TW202405174A - 用於抑制超氧化物歧化酶1(SOD1)表現之RNAi藥劑、其組合物及使用方法 - Google Patents
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Abstract
本發明描述用於抑制超氧化物歧化酶1 (Superoxide Dismutase 1;SOD1)基因之RNAi藥劑、包括RNAi藥劑之組合物及方法。本文揭示之SOD1 RNAi藥劑及RNAi藥劑結合物抑制SOD1基因表現。本發明亦描述包括一或多種SOD1 RNAi藥劑,視情況與一或多種額外治療劑之醫藥組合物。活體內遞送所描述之SOD1 RNAi藥劑至中樞神經系統(CNS)組織提供對SOD1基因表現之抑制及降低SOD1活性,此可對個體,包括人類個體提供治療益處,以用於治療各種疾病,包括肌肉萎縮性脊髓側索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis;ALS)。
Description
本發明係關於RNA干擾(RNAi)藥劑,例如雙股RNAi藥劑,諸如經化學修飾之小干擾RNA (siRNA),其用於抑制超氧化物歧化酶1 (Superoxide Dismutase 1;「SOD1」)基因表現;包括SOD1 RNAi藥劑組合物;及其使用方法。
超氧化物歧化酶1 (Superoxide dismutase 1;SOD1)為防護細胞代謝期間產生之氧自由基物種之自由基清除酶的超氧化物歧化酶家族類別之成員。所有哺乳動物均具有3種超氧化物歧化酶同功異型物:Cu/ZnSOD (SOD1)、粒線體MnSOD (SOD2)及胞外Cu/ZnSOD (SOD3)。SOD1為細胞質中高度豐富、廣泛表現且主要的岐化酶,且有助於大部分細胞SOD活性(JD Crapo等人, Copper, zinc superoxide dismutase is primarily a cytosolic protein in human cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 1992;89(21):10405-9)。153胺基酸SOD1蛋白用作結合銅及鋅且在2個利用酶活性位點中之基本銅原子之不對稱步驟中催化超氧化物自由基轉化為過氧化氫及氧氣(JD Rothstein, TDP-43 in amyotrophic lateral sclerosis: pathophysiology or patho-babel? Ann Neurol. 2007;61(5):382-4.)。除作為抗氧化劑酶以外,據報導,人類SOD1蛋白在暴露於氧化脅迫之後活化核基因轉錄(CK Tsang等人, Superoxide dismutase 1 acts as a nuclear transcription factor to regulate oxidative stress resistance. Nat Commun. 2014;5:3446.),參與RNA代謝之調節((Z. Butti及SA Patten, RNA Dysregulation in Amyotrophic Lateral Sclerosis. Front Genet. 2018;9:712.;L Lu等人, Mutant Cu/Zn-superoxide dismutase associated with amyotrophic lateral sclerosis destabilizes vascular endothelial growth factor mRNA and downregulates its expression. J Neurosci. 2007;27(30):7929-38.),及調節葡萄糖感測路徑以抑制呼吸(AR Reddi及VC Culotta, SOD1 integrates signals from oxygen and glucose to repress respiration. Cell. 2013;152(1-2):224-35.)。在1993年,Rosen等人鑑別出與家族性肌肉萎縮性脊髓側索硬化症(familial amyotrophic lateral sclerosis;fALS)之成年發作型致命神經退化性病例相關之SOD1突變(DR Rosen等人, Mutations in Cu/Zn superoxide dismutase gene are associated with familial amyotrophic lateral sclerosis. Nature. 1993;362(6415):59-62.)。
肌肉萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)為引起初級運動皮質、腦幹及脊髓中上部及下部運動神經元之進行性退化的致命運動神經元病症(A. Chio等人, Global epidemiology of amyotrophic lateral sclerosis: a systematic review of the published literature. Neuroepidemiology. 2013;41(2):118-30.;O. Hardiman等人, Amyotrophic lateral sclerosis. Nat Rev Dis Primers. 2017;3:17071.;N. Nowicka等人, Risk Factors and Emerging Therapies in Amyotrophic Lateral Sclerosis. Int J Mol Sci. 2019;20(11).)。運動神經元之退化及損失引起骨骼肌之進行性無力及萎縮,此通常在3至5年內進展為麻痺及死亡(Hardiman 2017)。當前,可用的ALS療法顯示僅中等功效且結果改善有限。大致15%至20%之fALS可能與遺傳性病因相關且相較於偶發性ALS病例(發作中位數年齡在58至63歲範圍內),發作年齡略微更年輕(47-53歲)。在遺傳定義的ALS病例中,約15%與SOD1基因中之顯性遺傳突變相關,且迄今為止,已在患有ALS之患者中鑑別出超過180種SOD1基因變異體(O. Abel等人, ALSoD: A user-friendly online bioinformatics tool for amyotrophic lateral sclerosis genetics. Hum Mutat. 2012;33(9):1345-51.;RAA van der Spek等人, The project MinE databrowser: bringing large-scale whole-genome sequencing in ALS to researchers and the public. Amyotroph Lateral Scler Frontotemporal Degener. 2019;20(5-6):432-40.)。
儘管SOD1突變之準確致病機制仍不完全瞭解,但存在由神經元中突變型SOD1聚集誘導之毒性功能獲得型導致毒性的共識。小鼠或大鼠中突變型SOD1之過度表現再現人類ALS之重要態樣,包括損失肌神經接合神經分佈及運動神經元死亡(LI Bruijn及DW Cleveland, Mechanisms of selective motor neuron death in ALS: insights from transgenic mouse models of motor neuron disease. Neuropathol Appl Neurobiol. 1996;22(5):373-87.;ME Gurney等人, Motor neuron degeneration in mice that express a human Cu,Zn superoxide dismutase mutation. Science. 1994;264(5166):1772-5.)。損失SOD1,儘管導致最終運動神經元功能異常,並不會導致運動神經元死亡(PM Andersen等人, Phenotypic heterogeneity in motor neuron disease patients with CuZn-superoxide dismutase mutations in Scandinavia. Brain. 1997;120 ( Pt 10):1723-37.;AG Reaume等人, Motor neurons in Cu/Zn superoxide dismutase-deficient mice develop normally but exhibit enhanced cell death after axonal injury. Nat Genet. 1996;13(1):43-7.)。另外,儘管最初咸信酶活性水平之變化為主要致病機制,但觀測到疾病嚴重程度並不與岐化酶活性水平相關(Andersen 1997; DW Cleveland等人, Toxic mutants in Charcot's sclerosis. Nature. 1995;378(6555):342-3.)。實際上,ALS中SOD1突變之主要作用與蛋白質聚集及錯誤摺疊分子之普里昂蛋白樣傳播相關(M Berdynski等人, SOD1 mutations associated with amyotrophic lateral sclerosis analysis of variant severity. Sci Rep. 2022;12(1):103.)。
鑒於SOD1之毒性功能獲得型作用,預測降低SOD1含量可治療SOD1 ALS。SOD1 ALS患者中此假設之支持係由最近批准之托芬森(tofersen)提供。托芬森為一種致使SOD1 信使RNA (mRNA)降解之反義寡核苷酸。在28週隨機分組VALOR 3期試驗中,托芬森與腦脊髓液(CSF)中SOD1蛋白之總濃度降低以及血漿中神經纖毛輕鏈(NfL)蛋白之濃度降低相關。此等結果解釋為表明降低SOD1 mRNA潛在地減緩潛在疾病進程。在52週時,VALOR及其開放標籤擴展之組合分析顯示,相較於在開放標籤擴展28週後開始托芬森之參與者,在VALOR開始時開始托芬森之參與者在以下方面具有較小數值減小:ALSFRS-R評分、預測的減緩生命能力之百分比及手持式肌力測定法百萬評分(T Miller等人, Phase 1-2 Trial of Antisense Oligonucleotide Tofersen for SOD1 ALS. N Engl J Med. 2020;383(2):109-19.)。
然而,7%之托芬森接受者報導嚴重的神經不良事件(adverse event;AE),且其兩週3次劑量之侵襲性給藥方案,隨後每月一次劑量,全部均經由鞘內(IT)注射,需要腰椎穿刺,進一步限制了其有限的功效。因此仍需要可安全且更有效地抑制ALS患者中之SOD1基因表現的療法。
需要能夠選擇性且有效地抑制SOD1基因表現之新穎RNA干擾(RNAi)藥劑(稱為RNAi藥劑、RNAi觸發劑或觸發劑),例如雙股RNAi藥劑,諸如siRNA,包括用作治療劑或藥劑。此外,需要用於治療與突變型SOD1基因表現相關之疾病或病症及/或可至少部分地由SOD1基因表現降低介導之病症的新穎SOD1特異性RNAi藥劑的組合物。
本文揭示之SOD1 RNAi藥劑之核苷酸序列及化學修飾以及其與某些適合於選擇性且有效地活體內遞送SOD1 RNAi藥劑至相關CNS細胞之特異性藥物動力學及藥效學(PK/PD)調節劑的組合,不同於先前揭示或此項技術中已知之彼等者。本文揭示之SOD1 RNAi藥劑提供對SOD1基因表現之高效且有效抑制。
一般而言,本發明之特徵在於SOD1基因特異性RNAi藥劑;包括SOD1 RNAi藥劑之組合物;及用於使用SOD1 RNAi藥劑及包括本文所描述之SOD1 RNAi藥劑之組合物活體外及/或活體內抑制SOD1基因表現的方法。本文所描述之SOD1 RNAi藥劑能夠選擇性且有效地降低SOD1基因表現,且因此降低SOD1酶表現。
所描述之SOD1 RNAi藥劑可用於症狀及疾病之治療性治療(包括預防性或防治性治療)方法中,該等症狀及疾病包含但不限於各種中樞神經系統疾病及神經退化疾病(包括ALS及阿茲海默氏症(Alzheimer's Disease))。
在一個態樣中,本發明之特徵在於用於抑制SOD1基因表現之RNAi藥劑,其中RNAi藥劑包括有義股(亦稱為乘客股)及反義股(亦稱為引導股)。有義股及反義股可彼此部分、實質上或完全互補。本文所描述之RNAi藥劑有義股之長度各自可為15至49個核苷酸長。本文所描述之RNAi藥劑反義股之長度各自可為18至49個核苷酸長。在一些實施例中,有義股及反義股之長度獨立地為18至26個核苷酸。有義股及反義股可為相同長度或不同長度。在一些實施例中,有義及反義股之長度獨立地為21至26個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度獨立地為21至24個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度均為21個核苷酸。在一些實施例中,反義股之長度獨立地為18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度獨立地為16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48或49個核苷酸。在遞送至表現SOD1之細胞,諸如內皮細胞、神經元、微神經膠質細胞及星形膠質細胞後,本文所描述之RNAi藥劑抑制活體內及/或活體外一或多種SOD1基因變體表現。
本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑靶向人類SOD1基因(參見例如SEQ ID NO: 1)。在一些實施例中,本文揭示之SOD1 RNAi藥劑靶向具有表1中揭示之任一序列的序列之SOD1基因之一部分。
在另一態樣中,本發明之特徵在於包括能夠選擇性且有效地降低SOD1基因表現之所揭示之SOD1 RNAi藥劑中之一或多者的組合物,包括醫藥組合物。包括一或多種本文所描述之SOD1 RNAi藥劑之組合物可向個體投與,諸如人類或動物個體,以用於治療(包括防治性治療或抑制)與SOD1蛋白或酶含量相關之症狀及疾病。
可用於SOD1 RNAi藥劑中之SOD1 RNAi藥劑有義股及反義股之實例提供於表3、4、5及6中。SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體之實例提供於表7A、7B、8、9A及10中。可由本文揭示之某些SOD1 RNAi藥劑之有義股及反義股組成或可包括其之19-核苷酸核心延伸段序列之實例提供於表2中。
在另一態樣中,本發明之特徵在於用於活體內遞送SOD1 RNAi藥劑至個體(諸如哺乳動物)中之神經元、星形膠質細胞、微神經膠質細胞及內皮細胞之方法。本文亦描述用於此類方法中之組合物。在一些實施例中,本文揭示用於活體內遞送SOD1 RNAi藥劑至個體之中樞神經系統細胞(神經元、星形膠質細胞、微神經膠質細胞及內皮細胞)之方法。在一些實施例中,個體為人類個體。
本文所揭示之方法包括藉由此項技術中已知之任何合適的手段向個體(例如人類或動物個體)投與一或多種SOD1 RNAi藥劑。包括一或多種SOD1 RNAi藥劑之本文所揭示之醫藥組合物可視是否需要局部或全身治療而以多種方式投與。投與可為但不限於例如靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內、真皮下(例如經由植入裝置)及腦實質內投與。在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物係藉由鞘內注射或腦室內注射投與。
在一些實施例中,希望本文所描述之SOD1 RNAi藥劑抑制中樞神經系統細胞中SOD1基因表現。
可使用此項技術中已知之任何寡核苷酸遞送技術將一或多種SOD1 RNAi藥劑遞送至目標細胞或組織。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑係藉由將RNAi藥劑與靶向基團或脂質部分共價連接而遞送至細胞或組織。
PK/PD調節劑可與SOD1 RNAi藥劑之有義股或反義股之3'或5'端連接。在一些實施例中,PK/PD調節劑與有義股之3'或5'端連接。在一些實施例中,PK/PD調節劑與有義股之5'端連接。在一些實施例中,PK/PD調節劑與RNAi藥劑之有義股及/或反義股上之核苷酸內部連接。在一些實施例中,PK/PD調節劑經由連接子與RNAi藥劑連接。
在另一態樣中,本發明之特徵在於包括一或多種具有表7A、7B、8、9A及10中揭示之雙螺旋體結構之SOD1 RNAi藥劑的組合物。
SOD1 RNAi藥劑之使用提供用於治療性(包括防治性)治療SOD1蛋白含量之降低可提供治療益處之疾病或病症的方法。本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑可用於治療各種神經退化疾病,包括ALS及阿茲海默氏症。此類治療方法包括向升高或突變型SOD1酶或SOD1酶活性超出所需水平之人類或動物投與SOD1 RNAi藥劑。
定義
如本文所用,術語「寡核苷酸」及「聚核苷酸」意謂鍵聯核苷的聚合物,該等鍵聯核苷中之各者可獨立地經修飾或未經修飾。
如本文所用,「RNAi藥劑」(亦稱為「RNAi觸發劑」)意謂含有RNA或RNA樣(例如經化學修飾之RNA)寡核苷酸分子之化學組合物,其能夠以序列特異性方式降解或抑制(例如在適當條件下降解或抑制)目標mRNA之信使RNA (mRNA)轉錄本的轉譯。如本文所用,RNAi藥劑可經由RNA干擾機制(亦即,經由與哺乳動物細胞之RNA干擾路徑機制(RNA誘導沈默複合物或RISC)之相互作用誘導RNA干擾)或藉由任何替代性機制或路徑來起作用。儘管咸信RNAi藥劑(如該術語在本文中所使用)主要經由RNA干擾機制起作用,但所揭示之RNAi藥劑不藉由任何特定路徑或作用機制結合或受限於任何特定路徑或作用機制。本文所揭示之RNAi藥劑包含有義股及反義股,且包括但不限於:小(或短)干擾RNA (siRNA)、雙股RNA (dsRNA)、微小RNA (miRNA)、短髮夾RNA (shRNA)及dicer受質。本文所描述之RNAi藥劑之反義股與所靶向之mRNA (亦即SOD1 mRNA)至少部分互補。RNAi藥劑可包括一或多種經修飾之核苷酸及/或一或多種非磷酸二酯鍵聯。
如本文所用,當提及給定基因之表現時,術語「沈默」、「降低」、「抑制」、「下調」或「基因敲減(knockdown)」意謂當用本文所描述之RNAi藥劑治療細胞、細胞群、組織、器官或個體時,相較於未曾或尚未經歷該治療之第二細胞、細胞群、組織、器官或個體,基因表現降低,藉由其中基因經轉錄之細胞、細胞群、組織、器官或個體中自基因轉錄之RNA含量或自mRNA轉譯之多肽、蛋白或蛋白次單元之含量所量測。
如本文所用,術語「序列」及「核苷酸序列」意謂使用標準命名法用一連串字母描述之一連串或一系列核鹼基或核苷酸。
如本文所用,「鹼基」、「核苷酸鹼基」或「核鹼基」為作為核苷酸組分之雜環嘧啶或嘌呤化合物,且包括主要嘌呤鹼基腺嘌呤及鳥嘌呤以及主要嘧啶鹼基胞嘧啶、胸腺嘧啶及尿嘧啶。核鹼基可進一步經修飾以包括但不限於通用鹼基、疏水性鹼基、混雜鹼基、尺寸擴展鹼基及氟化鹼基。(參見例如Modified Nucleosides in Biochemistry, Biotechnology and Medicine, Herdewijn, P.編Wiley-VCH, 2008)。此類經修飾之核鹼基(包括含有經修飾之核鹼基之胺基亞磷酸酯化合物)之合成為此項技術中已知的。
如本文所用且除非另外指示,否則術語「互補」在用於相對於第二核鹼基或核苷酸序列(例如,RNAi藥劑反義股或單股反義寡核苷酸)描述第一核鹼基或核苷酸序列(例如,RNAi藥劑有義股或靶向mRNA)時,意謂包括第一核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸在某些標準條件下與包括第二核苷酸序列之寡核苷酸雜交(在哺乳動物生理條件(或其他適合之活體內或活體外條件)下形成鹼基對氫鍵)及形成雙螺旋體或雙螺旋結構之能力。一般熟習此項技術者將能夠選擇最適合於雜交測試之條件組。至少在滿足以上雜交要求之範圍內,互補序列包括沃森-克里克鹼基對(Watson-Crick base pair)或非沃森-克里克鹼基對且包括天然或經修飾之核苷酸或核苷酸模擬物。序列一致性或互補性與修飾無關。舉例而言,出於判定一致性或互補性之目的,如本文所定義之a及Af與U (或T)互補,且與A一致。
如本文所用,「完美互補」或「完全互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中之所有(100%)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中之相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
如本文所用,「部分互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中的至少70% (但並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中的相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
如本文所用,「實質上互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中之至少85% (但並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中之相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
如本文所用,術語「互補」、「完全互補」、「部分互補」及「實質上互補」係關於RNAi藥劑之有義股與反義股之間或RNAi藥劑之反義股與SOD1 mRNA之序列之間的核鹼基或核苷酸匹配而使用。
如本文所用,可用於核酸序列之術語「實質上一致」或「實質一致性」意謂核苷酸序列(或核苷酸序列之一部分)相較於參考序列具有至少約85%序列一致性或更高,例如至少90%、至少95%或至少99%一致性。序列一致性之百分比係藉由在比較窗口內比較兩個最佳比對序列來測定。藉由如下步驟計算百分比:測定兩個序列中存在之相同類型的核酸鹼基的位置數,得到匹配位置數,將匹配位置數除以比較窗中之總位置數且將結果乘以100,得到序列一致性百分比。本文中所揭示之發明涵蓋與本文中所揭示之核苷酸序列實質上一致的核苷酸序列。
如本文所用,術語「治療(treat)」、「治療(treatment)」及其類似者意謂用於提供個體疾病之一或多個症狀之次數、嚴重程度及/或頻率的減輕或緩解之方法或步驟。如本文所用,「治療(treat)」及「治療(treatment)」可包括個體中之疾病之一或多個症狀的次數、嚴重程度及/或頻率之預防、管理、防治性治療及/或抑制或降低。
如本文所用,當提及RNAi藥劑時,片語「引入細胞中」意謂將RNAi藥劑功能性遞送至細胞中。片語「功能性遞送」意謂以使RNAi藥劑能夠具有預期生物活性(例如,基因表現之序列特異性抑制)之方式將RNAi藥劑遞送至細胞中。
除非另外陳述,否則使用如本文所用之符號
意謂根據本文所描述之發明之範疇任何基團可與其連接。
如本文所用,術語「異構物」係指具有相同分子式,但在性質或其原子之鍵結序列或其原子在空間中之排列方面不同的化合物。在其原子空間排列方面不同之異構物稱為「立體異構物」。彼此不為鏡像之立體異構物稱為「非鏡像異構物」,且為不可重疊之鏡像的立體異構物稱為「鏡像異構物」或有時稱為光學異構物。鍵合至四個不相同的取代基之碳原子稱為「對掌性中心」。
如本文所用,除非在結構中特定鑑別為具有特定構形,否則對於其中存在不對稱中心且因此產生鏡像異構物、非鏡像異構物或其他立體異構組態之各結構,本文所揭示之各結構意欲表示所有此類可能的異構物,包括其光學純及外消旋形式。舉例而言,本文所揭示之結構意欲涵蓋非鏡像異構物之混合物以及單一立體異構物。
如在本文申請專利範圍中所使用,片語「由…組成」不包括申請專利範圍中未指定之任何要素、步驟或成分。當用於本文之申請專利範圍中時,片語「基本上由……組成」將申請專利範圍之範疇限制於所指定之材料或步驟及實質上不影響所主張發明之基礎及新穎特徵的材料或步驟。
一般熟習此項技術者將容易理解及瞭解,視化合物或組合物所置放的環境而定,本文所揭示之化合物及組合物可具有呈質子化或去質子化狀態之某些原子(例如,N、O或S原子)。因此,如本文所用,本文所揭示之結構設想,某些官能基(諸如OH、SH或NH)可進行質子化或去質子化。本文之揭示內容意欲涵蓋所揭示化合物及組合物,而與其基於環境(諸如pH)之質子化狀態無關,如一般熟習此項技術者可容易地理解。對應地,具有不穩定質子或鹼性原子之本文所描述之化合物亦應理解為表示對應化合物之鹽形式。本文所描述之化合物可呈游離酸、游離鹼或鹽形式。本文所描述之化合物的醫藥學上可接受之鹽應理解為在本發明之範疇內。
如本文所用,當參考兩種化合物或分子之間的連接時,術語「連接」或「結合」意謂兩種化合物或分子藉由共價鍵接合。除非加以陳述,否則如本文所用,術語「連接」及「結合」可指第一化合物與第二化合物之間在存在或不存在任何插入原子或原子基團之情況下的連接。
如本文所用,術語「包括」在本文中用於意謂片語「包括但不限於」且可與該片語互換使用。除非上下文另有明確指示,否則術語「或」在本文中用於意謂術語「及/或」且可與該術語互換使用。
除非另外定義,否則本文所用之所有技術及科學術語均具有如一般熟習此項技術者通常所理解的相同含義。儘管類似或等效於本文所描述之方法及材料可用於本發明的實踐或測試中,但下文描述適合的方法及材料。本文所提及之所有公開案、專利申請案、專利及其他參考案均以全文引用的方式併入本文中。倘若有衝突,本說明書(包括定義)將占主導。另外,該等材料、方法及實例僅為說明性的且並不意欲為限制性的。
本發明之其他目標、特徵、態樣及優勢將自以下實施方式、附圖及申請專利範圍而變得顯而易見。
相關申請案之交叉參考
本申請案主張2023年4月11日申請之美國臨時專利申請案第63/495,517號及2022年6月15日申請之美國臨時專利申請案第63/352,454號之優先權,該等申請案中之各者的內容以全文引用之方式併入本文中。
序列表
本申請案含有序列表,該序列表已以電XML格式提交且以全文引用之方式併入本文中。XML複本命名為30699-WO_SEQLIST.xml,創建於2023年6月13日,且大小為6499 kb。
RNAi 藥劑
本文描述用於抑制SOD1基因表現之RNAi藥劑(在本文中稱為SOD1 RNAi藥劑或SOD1 RNAi觸發劑)。本文所揭示之各SOD1 RNAi藥劑包含有義股及反義股。有義股之長度可為15至49個核苷酸。反義股之長度可為18至30個核苷酸。有義股及反義股可為相同長度或其可為不同長度。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自獨立地為18至27個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股兩者之長度各自為21-26個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自為21-24個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自獨立地為19-21個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約19個核苷酸,而反義股之長度為約21個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約21個核苷酸,而反義股之長度為約23個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為23個核苷酸,且反義股之長度為21個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股兩者之長度各自為21個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑有義股之長度各自獨立地為15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48或49個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑反義股之長度各自獨立地為18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸。在一些實施例中,雙股RNAi藥劑具有約16、17、18、19、20、21、22、23或24個核苷酸之雙螺旋體長度。
用於形成SOD1 RNAi藥劑之核苷酸序列的實例提供於表2、3、4、5、6及10中。包括表2、3、4、5、6中之有義股及反義股序列的RNAi藥劑雙螺旋體的實例顯示於表7A、7B、8、9A及10中。
在一些實施例中,有義股與反義股之間完全互補、實質上互補或部分互補的區域之長度為16-26 (例如16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26)個核苷酸,且存在於反義股之5'端或其附近(例如,此區域可與反義股之5'端間隔0、1、2、3或4個不是完全互補、實質上互補或部分互補的核苷酸)。
本文所描述之SOD1 RNAi藥劑之有義股包括與SOD1 mRNA中相同數目個核苷酸之核心延伸段序列(在本文中亦稱為「核心延伸段」或「核心序列」)具有至少85%一致性的至少15個連續核苷酸。在一些實施例中,有義股核心延伸段序列與反義股中之核心延伸段序列100% (完美)互補或至少約85% (實質上)互補,且因此有義股核心延伸段序列通常與SOD1 mRNA目標中存在之相同長度(有時稱為例如目標序列)之核苷酸序列完美一致或至少約85%一致。在一些實施例中,此有義股核心延伸段之長度為15、16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心延伸段之長度為17個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心延伸段之長度為19個核苷酸。
本文所描述之SOD1 RNAi藥劑之反義股包括與SOD1 mRNA中具有相同數目個核苷酸的核心延伸段及對應有義股中具有相同數目個核苷酸之核心延伸段具有至少85%互補性之至少16個連續核苷酸。在一些實施例中,反義股核心延伸段與SOD1 mRNA目標中存在之相同長度之核苷酸序列(例如目標序列)100% (完美)互補或至少約85% (實質上)互補。在一些實施例中,此反義股核心延伸段之長度為16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心延伸段之長度為19個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心延伸段之長度為17個核苷酸。有義股核心延伸段序列可具有與對應反義核心序列相同的長度或其可為不同長度。
SOD1 RNAi藥劑有義股及反義股黏接形成雙螺旋體。SOD1 RNAi藥劑之有義股及反義股可彼此部分、實質上或完全互補。在互補雙螺旋體區內,有義股核心延伸段序列與反義核心延伸段序列至少85%互補或100%互補。在一些實施例中,有義股核心延伸段序列含有具有與反義股核心延伸段序列之對應16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸序列至少85%或100%互補之至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22或至少23個核苷酸的序列(亦即SOD1 RNAi藥劑之有義及反義核心延伸段序列具有至少85%鹼基配對或100%鹼基配對之至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22或至少23個核苷酸的區域)。
在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之反義股與表2或表3中之任一反義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之有義股與表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一有義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,有義股及/或反義股可視情況且獨立地在核心延伸段序列之3'端、5'端或3'及5'端兩者處含有額外1、2、3、4、5或6個核苷酸(延伸部分)。反義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與SOD1 mRNA中之對應序列互補。有義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與SOD1 mRNA中之對應序列一致。反義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與對應有義股之額外核苷酸(若存在)互補。
如本文所用,延伸部分在有義股核心延伸段序列及/或反義股核心延伸段序列之5'及/或3'端包含1、2、3、4、5或6個核苷酸。有義股上之延伸部分核苷酸可與或可不與對應反義股中之核苷酸(核心延伸段序列核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。相反,反義股上之延伸部分核苷酸可與或可不與對應有義股中之核苷酸(核心延伸段核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股與反義股兩者均含有3'及5'延伸部分。在一些實施例中,一個股之一或多個3'延伸核苷酸與另一股之一或多個5'延伸核苷酸鹼基配對。在其他實施例中,一個股之一或多個3'延伸部分核苷酸不與另一股之一或多個5'延伸部分核苷酸鹼基配對。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑具有含有3'延伸部分之反義股及含有5'延伸部分之有義股。在一些實施例中,延伸部分核苷酸未配對且形成懸垂物。如本文所用,「懸垂物」係指位於有義股或反義股之末端處的一或多個未配對核苷酸的延伸段,其不形成本文中所揭示之RNAi藥劑之雜交部分或雙螺旋部分的部分。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4、5或6個核苷酸之3'延伸部分之反義股。在其他實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2或3個核苷酸之3'延伸部分的反義股。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含與對應SOD1 mRNA序列互補之核苷酸。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含不與對應SOD1 mRNA序列互補之核苷酸。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4或5個核苷酸之3'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含腺苷、尿嘧啶或胸苷核苷酸、AT二核苷酸或與SOD1 mRNA序列中之核苷酸對應或一致的核苷酸。在一些實施例中,3'有義股延伸部分包括或由以下序列中之一者組成(但不限於):T、UT、TT、UU、UUT、TTT、或TTTT (各自5'至3'列出)。
有義股可具有3'延伸部分及/或5'延伸部分。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4、5或6個核苷酸之5'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含與SOD1 mRNA序列中之核苷酸對應或一致的核苷酸。
用於形成SOD1 RNAi藥劑之序列的實例提供於表2、3、4、5、6及10中。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包括表2、3或10中之任一序列的序列。在某些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表3中之任一經修飾之序列或由其組成。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包括表2或表3中之任一序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17、2-15、2-17、1-18、2-18、1-19、2-19、1-20、2-20、1-21或2-21之序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包括表2、4、5或6中之任一序列的序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包括表2、4、5或6中之任一序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-18、1-19、1-20、1-21、2-19、2-20、2-21、3-20、3-21或4-21之序列。在某些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包含表4、5、6或10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列或由其組成。
在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑之有義股及反義股含有相同數目個核苷酸。在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑之有義股及反義股含有不同數目個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均非鈍端。如本文所用,「鈍端」係指雙股RNAi藥劑中兩個黏著股之末端核苷酸互補(形成互補鹼基對)的一端。
在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之末端均非磨損端。如本文所用,磨損端係指雙股RNAi藥劑之一端,其中兩個黏著股之末端核苷酸形成對(亦即,不形成懸垂物),但並不互補(亦即,形成非互補對)。在一些實施例中,雙股RNAi藥劑之一個股之末端處的一或多個未配對核苷酸形成懸垂物。未配對核苷酸可位於有義股或反義股上,從而產生3'或5'懸垂物。在一些實施例中,RNAi藥劑含有:鈍端及磨損端、鈍端及5'懸垂端、鈍端及3'懸垂端、磨損端及5'懸垂端、磨損端及3'懸垂端、兩個5'懸垂端、兩個3'懸垂端、5'懸垂端及3'懸垂端、兩個磨損端或兩個鈍端。通常,懸垂物(若存在)位於有義股、反義股或有義股及反義股兩者之3'末端。
本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑亦可由一或多個經修飾之核苷酸構成。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有義股的實質上全部核苷酸及反義股的實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑可進一步由一或多個經修飾之核苷間鍵聯,例如一或多個硫代磷酸酯鍵聯構成。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸及一或多個經修飾之核苷間鍵聯。在一些實施例中,2'-修飾之核苷酸與經修飾之核苷間鍵聯組合。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備或提供為鹽、混合鹽或無酸形式。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備為醫藥學上可接受之鹽形式。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備為醫藥學上可接受之鈉鹽形式。此項技術中所熟知之此類形式在本文中所揭示之發明之範疇內。
經修飾之核苷酸
當用於各種寡核苷酸構築體中時,經修飾之核苷酸可保留該化合物在細胞中之活性,同時增加此等化合物之血清穩定性,且亦可最小化在投與寡核苷酸構築體後人類中活化干擾素活性之可能性。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸。如本文所用,「經修飾之核苷酸」為除核糖核苷酸(2'-羥基核苷酸)以外的核苷酸。在一些實施例中,至少50% (例如至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或100%)的核苷酸為經修飾之核苷酸。如本文所用,經修飾之核苷酸可包括但不限於去氧核糖核苷酸、核苷酸模擬物、無鹼基核苷酸、2'-修飾之核苷酸、反向核苷酸、包含經修飾之核鹼基之核苷酸、橋聯核苷酸、肽核酸(PNA)、2',3'-開環核苷酸模擬物(解鎖核鹼基類似物核鹼基、鎖定核苷酸、3'-O-甲氧基(2'核苷間連接)核苷酸、2'-F-阿拉伯核苷酸、5'-Me,2'-氟核苷酸、(N-𠰌啉基)核苷酸、膦酸乙烯酯去氧核糖核苷酸、含膦酸乙烯酯之核苷酸及含膦酸環丙酯之核苷酸。2'-修飾之核苷酸(亦即在五員糖環之2'位置具有除羥基以外之基團的核苷酸)包括但不限於2'-O-甲基核苷酸(本文中或此項技術中亦稱為2'-甲氧基核苷酸)、2'-氟核苷酸(本文中或此項技術中亦稱為2'-去氧-2'-氟核苷酸)、2'-去氧核苷酸、2'-甲氧基乙基(2'-O-2-甲氧基乙基)核苷酸(本文中或此項技術中亦稱為2'-MOE核苷酸)、2'-胺基核苷酸及2'-烷基核苷酸。並非既定化合物之所有位置均需經均一修飾。相反,超過一個修飾可併入單一SOD1 RNAi藥劑中或甚至其單個核苷酸中。SOD1 RNAi藥劑有義股及反義股可藉由此項技術中已知之方法合成及/或修飾。一個核苷酸處之修飾獨立於另一核苷酸處之修飾。
經修飾之核鹼基包括合成及天然核鹼基,諸如5-取代之嘧啶;6-氮雜嘧啶及N-2、N-6及O-6取代之嘌呤(例如2-胺基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶或5-丙炔基胞嘧啶);5-甲基胞嘧啶(5-me-C);5-羥甲基胞嘧啶;肌苷;黃嘌呤;次黃嘌呤;2-胺基腺嘌呤;腺嘌呤及鳥嘌呤之6-烷基(例如6-甲基、6-乙基、6-異丙基或6-正丁基)衍生物;腺嘌呤及鳥嘌呤之2-烷基(例如2-甲基、2-乙基、2-異丙基或2-正丁基)及其他烷基衍生物;2-硫尿嘧啶;2-硫胸腺嘧啶;2-硫胞嘧啶;5-鹵基尿嘧啶;胞嘧啶;5-丙炔基尿嘧啶;5-丙炔基胞嘧啶;6-偶氮尿嘧啶;6-偶氮胞嘧啶;6-偶氮胸腺嘧啶;5-尿嘧啶(假尿嘧啶);4-硫尿嘧啶;8-鹵基、8-胺基、8-硫氫基、8-硫烷基、8-羥基及其他8-取代之腺嘌呤及鳥嘌呤;5-鹵基(例如5-溴)、5-三氟甲基及其他5-取代之尿嘧啶及胞嘧啶;7-甲基鳥嘌呤及7-甲基腺嘌呤;8-氮雜鳥嘌呤及8-氮雜腺嘌呤;7-脫氮鳥嘌呤;7-脫氮腺嘌呤;3-脫氮鳥嘌呤;及3-脫氮腺嘌呤。
在一些實施例中,反義股之5'及/或3'端可包括無鹼基殘基(Ab),其亦可稱為「無鹼基位點」或「無鹼基核苷酸」。無鹼基殘基(Ab)為在糖部分之1'位置不具有核鹼基之核苷酸或核苷。(參見例如美國專利第5,998,203號)。在一些實施例中,無鹼基殘基可置於核苷酸序列內部。在一些實施例中,Ab或AbAb可添加至反義股之3'端。在一些實施例中,有義股之5'端可包括一或多個額外無鹼基殘基(例如,(Ab)或(AbAb))。在一些實施例中,UUAb、UAb或Ab添加至有義股之3'端。在一些實施例中,無鹼基(去氧核糖)殘基可經核糖醇(無鹼基核糖)殘基置換。
在一些實施例中,RNAi藥劑之全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。如本文所用,其中所存在的實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸之RNAi藥劑為有義股及反義股兩者中四個或更少(亦即0、1、2、3或4個)核苷酸為核糖核苷酸(亦即未經修飾)的RNAi藥劑。如本文所用,其中存在之實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸的有義股為有義股中兩個或更少(亦即0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的有義股。如本文所用,其中所存在之實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸的反義股為反義股中兩個或更少(亦即0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的反義股。在一些實施例中,RNAi藥劑之一或多個核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸。某些經修飾之核苷酸之化學結構闡述於本文表11中。
經修飾之核苷間鍵聯
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之一或多個核苷酸由非標準鍵聯或主鏈(亦即,經修飾之核苷間鍵聯或經修飾之主鏈)連接。經修飾之核苷間鍵聯或主鏈包括但不限於硫代磷酸酯基(本文中表示為小寫字母「s」)、對掌性硫代磷酸酯、硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、胺基烷基-磷酸三酯、膦酸烷基酯(例如膦酸甲酯或3'-伸烷基膦酸酯)、對掌性膦酸酯、亞膦酸酯、胺基磷酸酯(例如3'-胺基胺基磷酸酯、胺基烷基胺基磷酸酯或硫羰基胺基磷酸酯)、硫羰基烷基-膦酸酯、硫羰基烷基磷酸三酯、(N-𠰌啉基)鍵聯、具有正常3'-5'鍵聯之硼烷磷酸酯、硼烷磷酸酯之2'-5'連接之類似物或具有反向極性之硼烷磷酸酯,其中相鄰核苷單元對使3'-5'連接至5'-3'或使2'-5'連接至5'-2'。在一些實施例中,經修飾之核苷間鍵聯或主鏈不具有磷原子。不具有磷原子之經修飾之核苷間鍵聯包括但不限於短鏈烷基或環烷基糖間鍵聯、混合雜原子及烷基或環烷基糖間鍵聯或一或多個短鏈雜原子或雜環糖間鍵聯。在一些實施例中,經修飾之核苷間主鏈包括但不限於矽氧烷主鏈、硫醚主鏈、亞碸主鏈、碸主鏈、甲醯基及硫甲醯基主鏈、亞甲基甲醯基及硫甲醯基主鏈、含有烯烴之主鏈、胺基磺酸酯主鏈、亞甲基亞胺基及亞甲基肼基主鏈、磺酸酯及磺醯胺主鏈、醯胺主鏈及其他具有混合N、O、S及CH
2組分之主鏈。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯,SOD1 RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯,或有義股及反義股兩者可獨立地含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯,SOD1 RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯,或有義股及反義股兩者可獨立地含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股含有至少兩個硫代磷酸酯核苷間鍵。在一些實施例中,硫代磷酸酯核苷間鍵在有義股之3'端的位置1-3處的核苷酸之間。在一些實施例中,一個硫代磷酸酯核苷間鍵聯在有義股核苷酸序列之5'端,且另一硫代磷酸酯鍵聯在有義股核苷酸序列之3'端。在一些實施例中,兩個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於有義股之5'端,且另一硫代磷酸酯鍵聯位於有義股之3'端。在一些實施例中,有義股在核苷酸之間不包任何硫代磷酸酯核苷間鍵聯,但在5'及3'端上之末端核苷酸之間含有一個、兩個或三個硫代磷酸酯鍵聯,且視情況存在反向無鹼基殘基端帽。在一些實施例中,靶向配體經由硫代磷酸酯鍵聯與有義股連接。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股含有四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在一些實施例中,四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置1-3處的核苷酸之間以及自5'端之位置19-21、20-22、21-23、22-24、23-25或24-26處的核苷酸之間。在一些實施例中,三個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置1-4之間,且第四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置20-21之間。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑在反義股中含有至少三個或四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。
加帽殘基或部分
在一些實施例中,有義股可包括一或多個加帽殘基或部分,在此項技術中時常稱為「帽」、「端帽」或「加帽殘基」。如本文所用,「加帽殘基」為非核苷酸化合物或可併入本文所揭示之RNAi藥劑之核苷酸序列的一或多個端處之其他部分。在一些情況下,加帽殘基可為RNAi藥劑提供某些有益特性,諸如防止核酸外切酶降解。在一些實施例中,添加反向無鹼基殘基(invAb) (在此項技術中亦稱為「反向無鹼基位點」)作為加帽殘基(參見表11)。(參見例如F. Czauderna, Nucleic Acids Res., 2003, 31(11), 2705-16)。加帽殘基為此項技術中通常已知的,且包括例如反向無鹼基殘基以及碳鏈,諸如末端C
3H
7(丙基)、C
6H
13(己基)或C
12H
25(十二烷基)基團。在一些實施例中,在有義股之5'末端、3'末端或5'及3'末端兩者處存在加帽殘基。在一些實施例中,有義股之5'端及/或3'端可包括超過一個反向無鹼基去氧核苷部分作為加帽殘基。
在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之3'端。在一些實施例中,一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點插入於靶向配體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個端末端或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。
在一些實施例中,一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,可將一或多個反向無鹼基殘基插入於靶向配體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。反向無鹼基殘基可經由磷酸酯鍵聯、硫代磷酸酯鍵聯(例如,本文中顯示為(invAb)s))或其他核苷間鍵聯連接。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個末端或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基可允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。在一些實施例中,反向無鹼基(去氧核糖)殘基可經反向核糖醇(無鹼基核糖)殘基置換。在一些實施例中,反義股核心延伸段序列之3'端或反義股序列之3'端可包括反向無鹼基殘基。反向無鹼基去氧核糖殘基之化學結構顯示於下表11中。
SOD1 RNAi 藥劑
本文揭示之SOD1 RNAi藥劑設計成靶向SOD1基因(例如SEQ ID NO: 1 (NM_000454.5))上之特定位置。依本文所定義,反義股序列設計成當與SOD1基因鹼基配對時,當反義股之5'端核鹼基與該基因上在給定位置下游(朝向3'端) 21個核苷酸處的位置比對時,在該基因上之該給定位置靶向該基因。舉例而言,如本文中表1及2所說明,設計成靶向SOD1基因位置304處之反義股序列需要在與該基因鹼基配對時,反義股之5'末端核鹼基與SOD1基因之位置324比對。
如本文所提供,SOD1 RNAi藥劑不需要反義股之位置1 (5'→3')處的核鹼基與該基因互補,其限制條件為與反義股及跨越至少16個連續核苷酸之核心延伸段序列的基因存在至少85%互補性(例如至少85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%互補性)。舉例而言,對於設計成靶向SOD1基因之位置304的本文揭示之SOD1 RNAi藥劑而言,SOD1 RNAi藥劑之反義股之5'端核鹼基必須與該基因之位置324比對;然而,反義股之5'端核鹼基可能但未必與SOD1基因之位置324互補,其限制條件為反義股及跨越至少16個連續核苷酸之核心延伸段序列之基因轉錄本存在至少85%互補性(例如至少85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%互補性)。尤其如本文揭示之各種實例所示,在藉由SOD1 RNAi藥劑來達成之抑制水平方面,該基因由SOD1 RNAi藥劑(例如無論SOD1 RNAi藥劑設計成靶向SOD1基因位置304處、位置264處、位置785處或一些其他位置處)之反義股結合之特異性位點為一種重要因子。(參見例如Kamola等人,
The siRNA Non-seed Region and Its Target Sequences are Auxiliary Determinants of Off-Target Effects,PLOS Computational Biology, 11(12),圖1(2015))。
在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑靶向SOD1基因之表1中顯示之SOD1序列之位置處或其附近。在一些實施例中,本文揭示之SOD1 RNAi藥劑之反義股包括與表1中揭示之目標SOD1 19聚體序列完全、實質上或至少部分互補的核心延伸段序列。
表 1.SOD1 19聚體mRNA目標序列(獲自智人(
homo sapiens)超氧化物歧化酶1(SOD1)轉錄本,基因庫(GenBank) NM_000454.5 (SEQ ID NO:1))
SEQ ID No. | SOD1 19 聚體 目標序列 (5 ' → 3') | SEQ ID NO: 1 上序列之對應位置 | 靶向基因位置( 如本文中所提及) |
290 | UCACUUUAAUCCUCUAUCC | 266 - 284 | 264 |
295 | UAACUCAUCUGUUAUCCUG | 573 - 591 | 571 |
349 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 377 - 395 | 375 |
304 | CCCAGUGCAGGGCAUCAUC | 116 - 134 | 114 |
309 | AGCAGAAGGAAAGUAAUGG | 142 - 160 | 140 |
314 | AAGUAAUGGACCAGUGAAG | 152 - 170 | 150 |
319 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUC | 204 - 222 | 202 |
322 | UGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 205 - 223 | 203 |
326 | GCAUGGAUUCCAUGUUCAU | 206 - 224 | 204 |
332 | UCCAUGUUCAUGAGUUUGG | 214 - 232 | 212 |
337 | CAGGUCCUCACUUUAAUCC | 259 - 277 | 257 |
342 | GAUGAAGAGAGGCAUGUUG | 306 - 324 | 304 |
345 | AUUGAAGAUUCUGUGAUCU | 375 - 393 | 373 |
349 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 377 - 395 | 375 |
355 | UGGUGGUCCAUGAAAAAGC | 430 - 448 | 428 |
358 | AUGAAAAAGCAGAUGACUU | 439 - 457 | 437 |
364 | UGAAAAAGCAGAUGACUUG | 440 - 458 | 438 |
369 | GUGGAAAUGAAGAAAGUAC | 466 - 484 | 464 |
374 | GGCUUGUGGUGUAAUUGGG | 512 - 530 | 510 |
379 | AACAUUCCCUUGGAUGUAG | 542 - 560 | 540 |
384 | UUCCCUUGGAUGUAGUCUG | 546 - 564 | 544 |
389 | CUUAACUCAUCUGUUAUCC | 571 - 589 | 569 |
392 | UUAACUCAUCUGUUAUCCU | 572 - 590 | 570 |
398 | UAACUCAUCUGUUAUCCUG | 573 - 591 | 571 |
403 | AACUCAUCUGUUAUCCUGC | 574 - 592 | 572 |
408 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGC | 578 - 596 | 576 |
413 | UCUGUUAUCCUGCUAGCUG | 580 - 598 | 578 |
416 | UAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 585 - 603 | 583 |
422 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUG | 588 - 606 | 586 |
425 | UGCUAGCUGUAGAAAUGUA | 590 - 608 | 588 |
