatc tcccgggctg tgtgtgatca tcgaatgaga     5940
          cacgtgtaag gagccctgca catcacagac actcaataca cactggctat catcaaccag     6000
          ttatcacaca tgttcccagg cccaggtcat tgtcagaacc ttcctcccca tctctattcc     6060
          tgtgtatgga ctctgtagtt ttctgtaatg atcaggtggc tgcccctcct ctgattatct     6120
          tctcctcata ccccaacagg acaagcggac ttttccttgc tgtgggagtg agggcagagg     6180
          aagctgcagc gaggtgagtg tctgtaaata gcaggtgatg gggactcagt gacagagaaa     6240
          caatctgggt taggttggtc ttgacatttg ctgccaccct agaaggatgt gcagagcccc     6300
          ggctgctcaa gcctccctct gtccacaggt ggctcacatt caatcccaca atttgttttc     6360
          tcctcctcaa gggtgcagca aaaccatcca ggtgggacag atacaggaga tcctcaaggt     6420
          aagcccctca gtgaccgggc tgctggcacc atggacccag gtaggctcgc ctcctcttcc     6480
          ctggctggtt cccactcgca cctagcacgg agggtggtgc ctccacagct gagtgaaccc     6540
          cagaggaacc cagatggaca aggaggccaa tgagtctgct ccaagcccca agagaagccg     6600
          catagagtcc cccgacccag gggtctgtgg ggccatctgc atcctgactt ctcctcaggg     6660
          ggggcacggc ccaggagccc acttcctctc taccctggca ctagcaaatg tctcaagtgg     6720
          ggcaggaggg ccttggggaa atggaaccag caggggaggg gagtgggggg agagcagggt     6780
          ccaggagggg agggctggga gagcaggttg accagcagcc ccgacctgtc acctcccgct     6840
          ctgctcccag ctgaccctgg gtgtttctag ccgaggctgg tcccctccct ccagctcttg     6900
          ccctgcacca gcccctctgc tctgagtggc cttgtgggaa tgtatcaggc ctgatccagc     6960
          ttccaactta actggacccc ggtctggcct ttgccacgtc ccctctgtgt gacctggcgc     7020
          gccttacctc ccctctcctg taccatgaga ataatatttc cccatgttgt cttgaggatc     7080
          aaatatgaca cagctatctg gcctggccgg tgcctgccac acggtagggc ctccctaagg     7140
          gctggttccc atcccctcta cctgtcccct gttgattcca ggtggaaggc acccagtcct     7200
          cccagctgtg ttaggggcac ccgccctgcc ctgcccacca caagcgcctg ctgaccaggg     7260
          atgactgccc cgggcagggg ttgagtccag tcatctaaaa tacccctggt caaagaaaaa     7320
          tctgaggccc agtagaattt taaagagttt atttgagtaa gaaagaattc ttgaattggg     7380
          aaacagcaaa ctggaggagg cttcgtgcta tggtgaaaaa gtgtgggaga caatgtttag     7440
          cgggtgaata tgaaactgca ataaggacat gacttgattg gttgcactta caaaacttcc     7500
          tgttttggtt tactttgttg gaaaatccct ggtcacattg gtgttggtga gtttagggag     7560
          gtctccgaat gcaggtgaga ccggacctta gccttgccca ggtttttgac atccaagaga     7620
          gaaaaaggtt aagtccaagc aaaagcaaaa gcaaaagcaa aagcaaatca gcttttattg     7680
          caaagcggac gctcaggctc gggggtggga gtgcaggcgg actcagaaga gccagtcggg     7740
          cccagtgtgg tttggggttt ctgcctttgc tggtttatta aattaagggg tggagtaagc     7800
          atgaagattt ctgggaagag gtggggattt cttggaactt ggcggggagg ggtgggtacc     7860
          acacagtttt gtaccaaaca caggcataca tggaactgct gtggcgcggg tgggggtggg     7920
