TW202016317A - 抗體藥物結合物之感受性標記 - Google Patents

抗體藥物結合物之感受性標記 Download PDF

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Abstract

本發明提供一種方法，其在罹患癌的人類患者中，在投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之際，將於mRNA層級的基因表現量作為指標而辨識投予對象。 本發明係關於在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，該方法包含:從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟；評價在該活體樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟；在hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟；及將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體的醫藥的對象之步驟。又，該方法包含從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟；評價在該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量之步驟；及將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。

Description

抗體藥物結合物之感受性標記
本發明係關於在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗體藥物結合物之醫藥的對象之方法。
幾乎所有的抗癌劑雖對特定的人類患者具有效果，但對其他人類患者不具效果。此係因癌的遺傳多樣性，有時甚至在同一患者內的癌之間亦會觀察到此情況。每個患者的藥效差異在分子標靶型抗癌劑中特別顯著。因此，必須進行用於決定任一抗癌劑對任一患者是否有效的適當檢查，且無法不進行此種檢查便期待抗癌劑的充分藥效。基於感受性標記的表現之診斷法的確立，係藉由預先特定對新抗癌劑顯示臨床反應的可能性高之患者，而成為加速開發該抗癌劑的手段。藉此，變得能明顯地降低臨床試驗的規模、期間及費用。基因體學、蛋白質體學或分子影像學的技術應能迅速且高感度地偵測感受性標記。但是，不論是否能利用關於癌的基因剖析之各種技術，皆難以稱抗癌劑的感受性標記處於被廣泛實用化的範圍。
作為上述的分子標靶型抗癌劑之標的，可列舉例如人類TROP2。人類TROP2(滋養層細胞表面蛋白質2(trophoblast cell surface protein 2))、TACSTD2：腫瘤相關鈣訊號傳導蛋白2(tumor-associated calcium signal transducer 2)、GA733-1、EGP-1、M1S1；以下，標記為hTROP2)係包含323個胺基酸殘基之單次跨膜的I型細胞膜蛋白質。
藉由使用臨床檢體的免疫組織化學分析，hTROP2顯示在各種源自上皮細胞的癌中過度表現，且在正常組織中僅在幾種組織的上皮細胞表現，其表現量亦低於腫瘤組織(非專利文獻1～5)。又，hTROP2的表現亦被報告指出在大腸癌(非專利文獻1)、胃癌(非專利文獻2)、胰臟癌(非專利文獻3)、口腔癌(非專利文獻4)、神經膠質瘤(非專利文獻5)中與預後不良相關。再者，有報告指出從使用大腸癌細胞的模式， hTROP2的表現與癌細胞的不依賴支架(non-scaffold dependent)細胞增殖及免疫不全小鼠的腫瘤形成相關聯(非專利文獻6)。
由此種暗示與癌的關聯性之資訊，目前為止樹立了多種抗hTROP2抗體，並正探討其抗腫瘤效果。在此之中，除了抗體單獨顯示在nu/nu小鼠異種移植模式中之抗腫瘤活性者(專利文獻1～4)以外，亦有揭示作為抗體藥物結合物而顯示抗腫瘤活性者(專利文獻5～7)等。然而，該等的活性的強度及適用範圍尚未充分，仍存在將hTROP2作為治療標的之未充足醫療需求。作為現有的抗體或抗體藥物結合物未滿足醫療需要的原因，除了作為醫藥的效果不充分，還可舉出未找到適當的感受性標記之點。例如，已知在小細胞肺癌中，無法藉由hTROP2的表現量預測將hTROP2作為標的之抗體藥物結合物所顯示的抗腫瘤活性(非專利文獻7)。
使與表現在癌細胞表面且可內化至細胞之抗原結合的抗體與具有細胞毒性的藥物結合而成之抗體藥物結合物(Antibody-Drug Conjugate；以下，亦稱為「ADC」)，係藉由將藥物選擇性地送達至癌細胞，而可期待使藥物累積在癌細胞內，且使癌細胞滅絕。作為此種抗體藥物結合物之一，已知有將抗體與為拓樸異構酶I抑制劑之依喜替康(exatecan)的衍生物作為構成要素的抗體藥物結合物(專利文獻9～15、非專利文獻8～16)。專利文獻9所記載之抗體藥物結合物含有抗hTROP2抗體，能使表現hTROP2抗體的癌細胞滅絕，但與現有的將hTROP2作為標的之抗體或抗體藥物結合物同樣地，有僅藉由hTROP2的表現量無法正確地預測抗腫瘤活性的可能性。
人類SLFN11(Schlafen family member 11)係包含901個胺基酸殘基之蛋白質，且對DNA複製壓力進行反應而與複製叉結合，被暗示具有阻礙DNA複製的功能(非專利文獻17)。又，亦指出癌細胞株對於包含拓樸異構酶I抑制劑的DNA障礙型抗癌劑之感受性、與SLFN11的mRNA表現量高度相關(非專利文獻18～19)。又，已知為聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制劑之維利帕尼(veliparib)及為抗DLL3抗體藥物結合物之特西諾瓦單抗(rovalpituzumab tesirine)(Rova-T)的併用係對於高表現SLFN11的小細胞肺癌患者具有延長壽命效果(非專利文獻20)。再者，亦已知為烷基化劑之替莫唑胺(Temozolomide)及維利帕尼的併用係對對高表現SLFN11的小細胞肺癌患者具有延長壽命效果(非專利文獻21)。然而，由使用依喜替康等拓樸異構酶I抑制劑的ADC所致之抗腫瘤活性與SLFN11的表現量之關係尚未明確，作為預測藥效的診斷藥之有效性亦不明確。 [先前技術文獻] [專利文獻]
[專利文獻1]國際公開第2008/144891號 [專利文獻2]國際公開第2011/145744號 [專利文獻3]國際公開第2011/155579號 [專利文獻4]國際公開第2013/077458號 [專利文獻5]國際公開第2003/074566號 [專利文獻6]國際公開第2011/068845號 [專利文獻7]國際公開第2013/068946號 [專利文獻8]美國專利第7999083號說明書 [專利文獻9]國際公開第2014/057687號 [專利文獻10]國際公開第2014/061277號 [專利文獻11]國際公開第2015/098099號 [專利文獻12]國際公開第2015/115091號 [專利文獻13]國際公開第2015/146132號 [專利文獻14]國際公開第2015/155976號 [專利文獻15]國際公開第2015/155998號
[非專利文獻] [非專利文獻1]Ohmachi T, et al., Clin. Cancer Res., 12(10), 3057-3063 (2006). [非專利文獻2]Muhlmann G, et al., J. Clin. Pathol., 62(2), 152-158 (2009). [非專利文獻3]Fong D, et al., Br. J. Cancer, 99(8), 1290-1295 (2008). [非專利文獻4]Fong D, et al., Mod. Pathol., 21(2), 186-191 (2008). [非專利文獻5]Ning S, et al., Neurol. Sci., 34(10), 1745-1750 (2013). [非專利文獻6]Wang J, et al., Mol. Cancer Ther., 7(2), 280-285 (2008). [非專利文獻7]Gray J. E., et al. Clin. Cancer Res. 23(19), 5711-5719 (2017) [非專利文獻8]Ducry, L., et al., Bioconjugate Chem. (2010) 21, 5-13. [非專利文獻9]Alley, S. C., et al., Current Opinion in Chemical Biology (2010) 14, 529-537. [非專利文獻10]Damle N. K. Expert Opin. Biol. Ther. (2004) 4, 1445-1452. [非專利文獻11]Senter P. D., et al., Nature Biotechnology (2012) 30, 631-637. [非專利文獻12]Howard A. et al., J Clin Oncol 29: 398-405. [非專利文獻13]Ogitani Y. et al., Clinical Cancer Research (2016) 22(20), 5097-5108. [非專利文獻14]Ogitani Y. et al., Cancer Science (2016) 107, 1039-1046. [非專利文獻15]Doi T, et al., Lancet Oncol 2017; 18: 1512-22. [非專利文獻16]Takegawa N, et al., Int. J. Cancer: 141, 1682-1689 (2017) [非專利文獻17]Murai J, et al., Mol. Cell 69(3), 371-384 (2018) [非專利文獻18]Zoppoli G, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 109(37):15030-15035 (2012) [非專利文獻19]Barretina J, et al., Nature 483(7391), 603-607 (2012) [非專利文獻20]Van Den Borg R, et al., Expert Rev. Anticancer Ther., 19 (6), 461-471 (2019) [非專利文獻21]Pietanza MC, et al., J, Clin. Oncol. 36 (23), 2386-2394 (2018)
[發明欲解決之課題]
本發明係在罹患癌的人類患者中，於投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之際，以mRNA層級的基因表現量作為指標而辨識投予對象之方法。 [用以解決課題之手段]
本發明人等發現，藉由組合hTROP2基因及SLFN11基因的mRNA層級的表現量，能精確度更高地辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象，進而完成本發明。
亦即，本發明包含以下各項目，但不受限於此等。
[1]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價在該活體樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟； 3)在hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟；及 4)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體的醫藥的對象之步驟。 [2]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價在該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量之步驟；及 3)將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [3]如[1]或[2]所記載之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由RNA定序而測定log2 [RPKM+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [4]如[3]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9及9.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [5]如[3]或[4]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [6]如[3]至[5]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [7]如[3]至[6]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [8]如[3]至[7]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [9]如[3]至[7]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.0、7.5及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [10]如[9]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [11]如[9]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於7.5之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [12]如[9]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於8.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [13]如[3]至[12]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [14]如[3]至[13]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [15]如[3]至[14]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [16]如[3]至[14]中任一項所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、2.0及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [17]如[16]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於1.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [18]如[16]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於2.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [19]如[16]所記載之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [20]如[1]或[2]所記載之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由RNA定序而測定log2 [FPKM+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [21]如[20]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0.7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [22]如[20]或[21]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [23]如[20]或[21]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於6.0或7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [24]如[22]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於6.