429 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAU | 591 - 609 | 589 |
435 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCC | 593 - 611 | 591 |
440 | GCUGUAGAAAUGUAUCCUG | 595 - 613 | 593 |
443 | CUGUAGAAAUGUAUCCUGA | 596 - 614 | 594 |
447 | AAUGUAUCCUGAUAAACAU | 603 - 621 | 601 |
451 | CUGAUAAACAUUAAACACU | 611 - 629 | 609 |
455 | ACAUUAAACACUGUAAUCU | 618 - 636 | 616 |
459 | AUUAAACACUGUAAUCUUA | 620 - 638 | 618 |
465 | CUUUAAAGUACCUGUAGUG | 670 - 688 | 668 |
470 | ACUGAUUUAUGAUCACUUG | 693 - 711 | 691 |
473 | AUGAUCACUUGGAAGAUUU | 701 - 719 | 699 |
477 | AUCACUUGGAAGAUUUGUA | 704 - 722 | 702 |
481 | UGGAAGAUUUGUAUAGUUU | 710 - 728 | 708 |
485 | GUUAAAAUGUCUGUUUCAA | 740 - 758 | 738 |
489 | AUGUCUGUUUCAAUGACCU | 746 - 764 | 744 |
493 | GUUUCAAUGACCUGUAUUU | 752 - 770 | 750 |
497 | CCUGUAUUUUGCCAGACUU | 762 - 780 | 760 |
501 | AAAUCACAGAUGGGUAUUA | 781 - 799 | 779 |
505 | ACAGAUGGGUAUUAAACUU | 786 - 804 | 784 |
511 | CAGAUGGGUAUUAAACUUG | 787 - 805 | 785 |
514 | AGAUGGGUAUUAAACUUGU | 788 - 806 | 786 |
518 | AUGGGUAUUAAACUUGUCA | 790 - 808 | 788 |
智人超氧化物歧化酶(SOD1),基因庫NM_000454.5 (SEQ ID NO:1),基因轉錄本(895個鹼基):
1 gcgtcgtagt ctcctgcagc gtctggggtt tccgttgcag tcctcggaac caggacctcg
61 gcgtggccta gcgagttatg gcgacgaagg ccgtgtgcgt gctgaagggc gacggcccag
121 tgcagggcat catcaatttc gagcagaagg aaagtaatgg accagtgaag gtgtggggaa
181 gcattaaagg actgactgaa ggcctgcatg gattccatgt tcatgagttt ggagataata
241 cagcaggctg taccagtgca ggtcctcact ttaatcctct atccagaaaa cacggtgggc
301 caaaggatga agagaggcat gttggagact tgggcaatgt gactgctgac aaagatggtg
361 tggccgatgt gtctattgaa gattctgtga tctcactctc aggagaccat tgcatcattg
421 gccgcacact ggtggtccat gaaaaagcag atgacttggg caaaggtgga aatgaagaaa
481 gtacaaagac aggaaacgct ggaagtcgtt tggcttgtgg tgtaattggg atcgcccaat
541 aaacattccc ttggatgtag tctgaggccc cttaactcat ctgttatcct gctagctgta
601 gaaatgtatc ctgataaaca ttaaacactg taatcttaaa agtgtaattg tgtgactttt
661 tcagagttgc tttaaagtac ctgtagtgag aaactgattt atgatcactt ggaagatttg
721 tatagtttta taaaactcag ttaaaatgtc tgtttcaatg acctgtattt tgccagactt
781 aaatcacaga tgggtattaa acttgtcaga atttctttgt cattcaagcc tgtgaataaa
841 aaccctgtat ggcacttatt atgaggctat taaaagaatc caaattcaaa ctaaa
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包括反義股,其中反義股之位置19 (5'→3')能夠與表1中揭示之19聚體目標序列之位置1形成鹼基對。在一些實施例中,SOD1藥劑包括反義股,其中反義股之位置1 (5'→3')能夠與表1中揭示之19聚體目標序列之位置19形成鹼基對。
在一些實施例中,SOD1藥劑包括反義股,其中反義股之位置2 (5'→3')能夠與表1中揭示之19聚體目標序列之位置18形成鹼基對。在一些實施例中,SOD1藥劑包括反義股,其中反義股之位置2至18 (5'→3')能夠與位於表1中揭示之19聚體目標序列之位置18至2處之各別互補鹼基中之各者形成鹼基對。
對於本文所揭示之RNAi藥劑而言,反義股之位置1處的核苷酸(自5'端→3'端)可與SOD1基因完美互補,或可與SOD1基因非互補。在一些實施例中,反義股之位置1處之核苷酸(自5'端→3'端)為U、A或dT。在一些實施例中,反義股之位置1處之核苷酸(自5'端→3'端)與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之任一反義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 2-18或2-19的序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi有義股包含表2、表4、表5、表6或表6a中之任一有義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17、1-18或2-18的序列。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑由以下構成:(i)反義股,其包含表2或表3中之任一反義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 2-18或2-19的序列;及(ii)有義股,其包含表2、表4、表5、表6或表6a中之任一有義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17或1-18的序列。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包括下表2中所示之核心19聚體核苷酸序列。
表 2.SOD1 RNAi藥劑反義股及有義股核心延伸段鹼基序列(N=任何核鹼基;I=肌苷(次黃嘌呤核鹼基))
SEQ ID NO:. | 反義股鹼基序列 (5' → 3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) | SEQ ID NO:. | 有 義股鹼基序列 (5' → 3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) | SEQ ID NO: 1 上之經 鑑別序列的對應位置 | 靶向基因位置 |
54 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 288 | UCACUUUAAUCCUCUAUCA | 266 - 284 | 264 |
55 | AGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 289 | UCACUUUAAUCCUCUAUCU | 266 - 284 | 264 |
56 | GGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 290 | UCACUUUAAUCCUCUAUCC | 266 - 284 | 264 |
57 | NGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 291 | UCACUUUAAUCCUCUAUCN | 266 - 284 | 264 |
58 | NGAUAGAGGAUUAAAGUGN | 292 | NCACUUUAAUCCUCUAUCN | 266 - 284 | 264 |
59 | UAGGAUAACAGAUGAGUUA | 293 | UAACUCAUCUGUUAUCCUA | 573 - 591 | 571 |
60 | AAGGAUAACAGAUGAGUUA | 294 | UAACUCAUCUGUUAUCCUU | 573 - 591 | 571 |
61 | CAGGAUAACAGAUGAGUUA | 295 | UAACUCAUCUGUUAUCCUG | 573 - 591 | 571 |
62 | NAGGAUAACAGAUGAGUUA | 296 | UAACUCAUCUGUUAUCCUN | 573 - 591 | 571 |
63 | NAGGAUAACAGAUGAGUUN | 297 | NAACUCAUCUGUUAUCCUN | 573 - 591 | 571 |
64 | UGAGAUCACAGAAUCUUCA | 298 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 377 - 395 | 375 |
65 | AGAGAUCACAGAAUCUUCA | 299 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCU | 377 - 395 | 375 |
66 | NGAGAUCACAGAAUCUUCA | 300 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCN | 377 - 395 | 375 |
67 | NGAGAUCACAGAAUCUUCN | 301 | NGAAGAUUCUGUGAUCUCN | 377 - 395 | 375 |
68 | UAUGAUGCCCUGCACUGGG | 302 | CCCAGUGCAGGGCAUCAUA | 116 - 134 | 114 |
69 | AAUGAUGCCCUGCACUGGG | 303 | CCCAGUGCAGGGCAUCAUU | 116 - 134 | 114 |
70 | GAUGAUGCCCUGCACUGGG | 304 | CCCAGUGCAGGGCAUCAUC | 116 - 134 | 114 |
71 | NAUGAUGCCCUGCACUGGG | 305 | CCCAGUGCAGGGCAUCAUN | 116 - 134 | 114 |
72 | NAUGAUGCCCUGCACUGGN | 306 | NCCAGUGCAGGGCAUCAUN | 116 - 134 | 114 |
73 | UCAUUACUUUCCUUCUGCU | 307 | AGCAGAAGGAAAGUAAUGA | 142 - 160 | 140 |
74 | ACAUUACUUUCCUUCUGCU | 308 | AGCAGAAGGAAAGUAAUGU | 142 - 160 | 140 |
75 | CCAUUACUUUCCUUCUGCU | 309 | AGCAGAAGGAAAGUAAUGG | 142 - 160 | 140 |
76 | NCAUUACUUUCCUUCUGCU | 310 | AGCAGAAGGAAAGUAAUGN | 142 - 160 | 140 |
77 | NCAUUACUUUCCUUCUGCN | 311 | NGCAGAAGGAAAGUAAUGN | 142 - 160 | 140 |
78 | UUUCACUGGUCCAUUACUU | 312 | AAGUAAUGGACCAGUGAAA | 152 - 170 | 150 |
79 | AUUCACUGGUCCAUUACUU | 313 | AAGUAAUGGACCAGUGAAU | 152 - 170 | 150 |
80 | CUUCACUGGUCCAUUACUU | 314 | AAGUAAUGGACCAGUGAAG | 152 - 170 | 150 |
81 | NUUCACUGGUCCAUUACUU | 315 | AAGUAAUGGACCAGUGAAN | 152 - 170 | 150 |
82 | NUUCACUGGUCCAUUACUN | 316 | NAGUAAUGGACCAGUGAAN | 152 - 170 | 150 |
83 | UAACAUGGAAUCCAUGCAG | 317 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUA | 204 - 222 | 202 |
84 | AAACAUGGAAUCCAUGCAG | 318 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUU | 204 - 222 | 202 |
85 | GAACAUGGAAUCCAUGCAG | 319 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUC | 204 - 222 | 202 |
86 | NAACAUGGAAUCCAUGCAG | 320 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUN | 204 - 222 | 202 |
87 | NAACAUGGAAUCCAUGCAN | 321 | NUGCAUGGAUUCCAUGUUN | 204 - 222 | 202 |
88 | UGAACAUGGAAUCCAUGCA | 322 | UGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 205 - 223 | 203 |
89 | AGAACAUGGAAUCCAUGCA | 323 | UGCAUGGAUUCCAUGUUCU | 205 - 223 | 203 |
90 | NGAACAUGGAAUCCAUGCA | 324 | UGCAUGGAUUCCAUGUUCN | 205 - 223 | 203 |
91 | NGAACAUGGAAUCCAUGCN | 325 | NGCAUGGAUUCCAUGUUCN | 205 - 223 | 203 |
92 | AUGAACAUGGAAUCCAUGC | 326 | GCAUGGAUUCCAUGUUCAU | 206 - 224 | 204 |
93 | UUGAACAUGGAAUCCAUGC | 327 | GCAUGGAUUCCAUGUUCAA | 206 - 224 | 204 |
94 | NUGAACAUGGAAUCCAUGC | 328 | GCAUGGAUUCCAUGUUCAN | 206 - 224 | 204 |
95 | NUGAACAUGGAAUCCAUGN | 329 | NCAUGGAUUCCAUGUUCAN | 206 - 224 | 204 |
96 | UCAAACUCAUGAACAUGGA | 330 | UCCAUGUUCAUGAGUUUGA | 214 - 232 | 212 |
97 | ACAAACUCAUGAACAUGGA | 331 | UCCAUGUUCAUGAGUUUGU | 214 - 232 | 212 |
98 | CCAAACUCAUGAACAUGGA | 332 | UCCAUGUUCAUGAGUUUGG | 214 - 232 | 212 |
99 | NCAAACUCAUGAACAUGGA | 333 | UCCAUGUUCAUGAGUUUGN | 214 - 232 | 212 |
100 | NCAAACUCAUGAACAUGGN | 334 | NCCAUGUUCAUGAGUUUGN | 214 - 232 | 212 |
101 | UGAUUAAAGUGAGGACCUG | 335 | CAGGUCCUCACUUUAAUCA | 259 - 277 | 257 |
102 | AGAUUAAAGUGAGGACCUG | 336 | CAGGUCCUCACUUUAAUCU | 259 - 277 | 257 |
103 | GGAUUAAAGUGAGGACCUG | 337 | CAGGUCCUCACUUUAAUCC | 259 - 277 | 257 |
104 | NGAUUAAAGUGAGGACCUG | 338 | CAGGUCCUCACUUUAAUCN | 259 - 277 | 257 |
105 | NGAUUAAAGUGAGGACCUN | 339 | NAGGUCCUCACUUUAAUCN | 259 - 277 | 257 |
106 | UAACAUGCCUCUCUUCAUC | 340 | GAUGAAGAGAGGCAUGUUA | 306 - 324 | 304 |
107 | AAACAUGCCUCUCUUCAUC | 341 | GAUGAAGAGAGGCAUGUUU | 306 - 324 | 304 |
108 | CAACAUGCCUCUCUUCAUC | 342 | GAUGAAGAGAGGCAUGUUG | 306 - 324 | 304 |
109 | NAACAUGCCUCUCUUCAUC | 343 | GAUGAAGAGAGGCAUGUUN | 306 - 324 | 304 |
110 | NAACAUGCCUCUCUUCAUN | 344 | NAUGAAGAGAGGCAUGUUN | 306 - 324 | 304 |
111 | AGAUCACAGAAUCUUCAAU | 345 | AUUGAAGAUUCUGUGAUCU | 375 - 393 | 373 |
112 | UGAUCACAGAAUCUUCAAU | 346 | AUUGAAGAUUCUGUGAUCA | 375 - 393 | 373 |
113 | NGAUCACAGAAUCUUCAAU | 347 | AUUGAAGAUUCUGUGAUCN | 375 - 393 | 373 |
114 | NGAUCACAGAAUCUUCAAN | 348 | NUUGAAGAUUCUGUGAUCN | 375 - 393 | 373 |
115 | UGAGAUCACAGAAUCUUCA | 349 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 377 - 395 | 375 |
116 | AGAGAUCACAGAAUCUUCA | 350 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCU | 377 - 395 | 375 |
117 | NGAGAUCACAGAAUCUUCA | 351 | UGAAGAUUCUGUGAUCUCN | 377 - 395 | 375 |
118 | NGAGAUCACAGAAUCUUCN | 352 | NGAAGAUUCUGUGAUCUCN | 377 - 395 | 375 |
119 | UCUUUUUCAUGGACCACCA | 353 | UGGUGGUCCAUGAAAAAGA | 430 - 448 | 428 |
120 | ACUUUUUCAUGGACCACCA | 354 | UGGUGGUCCAUGAAAAAGU | 430 - 448 | 428 |
121 | GCUUUUUCAUGGACCACCA | 355 | UGGUGGUCCAUGAAAAAGC | 430 - 448 | 428 |
122 | NCUUUUUCAUGGACCACCA | 356 | UGGUGGUCCAUGAAAAAGN | 430 - 448 | 428 |
123 | NCUUUUUCAUGGACCACCN | 357 | NGGUGGUCCAUGAAAAAGN | 430 - 448 | 428 |
124 | AAGUCAUCUGCUUUUUCAU | 358 | AUGAAAAAGCAGAUGACUU | 439 - 457 | 437 |
125 | UAGUCAUCUGCUUUUUCAU | 359 | AUGAAAAAGCAGAUGACUA | 439 - 457 | 437 |
126 | NAGUCAUCUGCUUUUUCAU | 360 | AUGAAAAAGCAGAUGACUN | 439 - 457 | 437 |
127 | NAGUCAUCUGCUUUUUCAN | 361 | NUGAAAAAGCAGAUGACUN | 439 - 457 | 437 |
128 | UAAGUCAUCUGCUUUUUCA | 362 | UGAAAAAGCAGAUGACUUA | 440 - 458 | 438 |
129 | AAAGUCAUCUGCUUUUUCA | 363 | UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 440 - 458 | 438 |
130 | CAAGUCAUCUGCUUUUUCA | 364 | UGAAAAAGCAGAUGACUUG | 440 - 458 | 438 |
131 | NAAGUCAUCUGCUUUUUCA | 365 | UGAAAAAGCAGAUGACUUN | 440 - 458 | 438 |
132 | NAAGUCAUCUGCUUUUUCN | 366 | NGAAAAAGCAGAUGACUUN | 440 - 458 | 438 |
133 | UUACUUUCUUCAUUUCCAC | 367 | GUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 466 - 484 | 464 |
134 | AUACUUUCUUCAUUUCCAC | 368 | GUGGAAAUGAAGAAAGUAU | 466 - 484 | 464 |
135 | GUACUUUCUUCAUUUCCAC | 369 | GUGGAAAUGAAGAAAGUAC | 466 - 484 | 464 |
136 | NUACUUUCUUCAUUUCCAC | 370 | GUGGAAAUGAAGAAAGUAN | 466 - 484 | 464 |
137 | NUACUUUCUUCAUUUCCAN | 371 | NUGGAAAUGAAGAAAGUAN | 466 - 484 | 464 |
138 | UCCAAUUACACCACAAGCC | 372 | GGCUUGUGGUGUAAUUGGA | 512 - 530 | 510 |
139 | ACCAAUUACACCACAAGCC | 373 | GGCUUGUGGUGUAAUUGGU | 512 - 530 | 510 |
140 | CCCAAUUACACCACAAGCC | 374 | GGCUUGUGGUGUAAUUGGG | 512 - 530 | 510 |
141 | NCCAAUUACACCACAAGCC | 375 | GGCUUGUGGUGUAAUUGGN | 512 - 530 | 510 |
142 | NCCAAUUACACCACAAGCN | 376 | NGCUUGUGGUGUAAUUGGN | 512 - 530 | 510 |
143 | UUACAUCCAAGGGAAUGUU | 377 | AACAUUCCCUUGGAUGUAA | 542 - 560 | 540 |
144 | AUACAUCCAAGGGAAUGUU | 378 | AACAUUCCCUUGGAUGUAU | 542 - 560 | 540 |
145 | CUACAUCCAAGGGAAUGUU | 379 | AACAUUCCCUUGGAUGUAG | 542 - 560 | 540 |
146 | NUACAUCCAAGGGAAUGUU | 380 | AACAUUCCCUUGGAUGUAN | 542 - 560 | 540 |
147 | NUACAUCCAAGGGAAUGUN | 381 | NACAUUCCCUUGGAUGUAN | 542 - 560 | 540 |
148 | UAGACUACAUCCAAGGGAA | 382 | UUCCCUUGGAUGUAGUCUA | 546 - 564 | 544 |
149 | AAGACUACAUCCAAGGGAA | 383 | UUCCCUUGGAUGUAGUCUU | 546 - 564 | 544 |
150 | CAGACUACAUCCAAGGGAA | 384 | UUCCCUUGGAUGUAGUCUG | 546 - 564 | 544 |
151 | NAGACUACAUCCAAGGGAA | 385 | UUCCCUUGGAUGUAGUCUN | 546 - 564 | 544 |
152 | NAGACUACAUCCAAGGGAN | 386 | NUCCCUUGGAUGUAGUCUN | 546 - 564 | 544 |
153 | UGAUAACAGAUGAGUUAAG | 387 | CUUAACUCAUCUGUUAUCA | 571 - 589 | 569 |
154 | AGAUAACAGAUGAGUUAAG | 388 | CUUAACUCAUCUGUUAUCU | 571 - 589 | 569 |
155 | GGAUAACAGAUGAGUUAAG | 389 | CUUAACUCAUCUGUUAUCC | 571 - 589 | 569 |
156 | NGAUAACAGAUGAGUUAAG | 390 | CUUAACUCAUCUGUUAUCN | 571 - 589 | 569 |
157 | NGAUAACAGAUGAGUUAAN | 391 | NUUAACUCAUCUGUUAUCN | 571 - 589 | 569 |
158 | AGGAUAACAGAUGAGUUAA | 392 | UUAACUCAUCUGUUAUCCU | 572 - 590 | 570 |
159 | UGGAUAACAGAUGAGUUAA | 393 | UUAACUCAUCUGUUAUCCA | 572 - 590 | 570 |
160 | NGGAUAACAGAUGAGUUAA | 394 | UUAACUCAUCUGUUAUCCN | 572 - 590 | 570 |
161 | NGGAUAACAGAUGAGUUAN | 395 | NUAACUCAUCUGUUAUCCN | 572 - 590 | 570 |
162 | UAGGAUAACAGAUGAGUUA | 396 | UAACUCAUCUGUUAUCCUA | 573 - 591 | 571 |
163 | AAGGAUAACAGAUGAGUUA | 397 | UAACUCAUCUGUUAUCCUU | 573 - 591 | 571 |
164 | CAGGAUAACAGAUGAGUUA | 398 | UAACUCAUCUGUUAUCCUG | 573 - 591 | 571 |
165 | NAGGAUAACAGAUGAGUUA | 399 | UAACUCAUCUGUUAUCCUN | 573 - 591 | 571 |
166 | NAGGAUAACAGAUGAGUUN | 400 | NAACUCAUCUGUUAUCCUN | 573 - 591 | 571 |
167 | UCAGGAUAACAGAUGAGUU | 401 | AACUCAUCUGUUAUCCUGA | 574 - 592 | 572 |
168 | ACAGGAUAACAGAUGAGUU | 402 | AACUCAUCUGUUAUCCUGU | 574 - 592 | 572 |
169 | GCAGGAUAACAGAUGAGUU | 403 | AACUCAUCUGUUAUCCUGC | 574 - 592 | 572 |
170 | NCAGGAUAACAGAUGAGUU | 404 | AACUCAUCUGUUAUCCUGN | 574 - 592 | 572 |
171 | NCAGGAUAACAGAUGAGUN | 405 | NACUCAUCUGUUAUCCUGN | 574 - 592 | 572 |
172 | UCUAGCAGGAUAACAGAUG | 406 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGA | 578 - 596 | 576 |
173 | ACUAGCAGGAUAACAGAUG | 407 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGU | 578 - 596 | 576 |
174 | GCUAGCAGGAUAACAGAUG | 408 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGC | 578 - 596 | 576 |
175 | NCUAGCAGGAUAACAGAUG | 409 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGN | 578 - 596 | 576 |
176 | NCUAGCAGGAUAACAGAUN | 410 | NAUCUGUUAUCCUGCUAGN | 578 - 596 | 576 |
177 | UAGCUAGCAGGAUAACAGA | 411 | UCUGUUAUCCUGCUAGCUA | 580 - 598 | 578 |
178 | AAGCUAGCAGGAUAACAGA | 412 | UCUGUUAUCCUGCUAGCUU | 580 - 598 | 578 |
179 | CAGCUAGCAGGAUAACAGA | 413 | UCUGUUAUCCUGCUAGCUG | 580 - 598 | 578 |
180 | NAGCUAGCAGGAUAACAGA | 414 | UCUGUUAUCCUGCUAGCUN | 580 - 598 | 578 |
181 | NAGCUAGCAGGAUAACAGN | 415 | NCUGUUAUCCUGCUAGCUN | 580 - 598 | 578 |
182 | UUCUACAGCUAGCAGGAUA | 416 | UAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 585 - 603 | 583 |
183 | AUCUACAGCUAGCAGGAUA | 417 | UAUCCUGCUAGCUGUAGAU | 585 - 603 | 583 |
184 | NUCUACAGCUAGCAGGAUA | 418 | UAUCCUGCUAGCUGUAGAN | 585 - 603 | 583 |
185 | NUCUACAGCUAGCAGGAUN | 419 | NAUCCUGCUAGCUGUAGAN | 585 - 603 | 583 |
186 | UAUUUCUACAGCUAGCAGG | 420 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUA | 588 - 606 | 586 |
187 | AAUUUCUACAGCUAGCAGG | 421 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUU | 588 - 606 | 586 |
188 | CAUUUCUACAGCUAGCAGG | 422 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUG | 588 - 606 | 586 |
189 | NAUUUCUACAGCUAGCAGG | 423 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUN | 588 - 606 | 586 |
190 | NAUUUCUACAGCUAGCAGN | 424 | NCUGCUAGCUGUAGAAAUN | 588 - 606 | 586 |
191 | UACAUUUCUACAGCUAGCA | 425 | UGCUAGCUGUAGAAAUGUA | 590 - 608 | 588 |
192 | AACAUUUCUACAGCUAGCA | 426 | UGCUAGCUGUAGAAAUGUU | 590 - 608 | 588 |
193 | NACAUUUCUACAGCUAGCA | 427 | UGCUAGCUGUAGAAAUGUN | 590 - 608 | 588 |
194 | NACAUUUCUACAGCUAGCN | 428 | NGCUAGCUGUAGAAAUGUN | 590 - 608 | 588 |
195 | AUACAUUUCUACAGCUAGC | 429 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAU | 591 - 609 | 589 |
196 | UUACAUUUCUACAGCUAGC | 430 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAA | 591 - 609 | 589 |
197 | NUACAUUUCUACAGCUAGC | 431 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAN | 591 - 609 | 589 |
198 | NUACAUUUCUACAGCUAGN | 432 | NCUAGCUGUAGAAAUGUAN | 591 - 609 | 589 |
199 | UGAUACAUUUCUACAGCUA | 433 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCA | 593 - 611 | 591 |
200 | AGAUACAUUUCUACAGCUA | 434 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCU | 593 - 611 | 591 |
201 | GGAUACAUUUCUACAGCUA | 435 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCC | 593 - 611 | 591 |
202 | NGAUACAUUUCUACAGCUA | 436 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCN | 593 - 611 | 591 |
203 | NGAUACAUUUCUACAGCUN | 437 | NAGCUGUAGAAAUGUAUCN | 593 - 611 | 591 |
204 | UAGGAUACAUUUCUACAGC | 438 | GCUGUAGAAAUGUAUCCUA | 595 - 613 | 593 |
205 | AAGGAUACAUUUCUACAGC | 439 | GCUGUAGAAAUGUAUCCUU | 595 - 613 | 593 |
206 | CAGGAUACAUUUCUACAGC | 440 | GCUGUAGAAAUGUAUCCUG | 595 - 613 | 593 |
207 | NAGGAUACAUUUCUACAGC | 441 | GCUGUAGAAAUGUAUCCUN | 595 - 613 | 593 |
208 | NAGGAUACAUUUCUACAGN | 442 | NCUGUAGAAAUGUAUCCUN | 595 - 613 | 593 |
209 | UCAGGAUACAUUUCUACAG | 443 | CUGUAGAAAUGUAUCCUGA | 596 - 614 | 594 |
210 | ACAGGAUACAUUUCUACAG | 444 | CUGUAGAAAUGUAUCCUGU | 596 - 614 | 594 |
211 | NCAGGAUACAUUUCUACAG | 445 | CUGUAGAAAUGUAUCCUGN | 596 - 614 | 594 |
212 | NCAGGAUACAUUUCUACAN | 446 | NUGUAGAAAUGUAUCCUGN | 596 - 614 | 594 |
213 | AUGUUUAUCAGGAUACAUU | 447 | AAUGUAUCCUGAUAAACAU | 603 - 621 | 601 |
214 | UUGUUUAUCAGGAUACAUU | 448 | AAUGUAUCCUGAUAAACAA | 603 - 621 | 601 |
215 | NUGUUUAUCAGGAUACAUU | 449 | AAUGUAUCCUGAUAAACAN | 603 - 621 | 601 |
216 | NUGUUUAUCAGGAUACAUN | 450 | NAUGUAUCCUGAUAAACAN | 603 - 621 | 601 |
217 | AGUGUUUAAUGUUUAUCAG | 451 | CUGAUAAACAUUAAACACU | 611 - 629 | 609 |
218 | UGUGUUUAAUGUUUAUCAG | 452 | CUGAUAAACAUUAAACACA | 611 - 629 | 609 |
219 | NGUGUUUAAUGUUUAUCAG | 453 | CUGAUAAACAUUAAACACN | 611 - 629 | 609 |
220 | NGUGUUUAAUGUUUAUCAN | 454 | NUGAUAAACAUUAAACACN | 611 - 629 | 609 |
221 | AGAUUACAGUGUUUAAUGU | 455 | ACAUUAAACACUGUAAUCU | 618 - 636 | 616 |
222 | UGAUUACAGUGUUUAAUGU | 456 | ACAUUAAACACUGUAAUCA | 618 - 636 | 616 |
223 | NGAUUACAGUGUUUAAUGU | 457 | ACAUUAAACACUGUAAUCN | 618 - 636 | 616 |
224 | NGAUUACAGUGUUUAAUGN | 458 | NCAUUAAACACUGUAAUCN | 618 - 636 | 616 |
225 | UAAGAUUACAGUGUUUAAU | 459 | AUUAAACACUGUAAUCUUA | 620 - 638 | 618 |
226 | AAAGAUUACAGUGUUUAAU | 460 | AUUAAACACUGUAAUCUUU | 620 - 638 | 618 |
227 | NAAGAUUACAGUGUUUAAU | 461 | AUUAAACACUGUAAUCUUN | 620 - 638 | 618 |
228 | NAAGAUUACAGUGUUUAAN | 462 | NUUAAACACUGUAAUCUUN | 620 - 638 | 618 |
229 | UACUACAGGUACUUUAAAG | 463 | CUUUAAAGUACCUGUAGUA | 670 - 688 | 668 |
230 | AACUACAGGUACUUUAAAG | 464 | CUUUAAAGUACCUGUAGUU | 670 - 688 | 668 |
231 | CACUACAGGUACUUUAAAG | 465 | CUUUAAAGUACCUGUAGUG | 670 - 688 | 668 |
232 | NACUACAGGUACUUUAAAG | 466 | CUUUAAAGUACCUGUAGUN | 670 - 688 | 668 |
233 | NACUACAGGUACUUUAAAN | 467 | NUUUAAAGUACCUGUAGUN | 670 - 688 | 668 |
234 | UAAGUGAUCAUAAAUCAGU | 468 | ACUGAUUUAUGAUCACUUA | 693 - 711 | 691 |
235 | AAAGUGAUCAUAAAUCAGU | 469 | ACUGAUUUAUGAUCACUUU | 693 - 711 | 691 |
236 | CAAGUGAUCAUAAAUCAGU | 470 | ACUGAUUUAUGAUCACUUG | 693 - 711 | 691 |
237 | NAAGUGAUCAUAAAUCAGU | 471 | ACUGAUUUAUGAUCACUUN | 693 - 711 | 691 |
238 | NAAGUGAUCAUAAAUCAGN | 472 | NCUGAUUUAUGAUCACUUN | 693 - 711 | 691 |
239 | AAAUCUUCCAAGUGAUCAU | 473 | AUGAUCACUUGGAAGAUUU | 701 - 719 | 699 |
240 | UAAUCUUCCAAGUGAUCAU | 474 | AUGAUCACUUGGAAGAUUA | 701 - 719 | 699 |
241 | NAAUCUUCCAAGUGAUCAU | 475 | AUGAUCACUUGGAAGAUUN | 701 - 719 | 699 |
242 | NAAUCUUCCAAGUGAUCAN | 476 | NUGAUCACUUGGAAGAUUN | 701 - 719 | 699 |
243 | UACAAAUCUUCCAAGUGAU | 477 | AUCACUUGGAAGAUUUGUA | 704 - 722 | 702 |
244 | AACAAAUCUUCCAAGUGAU | 478 | AUCACUUGGAAGAUUUGUU | 704 - 722 | 702 |
245 | NACAAAUCUUCCAAGUGAU | 479 | AUCACUUGGAAGAUUUGUN | 704 - 722 | 702 |
246 | NACAAAUCUUCCAAGUGAN | 480 | NUCACUUGGAAGAUUUGUN | 704 - 722 | 702 |
247 | AAACUAUACAAAUCUUCCA | 481 | UGGAAGAUUUGUAUAGUUU | 710 - 728 | 708 |
248 | UAACUAUACAAAUCUUCCA | 482 | UGGAAGAUUUGUAUAGUUA | 710 - 728 | 708 |
249 | NAACUAUACAAAUCUUCCA | 483 | UGGAAGAUUUGUAUAGUUN | 710 - 728 | 708 |
250 | NAACUAUACAAAUCUUCCN | 484 | NGGAAGAUUUGUAUAGUUN | 710 - 728 | 708 |
251 | UUGAAACAGACAUUUUAAC | 485 | GUUAAAAUGUCUGUUUCAA | 740 - 758 | 738 |
252 | AUGAAACAGACAUUUUAAC | 486 | GUUAAAAUGUCUGUUUCAU | 740 - 758 | 738 |
253 | NUGAAACAGACAUUUUAAC | 487 | GUUAAAAUGUCUGUUUCAN | 740 - 758 | 738 |
254 | NUGAAACAGACAUUUUAAN | 488 | NUUAAAAUGUCUGUUUCAN | 740 - 758 | 738 |
255 | AGGUCAUUGAAACAGACAU | 489 | AUGUCUGUUUCAAUGACCU | 746 - 764 | 744 |
256 | UGGUCAUUGAAACAGACAU | 490 | AUGUCUGUUUCAAUGACCA | 746 - 764 | 744 |
257 | NGGUCAUUGAAACAGACAU | 491 | AUGUCUGUUUCAAUGACCN | 746 - 764 | 744 |
258 | NGGUCAUUGAAACAGACAN | 492 | NUGUCUGUUUCAAUGACCN | 746 - 764 | 744 |
259 | AAAUACAGGUCAUUGAAAC | 493 | GUUUCAAUGACCUGUAUUU | 752 - 770 | 750 |
260 | UAAUACAGGUCAUUGAAAC | 494 | GUUUCAAUGACCUGUAUUA | 752 - 770 | 750 |
261 | NAAUACAGGUCAUUGAAAC | 495 | GUUUCAAUGACCUGUAUUN | 752 - 770 | 750 |
262 | NAAUACAGGUCAUUGAAAN | 496 | NUUUCAAUGACCUGUAUUN | 752 - 770 | 750 |
263 | AAGUCUGGCAAAAUACAGG | 497 | CCUGUAUUUUGCCAGACUU | 762 - 780 | 760 |
264 | UAGUCUGGCAAAAUACAGG | 498 | CCUGUAUUUUGCCAGACUA | 762 - 780 | 760 |
265 | NAGUCUGGCAAAAUACAGG | 499 | CCUGUAUUUUGCCAGACUN | 762 - 780 | 760 |
266 | NAGUCUGGCAAAAUACAGN | 500 | NCUGUAUUUUGCCAGACUN | 762 - 780 | 760 |
267 | UAAUACCCAUCUGUGAUUU | 501 | AAAUCACAGAUGGGUAUUA | 781 - 799 | 779 |
268 | AAAUACCCAUCUGUGAUUU | 502 | AAAUCACAGAUGGGUAUUU | 781 - 799 | 779 |
269 | NAAUACCCAUCUGUGAUUU | 503 | AAAUCACAGAUGGGUAUUN | 781 - 799 | 779 |
270 | NAAUACCCAUCUGUGAUUN | 504 | NAAUCACAGAUGGGUAUUN | 781 - 799 | 779 |
271 | AAGUUUAAUACCCAUCUGU | 505 | ACAGAUGGGUAUUAAACUU | 786 - 804 | 784 |
272 | UAGUUUAAUACCCAUCUGU | 506 | ACAGAUGGGUAUUAAACUA | 786 - 804 | 784 |
273 | NAGUUUAAUACCCAUCUGU | 507 | ACAGAUGGGUAUUAAACUN | 786 - 804 | 784 |
274 | NAGUUUAAUACCCAUCUGN | 508 | NCAGAUGGGUAUUAAACUN | 786 - 804 | 784 |
275 | UAAGUUUAAUACCCAUCUG | 509 | CAGAUGGGUAUUAAACUUA | 787 - 805 | 785 |
276 | AAAGUUUAAUACCCAUCUG | 510 | CAGAUGGGUAUUAAACUUU | 787 - 805 | 785 |
277 | CAAGUUUAAUACCCAUCUG | 511 | CAGAUGGGUAUUAAACUUG | 787 - 805 | 785 |
278 | NAAGUUUAAUACCCAUCUG | 512 | CAGAUGGGUAUUAAACUUN | 787 - 805 | 785 |
278 | NAAGUUUAAUACCCAUCUN | 513 | NAGAUGGGUAUUAAACUUN | 787 - 805 | 785 |
280 | ACAAGUUUAAUACCCAUCU | 514 | AGAUGGGUAUUAAACUUGU | 788 - 806 | 786 |
281 | UCAAGUUUAAUACCCAUCU | 515 | AGAUGGGUAUUAAACUUGA | 788 - 806 | 786 |
282 | NCAAGUUUAAUACCCAUCU | 516 | AGAUGGGUAUUAAACUUGN | 788 - 806 | 786 |
283 | NCAAGUUUAAUACCCAUCN | 517 | NGAUGGGUAUUAAACUUGN | 788 - 806 | 786 |
284 | UGACAAGUUUAAUACCCAU | 518 | AUGGGUAUUAAACUUGUCA | 790 - 808 | 788 |
285 | AGACAAGUUUAAUACCCAU | 519 | AUGGGUAUUAAACUUGUCU | 790 - 808 | 788 |
286 | NGACAAGUUUAAUACCCAU | 520 | AUGGGUAUUAAACUUGUCN | 790 - 808 | 788 |
287 | NGACAAGUUUAAUACCCAN | 521 | NUGGGUAUUAAACUUGUCN | 790 - 808 | 788 |
包含表2中之核苷酸序列或由其組成之SOD1 RNAi藥劑有義股及反義股可為經修飾之核苷酸或未經修飾之核苷酸。在一些實施例中,具有包含表2中之任一核苷酸序列或由其組成之有義股及反義股序列的SOD1 RNAi藥劑全部或實質上全部為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之反義股與表2中之任一反義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之有義股與表2中之任一有義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。
如本文所用,表2中所揭示之序列中所列的各N可獨立地選自任何及所有核鹼基(包括經修飾及未經修飾之核苷酸兩者上存在之彼等核鹼基)。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸相同的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不同的核鹼基。
某些經修飾之SOD1 RNAi藥劑有義股及反義股提供於表3、表4、表5、表6、表6a及表10中。某些經修飾之SOD1 RNAi藥劑反義股以及其基礎未經修飾之核鹼基序列提供於表3中。某些經修飾之SOD1 RNAi藥劑有義股以及其基礎未經修飾之核鹼基序列提供於表4、5及6中。在形成SOD1 RNAi藥劑中,表3、4、5及6以及上文表2中列舉之基礎鹼基序列中之各者來的各核苷酸可為經修飾之核苷酸。
本文所描述之SOD1 RNAi藥劑藉由反義股與有義股黏著而形成。含有表2、表4、表5、表6、表6a中所列序列之有義股可與含有表2或表3所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補性之區域。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之任一序列的核苷酸序列。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含以下或由以下組成:具有表2、表3、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列的有義股及反義股之核鹼基序列的雙螺旋體。
含有經修飾之核苷酸之反義股的實例提供於表3中。含有經修飾之核苷酸之有義股的實例提供於表4、5及6中。
如表3、4、5、6、6a及10中所用,使用以下記法指示經修飾之核苷酸、靶向基團及連接基團:
A = 腺苷-3'-磷酸酯
C = 胞苷-3'-磷酸酯
G = 鳥苷-3'-磷酸酯
U = 尿苷-3'-磷酸酯
I = 肌苷-3'-磷酸酯
a = 2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸酯
as = 2'-O-甲基腺苷-3'-硫代磷酸酯
c = 2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸酯
cs = 2'-O-甲基胞苷-3'-硫代磷酸酯
g = 2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸酯
gs = 2'-O-甲基鳥苷-3'-硫代磷酸酯
i = 2'-O-甲基肌苷-3'-磷酸酯
is = 2'-O-甲基肌苷-3'-硫代磷酸酯
t = 2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸酯
ts = 2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
u = 2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸酯
us = 2'-O-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
Af = 2'-氟腺苷-3'-磷酸酯
Afs = 2'-氟腺苷-3'-硫代磷酸酯(phosporothioate)
Cf = 2'-氟胞苷-3'-磷酸酯
Cfs = 2'-氟胞苷-3'-硫代磷酸酯
Gf = 2'-氟鳥苷-3'-磷酸酯
Gfs = 2'-氟鳥苷-3'-硫代磷酸酯
Tf = 2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-磷酸酯
Tfs = 2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
Uf = 2'-氟尿苷-3'-磷酸酯
Ufs = 2'-氟尿苷-3'-硫代磷酸酯
dT = 2'-去氧胸苷-3'-磷酸酯
A
UNA= 2',3'-開環-腺苷-3'-磷酸酯
A
UNAs
= 2',3'-開環-腺苷-3'-硫代磷酸酯
C
UNA= 2',3'-開環-胞苷-3'-磷酸酯
C
UNAs
= 2',3'-開環-胞苷-3'-硫代磷酸酯
G
UNA= 2',3'-開環-鳥苷-3'-磷酸酯
G
UNAs
= 2',3'-開環-鳥苷-3'-硫代磷酸酯
U
UNA= 2',3'-開環-尿苷-3'-磷酸酯
U
UNAs
= 2',3'-開環-尿苷-3'-硫代磷酸酯
a_2N = 參見表11
a_2Ns = 參見表11
(invAb) = 反向無鹼基去氧核糖核苷酸-5'-磷酸酯,參見表11
(invAb)s = 反向無鹼基去氧核糖核苷酸-5'-硫代磷酸酯,參見表11
s = 硫代磷酸酯鍵聯
p = 末端磷酸酯(如所合成)
vpdN = 膦酸乙烯酯去氧核糖核苷酸
cPrpa = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸酯(參見表11)
cPrpas = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基腺苷-3'-硫代磷酸酯(參見表11)
cPrpu = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸酯(參見表11)
cPrpus = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯(參見表11)
(Alk-SS-C6) = 參見表11
(C6-SS-Alk) = 參見表11
(C6-SS-C6) = 參見表11
(6-SS-6) = 參見表11
(C6-SS-Alk-Me) = 參見表11
(NH2-C6) = 參見表11
(NH-C6) = 參見表11
(NH-C6)s = 參見表11
-L6-C6- = 參見表11
-L6-C6s- = 參見表11
LP183rs = 參見表11
LP409s =參見表11
cC16 = 參見表11
aC16 = 參見表11
gC16 = 參見表11
uC16 = 參見表11
ALNA = 參見表11
c16s = 參見表11
C22s = 參見表11
HO-C16s = 參見表11
(2C8C12)s = 參見表11
(2C6C10)s = 參見表11
LP283 = 參見表11
LP293 = 參見表11
LP310 = 參見表11
LP383 = 參見表11
LP395 = 參見表11
LP395s = 參見表11
LP396 = 參見表11
如一般熟習此項技術者將容易地理解,除非藉由序列(諸如藉由硫代磷酸酯鍵聯「s」)另外指示,否則當存在於寡核苷酸中時,核苷酸單體藉由5'-3'-磷酸二酯鍵相互連接。如一般熟習此項技術者將清楚地理解,包括如本文所揭示之經修飾之核苷酸序列中所顯示之硫代磷酸酯鍵聯替代寡核苷酸中通常存在之磷酸二酯鍵聯。此外,一般熟習此項技術者將容易理解,離體給定寡核苷酸序列之3'端的末端核苷酸通常將在給定單體之各別3'位置處具有羥基(-OH)而非磷酸酯部分。另外,對於本文所揭示之實施例,當5'→3'觀察各別股時,插入反向無鹼基殘基使得去氧核糖之3'位置連接在各別股上之前述單體的3'端處(參見例如表11)。此外,如一般技術者將容易地理解及瞭解,雖然本文中所描繪之硫代磷酸酯化學結構通常顯示陰離子位於硫原子上,但本文所揭示之發明涵蓋所有硫代磷酸酯互變異構物(例如,其中硫原子具有雙鍵且陰離子位於氧原子上)。本文中除非另外明確指示,否則在描述本文中所揭示之SOD1 RNAi藥劑及SOD1 RNAi藥劑之組合物時使用一般熟習此項技術者之此類理解。
下表11中提供之化學結構中包括與本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑一起使用之PK/PD調節劑及連接基團的某些實例。各有義股及/或反義股可具有本文所列之任何PK/PD調節劑或連接基團,以及與序列之5'及/或3'端結合的其他靶向基團、PK/PD調節劑、連接基團。
表 3.
