SA519401668B1 - نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُخفّض - Google Patents
نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُخفّض Download PDFInfo
- Publication number
- SA519401668B1 SA519401668B1 SA519401668A SA519401668A SA519401668B1 SA 519401668 B1 SA519401668 B1 SA 519401668B1 SA 519401668 A SA519401668 A SA 519401668A SA 519401668 A SA519401668 A SA 519401668A SA 519401668 B1 SA519401668 B1 SA 519401668B1
- Authority
- SA
- Saudi Arabia
- Prior art keywords
- organism
- sequence
- gene
- mutant
- chlorophyte
- Prior art date
Links
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 title claims abstract description 134
- 230000000243 photosynthetic effect Effects 0.000 title claims abstract description 87
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 78
- ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M chlorophyll a Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M 0.000 claims abstract description 72
- 229930002875 chlorophyll Natural products 0.000 claims abstract description 68
- 235000019804 chlorophyll Nutrition 0.000 claims abstract description 68
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 59
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 claims abstract description 52
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 554
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 199
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 194
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 189
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 189
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 129
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 128
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 88
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 87
- 241001036353 Parachlorella Species 0.000 claims description 86
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 79
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 78
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 65
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 63
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 62
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 62
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 56
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 54
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 47
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 44
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 35
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 35
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 31
- 101710192640 Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase Proteins 0.000 claims description 25
- 101710153769 Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase, chloroplastic Proteins 0.000 claims description 25
- 239000013068 control sample Substances 0.000 claims description 22
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 21
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 16
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims description 16
- 108010003581 Ribulose-bisphosphate carboxylase Proteins 0.000 claims description 13
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims description 13
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 11
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims description 11
- 208000016444 Benign adult familial myoclonic epilepsy Diseases 0.000 claims description 10
- NSMUHPMZFPKNMZ-VBYMZDBQSA-M chlorophyll b Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C=O)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 NSMUHPMZFPKNMZ-VBYMZDBQSA-M 0.000 claims description 10
- 208000016427 familial adult myoclonic epilepsy Diseases 0.000 claims description 10
- 235000019387 fatty acid methyl ester Nutrition 0.000 claims description 10
- 229930002869 chlorophyll b Natural products 0.000 claims description 9
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 9
- ZGNITFSDLCMLGI-UHFFFAOYSA-N flubendiamide Chemical compound CC1=CC(C(F)(C(F)(F)F)C(F)(F)F)=CC=C1NC(=O)C1=CC=CC(I)=C1C(=O)NC(C)(C)CS(C)(=O)=O ZGNITFSDLCMLGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 claims description 8
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims description 8
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims description 8
- 229930002868 chlorophyll a Natural products 0.000 claims description 7
- 239000000049 pigment Substances 0.000 claims description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 7
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 claims description 6
- 230000006698 induction Effects 0.000 claims description 6
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 6
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 claims description 6
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 claims description 6
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 claims description 6
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 claims description 6
- 241000195649 Chlorella <Chlorellales> Species 0.000 claims description 5
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims description 5
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 5
- 150000003505 terpenes Chemical class 0.000 claims description 5
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 claims description 4
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims description 4
- ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N D-threo-2-Pentulose Natural products OCC(O)C(O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 241000513961 Tetrachlorella Species 0.000 claims description 4
- 239000008272 agar Substances 0.000 claims description 4
- 230000002950 deficient Effects 0.000 claims description 4
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 claims description 4
- 239000005556 hormone Substances 0.000 claims description 4
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 claims description 4
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims description 4
- 229930001119 polyketide Natural products 0.000 claims description 4
- 125000000830 polyketide group Chemical group 0.000 claims description 4
- 101150073128 56 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 241000894422 Pseudochlorella Species 0.000 claims description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 3
- 241001293481 Trebouxiophyceae Species 0.000 claims description 2
- 238000000429 assembly Methods 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 claims 2
- PEYUIKBAABKQKQ-AFHBHXEDSA-N (+)-sesamin Chemical compound C1=C2OCOC2=CC([C@H]2OC[C@H]3[C@@H]2CO[C@@H]3C2=CC=C3OCOC3=C2)=C1 PEYUIKBAABKQKQ-AFHBHXEDSA-N 0.000 claims 1
- 101150011812 AADAC gene Proteins 0.000 claims 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N Acrylic acid Chemical compound OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000252073 Anguilliformes Species 0.000 claims 1
- 241000726103 Atta Species 0.000 claims 1
- 241000270299 Boa Species 0.000 claims 1
- 101100518633 Caenorhabditis elegans dpy-18 gene Proteins 0.000 claims 1
- 241000511343 Chondrostoma nasus Species 0.000 claims 1
- 235000017274 Diospyros sandwicensis Nutrition 0.000 claims 1
- 241000282838 Lama Species 0.000 claims 1
- 229940110339 Long-acting muscarinic antagonist Drugs 0.000 claims 1
- 101100119135 Mus musculus Esrrb gene Proteins 0.000 claims 1
- 240000007643 Phytolacca americana Species 0.000 claims 1
- 206010036590 Premature baby Diseases 0.000 claims 1
- 240000005499 Sasa Species 0.000 claims 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 claims 1
- 210000003423 ankle Anatomy 0.000 claims 1
- 208000008784 apnea Diseases 0.000 claims 1
- 230000000712 assembly Effects 0.000 claims 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 claims 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 claims 1
- 238000005430 electron energy loss spectroscopy Methods 0.000 claims 1
- PEYUIKBAABKQKQ-UHFFFAOYSA-N epiasarinin Natural products C1=C2OCOC2=CC(C2OCC3C2COC3C2=CC=C3OCOC3=C2)=C1 PEYUIKBAABKQKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 claims 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 claims 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims 1
- RONZAEMNMFQXRA-UHFFFAOYSA-N mirtazapine Chemical compound C1C2=CC=CN=C2N2CCN(C)CC2C2=CC=CC=C21 RONZAEMNMFQXRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N nifedipine Chemical compound COC(=O)C1=C(C)NC(C)=C(C(=O)OC)C1C1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- VIKNJXKGJWUCNN-XGXHKTLJSA-N norethisterone Chemical compound O=C1CC[C@@H]2[C@H]3CC[C@](C)([C@](CC4)(O)C#C)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 VIKNJXKGJWUCNN-XGXHKTLJSA-N 0.000 claims 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 claims 1
- 229940023942 remeron Drugs 0.000 claims 1
- 230000033764 rhythmic process Effects 0.000 claims 1
- 150000003292 ribulose derivatives Chemical class 0.000 claims 1
- VRMHCMWQHAXTOR-CMOCDZPBSA-N sesamin Natural products C1=C2OCOC2=CC([C@@H]2OC[C@@]3(C)[C@H](C=4C=C5OCOC5=CC=4)OC[C@]32C)=C1 VRMHCMWQHAXTOR-CMOCDZPBSA-N 0.000 claims 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 claims 1
- 235000012976 tarts Nutrition 0.000 claims 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 claims 1
- 239000011800 void material Substances 0.000 claims 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 abstract description 121
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 6
- 101100204457 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) SVF1 gene Proteins 0.000 abstract 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 343
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 189
- 239000000047 product Substances 0.000 description 156
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 130
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 116
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 115
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 96
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 61
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 53
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 53
- 230000004044 response Effects 0.000 description 52
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 51
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 41
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 40
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 39
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 39
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 38
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 38
- 241000196321 Tetraselmis Species 0.000 description 34
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 32
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 32
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 30
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 30
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 29
- 102000016538 Myb domains Human genes 0.000 description 27
- 108050006056 Myb domains Proteins 0.000 description 27
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 27
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 26
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 26
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 25
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 25
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 25
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 25
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 25
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 21
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 21
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 20
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 20
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 19
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 19
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 18
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 18
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 17
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 16
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 15
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 15
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 15
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 15
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 14
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 14
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 14
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 14
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 14
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 14
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 14
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 13
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 13
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 13
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 13
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 13
- 230000029553 photosynthesis Effects 0.000 description 13
- 238000010672 photosynthesis Methods 0.000 description 13
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 13
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 13
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 12
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 12
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 11
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 11
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 11
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 10
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 10
- 230000008859 change Effects 0.000 description 10
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 10
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 10
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 10
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 10
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 10
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 10
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 10
- 241000514008 Oocystis Species 0.000 description 9
- 108010067035 Pancrelipase Proteins 0.000 description 9
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 9
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 9
- 229940092125 creon Drugs 0.000 description 9
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 9
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 9
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 241000134884 Ericales Species 0.000 description 8
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 8
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 8
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 8
- -1 alkane compounds Chemical class 0.000 description 8
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 8
- 230000004992 fission Effects 0.000 description 8
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 8
- 230000027756 respiratory electron transport chain Effects 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 7
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 7
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 7
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 7
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 7
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 7
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 7
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 7
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 7
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 7
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 7
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 6
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 6
- 102100029648 Beta-arrestin-2 Human genes 0.000 description 6
- 241000195585 Chlamydomonas Species 0.000 description 6
- 241000195597 Chlamydomonas reinhardtii Species 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 6
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 6
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101000728661 Homo sapiens Beta-arrestin-2 Proteins 0.000 description 6
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 6
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 6
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010060806 Photosystem II Protein Complex Proteins 0.000 description 6
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000220221 Rosales Species 0.000 description 6
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 6
- 102000003978 Tissue Plasminogen Activator Human genes 0.000 description 6
- 108090000373 Tissue Plasminogen Activator Proteins 0.000 description 6
- 229940099983 activase Drugs 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 235000021186 dishes Nutrition 0.000 description 6
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 6
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 6
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 6
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 6
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 6
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 6
- 230000008569 process Effects 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- VWDWKYIASSYTQR-UHFFFAOYSA-N sodium nitrate Chemical compound [Na+].[O-][N+]([O-])=O VWDWKYIASSYTQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 6
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 6
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 6
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 6
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 6
- VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N Ala-Gly-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- LIVXPXUVXFRWNY-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O LIVXPXUVXFRWNY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- 101710082751 Carboxypeptidase S1 homolog A Proteins 0.000 description 5
- 241000195628 Chlorophyta Species 0.000 description 5
- 241001046556 Coccomyxa subellipsoidea Species 0.000 description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 5
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 5
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 5
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 5
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 5
- 241000378279 Parvimonas sp. Species 0.000 description 5
- 241001536628 Poales Species 0.000 description 5
- FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- 241000195615 Volvox Species 0.000 description 5
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 5
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 5
- 230000003190 augmentative effect Effects 0.000 description 5
- 230000001651 autotrophic effect Effects 0.000 description 5
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 5
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 5
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 5
- 238000002290 gas chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 description 5
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 5
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 5
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 5
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 5
- 235000021251 pulses Nutrition 0.000 description 5
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 5
- 235000002020 sage Nutrition 0.000 description 5
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 102100034088 40S ribosomal protein S4, X isoform Human genes 0.000 description 4
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N Ala-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 241000756998 Alismatales Species 0.000 description 4
- 241000219504 Caryophyllales Species 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000195634 Dunaliella Species 0.000 description 4
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 4
- 241000219427 Fagales Species 0.000 description 4
- YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N His-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 4
- DRKZDEFADVYTLU-AVGNSLFASA-N His-Val-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DRKZDEFADVYTLU-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- 101000732165 Homo sapiens 40S ribosomal protein S4, X isoform Proteins 0.000 description 4
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- 241000219171 Malpighiales Species 0.000 description 4
- XOFDBXYPKZUAAM-GUBZILKMSA-N Met-Met-Ser Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N XOFDBXYPKZUAAM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- WYDFQSJOARJAMM-GUBZILKMSA-N Met-Pro-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WYDFQSJOARJAMM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 4
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 4
- IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N N-Heptane Chemical compound CCCCCCC IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 4
- 241000224474 Nannochloropsis Species 0.000 description 4
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 4
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 4
- 241001221669 Ostreococcus Species 0.000 description 4
- 241000987906 Ostreococcus 'lucimarinus' Species 0.000 description 4
- 241000123637 Pandanales Species 0.000 description 4
- SBVPYBFMIGDIDX-SRVKXCTJSA-N Pro-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1N(C(=O)[C@H]2NCCC2)CCC1 SBVPYBFMIGDIDX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- 102000007327 Protamines Human genes 0.000 description 4
- 108010007568 Protamines Proteins 0.000 description 4
- VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N Ser-Asn-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 4
- 235000002560 Solanum lycopersicum Nutrition 0.000 description 4
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 4
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 4
- 108091028113 Trans-activating crRNA Proteins 0.000 description 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N Val-Leu-Ser Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- BGXVHVMJZCSOCA-AVGNSLFASA-N Val-Pro-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BGXVHVMJZCSOCA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 4
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 4
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 4
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 4
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 4
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 4
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 4
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 4
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 4
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 4
- 231100000707 mutagenic chemical Toxicity 0.000 description 4
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 4
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 4
- 108700042769 prolyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 229940048914 protamine Drugs 0.000 description 4
- 238000011218 seed culture Methods 0.000 description 4
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 4
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 4
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 4
- 230000000946 synaptic effect Effects 0.000 description 4
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 4
- IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N valinyl-arginine Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 3
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- 241001610441 Arabidopsis halleri Species 0.000 description 3
- 241000610258 Arabidopsis lyrata Species 0.000 description 3
- JGLWFWXGOINXEA-YDHLFZDLSA-N Asp-Val-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 JGLWFWXGOINXEA-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000007575 Calluna vulgaris Nutrition 0.000 description 3
- 240000006162 Chenopodium quinoa Species 0.000 description 3
- 235000015493 Chenopodium quinoa Nutrition 0.000 description 3
- 241000508318 Chlorogonium Species 0.000 description 3
- 241000688489 Chromochloris Species 0.000 description 3
- 241001442241 Chromochloris zofingiensis Species 0.000 description 3
- 241000134090 Coccomyxa <Trebouxiophyceae> Species 0.000 description 3
- 241001147476 Cyclotella Species 0.000 description 3
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N D-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 3
- ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N D-ribulose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 3
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N Gly-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N Gly-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N 0.000 description 3
- IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 3
- YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N Gly-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N 0.000 description 3
- AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N Gly-Val-Thr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N 0.000 description 3
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 3
- 235000009432 Gossypium hirsutum Nutrition 0.000 description 3
- 244000299507 Gossypium hirsutum Species 0.000 description 3
- 241000168525 Haematococcus Species 0.000 description 3
- STOOMQFEJUVAKR-KKUMJFAQSA-N His-His-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CNC=N1 STOOMQFEJUVAKR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- XJFITURPHAKKAI-SRVKXCTJSA-N His-Pro-Gln Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)C1=CN=CN1 XJFITURPHAKKAI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- 206010021033 Hypomenorrhoea Diseases 0.000 description 3
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010044467 Isoenzymes Proteins 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- 241000207832 Lamiales Species 0.000 description 3
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 3
- QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N Leu-Pro-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- 241000220225 Malus Species 0.000 description 3
- ACYHZNZHIZWLQF-BQBZGAKWSA-N Met-Asn-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O ACYHZNZHIZWLQF-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- OHMKUHXCDSCOMT-QXEWZRGKSA-N Met-Asn-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OHMKUHXCDSCOMT-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 3
- FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N Met-Asp-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N Met-Gly-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N 0.000 description 3
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 3
- 241000180113 Monodus Species 0.000 description 3
- 241000502321 Navicula Species 0.000 description 3
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 3
- 241000206731 Phaeodactylum Species 0.000 description 3
- 241000218657 Picea Species 0.000 description 3
- 241001060422 Picochlorum Species 0.000 description 3
- DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- 240000000528 Ricinus communis Species 0.000 description 3
- 235000004443 Ricinus communis Nutrition 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000519559 Sphagnum fallax Species 0.000 description 3
- 244000299461 Theobroma cacao Species 0.000 description 3
- 235000009470 Theobroma cacao Nutrition 0.000 description 3
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 3
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 3
- MHAHQDBEIDPFQS-NHCYSSNCSA-N Val-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C MHAHQDBEIDPFQS-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- SVLAAUGFIHSJPK-JYJNAYRXSA-N Val-Trp-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N SVLAAUGFIHSJPK-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N Val-Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 3
- 235000014787 Vitis vinifera Nutrition 0.000 description 3
- 240000006365 Vitis vinifera Species 0.000 description 3
- 241000195614 Volvox carteri Species 0.000 description 3
- 239000004164 Wax ester Substances 0.000 description 3
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 description 3
- 108010024078 alanyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 3
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 3
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 3
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 3
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 3
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 238000007821 culture assay Methods 0.000 description 3
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 230000011559 double-strand break repair via nonhomologous end joining Effects 0.000 description 3
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 3
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010082286 glycyl-seryl-alanine Proteins 0.000 description 3
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 3
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 3
- 235000002532 grape seed extract Nutrition 0.000 description 3
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 3
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 3
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 3
- IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N hydrogen chloride Substances Cl.Cl IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910000041 hydrogen chloride Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 3
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 3
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 108010063431 methionyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 3
- 235000019799 monosodium phosphate Nutrition 0.000 description 3
- 230000030648 nucleus localization Effects 0.000 description 3
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 108010020755 prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 3
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 3
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 3
- AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M sodium dihydrogen phosphate Chemical compound [Na+].OP(O)([O-])=O AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 235000010344 sodium nitrate Nutrition 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 3
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 3
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 3
- 108010003885 valyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 235000019386 wax ester Nutrition 0.000 description 3
- BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N (2s)-1-[2-[[(2s)-pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1 BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N Ala-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XUCHENWTTBFODJ-FXQIFTODSA-N Ala-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XUCHENWTTBFODJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- NCQMBSJGJMYKCK-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NCQMBSJGJMYKCK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- KUFVXLQLDHJVOG-SHGPDSBTSA-N Ala-Thr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O KUFVXLQLDHJVOG-SHGPDSBTSA-N 0.000 description 2
- REWSWYIDQIELBE-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O REWSWYIDQIELBE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- 241001136792 Alle Species 0.000 description 2
- 241000722956 Amborella trichopoda Species 0.000 description 2
- 241000196169 Ankistrodesmus Species 0.000 description 2
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 2
- 241000186692 Araucariales Species 0.000 description 2
- 241000123640 Arecales Species 0.000 description 2
- SQKPKIJVWHAWNF-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Lys Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O SQKPKIJVWHAWNF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N Arg-Asp-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)CN=C(N)N HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- CBWCQCANJSGUOH-ZKWXMUAHSA-N Asn-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CBWCQCANJSGUOH-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N Asp-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LKIYSIYBKYLKPU-BIIVOSGPSA-N Asp-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O LKIYSIYBKYLKPU-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 2
- QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 241000208837 Asterales Species 0.000 description 2
- 241000196313 Asteromonas Species 0.000 description 2
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 2
- 108010006654 Bleomycin Proteins 0.000 description 2
- 241000180102 Botrydium Species 0.000 description 2
- 241001536324 Botryococcus Species 0.000 description 2
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 2
- 240000008100 Brassica rapa Species 0.000 description 2
- 235000011292 Brassica rapa Nutrition 0.000 description 2
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 2
- 241000218980 Brassicales Species 0.000 description 2
- 241000195940 Bryophyta Species 0.000 description 2
- 238000010356 CRISPR-Cas9 genome editing Methods 0.000 description 2
- 241000218459 Carteria Species 0.000 description 2
- 241000632385 Celastrales Species 0.000 description 2
- 241000227752 Chaetoceros Species 0.000 description 2
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000180279 Chlorococcum Species 0.000 description 2
- 241000818164 Chlorodendrophyceae Species 0.000 description 2
- 235000007516 Chrysanthemum Nutrition 0.000 description 2
- 244000189548 Chrysanthemum x morifolium Species 0.000 description 2
- 241000391097 Chrysosphaera Species 0.000 description 2
- 241000218631 Coniferophyta Species 0.000 description 2
- 241000134970 Cornales Species 0.000 description 2
- 241001245609 Cricosphaera Species 0.000 description 2
- 241000186690 Cupressales Species 0.000 description 2
- 108010052832 Cytochromes Proteins 0.000 description 2
- 102000018832 Cytochromes Human genes 0.000 description 2
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 2
- 235000002767 Daucus carota Nutrition 0.000 description 2
- 244000000626 Daucus carota Species 0.000 description 2
- 241000305506 Desmodesmus Species 0.000 description 2
- 241000618813 Dilleniales Species 0.000 description 2
- 101100234002 Drosophila melanogaster Shal gene Proteins 0.000 description 2
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 241000354295 Eremosphaera Species 0.000 description 2
- 241000224472 Eustigmatophyceae Species 0.000 description 2
- 241000179230 Eustigmatos Species 0.000 description 2
- 241001247262 Fabales Species 0.000 description 2
- 240000009088 Fragaria x ananassa Species 0.000 description 2
- 241001466505 Fragilaria Species 0.000 description 2
- 241000923853 Franceia Species 0.000 description 2
- 241000208326 Gentianales Species 0.000 description 2
- 241000134874 Geraniales Species 0.000 description 2
- GFLNKSQHOBOMNM-AVGNSLFASA-N Gln-His-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N GFLNKSQHOBOMNM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- YSDLIYZLOTZZNP-UWVGGRQHSA-N Gly-Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN YSDLIYZLOTZZNP-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- JQFILXICXLDTRR-FBCQKBJTSA-N Gly-Thr-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCC(O)=O JQFILXICXLDTRR-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000218664 Gnetales Species 0.000 description 2
- 241001105006 Hantzschia Species 0.000 description 2
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 2
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000206758 Heterosigma Species 0.000 description 2
- XIGFLVCAVQQGNS-IHRRRGAJSA-N His-Pro-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XIGFLVCAVQQGNS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 2
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 2
- 241001037825 Hymenomonas Species 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 2
- 244000017020 Ipomoea batatas Species 0.000 description 2
- 235000002678 Ipomoea batatas Nutrition 0.000 description 2
- NHTMVDHEPJAVLT-UHFFFAOYSA-N Isooctane Chemical compound CC(C)CC(C)(C)C NHTMVDHEPJAVLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- 241000218194 Laurales Species 0.000 description 2
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N Leu-Ala-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- FZMNAYBEFGZEIF-AVGNSLFASA-N Leu-Met-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N FZMNAYBEFGZEIF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N Leu-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- 241000234269 Liliales Species 0.000 description 2
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 2
- RVOMPSJXSRPFJT-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RVOMPSJXSRPFJT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- SJNZALDHDUYDBU-IHRRRGAJSA-N Lys-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O SJNZALDHDUYDBU-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- NTSPQIONFJUMJV-AVGNSLFASA-N Lys-Arg-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NTSPQIONFJUMJV-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- ZVZRQKJOQQAFCF-ULQDDVLXSA-N Lys-Tyr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZVZRQKJOQQAFCF-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 241000218922 Magnoliophyta Species 0.000 description 2
- 244000081841 Malus domestica Species 0.000 description 2
- 235000011430 Malus pumila Nutrition 0.000 description 2
- 241000134966 Malvales Species 0.000 description 2
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 2
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 2
- KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N Met-Leu-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- LXCSZPUQKMTXNW-BQBZGAKWSA-N Met-Ser-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O LXCSZPUQKMTXNW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 241001478792 Monoraphidium Species 0.000 description 2
- 241000134886 Myrtales Species 0.000 description 2
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000196305 Nannochloris Species 0.000 description 2
- 241000195644 Neochloris Species 0.000 description 2
- 241001442227 Nephroselmis Species 0.000 description 2
- 241000180701 Nitzschia <flatworm> Species 0.000 description 2
- 241000039470 Nymphaeales Species 0.000 description 2
- 241000199478 Ochromonas Species 0.000 description 2
- 241000546131 Oedogonium Species 0.000 description 2
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 2
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 2
- 241000196159 Parietochloris Species 0.000 description 2
- 241000206766 Pavlova Species 0.000 description 2
- 240000007377 Petunia x hybrida Species 0.000 description 2
- RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N Phe-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000195887 Physcomitrella patens Species 0.000 description 2
- 108700001094 Plant Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000196317 Platymonas Species 0.000 description 2
- 241000722208 Pleurochrysis Species 0.000 description 2
- 241000996896 Pleurococcus Species 0.000 description 2
- 241000500034 Podostemaceae Species 0.000 description 2
- ORPZXBQTEHINPB-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O ORPZXBQTEHINPB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- CLNJSLSHKJECME-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 CLNJSLSHKJECME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- FXGIMYRVJJEIIM-UWVGGRQHSA-N Pro-Leu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FXGIMYRVJJEIIM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 241000617410 Proteales Species 0.000 description 2
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 2
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 2
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 2
- 241000196250 Prototheca Species 0.000 description 2
- 241000180717 Pseudoneochloris Species 0.000 description 2
- 241001509341 Pyramimonas Species 0.000 description 2
- 241000195604 Pyrobotrys Species 0.000 description 2
- 241000220324 Pyrus Species 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000220317 Rosa Species 0.000 description 2
- 241000208437 Sarraceniaceae Species 0.000 description 2
- 241000195663 Scenedesmus Species 0.000 description 2
- 241000680878 Schizochlamydella Species 0.000 description 2
- BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N Ser-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N Ser-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- CRJZZXMAADSBBQ-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO CRJZZXMAADSBBQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 235000015076 Shorea robusta Nutrition 0.000 description 2
- 244000166071 Shorea robusta Species 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 244000062793 Sorghum vulgare Species 0.000 description 2
- 235000009337 Spinacia oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 244000300264 Spinacia oleracea Species 0.000 description 2
- 241001148696 Stichococcus Species 0.000 description 2
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 2
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001491691 Thalassiosira Species 0.000 description 2
- JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N Thiamine Natural products CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BSNZTJXVDOINSR-JXUBOQSCSA-N Thr-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BSNZTJXVDOINSR-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 2
- UKBSDLHIKIXJKH-HJGDQZAQSA-N Thr-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UKBSDLHIKIXJKH-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 2
- 241000199474 Tribonema Species 0.000 description 2
- 208000026487 Triploidy Diseases 0.000 description 2
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 2
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 2
- 241000569574 Trochodendrales Species 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N Val-Gly-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- URIRWLJVWHYLET-ONGXEEELSA-N Val-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)C(C)C URIRWLJVWHYLET-ONGXEEELSA-N 0.000 description 2
- GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N Val-Ser-Pro Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WHNSHJJNWNSTSU-BZSNNMDCSA-N Val-Val-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WHNSHJJNWNSTSU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- 241001411205 Viridiella Species 0.000 description 2
- 241000180093 Vischeria Species 0.000 description 2
- 229930003779 Vitamin B12 Natural products 0.000 description 2
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 2
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 2
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000234675 Zingiberales Species 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 108010086434 alanyl-seryl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 2
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 235000015107 ale Nutrition 0.000 description 2
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 2
- 230000003078 antioxidant effect Effects 0.000 description 2
- 235000021016 apples Nutrition 0.000 description 2
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 2
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 2
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 2
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 2
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 101150036080 at gene Proteins 0.000 description 2
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 238000007622 bioinformatic analysis Methods 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 238000005422 blasting Methods 0.000 description 2
- 229960001561 bleomycin Drugs 0.000 description 2
- OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O bleomycin A2 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O 0.000 description 2
- WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N boron trifluoride Chemical compound FB(F)F WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005587 bubbling Effects 0.000 description 2
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 2
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 2
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M cobalt(2+);[(2r,3s,4r,5s)-5-(5,6-dimethylbenzimidazol-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2r)-1-[3-[(1r,2r,3r,4z,7s,9z,12s,13s,14z,17s,18s,19r)-2,13,18-tris(2-amino-2-oxoethyl)-7,12,17-tris(3-amino-3-oxopropyl)-3,5,8,8,13,15,18,19-octamethyl-2 Chemical compound [Co+2].N#[C-].[N-]([C@@H]1[C@H](CC(N)=O)[C@@]2(C)CCC(=O)NC[C@@H](C)OP(O)(=O)O[C@H]3[C@H]([C@H](O[C@@H]3CO)N3C4=CC(C)=C(C)C=C4N=C3)O)\C2=C(C)/C([C@H](C\2(C)C)CCC(N)=O)=N/C/2=C\C([C@H]([C@@]/2(CC(N)=O)C)CCC(N)=O)=N\C\2=C(C)/C2=N[C@]1(C)[C@@](C)(CC(N)=O)[C@@H]2CCC(N)=O AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M 0.000 description 2
- 238000002485 combustion reaction Methods 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000011437 continuous method Methods 0.000 description 2
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009795 derivation Methods 0.000 description 2
- 150000001993 dienes Chemical class 0.000 description 2
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 2
- JVSWJIKNEAIKJW-UHFFFAOYSA-N dimethyl-hexane Natural products CCCCCC(C)C JVSWJIKNEAIKJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910001873 dinitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 2
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 150000002191 fatty alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 210000003495 flagella Anatomy 0.000 description 2
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 2
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 2
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 2
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 2
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 2
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 2
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 2
- 239000000413 hydrolysate Substances 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 2
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 2
- 150000004702 methyl esters Chemical class 0.000 description 2
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 2
- 235000019713 millet Nutrition 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 229910000403 monosodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 2
- 230000001293 nucleolytic effect Effects 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 235000012162 pavlova Nutrition 0.000 description 2
- 235000021017 pears Nutrition 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- 238000009160 phytotherapy Methods 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 2
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 2
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 2
- 239000000700 radioactive tracer Substances 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000004317 sodium nitrate Substances 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 108010005652 splenotritin Proteins 0.000 description 2
- 235000021012 strawberries Nutrition 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 235000019157 thiamine Nutrition 0.000 description 2
- KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N thiamine Chemical compound CC1=C(CCO)SCN1CC1=CN=C(C)N=C1N KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960003495 thiamine Drugs 0.000 description 2
- 239000011721 thiamine Substances 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 2
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 2
- 238000011222 transcriptome analysis Methods 0.000 description 2
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- 235000019163 vitamin B12 Nutrition 0.000 description 2
- 239000011715 vitamin B12 Substances 0.000 description 2
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- HXUVTXPOZRFMOY-NSHDSACASA-N 2-[[(2s)-2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]acetic acid Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HXUVTXPOZRFMOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- WOJJIRYPFAZEPF-YFKPBYRVSA-N 2-[[(2s)-2-[[2-[(2-azaniumylacetyl)amino]acetyl]amino]propanoyl]amino]acetate Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN WOJJIRYPFAZEPF-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- XMTQQYYKAHVGBJ-UHFFFAOYSA-N 3-(3,4-DICHLOROPHENYL)-1,1-DIMETHYLUREA Chemical compound CN(C)C(=O)NC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 XMTQQYYKAHVGBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150096316 5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150044182 8 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091006112 ATPases Proteins 0.000 description 1
- 102100022734 Acyl carrier protein, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000057290 Adenosine Triphosphatases Human genes 0.000 description 1
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 1
- SBGXWWCLHIOABR-UHFFFAOYSA-N Ala Ala Gly Ala Chemical compound CC(N)C(=O)NC(C)C(=O)NCC(=O)NC(C)C(O)=O SBGXWWCLHIOABR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAQGRPOPTAUUBM-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AAQGRPOPTAUUBM-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- WQVFQXXBNHHPLX-ZKWXMUAHSA-N Ala-Ala-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O WQVFQXXBNHHPLX-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- JBGSZRYCXBPWGX-BQBZGAKWSA-N Ala-Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CCCN=C(N)N JBGSZRYCXBPWGX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- TTXMOJWKNRJWQJ-FXQIFTODSA-N Ala-Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CCCN=C(N)N TTXMOJWKNRJWQJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N Ala-Asp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- XAGIMRPOEJSYER-CIUDSAMLSA-N Ala-Cys-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N XAGIMRPOEJSYER-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OILNWMNBLIHXQK-ZLUOBGJFSA-N Ala-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OILNWMNBLIHXQK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N Ala-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MQIGTEQXYCRLGK-BQBZGAKWSA-N Ala-Gly-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O MQIGTEQXYCRLGK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 108010076441 Ala-His-His Proteins 0.000 description 1
- HUUOZYZWNCXTFK-INTQDDNPSA-N Ala-His-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N HUUOZYZWNCXTFK-INTQDDNPSA-N 0.000 description 1
- HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DPNZTBKGAUAZQU-DLOVCJGASA-N Ala-Leu-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N DPNZTBKGAUAZQU-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- VGMNWQOPSFBBBG-XUXIUFHCSA-N Ala-Leu-Leu-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VGMNWQOPSFBBBG-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N Ala-Leu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N Ala-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N Ala-Lys-Lys Natural products NCCCCC(NC(=O)C(N)C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OINVDEKBKBCPLX-JXUBOQSCSA-N Ala-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OINVDEKBKBCPLX-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N Ala-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- VEAPAYQQLSEKEM-GUBZILKMSA-N Ala-Met-Met Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O VEAPAYQQLSEKEM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IPZQNYYAYVRKKK-FXQIFTODSA-N Ala-Pro-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IPZQNYYAYVRKKK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N Ala-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- GMGWOTQMUKYZIE-UBHSHLNASA-N Ala-Pro-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 GMGWOTQMUKYZIE-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N Ala-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- RTZCUEHYUQZIDE-WHFBIAKZSA-N Ala-Ser-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RTZCUEHYUQZIDE-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- NHWYNIZWLJYZAG-XVYDVKMFSA-N Ala-Ser-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N NHWYNIZWLJYZAG-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- OMCKWYSDUQBYCN-FXQIFTODSA-N Ala-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O OMCKWYSDUQBYCN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N Ala-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- NZGRHTKZFSVPAN-BIIVOSGPSA-N Ala-Ser-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N NZGRHTKZFSVPAN-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- IOFVWPYSRSCWHI-JXUBOQSCSA-N Ala-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](C)N IOFVWPYSRSCWHI-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- NLYYHIKRBRMAJV-AEJSXWLSSA-N Ala-Val-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N NLYYHIKRBRMAJV-AEJSXWLSSA-N 0.000 description 1
- 241000722957 Amborella Species 0.000 description 1
- 241000611184 Amphora Species 0.000 description 1
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N Arg-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KJGNDQCYBNBXDA-GUBZILKMSA-N Arg-Arg-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)CN=C(N)N KJGNDQCYBNBXDA-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N Arg-Arg-Thr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- ITVINTQUZMQWJR-QXEWZRGKSA-N Arg-Asn-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ITVINTQUZMQWJR-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- XVLLUZMFSAYKJV-GUBZILKMSA-N Arg-Asp-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XVLLUZMFSAYKJV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N Arg-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JVMKBJNSRZWDBO-FXQIFTODSA-N Arg-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JVMKBJNSRZWDBO-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BMNVSPMWMICFRV-DCAQKATOSA-N Arg-His-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CN=CN1 BMNVSPMWMICFRV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CVXXSWQORBZAAA-SRVKXCTJSA-N Arg-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N CVXXSWQORBZAAA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- KXOPYFNQLVUOAQ-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KXOPYFNQLVUOAQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- FRBAHXABMQXSJQ-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FRBAHXABMQXSJQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ULBHWNVWSCJLCO-NHCYSSNCSA-N Arg-Val-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ULBHWNVWSCJLCO-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- 241000370685 Arge Species 0.000 description 1
- YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ORXCYAFUCSTQGY-FXQIFTODSA-N Asn-Ala-Met Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ORXCYAFUCSTQGY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N Asn-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- VKCOHFFSTKCXEQ-OLHMAJIHSA-N Asn-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VKCOHFFSTKCXEQ-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- PNHQRQTVBRDIEF-CIUDSAMLSA-N Asn-Leu-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N PNHQRQTVBRDIEF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NUCUBYIUPVYGPP-XIRDDKMYSA-N Asn-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O NUCUBYIUPVYGPP-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- GIQCDTKOIPUDSG-GARJFASQSA-N Asn-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O GIQCDTKOIPUDSG-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N Asn-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JTXVXGXTRXMOFJ-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JTXVXGXTRXMOFJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- YRTOMUMWSTUQAX-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YRTOMUMWSTUQAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asn Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)C(=O)N REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N Asn-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- UGXYFDQFLVCDFC-CIUDSAMLSA-N Asn-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O UGXYFDQFLVCDFC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZNYKKCADEQAZKA-FXQIFTODSA-N Asn-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O ZNYKKCADEQAZKA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZUFPUBYQYWCMDB-NUMRIWBASA-N Asn-Thr-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZUFPUBYQYWCMDB-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- QXNGSPZMGFEZNO-QRTARXTBSA-N Asn-Val-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O QXNGSPZMGFEZNO-QRTARXTBSA-N 0.000 description 1
- VPSHHQXIWLGVDD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VPSHHQXIWLGVDD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N Asp-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- LTXGDRFJRZSZAV-CIUDSAMLSA-N Asp-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N LTXGDRFJRZSZAV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KHGPWGKPYHPOIK-QWRGUYRKSA-N Asp-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O KHGPWGKPYHPOIK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- CRNKLABLTICXDV-GUBZILKMSA-N Asp-His-Glu Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N CRNKLABLTICXDV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N Asp-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KPSHWSWFPUDEGF-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC(O)=O KPSHWSWFPUDEGF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KESWRFKUZRUTAH-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O KESWRFKUZRUTAH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N Asp-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- UTLCRGFJFSZWAW-OLHMAJIHSA-N Asp-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O UTLCRGFJFSZWAW-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N Asp-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- NWAHPBGBDIFUFD-KKUMJFAQSA-N Asp-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NWAHPBGBDIFUFD-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XMKXONRMGJXCJV-LAEOZQHASA-N Asp-Val-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XMKXONRMGJXCJV-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- XQFLFQWOBXPMHW-NHCYSSNCSA-N Asp-Val-His Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O XQFLFQWOBXPMHW-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- GXIUDSXIUSTSLO-QXEWZRGKSA-N Asp-Val-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N GXIUDSXIUSTSLO-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- ZUNMTUPRQMWMHX-LSJOCFKGSA-N Asp-Val-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ZUNMTUPRQMWMHX-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 241001465318 Aspergillus terreus Species 0.000 description 1
- 241000178280 Aureococcus Species 0.000 description 1
- 241001425589 Auxenochlorella Species 0.000 description 1
- 229910015900 BF3 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000616862 Belliella Species 0.000 description 1
- 241000308615 Bolidomonas Species 0.000 description 1
- 238000010453 CRISPR/Cas method Methods 0.000 description 1
- 101150018129 CSF2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150069031 CSN2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100228200 Caenorhabditis elegans gly-5 gene Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001554545 Carteris Species 0.000 description 1
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101710195281 Chlorophyll a-b binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101710143415 Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101710181042 Chlorophyll a-b binding protein 1A, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101710091905 Chlorophyll a-b binding protein 2, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101710095244 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101710127489 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710184917 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101710102593 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 239000005046 Chlorosilane Substances 0.000 description 1
- 241000195492 Chroomonas Species 0.000 description 1
- 241000206751 Chrysophyceae Species 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- 241000233971 Commelinales Species 0.000 description 1
- 108010028773 Complement C5 Proteins 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- QNYVPIIHDIDFPU-UHFFFAOYSA-N Conferon Natural products CC1=CCC2C(CCC(=O)C2(C)C)C1COc3ccc4C=CC(=O)Oc4c3 QNYVPIIHDIDFPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010010356 Congenital anomaly Diseases 0.000 description 1
- 241000199913 Crypthecodinium Species 0.000 description 1
- 241000196114 Cycadales Species 0.000 description 1
- 241000206743 Cylindrotheca Species 0.000 description 1
- MBPKYKSYUAPLMY-DCAQKATOSA-N Cys-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MBPKYKSYUAPLMY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IIGHQOPGMGKDMT-SRVKXCTJSA-N Cys-Asp-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N IIGHQOPGMGKDMT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XRTISHJEPHMBJG-SRVKXCTJSA-N Cys-Asp-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XRTISHJEPHMBJG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OXOQBEVULIBOSH-ZDLURKLDSA-N Cys-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OXOQBEVULIBOSH-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- UCSXXFRXHGUXCQ-SRVKXCTJSA-N Cys-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N UCSXXFRXHGUXCQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JEKIARHEWURQRJ-BZSNNMDCSA-N Cys-Phe-Tyr Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N JEKIARHEWURQRJ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- KVCJEMHFLGVINV-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Asn Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KVCJEMHFLGVINV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LKHMGNHQULEPFY-ACZMJKKPSA-N Cys-Ser-Glu Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LKHMGNHQULEPFY-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- 102100039282 Cytochrome P450 26A1 Human genes 0.000 description 1
- ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N D-erythro-ascorbic acid Natural products OCC1OC(=O)C(O)=C1O ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 230000008836 DNA modification Effects 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 101150105088 Dele1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 description 1
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 description 1
- 241000199914 Dinophyceae Species 0.000 description 1
- 241000207977 Dipsacales Species 0.000 description 1
- QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N Disodium Chemical compound [Na][Na] QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001096166 Ellipsoidion Species 0.000 description 1
- 241000200106 Emiliania Species 0.000 description 1
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000195620 Euglena Species 0.000 description 1
- 241000195623 Euglenida Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 1
- 241001467599 Fragilariophyceae Species 0.000 description 1
- 241000195875 Funariales Species 0.000 description 1
- 102000013446 GTP Phosphohydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108091006109 GTPases Proteins 0.000 description 1
- 102000002464 Galactosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010093031 Galactosidases Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 241000218790 Ginkgoales Species 0.000 description 1
- YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N Gln-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N Gln-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- RGRMOYQUIJVQQD-SRVKXCTJSA-N Gln-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N RGRMOYQUIJVQQD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ULXXDWZMMSQBDC-ACZMJKKPSA-N Gln-Asp-Asp Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ULXXDWZMMSQBDC-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N Gln-Gln-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XKBASPWPBXNVLQ-WDSKDSINSA-N Gln-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XKBASPWPBXNVLQ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JZOYFBPIEHCDFV-YUMQZZPRSA-N Gln-His Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 JZOYFBPIEHCDFV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- BZULIEARJFRINC-IHRRRGAJSA-N Gln-Phe-Glu Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N BZULIEARJFRINC-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QFXNFFZTMFHPST-DZKIICNBSA-N Gln-Phe-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N QFXNFFZTMFHPST-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- ITYRYNUZHPNCIK-GUBZILKMSA-N Glu-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ITYRYNUZHPNCIK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MXOODARRORARSU-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Ser Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N MXOODARRORARSU-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- CVPXINNKRTZBMO-CIUDSAMLSA-N Glu-Arg-Asn Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)CN=C(N)N CVPXINNKRTZBMO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N Glu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- PCBBLFVHTYNQGG-LAEOZQHASA-N Glu-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N PCBBLFVHTYNQGG-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N Glu-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- GYCPQVFKCPPRQB-GUBZILKMSA-N Glu-Gln-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N GYCPQVFKCPPRQB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YLJHCWNDBKKOEB-IHRRRGAJSA-N Glu-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O YLJHCWNDBKKOEB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N Glu-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- WDTAKCUOIKHCTB-NKIYYHGXSA-N Glu-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O WDTAKCUOIKHCTB-NKIYYHGXSA-N 0.000 description 1
- ZMVCLTGPGWJAEE-JYJNAYRXSA-N Glu-His-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O ZMVCLTGPGWJAEE-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- PJBVXVBTTFZPHJ-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N PJBVXVBTTFZPHJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DWBBKNPKDHXIAC-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O DWBBKNPKDHXIAC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HRBYTAIBKPNZKQ-AVGNSLFASA-N Glu-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O HRBYTAIBKPNZKQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- BHXSLRDWXIFKTP-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N BHXSLRDWXIFKTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N Glu-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N Glu-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- JRDYDYXZKFNNRQ-XPUUQOCRSA-N Gly-Ala-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN JRDYDYXZKFNNRQ-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- UPOJUWHGMDJUQZ-IUCAKERBSA-N Gly-Arg-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UPOJUWHGMDJUQZ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RJIVPOXLQFJRTG-LURJTMIESA-N Gly-Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N RJIVPOXLQFJRTG-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N Gly-Glu-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CN YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N Gly-Gly-Pro zwitterion Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N Gly-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- FQKKPCWTZZEDIC-XPUUQOCRSA-N Gly-His-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 FQKKPCWTZZEDIC-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- UUWOBINZFGTFMS-UWVGGRQHSA-N Gly-His-Met Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O UUWOBINZFGTFMS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N Gly-His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)CN ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- YIFUFYZELCMPJP-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Cys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O YIFUFYZELCMPJP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- LLZXNUUIBOALNY-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN LLZXNUUIBOALNY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N Gly-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CN)C(=O)O WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N 0.000 description 1
- DBJYVKDPGIFXFO-BQBZGAKWSA-N Gly-Met-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DBJYVKDPGIFXFO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- RUDRIZRGOLQSMX-IUCAKERBSA-N Gly-Met-Met Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O RUDRIZRGOLQSMX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LXTRSHQLGYINON-DTWKUNHWSA-N Gly-Met-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN LXTRSHQLGYINON-DTWKUNHWSA-N 0.000 description 1
- OMOZPGCHVWOXHN-BQBZGAKWSA-N Gly-Met-Ser Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)CN OMOZPGCHVWOXHN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N Gly-Met-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- YLEIWGJJBFBFHC-KBPBESRZSA-N Gly-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 YLEIWGJJBFBFHC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N Gly-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)CN)C(=O)O IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 1
- GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WDXLKVQATNEAJQ-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Asp Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WDXLKVQATNEAJQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N Gly-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BMWFDYIYBAFROD-WPRPVWTQSA-N Gly-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN BMWFDYIYBAFROD-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- FGPLUIQCSKGLTI-WDSKDSINSA-N Gly-Ser-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O FGPLUIQCSKGLTI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N Gly-Val-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 241000206759 Haptophyceae Species 0.000 description 1
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 1
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- QIVPRLJQQVXCIY-HGNGGELXSA-N His-Ala-Gln Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O QIVPRLJQQVXCIY-HGNGGELXSA-N 0.000 description 1
- IPIVXQQRZXEUGW-UWJYBYFXSA-N His-Ala-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IPIVXQQRZXEUGW-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- DZMVESFTHXSSPZ-XVYDVKMFSA-N His-Ala-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DZMVESFTHXSSPZ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- MAABHGXCIBEYQR-XVYDVKMFSA-N His-Asn-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N MAABHGXCIBEYQR-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- RGPWUJOMKFYFSR-QWRGUYRKSA-N His-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RGPWUJOMKFYFSR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- PMWSGVRIMIFXQH-KKUMJFAQSA-N His-His-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)C1=CN=CN1 PMWSGVRIMIFXQH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- SKOKHBGDXGTDDP-MELADBBJSA-N His-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N SKOKHBGDXGTDDP-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- CKRJBQJIGOEKMC-SRVKXCTJSA-N His-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CKRJBQJIGOEKMC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YXASFUBDSDAXQD-UWVGGRQHSA-N His-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O YXASFUBDSDAXQD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- RNAYRCNHRYEBTH-IHRRRGAJSA-N His-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RNAYRCNHRYEBTH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N His-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N His-Pro-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CN=CN1 QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- STGQSBKUYSPPIG-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 STGQSBKUYSPPIG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MDOBWSFNSNPENN-PMVVWTBXSA-N His-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O MDOBWSFNSNPENN-PMVVWTBXSA-N 0.000 description 1
- VLDVBZICYBVQHB-IUCAKERBSA-N His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 VLDVBZICYBVQHB-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 108010072039 Histidine kinase Proteins 0.000 description 1
- 101000678845 Homo sapiens Acyl carrier protein, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000745891 Homo sapiens Cytochrome P450 26A1 Proteins 0.000 description 1
- 101000611240 Homo sapiens Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 101000580349 Hordeum vulgare Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase B, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001501885 Isochrysis Species 0.000 description 1
- 229930194224 Kinamycin Natural products 0.000 description 1
- SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N L-2-aminopentanoic acid Chemical compound CCC[C@H](N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- HGCNKOLVKRAVHD-UHFFFAOYSA-N L-Met-L-Phe Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HGCNKOLVKRAVHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N L-alanyl-L-prolylglycine zwitterion Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N L-norVal-OH Natural products CCCC(N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001185603 Labrys Species 0.000 description 1
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 description 1
- 240000008415 Lactuca sativa Species 0.000 description 1
- 241000272168 Laridae Species 0.000 description 1
- 241000936931 Lepocinclis Species 0.000 description 1
- LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N Leu-Ala-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HBJZFCIVFIBNSV-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HBJZFCIVFIBNSV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N Leu-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- YOZCKMXHBYKOMQ-IHRRRGAJSA-N Leu-Arg-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N YOZCKMXHBYKOMQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N Leu-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N Leu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N Leu-Asn-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N Leu-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N Leu-Asp-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N Leu-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N Leu-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N Leu-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- LAPSXOAUPNOINL-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O LAPSXOAUPNOINL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N Leu-Gly-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- QPXBPQUGXHURGP-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N QPXBPQUGXHURGP-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- YFBBUHJJUXXZOF-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YFBBUHJJUXXZOF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- POZULHZYLPGXMR-ONGXEEELSA-N Leu-Gly-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O POZULHZYLPGXMR-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OHZIZVWQXJPBJS-IXOXFDKPSA-N Leu-His-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OHZIZVWQXJPBJS-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JLWZLIQRYCTYBD-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JLWZLIQRYCTYBD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N Leu-Lys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- LZHJZLHSRGWBBE-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LZHJZLHSRGWBBE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WXZOHBVPVKABQN-DCAQKATOSA-N Leu-Met-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N WXZOHBVPVKABQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FLNPJLDPGMLWAU-UWVGGRQHSA-N Leu-Met-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C FLNPJLDPGMLWAU-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PPGBXYKMUMHFBF-KATARQTJSA-N Leu-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PPGBXYKMUMHFBF-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000234435 Lilium Species 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 101500021084 Locusta migratoria 5 kDa peptide Proteins 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N Lys-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GJJQCBVRWDGLMQ-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GJJQCBVRWDGLMQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N Lys-Gly-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- KKFVKBWCXXLKIK-AVGNSLFASA-N Lys-His-Glu Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N KKFVKBWCXXLKIK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- YXPJCVNIDDKGOE-MELADBBJSA-N Lys-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O YXPJCVNIDDKGOE-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N Lys-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MEQLGHAMAUPOSJ-DCAQKATOSA-N Lys-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MEQLGHAMAUPOSJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DRRXXZBXDMLGFC-IHRRRGAJSA-N Lys-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN DRRXXZBXDMLGFC-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N Lys-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical group [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000983121 Mamiellophyceae Species 0.000 description 1
- 229910021380 Manganese Chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L Manganese chloride Chemical compound Cl[Mn]Cl GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 240000000233 Melia azedarach Species 0.000 description 1
- IVCPHARVJUYDPA-FXQIFTODSA-N Met-Asn-Asp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N IVCPHARVJUYDPA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- IHITVQKJXQQGLJ-LPEHRKFASA-N Met-Asn-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N IHITVQKJXQQGLJ-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- OSOLWRWQADPDIQ-DCAQKATOSA-N Met-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OSOLWRWQADPDIQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- TZLYIHDABYBOCJ-FXQIFTODSA-N Met-Asp-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O TZLYIHDABYBOCJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PTYVBBNIAQWUFV-DCAQKATOSA-N Met-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCSC)N PTYVBBNIAQWUFV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CRGKLOXHKICQOL-GARJFASQSA-N Met-Gln-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N CRGKLOXHKICQOL-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- MYAPQOBHGWJZOM-UWVGGRQHSA-N Met-Gly-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C MYAPQOBHGWJZOM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- LQMHZERGCQJKAH-STQMWFEESA-N Met-Gly-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 LQMHZERGCQJKAH-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- BMHIFARYXOJDLD-WPRPVWTQSA-N Met-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BMHIFARYXOJDLD-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- NTYQUVLERIHPMU-HRCADAONSA-N Met-Phe-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N NTYQUVLERIHPMU-HRCADAONSA-N 0.000 description 1
- VQILILSLEFDECU-GUBZILKMSA-N Met-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VQILILSLEFDECU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- VSJAPSMRFYUOKS-IUCAKERBSA-N Met-Pro-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O VSJAPSMRFYUOKS-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- NHXXGBXJTLRGJI-GUBZILKMSA-N Met-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NHXXGBXJTLRGJI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MIXPUVSPPOWTCR-FXQIFTODSA-N Met-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MIXPUVSPPOWTCR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- YGNUDKAPJARTEM-GUBZILKMSA-N Met-Val-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YGNUDKAPJARTEM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000586743 Micractinium Species 0.000 description 1
- 241001536507 Micromonas pusilla Species 0.000 description 1
- WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N N-L-arginyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCCN=C(N)N WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MSPCIZMDDUQPGJ-UHFFFAOYSA-N N-methyl-N-(trimethylsilyl)trifluoroacetamide Chemical compound C[Si](C)(C)N(C)C(=O)C(F)(F)F MSPCIZMDDUQPGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108090000913 Nitrate Reductases Proteins 0.000 description 1
- IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-M Nitrite anion Chemical compound [O-]N=O IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 241000209094 Oryza Species 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- UOZODPSAJZTQNH-UHFFFAOYSA-N Paromomycin II Natural products NC1C(O)C(O)C(CN)OC1OC1C(O)C(OC2C(C(N)CC(N)C2O)OC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)N)OC1CO UOZODPSAJZTQNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000122116 Parvimonas Species 0.000 description 1
- 240000002834 Paulownia tomentosa Species 0.000 description 1
- 235000010678 Paulownia tomentosa Nutrition 0.000 description 1
- 241001494897 Pelagomonas Species 0.000 description 1
- 241001494902 Pelagophyceae Species 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 1
- FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N Phe-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- AGYXCMYVTBYGCT-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AGYXCMYVTBYGCT-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- HHOOEUSPFGPZFP-QWRGUYRKSA-N Phe-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O HHOOEUSPFGPZFP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- AWAYOWOUGVZXOB-BZSNNMDCSA-N Phe-Asn-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 AWAYOWOUGVZXOB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N Phe-Pro Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N1[C@@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- JLLJTMHNXQTMCK-UBHSHLNASA-N Phe-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JLLJTMHNXQTMCK-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- ZJPGOXWRFNKIQL-JYJNAYRXSA-N Phe-Pro-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 ZJPGOXWRFNKIQL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- GOUWCZRDTWTODO-YDHLFZDLSA-N Phe-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GOUWCZRDTWTODO-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N Phe-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-L Phosphate ion(2-) Chemical compound OP([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108010081996 Photosystem I Protein Complex Proteins 0.000 description 1
- 241000425347 Phyla <beetle> Species 0.000 description 1
- 241000195888 Physcomitrella Species 0.000 description 1
- 241001377010 Pila Species 0.000 description 1
- 235000008331 Pinus X rigitaeda Nutrition 0.000 description 1
- 241000018646 Pinus brutia Species 0.000 description 1
- 235000011613 Pinus brutia Nutrition 0.000 description 1
- 241000758713 Piperales Species 0.000 description 1
- APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KIZQGKLMXKGDIV-BQBZGAKWSA-N Pro-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KIZQGKLMXKGDIV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CGBYDGAJHSOGFQ-LPEHRKFASA-N Pro-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 CGBYDGAJHSOGFQ-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- XQLBWXHVZVBNJM-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 XQLBWXHVZVBNJM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XROLYVMNVIKVEM-BQBZGAKWSA-N Pro-Asn-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O XROLYVMNVIKVEM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UTAUEDINXUMHLG-FXQIFTODSA-N Pro-Asp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 UTAUEDINXUMHLG-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SGCZFWSQERRKBD-BQBZGAKWSA-N Pro-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 SGCZFWSQERRKBD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N Pro-Cys-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N Pro-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HAEGAELAYWSUNC-WPRPVWTQSA-N Pro-Gly-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HAEGAELAYWSUNC-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- JUJGNDZIKKQMDJ-IHRRRGAJSA-N Pro-His-His Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(O)=O JUJGNDZIKKQMDJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- BODDREDDDRZUCF-QTKMDUPCSA-N Pro-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O BODDREDDDRZUCF-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- MCWHYUWXVNRXFV-RWMBFGLXSA-N Pro-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 MCWHYUWXVNRXFV-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- JUJCUYWRJMFJJF-AVGNSLFASA-N Pro-Lys-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 JUJCUYWRJMFJJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HBBBLSVBQGZKOZ-GUBZILKMSA-N Pro-Met-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HBBBLSVBQGZKOZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N Pro-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KDBHVPXBQADZKY-GUBZILKMSA-N Pro-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 KDBHVPXBQADZKY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N Pro-Pro-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- SVXXJYJCRNKDDE-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-His Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CN=CN1 SVXXJYJCRNKDDE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- RCYUBVHMVUHEBM-RCWTZXSCSA-N Pro-Pro-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RCYUBVHMVUHEBM-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N Pro-Ser-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MKGIILKDUGDRRO-FXQIFTODSA-N Pro-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MKGIILKDUGDRRO-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- UCTIUWKCVNGEFH-OBJOEFQTSA-N Pro-Val-Gly-Pro Chemical compound N([C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 UCTIUWKCVNGEFH-OBJOEFQTSA-N 0.000 description 1
- VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N Pro-Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 241000192142 Proteobacteria Species 0.000 description 1
- 241001369990 Pseudostaurastrum Species 0.000 description 1
- 101150111829 RBCS2 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010079005 RDV peptide Proteins 0.000 description 1
- 108010003201 RGH 0205 Proteins 0.000 description 1
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 1
- 241001128129 Rafflesiaceae Species 0.000 description 1
- 241001518925 Raphidophyceae Species 0.000 description 1
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 1
- JVWLUVNSQYXYBE-UHFFFAOYSA-N Ribitol Natural products OCC(C)C(O)C(O)CO JVWLUVNSQYXYBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000004389 Ribonucleoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010081734 Ribonucleoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 102100028029 SCL-interrupting locus protein Human genes 0.000 description 1
- 235000012377 Salvia columbariae var. columbariae Nutrition 0.000 description 1
- 235000001498 Salvia hispanica Nutrition 0.000 description 1
- 240000005481 Salvia hispanica Species 0.000 description 1
- 241000134968 Sapindales Species 0.000 description 1
- 241000134890 Saxifragales Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- MWMKFWJYRRGXOR-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Asn Chemical compound N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)O)CC(N)=O)C)CO MWMKFWJYRRGXOR-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BRKHVZNDAOMAHX-BIIVOSGPSA-N Ser-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N BRKHVZNDAOMAHX-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N Ser-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- BNFVPSRLHHPQKS-WHFBIAKZSA-N Ser-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O BNFVPSRLHHPQKS-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N Ser-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SNVIOQXAHVORQM-WDSKDSINSA-N Ser-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O SNVIOQXAHVORQM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MIJWOJAXARLEHA-WDSKDSINSA-N Ser-Gly-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O MIJWOJAXARLEHA-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N Ser-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- XXXAXOWMBOKTRN-XPUUQOCRSA-N Ser-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XXXAXOWMBOKTRN-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- FUMGHWDRRFCKEP-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FUMGHWDRRFCKEP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CO VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N Ser-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N Ser-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DINQYZRMXGWWTG-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DINQYZRMXGWWTG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- FZXOPYUEQGDGMS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ser-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FZXOPYUEQGDGMS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N Ser-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KIEIJCFVGZCUAS-MELADBBJSA-N Ser-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O KIEIJCFVGZCUAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N Ser-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- SYCFMSYTIFXWAJ-DCAQKATOSA-N Ser-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N SYCFMSYTIFXWAJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(O)=O HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241000206733 Skeletonema Species 0.000 description 1
- 241000736283 Sphagnales Species 0.000 description 1
- 241001442222 Staurastrum Species 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930182558 Sterol Natural products 0.000 description 1
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 1
- 241000272534 Struthio camelus Species 0.000 description 1
- 108091027544 Subgenomic mRNA Proteins 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UCKMPCXJQFINFW-UHFFFAOYSA-N Sulphide Chemical compound [S-2] UCKMPCXJQFINFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 1
- 241001467596 Synurophyceae Species 0.000 description 1
- 238000010459 TALEN Methods 0.000 description 1
- 241000030538 Thecla Species 0.000 description 1
- ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N Thr-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- GFDUZZACIWNMPE-KZVJFYERSA-N Thr-Ala-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O GFDUZZACIWNMPE-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- JMZKMSTYXHFYAK-VEVYYDQMSA-N Thr-Arg-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O JMZKMSTYXHFYAK-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- YOSLMIPKOUAHKI-OLHMAJIHSA-N Thr-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YOSLMIPKOUAHKI-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N Thr-Gly-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 1
- AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- NYQIZWROIMIQSL-VEVYYDQMSA-N Thr-Pro-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NYQIZWROIMIQSL-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N Thr-Pro-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- TZQWJCGVCIJDMU-HEIBUPTGSA-N Thr-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O TZQWJCGVCIJDMU-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- SBYQHZCMVSPQCS-RCWTZXSCSA-N Thr-Val-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O SBYQHZCMVSPQCS-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 101100524645 Toxoplasma gondii ROM5 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010043645 Transcription Activator-Like Effector Nucleases Proteins 0.000 description 1
- 102220482238 Tripartite motif-containing protein 74_W13R_mutation Human genes 0.000 description 1
- 208000037280 Trisomy Diseases 0.000 description 1
- 241001504505 Troglodytes troglodytes Species 0.000 description 1
- PMIJXCLOQFMOKZ-BPUTZDHNSA-N Trp-Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N PMIJXCLOQFMOKZ-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- AKXBNSZMYAOGLS-STQMWFEESA-N Tyr-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AKXBNSZMYAOGLS-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- RCLOWEZASFJFEX-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 RCLOWEZASFJFEX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- YYZPVPJCOGGQPC-JYJNAYRXSA-N Tyr-His-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O YYZPVPJCOGGQPC-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- PMHLLBKTDHQMCY-ULQDDVLXSA-N Tyr-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PMHLLBKTDHQMCY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241001465357 Ulvophyceae Species 0.000 description 1
- ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N Val-Ala-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N Val-Ala-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- XQVRMLRMTAGSFJ-QXEWZRGKSA-N Val-Asp-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N XQVRMLRMTAGSFJ-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- QHDXUYOYTPWCSK-RCOVLWMOSA-N Val-Asp-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O)N QHDXUYOYTPWCSK-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N Val-Asp-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- VVZDBPBZHLQPPB-XVKPBYJWSA-N Val-Glu-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O VVZDBPBZHLQPPB-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- ZXAGTABZUOMUDO-GVXVVHGQSA-N Val-Glu-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N ZXAGTABZUOMUDO-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- OXGVAUFVTOPFFA-XPUUQOCRSA-N Val-Gly-Cys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N OXGVAUFVTOPFFA-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- FXVDGDZRYLFQKY-WPRPVWTQSA-N Val-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)C(C)C FXVDGDZRYLFQKY-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- RFKJNTRMXGCKFE-FHWLQOOXSA-N Val-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 RFKJNTRMXGCKFE-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 1
- KISFXYYRKKNLOP-IHRRRGAJSA-N Val-Phe-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N KISFXYYRKKNLOP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VSCIANXXVZOYOC-AVGNSLFASA-N Val-Pro-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N VSCIANXXVZOYOC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- SSYBNWFXCFNRFN-GUBZILKMSA-N Val-Pro-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SSYBNWFXCFNRFN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DEGUERSKQBRZMZ-FXQIFTODSA-N Val-Ser-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DEGUERSKQBRZMZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DLLRRUDLMSJTMB-GUBZILKMSA-N Val-Ser-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N DLLRRUDLMSJTMB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- GBIUHAYJGWVNLN-AEJSXWLSSA-N Val-Ser-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N GBIUHAYJGWVNLN-AEJSXWLSSA-N 0.000 description 1
- UJMCYJKPDFQLHX-XGEHTFHBSA-N Val-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O UJMCYJKPDFQLHX-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N Val-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N Val-Thr-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- TVGWMCTYUFBXAP-QTKMDUPCSA-N Val-Thr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O TVGWMCTYUFBXAP-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- JXCOEPXCBVCTRD-JYJNAYRXSA-N Val-Tyr-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N JXCOEPXCBVCTRD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N Val-Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N Val-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC([O-])=O AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 241000200212 Vaucheria Species 0.000 description 1
- 241001464837 Viridiplantae Species 0.000 description 1
- 229930003268 Vitamin C Natural products 0.000 description 1
- 241000206764 Xanthophyceae Species 0.000 description 1
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000005903 acid hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 230000009418 agronomic effect Effects 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 150000001335 aliphatic alkanes Chemical class 0.000 description 1
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 description 1
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 229940053200 antiepileptics fatty acid derivative Drugs 0.000 description 1
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010069926 arginyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 1
- 239000010426 asphalt Substances 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002869 basic local alignment search tool Methods 0.000 description 1
- OGBUMNBNEWYMNJ-UHFFFAOYSA-N batilol Chemical class CCCCCCCCCCCCCCCCCCOCC(O)CO OGBUMNBNEWYMNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000010364 biochemical engineering Methods 0.000 description 1
- 238000010876 biochemical test Methods 0.000 description 1
- 239000006177 biological buffer Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 229930189065 blasticidin Natural products 0.000 description 1
- 108010083912 bleomycin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N calcitonin Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(N)=O)C(C)C)C(=O)[C@@H]1CSSC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1 BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- 108020001778 catalytic domains Proteins 0.000 description 1
- 101150027769 cda gene Proteins 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000001311 chemical methods and process Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 235000014167 chia Nutrition 0.000 description 1
- 108091000085 chlorophyll binding Proteins 0.000 description 1
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 1
- KOPOQZFJUQMUML-UHFFFAOYSA-N chlorosilane Chemical compound Cl[SiH3] KOPOQZFJUQMUML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IJOOHPMOJXWVHK-UHFFFAOYSA-N chlorotrimethylsilane Chemical compound C[Si](C)(C)Cl IJOOHPMOJXWVHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000003245 coal Substances 0.000 description 1
- GVPFVAHMJGGAJG-UHFFFAOYSA-L cobalt dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Co+2] GVPFVAHMJGGAJG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- JECGPMYZUFFYJW-UHFFFAOYSA-N conferone Natural products CC1=CCC2C(C)(C)C(=O)CCC2(C)C1COc3cccc4C=CC(=O)Oc34 JECGPMYZUFFYJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 101150055601 cops2 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- UFULAYFCSOUIOV-UHFFFAOYSA-N cysteamine Chemical compound NCCS UFULAYFCSOUIOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007872 degassing Methods 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 108010009297 diglycyl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000295 emission spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007457 establishment of nucleus localization Effects 0.000 description 1
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 1
- 241001233957 eudicotyledons Species 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000009313 farming Methods 0.000 description 1
- 150000002192 fatty aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 230000004720 fertilization Effects 0.000 description 1
- 239000010419 fine particle Substances 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 1
- 239000003205 fragrance Substances 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 235000021588 free fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- SJWWTRQNNRNTPU-ABBNZJFMSA-N fucoxanthin Chemical compound C[C@@]1(O)C[C@@H](OC(=O)C)CC(C)(C)C1=C=C\C(C)=C\C=C\C(\C)=C\C=C\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)C(=O)C[C@]1(C(C[C@H](O)C2)(C)C)[C@]2(C)O1 SJWWTRQNNRNTPU-ABBNZJFMSA-N 0.000 description 1
- AQLRNQCFQNNMJA-UHFFFAOYSA-N fucoxanthin Natural products CC(=O)OC1CC(C)(C)C(=C=CC(=CC=CC(=CC=CC=C(/C)C=CC=C(/C)C(=O)CC23OC2(C)CC(O)CC3(C)C)C)CO)C(C)(O)C1 AQLRNQCFQNNMJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005021 gait Effects 0.000 description 1
- 108010006664 gamma-glutamyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000004077 genetic alteration Effects 0.000 description 1
- 231100000118 genetic alteration Toxicity 0.000 description 1
- 235000003869 genetically modified organism Nutrition 0.000 description 1
- 238000012268 genome sequencing Methods 0.000 description 1
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 1
- 239000003292 glue Substances 0.000 description 1
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 1
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 101150089730 gly-10 gene Proteins 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 125000005456 glyceride group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003976 glyceryl group Chemical group [H]C([*])([H])C(O[H])([H])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 108010000434 glycyl-alanyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010051307 glycyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010043293 glycyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010045126 glycyl-tyrosyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 239000004519 grease Substances 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 239000001307 helium Substances 0.000 description 1
- 229910052734 helium Inorganic materials 0.000 description 1
- SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N helium atom Chemical compound [He] SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UQEAIHBTYFGYIE-UHFFFAOYSA-N hexamethyldisiloxane Chemical compound C[Si](C)(C)O[Si](C)(C)C UQEAIHBTYFGYIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VKYKSIONXSXAKP-UHFFFAOYSA-N hexamethylenetetramine Chemical compound C1N(C2)CN3CN1CN2C3 VKYKSIONXSXAKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 1
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010050343 histidyl-alanyl-glutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 238000002743 insertional mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- MVZXTUSAYBWAAM-UHFFFAOYSA-N iron;sulfuric acid Chemical compound [Fe].OS(O)(=O)=O MVZXTUSAYBWAAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 1
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 1
- 108010045397 lysyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000002867 manganese chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000011565 manganese chloride Substances 0.000 description 1
- 229940099607 manganese chloride Drugs 0.000 description 1
- HEBKCHPVOIAQTA-UHFFFAOYSA-N meso ribitol Natural products OCC(O)C(O)C(O)CO HEBKCHPVOIAQTA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 1
- 238000004452 microanalysis Methods 0.000 description 1
- 230000025608 mitochondrion localization Effects 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 150000002829 nitrogen Chemical class 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N nitrous oxide Inorganic materials [O-][N+]#N GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 1
- 239000005304 optical glass Substances 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000012044 organic layer Substances 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000005022 packaging material Substances 0.000 description 1
- UOZODPSAJZTQNH-LSWIJEOBSA-N paromomycin Chemical compound N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](N)C[C@@H](N)[C@@H]2O)O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)N)O[C@@H]1CO UOZODPSAJZTQNH-LSWIJEOBSA-N 0.000 description 1
- 229960001914 paromomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 239000010451 perlite Substances 0.000 description 1
- 235000019362 perlite Nutrition 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010024654 phenylalanyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005375 photometry Methods 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 210000002706 plastid Anatomy 0.000 description 1
- 239000002574 poison Substances 0.000 description 1
- 231100000614 poison Toxicity 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 238000012809 post-inoculation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 108010093296 prolyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010087846 prolyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- QQKDTTWZXHEGAQ-UHFFFAOYSA-N propyl carbonochloridate Chemical compound CCCOC(Cl)=O QQKDTTWZXHEGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 102000005912 ran GTP Binding Protein Human genes 0.000 description 1
- 108010005597 ran GTP Binding Protein Proteins 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 108010054624 red fluorescent protein Proteins 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 238000012340 reverse transcriptase PCR Methods 0.000 description 1
- HEBKCHPVOIAQTA-ZXFHETKHSA-N ribitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO HEBKCHPVOIAQTA-ZXFHETKHSA-N 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical class 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 239000007320 rich medium Substances 0.000 description 1
- 102200048119 rs104894035 Human genes 0.000 description 1
- 102200067350 rs118203990 Human genes 0.000 description 1
- 102220050672 rs193920918 Human genes 0.000 description 1
- 102200004067 rs199472715 Human genes 0.000 description 1
- 102220115889 rs377607698 Human genes 0.000 description 1
- 102220059708 rs754339271 Human genes 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N silicon carbide Chemical compound [Si+]#[C-] HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910010271 silicon carbide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000015393 sodium molybdate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011684 sodium molybdate Substances 0.000 description 1
- TVXXNOYZHKPKGW-UHFFFAOYSA-N sodium molybdate (anhydrous) Chemical compound [Na+].[Na+].[O-][Mo]([O-])(=O)=O TVXXNOYZHKPKGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 1
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 150000003432 sterols Chemical class 0.000 description 1
- 235000003702 sterols Nutrition 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- JLKIGFTWXXRPMT-UHFFFAOYSA-N sulphamethoxazole Chemical compound O1C(C)=CC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=N1 JLKIGFTWXXRPMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YODZTKMDCQEPHD-UHFFFAOYSA-N thiodiglycol Chemical compound OCCSCCO YODZTKMDCQEPHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229950006389 thiodiglycol Drugs 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 150000003613 toluenes Chemical class 0.000 description 1
- 108091006106 transcriptional activators Proteins 0.000 description 1
- 238000013422 transcriptome assay Methods 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N triformin Chemical compound O=COCC(OC=O)COC=O UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 230000007306 turnover Effects 0.000 description 1
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000010455 vermiculite Substances 0.000 description 1
- 235000019354 vermiculite Nutrition 0.000 description 1
- 229910052902 vermiculite Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019154 vitamin C Nutrition 0.000 description 1
- 239000011718 vitamin C Substances 0.000 description 1
- 150000003722 vitamin derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L zinc sulfate Chemical compound [Zn+2].[O-]S([O-])(=O)=O NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229960001763 zinc sulfate Drugs 0.000 description 1
- 229910000368 zinc sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/405—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from algae
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
- A01H1/00—Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
- A01H1/06—Processes for producing mutations, e.g. treatment with chemicals or with radiation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/12—Unicellular algae; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/12—Unicellular algae; Culture media therefor
- C12N1/125—Unicellular algae isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/36—Adaptation or attenuation of cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/01—Preparation of mutants without inserting foreign genetic material therein; Screening processes therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8262—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield involving plant development
- C12N15/8269—Photosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/89—Algae ; Processes using algae
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
- Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
- Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Botany (AREA)
- Virology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physiology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
Abstract
يتعلق الاختراع الحالي بتوفير كائنات دقيقة تخليقية ضوئية mutant photosynthetic microorgnaisms ناتجة عن طفرة mutants بها جين SGI1 مُوهن. ويكون بنواتج الطفرة محتوي كلوروفيل chlorophyll منخفض وإنتاجية متزايدة بالنسبة للخلايا من النوع البريّ wild type cells. تم أيضاً الكشف عن طرق لاستخدام نواتج الطفرة المذكورة لإنتاج كتلة حيوية biomass أو منتجات حيوية bioproducts وطرق لفحص نواتج الطفرة mutants المذكورة. شكل 2.
Description
نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُحْفّض High Productivity Algal Mutants Having Reduced Photosynthetic Antenna الوصف الكامل خلفية الاختراع يتعلق الاختراع الحالي بتطفيرات من الكائنات الحية التخليقية الضوئية photosynthetic Sl organisms بها كلوروفيل Chlorophyll منخفض وكتلة Lugs زائدة increased 5 فوقابلية إنتاج للشحوم. يتعلق الاختراع الحالي Load بطرق لإنشاء؛ واختيار التطفيرات المذكورة. إن معالجة الكائنات التخليقية الضوئية photosynthetic organisms لزيادة فعالية التخليق الضوئي لإنتاجية lof هو بمثابة هدف طويل الأمد لعلماء النباتات والعلماء في علم الأحياء المتعلقة بالطحالب. وقد قام الطلبين الأمريكيين رقم 2014/0220638 ورقم 2016/030489؛ 0 على تطفيرات من الطحالب والتي يطلق عليها تطفيرات "ها1 !اا" lly بها كلوروفيل chlorophyll منخفض ولديها قدرة منخفضة في التأقلم مع الضوءٍ المنخفض؛ وبالتالي فهي تحتفظ بحالة الكلوروفيل المتخفض من الخلايا المهيأة للضوء العالي حتى في وجود ضوء منخفض. يصف الطلب الأمريكي رقم 2014/0220638؛ تطفيرات من الطحالب التي لها تطفيرات في منظم التأقلم الخاص بالضوءٍ من جينات LAR2 5 LART و3جاههاء والطلب الأمريكي رقم 5 2016/030489 الذي يكشف عن تطفيرات من الطحالب لها تطفيرات في جين 584054 للكلورويلاست (صانعة اليخضور) . الوصف العام للاختراع تم هنا توفير كائنات تخليق ضوئي التي لها بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 Significant Growth Improvement 1 (SGI1) يكون لكائنات التخليق الضوئى photosynthetic organisms المتطفرة إنتاجية عالية بالمقارنة بكائنات التخليق
الضوئي من عينة المقارنة والتي تكون متماثلة إلى حد كبير مع الكائنات الدقيقة الخاصة بالتخليق الضوئي المتطفرة باستثناء أنه ليس لديها جين 1ا56. يمكن قياس الإنتاجية العالية في شكل معدل تراكم الكتلة الحيوية أو في شكل معدل إنتاج منتج حيوي؛ مثل؛ على سبيل (JB شحم همزا بروتين protein أحد السكريات sugars أو الكربوهيدرات carbohydrates (على سبيل المثال؛ واحد أو أكثر من السكريات sugars أو المركبات الكحولية (alcohols أو
الخضابات pigments أو المواد المضادة للأكسدة cantioxidants تربينويدات «ferpenoids الفيتاميانات vitamins أو البوليمرات polymers يمكن أن تقوم تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT التي تم الكشف عنها هنا بعرض إنتاجية عالية في ظل ظروف التغذية الضوئية الذاتية.
0 وكما تم وصفه هناء فإن بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 «(SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون عبارة عن بولي ببتيد polypeptide 41 نطاق مستقبل منظم للاستجابة (نطاق RR ( ونطاق رابط ل الحمض النووي الرربوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) مشابه ل myb ((0لا؛ حيث أن نطاق RR يكون عبارة عن الطرف N= بالنسبة للنطاق 0لا01؛ ويتم فصل
اثنين من النطاقات بواسطة متوالية من الأحماض الأمينية «sequence of amino acids والتي يطلق عليها هنا بأنها رابط والذي لا ينتمي لأي نطاق. يمكن أن يكون نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق myb في العديد من النماذج في نصف الطرف - N من البروتين. يكون جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 0 الموهن عبارة عن جين 1ا56 والذي له الوظيفة أو التعبير الذي تم إتلافه بحيث أن متنج الجين (بولي ببتيد polypeptide 1ا56 ) يتم اختزاله فيما يتعلق بالمقدار أو النشاط بالنسبة للوفرة أو النشاط في الكائن الحي من النوع could أي أن وظيفة بولي ببتيد 56١1 polypeptide يتم تقليلها نتيجة وجود تطفيرات من جين 5611 أو نتيجة المعالجات الجينية خارج جين 5611 نفسه Ally تؤثر على التعبير عن جين SGI
يقوم الكائن الحي الخاص بالتخليق الضوئي كما تم توفيره هنا والذي به جين 5611 موهن بعرض إنتاجية عالية بالنسبة للكائن الحي التخليقي الضوئي من عينة المقارنة ويكون به كلوروفيل chlorophyll منخفض بالنسبة لكائن التخليق الضوئي من die المقارنة. في بعض ALY) فإن كائن التخليق الضوئي الذي له جين 561 موهن يكون به مقدار منخفض من الكلوروفيل ب؛
وفي بعض الأمثلة يمكن أن يكون بكائن التخليق الضوئي المتطفر جين 1ا56 موهن وله نسبة كلوروفيل chlorophyll أ متزايدة : نسبة الكلوروفيل ب. يمكن أن يشتمل كائن التخليق الضوئي المتطفر كما تم توفيره هنا والذي به جين 561 موهن على حجم هوائي تخليقي ضوئي متناقص؛ على سبيل المثال؛ نظام ضوئي مخفض reduced photosystem Il (PSI) Il و/أو حجم هوائي لنظام ضوئي منخفض | reduced photosystem | (PSI) حجم هوائي.
0 يمكن أن تنتج تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 عالية الإنتاجية ALS حيوية أكبر بالمقارنة بكائن التخليق الضوئي من عينة المقارنة» على سبيل (JB كتلة حيوية أكبر كل يوم بالمقارنة بعينة المقارنة أو بالكتلة الحيوية المشتقة من الكائن al من التخليق الضوئي من النوع البري من الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism المتطفر. يمكن أن تكون إنتاجية الكتلة الحيوية 5 عبارة عن وزن Gls خالي من الغبار ash free dry weight (AFDW) « وزن «la وزن رطب؛ أو إنتاجية كربون عضوي إجمالي total organic carbon (©10). وعلى نحو بديل أو بالإضافة إلى ذلك» فإن ناتج sia 5611 يمكن أن ينتج المزيد من المنتجات الحيوية؛ مثل؛ على سبيل المثال وليس الحصر؛ الشحم lipid أو البروتين 00018(17أو الكريوهيدرات carbohydrates أو واحد أو أكثر من البولي كيتيدات وتربينويدات dterpenoids والخضابات pigments 0 ومضادات الأكسدة antioxidant والفيتامين cvitamin وواحد أو أكثر من الأحماض؛ وواحد أو أكثر من الكرويهيدرات carbohydrates والكحول والهرومون والسيتوكين 6 والببتيد أو البوليمر الذي يتم إنتاجه بواسطة الكائن الحي من عينة المقارنة التي تمت زراعتها تحت ظروف مشابهة إلى حد كبير على نفس الفترة الزمنية. في بعض النماذج؛ فإن الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج 5 الطفرة كما تم توفيره هنا ينتج على الأقل 9610؛ على الأقل 9615؛ على الأقل 9620 على الأقل
5. على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على الأقل 9640؛ على الأقل 9645؛ على الأقل 0. على الأقل 9660 على JN 9670؛ على الأقل 9680 على الأقل 9690 أو على الأقل 96100 أكثر من الكتلة الحيوية بالمقارنة مع الكائن الحي الخاص بالتخليق الضوئي الذي تمت زراعته أو تمت زراعته في ظل ظروف مشابهة إلى حد كبير للظروف التي تكون فيها الطحالب في شلك دفعات أو في صورة شبه متصلة أو في صورة ظروف زراعة مستمرة (Sag أن
تكون ظروف زراعة زاخرة بمادة التغذية أو يمكن أن تكون ظروف زراعة ليس بها نيتروجين؛ أو يمكن أن تكون ظروف بها تغذية ضوئية ذاتية. يمكن أن يكون للإنتاجية العالية من تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 مقطع شبكي للامتزاز الوظيفي
0 المنخفض من نظام ضوئي مخفض (PSII) ١١ (PSIl) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ أو "حجم هوائي PSII مخفض". على سبيل المثال؛ يمكن تقليل حجم الوحدة المقطعية الخاصة بهوائي 05/١١ من خلال تقليل بمقدار على الأقل حوالي 9610؛ على الأقل 9620 على الأقل 0. على الأقل 9625؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على الأقل 9640؛ على الأقل 5. على الأقل 9650 على الأقل 9660 على الأقل حوالي 9670 أو على الأقل حوالي
5 %80 بالنسبة لحجم هوائي PSI بالنسبة للكائن الدقيق من عينة المقارنة. يمكن أن يكون لناتج طفرة (STIL بشكل إضافي مقطع عرضي للامتصاص الوظيفي من (OPS) PSI على سبيل المثال» يمكن تقليل حجم الوحدة المقطعية العرضية الخاصة بهوائي نظام ضوئي منخفض ١ REDUCED PHOTOSYSTEM ١ (ا05)من خلال تقليل بمقدار على الأقل 9610؛ على الأقل 9620؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9625؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على
0 الأقل 9640؛ على الأقل 9645؛ على الأقل 9650؛ على الأقل 9660 بالنسبة لحجم هوائي نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١ ابالنسبة لكائن التخليق الضوئي من عينة المقارنة. في العديد من النماذج فإن الكائن الحي للتخليق الضوئي photosynthetic organism لناتج الطفرة كما تم توفيره هنا يشتمل على 77/710 متزايد بالنسبة للكائن الخاص بالتخليق الضوئي من
5 عينة المقارنة. على سبيل المثال؛ فإن كائن التخليق الضوئي لناتج الطفرة يكون به Iulia FV/FM
بمقدار على الأقل 965؛ على الأقل 9610؛ على الأقل 9612؛ على الأقل 9615؛ على الأقل 0. على الأقل 9630؛ على الأقل 9640 أو على الأقل 9650 بالنسبة للكائن الحي من التخليق الضوئي من عينة المقارنة؛ على سبيل (JE يتزايد بين حوالي 965 وحوالي 1650 أو بين حوالي 765 وحوالي 7630 بالنسبة لكائن حي من التخليق الضوئي من عينة المقارنة.
علاوة على ذلك؛ فإن الكائن الحي للتخليق الضوئي photosynthetic organism الذي تم توفيره هنا يمكن أن يكون به مقدار متزايد من النقل الإليكتروني على جانب المستقبل من النظام الضوئي اا(7”©98/1 ) بالنسبة لعينة المقارنة أو بالنسبة لخلية من النوع غير المعالج. يمكن أن يشتمل ناتج الطفرة كما تم توفيره هنا على lly 7”©08/1 ded تتزايد بمقدار على الأقل حوالي %20 9630 9640 9650 9660 9680؛ أو 96100 بالنسبة للنوع غير المعالج أو للكائن
0 الحي من عينة المقارنة. بالإضافة إلى ذلك؛ فإن معدل تثبيت الكربون (C) *«00018)) في ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT كما تم توفيره هنا يمكن أن يزيد بالنسبة للكائن الحي من due المقارنة. على سبيل المثال؛ فإن Pmax (©14) يمكن أن تتم زيادته بمقدار على الأقل حوالي %20 9630 9640 9650 9660 5 %80< أو 16100 بالنسبة للنوع غير المعالج أو للكائن الحي من die المقارنة. في بعض النماذج؛ فإن نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون بها نظام ضوئي منخفض ١ REDUCED PHOTOSYSTEM | (ا05)متناقصاً و/أو حجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ ويمكن أن تشتمل Lad على كميات عالية من رببولوز باي فوسفات كريوكسيلاز أكتيفاز ( ريبولوز أكتيفاز أو (RA بالمقارنة بعينة المقارنة أو بالكائن al) غير المتجانس؛ على سبيل المثال» على الأقل حوالي ¢1.2 1.4؛ 1.6 1.8 2 أو 2.5 ضعف من كمية suns) أكتيفاز (RA) RUBISCO ACTIVASE في شكل GIS حي من عينة المقارنة. في بعض النماذج؛ فإن نواتج الطفرة توضح التعبير المتناقص من 6< 8؛ ¢10 12 أو 14 جين LHCP وتعبير متزايد من جين ie RA جين RA-Q أو RA- 5 8. تم هنا الكشف عن كائنات حية للتخليق الضوئي ناتجة الطفرة lly تشتمل على كمية
منخفضة من الكلوروفيل chlorophyll وحجم هوائي نظام ضوئي مخفض ١١ (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١ مخفض حيث أن الهوائي يكون به كمية أعلى من روبيسكو أكتيفاز بالمقارنة بالكائنات الحية من التخليق الضوئي لعينة المقارنة. يمكن أن يكون لنواتج الطفرة جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT (GROWTH IMPROVEMENT 1 5 ويمكن أن يكون بها إنتاجية Jef بالمقارنة بالكائنات الحية الخاصة بالتخليق الضوئي لعينة المقارنة. تقوم جينات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH (561) IMPROVEMENT 1 بتشفير البولي ببتيد polypeptide المشتمل على نطاق مستقبل استجابة response receiver (RR) ونطاق amyb حيث أن نطاق myb يكون عبارة عن الطرف - C 0 بالنسبة لنطاق RR في بعض النماذج؛ فإن الجين يشفر البولي ببتيد polypeptide الذي له خصائص نطاق fag) من النهاية الطرفية (N= ورابط myb-RR حيث يكون الرابط عبارة عن متوالية حمض الأميني التي لا تكون عبارة عن gia من نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER أو نطاق 0لا00. يمكن أن يكون يشتمل الرابط بشكل اختياري على متوالية موضع نووي nuclear localization sequence (NLS) يمكن أن يكون بولي بيتيد SGI polypeptide عبارة عن بولي ببتيد polypeptide له الطرف N= من النطاق RR بالنسبة لنطاق myb بواسطة الرابط الذي لا ينتمي لأي نطاق؛ حيث أن البولي ببتيد polypeptide 41 درجة من على الأقل 350 Lexie يتم مسحه باستخدام Hidden Markov (HMM) Model التي تتعرف على خصائص نطاق تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (5611) من البولي ببتيد wipolypeptide 0 1ا56 من الطحالب؛ كما تم توضيحه في المثال رقم 6. تم توفير أمثلة للبولي ببتيد ciipolypeptide المذكورة من SGI في الجدول رقم 3 والجدول رقم 4. في العديد من الأمثلة؛ فإن الجين الذي يتم توهينه في ناتج الطفرة كما تم توفيره هنا يمكن أن يقوم بتشفير (في الكائن الحي من النوع غير المعالج ) بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) والذي له نطاق myb 5 المشتمل على الأقل على 9655؛ على الأقل 9665؛ على الأقل 9670 على الأقل 9675
على JN 9680؛ على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على الأقل 9695؛ من التطابق في هوية متوالية الحمض الأميني بالنسبة لنطاق Jia emyb المتوالية بهوية رقم: 58 المتوالية بهوية رقم: ¢59 المتوالية بهوية رقم: 60« المتوالية بهوية رقم: 61؛ المتوالية بهوية رقم: 62؛ المتوالية بهوية رقم: 63؛ المتوالية بهوية رقم: 64؛ المتوالية بهوية رقم: 65؛ المتوالية بهوية رقم: 66؛ المتوالية بهوية رقم: 67؛ المتوالية بهوية رقم: 68؛ المتوالية بهوية رقم: 69؛ المتوالية بهوية رقم: 0 المتوالية بهوية رقم: 71 المتوالية بهوية رقم: 72 المتوالية بهوية رقم: 73» المتوالية بهوية رقم: 74 أو المتوالية بهوية رقم: 75 و/أو يشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER به على الأقل 9650؛ على الأقل %55 على الأقل 9660 على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680 على الأقل 9685؛ 0 على الأقل 9690؛ أو على الأقل 9695 من التطابق في متوالية الحمض الأميني بالنسبة لنطاق Jie RR المتوالية بهوية رقم: 40 المتوالية بهوية رقم: 41؛ المتوالية بهوية رقم: 42 المتوالية بهوية رقم: 43؛ المتوالية بهوية رقم: 44( المتوالية بهوية رقم: 45؛ المتوالية بهوية رقم: 46؛ المتوالية بهوية رقم: 47؛ المتوالية بهوية رقم: (AB المتوالية بهوية رقم: 49 المتوالية بهوية رقم: 0 المتوالية بهوية رقم: 51؛ المتوالية بهوية رقم: 52( المتوالية بهوية رقم: 53؛ المتوالية بهوية 5 رقم: 54 المتوالية بهوية رقم: 55« المتوالية بهوية رقم: 56؛ أو المتوالية بهوية رقم: 57. وعلى نحو بديل؛ أو بالإضافة إلى ذلك»؛ فإن الجين الذي تم توهينه في ناتج طفرة كما تم توفيره هنا يمكن أن يشفر (في الكائن الحي من النوع غير المعالج) البولي ببتيد polypeptide الذي يشتمل على متوالية حمض أميني بها على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل 9660؛ على الأقل 5. على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685؛ على الأقل 0 %90( أو على الأقل 9695 من التطابق في متوالية الحمض الأميني بالنسبة لبولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT Jie GROWTH IMPROVEMENT 1 المتوالية بهوية رقم :3 المتوالية بهوية رقم: 9؛ المتوالية بهوية رقم: 10 المتوالية بهوية رقم: 11( المتوالية بهوية رقم: 12؛ المتوالية بهوية رقم: 3 المتوالية بهوية رقم: 14 المتوالية بهوية رقم: 15( المتوالية بهوية رقم: 16 المتوالية بهوية 5 رقم: 17 المتوالية بهوية رقم: 18( المتوالية بهوية رقم: 19( المتوالية بهوية رقم: 20 المتوالية بهوية رقم: 21( المتوالية بهوية رقم: (DD المتوالية بهوية رقم: 23( المتوالية بهوية رقم: 24
المتوالية بهوية رقم: 25( المتوالية بهوية رقم: 26؛ المتوالية بهوية رقم: 27؛ المتوالية بهوية رقم: 28 المتوالية بهوية رقم: 29( المتوالية بهوية رقم: 30, المتوالية بهوية رقم: 31؛ المتوالية بهوية رقم: 32 المتوالية بهوية رقم: 33( المتوالية بهوية رقم: 34؛ المتوالية بهوية رقم: 35( المتوالية بهوية رقم: 36 المتوالية بهوية رقم: 37, المتوالية بهوية رقم: 38( أو المتوالية بهوية رقم: 39. "تم هناء في بعض النماذج؛ توفير كائنات دقيقة طحلبية ناتجة طفرة لها جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT موهن» حيث أن نواتج الطفرة يكون بها إنتاج كتلة حيوية عالية أو تمنت المزيد من المنتج الحيوي؛ بالمقارنة مع الكائنات الدقيقة الطحلبية الخاصة بعينة المقارنة. يمكن أن يكون للتطفيرات الطحلبية كلوروفيل chlorophyll منخفض ويمك أن تشتمل على حجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED 011010575184١١ 0 منخفض. في بعض الأمثلة؛ فإن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 الذي يتم توهينه في ناتج الطفرة يمكن أن ash بتشفير بولي ببتيد sills 5611 polypeptide له نطاق myb المشتمل على الأقل على %55 على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685 على الأقل 9690 5 أو على الأقل 9695؛ من التطابق في هوية متوالية الحمض الأميني بالنسبة لنطاق 0لا07؛ مثل المتوالية بهوية رقم: 58؛ المتوالية بهوية رقم: 59( المتوالية بهوية رقم: 60؛ المتوالية بهوية رقم: 1 المتوالية بهوية رقم: 62؛ المتوالية بهوية رقم: 63؛ المتوالية بهوية رقم: 64؛ المتوالية بهوية رقم: 65؛ المتوالية بهوية رقم: 66؛ المتوالية بهوية رقم: 67؛ و/أو يشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER به على الأقل 9650 على الأقل 9655 على 0 الأقل 9660؛ على الأقل 9665؛ على الأقل 9670 على الأقل 9675؛ على الأقل 80 على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على الأقل 9695 من التطابق في متوالية الحمض الأميني بالنسبة لنطاق Jie RR المتوالية بهوية رقم: 40 المتوالية بهوية رقم: 41؛ المتوالية بهوية رقم: 42 المتوالية بهوية رقم: 43؛ المتوالية بهوية رقم: 44؛ المتوالية بهوية رقم: 45 المتوالية بهوية رقم: 46 المتوالية بهوية رقم: AT المتوالية بهوية رقم: 48( المتوالية بهوية رقم: 49. وعلى نحو 5 بديلء أو بالإضافة إلى ذلك» فإن الجين الذي تم توهينه في ناتج الطفرة كما تم توفيره هنا يمكن أن
يشفر (في الطحالب من النوع غير المعالج) البولي ببتيد polypeptide الذي يشتمل على متوالية
حمض أميني بها على JY) 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل %60 على الأقل 9665؛
على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685 على الأقل 9690
أو على الأقل 9695 من التطابق في متوالية الحمض الأميني بالنسبة لبولي ببتيد polypeptide 5 تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 مثل المتوالية بهوية )3:08( المتوالية بهوية رقم: 9< المتوالية بهوية رقم:
0 المتوالية بهوية رقم: 11( المتوالية بهوية رقم: 12 المتوالية بهوية رقم: 13( المتوالية بهوية
رقم: 14 المتوالية بهوية رقم: 15( المتوالية بهوية رقم: 16؛ المتوالية بهوية رقم: 17 المتوالية
بهوية رقم: 18 أو المتوالية بهوية رقم 19.