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [25]如[22]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [26]如[20]至[25]中任一項所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [27]如[20]至[26]中任一項所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [28]如[22]至[26]中任一項所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於2.0或3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [29]如[28]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於2.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [30]如[28]所記載之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [31]如[1]或[2]所記載之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由EdgeSeq檢定測定log2 [MNC+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [32]如[31]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9及15.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [33]如[31]或[32]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9及14.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [34]如[31]或[32]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0、13.0或14.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [35]如[34]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [36]如[34]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於13.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [37]如[34]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於14.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。 [38]如[31]至[37]中任一項所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4及13.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [39]如[31]至[38]中任一項所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4及12.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [40]如[31]至[38]中任一項所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、12.0及12.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [41]如[40]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於11.5之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [42]如[40]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [43]如[40]所記載之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.5之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。 [44]如[1]至[43]中任一項所記載之方法，其中，活體樣本包含腫瘤樣本。 [45]如[1]至[44]中任一項所記載之方法，其中，含有抗hTROP2抗體的醫藥為抗hTROP2抗體藥物結合物。 [46]如[45]所記載之方法，其中，抗hTROP2抗體藥物結合物為由下式所示之藥物連接子，與抗hTROP2抗體藉由硫醚鍵而結合之抗體藥物結合物，
Figure 02_image001
(式中，A表示與抗hTROP2抗體的結合位置)。 [47]如[46]所記載之方法，其中，抗hTROP2抗體為包含由序列識別號1中胺基酸編號20至470所記載的胺基酸序列而成之重鏈及由序列識別號2中胺基酸編號21至234所記載的胺基酸序列而成之輕鏈的抗體。 [48]如[47]所記載之方法，其中，抗hTROP2抗體的重鏈羧基末端的離胺酸殘基缺失。 [49]如[46]至[48]中任一項所記載之方法，其中，藥物-連接子結構的每一抗體的平均結合數為2至8個的範圍。 [50]如[46]至[49]中任一項所記載之方法，其中，藥物-連接子結構的每一抗體的平均結合數為3.5至4.5個的範圍。 [51]如[45]所記載之方法，其中，抗hTROP2抗體藥物結合物為薩妥珠單抗加維特康(Sacituzumab Govitecan) (IMMU-132)。 [52]如[1]至[51]所記載之方法，其中，癌為肺癌、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、前列腺癌、多形性神經膠質母細胞瘤、卵巢癌、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、子宮頸癌、子宮體癌、頭頸部癌、食道癌、膽管癌、甲狀腺癌、淋巴瘤、急性骨髓性白血病、急性淋巴性白血病及/或多發性骨髓瘤。 再者，本發明亦包含以下項目。此外，[3]至[52]的要素或要件亦能適用於以下發明。 [53]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量之步驟；及 3)將具有hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [54]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟；及 3)將具有hTROP2基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [55]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價該樣本中於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟；及 3)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [56]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價在該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量之步驟；及 3)將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [57]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟； 3)在hTROP2基因的表現得量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟；及 4)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體的醫藥的對象之步驟。 [58]一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價該樣本中於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟； 3)於SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟；及 4)將具有hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。 [59]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該活體樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量； 3)於hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量；再者 4)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [60]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量；再者 3)將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [61]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量；再者 3)將具有hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [62]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量；再者 3)將具有hTROP2基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [63]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的SLFN11基因的表現量；及 3)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [64]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量；再者 3)將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [65]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量； 3)於hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量；再者 4)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [66]一種方法，其係包含投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之癌的治療方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本； 2)評價該樣本中於mRNA層級的SLFN11基因的表現量； 3)於SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的hTROP2基因的表現量；再者 4)將具有hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者選擇作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象。 [發明之效果]
藉由辨識投予含有抗hTROP2抗體的醫藥之對象，可選擇可期待藥效的患者並投予醫藥。
[用以實施發明的形態]
定義 本說明書中，只要未另外提及，則在提及數值時，「約」係意指所示之數值的±10%。
本說明書中，「癌」與「腫瘤」能相互取代使用。
本說明書中，所謂「基因」的用語中，不僅包含DNA，亦包含其mRNA、cDNA及其cRNA。
本說明書中，所謂「多核苷酸」的用語係以與核酸相同的意義使用，亦包含DNA、RNA、探針、寡核苷酸及引子。
本說明書中，未區別地使用「多肽」與「蛋白質」。
本說明書中，「細胞」中亦包含動物個體內的細胞、培養細胞。
本說明書中，「hTROP2」意指由NM_002353 (NCBI)的存取編號所辨識之基因所編碼的人類蛋白質、及其對偶基因變異體，包含以NP_002344(NCBI)鑑定之蛋白質。
本說明書中，「SLFN11」意指由NM_152270 (NCBI)的存取編號所辨識之基因所編碼的人類蛋白質、及其對偶基因變異體，包含以NP_689483(NCBI)鑑定之蛋白質。
本說明書中，所謂「抗體的抗原結合片段」，意指具有與抗原的結合活性之抗體的部分片段，包含Fab、F(ab’)2、Fv、scFv、雙鏈抗體(diabody)、線狀抗體及由抗體片段所形成之多特異性抗體等。又，抗體的抗原結合片段亦包含為已在還原條件下處理F(ab’)2之抗體的可變區的一價片段之Fab’。但是，只要具有與抗原的結合能力，則未限定於此等分子。又，此等抗原結合片段不僅包含已以適當酵素處理抗體蛋白質的全長分子者，亦包含使用經基因工程所改變之抗體基因而在適當宿主細胞中所產生的蛋白質。
本說明書中之所謂「CDR」，意指互補決定區(CDR：Complemetarity determing region)。抗體分子的重鏈及輕鏈中已知分別有三處的CDR。CDR亦稱為超可變區(hypervariable domain)，位於抗體的重鏈及輕鏈的可變區內，為一級結構的變異性特別高的部位，在重鏈及輕鏈的多肽鏈的一級結構上，分別分離成三處。本說明書中，針對抗體的CDR，將重鏈的CDR從重鏈胺基酸序列的胺基末端側起標示為CDRH1、CDRH2、CDRH3，將輕鏈的CDR從輕鏈胺基酸序列的胺基末端側起標示為CDRL1、CDRL2、CDRL3。此等部位在立體結構上互相接近，決定對於所結合之抗原的特異性。
本說明書中，對於治療的「反應」，意指關於所治療之腫瘤，顯示該腫瘤(a)增殖的延遲、(b)增殖的停止或(c)退縮。
抗hTROP2抗體
本發明中所使用之抗hTROP2抗體，可藉由使用此領域所通常實施的方法，將選自hTROP2或hTROP2的胺基酸序列之任意多肽對動物進行免疫，採取在活體內所產生的抗體並進行純化而得。成為抗原的TROP2的生物種類不限於人類，亦可將源自小鼠、大鼠等人類以外的動物之TROP2對動物進行免疫。此情形中，藉由將與所取得之異種TROP2結合的抗體及hTROP2的交叉反應性進行試驗，可篩選能應用於人類疾病的抗體。
又，依據公知的方法(例如，Kohler and Milstein,Nature(1975)256,p.495-497;Kennet,R.ed., Monoclonal Antibodies,p.365-367,Plenum Press,N.Y. (1980))，藉由使產生抗hTROP2抗體的抗體產生細胞與骨髓瘤細胞進行融合而樹立融合瘤，亦可獲得單株抗體。
此外，成為抗原的hTROP2可藉由利用基因操作使宿主細胞表現hTROP2基因而得。具體而言，只要製作能表現hTROP2基因的載體，將此導入宿主細胞，使該基因表現，並將已表現的TROP2進行純化即可。又，亦能將由上述基因操作所致之hTROP2表現細胞、或表現hTROP2之細胞株使用作為hTROP2蛋白質。
本發明的抗體中，除了上述抗hTROP2的單株抗體，亦包含以使對於人類的異種抗原性降低等為目的而經人為改變的基因重組型抗體，例如嵌合(Chimeric)抗體、人源化(Humanized)抗體、人類抗體(human antibody)等。此等抗體可使用既知的方法而製造。
作為人源化抗體的一例，可列舉包含序列識別號1所示之重鏈胺基酸序列及序列識別號2所示之輕鏈胺基酸序列的人源化抗體，但不限於此。
例如，國際公開第2008/144891號、國際公開第2011/145744號、國際公開第2011/155579號、國際公開第2013/077458號、國際公開第2003/074566號、國際公開第2011/068845號、國際公開第2013/068946號、美國專利第7999083號說明書、或國際公開第2015/098099號所記載之各種抗hTROP2抗體能使用在本發明中。
此外，已知哺乳類培養細胞所產生之抗體的重鏈的羧基末端的離胺酸殘基缺失(Tsubaki et.al., Int. J. Biol. Macromol, 139-147,2013)。但是，此重鏈序列的缺失不會影響抗體的抗原結合能及效應作用(effector function)(補體的活化或抗體依賴性細胞毒殺作用等)。因此，在本發明中，亦能使用上述重鏈羧基末端的離胺酸殘基已缺失的抗體。
