TW202208420A - T細胞受體及其針對prame陽性癌症的免疫治療 - Google Patents

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Abstract

本發明涉及針對腫瘤相關抗原(TAA)、特別是針對優先表達黑色素瘤抗原(PRAME)的抗原識別構建體。本發明特別提出了對本發明腫瘤表達抗原具有選擇性和特異性的新型T細胞受體(TCR)分子。本發明的TCR及其衍生的TAA結合片段可用於診斷、治療和預防表達TAA的癌性疾病。還提出了編碼本發明抗原識別構建體的核酸、包含這些核酸的載體、表達抗原識別構建體的重組細胞以及包含本發明化合物的藥物組合物。

Description

T細胞受體及其針對PRAME陽性癌症的免疫治療
本發明涉及針對腫瘤相關抗原(TAA)、特別是針對優先表達黑色素瘤抗原(PRAME)的抗原識別構建體。本發明特別提出了對本發明腫瘤表達抗原具有選擇性和特異性的新型T細胞受體(TCR)分子。本發明的TCR及其衍生的TAA結合片段可用於診斷、治療和預防表達TAA的癌性疾病。還提出了編碼本發明抗原識別構建體的核酸、包含這些核酸的載體、表達抗原識別構建體的重組細胞以及包含本發明化合物的藥物組合物。
PRAME由PRAME基因編碼，PRAME基因在很大比例的腫瘤中高水準表達，包括黑色素瘤、非小細胞肺癌、卵巢癌、腎細胞癌(RCC)、乳腺癌、宮頸癌、結腸癌、肉瘤、神經母細胞瘤，以及幾種類型的白血病。PRAME是富含亮氨酸重複序列(LRR)蛋白質PRAME家族的最佳特徵成員。哺乳動物基因組包含PRAME家族的多個成員，而在其他脊椎動物基因組中，僅確定一個PRAME樣LRR蛋白。PRAME是一種癌症/睾丸抗原，在除睾丸以外的正常成人組織中以非常低的水準表達，但在各種癌細胞中以高水準表達。
基於T細胞的免疫治療靶標代表作用于主要組織相容性複合體(MHC)分子提呈的來源於腫瘤相關蛋白或腫瘤特異性蛋白的肽表位。這些腫瘤相關抗原(TAA)可以是源自所有蛋白類型的肽，如酶、受體、轉錄因子等，它們在相應腫瘤的細胞中被表達，並且與同源未變的細胞相比，其表達通常上調。
細胞免疫反應的特定元素能特異性地識別和破壞腫瘤細胞。從腫瘤浸潤細胞群或外周血中分離出的T細胞表明，這些細胞在癌症的天然免疫防禦中發揮了重要作用。特別是CD8陽性T細胞在這種反應中發揮重要作用，TCD8+ 能識別通常8至10個源自蛋白或位於細胞質的缺損核糖體產物(DRiP)的氨基酸殘基的主要組織相容性複合體(MHC)所載的肽中所含的I類分子。人MHC分子也稱為人白細胞-抗原(HLA)。
MHC分子有兩類：MHC I類和MHC II類。肽和MHC I類的複合體由負載相應T細胞受體(TCR)的CD8陽性T細胞進行識別，而肽和MHC II類分子的複合體由負載相應TCR的CD4陽性輔助T細胞進行識別。由於CD8依賴型和CD4依賴型這兩種反應共同並協同地促進抗腫瘤作用，因此，確定和表徵腫瘤相關抗原和相應T細胞受體在開發癌症免疫治療（如：疫苗和細胞治療）中非常重要。
在MHC I類依賴性免疫反應中，肽不僅能與腫瘤細胞表達的某些MHC-I類分子結合，而且它們之後還必須能被T細胞負載的特異性T細胞受體(TCR)識別。因此，TAA是基於T細胞療法（包括但不限於腫瘤疫苗和細胞療法）研發的起點。
大約90%的外周血T細胞表達由一個α多肽和一個β多肽組成的TCR。一小部分T細胞（約占總T細胞的5%）表現出由一個γ多肽和一個δ多肽組成的TCR。在被稱為上皮內淋巴細胞(IEL)的淋巴細胞群內，發現γδT細胞在其腸道粘膜中豐度最高。啟動γδ T細胞的抗原性分子仍然鮮為人知。但是，γδ T細胞不是MHC限制性細胞，似乎能夠識別整個蛋白質，而不是要求肽在抗原提呈細胞上由MHC分子提呈，雖然有些識別MHC IB類分子。構成外周血中主要γδT細胞群的人Vγ9/Vδ2T細胞具有獨特性，它們特異性地且快速地應答小非肽類微生物代謝物HMB-PP（一種異戊烯基焦磷酸鹽前體）。可以在健康供體外周血中發現的T細胞百分比估計如下：CD3+=70.78%±4.71；CD3+CD4+=38.97%±5.66；CD3+CD8+=28.955%±7.43；CD3+CD56+=5.22%±1.74；CD3-CD56+=10.305%±4.7；CD3+CD45RA+=45.00%±7.19和CD3+CD45RO+=27.21%±7.34。
T細胞克隆的T細胞抗原受體的鏈各自由指定可變(V)、[多樣性(D)]、連接(J)和恒定(C)結構域的獨特組合構成。在每個T細胞克隆中，α和β鏈或δ和γ鏈的V、D和J結構域的組合以該T細胞克隆獨特特徵的方式參與抗原識別，並定義一個獨特的結合位點（也被稱為獨特型T細胞克隆）。而C結構域不參與抗原結合。
TCR是免疫球蛋白超家族的異二聚體細胞表面蛋白，其與參與介導信號轉導的CD3複合體的不變蛋白質相關。TCR以αβ和γδ形式存在，其結構相似，但解剖位置非常不同，也可能功能也非常不同。天然異二聚體αβ TCR和γδ TCR的細胞外部分各自均由兩個多肽組成，每個多肽都有一個膜近端恒定結構域和一個膜遠端可變結構域。每個恒定和可變結構域都包括一個鏈內二硫鍵。可變結構域包含與抗體互補決定區(CDR)類似的高度多態性環。使用TCR基因療法可克服目前的一些障礙。它可讓患者自己的T細胞在短時間內具有所需的特異性並產生足夠數量的T細胞，從而避免其耗盡。TCR將被轉導至強效T細胞（例如，中央記憶T細胞或具有幹細胞特徵的T細胞）中，這可確保轉移時產生更好的持久性和功能。TCR工程化T細胞將透過化學療法或照射被注入淋巴細胞減少的癌症患者，從而獲得有效的植入，但抑制免疫抑制。
雖然在開發用於癌症治療的分子靶向藥物方面取得了進展，但是，本領域仍然需要開發專門靶向作用於癌細胞高度特異性分子的抗癌新藥。本發明說明書透過提出新型PRAME TCR、各自的重組TCR構建體、核酸、載體和與TAA表位特異性結合的公開宿主細胞來滿足此需求；以及使用這些分子治療癌症的方法。本發明背景中術語TAA具體涉及以下優選蛋白質：PRAME及其片段或類似物，尤其是包含SEQ ID NO：97至115、優選為SEQ ID NO：97至106、更優選為SEQ ID NO：97所示的抗原性肽序列或由其組成的片段或類似物。
在第一方面，本發明的目的透過抗原識別構建體來解決，所述抗原識別構建體包含至少一個互補決定區(CDR) 3，其與選自SEQ ID NO 3、9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、129和135的氨基酸序列至少具有50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或優選為100%序列同一性。
在一些實施方案中，本發明的抗原識別構建體特異性結合TAA-肽-HLA分子複合體，其中所述TAA肽包含TAA的變體或由TAA的變體組成，其至少66%、優選至少77%、更優選至少88%同源（優選為至少77%或至少88%相同），其中所述變體與HLA I類或II類分子結合和/或誘導與所述肽或其藥用鹽交叉反應的T細胞，其中所述肽不是潛在的全長多肽。
用於本文時，當在本文中用於兩個或更多個核酸或蛋白質/多肽序列背景下任何地方時，術語「相同」或「同一性」百分比是指兩個或更多個序列或子序列相同或具有（即，至少具有）特定百分比的氨基酸殘基或核苷酸，所述氨基酸殘基或核苷酸透過使用序列比較演算法測量或人工比對和目視檢查相同（即，在指定區域中，當在比較視窗或指定區域上進行比較和比對以獲得最大對應性時，優選為在全長序列中，具有或至少具有約60%同一性，優選具有或至少具有65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%或94%同一性，更優選具有或至少具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性）（例如參見NCBI網站）。在一項特定的實施方案中，例如，當將本發明的抗原識別構建體的蛋白質或核酸序列與另一種蛋白質/基因進行比較時，同一性百分比可透過NCBI網站支持的Blast搜索來確定；特別是用於確定氨基酸同一性時，使用含有以下參數的BLASTP 搜索：預期閾值10；字數：6；矩陣：BLOSUM62；空位罰分：存在：11，擴展：1；相鄰詞語閾值：11；構圖調整：條件構圖分數矩陣調整。
在本發明的背景下，應當理解的是，被稱為「包括」本發明某些特徵的任何實施方案應被理解為在一些更優選的實施方案中納入由本發明非常相同特徵「組成」或「基本上組成」的更加嚴格的描述。
在另一個附加或替代實施方案中，抗原識別構建體還可包含CDR1和/或CDR2、更優選為CDR2bis結構域序列。在可變結構域內，CDR1和CDR2或CDR2bis位於多肽鏈的可變(V)區域，CDR3包括一部分V區域、全部多樣性(D)區域和連接(J)區域。CDR3是最可變的，是負責特異性和選擇性識別抗原的主要CDR。CDR1、CDR2和CDR2bis序列可能選自人可變鏈等位基因的CDR序列。
天然α-β異二聚體TCR具有一個α鏈和一個β鏈。每個鏈都包括可變、連接和恒定區域，β鏈通常還包括可變區和連接區之間的短多樣性區域，但是該多樣性區域常被視為連接區域的一部分。每個可變區都包括嵌入在框架序列中的三個CDR（互補決定區），其中一個是稱為 CDR3的高度可變區。存在幾種類型的α鏈可變(Vα)區和幾種類型的β鏈可變(Vβ)區，由其框架、CDR1和CDR2序列及部分定義的CDR3序列區分。Vα類型透過唯一的TRAV號在IMGT命名中提及，Vβ類型透過唯一的TRBV號被提及。關於免疫球蛋白抗體和TCR基因的更多資訊，參見國際免疫基因學資訊系統?，Lefranc MP等人(Nucleic Acids Res.2015 Jan;43(Database issue):D413-22; and http://www.imgt.org/)。
因此，在一個附加或替代實施方案中，本發明的抗原識別構建體包含如下文表1中所數的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列組合，其與CDR3序列一起顯示相應的可變鏈等位基因。因此，優選的是本發明的抗原識別構建體，其包含至少一個、優選為全部四個CDR序列CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3。優選情況是，本發明的抗原識別構建體包含本文公開的本發明的單個TCR可變區的各 CDR1、CDR2bis和CDR3（參見下文表1和實施例章節）。
本文所用術語「特異性」或「抗原特異性」或「特異性針對」給定抗原系指當所述抗原由HLA，優選為HLA A2提呈時，抗原識別構建體可與所述抗原特異性結合，優選為TAA抗原，更優選為具有高親合力的抗原。例如，作為抗原識別構建體的TCR可視為對TAA具有「抗原特異性」，條件是在與使用低濃度TAA抗原，例如下文提出的TAA表位和抗原（例如，約10-11 mol/l、10-10 mol/l、10-9 mol/l、10-8 mol/l、10-7 mol/l、10-6 mol/l、10-5 mol/l）脈衝處理的靶細胞共培養時，表達TCR並與TAA提呈HLA接觸的T細胞分泌至少約200 pg/ml或以上（例如，250 pg/ml或以上、300 pg/ml或以上、400 pg/ml或以上、500 pg/ml或以上、600 pg/ml或以上、700 pg/ml或以上、1000 pg/ml或以上、2,000 pg/ml或以上、2,500 pg/ml或以上、5,000 pg/ml或以上）的干擾素γ (IFN-γ)。替代或附加情況是，如果表達TCR的T細胞在與低濃度TAA抗原脈衝的靶細胞共培養時分泌至少兩倍於IFN-γ未轉染背景水準的IFN-γ，則認為TCR對TAA具有「抗原特異性」。如上所述的這種「特異性」可用ELISA進行分析。
在本發明的一個替代或附加實施方案中，抗原識別構建體選擇性地與TAA衍生的抗原性肽結合；優選其中TAA抗原性肽為具有SEQ ID NO：97至115、最優選為SEQ ID NO：97所示氨基酸序列的蛋白質表位或肽或其變體，其中所述變體氨基酸缺失、添加、插入或取代不超過三個、優選為兩個、最優選為不超過一個氨基酸位置。
術語「選擇性」或「選擇性識別/結合」被理解為是指抗原識別構建體（如TCR或抗體）的性質，選擇性地識別或結合至優選僅一個特異性表位，優選為與另一個表位沒有或基本上沒有交叉反應。優選情況為，術語「選擇性」或「選擇性識別/結合」是指抗原識別構建體（例如TCR）選擇性地識別或結合優選僅一個特異性表位，且優選為與另一個表位沒有或基本上沒有交叉反應，其中所述表位對於一種蛋白質是獨特的，使得抗原識別構建體對另一種表位和另一種蛋白質沒有或基本上沒有交叉反應性。
根據本發明的抗原識別構建體優選為選自抗體或其衍生物或片段、或T細胞受體(TCR)或其衍生物或片段。本發明的抗體或TCR的衍生物或片段應優選為可保留母體分子的抗原結合/識別能力，特別是其如上所述的特異性和/或選擇性。此類結合功能可以透過如本文所定義的CDR3區的存在來保留。
在本發明的一實施方案中，本發明的TCR能夠以主要組織相容性複合體(MHC) I類依賴性方式識別TAA抗原。本文使用的「MHC I類依賴性方式」系指在MHC I類分子的背景中在結合TAA抗原時TCR引起免疫應答。MHC I類分子可以是本領域已知的任何MHC I類分子，例如HLA-A分子。在本發明的一項優先實施方案中，MHC I類分子為HLA-A2分子。
本發明提供單鏈抗原識別構建體和雙鏈識別構建體。
在一實施方案中，該TCRα可變結構域具有至少一個與表1所示TCRα結構域相關的突變；和/或該TCRβ可變結構域具有至少一個與表1所示TCRβ結構域相關的突變。在一實施方案中，TCRα可變結構域和/或TCRβ可變結構域中包含至少一個突變的TCR對於TAA肽HLA分子複合體的結合親和力和/或結合半衰期至少是包含未突變TCRα結構域和/或未突變TCRβ可變結構域的TCR的兩倍。
本說明書的TCRα鏈可能進一步包含TCRα跨膜結構域和/或TCRα細胞內結構域。本說明書的TCRβ鏈可能進一步包含TCRβ跨膜結構域和/或TCRβ細胞內結構域。
本發明特別提出一種作為抗原識別構建體或其片段或衍生物的TCR。TCR 優選為人TCR，其被理解為由人TCR基因座產生，因此包含人TCR序列。此外，本發明TCR的特徵在於它源自人，並且特異性地識別本發明的TAA抗原。
本發明的另一項實施方案另外提供上述抗原識別構建體，其誘導免疫應答，優選為其中免疫應答的特徵在於干擾素(IFN) γ水準增加。
本發明的TCR可以為單鏈α或β，或γ和δ分子，或為由α和β鏈或γ和δ鏈兩者組成的雙鏈構建體。
本發明的抗原識別構建體可能包含TCR α或γ鏈；和/或TCR β或δ鏈；其中所述TCR α或γ鏈包含與選自SEQ ID NO. 3、15、27、39、51、63、75和129的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR3，和/或其中所述TCR β或δ鏈包含與選自SEQ ID NO. 9、21、33、45、57、69、81和135的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR3。
最優選地，在一些另外的實施方案中，其中本披露是指包含本文公開的TCR鏈的任何一個、兩個、三個或全部CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3區的抗原識別構建體（參見表1），此類抗原識別構建體可能為優選，其包含本發明相應的CDR序列，其不超過三個、兩個、優選為僅一個修飾的氨基酸殘基。修飾的氨基酸殘基可能選自氨基酸插入、缺失或取代基。最為優先的情況是三個、兩個、優選為僅一個修飾的氨基酸殘基為相應CDR序列的第一個或最後一個氨基酸殘基。如果修飾是取代，則在一些實施方案中優選取代為保守的氨基酸取代。
如果本發明的抗原識別構建體由至少兩個氨基酸鏈（如雙鏈TCR或其抗原結合片段）組成，則抗原識別構建體可能包含根據SEQ ID NO：3的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：9的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：15的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：21的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：27的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：33的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：39的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：45的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：51的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：57的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：63的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：69的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：75的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：81的第二個多肽鏈氨基酸序列；或根據SEQ ID NO：129的第一個多肽鏈氨基酸序列和根據SEQ ID NO：135的第二個多肽鏈氨基酸序列。上述任一雙鏈TCR或其抗原結合片段均是本發明的優選 TCR。在一些實施方案中，本發明雙鏈TCR的CDR3可能突變。如上所述的CDR3序列突變優選包括取代、缺失、添加或插入不超過3個、優選為2個、最優選為不超過1個氨基酸殘基。在一些實施方案中，第一個多肽鏈可能是TCRα或γ鏈，第二個多肽鏈可能是TCRβ或δ鏈。優選為αβ或γδ TCR的組合。
