TW200907341A - Methods, kits, and compounds for determining responsiveness to treatment of a pathological disorder by epothilones - Google Patents

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200907341 九、發明說明： 【發明所屬之技術領域】 本發明提供藉由分析自*右勹

μ θ w有包括非小細胞肺癌（NSCIX 之疾病的個體獲得之樣本中 +甲之基因表現概況及/或某些分 子標記來測定該個體對以埃坡黴素治療之潛在反應性:方 法、套組及化合物。本發明另外係關於該等化合物視情況 與其他治療劑組合用於治療患有該疾病之個體的方法、化 σ物及用途。亦提供表現程度已測定為在埃坡黴素反應者 與埃坡黴素不反應者之間不同的基因及/或由其編碼之蛋 白質。 【先前技術】 癌症被認為是嚴重且普遍之疾病。據美國國家癌症學會 (National Cancer Institute)估計，單在美國，3人中就有1 人將會在其有生之年遭受癌症折磨。而且，約5〇%至6〇% 之癌症接觸者將最終死於該疾病。肺癌為最常見癌症之 一 ’估計2003年會湧現172,000個新病例及157,000例死亡 (Jemal等人，2003，CA Cancer J· Clin·，53，5-26)。通常將 肺癌分為小細胞肺癌（small-cell lung carcinomas，SCLC) 或非小細胞肺癌（non-small cell lung carcinomas， NSCLC) 〇 SCLC構成所有肺癌之約20%，NSCLC構成餘下 約 80%。進一步將 NSCLC 分成腺癌（adenocarcinoma， AC)(所有病例之約30-35%)、鱗狀細胞癌（squamous cell carcinoma，SCC)(所有病例之約30%)及大細胞癌（large cell carcinoma，LCC)(所有病例之約10%)。未在文獻中明確定 132324.doc 200907341 義之其他NSCLC亞型包括腺鱗細胞癌（acjen〇SqUarn〇us cell carcinoma ’ ASCC)及細支氣管肺泡癌（bronchi〇alveolar carcinoma，BAC) 〇 肺癌為全世界癌症死亡之首要原因，且更特定言之，非 小細胞肺癌佔所有疾病病例之約^(^(Cancef Facts and

Figures，2002, American Cancer Society, Atlanta，第 11 頁）。非小細胞肺癌有四個主要類型，包括腺癌、鱗狀細 胞癌、細支氣管肺泡癌及大細胞癌。基於細胞形態學，腺 f ' ' 癌及鱗狀細胞癌為最常見之NSCLC類型（Travis等人， 1996, Lung Cancer Principles and Practice, Lippincott-Raven，New York，第361-395頁）。腺癌之特徵在於處於肺 中的周邊位置且經常具有K-ras致癌基因之突變（Gazdar等 人，1994，Anticancer Res. 14:261-267)。鱗狀細胞癌通常 位於中心地帶且經常攜帶p53基因突變（Niklinska等人， 2001, Folia Histochem. Cytobiol. 39:147-148)。一 種特別 普遍之癌症形式（尤其在女性中）為乳癌。作為女性死亡之 \ 首要原因’乳癌之發病率在最近三十年間在美國已逐漸增 加。在1997年’據估計在美國報導了 ι81，〇〇〇新病例且 44,000 人將死於乳癌（Parker等人，1997，CA Cancer J. CHn· 47.5 27，Chu 等人 ’ 1996，J. Nat· Cancer Inst. 88:1571-1579)。 主基因表現特徵（gene expression signature)形式之染色 體組資訊具有在疾病預後中定義臨床上相關風險因素之確 定此力。最近研究已產生此等與乳癌中（參見West, M.等 132324.doc 200907341 人，Proc. Natl. Acad· Sci.，USA 98，1 1462-11467 (2001); Spang，R.等人，In Silico Biol. 2，0033 (2002); van'T Veer, L. J·等人，Nature 415, 530-536 (2002); van de Vijver，M. J.等人，N. Engl. J. Med. 347，1999-2009 (2002))以及其他 癌症中（參見 Pomeroy, S. L.等人，Nature 415，436-442 (2002); Alizadeh，A. A.等人，Nature 403，503-511 (2000); Bhattacharjee，A.等人，Proc, Natl. Acad. Sci. USA 98, 13790-13795 (2001); Ramaswamy, S.等人，Proc. Natl. Acad. Sci. 98，15149-15154 (2001); Golub, T. R.等人， Science 286, 531-537 (1999); Shipp，Μ· Α·等人，Nat. Med. 8，68-74 (2002); Yeoh，E.-J_等人，Cancer Cell 1，133-143 (2002))及非癌症疾病情形中淋巴結轉移及疾病復發相關之 特徵（signature)。儘管對療法進行了相當多之研究，但此 等及其他癌症仍難以有效診斷及治療。因此，在此項技術 中存在對分類且治療此等癌症之改良方法的需要。 近幾十年來’開發出了 —系列用於腫瘤治療之高效新穎 化學治療劑。儘管付出所有此等努力，但治療選擇及治療 窗仍受限於此等藥劑之高固有毒性。 通常僅一小部分所投與之物質量到達腫瘤（Anderson等 人，Clin Pharmacokinet 27，191-201，1994; Thorpe等人， Breast Cane Res Treat 36, 237_251, 1995)，而大量物質由 健康組織所吸收且因此造成許多不合需要之副作用。 為此，在目私位點處選擇性釋放全身性投與之化學治療 劑始終為—項科學挑戰。新近開發之目的在於例如藉由轉 132324.doc 200907341 化為前藥形式且僅當到達腫瘤時藉由腫瘤相關酵素分解無 毒性剞藥來解毒細胞抑制劑（Cyt〇static agent)。此概念之 驗證可由 Bosslet(Bosslet等人，Cane Res 58，1195-1201, 1998)在基於阿黴素（doxorubicin)之無毒性前藥之實例中達 成’該無母性剛藥與葡糖搭酸（glucuronic acid)化學連接。 在此情況下’利用在許多腫瘤之壞死區中觀察到提高之溶 酶體 β-D-葡糖醛酸酶（lyS0S0mal p_D_glucur〇nidase)活性之 發現。 關於辨識結合區之理解之進一步發展（尤其在單株抗體 領域或其來自特異性腫瘤抗原之片段中）使得可能設想藉 由在目標位點處特異性釋放抗腫瘤活性成份之選擇性腫瘤 治療。當到達目標位點時，共軛物（conjugate)與細胞表面 結合，且活性成份可視情況在整個複合物首先内化之後釋 放。 然而實體腫瘤的成功療法，尤其用單株抗體進行治療 時，會因抗體在腫瘤中滲透不足以及相應腫瘤相關抗原在 腫瘤組織中分布不均而受到限制。 此等限制因此可藉由以特異性方式攻擊腫瘤血管系統來 加以避免。在約2 mm3體積以下之腫瘤的生長係基於血管 新生（neoangiogenesis)。額外的腫瘤生長係基於完整血管 系統，該系統確保營養素供應或廢物處置。因而對此系統 之選擇性破壞應引起腫瘤壞死。與直接進攻腫瘤本身相 比，攻擊腫瘤之血管系統提供許多優勢。與腫瘤細胞相 比’内皮細胞較易於接近，此係因為無須穿過腫瘤組織。 132324.doc 200907341 對個別腫瘤血管之損壞應引起一千個腫瘤細胞壞死。為損 壞腫瘤血管，不必殺死所有内皮細胞。特異性攻擊腫瘤中 或腫瘤附近之内皮細胞使全身性副作用最小化。内皮細胞 在遺傳上極穩定’使得針對腫瘤治療劑發展抗性的機率較 低。 埃坡黴素及其類似物之結構類別（structural class)提供避 免在此項技術中所觀察到之部分缺點的可能性。埃坡黴素 為一類新穎的誘導細胞凋亡之抗腫瘤化合物。關於研究結 果之不同公開案及報導（例如IDrugs，2〇〇2，5(1〇):949-954) 已證明其抗癌活性。與在臨床實踐中所用之化學治療劑 (諸如兔杉醇（taxol)、阿黴素、順銘（cis_piatjnum)或喜樹驗 (camptothecin))相比，關於此等細胞之活性強度可達 10,000倍之高。劑量方案係自研究報導或自其他公開案已 知’例如自WO 99/43 320已知關於埃坡黴素A及B。

在此項技術中已知埃坡黴素衍生物，例如自WO 93/10102 ' WO 9^9/02514 ' WO 2000/066589 、WO 2001/027308 及 WO 2002/080846 已知。 埃坡黴素為一類新穎的微管穩定化細胞毒性劑 (microtubule stabilizing cytotoxic agent)(參見 Gerth，K.等 人，J. Antibiot，1996，49，560-3;或 Hoefle等人，Angew. Chem. [Applied Chem.]，1996，108，1671-1673)。此等細胞 毒性抗有絲分裂劑藉由與紡錘體-肽微管蛋白（tubulin)結合 來阻斷增殖細胞之有絲分裂紡錘體，且因此引起細胞凋亡 (K.-H. Altmann, Curr. Opin. Chem. Biol., 2001, 5, 424- 132324.doc -10· 200907341 431)。 近來已發現天然產物埃坡黴素A及B以及其一些合成衍 生物與癌症治療有關之關注，且已對其合成（K. Nicolaou 等人，Angew. Chem., 1998，7/0，2120-2153)及修飾結構之 合成做了大量工作。 WO 99/07692、WO 99/02514、WO 99/67252 及 WO 2004/014919揭示埃坡黴素衍生物、其合成及醫藥用途。 WO 00/66589涉及具有烯基、炔基或在巨環之6(10)_位置 處含有取代基之環醚的埃坡黴素衍生物之合成及醫藥用 途。WO 00/49021揭示在16(3)-位置中具有鹵素取代基之 埃坡黴素衍生物及其合成。WO 00/71521揭示合成烯系埃 坡黴素之方法。WO 98/25929涉及製造埃坡黴素類似物之 庫。 然而，對於包括埃坡黴素之任何抗癌藥物而言，通常觀 察到一些患者對指定治療反應良好而另一些卻並非如此。 就此而5，基因概況分析（gene pr〇filing)已證明為區分對 某化學治療治療有反應之患者（稱為反應者）與不反應者之 適用工具就特異性化學治療藥物而言反應者相對不反應 者之基因表現概況可用以預測個別患者對此等藥物之反應 且因^允許獲得較有效之治療方案。另外，可組合關於特 異性樂物之基因表現概況，以預測多藥物方案之成功性 (#^A. Potti#A . Nature Medicine, 2006, 12(11), 1294-1300)〇 在不同類型癌細胞中 τ <入IT遺傳;^ 5己的表現可經由微陣 132324.doc 200907341 列技術及其他方法（例如參見P.A. Clarke等人，Eur. j.

Cancer, 2004，40，2560-2591; G. Mtiller-Hagen等人，Drug

Discovery & Development，2004，7f3), 291-303)來加以研 究。如上所述，此等研究為適用的，因為特異性遺傳標記 在針對特異性化學治療劑之反應者與不反應者中顯示差I 表現。然而’必須個別測定患者對各藥物之反應概況（參 見 A. Potti 等人，Nature Medicine, 2006, 12(11), 1294 13〇〇)。最近’研究了在肺癌治療中對EGFR酪胺酸抑制劑 敏感之患者的基因表現專利（J.M· Balko等人，BMc

Genomics，2006, 7, 289)，且在另一研究中鑑別了為對太平 洋紫杉醇（paclitaxel)敏感性之決定因素的特異性基因（c

Swanton等人，Cancer Cell，2007, "，498-512)。 然而’因為指示患者對某化學治療化合物之敏感性的遺 傳標記需要對各藥物個別地鑑別，所以在確定個別治療方 案時基因表現概況的適用性僅限於遺傳標記已知之藥物。 懾g近年來在癌症治療方面存在顯著進步，但 對鑑別對指定抗癌藥物有反應之患者子群存在需要，: 更合理地選擇以高機率受益於療法之患者 效性引起之副作用。廿悴拟斟认〜 未物無 “ 乍用此清形對於埃坡黴素結構類別而t尤 其適用。 7。凡 測個體對以埃 此目標及其他 因此，本發明之一目標在於提供適用於預 坡黴素治療疾病之潛在反應性的新穎標，己。 ，藉由本發明在下文所述之 【發明内容】 取 132324.doc -12- 200907341 本發明者已發現本文中提供之方法、套組及化合物可成 功地用於鑑別預期對以埃坡黴素治療諸如非小細胞肺癌之 疾病有反應之患者的子群。 因此，在第一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴 素治療疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來 自該個體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的 表現程度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細 胞色素P(cytochrome P，CYP)同功異型物、微粒體環氧化 物水解酶（microsomal epoxide hydrolase，EPHX1)、細胞 質環氧化物水解酶（cytoplasmic epoxide hydrolase， EPHX2)、叛酸 S旨酶 2(carboxyl esterase 2，CES2)、 p53(TP53) ' ^ Fas-^a ^ (pro-apoptotic Fas- interacting partner，DAXX)、神經調節蛋白 l(neuregulin 1，NRG1)、肝細胞生長因子（hepatocyte growth factor， HGF)、肌縮蛋白（dystrophin，DMD)、UGT1A1、UGT1 A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1 (SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶（heme oxygenase， HMOX1) 、 NIP3(BNIP3) 、 BNIP3L 、碳酸酐酶 (Carboanhydrase)2、9及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、 運鐵蛋白（transferrin，TF)、HIF-脯胺醯基經化酶（HIF-prolyl hydroxylase ， EGLN3) 、 E2F3 、 EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4 、ITGA6 、KIFAP3 、TIMP2 、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1或其任何組合。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 132324.doc -13 - 200907341 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細 胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、促凋亡Fas-相互作用搭配 物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD) 、UGT1A3 、UGT1A4 、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1、血紅素加 氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯 胺酸基經化酶（ELGN3)。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧 化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、 神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋 白、UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶 A(aldolaseA)、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯基羥化酶 或其任何組合。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 132324.doc -14- 200907341 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧 化物水解酶（EPHX1)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭 配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD) 、UGT1A1 、UGT1A3 、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 、 VEGF(VEGFA)、 GLUT1(SLC2A1)、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3 (BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)或其任何組合。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧 化物水解酶（EPHX1)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭 配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10、AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶 A、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺酿基經化酶 或其任何組合。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 132324.doc -15- 200907341 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHXl)、細 胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基 羥化酶或其任何組合。AKR1C2。 在一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療疾 病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個體 之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧 化物水解酶、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯基羥化酶或其任何組合。 在一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療疾 病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個體 之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細 胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、促凋亡Fas-相互作用搭配 物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 132324.doc -16- 200907341 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3 、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、 NIP3、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)或其任何組合。AKR1C2。 在又一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細 胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、 p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺 醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、 EPHA4、ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、 FSHPRH1或其任何組合。 在又一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細 132324.doc 200907341 胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、 p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2 及 9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺酿基經化 酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、 ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 或其任何組合。 在另一態樣中，本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之至少一種基因或由其編碼之蛋白質的表現程 度，其中該蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素 P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧 化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、 羧酸酯酶2(CES2)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、 神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋 白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2 及 9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基經化 酶(EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4、 ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 132324.doc -18- 200907341 或其任何組合。 在本發明之又一態樣中，上述清單之蛋白質的任何子組 合可用於測定個體對以埃坡黴素（尤其沙戈匹隆 (sag〇Pil〇ne))治療疾病之潛在反應性的方法中，其中該方 法包含分析來自該個體之樣本中之至少一種基因或由其編 碼之蛋白質的表現程度。 在另一態樣中’本發明提供測定個體對以埃坡黴素治療 疾病之潛在反應性的方法，《中該方法包含分析來自該個 體之樣本中之複基因的表現程度；及藉由比較該等基因之 表現程度與指示途徑失調（pathway deregulati〇n)之參考概 況來债測途控失調之存在，《中途徑失調之存在指示該個 體對以該埃坡黴素治療之潛在減小的反應性（埃坡黴素不 反應者）。 Μ 本發明之又—態樣係關於敎患有惡性病症之個體對以 埃坡黴素治療該病症之潛在反應性的標記之方法，其中該 方法包含：將腫瘤細胞自個體轉移至裸小鼠中，測定生長 於免疫缺小鼠或Α鼠上之原發腫瘤或視情況繼代 (passaged)異種移植腫瘤是否對以埃坡黴素治療有反應， 測疋複基因或由其編碼之蛋白f在該等異種移植物中或在 來自此等J、氣或大鼠之血液或其他組織中的表現程度，及 藉由比較該基因或由其編碼之蛋白質在至少一個異種移植 或在來自此等對該埃坡徽素治療有反應之小鼠或大鼠 之血液或其他組織中的表現程度與相同基因或蛋白質在至 少一個異種移植物中或在來自此等對該埃坡黴素治療無反 132324.doc -19- 200907341 應之小鼠或大鼠之血液或其他組織中的表現程度，來鑑別 標記蛋白質或編碼該蛋白質之基因，或者其中將表現程度 與非惡性組織中之參考標準相比，藉此標記蛋白質在反應 者中與不反應者中相比，或與該參考標準表現程度相比具 有改變之表現程度。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之一或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以 埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該 標記蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP) 同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環 氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、p53(TP53)、 促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白 1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、 UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺 醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、 EPHA4、ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、 FSHPRH1。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之一或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以 埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該 標記蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP) 132324.doc -20· 200907341 同功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHXl)、細胞質環 氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、p53(TP53)、 促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白 1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、 UGT1A3 、UGT1A4 、UGT1A8 、UGT1A10 、VEGF (VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺 醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、 EPHA4、ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、 FSHPRH1。 在一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段之 一或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃 坡黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標 記蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同 功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧 化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、p53(TP53)、促 凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白 1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、 UGT1A3 、UGT1A4 、UGT1A8 、UGT1A10 、VEGF (VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶2及 9(CA2、 CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、 132324.doc -21 - 200907341 KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段之 一或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃 坡黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標 記蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同 功異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧 化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、促凋亡Fas-相互 作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長 因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8 ' UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶2及9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白 (TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4 、ITGA6 、KIFAP3 、TIMP2 、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 本發明之另一態樣係關於編碼標記蛋白質或其片段之一 或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃坡 黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標記 蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同功 異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解 酶、p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節 蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、 UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 AKR1C2、VEGF、GLUT1、酸縮酶A、金紅素加氧酶、 132324.doc •22· 200907341 NIP3、PGKl、運鐵蛋白、HIF_脯胺醯基羥化酶。 本發明之另一態樣係關於編碼標記蛋白質或其片段之一 或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃坡 黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標記 蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素p(CYp)同功 異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解 酶、P53、促〉周亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節 蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、I縮酶a、血紅素加氧酶、NIp3、 PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯基羥化酶。 本發明之另一態樣係關於編碼標記蛋白質或其片段之一 或夕種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃坡 黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標記 蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素1>((：¥15)同功 異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解 酶、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白 1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、UGTlA3、 UGT1A4 ' UGT1A8 > UGT1A10 ^ AKR1C2 > VEGF > GLUT1、I缩酶A、血紅素加氧酶、Nip3、pGK1、運鐵蛋 白、HIF-脯胺醯基羥化酶。 本發明之另一態樣係關於編碼標記蛋白質或其片段之一 或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃坡 黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標記 132324.doc -23- 200907341 蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同功 異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化 物水解酶（EPHX2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配 物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3 、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3(BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯 基羥化酶（EGLN3)。 本發明之另一態樣係關於編碼標記蛋白質或其片段之一 或多種核酸或具有其互補序列之核酸在測定個體對以埃坡 黴素治療疾病之潛在反應性的方法中之用途，其中該標記 蛋白質係選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同功 異型物、微粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化 物水解酶（EPHX2)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、 神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋 白（DMD) ' UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 V. VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)。 在本發明之又一態樣中，核酸之任何子組合可用以在測 定個體對以埃坡黴素（尤其沙戈匹隆）治療疾病之潛在反應 性的方法中為上文清單中規定之標記蛋白質或其片段編 碼0 或者，用於本發明方法中之核酸可在嚴格條件下與編碼 該標記蛋白質之基因雜交，或其可具有與編碼該標記蛋白 132324.doc •24- 200907341 質之基因的編碼股序列互補之序列。 本發明之另-態樣係關於針對如上定義之標記蛋 抗體或任何其他源自抗體之結合劑的用途。 在又一態樣中，本發明係關於測定個體對以埃坡黴 療疾病之潛在反應性㈣組，其巾料套^含至少二治 如上所述之核酸或抗體。 夕個 本毛月之另態、樣係關於治療患有疾病之個體的方、、去 其包含分析該個體之基因表現概況，以確定個體是否將餅 以埃坡黴素治療有反應，及若分析表明個體將對以該埃坡 黴素治療妓應m料效量之埃賴素治療個體。 根據本發明，該疾病係選自由以下各疾病組成之群亞 性病症、腫瘤疾病、發炎性疾病、神經 ： 生成相關疾病、多…化症、阿茲二氏血:

