TW201514310A - 發炎性疾病之抗-tnf與抗-il17組合療法生物標記 - Google Patents

發炎性疾病之抗-tnf與抗-il17組合療法生物標記 Download PDF

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Abstract

本發明中提供之方法,其係以評量來自於個體之試樣的CXCL1及/或CXCL5標記之量,預測抗-TNF與抗-IL-17組合療法在治療患發炎性疾病之個體的藥效。

Description

發炎性疾病之抗-TNF與抗-IL17組合療法生物標記
本申請案主張2013年1月21日提出之美國專利臨時申請案第61/754,917號之優先權。同時前述申請案之全部內容均包含於本申請案之中作為參考。
抗細胞激素療法對發炎性疾病,可治療其症狀並抑制病症之進行,因此目前已成為其標準之護理法。但儘管有多種治療選項,許多患者仍無法實質地經歷病症活性之降低。基本上,藉由組合藥劑以提高抑制免疫量係得到改善功效的似乎合理計策。但為達到該目的之組合抗細胞激素療法,卻由於無法接受之安全性及耐受性(REF)之課題而無法進展。雖然如此,在發炎性疾病之治療上仍期望找到可達到回應可接受的安全性之更進一步改善的正確組合療法。
風濕性關節炎(RA)係醫療上特別受到注目之發炎性疾病。RA為慢性之全身性自體免疫系統疾病,但其病因仍然不明。其在器官上顯示之病徵,包括由關節發炎而引發之疼痛、腫脹及漸進式骨骼及軟骨變形並會引發 多種包含貧血之併發症,且有提高心血管疾病之危險。RA的特徵在於藉由經活化的淋巴細胞、肥大細胞及嗜中性白血球細胞,而引起關節滑膜細胞浸潤,使關節滑膜增生及血管新生。據報告在2012年時已有超過5百萬人罹患RA,當中約26%為輕度,49%為中度,25%為重度病症,且罹患的女性比男性多3倍。但在許多病例中,以目前治療的療養方法並非完全有效。
抗-TNF療法在RA方面係最常處方之抗細胞激素療法。TNF係前驅發炎性細胞激素,可提高多種包括趨化細胞激素(chemokines)、細胞激素、類花生酸(eicosinoids)及間質金屬蛋白酶之與疼痛、炎症及關節變形相關的介體(mediator)之表現。然而在無法緩解之許多關節炎患者及嚙齒動物的疾病模式中,抗-TNF療法顯示對抑制該前驅發炎性患級之表現只有部分效果。根據許多體外研究,顯然TNF與IL-17共同作用以調節前驅發炎性基因之表現,因此使此二種治療成為具有吸引力之可能組合療法。實際上,最近之報告顯示,在小鼠CIA中組合抗-TNF/抗-IL-17有增加的功效。
因此,此項技術領域有必要開發發炎性疾病之療法,以及評價或預測對包含抗-TNF與抗-IL-17的組合發炎性疾病療法之回應的方法及用於評價或預測該回應之組成物。
本發明係基於識別抗-TNF及抗-IL-17之 組合療法的新穎之生物標記。特別,本發明係至少部分,基於觀察到相對於對照標記,抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法可降低患有發炎性疾病的個體之CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,這表示組合療法有效於或會有效於治療患有發炎性疾病之個體的效力。因此,本發明有用於:(i)評量個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法、(ii)檢測包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之有效性、(iii)對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法篩選進行臨床試驗之個體及(iv)識別用於治療對患有發炎性疾病之個體之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。
因此,本發明之一態樣,係提供評量個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療的方法。該方法包括下列步驟:對取自於個體之試樣評量其中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,並以該標記的表現量與對照標記的表現量比較。在與對照標記之表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即表示組合療法會有效於治療該個體。另一方面,與對照標記之表現量比較,在經過包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
另一態樣中,本發明提供評量患有發炎性疾病的個體是否將回應於包含抗-TNF治療與抗-IL-17 治療之組合療法的治療之方法。該方法包括下列步驟:處理取自於個體之試樣使其轉形,而可評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,以及將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較。在與對照標記的表現量比較時,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。或者,與對照標記之表現量比較,在經過包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
本發明之另一態樣,係提供以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療患有發炎性疾病之個體之方法。該方法包括下列步驟:篩選在與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較時,顯示CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高之個體,以及以組合療法對個體以治療有效量投藥。或者,與對照標記之表現量比較,在經過包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
本發明之又另一態樣,係在使患有發炎性疾病之個體禁用包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法。該方法包括下列步驟:篩選在與對照標記的表現量(例如正常或疾病之標準值或實驗值之範圍)比較 時,顯示CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低之個體。
本發明之又另一態樣,係提供對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法檢測治療之有效性之方法。該方法包括下列步驟:對取自於個體之試樣以組合療法以治療有效量投藥個體之後之個體的試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,以及將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較。在與對照標記之表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示組合療法會有效於治療該個體。
本發明之另一態樣,係提供對以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療發炎性疾病篩選進行臨床試驗的個體之方法。該方法包括下列步驟:對取自於個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,並將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較。在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該個體適於進行臨床試驗。另一方面,與對照標記之表現量比較,在經過包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
本發明之又另一態樣,係提供識別適於治 療患有發炎性疾病之個體之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法。該方法包括下列步驟:評量取自於個體之試樣的CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,並將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較。在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。該方法亦可包括以複數個不同之組合療法進行試驗。或者,與對照標記之表現量比較,在個體以組合療法投藥之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
本發明之又再另一態樣,係提供評量患有發炎性疾病的個體是否將回應包含抗-TNFα抗體與抗-IL-17抗體的組合療法之治療之方法。該方法包括下列步驟:將取自於個體之試樣使用與CXCL1及CXCL5標記之至少一者互相作用且將該試樣轉形而可偵測CXCL1及CXCL5標記之至少一者之藥劑,評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量與對照標記的表現量比較。在與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。另一方面,在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法投藥之後,與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者 的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
本發明之又再另一態樣,係在提供套組以:(i)評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該套組包括對取自於個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者之試劑的表現量、以及對照標記,例如正常之實驗值範圍。套組亦包括下列者之使用說明:(i)評量個體是否將回應組合療法、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該使用說明可對應於下述中任意一種或多種之態樣。
一具體實施例中,上述說明之任意一種或多種態樣係可與以下任意一種或多種特徵組合。
具體實施例中,係在抗-TNF治療與抗-IL-17治療對個體以預定量投藥之後,評量試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。具體實施例中,該預定量可包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之至少一者之低於治療劑量。另一具體實施例中,該預定量可包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之低於治療劑量。本發明再另一具體實施例中,該預定量可包含至少一種抗-TNF治療與抗-IL-17治療之治療劑量。本發明之又另一具體實 施例中,該預定量係包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之治療劑量。
具體實施例中,對照標記的表現量,係在個體以預定量之抗-TNF治療與抗-IL-17治療投藥之前,試樣中對照標記的表現量。
具體實施例中,對照標記的表現量,係患有發炎性疾病個體之族群中對照標記的平均表現量。另一具體實施例中,對照標記的表現量,係個體在含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之前,對照標記的表現量。
具體實施例中,對照標記包含CXCL1標記或CXCL5標記。另一具體實施例中,對照標記包含CXCL1標記及CXCL5標記二者。
具體實施例中,患有發炎性疾病個體之族群,係接受抗-TNF治療與抗-IL-17治療之至少一者。一具體實施例中,患有發炎性疾病個體之族群,係接受抗-TNF治療與抗-IL-17治療。
具體實施例中,抗-TNF治療包含抗-TNF結合蛋白。具體實施例中,抗-TNF結合蛋白包含可專一地結合於蛋白之抗體或其抗原結合片段。另一具體實施例中,該抗-TNF抗體或其抗原結合片段,係鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2、ScFv、SMIP、親和體(affibody)、吸附體(avimer)、彈性體(versabody)、奈米體(nanobody),功能域 抗體(a domain antibody)或前述任一者之任何抗原結合片段。
具體實施例中,該抗-TNF抗體係抗-TNFα抗體,例如人類抗-TNF抗體(如:Adalimumab(註冊商標)或其抗原結合片段)。另一具體實施例中,該抗-TNF抗體,包含人源化抗-TNF抗體(如:英夫利普單抗(infliximab)或其抗原結合片段)。
具體實施例中,該抗-TNFα結合蛋白包含融合蛋白(如:依那西普(etanercept)或其抗原結合片段)。
具體實施例中,該抗-IL-17治療包含抗-IL-17結合蛋白。具體實施例中,該抗-IL-17結合蛋白包含可專一結合至該蛋白質之抗體或其抗原結合片段。另一具體實施例中,該抗-IL-17抗體或其抗原結合片段,係鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2,ScFv、SMIP、親和體、吸附體、彈性體、奈米體、功能域抗體或前述任一者之抗原結合片段。
具體實施例中,該抗-IL-17抗體包含人類抗體(如:蘇金單抗(secukinumab)或RG7624或其抗原結合片段)。具體實施例中,該抗-IL-17抗體,係包含人源化抗體(如:10F7、B6-17或其抗原結合片段)。
具體實施例中,該抗-IL-17結合蛋白包含融合蛋白。