在一些實施方案中，TCR或其抗原結合片段由TCR α和TCR β鏈或γ和δ鏈組成。此類雙鏈TCR包括在每個鏈可變區內，並且各可變區包含一個CDR1、一個CDR2或更優選為一個CDR2bis和一個CDR3序列。TCR包含SEQ ID NO：4和10；或16和22；或28和34；或40和46；或52和58；或64和70；或76和82；或130和136可變鏈氨基酸序列中所包含的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列。
本發明的一些實施方案涉及由TCR α和TCR β鏈組成的TCR或其片段，其中所述TCR包含與選自根據SEQ ID NO：4和10；或16和22；或28和34；或40和46；或52和58；或64和70；或76和82；或130和136的α和β鏈的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或優選為100%序列同一性的可變區序列。
在一個特別優選的實施方案中，本發明提供了由TCRα和TCRβ鏈組成的改進TCR，稱為R11P3D3_KE，其中所述TCR包含與選自根據SEQ ID NO：132和138的α和β鏈的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或優選為100%序列同一性的可變區序列。與其母體受體（本文稱為R11P3D3）相比，該TCR在腫瘤細胞識別方面顯示出了令人驚訝的功能改善。
本發明的TCR可以進一步包含源自任何合適物種的恒定區，如任何哺乳動物，例如：人、大鼠、猴、兔、驢或小鼠。在本發明的一項實施方案中，本發明的TCR進一步包含人恒定區。在一些優選實施方案中，本發明TCR的恒定區可例如透過引入異源序列、優選為小鼠序列來稍加修飾，這可能增加TCR的表達和穩定性。在一些優選實施方案中，本發明TCR的可變區可例如透過引入單點突變以優化TCR穩定性和/或增強TCR鏈配對而稍加修飾。
本發明的一些實施方案涉及由TCR α和TCR β鏈組成的TCR或其片段，其中所述TCR包含與選自根據SEQ ID NO：5和11；或17和23；或29和35；或41和47；或53和59；或65和71；或77和83；或131和137的α和β鏈的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或優選為100%序列同一性的恒定區。
本發明的TCR α或γ鏈還可能包含與選自SEQ ID NO.1、13、25、37、49、61、73和127的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR1；和/或與選自SEQ ID NO.2、14、26、38、50、62、74和128的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2；和/或更優選為與選自SEQ ID NO. 196、197、198、199、200、201、202和204的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2bis。
根據本發明，TCR β或γ鏈還可能包含與選自SEQ ID NO. 7、19、31、43、55、67、79和133的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR1；和/或與選自SEQ ID NO. 8、20、32、44、56、68、80和134的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2；和/或更優選為與選自SEQ ID NO. 8、20、32、44、56、68、80和134的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2bis。
在一項進一步的實施方案中，抗原識別構建體可能包含TCR的結合片段，並且其中所述結合片段包含一個鏈CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3，其或可選自具有SEQ ID NO. 1、2、3、196；或7、8、9；或13、14、15、197；或19、20、21；或25、26、27、198；或31、32、33；或37、38、39、199；或43、44、45；或49、50、51、200；或55、56、57；或61、62、63、201；或67、68、69；或73、74、75、202；或79、80、81；或127、128、129、204；或133、134、135的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列。
在本發明的進一步實施方案中，本文其他地方所述的抗原識別構建體是由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成的TCR或其片段，其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID NO：1至3和196的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID NO：7至9的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID NO：13至15和197的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID NO：19至21的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID NO：25至27和198的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID NO：31至33的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：37至39和199的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：43至45的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：49至51和200的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：55至57的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：61至63和201的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：67至69的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：73至75和202的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：79至81的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：127至129和204的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：133至135的氨基酸序列的CDR1、CDR2、CDR2bis和CDR3序列。
在本發明的進一步實施方案中，前文所述的抗原識別構建體是由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成的TCR或其片段，其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID No.4的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.10的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.16的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.22的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.28的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.34的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.40的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.46的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.52的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.58的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.64的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.70的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.76的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.82的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.130的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.136的氨基酸序列的可變區序列。
在本發明的進一步實施方案中，前文所述的抗原識別構建體是TCR或其片段，其還包含與選自ID NO.5、11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、131和137的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的TCR 恒定區；優選地，其中TCR由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成，其中TCRα鏈序列包含與SEQ ID NO. 5、17、29、41、53、65、77和131的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的恒定區；並且其中TCRβ鏈序列包含與SEQ ID NO. 11、23、35、47、59、71、83和137的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的恒定區。
此外，所披露的是前文所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 6的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 12的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。本發明還提出了 TCR，其包含與SEQ ID No.18的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 24的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 30的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 36的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 42的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 48的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 54的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 60的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 66的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 72的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 78的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 84的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。在進一步的實施方案中，本發明提出的抗原識別構建體為TCR並且包含與SEQ ID No. 132的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 138的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。
本文所用的術語「鼠」或「人」在提及抗原識別構建體或TCR 時，或本文所述的TCR的任何組分（例如，互補性決定區(CDR)、可變區、恒定區，α鏈和/或β鏈）是指源自小鼠或人未經排列的TCR基因座的TCR（或其組分）。
在本發明的一項實施方案中，提供了嵌合TCR，其中所述TCR鏈包含來自多物種的序列。優選情況為，本發明的TCR可包含α鏈，其包含α鏈的人可變區和例如鼠 TCRα鏈的鼠恒定區。
在一項實施方案中，本發明的TCR是由根據上述實施方案的人可變區和人恒定區組成的人TCR。
在一些實施方案中，抗原識別構建體被鼠源化或人源化。當將來自外來物種的氨基酸序列引入本發明的構建體時，使用這些術語。
本發明的TCR可能為單鏈TCR (scTCR)。本發明的scTCR應在一個多肽鏈中包含全部或部分α鏈序列和全部或部分β鏈序列，優選為透過肽接頭連接。scTCR可包含第一TCR鏈（例如，α鏈）的可變區的多肽和整個（全長）第二TCR鏈（例如，β鏈）的多肽，反之亦然。此外，scTCR可以任選地包含一個或多個將兩個或多個多肽連接在一起的接頭。例如，接頭可以是肽，其將兩個單鏈連接在一起，如本文所述。還提供了本發明的scTCR，其與人細胞因子如IL-2、IL-7或IL-15融合。
本發明的抗原識別構建體還可能以包含至少兩個scTCR分子的多聚複合體形式提供，其中所述scTCR分子各自與至少一種生物素部分或其他相互連接的分子/接頭融合，並且其中所述scTCR透過生物素-鏈黴親和素相互作用相互連接，以形成所述多聚體複合體。本領域已知的用於產生多聚體TCR的類似方法也是可能的並且包括在本披露資料中。還提出了更高級的多聚體複合體，其包含本發明兩種以上的scTCR。
為了本發明的目的，TCR是具有至少一個TCRα或γ和/或TCR β或δ可變結構域的部分。通常，它們包括TCRα可變結構域和TCRβ可變結構域，或者 TCRγ可變結構域和TCRδ可變結構域兩者。它們可能為αβ/γδ異源二聚體，也可能為單鏈形式。為了用於過繼療法，αβ或γδ異二聚體TCR可能例如被轉染為具有細胞質和跨膜結構域的全長鏈。如果需要，相應恒定結構域殘基之間可能存在引入的二硫鍵。
在一項優選的實施方案中，抗原識別構建體為人TCR或其片段或衍生物。人TCR或其片段或衍生物是一種TCR，其包含超過50%的相應人TCR序列。優選情況為，只有少部分TCR序列為人工來源或源自其他物種。然而，眾所周知，例如，人源的嵌合TCR在恒定結構域含有鼠源序列是有利的。因此，特別優選的是根據本發明的TCR，其在其恒定結構域的細胞外部分含有鼠序列。
因此，又為優選的是本發明的抗原識別構建體能夠以人白細胞抗原(HLA)依賴性方式、優選以HLA-A*02依賴性方式識別其抗原。在本發明的上下文中，術語「HLA依賴性方式」系指抗原識別構建體僅在抗原肽由所述HLA提呈的情況下才與抗原結合。
在一項實施方案中，根據本發明的抗原識別構建體優選為誘導免疫應答，優選為其中免疫應答的特徵在於干擾素(IFN) γ水準增加。
本發明還提出了包含本文所述的任何TCR（或其功能變體）的功能部分的多肽，例如，選自實施例部分和表1中所述R11P3D3、R16P1C10、R16P1E8、R17P1A9、R17P1D7、R17P1G3、R17P2B6和R11P3D3_KE中的任何一種TCR。本文所用的術語「多肽」包括寡肽，並且系指透過一個或多個肽鍵連接的氨基酸的單鏈。關於本發明的多肽，功能部分可以是包含TCR（或其功能變體）連續氨基酸的任何部分，其中部分條件是功能部分與TAA抗原特異性結合，優選為如表2中所公開，以及與肽A1至A9 (SEQ ID NO：97和98-106)和肽T1至T9 (SEQ ID NO：107-115)特異性結合。當使用與TCR（或其功能變體）相關時，術語「功能部分」系指本發明TCR（或其功能變體）的任何部分或片段，其中該部分或片段保留 TCR（或其功能變體）的生物活性，其為母體TCR或其親代功能變體的一部分。功能部分包括，例如，保留與TAA抗原特異性結合的能力（以HLA依賴性方式）或以與母體TCR（或其功能變體）相似程度、相同程度或更高程度檢測、治療或預防癌症的TCR（或其功能變體）的那些部分。關於母體TCR（或其功能變體），功能部分可以包括，例如，約10%、25%、30%、50%、68%、80%、90%、95%或更多母體TCR可變序列（或其功能變體）。