          gtttagtgag acaaggaggg tatgattgag tgtgaggcga atcgtgagtc cgacccagca     7980
          ctgagttgga tcttactggt cttcgccgga ttggccactt cctgtttgtc agggtcctgt     8040
          aggcctgtcg cctccccctg tccctgcagc tggtttcagc agctccttct gtgtctgtca     8100
          tgggaaccag ctgcctggag ttcttgtttc ttctatgacc tcccagtatt cccatctcag     8160
          catggcccgc tgtcagctgg ctgctcgtga ctggccgagg ttaagttttg tttgtgtcta     8220
          acagaagcgc ccatctgatg tgaccccagt tcagtttccc acagcttgca gtttaagggg     8280
          ggtgacagcc gttctcaagg cctcgtaggt attgtttgcc caggaatgtt tcagagctgg     8340
          attttgtttt aattttgctt ttatatccac cagccccacc ccaccaagaa atatacagat     8400
          ttagtgctgg aggttccttc catccaaccc tgggtttcct tcttcctttt ggtgaagaag     8460
          gaaaaagaaa aaaccagaca agtcctcgcc cagccgagtc agcactgcgt tcatttccct     8520
          aagccccatt tccttaggat ggcttcctcc cctcactgag ttgcagtggc aaccaagtca     8580
          gctctgctca ggagccgccc tgtacagcaa actgggctgt gctgaatcct gtccaagacc     8640
          aggggagggc agggaagatt agaagccagg agctcctagg ccaccccgga ttcctgggct     8700
          gggctgggct agggggccaa ggaagaaact gtccctccca aacaggatga tctgtggttt     8760
          aataccaaat cacaggcatt tttaaaacac aaggagtctt cgaagcaatg tcaaggaaac     8820
          gttggccttg gagtcaaatc ctgagcttcc tgcttgctgg ttttgggcgg tgactctcgc     8880
          tgtctggatt ttactttctt cttctgtgaa ttaagaatga ggccccttgt gtgtccacag     8940
          caggaaacaa ttttacatca tgtctcggtg cacacacaaa tacatactgg tccccagtcc     9000
          attatctgta attccataat ttccagatcc ctgcaaacca cacattttgg gggcagctga     9060
          cttcaggagt aatcctgctc tgtactgact cgagttcttt gtaggcctac cattatttac     9120
          cccatttaat gtgaatattt gcttgtttca ctgttgaaac atgtgtgggt ttgattacgg     9180
          ggagcagtct agcctctgct gggaatggtc aggaatatac catatgcacc ccgtgtcctt     9240
          tctaaaatag tgaaaattcg gaatgcctaa acacatctgg attccaggaa tttacattaa     9300
          gggatatata tttgaaataa ctcacaaaaa acaatactca tccctgctgt gattgctata     9360
          ttctgatatt ttcaaatcga ttttcttttc aaaatgctgc tcttgaacca ataaactaat     9420
          ttcataaccc aatgatgtgt tgaaactcac attttgaaga cacaggtata aagtgtttga     9480
          cacccaacag gcacgtggca gatagaagtg atcactggga tgtttcctct tccttggcct     9540
          ggaaggctca ctttgtgttg gttctgagct gaaaaggatt cattcctccc caaagcactg     9600
          tggcactccc ctggtgtttc aatattctca ggctgccatg gtaaaatatc acaggctggg     9660
          tgacttcaac atctggtttt tcttttctca cacttccaga ggcaagaagt ccaaggcgaa     9720
          ggtgccggca gggttggagt ctggggagga ctctcttgct ggcttgtgga ggctgccttt     9780
          gtgctgtgtg atcacgtggc ttgcttgtgt ctctttcact tcctacaata ggacactagc     9840
          cctctaacag gattagagtc ctacccttgc gatctcattc agtctttttt tttttttttt     9900
          ttttgagacg gagtctcgct ctgtcaccca ggctggagtg cagtggccgg atctcagctc     9960