具體實施例中,該抗-TNF治療包含胺甲蝶 呤(methotrexate)、其類似物或其藥理上容許之鹽。具體實施例中,該抗-IL-17治療包含胺甲蝶呤、其類似物或其藥理上容許之鹽。具體實施例中,該抗-TNF治療與抗-IL-17治療之至少一者包含胺甲蝶呤、其類似物或其藥理上容許之鹽。具體實施例中,抗-TNF治療與抗-IL-17治療二者包含胺甲蝶呤、其類似物或其藥理上容許之鹽。
具體實施例中,該組合療法包含以結合TNF及IL-17之至少一者之多重專一性結合蛋白投藥。具體實施例中,該組合療法包含以結合TNF及IL-17之多重專一性結合蛋白投藥。具體實施例中,多重專一性結合蛋白包含結合TNF及IL-17之至少一者的雙可變功能域免疫球蛋白(DVD-IgTM)分子、半體DVD-Ig(hDVD-Ig)分子、三可變功能域免疫球蛋白(tDVD-Ig)分子、受體可變功能域免疫球蛋白(rDVD-Ig)分子、多價域DVD-Ig(pDVD-Ig)分子、單抗體DVD-Ig(mDVD-Ig)分子、交叉(cross over)(coDVD-Ig)分子、血腦障壁(bbbDVD-Ig)分子、含可分解連接部(cleavable linker)DVD-Ig(clDVD-Ig)分子或重導向細胞毒性型(redirected cytotoxicity)DVD-Ig(rcDVD-Ig)分子。
具體實施例中,係評量其CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。另一具體實施例中,係評量CXCL1及CXCL5標記的表現量。於其一例中,在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,表示該組合療法會有效。於另一例中,在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記二者之表現量 均較高時,表示該組合療法會有效。於又另一例中,在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低表示該組合療法有效。另一具體實施例中,在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記二者之表現量均較低表示該組合療法有效。
具體實施例中,個體係未預先以包含抗-TNF治療之單劑療法或以包含抗-IL-17治療之單劑療法進行治療。
具體實施例中,相較於包含抗-TNF治療之單劑療法,組合療法更大程度地降低CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。具體實施例中,相較於包含抗-TNF治療之單劑療法,組合療法更大程度地降低CXCL1及CXCL5標記的表現量。
具體實施例中,相較於包含抗-TNF治療之單劑療法,組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。
具體實施例中,個體係不回應包含抗-TNF治療之單劑療法。
具體實施例中,相較於包含抗-IL-17治療之單劑療法,組合療法更大程度地降低CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
具體實施例中,相較於包含抗-IL-17治療之單劑療法,組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。一具體實施例中,個體不回應包含抗-IL-17治療之單劑療法。
具體實施例中,相較於包含抗-TNF治療之單劑療法及包含抗-IL-17治療之單劑療法二者,組合療法更大程度地降低CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
具體實施例中,相較於包含抗-TNF治療之單劑療法及包含抗-IL-17治療之單劑療法二者,組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。
具體實施例中,個體不回應包含抗-TNF治療之單劑療法或包含抗-IL-17治療之單劑療法。
具體實施例中,CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,係以核酸量評量。具體實施例中,評量其CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,係藉由測定RNA,例如mRNA、miRNA或hnRNA。另一具體實施例中,評量其CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,係測定DNA(例如:cDNA)。具體實施例中,CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,可藉由使用聚合酶鏈鎖反應(PCR)擴增反應、反轉錄酶PCR分析、定量反轉錄酶PCR分析、北方印漬分析、RNA分解酶保護分析法、數位式RNA測定/定量法及其組合或次組合而評量。
具體實施例中,CXCL1及/或CXCL5標記包含蛋白質。該蛋白質以結合CXCL1及CXCL5標記之至少一者的結合蛋白測定。一具體實施例中,結合蛋白係結合CXCL1及CXCL5標記之至少一者的抗體或其抗原結合蛋白。
具體實施例中,抗體或其抗原結合片段包含標識,例如,放射性標識、生物素標識、發色團、螢光體及酵素。
具體實施例中,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量係使用免疫分析法、西方印漬分析法、放射性免疫分析法、免疫螢光光度、免疫沉澱、平衡透析、免疫擴散、電化學發光免疫分析法(ECLIA)、ELISA分析法、免疫聚合酶鏈鎖反應或其組合或次組合而評量。具體實施例中,免疫分析法包含溶液為主的免疫分析法,例如包含電化學發光、化學發光、螢光化學發光、螢光偏極或時間解析螢光法。具體實施例中,免疫分析法包含三明治型免疫分析法,例如包含電化學發光、化學發光或螢光化學發光法。
具體實施例中,藉由使用生物檢定,例如患者的細胞(如:單核細胞)係經移出且在含組合療法之培養基中測試之擬體內(ex vivo)分析而評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
具體實施例中,該試樣包含取自於個體之體液或其組成。具體實施例中,體液包含下列中至少一種者羊水、眼房液、玻璃狀液、膽汁、血液、乳汁、腦脊髓液、耳垢、乳糜、囊液、內淋巴、糞便、胃酸、胃液、淋巴、黏液、乳頭抽吸液、心囊液、外淋巴、腹膜液、血漿、胸膜滲液、膿、唾液、皮脂、精液、汗液、血清、痰、滑液、淚液、尿液、陰道分泌物或由活體組織切片收集之液 體。一具體實施例中,試樣包含取自於個體的血液。
具體實施例中,試樣包含取自於個體的組織或細胞或其組成。
具體實施例中,試樣係來自於顯現至少一種發炎性疾病症候之人類個體。一具體實施例中,試樣係來自於顯現風濕性關節炎之至少一種系統的人類個體。該風濕性關節炎之症候包括,但不限於,關節腫、關節痛、發炎及/或骨質流失。一具體實施例中,試樣係來自於顯現下列者之至少一種系統:牛皮癬(包括但不限定於皮膚發炎、皮膚刺激、皮膚泛紅、皮膚損傷、指甲穿孔、指甲脫落、指甲增厚及/或指甲變色)、牛皮癬性關節炎、關節黏連性脊椎炎、幼年特發性關節炎、貝賽特氏症、脊椎關節炎、葡萄膜炎或全身性紅斑性狼瘡的人類個體。
具體實施例中,個體係人類之個體。一具體實施例中,個體患有發炎性疾病。一具體實施例中,發炎性疾病係風濕性關節炎。另一具體實施例中,發炎性疾病係牛皮癬、牛皮癬性關節炎、關節黏連性脊椎炎、幼年特發性關節炎、貝賽特氏(Behcet’s)症、脊椎關節炎或葡萄膜炎、全身性紅斑性狼瘡。
具體實施例中,組合療法包含經針對TNF及IL-17之DVD-Ig分子。具體實施例中,DVD-Ig分子結合TNFα及IL-17。
具體實施例中,與CXCL1及CXCL5標記之至少一者相互作用之試劑,係抗-CXCL1或抗-CXCL5之 抗體或其抗原結合片段。
抗-CXCL1抗體之具體例,包括,但不限定於EMD Millipore公司:AP1151-100UG,Everest Biotech公司:EB09637,Lifespan Biosciences公司:LS-B2843、LS-B2513、LS-C108147,eBioscience公司:50-7519-42、50-7519-41,AbD Serotec公司:AAM40B、AAM40、AAR22B,Thermo Fisher Scientific公司:PA1-32959、PA1-32924、PA1-20861,Abbiotec公司:251349、12335-1-AP、AP08852PU-N,NovaTeinBio公司:63059,Abgent公司:AT1688a,Aviva Systems Biology公司:AVARP07032_P050、OASA08635、OAEB00281,United States Biological公司:C8297-97A、C8298-01B、C8298-01C,Creative Biomart公司:CAB-1005MH、CAB-3086MH、CAB-115MH,Novus Biologicals公司:NBP1-61297、NBP1-51486、NBP1-19301,Abnova公司:H00002919-M01、H00002919-D01P、H00002919-M03,Fitzgerald公司:70R-10502、及ProSci公司:31-057、42-129、42-196。
抗-CXCL5抗體之具體例,包括Lifespan Biosciences公司:LS-B5529,AbD Serotec公司:AHP1279、AAM42、AHP1279B,Proteintech Group公司:10809-1-AP、PA1-29657,Biorbyt公司:orb13909、orb13450,Acris Antibodies公司:AM31037PU-N、PP1003B2、PP1003P1,NovaTeinBio公司:63066、AT1694a、AT1693a,Aiva Systems Biology公司:OASA07658、OASA08449、OASA07657,United States Biological公司:C8297-98H1、C8297-98H、E2275-07,Creative Biomart公司:CAB-5426MH、CAB-5425MH,Novus Biologicals公司:33140002,Abnova公司:H00006374-M05、H00006374-M03、及H00006374-B01。
具體實施例中,與CXCL1及CXCL5標記之至少一者互相作用之試劑,包含CXCL1及CXCL5標記之至少一者的專一性核酸探針。
具體實施例中,評量試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,包含使用抗-CXCL1或抗-CXCL5抗體進行免疫分析。具體實施例中,試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之評量,係包含使用抗-CXCL1及抗-CXCL5抗體進行免疫分析。
具體實施例中,評量試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量包含分析法的新穎組合。
具體實施例中,發炎性疾病包含風濕性關節炎。本發明之其他具體實施例中,發炎性疾病包含下述之至少一種:牛皮癬、牛皮癬性關節炎、關節黏連性脊椎炎、幼年特發性關節炎、貝賽特氏症、脊椎關節炎、葡萄膜炎、及全身性紅斑性狼瘡。
具體實施例中,標記包含基因產物。基因產物可包含蛋白質或RNA。
又再另一態樣,本發明提供套組以:(i)評量患有發炎性疾病的個體是否將回應於包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療、(ii)檢測組合療法的 效力、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。套組包括對取自於個體試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑及對照標記。套組亦包括下列者之使用說明:(i)評量個體是否將回應於組合療法、(ii)檢測組合療法的效力、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該使用說明可對應於下述中任意一種或多種之態樣。
具體實施例中,套組中用以評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑包含擴增及測定CXCL1及CXCL5標記之至少一者的探針。
具體實施例中,套組中評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑包含抗體或其抗原結合片段。
具體實施例中,套組中又包含用於自個體取得生物試樣之試劑。
第1A圖所示係人類CXCL1蛋白質之胺基酸序列。
第1B圖所示係人類CXCL1基因之核酸序列。
第2A圖所示係人類CXCL5蛋白質之胺基酸序列。
第2B圖所示係人類CXCL5基因之核酸序列。
第3圖顯示在以小鼠膠原蛋白誘發關節炎(CIA)模式 中,相較於單獨抗-TNF治療或單獨抗-IL-17治療,抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法可予更佳之保護。
第4圖顯示相較於單獨抗-TNF治療或單獨抗-IL-17治療,組合抗-TNF治療與抗-IL-17治療展現較優異的骨保護。
第5圖顯示在小鼠及人類二者的滑膜細胞中,IL-17及TNF協同地上調CXCL1及CXCL5之基因表現。
第6圖顯示在小鼠軟骨細胞中,IL-17及TNF協同地上調CXCL1及CXCL5基因。
第7圖所示係CIA小鼠在單獨以抗-IL-17抗體、單獨以抗-TNF抗體、及以抗-IL-17抗體與抗-TNF抗體之組合時,腳掌溶解物及血清中CXCL1及CXCL5的蛋白質量。
第8圖所示為相較於正常對照,RA患者中CXCL1及CXCL5之上調。
第9圖顯示於以抗-TNF治療之RA患者及以抗-TNF+胺甲蝶呤治療之RA患者間CXCL1的量與CXCL5的量並無明顯之差異,且該類患者對任一種單一治療均為不敏感。
第10圖係圖示第9圖所示試驗之數值結果。