Jhelme,s disease)^! . t Γ, m ^ ^ 郎火’且較佳為惡性病症。

因此，本發明亦係關於埃坡黴素對於製造醫藥的用途， 該醫藥係用於治療患有選自以下各疾病之疾病的個體：亞 性病症、腫瘤疾病、發炎性疾病、神經退化性疾病、血管 ^成=關疾病、多發性硬化症、阿茲海默氏症、骨質疏鬆 H疾病或類風濕性關節炎，|中待治療之個體已測定 :對以埃坡黴素治療有反應。該醫藥可視情況連同已知對 治療該疾病有效之另一治療劑—起投與。 該惡性病症較佳係選自_巢癌、胃癌、結腸癌、腺癌、 礼癌、肺癌、前列腺癌、頭及頸癌、惡性黑色素瘤、急性 132324.doc 25· 200907341 淋巴球性白& p 成病、急性骨髓性白血病、骨轉蒋、 轉移。在本發明，# 月轉H廇及腦 發月之一態樣中，惡性病症係選自由 病組成之群” ^下各疾 p巢癌、月癌、結腸癌、乳癌、肺癌、前列 腺癌、頭及頸、皮 A 貝癌、腦瘤或惡性黑色素瘤。在本發明之另一 二二惡性病症係選自肺癌、卵巢癌及乳癌，而惡性病 症敢佳為非小細胞肺癌（NSCLC)。 本發明之另—態樣係關於埃坡黴素及至少—種盆他 7對於製造醫藥組合物的用途，該醫藥組合物係用於^療 患有選自以下各疾病之疾病的個體：惡性病症、腫瘤疾 病、發炎性疾病、神經退化性疾病、金管生成相關疾病、、 多發性硬化症、阿兹海默氏症、骨質疏鬆症、骨疾病或類 風漏性關節炎，其中待治療之個體對以該埃坡徽素治療無 反應。在此情況下，該至少一種其他治療劑能夠調節指示 對以埃坡黴素治療無反應之途徑的活性程度。 在本發明之情形中，此項技術中所已知之所有埃坡黴 素、埃坡黴素衍生物及埃坡黴素共軛物均特定地涵蓋於本 文中。舉例而言，根據本發明之埃坡黴素包括（但不限於） 由以下各物組成之群：埃坡黴素A、埃坡黴素B、埃坡黴 素C、13-烷基-埃坡黴素C衍生物、埃坡黴素D、反式埃坡 黴素D、埃坡黴素E、埃坡黴素F、埃坡黴素之效應共軛物 (effector conjugate)、沙戈四隆、伊沙匹隆（ixabepii〇ne) (BMS-247550)、BMS-310705、EPO_9〇6、帕妥匹隆 (patupilone)、Kos-862、Kos-1584、Kos-1803、ABJ 879， 或此等化合物之醫藥學上可接受之鹽。 132324.doc -26- 200907341 本發明之一態樣係關於測定患有疾病，尤其患有癌症疾 病之個體對埃坡黴素，尤其對上述埃坡黴素衍生物，較佳 地對沙戈匹隆的潛在反應性之方法、套組及化合物。 【實施方式】 本發明尤其係關於測定患有疾病之個體對以埃坡黴素治 療之潛在反應性的方法、套組及化合物。潛在反應性—般 藉由分析某些標記基因或由其編碼之蛋白質纟來自患㈣ 疾病之個體的樣本中之表現程度來測定，纟中改變之表現 程度或突變狀態指㈣以該埃坡黴素治療之反應性或無反 應性。SUt ’本發明允許!！別較可能對埃坡黴素治療有反 應之患者子群。另-優勢在於本發明之方法可有助於降低 因投與埃坡黴素而引起之副作用的發生率及嚴重程度，且 亦可有助於找到適當劑量方案。另外，發現指示某一反應 性之標記亦提供產生合理治療方案之可能性，該合理治療 方案包括與根據患者所測定之巧_ u 反應性選擇之精選治療劑的 組合療法。 除非另作定義，否則本文中 ♦X甲所用之所有技術及科學術語 均具有熟習本發明所屬領域 砀之一般技術者通常所理解的相 同含義。 除非上下文明確指出，否 貝J術S吾或在本文中意指術語 ”及/或”，且與術語”及/或” 立 X互換使用。術語"諸如"在本文中 意指短語”諸如（但不限於）"， 且與短浯”諸如（但不限於）”互 換使用。 ”患者”或”個體"可音扣Λ 類或非人類動物，較佳為哺乳 132324.doc -27. 200907341 動物。 術語"表現，，在本文中意指自DNA產生多肽之方法。該方 法包括將基因轉錄為mRNA且將此mRNA轉譯為多狀。視 使用情形而定表現”可指產生RNA、蛋白質或兩者。 術語''疾病（Pathological disorder/disease)"係廣泛地使用 且係指身體之任何部分、器官或系統，或其任何組合之正 常結構或功能的任何失常。特定疾病藉由包括生物變化、 化學變化及物理變化之特徵症狀及體征來表現，且經常與 多種其他因素有關，該等因素包括（但不限於）人口因素、 環境因素、職業时、遺傳因素及醫學史因素…些特徵 體征、症狀及相關因素可經由多種方法加以定量以產生重 要診斷資訊。 从士 冲丨山叫胆仪兴土題組合 物中一或多者。若其係在不期望 別呈届况（例如，癌症或癌轉 移）之故床表現之前投斑，則兮、、二成达 m合療為預防性的，亦即其 保護主體以避免產生不期望 #而若在不期望之病況 表現之後技與，則該治療為治 改善<伴㈣h㈣ （ 忍欲減少、 保持現有不期望之病況或由此引起之副作用）。 術語”治療作用"係指在動 s ^ ^ 尤其在哺乳動物中，且 更尤其在人類中由藥理學上 ,,m 丨物質所引起的局部或+1 作用。該術語因此表示意欲 飞王身 格^. 用於在動物或人類中診斷、户 癒、緩和、治療或預防疾病 口 展及狀況之任何物質。/以向所需身體或心理發 短語”治療有效量”意謂以 、用於任何治療之合理益處/風 I32324.doc •28_ 200907341 險比產生一些所需局部或全身作用之此物質的量。在一些 實施例中，治療有效量之化合物將視其治療指數、溶解性 等因素而定。舉例而言’本發明之一些細胞株可以足以產 生適用於此治療之合理益處/風險比之量投與。 如本文中所用之術語"抗體”意欲包括全部抗體，例如任 何同型（isotype)之抗體（IgG、IgA、IgM、IgE等），且包括 其亦對脊椎動物（例如哺乳動物）體内蛋白質具有特異反應 性之片段。抗體可使用習知技術斷裂（fragmented)，且針 對效用及/或與所關注之特異性抗原決定基之相互作用篩 檢片段。因此，該術語包括能夠選擇性地與某一蛋白質反 應之抗體分子之以蛋白分解或重組製備之部分之區段。此 等蛋白水解及/或重組片段之非限制性實例包括Fab、 F(ab’）2、Fab’、Fv，及含有藉由肽連接子接合之V[L]及/或 V[H]域的單鏈抗體（scFv)。可使scFV共價或非共價連接以 形成具有兩個或兩個以上結合位點之抗體。術語抗體亦包 括多株抗體、單株抗體或抗體之其他純化製劑及重組抗 體、部分或完全人化抗體或抗體片段以及抗體狀蛋白質或 寡核苷酸或其組合。抗體狀蛋白質及片段中任一者在本文 中將亦稱為源自抗體之結合部分。 術語"抗腫瘤劑"在本文中用以指具有以下功能特性之藥 劑：抑制人類之瘤或瘤性細胞生長之發展或進展，尤其惡 性（癌性）病變’諸如癌、肉瘤、淋巴瘤、白血病，或抑制/ 壓制腫瘤内皮及基質細胞以及幹細胞。

術語”細胞色素P(CYP)同功異型物"包括（但不限於）CYP 132324.doc -29- 200907341 2E1、CYP2C9、CYP2C18及 CYP1B1。 術語"埃坡黴素”意謂在此項技術中已知之所有埃坡黴 素、埃坡黴素衍生物及埃坡黴素共軛物，更特定言之如下 文在說明書中所述之埃坡黴素群，尤其由以下各物組成之 群：埃坡黴素A、埃坡黴素B、埃坡黴素c、13_烷基-埃坡 黴素C衍生物、埃坡黴素D、反式埃坡黴素D、埃坡黴素 E、埃坡黴素F、沙戈匹隆、伊沙匹隆（BMs_24755〇)、 bms-310705、EPO_906、帕妥匹隆、K〇s 862、k〇s_ 1584、K〇S-18〇3、ABJ 879,或此等化合物之醫藥學上可 接受之鹽或任何埃坡黴素之效應共軛物，最佳為沙戈匹 隆，其為（18,35,78，1011，118，128，1611)-7，11-二羥基_3_(2_甲 基-苯并噻唑-5-基）-10-(丙_2_烯基）_8,8，12,16_四甲基_ 4,17-一氧雜雙環[14.1.0]-十七烧_5,9-二酮 術語"過表現（overexpressed)"或"低表現（underexpressed)n 通常係關於核酸序列或蛋白質在腫瘤或其他組織中較之在 非腫瘤細胞（亦即正常對照物）中通常所觀察到之程度分別 更问或更低之表現，或在本發明之情形中，亦指其中相對 於不反應者腫瘤或其他組織，在反應者中對以指定治療劑 治療之表現程度不同。在較佳實施例中，在癌細胞中過表 現之核酸或蛋白質的表現程度在癌細胞中相對於在正常對 照物中至少要大 10%、20%、40%、50%、60%、80%、 100%、150%、200〇/〇、300%、400〇/〇、500〇/〇、750%、 1,000%、2,〇〇〇〇/0、5,〇〇〇%或 1〇,〇〇〇〇/0。 或者’術語低表現及過表現亦可意謂該標記蛋白質之表 132324.doc •30- 200907341 ，較佳至少約2倍，或者其 大至少約3倍，且較佳至少 現粒度增大或減小至少約1 · 5倍 中該標記蛋白質之表現程度增 約5倍。 =如根據本發明之埃坡彳數素的治療劑之術語”反應 係指其中以該治療劑治療產生根據疾病之 個二：(CUniCal ah—測定之康復或至少停滞的樣本或 、λ…例而5，在惡性病症中，反應者將在以該治療劑 …療之後或期間顯示腫瘤緩解/消退（代…⑷⑽/ session)(亦即與治療開始時相比腫瘤體積減小)或疾病 =滯（基本上無腫瘤進展，亦即腫瘤體積基本上保持恆 定）。在某些較佳實施例中，腫瘤緩解將係 少減小5一、 60%、70%、80%、90%或 1〇〇%。 類似地，關於諸如根據本發明之埃坡黴素的治療劑之術 語"不反應者，，或”無反應性”係指其中以該治療劑治療並不 產生根據疾病之臨床準則測定之康復或至少停滯的樣本或 個體。舉例而t，在惡性病症中，不反應者將在以該治療 劑治療之後或期間經歷腫瘤進展（亦即，腫瘤體積增大）。 腫瘤消退/緩解或腫瘤生長可（例如）藉由在以治療劑或治 療劑之組合物治療樣本或個體之後或期間在此項技術中熟 知之曲線（TVUC)測試下之標準腫瘤體積來測定。 如本文中所用，術語”途徑"意欲意謂與產生產物或活性 之兩種或兩種以上連續分子相互作用有關之一組系統組 份。一種途徑可產生多種產物或活性，其可包括（例如）分 132324.doc 31 200907341 子相互作用、核酸或多肽之表現變化、在兩個或兩個以上 分子之間複合物的形成或解離、代謝產物之積累或破壞、 酵素或結合活性之活化或去活化。因此，術語"途徑”包括 多種途徑類型，諸如生物化學途徑（bi〇chemical pathway)、基因表現途徑（gene expressi〇n pathway)及調節 途徑（regulatory pathway)。類似地，一途徑可包括此等例 示性途徑類型之組合。舉例而言，生物化學途徑可包括使 一種化合物轉化為另一種化合物之酶促途徑（諸如在代謝 中），及使酵素活性、多肽結構及多肽功能活性發生變化 之信號轉導途徑。其他途徑亦可包括與治療劑代謝或修飾 以製備用於自身體解毒/排除之化合物有關之途徑類型。 在一些實施例中，生物化學途徑可為碳水化合物代謝途 徑，其在一特定實施例中係選自由以下各過程組成之群： 糖酵解/葡糖新生（glycolysis/gluconeogenesis)、擦檬酸循 環（citrate cycle，TCA循環）、戊糖磷酸途徑（pent〇se phosphate pathway}、戊糖與葡萄糖醛酸相互轉化（pent〇se and glucuronate interconversion)、果糖及甘露糖代謝 (fructose and mannose metabolism)、半乳糖代謝（galactose metabolism)、抗壞血酸及醛糖二酸代謝（asc〇rbate alld aldarate metabolism)、澱粉及蔗糖代謝（starch ancl sucrose metabolism)、胺基糖代謝（amino sugars metabolism)、核 普酸糖代謝（nucleotide sugars metabolism)、丙酮酸代謝 (pyruvate metabolism)、乙醛酸及二羧酸代謝（giy〇xyiate and dicarboxylate metabolism)、丙酸代謝（propi〇nate 132324.doc 32- 200907341 metabolism)、丁 酸代謝（butanoate metabolism)、C5 支鏈二 元酸代謝（C5-branched dibasic acid metabolism)、肌醇代 謝（inositol metabolism)及肌醇填酸代謝（inositol phosphate metabolism)。其他途徑包括能量代謝途徑，其在一特定實 施例中係選自由以下各過程組成之群：氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation)、ATP合成、光合作用、碳固 定、還原性羧酸循環（reductive carboxylate cycle)(C02固 定）、甲烷代謝、氮代謝及硫代謝。 在一些實施例中，生物化學途徑為脂質代謝途徑，其在 一特定實施例中係選自由以下各過程組成之群：脂肪酸生 物合成（路徑1)、脂肪酸生物合成（路徑2)、脂肪酸代謝、 嗣體合成及降解（synthesis and degradati〇n 〇f ket〇ne bodies)、類固醇之生物合成、膽酸生物合成、類固醇 激素代謝、雄激素及雌激素代謝、甘油脂代謝、磷脂降 解、前列腺素及白三烯代謝（pr〇staglandin and leuk(miene metabolism)。 在一些實施例中’生物化學途徑為核苷酸代謝途徑，其 在一特定實施例中係選自由嗓呤代謝及^定代謝組成之 群。 她列，生物化學途徑為胺基酸代謝途徑，其 在一特定實施例中係選自由以下各過程組成之群：㈣酸 代謝、丙胺酸及天冬胺酸代謝、甘胺酸、絲胺酸及蘇胺酸 代謝、甲硫胺酸代謝、半胱胺酸代謝、類胺酸、白胺酸及 異白胺酸降解'绳胺酸、白胺酸及異白胺酸生物合成、離 132324.doc • 33 - 200907341 胺酸生物合成、離胺酸降解、精胺酸及腩胺酸代謝、組胺 酸代謝、酪胺酸代謝、苯丙胺酸代謝、色胺酸代謝、苯丙 胺酸、路胺酸及色胺酸生物合成、尿素循環、@_丙胺酸代 謝、牛磺酸及亞牛磺酸代謝（taurine and hypotaudne metabolism)、胺基膦酸代謝（amin〇ph〇sph〇nate metabolism) > 硒基胺基酸代謝（selenoamin〇 acid metabolism)、氰基胺基酸代謝（Cyanoamino acid metabolism)、D-麩胺醯胺及D-麵胺酸代謝（D_glutamine and D-glutamate metabolism)、D-精胺酸及D_鳥胺酸代謝 (D-arginine and D-ornithine metabolism)、D-丙胺酸代謝及 麩胱甘肽代謝。 在一些實施例中，生物化學途徑為聚糖生物合成及代謝 途徑（glycan biosynthesis and metabolism pathway)，其在 一特定實施例中係選自由以下各過程組成之群：N-聚糖生 物合成、N-聚糖降解、〇-聚糖生物合成、硫酸軟骨素/硫 酸乙醯肝素生物合成（chondroitin/heparan sulfate biosynthesis)、硫酸角質素生物合成（keratan sulfate biosynthesis)、葡糖胺聚糖降解（glyCOSaininoglycan degradation)、脂多醣生物合成（lipopolysaccharide biosynthesis)、糖基構脂醯肌醇（GPI)錨生物合成 (clycosylphosphatidylinositol(GPI)-anchor biosynthesis)、 肽聚糖生物合成（peptidoglycan biosynthesis)、鞘酿脂代謝 (glycosphingolipid metabolism)、企型糖脂生物合成乳糖 系歹1J (blood group glycolipid biosynthesis-lactoseries)、血 132324.doc -34- 200907341 型糖月曰生物合成-新-乳糖系列（bl〇〇d gr〇Up glyc〇lipid bi〇synthesis-neo-lact〇series)、紅血球糖苷脂代謝 (globoside metabolism)及神經節苷脂生物合成（gangH〇side biosynthesis)。 舉例而言，基因表現途徑可包括誘導、增強或壓制特定 基因表現之分子。因此，基因表現途徑可包括起與該一或 多種調節基因之啟動子或其他調節區域中之特異性DNA序 列結合的壓制基因（repressor)及轉錄因子作用之多肽。基 因表現途徑之實例為響應於生長刺激而誘導細胞週期基因 表現。 如本文中所用，術語"失調途徑（dereguiated pathway)„意 欲意謂與”正常”調節途徑相比具有改變之活性的途徑。例 如’活性變化包括在特定條件下誘導途徑組份之表現、活 性或物理相互作用之變化。術語”失調途徑"在本文中意指 過度活化（hyperactivated)或活化不足（hypoactivated)之途 控。若一途控具有比正常途徑大至少丨〇%、2〇%、5〇0/。、 75%、100%、200%、5 00%、1000%之活性/信號傳導，則 其為過度活化。若一途徑具有比正常途徑小至少丨〇%、 20%、50%、75%、1〇〇%、200%、500%、1〇00%之活性/信 號傳導’則其為活化不足。活化狀態之變化可歸因於基因 突變（諸如點突變、缺失或擴增）、轉錄調節之變化（諸如甲 基化、磷酸化或乙醯化變化）或蛋白質調節之變化（諸如轉 譯或後轉譯控制機制）。在一些實施例中，失調係由在該 失調途徑中上調（亦即過表現）或下調（亦即低表現）之一或 132324.doc -35- 200907341 多種基因或由其編碼之蛋白質所引起。 在-實施例中，失調途徑為調節途徑。例如，調節途徑 可包括在特定條件下控制細胞功能之途徑。調節途徑藉由 (例如)改變系統組份之活性或生物化學途徑、基因表現途 徑或其他類型途徑之活性來控制細胞功能。調節途徑之特 ，實例包括響應於生物化學系統之環境刺激來活化細胞功 月b之途；l，諸如響應於細胞生長信號之存在來抑制細胞分 化，及響應於半乳糖之存在及壓制糖（repressing sugar)之 缺乏來活化半乳糖輸入及催化（galaet〇se imp〇rt catalysis)。術語”組份，，當關於網路或途徑使用時意欲意謂 生物化學系統、網路或途徑之分子成份，諸如多肽、核 酸、其他巨分子或其他生物分子。 在另一實施例中，失調途徑為信號傳導途徑。信號傳導 途徑包括MAPK信號傳導途徑、Wnt信號傳導途徑、TGF_p 信號傳導途徑、toll樣受體信號傳導途徑、Jak_STAT信號 傳導途徑、第二訊息信號傳導途徑及麟脂醯肌醇信號傳導 途徑。 在一些實施例中’途徑或失調途徑含有腫瘤抑制因子 (suppressor)或致癌基因或兩者。指定致癌基因或腫瘤抑制 基因的途徑在此項技術中為人所熟知，且可藉由參考描述 基因之功能及其途徑分類的若干資料庫中任一者及/或藉 由參考文獻來指定（亦參見Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology. Gerhard Michal (編 者）Wiley，John & Sons, Incorporated，（1998); Biochemistry -36- 132324.doc 200907341 of Signal Transduction and Regulation, Gerhard Krauss, Wiley, John & Sons, Incorporated, (2003); Signal