本發明中所使用之抗hTROP2抗體中，亦包含該抗體的抗原結合片段。作為抗體的抗原結合片段，可列舉Fab、F(ab’)2、Fv、或使重鏈及輕鏈的Fv以適當連接子(linker)連結之單鏈Fv(scFv)、雙鏈抗體(diabody，diabodies)、線狀抗體、及由抗體片段所形成之多特異性抗體等。又，抗體的片段亦包含為已在還原條件下處理F(ab’)2之抗體的可變區的一價片段之Fab’。
本發明中所使用之抗hTROP2抗體中，亦包含抗體的修飾體。所謂該修飾體，意指對本發明的抗體施以化學或生物學的修飾而成者。化學的修飾體中，包含對胺基酸骨架的化學部分的結合、N-鍵或O-鍵碳水化合物鏈的化學修飾體等。生物學的修飾體中，包含經轉譯後修飾(例如，對N-鍵或O-鍵的糖鏈加成、N端或C端的加工、脫醯胺化、天門冬酸的異構化、甲硫胺酸的氧化)者、藉由使用原核生物宿主細胞使其表現而在N端加成甲硫胺酸殘基者等。又，本發明中所使用之抗hTROP2抗體中，亦包含為了能偵測或分離抗hTROP2抗體或hTROP2而經標識者，例如酵素標識物、螢光標識物、親和性標識物之修飾物。此種抗hTROP2抗體的修飾物有用於抗體的穩定性及血中滯留性的改善、抗原性的降低、抗hTROP2抗體或hTROP2的偵測或分離等。
又，藉由將本發明中所使用之抗hTROP2抗體所結合之糖鏈修飾進行調整(醣苷化、去岩藻醣化等)，能增強抗體依賴性細胞毒性活性。作為抗體的糖鏈修飾的調整技術，已知有國際公開第1999/54342號、國際公開第2000/61739號、國際公開第2002/31140號等，但不限於此等。本發明中所使用之抗hTROP2抗體中亦包含已調整該糖鏈修飾的抗體。
其他抗體
本發明的方法亦能使用在含有與抗hTROP2抗體以外的抗原結合的抗體之醫藥。對於本發明所使用之抗hTROP2抗體以外的抗體並無特別限制，但可列舉例如，抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗B7-H3抗體、抗CD3抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD98抗體、抗DR5抗體、抗EGFR抗體、抗EPHA2抗體、抗FGFR2抗體、抗FGFR4抗體、抗FOLR1抗體、抗VEGF抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD70抗體、抗PSMA抗體、抗CEA抗體及抗間皮素(Mesothelin)抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗Cripto抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素(Integrin)抗體、抗肌腱蛋白-C(Tenascin-C)抗體、抗SLC44A4抗體、抗GPR20抗體及抗CDH6抗體，較佳可列舉抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗B7-H3抗體、抗GPR20抗體及抗CDH6抗體，更佳可列舉抗HER2抗體。各抗體能以與抗hTROP2抗體同樣的方法取得。又，各抗體係與抗hTROP2抗體同樣地具有抗體所通常具有的普遍性質。
本發明中，所謂「抗HER2抗體」，係指與HER2(人類第二型類上皮生長因子受體，Human Epidermal Growth Factor Receptor Type 2； ErbB-2)特異性結合，較佳為具有藉由與HER2結合而內化至HER2表現細胞之活性的抗體。作為抗HER2抗體，可列舉例如，曲妥珠單抗(Trastuzumab)(美國專利第5821337號)、帕妥珠單抗(Pertuzumab)(國際公開第01/00245號)，較佳可列舉曲妥珠單抗。本發明中，所謂「抗HER3抗體」，係指與HER3(人類第三型類上皮生長因子受體，Human Epidermal Growth Factor Receptor Type 3； ErbB-3)特異性結合，較佳為具有藉由與HER3結合而內化至HER3表現細胞之活性的抗體。作為抗HER3抗體，可列舉例如，帕瑞圖單抗(Patritumab； U3-1287)、U1-59(國際公開第2007/077028號)、MM-121(絲里班圖單抗(Seribantumab))、國際公開2008/100624號記載之抗ERBB3抗體、RG-7116(倫雷珠單抗(Lumretuzumab))及LJM-716((依根妥單抗Elgemtumab))，較佳可列舉帕瑞圖單抗及U1-59。
本發明中，所謂「抗B7-H3抗體」，係指與B7-H3(B細胞抗原#7同源物3(B cell antigen #7 homolog 3)； PD-L3； CD276)特異性結合，較佳為具有藉由與B7-H3結合而內化至B7-H3表現細胞之活性的抗體。作為抗B7-H3抗體，可列舉例如，M30-H1-L4(國際公開第2014/057687號)。
本發明中，所謂「抗GPR20抗體」，係指與GPR20(G蛋白偶聯受體(G Protein-coupled receptor 20))特異性結合，較佳為具有藉由與GPR20結合而內化至GPR20表現細胞之活性的抗體。作為抗GPR20抗體，可列舉例如，h046-H4e/L7(國際公開第2018/135501號)。
本發明中，所謂「抗CDH6抗體」，係指與CDH6(鈣黏蛋白-6，Cadherin-6)特異性結合，較佳為具有藉由與CDH6結合而內化至CDH6表現細胞之活性的抗體。作為抗CDH6抗體，可列舉例如H01L02(國際公開第2018/212136號)。
抗體藥物結合物 本發明中所使用之抗體藥物結合物係由下式所示之藥物連接子與抗體藉由硫醚鍵而結合之抗體藥物結合物，
Figure 02_image003
(式中，A表示與抗體的結合位置)。
本發明中，抗體藥物結合物之中，將包含連接子及藥物之部分結構稱為「藥物連接子」。此藥物連接子係與在抗體的鏈間的雙硫鍵部位(二處的重鏈-重鏈間、及二處的重鏈-輕鏈間)所產生之硫醇基(換言之，半胱胺酸殘基的硫原子)結合。
本發明的藥物連接子係將為拓樸異構酶I抑制劑之依喜替康(IUPAC名：(1S,9S)-1-胺基-9-乙基-5-氟-1,2,3,9,12,15-六氫-9-羥基-4-甲基-10H,13H-苯并[de]哌喃并[3’,4’：6,7]吲
Figure 108130044-A0101-12-0029-1
并[1,2-b]喹啉-10,13-二酮，(亦可以化學名表示：(1S,9S)-1-胺基-9-乙基-5-氟-2,3-二氫-9-羥基-4-甲基-1H,12H-苯并[de]哌喃并[3’,4’：6,7]吲
Figure 108130044-A0101-12-0029-1
并[1,2-b]喹啉-10,13(9H,15H)-二酮))作為構成要素。依喜替康係由下式所示之具有抗腫瘤效果的喜樹鹼衍生物，
Figure 02_image005
。
本發明中所使用之抗體藥物結合物亦可由下式表示。
Figure 02_image007
於此，藥物連接子藉由抗體與硫醚鍵而結合。又，n與所謂平均藥物結合數(DAR；Drug-to-Antibody Ratio)同意義，表示每一抗體的藥物連接子的平均結合數。本發明中所使用之抗體藥物結合物的每一抗體的藥物連接子的平均結合數能在0～8的範圍調整，但較佳為2至8。抗hTROP2抗體之情形的平均結合數更佳為3至5，再佳為3.5至4.5。
本發明所使用之抗體藥物結合物係在移動至癌細胞內後切斷連接子部分，而游離由下式所表示之化合物，
Figure 02_image009
。
上述化合物被認為是本發明所使用之抗體藥物結合物的抗腫瘤活性的本體，已確認具有拓樸異構酶I抑制作用(Ogitani Y. et al., Clinical Cancer Research, 2016, Oct 15;22(20):5097-5108, Epub 2016 Mar 29)。只要為游離上述化合物的抗體藥物結合物，則能不將抗體所辨識的抗原限定為hTROP2地適用本發明的方法。
拓樸異構酶I係藉由進行DNA的單鏈的切斷與再結合而改變DNA的高次結構(higher order structure)而與DNA的合成相關之酵素。因此，具有拓樸異構酶I抑制作用之藥劑係藉由抑制DNA的合成而在細胞周期的S期(DNA合成期)使細胞分裂停止，並誘導由細胞凋亡所致之細胞死亡，藉此可抑制癌細胞的增殖。
此外，本發明所使用之抗體藥物結合物，亦已知具有旁觀者效應(bystander effect)(Ogitani Y. et al., Cancer Science (2016) 107,1039-1046)。此旁觀者效應係在本發明所使用之抗體藥物結合物內化進入標的表現癌細胞後，上述化合物藉由即使對於未表現標的之鄰近癌細胞亦有抗腫瘤效果而發揮作用。
本發明中所使用之抗體藥物結合物的製造所使用之藥物連接子中間體係由下式所示。
Figure 02_image011
上述的藥物連接子中間體可以所謂N-[6-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)己醯基]甘胺醯基甘胺醯基-L-苯丙胺醯基-N-[(2-｛[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羥基-4-甲基-10,13-二側氧基-2,3,9,10,13,15-六氫-1H，12H-苯并[de]哌喃并[3’,4’:6,7]吲
Figure 108130044-A0101-12-0029-1
并[1,2-b]喹啉-1-基]胺基｝-2-側氧基乙氧基)甲基]甘胺醯胺的化學名表示，可參考國際公開第2015/098099號等的記載而製造。
本發明中所使用之抗體藥物結合物可藉由使前述藥物連接子中間體與具有硫醇基(或亦稱為氫硫基)的抗體進行反應而製造。
具有氫硫基的抗體，可利用本發明所屬技術領域中具有通常知識者所周知的方法而得(Hermanson, G. T, Bioconjugate Techniques, pp.56-136, pp.456-493, Academic Press(1996))。例如，將參(2-羧乙基)膦鹽酸鹽(TCEP)等還原劑，相對於每一個抗體內鏈間二硫化物使用0.3至3莫耳當量，在包含乙烯二胺四乙酸(EDTA)等螯合劑的緩衝液中，使其與抗體進行反應，藉此可獲得抗體內鏈間二硫化物被部分或完全還原之具有氫硫基的抗體。
再者，每一個具有氫硫基的抗體，使用2至20莫耳當量的藥物連接子中間體，可製造每一個抗體結合有2個至8個藥物的抗體藥物結合物。
所製造之抗體藥物結合物的每一分子抗體的平均藥物結合數，例如可藉由利用測定280nm及370nM的二波長中之抗體藥物結合物與其結合物前驅物的UV吸光度而算出之方法(UV法)、或將以還原劑處理抗體藥物結合物而得之各片段利用HPLC測定而定量並算出之方法(HPLC法)而進行。
抗體與藥物連接子中間體的結合物、及抗體藥物結合物的每一分子抗體的平均藥物結合數的算出，可參考國際公開第2015/098099號及國際公開第2017/002776號等的記載而實施。
作為本發明所使用之上述具有藥物連接子的抗hTROP2抗體藥物結合物，可列舉國際公開第2015/098099號所記載之抗體藥物結合物。此外，該國際公開所記載之抗hTROP2抗體藥物結合物中，較佳者為含有包含重鏈胺基酸序列以及輕鏈胺基酸序列的抗體，該重鏈胺基酸序列在重鏈可變區含有由序列表的序列識別號3所示之胺基酸序列而成的CDRH1(TAGMQ)、由序列識別號4所示之胺基酸序列而成的CDRH2(WINTHSGVPKYAEDFKG)、及由序列識別號25所示之胺基酸序列而成的CDRH3(SGFGSSYWYFDV)，該輕鏈胺基酸序列在輕鏈可變區含有由序列表的序列識別號6所示之胺基酸序列而成的CDRL1(KASQDVSTAVA)、由序列識別號7所示之胺基酸序列而成的CDRL2(SASYRYT)、及由序列識別號8所示之胺基酸序列而成的CDRL3(QQHYITPLT)。該國際公開所記載之抗hTROP2抗體藥物結合物中，再佳者為含有包含重鏈胺基酸序列及輕鏈胺基酸序列的抗體，該重鏈胺基酸序列含有由序列識別號1所示之胺基酸序列的第20至140個的胺基酸殘基而成的重鏈可變區，該輕鏈胺基酸序列含有由序列識別號2所示之胺基酸序列的第21至129個的胺基酸殘基而成的輕鏈可變區。該國際公開所記載之抗hTROP2抗體藥物結合物中，特佳者為含有包含序列識別號1所示之重鏈胺基酸序列及序列識別號2所示之輕鏈胺基酸序列的抗體。
此外，已知哺乳類培養細胞所產生之抗體的重鏈的羧基末端的離胺酸殘基缺失。因此，上述抗體藥物結合物亦含有重鏈羧基末端的離胺酸殘基已缺失的抗體。
但是，只要所含有的抗體可辨識hTROP2，則本發明所使用之抗hTROP2抗體藥物結合物不限於具有上述特定藥物連接子者。作為此種抗hTROP2抗體藥物結合物的實例，能舉出薩妥珠單抗加維特康(IMMU-132)。又，國際公開第2003/074566號、國際公開第2011/068845號、國際公開第2013/068946號、或美國專利第7999083號說明書所記載之抗hTROP2抗體藥物結合物亦能使用於本發明。
活體樣本
對象，例如將從被診斷罹患癌的對象所採取之活體樣本使用作為RNA的供給源，能決定該樣本中為RNA層級的基因表現的程度。該活體樣本，例如能包含血液，例如全部血液或源自血液之物，例如胞外體、組織、細胞及或循環系統組織細胞。在一些態樣中，該活體樣本亦可取自腫瘤。
胞外體(exosome)係包含由細胞所分泌的脂質雙層膜之小胞。藉由自1980年代被發現至今的眾多研究，已知其在細胞間移動並運送各種分子。依據其形態的特徵，不僅蛋白質，亦包含核酸、糖質、脂質等許多生理活性分子。又，胞外體包含miRNA及mRNA，其等已知在細胞間被運送。因此，作為適用於本發明的活體樣本，亦能選擇胞外體。
活體樣本亦可藉由靜脈穿刺等公知手段、或使用公知的腫瘤活體組織切片裝置及流程而取得。內視鏡活體組織切片、切除活體組織切片、切開活體組織切片、細針活體組織切片、穿刺活體組織切片(punch biopsy)、刮除活體組織切片及皮膚活體組織切片係本發明所屬技術領域中具有通常知識者為了取得腫瘤樣本而能使用之經認可的醫療流程的例子。活體樣本應具有充分大的尺寸以提供用於測定基因表現的充分RNA或薄片。
在一些態樣中，本案方法包含同意提供自體組織樣本或採取自體組織樣本，並評價在被診斷罹患癌的人類對象中於mRNA層級的基因表現之步驟。
前述活體樣本可為能測定基因表現或量的任意形態。亦即，該樣本必須足以進行RNA萃取或薄層製備。因此，該樣本為新鮮，且能使用適當的低溫技術保存，或使用非低溫技術保存。例如，操作臨床活體組織切片樣本的標準程序係將組織樣本在福馬林中進行固定，並將其包埋在石蠟中。此形態的樣本係普遍已知的福馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織。製備用於後續分析的組織之適當技術係本發明所屬技術領域中具有通常知識者所周知。
基因表現
本案中，活體樣本中的基因表現程度的決定或測定，係使用適當方法而實施。該技術領域中周知數種此種方法。例如，基因表現的決定係藉由測定樣本中的RNA，例如mRNA的層級或量而完成。
PCR或微陣列的引子及/或探針係被設計在mRNA的3’末端上。其原因在於，認為在RNA分離或cDNA合成的實驗程序的過程中具有高保存性(穩定性)。前述探針能以偵測特定形態的轉錄變異體之方式，基於所期望的序列而設計。將適當的偵測方法的例子揭示於以下，但不受限於此等。
RNA分析 公知的微陣列分析、定量的聚合酶鏈反應(PCR)係決定於mRNA層級的基因表現的程度之方法的例子。在一些態樣中，RNA係使用標準流程而從細胞、腫瘤或組織進行萃取。在其他態樣中，RNA分析係使用不需要RNA分離的技術而實施。
用於從組織樣品迅速且有效率地萃取真核生物mRNA(亦即，聚(a)RNA)的方法已被充分確立，且為本發明所屬技術領域中具有通常知識者所公知。例如，參照Ausubel等，1997, Current Protocols of Molecular Biology, John Wiley ＆ Sons。上述組織樣品能為新鮮、冷凍、或被固定且被石蠟包埋(FFPE)、臨床研究腫瘤標本。一般而言，從新鮮的組織樣品或冷凍組織樣品所分離的RNA係呈現其片段化少於源自FFPE樣品的RNA之傾向。但是，腫瘤材料的FFPE樣品能更容易取得，FFPE樣品係本發明的方法中用於使用的RNA的適當供給源。針對作為用於由RT-PCR所致之基因表現剖析的RNA供給源之FFPE樣品的考察，請參照例如Clark-Langone等，2007, BMC Genomics 8：279。又，請參照De Andreus等，1995, Biotechniques 18：42044；及Baker等，美國專利申請公開第2005/0095634號。
關於RNA萃取及製備，一般使用業者的附說明書的市售套組。作為各種RNA分離製品及完整套組之商業的業者，可列舉Qiagen(Valencia，CA)、Invitrogen(Carlsbad，CA)、Ambion(Austin，TX)及Exiqon(Woburn，MA)。