0 بالإضافة إلى ذلك؛ تم هنا توفير نواتج طفرة طحلبية لها جين 1ا56 موهن والذي له محتوي بروتين 010160 عالي لكل وحدة من الكتلة الحيوية بالمقارنة مع الطحالب السليفة التي تم ie اشتقاقها. يمكن أن يشتمل محتوي البروتين Jlaliprotein من الطحالب؛ على سبيل (Jad) على الأقل على 965؛ على الأقل على 9610؛ على الأقل 9615 أو على الأقل على 9620 أكثر م البروتين leprotein أساس الكتلة الحيوية بالمقارنة مع عينة المقارنة أو مع الطحالب من النوع
5 الذي لم تتم معالجته. في بعض النماذج؛ فإن نواتج طفرة SGI الطحلبية كان لها محتوي بروتين 07د يوضح معدل نمو أعلى و/أو إنتاجية كتلة حيوية أعلى بالمقارنة مع عينة المقارنة أو مع السلاسل الطحلبية من النوع غير المعالج أو من عينة المقارنة التي تم منها اشتقاقها. تم أيضاً تضمين الكتلة الحيوية من الطحالب البروتينية العالية والتي يكون بها الكتلة الطحلبية مشتملة على خلايا طحلبية متطفرة والتي بها جين 1ا56 موهن؛ حيث أن الخلايا الطحلبية المتطفرة لها محتوي
0 بروتين 00016(0على بالمقارنة مع الطحالب من النوع لبري أو الطحالب من عينة المقارنة التي تم منها اشتقاقها. علاوة على ذلك تم توفير ناتج تحلل خاص بخلايا ناتجة طفرة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT من الطحالب. يمكن أن يكون ناتج التحلل به بشكل اختياري محتوي بروتين Jlelprotein من ذلك الخاص بناتج تحلل الطحالب من النوع البري.
(Sa أن تقوم LESH الدقيقة الطحلبية ناتجة الطفرة التي بها جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) موهن؛ بإنتاج المزيد من الكتلة الحيوية أو المزيد من المنتج الحيوي بالمقارنة Le تم إنتاجه بواسطة الكائن الحي الخاص بعينة المقارنة الذي تمت زراعته تحت نفس الظروف إلى حد كبير. يمكن أن يكون المنتج الحيوي؛ على سبيل المثال» عبارة عن كتلة حيوية؛ أو شحم lipid أو بروتين 0101817أو كريوهيدرات. في العديد من النماذج؛ فإن ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يمكن أن يقوم بإنتاج أكثر من واحد أو كثر من الشحوم أو واحد أو أكثر من البروتينات أو واحد أو أكثر من البولي كيتيدات وتربينويدات terpenoids والخضابات pigments ومضادات الأكسدة antioxidant والفيتامين vitamin 0 وواحد أو أكثر من الأحماض؛ وواحد أو أكثر من الك رويهيدرات «carbohydrates والكحول والهرومون والسيتوكين Cytokine والببتيد أو البوليمر الذي يتم إنتاجه بواسطة الطحالب من عينة المقارنة التي ليس بها جين 561 موهن. في بعض النماذج» فإن الطحالب ناتجة الطفرة يكون بها جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 موهن تم إنتاجه عند 9610؛ على الأقل9615؛ على 5 الأقل9620؛ على الأقل9625؛ على الأقل9630؛ على الأقل9635؛ على الأقل9640؛ على الأقل9645؛ على الأقل9650؛ على الأقل9660؛ على الأقل9670؛ على الأقل9680؛ على الأقل9690 أو على الأقل 96100 أكثر من المنتج الحيوي بالمقارنة مع طحالب die المقارنة تحت نفس الظروف إلى حد كبير؛ والتي يمكن أن يتم إنتاجها في صورة دفعية أو في صورة شبه مستمرة» أو في ظروف مزرعة متصلة ويمكن أن تكون في ظروف ded) زاخرة بمادة التغذية أو 0 يمكن أن تكو ظروف مستنفد منها النيتروجين أو يمكن أن تكون في ظروف تغذية ذاتية ضوئية. يمكن قياس الكتلة الحيوية؛ على سبيل المثال؛ الوزن الخالي من الرماد ash free (AFDW) dry weight أو الكريون العضوي الإجمالي total organic carbon (TOC) علاوة على ذلك؛ فإن ناتج الطفرة الطحلبي يمكن أن يكون له جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (1ا56) موهن ويمكن أن 5 يشتمل على إنتاجية أعلى بالنسبة لعينة المقارنة أو الطحالب من النوع البري التي يكون بها
كلوروفيل chlorophyll مخفض بالنسبة لعينة المقارنة أو بالنسبة للطحالب من النوع البري. على سبيل المثال» يمكن أن يتم تقليل الكلوروفيل chlorophyll بمقدار حوالي 9620 إلى حوالي %80 بالنسبة لمستويات النوع غير المعالج؛ على سبيل المثال؛ بمقدار حوالي %30 إلى حوالي 70670 من مستويات النوع غير المعالج.
يمكن أن يشتمل الكائن al الدقيق من الطحالب ناتج الطفرة على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (1ا56) الموهن كما تم توفيره هنا Sang أن يكون به نظام ضوئي مخفض reduced photosystem ١١ (PSII) Il من حجم الهوائي. على سبيل المثال؛ يمكن تقليل حجم الوحدة المقطعية العرضية من هوائي PSII من خلال تقليل بمقدار على الأقل 9610؛ على الأقل 9620؛ على الأقل 9630؛ على الأقل
0 625»؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على الأقل 9640؛ على الأقل 9645؛ على الأقل 0. على الأقل 9660 بالنسبة لحجم هوائي PSI بالنسبة للكائن الدقيق من عينة المقارنة. يكون لناتج الطفرة من الطحالب الذي تم توفيره هنا جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 موهن والذي يوضح إنتاجية أعلى بالمقارنة بالكائن الدقيق من عينة المقارنة والذي يشتمل بشكل إضافي واختياري على هوائي
من نظام ضوئي مخفض | (ا05). على سبيل JE) يمكن تقليل حجم الوحدة المقطعية العرضية من هوائي نظام ضوئي مخفض (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ اا من خلال تقليل بمقدار على الأقل 9610؛ على الأقل 9620؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9625؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على الأقل 9640؛ على الأقل 9645؛ على الأقل 9650؛ على الأقل 9660 بالنسبة لحجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED
01101058751814١ 20 بالنسبة للكائن الدقيق من عينة المقارنة. وبصورة إضافية؛ فإن الطحالب ناتجة الطفرة التي تم توفيرها هنا تشتمل على جين تحسين نمو nS مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT الذي به امتصاص كربون متزايد موضع لمعدل التخليق الضوئي بالنسبة للطحالب من عينة المقارن؛ على سبيل المثال» (C) Pmax بالنسبة للطحالب من عينة المقارنة. يمكن أن تزيد
Pmax 5 (©) بمقدار على الأقل حوالي 9610؛ على الأقل 9620؛ على الأقل 9625؛ على الأقل
— 1 3 —
%30< على الأقل 9640؛ على الأقل 9645؛ أو على الأقل %50 بالنسبة ل (C) Pmax من
الكائن الدقيق لعينة المقارنة.
يمكن أن يشتمل ناتج الطفرة من الطحالب على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1
(SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 موهن به تعبير منخفض من
5 جينات LHC على سبيل (JB يكون هناك على الأقل 6؛ على الأقل 8؛ على الأقل 10؛ على
الأقل 12 جين LHC يتم تقليله بشكل منتظم بالنسبة لمستوي التعبير في خلية due المقارنة.
يمكن أن يكون النقص فى تعبير جينات (LHC على سبيل (Jha عند على الأقل 9620
%30 %40 %50 97660 أو 9670 من aril) في مستوي نواتج الانتساخ LHC
علاوة على ذلك» يمكن أن يكون ناتج طفرة الطحالب كما تم توفيره هنا والذي يحتوي على جين 0 تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 موهن قد زاد من وفرة بولي ببتيد polypeptide روبيسكو أكتيفاز (RA)
1.5 يمكن أن يكون مستوى بروتين 0016:0174 على سبيل المثال» .4051500 Activase
أضعاف أو 2 من الأضعاف أو 2.5 من الأضعاف أو أكبر من 2.5 ضعف من مستوى خلية
عينة المقارنة أو النوع البري. يمكن زبادة واحد أو JS من أيزوم ه>ا ألفا أو أيزوم RA بيتا في نواتج الطفرة ذات الإنتاجية العالية كما تم توفيره هنا. يمكن أيضًا رفع مستوى انتساخ روبيسكو
أكتيفاز (RA) RUBISCO ACTIVASE في ناتج طفرة الطحالب كما تم توفيره cla على سبيل
المثال» من حوالي 1.2 ضعف إلى 10 أضعاف مستويات الأنواع البرية أو أكثر. تم هنا في
بعض النماذج توفر ناتج طفرة طحالب الكلوروفيل chlorophyll التي لها حجم هوائي نظام
ضوئي مخفض (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ اا منخفض وزبادة التعبير عن RA 20 يمكن أن يكون التخفيض في حجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED
PHOTOSYSTEM ١١ على سبيل المثال؛ على الأقل 720 أو 730 على الأقل فيما يتعلق
بحجم هوائي PSI من النوع البري؛ ويمكن أن تصل الزيادة في مستوى البروتين sillprotein ¢
البري من روبيسكو أكتيفاز (RA) RUBISCO ACTIVASE إلى ضعفين.
في نماذج مختلفة»؛ يشتم ناتج طفرة الطحالب عالية الإنتاجية كما تم توفيره هنا والتي تحتوي على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 الموهن على 710 على الأقل» 712 على الأقل» 714 على (JN 5 على الأقل» 217 على الأقل» أو 720 على الأقل من البروتين leprotein أساس إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON من طحالب عينة المقارنة. على سبيل المثال» يمكن لطفرات الطحالب عالية الإنتاجية أن تنتج 710 على الأقل» 720 على الأقلء 725 على الأقل» 730 على الأقل» 735 على الأقل» 740 على الأقل» 750 على الأقل؛ أو ما لا يقل عن 60 7 من البروتين 00016(0من خلية عينة المقارنة على أساس يومي في نظام دفعة واحدة؛ نظام مستمرء أو نظام شبه مستمر. يمكن أن تكون الكائنات الحية الدقيقة الطحالب المتحولة كما تم توفيره هنا عبارة عن أي طحالب حقيقية النواة» على سبيل المثال لا الحصر كلوروفيت Chlorophyte أو كلوروفيت طحلبية .Charyophyte alga 0 على سبيل (Jbl يمكن أن تكون الطحالب المجهرية الطحلبية عبارة عن طحالب الكلوروفيت Chlorophyte من كلوروفيسيس <Chlorophyceace أو كلورودتدروفيسياء أو براسينوفيسيس» أو فئة تريبوكسيوفيسيا. في بعض النماذج؛ يمكن أن تكون الطحالب المجهرية الناتجة من الطفرة عضوًا في الكلوروفيسيس <Chlorophyceace مثل نوع من أستوموموناس؛ أنكيسترودوسموس؛ كارتيرياء كلاميوموناس» كلوروكوكوم؛ كلوروجونيوم» كريسوسفايراء دونالييلا» 5 هيماتوكوكوس» مونورافيديوم» نيكلوريس» أوبودوجونيوم؛ بيلا جونموناس بليوروكوس بيروبوتريريس؛ سينديسميوس أو فولفوكس. في نماذج بديلة؛ يمكن أن تكون الطحالب الدقيقة ناتجة الطفرة عضواً من الكلوروند روفيفيساي» مثل نوع من الأنواع من براسيفاديوس» شيرفاليا» أو تتراتاسيلميس. في نماذج edly يمكن أن تكون الطحالب الدقيقة ناتجة الطفرة عضواً من براسنوفيسيايس» واختياريا نوعا من اوستريكوكوس أو ميكروموناس. علاوة على ذلك وبصورة بديلة؛ يمكن أن تكون الطحالب 0 المجهرية الناتجة من الطفرة عضوًا في كلودوندروفايسيكاي»؛ مثل نوع من براسيفاديوس؛ شيرفيليا؛ أو تتراتاسيلميس؛ أو يمكن أن يكون عضوا في تريبوكسيفيهايساي؛ واختياريا نوعا من جنس تم اختياره من المجموعة المكونة من بوتريكوكوس» شلوريلا »أوكسينوكلوريلا» هيفوكلوريلا» مارينكلوريلاً» باراخلوريلاً» بسوكلوريلاً» تيتراكلوريلا» إريموسفيرا؛ فرانسيز؛ ميكروكينيوم؛ نانواكلوريس» أووكستيس؛ بيكوكلوروم؛ بروتوتيكاء ستيكوكوكوس؛ أو فيريديلا.
يتمثل الجانب الآخر من الاختراع في طريقة صنع منتج حيوي؛ حيث Jali الطريقة على استنبات ناتج طفرة ضوئية متحولة من ناتج الطفرة على النحو المنصوص عليه هنا ويحتوي على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 الموهن لإنتاج المنتج الحيوي. يمكن أن تشمل الطريقة كذلك استرداد المنتج الحيوي من المزرعة أو من الكائن الحي. على سبيل المثال؛ يمكن استرداد المنتج من وسط
المزرعة؛ أو خلايا الطحالب المحصودة؛ أو من المزرعة ككل؛ أو يمكن عزله عن النباتات عن طريق الحصاد أو تجانس الأنسجة النباتية؛ على سبيل المثال. يمكن أن يكون المنتج الحيوي؛ على سبيل المثال» عبارة عن الكتلة الحيوية أو البروتين siprotein الدهون أو الكريوهيدرات carbohydrates علاوة على ell يمكن أن يكون المنتج واحدًا أو أكثر من الدهون أو
0 البروتينات أو البوليكيتيدات أو التربينويدات terpenoids أو الأصباغ أو مضادات الأكسدة 0104 أو الفيتامينات أو النيوكليوتيدات أو الأحماض النووية أو الأحماض الأمينية أو الكريوهيدرات carbohydrates أو الكحول أو الهرمونات أو السيتوكينات أو الببتيدات أو البوليمرات polymers بعض النماذج» يكون المنتج عبارة عن AIS حيوية عالية البروتين» حيث يشكل البروتين 00016(0ما لا يقل عن 50 7 من إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC)
TOTAL ORGANIC CARBON 5 للكائن المخلق ضوئياً أو الأنسجة منه. في النماذج البديلة؛ يكون المنتج عبارة عن دهون؛ وقد يكون؛ على سبيل المثال؛ ثلاثي الجليسريد. يمكن أن تشتمل الطريقة على استنبات ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (1ا56) من الطحالب في dads واحدة؛ أو بصورة شبه مستمرة؛ أو في مزرعة مستمرة حيث قد تكون بيئة الاستزراع مليئة
0 بالمغذيات؛ أو يمكن أن تكون على سبيل المثال» خالية من النيتروجين. يمكن أن تكون الزراعة تحت ظروف التغذية الضوئية؛ حيث يكون الكربون غير العضوي؛ مثل ثاني أكسيد الكربون أو الكريونات؛ هو المصدر الوحيد للكربون في وسط الاستزراع لإنتاج الجزيئات العضوية بواسطة ناتج الطفرة من الطحالب. هناك جانب آخر للاختراع ينطوي على طريقة لعزل الطحالب الناتجة من الطفرة ذات الإنتاجية
5 العالية فيما يتعلق بالطحالب السليفة التي تم منها اشتقاق تلك الطحالب. تشتمل الطريقة على :
استنبات سلالة الطحالب في ظل ظروف تغذية ضوئية ذاتية شبه مستمرة أو مستمرة لعشرين جيلاً على الأقل وعزل سلالة متحورة واحدة على الأقل عن المزرعة؛ حيث يكون للسلالة المعزولة معدل نمو أعلى من السلالة السليفة من الطحالب. يمكن أن تشمل الطريقة خطوة التطفير قبل الزراعة. يمكن أن يكون؛ على سبيل المثال؛ التطفير عن طريق الأشعة UV أو إشعاع جاما أو الطفرات الكيميائية أو الطفرات التداخلية العشوائية أو التطفير المستهدفة. في العديد من النماذج؛ يتم
تعريض الطحالب لضوء ثابت أثناء الزراعة. في نماذج مختلفة؛ تكون شدة الضوء الذي تتعرض له الطحالب أثناء الاستزراع 500 ميكرو أينشتاين على (JB) 600 ميكرو أينشتاين» 700 ميكرو أينشتاين» على «JVI 800 ميكرو أينشتاين على الأقل» 900 ميكرو أينشتاين على الأقل» 1000 ميكرو أينشتاين على الأقل» 1100 على الأقل ميكرو أينشتاين» 1200 ميكرو أينشتاين على
0 الأقل. 1400 ميكرو أينشتاين على الأقل» 1600 ميكرو أينشتاين على الأقل؛» 1800 ميكرو أينشتاين على JS 2000 ميكرو أينشتاين على JN 2200 ميكرو أينشتاين على الأقل؛ 0 ميكرو أينشتاين على الأقل. يمكن تقييم سلالة الخلية المعزولة التي تحتوي على معدل نمو أعلى من أجل زيادة الإنتاجية بالنسبة لسلالة الخلية السليفة؛ على سبيل المثال» في طريقة الزراعية edad أو شبه المستمرة؛ أو
5 المستمرة. يمكن أن يشمل Jie ناتج طفرة عالي الإنتاجية اختيارياً على: قياس واحد أو أكثر من 71/507 سيجما “نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM Il PSI أو ©) Pmax ( (Pmax لتثبيت الكربون). يمكن أن تشمل الطريقة أيضًا تحديد تسلسل جينوم ناتج الطفرة المعزول ذي الإنتاجية العالية لتحديد التطفير.
0 وتكون طريقة أخرى خاصة بالاختراع عبارة عن طريقة لاختيار نواتج الطفرة من الطحالب ذات الإنتاجية dalled) حيث تشتمل الطريقة على: تحوير مجموعة من الطحالب؛ واختيار خلايا منخفضة الكلوروفيل chlorophyll باستخدام فرز الخلايا المنشط بالفلورية (FACS) وتوزيع سلالات الخلية المعزولة من خلايا تألق الكلوروفيل المنخفض المختار في أطباق متعددة العيون؛ وفحص LIA الفلوروفيل المنخفض في أطباق متعددة العيون في حجم الهوائي للنظام الضوئي Il
Fv/Fm (PSI) 5 واختيار سلالة خلية واحدة على الأقل بها حجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il
— 1 7 —
(PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ وزيادة الخلايا البرية لكي يتم اختيار ناتج الطفرة
عال الإنتاجية. يمكن أن تشتمل الطريقة بصورة اختيارية على قياس *«0018. يمكن تقييم سلالة
الخلية المعزولة التى تحتوي على معدل نمو أعلى من أجل زيادة الإنتاجية بالنسبة لسلالة الخلية
dala على سبيل المثال» فى طريقة الزراعية الدُفعية؛ أو شبه المستمرة؛ أو المستمرة. يمكن أن تشمل الطريقة PCR و/أو تسلسل gia واحد على الأقل من الجينوم من ناتج الطفرة المعزول ذي
الإنتاجية العالية لتحديد التطفير.
شرح مختصر للرسومات
شكل 11 يوفر مخطط يوضح lat في الإنتاجية الخاصة بتطفيرات تقليدية من باراكلوريلا NE=
7843 بالمقارنة مع 85 11 -| //ا تحت ظروف الزراعة المستمر الضوء أو شبه المستمرة (70665
0 في اليوم من التخفيف و2000 ميكرو أينشتاين» 961 من ثاني أكسيد الكربون (CO2) .(CARBON DIOXIDE تكون البيانات التي تم تمثيلها من المزارع المزدوجة البيولوجية. شكل 1ب يوفر مخطط يوضح lad في الإنتاجية الخاصة بتطفيرات تقليدية من باراكلوريلا - له 0 بالمقارنة مع 1-1185//ا تحت ظروف الزراعة المستمر الضوءٍ أو شبه المستمرة )%65 في اليوم من التخفيف و2000 ميكرو أينشتاين»؛ 961 من ثاني أكسيد الكربون (CO2)
.(CARBON DIOXIDE 5 تكون البيانات التي تم تمثيلها من المزارع المزدوجة البيولوجية. يكون الشكل رقم 2 عبارة عن مخطط خاص ببنية جين باراكلوريلا 1-2261 (5611) التي توضح مواضع SNPS التي تم اكتشافها بواسطة توالي الجينوم من NE-7843 و NE- 0 . تم توضيح الموضع المستهدف بواسطة حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) الخاص بتطفير قابل للإدراج يتوسطه 6859 .
0 يكون الشكل رقم 3 عبارة عن مخطط يوضح إنتاجيات إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON من نواتج طفرة محورة من باراكلوريلا 1-2261 (1ا56). تمثل البيانات انحراف متوسط وانحراف قياسي م ثلاثية نسخ بيولوجية تم اختباره تحت ظطظروف زراعة بضوءٍ مستمر )2000 ميكرو إليكترون) أو شبه مستمر.
يكون الشكل رقم 4 عبارة عن محاذاة خاصة بنطاق بمستقبل منظم الاستجابة response (RR) receiver من البولي ببتيد ©010م0017/06ات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 للطحالب. تكون المتواليات الموضحة هي 0/1-1185/ Parachlorella sp. ) متوالية بهوية رقم: 58(« Coccomyxa subellipsoidea 5 ( متوالية بهوية رقم: 59(« lucimarinus 0516000005 ( متوالية بهوية
رقم: 60(« Chlamydomonas reinhardtii ( متوالية بهوية رقم: 61)) Chromochloris Volvox cartericzofingiensis ( متوالية بهوية رقم: 63) 105 Tetraselmis sp. ) متوالية بهوية رقم: 64(« .Oocystis sp (متوالية بهوية رقم:65) و Micromonas sp. RCC299 (متوالية بهوية رقم:66 ).
0 الشكل رقم 5 عبارة عن محاذاة خاصة بنطاق Myb من بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT من الطحالب. تكون المتواليات الموضحة هي Parachlorella sp.
WT-1185 ( متوالية بهوية رقم: 40(« Coccomyxa subellipsoidea ( متوالية بهوية رقم: 41(« Ostreococcus lucimarinus ( متوالية بهوية رقم: 42(« Chlamydomonas reinhardtii ( متوالية بهوية
رقم: 43(« Chromochloris zofingiensis (متوالية بهوية رقم 44(« Volvox carteri ) متوالية بهوية رقم: 45( 105 Tetraselmis sp. ) متوالية بهوية رقم: 46(« .Oocystis sp (متوالية بهوية )47:48( و Micromonas sp.
RCC299 (متوالية بهوية رقم:48 ). الشكل رقم 6 عبارة عن شكل تخطيطي من طريقة فحص FACS-FIRe لم يتم توضيط ناتج التطفير» والذي يمكن أن يتم إجراؤه قبل FACS يمكن أن تشمل الطريقة كذلك اختبار قابلية
0 الإنتاج. JS رقم 7 عبارة عن مخطط خاص ببنية جين الباراكلوريلا يوضح مواضع 50105 التي تم اكتشافها بواسطة متوالية الجينوم من NE-13380 3 NE-07843 و «GE-13371 «GE-13232 (GE-16399 (GE-16347 «<GE-16346 GE-16345 «GE13380 GE-16980 SGE-13428 الناتجة من التطفير الذي يتوسطه 0859. تم توضيح موضع
RNAs 5 الاسترشادي بواسطة الأسهم.
يكون الشكل رقم 8 عبارة عن مخطط يوضح نتائج التحليل التقريبية الدقيقة لكتلة حيوية من الباراكلوريلا من النوع غير المعالج من 1-1185//ا و NE=13380 ناتج التطفير التقليدي لكي يتم تحديد مستوي الشحم lipid والبروتين 0301861 والكريوهيدرات .carbohydrates تم الحصول على العينات من المزارع التي تمت تهيئتها بحيث تكون في Ala ثابتة عند 9640 من التخفيف اليومي في نظام شبه مستمر. تم تمثيل (FAMES والكريوهيدرات carbohydrates والأحماض
الأميني في شكل 96 من إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON الموجودة في أجزاء يتم حسابها بواسطة محتوي البروتين 0101860من كل فئرة من ناتج التحليل. أوضحت الأرقام الداخلية في 96 ل © في البروتين dadprotein النسبة المئوية الفعلية.
0 الشكل 9 عبارة عن خريطة حرارة تستند إلى بيانات نواتج الانتساخ ل 15 Gan من LHC من الباراكلوريلا والتي (باستثناء (CP26 التي يتم تنظيمها في ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT من NE- 3 فيما يتعلق بسلالة الوالدين من النوع البري من WT-1185 . شكال 10 رسم بياني يوضح نتائج تحليل MRM لمحتوى نظام ضوئي مخفض II (PSII)
REDUCED PHOTOSYSTEM ١ 5 و نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED JPHOTOSYSTEM | روبيسكو من النوع الباراكلوويلا من النوع البري (1-1185 //ا) وطفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 التقليدية NE-7843) و (NE-13380 عدد معقدات بروتين PSII proteinPSI و بروتين 01016(7روبيسكو لكل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC)
TOTAL ORGANIC CARBON 0 في النوع البري من 1-1185 /0/ا وناتج الطفرة من NE- .7843 شكال 10ب رسم بياني يوضح نتائج تحليل (sind MRM نظام ضوئي مخفض ١١ (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ و نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED JPHOTOSYSTEM | روبيسكو من النوع الباراكلوويلا من النوع البري (1-1185 //ا) وطفرات
5 تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH (561)
IMPROVEMENT 1 التقليدية NE-7843) و (NE-13380 عدد PSI و نظام ضوئي مخفض II (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ و معقدات بروتين 01016117وبيسكو لكل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON في النوع البري من WT-1185 و ناتج طفرة NE-13380 5 شكال 10ج رسم بياني يوضح نتائج تحليل MRM لمحتوى PSI نظام ضوئي منخفض ١
Kung) o(PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM | من النوع الباراكلوريلا من النوع البري (WT-1185) وطفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 التقليدية NE-7843) و .(NE-13380 عدد من PSI ونظام ضوئي مخفض ١١ (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM II ومعقدات بروتين
0 001600روبيسكو في النوع البري من 1-1185//ا NE=133805 ناتج الطفرة على أساس البروتين JSlprotein جرام. شكال 10د رسم بياني يوضح نتائج تحليل MRM لمحتوى PSI و نظام ضوئي منخفض ١ Kung) o(PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM | من النوع الباراكلوريلا من النوع البري (WT-1185) وطفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
GROWTH IMPROVEMENT 1 5 التقليدية NE-7843) و (NE-13380 انخفاض البروتين JSprotein إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON في تحليل MRM مقارنة بتحليل التقربب الدقيق (الشكل 8) الذي يرتبط بكفاءة الاستخراج غير المثالية. الشكل رقم 111 عبارة عن مخطط يوضح الاختلاف في نظام ضوئي مخفض ١١ (PSII)
REDUCED 011010575114١ 0 ونظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED 011010575110١ اومحتوي Seng) أكتيفاز Rubisco Activase (RA) من الباراكلوريلا من النوع غير المعالج (0/1-1185/) والتطفير التقليدي ل 0-7843 بواسطة التحليل الدقيق. الشكل رقم 11ب يوضح تبقيعات ويسترن المستخدمة للقياس الكمي PSII ونظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١ اوروبيسيكو أكتيفاز Rubisco (RA)
— 1 2 — 06 في الباراكلوريلا من النوع البري (WT=1185) وناتج التطفير التقليدي تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT من .NE-7843 الشكل رقم 12 يوضح مخطط يوضح NE=T7843 ناتج الطفرة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) التي تزيد من إنتاجية الكتلة الحيوية تحت ظروف زراعة SCPA (شبه المستمرة) في النموذج الضوئي على غرار CAdmperial Valley في اليوم الرابع من مايو. تمثل البيانات ثلاث نسخ بيولوجية. الشكل 13 عبارة عن رسم بياني يوضح تراكم إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON الحجمى فى ظل ظروف المعالجة الإشعاعية ب EPICs diel فى 0 دفعة يتوفر فيها N= يتم عرض البيانات المكررة البيولوجية بشكل فردي في SWT-1185 NE-13380 . الشكل رقم 114 عبارة عن مخطط يوضح الإنتاجية الحجمية ل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON في ظل دفعة خالية من N من نموذج 85م الذي تمت ملاحظته في سلالة NE-07843 بالمقارنة مع سلالة من النوع البري من WT-1185 5 الشكل رقم 14ب عبارة عن مخطط يوضح الإنتاجية الحجمية ل FAME في ظل دفعة خالية من N من نموذج AFS الذي تمت ملاحظته في سلالة NE-07843 بالمقارنة مع سلالة من النوع البري من 1-1185 /ل/ا. يوفر الشكل رقم 15 مخططات خاصة بأليلات بتتراسيليميس تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT ومواضع خاصة 0 بمتواليات مستهدفة خاصة بالتوجيه من MAL (وسيلة التوجيه 1) و 62ل (وسيلة التوجيه 2). شكل 116 مخطط يوضح محتوى الكلوروفيل chlorophyll في نواتج طفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT المستهدفة في 0859 على أساس إنتاجية كربون عضوي (TOC) TOTAL lea) .ORGANIC CARBON
— 2 2 — شكل 16ب مخطط يوضح محتوى الكلوروفيل chlorophyll في نواتج طفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT المستهدفة فى 0859 على أساس كل خلية . شكل 16ج مخطط يوضح محتوى الكلوروفيل chlorophyll في نواتج طفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT
المستهدفة , يوفر الكلوروفيل نسب أ: ب من نسائل ناتج الطفرة. شكل 117 مخطط يوضح قياسات ضوئية فسيولوجية من نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهفن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسميس مستهدفة من 0859 و المقطع العرضي نظام ضوئي مخفض Il (PSIl) REDUCED
01107095751784١ 0 المقاس عند 450 نانومتر شكل 17ب مخطط يوضح قياسات ضوئية فسيولوجية من نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسميس مستهدفة من 0859 و المقطع العرضي نظام ضوئي مخفض Il (PSIl) REDUCED PHOTOSYSTEM I المقاس عند 520 نانومتر
5 شكل 17ج مخطط يوضح قياسات ضوئية فسيولوجية من نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسميس مستهدفة من 0359 رو Fv /Fm شكل 17د مخطط يوضح قياسات ضوئية فسيولوجية من نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسميس
0 مستهدفة من CaSO والمعدل الإجمالي نظام ضوئي مخفض Il (PSIl) REDUCED .PHOTOSYSTEM ١١ شكل 118 رسم بياني يوضح قياسات فيزيائية ضوئية لنواتج طفرة تتراسليميس تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT المستهدفة في Cas9 و 14ج من *«2008 لكل خلية.
— 3 2 — شكل 18ب رسم بياني يوضح قياسات فيزيائية ضوئية لنواتج طفرة تتراسليميس تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT المستهدفة في 0859 و14ج من Pmax لكل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL .ORGANIC CARBON شكل 18ج رسم بياني يوضح قياسات 45058 ضوئية لنواتج طفرة تتراسليميس تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT المستهدفة فى Cas و معدل النمو. يوفر الشكل 19 رسمًا بيانيًا يوفر إنتاجية إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON المساحية لاثنين من سلالات ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين 0 الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسليميس مستهدفة من 0859؛ و 5124096و 51424098 في نظام زراعة شبه مستمر لمدة 24 ساعة. jis الشكل 120 رسمًا Gly يوفر إنتاجية إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON المساحية لاثنين من سلالات ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين 5 الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) تتراسليميس مستهدفة من «Cas9 و sSTR24096 51/424098 في نظام زراعة diel شبه مستمر. يوفر الشكل 20ب Wily Law) يوفر إنتاجية إنتاجية كربون عضوي (TOC) TOTAL lea] ORGANIC CARBON المساحية لسلالة ناتج طفرة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 1 من البراكلوريللا «SGI «(NE-78435 0 في نظام زراعة diel شبه المستمر. الشكل رقم 21 عبارة عن مخطط ضوئي من النوع غير المعالج من نباتات الأرابيدويسيس من النوع البري )4 قطاعات على اليسار) ونباتات الأرابيدوياس ناتجة الطفرة من ARR2 ( 4 قطاعات على اليمين) التي تُزرع لنفس العدد من الأيام.
— 2 4 —
يكون الشكل رقم 121 عبارة عن مخطط يوضح محتوي الكلوروفيل chlorophyll أ والكلوروفيل ب من النوع البري من نبات الأرابيدويسيس ونباتات ناتجة الطفرة من ARR2 في شكل نسبة مئوية من الوزن الرطب. الشكل 22 أ عبارة عن رسم بياني للوزن الجاف للنباتات الأرابيدويسيس من النوع البري ونباتات
ARR2 5 ناتجة الطفرة فى 23 Magi الشكل 22 ب عبارة عن رسم بياني للوزن الرطب للنباتات الأرابيدويسيس من النوع البري ونباتات 232 ناتجة الطفرة فى 23 يومًا. الشكل 22ج Ble عن رسم بياني للوزن الجاف للنباتات الأرابيدويسيس من النوع البري ونباتات 232 ناتجة الطفرة فى 18 Jag
0 الشكل 22د عبارة عن رسم بياني للوزن الرطبة للنباتات الأرابيدويسيس من النوع ull ونباتات 232 ناتجة الطفرة فى 18 Jag الوصف التفصيلىي: تم هنا توفير نواتج طفرة بها محتوي منخفض من الكلوروفيل chlorophyll وفعالية تخليق ضوئي عالية بالنسبة للطحالب من عينة المقارنة؛ والتي يكون بها نواتج الطفرة من الطحالب لها تعبير
15 موهن من الجين الذي يشفر البولي ببتيد polypeptide الذي يشتمل على نطاق مستقبل الاستجابة ونطاق متجانس. يكون بروتين 0001817018617 البكتيري عبارة عن عضو من نظام من اثنين من المحتويات Ally تؤثر على تغييرات خاصة بالانتساخ في مقدمة الإشارات البيئية في استجابة للإشارات البيئية.
0 وما لم يتم تحديد خلاف ذلك فإن كل المصطلحات التقنية والعلمية المستخدمة هنا لها نفس المعاني المفهومة بصورة شائعة للشخص ذي المهارة العادية في المجال الذي ينتمي ad] الاختراع. وفى حالة التعارض؛ سيتحكم الطلب الحالى؛ بما فى ذلك التعريفات. وما لم يقتض السياق خلاف ذلك؛ ستشتمل المصطلحات المفردة على صيغ الجمع وستشتمل مصطلحات الجمع على المفرد .
تكون كل الأمداء التي تم توفيرها في الطلب الحالي هي أمداء شاملة للقيم من الأطراف العلوية والأطراف السفلية من المدى ما لم يتم توضيح خلاف ذلك. تم دمج كل المنشورات»؛ وبراءات الاختراع والمراجع الأخرى المذكورة هنا كمراجع بكاملها لكافة الأغراض كما لو أن كل نشرة فردية أو طلب براءة فردي قد تم توضيحه ودمجه بشكل فردي هنا كمرجع. يشير المصطلح 'و/أو" كما تم استخدامه هنا إلى عبارة مثل "أو و/أو ب" هنا والتي يُقصد منها أن تشتمل على "أ وب "أ أواب" و أ" واب" يعني المصطلح "حوالي" إما 9610 من القيمة المذكور؛ أو في مدى 965 من القيمة التي تم ذكراء أو في بعض الحالات في مدى من 962.5 من القيمة المذكورة أو 'حوالي" والذي يمكن أن يشير 0 يعني التقريب لأقرب رقم هام. يستخدم مصطلح "الجين" على نطاق واسع للإشارة إلى أي جزء من جزيء الحمض النووي (بصورة نمطية الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID «(DNA) ولكن بشكل اختياري حمض نووي رببوزي (RIBONUCLEIC ACID (RNA) الذي يشفر البولي ببتيد polypeptide أو RNA الذي تم التعبير عنه. وبالتالي؛ تشتمل الجينات على 5 _متواليات تشفر RNA تم التعبير عنه (والتي (Ka أن تشتمل على متواليات مشفرة للبولي ببتيد polypeptide )5 « على سبيل المثال» (RNAS وظيفية؛ مثل RNAs رببوني و tRNAs RNAS في عكس اتجاه النسخ 5 microRNAS دقيق 5 RNAS من الهيبارين القصير والريبوزيمات؛ إلخ). قد تشمل الجينات أيضًا المتواليات المنظمة اللازمة للتعبير عنها أو التي تؤثر على التعبير عنهاء وكذلك المتواليات المرتبطة بالبروتين slprotein المتوالية المشفرة ل حمض 0 نوي RIBONUCLEIC ACID (RNA) (ism) في حالته الطبيعية؛ على سبيل المثال؛ متواليات الإنترون» 5 أو 3” من المتواليات غير المترجمة؛ إلخ. في بعض الأمثلة؛ قد يشير "all فقط إلى ia مشفر للبروتين 01016(7من جزيء الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) أو (RNA والذي قد يشمل أو لا يشمل الإنترونات. يفضل أن يكون الجين أكبر من 50 نيوكليوتيد في الطول؛ وبفضل أن يكون أكبر من
0 نيوكليوتيد في الطول؛ ويمكن أن يكون؛ على سبيل المثال؛ بين 50 نيوكليوتيد و 500000 نيوكليوتيد في الطول؛ die ما بين 100 نيوكليوتيد 100000 نيوكليوتيد في الطول أو بين حوالي 0 نيوكليوتيدات وحوالي 50000 نيوكليوتيد في الطول أو بين حوالي 200 نيوكليوتيد وحوالي 0 نيوكليوتيدات في الطول. يمكن الحصول على الجينات من مجموعة متنوعة من
المصادر؛ بما في ذلك الاستنساخ من مصدر محل الاهتمام أو التخليق من معلومات المتوالية المعروفة أو المتوقعة. يشير المصطلح "الحمض النووي" أو "جزيء الحمض النووي" إلى sin منالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) أو (على سبيل المثال؛ (MRNA) ويشمل أيضًا الأحماض النووية ذات الصور الأساسية المعدّلة (على سبيل المثال؛
0 الأحماض النووية الببتيدية؛ والأحماض النووبة المقفلة) أو القواعد النووية المعدلة أو غير المعدلة التي تحدث بشكل طبيعي. يمكن أن تكون جزيئات الحمض النووي عبارة عن جزيء مزدوج الجديلة أو منفرد الجديلة أو جزيء حمض نووي منفرد الجديلة أو جزيء حمض نووي الذي يشتمل على الجين أو جزءِ منه والذي يمكن أن يكون جديلة مشفرة (في اتجاه النسخ)؛ أو جديلة غير مشفرة (في عكس اتجاه النسخ).
5 يمكن أن يكون جزيء الحمض النووي أو البولي ببتيد polypeptide قد 'تم اشتقاقه من" مصدر موضح والذي يشتمل على عملية العزل (بصورة كاملة أو جزئية) لجزء الحمض النووي أو البولي ببتيد polypeptide من المصدر المحدد. يمكن أن يكون جزيء الحمض النووي مشتقاً من المصدر الموضح؛ على سبيل المثال؛ بواسطة الانتساخ المباشرء أو تكبير POR أو التخليق الصناعي من مصدر البولي نيوكليوتيد الموضح أو الذي يعتمد على متوالية مرتبطة مع مصدر
Joli 0 نيوكليوتيدات؛ Ally يمكن أن تكون؛ على سبيل (JB أنواع من الكائن الحي. تشتمل الجينات أو جزيئات الحمض النووي المشتقة من مصدر أو نوع معين أيضًا على جينات أو جزيئات الحمض النووي التي لها تعديلات متسلسلة Lad يتعلق بجزيئات الحمض النووي المصدر؛ أي متوالية جزيء الحمض النووي أو الجين المشتقة من متوالية جزيء الحمض النووي أو الجين من المصدر أو الأنواع المشار إليها ولكن قد يكون بها تعديلات. على سبيل المثال» يمكن أن
5 يشتمل الجين أو جزيء الحمض النووي المستمد من مصدر (de) سبيل المثال؛ جين محدد
مرجعي) على واحد أو أكثر من التطفيرات بالنسبة لجين المصدر أو جزيء الحمض النووي والذي يتم إدخاله بصورة غير مقصودة أو غير متعمدة؛ وإذا تم إدخال واحد أو أكثر من التطفيرات؛ بما في ذلك الاستبدالات أو الحذوفات أو الإدراجات بصورة متعمدة في تطفيرات المتوالية فإنه يمكن أن يتم إدخالها بصورة عشوائية أو بصورة مستهدفة من الخلايا أو الأحماض النووية؛ من خلال التطفير أو من خلال التخليق الجيني أو تقنيات معالجة حيوية جزيئية أو من خال التخليق الكيميائي أو باستخدام أي توليفة من ذلك. يتم اشتقاق الجين أو جزيء الحمض النووي من الجين المرجعي أو من جزيء الحمض النووي الذي يشفر حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) الوظيفي أو البولي ببتيد polypeptide الذي يمكنه تشفير RNA الوظيفي أو البلوي ببتيد المشتمل على 765 770 على الأقل» 775 780 على الأقل 7 785 على الأقل؛ 0 290 على الأقل؛ أو 795 على الأقل من التطابق في هوية متوالية مع بولي RNA الوظيفي المرجعي أو من المصدر أو البلوي ببتيد أو شظية وظيفية منه. على سبيل Jad) يتم اشتقاق الجين أو جزيء الحمض النووي من الجين المرجعي أو من جزيء الحمض النووي الذي يشفر RNA الوظيفي أو البولي ببتيد polypeptide الذي يمكنه تشفير RNA الوظيفي أو البلوي ببتيد المشتمل على 9685؛ 9690 على الأقل» 9695 9696 على الأقل 7 9697 على «JY 9698 5 على الأقل» أو 9699 على الأقل من التطابق في usa متوالية مع بولي حمض نووي Gis) RIBONUCLEIC ACID (RNA) الوظيفي المرجعي أو من المصدر أو البلوي ببتيد أو شظية وظيفية منه. وبصورة مشابهة؛ فإن البولي ببتيد polypeptide أو البروتين 001617المشتق من مصرد محدد أو أنواع محددة يشتمل على البولي ببتيد wipolypeptide أو البروتينات المشتملة على التعديلات 0 بالنسبة لمصدر البولي ببتيد ©10م708©8ا0مات؛ حيث أن البولي ببتيد polypeptide يتم اشتقاقه من المتواليات أو البولي ببتيد cipolypeptide من المصدر المرجعي أو الأنواع التي يمكن أ يكون بها تلك التعديلات. على سبيل المثال؛ يمكن أن يشتمل البولي ببتيد polypeptide أو البروتين 03016(7المشتق من المصدر (على سبيل المثال» على بروتين 01016[17مرجعي) والذي يمكن أن يشتمل على واحدة أو أكثر من التطفيرات (اختلافات الحمض الأميني) بالنسبة لبولي 5 ببتيد polypeptide المصدر والذي يكون غير مقصود أو يتم إدخاله بصورة متعمدة (على سبيل
المثال؛ بواسطة التطفير الخاص بتشفير جزيء الحمض النووي). قد يشتمل البولي ببتيد 6 المشتق من البولي ببتيد polypeptide المرجعي الذي به على الأقل 260 على الأقل 9665 770 على الأقل» 775 780 على الأقل 7 785 على الأقل» 790 على الأقل؛ أو 795 على الأقل من التطابق مع البولي ببتيد polypeptide لمرجعي أو مع الشظية الوظيفية _منه. على سبيل المثال؛ قد يشتمل البولي ببتيد polypeptide المشتق من البولي ببتيد aaa polypeptide الذي به على الأقل 9680؛ على الأقل 9685 9690 على الأقل؛ %95« 9696 على الأقل 7 9697 على الأقل» 9698 على الأقل؛ أو 9699 على الأقل من التطابق مع البولي ببتيد polypeptide لمرجعي أو مع الشظية الوظيفية منه. LS تم استخدامه هناء يشير 'معزول" إلى حمض نووي أو بروتين 00016(0الذي تمت إزالته من 0 الوسط الطبيعي أو السياق والذي يكون به الحمض النووي أو البروتين Taga gaprotein في البيئة الطبيعية. على سبيل المثال؛ تمت إزال البروتين 0301©817المعزول أو جزيء الحمض النووي من الخلية أو من الكائن الحي والذي يرتبط مع الوسط الطبيعي أو الوسط الأصلي. يمكن تنقية الحمض النووي المعزول أو البروتين protein بعض الحلالات؛ بشكل جزئي أو إلى حد كبير ولكن لا يوجد هناك مستوي تنقية محدد يمكن الحصول علية لغرض العزل. وبالتالي؛ على سبيل 5 المثال» فإن جزيء الحمض النووي (Sa أن يكون Ble عن متوالية حمض نووي والتي تم استئصالها من الكرموسوم؛ أو الجينوم أو الإيبوزوم حيث يتم تكاملها بداخل الطبيعية. يشير مصطلح متوالية نتيوكليوتيد أو متوالية جزيء حمض نووي "A أو متوالية بروتين slprotein بولي ببتيد polypeptide إلى متوالية خالية إلى حد كبير من المادة الخلوية ومن المكونات الخلوية. يمكن أن يكون جزيء الحمض النووي النقي أو البروتين Wlaprotein إلى حد 0 كبير من المواد الكيميائية فوق المادة المنظمة أو المذيب؛ على سبيل المثال. لا يقصد من المصطلح "خالية إلى نحو كبير" بأن يشير إلى مكونات أخرى خلاف جزيئات الحمض النووي الجديدة والتي لا تكون قابلة للاكتشاف. تشير المصطلحات "حادثة بشكل طبيعي" و" من النوع البري” إلى صورة موجودة في الطبيعية. على سبيل المثال؛ قد يوجد جزيء حمض نووي طبيعي أو من النوع البري أو متوالية النيوكليوتيد
أو البروتين protein صورة معزولة من مصدر طبيعي ea ولا يتم تعديلها عن قصد عن طريق المعالجة البشرية. وكما هو مستخدم هنا فإن مصطلح "الموهن” يعني انخفاض في الكمية أو الدرجة أو الشدة؛ أو القوة. الجين الموهن هو جين ينتج كمية أقل من منتجه المشفر و / أو ينتج منتجًا مشفرًا أقل نرظيفية؛ فيما يتعلق بالجين الموهن أو الجين من النوع البري. يمكن أن يقوم الجين الموهن في بعض الأمثلة بعدم إنتاج المنتجات المشفرة منه أو يمكن أن ينتج منتج جيني (بولي ببتيد (polypeptide الذي يكون غير فعال بشكل كامل. قد يشير التعبير الجيني الموهن إلى كمية و / أو معدل تم تخفيضه بشكل كبير في نسخ الجين ذي الصلة أو عمليات الترجمة أو الطي أو عمليات التجميع من البروتين 0301607المشفر. وكأمثلة غير محدودة؛ قد يكون الجين الموهن عبارة 0 عن جين متحور أو تم إتلافه ei) جين تم إتلافه عن طريق الحذف الجزئي أو الكلي؛ أو الاقتطاع؛ أو التحول الإطاري» أو طفرة الإدراج) الذي لا يشفر إطار قراءة وظيفي كامل أو يقلل من التعبير بسبب لتغيير أو الإتلاف في المتواليات التنظيمية الجينية: يمكن أن يكون الجين الموهن عبارة عن جين والذي يكون به واحدة أو أكثر من التطفيرات تؤثر على متوالية الحمض الأميني من البولي ببتيد polypeptide المشفرء حيث أن البلوي ببتيد المشفر يتم تقليله من Lal 5 الكمية 5 If النشاط بواسطة التطفير (التطفيرات). يمكن أن يكون الجين الموهن» Ble عن جين مستهدف بواسطة البنية ally تقلل من تعبير الجين؛ مثل؛ على سبيل (Jal حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) في عكس اتجاه النسخ أو RNA دقيق» جزيء RNAI أو الريبوزوم. يمكن أن يكون تعبير الجين الموهن Sle عن تعبير جيني والذي يقوم بالقضاء؛ على سبيل Jal على أو تقليل الكمية بشكل كبير أو بشكل لا يمكن اكتشافه. يمكن أن يكون تعبير 0 الجين الموهن؛ عبارة عن تعبير ينتج عنه RNA أو بروتين 00016(0والذي لا يكون وظيفياً بشكل كامل أو غير وظيفي؛ على سبيل المثال؛ يمكن أن يكون تعبير جين موهن والذي ينتج die حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) مقطوع و/أو بولي ببتيد polypeptide يشير مصطلح "جزيء حمض نووي خارجي المنشاً" أو ”جين خارجي المنشاً” إلى جزيء حمض نووي أو جين والذي تم إدخاله oF) تحويله") بداخل خلية. يمكن أن تتم الإشارة إلى خلية معدلة في 5 شكل dda ناتجة عودة الارتباط والتي يتم بها إدخال جين (جينات) خارجية المنشاً. يشار أيضًا إلى
تسل الخلية المحولة بجزيء الحمض النووي باسم "المحوّل" إذا ورث جزيء الحمض النووي الخارجي. يمكن اشتقاق الجين خارجي المنشاً أو جزيء الحمض النووي من أنواع مختلفة (وأيضاً "غير المتجانس) أو من نفس الأنواع (وما إلى ذلك "المتجانس) بالنسبة للخلية لاتي تم تحويلها. يكون جزيء الحمض النووي "داخلي المنشاً" أو البروتين Hlaeprotein عن جزيء حمض نووي أصليء أو جين أو بروتين Cusprotein يحدث؛ أو الذي يتم إنتاجه بشكل طبيعي من خلال
العائل. يتم استخدام المصطلح "أصلي" لكي يشير إلى متواليات الحمض النووي أو متواليات الحمض الأميني التي تحدث بشكل طبيعي في العائل. يتم استخدام المصطلح " غير أصلي " لكي يشير إلى متواليات الحمض النووي أو متواليات الحمض الأميني التي لا تحدث بشكل طبيعي في
0 العائل. وبالتالي؛ يكون الجزيء حمض نووي "غير أصلي" Ble عن جزيء حمض نووي والذي لا يكون موجوداً بشكل طبيعي في خلية العائل؛ على سبيل المثال؛ جزءِ الحمض النووي غير الأصلي والذي يكون خارجي بالنسبة للخلية العائلة أو الكائن الدقيق والذي يتم به إدخاله؛ ويمكن أن يكون غير متجانس بالنسبة للخالية العائلة أو الكائن الدقيق. وبصورة إضافية؛ فإن متوالية الحمض النووي أو متوالية الحمض الأميني التي تمت إزالتها من الخلية أو تعريضها للمعالجة في المعمل
5 .وتم إدخالها أو sale) إدخالها في الخلية العائلة بحيث تختلف في المتوالية أو الموضع في الجينوم بالنسبة للموضع في الكائن الحي غير المعالج (أي بصورة مجاورة مع أو مرتبط بشكل فعال مع المتواليات التي لا تكون مجاورة أو تم تشغيلها أو مرتبطة مع الكائن الحي غير المتحول) والتي يتم اعتبارها بأنها "غير أصلية". تشتمل الجينات غير الأصلية؛ على الجينات داخلية المنشاً بالنسبة للكائنات الدقيقة التي ترتبط بشكل فعال مع أو بمتواليات منظمة غير متجانسة والتي يتم ربطها
0 بصورة ناتجة عودة الارتباط مع الخلايا العائلة. يكون جزيء الحمض النووي 'ناتج عودة BLY أو "المعدل" عبارة عن جزيء حمض نووي والذي تم تغييره من خلال المعالجة البشرية. تشتمل الأمثلة غير الحصرية؛ على جزيء الحمض النووي ناتج عودة الارتباط الذي يشتمل على أي جزيء حمض نووي والذي: 1) تم تخليقه بشكل جزئي أو بشكل كلي أو تم تعديل في المعمل؛ على سبيل المثال؛ باستخدام تقنيات كيميائية أو
5 إنزيمية (على سبيل (JB) من خلال تخليق الحمض الكيميائي؛ أو باستخدام الإنزيمات الخاصة
بالانتساخ؛ البلمرة أو الاهتضام (الخارجي الحال للنويات أو الداخلي الحال للنويات)؛ أو عن Gob الريط أو الانتساخ العكسي أو الانتساخ أو تعديل القاعدة La) في ذلك؛ على سبيل المثال؛ المعالجة بالميثيل) و والتكامل أو المعالجة بناتج عودة الارتباط (بما في ذلك ناتج عودة الارتباط المتجانس أو ناتج عودة الارتباط المحدد بالزمن) من جزيئات الحمض النووي)؛ 2) يشتمل على متواليات نيوكليوتيد مرتبطة والتي لا ترتبط بصورة مشتركة في الطبيعة؛ 3) تم تعديله باستخدام
تقنيات الانتساخ الجزيئي بحيث يفتقر لواحد أو أكثر من النيوكليوتيدات بالنسبة لمتوالية جزيء الحمض النووي الحادث بشكل طبيعي؛ و/أو 4 تمت معالجته باستخدام تقنيات الانتساخ الجزيئي بحيث يكون به واحد أو أكثر من متغيرات المتوالية أو إعادة الترتيب بالنسبة لمتوالية الحمض النووي الحادث بشكل طبيعي. وكمثال غير حصري؛ فإن CDNA تكون عبارة عن جزيء الحمض
0 النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) ناتج عودة الارتباط كما هو الحال مع أي جزيء حمض نووي والذي تم إنشاؤه بواسطة تفاعل (تفاعلات) بوليمراز أو الذي ترتبط مه الرابط أو تم تكامله بداخل الناقل مثل؛ ناقل الانتساخ أو ناقل التعبير. يشير المصطلح "بروتين 0001610 ناتج sage الارتباط" كما تم استخدامه هنا إلى بروتين يتم إنتاجه بواسطة المعالجة الجينية بغض النظر عن ما إذا كانت الحمض النووي مختفاً
5 عن البروتين protein النوع البري. عند تطبيقه على الكائنات الحية؛ يشير المصطلح ناتج عودة الارتباط أو المعدل بالهندسة الوراثية أو المعدل جينياً إلى الكائنات الحية التي تم معالجتها عن طريق إدخال متوالية الحمض النووي ناتج عودة الارتباط غير المتجانس أو الخارجي المنشاً في الكائن الحي Ao) سبيل المثال؛ متوالية الحمض النووي غير الأصلية) والتي تشتمل على المعالجات الجينية والتطفيرات المستهدفة
0 واستبدال الجينات واستبدال المعزز والحذف أو التلف أو الإدراج وأيضاً الإدخال بداخل الجينات وأيضاً الإدخال عبر الجينات أو الجينات التخليقية أو متواليات الحمض النووي بداخل الكائن الحي. أي أن ناتج sage الارتباط أو المعدل أو المعالج بشكل جيني يشير إلى الكائنات الحية التي تم تغييرها بواسطة التدخل البشري. يمكن أن تكون الكائنات الحية ناتجة عودة الارتباط أو المعالجة بصورة جينية عبارة عن كائنات حية التي يتم بها إدخال الجين الذي 'تم تعطيله". تشتمل fio تلك
5 البنيات» على سبيل المثال» لا الحصر على؛ (RNAi ى siRNA 5 shRNA 5 microRNA
وبنيات عكس اتجاه النسخ cling ريبوزومية. وتم أيضاً تضمين الكائنات الحية والتي بها جينات تم تغييرها بواسطة نشاط إنزيمات ميجا نيوكلياز» ونيولكياز إصبع الزنك» 5 TALENS أو أنظمة .cas/CRISPR يمكن أن يتم تكامل جزيء الحمض النووي ناتج عودة الارتباط أو خارجي المنشاً في الجينوم من الكائن الحي المعدل بصورة جينية / ناتج عودة الارتباط أو يمكن أن لا يتم تكاملها في الجينوم العائل. وكما تم استخدامه هناء يشتمل المصطلح CAS دقيق ناتج عودة الارتباط" أو خلية عائل ناتجة sage الارتباط" على الذرية أو مشتقات من الكائنات الدقيقة ناتجة عودة الارتباط من الاختراع. ولأنه قد تطراً تعديلات معينة في الأجيال اللاحقة نتيجة إما للطفرة أو التأثيرات البيئية؛ فقد لا يكون هذا النسل؛ في الحقيقة مطابقًا للخلية الوالدية؛ لكنه يظل متضمتًا في as مجال المصطلح وفقًا للاستخدام الوارد في هذا الطلب.
0 يشير المصطلح 'معزز" إلى متوالية حمض نووي قادرة على ربط بوليمراز حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) في الخلية وبدء الانتساخ الخاص بمتوالية تشفير بعدية ( اتجاه 3' ). يشتمل المعزز على العدد عند الحد الأدنى له من القواعد أو العناصر الضرورية لبدء الانتساخ عند مستويات قابلة للاكتشاف على الصورة الأساسية. يمكن أن يشتمل المعزز على نطاقات الارتباط (متواليات توافقية) قابلة للاستجابة الخاصة بالارتباط من بوليميراز RNA
5 الغالب تشتمل المعززات حقيقية النواة» ولكن ليس "Lalas على صناديق "TATA" وصناديق CAT يمكن أن تشتمل المعززات أولية النواة على 10- و35 متواليات معزز توافقية. هناك عدد nS من المعززات؛ بما في ذلك المعززات الأساسية والمعززات القابلة للحث والمعززات القابلة للكبح؛ من العديد من المصادر المختلفة والمعروفة بشكل جيد في المجال. تشتمل المجالات التوضيحية؛ على سبيل المثال لا الحصر؛ على أنواع الخلية الطحلبية أو الفيروسية أو الخلية الثدية
0 خلايا الحشرات والنباتات وخلايا الخميرة وأنواع الخلايا البكتيرية والمعززات المناسبة من تلك المصادر والتي تكون قابلة للإتاحة أو يمكن أن تكون متاحة بسهولة على الإنترنت أو على سبيل المثال» من مكتبات ATCC (ie ومصادر تجارية أو مصادر فردية أخرى. يمكن أن تكون المعزات عبارة عن معززات أحادية الاتجاه (انتساخ مبدئي في أحد الاتجاهات) أو ثنائية الاتجاه (انتساخ مبدئي في أي من الاتجاهين). يمكن أن يكون المعزز عبارة عن معزز تأسيسي أو معزز
5 قابل للكبح أو يمكن أن يكون عبارة عن معزز قابل للحث. يمكن أن تشتمل منطقة المعزز»
بالإضافة إلى المعزز القريب الخاص بالجين؛ حيث يرتبط بوليميراز حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) لكي يتم البدء في الانتساخ» والمتوالية الغضافية العلوية من الجين ولاذي يمكن أن يكون في مدى من 1 كيلو بايت؛ 2 كيلو بايت؛ 3 كيلو بايت؛ 4 كيل بايت أو أكثر من موضع البدء الخاص بالانتساخ من الجين حيث يمكن أن تشتمل المتوالية الغضافية على التأثير الخاص بمعدل الانتساخ من الجين البعدي Sas اختياري الاستجابة الخاصة
بالمعزز نحو الظروف الخاصة بالتطوير أو الظروف البيئية أو الظروف الحيوية الكيميائية (على سبيل المثال»الأيضية). يشير المصطلح" غير متجانس" عندما يتم استخدامه عند الإشارة إلى البولي نيوكليوتيد؛ الجين أو الحمض النووي أو البولي ببتيد polypeptide أو الإنزيم إلى بولين نيوكليوتيد» جين حمض نووي
0 ويولي ببتيد polypeptide أو إنزيم؛ والذي يكون من مصدر أو مشتق من مصدر خلاف أنواع الكائن الحي من Bilal) وعلى النقيض من ذلك؛ فإن البولي نيوكليوتيد "غير المتجانس"؛ الجين والحمض النووي؛ البولي ببتيد polypeptide أو الإنيزم يتم استخدامه هنا لكي يشير إلى البولي نيوكليوتيد؛ الجين والحمض النووي أو البولي ببتيد polypeptide أو الإنزيم والذي يتم اشتقاقه من أنواع من الكائن الحي العائل. وعند الإشارة 790 المتوالية المنظمة للجين أو متوالية الحمض
5 النووي المساعدة المستخدمة في الحفاظ على أو معالجة متوالية الجين (على سبيل المثال؛ المعزز من منطقة غير مترجمة 5 المنطقة غير المترجمة 3” أو متوالية إضافة بولي أ ومتوالية الإنترون أو موضع التضفير أو موضع ربط الريبوزوم» موضع إدخال الريبزوم» ومنطقة تشابه الجينوم؛ وموضع ناتج عودة الارتباط إلخ) فإن مصطلح "غير متجانس" يشير إلى أن المتوالية المنظمة أو المتوالية المساعدة لا يرتبط بصورة طبيعية مع الجين والذي تكون المتوالية المنظمة أو متوالية
0 الاحمض الأميني المساعدة مجاورة له في البنية أو في الجينوم أو الإيبيسوم. ويهذه الطريقة فإن المعزز يرتطب بصورة فعالة مع الجين والذي لا يرتبط معه بشكل فعال في حالته الطبيعية (أي في الجينوم من الكائن الحي غير المعالج بصورة جينية) والذي تمت الإشارة إليه هنا 'كمعزز غير متجانس"؛ على الرغم من ذلك فإن المعزز يمكن اشتقاقه من نفس الأنواع (أي في بعض الحالات؛ نفس الكائن الحي) مثل الجين الذي يرتبط به.
وكما تم استخدامه (lia يقصد من المصطلح "بروتين"” أو بولي ببتيد ‘polypeptide أن يشتمل على "البولي ببتيد polypeptide "المنفرد”» وأيضا "البولي ببتيد "wipolypeptide بصيغة الجمع وبشير إلى جزيء يضم المونومرات (الأحماض الأمينية) المرتبطة بصورة خطية بواسطة روابط الأميد (والمعروفة Lad بانها روابط ببتيد). يشير المصطلح of ببتيد "polypeptide إلى أي عنصر حماية أو أي سلسلة أو سلال من الأحماض الأميني والتي لا تشير إلى طول محدد من
المنتج. وبالتالي؛ يتم استخدام الببتيدات؛ الببتيدات الثنائية؛ والببتيدات الثلاثية والأوليجيو ببتيدات؛ و"البروتين» و'سلسلة الحمض الأميني" أو أي مصطلح يتم استخدامه للإشارة إلى السلسلة أو السلاسل من اثنين أو أكثر من الأحماض الأمينية والتي تم تضمينها في التعريف من "البولي ببتيد "polypeptide والمصطلح 'البولي ببتيد ‘polypeptide الذي يمكن استدخامه Ya من أو بشكل
0 تبادلي مع أي من تلك المصطلحات. تكون أرقام الموصول لأي بروتين protein تم توفيرها بصورة شاعئة في الأقواس بعد الجين أو أسما ءالأنواع عبارة عن وسائل تعريف فريدة خاصة بسجل الجيد المتاح بصورة dale على موقع الويب للمركز الدولي للمعلومات الكيميائية الحيوية National Center for (NCBI)
|١007 لا09ا00.010.010.9017/(810180000) والذي يتم الحفاظ عليه في
5 0001.010.010.907. يكون رقم تعريف المتوالية 8Le (Gl) " 6601070 Cajal’ عن رقم محدد خاص بالنيوكليوتيد أو متوالية الحمض الأميني. إذا تم تغيير المتوالية بأي صورة؛ يتم تحديد عدد جديد من ا6. تكون أداة تاريخ مراجعة المتوالية متاحة لكي يتم تتبع العديد من أرقام Gl وأعداد النسخ وتواريخ التخديثات الخاصةب المتواليات (Ally تظهر في سجل جيني محدد. يكون البحث والحصول على الأحماض النووية أو متواليات الجين أو متواليات البروتين 001617معتمدة على
0 أحداد الوصول وأعداد Gl المعروفة بشكل جيد في المجال؛ على سبيل المثال؛ الصور الحيوية للخلية وخصائص الكيميائية الحيوية والخصائص البيولوجية والصور الجينية الجزيئية. وكما تم استخدامه هناء يتم تحديد المصطلحات "النسبة المئوية لهوية المتوالية" أو "التطابق” بالنسبة لحمض نووي أو متواليات البولي ببتيد polypeptide في شكل نسبة مئوية من النيوكليوتيد أو الوحدات البنائية للحمض الأميني في متوالية العضو والتي تكون متماثلة مع البولي ببتيد
cipolypeptide 5 المعروفة؛ وذلك بعد محاذاة المتوالية مع النسبة لامئوية عند الحد الأقصى لها
وفجوات الإدخال؛ إذا كان ذلك واضحاً؛ لكي يتم تحقيق النسبة المئوية للتشابه عند الحد الأقصى له. يجب أن يتم اعتبار أن الإدراج عند الطرف N= أو الإدراج عند الطرف -6 أو الحذوفات يجب اعتبارها باءها تؤثر على التشابه؛ أنواع الحذف الداخلية و/أو الإدراجات بداخل متوالية البولي ببتيد polypeptide من أقل من حوالي 30 أو أقل من حوالي 20 أو أقل من حوالي 10 من الوحدات البنائية للحمض الاميني والتي لا يجب اعتبارها بأنها مؤثرة على التشابه. إن التشابه أو الهوية عند مستوي متوالية حمض أميني أو مستوي نيوكليوتيد يمكن أن يتم تحديده بواسطة تحليل (Basic Local Alignment Search Tool ) BLAST الذييستخدم الخوارزم المستخدم بواسطة برامج مثل blastn y blastp رو blastx رو tblastn و Nucleic «Altschul (1997)) tblastx Proc.
Natl.
Acad.
Sci. «and Karlin (1990) «3402-3389 25 .Acids Res 2264-2268:USA 87 0 ) والتي تم تصميمها لعمليات البحث في تشابه المتوالية. تأخذ الطريقة المستخدمة بواسطة برنامج BLAST في الاعتبار أولاً للمقاطع؛ مع أو بدون فجوات؛ بين متوالية الاستفسار ومتوالية قاعدة البيانات؛ وبعد ذلك تقوم بتقييم الأهمية الإحصائية الخاصة بكل المطابقات Ally تكون قابلة للتحديد وفي الهاية يتم فقط تلخيص المتطاقات والتي تفير بالقيمة الحدية المختارة أولاً ally لها أهمية كبيرة. ولأغراض المناقشة فقط وأثناء البحث عن التشابه في 5 قواعد المتواليات» انظرء )1994( Nature Genetics 6:Altschul ,119-129 . إن متغيرات البحث الخاصة بالرسم البياني وأنواع الوصوف والمحاذاة؛ باستثناء (أي القيمة الحدية الهامة من الناحية الإحصائصة الخاصة بالوصر المطابقة الخاصة بالتقرير في مقابل متواليات قاعدة البيانات) cde shall shally والقولالب والمرشح (منخفض التعقيد) يمكن ضبطه عند الإعدادات الأصلية. كان قالب التصنيع الأصلي؛ المستخدم بواسطة blastx 5 blastp و thlastx ; thlastn 0 عبارة عن قالب Natl.
Acad.
Sci.
USA . Proc.Henikoff (1992) ( BLOSUM62 10915-10919:89 ) والذي تمت التوصية به فيما يتعلق بمتواليات الاستفسار على 85 وحدة في الطول (قواعد النيوكليوتيد أو الأحماض الأمينية). بالنسبة ل blastn فإن التصميم الخاص بمتواليات نيوكليوتيد المقارنة؛ وقالب التصنيف يتم ضبطه بواسطة نسب Me (أي؛ درجة المكافئة الخاصة بزوج من الوحدات البنائية الخاصة بالتطابق) 5 مع N ( أي درجة تعويضية خاصة بالوحدات البنائية غير المتطابقة)؛ حيث أن قيم الوضع
الأصلي الخاصة ب اا و لا يمكن أن تكون +5 و-4؛ على الترتيب. يمكن ضبط أربعة متغيرات WLS blastn يلي: 10=Q ( تعويض عن إنشاء الفجوة)؛ =R 10 (تعويض عن تمديد الفجوة)؛ الرفة =1 (إنشاء كلمة تصطدم عند كل موضع dd) بطول الاستفسار)؛ و 16-9807 (بط عرض النافذة بداخل محاذيات الفجوة التي تم توضيحها). يمكن أن تكون إعدادات المتغير من Blastp 5 خاصة بالمقارنة الخاصة بمتوالية لاحمض الأيمين التي يمن أن تكون عبارة عن : 8©-9؛ -2؛
الطرفة <1؛ و 32-08010. يمكن أن تقوم مقارنة 865171 بين المتواليات؛ المتاحة في نسخة «GCG package version 10.0 باستخدام متغيرات الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) حيث =GAP 50 (التعويض عن إنشاء الفجوة) 5 3=LEN (التعويض عن تمديد الفجوة) و الإعدادات المكافئة في مقارنة البروتين
igprotein 0 يمكن أن تكون 8=GAP 5 لاع ا-2. وكما تم استخدامها هنا فإن العبارة "استبدال حمض أميني محافظ' أو pila? محافظ” يشير إلى استبدال للحمض الأميني بواسطة حمض أميني آخر مع خاصية مشتركة. تكون الطريقة الوظيفية لخاصة بتحديد الخصائص المشتركة بين الأحماض الأمينية الفردية هي لتحليل الترددات الطبيعية من التغييرات الخاصة بالحمض الأميني بين البروتينات المناظرة من مبادئ الكائن الحية المتجانسة
Springer-Verlag«Schulz (1979) Principles of Protein Structure) 5 (. وطبقاً لتلك التحليلات؛ يمكن تحديد مجموعات الأحماض الأمينية عندما تكزون الأحماض الأمينية في مجموعة خاصة بالتبادل بصورة مفضلة مع كل منها ويالتالي تكون مشابهة لكل من أو معظمها ي التأثير على بنية البروتين Schulz (1979) Principles of Protein ( JlaYlprotein Springer-Verlag.Structure ( . يمكن أن تشتمل مجموعات الحمض الأميني التي تم تحديثها
20 في تلك الطريقة على: 'مجموعة قابلة للشحن/ مجموعة قطبية) تقتمل على AspGlu :50 Arge 0 ؛ و His ؛ ومجموعة عطرية أو "ils والتي تشتمل على «Tyr « PhePro و م1 ؛ و 'مجموعة "lal والتي تقتمل على Vale AlaGly م16 560/66 Thre « و5لا©. وفي كل مجموعة فإن المجموعات الفرعية يمكن أن يتم تحديدها. على سبيل Jal) فإن المجموعة من الأحماض المشحونة/ الأحماض القطبية يمكن أن يتم تقسيمها بشكل فرعي إلى
5 مجموعات فرعية بما في ذلك: "المجموعة الفرعية المشحونة بشكل موجب" التي تشتمل على Lys
His 5 Arg ؛ و'المجموعة الفرعية التي تم تشحنها بشكل سالب" المشتملة على Asn و Gn مثال آخرء فإن المجموعة العطرية أو المجموعة الحلقية يمكن أن يتم تقسيمها بشكل حلقي في مجموعات "ded تشتمل على (Pro و His و 110؛ و 'مجموعة فينيل فرعية"' تشتمل على Phe و الا1. في مثال إضافي» فإن المجموعة الأليفاتية يمكن أن يتم تقسيمها بشكل فرعي إلى مجموعات فرعية بما في ذلك: " المجموعة الفرعية غير القطبية الأليفاتية الكبيرة” التي تشتمل على
Val لاا و lle ؛ و 'مجموعة فرحية قطببية أليفاتية كبيرة” تشتمل على Met و5861 و1713 و Cys و "المجموعة الفرعية المتبقية الصغيرة" التي تشتمل على Gly و18/. تشتمل أمثلة التطفيرات المحافظة على استبدالات الحمض الأميني من الأحماض الأمينية بداخل المجموعات الفرعية oie coded على سبيل المثال لا الحصر على: Lys الخاصة ب 818 أو العكس بالعكس بحيث
0 أن الشحنة الموجبة يمكن الحفاظ عليها؛ Glu خاصة ب Glu أو العكس بالعكس؛ بحيث أن الشحنة السالبة يمكن أن يتم الحفاظ عليها؛ Ser خاصة ب 173 أو العكس بالعكس حيث أن Al OH= يمكن الحفاظ عليه؛ Ging خاص ب Asn أو العكس بالعكس» بحيث يمكن الحفاظ على NH2- الحرة. تكون "الصورة المتغيرة المحافظة' عبارة عن بولي ببتيد polypeptide والذي يشتمل على واحد أو أكثر من الأحماض الأمينية والتي يتم استبدالها لاستقبال واحد أو أكثر من الأحماض
5 الأمينية من البولي ببتيد polypeptide المرجعي (على سبيل المثال؛ البولي الببتيد الذ يكون به متوالية يتم الكشف عنها في النشررة أو قاعدة بيانات المتوالية أو حيث أن المتوالية يتم تحديدها بواسطة توالي الحمض النووي) مع خصائص مشتركة للحمض الأميني؛ على سبيل المثال؛ التي تنتمي إلى نفس مجموعة الحمض الأميني أو المجموعة كما تم توضيحه أعلاه. LS تم استخدامه هناء يشتمل "التعبير" على التعبير عن الجين عند مستوي على الأقل من إنتاج
0 حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) و 'منتج تعبير" يشتمل على المنتج الالناتج؛ على سبيل المثال؛ البولي ببتيد polypeptide أو RNA الوظيفي (على سبيل المثال؛ RNA الرببوزومي» tRNA و RNA في عكس اتجاه RNA 5 ceil) الدقيق؛ 5 ShRNA والريبوزوم؛ إلخ) من الجين الذي تم التعبير عنه. يشتمل المصطلح "تعبير متزايد على تغييرات في تعبير اجين لتسهيل إنتاج MRNA المتزايد و/أو تعبير البولي ببتيد polypeptide المتزايد.
25 يشتمل "الإنتاج المتزايد" [من منتج الجين] على زيادة في كمية تعبير البولي ببتيد «polypeptide
في مستو النشاط الإنزيمي من البولي ببتيد polypeptide أو توليفة من كل منها بالمقارنة مع المنتج الأصلي أو النشاط الإنزيمي من البولي ببتيد polypeptide تشتمل بعض سمات الاختراع الحالي على حذ جزئي أو حذف إلى حد كبير أو حذف كامل أو إنماد أو تثبيط أو التقليل بصورة متحكم فيها للتعبير عن متواليات بولي نيوكليوتيد محددة. يمكن أن 5 .يتم حذف الجينات بشكل جزئي أو بشكل كلي أو بشكل كامل أو يمكن الإخماد أو التخميد أو عدم التنشيط أو يمكن التنظيم بالتقليل المتحكم فيه للتعبير لكي يتم التأثير على النشاط الذي تم إجراؤه بواسطة البولي ببتيد polypeptide التي تشفره؛ مثل النشاط الخاص بالإنزيم. يمكن حذف الجينات بصورة جزئية أو إلى حد كبير أو بصورة كاملة أو يمكن أن يتم الإخماد أو يمكن أن يتم عدم التنشيط أو يمكن التنظيم بصورة متحكم فيها من خلال إدراج متواليات الحمض النووي والتي 0 تتلف الوظيفة و/أو التعبير الخاص بالجين (على سبيل المثال؛ الإدراج الجيني أو التطفير من خلال ترانسبوزون أو ميجا نيوكلياز الذي تم تعديله أو ناتج عودة الارتباط المتجانس أو أي طرق معروفة أخرى في المجال). يمكن استخدام المصطلحات "يقضي على" و"القضاء' و "التعطيل الجيني" بصورة تبادلية مع المصطلحات Cain” "حذف جزئي"؛ و"حذف إلى حد كبير" أو "حذف كامل". في نماذج معينة؛ فإن الكائن الدقيق محل الاهتمام يمك تعديله بواسطة ناتج sage الارتباط غير المتجانس الموجه بالموضع أو التكامل المستهدف أو التطفير باستخدام نظام cas/CRISPR لكي تتم معالجة جين محدد محل الاهتمام. في نماذج أخرى lead فإن الإدراج المستهدف بداخل أو التطفير الخاص بالمنطقة المنظمة للجين باستخدام نظام RNAI 5 «cas/CRISPR أو بنيات الحمض النووي (ghoul) منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) في عكس اتجاه النسخ (850018) يمكن استخدامها بصورة جزئية أو إلى حد كبير أو بصورة كاملة 0 ا لإخماد أو عدم تنشيط أو التنظيم بالتقليل المتحكم فيه لجين معين محل الاهتمام. يمكن أن يتم فهم تلك الإدراجات أو الحذوفات أو أي تعديلات أخرى من جزيئات لاحمض النووي المعين أو متواليات البولي نيوكليوتيد المحددة بحيث يتم تضمين " التعديل (التعديلات)" الجينية والتي ينتج عنها سلالات خاصة بالكائنات الدقيقة أو الخلايا العائلة التي يمكن أن يتم فهاما بأنها 'معدلة بشكل جيني" أو 'معدلة جينياً" أو 'محولة".
وكما تم استخدامه هناء يشتمل المصطلح "تمت زبادته بصورة متحكم فيها" أو 'زيادة متحكم "gd على زيادة في التعبير الخاص بالجين أو جزيء الحمض النووي محل الاهتمام أو النشاط الخاص بالإنزيم؛ على سبيل المثال؛ الزيادة في التعبير الجيني أو النشاط الإنزيمي بالمقارنة مع التعبير او Lala في الجينات النمطية خلاف ذلك أو الإنزيم الذي لم تتم زيادته بصورة متحكم فيها.
وكما تم استخدامه هناء يشتمل المصطلح "تم تقليله بصورة متحكم فيها" أو 'تقليل مُتحكم فيه" على تقليل في التعبير الخاص بالجين أو جزيء الحمض النووي محل الاهتمام أو النشاط الخاص بالإنزيم؛ على سبيل المثال؛ التقليل في التعبير الجيني أو النشاط الإنزيمي بالمقارنة مع التعبير او النتشاط في الجينات النمطية CDA ذلك أو الإنزيم الذي لم يتم إنقاصه بصورة متحكم فيها. وكما تم استخدامه هناء يشير 'ناتج طفرة" إلى كائن حي له تطفير في الجين الذي يكون عبارة عن
das 0 للتطفير التقليدي؛ على سبيل المثال» باستخدام إشعاع جاماء UV أو الجينات المتطفرة الكيميائية أو كائن حي ناتج عودة الارتباط والذي له بنية متغيرة أو تعبير خاص بالجين كنتيجة للمعالجة الهندسية الجينية والتي تشتمل العديد منهاء على سبيل المثال لا الحصر؛ على التعبير المفرط بما في ذلك التعبير عن الجين تحت تنظيم مؤقت مختلف أو تنظيم بيولوجي أو تنظيم خاص بالوسط و/أو درجة مختلفة بالمقارنة مع ما يحدث بشكل طبيعي و/أو التعبير الخاص
5 بالجين والذي لا يتم التعبير عنه بصورة طبيعية في الخلية ناتجة عودة الارتباط؛ أو تقنية ناتجة عودة الارتباط المتشابهة Lay في ذلك التعطيل الجيني والتشغيل الجيني (على سبيل المثال؛ استبدال الجين باستخدام جينات تشفر البلولي ببتيد الذي له نشاط أكبر أو نشاط أقل بالمقارنة بالبولي ببتيد polypeptide من النوع غير المعالج و/أو البولي ببتيد 106م7086ا00ات السائدة بشكل سالب )؛ وتوهين الجين من خلال RNA (RNAI في عكس اتجاه النسخ أو الريبوزمات أو ما شابه ذلك
0 والمعالجة الجينومية باستخدام إنزيمات ميجانيوكلياز» و TALENS و/أو تقنيات CRISPR وما als ذلك. ويالتالي فإن ناتج الطفرة لا يكون عبارة عن كائن حي حادث بشكل طبيعي ولكنه يكون عبارة عن نتيجة التدخل البشري. سوف يشتمل الكائن الحي ناتج عودة لارتباط محل الاهتمام على النوع الفرعي الظاهري الذي يختلف عن النوع غير المعالج المناظر أو السلالة السليفة والتي تفتقر للتطفير» حيث أن النمط الظاهري يمكن اختباره بواسطة اختبارات «gall وتحليل المنتج وخصائص
5 الالتخليق الضوئي والاختبارات الكيميائية الحيوية؛ إلخ. وعند الإشارة إلى 'ناتج التطفير" فإن ذلك
يعني الجين والذي يكون به تغيير قاعدة واحدة على الأقل (نيوكليوتيد)؛ أو حذف أو إدراج بالنسبة للجين الاصلي أو الجين غير المعالج. يمكن أن يكون التطفير (التغيير أو الحذف و/أو الإدراج لواحد أو أكثر من النيوكليوتيدات) في منطقة التشفير من الجين أو يمكن أن يكون في إنترون» 3" UTR و 5 UTR أ منطقة لامعززء على سبيل المثال؛ في مدى 2 كيلو قاعدة من موضع بدء الانتساخ أو في 3 كيلو قاعدة أو موضع بدء الترجمة. على سبيل المثال؛ فإن ناتج الطفرة يشتمل على التعبير الموهن من الجين كما تم الكشف عنه هنا والذي يمكن أن يكون واحد من التغييرات في القاعدة النووية و/أو واحد أو أكثر من حذوفات القاعدة النووية و/أو واحد أو أكثر من إدراجات القاعدة النووية؛ بدالخ المنطقة الخاصة بجين 5 ” من موضع بدء الانتساخ؛ Laie هو الحال في الأمثلة غير الحصرية والتي تكون في مدى من 2 كيلو قاعدة؛ أو في مدى 1.2 كيلو قاعدة؛ أو
0 في مدى 1 كيلة قاعدة أو في مدى من 0.5 كيلو قاعدة من موضع بدء الانتساخ المعروف أو المفترض أو في مدى 3 كيلو قاعدة أو في مدى 2.5 كيلو قاعدة؛ أو في مدى من 2 كيلو قاعدة؛ أو في مدى 1.5 كيلو قاعدة؛ أو في مدى من 1 كيلو قاعدة أو في مدى 0.5 كيلو قاعدة من موضع بدء الترجمة. ABS غير حصرية؛ فإن الجين ناتج الطفرة (Sa أن يكون Ble عن جين له تطفير؛ وإدراج او حذف بداخل منطقة المعزز والذي يمكن أن يكون إما زائداً أو متناقصاً عن
5 اتعبير الخاص بالجين؛ والذي يمكن أن يكون Ble عن جين الذي له حذف ينتج die إنتاج خاص بالبروتين 0301610غير الوظيفي؛ أو البروتين 0201610المقطوع أو البروتين 00016107السلبي السائد أو عدم وجود بروتين؛ أو يمكن أن يكون عبارة عن جين له واحدة أو أكثر من نقاط التطفير والتي تؤدي إلى تغيير في الحمض الأميني من البروتين 0004810المشفر أو ينتج عنه تضفير غير منتظم من ناتج انتساخ الجين؛ إلخ.