功能部分可以在該部分的氨基或羧基末端或兩個末端包含額外的氨基酸，其中在母體TCR或其功能變體的氨基酸序列中未發現額外的氨基酸。理想的情況是，額外的氨基酸不干擾功能部分的生物學功能，例如，特異性結合TAA抗原；和/或具有檢測癌症、治療或預防癌症等能力。更理想的是，與母體TCR或其功能變體的生物學活性相比，額外的氨基酸增強了生物學活性。
多肽可包含本發明TCR的α和β鏈的一個或兩個功能部分或其功能變體，例如包含本發明TCR的α和/或β鏈可變區的CDR1、CDR2、CDR2bis和（優選）CDR3之一或其功能變體的功能部分。在本發明的一項實施方案中，多肽可包含功能部分，其包含SEQ ID NO：3、9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、129和135的氨基酸序列（本發明TCR可變區的CDR3）或其組合。在本發明的一項實施方案中，本發明的多肽可包括例如本發明TCR的可變區或其功能變體，其包含上述CDR區的組合。在這一點來說，多肽可包含SEQ ID NO：4、10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、130和136中的任一個氨基酸序列（本發明TCR的α或β鏈的可變區）。
在一些情況下，本發明的構建體可能包含一個或兩個多肽鏈，其包含根據SEQ ID NO：1至84和127至138和196至202和204（CDR序列，恒定和可變區和全長序列）中任一項的一個序列或其功能片段，並且進一步包含其他氨基酸序列，例如，編碼免疫球蛋白或其部分的氨基酸序列，則本發明的蛋白質可以是融合蛋白。就此而言，本發明還提供了包含本文所述的至少一種本發明的多肽與至少一種其他多肽的融合蛋白。其他的多肽可以作為融合蛋白的單獨多肽存在，或者可以作為與本文所述的本發明多肽之一框架（串聯）表達的多肽存在。其他多肽可包括任何肽或蛋白質分子或其部分，包括但不限於免疫球蛋白、CD3、CD4、CD8、MHC分子、CD1分子（例如，CD1a、CD1b、CD1c、CD1d等）。
融合蛋白可以包含本發明多肽的一個或多個拷貝和/或另一個多肽的一個或多個拷貝。例如，融合蛋白可包含本發明多肽和/或另一多肽的1、2、3、4、5個或更多個拷貝。製備融合蛋白的合適方法是本領域已知的，並且包括例如重組方法。在本發明的一些實施方案中，本發明的TCR（及其功能部分和功能變體）、多肽和蛋白質可以表達為單一蛋白，其包含連接α鏈和β鏈和連接γ鏈和δ鏈的連接肽。就此而言，本發明的TCR（及其功能變體和功能部分）、多肽和蛋白質包含本發明TCR可變區的氨基酸序列，並且可能進一步包含接頭肽。接頭肽可以有利地促進宿主細胞中重組TCR（包括其功能部分和功能變體）、多肽和/或蛋白質的表達。接頭肽可包含任何合適的氨基酸序列。單鏈TCR構建體的接頭序列是本領域公知的。此類單鏈構建體可進一步包含一個或兩個恒定結構域序列。在透過宿主細胞表達包括接頭肽的構建體後，接頭肽也可能被裂解，導致 α和β鏈以及 γ和δ鏈分離。
如上所述，本發明TCR的結合功能可能在抗體框架中提供。例如，本發明TCR的CDR序列，可能包括額外的3個、2個或1個N和/或C末端框架殘基，可以直接接枝到抗體可變重/輕鏈序列中。本文中使用了各種語法形式的術語「抗體」，系指免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的免疫活性部分，即含有抗原結合位點或互補位的分子。此類分子也被稱為免疫球蛋白分子的「抗原結合片段」。本發明還提出了與本文所述的抗原特異性結合的抗體或其抗原結合部分。抗體可以是本領域已知的任何類型的免疫球蛋白。例如，抗體可以是任何同種型免疫球蛋白，例如IgA、IgD、IgE、IgG、IgM等。抗體可以是單克隆或多克隆抗體。抗體可以是天然存在的抗體，例如從哺乳動物（例如，小鼠、兔、山羊、馬、雞、倉鼠、人等）中分離和/或純化的抗體。或者，抗體可以是基因工程化抗體，例如人源化抗體或嵌合抗體。抗體可以是單體或聚合體形式。
術語「抗體」包括但不限於基因工程化或其他修飾形式的免疫球蛋白，例如胞內抗體、嵌合抗體、完全人抗體、人源化抗體（例如由「CDR 移植」產生）、抗體片段和異源偶聯抗體（例如雙特異性抗體、雙鏈抗體、三鏈抗體、四鏈抗體等）。術語「抗體」包括半胱氨酸雙鏈抗體和微型抗體。因此，本文提供的關於「抗體」或「抗體樣構建體」的每個實施方案也被視為雙特異性抗體、雙鏈抗體、scFv片段、嵌合抗體受體(CAR)構建體，雙鏈抗體和/或微型抗體，除非另有明確表示。如本文所公開的，術語「抗體」包括免疫球蛋白家族的多肽或包含免疫球蛋白片段的多肽，所述多肽能夠非共價、可逆地並以特異性方式結合相應的抗原，優選為本發明的TAA。示例性抗體結構單元包括四聚體。在一些實施方案中，全長抗體可由兩對相同的多肽鏈組成，每對具有一個「輕」和一個「重」鏈（透過二硫鍵連接）。抗體結構和同種型是本領域技術人員所熟知的（例如，Janeway's Immunobiology, 9th edition, 2016所述）。
公認的哺乳動物免疫球蛋白基因包括κ、λ、α、γ、δ、ε和μ 恒定區基因，以及無數免疫球蛋白可變區基因（關於免疫球蛋白基因的更多資訊，參見國際免疫基因學資訊系統?，Lefranc M-P et al, Nucleic Acids Res.2015 Jan;43(Database issue):D413-22; and http://www.imgt.org/）。對於全長鏈，輕鏈被分為κ或λ類。對於全長鏈，重鏈分為γ、μ、α、δ或ε類，其又分別定義免疫球蛋白類別為IgG、IgM、IgA、IgD和IgE。每個鏈的N末端限定了主要負責抗原識別的約100至110個或更多個氨基酸的可變區。術語可變輕鏈(VL)和可變重鏈(VH)分別指輕鏈和重鏈的這些區域。用於本發明時，「抗體」包括抗體及其片段的所有變體。因此，在該概念的範圍內，為具有相同、基本上相同或相似結合特異性的全長抗體、嵌合抗體、人源化抗體、單鏈抗體(scFv)、Fab、Fab'和這些片段的多聚體形式（例如，F (ab') 2）。在一些實施方案中，抗體與本發明的肽TAA特異性結合。根據本發明的優選抗原識別構建體包括抗體重鏈，優選為其可變結構域，或其抗原結合片段和/或抗體輕鏈，優選為其可變結構域，或其抗原結合片段。類似地，二硫鍵穩定的可變區片段(dsFv)可以透過重組DNA技術製備，但本發明的抗體片段不限於這些示例性類型的抗體片段。此外，抗體或其抗原結合部分可以被修飾為包括可檢測的標記，例如放射性同位素、螢光團（例如，異硫氰酸螢光素(FITC)，藻紅蛋白(PE)）、酶（例如，鹼性磷酸酶、辣根過氧化物酶）和元素顆粒（例如，金顆粒）。在某些情況下，與SEQ ID NO：3、9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、129和135中提供的CDR3序列相比，TCR CDR3序列可以略加修飾，但優選不超過3個氨基酸殘基，優選為僅兩個，最優選為僅一個氨基酸位置。優選地，抗體包含該CDR3，優選為該組合中所有的CDR1、CDR2bis和CDR3區，如表1中本發明的TCR所示，在每種情況下與這些序列相比，獨立地可選地具有不多於三個或兩個、優選為一個氨基酸取代、插入和/或缺失基。
製備抗體的合適方法是本領域已知的。例如，標準雜交瘤方法描述於例如，Kohler and Milstein, Eur. J. Immunol, 5, 51 1-519 (1976), Harlow and Lane (eds.), Antibodies:A Laboratory Manual, CSH Press (1988), and C.A. Janeway et al.(eds.), Immunobiology, 8 Ed., Garland Publishing, New York, NY (201 1) 一文中。或者，其他方法，例如EBV雜交瘤方法（Haskard and Archer, J. Immunol. Methods, 74(2), 361-67 (1984),和Roder et al, Methods Enzymol, 121, 140-67 (1986)）和噬菌體載體表達系統（參見例如，Huse et al., Science, 246, 1275-81 (1989)）都是本領域已知的。此外，在非人動物中產生抗體的方法描述於例如美國專利5,545,806、5,569,825和5,714,352以及美國專利申請公開號2002/0197266中。
本發明的一些實施方案也涉及作為可溶性TCR的TCR或其功能片段和多肽。用於本文時，術語可溶性「T細胞受體」系指天然TCR的異二聚體截短變體，其包含TCR α鏈和β鏈的細胞外部分，例如，透過二硫鍵連接，但是其缺乏天然蛋白質的跨膜和胞質結構域。術語可溶性「T細胞受體α鏈和可溶性T細胞受體β鏈序列」系指缺乏跨膜和胞質結構域的TCR α鏈和β鏈序列。可溶性TCR α鏈和β鏈的序列（氨基酸或核酸）可以與天然TCR中的相應序列相同，或者與相應的天然TCR序列相比，可以包含變體可溶性TCR α鏈和β鏈序列。本文所用的術語「可溶性T細胞受體」包括具有變體或非變體可溶性TCRα鏈和β鏈序列的可溶性TCR。這些變異可以在可溶性TCR α鏈和β鏈序列的可變區或恒定區中，並且可以包括但不限於氨基酸缺失、插入、取代突變以及不改變氨基酸序列的核酸序列改變。在任何情況下本發明的可溶性TCR 都保留其母體分子的結合功能。
上述問題透過編碼本發明抗原識別構建體的核酸或任何上述蛋白質或多肽構建體得以進一步解決。核酸優選為(a)具有編碼根據本發明的抗原識別構建體的鏈；(b)具有與(a)中的鏈互補的鏈；或(c)具有在嚴格條件下與如(a)或(b)所述的分子雜交的鏈。嚴格條件是本領域技術人員已知的，具體來自Sambrook等人的「Molecular Cloning」一文。除此之外，核酸任選具有進一步的序列，其是表達對應於蛋白質的核酸序列所必需的，特別是用於在哺乳動物/人細胞中表達。使用的核酸可包含於適於允許在細胞中表達對應於該肽的核酸序列的載體中。然而，核酸也可用於轉化抗原呈遞細胞，其可能不限於經典的抗原呈遞細胞，例如樹突狀細胞，這樣，使得他們本身在其細胞表面上產生相應的蛋白質。
在一些實施方案中，抗原識別構建體的多肽可以由核酸編碼並在體內或體外表達。因此，在一些實施方案中，提出了編碼抗原識別構建體的核酸。在一些實施方案中，核酸編碼本發明抗原識別構建體的一個部分或單體（例如：本發明TCR的兩條鏈之一），和/或另一個核酸編碼本發明抗原識別構建體的另一部分或單體（例如：TCR的兩條鏈中的另一條）。在一些實施方案中，核酸編碼兩個或更多個抗原識別構建體多肽鏈，例如，至少2個TCR鏈。編碼多個抗原識別構建體鏈的核酸可以包括至少兩個鏈序列之間的核酸切割位元點，可以編碼兩個或更多個鏈序列之間的轉錄或翻譯起始位點，和/或可以編碼兩個或更多個抗原識別構建體鏈之間的蛋白水解靶位點。
本文所用的「核酸」包括「多核苷酸」、「寡核苷酸」和「核酸分子」，通常是指可以為單鏈或雙鏈、合成或從自然資源中獲得（例如，分離和/或純化）的DNA或RNA聚合物，其可含有天然、非天然的或改變的核苷酸，並且可含有天然、非天然的或改變的核苷酸間連接子，例如氨基磷酸酯連接子或磷硫代磷酸酯連接子，而非未修飾寡核苷酸的核苷酸之間的磷酸二酯。
優選地，本發明的核酸為重組核酸。本文所用的術語「重組」系指(i)透過將天然或合成核酸區段連接到可在活細胞中複製的核酸分子而構建在活細胞外部的分子，或(ii)從複製上述(i)中所述內容而產生的分子。為了本文的目的，複製可以是體外複製，也可以是體內複製。核酸可包含編碼本文所述的任何TCR、多肽或蛋白質或功能部分或其功能變體的任何核苷酸序列。
此外，本發明提出了包含如上所述的本發明核酸的載體。理想情況是，載體為表達載體或重組表達載體。術語「重組表達載體」在本發明背景下系指允許在合適宿主細胞中表達mRNA、蛋白質或多肽的核酸構建體。本發明的重組表達載體可以是任何合適的重組表達載體，並可用於轉化或轉染任何合適的宿主。合適的載體包括設計用於繁殖和擴增或用於表達或兩者兼有的載體，例如質粒和病毒。動物表達載體的實例包括pEUK-Cl、pMAM和pMAMneo。優選地，重組表達載體為病毒載體，例如，逆轉錄病毒載體。重組表達載體包括調節序列，例如轉錄和翻譯起始和終止密碼子，其特異於宿主細胞（例如，細菌、真菌、植物或動物）的類型，其中載體將被引入其中並且在其中可以進行本發明核酸的表達。此外，本發明的載體可能包括一個或多個標誌物基因，其允許選擇轉化或轉染的宿主。重組表達載體可包含與編碼本發明構建體的核苷酸序列或者與編碼本發明構建體的核苷酸序列互補或雜交的核苷酸序列在操作上可連接的天然或規範性啟動子。啟動子的選擇包括例如強、弱、誘導型、組織特異性和開發特異性啟動子。啟動子可以是非病毒啟動子，也可以是病毒啟動子。本發明的重組表達載體可以被設計用於暫態表達、穩定表達或兩者的表達。此外，重組表達載體可以用於組成型表達或誘導型表達。
本發明還涉及包含根據本發明的抗原識別構建體的宿主細胞。具體地，本發明的宿主細胞包含如上所述的核酸或載體。宿主細胞可以是真核細胞，例如植物、動物、真菌或藻類，也可以是原核細胞，例如細菌或原生動物。宿主細胞可以是培養細胞或原代細胞，即直接從生物體（例如人）分離。宿主細胞可以是貼壁細胞或懸浮細胞（即，在懸浮液中生長的細胞）。為了產生重組TCR、多肽或蛋白質的目的，宿主細胞優選為哺乳動物細胞。最優選地，宿主細胞為人細胞。雖然宿主細胞可以是任何細胞類型，可以來自任何類型的組織，可以是任何發育階段的細胞，但是宿主細胞優選為外周血白細胞(PBL)或外周血單核細胞(PBMC)。更優選地，宿主細胞為T細胞。T細胞可以是任何T細胞，諸如培養的T細胞，例如，原代T細胞或來自培養T細胞系的T細胞，例如Jurkat、SupT1等，或獲得自哺乳動物的T細胞，優選為來自人類患者的T細胞或T細胞前體。如果獲得自哺乳動物，T細胞可從許多來源獲得，包括但不限於血液、骨髓、淋巴結、胸腺或其他組織或液體。T細胞還可以是富集或純化的。優選地，T細胞為人T細胞。更優選地，T細胞是分離自人的T細胞。T細胞可以是任何類型的T細胞並且可以是任何發育階段的，包括但不限於CD4陽性和/或CD8陽性、CD4陽性輔助T細胞，例如，Th1和Th2細胞、CD8-陽性T細胞（例如，細胞毒性T細胞）、腫瘤浸潤細胞(TIL)、記憶T細胞、幼稚T細胞等。優選地，T細胞為CD8陽性T細胞或CD4陽性T細胞。
優選地，本發明的宿主細胞為淋巴細胞，優選為T淋巴細胞，例如CD4陽性或CD8陽性T細胞。宿主細胞更優選為對表達TAA的腫瘤細胞特異性的腫瘤反應性T細胞。
本發明的目的還透過製備TAA特異性抗原識別構建體或TAA特異性抗原識別構建體表達細胞系的方法來解決，包括 a.提出合適的宿主細胞， b.提供一種基因構建體，其包含編碼根據本發明公開的抗原識別構建體的編碼序列， c.將所述基因構建體引入所述合適的宿主細胞，和 d.由所述合適的宿主細胞表達所述基因構建體。 所述方法可能進一步包括在所述合適宿主細胞上進行細胞表面呈遞所述抗原識別構建體的步驟。
在其他優選的實施方案中，所述基因構建體是包含與所述編碼序列可操作地連接的啟動子序列的表達構建體。優選地，所述抗原識別構建體來源於哺乳動物，優選來源於人。用於本發明方法的優選合適宿主細胞為哺乳動物細胞，諸如人細胞，特別是人T淋巴細胞。用於本發明的T細胞在上文中進行了詳細描述。
本發明還包括實施方案，其中所述抗原識別構建體為修飾的TCR，其中所述修飾是加入功能結構域，諸如標記物或治療活性物質。此外，包括具有可選結構域的TCR，諸如可選膜錨定結構域而不是內源性跨膜區。此外，還包括在TCR可變結構域或恒定結構域中具有點突變的TCR，以改善TCR表達或穩定性和/或鏈配對。
理想情況是，用於將基因構建體引入所述合適宿主細胞的轉染系統為逆轉錄病毒載體系統。此類系統是本領域技術人員所熟知的。
本發明還包括在一項實施方案中，從細胞中分離和純化抗原識別構建體的另外的方法步驟，以及任選地在T細胞中重構經翻譯的抗原識別構建體片段。
本發明的另一方面提出了透過產生T細胞受體(TCR)的方法獲得的或可獲得的T細胞，其中T細胞受體(TCR)對於腫瘤細胞具有特異性並且具有如上所述的高親合力。此類T細胞取決於本發明方法中使用的宿主細胞，例如人或非人T細胞，優選為人TCR。
本文中在多肽（例如：抗原識別構建體（其實例可以是抗體））背景下使用的術語「分離」是指從蛋白質或多肽或其他污染物純化的多肽，未經純化會干擾其治療、診斷、預防、研究或其他用途。根據本發明的抗原識別構建體可以是重組、合成或修飾（非天然）抗原結合構建體。本文中在多核酸或細胞背景下使用的術語「分離」是指從 DNA、RNA、蛋白或多肽或其他污染物（例如其他細胞）純化的核酸或細胞，未經純化會干擾其治療、診斷、預防、研究或其他用途，或者是指重組、合成或修飾（非天然）核酸。在此背景中，「重組」蛋白/多肽或核酸是使用重組技術製備的。產生重組核酸和蛋白的方法和技術是本領域熟知的。
本發明的另一方面涉及本文公開的用於藥物中的抗原識別構建體、核酸、載體、藥物組合物和/或宿主細胞。在一項優選實施方案中在藥物中的用途包括在診斷、預防和/或治療諸如惡性或良性腫瘤疾病等腫瘤疾病中的用途。腫瘤疾病為，例如，在所述腫瘤疾病的癌細胞或腫瘤細胞中以表達TAA為特徵的腫瘤疾病。
關於根據本公開資料的抗原識別構建體和由其衍生的、與其相關的或編碼所述構建體的其他材料的上述醫療應用，待治療和/或診斷的疾病可以為任何增殖性疾病，優選為其特徵在於表達本發明的TAA或TAA表位序列，例如，所述疾病可以為任何癌症，包括以下癌症中任一種：急性淋巴細胞癌、急性骨髓性白血病、腺泡狀橫紋肌肉瘤、骨癌、腦癌、乳腺癌、肛門癌、肛管癌或肛門直腸癌、眼癌、肝內膽管癌、關節癌、頸癌、膽囊癌或胸膜癌、鼻癌、鼻腔癌或中耳癌、口腔癌、陰道癌、外陰癌、慢性淋巴細胞性白血病、慢性髓細胞癌、結腸癌、食管癌、宮頸癌、胃腸類癌、神經膠質瘤、霍奇金淋巴瘤、下嚥癌、腎癌、喉癌、肝癌、肺癌、惡性間皮瘤、黑色素瘤、多發性骨髓瘤、鼻咽癌、非霍奇金淋巴瘤、口咽癌、卵巢癌、陰莖癌、胰腺癌、腹膜癌、網膜癌、腸系膜癌、咽癌、攝護腺癌、直腸癌、腎癌、皮膚癌、小腸癌、軟組織癌、胃癌、睾丸癌、甲狀腺癌、子宮癌、輸尿管癌和膀胱癌。優選的癌症為宮頸癌、口咽癌、肛門癌、肛管癌、肛門直腸癌、陰道癌、外陰癌或陰莖癌。特別優選的癌症為TAA陽性癌症，優選包括卵巢癌、白血病或黑色素瘤。