本發明係基於識別用於抗-IL-17與抗-TNF之組合療法的新穎生物標記。特別地,本發明係 基於,至少部分,觀察到相對於對照標記,抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法,可降低患有發炎性疾病的個體之CXCL1及/或CXCL5標記的表現量,其表示組合療法有效於或會有效於治療患有發炎性疾病之個體。因此,本發明有用於:(i)評量個體是否回應於包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法、(ii)檢測包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之有效性、(iii)對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法篩選進行臨床試驗的個體及/或(iv)識別用於治療對患有發炎性疾病之個體之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。
除非另行說明,本發明中所使用之科學及技術名詞係本技術領域中具有通常知識者熟知的含意。名詞之含意及範圍應為明確,惟當有任何潛在模糊不清處,本文提供之定義優先於所有詞典中或外來定意。同時,除非上下文中另有要求,單數名詞,例如“一(a)”或“一(an)”之記載,係包括其複數者,例如“一種或多種標記”(如生物標記),“一些”、“其類”、及“各種”。本說明書中,除非另行指明或指定,所謂“或”意指“及/或”。同時,使用之名詞“包括”、“包含”,以及其他形態之名詞,如“其包括”、“所包括”、“其包含”、及“所包含”,並無限定。此外,名詞如“單元”、“組分”,除非別行指明,係包含含1單位之單元及組分以及含多於1單位之單元及組分二者。
在句中之“評量患有發炎性疾病之個體是 否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法”,係指分析以一劑量之組合療法治療個體會是治療上有效(如可提供個體治療成效)或不會是治療上有效之可能性。分析治療會是或不會是有效之可能性,通常可在治療開始前或重新治療前進行。替代或組合地,可在治療期間進行分析有效治療之可能性,例如評量治療應繼續或中斷。
其名詞“抗-TNF之治療”包括對TNF相關疾病之任何治療及/或影響(如抑制)TNF路徑之任何治療。該名詞包括具有結合至或中和、抑制、降低或負調腫瘤壞死因子(TNF)活性之效果的TNF拮抗劑。具體實施例中,抗-TNF治療包含抗-TNF結合蛋白。具體實施例中,抗-TNF治療可包含抗-TNF抗體或其抗原結合片段。具體實施例中,抗體為鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2、ScFv、SMIP、親和體、吸附體、彈性體、奈米體、功能域抗體或前述任一者之抗原結合片段。
具體實施例中,抗-TNF抗體包含抗-TNFα抗體,如人類抗-TNF抗體如人類抗-TNFα抗體,如Adalimumab®或其抗原結合片段(參考美國專利第6,090,382號公報)。另一具體實施例中,抗-TNF抗體包含人源化抗-TNF抗體,如英夫利普單抗或其抗原結合片段。另一具體實施例中,抗-TNF結合蛋白包含融合蛋白,如依那西普或其抗原結合片段。其他具體實施例中,抗-TNF治療包含胺甲蝶呤、其類似物或其藥理上容許之 鹽。
具體實施例中,抗-TNF包含多重專一性結合蛋白。具體實施例中,多重專一性結合蛋白包含雙可變功能域免疫球蛋白(DVD-IgTM)分子、半體DVD-Ig(hDVD-Ig)分子、三可變功能域免疫球蛋白(tDVD-Ig)分子、受體可變功能域免疫球蛋白(rDVD-Ig)分子、多價DVD-Ig(pDVD-Ig)分子、單抗體DVD-Ig(mDVD-Ig)分子、交叉(coDVD-Ig)分子、血腦障壁(bbbDVD-Ig)分子、含可分解連接部之DVD-Ig(clDVD-Ig)分子或重導向細胞毒性型DVD-Ig(rcDVD-Ig)分子。
其名詞“抗-IL-17治療”包括對IL-17相關疾病之任何治療及/或影響(如抑制)IL-17路徑之任何治療。該名詞包括具有結合至或中和、抑制、降低或負調介白素17(IL-17)活性之效果的IL-17拮抗劑。具體實施例中,抗-IL-17治療包含抗-IL-17之結合蛋白。其他具體實施例中,抗-IL-17結合蛋白包含融合蛋白。具體實施例中,抗-IL-17治療包含抗-IL-17抗體或其抗原結合片段。具體實施例中,抗-IL-17抗體包含人類抗體,如蘇金單抗及RG7624或其抗原結合片段。具體實施例中,抗-IL-17抗體包含人源化抗體,如伊塞珠單抗、10F7、B6-17或其抗原結合片段。其他具體實施例中,抗-IL-17治療包含胺甲喋呤、其類似物或其藥理上容許之鹽。具體實施例中,抗-IL-17可包括如上述之多重專一性結合蛋白,並在以下更詳細說明。
評量生物標記表現量的免疫分析法中所使用之抗體,可經可偵測之標識予以標識。關於探針或抗體使用之名詞“標識”,係包含於探針或抗體併入標識(如放射性原子)之直接標識法、偶合(即物理性交聯)可偵測性物質標識至探針或抗體,以及藉由與其他已直接標識之試劑反應而間接標識探針或抗體。間接標識之例,包括如偵測以螢光標識初級抗體之二級抗體及以生物素在DNA探針之末端標識而可偵測其所標識的卵白素(streptavidin)之螢光。
一具體實施例中,抗體係經如放射性標識、發色團標識、螢光團標識或酵素標識所標識之抗體。另一具體實施例中,係使用與生物標記專一性結合之抗體衍生物,如接合在受質或蛋白質或蛋白質-配位子(ligand)對之配位子(如生物素-卵白素)的抗體,或者抗體片段(如單鏈抗體或分離之抗體超可變功能域)。
名詞“發炎性疾病”係指以慢性或急性發炎為特徵之疾病或異常。本技術領域中已知多種之發炎性疾病,可舉如關節炎,包括風濕性關節炎、骨關節炎、牛皮癬性關節炎、幼年特發性關節炎;壞死性腸結腸炎(NEC);胃腸炎;腸型感冒;胃型感冒;骨盆腔炎(PID);肺氣腫;胸膜炎;腎盂炎;咽炎;咽喉炎;咽峽炎;痤瘡;發炎泛紅;泌尿道感染;闌尾炎;黏液囊炎;結腸炎;膀胱炎;皮膚炎;靜脈炎;鼻炎;肌腱炎;扁桃腺炎;脈管炎;氣喘;自體免疫疾病;乳糜瀉;慢性前列腺炎;腎絲 球性腎炎;過敏症;發炎性腸炎;骨盆發炎症;再灌流損傷;類肉瘤病;移植排斥;脈管炎;間質性膀胱炎;花粉熱;齒根骨膜炎;動脈粥狀硬化;牛皮癬;關節黏連性脊椎炎;幼年特發性關節炎;貝賽特氏症;脊椎關節炎;葡萄膜炎;全身性紅斑性狼瘡,及一些癌症(如膽囊癌)。
其中之名詞“標記”或“生物標記”在此可交換使用,意指使用以指示生物狀態之物質,可舉如:基因、信使RNA、(mRNAs、微RNA(miRNAs))、異源核RNA(hnRNAs)、及蛋白質或其部分。
“表現量”或“表現型態”,意指例如與標準或對照比較時,個體內一種或多種標記或生物標記對照之表現的定量或定性的總結。
CXCL1及/或CXCL5之“表現量較高”或“表現量增加”,意指試驗之試樣的表現量高於用於評量表現之分析法的標準誤差,而以較高於對照試樣(如來自於健康而未受例如RA之發炎性疾病所苦的個體;及/或來自於病症進行緩慢之個體的試樣及/或數個對照試樣之CXCL1及/或CXCL5的平均表現量)之CXCL1及/或CXCL5表現量的至少2倍為佳,3、4、5、6、7、8、9或10倍或更多為更佳。
CXCL1及/或CXCL5之“表現量較低”或“表現量減低”,意指試驗之試樣的表現量低於供用於評量表現之分析法的標準誤差,而以較低於對照試樣(如來自於發炎性疾病進行快速之個體的試樣及/或例如RA之發炎 性疾病的個體在以療法之部分投藥前的試樣、及/或數個對照試樣之CXCL1及/或CXCL5的平均表現量)之CXCL1及/或CXCL5表現量的至少2倍為佳,3、4、5、6、7、8、9或10倍或更多為更佳。
名詞“CXCL1”意指趨化激素配位子1之基因,係屬CXC趨化激素家族之小的細胞激素,先前稱之為GRO1致癌基因、GROα、KC、嗜中性球細胞活化蛋白3(NAP-3)及促黑色素細胞腫瘤生長活性-α(MSGA-α)。在人類,該蛋白質係由CXCL1基因所編碼。在其他動物,該蛋白質為由異種同源基因所編碼。CXCL1之核苷酸及胺基酸序列在本技術領域中為已知並可如由例如NCBI GenBank的已公開而一般可得的資料庫(databases)查得。人類CXCL1基因可於GenBank Accession No.AAH11976.1,而人類CXCL1蛋白質可於NCBI Reference Sequence NM 001511.3查得。人類CXCL1蛋白質及基因之序列如第1A及1B圖所示。
其名詞“CXCL5”,意指CXCL5之基因,係屬CXC趨化激素家族之小的細胞激素,亦為先前已知的上皮衍生之嗜中性球細胞活化胜肽78(ENA-78)。CXCL5在細胞受發炎性細胞激素介白素-1或腫瘤壞死因子-α刺激之後產生。人類中,其蛋白質係由CXCL5基因所編碼,其他動物中,其蛋白質為由異種同源基因所編碼。本發明技術中CXCL5之核苷酸及胺基酸序列為已知,並可由例如NCBI GenBank之公開而一般可得的資料庫查得。人類 CXCL1基因可於GenBank Accession No.EAX05696.1,而人類CXCL1蛋白質可於NCBI Reference Sequence NM 002994.3查得。人類CXCL1蛋白質及基因之序列如第2A及2B圖所示。
提及基因時包括該基因之原生存在型或內源型基因,包括可見於個體中之基因的野生型、多形型(polymorphic)或對偶基因型之變體或突變體(如生殖細胞突變、體細胞突變)基因。具體實施例中,生物標記基因之序列以至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%相同於CXCL1及/或CXCL5序列為佳。序列同一性可如以NCBI BLAST(如具有預設參數之Megablast)比較其序列而得。
具體實施例中,生物標記表現量係相對於對照試樣而評量,如正常組織(如評量所觀察之正常組織的試樣中生物標記之表現量的範圍)生物標記的表現量。一具體實施例中,生物標記表現量係相對於對照試樣而評量,如來自於其他患有發炎性疾病的個體之試樣中生物標記之表現量。例如,來自於其他個體的試樣中生物標記之表現量,可經評量而定義出與含抗-TNF治療及/或抗-IL-17治療的治療相關之敏感性(sensitivity)的量,再將來自感興趣之個體的試樣之生物標記的表現量與此等表現量比較。
名詞“已知之標準量”或“對照量”,係指用以與衍生自個體之試樣中之生物標記比較表現量之已 接受或預定之例如CXCL1及/或CXCL5的生物標記之表現量。一具體實施例中,生物標記之對照表現量,係於衍生自於個體族群的試樣中生物標記之平均表現量,舉例如具有如RA的發炎性疾病之個體族群的試樣的生物標記之平均表現量。另一具體實施例中,該族群係包含不回應抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之個體組或以高或正常量表現各生物標記之個體組。另一具體實施例中,對照量係由正常組織之生物標記的表現量範圍所組成。另一具體實施例中,對照量係由來自帶有RA之各種個體的細胞或血漿中生物標記的表現量所組成。另一具體實施例中,“對照量”亦意指對個體的預治療量。
當由於例行操作本文所述的方法而有更多資訊可以應用,可使用本發明中生物標記之“對照”表現量族群平均值。其他具體實施例中,生物標記之“對照”表現量,可以由已歸檔之個體試樣等,在個體可能發症發炎性疾病之前評量自個體取得之個體試樣中各生物標記的表現量而予以評量。
本發明中生物標記的對照表現量,可自已公開而一般可得的資料庫獲得。同時,Universal Reference Total RNA(Clontech Laboratories)、及Universal Human Reference RNA(Stratagene)等可使用為對照。舉例如qPCR可用以評量生物標記之表現量,以及相對於使用該對照用以偵測所需的循環數,偵測來自個體之試樣中的生物標記表現量所需的循環數的增加顯示生物標記之表現量低。
本文中使用之名詞“個體”或“患者”,意指人類及如家畜之非人類動物患者。其中之名詞“非人類動物”,包括脊椎動物,諸如:如非人類靈長類、小鼠、囓齒類、兔、山羊、犬、貓、馬、牛、綿羊、狗、貓、馬或牛屬之哺乳動物。具體實施例中,個體係人類(如帶有如RA之發炎性疾病的人類)。
其中名詞“試樣”,意指自個體取得或單離之細胞、組織或體液,以及存在於個體之細胞、組織或體液。其中名詞“試樣”,包括任何來自個體之體液、組織或細胞或細胞集合,以及其任何組分,如片段或萃取液。一具體實施例中,組織或細胞係由個體移出。另一具體實施例中,組織或細胞係存在於個體內。具體實施例中,體液包含:羊水、眼房液、玻璃狀液、膽汁、血液、乳汁、腦脊髓液、耳垢、乳糜、囊液、內淋巴、糞便、胃酸、胃液、淋巴、黏液、乳頭抽吸液、心囊液、外淋巴、腹膜液、血漿、胸膜滲液、膿、唾液、皮脂、精液、汗液、血清、痰、滑液、淚液、尿液、陰道分泌物或由活體組織切片收集之液體。一具體實施例中,試樣係包含來自於個體的蛋白質(如蛋白質或胜肽)。另一具體實施例中,試樣係包含來自於個體的RNA(如mRNA)或DNA(如基因體DNA分子)。
以下再更詳細說明本發明之各態樣。
I.預測患有發炎性疾病之個體對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之回應及相關方法
各態樣中,本發明提供評量以患有發炎性疾病的個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法的治療之方法。該方法包括下述步驟:評量取自於個體之試樣的CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及以該標記表現量與對照標記表現量比較。在與對照標記之表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,表示組合療法會有效於治療個體。或者,與以組合療法治療之前的對照標記表現量比較,在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,表示組合療法會有效於治療個體。
另一態樣中,本發明提供評量患有發炎性疾病的個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療的方法。本發明中之方法包含下列步驟:處理取自於個體之試樣以使其經轉形,而可評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常或疾病的標準值或實驗值之範圍)比較。在與對照標記表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,表示組合療法會有效於治療個體。另一方面,與對照標記表現量比較,在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,表示組合療法可有效於治療個體。