Transduction. Bastien D. Gomperts, Academic Press, Incorporated (2003))。可使用之資料庫包括（但不限 於）http://www.genome.jp/kegg/kegg4.html;在http://www.ncbi.nih.gov 之 Pubmed ' OMIM 及 Entrez;在 http://www.expasy.org/之 Swiss-Prot資料庫’及在此項技術中已知之許多其他資料 庫。 術語”致癌途徑”在本文中意指當過度活化或活化不足時 促使癌症起始或進展之途徑。在一實施例中，致癌途徑為 含有致癌基因或腫瘤抑制基因之途徑。 在進一步詳細描述本發明及其較佳實施例之前，應瞭解 本發明並不限於下述本發明之特定實施例，因為可產生特 疋實施例之變化型式且仍屬於隨附申請專利範圍之範疇。 亦應瞭解所採用之命名法僅為描述特定實施例之目的，而 並不意欲以任何方式加以限制 較佳實施例之詳細描述 如本文中前述，本發明之一態樣係關於測定個體對以埃 坡黴素治療疾病之潛在反應性的方法，其中該方法包含分 析來自該個體之樣本中的至少—種由本發明者鑑別之標記 基因（或由其編碼之蛋白質）的表現程度。測定患者對埃坡 黴素〜療之反應狀態（resp〇nse sUtus)的潛在標記基因係選 自由以下各物組成之群：細胞色素p(CYp)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酿、 解屿（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 132324.doc -37- 200907341 (EPHX2)、缓酸酯酶 2(CES2)、ρ53(ΤΡ53)、促凋亡 Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1 (SLC2A1) 、ALDOC 、血紅素加氧酶（HMOX1)、 NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9及 12(CA2、CA9、 CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、 KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 或其任何 組合。 在本發明之另一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3 、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、 PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、 E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、 TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 或其任何組合。 在本發明之另一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 132324.doc -38- 200907341 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸醋酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶2及9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白 (TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4 、ITGA6 、KIFAP3 、TIMP2 、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 或其任何組合。 在本發明之又一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節 蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L ' 碳酸酐酶 2 及 9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化 酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4、 ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 132324.doc -39- 200907341 或其任何組合。 在本發明之另一態樣中，潛在標記基因可選自由以下各 物組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物，尤其 CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP1B1、微粒體環氧化 物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促〉周亡Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白、UGT1A1 、UGT1A3 、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、VEGF、 GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋 白及HIF-脯胺醯基經化酶。 在本發明之另一態樣中，潛在標記基因可選自由以下各 物組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物，尤其 CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及CYP1B1、微粒體環氧化 物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、 p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化 酶（EGLN3)。 在本發明之另一態樣中，潛在標記基因可選自由以下各 物組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物，尤其 CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及CYP1B1、微粒體環氧化 物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、 132324.doc -40- 200907341 ρ53(ΤΡ53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3、PGK1、 運鐵蛋白（TF)及HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)。 在本發明之又一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物，尤其CYP 2E1、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶 A、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯 基經化酶。 在本發明之又一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物，尤其CYP 2E1、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10、AKR1C2、VEGF、GLUT1、搭縮酶 A、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醢基羥化 132324.doc -41 - 200907341 酶。 本發明之又一態樣在於測定患者對埃坡黴素治療之反應 狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞色 素P(CYP)同功異型物，尤其CYP 2E1 、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 氧化物水解酶、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經 調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在本發明之又一態樣中，測定患者對埃坡黴素治療之反 應狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞 色素P(CYP)同功異型物，尤其CYP 2E1、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。醛縮酶A、 AKR1C2。 本發明之又一態樣在於測定患者對埃坡黴素治療之反應 狀態的潛在標記基因係選自由以下各物組成之群：細胞色 素P(CYP)同功異型物，尤其CYP 2E1、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 132324.doc -42- 200907341 氧化物水解酶、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經 調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGf)、肌縮蛋白、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF、 GLUT1、血紅素加氧酶、nip3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶》醛縮酶A、AKR1C2。 在本發明之又一態樣中，上文清單中所示之潛在標記基 因的任何子組合可用於測定患者對於埃坡黴素，尤其沙戈 匹隆治療之反應狀態。 在本文中’應瞭解若未明確規定，本文涵蓋前述標記基 因之所有同功異型物。本發明者已發現以下關於上述基因 之表現程度或突變狀態的觀察中之任一者指示對於埃坡黴 素治療疾病之潛在反應性或減小反應性（亦即在本文中定 義為無反應性）。 舉例而言，已觀察到埃坡黴素之所有反應者具有p53之 大·變，導致喪失該基因之功能表型。p53功能喪失突變通 常與惡性病症之特別不良預後相關。然而，令人驚訝地發 現’具有突變p53基因之腫瘤對於埃坡黴素治療反應尤其 好（進一步之細郎請參見實例部分）。因此，導致功能喪失 之突變P53基因的存在指示患者對於埃坡黴素治療之潛在 反應性。因此，基於此等事實之方法、用途及套組為本發 明之態樣。 指示患者對於埃坡黴素治療之潛在反應性的標記基因之 其他實例為DAXX基因及肌縮蛋白基因。本發明者已發現 D A X X及/或肌縮蛋白之增大基因表現指示患者對於埃坡黴 132324.doc • 43· 200907341 素治療之潛在反應性。 =發明方法中，以下基因中至少一者之增大表現指示 心ί於埃坡黴素治療之潛在減小反應性：cYp同功異麼 :faCYP 2E1、CYP2C9、CYp2ci8 及 cYp26Ai)、微粒 豆％乳化物轉酶、細胞f環氧化物水解酶、NRG1及/或 HGF。若發現上述基因中至少—者具有増大表現程度，則 已可預期潛在減小反應性。然而’通常將觀察到多於一 種’較佳多於兩種、二插、四插出 一裡四種或五種基因將在無反應性 患者中顯示增大表現程度。 ，在本文巾有時將經則對以埃賴素治㈣反應之患者 稱為埃坡黴素反應者，而在本文中有時將顯示如本文中所 定義減小之反應性或無反應性的患者稱為埃坡黴素不反應 者0 本文亦涵蓋測定潛在反應性之方法，其中該方法包含分 析複基因在來自該個體之樣本中的表現程度；及藉由比較 該等基因之表現程度與指示途徑失調之參考概況來偵測途 徑失調之存在。或者，可比較表現概況與"正常"患者/樣本 (亦即未受該疾病影響）之參考概況。根據本發明之方法， 途徑失調之存在指示該個體對以該埃坡黴素治療之潛在減 小之反應性。換言之，可隨後將此患者歸類為埃坡黴素不 反應者。 經發現在埃坡黴素不反應者個體中失調之途徑包括尿苷 二填酸葡萄糠醛酸轉移酶途徑（UDp glucur〇n〇syl_ transferases pathway)及低氧（HIF1A)反應途徑（Resp〇nse t〇 132324.doc -44 - 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Hypoxia (HIF1A) pathway)。因此，測定失調尿苦二填酸 葡萄糖醛酸轉移酶途徑及/或失調低氧（HIF1A)反應途徑之 存在的本發明之方法亦涵蓋於本文中且適用於預測患者極 可能對以埃坡黴素治療無反應。 在本發明之情形中，若觀察到為選自由UGT1A1、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 及 AKR1C2 組成 之群的蛋白質編碼之基因中至少一者之表現程度增大，則 將存在失調的尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶途徑。類似 地，當觀察到為選自由VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素 加氧酶、NIP3、BNIP3L、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯 基羥化酶、CA9、CA12組成之群的蛋白質編碼之基因中至 少一者之表現程度增大時，將存在失調的低氧反應 (HIF1A)途徑。因此，本發明根據此等基因群或其任何子 群或各自蛋白質或其任何子群所述之用途、方法或套組為 本發明之特定態樣。 本發明之另一態樣為本發明根據由UGT1A3、 UGT1 A4、UGT1A8、UGT1A10 及 AKR1C2 組成之群或由 VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 BNIP3L、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶、CA9 組成之群所述之用途、方法或套組。 本發明之另一態樣為本發明根據由UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8 及 UGT1A10 組成之群或由 VEGF、 GLUT1、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3、BNIP3L、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、CA9之 132324.doc -45- 200907341 群所述之用途、方法或套組。 柜據測疋對以埃坡黴素治療之潛在反應性的方法測定基 因或由其編碼之蛋白t的表現程度較佳地離體㈣Wvo)或 .甚士活體外…v_)進行。在此項技術中熟知表現程度之 測疋些實例提供於實例部分及圖式中。根據在此項技 #中熟知之程序，較佳自基線狀態（baseline status)，亦即 自，（尚未）以埃坡黴素治療之樣本測定表現程度。然而， '、°、在原自已以埃坡黴素或另一治療劑治療之個體的樣 ^中測定-種或-種以上標記基因之表現程度。但，為獲 得最佳、、’σ果’應在未經治療樣本中測定表現程度。 卜夕種測①帛基因或複基因之表現程度的方法在此項技 術中為已知且4日4占_l心 且了根據本發明之方法使用。用於便利地獲得 基因表現概況之-種較佳技術包括使用所謂之微陣列 (mlcroarray)。許多不同微陣列在此項技術中為可得，其包 括（但不限於）基於蛋白質、驗或cDNA之微陣列、SNp陣 7或微職陣列。舉例而言，如在實例部分中進—步詳細 才田述藉助於例如可但 ， Η 了侍自Affymetnx公司的所謂基因晶片可 便利地’収基因表現概況。諸如得自Affymetrix公司之彼 :的基因晶片微陣列係由在經塗覆之石英表面上特定位置 处化予σ成之小DNA片段（在本文稱為探針）組成。將合成 ^探針之精確位置稱作部件（feature)，且在一個陣列上可 3 :數百萬個部件。藉由自實驗樣本萃取且標記核酸，且 =將彼等製備樣本雜交至陣列’可在各部件處監測標記 里’從而能夠實現對全基因組規模（wh〇ie_genc)me⑽⑷ 132324.doc -46- 200907341 之廣泛應用一包括基因程度及外顯子（exon)程度表現分 析新賴轉錄物發現、基因定型（genotyping)及再定序 (resequencing) ° 或者可藉由基於PCR之技術，諸如定量rT_pcr，或藉由 螢光原位雜交（fluorescence in situ hybridizati〇n，fish)技 術（例如，細胞凋亡之TUNEL)來定量測定表現程度。 當然’指定蛋白質之表現程度測定並不限於基於核酸之 偵測方法。因此，測定指定蛋白質之表現程度的其他可能 方式包括使用西方墨點（western bl〇t)技術、酵素結合免疫 吸附法（ELISA)、放射免疫法（ria)、免疫組織化學方法、 質概況分析技術，諸如LC-MS/MS、ESI或MALDI-ToF。 測定標記蛋白質之表現程度的又一替代性方式係由使用 基於抗體之技術組成，其包括在此項技術中一般已知之蛋 白貝微陣列及組織陣列。應以其如本文中所定義之最寬含 義理解如本文中所用之抗體，且熟習此項技術者將瞭解許 多抗體或源自抗體之結合部分可用於指定蛋白質之表現程 度的定量。合適抗體之實例包括（但不限於）多株抗體、單 株抗體或抗體之其他純化製劑及重組抗體。其亦包括能夠 選擇性地與某一蛋白質反應之抗體分子之以蛋白分解或重 組製備之部分之區段。此等蛋白水解及/或重組片段之非 限制性實例包括Fab、F(ab，）2、Fab，、Fv,及含有藉由肽連 接子接合之V[L]及/或V[H]域的單鏈抗體（scFv)。可使scFv, 共價或非共價連接以形成具有兩個或兩個以上結合位點之 抗體。 132324.doc •47· 200907341 。在本發明之情形中，用於偵測表現程度之抗體、衍生物 或片奴可另外包含允許其便利偵測及/或定量之可偵測標 "己在此項技術中已知可與抗體及其類似物連接之許多合 I榇°己舉例而言，用於此情形中之較佳可偵測標記為含 有-或多種放射性原子之標記，或螢光生成基質或螢光標 ’二而許多其他合適的可偵測標記為已知且可同樣用 於本發明之方法中。 在另—態樣t ’本發明亦係關於測定或鑑關於患有惡 |生病症之個體對以埃坡黴素治療該病症之潛在反應性的標 記（基因或由其編碼之蛋白質）之方法。根據本發明之此態 樣4α别心不以埃坡黴素治療之個體的潛在反應性之（新賴） 標記基因包含以下步驟：將腫瘤細胞自患有惡性病症之個 體轉移至（免疫激發（imm_lGgieaiiy咖以吻》裸小鼠 中’測定原發腫瘤或視情況生長於小鼠或大鼠上之繼代異 種移植腫瘤是否對以埃坡黴素治療有反應，及測定-種基 因或較佳複基因或由其編碼之蛋白質在該生長於小鼠或二 2上之繼代異種移植腫瘤中或來自動物之血液或組織中之 2現程度…旦已獲得表現數據，該方法即另外包括以下 步驟.藉由將該基因或由其編碼之蛋白質在至少一個生長 於小鼠或大鼠上之繼代異稽銘 去、Λ 〇 吳種移植腫瘤中或來自對該埃坡黴 素一療有反應之動物的血液或 並 因或蛋白質在至少—個生長於小現程度與相同基 、j 、或大鼠上之繼代里種移 植腫瘤中或來自對該埃坡黴素” ,..., 席…、汉應之動物的血液壶 組織中的表現程度作比較，来 夜次 來鑑別h记蛋白質或編碼該蛋 132324.doc -48· 200907341 白質之基因’其中該標記蛋白質在反應者中與不反應者中 相比具有改變之表現程度。在此情形令，改變之表現程度 可意謂表現程度增大或減小。或者，標記亦可在反應者樣 本中與不反應者樣本中相比具有改變之突變狀態。本文已 描述之後者的一個實例為腫瘤抑制因子轉錄因子p53，其 通常如圖5中所示在反應者中相對於在不反應者中具有不 同突變狀態。 或者其可藉由以下比較來鑑別：將自至少一個反應者 (生長於】亂或大鼠上之繼代異種移植腫瘤或來自動物之 '液或組織)獲得之腫瘤樣本中之表現程度與自已知為埃 坡徵素治療之*反應者的個體獲得之參考標準（非惡性植 織’或反之亦然）作比較，纟中該標記蛋白質在反應者中 與不反應者中相比具有改變之表現程度，或反之亦然。 根據後-方法之表現程度亦可藉由在此項技術中一般已 知之方法測定，且可與本文中先前所述之方法相同或不 同。在尤其較佳之實施例中，藉由使用如本文所述之微陣 列來測定-種基因或複基因之表現程度。 圖1中顯示用於鑑別埃坡黴素反應標記之以上方法的一 種合適例示性配置，作圖由 _ ^ 夏仁圖1中所不之配置的許多修改 熟習此項技術者顯而总目 、 … 而易見。惡性病症最佳係選自由肺# (尤其NSCLC' SCLC)、卵I、鹿义以, 厂 P巢μ、則列腺癌、神經膠質瘤、 黑色素瘤或乳癌組成之群。惡性病症較佳係、選自由留、 卵巢癌或乳癌組成之雜 /· 士找 玖之群。在本發明之情形中，尤复 惡性病症為非小細胞肺癌（NSCLC)。 之 132324.doc •49· 200907341 對熟習此項技術者將顯而易見，本發明之診斷方法將採 用核酸或蛋白質來偵測一種基因或複基因或由其編碼之蛋 白質的表現程度。 因此，本發明另外係關於編碼標記蛋白質或其片段之核 酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之方法 中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成之 群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1 、UGT1A3 、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1 (SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3 (BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、 CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、 KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1，或用於 選擇如上所定義之標記基因的子群中任一者。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 132324.doc -50- 200907341 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、 PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、 E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、 TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1 、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8 ' UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1 (SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3 (BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2及 9(CA2、CA9)、PGK1、 運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、 EIF4E及 EIF4ABP1 ' EPHA4、ITGA6、KIFAP3、TIMP2、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 132324.doc -51 - 200907341 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、促凋亡Fas-相互作用搭西己物（DAXX)、神經調節 蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ' VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧 酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2 及 9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化 酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、 ITGA6 、 KIFAP3 、 TIMP2 、RPS6KB1 、TIMP2 、 FSHPRH1。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用 搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF) '肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶同功異 型物 UGT1A1 、 UGT1A3 、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 ; AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化 酶。 132324.doc 52- 200907341 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用 搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1 (NRG 1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶同功異 型物 UGT1A3 、UGT1A4 、UGT1A8 、UGT1A10 ； AKR1C2、VEGF、GLUT1、越縮酶A、血紅素力口氧酶、 NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用 搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、尿苷二填酸葡萄糖醛酸轉移酶同功異 型物 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ; VEGF、 GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 132324.doc -53- 200907341 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋亡Fas-相互作用 搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶同功異 型物 UGT1A1 、 UGT1A3 、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 ; VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶同功異 型物 UGT1A3 、UGT1A4 、UGT1A8 、UGT1A10 ； AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、 NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醢基羥化酶。 在另一態樣中，本發明係關於編碼標記蛋白質或其片段 之核酸在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途，其中該標記蛋白質係選自由以下各物組成 之群：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、 132324.doc -54- 200907341 CYP2C9、CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（ΕρΗχ2)、促凋亡-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、尿芽二義葡萄糖搭酸 轉移酶同功異型物UGT1A3、UGT1A4、TOT1A8、 ucmA10 ; VEGF(VEGFA)、GLUT1、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF_脯胺醯基羥化 酶（EGLN3)。 在本發明之又一態樣中’為如上述清單中規定之標記蛋 白貝或其片段編碼的核酸之任何子組合可用於測定個體對 以埃坡黴素（尤其沙戈匹隆）治療疾病之潛在反應性的方法 中〇 本文S然亦涵蓋具有與該標記蛋白質之互補序列的核 酸。編碼該標記蛋白質之片段的核酸必須具有足夠長度以 特異性鑑別所關注之基因表現產物，且通常包含至少i 0 個’較佳至少1 5、20、25、30個，且在—些情況下甚至更 多的驗基。 可用於測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的 方法中之其他核酸為彼等在嚴格條件下與編碼如上文定義 之標記蛋白質的基因雜交之核酸，或具有與其互補或同源 序列之核酸。 如本文中所用，術語”互補”係指在核酸分子之核苷酸單 元之間的Watson-Crick或Hoogsteen驗基配對，且術語"結 合”意謂在兩種多肽或化合物或相關多肽或化合物或其組 132324.doc •55· 200907341 合之間的物理或化學相互作用。 "同源核酸序列”或”同源胺基酸序列 在核«層面或胺基酸層面上具二 型物可由於(例如)RNA之替代性拼接而在同—生物體之二 同組織中表現。或者同功異型物可由不同基因編碼。Α 蛋：本二之此態樣的較佳實施例中，核酸將與編碼標記 之基因（較佳人類）的序列具有多於60%、多於 7 0 %、多 8 夕 多於 80/O、夕於 9〇%、多於 93〇/〇、95%、96%、 97/〇、98%、99%或甚至⑽％之同源性。核酸序列最佳 ^對應於編碼標記蛋白質之基因的編碼股或非之 序列。 如本文中所用’短語，，嚴格雜交條件”係指探針、引子或 寡核苦酸或在本文中所提及之任何其他核酸序列將錄目 標序列雜交但不與其他序列雜交之條件。嚴格條件為序列 依賴性且將隨情況而變。較長序列之特異性雜交溫度高於 較紐序列…般而言’將嚴格條件選為在規定離子強度及 PH值下比特異序列之熱熔點（Tm)低約代。Μ為與目標序 列互補之探針的5〇%在平衡狀態下與目標序列雜交的溫度 (在規定離子強度、_及核酸濃度下）。因為目標序列__ 般過量存在，户斥以在，在平衡狀態下佔用观之探 針。嚴格條件通常將為其中在ρΗ7〇至8·3下鹽濃度小於約 Κ0Μ納離子，通常為約〇.〇1 ΜΛι〇μ納離子（或其他 鹽），且溫度對於短探針、引子或寡核例如，10 nt至 L言至少為約贼且對於較長探針、引子及寡核苦 132324.doc -56- 200907341 酸而言至少為約60°C的彼等條件。嚴格條件亦可藉由添加 諸如甲醯胺之去穩定劑來達成。嚴格條件為熟習此項技術 者已知且可見於Ausubel等人（編），CURrent pR〇T〇cc^s IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6 中。 根據本發明之核酸的較佳嚴格雜交條件為在65t>c下在包 含 6XSSC、50 mM Tris_Hcl(pH 7 5)、1 祕 edta、〇 〇2% PW、0.02% Ficoll、〇·〇2% BSA 及 5〇〇 ㈣机變性鞋魚精 子DNA之高鹽緩衝液中雜交，接著在5〇<t下在〇2xSsc、 0.01% BSA中洗滌一或多次。 在此態樣之其他較佳實施例中’將用於測定埃坡黴素反 應）·生之核馱固疋在諸如如本文所述基於rna或之微 陣歹J的裝置上。因此’用於此等方法中之核酸可為或 DNA，且可以單股或雙股形式使用。 儘管核酸之使用並不限於本文所述之測定埃坡黴素反應 之方法然而較佳根據本發明之方法來測定反應性。 在另相關態樣中，本發明係關於抗體或源自抗體之結 合部分在測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反應性之 方法中的用途。士 女本文中所說明’可能以蛋白質程度偵測 表現程度，亦即± # m l > P轉由‘用如在上文進一步詳細定義之抗體 或源自抗體之έ士 a Αιτ八 „ 、'σ。4 /刀。用於本發明之此態樣中的抗體及 源自抗體之結合部八 4刀必須此夠特異性結合或偵測選自由以 下各物組成之群的卢 的h δ己基因之表現產物中至少一者：細胞 色素P(CYP)同功 力異型物、微粒體環氧化物水解酶 132324.doc -57- 200907341 (EPHXl)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1 、UGT1A3 、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1 (SLC2A1)、ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3 (BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、 CA12)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、 KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。如本文 已討論，抗體將較佳地與允許其便利偵測及定量之諸如放 射性標記之可偵測標記或螢光標記連接。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、竣酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡 Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、 PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醢基羥化酶（EGLN3)、 E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、 132324.doc -58 - 200907341 TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、叛酸酯酶 2(CES2)、p53(TP53)、促凋亡 Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶2及9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白 (TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4 、ITGA6 、KIFAP3 、TIMP2 、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在本發明之又一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、羧酸酯酶2(CES2)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、 ALDOC、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶2及9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白 132324.doc -59- 200907341 (TF)、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1 、EPHA4 、ITGA6 、KIFAP3 、TIMP2 、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分係 選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物 (諸如，CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒 體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋 亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、 肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛 酸轉移酶同功異型物UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10 ; AKR1C2、VEGF、GLUT1、酿縮酶 A、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯 基經化酶。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分係 選自由以下各物組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物 (諸如，CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒 體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋 亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、 肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛 酸轉移酶同功異型物UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、 UGT1A8、UGT1A10 ; VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、 NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 132324.doc •60· 200907341 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸 如，CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒體 環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、p53、促凋亡 Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝 細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸 轉移酶同功異型物UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10 ; AKR1C2、VEGF、GLUT1、醛縮酶 A、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化 酶。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸 如，CYP 2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒體 環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、p 5 3、促凋亡 Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝 細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸 轉移酶同功異型物UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10 ; VEGF ' GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。醛縮酶A、 AKR1C2。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸 如，CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒體 132324.doc -61 · 200907341 環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、促凋亡Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶 同功異型物 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ; AKR1C2、VEGF、GLUT1、搭縮酶A、血紅素力口氧酶、 NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在本發明之另一態樣中，抗體及源自抗體之結合部分能 夠特異性結合或偵測選自由以下各物組成之群的標記基因 之表現產物中至少一者：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸 如，CYP2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒體 環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、促凋亡Fas-相 互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生 長因子（HGF)、肌縮蛋白、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶 同功異型物 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ; VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白 及HIF-脯胺醯基羥化酶。醛縮酶A、AKR1C2。 在本發明之又一態樣中，可將能夠特異性結合或偵測上 文規定清單之標記基因的表現產物中至少一者之抗體及/ 或源自抗體之結合部分的任何子組合用於測定個體對以埃 坡黴素（尤其沙戈匹隆）治療疾病之潛在反應性的方法中。 類似於核酸之使用，抗體或源自抗體之結合部分的使用 亦不限於本文所述之測定埃坡黴素反應性之方法。然而， 較佳根據本發明之方法測定反應性。 本發明之又一態樣係關於測定個體對以埃坡黴素治療疾 132324.doc -62- 200907341 病之潛在反應性的套組，其中該套組包含至少一種如上文 所定義之核酸。然而’套組較佳地包含—種以上核酸，亦 即多種不同核酸，#中各核酸編碼單一蛋白質或與單一蛋 白f雜交且因此適用於測定編碼標記蛋白質之複基因的表 現权度。在較佳實施例中，套組中不同核酸之數目將為 2、3、4、5、6、7、8、9、1〇、U、12、13、14、15、 16 _ 17、18 ' 19 ' 20、21、22、23、24 或 25(亦即，本文 中經描述為埃坡黴素反應性之標記的蛋白質/同功異型物 之子集或所有蛋白質/同功異型物）。 本文中涵蓋的測定個體對以埃坡黴素治療疾病之潛在反 應欧的其他套組包含至少—種如上文所定義之抗體或源自 抗體之、、Ό合部分。套組較佳地包含—種以上抗體或源自抗 體之、…σ #分。換言之’套組將包含多種不同抗體或源自 抗體之結合部分，#中各抗體或源自抗體之結合部分能夠 偵测規疋標記蛋白質。此套組因此適用於測定多個標記蛋 白質之表現程度。在較佳實施例中，套組中不同抗體之數 目將為2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、 5 16、17 ' 18、19、20 ' 21、22、23、24或 25(亦即， 本文中經描述為埃坡黴素反應性之標記的蛋白質/同功異 ^物之子集或所有蛋白質/同功異型物）。當然，該等套組 亦Jr J| _太z 丄 早—套、，且中包含某些標記之核酸及抗體或源自抗體 之結合部分。 在某些實施例中’本發明之套組將包含固定在如上文所 述之微陣列上的核酸或抗體或源自抗體之結合部分。套組 132324.doc -63 - 200907341 可視情況包含其他諸如 外包含使用說明，其例如：=劑之化合物，且可另 體對以埃坡黴素治療疾病反用者說明在測定個 別埃坡徵素反應性之（1他^=2方法中，或在鑑 U、他）¼ s己的方法中如付刹 ，、'且份。套組中之化合物可存在於單—容 二之 容器中，曰·B中或存在於多個 操或來乾开^^ _如’水溶液或醇）中，或以乾 一 V；t子在，或附著/固定於固體晶片上’等 :本發明提供之診斷方法允許鑑別預期對坡辛 ί有反應之患有疾病的個體。類似地，該等方法可= 應性。 #坡#素治療為無反應性或至少較小反 因Si本ί所述之診斷方法獲得的有價值資訊，本發明 因此在另-態樣中提供治療患有疾病之個體的方法，里中 該方法包含以下步驟：分析至少一種編碼該個體之標:蛋 白質的基因之表現程度以測定個體是否將對以埃坡徽素治 療有反應’及若分析表明該個體將對以該埃坡徽素治療有 反應’則以埃坡黴素治療個體。該方法較佳包括分析患有 疾病之個體的基因表現概況，其中為選自由以下各物组成 之群的標記基因之子集或全部測定基因表現概況：細胞色 素P(CYP)同功異型物（諸如，CYP2E1、CYP2C9、 CYP2C18及CYP26A1)、微粒體環氧化物水解酶、細胞質 %氧化物水解酶、p53、促〉周亡相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRGi)、#細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、尿脊二填酸葡萄糖駿酸轉移酶同功異 132324.doc -64- 200907341 型物 UGT1A1 、 UGT1A3 、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 ; AKR1C2、VEGF、GLUT1、链縮酶 A、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化 酶。 可為選自由以下各物組成之群的標記基因之子集或全部 測定基因表現概況：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸如， CYP 2E1、CYP2C9、CYP2C18及 CYP26A1)、微粒體環氧 化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、 p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調 節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、尿苷二磷酸葡萄糠醛酸轉移酶同功異型物 UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ; VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白 及HIF-脯胺醯基羥化酶。 亦可為選自由以下各物組成之群的標記基因之子集或全 部測定基因表現概況：細胞色素P(CYP)同功異型物（諸 如，CYP 2E1、CYP2C9、CYP2C18 及 CYP26A1)、微粒體 環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶 同功異型物 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10 ; VEGF(VEGFA)、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、 運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 132324.doc -65- 200907341 .在本發明之另-態樣中，亦可為選自由以下各物組成之 群的標記基因之子集或全部測定基因表現概況：細胞色素 (p)同功異型物（諸如，CYP 2E1、CYP2C9、CYP2C18 及YP26A1)、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環 氧化物水解酶（ΕΡΗΧ2)、促调亡化·相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白職叫、#細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白、品过 ( MD)尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶 同功異型物 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGTiAi〇 ; veGF(vegfa)、GLUT1、血紅素加氧酶·3、 運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在本發明之此實施例的較佳實施例中，根據本文所述之 診斷方法進行分析。 在一不同但相關之態财，本發明亦係關於埃坡黴素對 於製造治療患有選自以下各疾病之疾病的個體之醫藥的用 途：惡性病症、腫瘤疾病、發炎性疾病、神經退化性疾 病、血f生成相關疾病、多發性硬化症、阿兹海默氏症、 骨質疏鬆症、骨疾病或類風濕性關節炎，其中待治療之個 體已測定為對以該埃坡黴素治療有反應。較佳、作非必兩 地，藉由本文所述之診斷方法中任—者測定埃坡黴素^ 性0 本發明之又-態樣係關於埃坡黴素對於製造治療腫瘤的 醫藥之用途，該腫瘤特徵在於選自由以下各物組成之群的 至少-種基因的改變之表現：細胞色素p(CYp)同功 物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、 132324.doc -66- 200907341 p53、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白 1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白、UGT1A1、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶。 在較佳實施例中，待以埃坡黴素治療之腫瘤特徵在於以 下狀況中任一者或一者以上：p53功能喪失（較低表現及突 變），與埃坡黴素不反應者或參考非腫瘤組織中之表現程 度相比，DAXX及/或肌縮蛋白增大之表現，以下各物之減 小或至少非增大之表現：細胞色素P(CYP)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、神經調節 蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、UGT1A1、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白或HIF-脯胺醯基羥化酶。 在另一較佳實施例中，待以埃坡黴素治療之腫瘤特徵在 於以下狀況中任一者或一者以上：p53功能喪失（較低表現 及突變），與埃坡黴素不反應者或參考非腫瘤組織中之表 現程度相比，DAXX及/或肌縮蛋白增大之表現，以下各物 之減小或至少非增大之表現：細胞色素P(CYP)同功異型 物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、神 經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白或HIF-脯胺醯基羥化 132324.doc -67- 200907341