本發明的構建體、蛋白質、TCR抗體、多肽和核酸特別用於免疫治療，優選用於過繼性T細胞治療。本發明化合物的給藥可以，例如，涉及將本發明的T細胞輸注入所述患者體內。優選地，此類T細胞為患者的自體T細胞，並且用本發明的核酸或抗原識別構建體在體外轉導。
本發明的抗原識別構建體、TCR、多肽、蛋白質（包括其功能變體）、核酸、重組表達載體、宿主細胞（包括其群體）和抗體（包括其抗原結合部分）以下統稱為「本發明的TCR材料」，可以配製成組合物，諸如藥物組合物。就此而言，本發明提出了一種藥物組合物，其包含本文所述的任意抗原識別構建體、TCR、多肽、蛋白質、功能部分、功能變體、核酸、表達載體、宿主細胞（包括其群體）和抗體（包括其抗原結合部分）以及藥用載體、賦形劑和/或穩定劑。含有任何本發明TCR材料的本發明藥物組合物可包含多於一種本發明的TCR材料，例如，多肽和核酸，或兩種或更多種不同的TCR（包括功能部分及其功能變體）。或者，藥物組合物可包含與另一種藥物活性劑或藥物組合的本發明TCR材料，諸如，化學治療劑，例如，天冬醯胺酶、白消安、卡鉑、順鉑、柔紅黴素、多柔比星、氟尿嘧啶、吉西他濱、羥基脲、甲氨蝶呤、紫杉醇、利妥昔單抗、長春花堿、長春新堿等。優選地，載體為藥用載體。關於藥物組合物，載體可以是常規用於所考慮的本發明的特定TCR材料的任意載體。這些藥用載體是本領域技術人員所熟知的，並且是公眾容易獲得的。優選情況是，藥用載體是在使用條件下無有害副作用或毒性的一種載體。
因此，本還提出了一種藥物組合物，其包含本文所述的本發明的任何產品和本發明的任何TCR材料，特別是任何蛋白質、核酸或宿主細胞。在一項優選的實施方案中，藥物組合物用於免疫治療，優選為繼代細胞治療。
優選地，本發明的TCR材料透過注射施用，如，靜脈內施用。當本發明的TCR材料為表達本發明TCR（或其功能變體）的宿主細胞時，用於注射的細胞藥用載體可能包括任何等滲載體，例如，生理鹽水（水中含有約0.90%w/v的NaCl、水中含有約300mOsm/L NaCl、或每升水中含有約9.0g NaCl）、NORMOSOL R電解質溶液(Abbott, Chicago, IL)、PLASMA-LYTE A (Baxter, Deerfield, IL)、水中含約5%葡萄糖或林格氏乳酸鹽。在一項實施方案中，藥用載體用人血清白蛋白補充。
為了本發明的目的，施用本發明TCR材料的數量或劑量（例如，當本發明TCR材料為一個或多個細胞時的細胞數量）可能在合理時間框架內在受試者或動物中足以影響治療或預防反應。例如，本發明TCR材料的劑量應該自施用起約2個小時或更長時間（例如，12至24小時）或更多小時的期間內與癌症抗原結合或檢測、治療或預防癌症。在某些實施方案中，時間可能更長。劑量將由本發明特定TCR材料的療效和動物（例如，人）的狀況以及待治療動物（例如，人）的體重決定。
預期本發明的藥物組合物、抗原識別構建體、TCR（包括其功能變體）、多肽、蛋白質、核酸、重組表達載體、宿主細胞或細胞群可用於癌症或TAA陽性癌前病變的治療或預防方法。本發明的TCR（及其功能變體）被認為可與本發明的TAA特異性結合，使得TCR（或本發明相關多肽或蛋白質及其功能變體）由細胞（如T細胞）表達或在細胞上表達時能夠介導針對表達本發明TAA的靶細胞的免疫應答，優選為經由MHC I或II在所述靶細胞的表面上提呈TAA肽。就此而言，本發明提出了哺乳動物中病症（特別是癌症）的治療或預防方法，包括向哺乳動物施用任何藥物組合物、抗原識別構建體，特別是TCR（及其功能變體）、多肽或本文所述的蛋白質、任何核酸或重組表達載體，其包含編碼本文所述的任何TCR（及其功能變體）、多肽、蛋白質的核苷酸序列或包含核酸或重組載體的任何宿主細胞或細胞群，該重組載體編碼本文所述的本發明的任何構建體（及其功能變體）、多肽或蛋白質，用量為有效治療或預防哺乳動物中病症的量，其中所述病症為癌症，如表達本發明TAA的癌症。
可用于本發明的藥用載體或稀釋劑的實例包括諸如SPGA、碳水化合物（例如，山梨糖醇、甘露糖醇、澱粉、蔗糖、葡萄糖、葡聚糖）等穩定劑，諸如白蛋白或酪蛋白等蛋白質，諸如牛血清或脫脂牛奶和緩衝液（例如，磷酸鹽緩衝液）等含蛋白製劑。
本文中所用的術語「治療」和「預防」以及源自這些術語的詞語並不一定意味著100%或完全治療或預防。相反，存在不同程度的治療或預防，而本領域普通技術人員認識到具有潛在的益處或治療效果。就此而言，本發明的方法可為哺乳動物的病症提供任何治療或預防水準的任意量。此外，本發明方法提出的治療或預防可包括待治療或預防病症（例如，癌症）的一種或多種病症或症狀的治療或預防。例如，治療或預防可以包括促進腫瘤消退。此外，為了本文之目的，「預防」可以包括推遲疾病或其症狀或病症的發作。
本發明還涉及一種治療癌症的方法，其包括與至少一種化學治療劑和/或放射治療組合施用本說明書的TCR、核酸或宿主細胞。
本發明的另一方面進一步涉及在（生物）樣本（例如從受試者或患者獲得的樣本）中檢測TAA蛋白或MHC與TAA蛋白（TAA的蛋白表位）的複合體的一種方法，包括使樣本與特異性結合所述TAA肽或TAA肽/MHC複合體的抗原識別構建體接觸，並檢測所述抗原識別構建體和所述TAA肽之間或與TAA肽/MHC複合體之間的結合情況。在一些實施方案中，抗原識別構建體是根據本文所述發明的TCR或抗體或類似構建體，或優選為抗原識別構建體。在一些實施方案中，（生物）樣本為腫瘤或癌症樣本（如：本文別處所述的那些樣本中的一種），例如，包含腫瘤或癌細胞的樣本。
還提出了一種在有需要的受試者中治療癌症的方法，包括： a) 從所述受試者中分離細胞； b) 用編碼本發明的抗原識別構建體的至少一種載體轉化細胞以產生轉化的細胞； c) 擴增轉化細胞以產生多個轉化細胞；和 d) 將所述多個轉化細胞施用於所述受試者。
還提出了一種在有需要的受試者中治療癌症的方法，包括： a) 從健康供體中分離細胞； b) 用編碼本發明的抗原識別構建體的一種載體轉化細胞以產生轉化的細胞； c) 擴增轉化細胞以產生多個轉化細胞；和 d) 將所述多個轉化細胞施用於所述受試者。
還提出了一種檢測生物樣本中癌症的方法，包括： a) 使生物樣本與本說明書的抗原識別構建體接觸； b) 檢測抗原識別構建體與生物樣本的結合情況。
在一些實施方案中，檢測癌症的方法在體外、體內或原位進行。
還提出了檢測哺乳動物中有無病症的方法。該方法包括(i)將包含哺乳動物一種或多種細胞的樣本接觸本發明的任何TCR（及其功能變體）、多肽、蛋白質、核酸、重組表達載體、宿主細胞、細胞群、抗體或其抗原結合部分或本文所述的藥物組合物，從而形成複合體，並包括檢測複合體，其中所述複合體的檢測提示哺乳動物中是否存在病症，其中所述病症為癌症，諸如表達TAA的惡性疾病。
關於檢測哺乳動物疾病的本發明方法，細胞樣本可以是包含全細胞、其裂解物或全部細胞裂解物的一部分的樣本，例如核或細胞質級分、全蛋白質級分或核酸級分。
為了本發明的檢測方法之目的，所述接觸可以在哺乳動物體外或體內進行。優選情況是，接觸在體外進行。
此外，複合體的檢測可以透過本領域已知的任何方式進行。例如，本文所述的本發明抗原識別構建體（及其功能變體）、多肽、蛋白質、核酸、重組表達載體、宿主細胞、細胞群或抗體或TCR或其抗原結合部分可以用檢測到的標記（諸如，放射性同位素、螢光團（例如，異硫氰酸螢光素(FITC)、藻紅蛋白(PE) ）、酶（例如，鹼性磷酸酶、辣根過氧化物酶）和元素顆粒（例如，金顆粒）進行標記。
為了本發明方法之目的，其中施用宿主細胞或細胞群，所述細胞可以是與哺乳動物同種異體或自體的細胞。優選情況是，細胞為哺乳動物自體細胞。
關於本發明TCR材料的上述醫療用途，待治療和/或診斷的癌症可以為任何癌症，包括以下癌症中任一種：急性淋巴細胞癌、急性骨髓性白血病、腺泡狀橫紋肌肉瘤、骨癌、腦癌、乳腺癌、肛門癌、肛管癌或肛門直腸癌、眼癌、肝內膽管癌、關節癌、頸癌、膽囊癌或胸膜癌、鼻癌、鼻腔癌或中耳癌、口腔癌、陰道癌、外陰癌、慢性淋巴細胞性白血病、慢性髓細胞癌、結腸癌、食管癌、宮頸癌、胃腸類癌、神經膠質瘤、霍奇金淋巴瘤、下嚥癌、腎癌、喉癌、肝癌、肺癌、惡性間皮瘤、黑色素瘤、多發性骨髓瘤、鼻咽癌、非霍奇金淋巴瘤、口咽癌、卵巢癌、陰莖癌、胰腺癌、腹膜癌、網膜癌、腸系膜癌、咽癌、攝護腺癌、直腸癌、腎癌、皮膚癌、小腸癌、軟組織癌、胃癌、睾丸癌、甲狀腺癌、子宮癌、輸尿管癌和膀胱癌。優選的癌症為宮頸癌、口咽癌、肛門癌、肛管癌、肛門直腸癌、陰道癌、外陰癌或陰莖癌。特別優選的癌症為TAA陽性癌症，例如：表達PRAME的癌症，如：卵巢癌、黑色素瘤或白血病。
總體上，本發明提出了患有腫瘤或腫瘤疾病的受試者的治療方法，其包括施用本發明公開的抗原識別構建體、核酸、載體、藥物組合物和/或宿主細胞。優選地，所述受試者為需要這種治療的受試者。優選實施方案中的受試者為患有TAA陽性的腫瘤或腫瘤疾病的哺乳動物受試者，優選為人類患者。
鑒於本文的公開內容，將理解本發明還涉及以下項目： 第1項：一種抗原識別構建體，其包含至少一個互補決定區(CDR) 3，其與選自NO.3、9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、129和135的氨基酸序列至少具有50%的序列同一性。 第2項：根據第1項的抗原識別構建體，其中所述抗原識別構建體能夠特異性地和/或選擇性地與本發明抗原肽的TAA結合。 第3項：根據第1或2項所述的抗原識別構建體，其中所述抗原識別構建體為一種抗體或其衍生物或片段、或一種T細胞受體(TCR)或其衍生物或片段。 第4項：根據第1至3項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述抗原識別構建體與提呈TAA抗原肽的人白細胞抗原(HLA)結合，其中所述HLA任選為A2型。 第5項：根據第1至4項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體特異性地和/或選擇性地結合具有選自SEQ ID NO：97至115、優選為SEQ ID NO：97的氨基酸序列的表位。 第6項：根據第1至5項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體為α/β-TCR，或其片段或衍生物，或所述構建體為γ/δ-TCR，或其片段或衍生物。 第7項：根據第1至6項中任一項所述的抗原識別構建體，其特徵在於，所述構建體是人源並特異性地和/或選擇性地識別TAA抗原肽。 第8項：根據第1至7項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述抗原識別構建體能夠在受試者中誘導免疫應答，任選其中所述免疫應答的特徵在於干擾素(IFN) γ水準增加。 第9項：根據第1至8項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含TCRα或γ鏈；和/或TCRβ或δ鏈；其中所述TCRα或γ鏈包含與選自SEQ ID NO. 3、15、27、39、51、63、75和129的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR3，和/或其中所述TCR β或δ鏈包含與選自SEQ ID NO. 9、21、33、45、57、69、81和135的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR3。 第10項：根據第9項中所述的抗原識別構建體，其中TCR α或γ鏈進一步包含與選自SEQ ID NO.1、13、25、37、49、61、73和127的氨基酸具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR1和/或與選自SEQ ID NO.2、14、26、38、50、62、74、128、196、197、198、199、200、201、202和204的氨基酸具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2。 第11項：根據第9或10項中所述的抗原識別構建體，其中TCR β或γ鏈進一步包含與選自SEQ ID NO. 7、19、31、43、55、67、79和133的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR1和/或與選自SEQ ID NO. 8、20、32、44、56、68、80和134的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的CDR2。 第12項：根據第1至11項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與選自SEQ ID NO.4、10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、130和136的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的TCR可變鏈區。 第13項：根據第1至12項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體被人源化、嵌合化和/或鼠源化。 第14項：根據第1至13項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含TCR的結合片段，並且其中所述結合片段包含CDR1至CDR3，其或可選自具有SEQ ID NO.1、2、3、196；或7、8、9；或13、14、15、197；或19、20、21；或25、26、27、198；或31、32、33；或37、38、39、199；或43、44、45；或49、50、51、200；或55、56、57；或61、62、63、201；或67、68、69；或73、74、75、202；或79、80,81；或127、128、129、204；或133、134、135的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列。 第15項：根據第1至14項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體為由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成的TCR或其片段，其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：1至3和196的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：7至9的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：13至15和197的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：19至21的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：25至27和198的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：31至33的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：37至39和199的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：43至45的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：49至51和200的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：55至57的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：61至63和201的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：67至69的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：73至75和202的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：79至81的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列；或其中所述TCRα鏈序列包含具有SEQ ID NO：127至129和204的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列，所述TCRβ鏈序列包含具有SEQ ID NO：133至135的氨基酸序列的CDR1至CDR3序列。 