          actgcaagct ccgcctcctg ggttcacgcc attctcctgc ctcagcctcc cgagtagctg    10020
          ggactacagg cgcctgtcac ctcgcccggc taagtttttg tatttttagt agagacgggg    10080
          tttcactgtg ttagccagga tggtctcgat ctcctgacct cgtgatccgc ccgtctcggc    10140
          ctcccaaagt gctgggatta caggcttgag ccaccgcgcc cagccctcat tcagtcttaa    10200
          ttgcttcctt aaaggcctga tctccaaata tagtcacctg actttagggc ttcagcatat    10260
          gaattttggg ggcatacaat tcccttgata gcactgatga ctccatcaaa cgtatcccac    10320
          accacagctg tcctggaaaa ttaacacgta accatctttt acgcaatggc tgttatctcc    10380
          tctacacttt cctccaacct gatccttttt tctttccaac tagagagcaa catttctctt    10440
          gaggattacc ttaattattt ccagaaaaac gtgagcccac aggagctgct actcctgctg    10500
          agtgaccata aagcctggga gagagtggtg gctactgctg aactgcccag gtaacctcca    10560
          tggggttatc tccattggga accctggtga tgccacccag atctcccttg ggctagtttt    10620
          ccctgacaga cacacctcct ccaggcaggc ccctctgctg ggcttgagga tgaccttctc    10680
          ggcagtccag gaggaacatt tcctcccaat ccttcgctgg cagtgagtag cctcaggctg    10740
          aggggacagg aagcccacag ggacagggtc atttctgcca tctgctggtg atgggaaatt    10800
          tgcgagttac tttcccactt tcagcctttc ttcatccatg gagttttatt gtgagaaaaa    10860
          tgagatcatg catgtaaagt actcagcata atgactgaca catagtaggt gcacagttaa    10920
          cgttaacatc ttacaaggtt ggtggaaata gaccagggtc aagggtcttc ctcttgaagt    10980
          ccagcagcac ttcctttggg acaagtccga aaaatcctga cttaattgat gtgtgttcct    11040
          ggggatgctg gctggggcct tttttctcat ctgaggaatt ccataaacac ggcaggaccc    11100
          ttctgctggt ccaggatgct gagaggctgg agtggacttg gacagcgatg ggtctctttc    11160
          cggctctgtc tgtgcccagt ccctgggctc taggcttatg tcatggagac tgggaactgt    11220
          catctgtcca atagaaatag caagtcaatg tcataggagt atggtgaagg ccttagagtg    11280
          aactccaggt caaaggtggg gaaccaagac caagatcctg gccaaaggcc aagagagacc    11340
          aagaccagtg tcaaagcctg gggtcaggat ggagcaagag tcagccttgg ttgtaggaca    11400
          agtaggaagg ttgaggcacc agggctggga ctagggtgtg gcaagagagg caccaagggc    11460
          ttgaaactta aggaggtcat gaacttgcag aggacatgtg agtgggagag gaatatttct    11520
          tctctgtctg ggagaggaat atttcttctc tgtctggatg atcccaacac tcatggacat    11580
          agagggtcat ggttgcctgt gtctctcaca ccctgcctgg gaactggcaa gttctgggct    11640
          accctttggg accttcttct cttctacaca aagaagcccc tgacaatggc aagcagtatg    11700
          ccttagtgac catctccata gtagaatgag ttgctgtcaa tgtatataat ttcaggggta    11760
          ctgagcagac tcacaagtcc ccaaccaaga aggaaaacac ttcctctacc atcttgtcca    11820
          aattcaggtc ttttcagcgt tagcaattta tatagatggt tctgaaagtg tcccgagtct    11880
          tctagaggtt ccataaaatt gcacacggcc ttggcgtaca cacaggtgaa gctgtcactg    11940
          ctaaggcatc agttaggctg gtgacatctg cgagtgagac ctggaaggtt gggggtgcag    12000