一般而言，RNA分離係開始於組織/細胞破壞。期望在組織/細胞破壞期間，將由RNase所致之RNA分解控制在最小限度。在RNA分離程序期間限制RNase活性的一種方法，係確保在上述細胞被破壞後立刻處於使改質劑與細胞內容物接觸的狀態。其他的一般習慣作法，係在RNA分離程序中包含一種以上的蛋白酶。依據需要，新鮮的組織樣品係在被採集後立刻在室溫下浸漬於RNA穩定化溶液中。上述穩定化溶液迅速浸透上述細胞，且儲存在4℃，並為了後續的分離，而將上述RNA穩定化。此種穩定化溶液之一，係以RNAlater(註冊商標)(Ambion，Austin，TX)的形態市售。
在一些流程中，全RNA係藉由氯化銫密度梯度離心分離而被從經破壞的腫瘤材料分離。一般而言，mRNA構成全細胞RNA中的約1%～5%。固定化寡(dT)(例如，寡(dT)纖維素)被一般使用在用於從核糖體RNA及轉送RNA分離mRNA。分離後被儲存之情形，RNA必須在不包含RNase的條件下被儲存。用於穩定地儲存經分離的RNA的方法，在該領域中為公知。能利用用於穩定地儲存RNA的各種市售製品。
微陣列 mRNA表現程度能使用以往的DNA微陣列表現剖析技術而決定(例如，測定)。DNA微陣列係固定化在固體表面或支持層(例如，玻璃、塑膠或矽)之特定DNA片段或探針的集合，各特定DNA片段係在陣列中佔有既知位置。通常，在嚴苛條件下之與經標識的RNA樣品之雜交係能偵測及定量對應於上述陣列中之各探針的RNA分子。在用於去除非特異性結合的樣品材料之嚴苛清洗後，上述微陣列係藉由雷射共軛焦顯微鏡或其他適當的偵測方法而被掃描。現代的市售DNA微陣列(時常作為DNA晶片而公知)，具代表性者係包含數萬的探針，因此，能同時測定數萬的基因的表現。此種微陣列能被使用在本發明的實施。或者，包含為了測定特定基因的表現所必要程度的數量的探針、與必要的調整或標準(例如，用於資料標準化)之特製晶片能被使用在本案方法的實施。
為了促進資料標準化，能使用二色的微陣列分析儀。二色(二通道)系統中，樣品係以第一波長發光且被第一螢光團標識，另一方面，RNA或cDNA標準係以不同波長發光且被第二螢光團標識。例如，Cy3(570nm)及Cy5(670nm)在二色的微陣列系統中時常被一起使用。
DNA微陣列技術被充分發展，且被市售並廣泛地使用。因此，在實施本案方法時，本發明所屬技術領域中具有通常知識者為了不進行過度實驗地測定編碼活體標記蛋白質之基因的表現程度，能使用微陣列技術。DNA微陣列晶片、試藥(例如，RNA或cDNA的製備、RNA或cDNA的標識所必要者、雜交溶液及清洗溶液)、設備(例如，微陣列分析儀)及流程係該領域所周知，並由各種商業的供應商市售。作為微陣列系統之商業的業者，可列舉Agilent Technologies(Santa Clara，CA)及Affymetrix(Santa Clara，CA)，但亦能使用其他的陣列系統。
定量的PCR mRNA的程度係能使用以往的定量的反轉錄酶聚合酶鏈反應(qRT-PCR)技術而測定。作為qRT-PCR的優點，可列舉感度、柔軟性、定量的正確性、辨識序列相同性高的mRNA間之能力。關於為了定量的PCR而將組織樣品進行加工處理的指南，能取自各種供應商(例如，針對qRT-PCR的裝置及試藥的製造業者及業者)(例如，Qiagen(Valencia，CA)及Ambion(Austin，TX))。用於qRT-PCR的自動運作的設備及系統已有市售，且在許多研究室中被慣用。周知的商業的系統之例子為Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time PCR System(Applied Biosystems，Foster City，CA)。
一旦取得經分離的mRNA，由RT-PCR所致之基因表現測定的第一步驟係將上述mRNA模板往cDNA進行反轉錄。接著，cDNA係在PCR反應中被指數函數地放大。二種被一般使用的反轉錄酶為禽骨髓母細胞瘤病毒(avian myeloblastosis virus)反轉錄酶(AMV-RT)及莫洛尼氏小鼠白血病病毒反轉錄酶(Moloney Murine Leukemia Virus- Reverse Transcriptase，MMLV-RT)。上述反轉錄反應，具代表性的是以特定引子、隨機六聚物、或寡(dT)引子而起始(primed)。適當的引子已有市售(例如，GeneAmp(註冊商標) RNA PCR套組(Perkin Elmer，Waltham，MA))。所得之cDNA生成物能在後續的聚合酶鏈反應中被使用作為模板。
上述PCR步驟係使用熱穩定性DNA依賴性DNA聚合酶而進行。PCR系統中最被一般使用的聚合酶為水生棲熱菌(Thermus aquaticus)(Taq)聚合酶。PCR的選擇性係由引子的使用而產生，該引子與被作為放大標的之DNA區域(亦即，由編碼所期望的蛋白質之基因被反轉錄而得之cDNA的區域)為互補。因此，本發明中使用qRT-PCR之情形，各標記基因中，特異性引子係基於上述基因的cDNA序列。商業的技術(例如，SYBR(註冊商標)green或TaqMan(註冊商標)(Applied Biosystems，Foster City，CA))能遵循業者的說明書而使用。mRNA層級能藉由比較持家基因(例如，β-肌動蛋白或GAPDH)的層級，而針對樣品間的裝載(loading)差異而被標準化。mRNA表現的程度能與任意單一的對照樣品(例如，源自通常的非腫瘤組織或細胞之mRNA)進行比較而表示。或者，能相對於腫瘤樣品的槽(pool)、或源自腫瘤細胞株、或源自市售的對照mRNA組之mRNA而表示。
基因的表現程度的PCR分析中的適當的引子組，能不進行過度實驗地被本發明所屬技術領域中具有通常知識者設計及合成。
或者，用於實施本發明的PCR引子組，能購自商業的供應商(例如，Applied Biosystems)。PCR引子較佳為長度為約17～25核苷酸。引子能使用用於熔解溫度(Tm)概算之以往的演算法，以具有特定Tm之方式而設計。用於引子設計及Tm概算的軟體已有市售(例如，Primer ExpressTM(Applied Biosystems))，在網際網路上亦能利用(例如，Primer3(Massachusetts Institute of Technology))。藉由應用PCR引子設計已確立之原理，多數的不同引子能被使用於測定任意指定基因的表現程度。
qNPA 在一些態樣中，RNA分析係使用不包含RNA萃取或分離的技術而實施。此種技術之一係以qNPA(註冊商標)的名稱而被市售(High Throughput Genomics， Inc.， Tucson， AＺ)，為定量核酸酶保護分析。此技術在進行分析的組織樣本為FFPE材料的形態之情形中為有利的。請參照例如See, e.g., Roberts et al, 2007, Laboratory Investigation 87:979-997。
nCounter Analysis System nCounter(註冊商標)係NanoString Technologies公司所開發之基於數位分子條碼技術而直接將分子進行計數的系統，能將最多800種類的RNA或DNA以單管進行迅速且高精度的分析。nCounter的分析中，使具有對目標分子的序列具特異性的條碼之探針(Reporter Probe)及用於與分析用捕捉(Capture)進行固定之探針(Capture Probe)與作為目標之核酸進行雜交，並藉由螢光掃描器將捕捉的表面所固定化之各目標序列的彩色條碼的排列進行計數。請參照例如Geiss G， et al.、26： 317-25 (2008)., Nature Biotechnology。
HTG EdgeSeq檢定s EdgeSeq係HTG Molecular Diagnostics公司所開發之由計測設備、消耗品、軟體的分析而成之包含腫瘤剖析、分子診斷測驗及生物標記的開發之樣品剖析應用程式。對生物學樣品使用核酸酶保護化學而自動化基因及基因活性的分子剖析。請參照例如Martel R., et al. Assay Drug Dev Technol. 2002 Nov;1(1):61-71。依據上述，能以計數值的形態獲得各基因的表現量。計數值係經過將樣品間的分布偏差進行補正之被稱為標準化的作業而被使用於分析。作為具體的標準化的手法，可列舉中位數標準化(Median Normalization)法。中位數標準化法中，利用下述所示的方法針對各樣品求取比例因子(Scaling factor)，藉由將基因的表現量扣除比例因子而進行補正。針對第i個樣品(Samplei )的第g個基因(Geneg )係求取全部樣品的表現量(計數值)的幾何平均，將Geneg 的表現量減去該幾何平均，將所得的值設為相對於Samplei 的Geneg 之比例因子(Sig )。在針對全部基因求取比例因子後，將Samplei 內的Sig 的中位數設為Samplei 的比例因子(Si )。最後，將Samplei 的全部基因表現量扣除Si 的值而獲得作為中位數標準化計數(Median Normalized Count，MNC)。針對本手法的詳細內容，請參照例如(Andres， S. and Huber W Genome Biol. 2010；11(10)：R106)。
次世代RNA定序 與以往的桑格氏法不同，係使用進行高度並列化處理且可以短時間且低成本取得莫大序列資訊的次世代定序技術之RNA定序分析，可更高感度且高精度地分析總轉錄本全體的表現。作為現在廣泛使用的代表性次世代定序技術，可列舉Illumina公司(Illumina Inc.)的單鹼基合成反應定序技術(Sequencing by synthesis)、Thermo Fisher Scientific公司(Thermo Fisher Scientific Inc.)的離子半導體定序技術(Ion Torrent technology)等。各技術的詳細內容請參照例如Buermans HP., et al. Biochim Biophys Acta. 2014 Oct;1842(10):1932-1941。又，使用上述次世代定序技術而得之各個序列資訊(讀取(lead))，經過藉由分別辨識源自何種基因的轉錄物者之定位(mapping)作業、藉由將各轉錄物所定位之讀取數利用轉錄物的長度或由該分析所得之總讀取數等而補正之所謂標準化的作業，而被使用於分析。作為具體的標準化的手法，可列舉例如將轉錄物的長度設為1kb，將總讀取數設為100萬，為以各基因的基因長進行補正的讀取數之每百萬映射序列讀數之每仟個鹼基的外顯子讀取(reads per kilobase of exon per million mapped sequence reads (RPKM))值。同樣地，亦廣泛使用將總讀取數設為100萬，將為以各基因的基因長所補正的片段數之每百萬映射序列讀數之每仟個鹼基的外顯子片段(fragments per kilobase of exon per million mapped sequence reads (FPKM))值，或表示在將各轉錄產物的讀取數以基因長進行補正且將總讀取數設為100萬之情形的轉錄產物數(transcripts per million(TPM))值等。相對於RPKM係使用既知的基因模式提高外顯子所定位之讀取數而計算每個基因的表現量，FPKM係藉由將每個所推定之同功型(isoform)提高片段數而計算同功型層級的表現量。各標準化的手法的詳細內容，可參照例如Conesa A., et al.Genome Biol. 2016 Jan 26; 17: 13。
hTROP2基因表現的評價 hTROP2基因表現能在源自人類患者的活體樣本中被評價。此種態樣包含依賴於mRNA層級的hTROP2基因表現的評價而獲得評價結果之步驟。一些態樣包含決定於mRNA層級的hTROP2基因表現的數值之步驟、及記錄以任意方法所決定的數值之步驟。
hTROP2基因表現程度能與指定的數值相關聯而被解釋。在與指定的數值相等之情形、為數值以上之情形、或大於之情形中，hTROP2基因表現程度被解釋為可預測對象對由含有抗hTROP2抗體的醫藥所致之治療具感受性(反應性)。在一些態樣中，在hTROP2基因表現程度與指定的數值相等之情形、為數值以下之情形、或小於數值之情形，被解釋為可預測腫瘤對由含有抗hTROP2抗體的醫藥所致之治療具抗性(非反應性)。
在一些態樣中，基於表示活體樣本中的hTROP2基因表現的程度之數值，hTROP2基因表現能被評價為高表現或低表現。對象係例如能基於於mRNA層級的hTROP2表現，而被評價為高表現或低表現。
前述表現程度能藉由如上述般的任意公知方法而被評價。例如，hTROP2基因表現量能基於藉由次世代RNA定序所算出之每百萬映射序列讀數之每仟個鹼基的外顯子讀取(reads per kilobase of exon per million mapped sequence reads(RPKM))值而被評價。RPKM值係使用將以次世代定序儀所得之讀取的數利用各基因的外顯子的長度及定序儀所讀取之序列的總數進行標準化的值，hTROP2基因的表現量可在RPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [RPKM+1]值並進行分析。
RPKM值與hTROP2基因表現相關。因此，RPKM值為高之情形，hTROP2基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [RPKM+1]值為指定數值以上、或大於之情形，被評價為高hTROP2基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在6.0～9.0的範圍選擇，例如能選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9及9.0所組成之群組。又，所設定的數值能在6.0～8.0的範圍選擇，例如能選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組。再者，所設定的數值能在6.5～8.0的範圍選擇，例如能選自由6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組。再者，所設定的數值能在7.0～8.0的範圍選擇，例如能選自由7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組。再者，所設定的數值能在7.5～8.0的範圍選擇，例如能選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組。所設定的數值亦能選自由6.5、7.0、7.5及8.0所組成之群組。
hTROP2基因表現量能基於藉由次世代RNA定序所算出之每百萬映射序列讀數之每仟個鹼基的外顯子片段(fragments per kilobase of exon per million mapped sequence reads(FPKM))值而被評價。FPKM值係使用將以次世代定序儀所得之讀取的數利用各基因的基因長及定序儀所讀取的序列的總數進行標準化的值，hTROP2基因的表現量可在FPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [FPKM+1]值並進行分析。
FPKM值與hTROP2基因表現相關。因此，FPKM值為高之情形，hTROP2基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [FPKM+1]值為指定數值以上、或大於之情形，被評價為高hTROP2基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在6.0～8.0的範圍選擇，例如能選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組。又，所設定的數值能在6.0～7.0的範圍選擇，例如能選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組。所設定的數值亦能選擇6.0或7.0。
hTROP2基因表現量能基於藉由EdgeSeq檢定所算出之中位數標準化計數(MNC)值而被評價。MNC值係以EdgeSeq檢定並使用中位數標準化法而得的值，hTROP2基因的表現量可在MNC值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [MNC+1]值並進行分析。
MNC值與hTROP2基因表現相關。因此，MNC值為高之情形，hTROP2基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [MNC+1]值為指定數值以上、或大於之情形，被評價為高hTROP2基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在12.0～15.0的範圍選擇，例如能選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9及15.0所組成之群組。又，所設定的數值能在12.0～14.0的範圍選擇，例如能選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9及14.0所組成之群組。所設定的數值亦能選擇12.0、13.0或14.0。
在一些態樣中，在mRNA層級的hTROP2基因表現係使用法規機構所認可的試驗進行評價。在一些態樣中，前述法規機構所認可的試驗係藉由FDA、EMA或PMDA而認可的試驗。
