TH14896U - ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) - Google Patents

ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa)

Info

Publication number
TH14896U
TH14896U TH1603001010U TH1603001010U TH14896U TH 14896 U TH14896 U TH 14896U TH 1603001010 U TH1603001010 U TH 1603001010U TH 1603001010 U TH1603001010 U TH 1603001010U TH 14896 U TH14896 U TH 14896U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
malassezia globosa
fungus
pcr
primers
program
Prior art date
Application number
TH1603001010U
Other languages
English (en)
Other versions
TH14896A3 (th
TH14896C3 (th
TH14896Y (th
Inventor
ชัยคำภา ผู้ช่วยศาสตราจารย์กัญญลักษณ์
Original Assignee
มหาวิทยาลัยขอนเเก่น
Filing date
Publication date
Application filed by มหาวิทยาลัยขอนเเก่น filed Critical มหาวิทยาลัยขอนเเก่น
Publication of TH14896U publication Critical patent/TH14896U/th
Publication of TH14896A3 publication Critical patent/TH14896A3/th
Publication of TH14896C3 publication Critical patent/TH14896C3/th
Publication of TH14896Y publication Critical patent/TH14896Y/th

Links

Abstract

------26/07/2561------(OCR) หน้า 1 ฃองจำนวน 1 หน้า บทสรุปการประดิษฐ์ ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาลซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) เป็นชุดตรวจที่ ประกอบด้วย ไพรเมอร์ (primer) จำนวน 1 คู่ ที่ใช้ตรวจสอบหาสารพันธุกรรม (DNA) ในระดับสปีชีส์ (species) คือ มาลาสซีเซีย โกสโบซา (Malassezia globosa) ด้วยเทคนิคปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส หรือ เทคนิคพีซีอาร์ (Polymerase chain reaction หรือ PCR) มีลำดับเบสดังนี้ - ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- cgt aca ata agt gtg tct ctg gcg -3’ - รีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- gtt teg ctg cgt tct tea teg -3’ และสามารถประกอบเพิ่มเติมด้วยชุดน้ำยาสำหรับการทำปฏิกิริยาเพื่อการตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ------------

Claims (4)