0 تشتمل النطاقات المحافظة؛ من البولي ببتيد cipolypeptide على تلك التي تم تحديدها في قاعدة "00" (نطاقات محافظة)؛ قاعدة بيانات (COG وقاعدة بيانات SMART وقاعدة بيانات (PRK وقاعدة بيانات TIGRFAM وقاعدة بيانات (/ebi.ac.uk/interpro) InterPro أو أخرى معروفة في المجال. تمت رعاية المركز الدولي الخاص بموقع الويب للمعلومات الكيميائية الحيوية (nebi.nim.nih.gov/Structure/cdd fwrpsb.cgi) بواسطة المعهد القومي للحصة
5 في الولايات المتحدة والمشتمل على قاعدة بيانات النطاق المحافظ conserved (CDD)
domain database والتي تم وصفها بأنها 'مصدر شروحات البروتين 0101617التي تتكون من تجميع معروفة لأنواع من المحاذاة الخاصة بالمتوالية المتعددة المشروحة بشكل جيد والبروتينات كاملة الطول. وتكون تلك الشروحات متاحة في شكل قوالب درجات محددة بالموضع (PSSMS) خاصة بالتحديد السريع الخاص بالنطاقات التي تم الحفاظ عليها في متواليات البروتين o<protein 5 خلال 851ا405-8. يشتمل محتوي CDD على النطاقات التي تمت معالجتها من NCBI
والتي تقوم باستخدام معلومات بنائية ثلاثية الأبعاد لكي تحدد بضو واضح نطاق الحدود وتوفر بصيرة بداخل علاقات المتوالية / البنية /الوظيفة وأيضاً نماذج يتم تصديرها من عدد من قواعد بيانات المصدر الخارجية ".(TIGRFAM (PRK (COG:SMART (Pfam) يشير المصطلح "Pfam إلى تجمع كبير من نطاقات البروتين lle protein البروتين
liprotein 0 تم الحفاظ عليها بواسطة اتحاد Pfam والمتاحة على العديد من مواضع الويب على مستوى العالم التي تمت رعايتها والتي Jain على: pfam.sanger.ac.uk/ (Welcome Trust, Sanger Institute); pfam.sbc.su.se (Stockholm Bioinformatics Howard Hughes Medical Center); pfam.janelia.org/ (Janelia Farm Institute); pfam.jouy.inra.fr/ (Institut national de la Recherche
Agronomique); and pfam.ccbb.re.kr. 5 وكان آخر نسخة أطلقت من Ble Pfam عن Pfam 30.0 (مايو 2016). تم تحديد نطاقات وعائلات Pfam باستخدام العديد من محاذيات المتواليات ونماذج Markov المخبأة (HMMs) تكون عائلة Pfam-A أو الصور المحددة من النطاق عبارة عن تحديدات عالية الجودة والتي تم إنشاؤها بواسطة المحاذاة الخاصة بالزراعة التي تمت معالجتها باستخدام أعضاء تمثيلية من عائلة البروتين ١1016م0ومخطط من نماذج Markov
0 بالاعتماد على المحاذيات التي تمت زراعتها. Leg) لم يتم تحديد خلاف ذلك؛ فإن المطابقات الخاصة بالبروتين 001610المطلوب بالنسبة لنطاق Pfam أو العائلة عبارة عن تطابقات Pfam- ه ). تنتمي كل المتواليات التي تم تحديدها إلى العائلة dang ذلك يتم استخدامها بشكل آلي والتي تقوم بإنشاء محاذيات كاملة للعائلة ( Sonnhammer (1998) Nucleic Acids Research Bateman (2000) Nucleic Acids Research 26, 263-266; :320-322 ,26
Bateman (2004) Nucleic Acids Research 32, Database Issue, 1383-2 25
D141; Finn (2006) Nucleic Acids Research Database Issue 34, 0247-
251; Finn (2010) Nucleic Acids Research Database Issue 38, D211- على سبيل المثال؛ باستخدام المواقع المرجعية Pfam, وعن طريق الدخول لقاعدة بيانات (222 باستخدام HMMs أعلاه؛ فإن متواليات البروتين 0101610يمكن أن يتم الاستفسار عنها في مقابل
التشابه برنامج بحث التشابه HMMER (على سبيل HMMER3HMMER?2 «Jill « أو
نسخة أعلى» 18.039ا0000761.12086/). تكون التطابقات الهامة Ally تحدد بروتين 00 |لاستفسار في شكل عائلة 01800 (أو التي لها نطاق (Pfam عبارة عن تلك التي يكون بدا درجة أكبر من أو مساوية للقيمة الحدية الخاصة بالتجميع الخاصة بنطاق Pfam يمكن استخدام قيم التوقع (قيم 6 ) في شكل إنشاء خاص بتضمين البروتين sdliprotein تم تحريره في Pfam 0 أو لتحديد ما إذا كان البروتين 0201©60لديه Pfam ls محدد؛ حيث يكون هناك قيم ع (أقل من 1.0؛ على سبيل المثال» أقل م 0.1 أو أقل من أو يساوي 0.01) الذي يمثل احتمالية منخفضة والتي قد تكون متطابقة بالصدفة. يكون Ble "CDNA" عن جزيء الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) الذي يشتمل على جزءٍ على الأقل من متوالية 5 النيوكليوتيد من جزيء MRNA مع استثناء أن جزيء DNA يقوم باستبدال ثيمين عند القاعدة النووية؛ أو 1 بدلاً من اليوريدين أو 7 والذي يحدث في متوالية MRNA يمكن أن يكون CDNA Sle عن صورة مزدوجة الجديلة أو منفردة الجديلة؛ أو يمكن؛ على سبيل المثال؛ أن يكون متمماً لمتوالية MRNA في أمثلة مفضلة؛ لا يشتمل CDNA على واحدة أو أكثر من متواليات الإنترون ally تحدث في الجين الحادث بشكل طبيعي بحيث أن 0011/8 يناظر (أي؛ Jie الجين عند 0 حدوثه في الجينوم من الكائن الحي). على سبيل المثال؛ فإن DNA يمكن أن يكون له متواليات من ead) العلوي من الإنترون من جين حادث بشكل طبيعي مجاور للمتواليات الخاصة بالتيار البعدي من الإنترون من الجين الحادث بشكل طبيعي حيث تكون المتواليات القبلية والبعدية غير متجاورة في جزيء الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) في الطبيعية gf) أن المتواليات تكون غير متجاورة عند حدوث الجيني بشكل 5 طبيعي). يمكن إنتاج CDNA بواسطة الانتساخ العكسي من جزيئات MRNA أو يمكن تخليقهاء
على سبيل المثال؛ بواسطة التخليق الكيميائي و/أو باستخدام واحد أو أكثر من إنزيمات التقييد أو واحد أو أكثر من إزيمات الليجاز أو واحد أو أكثر من إنزيمات البوليميراز (بما في ذلك؛ على سبيل المثال وليس الحصرء بوليمرات يتحمل درجة الحرارة العالية والذي يمكن استخدامه في تفاعل سلسلة البوليمراز PCRS) وواحد أو أكثر من إنزيمات روكومبيناز» إلخ بالاعتماد على معرفة متوالية CDNA والتي يمكن أن تكون معتمدة بصورة اختيارية على التعريف الخاص بمناطق
التشفير من متواليات الجينوم أو مترجمة من CDNAS جزئي من المتواليات المتعددة. عند الإشارة إلى الخصائص بها بأنها 'متشابهة إلى حد aS أو متطابقة إلى حد كبير” بدون مزيد من الشرح للمعنى المقصود؛ فإن ذلك يعني أن تلك الخصائص تكون بنسبة من 9610؛ ويفضل 5 وبيفضل أن تكون بنسبة 2.5 من القيمة المرجعية. عندما يكون المعني المقصود هو "إلى حد
0 كبير" في سياق معين لم يتم توضيحه أعلاه؛ فإن هذا المصطلح يتم استخدامه لكي يشتمل على انحرافات ضئيلة أو انحرافات غير ذات lly dad لا تكون عبارة عن مواد بالنسبة للخصائص التي يتم اعتبارها بانها مهمة في سياق الاختراع. تكون "خلية عينة المقارنة"؛ "الكائن الحي لعينة Clad) أو "الكائن الدقيق لعينة المقارنة' إما خلية من النوع البري أو كائن حي أو كائن حي دقيق والذي تم منه اشتقاق خلية الطفرة؛ الكائن الحين أو
5 الكائن الحي الدقيق (والذي تم تعديله بصورة جينية أو خلية متطفرة؛ أو كائن حي أو كائن حي دقيق) والذي تم اشتقاقه بصورة مباشرة أو بصورة غير مباشرة أو يكون عبارة عن خلية أو كائن حي أو كائن حي دقيق والذي كان متطابقاً إلى حد كبير بالنسبة للخلية ناتجة الطفرة أو الكائن الحي أو الكائن الحي الدقيق الذي تمت الإشارة إليه باستثناء due المقارنة أو الكائن الحي أو الكائن all الدقيق الذي لا يشتمل على التطفيرات الناتجة عن الإنتاجية المتزايدة؛ على سبيل
0 المثال؛ عينة المقارنة أو الكائن الحي أو الكائن الحي الدقيق الذي لم تتم معالجته أو يتم تطفيره أو يتم توهينه إلى جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT .GROWTH IMPROVEMENT 1 على سبيل المثال» عندما يشتمل تشتمل الطحالب ناتجة عودة الارتباط على تطفير في جين SCHL فإن طحالب 8198 يمكن أن تكون متطابقة إلى حد كبير مع الطحالب ناتجة عودة الارتباط باستثناء طحالب عينة المقارنة التي لا تشتمل على طفرة
في جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 تشير Gait الظروف" أو " نفس ظروف الزراعة" كما تم استخدامه هناء إلى نفس الظروف إلى حد كبير حيث أن أي اختلافات بين الظروف المرجعية التي يمكن أن تكون موجودة يمكن أن تكون عند الحد الأدنى لها أو لا تكون ذات صلة بالنسبة للوظيفة أو الخصائص الخاصة بالكائن الدقيق الذي تم die أخذ sald) الخاصة بالاختراع بما في ذلك إنتاج الشحم lipid أو إنتاج الكتلة الحيوية. وكما تم استخدامه هناء يشير مصطلح lipid aad أو " شحومات" إلى (gan وشموع؛ وأحماض دهنية ومشتقات حمض دهني مثل كحولات شحمية وإسترات شمع ومركبات ألكان ومركبات ألكين ومركبات ستيرول ومركبات جليسريدات أحادية وشحوم فوسفو وشحوم إسفنجية وشحوم ساكرو 0 وشحوم الجليسيريل. يشير مصطلح "شحوم FAME " أو "FAME" إلى شحوم والتي لها أجزاء من الأسيل Ally مكن اشتقاقها بالنسبة لإسترات ميثيل من الشحم الدهني؛ مثل؛ على سبيل المثال؛ جليسيريدات مونو أسيل؛ أو جليسريدات ثنائية أسيل أو جليسريدات ثلاثية الأسيل أو إسترات شمع وشحوم غشائية Jie شحوم فوسفو وشحوم جلاكتو إلخ؛ (Sass اختبار إنتاجية FAME بالمللي جرام لكل لتر (مجم/لتر) وبالنسبة للطحالب يمكن أن يتم تقريراه في شكل جرام لكل متر 2 في 5 اليوم (جم/م2//ليوم). في الاختبارات شبه المستمرة التي تم توفيرها هنا فإن قيم مجم/اللتر يتم تحويلها إلى جم/م2/اليوم من خلال أخذا في الحساب مع مساحة الإشعاع الساقط (فتحة حاملة القارورة SCPA من 1 /2 x ” 33 //8” « أو 0.003145م2) وحج من المزرعة من (550مل). لكي يتم الحصول على قيم الإنتاجية في جم/2/إليوم؛ يتم ضرب قيم مجم/اللتر في معدل التخفيف اليومي )%30( وعامل التحويل من 0.175. عندما تتم الإشارة إلى الشحوم أو 0 الفتئات الفرعية منها (على سبيل المثال» TAG أو (FAME في شكل نسبة مئوية؛ فإن النسبة المثوية تكون عبارة عن نسبة مئوية بالوزن ما لم يتم توضيح خلاف ذلك. وكما تم استخدامه هناء يشير المصطلح 'منتج حمض شحمي" على أحماض شحوم حرة وجليسريدات أحادية أو ثنائية أو جليسريدات ثلاثية أو ألديهيدات شحمية أو كحولات شحمية أو إسترات حمض شحمي (بما في ذلك؛ على سبيل المثال وليس الحصر إسترات الشمع)؛ 5 والهيدروكربونات؛ بما في ذلك على سبيل المثال وليس الحصرء مركبات ألكان ومركبات ألكين).
تشير 'كتلة حيوية" إلى كتلة خلوية سواء أكانت من خلايا حية أو خلايا ميتة؛ diag اختبارهاء على سبيل Jal في شكل وزن رطب أو في شكل وزن حبيبات ماصة أو في شكل وزن جاف (على سبيل المثال؛ أليف للمذيب من die المزرعة أو من خليا محببة)؛ أو وزن جاف خالي من الرماد ash free dry weight ( AFDW)) « أو كريون عضوي إجمالي total (TOC) OFganic 6800500 5 يستخدم طرق معروفة في المجال. تزيد الكتلة الحيوية أثناء نمو المزرعة تحت
ظروف تسمح بالنمو ويمكن أن تتم الإشارة إليها في 'شكل تراكم كتلة حيوية" في مزرعة الخلية؛ على سبيل المثال. في المزارع المستمرة أو شبه المستمرة والتي تخضع لتخفيف ستسمر أو منتظم فإن الكتلة الحيوية التي تم إنتاجها سوف يتم تراكمها في المزرعة وتتم إزالتها أثناء التخفيف الخاص بالمزرعة. وبالتالي؛ فإن إنتاجية الكتلة الحيوية (تزيد في الكتلة الحيوية) من خلال المزارع المذكورة
0 ويمكن أن تتم الإشارة إليها في شكل "تراكم للكتلة الحيوية". يمكن اختبار قابلية إنتاج الكتلة الحيوية في شكل إنتاجية إنتاجية كربون عضوي إجماني (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON بالمللي جرام لكل لتر (مجم/اللتر) ويمكن تسجيل الطحالب بالجرامات لكل jie 2 لكل يوم (جم/م2/اليوم). في الاختبارات شبه المستمرة التي تم توفيرها هنا فإن قيم مجم/اللتر يتم تحويلها إلى جم/م2/اليوم من خلال أخذا في الحساب مع مساحة الإشعاع الساقط (فتحة حاملة القارورة
SCPA 5 من 1 /2 x "33 //8” »؛ أو 0.003145م2) pans المزرعة من (550مل). لكي يتم الحصول على قيم الإنتاجية في جم/2/اليوم؛ يتم ضرب قيم مجم/اللتر في معدل التخفيف اليومي )%30( وعامل التحويل من 0.175. عندما يتم التعبير عن الكتلة الحيوية في شكل نسبة مئوية فإن النسبة المئثوية تكون عبارة عن نسبة dase بالوزن ما لم يتم توضيح خلاف ذلك. وفي سياق الاختراع؛ فإن saad النيتروجين" يكون عبارة عن مصدر للنيتروجين والذي يمكن أن
0 يتم أخذه وتعريضه للأيض بواسطة تعريض الكائن الدقيق أو تضمينه بداخل جزيئات حيوية خاصة بالنمو والتكاثر. على سبيل المثال؛ فإن المركبات التي تشتمل على نيتروجين لا يمن أن يتم أخذها في الاعتبار وتأيضها بواسطة الكائن الدقيق الخاص بالنمو (على سبيل المثال؛ المحاليل المنظمة البيولوجية المشتملة على النيتروجين مثل محاليل هيريس وتربس» إلخ) ally لا يتم اعتبارها بأنها مصادر نيتروجين في سياق الاختبار.
يشير المصطلح "نيتروجين مختزل" كما تم استخدامه هنا إلى نيتروجين في الصورة الكيميائية من الأمونيوم؛ الأمونياء واليوريا أو أحماض الأمين والتي يمكن أن يتم أخذها وتأيضها بواسطة الكائن الدقيق الذي تمت زراعته لتوفر مصدر من النيتروجين الخاص بالتضمين بداخل الجزيئات الحيوية وبالتالي دعم النمو. على سبيل المثال؛ وبالإضافة إلى الأمونيوم/ الأمونيا واليوريا والنيتروجين المختزل فيمكن تضمين العديد من الأحماض الأمينية حيث أن الحمض (الأحماض الأمينية يمكن استخدامها كمصدر نيتروجين للكائن الحي الخاضع. يمكن أن تشتمل الأمثلة الخاصة بالأحماض الأمينية؛ على سبيل المثال لا الحصر على الجلوتامات والجلوتامين والهيستيدين والللايسين والأسبارجين والألانين والجليسين. يشير "النيتروجين غير المختزل" في سيقا مصدر النيتروجين الذي يمكن أن يوجد في وسط المزرعة الخاص بالكائنات الدقيقة إلى نيترات أو نيتريت والذي يجب 0 أن يتم اختزاله قبل التمثيل في المركبات العضوية بواسطة الكائن الدقيق. يتم استخدام " المصدر المنفرد من النيتروجين [في وسط المزرعة] بصورة تبادلية مع ' المصدر المنفرد للنيتروجين إلى حد كبير" والذي يوضع عدم وجود مصدر خلاف النيتروجين يتم إضافته بصورة مقصودة لوسط المزرعة أو عدم وجود أي مصدر نيتروجين آخر بكمية كافية للزيادة الهامة والنمو الخاص بالكائنات الدقيقة أو الخلايا المزروعة في الوسط المرجعي. وخلال هذا التطبيق؛ 5 ولغرض التلخيص؛ فإن المصطلحات "نترات فقط" يتم استخدامه لكي يتم توضيح أوساط المزرعة والتي يكون بها النترات عبارة عن المصدر الوحيد للنيتروجين الذي يكون متاحاً لكائنات الدقيقة الخاصة بدعم النمو. وبصورة مشابهة؛ يتم استخدام "المصدر الوحيد للكربون [في وسط المزرعة"] بصورة تبادلية مع " المصدر الوحيد إلى حد كبر من الكربون" والذي يوضح أنه لا يوجد مصدر كريون آخر موجود 0 بكمية كافية لزيادة الإنتاجين؛ النمو أو الانتشار الخاص بالكائنات الدقيقة أو الخلايا التي تمت زراعتها في الوسط المرجعي أو تم تضمينها في الجزيئات الحيوية مثل الشحوم المنتجة بواسطة الكائنات الدقيقة أو الخلايا. يشير التعبير ظروف 'زاخرة بالنيتروجين" إلى ظروف أوساط لا يوجد بها نمو إضافي أو فائد انتشار ناتجة عن إضافة المزبد من النيتروجين (في صورة يكن استخداماه بواسطة الكائن الدقيق) 5 بالنسبة للوسط. وبصورة مشابهة؛ فإن الظروف BABI بالأكسجين” تشير إلى ظروف أوساط لا
يكون بها أي مادة تغذية محددة لنم أو Lan أي أنه عندما يكون الوسط زاخراً بالتغذية؛ OB إضافة مادة (مواد) التغذية الإضافية للوسط لا ينتج عنها تحسناً في معدل النمو أو الانتشار. وفي سياق AN بمادة التغذية"؛ "مواد التغذية" فإن ذلك (Jandy كأمثلة غير حصرية؛ على الفوسفات والكبريت والحديد ويشكل اختياري السليكا ولكنه يستثني مصادر الكربون؛ Jie السكريات sugars 5 أو الأحماض العضوية التي يمكن استخدامها بواسطة الكائن الحي في شكل مصدر طاقة. بولي ببتيد cipolypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 وكما تم وصفه هناء تشير عبارة "5611 " أو " تحسن النمو الهام 1" للبولي ببتيد 56 ات إلى بولي ببتيد 106م017086مات تشتمل على مستقبل منظم للإستجابة أو 0 نطاق "مستقبل استجابة (pfam PFO0072) "(RR) RESPONSE RECEIVER ويمكن أن تكون عبارة عن نطاق رابط مشابه ل Myb والذي يطلق عليه هنا ببساطه بأنه نطاق "0لا00" PFO0249) 01800) حيث يكون نطاق RR عبارة عن طرف myb مثبت بالنسبة للطرف N- تشتمل متوالية الحمض الأميني من البولي ببتيد polypeptide 5611 الذي يشتمل على RR GA ونطاق myb على تمديد للأحماض الامينية lly تحدث بين نطاقات RR و myb 5 والتي توجد محافظة بشكل ضئيل أو لا تكون محافظة من بين البولي ببتيد wipolypeptide myb المحافظة. يمكن الإشارة إلى متوالية الحمض الأميني الحادثة بين نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق myb هنا بأنها رابطة بين اثنين من النطاقات. يمكن أن يكون الرابط بأي طول؛ وفي العديد من الأمثلة فإن المدى في الطول من واحد إلى حوالي 0 حمض أميني أو من 10 إلى حوالي 200 حمض أميني أو من عشرين إلى حوالي 150 0 حمض أميني في الطول. يمكن أن يكون تشتمل منطقة الرابط بشكل اختياري على متوالية تحديد موضع نووري .nuclear localization sequence (NLS) يمكن أن يتصف نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER بداخل بروتين 707تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في شكل 01700072 pfam أو في شكل 'نطاق مستقبل إشارة" أو بساطة GUY مستقبل" و/أو يمكن أن يتم تصنيفه في شكل 0000156 في قاعدة نطاق محافظ
((00©؛ مثل 6060784 في مجموعات من المجموعات متحدة الأصل الجيني من قاعدة بيانات البروتينات؛ أو في شكل نطاق alike” Interpro عليا مشابهة ل «CheY" .IPRO11006 تم اكتشاف أن نطاق في الأنظمة المنظمة لاثنين من المكونات البكتيرية (مثل نظام من اثنين من المكونات الخاصة بالانجذاب البكتيري والذي يشتمل على بولي ببتيد polypeptide 5 معروف بأنه (CheY والذي يتم فيه استقبال الإشارة من مشارك المستشعر. يكون نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من تلك الأنظمة في الغالب عند الطرف -ل! بالنسبة للنطاق الرابط الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) ويمكن أن يشتمل على موضع مستقبل الفوسفات. يوفر الشكل رقم 4 محاذيات من نطاقات هي Parachlorella sp.
WT-1185 ( متوالية بهوية 0 رقم: 58(« Coccomyxa subellipsoidea ( متوالية بهوية رقم: 59(« Ostreococcus lucimarinus ( متوالية بهوية رقم: 60(« Chlamydomonas reinhardtii ) متوالية بهوية رقم: 61(« 20109160515 Volvox carteric<Chromochloris ( متوالية بهوية رقم: 63)؛ Tetraselmis sp. 105 ( متوالية بهوية رقم: 64(« Oocystis sp.
WT-4183 (متوالية بهوية )65:48( و Micromonas sp.
RCC299 (متوالية بهوية رقم:66 ). 15 يمكن أن يكون نطاق 0لا بداخل بروتين 010160تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (561)؛ على سبيل المثال» :pfamPF00249 Jie يمكن تحديد 'نطاق ربط الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) المشابه s/s Myb' يمكن تحديده في شكل نطاق 116401557 " نطاق ربط DNA مشابه ل amyb وفئة SHAQKYF أو في شكل نطاق 0 عائثلة We مشابهة ل IPRO09057)) Interpro Homeobox و/أو نطاق Interpro Myb .(IPRO17930) بالإضافة إلى الاشتمال على طرف N من نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER مع نطاق amyb فإن بروتين Cpuaiprotein نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (1ا56) كما تم توفيره هنا يمكن أن يشتمل على درجة من 30 أعلى أول 320 أو أعلى أو 34 أو أعلى أو 350 أو أعلى أو 360 أو
أعلى أو 370 أو أعلى مع قيمة -6 من أقل من حوالي 6-101 أو6501 أو 6-701 أو 6-1 100 عندما يتم المسح باستخدام نموذج (HMM) Hidden Markov الذي تم تصميمه بالنسيلة لبروتينات الدرجة الخاصة بقاعدة عن كيفية أن متوالية الحمض الأميني الخاصة بالبروتين 200 تتوافق مع الأحماض الأمينية المحافظة من منطقة من متشابهات SGI في الطحالب hail) 5 المثال رقم 6). تكون المنطقة الخاصة بالبولي ببتيد cipolypeptide المستخدمة لتطوير HMM عبارة عن متوالية أحماض أمينية تشتمل (بصورة مسبقة في اتجاه الطرف N= بالنسبة للطرف -0) على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER والرابط ورابط .myb في HMM وهي مواضع الحمض الأميني المحافظة بشكل عالي؛ فإنه يتم وزنها بصورة أكثر ثقلاً عن تلك المواضع المحافظة من الحمض الأميني مع المنطقة المقارنة من البولي ببتيد polypeptide 0 لكي يتم الوصول إلى الدرجة. إن البولي ببتيد wipolypeptide التي بها درجات تكون على الأقل 300 أو من 350 أو «SH على سبيل المثال؛ 370 أو أكثر عندما يتم المسح باستخدام نموذج HMM بالاعتماد على متواليات البروتين protein البولي ببتيد ciipolypeptide الطحلبية تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 فإن ذلك يشتمل على متوالية مستمرة بصورة منفردة Allg تشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ورابط ويمكن أن يشتمل على نطاق Myb الذي تم تطويره باستخدام» يشتمل على بدون تخفيف؛ البولي ببتيد ©706010ا00ات من الطحالب وأنواع النباتات من 1185 Parachlorella sp. (المتوالية بهوية رقم 3(« Coccomyxa subellipsoidea (المتوالية بهوية رقم 9)؛ Ostreococcus lucimarinus (المتوالية بهوية رقم 10) Chlamydomonas reinhardtii 0 «(المتوالية بهوية رقم 11)؛ Volvox carteri (المتوالية بهوية قم 13(« 105 Tetraselmis sp. (المتوالية بهوية رقم 14 15و 16(« و .O0cystis sp (المتوالية بهوية رقم 17(« و Oocystis م (المتوالية بهوية رقم 18(« .Oocystis sp (المتوالية بهوية رقم 19 Sphagnum fallax (المتوالية بهوية رقم 20 (¢ 081605 Physcomitrella (المتوالية بهوية رقم 21)؛ Arabidopsis thaliana (المتوالية بهوية رقم 22(¢ Arabidopsis hallerig (المتوالية بهوية 5 رقم 23(« 5 Arabidopsis lyrata (المتوالية بهوية رقم 24(« و Helianthus annuus (المتوالية بهوية رقم 25( Vitis vinifera g (المتوالية بهوية رقم 26( وى Amborella
6058 (المتوالية بهوية قم 27)؛ و Ricinus communis (المتوالية بهوية رقم 28)؛ Solanum lycopersicum (المتوالية بهوية رقم 29(« و Solanum lycopersicum (المتوالية بهوية رقم 30(« و Gossypium hirsutum (المتوالية بهوية رقم 31(« Theobroma cacao (المتوالية بهوية قم 32(« Phaeolis vulgaris g (المتوالية بهوية رقم Glycine max 4 »)33 5 (المتوالية بهوية رقم 34(« و Chenopodium quinoa (المتوالية بهوية
رقم 35(« 5 Malus domesticus (المتوالية بهوية رقم 36) 5 Zea mays (المتوالية digg رقم Oryza 5807/8, (38 (المتوالية بهوية رقم 39). تم أيضاً تضمين بولي ببتيد <ipolypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 التي بها على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل 9660 على
0 الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675 على الأقل 9680؛ على الأقل 85 على الأقل 9690؛ على الأقل 9695 على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698؛ أو على الأقل 1699 من التطابق مع أي مما سبق؛ حيث أن البولي ببتيد polypeptide يكون له نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق myb ونطاق RR الذي يكون عبارة عن طرف N بالنسبة لأي نطاق 0لا07؛ حيث أن البولي ببتيد Polypeptide من
تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون عبارة عن بولي ببتيد polypeptide حادث بشكل طبيعي أو صورة متغيرة منه. في العديد من النماذج؛ فإن البولي ببتيد polypeptide 561 تكون من أنواع نباتية أو من أنواع طحلبية؛ أي بولي ببتيد ©0017086080|ات تحدث بشكل طبيعي من النبات أو من أنواع طحلبية. إن الجين المشفر للبولي ببتيد polypeptide 1ا56 كما تم توفيره هناء على سبيل
0 المثال» Ble عن جين والذي يتم إتلافه أو له تعبير يتم توهينه في ناتج الطفرة كما تم توفيره هناء والذي يمكن في العديد من النماذج أن يكون عبارة عن جين حادث بشكل طبيعي من النبات أو من أنواع طحلبية والتي تشفر البولي ببتيد polypeptide كما تم الكشف عنه هنا. في بعض النماذج فإن البولي ببتيد polypeptide كما تم توفيره هناء يكون عبارة عن بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
GROWTH IMPROVEMENT 1 5 طحلبي؛ على سبيل (JE يشتمل على متوالية من بولي
ببتيد polypeptide 1ا56 من الطحالب الحادثة بشكل طبيعي؛ حيث أن البولي ببتيد polypeptide الطحلبي يشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق myb ونطاق RR والذي يكون عبارة عن طرف N= بالنسبة لنطاق .myb يمكن أن يشتمل البولي ببتيد polypeptide بصورة اختيارية على الأقل على 50 على الأقل9655؛ على الأقل9660؛ على الأقل9665؛ على STON! على الأقل9675؛ على
الأقل9680؛ على الأقل9685؛ على الأقل9690؛ على الأقل9695؛ على الأقل9696؛ على الأقل9697؛ على الأقل9698؛ أو على الأقل 9699 من التطابق مع البولي ببتيد ciipolypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 التي تم الكشف عنها هنا. في بعض النماذج؛ فإن جين
56١1 0 يمكن أن يكون عبارة عن جين يشفر بولي ببتيد polypeptide 5611 طحلبي «Jie على سبيل المثال؛ البولي ببتيد polypeptide المشتمل على متوالية منم بولي ببتدات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT الطحلبية Balad) بشكل طبيعي. يكون لجين 5611 الذي يشفر البولي ببتيد 1106م08/اا0مات متوالية من بولي ببتيد SGI wipolypeptide الطحلبية الحادثة بشكل طبيعي والذي يمكن أن
5 يكون عبارة عن جين له متوالية جينة حادثة بشكل طبيعي من متوالية مشفرة للجين أو يمكن أن يشتمل على متوالية تختلف عن المتوالية من الجين الحادث بشكل طبيعي. في العديد من النماذج؛ فإن الجين الذي يتم توهينه أو الموهن أو الذي يتم إتلافه في all CASH الخاص بالتخليق الضوئي كما تم الكشف die هنا يمكن أن يكون عبارة عن جين يتم تحديده خلال BLAST على سبيل المثال؛ باستخدام واحدة أو أكثر من المتواليات التي تم الكشف عنها هنا في شكل مواد
0 استفسار و/أو في شكل مسح HMM حيث أن HMM يتم إنشاؤه من متواليات الأحماض الأمينية؛ على سبيل المثال» عن المحاذاة مع ستة على الأقل من As ببتيد 108م08لاا0مات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH Cus 1/10101/1/111 1 أن متواليات الحمض الأميني تشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق «myb حيث أن نطاق RR يكون عبارة عن
5 الطرف N= بالنسبة لنطاق myb وحيث لا توجد هناك أي متوالية رابطة بين نطاقات RR ولام والتي لا تنتمي إلى أي نطاق.
في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون له متوالية من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على الأقل على 9685؛ على الأقل9690؛ أو على JN 5 على 1695 من التطابق مع نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي الحادث بشكل طبيعي و/أو الذي به على الأقل 0 على الأقل9655؛ على الأقل9660؛ على الأقل9665؛ على TON على الأقل9675,؛ على الأقل9680؛ على الأقل9685؛ على الأقل9690؛ على الأقل9695؛ على الأقل9696؛ على الأقل9697؛ على الأقل9698؛ أو على الأقل 9699 من التطابق مع أي من 0 المتواليات: متوالية بهوية رقم: 40؛ متوالية بهوية رقم: 41؛ متوالية بهوية رقم: 42؛ متوالية بهوية رقم: 43 متوالية بهوية رقم: 44؛ متوالية بهوية رقم: 45؛ متوالية بهوية رقم: 46 متوالية بهوية رقم: 47 متوالية بهوية رقم: 48 متوالية بهوية رقم: 49. في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون له متوالية من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (5611) الطحلبي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على الأقل على 9685؛ على الأقل9690؛ أو على الأقل على 9695 من التطابق مع نطاق Myb من بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (5611) الطحلبي الحادث بشكل 0 طبيعي و/أو الذي به على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل B60 على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685 على الأقل 9690 على الأقل 9695؛ على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698؛ أو على الأقل 9 من التطابق مع أي من المتواليات: متوالية بهوية رقم: 58؛ متوالية بهوية رقم: 59 متوالية بهوية رقم: 60؛ متوالية بهوية رقم: 61؛ متوالية بهوية رقم: 62؛ متوالية بهوية رقم: 63؛ متوالية 5 بهوية رقم: 64؛ متوالية بهوية رقم: 65؛ متوالية بهوية رقم: 66؛ متوالية بهوية رقم: 67.
في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يكون له متوالية من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على الأقل على 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على الأقل على 91695 من التطابق مع بولي ببتيد polypeptide 5611 الطحلبي الحادث بشكل طبيعي و/أو الذي به على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل %60( على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ على الأقل 9695؛ على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698؛ أو على الأقل 9699 من التطابق مع أي من المتواليات: متوالية بهوية رقم: 3( متوالية بهوية رقم: 9؛ متوالية بهوية رقم: 0 10 متوالية بهوية رقم: 11 متوالية بهوية رقم: 12( متوالية بهوية رقم: 13 متوالية بهوية رقم: 4 متوالية بهوية رقم: 15 متوالية بهوية رقم: 16 متوالية بهوية رقم: 17( المتوالية بهوية رقم 8 أو المتوالية بهوي رقم 19. في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد SGI polypeptide يكون له متوالية من بولي ain polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 النباتي أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide 1 النباتي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على الأقل على 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على JV) على 9695 من التطابق مع بولي ببتيد SGI polypeptide النباتي الحادث بشكل طبيعي و/أو الذي به على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل %60( على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ على 0 الأقل 9695؛ على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698؛ أو على الأقل 9699 من التطابق مع نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من متوالية بهوية رقم: SO متوالية بهوية رقم: 51؛ متوالية بهوية رقم: 52؛ متوالية بهوية رقم: 53؛ متوالية بهوية رقم: 4 متوالية بهوية رقم: 55؛ متوالية بهوية رقم: 56؛ متوالية بهوية رقم: 57. في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد SGI polypeptide يكون له متوالية من بولي ببتيد polypeptide 5611 النباتي 5 أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide 5611 النباتي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على
الأقل على 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على الأقل على 9695 من التطابق مع بولي ببتيد SGIL polypeptide النباتي الحادث بشكل طبيعي و/أو الذي به على الأقل 9668؛ على الأقل 5. على الأقل 9660؛ على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 0. على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ على الأقل 9695؛ على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698 أو على الأقل 9699 من التطابق مع نطاق MYb من متوالية بهوية رقم: 68 متوالية بهوية رقم: 69؛ متوالية بهوية رقم: 70 متوالية بهوية رقم: 71 متوالية بهوية رقم: 72 متوالية بهوية رقم: 73 متوالية بهوية رقم: 74 أو متوالية بهوية رقم: 75. في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد SGI polypeptide يكون له متوالية من بولي ain polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 0 النباتي أو صورة متغيرة من بولي ببتيد polypeptide 1 النباتي الحادث بشكل طبيعي المشتمل على الأقل على 9685؛ على الأقل 9690؛ أو على الأقل على 9695 من التطابق مع بولي ببتيد SGI polypeptide الطحلبي الحادث بشكل طبيعي و/أو الذي به على الأقل 9650؛ على الأقل 9655؛ على الأقل %60( على الأقل 9665؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 9675؛ على الأقل 9680؛ على الأقل 9685؛ على الأقل 9690؛ على 5 الأقل 9695؛ على الأقل 9696؛ على الأقل 9697؛ على الأقل 9698؛ أو على الأقل 9699 من التطابق مع متوالية بهوية رقم: 20؛ متوالية بهوية رقم: 21؛ متوالية بهوية رقم: 22؛ متوالية بهوية رقم: 23( متوالية بهوية رقم: 24 متوالية بهوية رقم: 25؛ متوالية بهوية رقم: 26 متوالية بهوية رقم: 27 متوالية بهوية رقم: 28 متوالية بهوية رقم: 29( المتوالية بهوية رقم 30 أو المتوالية بهوي رقم 33 متوالية بهوية رقم: 34 متوالية بهوية رقم: ¢35 متوالية بهوية رقم: 36؛ متوالية 0 بهوية رقم: 37 متوالية بهوية رقم: 38 أو المتوالية بهوية رقم 39. السلالات المتطفرة تشتمل الطفرات التي تم توفيرها هنا والتي بها جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (5611) متطفر على كائنات تخليقية ضوئية؛ مثل الكائن التخليقي اللاضوئي حقيقي النواة؛ والتي تشتمل على النباتات والطحالب Jie 5 الطحالب حقيقية النواة المنفردة (طحالب دقيقة).
يكون للسلالة الطحلبية جين 1ا56 المتطفر الذي يمكن في بعضد الأمثلة؛ أن يتم تعديله بشكل جيني بحيث يشتمل على تعبير موهن من جين 5611 والذي يمكن أن يكون عبارة عن أي سلالة 0110801165 طحلبية حقيقية النواة مثل» على سبيل المثال» أنواع من أي من الأنواع العامة من «Boekelovia (Asteromonas (Ankistrodesmus (Amphora تل «Bracteococcus (Botryococcus (Botrydium (Borodinella «Bolidomonas 5 «Chlorogonium (Chlorococcum (Chlamydomonas (Carteria (Chaetoceros «Crypthecodinium (Cricosphaera (Chrysosphaera Chroomonas (Chlorella «Elipsoidon (Dunaliella :Desmodesmus (Cyclotella (Cryptomonas «Franceia (Eustigmatos (Euglena (Ernodesmius (Eremosphaera (Emiliania «Hantzschia (<Haematococcus (Gloeothamnion (Fragilaropsis (Fragilaria 10 «Micractinium ¢ Lepocinclis:<Isochrysis <Hymenomonas (Heterosigma «Navicula «(Nannochloropsis (Nannochloris <Monoraphidium (Monodus «Ochromonas «Nitzschia (Nephroselmis (Nephrochloris (Neochloris «Parietochloris (Parachlorella (Ostreococcus 000/505 <Oedogonium «Picochlorum (Phagus (Phaeodactylum (Pelagomonas (Pavlova (Pascheria 15 «Pseudochlorella (Prototheca (Pleurococcus (Pleurochrysis (Platymonas «Pyrobotrys (Pyramimonas (Pseudostaurastrum (Pseudoneochloris «Spyrogyra (Skeletonema (Schizochlamydella (Scenedesmus «Tribonema (Thalassiosira (Tetraselmis (Tetrachlorella «Stichococcus
Volvox 4 «Vischeria (Viridiella (Vaucheria 0 على سبيل المثال؛ تكون الطحالب التي بها طفرة في جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن هنا aie كما تم الكشف )5611( SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 1 (بما في ذلك الأعضاء phyla ochrophyta عبارة عن الأنواع التي تنتمي لأي من الأنواع من « fragilariophyceae« coscinodiscophyceaebacillariophyceae من «chrysophyceae (pelagophyceae « xanthophyceae.eustigmatophyceae 25
haptophyta 5 (synurophyceae 4 raphidophyceae (بما في ذلك أعضاء من coccolithophyceae و chlorophyta 4 (paviophyceae (بما في ذلك أعضاء hephrophyceae: chlorophyceaetrebouxiophyceae « mamiellophyceae« ulvophyceae«pyramimonadophyceae « و chlorodendrophyceae 5 ( وأيضاً euglenoids scharyophyta ومركبات داينوفلاجيلات. في بعض النماذج؛ من الطلب الحالي؛ فإن الكائنات الحية الدقيقة المفضلة والتي يمكن أن يتم تطفيرها أو معالجتها بشكل جيني؛ تشتمل على سبيل المثال وليس الحصر؛ على أنواع الكلوروفيت Chlorophyte مثل «Tetrachlorella (<Pseudochlorella « ParachlorellacChlorella «Micratinium (Franceia (Oocystis (Prototheca (Auxenochlorella «Eremosphaera (Schizochlamydella (<Nannochloris (Picochlorum 10 «Parietochloris Borodinella (Viridiella (Botryococcus (Stichococcus «Desmodesmus (Monoraphidium (Neochloris «Bracteacoccus «Chlamydomonas (Carteria (Ankistrodesmus (Scenedesmus «Dunaliella «Platymonas (Volvox (Chlorogonium (Chlorococcum «Nephroselmis (Oedogonium (Pyrobotrys (Asteromonas (Haematococcus 15 «Ostreococcus (Pseudoneochloris (Pyramimonas (Pleurococcus (Tetraselmis و .Staurastrum في مثال آخر» فإن نواتج الطفرة يمكن معالجتها أو يمكن عزلها باستخدام أنواع طحلبية متغايرة من السوطيات مثل أنواع edie casi على سبيل (Jl) أنوع من أي من الأنواع العامة من 0 متمد 0861006105 «Hantzschia (Fragilaropsis (Fragilaria (Cyclotella «Phaeodactylum «Nitzschia «Navicula أو Thalassiosira في أمثلة إضافية؛ فإن ناتج الطفرة كما تم الكشف عنه هنا يكون Ble عن أنواع متعددة من فئة Eustigmatophyceae (Jie على سبيل المثال أنواع من Monodus: Vischeria« Eustigmatos Ellipsoidion « <Nannochloropsis أو .Pseudostaurastrum تشتمل الأنواع الأخرى من Ochrophyta 5 التي يمكن أخذها في الاعتبار؛ على سبيل المثال لا الحصر؛ على Boldimonas
Bigeloweillac Aureococcus: Monodus: Tribonema«: Baucheria:Botrydium « Heterosigma: Ochromonas:Chrysosphaera.Pelagomomas « Isochrysisc Hymenomonas: Cricosphaera.BoekeloviacNephrochloris « .Pavlova 4 «Pleurochrysis في نماذج إضافية؛ فإن الكائنات الحية التي مكن تطفيرها أو معالجتها بحيث تشتمل على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH (561) IMPROVEMENT 1 موهن أو متطفر تشتمل على أنواع نباتية. هناك تنوع واسع من النباتات وأنظمة الخلايا النباتية والتي يمكن تطفيرها أو معالجتها لكي يت توفير التعبير عن جين ا56؛ على سبيل المثال؛ باستخدام بنيات حمض نووي والعديد من طرق التحويل المعروفة في المجال 0 (نظرء Methods Mol BiolcGuerineau F. . )1995( 32-49:1). في نماذج مفضلة؛ فإن النباتات المستهدفة والخلايا النباتية تشتمل؛ على سبيل المثال لا الحصرء على تلك النباتات أحادية الفلقة والنباتات ثننائية الفلقة (ie المحاصيل بما في ذلك محاصيل الحبوب Jie) القمح والذرة والأرز والدخن والشعير)» محاصيل الفاكهة (مثل الطماطم» التفاح والكمثرى والفراولة والبرتقال) والمحاصيل العلفية (على سبيل المثال» البرسيم) والمحاصيل الجذرية النباتية (مثل 5 البطاطس والجزر وبنجر السكر والبطاطا الحلوة)؛ محاصيل الخضر الورقية (على سبيل المثال؛ والخس؛ والسبانخ)؛ النباتات المزهرة (على سبيل المثال؛ البطونية؛ وردة؛ أقحوان)؛ الصنويريات وأشجار الصنوير (على سبيل المثال؛ والتنوب والصنوير» الراتينجية)؛ النباتات المستخدمة في علاج النبات Je) سبيل المثال؛ نباتات تراكم الفلزات الثقيلة )؛ المحاصيل الزيتية (Ae) سبيل (JU) عباد الشمس؛ بذور اللفت) والنباتات المستخدمة لأغراض تجريبية ( مثل الأرابيدوسيس). 0 ولالتالي فإن تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يمكن أن يتم إنشاؤها في مدى واسع من النباتات؛ cio على سبيل (JU) نباتات النباتات ذوات الفلقتين التي تنتمي ترتبة Miciales<Magniolales « Ranunculalesc<Nymphaeales: Aristochiales: Piperales:Laurales « Hamamelidales: Trochodendrales: Sarraceniaceae:Papeverales « «CasuarinalesFagales: Myricales: LeitnerialescEucomiales 25
« Dilleniales: Plumbaginales: Polygonales: Batales.Caryophyllales « Salicales: Violales: Lecythidales.Urticales. Malvales:Theales « Rosales«Primulales: Ebenales: Diapensales: Ericales:Capparales
San « Proteales: Cornales: Myrtales: Haloragales: Podostemales:Fabales « Sapindales Rhamnales: Euphorbiales.Celastrales: Rafflesialesctales 5 « Gentianales: Umbellales: Polygalales: Geraniales<Juglandales «Campanulales:Scrophulariales: Plantaginales: Lamiales:Polemoniales JAsterales i DipsacalescRubiales يمكن إنشاء التطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) في النباتات أحادية 0 الفلقة Jie تلك التي تنتمي تترية Hydrocharitales.Alismatales 802165ز2لا Juncales: 003165 510108165 Eriocaulalesc Commelinales:Triuridales « Cyclanthales: Arecales. Zingiberales: Bromeliales: Typhales:Cyperales « and Orchid ales: Lilliales: Arales.Pandanales أو مع النباتات التي تنتمي ل «Gymnospermae على سبيل المثال»؛ تلك التي تنتمي لرتبة المخروطيات» «Ginkgoales Cupressales and Gnetales: Araucariales.Cycadales 5 أو مع النباتات التي تم تصنيفها في شكل حزازيات (Bryophyta)) على سبيل Sphagnales «Jill و .Funariales تشتمل الأنواع النباتية غير الحصرية والتوضيحية على تلك التي بها جين 5611 والمشتمل على «Arabidopsis thaliana « Physcomitrella patens.Sphagnum fallax «Vitis vinifera (Helianthus annuus Arabidopsis lyrata «Arabidopsis halleri «Solanum lycopersicum (Ricinus communis (Amborella trichopoda 20
Phaeolis (Theobroma cacao (Gossypium hirsutum (Solanum tuberosum
Zea Malus domesticus (Chenopodium quinoa «Glycine max «vulgaris .Oryza sativa , «Brassica rapa (mays التوهين الجيني
تم توفير الكائن الدقيق المتطفر هنا والمشتمل على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 الموهن وتم إنشاؤه بواسطة التدخل البشري؛ على سبيل Sled من خلال التطفير التقليدي أو المعالجة الجينية. على سبيل Jal) فإن الكائن الدقيق المتطفر كما تم توفيره هنا يمكن أن يكون عبارة عن ناتج طفرة تم إنشاؤه بواسطة أي طريقة تطفير ALE للتنفيذ Lo في ذلك؛ على سبيل المثال لا الحصر؛ إشعاع UV إشعاع جاماء أو التطفير الكيميائي والفحص الخاص بنواتج الطفرة والتي بها كلوروفيل chlorophyll متناقص وإنتاجية متزايدة على سبيل المثال؛ باستخدام طرق تك الكشف عنها هنا. على سبيل المثال» فإن فحص نواتج طفرة الكلووفيل المختزلة يمكنها أن تستخدم تصنيف خلية التألق المنشطة (FACS) الفحص (rad) و/أو الاستخلاص والقياس الخاص بامتصاص
0 الكلوروفيل chlorophyll يمكن اختيار الإنتاجية المتزايدة بواسطة النمو الخاص بنواتج الطفرة من الوزن الجاف؛ الوزن الرطب والوزن الجاف الخالي من الرماد أو الكربون العضوي الإجمالي organic carbon (TOC) 10181. تكون طرق إنشاء نواتج الطفرة الخاصة بالكائنات الحية المخلقة ضوئياً باستخدام ناتج التطفير الكلاسيكي والإنشاء الهندسي معروفة بشكل جيد في المجال.
5 تشتمل أمثلة الجينات الموهنة؛ على سبيل المثال لا الحصر على الجينات التي بها واحد او أكثر من استبدالات النيوكلويتيد والتي تغيير مت المتوالية لواحد أو أكثر من الأحماض الأمينية التي ينتج عنها نشاط تم تقليله أو نشاط تم إلغاؤه من البروتين 030160المشفرح والإدراجات أو الحذوفات (الطفرات الجينية القصيرة) في الجينات التي تغير متوالية الحمض الأميني من البروتين 00 بواسطة إزاحة الإطار و/أو إدخال كودونات الإيقاف؛ والإدراجات الكبيرة بداخل الجين
0 والتي ينتك عنها إزاحة في الإطار أو قطع خاص بالبولي ببتيد polypeptide المشفر أو عدم الثبات في حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) الذي تمن نسخه بواسطة (Gall حذوفات كبيرة Ally لا ينتج عنها بروتين "(01016وظيفي وإدراجات وحذوفات أو تطفيرات نقطية في المناطق الخاصة بالجين من 5” أو 3" من منطق التشفير التي تؤثر على الانتساخ؛ الإدراجات والحذوفات أو التطفيرات النقطية في الإنترونات أو روابط الإنترون / الأكسون والتي
5 توثر على الانتساخ والربط أو الثبات حمض نووي .RIBONUCLEIC ACID (RNA) (sjsu)
يمكن أن يكون الجن الموهن أيضاً عبارة عن جين له انتساخ مستهدف بواسطة؛ على سبيل المثال؛ (RNAI وهلا في عكس اتجاه النسخ ورببوزومات؛ أو ما شابه ذلك. يشتمل الكائن الحي الخاص بالتخليق الضوئي على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 الذي يطلق عليه هنا بأنه "ناتج طفرة
56١11 5 " بغض النظر عن الآلية الخاصة بالتوهين من جين 1ا56. يمكن أن يتم عزل التطفيرات بواسطة الطرق التي تم الكشف عنها هناء Ally تشتمل على إجراءات التطفير والفحص التي تم الكشف عنها هنا وأيضاً من خلال المعالجة الجينية. وبالتالي فإن ناتج الطفرة يمكن أن يكون ناتج طفرة معالج بشكل جيني؛ على سبيل المثال؛ ناتج طفرة يكون به جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
GROWTH IMPROVEMENT 1 0 قد تم استهدافه بواسطة ناتج عودة الارتباط الخاص بالمعالج الجينية أو التعطيل الجيني؛ أو استبدال الجين (على سبيل المثال» باستخدام صورة متطفرة من الجين والذي يمكن أن تم تشفيره من البولي ببتيد polypeptide المشترك على نشاط منخفض بالنسبة لنوع البولي ببتيد (polypeptide على سبيل المثال؛ يمكن معالجة الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism محل الاهتمام بواسطة ناتج sage الارتباط المتجانس
5 الموجه بالموضع لكي يتم إدراج المتوالية بداخل موضع الجينوم ويالتالي تغيير الجين و/أو التعبير و/أو إدراج المعزز بداخل الموضع الجيني من الكائن الدقيق العائل لكي يتم التأثير على تعبير الجين عند الموضع. على سبيل المثال؛ فإن المعالجة الجينية أو التعطيل الجيني ا؛ الاستبدال الجيني من خلال عملية المعالجة ناتجة عودة الارتباط يمكن أن تتم من خلال التحويل الخاص بشظية الحمض النووي
0 (على سبيل المثال؛ الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC lly (ACID (DNA) تشتمل على المتوالية المشابه للمنطقة من الجينوم بالنسبة pial الذي تم coy حيث يتم قطع المتوالية بواسطة متوالية غريبة وبصورة نمطية جين مرقم قابل للاختيار والذي يسمح بالاختيار فيما يتعلق بالبنية المتكاملة. يمكن أن تكون المتواليات المحيطة المتجانسة للجينوم على أي من الجوانب من المتوالية الغريبة أو متوالية الجين المتطفرة؛ على سبيل المثل
5 على الأقل حوالي 50؛ ؛ على الأقل حوالي 100( على الأقل حوالي 200 على الأقل حوالي
300 على الأقل حوالي 400 على الأقل حوالي 500 على الأقل حوالي 600؛ على الأقل حوالي (TOO على الأقل حوالي 800؛ على الأقل حوالي 900 على الأقل حوالي 1000 على الأقل حوالي 10200« على الأقل حوالي 16500 على الأقل حوالي 1750؛ أو على الأقل حوالي 0 إعلى سبيل المثال» على الأقل أي من 50؛ 100 200500 1000 1500 أو 2000( من النيكليوتيدات في الطول. يمكن توفير بنية جين تم تعطيله جينياً أو بنية 'تم تشغيلها جينياً” lly يكون بها متوالية due قد تمت إحاظتها بواسطة متواليات الجين في الناقل حيث يمن المعالجة بصورة خطية؛ عل سبيل المثال؛ إلى الخارج من المنطقة Ally تخضع لظروف ناتجة عودة الارتباط غير المتجانسة أو يمكن أن يتم توفيرها بصورة شظية خطية lly لا تكون في سياق الناقل» على سبيل المثال؛ التعطيل الجيني أو بنية الخاصة بالتشغيل الجيني والتي 0 يمكن عزلها أو تخليقها بما في ذلك؛ على سبيل المثال لا الحصر منتج PCR في بعض الحالات؛ فإن نظام المرقم الخاص بالتشتيت يمكن استخدامه لإنتاج وحدات التعطيل الجيني بواسطة عملية ناتجة عودة الارتباط المتجانس؛ حيث أن اينين من شظايا الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) يمكن إدخالهم بحيث يتم تجديد المرقم القابل للاختيار وإتلاف موضع الجين محل الاهتمام من خلال ثلاثة من الحالات التشابكية .(163-157FEMS Microbiol Lett 273: (2007) .Jeong etal) 5 في واحدة من السمات؛ يوفر الكشف الحالي كائنات معدلة معدلة بشكل جيني؛ على سبيل المثال؛ كائنات دقيقة بها واحد او أكثر من التعديلات الجينية أو التطفيرات الخاصة بالتعبير الموهن عن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 وكما تم استخدامه هناء يشير مصطلح 'توهين" أو 'تعبير متغير و/أو 0 نظيفة خاصة بالجين (على سبيل المثال؛ جين 1ا56 ) إلى تقليل أو القضاء على تعبير الجين في أي طريقة والتي تقلل من الإنتاج و/أو الوظيفة الخاصة ببروتين ula protein تم التعبير عنه بشكل كامل وبشكل وظيفي. تشتمل وسائل توهين الجين؛ cio جين 1ا565؛ على سبيل المثال» على بنيات ناتجة عودة الارتباط متجانسة؛ وأنظمة «CRISPR بما في ذلك (RNAs الذي تم توجيهه أو 0859 أو أي إنزيمات cas أخرى؛ على سبيل المثال» 0011؛ و 00151 050701 5 أو أخرى (Say اختياري شظايا مانح خلاصة بالإدراج بداخل موضع مستهدف؛ بنيات (RNAI
بما في ذلك ling ShRNAS حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) في عكس اتجاه النسخ؛ cling ريبوزوم؛ 1/81015؛ ومركبات نيوكلياز إصبع الزنك؛ ومركبات ميجانيوكلياز. على سبيل المثال وفي بعض النماذج؛ فإن الجين يمكن أن يتم إتلافه. على سبيل المثال» بسبب إدراج أو استبدال الجين بواسطة نشاط ناتج عودة الارتباط متجانس و/أو بواسطة النشاط الخاص بقطع جديلة مزدوج والذي يحث العامل Jie ميجانيوكلياز (انظرء على سبيل Jul الطلب الدولي رقم 2012/017329 (الطلب الأمريكي رقم 2013/0164850 والطلب الأمريكي رقم 2016/0272980 )¢ ونيوكلياز إصبع الزنك ) )2012( Perez—Pinera et al. «Curr.
Opin.
Chem.
Biol. 16:268-7 الطلب الدولي 2012/017329 ) 0 والطلب الأمريكي 2012/0324603( الطلب الأمريكي 0 2016/0130599 ل18150؛ الطلب الأمريكي 2016/013599 والطلب الدولي رقم 1 الطلب الدولي (2016/0272980) أو بروتين proteincas (على سبيل «Jbl بروتين proteinCas9 بروتين 10167ممرسل عصبي 1 أو بروتين 10160صمرسل 1 ) من نظام CRISPR (انظر؛ على سبيل المثال؛ الطلبات الأمريكية ¢8/359.697 5 8/356.889؛ 2016/030489؛ 2016/0090603 5 2014/0068797؛ 5 2016/0208243؛ 2017/0233756). تكون طرق الإتلاف الأخرى معروفة في المجال ويمكن أن تكون مناسبة سهنا كما يمكن فهمه بواسطة الشخص ذي المهارة العادية في المجال. في بعض النماذج, فإن الكائن الحي ناتج التطفير يكون هل واحد أو أكثر من التطفيرات والتي تؤثر على التعبير عن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يمكن أن يشتمل الكائن الحي الدقيق 0 الذي تمت معالجته والذي به تعبير موهن من جين SGI على جين 5611 تالف والذي يشتمل على أحد الإدراجات على الأقل والتطفيرات أو الحذف الخاص بتقليل أو تعطيل التعبير عن الجين من الجين 1ا56 الوظيفي بشكل كامل والذي لا ينتج أو الذي يتم إنتاجه بكميات منخفضة بالمقارنة بما تم إنتاجه بواسطة الكائن الدقيق من عينة المقارنة لاذي لا يشتمل على جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 تالف. على سبيل المثال؛ وفي بضع النماذج؛ فإن واحد أو أكثر من
التطفيرات (التغيير أو الحذف و/أو الإدراج لواحد أو أكثر من النيوكليوتيدات) في منطقة التشفير من الجين؛ يمكن أن يكون في إنترون» 3" UTR و 5 7لا أ و منطقة المعزز؛ على سبيل المتال؛ في مدى من 1 كيلو قاعدة من الانتساخ في موضع البدء؛ أو في مدى حوالي 2 كيلو قاعدة من موضع بدء الانتساخ أو في مدى حوالي 3 كيلو قاعدة أو موضع بدء الترجمة. في بعض النماذج؛ على سبيل (Jl فإن ناتج الطفرة نم الكائن الحي الدقيق الذي به التعبير الموهن عن الجين كما تم الكشف die هناء يمكن أن يشتمل على واحد أو أكثر من التطفيرات والتي يمكن أن تكون واحد من التغييرات في القاعدة النووية و/أو واحد أو أكثر من حذوفات القاعدة النووية و/أو واحد أو أكثر من إدراجات القاعدة النووية؛ بداخل المنطقة الخاصة بجين 5 من موضع بدء oz La) مثلما هو الحال في الأمثلة غير الحصرية والتي تكون في مدى من حوالي 2 كيلو 0 قاعدة؛ أو في مدى حوالي 1.2 كيلو قاعدة؛ أو في مدى حوالي 1 كيلة قاعدة أو في مدى من حوالي 0.5 كيلو قاعدة من موضع بدء الانتساخ المعروف أو المفترض أو في مدى حوالي 3 كيلو قاعدة أو في مدى حوالي 5 كيلو deli أو في مدى من حوالي 2 كيلو sels أو في مدى حوالي 1.5 كيلو قاعدة؛ أو في مدى من حوالي 1 كيلو قاعدة أو في مدى حوالي 0.5 كيلو قاعدة من موضع بدء الترجمة. وكأمثلة غير حصرية؛ فإن الجين ناتج الطفرة يمكن أن يكون عبارة عن 5 جين له تطفيرء وإدراج او حذف بداخل منطقة المعزز والذي يمكن أن يكون إما زائداً أو متناقصاً عن التعبير الخاص بالجين؛ والذي يمكن أن يكون عبارة عن جين الذي له حذف ينتج عنه إنتاج خاص بالبروتين 0301610غير الوظيفي؛ أو البروتين 0201610المقطوع أو البروتين 00016107السلبي السائد أو عدم وجود بروتين؛ أو يمكن أن يكون عبارة عن جين له واحدة أو أكثر من نقاط التطفير والتي تؤدي إلى تغيير في الحمض الأميني من البروتين adaliprotein أو ينتج die تضفير غير 0 منتتظم من ناتج انتساخ الجين» إلخ. تمت الإشارة إلى أنظمة CRISPR هناء وتمت المراجعة بواسطة Cell ( .Hsu et al 2014¢157:1262-1278 ) والتي تشتمل؛ بالإضافة إلى بولي ببتيد polypeptide نيوكلياز 5 أو المعقد والذي يستهدف حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) وفي الغالب يشير 8/ل00' والذي يتفاعل مع موضع استهداف الجينوم بواسطة التتميم الخاص 5 بمتوالية موضع مستهدفة؛ التنشيط التشاكلي dling’) التتبع') حمض نووي رببوزي
RIBONUCLEIC ACID (RNA) والتي تتعقد مع بولي ببتيد (Sag cas polypeptide أن Jails على منطقة lly ترتبط (بواسطة التميم) في CRNA المستهدف. يستخدم هذا الكشف استخدام اثنين من جزيئات حمض نوري رببوزي 'crRNA" ( RIBONUCLEIC ACID (RNA) و 1:80:08 والتي يمكن أن يتم تحويلها بصورة مشتركة في سلالة عائل (أو يتم التعبير lie 5 في سلسلة العائل) والتي تم التعبير نها أو تم نقل العدوى لها باستخدام بروتين proteincas خاصة بتحرير الجينوم؛ أو استخدام RNA الدليلية المنفرد والتي تشتمل على متمم متوالية بالنسبة لمتوالية المستهدف وأيضاً المتوالية التي delim مع بروتين 000160085. أي أنه؛ وفي بعض الاستراتيجيات؛ فإن نظام CRISPR كما تم استخدامه هنا يمكن أن يشتمل على اثنين من جزيئات RNA (بولي نيوكليوتيدات RNA ؛ ~RNA" خاص بالتتبع" و RNA" خاص بالمستهدف" 0 أو "rRNA انظر Lad يلي) وتمت الإشارة إليه هنا بأنه sin’ مزدوج من حمض نووي Sisk) RIBONUCLEIC ACID (RNA) مستهدفة من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين 'DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) أو RNA" مستهدف من الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) لاثنين من الجزيئات". وعلى نحو بديل؛ وكما تم توضيحه في الأمثلة. فإن حمض نووي رببوني RIBONUCLEIC ACID (RNA) 5 يتسهدف DNA على متوالية تنشيط تشابكية خاصة بالتفاعل مع بروتين proteincas (بالإضافة إلى متواليات متجانسة مستهدفة (( (Cr) والتي يكون بها RNA المستهدفة ل الحمض النووي الرربوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) عبارة عن جزيء RNA منفرد (بولي نيوكليوتيد حمض نوري رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) مستهدف) وتتم الإشارة إليه هنا بأنه RNA" دليلي خيمري”» و"حمض نووي ريبوزي ACID (RNA) 0 41801000110 دليلي منفرد" أو "SgRNA" تكون المصطلحات RNA" يستهدف DNA " ولهلا90" قد تم تضمينه وتمت الإشارة إليه بصورة إجمالية مع جزيء مزدوج من RNAS يستهدف DNA ومع جزيء منفرد من RNAS يستهدف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) (أيء .(sgRNASs تكون كل من RNAS الموجهة بالجزيء المنفرد واثنين من أنظمة حمض نووي RIBONUCLEIC (sis) ACID (RNA) 5 تم وصفها بالتفصيل في المراجع وعلى سبيل المثال» في نشرة طلب البراءة الأمريكي رقم 2014/0068797 والذي تم تضمينه هنا كمرجع بكامله. تشتمل بعض النماذج
والطرق والتركيبات المقدمة هنا RNA le توجيهي والذي له متوالية مناظرة لمتوالية مستهدفة في جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في بعض النماذج؛ يكون حمض نووي RIBONUCLEIC (isu) ACID (RNA) التوجيهي Ble عن صورة موجة خيمرية. في نماذج أخرى لا RNA Jain التوجيهي على متوالية وسيلة تتبع. في بعض الأمثلة؛ فإن كل من «rRNA الخاصة باستهداف موضع الجين 5 tracrRNA قد تم استخدامه في طريقة التطفير التي يتوسطها 085. في بعض النماذج؛ فإن بروتين proteincas يتم التعبير عنه في الخلية المستهدفة أو الكائن الحي وفي بعض النماذج البديلة فإن بروتين proteincas يمكن أن يتم إدخاله في lal) على سبيل المثال؛ في شكل معقد رببونيوكليوتيد والذي يشتمل على حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) 0 توجيني والذي يمكن أن يكون RNA توجيهي خيمري أو 8/ل051 و؛ في بعض النماذج؛ 8ل80. (Sa استخدام أي بروتين proteincas في الطرق cla على سبيل المثال؛ Cas9 (Cas8 (Cas7 256 «Cas5 (Cas4 (Cas3 92 61 (المعروف أيضاً بأنه 0801 و «Cse2 05861 «Csy3 «Csy2 «Csyl 08510 ((Csx12 «Csn2 (Csa5 «Csc2 1 لق 5012 5013 5014 55 05176 «Cmr5 «Cmr4 Cmr3 «Cmrl 5 قدصت «Cpfl «Cms] 1موث «Csb3 «(Csb2 «Csf2 «(Csf]l «Csx15 «Csx1 «Csx3 (CsaX (Csx16 «Csx10 «Csx14 «Csx17 (Csf3 0814 ؛ 0201؛ 0202؛ 0203)؛ والصور التجانسة منه أو النسخ المعدلة منه. يمكن أن يكون بروتين proteincas عبارة عن بروتين Jie cproteinCas9 بروتين proteinCas9 من S. aureus: S. pneumonia. 5. thermophilus.Staphylococcus pyogenes « أو (Neisseria meningitidis 20 كأمثلة غير حصرية. تم أيضاً الأخذ في الاعتبار لبروتينات Cas9 والتي تم توفيرها في شلك المتواليات من 256-1 و1346-795 في نشرة طلب البراءة الأمريكي رقم 2014/0068797؛ ولاتي تم تحضيرها هنا كمرجع بكاملها؛ والبروتينات 0859 الخيمرية والتي يمكن أن يتم دمجها مع نطاقات من أكثر من بروتين proteinCas9 وأيضاً الصور المتغيرة منها والتطفيرات من بروتينات 0859 تم تحديدها. يمكن أن يكون نيوكلياز موجه من حمض نووي 5 روزي «(RIBONUCLEIC ACID (RNA) على سبيل المثال؛ عبارة عن بروتين
61م (انظر» على سبيل المثال؛ البراءة الأمريكية رقم 2016/0208243) أو بروتين 1 (انظرء على سبيل المثال البراءة الأمريكية رقم 2017/0233756 ). يقوم نشاط Cas بانشطار الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) المستهدف لكي يتم إنتاج أجزا ء متكيرة مزدوجة الجديلة. يتم بعد ذلك تصليح تلك الأجزاء المكسورة بواسطة الخلية في إحدى الطرق التالية: في الطرف غير المتجانس المرتبط (NHEJ)) فإن الأجزاء المكسورة المزدوجة الجديلة يتم تصليحها بواسطة Jal المباشر الخاص بالأطراف المكسورة بالنسبة لبعضها الآخر. في تلك الحالة؛ لا يكون هناك أي Bale حمض نووي قد تم إدراجها في الموضع؛ على الرغم نم أن بعض مواد الأحماض النووية يمكن أن يتم فقدهاء مما ينتج die تخفف أو تغيير وفي الغالب ينتج عنه تطفير. 0 في الإصلاح الموجه بالتشابه؛ فإن بولي ببتيد polypeptide المانح (الذي يطلق عليه في بعض الاحيان بأنه 'الحمض النووي Soul منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) للمائح أو DNA الذي تم تحريره") يمكن أن يكون له تشابه بالنسبة لمتوالية DNA مستهدفة والتي يتم استخداها في شكل صورة أساسية خاصة بإصلاح متوالية الحمض النووي الرربوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) المستهدفة؛ مما ينتج 5 عنه نقال خاص بالمعلومات لاجينية من البولي نيوكليوتيد المانح dually لمستهدف DNA وكما تم استخدامه فإن مادة الحمض النووي يمكن ان يتم إدراجها/ نسخها في الموضع. يمكن أن تؤدي تعديلات DNA نتيجة NHEJ و/أو الإصلاح الموجه بالتشابه Jo) سبيل (Jad) باستدام جزيء mile الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) ) إلى على سبيل المثال؛ تصحيح الجين واستبدال الجين ووضع علامة على الجين وإدراج الجين 0 المستهدف وحذف النيوكليوتيد؛ وإتلاف الجين وتطفير الجين؛ إلخ. في بعض الحالات؛ يمكن استخدام انشطار الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) بواسطة بولي ببتيد polypeptide معدل موجه بالموضع (على سبيل المثال؛ نيوكلياز 085؛ نيوكلياز إصبع «ll وميجا نيوكلياز أو (TALEN لكي يتم حذف مادة الحمض النووي من متوالية DNA المستهدفة بواسطة الانشطار لمتوالية DNA 5 المستهدفة والسماح للخلية بأن تقوم بإصلاح المتوالية في غياب البولي نيوكليوتيد المائح الذي تم
توفيره خارجي المنشاً. يمكن أن ينتج عن مثل تلك الحالات التطفير (إصلاح (‘Mis عند موضع ربط أطراف الانشطار والذي يمكن أن ينتج عنه إتلاف الجين. leg نحو cay إذا تم إعطاء حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) الذي يستهدف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) 5 بصورة مشتركة فإن ذلك يعبر عن نيوكلياز cas مع DNA المانح؛ (Sarg استخدام الطرق المذكورة لكي تتم dil] أي؛ إدراج أو استبدال مادة حمض نووي مع متوالية DNA مستهدفة (على سبيل المثال؛ التعطيل الجيني” بواسطة التطفير الإدراجي أو "التشغيل الجيني" للحمض النووي والذي يشفر البروتين protein على سبيل المثال» مرقم قابل للاختيار و/أو أي بروتين 10167صمحل الاهتمام) و/للم 51 5 «MIRNA إلخ لتعديل متوالية الحمض النووي (على 10 سبيل المثال؛ إدخال تطفير) وما شابه ذلك. يمكن أن يكون المائح» في نماذج محددة؛ مشتملاً على متوالية منظمة للجين (على سبيل المثال؛ معزز) والذي يمكن؛ باستخدام CRISPR مستهدف»؛ أن يتم إدراجه في gall العلوي من مناطق التشفير من الجين والجزءِ العلوي من منطقة معزز قريبة مفترضة من الجين؛ على سبيل المثال؛ « على الأقل حوالي 50 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 100 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 120 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 150 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 200 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 250 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 300 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 350 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 400 زوج قاعدة؛ على الأقل حوالي 450 زوج قاعدة cl على الأقل حوالي 0 زوج قاعدة (على سبيل المثال» على الأقل 50» 100 200» 300 400 أو 500 زوج قاعدة ) في al) القبلي من ATG عند البدء من منطقة التشفير من جين تحسين نمو كبير مشفر 0 للجين الموهن 1 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT يمكن أن يشتمل mile الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين 8610م DEOXYRIBONUCLEIC (DNA) على متوالية مثل» على سبيل المثال» مرقم قابل للاختيار أو أي متوالية مناسبة والتي يمكن تداخلها مع المعزز الأصلي. يتم إدراج المتوالية الإضافية في gall العلوي من ATG الخاص بالبدء من SGI عند إطار القراءة (على سبيل المثال» في 1475لا أو الجزءِ العلوي من 5 موضع بدء الانتساخ من جين ا56!) والذي يمكنه تقليل أو حتى القضاء على التعبير الخاص
بجين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 داخلي المنشاً. وعلى نحو بديل؛ أو بالإضافة إلى ذلك؛ فإن جين 5611 يمكن أن يكون له معزز داخلي المنشاً خاص به يتم استبداله بشكل كامل أو بشكل جزئي بواسطة معزز أضعف أو معزز يتم تنظيمه بصورة مختلفة أو متوالية خلاف المعزز.
في بعض الأمثلة؛ فإن جزيء الحمض النووي الذي يتم إدخاله في خلية العائل لإنشاء سلالة خلية تحرير جينوم le الفعالية تعمل على تشفير إنزيم 0859 والذي يتم تطفيره بالنسبة لإنزيم من النوع المناظر مثل إنزيم 6859 المتطفر الذي يفتقر للقدرة على انشطار واحدة أو كل من الجدائل الخاصة بالبولي نيوكليوتيد المستهدف المشتمل على متوالية مستهدفة. على سبيل المثال؛ فإن استبدال أسبارتات بألانين (010/8) في نطاق | RUVC الحفزي من 0859 من pyogenes .5
0 يعمل على تحويل 0859 من النيوكليواز والذي يشفر كل من الجدائل بالنسبة لنيكاز (إنزيم يشطر جديلة منفردة). تشتمل الأمثلة لاأخرى الخاصة بالتطفيرات التي تحول 0859 على؛ بدون (pan 18408 او 18548و 5 .NBO3A في بعض النماذج؛ فإن 6859 نيكاز يمكن استخدامها في توليفة مع متوالية (متواليات)؛ على سبيل المثال؛ اثنين من متواليات توجيهية (Ally تستهدف الجدائل في اتجاه النسخ والجدائل في عكس اتجاه النسخ من مستهدف الحمض النووي الرببوزي
5 منقوص الأكسجين .DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) تسمح تلك التوليفة لكل من الجدائل بأن يتم تحزيزها واستخدامها JNHEJ Gaal تقوم اثنين من المستهدفات الخاصة بنيكاز (بصورة قريبة ولكنها تستهدف الجدائل المختلفة من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين lly (DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) يمكن استخدامها لحث NHEJ المتطفر. إن الاستهداف الخاص بالموضع باستخدام الإنزيمات والتي تقوم بشطر السلاسل المقابلة عند
0 المواضع المتذبذبة يمكن أن تقلل الانشاطر غير المستهدف؛ كما هو الحال مع الجدائل والتي يتم انشطارها بصورة دقيقة وبصورة خاصة لكي يتم تحقيق تطفير الجينوم. في أمثلة إضافية إن إنزيم 9 المتطفر والذي يعيق القدرة الخاصة DNA المنشطر يمكن التعبير عنه في الخلية حيث أن واحدة أو أكثر من RNAS الموجهة يمكن أن تستهدف التيار العلوي من موضع بدء الترجمة أو الانتساخ من الجين المستهدف والذي يتم إدخاله أيضاً. وفي هذه الحالة؛ فإن إنزيم 085 يمكن أن
5 يبرتبط مع المتوالية المستهدفة ويعيق الانتساق الخاص بالجين المستهدف et al) أ©. )2013(
Cell 152:1173-1183). إن واجهة CRISPR المذكورة من التعبير الجيني يمكن أن تتم slay) إليها في شكل RNAI ويمكن وصفها Load بالتفصيل في .Larson et al (2013) :8Nat.
Protoc. 2196-2180. في بعض الحالات؛ فإن بولي ببتيد cas polypeptide Jia بولي ببتيد polypeptide 08359 يكون عبارة عن بولي ببتيد polypeptide اندماج يشتمل؛ على سبيل المثال؛ على: Jo (i ببتيد polypeptide 0859 (والذي يمكن أن يكون بشكل اختياري عبارة عن بولي ببتيد polypeptide 0859 كما تم وصفه أعلاه)؛ و ب) يرتبط بشكل تساهمي مع البولي ببتيد polypeptide غير المتجانس (والذي يطلق عليه أيضاً بأنه " مشارك اندماج"). يمكن أن يتم ربط متوالية الحمض النووي غير المتجانسة مع متوالية حمض نووي أخرى (على سبيل بواسطة المعالجة الجينية) لكي يتم إنشاء متوالية نيوكليوتيد خيمري تشفر البولي ببتيد polypeptide 0 الخيمري. في بعض النماذج؛ فإن بولي ببتيد polypeptide الاندماج يتم إنتاجه بواسطة دمج البولي ببتيد polypeptide 0859 مع متوالية غير متجانسة Ally توفر تحديد موضع خلوي فرعي gl) متولية غير متجانسة والتي تكون عبارة عن متوالية موضع خلوي فرعي؛ على سبيل (Jbl إشارة تحديد موضع نووي nuclear localization sequence (NLS) لاستهداف النواة؛ وإشارة تحديد موضع الميتوكوندريا وإشارة تحديد موضع الكلورويلاست لاستهداف 5 كلورويلاست؛ وإشارة احتجاز ER ؛ وما شابه ذلك). في بعض النماذج, فإن المتوالية غير المتجانسة يمكن أن توفر علامة (gf) متوالية غير متجانسة تكون عبارة عن مرقم قابل للاكتشاف) لسهولة التتبع و/أو التنقية (على سبيل «Jal بروتين 000180تألق؛ على سبيل المثال؛ بروتين 07 فلوروسنت أخضر (CFP (RFP (YFP (GFP) /اع00 tdTomato وما شابه ذلك؛ وعلامة هيماتوجلوتينين hemagglutinin (HA) ؛ وعلامة FLAG ؛ وعلامة Myc ؛ وما 0 شابه ذلك). يمكن أن تتم معالجة الخلايا العائلة بصورة جينية (على سبيل (Jal) النقل العارض للإشارة لها أو تحويلها أو نقل العدوى لها) باستخدام؛ على سبيل المثال؛ بنية ناقل (Ally يمكن؛ على سبيل المثال» أن تكون عبارة عن ناقل متجانس ناتج عودة الارتباط والذي يشتمل على متواليات حمض نووي متجانسة بالنسبة لجز من موضع جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 من الخلية العائلة أو بالنسبة للمناطق
المجاورة له أو يمكن أن يكون ناقل تعبير خاص بالتعبير عن أي توليفة من بروتين proteincas (على سبيل المثال؛ بروتين RNA 4 proteinCas9) دليلي خيمري من CRISPR أى crRNA و/أو tracrRNA وبنية RNAI ( على سبيل المثال» ShRNA )أو حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) في عكس اتجاه النسخ أو الجسيم الشحمي. يمكن أن يكون الناقل؛ على سبيل المثال» في صورة بلازميد أو جسيم فيروسي أو ملتهمة؛ إلخ. يمكن أن يكون الناقل الخاص بالتعبير من البولي ببتيد polypeptide أو RNA خاصاً بتحرير الجينوم ويمكن تصميمه للتكامل بداخل عائل» على سبيل المثال» بواسطة المعالجة ناتجة عودة الارتباط المتجانسة. يمكن استخدام ناقل يشتمل على متوالية بولي نيوكليوتيد كما تم وصفه هناء على سبيل المثال؛ المتواليات التي بها تشابه مع متواليات جين 1ا56 من العائل (بما في ذلك متواليات تكون 0 قبلية أو بعدية بالنسبة للمتواليات المشفرة ل تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا56) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 )وأيضاً (Sing اختياري مرقم قابل للاختيار أو جين مسجل وذلك لكي يتم تحويل عائل مناسب بحيث يتم التسبب في توهين جين 1 . يمكن أن يشتمل الكائن الحي الدقيق في بعض الأمثلة على التعبير المختزل ولكن غير المبطل من جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 والكائن الدقيق ناتج عودة الارتباط الذي يشتمل على زيادة في إنتاج الشحم 0أمألمن حوالي %25 إلى حوالي 96200 أو أكثر؛ على سبيل المثال. على سبيل المثال؛ فإن الزيادة في إنتاج الشحم يمكن أن تكون بين حوالي 1625 أكثر إلى حوالي 16200 أكثر أو إلى حوالي 9625 أكثر إلى حوالي 16175 أكثرء أو إلى حوالي 9625 أكثر إلى حوالي 96150 0 أكثرء أو إلى حوالي 9625 أكثر إلى حوالي 16125 أكثر» أو إلى حوالي 9650 أكثر إلى حوالي 0 أكثر؛ أو إلى حوالي 1650 أكثر إلى حوالي 96175 iS أو إلى حوالي 91650 أكثر إلى حوالي 16150 أكثر؛ أو إلى حوالي 9650 أكثر إلى حوالي 96125 أكثرء أو إلى حوالي 9675 أكثر إلى Jos 96200 أكثر؛ أو إلى or حوالي 9675 أكثر إلى حوالي 96175 أكثرء أو إلى حوالي 9675 أكثر إلى حوالي 96150؛ أو حوالي 9675 أكثر إلى حوالي 96125 أكثر (على سبيل المثال» 916200-25 أكثر). يمكن أن يشتمل الكائن الحي المعدل والمخلق ضوئياً كما تم
توفيره هنا في بعض الامثلة على بنية حمض نووي موهنة خاصة بتوهين التعبير عن جين SGI
في بعض or Sail) فإن الكائن الدقيق المعدل جينياً كما تم توفيره هنا يمكن أن يشتمل على بنية
حمض نووي خاصة بتوهين التعبير عن البولي ببتيد .SGIT polypeptide على سبيل المثال»
فإن الكائن الحي الدقيق العائل يمكن أن يشتمل على بنية خاصة بالتعبير عن جزيء RNAI أو إنزيم ريبوزي أو جزيء ناتج عودة الارتباط والذي يقلل من تعبير جين 1ا56. في بعض الأمثلة؛
فإن الكائن الدقيق ناتج عودة الارتباط كما تم توفيره هنا يمكن أن يشتمل على بنية تم إدخالها واحدة
على الأقل خاصة بالتعبير المختزل عن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا56)
.SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1
في بعض الأمثلة؛ فإن السلاسل التي تم تعديلها يمن أن يتم فحصها للتعبير عن جين 5611
0 والذي يتم تقليله بالنسبة لخلية عينة المقارنة والتي لا تشتمل على تعديل جيني خاص بتوهين التعبير عن جين 1ا56 ولكنه لا يتم القضا عليها باستخدام الطرق المعروفة في المجال مثل؛ على سبيل المثال» RNA-Seq أو الانتساخ العكسي ل (Sa .)41-0014( PCR تعديل السلالة الجينية التي تم توفيرها هنا لكي تشتمل على بنية خاصة بتوهين التعبير عن الجين من خلال تقليل الكمية أو الثبات أو قابلية das ill الخاصة ب MRNA من الجين الذي يشفر البولي
5 ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
.GROWTH IMPROVEMENT 1 على سبيل المثال» يمكن تحويل الكائن all مثل السلالة الطحلبية أو سلالة kont غير متجانسة باستخدام حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) في عكس اتجاه النسخ؛ RNAI أو بنية الريبوزوم التي تستهدف MRNA من جين 1ا56 باستخدام طرق معروفة في المجال. على سبيل المثال؛ فإن بنية حمض نووي رببوزي
RIBONUCLEIC ACID (RNA) 0 في عكس اتجاه النسخ تشتمل على كل أو جزء من المنطقة التي تم انتساخها من الجين الذي يمكن أن يتم إدخاله في الكائن الحي الدقيق لكي يتم تقليل التعبير ( Shroda et al. (1999) The Plant Cell 11:1165-78: Ngiam et al. Appl.
Environ.
Microbiol. 66: 775-782; Ohnuma et al. (2009) )2000( Protoplasma 236: 107-112; Lavaud et al. (2012) PLoS One 7:e36806).
25 وعلى نحو بديل؛ أو بالإضافة إلى ذلك» فإن بنية RNAT ( على سبيل المثال؛ البنية التي تشفر
حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) هيبارين) تستهدف الجين المشتم على نطاق TPR ويمكن أن يتم إدخاله في كائن حي خاص بالتخليق الضوئي Jie أحد الطحالب أو النباتات الخاصة بتقليل التعبير عن جين 5611 (انظرء؛ على سبيل المثال؛ Cerruti et al. Eukaryotic Cell (2011) 10: 1164-1172: Shroda et al. (2006) Curr. )2011( (Genet. 49:69-84 5
تكون الريبوزيمات عبارة عن معقدات بروتين lly ProteinRNA تقوم بشطل الأحماض النووية في طريقة محددة الموضع. تشتمل الريبوزيمات على نطاقات حفزية (Allg تشتمل على نشاط إندوكلياز. Mad سبيل المثال» تقرر البراءة الأمريكية رقم 5.354.855 (التي تم تضمينها هنا بكاملها كمرجع) بأن رببوزيمات معينة يمكنها أن تعمل في شكل إندوكلياز مع خاصية متوالية أعلى
0 -من تلك الخاصة بالريبونيكلياز المعروف (Ally تصل إلى إنزيمات تقييد الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين .DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) يمكن تصميم بنيات حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) (الريبوزيمات) بحيث تكون في صورة زوج قاعدة مع MRNA الذي يشفر الجن كما تم توفيره هنا والذي ashy بشطر المستهدف MRNA بعض الأمثلة؛ فإن متواليات الرببوزيم يمكن أن يتم تكاملها مع مضادات انتساخ خاصة بنية
حمض نووي RIBONUCLEIC ACID (RNA) isn) خاصة بالإنشطار المتوسط من المستهدف. يمكن الأخذ في الأعتبار للعديد من الرببوزيمات Lad يتعلق بتصميمها واستخدامها وهي معروفة في المجال وتم وصفهاء على سبيل المثال؛ Nature (1988) .Haseloff et al .334:585-591 تم استهداف الريبوزيمات بحيث تعطي متوالية بواسطة تلدين الموضع بواسطة تفاعلات زوج القاعدة الأساسية المتمم. كان من المطلوب وجود اثنين من صور التمديد الخاصة
0 بالاستهداف. تقوم الاثنين من صور التمديد تلك بإحاطة بنية الريبوزويمات الحفزية كما تم تحديده أعلاه. يمكن أن تتنوع كل بنية تمديد من المتوالية في الطول من 7 إلى 15 نيوكليوتيد. يكون المطلب الوحيد الخاص بتحديد متواليات التجانس هوء؛ على المستهدف حمض نووي رببوزي (RIBONUCLEIC ACID (RNA) بحيث يتم فصله بواسطة متوالية محددة والتي تكون عبارة عن موضع انشطار. وبالنسبة للحمض النووي الريبوزي الذي على شكل المطرقة فإن موضع
5 الانشطار يكون عبارة عن متوالية ثنائية النيوكليوتيد على RNA المستهدف والذي يكون عبارة عن
اليوراسيل ((لاء يلي ذلك إما الأدينين adenine أو السيتوسين cytosine أو اليوراسيل uracil ( مار Nucl Acids Res 23:2250-68.10000500 et al.) (U IC (1995) ). كان تردد النيوكليوتيد المذكور الذي حيث في أي حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) معين بصورة إحصائية هو 3 من 16. على سبيل المثال؛ فإن أي مرسل مستهدف معين حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) من 1000 قاعدة أو 187 موضع
انشطا ثنائي النيوكليوتيد والذي يكون محتمل من الناحية الإحصائية. تمت مناقشة التصميم العام والتحسين الخاص بالريبوزيم في نشاط الانشطار RNA بمزيد من التفصيل ( Haseloff and Gerlach (1988) Nature 334:585-591; Symons Ann Rev Biochem 61: 641-71; Chowrira et al. (1994) J Biol )1992(
«(Chem 269:25856-64; Thompson et al. (1995) supra 0 وقد تم تضمين JS منها كمرجع بكاملها هنا. إن التصميم والاختبار الخاص بالريبوزومات الخاصة بالانشطار الفعال ل حمض نووي RIBONUCLEIC ACID (RNA) (gion) المستهدف يكون معروفاً بشكل جيد للماهر في المجال. تم وصف أمثلة الطرق العلمية الخاصة بتصميم واختبار الريبوزومات بواسطة supra and Lieber and Strauss (1995) Mol Cell 000/18 et al. )1994(
(Biol. 15: 540-51 5 وقد تم تضمينها في هذه الوثيقة بأكملها كمراجع. إن تحديد متواليات التشغيل والمتواليات المفضلة للاستخدام في النقص المتحكم فيه لجين معين هو طريقة لتحضير اختبار متوالية معينة ويتم ممارسته بصورة روتينية أو "and بطريقة معروفة لذوي المهارة في المجال. تم وصف استخدام بنيات RNAT في المراجع المذكورة أعلاه؛ وأيضاً في الطلب الأمريكي رقم 2005/0166289 والطلب الدولي رقم 2013/016267 (وقد تم تضمين كلم منها هنا
0 كمراجع بكاملها)؛ على سبيل المثال. تم توصيل حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) مزدوجة الجديلة مع التشابه مع جين المستهدف بالنسبة للخلية أو تم إنتاجه في الخلية بواسطة التعبير عن بنية (RNAI على سبيل المثال؛ بنية هيبارين قصير RNAI (50). يمكن ن تشتمل البنية على متوالية والتي تكون نمطية بالنسبة للجين المستهدف؛ أو عى الأقل بها حوالي 0 على JN حوالي 5. على الأقل حوالي %60« على الأقل حوالي 5. على الأقل
5 حوالي 9670؛ على الأقل حوالي 9675؛ على الأقل حوالي 9680 على الأقل حوالي 9685؛ على
الأقل حوالي 9690؛ على الأقل حوالي 9695 على الأقل حوالي 9696؛ على الأقل حوالي 7. على الأقل حوالي 9698؛ أو على الأقل حوالي 9699 من التطابق بالنسبة لمتوالية الجين المستهدف.يمكن أن تشتمل البنية على الأقل على حوالي 20 على الأقل حوالي 30 على الأقل حوالي 40؛ على الأقل حوالي 50؛ على الأقل حوالي 100 على الأقل حوالي 200؛ على الأقل حوالي 300 على الأقل حوالي 400 على الأقل حوالي 500 على الأقل حوالي 600؛ على الأقل حوالي 700( على الأقل حوالي 800؛ على الأقل حوالي 900 of على الأقل حوالي 1 كيلو قاعدة من المتوالية (على سبيل Jha) على الأقل 20 50« 100« 200« 400« 600« 0 أو 1 كيلو قاعدة من المتوالية) من التشابه بالنسبة لجين مستهدف. يمكن تعديل نواقل التعبير باستخدام المعززات التي تم اختيارها للتعبير المتصل والتعبير القابل للحث من بنية RNAI 0 مثل البنية التي تنتج ShRNA يمكن أن تكون المعززات المستخدمة في عكس اتجاه النسخ؛ RNAI أو بنيات الحمض النووي الريبوزي Ble عن صور وظيفية في ASH الحي العائل والتي يمكن أن تكون مناسبة لمستويات التعبير المطلوية للتعبير عن الجين المستهدف بالكمية المطلوية. تكون المعززات الوظيفية في الطحالب والنباتات معروفة في المجال وتم الكشف عنها هنا. يمكن أن تكون البنية قد تم تحويلها 5 إلى طحال أو نباتات باستخدام أي طريقة ممكنة بما في ذلك أي طريقة تم الكشف عنها هنا. إن الكائن الحي ناتج عودة الارتباط أو الكائن الدقيق المحول باستخدام جزيء حمض نووي والخاص بتوهين التعبير عن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT «is GROWTH IMPROVEMENT 1 على سبيل المثال لا الحصر RNAI أو بنية الجين الريبوزي؛ يمكن أن يكون له خصائص خاصة بناتج طفرة 1ا56 التي تم وصفها هنا La في ذلك؛ 0 على سبيل المثال وليس الحصرء الكلوروفيل chlorophyll المتناقص وفعالية التخليق الضوئي المتزايدة وقابلية الإنتاج المتزايدة في المزرعة بالنسبة للكائن الحي العائل أو الكائن الحي الدقيق لا يشتمل على جزيء حمض نووي خارجي Lind) مما ينتج عنه تعبير جين موهن. سوف يدرك الماهر في المجال أن عدد من طرق التحويل يمكن استخدامها فيما يتعلق بالتحويل الجيني للكائنات الدقيقة؛ ويتالي يمكن أن يتم نشرها Lad يتعلق بطرق الاختراع الحالي. يقصد من 5 "لتحويل الثابت" أن يعني أن بنية الحمض النووي يتم الإدخال في الكائن الحي وتتكامل بداخل
الجينوم من الكائن الحي أو تكون عبارة عن بنية إيبوزومية ثابتة وتكون قابلة لتثبيتها بواسطة ذرية منها. يقصد من "التحويل العابر” أن يعني أن البولي نيوكليوتيد يقصد die أن يتم إدخاله في الكائن الحي ولا يتكامل مع الجينو أو خلاف ذلك يصب أساسياً أو يتم وضعه بصورة ثابتة بواسطة الأجيال المتتالية.