SLFN11基因表現的評價 SLFN11基因表現能在源自人類患者的活體樣本中被評價。此種態樣包含依賴於mRNA層級的SLFN11基因表現的評價而獲得評價結果之步驟。一些態樣包含決定於mRNA層級的SLFN11基因表現的數值之步驟、及記錄以任意方法所決定的數值之步驟。
SLFN11基因表現程度能與指定的數值相關聯而被解釋。在與指定數值相等之情形、為數值以上之情形、或大於之情形中，SLFN11基因表現程度被解釋為可預測對象對由含有抗hTROP2抗體的醫藥所致之治療具感受性(反應性)。在一些態樣中，在SLFN11基因表現程度與指定數值相等之情形、為數值以下之情形、或小於數值之情形，被解釋為可預測腫瘤對由含有抗hTROP2抗體的醫藥所致之治療具抗性(非反應性)。
在一些態樣中，基於表示活體樣本中的SLFN11基因表現的程度之數值，SLFN11基因表現能被評價為高表現或低表現。對象例如能基於在mRNA層級的SLFN11表現，而被評價為高表現或低表現。
前述表現程度能藉由如上述般的任意公知方法而被評價。例如，SLFN11基因表現量與hTROP2基因之情形相同，能基於RPKM值而被評價。SLFN11基因的表現量可在RPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [RPKM+1]值並進行分析。
RPKM值與SLFN11基因表現相關。因此，RPKM值為高之情形，SLFN11基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [RPKM+1]值大於指定數值之情形，被評價為高SLFN11基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在1.0～4.0的範圍選擇，例如能選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組。又，所設定的數值能在1.0～3.0的範圍選擇，例如能選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組。再者，所設定的數值能在2.0～3.0的範圍選擇，例如能選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組。所設定的數值能選自由1.0、2.0及3.0所組成之群組，亦能設定成3.0。
SLFN11基因表現量係與hTROP2基因之情形相同，能基於FPKM值而被評價。SLFN11基因的表現量可在FPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [FPKM+1]值並進行分析。
FPKM值與SLFN11基因表現相關。因此，FPKM值為高之情形，SLFN11基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [FPKM]值大於指定數值之情形，被評價為高SLFN11基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在2.0～4.0的範圍選擇，例如能選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組。又，所設定的數值能在2.0～3.0的範圍選擇，例如能選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組。所設定的數值能選擇2.0或3.0。
SLFN11基因表現量係與hTROP2基因之情形相同，能基於MNC值而被評價。SLFN11基因的表現量可在MNC值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [MNC+1]值並進行分析。
MNC值與SLFN11基因表現相關。因此，MNC值高之情形，SLFN11基因表現亦高。在一些態樣中，Log2 [MNC]值大於指定數值之情形，被評價為高SLFN11基因表現。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。所設定的數值能在11.5～13.5的範圍選擇，例如能選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4及13.5所組成之群組。又，所設定的數值能在11.5～12.5的範圍選擇，例如能選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4及12.5所組成之群組。所設定的數值能選擇11.5、12.0或12.5。
在一些態樣中，在mRNA層級的SLFN11基因表現係使用法規機構所認可的試驗進行評價。在一些態樣中，前述法規機構所認可的試驗係例如藉由FDA、EMA或PMDA而被認可的試驗。
投予與治療 在一些態樣中，hTROP2基因表現的評價能與SLFN11基因的表現組合而被評價。藉由組合二種的感受性標記，能精度更高地進行評價。在一些態樣中，罹患癌的人類患者在被評價為hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現高之情形中，係投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而能被治療。在一些態樣中，罹患癌的人類患者在被評價為hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現低之情形中，能回避投予含有抗hTROP2抗體的醫藥。
作為含有抗hTROP2抗體的醫藥之較佳投予量，可列舉2.0mg/kg、4.0mg/kg、6.0mg/kg、8.0mg/kg或10.0mg/kg的各投予量，但不受限於此等投予量。又，作為含有抗hTROP2抗體的醫藥之較佳的投予間隔，可列舉間隔3週，但不受限於此投予間隔。
hTROP2及SLFN11基因表現量能基於RPKM值而被評價。各基因的表現量可在RPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [RPKM+1]值並進行分析。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。
如前述，在hTROP2基因中之Log2 [RPKM+1]值能設定在6.0～9.0的範圍。又，在SLFN11基因中之Log2 [RPKM+1]值能設定在1.0～4.0的範圍。在組合所設定之數值之情形，罹患癌的人類患者在滿足hTROP2及SLFN11基因中之設定值的雙方之情形中，係投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而能被治療。又，在一些態樣中，在滿足hTROP2或SLFN11基因中之設定值的任一方之情形中，係投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而能被治療。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之較佳的Log2 [RPKM+1]設定值的組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9及2.0所組成之群組的一個數值的組合；在hTROP2基因中係選自由6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的一個數值的組合；以及在hTROP2基因中係選自由7.0、7.1、7.2、7.3、7.4及7.5所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的一個數值的組合。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之較佳的Log2 [RPKM+1]設定值的進一步其他組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的一個數值的組合；在hTROP2基因中係選自由6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的一個數值的組合；在hTROP2基因中係選自由7.0、7.1、7.2、7.3、7.4及7.5所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的一個數值的組合；以及在hTROP2基因中係選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的一個數值的組合。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之再佳的Log2 [RPKM+1]設定值的組合，可列舉滿足在hTROP2基因中之7.5及在SLFN11基因中之1.0的組合、或在hTROP2基因中之6.5及在SLFN11基因中之2.0的組合中任一者之情形。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之再佳的Log2 [RPKM+1]設定值的其他組合，可列舉滿足在hTROP2基因中之7.5及在SLFN11基因中之2.0的組合、或在hTROP2基因中之6.5及在SLFN11基因中之3.0的組合中任一者之情形。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之再佳的Log2 [RPKM+1]設定值的其他組合，可列舉選自由在hTROP2基因中之7.5及在SLFN11基因中之1.0的組合、在hTROP2基因中之6.5及在SLFN11基因中之2.0的組合、在hTROP2基因中之7.5及在SLFN11基因中之2.0的組合、以及在hTROP2基因中之6.5及在SLFN11基因中之3.0的組合之群組的任一組合。
又，hTROP2及SLFN11基因表現量能基於FPKM值而評價。各基因的表現量可在FPKM值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [FPKM+1]值並進行分析。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。
如前述，在hTROP2基因中之Log2 [FPKM+1]值能設定在6.0～8.0的範圍。又，在SLFN11基因中之Log2 [FPKM+1]值能設定在2.0～4.0的範圍。在組合所設定之數值之情形，罹患癌的人類患者在滿足hTROP2及SLFN11基因中之設定值的雙方之情形中，係能被投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而治療。又，在一些態樣中，在滿足hTROP2或SLFN11基因中之設定值的任一方之情形中，係能被投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而治療。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之較佳的Log2 [FPKM+1]設定值的組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由7.0、7.1、7.2、7，3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的一個數值的組合。
又，作為其他較佳的組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4，6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的一個數值的組合。
再者作為其他組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由7.0、7.1、7.2、7，3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的一個數值的組合。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之再佳的Log2 [FPKM+1]設定值的其他組合，可列舉選自由在hTROP2基因中之7.0及在SLFN11基因中之2.0的組合、在hTROP2基因中之6.0及在SLFN11基因中之3.0的組合、以及在hTROP2基因中之7.0及在SLFN11基因中之3.0的組合所組成之群組的任一組合。
再者，hTROP2及SLFN11基因表現量能基於MNC值而評價。各基因的表現量可將MNC值加上1，而使用作為對數(Log2 )值之Log2 [MNC+1]值並進行分析。指定數值能以將偽陽性及偽陰性的不期望效果最小化之方式被統計性地設定。
如前述，在hTROP2基因中之Log2 [MNC+1]值能設定在12.0～14.0的範圍。又，在SLFN11基因中之Log2 [MNC+1]值能設定在11.5～12.5的範圍。在組合所設定的數值之情形，罹患癌的人類患者在滿足在hTROP2及SLFN11基因中之設定值的雙方之情形中，係投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而能被治療。又，在一些態樣中，在滿足在hTROP2或SLFN11基因中之設定值的任一方之情形中，係投予含有抗hTROP2抗體的醫藥而能被治療。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之較佳的Log2 [MNC+1]設定值的組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9及15.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4及13.5所組成之群組的一個數值的組合。
又，作為其他較佳的組合，可列舉在hTROP2基因中係選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9及14.0所組成之群組的一個數值及在SLFN11基因中係選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4及12.5所組成之群組的一個數值的組合。
再者作為其他組合，可列舉在hTROP2基因中係選自12.0、13.0或14.0的一個數值及在SLFN11基因中係選自11.5、12.0或12.5的一個數值的組合。
作為在hTROP2及SLFN11基因中之再佳的Log2 [MNC+1]設定值的其他組合，可列舉選自由在hTROP2基因中之12.0及在SLFN11基因中之11.5的組合、在hTROP2基因中之14.0及在SLFN11基因中之11.5的組合、在hTROP2基因中之12.0及在SLFN11基因中之12.5的組合、以及在hTROP2基因中之14.0及在SLFN11基因中之12.5的組合所組成之群組的任一組合。
基因表現量的測定及評價亦可同時針對hTROP2基因及SLFN11基因進行。
或者，亦可針對在一開始進行hTROP2基因的表現量的測定及評價而被評價為hTROP2基因的表現量高之人類患者，進行SLFN11基因的表現量的測定及評價。
或者，亦可針對在一開始進行SLFN11基因的表現量的測定及評價而被評價為SLFN11基因的表現量高之人類患者，進行hTROP2基因的表現量的測定及評價。
在一些態樣中，於mRNA層級的hTROP2及SLFN11基因表現係使用法規機構所認可的試驗進行評價。在一些態樣中，前述法規機構所認可的試驗係FDA、EMA或PMDA所認可的試驗。
試驗套組 本發明亦關於具備用於實施本發明方法的一些構成之診斷試驗套組。診斷試驗套組使診斷分析的實施中之便利性、迅速性及再現性提升。例如，在以qRT-PCR為基礎的態樣中，基本的診斷試驗套組包含分析基因的表現之PCR引子。在其他態樣中，更詳細的試驗套組，除了PCR引子，更具備用於使用PCR技術測定基因表現程度之緩衝劑、試藥及詳細說明書。在一些態樣中，該套組具備除了試驗流程及RNA樣本以外之試驗所需的所有耗材。 [實施例]
藉由以下的實施例具體地說明本發明，但本發明不受限於此等實施例。
實施例1.抗體藥物結合物的製造 遵循國際公開第2015/098099號及國際公報第2017/002776所記載之製造方法，使用人源化抗hTROP2抗體(包含由序列識別號1中胺基酸編號20至470所記載的胺基酸序列而成之重鏈及由序列識別號2中胺基酸編號21至234所記載的胺基酸序列而成之輕鏈而成的抗體)，製造由下式所示之藥物連接子，與抗hTROP2抗體藉由硫醚鍵所結合之抗體藥物結合物(以下稱為「抗體藥物結合物(1)」)，
Figure 02_image013
(式中，A表示與抗hTROP2抗體的結合位置)。每一分子抗體的平均藥物結合數能在0～8的範圍調整，但本次製造平均藥物結合數3.5～4.5的抗體藥物結合物，並在以下的實施例中使用。
實施例2.抗體藥物結合物的抗腫瘤效果的評價(1) 小鼠：將5～8週齡的雌nu/nu小鼠(Envigo)在實驗使用前以SPF條件化馴化3日以上。對小鼠餵食已滅菌的固體飼料(Teklad2919，Envigo)，並給予經逆滲透膜處理的水(包含2ppm氯)。