第16項：根據第1至15項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體為由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成的TCR或其片段，其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.4的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.10的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.16的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.22的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.28的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.34的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.40的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.46的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.52的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.58的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.64的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.70的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.76的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.82的氨基酸序列的可變區序列；或其中所述TCR α鏈序列包含具有SEQ ID No.130的氨基酸序列的可變區序列，並且其中所述TCR β鏈序列包含具有SEQ ID No.136的氨基酸序列的可變區序列。 第17項：根據第1至16項中任一項所述的抗原識別構建體，其中所述構建體為TCR或其片段，其還包含與選自ID NO. 5、11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、131和137的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80、90%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的TCR 恒定區；優選地，其中TCR由至少一個TCRα和一個TCRβ鏈序列組成，其中TCRα鏈序列包含與SEQ ID NO. 5、17、29、41、53、65、77和131的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的恒定區；並且其中TCRβ鏈序列包含與SEQ ID NO. 11、23、35、47、59、71、83和137的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的恒定區。 第18項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 6的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 12的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第19項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 18的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 24的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20a項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 30的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 36的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20b項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 42的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 48的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20c項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 54的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 60的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20d項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 66的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 72的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20e項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 78的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 84的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第20f項：根據第1至17項中任一項所述的抗原識別構建體，其包含與SEQ ID No. 132的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第一個TCR鏈，以及與SEQ ID No. 138的氨基酸序列具有至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、98%、99%或100%序列同一性的第二個TCR鏈。 第21項：一種核酸，其編碼根據第20f項中任一項的抗原識別構建體。 第22項：一種載體，其包含根據第21項所述的核酸。 第23項：一種宿主細胞，其包含根據第1至20項中任一項所述的抗原識別構建體或根據第21項所述的核酸或根據第22項所述的載體。 第24項：根據第23項所述的宿主細胞，其中所述細胞為淋巴細胞，優選為T淋巴細胞或T淋巴細胞祖細胞，更優選為CD4或CD8陽性T細胞。 第25項：一種藥物組合物，其包含根據第1至20f項中任一項所述的抗原識別構建體，或根據第21項所述的核酸，或根據第22項所述的載體，或根據第23或24項所述的宿主細胞，以及藥用載體、穩定劑和/或賦形劑。 第26項：根據第1至20f項中任一項所述的抗原識別構建體，或根據第21項所述的核酸，或根據第22項所述的載體，或根據第23或24項所述的宿主細胞，或根據第25項用於藥物的藥物組合物。 第27項：抗原識別構建體或核酸或載體或宿主細胞或藥物組合物根據第26項所述的用途，在診斷、預防和/或治療增殖性疾病的用途，其中所述疾病包括惡性或良性腫瘤疾病。 第28項：抗原識別構建體或核酸或載體或宿主細胞或藥物組合物根據第27項所述的用途，其中所述腫瘤疾病的特徵在於TAA在腫瘤疾病的腫瘤細胞中表達。 第29項：抗原識別構建體或核酸或載體或宿主細胞或藥物組合物根據第26至28項中任一項所述的用途，其中所述在藥物中的用途是在免疫治療中的用途，任選地包含過繼細胞轉移，其中所述免疫治療包括過繼自體或異源T細胞治療。 第30項：一種製備表達細胞系的TAA特異性抗原識別構建體的方法，包括 a.提出合適的宿主細胞， b.提出一種遺傳構建體，其包含編碼根據第1至20f項中任一項所述的抗原識別構建體的編碼序列， c.引入所述合適的宿主細胞、所述遺傳構建體， d.由所述合適的宿主細胞表達所述基因構建體。 第31項：根據第30項所述的方法，還包括所述抗原識別構建體的細胞表面提呈。 第32項：根據第30或31項所述的方法，其中所述遺傳構建體是包含與所述編碼序列可操作地連接的啟動子序列的表達構建體。 第33項：根據第30至32項中任一項所述的方法，其中所述抗原識別構建體為哺乳動物來源，優選為人來源。 第34項：根據第30至33項中任一項所述的方法，其中所述合適的宿主細胞為哺乳動物細胞，其任選地選自人細胞或人T淋巴細胞。 第35項：根據第30至34項中任一項所述的方法，其中所述抗原識別構建體為修飾的TCR，其中所述修飾包括添加包含標記的功能結構域或包含膜錨定結構域的可選結構域。 第36項：根據第35項所述的方法，其中所述抗原識別構建體為α/βTCR、γ/δTCR或單鏈TCR (scTCR)。 第37項：根據第30至36項中任一項所述的方法，其中所述遺傳構建體透過逆轉錄病毒轉染被導入所述合適的宿主細胞。 第38項：根據第30至37項中任一項所述的方法，進一步包括從合適的宿主細胞分離和純化所述抗原識別構建體，或在T細胞中重構所述抗原識別構建體。
從健康供體的T細胞中分離和擴增針對本文公開的PRAME-004肽的7種PRAME特異性TCR（R11P3D3、R16P1C10、R16P1E8、R17P1A9、R17P1D7、R17P1G3和R17P2B6，參見表1），每種編碼腫瘤特異性TCR-α和TCR-β鏈。根據之前描述的方法 (Walter et al., 2003 J Immunol., Nov 15;171(10):4974-8) 體外刺激來自健康供體的細胞，靶標特異性細胞使用HLA-A*02多聚體進行單細胞分選，然後進行隨後的TCR分離。例如根據Green和Sambrook所著的分子克隆實驗室手冊第四版所述的標準方法透過5'RACE分離TCR序列。對TCR R11P3D3、R16P1C10、R16P1E8、R17P1A9、R17P1D7、R17P1G3和R17P2B6的α和β可變區進行測序並克隆以進行進一步的功能表征。
R11P3D3、R16P1C10、R17P1D7和R17P2B6來自HLA-A*02陰性供體（同種反應性環境），R16P1E8、R17P1A9和R17P1G3來自HLA-A*02陽性供體。
此外，本文公開了突變型TCR R11P3D3_KE（R11P3D3的增強變體）。如PCT/EP2017/081745所述，由母體TCR修飾得出增強TCR 變體R11P3D3_KE，在此透過引用特別引入，在下面的實施例8中，在TCR功能表征之前透過基因合成獲得編碼序列。實施例 1 ： T 細胞受體 R11P3D3
TCR R11P3D3（SEQ ID NO：1-12和196）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖8）。
R11P3D3特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖1）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖8）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R11P3D3的EC50為0.74 nM（圖15），對HLA-A*02-提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)的結合親和力(KD )為18-26µM。
R11P3D3在人原代 CD8+T細胞中再次表達可選擇性識別和殺死HLA-A*02/PRAME-004提呈腫瘤細胞系（圖24、25和32）。TCR R11P3D3對25種測試的健康、原代或iPSC衍生細胞類型（圖24和25）中的任何一種都無應答，並對另外67種相似但在HLA-A*02背景下不相關的肽（其中57種在位置3、5、6和7與PRAME-004相同）進行了交叉反應性測試（圖8、22和23）。實施例 2 ： T 細胞受體 R16P1C10
TCR R16P1C10（SEQ ID NO：13-24和197）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖9）。
R16P1C10特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ並分別與HLA-A*02四聚體結合（圖21），其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖2）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖9）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R16P1C10的EC50為9.6 nM（圖16）。實施例 3 ： T 細胞受體 R16P1E8
TCR R16P1E8（SEQ ID NO：25-36和198）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖10）。
R16P1E8特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖3）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖10）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R16P1E8的EC50為~1 µM（圖17）。實施例 4 ： T 細胞受體 R17P1A9
TCR R17P1A9（SEQ ID NO：37-48和199）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖11）。
R17P1A9特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸取代變體（圖4）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖11）。NYESO1-001肽用作陰性對照。實施例 5 ： T 細胞受體 R17P1D7
TCR R17P1D7（SEQ ID NO：49-60和200）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖12）。
R17P1D7特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖5）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖12）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R17P1D7的EC50為1.83 nM（圖18）。實施例 6 ： T 細胞受體 R17P1G3
TCR R17P1G3（SEQ ID NO：61-72和201）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖13）。
R17P1G3特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖6）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖13）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R17P1G3的EC50為8.63 nM（圖19）。實施例 7 ： T 細胞受體 R17P2B6
TCR R17P2B6（SEQ ID NO：73-84和202）受限於HLA-A*02提呈的PRAME-004 (SEQ ID NO：97)（參見圖14）。
R17P2B6特異性識別PRAME-004，因為與HLA-A*02+靶細胞共同培養時再次表達該TCR的人原代 CD8+T細胞釋放IFNγ，其載有PRAME-004肽或PRAME-004肽的丙氨酸或蘇氨酸取代變體（圖7）或與PRAME-004具有高度序列相似性的不同肽（圖14）。NYESO1-001肽用作陰性對照。TCR R17P2B6的EC50為2.11 nM（圖20），並且對HLA-A*02-提呈的PRAME-004結合親和力(KD )為13 µM。實施例 8 ：增強 T 細胞受體 R11P3D3_KE
突變的「增強配對」TCR R11P3D3_KE 作為R11P3D3的變體引入，其中天然攜帶 αW44/βQ44的α和β可變結構域突變為αK44/βE44。該雙重突變選自PCT/EP2017/081745中的列表，透過引用特別併入。它專門設計用於恢復對TCR支架的最佳相互作用和形狀互補性。
與親本TCR R11P3D3相比，增強TCR R11P3D3_KE顯示出 PRAME-004識別的優異靈敏度。與親本TCR R11P3D3相比，增強TCR R11P3D3_KE對PRAME-004提呈腫瘤細胞系的應答更強（圖30）。此外，與R11P3D3相比，R11P3D3_KE的溶細胞活性更強（圖32）。如實施例1（R11P3D3，KD =18-26μM）和實施例8（R11P3D3_KE，KD =5.3μM）中所述，增強TCR R11P3D3_KE所觀察到的功能應答改善與對PRAME-004的結合親和性增加一致。
無
在以下實施例中將對本發明進一步進行說明，參照隨附圖表和序列，但是不僅限於此。為了本發明之目的，所有參考文獻均以完整引用的形式併入本文。在圖和序列中：
圖 1 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了幾種不同的供體。
圖 2 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R16P1C10（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了幾種不同的供體。