يمكن أن ينتج عن التحويل الجيني في الإدراج الثابت و/أو التعبير الخاص بالجينات الانتقالية والبنيات من أي نويات أو بلاستيدات وفي بعض الحالات يمكن أن ينتج عنها تعبير انتقالي خاص بالجينات الانتقالية. يمكن استخدام طرق التحويل أيضاً لكي يتم إدخال RNAs دليلي DNAs i خاصة بالتحرير. تم تسجيل التحويل الجيني الخاص بالطحالب الدقيقة بصورة ناجحة لأ:ثر من 0 سلالة مختلفة من الطحالب الدقيقة والتي يمكن أن تنتمي إلى حوالي 22 نوعاً من الطحالب
0 الخضراء أو الحراء أو الطحالب dad أو الطحالب الترابية (انظرء على سبيل (Jia) et al. كاالااق8 الو J.
Ind. 2010: and Gong et al.
Eukaryotic 2011).Biotechnol.
Microbiol تشتمل الأمثلة غير الحصرية من طرق التحويل المفيدة المذكورة على تقليب الخلايا في وجود خرزات زجاجية أو كربيد السيليكون في شكل شعيرات»؛ على سبيل المثال» 810160001065088 «15(3):452-460 00016 ;1993 0:06 .
Plant J.c 1990; Michael and Miller<Natl.
Acad.
Sci.
U.S.A. 5 13¢ ¢—427 5 تم استخدام تقنية الاستشراد الكهربي بنجاح فيما يتعلق بالتحويل الجيني للعديد من أنود الطحالب الدقيقة والتي تشتمل؛ على سبيل المثال؛ وليس الحصر على Nannochloropsis .sp ( انظرء على سبيل المثال» J.
Phycol..Chen et al. 44:768-76¢ ¢)2008 « (Chlorella sp (انظر على سبيل Curr Genet..Chen et al. (Jud 39:365-370¢ «
No. 9¢ Plant Cell Rep.
Vol.18:2001; Chow and Tung 0 778-780¢ ¢)1999 « GeneticsChlamydomonas (Shimogawara et al. « 148 :1828-1821« Mol.
Biotechnol. «and Dunaliella (Sun et al. (1998 3)30(: 192-185« 2005( على سبيل المثال. تمت الإشارة إلى القذف الدقيق أيضاً بأنه تفجير دقيق للجسيمات أو التحويل بالمسدس الجيني أو التفجير الحيوي والذي يتم استخدامه بصورة ناجة للعديد من أنواع
5 الطحالب Loy في ذلك على سبيل المثال» الطحالب الدياتومية Apt et ( Phaeodactylum (ie
(Mol.
Gen.
Genet. «al. 252:572-579« 1996)ونوع Cyclotella ونوع J.
Phycol..Dunahay et al.)Navicula 31:1004-1012¢ .1995 ) ¢ ونوع الطحالب J.
Phycol.
Fischer et al.) Cylindrotheca 35:113-120¢ 1999¢ (¢ ونوع الطحالب Phycol.
Res. 59: 113- «Miyagawa—-Yamaguchi et al.) .Chaetoceros sp 119< 2011(« وأيضاً أنواع الطحالب الخضراء مثل Biologia (El-Sheekh) Chlorella «No.2: 209-216 Vol.42 Plantarum 1999( وأنواع «Volvox (Jakobiak et al. (Protist 155:381-93< 2004(. وبصورة إضافية فإن تقنيات وسلة تحويل الجين الذي يتوسطه بكتريا الأجرعية تكون مفيردة لعملية التحويل الجيني للطحالب الدقيقة مثل تلك التي تم تقريرهاء على سبيل المثال بواسطة Plant Sci..Kumar 166(3):731-738¢ 2004¢ « Suppl. 11¢ Vol. 37¢ J.
Phycol.cCheney etal.; 0 +2001 . إن الترافق باستخدام أنواع بكتيرية قد تم استخدامه فيما يتعلق بناقل خاص بالجينات ding خاصة بالطحالب كما تم الكشف عنه؛ على سبيل المثال؛ في الطلب الأمريكي رقم 2016/0244770 الذي تم تضمينه هنا كمرجع. سوف يشتمل ناقل التحويل أو البنية كما تم وصفها هنا بشكل نمطي على جين مرقم والذي يمنح 5 نمط ظاهري قابل للاختيار أو قابل للقياس على خلايا العائل المستهدفة؛ على سبيل المثال؛ الخلايا الطحلبية أو يمكن ن يتم تحويله بصورة مشتركة مع البنية التي تشتمل على مرقم. تم تطوير عدد من المرقمات القابلة للإختيار بصورة ناجحة للعزل الفعال لنواتج التحويل الجيني من الطحالب. تشتمل المرقمات القابلة للاختيار.على المقاومة للمضادات الحيوية؛ ومرقمات الفرووسنت والمرقمات الكيميائية الحيوية. تم استخدام العديد من جينات المقاومة للمضادات الحيوية 0 المختلفة بصورة ناجحة لاختيار نواتج التحويل الجينية الدقيقة بما في ذلك بلاستوسيدين؛ وبلوميسين (انظرء على سبيل المثالء Apt et al.,1996,supra; Fischer et al.,1999,supra; 61,1999,Lumbreras et al.,Plant -19,353,.ل Fuhrmann et al.,Plant J.,14(4):441-447,1998; Zaslavskaia et al.,J.
Phycol.,36:379- 386,2000),spectinomycin (Cerutti et al.,Genetics,145: 97-110,1997; Doetsch et al.,Curr.
Genet.,39,49-60,2001; Fargo,Mol.
Cell. 25
Biol.,19:6980-90,1999),streptomycin (Berthold et al.,Protist,153:401-
Jakobiak et al.,Protist,supra.; Sizova et ( ))),باروموميسين 2
Zaslavskaia et ) cpus gal. Gene, 277:221-229,2001),
Dunahay et al.,1995,supra; Poulsen and ) al.,2000,supra),G418
Kroger,FEBS Lett.,272:3413-3423,2005,Zaslavskaia et al.,2000,supra), 5
Poulsen and ) وكلورو مفينوكول 861310010 et al.,2002,supra),) هيجروميسين من المرقمات الأخرى. يمكن أن تكون المرقمات القابلة للانتقاء 2aalig(Kroger,2005,supra عبارة Chlamydomonas نوع طحالب Jie الأخرى الخاصة بالاستخدام في الطحالب الدقيقة
Gen. Genet. .Bateman, Mol) عن مرقمات توفر مقاومة لكيناميسين وأميكاسين
ZEOCIN™ 2000)؛ زبوميسين وفيلوميسين (على سبيل المثال» ,10-263:404 0 (1996 ,30-251:23Stevens, Mol Gen. Genet. ) المقاومة (pheomycin D1 تشتمل مرقمات Sizova et al., 2001, supra).) ومقاومة باراموموسين ونيوميسين
Falciatore ) الفلوروسنت الاخرى أو المرقمات الكروموجينية التي تم استخدامها على ليوسيفيراز
Plant <(Fuhrmann et al. ;1999 (251-239 : .ك1 Mar. Biotechnol..et al. «(1991 322-317 19: « Curr. Genet.. 2004; Jarvis and Brown:Mol. Biol. 5 supra; « 2001¢ supra; Cheney et al. 2001:0080 et al.) جلوكورينداز =f « supra; Falciatore et al. 1999: supra; EI-Sheekh. 1999.Chow and Tung -8 )و 1994¢ 1:165-169¢ J. Mar. Biotechnol.. supra; Kubler et al..1999 « 2003; Jiang et .ا 15:345-349. J. Appl. Phycol..Gan et al.) جلاكتوسيداز « High Technol. Lett. 2003; Qin et al.c 21:1211-1216«Plant Cell Rep. 20 «Cheney et al.) (GFP) أخضر cig sliprotein وبروتين ( 2003¢13:87-89 « Plant .ل Franklin et al. 2002 Plant Cell supra; Ender et al..2001 210).¢ 1482002; 56 سوف يدرك الماهر في المجال بسهولة أن العديد من متواليات المعزز المعروفة يمكن أن يتم نشرها بصورة مفيدة في أنظمة التحويل من الأنواع الطحلبية الدقيقة طبقاً للتحويل الحالي. على سبيل 5
(Jal فإن المعزز يمكن أن يتم استخدامه بصورة شائعة لكي يتم تشغيل التعبير الجيني في الطحالب الدقيقة والتي تشتل على العديد من النسخ من معزز فيروس تبرقش القرنبيط 535 (CaMV35S) والذي تم استخدامه في كل من ثنائيات السوطيات والطحالب الخضراء ( Chow et al, Plant Cell Rep., 18:778-780, 1999; Jarvis and Brown, Curr. Genet., 317-321, 1991; Lohuis and Miller, Plant J., 13:427-435, 1998). 5 ٠ وتم تسجيل معزز 57/40 من الفيروس القردي بحيث يكون فعالاً في العديد من الطحالب Gan et al., J.
Appl.
Phycol., 151 345-349, 2003; Qin et al., ( .(Hydrobiologia 398-399, 469-472, 1999 ويمكن أن تكون المعززات من RBCS2 ) ريبولوز باي فوسفات كريوكسيلاز cilaage فرعية دقيقة ( Fuhrmann et al., Plant J., 10 1999 ,19:353-361( وأنواع 0880 (بروتين CaiSprotein من معقد النظام الضوئي ١ ؛ (Fischer and Rochaix, FEBS Lett. 581:5555-5560, 2001 من كلاميدوموناس عبارة عن معززات مفيدة أيضاً. إن معززات الاندماج من HSPTOA/RBCS?2 و 15708 (تيويولين) و(2000 ,21:121-131 (Schroda et al., Plant J., « يمكن أن تكون أيضاً مفيدة لتحسين التعبير عن الجينات التشابكية؛ والتي يمكن أن يتم فيها استخدام معزز 1150708 في شكل منشط انتساخي عندما يتم وضعه بصورة قبلية بالنسبة للمعززات الأخرى. يمكن تحقيق التعبير عال المستوي من الجين محل لااهتمام؛ على سبيل (Jil في الأنواع الدياتومية؛ تحت تحكم المعزز من جين 100 الذي يشفر بروتين Lyjprotein فوكوكسانثين دياتومي -كلوروفيل ) Falciatore et al., Mar.
Biotechnol., 1:239-( a/b Zaslavskaia et al., J.
Phycol. 36:379-386, 2000 ;1999 ,251( أو جين Vep 20 الذي يشفر بروتين Las protein أوستيجماتوفيت فيولكانثين -الكلوروفيل أ / ب (انظر البراءة الأمريكية رقم 8318482 والتي تم تضمينها هنا كمرجع). وإذا كان ذلك مرغوياً؛ فإن المعززات القابلة للحث يمكن أ توفر تعبير سريع أو تعبير متحكم فيه بصورة جيدة من الجينات في الطحالب الدقيقة الانتقالية الجينية. على سبيل المثال؛ فإن مناطق المعزز من جينات NR تشفر ربداكتاز نيترات والذي يمكن استخدامه مثل المعززات القابلة للحث. يتم كبح نشاط المعزز بشكل نمطي 5 بواسطة NR الأمونيوم وبتم dia عندما يتم استبدال الأمونيوم بالنيترات ( Poulsen and (Kroger, FEBS Lett 272:3413-3423, 5 ؛ وبالتالي فإن التبعير الجيني يمكن أن
تم تحويله أو عندما تنمو الخاليا الطحلبية الدقيقة في وجود الأمونيوم/ النترات. يطلق على معزز الطحالب من نوع Nannochloropsis الكابح للأمونيوم ash "نيتريك /كبرتيدت ربداكتاز كابح للأمونيا" وقد تم الكشف die في الطلب الأمريكي رقم 2017/0073695 وقد تم تضمينه هنا كمرجع. تشتمل المعززات والطحالب الإضافية التي يمكن ان يتم ساتخداها في البنيات وأنظمة
التحويل التي تم توفيرها هنا على تلك التي تم الكشف عنها في طلب البراءة الأمريكي رقم 9 وطلب البراءة الأمريكي رقم ¢8¢883¢993 وطلب البراءة الأمريكي بالنشرة رقم:8:883:993 ؛ ونشرة طلب البراءة الأمريكي رقم:2013/0323780 ؛ ونشرة طلب البراءة الأمريكي رقم:2014/0363892 ؛ ونشرة طلب البراءة الأمريكي رقم :2017/0152520« ونشرة طلب البراءة الأمريكي رقم 2017/0114107؛ وقد تم تضمين كل منها هنا كمراجع بكاملها.
0 يمن أن تكون الخلايا العائلة أو الكائئات الدقيقة إما خلايا غير محول أو كائنات دققة يمكن أن تكن عبارة عن خلايا أو كائنات حية Ally يتم تحويلها dail مع جزيء حمض نووي خارجي Las واحد على الأقل. على سبيل المثال؛ فإن الخلية العائلة من الطحالب أو النباتات والتي يتم تعديلها بحيث تشتمل على تعبير موهن من جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1
(SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يمن أن تشتمل أيضاً على
5 واحدة أو أكثر من الجينات التشابكية Ally يمكن أن تمنح أو تساهم في أي ميزة مرغوية؛ على سبيل المثال وليس الحصرء الإنتاج المتزايد الخاص بالجزيئات الحيوية محل الاهتمام؛ Jie واحدة أو أكثر من البروتينات؛ أو الخضابات pigments أو الكحولات أو الشحوم. تم وصف التحول من الخلايا الطحلبية بواسطة التفجير الدقيق» على سبيل المثال» في نسرة البراءة الأمريكية رقم 8:883:993 ونشرة alla البراءة الأمريكي رقم 2017/0130238 وقد تم تضمين
0 كل منهما هنا كمرجع بكاملها. تم أيضاً وصف تفجير الخلايا باستخدام مسدس BioRad Helios® Gene في Gene Gun System Instruction Manual 1.16/05 1/1165241 المتاح في bio-rad.com/en-us/product/helios—gene—gun- .(system?tab=Documents في العديد من السمات؛ فإن تطفيرات التوهين الجيني يتم إنشاؤها في النباتات. تشتمل الطريقة؛
5 على سبيل المثال على إدخال نظام CRISPR كما تم وصفه هنا لكي يتم استهداف واحد أو
أكثر من الجينات النباتية 5611. يكون هناك تنوع واسع من النباتات وأنظمة الخلايا النباتية وذلك للخصائص الفسيولوجية والخصائص الزراعية الموصوفة هنا باستخدام بنيات الحمض النووي من الكشف الحالي والتي تشتمل على طرق التحويل المعروفة في المجال (انظرء «Guerineau F. Methods Mol Biol )1995( 32-49:1). في نماذج مفضلة؛ فإن النباتات المستهدفة والخلايا النباتية الخاصة بالمعالجة تشتمل؛ على سبيل JE لا الحصرء على تلك النباتات أحادية
الفلقة والنباتات ثننائية الفلقة Jie المحاصيل Loy في ذلك محاصيل الحبوب (مثل القمح والذرة والأرز والدخن والشعير)؛ محاصيل الفاكهة (مثل الطماطم» التفاح والكمثرى والفراولة والبرتقال) والمحاصيل العلفية (على سبيل المثال؛ البرسيم) والمحاصيل الجذرية النباتية Jia) البطاطس والجزر وينجر السكر والبطاطا الحلوة)» محاصيل الخضر الورقية (على سبيل المثال» pally
0 والسبانخ)؛ النباتات المزهرة le) سبيل (Jal) البطونية؛ وردة؛ أقحوان)؛ الصنويريات وأشجار sical (على سبيل المثال؛ والتنوب والصنوير» الراتينجية)؛ النباتات المستخدمة في علاج النبات Je) سبيل المثال؛ نباتات تراكم الفلزات الثقيلة )؛ المحاصيل الزيتية (على سبيل المثال؛ عباد الشمس» بذور اللفت) والنباتات المستخدمة لأغراض تجريبية ( مثل الأرابيدوبسيس). ويالتالي فإن تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 5 يمكن أن يتم إنشاؤها في مدى واسع من النباتات؛ مثل؛ على سبيل المثال» نباتات النباتات ذوات الفلقتين التي تنتمي ترتبة Laurales« Miciales<Magniolales « كماد اه م1 0013165 ]أن Ranunculalesc<Nymphaeales: 8028116138165 Hamamelidales: Trochodendrales.Sarraceniaceae 71718165فوو نا Batales: CaryophyllalescCasuarinales:Fagales: Myricales:Leitneriales «
«Urticales.
Malvales: Theales: Dilleniales: Plumbaginales:Polygonales 0 « Diapensales: Ericales: Capparales: Salicales: Violales:Lecythidales « Haloragales: Podostemales: Fabales: Rosales:Primulales<Ebenales «Celastrales: Rafflesiales: San tales: Proteales: CornalesMyrtales « Geraniales: Juglandales: Sapindalesc Rhamnales:Euphorbiales
« Lamiales: Polemoniales: Gentianales.
Umbellales.Polygalales 25
— 8 1 — »و Dipsacales: RubialescCampanulales.ScrophularialescPlantaginales .Asterales تلك التى تنتمى لترية Jie فى النباتات أحادية الفلقة SGI يمكن إنشاء التطفيرات «Commelinales (Triuridales «(Najadales (Hydrocharitales (Alismatales «Typhales (Cyperales (Juncales (Poales (Restionales (Eriocaulales 5
«Arales (Pandanales (Cyclanthales (Arecales (Zingiberales (Bromeliales على سبيل «Gymnospermae أو مع النباتات التي تنتمي ل Orchid ales نااناء و 5 « Araucariales« Cycadales:Ginkgoales تنتمى لرتبة المخروطيات»؛ all المثال؛ تلك . Gnetales و Cupressales
وعلى نحو بديل أو بالإضافة إلى أي من النماذج التي تم توضيحها هنا ألعاهاً تم تضمين النماذج التالية: النموذج 1: عبارة عن كائن حيم تخليقي ضوئي ناتج طفرة به جين موهن يشفر بولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT (GROWTH IMPROVEMENT 1 حيث أن الكائن الحى التخليقى الضوئى
photosynthetic organism 5 ينتج كتلة حيوية أكبر أو قدر أكرب من المنتج الحيوي بالمقارنة بكائن حي تخليقي ضوئي من عينة المقارنة نامي أو تمت زراعته في ظل ظروف مشابهة إلى حد كبير وبصورة اختيارية عندما يتم الوفاء بواحد أو أكثر مما يلي: 1 يكون بالكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة كلوروفيل chlorophyll منخفض بالنسبة للكائن الحى الدقيق التخليقى الضوئى من die المقارنة؛
20 1 يكون بالكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة كلوروفيل chlorophyll نسبة متزايدة من الكلوروفيل من أ: ب بالنسبة للكائن الحى التخليقى الضوئى من عينة المقارنة؛
-2ع8-
ج) يكون بالكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة هوائي من نظام ضوئي منخفض من reduced photosystem ١١ (PSI) ١١ بالحجم بالنسبة للكائن الحي التخليقي الضوئي؛ د) الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة طبقاً لعنصر
الحماية 1؛ حيث أن الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة يكون به Pmax 140 أعلى بالمقارنة مع الكائن all التخليقي الضوئي photosynthetic 0 من عينة المقارنة؛ ه) الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة طبقاً لعنصر الحماية 1 Cua أن الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة
0 يكون به FY/Fm أعلى بالمقارنة مع الكائن الحي من عينة المقارنة؛
و) يشتمل الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism على محتوي بروتين 07 على بالمقارنة بالكائن Al من عينة المقارنة؛ و
ز) يشتمل الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism على محتوي روبيسيكو أكتيفاز أعلى بالمقارنة بالكائن الحي من عينة المقارنة.
5 النموذج 2: كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً لعنصر الحماية 1؛ حيث أن الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج التطفرة ينتج على الأقل 610؛ على الأقل 5. على الأقل 9620؛ على الأقل 9625؛ على الأقل 9630؛ على الأقل 9635؛ على الأقل 0. على الأقل 9645؛ على الأقل 9650؛ على الأقل 9660؛ على الأقل 9670؛ على الأقل 0. على الأقل 9690 أو؛ على الأقل 96100 أكثر من الكتلة الحيوية أو؛ على الأقل 9610؛
0 على الأقل 9615؛ على الأقل 9620 على الأقل 9625؛ على الأقل %30« على الأقل %35 على الأقل 9640,؛ على الأقل 9645؛ على الأقل 9650؛ على الأقل 9660 على الأقل 9670 على الأقل 9680؛ على الأقل 9690 cor على الأقل 96100 أكثر من منتج حيوي واحد على الأقل بالمقارنة مع كائن حي تخليقي ضوئي من عينة المقارنة نامي أو مزروع في ظل ظروف مشابهة إلى حد كبير وبصورة اختيارية عندما يكون المنتج الحيوي عبارة عن واحد أو أكثر من
الشحومات أو واحد أو أكثر من الكريوهيدرات carbohydrates أو واحد أو أ:ثر من لابروتينات أو الببتيدات أو واحد أو أكثر من الأحماض النووية أو واحد أو أكثر من السكريات sugars أو واحد أو أكثر من الكحوليات أو واحد أو أكثر من الأحماض الأمينية أو واحد أو أكثر من النيوكليوتيدات أو واحد أو أكثر من مضادات الأكسدة antioxidant أو واحد أو أكثر من الخضابات pigments أو واحد أو JST من المواد الملونة أو واحد أو أكثر من الفيتامنات أو واحد أو أكثر من التربيونيدات أو واحد أو أكثر من البوليمرات polymers النموذج 3: عبارة عن كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً للنموذج 1 أو النموذج 2؛ حيث أن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يقوم بتشفير بولي ببتيد SGI polypeptide المشتمل على نطاق myb 0 .من الطرف -6 بالنسبة لنطاق مستقبل منظم استجابة؛ وبشكل اختياري حيث أن البولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 : 1( يشتمل على متوالية حمض أميني والتي تشفر نطاق مستقبل منظم الإشارة (RR) الذي به على الأفل 9650؛ على الأقل» 9655؛ على (JY) 9660؛ على الأقل» 9665 على (J 9670 5 على (JW 9675؛ على «JW 9680؛ على (JN 9685؛ على الأقل» 9690؛ أو على الأقل 5 من التطابق بالنسبة لأي من المتوالية بهوية رقم: 40. المتوالية بهوية رقم: 41. المتوالية بهوية رقم: 42؛ المتوالية بهوية رقم: 43؛ المتوالية بهوية رقم: 44؛ المتوالية بهوية رقم: 45؛ المتوالية بهوية رقم: 46( المتوالية بهوية رقم: 47 المتوالية بهوية رقم: 48 المتوالية بهوية رقم: 9. المتوالية بهوية رقم: 50؛ المتوالية بهوية رقم: 51( المتوالية بهوية رقم: 52( المتوالية بهوية 0 رقم: 53 المتوالية بهوية رقم: 54؛ المتوالية بهوية رقم: 55 المتوالية بهوية رقم: 56« OF المتوالية بهوية رقم: 57: و/أو ب) يشتمل على متوالية حمض أميني والتي تشفر نطاق myb الذي به على الأقل 9650؛ على الأقل» 9673؛ على (INI 9660؛ على الأقل» 9665؛ على (JN 9670 على الأقل» 9675 على (JV 9680؛ على (JV) 9685؛ على (JY 9690؛ أو على الأقل 9695 من التطابق 5 بالنسبة لأي من المتوالية بهوية رقم: 58( المتوالية بهوية رقم: 59( المتوالية بهوية رقم: 60؛
— 4 8 — المتوالية بهوية رقم : 61؛ المتوالية بهوية رقم : 62 المتوالية بهوية رقم : 63« المتوالية بهوية رقم: 4؛ المتوالية بهوية رقم: 65؛ المتوالية بهوية رقم: 66؛ المتوالية بهوية رقم: 67( المتوالية بهوية رقم: 68 المتوالية بهوية رقم: 69؛ المتوالية بهوية رقم: (TO المتوالية بهوية رقم: 71 المتوالية بهوية رقم: 72 المتوالية بهوية رقم: 73( المتوالية بهوية رقم: 74 أو» المتوالية بهوية رقم: 75. النموذج 4: Ble عن كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً (oY من النماذج من 3-1؛ حيث أن جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يتم تطفيره؛ (Sang اختياري؛ حيث: أ) يشتمل جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 على حذف يعمل على تخميد نشاط الجين؛ 0 =( جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يشتمل على التطفير الذي يقوم بتغيير حمض أميني واحد على الأقل من البولي ببتيد polypeptide تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (56511) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 الذي تم تشفيره بواسطة الجين؛ ج) جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 الذي يشتمل على إدراج لشظية الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) والتى تعمل على تخميد الجين؛ (a جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 والذي يشتمل على إدراج شظية الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) التي تم إدراجها في المنطقة غير 0 المترجمة من 575 3" من الجين والتي تقوم بتقليل التعبير عن الجين؛ و/أو ه ) جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 والذي يشتمل على حذف في المنطقة غير المترجمة من 575 3" من الجين والذي يقوم بتقليل التعبير عن الجين.
— 5 8 — النموذج5: عبارة عن كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً لأي من النماذج من 3-1؛ حيث أن الكاتن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة يشتمل على بنية RNA والبنية في عكس اتجاه النسخ أو بنية الريبوزوم التي تستهدف ناتج انتساخ الجين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 5 . النموذج 6: عبارة عن كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً لأي من النماذج من 5-1 حيث الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة يكون عبارة عن نبات
أو بصورة اختيارية نبات وحيد الفلقة أو نبات ثنائى الفلقة أو أحد الحزازيات. النموذج 7: عبارة عن كائن حي تخليقي ضوئي ناتج طفرة طبقاً لأي من النماذج من 5-1؛ حيث 0 الكائن al التخليقي الضوئي photosynthetic organism ناتج الطفرة يكون عبارة عن أحد الطحاب وبصورة اختيارية طحاب دقيقة أو بشكل اختياري كلورفيت أو كلوروفيت Chlorophyte النموذج7: عبارة عن كائن حي تخليقي ضوئي طبقاً للنموذج 7 حيث أن الكائن الدقيق التخليقي الضوئي ناتج الطفرة يكون عبارة عن طحالب كلوروفيت Chlorophyte من نوع Chlorophyceace 5 أو من نوع Chlorodendrophyceae أو Prasinophyceace أو من فئة .Trebouxiophyceae النموذج رقم 8 عبارة عن كتلة حيوية تشتمل على كائن حي تخليقي ضوئي طبقاً لأي من النماذج السابقة. النموذج 9: عبارة عن طريقة لإنتاج كتلة حيوية أو متج حيوي يشتمل على زراعي أي من الكائنات 0 الحية التخليقية لاضوتية ناتجة الطفرة من النماذج من 7-1 وعزل الكتلة الحيوية. الأمثلة الأوساط
يكون 01/119 عبارة عن وسط زاخر بالمواد الغذائية والذي يشتمل على: 35 gia في الملوين بالوزن من أملاح 07 ثابتة Eco Systems; Apopka) عتادناوها- ) و5 x محللو تخصيب ماء بحري من نوع 50( 2/] (eX Guillard’s المخزون من «Sigma-Aldrich Louis .100:54 « بكتالوج رقم 60154؛ مع تركيزات نهائية من المكونات في الأوساط: 4.413 نانو مولار من نيترات الصوديوم؛ و0.16 مل مولار من فوسفاات اصودويم أحادية القاعد؛ و0.103 ميكرو مولار من البيوتين؛ و0.240 ميكرو مولار من كلوريد الكوبالت tH206 ٠ 0 ميكرو مولار من كبربتات كويريك *1205؛ و0.0585 ميكرو مولار من EDTA: 0 ثنائية الصوديوم ؛ و4.54 ميكرو مولار من كلوريد المنجنيز 21120 :1/8 نا ؛ 0.124 ميكرو مولار من مولبيدات الصوديوم ¢H202 Sodium molybdate 1.48 ميحكرو مولار 0 ثيامين * ا10ا؛ و0.0185 ميكرو مولار من فيتامين B12 ؛ و0.382 ميكرو مولار من ling الزنك .(H207 ٠ Zinc sulfate يكون PM074 عبارة عن وسط يزخر مادة تغذية والتي تم تحضيرها من خلال إضافة 1.3 مل من جزءٍ تغذية الطحالب من (Aquatic Eco-Systems ( i PROLINE® F/2 Algae و1.3 مل من جزءٍ تغذية الطحالب (Aquatic Eco-Systems) PROLINE® F/2 عند 5 حجم نهائي من 1 لتر من أملاح محلول Instant Ocean ( 35 جم/اللتر) من أنظمة ApopkacAquatic Eco Systems اح ). تشتمل كل من البرولين أ والبرولين ب على 8.8 مل مولار من نترات الصوديوم NaNO3) Sodium nitrate )؛ و 0.361 مل مولار من 18/120040 و10 F/2 x من الفازات الضئيلة و 210/ “2 من الفيتامينات ( (Guillard (1975 ومزرعة العوالق النباتية لكي يتم تغذية اللافقاريات البحرية " Culture of eds: Smith W.L. and Chanley M.H.) ) "Marine Invertebrate Animals 0 USA. pp 26-60. New York.Plenum Press ). يكون Sle (PM14T عن وسط زاخر بمادة التغذية التي تكون معتمدة على PMO74 ولكن بها 0 من الأملاح. والتي تم تحضيرها من خلال إضافة 1.3 مل من جزءِ تغذية الطحالب من (Aquatic Eco-Systems ( | PROLINE® F/2 Algae و1.3 مل من gia تغذية 5 الطحالب PROLINE® F/2 ب (Aquatic Eco-Systems) عند حجم نهائي من 1 لتر من
أملاح محلول Instant Ocean ( 17.5جم/اللتر) من أنظمة «Aquatic Eco Systems FL<Apopka ). يكون (PMIS3 عبارة عن وسط زاخر بمادة التغذية التي تكون معتمدة على 01/074 ولكنها مشتملة على Lyall بدلاً من النيترات كما هو الحال مع مصدر النيتروجين. lly تم تحضيرها من خلال إضافة 1.3 مل من ga تغذية الطحائلب من PROLINE® F/2 Algae أ ( Aquatic (Eco-Systems و 1.3 مل من محلول ©” إلى حجم نهائي من 1 لتر من محلول من أملاح 0 ثابتة )17.5 جم/اللتر) FL ApopkacAquatic Eco Systems) )و بعد ذلك الإضافة ل 4 ملء إذا تم تعقيم المرشح 1.1 مولار باليوريا. يكون المحلول ج عبارة عن 38.75 جم/اللتر من فوسفات أحادي الصوديوم ( «<Monosodium phosphate 120 (NaH2PO4 0 و758 مجم/اللتر من الثيامين وا10ا.3.88 مجم//اللتر من الفيتامين B12 vitamin 3.84 مجم/اللتر من البيوتين. المثال رقم 1 التطفير باستخدام UV من سلالة باراتشيلورا لكي يتم عزل نواتج الطفرة من الكلوروفيت Chlorophyte أو أنواع الطحالب الخضاراء فإن خلايا سلالة باراتشيلورا من WT=1185 يتم تطفيرها باستخدام UV وبتم اختيارها بالاعتماد على تألق 5 الكلوروفيل chlorophyll المنخفض بعد التأقلم مع الضوء المنخفض. يتم استخدام سلالة براتشيلورا لكي يتم التطفير» WT=1185 من الوسط البحري. تم إنماء خلايا براتشيلورا 0/17-1185ا إلى طور خورازمي متوسط ويعد ذلك تم التخفيف إلى 1 x 10 6 خلية/ المل باستخدام وسط النمو 9. تم نقل معلقات الخلية بواسطة أنبوب صغير إلى طبق من نوع Petri 100 مم وتم وضعه بداخل وسيلة ريط تشابكية من Agilent ( STRATALINKER® 2400 UV Santa ClaracTechnologies 0 .لان ) مع إزالة غطاء الطبق. تم إجراء عملية المعالجة الإشعاعية ب UV باستخدم 10000 25000 و50000 ميكرو جول/سم2. وبعد المعالجة الإشعاعية؛ فإن معلق الخلية يتم نقله بأنبوب دقيق إلى قارورة رج تم تغليفها برقاقة لمنع التعرض للضوء لمدة 24 ساعة أثناء عملية الاستخلاص.
المثال رقم 2 فصل سلالة .PARACHLORELLA SP منخفضة الكلوروفيل chlorophyll نتائج طفرة سلالة 1-1185 /0/ا وبعد التطفير ولااستخلاص كما تم وصفه في المثال رقم 1 فإن الخلايا من المستعمرات التي لها لون شاحب يتم اختيارها ويتم السماح لا بأن تنمو بين مدة من يوم واحد إلى خمسة أيام في ضوءٍ منخفض ( من 100 ميكرو مول من الفوتونات م -2 ثانية -1) من الضوء بعد تلك المدة يتم تصنيفها بواسطة قياس التدفق الخلوي باستخدام مقياس التدفق الخلوي من نوع WT-1185 (BD CA) » 530 5 ؛ لكي يتم اختيال الخلايا التي لها تألق كلوروفيل chlorophyll منخفض. بوصفة dele فإن gia من الخلايا مع dad منخفضة تقريباً تصل إلى 5 إلى %2 من تألق الكلوروفيل تتم مقارنتها مع مجموعة إجمالية من الخلايا والتي تم اختيارها. 0 بالإضافة إلى cells فإن الفحص الاولي من السلالات التي بها اختزال للهوائي يتم عزلها من خلال قياس التدفق الخلوي والذي يتم إجراؤه خلال اختيار الطحالب الخضارءٍ الشاحبة أو المستعمرات الصفراء بصورة بصرية بعد تصنيف LIAN ولكي يتم فحص سالالت مختزلة من الهوائي المفترض من نواتج طفرة خضابات مختزلة ومن الصور الموجبة الزائدة فإنه يتم تعريض المستعمرات المختارة إلى عملية حص ززاعة ثانوية عالية الإنتاجية الخاصة بالوسط لكي يتم التأقلم 5 مع نواتج العزل بالنسبة لظروف بها ضوء منخفض قبل أن يتم القياس الفسيولوجي الضوئي. تمت مقارنة تألق الكلوروفيل chlorophyll أثناء تأقلم الضوء المنخفض الذي تمت مراقبته أثناء تأقلم الضوء المنخفض لاختيار المستعمرات والتي تم الحفاظ عليها في خصائص تألق الكلوروفيل chlorophyll المنخفض من حالة التأقلم مع الضوء العالي. أوضحت المستعمرات التي تم اختيارها أن هناك زيادة صغيرة فقط في الكلوروفيل chlorophyll (بالنسبة LAT من النوع غير المعالج) 0 عندما يتم نقلها من الضوء العالي إلى الضوء المنخفض. تم إجراء اختبارات الزراعة شبه المتصلة في ضوء عالي بدرجة ثابتة (حوالي 1700 ميكرو مول من الفوتونات م -2 ثنانية -1) باستخدام مزرعة 165 مل في 75 سم2 من قوارير مزرعة النسيج لكي يتم تحديد السلالات التي لها إنتاجية متزايدة (معدل متزايد من إنتاج الكتل الحيوية والذي تم قياسه عند تراكم إنتاجية كربون عضوي إجمالي ((TOC) TOTAL ORGANIC CARBON 5 بالنسبة ADL سليفة من النوع البري 1-1185 //ا. تم تلقيح اثنين من قواريري 75 سم2 باستخدام
مزرعة البذور من سلالة ناتج طفرة معين. وكانت للقوارير سدادات لها أنابيب متصلة بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب ثاني أكسيد الكريون (CO2) CARBON DIOXIDE (961 من (CO2 والذي تم بداخله عمل فقاقيع خلال المزرعة. تمت محاذاة القوارير مع العرض (البُعد الأضيق) في مقابل مخزون goin 50 ). كان عمق المزرعة (المسافة من الجدار الخاص بالقارورة الأيضيق إلى مصدر الجدار عند الجزء shall من القارورة ) تقريباً 8.0
سم. تم تخفيف المزارع بصورة يومية عند بداية فترة الضوء بواسطة Al) 9665 من حجم المزرعة واستبداله بأوساط 01/1119 جديدة تم تخفيفها لكي يت ضبط الزيادة في ملوحة نتيجة وجود التبخير الذي يحدث في المزارع )212 مل من داي H20 إلى 1 لتر من وسط 01/119). تم أخذا العينات لغرض تحليل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC
CARBON 0 من المزرعة التي تمت إزالتها لغرض التخفيف. تم تحليل اثنين من نواتج العزل وهما NE-7843 و NE-13380 اللذين تم تحديدهما في هذا الاختبار بأنهما يشتملان على إنتاجية زائدة بصورة إضافية. Jul رقم 3 اختبارات الإنتاجية شبه المستمرة من نواتج طفرات طحلبية من NE-784 و NE- 13380
5 ومن بين سلالات الباراتشيلولار والتي توجد ويها كلوروفيل chlorophyll مختزل تحت ظروف ضوءٍ منخفضة فإن هناك اثنين من نواتج العزل التي تم تحليلها فيما يتعلق بالإنتاجية المتزايدة: نواتج الطفرة من NE-7843 و .NE-13380 في اختبار الإنتاجية فإن المزارع ذاتية التغذية من نواتج الطفرة يتم نموها على مدى عدة أيام في طريقة شبه مستمرة من الضوءٍ الثابت (-61© (SCPA مع عينات مزرعة تمت إزالتها بصورة يومية لغرض تحديد الكتلة الحيوية. تم الحفاظ على
0 الضوءمٍ عند ثابت 2000-1900 ميكرو مول من الفوتونات م -2 ثانية -1 لمدة 24 ساعة كل يوم. في هذا الاختبار فإن وسط المزرعة 01/119 في قارورة 225 سم2 يتم تلقيحه باستخدام مزارع البذور من سلالة ناتج طفرة معينة. تبد البدء بثلاثة من المزارع لكل سلالة. تم ربط القوارير المشتملة على قضبان تقليب والتي لها سدادات لها أنابيب بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب ثاني أكسيد الكريون (CO2) CARBON DIOXIDE )%1 من 602)
5 والذي تم بداخله عمل فقاقيع خلال المزارع. تمت محاذاة القوارير مع العرض (البُعد الأضيق) في
مقابل مخزون ضوء لاا ). كان البُعد الخاص "بالعمق" من القوارير؛ الممتدة مرة ثانية من مصدر الضوء هو 13.7 سم. مع الأخذ في الحساب لموضع القوارير التي لها مسافة أبعد من الخلايا في القارورة من سطح مصدر الضوء والذي يكون عند 15.5 سم. تم تخفيف المزارع بصورة يومية بواسطة إزالة 9665 من حجم المزرعة واستبداله باستخام وسط مزرعة PM119
جديد تم تخفيفه لكي يتم ضبط الأجزاء المتزايدة في الملوحة نتيجة التبخير الذي يحدث في المزارع. تم أخذا العينات لغرض تحليل إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON من المزرعة التي تمت إزالتها لغرض التخفيف. تم إجراء اختبار الإنتاجية شبه المتصلة لمدة 12 ساعة مرة واحدة وقد وصلت المزارع إلى الحالة الثابتة. تم اختبار الإنتاجية الخاصة بهذا الاختبار بواسطة قياس الكربون لاعضوي الإجمالي (TOC)
total organic carbon 0 من العينات والتي تمت إزالتها بشكل يومي. تم تحديد إجمالي الكربون العضوي (TOC) بواسطة تخفيف 2 مل من مزرعة الخلية إلى حجم إجمالي من 20 مل باستخدام ماء ا0ا. تم إجراء الحقن ثلاثة مرات لكل مقياس في وسيلة Shimadzu 100-1/065[ Judas لكي يتم تحديد الكريون الإجمالي (TC) والكريون غير العضوي الإجمالي (TIC) تم ضبط فرن الاحتراق عند 720 درجة مئوية وتم تحديد إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL
ORGANIC CARBON 5 بواسطة طرح TIC من ©1. كان مدى أريعن نقاجط المعايرة من 2 جزء في المليون إلى 200 جزءٍ في المليون بصورة مناظرة إلى 2000-20 جزء في المليون من المزارع غير المخففة باستخدام معامل الارتباط من 22 > 0.999. تم توضيح النتائج التوضيحية من اختبارات الإنتاجية بقمياس صغير في الشكل رقم 11 Lad يتعلق بتطفير 8-7843 الشكل رقم 1ب فيما يتعلق بتطفير Cus (NE-13380 تم توضيح الإنتاجية
0 اليومية المتوسطة من الثنائية الخاصة بالمزرعة على مدى 12 يوم من الزراعة. يوضح الشكل رقم 511 1ب أن التطفيرات NE-7843 و (NE-13380 على الترتيب يكون لها إنتاجية أعلى في اختبار CLSCPA المذكور؛ وتوضح كل منها متوسط من 970634 من الزيادة على مدى النوع غير المعالج في إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON بالمقارنة مع دورة الاختبار التي تصل إلى 12 يوماً.
5 المثال رقم 4 النسخ الجيني لنواتج طفرة طحائلب ARACHLORELLA LIHLA
— 1 9 — تم توالي الجينومات من NE-13380 و 81-7843 لكي يتم تحديد التطفيرات Jie الصور متعددة الأشكال المتعددة (SNPS) أو تطفيرات الإدراج /الحذف (أجزاء الحذف) Ally يمكن أن تقوم أي منها بتشكل الأساس الجيني الخاص بالأنواع المصلية لاتي تمت ملاحظتها في اثنين من تلك السلالات. تم تحديد SNPs في الجينوم من NE-13380 والذي يتسبب في وجود طفرات في انابيب تشفير من أربعة جينات مختلفة (الأربعة صفوف الأولى من الجدول رقم 1). الجدول 1 SNPs في جينوم NE-13380 الجين (الجينات) | الوصف نوع SNP تعديل المتوالية المتطفرة المشفرة 1-99 النطاق الرابط ل الحمض ١ الصورة المتغيرة Trp13Arg النووي الريبوزي منقوص | لعكس اتجاه النسخ لأكسجين DEOXYRIBONUCL EIC ACID (DNA) الحلزوني المجنح نطاق 1 من السلسلة ج 1-9 بروتين protein التنبؤ | إيقاف تم الوصول | Arg575Stop به محافظ إليه. 1-1-1 ا تقل بروتين الصورة المتغيرة Ser1019Leu 1004 07 الكالسيوم المرتبط | لعكس اتجاه النسخ مع الصورة السوطية من ATPase
1-1 بروتين 000160مشابه ل | الصورة المتغيرة من ١ احتجاز الإنترون CheY مستقبل الريط & المحتمل الصورة المتغيرة من الإنترون 1-86 السلسلة الخفيفة المحافظة | المنطقة بين لا يوجد. 7-0899 ,. 4 من الدايين الذي تم الجينات التنبؤ به بالنسبة للجزء 1-0900. المحوري 1-7 الصورة المتماثلة من الصورة المتغيرة من | لا يوجد. البروتين 101018617 من الإنترون 1 التي تعتمد على Hla ATP من RNA T-9629. عامل المعالجة بالريبوسيل | الصورة المتغيرة من | لا يوجد. من ADP= من Gig | الجين القبلي 07( تنشيط GTPase | والصورة المتغيرة للصورة المتماثلة 1 من الإنترون والبروتين 01016117المحافظ الذي تم التنبؤ به. وأثناء إجراء هذا التحليل الخاص بتطفيرات (NE-13380 فقد كشف تحليل NE-7843 agua أن تلك السلالة تشتمل Load على SNPs متمايز (الجدول رقم 2) بما في ذلك 5110 في جين T-2261 (متوالية الجين التي تم توفيرها في شكل متوالية بهوية رقم 1؛ متوالية تشفير تم توفيرها في شكل المتوالية بهوية رقم 2 lly تشفر متوالية البروتين 02049(7من المتوالية Loses رقم 3)؛ والجين الذي تم تطفيره أيضاً في NE=13380 (الصف 4 من الجدول رقم 1)- مما يوفر دليلاً
— 3 9 — قوياً بحيث التطفيرات في جين 1-2261 تعمل على التسبب في الإنتاجية العالية جداً المرغوية للنموع الجيني من السلالات. الجدول 2 SNPs في جينوم NE-7843 الجين الوصف نوع SNP تعديل المتوالية المشفرة (الجينات) المتطفرة T-. بروتين dileprotein رابطة ل إيقاف تم الوصول | Lys329. Ran 0936 من إصبع الزنك -20 إليه. CYP 7110 T= 0450 من الصورة المتغيرة Leu508Cys. 4448 السيتوكروم لعكس اتجاه النسخ T= كيناز هيستيدين لمستشعر منظم | الصورة المتغيرة Leu250Pro. 2261 استجابة من النوع =[ CheY لعكس اتجاه النسخ T- أوكسيدوريداكتاز فلافوديكسين- | الصورة المتغيرة Lys577Glu. 3935 بوروفات لعكس اتجاه النسخ T= سلسلة ضوءٍ دايين من LC8 الصورة المتغيرة Tyr77His. 8682 النوع 2 لعكس اتجاه النسخ T= بروتينات نيوكليوتيدية مشابهة J | الصورة المتغيرة Asp32Asn. Sm| 5 لعكس اتجاه النسخ Yl T= من الفئة | الصورة المتغيرة Gly26Cys. 5398 لعكس اتجاه النسخ يوضح الشكل رقم 2 التغذية التمايلية في جين 1-2661 Parachlorella والتي بها نطاق مشابه ل CheY من مننظم الاستجابة.
المثال رقم 5 إنشاء تطفيرات مستهدفة في جين 1-2661 PARACHLORELLA ' بروتين 0مشابه ل CHEY من المنظم الخاص بالاستجابة" ولكي يتم التوضيح بصورة محددة للتطفير من جين 1-2261 الذي ينتج عنه إنتاجية عالية من النمط الظاهري؛ فقد تم إنشاء ثلاثة سلالات في جين 1-2261 قد تم تعطيلها بواسطة التطفير الجيني الخاص بالإدراج الذي يتوسطه 0859 مع استهداف حمض نووي رببوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) من طرف 3: من الأكسون الثاني من جين 1-2261 (الشكل رقم 2). كان الدليل RNA التوجيهي المنفرد (sg RNA) (المتوالية بهوية رقم 5) قد تم تضمينها في المتوالية المستهدفة من المتوالية بهوية رقم 4 (أي متوالية CRISPR أو متوالية مناظرة للمتوالية المستهدفة من جين 1-2261) وتم إنتاجها بواسطة تلدين اثنين من الأوليجيومرات 0 الحمض النووي Ghoul منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) المتممة والتي تم تضمينها في متوالية من معزز TT بكلي يتم إنشاء ناتج انتساخ جديلة مزدوج خاص بالانتساخ في المعمل. تم إجراء تفاعلات الانتساخ في المعمل باستخدام طقم CALife Technologies cat # AM1354M; Carlsbad) MEGAshortscript™ T7 ( طبقاً لبروتوكول المصنع. تمت تنقية المتبقي باستخدام حمض نووي رببوني RIBONUCLEIC ACID (RNA) 5 باستخدام أعمدة CA; «Zymo-Spin™ V-E (Zymo Research; Irvine (cat #C1024-25 وذلك طبقاً لبروتوكولات المصنع. تم تحويل RNA الدليل إلى خلايا من سلالة خلية محررة ومعبرة عن .Parachlorella Cas9 تم إنتاج سلالة المحرر المعبرة عن 0859 بواسطة تحويل النوع غير المعالج من سلالة 628 من نوع 1-1185//ا مع البنية التي تم تضمينها: 1) كاسيتات تعبير 0859 0 والتي يتم تضمينها في كودودة جين 0859 المعغدل والذي تم تحسينه من Parachlorella والإنترونات المشتملة على براكوليلا والتي تم تضمينها أيضاً والمشتملة على علامة FLAG عند الطرف N= وإشارة تحديد موضع نووي ورابط ببتيد (المتوالية dager رقم 76) والتي ترتبط بصورة فالة مع معزز من 40517 Parachlorella (المتوالية بهوية رقم 77) ووسيلة إنهاء Parachlorella 7 (المتولاية بهوية رقم 78)؛ و2 ) مرقم قابل للانتقاء من كاسيت 5 الاتعبير والذي يتم تضمينه في الجين المقاوم للبلاستيسيدين من كودون Aspergillus terreus
الذي تم تحسينه lad يتعلق ب Parachlorella وإنترونات Parachlorella المشتملة عليها (المتوالية بهوية رقم 79)؛ والمرتبطة بصورة فعالة مع معزز 4054 Parachlorella (المتوالية بهوية رقم 80( ووسيلة إنهاء Parachlorella RPS4 (المتوالية بهوية رقم 81)؛ و3) كاسيت تعبير مسجل (GFP والذي تم تضمينه في جين Moscow:Evrogen) TurboGFP «
405518 !)(المتوالية بهوية رقم 82)؛ والذي تم إيداعه بواسطة معزز Parachlorella ACP1 (متوالية بهوية رقم 83) وتم إنهاؤه بواسطة وسيلة الإنهاء 8001 (المتوالية بهوية رقم 84). (انظرء على سبيل المثال» نشرة طلب البراءة الأمريكية رقم 2016/030489 وأيضا نشرة طلب البراءة الأمريكية رقم 2017/0073695 ونشرة (alla البراءة الأمريكية رقم 2017/0152520 وقد تم تضمينها كلها هنا كمراجع بكاملها).
0 تم تحويل حمض نووي ريبوزي RIBONUCLEIC ACID (RNA) الدليلي في سلالة المحرر من 65-15699 مع شظية mile من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) والتي تم تضمينها في جين مقاومة البلوميسين 'BleR الذي تم تحسينه بواسطة الكودون من Parachlorella والمشتمل على إنترونات 58 (المتوالية بهوية رقم 6) والمرتبط بصورة فعالة مع معزز Parachlorella
RPS4 5 (المتوالية بهوية رقم 7) ووسيلة إنهاء Parachlorella RPS4 ( المتوالية بهوية رقم 8). تم إجراء التحويل بواسطة الاستشراد الكهربي بصورة أساسية كما تم وصفه في الطلب الدولي رقم 9 . ويبعد الاستشراد الكهربي؛ تم وضع الخلايا في أطباق على وسط آجار يشتمل على 250 ميكرو جرام/مل من الزيوسين لكي يتم اختيارها فيما يتعلق نواتج الطفرة والتي تم تضمينها في كاسيت BleR تم فحص نواتج الطفرة بواسطة PCR الخاصة بالمستعمرة من
0 البادئات التي تم تحديدها بحيث تقوم بالتضخيم عبر الموضع المستهدف الأصلي وتم اختيار ثلاثة سلالات والتي تم بها إدراج كاسيت BleR في موضع جين 1-2661: GE-4 (GE-16391 GE-16393 16392 . تم اختبار تطفيرات dallas من Cas9 من GE-16393 y GE-16392 3 GE-16391 وناتج الطفرة المشتق بصورة كلاسيكية NE-7843 تحت ظروف ضوءٍ بصورة مستمرة في ظروف
25 اختبار إنتاجية خاص بالتخفيف شبه المتصل semi-continuous dilution (SCPA)
productivity assay كما تم وصفه في المثال رقم 3 (اختبار 012000 : وتم الحفاظ على gull عند 200-1900 ميكرو مول فوتون من 5606-1 01-2 sad 24 ساعة في اليوم تحت الزراعة وتم التخفيف مرة ثانية بمقدار 9665 يومياً). تم اكتشاف أن نواتج الطفرة المعدلة من 9 تقوم بعرض زيادة في الإنتاجية ل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL
ORGANIC CARBON 5 بالمقارنة مع السلالات من النوع البري عند مقدار متطابق إلى حد كبير بالنسبة لما تمت ملاحظته في السلالات الفعلية من التطفير التقليدي (الشكل رقم 3)؛ مع GE-16392 الذي يوضح حوالي 9626 من الزيادة في إنتاجية الكتلة الحيوية 5 GE-16391 ونواتج طفرة 65-16393 توضح الزيادة في الإنتاجية في الكتلة الحيوية من 9633 و9634. ومن ذلك فقد مت استنتاج أن التعديل الجيني أو الاختزال الكبير لتعبير 1-2661 أو الوظيفة في
Parachlorella WT1185 0 يمكن أن يؤدي إلى زيادة من 1635-25 في إنتاجية الكتلة الحيوية تحت ظروف ضوء عالي متصلة. ويسبب تأثيره على الإنتاجية فإن جين 1-2661 قد تمت تسميته بأنه تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 أو وسيلة تحسين النمو الكبيرة 1. المثال رقم 6 الصور متحدة الأصل من جين 1ا56 PARACHLORELLA (1-2661)
5 والصور متحدة الأصل في الكائن الدقيقة التخليقية الضوئية الأخرى تم اكتشاف أن جين 1ا56 Parachlorella (المتوالية بهوية رقم 1؛ المشفرة التي تم توفيرها في شكل المتوالية بهوية رقم 2) يقوم بتشفير البولي ببتيد polypeptide (المتوالية بهوية رقم 3) والذي يشتمل على اثنني من النطاقات الوظيفية الأصلية والتي تحدث كل منها في النتصف الطرفي من لاا من بروتين 0101610الحمض الأميني 619. إن وجود مستقبل منظم الاستجابة أو نطاق
(Pfam PFO0072))'RR" 0 يمتد من الحمض الأميني 36 تقريباً إلى الحمض الاميني 148 من بولي ببتيد Parachlorella 5611 polypeptide (المتوالية بهوية رقم 3)؛ والذي يكون مسؤئلاً عن الشرح التوضيحي الحيوي ل تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611)
Jie SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 البولي بببتيد المشابه ل CheY (انظرء الجدول رقم 1 و2). يتسم نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER Lad 5 بأنه Glad مستقبل إشارة'» 0000156؛ في قاعدة بيانات النطاق المحافظ ((0010؛ التي
تمتد من الحمض الأميني من 37 وحتى الحمض الأميني 145. ويتصف هذا أيضاً أنه 'نطاق مستقبل مشابه ل (REC) Che و0060784 في مجموعات من المجموعات متحدة الأصل من قاعدة يانات لابروتينات وكما هو الحال مع نطاق Interpro "العاتلة العليا المشابهة ل 0©7؛ 5 IPRO11006 مع كل من تلك النطاقات التي تمتد تقريباً من النطاقات المميزة من
حوالي 33 حمض أميني إلى حوالي 161 حمض أميني من بولي ببتيد polypeptide 561 من المتوالية بهوية رقم 3: تم اكتشاف أن نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER (الذي يطلق عليه بهض الأحيان هنا "المستقبل" أو في الغالب نطاق (REC في الأنظمة المنظمة لاثنين من المكونات البكتيرية (مثل نظام من اثنين من المكونات الخاصة بالانجذاب الكبتيري والذي يشتمل على بولي ببتيد polypeptide معروف بأنه (CheY والذي يتم
0 فيه استقبال الإشارة من مشارك المستشعر. تم اكتشاف أن نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER في تلك لاأنظمة بأءه طرف N= بالنسبة لنطاق ربط الحمض النووي الرربوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) وشتمل بصورة نمطية على موضع مستقبل فوسفو والذ يمكن أن تتم معالجته بالفسفوريل؛ حيث أن موضع المعالجة بالفسفوريل يمكن أن يكون مسئلاً عن التنشيط الخاص به أو إيقاف النشاط.
5 يكون لجين 1ا56 Parachlorella أيضاً (جين 1-2661 ) نطاق myb الذي تم تثبيته في طرف ©- بالنسبة لنطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER يتم تحديد نطاق myb في شكل :pfam PF00249 إن 'نطاق ربط DNA المشابه ل "0ل/ا؛ الذي يمتد من موضع حمض أميني تقريباً 204 إلى تقريباً موضع الحمض الأميني 254 من المتوالية بهوية رقم 3 وبتم تحديده في شكل نطاق محافظ من 1161401557 من "نطاق رابط ل DNA مشابه ل
amyb 0 وفئة SHAQKYF ' والتي تمتد من موضع حمض أميني Lj 202 حتلى موضع الحمض الأميني 5 من المتوالية بهوية رقم 3 (بولي ببتيد .(Parachlorella polypeptide وعندما تقوم المتوالية بهوية رقم 3 بالاستعلام من خلال تحليل متوالية بروتين proteininterpro وقاعدة بيانات التصنيف فيتم تحديد العائلة العليا من النطاق الشابه ل Homeobox ( (|PRO090ST) تمتد من موضع الحمض الأميني 201 إلى موضع الحمض الاميني 259 من
المتوالية بهوية رقم 3 ونطاق (IPRO17930) nterpro Myb التي تمتد من موضع الحمض الأميني 199 وحتى موضع الحمض الأميني 258 من المتوالية بهوية رقم 3. بالإضافة إلى ذلك؛ فإن إشارة تحديد الموضع يمكن أن يتم تحديدها في بولي ببتيد polypeptide Parachlorella 1 الذي تم تثبيته بين نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE
RECEIVER 5 ونطاق Myb بداخل منطقة من الحمض الأميني المحافظ المنخفض والتي يطلق عليها هنا بأناه رابط بين النطاقات المحافظة. لا يمكن اكتشاف أي نطاقات بروتين ddslasprotein في المنطقة الخاصة ببولي ببتيد Parachlorella SGI1 polypeptide من الطرف C وحتى النطاق 0/ا07. وعلى النقيض من ذلك؛ فإن تصميم تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
GROWTH IMPROVEMENT 1 10 من نطاقات RR و0لا07» حيث يكون نطاق Myb عبارة عن الطرف C= الذي تم تصميمه لنطاق RR فإنه يوجد في العديد من البورتينات لامشفرة في جينومات النباتات الخضراء. تم استخدم تحليل المعلومات الحيوية لكي يتم تحديد الصور المتماثلة الأصل من 5611 Parachlorella في النبات الإضافي وفي أنواع الطحالب بالاعتماد على التصميم المحافظ.
5 ولكي يتم تحديد فئة من بروتينات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611)
SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في الكائنات الحية الخاصة بالتخليق الضوئي الجديدة فقد تم إنشاء نموذج (HMM) Hidden Markov لتوضيح تصميم نطاق myb من مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ' الموجود في بولي ببتيد .Parachlorella 5611 polypeptide تم تضمين متوالية الحمض الأميني المستهدفة في
0 تطوير HMM في وحدة التمديد المتجاورة الخاصة بمتوالية الحمض الأميني التي تم تضمينها في كل من نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER ونطاق myb وأيضاً ماطق الرايط بين اثنين من النطاقات. وكخطوة (sgl فإن متوالية بولي ببتيد Parachlorella 5611 polypeptide (المتوالية بهوية رقم 3) يتم استخدامها لكي يتم البحث عن BLAST في قاعدة بيانات Gl Phytozome v.12
التي تشتمل على جينومات النباتات والطحالب. تم أيضاً إضافة ثلاثة جينومات طحلبية (من أنواع gTetraselmis 8 000/505 ) إلى قاعدة البيانات التي يتم البحث فيها. تم توقف البحث عند الوصول لحوالي 2000 نتيجة. تم تحليل النتائج المذكورة بعد ذلك» بواسطة InterProScan (المتاح من EMBL-EBI [European Molecular Biolgy at « for examplecLaboratories—European Bioinformatics Institute 5 cebi.ac.uk]) وذلك لضمان أن النتائج التي تم الحصول عليها خاصة بنطاق العائلة العلييا المشابهة ل (IPRO11006) Interpro CheY ونطاق Myb أو نطاق مشابه Interpro J Homeobox أو نطاق IPRO17930 51 IPRO09057) Myb ). تم القضاء على كل من الأعضاء التي لا تشتمل على كل من النطاقات. قامت تلك الخطوة بتقليل عدد النتائج المختارة بين 0 900 و1000 مع البولي ببتيد wipolypeptide التي لها اثنين من خصائص النطاق (نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من الطرف N بالنسبة لنطاق myb ) والذي تم تحديده بصورة واضحة في البولي ببتيد ©10م7/06ا00ات من كل من الطحالب والنباتات الأعلى. تم استخدام المتواليات الناتجة لكي يتم تجميع شجرة تطور السلالات بالاعتماد على التشابه في المتوالية. أوضح الشجرة الخاصة بتطور السلالات وجود تجميعة واضحة من البولي ببتيد 106م7/06ا00ات غير المتجانسة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 من أنواع طحلبية. في أنواع معينة من الطحالب؛ فإن عدد من جينات مشابهة ل SGI يكون منخفضاً جداً. وبصورة نمطية؛ فإن الجين المنفرد تم تحديده في أنواع طحلبية معينة؛ على الرغم من ذلك فإن ثلاثة من Tetraselmis كان به جين متشابهة عالية قد تم تحديدهم والذي كان في كل أليلات الاحتمالية 0 الخاصة بنفس الجين والسلاسل التي تم اختبارها بالنسبة للصور ثلاثية الصبغة. أوضح العدد المنخفض من جينات 5611 في أنواع طحلبية معينة أن هناك جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT تم تحديده أو جينات في الأنواع الطحلبية Ally تكون في الواقع عبارة عن جين SGI وظيفي من الأنواع المذكورة وذلك في شكل دالة للبولي ببتيد polypeptide 5611 المنفرد الموجود في سلالة Parachlorella 5 والتي تكون عبارة عن صورة منفردة الصبغيات ويكون بهال ثلاثة من البولي
ببتيد 106م7/086ا0مات من 1ا565 Alle التشابه والتي تم تحديدها في Tetraselmis والتي يعتقد أنها ثلاثية الصبغة وتم تصحيحها من الناحية الوظيفية (انظر الأمثلة من 5 و7 و18-16). تم تتابع جينومات Parachlorella و Tetraselmis بصورة داخلية). ولكي يتم إنشاء معيار خاص بالصور متحدة الأصل من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 في الكائنات الحية التخليقية
لاضوءية الأخرى في الكائن الحية من التخليق الضوئي فإن نموذج Hidden Markov Model (HMM) قد تم تطويره بالاعتماد على مجموعة طحلبية من متواليات بولي ببتيد polypeptide 1. تم تطوير HMM بالاعتماد على ga الطرف - ل١- من بولي ببتيد polypeptide 1 الذي يشتمل على كل من نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER
0 وتلا بما في ذلك نطاقات الرابط بين اثنين من النطاقات المحافظة. تكون متاوولية البولي ببتيد wipolypeptide من الطرف -6 وحتى النطاق 0لا لتي لا تشتمل على أي بنية محافظة قابلة للتعرف عليها قد تم استثناؤها من بناء النموذج. تم استخدام 3.152 111/10/14 لكي يتم إنشاء HMM باستخدام محاذيات متوالية متعددة Multiple Sequence Alignments (MSAs) من متواليات ملكية خاصة ب Parachlorella و Oocystis وبولي ببتيد ciipolypeptide
Tetraselmis 5 وأيضاً متواليات من قاعدة بيانات dale من البولي ببتيد polypeptide من Chlamydomonas reinhardtii و Volvox carteri و Chromochloris zofingiensis و Micromonas sp.
RCC299 4 Coccomyxa subellipsoidea و Ostreococcus .luminarinus تم إنشاء العديد من محاذيات المتوالية (MSAS) من الأجزاء الطرفية ل لا1- من البروتينات كما تم وصفه ذلك أعلاه باستخدام طقم أدوات 1123 وباستخدام تقنية تدفق
0 0900941©. يقوم هذا النظام باستخدام برامج داخلية من نوع Muscle و MAFFT ى Clustal 8 و M—coffee لغرض المحاذاة وبرنامج timAl الخاص بإنهاء المحاذاة وا PhyML الخاص بالتداخل في الجين النباتي. تكون كل تلك البرامج متاحة بشكل عام. يكون HMM على عكس JS برامج متوالية البروتين 0701©7المنفرردة المستخدمن لمقارنة التشابه؛ على سبيل المثال؛ فإنه يقوم بجمع المعلومات من العديد من متواليات البروتين 00016(0وبالتالي يكون قادراً على
5 التمييز بصورة محافظة وعالية من العديد من الوحدات المتباينة للغاية بداخل متوالية البولي ببتيد
56 ويأخذ ذلك في حسبانه عندما يتم تحديد العلاقة الخاصة بالمتواليات. عندما يتم استخدام 141/00 لكي يتم توضيد درجة المتوالية؛ فإن الوحدات المحافظة بصورة عالية تستقبل المزيد من الوزين والذي يكون من وحدات بنائية متبانية ويالتالي يتم توفير حساسية AB ودقة بالمقارنة مع 55/5 الأبسط.
5 .تم استخدام HMM 5611 لكي يتم تحديد درجة البولي polypeptide ain الذي تم تحديده في بحث BLAST والذي يتم التثبت aie أيضاً على أساس أنه يشتمل على اثنين من النطاقات المحافظة من (مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER و 0لا0). إن الدرجات الأعلى (باستخدام استثناء التصيف العالي جدا من مشابه Arabidopsis halleri المتوالية بهوية رقم 23) قد وجد في أنواع طحلبية باستخدام درجات HMM الخاصة بالصور متحدة الأصل
0 الافتراضية التي تتراوح من حوالي 475 إلى أقل من 200 في قاعدة بيانات الكائن التخليقي الضوئي. كانت درجات الطحالب المتجانسة من HMM في تلك العينة متراوحة بصفة عامة من حوالي 400 إلى حوالي 450. وكما هو موضح في الجدول رقم 3 فإن الصور المشابهة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 في أنواع Oocystis و Parachlorella jTetraselmis وكل صور
5 التشابه الطحلبية كان لدها درجات من حوالي 400 أو أكثر. إن الدرجات المنخفضة بصورة غير طبيعية من بولي ببتيد polypeptide من نوع 2010916055 hromochloris سوف تكون بصورة محتملة نتيجة للشرح الجينيوم المحدد ؛ والمحاذاة الخاصة بنطاقات مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من بولي ببتيد wipolypeptide 5611 (الشكلر قم 4) والتي توضح نطاق متوالية من RR 2070960515 .© (المتوالية بهوية رقم 44) والذي يظهر بأنه غير
0 موجود في وحدة التمديد المتصلة من الأحماض الأمينية عند المنطقة الطرفة N= من النطاق المذكور. تكون التشابهات الموجودة في المتوالية من نطاقات مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER من الصور المتجانسة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 1 (5611) الطحلبي قد تم توضيحها في الشكل رقم 4 مع نطاق Parachlorella 5611 RR (المتوالية بهوية رقم 4) والتي تكون
5 متراوحة من حوالي 9655 إلى حوالي 80 96 من التشابه مع هوية متوالية الحمض الأميني. يوفر
الشكل رقم 5 محاذاة خاصة بمتواليات نطاق myb من البولي ببتيد ©10م7086ا0مات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT مع التشابهات الخاصة بالمتوالية مع نطاق Parachlorella myb (المتوالية بهوية رقم : 58) والذي يتراوح من حوالي 1685 إلى حوالي 1697 من التطابق في متوالية الحمض الأميني من بين تك المجموعة من التشابهات الخاصة بالمتوالية. الجدول 3 الصور المتماثلة الأصل من 1ا56 في أنواع الطحالب الكائن الحى متوالية نطاق نطاق درجة HMM | قيمة E البولى Myb RR polypep tide Parachlorella sp. متوالية متوالية متوالية 400.20 8.5e- 1185 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 118 :3 : 40 :58 Coccomyxa متوالية متوالية متوالية 403.0 1.2e- subellipsoidea بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 118 :9 : 41 :59 Ostreococcus متوالية متوالية متوالية 425.8 1.4e- lucimarinus بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 125 : 10 : 42 : 60 Chlamydomonas متوالية متوالية متوالية 413.3 8.4e- reinhardtii بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 122 : 11 : 43 : 61
Chromochloris متوالية متوالية متوالية 292.6 -6.16 zofingiensis بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 85 :12 : 44 :62 Volvox carteri متوالية ١ متوالية متوالية 441.4 2.3e- بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 130 :13 : 45 :63 Tetraselmis sp. متوالية متوالية متوالية 403.6 -7.96 105 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 119 : 14 : 46 : 64 (1-5172) Tetraselmis sp. متوالية متوالية متوالية 403.0 -1.26 105 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 118 :15 : 46 : 64 (T-5185) Tetraselmis sp. متوالية متوالية متوالية 402.9 1.3e- 105 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 118 : 16 : 46 : 64 (T-5230) Oocystis sp. متوالية ١ متوالية متوالية 426.9 668-56 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم : 17 : 47 : 65 Micromonas sp. متوالية متوالية متوالية 418.4 2.4e- RC299 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 123 :18 : 48 : 66
Micromonas pusilla | متوالية متوالية متوالية 405.9 -1.66 بهوية رقم | بهوية رقم | بهوية رقم 119 :19 : 49 : 67 يكون للأنواع النباتية تشابها والتي بها درجات HMM تتراوح من حوالي 475.9 ) Arabidopsis (halleri إلى أقل من 200. تشتمل أمثلة الصور المتماثلة من النباتات على درجات HMM من 0 أو أكثر والتي تم توفيرها في الجدول رقم 4. تم توضيح تاثيرات النمو على النباتات التي بها تطفيرات فى الجين المشفر لواحدة من الصور المتماظة Arabidopsis gaditana nag 'ARR2" 5 الذي به درجة HMM من 371؛ في المثال رقم 19. الجدول 4 الصور المتماثلة ل تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5511) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في الأنواع النباتية الكائن الحى متوالية نطاق | نطاق درجة قيمة E البولى HMM Myb| RR polypep tide Sphagnum fallax متوالية متوالية | متوالية | 397.3 6.8e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 117 : 20 رقم : ١ : 68
١ Physcomitrella patens متوالية متوالية | متوالية 372.3 2.8e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 109 :21 رقم : : 69 51
١. 209851000515 38 متوالية متوالية | متوالية 371.1 -6.46 بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 109 :22 رقم : | TO: 52 Arabidopsis halleri متوالية متوالية | متوالية | 475.9 6.9e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 141 :23 رقم : :71 53 Arabidopsis lyrata متوالية متوالية 395.5 2.4e- بهوية رقم بهوية رقم 116 : 24 : 71 Helianthus annus متوالية 391.2 4.9e- بهوية رقم 115 :25 Vitis vinifera متوالية متوالية | متوالية | 390.6 7.3e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 115 : 26 رقم : |: 72 54 Amborella trichopoda | متوالية 390.1 le- بهوية رقم 114 : 27
1.16- 390.1 متوالية Ricinus communis 114 بهوية رقم 28:
3.46- 388.4 متوالية | Solanum lycopersicum 114 بهوية رقم 29:
7.96- 387.2 متوالية Solanum tuberosum 114 بهوية رقم :
2.1e- 385.8 متوالية Gossypium hirsutum 113 بهوية رقم 31:
1.6e- 383.0 متوالية Theobroma cacao 112 بهوية رقم 32:
4.2e- 381.6 متوالية Phaseolus vulgaris 112 بهوية رقم 33:
4.6e- 381.4 | ةيلاوتم | متوالية متوالية Glycine max 112 بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 73 :| : رقم 34 :
١ Chenopodium quinoa متوالية 373.7 -1.16 بهوية رقم 109 :35 Malus domestica متوالية 372.6 2.4e- بهوية رقم 109 :36 Zea mays متوالية متوالية | متوالية | 371.5 4.9e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 109 :37 رقم : : 74 56 Brassica rapa متوالية 370.5 le- بهوية رقم 108 :38 Oryza sativa متوالية متوالية | متوالية | 369.6 1.9e- بهوية رقم | بهوية | بهوية رقم 108 :39 رقم : : 75 57 في كل من الصور المتماثلة الطحلبية ومن النباتات التي تم توضيحاه في الجدلو رقم 2 والجدول رقم 3؛ فإن نطاق مستقبل استجابة myb 5 (RR) RESPONSE RECEIVER يوجدان بداخل الأحماض الامينية الاولى (الطرف (N= من متوالية البولى ببتيد polypeptide كما تم شرحه في جينومات JCI وعدم وجد نطاقات محافظة والتي تم تحديدها في طرف الكربوكسي بالنسبة لنطاق Amyb 5 الصور المتماثلة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 المذكورة.
المثال رقم 7 محتوي الكلوروفيل chlorophyll وحجم الهوائي والمعالجة الفسيولوجية الضوئية من تطفيرات SGI1 من NE-13380 5 NE-7843 إن محتوي الكلورفيل الخاص بتطفيرات الإنتاجية العالية تم تحديدها بواسطة طرح LOAN باستخدام ميثانول متم تحليلها بواسطة المادة الطافية بواسطة القياس الطيفي. وباختصارء فإن shal مساوية من 500 ميكرو لتر من المزرعة يتم نقلها في الأنابيب بداخل أنابيب ملتفة عند الجزء العلوي سعة 0 مل وبتم وضعها باستخدام الالطرد المركزي الدقيق العلوي للجدول عند 15000 لفة لمدة 10 دقائق. تم شفط المواد الطافية من الكريبات وتم إعادة تعليق كل كرية في 1.5 مل من 1699.8 من الميثانو (الذي تم تعديله فيما سبق باستخدام كروينات الماغنسيوم). تمت إضافة 0.2 مل من الخرزات الزجاجية (بقطر 0.1 (ae لكل dala) وتم الطرق عليها ملد 3 دقائق؛ وتم نقل 1.0 مل sald) ge 0 الطافية إلى أنابيب بغطاء متحرك وتم الطرد GO في وسيلة طرد مركزي علوية على منضدة عند 15000 لفة كل 10 دقائق. تم تحول الكريات الناتجة إلى اللون الأبيض مما يدل على اكتمال الاستخلاص. تم الشفط بالأنابيب ل 0.8 مل من كل مادة طافية بداخل كوفيت زجاجي بصري وتمت قراءة الأطوال الموجية للامتصاص بصورة مباشرة عند 720 نانو مترء و665 نانو متر و652 نانو متر. أجريت قياسات طيفية في النموذج الشعاعي المزدوج باستخدام 5 عينة لم تتم معالجتها من الميثانول 9699.8. تم استخدام المعادلات التالية لكي يتم حساب تركيز الكلوروفيل A665-AT720) + 9.16 )16.72] = 3Chlorophyll a [g m— :chlorophyll (A652-A720) and Chlorophyll b [g m-3] = 34.09(A652-A720) - 15.28(A665-AT20). تم جعل كمية الكلوروفيل chlorophyll بصورة قياسية على كل خلية وعلى أساس إنتاجية كريون عضوي إجماني .(TOC) TOTAL ORGANIC CARBON 0 يوضح الجدول رقم 5 أنه وعلى الرغم من أن كمية الكلوروفيل الإجمالية لكل خلية تتراوح إلى حد ما بين نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT (GROWTH IMPROVEMENT 1 فإنه يتم تقليلا بصورة عامة بالنسبة لخلايا من النوع البري بكمية تتراوح من حوالي 7030 إلى حوالي 7665 والتي تكون متوافقة مع النقص الذي تمت ملاحظته في حجم الهوائي. وعلى أساس كل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL
ORGANIC CARBON فقد تراوح النقص في الكلوروفيل chlorophyll الإجمالي في نواتج طفرة 1ا56 بالنسبة لخلايا من النوع البري من حوالي 9630 إلى حوالي 9650. الجدول 5 محتوي الكلوروفيل من نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين (SGI1) 1 Casall SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 وطحالب من النوع البري السلالة sl| Chib| /Chib| «Chla| [Chia | إجمالي الخلية الخلية . Chl Chl Yo من Yo من [TOC | ¢ | ¢ % a | OS بيكو 7 التغير | of Toc Fa | . )%( من التغيّر 0 0 ض ١ 0 ض ١ " 7 ض ١ ا 0 ض NE- 0.287 61 0.063 |-%35 |%4.4 -9636 13380 GE- 0.250 |-%12 0.045 |-%54 963.7 -9646 16491 GE- 1 |-%26 0.035 |-%64 |%3.4 -9650 16492 GE- 0.246 14-0" 0.043 |-%55 |%3.6 -9647 16493 بالإضافة إلى محتوي الكلوروفيل cchlorophyll فقد تم تحليل سلالات التعطيل الجيني ل «SGIT NE-7843 , و GE-16391 3 NE-13380 و GE-16392 و 65-16393 فيما يتعلق بحجم هوائي نظام ضوئي مخفض «ll (PSIl) REDUCED PHOTOSYSTEM Il وحجم
هوائي نظام ضوئي منخفض | (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM امن Qa’t/1 (معدل التشبع الضوئي من تقل الإليكترون على جانب المستقبل من النظام الضوئي Il عند تشبع الضوء وقياس الفعالية لاخاصة بنقل الإليكترون التخليقي الضوئي الخطي) وأيضاً في شكل 7# الخاص بتثبيت الكريون. تمت زراعة WIA من النوع البري وسلالات ناتجة طفرة من 5611 في اختبار مزرعة شبه متصلة بضوءٍ ثابت (/01-500) كما تم وصفه في المثال رقم 3. تم الحصلو على بيانات عن النوع البري من Parachlorella ونواتج طفرة تقليدية من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH NE-7843) IMPROVEMENT 1 و (NE-13380 في التجارب المنفصلة من تلك التي تم تضمينها في ثلاثة من صور التعطيل الجيني ل 561 المستهدفة GE- GE-16491) (GE-16493 516492 0 تم إجراء تحليل للعديد من متغيرا تخليقية ضوئية باستخدام تقنية حث الفلوروسنت والتراخي (FIRE) التي تم تطويرها لقياس سلاسل شاملة من خصائص تخليقية ضوئية وخصائص فسيولوجية من الكائن all التخليقية الضوئية ( Gorbunov and Falkowski “Fluorescence Induction and Relaxation (FIRe) Technique and )2005( Instrumentation for Monitoring Photosynthetic Processes and Primary Photosynthesis: Fundamental :Production in Aquatic Ecosystems” in 5 th International Congress of 13 Proc. (Aspects to Global Perspectives (Eds: A. van der Est « Aug.29 — Sept. 3 Montreal:Photosynthesis .2004 pp. 1029-1031).¢ V.2¢ Allen Presscand D.
Bruce) تعتمد تقنية FIRe على قياس وتحليل مخططات الكلوروفيل chlorophyll (التألق المتنوع” راجع ذلك عند et.
Falkowski “Development and Application of Variable Chlorophyll 2004 al. 20 Fluorescence Techniques in Marine Ecosystems” in: Chlorophyll a Fluorescence: تكون بصمة التخليق الضوئي ) C.
Papageorgiou and PP. 757-778» Springer.eds).Govingjee ) معتمدة على العلاقة بين تألق الكلوروفيل chlorophyll وفعالية عمليات التخليق الضوئي. توفر تلك التقنية مجموعة من المتغيرات التي 5 توضح عمليات تجميع الضوء الخاصة بالتخليق الضوئي المتمايزة في النظم الضوئي (PSI) ١١ Jai reduced photosystem ١١ الإليكترون التخليقي الضوئي إلى تثبيت الكريون. تقوم
القياسات التي تم إجراؤها هنا باستخدام جهاز mini-FIRe الذي تم إنتاجه بواسطة Maxim East Brunswick Gorbunov aof Rutgers University »لل .. والجهاز المتاح تجارياً FIRe من satlantic.com and planet-« Canada«Sea-Bird Scientific (Halifax (ocean. co.uk وأيضاالمعلومات المتعلقة باستخدام جهاز FIRe والمتاحة في كتيبات الشركة. تم أخذ كل القياسات باستخدام الضوء الثابت )2000 ميكرو مولر من الفوتون. م-2 ثانية -1) من المزارع شبه المستمرة (CL=SCPA) والمزارع (انظر المثال رقم 3). لكي يتم الحصول على قياسات |ا605 FV/FM and من الحث الخاص بالفلوروسنت فقد تم إجراء حركيات الارتخاء Fluorescence Induction and Relaxation (FIRe) في الظلام. تم عرض القيم الخاصة ب Fv/Fm and oPSII في الجدول رقم 7 وتم حسابها في شكل متوسط من 6 قياسات (3 0 قياسات لكل 2 من الصور المتماثلة البيولوجية)؛ لم تزيد الأخطاء في تلك المتغيارت عن 965. تم إجراء قياسات المقطع العرضي من نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED /0]101057511اباستخدام وسيلة القياس الطيفي 15-10 ل المعدلة باستخدام مجموعة المرشح لكي يتم قياس إزاحة إليكترونية لونية electrochromic shift (ECS) عند 520 نانو متر مزودة بوسيلة ومضية خاصة بالتحويل المنفرد .single turnover flasher (STF) كانت 5 كثافة لاقدرة عند القمة في غرفة العينة عالية بصورة كافية لضمان الإغلاق الكامل لمراكز التفاعل في حوالي 10 ميكرو ثانية. كان معدل الاستثارة الناتج هو حوالي 1 إلى 3 نتائج في كل مركز تفاعل لكل 10 ميكرو ثانية (بالاعتماد على مقطع عرضي خاص بالامتصاص من النظام الضوئي). تم التحكم في STF الذي تم إمنتاجه من نبضات ضوئية فائقة قصيرة من ضوءٍ أزرق (455 نانو متر مع 30 نانو مل من عرض النطاق النصفي) وتم التحكم في زمن النبضة بواسطة 0 وسيلة الحث من وسيلة القياس الطيفي الكتلي 15-10ل. تم التحكم في مدة النبضة بواسطة صندوق التحكم في النبضة وكانت قابلة للضبط في مدى من 1 ميكرو ثانية إلى 50 ميكرو ثانية باستخدام وسيلة قياس gad) على اللوحة الأمامية. ولكي يتم قياس المقطع العرضي من نظام ضوئي منخفض | (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM افقد قمنا بتخفيف المزارع إلى OD من 0.2 عند حد أقصى من الكلوروفيل chlorophyll (حوالي 440 نانو متر) بالاعتماد 5 على قياس أطياف الامتصاص من المعلق باستخدام وسيلة قياس طيفي من Perkin Elmer
Lambda 650 مزودة بكرية متكاملة. تم قياس ECS باستخدام 10 ميكرو ثانية من الومضات مع كثافات تتراوح من 4000 إلى 12000 ميكرو مول من فولتونات م-2 ثانية -1 في وجود DCMU وهيدروكسيل أمين hydroxylamine تم تزويد المنحنى التجريبي بدالة أسية بسيطة. ECS = ECSy x (1 — e!t>%psr) حيث تكون ECSy عبارة عن إشارة الحد الأقصى من ECS ¢ وتكون +1 عبرة عن كثافة لافوتون في الفوتقونات/م2؛ وتكون روم5 عبارة عن المقطع العرضي الوظيفي من PSI كانت القيم الخاصة بالمقطع العرضي الوظيفي من نظام ضوئي متخفض (PSI) REDUCED ١1010575114١ الخاصة بالنوع غير المعالج من (WT-1185) Parachlorella هو x 10718 )0.5 + 4.0)م2. تكون تلك القيم قريبة لتلك التي تم الحصولعليها من المقطع
0 العرضي الوظيفي من نظام ضوئي مخفض ١١ (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM Il الذي ينمو تحت نفس الظروف ((002 18 10 X (0.1 + 4.3) = ,روم6)). تم تقدير الأخطاء الخاصة بالمتغيرات بحيث لا تزيد عن 7620. تم قياس معدلات تثبيت الكريون (©146 (Pmax باستخدام المزراع الطبيعية بالنسبة ل 5 ميكرو جرام من chl مل -1 في الأوساط المشتملة على 0.5 جم 1-1 )5.95 مل مولار) من
5 بيكريونات الصوديوم. تمت إضافة 20.4 ميكرو Ci مل-1 14C من بيكرينات لاصوديوم لكل مزرعة وتم تعريضها إلى 2500 ميكرو إينشتاين لمدة تصل إلى 10 دقائق. تم جعل العينات حمضية بصورة فورية باستخدام 2 عياري من HO وتم السماح لها بطرد الغاز طوال الليل. وفي اليوم التالي تم قياس العينات باستخدام وسيلة الحساب الومضية 56500 Beckman وتم حساب كتلتها.
0 تتم تحديد 0877 (الزمن الخاص بانتقال الإليكترون على جانب المستقبل من نظام ضوئي مخفض ١| (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ المقاس تحت ظروف ضوء مشبع- بصورة فعالة بواسطة الخطوة al) الخاصة بانتقال الإليكترون التخليقي الضوئي الخطي) من منحنيات ضوءٍ FIRE ومن منحنيات حركيات الارتخاء المستحث بالظلام dark induced (DIRK) kinetics 61878100. تم تقدير تركيز PSII الحجمي بالنسبة للنوع البري في شكل
PSI.530Fv/o) 5 تم تقدير الأخطاء الخاصة بالمتغيرات بحيث لا تزيد عن 9615. تم تقدير
المقطع العرضي للامتصاص البصري (مع طيف انبعاث متوسط خاص بمصدر الضوء) باستخدام المعادلة التالية: In(10) OD(}) IA) 3 7[ 1 Achl/TOC = Tama n XT X50 ei Al [oe 101 وا [Chl/TOC] حيث [ChI/TOCT عبارة عن كلوروفيل/ إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL
ORGANIC CARBON 5 من العينة؛ وتكون OD(A) عبارة عن قياس BUS ضوئية من العينة عند طول موجي من Aly A والتي يتم قياسها من طول مسار الشعاع في كوفيت (1سم)؛ وتكون (10 عبارة عن كثافة مصدر الضوء المستخدم gail الطحالب عند الطول الموجي A الجدول 6 متغيرات التألق والتخليق الضوئي المقاسة باستخدام تقنية FIRe
متغيرات JTS- FIRe الوصف 0 التى تمت استعادتها Fv/Fm إنتاج الحصيلة الخاصة بالكمية عند الحد الأقصى لها من لكيمياء الضوئية فى نظام ضوئي مخفض Il (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ المقاسة فى Ala تمت هيئتها في الظلام (بدون أبعاد). يتميز هذا المتغير بوجود كفاءة تفاعلات التخليق الضوئى الأولية.
oPSII والمقطع العرضي للامتصاص الوظيفي من نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ ) أنجستروم2) في حالة تمت تهيئتها في الظلام. ويكون المتغير عبارة عن منتج من مقطع تشابكي للامتصاص الخاص ب PSII (أي؛ الحجم الفيزيائي من وحدة (PSI والحصيلة الخاصة بالكمية من الكيمياء الضوئية في |ا05. والتي يمكن قياسها باستخدام أطوال موجية مختلفة لاستثارة. oPSI والمقطع العرضي للامتصاص الوظيفي من نظام ضوئي منخفض ١ )(PSl) REDUCED PHOTOSYSTEM | أنجستروم2) في A تمت تهيئتها في الظلام. ويكون المتغير عبارة عن منتج من مقطع تشابكي للامتصاص الخاص ب PSII (أي؛ الحجم الفيزيائي من وحدة نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED (PHOTOSYSTEM | والحصيلة الخاصة بالكمية من الكيمياء لضوئية في PSI 1/8 ومعدل تشبع spall من نقل الإليكترون على جانب المستقبل من م الفوتون I أوضحت المتغيرات فعالية خاصة بنقل الإليكترون لتخليقي من الفوتون. يوضح الجدول رقم 7 أن كل تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 قد أوضح الزيادة في 7/7100 (بمقدار حوالي 1614-10 ) بينما تعرض حجم مقطعي عرضي للهوائي منخفض بالمقارنة مع سلالة لانوع لابري والتي تم اشتقاقها منها. إن تطفيرات 5611 يكون لها حجم هوائي مخفض من نظام ضوئي مخفض II (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM Il ونظام ضوئي منخفض (PSI) SIREDUCED PHOTOSYSTEM ١ من %50-40( بالنسبة للنوع البري)؛ ومعدلات عالية من نقل الإليكترون على جانب المستقبل من PSI (981/1) تحت ضوء مشبع (متزايد
بين حوالي 9635 وحوالي 96130؛ ويمقدار على الأقل حوالي 16100 بالنسبة للنوع غير المعالج في نواج الطفرة المعدلة) وومعدلات عالية من امتصاص الكربون (Pmax) (والتي تصل على الأقل لحوالي 40-30 96 بالنسبة للنوع البري)؛ وذلك كما تم تحديده بواسطة بروتين protein )48 التفاعل» aig الحفاظ على عدد الأنظمة الضوئية على أساس إنتاجية OS
عضوي إجمالى (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON (انظر المثال رقم 7). كانت السلاسل متسمة أيضاً بوجود نسبة كلوروفيل chlorophyll أ عالية بالمقارنة بنسبة الكلوروفيل ب وذلك بالمقارنة مع النوع غير المعالج (وتكون الزيادة تقريباً 9670)؛ Ally تكون موضحة للنقص في الضوء المحيطي من معقدات التجميع والذي يكون متوافقاً مع الحجم المنخفض الذي تمت ملاحظته من المقطع العرضي الوظيفي من نظام ضوئي مخفض Il (PSI) REDUCED
.PHOTOSYSTEM ١ 0 (الجدول رقم 7). أوضحت طفرات KO 5611 التي تمت استعادتها GE-16491) و65-16492 و 65-16493 ) المعدلة باستخدام (CRISPR/Cas9 وجود نمط ضوئي فسيولوجي مشابه بالنسبة للتطفيرات لاأصلية؛ ولكن مع عمليات نقص كبيرة في الهوائي من All) PSI تصل إلى 9655)؛ وبمعدلات أسرعء من نقل الإليكترون على جانب المستقبل من PSI تحت ضوء التشبع (وبصورة متزايدة بما يصل لحوالي 96130 ) ومعدلات
5 متزايدة من امتصاص الكربون (بما يصل لحوالي 9680 أعلى في 65-16491) (الجدول رقم 7( الجدول 7 الفسيولوجيا الضوئية من نواتج طفرة Parachlorella SGI
سلالة ٍ 14C FIRe/JTS-10 == Stra# الخلية: Pmax | 1 oPSI oPSlI oPSIl | FV/FM حجم 8 الخلية؛ (نانو مول "مس ا ا C ميكر ( أنجستر | ( أنجسترو | ( أنجستر | -1)5( ١ 140/ميكر : : : متر3 وم de? م die? وم 2عند و جرام
0 تنانو 450 نانو | 450 106/ متر) متر) نانو متر) الساعة) WT- 0.598 | 428 153 380 94 10.1 40 1185 NE- 7843 | 0.667 | 277 194 14.8 63 NE- 240 13380 | 0.677 | 261 84 197 17.3 57 GE- 16491 | 0.678 3د2 75 211 19.6 83 GE- 0.688 235 225 15.4 16492 85 GE- 7 | 243 71 250 16.2 16493 76 المثال رقم 8 الفحص الفسيولوجي الضوئي لنواتج طفرة طحلبية عالية الإنتاجية وبالاعتماد على اكتشاف أن التطفيرات ذات الإنتاجية العالية من NE-7843 و NE-13380 فإنها تستخدم سلاسل هوائي منخفضة واختبارات إنتاجية واكتشاف تالي بحيث أن التطفيرات لاخصة بالإنتاجية تكون عبارة عن خصائص فسيولوجية ضوئية متمائية كما تم ضبطه أعلاه في الجدول رقم 5 وفي الجدول رقم 6 والذ يشتمل على حصيلة تخليق ضوئي عالية عند الحد الأدنى لها «(FV/FM) مع حجم هوائي نظام ضوئي مخفض Il (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ مخفض (0PSI) ومعدل تغير ل PSI متزايد (Qa’T/1) مع فحص
خاص بالإنتاجية العالية من نواتج طفرة الطحالب ذات الإنتاجية العالية والذي يطلق عليه هنا فحص FACS-FIRE'"." إن الفحص يشتمل على انتقاء نواتج sh كلوروفيل chlorophyll منخفضة من مجموعة طحلبية سليفة باستخدام FACS وفحص السلالات الفردية من المجموعة المختارة بواسطة Led FACS يتلعق بتألق الكلوروفيل المنخفض وذلك باستخدام وسيلة FIRe التي تم وصفها في المثال رقم 6 لكي يتم تحديد حجم هوائي PSI (ا6051) عند واحد أو أكثر من
الأطوال الموجية؛ FV/FM ومعدل نقل الإليكتورن عند جانب المستقبل من نظام ضوئي مخفض ١١ (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ (28(.7/1 تم تمديد السلاسل التي لها حجم هوائي PSII منخفض» وزيادة في says VFM في 87/1 وتمت sale) اختبارها وتم اختبارها مرة ثانية Lad يتلعق بمعدل امتصاص (14C) Pm والإنتاجية في المزارع.