測定、計算式：以電子式數位測徑器(CD-6PMX，Mitutoyo Corp.)，1週測定2次腫瘤的長徑及短徑，使用以下的計算式算出腫瘤體積(mm3 )。 腫瘤體積(mm3 )=0.52×長徑(mm)×[短徑(mm)]2
使用將源自各癌患者的腫瘤片移植至小鼠皮下並進行繼代而得之腫瘤，將已細切成約5x5x5mm3 的腫瘤片皮下移植至雌nu/nu小鼠的左側腹部，作成各源自患者的腫瘤異種移植(patient-derived xenograft，PDX)模式。在已移植的腫瘤體積的平均值到達150～300mm3 的時間點實施隨機分組(第0日)。在分組的同日，以10mg/kg的用量，尾靜脈內投予抗體藥物結合物(1)。作為陰性對照，以10mL/kg的液量同樣地投予配方緩衝液(Formulation buffer)。使用投予21日後的各腫瘤體積，遵循以下的計算式算出腫瘤增殖抑制率(TGI(%))(表1)。 腫瘤增殖抑制率(%)=100×(1-Tf/平均 Cf) Tf：抗體藥物結合物(1)在投予21日後的腫瘤體積 平均 Cf：陰性對照組小鼠在投予21日後的腫瘤體積的相加平均值
上述全部的試驗係在Champions Oncology公司(Champions公司)進行實施。
表1 在各PDX模式中之抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤活性(TGI%)
Figure 108130044-A0304-0001
實施例3.在源自各PDX小鼠模式的腫瘤中之hTROP2及SLFN11基因表現量(RPKM值)、以及與抗體藥物結合物(1)抗腫瘤活性的關聯 實施例2中所使用之在各PDX模式中之基因表現量資料係將利用Champions公司所取得及標準化之RPKM值加上1，取得作為對數(Log2 )值之Log2 [RPKM+1]值(表2)，使用此而分析抗體藥物結合物(1)在PDX模式中之抗腫瘤活性(表1)與hTROP2基因及SLFN11基因的表現量的關聯。在將已評價的全部模式分成hTROP2基因及SLFN11基因顯示一定以上的表現量的組別之情形(表3)，顯示一定以上的藥效(本次採用TGI為75%以上的基準作為一例)之動物模式的比例係顯示hTROP2基因表現愈增加且SLFN11基因表現愈增加則愈提高(表4)。未進行依SLFN11基因表現的分組之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例係停止在47～63%，明顯得知hTROP2基因表現量及SLFN11基因表現量的組合能使用作為預測抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤效果之感受性標記。例如，hTROP2基因的Log2 [RPKM+1]值大於7.5且SLFN11基因的Log2 [RPKM+1]值大於1.0之情形、或hTROP2基因的Log2 [RPKM+1]值大於6.5且SLFN11基因的Log2 [RPKM+1]大於2.0之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例成為約80%至100%。又，hTROP2基因的Log2 [RPKM+1]值大於7.5且SLFN11基因的Log2 [RPKM+1]值大於2.0之情形、或hTROP2基因的Log2 [RPKM+1]值大於6.5且SLFN11基因的Log2 [RPKM+1]大於3.0之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例成為100%。此外，即使在TGI為60%以上或70%以上之情形，藉由TGI為75%以上之情形中所設定之各Log2 [RPKM+1]值，亦能以同等的預測率預測抗腫瘤效果。TGI為80%以上之情形，僅Log2 [RPKM+1]值大於7.5且SLFN11基因的Log2 [RPKM+1]值大於1.0且2以下之情形的預測率低於60%。
表2 在各PDX模式中之hTROP2基因及SLFN11基因表現量
Figure 108130044-A0304-0002
表3 表現一定量以上的hTROP2基因及表現一定量以上的SLFN11基因之PDX模式數量
Figure 108130044-A0304-0003
表4 在表現一定量以上的hTROP2基因表現及表現一定量以上的SLFN11基因之PDX模式中由抗體藥物結合物(1)所致之TGI顯示75%以上的比例
Figure 108130044-A0304-0004
實施例4.抗體藥物結合物的抗腫瘤效果的評價(2) 小鼠：將5～8週齡的雌nu/nu小鼠(Envigo)在實驗使用前以SPF條件化進行3日以上的馴化。對小鼠餵食已滅菌的固體飼料(Teklad2919，Envigo)，並給予經逆滲透膜處理的水(包含2ppm氯)。
測定、計算式：以電子式數位測徑器(CD-6PMX，Mitutoyo Corp.)，1週測定2次腫瘤的長徑及短徑，使用以下的計算式算出腫瘤體積(mm3 )。 腫瘤體積(mm3 )=0.52×長徑(mm)×[短徑(mm)]2
使用將源自各癌患者的腫瘤片移植至小鼠皮下並進行繼代而得之腫瘤，將細切成約5x5x5mm3 的腫瘤片皮下移植至雌nu/nu小鼠的左側腹部，作成各源自患者的腫瘤異種移植(PDX)模式。在已移植的腫瘤體積的平均值到達150～300mm3 的時間點隨機實施分組第0日)。在分組的同日，以10mg/kg的用量，尾靜脈內投予抗體藥物結合物(1)。作為陰性對照，以10mL/kg的液量同樣地投予配方緩衝液。
針對實施例2及本實施例所評價之PDX模式，使用投予10～15日後的各腫瘤體積，遵循以下的計算式算出腫瘤增殖抑制率(TGI(%))(表5)。 腫瘤增殖抑制率(%)=100×(1-Tf/平均 Cf) Tf：抗體藥物結合物(1)在投予10～15日後的腫瘤體積 平均 Cf：陰性對照組小鼠在投予10～15日後的腫瘤體積的相加平均值
表5 在各PDX模式中之抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤活性(TGI%)
Figure 108130044-A0304-0005
實施例5.在源自各PDX小鼠模式的腫瘤中之hTROP2及SLFN11基因表現量(FPKM值)、以及與抗體藥物結合物(1)抗腫瘤活性的關聯 在實施例4中所使用之在各PDX模式中之基因表現量資料係使用由各腫瘤的福馬林固定石蠟包埋標本所萃取之RNA，並利用次世代RNA定序法而取得。將所取得的資料標準化成FPKM值後，在FPKM加上1，設為作為對數(Log2 )的值之Log2 [FPKM+1]值(表6)，使用此而分析抗體藥物結合物(1)在PDX模式中之抗腫瘤活性(表5)與hTROP2基因及SLFN11基因的表現量的關聯。在將所評價之全部模式分成hTROP2基因及SLFN11基因顯示一定以上的表現量之群組之情形(表7)，顯示一定以上的藥效(本次採用TGI為75%以上的基準作為一例)之動物模式的比例係顯示hTROP2基因表現愈增加且SLFN11基因表現愈增加則愈提高(表8)。在不進行依SLFN11基因表現之分組之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例係停止在43～50%，明確得知hTROP2基因表現量及SLFN11基因表現量的組合能使用作為預測抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤效果之感受性標記。例如，在hTROP2基因的Log2 [FPKM+1]值大於7.0且SLFN11基因的Log2 [FPKM+1]值大於2.0之情形、或hTROP2基因的Log2 [FPKM+1]值大於6.0且SLFN11基因的Log2 [FPKM+1]大於3.0之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例成為約80%至100%。又，在hTROP2基因的Log2 [FPKM+1]值大於7.0且SLFN11基因的Log2 [FPKM+1]值大於3.0之情形，TGI顯示為75%以上之動物模式的比例成為100%。此外，即使在TGI為70%或80%以上之情形，藉由在TGI為75%以上之情形中所設定之各Log2 [FPKM+1]值，亦能以同等的預測率預測抗腫瘤效果。
表6 在各PDX模式中之hTROP2基因及SLFN11基因表現量
Figure 108130044-A0304-0006
表7 表現一定量以上的hTROP2基因及表現一定量以上的SLFN11基因之PDX模式數量
Figure 108130044-A0304-0007
表8 在表現一定量以上的hTROP2基因及表現一定量以上的SLFN11基因之PDX模式中由抗體藥物結合物(1)所致之TGI顯示為75%以上的比例
Figure 108130044-A0304-0008
實施例6.化合物(1)的製造 遵循國際公開第2014/057687號及國際公報第2015/115091所記載之製造方法，製造由下式所示之化合物(以下，稱為「化合物(1)」)
Figure 02_image015
。
實施例7.在SLFN11減弱時的細胞增殖抑制試驗 7-(1)：對於人類咽頭癌細胞株FaDu的效果 由ATCC取得人類咽頭癌細胞株FaDu，並使用於評價。在10cm細胞培養培養皿中，將利用包含非必需胺基酸溶液、丙酮酸溶液及10%胎牛血清的MEM培養基懸浮成2×105 cells/mL之FaDu細胞播種至10mL/培養皿。從播種起經過24小時後，將100pmol的ON-TARGETplus SLFN11 siRNA (Dharamcon)或ON-TARGETplus Non-targeting Control Pool(Dharamcon)及30μL的LipofectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent(ThermoFisher)懸浮於1mL的Opti-MEM培養基，並將全部量添加至培養基。經過72小時後，去除培養基並利用PBS清洗後，使用1mL的TrypLETM Express，從培養皿分離細胞並回收。所回收之細胞係利用包含非必需胺基酸溶液、丙酮酸溶液及10%胎牛血清的MEM培養基懸浮成5×104 cells/mL。以100μL/孔播種至96孔細胞培養盤。從播種起24小時後，以100μL/孔將培養基交換成包含100nM、33nM、11nM、3.7nM、1.2nM、0.41nM、0.13nM、0.045nM或0nM的化合物(1)或抗體藥物結合物(1)之培養基。抗體藥物結合物(1)的莫耳濃度係將平均分子量設為150,000而算出。細胞皆在37℃、5%CO2 下進行培養。從培養基交換起經過72小時後，以100μL/孔添加至ATPlite 1step檢測系統(PerkinElmer)，在室溫培養10分鐘後，測定各孔的發光強度。
各條件中之細胞增殖抑制率(%)係使用以下的計算式而算出。 細胞增殖抑制率(%)=100×(1-T/C) T：各檢體添加孔的平均發光強度 C：已添加各檢體0nM之孔的平均發光強度
在各條件中之50%抑制濃度係在以下的計算式中進行擬合並算出。
細胞生存率(%)=(Emax-Emin)×檢體濃度γ /((Emax-50)/(50-Emin)×IC50γ +檢體濃度γ )+Emin Emax：最大細胞增殖抑制率(%) Emin：最小細胞增殖抑制率(%) IC50：50%抑制濃度 γ：Hill係數
對計算式的擬合係使用SAS system Release 9.2(SAS Institute Inc.)。
將在SLFN11減弱時的FaDu細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果揭示於圖4。又，將所算出之各50%抑制濃度揭示於表9。藉由對於Fadu細胞株的SLFN11減弱，化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖抑制效果減弱。
表9 在FaDu細胞中之SLFN11減弱時的化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖50%抑制濃度及其變化倍率
Figure 108130044-A0304-0009
7-(2)：對於人類肺癌細胞株NCI-H1781的效果 由ATCC取得人類肺癌細胞株NCI-H1781，並使用於評價。在10cm細胞培養培養皿中，將利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成2×105 cells/mL之NCI-H1781細胞播種至10mL/培養皿。從播種起經過24小時後，將100pmol的ON-TARGETplus SLFN11 siRNA(Dharamcon)或ON-TARGETplus無標靶對照池(Dharamcon)及30μL的LipofectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent (ThermoFisher)懸浮於1mL的Opti-MEM培養基，並將全部量添加至培養基。經過72小時後，去除培養基並利用PBS清洗後，使用1mL的TrypLETM Express，從培養皿分離細胞並回收。所回收之細胞係將利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成5×104 cells/mL。以100μL/孔播種至96孔細胞培養盤。從播種起24小時後，以100μL/孔將培養基交換成包含100nM、33nM、11nM、3.7nM、1.2nM、0.41nM、0.13nM、0.045nM或0nM的化合物(1)或抗體藥物結合物(1)之培養基。抗體藥物結合物(1)的莫耳濃度係將平均分子量設為150,000而算出。細胞皆在37℃、5%CO2 下進行培養。從培養基交換起經過72小時後，以100μL/孔添加至ATPlite 1step檢測系統(PerkinElmer)，在室溫培養10分鐘後，測定各孔的發光強度。
各條件中之細胞增殖抑制率(%)係使用以下的計算式而算出。 細胞增殖抑制率(%)=100×(1-T/C) T：各檢體添加孔的平均發光強度 C：已添加各檢體0nM之孔的平均發光強度
各條件中之50%抑制濃度係在以下的計算式中進行擬合並算出。 細胞生存率(%)=(Emax-Emin)×檢體濃度γ /((Emax-50)/(50-Emin)×IC50γ +檢體濃度γ )+Emin Emax：最大細胞增殖抑制率(%) Emin：最小細胞增殖抑制率(%) IC50：50%抑制濃度 γ：Hill係數
對計算式的擬合係使用SAS system Release 9.2(SAS Institute Inc.)。
將在SLFN11減弱時的NCI-H1781細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果揭示於圖5。又，將所算出之各50%抑制濃度揭示於表10。藉由對於NCI-H1781細胞株的SLFN11減弱，化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖抑制效果減弱。
表10 在NCI-H1781細胞中之SLFN11減弱時的化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖50%抑制濃度及其變化倍率
Figure 108130044-A0304-0010
7-(3)：對於人類肺癌細胞株Calu-3的效果 由ATCC取得人類肺癌細胞株Calu-3，並使用於評價。在10cm細胞培養培養皿中，將利用包含非必需胺基酸溶液、丙酮酸溶液及10%胎牛血清的MEM培養基懸浮成2×105 cells/mL之Calu-3細胞播種至10mL/培養皿。從播種起經過24小時後，將100pmol的ON-TARGETplus SLFN11 siRNA(Dharamcon)或ON-TARGETplus 無標靶對照池(Dharamcon)及30μL的LipofectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent(ThermoFisher)懸浮於1mL的Opti-MEM培養基，並將全部量添加至培養基。經過72小時後，去除培養基並利用PBS清洗後，使用1mL的TrypLETM Express，從培養皿分離細胞並回收。所回收之細胞係在包含非必需胺基酸溶液、丙酮酸溶液及10%胎牛血清的MEM培養基中懸浮成5×104 cells/mL。以100μL/孔播種於96孔細胞培養盤。從播種起24小時後，以100μL/孔將培養基交換成包含100nM、33nM、11nM、3.7nM、1.2nM、0.41nM、0.13nM、0.045nM或0nM的化合物(1)或抗體藥物結合物(1)之培養基。抗體藥物結合物(1)的莫耳濃度係將平均分子量設為150,000而算出。細胞皆在37℃、5%CO2 下進行培養。從培養基交換起經過72小時後，以100μL/孔添加至ATPlite 1step檢測系統(PerkinElmer)，在室溫培養10分鐘後，測定各孔的發光強度。
各條件中之細胞增殖抑制率(%)係使用以下的計算式而算出。 細胞增殖抑制率(%)=100×(1-T/C) T：各檢體添加孔的平均發光強度 C：已添加各檢體0nM之孔的平均發光強度