又另一態樣,本發明提供以包含抗-TNF 治療與抗-IL-17治療的組合療法治療患有發炎性疾病之個體的方法。該方法包括下列步驟:篩選在與對照標記之的表現量比較時,顯示CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高之個體,及以組合療法對個體以治療有效量投藥。或者,與對照標記表現量比較,在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,表示組合療法會有效於治療個體。
又另一態樣,本發明提供在使患有發炎性疾病之個體禁用包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法。該方法包括下列步驟:篩選在與對照標記之表現量或正常之實驗值範圍比較時,顯示CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低之個體。
又再另一態樣,本發明提供對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法檢測治療之有效性之方法。該方法包括下列步驟:對取自於經組合療法以治療有效量投藥個體之後之個體的試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將該標記的表現量與對照標記的表現量(例如正常之實驗值範圍)比較。在與對照標記表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,表示組合療法會有效於治療個體。
另一態樣,本發明供對以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療發炎性疾病篩選進行臨床試驗的個體之方法。該方法包括下列步驟:對取自於個 體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將該標記的表現量與對照標記之表現量比較。在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該個體適於進行臨床試驗。或者,與對照標記之表現量比較,在經過包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法在臨床試驗中會有效於治療個體。
又另一態樣,本發明提供識別適於治療患有發炎性疾病之個體之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法。該方法包括下列步驟:評量取自於個體之試樣的CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將該標記的表現量與對照標記的表現量比較。在與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。該方法亦可包括以複數個不同之組合療法進行試驗。或者,與已經以組合療法預治療之對照標記之表現量,在個體以組合療法投藥之後,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即表示該組合療法會有效於治療該個體。
又另一態樣,本發明提供評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNFα抗體及抗-IL-17抗體的組合療法之治療之方法。該方法包括下列步驟:將取自於個體之試樣使用與CXCL1及CXCL5標記之至少一 者互相作用,且將該試樣轉形而可偵測CXCL1及CXCL5標記之至少一者之試劑,評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量及將CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量與對照標記的表現量比較。在與對照標記的表現量(例如正常之實驗值範圍)比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。或者,在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法投藥之後,與對照標記的表現量比較,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
又再另一態樣,本發明提供套組,其用以:(i)評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該套組包括對取自於個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑,以及對照標記(例如正常之實驗值範圍)。套組亦包括下列者之使用說明:(i)評量個體是否將回應組合療法、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體及/或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。使用說明可對應於本文所述之任意一種或多種之態樣。
任何適當的分析方法,可利用於本發明之 方法以評估分析(直接或間接)試樣中生物標記表現量。具體實施例中,觀察到生物標記之對照表現量與該生物標記表現量之間有差異。一具體實施例中,該差異係大於用以評量生物標記表現量之方法的偵測極限(limit)。其他具體實施例中,該差異係大於或相等於分析方法之標準偏差,如差異須至少大於分析方法標準偏差的約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約6倍、約7倍、約8倍、約9倍、約10倍、約15倍、約20倍、約25倍、約100倍、約500倍或約1000倍。具體實施例中,與對照表現量比較,試樣的生物標記之表現量可使用有參數或無參數敘述之統計學、比較、迴歸分析等予以分析。
具體實施例中,來自於個體之試樣的生物標記之表現量,係測定相對於對照之差異,該差異係大於對照試樣的生物標記表現量約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約100%、約150%、約200%、約250%、約300%、約350%、約400%、約450%、約500%、約600%、約700%、約800%、約900%或約1000%。
具體實施例中,來自於個體之試樣的生物標記之表現量,係測定相對於對照之差異,該差異係小於對於試樣的生物標記表現量約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%或約90%。
取自於個體之試樣中的例如CXCL1及/或 CXCL5之生物標記的表現量,可藉由將試樣內生物標記轉形為可測定及/或定量部分的任何廣泛種類的技術及方法分析。此類方法的非限定性實例包括使用偵測蛋白質之免疫方法、蛋白質純化方法、蛋白質功能或活性分析、核酸雜交方法、核酸反轉錄方法、及核酸擴增方法、免疫印漬法、西方印漬法、北方印漬法、電子顯微鏡、如MALDI-TOF及SELDI-TOE之質譜分析法、免疫沉澱法、免疫螢光分析技術、免疫組織化學法、如擴增ELISA之酵素連結免疫吸附法(ELISA)、如血清ELISA的血液為主之定量分析、尿液為主之定量分析、流動式細胞測量分析、南方雜交法、陣列分析法等及其組合或次組合而分析試樣。
一具體實施例中,試樣中生物標記表現量之評量係藉由測定生物標記基因之已轉錄之聚核苷酸或其部分,例如mRNA或cDNA。RNA可由細胞使用包括,例如,使用酸酚/異硫氰酸胍萃取(RNAzol B,Biogenesis公司)、RNeasy RNA製作套組(Qiagen公司)或PAXgene(PreAnalytix公司,瑞士)之RNA萃取技術萃取。利用核糖核酸雜交之典型分析類型包括核標記轉錄速率測定法(nuclear run-on assay)、RT-PCR、定量PCR分析、RNA分解酶保護測定法(Melton等:Nuc.Acids Res.,12:7035)、北方印漬及原位雜交法。mRNA試樣分析之其他適當系統包括微陣列分析法(如使用Affymetrix微陣列系統或Illumina’s BeadArray Technology)。
一具體實施例中,生物標記之表現量係使 用核酸探針評量。其中所使用之名詞“探針”,係指任何可選擇性地結合至特定生物標記的分子。探針可以本技術領域中已知之技術合成,或者以適當之生物製備方法得到。探針亦可具體地設計藉由加成或併入標識而標識者。可利用為探針之分子之實例包括但不限於RNA、DNA、蛋白質、抗體及有機分子。
如前所述,經單離的Mrna可使用於雜交及擴增分析法包括但不限於南方或北方分析法、聚合酶鏈鎖反應(PCR)分析法及探針陣列。評量mRNA量之一種方法涉及使經單離的mRNA與可雜交至生物標記mRNA的核酸分子(探針)接觸。核酸探針可為例如全長之cDNA或其部分,例如其長度至少為約7、10、15、20、25、30、35、40、45、50、100、250或約500個核苷酸,且在適當之雜交條件下可充分而專一地與生物標記基因體DNA雜交的寡核苷酸。特別之具體實施例中,探針在嚴苛條件下會與生物標記基因體DNA結合。該嚴苛條件如在約45℃於6×氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)中雜交,接著再於50至65℃以0.2×SSC、0.1%SDS清洗一次或多次,此係本技術領域中具有通常知識者所熟習且可由Ausubel等編著之Current Protocols in Molecular Biology(1995),John Wiley & Sons公司出版,第2、4及6節中查得,其教示亦包含於此作為參考。嚴苛條件另外亦可由:Sambrook等編著之Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1989),Cold Spring Harbor Press公司(Cold Spring Harbor,紐約)出版,第7、9及11章中查得, 其教示亦包含於此作為參考。
一具體實施例中,係將mRNA固定於固體之表面再與探針接觸,舉例如將經單離之mRNA在瓊脂聚醣凝膠上泳動,再使mRNA由凝膠轉漬至例如硝基纖維素之膜上。替代具體實施例中,係將探針固定於例如Affymetrix基因陣列晶片之固體的表面,再使探針接觸mRNA。本技術領域具有通常知識者可容易地調整mRNA之偵測方法,再使用以評量生物標記mRNA的量。
試樣中生物標記表現量之評量,亦可以使用下述方法如涉及試樣中之mRNA經由例如:RT-PCR(如先前Mullis人等在1987年之美國專利第4,683,202號公報中之實施例)接合酶鏈鎖反應(Barany:Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:189-193(1991))、自主序列複製系統(self-sustained sequence replication)(Guatelli等:Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:1874-1878(1990))、轉錄擴增系統(Kwoh等:Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:1173-1177(1989))、Q-β複製酶(Lizardi等:Bio/Technology 6:1197(1988))、轉環式複製(rolling circle replication)(Lizardi等:美國專利第5,854,033號公報)或其他任何之核酸擴增方法之核酸擴增及/或反轉錄酶(製備cDNA),之後再偵測擴增分子。此類方案特別可用於偵測如其分子存在數極少的核酸分子。本發明之特別之態樣中,生物標記之表現量可以定量螢光發光RT-PCR(例如:TaqManTM System)評量。該類方法通常係使用生物標記專一性之寡核苷酸引子(primer)對用以設計已知序列的專一性 寡核苷酸引子的方法亦為本技術領域所熟習者。
生物標記mRNA之表現量,可以膜印漬(如使用在例如北方、南方、點等之雜交分析中)或微孔盤、試樣管、凝膠、細珠或纖維(或任意含結合核酸之固體承載體)檢測。其例可參見如美國專利第5,770,722號、第5,874,219號、第5,744,305號、第5,677,195號及第5,445,934號,其全部與此類分析相關之內容均包含於本申請案之中作為參考。生物標記表現量之評量,亦包含在溶液中使用核酸探針。
一具體實施例中,微陣列係使用於測定或定量生物標記之表現量。由於在不同實驗之間的再現性,微陣列特別適於此目的。DNA微陣列提供一種同時測定大量基因之表現量的方法。各陣列由吸附在固體承載體上之擷取探針(capture probe)之可再現模式所組成。標識之RNA或DNA再與陣列上互補之探針雜交後,以雷射掃瞄測定。陣列上各探針之雜交強度,再經過評量並轉換為表示基因相對表現量的量值。其例可參見如美國專利第6,040,138號、第5,800,992號、第6,020,135號、第6,033,860號及第6,344,316號,其全部與此類分析相關之內容均包含於本申請案中作為參考。高密度寡核苷酸陣列,特別可用以評量試樣中大量RNA之基因表現型態(profile)。
生物標記之表現亦可以蛋白質層級分析,即使用測定試劑,直接或間接測定由生物標記的mRNA所編碼之蛋白質產物。舉例如具有可專一性地與所欲測定的 生物標記之蛋白質產物結合之抗體試劑時,即可使用該抗體試劑而利用如免疫組織化學、ELISA、FACS分析等技術,測定來自於個體之試樣的生物標記之表現。
其他已知於蛋白質層級分析測定生物標記之方法包括如電泳、毛細管電泳、高效液相層析法(HPLC)、薄層層析法(TLC)、超擴散層析法(hyperdiffusion chromatography)等方法,或各種免疫性之如:流體(fluid)或膠體沉澱反應、免疫擴散法(單向或雙向)、免疫電泳、放射性免疫分析法(RIA)、酵素連結免疫吸附分析法(enzyme-linked immunosorbent assay)(ELISA)、免疫螢光法及西方印漬分析法的方法。