0 وفي التجارب الاسترشادية؛ تم تطفير الوع البري من Parachlorella Wa (السلالة -1//ا 5) بواسطة UV كما تم وصفه في المثال رقم 1. يمكن أن يتم أيضاً التأثير على التطفيرات بواسطة التطفيرات لاكيميائية والتخليق بالتطفير الخاص بالإدراج (انظرء على سبيل المثال؛ lll الأمريكي رقم 2014/0220638 الذي تم إدراجه هنا كمرجع) أو حتى التطفير المستهدف مثلما هو الحال بواسطة CRISPR/Cas (انظر على سبيل المثال؛ الطلب الأمريكي رقم
5 2016/030489؛ الذي تم إدراجه هنا كمرجع بكامله). وكما تم وصفه في المثال رقم 2؛ تم السماح WAY الطحلبية المتطفرة بأن تتم استعادتها في ضوئي منخفض dag ذلك يتم تعريضها لتصنيف خلية منشطة خاص بالتألق (FACS) حيث يكون هناك خلايا تألق كلوروفيل chlorophyll منخفض والتي تشتمل على مقدار منخفض تقريباً من 0.5 إلى 962 من تألق الكلوروفيل بالمقارنة مع المجموعة الإجمالية من الخلايا التي تم
0 اختيارها. (يمكن فرض الأمداء الأكثر صرامة أو الأقل صرامة أو الأمداء الأوسع أو الأمداء الأضيق من تألق الكلوروفيل chlorophyll على اختيار FACS وذلك وفقاً لتقدير المستخدم. تم وضع الخلايا التي تم تصنيفها من FACS على الطبق ويعد نمو المستعمرات فإنه يتم التقاطها بصورة منفردة وبتم تلقيحها بداخل وسط المزرعة (المفتقرة لمصدر الكريون المخفض) في أطباق بها 96 عيناً ويتم السماح للمزارع بالنمو lly تتغذي بصورة ذاتية في squall )500 ميكرو
5 إينشتاين م-2 ثانية -1. تم البدء في المزارع التي لها حجم صغير (تقريباً من 200-100 ميكرو
لتر) في عشرة أطباق بها 96 Tue مما ينتج عنه تقريباً 960 مزرعة فردية من السلالات المختارة من الكلوروفيل .chlorophyll كانت المرحلة الثانية من الفحص خاصة بنواتج طفرة عالية الغنتاجية والمستخدم في وسيلة FIRe مع كبل بصري من الألياف المرتبطة والتي تنقل النبضات الضوئية الخاصة بألق خلية خاص بالمسبار ونقل التألق المتجمع إلى وسيلة اكتشاف المعدات. تم تثبيت الكبل البصري الليفي على كل عين فردية لكي يتم سبر وقياس التألق من سلالات الخلية المعزولة والتي تم تسجيلها واستخدامها لحساب FV/FM وحجم هوائي PSI (1ا6051) ومعدل التغير نظام ضوئي مخفض II (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ (معدل نقل الإليكترون عند جانب المستقبل من PSII 28:/1) بواسطة وسيلة 148]. تتزايد السلالات التي تعرض FV/FM بمقدار يكون 0 على الأقل 9610 من حجم هوائي |ا05 والمخفض بمقدار على لاأقل 9630؛ ومعدل تحويل PSII المتزايد بمقدار على الأقل حوالي 9650 والذي تم اختياره للدراسة الإضافية. يمكن ضبط قيم الأجزاء المقطوعة بحيث تكون لها قيم مختلفة وذلك طبقاً لتقدير المستخدم؛ على سبيل المثال» فإن FV/FM يتزياد بمقدار على الأقل 965؛ وحجم هوائي ١ا05 والذي يقل بمقدار على الأقل 9620؛ ومعدل تحول ل نظام ضوئي مخفض ١١ (PSIl) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ الذي 5 يقل بمقدار 9620 على الأقل أو معيار أكثر صرامة يمكن استخدامه لسلالات مختارة محل الاهتمام. تم توضيح مخطط خاص بعملية الفحص في الشكل رقم 6. يشتمل الفحصل؛ ويتضمن على اختيار يعتمد على FACS من سلالات الكلوروفيل chlorophyll المنخفضة و فحص يعتمد على FIRe وذلك للمزارع الصغيرة والتي يمكن معالجتها بصورة آلية؛ على سبيل (JU بواسطة وسيلة FACS 0 والتي توجه خلايا الكلوروفيل بصورة مباشرة للعيون في الأطباق متعددة العيون و/أو يتم ذلك بواسطة ذراع ميكانيكي آلي لكي يتم تحديد الموضع بنجاح بالنسبة لكبل بصري خاص بالألياف FIRe أو في شكل LED متصاعد باستخدام نظام وسيلة اكتشاف تألق أو باسخدام نظام آخر قادر على توفير ومضات ضوئية بشدة عالية بالميكرو ثانية وتمجميع الإشارات الخاصة بالتألق على مدى العيون من أطباق متعددة العيون.
أوضحت السلالات الطحلبية وجود تألق كلوروفيل chlorophyll منخفض وحجم هوائي منخفض وزيادة في FV/FM وزيادة في معلد التحول (Qa’t/1 ( PSII والذي يمكن اختباره بصورة إضافية لكي يتم توفيره في المثال رقم 6 coded على سبيل المثال» من خلال محتوي الكلوروفيل chlorophyll المنخفض ب و/أو امتصاص الكريون المتزايد والإنتاجية الأعلى فى المزرعة؛ على سبيل Jl في مزرعة شبه متصلة (على سبيل المثال» المثال رقم 3( .
تم تحديد العديد من سلالات الطفرة باستخدام طرق فحص FACS-FIRE من بين بينها NE- 0 والتي تم das الجينوم الخاص بها متسلسل. تم اكتشاف أن NE-16980 عبارة عن تطفير بتحويل الإطار في تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (1-2661) (الشكل رقم 7).
0 المثال رقم 9 التحليل الدقيق الخاص بتطفيرات SGI] من NE-7843 و NE-13380 ولكي يتم تحديد تركيبة الكتلة الحيوية الإجمالية؛ من نواتج تطفير 56١1 فقد تم إجراء التحليل الكمي من العينات من المزاع النامية في الطريقة شبه المتصلة مع تخفيف 9640 بصورة يومية لكي يتم تحديد محتوى الشحم 010 اوالبروتين 030167 والكريوهيدرات carbohydrates في الخلايا في المزرعة شبه المتصلة. وبعد أن تصل المزراع إلى الحالة الثابتة؛ تتم إزالة أجزاء مساوية من
5 المزارع بصورة يومية ويتم استخدمها لتحليلالشحم والبروتين 0016117 والكريوهيدرات 5 . تم تحديد Jaa} الكريون العضوي total organic carbon (TOC) من عينات مزرعة الطحالب بواسطة تخفيف 2 مل من مزرعة الخلية إلى حجم إجمالي من 20 مل باستخدام ماء ا0ا. تم إجراء الحقن ثلاثة مرات لكل مقياس في وسيلة تحليل Shimadzu TOC— [05/ لكي يتم تحديد الكريون الإجمالي (TC) والكربون غير العضوي الإجمالي (TIC) تم ضبط
0 فن الاحتراق عند 720 درجة Asie وتم تحديد إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON بواسطة طرح © من ©1. كان مدى أريعن نقاجط المعايرة من 2 جزء في المليون إلى 200 جزء في المليون بصورة مناظرة إلى 2000-20 جزء في المليون من المزارع غير المخففة باستخدام معامل الارتباط من 2r > 0.999.
ولكي يتم تحديد محتوي الشحم؛ فإن تحليل FAME يتم إجراؤه de عينات من 2 مل والتي تم تجففها باستخدام 111-476 68061/8©6. ولكي يتم تجفيف الحبيبات فقد تمت إضافة ما يلي: 0 ميكرو لتر من 500 مل مولار من KOH في الميثانول» و200 ميكرو لتر من تترا هيدروفيوران تشتمل على 160.05 توليوين هيدروكسيل معالج بالبيوتيل و40 ميكرو لتر من 2
مجم/ل من حمض 011:0 الخالي من الشحم/ 013:0 من الجليسريد الثلاثني / 23:0 إستر ميثيل بحمض شحمي وذلك كخليط قياسي داخلي و500 ميكرو لتر من خرزات زجاجية (425- 0 ميكرو لتر في القطر). تمت تغطية الزججات باستخدام أغطية مبطنة تفتح من أعلى من نوع TFE septa وتم وضعها في SPEX GenoGrinder عند 1.65 ألف لفة لمدة 7.5 دقيقة. تم تسخين العينات بعد ذلك عند 80 درجة مئوية لمدة خمس دقائق وتم السماح لها بأن تبرد.
0 ولغرض الاشتقاق؛ فقد تمت إضافة 500 ميكرو لتر من 9610 من بورون تراي فلوريد في الميثانول إلى العينات قبل أن يتم التسخين عند 80 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة. تم السماح للعينات بأن تبرد قبل إضافة 2 مل من الهيبتان و500 ميكرور لتر من 5 مولار من NaCl تم بعد ذلك عمل تدويم للعينات لمدة خمسة دقائق عند 2 كيلو لفة وتم الطرد المركزي في النهاية لمدة ثلاثة دقائق عند 1 كيلو لفة ف الدقيقة. تم أخذ العينات من طبقة الهيبتان باستخدام وسيلة أخذ عينات
5 آلية من نوع 8ام8010580/. Gerstel MPS قام الحساب الكمي باستخدام 80 ميكرو جرام من المقياس الداخلي من FAME 023:0 . لكي يتم تحديد محتوي البروتين» تم التحليل المائي لعينات الكتلة الحيوية المعزولة وتم اشتقاق الأحماض الأمينية إلى إسترات بروبيل برويوكسي كريونيل amino acids were (AAPE’S) derivatized to propoxycarbonyl propyl esters وتم التحليل من خلال 60/1/15 وتم
0 الحساب الكمي في مقابل المقياس الداخلي؛ كما تم توضيحه بالتفصيل فيما يلي. تم الطرد المركزي لأجزاء مساوية )0.5 (Je من نوع (WT-1185 ( Parachlorella وسالالة التعطيل الجيني من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 من 6-13380 من مزارع شبه متصلة وتم غسل الكريات مرتين باستخدام محلول ملحي منظم من الفوسفات -phosphate buffered saline (PBS) وفي
5 النهاية فإن تلك الخلايا يتم sale] تعليقها في حجم نهائي من 0.5 مل (حجم بدء) ويتم نقل العدوى
لها في 4 مل من القارورة الزجاجية. تمت إضافة عينة المزرعة من 800 ميكرو لتر من 6 مولار من كلوريد الهيدروجين hydrogen chloride (Hel) مع TGA عند (400 ميكرو لتر من حمض off جلايكوليك thioglycolic acid (TGA) عند 19.6 مل من 6 مولار HCl قبل الاستخدام مباشرة). تم بعد ذلك إضافة عشرة ميكرو لتر من الميثانول إلى الزجاجة Lig ذلك 200 ميكرو لتر من 20 مل مولار من نورفالين المستخدم في شكل مقياس داخلي. تمت تغطية كل قارورة باستخدام 2N لمدة 10 ثواني؛ بعد تلك المدة؛ فإن القوارير يتم تعريضها للدوامات لمدة 1 دقيقة عند 2500 لفة في الدقيقة لكي يتم تجانس العينات. تم بعد ذلك وضع القوارير في فرن به درجة حرارة 110 درجة مثوية لمدة 22 ساعة. وعند نهاية الحضانة بالتحلل المائي» يتم إجراء تدوير للقوارير لمدة 10 دقائق عند 2500 لفة في الدقيقة ويتم لاطرد المركزي عند 1000 لفة في 0 الدقيقة بعد توقف الطرد المركزي. تمت إزالة 50 جزء مساوي من كل قارورة وتم تجفيفاه بواسطة وضعها في EZ-2 Genevac الأمن من ناحية الحمض والذي تتم إدارته باستخدام طريقة كلوريد الهيدروجين hydrogen chloride (Hel) لمدة 3 ساعات قبل عملية الاشتقاق. ولغرض عملية الاشتقاق» ld هناك 250 ميكرو لتر من H 0201-6 قد تمت إضافته حتى يتم تجفف نواتج تحلل الحمض؛ يلي ذلك 10 ميكرو لتر من خليط ناتج الأكسدة ويعد ذلك 120 5 ميكرو لتر من 0.5 مولار من هيدروكسيد الصوديوم .(NaOH) sodium hydroxide تم تحضير خليط من مضاد الأكسدة بواسطة إضافة 0.25 مل من 7١-بروييل» 50 ميكرو لتر من ثيو داي جليكلو وحبيبات قليلة من الفينول إلى 2.20 مل من O2MIlli-Q H وتم التعريض إلى التدويم. تم بعد ذلك إضافة 50 ميكرو لتر من المحفزء وخليط من 4: 1 من البيريدين و 7- بروبانول وتمت تغطية الزجاجات وتعريضها للتدويم عند 2500 لفة في الدقيقة لمدة 1 دقيقة. وتم 0 بعد ذلك إضافة 50 ميكرو لتر من البروييل كلوروفورمات وتمت تغطية الزجاجات وتم تدويمها عند 2500 لفة لمدة 1 دقيقة. ويعد 1 دقيقة من الحضانة؛ فإن الزجاجية يتم تدويمها مرة ثانية عند 0 لفة في الدقيقة لمدة 1 دقيقة dang ذلك تمت إضافة 500 ميكرو لتر من خليط من 4: 1 من أيزو أوكتان وكلوروفورم إلى الزجاجة والتي يتم تغطيتها بعد ذلك وتدويمها عند 2500 لفة في الدقيقة لمدة 1 دقيقة. تتم تغطية الرف الموضوع عليه قوارير الينات باستخدام رف AT وبتم الرج 5 لمدة 20 مرة لضمان تحول العينات لمستحلب. تم الطرد المركزي للعينات بعد ذلك حتى يصل
الطرد المركزي إلى 1000 لفة في الدقيقة ويعد ذلك يتم إيقاف الطرد المركزي. تمت إزالة 200
ميكرو لتر من الطبقة العضوية في قارورة GC جديدة مع زجاج يتم إدراجه وتحليله بواسطة
.GC/MS
تم تحليل العينات بواسطة GC/MS وباستخدام ZB-AAA 0.2510 من حجم تحليل حمض أميني GC 0 وتم الحساب الكمي باستخدام مقياس نورفالين داخلي. كانت مذيب 1 Wash
الإبري من الأسيتون وكان مذيب 2 Wash الإبري من أيزو أوكتان/ كلوروفورم (80/ 20) مع
البرمجة عند 110 درجة مئوية والتوقف عند 0 درجة لمدة 30 درجة/الدقيقة بالنسبة ل 320 درجة
والتوقف عند 0.5 دقائق باستخدام 4 ميكرو لتر من الحقن عند 15: 1 من التشتت و250 درجة
عند 1.1 مل/الدقيقة باستخدام خط ناقل من 300 درجة مئوية.
0 تتم تكبير البيانات من GC-MS بواسطة 0.005 لتر للحصول على ad بالميكرو مول؛ وتم الضرب في الوزن الجزيئي للحمض الأميني. تم تقسيم القيمة على 5 لكي يتم تصحيح الحجم الذي تم الحصول عليه بالميكرو جرام/المللي لكل حمض أميني. يتم تحويل الأسبارجين إلى حمض أسبارتيك أثناء التحلل المائي؛ Jilly فإن الأسبارجين بالإضافة إلى حمض الأسبارتيك يتم تحديدهما بأنهما حمض أسبارتيك في تلك الطرق. لا يتم قياس التريتوفان بواسطة تلك الطرق ولكن
5 لا يتم إجراء أي تكسير هام خاص بالأحماض الأمينية في بروتينات Parachlorella. بالنسبة للحساب الكمي من الكريوهيدرات carbohydrates الغجمالية فإن الكتلة الحيوية يتم تحليلها مائياً لمدة ساعة واحدة في حمض هيدروكلوريك 6 عياري لكي يتم تحويل البولي سكاريدات إلى سكاريد أحادي. تم تحويل مواد الكاريد الأحادية الناتجة إلى تراي ميثيل سيليل إيثر باستخدام MSTFA من -١ ميثيل -ل1- تراي ميثيل سيليل تراي فلورو أسيتاميد مع 961 من تراي ميثيل
0 كلورو سيلان lily يتم تحويلها وحسابتها بصورة كمية باستخدام تحليل 60-1/5. وبالنسبة للتحلل المائي للحمض من عينات المزارع؛ فإن هناك 500 ميكرو لتر من Milli-Q O2H قد تمت إضافته عند 500 ميكرو لتر من عينات المزرعة في 4 مل من القوارير أو حيث أن عينة المزرعة تكون أكثر تركيزاً (أعلى من إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL (ORGANIC CARBON و800 ميكرو لتر من O2Milli-Q H الذي تمت إضافته إلى 200
ميكرو لتر من die الزراعة. تمت إضافة 20 ميكرو لتر من 2.5 مجم/المللي من الريبيتول و ل-013-جليوكوز في شكل مقياس داخلي بالنسبة ل 1 مل من المزرعة المخففة من العينات في 4 مل من القوارير. تم بعد ذلك إضافة 1 مل من HOI المركز لكل قارورة وتمت تغطية القوارير وتم وضعها في حمام جاف عند 105 درجة مئوية لمدة 1 ساعة. تم بعد ذلك السماح للعينات Ob 5 تبرد إلى درجة حرارة الغرفة وتم نقل 100 ميكرو لتر إلى ga الغدراج daly أنبوب طرد مركزي دقيق من 1.5 مل. ولغرض الاشتقاق؛ فإن الأنابيب الخاصة بالطرد الدقيق والتي تشتمل على نواتج إدراج زجاجية فإنها Jails على عينات يتم وضعها في وسيلة LY) EZ-2 Genevac من ناحية الحمض وبتم تشغيلها بطريقة sad HCL 3 ساعات على الأقل. وبعد التجفيف؛ تتم إضافة 100 ميكرو لتر من 0 عامل الكشف الخاص بالاشتقاق والذي يتكون من 800 ميكرو تر من البيريدين الجاف إلى 1 مل من MFSTA-1% TMCS المفتوح الجديد لكل عينة. تمت حضانة العينات لمدة 1 ساعة عند 0 درجة مئوية بينما يتم الخلط عند 1000 درجة مئوية في وسيلة خلط من نوع Eppendorf Thermomixer . ويعد الحضان؛ فإن العينة يتم تحليلها بصورة مباشرة بواسطة GC/MS تم تحليل العينات بواسطة GC/MS الذي يستخدم Xa X30 DB5-MS 250 ميكرو متر* 25 ميكرو متر من عمود GC وتم الحساب الكمي باستخدام مقياس جلوكوز داخلي من C.13-U كان ude الغسل الإبري عبارة عن البيريدين مع galing من 1 دقيقة من التعادل» و170 درجة digi لمدة 8 دقائق و10 درجة مثوبة/ الدقيقة عند 210 درجة مئوية لمدة 0 دقيقة وبعد ذلك 50 درجة [Ashe الدقيقة عند 325 درجة مئوية لمدة 2 دقيقة (بزمن دورة إجمالية من 16.3 دقيقة). يوضح الشكل رقم 8 نتاشج التحليل على سلالة Parachlorella من النوع البري Lay نواتج 0 طفة التعطيل الجيني بتوهين الجين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (561) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 من 13380--6. وبصورة غير متوقعة فإن طفرة التعطيل الجيني 5611 من NE-13380 قد تمت ملاحظتها بحيث تشتمل على نسبة متزايدة من الكربون العضوي الإجمالي في شكل بروتين 00016(0بالنسبة للنوع غير المعالج والذي يوضح تقريباً 9620 من الزيادة في البروتين protein بالنسبة لكل أساس من إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON بالنسبة لسلالة من النوع
(WT-1185) (snl! يكون لناتج طفرة 1ا56 التي تم توضيحها في المثال رقم 3 تراكم كريون عضوي إجمالي متزايد بالمقارنة مع النوع البري في اختبار شبه متصل والذي يوضح شحم 0 امنخفض مناظر وكربوهيدرات. تم الوصول إلى تركيبات الحمض الأميني من البروتين ci protein طفرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT
GROWTH IMPROVEMENT 1 5 بحيث تكون مشابهة بشكل عالي لتلك الخاصة بالخلايا من النوع البري. وتقوم سلالات طفرة 5611 بالتالي بتوفير وسائل جينية خاصة Baby محتوي البروتين 0من الطحالب ومن الكتلة الحيوية الطحلبية. ويالاعتماد على ظروف المزرعة؛ فيمكن توقع زيادة تصل لحوالي 0 إلى تقريباً 9660 من إنتاجية البروتين 001©0معند تركيب النسبة لامئوية للزيادة من البروتين aqprotein إنتاجية الكتلة الحيوية المتزايدة التي تم توضيحها بواسطة
0 تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 المثال رقم 10 الصور المنتسخة والصور البروتينية من طفيرات 5611 من NE-7843 رو NE- 0 . تم إجراء تحليل الصور المنتسخة على نواتج استخلاص MRNA من النوع البري من سلالات ناتج الطفرة 1ا56 و 15-7843 و NE-13380 المزروعة في اختبار المزارع شبه المتصلة بالضوء الثابت ( اختبار CL-SCPA أو '012000") كما تم وصفه في المثال رقم 3. أظهر التحليل الخاص بنواتج الانتساخ من تطفيرات SGIT وجود عدد كبير من الجينات المنظمة المختلفة بالنسبة للنوع الفرعي. وفي شكل نواتج طفرة 56١1 التي تم توضيحها هنا فإن الكلوروفيل chlorophyll المنخفضة وهوائي التخليق الضوئي المنخفض قد تم أخذهما في دائرة الاهتمام 0 لمعرفة ما إذا كانت جينات البروتين 020160 الرابطة للكلوروفيل التي تم تجميعها (LHC) لها وفرة أقل في نواتج الانتساخ بالنسبة لسلالة سليفة من النوع البري. تم تحديد خسة عشر lia في جينوم 98 وبصورة ملفتة للنظر تم استثناء الجينات المشفرة لبولي ببتيد polypeptide 6 ويبولي ببتيد LHC polypeptide المرتبطة مع مركز تفاعل نظام ضوئي مخفض II (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ وكلها من جينات LHC Parachlorella 5 المعددة والتي توجد بصورة تم تنظيمها بشكل أقل في نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين
الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) بالنسبة لمستويات تعبير gill البري (الشكل رقم 9). og الصورة المتوسطة؛ فإن LHCs mRNAs يوضح حوالي 7 ضعف من النقص في الوفرة في SGI بالمقارنة مع 1-1185//ا. ومن الملاحظات الووضحة الأخرى من بيانات نواتج الانتساخ المذكورة أن روبيسكو أكتيفاز يمكن اكتشافه أنه به تقريباً 6 أضعاف أعلى في وفرة الانتساخ في ناتج الطفرة 5611.
تم إجراء تحليل الصور البروتينية العامة لنواتج طفرة ١-1185 /الاو NE-7843 5 SGI1 المزروعة في اختبار الزراعة شبه المتصلة بالضوء الثابت ( اختبار CL-SCPA أو ('CL2000" كما تم وصفه في المثال رقم 3. تم إجراء تحليل قياس الطيف الكتلي ( Michigan State 0٠١ East Lansing<University Proteomics Core Facility ) لكي يتم تحديد وفرة
0 البروتين dalaliprotein وبصورة متجانسة مع بيانات قياس الانتساخ فإن ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT يوضح وفرة بروتين proteinlHC المنخفضة ووفرة أكتيفاز روبيسكو بالنسبة لخلايا النوع البري. تم إجراء تحليل الصور البروتينية المستهدفة للنوع البري وسلاسل طفرة NE-7843) SGI1 NE-13380 5 ) المزروعة في اختبار الزراعة شبه المتصلة بالضوء الثابت ( اختبار -ا6
5 5008 أو ('CL2000" كما تم وصفه في المثال رقم 3. تم إجراء تحليل البروتين 7 استخدام مراقبة التفاعل المتعددة (MRM) طريقة القياس الكتلي بالمقارنة مع الحساب الكمي المستهدف الذي تم توفيره من البروتينات محل الاهتمام مع خاصية عالي وحساسية باستخدام المقاييس الداخلية الخاصة بكل بروتين 010167محل الاهتمام (انظرء على سبيل المثال؛ Mol. (2006Domon et al. ) ;4552-78:4543Anal Chem. )2006( .Qu et al
Wolf-Yadlin et al (2007) Proc.
Natl. ;1926-5:1921Cell.
Proteomics 20 Mol.
Cell. (2007Stahl-Zeng et al. (;5865-104:5860Acad.
Sci.
USA .(1817-6:1809Proteomics تم استخدام بببتيدات عالية الجودة من PsaD (الوحدة الفرعية PS ١ ) و0908 (الوحدة الفرعية RbCL 5 (PS ١| (وحدة فرعية كبيرة من روبيسكو) لكي يتم الحساب الكمي PSI] |ا5”اوالوفرة في Sung) في النوع غير المعالج من Parachlorella
(WT-1185) 5 وتطفيرات 1ا56 NE-13380 NE-7843) ). أوضحت نتائج تحليل البروتين
CA« La JollacJadeBio ( proteinMRM ) أن نواتج طفرة 1ا56 تتميز Ob بها محتوي 0 إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON متزايد ونسبة من :|[05نظام ضوئي منخفض (PSI) REDUCED PHOTOSYSTEM ١ ا(الشكل رقم 110 و10ب). تم أيضاً ملاحظة محتوي روبيسكو/إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON 5 العالي في تطفيرات 1ا56 بالمقارنة مع النوع الفرعي (الشكل رقم 0 و10ب) lly تقوم بتشكيل تحليل بيروكسيمات دقيق (المثال رقم 6) والذي به Sinn بروتين 0101660 عالي لكل إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC (CARBON وعلى الرغم من أن مقارنة تحليل Westerns لمستويات 55510 (بولي ببتيد PS II polypeptide ( و الوحدة الفرعية الكبيرة من روبيسكو وأكتيفاز روبيسكو قد أوضحت أهه
0 عندما يكون هناك صورة طبيعية بالنسبة للبروتين JleaYlprotein من مستويات PSII و روديسكو قد تمت مقارئنتها مع النوع الفرعي ومع تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIT) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 بالمقارنة مع ناتج الطفرة من 1 الذي به محتوي بروتين 03016(0أعلى/ محتوي إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON بصورة إجمالية (الشكل رقم 10ج و10د).
هناك زبادة في الوفرة الخاصة ببروتين Slacsiprotein روبيسيكو Rubisco Activase (RA) قد تمت ملاحظتها في تحليل كل من نواتج الانتساخ ونواتج البروتين 0001810( الشكل رقم 11أ و11ب). تم التثبت من تلك الملاحظات من خلال تحليل ويسترن الكمي. تختلف الاثنين من الإنزيمات المتماثلة من روبيسيكو (ألفا وبيتا) بصورة أساسية في الأطراف N= منها مع RA- والتي لها طرف N= ممتد بالنسبة ل (RAR يوضح الشكل رقم 11ب تبقيع ويسترن والذي يكون
0 به ايزوزيم ألفا من بروتين 03016(0أكتيفاز روبيسيكو (RA-0) قد تم اكتشافه أنه متزايد بصورة قليلة وأن ايزوزيم بيتا من بروتين 0180 مأكتيفاز (RA-B) أن به زيادة كبيرة في الوفرة والتي تكون تقريباً 2.5 ضعف من مستوي بروتين 00019(0النوع البري ولاذي يتكون من الوفرة المتزايدة من ناتج انتساخ روبيسكو أكتيفاز (RA) RUBISCO ACTIVASE الطفرة كما تم تحديده بواسطة تحليل ناتج الانتساخ.
المثال رقم 11 إنتاجية ناتج الطفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5611) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في الزراعة شبه المتصلة والتي تحاكي ظروف الإشعاع الطبيعي لكي يتم اختبار الانتاجية الخاصة بنواتج الطفرة 5611 في نظام شبه متصل تحت نظام ضوئي والذي يحاكي ظروف ضوء النهار الطبيعية في يوم ربيعي في جنوب كاليفورنيا؛ مع قياس المزارع والذي تم استخدامه لكي يتم تلقيح قوارير مزرعة نسيج مستطيلة سعة 225 سم2 تشتمل كل منها على حجم إجمالي نهائي من 550 ميكرو لتر من المزرعة بعد التلقيح. كان حجم اللقاح النمطي تقرياً هو 200 مل للمزرعة التي تم قياسها والذي تمت إضافته إلى تقريباً 350 مل من وسط المزرعة 119//. تم تخفيف المزارع بصورة يومية وذلك عند منتصف النهار عندما تكون شدة 0 الضوء عند القمة الخاصة بها من خلال إزالة 9665 من الحجم واستبدالها مع نفس الحجم من وسط الاختبار بالإضافة إلى 10مل من الماء منزوع الأيونات لكي يتم تحضيره فيما يتعلق بالتبخير (بما في ذلك وسط التعويض). تم تشغيل الاختبارات شبه المتصلة بصورة نميطة لمدة 14-0 يوماً. تم حساب الشحم 0أم(االيومي وإنتاجيات الكتلة الحيوية فقط Lad يتعلق بالمزارع التي تصل إلى الحالة لاثابتة (حيث يكون هناك زيادة في النمو مساوية لعامل التخفيف الخاص 5 بالاختبار). تم البدء بثلاثة من المزارع لكل سلالة. تم عمل فقاقيع بداخل القوارير المشتملة على قضبان تقليب والتي لها سدادات لها أنابيب مدرجة مرتبطة بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب200 (961 من 200) وذلك خلال المزارع. تم تثبيت القوارير في مغطس Sle تمت برمجته للحفاظ على درجة الحرارة ثابتة عند 25 درجة مئوية على قضبان التقليب Ally تم ضبطها عند 0 575 لفة في الدقيقة أثناء فترة الاختبار. تم تغليف قوارير المزرعة باستخدام بلاستيك أبيض معتم لكي يوفر 31.5 سم2 من الفتح المستطيل لغرض المعالجة الإشعاعية للوصول إلى المزرعة. تمت محاذاة القوارير باستخدام العرض (البعد الأضيق) في مقابل مخزن الضوءٍ LED والذي تمت برمجته لدورة من لاضوء/ الظلام مع مخطط ضوء والذي يتزايد حتى الوصول إلى "شمس الظهيرة” وبعد ذلك يتناقص حتى نهاية فترة الضوء. تم تصميم مخطط الضوءٍ لكي يحاكي يوم ربيعي في 5 جنوب كاليفورنيا. 14 ساعة من الضوء: 10 ساعات من الظلام مع dad ضوء عند تقريبا
0 ميكرو .5 تم عمل فقاقيع بداخل القوارير المشتملة على قضبان تقليب lly لها سدادات لها أنابيب مدرجة مرتبطة بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب200 (961 من 2CO معدل التدفق 300 مل في الدقيقة). تم تثبيت القوارير في مغطس مائي تمت برمجته للحفاظ على درجة الحرارة ثابتة عند 25 درجة مثوية على قضبان التقليب والتي تم ضبطها عند 575 لفة في الدقيقة أثناء فترة الاختبار. تم حساب إنتاجيات الكتلة الحيوية اليومية (إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL (ORGANIC CARBON من المزارع التي وصلت للحالة الثابتة. تم حساب إنتاجيات TOC المترية في (مجم//اللتر/ اليوم) بواسطة ضرب كميات إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON الحجمية بواسطة معدل التخفيف. تم حساب الإنتاجيات 0 المساحية (جم/م2/اليوم) بواسطة تقسيم الإنتاجية الإجمالية للمزرعة على الحجم الخاص بالفتحة والتي يتم السماح للإشعاع بداخلها. g = * ا0.55 _ * هدم (volumetric productivity) 9
L * day 0.00315 m2 1000 mg m2 * يوضح الشكل رقم 12 إنتاجية TOC اليومية المتوسطة الخاصة بمزارع ثلاثيات من ناتج طفرة 3 -لتحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 وسلالة من نوع بري من 1-1185//ا في اختبار يومي شبه متصل الذي تم توضيحه تحت تلك الظروف بحيث يعرض زيادة تصل إلى 9620 في الإنتاجية بالنسبة للنوع البري. 0 المثال رقم 12 إنتاجية مزارع دفعية تحت ظروف زاخرة بالمغذيات تم Lad اختبار الإنتاجية من ناتج تطفير تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (5911) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 على مدى أسويع واحد بينما تتم الزراعة في طريقة دفعية زاخرة بالنيتروجين. تم تلقيح المزارع من 80-1338580 ومن النوع البري من
WT-1185 ب 00730 أولي من 0.5 من المزارع الخاصة بالبذور Al) تمت زيادته) والتي تنمو في وسط مزرعة زاخر بالنيتروجين. وبعد التلقيح فإن المعالجة بسلالة التعطيل الجيني من NE-13380 وسلالة النوع غير المعالج من 1-1185// قد تم إنماؤها في مزارع ثلاثية في اختبار الدفعات في قوارير مزرعة نسيج مستطيلة سعة 75 سم2 التي تشتمل على 175 مل من وسط 01/4119 لمدة سبعة أيام. تم تثبيت القوارير باستخدام aad 'العرض" الأضيق في مقابل مصدر ضوءٍ LED تم تغليف قوارير المزرعة باستخدام بلاستيك أبيض معتم لكي يوفر 21.1 سم2 من الفتح المستطيل لغرض المعالجة الإشعاعية للوصول إلى المزارع. تمت برمجة الإشعاع عند دورة 16 ساعة ضوءٍ : 8 ساعات ظلام مع منحدر خطي من الإشعاع من 0 إلى 1200 ميكرو إينشتاين على مدى 4 ساعات ay 0 أن يتم توقع الإشعاع sad ستة ساعات عند 1200 ميكرو إينشتاين ويعد ذلك يتم خفض المنحدر الخطي في الإشعاع من 1200 إلى صفر ميكرو أينشتاين في دورة مدتها 4 ساعات (متازية أو متناقصة في 15 dads من الفواصل). تمت إضافة 0211 منزوع الأيونات إلى المزارع بشكل يومي لكي يتمس استبدال الفاقد في التبخير. تم تنظيم درجة الحرارة في المزارع بواسطة حمام ماء تم ضبطه عند 25 درجة مئوية. تمت إزالة العينات (5 مل) على أساس يومي لاختبار الكربون 5 العضوي الإجمالي total organic carbon (TOC) كما تم وصفه في المثال رقم 3. تم shal أخذ العينات عند 30 دقيقة قبل نهاية دورة الضوء. يوضح الشكل رقم 13 أن هناك تحت تلك الدفعة ظروف زاخرة بالنيتروجين وناتج طفرة من NE- 0 اأتحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 يتم إجراؤه مع النوع البشري في تراكم الكتلة الحيوية. 0 المثال رقم 13 إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON وقابلية إنتاجية من الشحوم من مزارع دفعية تحت ظروف محدودة من النيتروجين تم أيضاً اختبار تطفير تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 فيما يتعلق بالكتلة الحيوية والتراكم تحت حدود من النيتروجين. تمت زراعة سلالة تم تعطيلها جينياً من 5611 و 105-7843 ومن النوع الفرعي من
0/1-5 في اختبار LLB لإنتاج في وسط زاخر بالنيتروجين؛ أين وسط مزرعة ليس به مصدر نيتروجين خاص بنمو الخلية. تم تلقيح مزارع الإنتاج لكي يتم البدء في 00730 من 0.5 من البذور مع مزارع تمت زيادتها وتم الإنماء في وسط PMOT4 وتم تضمينها في 8.8 مل مولار من النترات. وبعد التلقيح تم إنما سلالة ZnCys للتعطيل الجيني من 1-7843 وسلالة النوع غير المعالج
من 0/1-1185 قد تم إنماؤها في مزارع ثلاثية 175 مل في اختبار الدفعات في قوارير مزرعة نسيج مستطيلة سعة 75 سم2 لمدة سبعة أيام. يوضح الشكل رقم 14] تراكم إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON حجمي من ظروف دفعية زاخرة ب لا. تم توضيح بيانات ثنائية بيولوجية خاصة ب
0 10/1-1185 و NE-13380 حيث أن ناتج الطفرة NE-13380 يتم إجراؤه من سلالة النوع غير المعالج في تراكم الكتلة الحيوية. الشكل رقم 14ب يوضح تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT والتي يتم إجراؤها فيما يتعلق بسلالة من النوع البري الخاصة بتراكم الشحوم (FAME) وتراكم تقريباً عند 0 أكثر من FAME من النوع غير المعالج بالمقارنة مدى من أسبوع من الاختبار.
5 المثال رقم 14 مزارع بها إشعاع عالي. تمت ملاحظة التحسينات على النمو من نواتج طفرة SGI التي تم الكشف عنها هنا في العديد من ظروف الزراعة (الجدول رقم 8). تم الحفاظ على المزارع عند تخفف عالي وفي ظل ظروف ضوءٍ عالي ثابت من خلال نظام التخفيف المتصل والذي يقوم بتقديم وسط مزرعة زاخر بالمادة المغذية البعدية وتفريغ بحجم مساوي من المزرعة. أوضحت نواتج الطفرة من Parachlorella
0 تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 أن هناك من 1620-18 من معدل النمو المتزايد في صورة متوسطة بالنسبة لظروف عالية spall )1400-500 ميكرو إينشتاين) وفي ظروف lo soa بصورة فائقة (5000 ميكرو إينشتاين) من ناتج طفرة SGI والتي تنمو عند تقريبا 5 أضعاف المعدل من ADL سليفة من النوع غير المعالج. يمكن استخدام معدل النمو الكبير تحت ظروف Alle الضوء
لكي يتم اختيار نواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT .GROWTH IMPROVEMENT 1 الجدول 8 معدلات النمو من سلالات Parachlorella فى كثافة منفضة وظروف ضوءٍ Alle 500 1400 5000 500 1400 5000 a السلالة ميكرو ١ ميكرو ميكرو - ١ ميكرو ١ ميكرو ميكرو أينشتاين | أينشتاين | أينشتاين | أينشتاين | أينشتاين ١ أينشتاين ’ ًّ ا ا يز ’ | - ا 20.0 20.0 التحسن و % %18.2 |%431.3 | % 2 |%431.3 أ معدل النمو في قارورة خاصة بالرج مع الزراعة ليومية الفرعية وضوء ثابت عند 500 ميكرو إينشتاين. ب معدل النمو في المزرعة المستمرة والذي يتم الحفاظ عليه عند كثافة منخفضة 0.1=7200D)) ( مع 1400 ميكرو إينشتاين في مفاعل ضوئي حيوي من نوع 1225 (/01-50). ج معدل النمو في المزرعة المستمرة والذي يتم الحفاظ عليه عند كثافة منخفضة ((0.1-72000 ( مع 5000 ميكرو إينشتاين في مفاعل ضوئي حيوي من نوع 51/1150 . 0 د- Parachlorella من النوع البري ه- Parachlorella مع تطفير تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1
و- الزيادة في معدل النمو في ناتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 في مقارنة مع ADL الأصلية من النوع البري. تم تلقيح عدد صغير من WIA ناتج الطفرة NE-13380 SGI في مفاعل ضوئي حيوي مع x 400 5 10 6 من النوع البري من خلايا WT-1185 Parachlorella والذي يمكن أن يتم إنماؤه في مزرعة متصلة في ظروف الكثافة المنخفضة ( 1 10% 6 خلية لكل (do مع son le )1400 ميكرو إينشتاين). وعلى مدى فترة من 60 يوماً من معدلات النمو التي تزيد ببطء؛ وبعد 60 يوممن الزراعة فقد وصل معدل النمو اليومي إلى 2.27. تم وضع المزرعة على طبق من الأجار وذلك لمستعمرات منفردة. تم التقاط المزارع الفردية وتم تحليلها Lad يتعلق بمعدل النمو 0 ومع وجود تطفيرات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT .GROWTH IMPROVEMENT 1 وبصورة يمكن ملاحظتها؛ فإن كل المستنسخات التي تم عزلها من الأطباق الموجودة بداخل تطفير تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا56) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 تقترح أنه من الممكن أن يتم اختيار التطفيرات من نوع SGI خلال استخدام المزرعة متخفضة الكثافة وعالية الضوء والزراعة المتصلة. على سبيل المثال؛ فإن التطفير الكيميائي من UV والتطفير بالإدراج العشوائي أو إجراءات تطفر أخرى يمكن أن يتم إجراؤهاء bg ذلك الكثافة والزراعة المتصلة بكثافة عالية الضوءٍ وذلك لمدة واد أو أثنين أو ثلاثة أو أربعة أو خمسة أو ستة أو سبعة أو ثمانية أسابيع أو أكثر لكي يتم إفراز نواتج طفرة عالية الإنتاجية مثل نواج طفرة من النوع تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 .(SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 0 يوضح الشكل رقم 7 خريطة خاصة بجين SGI مع مواضع خاصة بالتطفيرات التي توجد في العديد من نواتج الطفرة التي تم تعليمها. تم عزل سلالة 16-7843 في وسائل الفصل التي تم الكشف عنها في الأمثلة من 6-1 والسلالة NE=16980 التي تم عزلها باستخدام وسيلة الفصل التي تم الكشف عنها في المثال رقم 7. تم عزل العديد من التطفيرات الغضافية التي لها تطفيرات تم تحديدها في الشكل رقم 7 تحت معدل عالي وتحت اختيار كثافة خاصة بالمزرعة من المثال 5 الحالي.
المثال رقم 15 تحديد واستهداف جين 5611 TETRASELMIS تمت الإشارة إلى الجينوم من ناتج العزل البيئي من الطحالب من النوع البري من أنواع Tetraselmis والتي يطلق عليها هنا بأنها Tetraselmis 1-105 //ا وتم تسلسلها بصورة كاملة في الموضع ols. (USAC 0/80 La Jollac 106.:5/0116116 Genomics) تحليل الجينوم متوافقاً مع sp.
WT-105 etraselmis ثلاثية الصبغة. وبالاعتماد على BLAST التبادلي؛ فإن متوالية بولي ببتيد Parachlorella polypeptide م SGI كمتواية خاصة بالاستفاسر تكون عبارة عن متوالية تتم ترجمتها Las يتعلق بجينوم Tetraselmis 1-105//ا وتم تحديد ثلاثة من الجينات وهي: 1-5172 (المتوالية بهوية رقم 85؛ المشتمل على متوالية مشفرة للبروتين 00 (أو متوالية CDNA ) من المتوالية بهوية رقم 86)» و1-5185 (المتوالية بهوية رقم 87؛ 0 والتي تشتمل على المتوالية المشفرة للبروتين f)protein متوالية (CDNA من المتوالية بهوية رقم 88( 5 1-5230 (لمتوالية بهوية رقم 89) والتي تشتمل على متوالي مشفرة للبروتين s)protein المتوالية CDNA ) من المتوالية بهوية رقم 90) والتي يتم اعتبارها بانها أليلات من جين Tetraselmis WT-105 107 تم تشفير البروتينات بواسطة الأليلات من 1-5185 (المتاولية بهوية رقم 14 و 1-5230 (المتوالية بهوية رقم 16) والتي تكون عالية لاتجانس والتي 5 توضح 1698 من التطابق في متوالية الحمض الاميني بواسطة BLAST إن البروتين 0010 الذي تم تشفيره بواسطة أليل 1-5172 (المتوالية بهوية رقم 15) يكون به 9690 من التطابق مع البروتين 02016(0المشفر لأليل 1-5230 (المتوالية بهوية رقم 16) و92 96 من التطابق مع البروتين 0018(0المشفر للأليل 1-5185 (المتوالية بهوية رقم 14) بواسطة تحليل BLAST تم تحديد كل أليل بحيث يشتمل على نطاق مستقبل استجابة (RR) RESPONSE RECEIVER 0 ونطاق myb (انظر الجدلو رقم 3). وتم أيضاً في الجدول رقم 3 توفير بولي ببتيد polypeptide أليلي من SGI1 Tetraselmis من 1-5172 و1-5185 و1-5230 و الذي يوجد dig درجات تكون على الأقل 400 وبصورة محددة 403.0 dad) ©-من 6-118(2؛ و403.6 dai) -6 من 6-119(9 و402.9 (قيمة ce 6-1183 )على الترتيب في مقابل HMM تم تطويره فيما يتعلق بتعريف البولي ببتيد ipolypeptide تحسين نمو pS مشغر
للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (5611) (المثال رقم 6( ولكي يتم إنشاء سلالة تمت معالجتها بشكل جيني من (SGI Tetraselmis فإن معقد رببو نيوكليوتبروتين 0101600859 (RNP) قد تم تضمينه في وسيلة توجيهية CRISPR-Cas9 من حمض 5958( رببوزي CRISPR-Cas9 5 crRNA)) RIBONUCLEIC ACID (RNA) من تتبع (rRNA) RNA المعقد مع بروتين proteinCas9 والذي تم إدخاله في خلايا طحلبية من Tetraselmis بواسطة تفجير الجسيم المحدد. كانت هناك مجموعة للترقيم قابلة للقياس لكي تم اختيار نواتج الطفرة والتي تم إدخالها بطول RNP 0859 على الجسيمات الدقيقة من الذهب. تم استخدام وسيلة التتبع SIRNA يتم تحضير 4105| من تحويل Tetraselmis والتي تم تعديلها 0 من نيوكليوتيد معدل بشكل كيميائي 67 من Alt-R® CRISPR~-Cas9 tracrRNA والذي تم إعطاؤه من USA |AcCoralville ( IDT ). تم استخدام crRNAS في تحويلات RNP وتم تعديلها بصورة كيميائية عند lls Alt-R® CRISPR-Cas9 crRNAS تم شراؤها من IDT Ally (USA IAcCoralville) تم تضمينها في 20 نيوكليوتيد من المتوالية المستهدفة (من 1 المتوالية بهوية رمق 91 أو 62ل؛ المتوالية بهوية رقم 92 الموجودةف يالأكسون الرابع من 5 كل ثلاثة من الأليلات من جين تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 (انظر؛ الشكل رقم 15). يشتمل crRNAS أيضاً على 16 متوالية نيوكليوتيد متممة بالنسبة للمتوالية من racrRNA وقبل أن يتم تشكيل معقدات RNP فإن crRNAs و fracrRNA تتم حضانتها بصورة قبلية لكي يتم السماح ل CrRNAS بأن يتم تهجينها مع .tracrRNA تم sale) تعليق كل RNA عند تركيز 0 من 100 ميكرو مولار من كميات مساوية من rRNA و FACrRNA RNA وتم دمجه في أنابيب منفصلة في 20 ميكرو مولار من الأجزاء المساوية بحيث أن كل من RNA يكون له تركيز من 50 ميكرو مولار في لك خليط تلدين؛ باستثناء أنه عندما يكون هناك اثنين من 00085 تم استخدامهما في تجربة منفردة فإن كل من 008 يكون لهتركيز من 25 ميكرو موال رمن خليط التلدين. تم تسخين RNAS المدمج عند 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق وبعد ذلك تم السماح له Ob
يبرد أعلى المنضدة. تم تخزين RNAS من جهاز CRISPR ووسيلة لاتتبع بصورة فوريدة وذلك عند -20 مثوية). تم تحضير خليط من tracrRNAS 5 CRISPR (10 ميكرو لتر من خليط التلدين) مع بروتين 9 في محلول ملحي منظم من الفوسفات (PBS) حيث أن التركيزالنهائي من بروتين 00016000859 كان هو 100 ميكرو جرام/ل وكان التركيز النهائي من RNAs هو 10
ميكرو مولار. تمت حضانة برويتن (crRNA(S المتلدن و rRNA 0859 في مدة 15 دققة عند درجة حرارة الغرفة لكي يتم تشكيل RNPs ولكي يتم تحضير الجسيمات الدقيقة من الذهب فقد تمت إضافة البروتامين (100 ميكرو لتر من 1 مجم/المللي من المحلول في PBS قد تم تحضيره من خلال التسخين عند 55 درجة مئوية
0 وحتى 65 درجة مثوية وتم التبريد إلى درجة حرارة الغرفة قبل الاستخدام) إلى 5 مجم من جسيمات الذهب )0.6 ميكرو (BioRad (Joa وتم تدويم خليط من جسيمات الذهب/ البروتامين ويعد ذلك تمت المعالجة الصوتية. ويعد أصبحت شظية الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) (لمتوالية بهوية رقم 93) والتي تم تضمينها مشتملة على جين قابل للترقيم مرتبط بصورة فعالة مع معزز 4840 Tetraselmis (المتوالية
5 بهوية رقم 94( ووسيلة إنهاء Tetraselmis RB40 (المتوالية بهوية رقم 95) مع معلق من البروتامين/ الذهب وتم جعل الخليط في صورة دوامية. كان كانت شظية DNA من المرقم القابل للاختيار هي منتج POR والذي يشتمل على كودوج جين مقاوم لنورسيوثيريسين من الكودون الذي تم تحسينه Lad يتلعق ب Tetraselmis (المتوالية بهوية رقم 96) والذي يتم ريطه مع معزز RB40 ووسيلة الإنهاء. كانت هناك 5 من النيوكليوتيدات المشهروة من كل بادئ (البادئ من
0 1//0818168 المتوالية بهوية رقم 97 والبادئ 1/0/1819 المتوالية بهوية رقم 98( والمستخدم لغنتاج كاسيت مرقم قابل للانتقاء بواسطة PCR يستخدم نصورة أصلية من البالزميد تشتمل على مجموعات فوسفوثيوات؛ مثل تلك التي لها شظية مجموعة كاسيت ALE للانقتاء والتي تم استدخامها في التحويلات والتي تكون Sle عن فوسفوثويات معدل على كل طرف. إن مستحضر Cas9 RNP (من البروتين siliprotein تم تلدينه (RNAs /Cas9 قد تمت
5 إضافته إلى جسيمات من الذهب بالإضافة إلى المرقم من شظية الحمض النووي الرببوزي منقوص
الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) في محلول بروتامين وبصورة مباشر بعد إضافة شظية DNA لمرقم قابل لالئتقاء مع جسيمات الذهب وتم تدويم الخليط ويعد ذلك تم وضعه على الثلج لمدة 4-2 ساعات. ويعد الحضانة على الثلج؛ فإن مستحضرات الجسيمات في حجم النانو من الذهب قد تم تدويرها بصورة مختصرة على وسيلة طرد مركزي وتم إزالة المادة الطافية وتمت غضافة 400 ميكرو لتر من 1.5 مجم/ مل من 1/0 في 085 لكل عينة من
الجسيمت الدقيق. تم لف العينات بصورة دوامية وتم تعرضها للموجات لاصوتية ملدة 10-5 ثواني ويعد ذلك تم التدوير مرة ثانية بعد أن يتم سحب جسيمات التعليق من PVP في جزءِ مجفف بشكل مسبق من Tefzel™ tubing بواسطة ربط المحقنة مع أنبوب مرن والذي يتم تركيزه مع أنبوب ™MTefzel وبتم سحبه من خليط الجسيم بداخل الطرف الماقبل من أنابيب MTefzel بواسطة
0 استخدام السحب من خلال المحقنة. إن أنابيب MTefzel التي تم تضمينها فى مستحضر جسيمات الذهب قد تم ضبطها عند 5 دقائق لكي يتم السماح لجسيمات الذهب بأن تستقر بعد أن يتم دفع محلول PVP إلى الخارج من الأنبوب من خلال المحقنة. تم تدوير الأنابيب بعد ذلك لكي يتم توزيع جسيمات الذهب على محيط داخلي من الأنابيب وتم السماح للهواء الجاف بأن يصل لحوالي 5 دقئاق (وأثناء تلك المدة فإن الأنابيب يتم تدويرها مرة واحدة أو اكثر من المرات الإضافية
5 لكي يتم توزيع الجسيمات) وبعد تلك المدة فإن أنابيب MTefzel يتم رطبها مع مصدر غاز النيتروجين وتم السماح لغاز النيتروجين بأن يتدفق خلال الأنابيب عند 0.1 لتر لكل دقيقة لمدة دقيقة واحدة ويعد ذلك عند حوالى 0.3 إلى حوالى 0.4 لتر لكل دقيقة لمدة 10-5 دقائق حتى اكتمال التجفف. تم تغليف أنابيب ™Tefzel على السطح الداخلي باستخدام جسيمات الذهب والذي تم بها التصاق الجسيمات مع الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين
DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) 0 من المرقم ذي الصلة 5 RNPs الذي يلتصق مع gall المقطوع في أجزاء من 0.5 بوصة والتي يت استخداماه في شكل خرطوشة في مسدس الجينات من نوع .BioRad Helios® Gene Gun Lady يتعلق بالتحويل عن طريق التفجير الدقيق فإن سلالة Tetraselmis 1-105 //ا قد تمت زراعتها لمدة ثلاثة أيام تقريباً في حجم من 100 مل من وسط مزرعة 01/074 والذي تم تلقيحه ب
5 00730 من 0.2.ى؛ تم تلقيح مزرعة البدء لكي يتم تلقيح مزرعة بها 1 لتر عند 3 x 510
خلية/ المللي؛ وواحد لتر من الزراعة التي تم السماح لها بأن تنمو لمدة 3 أيام. تم إعادة تعليق الخلايا عند تركيز من 10 8 خلية لكل مل مع تقريبا 10 7 خلية ( 100 ميكرو لتر) من الطبق بداخل دائرة قطرية عند 4 سم على 962 من أطباق وسط آجار 01/074 لكل عملية تفجير. تم السماح للخلايا التي تم وضعها في الطبق بأن تجف في الغطاء وتم بعد ذلك تفجيرها باستخدام خراطيش مجهزة من مسافة تصل لحوالي 5 سم باستخدام الهليوم عند 600 dh) على البوصة المريعة. وفي اليوم التالي فإن GUI) يتم نضحها باستخدام وسط ing PM147 إعادة وضعها على أطباق التي تشتمل على نورسيثرسين 200 ميكرو جرام/مل. وبعد 14-10 يوماً من النمو على أطباق مختارة ف> تم إعادة وضع حزم من المستعمرات على أطباق 01/147 انتقائية واتي تشتل على 200 ميكرو جرام/مل من نوروسيثرسيثين. تم فحص 0 الأطباق الباقية على قيد الحياة من POR لغرض وجود تطفيرات في موضع تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (1ا56). تم اكتشاف أن كاسيت الجين المرقم القابل للاختيار (المتوالية بهوية رقم 93 ) لم يتم إدراجه في موضع إتلاف Cas9 من خلايا Tetraselmis المحولة وبالتالي فإن تطفيرات مستهدفة من 1 تكون عبارة عن إدراجات صغيرة للغاية أو حذوفات (أجزاء محذوفة) عند موضع مستهدف 5 .من .56١11 تم توليد PCR Lad من المستنسخات من Sanger التي تم تتاليها لكي يتم اكتشاف حالات التطفير. تم اكتشاف العديد من الأجزاء المحولة والتي لها تطير عند موضع مستهدف. وقد تم اختيار عشرة من تلك الأجزاء لكي يتم استنساخ الحمض النووي (Ghoul منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) الجينمي في متوالية E. coli بالنسبة للمتوالية لكل أليل. تم تحديد كل المستنسخات في الجدول رقم 8 بواسطة عمل المتوالية بحيث يكون عبارة عن 0 وسائل معالجة بالتعطيل الجيني الثلاثي (gl) أنها تكون متجانسة الزيجوت بالنسبة للتطفير) ما استثناء أن النسيلة 8 كانت متغايرة الزيجوت بالنسبة للأليل ناتج الطفرة. الجدول 9 أليلات ناتج طفرة في مستنسخات Tetraselmis معزولة بعد تحويل RNP باستخدام RNAS توجيهي مستهدف من SGI
عدد هوية السلالة وسيلة (وسائل) نوع التطفير النسائل التوجيه المستخدمة في التحويل om ل ا د MA1+JC2 oy 7 زوج قاعدة من الإدراج reset] wee] wren) wee |e Teme oy و MA1+JC2 Se 5 زوج قاعدة من الإدراج المثال رقم 16 المعالجة الضوئية الفسيولوجية الخاصة بنواتج طفرة TETRASELMIS 5611 المستهدفة ولكي يتم توضيح خصائص تلك النسائل فقد تم عرض (ued من عشرة من تلك النسائل في الجدول رقم 8 (النسيلة 2« 6 و7 و8 و10) وتمت زراعتها بطرية التغذية الذاتية تحت ظروف بها ضوء منخفض لمدة 24 ساعة/ اليوم (40 1 مول من الفوتون م-2-ثائية -1 ( في وسط مزرعة
زاخر ب 70/074 والذي لا يشتمل على مصدر كريون منخفض وبتم تضمين نترات في شكل مصدر نيتروجين. تم تخفيف المزارع بصورة يومية للحصول على عدد خلايا ثابت. تم استخلاص الكلوروفيل chlorophyll وتم إجراء قياسيات 14C Pmax FIRe كما تم وصفه في المثال رقم 7. تم توضيح النتائج في الشكل رقم 16أ» ب» وج؛ والشكل رقم 117 ب»؛ وجج ود والشكل رقم eg 118 5 وج. في الظروف التي يكون بها ضوء منخفض» فإن نسبة الكلوروفيل أب تتم زيادتها بالنسبة للسلالة من النوع غير المعالج لكل نواتج الطفرة (الشكل رقم 16ج) مع النسائل من 02 7 و10 التي توضح تقليل في الكلوروفيل chlorophyll الإجمالي وبصورة خاصة في الكلوروفيل ب على أساس كل من إنتاجية كريون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON (الشكل رقم 116( وكل خلية (الشكل رقم 16ب). إن كل النسائل قد أوضح نقصاً في حجم مقطعي
0 عرضي من نظام ضوئي مخفض II (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ عند كل من 0 و520 نان ومت من الإثارة مع النسائل 2؛ 7 و10 التي توضح نقصاً في الحجم المقطعي العرضي بالنسبة للنوع البري (الشكل رقم 117 و17ب). أوضحت النسائل من 2؛ 7 و10 Lad وجود مقاومة كبيرة في Fv/Fm (الشكل رقم 17ج) بينما تقوم كل النسائل بتوضيح مترات تحويل ضوئية تخليقية منخفضة من نظام ضوئي مخفض Il (PSII) REDUCED
0110105751814١١ 5 (الشكل رقم 17د). تمت زيادة Pmax 146 لكل النسائل على أساس كل خلية وعلى اساس كل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON (الشكل رقم 118 والشكل رقم 18ب) وكل النسائل كان لها معدلات نمو أعلى (الشكل رقم 18ج). وقد تم إعطاء المتنسخات من 2 و7 أسماء السلالات (STR24096 5 STR24094 على
0 الترتيب؛ ويعد ذلك تم الاختبار في اختبار شبه متصل والذي تم استخدامه في برنامج ضوئي يومي مع فترة 14 ساعة ضوءٍ وتم الحث عند كثافة ضوئية في يوم ربيعي والذي تمت محاكاته مع الكثافة الضوئية في يوم ربيعي في جنوب كاليفورنيا عند قمة كثافة تصل لحوالي 2000 مول فوتون م-2 ثانية -1 عند شمس الظهيرة. تم استخدام ثلاث من نواتج الانتساخ البيولوجية من كل سلالة وتم جعل النتائج متوسطة من الثلاثة مزارع. تم لف زجاجات المزرعة بصورة جزئية في
5 رقاقة معدنية كي تيم تعكس الضوء الذي لم يتم امتصاصه بصورة أولية بداخل المزرعة. كانت
وسط الزراعة هو 53 1 PM والذي يشتمل على يوريا في شكل مصدر نيتروجين ولا يشتمل على مصدر كريون منخفض (أي سلالات تمت زراعتها من خلال التغذية الذاتية) ويتم تخفيف المزارع مرة ثانية إلى 91660 يومياً. وكما تم تلخيصه في الجدول رقم 10؛ وتحت تلك الظروف فإن سلالات ناتج الطفرة من 1ا56 3 STR24096 5 STR24094 يكون لها FV/Fm متزايد وحجم هوائي متناقص نظام ضوئي مخفض || Il (PSII) REDUCED PHOTOSYSTEM (تم قياسه مع 520 نانو jie من الاستثارة) و|ا05 متزايد لكل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON يتم تقليل الكلوروفيل chlorophyll في شكل نسبة مئثوية من TOC في نواتج طفرة Tetraselmis 5611 وتزايدت نسبة الكلوروفيل أ إلى الكلوروفيل ب. كان معدل التخليق الضوئي والذي تم قياسه في شكل 140 الذي تم تضمينه قد 0 تمت زيادته من حوالي 15 إلى 9620 في التطفيرات المذكورة. تم تجسيل الإنتاجية بالجرام من إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON الذي تم إنتاجه لكل متر في اليوم وتمت الزيادة عند حوالي 6.5 96 في 5724094 و كانت تقريباً 9610 في 6 . الجدول 10 المعالجة الفسيولوجية الضوئية لنواتج طفرة تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT 1 5 (5611) في مزارع يومية شبه متصلة السلالة | FIRe الكلوروفيل 14C الإنتاج i | Pmax chlorophyll PSI/TO| +©١05ا١ Fv/F 0/10 01 انانو جم-2 a:b Cc Cc a m مول اليوم - 14C/u 1 (ms / 9 TOC/ h
WT- | 0.621 | 148 ]5.0 +17 8 ا2.0 25.66 ]15.5 CT STR2 | 0.683 | 108 |3.6 |20 4 |2.8 ]30.8 16.5 4094 +%10 |= - +%17.64 |— +9640 | +20.3 | +6.4 27 | 28 %17.9 % %5 % % STR2 |0.677 )4.3117 |21 6 |2.5 29.7 ]17.1 40% +9.0 |- - +%23.5 |-%2.5 | +%25 | +%16 | +.10 % 21 ]14 %3 % % المثال رقم 17 إنتاجية نواتج طفرة 56١1 TETRASELMIS في نظام مزرعة شبه متصل بضوء ثابت في CL-SCUBA (اختبار يعتمد على اليوريا شبه متصل في ضوء ثابت)؛ تم إنماء مزارع تغذية ذاتية من نواتج طفرة Tetraselmis 5611 لمدة عدة all في وضع شبه متصل وضوء ثابت باستخدام عينات الزراعة التي تم حذها عند نفس الزمن كل يوم Lad يتعلق بتحديد الكتلة الحيوية. تمت برمجنة الضوءٍ بحيث يكون عند 2000 ميكرو مول من الفوتونات م-2 ثانية -1. في هذا الاختبار فقد تم تلقيح 420 مل من وسط المزرعة 01/1153 (والذي يشتمل على اليوريا في شكل مصدر نيتروجين) في قارورة مربعة 500 مل والتي تم تلقيحها باستخدام مزارع البذور من سلالة معينة. تم البدء بثلاثة من المزارع لكل سلالة. تم ربط القوارير المشتملة على قضبان تقليب والتي 0 .لها سدادات لها أنابيب بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب المثال رقم 2 (961 من 2 (CO والذي تم بداخله عمل فقاقيع خلال المزارع. تمت محاذاة الفقاقيع باستخدام فتحة من 0.0875 م2 نحو الضوء و بُعد خاص "بالعمق” من القوارير؛ مما يزيد مرة ثانية من مصدر coal والذي كان 8سم. تم تخفيف المزارع بشكل يومي بواسطة إزالة 9640 من حجم المزرعة وتم استبدالها باستخدام وسط مزرعة 01/4153 التي تم تخفيفها لكي يتم الضبط فيما يتعلق بالزيادة
في الملوحة نتيجة التبخير الذي يحدث في المزارع. تم أخذا العينات لغرض تحليل TOC من المزرعة التي تمت إزالتها لغرض التخفيف بعد أن وصلة الزراعة للحالة الثابتة. يوضح الشكل رقم 19 الحالة تحت تلك الظروف من الزراعة شبه المتصلة في الضوء الثابت؛ حيث توضح تطفيرات STR24096 5 Tetraselmis SGI و 51424096 وجود 97613 و9618 من الزيادة في الكتلة الحيوية على الترتيب بالنسبة لخلايا من النوع البري ADL)
6 الست المثال رقم 18 إنتاجية نواتج طفرة TETRASELMIS ونواتج طفرة PARACHLORELLA 1 في نظام مزرعة شبه متصل من DIEL . في /8لا50 من diel (اختبار يعتمد على اليوريا شبه المتصل) فإن المزارع ذاتية التغذية من
0 نواتج الطفرة يتم إنماؤها لمدة عدة أيام في وضع شبه متصل من دورة الضوء اليومية. تمت برمجة الضوء لكي يحاكي يوم ربيعي متوسط في منطقة Imperial Valley من كاليفورنيا والذي يتوسط فيه الظلام إلى 2000 ميكرو مول من الفوتونات م-2 ثانية -1 عند الظهر. تم أخذ العينات عند 'الغسق" كل يوم. في هذا الاختبار فقد تم تلقيح 420 مل من وسط المزرعة PM153 المعتمد على اليوريا في قارورة مريعة 500 سم2 باستخدام مزارع البذور من سلالة ناتج طفرة معينة. تم
5 البدء بثلاثة من المزارع لكل سلالة. تم ربط القوارير المشتملة على قضبان تقليب والتي لها سدادات لها أنابيب بمرشحات على شكل محاقن لتوصيل الهواء المخصب ب المثال رقم 2 (961 من CO 2( والذي تم بداخله عمل فقاقيع خلال المزارع. تمت محاذاة القوارير باستخدام فتحة نحو الضوءٍ من 0.0875 م2 و بُعد خاص "بالعمق" من القوارير؛ مما يزيد مرة ثانية من مصدر الضوء؛ والذي كان 8سم. تم تخفيف المزارع بشكل يومي بواسطة All) 9640 من حجم المزرعة وتم
0 استبدالها باستخدام وسط مزرعة 01/153 التي تم تخفيفها لكي يتم الضبط Lad يتعلق بالزيادة في الملوحة نتيجة التبخير الذي يحدث في المزارع. تمت إزالة عينات المزرعة بشكل يومي لتحديد الكتلة الحيوية بعد أن وصلت المزارع إلى الحالة الثابتة. تم أخذا العينات لغرض تحليل إنتاجية كربون عضوي إجمالي (TOC) TOTAL ORGANIC CARBON من المزرعة التي تمت إزالتها لغرض التخفيف.
يوضح الشكل رقم 120 أنه وتحت تلك cg hall فإن نواتج طفرة SGI Tetraselmis قد أوضحت أنه هناك زبادة ما بين 9612 و9616 من الكتلة الحيوية بالنسبة لخلايا من النوع غير المعالج. وبصورة موازية؛ يتم sha اختبار SCUBA في الدورة اليومية طبقاً لنفس البروتوكول وتم اختبار ناتج الطفرة من NE-7843 Parachlorella 561100101801 في مزارع ثلاثية مع مزرعة ثلاثية من سلالة من النوع البري من Parachlorella من 1-1185//ا. يوضح الشكل رقم 20ب أنه وتحت نظام الزراعة المذكور فإن ناتج طفرة 561 Parachlorella و 815-7843 قد أوضح أن هنا زيادة 9018 في الإنتاجية بالنسبة للسلالة من النوع غير المعالج.
ARABIDOPSIS SGI1 sla المثال رقم 19 تحليل 0 ولكي يتم تحديد تاثيرات تطفير 1ا56 في النباتات العلياء فقد قمنا أولاً بتحديد السلالات القريبة منها من جين Parachlorella 5611 في thaliana 1801000515. وياستخدام تحليل المعلومات الحيوية التي تم الكشف عناه في المثال رقم 6 فقد كانت الصورة المشابهة الأقر من A. thaliana ل Parachlorella تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 SIGNIFICANT (561) GROWTH IMPROVEMENT 1 هي ARR2 (المتوالية بهوية رقم 22). 5 تم الحصول على البذور من نباتات A. thaliana مع تطفيرات في ARR] و ARR2 وايضاً عينة المقارنة من النوع ll من مركز مصدر Arabidopsis (88140). تمت زراعة البذور في الترية (90650 من البذور من MiracleGro المخصبة مع خليط البدء في في الترب؛ و9625 من البيرليت و9625 من الفيرميكيوليت). تمت معالجة البذور dese dell عند 4 درجة Logie لمدة خمسة أيام قبل النقل إلى كونفيريون لغرض النمو. تم إنماء النباتت جنباً إلى جنب في أربعة 0 ظروف مختلفة في وعاء كونفيرون والذي تم ضبطه عند 25 درجة مثئوية. استقبلت النباتات حوالي 70 ميكرو لتر إنشتاني من الضوء مع فترة 12 ساعة ظلام. كان نمو ناتج طفرة 814141 أبطأ إلى حد كبير من كل من النوع البري والنباتات 842 Lady وبالتالي تلك التي تم تثبيتها على المقارنة بين النوع غير المعالج ونباتات ناتج الطفرة 8142/5611 (التي يطلق عليها هنا نباتات تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH
IMPROVEMENT 1 ). وأثناء اثنين من تجارب gall الأولية فقد لاحظنا تحسناً بصرياً في sail الخاص بنباتات ناتجة الطفرة (الشكل رقم 21أ). كان لنواتج Parachlorella sh 5611 كلوروفيل chlorophyll منخفض وبالتالي تم تحديد محتوي الكلوروفيل في النوع البري من 25 وأوراق 1ا56. تم استخلاص الكلوروفيل باستخدام كل من الأسيتون والميثانول من ثلاثة من الأنواع البرية ونباتات ناتجة الطفرة من ARR2 (اثنين من الأورام من كل نبات). وقد لاحظنا اختزال كبير فى كمية الكلوروفيل chlorophyll فى نباتات متطفرة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 1 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH IMPROVEMENT (الشكل رقم 21ب). في اثنين من التجارب الخاصة بالنمو الأخيرة؛ فقد قمنا بجمع النباتات عند اليوم 23 وعند اليوم 18 لكي يتم تحديد J لأوزان ارطبة والأوزان الجافة لبراعم النبات . وعلى الرغم 0 .من أننا لاحظنا وجو تنوع بير بن النباتات الفردة وتراكب عالي بين انوع غير المعالج والنباتات 1 فإن النباتات 5611 تكون متوافقة ويها متوسط Je من أوازن البراعم من حوالي 9610 عند اليوم 23 (الشكل رقم 122 وب) وخحوالي 9640 عند اليوم 18 (الشكل رقم 22ج ود). وكما تم الوصلو إليه في الطحالب الخضراء (من نوع Parachlorella و (Tetraselmis وباستخدام تطفيرات 1ا565؛ فقد لاحظنا وجود كلوروفيل Chlorophyll منخفض وزبادة فى متوسط الكمية 5 الحيوية أثناء النمو في تطفير A. thaliana 1ا56؛ مما يوضح أن تطفيرات SGI يمكنها أن ترتبط مع إنتاجية متزايدة في النباتات الأعلى الأخرى أيضاً. leg الرغم من أن الاختراع قد تم وصفه مع الإشارة إلى الأمثلة السابقة؛ فيجب أن يتم فهم أنه يمكن أن يضم تعديلات وصور متغيرة بداخل فحوى ومجال الاختراع. ونتيجة ذلك؛ فإن الاختراع الحالى يتحدد فقط من خلال عناصر الحماية التالية. 0 قائمة المتواليات <110 >مؤسسة سيتتيثيك جيونوميكس. MOELLERING, Eric R. BAUMANN, Nicholas RADAKOVITS, Randor R.