=發明者所證實，特徵在於上述病況中任—者之腫瘤 /較了此對埃坡黴素治療作出反應（亦即，腫瘤緩 解）0 在本發明之較佳實施例中， 巢癌及乳癌組成之群。腫瘤 (NSCLC)〇 腫瘤疾病係選自由肺癌、印 疾病最佳為非小細胞肺癌 對於=發明之某些實施例而言，根據本發明包含埃坡黴 素之醫藥可另外包含至少—種已知在治療疾病中有效之其 他治療劑：較佳已知該至少一種其他治療劑調節與該病症 有關之途裎的活性程度。此等其他治療劑之實例可較佳地 選自由以下各物組成之群：抗腫瘤劑、消炎劑、神經保護 劑、在治療血官生成相關疾病、多發性硬化症、阿茲海默 氏症、骨質疏鬆症、骨疾病或類風濕性關節炎中有效之藥

劑。該至少-種其他治療劑較佳引發增強之細胞死亡“田 胞凋亡）及壞死。 抗腫瘤劑之合適實例包括（但不限於）依託泊苷 (etoposide)、順鉑（cispiatin)、卡鉑（carb〇platin)、吉西他 濱（gemcitabine)、卡西他濱（capecitabine)、氣尿嘧啶 (fluorouracil)、紫杉醇、多西他賽（d〇cetaxeI)、溫諾平 (navelbine)、西妥昔單抗（cetuximab)、埃羅替尼 (erlotinib) 長春瑞賓（vinorelbine)及絲裂徵素 (mitomycin)、激酶靶向藥物，諸如EGFI^p制劑拉帕替尼 (lapatinib)，或生長因子抗體贺癌平（herceptin)、西妥昔單 132324.doc •68- 200907341 抗、VEGFR激酶，諸如索拉非尼（sorafenib)、舒尼替尼 (sutent)、IGFR激酶、mT〇R抑制劑、hdac抑制劑（諸如 SAHA)、蛋白酶體抑制劑（諸如萬科（vehde))、類固醇受 體拮抗劑(諸如抗雌激素）、芳香酶抑制劑、抗雄激素、 舰甲基轉移酶抑· ’諸如氣胞苦（azaeytidine)，及其 類似物。 ' 本發明之又-態樣係關於埃坡黴素及至少—種其他治療 劑對於製造治療患有選自以下各疾病之疾病的個體之醫藥 組合物的用途：惡性病症、腫瘤疾病、發炎性疾病、神經 退化性疾病、血管生成相關疾病、多發性硬化症、阿兹海 默氏症、#質疏鬆症 '骨疾病或類風濕性關節炎，1中待 治療之個體係已知或已根據本發明之料方法測定為對以 該埃坡黴素治療無反應。在此態樣中，選擇該至少一種其 他治療劑以便能夠調節指示該個體對以埃坡黴素治療無： 應性之途徑的活性程度。換言之，該其他治療劑將能夠影 響負責所觀察之埃坡黴素無反應性之途徑。原則上，細胞 防止或至少減小埃坡黴素之影響有若干種可能方式。一種 方式為上調代謝埃坡黴素之途徑（亦即，埃坡黴素之代謝 失活）’ 另-可能選擇為改變細胞對埃坡黴素之反應方 式’例如改變某些基因之表現程度從㈣起較低細胞洞亡 誘導。因&，藉由謹慎選擇影響且理想地防止細胞之此等 代謝適應的另-治療劑，成功之組合療法成為可能。根據 j文所提供之發現，因此尤其較佳的為至少一種且較佳至 夕2、3、4、5或6種其他治療劑係選自能夠降低編碼選自 132324.doc •69- 200907341 由以下各物組成之群的蛋白質之至少一種基因的表現程度 之治療劑：CYP同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細 胞質環氧化物水解酶、NRG1、HGF、UGT1A1、 UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、 VEGF、GLUT1、搭縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶，或者該群係由 以下各物組成：CYP同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶、細胞質環氧化物水解酶、NRG1、HGF、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、VEGF、 GLUT1、越縮酶A、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋 白及HIF-脯胺醯基羥化酶，或者該群係由以下各物組成： CYP同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細胞質環氧化 物水解酶、NRG1 、HGF、UGT1A1 、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、VEGF、GLUT1、血紅素 加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化 酶，或者該群係由以下各物組成：CYP同功異型物、微粒 體環氧化物水解酶、細胞質環氧化物水解酶、NRG1、 HGF 、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF、GLUT1、血紅素加氧酶、NIP3、PGK1、運鐵蛋白 及HIF-脯胺醯基羥化酶。 或者，至少一種且較佳至少2、3、4、5或6種其他治療 劑係選自能夠增大編碼DAXX及/或肌縮蛋白之基因的表現 程度之治療劑。 所有本文中提供之醫藥及醫藥組合物均可視情況包含其 132324.doc -70- 200907341 他組份’諸如醫藥學上典 劑及其類似物。 & _、稀釋劑及/或η形 △對於本發明之任何態樣而言，亦即對㈣有診斷 -療性方法、套組、組合物及用途而言，本文 及 包括已知受投與埃坡徽素影響之任何病症。在本發明= 神：因此為惡性病症、腫瘤疾病、發炎性疾病： 兹㈣氏管生成相關疾病、多發性硬化症、阿 、”、/正Θ貝疏鬆症、骨疾病或類風濕性關節炎。 尤其較料將本發明之埃坡黴素用於治療不可有效 之原發腫瘤及/㈣移，其㈣為單—療法或與愈加引發 細胞死亡(細胞計)及壞死之物質組合的形式以使當細 胞/刀解時’其引起通常細胞内、溶酶體酵素（諸如葡糖醛 酸酶）提高之釋放，從而引起根據本發明之共輛物更㈣ 之反應。 關於投與具有本發明之埃坡黴素的組合，舉例而言，涵 蓋用於所謂”血管靶向"的治療劑。此等物質引起破壞，尤 其破壞腫瘤内皮，隨後由於營養素供應缺乏而導致腫瘤壞 死增強。 在此情況下與上述物質組合之治療或投與包含同時（以 混合物及獨立劑量形式)及分別獨立投與組合之個別組 份，例如交替投與’以及其中-種組份作為長期藥物提供 而此外另一組份定期或不定期投與較短時期之投與方案。 在此情況下，可經由相同或經由不同投與路徑來送入組合 之組伤。在上述組合形式之投與中，較佳為組合之組份達 132324.doc -71 - 200907341 成相加作用之彼等投與方案；尤其較佳為達成協同作用之 彼等投與方案。 待以埃坡黴素治療之較佳惡性病症包括（但不限於）癌、 黑色素瘤、淋巴瘤、肉瘤及白血病。尤其較佳之疾病係選 自肺癌、卵巢癌及乳癌。如已於實例部分中所示，一種一 般經受埃坡黴素治療之尤其較佳癌症類型為非小細胞肺癌 (NSCLC)。換言之，每當本發明提及疾病時，應理解為包 括前述病症或疾病中任一者。 同樣地，每當本發明提及埃坡黴素時，應包括屬於埃坡 黴素、埃坡黴素衍生物、埃坡黴素共軛物及其類似物之結 構類別的任何化合物。為達成本發明之目的，本文中將埃 坡黴素定義為具有16員環及可變取代基以及作為與微管蛋 白結合之細胞抑制劑之醫藥活性的環狀分子（Asnes等人， Anal. Biochem. 1979，98，64-73; Job 等人，Cellular Pharmacol. 1993，I (增補 I)，S7-S10; Lichtner等人，PNAS 2001， 98, 11743-11748)。

在本發明情形中之埃坡黴素亦包括埃坡黴素共軛物，諸 如在W0 2004/050089及WO 2004/012735中所述之彼等， 該等專利之揭示内容以全文形式併入本文中。在WO 93/10102 ' WO 98/25929 ' WO 99/02514 > WO 99/07692 ' WO 99/02514、WO 99/67252、WO 00/49021、WO 00/66589 、 WO 00/71521 、 WO 01/027308 、 WO 02/080846、WO 03/074053、WO 2004/014919 及 WO 2005/074901中描述有其他埃坡黴素，該等文獻之揭示内 132324.doc •72- 200907341 容同樣以全文形式併入本文中。換言之，應將如本文中所 用之埃坡黴素"理解為 包括在則迷國際申言青案或其家 族成貝之任一者中所述之埃坡黴素化合物。 因此，本發明亦包括通式I之埃坡黴素共軛物： ί'

其中 R 、R彼此獨立地為氫、Ci_Ci〇烷基、芳基 基，或一起為-(CH2)m-基團，其中至5, 、R2b彼此獨立地為氫、G-Cw烷基、芳基 基，或一起為-(CH2)n-基團，其中11為2至5 C1〇烯基，或CVC,。炔基， 為氫、q-Cu烷基、芳基或芳烷基，且 、R4b彼此獨立地為氫、Ci_CiG烷基、芳基 基，或一起為-(CH2)P基團，其中1)為2至5， 為氯、ca。烧基、芳基、芳烷基、c〇2H、 基、CH2〇H、CH2〇 燒基、CH2〇 醯基、 ch2nh2、CH2N(烧基、醯基）12，或cH2Hai， 為鹵素原子， R6、R7在各情況下均為氫，或—起為一額外鍵或—起為

R 2a R3 R4a R5

Hal 6 132324.doc 芳烷 芳燒 或C2- ’芳烷 C〇2燒 CN、 -73- 200907341 氧原子，或一起為NH基團，或一起為N_烷基或 一起為ch2基團，且 土’

G 為氧原子或CH2， D_1E 為基團 H2C-CH2、HC=CH、C Ξ C w CH(OH)、CH(〇H)-CH2、ch2-ch(oh)、HC~CH、〇 CH2 ’或若G表示CH2基團則為CH2-0， =基團C( = X)R8，或雙環或三環芳族或雜芳族基 L3 為氫’或若W中之基團含有羥基， 團Ο-L4，或若W中之基團含有胺基 基團 NR25-L4， 則與後者形成基 ，則與後者形成

R25 X

R8 R9 R1 為氫或cvc1Q烷基， 為氧原子或兩個OR2。基團，或應為直鏈或支鏈之 C2-C1Q伸烷基二氧基，或h/〇r9，或cr1Qr1i義 為虱、CVC10烷基、芳基、芳烷基、鹵素或CN， 為氫或保護基PGX， ’且 11在各情況下彼此獨立地為氫、Ci_Cm烷基— 基或芳烷基，或連同亞甲基碳原子一 ^、方 昌拍U & 5貝至7 Z 可表示氧或H/OR12， R12 -Γ * _ 表示氫或保護基PGZ， Y 可表不基團 0-C(=0)、〇_CH2、CH2_C(= 、 2 c(==〇)^nr21-so2 > I32324.doc •74- 200907341 R2Q可表示CVCu烷基， R21可表示氫原子或^-匚!。烷基， PGX、PGY及PGZ可表示保護基PG，且 L1、A 1/可彼此獨立地表示氫、基叫哪卜基團 C(=S)C卜基團PGY或通式HI之連接子-辨識單元 (linker-recognition unit)； 條件在於至少-個取代基Ll、KL4表示通式⑽之連 接子-辨識單it或通式V之連接子；條件在於至少—個取 代基L1、L2或L4表示通式⑽之連接子_辨識單元或通式 (V)之連接子， 通式（III)之連接子_辨識單元具有以下結構： -U R22b

R22a III ,

O-EG 其中 tj 22a rv22b ' R可彼此獨立地表示氫、Ci-C2。烷基、（^-(:以醯 基、醯氧基、芳基、芳烷基、羥基、烷氧 基、C02H、C〇2烷基、鹵素、CN、N02、nh2 或 N3， u 可表示-C(=0)NR23_、-C(=S)NR23-、-C(=0)NR23_ CH2_、_c(=S)NR23-CH2-、-c(=o)o·、-C(=S)0_ 、-C(=〇)〇-CH2-、-C(=S)0-CH2·， r23可表示氫或Cl-C1Q烷基，且 EG 為通式IV之辨識單元， 132324.doc •75- 200907341

其中 24 R 可表示基團CH2OPG4或基團co2r26， PG1、PG2、pG3及PG4可彼此獨立地表示氫或保護基 PG， R26可表示氫、（VC2Q烷基、CVC20烯基、（：4-(：7環烧基 (其可含有氧原子）、芳基、芳烷基、參院基） 石夕烧基、雙（Ci-C2。烧基）芳基石夕烧基、烧基） 一务基石夕烧基或參（芳烧基）石夕烧基， PGX、卩0¥及卩02可表示保護基PG， 通式（V)之連接子單元具有以下結構：

其中 T 表示鹵素、OH、〇-烷基、c〇2H、C02-烷基、_NHR23a、 N〇2 N3、_CN、Ci-C^20 烧基、¢1-(^20 酿基或 Cl-C 2 0酿氧基， U(I)表示一鍵、氧或NR24a， 0 表示0至5， V 表示氧或NR24b，

Aal表示一鍵或通式…之基團，且Aa2、Aa3彼此獨立 132324.doc -76- 200907341 地表示通式νι之基團：

該通式之基團係衍生自通式VI,之天然或非天然胺基 酸HO-Aal_H、HO-Aa2-H或 ΗΟ-Αα3-ϋ，

Ο HO

Η VI*

R24c N 其中 RA 可在 HO-Aal_H、H〇-Aa2-H 或 H0_Aa3-H 中相同或 同，且a-取代基表示天然或非天然胺基酸， R22可表示氫、Cl-C1Q烷基、芳基或芳烷基， R23a可表示氫、C,-ClQ烷基或Ci_Cig醯基， R24、R24、R2〜彼此獨立地表示氫或Cl-Cl0烷基， q可表示1至2〇， FG1 可表示 eve,。院基-S3、 〇Γ\

V 0 或 C02H; 該通式I之埃坡黴素共軛物呈均一異構體或不同異構 之混合物形式及/或呈其醫藥學上可接受之鹽形式。 下所述之以下化合物尤其較佳作為本發明之埃坡黴 中的效應元件（effector element): 132324.doc ·77· 200907341 (48,711，88,98，13/，163(£))-4,8-二羥基_557〇1 ，’，y，13-五甲基- 16-[1-甲基-2-(2-曱基-噻唑-4-基）-乙烯基]_氧雜環十六“％ 烯-2,6-二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(E))-4,8-:·*.!。^。^ U-(2-羥曱基-噻 嗤-4-基）-1-曱基-乙稀基]-5,5,7,9，13-五曱基-氧雜環十六_ 13-烯-2,6-二酮； (48,711，88,98，13乙，163(£))-16-[2，（2-胺基甲其1)金| 土 τ丞-噻唑_4_基）_ 1-曱基-乙烯基]-4,8-二經基-5,5,7,9，13-五甲其^1 τ丞_氧雜環十 六-13-烯-2,6-二酮； (18,33(£)，78，1011,113，128，1611)-7,11-二羥某881。 ^ '»,0,10,12,16- 五甲基-3-[1-曱基-2-(2 -甲基-嗟。坐-4-基）-乙稀基]_4 I? _长 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9·二酮； (18,38(丑），78，1011，113，123，1611)-7，11-二羥基.3_[2_(2_經 基-°塞嗤-4 -基）-1-曱基-乙烯基]-8,8,1〇，12,16-五甲美4 I? 二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,38(丑)，78，10尺，113，123，1认)-3-[2-(2-胺基甲基_嗔唾4 基）-1-甲基-乙烯基]-7,11-二經基-8,8,10,12,16-五甲並 T - 4,17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (48,711，88,98，132，168斤))-4,8-二羥基-7-乙基_55〇11_> ，」，y，i 3-四 曱基-16-[1-曱基-2-(2-甲基·噻唑-4-基）-乙烯基]_氧雜環十 六-13 -稀-2，6 -二闕， (48,711，88,98，132，168斤))-4,8-二羥基-16-[2-(2-經甲&塞