------26/07/2561------(OCR) หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า ข้อถือสิทธิ
1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเรีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ประกอบด้วย คู่ไพรเมอร์ (primer) ที่ใช้เพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรามาลาสซีเรีย โกลโบซา (Malassezia globosa) มีลำดับเบสดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- cgt aca ata agt gtg tct ctg gcg -3’ รีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- gtt tcg ctg cgt tct tca tcg -3’
2. กรรมวิธีการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อรามาลาลซีเซีย โกสโบซา (Malassezia globosa) โดยใช้ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาลซีเซีย โกสโบซา (Malassezia globosa) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ด้วย วิธีปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรล หรือ เทคนิคพีซีอาร์ (PCR) โดยใช้เครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler หรือ PCR machine) มีเงื่อนไขของโปรแกรมอุณหภูมิเพื่อเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ตามขั้นตอน ดังนี้ ขั้นที่ 1 โปรแกรมพรี-ดีเนเจอร์ (Pre-denature) ใช้อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 3 นาที ขั้นที่ 2 โปรแกรมแอมพลิฟิเคชั่น (Amplification) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนดีแนทเจอ เรชั่น (Denaturation) ที่อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 45 วินาที ขั้นตอนแอนเนียลลิง (Annealing) ที่ อุณหภูมิ 62 องศาเซลเซียส นาน 30 วินาที และขั้นตอนเอ็กเท็นชั่น (Extension) ที่อุณหภูมิ 72 องศา เซลเซียส นาน30 วินาที ทำซ้ำทั้งหมด 30รอบ (cycles) โดยอัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ (temperature transition rate) ของเครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler) เป็น 5 องศาเซลเซียสต่อวินาที ขั้นที่ 3 โปรแกรมไฟนอล เอ็กเท็นชั่น (Final extension) ใช้อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส นาน 4 นาที ขั้นที่ 4 โปรแกรมคูลลิง (Cooling) ลดอุณหภูมิลงถึง 4 องศาเซลเซียส (ไม่จำกัดเวลา) ------------ ------28/12/2560------(OCR) หน้า 1 ของจำนวน 2 หน้า ข้อถือสิทธิ
1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาลซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ประกอบด้วย คู่ไพรเมอร์ (primer) ที่ใช้เพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรามาลาลซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) มีลำดับเบสดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- cgt aca ata agt gtg tct ctg gcg -3’ รีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) มีลำดับเบสเป็น 5’- gtt teg ctg cgt tct tea teg -3’
2. ชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกสโบซา (Malassezia globosa) ที่ซึ่งใช้ประกอบ ร่วมกับไพรเมอร์ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ชุดนายาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาลซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ประกอบด้วย น้ำยาสิบเอ็กพีซีอาร์ บัฟเฟอร์ (10XPCR buffer) ประกอบด้วย 50 มิลลิโมลาร์ โพแทสเซียมคลอ ไรด์ (millimolar Potassium chloride; mM KCI), 10 มิลลิโมลาร์ ทริสไฮโดรคลอไรด์ (millimolar Tris- Hydrochloride; mM Tris-HCI pH 8.3) และ 1-1.5 มิลลิโมลาร์ แมกนีเซียมคลอไรด์ (millimolar Magnesium chloride; mM MgCI2) น้ำยาดีเอ็นทีพี มิกซ์ (dNTPs mix) ประกอบด้วย ดีเอ็นทีพี มิกซ์ (dNTPs mix) 4 ชนิด คือ ดีเอทีพี (dATP), ดีซีทีพี(dCTP), ดีจีทีพี(dGTP) และดีทีทีพี(dTTP) ความเข้มข้น 10 มิลลิโมลาร์ น้ำยาแมกนีเซียมคลอไรด์ (MgCI2) ความเข้มข้น 50 มิลลิโมลาร์ น้ำยาแท็ก ดีเอ็นเอ โพลีเมอร์เรส (Taq DNA polymerase) ความเข้มข้น 5 ยูนิต ต่อไมโครลิตร น้ำกลั่นบริสุทธิ์ปราศจากอิออน (deionized distilled water) ที่มีความบริสุทธิ์ระดับพีซีอาร์ (PCR grad)
3. ไพรเมอร์และชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ตาม ข้อถือสิทธิที่ 1 หรือ 2 ที่ซึ่ง คู่ไพรเมอร์ (primer) ที่ใช้เพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรามาลาสซี เซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) มีปริมาณส่วนประกอบของน้ำยาทดสอบ (Master mix) ที่เหมาะสม ที่สุด สำหรับการทดสอบใน 1 ปฏิกิริยา คือ ไพรเมอร์ (primer) สำหรับเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรา มาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) 1 คู่ ประกอบด้วยฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) และรีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) ที่มีความเข้มข้น 10 ไมโครโมลาร์ ปริมาตรอย่างละ 0.6 ไมโครลิตร พีซีอาร์รีแอกชั่น มิกซ์ (PCR reaction mix) ประกอบด้วยพีซีอาร์บัฟเฟอร์ (PCR buffer) ความ เข้มข้น 10X ปริมาตร 3 ไมโครลิตร, ดีเอ็นทีพี (dNTPs) ทั้ง 4 ชนิด ได้แก่ dATP, dCTP, dGTP และ dTTP ที่ มีความเข้มข้น 10 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 0.6 ไมโครลิตร, สารละลายแมกนีเซียมคลอไรด์ (Magnesium หน้า 2 ของจำนวน 2 หน้า chloride; MgCI2) ที่มีความเข้มข้น 50 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 0.6 ไมโครลิตร และเอนไซม์ (enzyme) แท็กดี เอ็นเอโพลิเมอเรส (Taq DNA polymerase) ความเข้มข้น 5 ยูนิต (unit) ต่อ ไมโครลิตร ปริมาตร 0.2 ไมโครลิตร สารพันธุกรรมที่สกัดได้จากตัวอย่างความเข้มข้น 1-50 นาโนกรัม ปรับด้วยน้ำกลั่นบริสุทธิ์ปราศจากอิออน (deionized distilled water) ที่มีความบริสุทธิ์ระดับพีซี อาร์ (PCR grad) ให้ได้ปริมาตรสุดท้ายเป็น 30 ไมโครลิตร