SPREAFICO, Roberto
KUZMINOV, Fedor
AJJAWI, Imad
IMAM, Saheed
SCHULTZ, Andrew 5
KWOK, Kathleen
AQUI, Moena
NOMINATI, Jennifer
VERRUTO,John
BAILEY, Shaun 10 <120>نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُخْفّض <130> SGI2080-1WO 62/441.002 >البراءة الأمريكية 1 50< 2016-12-30>151< 15 <160> 98 <170> Patentln version 3.5 <210> 1 <211> 4531
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221>سمة ميسك 5 <223>جين 1 >400< 1 atgtctggtt cagctggatc gggccaggcet actctcagac atgacggtgg ctctgetgge 60 ggcagtgggc ctgtctcaga cggtttttca ccggccggec tgaaggtaaa gtagaaagac 120 10 actcatacac atcttggttc ggcgttgaaa gtaggtcatt aacatactct ataaccaata 180 tttgtaggtt ctggtcgtgg acgacgacct catgtgcctt aaggtggtgt cagccatgtt 240 gaagaggtgc agctatcaag gtgaggtctt tactggtgtc tgttattgct gtaacatcat 300 ttcgctgttg cacaatttaa acatttgtaa tttactgttg ttattgcagt ggccactigt 360 agcagtggca gcgaggcact gacacttcta cgtgaacgca acgaggacgg atcctccgac 5 420 cagttcgacc tcgtactgtc agatgtttac atgccgggta tgtcgtattc cttgtaaac 480 tttacaatat gcgtctagtt tgacgcgtac actttgtaca ctttgcaaaa acgcaccctg 540 cgaggtctgc catttggtca ctacaacttg geccaccttgg ttgcaagttt gcaagttcge 600 tctacgtcaa cgctgcaaaa tgaaccaatt gttttgcact gaccctgcca accttcattt 660 20 gtggctgcag acatggacgg tttcaagctg cttgaacaca tcggtctaga gttggagctt 720 cccgttatca gtaagttgat cgagccgagt ccagagcgaa gcectgcttct atactattag 780 cagctgtctt ttgatatttg acagcttgac ttgatatggt cacagagcat acttgcaacc 840 aggttacctg ttgaactagc aactgtgccc aagcatctct tcaagcacct ccgtcagtcc 900 5 atagggtact gttgatttgt actctgcaat actgcactgt aatgcgctgt gaatcactgc 960 ccttcacctc tagatggtgce ttccctggag 001-6006083 cctececgecte aageccctca 1020 catgcctctc 606602102 agtgatgtca tccaacgggg acacgaatgt cgtgetgegg 1080 10 ggggtcaccc acggggctgt ggactttctg atcaagcccg ttcgaattga ggagctgcgg 1140 aacgtgtggc agcacgtggt gcgtcgtcgt tccatggege tggccaggac gccagacgag 1200 gggggacact cggacgagga ctctcaggtg cccttggcag cttctgggeg gettgetgtg 5 1260 tcggatgcca cttggactgg ggatgcacga 90999109999 gacaatggga gatgggccat 1320 agtaggccag agttgatggc agtggtggtg ggggggagta ggcgggagag aagcagccat 1380 20 cctggtgttg gttttgatga ttgagtgcat ggggatgatg cacaggtgag ctgactggat 1440 gccttgtctt getgtgetge getgcagegg cacagtgtga aacgcaagga 19 1500 agcccgctge agctcagcac agagcagggc gggaacaaga agccaagagt ggtgtggtcg 1560 gtggagatgc accaacaggt gtgcttgcgg gcgggtgtat acgggggagg ggggcecaget 5
1620 gctggctgac ctggcgtgeg cggtgcattg cacttggcga tgaggggegt gettcagtat 1680 gtagctggga cgcaattggt tgtgctgtgt gaccagtgca caaaatacat ccctgaattc
1740 10 cagtgggttg aacagagttg tcctggaggt gggaagcaaa cgcgcacgtg gtagagggga 1800 gcagggtgca gaacagccgc agcaggggtg ttgcgcagtg tgcaggtatc ctgcctccat 1860 gccecgggec atgggceatac tacgetggta ccgtcaggat gggegttgag cetggettgg 5 1920 ggggcagggg gcgagcgaat 9099381999 agcggeaggt gctgggaggg tggetgactg 1980 gcttgcagga gcgcaagtcc tgtcgggggce gtcgtcctgt tcccteectge cegcettcace
2040 20 cacgttcact ctcatgcctc cacactcctg ctgctgacac acctgtcgec acctcegcetg 2100 cagtttgtga acgcggtcaa 160210992 attgacaagg cggtgcccaa gcggattctg 2160 gacctgatga acgtggaggg gctgacgcgc gagaacgtgg ccagccatct gcaggtgcct 2220 gccatgaccc ctcccaccag ggacctggtg ttttgacacc ctggaactcc tetttgacgg 5
2280 agcctccagt tcaattccag caatcgaatt gaatcaaaaa gcatgtgcac ccacgtgctg 2340 tttgaatgtc ccatgtggta ggaaacacaa ctgccccctt gecatttget ggagggtgee
2400 10 cgctgcgceca tgccecgagtg cgcetgtgetec agegttgtge tgecgecccece getgactgaa 2460 gctgacagceg tgcggcetgag gagggtacty 9999899999 ggtgggagge ggccgetgge 2520 ggcggaaggg agggtgtgca cgcatggaca cagggccttt ccgeccctgeca cggectctac 5 2580 tgcaccctgc cacgtgatgt atcgacatgg tgggccatgce tgtgctgtge cgctgcagaa 2640 gtaccgcctg tacctgaagc gggtggaggg agtgcaatcg ggtgcggcag cctccaagca
2700 20 gcaccagcac ccgcagtatc accagcagca gcagcagcag caagcgcaac ctcgtgcage 2760 tgtctccect gecagceagctt cetttggtge ccetttecttg ggageccege agcaggcegcea 2820 gcagggcatg ccgcagctgg ggatgcctgt gcaggtgaag actgccccce 060001666 2880 cctttccatc ttccectccat cagectgcetg ttecttacce ttgtcaacce gtctetectt 2940 5 tttcgcaagc agcgcaccac cccccatgca cgcecttgect ggcactgttg tcagctgecce 3000 ccctagaaat acacaaggtg tgggtgcaac tggtgggacc 0016060606 cceceectggg 3060 gctgcagggt ctcectccaa acttggcage catgggatce cagecgecge acatccectt 10 3120 ccagcaggcc ctggccatgc aggcggecggce tgecggegget gcagecageg gegegcetecce 3180 cgggagtctg cccecctaca tgccacccee ggggatgatg ccccecggea tgecgggggg
3240 15 ggtccceggt atgggagggg tggtggggcea tecctcaggta cgggcagcac atgagtggge 3300 aggggtattg gagaggggaa gggcagggag gttgcatgtg aggggctgca tggcaaagag 3360 gctgcagege aggtgttget tgcagcactt cccetecggtg gegettgeat caaattttga 3420 20 2160160666 gatgggeacg 009191919 9999999919 ggatggggga 199999199 3480 tttgtggcat gtcgggegct 1121-1266 cgggeccctg ceectgectg tacgegtgeg 00 catgtgtgca gatgcccgcc ccagggatgg actttgcggg tttcaacggg tatggcaacg 3600 ctgcgggggg gctgatgttt ggcgggcage agcaggecgca gcacgcgcag cagcacgcegt 3660 5 cagcgcaagc gggctcgcetg gcgcagcage aggcgcagca agtatccatg ggettgggec 3720 ttatgccccce ccegttgggg ttccegecca cetecgetecge cgegecagec 6060-1-9 3780 cagcaactga gcccgecgcea gecccactce cectgacgte ctcgeecgeca getgettcag 10 3840 caggcggcag cggcggecca gcagcagctg ctccgcagca cagcageggce geccgecagead 3900 cccaagcccc ccatcaccac ccacagtgct cggagcaggg ageggggggg ctececegeccce 3960 15 cgctgcecgce gtccagegece ccgeagtect 31660016066 tececceectee tcgecaggecg 4020 ctttgcatga cccggacgaa cactaccccc caggctcgge agaggtgage acgtccececce 4080 gccccctece 600000006 606011662 ttcacectgg cttggegtge aatgaaacce 20 4140 taaataaccc taaaacctca ttatcagttg caaattggac ccgtgaagcg ggcgggggca 4200 actgcgctct gectggtgtca gecgcetgtcete tgecggttce tgecccagegt gegectgecat 4260 gcaagggggg atgggggggg ggaggcattt aacaataggce cagtcatctc caatccaccg 4320 5 tcaatttcag 0000106026 000010061 cateccecttg cagatgcacc accagcacct 4380 cccagggctg tgtggcttta acccggacga cctgetgggg gggcagcetgg gggacatggg 4440 gttcctgggg gagetggggg 919909091099 aggaaagcac gaacaggacg acttcctgga 10 4500 cctgctgetg aagggggagg aggagcetgtg a 4531 <210> 2 <211> 1860
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الريبوزي منقوص الأكسجين manli<2]2> 15 (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221كسمة ميسك wads >متوالية 223< 1 20 >400< 2 atgtctggtt cagctggatc gggccaggcet actctcagac atgacggtgg ctctgetgge 60 ggcagtgggc ctgtctcaga cggtttttca ccggccggec tgaaggttct ggtcgtggac 120 gacgacctca tgtgccttaa ggtggtgtca gccatgttga agaggtgcag ctatcaagtg 180 5 gccacttgta gcagtggcag cgaggcactg acacttctac gtgaacgcaa cgaggacgga 240 tcctccgacc agttcgacct cgtactgtca gatgtttaca tgccggacat ggacggtttc 300 aagctgcttg aacacatcgg tctagagttg gagcttcccg ttatcatgat gtcatccaac 360 ggggacacga atgtcgtgct gcggggggtc acccacgggg ctgtggactt tctgatcaag 10 420 cccgttcgaa ttgaggagct gcggaacgtg tggcagcacg tggtgegtcg tegttccatg 480 gcgctggeca ggacgccaga cgagggggga cactcggacg aggactctca gecggcacagt 540 15 gtgaaacgca aggagtcgga gcagagcccg ctgcagctca gcacagagca gggcgggaac 600 aagaagccaa gagtggtgtg gtcggtggag atgcaccaac agtttgtgaa cgcggtcaac 660 tccctgggcea ttgacaaggce ggtgcccaag cggattctgg acctgatgaa cgtggagggg 0 720 ctgacgcgcg 3133809011926 cagccatctg cagaagtacc gcctgtacct gaagecgggtg 780 gagggagtgc aatcgggtgc ggcagcctcc aagcagcacc agcacccgca gtatcaccag 840 cagcagcagc agcagcaagc gcaacctcgt gcagetgtct cccectgcage agcettecttt 5 900 ggtgcccttt ccttgggage cccgcagcag gecgcagcagg gcatgecgca getggggatg 960 cctgtgcagg gtctcecctec aaacttggca gecatgggat 068006006 0080816006 1020 10 ttccagcagg ccctggccat gcaggeggeg getgeggegg ctgcagecag cggegcegcte 1080 cccgggagte 006000013 catgccacce ccggggatga tgeccececgg catgeecgggg 1140 ggggtcccecg gtatgggagg ggtggtgggg catcctcaga tgcccgecee agggatggac 5 1200 tttgcgggtt tcaacgggta tggcaacgct gcgggggggce tgatgtttgg cgggcagceag 1260 caggcgcagc acgcgcagca gcacgcgtca gecgcaagcegg getecgetgge gcagcagceag 1320 0 gcgcagcaag tatccatggg cttgggcectt atgcccceee cgttggggtt ccecgeccacce 1380 tcgctcgeeg 0008300602 gegceteccgea gcaactgage 000600806 0680160626 1440 ctgacgtcct cgccgecagce tgcttcagca 000092089020 gecggeccage agcagcetgcet 1500 ccgcagcaca gcagcggcegce cgcagcagcec caagccccec atcaccaccce acagtgetcg 5 1560 gagcagggag cgggggggct cccgecceccg ctgececgegt ccagegecce gecagtectat 1620 000100016 000010216 gecaggcecegcet ttgcatgacc cggacgaaca ctaccecccca 1680 10 ggctcggcag agatgcacca ccagcacctc ccagggctgt gtggctttaa cccggacgac 1740 ctgctggggg ggcagetggg ggacatgggg 1020١199999 agetgggggg ggcggtggga 1800 ggaaagcacg aacaggacga cttcctggac ctgctgctga agggggagga ggagetgtga 5 1860 <210> 3 <211> 619 <212> PRT <213> Parachlorella sp. 0 <220>
<221كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 3
Met Ser Gly Ser Ala Gly Ser Gly Gln Ala Thr Leu Arg His Asp Gly 1 5 10 15 5
Gly Ser Ala Gly Gly Ser Gly Pro Val Ser Asp Gly Phe Ser Pro Ala
Gly Leu Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Leu Met Cys Leu Lys Val
Val Ser Ala Met Leu Lys Arg Cys Ser Tyr Gin Val Ala Thr Cys Ser 10 60
Ser Gly Ser Glu Ala Leu Thr Leu Leu Arg Glu Arg Asn Glu Asp Gly 65 70 75 80
Ser Ser Asp GIn Phe Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp 85 90 95 15
Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His lle Gly Leu Glu Leu Glu Leu 100 105 110
Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr Asn Val Val Leu Arg 115 120 125
Gly Val Thr His Gly Ala Val Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg lle 130 135 140
Glu Glu Leu Arg Asn Val Trp GIn His Val Val Arg Arg Arg Ser Met 145 150 155 160
Ala Leu Ala Arg Thr Pro Asp Glu Gly Gly His Ser Asp Glu Asp Ser 5 165 170 175
Gln Arg His Ser Val Lys Arg Lys Glu Ser Glu GIn Ser Pro Leu 0 180 185 190
Leu Ser Thr Glu 60 Gly Gly Asn Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser 195 200 205 10
Val Glu Met His Gin Gln Phe Val Asn Ala Val Asn Ser Leu Gly lle 210 215 220
Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Asp Leu Met Asn Val Glu Gly 225 230 235 240
Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr 15 245 250 255
Leu Lys Arg Val Glu Gly Val Gin Ser Gly Ala Ala Ala Ser Lys 0 260 265 270
His Gin His Pro Gln Tyr His Gln Gln Gin مي Gin Gln Gln Ala GIn
275 280 285
Pro Arg Ala Ala Val Ser Pro Ala Ala Ala Ser Phe Gly Ala Leu Ser 290 295 300
Leu Gly Ala Pro 0 Gin Ala Gln Gin Gly Met Pro Gin Leu Gly Met 305 310 315 320 5
Pro Val GIn Gly Leu Pro Pro Asn Leu Ala Ala Met Gly Ser Gin Pro 325 330 335
Pro His lle Pro Phe GIn GIn Ala Leu Ala Met Gin Ala Ala Ala Ala 340 345 350
Ala Ala Ala Ala Ser Gly Ala Leu Pro Gly Ser Leu Pro Pro Tyr Met 10 355 360 365
Pro Pro Pro Gly Met Met Pro Pro Gly Met Pro Gly Gly Val Pro Gly 370 375 380
Met Gly Gly Val Val Gly His Pro Glin Met Pro Ala Pro Gly Met Asp 385 390 395 400 15
Phe Ala Gly Phe Asn Gly Tyr Gly Asn Ala Ala Gly Gly Leu Met Phe 405 410 415
Gly Gly GIn GIn GIn Ala GIn His Ala GIn GIn His Ala Ser Ala Gin 420 425 430
Ala Gly Ser Leu Ala GIn GIn Gin Ala Gln GIn Val Ser Met Gly Leu 435 440 445
Gly Leu Met Pro Pro Pro Leu Gly Phe Pro Pro Thr Ser Leu Ala Ala 450 455 460
Pro Ala Pro Arg Ser Ala Ala Thr Glu Pro Ala Ala Ala Pro Leu Pro 5 465 470 475 480
Leu Thr Ser Ser Pro Pro Ala Ala Ser Ala Gly Gly Ser Gly Gly Pro 485 490 495
Ala Ala Ala Ala Pro GIn His Ser Ser Gly Ala Ala Ala Ala Gin Ala 500 505 510 10
Pro His His His Pro Gln Cys Ser Glu 60 Gly Ala Gly Gly Leu Pro 515 520 525
Pro Pro Leu Pro Ala Ser Ser Ala Pro GIn Ser Tyr Pro Leu Pro Pro 530 535 540
Pro Ser Ser GIn Ala Ala Leu His Asp Pro Asp Glu His Tyr Pro Pro 15 545 550 555 560
Gly Ser Ala Glu Met His His Gin His Leu Pro Gly Leu Cys Gly Phe 565 570 575
Asn Pro Asp Asp Leu Leu Gly Gly Gin Leu Gly Asp Met Gly Phe Leu
580 585 590
Gly Glu Leu Gly Gly Ala Val Gly Gly Lys His Glu Gln Asp Asp Phe 595 600 605
Leu Asp Leu Leu Leu Lys Gly Glu Glu Glu Leu 610 615 5 <210> 4 <211> 23 <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) <213> Parachlorella sp. 0 <220> <221 كسمة ميسك <223>المتوالية المستهدفة في جين 1ا56 من Parachlorella // 1-1185, iD including PAM <400> 4 15 acaccacctt aaggcacatg agg 23 <210> 5 <211> 105
RIBONUCLEIC ACID (RNA) >حمض نوري رببوزي 212<
<213>متوالية اصطناعية >220< >23 >تخليقية >220< <221>سمة ميسك <223>نئ ظملةدليلي لاستهداف 1ا56 Parachlorella جين 5 <400> ggacaccacc uuaaggcaca ugguuuuaga gcuagaaaua gcaaguuaaa auaaggcuag 60 uccguuauca acuugaaaaa guggcaccga gucggugcuu uuuuu 0 105 6 >210< 2667 >211< <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUGLEIC ACID (DNA) 5 <213>متوالية اصطناعية >220< >23 >تخليقية >220< <221>سمة ميسك
<223>مقاوم للبلوميسين "BIER" جين , محسن ل
Parachlorella باستخدام Parachlorella إنترونات
<400> 6
atggccaaac tgacatccgc tgttcctgtg ttgacagcaa gagatgttgc aggtgcagtg
60 5
gagttttgtg agttctgaga agctgattgt tgtttaactt ctttgaaagc tttatcgaag 120
attctgcaag cgatgaacat tgcttgtcaa gaccgagagc tgcatgccca cttgacatcc
180
agctttgaac ggctcttcat gtttgatttg tttctgattg tagggacaga tagactgggg 240 tttagcaggg actttgtgga ggacgatttt gcaggagtgg tgagggatga tgtgacactg 10
300
tttatctcag cagtgcagga tcaagtgagt gcagcgtcag ctgtggcagt tgttggcttt 360
cgtctcagtc agtagtttgc tgggattgat tatggagggc acagttgcaa ttttgagttg 420
cacgttgcga caagcgtgtt gacaaagcgt ggtcaagccg gccagtcttg ccggtggegg 480 15
gtggcttggt ctaacttccg ctctacagca atcgttttgt tcatggttac ggggctggeg 540
tgccagaaag tcctggtcag ccaccctcgce ttcaaagecg tagcccaaca actttgcgaa
600
tatgttcgat ttgcaggtgg tgcccgataa tacactggca tgggtttggg tgagaggtac 660 agctctgcgt gcaacaggtt gcaagatgca gcgcaggtct tccctggtca aacgatgtat 0
720 gcagagttga gaggcacttg agctgggtga atggcgtggg ctcgtaggta gtgtgcaggg 780 caggaagggc agccaatttt ggagttgtgg tccggtgtcg ttgcttcgag ccttattagg 840 actcttgctc atcaaagcgt tagttgtgaa taagttgatc tgaaaggatg ttatgtacag 900 caagcagcag cagttaagag tctggggagt agctgcacag ggcgaggtgt caagatggga م 960 agggtcctge ctecttatgt gtttttcect gtaggggagg aagcctctta tgggcaatgg 1020 ttgggcatat tttccagcca geccttcttt ctataggggce cagggtggge ccagcetegte 1080 ttggcttcca ccaccaggag agtgagggca ttgaagggcc ataaatagtc ctcccatcta 1140 10 cgtgcaccag agggtgtcgt ctaggctgtg catgccacga ggggaaggag ccaagaatga 1200 gtgtatgggt tgttttcatg tttaggctgg gataaaactg ttttcaattg cgcctgecgg 1260 gtgaaaacca cagcagcatc agcaagcttg gagaaggcca gcccgecccag cacaggctca 1320 15 cgttcccact caggcggtca gtcgggcggg ggtgtgagtc aggcaggcega gggtgtctgt 1380 gcctgacatc agcacctctg cttagccact gcagcccctg gagcagggta gggcegtcatt 1440 tgcagcaatc acctgctgcc tcacacgtcg cagcttggaa tttcaacgac catcagcget 20 1500 gggottgttg agggatcata gcagattttg gtgcagectg gttgtcatge tetttgtgga 1560 atggcctcta tgttcgagca attcgttgga tgttgaggtg cttggggaca gagagtcgaa 1620 tgatgggcca gggtcaaaca tgcgagcegtt tggctgagtc ageggttttt getggtcact 1680 5 ttttcttttg tttcttattt aggtttgatg gatgtgtttt gtgctgctge cctgaagcetg 1740 cagcagcgtg tctgccctge getactgecgg gcaccaaggce tatgtgetgg tgcactcgge 1800 tgcgctgcac ctgtgcacct cgcactcegt ccagectceca tgcagcacac gtactcacgg
1860 10 tgtcctectg acctgtecgta cgctattcca aacttgctct tttgectgecg ctgcetetegt 1920 acacaattgc tgttgattat cgatatctaa tcgagcgcct gctgactgaa ctccgcaggt 1980 ttggatgaac tgtatgcaga gtggtctgaa gtggtgagca ccaactttag gtgggtggge 2040 tctgaaggag gaggagggag cgggtgatta aacagggcct gcatgaagag gagcagggge 15 2100 tgcatggaca gcagggggaa ggtgcagaag ggagggtcaa gcggggttca ggtggctgtg 2160 ggtttctgca cgagcagtga aagaagctgt atccttccac ctgctttcac tggcgaaagg
2220 0 ttgaaaacag gatgtcgcag ctggaaagat gttgcgctgt caagtgcaag ccatggttga 2280 gggtatgcct gtgtgcatgt gcttcttaaa gttactcctg ttctatggtt ctgggtgcett 2340 gttgtttgtg gtgcagggat gcaagcggac ctgcaatgac agagattgga gaacaacctt 2400 5 ggggaaggga gtttgcattg agagatcctg caggtgaggg ggcatgtaag caatggcagg 2460 caattcaaga acgaatcatt gctgcaaatg ctgggatggt atgcagctga ggtatctatt 2520 gccttgtatt ttgtctcgca ttgcatcggt ggtgegttct gtggecctgag gecacagttct 2580 10 tgctgtttga taagggttcg actgagttgt cgtgtgtgct gtgctgcagg caattgcgtg 2640 cactttgttg cagaagaaca ggactga 2667 <210> 17 <211> 530
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين 15 (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221 >سمة ميسك RPS4 20 <223>معزز
<400> 7 ccaccatggg ggaggtttga agtgtgcgcc tgatataatc atacacctaa aagcaccact 60 tgctgattgt gaagggacta tgtcgtttat gacgggacgt tacgctggcc gatggtttga 120 atttggacgc tgtggtagaa tgttatatgg acgtaaaggt tggcatattg aaaatcgtct 180 5 tcgcaggcaa acttctagac gtgtgaccca ccggtaaaac gacaagcgtg gcgcgtcgat 240 tgcgctttga acgtcgtttg ttggactcca gatgaacctc aaaatcaaag cggtgattga 300 cgaaaatcaa atgacagccc gcaaaatttc atcagccttc ggatcggatt ctcagaatct 360 10 gattgtccct getggctaca tttatgaaat ttcgtacatt ttggcagaaa tgtcccaata 420 ccatagcact gccgcctgag ctcacccgag caatgcatac tgggtacctc 6681-19 480 ccctetttcc aagcccagtg ctgttgtaat agccaaaggg ctcagtaaca 530 <210> 8 15 <211> 546
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> 20
<221كسمة ميسك <223>وسيلة إنهاء +4 <400> 8 gcatagcatc agcctgtggc agggttgtgg tagggctgag tggcagggtt aaaggggttg 60 5 cctaccccac ccctactctc atgacaccag caacagcagc agctcatgca gtactcaaat 120 cactgatgtc aatggtgtga cacatttggt taaggctgct ttttaaagtg ctgctttggg 180 ggcagtgact gtgcagagct tggagcgtat ccccatgtaa tcagaaccga cgagagttcg 240 10 gggcaacctt tcatcttcac attttttgtg atcagctaca gagtctgaaa tcaaatagag 300 gctgccatct aaacgcagga gtcacaacga aggcgaaaac tccaattgct gtactcaatg 360 cactaagtga ttgttcaatg gataaataca ctatgctcaa ttcatgccag cagagctgct 420 ccttccagec agctacaatg gctttttcca cgcctttiga agtatgaatg ttcagcttge 480 15 tgtgcttgat gcatcaccat aaacacaatt ctacaacatt tcatgccaac aacagtacgg 540 gctttc 546 <210> 9 <211> 302 20
<212> PRT <213> Coccomyxa subellipsoidea <220> <221كسمة ميسك polypeptide , NCBI Accession XP_005652114 <223>بولي ببتيد 5611 5 <400> 9
Met Gly Leu Lys Ala Arg Ala Ala Ser Val Ser Val His Ser Ser Ala 1 5 10 15
Asn Asn Thr Ala Ser Pro Leu Ser Ser Gly Arg Arg Gly Phe Pro His 10
Ser Gly Glu Met Ser Gly Glu Asp Leu Ala Arg Ser Asp Ser Trp Glu
Met Phe Pro Ala Gly Leu Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu 60
Cys Leu Lys Val Val Glu His Met Leu Arg Arg Cys Asn Tyr Gin Val 15 65 70 75 80
Thr Thr Cys Pro Asn Gly Lys Ala Ala Leu Glu Lys Leu Arg Asp Arg 85 90 95
Ser Val His Phe Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met
100 105 110
Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His lle Gly Leu Glu Leu Asp Leu Pro 115 120 125
Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Glu Thr Asn Val Val Leu Arg Gly 130 135 140 5
Val Thr His Gly Ala Val Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg Val Glu 145 150 155 160
Glu Leu Arg Asn Val Trp GIn His Val Val Arg Arg Lys Arg Asp 0 165 170 175
Ala Val Ser GIn Ala Arg Asp Ser Arg Asp lle Ser Asp Glu Glu Gly 10 180 185 190
Thr Asp Asp Gly Lys Pro Arg Asp Lys Lys Arg Lys Glu Val lle Leu 195 200 205
Val Leu Trp Trp Asp Met Gin Arg Arg Asp Ser Asp Asp Gly Val Ser 210 215 220 15
Ala Lys Lys Ala Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His 60 Gin Phe 225 230 235 240
Val GIn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg 245 250 255 lle Leu Asp Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala 260 265 270
Ser His Leu GIn Val Pro His Leu Ser lle Phe Ser Pro Leu Phe Ala 275 280 285
Glu Leu Met Ser Thr Leu Pro Arg Arg Cys Phe Tyr Asp Phe 5 290 295 300 <210> 10 <211> 270 <212> PRT <213> Ostreococcus lucimarinus 10 <220> <221كسمة ميسك polypeptide , NCBI Accession XP_001415508 <223>بولي ببتيد 1 <400> 10
Phe Pro Ala Gly Leu Gly Val Leu Val Val Asp Asp Asp Leu Leu Cys 15 1 5 10 15
Leu Lys Val Val Glu Lys Met Leu Lys Ala Cys Lys Tyr Lys Val Thr
Ala Cys Ser Thr Ala Lys Thr Ala Leu Glu lle Leu Arg Thr Arg Lys
Glu Glu Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp 60
Gly Phe Lys Leu Leu Glu lle lle Gln Phe Glu Leu Ala Leu Pro Val 65 70 75 80 5
Leu Met Met Ser Ala Asn Ser Asp Ser Ser Val Val Leu Arg Gly lle 85 90 95 lle His Gly Ala Val Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu 100 105 110
Leu Arg Asn lle Trp GIn His Val Val Arg Arg Asp Tyr Ser Ser Ala 10 115 120 125
Lys Ser Ser Gly Ser Glu Asp Val Glu Ala Ser Ser Pro Ser Lys Arg 130 135 140
Ala Lys Thr Ser Gly Ser Asn Ser Lys Ser Glu Glu Val Asp Arg Thr 145 150 155 160 15
Ala Ser Glu Met Ser Ser Gly Lys Ala Arg Lys Lys Pro Thr Gly Lys 165 170 175
Lys Gly Gly Lys Ser Val Lys Glu Ala Glu Lys Lys Asp Val Val Asp 180 185 190
Asn Ser Asn Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Ala Glu Leu His 195 200 205
Ala GIn Phe Val Thr Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val 210 215 220
Pro Lys Arg lle Leu Asp Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu 5 225 230 235 240
Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu 245 250 255
Gln Gly Asn Asp Ala Arg Gly Gly Gly Asn Ala Ser Ser Thr 260 265 270 0 <210> 11 <211> 941 <212> PRT <213> Chlamydomonas reinhardtii <220> 15 >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 >400< 1
Met Asp Ser Gin Gly Val Lys Leu Glu Glu His Pro Gly His Thr Gly
1 5 10 15
Gly His Trp GIn Gly Phe Pro Ala Gly Leu Arg Leu Leu Val Val Asp
Asp Asp Pro Leu Cys Leu Lys Val Val Glu Gln Met Leu Arg Lys Cys 5
Ser Tyr Glu Val Thr Val Cys Ser Asn Ala Thr Thr Ala Leu Asn lle 60
Leu Arg Asp Lys Asn Thr Glu Tyr Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr 65 70 75 80
Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Arg Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu 10 85 90 95
Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr Ser Asn 100 105 110
Val Leu Arg Gly Val Thr His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro 115 120 125 15
Val Arg Leu Glu Glu Leu Arg Asn Leu Trp صا His Val Val Arg Arg 130 135 140
Arg Arg GIn His Ala Gln Glu lle Asp Ser Asp Glu GIn Ser Gin Glu 145 150 155 160
Arg Asp Glu Asp GIn Thr Arg Asn Lys Arg Lys Ala Asp Ala Ala Gly 165 170 175
Val Thr Gly Asp GIn Cys Arg Leu Asn Gly Ser Gly Ser Gly Gly Ala 180 185 190
Ala Gly Pro Gly Ser Gly Gly Gly Ala Gly Gly Met Thr Asp Glu Met 5 195 200 205
Leu Met Met Ser Gly Gly Glu Asn Gly Ser Asn Lys Lys Ala Arg Val 210 215 220
Val Trp Ser Val Glu Met His GIn GIn Phe Val Asn Ala Val Asn Gin 225 230 235 240 10
Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Glu lle Met Gly 245 250 255
Val Asp Gly Ser Ala Gly Arg Leu Ala Asp Thr Ser Gly Arg Asp Val 260 265 270
Cys Gly Thr Val Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val Ser Gly Val Thr 15 275 280 285
Pro Ser Gly His His His Asn Ala Ala His Lys Ser Asn Lys Pro Ser 290 295 300
Pro His Thr Thr Pro Pro Pro Pro Ala Leu Pro Gly Gln Ala Gly Thr
305 310 315 320
His Pro Ala Asn Gin Ala Thr Ala lle Pro Pro Pro Pro Gin Pro Gly 325 330 335
Ser Gly Thr Ala Ala Gly Ala Gly Ala Ala Ala Ala Gly Thr Gly Gly 340 345 350 5
Gly Ala Ala Ala Ala Asn Gly His Ala Ala Thr Thr Gly Ala Gly Thr 355 360 365
Pro Gly Ala Ala Pro Gly Ala Gly Gly Gly Val Gly Gly Thr Gly Ala 370 375 380
Gly Gly Leu Gly Ser Gly Pro Asp Gly Ala Ala Ala Ala Ala Gly Pro 10 385 390 395 400
Gly Pro Gly Ala Ala Val Pro Gly Gly Leu Gly Gly Leu Pro Leu Pro 405 410 415
Pro Gly Ala Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly Gly Phe Gly Gly Pro Ser 420 425 430 15
Pro Pro Pro Pro Pro His Pro Ala Ala Leu Leu Ala Asn Pro Met Ala 435 440 445
Ala Ala Val Ala Gly Leu Asn GIn Ser Leu Leu Asn Ala Met Gly Ser 450 455 460
Leu Gly Val Gly Val Gly Gly Met Ser Pro Leu Gly Pro Val Gly Pro 465 470 475 480
Leu Gly Pro Leu Gly Gly Leu Pro Gly Leu Pro Gly Met Gln Pro Pro 485 490 495
Pro Leu Gly Met Gly Gly Leu Gin Pro Gly Met Gly Pro Leu Gly Pro 5 500 505 510
Leu Gly Leu Pro Gly Met Gly Gly Leu Pro Gly Leu Pro Gly Met Asn 515 520 525
Pro Met Ala Asn Leu Met Gin Gly Met Ala Ala Gly Met Ala Ala Ala 530 535 540 10
Asn GIn Met Asn Gly Met Gly Gly His Met Gly Gly His Met Gly Gly 545 550 555 560
Met Asn Gly Pro Met Gly Ala Leu Ala Gly Met Asn Gly Leu Asn Gly 565 570 575
Ala Met Met Gly Gly Leu Pro Gly Met Gly Gly Pro Gin Asn Met Phe 15 580 585 590
Gln Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala GIn GIn Gin GIn Gin 0 GIn Glu 595 600 605
Gln GIn His Ala Met Met Gin Gin Ala Ala Ala Gly Leu Leu Ala Ser
610 615 620
GIn GIn GIn GIn GIn Gin 0 GIn GIn Gln GIn GIn Gin Gin Gin Ala 625 630 635 640
Leu GIn GIn GIn GIn GIn GIn Gly Met Ala Val Ser Pro Pro Gly Pro 645 650 655 5
His Asn Ala Thr Pro Asn Gly Gin Leu His Thr His Pro Gln Ala His 660 665 670
His Pro His GIn His Gly Leu His Ala His Ala His Pro His GIn His 675 680 685
Leu Asn Thr Ala Pro Ala Gly Ala Leu Gly Leu Ser Pro Pro 0 Pro 10 690 695 700
Pro Ala Gly Leu Leu Ser Ala Ser Gly Leu Ser Ser Gly Pro Asp Gly 705 710 715 720
Ser Gly Leu Gly Ser Gly Val Gly Gly Leu Leu Asp Gly Leu GIn GIn 725 730 735 15
His Pro His His Pro Gin Leu GIn Leu Ala Gly Ser Leu Gly Thr Gly 740 745 750
Gly Thr Gly Arg Ser Ser Gly Ala Ala Gly Arg Gly Ser Leu Asp Leu 755 760 765
Pro Ala Asp Leu Met Gly Met Ala Leu Leu Asp Phe Pro Pro Val Pro 770 775 780
Val Pro Gly Gly Ala Asp Val Gly Met Ala Gly Ala Gly Gly Gly Ala 785 790 795 800
Ala Gly Ala His His His Gly His GIn Gly His GIn Gly lle Gly Gly 5 805 810 815
Gly Ala Gly Val Gly lle Ala Gly Gly Val Gly Cys Gly Val Pro Ala 820 825 830
Ala Ala His Gly Leu Glu Pro Ala lle Leu Met Asp Asp Pro Ala Asp 835 840 845 10
Leu Gly Ala Val Phe Ser Asp Val Met Tyr Gly Thr Pro Gly Gly Gly 850 855 860
Gly Val Pro Gly Gly Val Pro Gly Gly Gly Val Gly Leu Gly Leu Gly 865 870 875 880
Ala Gly GIn Val Pro Ser Gly Pro Ala Gly Ala Gly Gly Leu His Ser 15 885 890 895
His His His Gln His His His His GIn His His Leu Gly His Val Val 900 905 910
Pro Val Gly Gly Val Asp Pro Leu Ala Gly Asp Ala Ala Lys Met Ala
915 920 925
Met Asn Asp Asp Asp Phe Phe Asn Phe Leu Leu Lys Asn 930 935 940 <210> 12 <211> 523 5 <212> PRT <213> Chromochloris zofingiensis <220> >سمة ميسك 221< polypeptide aan <223>بولي 1 10 <400> 12
Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Thr Val Gly Leu Glu Leu Asp Leu 1 5 10 15
Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Glu His Thr Thr Val Met Arg 15
Gly Val Thr His Gly Ala Cys Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg lle
Glu Glu Leu Arg Asn lle Trp Gin His Val lle Arg Arg Thr Arg His 60
Pro Val Phe Arg Asp Leu Glu Pro Asp Asp His Glu Gly Gly Asp Tyr 65 70 75 80
Glu Ala Ser Lys Lys Arg Lys Asp Leu Tyr Arg Gly Glu Asn Ser Ser 85 90 95
Gly Ser Gly Gly Ala Gly Gly Leu Glu Arg Asp Asp Asp Gly Ser Ala 5 100 105 110
Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Glin Gin Phe 115 120 125
Val GIn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys 130 135 140 10 lle Leu Glu Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala 145 150 155 160
Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val Gin Gly Val 165 170 175
GIn Ala Pro Phe Gly Leu Pro Asn lle Gin Leu Pro Arg Gin Thr Ser 15 180 185 190
Ser Lys Gly Ala Gly Ser Ser Ser Gln GIn Gln His His Gln Gln Gin 195 200 205
Gln His GIn GIn GIn His GIn His GIn His GIn Thr Ala Leu Gly Thr
210 215 220
Gly GIn GIn GIn Ser His GIn Leu GIn Pro Cys Pro Val Ser Thr Ala 225 230 235 240
Thr Pro Val Met Pro Ser Pro Asp Ala Met Val Ala Ala Ser Met Met 245 250 255 5
Ser Ser GIn Ala Met Ala Ala Met Ala Pro Gly Val Met Asn Pro Met 260 265 270
Thr Ala Met Asn Ser Met Met Ala Gly Leu Asn Pro Asn Met Met Gly 275 280 285
Met Ala Ala Gly Leu Gly Leu Ala Gly Leu Gly lle Gly Gly Met Ala 10 290 295 300
Gly His Pro Val Pro Asn Pro Met Leu Ala Gly Met Gly Pro Met Gly 305 310 315 320
Leu Gly Leu Pro Pro Pro Pro Gly Met Pro Pro Pro Pro Pro Gly Met 325 330 335 15
Pro Pro Gly Met Pro Pro Gly Met Pro Pro Gly Met Pro Ala Met Met 340 345 350
Gln Gly Leu Ser Met Ala Gly Met Ser His Leu Ala Ala Ala Gly Met 355 360 365
Arg Pro Pro Pro Gly Ala Leu Gly Gly His Leu Gly Gly Pro Gly Leu 370 375 380
Ser Pro Phe Gly Pro Pro Pro Pro Pro Gly Ala Asp Pro Ala Asn Met 385 390 395 400
Met Ala Asn Met Ser Ser Met Met Ala Asn Met Gin Ala Ala Leu Ala 5 405 410 415
Phe GIn Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ala GIn His Gin Ala Ala Ser Thr 420 425 430
Gly Ser Val Ala Pro Gly Arg Gin GIn GIn Val His Gln His Gin Gin 435 440 445 10
Ala Val Gly Met Ala Val Asp Asp Ala Ala Ala Phe Pro Ser Pro Gly 450 455 460
Cys Arg Pro Asn Gly Ser Ala Asp Ala Gly Ala GIn Ser Ala Ala Glu 465 470 475 480
Pro Asn Asp Phe Ser Arg Val Phe Asp Asp Pro Phe Ala Gin Pro Ala 15 485 490 495
Ala Ser Pro Ser Gly Ala Ala Ala Ala Gly Ser Asn Glu Ala Pro Gly 500 505 510
Met Asp Asp Phe Leu Asp Phe Phe Leu Lys Ser
515 520 <210> 13 <211> 834 <212> PRT <213> Volvox carteri 5 <220> >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 >400< 3
Met Asp Gly Arg Ala Glu Gly Thr Val Ala lle Lys Gln Glu Asp His 10 1 5 10 15
Ala Ser Gly His Trp His Asn Phe Pro Ala Gly Leu Arg Leu Leu Val
Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu Lys Val Val Glu Gin Met Leu Arg 15
Lys Cys Ser Tyr Asp Val Thr Thr Cys Thr Asn Ala Thr Met Ala Leu 60
Asn Leu Leu Arg Asp Lys Ser Thr Glu Tyr Asp Leu Val Leu Ser Asp 65 70 75 80
Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Val Val Gly 85 90 95
Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr 100 105 110
Ser Asn Val Leu Arg Gly Val Thr His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle 5 115 120 125
Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu Arg Asn Leu Trp GIn His Val Val 130 135 140
Arg Arg Arg Arg GIn Leu Asn Leu Asp Met Asp Ser Asp Glu His Ser 145 150 155 160 10
Gln Glu Arg Asp Asp Asp Gin Gly Arg Lys Arg Lys Ala Asp Thr Ala 165 170 175
Gly Cys lle Gly Asp GIn Leu Arg Met Met Gly Ala Gly Cys Ser Gly 180 185 190
Gly Ala Asn Gly Leu Gly Ser Thr Gly Asn Leu Gly Ala Val Ala Thr 15 195 200 205
Gly Ser Ala Gly Leu Gly Leu Gly Leu Gly Thr Ala Ala Asp Glu Leu 210 215 220
Gly Leu Gly Leu Asp Asn Gly Ser Ser Lys Lys Ala Arg Val Val Trp
225 230 235 240
Ser Val Glu Met His Gln Glin Phe Val Asn Ala Val Asn Gin Leu Gly 245 250 255 lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Glu lle Met Asn Val Asp 260 265 270 5
Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu Gin Lys Tyr Arg Leu 275 280 285
Tyr Leu Lys Arg Val Ser Gly Ala GIn ماي Pro Gly Gin Asn Arg Val 290 295 300
Ser Arg Pro Ser Pro Pro Gin Pro Gln Ser Pro Gin Val Pro Ser GIn 10 305 310 315 320
Gln GIn GIn Ser Leu Pro Gly Gly Gly Gly Ala Ala Ala Ala Gly Ala 325 330 335
Gly GIn Leu GIn Gly Gly Gly Gly Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ser Leu 340 345 350 15
Ala Ser lle Leu Ala Gly Gly Gly Pro Ala Gly Gly Gly Ala Gly Ala 355 360 365
Gly Pro Pro Pro Gly Gly Gly GIn Leu Gly Ala Asp Gly Gly Gly Pro 370 375 380
Gly Pro Gly Leu Ser Ser Ala Val Ala Asn Ala Met Ser Ala Ala Ala 385 390 395 400
Ala Ala Gly Gly Phe Pro Thr Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro His Pro 405 410 415
Ala Ala Leu Leu Ala Ala Asn Pro Met Met Ala Ala Ala Ala Gly Leu 5 420 425 430
Asn Pro Leu Leu Gly Ala Met Gly Gly Leu Gly Val Gly Pro Leu Gly 435 440 445
Pro Leu Asn Pro Leu Asn Gly Met Pro Met Pro Gly Met Gin Pro Pro 450 455 460 10
Leu Gly Leu Leu Pro Gly Leu Pro Gly Pro Gly Gly Gln Leu Gly Leu 465 470 475 480
Gly Pro Leu Gly Pro lle Gly Leu Pro Gly Pro Gly Pro Leu Pro Ser 485 490 495
Leu Pro Ala Gly Leu Pro Leu Asn Pro Met Ala Asn Gly Leu Gin Gin 15 500 505 510
Met Ala Ala Ala Asn Leu Met Gin Gly Met Ala Gly Met Gly Gin Leu 515 520 525
Pro Ala Leu Ser Met Asn Gly Met Asn Gly lle Met Gly Pro Leu Pro
530 535 540
Gly Val Gly Leu Pro Gly Pro Gin GIn His Leu Phe Pro Gin Gin GIn 545 550 555 560
Gln Pro His Leu GIn Gln GIn GIn GIn Gin Gln Gln GIn Lys Asp Leu 565 570 575 5
Gln Met Ala GIn Lys Gin His Gin Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val 580 585 590
Ala Ala Ala Val Ala Ala Ala Gln His GIn GIn ماي ماي Pro Gin Ala 595 600 605
GIn GIn GIn Pro Gin Pro Gin Gln Gln Gln GIn GIn Pro Gly Lys Leu 10 610 615 620
Pro Gin Ala Thr Val Gly Thr Pro Ala Leu Ala Ser Pro Ala Gly Ala 625 630 635 640
Leu Pro Arg Gin Pro Ser Gly GIn His Pro His Thr Leu Ser Ser Ser 645 650 655 15
Ser Leu His Thr ماي هي Pro His Gln 0 0 Leu Leu His Ser 0 660 665 670
Pro Ser Ser Thr His Leu Ala Thr Asn Asn Thr Leu Ala Met Ala Pro 675 680 685
Ala Leu Asn Gly Thr Leu Asp Val Gly Gly Lys Gly His Leu His Ala 690 695 700
Ala Gly Gly GIn Gly Ala Gly Ala Gly Ala Gly Ala Val Leu Asp lle 705 710 715 720
Pro Pro Asp Leu lle Gly Gly Leu lle Glu Asp Gly Phe Gly Ala Pro 5 725 730 735
Pro Gly Pro Thr lle Gin Leu Ala His Gly Thr Ala Ala Val Leu Asp 740 745 750
Pro Thr Met Leu Leu Asp Glu Gly Asp Asn Ser Asp Phe Ala Ala Val 755 760 765 10
Phe GIn Glu Met Ser Ser Tyr Gly Gly Gly Gly Val lle Gly Gly Gly 770 775 780
Gly Ser Gly Ala Gly Ala Met Gly Val Leu Gly His Gly Leu Leu Ala 785 790 795 800
Ala Gly Gly Pro Val Met Val Asp Val Ala Ala Gly Leu Ala Gly Val 15 805 810 815
Thr Glu Thr Ala Thr Arg Val Asp Asp Asp Phe Leu Asn Phe Leu Leu 820 825 830
Lys Ser
<210> 14 <211> 446 <212> PRT <213> Tetraselmis sp. 5 <220> >سمة ميسك 221< 1 <223كبولي ببتيد 5172 polypeptide 4 <400>
Met Ser Cys Thr Val Ala Ser Phe Pro Pro Ala Ala Gly Gly Gin Gly 10 1 5 10 15
Ser Pro Ala Thr Pro Val Pro Tyr Gin Asp Leu Leu Val Lys Arg 07
Asp GIn Trp Ser Asn Phe Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Ala Asp 15
Asn Asp Pro Ala Ser Leu GIn GIn Val Glu Lys Met Leu Lys Lys Cys 60
Ser Tyr GIn Val Thr Leu Cys Ser Ser Gly Lys Asn Ser Leu Glu lle 65 70 75 80
Leu Arg Lys Arg Arg Glu Glu Phe Asp Leu Val Leu Ala Asp Ala Asn 85 90 95
Leu Pro Asp lle Asp Gly Phe Lys Leu Leu His Val Cys His Thr Glu 100 105 110
Leu Ser Leu Pro Val Val Leu Met Ser Gly Thr Ser Asp Thr Gin Leu 5 115 120 125
Val Met Arg Gly Val Met Asp Gly Ala Arg Asp Phe Leu lle Lys Pro 130 135 140
Leu Arg Val Glu Glu Leu Lys Val Leu Trp GIn His Leu Val Arg Phe 145 150 155 160 10
Thr Ser Glu lle Thr Lys Thr Asp Ala Gin Leu Asn Val Val Lys Val 165 170 175
Glu Leu Asp Gly Gly Arg Pro Ala Gly Glu Val Ser Thr Ser GIn Asn 180 185 190
Gly Ser GIn Cys Thr Glu Arg Glu Gly Glu Gly Asn Ser Ser Lys Lys 15 195 200 205
Gln Arg Met Asn Trp Ser Asp Glu Met His Gln Glin Phe Val Asn Ala 210 215 220
Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Asp
225 230 235 240
Leu Met Ser Val Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu 245 250 255
Gln Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Lys Arg Met Ala Asn His GIn Glu Asn 260 265 270 5
Gly Lys GIn Ala Val Met Ser Thr Asp Thr lle Ala Arg Ala Glu Ala 275 280 285
Ala Tyr 60 Gly Gly Met Pro Gin Gly Gln Gln Met Met Gin Gln Glu 290 295 300
His Ser Gly Gln Ala Val GIn Tyr Ser Gln Pro His Ala Pro Gly Gly 10 305 310 315 320
Leu His GIn Gin Ala Met Pro Ala Gin Met His Met Gly Met Met Pro 325 330 335
Ala Gly Pro Gin Pro Gly Ser Met Gin Met Ala Pro His His Val Met 340 345 350 15
Gln Met Pro Asn Gly GIn Val Met Val Met Gin Gln Met Gly Pro Arg 355 360 365
Pro Gly Met Pro Pro Gly Met Pro Gln Gin Met Met Ala Ser Ser Gin 370 375 380
Gln Met Gly Met Leu GIn Pro Gly Met Pro Ala Gly Gin Met Leu His 385 390 395 400
Phe GIn His Pro GIn صا Val His Gin His Pro Pro Ser Ser Gly Pro 405 410 415
Met His Ala Val 60 His Met Glu Tyr Ala Tyr Ser Gln Pro Met Gin 5 420 425 430
Met Ala Gly Trp Pro Val Gin Gly Gin Pro Gly Asn Gin Ala 435 440 445 <210> 15 <211> 490 10 <212> PRT <213> Tetraselmis sp. <220> <221 >سمة ميسك 1 <223كبولي ببتيد 5185 polypeptide >400< 5
Met Thr Pro Thr Pro Pro Met Ser Cys Thr Val Ala Ser Phe Pro Pro 1 5 10 15
Ala Ala Gly Gly GIn Gly Ser Pro Ala Thr Pro Val Pro Tyr Gin Asp
Leu Leu Val Lys Arg Gin Asp ماك Trp Ser Asn Phe Pro Ala Gly Leu
Arg Val Leu Val Ala Asp Asn Asp Pro Ala Ser Leu GIn Gin Val Glu 60 5
Lys Met Leu Lys Lys Cys Ser Tyr Gln Val Thr Leu Cys Ser Ser Gly 65 70 75 80
Lys Asn Ser Leu Glu lle Leu Arg Lys Arg Arg Glu Glu Phe Asp Leu 85 90 95
Val Leu Ala Asp Ala Asn Leu Pro Asp lle Asp Gly Phe Lys Leu Leu 10 100 105 110
His Val Cys His Thr Glu Leu Ser Leu Pro Val Val Leu Met Ser Gly 115 120 125
Thr Ser Asp Thr GIn Leu Val Met Arg Gly Val Met Asp Gly Ala Arg 130 135 140 15
Asp Phe Leu lle Lys Pro Leu Arg Val Glu Glu Leu Lys Val Leu Trp 145 150 155 160
Gln His Leu Val Arg Phe Thr Ser Glu lle Thr Lys Thr Asp Ala Gin 165 170 175
Leu Asn Val Val Lys Val Glu Leu Asp Gly Gly Arg Pro Ala Gly Glu 180 185 190
Val Ser Thr Ser GIn Asn Gly Ser GIn Cys Thr Glu Arg Glu Gly Glu 195 200 205
Gly Asn Ser Ser Lys Lys Gln Arg Met Asn Trp Ser Asp Glu Met His 5 210 215 220
Gln GIn Phe Val Asn Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val 225 230 235 240
Pro Lys Arg lle Leu Asp Leu Met Ser Val Glu Gly Leu Thr Arg Glu 245 250 255 10
Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Lys Arg Met 260 265 270
Ala Asn His GIn Glu Asn Gly Lys GIn Ala Val Met Ser Thr Asp Thr 275 280 285 lle Ala Arg Ala Glu Ala Ala Tyr 60 Gly Gly Met Pro Gin Gly Gin 15 290 295 300
Gln Met Met GIn Gin Glu His Ser Gly GIn Ala Val GIn Tyr Ser 0 305 310 315 320
Pro His Ala Pro Gly Gly Leu His GIn Gin Ala Met Pro Ala Gin Met
325 330 335
His Met Gly Met Met Pro Ala Gly Pro Gin Pro Gly Ser Met Gln Met 340 345 350
Ala Pro His His Val Met Gln Met Pro Asn Gly Gin Val Met Val Met 355 360 365 5
Gln GIn Met Gly Pro Arg Pro Gly Met Pro Pro Gly Met Pro Gin 0 370 375 380
Met Met Ala Ser Ser Gln GIn Met Gly Met Leu Gin Pro Gly Met Pro 385 390 395 400
Ala Gly GIn Met Leu His Phe GIn His Pro 60 Gin Val His Gin His 10 405 410 415
Pro Pro Ser Ser Gly Pro Met His Ala Gly Gly Glu Met lle Asp Pro 420 425 430
Gly Ser Met Gin Arg Leu His GIn Gin Pro His Tyr lle Gly Pro Asn 435 440 445 15
Gly GIn His Met Pro Ala Pro Ala Met Gly Met Pro Ser Gly Thr Val 450 455 460
Gln His Met Glu Tyr Ala Tyr Ser Gin Pro Met GIn Met Ala Gly Trp 465 470 475 480
Pro Val Gln Gly GIn Pro Gly Asn صاى Ala 485 490 <210> 16 <211> 574 <212> PRT 5 <213> Tetraselmis sp. <220> >سمة ميسك 221< polypeptide 5230 <223كبولي ببتيد 1 >400< 16 0
Met Thr Met Pro Leu Gly Gly Gly Leu Cys Met Lys Asp Arg lle His 1 5 10 15
Gly Asp Glu Arg Tyr Arg Ser Lys Ala Lys Arg GIn Val Asn Thr lle
Phe Ala Phe Thr Gin Arg Asn Thr Trp Arg Gly Arg Phe Arg Leu Cys 15
Ser Tyr Arg Thr Thr Glu Leu Leu Gly Gly Ser Lys Thr Thr Glu Pro 60
Gly Arg Gly Thr Phe Val Leu GIn lle Phe Met Cys Val Lys Asn Ala
65 70 75 80
Ser lle Asp Asp Gly Ser Arg His lle Ser Thr Ser Arg Gly Leu Glu 85 90 95
Ser Val Leu Lys Arg Arg Gly Gly Gin Gly Ala Pro Ala Ala Pro Val 100 105 110 5
Pro Tyr His Asp Leu Leu Val Lys Arg Gin Asp Gin Trp Ser Asn Phe 115 120 125
Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Ala Asp Asn Asp Pro Ala Ser Leu 130 135 140
GIn GIn Val Glu Lys Met Leu Lys Lys Cys Ser Tyr Gln Val Thr Leu 10 145 150 155 160
Cys Ser Ser Gly Lys Asn Ser Leu Glu lle Leu Arg Lys Arg Arg Glu 165 170 175
Glu Phe Asp Leu Val Leu Ala Asp Ala Asn Leu Pro Asp lle Asp Gly 180 185 190 15
Phe Lys Leu Leu His Val Cys His Thr Glu Leu Ser Leu Pro Val Val 195 200 205
Leu Met Ser Gly Thr Ser Asp Thr Gln Leu Val Met Arg Gly Val Met 210 215 220
Asp Gly Ala Arg Asp Phe Leu lle Lys Pro Leu Arg Val Glu Glu Leu 225 230 235 240
Lys Val Leu Trp GIn His Leu Val Arg Phe Thr Ser Glu lle Thr Lys 245 250 255
Thr Asp Ala Gln Leu Asn Val Val Lys Val Glu Leu Asp Ser Gly Arg 5 260 265 270
Pro Ala Gly Glu Val Ser Thr Ser Gln Asn Gly Ser GIn Cys Ala Glu 275 280 285
Arg Glu Gly Glu Gly Asn Ser Ser Lys Lys GIn Arg Met Asn Trp Ser 290 295 300 10
Asp Glu Met His Gin GIn Phe Val Asn Ala Val Asn Gin Leu Gly lle 305 310 315 320
Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Asp Leu Met Ser Val Glu Gly 325 330 335
Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr 15 340 345 350
Leu Lys Arg Met Ala Asn His GIn Glu Asn Gly Lys Gin Ala Val Met 355 360 365
Ser Thr Asp Thr lle Ala Arg Ala Glu Ala Ala Tyr Gin Gly Gly Met
370 375 380
Pro Gin Gly Gln Gin Met Met Gln Gin Glu His Ser Gly دي Ala Val 385 390 395 400
Gln Tyr Ser Gln Pro His Ala Pro Ser Gly Leu His Gin GIn Ala Met 405 410 415 5
Pro Ala Gin Met His Met Gly Met Met Pro Ala Gly Pro Gin Pro Gly 420 425 430
Ser Met GIn Met Ala Pro His His Val Met Gln Met Pro Asn Gly Gin 435 440 445
Val Met Val Met GIn Gin Met Gly Pro Arg Pro Gly Met Pro Pro Gly 10 450 455 460
Met Pro Gln Gin Met Met Ala Ser Ser Gin Gin Met Gly Met Leu Gin 465 470 475 480
Pro Gly Met Pro Ala Gly Gin Met Leu His Phe Gin His Pro Gin 0 485 490 495 15
Val His GIn His Pro Pro Ser Ser Gly Pro Met His Ala Gly Gly Glu 500 505 510
Met lle Asp Pro Gly Ser Met Gin Arg Leu His Gln GIn Pro His Tyr 515 520 525 lle Val Pro Asn Ala GIn His Met Pro Ala Pro Ala Met Gly Met Pro 530 535 540
Pro Gly Ala Val Gln His Met Glu Tyr Ala Tyr Ser Gln Pro Met Gin 545 550 555 560
Met Ala Gly Trp Pro Val Gln Gly Gin Pro Gly Ser Gin Ala 5 565 570 <210> 17 <211> 674 <212> PRT <213> Oocystis sp. 10 <220> <221 >سمة ميسك 1 <223كبولي ببتيد 5549 polypeptide 7 >400<
Met Leu Ala Phe Thr His ماى Arg Met Thr Thr Ala Pro Ala Leu Ala 15 1 5 10 15
Val Ala Thr Ser His Phe Phe Ala His Val Arg Val Thr Thr Gly Ser
Ser Ala lle Ala Thr Val Phe Ala Ala Arg Ser Arg Gly Ser Gly Leu
Leu Ala Gly Phe Asn Thr Met Glu Asn Val Lys Val Glu Val Pro Glu 60
Val Val Pro Glu Asn Val Asn Phe Pro Ala Gly Leu Lys Val Leu Val 65 70 75 80 5
Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu Lys Val lle Asp Gin Met Leu Arg 85 90 95
Arg Cys Asn Tyr Ala Ala Thr Thr Cys GIn Ser Ser Leu Glu Ala Leu 100 105 110
Glu Leu Leu Arg Ser Ser Lys Glu Asn His Phe Asp Leu Val Leu Ser 10 115 120 125
Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu lle lle 130 135 140
Gly Leu Glu Met Gly Leu Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Glu 145 150 155 160 15
Thr Gly Val Val Phe Arg Gly Val Thr His Gly Ala Val Asp Phe Leu 165 170 175 lle Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu Arg Asn Leu Trp Gln His Val 180 185 190
Val Arg Lys Thr Met Val Val Pro Ser Asn Asp Lys Ala Thr Ser Glu 195 200 205
Glu Asp Gly Glu Glu Ser Lys His Arg Val Asp Arg Lys Arg Lys Glu 210 215 220
Ser Phe His Ser Arg Ala Arg Glu Gln Val Glu lle Ala Cys Ser Val 5 225 230 235 240
Val Pro Ala Leu Leu Trp Pro Thr Val Pro Pro Ser Ser Val His Pro 245 250 255
Thr Ser Ser Ser Phe Leu Arg Ser His Val Leu Leu Leu GIn Arg Ser 260 265 270 10
Ser Gly Gly Lys Asp Val Leu Asp Glu Gly Gly Ser Asn Ala Lys Lys 275 280 285
Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gln Glin Phe Val Asn Ala 290 295 300
Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Asp 15 305 310 315 320
Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu 325 330 335
Gln Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val Ala Gly lle Asn Thr Ala
340 345 350
Thr Gly Ser Arg Asn Gly Lys Gly Arg Ser Asp Val Ser Gly Leu Ser 355 360 365
Gly Met Pro Asn Gly Ser Leu Pro Met Pro Gly Met Met Pro Pro His 370 375 380 5
Met Ala Ala Gly Met Leu Leu Ala Gly Met Ala Ala Asp Val Gly Pro 385 390 395 400
Arg Pro His Pro Phe Pro lle Met Pro Met Pro Ala Met Ala Leu GIn 405 410 415
Gly Met His Gly Gly Met Ala Gin Met Met Gin Leu Pro Pro Gly Met 10 420 425 430
Pro Pro Pro Met Met Met Pro Met Ala Pro Leu Leu Pro Ser Gin Leu 435 440 445
Ala Ala Leu Gly 60 Gln GIn 60 GIn Gln Gln GIn Gin GIn Val Ala 450 455 460 15
Arg Ser Glu Ser Met Pro Ser Glu Asn Gly Val Ala Gly Pro Ser Gly 465 470 475 480
Ser Phe Thr Ala Met Leu Asn Gly Pro Ala Pro Met Glu Ser Ser Pro 485 490 495
Phe Ala Ala Leu GIn Val Phe Gly Pro Pro Gln Gly Met Glu GIn Leu 500 505 510
Thr Gln Gln Gln GIn ماي Gln ما Gin Ala Gly Ala Ala Ala Phe Val 515 520 525
Ala Ala Phe Ala Ala Ala Asn Gly Gly Asp Met GIn Gly Gly Gly Gly 5 530 535 540
Gly Pro Gly Pro Met Leu Gly Gly Ala Gly Gly Ala Gly Pro Leu Leu 545 550 555 560
Gly Gly Val Gly Gly Gly Asp Pro Leu His Gly Gly Gly Gly Ser Ser 565 570 575 10
Ala Leu Gly Gly Arg Pro Met Met Ser Ala Glu Gin Pro Met Gly Gly 580 585 590
Ser Gly Gly Leu Ala Ser Asn Ser Leu Thr Val Gln Gln Asn Asp Leu 595 600 605
Ala GIn Met Cys Ser GIn Leu Asp Val Asn Gly Leu GIn Ala Val Ala 15 610 615 620
Ala Ala Ala Ala Ala Gly Ala Met Gly Ala Pro Gly Gly Ala Gly Gly 625 630 635 640
Ala Met Pro Pro Ser Ser Val Gly Gly Val Gly Pro Asp Met Lys Leu
645 650 655
Thr Glu Gln Asp Asp Phe Phe Ser Phe Leu Leu Lys Asp Ser Asn Leu 660 665 670 lle Asp <210> 18 <211> 488 <212> PRT <213> Micromonas sp. RCC299 <220> 10 >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 18
Met Ser Thr Pro Ala Val Ser Lys Gly Phe Pro lle Gly Leu Arg Val 1 5 10 15 15
Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu Lys lle Val Glu Lys Met
Leu Lys Arg Cys GIn Tyr Glu Val Thr Thr Phe Ser Arg Gly Ala Glu
Ala Leu Lys Thr Leu Arg Glu Arg Lys Asp Asp Phe Asp lle Val Leu 60
Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His 65 70 75 80 lle Ala Leu Glu Leu Asp lle Pro Val Met Met Met Ser Ala Asn Cys 5 85 90 95
Ala Thr Asp Val Val Leu Arg Gly lle lle His Gly Ala Val Asp Tyr 100 105 110
Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu Arg Asn lle Trp GIn His 115 120 125 10
Val Val Arg Arg Lys Arg Glu Ser Ser Gin Gly Asn Leu Arg Ser Gly 130 135 140
Glu Gly Gly Ser Asn Gly Arg Thr Val Ser Gly Gly Ser Thr Gly Glu 145 150 155 160
Gly Gly Gly Lys Asp Ser Lys Gly Ser Ser Glu Gin His Gly Asp Ala 15 165 170 175
Lys Asp Lys Thr Gly Ser Ala Gly Gly Ser Gly Gly Ser Ser Lys Arg 180 185 190
Lys Lys Gly Ser Gly Lys Lys Gly Asp Glu Gly Thr Asp Glu Val Lys
195 200 205
Asp Gly Ser Gly Gly Asp Glu Asn Glu Asp Ser Ser Ala Leu Lys Lys 210 215 220
Pro Arg Val Val Trp Ser Ala Glu Leu His Gln Gln Phe Val Thr Ala 225 230 235 240 5
Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Asp 245 250 255
Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu 260 265 270
GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu GIn Gly Val Asn Ser Gly 10 275 280 285
Gly Ala Pro Gly Gly Gly Pro Gly Phe Met Ser Pro lle Ala Leu Asp 290 295 300
Gly Ser Met Val Gln Gly Gly Pro Gly Gly Arg Val Gly Ser Pro Ala 305 310 315 320 5 lle Gly Gly Pro Asn Gly Pro lle Met Val Gly His Gly His lle Asp 325 330 335
Pro Ala Met Leu Ala Gly Gly Ala Pro Gin Thr lle GIn Met Gly Met 340 345 350
Val Tyr Gly Gly Pro Gly Met Gly Pro Pro Gin Met Met Ala Pro Asn 355 360 365
Gly Lys Gly Gly Gly Gly Met Pro Gly Gly Tyr Val Met Gin Pro Gly 370 375 380
GIn Met Met Ala Pro Asn Gly Gin Met Met Pro Val Gly Gin Met Gly 5 385 390 395 400
Pro Gly Gly Met Met Val Gin Gly Pro Gly Gly Gly Met Met Gin Met 405 410 415
His Asp Gly Gly Met Met Asn Gly Asn Gly Ser Tyr Gly Ser Leu 0 420 425 430 10
Asn Met Lys GIn Gly Asn Gly Val Val Met Met Pro Asn Gly Gly Met 435 440 445
Gly Gly Val Asp Gly Ala lle Pro Asn Met Ala Thr Gly Leu lle Asn 450 455 460
Gly GIn Gly Leu Pro Asp Asp Asp Val Leu Asp Met Phe Leu Lys Asp 15 465 470 475 480
Gly Leu Pro Glu Gly Glu Gly Phe 485 <210> 19
<211> 4 <212> PRT <213> Micromonas pusilla <220> <221كسمة ميسك 5 polypeptide <223>بولي ببتيد 1 >400< 9
Met Thr Ala Glu Lys Lys Glu Leu Lys Val Phe Pro Ala Gly Leu Arg 1 5 10 15
Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu Arg lle Val Glu Lys 10
Met Leu Lys Arg Cys GIn Tyr Glu Val Thr Thr Phe Ser Arg Gly Ala
Glu Ala Leu Glu Thr Leu Arg Ala Arg Arg Asp Asp Phe Asp lle Val 60 15
Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu 65 70 75 80
His lle Ala Leu Glu Leu Asp Val Pro Val Met Met Met Ser Ala Asn 85 90 95
Cys Ala Thr Asp Val Val Leu Arg Gly lle lle His Gly Ala Val Asp 100 105 110
Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu Arg Asn lle Trp Gin 115 120 125
His Val Val Arg Arg Gin Arg Glu Pro Ser Lys Asp Gly Ala Ala Gly 5 130 135 140
Lys Gly Gly Gly Ala Ser Gly Ala Pro Glu Val Ser Gly Asp Thr His 145 150 155 160
Ala Asn Thr Asp Asp Lys Gln Asp Gly Asn Ala Thr Asp Ser Lys Gly 165 170 175 10
Ser Gly Ser GIn Lys Arg Lys Ser Gly Lys Ser Gly Asp Asp Gly Gly 180 185 190
Lys Asp Gly Gly Gly Ser Gly Gly Lys Asp Gly Asp Ala Ser Asn Lys 195 200 205
Gly Asn Asn Asn Lys Arg Lys Lys Gly Lys Ser Asn Asp Ala Thr Glu 15 210 215 220
Thr Ala Gly Gly Ala Gly Val Glu Asp Asn Asp Asp Thr Ser Gly Leu 225 230 235 240
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Pro Glu Leu His Gln Gin Phe Val
245 250 255
Thr Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle 260 265 270
Leu Asp Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 275 280 285 5
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu GIn Gly Val Asn 290 295 300
Asn Asn Gly Thr Val Pro Ser Gly Ala Ala Gly Phe Met Thr Gly Leu 305 310 315 320
Ala lle Asp Gly Val Gly Gly Val Met Gly Pro Pro Thr Thr Gly Ser 10 325 330 335
Pro Ala Met Asn Gly Pro Gly Gly Pro Gly Gly Gly Leu Val Met Gly 340 345 350
Pro Gly His Met Gly Gly Pro His Met Asp Gly Ser Gly Met Met His 355 360 365 15
Met Gly Pro Gly Gly Pro Met Ala Gly Met Thr Val Val Tyr Gly Gly 370 375 380
Gly Met Pro Gly Gly Met Pro Gly Gly Ala Asp Ser Lys Asn Gly Ala 385 390 395 400
Ser Gly Gin Pro Pro Pro Gly Gly Tyr Val Val Met Gly Gly Pro His 405 410 415
Gly Gly Gly Pro Gly Gly Ala Pro Met Met Met Gin His Gly Gly Met 420 425 430
Val Pro Gly Pro Gly Pro Gly Leu Val Pro Gly Pro Gly Gly Ser Leu 5 435 440 445
Met Met Pro Ala Gly Met Met Pro Asp Gly Gly Gly Gly Met Val Gly 450 455 460
Val His Val Gly Pro Gly Val Val Met Gly Gln His Gln Leu Gly Gly 465 470 475 480 10
Lys His Ser Ser Gly Gly Ala Gly Met Ala Gly Gly Ser Ala Ala Gly 485 490 495
Lys Gly Ala Gin Arg Gly Gly Val Gly Gly Ala Phe Asp Val Pro Pro 500 505 510
Thr Asn Gly Ser Leu Asp Ala Asp Glu lle Gly Asp Asp Val Leu Thr 15 515 520 525
Met Phe Leu Lys Asp Gly Leu Pro Glu Met Asn Asp Gly Asp Ala Leu 530 535 540 <210> 20
<211> 6 <212> PRT <213> Sphagnum fallax <220> <221كسمة ميسك 5 polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 20
Met Ser Gly Gly Asp Leu Ser Arg Val Arg Glu Gly Thr Ala Asp Leu 1 5 10 15
Asp Pro Val Met Ala Ser His صاى His Pro Pro Pro Arg GIn Gln Ser 10
His GIn GIn Pro Lys Asn His GIn GIn Glu Ala His 60 ماي His Cys
Ser Ser Ala Glu Thr Thr Ser Pro Asn Asn Thr Ala Arg Gly Ala Gly 60 15
Ala Thr Tyr Gly Lys Met Glu Pro Ala Asp Asp Phe Pro Ala Gly Leu 65 70 75 80
Arg lle Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Ala lle Leu Lys 85 90 95
Lys Met Leu 60 Gln Cys Ser Tyr Gln Val Thr Thr Cys Gly Arg Ala 100 105 110
Thr Arg Ala Leu Glu Leu Leu Arg Glu Asp Lys Asp Lys Phe Asp Leu 115 120 125
Val lle Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu 5 130 135 140
Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Gly 145 150 155 160
Asn Gly Glu Thr Ser Val Val Met Lys Gly lle Thr His Gly Ala Cys 165 170 175 10
Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu Ser Asn lle Trp 180 185 190
Gln His Val Val Arg Lys Leu Arg Ser Glu Pro Lys Glu His Ser Ala 195 200 205
Ser Leu Glu Asp Gly Asp Arg Gin Arg Arg Gly Gly Ala Glu Asp Ala 15 210 215 220
Asp Asn Thr Ser Ser Ala Ala Asp Thr Ala Asp Gly lle Trp Arg Asn 225 230 235 240
Lys Lys Lys Lys Glu Ala Lys Glu Asp Glu Glu Asp Phe Glu Gin Asp
245 250 255
Asn Asp Asp Pro Ser Thr Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val 260 265 270
Glu Leu His GIn GIn Phe Val Ser Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp 275 280 285 5
Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Ser Val Gin Gly Leu 290 295 300
Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu Gin Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu 305 310 315 320
Lys Arg Leu Ser Gly Val Thr Ser Gin Ser Asn Ser Leu Asn Val Ser 10 325 330 335
Phe Gly Gly Pro Asp Ala Gly Tyr Gly Gly Leu Phe Gly Leu Asp Glu 340 345 350
Met Ser Asp Tyr Arg Asn Leu Val Thr Asn Gly His Leu Pro Ala 07 355 360 365 15
Thr lle Ala Ala Leu His His Ala Asn Met Ala Gly Arg Leu Gly Ala 370 375 380
Ser Ser Gly Met Val Gly Pro Ser Ser Pro Leu Asp Pro Ser Val Leu 385 390 395 400
Ala GIn lle Ala Ala Leu 60 Ser Gly Ser Leu Pro Arg Pro Gly Met 405 410 415
Asp Gly Ser Leu GIn Gly Asn GIn Ala Gly Leu Leu GIn Ser Leu Ser 420 425 430
Gly Ala Leu Asp Tyr Asn Ser Leu His Gln Ser His Leu Leu Pro Ala 5 435 440 445 lle Gly Gin Leu Gly 60 Leu Asp Glu Leu Pro Ser Leu Lys Ser Met 450 455 460
Gln His GIn Leu Gly Met Gly Ser Leu Gly Gly Ser Thr Arg Asn Leu 465 470 475 480 10
Ala Gly Ser Pro Asn Glu Glu Leu Thr Met Gin Leu Leu 60 GIn Arg 485 490 495
Ala GIn GIn GIn Ser Gly Gly Ser Pro lle Asn Leu Pro GIn Ala Thr 500 505 510
Gly lle Leu Arg Pro Leu Ser Ser Asn lle Asn Gin Gly Gly Ser Val 15 515 520 525
Pro Asn Leu Val Gly Val lle Pro Gly Thr Ala lle Gly Leu Ser Asn 530 535 540
Met Cys Ser Gly Gly Arg Glu Phe Gly Ser Ser Ser Gly Leu Leu Ser
545 550 555 560
Ala Ser Gly Ser Leu Met GIn Ser Ser Thr Val Glu Ala 60 Asn Leu 565 570 575
Asn Phe Gly Gly Ser Ser Gly Ser Ser Gly Cys Ser Phe GIn Ala Ser 580 585 590 5
Val Leu Ser Ser Lys Thr Gly Gly Leu Glu Asp Leu Asn Pro Ala Lys 595 600 605
Arg Val Arg Thr Thr Tyr Ser Ala Leu Ser His Ser Ser Pro Asp Leu 610 615 620
Gly GIn Ser Ser Arg Pro Ala Trp Leu Gly Ser 0 Glu Gly Leu Val 10 625 630 635 640
His Gly Asp Pro Val Tyr Ser Pro His Gin Leu Ser Leu Pro Arg 07 645 650 655
Asp lle Val Gly Gly lle Gly Ser Ser Gly Arg Pro Ala Tyr Met Gly 660 665 670 15
Ser 0 Ser Met Gly Ser Leu Gly Met Asn Phe Pro Leu Ser Leu Ala 675 680 685
Val Asp Ala Gly Ala Val Arg Pro Ser Leu Thr Arg Gly Gin Ser Leu 690 695 700
Thr Glu GIn Val Ala Ala Asn Arg Glu Leu Lys Phe Pro Lys Glu Glu 705 710 715 720
Arg Gly Arg Asp Asn Leu Met Cys Ala Arg Leu Gly Gly Gly Met lle 725 730 735
Thr Asn Glu Ser Ser Ser Glu Glu Leu Leu Asn Tyr Leu Lys GIn Ser 5 740 745 750
His Glu Gly Leu Gly Phe Met Glu Gly Asp Leu Val Ser Asp Gly Tyr 755 760 765
Pro Val Asp Asn Leu Tyr Val Lys 770 775 10 <210> 1 <211> 5 <212> PRT <213> Physcomitrella patens <220> 15 >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 21
Met Gly Gly Gly Tyr Leu Ser Ser Thr Val Asn Met Gly Glu Ser Arg
1 5 10 15
Asp Gly Gly Ser Pro Ala Met Ala Thr Leu 60 0 Gin GIn Lys His
Gln Pro Leu Asn Pro Asn His GIn Asn Pro Arg Asn Arg Ser Asn Ser 5
Ser Pro Thr Asn Cys Tyr Ser Asn Thr Ala Trp Gly Ala Lys Pro Ala 60
Lys Leu Asp Thr Pro Asp Glu Phe Pro Val Gly Met Arg Val Leu Val 65 70 75 80
Val Asp Asp Asn Pro Thr Cys Leu Met lle Leu Glu Gin Met Leu Val 10 85 90 95
Arg Cys Ala Tyr Arg Val Thr Thr Cys Gly Lys Ala Thr Glu Ala Leu 100 105 110
Ser Met Leu Arg Glu Asp lle Gly Lys Phe Asp Val Val lle Ser Asp 115 120 125 15
Val Asp Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly 130 135 140
Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Val Ser Gly Asn Gly Glu Thr 145 150 155 160
Ser Ala Val Met Lys Gly lle Thr His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Leu 165 170 175
Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu Arg Asn lle Trp Gin His Val Val 180 185 190
Arg Lys Lys Arg Arg Glu Val Lys Ala Val Ala Thr Lys Ser Val Glu 5 195 200 205
Glu Ala Gly Gly Cys Glu Arg Pro Lys Arg Gly Gly Gly Ala Asp Asp 210 215 220
Ala Asp Tyr Thr Ser Ser Ala Thr Asp Thr Thr Asp Ser Asn Trp Lys 225 230 235 240 10
Leu Thr Lys Arg Arg Lys Gly Glu Phe Lys Asp Glu Asn Glu Glu Asp 245 250 255
Asn Glu GIn Glu Asn Asp Asp Pro Ser Thr Leu Lys Arg Pro Arg Val 260 265 270
Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gin Phe Val Ser Ala Val Asn 0 15 275 280 285
Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Gly 290 295 300
Val GIn Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr
305 310 315 320
Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Gly Val Thr Ser Gln Gln Gly Asn 325 330 335
Met Ser Ala His Phe Gly Gly Ser Asp Pro Phe Cys Met Met Pro Pro 340 345 350 5
Asp Met Ser Leu Ala Asn Gly 60 Leu Thr Pro Gln Ala Leu Ala Lys 355 360 365
Phe His Met Leu Gly Arg Met Asn Ala Thr Asn Gly lle Gly Phe Ser 370 375 380
Gly Gly Gly Leu Asp Pro Gly Met Asn Gin Met Phe Leu GIn Asp Leu 10 385 390 395 400
Pro Arg Pro Pro GIn Leu Asn Ser Met Leu Arg Asn Asn Thr Gly Leu 405 410 415
Leu Ala Ser Val Pro Asn Gly Leu GIn His Leu Glu GIn Leu Ser Glu 420 425 430 15
Pro His His Val His Val Val Asn Glu Leu Glu His Tyr Pro Ser Asn 435 440 445
Thr Lys Val Tyr Pro Gin Leu Asn Gly Asn Leu Asp Val Ser Val Gly 450 455 460
Pro Leu Gly Ala Ala Asn Gly Asn Leu Ala Ser Asn Pro Asn Ser Asp 465 470 475 480
Thr Leu Leu Met His lle Leu His Ser Arg Ala Ser 60 Gin Gly Val 485 490 495
Gly Ser Pro Ser Thr Leu Pro Gln Pro Arg Cys Gly Leu Asn Pro Thr 5 500 505 510
His Leu Leu Ser Asn Asp lle Asn Phe Ala Pro Val Gly Ser Leu Pro 515 520 525
Asn Leu Ala Gly Ser Leu Gly Pro Ala Val Gly Leu Ser Ala lle Pro 530 535 540 10
Gly Ser Ala Gly Gly Arg Asp Leu Ser Pro Ser Val Gly Gly Ser Gly 545 550 555 560
Ala Ser Leu Ser Ser Pro Leu Gly Ser Leu Val Arg Arg Pro Leu Met 565 570 575
Ala Glu Glu ماك Ser Asn Pro Val Asn Ser Thr Asn Gly Thr Tyr Ser 15 580 585 590
Met Ala His Ser Gly Gln Ser Pro Lys Pro Ser Gly Asp Thr Leu Pro 595 600 605
Thr Pro Leu Asn Glu Gly Leu Glu 60 GIn Gin Pro Leu Trp Ala Leu
610 615 620
Tyr Gln Asn Pro Met Asn GIn Leu Ser His Gly Pro Ser Gln Gly Phe 625 630 635 640
Pro His Asp Ser Leu GIn Trp Ser Val Leu Thr Glu Asn Leu Ser Phe 645 650 655 5
Gly Asp Met Gly GIn Ser Leu Ser Ala Gly Leu lle Ser Gln Phe Ser 660 665 670
Ser 0 Gly GIn Asp Asn Gly lle Gly Phe Ala Pro Pro Ser Gin Arg 675 680 685
Gly Ser Tyr Thr Arg Gin Ser Val Ser Phe Pro Ala Ser Ser Ala Leu 10 690 695 700
Asp Gly Arg Met Val Arg Ser Ser Tyr Glu Pro 705 710 715 <210> 22 <211> 664 15 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana ARR2 <220> <221 كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 11 >400< 2
Met Val Asn Pro Gly His Gly Arg Gly Pro Asp Ser Gly Thr Ala Ala 1 5 10 15
Gly Gly Ser Asn Ser Asp Pro Phe Pro Ala Asn Leu Arg Val Leu Val 5
Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Met lle Leu Glu Arg Met Leu Met
Thr Cys Leu Tyr Arg Val Thr Lys Cys Asn Arg Ala Glu Ser Ala Leu 60 10
Ser Leu Leu Arg Lys Asn Lys Asn Gly Phe Asp lle Val lle Ser Asp 65 70 75 80
Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His Val Gly 85 90 95
Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala Asp Asp Ser Lys 15 100 105 110
Ser Val Val Leu Lys Gly Val Thr His Gly Ala Val Asp Tyr Leu lle 115 120 125
Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu Lys Asn lle Trp Gin His Val Val
130 135 140
Arg Lys Lys Arg Asn Glu Trp Asn Val Ser Glu His Ser Gly Gly Ser 145 150 155 160 lle Glu Asp Thr Gly Gly Asp Arg Asp Arg 60 GIn Gin His Arg Glu 165 170 175 5
Asp Ala Asp Asn Asn Ser Ser Ser Val Asn Glu Gly Asn Gly Arg Ser 180 185 190
Ser Arg Lys Arg Lys Glu Glu Glu Val Asp Asp GIn Gly Asp Asp Lys 195 200 205
Glu Asp Ser Ser Ser Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu 10 210 215 220
Leu His Gln Gln Phe Val Ala Ala Val Asn GIn Leu Gly Val Asp Lys 225 230 235 240
Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Glu Met Met Asn Val Pro Gly Leu Thr 245 250 255 15
Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Arg 260 265 270
Arg Leu Gly Gly Val Ser Gln His Gln Gly Asn Met Asn His Ser Phe 275 280 285
Met Thr Gly مي Asp GIn Ser Phe Gly Pro Leu Ser Ser Leu Asn Gly 290 295 300
Phe Asp Leu GIn Ser Leu Ala Val Thr Gly Gin Leu Pro Pro GIn Ser 305 310 315 320
Leu Ala 60 Leu Gin Ala Ala Gly Leu Gly Arg Pro Thr Leu Ala Lys 5 325 330 335
Pro Gly Met Ser Val Ser Pro Leu Val Asp GIn Arg Ser lle Phe Asn 340 345 350
Phe Glu Asn Pro Lys lle Arg Phe Gly Asp Gly His Gly 60 Thr Met 355 360 365 10
Asn Asn Gly Asn Leu Leu His Gly Val Pro Thr Gly Ser His Met Arg 370 375 380
Leu Arg Pro Gly Gin Asn Val Gln Ser Ser Gly Met Met Leu Pro Val 385 390 395 400
Ala Asp Gin Leu Pro Arg Gly Gly Pro Ser Met Leu Pro Ser Leu Gly 15 405 410 415 صا GIn Pro lle Leu Ser Ser Ser Val Ser Arg Arg Ser Asp Leu Thr 420 425 430
Gly Ala Leu Ala Val Arg Asn Ser lle Pro Glu Thr Asn Ser Arg Val
435 440 445
Leu Pro Thr Thr His Ser Val Phe Asn Asn Phe Pro Ala Asp Leu Pro 450 455 460
Arg Ser Ser Phe Pro Leu Ala Ser Ala Pro Gly lle Ser Val Pro Val 465 470 475 480 5
Ser Val Ser Tyr Gln Glu Glu Val Asn Ser Ser Asp Ala Lys Gly Gly 485 490 495
Ser Ser Ala Ala Thr Ala Gly Phe Gly Asn Pro Ser Tyr Asp lle Phe 500 505 510
Asn Asp Phe Pro Gin His GIn GIn His Asn Lys Asn lle Ser Asn Lys 10 515 520 525
Leu Asn Asp Trp Asp Leu Arg Asn Met Gly Leu Val Phe Ser Ser Asn 530 535 540
Gln Asp Ala Ala Thr Ala Thr Ala Thr Ala Ala Phe Ser Thr Ser Glu 545 550 555 560 15
Ala Tyr Ser Ser Ser Ser Thr GIn Arg Lys Arg Arg Glu Thr Asp Ala 565 570 575
Thr Val Val Gly Glu His Gly GIn Asn Leu GIn Ser Pro Ser Arg Asn 580 585 590
Leu Tyr His Leu Asn His Val Phe Met Asp Gly Gly Ser Val Arg Val 595 600 605
Lys Ser Glu Arg Val Ala Glu Thr Val Thr Cys Pro Pro Ala Asn Thr 610 615 620
Leu Phe His Glu Gln Tyr Asn Gin Glu Asp Leu Met Ser Ala Phe Leu 5 625 630 635 640
Lys Gin Glu Gly lle Pro Ser Val Asp Asn Glu Phe Glu Phe Asp Gly 645 650 655
Tyr Ser lle Asp Asn lle Gin Val 660 10 <210> 23 <211> 1036 <212> PRT <213> Arabidopsis halleri <220> 15 >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد ARRI18/SGI <400> 23
Leu Ser Lys Lys GIn Asn Glu Asp Ala Ser Gly Arg Lys Glu Glu Asp
1 5 10 15
Gly Lys Gly Asn Glu His Asn Gly Met Glu Ser Cys Thr Arg Met Lys
Arg Thr Val Trp Thr Val Glu Leu His Gln Lys Phe Val Asn Ala Phe 5
GIn GIn Leu Gly Leu Asp Lys Ala Ser Pro Glu GIn lle His Ala Leu 60
Met Asn Val Glu Gly Leu Pro Val lle Asn Val Ala Ser His Leu GIn 65 70 75 80
Lys Tyr Arg Leu Phe Leu Lys Lys lle Tyr Glu Gly Gln Gin Leu Asp 10 85 90 95
Met Ala Thr lle Gin Leu Leu Leu Ser Ala Gly Ser His Phe Pro 0 100 105 110
Thr Pro Trp Thr Asn His Cys Ser Ser Phe lle Gln GIn Gly His His 115 120 125 15
Gln Asn Ser Ser Asn Ser Ser Glu Thr Tyr His Thr Thr Leu Ser Pro 130 135 140
Arg Val Gin Lys Val Asn Thr Phe GIn Pro Ser Ser Ser Pro Leu Lys 145 150 155 160
Pro Leu Leu Phe Pro Lys Ser Asn lle Ser Ala Phe Lys Glu Asp Phe 165 170 175
Lys Ser lle Lys Glu Pro Ala lle Val Gly Asp Ser Ser Leu Asp Ser 180 185 190
Ser Lys Pro Arg Asn Ser Phe GIn Thr Ala Ser Lys Phe Pro Lys Thr 5 195 200 205
Asp Pro Cys Thr Gly Ser Tyr lle lle Glu lle Met Thr Glu Pro Tyr 210 215 220
Tyr Gly Lys Ser Ser Arg Arg His Ser Asn Phe Ser Ala Tyr Met Gly 225 230 235 240 10
Asp Phe Lys Ser lle Lys Asp Pro Glu lle Val Gin Glu Ser Arg Thr 245 250 255
Arg Lys Asn His Gly Arg Val Val Trp Ser His Glu Leu His GIn Lys 260 265 270
Phe Leu Asn Ala lle Asp GIn Leu Gly Gly Asn Glu Lys Ala lle Pro 15 275 280 285
Lys Lys lle Leu Ala Val Met Asn Val Glu Gly Leu Thr Arg Leu Asn 290 295 300
Val Ala Thr His Leu GIn Lys Tyr Arg Gin Cys Cys Ser Ala Glu Ala
305 310 315 320
Gln GIn Leu Asn Met Ala Thr Arg Lys Leu Pro Ser Ser Glu His Leu 325 330 335
Pro GIn Ser Pro Ser Thr Asn His His Ser Ser Leu Ser Pro Arg Val 340 345 350 5
Gln Asp Val Asn lle Arg Leu Trp Ser Ser Ser Pro Lys Arg GIn Asp 355 360 365
Gin lle Leu Val Tyr Val Leu Phe Ser Phe Glu Asn Asp Asn Gly Arg 370 375 380
Glu Glu Thr Thr Cys Arg Arg lle Ala Ser Thr Met Glu Leu Gly Ser 10 385 390 395 400
Thr Glu Asp Gly Arg His Asp Lys Phe Pro Val Gly Met Arg Val Leu 405 410 415
Ala Val Asp Asp Asn Pro Thr Cys Leu Arg Lys Leu Glu Glu Leu Leu 420 425 430 15
Leu Arg Cys Lys Tyr His Val Thr Lys Thr Met Glu Ser Arg Lys Ala 435 440 445
Leu Glu Leu Leu Arg Glu Asn Ser Asn Met Phe Asp Leu Val lle Ser 450 455 460
Asp Val Glu Met Pro Asp Thr Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu lle Gly 465 470 475 480
Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Leu Ser Ala His Ser Asp Tyr 485 490 495
Asp Ser Val Met Lys Gly lle lle His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Val 5 500 505 510
Lys Pro Val Gly Leu Lys Glu Leu GIn Asn lle Trp His His Val Val 515 520 525
Lys Lys Asn lle Lys Ser Tyr Ala Lys Asn lle Gly Pro Ser Arg 0 530 535 540 10
Leu Leu Pro Pro Ser Glu Ser Asn Leu Val Pro Ser Ala Ser Lys Lys 545 550 555 560
Arg Lys Glu Lys Ala Ser Asp Ser Gly Asp Glu Asp Asp Ser Asp Arg 565 570 575
Glu Glu Asp Asp Gly Glu Gly Ser Glu Gin Asp Gly Glu Glu Ser Gly 15 580 585 590
Thr Arg Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser 0 Glu Leu His GIn Lys 595 600 605
Phe Val Ser Ala Val GIn Gin Leu Gly Leu Asp Lys Ala Val Pro Lys
610 615 620
Lys lle Leu Asp Leu Met Ser lle Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val 625 630 635 640
Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Lys lle Asp Glu 645 650 655 5
Gly GIn GIn GIn Asn Met Thr Pro Asp Ala Phe Gly Thr Arg Asp Ser 660 665 670
Ser Tyr Phe GIn Met Ala GIn Leu Asp Gly Leu Arg Asp Phe Thr Ala 675 680 685
Thr Arg Gin lle Pro Ser Ser Gly Leu Leu Ser Arg Ser His Leu Thr 10 690 695 700
Lys Leu GIn Pro Pro Met Tyr Ser Ser lle Asn Leu Gln Gly Met Asn 705 710 715 720
Ser Ser Ser Phe lle Gln GIn Gly His His His Asn Ser Ser Asn Ser 725 730 735 15
Ala Asn Pro Phe Gly Thr Tyr His Thr Thr Leu Ser Pro Arg lle Gin 740 745 750
Asn Val Asn Leu Leu GIn Arg Thr Ser Ser Pro Leu Glu Thr Leu 0 755 760 765
Phe Pro Arg Ser Lys Ser Tyr lle Gly Asp Phe Lys Gly lle Gly Asp 770 7175 780
Arg Ala Val Gly Gly Ser Phe Leu Asp Ser Cys Met Pro Phe Gly Ser 785 790 795 800
Ser Ser Thr Ser Leu Pro Ser Ala Ser Thr Asn Thr Leu Met Leu Gin 5 805 810 815
Ala Asn Tyr Thr Gin Pro Leu His lle Ala Ser Asp Gly Asn Gin Pro 820 825 830
Cys lle Glu Gly Thr Pro Ser Asn Ser Ala Ser Pro Asn lle Ser Phe 835 840 845 10
Gln Gly Leu Ser Arg Phe Pro Ser His Ser Trp Gln Gly Asn Leu Asn 850 855 860
Thr Thr Arg Phe Pro Pro Ser Ser Leu Pro Leu Asn Gin Ala Phe Leu 865 870 875 880
Pro Asp GIn Val Thr Cys Ala Gly Asn Asn Leu Gly Asp Cys Thr Ser 15 885 890 895
Leu Val Ser Ala Gly Asn Pro Gly Gly Glu Met Gin Cys Glu Pro 07 900 905 910
Leu Leu Gly Gly Phe Met Gin Asn Met Asn Pro Leu Asp Gly 60 Lys
915 920 925
Trp Glu Gln Gln Asn Ser Met Leu Asn Asn Pro Phe Gly Asn lle Glu 930 935 940
Tyr Pro Leu Ser Ala Asp Asn Met Val Phe Arg Asp Asn Asn Ala Thr 945 950 955 960 5
Arg Asn Lys Gly Leu Asp Glu Ser Leu Met Asn Pro lle Asp Asn Ser 965 970 975
Gln Glu Tyr Val Gly Lys Ala Thr Thr Met Leu Asp Pro Glu Met Lys 980 985 990
Ser Gly Lys Pro Glu Asn Asp Asn Gin His Asp Val Phe Asp Asp lle 10 995 1000 1005
Met Asn Glu Met Met Lys Gin Glu Glu Asn Asn Gly Met Val Ser 1010 1015 1020
Val Ala Thr Arg Phe Gly Phe Asp Ser Phe Pro Pro Pro 1025 1030 1035 15 <210> 24 <211> 4 <212> PRT <213> Arabidopsis lyrata
<220> <221كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 4
Met Gly Asp Phe Lys Ser lle Lys Glu Pro Glu lle Val 60 Glu Ser 5 1 5 10 15
Arg Thr Arg Lys Asn His Gly Arg Val Val Trp Ser His Glu Leu His
Gln Lys Phe Leu His Ala lle Asp Gin Leu Gly Gly Asn Asp Lys Ala 10 lle Pro Lys Lys lle Leu Ala Val Met Asn Val Glu Gly Leu Thr Arg 60
Leu Asn Val Ala Thr His Leu GIn Lys Tyr Arg Gin Cys Cys Ser Thr 65 70 75 80
Glu Ala GIn GIn Leu Asn Met Ala Thr Arg Lys Leu Pro Ser Ser Glu 15 85 90 95
His Leu Pro GIn Ser Pro Ser Thr Asn His His Ser Ser Leu Ser Pro 100 105 110
Arg Val GIn Asp Asn Asp Asn Gly Arg Glu Glu Thr Thr Cys Arg Arg
115 120 125 lle Ala Ser Thr Met Glu Leu Gly Ser Thr Glu Asp Gly Arg His Asp 130 135 140
Lys Phe Pro Val Gly Met Arg Val Leu Ala Val Asp Asp Asn Pro Thr 145 150 155 160 5
Cys Leu Arg Lys Leu Glu Glu Leu Leu Leu Arg Cys Lys Tyr His Val 165 170 175
Thr Lys Thr Met Glu Ser Arg Lys Ala Leu Glu Leu Leu Arg Glu Asn 180 185 190
Ser Asn Met Phe Asp Leu Val lle Ser Asp Val Glu Met Pro Asp Thr 10 195 200 205
Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu lle Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val 210 215 220 lle Met Leu Ser Ala His Ser Asp Tyr Asp Ser Val Met Lys Gly lle 225 230 235 240 5 lle His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Val Lys Pro Val Gly Leu Lys Glu 245 250 255
Leu GIn Asn lle Trp His His Val Val Lys Lys Asn lle Lys Ser Tyr 260 265 270
Ala Lys Asn lle Gly Pro Ser Arg GIn Leu Leu Pro Pro Ser Glu Ser 275 280 285
Asn Leu Val Pro Ser Ala Ser Lys Lys Arg Lys Glu Lys Ala Asn Asp 290 295 300
Ser Gly Asp Glu Asp Asp Ser Asp Arg Glu Glu Asp Asp Gly Glu Gly 5 305 310 315 320
Ser Glu GIn Asp Gly Asp Glu Ala Gly Thr Arg Lys Lys Pro Arg Val 325 330 335
Val Trp Ser GIn Glu Leu His GIn Lys Phe Val Ser Ala Val Gln 07 340 345 350 10
Leu Gly Leu Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Asp Leu Met Ser 355 360 365 lle Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu Gin Lys Tyr 370 375 380
Arg Leu Tyr Leu Lys Lys lle Asp Glu Gly 60 GIn Glin Asn Met Thr 15 385 390 395 400
Pro Asp Ala Phe Gly Thr Arg Asp Ser Ser Tyr Phe Gin Met Ala GIn 405 410 415
Leu Asp Gly Leu Arg Asp Phe Thr Ala Thr Arg Gin lle Pro Ser Ser
420 425 430
Gly Leu Leu Ser Arg Ser His Leu Thr Lys Leu Gln Pro Pro Met Tyr 435 440 445
Ser Ser lle Asn Leu GIn Gly Met Asn Ser Ser Ser Phe lle Gln 0 450 455 460 5
Gly His His His Asn Ser Ser Asn Ser Ala Asn Pro Phe Gly Thr Tyr 465 470 475 480
His Thr Thr Leu Ser Pro Arg lle GIn Asn Val Asn Leu Phe GIn Arg 485 490 495
Thr Ser Ser Pro Leu Glu Thr Leu Gin Phe Pro Arg Ser Lys Ser Tyr 10 500 505 510 lle Gly Asp Phe Lys Gly lle Gly Asp Arg Ala Val Gly Gly Ser Phe 515 520 525
Leu Asp Ser Cys Met Pro Phe Gly Ser Ser Ser Thr Ser Leu Pro Ser 530 535 540 15
Ala Ser Thr Asn Thr Leu Met Leu GIn Ala Asn Tyr Thr Gin Pro Leu 545 550 555 560
His lle Ser Ser Asp Gly Asn Gin Pro Cys lle Glu Gly Thr Pro Ser 565 570 575
Asn Ser Ala Ser Pro Asn lle Ser Phe Gin Gly Leu Ser Arg Phe Pro 580 585 590
Ser His Ser Trp GIn Gly Asn Leu Asn Thr Thr Arg Phe Pro Pro Ser 595 600 605
Ser Leu Pro Leu Asn Pro Ala Phe Leu Pro Asp Gin Val Thr Cys Ala 5 610 615 620
Gly Asn Asn Leu Gly Asp Cys Thr Ser Leu Val Ser Ala Gly Asn Pro 625 630 635 640
Gly Gly Glu lle GIn Cys Glu Pro GIn Leu Leu Gly Gly Phe Met GIn 645 650 655 10
Asn Met Asn Pro Leu Asp Gly 60 Lys Trp Glu GIn Gin Asn Cys Thr 660 665 670
Met Leu Asn Asn Pro Phe Gly Asn lle Glu Tyr Pro Leu Pro Ala Asp 675 680 685