各條件中之50%抑制濃度係在以下的計算式中進行擬合並算出。 細胞生存率(%)=(Emax-Emin)×檢體濃度γ /((Emax-50)/(50-Emin)×IC50γ +檢體濃度γ )+Emin Emax：最大細胞增殖抑制率(%) Emin：最小細胞增殖抑制率(%) IC50：50%抑制濃度 γ：Hill係數
對計算式的擬合係使用SAS system Release 9.2(SAS Institute Inc.)。
將在SLFN11減弱時的Calu-3細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果揭示於圖6。又，將所算出之各50%抑制濃度揭示於表11。藉由對於Calu-3細胞株的SLFN11減弱，化合物(1)的細胞增殖抑制效果減弱。
表11 在Calu-3細胞中之SLFN11減弱時的化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖50%抑制濃度及其變化倍率
Figure 108130044-A0304-0011
7-(4)：對於人類乳癌細胞株MDA-MB-468的效果
由ATCC取得人類乳癌細胞株MDA-MB-468，並使用於評價。在10cm細胞培養培養皿中，將利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成2×105 cells/mL之MDA-MB-468細胞播種至10mL/培養皿。從播種起經過24小時後，將100pmol的ON-TARGETplus SLFN11 siRNA(Dharamcon)或ON-TARGETplus 無標靶對照池(Dharamcon)及30μL的LipofectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent(ThermoFisher)懸浮於1mL的Opti-MEM培養基，並將全部量添加至培養基。經過72小時後，去除培養基並利用PBS清洗後，使用1mL的TrypLETM Express，從培養皿分離細胞並回收。所回收之細胞係將利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成5×104 cells/mL。以100μL/孔播種至96孔細胞培養盤。從播種起24小時後，以100μL/孔將培養基交換成包含100nM、33nM、11nM、3.7nM、1.2nM、0.41nM、0.13nM、0.045nM或0nM的化合物(1)或抗體藥物結合物(1)之培養基。抗體藥物結合物(1)的莫耳濃度係將平均分子量設為150,000而算出。細胞皆在37℃、5%CO2 下進行培養。從培養基交換起經過72小時後，以100μL/孔添加至ATPlite 1step檢測系統(PerkinElmer)，在室溫培養10分鐘後，測定各孔的發光強度。
各條件中之細胞增殖抑制率(%)係使用以下的計算式而算出。 細胞增殖抑制率(%)=100×(1-T/C) T：各檢體添加孔的平均發光強度 C：已添加各檢體0nM之孔的平均發光強度
各條件中之50%抑制濃度係在以下的計算式中進行擬合並算出。 細胞生存率(%)=(Emax-Emin)×檢體濃度γ /((Emax-50)/(50-Emin)×IC50γ +檢體濃度γ )+Emin Emax：最大細胞增殖抑制率(%) Emin：最小細胞增殖抑制率(%) IC50：50%抑制濃度 γ：Hill係數
對計算式的擬合係使用SAS system Release 9.2(SAS Institute Inc.)。
將在SLFN11減弱時的MDA-MB-468細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果揭示於圖7。將所算出之各50%抑制濃度揭示於表12。藉由對於MDA-MB-468細胞株之SLFN11減弱，化合物(1)的細胞增殖抑制效果減弱。
表12 在MDA-MB-468細胞中之SLFN11減弱時的化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖50%抑制濃度及其變化倍率
Figure 108130044-A0304-0012
7-(5)：對於人類乳癌細胞株HCC38的效果
由ATCC取得人類乳癌細胞株HCC38，並使用於評價。在10cm細胞培養培養皿中，將利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成2×105 cells/mL之HCC38細胞播種於10mL/培養皿。從播種起經過24小時後，將100pmol的ON-TARGETplus SLFN11 siRNA(Dharamcon)或ON-TARGETplus 無標靶對照池(Dharamcon)及30μL的LipofectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent (ThermoFisher)懸浮於1mL的Opti-MEM培養基，並將全部量添加至培養基。經過72小時後，去除培養基並利用PBS清洗後，使用1mL的TrypLETM Express從培養皿分離細胞並回收。所回收之細胞係利用包含10%胎牛血清的RPMI-1640培養基懸浮成5×104 cells/mL。在96孔細胞培養盤以100μL/孔進行播種。從播種起24小時後，以100μL/孔將培養基交換成包含100nM、33nM、11nM、3.7nM、1.2nM、0.41nM、0.13nM、0.045nM或0nM的化合物(1)或抗體藥物結合物(1)的培養基。抗體藥物結合物(1)的莫耳濃度係將平均分子量設為150,000而算出。細胞皆在37℃、5%CO2 下進行培養。從培養基交換起經過72小時後，以100μL/孔添加至ATPlite 1step檢測系統(PerkinElmer)，在室溫培養10分鐘後，測定各孔的發光強度。
各條件中之細胞增殖抑制率(%)係使用以下的計算式而算出。 細胞增殖抑制率(%)=100×(1-T/C) T：各檢體添加孔的平均發光強度 C：已添加各檢體0nM之孔的平均發光強度
各條件中之50%抑制濃度係在以下計算式中進行擬合並算出。 細胞生存率(%)=(Emax-Emin)×檢體濃度γ /((Emax-50)/(50-Emin)×IC50γ +檢體濃度γ )+Emin Emax：最大細胞增殖抑制率(%) Emin：最小細胞增殖抑制率(%) IC50：50%抑制濃度 γ：Hill係數
對於計算式的擬合係使用SAS system Release 9.2(SAS Institute Inc.)。
將在SLFN11減弱時的HCC38細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果揭示於圖8。又，將所算出之各50%抑制濃度揭示於表13。藉由對於HCC38細胞株之SLFN11減弱，化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖抑制效果減弱。
表13 在HCC38細胞中之SLFN11減弱時的化合物(1)及抗體藥物結合物(1)的細胞增殖50%抑制濃度及其變化倍率
Figure 108130044-A0304-0013
實施例8.在臨床試驗中之源自各患者的腫瘤的hTROP2及SLFN11基因表現量(中位數標準化計數值)、以及與抗體藥物結合物(1)抗腫瘤活性的關聯
8-(1)試驗計劃及藥劑的效果 在將復發/進行性的非小細胞肺癌患者作為對象之第一相臨床試驗用量漸增部分中，抗體藥物結合物(1)在被辨識到無法容忍的毒性或病態的惡化前，每3週1次進行靜脈內投予。用量限制毒性係在Cycle 1(第1～21日)求取。在報名臨床試驗後直到第一次投藥前實施腫瘤採取。將在各患者中之投予用量及最大腫瘤變化率(%)揭示於表14。此外，最大腫瘤變化率的值為負值之情形，意指藉由抗體藥物結合物(1)的投予而腫瘤縮小。
8-(2)在腫瘤中之SLFN11、TROP2 mRNA 量的測定
各患者中之基因表現資料係由抗體藥物結合物(1)投藥前之各患者的腫瘤組織的福馬林固定石蠟包埋標本進行切片作成，並在進行由雷射顯微切割法(Laser microdissection)所致之腫瘤部位的切出後，利用EdgeSeq而取得。所取得之計數資料係藉由中位數標準化法而進行標準化，作為各基因的表現量。上述全部試驗係在HTG Molecular Diagnostics公司中實施。
在HTG Molecular Diagnostics公司所取得及標準化之中位數標準化計數(Median Normalized Count)(MNC)值加上1，取得作為對數(Log2 )的值之Log2 [MNC+1]值(表15)，使用此而分析抗體藥物結合物(1)的患者中之抗腫瘤活性(表14)與hTROP2基因及SLFN11基因的表現量的關聯。在將所評價之全部患者分成hTROP2基因及SLFN11基因顯示一定以上的表現量之群組之情形(表16)，顯示一定以上的藥效(最大腫瘤變化率為0%以下)之患者的比例係hTROP2基因表現愈增加且SLFN11基因表現愈增加而顯示愈提高(表17)。在不進行依SLFN11基因表現之分組之情形，最大腫瘤變化率顯示為0%之患者的比例係停止在75～80%，明確得知hTROP2基因表現量及SLFN11基因表現量的組合能使用作為預測抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤效果之感受性標記。例如，在hTROP2基因的Log2 [MNC+1]值大於12且SLFN11基因的Log2 [MNC+1]值大於11.5之情形，最大腫瘤變化率顯示為0%以下之患者的比例成為約80%至100%。
表14 在各患者中之抗體藥物結合物(1)的抗腫瘤活性(最大腫瘤變化率)
Figure 108130044-A0304-0014
表15 在各患者中之hTROP2基因及SLFN11基因表現量
Figure 108130044-A0304-0015
表16 表現一定量以上的hTROP2基因及表現一定量以上的SLFN11基因之患者數量
Figure 108130044-A0304-0016
表17 在表現一定量以上的hTROP2基因及表現一定量以上的SLFN11基因之患者中由抗體藥物結合物(1)所致之最大腫瘤變化率顯示為0%以下的比例
Figure 108130044-A0304-0017
 [序列表非關鍵詞文字]
序列識別號1：人源化抗hTROP2抗體重鏈的胺基酸序列 序列識別號2：人源化抗hTROP2抗體輕鏈的胺基酸序列 序列識別號3：人源化抗hTROP2抗體重鏈的CDRH1序列 序列識別號4：人源化抗hTROP2抗體重鏈的CDRH2序列 序列識別號5：人源化抗hTROP2抗體重鏈的CDRH3序列 序列識別號6：人源化抗hTROP2抗體輕鏈的CDRL1序列 序列識別號7：人源化抗hTROP2抗體輕鏈的CDRL2序列 序列識別號8：人源化抗hTROP2抗體輕鏈的CDRL3序列
無。
圖1呈示人源化抗hTROP2抗體重鏈的胺基酸序列(序列識別號1)。 圖2呈示人源化抗hTROP2抗體輕鏈的胺基酸序列(序列識別號2)。 圖3呈示人源化抗hTROP2抗體重鏈的CDRH1序列(序列識別號3)、CDRH2序列(序列識別號4)、及CDRH3序列(序列識別號5)、以及人源化抗hTROP2抗體輕鏈的CDRL1序列(序列識別號6)、CDRL2序列(序列識別號7)、及CDRL3序列(序列識別號8)。 圖4係呈示SLFN11減弱時的FaDu細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果的圖。 圖5係呈示SLFN11減弱時的NCI-H1781細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果的圖。 圖6係呈示SLFN11減弱時的Calu-3細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果的圖。 圖7係呈示SLFN11減弱時的MDA-MB-468細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果的圖。 圖8係呈示SLFN11減弱時的HCC38細胞中之由化合物(1)或抗體藥物結合物(1)所致之細胞增殖抑制效果的圖。
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002
Figure 12_A0101_SEQ_0003
Figure 12_A0101_SEQ_0004
Figure 12_A0101_SEQ_0005
Figure 12_A0101_SEQ_0006
無。

Claims (52)

  1. 一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價在該活體樣本中於mRNA層級的hTROP2基因的表現量之步驟； 3)在hTROP2基因的表現量被判斷為高之該活體樣本中評價於mRNA層級的SLFN11基因的表現量之步驟；及 4)將具有SLFN11基因的表現量被判斷為高之該活體樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體的醫藥的對象之步驟。
  2. 一種方法，其係在罹患癌的人類患者中，辨識投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之方法，包含： 1)從被診斷罹患癌的人類患者取得活體樣本之步驟； 2)評價在該樣本中於mRNA層級的hTROP2基因及SLFN11基因的表現量之步驟；及 3)將具有hTROP2基因及SLFN11基因的表現量被判斷為高之該樣本的人類患者辨識作為投予含有抗hTROP2抗體之醫藥的對象之步驟。
  3. 如請求項1或2之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由RNA定序而測定log2 [RPKM+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  4. 如請求項3之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9及9.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  5. 如請求項3或4之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  6. 如請求項3至5中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  7. 如請求項3至6中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  8. 如請求項3至7中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  9. 如請求項3至7中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由7.0、7.5及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  10. 如請求項9之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  11. 如請求項9之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於7.5之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  12. 如請求項9之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於8.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  13. 如請求項3至12中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  14. 如請求項3至13中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  15. 如請求項3至14中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  16. 如請求項3至14中任一項之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於選自由1.0、2.0及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  17. 如請求項16之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於1.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  18. 如請求項16之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於2.