4. ไพรเมอร์และชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ตาม ข้อถือสิทธิที่ 1 -3 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอ เรส หรือ เทคนิคพีซีอาร์ (PCR) โดยใช้เครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler หรือ PCR machine) มี เงื่อนไขของโปรแกรมอุณหภูมิเพื่อเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ตามขั้นตอนดังนี้ ขั้นที่ 1 โปรแกรมพรี-ดีเนเจอร์ (Pre-denature) ใช้อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 3 นาที ขั้นที่ 2 โปรแกรมแอมพลิฟิเคชั่น (Amplification) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนดีแนทเจอ เรชั่น (Denaturation) ที่อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 45 วินาที ขั้นตอนแอนเนียลลิง (Annealing) ที่ อุณหภูมิ 62 องศาเซลเซียส นาน 30 วินาที และขั้นตอนเอ็กเท็นชั่น (Extension) ที่อุณหภูมิ 72 องศา เซลเซียส นาน30 วินาที ทำซ้ำทั้งหมด 30 รอบ (cycles) โดยอัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ (temperature transition rate) ของเครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler) เป็น 5 องศาเซลเซียสต่อวินาที ขั้นที่ 3 โปรแกรมไฟนอล เอ็กเท็นชั่น (Final extension) ใช้อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส นาน 4 นาที ขั้นที่ 4 โปรแกรมคูลลิง (Cooling) ลดอุณหภูมิลงถึง 4 องศาเซลเซียส (ไม่จำกัดเวลา) ------------
1. ไพรเมอร์เเละชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ประกอบด้วย คู่ไพรเมอร์ (primer) ที่ใช้เพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) มีลำดับเบสดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) มีลำดับเบสเป็น 5' - cgt aca ata agt gtg tct ctg gcg -3' รีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) มีลำดับเบสเป็น 5' - gtt tcg ctg cgt tct tca tcg -3'
2. ไพรเมอร์เเละชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ตาม ข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง สามารถประกอบเพิ่มเติมด้วย ชุดน้ำยาสำหรับการทำปฏิกิริยาเพื่อการตรวจวินิจฉัยเชื้อ รามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ซึ่งประกอบด้วย น้ำยาสิบเอ็กพีซีอาร์ บัฟเฟอร์ (10XPCR buffer) ประกอบด้วย 50 มิลลิโมลาร์ โพเเทสเซียมคลอ ไรด์ (millimolar Potassium chloride; mM KCI), 10 มิลลิโมลาร์ ทริสไฮโดรคลอไรด์ (millimolar Tris- Hydrochloride; mM Tris-HCI pH 8.3) และ 1-1.5 มิลลิโมลาร์ แมกนีเซียมคลอไรด์ (millimolar Magnesium chloride; mM MgCI2) น้ำยาดีเอ็นทีพี มิกซ์ (dNTPs mix) ประกอบด้วย ดีเอ็นทีพี มิกซ์ (dNTPs mix) 4 ชนิด คือ ดีเอทีพี (dATP), ดีซีทีพี(dCTP), ดีจีทีพี(dGTP) และ ดีทีทีพี(dTTP) ความเข้มข้น 10 มิลลิโมลาร์ น้ำยาแม็กนีเซียมคลอไรด์ (MgCl2) ความเข้มข้น 50 มิลลิโมลาร์ น้ำยาแท็ก ดีเอ็นเอ โพลีเมอร์เรส (Taq DNA polymerase) ความเข้มข้น 5 ยูนิต ต่อไมโครลิตร น้ำกลั่นบริสุทธิ์ปราศจากอิออน (deionized distilled water) ที่มีความบริสุทธิ์ระดับพีซีอาร์ (PCR grad)
3. ไพรเมอร์เเละชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ตาม ข้อถือสิทธิที่ 1 หรือ 2 ที่ซึ่ง คู่ไพรเมอร์ (primer) ที่ใช้เพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรามาลาสซี เซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) มีปริมาณส่วนประกอบของน้ำยาทดสอบ (Master mix) ที่เหมาะสม ที่สุด สำหรับการทดสอบใน 1 ปฏิกิริยา คือ ไพรเมอร์ (primer) สำหรับเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ของเชื้อรา มาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) 1 คู่ ประกอบด้วยฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) และรีเวอร์สไพรเมอร์ (reverse primer) ที่มีความเข้มข้ม 10 ไมโครโมลาร์ ปริมาตรอย่างละ 0.6 ไมโครลิตร พีซีอาร์เเอกชั่น มิกซ์ (PCR reaction mix) ประกอบด้วยพีซีอาร์บัฟเฟอร์ (PCR buffer) ความ เข้มข้น 10X ปริมาตร 3 ไมโครลิตร, ดีเอ็นทีพี (dNTPs) ทั้ง 4 ชนิด ได้เเก่ dATP. dCTP, dGTP เเละ dTTP ที่ มีความเข้มข้น 10 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 0.6 ไมโครลิตร, สารละลายเเมกนีเซียมคลอไรด์ (Magnesium chloride; MgCl2) ที่มีความเข้มข้น 50 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 0.6 ไมโครลิตร เเละเอนไซม์ (enzyme) เเท็กดี เอ็นเอโพลิเมอเรส (Taq DNA polymerase) ความเข้มข้น 5 unit ต่อ ไมโครลิตร ปริมาตร 0.2 ไมโครลิตร สารพันธุกรรมที่สกัดได้จากตัวอย่างความเข้มข้น 1-50 นาโนกรัม ปรับด้วยน้ำกลั่นบริสุทธิ์ปราศจากอิออน (deionized distilled water) ที่มีความบริสุทธิ์ระดับพีซี อาร์ (PCR grad) ให้ได้ปริมาตรสุดท้ายเป็น 30 ไมโครลิตร
4. ไพรเมอร์เเละชุดน้ำยาสำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) ตาม ข้อถือสิทธิที่ 1-3 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอ เรส หรือ เทคนิคพีซีอาร์ (PCR) โดยใช้เครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler หรือ PCR machine) มี เงื่อนไขของโปรเเกรมอุณหภูมิเพื่อเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม (DNA) ตามขั้นตอนดังนี้ ขั้นที่ 1 โปรเเกรมพรี-ดีเจอร์ (Pre-denature) ใช้อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 3 นาที ชั้นที่ 2 โปรเเกรมเเอมพลิฟิเคชั่น (Amplification) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนดีเเนทเจอ เรชั่น (Denaturation) ที่อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส นาน 45 วินาที ขั้นตอนเเอนเนียลลิง (Annealing) ที่ อุณหภูมิ 62 องศาเซลเซียส นาน 30 วินาที เเละขั้นตอนเอ็กเท็นชั่น (Extension) ที่อุณหภูมิ 72 องศา เซลเซียส นาน 30 วินาที ทำซ้ำทั้งหมด 30 รอบ (cycles) โดยอัตราการเปลี่ยนเเปลงอุณหภูมิ (temperature transition rate) ของเครื่องเทอร์มอลไซเคลอร์ (Thermal cycler) เป็น 5 องศาเซลเซียสต่อวินาที ขั้นที่ 3 โปรเเกรมไฟนอล เอ็กเท็นชั่น (Final extension) ใช้อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส นาน 4 นาที ขั้นที่ 4 โปรเเกรมคูลลิง (Cooling) ลดอุณหภูมิลงถึง 4 องศาเซลเซียส (ไม่จำกัดเวลา)
TH1603001010U 2015-07-28 ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa) TH14896Y (th)