SOD1 RNAi藥劑反義股序列
表 4.SOD1藥劑有義股序列(不顯示連接子、結合物或加帽部分)
(A
2N)=2-胺基腺苷核苷酸
表 5.SOD1藥劑有義股序列(顯示(NH2-C6)連接子、(NAG37)s配體或(invAb)端帽(關於結構資訊參見表11。))
表 6.SOD1藥劑有義股序列(顯示脂質部分)。脂質部分之結構顯示於表11中。
表 6a.SOD1藥劑有義股序列(顯示脂質部分)。脂質部分之結構顯示於表11中。
AS 股ID | 經修飾之反義股(5' → 3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' → 3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM13284-AS | usUfsusCfaCfuggucCfaUfuAfcUfuusc | 522 | UUUCACUGGUCCAUUACUUUC | 1080 |
AM13286-AS | usAfsasCfaUfggaauCfcAfuGfcAfggsc | 523 | UAACAUGGAAUCCAUGCAGGC | 1081 |
AM13288-AS | usCfsasAfaCfucaugAfaCfaUfgGfaasu | 524 | UCAAACUCAUGAACAUGGAAU | 1082 |
AM13290-AS | usGfsasUfuAfaagugAfgGfaCfcUfgcsa | 525 | UGAUUAAAGUGAGGACCUGCA | 1083 |
AM13292-AS | usGfsasUfaGfaggauUfaAfaGfuGfagsg | 526 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM13294-AS | usAfsasCfaUfgccucUfcUfuCfaUfccsu | 527 | UAACAUGCCUCUCUUCAUCCU | 1085 |
AM13296-AS | asGfsasUfcAfcagaaUfcUfuCfaAfuasg | 528 | AGAUCACAGAAUCUUCAAUAG | 1086 |
AM13298-AS | usCfscsAfaUfuacacCfaCfaAfgCfcasa | 529 | UCCAAUUACACCACAAGCCAA | 1087 |
AM13300-AS | usUfsasCfaUfccaagGfgAfaUfgUfuusa | 530 | UUACAUCCAAGGGAAUGUUUA | 1088 |
AM13302-AS | usAfsgsAfcUfacaucCfaAfgGfgAfausg | 531 | UAGACUACAUCCAAGGGAAUG | 1089 |
AM13304-AS | usAfsgsGfaUfaacagAfuGfaGfuUfaasg | 532 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM13306-AS | usUfscsUfaCfagcuaGfcAfgGfaUfaasc | 533 | UUCUACAGCUAGCAGGAUAAC | 1091 |
AM13308-AS | usGfsasUfaCfauuucUfaCfaGfcUfagsc | 534 | UGAUACAUUUCUACAGCUAGC | 1092 |
AM13310-AS | usAfsgsGfaUfacauuUfcUfaCfaGfcusa | 535 | UAGGAUACAUUUCUACAGCUA | 1093 |
AM13312-AS | asUfsgsUfuUfaucagGfaUfaCfaUfuusc | 536 | AUGUUUAUCAGGAUACAUUUC | 1094 |
AM13314-AS | asGfsusGfuUfuaaugUfuUfaUfcAfggsa | 537 | AGUGUUUAAUGUUUAUCAGGA | 1095 |
AM13316-AS | asGfsasUfuAfcagugUfuUfaAfuGfuusu | 538 | AGAUUACAGUGUUUAAUGUUU | 1096 |
AM13318-AS | usAfscsUfaCfagguaCfuUfuAfaAfgcsa | 539 | UACUACAGGUACUUUAAAGCA | 1097 |
AM13320-AS | usAfsasGfuGfaucauAfaAfuCfaGfuusu | 540 | UAAGUGAUCAUAAAUCAGUUU | 1098 |
AM13322-AS | asAfsasCfuAfuacaaAfuCfuUfcCfaasg | 541 | AAACUAUACAAAUCUUCCAAG | 1099 |
AM13324-AS | asAfsasUfaCfaggucAfuUfgAfaAfcasg | 542 | AAAUACAGGUCAUUGAAACAG | 1100 |
AM13326-AS | usAfsasUfaCfccaucUfgUfgAfuUfuasa | 543 | UAAUACCCAUCUGUGAUUUAA | 1101 |
AM13328-AS | usGfsasCfaAfguuuaAfuAfcCfcAfucsu | 544 | UGACAAGUUUAAUACCCAUCU | 1102 |
AM13918-AS | usCfsasUfuAfcuuucCfuUfcUfgCfucsg | 545 | UCAUUACUUUCCUUCUGCUCG | 1103 |
AM13920-AS | usGfsasAfcAfuggaaUfcCfaUfgCfagsg | 546 | UGAACAUGGAAUCCAUGCAGG | 1104 |
AM13922-AS | usGfsasGfaUfcacagAfaUfcUfuCfaasc | 547 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM13924-AS | asAfsasGfuCfaucugCfuUfuUfuCfausg | 548 | AAAGUCAUCUGCUUUUUCAUG | 1106 |
AM13926-AS | asAfsusUfuCfuacagCfuAfgCfaGfgasu | 549 | AAUUUCUACAGCUAGCAGGAU | 1107 |
AM13928-AS | asAfscsAfaAfucuucCfaAfgUfgAfucsa | 550 | AACAAAUCUUCCAAGUGAUCA | 1108 |
AM13930-AS | asAfsgsUfuUfaauacCfcAfuCfuGfugsa | 551 | AAGUUUAAUACCCAUCUGUGA | 1109 |
AM14017-AS | usGfsasuaGfaggauUfaAfaGfugagsg | 552 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14019-AS | usGfsasuaGfaggauUfaAfaGfugagsc | 553 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGC | 1110 |
AM14020-AS | usGfsasuaGfaggauUfaAfaGfugagssc | 554 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGC | 1110 |
AM14021-AS | usGfsasuaGfaggAfuUfaAfaGfugagsg | 555 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14022-AS | usGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 556 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14023-AS | usGfsasuagaggauUfaAfaGfugagsg | 557 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14024-AS | cPrpuGfauaGfaggauUfaAfaGfugagssg | 558 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14026-AS | usGfsasuaGfaggAfuUfaAfaGfuga | 559 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14096-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuuaasg | 560 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14097-AS | usAfsgsgauaacagAfuGfaGfuuaasg | 561 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14098-AS | usAfsgsgauaAfCfagAfuGfaGfuuaasg | 562 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14099-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuuaa_2Nsg | 563 | UAGGAUAACAGAUGAGUUA(A 2N)G | 1214 |
AM14100-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuua_2Nasg | 564 | UAGGAUAACAGAUGAGUU(A 2N)AG | 1215 |
AM14102-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuuagsg | 565 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAGG | 1112 |
AM14103-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuuaassg | 566 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14104-AS | cPrpuAfggaUfaacagAfuGfaGfuuaassg | 567 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14106-AS | usAfsgsgaUfaacagAfuGfaGfuusa_2N | 568 | UAGGAUAACAGAUGAGUU(A 2N) | 1228 |
AM14270-AS | usGfsasuaGfaggAfuUfaAfaGfugsa | 569 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14271-AS | usGfsasuaGfaggAfuUfaAfaGfugssa | 570 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14272-AS | cPrpuGfauaGfaggAfuUfaAfaGfugssa | 571 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14273-AS | cPrpuGfauAfgaGfGfauUfaAfaGfugssa | 572 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14277-AS | cPrpusGfsasUfaGfaggauUfaAfaGfuGfagsg | 573 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14279-AS | cPrpusAfsgsGfaUfaacagAfuGfaGfuUfaasg | 574 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14335-AS | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 575 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14339-AS | usGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 576 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14341-AS | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 577 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14342-AS | cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 578 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14343-AS | cPrpusGfsasuAfgaggAfuUfaAfaGfugagsg | 579 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14344-AS | cPrpusGfsasUfagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 580 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14345-AS | cPrpuGfauagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 581 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM14347-AS | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugssa | 582 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGA | 1111 |
AM14365-AS | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaasg | 583 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14366-AS | usAfsgsgAfuaacagAfuGfaGfuuaasg | 584 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14367-AS | usAfsgsgauAfacagAfuGfaGfuuaasg | 585 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14368-AS | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuua_2Nasg | 586 | UAGGAUAACAGAUGAGUU(A 2N)AG | 1215 |
AM14369-AS | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 587 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14370-AS | cPrpusAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 588 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14371-AS | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 589 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM14373-AS | cPrpusAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuussa | 590 | UAGGAUAACAGAUGAGUUA | 1113 |
AM14506-AS | usUfsasCfuuucuucAfuUfuCfcAfcCfsu | 591 | UUACUUUCUUCAUUUCCACCU | 1114 |
AM15044-AS | cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagssg | 592 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15045-AS | cPrpuGfauagAfggAfuUfaAfaGfugagssg | 593 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15046-AS | cPrpuGfauagAfggAfuUfaAfaGfugasgsg | 594 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15047-AS | cPrpuGfauagAfggAfuUfaAfaGfugagssc | 595 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGC | 1110 |
AM15048-AS | cPrpuGfauagaGfgAfuUfaAfaGfugagssg | 596 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15050-AS | cPrpuGfauagAfgGfauuaAfaGfugagssg | 597 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15052-AS | cPrpuGfauagAfgGfauuaAfaGfugagssc | 598 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGC | 1110 |
AM15054-AS | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassc | 599 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAC | 1115 |
AM15055-AS | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaasg | 600 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM15056-AS | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuasasg | 601 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM15058-AS | cPrpuAfggAfuaacAfgAfuGfaGfuuaassg | 602 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM15059-AS | cPrpuAfggAfuaacAfgAfuGfaGfuuaassc | 603 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAC | 1115 |
AM15060-AS | cPrpuAfggauaacAfgAfuGfaGfuuaassg | 604 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM15061-AS | cPrpuAfggauaacAfgAfuGfaGfuuaassc | 605 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAC | 1115 |
AM15062-AS | cPrpuAfggAfuaAfcagauGfaGfuuaassg | 606 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM15245-AS | usGfsasUfagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 607 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15246-AS | usGfsasUfagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 608 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15556-AS | cPrpusUfsuAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 609 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM15751-AS | cPrpuGfauagaGfgAfuUfaAfaGfugagsg | 610 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15932-AS | cPrpusGfsasuA UNAgAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 611 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15933-AS | cPrpusGfsasuaG UNAAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 612 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15934-AS | cPrpusGfsasuagA UNAggAfuUfaAfaGfugagsg | 613 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM15935-AS | cPrpusGfsasuagGfggAfuUfaAfaGfugagsg | 614 | UGAUAGGGGAUUAAAGUGAGG | 1117 |
AM15936-AS | cPrpusGfsasuagaG UNAgAfuUfaAfaGfugagsg | 615 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM16051-AS | cPrpusgsasuagagGfAfUfuaaagugagsgs(invAb) | 616 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM16114-AS | cPrpusgsasuAfgAfggAfuUfaaaGfuGfagsg | 618 | UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG | 1084 |
AM16144-AS | cPrpuAfgGfA UNAuaacagAfuGfaGfuuaassg | 620 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM16145-AS | cPrpuAfgGfaU UNAaacagAfuGfaGfuuaassg | 621 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM16146-AS | cPrpuAfgGfauA UNAacagAfuGfaGfuuaassg | 622 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM16147-AS | cPrpuAfgGfauaA UNAcagAfuGfaGfuuaassg | 623 | UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG | 1090 |
AM16169-AS | cPrpusGfsasGfaUfcacagAfaUfcUfuCfaasc | 624 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16171-AS | cPrpusGfsgsAfuAfacagaUfgAfgUfuAfagsg | 625 | UGGAUAACAGAUGAGUUAAGG | 1118 |
AM16173-AS | cPrpusCfsusAfgCfaggauAfaCfaGfaUfgasg | 626 | UCUAGCAGGAUAACAGAUGAG | 1119 |
AM16175-AS | cPrpusUfsasCfaUfuucuaCfaGfcUfaGfcasg | 627 | UUACAUUUCUACAGCUAGCAG | 1120 |
AM16177-AS | cPrpusGfsusGfuUfuaaugUfuUfaUfcAfggsg | 628 | UGUGUUUAAUGUUUAUCAGGG | 1121 |
AM16179-AS | cPrpusAfsasGfaUfuacagUfgUfuUfaAfugsc | 629 | UAAGAUUACAGUGUUUAAUGC | 1122 |
AM16181-AS | cPrpusAfsasUfcUfuccaaGfuGfaUfcAfuasg | 630 | UAAUCUUCCAAGUGAUCAUAG | 1123 |
AM16183-AS | cPrpusAfsgsUfcUfggcaaAfaUfaCfaGfgusc | 631 | UAGUCUGGCAAAAUACAGGUC | 1124 |
AM16238-AS | cPrpasUfsgsAfaCfauggaAfuCfcAfuGfcasg | 632 | AUGAACAUGGAAUCCAUGCAG | 1125 |
AM16240-AS | cPrpusCfsusUfuUfucaugGfaCfcAfcCfagsu | 633 | UCUUUUUCAUGGACCACCAGU | 1126 |
AM16242-AS | cPrpasAfsgsUfcAfucugcUfuUfuUfcAfugsg | 634 | AAGUCAUCUGCUUUUUCAUGG | 1127 |
AM16244-AS | cPrpusUfsasCfuUfucuucAfuUfuCfcAfccsu | 635 | UUACUUUCUUCAUUUCCACCU | 1114 |
AM16246-AS | cPrpusGfsasUfaAfcagauGfaGfuUfaAfggsg | 636 | UGAUAACAGAUGAGUUAAGGG | 1128 |
AM16248-AS | cPrpusCfsasGfgAfuaacaGfaUfgAfgUfuasg | 637 | UCAGGAUAACAGAUGAGUUAG | 1129 |
AM16250-AS | cPrpusAfsgsCfuAfgcaggAfuAfaCfaGfausg | 638 | UAGCUAGCAGGAUAACAGAUG | 1130 |
AM16252-AS | cPrpusAfscsAfuUfucuacAfgCfuAfgCfagsg | 639 | UACAUUUCUACAGCUAGCAGG | 1131 |
AM16254-AS | cPrpusUfsgsAfaAfcagacAfuUfuUfaAfcusg | 640 | UUGAAACAGACAUUUUAACUG | 1132 |
AM16256-AS | cPrpasGfsgsUfcAfuugaaAfcAfgAfcAfuusc | 641 | AGGUCAUUGAAACAGACAUUC | 1133 |
AM16258-AS | cPrpusAfsasGfuUfuaauaCfcCfaUfcUfgusg | 642 | UAAGUUUAAUACCCAUCUGUG | 1134 |
AM16260-AS | cPrpasCfsasAfgUfuuaauAfcCfcAfuCfugsc | 643 | ACAAGUUUAAUACCCAUCUGC | 1135 |
AM16950-AS | cPrpusGfsasGfaucacagAfaUfcUfucaasc | 644 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16951-AS | cPrpusGfsasGfaucacagAfaUfcUfucasasc | 645 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16952-AS | cPrpusGfsaGfaucacagAfaUfcUfucasasc | 646 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16953-AS | cPrpusGfsaGfaucacagAfaUfcUfucaassc | 647 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16955-AS | cPrpusGfsaGfauC UNAacagAfaUfcUfucasasc | 648 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16956-AS | cPrpusGfsaGfaU UNAcacagAfaUfcUfucasasc | 649 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16957-AS | cPrpusGfsagauCfacagAfaUfcUfucasasc | 650 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM16958-AS | cPrpusGfsagaucacagaaUfcUfucasasc | 651 | UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC | 1105 |
AM12559-AS | usUfsusAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 652 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14500-AS | usCfsasUfguuucuuAfgAfgUfgAfgGfsa | 653 | UCAUGUUUCUUAGAGUGAGGA | 1136 |
AM13980-AS | cPrpusUfsusAfgAfgUfgAfgGfaUfusAfsasAfsasu | 654 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAU | 1137 |
AM15558-AS | cPrpuUfuagagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 655 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM12560-AS | cPrpusUfsusAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 656 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14510-AS | usUfsusUfgaggguaGfcAfgAfuGfaGfsu | 657 | UUUUGAGGGUAGCAGAUGAGU | 1138 |
AM14516-AS | usAfscsAfacucuucAfgAfuUfaCfaGfsu | 658 | UACAACUCUUCAGAUUACAGU | 1139 |
AM13589-AS | cPrpuUfuAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 659 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM16904-AS | cPrpusUfsusagAfgUfGfaggaUfuAfaaausg | 660 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM15424-AS | cPrpusUfsusagagugagGfaUfuAfaaaussg | 661 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM15556-AS | cPrpusUfsuAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 662 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM15242-AS | cPrpusAfscsAfguuuaAfuGfgUfuUfgaggssg | 663 | UACAGUUUAAUGGUUUGAGGG | 1140 |
AM14512-AS | usAfscsAfguuuaauGfgUfuUfgAfgGfsg | 664 | UACAGUUUAAUGGUUUGAGGG | 1140 |
AM14514-AS | usCfsasGfauuacagUfuUfaAfuGfgUfsu | 666 | UCAGAUUACAGUUUAAUGGUU | 1141 |
AM13978-AS | cPrpusUfsusAfgAfgUfgAfgGfaUfuAfaAfausg | 667 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14498-AS | usAfsgsGfauuaaaaUfgAfgGfuCfcUfsg | 668 | UAGGAUUAAAAUGAGGUCCUG | 1142 |
AM17087-AS | (invAb)susususagaguGfAfGfgauuaaaausgs(invAb) | 669 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14508-AS | usGfsusCfuuuguacUfuUfcUfuCfaUfsu | 670 | UGUCUUUGUACUUUCUUCAUU | 1143 |
AM14275-AS | cPrpusUfsusagAfgUfGfaggaUfuAfaaaugsasg | 671 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUGAG | 1144 |
AM15557-AS | cPrpusUfuAfgagugagGfaUfuAfaAfaUfsg | 672 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14506-AS | usUfsasCfuuucuucAfuUfuCfcAfcCfsu | 673 | UUACUUUCUUCAUUUCCACCU | 1114 |
AM14504-AS | usUfscsAfucuuguuUfcUfcAfuGfgAfsc | 674 | UUCAUCUUGUUUCUCAUGGAC | 1145 |
AM14937-AS | cPrpusususAfgAfgUfgagGfauuAfaAfaUfgs(invAb) | 675 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14307-AS | cPrpusUfsusAfgagugagGfaUfusAfsasAfsasUfsg | 676 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM15426-AS | cPrpusAfcaguuuaauGfgUfuUfgaggssg | 677 | UACAGUUUAAUGGUUUGAGGG | 1140 |
AM15425-AS | cPrpusAfscsaguuuaauGfgUfuUfgaggssg | 678 | UACAGUUUAAUGGUUUGAGGG | 1140 |
AM13976-AS | cPrpusUfsusAfgAfgugagGfaUfuAfaAfausg | 679 | UUUAGAGUGAGGAUUAAAAUG | 1116 |
AM14502-AS | usAfsasUfgauggaaUfgCfuCfuCfcUfsg | 680 | UAAUGAUGGAAUGCUCUCCUG | 1146 |
股ID | 經修飾之有義股(5' → 3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' → 3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM13283-SS | gaaaguaaUfGfGfaccagugaaa | 681 | GAAAGUAAUGGACCAGUGAAA | 1147 |
AM13285-SS | gccugcauGfGfAfuuccauguua | 682 | GCCUGCAUGGAUUCCAUGUUA | 1148 |
AM13287-SS | auuccaugUfUfCfaugaguuuga | 683 | AUUCCAUGUUCAUGAGUUUGA | 1149 |
AM13289-SS | ugcaggucCfUfCfacuuuaauca | 684 | UGCAGGUCCUCACUUUAAUCA | 1150 |
AM13291-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 685 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM13293-SS | aggaugaaGfAfGfaggcauguua | 686 | AGGAUGAAGAGAGGCAUGUUA | 1152 |
AM13295-SS | cuauugaaGfAfUfucugugaucu | 687 | CUAUUGAAGAUUCUGUGAUCU | 1153 |
AM13297-SS | uuggcuugUfGfGfuguaauugga | 688 | UUGGCUUGUGGUGUAAUUGGA | 1154 |
AM13299-SS | ua_2NaacauuCfCfCfuuggauguaa | 689 | U(A 2N)AACAUUCCCUUGGAUGUAA | 1217 |
AM13301-SS | cauucccuUfGfGfauguagucua | 690 | CAUUCCCUUGGAUGUAGUCUA | 1156 |
AM13303-SS | cuuaacucAfUfCfuguuauccua | 691 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM13305-SS | guuauccuGfCfUfagcuguagaa | 692 | GUUAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 1158 |
AM13307-SS | gcuagcugUfAfGfaaauguauca | 693 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAUCA | 1159 |
AM13309-SS | uagcuguaGfAfAfauguauccua | 694 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCCUA | 1160 |
AM13311-SS | gaaauguaUfCfCfugauaaacau | 695 | GAAAUGUAUCCUGAUAAACAU | 1161 |
AM13313-SS | uccugauaAfAfCfauuaaacacu | 696 | UCCUGAUAAACAUUAAACACU | 1162 |
AM13315-SS | a_2NaacauuaAfAfCfacuguaaucu | 697 | (A 2N)AACAUUAAACACUGUAAUCU | 1218 |
AM13317-SS | ugcuuuaaAfGfUfaccuguagua | 698 | UGCUUUAAAGUACCUGUAGUA | 1164 |
AM13319-SS | aaacugauUfUfAfugaucacuua | 699 | AAACUGAUUUAUGAUCACUUA | 1165 |
AM13321-SS | cuuggaagAfUfUfuguauaguuu | 700 | CUUGGAAGAUUUGUAUAGUUU | 1166 |
AM13323-SS | cuguuucaAfUfGfaccuguauuu | 701 | CUGUUUCAAUGACCUGUAUUU | 1167 |
AM13325-SS | uuaaaucaCfAfGfauggguauua | 702 | UUAAAUCACAGAUGGGUAUUA | 1168 |
AM13327-SS | a_2NgauggguAfUfUfaaacuuguca | 703 | (A 2N)GAUGGGUAUUAAACUUGUCA | 1169 |
AM13917-SS | cgagcagaAfGfGfaaaguaauga | 704 | CGAGCAGAAGGAAAGUAAUGA | 1170 |
AM13919-SS | ccugcaugGfAfUfuccauguuca | 705 | CCUGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 1171 |
AM13921-SS | guugaagaUfUfCfugugaucuca | 706 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM13923-SS | ca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuu | 707 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM13925-SS | auccugcuAfGfCfuguagaaauu | 708 | AUCCUGCUAGCUGUAGAAAUU | 1174 |
AM13927-SS | uga_2NucacuUfGfGfaagauuuguu | 709 | UG(A 2N)UCACUUGGAAGAUUUGUU | 1219 |
AM13929-SS | ucacagauGfGfGfuauuaaacuu | 710 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM13988-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 711 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM13997-SS | cgagcagaAfGfGfaaaguaauga | 712 | CGAGCAGAAGGAAAGUAAUGA | 1170 |
AM13998-SS | ccugcaugGfAfUfuccauguuca | 713 | CCUGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 1171 |
AM13999-SS | guugaagaUfUfCfugugaucuca | 714 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM14000-SS | ca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuu | 715 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM14001-SS | auccugcuAfGfCfuguagaaauu | 716 | AUCCUGCUAGCUGUAGAAAUU | 1174 |
AM14002-SS | uga_2NucacuUfGfGfaagauuuguu | 717 | UG(A 2N)UCACUUGGAAGAUUUGUU | 1219 |
AM14003-SS | ucacagauGfGfGfuauuaaacuu | 718 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM14004-SS | gaaauguaUfCfCfugauaaacau | 719 | GAAAUGUAUCCUGAUAAACAU | 1161 |
AM14018-SS | gcucacuuUfAfAfuccucuauca | 720 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM14025-SS | ucacuuUfAfAfuccucuauca | 721 | UCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1178 |
AM14089-SS | cuuaacucAfUfCfuguuauccua | 722 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM14101-SS | ccuaacucAfUfCfuguuauccua | 723 | CCUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1179 |
AM14105-SS | uaacucAfUfCfuguuauccua | 724 | UAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1180 |
AM14334-SS | gcucacuuUfAfAfuccucuauca | 725 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM14340-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauua | 726 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUUA | 1181 |
AM14346-SS | ucacuuUfAfAfuccucuauca | 727 | UCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1178 |
AM14372-SS | ua_2NacucAfUfCfuguuauccua | 728 | U(A 2N)ACUCAUCUGUUAUCCUA | 1220 |
AM15049-SS | ccucAfcuuUfAfAfUfccucuauca | 729 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM15051-SS | gcucAfcuuUfAfAfUfccucuauca | 730 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM15053-SS | guuaacucAfUfCfuguuauccua | 731 | GUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1182 |
AM15057-SS | cuuaAfcucAfUfCfUfguuauccua | 732 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM15752-SS | ccucAfcuuUfAfAfUfccucuauca | 733 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM15931-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 734 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16118-SS | ca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuu | 735 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM16119-SS | cuuaacucAfUfCfuguuauccua | 736 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16120-SS | guuauccuGfCfUfagcuguagaa | 737 | GUUAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 1158 |
AM16121-SS | uccugauaAfAfCfauuaaacacu | 738 | UCCUGAUAAACAUUAAACACU | 1162 |
AM16168-SS | guugaagaUfUfCfugugaucuca | 739 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16170-SS | ccuuaacuCfAfUfcuguuaucca | 740 | CCUUAACUCAUCUGUUAUCCA | 1183 |
AM16172-SS | cucaucugUfUfAfuccugcuaga | 741 | CUCAUCUGUUAUCCUGCUAGA | 1184 |
AM16174-SS | cugcuagcUfGfUfagaaauguaa | 742 | CUGCUAGCUGUAGAAAUGUAA | 1185 |
AM16176-SS | cccugauaAfAfCfauuaaacaca | 743 | CCCUGAUAAACAUUAAACACA | 1186 |
AM16178-SS | gca_2NuuaaaCfAfCfuguaaucuua | 744 | GC(A 2N)UUAAACACUGUAAUCUUA | 1221 |
AM16180-SS | cua_2NugaucAfCfUfuggaagauua | 745 | CU(A 2N)UGAUCACUUGGAAGAUUA | 1222 |
AM16182-SS | gaccuguaUfUfUfugccagacua | 746 | GACCUGUAUUUUGCCAGACUA | 1189 |
AM16237-SS | cugcauggAfUfUfccauguucau | 747 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUCAU | 1190 |
AM16239-SS | acugguggUfCfCfaugaaaaaga | 748 | ACUGGUGGUCCAUGAAAAAGA | 1191 |
AM16241-SS | ccaugaaaAfAfGfcagaugacuu | 749 | CCAUGAAAAAGCAGAUGACUU | 1192 |
AM16243-SS | agguggaaAfUfGfaagaaaguaa | 750 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM16245-SS | cccuuaacUfCfAfucuguuauca | 751 | CCCUUAACUCAUCUGUUAUCA | 1194 |
AM16247-SS | cua_2NacucaUfCfUfguuauccuga | 752 | CU(A 2N)ACUCAUCUGUUAUCCUGA | 1223 |
AM16249-SS | caucuguuAfUfCfcugcuaguuas | 753 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGUUA | 1196 |
AM16251-SS | ccugcuagCfUfGfuagaaauguas | 754 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUGUA | 1197 |
AM16253-SS | caguuaaaAfUfGfucuguuucaas | 755 | CAGUUAAAAUGUCUGUUUCAA | 1198 |
AM16255-SS | ga_2NaugucuGfUfUfucaaugacuu | 756 | G(A 2N)AUGUCUGUUUCAAUGACUU | 1224 |
AM16257-SS | cacagaugGfGfUfauuaaacuua | 757 | CACAGAUGGGUAUUAAACUUA | 1200 |
AM16259-SS | gcagauggGfUfAfuuaaacuugu | 758 | GCAGAUGGGUAUUAAACUUGU | 1201 |
AM16616-SS | cuuaacucAfUfCfuguuauccua | 759 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16617-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 760 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16618-SS | ca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuu | 761 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM16619-SS | ucacagauGfGfGfuauuaaacuu | 762 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM16672-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 763 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16688-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 764 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16705-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 765 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16706-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 766 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16800-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 767 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16814-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 768 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16815-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 769 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16949-SS | guugaagaUfUfCfugugaucuca | 770 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16954-SS | guugaagaUfuCfuGfugaucuca | 771 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM17192-SS | ccucacuuUfAfAfuccucuauca | 772 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM13767-SS | cauuuuaaUfCfCfucaAlkcucuaaa | 773 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14676-SS | guccaugaGfAfAfacaagaugaa | 774 | GUCCAUGAGAAACAAGAUGAA | 1203 |
AM14520-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 775 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14499-SS | uccucacuCfUfAfagaaacauga | 776 | UCCUCACUCUAAGAAACAUGA | 1204 |
AM14274-SS | cauuuuC16AfaUfCfCfucacucuaaa | 777 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM13548-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 778 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM12590-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 779 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14677-SS | agguggaaAfUfGfaagaaaguaa | 780 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM14517-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 781 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14679-SS | acucaucuGfCfUfacccucaaaa | 782 | ACUCAUCUGCUACCCUCAAAA | 1205 |
AM13769-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuAlkaaa | 783 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1202 |
AM14519-SS | csauuuuaaUfCfCfucacucuaaas | 784 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14680-SS | cccucaaaCfCfAfuuaaacugua | 785 | CCCUCAAACCAUUAAACUGUA | 1206 |
AM16116-SS | csauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 786 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14507-SS | aaugaagaAfAfGfuacaaagaca | 787 | AAUGAAGAAAGUACAAAGACA | 1207 |
AM13397-SS | cauuuuaaUfCfCfucacuC16cuaaa | 788 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14674-SS | uccucacuCfUfAfagaaacauga | 789 | UCCUCACUCUAAGAAACAUGA | 1204 |
AM16529-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 790 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14511-SS | cccucaaaCfCfAfuuaaacugua | 791 | CCCUCAAACCAUUAAACUGUA | 1206 |
AM14505-SS | agguggaaAfUfGfaagaaaguaa | 792 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM14515-SS | acuguaauCfUfGfaagaguugua | 793 | ACUGUAAUCUGAAGAGUUGUA | 1208 |
AM14678-SS | aaugaagaAfAfGfuacaaagaca | 794 | AAUGAAGAAAGUACAAAGACA | 1207 |
AM14503-SS | guccaugaGfAfAfacaagaugaa | 795 | GUCCAUGAGAAACAAGAUGAA | 1203 |
AM14675-SS | caggagagCfAfUfuccaucauua | 796 | CAGGAGAGCAUUCCAUCAUUA | 1209 |
AM13977-SS | cauuuuaaUfCfCfuCfaCfuCfuAfaa | 797 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15561-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucua_2Naa | 798 | CAUUUUAAUCCUCACUCU(A 2N)AA | 1225 |
AM15559-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa_2N | 799 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAA(A 2N) | 1226 |
AM13588-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 800 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14518-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 801 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15562-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuALNAaas | 802 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16134-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 803 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15554-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 804 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14682-SS | acuguaauCfUfGfaagaguugua | 805 | ACUGUAAUCUGAAGAGUUGUA | 1208 |
AM15555-SS | csauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 806 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM13768-SS | cauuuuaaUfCfCfuAlkcacucuaaa | 807 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14681-SS | aaccauuaAfAfCfuguaaucuga | 808 | AACCAUUAAACUGUAAUCUGA | 1210 |
AM12558-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 809 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16524-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 810 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14497-SS | caggaccuCfAfUfuuuaauccua | 811 | CAGGACCUCAUUUUAAUCCUA | 1211 |
AM13975-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaaa | 812 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14509-SS | acucaucuGfCfUfacccucaaaa | 813 | ACUCAUCUGCUACCCUCAAAA | 1205 |
AM16903-SS | cauuuuAfaUfCfCfucacucuaaa | 814 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15560-SS | cauuuuaaUfCfCfucacucuaa_2Na | 815 | CAUUUUAAUCCUCACUCUA(A 2N)A | 1227 |
AM14513-SS | aaccauuaAfAfCfuguaaucuga | 816 | AACCAUUAAACUGUAAUCUGA | 1210 |
AM14673-SS | caggaccuCfAfUfuuuaauccua | 817 | CAGGACCUCAUUUUAAUCCUA | 1211 |
AM14501-SS | caggagagCfAfUfuccaucauua | 818 | CAGGAGAGCAUUCCAUCAUUA | 1209 |
AM-17382-SS | guugaagaUfuCfuGfugaucuca | 819 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
股ID | 經修飾之有義股(5' → 3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' → 3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM13283-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgaaaguaaUfGfGfaccagugaaas(invAb) | 820 | GAAAGUAAUGGACCAGUGAAA | 1147 |
AM13285-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgccugcauGfGfAfuuccauguuas(invAb) | 821 | GCCUGCAUGGAUUCCAUGUUA | 1148 |
AM13287-SS | (NH2-C6)s(invAb)sauuccaugUfUfCfaugaguuugas(invAb) | 822 | AUUCCAUGUUCAUGAGUUUGA | 1149 |
AM13289-SS | (NH2-C6)s(invAb)sugcaggucCfUfCfacuuuaaucas(invAb) | 823 | UGCAGGUCCUCACUUUAAUCA | 1150 |
AM13291-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 824 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM13293-SS | (NH2-C6)s(invAb)saggaugaaGfAfGfaggcauguuas(invAb) | 825 | AGGAUGAAGAGAGGCAUGUUA | 1152 |
AM13295-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuauugaaGfAfUfucugugaucus(invAb) | 826 | CUAUUGAAGAUUCUGUGAUCU | 1153 |
AM13297-SS | (NH2-C6)s(invAb)suuggcuugUfGfGfuguaauuggas(invAb) | 827 | UUGGCUUGUGGUGUAAUUGGA | 1154 |
AM13299-SS | (NH2-C6)s(invAb)sua_2NaacauuCfCfCfuuggauguaas(invAb) | 828 | U(A 2N)AACAUUCCCUUGGAUGUAA | 1217 |
AM13301-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauucccuUfGfGfauguagucuas(invAb) | 829 | CAUUCCCUUGGAUGUAGUCUA | 1156 |
AM13303-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 830 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM13305-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguuauccuGfCfUfagcuguagaas(invAb) | 831 | GUUAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 1158 |
AM13307-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgcuagcugUfAfGfaaauguaucas(invAb) | 832 | GCUAGCUGUAGAAAUGUAUCA | 1159 |
AM13309-SS | (NH2-C6)s(invAb)suagcuguaGfAfAfauguauccuas(invAb) | 833 | UAGCUGUAGAAAUGUAUCCUA | 1160 |
AM13311-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgaaauguaUfCfCfugauaaacaus(invAb) | 834 | GAAAUGUAUCCUGAUAAACAU | 1161 |
AM13313-SS | (NH2-C6)s(invAb)succugauaAfAfCfauuaaacacus(invAb) | 835 | UCCUGAUAAACAUUAAACACU | 1162 |
AM13315-SS | (NH2-C6)s(invAb)sa_2NaacauuaAfAfCfacuguaaucus(invAb) | 836 | (A 2N)AACAUUAAACACUGUAAUCU | 1129 |
AM13317-SS | (NH2-C6)s(invAb)sugcuuuaaAfGfUfaccuguaguas(invAb) | 837 | UGCUUUAAAGUACCUGUAGUA | 1164 |
AM13319-SS | (NH2-C6)s(invAb)saaacugauUfUfAfugaucacuuas(invAb) | 838 | AAACUGAUUUAUGAUCACUUA | 1165 |
AM13321-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuuggaagAfUfUfuguauaguuus(invAb) | 839 | CUUGGAAGAUUUGUAUAGUUU | 1166 |
AM13323-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuguuucaAfUfGfaccuguauuus(invAb) | 840 | CUGUUUCAAUGACCUGUAUUU | 1167 |
AM13325-SS | (NH2-C6)s(invAb)suuaaaucaCfAfGfauggguauuas(invAb) | 841 | UUAAAUCACAGAUGGGUAUUA | 1168 |
AM13327-SS | (NH2-C6)s(invAb)sa_2NgauggguAfUfUfaaacuugucas(invAb) | 842 | (A 2N)GAUGGGUAUUAAACUUGUCA | 1169 |
AM13917-SS | (NH2-C6)s(invAb)scgagcagaAfGfGfaaaguaaugas(invAb) | 843 | CGAGCAGAAGGAAAGUAAUGA | 1170 |
AM13919-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccugcaugGfAfUfuccauguucas(invAb) | 844 | CCUGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 1171 |
AM13921-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 845 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM13923-SS | (NH2-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 846 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM13925-SS | (NH2-C6)s(invAb)sauccugcuAfGfCfuguagaaauus(invAb) | 847 | AUCCUGCUAGCUGUAGAAAUU | 1174 |
AM13927-SS | (NH2-C6)s(invAb)suga_2NucacuUfGfGfaagauuuguus(invAb) | 848 | UG(A 2N)UCACUUGGAAGAUUUGUU | 1219 |
AM13929-SS | (NH2-C6)s(invAb)sucacagauGfGfGfuauuaaacuus(invAb) | 849 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM13988-SS | (NAG37)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 850 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM13997-SS | (NAG37)s(invAb)scgagcagaAfGfGfaaaguaaugas(invAb) | 851 | CGAGCAGAAGGAAAGUAAUGA | 1170 |
AM13998-SS | (NAG37)s(invAb)sccugcaugGfAfUfuccauguucas(invAb) | 852 | CCUGCAUGGAUUCCAUGUUCA | 1171 |
AM13999-SS | (NAG37)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 853 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM14000-SS | (NAG37)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 854 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM14001-SS | (NAG37)s(invAb)sauccugcuAfGfCfuguagaaauus(invAb) | 855 | AUCCUGCUAGCUGUAGAAAUU | 1174 |
AM14002-SS | (NAG37)s(invAb)suga_2NucacuUfGfGfaagauuuguus(invAb) | 856 | UG(A 2N)UCACUUGGAAGAUUUGUU | 1219 |
AM14003-SS | (NAG37)s(invAb)sucacagauGfGfGfuauuaaacuus(invAb) | 857 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM14004-SS | (NAG37)s(invAb)sgaaauguaUfCfCfugauaaacaus(invAb) | 858 | GAAAUGUAUCCUGAUAAACAU | 1161 |
AM14018-SS | (NAG37)s(invAb)sgcucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 859 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM14025-SS | (NAG37)s(invAb)sucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 860 | UCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1178 |
AM14089-SS | (NAG37)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 861 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM14101-SS | (NAG37)s(invAb)sccuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 862 | CCUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1179 |
AM14105-SS | (NAG37)s(invAb)suaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 863 | UAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1180 |
AM14276-SS | (invAb)sccucacuC16uUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 864 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM14278-SS | (invAb)scuuaacuC16cAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 865 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM14334-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgcucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 866 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM14340-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuauuas(invAb) | 867 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUUA | 1181 |
AM14346-SS | (NH2-C6)s(invAb)sucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 868 | UCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1178 |
AM14372-SS | (NH2-C6)s(invAb)sua_2NacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 869 | U(A 2N)ACUCAUCUGUUAUCCUA | 1220 |
AM15049-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucAfcuuUfAfAfUfccucuaucas(invAb) | 870 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM15051-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgcucAfcuuUfAfAfUfccucuaucas(invAb) | 871 | GCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1177 |
AM15053-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 872 | GUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1182 |
AM15057-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuuaAfcucAfUfCfUfguuauccuas(invAb) | 873 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM15752-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucAfcuuUfAfAfUfccucuaucas(invAb) | 874 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM15931-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 875 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16019-SS | (invAb)sccuC16cacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 876 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16020-SS | (invAb)sccucaC16cuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 877 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16021-SS | (invAb)sccucacuuC16UfAfAfuccucuaucas(invAb) | 878 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16022-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccuC16cuaucas(invAb) | 879 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16023-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuauC16cas(invAb) | 880 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16024-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuC16aucas(invAb) | 881 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16118-SS | (NH2-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 882 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM16119-SS | (NH2-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 883 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16120-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguuauccuGfCfUfagcuguagaas(invAb) | 884 | GUUAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 1158 |
AM16121-SS | (NH2-C6)s(invAb)succugauaAfAfCfauuaaacacus(invAb) | 885 | UCCUGAUAAACAUUAAACACU | 1162 |
AM16136-SS | (invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuC16as(invAb) | 886 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16137-SS | (invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauC16ccuas(invAb) | 887 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16138-SS | (invAb)scuuaacucAfUfCfuguC16uauccuas(invAb) | 888 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16139-SS | (invAb)scuuaacucAfUfCfuC16guuauccuas(invAb) | 889 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16140-SS | (invAb)scuuC16aacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 890 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16141-SS | (invAb)scuC16uaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 891 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16168-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 892 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16170-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccuuaacuCfAfUfcuguuauccas(invAb) | 893 | CCUUAACUCAUCUGUUAUCCA | 1183 |
AM16172-SS | (NH2-C6)s(invAb)scucaucugUfUfAfuccugcuagas(invAb) | 894 | CUCAUCUGUUAUCCUGCUAGA | 1184 |
AM16174-SS | (NH2-C6)s(invAb)scugcuagcUfGfUfagaaauguaas(invAb) | 895 | CUGCUAGCUGUAGAAAUGUAA | 1185 |
AM16176-SS | (NH2-C6)s(invAb)scccugauaAfAfCfauuaaacacas(invAb) | 896 | CCCUGAUAAACAUUAAACACA | 1186 |
AM16178-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgca_2NuuaaaCfAfCfuguaaucuuas(invAb) | 897 | GC(A 2N)UUAAACACUGUAAUCUUA | 1221 |