Asn Met Val Phe Arg Asp Asn Asn Ala Thr Arg Ser Lys Gly Leu Asp 15 690 695 700
Glu Ser Leu Met Asn Pro lle Asp Asn Ser 0 Glu Tyr Val Gly Lys 705 710 715 720
Ala Thr Thr Met Leu Asp Pro Glu Met Lys Ser Gly Lys Pro Glu Asn
725 730 735
Asp Asn Gin His Asp Val Phe Asp Asp Leu Met Asn Glu Met Met Lys 740 745 750
Gln Glu Glu Asn Asn Gly Met Val Ser Val Ala Thr Arg Phe Gly Phe 755 760 765 5
Asp Ser Phe Pro Pro Pro 770 <210> 5 <211> 578 <212> PRT 10 <213> Helianthus annus <220> >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 25 5
Met Thr Thr Gly Ser Ser Phe Gly Ser Gly Ser Leu Gly Cys Lys GIn 1 5 10 15
Glu Thr Gly Val Pro Asp Gin Phe Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val
Val Asp Asp Asp Val lle Cys Leu Lys lle Leu Glu Glin Met Leu Arg
Arg Cys Ser Tyr His Val Thr Thr Cys Ser GIn Ala Thr Ala Ala Leu 60
Asn Leu Leu Arg Glu Arg Lys Gly Cys Phe Asp Val Val Leu Ser Asp 5 65 70 75 80
Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly 85 90 95
Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala Asp Gly Arg Thr 100 105 110 10
Asn Leu Val Leu Arg Gly lle Arg His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle 115 120 125
Lys Pro lle Arg Glu Glu GIn Leu Lys Asn lle Trp Gln His Val lle 130 135 140
Arg Lys Lys Trp Asn Glu Asn Lys Glu His Glu His Ser Gly Ser Val 15 145 150 155 160
Asp Asp Lys Asp Arg His Lys Arg Gly Gly Asp Asp Asn Asp Tyr Ala 165 170 175
Ser Ser Val Asn Glu Gly Gly Asp Gly lle Leu Thr Ser His Lys Lys
180 185 190
Lys Arg His Asn Asn Lys Glu Glu Asp Asp Gly Glu Leu Glu Thr Asp 195 200 205
Glu Pro Gly Gly Ser Lys Lys Ala Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu 210 215 220 5
His Gin GIn Phe Val Thr Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala 225 230 235 240
Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg 245 250 255
Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg 10 260 265 270
Leu Ser Gly Val Ala Gin GIn Gly Gly Gly Pro Asn Ser Phe Cys Gly 275 280 285
Ser lle Asp Gln Asn Pro Lys Leu Ala Ser Tyr Ala Arg Phe Glu lle 290 295 300 15
Gln Ala Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Gin Thr Leu Val Ala 305 310 315 320
Leu His Ala Glu Leu Leu Gly GIn Pro Thr Ala Asn Val Gly Met Pro 325 330 335
Val Leu Asp His GIn Pro Leu Met GIn Pro Ser Lys Cys Gly Pro Val 340 345 350
Asp His Val Met Ser Tyr Gly GIn Thr Leu Pro Ser Asn Val Thr Lys 355 360 365
GIn Val Pro GIn Pro Ala lle Glu Asp Val His Ser Gly Leu Gly Ala 5 370 375 380
Trp His Ser Asn Asn Met Val Gly Gly Tyr Gly Gin Leu Gly Gly GIn 385 390 395 400
Asn Trp His Asn Met Leu Leu Gly Met Leu GIn Ser GIn Ser His 0 405 410 415 10
Leu GIn Lys Gin Ser lle Thr Val Gin Pro Ser Arg Leu Val Val Pro 420 425 430
Ser GIn Ser Ser Asn Phe Gin Ala Val Asn Asn Gly Val Pro Val Asn 435 440 445
GIn Thr Thr Gly Phe Asn Asn Ser Thr Val lle Asn Tyr Ala Val Gly 15 450 455 460
Gln Arg Thr Glu Arg Asp Val Glu Asn Gin lle Gly Gly Gln Ser Ser 465 470 475 480
Val Ser Asn lle Ser Val Lys Glu Met Gly Glu Lys GIn lle Ser Phe
485 490 495
Gly Glu Ser Val His Val Leu Asp Gln Gly Ser Leu Arg Asn Leu Gly 500 505 510
Phe Val Gly Lys Lys Ser Ser lle Pro Ser Arg Phe Ala Val Tyr Glu 515 520 525 5
Ala Ala Glu Ser Leu Thr His Asn Leu Asn Tyr Gly Asp Asn Asn Gly 530 535 540
Glu Arg Arg Val Lys Gln Glu Pro Asn lle Glu Phe Leu Glu Asn Ser 545 550 555 560
Lys Ala Gly Ala His Arg Val Ser GIn Asn Asp Leu Met Ser Lys Gin 10 565 570 575
Val Arg <210> 26 <211> 428 15 <212> PRT <213> Vitis vinifera <220> كسمة ميسك 221<
<223> GSVIVT01011650001 <400> 26
Met Ala Ala Leu Leu Lys Val Pro Pro Gln Ser Ser Gly Gly Thr Asn 1 5 10 15
Gly Ser Cys Lys Ala Asp Val Val Val Ser Asp GIn Phe Pro Ala Gly 5
Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Val Thr Cys Leu Lys lle Leu
Glu GIn Met Leu Arg Arg Cys Leu Tyr His Val Thr Thr Cys Ser Gin 60 10
Ala Thr lle Ala Leu Asn lle Leu Arg Glu Lys Lys Gly Cys Phe Asp 65 70 75 80 lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Tyr Lys Leu 85 90 95
Leu Glu His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser 15 100 105 110
Ala Asp Gly Arg Thr Ser Ala Val Met Arg Gly lle Arg His Gly Ala 115 120 125
Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro lle Arg Glu Glu Glu Leu Lys Asn lle
130 135 140
Trp Gln His Val Val Arg Lys Lys Trp Asn Glu Asn Lys Glu His Glu 145 150 155 160
His Ser Gly Ser Leu Glu Asp Asn Asp Arg His Lys Arg Gly Gly Glu 165 170 175 5
Asp Ala Glu Tyr Ala Ser Ser Val Asn Glu Gly Ala Glu Gly lle Leu 180 185 190
Lys Gly GIn Lys Lys Arg Arg Asp Ser Lys Asp Glu Asp Asp Gly Glu 195 200 205
Leu Glu Asn Glu Asp Pro Ser Thr Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp 10 210 215 220
Ser Val Glu Leu His Gln Gln Phe Val Ser Ala Val Asn GIn Leu Gly 225 230 235 240 lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro 245 250 255 15
Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu 260 265 270
Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Gly Val Ala Gin GIn Gin Gly Gly lle Pro 275 280 285
Asn Ser Phe Cys Gly Pro Val Glu Pro Asn Val Lys Leu Gly Ser Leu 290 295 300
Gly Arg Phe Asp lle Gin Ala Leu Ala Ala Ser Gly 60 lle Pro Pro 305 310 315 320
GIn Thr Leu Ala Ala Leu GIn Ala Glu Leu Leu Gly Arg Pro Thr Ser 5 325 330 335
Asn Leu Val Leu Pro Ala Met Asp GIn Pro Ala Leu Leu GIn Ala Ser 340 345 350
Leu GIn Gly Pro Lys Cys lle Pro Val Glu His Gly Val Ala Phe Gly 355 360 365 10
Gln Pro Leu Val Lys Cys GIn Thr Asn lle Ser Lys His Phe Pro Pro 370 375 380
Thr Val Val Ser Thr Glu Asp Val Pro Ser Gly Phe Gly Ala Trp Pro 385 390 395 400
Ser Asn Ser Leu Gly Thr Val Gly Thr Ser Gly Ser Leu Gly Gly Leu 15 405 410 415
Ser Ala GIn Asn Asn Asn lle Leu Met Asp Met Lys 420 425 <210> 27
<211> 9 <212> PRT <213> Amborella trichopoda <220> <221كسمة ميسك 5 polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 27
Met Ala Asn Val Gin Lys Leu Pro His Ser Ser lle Ser Thr Ala Ser 1 5 10 15
Ser Tyr Gly Ser Cys Arg Gly Glu Gly Val Pro Asp Gin Phe Pro Ala 10
Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Thr Thr Cys Leu Arg lle
Leu Glu GIn Met Leu Arg Lys Cys Met Tyr Lys Val Thr Thr Cys Cys 60 15
Arg Ala Thr Asp Ala Leu Asp Thr Leu Arg Gly Ser Lys Gly Cys Phe 65 70 75 80
Asp Val Val lle Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys 85 90 95
Leu Leu Glu His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met 100 105 110
Ser Ala Asp Ala Arg Phe Ser Ala Val Met Lys Gly lle Lys His Gly 115 120 125
Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu Lys Asn 5 130 135 140 lle Trp GIn His Val Val Arg Lys Lys Trp Asn Glu Thr Lys Glu His 145 150 155 160
Asp Gin Ser Gly Ser lle Glu Asp Asn Glu Arg His Lys Arg Gly Ser 165 170 175 10
Asp Asp Ala Glu Tyr Ala Ser Ser Val Asn Glu Gly Thr Asp Gly Asn 180 185 190
Trp Lys Val GIn Lys Lys Arg Lys Asp Ser Lys Glu Glu Glu Asp Asp 195 200 205
Gly Glu GIn Glu Asn Glu Asp Pro Ser Ala Ala Lys Lys Pro Arg Val 15 210 215 220
Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn GIn Phe Val Asn Ala Val Asn 07 225 230 235 240
Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn
245 250 255
Val GIn Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe 260 265 270
Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Gly His GIn Ala Gly Val Ser Ser 275 280 285 5
Ser Phe Cys Gly Ser Val Asp Pro Asn Ser Lys Leu Gly Pro Leu Ser 290 295 300
Gln Leu Asp lle Arg Ala Leu Thr Ala Ser Gly Gin lle Pro Ser Gin 305 310 315 320
Thr Leu Ala Ala Leu GIn Ala Glu Leu Leu Gly Arg Pro Ser Asn Asn 10 325 330 335
Val Ala Met Pro Val Tyr Gly Gln Thr Leu Val Lys Cys Gln Pro Asn 340 345 350
Leu Pro Lys Gln Phe Pro Gin Pro Asn Leu Pro Val Asp Asp Val GIn 355 360 365 15
Ser Ser Leu Ser lle Trp GIn His His Leu Ser Ser Gly Met Pro Leu 370 375 380
Gly Gly Leu Asn Pro Gln Asn Asn Gly Leu Leu Met 60 GIn Gin 07 385 390 395 400
GIn Leu Thr lle Glu Ser Asn Arg Pro Cys Asn Val GIn Pro Ser Cys 405 410 415
His Val Ala Pro Ser Asn Gly Gly Phe Thr Met Arg Asn Asn Pro Thr 420 425 430
Ser Ser Asn Ala Ser Ser Val Glu Tyr Asn Ser Leu Leu Ser Ser GIn 5 435 440 445
Gly Asp Val Gly Gin lle Ser Gln Ala Ser Gly Ser Asp Leu Ala Thr 450 455 460
Thr Val GIn Ser Asn Gly Gly Phe Lys Ser Leu Asp Tyr Arg Asn Met 465 470 475 480 10
Gly GIn Val Ser Leu Glu Ser Thr Ser Asp Leu Val Ser Thr Gln Asn 485 490 495
Asn Gly Phe Lys Gly Met Glu Leu Arg Asn Val Gly Ser Leu Gly Gly 500 505 510
Tyr Pro Leu Ser Ser Ser Val Ser Ala Gly Ser Thr Lys Thr Glu Asn 15 515 520 525
Gly GIn Ser Phe Ser Gin Val Arg Thr Gly Pro Arg Met Ser Met Gly 530 535 540
Pro Thr Gly Gln Phe Val Gly Pro Pro Thr lle Arg Arg Leu Pro Met
545 550 555 560
Val Asp Gly Gly Thr His Arg Asn Ser Leu Gly Phe Val Gly Lys Gly 565 570 575
Val Ser lle Pro Ser Arg Phe Met Pro Asp Ser Gly Ser Pro Thr Gly 580 585 590 5
Val Gly Glu Glu Cys Thr Leu Pro Lys Gln Glu Val Asp Pro Asp Phe 595 600 605
Phe Asp Ser Leu Lys Val Gly Pro Val Gly Val Gln His Tyr Ala Ser 610 615 620
Gly Asp Leu Met Ser Val Leu Ser Lys 60 60 Gin Ala Ser Thr Gly 10 625 630 635 640
Asn Leu Asp Cys Glu Phe Gly lle Asp Gly Tyr 60 Leu Gly Asn lle 645 650 655
His Val Lys <210> 28 <211> 669 <212> PRT <213> Ricinus communis
<220> <221كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 28
Met Ala Ala Leu GIn Arg Val Ala Ser Ser Val Ser Ala Thr Ala Ser 5 1 5 10 15
Asn Tyr Ser Ser Cys Lys Gly Asn Gly Val Val Thr Ala Thr Ala Asp
Val Ala Val Ser Asp Gln Phe Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val 10
Asp Asp Asp Thr Thr Cys Leu Arg lle Leu Glu Gln Met Leu Arg Arg 60
Cys Leu Tyr His Val Thr Thr Cys Ser Gln Ala Lys Val Ala Leu Asn 65 70 75 80
Leu Leu Arg Glu Arg Lys Gly Cys Phe Asp Val Val Leu Ser Asp Val 15 85 90 95
His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His Val Gly Leu 100 105 110
Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala Asp Gly Arg Thr Ser
115 120 125
Ala Val Met Arg Gly lle Arg His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys 130 135 140
Pro lle Arg Glu Glu Glu Leu Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg 145 150 155 160 5
Lys Lys Trp His Glu Asn Lys Glu lle Glu His Ser Gly Ser Leu Glu 165 170 175
Asp Asn Asp Arg His Lys Arg Gly Asn Glu Asp Ala Glu Tyr Thr Ser 180 185 190
Ser Val Asn Glu Gly Thr Glu Gly Val Leu Lys Gly Gin Lys Arg Arg 10 195 200 205
Ser Asn Ser Lys Asp Glu Asp Asp Gly Glu Pro Asp Ser Asp Asp Pro 210 215 220
Ser Thr Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn 225 230 235 240 5
Gln Phe Val Ser Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro 245 250 255
Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn 260 265 270
Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser 275 280 285
Gly Val Ala 60 GIn Gly Gly lle Ser Ser Thr Phe Cys Gly Pro Met 290 295 300
Asp Ser Asn Val Lys Leu Asn Ser Leu Gly Arg Phe Asp lle Gin Ala 5 305 310 315 320
Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Gin Thr Leu Ala Ala Leu His 325 330 335
Ala Glu Leu Phe Gly Arg Pro Thr Gly Ser Leu Val Thr Thr Met Asp 340 345 350 10
GIn Pro Thr Leu Leu Gin Ala Ser Arg Gin Ser Pro Lys Cys lle Pro 355 360 365
Val Glu His Gly Val Thr Phe Gly Gin Pro lle Val Lys Cys Ser Ser 370 375 380
Gly lle Ser Lys His Phe Pro Gln Asn Met Val Ser Val Glu Glu Val 15 385 390 395 400
Ser Ser Gly Tyr Gly Ala Trp Pro Ser Asn Ser Leu Gly Thr Val Gly 405 410 415
Pro Ser Thr Asn Leu Gly Gly Met Thr Thr GIn Asn Gly Asn Met Leu
420 425 430
Met Asp lle Phe His 60 Gin GIn Lys 60 GIn GIn Pro Gln ماي Gin 435 440 445
Gln Ser Leu Ala Asp Pro Ser Arg Ser lle Asn Val Gln Pro Ser Cys 450 455 460 5
Leu Val Val Pro Ser GIn Ser Ser Ala Cys Phe GIn Ala Gly Asn Ser 465 470 475 480
Pro Ala Ser Val Asn GIn Ser Asn Phe Asn Arg Asn Val Val lle Asp 485 490 495
Tyr Ser Leu Leu Ser Ser GIn Ser Asn Ash Ser Ala Leu Asn lle Gly 10 500 505 510
His lle Pro Glu Gly Asp Leu Lys Thr Thr Gly Ala Val Asn Gly Tyr 515 520 525
Ser Ala Pro Gly Ser Leu Ser Pro Pro Ala Ser Ser Cys Ser Val Asn 530 535 540 15
Ala Asp Ser Gly Val Pro Arg GIn Val Gin Asn Pro Thr Leu Ala Phe 545 550 555 560
Gly Ala Val Arg GIn Leu Pro Ala Leu Ser Pro Asn lle Phe Asn lle 565 570 575
Gln Gly Ser Tyr Gly Val Arg Ser Asp Asp lle Leu Asp GIn Gly Pro 580 585 590
Phe Phe Lys Asn Leu Gly Phe Val Gly Lys Gly Thr Cys lle Pro Ser 595 600 605
Arg Phe Ala Val Asp Glu Phe Glu Thr Pro Ser Ser Asn Leu Ser His 5 610 615 620
Gly Lys Leu Tyr Val Glu Asn Asn Asp Asn Lys Val Lys Gln Glu Pro 625 630 635 640
Asn lle Asp Phe Thr Asp Thr Ser Arg Val Gly lle Pro Val Leu 0 645 650 655 10
Gln Tyr Pro Pro Asn Asp Leu Met Ser Val Phe Thr Glu 660 665 <210> 29 <211> 654 <212> PRT 15 <213> Solanum lycopersicum <220> >سمة ميسك 221< <223> Solyc049008050.2.1
<400> 29
Met Val Ser Met Ser Gly Glu Val Ala Thr Cys Lys Ser Glu Ala Thr 1 5 10 15
Val Val Thr Asp His Phe Pro Val Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp 5
Asp Asp Val Val Cys Leu Arg lle lle Glu Gin Met Leu Arg Arg Cys
Lys Tyr Ser Val Thr Thr Cys Thr Gln Ala Met Val Ala Leu Asn Leu 60
Leu Arg Glu Lys Arg Gly Thr Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His 10 65 70 75 80
Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu 85 90 95
Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Gly Asp Gly Arg Thr Asn Leu 100 105 110 15
Val Met Arg Gly Val Gln His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro 115 120 125 lle Arg Asp Glu Glu Leu Lys Asn lle Trp Gln His Val Val Arg Lys 130 135 140
Arg Tyr Asn Ser Ser Lys Glu Pro Glu Cys Ser Gly Ser Leu Asp Asp 145 150 155 160
Asn Asp Arg Tyr Arg Arg Arg Ser Asp Asp Ala Glu Cys Ala Ser Ser 165 170 175
Val lle Glu Gly Ala Asp Gly Val Leu Lys Pro Gin Lys Lys Lys Arg 5 180 185 190
Glu Ala Lys Glu Asp Asp Thr Glu Met Glu Asn Asp Asp Pro Ser Thr 195 200 205
Thr Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His Gin GIn Phe 210 215 220 10
Val Ser Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg 225 230 235 240 lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala 245 250 255
Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Gly Val 15 260 265 270
Val GIn Gln GIn Gly Gly Leu Pro Ser Thr Phe Cys Gly Pro lle Glu 275 280 285
Gln Asn Ser Glu Leu Gly Ser Leu Gly Arg Phe Asp lle Gin Ala Leu
290 295 300
Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Glu Thr Leu Thr Ala Leu His Ala 305 310 315 320
Glu Leu Leu Gly Arg Ser Thr Ser Asn Leu Val Leu Pro Ala Val Glu 325 330 335 5
GIn GIn Asn Leu Val Gln Val Ser Leu 60 GIn Ala Lys Cys lle Pro 340 345 350
Val Asp GIn Val Met Ala Tyr Gly GIn Pro Leu Leu Lys Cys Pro Ala 355 360 365
Ser lle Ser Asn Ser Lys His Leu Ser Gin Ala lle Leu Ser Ala Glu 10 370 375 380
Asp Val His Ser Gly Phe Gly Ser GIn Arg Ala Lys Asn lle Cys Met 385 390 395 400
Val Pro Ser Ser Asn Pro lle Ala Pro Asn Ser Asn Met Leu Thr Ala 405 410 415 15
Met Met Gin GIn Gin Gin Trp GIn Lys 60 Gin هاي lle Glu Leu 60 420 425 430
His Arg GIn Ser Gly Pro Pro Glu Val Asn Arg Ser lle Asn Val GIn 435 440 445
Pro Ser Cys Leu Val Leu Pro Ser 60 Leu Pro Gly His Phe Gin Val 450 455 460
Gly Asp Ser Pro Ala Ser lle Ser Arg Ala Gly Ser Leu Ser Lys Ser 465 470 475 480
Ser Val lle Asp Tyr Gly Val Leu Ser Pro GIn Ser Asn Asn Ser Ser 5 485 490 495
Gly Val Val Gin Val Leu Asp Arg Glu Leu Lys Pro Glu Cys Gly Leu 500 505 510
Asn Arg Leu Pro Ser Gly Gly Ser Leu Ser Arg Ser Cys Ser lle Asn 515 520 525 10
Ala Asp Asn Ser Val Asp Leu GIn Leu His Asn Ser Ser Ser Ala Phe 530 535 540
Gly Ser Ser Lys Gin Leu Pro Gly Leu lle Pro Ser His Leu Gly Ser 545 550 555 560
Pro Val Pro Tyr Cys lle Asn Ser Ser Leu Val Leu Asp Gin Gly Arg 15 565 570 575
Met Lys Gly Ala Ser lle Pro Ser Arg Phe Ala Val Asp Glu Ser Asp 580 585 590
Ser Pro Met Cys Asn Phe Asn Thr Ala Lys lle Tyr Leu Glu Glu Thr
595 600 605
Lys Val Lys GIn Glu Pro Asn Met Asn Val Met Glu Asn Ala Lys Val 610 615 620
Gly Pro Ala lle Phe Gin Lys Phe Gln Pro Gly Asp Leu Met Ser Val 625 630 635 640 5
Phe Arg Leu Ser Phe Ala Arg Val Lys Val Ser Ser Ser Pro 645 650 <210> 30 <211> 653 <212> PRT 10 <213> Solanum tuberosum <220> >سمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 30 15
Met Ser Gly Asp Val Ala Thr Cys Lys Ser Glu Ala Thr Val Val Thr 1 5 10 15
Asp His Phe Pro Leu Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Val
Val Cys Leu Arg lle lle Glu Gln Met Leu Arg Arg Cys Lys Tyr Ser
Val Thr Thr Cys Thr Gln Ala Met Val Ala Leu Asn Leu Leu Arg Glu 60
Lys Arg Gly Thr Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp 5 65 70 75 80
Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu 85 90 95
Pro Val lle Met Met Ser Gly Asp Gly Arg Thr Asn Leu Val Met Arg 100 105 110 10
Gly Val Gin His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro lle Arg Asp 115 120 125
Glu Glu Leu Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Lys Arg Tyr Asn 130 135 140
Ser Ser Lys Glu Leu Glu Cys Ser Gly Ser Leu Asp Asp Asn Asp Arg 15 145 150 155 160
Tyr Lys Arg Gly Ser Asp Asp Ala Glu Cys Ala Ser Ser Val lle Glu 165 170 175
Gly Ala Asp Gly Val Leu Lys Pro Gin Lys Lys Lys Arg Glu Ala Lys
180 185 190
Glu Glu Asp Asp Thr Glu Met Glu Asn Asp Asp Pro Ser Thr Ser Lys 195 200 205
Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His Gin GIn Phe Val Ser 210 215 220 5
Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu 225 230 235 240
Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His 245 250 255
Leu GIn Glu Asn GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Gly 10 260 265 270
Val Val 60 GIn Gln Gly Gly Leu Pro Ser Thr Phe Cys Gly Pro lle 275 280 285
Glu 60 Asn Ser Glu Leu Gly Ser Leu Gly Arg Phe Asp lle Gin Ala 290 295 300 15
Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Glu Thr Leu Thr Ala Leu His 305 310 315 320
Ala Glu Leu Leu Gly Arg Ser Thr Ser Asn Leu Val Leu Pro Ala Val 325 330 335
Glu lle Gin Asn Leu Leu GIn Ala Ser Leu Gin GIn Ala Lys Cys lle 340 345 350
Pro Ala Asp GIn Val Met Ala Tyr Gly Gln Pro Leu Leu Lys Cys His 355 360 365
Pro Ser lle Ser Asn Ser Lys His Leu Ser GIn Ser lle Leu Ser Ala 5 370 375 380
Glu Asp Val His Ser Gly Phe Gly Ser ماى Arg Ala Lys Asn lle Cys 385 390 395 400
Leu Val Pro Ser Ser Asn Pro lle Gly Leu Ala Ala Pro Asn Ser Asn 405 410 415 10
Met Leu Met Ala Met Met Gin ماي Gin GIn Trp ماي Lys Gln Gin Gin 420 425 430
Met Glu Leu GIn His Arg Arg Ser Gly Pro Pro Glu Val Asn His Ser 435 440 445 lle Asn Val GIn Pro Ser Cys Leu Val Leu Pro Ser GIn Leu Pro Gly 15 450 455 460
Asn Phe GIn Val Gly Asp Ser Pro Ala Ser lle Ser Arg Ala Gly Ser 465 470 475 480
Leu Ser Lys Ser Ser Val lle Asp Tyr Gly Val Leu Ser Pro GIn Ser
485 490 495
Asn Asn Ser Ser Gly Val Val Gin Val Leu Asp Arg Glu Leu Lys Pro 500 505 510
Glu Cys Gly Leu Asn Arg Leu Pro Ser Gly Gly Ser Leu Ser Arg Ser 515 520 525 5
Cys Ser lle Asn Ala Asp Asn Ser Val Gly Leu GIn Leu His Asn Ser 530 535 540
Ser Ser Ala Phe Gly Ser Ser Lys GIn Leu Pro Ala Leu lle Pro Asn 545 550 555 560
His Leu Gly Ser Pro Val Pro Tyr Tyr lle Asn Ser Ser GIn Val Leu 10 565 570 575
Asp Gin Gly His Thr Arg Asn Pro Gly Val Gly Lys Cys Ala Ser lle 580 585 590
Pro Ser Arg Phe Ala Val Asp Glu Ser Asp Ser Pro Met Cys Asn Phe 595 600 605 15
Asn Thr Ala Lys Asn Tyr Leu Glu Glu Thr Lys Val Lys Gln Glu Pro 610 615 620
Asn Met Asn Val Met Glu Asn Ala Lys Val Gly Pro Ala lle Phe 07 625 630 635 640
Lys Phe Gin Pro Gly Asp Leu Met Ser Val Phe Ser Asp 645 650 <210> 31 <211> 669 <212> PRT 5 <213> Gossypium hirsutum <220> <221كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 31 10
Met Ala Thr Met His Arg Val Val 60 Ser Ser Val Ser Thr Ser Asp 1 5 10 15
Ala Thr Thr Thr Ser Tyr Asp Gly Leu Thr Ser Cys Lys Ala Ala Asp lle Val lle Ser Asp GIn Phe Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val 15
Asp Asp Asp lle Thr Cys Leu Lys lle Leu Glu Lys Met Leu His Arg 60
Cys Arg Tyr His Val Thr Thr Cys Pro Gln Ala Lys Val Ala Leu Asn
65 70 75 80
Leu Leu Arg Glu Arg Lys Gly Cys Phe Asp Val lle Leu Ser Asp Val 85 90 95
Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly Tyr Lys Leu Leu Glu His Val Gly Leu 100 105 110 5
Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala Asp Gly Ser Thr Arg 115 120 125
Ala Val Met Lys Gly lle Arg His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys 130 135 140
Pro lle Arg Glu Glu Glu Leu Lys Asn lle Trp ماي His Val Val Arg 10 145 150 155 160
Lys Lys Trp Asn Glu Asn Lys Glu Leu Glu His Ser Gly Ser Leu Asp 165 170 175
Asp Thr Asp GIn His Lys GIn Arg His Asp Asp Ala Glu Tyr Ala Ser 180 185 190 15
Ser Val Asn Asp Ala Thr Glu Thr Ser Leu Lys Pro Leu Lys Lys Arg 195 200 205
Ser Asn Ser Lys Glu Glu Asp Asp Gly Glu lle Asp Asn Asp Asp Pro 210 215 220
Ser Thr Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His 0 225 230 235 240
Gln Phe Val Ser Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro 245 250 255
Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn 5 260 265 270
Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg lle Ser 275 280 285
Gly Val Ala 60 GIn Gly Gly lle Ala Asn Pro Leu Cys Gly Pro Val 290 295 300 10
Glu Ala Asn Val Lys lle Gly Ser Leu Gly Ser Phe Asn lle Gin Ala 305 310 315 320
Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Gin Thr Leu Ala Ala Val His 325 330 335
Ala Glu Leu Leu Gly Arg Ser Ala Gly Asn Leu Val Val Ala Thr Asp 15 340 345 350
Gln Pro Ala Leu Leu Gin Ala Thr Pro Gln Gly Ala Lys Cys lle GIn 355 360 365
Val Asp GIn Gly Val Ala Phe Val Gin His Ser Val Lys Ser Glu Ser
370 375 380
Ser Ser Ser Lys His Phe Ser GIn Ser Phe Ala Pro Val Glu Asp Val 385 390 395 400
Ala Ser Gly Phe Arg Ser Trp Pro Ser Asn Asn lle Gly Thr Ala Gly 405 410 415 5
Pro Ser Asn Ser Gly Gly Leu Ser Ser GIn Asn Gly Asn Met Leu lle 420 425 430
Asp Leu Leu GIn GIn Gin GIn Gin Leu GIn Lys Pro GIn Gin Arg Ser 435 440 445
Thr Val Ser Glu Leu Arg Arg Ser lle Asn Val Gln Pro Ser Cys His 10 450 455 460
Val Val Pro Ser GIn Ser Ser Ala Ser Phe Arg Ala Gly Asn Ser Pro 465 470 475 480
Val Ser Val Thr Gin Asn Gly Ser Tyr Ser Arg Thr Ala Val lle Asp 485 490 495 15
Tyr Ser Leu Leu Ser Ser 60 Ser Asn Cys Pro Ser Leu Asn lle Gly 500 505 510
Gln Val Ser Asp Val Asn Leu GIn Thr Thr Gly Val Leu Ser Gly Tyr 515 520 525 lle Pro Pro Ala Ser Val Ser Pro Ser Val Ser Ser Cys Ser Val Asn 530 535 540
Ala Asp Asn Cys Ala Ser Gln GIn Val 60 Thr Ser Ser Met Thr Phe 545 550 555 560
Lys Ala Ser Arg His Leu Pro Gly Phe Val His Ser Thr Ser Asn lle 5 565 570 575
Pro Asp Pro Tyr Gly Ser Thr Lys Ser Gly Asp Leu Leu Asn Gin Glu 580 585 590
Pro Phe Asn Asn Leu Gly Tyr lle Asn Lys Gly Thr Cys Leu Pro Ala 595 600 605 10
Lys Phe Ala Val Asp Glu Phe Gin Ser His Leu Ser Ser Ser Ser His 610 615 620
Gly Lys Val Phe Ser Glu Asn lle Gly Thr Arg Val Lys Gin Glu Pro 625 630 635 640
Ser Met Glu Phe Gly Asp Asn Ala Lys Val Gly lle Pro Met Leu Gin 15 645 650 655
Gln Phe Arg Pro Asn Asp Leu Met Ser Val Phe Thr Glu 660 665 <210> 32
<211> 1 <212> PRT <213> Theobroma cacao <220> <221كسمة ميسك 5 polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 2
Met Asn Ser Ser Ser Gly Lys Gly Ser Met Ser Ala Ala Ser Ser Ser 1 5 10 15
Ala Ala Trp Lys Ala Gly Asp Val Val Pro Asp 60 Phe Pro Ala Gly 10
Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Met lle Leu
Glu Lys Met Leu Arg Thr Cys Leu Tyr Glu Val Thr Lys Cys Asn Arg 60 15
Ala Glu Thr Ala Leu Ser Leu Leu Arg Glu Asn Lys Asn Gly Phe Asp 65 70 75 80 lle Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu 85 90 95
Leu Glu His lle Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser 100 105 110
Ala Asp Asp Gly Lys His Val Val Met Lys Gly Val Thr His Gly Ala 115 120 125
Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu Lys Asn lle 5 130 135 140
Trp GIn His Val Val Arg Lys Arg Lys Asn Glu Trp Lys Asp Phe Glu 145 150 155 160
Gln Ser Gly Ser Val Glu Glu Gly Asp Arg GIn Pro Lys 60 Ser Glu 165 170 175 10
Glu Ala Asp Tyr Ser Ser Ser Ala Asn Glu Gly Asn Trp Lys Ser Ser 180 185 190
Lys Lys Arg Lys Asp Asp Asp Asp Glu Ala Glu Glu Arg Asp Asp Thr 195 200 205
Ser Thr Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His 0 15 210 215 220
Gln Phe Val Ala Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro 225 230 235 240
Lys Lys lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn
245 250 255
Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu Ser 260 265 270
Gly Val Ser Gln His GIn Ser Asn Leu Asn Asn Ser Phe Met Ser Pro 275 280 285 5
Gln Glu Ala Thr Phe Gly Pro Leu Ser Pro Leu Asn Gly Leu Asp Leu 290 295 300
GIn Thr Leu Ala Ala Thr Gly Gin Leu Pro Ala Gin Ser Leu Ala Thr 305 310 315 320
Phe Gin Ala Ala Gly Leu Gly Arg Ser Thr Ala Lys Ser Gly lle Ala 10 325 330 335
Met Pro Leu Val Asp Gln Arg Asn lle Phe Ser Phe Glu Asn Pro Lys 340 345 350
Leu Arg Phe Gly Glu Gly Gln Gln GIn His Met Asn Asn Asn Lys 0 355 360 365 15
Leu Asn Leu Leu His Gly lle Pro Thr Thr Met Glu Pro Lys Gin Leu 370 375 380
Ala Ser Leu His His Ser Ala Gin Ser lle Gly Asn lle Asn Met Gin 385 390 395 400
Val Thr Ser His Gly Val (ا6 Gly Ser (ا6 Asn Asn Ser Leu Leu lle 405 410 415
Gln Met Ala Gin Pro Gln Pro Arg Gly Gin lle Leu Asn Asp Ser Thr 420 425 430
Gly Ser His Ala Pro Arg Leu Pro Ser Thr Leu Gly GIn Pro lle Leu 5 435 440 445
Ser Asn Gly lle Ala Ala Asn Val Ser Thr Arg Asn Gly lle Pro Glu 450 455 460
Asn lle Arg Gly Pro Gly Tyr Asn Pro Val Ser GIn Thr Ser Ser Leu 465 470 475 480 10
Leu Asn Phe Pro Met Asn His Thr Ser Glu Leu Pro Gly Asn Ser Phe 485 490 495
Pro Leu Gly Thr Thr Pro Gly lle Ser Ser Leu Thr Ser Lys Gly Ala 500 505 510
Phe Gin Glu Asp lle Asn Ser Asp Val Lys Gly Ser Gly Gly Phe Met 15 515 520 525
Pro Ser Tyr Asp lle Phe Asn Asp Leu Asn GIn His Lys Pro Gin Asn 530 535 540
Trp Glu Leu GIn Asn Val Gly Met Thr Phe Asp Ala Ser GIn His Ser
545 550 555 560
Asn Ser Leu GIn Gly Asn Leu Asp Leu Ala GIn Ser lle Leu Val GIn 565 570 575
Gln Gly Phe Ser Ser Gly Gin Met Asn Gly Gin Asn Arg Ser Ala Ala 580 585 590 5
Val Val Ser Lys Ala Met Phe Ser Ala Gly Asp Cys Thr Glu Gin Gly 595 600 605
Asn Ala GIn Asn Val Asn His His Leu Asn Asn Leu Leu Val Asp Asn 610 615 620
Thr lle Arg lle Lys Ser Glu Arg Val Ala Asp Ala Gly Pro Ala Asn 10 625 630 635 640
Leu Phe Pro Asp His Phe Gly Gin Glu Asp Leu Met Ser Ala Leu Leu 645 650 655
Lys GIn GIn Asp Gly lle Ala Pro Ala Glu Asn Glu Phe Asp Phe Asp 660 665 670 15
Gly Tyr Ser Met Asp Asn lle Pro Val 675 680 <210> 33 <211> 579
<212> PRT <213> Phaseolus vulgaris <220> <221كسمة ميسك polypeptide any <223>بولي 5611 55 <400> 3
Met Asn Leu Ser Asn Gly Lys Gly Ser Met Ser Thr Val Thr Thr Thr 1 5 10 15
Ala Val Met Lys Ser Gly Asp Ala Val Ser Asp Gin Phe Pro Ala Gly 10
Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Met lle Leu
Glu Lys Met Leu Arg Thr Cys Leu Tyr Glu Val Thr Lys Cys Asn Arg 60
Ala Glu Thr Ala Leu Ser Leu Leu Arg Glu Asn Lys Asn Gly Phe Asp 15 65 70 75 80 lle Val Ser Ala Asn Glu Gly Ser Trp Arg Asn Ser Lys Lys Arg Arg 85 90 95
Asp Glu Glu Glu Glu Ala Glu Asp Arg Asp Asp Thr Ser Thr Leu Lys
100 105 110
Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gln Phe Val Ala 115 120 125
Ala Val Asp Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu 130 135 140 5
Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His 145 150 155 160
Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu Ser Gly Val Ser 0 165 170 175
His GIn Asn Asn Leu Asn Asn Ser Phe Leu Gly Ser Gin Glu Ala Thr 10 180 185 190
Phe Gly Thr lle Ser Ser lle Asn Gly lle Asp Leu Gin Thr Leu Ala 195 200 205
Val Thr Gly Gin Leu Pro Ala Gin Ser Leu Ala Thr Leu GIn Ala Ala 210 215 220 15
Gly Leu Gly Arg Ser Thr Ala Lys Thr Gly Val Pro Met Pro Leu Met 225 230 235 240
Asp GIn Arg Asn Leu Phe Ser Phe Glu Asn Pro Arg Val Arg Phe Gly 245 250 255
Glu Gly 60 GIn ماي His Leu Ser Ser Ser Lys Pro Met Asn Leu Leu 260 265 270
Leu Gly lle Pro Thr Asn Met Glu Pro Lys GIn Leu Ala Asn Leu His 275 280 285
GIn Ser Thr GIn Ser lle Ala Ser Leu Asn Met Arg Val Asn Ala Ser 5 290 295 300
Ala Thr GIn Gly Asn Pro Leu Met Met GIn Met Pro Gin Ser Gin Pro 305 310 315 320
Arg Gly GIn Met Leu Ser Glu Asn Thr Gly Pro Arg Val Pro Arg Leu 325 330 335 10
Pro Ser Ser Leu Gly GIn Pro Thr Val Ser Asn Gly lle Ser Asn Gly 340 345 350
Phe Leu Gly Arg Asn Gly lle Ala Gly Asn Asn Arg Gly Pro Ala Tyr 355 360 365
Asn Pro Val Pro Pro Asn Ser Ser Leu Leu Ser Phe Pro Met Asn 0 15 370 375 380
Ser Ser Glu Val Ser Val Asn Asn Ser Leu Pro Leu Gly Ser Ser Pro 385 390 395 400
Gly lle Ser Ser lle Thr Thr Lys Gly Ser Phe GIn Glu Glu Val Thr
405 410 415
Ser Gly lle Lys Ala Thr Gly Gly Phe Pro Ser Tyr Asp lle Phe Asn 420 425 430
Glu Leu His His GIn Lys Ser His Asp Trp Glu lle Thr Asn Pro Ser 435 440 445 5
Leu Thr Tyr Ser Ala Ser His His Ala Asn Pro Leu Gin Gly Asn lle 450 455 460
Asp Val Ser Pro Ser Val Leu Val His Gln Gly Phe Ser Ser Thr GIn 465 470 475 480
GIn Asn Gly Gin Ser Arg Asp Ala Thr Leu lle Gly Lys Ala Met Phe 10 485 490 495
Ser Leu Gly Glu Gly Ser Glu Gin Asp Asn Leu Gln Asn Ala Val Gin 500 505 510
His Leu His Pro Leu Leu Val Asp Asn Ser lle Arg Val Lys Ala Glu 515 520 525 15
Arg lle Pro Asp Ala Ser Ser GIn Thr Asn Leu Phe Pro Asp His Tyr 530 535 540
Val GIn Glu Asp Leu Met Ser Ala Leu Leu Lys Gln Gin Glu Gly Met 545 550 555 560
Gly Pro Ala Glu Ser Glu Phe Glu Phe Asp Ala Tyr Ser Leu Asp Asn 565 570 575 lle Pro Val
<210> 34 5 <211> 679 <212> PRT <213> Glycine max <220>
<221>سمة ميسك 1 <223>بولي ببتيد polypeptide 4 >400< Met Asn Leu Ser Asn Gly Lys Gly Ser Met Ser Thr Leu Thr Ala Ser 10 5 1 Val Val Met Lys Ser Gly Asp Ala Val Ser Asp Gln Phe Pro Ala Gly 15 25 20 Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Met lle Leu 40 35 Glu Lys Met Leu Arg Thr Cys Leu Tyr Glu Val Thr Lys Cys Asn Arg
Ala Glu Thr Ala Leu Ser Leu Leu Arg Glu Asn Lys Asn Gly Phe Asp 65 70 75 80 lle Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu 85 90 95 5
Leu Glu His lle Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser 100 105 110
Ala Asp Asp Gly Lys Ser Val Val Met Lys Gly Val Thr His Gly Ala 115 120 125
Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu Lys Asn lle 10 130 135 140
Trp Gln His Val Val Arg Lys Arg Lys Asn Glu Trp Lys Asp Ala Glu 145 150 155 160
Gln Ser Gly Ser Ala Glu Glu Gly Asp Arg Gin Pro Lys Ala Ser Asp 165 170 175 15
Glu Ala Asp Tyr Ser Ser Ser Ala Asn Glu Gly Ser Trp Arg Asn Ser 180 185 190
Lys Lys Arg Arg Asp Glu Glu Glu Glu Ala Glu Asp Arg Asp Asp Thr 195 200 205
Ser Thr Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His Gin 210 215 220
Gln Phe Val Ala Ala Val Asp GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro 225 230 235 240
Lys Lys lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn 5 245 250 255
Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu Ser 260 265 270
Gly Val Ser Gln His GIn Asn Asn Met Asn Asn Ser Phe Leu Ser Pro 275 280 285 10
Gln Glu Ala Thr Phe Gly Thr lle Ser Ser lle Asn Gly lle Asp Leu 290 295 300
GIn Thr Leu Ala Val Ala Gly 60 Leu Pro Ala Gin Ser Leu Ala Thr 305 310 315 320
Leu GIn Ala Ala Gly Leu Gly Arg Pro Thr Gly Lys Ala Gly Val Pro 15 325 330 335
Met Pro Leu Met Asp GIn Arg Asn Leu Phe Ser Phe Glu Asn Pro Arg 340 345 350
Leu Arg Phe Gly Glu Gly 60 GIn Gin His Leu Ser Thr Ser Lys Pro
355 360 365
Met Asn Leu Leu His Gly lle Pro Thr Asn Met Glu Pro Lys GIn Leu 370 375 380
Ala Asn Leu His 60 Ser Thr GIn Ser lle Gly Ser Leu Asn Met Arg 385 390 395 400 5
Val Asn Ala Ser Ala Thr Gin Gly Ser Pro Leu Leu Met Gin Met Ala 405 410 415
Gln Ser GIn Pro Arg Gly Gin Met Leu Ser Glu Asn lle Gly Pro Arg 420 425 430
Val Pro Arg Leu Pro Ser Ser Leu Gly GIn Pro Thr Val Ser Asn Gly 10 435 440 445 lle Ser Asn Gly Leu Leu Gly Arg Asn Gly lle Ala Gly Asn Asn Arg 450 455 460
Gly Pro Ala Tyr Asn Pro Val Pro Pro Ser Ser Ser Leu Leu Ser Phe 465 470 475 480 15
Pro Met Asn GIn Thr Ser Glu Met Ser Val Asn Asn Ser Phe Pro Leu 485 490 495
Gly Ser Thr Pro Gly lle Ser Ser lle Thr Thr Lys Gly Ser Phe 0 500 505 510
Glu Glu Val Thr Ser Gly lle Lys Gly Ser Gly Gly Phe Pro Ser Tyr 515 520 525
Asp lle Phe Asn Glu Leu His His GIn Lys Pro His Asp Trp Glu lle 530 535 540
Thr Asn Pro Asn Leu Thr Tyr Asn Ala Ser GIn His Ala Asn Pro Leu 5 545 550 555 560
Gln Gly Asn lle Asp Val Thr Pro Ser Val Leu Val His Gln Gly Phe 565 570 575
Ser Ser Thr GIn Gln Thr Gly GIn Ser Arg Asp Ala Ala Leu lle Gly 580 585 590 10
Lys Ala Met Phe Ser Met Gly Glu Gly Leu Glu GIn Asn Asn Phe 07 595 600 605
Asn Ala Ser GIn Asn Leu Asn Ser Leu Leu Leu Asp Asn Ser lle Arg 610 615 620
Val Lys Ala Glu Arg lle Pro Asp Ala Ser Ser Gin Thr Asn Leu Phe 15 625 630 635 640
Pro Glu His Tyr Gly 60 Glu Asp Leu Met Ser Ala Leu Leu Lys Gin 645 650 655
Gln Glu Gly Met Gly Pro Ser Glu Asn Glu Phe Asp Phe Asp Gly Tyr
660 665 670
Ser Leu Asp Asn lle Pro Val 675 <210> 35 <211> 668 5 <212> PRT <213> Chenopodium quinoa <220> >سمة ميسك 221< polypeptide aan <223>بولي 1 10 >400< 5
Met Asn Leu Gly Gly Gly Leu Met Gly Ser Met Ala Met Pro Ser Ser 1 5 10 15
Thr Val Ser Arg Lys Ser Ser Glu Val Val Thr Ala Asp Gln Phe Pro 15
Val Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Thr lle Leu Glu Lys Met Leu Arg Thr Cys Arg Tyr Glu Val Thr Lys Thr 60
Asn Arg Ala Glu His Ala Leu Asn Met Leu Arg Glu Asn Lys Asn Gly 65 70 75 80
Phe Asp Val Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe 85 90 95
Lys Leu Leu Glu Gin Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met 5 100 105 110
Met Ser Ala Asp Asp Ser Lys GIn Val Val Met Lys Gly Val Thr His 115 120 125
Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu Lys 130 135 140 10
Asn lle Trp GIn His Val Val Arg Lys Lys Lys Tyr Glu Tyr Asn Lys 145 150 155 160
Asp Val Glu GIn Ser Gly Ser Trp Asp Glu Gly Asp Arg Gin Leu Lys 165 170 175
His Asp Asp Ala Val Ser Ser Pro Ala Asn Asp Gly Ser Trp Lys Asn 15 180 185 190
Ser Lys Arg Lys Ser Gly Glu Asp Asp Glu Ala Asp Asp Lys Asp Asp 195 200 205
Thr Thr Thr Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His
210 215 220
GIn GIn Phe Val Ala Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val 225 230 235 240
Pro Lys Lys lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu 245 250 255 5
Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu 260 265 270
Ser Gly Val Ser GIn His GIn Gly Gly Leu Asn Ser Ser Phe Met Pro 275 280 285
GIn Asp Pro Ser Phe Ser Thr Met Ser Ser Leu Gly Gly lle Asp Leu 10 290 295 300
GIn Thr Leu Ala Ala Thr Gly Gin Leu Ser Ala GIn Thr Leu Ala Ala 305 310 315 320
Tyr Thr Arg Leu Pro Pro Thr lle Lys Pro Gly lle Ser Met Pro Phe 325 330 335 15
Val Asp Gln Arg Asn Leu Phe Ser Phe Glu Asn Ser Lys Leu Arg Tyr 340 345 350
Gly Asp Gly GIn Gln Ser Gin lle Ser Asn Val Ser Lys GIn Met Asn 355 360 365
Leu Leu His Gly Phe Pro Thr Thr Met Glu Pro Lys Gin Leu Ala Val 370 375 380
Leu Asn GIn Ser Ala GIn Thr Leu Gly Ser Met Asn Met Gin Ala Asn 385 390 395 400
Ala Ser Ser Ser His GIn Ser Ser Ser Leu Leu Met 60 Gin Met Val 5 405 410 415
Pro GIn GIn Arg Gly His lle Ser Asn Glu Ser lle Ser Ser Gin Val 420 425 430
Pro Arg lle Gin Pro Ser Val Gly Gln Pro Leu GIn Ser Asn Gly Asn 435 440 445 10
Ala Asn Ala Val Leu Ser Arg Asn Gly lle Pro Tyr Asp Pro Val Asn 450 455 460 ماك Ser Ala Ser Val Val Asp Phe Ser Val Asn His lle Pro Glu Leu 465 470 475 480
Pro Gly Asn Ser Phe Pro Leu Gly Ser Thr Pro Gly lle Thr Ser lle 15 485 490 495
Thr Ser Lys Gly Phe Asn Gin Glu Glu lle Gly Ser Asp lle Lys Val 500 505 510
Ser Arg Gly Phe Val Gly Ser Tyr Asp Met Phe Ser Glu Leu GIn His
515 520 525
Lys Pro Gln Glu Trp Glin Met Gln Asn Pro Asn Met Gly Phe Ala Gly 530 535 540
Ser Ser GIn His Val Pro Ser Val Gln Ser Gly Val Asn Val Ala Pro 545 550 555 560 5
Ser lle Met Val Asn Gin Ser Tyr Val Ser Gly Gin Lys Asn Glu GIn 565 570 575
Asn Gly His Ser Met Ala Gly Lys Pro Met Tyr Ser Ala Gly Leu Glu 580 585 590
Asn GIn His Met Gly Met Gin Asn Val Asn Gln Asn Tyr Asn Ser lle 10 595 600 605
His Val Asn Asn Ser Ser Arg Val Lys Ala Glu Ser Val Ser Asp Val 610 615 620
Val Asn Leu Gly Ala Asn Leu Phe Asp Tyr Ser Pro Glu Asp Met Leu 625 630 635 640 15
Ser Thr lle Met Leu Lys Gin Gln Glu Gly lle Gly Ser Gly Asp Phe 645 650 655
Asp Phe Asp Gly Tyr Thr Leu Asp Asn lle Pro Val 660 665
6 >210< 670 >211< PRT >212< Malus domestica >213< >220< <221>سمة ميسك 1 <223>بولي ببتيد polypeptide >220< <221>سمة ميسك )195)..(195( >222< 8 <223>يمكن أن تكون عبارة عن أي حمض أميني حادث طبيعياً >220< <221>سمة ميسك (215(..)215) >222< 5 88لا <223>يمكن أن تكون عبارة عن أي حمض أميني حادث طبيعياً >220< <221>سمة ميسك (530(..)530) >222< 8 <223>يمكن أن تكون عبارة عن أي حمض أميني حادث طبيعياً
<220> <221 >سمة ميسك (540(..)540) >222< 8 <223>يمكن أن تكون عبارة عن أي حمض أميني حادث طبيعياً <220> 5 <221 >سمة ميسك (579(..)579) >222< 8 <223>يمكن أن تكون عبارة عن أي حمض أميني حادث طبيعياً 6 >400<
Met Ala Ala Leu GIn Arg Val Ala Gin Ser Ser Val Ser Thr Thr Ala 10 1 5 10 15
Ser Ser Tyr Gly Ser Cys Lys Val Gly Gly Gly Val Leu Ser Pro Ser
Ala Gly lle Glu Met Ala Val Pro Asn Gin Phe Pro Ala Gly Leu Arg 15
Val Leu Val Val Asp Asp Asp Thr Thr Cys Leu Arg lle Leu Glu Leu 60
Met Leu Leu Arg Cys Leu Tyr GIn Val Thr Thr Cys Ser Glu Ala Thr 65 70 75 80
Val Ala Leu Asn Leu Leu Arg Glu Arg Lys Asp Cys Phe Asp Val Val 85 90 95
Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu 100 105 110
His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala Asp 5 115 120 125
Gly Arg Thr Ser Val Val Met Arg Gly lle Arg His Gly Ala Cys Asp 130 135 140
Phe Leu lle Lys Pro lle Ser Glu Ala Glu Leu Lys Asn lle Trp 07 145 150 155 160 10
His Val Val Arg Lys Lys Trp Asn Gly Ser Lys Glu Leu Glu His Ser 165 170 175
Gly Ser Leu Glu Asp Asn Asp Pro His Lys Arg Gly Asn Asn Asp Phe 180 185 190
Glu Tyr Xaa Ser Ser Val Asn Glu Gly Thr Glu Val Ser Leu Lys Gly 15 195 200 205
His Lys Lys Arg lle Asn Xaa Lys Glu Asp Asp Asp Gly Asp Thr Glu 210 215 220
Asn Asp Asp Leu Ser Thr Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val
225 230 235 240
Glu Leu His GIn GIn Phe Val Thr Ala Val Asn Gin Leu Gly Leu Asp 245 250 255
Lys Ala Val Pro Lys Arg lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu 260 265 270 5
Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu 275 280 285
Lys Arg Leu Ser Gly Val Ala Gln GIn Gin Ser Gly lle Ala Asn Pro 290 295 300
Leu Cys Gly Pro Val Asp Ser Asn Gly Lys Leu Gly Ser Leu Ser Arg 10 305 310 315 320
Phe Asp Phe Gin Ala Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Gin Thr 325 330 335
Leu Ala Ala Leu GIn Ala Glu Leu Leu Gly GIn Pro Ala Gly Asn Leu 340 345 350 15
Val Pro Ala Met Asp Gin Pro Ala Leu Leu His Ala Ser Leu GIn Ala 355 360 365
Pro Lys Arg Pro Pro Val Glu His Gly Val Pro Phe Met Gin Pro Phe 370 375 380
Val Lys Ser GIn Ser Asn Val Ser Lys His Phe Pro Gin Ser Val lle 385 390 395 400
Ser Ala Glu Asp Ala Ser Leu Gly Phe Gly Gin Trp Arg Ser Asn Ser 405 410 415
Arg Ser Thr Val Ala Pro Ser Asn Asp His Gly Gly Leu Ser Thr GIn 5 420 425 430
Asn Ser Asn Leu Leu Met Gly lle Val Pro Gin Glu Gin Arg Gin His 435 440 445
Lys Arg Thr Gln Gin GIn Ser Val Leu Thr Glu Pro Ser Arg Ser Phe 450 455 460 10
Asn Val 60 Pro Ser Cys Leu Val Val Pro Ser GIn Ser Ser Thr Gly 465 470 475 480
Phe GIn Ala Gly Asn Ser Pro Ala Ser Val Asn GIn Ser Ser Ser Phe 485 490 495
Asn Arg Ser Thr Val Val Asp Tyr Ser Leu Pro Ser Asp 60 Ser Asn 15 500 505 510
Asn Ser Leu Asn Val Gly His lle Pro Thr Gly Asn Pro Lys Thr Ser 515 520 525
Gly Xaa Leu Gly Gly Tyr Ser Gly Pro Gly Ser Xaa Cys Ala Thr Ser
530 535 540
Cys Leu Val Asn Ala Asp Asn Ser Thr Ser Tyr Gln Asn Ser Thr Ala 545 550 555 560
Thr Phe Ser Asp Ser Arg Glu Leu Pro Gly Phe Leu His Asn Thr Ala 565 570 575 5
Asn Ser Xaa Gly Phe Tyr Val Asp Lys Ser Gly Glu Met Leu Asp 0 580 585 590
Gly Pro Leu Arg Asn Leu Gly Phe Val Gly Lys Glu Thr Cys lle Pro 595 600 605
Ser Arg Phe Ala Val Asp Asp Phe Glu Ser Gln Met Ser Asn Leu Asn 10 610 615 620
Pro Gly Arg lle His Val Glu Ser Ser Gly Thr Leu Val Lys Gln Glu 625 630 635 640
Pro Ser Glu Asp Tyr Val Asp Asn Ala Lys Leu Gly lle Pro lle Leu 645 650 655 15
His GIn Tyr Ser Ser Ser Asp Phe Met Ser Pro Phe Ala Asp 660 665 670 <210> 37 <211> 802
<212> PRT <213> Zea mays <220> <221كسمة ميسك polypeptide any <223>بولي 5611 55 <400> 37
Pro Tyr Pro Thr His Thr Leu Leu Pro GIn Pro His Leu Ser Leu Ser 1 5 10 15
Ala Cys Val Leu Leu Val Leu Leu Ser Leu Ser Ser Pro Ala Leu Thr 10
Ser Pro Pro Phe Pro Ala Val Ser Trp lle Ser Arg lle Gln Thr Thr
Ala Leu Val Ser Leu Pro Ser Cys Leu Leu Pro Ala Tyr Val Gin Glu 60
Gly Pro Cys Leu Gly Asp Pro Gly Ala Trp Phe Leu Gly Ser Ala Ala 15 65 70 75 80
Ser Ala Ala Val Gly Phe Ala Glu Pro Glu Pro Pro Glu Met Thr Val 85 90 95
Asp Glu Leu Lys Leu GIn Ala Arg Ala Ser Gly Gly His Gly Ala Lys
100 105 110
Asp GIn Phe Pro Val Gly Met Arg Val Leu Ala Val Asp Asp Asp Pro 115 120 125
Thr Cys Leu Lys lle Leu Glu Asn Leu Leu Leu Arg Cys 60 Tyr His 130 135 140 5
Val Thr Thr Thr Gly Gln Ala Ala Thr Ala Leu Lys Leu Leu Arg Glu 145 150 155 160
Lys Lys Asp Gin Phe Asp Leu Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp 165 170 175
Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu 10 180 185 190
Pro Val lle Met Leu Ser Ala Asn Gly Glu Thr Gln Thr Val Met Lys 195 200 205
Gly lle Thr His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle 210 215 220 15
Glu GIn Leu Arg Thr lle Trp GIn His Val Val Arg Arg Arg Ser Cys 225 230 235 240
Asp Ala Lys Asn Ser Gly Asn Asp Asn Asp Asp Ser Gly Lys Lys Leu 245 250 255
ماك Val Val Ser Ala Glu Gly Asp Asn Gly Gly Val Asn Arg Asn Lys 260 265 270
Arg lle Ser Arg Lys Gly Arg Asp Asp Asn Gly Asp Asp Gly Asp Asp 275 280 285
Ser Asp Asp Asn Ser Asn Glu Asn Gly Asp Ser Ser Ser Gln Lys Lys 5 290 295 300
Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His Arg Lys Phe Val Ala Ala 305 310 315 320
Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Asp 325 330 335 10
Leu Met Asn Val Glu Asn lle Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu 340 345 350
Gln Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Ser Ala Asp Ala Ser Arg 355 360 365
GIn Ala Asn Leu Thr Ala Ala Phe Gly Gly Arg Asn Pro Ala Tyr Val 15 370 375 380
Asn Met Gly Leu Asp Ala Phe Arg Gin Tyr Asn Ala Tyr Gly Arg Tyr 385 390 395 400
Arg Pro Val Pro Thr Thr Asn His Ser Gln Pro Asn Asn Leu Leu Ala
405 410 415
Arg Met Asn Ser Pro Ala Phe Gly Met His Gly Leu Leu Pro Ser Gin 420 425 430
Pro Leu GIn lle Gly His Asn GIn Asn Asn Leu Ser Thr Ser Leu Gly 435 440 445 5
Asn Val Gly Gly Met Asn Asn Gly Asn Leu lle Arg Gly Ala His Met 450 455 460
Pro Leu GIn Asp Thr Ser Lys Cys Phe Pro Thr Gly Pro Ser Gly Asn 465 470 475 480
Ser Phe Ala Asn lle Ser Asn Ser Thr Gln Leu Val Thr Thr Asn Asn 10 485 490 495
Leu Pro Leu GIn Ser Leu Glu Pro Ser Asn Gln GIn His Leu Gly Arg 500 505 510
Leu His Ser Ser Ala Asp Pro Phe Asn Ser Phe Val Gly Glu Pro Pro 515 520 525 15
Gln Phe Ala Asp Leu Gly Arg Cys Asn Thr Thr Trp Pro Thr Ala Val 530 535 540
Ser Ser Ser Asn Val GIn Glu lle Gly GIn Lys Asp Arg lle Val Asn 545 550 555 560
Arg Pro Lys Leu Glu Pro Leu Ser Ser Phe Thr Glu Ala Ser Ser 07 565 570 575 lle Pro Leu Leu Gly Asn Glu Met Gin Ser His Gln Val Ala Ser Leu 580 585 590
Ala Ser Asn Gly Leu Pro Met Pro Phe Thr Gin Glu Ala Val Pro Phe 5 595 600 605
Ala Tyr Gly Ser Ser Thr Asn Ser Arg Glu Met Leu Asn Asn Asn Leu 610 615 620
Ala Leu Ser Asn Ser Gly Val Asn Ser Thr Leu Pro Asn Leu Arg lle 625 630 635 640 10
Asp Gly Ser Val Val Pro Gly 60 Thr Leu Gly Gly Ser Asn Ser Gly 645 650 655
Gly Cys Val Val Pro Pro Leu Gin Asp Gly Arg lle Asp His GIn Ala 660 665 670
Val Ser Ser His Leu Asn Tyr Asn Asn Glu Leu Met Gly Thr Gly Arg 15 675 680 685
Leu GIn Arg Gly Leu Ser Gly Gly Leu Asp Asp lle Val Val Asp Met 690 695 700
Phe Arg Pro Asp Arg Ala Asp Asp Gly Val Ser Phe lle Asp Gly Asp
705 710 715 720
Trp Glu Leu Arg Pro Gly Ser Ser Val Thr Ser Glu Tyr Gln Leu Cys 725 730 735
Gly lle Cys Tyr Leu Asn Ser Tyr Asp Tyr Val Phe Lys Ser Gly Val 740 745 750 5
Asn Cys Gly Tyr Arg Asp lle Gin His Val Tyr Glu Pro Arg Asn Asp 755 760 765
Val Leu Phe Pro Leu Gly Asn Arg Phe Ala Val Pro Phe Val Asp Cys 770 775 780
His Cys lle Val Ala Ser Leu Ala Glu Thr Glu Val Lys Gly Lys Asp 10 785 790 795 800
GIn Ala <210> 38 <211> 591 15 <212> PRT <213> Brassica rapa <220> كسمة ميسك 221< polypeptide <223>بولي ببتيد 1 <400> 38
Met Leu Asn Pro Gly Val Val Gly Gly Ser Ser Asn Ser Asp Pro Phe 1 5 10 15
Pro Ser Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu 5
Met lle Leu Glu Arg Met Leu Lys Thr Cys Leu Tyr Arg Val Thr Lys
Cys Asn Arg Ala Glu lle Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Lys Asn 60 10
Gly Phe Asp lle Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asn Gly 65 70 75 80
Phe Lys Leu Leu Glu His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 85 90 95
Met Met Ser Ala Asp Asp Ser Lys Ser Val Val Leu Lys Gly Val Thr 15 100 105 110
His Gly Ala Val Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu 115 120 125
Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Lys Lys GIn Asn Val Ser Glu
130 135 140
His Ser Gly Ser Val Glu Glu Thr Gly Gly Asp Arg Gin Gln Gln 0 145 150 155 160
Arg Gly Asp Asp Asp Asp Asp Gly Asn Asn Ser Ser Ser Gly Asn Asn 165 170 175 5
Glu Gly Asn Leu Arg Lys Arg Lys Glu Glu Glu GIn Gly Asp Asp Lys 180 185 190
Glu Asp Thr Ser Ser Leu Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu 195 200 205
Leu His GIn GIn Phe Val Ala Ala Val Asn His Leu Gly Val Asp Lys 10 210 215 220
Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Glu Met Met Asn Val Gin Gly Leu Thr 225 230 235 240
Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Lys 245 250 255 15
Arg Leu Gly Gly Val Ser 60 Gly Asn Met Asn His Ser Phe Leu Thr 260 265 270
Gly GIn Asp Pro Ser Tyr Gly Pro Leu Asn Gly Phe Asp Leu Gin Gly 275 280 285
Leu Ala Thr Ala Gly GIn Leu GIn Ala GIn Ser Leu Ala Gin Leu Gin 290 295 300
Ala Val Gly Leu Gly GIn Ser Ser Ser Pro Leu lle Lys Pro Gly lle 305 310 315 320
Thr Ser Val Asp GIn Arg Ser Phe Phe Thr Phe Gin Asn Ser Lys Ser 5 325 330 335
Arg Phe Gly Asp Gly His Gly Pro Met Met Met Asn Gly Gly Gly Gly 340 345 350
Asn Lys GIn Thr Ser Leu Leu His Gly Val Pro Thr Gly His Met Arg 355 360 365 10
Leu GIn GIn GIn GIn Met Ala Gly Met Arg Val Ala Gly Pro Ser Met 370 375 380
Gln 0 GIn GIn GIn Gln Ser Met Leu Ser Arg Arg Ser Val Pro Glu 385 390 395 400
Thr Arg Ser Ser Arg Val Leu Pro Ala Ala Thr His Ser Ala Leu Asn 15 405 410 415
Asn Ser Phe Pro Leu Ala Ser Ala Pro Gly Met Met Ser Val Ser Asp 420 425 430
Thr Lys Gly Val Asn Glu Phe Cys Asn Pro Ser Tyr Asp lle Leu Asn
435 440 445
Asn Phe Pro Gln GIn ماه His His Asn Asn Asn Asn Asn Arg Val Asn 450 455 460
Glu Trp Asp Leu Arg Asn Val Gly Met Val Phe Asn Ser His Gin Asp 465 470 475 480 5
Asn Thr Thr Ser Ala Ala Phe Ser Thr Ser Glu Ala Tyr Ser Ser Ser 485 490 495
Ser Thr His Lys Arg Lys Arg Glu Ala Glu Leu Val Val Glu His Gly 500 505 510
GIn Asn GIn GIn GIn Pro Gin Ser Arg Ser Val Lys Pro Met Asn GIn 10 515 520 525
Thr Tyr Met Asp Gly Gly Gly Ser Val Arg Met Lys Thr Glu Thr Val 530 535 540
Thr Cys Pro Pro Gln Ala Thr Thr Met Phe His Glu GIn Tyr Ser Asn 545 550 555 560 15
Gln Asp Asp Leu Leu Ser Asp Leu Leu Lys Gin Glu Gly Leu Leu Asp 565 570 575
Thr Glu Phe Asp Phe Glu Gly Tyr Ser Phe Asp Ser lle Leu Val 580 585 590
<210> 9 <211> 691 <212> PRT <213> Oryza sativa <220> 5 <221كسمة ميسك polypeptide <223>بولي ببتيد 1 >400< 9
Met Ala Pro Val Glu Asp Gly Gly Gly Val Glu Phe Pro Val Gly Met 1 5 10 15 10
Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu Ala Val Leu Lys
Arg Met Leu Leu Glu Cys Arg Tyr Asp Ala Thr Thr Cys Ser GIn Ala
Thr Arg Ala Leu Thr Met Leu Arg Glu Asn Arg Arg Gly Phe Asp Val 15 60 lle lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly Phe Arg Leu Leu 65 70 75 80
Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met Met Ser Ala
85 90 95
Asp Ser Arg Thr Asp lle Val Met Lys Gly lle Lys His Gly Ala Cys 100 105 110
Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg Met Glu Glu Leu Lys Asn lle Trp 115 120 125 5
Gln His Val lle Arg Lys Lys Phe Asn Glu Asn Lys Glu His Glu His 130 135 140
Ser Gly Ser Leu Asp Asp Thr Asp Arg Thr Arg Pro Thr Asn Asn Asp 145 150 155 160
Asn Glu Tyr Ala Ser Ser Ala Asn Asp Gly Ala Glu Gly Ser Trp Lys 10 165 170 175
Ser 0 Lys Lys Lys Arg Asp Lys Asp Asp Asp Asp Gly Glu Leu Glu 180 185 190
Ser Gly Asp Pro Ser Ser Thr Ser Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser 195 200 205 15
Val Glu Leu His GIn GIn Phe Val Asn Ala Val Asn His Leu Gly lle 210 215 220
Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly 225 230 235 240
Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr 245 250 255
Leu Lys Arg lle Ala Gin His His Ala Gly lle Ala Asn Pro Phe Cys 260 265 270
Pro Pro Ala Ser Ser Gly Lys Val Gly Ser Leu Gly Gly Leu Asp Phe 5 275 280 285
Gln Ala Leu Ala Ala Ser Gly Gin lle Pro Pro Gln Ala Leu Ala Ala 290 295 300
Leu GIn Asp Glu Leu Leu Gly Arg Pro Thr Asn Ser Leu Val Leu Pro 305 310 315 320 10
Gly Arg Asp GIn Ser Ser Leu Arg Leu Ala Ala Val Lys Gly Asn Lys 325 330 335
Pro His Gly Glu Arg Glu lle Ala Phe Gly 60 Pro lle Tyr Lys Cys 340 345 350
GIn Asn Asn Ala Tyr Gly Ala Phe Pro Gln Ser Ser Pro Ala Val Gly 15 355 360 365
Gly Met Pro Ser Phe Ser Ala Trp Pro Asn Asn Lys Leu Gly Met Ala 370 375 380
Asp Ser Thr Gly Thr Leu Gly Gly Met Ser Asn Ser Gln Asn Ser Asn
385 390 395 400 lle Val Leu His Glu Leu GIn Gin GIn Pro Asp Ala Met Leu Ser Gly 405 410 415
Thr Leu His Ser Leu Asp Val Lys Pro Ser Gly lle Val Met Pro Ser 420 425 430 5
Gln Ser Leu Asn Thr Phe Ser Ala Ser Glu Gly Leu Ser Pro Asn Gin 435 440 445
Asn Thr Leu Met lle Pro Ala GIn Ser Ser Gly Phe Leu Ala Ala Met 450 455 460
Pro Pro Ser Met Lys His Glu Pro Val Leu Ala Thr Ser 0 Pro Ser 10 465 470 475 480
Ser Ser Leu Leu Gly Gly lle Asp Leu Val Asn GIn Ala Ser Thr Ser 485 490 495
Gln Pro Leu lle Ser Ala His Gly Gly Gly Asn Leu Ser Gly Leu Val 500 505 510 15
Asn Arg Asn Pro Asn Val Val Pro Ser GIn Gly lle Ser Thr Phe His 515 520 525
Thr Pro Asn Asn Pro Tyr Leu Val Ser Pro Asn Ser Met Gly Met Gly 530 535 540
Ser Lys GIn Pro Pro Gly Val Leu Lys Thr Glu Asn Ser Asp Ala Leu 545 550 555 560
Asn His Ser Tyr Gly Tyr Leu Gly Gly Ser Asn Pro Pro Met Asp Ser 565 570 575
Gly Leu Leu Ser Ser GIn Ser Lys Asn Thr GIn Phe Gly Leu Leu Gly 5 580 585 590
Gln Asp Asp lle Thr Gly Ser Trp Ser Pro Leu Pro Asn Val Asp Ser 595 600 605
Tyr Gly Asn Thr Val Gly Leu Ser His Pro Gly Ser Ser Ser Ser Ser 610 615 620 10
Phe GIn Ser Ser Asn Val Ala Leu Gly Lys Leu Pro Asp GIn Gly Arg 625 630 635 640
Gly Lys Asn His Gly Phe Val Gly Lys Gly Thr Cys lle Pro Ser Arg 645 650 655
Phe Ala Val Asp Glu lle Glu Ser Pro Thr Asn Asn Leu Ser His Ser 15 660 665 670 lle Gly Ser Ser Gly Asp lle Met Ser Pro Asp lle Phe Gly Phe Ser 675 680 685
Gly Gln Met
<210> 40 <211> 126 <212> PRT <213> Parachlorella sp. 5 <220> <221 >سمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من 1ا56 بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم :
NO:3 0 <400> 40
Pro Ala Gly Leu Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Leu Met Cys Leu 1 5 10 15
Lys Val Val Ser Ala Met Leu Lys Arg Cys Ser Tyr Gin Val Ala Thr 15
Cys Ser Ser Gly Ser Glu Ala Leu Thr Leu Leu Arg Glu Arg Asn Glu
Asp Gly Ser Ser Asp GIn Phe Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met 60
Pro Asp Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu His lle Gly Leu Glu Leu 65 70 75 80
Glu Leu Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr Asn Val Val 85 90 95
Leu Arg Gly Val Thr His Gly Ala Val Asp Phe Leu lle Lys Pro Val 5 100 105 110
Arg lle Glu Glu Leu Arg Asn Val Trp GIn His Val Val Arg 115 120 125 <210> 41 <211> 123 10 <212> PRT <213> Coccomyxa subellipsoidea <220> <221كسمة ميسك من متوالية بهوية polypeptide <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من 1ا56 بولي ببتيد 15 : رقم NO:9 <400> 41
Pro Ala Gly Leu Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu
1 5 10 15
Lys Val Val Glu His Met Leu Arg Arg Cys Asn Tyr 60 Val Thr Thr
Cys Pro Asn Gly Lys Ala Ala Leu Glu Lys Leu Arg Asp Arg Ser Val 5
His Phe Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu His lle Gly Leu Glu Leu Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80
Met Met Ser Ser Asn Gly Glu Thr Asn Val Val Leu Arg Gly Val Thr 10 85 90 95
His Gly Ala Val Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg Val Glu Glu Leu 100 105 110
Arg Asn Val Trp GIn His Val Val Arg Arg Lys 115 120 15 <210> 42 <211> 122 <212> PRT <213> Ostreococcus lucimarinus
<220> <221كسمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوبنة رقم : :10 <400> 2
Pro Ala Gly Leu Gly Val Leu Val Val Asp Asp Asp Leu Leu Cys Leu 1 5 10 15
Lys Val Val Glu Lys Met Leu Lys Ala Cys Lys Tyr Lys Val Thr Ala 10
Cys Ser Thr Ala Lys Thr Ala Leu Glu lle Leu Arg Thr Arg Lys Glu
Glu Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60 15
Phe Lys Leu Leu Glu lle lle Gln Phe Glu Leu Ala Leu Pro Val Leu 65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asn Ser Asp Ser Ser Val Val Leu Arg Gly lle lle 85 90 95
His Gly Ala Val Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu 100 105 110
Arg Asn lle Trp صاى His Val Val Arg Arg 115 120 <210> 43 5 <211> 123 <212> PRT <213> Chlamydomonas reinhardtii <220> كسمة ميسك 221< 10 (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide ببتيد يلوب5|61ل17١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم :11 <400> 43 5
Pro Ala Gly Leu Arg Leu Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu 1 5 10 15
Lys Val Val Glu Gln Met Leu Arg Lys Cys Ser Tyr Glu Val Thr Val
Cys Ser Asn Ala Thr Thr Ala Leu Asn lle Leu Arg Asp Lys Asn Thr
Glu Tyr Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Arg Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 5 65 70 75 80
Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr Ser Asn Val Leu Arg Gly Val Thr 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu 100 105 110 10
Arg Asn Leu Trp GIn His Val Val Arg Arg Arg 115 120 <210> 44 <211> 61 <212> PRT 15 <213> Chromochloris zofingiensis <220> <221كسمة ميسك
(SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:12 <400> 44 5
Met Asp Gly Phe Lys Leu Leu Glu Thr Val Gly Leu Glu Leu Asp Leu 1 5 10 15
Pro Val lle Met Met Ser Ser Asn Gly Glu His Thr Thr Val Met Arg
Gly Val Thr His Gly Ala Cys Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg lle 10
Glu Glu Leu Arg Asn lle Trp Gin His Val lle Arg Arg 60 <210> 45 <211> 123 15 <212> PRT <213> Volvox carteri <220> <221كسمة ميسك
(SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:13 <400> 45 5
Pro Ala Gly Leu Arg Leu Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu 1 5 10 15
Lys Val Val Glu Gin Met Leu Arg Lys Cys Ser Tyr Asp Val Thr Thr
Cys Thr Asn Ala Thr Met Ala Leu Asn Leu Leu Arg Asp Lys Ser Thr 10
Glu Tyr Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu Val Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80 15
Met Met Ser Ser Asn Gly Asp Thr Ser Asn Val Leu Arg Gly Val Thr 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu 100 105 110
Arg Asn Leu Trp GIn His Val Val Arg Arg Arg 115 120 <210> 46 <211> 121 <212> PRT 5 <213> Tetraselmis sp. <220> >سمة ميسك 221< (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن polypeptide 5 of ببتيد يلوبكا61ل1١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1 10
SEQ ID
NO:14, SEQ ID NO:15, and SEQ ID NO:16 <400> 46
Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Ala Asp Asn Asp Pro Ala Ser Leu 1 5 10 15 15
Gln GIn Val Glu Lys Met Leu Lys Lys Cys Ser Tyr Gln Val Thr Leu
Cys Ser Ser Gly Lys Asn Ser Leu Glu lle Leu Arg Lys Arg Arg Glu
Glu Phe Asp Leu Val Leu Ala Asp Ala Asn Leu Pro Asp lle Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu His Val Cys His Thr Glu Leu Ser Leu Pro Val Val 65 70 75 80
Leu Met Ser Gly Thr Ser Asp Thr Gin Leu Val Met Arg Gly Val Met 5 85 90 95
Asp Gly Ala Arg Asp Phe Leu lle Lys Pro Leu Arg Val Glu Glu Leu 100 105 110
Lys Val Leu Trp GIn His Leu Val Arg 115 120 10 <210> 47 <211> 123 <212> PRT <213> Oocystis sp. <220> 15 <221كسمة ميسك (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:17 <400> 47
Pro Ala Gly Leu Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu 1 5 10 15
Lys Val lle Asp GIn Met Leu Arg Arg Cys Asn Tyr Ala Ala Thr Thr 5
Cys Gin Ser Ser Leu Glu Ala Leu Glu Leu Leu Arg Ser Ser Lys Glu
Asn His Phe Asp Leu Val Leu Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp 60 10
Gly Phe Lys Leu Leu Glu lle lle Gly Leu Glu Met Gly Leu Pro Val 65 70 75 80 lle Met Met Ser Ser Asn Gly Glu Thr Gly Val Val Phe Arg Gly Val 85 90 95
Thr His Gly Ala Val Asp Phe Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Glu 15 100 105 110
Leu Arg Asn Leu Trp GIn His Val Val Arg Lys 115 120 <210> 48
<211> 3 <212> PRT <213> Micromonas sp. RCC299 <220> <221كسمة ميسك 5 (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:18 <400> 48 10
Pro lle Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu 1 5 10 15
Lys lle Val Glu Lys Met Leu Lys Arg Cys GIn Tyr Glu Val Thr Thr
Phe Ser Arg Gly Ala Glu Ala Leu Lys Thr Leu Arg Glu Arg Lys Asp 15
Asp Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu His lle Ala Leu Glu Leu Asp lle Pro Val Met
65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asn Cys Ala Thr Asp Val Val Leu Arg Gly lle lle 85 90 95
His Gly Ala Val Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu 100 105 110 5
Arg Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Arg Lys 115 120 <210> 49 <211> 123 <212> PRT 10 <213> Micromonas pusilla <220> <221 >سمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 15 1ل0/8١17ل5|61بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم : NO:19 49 >400< Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Leu Cys Leu
1 5 10 15
Arg lle Val Glu Lys Met Leu Lys Arg Cys 60 Tyr Glu Val Thr Thr
Phe Ser Arg Gly Ala Glu Ala Leu Glu Thr Leu Arg Ala Arg Arg Asp 5
Asp Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu His lle Ala Leu Glu Leu Asp Val Pro Val Met 65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asn Cys Ala Thr Asp Val Val Leu Arg Gly lle lle 10 85 90 95
His Gly Ala Val Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu 100 105 110
Arg Asn lle Trp صاى His Val Val Arg Arg 0 115 120 15 <210> 50 <211> 123 <212> PRT <213> Sphagnum fallax
<220> <221كسمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوبنة رقم :
NO:20 <400> 50
Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro lle Cys Leu 1 5 10 15
Met lle Leu Asp Arg Met Leu Arg GIn Cys Ser Tyr Gin Val Thr Thr 10
Cys Gly Arg Ala Thr Lys Ala Leu Glu Leu Leu Arg Glu Val Lys Asp
Lys Phe Asp Leu Val lle Ser Asp Val Tyr Met Pro Asp Met Asp Gly 60 15
Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80
Met Met Ser Ser Asp Gly Glu Thr Ser Ala Val Met Lys Gly lle Thr 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg Leu Glu Glu Leu 100 105 110
Arg Asn lle Trp GIn His Val Val Arg Lys Lys 115 120 <210> 51 5 <211> 123 <212> PRT <213> Physcomitrella patens <220> كسمة ميسك 221< 10 (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide ببتيد يلوب5|61ل17١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:20 <400> 51 15
Pro Val Gly Met Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asn Pro Thr Cys Leu 1 5 10 15
Met lle Leu Glu Gin Met Leu Val Arg Cys Ala Tyr Arg Val Thr Thr
Cys Gly Lys Ala Thr Glu Ala Leu Ser Met Leu Arg Glu Asp lle Gly
Lys Phe Asp Val Val lle Ser Asp Val Asp Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 5 65 70 75 80
Met Val Ser Gly Asn Gly Glu Thr Ser Ala Val Met Lys Gly lle Thr 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Leu Lys Pro Val Arg lle Glu Glu Leu 100 105 110 10
Arg Asn lle Trp GIn His Val Val Arg Lys Lys 115 120 <210> 52 <211> 123 <212> PRT 15 <213> Arabidopsis thaliana <220> >سمة ميسك 221<
(SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:22 <400> 52 5
Pro Ala Asn Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu 1 5 10 15
Met lle Leu Glu Arg Met Leu Met Thr Cys Leu Tyr Arg Val Thr Lys
Cys Asn Arg Ala Glu Ser Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Lys Asn 10
Gly Phe Asp lle Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80 15
Met Met Ser Ala Asp Asp Ser Lys Ser Val Val Leu Lys Gly Val Thr 85 90 95
His Gly Ala Val Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu 100 105 110
Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Lys Lys 115 120 <210> 53 <211> 121 <212> PRT 5 <213> Arabidopsis halleri <220> <221كسمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 10 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم : NO:24 53 >400< Pro Val Gly Met Arg Val Leu Ala Val Asp Asp Asn Pro Thr Cys Leu 1 5 10 15 15
Arg Lys Leu Glu Glu Leu Leu Leu Arg Cys Lys Tyr His Val Thr Lys
Thr Met Glu Ser Arg Lys Ala Leu Glu Leu Leu Arg Glu Asn Ser Asn
Met Phe Asp Leu Val lle Ser Asp Val Glu Met Pro Asp Thr Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu lle Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle Met 65 70 75 80
Leu Ser Ala His Ser Asp Tyr Asp Ser Val Met Lys Gly lle lle His 5 85 90 95
Gly Ala Cys Asp Tyr Leu Val Lys Pro Val Gly Leu Lys Glu Leu 07 100 105 110
Asn lle Trp His His Val Val Lys Lys 115 120 10 <210> 54 <211> 123 <212> PRT <213> Vitis vinifera <220> 15 <221كسمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم :
NO:26 <400> 54
Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Val Thr Cys Leu 1 5 10 15
Lys lle Leu Glu ماي Met Leu Arg Arg Cys Leu Tyr His Val Thr Thr 5
Cys Ser GIn Ala Thr lle Ala Leu Asn lle Leu Arg Glu Lys Lys Gly
Cys Phe Asp lle Val Leu Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60 10
Tyr Lys Leu Leu Glu His Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asp Gly Arg Thr Ser Ala Val Met Arg Gly lle Arg 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro lle Arg Glu Glu Glu Leu 15 100 105 110
Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Lys Lys 115 120 <210> 55
<211> 3 <212> PRT <213> Glycine max <220> <221كسمة ميسك 5 (SGIL) 1 <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم
NO:34 <400> 55 10
Pro Ala Gly Leu Arg Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu 1 5 10 15
Met lle Leu Glu Lys Met Leu Arg Thr Cys Leu Tyr Glu Val Thr Lys
Cys Asn Arg Ala Glu Thr Ala Leu Ser Leu Leu Arg Glu Asn Lys Asn 15
Gly Phe Asp lle Val lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Lys Leu Leu Glu His lle Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle
65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asp Asp Gly Lys Ser Val Val Met Lys Gly Val Thr 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg lle Glu Ala Leu 100 105 110 5
Lys Asn lle Trp GIn His Val Val Arg Lys Arg 115 120 <210> 56 <211> 123 <212> PRT 10 <213> Zea mays <220> <221 >سمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 15 1ل0/8١17ل5|61بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم : NO:37 56 >400< Pro Val Gly Met Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu
1 5 10 15
Val Val Leu Lys Arg Met Leu Leu Glu Cys Arg Tyr Asp Val Thr Thr
Cys Pro GIn Ala Thr Arg Ala Leu Thr Met Leu Arg Glu Asn Arg Arg 5
Gly Phe Asp Val lle lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60
Phe Arg Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asp Ser Arg Thr Asp lle Val Met Lys Gly lle Lys 10 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg Met Glu Glu Leu 100 105 110
Lys Asn lle Trp Gin His Val Val Arg Lys Lys 115 120 15 <210> 57 <211> 123 <212> PRT <213> Oryza sativa
<220> <221كسمة ميسك <223>نطاق مستقبل منظم استجابة من تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGIL) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوبنة رقم :
NO:39 <400> 57
Pro Val Gly Met Lys Val Leu Val Val Asp Asp Asp Pro Thr Cys Leu 1 5 10 15
Ala Val Leu Lys Arg Met Leu Leu Glu Cys Arg Tyr Asp Ala Thr Thr 10
Cys Ser GIn Ala Thr Arg Ala Leu Thr Met Leu Arg Glu Asn Arg Arg
Gly Phe Asp Val lle lle Ser Asp Val His Met Pro Asp Met Asp Gly 60 15
Phe Arg Leu Leu Glu Leu Val Gly Leu Glu Met Asp Leu Pro Val lle 65 70 75 80
Met Met Ser Ala Asp Ser Arg Thr Asp lle Val Met Lys Gly lle Lys 85 90 95
His Gly Ala Cys Asp Tyr Leu lle Lys Pro Val Arg Met Glu Glu Leu 100 105 110
Lys Asn lle Trp Gin His Val lle Arg Lys Lys 115 120 <210> 58 5 <211> 60 <212> PRT <213> Parachlorella sp. <220> <221>سمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم 810:3 : 58 >400< Phe Val 15 دا Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His GIn 10 5 1 Asn Ala Val Asn Ser Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle 25 20 Leu Asp Leu Met Asn Val Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
35 40 45
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val 50 55 60 <210> 59 <211> 51 5 <212> PRT <213> Coccomyxa subellipsoidea <220> <221 >سمة ميسك Myb domain of 0 <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) GROWTH IMPROVEMENT 1 1ل0/8١17ل5|61بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم810:9 : 9 >400< Lys Lys Ala Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gin Gln Phe Val 1 5 10 15 15
Gln Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle
Leu Asp Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu 07 50 <210> 60 <211> 61 <212> PRT 5 <213> Ostreococcus lucimarinus <220> <221كسمة ميسك <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 10 : بهوية رقم810:10 <400> 60
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Ala Glu Leu His Ala Gin Phe Val 1 5 10 15
Thr Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle 15
Leu Asp Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu GIn
50 55 60 <210> 1 <211> 65 <212> PRT <213> Chlamydomonas reinhardtii 5 <220> >سمة ميسك 221< <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of من متوالية polypeptide ببتيد يلوب5|61ل17١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم210:11 0 >400< 1
Lys Lys Ala Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gin Gln Phe Val 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle 15
Leu Glu lle Met Gly Val Asp Gly Ser Ala Gly Arg Leu Ala Asp Thr
Ser Gly Arg Asp Val Cys Gly Thr Val Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg 60
Val 65 <210> 62 <211> 61 <212> PRT 5 <213> Chromochloris zofingiensis <220> <221كسمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم810:12 : 2 <400> Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gln Gin Phe Val 1 5 10 15
GIn Ala Val Asn ها Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle 15
Leu Glu Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val Gin
50 55 60 <210> 63 <211> 60 <212> PRT <213> Volvox carteri 5 <220> <221 >سمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 1ل0/8١17ل5|61بولي ببتيد polypeptide من متوالية 0 بهوية رقم210:13 : <400> 63 Lys Lys Ala Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gin Gln Phe Val 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle 15
Leu Glu lle Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val 60
<210> 4 <211> 60 <212> PRT <213> Tetraselmis sp. <220> 5 >سمة ميسك 221< <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of polypeptide 5 of ببتيد يلوبكا61ل1١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1
SEQ ID 10:14, SEQ ID 10:15, and SEQ ID NO:16 10 <400> 4
Lys Lys Gln Arg Met Asn Trp Ser Asp Glu Met His 60 Gin Phe Val 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle 15
Leu Asp Leu Met Ser Val Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Lys Arg Met 60
<210> 65 <211> 60 <212> PRT <213> Oocystis sp. <220> 5 <221 >سمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 1ل0/8١17ل5|61بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية )03 NO:17 : <400> 65 0
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Met His Gln Gin Phe Val 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle
Leu Asp Leu Met Asn Val Asp Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 15 His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Val 50 55 60 <210> 66
<211> 1 <212> PRT <213> Micromonas sp. RCC299 <220> >سمة ميسك 221< 5 <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of من متوالية polypeptide ببتيد يلوب5|61ل17١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم810:18 <400> 66
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Ala Glu Leu His Gln Gin Phe Val 10 1 5 10 15
Thr Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle
Leu Asp Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 15
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu GIn 60 <210> 7 <211> 1
<212> PRT <213> Micromonas pusillada <220> <221كسمة ميسك Myb domain of 5 <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (SGI1) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم810:19 : 67 >400< Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Pro Glu Leu His Gin Gln Phe Val 1 5 10 15 10
Thr Ala Val Asn GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle
Leu Asp Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu Gin 15 60 <210> 68 <211> 60 <212> PRT
<213> Sphagnum fallax <220> <221كسمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 5 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم810:20 : 68 >400< Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gin Phe Val 1 5 10 15
Ser Ala Val Asn ما Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle 10
Leu Glu Leu Met Ser Val His Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu 60 15 <210> 69 <211> 60 <212> PRT <213> Physcomitrella patens