0圭-4 -基）-1-曱基-乙稀基]-7-乙基-5,5，9,13-四曱美备A | m _虱雜環 十六-13-烯-2,6-二酮； 132324.doc -78- 200907341 (48,711，88,98，132，165(£))-16-[2-(2-胺基甲其* τ I -噻唑-4-基）_ 1_曱基-乙婦基]-4,8-二經基-7-乙基-5，5 9 β，13·四甲基-氧雜 環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S(E)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二翔技 ι 各基-10-乙基_ 4，17-二氧雜雙環[14_1·〇]-十七烷-5,9·二網； (18,38斤），78，10尺，113，123，161〇-7，11-二羥其。「 & 丞-3-[2-(2_ 羥甲 基-噻》坐-4-基）_1_甲基-乙烯基]_ι〇_乙基_8 土 0，s，12，16-四曱基· 4，17-二氧雜雙環[m.I.O]十七烷-5,9-二_ ; (1S，3S(E)，7S’10R’11S，12S，16R)-3-[2-(2*^&Ta^^4 基）-1-甲基-乙烯基]-7，11-二羥基-10-乙基s 〇 μ , 土 8，8,12,16-四甲 基-4，1 7-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二明； (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(Z))-4,8-:.*-5,5,7,9，13_st* 16-[1-氟-2-(2-甲基-噻唑-4-基）-乙烯基卜氧雜環十六_i3_烯 2,6-二酮； (4&’711’88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-16_[2_(2_羥甲基_噻 唑-4-基）-1-氟-乙烯基]_5,5,7,9，13_五甲基_氧雜環十六_13_ 稀-2,6-二酿| ; (48,7尺，88,98，132，1680))-16-[2-(2-胺基曱基_嗔唾_4其 1-氟-乙烯基]-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五甲基_氧雜環十1 13-烯-2,6-二酮； 、 (18,38(乙），78，1〇11，113，128，16尺)-7，11-二羥基_8,8,1〇12 五甲基-3-[l -氟- 2-(2 -甲基-0塞0坐-4-基）-乙婦基]_4 ι? _ 雙環[14.1.0]十七烷_5,9_二酮； 氧雜 132324.doc -79- 200907341 (18,38(2)，78，1011,118，12 8，1611)-7，11-二羥基-3-[2-(2-羥甲 基-噻哇_4_基）-1-氟-乙烯基]-8,8,10，12，16-五甲基-4，17-二 氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8(乙），78，10!1,118，128，1611)-3-[2-(2-胺基甲基-噻唑-4-基）-1-氟-乙烯基]-7，11-二羥基-8,8，10,12,16-五曱基-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S,7R，8S,9S,13Z，16S(Z))-4,8-:g*-5,5,7,9,13-if*-16-[1-氯-2-(2-甲基-噻唑-4-基）-乙烯基]-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711,88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥甲基-噻 唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-5，5,7,9,13-五曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711,88,98，137，168(2))-16-[2-(2-胺基曱基-噻唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五曱基-氧雜環十六-1 3 -稀-2，6 -二嗣， (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-:.S-8,8，10，12，16-五曱基-3-[l-氯-2-(2-甲基-噻唑-4-基）-乙烯基]-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,38(2)，78，1011，118，128，1611)-7，11-二羥基-3-[2-(2-羥曱 基-噻唑_4_基）-1-氣-乙烯基]-8,8，10，12，16-五甲基-4，17-二 氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8(乙），78，1011，118,123，1611)-3-[2-(2-胺基曱基-噻唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-7,11-二羥基-8,8,10,12,16-五甲基-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； 132324.doc -80- 200907341 (48,711，88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9，13-四 甲基-16-[1-氟- 2-(2 -甲基-°塞。坐-4-基）-已稀基]-氧雜環十六_ 13-稀-2,6-二銅； (48,711，8 8,98，132，168(2))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥甲基_〇塞 。坐-4 -基）-1-氟-乙稀基]-7 -乙基-5,5，9,13 -四甲基-氧雜環十 六-13-稀-2,6-二闕； (4呂，711，8 8,98，132，168(2))-16-[2-(2-胺基曱基-噻唑_4_基）_ 1-氟-乙烯基]-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13-四甲基_氧雜产 十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S,10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-1〇_ 乙基 _ 8,8,12,16-四曱基-3-[l -氣-2-(2-甲基-嗟〇坐-4 -基）_乙稀某] 4，17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-[2-(2-經甲 基-嚷嗤-4-基）-1-氟-乙烯基]-10-乙基-8,8，12，16-四甲基_ 4，17·二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； 1(18’38(乙），78，10尺,118，123，1611)-3-[2-(2-胺基甲基_嘆唾_4_ V，. 基）·1-氟-乙烯基]-7，11-二羥基-10-乙基-8,8，12，16_四甲基_ 4，17-二氧雜雙環[14.10]_十七烷_5,9_二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(Z))-4,8^mS-7_6S-5,5,9，13w 甲基16 [1-氣- 2- (2 -曱基-0塞0坐-4 -基）-乙稀基]•氧雜環_|__ 1 3-烯-2,6-二 _ ; (48,711，88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥曱基_嘆 峻_4_基）-1-氣-乙烯基]_7_乙基_5,5,9，1；3_四甲基-氧雜環十 六-13-稀 _2,6-二酮； 132324.doc -81 - 200907341 (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(Z))_16_[2_(2^&t&h4d_ 1-氯-乙烯基]-4,8-二羥基-7-乙基·5,5,9，13·四甲基_氧雜環 十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11--絲 Α 1Λ —* &丞-10-乙基_ M，l2，16-四曱基 小卜氣-2_(2· 甲基，唾 _4_基）_ 乙烯基 ]· 4，17-二氧雜雙環[M.l.O]-十七烷-5,9-二輞； 基H4_基）小氯-乙稀基]_10_乙基_88i2，i6四曱基_ 4，17-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二_ ; 土 (13’38(2)’78’1(^’115’128’161^3_[2_(2_胺基甲基·喧哇心 基）-ι_氣-乙烯基]-7，n-二羥基-10-乙基_8,81216_四甲基_ 4，17-二氧雜雙環[14,1.0]-十七烷-5,9-二綱； (48,711，88,98，132，168(丑)）-4,8-二經基_5,5,7,9，13_五甲笑 16-[1-甲基·2-(2-吡啶基）-乙烯基]-氧雜環十六_13-烯 二酮； (13,38(£)，78，10尺，118，125，1611)-7,11-二羥盖5^1。 五甲基-3-[l-曱基-2-(2-"比啶基）-乙烯基]_4，17_ & I -S，8，l〇，i2，i6_ 氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711，88,98，132，168(£))-4,8-二羥基-7-乙基_5 土 ，5，9，1 3-四 曱基-16-[1-曱基-2-(2-0比咬基）-乙浠基]-氧雜環+ 、丁 y、]3-烯_ 2,6-二酮； (1S,3S(E)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥武 乙基- 8,8，12，16-四曱基-3-[1-甲基-2-(2-吡啶基）-乙缔義]41 氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； ’ ~ — 132324.doc •82- 200907341 (48,711，88,93，132，168(2))-4,8-二羥美5<7。1 土 -D，/，y，i3-五甲基 _ 16-[1-氟-2-(2-吡啶基）-乙烯基]-氧雜環十六·丨烯 酮； 二羥基-8,8，1〇，1216_ 基]-4，17-二氧雜雙環 (1S，3S(Z)，7S，10R,11S，12S，16R)-7，U· 五甲基-3-[l-氟-2-(2-吡啶基）-乙稀 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,7尺，88,98，132，168〇)-4,8-二羥基_<^7〇1， m W7,9，13-五甲基 _ 1 6-[ 1 -氯-2-(2- °比咬基）-乙烯基]-氧雜環+

^、· u ·締·2,6-二 酮； (18,38(2),78，10尺，118，128，1611)-7，11_二鞀其"1。 &丞-8,8，1〇，ΐ2，ΐ6- 五甲基-3-[1-氯-2-(2- °比口定基）-乙稀基μ#】7 _备μ μ 巫』4,17- —礼雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； 基 _5,5,9，13-四 環十六-13 -烯_ (48,711，88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-7_乙 甲基-16-[1-氣-2-(2_0比咬基）-乙稀基]_氧雜 2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-:^Aia 战·％ -10-乙基_ 8,8’12，16-四甲基-3-[l-氟·2-(2-。比啶基）_乙烯基卜4，17_二氧 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； 乙基-5,5,9，13-四 雜環十六-13_烯_ (48,711,88,98,132，168(2))-4,8-二羥基-7_ 曱基-16_[1-氣-2-(2_°比°定基）-乙稀基卜氧 2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二翔 | ιλ 炫I -10-乙基- 8,8，12，16-四曱基-3-[1-氣-2-(2-°比咬基）_乙烯基]_4，17_二氧 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； 132324.doc -83 · 200907341 (4S，7R,8S，9S，13Z，16S(E))-4,8-:M*-5,5,7,9，13-Sf*- 16- [1-甲基-2-(2-甲基-噁唑-4-基）-乙烯基]-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S，7R,8S，9S，13Z，16S(E))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥甲基-噁 唑-4-基）-1-曱基-乙烯基]-5,5,7,9,13-五甲基-氧雜環十六-1 3 -稀-2，6 -二嗣， (48,711，88,98，132,168(£))-16-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4-基）- 1-曱基-乙浠基]-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五甲基-氧雜環十 / - 六-1 3 - - 2，6 -二嗣， (1S,3S(E)，7S，10R,11S，12S,16R)-7,11-二羥基-8,8，10,12，16-五甲基-3-[l-曱基-2-(2-曱基-噁唑-4-基）-乙烯基]-4，17-二氧 雜-雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (lS，3S(E)，7S，10R,llS,12S，16R)-7,ll-:g*-3-[2-(2jlT 基-噁唑-4-基）-1-曱基-乙烯基]-8,8，1 0,12,16-五曱基-4,17-二氧雜-雙環[14.1.0]-十七烷_5,9-二酮； (18,3 8(丑）,78，1011,118,128，16尺)-3-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4- \ , 基）-1-甲基-乙烯基]-7，11-二羥基-8,8,10,12,16-五甲基-4, 17- 二氧雜-雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S,9S，13Z，16S(E))-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13-四 曱基-16-[1-甲基-2-(2-甲基-噁唑-4-基）-乙烯基]-氧雜環十 六-13-烯-2,6-二酮； (48,711，88,98，132，168(£))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥曱基-噁 唑-4-基）-1-曱基-乙烯基]-7-乙基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環 十六-13-烯-2,6-二酮； 132324.doc -84- 200907341 • °惡嗤-4-基）· -四甲基·氧雜 (4呂，711，88,98，132,168(丑))-16-[2-(2-胺基甲基 1-甲基-乙稀基]-4,8-二經基-7-乙基-5,5,9，13 ί哀十六-13 -稀-2,6 -二嗣； (18,38(丑），73，1011，118，128，1611)-7，11-二羥其1^ & 1-10-乙基·8,8, 12，16-四甲基-3_[1-曱基-2-(2-甲基-噁唑_4_其、 I )-乙稀基]-4, 17-二氧雜-雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二鋼； (lS，3S(E)，7S，10R，llS，12S，16R)-7，ll-:_^， & 暴-3-[2-(2-羥曱 基-噁唑-4-基）-1_甲基-乙烯基]_1〇_乙基_8 8 /.

四曱基_ 4，17·二氧雜-雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酿j ; (18,38(£)，78，1011，118，128，161〇-3-[2-(2-胺其田好 双岙甲基-噁唑_4 基）-1-曱基-乙烯基]-7，11-二羥基-10-乙基_s Q μ ^Ίΐ2,16-四甲 基-4，17-二氧雜_雙環[14.1.0]_十七烷_5,9_二綱； (43,7尺’88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-5,5,7,9，13_五甲美 16-[1-氟-2-(2·曱基-噁唑_4_基）_乙烯基]_氧雜環十六 2，6 -二酿I， - -13- (4S’7R，8S，9S，13Z，16S(Z))-4,8-:.|-i6_[2_(2 jT 基 峻-4-基）-1、氟-乙烯基]·5,5,7,9，13_五甲基-氧雜環十六 烯-2,6-二_ ; 1-氣·乙稀基]_4,8_二經基_5,5,7,9，13_五甲基_氧雜環十土六_ 13-烯-2,6-二嗣； 五曱基-3-Π-氟_2_(2_甲基-噁唑_4_基）_乙烯基]_4，17_二氧雜 雙環π4·1.0]十七烷_5,9-二酮； 132324.doc -85 - 200907341 (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-[2-(2-羥曱 基-噁唑-4-基）-1-氟-乙烯基]-8,8,10，12,16-五曱基-4,17-二 氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8(乙），78，1011，113，128，1611)-3-[2-(2-胺基曱基-噁唑-4-基）-1-氟-乙烯基]-7，11-二羥基-8,8，10,12,16-五甲基-4,17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(Z))-4,8-:.*-5,5,7,9，13-Sf*-16-[1-氯-2-(2-曱基-噁唑-4-基）-乙烯基]-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4呂，711，8 8,98，132，168(2))-4,8-二羥基-16_[2-(2-羥甲基-噁 唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-5,5,7,9，13-五曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4呂，711，8 8,98，132，168(2))-16-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五甲基-氧雜環十六-1 3-烯-2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-8,8，10，12，16- \ 五甲基-3-[l-氯-2-(2-甲基-噁唑-4-基）-乙烯基]-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7,11-二羥基-3-[2-(2-羥曱 基-噁唑-4-基）-1-氣-乙烯基]-8,8,10,12,16-五曱基-4,17-二 氧雜雙環[14,1,0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8(2),78，1011，118，128，1611)-3-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4-基）-1-氣-乙烯基]-7,11-二羥基-8,8，10，12,16-五甲基-4,17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； 132324.doc -86- 200907341 (48,711，88,98，132，168(2))-4,8-二羥基-7-乙基_5。 ，），θ，13-四 曱基-16-[1-氟_2_(2_曱基-噁唑_4-基）-乙烯基]_氧雜環十山 13-烯-2,6-二酮； (4S，7R，_，13Z，16S(Z))^^ 唑-4-基）-1-氟-乙烯基]_7_乙基-5,5,9,13-六-13-烯-2,6-二酮； 四甲基-氧雜環十 (48,711，83,98，132，168(2))-16-[2-(2-胺基曱基-11惡11坐_4&) 1-氣-乙稀基]-4,8 -二輕基-7-乙基-5,5，9,13 -四甲| — τ I -氣雜環 十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S(Z)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基 _1〇 乙夷 8,8,12,16-四曱基-3-[l -氟-2-(2-曱基-〇惡η坐_4_基）_乙稀芙] 4,17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,38(乙），78，1011，118，128，1611)-7，11-二羥基-3_[2_(2_声甲 基-嗯峻-4·基）-1-氟-乙烯基]-10-乙基·8,8，12，16_四甲義 4，17-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8〇,78，1011，118，12 8，1611)-3-[2-(2-胺基甲基_(1惡唾4 基）-!-氟乙烯基]-7，11-二羥基-10-乙基-8,8，12，16_四甲其 4，17-二氧雜雙環[m.O]-十七烷-5,9-二酮； (48,7尺’88,98，13乙，168(2))-4,8-二羥基-7-乙基_55()1， ，，i 3·四 甲基氣- 2-(2 -曱基-°惡°坐-4-基）-乙浠基]_氧雜環十丄 1 3-烯-2,6-二 _ ; (4S，7R，8S，9S，13Z，16S(Z))-4,8-:.*-16-[2-(2-^f&^ 。坐-4-基）-1-氣-乙烯基]-7-乙基-5,5,9，13-四曱基·氧雜環i 六-13-烯-2,6-二酮； 132324.doc -87 - 200907341 (4呂，711，8 8,9 8,132，168(2))-16-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環 十六-1 3 -稀-2，6 -二嗣， (1S,3S(Z)，7S，10R，11S，12S,16R)-7，11-二羥基-10-乙基-8,8，12,16-四甲基-3-[卜氯-2-(2-甲基-噁唑-4-基）-乙烯基]-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (lS，3S(Z)，7S，10R，llS，12S，16R)-7，ll-:.*-3-[2-(2-Mf 基-噁唑-4-基）-1-氯-乙烯基]-10-乙基-8,8,12,16-四甲基-4,17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8〇,78，1011，118,12 8，1611)-3-[2-(2-胺基甲基-噁唑-4-基）_ 1 鼠-乙卸基]-7，11 -二經基-1 0-乙基- 8,8，12，16-四甲基_ 4，17-二氧雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S，7R,8S，9S，13Z,16S(E))-4,8-:.*-5,5,7,9，13-Sf*-1 6-[2-(2-曱基-噻唑-4-基）-乙烯基]-氧雜環十六-1 3-烯-2,6-二酮； (48,711，88,98,132,168(£))-4,8-二羥基-16-[2-(2-羥曱基-噻 唑-4-基）-乙烯基]-5,5，7,9,13-五曱基-氧雜環十六-13-烯- 2.6- 二酮； (48,711，8 3,98,137，168作））-16-[2-(2-胺基曱基-噻唑-4-基）-乙烯基]-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五曱基-氧雜環十六-13-烯- 2.6- 二酮； (1S，3S(E)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11_ 二羥基-8,8,10，12，16-五甲基-3-[2-(2-曱基-噻唑-4-基）-乙烯基]-4,17-二氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； 132324.doc -88- 200907341 甲 雙 (1S，3S(E)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二 基-嗟坐-4·基）_乙稀基]-8,8，10，12，16-五 環[14.1.0]十七烷-5,9_二酮； (18,33斤)，78，10尺，113，128，1611)-3-[2-(2-胺基¥基11塞 基）-乙烯基]-7,11 -二經基-8,8,10,12,16-五甲義_4 _ 土 ""Ή-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； ’ 四 (48,711，88,98，132，168斤））-4,8-二羥基-7-乙基_5 甲基-16-[2-(2-曱基-噻唑-4-基）-乙烯基μ氣雜 / / J孔雜裱十六-1 3 稀-2,6-二酮； (48,711，88,98，132，168(丑))-4,8-二羥基-16_『2〇』 L (二經甲基_嘆 唑-4-基）-乙烯基]-7-乙基-5,5,9，13-四甲基_氧 " 和雊每十六-1 3 - 烯-2,6-二酮； (48,7尺，88,98，132，168卬))-16-[2-(2-胺基甲美 丞-嗅。坐_4_基）- 乙稀基]-4,8 -二經基-7 -乙基-5,5,9，13-四甲龙— 7 I ·氣雜環十六_ 13-烯-2,6-二酮； 基乙基-乙烯基]-4，17-二 (1S,3S(E)，7S，10R，11S，12S,16R)-7，11-二輕 8,8，12，16-四甲基-3-[2-(2-甲基-噻唑-4-基）_ 氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S(E)，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-:_a， 理U-[2_(2_羥曱 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(18,33,78，10尺，113，123，16尺)-7，11-二羥某3〇4 ’工签- 趣甲基-笨 并〇塞。坐_5_基）_8,8，10，12，16_五甲基_4，17_二氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9_二酮； < 132324.doc •90- 200907341 (18,38,78，1011，118，128，1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-8,8,10,12,16-五甲基-4,17-二氧雜雙環 [14.1.0] 十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S，9S,13Z,16S)-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13 -四曱 基-16-(2-曱基-苯并噻唑-5·基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4S,7R，8S，9S，13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基-苯并噻 哇-5-基）-7-乙基-5，5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4S,7R,8S，9S，13Z,16S)-16-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-乙基-8,8，12,16-四甲基-3-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-4,1 7-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S,3S，7S，10R,11S，12S，16R)-7,11-二羥基-3-(2-羥甲基-苯 并噻唑-5-基）-10-乙基-8,8,12,16-四甲基-4，1 7-二氧雜雙環 [14.1.0] -十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78，1011,118，128,1611)-3-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-乙基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R,8S,9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-7-丙基-5,5,9,13 -四曱 基-16-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； 132324.doc -91 - 200907341 (4S，7R,8S,9S,13Z，1 6S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 哇-5-基）-7-丙基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (48,711，88,98,132,168)-16-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丙基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S,10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-丙基-8,8，12,16-四曱基-3-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-4,1 7-二氧雜雙 / - 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,38,78，1011,118，12 8，1611)-7,11-二羥基-3-(2-羥甲基-苯 并噻唑-5-基）-10-丙基-8,8,12,16-四甲基-4,17-二氧雜雙環 [14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (lS，3S,7S，10R，llS，12S，16R)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丙基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R,8S，9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-7- 丁基-5,5,9,13-四甲 V 基-16-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (48,711，88,98，13乙，168)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 唑-5-基）-7-丁基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4呂,711,8 8,98,132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； 132324.doc -92- 200907341 (1S，3S，7S，10R，11S，12S,16R)-7，11-二羥基-10- 丁基- 8.8.12.16- 四甲基-3-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S,7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥甲基-苯 并噻唑-5-基）-10-丁基-8,8，12，16-四曱基-4，17-二氧雜雙環 [14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,38,78，1011,118，128，1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5- 基）-7，11-二羥基-10-丁基-8,8,12，16-四甲基-4，17-二氧雜雙 / 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711，88,98，132，168)-4,8-二羥基-7-烯丙基-5,5,9，1：3-四曱 基-16-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4S，7R，8S，9S, 13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 唑-5-基）-7-烯丙基-5,5,9,1 3-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711，88,98，132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）-4,8-二羥基-7-烯丙基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S,7S,10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-烯丙基- 8.8.12.16- 四曱基-3-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S，7S，10R,11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噻唑-5-基）-10-烯丙基-8,8,12,1 6-四曱基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； 132324.doc -93 - 200907341 (18,3 8,78，1011,118，128,161〇-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-烯丙基-8,8,12,16-四曱基-4，17-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711,88,98,132，168)-4,8-二羥基-7-丙-2-炔基-5,5,9,13-四甲基-16-(2-曱基·苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S,7R，8S,9S,13Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 唑-5-基）-7-丙-2-炔基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711,83,93，132，163)-16-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-4,8-二羥基-7-丙-2-炔基-5，5,9，13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S,7S,10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四曱基-3-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (lS，3S,7S，10R,llS，12S，16R)-7,11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噻唑-5-基）-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78，1011,118,123，1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四甲基-4，17-二氧 雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z,16S)-4,8-二羥基-7- 丁 -3-烯基-5,5,9,13-四曱基-16-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； 132324.doc -94- 200907341 (4S，7R,8S,9S，13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 唑-5-基）-7-丁-3-烯基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4呂,711，8 8,98，132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁-3-烯基-5,5,9，13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7,11-二羥基-10- 丁 -3-烯基-8,8,12,16-四甲基-3-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-4,1 7-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78，10尺，118，128，1611)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噻唑-5-基）-10-丁 -3-烯基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,38,78,1011，118,128，1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丁 -3-烯基-8,8,12，1 6-四曱基-4,17-二氧 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,7尺，88,98，132，168)-4,8-二羥基-7-丁-3-炔基-5,5,9，13- .> \ 四甲基-16-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S，7R，8S，9S,13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噻 唑-5-基）-7-丁-3-炔基-5,5，9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6_ 二酮； (48,711,8 8,9 8,132,168)-16-(2-胺基曱基-苯并噻唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁-3-炔基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13- 稀-2，6 --—酿]， 132324.doc -95- 200907341 (1S，3S,7S，10R,11S，12S，16R)-7,11-二羥基-10- 丁 -3 -炔基-8,8,12,16-四甲基-3-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S,7S,10R,11S,12S，16R)-7,11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噻唑-5-基）-10-丁 -3_炔基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (18,3 3,78，1011,118，128,16尺)-3-(2-胺基甲基-苯并噻唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丁 -3-炔基-8,8，12，16·四曱基-4,17-二氧 / . 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711，88,98，132，168)-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五甲基-16-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S，7R，8S,9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基-苯并噁 唑-5-基）-5,5,7,9,13-五曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711，8 8,98，132，168)-16-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； 、 （1S，3S，7S,10R,11S，12S，16R)-7，11-二羥基-8,8，10，12，16-五 曱基-3-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-4，1 7-二氧雜雙環[14.1.0] 十七烷-5,9-二酮； (1S,3S,7S,10R,11S，12S，16R)-7,11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噁唑-5-基）-8,8，10，12,16-五甲基-4,17-二氧雜雙環 [14·1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,7 8,1011，118,128,161〇-3-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-7,11-二羥基-8,8,10,12,16-五甲基-4,17-二氧雜雙環 132324.doc -96- 200907341 [14.1.0] 十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S,9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9,13-四甲 基-16-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4S，7R,8S，9S，13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基·苯并噁 唑-5-基）-7-乙基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (48,711，8 8,98，132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5-基）-4,8-二羥基-7-乙基-5,5,9，13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-乙基-8,8,12,16-四甲基-3-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S,7S，10R，11S,12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥甲基-苯 并噁唑-5-基）-10-乙基-8,8,12,16-四甲基-4，17-二氧雜雙環 [14.1.0] 十七烷-5,9-二酮； (13,38,78,1011，118,128，16尺)-3-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5-基）-7，11-二羥基-10-乙基-8,8，12，16-四甲基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z,16S)-4,8-二羥基-7-丙基-5,5,9,13 -四曱 基-16-(2-曱基-苯并°惡°坐-5-基）-乳雜壤十六-13-烤-2,6-二 酮； (48,711，88,98，132，168)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基-苯并噁 唑-5-基）-7-丙基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 132324.doc -97- 200907341 酮； (48,711，88,98,132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丙基-5,5,9，13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S,3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11·二羥基-10-丙基-8,8，12,16-四曱基-3-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-4，17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 ί 并噁唑-5-基）-10-丙基-8,8,12,16-四甲基-4,1 7-二氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,38,78，10尺，118，128，16尺)-3-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丙基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R,8S，9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-7- 丁基-5,5,9,13 -四曱 基-16-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； * (4S,7R，8S,9S,13Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噁 唑-5-基）-7-丁基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (4呂,711，8 8,98,132,168)-16-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁基-5,5,9，13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10- 丁基-8,8，12，16-四甲基-3-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-4，17-二氧雜雙 132324.doc -98- 200907341 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S,7S，10R，11S,12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噁唑-5-基）-10-丁基-8,8，12，16-四曱基-4，17-二氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78,1011，113，128，1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丁基-8,8,12,16-四甲基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711,88,98，132，168)-4,8-二羥基-7-烯丙基-5,5,9，13-四甲 基-16-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二 酮； (48,711，8 8,98,132，168)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噁 唑-5-基）-7-烯丙基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711,88,98，132，168)-16-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-4,8-二羥基-7-烯丙基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7,11-二羥基-10-烯丙基-8,8,12,16-四甲基-3-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (1S，3S,7S,10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噁唑-5-基）-10-烯丙基-8,8,12，1 6-四曱基-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78，10尺，113，128,16尺)-3-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-7,11-二羥基-10-烯丙基-8,8,12,16-四曱基-4，17-二氧雜 132324.doc -99- 200907341 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R，8S，9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-7-丙-2-炔基-5,5,9，13-四曱基-16-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (48,711，8 8,98，132,168)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基-苯并噁 唑-5-基）-7-丙-2-炔基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4呂,711，88,98,132，168)-16-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-4,8-二羥基-7-丙-2-炔基-5,5,9,13-四甲基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-二羥基-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四曱基-3-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78，1011，118,128，16尺)-7，11-二羥基-3-(2-羥甲基-苯 并噁唑-5-基）-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四甲基-4，17-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,78,1011，118，128,1611)-3-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）-7,11-二羥基-10-丙-2-炔基-8,8,12,16-四曱基-4，1 7-二氧 雜雙環[14.1.0]-十七烷-5,9-二酮； (4S，7R,8S，9S,13Z,16S)-4,8-二羥基-7- 丁 -3 -烯基-5,5,9,13-四甲基-16-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S，7R，8S，9S，13Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥曱基-苯并噁 唑-5-基）-7-丁-3-烯基-5,5,9，13-四甲基-氧雜環十六-13-烯- 132324.doc -100- 200907341 2.6- 二酮； (48,711，8 8,98，132，168)-16-(2-胺基甲基-苯并噁唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁-3-烯基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-浠-2,6-二酮； (1S,3S，7S，10R,11S，12S,16R)-7，11-二羥基 _10_ 丁 -3-烯基- 8.8.12.16- 四曱基-3-(2-曱基-苯并噁唑-5-基）-4，17-二氧雜雙 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,3 8,73，1011,118,128，1611)-7，11-二羥基-3-(2-羥曱基-苯 并噁唑-5-基）-10-丁 -3-烯基-8,8,12,16-四曱基-4,17-二氧雜 雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,38,78，1011，118，128,16尺)-3-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5_ 基）-7,11-二羥基-10-丁 -3-烯基-8,8,12,16-四甲基-4,17-二氧 雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (48,711,88,98，132,168)-4,8-二羥基-7-丁-3-炔基-5,5,9，13-四曱基-16-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (4S,7R，8S,9S,13Z,16S)-4,8-二羥基-16-(2-羥甲基-苯并噁 唑-5-基）-7-丁-3-炔基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯- 2.6- 二酮； (48,711，8 8,98，132，168)-16-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5-基）- 4.8- 二羥基-7-丁-3-炔基-5,5,9,13-四曱基-氧雜環十六-13-烯-2,6-二酮； (1S，3S，7S,10R，11S,12S,16R)-7,11-二羥基-10- 丁 -3 -炔基- 8.8.12.16- 四甲基-3-(2-甲基-苯并噁唑-5-基）-4,17-二氧雜雙 132324.doc • 101 - 200907341 環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (18,38,78，1011，118，128，1611)-7，11-二羥基_3-(2-羥甲基-苯 并0惡唑-5-基）-10-丁 -3·炔基-8,8，12，1 6-四曱基-4,17-二氧雜 雙環[14.1,0]十七烷-5,9-二酮； (lS，3S，7S，10R，llS，12S，16R)-3-(2-胺基曱基-苯并噁唑-5- 基）-7,11-二羥基 _1〇_ 丁 _3_炔基 _8,8，12，16_ 四曱基 _4，17_二氧 雜雙環[14.1.0]十七烧-5,9-二酮。 在3有上述元件之一的通式（I)之化合物中，上述元件中 之氫原子經式⑴中指出之位置中的基團li_l3置換，藉此 基團IJ-L3具有上文指出之含義。 上述共軛物可包含一或多個辨識單元；在此情況下，與 共概物相關之辨識單元可相同或不同。共軛物之辨識單元 車父佳為相同。 通式I之化合物可以其α環糊精籠形物（clathrate)、p環糊 精籠形物或γ環糊精籠形物，或其經取代α環糊精籠形物、 β環糊精籠形物或γ環糊精籠形物之形式，或以脂質或聚乙 二醇化組合物之形式使用。 -他較佳實;^例中’埃坡黴素分子含有内酯或内醯胺 部分。 用於本發明之埃坡黴素的另一較佳群為以下通式之化合 132324.doc 200907341