來自於試樣之蛋白質可以包括本技術領域中具有通常知識者所熟習之技術的各種技術單離。所使用之蛋白質單離方法,可舉如Harlow及Lane(Harlow及Lane編之Antibodies:A Laboratory Manual(1988),Cold Spring Harbor Laboratory Press公司出版,Cold Spring Harbor,紐約)之說明。
一具體實施例中,抗體或抗體片段係使用於測定所表現之蛋白質的例如西方印漬法或免疫螢光技術的方法中。評量本發明之生物標記表現量之抗體亦可由商品化之商品獲得。
抗-CXCL1抗體亦可容易地由許多商品供應商獲得。例如,EMD Millipore公司:AP1151-100UG,Everest Biotech公司:EB09637,Lifespan Biosciences公司: LS-B2843、LS-B2513、LS-C108147,eBioscience公司:50-7519-42、50-7519-41,AbD Serotec公司:AAM40B、AAM40、AAR22B,Thermo Fisher Scientific公司:PA1-32959、PA1-32924、PA1-20861,Abbiotec公司:251349、12335-1-AP、AP08852PU-N,NovaTeinBio公司:63059,Abgent公司:AT1688a,Aviva Systems Biology公司:AVARP07032 P050、OASA08635、OAEB00281,United States Biological公司:C8297-97A、C8298-01B、C8298-01C,Creative Biomart公司:CAB-1005MH、CAB-3086MH、CAB-115MH,Novus Biologicals公司:NBP1-61297、NBP1-51486、NBP1-19301,Abnova公司:H00002919-M01、H00002919-D01P、H00002919-M03,Fitzgerald公司:70R-10502,ProSci公司:31-057、42-129、42-196。
抗-CXCL5抗體亦可容易地由許多商品供應商獲得。例如,Lifespan Biosciences公司:LS-B5529,AbD Serotec公司:AHP1279、AAM42、AHP1279B,Proteintech Group公司:10809-1-AP、PA1-29657,Biorbyt公司:orb13909、orb13450,Acris Antibodies公司:AM31037PU-N、PP1003B2、PP1003P1,NovaTeinBio公司:63066、AT1694a、AT1693a,Aiva Systems Biology公司:OASA07658、OASA08449、OASA07657,United States Biological公司:C8297-98H1、C8297-98H、E2275-07,Creative Biomart公司:CAB-5426MH、CAB-5425MH,Novus Biologicals公司:33140002,Abnova公司:H00006374-M05、H00006374-M03、 H00006374-B01。
在西方印漬法及免疫螢光技術中,抗體或蛋白質亦可固定在固體承載體。適當之固相承載體或載體(carrier)包括可結合抗原或抗體之任何承載體。一般所熟習之承載體或載體包括:玻璃、聚苯乙烯、聚丙烯、聚乙烯、葡聚醣、尼龍、澱粉酶、天然及修飾纖維素、聚丙烯醯胺、輝長岩及磁鐵石。
技術領域中具有通常知識者認知有多種其他已知之適當的載體用於結合抗體或抗原,且該類承載體可加以調整而使用於本發明中。例如,自細胞單離之蛋白質可在聚丙烯醯胺凝膠電泳後固定在如硝基纖維素的固相承載體上。在以適當之緩衝液潤洗承載體之後,再以可偵測的經標識抗體處裡。之後可再以緩衝液第二次潤洗固相承載體以移除未結合之抗體。結合在固體承載體上之標識量,即可以一般之方法測定。其中測定蛋白質之電泳技術,係本技術領域中具有通常知識者所熟習之技術(一般可參見:R.Scopes(1982):Protein Purification,Springer-Verlag公司出版,紐約;Deutscher,(1990):Methods in Enzymology,第182卷:Guide to Protein Purification,Academic Press公司出版,紐約)。
其他之標準方法亦包括免疫分析技術,亦為本技術領域中具有通常知識者所熟習的技術之一,可參考Price及Newman編:Principles And Practice Of Immunoassay(1997),第2版,MacMillan公司出版及Harlow 及Lane編:Antibodies,A Laboratory Manual(1988),第9章,Cold Spring Harbor Laboratory出版。
本發明一具體實施例中,使用蛋白質體方法,例如質譜法係由離子性化學化合物產生荷電分子(或其片段)且測定其質量-對-電荷比例所組成之分析技術。通常之質譜分析程序,係由個體取得試樣,再加載在質譜儀,以不同之方法(例如以電子束衝擊)使其組分(例如生物標記)離子化,結果產生荷電粒子(離子)。之後使離子通過電磁場而由其移動計算粒子之質量-對-電荷比例。
例如,基質相關雷射脫附/離子化-飛行時間式質譜(MALDI-TOF MS)或表面強化雷射脫附/離子化-飛行時間式質譜(SELDI-TOF MS),係包含以例如血清之生物試樣應用於蛋白質結合晶片(參考:Wright,G.L.,Jr.等(2002)Expert Rev Mol Diagn 2:549,Li,J.等(2002)Clin Chem 48:1296,Laronga,C.等(2003)Dis biomarkers 19:229,Petricoin,E.F.等(2002)359:572,Adam,B.L.等(2002)Cancer Res 62:3609,Tolson,J.等(2004)Lab Invest 84:845,Xiao,Z.等(2001)Cancer Res 61:6029)可用於蛋白質層次評量生物標記之表現量。
同時,評量體內生物標識表現量的技術,包括對個體導入導向生物標記之標識抗體,其結合並轉形生物標記為可測定之分子。如前所述,可測定的生物標記在個體內之存在、量或甚至其位置,可以標準影像技術測定。
一般而言,在須測定生物標記與對照的表現量之差異時,來自於患有發炎性疾病(如RA)且經過抗-TNF治療與抗-IL-17治療之治療或考慮進行此類治療之個體的試樣之生物標記的表現量,與對照試樣之生物標記表現量之差異盡可能高為佳。雖然該差異可盡量小至評量表現量的方法之偵測極限,以差異較其方法之偵測極限為大或較分析方法之標準誤差為大為佳,其差異較分析方法之標準誤差至少大了約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約6倍、約7倍、約8倍、約9倍、約10倍、約15倍、約20倍、約25倍、約100倍、約500倍、1000倍更佳。另一方面,以差異較其方法之偵測極限為大或較分析方法之標準誤差為大為佳,其差異較分析方法之標準誤差至少小了約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約6倍、約7倍、約8倍、約9倍、約10倍、約15倍、約20倍、約25倍、約100倍、約500倍、1000倍更佳。
表現量之分析可使用取自於患有發炎性疾病之個體的任何適當試樣,包括缺乏表現例如CXCL1及/或CXCL5之生物標記者。例如,試樣可為任意之如部分或萃取的體液或其組成,例如得自個體之血液、血漿、淋巴、滑液、囊液、尿液、乳頭抽吸液,或由活體組織切片收集之體液、羊水、眼房液、玻璃樣液、膽汁、血液、乳汁、腦脊髓液、耳垢、乳糜、囊液、內淋巴、糞便、胃酸、胃液、黏液、心囊液、外淋巴、腹膜液、血漿、胸膜滲液、膿、唾液、皮脂、精液、汗液、血清、痰、滑液、關節組 織或關節液、淚液,或陰道分泌物。通常之情形下,體液可為取自個體的血液或其組分,包括全血液或其組分,包括血漿、血清及血液之細胞,例如紅血球、白血球及血小板。其他通常之情形下,體液可為滑液、關節組織或關節液,或反映發炎性疾病(如RA)之任何其他試樣。試樣亦可為取自個體之任意組織或其組分,結締組織、淋巴組織或肌肉組織。
自個體取得試樣的技術或方法,係本技術領域中一般熟習之技術,包括例如,以口腔棉棒或由漱口水、出血取得試樣;取得活體組織切片;或滑液或其他患有發炎性疾病的個體之試樣(如:牛皮癬或牛皮癬性關節炎之皮膚)。自體液或組織試樣單離組成(如:細胞、RNA或DNA),可以各種技術達成。而且試樣在取得後,亦可再加以處理。
II.以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療
由觀察已知患有發炎性疾病之個體(如:RA)的CXCL1及/或CXCL5之表現量影響抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法對個體之效果,本技術領域中具有通常知識者可依據個體內CXCL1及/或CXCL5生物標記之表現量適當選擇個體之治療方案。
因此,本發明提供以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療患有發炎性疾病之個體的方法。
具體實施例中,個體可於先前經過包含抗-TNF治療或抗-IL-17治療的單劑療法、包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法、及/或替代療法治療。其他具體實施例中,個體可為首次考慮以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療。並評量CXCL1標記及CXCL5標記之至少一者的表現量。若評量出CXCL1及CXCL5生物標記之至少一者的表現量較對照表現量高時,即可能以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療具有效果。然而,並無須其所有分析的生物標記在與各對照比較時均為高表現量。例如,某些生物標記可能顯示為正常或高表現量,惟在以含抗-TNF之抗體與抗-IL-17之抗體的組合療法治療時,可能顯示例如要麼CXCL1要麼CXCL5的表現量較對照量為低。
所選擇之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療方案,通常包括至少一個下述參數(parameter)為佳,通常再包括多個或全部下述條件:劑量、配方、投藥途徑及/或投藥頻率時更佳。治療方案特別參數之選擇,可依據該技術中先前已建立之抗-TNF療法及抗-IL-17療法的治療參數,例如FDA Approved Label for Adalimumab®所提出之Dosage and Administration操作程序、英夫利普單抗(infliximab)及蘇金單抗(secukinumab)中所述者,其全部內容亦包含於此作為參考。各種劑量、配方、投藥途徑及/或投藥頻率方面,亦可根據本業中已知之方法,在例如患者之疾病、年齡、性別及體重,以及發炎 性疾病(如RA)之嚴重度或階段的各種要素方面作更改。
抗-TNF治療與抗-IL-17治療可同時或不同時投藥。組合療法亦可包括同時或近於同時以抗-TNF療法及抗-IL-17療法投藥。其他具體實施例,在其中分開時而抗-TNF療法及抗-IL-17療法二者伴隨地及/或達致協同作用之效果時,組合療法可包括以抗-TNF療法接著再以抗-IL-17療法投藥。其他具體實施例中,在其中分開時而抗-TNF療法及抗-IL-17療法二者伴隨地及/或達致協同作用之效果時,組合療法可包括以抗-IL-17療法接著再以抗-TNF療法之投藥。具體實施例中,組合療法包括抗-TNF療法及抗-IL-17療法二者在相同配方中(如為單一之分子或為兩分開之分子)。其他具體實施例中,組合療法可包括兩種分開之配方,其中一者包含抗-TNF療法且另一者含抗-IL-17。
一具體實施例中,組合療法可為如WO/2010/102251號中所述之DVD-Ig結合蛋白(如抗-TNF-抗-IL-17-DVD-Ig,其全部亦包含於此作為參考。
一具體實施例中,組合療法可為如WO/2010/102251號公報中所述之DVD-Ig結合蛋白(如抗-TNF-抗-IL-17 DVD-Ig),其全部亦包含於此作為參考。
如使用於本文,名詞“治療有效量”,意指本文揭示之抗-TNF治療與抗-IL-17治療可治療發炎性疾病(如RA)之量。療法投藥之劑量須依照本發明,但當然須按照其他包括如投藥之療法、投藥途徑、患者之情況及所治療之例 如個體RA的嚴重度之病理情況的具體情況評量。
個體之投藥,通常組合療法調配為包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療以及醫藥上容許之載體之醫藥組成物。通常治療組成物須無菌且在製造及儲存之情形下須有充分之安定性。
如使用於本文,“醫藥上容許之載體”,包括任意及所有生理上相容之溶劑、分散介質、包衣、抗菌及抗真菌劑、等張及延緩吸收劑等。適合非經腸(如:靜脈內、肌肉內、皮下、脊髓內)投藥(如:注射、輸注)之載體更佳。視投藥途徑而定,活性化合物可以保護化合物免於酸之作用及其他使化合物失活之自然條件的材料包覆。
依據本發明,有多種可合併使用於包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之抗發炎方案。此等包括如:非類固醇抗發炎藥劑(NSAIDs)、類固醇,包括:胺甲喋呤(methotrexate)(Trexall)、來氟米特(leflunomide)(艾炎寧(Arava))、羥氯奎寧(hydroxychloroquine)(必賴克婁(Plaquenil))、柳氮磺胺吡啶(sulfasalazine)(柳氮磺胺嘧啶(Azulfidine))及米諾四環素(minocycline)(美滿黴素(Dynacin)、美克寧(Minocin))之疾病修飾型抗風濕藥劑(DMARDs),及包括:硫唑嘌呤(azathioprine)(因妙潤(Imuran)、依木蘭(Azasan))、環孢黴素(cyclosporine)(新體睦(Neoral)、山地明(Sandimmune)、吉葛瑞福(Gengraf))及環磷醯胺(cyclophosphamide)(癌得星(Cytoxan))之免疫抑制劑。