          ggggcaggtc aggaggcggt aaggtggctg gagagtccat gtggagccag aatgaatacc    12060
          cagatctccc actccggtca actggggcag tgcccggacc cagtagcctt cagccagaaa    12120
          gtgaaagggc atgaggcctt ggaagggagc acatgccagg caaagtgagc tcctgtctct    12180
          ctgaggtttg gtttcgtttg aattcaaagt actcagaggt agccagacgg caatgtctga    12240
          gggcacctta cctttgacgc cacctgaaca ttaatgggga ttcctaaaat catctttaga    12300
          ttttataatt cactagaagg attcatataa ctcactaaaa actgctattt cacgatcgtg    12360
          gtttatcaca cagaaagaac acagattaaa atcagcctaa ggaagagaca cacagggcag    12420
          agtctgggag ggcttcaggt gtgaagcttc attgtcctca ggacgctgtg atctcctgtg    12480
          ccaatgtggg acaagacaca tggggtgctg ccaaccaggg aagctcaccc agttaaggaa    12540
          acattcctgt gaatcacaag aaatcaggaa ggaagccttt attcaggatg gttgttacag    12600
          gggagggaga ccgagtccag ctccaaacac agtaaagaca gagagggagt cacagccaac    12660
          accagggtga ggggcggcag atggaacagg actaacagga gacaccagag tgggatgttc    12720
          ctgccaaact gtcctaacag gattctcgct aaaggcaggt cagacactca cccatcaacg    12780
          gtgggagtga ggagcatgat cagatagcaa agagtgctca gacagcaagc agggaggacc    12840
          ctccctaaac cgacttgggg agattcttgc tgagctgggc agtgcaagtc cagcaagcag    12900
          tgggtgggtg tggaaggcca aggtcggcgc ctagtggaga agaagctctg aagcgccccg    12960
          ctggagctgg tcaagcagaa agtctttctc aacccatgtc ttagtgtcca gaatatttgc    13020
          tggggttgga tcacaagctg ccctcatgac tgacctgtag tctccagccc ctccctgagg    13080
          tctcacacct ttagtcccca ggtcctctgg aagtcaggaa agacaccaaa tagccccaaa    13140
          ccccatcatc catcacattg ctgtactgtc ccgtggccaa atcaccagac aaagaaagat    13200
          gttcctacca ggcaggacac tccaggagcc tggagatcac ttcccaggag ctgaggacaa    13260
          agggaaggcc tctctttggg aaaagttcat gcttcacttt gctaccatcc tgggaataag    13320
          gtgtctttgt cccactctca cggctctttg ttcatctgca gagttttccc ctctccaaac    13380
          actttggcaa tcacagtgtt ggcctgccct tgagtgagga ggcatcttta tcaaacacct    13440
          accacgaaag agcatctgag atgcctttaa gatatttatt tccatatgga ataagtactg    13500
          aggggtatct atgatgaaca aagcatgttt gagcttaaat tctcttcatt tgtaaaattt    13560
          gtttctattt gattgatagt gagagctctg caatttacac aggatagaga tcgcatggag    13620
          ccgatttcac agacagggaa actgcatttc ttaatccttt aaactttcct tgtgcaggga    13680
          tgaggcagat gagctctata aagctctgaa caagcttata agacacatgg tcatgaaaga    13740
          caaaaactgg ctcgaagaag tccagcagca cagaaagcgg tttttggaag agtttcctca    13800
          gttggaaagg gagcttcagg ataaaataag aaggctctgc gaccttgcag gtgaggttca    13860
          gaaggtccac aaaggcgcca ccatcgccaa tgcgttctcc agcactctcg gcgttgcctc    13920
          tggtgtcctg accttcctcg gcatgggtct ggcacccttc acagcgggga gcagccttgt    13980
          gctcttggaa cctgtgacgg ggttgggaat cgcagccacc ttgaccggga ttaccagcgg    14040