Publications (4)

Publication Number Publication Date
TH14896U true TH14896U (th) 2019-01-14
TH14896A3 TH14896A3 (th) 2019-01-14
TH14896C3 TH14896C3 (th) 2019-01-14
TH14896Y TH14896Y (th) 2019-01-14

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Özay et al. A review of reaction enhancement strategies for isothermal nucleic acid amplification reactions
Kim et al. ChIP–quantitative polymerase chain reaction (ChIP-qPCR)
WO2005089508A3 (en) Dna sequence detection by limited primer extension
NZ748011A (en) Multiplex nucleic acid assay methods capable of detecting closely related alleles, and reagents therefor
WO2007127992A3 (en) Use of base-modified deoxynucleoside triphosphates
WO2014004852A3 (en) Kit for isothermal dna amplification starting from an rna template
JP2014502496A5 (th)
WO2015148218A3 (en) Isothermal amplification under low salt condition
MX2016014292A (es) Composiciones y metodos para detectar la enfermedad del dragon amarillo (huanglongbing).
EP3087200B1 (en) Kits and methods for multiplex analysis of 13 mr y-strs
US20220025451A1 (en) Kit for determining nucleic acid degradation
US20160153029A1 (en) Dna sequences to assess contamination in dna sequencing
MY174088A (en) A method of detecting porcine markers for identifying pork content in a sample
GB2590210A (en) Compositions and methods for detecting group B Streptococcus nucleic acid
TH14896Y (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย โกลโบซา (Malassezia globosa)
JP2014083052A5 (th)
MX2019011503A (es) Composiciones de cebador y métodos multiplex para detectar la presencia de listeria.
TH14897Y (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย เรสทริกต้า (Malassezia restricta)
TH14897U (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย เรสทริกต้า (Malassezia restricta)
TH14900U (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย ซิมโพเดียลิส (Malassezia sympodialis)
TH14900Y (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย ซิมโพเดียลิส (Malassezia sympodialis)
TH14899Y (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย เฟอร์เฟอร์ (Malassezia furfur)
TH14899U (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย เฟอร์เฟอร์ (Malassezia furfur)
TH14895U (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย สล็อฟฟิอี้ (Malassezia slooffiae)
TH14895Y (th) ไพรเมอร์สำหรับตรวจเชื้อรามาลาสซีเซีย สล็อฟฟิอี้ (Malassezia slooffiae)