AM16180-SS | (NH2-C6)s(invAb)scua_2NugaucAfCfUfuggaagauuas(invAb) | 898 | CU(A 2N)UGAUCACUUGGAAGAUUA | 1222 |
AM16182-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgaccuguaUfUfUfugccagacuas(invAb) | 899 | GACCUGUAUUUUGCCAGACUA | 1189 |
AM16237-SS | (NH2-C6)s(invAb)scugcauggAfUfUfccauguucaus(invAb) | 900 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUCAU | 1190 |
AM16239-SS | (NH2-C6)s(invAb)sacugguggUfCfCfaugaaaaagas(invAb) | 901 | ACUGGUGGUCCAUGAAAAAGA | 1191 |
AM16241-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccaugaaaAfAfGfcagaugacuus(invAb) | 902 | CCAUGAAAAAGCAGAUGACUU | 1192 |
AM16243-SS | (NH2-C6)s(invAb)sagguggaaAfUfGfaagaaaguaas(invAb) | 903 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM16245-SS | (NH2-C6)s(invAb)scccuuaacUfCfAfucuguuaucas(invAb) | 904 | CCCUUAACUCAUCUGUUAUCA | 1194 |
AM16247-SS | (NH2-C6)s(invAb)scua_2NacucaUfCfUfguuauccugas(invAb) | 905 | CU(A 2N)ACUCAUCUGUUAUCCUGA | 1223 |
AM16249-SS | (NH2-C6)s(invAb)scaucuguuAfUfCfcugcuaguuas(invAb) | 906 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGUUA | 1196 |
AM16251-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccugcuagCfUfGfuagaaauguas(invAb) | 907 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUGUA | 1197 |
AM16253-SS | (NH2-C6)s(invAb)scaguuaaaAfUfGfucuguuucaas(invAb) | 908 | CAGUUAAAAUGUCUGUUUCAA | 1198 |
AM16255-SS | (NH2-C6)s(invAb)sga_2NaugucuGfUfUfucaaugacuus(invAb) | 909 | G(A 2N)AUGUCUGUUUCAAUGACUU | 1224 |
AM16257-SS | (NH2-C6)s(invAb)scacagaugGfGfUfauuaaacuuas(invAb) | 910 | CACAGAUGGGUAUUAAACUUA | 1200 |
AM16259-SS | (NH2-C6)s(invAb)sgcagauggGfUfAfuuaaacuugus(invAb) | 911 | GCAGAUGGGUAUUAAACUUGU | 1201 |
AM16616-SS | (NH2-C6)rs(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 912 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16617-SS | (NH2-C6)rs(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 913 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16618-SS | (NH2-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 914 | C(A 2N)UGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1218 |
AM16619-SS | (NH2-C6)s(invAb)sucacagauGfGfGfuauuaaacuus(invAb) | 915 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM16672-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 916 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16688-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 917 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16705-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 918 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16706-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 919 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16800-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 920 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16814-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 921 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16815-SS | (invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 922 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16949-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 923 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16954-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguugaagaUfuCfuGfugaucucas(invAb) | 924 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM17098-SS | (invAb)sccucacC16uuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 925 | CCUCAUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM17192-SS | (NH2-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb)(C6-SS-MeC5)dT | 926 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCAT | 1212 |
AM13767-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucaAlkcucuaaas(invAb)(C6-SS-C6)dT | 927 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM14676-SS | (NAG37)s(invAb)sguccaugaGfAfAfacaagaugaas(invAb) | 928 | GUCCAUGAGAAACAAGAUGAA | 1203 |
AM14520-SS | (NH2-C6)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 929 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14499-SS | (NH2-C6)s(invAb)succucacuCfUfAfagaaacaugas(invAb) | 930 | UCCUCACUCUAAGAAACAUGA | 1204 |
AM14274-SS | (invAb)scauuuuC16AfaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 931 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM13548-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)(C6-SS-C6)dT | 932 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM12590-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 933 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14677-SS | (NAG37)s(invAb)sagguggaaAfUfGfaagaaaguaas(invAb) | 934 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM14517-SS | (NH2-C6)(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 935 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14679-SS | (NAG37)s(invAb)sacucaucuGfCfUfacccucaaaas(invAb) | 936 | ACUCAUCUGCUACCCUCAAAA | 1205 |
AM13769-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuAlkaaas(invAb)(C6-SS-C6)dT | 937 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM14519-SS | (NH2-C6)scsauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 938 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14680-SS | (NAG37)s(invAb)scccucaaaCfCfAfuuaaacuguas(invAb) | 939 | CCCUCAAACCAUUAAACUGUA | 1206 |
AM16116-SS | (NH2-C6)s(invAb)csauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-SS-C6)dT | 940 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM14507-SS | (NH2-C6)s(invAb)saaugaagaAfAfGfuacaaagacas(invAb) | 941 | AAUGAAGAAAGUACAAAGACA | 1207 |
AM13397-SS | (invAb)scauuuuaaUfCfCfucacuC16cuaaas(invAb) | 942 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14674-SS | (NAG37)s(invAb)succucacuCfUfAfagaaacaugas(invAb) | 943 | UCCUCACUCUAAGAAACAUGA | 1204 |
AM16529-SS | (invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 944 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14511-SS | (NH2-C6)s(invAb)scccucaaaCfCfAfuuaaacuguas(invAb) | 945 | CCCUCAAACCAUUAAACUGUA | 1206 |
AM14505-SS | (NH2-C6)s(invAb)sagguggaaAfUfGfaagaaaguaas(invAb) | 946 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM14515-SS | (NH2-C6)s(invAb)sacuguaauCfUfGfaagaguuguas(invAb) | 947 | ACUGUAAUCUGAAGAGUUGUA | 1208 |
AM14678-SS | (NAG37)s(invAb)saaugaagaAfAfGfuacaaagacas(invAb) | 948 | AAUGAAGAAAGUACAAAGACA | 1207 |
AM14503-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguccaugaGfAfAfacaagaugaas(invAb) | 949 | GUCCAUGAGAAACAAGAUGAA | 1203 |
AM14675-SS | (NAG37)s(invAb)scaggagagCfAfUfuccaucauuas(invAb) | 950 | CAGGAGAGCAUUCCAUCAUUA | 1209 |
AM13977-SS | (invAb)scauuuuaaUfCfCfuCfaCfuCfuAfaas(invAb)s(C6-NH2) | 951 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15561-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucua_2Naas(invAb) | 952 | CAUUUUAAUCCUCACUCU(A 2N)AA | 1225 |
AM15559-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaa_2Ns(invAb) | 953 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAA(A 2N) | 1226 |
AM13588-SS | (NH2-C6)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaa(invAb) | 954 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14518-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaa(invAb) | 955 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15562-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuALNAaas(invAb) | 956 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16134-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-NH2) | 957 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15554-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-SS-C6)dT | 958 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM14682-SS | (NAG37)s(invAb)sacuguaauCfUfGfaagaguuguas(invAb) | 959 | ACUGUAAUCUGAAGAGUUGUA | 1208 |
AM13395-SS | (invAb)scauC16uuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 960 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15555-SS | (NH2-C6)(invAb)scsauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-SS-C6)dT | 961 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM15043-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuC16aaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 962 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM13768-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfuAlkcacucuaaas(invAb)(C6-SS-C6)dT | 963 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAAT | 1213 |
AM14681-SS | (NAG37)s(invAb)saaccauuaAfAfCfuguaaucugas(invAb) | 964 | AACCAUUAAACUGUAAUCUGA | 1210 |
AM12558-SS | (NAG37)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 965 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16524-SS | (invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 966 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14497-SS | (NH2-C6)s(invAb)scaggaccuCfAfUfuuuaauccuas(invAb) | 967 | CAGGACCUCAUUUUAAUCCUA | 1211 |
AM13975-SS | (invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-NH2) | 968 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM14509-SS | (NH2-C6)s(invAb)sacucaucuGfCfUfacccucaaaas(invAb) | 969 | ACUCAUCUGCUACCCUCAAAA | 1205 |
AM16903-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuAfaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 970 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16525-SS | (NAG37)s(invAb)scauuuuC16aaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 971 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM15560-SS | (NH2-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaa_2Nas(invAb) | 972 | CAUUUUAAUCCUCACUCUA(A 2N)A | 1227 |
AM14513-SS | (NH2-C6)s(invAb)saaccauuaAfAfCfuguaaucugas(invAb) | 973 | AACCAUUAAACUGUAAUCUGA | 1210 |
AM14673-SS | (NAG37)s(invAb)scaggaccuCfAfUfuuuaauccuas(invAb) | 974 | CAGGACCUCAUUUUAAUCCUA | 1211 |
AM14501-SS | (NH2-C6)s(invAb)scaggagagCfAfUfuccaucauuas(invAb) | 975 | CAGGAGAGCAUUCCAUCAUUA | 1209 |
AM13396-SS | (invAb)scauuuuC16aaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 976 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM17382-SS | (NH2-C6)s(invAb)sguugaagaUfuCfuGfugaucucas(invAb) | 977 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
股ID | 經修飾之有義股(5' → 3') | SEQ ID NO. | 無連接子或結合物之對應有義股 AM 編號( 參見表4 ) |
CS001845 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgaaaguaaUfGfGfaccagugaaas(invAb) | 978 | AM13283-SS |
CS001847 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgccugcauGfGfAfuuccauguuas(invAb) | 979 | AM13285-SS |
CS001849 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sauuccaugUfUfCfaugaguuugas(invAb) | 980 | AM13287-SS |
CS001851 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sugcaggucCfUfCfacuuuaaucas(invAb) | 981 | AM13289-SS |
CS001853 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 982 | AM13291-SS |
CS001855 | LP183-(NH-C6)s(invAb)saggaugaaGfAfGfaggcauguuas(invAb) | 983 | AM13293-SS |
CS001857 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuauugaaGfAfUfucugugaucus(invAb) | 984 | AM13295-SS |
CS001859 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suuggcuugUfGfGfuguaauuggas(invAb) | 985 | AM13297-SS |
CS001861 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sua_2NaacauuCfCfCfuuggauguaas(invAb) | 986 | AM13299-SS |
CS001863 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scauucccuUfGfGfauguagucuas(invAb) | 987 | AM13301-SS |
CS001865 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 988 | AM13303-SS |
CS001867 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguuauccuGfCfUfagcuguagaas(invAb) | 989 | AM13305-SS |
CS001869 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgcuagcugUfAfGfaaauguaucas(invAb) | 990 | AM13307-SS |
CS001871 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suagcuguaGfAfAfauguauccuas(invAb) | 991 | AM13309-SS |
CS001873 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgaaauguaUfCfCfugauaaacaus(invAb) | 992 | AM13311-SS |
CS001875 | LP183-(NH-C6)s(invAb)succugauaAfAfCfauuaaacacus(invAb) | 993 | AM13313-SS |
CS001877 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sa_2NaacauuaAfAfCfacuguaaucus(invAb) | 994 | AM13315-SS |
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CS002899 | LP310-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1030 | AM13303-SS |
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CS003257 | LP396-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1034 | AM13291-SS |
CS003258 | LP395-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1035 | AM13291-SS |
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股ID | 經修飾之有義股(5' → 3') | SEQ ID NO. | SEQ ID NO. | |
AM15752-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucAfcuuUfAfAfUfccucuaucas(invAb) | 1037 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM15931-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1038 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16118-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 1039 | CAUGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1173 |
AM16119-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1040 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16120-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguuauccuGfCfUfagcuguagaas(invAb) | 1041 | GUUAUCCUGCUAGCUGUAGAA | 1158 |
AM16121-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)succugauaAfAfCfauuaaacacus(invAb) | 1042 | UCCUGAUAAACAUUAAACACU | 1162 |
AM16168-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 1043 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16170-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccuuaacuCfAfUfcuguuauccas(invAb) | 1044 | CCUUAACUCAUCUGUUAUCCA | 1183 |
AM16172-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scucaucugUfUfAfuccugcuagas(invAb) | 1045 | CUCAUCUGUUAUCCUGCUAGA | 1184 |
AM16174-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scugcuagcUfGfUfagaaauguaas(invAb) | 1046 | CUGCUAGCUGUAGAAAUGUAA | 1185 |
AM16176-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scccugauaAfAfCfauuaaacacas(invAb) | 1047 | CCCUGAUAAACAUUAAACACA | 1186 |
AM16178-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgca_2NuuaaaCfAfCfuguaaucuuas(invAb) | 1048 | GCAUUAAACACUGUAAUCUUA | 1187 |
AM16180-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scua_2NugaucAfCfUfuggaagauuas(invAb) | 1049 | CUAUGAUCACUUGGAAGAUUA | 1188 |
AM16182-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgaccuguaUfUfUfugccagacuas(invAb) | 1050 | GACCUGUAUUUUGCCAGACUA | 1189 |
AM16237-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scugcauggAfUfUfccauguucaus(invAb) | 1051 | CUGCAUGGAUUCCAUGUUCAU | 1190 |
AM16239-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sacugguggUfCfCfaugaaaaagas(invAb) | 1052 | ACUGGUGGUCCAUGAAAAAGA | 1191 |
AM16241-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccaugaaaAfAfGfcagaugacuus(invAb) | 1053 | CCAUGAAAAAGCAGAUGACUU | 1192 |
AM16243-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sagguggaaAfUfGfaagaaaguaas(invAb) | 1054 | AGGUGGAAAUGAAGAAAGUAA | 1193 |
AM16245-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scccuuaacUfCfAfucuguuaucas(invAb) | 1055 | CCCUUAACUCAUCUGUUAUCA | 1194 |
AM16247-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scua_2NacucaUfCfUfguuauccugas(invAb) | 1056 | CUAACUCAUCUGUUAUCCUGA | 1195 |
AM16249-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scaucuguuAfUfCfcugcuaguuas(invAb) | 1057 | CAUCUGUUAUCCUGCUAGUUA | 1196 |
AM16251-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccugcuagCfUfGfuagaaauguas(invAb) | 1058 | CCUGCUAGCUGUAGAAAUGUA | 1197 |
AM16253-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scaguuaaaAfUfGfucuguuucaas(invAb) | 1059 | CAGUUAAAAUGUCUGUUUCAA | 1198 |
AM16255-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sga_2NaugucuGfUfUfucaaugacuus(invAb) | 1060 | GAAUGUCUGUUUCAAUGACUU | 1199 |
AM16257-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scacagaugGfGfUfauuaaacuuas(invAb) | 1061 | CACAGAUGGGUAUUAAACUUA | 1200 |
AM16259-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgcagauggGfUfAfuuaaacuugus(invAb) | 1062 | GCAGAUGGGUAUUAAACUUGU | 1201 |
AM16616-SS | LP183rs(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1063 | CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA | 1157 |
AM16617-SS | LP183rs(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1064 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16618-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 1065 | CAUGAAAAAGCAGAUGACUUU | 1173 |
AM16619-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sucacagauGfGfGfuauuaaacuus(invAb) | 1066 | UCACAGAUGGGUAUUAAACUU | 1176 |
AM16672-SS | LP409-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1067 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16688-SS | LP395-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1068 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16705-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1069 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16706-SS | C22s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1070 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16800-SS | HO-C16s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1071 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16814-SS | (2C8C12)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1072 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16815-SS | (2C6C10)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1073 | CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA | 1151 |
AM16949-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 1074 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16954-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguugaagaUfuCfuGfugaucucas(invAb) | 1075 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
AM16529-SS | LP183rs(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb) | 1076 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
AM16134-SS | LP183-(NH-C6)s(invAb)scauuuuaaUfCfCfucacucuaaas(invAb)s(C6-NH2) | 1077 | CAUUUUAAUCCUCACUCUAAA | 1202 |
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AM17382-SS | LP293-(NH-C6)s(invAb)sguugaagaUfuCfuGfugaucucas(invAb) | 1079 | GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA | 1172 |
本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑藉由反義股與有義股黏著而形成。含有表2、表4、表5、表6或表6a中所列序列之有義股可與含有表2或表3所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補性之區域。
如上表5中所示,顯示某些實例SOD1 RNAi藥劑核苷酸序列在有義股之5'末端及3'末端中之一者或兩者處進一步包括反應性連接基團。舉例而言,上表5中顯示之許多SOD1 RNAi藥劑有義股序列在核苷酸序列之5'端具有(NH2-C6)連接基團。其他連接基團,諸如(6-SS-6)連接基團或(C6-SS-C6)連接基團可同樣或者在某些實施例中存在。此類反應性連接基團定位成促進靶向配體、靶向基團及/或PK/PD調節劑與本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之連接。連接或結合反應為此項技術中所熟知且使得在兩種分子或反應物之間形成共價鍵。用於本文中之發明之範疇中之適合結合反應包括但不限於醯胺偶合反應、麥克爾加成反應(Michael addition reaction)、腙形成反應、反向需求狄爾斯-阿爾德環加成反應(inverse-demand Diels-Alder cycloaddition reaction)、肟接合及銅(I)-催化或應力促進之疊氮化合物-炔烴環加成反應環加成反應。
在一些實施例中,靶向配體可合成為活化酯,諸如四氟苯基(TFP)酯,其可由反應性胺基(例如NH
2-C
6)置換以將靶向配體與本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑連接。在一些實施例中,靶向配體合成為疊氮化合物,其可例如經由銅(I)-催化或應力促進之疊氮化合物-炔烴環加成反應與炔丙基或DBCO基團結合。
另外,某些核苷酸序列可合成為在有義股之3'端末端處具有dT核苷酸,隨後(3' → 5')連接子(例如C6-SS-C6)。在一些實施例中,連接子可促進與額外組分,諸如脂質或一或多種靶向配體之鍵聯。如本文中所描述,C6-SS-C6之二硫鍵首先被還原,從而自分子移除dT,此接著可促進結合所需組分。末端dT核苷酸因此不係完全結合之構築體的一部分。
在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之反義股與表3或表10中之任一反義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之有義股與表4、表5、表6、表6a或表10中之任一有義股序列相差0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之任一序列的核苷酸序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表10中之任一序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17、2-17、1-18、2-18、1-19、2-19、1-20、2-20、1-21、2-21、1-22、2-22、1-23、2-23、1-24或2-24的序列。在某些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表3或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列或由其組成。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包含表2或表4中之任一序列之核苷酸序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包含表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17、2-17、3-17、4-17、1-18、2-18、3-18、4-18、1-19、2-19、3-19、4-19、1-20、2-20、3-20、4-20、1-21、2-21、3-21、4-21、1-22、2-22、3-22、4-22、1-23、2-23、3-23、4-23、1-24、2-24、3-24或4-24的序列。在某些實施例中,SOD1 RNAi藥劑有義股包含表3或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列或由其組成。
對於本文所揭示之RNAi藥劑而言,反義股之位置1處的核苷酸(自5'端→3'端)可與SOD1基因完美互補,或可與SOD1基因非互補。在一些實施例中,反義股之位置1處的核苷酸(自5'端→3'端)為U、A或dT (或U、A或dT之經修飾型式)。在一些實施例中,反義股之位置1處之核苷酸(自5'端→3'端)與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表10中之任一反義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 2-18或2-19的序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi有義股包含表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一有義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17或1-18的序列。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包括(i)反義股,其包含表2、表3或表10中之任一反義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 2-18或2-19的序列;及(ii)有義股,其包含表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一有義股序列之核苷酸(自5'端→3'端) 1-17或1-18的序列。
含有表2或表4中所列序列之有義股可與含有表2或表3所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補性之區域。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑具有:有義股,其由表4、表5、表6、表6a或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列組成;及反義股,其由表3或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列組成。某些代表性序列配對由表7A、7B、8及9A中顯示之雙螺旋體ID編號例示。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的雙螺旋體、由其組成或基本上由其組成。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者組成。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股核苷酸序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股核苷酸序列,及靶向基團、連接基團、PK/PD調節劑及/或其他非核苷酸基團,其中靶向基團、連接基團、PK/PD調節劑及/或其他非核苷酸基團與有義股或反義股共價連接(亦即,結合)。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包括本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾之核苷酸序列。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾之核苷酸序列,及靶向基團、連接基團及/或其他非核苷酸基團,其中靶向基團、連接基團、PK/PD調節劑及/或其他非核苷酸基團與有義股或反義股共價連接(亦即,結合)。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表2、7A、7B、8、9A或10之任一反義股/有義股雙螺旋體之核苷酸序列的反義股及有義股,且包含PK/PD調節劑。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表2、7A、7B、8、9A或10之任一反義股/有義股雙螺旋體之核苷酸序列的反義股及有義股,且包含一或多個脂質部分。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表2、7A、7B、8、9A或10之任一反義股/有義股雙螺旋體之核苷酸序列的反義股及有義股,且包含脂質部分。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表2、7A、7B、8、9A或10之任一反義股/有義股雙螺旋體之核苷酸序列的反義股及有義股,且包含一或多個脂質部分。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表7A、7B、8、9A及10之任一反義股/有義股雙螺旋體之經修飾之核苷酸序列的反義股及有義股。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含具有表7A、7B、8、9A及10之任一反義股/有義股雙螺旋體之經修飾之核苷酸序列的反義股及有義股,且包含脂質部分。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑包含表7A、7B、8、9A及10之任一雙螺旋體,由其組成或基本上由其組成。
表 7A.具有經修飾及未經修飾之核苷酸序列之對應有義股及反義股ID編號及序列ID編號之SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體。(不顯示連接劑或結合物)
雙螺旋體 | AS ID | 經修飾之AS SEQ ID NO: | 未經修飾之AS SEQ ID NO: | SS ID | 經修飾之SS SEQ ID NO: | 未經修飾之SS SEQ ID NO: |
AD09381 | AM13284-AS | 522 | 1080 | AM13283-SS | 681 | 1147 |
AD09382 | AM13286-AS | 523 | 1081 | AM13285-SS | 682 | 1148 |
AD09383 | AM13288-AS | 524 | 1082 | AM13287-SS | 683 | 1149 |
AD09384 | AM13290-AS | 525 | 1083 | AM13289-SS | 684 | 1150 |
AD09385 | AM13292-AS | 526 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD09386 | AM13294-AS | 527 | 1085 | AM13293-SS | 686 | 1152 |
AD09387 | AM13296-AS | 528 | 1086 | AM13295-SS | 687 | 1153 |
AD09388 | AM13298-AS | 529 | 1087 | AM13297-SS | 688 | 1154 |
AD09389 | AM13300-AS | 530 | 1088 | AM13299-SS | 689 | 1155 |
AD09390 | AM13302-AS | 531 | 1089 | AM13301-SS | 690 | 1156 |
AD09391 | AM13304-AS | 532 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD09392 | AM13306-AS | 533 | 1091 | AM13305-SS | 692 | 1158 |
AD09393 | AM13308-AS | 534 | 1092 | AM13307-SS | 693 | 1159 |
AD09394 | AM13310-AS | 535 | 1093 | AM13309-SS | 694 | 1160 |
AD09395 | AM13312-AS | 536 | 1094 | AM13311-SS | 685 | 1161 |
AD09396 | AM13314-AS | 537 | 1095 | AM13313-SS | 696 | 1162 |
AD09397 | AM13316-AS | 538 | 1096 | AM13315-SS | 697 | 1163 |
AD09398 | AM13318-AS | 539 | 1097 | AM13317-SS | 698 | 1164 |
AD09399 | AM13320-AS | 540 | 1098 | AM13319-SS | 699 | 1165 |
AD09400 | AM13322-AS | 541 | 1099 | AM13321-SS | 700 | 1166 |
AD09401 | AM13324-AS | 542 | 1100 | AM13323-SS | 701 | 1167 |
AD09402 | AM13326-AS | 543 | 1101 | AM13325-SS | 702 | 1168 |
AD09403 | AM13328-AS | 544 | 1102 | AM13327-SS | 703 | 1169 |
AD09754 | AM13918-AS | 545 | 1103 | AM13917-SS | 704 | 1170 |
AD09755 | AM13920-AS | 546 | 1104 | AM13919-SS | 705 | 1171 |
AD09756 | AM13922-AS | 547 | 1105 | AM13921-SS | 706 | 1172 |
AD09757 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM13923-SS | 707 | 1173 |
AD09758 | AM13926-AS | 549 | 1107 | AM13925-SS | 708 | 1174 |
AD09759 | AM13928-AS | 550 | 1108 | AM13927-SS | 709 | 1175 |
AD09760 | AM13930-AS | 551 | 1109 | AM13929-SS | 710 | 1176 |
AD09798 | AM13292-AS | 526 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09806 | AM13918-AS | 545 | 1103 | AM13997-SS | 712 | 1170 |
AD09807 | AM13920-AS | 546 | 1104 | AM13998-SS | 713 | 1171 |
AD09808 | AM13922-AS | 547 | 1105 | AM13999-SS | 714 | 1172 |
AD09809 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM14000-SS | 715 | 1173 |
AD09810 | AM13926-AS | 549 | 1107 | AM14001-SS | 716 | 1174 |
AD09811 | AM13928-AS | 550 | 1108 | AM14002-SS | 717 | 1175 |
AD09812 | AM13930-AS | 551 | 1109 | AM14003-SS | 718 | 1176 |
AD09813 | AM13312-AS | 536 | 1094 | AM14004-SS | 719 | 1161 |
AD09825 | AM14017-AS | 552 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09826 | AM14019-AS | 553 | 1110 | AM14018-SS | 720 | 1177 |
AD09827 | AM14020-AS | 554 | 1110 | AM14018-SS | 780 | 1177 |
AD09828 | AM14021-AS | 555 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09829 | AM14022-AS | 556 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09830 | AM14023-AS | 557 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09831 | AM14024-AS | 558 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD09832 | AM14026-AS | 559 | 1111 | AM14025-SS | 721 | 1178 |
AD09869 | AM13304-AS | 532 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09878 | AM14096-AS | 560 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09879 | AM14097-AS | 561 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09880 | AM14098-AS | 562 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09881 | AM14099-AS | 563 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09882 | AM14100-AS | 564 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09883 | AM14102-AS | 565 | 1112 | AM14101-SS | 723 | 1179 |
AD09884 | AM14103-AS | 566 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09885 | AM14104-AS | 567 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD09886 | AM14106-AS | 568 | 1113 | AM14105-SS | 724 | 1180 |
AD10001 | AM14270-AS | 569 | 1111 | AM14025-SS | 721 | 1178 |
AD10002 | AM14271-AS | 570 | 1111 | AM14025-SS | 721 | 1178 |
AD10003 | AM14272-AS | 571 | 1111 | AM14025-SS | 721 | 1178 |
AD10004 | AM14273-AS | 572 | 1111 | AM14025-SS | 721 | 1178 |
AD10006 | AM14277-AS | 573 | 1084 | AM14276-SS | 864 | 1151 |
AD10007 | AM14279-AS | 574 | 1090 | AM14278-SS | 865 | 1157 |
AD10055 | AM14020-AS | 554 | 1110 | AM14334-SS | 725 | 1177 |
AD10056 | AM14021-AS | 555 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10057 | AM14022-AS | 556 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10058 | AM14023-AS | 557 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10059 | AM14024-AS | 558 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10060 | AM14335-AS | 575 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD10061 | AM14335-AS | 575 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10066 | AM14339-AS | 576 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10067 | AM14339-AS | 576 | 1084 | AM14340-SS | 726 | 1181 |
AD10068 | AM14341-AS | 577 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10069 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10070 | AM14343-AS | 579 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10071 | AM14344-AS | 580 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10072 | AM14345-AS | 581 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10073 | AM14347-AS | 582 | 1111 | AM14346-SS | 727 | 1178 |
AD10077 | AM14365-AS | 583 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10078 | AM14366-AS | 584 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10079 | AM14367-AS | 585 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10080 | AM14368-AS | 586 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10081 | AM14369-AS | 587 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10082 | AM14370-AS | 588 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10083 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10084 | AM14373-AS | 590 | 1113 | AM14372-SS | 728 | 1180 |
AD10564 | AM15044-AS | 592 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10565 | AM15045-AS | 593 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10566 | AM15046-AS | 594 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10567 | AM15047-AS | 595 | 1110 | AM14334-SS | 725 | 1177 |
AD10568 | AM15048-AS | 596 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10569 | AM15048-AS | 596 | 1084 | AM15049-SS | 729 | 1151 |
AD10570 | AM15050-AS | 597 | 1084 | AM15049-SS | 729 | 1151 |
AD10571 | AM15052-AS | 598 | 1110 | AM15051-SS | 730 | 1177 |
AD10572 | AM15050-AS | 597 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD10573 | AM15054-AS | 599 | 1115 | AM15053-SS | 731 | 1182 |
AD10574 | AM15055-AS | 600 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10575 | AM15056-AS | 601 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10576 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM15057-SS | 732 | 1157 |
AD10577 | AM15058-AS | 602 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10578 | AM15059-AS | 603 | 1115 | AM15053-SS | 731 | 1182 |
AD10579 | AM15060-AS | 604 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10580 | AM15061-AS | 605 | 1115 | AM15053-SS | 731 | 1182 |
AD10581 | AM15062-AS | 606 | 1090 | AM13303-SS | 691 | 1157 |
AD10694 | AM14365-AS | 583 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD10695 | AM14369-AS | 587 | 1090 | AM14089-SS | 722 | 1157 |
AD10696 | AM15245-AS | 607 | 1084 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD10697 | AM15246-AS | 609 | 1116 | AM13988-SS | 711 | 1151 |
AD11066 | AM15751-AS | 610 | 1084 | AM15752-SS | 733 | 1151 |
AD11068 | AM15048-AS | 596 | 1084 | AM15752-SS | 733 | 1151 |
AD11196 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11197 | AM15932-AS | 611 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11198 | AM15933-AS | 612 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11199 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11200 | AM15935-AS | 614 | 1117 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11201 | AM15936-AS | 615 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11274 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16019-SS | 876 | 1151 |
AD11275 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16020-SS | 877 | 1151 |
AD11276 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM14276-SS | 864 | 1151 |
AD11277 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16021-SS | 878 | 1151 |
AD11278 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16022-SS | 879 | 1151 |
AD11279 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16023-SS | 880 | 1151 |
AD11280 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM16024-SS | 881 | 1151 |
AD11295 | AM16051-AS | 616 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD11335 | AM16114-AS | 618 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD11340 | AM13292-AS | 526 | 1084 | AM15931-SS | 734 | 1151 |
AD11341 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM16118-SS | 735 | 1173 |
AD11342 | AM13304-AS | 532 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11343 | AM13306-AS | 533 | 1091 | AM16120-SS | 737 | 1158 |
AD11344 | AM13314-AS | 537 | 1095 | AM16121-SS | 738 | 1162 |
AD11358 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11359 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16136-SS | 886 | 1157 |
AD11360 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16137-SS | 887 | 1157 |
AD11361 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16138-SS | 888 | 1157 |
AD11362 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16139-SS | 889 | 1157 |
AD11363 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM14278-SS | 865 | 1157 |
AD11364 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16140-SS | 890 | 1157 |
AD11365 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16141-SS | 891 | 1157 |
AD11370 | AM16144-AS | 620 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11371 | AM16145-AS | 621 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11372 | AM16146-AS | 622 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11373 | AM16147-AS | 623 | 1090 | AM16119-SS | 736 | 1157 |
AD11384 | AM16169-AS | 624 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11385 | AM16171-AS | 625 | 1118 | AM16170-SS | 740 | 1183 |
AD11386 | AM16173-AS | 626 | 1119 | AM16172-SS | 741 | 1184 |
AD11387 | AM16175-AS | 627 | 1120 | AM16174-SS | 745 | 1185 |
AD11388 | AM16177-AS | 628 | 1121 | AM16176-SS | 743 | 1186 |
AD11389 | AM16179-AS | 629 | 1122 | AM16178-SS | 744 | 1187 |
AD11390 | AM16181-AS | 630 | 1123 | AM16180-SS | 745 | 1188 |
AD11391 | AM16183-AS | 631 | 1124 | AM16182-SS | 746 | 1189 |
AD11429 | AM16238-AS | 632 | 1125 | AM16237-SS | 747 | 1190 |
AD11430 | AM16240-AS | 633 | 1126 | AM16239-SS | 748 | 1191 |
AD11431 | AM16242-AS | 634 | 1127 | AM16241-SS | 749 | 1192 |
AD11432 | AM16244-AS | 635 | 1114 | AM16243-SS | 750 | 1193 |
AD11433 | AM16246-AS | 636 | 1128 | AM16245-SS | 751 | 1194 |
AD11434 | AM16248-AS | 637 | 1129 | AM16247-SS | 752 | 1195 |
AD11435 | AM16250-AS | 643 | 1130 | AM16249-SS | 753 | 1196 |
AD11436 | AM16252-AS | 639 | 1131 | AM16251-SS | 754 | 1197 |
AD11437 | AM16254-AS | 640 | 1132 | AM16253-SS | 755 | 1198 |
AD11438 | AM16256-AS | 641 | 1133 | AM16255-SS | 756 | 1199 |
AD11439 | AM16258-AS | 642 | 1134 | AM16257-SS | 757 | 1200 |
AD11440 | AM16260-AS | 643 | 1135 | AM16259-SS | 758 | 1201 |
AD11556 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM13291-SS | 685 | 1151 |
AD11691 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16616-SS | 759 | 1157 |
AD11692 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16617-SS | 760 | 1151 |
AD11693 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM16118-SS | 735 | 1173 |
AD11694 | AM13930-AS | 551 | 1109 | AM16619-SS | 762 | 1176 |
AD11728 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16672-SS | 763 | 1151 |
AD11731 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM14276-SS | 864 | 1151 |
AD11732 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16022-SS | 879 | 1151 |
AD11739 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16688-SS | 764 | 1151 |
AD11758 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16705-SS | 765 | 1151 |
AD11759 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16706-SS | 766 | 1151 |
AD11821 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16800-SS | 767 | 1151 |
AD11841 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16814-SS | 768 | 1151 |
AD11842 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16815-SS | 769 | 1151 |
AD11939 | AM16169-AS | 624 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11940 | AM16950-AS | 644 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11941 | AM16951-AS | 645 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11942 | AM16952-AS | 646 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11943 | AM16953-AS | 647 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11944 | AM16952-AS | 646 | 1105 | AM16954-SS | 771 | 1172 |
AD11945 | AM16955-AS | 648 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11946 | AM16956-AS | 649 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD11947 | AM16957-AS | 650 | 1105 | AM16954-SS | 771 | 1172 |
AD11948 | AM16958-AS | 651 | 1105 | AM16168-SS | 739 | 1172 |
AD12063 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM17098-SS | 925 | 1151 |
AD12139 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM17192-SS | 772 | 1151 |
表 7B.具有經修飾及未經修飾之核苷酸序列之對應有義股及反義股ID編號及序列ID編號的SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體。
雙螺旋體 | AS ID | 經修飾之AS SEQ ID NO: | 未經修飾之AS SEQ ID NO: | SS ID | 經修飾之SS SEQ ID NO: | 未經修飾之SS SEQ ID NO: |
AD11066 | AM15751-AS | 610 | 1084 | AM15752-SS | 874 | 1151 |
AD11068 | AM15048-AS | 596 | 1084 | AM15752-SS | 874 | 1151 |
AD11196 | AM14342-AS | 578 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11197 | AM15932-AS | 611 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11198 | AM15933-AS | 612 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11199 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11200 | AM15935-AS | 614 | 1117 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11201 | AM15936-AS | 615 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11340 | AM13292-AS | 526 | 1084 | AM15931-SS | 875 | 1151 |
AD11341 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM16118-SS | 882 | 1173 |
AD11342 | AM13304-AS | 532 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11343 | AM13306-AS | 533 | 1091 | AM16120-SS | 884 | 1158 |
AD11344 | AM13314-AS | 537 | 1095 | AM16121-SS | 885 | 1162 |
AD11358 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11370 | AM16144-AS | 620 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11371 | AM16145-AS | 621 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11372 | AM16146-AS | 622 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11373 | AM16147-AS | 623 | 1090 | AM16119-SS | 883 | 1157 |
AD11384 | AM16169-AS | 624 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11385 | AM16171-AS | 625 | 1118 | AM16170-SS | 893 | 1183 |
AD11386 | AM16173-AS | 626 | 1119 | AM16172-SS | 894 | 1184 |
AD11387 | AM16175-AS | 627 | 1120 | AM16174-SS | 895 | 1185 |
AD11388 | AM16177-AS | 628 | 1121 | AM16176-SS | 896 | 1186 |
AD11389 | AM16179-AS | 629 | 1122 | AM16178-SS | 897 | 1187 |
AD11390 | AM16181-AS | 630 | 1123 | AM16180-SS | 898 | 1188 |
AD11391 | AM16183-AS | 631 | 1124 | AM16182-SS | 899 | 1189 |
AD11429 | AM16238-AS | 632 | 1125 | AM16237-SS | 900 | 1190 |
AD11430 | AM16240-AS | 633 | 1126 | AM16239-SS | 901 | 1191 |
AD11431 | AM16242-AS | 634 | 1127 | AM16241-SS | 902 | 1192 |
AD11432 | AM16244-AS | 635 | 1114 | AM16243-SS | 903 | 1193 |
AD11433 | AM16246-AS | 636 | 1128 | AM16245-SS | 904 | 1194 |
AD11434 | AM16248-AS | 637 | 1129 | AM16247-SS | 905 | 1195 |
AD11435 | AM16250-AS | 638 | 1130 | AM16249-SS | 906 | 1196 |
AD11436 | AM16252-AS | 639 | 1131 | AM16251-SS | 907 | 1197 |
AD11437 | AM16254-AS | 640 | 1132 | AM16253-SS | 908 | 1198 |
AD11438 | AM16256-AS | 641 | 1133 | AM16255-SS | 909 | 1199 |
AD11439 | AM16258-AS | 642 | 1134 | AM16257-SS | 910 | 1200 |
AD11440 | AM16260-AS | 643 | 1135 | AM16259-SS | 911 | 1201 |
AD11691 | AM14371-AS | 589 | 1090 | AM16616-SS | 912 | 1157 |
AD11692 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16617-SS | 913 | 1151 |
AD11693 | AM13924-AS | 548 | 1106 | AM16118-SS | 882 | 1173 |
AD11694 | AM13930-AS | 551 | 1109 | AM16619-SS | 915 | 1176 |
AD11728 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16672-SS | 916 | 1151 |
AD11739 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16688-SS | 917 | 1151 |
AD11758 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16705-SS | 918 | 1151 |
AD11759 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16706-SS | 919 | 1151 |
AD11821 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16800-SS | 920 | 1151 |
AD11841 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16814-SS | 921 | 1151 |
AD11842 | AM15934-AS | 613 | 1084 | AM16815-SS | 922 | 1151 |
AD11939 | AM16169-AS | 624 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11940 | AM16950-AS | 644 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11941 | AM16951-AS | 645 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11942 | AM16952-AS | 646 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11943 | AM16953-AS | 647 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11944 | AM16952-AS | 646 | 1105 | AM16954-SS | 924 | 1172 |