          tagcgtggaa tacgcaaaga agcggtcggc acaagccgaa gcccatgaac tggtcaacaa    14100
          aagccttgac accgtggagg agatgaacga gtttctgtat cacaacatac ccaactttat    14160
          ttccttacgt gtcaatcttg tcaaattcac agaagacact gggaaggcca tccgtgccat    14220
          caggcaagcc agagccaacc ctcactcagt accacatgtc ccagcctcac tccaccgggt    14280
          cactgagcca gtctcagcta caagctttga agagatggag agatggagag agttggagag    14340
          atggagagag ttgctgaatc ccgcaccacg ggggtgatca gaggagccaa gatcgttgat    14400
          aaggtctttg aaggcgccct tttcgtgctg gacgtagtca gcctcgtgtg ccagttaaag    14460
          cacttacatg agggggcaaa gtcaaagaca gctgaggagc tgaagaaggt ggctcaggag    14520
          ctggagaaga agctaaacat tctcaacaag aagtatgaga ctctgcgcca agaaccgtga    14580
          ccacagggca gggcaaccac caggggagat atgcctggga cgggccaaga caaaatgcaa    14640
          actttttttt tttt                                                      14654
          
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Claims (15)

  1. 一種包含修飾的寡核苷酸之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該修飾的寡核苷酸由16至30個連接的核苷組成,及具有包含SEQ ID NO:1164的核鹼模體列(nucleobase sequence)的核鹼模體列。
  2. 如請求項1之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該修飾的寡核苷酸由16個連結的核苷所組成。
  3. 如請求項1或2之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該修飾的寡核苷酸包含至少一個修飾的核苷間連接、及/或至少一個修飾的糖、及/或至少一個修飾的核鹼基。
  4. 如請求項3之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的核苷間連接係硫代磷酸酯核苷間連接。
  5. 如請求項3或4之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的糖係二環糖。
  6. 如請求項5之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該二環糖包含4'-CH 2-O-2'基團、或4'-CH(CH 3)-O-2' 基團、或4'-(CH 2) 2-O-2'基團。
  7. 如請求項3或4之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的的糖包含2'-O(CH) 2-OCH 3基團 或 2'-O-CH 3基團。
  8. 如請求項3至7中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的核鹼基係5-甲基胞嘧啶。
  9. 如請求項3至7中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的核鹼基包含: 由連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由連接的核苷組成的5'翼區段;及 由連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間,其中每個翼區段的每個核苷包含修飾的糖。
  10. 如請求項1之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該至少一個修飾的核鹼基包含: 由九個連接的去氧核苷組成的缺口區段; 由三個連接的核苷組成的5'翼區段;及 由四個連接的核苷組成的3'翼區段; 其中該缺口區段位於該5'翼區段與該3'翼區段之間,其中每個翼區段的每個核苷包含cEt糖;其中每個核苷間連接是硫代磷酸酯連接;其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
  11. 如請求項1至10中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該藥學上可接受的鹽係鈉鹽。
  12. 如請求項1至10中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽,其中該藥學上可接受的鹽係鉀鹽。
  13. 一種組合物,其包含如請求項1至12中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽,以及藥學上可接受的賦形劑。
  14. 一種如請求項1至12中任一項之化合物或其藥學上可接受的鹽之用途,其係用於製備用以治療、預防或緩解與APOL1相關的疾病的藥物。
  15. 如請求項14之用途,其中該疾病係選自:局灶性節段性腎小球硬化症(FSGS)、塌陷性腎病、慢性腎病(CKD)、高血壓歸因的腎病、HIV相關的腎病、鐮狀細胞腎病、良性小動脈腎硬化、狼瘡性腎炎、終末期腎病(ESKD)和其他形式的APOL1相關的蛋白尿病。
TW113114934A 2018-05-22 2019-05-21 Apol1表現之調節劑 TW202430638A (zh)

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