其中： R R各自獨立地為氫、Ci_C丨〇烷基、芳基、芳烷基， 或起形成-(CH2)m-基團’其中m為2至5 ; R各自獨立地為氫、C^-Cw烷基、芳基、芳烷基， 或一起形成-(CH2)n-基團，其中11為2至5，或為C2_ ci〇烯基或C2-C1()炔基； R 為氫、C1-C1()烧基 '芳基、芳烧基； T?4a、·ρ41)々 a v 各自獨立地為氫、c丨-c1()烷基、芳基、芳烷基’ 或一起形成-(CH2)P基團’其中P為2至5 ; R 為氫、C1-C10烷基、芳基、芳烷基、c〇2H、c〇2^ 基、ch2〇h、ch2o 烷基、ch2o 醯基、CN、 CH2NH2、CH2N(烷基、醯基)】，2*CH2Hal ; R、R各自為氫，或一起形成一額外鍵，或一起形成環氧 官能基； G 為Ο或CH2 ; D-E —起為基團-H2C-CH2-、-HC = CH-、-C5 c、、 -CH(OH)-CH(OH)- 、 -CH(OH)-CH2-、仰 CH(OH)-、-CH2-0-、-0-CH2-或 cii-、CH，藉此若 Q為 O，則D-E不能為CH2-〇 ;或 132324.doc -103- 200907341 D-E-G —起為基團 h2C-CH=CH ; W 為基團C(=X)R8，或為雙環或三環芳族或雜芳族武 團； 1

X R8 R9 R10 Z R12 A-Y R20 r21 PGX 為〇或兩個基團OR20,或C2_c10伸烷基二氧基（其可 為直鏈或支鏈）’或Η及基團0R9，或基團（^1呔11 ; 為氯、C〗-C10烧基、芳基、芳烷基、鹵素、cn; 為氫或保護基PGX ; R11各自獨立地為氫、Cl_C2Q烷基、芳基、芳烷基， 或連同亞甲基碳一起形成5員至7員碳環； 12 〇-ch2、CH2-C(=〇) NR21 為〇或Η及基團OR1 為氫或保護基PGZ 為基團o-c(=o) c(=0)、NR21-S〇2 為C1-C2G烷基； 為氫或（VCw烷基； ?〇2為（：丨-C2〇烷基、C4-C7環烷基（其可在環中含有一 或多個氧原子）、芳基、芳烧基、醯基%^ 基、（VCu烷基磺醯基、芳基磺醯基、= —V^i-C2〇^ 基）矽烷基、二（Cl-C2G烷基）芳基矽烷基、（Ci_c2〇烷 基）一 ^基石夕烧基或三（芳院基）石夕院基； 該通式化合物係、呈單-立體異構體或不同I體異構體之現 合物形式，及/或呈其醫藥學上可接受之鹽形式。 用於本發明之埃坡黴素的另一較佳群為 物： 卜通式之化合 132324.doc 200907341

其中：

R f 、各自獨立地為氫、Ci_Ci〇烧基、芳基 或起形成-(CH丄·基團，其土方烷基， R2a 2b ，、甲 m為 2 至 5 ’ 各自獨立地為氫、Ci 或-起形成倘)n_基團，其中…至5二基、芳·， 或C2_C1()炔基； —為C2-C1G烯基 R為氫、c〗-c1()院基、芳基、芳烧基； R 、Rb各自獨立地為氫 或一起形成-(CH2)p基團， R5為氫' (VCw院基、 基、ch2oh、ch2o 烷基 C1-C1()烷基、芳基、芳烷基， 其中P為2至5 ; 芳基、芳烷基、co2h、C02貌 、CH20 醯基、CN、CH2NH2、 CH2N(烧基、醯基h 2或(^2办1、CHal3 ; 6 7 R、R各自為虱，或一起形成一額外鍵，或一起形成環氧 官能基； G 為Ο或CH2 ; D-E—起為基團-H2C-CH2-、-HC = CH-、-C^ C-、 -CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH2-、-CH2-CH(OH)-、 -CH2-0-、-0-CH2-或 ch?ch， 132324.doc -105· 200907341 藉此若G為Ο，則D-E不能為CH2-〇 ;或 D-E-G—起為基團 h2C-CH=CH ; W為基團C(=X)R8，或為芳族或雜芳族基團 X 為〇或基團cr9r10 ; 、鹵素、CN ; '基、芳烧基，或 R 為氫、C1-C10烧基、芳基、芳烧基 R9、R1Q各自獨立地為氫、C1_C2G烷基 連同亞甲基碳一起形成5員至7員碳環； z 為〇或Η及基團OR"; f n R 為氫或保護基PGZ ; A-Y 為基團 〇_C(=0)、〇_CH2 ' CH2_C(=⑺、nr12-C(=〇)、 NR12-S02 ； R12為氫或cvcw烧基； PGZ gC〗-C2〇烷基、CrC：7環烷基（其可在環中含有一或多 個氧原子）、芳基、芳烷基、Ci_C2〇醯基、芳醯基、Ci_c2〇 烷基磺醯基、芳基磺醯基、三（Ci_C2G烷基）矽烷基、二（Ci_ I Cm烷基）芳基矽烷基、（C〗_C2G烷基）二芳基矽烷基或三（芳 烷基）矽烷基； 该通式化合物係呈單一立體異構體或不同立體異構體之混 合物形式，及/或呈其醫藥學上可接受之鹽形式。 埃坡黴素之又一群為式〗之埃坡黴素，其中： R R各自獨立地為氫、C丨-C4烧基或一起形成_(cH2)m-基團，其中m為2至5 ; R R各自獨立地為氫、Ci-C5烧基或一起形成_(cH2)n· 基團，其中n為2至5，或C2-C6烯基，或（^匕炔 132324.doc 200907341 基； r3 為氫， R 、R4b各自獨立地為氫、Ci_C4烷基， R 為氫、G-CU烷基、C(Hal)3 ; R6、R7各自為氫，或一起形成一額外鍵 官能基； 或—起形成環氧 f G 為 CH2 ; D"E 為基團H2C-CH2，或 D_E_G 一起為基團 H2C-CH=CH ; 團 X 為基團cr9r10 ; R 為氫、CVC4烷基、 R9、R1G各自獨立地為氫、 z 為〇 ; 鹵素， Ci-C4燒基、芳基 芳烷基，

两丞图O-i NR -C(=〇) R 為氫或烷基； 該式I埃坡黴素係呈單一立體異構 混合物形式，及/或呈i醫筚風 5 5立體異構體 在本發明咅義上、商用之垃 接受之鹽形式。 月％、義上適用之埃坡黴素的 埃坡黴素， 較佳群為式（I)之 其中 〜b各自獨立地為氫、C1_C2貌 ' 基團，其中m為2至5， 5 开/成-⑷!·^；^- 之 132324.doc -107- 200907341

R 2a R2b各自獨立地為氫、Cl_C5烧基，或一起形成.(cl 基團，其中η為2至5，或C心烯基，或C2-CA 基； R3 為氯， R 、R各自獨立地為氫、烷基， R 為氫或甲基或三氟甲基， R、R -起形成-額外鍵’或一起形成環氧官能基； G 為 ch2 ; D-E 為基團H2C-CH2，或 D_E_G —起為基團 H2C-CH=CH， W 4基團C(=X)R8，或為嗟唾基、。惡嗤基、吼咬基、 N-側氧基-吼啶基；苯并噻唑基、苯并噁唑基、苯 并咪唑基，其視情況經Ci_c3烷基、羥烷基、

Ci-C3胺基烷基' 烷基磺醯基取代， X 為基團cr9r10; r8為氣、甲基、氣、氟， R R各自獨立地為氫、Ci_c4烧基、噻唑基、嗔唑基、 匕定基、N-側氧基_吡啶基，其視情況經c^c3烷 基、C丨-C3羥烷基、芳烷基取代， z 為〇， A-Y R】2 為基團 0-C(=〇)、NRi2_c(=C))， 為氫或Crq烷基； 該式（I)埃坡黴素係呈單一 之混合物形式，及/或呈其醫 立體異構體或不同立體異構體 藥學上可接受之鹽形式。 132324.doc 200907341 在本發明情形中尤其較佳之埃坡黴素或埃坡黴素類似物 或衍生物包括埃坡黴素A、埃坡黴素B、埃坡黴素c 烷基-埃坡黴素C衍生物、埃坡黴素D、反式埃坡黴素〇、 埃坡黴素E、埃坡黴#、埃坡徽素之效應共輛物、沙戈匹 隆，或在文獻中稱為以下各物之埃坡黴素中任一者：伊沙 匹隆（BMS-247550)、BMS_31〇7〇5、Ep〇_9〇6、帕妥匹隆: k〇s-862、kos_1584、k〇s_18〇3、娜 879。當然上述埃 坡黴素之任何醫藥學上可接受之鹽亦均應包括於本文中。 對於所有前述埃坡黴素及埃坡黴素共軛物而言，均應將 基團理解為具有以下含義： 〜 作為烧基 Rla、Rib、R2a、R2b、r3 〜、〜丨、〜b、R23、R^^ 考慮具有1-20個碳原子之直鏈或支鏈烷基，諸如甲基、乙 基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、第三丁基、戊基、異 戊基、新戊基、庚基、己基及癸基。 烷基R1 5、R2a、R2b、R3、R4a、 R21、R22a

Rj 20 r、R5、R8、 、R25、R26及R27亦可經全 栽i 化或細 1 _ 5 個邊-4- J5 ~7 vt « I國I原子、羥基、c丨-C4烷氧基或 基（其可經1-3個i素原子取代）取代。

R R1

R

R 22b C6-C12 芳 作為芳基Rla、RU、R2a、R2b、r3、R4a、R4b、R5、

Rl、Rl1、R22、R22、R1R27，具有-或多個雜原子之 經取代及未經取代之碳環或雜環基，諸如苯基、萘基"夫 喃基、噻吩基、吡啶基、吡唑基、嘧啶基、噁唑基、噠嗪 基、㈣基、㈣基K基、苯并❹基、苯并喔唾基 132324.doc •109- 200907341 (其可在一或多個位置處經函素、〇Η、〇_烧基、c〇2H、 ccv院基、-nh2、_n〇2、_N3、_CN、Ci_c2。烧基、 醯基、C,-C2Q醯氧基取代）為合適的。若將雜原子氧化時芳 族特徵不喪失，則可氧化雜原子，諸如將t定基氧化為吼 咬基-N-氧化物。 作為雙私及二％方基w，具有—或多個雜原子之經取代 及未經取代之碳環或雜環基，諸如萘基、Μ、苯并㈣ 基、苯并Μ基、料㈣基、㈣基、異㈣基、苯并 嚼嗪基、苯并Μ基、㈣基、心基、㈣琳基、四氣 異啥琳基、四氫喹琳基、嘆吩并_基⑽en〇Pyridinyl)、 吼口多吼咬基（Pyrid0pyridinyl)、苯并。比唾基、苯并三唾基 或二氣十朵基（其可在—或多個位置處經i素、〇H、〇 ^ 基、⑶2H、C〇2-烧基、^ 烧基、Cl_C2。醯基或Ci_c2Q醯氧基取代）為合適的。若將: =化時芳族特徵不喪失，則可氧化雜原子，諸如將噎 ί :化為圭啉基-N·乳化物。較佳之基團w為苯 基及笨并噁唑基。 在 R,a、Rlb、R2b' r3 4 π κ ' R ' R8 Λ Rio 22b 一 26 „ n27 氏 二、〜〜26及R27中之芳烧基可在環中含有至

個原子’較佳6至10個c原子’且在燒基鏈中含有U 個，較佳1至4個原子。作. 乍為方烷基’例如考慮节基、苯 土、萘基甲基、萘基乙基、吱喃基^ 対其^ ㈣暴甲基、壤吩基乙基 土丙基。壤可在一或多個位置處經自素、。 基、c〇2h、c〇2_烧基、_N〇2、_N3、 、 -