AD11945 | AM16955-AS | 648 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11946 | AM16956-AS | 649 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD11947 | AM16957-AS | 650 | 1105 | AM16954-SS | 924 | 1172 |
AD11948 | AM16958-AS | 651 | 1105 | AM16168-SS | 892 | 1172 |
AD12261 | AM16952-AS | 646 | 1105 | AM17382-SS | 977 | 1172 |
表 8.具有經修飾及未經修飾之核苷酸序列之對應有義股及反義股ID編號及序列ID編號的SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體。(顯示PK/PD調節劑)
雙螺旋體 | SS ID | 經修飾之SS SEQ ID NO: | 未經修飾之SS SEQ ID NO: | AS ID | 經修飾之AS SEQ ID NO: | 未經修飾之AS SEQ ID NO: |
AC001451 | CS001845 | 978 | 1147 | AM13284-AS | 522 | 1080 |
AC001452 | CS001847 | 979 | 1148 | AM13286-AS | 523 | 1081 |
AC001453 | CS001849 | 980 | 1149 | AM13288-AS | 524 | 1082 |
AC001454 | CS001851 | 981 | 1150 | AM13290-AS | 525 | 1083 |
AC001455 | CS001853 | 982 | 1151 | AM13292-AS | 526 | 1084 |
AC001456 | CS001855 | 983 | 1152 | AM13294-AS | 527 | 1085 |
AC001457 | CS001857 | 984 | 1153 | AM13296-AS | 528 | 1086 |
AC001458 | CS001859 | 985 | 1154 | AM13298-AS | 529 | 1087 |
AC001459 | CS001861 | 986 | 1155 | AM13300-AS | 530 | 1088 |
AC001460 | CS001863 | 987 | 1156 | AM13302-AS | 531 | 1089 |
AC001461 | CS001865 | 988 | 1157 | AM13304-AS | 532 | 1090 |
AC001462 | CS001867 | 989 | 1158 | AM13306-AS | 533 | 1091 |
AC001463 | CS001869 | 990 | 1159 | AM13308-AS | 534 | 1092 |
AC001464 | CS001871 | 991 | 1160 | AM13310-AS | 535 | 1093 |
AC001465 | CS001873 | 992 | 1161 | AM13312-AS | 536 | 1094 |
AC001466 | CS001875 | 993 | 1162 | AM13314-AS | 537 | 1095 |
AC001467 | CS001877 | 994 | 1163 | AM13316-AS | 538 | 1096 |
AC001468 | CS001879 | 995 | 1164 | AM13318-AS | 539 | 1097 |
AC001469 | CS001881 | 996 | 1165 | AM13320-AS | 540 | 1098 |
AC001470 | CS001883 | 997 | 1166 | AM13322-AS | 541 | 1099 |
AC001471 | CS001885 | 998 | 1167 | AM13324-AS | 542 | 1100 |
AC001472 | CS001887 | 999 | 1168 | AM13326-AS | 543 | 1101 |
AC001473 | CS001889 | 1000 | 1169 | AM13328-AS | 544 | 1102 |
AC001621 | CS002094 | 1001 | 1170 | AM13918-AS | 545 | 1103 |
AC001622 | CS002096 | 1002 | 1171 | AM13920-AS | 546 | 1104 |
AC001623 | CS002098 | 1003 | 1172 | AM13922-AS | 547 | 1105 |
AC001624 | CS002100 | 1004 | 1173 | AM13924-AS | 548 | 1106 |
AC001625 | CS002102 | 1005 | 1174 | AM13926-AS | 549 | 1107 |
AC001626 | CS002104 | 1006 | 1175 | AM13928-AS | 550 | 1108 |
AC001627 | CS002106 | 1007 | 1176 | AM13930-AS | 551 | 1109 |
AC001801 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14365-AS | 583 | 1090 |
AC001802 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14366-AS | 584 | 1090 |
AC001803 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14367-AS | 585 | 1090 |
AC001804 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14368-AS | 586 | 1090 |
AC001805 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14369-AS | 587 | 1090 |
AC001806 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14370-AS | 588 | 1090 |
AC001807 | CS001865 | 1008 | 1157 | AM14371-AS | 589 | 1090 |
AC001808 | CS002303 | 1009 | 1180 | AM14373-AS | 590 | 1113 |
AC001809 | CS002305 | 1010 | 1177 | AM14020-AS | 554 | 1110 |
AC001810 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14021-AS | 555 | 1084 |
AC001811 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14022-AS | 556 | 1084 |
AC001812 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14023-AS | 557 | 1084 |
AC001813 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14024-AS | 558 | 1084 |
AC001814 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14335-AS | 575 | 1084 |
AC001815 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14339-AS | 576 | 1084 |
AC001816 | CS002313 | 726 | 1181 | AM14339-AS | 576 | 1084 |
AC001817 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14341-AS | 577 | 1084 |
AC001818 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14342-AS | 578 | 1084 |
AC001819 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14343-AS | 579 | 1084 |
AC001820 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14344-AS | 580 | 1084 |
AC001821 | CS001853 | 1011 | 1151 | AM14345-AS | 581 | 1084 |
AC001822 | CS002319 | 1012 | 1178 | AM14347-AS | 582 | 1111 |
AC002099 | CS002664 | 1013 | 1151 | AM14342-AS | 578 | 1084 |
AC002101 | CS002666 | 1014 | 1151 | AM14342-AS | 578 | 1084 |
AC002102 | CS002667 | 1015 | 1182 | AM15054-AS | 599 | 1115 |
AC002103 | CS001865 | 1016 | 1157 | AM15055-AS | 600 | 1090 |
AC002104 | CS001865 | 1016 | 1157 | AM15056-AS | 601 | 1090 |
AC002105 | CS002671 | 1018 | 1157 | AM14371-AS | 589 | 1090 |
AC002106 | CS001865 | 1016 | 1157 | AM15058-AS | 602 | 1090 |
AC002107 | CS002667 | 1022 | 1182 | AM15059-AS | 603 | 1115 |
AC002108 | CS001865 | 1016 | 1157 | AM15060-AS | 604 | 1090 |
AC002109 | CS002667 | 1022 | 1182 | AM15061-AS | 605 | 1115 |
AC002110 | CS001865 | 1016 | 1157 | AM15062-AS | 606 | 1090 |
AC002111 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15044-AS | 592 | 1084 |
AC002112 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15045-AS | 593 | 1084 |
AC002113 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15046-AS | 594 | 1084 |
AC002114 | CS002305 | 1010 | 1177 | AM15047-AS | 595 | 1110 |
AC002115 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15048-AS | 594 | 1084 |
AC002116 | CS002682 | 1025 | 1151 | AM15048-AS | 594 | 1084 |
AC002117 | CS002682 | 1025 | 1151 | AM15050-AS | 597 | 1084 |
AC002118 | CS002684 | 1027 | 1177 | AM15052-AS | 598 | 1110 |
AC002119 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15050-AS | 597 | 1084 |
AC002272 | CS002884 | 1029 | 1151 | AM14342-AS | 578 | 1084 |
AC002286 | CS002899 | 1030 | 1157 | AM14370-AS | 588 | 1090 |
AC002287 | CS002900 | 1031 | 1157 | AM14370-AS | 588 | 1090 |
AC002370 | CS001853 | 982 | 1151 | AM16051-AS | 616 | 1084 |
AC002380 | CS001853 | 982 | 1151 | AM16114-AS | 618 | 1084 |
AC002478 | CS001853 | 982 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002479 | CS002884 | 1029 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002547 | CS003254 | 685 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002548 | CS003255 | 1032 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002549 | CS003256 | 1033 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002550 | CS003257 | 1034 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC002551 | CS003258 | 1035 | 1151 | AM15934-AS | 613 | 1084 |
AC910358 | CS913315 | 1036 | 1172 | AM16952-AS | 646 | 1105 |
表 9A.提及靶向於SOD1基因上之位置的結合物雙螺旋體ID編號
雙螺旋體 | SS ID | AS ID | 雙螺旋體 | (SEQ ID NO:1 之) 靶向SOD1 基因 位置 |
AC001451 | CS001845 | AM13284-AS | AD09381 | 150 |
AC001452 | CS001847 | AM13286-AS | AD09382 | 202 |
AC001453 | CS001849 | AM13288-AS | AD09383 | 212 |
AC001454 | CS001851 | AM13290-AS | AD09384 | 257 |
AC001455 | CS001853 | AM13292-AS | AD09385 | 264 |
AC001456 | CS001855 | AM13294-AS | AD09386 | 304 |
AC001457 | CS001857 | AM13296-AS | AD09387 | 373 |
AC001458 | CS001859 | AM13298-AS | AD09388 | 510 |
AC001459 | CS001861 | AM13300-AS | AD09389 | 540 |
AC001460 | CS001863 | AM13302-AS | AD09390 | 544 |
AC001461 | CS001865 | AM13304-AS | AD09391 | 571 |
AC001462 | CS001867 | AM13306-AS | AD09392 | 583 |
AC001463 | CS001869 | AM13308-AS | AD09393 | 591 |
AC001464 | CS001871 | AM13310-AS | AD09394 | 593 |
AC001465 | CS001873 | AM13312-AS | AD09395 | 601 |
AC001466 | CS001875 | AM13314-AS | AD09396 | 609 |
AC001467 | CS001877 | AM13316-AS | AD09397 | 616 |
AC001468 | CS001879 | AM13318-AS | AD09398 | 668 |
AC001469 | CS001881 | AM13320-AS | AD09399 | 691 |
AC001470 | CS001883 | AM13322-AS | AD09400 | 708 |
AC001471 | CS001885 | AM13324-AS | AD09401 | 750 |
AC001472 | CS001887 | AM13326-AS | AD09402 | 779 |
AC001473 | CS001889 | AM13328-AS | AD09403 | 788 |
AC001621 | CS002094 | AM13918-AS | AD09754 | 140 |
AC001622 | CS002096 | AM13920-AS | AD09755 | 203 |
AC001623 | CS002098 | AM13922-AS | AD09756 | 375 |
AC001624 | CS002100 | AM13924-AS | AD09757 | 438 |
AC001625 | CS002102 | AM13926-AS | AD09758 | 586 |
AC001626 | CS002104 | AM13928-AS | AD09759 | 702 |
AC001627 | CS002106 | AM13930-AS | AD09760 | 784 |
AC001801 | CS001865 | AM14365-AS | AD10077 | 571 |
AC001802 | CS001865 | AM14366-AS | AD10078 | 571 |
AC001803 | CS001865 | AM14367-AS | AD10079 | 571 |
AC001804 | CS001865 | AM14368-AS | AD10080 | 571 |
AC001805 | CS001865 | AM14369-AS | AD10081 | 571 |
AC001806 | CS001865 | AM14370-AS | AD10082 | 571 |
AC001807 | CS001865 | AM14371-AS | AD10083 | 571 |
AC001808 | CS002303 | AM14373-AS | AD10084 | 571 |
AC001809 | CS002305 | AM14020-AS | AD10055 | 264 |
AC001810 | CS001853 | AM14021-AS | AD10056 | 264 |
AC001811 | CS001853 | AM14022-AS | AD10057 | 264 |
AC001812 | CS001853 | AM14023-AS | AD10058 | 264 |
AC001813 | CS001853 | AM14024-AS | AD10059 | 264 |
AC001814 | CS001853 | AM14335-AS | AD10061 | 264 |
AC001815 | CS001853 | AM14339-AS | AD10066 | 264 |
AC001816 | CS002313 | AM14339-AS | AD10067 | 264 |
AC001817 | CS001853 | AM14341-AS | AD10068 | 264 |
AC001818 | CS001853 | AM14342-AS | AD10069 | 264 |
AC001819 | CS001853 | AM14343-AS | AD10070 | 264 |
AC001820 | CS001853 | AM14344-AS | AD10071 | 264 |
AC001821 | CS001853 | AM14345-AS | AD10072 | 264 |
AC001822 | CS002319 | AM14347-AS | AD10073 | 264 |
AC002099 | CS002664 | AM14342-AS | AD10069 | 264 |
AC002101 | CS002666 | AM14342-AS | AD10069 | 264 |
AC002102 | CS002667 | AM15054-AS | AD10573 | 571 |
AC002103 | CS001865 | AM15055-AS | AD10574 | 571 |
AC002104 | CS001865 | AM15056-AS | AD10575 | 571 |
AC002105 | CS002671 | AM14371-AS | AD10576 | 571 |
AC002106 | CS001865 | AM15058-AS | AD10577 | 571 |
AC002107 | CS002667 | AM15059-AS | AD10578 | 571 |
AC002108 | CS001865 | AM15060-AS | AD10579 | 571 |
AC002109 | CS002667 | AM15061-AS | AD10580 | 571 |
AC002110 | CS001865 | AM15062-AS | AD10581 | 571 |
AC002111 | CS001853 | AM15044-AS | AD10564 | 264 |
AC002112 | CS001853 | AM15045-AS | AD10565 | 264 |
AC002113 | CS001853 | AM15046-AS | AD10566 | 264 |
AC002114 | CS002305 | AM15047-AS | AD10567 | 264 |
AC002115 | CS001853 | AM15048-AS | AD10568 | 264 |
AC002116 | CS002682 | AM15048-AS | AD10569 | 264 |
AC002117 | CS002682 | AM15050-AS | AD10570 | 264 |
AC002118 | CS002684 | AM15052-AS | AD10571 | 264 |
AC002119 | CS001853 | AM15050-AS | AD10572 | 264 |
AC002272 | CS002884 | AM14342-AS | AD10069 | 264 |
AC002286 | CS002899 | AM14370-AS | AD10082 | 571 |
AC002287 | CS002900 | AM14370-AS | AD10082 | 571 |
AC002370 | CS001853 | AM16051-AS | AD11295 | 264 |
AC002380 | CS001853 | AM16114-AS | AD11335 | 264 |
AC002478 | CS001853 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002479 | CS002884 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002547 | CS003254 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002548 | CS003255 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002549 | CS003256 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002550 | CS003257 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC002551 | CS003258 | AM15934-AS | AD11556 | 264 |
AC910358 | CS913315 | AM16952-AS | AD12261 | 375 |
表 10.具有經化學修飾之反義股及有義股的結合物ID編號(包括連接子及結合物)
AC ID 編號 | 有義股( 完全經結合PK/PD 調節劑修飾) (5' → 3') | SEQ ID NO: | 反 義股(5' → 3') | SEQ ID NO: |
AC001451 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgaaaguaaUfGfGfaccagugaaas(invAb) | 978 | usUfsusCfaCfuggucCfaUfuAfcUfuusc | 522 |
AC001452 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgccugcauGfGfAfuuccauguuas(invAb) | 979 | usAfsasCfaUfggaauCfcAfuGfcAfggsc | 523 |
AC001453 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sauuccaugUfUfCfaugaguuugas(invAb) | 980 | usCfsasAfaCfucaugAfaCfaUfgGfaasu | 524 |
AC001454 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sugcaggucCfUfCfacuuuaaucas(invAb) | 981 | usGfsasUfuAfaagugAfgGfaCfcUfgcsa | 525 |
AC001455 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 982 | usGfsasUfaGfaggauUfaAfaGfuGfagsg | 526 |
AC001456 | LP183-(NH-C6)s(invAb)saggaugaaGfAfGfaggcauguuas(invAb) | 983 | usAfsasCfaUfgccucUfcUfuCfaUfccsu | 527 |
AC001457 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuauugaaGfAfUfucugugaucus(invAb) | 984 | asGfsasUfcAfcagaaUfcUfuCfaAfuasg | 528 |
AC001458 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suuggcuugUfGfGfuguaauuggas(invAb) | 985 | usCfscsAfaUfuacacCfaCfaAfgCfcasa | 529 |
AC001459 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sua_2NaacauuCfCfCfuuggauguaas(invAb) | 986 | usUfsasCfaUfccaagGfgAfaUfgUfuusa | 530 |
AC001460 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scauucccuUfGfGfauguagucuas(invAb) | 987 | usAfsgsAfcUfacaucCfaAfgGfgAfausg | 531 |
AC001461 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 988 | usAfsgsGfaUfaacagAfuGfaGfuUfaasg | 532 |
AC001462 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguuauccuGfCfUfagcuguagaas(invAb) | 989 | usUfscsUfaCfagcuaGfcAfgGfaUfaasc | 533 |
AC001463 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgcuagcugUfAfGfaaauguaucas(invAb) | 990 | usGfsasUfaCfauuucUfaCfaGfcUfagsc | 534 |
AC001464 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suagcuguaGfAfAfauguauccuas(invAb) | 991 | usAfsgsGfaUfacauuUfcUfaCfaGfcusa | 535 |
AC001465 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgaaauguaUfCfCfugauaaacaus(invAb) | 992 | asUfsgsUfuUfaucagGfaUfaCfaUfuusc | 536 |
AC001466 | LP183-(NH-C6)s(invAb)succugauaAfAfCfauuaaacacus(invAb) | 993 | asGfsusGfuUfuaaugUfuUfaUfcAfggsa | 537 |
AC001467 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sa_2NaacauuaAfAfCfacuguaaucus(invAb) | 994 | asGfsasUfuAfcagugUfuUfaAfuGfuusu | 538 |
AC001468 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sugcuuuaaAfGfUfaccuguaguas(invAb) | 995 | usAfscsUfaCfagguaCfuUfuAfaAfgcsa | 539 |
AC001469 | LP183-(NH-C6)s(invAb)saaacugauUfUfAfugaucacuuas(invAb) | 996 | usAfsasGfuGfaucauAfaAfuCfaGfuusu | 540 |
AC001470 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuggaagAfUfUfuguauaguuus(invAb) | 997 | asAfsasCfuAfuacaaAfuCfuUfcCfaasg | 541 |
AC001471 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuguuucaAfUfGfaccuguauuus(invAb) | 998 | asAfsasUfaCfaggucAfuUfgAfaAfcasg | 542 |
AC001472 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suuaaaucaCfAfGfauggguauuas(invAb) | 999 | usAfsasUfaCfccaucUfgUfgAfuUfuasa | 543 |
AC001473 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sa_2NgauggguAfUfUfaaacuugucas(invAb) | 1000 | usGfsasCfaAfguuuaAfuAfcCfcAfucsu | 544 |
AC001621 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scgagcagaAfGfGfaaaguaaugas(invAb) | 1001 | usCfsasUfuAfcuuucCfuUfcUfgCfucsg | 545 |
AC001622 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccugcaugGfAfUfuccauguucas(invAb) | 1002 | usGfsasAfcAfuggaaUfcCfaUfgCfagsg | 546 |
AC001623 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguugaagaUfUfCfugugaucucas(invAb) | 1003 | usGfsasGfaUfcacagAfaUfcUfuCfaasc | 547 |
AC001624 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sca_2NugaaaaAfGfCfagaugacuuus(invAb) | 1004 | asAfsasGfuCfaucugCfuUfuUfuCfausg | 548 |
AC001625 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sauccugcuAfGfCfuguagaaauus(invAb) | 1005 | asAfsusUfuCfuacagCfuAfgCfaGfgasu | 549 |
AC001626 | LP183-(NH-C6)s(invAb)suga_2NucacuUfGfGfaagauuuguus(invAb) | 1006 | asAfscsAfaAfucuucCfaAfgUfgAfucsa | 550 |
AC001627 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sucacagauGfGfGfuauuaaacuus(invAb) | 1007 | asAfsgsUfuUfaauacCfcAfuCfuGfugsa | 551 |
AC001801 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaasg | 583 |
AC001802 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | usAfsgsgAfuaacagAfuGfaGfuuaasg | 584 |
AC001803 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | usAfsgsgauAfacagAfuGfaGfuuaasg | 585 |
AC001804 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuua_2Nasg | 586 |
AC001805 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | usAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 587 |
AC001806 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | cPrpusAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 588 |
AC001807 | LP183-(NH-C6)s(invAb)scuuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1008 | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassg | 589 |
AC001808 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sua_2NacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1009 | cPrpusAfsgsGfauaacagAfuGfaGfuussa | 590 |
AC001809 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sgcucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1010 | usGfsasuaGfaggauUfaAfaGfugagssc | 554 |
AC001810 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | usGfsasuaGfaggAfuUfaAfaGfugagsg | 555 |
AC001811 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | usGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 556 |
AC001812 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | usGfsasuagaggauUfaAfaGfugagsg | 557 |
AC001813 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpuGfauaGfaggauUfaAfaGfugagssg | 558 |
AC001814 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 575 |
AC001815 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | usGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 576 |
AC001816 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuauuas(invAb) | 726 | usGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 576 |
AC001817 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 577 |
AC001818 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 578 |
AC001819 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpusGfsasuAfgaggAfuUfaAfaGfugagsg | 579 |
AC001820 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpusGfsasUfagaggAfuUfaAfaGfugagsg | 580 |
AC001821 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1011 | cPrpuGfauagaggAfuUfaAfaGfugagssg | 581 |
AC001822 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1012 | cPrpusGfsasuagaggAfuUfaAfaGfugssa | 582 |
AC002099 | LP304-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1013 | cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 578 |
AC002101 | LP310-(NH-C6)s(invAb)sccucacuuUfAfAfuccucuaucas(invAb) | 1014 | cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg | 578 |
AC002102 | LP183-(NH-C6)s(invAb)sguuaacucAfUfCfuguuauccuas(invAb) | 1015 | cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassc | 599 |
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在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備或提供為鹽、混合鹽或無酸形式。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備或提供為醫藥學上可接受之鹽形式。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑製備或提供為醫藥學上可接受之鈉鹽或鉀鹽形式。在遞送至表現SOD1基因之細胞後,本文中所描述之RNAi藥劑抑制或基因敲減活體內及/或活體外一或多種SOD1基因之表現。
靶向基團、連接基團、脂質 PK/PD 部分及遞送運載體 (Vehicle)
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑含有一或多個非核苷酸基團或與其結合,該等基團包括但不限於靶向基團、連接基團、藥物動力學/藥效學(PK/PD)調節劑、遞送聚合物或遞送運載體。非核苷酸基團可增強RNAi藥劑之靶向、遞送或連接。非核苷酸基團可共價連接至有義股及/或反義股之3'及/或5'端。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑含有與有義股之3'及/或5'端連接之非核苷酸基團。在一些實施例中,非核苷酸基團與SOD1 RNAi藥劑有義股之5'端連接。非核苷酸基團可經由連接子/連接基團直接或間接地連接與RNAi藥劑。在一些實施例中,非核苷酸基團經由不穩定、可裂解或可逆鍵或連接子與RNAi藥劑連接。
在一些實施例中,非核苷酸基團增強與其連接之RNAi藥劑或結合物之藥物動力學或生物分佈特性,以改良細胞特異性或組織特異性分佈及結合物之細胞特異性吸收。在一些實施例中,非核苷酸基團增強RNAi藥劑之胞吞作用。
靶向基團或靶向部分增強結合物或與其連接之結合物或RNAi藥劑的藥物動力學或生物分佈特性,以改良結合物或RNAi藥劑之細胞特異性(在一些情況下包括器官特異性)分佈及細胞特異性(或器官特異性)吸收。靶向基團可為一價、二價、三價、四價或具有更高價數,以用於其所針對之目標。代表性靶向基團包括但不限於對細胞表面分子具有親和力之化合物、對細胞表面分子具有親和力之細胞受體配體、半抗原、抗體、單株抗體、抗體片段及抗體模擬物。在一些實施例中,靶向基團使用連接子(諸如PEG連接子)或一個、兩個或三個無鹼基及/或核糖醇(無鹼基核糖)殘基(在一些情況下其可充當連接子)與RNAi藥劑連接。
具有或不具有連接子之靶向基團可與表2、3、4、5、6及10中所揭示之任一有義及/或反義股的5'或3'端連接。具有或不具有靶向基團之連接子可與表2、3、4、5、6及10中所揭示之任一有義及/或反義股的5'或3'端連接。
可合成在5'端及/或3'端具有反應性基團,諸如胺基(在本文中亦稱為胺)的本文所描述之SOD1 RNAi藥劑。反應性基團隨後可用於使用此項技術中典型之方法連接靶向部分。
舉例而言,在一些實施例中,合成在RNAi藥劑之有義股之5'端具有NH
2-C
6基團的本文揭示之SOD1 RNAi藥劑。末端胺基隨後可反應以例如與包括脂質部分基團形成結合物。在一些實施例中,合成在RNAi藥劑之有義股之5'端具有一或多個炔烴基團的本文揭示之SOD1 RNAi藥劑。
在一些實施例中,靶向基團在不使用額外連接子之情況下與SOD1 RNAi藥劑連接。在一些實施例中,設計具有容易存在以有助於與SOD1 RNAi藥劑鍵聯之連接子的靶向基團。在一些實施例中,當組合物中包括兩種或更多種RNAi藥劑時,該兩種或更多種RNAi藥劑可使用相同連接子與其各別靶向基團連接。在一些實施例中,當組合物中包括兩種或更多種RNAi藥劑時,該兩種或更多種RNAi藥劑使用不同連接子與其各別靶向基團連接。
在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑結合。連接基團促進藥劑與靶向基團、藥物動力學調節劑、遞送聚合物或遞送運載體之共價鍵聯。鍵聯基團可與RNAi藥劑有義股或反義股之3'及/或5'端連接。在一些實施例中,鍵聯基團與RNAi藥劑有義股連接。在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑有義股之5'或3'端結合。在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑有義股之5'端結合。連接基團之實例包括但不限於:C6-SS-C6;6-SS-6;反應性基團,諸如一級胺(例如,NH2-C6)及炔烴;烷基;無鹼基殘基/核苷酸;胺基酸;三炔烴官能化基團;核糖醇;及/或PEG基團。某些連接基團之實例提供於表11中。
連接子或連接基團為兩個原子之間的連接,其經由一或多個共價鍵將一個所關注之化學基團(諸如RNAi藥劑)或區段與另一所關注之化學基團(諸如靶向基團、藥物動力學調節劑或遞送聚合物)或區段連接。不穩定鍵聯含有不穩定鍵。連接可視情況包括使兩個接合原子之間的距離增加的間隔子。間隔子可進一步增加鍵聯之可撓性及/或長度。間隔子包括但不限於烷基、烯基、炔基、芳基、芳烷基、芳烯基及芳炔基;其各自可含有一或多個雜原子、雜環、胺基酸、核苷酸及醣類。間隔子基團為此項技術中所熟知且前述清單並不意欲限制本說明書之範疇。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑與聚乙二醇(PEG)部分或與具有12個或更多個碳原子之疏水性基團(諸如膽固醇或軟脂醯基)結合。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑與一或多個脂質PK/PD部分(在本文中稱為「脂質部分」或「PK/PD調節劑」)連接。脂質PK/PD部分可增強RNAi藥劑之藥效學或藥物動力學特性。在一些實施例中,脂質部分可在本文所描述之RNAi藥劑之有義股或反義股之3'或5'端與連接子結合。在一些實施例中,脂質部分可連接於本文所描述之RNAi藥劑之有義股或反義股之3'或5'端兩者處。
在一些實施例中,脂質部分可藉由使包含含胺連接子(例如(NH2-C6)) (參見表11)之SOD1 RNAi藥劑反應與SOD1 RNAi藥劑結合。在一些實施例中,含胺連接子可位於SOD1 RNAi藥劑之有義股或反義股之5'端上。在一些實施例中,含胺連接子可位於RNAi藥劑之有義股或反義股之3'端上。
在一些實施例中,包含含胺連接子(諸如(NH2-C6)或(NH2-C6)s)之RNAi藥劑可與包含活化酯部分之脂質反應。具有活化酯部分之實例脂質包括如下表11中所示之LP183-p、LP 283-p、LP293-p、LP304-p、LP310-p、LP383-p、LP395-p及LP396-p。
在一些實施例中,可使用胺基亞磷酸酯合成使SOD1 RNAi藥劑與脂質部分結合。使用胺基亞磷酸酯合成寡核苷酸為此項技術中所熟知的。在一些實施例中,可使用胺基亞磷酸酯使脂質部分與SOD1 RNAi藥劑之有義股或反義股之5'端結合。在一些實施例中,可使用胺基亞磷酸酯使脂質部分與SOD1 RNAi藥劑之有義股或反義股之3'端結合。在一些實施例中,選自全部均如下表11中所示之(2C8C12)-p、(2C6C10)-p、LP429胺基亞磷酸酯、HO-C16-p、C16-p或C22-p之胺基亞磷酸酯可用於使脂質部分與SOD1 RNAi藥劑結合。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之內部核苷酸上(亦即,不在3'或5'末端核苷酸上)可包含脂質部分。在一些實施例中,內部核苷酸可與核糖之2'位置連接。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑可包含如下表11中所示之aC16、uC16、cC16或gC16。
表2、3、4、5、6及10中所列之任一SOD1 RNAi藥劑核苷酸序列(無論經修飾或未經修飾)可含有3'及/或5'靶向基團、連接基團及/或脂質PK/PD部分。表3、4、5、6及10中所列或本文另外所描述之含有3'或5'靶向基團、連接基團及/或脂質PK/PD調節劑之任一SOD1 RNAi藥劑序列可替代地不含有3'或5'靶向基團、連接基團或脂質PK/PD調節劑,或可含有不同的3'或5'靶向基團、連接基團或脂質PK/PD部分,包括但不限於表11中描繪之彼等者。表7A、7B、8、9A及10中所列之任一SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體(無論經修飾或未經修飾)可進一步包括靶向基團、連接基團或PK/PD部分,包括但不限於表11中描繪之彼等者,且靶向基團、連接基團或PK/PD部分可與SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體之有義股或反義股之3'或5'端連接。
某些經修飾之核苷酸、加帽部分、脂質部分及連接基團之實例提供於表11中。
表 11.表示各種經修飾之核苷酸、加帽部分、脂質PK/PD部分及連接基團之結構(其中
指示連接點)
cPrpus cPrpu |
cPrpas cPrpa |
a_2N a_2Ns |
當位於內部時: (invAb) |
當位於內部時: (invAb)s |
當位於3'末端時: (invAb) |
當位於3'末端時: (C6-SS-C6) |
當位於內部時: (C6-SS-C6) |
當位於3'末端時: (6-SS-6) |
當位於內部時: (6-SS-6) |
(NH2-C6) |
(NH2-C6)s |
(NH-C6) |
(NH-C6)s |
LP128 |
LP128-p 購自Santa Cruz #sc-219228 |
LP132 |
LP132-p 可商購 |
LP183 |
LP183-p (Sigma) |
LP183胺基亞磷酸酯 |
LP183rs |
LP183r-p |
LP200 |
LP200-p (可商購) |
LP232 |
LP232-p |
LP-233a |
LP233-p |
LP242 |
LP242-p |
LP243 |
LP243-p |
LP245 |
LP245-p |
LP249 |
LP249-p |
LP257 |
LP257-p |
LP259 |
LP259-p |
LP260 |
LP260-p |
LP262 |
LP262-p |
LP269 |
LP269-p |
LP273 |
LP273-p |
LP274 |
LP274-p |
LP276 |
LP276-p (可商購) |
LP283 |
LP283-p |
LP286 |
LP286-p |
LP287 |
LP287-p |
LP289 |
LP289-p (可商購) |
LP290 |
LP290-p |
LP293 |
LP293-p |
LP296 |
LP296-p |
LP300 |
LP300-p |
LP303 |
LP303-p |
LP304 |
LP304-p |
LP310 |
LP310-p |
LP383 |
LP383-p |
LP395 |
LP395-p |
LP395s |
LP395胺基亞磷酸酯 |
LP396 |
LP396-p |
LP409 |
LP409s |
LP409胺基亞磷酸酯 |
LP429 |
LP429-p |
LP430 |
LP430-p |
LP431 |
LP431-p |
LP435 |
LP435-p |
LP439 |
LP439-p |
LP440 |
LP440-p |
LP441 |
LP441-p |
LP456 |
LP456-p |
LP462 |
LP462-p |
LP463 |
LP463-p |
LP464 |
LP464-p |
LP465 |
LP465-p |
LP466 |
LP466-p |
LP493a (2'內部) |
LP493-p (2'內部) (其中B為核鹼基) |
aC16 |
uC16 |
cC16 |
gC16 |
(2C8C12)s |
(2C8C12)-p |
(2C6C10)s |
(2C6C10)-p |
HO-C16s |
HO-C16胺基亞磷酸酯 |
c16s |
c16-p |
C22s |
C22-p |
ALNA |
或者,可使用此項技術中已知的其他連接基團。在許多情況下,連接基團可商業地獲得或者併入可商購的核苷酸胺基亞磷酸酯中。(參見例如國際專利申請公開案第WO 2019/161213號,其以全文引用之方式併入本文中)。
在一些實施例中,在不與靶向配體或藥物動力學/藥效學(PK/PD)調節劑結合之情況下遞送SOD1 RNAi藥劑(稱為「裸」或「裸RNAi藥劑」)。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑與靶向基團、連接基團、PK調節劑及/或另一非核苷酸基團結合以促進將SOD1 RNAi藥劑遞送至所選細胞或組織,例如活體內CNS細胞。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑與脂質部分結合。
在一些實施例中,遞送運載體可用於將RNAi藥劑遞送至細胞或組織中。遞送運載體為使RNAi藥劑遞送至細胞或組織改良之化合物。遞送運載體可包括但不限於以下或由其組成:聚合物,諸如兩親媒性聚合物、膜活性聚合物、肽、蜂毒素胜肽、蜂毒素樣肽(MLP)、脂質、經可逆修飾之聚合物或肽或經可逆修飾之膜活性多元胺。
在一些實施例中,RNAi藥劑可與脂質、奈米粒子、聚合物、脂質體、微胞、DPC或核酸遞送技術中可利用之其他遞送系統組合。RNAi藥劑亦可以化學方式與靶向基團、脂質(包括但不限於膽固醇基及膽固醇基衍生物)結合,藉由離子電滲或藉由併入此項技術中可利用之其他遞送運載體或系統(諸如水凝膠、環糊精、生物可降解奈米膠囊、生物黏附微球體或蛋白質載體)中來囊封於奈米粒子、脂質體、微胞中,與聚合物或DPC結合(參見例如WO 2000/053722、WO 2008/022309、WO 2011/104169及WO 2012/083185、WO 2013/032829、WO 2013/158141,其中之各者以引用的方式併入本文中)。在一些實施例中,RNAi藥劑可與對於CNS細胞具有親和力之抗體結合。在一些實施例中,RNAi藥劑可與對於CNS細胞或CNS細胞上存在之受體具有親和力之靶向配體連接。
醫藥組合物及調配物
本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑可製備醫藥組合物或調配物(在本文中亦稱為「藥劑」)形式。在一些實施例中,醫藥組合物包括至少一種SOD1 RNAi藥劑。此等醫藥組合物尤其適用於抑制目標細胞、細胞群、組織或生物體中SOD1 mRNA之表現。該等醫藥組合物可用於治療患有將得益於目標mRNA含量降低或目標基因表現抑制之疾病、病症或病狀的個體。該等醫藥組合物可用於治療處於患有將得益於目標mRNA含量降低或目標基因表現抑制之疾病或病症之風險下的個體。在一個實施例中,方法包括向欲治療之個體投與同如本文所描述之PK/PD調節劑連接的SOD1 RNAi藥劑。在一些實施例中,將一或多種醫藥學上可接受之賦形劑(包括運載體、載體、稀釋劑及/或遞送聚合物)添加至包括SOD1 RNAi藥劑之醫藥組合物中,從而形成適合於活體內遞送至個體(包括人類)的醫藥調配物或藥劑。
包括本文揭示之SOD1 RNAi藥劑及方法之醫藥組合物降低細胞、細胞群、組織、器官或個體中目標mRNA之含量,包括藉由向個體投與治療有效量之本文所描述之SOD1 RNAi藥劑,從而抑制個體中SOD1 mRNA之表現。在一些實施例中,個體先前已鑑別或診斷為患有可至少部分地由SOD1基因表現降低介導之疾病或病症。在一些實施例中,個體先前已經診斷患有一或多種神經退化疾病,諸如ALS及阿茲海默氏症。在一些實施例中,神經退行疾病為ALS。
在一些實施例中,個體先前已經診斷患有神經退化疾病。
本發明之實施例包括用於將SOD1 RNAi藥劑遞送至活體內CNS細胞之醫藥組合物。此類醫藥組合物可包括例如與脂質部分結合之SOD1 RNAi藥劑。
在一些實施例中,包括SOD1 RNAi藥劑之所描述醫藥組合物用於治療或管理將得益於SOD1表現抑制之個體中的臨床表現。在一些實施例中,向需要此類治療之個體投與治療或預防有效量的一或多種醫藥組合物。在一些實施例中,投與任一所揭示之SOD1 RNAi藥劑可用於降低個體中疾病之症狀之數目、嚴重程度及/或頻率。
在一些實施例中,所描述之SOD1 RNAi藥劑視情況與一或多種額外(亦即第二、第三等)治療劑組合。第二治療劑可為另一SOD1 RNAi藥劑(例如靶向SOD1基因內之不同序列之SOD1 RNAi藥劑)。在一些實施例中,第二治療劑可為靶向SOD1基因之RNAi藥劑。額外治療劑亦可為小分子藥物、抗體、抗體片段及/或適體。SOD1 RNAi藥劑在具有或不具有一或多種額外治療劑之情況下可與一或多種賦形劑組合以形成醫藥組合物。
包括SOD1 RNAi藥劑之所描述之醫藥組合物可用於治療患有將得益於SOD1 mRNA表現降低或抑制之疾病或病症的個體中之至少一個症狀。在一些實施例中,向個體投與治療有效量之一或多種包括SOD1 RNAi藥劑之醫藥組合物,從而治療該症狀。在其他實施例中,向個體投與預防有效量之一或多種SOD1 RNAi藥劑,從而預防或抑制至少一個症狀。
在一些實施例中,向哺乳動物投與於醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑中之所描述之SOD1 RNAi藥劑中之一或多者。在一些實施例中,哺乳動物為人類。
投與途徑為SOD1 RNAi藥劑藉以與身體接觸之路徑。一般而言,投與藥物、寡核苷酸及核酸以治療哺乳動物之方法為此項技術中所熟知的,且可應用於本文所描述之組合物的投與。本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑可以根據特定途徑適當調適的製劑形式經由任何適合途徑投與。因此,在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物係經由吸入、鼻內投與、氣管內投與或口咽吸氣投與來進行投與。在一些實施例中,醫藥組合物可藉由注射,例如靜脈內、肌肉內、皮內、皮下、腦室內、關節內、眼內或腹膜內或外用投與。
可使用此項技術中已知之寡核苷酸遞送技術將包括本文所描述之SOD1 RNAi藥劑之醫藥組合物遞送至細胞、細胞群、組織或個體。一般而言,此項技術中公認用於遞送核酸分子(活體外或活體內)之任何適合方法均適合與本文所描述之組合物一起使用。舉例而言,遞送可藉由以下實現:局部(local)投與(例如直接注射、植入或外用投與)、全身性投與或皮下、靜脈內、腹膜內或非經腸途徑,包含顱內(例如室內、腦實質內及鞘內)、腦室內、肌肉內、透皮、氣道(氣溶膠)、經鼻、經口、經直腸或外用(包含經頰及舌下)投與。在一些實施例中,組合物係經由吸入、鼻內投與、口咽吸氣投與或氣管內投與來進行投與。舉例而言,在一些實施例中,希望本文所描述之SOD1 RNAi藥劑抑制CNS中SOD1基因之表現。
在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物包含一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。本文所描述之醫藥組合物經調配以用於向個體進行投與。
如本文所用,醫藥組合物或藥劑包括藥理學有效量之所描述之治療性化合物中之至少一者及一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。醫藥學上可接受之賦形劑為除藥物遞送系統中有意包括之活性醫藥成分(Active Pharmaceutical Ingredient;API,治療性產物,例如SOD1 RNAi藥劑)以外的物質。賦形劑在預期劑量下不發揮或不意欲發揮治療作用。賦形劑可用於a)在製造期間輔助加工藥物遞送系統,b)保護、支持或增強API之穩定性、生物可利用性或患者接受性,c)有助於產物鑑別,及/或d)在儲存或使用期間增強API遞送之總體安全性、有效性之任何其他屬性。醫藥學上可接受之賦形劑可為或可不為惰性物質。
賦形劑包括但不限於:吸收增強劑、抗黏劑、抗起泡劑、抗氧化劑、黏合劑、緩衝劑、載劑、包衣劑、顏料、遞送增強劑、遞送聚合物、清潔劑、聚葡萄糖、右旋糖、稀釋劑、崩解劑、乳化劑、增量劑、填充劑、調味劑、滑動劑、保濕劑、潤滑劑、油狀物、聚合物、防腐劑、鹽水、鹽、溶劑、糖、界面活性劑、懸浮劑、持續釋放型基質、甜味劑、增稠劑、張力劑、媒劑、憎水劑及潤濕劑。
適合於可注射使用之醫藥組合物包括無菌水溶液(在水溶性情況下)或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末。對於靜脈內投與,適合載劑包括生理鹽水、抑菌水、Cremophor® ELTM (BASF, Parsippany, NJ)或磷酸鹽緩衝生理鹽水(PBS)。其應在製造及儲存條件下穩定且應抵抗諸如細菌及真菌之微生物的污染作用而保藏。載劑可為含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液體聚乙二醇)之溶劑或分散介質及其適合混合物。適當流動性可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣、藉由維持所需粒徑(在分散液之情況下)及藉由使用界面活性劑來維持適當流動性。在許多情況下,組合物中將較佳包括等張劑,例如,糖、多元醇(諸如,甘露醇、山梨糖醇)及氯化鈉。可注射組合物之延長吸收可藉由在組合物中包括延遲吸收之藥劑(例如單硬脂酸鋁及明膠)來達成。
可藉由如下方法來製備無菌可注射溶液:將所需量之活性化合物與上文所列舉之成分中之一者或其組合一起併入適當溶劑中,視需要隨後進行過濾滅菌。一般而言,藉由將活性化合物併入含有鹼性分散介質及自上文所列舉之彼等成分之所需其他成分的無菌媒劑中來製備分散液。在用於製備無菌可注射溶液之無菌粉末之情況下,較佳製備方法包括真空乾燥及冷凍乾燥,其產生活性成分加來自其先前無菌過濾溶液之任何額外所需成分的粉末。
適用於關節內投與之調配物可呈藥物之無菌水性製劑形式,其可呈微晶形式,例如呈水性微晶懸浮液形式。脂質調配物或生物可降解聚合物系統亦可用於使藥物用於關節內及經眼投與。
活性化合物可用將防止化合物自體內快速消除之載劑製備,諸如控制釋放調配物,包括植入物及微囊封遞送系統。可使用生物可降解的生物相容性聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此類調配物之方法為熟習此項技術者顯而易見的。脂質體懸浮液亦可用作醫藥學上可接受之載劑。此等可根據熟習此項技術者已知之方法製備,例如如美國專利第4,522,811號中所描述。
SOD1 RNAi藥劑可以單位劑型調配成組合物以方便投與及劑量之均一性。單位劑型係指適合以單位劑量用於欲治療之個體的物理離散單元;各單元含有預定量之活性化合物,經計算與所需醫藥載劑聯合產生所需治療效果。本發明之單位劑型之規格由以下因素規定且直接視以下因素而定:活性化合物之獨特特徵及欲達成之治療效果,及混配此類活性化合物用於治療個體之此項技術中固有的限制。
醫藥組合物可含有常見於醫藥組合物中之其他額外組分。此類額外組分包括但不限於:止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑或抗炎劑(例如,抗組胺劑、苯海拉明(diphenhydramine)等)。亦設想表現或包含本文所定義之RNAi藥劑的細胞、組織或經分離之器官可用作「醫藥組合物」。如本文所用,「藥理學有效量」、「治療有效量」或簡稱「有效量」係指產生藥理學、治療性或預防性結果之RNAi藥劑之量。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑醫藥組合物可含有鹽,諸如氯化鈉、氯化鈣、氯化鎂、氯化鉀、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉或其組合。
在一些實施例中,本文所揭示之方法除了投與本文所揭示之RNAi藥劑以外,進一步包含投與第二治療劑或第二治療之步驟。在一些實施例中,第二治療劑為另一SOD1 RNAi藥劑(例如靶向SOD1目標內之不同序列之SOD1 RNAi藥劑)。在其他實施例中,第二治療劑可為小分子藥物、抗體、抗體片段及/或適體。
在一些實施例中,本文描述包括至少兩種具有不同序列之SOD1 RNAi藥劑之組合或混合物的組合物。在一些實施例中,該兩種或更多種SOD1 RNAi藥劑各自分別且獨立地與脂質連接。
本文描述用於將SOD1 RNAi藥劑遞送至中樞神經系統(CNS)細胞中之組合物。此外,本文中一般描述用於將SOD1 RNAi藥劑遞送至活體內細胞(包括神經元、星形膠質細胞、微神經膠質細胞及內皮細胞)中之組合物。
一般而言,本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑之有效量將在約0.0001至約20 mg/kg體重劑量之範圍內,例如約0.001至約5 mg/kg體重劑量。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有效量將在每劑量約0.01 mg/kg至約3.0 mg/kg體重之範圍內。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有效量將在每劑量約0.03 mg/kg至約2.0 mg/kg體重之範圍內。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有效量將在約0.01至約1.0 mg/kg之範圍內。在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑之有效量將在約0.50至約1.0 mg/kg之範圍內。在一些實施例中,向個體投與固定劑量之SOD1 RNAi藥劑。在一些實施例中,向人類個體投與之劑量在約1.0 mg至約750 mg。在一些實施例中,向人類個體投與之SOD1 RNAi藥劑之劑量在約10 mg至約450 mg。在一些實施例中,向人類個體投與之SOD1 RNAi藥劑之劑量在約25 mg至約450 mg。在一些實施例中,向人類個體投與之SOD1 RNAi藥劑之劑量為約50 mg、約75 mg、約100 mg、約150 mg、約200 mg、約250 mg、約300 mg、約350 mg、約400 mg或約450 mg。投與量亦將可能視諸如患者之整體健康狀況、所遞送之化合物之相關生物學功效、藥物之調配物、調配物中賦形劑之存在及類型以及投與途徑之變數而定。此外,應理解可提高所投與之初始劑量以超出以上上限含量而快速獲得所需血液含量或組織含量,或初始劑量可小於最佳值。在一些實施例中,每天投與劑量。在一些實施例中,每週投與劑量一次。在其他實施例中,每兩週一次、每三週一次、每月一次或每季度一次(亦即,每三個月一次)投與劑量。
為了治療疾病或為了形成藥劑或組合物以用於治療疾病,包括SOD1 RNAi藥劑之本文所描述之醫藥組合物可與賦形劑或與包括但不限於以下之第二治療劑或治療組合:第二或其他RNAi藥劑、小分子藥物、抗體、抗體片段、肽及/或適體。
當添加至醫藥學上可接受之賦形劑或佐劑中時,所描述之SOD1 RNAi藥劑可封裝於套組、容器、封裝物或分配器中。
治療及抑制 SOD1 基因表現 之方法
本文揭示之SOD1 RNAi藥劑可用於治療患有將得益於投與RNAi藥劑之疾病或病症的個體(例如人類或其他哺乳動物)。在一些實施例中,本文揭示之RNAi藥劑可用於治療將得益於SOD1 mRNA表現降低及/或抑制,及/或SOD1蛋白及/或酶含量降低的個體(例如人類)。
在一些實施例中,本文揭示之RNAi藥劑可用於治療患有其中個體將得益於突變型SOD1酶降低之疾病或病症(包括但不限於ALS及阿茲海默氏症)的個體(例如人類)。個體之治療可包括治療性及/或預防性治療。向個體投與治療有效量之任何一或多種本文所描述之SOD1 RNAi藥劑。個體可為人類、患者或人類患者。個體可為成人、青年、兒童或嬰兒。本文所描述之醫藥組合物之投與可投與至人類或動物。
已知突變型SOD1活性促進神經退化病症。在一些實施例中,所描述之SOD1 RNAi藥劑用於個體中治療至少部分地藉由突變型SOD1酶含量降低介導之至少一個症狀。向個體投與治療有效量之所描述之SOD1 RNAi藥劑中之任何一或多者。在一些實施例中,向個體投與預防有效量之所描述的RNAi藥劑中之任何一或多者,從而藉由預防或抑制至少一個症狀來治療個體。
在某些實施例中,本發明提供用於治療有需要之患者中至少部分地藉由SOD1基因表現介導之疾病、病症、病狀或病理狀態的方法,其中該等方法包括向患者投與本文所描述之SOD1 RNAi藥劑中之任一者。
在一些實施例中,SOD1 RNAi藥劑用於治療或管理個體之臨床表現或病理狀態,其中該臨床表現或病理狀態至少部分地由SOD1基因表現降低介導。向個體投與治療有效量之本文所描述之SOD1 RNAi藥劑或含有SOD1 RNAi藥劑之組合物中之一或多者。在一些實施例中,該方法包含向欲治療之個體投與包含本文所描述之SOD1 RNAi藥劑的組合物。
在另一態樣中,本發明之特徵在於治療(包括預防性或預防性治療)可由SOD1蛋白及/或酶含量降低解決之疾病或症狀的方法,該等方法包含向有需要之個體投與包括包含表2、表3表10中之任一序列之序列的反義股的SOD1 RNAi藥劑。本文亦描述用於此類方法中之組合物。
所描述之SOD1 RNAi藥劑及/或包括SOD1 RNAi藥劑之組合物可用於用於治療性治療由SOD1蛋白及/或酶活性水平增強或升高引起之疾病或病狀的方法中。此類方法包括向個體(例如人類或動物個體)投與如本文所描述之SOD1 RNAi藥劑。
在另一態樣中,本發明提供用於治療(包括防治性治療)至少部分地藉由SOD1基因表現介導之病理狀態(諸如病狀或疾病)的方法,其中該等方法包括向個體投與治療有效量之包括包含表2、表3或表10中之任一序列之序列的反義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制SOD1基因表現之方法,其中該等方法包括向細胞投與包括包含表2、表3或表10中之任一序列之序列的反義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於治療(包括防治性治療)至少部分地藉由SOD1基因表現介導之病理狀態之方法,其中該等方法包括向個體投與治療有效量之包括包含表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之序列的有義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制SOD1基因表現之方法,其中該等方法包含向細胞投與包括包含表2、表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之序列的有義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於治療(包括防治性治療)至少部分地藉由SOD1基因表現介導之病理狀態之方法,其中該等方法包括向個體投與治療有效量之包括包含表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之序列的有義股,及包含表3或表10中之任一序列之序列的反義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制SOD1基因表現之方法,其中該等方法包括向細胞投與包括包含表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之序列的有義股,及包含表3或表10中之任一序列之序列的反義股的RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示抑制SOD1基因表現之方法,其中該等方法包括向個體投與包括由表4、表5、表6、表6a或表10中之任一序列之核鹼基序列組成的有義股,及由表3或表10中之任一序列之核鹼基序列組成的反義股的SOD1 RNAi藥劑。在其他實施例中,本文揭示抑制SOD1基因表現之方法,其中該等方法包括向個體投與包括由表4、表5、表6、表6a或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列組成的有義股,及由表3或表10中之任一經修飾之序列的經修飾之序列組成的反義股的SOD1 RNAi藥劑。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制細胞中SOD1基因表現之方法,其中該等方法包括投與一或多種包含表7A、7B、8、9A及10中所闡述之雙螺旋體中之一者的雙螺旋體結構的SOD1 RNAi藥劑。
在一些實施例中,相對於在投與SOD1 RNAi藥劑前之個體或未接受SOD1 RNAi藥劑之個體,投與所描述之SOD1 RNAi藥劑之個體之某些CNS細胞中SOD1基因之基因表現量及/或mRNA含量降低了至少約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在一些實施例中,相對於在投與SOD1 RNAi藥劑前之個體或未接受SOD1 RNAi藥劑之個體,投與所描述之SOD1 RNAi藥劑之個體之某些CNS細胞中的SOD1蛋白及/或酶含量降低了至少約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞群及/或組織中,個體中之基因表現量、蛋白質含量及/或mRNA含量可降低。在一些實施例中,相對於在投與SOD1 RNAi藥劑前之個體或未接受SOD1 RNAi藥劑之個體,已投與所描述之SOD1 RNAi藥劑之個體之某些CNS細胞中的SOD1 mRNA含量降低了至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%。
基因表現、mRNA及蛋白質含量之降低可藉由此項技術中已知之任何方法來評定。SOD1蛋白及/或酶含量之降低或下降在本文中統稱為SOD1表現之下降、降低或抑制。本文所闡述之實例說明用於評定SOD1基因表現抑制之已知方法,包括但不限於測定SOD1酶含量。
細胞、組織、器官及非人類生物體
涵蓋包括本文所描述之SOD1 RNAi藥劑中之至少一者的細胞、組織、器官及非人類生物體。藉由將RNAi藥劑遞送至細胞、組織、器官或非人類生物體中來製得細胞、組織、器官或非人類生物體。
額外說明性實施例
本文提供所揭示技術之某些額外說明性實施例。此等實施例僅為說明性的且不限制本發明或其所附申請專利範圍之範疇。
實施例1.一種用於抑制超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現之RNAi藥劑,其包含:
反義股,其包含與表2或表3中所提供之序列中之任一者相差0或1個核苷酸之至少17個連續核苷酸;及
有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列。
實施例2.如實施例1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表2或表3中所提供之序列中之任一者的核苷酸2-18。
實施例3.如實施例1或實施例2之RNAi藥劑,其中該有義股包含與表2或表4中所提供之序列中之任一者相差0或1個核苷酸之至少17個連續核苷酸的核苷酸序列,且其中該有義股在該連續17個核苷酸內具有與該反義股至少85%互補的區域。
實施例4.如實施例1至3中任一項之RNAi藥劑,其中該SOD1 RNAi藥劑之至少一個核苷酸為經修飾之核苷酸或包括經修飾之核苷間鍵聯。
實施例5.如實施例1至4中任一項之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例6.如實施例4至5中任一項之RNAi藥劑,其中該經修飾之核苷酸選自由以下組成之群:2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸、2'-去氧核苷酸、2',3'-開環核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿拉伯糖核苷酸、2'-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2'-O-甲基核苷酸、反向2'-去氧核苷酸、2'-胺基修飾之核苷酸、2'-烷基修飾之核苷酸、(N-𠰌啉基)核苷酸、含有膦酸乙烯酯之核苷酸、含有膦酸環丙酯之核苷酸及3'-O-甲基核苷酸。
實施例7.如實施例5之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸均經2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸或其組合修飾。
實施例8.如實施例1至7中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
實施例9.如實施例1至8中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含表4中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
實施例10.如實施例1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列,且該有義股包含表4中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
實施例11.如實施例1至10中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股之長度為18至30個核苷酸,且該反義股之長度為18至30個核苷酸。
實施例12.如實施例11之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至27個核苷酸。
實施例13.如實施例12之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至24個核苷酸。
實施例14.如實施例13之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為21個核苷酸。
實施例15.如實施例14之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑具有兩個鈍端。
實施例16.如實施例1至15中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個端帽。
實施例17.如實施例1至16中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
實施例18.如實施例1之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑由有義股及反義股構成,該有義股及該反義股形成具有表7A、表7B、表8、表9A或表10中之雙螺旋體中之任一者之結構的雙螺旋體。
實施例19.如實施例18之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例20.如實施例1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股由與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由其組成或包含其:
UGAUAGAGGAUUAAAGUGA (SEQ ID NO: 54);
UAGGAUAACAGAUGAGUUA (SEQ ID NO: 59);
UGAGAUCACAGAAUCUUCA (SEQ ID NO: 64);
UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG (SEQ ID NO: 1084);
UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG (SEQ ID NO: 1090);或
UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC (SEQ ID NO: 1105)。
實施例21.如實施例20之RNAi藥劑,其中該有義股由與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由其組成或包含其:
UCACUUUAAUCCUCUAUCA (SEQ ID NO: 288);
UAACUCAUCUGUUAUCCUA (SEQ ID NO: 293);
GUUGAAGAUUCUGUGAUCU (SEQ ID NO: 298);
CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA (SEQ ID NO: 1151);
CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA (SEQ ID NO: 1157);或
GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA (SEQ ID NO: 1172)。
實施例22.如實施例20或21之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例23.如實施例1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股包含與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由其組成或基本上由其組成:
cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg (SEQ ID NO: 578);
cPrpusGfsasuagA
UNAggAfuUfaAfaGfugagsg (SEQ ID NO: 613);
cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassg (SEQ ID NO: 589);或
cPrpusGfsaGfaucacagAfaUfcUfucasasc (SEQ ID NO: 646);
其中a、c、g及u分別表示2'-O-甲基腺苷、2'-O-甲基胞苷、2'-O-甲基鳥苷及2'-O-甲基尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、2'-氟胞苷、2'-氟鳥苷及2'-氟尿苷;cPrpu表示5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵聯;A
UNA表示2',3'-開環-腺苷-3'-磷酸酯;且其中該有義股上之全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例24.如實施例1之RNAi藥劑,其中該有義股包含與以下核苷酸序列(5'→3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由其組成或基本上由其組成:
ccucacuuUfAfAfuccucuauca (SEQ ID NO: 685);
cuuaacucAfUfCfuguuauccua (SEQ ID NO: 691);或
guugaagaUfuCfuGfugaucuca (SEQ ID NO: 771);
其中a、c、g、i及u分別表示2'-O-甲基腺苷、2'-O-甲基胞苷、2'-O-甲基鳥苷、2'-O-甲基肌苷及2'-O-甲基尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、2'-氟胞苷、2'-氟鳥苷及2'-氟尿苷;且s表示硫代磷酸酯鍵聯;且其中該反義股上之全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例25.如實施例20至24中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股在該核苷酸序列之3'末端、該核苷酸序列之5'端或兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
實施例26.如實施例1至25中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑與脂質部分連接。
實施例27.如實施例26之RNAi藥劑,其中該脂質部分選自由以下組成之群:
其中
指示與該RNAi藥劑之連接點。
LP128 |
LP132 |
LP183 |
LP183rs |
LP200 |
LP232 |
LP233 |
LP243 |
LP245 |
LP249 |
LP257 |
LP259 |
LP260 |
LP262 |
LP269 |
LP273 |
LP274 |
LP276 |
LP283 |
LP286 |
LP287 |
LP289 |
LP290 |
LP293 |
LP296 |
LP300 |
LP303 |
LP304 |
LP310 |
LP383 |
LP395 |
LP395s |
LP396 |
LP409 |
LP409s |
LP429 |
LP430 |
LP431 |
LP435 |
LP439 |
LP440 |
LP441 |
LP456 |
LP462 |
LP463 |
LP464 |
LP465 |
LP466 |
LP493a (2'內部) |
aC16 |
uC16 |
cC16 |
gC16 |
(2C8C12)s |
(2C6C10)s |
HO-C16s |
c16s |
C22s |
實施例28.如實施例26或實施例27之RNAi藥劑,其中該脂質部分與該有義股結合。
實施例29.如實施例28之RNAi藥劑,其中該脂質部分與該有義股之5'末端結合。
實施例30.一種組合物,其包含如實施例1至29中任一項之RNAi藥劑,其中該組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
實施例31.如實施例30之組合物,其進一步包含能夠抑制超氧化物歧化酶1基因表現的第二RNAi藥劑。
實施例32.如實施例30至31中任一項之組合物,其進一步包含一或多種額外治療劑。
實施例33.如實施例30至32中任一項之組合物,其中該RNAi藥劑為鈉鹽。
實施例34.如實施例30至33中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為注射用水。
實施例35.如實施例30至33中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為緩衝鹽水溶液。
實施例36.如實施例30至35中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑包含氯化鈉、氯化鈣、氯化鎂、氯化鉀、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉或其組合。
實施例37.一種用於抑制細胞中SOD1基因表現之方法,該方法包含將有效量之如實施例1至29中任一項之RNAi藥劑或如實施例30至36中任一項之組合物引入細胞中。
實施例38.如實施例37之方法,其中該細胞在個體體內。
實施例39.如實施例38之方法,其中該個體為人類個體。
實施例40.如實施例37至39中任一項之方法,其中在投與該RNAi藥劑後,該超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現被抑制至少約30%。
實施例41.一種治療一或多個與突變型SOD1活性水平增強或升高相關之症狀或疾病之方法,該方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量之如實施例30至36中任一項之組合物。
實施例42.如實施例39之方法,其中該疾病為神經退化疾病。
實施例43.如實施例40之方法,其中該神經退化疾病為肌肉萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)或阿茲海默氏症。
實施例44.如實施例41之方法,其中該疾病為ALS。
實施例45.如實施例42之方法,其中該疾病為SOD1連鎖家族性ALS。
實施例46.如實施例37至45中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.01 mg/kg至約5.0 mg/kg該個體體重之劑量投與。
實施例47.如實施例37至46中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.03 mg/kg至約2.0 mg/kg該個體體重之劑量投與。
實施例48.如實施例37至45中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約25 mg至約450 mg之固定劑量投與。
實施例49.如實施例48之方法,其中該RNAi藥劑係以約25 mg、約50 mg、約150 mg或約450 mg之劑量投與。
實施例50.如實施例37至49中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以兩個或更多個劑量投與。
實施例51.一種如實施例1至29中任一項之RNAi藥劑之用途,其用於治療至少部分地由突變型SOD1活性及/或SOD1基因表現介導之疾病、病症或症狀。
實施例52.一種如實施例30至36中任一項之組合物之用途,其用於治療至少部分地由超氧化物歧化酶1(SOD1)活性及/或超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現介導之疾病、病症或症狀。
實施例53.一種如實施例30至36中任一項之組合物之用途,其用於製造用於治療至少部分地由超氧化物歧化酶1(SOD1)活性及/或超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現介導之疾病、病症或症狀的藥劑。
實施例54.如實施例51至53中任一項之用途,其中該疾病為神經退化疾病。
實施例55.一種製備如實施例1至29中任一項之RNAi藥劑的方法,其包含使有義股及反義股黏著以形成雙股核糖核酸分子。
實施例56.如實施例55之方法,其中該有義股包含脂質部分。
實施例57.如實施例55之方法,其包含將脂質部分與該有義股結合。
實例 實例 1. 合成 SOD1 RNAi 藥劑 。
根據以下合成本文所揭示之SOD1 RNAi藥劑雙螺旋體:
A.