已知在本技術領域中使用的此等種類及其他種類,亦可以本技術領域中的技術評量,即可使用此等方案於治療同類型之發炎性疾病。同時,在其在本技術領域中使用時,與本技術領域中所知之參數(parameters)(如治療方案及劑量)類似時,亦可進行此等方案。然而,由於可了解其在本技術領域中抗-TNF治療與抗-IL-17治療之其他用途,亦可以此等方案調節一些條件。例如,在其他藥劑平常為單獨之治療藥劑,而在本發明中與抗-TNF治療與抗-IL-17治療組合時,亦可以本技術領域中已知之技術評量,而減低藥劑之劑量。
III.本發明之套組
又再另一態樣,係在提供套組,其用以:(i)評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)對發炎性疾病之組合療法篩選進行臨床試驗之個體或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該套組包括對取自於個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑及對照標記。套組亦包括下列者之使用說明:(i)評量患者是否將回應組合療法、(ii)檢測組合療法的有效性、(iii)對組合療法篩選進行臨床試驗之個體或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體的包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。該使用說明可對應於下述中任意一種或多種之態樣。
本發明之套組可視需要地包含有用於進行本發明方法的額外組分。
例如套組可包含用於自個體取得生物試樣及/或對照試樣之試劑。
再者,套組係包含評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑。一具體例中,評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑,係包含用於擴增及測定CXCL1及CXCL5標記之至少一者的探針。另外之具體例中,評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑包含抗體或其抗原結合片段。
在對照標記方面,套組可包括預定評量之對照值(如根據已預定之個體族群)。或者,套組可包括評量個體(如可能進行療法者或接受療法之個體)中對照表現量之試劑及使用說明。
一具體實施例中,評量來自於個體之生物試樣的至少一種生物標記的表現量之試劑,包含核酸製劑,其係是以測定編碼生物標記之核酸表現,例如mRNA。此核酸製劑包括至少一種亦可含多於一種的核酸探針或引子,且其序列係經過設計,以使核酸製劑可測定來自於個體之試樣中編碼生物標記的核酸表現,如mRNA。較佳的核酸製劑包括二種或多種PCR引子,其允許編碼感興趣之生物標記的mRNA段的PCR擴增。其他具體實施例中,套組包括CXCL1及/或CXCL5的核酸製劑。
評量CXCL1及/或CXCL5的表現量之意, 例如,亦可包括用以評估表現(如核酸或蛋白質量層級)之分析所使用之如緩衝液或其他的試劑。該分析係如移出患者細胞(例如單核球細胞)並在含組合療法之培養基中進行試驗的活體外分析之生物分析。
另一具體實施例中,套組可再包含包含抗-TNF治療與抗-IL17治療的組合療法,以治療本文所述之發炎性疾病。其例如為包含針對抗TNF及IL-17,或特別針對TNFα及IL17之DVD-Ig分子的組合療法。
本發明之套組,係設計利用於人類之個體為佳。
以下再舉實施例說明本發明,但並不限定於此。本申請案中特別列出之所有參考文獻、專利及公開專利申請之內容、以及說明圖,其全部亦包含於此作為參考。
實施例
實施例1:抗-TNF與抗-IL17單獨及組合在膠原蛋白誘發關節炎小鼠模式中之功效
在本實例中,抗-TNF或抗-IL-17或其組合之功效,係以膠原蛋白誘發關節炎小鼠模式測量,其結果如第3圖所示。以雄性DBA/1J小鼠,由尾基部注射(i.d.)含100μL溶於0.1N乙酸之100μg第II型牛膠原蛋白及100μL含100μg之結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculois)H37Ra株之胡氏完全佐劑(complete Freund’s adjuvant)的乳劑。21天後小鼠再以1.0mg酵母聚醣A之200μL磷酸鹽緩衝液 (PBS)皮下注射(i.p.)追加免疫。小鼠在追加免疫3日內病症發病。最初一週每日檢測小鼠之關節炎,之後每週進行3次。對各腳掌以以下之基準評分:0=正常,1=足部或踝部部位之一腫脹,2=足部及踝部腫脹,3=關節僵直。再總計各動物全部4腳掌之評分(最高評分為12),並以各組之全部動物的總評分之平均表示關節炎平均評分(Mean Arthritic Score)(MAS)。以含12mg/kg之抗-TNF抗體8C11、12mg/kg之抗-IL-17抗體MAB421之一,或者12mg/kg之各抗體的磷酸鹽緩衝液(PBS),以皮下注射對動物投藥2×/週。在一個實驗例中,動物在預防性處理模式中,在顯現關節炎症候之前,接受抗體治療。在第二個實驗例中,動物在治療性原理模式中,在關節炎症候發病之後,接受抗體治療。在這二種型態之實驗例中,以抗-TNF或抗-IL-17之治療對降低腳掌關節炎均為部分有效,然而,組合抗-TNF與抗-IL-17之治療較之任一單獨之單劑療法均有較大的功效。
實施例2:抗-TNF與抗-IL-17單獨及組合在膠原蛋白誘發關節炎小鼠模式中骨保護之比較
在本實例中,TNF及IL-17之較大的組合阻斷功效已於保護骨流失證實且在第4圖中顯示。如實例1之所述,於DBA/1J小鼠誘發關節炎。骨流失量係在本試驗之終了,即關節炎症候發病三週之後測定其量。保護骨流失之效果,係於接受療法之治療方案的動物測定。移除後腳掌脛骨/腓骨之中央部分並置於10%中性福馬林緩衝溶液中。腳 掌係以Scanco μCT40(Scanco Medical AG公司製造)在55kVp及145μA之條件下,以高解析設定(High Resolution setting)(1000 Projections/180°之2048×2048像素影像)及Isotropic Voxels以積分時間180毫秒操作,可得到最終等向立體像素大小為18μm×18μm×18μm之影像。之後,由跟骨與舟骨交接處之關節延伸至跗骨靠近所欲探討之區,手繪固定100片(1.8mm)高度之圓柱輪廓圖。由內空白對照顯示此區分析上為體積具高保守性及統計上具再現性之區。3-D定量評估係以ScancoAG分析軟體進行骨體積(mm3)及表面積對體積比之分析,以得到跗骨表面粗糙度(mm-1)之粗估值。使用之分析儀器高斯三角積分參數(sigma gauss)為0.8及1.0,以1000為上限閾值並以320為下限閾值。如第4圖所示,接受載體(vehicle)治療組之關節炎小鼠,其骨體積明顯減少。相反地,單獨以抗-TNF或抗-IL-17治療之結果,分別為42或66%(相對於媒劑對照,p值<0.05),明顯保護骨流失。組合抗-TNF與抗-IL-17之治療的結果,相對於媒劑為80%(p<0.05),更大程度保護骨流失。
實施例3:TNF與IL17在CIA及RA中之相互作用
本實施例中,係以基因表現型態化為研究生物標記之工具,其反映抗-TNF與抗-IL17療法之合作作用。此情況中,除非另外述明,在抗-TNF療法中係使用8C11抗體,在抗-IL-17療法中係使用大鼠之抗小鼠抗-IL17抗 體MAB421。之後以本技術領域中已知之方法,將疾病相關RNA回應特徵化,並識別出對組合抗-TNF與抗-IL-17之療法之敏感性,但明顯地對抗-TNF或抗-IL17之單劑療法為較低敏感性之類群。因為其在臨床位點需要最低製備或操作的容易取得生物液中為歷時安定的,故將CXCL1及CXCL5識別為生物標記。於小鼠使用膠原蛋白誘發關節炎(CIA)模式,所測定之全腳掌均質物中之CXCL1及CXCL5生物標記顯示RNA量之變化係蛋白質量變化的優良預測指標。再者,在如下所討論之該等結果建立抗-TNF療法與抗-IL-17療法的組合療法顯示存在著協同效果。
CXCL1及CXCL5之統計分析-回應性及無回應性
如果治療與疾病之間的差異顯著性之p-值(使用學生t-test(Student’s t-test,無多重比較校正))落在高於0.05或治療所致變化倍率低於0.1對數(log)(25%)時,即不論其變化之顯著性均視為CXCL1及/或CXCL5基因對給定治療無回應性。
CIA模式與RNA之製備
雄性DBA/1J小鼠,由尾基部(i.d.)注射含100μL溶於0.1N乙酸之100μg第II型牛膠原蛋白及100μL含100μg之結核分枝桿菌H37Ra株之胡氏完全佐劑的乳劑。21日後再以1.0mg酵母聚醣A之200μL磷酸鹽緩衝液(PBS)皮下注射小鼠追加免疫。小鼠在追加免疫3日內病症發病。
最初一週每日檢測小鼠之關節炎,之後每週進行3 次。對各腳掌以以下之基準評分:0=正常,1=足部或踝部部位之一腫脹,2=足部及踝部腫脹,3=關節僵直。之後總計各動物全部4腳掌之評分(最高評分為12),並以各組之全部動物的總評分之平均表示關節炎平均評分。再以Caliper厚度計(Caliper Thickness-Gage,Dyer公司,210-115),測量腳掌腫脹之變化。對於治療劑量,小鼠係以疾病之最初臨床症狀最高為2分登記分組。
在第一次顯示疾病症狀後7日,由小鼠腳掌剝皮製備RNA。並由登記,隨機將小鼠分成單劑療法(任一種抗體6mg/kg)組、組合療法(各一種抗體6mg/kg)組或以同型對照治療之小鼠的治療類組。劑量係依據先前劑量回應實驗所評量之最大有效劑量6mg/kg予以選擇。
路徑之分析
路徑之比較係以Ingenuity Pathway Assist及Fisher’s Exact Test法分析。該分析中,所指路徑具有顯著性<0.05以及至少二種經調控的轉錄物。
結果:
IL-17與TNF在CIA小鼠中顯示合作調控基因表現
分析來自於CIA小鼠之總腳掌RNA,以探討二種細胞激素之路徑於調控疾病活性之相互作用。與健康動物比較,疾病動物中,CXCL1及CXCL5基因表現顯著向上調控。由分組之結果顯示,接受類似治療方案之小鼠均有類似之RNA表現型態。單獨以抗-IL-17抗體治療之動物與對基因表現顯示最低效果,以載劑治療之動物被分到相同 之組。以抗-TNF抗體治療之小鼠被分組到一塊,但與以抗-TNF與抗-IL-17二者治療的小鼠分開,其相對於抗-IL-17之單劑療法只中等效力。因此,根據不偏估分組分析,有效果梯度跨越三種治療方案。
依據分組分析,只有少數疾病相關基因顯著回應抗-TNF治療,但對抗-IL-17治療顯著地回應者更少。然而,相較於回應抗-TNF單劑療法之基因數,回應組合療法之基因數約為2倍。由進一步以相同之統計標準分析顯示,大多數單獨由抗-IL17調控之mRNA亦可受到組合調控。由比較可知只有半數單獨受抗-TNF調控之基因亦受到組合調控。
由路徑分析顯示組合療法比單劑療法實質上影響更多的系統
所觀察到增加的mRNA調控,可能係由於增加的效力,以致可偵測到更多位於或多或少受單劑療法所影響相同路徑中的mRNA。另一方面,增加的mRNA調控,亦可能為質方面之結果而顯示對不受單劑療法影響之路徑的效果。為有助於區分兩種機制,再以輔助路徑資料庫(Ingenuity Pathway AssistTM),對各治療組中受調控之基因進行路徑分析。該分析顯示,雖然有許多路徑受共同調控,但實質上地更多的路徑係受組合治療所影響,顯示另外的非多餘之功能係歸因於抗-TNF與抗-IL-17治療之組合。
為評量mRNA量之增加是否反映蛋白質量之變化,使用Ingenuity Pathway AssistTM分析CXCL1蛋白質及CXCL5 蛋白質之量。總腳掌均質物中所測定之CXCL1蛋白質及CXCL5蛋白質二者的量,有實質地疾病相關的增加。回應單獨及組合之抗-TNF與抗-IL-17治療之此等蛋白質量降低為不同程度。在所有情形中,與任一單劑療法比較,回應組合療法之CXCL1蛋白質及CXCL5蛋白質之量大為降低。因此,CXCL1之RNA及CXCL5之RNA的量之變化,在小鼠CIA模式中為CXCL1蛋白質及CXCL5蛋白質表現之質相關性預測指標,以及抗-TNF與抗-IL-17治療回應性之指標。
第7圖顯示小鼠腳掌溶解物(左圖柱)及血清(右圖柱)中蛋白質之表現量。血清中可觀察到的傾向反映由腳掌溶解物中所觀察之CXCL1的傾向。CXCL1的蛋白質量在患有疾病之小鼠中向上調控,在任一單劑療法中即使有亦唯有少量地向下調控,但在組合療法中則實質地向下調控。因此,在腳掌及血清之趨化激素量具有一般相關。
為了評量所分泌的CXCL1及CXCL5蛋白質量在人類是否受到類似調控,由形成RA之患者及健康對照獲得血清試樣。
第8圖顯示相較於非RA之對照,RA患者之CXCL1及CXCL5的蛋白質量大幅地向上調控。由於對回應現有之商業組合療法之生物標記有需求,第8圖中所示之試驗中,RA類群係包括單獨以胺甲喋呤或以復邁(Humira)再加胺甲喋呤治療,以評量在存在外加之TNF阻斷時,CXCL1及CXCL5標記是否持續地過度表現。第9圖顯示,單獨以 胺甲喋呤或以胺甲喋呤再加抗-TNF治療,對CXCL1及CXCL5之量並無顯著之影響。第10圖係第9圖所示之實驗數量化的結果。
參考資料整理
本專利申請書中所列之所有可能列出的參考資料(包括演講之參考文獻、專利、專利申請書、資料庫及網站)之內容,不論為任何目的其全部亦列舉於此作為參考,在此特別聲明。除非特別明載,本發明中之操作,可使用本技術領域中所熟習之一般免疫、分子生物及細胞生物技術。
均等說明
本發明在不背離其本意或相關之基本特性下,亦包含其他特定之形態。本發明前述之具體實施例,即係各種具體之態樣,但本發明中之敘述並不受其限定。本發明之範圍係如其中所舉之申請專利範圍,而非在其前之敘述,因此亦包含與申請專利範圍之意義及範圍均等的變化。
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由於本案的圖為試驗化合物的結果數據,並非本案的代表圖。故本案無指定代表圖。

Claims (97)