Ll_C2G烷基 132324.doc -】】〇· 200907341

Ci-C2〇醯基或C^-C^o醯氧基取代。 作為保護基PG之代表’可提及參（Ci_C2G烷基）矽烷基、 雙（C^-Cm烷基）芳基矽烷基、（Ci_C2〇烷基）_二芳基矽烷基、 參（芳烧基）破烧基、Ci-CM烧基、C2_C2G烯基、C4_C7環烧 基（其可另外在環中含有氧原子）、芳基、C7_C2()芳烷基、 CVC^o醢基、芳醯基、Cl_c2()烷氧羰基、Ci_c2〇烷基磺醯基 以及芳基績醯基。 作為保護基PG之烷基、矽烷基及醯基，尤其考慮熟習 此項技術者已知之基團。較佳為可易於自相應烷基醚及矽 烧基_分裂之烷基或矽烷基，諸如甲氧基甲基、甲氧基乙 基、乙氧基乙基、四氫派喃基、四氫吱。南基、三甲基石夕烧 基、二乙基石夕烷基、第三丁基二甲基石夕烧基、第三丁基二 苯基矽烷基、三苄基矽烷基、三異丙基矽烷基、节基、對 硝基苄基或對甲氧基节基以及烷基磺醯基及芳基磺醯基。 作為烧氧羰基’例如三氯乙氧羰基（丁roc)為合適的。作為 醯基，例如甲醯基、乙醯基、丙醢基、異丙醯基、三氯甲 基羰基、三曱基乙醯基、丁醯基或苄醯基（其可經胺基及/ 或羥基取代）為合適的。 作為胺基保護基PG ’考慮熟習此項技術者已知之基 團。舉例而言，可提及Alloc、Boc、Z、苄基、f_Moc、 Troc、Stabase或 benzostabase基團。 作為鹵素原子，考慮氣、氯、溴或埃。 酿基可含有1至20個碳原子，藉此甲醯基、乙醯基、丙 醯基、異丙醯基及三甲基乙醯基為較佳。 132324.doc -111 - 200907341 術語N(院基、醢基）,2包括N(烷基）2、N(烷基）（醯基）、 N(醯基h，藉此烷基為如上所定義之烷基，且醯基係 如上所定義但亦包括苄醯基。 對於X可能之C2_C1Q伸烷基_α，ω _二氧基較佳為伸乙基縮 酮基或新戊基縮酮基。 在本發明之一態樣中，係關於包含以下各物之群的埃坡 黴素之方法、用途及套組：（4S，7R，8s,9s，13E/z,16S)_4,8_ 二羥基-16-(2-甲基_苯并噁唑·5_基）_1_氧雜_5,5,9，13_四甲 基-7-(丙-2-烯-1-基）-環十六_ΐ3-稀-2,6-二_; (18/11，38,78，1011，1111，128，1611/8)-7，11-二經基_1〇_(丙_2_稀_ 1-基）-3-(1_甲基_2·(2_曱基_苯并噁唑巧_基）_8,8，12，16_四甲 基-4,17-二氧雜雙環[141 〇]十七烷_5,9_二酮； (4S’7R，8S，9S，13E/Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-曱基-苯并噻 唑-5_基）'1_氧雜_5,5,9,13-四曱基-7-(丙-2-烯-1-基）-環十六_ 13 -稀-2，6 -二 _ ; (13/尺，38,78，1〇11，118，128，1611/8)-7，11-二羥基_1〇-(丙-2-晞_ 1-基）-3-(1-甲基_2_(2_甲基，苯并噻唑_5_基）_8,8,1216_四曱 基-4，17-二氧雜雙環[14 1〇]十七坑_5,9_二酮； (18/11，38,78，1〇11，1111，123，1611/8)-7，11-二羥基-1〇-(丙-2-稀_ 1-基）-3-(1-甲基_2_(2_甲基-苯并嘍唑_5_基）_8,8，12,16_四曱 基-4，17-二氧雜雙環[141〇]十七烷_5,9_二酮； (48,711，88,98，13£/2，168)-4,8-二羥基-16-(2-甲基-苯并嘆 。坐_5_基氧雜-9,13-二甲基-5,5-(1,3-三亞甲基）_7-(丙-2-稀-1-基）-環十六_13_烯_2,6_二酮； 132324.doc -112- 200907341 (18/11，38,7 8,1011，1111,128，1611/8)-7，11-二羥基-10-(丙-2-烯-1-基）-3-( 1-曱基-2-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-12,16-二曱基-8,8-(1，3-三亞甲基）-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二 酮； (4S,7R，8S，9S，13E/Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-曱基-苯并噻 唑-5-基）-1-氧雜-5,5,9，13-四曱基-7-(丙-2-炔-1-基）-環十六-13-烯-2,6-二酮； (1呂/11，38,7 8，1011,1111，123，1611/8)-7，11-二羥基-10-(丙-2-炔-1-基）-3-(1-甲基-2-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-8,8，12，16-四甲 基-4,1 7-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R，8S，9S,13E/Z,16S)-4,8-二羥基-16-(喹啉-7-基）-1-氧 雜-5,5,9,13-四曱基-7-(丙-2-烯-1-基）-環十六-13-烯-2,6-二 酮； (1S/R，3S，7S,10R，11R，12S，16R/S)-7，11-二羥基-10-(丙-2-烯-1-基）-3-(喹啉-7-基）-8,8,12,16-四甲基-4,17-二氧雜雙環 [14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S，7R,8S，9S, 13E/Z，16S)-4,8-二羥基-16-(1,2-二甲基-1H-苯 并咪哇-5-基）-1-氧雜-5,5,9,13-四甲基-7-(丙-2-烯-1-基）-環 十六-13-烯-2,6-二酮； (1S/R，3S，7S,10R，11R，12S,16R/S)-7，11-二羥基-10-(丙-2-烯-1-基）-3-( 1,2-二甲基-1H-苯并咪唑-5-基）-8,8,12,16-四甲基-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮； (4S,7R,8S，9S，13E/Z，16S)-4,8-二羥基-16-(2-甲基-苯并噻 唑-5-基）-1-氮雜-5,5,9,13-四曱基-7-(丙-2-烯-1-基）-環十六- 132324.doc -113- 200907341 13-烯-2,6-二酮； (18/11，38,78，1011，118，12 8，1611/8)-7，11-二羥基-10-(丙-2-烯-1-基）-3-(1-甲基-2-(2-曱基-苯并噻唑-5-基）-8,8，12，16-四甲 基-4-氮雜-17-氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮，及 (18/尺，38,78，1011,1111，128，1611/8)-7，11-二羥基-10-(丙-2-烯-1-基）-3-(1-甲基-2-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-8,8,12,16-四甲 基-4-氮雜-17-氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮， (1S，3S(E)，7S，10R，11S,12S，16R)-7，11-:M*-8,8，10，12，16-五曱基-3-[l-(2-曱基-1,3-噻唑-4-基）丙-1-烯-2-基]-4，17-二 氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮， (lS，3S(E)，7S，10R，llS,12S,16R)-7，ll-: — *-8,8，10，12，16-五曱基- 3- [l-(2 -曱基-1，3-°塞。坐-4-基）丙-1 -稀-2-基]-17-氧雜·* 4-氮雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮， (48,711，83,98,132,168(丑））-4,8-二羥基-5,5,7,9,13-五曱基-16-[1-(2-甲基-1，3 - 0塞°坐-4-基）丙-1-稀-2-基]-氧雜ί展十六_ 1 3 - - 2，6 -二嗣’ (48,711，8 8,98，1(^，132，168(丑））-4,8-二羥基-5,5,7,9，13-五曱 基-16-[l-(2-甲基-1,3 - °塞°坐-4 -基）丙-1-稀-2 -基]-氧雜5哀十 六-1 0，1 3 -二稀-2，6 -二酬， (4S，7R，8S,9S，10E,13Z，16S(E))-4,8-:g*-5,5,7,9-raTS-13-三氟甲基-16-[1-(2_曱基-1,3-噻唑-4-基）丙-1-烯-2-基]-氧雜環十六-10,13-二烯-2,6-二酮， (1 S，3S(E),7S，10R，11 S，12S，16R)-7，11-二羥基-8,8，10,12,16-五曱基-3-[l-(2-甲基硫基-1，3-噻唑-4-基）丙-1-烯-2-基]- 132324.doc -114- 200907341 4，17-二氧雜雙環[14丨〇]十七烷_5,9_二酮， 其係呈單一立體異構體或不同立體異構體之混合物形式， 及/或呈其醫藥學上可接受之鹽形式。 在本發明之另一態樣中，可使用以下埃坡黴素： (4S,7R,8S,9S,13E/Z，16S)-4,8-二經基-16-(2-甲基-笨并 „塞 唑-5-基）-ΐ·氧雜_5,5,9，13_四甲基_7_(丙·^烯—丨―基）·環十六_ 13-烯-2,6-二酮； (1S/R’3S，7S，10R，11R，12S，16R/S)_7，u_:m&1〇_(^24_ 1-基）-3-(2-曱基-苯并噻唑_5_基）_8,8，12，16_四曱基_4，i7_二 氧雜雙環[14.1.0]十七燒_5,9_二酮； (1S/R，3S，7S，10R，11S，12S，16R/s)_7,u_:^&_1〇(^24_ 1-基）-3-(2-甲基-苯并噻唑_5_基）_8,8，1216四甲基_4，i7_二 氧雜雙環[14.1.0]十七燒_5,9-二酮， 或其任何立體異構體，其係呈單一立體異構體或不同立體 異構體之混合物形式，及/或呈其醫藥學上可接受之鹽形 式。 在本發明意義上最佳之埃坡黴素為（ls,3S,7S，1〇R，lls， 128，1611)-7，11-二羥基-1〇_(丙_2_烯_1_基）_3(2_曱基_苯并噻 唑-5-基）_8,8，12，16_四曱基_417_二氧雜雙環[141〇]十七 烧-5,9-二酮（沙戈匹隆）。 作為較佳辨識單元EG，例如考慮藉由合適酵素在增生 組織中過表現而可自後者分裂之彼等者。舉例而言，就此 可提及葡糖醛酸酶。 通式I之較佳化合物為其中滿足以下各項之彼等者：Α_γ 132324.doc •115- 200907341 表示0-c(=0)或nr2】_c(=0) ; D E表示邮偶基團或 HOCH基團；G表示CH2基團；z表示氧原子，· Ria、Rib在 各情况下均表不絲或H(CH2)p基團，其中p 等於2或3或4，·！^、R2b彼此獨立地表示氫、Ci_Ci。烧基、 C2-C10稀基，或C2_ClQ炔基；r3表示氫；R4a、此獨立 地表示氫或Cl.Cl0院基；R5表示氫或CVC4烧基或CH2〇H或 2NH2或CHsN(烧基、醯基）1Z或CH2Hai ; R6及R7 一起表 示-額外鍵或一起為氧原子或一起為NH基團或一起為N_ 烷基或一起為CH2基團；W表示基團C(=X)R8或2_甲基苯并 噻坐5基或2-甲基笨并噁唑_5_基或喹啉·7_基或胺基甲 基苯并㈣·5·基或2_經甲基苯并㈣_5•基或2•胺基甲基苯 并惡嗤-5-基或2-經甲基-苯并„惡唾_5_基；χ表示cRl()Rn基 團。；R8表示氫或CVC道基或氣原子或氣原子或漠原子； R10/R"表示氫/2·甲基噻唾·4_基或氫/2_D比啶基或氫/2_甲基 噁唑-4-基或氫/2_胺基甲基噻唑_4_基或氫/2_胺基甲基噁唑_ 4-基或氫/2-經甲基嗟唾_4_基或氣/2_經甲基鳴、嗤_4_基& 在一較佳實施例中，基團尺仏及R22b係選自由以下各物 組成之群：Cl_C8烷基、Ci_C8烷氧基、函素、硝基、CN、 3 NH2及CO^CrC：8烷基）。就此而論，尤其較佳為基團 甲基、乙基、丙基、異丙基、第三丁基、Cf3、CA、F、 C卜硝基、CN、n3、腿2、c〇2_甲基、c〇2_乙基、c〇2-丙 基及C〇2-異丙基。 在另—較佳實施例中，基團R26係選自由Ci_C8烷基及C2_ Cs烯基組成之群。就此而論，尤其較佳為基團甲基、乙 132324.doc 200907341 基'丙基、異丙基、第三丁基、CF3、丙烯基及丁稀基。 在另一較佳實施例中，選擇基團R2a及R2b使得基團RZa或 R之一表不氫，而另一基團在各情況下選自由c广匕烷 基、CrC7烯基及CrC7炔基組成之群。就此而論，尤其較 佳為基團甲基、乙基、丙基、異丙基、丙烯基、丁烯基、 丙炔基及丁炔基。 較佳之連接子-辨識單元具有通式ιπ1 :

RG表示〇=c=N基團或S=C=N基團或〇=〇N-CH2基團或 S=C=N-CH2基團；且 R 2a、R22b&EG具有上文指出之含義； 以及通式III2之連接子_辨識單元：

其中 RG2表示HO-CH2基團或hnr23_ch2基團，且 R 、R22b及EG具有上文指出之含義； 但條件在於不包括以下化合物： (4_羥曱基）苯基_2,3,4,6-四-〇-乙醯基-α-D-哌喃半乳糖苷； (2_羥甲基）苯基-2,3,4,6-四-〇-乙醯基-a-D-哌喃半乳糖苷； 132324.doc -117- 200907341 (4-羥曱基）苯基-2,3，4-三-Ο-乙醯基-β-D-葡萄糖苷酸-6-曱 酯； (2-羥甲基）苯基-2,3,4-三-0-乙醯基-β-D-葡萄糖苷酸-6-甲 酯； (4-羥甲基）苯基-2,3,4,6-四-Ο-乙醯基-β-D-葡萄哌喃糖苷； (2-羥曱基-4-硝基）苯基-2,3,4,6-四-Ο-乙醯基-α-D-哌喃半乳 糖苷； (4 -經甲基-2 -硝基）苯基- 2,3,4,6 -四-0-乙酿基-a - D -旅喃半乳 糖苷； (2-羥甲基-4-硝基）苯基-2,3,4-三-Ο-乙醯基-β-D-葡萄糖苷 酸-6-曱酯； (4-羥曱基-2-硝基）苯基-2,3,4-三-0-乙醯基-β-D-葡萄糖苷 酸-6-曱酯； (2 -氣-4-經甲基）苯基- 2,3,4,6 -四-0-乙酿基-a - D - °瓜喃半乳糖 苷； (2-氯-4-羥曱基）苯基-2,3,4-三-0-乙醯基-(3-0-葡萄糖苷酸-6 -曱醋； 以及通式III3之連接子-辨識單元：

RG3 表示 Hal-C(=0)-CH2 基團或 Hal-C(=S)-CH2 基團或 R27-c(=o)-o-c(=o)-ch2基團或 r27-c(=o)-o-c(=s)-ch2基團或 132324.doc -118- 200907341 CTV〇 i 〇^°-r A’v〇-c- 基團或〇 H2基團； R7為Cl-ClG烷基、芳基或芳烷基；且 R22a、R22b&EG具有上述含義； 但條件在於不包括以下化合物： 2,5_二側氧基吡咯啶-1-基-[4-(2,3,4,6-四-〇-乙醯基_01_1)_哌 喃半乳糖苷基）-苄基]碳酸酯； 2,5-二側氧基吡咯啶_丨_基·[2_(2,3,4,6-四_〇_乙醯基_a_D-哌 喃半乳糖苷基）·苄基]碳酸酯； 2.5- 二側氧基吡咯啶-1-基-[4-((2,3，心三-0-乙醯基葡 萄派喃糖苷基）_甲基糖醛酸）苄基]碳酸酯； 4硝基本基· [2-((2，3，4-三-〇-乙醯基-β-D-葡萄〇辰喃糖苷基） 甲基糖备酸）-卞基]碳酸自旨； 2.5- 二側氧基吡咯啶-^基·[各^^七^四七-乙醯基^-^葡 萄旅喃糖苷基）苄基]_碳酸酯；

4-石肖基本基-[2-(2,3,4,6-四-0-乙醯基-〇[-0-旅喃半乳糖苦 基）-5-硝基苄基]-碳酸酯； 4_硝基苯基-[2_((2,3,4·三_〇_乙醯基萄哌喃糖苷基） 甲基糖醛酸）-5-硝基苄基]碳酸酯； 4-硝基苯基-[4-甲氧基_5_硝基_2_((2,3,4-三-〇-乙醯基_p_D_ 葡萄哌喃糖苷基）甲基糖醛酸）苄基]碳酸酯； 4_硝基苯基-[4-((2,3,4-三-0·乙醯基-β-D-葡萄哌喃糖芽基） 曱基糖醛酸）-5-硝基苄基]碳酸酯； 4 -氣本基-[2-((2,3,4-三-〇-乙醯基- β-D-葡萄。辰喃糖苦基）曱 I32324.doc -119- 200907341 基糖醛酸）-5-硝基节基]碳酸酯。 在某些較佳實施例中，埃坡黴素共軛物可含有一個以上 辨識單元，視情況其中辨識單元為相同。辨識單元可（例 如）選自抗體或其抗原結合片段，其對選自由以下各物組 成之群的抗原具有特異性：CD19、CD20、CD40、 CD22、CD25、CD5、CD52、CD10、CD2、CD7、CD33、 CD38 、 CD40 、 CD72 、 CD4 、 CD21 、 CD37 、 CD30 、 VCAM 、 CD31 、 ELAM 、内皮因子（endoglin)、 VEGFRI/II、VEGFRvIII、scFv(14El)、ανβ3、Tiel/2、 TES23(CD44ex6)、磷月旨醯絲胺酸、PSMA、VEGFR/VEGF 複合物及ED-B-纖維結合蛋白。 已以名為沙戈匹隆之較佳埃坡黴素衍生物進行以下實 例，該沙戈匹隆為：（1S，3S，7S，10R，11S，12S，16R)-7，11-: 羥基-10-烯丙基-8,8，12，16-四曱基-3-(2-甲基-苯并噻唑-5-基）-4，17-二氧雜雙環[14.1.0]十七烷-5,9-二酮。 一般根據熟習此項技術者已知之方法進行埃坡黴素、其 前驅體及衍生物之製造。例如在以下各案中描述合適方 法：DE 19907588、WO 98/25929、WO 99/58534、WO 99/2514 ' WO 99/67252 > WO 99/67253 > WO 99/7692 > EP 99/4915、WO 00/485、WO 00/1333、WO 00/66589、WO 00/49019 > WO 00/49020、WO 00/49021、WO 00/71521、 WO 00/37473、WO 00/57874、WO 01/92255、WO 01/81342、WO 01/73103、WO 01/64650、WO 01/70716、 US 6204388、US 6387927、US 6380394、US 02/52028、 132324.doc -120- 200907341 U S 0 2 / 5 8 2 8 6 、 U S f) 9 / a , λ q λ 02/62030 ，W〇 02/32844 > W〇 02/30356、WO 02/19swrr\ / WU U2/32844、WO 02/l4323及 w〇 〇2/844〇。 熟習此項技術者將顯而易見，本文所述之實施例的許多 修改及變體在不脫離本發明之精神及範㈣情況下為可能 的。在以下非限制性實例中進—步說明本發明及其優勢。 如在實例中所述之基因或蛋白質的所有子群及結合該等子 群之根據纟發明之方，去、用収套組為本發明之特定態 樣。 " 實例 實例1 :肺癌異種移植模型 藉由將新鮮腫瘤物質自NSCLC患者皮下移植於裸小鼠中 來建立肺癌異種移植模型。腫瘤類型包括多形癌 (pleomorphic carcinoma)(7187、7336)、鱗狀細胞癌 (7126、7177、7298、7343、7462、7433 ' 753 0)、去分化 癌（dedifferentiated carcinoma)(7668)、腺癌（7064、7198、

7406、73 87、7466、7612)及小細胞肺癌（7530)。研究設計 之示意性概述呈現於圖1中。 應瞭解活體内（in vivo)模型並不限於分析上述癌，而亦 可用以分析具有另一類型癌症或疾病之患者對化合物或化 合物之混合物的反應。 使用相對於對照小鼠之被治療者之腫瘤面積減小（T/C 比）’或與基線處（第一次治療之曰）體積相比之絕對腫瘤體 積的平均變化來測定抗腫瘤活性。 1將自具有確定癌症之患者獲得之肺癌活組織檢查物移 132324.doc -121 - 200907341 植於裸小鼠中。產生用依託泊苷、卡鉑、吉西他濱、紫杉 醇、溫諾平、西妥昔單抗、埃羅替尼及沙戈匹隆治療之腫 瘤生長曲線。根據此項技術中已知之方法在模型中分析 P53之突變狀態。在長期實驗中表徵十四個沙戈匹隆反應 者及八個沙戈匹隆不反應者。以PBS治療PBS對照組或以 /：/戈匹隆’α療歷時24 hr，隨後殺死（saerifiee)。根據此項 技術中已知之方法分離沙戈匹隆反應者及不反應者模型之 RN A且根據製造商說明使其雜交於陣列上。 如本文所證實，沙戈匹隆在整個NSCLC異種移植物之範 圍顯不優良腫瘤生長抑制活性。與通常用於NSCLC；中的細 胞毒性劑（諸如卡鉑、太平洋紫杉醇、吉西他濱、依託泊 苷及長春瑞賓）相比，沙戈匹隆顯示優良活性及耐受性（圖 2a及2b)。 *刀析22個不同肺癌異種移植物對沙戈匹隆及其他抗腫 瘤’π療之敏感性時（圖2&及2b)，沙戈匹隆為在所有22個肺 腫瘤中抑制腫瘤生長之唯一藥劑且在12個NSCLC(76.5%) 中尤為顯著，具有<20%之T/c比，其意謂生長減小大於 8〇 /〇。將沙戈匹隆之活性與用於NSclc控制中之標準化學 療法（卡鉑、太平洋紫杉醇、吉西他濱、依託泊苷及長春 瑞食）相比較。 在所#估之其他化學治療藥物中，吉西他濱亦產生高反 應百为比（總體80.0%及47.0%具有<20°/。之T/C比）但與顯著 毒性有關’此不同於沙戈匹隆。太平洋紫杉醇在812。/〇腫 瘤中引發反應，而56.2%具有<20%之T/C比，且卡鉑在 132324.doc -122- 200907341 68.8°/。腫瘤中產生反應，但僅在25.0%樣本中具有<2〇%之 T/C 比（圖 2a及 2b)。 儘管以吉西他濱之反應亦較高（61.5%)，但應注意，與 沙戈匹隆對比’由於毒性，使得在該等模型的7個模型 中’每組（n=6)至少2隻動物不能加以評估，且毒性妨礙該 等模型的2個模型中任一小鼠的評估（圖2a及2b)。 總而言之’與通常用於NSCLC治療中之其他藥劑（包括 卡銘、太平洋紫杉醇、吉西他濱、依託泊苷及長春瑞賓） 相比，沙戈匹隆顯示腫瘤體積相對於對照物（媒劑）之優良 減小（圖2及3)。沙戈匹隆針對一系列新穎NSCLC異種移植 模型為面活性。肺異種移植模型之反應以沙戈匹隆為最 高。圖4顯示22個NSCLC異種移植模型對沙戈匹隆之反 應。在以沙戈匹隆治療之後’十一個樣本顯示腫瘤消退且 二個樣本顯示穩定疾病（一共14個反應者）及八個顯示腫瘤 進展（不反應者）。 實例2 :表現基因之分析 自殺死之動物取出2x2x2 mm3腫瘤組織樣本。將樣本速 凍（snap frozen)且儲存於液氮中直至使用。使用丁^加丨試劑 (Invitrogen，Karlsruhe, Germany)製備腫瘤樣本之總RNA， 接者根據製商建s義以RNeasy® Mini套組（Qiagen，Hilden， Germany)淨化。包括脫氧核糖核酸酶^^⑽化消 化步驟以消除染色體組DNA。就完整性而言使用RNA LabChip於 Agilent Bioanalyzer 2100(Agilent Technologies Inc.，USA)上且就濃度而言在Peqiab Nan〇Dr〇p上檢查總 132324.doc -123- 200907341 RNA之品質。 根據製造商說明在原發腫瘤及繼代異種移植物上進行 Affymetrix基因表現概況分析（Affymetrix Inc., California, USA)。 根據製造商說明使用來自Affymetrix(PN 900493)之單循 環真核目標標記檢定（One-Cycle eukaryotic target labeling assay)。簡言之，在第一股cDNA合成反應中使用T7標籤之 寡dT引子將2 pg高品質總RNA反轉錄。在核糖核酸酶Η介 導之第二股cDNA合成之後，純化雙股cDNA且使其充當產 生生物素標記互補RNA(cRNA)的後續活體外轉錄反應之模 板。接著將生物素標記cRNA淨化、斷裂且雜交至含有約 54675個探針組之基因晶片HGU133Plus2.0表現陣列 (Affymetrix，Inc., Santa Clara, CA，U.S.A·)。洗務基因晶 片，且在基因晶片 Fluidics Station 450(Affymetrix, Inc”