合成。根據寡核苷酸合成中使用之固相胺基亞磷酸酯技術合成SOD1 RNAi藥劑之有義股及反義股。視規模而定,使用MerMade96E® (Bioautomation)、MerMade12® (Bioautomation)或OP Pilot 100 (GE Healthcare)。在由受控孔玻璃(CPG,500Å或600Å,獲自Prime Synthesis, Aston, PA, USA)製成之固體載體上進行合成。所有RNA及2'-修飾之RNA胺基亞磷酸酯係購自Thermo Fisher Scientific (Milwaukee, WI, USA)。具體言之,所使用之2'-O-甲基胺基亞磷酸酯包括以下:(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N
6-(苯甲醯基)-2'-O-甲基-腺苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯、5'-O-二甲氧基-三苯甲基-N
4-(乙醯基)-2'-O-甲基-胞嘧啶核苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基-胺基)胺基亞磷酸酯、(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N
2-(異丁醯基)-2'-O-甲基-鳥苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯及5'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-O-甲基-鳥苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯。2'-去氧-2'-氟-胺基亞磷酸酯攜帶與2'-O-甲基RNA胺基酸酯相同之保護基。5'-二甲氧基三苯甲基-2'-O-甲基-肌苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯係購自Glen Research (Virginia)。反向無鹼基(3'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-去氧核糖-5'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯係購自ChemGenes (Wilmington, MA, USA)。使用以下UNA胺基亞磷酸酯:5'-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-(苯甲醯基)-2',3'-開環-腺苷、2'-苯甲醯基-3'-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-胺基亞磷酸酯、5'-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N-乙醯基-2',3'-開環-胞嘧啶、2'-苯甲醯基-3'-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-胺基亞磷酸酯、5'-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N-異丁醯基-2',3'-開環-鳥苷、2'-苯甲醯基-3'-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-胺基亞磷酸酯及5'-(4,4'-二甲氧基-三苯甲基)-2',3'-開環-尿苷、2'-苯甲醯基-3'-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-胺基亞磷酸酯。TFA胺基連接臂胺基亞磷酸酯亦為商業上購買的(ThermoFisher)。連接子L6以炔丙基-PEG5-NHS形式購自BroadPharm (目錄號BP-20907)且使用標準偶聯條件與來自胺基連接臂胺基亞磷酸酯之NH
2-C
6基團偶聯以形成-L6-C6-。連接子Alk-cyHex以含炔丙基化合物胺基亞磷酸酯化合物形式類似地商業地購自Lumiprobe (炔烴胺基亞磷酸酯,5'端),以形成連接子-Alk-cyHex-。在各情況下,如使用本文所闡述之條件所指定引入硫代磷酸酯鍵聯。根據國際專利申請公開案第WO 2017/214112號合成膦酸環丙酯胺基亞磷酸酯(亦參見Altenhofer等人, Chem. Communications (Royal Soc. Chem.), 57(55):6808-6811 (2021年7月))。
將含有三炔烴之胺基亞磷酸酯溶解於無水二氯甲烷或無水乙腈中(50 mM),同時將所有其他胺基酸酯溶解於無水乙腈中(50 mM)且添加分子篩(3Å)。使用5-苯甲硫基-1H-四唑(BTT,250 mM於乙腈中)或5-乙硫基-1H-四唑(ETT,250 mM於乙腈中)作為活化劑溶液。偶聯時間為10分鐘(RNA)、90秒(2' O-Me)及60秒(2' F)。為了引入硫代磷酸酯鍵聯,使用3-苯基1,2,4-二噻唑啉-5-酮(POS,獲自PolyOrg, Inc., Leominster, MA, USA)於無水乙腈中之100 mM溶液。
或者,在合成後引入三炔烴部分(參見下文部分E)。對於此途徑,有義股用含有一級胺之5'及/或3'端核苷酸官能化。將TFA胺基連接臂胺基亞磷酸酯溶解於無水乙腈中(50 mM)且添加分子篩(3Å)。使用5-苯甲硫基-1H-四唑(BTT,250 mM於乙腈中)或5-乙硫基-1H-四唑(ETT,250 mM於乙腈中)作為活化劑溶液。偶聯時間為10分鐘(RNA)、90秒(2' O-Me)及60秒(2' F)。為了引入硫代磷酸酯鍵聯,使用3-苯基1,2,4-二噻唑啉-5-酮(POS,獲自PolyOrg, Inc., Leominster, MA, USA)於無水乙腈中之100 mM溶液。
B. 載體結合寡聚物之裂解及脫除保護基 。在固相合成完成之後,乾燥固體載體在30℃下用含40 wt%甲胺之水及28%至31%氫氧化銨溶液(Aldrich)之1:1體積溶液處理1.5小時。將溶液蒸發且固體殘餘物於水中復原(參見下文)。
C. 純化。使用TSKgel SuperQ-5PW 13µm管柱及Shimadzu LC-8系統,藉由陰離子交換HPLC純化粗寡聚物。緩衝液A為20 mM Tris、5 mM EDTA,pH 9.0且含有20%乙腈;且緩衝液B與緩衝液A相同,其中添加有1.5 M氯化鈉。記錄在260 nm下之UV跡線。將適當溶離份合併,接著用100 mM碳酸氫銨,pH 6.7及20%乙腈或過濾水之操作緩衝液,使用封裝有Sephadex G-25細粒之GE Healthcare XK 16/40管柱藉由尺寸排阻HPLC來操作。或者,將合併之溶離份去鹽且經由切向流過濾將其交換至適當緩衝液或溶劑系統中。
D. 黏著。藉由將等莫耳RNA溶液(有義及反義)合併於1×PBS (磷酸鹽緩衝鹽水,1×, Corning, Cellgro)中來使互補股混合以形成RNAi藥劑。將一些RNAi藥劑凍乾且儲存在−15至−25℃下。藉由在UV-Vis光譜儀上量測1× PBS中之溶液吸光度來確定雙螺旋體濃度。接著將260 nm下之溶液吸光度乘以換算因數(0.050 mg/(mL∙cm))及稀釋因數以測定雙螺旋體濃度。
E.
合成脂質
若實例1E中不包括本文所描述之脂質,則假定化合物為可商購的或可容易地藉由與標準商業製造商簽訂合同來獲得。舉例而言,商業地購買LP395p及LP396p。
合成
LP-183
胺基亞磷酸酯
在室溫下,向化合物2 (2.00 g)於DCM中之溶液中逐滴添加TEA (2.27 mL),隨後添加化合物1 (4.931 g)。接著在室溫下攪拌混合物2 h。接著過濾混合物。將白色固體乾燥過夜。產物呈白色固體狀,產量為4.267 g,74%。LC-MS:[M+H]計算值356.35,實驗值356.63。
在室溫下,向化合物1 (2.54 g)於120 mL DCM中之混合物中逐滴添加化合物3 (0.61 g),隨後添加化合物2 (5.37 g)。接著在室溫下攪拌混合物過夜。添加5 mL TEA,隨後添加矽藻土(Celite)。在真空中移除溶劑後,藉由乾法將殘餘物負載於40 g管柱上。使用己烷(2% TEA)至50% EtOAc (2% TEA)/己烷(2% TEA)作為梯度以純化產物。產物為白色蠟狀固體,產量為3.462 g,87%。LC-MS:[M+H]計算值556.46,實驗值556.64。
合成
LP-183r-p
在室溫下,向化合物
1(312 mg)於10 mL DCM中之溶液中添加化合物
2(299 mg)及EDC (498 mg)。在室溫下攪拌反應混合物1 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物乾式負載於12 g管柱上。使用己烷至EtOAc作為移動相。產物為透明油,408 mg,75%產率。LC-MS:[M+H]計算值230.10,實驗值230.34。
在室溫下,向化合物
1(408 mg)於20 mL DCM中之溶液中添加化合物
2(516 mg)及TEA (0.745 mL)。在室溫下攪拌反應混合物過夜。在真空中移除溶劑之後,使殘餘物在MeOH中再結晶。產物為白色固體,555 mg,88%產率。LC-MS:[M+H]計算值356.35,實驗值356.45。
在室溫下,向化合物
1(200 mg)於10 mL DCM中之混合物中逐滴添加化合物
3(33.2 mg),隨後添加化合物
2(339 mg)。接著在室溫下攪拌混合物過夜。添加1 mL TEA,隨後添加一些Celite®。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物乾式負載於4 g管柱上。使用作為梯度之己烷(2% TEA)至50% EtOAc (2% TEA)/己烷(2% TEA)作為移動相。產物為白色蠟狀固體,95 mg,30%產率。LC-MS:[M+H]計算值556.46,實驗值556.82。
合成
LP232-p
將軟脂醯氯(100 mg)攪拌於順-4-(boc-胺基)環己胺(0.0819 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(己烷至EtOAc)純化粗產物。產物為52 mg,31%。
向
1(0.0520 g)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N),直至boc脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物攪拌於
2(0.0316 g)、DIPEA (0.0445 g)及COMU (0.0620 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(DCM至20% MeOH/DCM)純化粗產物。產物為45 mg,65%。
向
1(0.0449 g)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N)直至OtBu脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物攪拌於
2(0.0217 g)、DIPEA (0.039 mL)及COMU (0.0425 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(DCM至20% MeOH/DCM)純化粗產物。產物為30 mg,58%。
合成
LP233-p
將軟脂酸
1(0.100 g)攪拌於
2(0.0693 g)、COMU (0.166 g)、DIPEA (0.16 mL)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜(在40℃下加熱)之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(己烷至EtOAc)純化粗產物。產物為96 mg,69%。
向
1(0.0955 g)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N)直至boc脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物攪拌於
2(0.0581 g)、DIPEA (0.11 mL)及COMU (0.114 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(DCM至20% MeOH/DCM)純化粗產物。產物為68 mg,54%。
向
1(0.068 g)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N)直至OtBu脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物攪拌於四氟苯酚(0.021 g)、DIPEA (0.059 mL)及COMU (0.064 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由管柱(DCM至20% MeOH/DCM)純化粗產物。產物為22 mg,28%。
合成
LP242-p
將軟脂酸(0.100 g)攪拌於tBu-3,9-二氮雜螺[5,5]十一烷-3-甲酸酯HCl (0.073 g)、COMU (0.166 g)、DIPEA (0.16 mL)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜(在40℃下加熱)之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
用HCl:二㗁烷處理
1(0.017 g),且在1小時之後,在真空中乾燥粗反應物。向此中添加
2(0.0095 g)、COMU (0.0186 g)、DIPEA (0.0134 g)於5 mL DCM中之溶液。在攪拌懸浮液之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
向
1(0.121 G)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N)直至otBu脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將粗物質
1攪拌於四氟苯酚(0.0585 g)、DIPEA (0.11 mL)及COMU (0.115 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
合成
LP243-p
將軟脂酸(0.100 g)攪拌於tBu-3,9-二氮雜螺[5,5]十一烷-3-甲酸酯HCl (0.0732 g)、COMU (0.166 g)、DIPEA (0.161 mL)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜(在40℃下加熱)之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
用HCl:二㗁烷處理
1(0.0200 g),且在1小時之後,在真空中乾燥粗反應物。向此中添加
2(0.0119 g)、COMU (0.0232 g)、DIPEA (0.022 mL)於5 mL DCM中之溶液。在攪拌懸浮液之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
向
1(0.121 g)中添加2 mL二㗁烷:HCl (4N)直至otBu脫除保護基完成。在真空中移除溶劑之後,將粗物質
1攪拌於四氟苯酚(0.0363 g)、DIPEA (0.104 mL)及COMU (0.112 g)於5 mL DCM中之溶液中。在攪拌懸浮液過夜之後,添加水,且有機物使用DCM萃取並經Na
2SO
4乾燥。在過濾之後,將溶劑濃縮至乾且藉由急驟層析純化粗產物。
合成
LP245-p
在室溫下,向
1(2.08 g)及
2(1.98 g)於50 mL甲苯中之混合物中添加TEA。在90℃下攪拌反應混合物過夜。在冷卻至室溫之後,添加EtOAc及水以用於處理。在40 g管柱上純化。使用作為梯度之己烷至30% EtOAc/己烷來純化。產物為淺黃色油,1388 mg,51%。LC-MS:[M+H]計算值339.21,實驗值339.62。
在室溫下,向
1(0.241 g)於MeOH/THF (4 mL/4 mL)中之混合物中添加1 N NaOH (6 mL)。在60℃下攪拌反應混合物1 h。在真空中移除有機溶劑之後,添加1 N HCl以將混合物調整至pH約1。接著,添加NaHCO
3以將pH調整至7與8之間。添加DCM以進行處理。在真空中移除DCM之後,將殘餘物置放於高真空中2 h。藉由DCM稀釋殘餘物,接著添加DIPEA (0.248 mL)、COMU (0.336 g)及
2(0.166 g)。在室溫下攪拌反應混合物2 h。用1 N HCl、NaHCO
3及鹽水洗滌反應混合物。在12 g管柱上進行純化。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為棕色油,285 mg,74%。LC-MS:[M+H]計算值540.34,實驗值541.07。
在室溫下,向
1(0.0740 g)及Pd/C於EtOAc中之混合物中裝入H
2(1 atm)。在室溫下攪拌反應混合物4 h。藉由Celite®墊過濾反應混合物。在真空中移除EtOAc之後,使殘餘物在高真空下1 h。將殘餘物溶解於3 mL DCM中,在室溫下添加
2(0.166 mL)及TEA (0.115 mL)。在室溫下攪拌混合物2 h。添加水以用於處理。在12 g管柱上進行純化。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為透明油,43 mg,37%。LC-MS:[M+H]計算值836.71,實驗值837.68。
在室溫下攪拌
1(0.0430 g)於4 N HCl/二㗁烷(3 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物置放於高真空下3 h。將殘餘物溶解於3 mL DMF中,接著添加DIPEA (0.027 g)、COMU (0.0660 g)及
2(0.017 g)。在室溫下攪拌混合物2 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為淺黃色油,34 mg,37%。LC-MS:[M+H]計算值928.64,實驗值929.59。
合成
LP249-p
在室溫下,向
1(0.0600 g)及
2(0.161 mL)於4 mL DCM中之混合物中添加TEA (0.111 mL)。在室溫下攪拌反應混合物2 h。添加水以用於處理。在4 g管柱上進行純化。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,74 mg,60%。LC-MS:[M+H]計算值465.41,實驗值465.91。
在室溫下,向
1(0.0740 g)於DCM中之溶液中添加TFA (50%於DCM中)。在室溫下攪拌反應混合物0.5 h。在真空中移除溶劑,接著使殘餘物在高真空下2 h。將殘餘物溶解於DMF中,接著在室溫下添加
2(0.0420 g)、DIPEA (0.084 mL)及COMU (0.102 g)。在室溫下攪拌混合物2 h。在真空中移除溶劑。在12 g管柱上進行純化。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為白色固體,56 mg,58%. LC-MS:[M+H]計算值609.48,實驗值610.29。
在室溫下攪拌
1(0.0560 g)於4 N HCl/二㗁烷(3 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,使殘餘物在高真空下3 h。將殘餘物溶解於2 mL DMF中,接著添加DIPEA (0.048 g)、COMU (0.118 g)及
2(0.031 g)。在室溫下攪拌混合物2 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為灰白色固體,16 mg,25%。LC-MS:[M+H]計算值701.42,實驗值702.20。
合成
LP257-p
在室溫下,向
1(0.100 g)於3 mL DCM中之溶液中添加
2(0.331 mL)及TEA (0.304 mL)。在室溫下攪拌反應物1 h。添加EtOAc以進行稀釋,接著用1 N HCl、NaHCO
3及鹽水洗滌混合物。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,134 mg,58%。LC-MS:[M+H]計算值422.36,實驗值422.79。
在室溫下攪拌
1(0.134 g)於4 N HCl/二㗁烷(8 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,使殘餘物在高真空下3 h。產物為白色固體,118 mg,其將未經進一步純化即用於下一步驟。LC-MS:[M+H]計算值366.30,實驗值366.62。
在室溫下,向
1(0.0490 g)於3 mL DMF中之溶液中添加COMU (0.086 g)、DIPEA (0.047 mL)及2 (0.045 g)。在室溫下攪拌混合物1 h。反應混合物用EtOAc稀釋,接著用1 N HCl、NaHCO
3及鹽水洗滌。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,23 mg,33%。LC-MS:[M+H]計算值514.29,實驗值514.79。
合成
LP259-p
在室溫下,向
1(0.100 g)於3 mL DCM中之溶液中添加
2(0.366 mL)及TEA (0.337 mL)。在室溫下攪拌反應物1 h。將反應混合物負載於12 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,183 mg,82%。LC-MS:[M+H]計算值368.32,實驗值368.60。
在60℃下攪拌
1(0.0900 g)於MeOH/THF/1 N NaOH (3 mL/3 mL/3 mL)中之溶液1 h。在冷卻至室溫之後,在真空中移除MeOH/THF。用1N HCl將pH調整至約1。添加EtOAc及水以進行處理。在真空中移除EtOAc之後,使殘餘物在高真空下3 h。將殘餘物溶解於3 mL DMF中,接著在室溫下添加COMU (0.136 g)、DIPEA (0.085 mL)及
2(0.053 g)。在室溫下攪拌反應物1 h。添加EtOAc以稀釋反應混合物。用1 N HCl、NaHCO
3及鹽水洗滌反應混合物。在真空中移除EtOAc之後,將殘餘物負載於12 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,87 mg,71%。LC-MS:[M+H]計算值502.29,實驗值502.72。
合成
LP260-p
在室溫下,向
1(0.100 g)於DDC中之溶液中添加
2(0.354 mL)及TEA (0.326 mL)。在室溫下攪拌反應物1 h。將反應混合物負載於12 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,208 mg,87%. LC-MS:[M+H]計算值410.36,實驗值410.73。
在室溫下攪拌
1(0.208 g)於4 N HCl/二㗁烷(8 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,使殘餘物在高真空下3 h。產物為白色固體,179 mg,其將未經進一步純化即用於下一步驟。LC-MS:[M+H]計算值354.30,實驗值354.65。
在室溫下,向
1(0.0760 g)於3 mL DMF中之溶液中添加COMU (0.120 g)、DIPEA (0.072 mL)及
2(0.0460 g)。在室溫下攪拌混合物1 h。反應混合物用EtOAc稀釋,接著用1 N HCl、NaHCO
3及鹽水洗滌。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於12 g管柱上。使用作為梯度之己烷至EtOAc來純化。產物為白色固體,55 mg,51%。LC-MS:[M+H]計算值502.29,實驗值502.72。
合成
LP262-p
在室溫下,向
1(0.0220 g)及
2(0.100 g)及DIPEA (0.017 mL)於2 mL DMF中之溶液中添加COMU (0.0240 g)。在室溫下攪拌混合物2 h。用DCM稀釋反應混合物。接著,其用1 N HCl、飽和NaHCO
3及鹽水洗滌。在4 g管柱上進行純化。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為透明固體,77 mg,65%。LC-MS:[M+2H]+H
2O計算值1294.76,實驗值1295.29;[M+3H]+H
2O計算值869.51,實驗值869.45;[M+4H]計算值638.88,實驗值638.54。
在室溫下攪拌
1(0.077 g)於DMF/哌啶(0.8 mL/0.2 mL)中之溶液1 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物置放於高真空下3 h。將殘餘物溶解於3 mL DMF中,接著在室溫下添加
2(0.016 g)及TEA (0.013 mL)。在室溫下攪拌反應物1.5 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為白色固體,61 mg,78%。LC-MS:[M+2H]+H
2O計算值1302.84,實驗值1303.81;[M+4H]計算值642.92,實驗值642.62。
在室溫下攪拌
1(0.0610 g)於4 N HCl/二㗁烷(5 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物置放於高真空下3 h。將殘餘物溶解於3 mL DMF中,接著在室溫下添加COMU (0.0152 g)、DIPEA (0.009 mL)及
2(0.0060 g)。在室溫下攪拌反應物1.5 h。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之DCM至20% MeOH/DCM來純化。產物為白色固體,13 mg,21%。LC-MS:[M+2H]+H
2O計算值1348.80,實驗值1348.94;[M+3H]+H
2O計算值905.54,實驗值905.09。
合成
LP269-p
在環境條件下,向
1(88.6 mg,0.500 mmol,1.0當量)及
2(93.7 mg,0.600 mmol,1.20當量)於20 mL DCM中之溶液中添加TEA (0.418 mL,3.000 mmol,6.0當量)。在室溫下攪拌反應物3小時,隨後添加COMU (257 mg,0.600 mmol,1.20當量),接著添加4-硝基苯酚(166.1 mg,1.000 mmol,2.0當量)。在室溫下攪拌反應物過夜。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。接著,混合物經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-100%之梯度,藉由CombiFlash®來純化殘餘物。獲得72 mg產物(19%產率)。
合成
LP273-p
在環境條件下,向化合物
1(0.200 g)、NEt
3(0.255 mL)及COMU (0.261 g)於DCM中之溶液中添加
2(0.152 g)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。直接濃縮反應混合物以用於分離。經由DCM液體負載至12-g管柱上,用己烷至100% EtOAc之梯度,藉由CombiFlash®純化殘餘物,其中產物在28% B下溶離。在真空下濃縮產物,得到透明且淡黃色油。MS m/z:[M+H]+計算值477.23 m/z,觀測值477.52 m/z。
合成
LP274-p
在環境條件下,向EPA
1(60.5 mg,0.200 mmol,1當量)及
2(36.5 mg,0.220 mmol,1.10當量)於20 mL DCM中之溶液中添加COMU (94.2 mg,0.220 mmol,1.10當量),且接著添加TEA (0.084 mL,0.600 mmol,3.0當量)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。接著,混合物經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-50%之梯度,藉由CombiFlash®來純化反應混合物。獲得69 mg產物(76%產率)。
合成
LP283-p
在環境條件下,向化合物
1(49 mg)、NEt
3(0.068 mL)及COMU (76.8 mg)於DMF中之溶液中添加化合物
2(29.8 mg)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。藉由LC-MS無法清楚地觀測到轉化,且實情為,使反應物攪拌30 min直至鮮黃色(在添加化合物
2之前)轉變為蜜橙色且觀測到所有材料大部分溶解。反應混合物用水洗滌,用DCM萃取,經Na
2SO
4乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由DCM液體負載至12-g管柱上,用己烷至100% EtOAc之梯度,藉由CombiFlash®純化殘餘物,其中產物在31% B下溶離。在真空下濃縮產物,得到白色固體殘餘物且藉由於CDCl
3中之1 H NMR確認。
合成
LP286-p
在環境條件下,向
1(78.5 mg,0.200 mmol,1當量)及
2(36.5 mg,0.220 mmol,1.10當量)於20 mL DCM中之溶液中添加COMU (94.2 mg,0.220 mmol,1.10當量),且接著添加TEA (0.084 mL,0.600 mmol,3.0當量)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。混合物經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-50%之梯度,藉由CombiFlash®來純化反應混合物。獲得69 mg產物(57%產率)。
合成
LP287-p
在環境條件下,向
1(43.3 mg,0.200 mmol,1當量)及
2(36.5 mg,0.220 mmol,1.10當量)於20 mL DCM中之溶液中添加COMU (94.2 mg,0.220 mmol,1.10當量),且接著添加TEA (0.084 mL,0.600 mmol,3.0當量)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。混合物經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-50%之梯度,藉由CombiFlash®來純化反應混合物。獲得52 mg產物(71%產率)。
合成
LP290-p
在環境條件下,向化合物
1(0.0540 g)、NEt
3(0.075 mL)及COMU (0.084 g)於DMF中之溶液中添加
2(0.0327 g)。攪拌反應物30 min直至鮮黃色(在添加2之前)轉變為蜜橙色且觀測到所有材料大部分溶解。反應混合物用水洗滌,用DCM萃取,經Na
2SO
4乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由DCM液體負載至12-g管柱上,用己烷至100% EtOAc之梯度,藉由CombiFlash®純化殘餘物,其中產物在31% B下溶離。在真空下濃縮產物,得到白色固體殘餘物且藉由於CDCl
3中之1 H NMR確認。LC-MS:[M+H]+計算值428.14 m/z,觀測值428.46 m/z。
合成
LP293-p
在環境條件下,向化合物
1(73 mg)、NEt
3(0.112 mL)及COMU (126 mg)於DMF中之溶液中添加化合物
2(48.9 mg)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。藉由LC-MS無法清楚地觀測到轉化,且實情為,使反應物攪拌30 min直至鮮黃色(在添加化合物
2之前)轉變為蜜橙色且觀測到所有材料大部分溶解。接著,反應混合物用水洗滌,用DCM萃取,經Na
2SO
4乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由DCM液體負載至12-g管柱上,用己烷至100% EtOAc之梯度,藉由CombiFlash®純化殘餘物,其中產物在30% B下溶離。在真空下濃縮產物,得到白色固體殘餘物且藉由於CDCl
3中之1 H NMR確認。
合成
LP296-p
在環境條件下,向化合物
1(0.0344 g)、NEt
3(0.0117 mL)及COMU (0.0182 g)於DCM中之溶液中添加
2(0.0071 g)。使反應物攪拌30 min直至鮮黃色(在添加
2之前)轉變為蜜橙色且觀測到所有材料大部分溶解。直接濃縮反應混合物以用於分離。經由DCM液體負載至4-g管柱上,用DCM至20% MeOH/DCM (0% B至20% B,至40% B,至50% B,接著至100% B),藉由CombiFlash®純化殘餘物,其中產物在23% B下溶離。在真空下濃縮產物,得到透明且無色油且藉由於CDCl
3中之1 H NMR確認。MS m/z:[M+H]+計算值1039.67 m/z;觀測值1040.36 m/z。
合成
LP300-p
在室溫下,向
2(5.29 g)於100 mL甲苯中之溶液中添加TEA (8.4 mL),接著逐滴添加
1(5.20 g)。在90℃下攪拌反應混合物16 h。在冷卻至室溫之後,添加EtOAc及水以進行處理。在120 g管柱上進行純化。使用作為梯度之己烷至30% EtOAc/己烷來純化。產物為淺黃色油,3658 mg,54%。LC-MS:[M+H]計算值339.21,實驗值339.17。
向
1(0.113 g)及10% Pd/C (0.0036 g)於10 mL EtOAc中之混合物中裝入H
2(約45 psi)。在室溫下攪拌反應混合物4 h。過濾後,在真空中移除溶劑。接著,將殘餘物置放於高真空下1 h。將殘餘物溶解於10 mL DCM中,接著在室溫下添加TEA (0.279 mL)及
2(0.405 mL)。在室溫下攪拌反應混合物1 h。在12 g管柱上進行純化。使用作為梯度之己烷至50% EtOAc/己烷來純化。產物為白色固體,141 mg,66%。LC-MS:[M+H]計算值635.57,實驗值635.95。
在室溫下,向
1(0.141 g)於MeOH/THF (3 mL/3 mL)中之溶液中添加1 N NaOH (3 mL)。在室溫下攪拌混合物2 h。在真空中移除有機溶劑之後,殘餘物用濃HCl酸化至pH約1。添加EtOAc以萃取產物。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物置放於高真空下3 h。將殘餘物溶解於DMF/DCM (5 mL/5 mL)中,接著添加DIPEA (0.077 mL)、COMU (0.143 g)及
2(0.074 g)。在室溫下攪拌混合物2 h。反應混合物用EtOAc稀釋,接著用1 N HCl及鹽水洗滌。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物負載於12 g管柱上。使用作為梯度之己烷至30% EtOAc/己烷來純化。產物為白色固體,80 mg,47%。LC-MS:[M+H]計算值769.55,實驗值769.98。
合成
LP303-p
在環境條件下,向維生素D
1(185 mg,0.500 mmol,1當量)及
2(111 mg,0.550 mmol,1.10當量)於30 mL DCM中之溶液中添加TEA (0.139 mL,1.00 mmol,2.0當量)。在室溫下攪拌反應物8小時。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。混合物經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-100%之梯度,藉由CombiFlash®來純化殘餘物。獲得95 mg產物(35%產率)。
合成
LP304-p
1(200 mg,0.377 mmol,1.0當量)用含LiOH (151 mg,3.77 mmol,10.0當量)之MeOH /TFH/H
2O (1:1:1,90 mL)水解。在移除全部有機溶劑之後,用1 N HCl將水相酸化至pH=3。用乙酸乙酯(100 mL×3)萃取反應混合物。合併有機相,經Na
2SO
4乾燥且濃縮,得到粗酸。
在環境條件下,向上文粗酸及四氟苯酚
4(68.9 mg,0.415 mmol,1.10當量)於30 mL DCM中之溶液中添加COMU (194 mg,0.453 mmol,1.20當量),且接著添加TEA (0.158 mL,1.13 mmol,3.0當量)。攪拌反應物直至藉由LC-MS觀測到完全轉化。用1 N HCl,接著用鹽水洗滌反應混合物。經Na
2SO
4乾燥且濃縮。使用矽膠作為固定相,用EA至Hex 0-100%之梯度,藉由CombiFlash®來純化反應混合物。獲得170 mg產物(85%產率)。
合成
LP310-p
在室溫下,向
1於DCM中之溶液中添加DIPEA (0.057 mL)、COMU (0.077 g)及
2(0.0300 g)。在室溫下攪拌2 h之後,用0.1 N HCl淬滅反應物。用鹽水洗滌有機層。在移除溶劑之後,將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之己烷至50%己烷/EtOAc來純化。產物為白色固體,46 mg,44%。LC-MS:[M+H]計算值422.36,實驗值422.61。
在室溫下攪拌
1(0.046 g)於4 N HCl/二㗁烷(2 mL)中之溶液過夜。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物置放於高真空下3 h。接著,在室溫下將殘餘物溶解於DCM中,接著在室溫下添加COMU (0.0700 g)、DIPEA (0.038 mL)及
2(0.036 g)。在室溫下攪拌2 h之後,在真空中移除溶劑。將殘餘物負載於4 g管柱上。使用作為梯度之己烷至50%己烷/EtOAc來純化。產物為白色固體,21 mg,38%。LC-MS:[M+H]計算值514.29,實驗值514.61。
合成
LP383-p
在室溫下,向化合物1 (0.050 g)於5 mL DCM中之溶液中添加化合物2 (0.023 g)及EDC (0.039 g)。在室溫下攪拌混合物1 h。在真空中移除溶劑之後,藉由乾法將殘餘物負載於4 g管柱上。使用己烷至50% EtOAc/己烷來純化產物。產物(Pdt)為白色固體,產量為29 mg。LC-MS:[M+H+H
2O]計算值388.27,實驗值388.03。
合成
LP409-p
將化合物
1(1.40 g)及
2(0.613 g)溶解於100 mL THF中,接著添加TEA (2.01 mL)。在60℃下攪拌反應物直至經由LC-MS確認完全轉化(2-3小時)。將反應物冷卻至室溫。獲得呈白色沈澱物狀之產物,將其過濾且用丙酮(20 mL)洗滌。使用