圖 3 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R16P1E8（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了幾種不同的供體。
圖 4 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-106) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1A9（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代變體（Ala_IFN-040和Ala_IFN-041）分析了不同的供體。
圖 5 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1D7（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了不同的供體。
圖 6 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1G3（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了不同的供體。
圖 7 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-115) 1-9位置(X1-X9)處的各種PRAME-004丙氨酸-或蘇氨酸-取代變體或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P2B6（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。針對丙氨酸取代（Ala_TCRA-0017和Ala_IFN-041）和蘇氨酸取代變體（Thr_TCRA-0036）分析了不同的供體。
圖 8 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-040和IFN-041。
圖 9 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R16P1C10（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-046和IFN-041。
圖 10 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R16P1E8（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-040和IFN-041。
圖 11 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1A9（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-040和IFN-041。
圖 12 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1D7（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-040和IFN-041。
圖 13 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P1G3（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-046和IFN-041。
圖 14 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或相似但不相關肽TMED9-001 (SEQ ID NO：116)、CAT-001 (SEQ ID NO：117)、DDX60L-001 (SEQ ID NO：118)、LRRC70-001 (SEQ ID NO：119)、PTPLB-001 (SEQ ID NO：120)、HDAC5-001 (SEQ ID NO：121)、VPS13B-002 (SEQ ID NO：122)、ZNF318-001 (SEQ ID NO：123)、CCDC51-001 (SEQ ID NO：124)或IFIT1-001 (SEQ ID NO：125)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R17P2B6（表1）的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。RNA電穿孔的CD8+T細胞單獨或與未載入靶細胞共孵育作為對照。分析了不同的供體IFN-040和IFN-041。
圖 15 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R11P3D3的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 16 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R16P1C10的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 17 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R16P1E8的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 18 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R17P1D7的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 19 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R17P1G3的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 20 ： 在用與載有PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)的T2靶細胞在10μM至10pM不同肽負載濃度中進行共同培養後，用TCR R17P2B6的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞的IFNγ釋放（表1）。用源自兩個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。分析了不同的供體TCRA-0003和TCRA-0017。
圖 21 ： 分別對TCR R16P1C10的α和β鏈RNA電穿孔的CD8+T細胞進行HLA-A*02/PRAME-004四聚體或HLA-A*02/NYESO1-001四聚體染色（表1）。與HLA-A*02/NYESO1-001複合體特異性結合的1G4TCR (SEQ ID:85-96)的RNA電穿孔的CD8+T細胞和模擬電穿孔 CD8+T細胞作為對照。
圖 22 ： 在用載有100 nM PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或類似（與3、5、6和7位置的PRAME-004相同）但不相關肽ACPL-001 (SEQ ID NO：139)、HSPB3-001 (SEQ ID NO：140)、UNC7-001 (SEQ ID NO：141)、SCYL2-001 (SEQ ID NO：142)、RPS2P8-001 (SEQ ID NO：143)、PCNXL3-003 (SEQ ID NO：144)、AQP6-001 (SEQ ID NO：145)、PCNX-001 (SEQ ID NO：146)、AQP6-002 (SEQ ID NO：147)、TRGV10-001 (SEQ ID NO：148)、NECAP1-001 (SEQ ID NO：149)或FBXW2-001 (SEQ ID NO：150)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞（D103805和D191451）或未轉導細胞（D103805 NT和D191451 NT）的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體D103805和D191451的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 23 ： 在用與載有100nM PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或類似（與3、5、6和7位置的PRAME-004相同）但不相關肽(SEQ ID NO：151-195)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體TCRA-0087和TCRA-0088的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 24 ： 在用不同的原代細胞（HCASMC（冠狀動脈平滑肌細胞））、HTSMC（氣管平滑肌細胞）、HRCEpC（腎皮質上皮細胞）、HCM（心肌細胞）、HCMEC（心臟微血管內皮細胞）、HSAEpC（小氣道上皮細胞）、HCF（心臟成纖維細胞））和iPSC衍生細胞類型（HN（神經元）、iHCM（心肌細胞）、HH（肝細胞）、HA（星形細胞））進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞（D103805和D191451）或未轉導細胞（D103805 NT和D191451 NT）的IFNγ釋放。腫瘤細胞系UACC-257（PRAME-004高）、Hs695T（PRAME-004中）、U266B1（PRAME-004極低）和MCF-7（無PRAME-004）提呈每種細胞的不同量PRAME-004。僅用T細胞作為對照。用源自兩個不同健康供體D103805和D191451的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 25 ： 在用不同的原代細胞（NHEK（表皮角質形成細胞）、HBEpC（支氣管上皮細胞）、HDMEC（真皮微血管內皮細胞）、HCAEC（冠狀動脈內皮細胞）、HAoEC（主動脈內皮細胞）、HPASMC（肺動脈平滑肌細胞）、HAoSMC（主動脈平滑肌細胞），HPF（肺成纖維細胞）、SkMC（骨骼肌細胞）、HOB（成骨細胞）、HCH（軟骨細胞）、HWP（白色前脂肪細胞）、hMSC-BM（間充質幹細胞）、NHDF（真皮成纖維細胞）進行共同培養後，用TCR R11P3D3（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞的IFNγ釋放。腫瘤細胞系UACC-257（PRAME-004高）、Hs695T（PRAME-004中）、U266B1（PRAME-004極低）和MCF-7（無PRAME-004）提呈每種細胞的不同拷貝 PRAME-004。僅用T細胞作為對照。用源自兩個不同健康供體TCRA-0084和TCRA-0085的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 26 ： 在用載有100nM PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或類似（與3、5、6和7位置的PRAME-004相同）但不相關肽ACPL-001 (SEQ ID NO：139)、HSPB3-001 (SEQ ID NO：140)、UNC7-001 (SEQ ID NO：141)、SCYL2-001 (SEQ ID NO：142)、RPS2P8-001 (SEQ ID NO：143)、PCNXL3-003 (SEQ ID NO：144)、AQP6-001 (SEQ ID NO：145)、PCNX-001 (SEQ ID NO：146)、AQP6-002 (SEQ ID NO：147)、TRGV10-001 (SEQ ID NO：148)、NECAP1-001 (SEQ ID NO：149)或FBXW2-001 (SEQ ID NO：150)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用增強TCR R11P3D3_KE（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞（D103805和D191451）或未轉導細胞（D103805 NT和D191451 NT）的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體D103805和D191451的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 27 ： 在用與載有100nM PRAME-004肽(SEQ ID NO：97)或類似（與3、5、6和7位置的PRAME-004相同）但不相關肽(SEQ ID NO：151-195)或對照肽NYESO1-001 (SEQ ID NO：126)的T2靶細胞進行共同培養後，用增強TCR R11P3D3_KE（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自兩個不同健康供體TCRA-0087和TCRA-0088的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 28 ： 在用不同的原代細胞（HCASMC（冠狀動脈平滑肌細胞））、HTSMC（氣管平滑肌細胞）、HRCEpC（腎皮質上皮細胞）、HCM（心肌細胞）、HCMEC（心臟微血管內皮細胞）、HSAEpC（小氣道上皮細胞）、HCF（心臟成纖維細胞））和iPSC衍生細胞類型（HN（神經元）、iHCM（心肌細胞）、HH（肝細胞）、HA（星形細胞））進行共同培養後，用增強TCR R11P3D3_KE（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞（D103805和D191451）或未轉導細胞（D103805 NT和D191451 NT）的IFNγ釋放。腫瘤細胞系UACC-257（PRAME-004高）、Hs695T（PRAME-004中）、U266B1（PRAME-004極低）和MCF-7（無PRAME-004）提呈每種細胞的不同量PRAME-004。僅用T細胞作為對照。用源自兩個不同健康供體D103805和D191451的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 29 ： 在用不同的原代細胞（NHEK（表皮角質形成細胞）、HBEpC（支氣管上皮細胞）、HDMEC（真皮微血管內皮細胞）、HCAEC（冠狀動脈內皮細胞）、HAoEC（主動脈內皮細胞）、HPASMC（肺動脈平滑肌細胞）、HAoSMC（主動脈平滑肌細胞），HPF（肺成纖維細胞）、SkMC（骨骼肌細胞）、HOB（成骨細胞）、HCH（軟骨細胞）、HWP（白色前脂肪細胞）、hMSC-BM（間充質幹細胞）、NHDF（真皮成纖維細胞）進行共同培養後，用增強TCR R11P3D3_KE（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞的IFNγ釋放。腫瘤細胞系UACC-257（PRAME-004高）、Hs695T（PRAME-004中）、U266B1（PRAME-004極低）和MCF-7（無PRAME-004）提呈每種細胞的不同拷貝 PRAME-004。僅用T細胞作為對照。用源自兩個不同健康供體TCRA-0084和TCRA-0085的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 30 ： 在用每種細胞提呈不同量PRAME-004的腫瘤細胞系UACC-257（PRAME-004高）、Hs695T（PRAME-004中）、U266B1（PRAME-004極低）和MCF-7（無PRAME-004）進行共同培養後，用TCR R11P3D3或增強TCR R11P3D3_KE（表1）慢病毒轉導的CD8+T細胞或未轉導細胞的IFNγ釋放。僅用T細胞作為對照。兩種TCR的IFNγ釋放與PRAME-004提呈相關，且與R11P3D3相比，R11P3D3_KE 誘導更高的應答。
圖 31 ： 在用與載有SEQ ID NO：97 (SEQ ID NO：98-106) 1-9位置(A1-A9)處的各種PRAME-004丙氨酸取代變體的T2靶細胞進行共同培養後，用增強TCR TCR R11P3D3_KE（表1）細胞慢病毒轉導的CD8+T細胞的IFNγ釋放。用源自三個不同健康供體的CD8+T細胞獲得IFNγ釋放數據。
圖 32 ： 效力測定，評估表達TCR R11P3D3或增強TCR R11P3D3_KE的慢病毒轉導T細胞針對PRAME-004+腫瘤細胞的細胞溶解活性。針對A-375（PRAME-004 低）或U2OS（PRAME-004中）腫瘤細胞測得的R11P3D3和R11P3D3_KE轉導的和未轉導 (NT)T細胞的細胞毒性應答。測定在基於72小時螢光顯微鏡檢查的細胞毒性測定中進行。結果顯示隨著時間推移腫瘤生長呈倍數增加。
表 1 ：本發明的 TCR 序列
SEQ ID NO ： TCR 鏈 區域 序列
1 R11P3D3 α CDR1 SSNFYA
2 R11P3D3 α CDR2 MTL
3 R11P3D3 α CDR3 CALYNNNDMRF