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  19. 如請求項16之方法，其中，log2 [RPKM+1]值大於3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  20. 如請求項1或2之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由RNA定序而測定log2 [FPKM+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  21. 如請求項20之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0.7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9及8.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  22. 如請求項20或21之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9及7.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  23. 如請求項20或21之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於6.0或7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  24. 如請求項22之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於6.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  25. 如請求項22之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於7.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  26. 如請求項20至25中任一項之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9及4.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  27. 如請求項20至26中任一項之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於選自由2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9及3.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  28. 如請求項20至26中任一項之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於2.0或3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  29. 如請求項28之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於2.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  30. 如請求項28之方法，其中，log2 [FPKM+1]值大於3.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  31. 如請求項1或2之方法，其中，由從被診斷罹患癌的人類患者所取得之活體樣本，藉由EdgeSeq檢定測定log2 [MNC+1]值，在其大於特定值之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因及/或SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  32. 如請求項31之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9及15.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  33. 如請求項31或32之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9及14.0所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  34. 如請求項31或32之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0、13.0或14.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  35. 如請求項34之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  36. 如請求項34之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於13.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  37. 如請求項34之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於14.0之情形中，於mRNA層級的hTROP2基因的表現量被判斷為高。
  38. 如請求項31至37中任一者之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4及13.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  39. 如請求項31至38中任一者之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4及12.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  40. 如請求項31至38中任一者之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於選自由11.5、12.0及12.5所組成之群組的任一者之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  41. 如請求項40之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於11.5之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  42. 如請求項40之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.0之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高。
  43. 如請求項40之方法，其中，log2 [MNC+1]值大於12.5之情形中，於mRNA層級的SLFN11基因的表現量被判斷為高，。
  44. 如請求項1至43中任一項之方法，其中，活體樣本包含腫瘤樣本。
  45. 如請求項1至44中任一項之方法，其中，含有抗hTROP2抗體的醫藥為抗hTROP2抗體藥物結合物。
  46. 如請求項45之方法，其中，抗hTROP2抗體藥物結合物為由下式所示之藥物連接子，與抗hTROP2抗體藉由硫醚鍵而結合之抗體藥物結合物，
    Figure 03_image017
    (式中，A表示與抗hTROP2抗體的結合位置)。
  47. 如請求項46之方法，其中，抗hTROP2抗體為包含由序列識別號1中胺基酸編號20至470所記載的胺基酸序列而成之重鏈及由序列識別號2中胺基酸編號21至234所記載的胺基酸序列而成之輕鏈的抗體。
  48. 如請求項47之方法，其中，抗hTROP2抗體的重鏈羧基末端的離胺酸殘基缺失。
  49. 如請求項46至48中任一項之方法，其中，藥物-連接子結構的每一抗體的平均結合數為2至8個的範圍。
  50. 如請求項46至49中任一項之方法，其中，藥物-連接子結構的每一抗體的平均結合數為3.5至4.5個的範圍。
  51. 如請求項45之方法，其中，抗hTROP2抗體藥物結合物為薩妥珠單抗加維特康(Sacituzumab Govitecan) (IMMU-132)。
  52. 如請求項1至51之方法，其中，癌為肺癌、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、前列腺癌、多形性神經膠質母細胞瘤、卵巢癌、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、子宮頸癌、子宮體癌、頭頸部癌、食道癌、膽管癌、甲狀腺癌、淋巴瘤、急性骨髓性白血病、急性淋巴性白血病及/或多發性骨髓瘤。
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Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11806405B1 (en) 2021-07-19 2023-11-07 Zeno Management, Inc. Immunoconjugates and methods

Family Cites Families (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0940468A1 (en) 1991-06-14 1999-09-08 Genentech, Inc. Humanized antibody variable domain
ES2434961T5 (es) 1998-04-20 2018-01-18 Roche Glycart Ag Ingeniería de glicosilación de anticuerpos para mejorar la citotoxicidad celular dependiente del anticuerpo
EP3031917A1 (en) 1999-04-09 2016-06-15 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. Method for controlling the activity of immunologically functional molecule
KR100850389B1 (ko) 1999-06-25 2008-08-04 제넨테크, 인크. 인간화 항-ＥｒｂＢ2 항체 및 항-ＥｒｂＢ2 항체를 사용한치료 방법
CN103333860B (zh) 2000-10-06 2015-07-08 协和发酵麒麟株式会社 产生抗体组合物的细胞
PT3483183T (pt) 2002-03-01 2021-06-02 Immunomedics Inc Imunoconjugado compreendendo anticorpos rs7 humanizados
JP2007509613A (ja) 2003-10-16 2007-04-19 ジェノミック ヘルス， インコーポレイテッド 遺伝子発現プロファイリングのためのｑＲＴ−ＰＣＲアッセイシステム
AR056857A1 (es) 2005-12-30 2007-10-24 U3 Pharma Ag Anticuerpos dirigidos hacia her-3 (receptor del factor de crecimiento epidérmico humano-3) y sus usos
US20080131428A1 (en) 2006-02-24 2008-06-05 Arius Research, Inc. Cytotoxicity mediation of cells evidencing surface expression of TROP-2
PL2129396T3 (pl) 2007-02-16 2014-02-28 Merrimack Pharmaceuticals Inc Przeciwciała przeciw ERBB3 i ich zastosowania
DK3912643T3 (da) 2009-02-13 2022-10-17 Immunomedics Inc Immunokonjugater med en intracellulært-spaltelig binding
WO2011068845A1 (en) 2009-12-02 2011-06-09 Immunomedics, Inc. Combining radioimmunotherapy and antibody-drug conjugates for improved cancer therapy
EA201500220A1 (ru) 2010-05-17 2015-10-30 Ливтех, Инк. Антитело против trop-2 человека, обладающее противоопухолевой активностью in vivo
EP2594589A1 (en) 2010-06-10 2013-05-22 Sapporo Medical University ANTI-Trop-2 ANTIBODY
RU2014116406A (ru) 2011-11-11 2015-12-20 Ринат Ньюросайенс Корп. Антитела, специфичные к trop-2, и их применения
US9427464B2 (en) 2011-11-22 2016-08-30 Chiome Bioscience Inc. Anti-human TROP-2 antibody having an antitumor activity in vivo
BR112015006521B1 (pt) 2012-10-11 2022-03-03 Daiichi Sankyo Company, Limited Conjugado anticorpo-fármaco, seu método de preparação e seu uso, fármacos e composição farmacêutica
ES2782248T3 (es) 2012-10-19 2020-09-11 Daiichi Sankyo Co Ltd Conjugado de anticuerpo y fármaco producido por la unión a través de un enlazador que tiene estructura hidrófila
AU2014371934B2 (en) * 2013-12-25 2020-01-23 Daiichi Sankyo Company, Limited Anti-TROP2 antibody-drug conjugate
KR102275925B1 (ko) 2014-01-31 2021-07-12 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 항-her2 항체-약물 접합체
JP2017114763A (ja) 2014-03-26 2017-06-29 第一三共株式会社 抗ｃｄ９８抗体−薬物コンジュゲート
KR20240008415A (ko) 2014-04-10 2024-01-18 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 항her3 항체-약물 콘주게이트
US11185594B2 (en) 2014-04-10 2021-11-30 Daiichi Sankyo Company, Limited (Anti-HER2 antibody)-drug conjugate
CA2990572C (en) 2015-06-29 2022-07-26 Daiichi Sankyo Company, Limited Method for selectively manufacturing antibody-drug conjugate
EP3572428A4 (en) 2017-01-17 2020-12-30 Daiichi Sankyo Company, Limited ANTI-GPR20 ANTIBODY AND ANTI-GPR20 ANTIBODY MEDICINAL CONJUGATE
TW202330036A (zh) 2017-05-15 2023-08-01 日商第一三共股份有限公司 抗體-藥物結合物之製造方法

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