1H及
13P NMR驗證化合物結構。
將化合物
1(1.9 g)、
2(0.846 g)及
3(2.98 g)溶解於100 mL DCM中,接著加熱至40℃。攪拌反應物直至溶液變得澄清。將反應物冷卻至室溫且攪拌過夜。在移除全部DCM之後,將產物乾式負載至24 g管柱上。使用0-50% (EA/Hex,添加1% TEA)作為移動相,獲得呈白色固體狀之產物。
合成
LP429-p
將17-羥基十六烷酸(
6) (3.53 g,12.3 mmol)添加至500 mL RBF中。用氮氣吹掃燒瓶,接著添加DCM (150 mL),隨後添加乙酸酐(18.6 mL,197 mmol)及吡啶(30.8 mL,382 mmol)。攪拌反應物過夜。將反應混合物濃縮且與甲苯共沸3次以移除殘餘吡啶、乙酸、乙酸酐。接著將殘餘物攪拌於100 mL之1:1 THF/NaHCO
3水溶液混合物中24小時。經由旋轉式蒸發器移除約一半THF,且混合物用水稀釋且用3 M HCl酸化直至pH為1。在酸化期間混合物變得極其多泡。藉由過濾收集產物且在真空中乾燥,產生3.22 g (80%產率)呈白色固體狀之化合物
5。產物未經進一步純化。
將化合物
5(3.47 g,10.6 mmol)溶解於THF (55 mL)中且在甲醇/冰浴中冷卻至-15至-20℃。一旦冷卻,則添加N-甲基𠰌啉(1.4 mL,12.7 mmol)及氯甲酸乙酯(1.2 mL,12.7 mmol)。在-15°C下攪拌反應物30分鐘。在30分鐘之後,添加疊氮化鈉(1.72公克,26.4 mmol)於水(6.6 mL)中之溶液,且在-5℃至0℃下在水/鹽/冰浴中攪拌反應物30分鐘。反應混合物用EtOAc (20 mL)及水(20 mL)稀釋。分離各層且用EtOAc (2×50 mL)萃取水層,將經合併之有機層用水(50 mL)、鹽水(50 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥且濃縮成白色固體。基於相對羰基在α位之質子,質子NMR顯示沒有剩餘的起始材料。將固體溶解於甲苯(55 mL)中且加熱至65℃直至氣體逸出停止(約30分鐘)。將反應物冷卻至室溫且添加N-羥基丁二醯亞胺(1.22 g,10.5 mmol),隨後添加吡啶(0.85 mL,10.5 mmol)。質子NMR指示在2小時之後並非所有異氰酸酯耗盡,再次添加2當量之N-羥基丁二醯亞胺(2.43 g,21.1 mmol)。攪拌反應物過夜。在攪拌過夜之後,質子NMR顯示沒有異氰酸酯剩餘。濃縮反應混合物,將所得白色粉末溶解於EtOAc (100 mL)中且倒入300 mL己烷中。藉由過濾收集沈澱物。產物之質子NMR顯示殘餘N-羥基丁二醯亞胺。將產物溶解於DCM中且藉由矽膠層析65:35己烷:EtOAc至0:100己烷:EtOAc來純化。產物在50% EtOAc下開始溶離且拖動至管柱上。合併含有產物之溶離份,得到2.25 g (48%產率)呈白色固體狀之化合物
7。
將化合物
7(1.00 g,2.27 mmol)添加至6-胺基-1-己醇(0.266 g,2.27 mmol)及NEt
3(0.95 mL,6.81 mmol)於DCM (50 mL)中之溶液中。形成白色沈澱物(ppt)。在18小時之後,按照LC-MS無SM剩餘。藉由旋轉式蒸發器濃縮反應物,將殘餘物溶解於約8 mL乙酸乙酯中且在冰箱中冷卻至-20℃。形成沈澱物且沈降於燒瓶底部。將EtOAc傾析兩次且收集沈澱物並在真空下乾燥,產生0.95公克(94%產率)呈白色粉末狀之化合物
8。
在100 mL RBF中,藉由連續3次蒸發甲苯來乾燥化合物
8(0.95 g,2.14 mmol)。向燒瓶中添加二異丙基銨四氮唑(0.146 g,0.86 mmol)及4埃分子篩。用氮氣吹掃且回填燒瓶3次,且將固體溶解於DCM (50 mL)中。攪拌混合物30分鐘。在30分鐘之後,添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.98 g,3.25 mmol)且攪拌反應物18小時。在18小時之後,LC-MS指示無起始醇剩餘。將反應物轉移至分液漏斗中,用飽和NaHCO
3水溶液(2×40 mL)、水(40 mL)、鹽水(40 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥且濃縮至乾燥。將己烷添加至燒瓶中且將殘餘物攪拌於己烷中2小時,得到白色沈澱物。藉由過濾收集白色固體,用己烷(2×20 mL)洗滌,且在真空下乾燥,得到1.2公克(87%產率)呈白色固體狀之化合物
9。
合成
LP430-p
向具有於DCM (5 mL)中之異氰酸十六烷基酯(1當量)的圓底燒瓶中添加1,6-己二醇(1當量)及TEA (2當量)於DCM (5 mL)中之溶液。在室溫下攪拌此混合物2小時。接著,在減壓下濃縮混合物且經由CombiFlash層析使用2% MeOH/DCM純化,得到20%產率之呈灰白色固體狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+386.3634 m/z,觀測值386.3642 m/z。
藉由兩次蒸發甲苯來乾燥化合物
1(1當量)。接著,將其溶解於無水DCM (10 mL)中,且添加二異丙基銨四氮唑(1.4當量),隨後添加活化分子篩(100 mg)。在室溫下,在N
2氣體下攪拌混合物30分鐘。接著,添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.6當量)且在室溫下繼續攪拌12小時。之後,添加0.3 mL TEA以淬滅反應物且將混合物直接負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (70:30)之CombiFlash層析,得到41.7%產率之呈蠟狀灰白色固體狀之純產物。LC-MS [M+H]
+586.4713 m/z,觀測值586.4720 m/z。
合成
LP431-p
向含有於DCM (5 mL)中之6-胺基-1-己醇(1.2當量)及TEA (2當量)之圓底燒瓶中添加氯甲酸十六烷基酯(1當量)於DCM (5 mL)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物2小時。接著,在減壓下濃縮混合物且經由CombiFlash層析使用2% MeOH/DCM純化,得到20%產率之呈灰白色固體狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+386.3634 m/z,觀測值386.3638 m/z。
藉由兩次蒸發甲苯來乾燥化合物
1(1當量)。接著,將其溶解於無水DCM (10 mL)中,且添加二異丙基銨四氮唑(1.4當量),隨後添加活化分子篩(100 mg)。在室溫下,在N
2氣體下攪拌混合物30分鐘。接著,添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.6當量)且在室溫下繼續攪拌12小時。之後,添加0.3 mL TEA以淬滅反應物且將混合物直接負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (70:30)之CombiFlash層析,得到82.3%產率之呈蠟狀灰白色固體狀之純產物。LC-MS [M+H]
+586.4713 m/z,觀測值586.4705 m/z。
合成
LP435-p
將十一烷酸(2.0 g,10.7 mmol)溶解於甲苯(30 mL)中且添加三乙胺(3.0 mL,21.5 mmol)及二苯基磷醯基疊氮化物(3.84 g,14.0 mmol)。攪拌反應物過夜。在鹼性條件下藉由質譜觀測醯基疊氮化物。濃縮混合物且藉由矽膠管柱層析(0:100 EtOAc:己烷至20:80 EtOAc:己烷)來純化粗產物。產物在10% EtOAc下溶離。濃縮含有產物之溶離份,得到0.975 g (43%產率)呈透明液體狀之化合物
21。
將化合物
21(0.975,5.2 mmol)溶解於甲苯(40 mL)中且加熱至65℃持續1小時。在到達65℃後觀測到氣體逸出且在大約30 min之後停止。將反應混合物冷卻至室溫。在單獨燒瓶中,將1-胺基-12-十二醇(1.05 g,5.2 mmol)溶解於THF (20 mL)及吡啶(0.85 mL,10.5 mmol)中。將甲苯溶液添加至THF溶液中且快速形成白色沈澱物(ppt)。攪拌反應物過夜。濃縮反應混合物,且自異丙醇再結晶粗產物,得到1.5558 g (77%產率)呈白色固體狀之化合物
22。
在100 mL RBF中,藉由連續2次蒸發甲苯來乾燥化合物
22(1.55 g,4.0 mmol)。向燒瓶中添加二異丙基銨四氮唑(0.277 g,1.6 mmol)及4埃分子篩。用氮氣吹掃且回填燒瓶3次,且將固體懸浮於中DCM (20 mL)中。固體僅部分溶解。向混合物中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.88 g,6.2 mmol)且攪拌反應物18小時。LC-MS指示無起始醇剩餘。將反應物轉移至分液漏斗中,用飽和NaHCO
3水溶液(2×40 mL)、水(40 mL)、鹽水(40 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥且濃縮至乾燥。將己烷添加至燒瓶中且將殘餘物攪拌於己烷中1小時,得到白色沈澱物。藉由過濾收集白色固體,用己烷(2×20 mL)洗滌,且在真空下乾燥,得到1.103公克白色粉末。質子NMR指示剩餘大量水,且大量材料為不可溶氯仿及DCM。將混合物懸浮於DCM中,經硫酸鎂乾燥,經由額外硫酸鎂墊過濾且濃縮,得到0.46 g (19%產率)呈灰白色粉末狀之化合物
LP435-p。
合成
LP439-p
將(3-胺基雙環[1.1.1]戊烷-1-基)甲醇
(2)(0.20 g,1.77 mmol)及2,5-二側氧基吡咯啶-1-基十六烷基胺基甲酸酯
(3)(0.67 g,1.75 mmol)溶解於DCM (40 mL)中,隨後添加三乙胺(0.72 mL,5.3 mmol)。攪拌反應物過夜。在18小時之後,觀測到沈澱物。藉由過濾收集沈澱物且用DCM (2×10 mL)洗滌。在真空中乾燥沈澱物,得到0.325 g (48%產率)之白色固體。質子NMR分析與產物一致,且粗材料之純度可接受以進行下一步驟。
藉由用甲苯4次連續蒸發來乾燥化合物
1(0.3公克,0.79 mmol),接著向燒瓶中添加二異丙基銨四氮唑(0.054 g,0.315 mmol)。用氮氣吹掃且回填燒瓶3次,將固體懸浮於DCM (20 mL)中且添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.39 mL,1.214 mmol)且攪拌反應物18小時。LC-MS分析指示在18小時之後無起始醇剩餘。將反應物轉移至分液漏斗中,用飽和NaHCO
3水溶液(2×40 mL)、水(40 mL)洗滌且濃縮至乾燥。將己烷添加至殘餘物中且攪拌混合物1小時,得到白色沈澱物。藉由過濾收集沈澱物,用己烷洗滌,且在真空下乾燥,得到0.395 g (86%產率)呈白色固體狀之
LP439-p。
合成
LP440-p
將無水MeOH (8 mL)冷卻至0℃,添加氫氧化鉀(3當量),且攪拌溶液30 min。接著,經由注射器添加16-溴十六烷酸(1當量)於無水MeOH (7 mL)中之溶液。將反應混合物加熱至回流,且攪拌過夜。在冷卻至室溫之後,在真空中移除MeOH且在1 N HCl (25 mL)及乙醚(5 mL)中復原所得粗混合物。使用乙醚(4×30 mL)萃取粗產物,將經合併之有機層用鹽水(30 mL)洗滌且經Na
2SO
4乾燥,且接著在真空中移除溶劑。接著,經由管柱層析使用己烷:乙酸乙酯(85:15)在矽膠上純化產物,得到86%產率之呈油狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+287.2586 m/z,觀測值287.2590。
向化合物
1(1當量)於DCM (50 mL)中之溶液中添加COMU (1.2當量)及DIPEA (2當量)。在室溫下攪拌此混合物30分鐘。接著,添加6-胺基-1-己醇(1.2當量)且在室溫下攪拌反應混合物12小時。接著,用1 M HCl (3×50 mL)洗滌混合物三次,用鹽水(50 mL)洗滌一次,經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮。向粗產物中添加ACN (100 mL)且使用熱風槍小心加熱直至所有固體可溶解。接著,將此混合物靜置於室溫下,此形成白色晶體。接著,經由真空過濾收集沈澱物且用ACN洗滌若干次以除去殘餘粉色。獲得74%產率之呈白色固體狀之化合物
2。LC-MS [M+H]
+386.3634 m/z,觀測值386.3626。
藉由兩次蒸發甲苯來乾燥化合物
3(1當量)。接著,將其溶解於無水DCM (10 mL)中,且添加二異丙基銨四氮唑(0.4當量),隨後添加活化分子篩(100 mg)。在室溫下,在N
2氣體下攪拌混合物30分鐘。接著,添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.5當量)且在室溫下繼續攪拌12小時。之後,添加0.3 mL TEA以淬滅反應物且將混合物直接負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (70:30)之CombiFlash層析,得到86%產率之呈蠟狀灰白色固體狀之純產物。LC-MS [M+H]
+586.4713 m/z,觀測值586.4705。
合成
LP441-p
向含有於EtOH (20 mL)中之6-胺基-1-己醇(2當量)的圓底燒瓶中添加1-溴十六烷(1當量)及TEA (1.1當量)。使此混合物回流12小時。接著,使溶液冷卻至室溫且在真空中移除溶劑。隨後,將粗物質溶解於H
2O (20 mL)中且用CH
3Cl (3×25 mL)萃取三次。經合併之有機物用鹽水(20 mL)洗滌一次,經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮。藉由CombiFlash層析使用10% MeOH/DCM + 1% TEA來純化粗混合物,得到44%產率之呈油狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+342.3736 m/z,觀測值342.3728。
在含有含MeOH (25 mL)之化合物
1(1當量)的圓底燒瓶中添加三氟乙酸乙酯(5當量)及DIPEA (2當量)。在40℃下攪拌反應混合物12小時。之後,在減壓下移除溶劑且經由CombiFlash層析使用4%-6% MeOH/DCM來純化粗物質,得到73%產率之呈油狀之化合物
2。LC-MS [M+H]
+438.3559 m/z,觀測值438.3551。
藉由兩次蒸發甲苯來乾燥化合物
2(1當量)。接著,將其溶解於無水DCM (10 mL)中,且添加二異丙基銨四氮唑(0.4當量),隨後添加活化分子篩(100 mg)。在室溫下,在N
2氣體下攪拌混合物30分鐘。接著,添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.5當量)且在室溫下繼續攪拌12小時。之後,添加0.3 mL TEA以淬滅反應物且將混合物直接負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (70:30)之CombiFlash層析,得到56%產率之呈蠟狀灰白色固體狀之純產物。LC-MS [M+H]
+638.4637 m/z,觀測值638.4629。
合成
LP456-p
在0℃下,在氮氣下將硼烷-四氫呋喃錯合物於四氫呋喃(1.5當量)中之1 M溶液逐滴添加至16-(三級-丁氧基)-16-側氧基十六烷酸(1當量)於無水四氫呋喃(20 mL)中之溶液中。在0℃下攪拌所得溶液2小時,接著移除冷卻浴,且在室溫下攪拌混合物過夜。添加碳酸氫鈉飽和水溶液(50 mL)以淬滅反應物。接著,用水(50 mL)稀釋混合物且用DCM (3×50 mL)萃取三次。經合併之有機物經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮。經由CombiFlash層析使用己烷:乙酸乙酯(80:20)來純化粗物質,得到82%產率之呈油狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+329.3056 m/z,觀測值329.5060。
將化合物
1(1當量)、碳酸銀(3當量)及催化量之碘於DCM (5 mL)中之混合物與分子篩一起攪拌15 min。向混合物中添加含2,3,4,6-四-O-乙醯基-α-D-葡糖哌喃糖基溴化物(1.5當量)之DCM (5 mL) (亦與分子篩一起攪拌15 min)。所得混合物用鋁箔覆蓋且在室溫下攪拌48小時,接著經由矽藻土過濾,用EtOAc洗滌。濃縮濾液,且經由CombiFlash管柱層析使用己烷:乙酸乙酯(80:20)來純化粗物質,得到33%產率之呈油狀之化合物
2。LC-MS:[M+H
2O]
+676.4034 m/z,觀測值676.4041。
向化合物
2於DCM (5 mL)中之溶液中添加TFA (15 mL)。在室溫下攪拌溶液2小時。之後,將混合物小心地倒入100 mL飽和NaHCO
3(水溶液)溶液中。一旦中和,則用DCM (3×100 mL)萃取水相三次。經合併之有機物經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮,得到97%產率之呈白色固體之化合物
3。LC-MS:[M+H]
+603.3381 m/z,觀測值603.3388。
向化合物
3(1當量)於DCM (10 mL)中之溶液中添加COMU (1.2當量)及DIPEA (2當量)。在室溫下攪拌此混合物30分鐘。接著,添加6-胺基-1-己醇(1.2當量)且在室溫下攪拌反應混合物12小時。接著,混合物用1 M HCl (3×10 mL)洗滌三次,用鹽水(10 mL)洗滌一次,經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮。經由CombiFlash層析使用0-100%己烷:乙酸乙酯歷經40分鐘純化粗物質,得到83%產率之呈油狀之化合物
4。LC-MS [M+H]
+702.4429 m/z,觀測值702.4421。
在將無水DCM (10 mL)裝入反應燒瓶之前,藉由旋轉式蒸發器用甲苯濃縮化合物
4(1當量)兩次。在環境溫度下,在N
2下用分子篩以900 RPM攪拌懸浮液。向懸浮液中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.5當量),隨後添加二異丙基銨四氮唑(0.4當量)。在12小時之後,添加TEA (300 μL),且將反應混合物乾式負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (60:40)來純化產物,得到64%產率之呈油狀之LP-456p。LC-MS [M+H]
+902.5507 m/z,觀測值902.5517。
合成
LP462-p
向含有2099-117 (1當量)之圓底燒瓶中添加無水THF (30 mL)且將溶液冷卻至-20℃。將氯甲酸乙酯(1.2)及N-甲基𠰌啉(1.2當量)添加至溶液中且在-20℃至-10℃下攪拌溶液30分鐘。將疊氮化鈉(2.5當量)於1.5 mL水中之溶液添加至反應物中且在-7℃下攪拌反應物90分鐘。反應物用EtOAc稀釋。分離水層且用EtOAc額外萃取2次。經合併之有機層用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥且濃縮為透明液體。當未觀測到額外氮氣形成時,將液體溶解於甲苯(30 mL)中且加熱至65℃持續1小時。隨後,在減壓下濃縮溶液且接著溶解於30 mL無水DCM中。將6-胺基-1-己醇(3當量)及吡啶(1當量)添加至反應混合物中且繼續攪拌12小時。在減壓下濃縮混合物至矽藻土上且經由CombiFlash層析使用於95% DCM中之5%甲醇純化,得到51%產率之呈油狀之化合物
1。LC-MS [M+H2O]
+717.4538 m/z,觀測值717.4530。
在將無水DCM (10 mL)裝入反應燒瓶之前,用甲苯旋轉蒸發化合物
1(1當量)兩次。在環境溫度下,在N
2下用分子篩以900 RPM攪拌懸浮液。向懸浮液中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.5當量),隨後添加二異丙基銨四氮唑(0.4當量)。在12小時之後,添加TEA (300 μL),且將反應混合物乾式負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (60:40)來純化產物,得到64%產率之呈油狀之
LP462-p。LC-MS [M+H]
+916.5538 m/z,觀測值916.5543。
合成
LP463-p
在室溫下,向16-羥基十六烷酸(1.5 g,5.5 mmol)於DCM (60 mL)中之溶液中添加乙酸酐(8.3 mL,88 mmol),隨後添加吡啶(13.75 mL,171 mmol)。在室溫下攪拌混合物過夜。在真空中移除溶劑之後,將殘餘物再溶解於DCM中且乾式負載於80 g管柱上。使用己烷至50% EtOAc/己烷來純化。獲得呈白色固體狀之化合物
24,1.22 g,62%。LC-MS:[M+H+H
2O]計算值375.27,實驗值374.80。
在室溫下攪拌化合物
24(1.22 g,3.4 mmol)於ACN (40 mL)及飽和NaHCO
3水溶液(10 mL)中之懸浮液過夜。用1 N HCl將pH調整至1。藉由抽濾收集沈澱物且用H
2O洗滌並風乾,得到1.15 g (107%產率)呈白色固體之化合物
25。藉由
1H NMR所測定,由於殘餘水,產率大於100%。LC-MS:[M+H]計算值315.25,實驗值315.59。
在室溫下,向化合物
25(1.15 g,3.66 mmol)及二異丙基乙胺(1.28 mL,7.3 mmol)於DCM (40 mL)中之溶液中添加COMU (1.8 g,4.4 mmol)及3-胺基雙環[1.1.1]戊烷-1-甲酸三級丁酯(0.81 g,4.4 mmol)。在室溫下攪拌混合物2小時。將反應混合物濃縮至矽膠上且藉由管柱層析(100%己烷:0% EtOAc至0%己烷:100% EtOAc)純化。合併含有產物之溶離份且經由旋轉式蒸發器移除溶劑,得到1.66 g (94%產率)呈棕色固體狀之化合物
26。LC-MS:[M+H]計算值480.37,實驗值480.76。
向化合物
26於DCM (10 mL)中之溶液中添加TFA (10 mL),且在室溫下攪拌反應物1.5小時。在真空中移除溶劑之後,使殘餘物在高真空下乾燥2小時。將殘餘物溶解於DCM (30 mL)及二異丙基乙胺(1.2 mL,6.9 mmol)中。在殘餘物溶解之後,在室溫下添加COMU (1.77 g,4.1 mmol)及6-胺基-1-己醇(0.49 g,4.1 mmol)。在室溫下攪拌混合物2.5小時。在真空中移除一部分溶劑之後,用ACN再結晶殘餘物。藉由抽濾收集產物且在真空中乾燥,得到1.48公克(82%產率)呈灰白色固體狀之化合物
27。LC-MS:[M+H]計算值523.41,實驗值524.06。
在室溫下,向化合物
27(0.3 g,0.57 mmol)於DCM (20 mL)中之混合物中添加二異丙基銨四氮唑(0.039 g,0.23 mmol),隨後逐滴添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.277 g,0.92 mmol)。接著使混合物回流2小時。在冷卻至室溫之後,用飽和NaHCO
3(水溶液)洗滌混合物兩次,隨後用H
2O洗滌。在真空中移除幾乎所有溶劑之後,將殘餘物添加至經攪拌之己烷中且形成白色凝膠沈澱物。在過濾之後,藉由抽濾收集白色固體且用己烷洗滌兩次。在高真空下乾燥白色固體,得到0.305 g (73%產率)呈白色固體狀之化合物
LP463-p。LC-MS:[M+H]計算值723.52,實驗值724.23。
合成
LP464-p
向16-胺基-十六烷酸(1當量)於無水MeOH (20 mL)中之溶液中添加三氟乙酸乙酯(1.5當量)及TEA (1.1當量)。在50℃下,在氮氣氛圍下攪拌反應物12小時。接著,在減壓下濃縮混合物,用EtOAc (30 mL)稀釋且用飽和KHSO
4(15 mL)洗滌兩次,用鹽水(15 mL)洗滌一次,經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮,得到79%產率之呈白色固體狀之化合物
1。LC-MS [M+H]
+368.2412 m/z,觀測值368.2419。
向化合物
1(1當量)於DCM (30 mL)中之溶液中添加COMU (1.2當量)及DIPEA (2當量)。在室溫下攪拌此混合物30分鐘。接著,添加6-胺基-1-己醇(1.2當量)且在室溫下攪拌反應混合物12小時。接著,混合物用1 M HCl (3×15 mL)洗滌三次,用鹽水(15 mL)洗滌一次,經Na
2SO
4乾燥且在減壓下濃縮。向粗產物中添加ACN (100 mL)且使用熱風槍小心加熱直至所有固體可溶解。接著,將此混合物靜置於室溫下,此形成白色晶體。接著,經由真空過濾收集沈澱物且用ACN洗滌若干次以除去殘餘粉色。獲得82%產率之呈白色固體狀之化合物
2。LC-MS [M+H]
+467.3461 m/z,觀測值467.3457。
在將無水DCM (10 mL)裝入反應燒瓶之前,在旋轉式蒸發器上用甲苯濃縮化合物
2(1當量)兩次。在環境溫度下,在N
2下用分子篩以900 RPM攪拌懸浮液。向懸浮液中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(1.5當量),隨後添加二異丙基銨四氮唑(0.4當量)。在12小時之後,添加TEA (300 μL),且將反應混合物乾式負載於矽藻土上。使用己烷:乙酸乙酯+ 1% TEA (60:40)來純化產物,得到77%產率之呈蠟狀固體之
LP464-p。LC-MS [M+H]
+667.4539 m/z,觀測值667.4544。
合成
LP465-p
將17-甲氧基-17-側氧基十六烷酸(1.0 g,3.2 mmol)溶解於THF (50 mL)中且添加三乙胺(0.89 mL,6.4 mmol)及DPPA (0.75 mL,3.5 mmol)。攪拌反應物過夜。濃縮反應混合物且藉由矽膠層析(20:80 EtOAc:己烷至100:0 EtOAc:己烷)來純化粗產物。產物在10% EtOAc下溶離。發現溶離份1至4含有產物,濃縮該等溶離份,得到0.60 g (56%產率)呈白色固體狀之化合物
17。
將化合物
17(0.58 g,1.7 mmol)溶解於甲苯(20 mL)中,且加熱至65℃直至不再觀測到氣體逸出(30分鐘)。將溶液冷卻至室溫,接著添加至6-胺基-1-己醇(0.2 g,1.7 mmol)及吡啶(0.14,1.7 mmol)於THF (20 mL)中之溶液中。用乙腈稀釋反應混合物且藉由抽濾收集沈澱物,用乙腈、己烷沖洗且在真空中乾燥,得到0.614 g (84%產率)呈白色固體狀之化合物
19。
在100 mL RBF中,藉由連續3次蒸發甲苯來乾燥化合物
19(0.60 g,1.4 mmol)。向燒瓶中添加二異丙基銨四氮唑(0.096 g,0.56 mmol)及4埃分子篩。用氮氣吹掃且回填燒瓶3次,且將固體懸浮於中DCM (40 mL)中。固體僅部分溶解。向混合物中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.65 g,2.2 mmol)且攪拌反應物18小時。在18小時之後,LC-MS指示無起始醇剩餘。將反應物轉移至分液漏斗中,用飽和NaHCO
3水溶液(2×40 mL)、水(40 mL)洗滌且濃縮至乾燥。將己烷添加至燒瓶中且將殘餘物攪拌於己烷中2小時,得到白色沈澱物。藉由過濾收集白色固體,用己烷(2×20 mL)洗滌,且在真空下乾燥,得到0.678公克(77%產率)呈白色固體狀之
LP465-p。
合成
LP466-p
將化合物
7(0.22 g,0.50 mmol)及3-胺基雙環[1.1.1]戊烷-1-甲酸三級丁酯(0.0915 g,0.50 mmol)溶解於DCM (10 mL)中且添加三乙胺(0.21 mL,1.5 mmol)。在18小時之後,按照LC-MS剩餘<2%之起始NHS酯。濃縮反應混合物且直接負載於矽膠管柱上以用於純化。藉由管柱層析(0% EtOAc/100%己烷至50% EtOAc 50%己烷)來純化產物。合併溶離份3至5,得到0.23 g (89%產率)呈白色固體狀之化合物
10。
將化合物10 (0.23 g,0.45 mmol)溶解於DCM (3 mL)中且添加三氟乙酸(3 mL)。攪拌溶液過夜。在18小時之後,按照LC-MS不存在SM。濃縮反應混合物且藉由與甲苯共蒸發2次來移除殘餘TFA,得到0.189 mg (93%)呈白色固體狀之化合物
11。
將化合物11 (0.189 g,0.48 mmol)及COMU (0.215 g,0.5 mmol)溶解於DCM (10 mL)中且添加三乙胺(0.333 mL,2.4 mmol)。攪拌反應物約5分鐘,接著添加6-胺基-1-己醇(0.059 g,0.5 mmol)。在1小時之後,按照LC-MS無起始材料剩餘。濃縮反應混合物且將水添加至殘餘物中。音波處理混合物直至所有材料懸浮於水中,且藉由過濾收集沈澱物且用水洗滌3次。在真空中乾燥沈澱物,得到0.166 g (70%產率)呈白色固體狀之化合物
12。
在100 mL RBF中,藉由連續2次蒸發甲苯來乾燥化合物
12(0.166 g,0.3 mmol)。向燒瓶中添加二異丙基銨四氮唑(0.02 g,0.12 mmol)及4埃分子篩。用氮氣吹掃且回填燒瓶3次,且將固體懸浮於中DCM (20 mL)中。固體僅部分溶解。向混合物中添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.14 g,0.46 mmol)且攪拌反應物18小時。LC-MS指示在18小時之後無起始醇剩餘。將反應物轉移至分液漏斗中,用飽和NaHCO
3水溶液(2×40 mL)、水(40 mL)、鹽水(40 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥且濃縮至乾燥。將己烷添加至燒瓶中且將殘餘物攪拌於己烷中1小時,得到白色沈澱物。藉由過濾收集白色固體,用己烷(2×20 mL)洗滌,且在真空下乾燥,得到0.116公克(51%產率)呈白色蠟質固體狀之
LP-466p。
合成
LP493-p (
顯示為
LP493-p
尿苷
)
向1-溴十六烷-16-醇(6.0 g,18.7 mmol)於DCM (90 mL)中之溶液中添加三乙胺(2.9 mL,20.5 mmol)。將所得溶液在冰/水浴中冷卻至0℃。在冷卻之後,逐滴添加乙醯氯(1.46 mL,20.5 mmol)。在添加完成之後,在0℃下攪拌反應物1小時,接著使其升溫至室溫且攪拌過夜。在約18小時之後,反應混合物用飽和NaHCO
3(20 mL)、1 M HCl (20 mL)、水(2×20 mL)、鹽水(20 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥且濃縮成白色固體。藉由矽膠層析(0:100 EtOAc:己烷至20:80 EtOAc:己烷)來純化粗產物。產物在10% EtOAc下溶離。濃縮溶離份5至12,得到6.02 g (89%產率)呈白色粉末狀之化合物
29。
根據文獻程序製備化合物
31。將化合物
31(1.0 g,2.1 mmol)、化合物
29(1.53 g,4.2 mmol)及四丁基碘化銨(1.6 g,0.42 mmol)置放於烘箱乾燥之燒瓶中。將燒瓶抽成真空且用氮氣吹掃三次,接著將無水DMF (10 mL)添加至燒瓶中。將溶液加熱至110℃持續18小時。在18小時之後,將反應物冷卻至室溫,且在真空中移除溶劑。將殘餘物再懸浮於DCM/MeOH中且濃縮於矽膠上以用於純化。用3% MeOH/97% DCM至20% MeOH/80% DCM溶離管柱。將含有2'及3'加成產物之溶離份合併且濃縮,得到0.236 g (21%產率)之化合物
30加3'加成產物。
藉由使用旋轉式蒸發器連續蒸發甲苯及無水吡啶來乾燥化合物
30+ 3'加成產物(0.23 g,0.44 mmol)。向燒瓶中添加DMAP (0.003 g,0.022 mmol)及二甲氧基三苯甲基氯(0.165 g,0.49 mmol)且將燒瓶抽成真空且用氮氣吹掃3次。將固體溶解於吡啶(10 mL)中。在室溫下攪拌反應物過夜。移除所有揮發物,藉由與甲苯共蒸餾來移除殘餘吡啶。將殘餘物分配於DCM (20 mL)與NaHCO
3水溶液(20 mL)之間。分離有機相,用DCM (20 mL)萃取水相,乾燥(Na
2SO
4)經合併之有機相且濃縮。藉由矽膠層析純化粗產物。用己烷/EtOAc + 2% v/v三乙胺之50:50混合物預處理二氧化矽。使用40 g管柱,溶離劑:己烷-乙酸乙酯+ 1% Et
3N,在CombiFlash上分離產物,20%至60%化合物在60% EtOAc下溶離。後期溶離份混雜有3'烷基化產物。合併且濃縮含有純2'烷基化產物之溶離份,得到0.107 g (27%產率)呈白色固體狀之化合物
32。
在25 mL RBF中,置放化合物
32(0.150 g,0.18 mmol)及二異丙基銨四氮唑(0.043 g,0.25 mmol)及4埃分子篩,且將燒瓶抽成真空並用氮氣吹掃3次。添加DCM (5 mL),隨後逐滴添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(0.092 mL,0.29 mmol)。攪拌反應物過夜。反應混合物用約2 mL飽和NaHCO
3淬滅,過濾至分液漏斗中,分離各層且用DCM (10 mL)再1次萃取NaHCO
3層。經合併之有機層經Na
2SO
4乾燥且濃縮成厚重黏稠液體。藉由矽膠層析(0:100 EtOAc:己烷至100:0 EtOAc:己烷)來純化粗產物。用己烷/EtOAc + 2% v/v三乙胺之50:50混合物預處理二氧化矽。產物在45% EtOAc下溶離。發現溶離份15至35含有幾乎沒有氧化產物污染之產物且經合併,得到0.088 g (47%產率)呈黏性無色固體狀之化合物
33。溶離份36至50經合併以得到44 mg黏性無色固體,且含有具有較多氧化物質之產物。
合成
(2C8C12)
胺基亞磷酸酯
將2-辛基-1-癸醇(1.00公克,3.35毫莫耳)及二異丙基銨四氮唑(0.2868公克,1.68 mmol)置放於燒瓶中且用氮氣吹掃燒瓶。將DCM (50 mL)添加至混合物中且逐滴添加2-氰基乙基
N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(2.66 mL,8.37 mmol)。在反應完成後,將3 mL三乙胺添加至反應物中且將反應物直接濃縮至矽藻土上以用於純化。藉由矽膠層析(0:100 EtOAc:己烷+ 2%三乙胺至100:0 EtOAc:己烷+ 2%三乙胺)純化粗產物。用100%己烷溶離產物。將含有產物之溶離份濃縮至1.268 g (76%產率)之透明液體。
合成
(2C6C10)
胺基亞磷酸酯
將2-己基-1-癸醇(1.00 g,4.13 mmol)及二異丙基銨四氮唑(0.353 g,2.06 mmol)置放於燒瓶中且用氮氣吹掃燒瓶。將DCM (50 mL)添加至混合物中且逐滴添加2-氰基乙基N,N,N',N'-四異丙基二胺基亞磷酸酯(3.27 mL,10.3 mmol)。在反應完成後,將3 mL三乙胺添加至反應物中且將反應物直接濃縮至矽藻土上以用於純化。藉由矽膠層析(0:100 EtOAc:己烷+ 2%三乙胺至100:0 EtOAc:己烷+ 2%三乙胺)純化粗產物。用100%己烷溶離產物。將含有產物之溶離份濃縮至1.32 g (72%產率)之透明液體。
合成
HO-C16
胺基亞磷酸酯
將1,16-十六烷二醇、N,N-二異丙基乙胺(0.100 g)溶解於2 mL THF中。以固體形式緩慢添加4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(2.2 g,6.6 mmol)。在2小時之後,藉由旋轉蒸發濃縮反應物,且藉由管柱層析(25%乙酸乙酯/75%己烷)純化產物。
在室溫下,將DMT-O-C
16-OH (0.200 g)、雙(二異丙胺基)(2-氰基乙氧基)膦(0.227 mL)及雙二異丙基銨四氮唑(0.0611 g)溶解於無水DCM中。將反應物封蓋並攪拌過夜。經由LC-MS (0.25 M NH
4HCO
3:H
2O緩衝液系統)測定轉化。將Celite®添加至反應混合物中,且其在真空下濃縮直至剩餘白色粉末。使用EtOAc/己烷(1%三乙胺)溶劑系統將混合物乾式負載於二氧化矽管柱(12公克)上以防止自矽膠水解。
[1]產物係由
31PNMR、
1HNMR及LC-MS表徵。
合成
C16
亞磷醯胺
在室溫下,將鯨蠟醇(1.10 g)、雙(二異丙胺基)(2-氰基乙氧基)膦(2.88 mL)及雙二異丙基銨四氮唑(0.778 g)溶解於DCM溶液中。將反應物封蓋並攪拌過夜。經由LC-MS (0.25 M NH
4HCO
3:H
2O緩衝液系統)測定轉化。將Celite®添加至反應混合物中,且其在真空下濃縮直至剩餘白色粉末。使用EtOAc/己烷(1%三乙胺)溶劑系統將混合物乾式負載於二氧化矽管柱(12公克)上以防止自矽膠水解。所需產物未保留於管柱上且在負載之後不久便離開。接著,經分離之產物係藉由LC-MS、
1HNMR及
31PNMR表徵。最終產率:856.5 mg (93.8%)。
合成
C22
亞磷醯胺
在室溫下,將二十二烷醇(docosanol) (1.10 g)、雙(二異丙胺基)(2-氰基乙氧基)膦(2.1 mL)及雙二異丙基銨四氮唑(0.577 g)溶解於DCM溶液中。將反應物封蓋並攪拌過夜。經由LC-MS (0.25 M NH
4HCO
3:H
2O緩衝液系統)測定轉化。將Celite®添加至反應混合物中,且其在真空下濃縮直至剩餘白色粉末。使用EtOAc/己烷(1%三乙胺)溶劑系統將混合物乾燥負載於經3 mL三乙胺預處理之二氧化矽管柱(12公克)上以防止自矽膠水解。接著,經分離之產物係藉由LC-MS、
1HNMR及
31PNMR表徵。最終產率:2.1085 g (118.8%)。
脂質
PK/PD
調節劑前驅物之結合
在黏著之前或之後,一或多種脂質PK/PD調節劑前驅物可與本文揭示之RNAi藥劑連接。下文描述用於將脂質PK/PD調節劑前驅物連接至本文所描繪之實例中所闡述之構築體的通用結合方法。
A.
活化酯
PK/PD
調節劑之結合
以下程序係用於使具有諸如四氟苯氧基(tetrafluorophenoxy;TFP)或對-硝基苯酚(para-nitrophenol;PNP)之活化酯部分的PK/PD調節劑與具有諸如C6-NH2、NH2-C6或(NH2-C6)之胺官能化之有義股的RNAi藥劑結合。將藉由凍乾乾燥的經黏著之RNAi藥劑以25 mg/mL溶解於DMSO及10%水(v/v%)中。接著,將50至100當量之TEA及3當量之活化酯PK/PD調節劑添加至溶液中。使溶液反應1至2小時,同時藉由RP-HPLC-MS (移動相A 100 mM HFIP,14 mM TEA;移動相B:乙腈,在Waters™ XBridge C18管柱上,Waters Corp.)監測。
接著,藉由添加12 mL乙腈及0.4 mL PBS使產物沈澱,且將固體離心成集結粒(pellet)。接著,將集結粒再溶解於0.4 mL 1×PBS及12 mL乙腈中。所得集結粒在高真空中乾燥一小時。
B.