Santa Clara, CA，U.S.A.)上以抗生蛋白鏈菌素-藻紅素 (streptavidin-phycoerythrin)染色。在基因晶片 Fluidics

Station 450上洗滌之後，在具有自裝卸機及條碼讀取器之 Affymetrix 基因晶片 3000 掃描儀（Affymetrix，Inc.，Santa Clara，CA，U.S.A.)上掃描陣列。根據製造商說明使用 HGU133Plus2.0陣列。 實例3 :差異表現基因之鑑別

Affymetrix HGU1 33Plus2.0研究之目標在於鑑別在沙戈 匹隆反應者與不反應者模型之間差異表現之基因（潛在地 指示預測性生物標記（predictive biomarker))。 132324.doc * 124- 200907341 以 Expressionist ρΓ〇 4 〇 Refiner(GeneData，Basel，ch)軟 體分析雜交障列之品質。此處，基於個別寡核苦酸料 ㈠木針)之原始強度，進行以下分析：根據相似性將實驗分 組且可移除潛在的離群實驗（或經選擇以進行再雜交、再 斷裂）’將特定實驗之品質與實際參考實驗（經計算為該組 中所有陣列之所有部件強度的平均值）作比較。另外，遮 蔽陣列上之缺陷。此處，對於各陣列而言，將空間信號分 布與其所屬之實驗組的參考實驗相比較。將與參考實驗相 比具有一貫較高或較低部件強度之具有尖銳邊界的區域標 不為缺陷且自進一步分析中排除。另外，進行信號校正 (失真及梯度），計算對照基因統計數據，且提供實驗品質 之總體分類。 以MAS5.0概括演算法概括各陣列上之探針強度，且將 精確（refined)及概括之數據載入coBi資料庫中（GenedaU，

Basel，CH)。以 Expressionist Pro 4.0 Analyst(GeneData,

Basel, CH)軟體進行探針組特定信號強度之分析β使用 Expressionist Analyst之分析包含盒形圖（Box plot)、中值 歸一化後之盒形圖（Box plot after median normalization)、 整體分析（Global Analyses)、主組份分析（Principal component analysis)、階層式叢集（Hierarchical clustering)、 標記基因分析（Marker gene analysis)、有效值比例（Valid value proportion)及統計學檢驗（statistical tests):以 Welch 校正之t檢驗。將數據組中值歸一化。 實例4:埃坡黴素反應性之潛在生物標記之分析 132324.doc -125- 200907341 使用實例2及3中揭示之方法進行潛在生物標記之分析以 比較J戈匹隆反應者相對於不反應者之基因表現模式。如 圖 5中所示，進行p53、EGFR&Ras_Mutati〇nstatus之相近 分析（Cl〇ser analysis)。此外，如 p53、hgf、ces2、 CYP2C18、CYP2C19、CA9、CA12、ITGA4、EPHA4之個 /'

別基因的詳細基因表現分析係顯示於圖6-8中。圖9及圖1 〇 中顯示建議作為生物標記之所有差異表現基因之概述。引 起Ρ53蛋白質功能喪失的突變ρ53基因或降低之Μ] mRNA 表現程度之存在令人驚訝地指示該個體對諸如沙戈匹隆之 埃坡黴素的潛在反應性（圖5及圖6)。DAXX及肌縮蛋白增 大之基因表現指示該個體對諸如沙戈匹隆之埃坡黴素的潛 在反應性。CYP同功異型物、微粒體環氧化物水解酶、細 胞質環氧化物水解酶、緩酸g旨酶、CA9、CA12、咖八々、 EPHA4、NRG1及/或HGF增大之基因表現指示該個體對以 沙戈匹隆治療潛在降低之反應性（圖6_8)。 因此’已鑑別-組區分埃坡黴素反應者與不反應者之候 選基因/途徑。為低氧娜1A途徑之部分的若干基因表現 或”質程度(例如，VEGF、GLlm、搭縮酶A、血紅素 加氧酶、NIP3、pGK1、運鐵蛋白、碳酸肝酶）之上調或下 調經發現在埃坡徵素不反應者中上調（圖9)。另彳，埃坡黴 素與碳酸酐酶抑制劑乙醯偶氮胺（acetaz〇iamide)之組合弓 起對埃坡黴素之敏化（如圖11所示）。 ° 實例5:冑種移植模型與原發鍾瘤之比較 對於組織學 加工原發腫瘤與繼代異種移植物之代表性 132324.doc •126- 200907341 二片染色以評估組織之組織學(tissue hist°_ (Η及E染色)且測定若干蛋白質之表現程度。 、發現NSCLC腫瘤異種移植物實際上與原發腫瘤相當。在 稞小鼠中之第-次繼代之後，異種移植物之組織學及細胞 表面蛋白質表現與原發腫瘤之彼者相當類似，表明異種移 植物保留其原發腫瘤特徵。基因表現概況分析說明異種移 植腫瘤在各種繼代之後與相應原發腫瘤叢集在—起。另 卜藉由比較表明在各種樣本之間存在良好相關性。此概 '兄刀析說月在裸小鼠中異種移植後，生長腫瘤與其相應患 者腫瘤相比並未顯著改變其特徵。在本發明中所述之模型 係預期抗癌化合4勿之概況分析的有價值工具。 【圖式簡單說明】 ~

圖1顯不臨床前肺癌研究設計：22個非小細胞肺癌 (NSCLC)異種移植模型係源自直接在外科手術後之患者原 發腫瘤；評估在低鼠繼代下對沙戈匹隆及標準化學療法之 反應且將樣本分為反應者及不反應者組。使來自未經治療 之對照腫瘤的RNA經受Affymetrix基因表現分析用於以腫 瘤反應辨別在基線處基因表現程度。 圖2A顯示藉由臨床準則分析之非小細胞肺癌（NSCLC)模 型對以沙戈匹隆及標準化學療法治療之反應；將腫瘤大小 縮減（tumor shrinkage)及穩定疾病歸類為反應者（R)，將腫 瘤進展歸類為不反應者（NR)。沙戈匹隆顯示最高功效，22 個模型中14個為反應者，N.D· ··未測試/不可估，tox : >= 50%毒性死亡。 132324.doc -127- 200907341

圖2B顯示藉由被治療者之腫瘤體積相對於對照樣本之關 係（τ/c值）所分析之非小細胞肺癌（NSCLC)模型對以沙戈匹 隆及標準化學療法治療之反應。在22個模型的所有22者 中’沙戈匹隆均顯示反應；++++ ·· T/c比0-5%，+++ : τ/C

比 6_2〇% ’ ++ : T/C 比 21-35%，+ : T/C 比 35-50%，- : T/C 比5 0 ’ η· t ·.未測試/不可估，t〇x : > = $ 〇%毒性死亡， pLC :多形癌，scc :鱗狀細胞癌，ADC :腺癌，lcc : 大細胞癌’ DDC :去分化癌。 圖3顯示源自患者之非小細胞肺癌（NSCLC)異種移植模 型之反應表徵實驗的實例；沙戈匹隆治療之天數由紅色箭 頭表示；A : Lu7298 :在沙戈匹隆治療後之腫瘤大小縮減 (反應者），B : Lu7198 :在沙戈匹隆治療後之腫瘤進展（不 反應者）。 圖4為顯示藉由臨床準則分析之在開始以沙戈匹隆治療 22個源自患者之非小細胞肺癌（NSCLC)異種移植模型後第 21天每組6隻動物之中值腫瘤體積變化之瀑布圖；腫瘤體 積之中值變化>30%=TP:以紅色表示之腫瘤進展，腫瘤體 積變化>-30% U<30%=SD:以紫色表示之穩定疾病，腫瘤 體積變化<-30%=TS :以藍色表示之腫瘤大小縮減。 圖5顯示EGFR、K-Ras及TP53之22個源自患者之非小細 胞肺癌（NSCLC)異種移植模型的突變分析及異種移植模型 對沙戈匹隆的反應，其係根據臨床參數，每組6隻動物之 腫瘤體積中值變化，>30%=ΤΡ :以紅色表示之腫瘤進展， 以紫色表示之穩定疾

腫瘤體積變化>-30% u<30%=SD 132324.doc .128- 200907341 病，腫瘤體積變化<-30%=TS :以藍色表示之腫瘤大小縮 減，fs =框架移位（frame shift)。以黃色表示蛋白質序列中 發生變.化之突變。TP53突變狀態顯示與沙戈匹隆反應顯著 相關（p<0.05)。 圖6顯示藉由Affymetrix分析對22個源自患者之非小細胞 肺癌（NSCLC)異種移植模型中之TP53(A)及HGF(B)轉錄物 所進行之基因表現分析，其係與沙戈匹隆反應及TP53突變 狀態（TP53 Mut)相關。TP :以紅色表示之腫瘤進展，SD : 以紫色表示之穩定疾病，TS :以藍色表示之腫瘤大小縮 減，wt :野生型，m :突變型。突變TP53或低TP53預示良 好沙戈匹隆，而高HGF程度預示TP53突變樣本中之沙戈匹 隆抗性。 圖7顯示藉由Affymetrix分析對22個源自患者之非小細胞 肺癌（NSCLC)異種移植模型中之CES2(A)、CYP2C18(B)、 CYP2C9(C)轉錄物所進行之基因表現分析，其係與沙戈匹 隆反應相關。TP :以紅色表示之腫瘤進展，SD :以紫色 表示之穩定疾病，TS :以藍色表示之腫瘤大小縮減，wt : 野生型，m :突變型。基因之較高表現潛在地與在沙戈匹 隆療法後具有腫瘤進展之異種移植模型中之沙戈匹隆代謝 有關。 圖8顯示藉由Affymetrix分析對22個源自患者之非小細胞 肺癌（NSCLC)異種移植模型中之CA9(A)、CA12(B)、 ITGA4(C)、EPHA4(D)轉錄物所進行之基因表現分析，其 係與沙戈匹隆反應相關；TP :以紅色表示之腫瘤進展， 132324.doc -129- 200907341 SD .以紫色表示之穩定疾病，ts :以藍色表示之腫瘤大 小縮減。基因之較高表現與在沙戈匹隆療法後具有腫瘤進 展之異種移植模型中之腫瘤低氧及細胞黏著有關。 圖9顯示在沙戈匹隆反應者模型（腫瘤大小縮減及穩定疾 病：14個模型’ 54個樣本）與不反應者模型（腫瘤進展：6個 模型’ 37個樣本）（各自2-5次重複實驗，藉由Affymetrix基 因表現概況分析）之間Welsh檢驗之平均值基因表現比及p 值；顯示在沙戈匹隆不反應者模型中具有較高表現之差異 表現沙戈匹隆生物標記候選物。 圖10顯示在沙戈匹隆反應者模型（腫瘤大小縮減及穩定 疾病：14個模型，54個樣本）與不反應者模型（腫瘤進展：6 個模型，3 7個樣本）（各自2-5次重複實驗，藉由Affymetrix 基因表現概況分析）之間Welsh檢驗之平均值基因表現比及 P值；顯示在沙戈匹隆反應者模型中具有較高表現之差異 表現沙戈匹隆生物標記候選物。 圖11顯示將A549 NSCLC細胞異種移植於裸个鼠中。如 所示在腫瘤移植後第7天開始治療小鼠：如箭頭所示在移 植後第17、32及45天給予沙戈匹隆6 mg/kg或8 mg/kg，在 投與沙戈匹隆之日起（在施用沙戈匹隆之前2 h及之後2 h) 一天一次或一天兩次口服乙醯偶氮胺，40毫克/天，歷時 五天。 因此，本發明之另一態樣係關於如上文指出之圖中每一 者之揭示内容以及此揭示内容與根據申請專利範圍之方 法、用途及套組之態樣的組合。 132324.doc -130-

Claims (1)

1. 200907341 十、申請專利範圍： 1 · 一種測定個體對於埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的活 體外vz7ro)方法’其中該方法包含分析該個體之樣本 中之至少一種基因或其編碼之蛋白質的表現程度，其中 該蛋白質係選自由以下組成之群：細胞色素P(cyto_ chrome P，CYP)同功異型物（isoform)、微粒體環氧化物 水解酶（microsomal epoxide hydrolase，EPHX1)、細胞質 環氧化物水解酶（cytoplasmic epoxide hydrolase， EPHX2) ' 叛酸酯酶 2(carboxyl esterase 2，CES2)、 p53(TP53)、促调亡Fas-相互作用搭配物（pro-apoptotic Fas-interacting partner，DAXX)、神經調節蛋白 l(neuregulin 1，NRG1)、肝細胞生長因子（hepatocyte growth factor，HGF)、肌縮蛋白（dystrophin，DMD)、 UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加 氧酶（heme oxygenase，HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶（Carboanhydrase)2、9 及 12(CA2、 CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋白（transferrin，TF)、HIF-脯胺醯基經化酶（HIF-prolyl hydroxylase，EGLN3)、 E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、 TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1 或其任何組合。 2.如請求項1之方法，其中該蛋白質係選自由以下組成之 群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、促凋亡 132324.doc 200907341 Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、 肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A3、 UGT1A4 、UGT1A8、UGT1A10、VEGF(VEGFA)、 GLUT1、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶（ELGN3)。 3. 如請求項1之方法，其中該蛋白質係選自由以下組成之 群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯 酶2(CES2)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神經 調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、 VEGF(VEGFA)、GLUT1(SLC2A1)、ALDOC、血紅素加 氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2及 9(CA2、CA9)、PGK1、運鐵蛋白（TF)、HIF-脯胺醯基羥 化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、EPHA4、 ITGA6、KIFAP3、TIMP2、RPS6KB1 、TIMP2、 FSHPRH1或其任何組合。 4. 一種測定個體對於埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的活 體外方法，其中該方法包含分析該個體之樣本中多個基 因的表現程度；及藉由比較該等基因之表現程度與指示 途徑失調之參考概況來偵測途徑失調之存在（作為低氧 (hypoxia)/HIF 1 α途徑），其中途徑失調之存在指示該個體 對於該埃坡黴素治療之潛在減小反應性（埃坡黴素不反應 者）。 132324.doc 200907341 5. 如請求項1之方法，其中該標記蛋白質之表現程度增大 至少約1.5倍。 6. —種編碼標記蛋白質或其片段之核酸的用途，其係用於 製造測定個體對於埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的藥 物，其中該標記蛋白質係選自由以下組成之群：細胞色 素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯酶 2、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神 經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10 、AKR1C2 、VEGF 、GLUT1 、醛縮酶 A(aldolase A)、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、 BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、 PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、 E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、 TIMP2、RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 7. 如請求項6之編碼標記蛋白質或其片段之核酸或具有其 互補序列之核酸的用途，其中該標記蛋白質係選自由以 下組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧 化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2) ' p53(TP53) 、 | >周亡Fas-才目互作用#酉己物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1 、UGT1A3、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 、 AKR1C2 、 VEGF 132324.doc 200907341 (VEGFa)、GLUT1 、醛縮酶A、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3(BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白及 HIF-脯胺 醯基羥化酶（EGLN3)。 8. 一種在嚴格條件下與編碼標記蛋白質之基因雜交的核酸 之用途，該標記蛋白質係選自由以下組成之群：細胞色 素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解酶 (EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸S旨酶 2、p53(TP5 3)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、神 經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋白 (DMD)、UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10、AKR1C2、VEGF(VEGFA)、GLUT1、搭縮酶 A、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、 碳酸酐酶2、9及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋 白、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1 、EPHA4、ITGA6、KIFAP3、TIMP2、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 9. 如請求項8之在嚴格條件下與編碼標記蛋白質之基因雜 交的核酸或具有其互補或同源序列之核酸之用途，其係 用於如請求項1至5中任一項之方法中，該標記蛋白質係 選自由以下組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微 粒體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD) 、UGT1A1 、UGT1A3 、 132324.doc 200907341 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、VEGF、 GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶（HM0X1)、NIP3 (BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)。 10. 如請求項9之用途，其中該核酸具有與編碼該標記蛋白 質之基因的編碼股序列互補之序列。 11. 如請求項9或10之用途，其中該核酸固定於微陣列上， 較佳其中該微陣列為基於蛋白質、RNA或cDNA之微陣 列，或SNP陣列。 12. —種針對標記蛋白質之抗體的用途，該標記蛋白質係選 自由以下組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒 體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、羧酸酯酶2、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用 搭配物（DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因 子（HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1、UGT1A3、 UGT1A4、UGT1A8、UGT1A10、AKR1C2、VEGF (VEGFA)、 GLUT 1、醒縮酶A、血紅素加氧酶 (HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、碳酸酐酶 2、9 及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋白、HIF-脯胺醯 基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E 及 EIF4ABP1、 EPHA4、ITGA6、KIFAP3 、TIMP2、RPS6KB1 、 TIMP2、FSHPRH1。 13. 如請求項12之用途，其係用於測定個體對於埃坡黴素治 療疾病之潛在反應性的方法中，其中該標記蛋白質係選 132324.doc 200907341 自由以下組成之群：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒 體環氧化物水解酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶 (EPHX2)、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物 (DAXX)、神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子 (HGF)、肌縮蛋白（DMD)、UGT1A1、UGT1A3、 UGT1A4 、 UGT1A8 、 UGT1A10 、 AKR1C2 、 VEGF 、 GLUT1、醛縮酶A、血紅素加氧酶（HMOX1)、 NIP3(BNIP3)、PGK1、運鐵蛋白及HIF-脯胺醯基羥化酶 (EGLN3)。 14. 一種抗體或源自抗體之結合部分之用途，其係用於製造 測定個體對於埃坡黴素治療疾病之潛在反應性的藥物， 該抗體或源自抗體之結合部分能夠特異性結合或偵測選 自由以下組成之群的標記基因之表現產物中之至少一 者：細胞色素P(CYP)同功異型物、微粒體環氧化物水解 酶（EPHX1)、細胞質環氧化物水解酶（EPHX2)、羧酸酯 酶2、p53(TP53)、促凋亡Fas-相互作用搭配物（DAXX)、 神經調節蛋白1(NRG1)、肝細胞生長因子（HGF)、肌縮蛋 白（DMD)、UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A8、 UGT1A10、AKR1C2、VEGF(VEGFA)、GLUT1、路縮酶 A、血紅素加氧酶（HMOX1)、NIP3(BNIP3)、BNIP3L、 碳酸酐酶2、9及 12(CA2、CA9、CA12)、PGK1、運鐵蛋 白、HIF-脯胺醯基羥化酶（EGLN3)、E2F3、EIF4E及 EIF4ABP1 、EPHA4、ITGA6、KIFAP3 、TIMP2、 RPS6KB1、TIMP2、FSHPRH1。 132324.doc 200907341 15, 一種埃坡黴素之料，其㈣於製造 體的華你 〜、〜有疾病之個 一。，其卡該欲治療之個體根據如請求項⑴尹任 一項之方法敎對於該埃坡黴素治療有反應。 16. 一種埃坡黴素及至少一種其他治療劑之用途，其係用於 製造治療患有選自以下疾病之個體的醫藥組合物：惡性 病症、腫瘤疾病、發炎栂，左 、 /㈤赞人/·生疾病、神經退化性疾病、血管 生成相關疾病、多發性硬化症、阿兹海默氏疒 (AlZheime,s d-se) ^ ^ 關節炎，其中該欲治療之個體根據如請求項山中任_ 項之方法载騎該埃坡黴以縣反應，且料其中 該至少-種其他治療劑能夠調節指示該個體對於埃坡 素治療無反應性之途徑的活性程度。 ‘'‘ 132324.doc