<220> <221كسمة ميسك Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية 5 بهوبة رقم10:21 : >400< 9 Lys Arg Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gin Phe Val 1 5 10 15
Ser Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle 10
Leu Glu Leu Met Gly Val Gin Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu 60 <210> 70 15 <211> 61 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <220>
<221كسمة ميسك <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : بهوية رقم810:22 <400> 70 5
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gin Phe Val 1 5 10 15
Ala Ala Val Asn GIn Leu Gly Val Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle
Leu Glu Met Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10
His Leu GIn Lys Tyr Arg lle Tyr Leu Arg Arg Leu Gly 60 <210> 71 <211> 61 15 <212> PRT <213> Arabidopsis halleri <220> <221كسمة ميسك
<223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of polypeptide 5 of ببتيد يلوبكا61ل1١0/8ل1 GROWTH IMPROVEMENT 1
SEQ ID NO:23 and SEQ ID NO:24 <400> 1
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Gin Glu Leu His GIn Lys Phe Val 5 1 5 10 15
Ser Ala Val GIn Gin Leu Gly Leu Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle
Leu Asp Leu Met Ser lle Glu Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10
His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Lys lle Asp 60 <210> 2 <211> 60 <212> PRT 15 <213> Vitis vinifera <220> >سمة ميسك 221<
Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية NO:2643) : 2 >400< Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gln Phe Val 5 1 5 10 15
Ser Ala Val Asn Gin Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Arg lle
Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10 His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg Leu 50 55 60 <210> 73 <211> 60 <212> PRT 15 <213> Glycine max <220> <221كسمة ميسك
Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم 810:34 : 3 >400< Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gln Phe Val 5 1 5 10 15
Ala Ala Val Asp GIn Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle
Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10 His Leu GIn Lys Tyr Arg Leu Tyr Leu Arg Arg Leu 50 55 60 <210> 74 <211> 60 <212> PRT 15 <213> Zea mays <220> <221كسمة ميسك
Myb domain of <223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) GROWTH IMPROVEMENT 1 10/811 17ل61ا5بولي ببتيد polypeptide من متوالية بهوية رقم NO:37 : 4 >400< Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His Gln Gin Phe Val 5 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn His Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle
Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10 His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg lle 50 55 60 <210> 75 <211> 60 <212> PRT 15 <213> Oryza sativa <220> <221كسمة ميسك
<223>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1 (1ا55) Myb domain of من متوالية polypeptide 17ل61ا5بولي ببتيد 10/811 GROWTH IMPROVEMENT 1 : NO:39,3, بهوية <400> 5
Lys Lys Pro Arg Val Val Trp Ser Val Glu Leu His GIn Gln Phe Val 5 1 5 10 15
Asn Ala Val Asn His Leu Gly lle Asp Lys Ala Val Pro Lys Lys lle
Leu Glu Leu Met Asn Val Pro Gly Leu Thr Arg Glu Asn Val Ala Ser 10
His Leu GIn Lys Phe Arg Leu Tyr Leu Lys Arg lle 60 <210> 6 <211> 5607
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> 15 (DNA) <213>متوالية اصطناعية <220> >تخليقية 3< <220> 20
<221كسمة ميسك
Parachlorella that includes <223>جين محسن ل 9 sequences encoding an N-terminal FLAG tag, nuclear localization signal, and peptide linker and contains introns from
Parachlorella 5 <400> 6 atgcccaaga agaagcggaa agtcggggac tacaaggacg acgatgacaa actggagcct 60 ggggagaagc cctataagtg tcctgagtgc gggaagagct tcagccaatc tggagcactg 120 10 acaaggcacc agaggacaca tacacgcgac aagaagtaca gcatcgggct ggatatcggg 180 accaattctg tgggatgggc cgtgattacc gacgagtata aggtgcccag caagaagttc 240 aaggtgctgg ggaacacaga ccgccacagc attaagaaga acctgatcgg ggcgetgetg 5 300 tttgattctg gagagacagc agaggcaacc gtgagtgaga acagttttca gatcgaatag 360 cacccccccg cctetgcage agtcgcatac cggcetgcagt aatagettgg ttcaacggceg 420 20 acctgaacaa gtactgtagt ttctatgcat acgaacttta tcgaatagaa tcacgcttgg 480 gtatcgatca taccttagcg ctcaatttca ttggctgcta cagaccatat tttcctcttc 540 acttgttgca gcgcctgaaa agaacagcaa gaaggcgcta cacccgeccgce aagaatagga 600 tttgctacct gcaagagatc ttcagcaacg agatggccaa ggtggacgac agcttcttce 660 5 atagactgga ggagtcgttc ctggtggagg aggataagaa gcacgagagg caccccatct 720 tcggtgagaa gagtttggct accaaatcta tcttttcata tcacatatac cgcctgatat 780 tctgaggtgg tggcttttgt ctttttcttt cagtattttt cttcgttggg aacctaccgce 840 gagggcattc attgtggcgg atctgtaagt gcgaccaggc tgtatccaat attttttcct 900 10 atcgcaggga acattgtgga tgaggtggcc taccacgaga agtaccccac aatctaccac 960 ctgcgcaaga agctggtgag aatctctgct tgtcgaatgt gtccagttgt gtcttgaate 1020 ctggcaagat gttcttttca ccatccgtcc tgcaaaagtg tcagaagtag catctctcga 1080 tcgcgttgtc acttcaacgce ctccgcaact ccccecegttg tgaatcetgt ggtcatgget 1140 5 cagcttttca gatctctacc tgcatgttgt ttgcctgtct cagtcctgec tgcacaaatce 1200 atcgcccttg tttactcctt gcaatcacgg attgtgtgca ggtggacagc acagataagg 1260 ccgatctgag gctgatctac ctggcattgg cccacatgat caagtttagg gggcacttcc 1320 0 tcatcgaggg ggatttgaac cccgacaaca gcgatgtgga caagctgttc atccagcetgg 1380 tgagtggagg gctggggttt 9999919999 99199993899 gaggcacgga tggtgtttic 1440 tcatgtccaa ccgtggttca tgcaaccgaa cagcagttic acaagatggt tccaacaggg 5
1500 tgctccattt ctccctgaca aaacctcgtg cggtccatcet ggtatagetg ggttagtagg 1560 gggttgtggg ctgtccacag tcagtgcgaa gcaggctcta ttgagcgtgt gctagtgtgt 1620 gctgtgctga ttggcatttt gttgggccga gtgttaggat tagggtaaat caccctaatt 1680 0 aaccttacat aataggactg tatgcaaatt tgttttccaa aaactctacc cagcgtggtc 1740 agactgcatg cactgtggag catgcatggg gctgaccctg ttgatcctge tcattctgcet 1800 tcctccaggt gcagacctac aaccagctgt ttgaggagaa ccccatcaac gcatctgggg 1860 ttgacgcaaa ggccattctg tctgcaaggt aggtgcagga agaagtgaat gatgcacaca 5 1920 tggtggaatc gtgatacaag cagcagcaag tgttggacca agacatgtgc gtgctttgct 1980 gctgccaagce tggcactgca ccaggtcgtg cattgatctg cacatttgat atactgtgag
2040 20 agtcagacga cgtcctttca gagcctgtgt gtgattctcc aggggttaac acgagtttcc 2100 tttctgccag tgagtcaccc tctcgetgct cgctectggt gcaggetgag caagtcaagg 2160 agactggaga acctgatcgc ccaattgcct ggagagaaga agaacgggct gttcgggaac 2220 ctgatcgcat tgtctctggg gttgaccccc aacttcaaga gcaacttcga cctggcagag 5S 2280 gacgcaaaac tgcagctgag caaggacacc tacgacgatg atctggacaa cctgctggcc 2340 cagattggag atcagtacgc agacctgttc ctggcagcca agaatctgag cgacgcaatt 2400 10 ctgctgagceg acattctgcg cgtgaacacc gagatcacca aggcacctct gagcgcaagce 2460 atgatcaaga ggtacgacga gcaccaccaa gacctgacac tgctgaaagc actggtgaga 2520 cagcagctgc ctgagaagta caaggagatc ttcttcgacc agagcaagaa cgggtacget 5 2580 gggtacattg atggaggagc aagccaagag gagttctaca agttcatcaa gcccatcctg 2640 gagaagatgg acgggacaga agagttgctg gtgaagctga atcgcgagga tctgctgagg 2700 20 aagcagagga cattcgacaa tgggagcatc ccacaccaga tccatctggg agagctgcac 2760 gcaattctga ggagacaaga ggacttctac ccgttcctga aggacaatcg cgagaagatc 2820 gagaagatcc tcacgttccg catcccgtac tatgtgggac ctctggcaag ggggaactct 2880 agatttgcct ggatgacccg caagagcgag gagacaatta caccctggaa cticgaggag 5S 2940 gtggtggata aaggggcatc tgcacagagc ttcatcgaga ggatgaccaa cttcgacaag 3000 aacctgccca acgagaaggt actgcctaag cattcactgc tgtacgagta cttcaccgtg 3060 10 tacaacgagc tgaccaaggt gaagtacgtg acagagggga tgaggaagcc agcatttctg 3120 agcggagagc aaaagaaggc catcgtggat ctgctgttca agaccaaccg caaggtgacc 3180 gtgaagcagc tgaaggagga ctacttcaag aagatcgagt gcttcgacag cgtggagatt 5 3240 tctggagtgg aggaccgctt caacgcatct ttggggacat accacgacct gctgaagatc 3300 atcaaggaca aggacttcct ggacaacgag gagaacgagg acatcctgga ggacattgtg 3360 20 ctgacactga ccctgttcga ggatagggag atgatcgagg agcgcctgaa gacatacgca 3420 cacctgtttg acgacaaggt gatgaagcag ctgaagagga ggcgctatac tggatgggga 3480 aggctgtcaa ggaagctgat taacgggatc cgcgacaagc agagcgggaa gacaattctg 3540 gacttcctga agagcgacgg gttcgcaaac cgcaacttca tgcagctgat ccacgacgat 5 3600 agcctgacct tcaaggagga catccagaag gcccaagtgt ctggacaagg ggatagcctg 3660 catgagcaca tcgcaaatct ggctgggtca cccgcaatca agaagggaat tctgcagacc 3720 10 gtgaaggtgg tggatgagct ggtgaaggtg atgggaaggc acaaacccga gaacatcgtg 3780 atcgagatgg caagggagaa ccagacaacc cagaagggac agaagaactc tagggagcgc 3840 atgaagcgca tcgaggaggg aattaaggag ctgggaagcc agatcctgaa ggagcatcct 15 3900 gtggagaaca cccaactgca gaacgagaag ctgtacctgt actacctgca gaacgggagg 3960 gacatgtacg tggatcaaga gctggacatc aaccgcctga gcgactatga cgtggaccac 4020 20 attgtgcctc agtcgttcct gaaggacgac agcatcgaca acaaggtgct gacaaggagce 4080 gacaagaatc gcggaaagag cgacaacgtg ccttcagaag aggtggtgaa gaagatgaag 4140 aactactggc gccagctgct gaacgcaaag ctgattacac agcgcaagtt cgacaacctg 4200 accaaggcag agaggggagg actgtcagaa ctggataagg ccgggttcat caagaggcaa 5 4260 ctggtggaga cacgccagat cacaaagcat gtggcccaga ttctggacag ccgcatgaac 4320 accaagtacg acgagaacga caagctgatc cgcgaggtga aggtgattac cctgaagagc 4380 10 aagctggtga gcgactttcg caaggacttc cagttctaca aggtgcgcga gatcaacaac 4440 taccaccacg cacacgacgc ctacctgaat gcagttgtgg gaacagccct gatcaagaag 4500 taccccaagc tggagagcga gttcgtgtat ggggactaca aggtgtacga cgtgcgcaag 5 4560 atgatcgcca agtctgagca agagatcggg aaggcaaccg ccaagtactt cttctacagce 4620 aacatcatga acttctticaa gaccgagatc accctggcca atggggagat taggaagaga 4680 20 cccctgatcg agaccaacgg agagactgga gagatcgtgt gggataaggg gagggacttt 4740 gcaacagtgc gcaaagtgct gagcatgcct caagtgaaca tcgtgaagaa gaccgaggtg 4800 cagactgggg gattctcaaa ggagagcatt ctgcccaagc gcaacagcga taagctgatt 4860 gcacgcaaga aggactggga ccccaagaag tatggggggt ttgatagccc caccgtggca 5 4920 tattctgtgt tggttgtggc caaggtggag aaggggaaga gcaagaagct gaagagcegtg 4980 aaggagctgc tggggatcac cattatggag aggagcagct tcgagaagaa ccccatcgac 5040 10 ttcctggagg caaaggggta taaggaggtg aagaaggacc tgatcatcaa gctgcccaag 5100 tacagcctgt tcgagctgga gaatgggagg aagaggatgc tggcatctge tggagaactg 5160 cagaagggga atgagttggc actgcctagc aagtacgtga acttcctgta cctggccage 5 5220 cactacgaga agctgaaggg atcacccgag gacaatgagc agaagcagct gtttgtggag 5280 cagcacaagc actacctgga cgagatcatc gagcagatca gcgagttcag caagcgcgtg 5340 20 attctggcag acgcaaacct ggataaggtg ctgagcgcct acaacaagca ccgcgataag 5400 cccattcgcg agcaagcaga gaacatcatc cacctgttca ccctgaccaa cctgggagca 5460 cctgcagcat tcaagtactt cgacaccacc atcgaccgca agaggtacac aagcaccaag 5520 gaagtgctgg acgcaaccct gattcaccag agcattactg ggctgtacga gacacgcatc 5 5580 gacctgtcac aactgggagg ggactga 5607 <210> 7 <211> 588
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين 10 (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221كسمة ميسك <223بمعزز RPS17 15 <400> 7 caacacctag ttggtaaata ccgttgctga tattgctctg taccagtaaa agagggctge 60 gatgagcgtt tttagtgcac ttcttcaaca cggaatattt ttcacaaatt ggtatgagaa 120 ccaattttgc aaaatgttcg ccctgtaaag tatcgctctg ggacgatcag cttgacgtaa 180 ttgtaggcga aaagggcgtt caaagtgcag ctttatgtat gaacgtcata aaatataaag 240 catagcacaa tcactgatag aaaatatttg tgcgcattaa aactctcact tctgttgcgg 300 atacaacgac ggaaatgaga agctigtgta agaagcaatt caagttttca ttttgtcatc 360 taaggtgtga tcctccgata ttcattaccg aatgctgatc tgagttggaa agatggcaat 420 5 atttagctgt gcacactttg acctccaggc cttggcggga atttagtatt ctagctttcc 480 tattggaacg ataggccagc caagtctcca gcttgtatac gctacaccag cagacatgct 540 ctcaatttag ctgacagtgt cttcatattt gtattatctg ttgtgtct 588 <210> 78 10 <211> 455
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> 15 <221كسمة ميسك <223>وسيلة إنهاء +7 <400> 78 ggtgcgaata gtgcttcagt aaaaaagtag caacttggtg caatatcgtc agggtcgtgt 60 20 ggtctgctcg ccagcaagtt ttttggcaca ggagagcgct ttttccgagt accgccaaag 120 ttcaagcatg tgctgtgatt cgctgttgce tcttatgata attgctcaaa gtttccaagce 180 attctatgtc caccctgcac cactaagttg tatggtgctt attctgcagg ggatgattca 240 tggtgcctaa aaattttgtg ctgctgtcge gtctgttttc tgtcgcagtt tagtgaatgt 300 5 aactccaaat accaaacttt tcatcacaat catattgatg cctttgtaag tgaattacag 360 cgttttttgc cataaaaaga agtaccgtga cattggggtc gtcataacaa gaagctttat 420 gaacaagcag cttgatctac gagacttata cataa 455 <210> 79 <211> 2691 10 <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) <213>متوالية اصطناعية >220< <3 >تخليقية <220> <221كسمة ميسك
Parachlorella, <223>جين محسن ل 88506010 resistance containing Parachlorella introns
>400< 9 atggcaaaac ctctctccca ggaagagtct accctgattg aaagggcaac agcaaccatc
60 aacagcattc ccattagcga ggactactct gttgtgagtt ctgagaagct gattgttgtt 120 taacttcttt gaaagcttta tcgaagattc tgcaagcgat gaacattgct tgtcaagacc 180 5 gagagctgca tgcccacttg acatccagct ttgaacggct cttcatgttt gatttgtttc 240 tgattgtagg catctgcagc attgagctct gatggaagga tctttacagg agtgagtgca
300 gcgtcagcetg tggcagttgt tggctttcgt ctcagtcagt agtttgctgg gattgattat 360 ggagggcaca gttgcaattt tgagttgcac gttgcgacaa gcgtgttgac aaagcgtggt 0
420 caagccggcc agtcttgceg gtggcgggtg gcttggtcta acttccgete tacggcaatce
480 gttttgttca tggttacggg gctggcgtge cagaaagtcce tggtcagcca ccctegcette 540 aaagccgtag cccaacaact ttgcgaatat gttcgatttg caggtgaacg tgtaccactt 5
600 tacaggagga ccttgtgcag aattggtggt gttaggtaca gctctgcgtg caacaggttg
660 caagatgcag cgcaggtctt ccctggtcaa acgatgtatg cagagttgag aggcacttga 720 0 gctgggtgaa tggcgtgggce tcgtaggtag tgtgcagggec aggaagggca gccaattttg 780 gagttgtggt ccggtgtcgt tgcticgagce cttattagga ctcttgectca tcaaagcegtt 840 agttgtgaat aagttgatct gaaaggatgt tatgtacagc aagcagcagc agttaagagt 900 5 ctggggagta gctgcacagg gcgaggtgtc aagatgggaa gggtcctgec tccttatgtg 960 tttttccctg taggggagga agcctcettat gggcaatggt tgggcatatt ttccagccag 1020 cccttctttc tataggggcec agggtgggec cagcetcgtet tggcttccac caccaggaga 1080 10 gtgagggcat tgaagggcca taaatagtcc tcccatctac gtgcaccaga gggtgtcgtc 1140 taggctgtgc atgccacgag gggaaggagc caagaatgag tgtatgggtt gttttcatgt 1200 ttaggctggg ataaaactgt tttcaattgc gcctgeccggg tgaaaaccac agcagcatca 5 1260 gcaagcttgg agaaggccag cccgcccagce acaggctcac gttcccactc aggcggtcag 1320 tcgggcggag gtgtgagtca ggcaggcgag ggtgtctgtg cctgacatca gcacctetge 1380 20 ttagccactg cagcccectgg agcagggtag ggcgtcattt gcagcaatca cctgetgect 1440 cacacgtcgc agcttggaat ttcaacgacc atcagcgctg gggttgttga gggatcatag 1500 cagattttgg tgcagcctgg ttgtcatgct ctttgtggaa tggcctctat gttcgagcaa 1560 ttcgttggat gttgaggtgc ttggggacag agagtcgaat gatgggccag ggtcaaacat 1620 5 gcgagcgttt ggctgagtca geggtttttg ctggtcactt tttcttttgt ticttattta 1680 ggtttgatgg atgtgttttg tgctgctgee ctgaagctge agcagcegtgt ctgcectgeg 1740 ctactgcggg caccaaggct atgtgctggt gcactcgget gegcetgcacc tgtgcaccte 1800 gcactccgtc cagcctccat gcagcacacg tactcacggt gtcctcectga cetgtegtac 10 1860 gctattccaa acttgctctt ttgctgccge tgctctcgta cacaattgct gttgattatc 1920 gatatctaat cgagcgcctg ctgactgaac tccgcaggta cagcagctgc agcagcagca 1980 ggaaatttga catgcattgt ggcaataggt gggtgggctc tgaaggagga ggagggageg 5 2040 ggtgattaaa cagggcctgc atgaagagga gcaggggctg cgtggacagc agggggaagg 2100 tgcagaaggg agggtcaagc ggggttcagg tggctgtggg tttctgcacg agcagtgaaa 2160 0 gaagctgtat ccttccacct gcttccactg gcgaaaggtt gaaaacagga 19120268302 2220 ggaaagatgt tgcgctgtca agtgcaagcc atggttgagg gtatgcctgt gtgcatgtge 2280 ttcttaaagt tactcctgtt ctatggttct gggtgcttgt tgtttgtggt gcagggaacg 2340 5 agaatagggg gattttgtca ccttgcggaa gatgtagaca ggtgttgttg gatctgcatc 2400 ccgggattaa ggtgaggggg catgtaagca atggcaggca attcaagaac gaatcattgc 2460 tgcaaatgct gggatggtat gcagctgagg tatctattge cttgtatttt gtctcgecatt 2520 0 gcatcggtgg tgcgttetgt ggectgagge acagttettg ctgtttgata agggttcgac 2580 tgagttgtcg tgtgtgctgt gctgcaggca atcgtgaagg attcagatgg gcagcctaca 2640 gcagtgggaa ttagagaact gctgccttct gggtatgtgt gggaaggata a 2691 <210> 80 15 <211> 530
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> 20 <221كسمة ميسك
<223>معزز +4 <400> 80 ccaccatggg ggaggtttga agtgtgcgcc tgatataatc atacacctaa aagcaccact 60 tgctgatigt gaagggacta tgtcgtttat gacgggacgt tacgctggcc gatggtttga 120 5 atttggacgc tgtggtagaa tgttatatgg acgtaaaggt tggcatattg aaaatcgtct 180 tcgcaggcaa acttctagac gtgtgaccca ccggtaaaac gacaagcgtg gcgcgtcgat 240 tgcgctttga acgtcgtttg ttggactcca gatgaacctc aaaatcaaag cggtgattga 300 cgaaaatcaa atgacagccc gcaaaatttc atcagccttic ggatcggatt ctcagaatct 0 360 gattgtccct getggctaca tttatgaaat ttcgtacatt ttggcagaaa tgtcccaata 420 ccatagcact gccgcctgag ctcacccgag caatgcatac tgggtacctc 6681-19 480 ccctetttcc aagcccagtg ctgttgtaat agccaaaggg ctcagtaaca 530 15 <210> 1 <211> 546
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) <213> Parachlorella sp. 0
<220> <221كسمة ميسك <223>وسيلة إنهاء +4 <400> 1 gcatagcatc agcctgtgge agggttgtgg tagggcetgag tggcagggtt aaaggggttg 5 60 cctaccccac ccctactctc atgacaccag caacagcagc agctcatgca gtactcaaat 120 cactgatgtc aatggtgtga cacatttggt taaggctgct ttttaaagtg ctgctttggg 180 ggcagtgact gtgcagagct tggagcgtat ccccatgtaa tcagaaccga cgagagttcg 10 240 gggcaacctt tcatcttcac attttttgtg atcagctaca gagtctgaaa tcaaatagag 300 gctgccatct aaacgcagga gtcacaacga aggcgaaaac tccaattgct gtactcaatg 360 cactaagtga ttgticaatg gataaataca ctatgctcaa ttcatgccag cagagctgct 420 15 ccttccagec agctacaatg gctttttcca cgcctttiga agtatgaatg ttcagcttge 480 tgtgcttgat gcatcaccat aaacacaatt ctacaacatt tcatgccaac aacagtacgg 540 gctttc 546 <210> 82 20
<211> 2
DEOXYRIBONUCLEIC ACID >الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين 12< (DNA) <213>متوالية اصطناعية <220> 5 >تخليقية 3< <220> <221كسمة ميسك <223> Encodes TurboGFP <400> 82 10 atgttggaga gcgacgagag cggcctgccc gccatggaga tcgagtgccg catcaccgge 60 accctgaacg gcgtggagtt cgagcetggtg ggcggecggag agggcacccc cgagcaggge 120 cgcatgacca acaagatgaa gagcaccaaa ggcgccctga ccttcagcce ctacctgetg 5 180 agccacgtga tgggctacgg cttctaccac ttcggcacct accccagegg ctacgagaac 240 cccttcctge acgccatcaa caacggceggce tacaccaaca cccgcatcga gaagtacgag 300 20 gacggcggcg tgctgcacgt gagcttcage taccgctacg aggccggecg 0103816006 360 gacttcaagg tgatgggcac cggcttcccc gaggacagcg tgatcttcac cgacaagatc 420 atccgcagca acgccaccgt ggagcacctg caccccatgg gcgataacga tctggatgge 5 480 agcttcaccc gcaccttcag cctgcgecgac ggeggctact acagcteccgt ggtggacagce 540 cacatgcact tcaagagcgc catccacccc agcatcctgc agaacggggg ccccatgtte 600 10 gccttccgee gegtggagga ggatcacage aacaccgagce tgggcatcgt ggagtaccag 660 cacgccttca agaccccgga tgcagatgec ggtgaagaat aa 702 <210> 83 <211> 572 15
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221كسمة ميسك 20 <223>معزز 1
<400> 83 agtttgcata gttaagtatg ctggctattg cagtacctta tatgcaaaca agtgctcaat 60 ctgtttcatc attgtctgtg ggcaaattgc ctgccaatat tctccagtta ttgectgttg 120 tttcaaatga ttgaaattgg aagttgtatt gctctacatt tttgacttgt gatttttica 180 ttigttgata tctgacaact gtgaactgca ctgaacttgc tgtgcttata aatgcatttt 240 5 tttgttttgg gccacgttga ttecttgtga tactttcctg ctatcaaacc aaaaatatac 300 tctcatgact gacgtgcaac aaatgcatgg aagctttcaa cgttacgaca gctgcettgece 360 ccccatcagc tattctacat gtgtaaccta ccttgcatgg ccaccacaac gctactgcat 420 gcaagatctg gcgcaactgg atgtcccaat agtagaagta tccggattat ctccgagagt 10 480 tttacatatg taatcgacgc catttctgtc atcaactata aatccattgc tcctgcattt 540 ctggcactga cattctacca caagcaatac ca 572 <210> 84 <211> 869 15
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Parachlorella sp. <220> <221>سمة ميسك 20
<223>وسيلة إنهاء 01 <400> 4 gcagcagctt gttatgcctt 603109902 atcagcatge tgcaagcetgt ctagatatcce 60 agctttcagt ggaggttgag cgagggtcag cagcggttcc ctggcgatgg cggtcagctt 120 5 ttctggaagc cttcactagg actgcgccca gcgcatgtga cgccaatcga acttgtgtge 180 aaggccaaat tttgtgaccc tgtgctgcac ttcatgtatt caagaattga gaagaaattt 240 cattgctgcc ctictttcac tttaatttcc atccctggat ccacctecca ccattgtggt 300 tgatgggtag gggttttggg taggtgcagt tcgttgtgca cgttgacatg tgtaacggtg 360 10 agcaaaggaa ttgctgggca agtagctatt gcagcttaag ggcatggtga aacacttgtg 420 ctgtatttac agaggaagcc agacaggtaa ggagtgtgtg gcagcttgga acaggagggc 480 tggtcgcaac aagtatgcat atcccatgat tgttgacata agagcagcag gtgcatattg 5 540 ccagcctttg tgaaagtgga ttgaaaatcg attagttggt gtgatagctg aggctaggca 600 ctgccaacct gcagtgaaat gaggctccaa gaccgggtaa taatacaggc aatcgaatcc 660 20 agttgaaatt acggcgatta aatccaagcg agcgttgtaa gaacatctgc acctgtctga 720 agtagtgagc ggataatgag cattgcttgc cttctatcac tatacctgac agttacgtgt 780 cacacactct caagcacaac acacagcggc aaagttactt gctaaacctc acagtcaagc 840 5 tgaaaataaa ggctaaatta cgtgagacc 869 <210> 85 <211> 2879
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) 0 <213> Tetraselmis sp. <220> <221كسمة ميسك (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن , T=-51722aIMPROVEMENT 1 15 <400> 85 atgagctgca cagtggcgtc ctttccgceec geggeggggg ggcagggcete gectgecacg 60 0001660831 accaggacct gectcgtgaag cggcaagacc agtggagcaa cttcccggee 120 0
0092-1192-9029 tgetggtgge agacaacgac cccgcectecge tgcagcaagt ggagaagatg 180 ctaaagaagt gtagctacca aggtgaggct gcgctgcccc tcgaaaggeg gececggecccc 240 caccccagct ggccacttge gecagtgcgceg tgttatcttg ataatccgaa aacgcegtttt 300 5 tttgcctegt tttatccege tagtcgtaca atccggtcgg ggcccaggea ggcaccggeg 360 gccacgcgca gacccacaca ccagctcacc ggttgectgct acactgatge atgctttacg 420 cccggtccca acagtaacac tgtgcagectc ggggaagaac tccctggaga tectccgcaa 10 480 gcggcgagag gaattcgacc tcgtgctgge ggacgcaaat ctaccaggtt ttcceecteca 540 ccctgtctge tcgagggggt acaccggtac tactaaccgc gacaattccg 6000108-26 600 15 gccgcecttcc cacgccacaa gcgacggaac tgattgtatt cctgctcceg gtetttcgee 660 tgcagacata gatggcttca agcttcttca cgtctgccac accgagcetgt cgctceeegt 720 cgtccgtaag agcectgetge ccgectcgaca tccacctege acttcaattt getattcagt 780 catcgtaccg tgccctgecc tgcacttcce tgccctgagg tatcccagtc gecatccegge 20 840
10100606006 000000006 0611:6606 aaacgtagtg atgtccggeca 0800038086 900 acagctggta 31909009929 tgatggatgg cgcgcgggac tttctgatca agcccectgceg 960 cgtggaggag ctcaaggtgc tctggcagca ccttgtgegce ttcacttcgg agatcaccaa 5
1020 gacagacgcg cagctaaatg ttgtcaaggt ggagctggac ggcggaaggc ctgcgggcga 1080 agtctctacg agtcagaacg gctcggtatg ccacagcagc ccatttgaag cagcccgttt
1140 10 cttgtagggc gcgaattatg cctcggegeg ttttcctece tectegeget gactecttgt 1200 gtgccccaca cagcaatgca ccgagcgcga gggcgaaggc aattcatcaa agaagcagceg 1260 catgaattgg agcgatgaaa tgcatcagca gtttgtcaat gccgttaacc agcttggcat
1320 15 cgacagtgcg 31006000066 060060066 006000161 cetgegactg ctetecegcete 1380 tccataagag taattgcgct cgcccacatg agctcgtgec gaccctgcetg teectgegetg 1440 ctcccggggt ccgcagaggce cgtacccaag cggattctag acctcatgag cgtggaggge 20 1500 ctcacacgag aaaacgtagc cagccacttg 8090160666 600806606 1-8 1560 tgttgggcga gtgactggtc aacccctgca atgatggctg aaccacagag cacttctgag 1620 atgcatgttc ttctgcagct gctgacctgt gcaccccctc cgccacatcg gattcccecce 1680 5 tccctgteat cctectceca tgeccecgeac gegtgcagaa ataccgceate tacttgaagce 1740 gcatggccaa ccaccaggaa aatgggaagc aagcggtgat gagcacggac acgatcgccc 1800 gcgctgaagc ggcgtaccag ggaggcatgc cccaggggca gcagatgatg cagcaggage 0 1860 acagcggcca ggcggtgcag tacagccagc cgcatgcccec cggeggcectg caccagcaag 1920 ccatgcccgce ccagatgcac atgggcatga tgccggecgg cccgcagecc 0008068106
1980 15 agatggcgcc gcaccacgtc atgcaaatgc ccaatgggca ggtgatggtg atgcagcaga 2040 tggggccgceg cccggggatg ccaccecggga tgeccgcagcea gatgatggec agcetcgcagce 2100 agatgggcat gcttcagccc ggcatgccgg cgggtcagat gttgcacttt cagcaccege 20 2160 agcaagtgca ccagcatccg ccaagctcag ggcctatgca 0680010260 ctacgcccect 2220 caatgagtcc 32166060066 000000666 ccaacccgec caagaaaaac atgcagtaaa 2280 tacgctctgt tttcgcatca acatttgatt ttagggacaa agagaatgac ctgtgcatgc 2340 5 agggttggaa aacttaacat tcacgcacca tacaagtaca tcatagcctt tgtatgttgc 2400 aatattagag gccactttca gagtttcagt ggctacctct attggcaatt ctgccgecgte 2460 tacgtgccca tgtgttgttc catttaattg gecttgecgge tegtcgegeg gegtgaagee - 2520 taccatggtg catttgtttt cctctttgat gcttattgac ctggtttctc ccctgtgtec 2580 10 atgtagaatg tgtttttagt gtgtgcatat cagtcgatgg ggtgttgtct tttgattgct 2640 gctgcactct ctttgtggct gatgtagatc tgtctgacgc agggggagag atgatagacc 2700 caggcagcat gcagcggttg catcagcagc cacactacat cggccccaac gggcagcaca 2760 15 tgccagcgcec tgcgatgggg atgcecgtetg gcacagtcca gcacatggag tacgcectaca 2820 gccagcccat gcagatggct ggctggcecgg tccaaggcca acccggcaac caagcctag 2879 <210> 86 20 <211> 1341
DEOXYRIBONUCLEIC ACID >الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين 12< (DNA) <213> Tetraselmis sp. <220> <221كسمة ميسك 5 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن pedi امتوالية MPROVEMENT 1 1-2 <400> 86 atgagctgca cagtggcgtc ctttccgceec geggeggggg ggcagggcete gectgecacg 60 10 0001660831 accaggacct getcgtgaag cggcaagacc agtggagcaa cttcccggec 120 gggctgcgceg tgetggtgge agacaacgac cccgcectecge tgcagcaagt ggagaagatg 180 ctaaagaagt gtagctacca agtaacactg tgcagctcgg ggaagaactc cctggagatc 15 240 ctccgcaagc ggcgagagga attcgacctc gtgctggcgg acgcaaatct accagacata 300 gatggcttca agcttcttca cgtctgccac accgagcetgt cgctececcegt cgtectgatg 360 tccggcacca gcgacacaca gctggtaatg cgecggegtga tggatggege gegggacttt 0 420 ctgatcaagc ccctgcgegt 1139939016 aaggtgcetct ggcagcacct tgtgegcette 480 acttcggaga tcaccaagac agacgcgcag ctaaatgttg tcaaggtgga gctggacggce 540 ggaaggcctg cgggcgaagt ctctacgagt cagaacggct cgcaatgcac cgagcgcgag م
600 ggcgaaggca attcatcaaa gaagcagcgc atgaattgga gcgatgaaat gcatcagcag 660 tttgtcaatg ccgttaacca gcttggcatc gacaaggcecg tacccaagceg gattctagac
720 0 ctcatgagcg tggagggcct cacacgagaa aacgtagcca gccacttgca gaaataccge 780 atctacttga agcgcatggc caaccaccag gaaaatggga agcaagcggt gatgagcacg 840 gacacgatcg cccgcgcetga agcggcegtac cagggaggca tgccccaggg gcagcagatg 5 900 atgcagcagg agcacagcgg ccaggcggtg cagtacagcc agccgcatge cceceggeggce 960 ctgcaccagc aagccatgcc cgcccagatg cacatgggca tgatgccggce 0069
1020 0 cccggcagca tgcagatggc geccgcaccac gtcatgcaaa tgcccaatgg gcaggtgatg 1080 gtgatgcagc agatggggcc 000-6090999 atgccacccg ggatgccgca gcagatgatg 1140 gccagctcge agcagatggg catgcttcag cccggecatge cggcgggtca gatgttgcac 1200 tttcagcacc cgcagcaagt gcaccagcat ccgccaagcet cagggcectat gcacgcagtc 5 1260 cagcacatgg agtacgccta cagccagccc atgcagatgg ctggctggcc ggtccaagge 1320 caacccggca accaagccta g 1341 <210> 87 10 <211> 2909
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. <220> 15 <221كسمة ميسك (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن 1ل-//10]|401/ااجين 1 1-5 <400> 7 atgactccta ccccacccat gagctgcaca gtggcgtect ttccgeccge ggeggggggg 20 60 cagggctcgc 10-6030066 cgtcccatac caggacctge 16910380200 gcaagaccag 120 tggagcaact tcccggecgg getgegegtg ctggtggcag acaacgaccce cgcectegcetg 180 cagcaagtgg agaagatgct aaagaagtgt agctaccaag gtgaggctgc gectgececcctc 5 240 gaaaggcggc cggcccccca ccccagetgg ccacgtgege agtgegegtg ttatcttgat 300 aatccgaaaa cgcgtttttt tgcctegttt tatcccgcaa gtcgtacaat ccggtcgggg 360 cccaggcagg caccggcggce cacgcgcaga cccacacacc agctcaccgg ttgetgectac 0 420 actgatgcat gctttacgcc cggtccccaa cagtaacact gtgcagctcg gggaagaact 480 ccctggagat cctccgcaag cggcgagagg aattcgacct cgtgctggeg gacgcaaatce 540 15 taccaggttt tcccectcac cctgtctget cgagggggta caccggtact actaaccgceg 600 acaattccgc ccgctcaccg ccgcecttcce acgccacaag cgacggaact gattgtatte 660 ctgctccegg tetttcgect gcagacatag atggcttcaa gceticttcac gtctgccaca 720 20 ccgagctgtc gctcceegte gtccgtaaga gectgetgee cgcetcgacat ccacctecgea 780 cttcaatttg ctattcagtc atcgtaccgt gccctgecct geacttecct gecctgaggt 840 atcccagtcg catccecggec 36000606006 6006000066 06000166 38 900 gtgatgtccg gcaccagcga cacacagctg gtaatgcgcg gcgtgatgga tggcgegegg 960 5 gactttctga tcaagcccct gegegtggag gagcetcaagg tgctctggeca gecaccttgtg 1020 cgcttcactt cggagatcac caagacagac gcgcagctaa atgttgtcaa ggtggagctg 1080 gacggcggaa ggcctgcggg cgaagtctct acgagtcaga acggctcggt atgccacage 10 1140 agcccatttg aagcagccca tttcttgtag ggcgegaatt atgcctcgge gegttttect 1200 cccgcctege gegctgacte cttgtgtgec ccacacagca atgcaccgag cgcgagggeg 1260 aaggcaattc atcaaagaag cagcgcatga attggagcga tgaaatgcat cagcagttty 15 1320 tcaatgccgt taaccagctt ggcatcgaca gtgcgatcce tccectcece 6600066-26 1380 ccacccaccc ccctcttcct gecgactgege tccactttce ttaagagtaa ttgagetcge 1440 ccacatgagc tcgtgccgac cctgctgtee tgegetgetc ccggggtecg cagaggeegt 20 1500 acccaagcgg attctagacc tcatgagcgt 911390990216 acacgagaaa acgtagccag 1560 ccacttgcag 010000000 0606060602 tttetcggea tgttgggega gtgactggte 1620 aacccctgca atgatggctg aaccacagag cacttctgag atgcatgttc عوقو 5
1680 tgctgaccta tgcaccccect ccgtcacatc ggattctcee ctecctgteca tectecteee 1740 atgccccgca cgcegtgcaga aataccgcat ctacttgaag cgcatggcca accaccagga 1800 aaatgggaag caagcggtga tgagcacgga cacgatcgcc cgcgctgaag cggcgtacca 0 1860 gggaggcatg ccccaggggce agcagatgat gcagcaggag cacagcggcc aggeggtgca 1920 gtacagccag ccgcatgccc ccggeggcect gcaccagcaa gcecatgeccg cccagatgca
1980 15 catgggcatg atgccggecg gecccgecagec cggcagcatg cagatggege cgcaccacgt 2040 catgcaaatg cccaatgggc aggtgatggt gatgcagcag atggggccgce gcccggggat 2100 gccgececggg atgccgcagce agatgatgge cagctcgcag cagatgggcea tgcttcagee 20 2160 cggcatgccg gcgggtcaga tgttgcactt tcagcacccg 8008801026 366800866 2220 gccaagctca gggcctatgc acgcaggtgc gctacgcccce tcaatgagtc 8106066666 2280 ccaacccgcc caagaaaaac atgcagtaaa tacacactgt tttcgcatca acatttgatt 5 2340 ttagggacaa agagaatgac ctgtgcatgc agggttggaa aacttaacat tcacgcacca 2400 tacaagtaca tcatagcctt tgtatgttgc aatattagag gccactttca gagtitcagt 460 ggctacctct attggcaatt ctgccgcegte tacgtgecca cgtgttgttg catttaattg 2520 10 gccttgegge tegtcgegeg gegtgaagec taccatggtg catttgcttt cetetttgat 2580 gcttattgac ctggtttctc ccctgegtce atgtagaatg tgtttttagt gtgtgcacat 2640 cagtcgatgg ggtgttgtct tttgattgct gctgcactct ctttgtggct gatgtagatc 2700 tgtctgacgc agggggagag atgatagacc caggcagcat 00806090110 catcagcagce 2760 15 cgcactacat cggccccaac gggcagcaca tgccagcgcec tgcgatgggg atgccgtctg 2820 gcacagtcca gcacatggag tacgcctaca gccagcccat gcagatggcet ggctggeegg 2880 tccaaggcca acctggcaac caagcctag 2909 20 <210> 88
<211> 1473
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الريبوزي منقوص الأكسجين manli<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. <220> 5 <221كسمة ميسك (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن pedi ls MPROVEMENT 1 1-55 <400> 88 atgactccta ccccacccat gagctgcaca gtggcgtect ttccgeccge ggeggggggg 10 60 cagggctcgc ctgccacgcec cgtcccatac caggacctge tcgtgaagcg gcaagaccag 120 tggagcaact tcccggecgg getgegegtg ctggtggcag acaacgaccce cgcectegcetg 180 15 cagcaagtgg agaagatgct aaagaagtgt agctaccaag taacactgtg cagctcgggg 240 aagaactccc tggagatcct ccgcaagcgg cgagaggaat tcgacctcgt getggeggac 300 gcaaatctac cagacataga tggcttcaag cttcttcacg tctgccacac cgagctgtcg 0 360 ctcceegteg tectgatgtc cggcaccage gacacacagce 0913819-90 cggegtgatg 420 gatggcgcgce gggactttct gatcaagccce ctgecgegtgg aggagctcaa ggtgctetgg 480 cagcaccttg tgcgcttcac ttcggagatc accaagacag acgcgcagct aaatgttgtc 5 540 aaggtggagc tggacggcgg aaggcctgcg ggcgaagtct ctacgagtca gaacggctcg 600 caatgcaccg agcgcgaggg cgaaggcaat tcatcaaaga agcagcgcat gaattggagce 660 10 gatgaaatgc atcagcagtt tgtcaatgcc gttaaccagc ttggcatcga caaggccgta 720 cccaagcgga ttctagacct catgagcgtg gagggcctca cacgagaaaa cgtagccage 780 cacttgcaga aataccgcat ctacttgaag cgcatggcca accaccagga aaatgggaag 15 840 caagcggtga tgagcacgga cacgatcgcc cgcgctgaag cggcgtacca gggaggcatg 900 ccccaggggce agcagatgat gcagcaggag cacagcggcc aggceggtgca gtacagccag 960 20 ccgcatgccc ccggeggect gcaccagcaa geccatgccecg cccagatgca catgggceatg 1020
2106009000 1600039202 cggcagcatg cagatggegce cgcaccacgt catgcaaatg 1080 cccaatgggc aggtgatggt gatgcagcag atggggccge gcccggggat gececgeecggg 1140 atgccgcagc agatgatgge cagctcgcag cagatgggca tgcttcagec cggecatgeceg 5 1200 gcgggtcaga tgttgcactt tcagcacccg cagcaagtgc accagcatcc gccaagctca 1260 gggcctatgc acgcaggggg agagatgata gacccaggca gcatgcagcg gttgcatcag 1320 10 cagccgcact acatcggccc caacgggcag cacatgccag cgcctgcgat ggggatgecg 1380 tctggcacag tccagcacat ggagtacgcc tacagccagce ccatgcagat ggctggetgg 1440 ccggtccaag gccaacctgg caaccaagcec tag 1473 5 <210> 9 <211> 3005
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. 20 <220>
<221كسمة ميسك (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن calMPROVEMENT 1 1-5230 <400> 9 atgagctgca cagtggcgtc gtttccgcca 029099029099099 gggcagggeg cgectgeege 5 60 gcccgtgceca taccacgacc tgctcgtgaa gcggcaagac cagtggagca acttcececgge 120 cgggctgegce gtgectggtgg cagacaacga ccccgcectecg ctacagcaag tggagaagat 180 10 gctaaagaag tgtagctacc aaggtgaggc tgctctgccc ctcgaaggge ggccggceacc 240 ccaccccagc tagacacgtt cgcagtgcgce gtgttatctt gataacccga aaacgcegttt 300 ttttgcctcg ttttatccecg ctagtecgtac ataccggtcg gggcccagge aggcaccgge 360 15 ggccacgcgc agacccacac accagctcac ccgttgectge tacactgatg catgctttac 420 gcccggtecc caacagtaac actgtgcagce tcgggcaaga attccctgga gatcctecge 480 aagcggcgag aggaattcga cctcgtgcetg gcggacgcaa atctaccagg ttttcccect 20 540 caccctgtgt gctcgagggg gtacaccgat actacaaacc gcgacaattc 66068و 600 00000001 cccacgecac aagcgacgaa actgattgta tttctgetce cggtettttg 660 cctgcagaca tagatggctt caagcttctg cacgtctgcc acaccgagct gtccctecce 720 5 gtcgtcegtg agagcectgcet geccacceget cgacatccag ctecgcacttc aatctgecat 780 tcacttatac cgtgccctge cctgcacttc cctgecctga ggtatcccat tegtatceeg 840 gcatgggttc tgaaagcgct 800000066 000606006 0606060066 ceccccaacgt 900 10 agtgatgtcc ggcaccagcg acacgcagct ggtaatgcge ggcgtgatgg atggcgcegceg 960 tgactttctg atcaagccce tgcgegtgga ggagctcaag gtgctctgge agcaccttgt 1020 gcgcttcact tcggagatca ccaagacaga cgcgcagcta aatgttgtca aggtggaget 15 1080 ggacagcgga aggcctgcgg gagaagtctc tacgagtcag aacggctcgg tatgccacag 1140 catctcattt gaagccgcegt cttecttgta gggecgcgaat catgcctcgg cgcegtctceca 1200 tctcgecteg cgcetgacttt ctgtgtgcece caaacagcaa tgcgeccgage gtgagggecga 20 1260 aggcaattca tcaaagaagc agcgcatgaa ttggagcgat gaaatgcatc agcagtttgt 1320 caatgccgtt aaccagcttg gcatcgacag tgcgaccccc 660012116 ctgecgactge 1380 gctccactct ccttaagagt aattgcactc ccccacataa gctcgttcecg accetgetgt 1440 5 cctgcgcetge tccgggggtc cgcagaggec gtacccaage ggattctaga cctcatgage 1500 gtggagggcc tcacacgaga aaacgtagcc agccacttgc 8001060066 600606666 1560 0000112-16 ggcatgttgg gecgagtgact ggtcaaccct gcaataatgg ctgaaccaca 0 1620 gagcacttct tagatgcatg tttttcctgc agctgctgac ctatgctccc ccceccecece 1680 0060006006 cgtcacatge gattccctee 060000106 ctgegceteeg ) 68 1740 ttcccecctt cctgtcatee tectgcaatg cccecgegege gtgcagaaat accgeatcta 15 1800 cttgaagcgc atggccaacc accaggaaaa tgggaagcaa gcggtgatga gcacggacac 1860 gatcgccege gectgaagegg cgtaccaggg aggcatgccec caggggcage agatgatgca 1920 0 gcaggaacac agcggccagg cggtgcagta cagccagccg catgcccecca geggectgca 1980 ccagcaagcc 31006000266 agatgcacat gggcatgatg ccggeccggec 00806609 2040 cagcatgcag atggcgccgc accacgtcat gcaaatgccc aacgggcagg tgatggtgat 2100 gcagcagatg gggccgcegece cggggatgec gecececgggatg ccgcagcaga tgatggccag 5 2160 ctcgcagcag atgggcatgc ttcagcccgg catgccggceg ggtcagatgt tgcactttca 2220 gcacccgcag caagtgcacc agcatccgcec aagctcaggg cctatgcacg caggtgegcet 2280 10 acgcccctca atgagtccat 00606060606 600600006 800000066 cccccagaat 2340 gcagtaaaca cactctgttt ccgcttcgtt atttggtttt agagaataac cagtgcatge 2400 aggattggaa tacttatcat ttacgcacca tgcaactaca ccacaccctt tgcatgtcgc 2460 15 aatattagag gccactttta gagtttcagg gactatctct attggcaatt ctgccgegte 0 tacgtgccca tgtgctgttc cagtaattgg cctcgecegct cgtcacatgg catgaagcecc 2580 accatggtgc atttgctgta ctctgaagct tcttgacctg gtttctccca tgtgtgtgtg 2640 tgtgtgtgtg tgtgtgtgtt gttgtggggg 09999999999 gcagaacatt tttcaggcac 2700 20 gaacccatgt agagtgtggt tttagtttgt acatatcagt gaatgaggtg ttgtcttttg 2760 attgttgctg cactctcttt gtggctgatg tagatctgtc tgacgcaggg ggagagatga 2820 tagacccagg cagcatgcag cggttgcatc agcagccgca ctacatcgtc 668800006 2880 agcacatgcc agcgcctgca atggggatgc cgcctggcge agtccagcac atggagtacg 2940 5 cctacagcca gcccatgcag atggcetggcet ggccggtcca aggccaacct ggcagtcagg 3000 cctag 3005 <210> 90 <211> 1725 10
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. <220> <221كسمة ميسك 15 (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن pedi ls MPROVEMENT 1 1-30 <400> 90 atgaccatgc cactcggcgg tggtctgtgc atgaaggatc gcatccatgg ggatgagagg 60 20 taccgttcca aggccaaacg ccaagtaaat acgatatttg cgttcaccca gcgcaacaca 120 tggcgcggac gcetteccggcet atgctcttat aggacaactg aattactggg cggaagcaaa 180 acgacggagc cgggaagggg aaccttcgtg ctgcagattt tcatgtgtgt taagaacgece 5 240 tccatcgacg acggctcacg ccatatttcc acgagccggg ggctggagte cgtecctgaag 300 cggcgggagg ggcagggcegce gectgeecgeg cecgtgecat accacgacct getecgtgaag 360 10 cggcaagacc agtggagcaa cttcccggec gggcetgegeg tgetggtgge agacaacgac 420 cccgcectecge tacagcaagt ggagaagatg ctaaagaagt gtagctacca agtaacactg 480 tgcagctcgg gcaagaattc cctggagatc ctccgcaage ggcgagagga attcgacctc 5 540 gtgctggcgg acgcaaatct accagacata gatggcttca agcttctgca cgtctgccac 600 accgagctgt ccctceecgt cgtectgatg tccggcacca gecgacacgca getggtaatg 660 20 cgcggcegtga tggatggcge gegtgacttt ctgatcaage cecctgegegt ggaggagcte 720 aaggtgctct ggcagcacct tgtgcgcttc acttcggaga tcaccaagac agacgcgcag 780 ctaaatgttg tcaaggtgga gctggacagc ggaaggcctg cgggagaagt ctctacgagt 840 cagaacggct cgcaatgcgc cgagcgtgag ggcgaaggca attcatcaaa gaagcagege 5 900 atgaattgga gcgatgaaat gcatcagcag tttgtcaatg ccgttaacca gcttggcatc 960 gacaaggccg tacccaagcg gattctagac ctcatgagcg tggagggcct cacacgagaa 1020 10 aacgtagcca gccacttgca gaaataccgc atctacttga agcgcatggc caaccaccag 1080 gaaaatggga agcaagcggt gatgagcacg gacacgatcg cccgcgctga agcggcegtac 1140 cagggaggca tgccccaggg gcagcagatg atgcagcagg aacacagcgg ccaggeggtg 5 1200 cagtacagcc agccgcatgce ccccageggce ctgcaccagce aagccatgec cgcccagatg 1260 cacatgggca tgatgccggce cggceccgecag cccggcagcea tgcagatgge geccgcaccac 1320 0 gtcatgcaaa tgcccaacgg gcaggtgatg gtgatgcagc agatggggcec gcgccegggg 1380
2100000009 1931190209008 gcagatgatg geccagcetcge agcagatggg catgcttcag 1440 cccggcatge cggegggtca gatgttgcac tttcagcacc cgcagcaagt gcaccagcat 1500 ccgccaagct cagggcectat gcacgcaggg ggagagatga tagacccagg cagcatgcag 5 1560 cggttgcatc agcagccgca ctacatcgtc cccaacgcgce agcacatgcc agcgcectgca 1620 atggggatgc cgcctggcege agtccagcac atggagtacg cctacagcca gcccatgcag 1680 10 atggctggct ggceggteca aggccaacct ggcagtcagg cctag 1725 <210> 91 <211> 20
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) 5 <213> Tetraselmis sp. <220> <221كسمة ميسك (SGI1) SIGNIFICANT GROWTH 1 <72>تحسين نمو كبير مشفر للجين الموهن
IMPROVEMENT 1 MA] target sequence for Cas9 20 <400> 91 gcaccttgtg cgcttcactt 20 <210> 92 <211> 19
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) 5 <213> Tetraselmis sp. <220> <221>كسمة ميسك <223> SGI] 02ل target sequence for Cas9 <400> 92 0 cagctaaatg ttgtcaagg 19 <210> 93 <211> 1941
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) 5 <213>متوالية اصطناعية <220> >تخليقية 2 3< <220>
<221كسمة ميسك <223> Nourseothricin expression cassette <400> 93 ggcggcatgt ctgcgcaagc cctgetgcta actggctcce gecgactgaat tcggaatgta 60 5 tgcgtggtta ttgcgtttcg tgtgcatata cttccgtgat actttcgcca actccatcag 120 cagtagttta tggacaggcg gcggcecgecg cccgecgatg acatcgtagt cgetegtegt 180 cagggaagtg ccgtcaggag cgtggtggcg geggegegge ggctecgegea ccggeggccg 240 10 gtgcggaaag gtgagcggag gcgceccgtga cgtccecctt tcgeccacca cectetacge 300 tcaacccaca ggtgattcag cacgccctcc 0606002-66 tccaggcaac cagtcacgcet 360 8016000006 agcegtatcge cggceccttce cgegcetggcet ttageggeag getcgeegee 5 420 tgatccggceg cgccectcgec gecgecaccg agaatcttcg cagcagecge accgecggga 480 agtgtactgg gcgaggggca gcaccgtgtc gcagcaaatg tgcgaggcgc gcaggaaacg 540 0 caggcatgcc gctggaatcc acgcggacaa tggaggggaa agggggggat tegttttggt 600 ggcccccagce gtagatgggg cagggtgacc aggtctcectt ttttccttca actgcccaga 660 ttcgtccgag gttgggcatt ccttgcatta cgggaaatac cgcgeggcte tgtaatgecg 720 5 gttgcgattt acgccttgta cttcaaatta ttgtttttcg gggaaaccca ccaggcetggg 780 ttcgctagcg aagcgtccaa gcectgactga gtagctgect gectggtcac cacttgaggt 840 ccaccacacc gcagtcactt gccctgecge catggeggtt ctgagtgetg ccatctetge 900 10 ctctgcagct gccaggcagg ctcgcecatcet gectgetgta cgccagcaca tectgacctee 960 000060066 ctgtcttect ctctcatagg aacatcectct aggacgaaaa gactttgaga 1020 cagctctacc tgtcgaggaa aaatgaccac actcgacgac accgcataca gataccgcac 5 1080 aagcgttcct ggcgacgcag aggcaattga ggcattagat ggcagcttca ccaccgacac 1140 cgtgtttaga gtgacagcaa ccggcgacgg ctttacactt agagaggttc cagtggaccc 1200 20 gccattgaca aaggtgtttc cagacgacga gagcgacgat gagagcgatg ctggtgaaga 1260 tggcgaccca gatagccgca catttgtgge atacggcgat gatggcgacc ttgetgggtt 1320 tgtggtggtg agctactctg gctggaatag acgcttgacc gtggaggata tcgaggttge 1380 accagagcat agaggccatg gagtgggtag agcactgatg ggtctggcaa ccgagtttgc م 1440 aagggagaga ggtgctggtc atctgtggtt ggaggtgaca aacgtgaacg caccagcgat 1500 ccacgcatac agaagaatgg gcttcacgct gtgcggcectg gatacagcac tgtatgatgg 1560 10 cacagcgagc gatggtgagc aagcactgta catgagcatg ccatgcccgt aagcgcetgtg 1620 cgcctagctt tgcectttgca ccaacgatga cggcgatgct ctgcatgtac ccecgtgeggg 1680 tgtatgtaaa tccatgtgcc ggagagcact tcgctcctic atcacacttt ttcgccatcc 1740 5 gccattccce geececcagect gaccaacctc tatgccccac caccecgggac tggcatgcect 1800 gaccctttca catgcgcggt cggcecttggg tcttctctct acacaagegg cgacttgcte 1860 gccaaagagg ataggtcaaa ggtcagtgaa catgttctct atatcacgct gtcggcgggt 1920 0 gttccactcg gtctgtcgaa a 1941
<210> 94 <211> 1042
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. 5 <220> <221كسمة ميسك <223>معزز RB40 >400< 4 ggcggcatgt ctgcgcaagce 0102-10-13 actggttcce ggggcetgaat tcggaatgta 0 60 tgcgtggtta ttgcgtttce tgtgcatata cttccgtgat actttcgcca actccatcag 120 cagtagttta tggacaggcg gcggecgecg cccgecgacg acatcgtagt cgetegtegt 180 cagggaagtg ccgtcaggag cgtggtggcg gcggegegge ggcetcgegee ccggeggeeg 5 240 gtgcggaaag gtgagcggag gcgeccgtga cgtcececctt tcgeccacca cectctacge 300 tcaacccaca ggtgattcag caagccctcc ggcccecgcecc tccaggcaac cagtcacgcet 360 20 agtccacccc agcgtatcge 000001166 cgegetggcet ttagcggcag getcgecgec 420 tgatccggceg cgccectcgec gecgecaccg agaatcttcg cagcagecge accgecggga 480 agtgtactgg gcgaggggca gcaccgtgtc gcagcaaatg tgcgaggcgc gcaggaaacg 5
540 caggcatgcc gctggaatcc acgcggacaa tggaggggaa agggggggat tegttttggt 600 ggcccccagce gtagatgggg cagggtgacc aggtctcectt ttttccttca actgcccaga
660 10 ttcgtccgag gttgggcatt ccttgcatta cgggaaatac cgcgceggcte tgtaatgecg 720 gttgcgattt acgccttgta cttcaaatta ttgtttttcg gggaaaccca ccaggcetggg 780 ttcgctagcg aagcgtccaa gectgactga gtagetgect gectggtcac cacttgaggt 840 ccaccacacc gcagtcactt gccectgecge catggeggtt ctgagtgetg ccatctetge 5 900 ctctgcagct gccaggcagg ctcgcecatcet gectgetgta cgccagcaca tectgacctee 960 0000060066 ctgtcttect ctectcatagg aacatcctct aggacgaaaa gactttgaga
1020 0 cagctctacc tgtcgaggaa aa 1042
<210> 95 <211> 329
DEOXYRIBONUCLEIC ACID النووي الرببوزي منقوص الأكسجين maali<2]2> (DNA) <213> Tetraselmis sp. 5 <220> <221كسمة ميسك <223>وسيلة إنهاء RB40 >400< 95 gcgcetgtgeg cctagcetttg cctttgcacc aacgatgacg gecgatgctet 081018226 60 10 cgcgcegggtg tatgtaaatc catgtgccgg agagcacttc getecttcat cacacttttt 120 cgccatccgce cattcccege cccagectga ccaacctceta tgeccccacca cccgggactg 180 gcatgcctga ccctttcaca tgcgeggtcg gecttgggte ttectctctac acaageggeg 240 acttgctcgc caaagaggat aggtcaaagg tcagtgaaca tgttctctat atcacgetgt 15 300 cggcgggtgt tccactcggt ctgtcgaaa 329 <210> 96 <211> 570
DEOXYRIBONUCLEIC ACID >الحمض النووي الرببوزي منقوص الأكسجين 12< (DNA) <213>متوالية اصطناعية <220> >تخليقية 223< 5 <220> <221كسمة ميسك
Tetraselmis] >جين محسن 223< nourseothricin resistance <400> 96 atgaccacac tcgacgacac cgcatacaga taccgcacaa gcgttcctgg cgacgcagag 10 60 gcaattgagg cattagatgg cagcttcacc accgacaccg tgtttagagt gacagcaacc 120 ggcgacggct ttacacttag agaggttcca gtggacccgce cattgacaaa ggtgtttcca 180 15 gacgacgaga gcgacgatga gagcgatgct ggtgaagatg gcgacccaga tagccgcaca 240 tttgtggcat acggcgatga tggcgacctt getgggtttg tggtggtgag ctactctgge 300 tggaatagac gcttgaccgt ggaggatatc gaggttgcac cagagcatag aggccatgga 360 20 gtgggtagag cactgatggg tctggcaacc gagtttgcaa gggagagagg tgctggtcat 420 ctgtggttgg aggtgacaaa cgtgaacgca ccagcgatcc acgcatacag aagaatgggc 480 ttcacgctgt gcggcectgga tacagcactg tatgatggca cagcgagcga tggtgagcaa 5 540 gcactgtaca tgagcatgcc atgcccgtaa 570 <210> 97 <211> 20
DEOXYRIBONUCLEIC ACID <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين 10 (DNA) <213>متوالية اصطناعية <220> >تخليقية 2 3< <220> 5 >سمة ميسك 221< <223> Primer MCA1818 <400> 97 ggcggcatgt ctgcgcaagce 20 <210> 98 20
4 <211> <212>الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) <213>متوالية اصطناعية >220< <23 >تخليقية >220< <221>كسمة ميسك Primer MCA1819 >223< 98 >400< tttcgacaga ccgagtggaa cacc 24
Claims (1)
- عناصر الحماية1. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism به تمزق disruption في جين يشفر encoding 6 بولي ببتيد SGI] polypeptide له متوالية منتقاة من المجموعة المشتملة على متوالية برقم تعريفي 3< متوالية برقم تعريفي 14 ومتوالية برقم تعريفي 15 ومتوالية برقم تعريفي 16؛ حيث أن الكائن الحي التخليقي الضوئي photosynthetic organism 5 ينتج كتلة حيوية 5 أكبر من كائن حي تخليقي ضوئي control photosynthetic organism من عينة المقارنة نامي أو تمت زراعته في ظل ظروف مشابهة إلى حد كبيرء حيث أن الكائن all من كلوروفيت chlorophyte organism من due المقارنة لا يشتمل على جين 1ا56 الممزق. 0 2. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 1 حيث أن الكائن organism all ينتج كتلة حيوية biomass على الأقل 9615؛ أكبر بالمقارنة مع كائن حي كلوروفيت chlorophyte organism من due المقارنة نامي أو مزروع في ظل ظروف مشابهة إلى حد كبير. 5 3. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 1؛ حيث أن الكائن organism all يكون به كلوروفيل مختزل reduced chlorophyll بالنسبة للكائن الحي من كلوروفيت chlorophyte organism من عينة المقارنة. 4 كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر 0 الحماية 3؛ حيث أن as) الحي 0 يشتمل على نسبة كلوروفيل chlorophyll أ: ب متزايدة بالنسبة للكائن الحي من كلوروفيت chlorophyte organism من due المقارنة.5. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 1 حيث أن للكائن الحي هوائي antenna لنظام ضوئي مختزل reduced (PSI) Ilphotosystem ١١ بحجم بالنسبة للكائن all من كلوروفيت chlorophyte organism من عينة المقارنة.6. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 5 الحماية 1؛ حيث أن الكائن organism all يكون به 14C Pmax أعلى بالمقارنة مع الكائن all من الكلوروفيت chlorophyte organism من due المقارنة.7. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 1؛ حيث أن الكائن organism all يكون به ef FV/Fm بالمقارنة مع الكائن الحي 10 من عينة المقارنة.8. كان حى من كلوروفيت chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 1؛ حيث أن الكائن الحي يكون به محتوي بروتين أعلى بالمقارنة مع الكائن Organism all من عينة المقارنة. 5 9. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 1؛ حيث أن الكائن organism all يكون به محتوي روبيسيكو أكتيفارز rubisco activase أعلى بالمقارنة مع الكائن all من due المقارنة .control organism0. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 0 الحماية OQ حيث أن AS الحي من الكلوروفيت chlorophyte organism ناتج الطفرة 11 يكون له ana هوائي ١١ من النظام الضوئي photosystem Il antenna (PSII) 6 منخفض بالنسبة لحجم الهوائي من الكائن Organism all من due المقارنة. AIST] حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 5 الحماية 10؛ حيث أن حجم الوحدة المقطعية العرضية من حجم هوائي كائن all هوائي لنظام ضوئي مختزل ١١ (PSII) ORGANISM HAS A REDUCED PHOTOSYSTEM ١١ قدتم تقليله بمقدار على الأقل 25 بالنسبة لحجم وحدة مقطعية مستعرضة من هوائي اا05 من SEN organism all لعينة المقارنة. 12 كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 10؛ Cua أن الكائن الحي organism ناتج الطفرة mutant به Pmax متزايد (14C) بالنسبة AD حي من عينة المقارنة.3. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 12( cua أن (Pmax (14C) تتم زيادته بمقدار على الأقل 9625؛ بالنسبة ل Pmax 0 (140) من الكائن Organism all من Lue المقارنة. (AIS. 14 حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 12( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة Mutant يكون به محتوي كلوروفيل chlorophyll منخفض بالنسبة لكائن حي من عينة المقارنة.5. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 14( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant يكون به كمية منخفضة من الكلوروفيل chlorophyll ب منخفض بالنسبة لكائن حي من due المقارنة .control organism16. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 14( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant يكون به على الأقل 9620 أقل من محتوي الكلوروفيل chlorophyll المنخفض بالنسبة لكائن حى من عينة المقارنة.7. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 5 الحماية 15( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant يكون به على الأقل 9620 أقل من محتوي الكلوروفيل chlorophyll المنخفض بالنسبة ASE حى من عينة المقارنة .8. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 10( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant به محتوي بروتين أعلى من الكائن Organism all من due المقارنة.19. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر الحماية 18 حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant به على الأقل 9610 من البروتين أكثر فى شكل نسبة مئوية للكربون العضوي organic carbon الإجمالى عن الكائن الحى Organism من due المقارنة. 0 20. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 19 حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant به على الأقل 9620 من البروتين أكثر في شكل نسبة مئوية للكريون العضوي الإجمالي من الكائن (Al من due المقارنة.control organism 5 21. كائن حي من كلوروفيت ناتج طفرة mutant chlorophyte organism طبقاً لعنصر الحماية 10( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant يكون به تعبير متناقص ل جينات من LHC على الأقل بالنسبة A حي من عينة المقارنة.2. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 0 الحماية 10( حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة Mutant به وفرة متزايدة من بولي ببتيد polypeptide منشط رببولاز باي فوسفات كريوكسيلاز ribulose bisphosphate (RA) carboxylase activator بالنسبة لكائن حى من عينة المقارنة .3. كان حي من كلوروفيت ناتج طفرة lh mutant chlorophyte organism لعنصر 5 الحماية 22؛ Cus أن بولي ببتيد polypeptide المنشط من ريبولوز باي فوسفات كربوكسيلازribulose bisphosphate carboxylase activator به على الأقل 1.5 مرة»؛ من الوفرة فى ناتج الطفرة mutant مثلما هو في الكائن Organism all من عينة المقارنة.4. كائن حي من كلوروفيت ناتج mutant chlorophyte organism sk طبقاً لأي من عناصر الحماية من 1 إلى 23؛ حيث أن الكائن organism all ناتج الطفرة mutant يكون من فئة .Trebouxiophyceae 25 كائن حي دقيق microorganism من Trebouxiophyte ناتج طفرة mutant طبقاً لعنصر الحماية 24( حيث أن الكائن all ناتج الطفرة mutant يكون عبارة عن نوع منتقى من 0 المجموعة المكونة من .Tetrachlorella ; <Pseudochlorella «Parachlorella Chlorella6. كائن حي دقيق microorganism من Trebouxiophyte ناتج طفرة mutant طبقاً لعنصر الحماية 24؛ حيث أن الكائن الحي الدقيق ناتج الطفرة mutant يكون من النوع.Parachlorella7. طريقة لتحضير منتج طحلبي algal product تشتمل على زراعة ناتج الطفرة لكلوروفيت Chlorophyte mutant وفقا لأي من عناصر الحماية من 1 إلى 23 لكي يتم إنتاج المنتج. 8- طريقة طبقاً لعنصر الحماية 27 lly تشتمل load على استخلاص المنتج recovering the product 0 من المزرعة culture9. طريقة طبقاً لعنصر الحماية 28( حيث يكون المنتج product عبارة عن كتلة Lig.biomass 25 30. طريقة طبقاً لعنصر الحماية 29 حيث يكون منتج الطحالب algal product عبارة عن واحد أو أكثر من الدهون lipids أو البروتينات proteins أو البوليكيتيدات polyketides أوالتربينويدات terpenoids أو الأصباغ pigments أو مضادات الأكسدة8010:08015. أو الفيتامينات vitamins أو النيوكليوتيدات nucleotides أو الأحماض النووية nucleic acids أو الأحماض الأمينية amino acids أو الكريوهيدرات carbohydrates أو الكحول alcohols أو الهرمونات hormones أو السيتوكينات cytokines أو الببتيدات peptides أو البوليمرات.polymers 51. طريقة طبقاً لعنصر الحماية 29؛ حيث يكون المنتج product عبارة واحد أو أكثر من الشحوم lipids dah .32 0 طبقاً لعنصر الحماية 27( حيث تكون الزراعة المذكورة فى ظروف زاخرة بمادة التغذية.nutrient replete conditions3. طريقة طبقاً لعنصر الحماية 27( حيث تكون الزراعة المذكورة فى ظروف نافدة المحتوى من.nitrogen deplete conditions jag sin)TOC إنتاجية TOC: Lat is 2” i Role + ل < ممع ممع ممعم ان 2 حم de ees & a 3 3 Le Xa : بت ¥ + A 2 نا 9 Pha - Lo JUIN . 2 ١ ٍ 2 & WI-118% NE-7B43 W185 غير Ch الشكل wat الشكلو Te ors eo 5: ات عي انس ل ااي اليه va, Nn ال A JE pra EEN ب ETT ب سم سم م | + NE-13380 SNP NE-07843 SNP0359 gRNA + ستيفالشكل *إنتاجية| TOC — ااا ب اا لت هج g &a. ب با لا با تنا د Eve 0 860 ا 0 د سس د لد ه WT-1185 NE-7843 GE-16493 GE-16492 GE-16491 الشكل +gh اللاسترت URDG TELLER لما تر LE الات ورت 1 5 لسارت EAL TL تتا ااي الاي ER SE ار ا ار RM انمتا اتا 1 مرج ل جع وري TS ل ل ل <- عم ات تتأ ا توا الاي الا اتا ليا لتنا لاج تا لتخي يق اندوع تا TS الست تب TTR TeX —ERFCTVLSIVEMPEMIOYR LIST لأا LR AT IY HV TAO STAN لات ل لا ا LAN الات اا تج حاتت I ELLIEAELENTG Ty د ا ل Oh awe mona FREIND OPT LIV IMIR EN I TEV TSHR T TRIN LED IVELELD LE ار CREF ات ات ees لي عم nnn es عا رمعا لمجم ل ل عه عه لي هه مي عل ل عام لاا جع مه لا ع عه يرع عام Chrowechlor is 78 الما مت تت الت الت دج الف جات لاا LEVEN RECS VY DV ل LOVER اطاط حصي تجلا RINE AVON TLIO ARG LE IR EX ERE TIAL NRRL LIN EHLLETORTELE 75 ل LV ATE ARI لاا Telranslmis TT مستت ا تين اق ا تارتن ترات ات ات ل LO TEV DOM R EONAR ع لا كيتلتا جح Ts تردق ور اتا لوا ال ل 7ج أ جر لتر اتا IT لتر ات CRC ا الت تي لوز تر I اتا اللي اا ا ا ل MVRQEW RL.Eg ات كر داحتا اررض التقوسي ل ا ال تال ER اقل سعط تمعدالع« د 5 تت رج واد الت ا THEAVIT الات يلخا ضاف عمجف اناLL RE VET ERIN IEDEVERE- 2 لاجو تا الأب لوج موه تتا الات TT ممصت لامعا 0ا لمعت ضا بجتسا ا ام ته اتا نك راتما اتا تاوالت تتا لتقا ا Chismydomonssا ERS. بورج LEN لزانتت ارون THEA لجا 37 ل لا LE م ته ل جتان اااHQ HYPRRy Ed تت ا تت EN لا لي عاTetrasginle TE لا ZOTR SIAL لمشت كت الا نان LISLE VERLRTLESH ميات imded تراتس IER كرا روا THEAV لج رح 7 ا FE كم موعتEELS NINOSVERRE 3 الات نوات لكام تا ل تش ليان ترق للد ااا نا IT ا ا لالشكل +وي لمعا وض تع لو ع اب الا يع تج اع ويم لور وا ونا رو ال تلبات 1 التتوعة تج ومججع 13 ااا اي ور عع معدا 0 لايم يج اج يام عاو كر تج اا روا لتو تيت لتخي للقت xa i تا عدت 1 اكع تج تم ج07 وجي جا اتيج عقا وجا سا1 2 معط نادت 83 الج 1 الموج TT جو باد أ اي الج وج بر وول ااانا Thlzmpdononas 3 A VS دق LUSEUVARELOKYRLYLERVG دوج وج الج عي تمسح جربو حو توه 5ط 4 يي تت ممومخظه وو LISSHVARULORYRELYLERV. تتح عاض تا اوتا ات الالح i بجوي ااا ص لمشتل ا وا لوجم اجات اا با تجا عا ١ اكع عا وج ح سد ERQIDMERADEMHEOUFVNAVRDQLO 3 و نت وجا مع AD للع ليع لوو ل طعا لطعي ا معت 07ت 1 لهم 81 ا الك ل ا ل ال اا ا عع مما ست الشكل 2التضتيف تكلور ويل متخقضن ثم sali مع HCL تم تطقير > ٍ : وا ع يد سس ا إٍّ Po ii : ا ا - تن I Co TEN ما و ER, النوع Fe REINER Lod {i > بيصقتلا Sx i S f 8 ا Ee Ea th oS لشت شيه متصل ومجموعات Sad eh نامية عند 15 مع تشفيضات يومية Ce ل من ١ 30s ) خلية منفردة على الأجار \ \ RN o التنقيج في سائل فى أطباق بها 47 عين Tr عد شو ثايت عالى Lait باستخام مااع تم استكلاصة عتد Fi ا TR اه ب رظي وي كا الام ان من اطباق Aa لكل and حب م تم يرم av امسا سا د 3 Ea ed 8 1 FER - 4 ا ا اا ات ا 1 + I معالجة/ حت ا اسان ا اتاد ا الي © I ا لمتشت ات ا اا 0 ال الات اتا تلات تت i ALL لحي ا ا ايان i ; ل nen Ly ااه Fe ey Sidi بق 4716 صورة فرئية يماقيها ye WT ٌ تقليل الهواتى : الشكل-٠Parachorella SGi1 oT i od i a. بت اط Jat حب & 3 Lo Go @ & | 8# 3 / تنما اد ل عو المح اناي 2 x wd 2 عكس اتجاة EIS lad ge Fall) اماف . إزراحة الإطار 5 a اتجاة التسخ DLP إعاذة ترتيب أكبر 5 & Ls = صورة متغيرة EAT مضق 2 a oN Lad Fo od ب ب 1 صورة متغيرة لمستقيل الشكل 9مله Var a ry sree en ااا 2 ; = | a 1 Jo اتج ع ا a gai A RI دح RES a Si Raa 0 ِ ْ Sn ea Boas فى 90 © No 3 q i as RR 3 i APNEA 5 ١ 1 mec oN . 4 ب ات أ ال ممح %C in FAME 83 | الع د مح ل 2 ٍ فى الكريوهيدرات 36 ! | TE O فى البزروتين 86 C a FF ¥ x ام لجع عع عع عع عع عع ا الات يف ل ey WT-1185 NE-13380 A JLESS ا . . TBOODO20 ا ا - : AE ENA RRNARRY 11 +1, TT ST hy ge em :. © T581783 aS م م 00 ا te و i . a TEB5822 NNN ree bOPS ibs الا TRB6IF0 © 231 المرئيطة ا A i أ لا nib nb ne pn a د 2 : يد 5 ً ا ا ا i ee TEO6188 ; a ] EE EN py : : ا T5BIy54 a ل ل 0 ا RERG05 : إْ ا إ وس ا ا ا ال ا Ts98781 ْ ا ا \ . A ET 1 سرع 1 0 Te i ا T5g8978 - 2577 المرثيطة ا الات لل اد i a EL 3 3 : د 97 ; CB rennces ا 7600582 NL IT591725 {CP285) EE N RRR > CheY-3281 WT-1185 ل ناا 3 Yo x 0 a0. ا ٌ ناد فى و بسكو 0 Saas نظام ا 2 م - i 1 > م i SF RAR تسوانى i نظام ضونى ومحتوى روبيسكو ANE 1100 mote fr mmr ers ms em نر A pi been مع لاقم ran ماقا عام قاسم لام عا ma aa i { a + : 3 = 3 i © 3 © احا اسح حم داج دح د حم لامي يات ساباب جا جاح لاا اط هرا = me إل ساح لوحا 1d = oi 3 bi Ug hammers ss sess see man naan dE ees o Cu 3 x 1 7 1 0: ا i 3 >: : on حنم ا ا : = RE Ca ob { TY vod » د اروك - gaan AVSIM re re wn وهاو :جا ااا لحت ولو ات ا 7:00 Ta . : w 8 8 : + rr FARR wa CR > حب َّ <x : 1 4 3 a RRS mn Cae ¥ » ERR 2 لعي يبعا بعر بغرا با العا ASIN a a اما م علا عا اع 4 [. No 5 A 8 7 : ا HE Sal od 4 bo : a i a“ fs Th EE i = ; 1 i Rea Ses frase i A. : 3 i 5 Se ا ل Et عاد ا ا ا ry ل : 1 شا i 3 ب YR La SR i oa hawd $ FT AP 3 Lia VEER Sr hd i ب ب 3 I : iN Tinh YER EH i : i i nd fied Sr rasan A Lad } ! 3 Me Wi in Rss i 2 : 1 i ات ب 1 4 BLE i معاي 7 os 3 58 x ” 7 Ei 5 ممكتضرة > be = Bras Sway = Wiis مر[. mt & A, + ب «> 3 : nai wr g محتوى البروتين 2 < نظام صضولى ومحتؤى روبيسكو جارح له سه جه جم جح جه له حم جح ججح لج تاجح رح بالخ حت جاجع ِ ات ا ay * 1 تح المع زوع TI ha Ee 4 { اجا لسع 1 v1 i i = i ; ¢ ¥ : ب | الحم i i : + 3 i i } = { 3 § 3 : 3 ao 3 pa a i i i Fe dg Epa Ef mn Land at 1 i i : tr 3 80 4 حاط و كوج aaa a اللا الايد له لد اعد ايه مويه عد م جات وروا :اذ ووو حادم م Hy 3 3 Se i i i . te H i { ب : 1 § i 0 i 1 3 t } § . ; جسم 0 HE i i i i : 1 3 ¥ i i bod = i i i : : ل i 3 . i i 8 Koen العام ماع اه ل R JOE [SR 31 قو hin ا أب a i ا ا o 1 } ; 3 i i HE ! i i % i 1 HE ¢ i i 1 + 1 i Pood “ i i i sont? i i : i i 3 0 fro i i i } i i = : 1 id . i i i الغ we de bee x A SE UU | Gg جتحت الت يد ~~ : 7 £ Sl BES Fda يروقين TON SH “ا يروتين ع رفخ HEAT Aa. BAe Divers : ا.كد he SREY3 J ——— 3 ااا وه 1 8 لا نمم سه" dL HRN BR EE EE BESsh Rublzco R&g R&DDN WTIIEE NI RET84RPsbD (PS HI) aRuhisco ( Rh C L) aiErال ا . 8 RA-WT1185 383TOC “au لايع + ل ام ا ا ا را اا eee & : ا i 3 fw Rf وي 8 ااا ا ا تي ص ¥en NE-7843 WT-1185 الشكل TYسسا مسسستسسسسسسس_سسسس ااي ا وق x rr 1 إْ J WT-1185 A لله & ْ 2 wa i — 5 ع i ْ x WT-1185 3 IE * ME-13380 A 1 NE 133808 ْ لاست ا سس سا سييست يويسا ل 8 5 § ¥ * اليوم الشكل ١+ةم ةم م اج ةي اجاج 3 : بس a } i ’ إٍْ * * ١ | م mT | 8 * i ل السدلندد اتش شم ”ابلا د ش ددس للللظاالف7ان7تظ©“7©([< ا ي 1 A ال إٍْ قي دق د لقا 2 0 & اا fom 8 ٍْ الإ تي شٍٍَ ٌَ َ<-خ>٠<- <- <-,- <> > »>> «+«<+ا+«>اء«>ا2 48 4 إٍْ 3 8 : ٍ WT 1185 5 006-073 | و a 3 £ ¥ ¥ 3 * اليوم! الشكل +11LN eee ض َ 2 * اس ايا 1 > a ١ 5 To ak »* % Rs + ; gd > » الل * تت[ م لا "١٠١ ت٠ ع تع تت fee = 1 Core : i ْ = «© WT-5GI-E-01185 1 الحو الا واو freee g og - gy سسا ٍ ٍ NE-SGI-E-07843OE . 1 * * ُ 2 5 ¥ اليوم ب VE انشكلTetraseimis SGIو١ gid Saft a EMREIEURTSOSTR : 1 ال ال : . 4 Yb الإسترشادي مالا 5055 بي يي ب يي ب بيو مس TTT a EE —. Tah الإسترشاذدى ا ال ان ان 8 ب اس ل سريواس يي يو yo الشكل i 84 34 WEY 7 jo 0 783 ما عوجي اط ممصي ا > الت i 2 i ! Cnt Fn MRR i IR اا 1 : = } 27 ا ايا حت حت تت ب ممتي JE قرفي ا الكل ااا He وو fF Mp ايو ...الا 1 id ! y ; fuk HA een I een] een سير ا الا +: 2 Hoge ad oon ny = EO THEE EE RE Eek han 2 ot, RE أ ui { > = + T a, 5 2 al 6 | i 1 «060 اليم ب ملي es ns NOT ed SR أ en Ne ceeneed م | eens SE م : : i { LISTERS SEE EEE SEE ا SEES i i الي حاتت نكي .ول eae ane fora Sa ; i إْ اا اا ااا ااا ااا 4 ا رجهو ag لمي ا احج جم 0 ل اع an Vpn ¥ he a mere اليج سد ean ججح 2" r : 1 ّ ! J may Era = Cad Ean Ca WT TOR seit 5 8117 قتةبة Smit WT IOS اتات SEE BEIT IIE sila = %YT الا ١١١ كن ee eee BR FR i i Bah #65 YE br ar TT I ER remeron SEE omen i So ١ i اا ف HA ممعم 0 يي ans 0 1 2 ا ا مدي vines veins SO cies ان i i i Aa با enna een ceed] eee een ce i i i i SE SN SS SR.SS. ane i i i i ye vee اليج اجيج rR لعج لجوج ee WT EO 5G 27 SEH SILT 25432 SEILER hoi Jats ZVI Jaaمقط عرضى Sig ناوا she مت تتا يت © ميقي ني faded 3 NY مس 3 4 ب 5 ال ا oh hey pa | 3{ مقطع عرضى وتليقي ل go) PEN تأنوعتر CORY oe لا ا اا ات اليو VE ٍ ٍ كؤ* een TE. ir ng A ار ل ا ٍ ل Tm 04 ع تجو _ ag. [ne 5 اق EEC لوو لقا ve يات لخ ا امور ااا يا ال ال ا ا 7 مع جلو 1 gS pra .ا Tan ا BER ل bee co Rg أ ا 1 سف v Ee Bot be = ue! a bo a ا ل م اا رم ا 0 EE ا JER ااا لاا ل BRE Be ل sor off Ra, or Noel RRR EGE SH = Caen oa ou a a fo = eed ب pe a ee nw 4 ا BB ا 3 SLE UR EE Ea a : _ EE CaS Reet a RA i aE] A dee --: CON: -=-- ال ا La Rie EEE as oe hE i HE $x [HEH we oe oe ae خا SRE EE ES fp ee Ee fad و اماف ks Ns 3 ps TR $a falas wae nd re = fe ا 52 2 2ه؛ 8B 8 NTS ا 0 TE Ol مر ل ا مي A ...ا« Be لط لخنم للجلا ا اي CELL WAGE SEAT SEIS RINT ER LEAT ححا ا لايع الصايضة الم ا wT SEA اع WT AGE 50 EAA الشكل حاب الشكل Pry FE) التحويل Asal :1 HED يجح ربط nn five gL LLL oa rer Fg ل" ا لقا EEE 7 دحل ] oa J اله 770 wR 2 LEE 1 ; 2 A 2 0 7 3 اا ا cen BB. حلي UR ce # NNN pe ا nT oo I . Moa ve 7 i يت een دجما لاب od an Ce Ce SEER ees Poke : 7 7 Sand Sa SE SER SEI Cn 2 a Em BA الع ’ WY SHE HHS HERE SHEE SrA ’ Fe EN VY AEE الشكل 1ج a > 7 7 ب" Pimax / das 3 : ٍ a Pmax [TOCI. i Yk A at wo x ا va “0% = i BoE 30| يم 9 = : i 3 بج اج نا 2 الل . 4 Bp 3 i ‘ ’ ¥ vi LANE 1 : وح YY = {oe I ve أ =. He RR EE 01 ٍٍ : \ . 2 oh Th iin 3 اها 3 yon Sen oe : oe 5 i : |< 3 NN SR Phy 1 2 ال : ٍ | a. a = a Fa i 4 : a.) [Ee gee Be fe 0 pi Fd o UE be 8 i no he ~ : Q 1 5 = ب al = i i , 5 RR BEE HE ب 3 : = \ EB Se ا م Si oi 3 يهاي 3 21 SS RIS Tl Si PRP Sk 3 £ : > i 5 5 ا on He PE FEN ’ : 4 م Ba So Bs ar Sis . seed rasp لجع جع A ال خدج Aaa عمجي ٠ ديح جه لف REE Cp REL end PR "م مج جع 8 الل جد Tre WTS0I05- 36-2 SEG SALT SES راج كستنان ااا متام 51-6 SOIT SEE ائفد ٍ VAAN gad معدا HA الشكل Yo (ah std [art Av اتشكل ER = i : ge prey 8,0 : MM سس i + ٍ Po 1 = oat ب i Po 1 0 1 : ُ 1 i . Pods : ا 1 i food ب إٍْ ْ Po : i i i Coed إ:ْ Lo : 1 i r ا : Po : 0 ْ Vee dd إٍْ Po : Pood : i y 0 247 نسشالسيسشسأسمنسشمسأساطسأنسيمشس أت لسع WTO0LES- Sai-2 HEE SEE Satie تلاق YA الشكلانتتاجية TOO فى مساحة شيا متصنة ا ا ا ا ا ااا لام اا وي وها 1 2 3 بد i ¥ EO re y y : 8 1 توا اي | ={ i © Wy ee fro Vo i إُ cee ا ا i EE اب ات | نالا Ya Es | > 1 Ee | Rn اس اا ا ا ET oo ory Ey § % ] ب i Wop Rn EL rrr ET oF 85 4 1 oF oF > Fo & ب 1 ao & 2 ' الشكل VRٍ إنتاجية TOO ف مساحة شبة متصضثة TN oa 1 ,9 اي M x & 0 ¥ 1111111١١١11111” AAA AAAS TTT Jct... IE BEB = 0 ااا لوول = ا ةما 1 ...5 الشكل .؟! ¥ 541 = مرديررتيتيتت.رترر ريت ل ميو تيور ا ااا ااا ااا ااا ات اكه 2.٠... , , , . . . , TE ...2 ...ااا ا اا .ا ...اا I. » enaesesaoes eens ¥ i © 0 Ri & SF & 2 إنتاجية TOC في مساحة شبة منضئة q 0 ال ساي 5 ا ا ا ب ل هايا 0 ْ ٍ 1 الشكل ٠ب = Faas x 1 ان & ع ال ا ا ا ا ااا او رج a ككل وكيك aa عو او وي يي a a رح رابك كك x , 5 a a aT ب ب q 2 نتحو اس ا السو a ل NR { ا NR GEE aia = { . ا BN RR i} 8 ماج حو RN fat Ree SL ال ل ا ب لاسا aaa 3 RA al Rep + * 3 di ا .الالح ارا ست لي ل ا NaN Lass CYR ae 2 \ 8 0 ; ae ae I aaa Me ¥ ey N = ل N 8 ا 5 Sag الو نح ا ا ا تا ا ا ae 3 ep ve \ N \ N ل a ل ا \ \ \ \ ل Ll a AY 8 لب A \ \ NN N Cold + 1 مو (HR EE EEE الا ا اا TL لذ Aa a 4 A NN eee اد BEE ren BUEN BEER ie = Bore X N\ NX Cold ad gt الو RE FRR 3 RPS ARRON — 7 3 \ Wiha) ads yt Z ل ا aR لعفا إن © Stee A sein a a RR Ra RN £0 i NY N N N المج ل Rs الل الال لايل 5 EY اا 8 9 1 8 ال ل ل re & من RENE SENN NERS A ا ل ا & نب & VEER EE aaa aE a OR an Be aR LY of Wo oF oF : Lae Fanaa Slo Nee & : 3 5 3 a =X ا يذ A a NE a ا SRI ا ا ل EK ملي Es NE hE Ne a8 A oy N OX OF A نا aE aE ألي a+ &Dey الشكل i» الشكل أبالوزن الجاف فى اليوم A vr ممم ع م ات و 0 : ْ ولا T : ذ Sa ay _ ٍ 3 Toe ae 7 7 ٍ 77 ل Ee ْ 3 i : ل مسا eee ا ال با UE .ب a £ 9 ro | re ق — »للكت Ya sxed - 28 المشكل ؟ ٠١ب. الوزن الرطب فى اليوم TT ae بيب 7 ٍ 1 ض Wea 3 sr | : 0 :5 ا اع لب ض 5 3 وففا و ماد ل لقا i row a جما النوع. البرى ارح الشكل ؟ أيج. الوزن الجاف فى اليوم Va مانت لل ا للتنلظاط باتلا تاللا د رن ن للدي ل“ رد بارت( وا oo A cc 32“. . bo — 1, - ار 7 لدم سستيتي 0 سجس smenep sesamin erm or Be النوع Chey الشكل + تجد. الوزن الرطب فى الوم VA اانا اانا ند ب مالل الم ب اتن ”> الموج EEE اواك eee كس م ا م م مس سا won : 4 ; : 3 a Tee ٍ 1 i 3 1 a 0 2 a d م : i 17 . Chat النوع Cad الشكل YYالحاضهة الهيلة السعودية الملضية الفكرية Swed Authority for intallentual Property pW RE .¥ + \ ا 0 § ام 5 + < Ne ge ”بن اج > عي كي الج دا لي ايام TEE ببح ةا Nase eg + Ed - 2 - 3 .++ .* وذلك بشرط تسديد المقابل المالي السنوي للبراءة وعدم بطلانها of سقوطها لمخالفتها ع لأي من أحكام نظام براءات الاختراع والتصميمات التخطيطية للدارات المتكاملة والأصناف ع النباتية والنماذج الصناعية أو لائحته التنفيذية. »> صادرة عن + ب ب ٠. ب الهيئة السعودية للملكية الفكرية > > > ”+ ص ب 101١ .| لريا 1*١ uo ؛ المملكة | لعربية | لسعودية SAIP@SAIP.GOV.SA
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662441002P | 2016-12-30 | 2016-12-30 | |
PCT/US2017/069073 WO2018126201A1 (en) | 2016-12-30 | 2017-12-29 | High productivity algal mutants having reduced photosynthetic antenna |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SA519401668B1 true SA519401668B1 (ar) | 2023-03-09 |
Family
ID=62708892
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SA519401668A SA519401668B1 (ar) | 2016-12-30 | 2019-04-28 | نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُخفّض |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US10968259B2 (ar) |
EP (1) | EP3562833A4 (ar) |
JP (1) | JP7057786B2 (ar) |
AU (1) | AU2017388870B2 (ar) |
BR (1) | BR112019013193A2 (ar) |
CA (1) | CA3047811A1 (ar) |
MX (1) | MX2019007765A (ar) |
SA (1) | SA519401668B1 (ar) |
WO (1) | WO2018126201A1 (ar) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SG10201906070XA (en) * | 2014-12-31 | 2019-08-27 | Synthetic Genomics Inc | Compositions and methods for high efficiency in vivo genome editing |
CN111527101A (zh) * | 2017-12-29 | 2020-08-11 | 合成基因组股份有限公司 | 用于改善生长的光合生物基因调节 |
AU2019310022A1 (en) * | 2018-07-23 | 2021-02-04 | Synthetic Genomics, Inc. | Microorganisms having increased lipid production, and compositions and methods of making and using the same |
JP2022505440A (ja) * | 2018-11-01 | 2022-01-14 | キージーン ナムローゼ フェンノートシャップ | 植物細胞におけるCRISPR/Casゲノム編集のためのデュアルガイドRNA |
JP7397437B2 (ja) * | 2018-11-07 | 2023-12-13 | 学校法人 中央大学 | クロロフィル含有率が減少し、且つ油脂生産性が増加した緑藻変異体及びその利用 |
WO2020111029A1 (ja) * | 2018-11-26 | 2020-06-04 | 株式会社カネカ | ゲノム編集方法 |
JP7416383B2 (ja) * | 2018-11-26 | 2024-01-17 | 株式会社カネカ | ゲノム編集方法 |
CN110033825B (zh) * | 2019-04-26 | 2021-08-13 | 扬州大学 | 一种箭筈豌豆种质资源筛选方法 |
MX2022007430A (es) * | 2019-12-17 | 2022-09-12 | Viridos Inc | Algas recombinantes con alta productividad de lipidos. |
CN116323646A (zh) * | 2020-09-11 | 2023-06-23 | 维里多斯公司 | 具有高脂质生产力的重组藻类 |
JPWO2022080234A1 (ar) * | 2020-10-12 | 2022-04-21 | ||
WO2022226341A1 (en) * | 2021-04-23 | 2022-10-27 | Viridos, Inc. | Chlorophyte algae having improved productivity |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2002312390A1 (en) * | 2001-06-06 | 2002-12-16 | The General Hospital Corporation | Cytokinin response regulators and uses thereof |
US9982272B2 (en) * | 2012-12-06 | 2018-05-29 | Synthetic Genomics, Inc. | Algal mutants having a locked-in high light acclimated phenotype |
CA2982848A1 (en) * | 2015-04-15 | 2016-10-20 | Synthetic Genomics, Inc. | Algal chloroplastic srp54 mutants |
-
2017
- 2017-12-29 US US15/859,094 patent/US10968259B2/en active Active
- 2017-12-29 AU AU2017388870A patent/AU2017388870B2/en active Active
- 2017-12-29 WO PCT/US2017/069073 patent/WO2018126201A1/en unknown
- 2017-12-29 CA CA3047811A patent/CA3047811A1/en active Pending
- 2017-12-29 BR BR112019013193A patent/BR112019013193A2/pt unknown
- 2017-12-29 EP EP17887143.0A patent/EP3562833A4/en active Pending
- 2017-12-29 JP JP2019535916A patent/JP7057786B2/ja active Active
- 2017-12-29 MX MX2019007765A patent/MX2019007765A/es unknown
-
2019
- 2019-04-28 SA SA519401668A patent/SA519401668B1/ar unknown
-
2021
- 2021-02-17 US US17/178,179 patent/US11787843B2/en active Active
-
2023
- 2023-09-27 US US18/475,792 patent/US20240052001A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BR112019013193A2 (pt) | 2019-12-10 |
MX2019007765A (es) | 2019-09-09 |
WO2018126201A1 (en) | 2018-07-05 |
EP3562833A4 (en) | 2020-07-01 |
JP7057786B2 (ja) | 2022-04-20 |
CA3047811A1 (en) | 2018-07-05 |
AU2017388870A1 (en) | 2019-07-04 |
US10968259B2 (en) | 2021-04-06 |
JP2020503051A (ja) | 2020-01-30 |
AU2017388870B2 (en) | 2023-01-12 |
US20180186842A1 (en) | 2018-07-05 |
US20240052001A1 (en) | 2024-02-15 |
EP3562833A1 (en) | 2019-11-06 |
US11787843B2 (en) | 2023-10-17 |
US20210188924A1 (en) | 2021-06-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
SA519401668B1 (ar) | نواتج طفرة من الطحالب عالية الإنتاجية لها هوائي تخليقي ضوئي مُخفّض | |
EP2929029B1 (en) | Algal mutants having a locked-in high light acclimated phenotype | |
JP7295864B2 (ja) | 成長を改善するための光合成生物の遺伝子調節方法 | |
US20160237449A1 (en) | Transgenic plants for nitrogen fixation | |
US20200157558A1 (en) | Algal chloroplastic srp54 mutants | |
Ali et al. | An assessment on CRISPR Cas as a novel asset in mitigating drought stress | |
CN112410314B (zh) | 乙酰转移酶OsG2基因及其编码的蛋白质的应用 | |
CN111154767A (zh) | 根长调控基因logl5及相应的构建体和其应用 | |
CN114736280A (zh) | ZmROA1蛋白在调控植物耐密性中的应用 | |
Khan et al. | Downregulation of the OsAKT1 K+/Na+ Transporter Gene by CRISPR-Cas9 Mediated Transformation in Sensitive Rice IR29 Makes it Tolerant to Salt Stress | |
Micol-Ponce et al. | The Tomato SlVIPP1 Gene Is Required for Plant Survival Through the Proper Development of Chloroplast Thylakoid Membrane | |
KR102677877B1 (ko) | 이중나선 dna의 표적화된 변형 방법 | |
CN116536290A (zh) | 天冬氨酸蛋白酶1及其编码基因在调控小麦光合作用、产量及蛋白含量中的应用 | |
CA3192136A1 (en) | Recombinant algae having high lipid productivity | |
JP2009219380A (ja) | 植物の亜ヒ酸トランスポーター及びその遺伝子 |