胺基亞磷酸酯
PK/PD
調節劑之結合
可使用典型之寡核苷酸製造條件將具有胺基亞磷酸酯部分之PK/PD調節劑連接於樹脂上。
C. PK/PD
調節劑之水解
某些PK/PD調節劑在上文實例1中所描述之裂解及脫除保護基條件中水解。舉例而言,所有LP-429p、LP-456p、LP-462p、LP-463p、LP-464p、LP-466p、LP-493p及HO-C16胺基亞磷酸酯均包括在裂解及脫除保護基條件下水解之部分。
在與寡核苷酸股結合之後,LP-465p在0.5-1 M碳酸鉀於1:1甲醇比水中之溶液中水解,且加熱至50-60℃持續約4小時。
實例 2. 轉殖基因 B6.Cg-Tg(SOD1*G93A) 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表12,對B6.Cg-Tg(SOD1*G93A)小鼠注射10 μL磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為5 mg/mL於PBS中(群組2、4及6)或20 mg/mL於PBS中(群組3、5及7):
表 12 : 實例 2 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(PBS) | n=4 | N/A |
群組2(50 μg LP183-AD09385) | n=4 | AC001455 |
群組3(200 μg LP183-AD09385) | n=4 | AC001455 |
群組4(50 μg LP183-AD09395) | n=4 | AC001465 |
群組5(200 μg LP183-AD09395) | n=4 | AC001465 |
群組6(50 μg LP183-AD09401) | n=4 | AC001471 |
群組7(200 μg LP183-AD09401) | n=4 | AC001471 |
各群組中給藥四隻(n=4)小鼠。在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第12天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲得組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表13中:
表 13. 藉由 qPCR 分析之實例 2 之各給藥組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | PBS | 1.000 | 0.075 | 0.081 | 1.000 | 0.076 | 0.082 |
2 | 50 μg AC001455 | 0.926 | 0.044 | 0.046 | 0.524 | 0.029 | 0.031 |
3 | 200 μg AC001455 | 0.754 | 0.124 | 0.148 | 0.226 | 0.024 | 0.027 |
4 | 50 μg AC001465 | 1.043 | 0.136 | 0.156 | 0.685 | 0.099 | 0.116 |
5 | 200 μg AC001465 | 0.689 | 0.112 | 0.133 | 0.359 | 0.049 | 0.057 |
6 | 50 μg AC001471 | 0.958 | 0.049 | 0.052 | 0.964 | 0.088 | 0.096 |
7 | 200 μg AC001471 | 0.981 | 0.092 | 0.101 | 0.672 | 0.054 | 0.059 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | PBS | 1.000 | 0.094 | 0.104 | 1.000 | 0.075 | 0.081 |
2 | 50 μg AC001455 | 0.575 | 0.071 | 0.080 | 0.926 | 0.044 | 0.046 |
3 | 200 μg AC001455 | 0.220 | 0.012 | 0.013 | 0.754 | 0.124 | 0.148 |
4 | 50 μg AC001465 | 0.628 | 0.105 | 0.127 | 1.043 | 0.136 | 0.156 |
5 | 200 μg AC001465 | 0.259 | 0.037 | 0.043 | 0.689 | 0.112 | 0.133 |
6 | 50 μg AC001471 | 0.923 | 0.036 | 0.038 | 0.958 | 0.049 | 0.052 |
7 | 200 μg AC001471 | 0.724 | 0.033 | 0.035 | 0.905 | 0.075 | 0.081 |
如表13中所示,在分析的每一個組織中,相對於PBS投與群組,SOD1 RNAi藥劑AC001455及AC001465顯示mRNA基因敲減方面之劑量依賴性改良。
實例 3. 轉殖基因 B6.Cg-Tg(SOD1*G93A) 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表14,對B6.Cg-Tg(SOD1*G93A)小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(artificial cerebrospinal fluid;aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為7 mg/mL於aCSF中:
表 14 : 實例 3 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(70 μg LP183-AD09381) | n=3 | AC001451 |
群組3(70 μg LP183-AD09382) | n=3 | AC001452 |
群組4(70 μg LP183-AD09384) | n=3 | AC001454 |
群組5(70 μg LP183-AD09385) | n=3 | AC001455 |
群組6(70 μg LP183-AD09386) | n=3 | AC001456 |
群組7(70 μg LP183-AD09388) | n=3 | AC001458 |
群組8(70 μg LP183-AD09389) | n=3 | AC001459 |
群組9(70 μg LP183-AD09390) | n=3 | AC001460 |
群組10(70 μg LP183-AD09391) | n=3 | AC001461 |
群組11(70 μg LP183-AD09392) | n=3 | AC001462 |
群組12(70 μg LP183-AD09393) | n=3 | AC001463 |
群組13(70 μg LP183-AD09396) | n=3 | AC001466 |
群組14(70 μg LP183-AD09397) | n=3 | AC001467 |
群組15(70 μg LP183-AD09400) | n=3 | AC001470 |
群組16(70 μg LP183-AD09401) | n=3 | AC001471 |
群組17(70 μg LP183-AD09402) | n=3 | AC001472 |
群組18(70 μg LP183-AD09403) | n=3 | AC001473 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第12天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲得組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。胸部脊髓中各群組之平均值結果顯示於下表15中:
表 15. 藉由 qPCR 分析之實例 3 之各給藥群組之小鼠胸部脊髓中 mRNA SOD1 的 相對表現。
hSOD1 | ||||||
群組# | 個別值 | |||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | ||
1 | aCSF | n=3 | 1 | 1.000 | 0.122 | 0.139 |
2 | 70 μg AC001451 | n=3 | 2 | 1.162 | 0.091 | 0.099 |
3 | 70 μg AC001452 | n=3 | 3 | 1.179 | 0.123 | 0.138 |
4 | 70 μg AC001454 | n=3 | 4 | 1.202 | 0.102 | 0.112 |
5 | 70 μg AC001455 | n=3 | 5 | 0.680 | 0.095 | 0.111 |
6 | 70 μg AC001456 | n=3 | 6 | 1.106 | 0.062 | 0.066 |
7 | 70 μg AC001458 | n=3 | 7 | 1.178 | 0.078 | 0.084 |
8 | 70 μg AC001459 | n=3 | 8 | 1.018 | 0.061 | 0.065 |
9 | 70 μg AC001460 | n=3 | 9 | 1.122 | 0.098 | 0.107 |
10 | 70 μg AC001461 | n=3 | 10 | 0.643 | 0.076 | 0.087 |
11 | 70 μg AC001462 | n=3 | 11 | 0.861 | 0.067 | 0.072 |
12 | 70 μg AC001463 | n=3 | 12 | 0.907 | 0.131 | 0.152 |
13 | 70 μg AC001466 | n=3 | 13 | 0.781 | 0.059 | 0.064 |
14 | 70 μg AC001467 | n=3 | 14 | 0.902 | 0.080 | 0.088 |
15 | 70 μg AC001470 | n=3 | 15 | 1.091 | 0.085 | 0.092 |
16 | 70 μg AC001471 | n=3 | 16 | 1.000 | 0.085 | 0.093 |
17 | 70 μg AC001472 | n=3 | 17 | 1.018 | 0.051 | 0.053 |
18 | 70 μg AC001473 | n=3 | 18 | 0.964 | 0.046 | 0.048 |
如表15中所示,相對於aCSF投與群組,幾個給藥群組顯示mRNA基因敲減的顯著改良。舉例而言,SOD1 RNAi藥劑AC001455顯示降低大約32% (0.680),且SOD1 RNAi藥劑AD001461顯示降低大約35% (0.643)。
實例 4. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表16,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為10 mg/mL於aCSF中:
表 16 : 實例 4 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(100 μg LP183-AD09385) | n=3 | AC001455 |
群組3(100 μg LP183-AD09391) | n=3 | AC001461 |
群組4(100 μg LP183-AD09756) | n=3 | AC001623 |
群組5(100 μg LP183-AD09757) | n=3 | AC001624 |
群組6(100 μg LP183-AD09758) | n=3 | AC001625 |
群組7(100 μg LP183-AD09760) | n=3 | AC001627 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表17中:
表 17. 藉由 qPCR 分析之實例 4 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.087 | 0.095 | 1.000 | 0.095 | 0.105 |
2 | 100 μg AC001455 | 0.740 | 0.128 | 0.155 | 0.264 | 0.059 | 0.075 |
3 | 100 μg AC001461 | 0.798 | 0.040 | 0.042 | 0.237 | 0.039 | 0.046 |
4 | 100 μg AC001623 | 0.792 | 0.099 | 0.113 | 0.577 | 0.035 | 0.037 |
5 | 100 μg AC001624 | 0.859 | 0.126 | 0.147 | 0.695 | 0.067 | 0.074 |
6 | 100 μg AC001625 | 0.823 | 0.166 | 0.208 | 0.858 | 0.065 | 0.071 |
7 | 100 μg AC001627 | 0.934 | 0.172 | 0.211 | 0.735 | 0.058 | 0.063 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.169 | 0.203 | 1.000 | 0.196 | 0.244 |
2 | 100 μg AC001455 | 0.532 | 0.048 | 0.053 | 0.544 | 0.055 | 0.061 |
3 | 100 μg AC001461 | 0.504 | 0.044 | 0.049 | 0.576 | 0.080 | 0.093 |
4 | 100 μg AC001623 | 0.412 | 0.151 | 0.239 | 0.760 | 0.138 | 0.169 |
5 | 100 μg AC001624 | 0.735 | 0.054 | 0.058 | 0.848 | 0.111 | 0.128 |
6 | 100 μg AC001625 | 0.705 | 0.117 | 0.140 | 0.759 | 0.147 | 0.182 |
7 | 100 μg AC001627 | 0.694 | 0.067 | 0.074 | 0.885 | 0.070 | 0.076 |
如表17中所示,在分析的每一個組織中,相對於aCSF投與群組,每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的數值改良,其中AC001455、AC001461及AC001623顯示在若干種不同組織類型中尤其穩固的抑制。
實例 5. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表18,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為10 mg/mL於aCSF中:
表 18 : 實例 5 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(100 μg LP183-AD09385) | n=3 | AC001455 |
群組3(100 μg LP183-AD10055) | n=3 | AC001809 |
群組4(100 μg LP183- AD10056) | n=3 | AC001810 |
群組5(100 μg LP183- AD10057) | n=3 | AC001811 |
群組6(100 μg LP183- AD10058) | n=3 | AC001812 |
群組7(100 μg LP183- AD10059) | n=3 | AC001813 |
群組8(100 μg LP183- AD10061) | n=3 | AC001814 |
群組9(100 μg LP183- AD10066) | n=3 | AC001815 |
群組10(100 μg LP183- AD10067) | n=3 | AC001816 |
群組11(100 μg LP183- AD10068) | n=3 | AC001817 |
群組12(100 μg LP183- AD10069) | n=3 | AC001818 |
群組13(100 μg LP183- AD10070) | n=3 | AC001819 |
群組14(100 μg LP183- AD10071) | n=3 | AC001820 |
群組15(100 μg LP183- AD10072) | n=3 | AC001821 |
群組16(100 μg LP183- AD10073) | n=3 | AC001822 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表19中:
表 19. 藉由 qPCR 分析之實例 5 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.090 | 0.099 | 1.000 | 0.079 | 0.085 |
2 | 100 μg AC001455 | 0.892 | 0.115 | 0.132 | 0.340 | 0.051 | 0.060 |
3 | 100 μg AC001809 | 0.851 | 0.169 | 0.212 | 0.365 | 0.048 | 0.055 |
4 | 100 μg AC001810 | 0.910 | 0.094 | 0.104 | 0.381 | 0.089 | 0.116 |
5 | 100 μg AC001811 | 0.816 | 0.039 | 0.041 | 0.434 | 0.096 | 0.124 |
6 | 100 μg AC001812 | 0.553 | 0.158 | 0.221 | 0.547 | 0.125 | 0.162 |
7 | 100 μg AC001813 | 0.400 | 0.054 | 0.063 | 0.178 | 0.013 | 0.014 |
8 | 100 μg AC001814 | 0.578 | 0.141 | 0.186 | 0.181 | 0.017 | 0.019 |
9 | 100 μg AC001815 | 0.916 | 0.102 | 0.115 | 0.374 | 0.054 | 0.063 |
10 | 100 μg AC001816 | 0.925 | 0.074 | 0.080 | 0.486 | 0.058 | 0.066 |
11 | 100 μg AC001817 | 0.347 | 0.115 | 0.172 | 0.249 | 0.082 | 0.122 |
12 | 100 μg AC001818 | 0.391 | 0.083 | 0.105 | 0.144 | 0.037 | 0.051 |
13 | 100 μg AC001819 | 0.399 | 0.051 | 0.059 | 0.286 | 0.111 | 0.182 |
14 | 100 μg AC001820 | 0.630 | 0.110 | 0.133 | 0.189 | 0.055 | 0.078 |
15 | 100 μg AC001821 | 0.670 | 0.050 | 0.054 | 0.202 | 0.016 | 0.018 |
16 | 100 μg AC001822 | 0.466 | 0.113 | 0.150 | 0.224 | 0.060 | 0.082 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.080 | 0.087 | 1.000 | 0.084 | 0.092 |
2 | 100 μg AC001455 | 0.354 | 0.029 | 0.032 | 0.587 | 0.045 | 0.049 |
3 | 100 μg AC001809 | 0.404 | 0.032 | 0.035 | 0.653 | 0.098 | 0.116 |
4 | 100 μg AC001810 | 0.338 | 0.057 | 0.069 | 0.637 | 0.074 | 0.083 |
5 | 100 μg AC001811 | 0.406 | 0.092 | 0.120 | 0.806 | 0.083 | 0.092 |
6 | 100 μg AC001812 | 0.436 | 0.098 | 0.127 | 0.610 | 0.082 | 0.095 |
7 | 100 μg AC001813 | 0.090 | 0.008 | 0.008 | 0.262 | 0.064 | 0.085 |
8 | 100 μg AC001814 | 0.057 | 0.007 | 0.008 | 0.206 | 0.025 | 0.028 |
9 | 100 μg AC001815 | 0.230 | 0.053 | 0.070 | 0.441 | 0.039 | 0.043 |
10 | 100 μg AC001816 | 0.530 | 0.052 | 0.057 | 0.870 | 0.084 | 0.093 |
11 | 100 μg AC001817 | 0.168 | 0.044 | 0.060 | 0.329 | 0.088 | 0.120 |
12 | 100 μg AC001818 | 0.075 | 0.008 | 0.009 | 0.128 | 0.013 | 0.015 |
13 | 100 μg AC001819 | 0.112 | 0.019 | 0.023 | 0.282 | 0.022 | 0.024 |
14 | 100 μg AC001820 | 0.089 | 0.020 | 0.025 | 0.229 | 0.044 | 0.055 |
15 | 100 μg AC001821 | 0.079 | 0.028 | 0.044 | 0.212 | 0.036 | 0.043 |
16 | 100 μg AC001822 | 0.114 | 0.014 | 0.015 | 0.259 | 0.057 | 0.073 |
如表19中所示,在分析的每一個組織中,相對於aCSF投與群組,每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的數值改良。值得注意的是,AC001813、AC001814及AC001818顯示在所有檢查組織中尤其強效的SOD1基因表現抑制。
實例 6. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表20,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為10 mg/mL於aCSF中:
表 20 : 實例 6 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(100 μg LP183-AD09391) | n=3 | AC001461 |
群組3(100 μg LP183-AD10077) | n=3 | AC001801 |
群組4(100 μg LP183- AD10078) | n=3 | AC001802 |
群組5(100 μg LP183- AD10079) | n=3 | AC001803 |
群組6(100 μg LP183- AD10080) | n=3 | AC001804 |
群組7(100 μg LP183- AD10081) | n=3 | AC001805 |
群組8(100 μg LP183- AD10082) | n=3 | AC001806 |
群組9(100 μg LP183- AD10083) | n=3 | AC001807 |
群組10(100 μg LP183- AD10084) | n=3 | AC001808 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表21中:
表 21. 藉由 qPCR 分析之實例 6 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.148 | 0.174 | 1.000 | 0.074 | 0.080 |
2 | 100 μg AC001461 | 1.013 | 0.074 | 0.080 | 0.511 | 0.047 | 0.052 |
3 | 100 μg AC001801 | 0.899 | 0.151 | 0.181 | 0.641 | 0.105 | 0.126 |
4 | 100 μg AC001802 | 1.008 | 0.097 | 0.108 | 0.585 | 0.054 | 0.060 |
5 | 100 μg AC001803 | 1.006 | 0.097 | 0.107 | 0.673 | 0.037 | 0.039 |
6 | 100 μg AC001804 | 1.057 | 0.132 | 0.151 | 0.758 | 0.112 | 0.132 |
7 | 100 μg AC001805 | 0.962 | 0.089 | 0.098 | 0.728 | 0.122 | 0.146 |
8 | 100 μg AC001806 | 0.435 | 0.183 | 0.315 | 0.602 | 0.085 | 0.098 |
9 | 100 μg AC001807 | 0.504 | 0.273 | 0.595 | 0.572 | 0.036 | 0.039 |
10 | 100 μg AC001808 | 0.516 | 0.257 | 0.511 | 0.588 | 0.070 | 0.080 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.151 | 0.178 | 1.000 | 0.088 | 0.097 |
2 | 100 μg AC001461 | 0.378 | 0.063 | 0.075 | 0.591 | 0.100 | 0.120 |
3 | 100 μg AC001801 | 0.448 | 0.121 | 0.165 | 0.538 | 0.072 | 0.083 |
4 | 100 μg AC001802 | 0.445 | 0.100 | 0.128 | 0.604 | 0.062 | 0.069 |
5 | 100 μg AC001803 | 0.761 | 0.129 | 0.156 | 0.679 | 0.115 | 0.139 |
6 | 100 μg AC001804 | 0.510 | 0.038 | 0.041 | 0.715 | 0.138 | 0.170 |
7 | 100 μg AC001805 | 0.265 | 0.078 | 0.111 | 0.525 | 0.061 | 0.069 |
8 | 100 μg AC001806 | 0.140 | 0.045 | 0.066 | 0.259 | 0.049 | 0.061 |
9 | 100 μg AC001807 | 0.077 | 0.021 | 0.028 | 0.310 | 0.044 | 0.051 |
10 | 100 μg AC001808 | 0.175 | 0.046 | 0.063 | 0.362 | 0.042 | 0.047 |
如表21中所示,在分析的大部分組織中,相對於aCSF投與群組,幾乎每一個給藥群組均顯示mRNA基因敲減方面的改良。
實例 7. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表22,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為5 mg/mL於aCSF中:
表 22 : 實例 7 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=4 | N/A |
群組2(50 μg LP183-AD10069) | n=4 | AC001818 |
群組3(50 μg LP183-AD10564) | n=4 | AC002111 |
群組4(50 μg LP183- AD10565) | n=4 | AC002112 |
群組5(50 μg LP183- AD10566) | n=4 | AC002113 |
群組6(50 μg LP183- AD10567) | n=4 | AC002114 |
群組7(50 μg LP183- AD10568) | n=4 | AC002115 |
群組8(50 μg LP183- AD10569) | n=4 | AC002116 |
群組9(50 μg LP183- AD10570) | n=4 | AC002117 |
群組10(50 μg LP183- AD10571) | n=4 | AC002118 |
群組11(50 μg LP183- AD10572) | n=4 | AC002119 |
群組12(50 μg LP310- AD10069) | n=4 | AC002101 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表23中:
表 23. 藉由 qPCR 分析之實例 7 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.088 | 0.097 | 1.000 | 0.092 | 0.102 |
2 | 50 μg AC001818 | 0.524 | 0.092 | 0.112 | 0.223 | 0.018 | 0.020 |
3 | 50 μg AC002111 | 0.446 | 0.112 | 0.149 | 0.185 | 0.032 | 0.038 |
4 | 50 μg AC002112 | 0.625 | 0.086 | 0.100 | 0.272 | 0.054 | 0.067 |
5 | 50 μg AC002113 | 0.784 | 0.070 | 0.077 | 0.332 | 0.057 | 0.069 |
6 | 50 μg AC002114 | 0.561 | 0.197 | 0.304 | 0.266 | 0.037 | 0.043 |
7 | 50 μg AC002115 | 0.542 | 0.067 | 0.076 | 0.301 | 0.049 | 0.059 |
8 | 50 μg AC002116 | 0.412 | 0.096 | 0.125 | 0.229 | 0.029 | 0.033 |
9 | 50 μg AC002117 | 0.526 | 0.059 | 0.067 | 0.220 | 0.025 | 0.028 |
10 | 50 μg AC002118 | 0.522 | 0.053 | 0.059 | 0.243 | 0.023 | 0.025 |
11 | 50 μg AC002119 | 0.487 | 0.124 | 0.166 | 0.228 | 0.035 | 0.042 |
12 | 50 μg AC002101 | 0.533 | 0.080 | 0.095 | 0.323 | 0.044 | 0.051 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.073 | 0.078 | 1.000 | 0.082 | 0.090 |
2 | 50 μg AC001818 | 0.077 | 0.014 | 0.017 | 0.134 | 0.025 | 0.030 |
3 | 50 μg AC002111 | 0.102 | 0.043 | 0.075 | 0.181 | 0.023 | 0.026 |
4 | 50 μg AC002112 | 0.107 | 0.039 | 0.062 | 0.333 | 0.070 | 0.088 |
5 | 50 μg AC002113 | 0.156 | 0.065 | 0.112 | 0.310 | 0.075 | 0.098 |
6 | 50 μg AC002114 | 0.105 | 0.038 | 0.060 | 0.246 | 0.034 | 0.039 |
7 | 50 μg AC002115 | 0.109 | 0.019 | 0.023 | 0.331 | 0.036 | 0.040 |
8 | 50 μg AC002116 | 0.075 | 0.016 | 0.021 | 0.243 | 0.045 | 0.056 |
9 | 50 μg AC002117 | 0.089 | 0.023 | 0.031 | 0.214 | 0.020 | 0.022 |
10 | 50 μg AC002118 | 0.098 | 0.036 | 0.058 | 0.255 | 0.028 | 0.031 |
11 | 50 μg AC002119 | 0.107 | 0.026 | 0.035 | 0.230 | 0.024 | 0.026 |
12 | 50 μg AC002101 | 0.205 | 0.028 | 0.032 | 0.369 | 0.035 | 0.038 |
如表23中所示,在分析的每一個組織中,相對於aCSF投與群組,每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的改良。
實例 8. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表24,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為5 mg/mL於aCSF中:
表 24 : 實例 8 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=4 | N/A |
群組2(50 μg LP183-AD10082) | n=4 | AC001806 |
群組3(50 μg LP183-AD10083) | n=4 | AC001807 |
群組4(50 μg LP183- AD10573) | n=4 | AC002102 |
群組5(50 μg LP183- AD10574) | n=4 | AC002103 |
群組6(50 μg LP183- AD10575) | n=4 | AC002104 |
群組7(50 μg LP183- AD10576) | n=4 | AC002105 |
群組8(50 μg LP183- AD10577) | n=4 | AC002106 |
群組9(50 μg LP183- AD10578) | n=4 | AC002107 |
群組10(50 μg LP183- AD10579) | n=4 | AC002108 |
群組11(50 μg LP183- AD10580) | n=4 | AC002109 |
群組12(50 μg LP183- AD10581) | n=4 | AC002110 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表25中:
表 25. 藉由 qPCR 分析之實例 8 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 胸部脊髓 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.088 | 0.096 | 1.000 | 0.092 | 0.102 |
2 | 50 μg AC001806 | 0.740 | 0.132 | 0.161 | 0.267 | 0.026 | 0.028 |
3 | 50 μg AC001807 | 0.712 | 0.087 | 0.099 | 0.316 | 0.119 | 0.191 |
4 | 50 μg AC002102 | 0.866 | 0.093 | 0.105 | 0.341 | 0.088 | 0.118 |
5 | 50 μg AC002103 | 1.049 | 0.076 | 0.082 | 0.507 | 0.137 | 0.187 |
6 | 50 μg AC002104 | 0.907 | 0.114 | 0.131 | 0.317 | 0.026 | 0.029 |
7 | 50 μg AC002105 | 1.084 | 0.049 | 0.052 | 0.282 | 0.070 | 0.093 |
8 | 50 μg AC002106 | 1.203 | 0.151 | 0.173 | 0.314 | 0.050 | 0.060 |
9 | 50 μg AC002107 | 1.181 | 0.245 | 0.309 | 0.477 | 0.112 | 0.147 |
10 | 50 μg AC002108 | 0.973 | 0.213 | 0.273 | 0.265 | 0.071 | 0.097 |
11 | 50 μg AC002109 | 0.884 | 0.196 | 0.252 | 0.346 | 0.060 | 0.073 |
12 | 50 μg AC002110 | 1.149 | 0.152 | 0.175 | 0.474 | 0.100 | 0.127 |
小腦 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.093 | 0.102 | 1.000 | 0.080 | 0.087 |
2 | 50 μg AC001806 | 0.506 | 0.057 | 0.065 | 0.351 | 0.047 | 0.054 |
3 | 50 μg AC001807 | 0.519 | 0.078 | 0.092 | 0.406 | 0.056 | 0.065 |
4 | 50 μg AC002102 | 0.481 | 0.038 | 0.041 | 0.403 | 0.046 | 0.052 |
5 | 50 μg AC002103 | 0.706 | 0.097 | 0.112 | 0.567 | 0.075 | 0.086 |
6 | 50 μg AC002104 | 0.598 | 0.083 | 0.096 | 0.580 | 0.071 | 0.081 |
7 | 50 μg AC002105 | 0.673 | 0.071 | 0.079 | 0.428 | 0.065 | 0.076 |
8 | 50 μg AC002106 | 0.590 | 0.041 | 0.045 | 0.488 | 0.082 | 0.098 |
9 | 50 μg AC002107 | 0.619 | 0.075 | 0.086 | 0.671 | 0.070 | 0.078 |
10 | 50 μg AC002108 | 0.514 | 0.053 | 0.059 | 0.396 | 0.067 | 0.080 |
11 | 50 μg AC002109 | 0.497 | 0.088 | 0.108 | 0.452 | 0.080 | 0.097 |
12 | 50 μg AC002110 | 0.688 | 0.071 | 0.080 | 0.653 | 0.102 | 0.122 |
如表25中所示,在胸部脊髓、小腦及腦幹中,相對於aCSF投與群組,每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的改良。
實例 9. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表26,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為3 mg/mL於aCSF中:
表 26 : 實例 9 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AD 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(30 μg LP183-AD11196) | n=3 | AD11196 |
群組3(30 μg LP183- AD11384) | n=3 | AD11384 |
群組4(30 μg LP183- AD11385) | n=3 | AD11385 |
群組5(30 μg LP183- AD11386) | n=3 | AD11386 |
群組6(30 μg LP183- AD11387) | n=3 | AD11387 |
群組7(30 μg LP183- AD11388) | n=3 | AD11388 |
群組8(30 μg LP183- AD11389) | n=3 | AD11389 |
群組9(30 μg LP183- AD11390) | n=3 | AD11390 |
群組10(30 μg LP183- AD11391) | n=3 | AD11391 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表27中:
表 27. 藉由 qPCR 分析之實例 9 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
如表27中所示,在分析的每一個組織中,相對於aCSF投與群組,幾乎每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的有意義的改良。
實例 10. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.146 | 0.171 | 1.000 | 0.078 | 0.084 |
2 | 30 μg AD11196 | 0.584 | 0.097 | 0.116 | 0.395 | 0.052 | 0.060 |
3 | 30 μg AD11384 | 0.658 | 0.089 | 0.103 | 0.443 | 0.073 | 0.087 |
4 | 30 μg AD11385 | 0.875 | 0.097 | 0.110 | 0.646 | 0.109 | 0.131 |
5 | 30 μg AD11386 | 0.925 | 0.093 | 0.103 | 0.753 | 0.091 | 0.103 |
6 | 30 μg AD11387 | 0.752 | 0.079 | 0.089 | 0.825 | 0.096 | 0.109 |
7 | 30 μg AD11388 | 0.772 | 0.088 | 0.100 | 0.751 | 0.120 | 0.143 |
8 | 30 μg AD11389 | 0.621 | 0.043 | 0.047 | 0.494 | 0.032 | 0.035 |
9 | 30 μg AD11390 | 0.906 | 0.141 | 0.166 | 0.804 | 0.133 | 0.160 |
10 | 30 μg AD11391 | 0.846 | 0.123 | 0.144 | 0.842 | 0.058 | 0.063 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.111 | 0.124 | 1.000 | 0.124 | 0.141 |
2 | 30 μg AD11196 | 0.155 | 0.080 | 0.166 | 0.349 | 0.045 | 0.051 |
3 | 30 μg AD11384 | 0.150 | 0.021 | 0.024 | 0.362 | 0.036 | 0.040 |
4 | 30 μg AD11385 | 0.333 | 0.084 | 0.112 | 0.453 | 0.047 | 0.052 |
5 | 30 μg AD11386 | 0.319 | 0.061 | 0.076 | 0.568 | 0.059 | 0.066 |
6 | 30 μg AD11387 | 0.380 | 0.030 | 0.033 | 0.620 | 0.072 | 0.082 |
7 | 30 μg AD11388 | 0.481 | 0.096 | 0.120 | 0.677 | 0.104 | 0.123 |
8 | 30 μg AD11389 | 0.337 | 0.054 | 0.065 | 0.362 | 0.031 | 0.034 |
9 | 30 μg AD11390 | 0.802 | 0.062 | 0.067 | 0.864 | 0.139 | 0.166 |
10 | 30 μg AD11391 | 0.755 | 0.038 | 0.040 | 0.934 | 0.140 | 0.164 |
在研究第1天,根據下表28,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為3 mg/mL於aCSF中:
表 28 : 實例 10 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AD 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(30 μg LP183-AD11196) | n=3 | AD11196 |
群組3(30 μg LP183- AD11429) | n=3 | AD11429 |
群組4(30 μg LP183- AD11430) | n=3 | AD11430 |
群組5(30 μg LP183- AD11431) | n=3 | AD11431 |
群組6(30 μg LP183- AD11432) | n=3 | AD11432 |
群組7(30 μg LP183- AD11433) | n=3 | AD11433 |
群組8(30 μg LP183- AD11434) | n=3 | AD11434 |
群組9(30 μg LP183- AD11435) | n=3 | AD11435 |
群組10(30 μg LP183- AD11436) | n=3 | AD11436 |
群組11(30 μg LP183- AD11437) | n=3 | AD11437 |
群組12(30 μg LP183- AD11438) | n=3 | AD11438 |
群組13(30 μg LP183- AD11439) | n=3 | AD11439 |
群組14(30 μg LP183- AD11440) | n=3 | AD11440 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表29中:
表 29. 藉由 qPCR 分析之實例 10 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
實例 11. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 小鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.087 | 0.096 | 1.000 | 0.132 | 0.152 |
2 | 30 μg AD11196 | 0.611 | 0.060 | 0.067 | 0.431 | 0.014 | 0.015 |
3 | 30 μg AD11429 | 1.031 | 0.093 | 0.102 | 0.797 | 0.133 | 0.159 |
4 | 30 μg AD11430 | 1.067 | 0.101 | 0.111 | 0.873 | 0.097 | 0.110 |
5 | 30 μg AD11431 | 1.079 | 0.052 | 0.054 | 0.678 | 0.065 | 0.072 |
6 | 30 μg AD11432 | 1.084 | 0.076 | 0.082 | 0.910 | 0.050 | 0.053 |
7 | 30 μg AD11433 | 0.885 | 0.058 | 0.062 | 0.648 | 0.053 | 0.057 |
8 | 30 μg AD11434 | 0.873 | 0.057 | 0.061 | 0.589 | 0.084 | 0.098 |
9 | 30 μg AD11435 | 0.968 | 0.120 | 0.137 | 0.855 | 0.143 | 0.172 |
10 | 30 μg AD11436 | 0.966 | 0.070 | 0.075 | 0.889 | 0.049 | 0.052 |
11 | 30 μg AD11437 | 0.832 | 0.145 | 0.175 | 0.755 | 0.063 | 0.069 |
12 | 30 μg AD11438 | 0.936 | 0.111 | 0.126 | 0.878 | 0.131 | 0.154 |
13 | 30 μg AD11439 | 1.087 | 0.046 | 0.048 | 0.800 | 0.102 | 0.117 |
14 | 30 μg AD11440 | 0.888 | 0.168 | 0.208 | 0.781 | 0.161 | 0.204 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.103 | 0.115 | 1.000 | 0.093 | 0.103 |
2 | 30 μg AD11196 | 0.362 | 0.073 | 0.092 | 0.576 | 0.050 | 0.055 |
3 | 30 μg AD11429 | 0.877 | 0.072 | 0.078 | 1.125 | 0.129 | 0.146 |
4 | 30 μg AD11430 | 0.815 | 0.078 | 0.086 | 0.983 | 0.065 | 0.069 |
5 | 30 μg AD11431 | 0.740 | 0.153 | 0.193 | 1.021 | 0.106 | 0.119 |
6 | 30 μg AD11432 | 0.830 | 0.191 | 0.248 | 0.945 | 0.201 | 0.255 |
7 | 30 μg AD11433 | 0.324 | 0.072 | 0.092 | 0.534 | 0.054 | 0.061 |
8 | 30 μg AD11434 | 0.654 | 0.057 | 0.063 | 0.745 | 0.071 | 0.079 |
9 | 30 μg AD11435 | 0.805 | 0.122 | 0.144 | 1.053 | 0.078 | 0.084 |
10 | 30 μg AD11436 | 0.725 | 0.120 | 0.144 | 0.965 | 0.089 | 0.098 |
11 | 30 μg AD11437 | 0.730 | 0.110 | 0.129 | 1.078 | 0.076 | 0.081 |
12 | 30 μg AD11438 | 0.782 | 0.090 | 0.102 | 1.247 | 0.195 | 0.232 |
13 | 30 μg AD11439 | 0.805 | 0.042 | 0.044 | 1.302 | 0.060 | 0.063 |
14 | 30 μg AD11440 | 0.847 | 0.158 | 0.195 | 0.939 | 0.168 | 0.204 |
在研究第1天,根據下表30,對Tg SOD1 G93A小鼠注射10 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或10 μL化合物調配物,該化合物調配物之濃度為1 mg/mL (群組2-4)、3 mg/mL (群組5-7)及10 mg/mL (群組8-10):
表 30 : 實例 11 之小鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 | AC 雙螺旋體編號 |
群組1(aCSF) | n=3 | N/A |
群組2(10 μg LP183-AD10083) | n=3 | AC001807 |
群組3(10 μg LP183- AD11556) | n=3 | AC002478 |
群組4(10 μg LP293- AD11556) | n=3 | AC002479 |
群組5(30 μg LP183-AD10083) | n=3 | AC001807 |
群組6(30 μg LP183- AD11556) | n=3 | AC002478 |
群組7(30 μg LP293- AD11556) | n=3 | AC002479 |
群組8(100 μg LP183- AD10083) | n=3 | AC001807 |
群組9(100 μg LP293- AD11556) | n=3 | AC002478 |
群組10(100 μg LP293- AD11556) | n=3 | AC002479 |
在第1天,對小鼠進行腦室內注射。在第8天,將小鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表31中:
表 31. 藉由 qPCR 分析之實例 11 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
如表31中所示,在分析的每一個組織中,相對於aCSF投與群組,幾乎每一個給藥群組顯示mRNA基因敲減方面的改良。
實例 12. 轉殖基因 Tg SOD1 G93A 大鼠中之活體內 SOD1 基因敲減
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.071 | 0.076 | 1.000 | 0.130 | 0.150 |
2 | 10 μg AC001807 | 1.001 | 0.050 | 0.052 | 1.094 | 0.115 | 0.128 |
3 | 10 μg AC002478 | 0.769 | 0.114 | 0.134 | 0.620 | 0.190 | 0.274 |
4 | 10 μg AC002479 | 0.893 | 0.068 | 0.074 | 0.754 | 0.136 | 0.167 |
5 | 30 μg AC001807 | 0.702 | 0.080 | 0.090 | 0.807 | 0.144 | 0.175 |
6 | 30 μg AC002478 | 0.597 | 0.063 | 0.071 | 0.353 | 0.027 | 0.029 |
7 | 30 μg AC002479 | 0.782 | 0.092 | 0.104 | 0.548 | 0.052 | 0.058 |
8 | 100 μg AC001807 | 0.726 | 0.143 | 0.178 | 0.368 | 0.087 | 0.114 |
9 | 100 μg AC002478 | 0.448 | 0.020 | 0.021 | 0.209 | 0.033 | 0.040 |
10 | 100 μg AC002479 | 0.434 | 0.083 | 0.102 | 0.244 | 0.023 | 0.025 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=3) | 群組平均值(n=3) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.142 | 0.166 | 1.000 | 0.188 | 0.232 |
2 | 10 μg AC001807 | 1.070 | 0.092 | 0.101 | 1.020 | 0.187 | 0.229 |
3 | 10 μg AC002478 | 0.471 | 0.054 | 0.061 | 0.779 | 0.103 | 0.119 |
4 | 10 μg AC002479 | 0.767 | 0.055 | 0.059 | 0.971 | 0.155 | 0.184 |
5 | 30 μg AC001807 | 0.667 | 0.175 | 0.238 | 0.806 | 0.062 | 0.068 |
6 | 30 μg AC002478 | 0.324 | 0.041 | 0.047 | 0.530 | 0.088 | 0.105 |
7 | 30 μg AC002479 | 0.360 | 0.149 | 0.255 | 0.563 | 0.114 | 0.143 |
8 | 100 μg AC001807 | 0.150 | 0.008 | 0.009 | 0.195 | 0.029 | 0.034 |
9 | 100 μg AC002478 | 0.096 | 0.049 | 0.099 | 0.210 | 0.054 | 0.072 |
10 | 100 μg AC002479 | 0.293 | 0.070 | 0.092 | 0.270 | 0.016 | 0.017 |
在研究第1天,根據下表32,對Tg SOD1 G93A大鼠注射30 μL人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或30 μL化合物調配物,該群組2-6之化合物調配物之濃度分別為0.33、1.0、3.33、10及30 mg/mL:
表 32 : 實例 12 之大鼠之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 |
群組1(aCSF) | n=4 |
群組2(10 μg AD12261) | n=4 |
群組3(30 μg AD12261) | n=4 |
群組4(100 μg AD12261) | n=4 |
群組5(300 μg AD12261) | n=4 |
群組6(900 μg AD12261) | n=4 |
在第1天對大鼠進行鞘內注射。在第85天,自各動物收集CSF,接著將大鼠安樂死,且收集左半腦及胸部脊髓且儲存於10% NBF中。自右半腦、胸部脊髓、皮質、小腦及腦幹獲取組織樣本。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。各群組之平均值結果顯示於下表33中:
表 33. 藉由 qPCR 分析之實例 12 之各給藥群組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
皮質 | 小腦 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.127 | 0.145 | 1.000 | 0.100 | 0.111 |
2 | 10 μg AD12261 | 1.148 | 0.085 | 0.092 | 0.963 | 0.106 | 0.119 |
3 | 30 μg AD12261 | 0.966 | 0.096 | 0.107 | 0.742 | 0.107 | 0.125 |
4 | 100 μg AD12261 | 0.843 | 0.267 | 0.391 | 0.572 | 0.213 | 0.339 |
5 | 300 μg AD12261 | 0.870 | 0.279 | 0.410 | 0.501 | 0.153 | 0.221 |
6 | 900 μg AD12261 | 0.733 | 0.171 | 0.223 | 0.316 | 0.097 | 0.139 |
胸部脊髓 | 腦幹 | ||||||
群組平均值(n=4) | 群組平均值(n=4) | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) | 相對表現 | 誤差 ( 低) | 誤差 ( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.185 | 0.228 | 1.000 | 0.257 | 0.345 |
2 | 10 μg AD12261 | 1.140 | 0.115 | 0.129 | 1.056 | 0.146 | 0.170 |
3 | 30 μg AD12261 | 0.845 | 0.153 | 0.186 | 0.988 | 0.213 | 0.272 |
4 | 100 μg AD12261 | 0.595 | 0.250 | 0.430 | 0.843 | 0.300 | 0.465 |
5 | 300 μg AD12261 | 0.507 | 0.130 | 0.175 | 0.865 | 0.124 | 0.145 |
6 | 900 μg AD12261 | 0.217 | 0.066 | 0.094 | 0.605 | 0.108 | 0.132 |
如上表33中所示,觀測到用AD12261 (亦稱為AC910358)處理之轉殖基因大鼠之SOD1 mRNA表現的劑量依賴性降低。實際上,在900 μg之最高劑量下,SOD1 RNAi藥劑AD12261能夠在皮質(0.733)中達成大約27%降低;在小腦(0.316)中達成大約69%降低;在胸部脊髓(0.217)中達成大約79%降低;及在腦幹(0.605)中達成大約40%降低。
實例 13. 石蟹獼猴中之活體內 SOD1 基因敲減
在研究第1天,根據下表34,對石蟹獼猴(cynomolgus monkeys)注射人工腦脊髓液(aCSF,獲自商業供應商)或在aCSF中含有45 mg AD12261之化合物調配物:
表 34 : 實例 13 之非人類靈長類動物之給藥群組。
群組ID | 給藥動物 |
群組1(aCSF) | n=4 |
群組2(45 mg AD12261)-第29天 | n=5 |
群組3(45 mg AD12261)-第85天 | n=5 |
群組4(45 mg AD12261)-第168天 | n=5 |
在群組1(對照)中對四隻(n=4)猴進行給藥,且在群組2、3及4 (觸發劑處理)中對五隻(n=5)猴進行給藥。在第1天對猴進行鞘內注射。在研究第29天,將群組1及2之動物安樂死,且自各動物收集腦及脊髓組織。在研究第85天,將群組3之動物安樂死,且自各動物收集腦及脊髓組織。在研究第168天,將群組4之動物安樂死,且自各動物收集腦及脊髓組織。藉由qPCR分析樣本之SOD1 mRNA基因敲減。相對於群組1,各群組之平均值結果顯示於下表35中:
表 35. 藉由 qPCR 分析之實例 13 之各給藥組之各種組織中 SOD1 mRNA 的 相對表現。
額葉皮質 | 顳葉皮質 | ||||||
群組平均值 | 群組平均值 | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.122 | 0.139 | 1.000 | 0.164 | 0.197 |
2-第29天 | AD12261 (45 mg) | 0.267 | 0.191 | 0.666 | 0.184 | 0.129 | 0.437 |
3-第85天 | AD12261 (45 mg) | 0.471 | 0.289 | 0.749 | 0.204 | 0.115 | 0.265 |
4-第168天 | AD12261 (45 mg) | 0.463 | 0.191 | 0.326 | 0.273 | 0.101 | 0.160 |
小腦( 皮質) | 腰脊髓 | ||||||
群組平均值 | 群組平均值 | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.207 | 0.262 | 1.000 | 0.535 | 1.152 |
2-第29天 | AD12261 (45 mg) | 0.368 | 0.212 | 0.503 | 0.040 | 0.020 | 0.039 |
3-第85天 | AD12261 (45 mg) | 0.726 | 0.220 | 0.316 | 0.025 | 0.012 | 0.024 |
4-第168天 | AD12261 (45 mg) | 0.984 | 0.264 | 0.361 | 0.115 | 0.057 | 0.113 |
頸部脊髓 | 運動 皮質 | ||||||
群組平均值 | 群組平均值 | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.297 | 0.422 | 1.000 | 0.183 | 0.224 |
2-第29天 | AD12261 (45 mg) | 0.119 | 0.080 | 0.238 | 0.281 | 0.178 | 0.490 |
3-第85天 | AD12261 (45 mg) | 0.372 | 0.176 | 0.335 | 0.188 | 0.091 | 0.176 |
4-第168天 | AD12261 (45 mg) | 0.906 | 0.206 | 0.266 | 0.676 | 0.364 | 0.790 |
海馬體 | 腦橋 | ||||||
群組平均值 | 群組平均值 | ||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) |
1 | aCSF | 1.000 | 0.180 | 0.220 | 1.000 | 0.370 | 0.586 |
2-第29天 | AD12261 (45 mg) | 0.175 | 0.131 | 0.520 | 0.306 | 0.176 | 0.412 |
3-第85天 | AD12261 (45 mg) | 0.373 | 0.073 | 0.090 | 0.925 | 0.320 | 0.489 |
4-第168天 | AD12261 (45 mg) | 0.481 | 0.155 | 0.229 | 0.981 | 0.296 | 0.425 |
胸部脊髓 | |||||||
群組平均值 | |||||||
群組# | 描述 | 相對表現 | 誤差( 低) | 誤差( 高) | |||
1 | aCSF | 1.000 | 0.185 | 0.227 | |||
2-第29天 | AD12261 (45 mg) | 0.122 | 0.074 | 0.188 | |||
3-第85天 | AD12261 (45 mg) | 0.130 | 0.085 | 0.248 | |||
4-第168天 | AD12261 (45 mg) | 0.628 | 0.255 | 0.430 |
如上表35中所示,在用AD12261處理之非人類靈長類動物之多個組織中觀測到SOD1 mRNA表現之持久(直至在單一鞘內注射後168天)降低。
其他實施例
應理解,雖然本發明已結合其實施方式描述,但前述描述意欲說明且不限制本發明之範疇,本發明之範疇係由隨附申請專利範圍之範疇界定。其他態樣、優勢及修改在所附申請專利範圍之範疇內。
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Claims (56)
- 一種用於抑制超氧化物歧化酶1 (Superoxide Dismutase 1;SOD1)基因表現之RNAi藥劑,其包含: 反義股,其包含與表2或表3中所提供之序列中之任一者相差0或1個核苷酸之至少17個連續核苷酸;及 有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表2或表3中所提供之序列中之任一者的核苷酸2-18。
- 如請求項1或請求項2之RNAi藥劑,其中該有義股包含與表2或表4中所提供之序列中之任一者相差0或1個核苷酸之至少17個連續核苷酸的核苷酸序列,且其中該有義股在該連續17個核苷酸內具有與該反義股至少85%互補的區域。
- 如請求項1至3中任一項之RNAi藥劑,其中該SOD1 RNAi藥劑之至少一個核苷酸為經修飾之核苷酸或包括經修飾之核苷間鍵聯。
- 如請求項1至4中任一項之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項4至5中任一項之RNAi藥劑,其中該經修飾之核苷酸選自由以下組成之群:2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸、2'-去氧核苷酸、2',3'-開環核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿拉伯糖核苷酸、2'-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2'-O-甲基核苷酸、反向2'-去氧核苷酸、2'-胺基修飾之核苷酸、2'-烷基修飾之核苷酸、(N-𠰌啉基)核苷酸、含有膦酸乙烯酯之核苷酸、含有膦酸環丙酯之核苷酸及3'-O-甲基核苷酸。
- 如請求項5之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸均經2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸或其組合修飾。
- 如請求項1至7中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
- 如請求項1至8中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含表4中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列,且該有義股包含表4中所提供之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
- 如請求項1至10中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股之長度為18至30個核苷酸,且該反義股之長度為18至30個核苷酸。
- 如請求項11之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至27個核苷酸。
- 如請求項12之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至24個核苷酸。
- 如請求項13之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為21個核苷酸。
- 如請求項14之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑具有兩個鈍端。
- 如請求項1至15中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個端帽。
- 如請求項1至16中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑由有義股及反義股構成,該有義股及該反義股形成具有表7A、表7B、表8、表9A或表10中之雙螺旋體中之任一者之結構的雙螺旋體。
- 如請求項18之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股由與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由其組成或包含其: UGAUAGAGGAUUAAAGUGA (SEQ ID NO: 54); UAGGAUAACAGAUGAGUUA (SEQ ID NO: 59); UGAGAUCACAGAAUCUUCA (SEQ ID NO: 64); UGAUAGAGGAUUAAAGUGAGG (SEQ ID NO: 1084); UAGGAUAACAGAUGAGUUAAG (SEQ ID NO: 1090);或 UGAGAUCACAGAAUCUUCAAC (SEQ ID NO: 1105)。
- 如請求項20之RNAi藥劑,其中該有義股由與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由其組成或包含其: UCACUUUAAUCCUCUAUCA (SEQ ID NO: 288); UAACUCAUCUGUUAUCCUA (SEQ ID NO: 293); GUUGAAGAUUCUGUGAUCU (SEQ ID NO: 298); CCUCACUUUAAUCCUCUAUCA (SEQ ID NO: 1151); CUUAACUCAUCUGUUAUCCUA (SEQ ID NO: 1157);或 GUUGAAGAUUCUGUGAUCUCA (SEQ ID NO: 1172)。
- 如請求項20或21之RNAi藥劑,其中全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股包含與以下核苷酸序列(5' → 3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由其組成或基本上由其組成: cPrpusGfsasuagAfggAfuUfaAfaGfugagsg (SEQ ID NO: 578); cPrpusGfsasuagA UNAggAfuUfaAfaGfugagsg (SEQ ID NO: 613); cPrpuAfgGfauaacagAfuGfaGfuuaassg (SEQ ID NO: 589);或 cPrpusGfsaGfaucacagAfaUfcUfucasasc (SEQ ID NO: 646); 其中a、c、g及u分別表示2'-O-甲基腺苷、2'-O-甲基胞苷、2'-O-甲基鳥苷及2'-O-甲基尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、2'-氟胞苷、2'-氟鳥苷及2'-氟尿苷;cPrpu表示5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵聯;A UNA表示2',3'-開環-腺苷-3'-磷酸酯;且其中該有義股上之全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該有義股包含與以下核苷酸序列(5'→3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由其組成或基本上由其組成: ccucacuuUfAfAfuccucuauca (SEQ ID NO: 685); cuuaacucAfUfCfuguuauccua (SEQ ID NO: 691);或 guugaagaUfuCfuGfugaucuca (SEQ ID NO: 771); 其中a、c、g、i及u分別表示2'-O-甲基腺苷、2'-O-甲基胞苷、2'-O-甲基鳥苷、2'-O-甲基肌苷及2'-O-甲基尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、2'-氟胞苷、2'-氟鳥苷及2'-氟尿苷;且s表示硫代磷酸酯鍵聯;且其中該反義股上之全部或實質上全部核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項20至24中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股在該核苷酸序列之3'末端、該核苷酸序列之5'端或兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
- 如請求項1至25中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑與脂質部分連接。
- 如請求項26之RNAi藥劑,其中該脂質部分選自由以下組成之群:
LP128 LP132 LP183 LP183rs LP200 LP232 LP233 LP243 LP245 LP249 LP257 LP259 LP260 LP262 LP269 LP273 LP274 LP276 LP283 LP286 LP287 LP289 LP290 LP293 LP296 LP300 LP303 LP304 LP310 LP383 LP395 LP395s LP396 LP409 LP409s LP429 LP430 LP431 LP435 LP439 LP440 LP441 LP456 LP462 LP463 LP464 LP465 LP466 LP493a (2'內部) aC16 uC16 cC16 gC16 (2C8C12)s (2C6C10)s HO-C16s c16s C22s - 如請求項26或請求項27之RNAi藥劑,其中該脂質部分與該有義股結合。
- 如請求項28之RNAi藥劑,其中該脂質部分與該有義股之5'末端結合。
- 一種組合物,其包含如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑,其中該組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
- 如請求項30之組合物,其進一步包含能夠抑制超氧化物歧化酶1基因表現的第二RNAi藥劑。
- 如請求項30至31中任一項之組合物,其進一步包含一或多種額外治療劑。
- 如請求項30至32中任一項之組合物,其中該RNAi藥劑為鈉鹽。
- 如請求項30至33中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為注射用水。
- 如請求項30至33中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為緩衝鹽水溶液。
- 一種用於抑制細胞中SOD1基因表現之方法,該方法包含將有效量之如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑或如請求項30至35中任一項之組合物引入細胞中。
- 如請求項36之方法,其中該細胞在個體體內。
- 如請求項37之方法,其中該個體為人類個體。
- 如請求項36至38中任一項之方法,其中在投與該RNAi藥劑後,該超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現被抑制至少約30%。
- 一種治療一或多個與突變型SOD1活性水平增強或升高相關之症狀或疾病之方法,該方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量之如請求項30至35中任一項之組合物。
- 如請求項40之方法,其中該疾病為神經退化疾病。
- 如請求項41之方法,其中該神經退化疾病為肌肉萎縮性脊髓側索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis;ALS)或阿茲海默氏症(Alzheimer's Disease)。
- 如請求項40之方法,其中該疾病為ALS。
- 如請求項43之方法,其中該疾病為SOD1連鎖家族性ALS。
- 如請求項36至44中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.01 mg/kg至約5.0 mg/kg該個體體重之劑量投與。
- 如請求項36至45中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.03 mg/kg至約2.0 mg/kg該個體體重之劑量投與。
- 如請求項36至44中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約25 mg至約450 mg之固定劑量投與。
- 如請求項47之方法,其中該RNAi藥劑係以約25 mg、約50 mg、約150 mg或約450 mg之劑量投與。
- 如請求項36至48中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以兩個或更多個劑量投與。
- 一種如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑之用途,其用於治療至少部分地由突變型SOD1活性及/或SOD1基因表現介導之疾病、病症或症狀。
- 一種如請求項30至35中任一項之組合物之用途,其用於治療至少部分地由超氧化物歧化酶1(SOD1)活性及/或超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現介導之疾病、病症或症狀。
- 一種如請求項30至35中任一項之組合物之用途,其用於製造用於治療至少部分地由超氧化物歧化酶1(SOD1)活性及/或超氧化物歧化酶1(SOD1)基因表現介導之疾病、病症或症狀的藥劑。
- 如請求項50至52中任一項之用途,其中該疾病為神經退化疾病。
- 一種製備如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑的方法,其包含使有義股及反義股黏著以形成雙股核糖核酸分子。
- 如請求項54之方法,其中該有義股包含脂質部分。
- 如請求項54之方法,其包含將脂質部分與該有義股結合。
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