  1. 一種評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療的方法,該方法包含下列步驟:對取自於該個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量;及將該標記的表現量與對照標記之表現量比較,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,及/或在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的該組合療法投藥後,與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  2. 一種評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療的方法,該方法包含下列步驟:處理取自於該個體之試樣以使其經轉形,而可評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量;及將該標記的表現量與對照標記之表現量比較,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體及/或在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的該組合療法投藥後,與對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的 表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  3. 一種以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療患有發炎性疾病之個體之方法,該方法包含下列步驟:篩選在與對照標記的表現量比較時,顯示CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高之個體及/或篩選在與對照標記的表現量比較時,顯示回應於該組合療法之CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低之個體;及以該組合療法對該個體以治療有效量投藥。
  4. 一種對包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法檢測治療之有效性之方法,該方法包含下列步驟:對取自於經該組合療法以治療有效量投藥個體之後之該個體的試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,及將該標記的表現量與對照標記的表現量比較,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  5. 一種對以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法治療發炎性疾病篩選進行臨床試驗的個體之方法,該方法包含下列步驟:對取自於個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之 至少一者的表現量;及將該標記的表現量與對照標記的表現量比較,其中在與對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,即顯示該個體適於進行該臨床試驗及/或在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的該組合療法投藥後,與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  6. 一種識別適於治療患有發炎性疾病之個體之包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法,該方法包含下列步驟:評量取自於該個體之試樣的CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量;及將該標記的表現量與對照標記的表現量比較,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,及/或在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的該組合療法投藥後,與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  7. 如申請專利範圍第6項所述之方法,其中以複數個不同組合療法進行試驗。
  8. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中係在抗-TNF治療與抗-IL-17治療對該個體以預定 量投藥之後,評量該試樣中該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
  9. 如申請專利範圍第8項所述之方法,其中該預定量包含該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療之至少一者之低於治療劑量。
  10. 如申請專利範圍第8項所述之方法,其中該預定量包含該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療之低於治療劑量。
  11. 如申請專利範圍第8項所述之方法,其中該預定量包含該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療之至少一者之治療劑量。
  12. 如申請專利範圍第8項所述之方法,其中該預定量包含該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療之治療劑量。
  13. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中對照標記的表現量,係在該個體以預定量之抗-TNF治療與抗-IL-17治療投藥之前,該試樣中對照標記的表現量。
  14. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該對照標記的表現量,係患有發炎性疾病個體族群中對照標記的平均表現量。
  15. 如申請專利範圍第14項所述之方法,其中該患有發炎性疾病個體族群接受該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療之至少一者。
  16. 如申請專利範圍第14項所述之方法,其中該患有發炎 性疾病個體族群接受該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療。
  17. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該對照標記包含CXCL1標記或CXCL5標記。
  18. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該對照標記包含CXCL1標記及CXCL5標記二者。
  19. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-TNF治療包含抗-TNF結合蛋白。
  20. 如申請專利範圍第19項所述之方法,其中該抗-TNF結合蛋白包含可專一地結合該蛋白質之融合蛋白、其抗體或其抗原結合片段。
  21. 如申請專利範圍第19項所述之方法,其中該抗-TNF結合蛋白包含抗-IL-17抗體或其抗原結合片段,為鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2,ScFv、SMIP、親和體、吸附體、彈性體、奈米體、功能域抗體或任何上述者之抗原結合片段。
  22. 如申請專利範圍第第20或21項所述之方法,其中該抗-TNF抗體為抗-TNFα抗體。
  23. 如申請專利範圍第20至22項中任一項所述之方法,其中該抗-TNF抗體包含人類抗-TNF抗體。
  24. 如申請專利範圍第23項所述之方法,其中該抗-TNFα抗體包含Adalimumab®或其抗原結合片段。
  25. 如申請專利範圍第20至22項中任一項所述之方法,其 中該抗-TNF抗體包含人源化抗-TNF抗體。
  26. 如申請專利範圍第25項所述之方法,其中該人源化抗-TNF抗體包含英夫利昔單抗(infliximab)或其抗原結合片段。
  27. 如申請專利範圍第19項所述之方法,其中該抗-TNF結合蛋白包含抗-TNFα融合蛋白。
  28. 如申請專利範圍第27項所述之方法,其中該抗-TNFα結合蛋白包含依那西普(etanercept)或其抗原結合片段。
  29. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-IL-17治療包含抗-IL-17結合蛋白。
  30. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-IL-17治療包含抗-IL-17抗體或其抗原結合片段。
  31. 如申請專利範圍第30項所述之方法,其中該抗-IL-17抗體包含人類抗體。
  32. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中該抗-IL-17抗體係選自於:蘇金單抗(secukinumab)及RG7624或其抗原結合片段所成之群。
  33. 如申請專利範圍第30項所述之方法,其中該抗-IL-17抗體包含人源化抗體。
  34. 如申請專利範圍第33項所述之方法,其中該抗-IL-17為伊塞珠單抗(ixekizumab)、10F7、B6-17或其抗原結合片段。
  35. 如申請專利範圍第29項所述之方法,其中該抗-IL-17 結合蛋白包含可專一性結合至該蛋白質之融合蛋白、抗體或其抗原結合片段。
  36. 如申請專利範圍第30項所述之方法,其中該抗-IL-17結合蛋白包含抗-IL-17抗體或其抗原結合片段,為鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2、ScFv、SMIP、親和體、吸附體、彈性體、奈米體、功能域抗體或任何上述者之抗原結合片段。
  37. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-IL-17治療包含胺甲蝶呤、其類似物或其醫藥上容許之鹽。
  38. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-TNF治療包含胺甲蝶呤、其類似物或其醫藥上容許之鹽。
  39. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該抗-TNF治療與該抗-IL-17治療二者包含胺甲蝶呤、其類似物或其醫藥上容許之鹽。
  40. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該組合療法包含以結合TNF及IL-17之至少一者的多重專一性結合蛋白投藥。
  41. 如申請專利範圍第40項所述之方法,其中該多重專一性結合蛋白包含結合TNFα TNF及IL-17之至少一者的雙可變功能域免疫球蛋白(DVD-IgTM)分子、半體DVD-Ig(hDVD-Ig)分子、三可變功能域免疫球蛋白 (TVD-IgtDVD-Ig)分子及受體可變功能域免疫球蛋白(rDVD-Ig)分子、在其一實驗例中,該多重專一性結合蛋白(如多價DVD-Ig(pDVD-Ig)分子)”、單抗體DVD-Ig(mDVD-Ig)分子、交叉(coDVD-Ig)分子、血腦障壁(bbbDVD-Ig)分子、含可分解連接部DVD-Ig(clDVD-Ig)分子或重導向細胞毒性型DVD-Ig(rcDVD-Ig)分子。
  42. 如申請專利範圍第40項所述之方法,其中該多重專一性結合蛋白可結合TNFα及IL-17。
  43. 如申請專利範圍第1至42項中任一項所述之方法,其中評量該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
  44. 如申請專利範圍第1至42項中任一項所述之方法,其中評量該CXCL1及CXCL5標記二者的表現量。
  45. 如申請專利範圍第44項所述之方法,其中與該對照標記之表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低表示該組合療法有效。
  46. 如申請專利範圍第44項所述之方法,其中與該對照標記之表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記二者的表現量較低表示該組合療法有效。
  47. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該個體未預先以包含抗-TNF治療之單劑療法或以包含抗-IL-17治療之單劑療法進行治療。
  48. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-TNF治療之單劑療法,該組合療法更大程度地降低該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的 表現量。
  49. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-TNF治療之單劑療法,該組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。
  50. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該個體不回應包含抗-TNF治療之單劑療法。
  51. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-IL-17治療之單劑療法,該組合療法更大程度地降低該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
  52. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-IL-17治療之單劑療法,該組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。
  53. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該個體不回應包含抗-IL-17治療之單劑療法。