4 R11P3D3 α 可變結構域 MEKNPLAAPLLILWFHLDCVSSILNVEQSPQSLHVQEGDSTNFTCSFPSSNFYALHWYRWETAKSPEALFVMTLNGDEKKKGRISATLNTKEGYSYLYIKGSQPEDSATYLCALYNNNDMRFGAGTRLTVKP
5 R11P3D3 α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
6 R11P3D3 α 全長 MEKNPLAAPLLILWFHLDCVSSILNVEQSPQSLHVQEGDSTNFTCSFPSSNFYALHWYRWETAKSPEALFVMTLNGDEKKKGRISATLNTKEGYSYLYIKGSQPEDSATYLCALYNNNDMRFGAGTRLTVKPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
7 R11P3D3 β CDR1 SGHNS
8 R11P3D3 β CDR2 FNNNVP
9 R11P3D3 β CDR3 CASSPGSTDTQYF
10 R11P3D3 β 可變結構域 MDSWTFCCVSLCILVAKHTDAGVIQSPRHEVTEMGQEVTLRCKPISGHNSLFWYRQTMMRGLELLIYFNNNVPIDDSGMPEDRFSAKMPNASFSTLKIQPSEPRDSAVYFCASSPGSTDTQYFGPGTRLTVL
11 R11P3D3 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
12 R11P3D3 β 全長 MDSWTFCCVSLCILVAKHTDAGVIQSPRHEVTEMGQEVTLRCKPISGHNSLFWYRQTMMRGLELLIYFNNNVPIDDSGMPEDRFSAKMPNASFSTLKIQPSEPRDSAVYFCASSPGSTDTQYFGPGTRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
13 R16P1C10 α CDR1 DRGSQS
14 R16P1C10 α CDR2 IY
15 R16P1C10 α CDR3 CAAVISNFGNEKLTF
16 R16P1C10 α 可變結構域 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMFIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAAVISNFGNEKLTFGTGTRLTIIP
17 R16P1C10 α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
18 R16P1C10 α 全長 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMFIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAAVISNFGNEKLTFGTGTRLTIIPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
19 R16P1C10 β CDR1 SGHRS
20 R16P1C10 β CDR2 YFSETQ
21 R16P1C10 β CDR3 CASSPWDSPNEQYF
22 R16P1C10 β 可變結構域 MGSRLLCWVLLCLLGAGPVKAGVTQTPRYLIKTRGQQVTLSCSPISGHRSVSWYQQTPGQGLQFLFEYFSETQRNKGNFPGRFSGRQFSNSRSEMNVSTLELGDSALYLCASSPWDSPNEQYFGPGTRLTVT
23 R16P1C10 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
24 R16P1C10 β 全長 MGSRLLCWVLLCLLGAGPVKAGVTQTPRYLIKTRGQQVTLSCSPISGHRSVSWYQQTPGQGLQFLFEYFSETQRNKGNFPGRFSGRQFSNSRSEMNVSTLELGDSALYLCASSPWDSPNEQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
25 R16P1E8 α CDR1 NSAFQY
26 R16P1E8 α CDR2 TY
27 R16P1E8 α CDR3 CAMSEAAGNKLTF
28 R16P1E8 α 可變結構域 MMKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQDPGPLSVPEGAIVSLNCTYSNSAFQYFMWYRQYSRKGPELLMYTYSSGNKEDGRFTAQVDKSSKYISLFIRDSQPSDSATYLCAMSEAAGNKLTFGGGTRVLVKP
29 R16P1E8 α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
30 R16P1E8 α 全長 MMKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQDPGPLSVPEGAIVSLNCTYSNSAFQYFMWYRQYSRKGPELLMYTYSSGNKEDGRFTAQVDKSSKYISLFIRDSQPSDSATYLCAMSEAAGNKLTFGGGTRVLVKPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
31 R16P1E8 β CDR1 SGHAT
32 R16P1E8 β CDR2 FQNNGV
33 R16P1E8 β CDR3 CASSYTNQGEAFF
34 R16P1E8 β 可變結構域 MGTRLLCWAALCLLGAELTEAGVAQSPRYKIIEKRQSVAFWCNPISGHATLYWYQQILGQGPKLLIQFQNNGVVDDSQLPKDRFSAERLKGVDSTLKIQPAKLEDSAVYLCASSYTNQGEAFFGQGTRLTVV
35 R16P1E8 β 恒定結構域 EDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF
36 R16P1E8 β 全長 MGTRLLCWAALCLLGAELTEAGVAQSPRYKIIEKRQSVAFWCNPISGHATLYWYQQILGQGPKLLIQFQNNGVVDDSQLPKDRFSAERLKGVDSTLKIQPAKLEDSAVYLCASSYTNQGEAFFGQGTRLTVVEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF
37 R17P1A9 α CDR1 DRGSQS
38 R17P1A9 α CDR2 IY
39 R17P1A9 α CDR3 CAVLNQAGTALIF
40 R17P1A9 α 可變結構域 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMSIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVLNQAGTALIFGKGTTLSVSS
41 R17P1A9 α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
42 R17P1A9 α 全長 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMSIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVLNQAGTALIFGKGTTLSVSSNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
43 R17P1A9 β CDR1 SGDLS
44 R17P1A9 β CDR2 YYNGEE
45 R17P1A9 β CDR3 CASSAETGPWLGNEQFF
46 R17P1A9 β 可變結構域 MGFRLLCCVAFCLLGAGPVDSGVTQTPKHLITATGQRVTLRCSPRSGDLSVYWYQQSLDQGLQFLIQYYNGEERAKGNILERFSAQQFPDLHSELNLSSLELGDSALYFCASSAETGPWLGNEQFFGPGTRLTVL
47 R17P1A9 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
48 R17P1A9 β 全長 MGFRLLCCVAFCLLGAGPVDSGVTQTPKHLITATGQRVTLRCSPRSGDLSVYWYQQSLDQGLQFLIQYYNGEERAKGNILERFSAQQFPDLHSELNLSSLELGDSALYFCASSAETGPWLGNEQFFGPGTRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
49 R17P1D7 α CDR1 TSESDYY
50 R17P1D7 α CDR2 QEAY
51 R17P1D7 α CDR3 CAYRWAQGGSEKLVF
52 R17P1D7 α 可變結構域 MACPGFLWALVISTCLEFSMAQTVTQSQPEMSVQEAETVTLSCTYDTSESDYYLFWYKQPPSRQMILVIRQEAYKQQNATENRFSVNFQKAAKSFSLKISDSQLGDAAMYFCAYRWAQGGSEKLVFGKGTKLTVNP
53 R17P1D7 α 恒定結構域 YIQKPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
54 R17P1D7 α 全長 MACPGFLWALVISTCLEFSMAQTVTQSQPEMSVQEAETVTLSCTYDTSESDYYLFWYKQPPSRQMILVIRQEAYKQQNATENRFSVNFQKAAKSFSLKISDSQLGDAAMYFCAYRWAQGGSEKLVFGKGTKLTVNPYIQKPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
55 R17P1D7 β CDR1 MGHDK
56 R17P1D7 β CDR2 SYGVNS
57 R17P1D7 β CDR3 CATELWSSGGTGELFF
58 R17P1D7 β 可變結構域 MTIRLLCYMGFYFLGAGLMEADIYQTPRYLVIGTGKKITLECSQTMGHDKMYWYQQDPGMELHLIHYSYGVNSTEKGDLSSESTVSRIRTEHFPLTLESARPSHTSQYLCATELWSSGGTGELFFGEGSRLTVL
59 R17P1D7 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
60 R17P1D7 β 全長 MTIRLLCYMGFYFLGAGLMEADIYQTPRYLVIGTGKKITLECSQTMGHDKMYWYQQDPGMELHLIHYSYGVNSTEKGDLSSESTVSRIRTEHFPLTLESARPSHTSQYLCATELWSSGGTGELFFGEGSRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
61 R17P1G3 α CDR1 DRGSQS
62 R17P1G3 α CDR2 IY
63 R17P1G3 α CDR3 CAVGPSGTYKYIF
64 R17P1G3 α 可變結構域 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMSIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVGPSGTYKYIFGTGTRLKVLA
65 R17P1G3 α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
66 R17P1G3 α 全長 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMSIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVGPSGTYKYIFGTGTRLKVLANIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
67 R17P1G3 β CDR1 MNHEY
68 R17P1G3 β CDR2 SMNVEV
69 R17P1G3 β CDR3 CASSPGGSGNEQFF
70 R17P1G3 β 可變結構域 MGPQLLGYVVLCLLGAGPLEAQVTQNPRYLITVTGKKLTVTCSQNMNHEYMSWYRQDPGLGLRQIYYSMNVEVTDKGDVPEGYKVSRKEKRNFPLILESPSPNQTSLYFCASSPGGSGNEQFFGPGTRLTVL
71 R17P1G3 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
72 R17P1G3 β 全長 MGPQLLGYVVLCLLGAGPLEAQVTQNPRYLITVTGKKLTVTCSQNMNHEYMSWYRQDPGLGLRQIYYSMNVEVTDKGDVPEGYKVSRKEKRNFPLILESPSPNQTSLYFCASSPGGSGNEQFFGPGTRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
73 R17P2B6 α CDR1 DRGSQS
74 R17P2B6 α CDR2 IY
75 R17P2B6 α CDR3 CAVVSGGGADGLTF
76 R17P2B6 α 可變結構域 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMFIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVVSGGGADGLTFGKGTHLIIQP
77 R17P2B6 α 恒定結構域 YIQKPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
78 R17P2B6 α 全長 MKSLRVLLVILWLQLSWVWSQQKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSQSFFWYRQYSGKSPELIMFIYSNGDKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVVSGGGADGLTFGKGTHLIIQPYIQKPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
79 R17P2B6 β CDR1 PRHDT
80 R17P2B6 β CDR2 FYEKMQ
81 R17P2B6 β CDR3 CASSLGRGGQPQHF
82 R17P2B6 β 可變結構域 MLSPDLPDSAWNTRLLCHVMLCLLGAVSVAAGVIQSPRHLIKEKRETATLKCYPIPRHDTVYWYQQGPGQDPQFLISFYEKMQSDKGSIPDRFSAQQFSDYHSELNMSSLELGDSALYFCASSLGRGGQPQHFGDGTRLSIL
83 R17P2B6 β 恒定結構域 EDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF
84 R17P2B6 β 全長 MLSPDLPDSAWNTRLLCHVMLCLLGAVSVAAGVIQSPRHLIKEKRETATLKCYPIPRHDTVYWYQQGPGQDPQFLISFYEKMQSDKGSIPDRFSAQQFSDYHSELNMSSLELGDSALYFCASSLGRGGQPQHFGDGTRLSILEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF
85 1G4 α CDR1 DSAIYN
86 1G4 α CDR2 IQS
87 1G4 α CDR3 CAVRPTSGGSYIPTF
88 1G4 α 可變結構域 METLLGLLILWLQLQWVSSKQEVTQIPAALSVPEGENLVLNCSFTDSAIYNLQWFRQDPGKGLTSLLLIQSSQREQTSGRLNASLDKSSGRSTLYIAASQPGDSATYLCAVRPTSGGSYIPTFGRGTSLIVHP
89 1G4 α 恒定結構域 YIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
90 1G4 α 全長 METLLGLLILWLQLQWVSSKQEVTQIPAALSVPEGENLVLNCSFTDSAIYNLQWFRQDPGKGLTSLLLIQSSQREQTSGRLNASLDKSSGRSTLYIAASQPGDSATYLCAVRPTSGGSYIPTFGRGTSLIVHPYIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
91 1G4 β CDR1 MNHEY
92 1G4 β CDR2 SVGAGI
93 1G4 β CDR3 CASSYVGNTGELFF
94 1G4 β 可變結構域 MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSYVGNTGELFFGEGSRLTVL
95 1G4 β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
96 1G4 β 全長 MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSYVGNTGELFFGEGSRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
127 R11P3D3_KE α CDR1 SSNFYA 
128 R11P3D3_KE α CDR2 MTL
129 R11P3D3_KE α CDR3 CALYNNNDMRF
130 R11P3D3_KE α 可變結構域 MEKNPLAAPLLILWFHLDCVSSILNVEQSPQSLHVQEGDSTNFTCSFPSSNFYALHWYRKETAKSPEALFVMTLNGDEKKKGRISATLNTKEGYSYLYIKGSQPEDSATYLCALYNNNDMRFGAGTRLTVKP
131 R11P3D3_KE α 恒定結構域 NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
132 R11P3D3_KE α 全長 MEKNPLAAPLLILWFHLDCVSSILNVEQSPQSLHVQEGDSTNFTCSFPSSNFYALHWYRKETAKSPEALFVMTLNGDEKKKGRISATLNTKEGYSYLYIKGSQPEDSATYLCALYNNNDMRFGAGTRLTVKPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
133 R11P3D3_KE β CDR1 SGHNS
134 R11P3D3_KE β CDR2 FNNNVP
135 R11P3D3_KE β CDR3 CASSPGSTDTQYF
136 R11P3D3_KE β 可變結構域 MDSWTFCCVSLCILVAKHTDAGVIQSPRHEVTEMGQEVTLRCKPISGHNSLFWYRETMMRGLELLIYFNNNVPIDDSGMPEDRFSAKMPNASFSTLKIQPSEPRDSAVYFCASSPGSTDTQYFGPGTRLTVL
137 R11P3D3_KE β 恒定結構域 EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
138 R11P3D3_KE β 全長 MDSWTFCCVSLCILVAKHTDAGVIQSPRHEVTEMGQEVTLRCKPISGHNSLFWYRETMMRGLELLIYFNNNVPIDDSGMPEDRFSAKMPNASFSTLKIQPSEPRDSAVYFCASSPGSTDTQYFGPGTRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG
196 R11P3D3 α CDR2bis MTLNGDE
197 R16P1C10 α CDR2bis IYSNGD
198 R16P1E8 α CDR2bis TYSSGN
199 R17P1A9 α CDR2bis IYSNGD
200 R17P1D7 α CDR2bis QEAYKQQ
201 R17P1G3 α CDR2bis IYSNGD
202 R17P2B6 α CDR2bis IYSNGD
203 1G4 α CDR2bis IQSSQRE
204 R11P3D3_KE α CDR2bis MTLNGDE
表 2 ：本發明的肽序列
肽代碼 序列 SEQ ID NO ：
PRAME-004 SLLQHLIGL 97
PRAME-004_A1 ALLQHLIGL 98
PRAME-004_A2 SALQHLIGL 99
PRAME-004_A3 SLAQHLIGL 100
PRAME-004_A4 SLLAHLIGL 101
PRAME-004_A5 SLLQALIGL 102
PRAME-004_A6 SLLQHAIGL 103
PRAME-004_A7 SLLQHLAGL 104
PRAME-004_A8 SLLQHLIAL 105
PRAME-004_A9 SLLQHLIGA 106
PRAME-004_T1 TLLQHLIGL 107
PRAME-004_T2 STLQHLIGL 108
PRAME-004_T3 SLTQHLIGL 109
PRAME-004_T4 SLLTHLIGL 110
PRAME-004_T5 SLLQTLIGL 111
PRAME-004_T6 SLLQHTIGL 112
PRAME-004_T7 SLLQHLTGL 113
PRAME-004_T8 SLLQHLITL 114
PRAME-004_T9 SLLQHLIGT 115
TMED9-001 SILQTLILV 116
CAT-001 SLIEHLQGL 117
DDX60L-001 SLIQHLEEI 118
LRRC70-001 SLLKNLIYL 119
PTPLB-001 SLLNHLPYL 120
HDAC5-001 SLLQHVLLL 121
VPS13B-002 SLLQKQIML 122
ZNF318-001 SLSQELVGV 123
CCDC51-001 SVLGALIGV 124
IFIT1-001 VLLHHQIGL 125
NYESO1-001 SLLMWITQV 126
ACPL-001 LLLVHLIPV 139
HSPB3-001 IILRHLIEI 140
UNC7-001 KILLHLIHI 141
SCYL2-001 KVLPHLIPL 142
RPS2P8-001 SALVHLIPV 143
PCNXL3-003 NALVHLIEV 144
AQP6-001 VALGHLIGI 145
PCNX-001 NALVHLIEI 146
AQP6-002 WALGHLIGI 147
TRGV10-001 QALEHLIYI 148
NECAP1-001 ISLAHLILV 149
FBXW2-001 ETLDHLISL 150
ACCSL-001 ALLSHLICR 151
ACER1-001 KELRHLIEV 152
ADAMTS14-001 IALVHLIMV 153
ARHGAP17-001 CWLCHLIKL 154
ARSE-001 GKLTHLIPV 155
ATP-009 HLLMHLIGS 156
AUNI-001 TQLDHLIPG 157
C16orf96-001 QDLWHLIKL 158
CDC7-002 IALKHLIPT 159
CDC7-003 IALKHLILT 160
CHRNA1-001 LQLIHLINV 161
FASTKD5-001 SQLVHLIYV 162
FRYL-002 CLLPHLIQH 163
FTH1-001 MVLVHLIHS 164
HERC4-002 SDLFHLIGV 165
HPS5-001 KLLFHLIQS 166
HPS5-002 KLLLHLIQS 167
HTR2C-001 SFLVHLIGL 168
IPM-001 YGLKHLISV 169
KIF16-001 SELPHLIGI 170
KLHL33-001 YALSHLIHA 171
LAMA3-001 TLLGHLISK 172
LOC100128170-001 SQLSHLIAM 173
MAP2K7-001 FFLVHLICM 174
MON2-003 VSLHHLINA 175
OR2AK2-001 IMLIHLIRL 176
OR2AK2-002 ITLIHLIRL 177
OR2B6-001 SELFHLIPL 178
OR2B6-002 SVLFHLIPL 179
OTUD7A-001 AQLAHLILS 180
OVOS2-001 FLLGHLIPR 181
PIGC-002 MLLGHLIFF 182
RAD54L2-003 VLLFHLIEE 183
RASEF-001 VFLRHLITL 184
RASGRF1-003 TLLDHLIFK 185
RPS2P20-001 SVLVHLIPA 186
SACS-001 AKLEHLIYL 187
SPATA31D5-001 SLLPHLILS 188
TPST2-001 SILGHLICS 189
TRGV10-002 QSLEHLIYI 190
UGP-001 YILNHLINP 191
USP51-001 YKLLHLIWI 192
ZNF423-002 KLLCHLIEH 193
ZNF584-001 ALLDHLITH 194
ZNF99-001 FMLSHLIQH 195
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Claims (36)

  1. 一種T細胞受體(TCR)分子，包含如SEQ ID NO：132所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：138所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：132所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：138所述的一TCR β鏈所組成。
  2. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：6所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：12所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：6所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：12所述的一TCR β鏈所組成。
  3. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：18所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：14所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：18所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：14所述的一TCR β鏈所組成。
  4. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：30所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：36所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：30所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：36所述的一TCR β鏈所組成。
  5. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：42所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：48所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：42所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：48所述的一TCR β鏈所組成。
  6. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：54所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：60所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：54所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：60所述的一TCR β鏈所組成。
  7. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：66所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：72所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：66所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：72所述的一TCR β鏈所組成。
  8. 一種TCR分子，包含如SEQ ID NO：78所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：84所述的一TCR β鏈，或由如SEQ ID NO：78所述的一TCR α鏈及如SEQ ID NO：84所述的一TCR β鏈所組成。
  9. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項1所述的TCR分子。
  10. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項2所述的TCR分子。
  11. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項3所述的TCR分子。
  12. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項4所述的TCR分子。
  13. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項5所述的TCR分子。
  14. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項6所述的TCR分子。
  15. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項7所述的TCR分子。
  16. 一種核酸或兩分開的核酸，其編碼如請求項8所述的TCR分子。
  17. 一種載體，其包含如請求項9所述的核酸或兩分開的核酸。
  18. 一種載體，其包含如請求項10所述的核酸或兩分開的核酸。
  19. 一種載體，其包含如請求項11所述的核酸或兩分開的核酸。
  20. 一種載體，其包含如請求項12所述的核酸或兩分開的核酸。
  21. 一種載體，其包含如請求項13所述的核酸或兩分開的核酸。
  22. 一種載體，其包含如請求項14所述的核酸或兩分開的核酸。
  23. 一種載體，其包含如請求項15所述的核酸或兩分開的核酸。
  24. 一種載體，其包含如請求項16所述的核酸或兩分開的核酸。
  25. 一種宿主細胞，其包含如請求項1所述的TCR分子、如請求項9所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項17所述的載體。
  26. 一種宿主細胞，其包含如請求項2所述的TCR分子、如請求項10所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項18所述的載體。
  27. 一種宿主細胞，其包含如請求項3所述的TCR分子、如請求項11所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項19所述的載體。
  28. 一種宿主細胞，其包含如請求項4所述的TCR分子、如請求項12所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項20所述的載體。
  29. 一種宿主細胞，其包含如請求項5所述的TCR分子、如請求項13所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項21所述的載體。
  30. 一種宿主細胞，其包含如請求項6所述的TCR分子、如請求項14所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項22所述的載體。
  31. 一種宿主細胞，其包含如請求項7所述的TCR分子、如請求項15所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項23所述的載體。
  32. 一種宿主細胞，其包含如請求項8所述的TCR分子、如請求項16所述的核酸或兩分開的核酸或如請求項24所述的載體。
  33. 一種藥物組合物，其包含如請求項1至8中任一項所述的TCR分子，或如請求項9至16中任一項所述的核酸或兩分開的核酸，或如請求項17至24中任一項所述的載體，或如請求項25至32中任一項所述的宿主細胞，以及一藥用載體、穩定劑及/或賦形劑。
  34. 一種如請求項1至8中任一項所述的TCR分子或如請求項9至16中任一項所述的核酸或如請求項17至24中任一項所述的載體或如請求項25至32中任一項所述的宿主細胞或如請求項33所述的藥物組合物在製備用於診斷、預防及/或治療一種增殖性疾病之藥物的用途。
  35. 一種製備表達腫瘤相關抗原(TAA)特異性TCR分子的細胞株的方法，該方法包括： a.   提供一合適的宿主細胞; b.   提供一基因構建體，其包含編碼如請求項1至8中任一項所述的TCR分子的一編碼序列； c.   將該基因構建體引入該合適的宿主細胞；以及 d.   由該合適的宿主細胞表達該基因構建體。
  36. 如請求項35所述的方法，進一步包括從該合適的宿主細胞分離和純化抗原識別構建體，以及在T細胞中重構所述TCR分子。
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