  54. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-TNF治療之單劑療法及包含抗-IL-17治療之單劑療法二者,該組合療法可較大程度地降低該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量。
  55. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中相較於包含抗-TNF治療之單劑療法及包含抗-IL-17治療之單劑療法二者,該組合療法有更佳之臨床結果或臨床終點。
  56. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該個體不回應包含抗-TNF治療之單劑療法或包含抗-IL-17治療之單劑療法。
  57. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中以核酸量評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  58. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中以測定RNA評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  59. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中以測定mRNA、miRNA或hnRNA評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  60. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中以測定DNA評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  61. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中以測定cDNA評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  62. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中以測定cDNA評量該CXCL1及/或CXCL5標記的表現量。
  63. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中該CXCL1及CXCL5標記的表現量係使用選自下述所成群組之技術予以評量:聚合酶鏈鎖反應(PCR)擴增反應、反轉錄酶PCR分析、定量反轉錄酶PCR分析、北方印漬分析、RNA分解酶保護分析法、數位式RNA測定/定量法及其組合或次組合。
  64. 如申請專利範圍第57項所述之方法,其中評量該試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,包含以 抗-CXCL1及抗-CXCL5抗體進行免疫分析。
  65. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該CXCL1及/或CXCL5標記包含蛋白質。
  66. 如申請專利範圍第65項所述之方法,其中該蛋白質以結合該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的結合蛋白測定。
  67. 如申請專利範圍第65項所述之方法,其中該結合蛋白包含可專一性結合於該蛋白質之抗體或其抗原結合片段。
  68. 如申請專利範圍第67項所述之方法,其中該抗體或其抗原結合片段選自下述所成群組:鼠類抗體、人類抗體、人源化抗體、雙重專一性抗體、嵌合抗體、Fab、Fab’、F(ab’)2、ScFv、SMIP、親和體、吸附體、彈性體、奈米體、功能域抗體及任何上述者之抗原結合片段。
  69. 如申請專利範圍第66項所述之方法,其中該結合蛋白包含多重專一性結合蛋白。
  70. 如申請專利範圍第69項所述之方法,其中多重專一性結合蛋白包含:雙可變功能域免疫球蛋白(DVD-IgTM)分子、半體DVD-Ig(hDVD-Ig)分子、三可變功能域免疫球蛋白(TVD-IgtDVD-Ig)分子及受體可變功能域免疫球蛋白(rDVD-Ig)分子、在其一實驗例中,多重專一性結合蛋白(如多價DVD-Ig(pDVD-Ig)分子)、單抗體DVD-Ig(mDVD-Ig)分子、交叉(coDVD-Ig)分子、血腦障壁(bbbDVD-Ig)分子、含可分解連接部DVD-Ig(clDVD-Ig) 分子或重導向細胞毒性型DVD-Ig(rcDVD-Ig)分子。
  71. 如申請專利範圍第67項所述之方法,其中該抗體或其抗原結合片段包含標識。
  72. 如申請專利範圍第71項所述之方法,其中該標識選自下述所成群組:放射性標識、生物素標識、發色團、螢光體、及酵素。
  73. 如申請專利範圍第1至72項中任一項所述之方法,其中該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量係使用選自下述所成群組之技術予以評量:免疫分析法、西方印漬法、放射性免疫分析法、免疫螢光光度、免疫沉澱、平衡透析、免疫擴散、電化學發光免疫分析法(ECLIA)、ELISA分析法、聚合酶鏈鎖反應、免疫聚合酶鏈鎖反應及其組合或次組合。
  74. 如申請專利範圍第73項所述之方法,其中該免疫分析法包含選自下述成群組之溶液為主的免疫分析法:電化學發光、化學發光、螢光化學發光、螢光偏極法及時間解析螢光法。
  75. 如申請專利範圍第73項所述之方法,其中該免疫分析法包含選自下述所成群組之三明治免疫分析法:電化學發光、化學發光及螢光化學發光法。
  76. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該試樣包含取自於該個體之體液或其組成。
  77. 如申請專利範圍第76項所述之方法,其中該體液包含選自下述所成群組者:血液、血清、滑液、淋巴、血 漿、尿液、羊水、眼房液、玻璃狀液、膽汁、乳汁、腦脊髓液、耳垢、乳糜、囊液、內淋巴、糞便、胃酸、胃液、黏液、乳頭抽吸液、心囊液、外淋巴、腹膜液、胸膜滲液、膿、唾液、皮脂、精液、汗液、血清、痰、淚液、陰道分泌物及由活體組織切片收集的液體。
  78. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該試樣包含取自於該個體的組織或細胞或其組分。
  79. 如申請專利範圍第1至6項中任一項所述之方法,其中該個體為人類個體。
  80. 一種套組,其係在於:(i)評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之治療、(ii)檢測該組合療法的有效性、(iii)對該發炎性疾病之組合療法篩選進行臨床試驗之個體或(iv)識別用於患有發炎性疾病之個體之含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法;該套組包括:對取自於該個體之試樣評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑;對照標記;及下述者之使用說明:(i)評量該個體是否將回應該組合療法;(ii)檢測該組合療法的有效性;(iii)對該組合療法篩選進行臨床試驗之個體或(iv)識別用於患有發炎性疾病之治療之含抗-TNF治療與抗-IL-17治療之組合療法。
  81. 如申請專利範圍第80項所述之套組,其中該組合療法 包含經針對TNF及IL-17之DVD-Ig分子。
  82. 如申請專利範圍第81項所述之套組,其中該DVD-Ig分子導向於抗TNFα及IL-17。
  83. 如申請專利範圍第80項所述之套組,其中該評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之藥劑,包含擴增及測定該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的探針。
  84. 如申請專利範圍第80項所述之套組,其中該評量CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量之試劑,包含抗體或其抗原結合片段。
  85. 如申請專利範圍第80項所述之套組,其中再包含用於由該個體取得生物試樣之試劑。
  86. 一種評量患有發炎性疾病之個體是否將回應包含抗-TNFα抗體與抗-IL-17抗體的組合療法之治療之方法,該方法包含下列步驟:將取自於該個體之試樣使用與該CXCL1及CXCL5標記之至少一者互相作用且將該試樣轉形而可偵測該CXCL1及CXCL5標記之至少一者之試劑,評量該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量;及將該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量與該對照標記的表現量比較,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較高時,及/或在以包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法投藥後, 與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低時,即顯示該組合療法會有效於治療該個體。
  87. 如申請專利範圍第86項所述之方法,其中該與CXCL1及CXCL5標記之至少一者互相作用之試劑,為抗-CXCL1或抗-CXCL5抗體或其抗原結合片段。
  88. 如申請專利範圍第87項所述之方法,其中該抗-CXCL1抗體為選自下述所成群組:EMD Millipore公司:AP1151-100UG,Everest Biotech公司:EB09637,Lifespan Biosciences公司:LS-B2843、LS-B2513、LS-C108147,eBioscience公司:50-7519-42、50-7519-41,AbD Serotec公司:AAM40B、AAM40、AAR22B,Thermo Fisher Scientific公司:PA1-32959、PA1-32924、PA1-20861,Abbiotec公司:251349、12335-1-AP、AP08852PU-N,NovaTeinBio公司:63059,Abgent公司:AT1688a,Aviva Systems Biology公司:AVARP07032_P050、OASA08635、OAEB00281,United States Biological公司:C8297-97A、C8298-01B、C8298-01C,Creative Biomart公司:CAB-1005MH、CAB-3086MH、CAB-115MH,Novus Biologicals公司:NBP1-61297、NBP1-51486、NBP1-19301,Abnova公司:H00002919-M01、H00002919-D01P、H00002919-M03,Fitzgerald公司:70R-10502、ProSci公司:31-057、42-129、42-196。
  89. 如申請專利範圍第87項所述之方法,其中該抗-CXCL5抗體為選自下述所成群組:Lifespan Biosciences公司:LS-B5529,AbD Serotec公司:AHP1279、AAM42、AHP1279B,Proteintech Group公司:10809-1-AP、PA1-29657,Biorbyt公司:orb13909、orb13450,Acris Antibodies公司:AM31037PU-N、PP1003B2、PP1003P1,NovaTeinBio公司:63066、AT1694a、AT1693a,Aiva Systems Biology公司:OASA07658、OASA08449、OASA07657,United States Biological公司:C8297-98H1、C8297-98H、E2275-07,Creative Biomart公司:CAB-5426MH、CAB-5425MH,Novus Biologicals公司:33140002,Abnova公司:H00006374-M05、H00006374-M03、H00006374-B01所成之群。
  90. 如申請專利範圍第86項所述之方法,其中該與CXCL1及CXCL5標記之至少一者互相作用之藥劑,包含CXCL1或CXCL5標記之至少一者的專一性核酸探針。
  91. 如申請專利範圍第86項所述之方法,其中該評量試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,包含使用抗-CXCL1或抗-CXCL5抗體進行之免疫分析。
  92. 如申請專利範圍第86項所述之方法,其中該評量試樣中CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量,包含分析法之新穎組合。
  93. 如申請專利範圍第1至92項中任一項所述之方法,其 中該發炎性疾病包含風濕性關節炎。
  94. 如申請專利範圍第1至92項中任一項所述之方法,其中該發炎性疾病包含下列之至少一者:牛皮癬、牛皮癬性關節炎、關節黏連性脊椎炎、幼年特發性關節炎、貝塞特氏症、脊椎關節炎、葡萄膜炎及全身性紅斑性狼瘡。
  95. 如申請專利範圍第1至92項中任一項所述之方法,其中該標記包含基因產物。
  96. 如申請專利範圍第95項所述之方法,其中該基因產物包含蛋白質或RNA。
  97. 一種在使患有發炎性疾病之個體禁忌包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法之方法,該方法包含評量個體在與對照標記的表現量、或實驗值之正常範圍比較時,CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低之步驟,其中在與該對照標記的表現量比較,該CXCL1及CXCL5標記之至少一者的表現量較低表示該個體不須禁忌包含抗-TNF治療與抗-IL-17治療的組合療法。
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