SA113340251B1 - حوافز لتفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات واستخدامها - Google Patents
حوافز لتفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات واستخدامها Download PDFInfo
- Publication number
- SA113340251B1 SA113340251B1 SA113340251A SA113340251A SA113340251B1 SA 113340251 B1 SA113340251 B1 SA 113340251B1 SA 113340251 A SA113340251 A SA 113340251A SA 113340251 A SA113340251 A SA 113340251A SA 113340251 B1 SA113340251 B1 SA 113340251B1
- Authority
- SA
- Saudi Arabia
- Prior art keywords
- sequence
- gene expression
- nucleic acid
- dna
- yyy
- Prior art date
Links
- 230000023603 positive regulation of transcription initiation, DNA-dependent Effects 0.000 title claims abstract description 44
- 230000003993 interaction Effects 0.000 title claims description 187
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 554
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims abstract description 151
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims abstract description 151
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 148
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 141
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 141
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 140
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 140
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 137
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 claims abstract description 90
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 75
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 74
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 74
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 56
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 24
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims description 361
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 260
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 196
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 182
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 180
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 171
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 151
- 108700001094 Plant Genes Proteins 0.000 claims description 92
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 91
- 239000012190 activator Substances 0.000 claims description 90
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 84
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 58
- 239000007809 chemical reaction catalyst Substances 0.000 claims description 52
- 108091006106 transcriptional activators Proteins 0.000 claims description 51
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 44
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 claims description 31
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 26
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 24
- 101710108846 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit Proteins 0.000 claims description 22
- 102100034703 mRNA decay activator protein ZFP36L2 Human genes 0.000 claims description 22
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 21
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 20
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 18
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 15
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 claims description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 14
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 13
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 12
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 claims description 11
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 11
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims description 11
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 claims description 9
- 101000608765 Homo sapiens Galectin-4 Proteins 0.000 claims description 9
- 235000015107 ale Nutrition 0.000 claims description 9
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 claims description 7
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 claims description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 7
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 claims description 7
- 108020003113 steroid hormone receptors Proteins 0.000 claims description 6
- 102000005969 steroid hormone receptors Human genes 0.000 claims description 6
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 5
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 claims description 4
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 claims description 4
- 235000007849 Lepidium sativum Nutrition 0.000 claims description 4
- 244000211187 Lepidium sativum Species 0.000 claims description 4
- 241000252067 Megalops atlanticus Species 0.000 claims description 4
- 230000003161 proteinsynthetic effect Effects 0.000 claims description 4
- 108700020534 tetracycline resistance-encoding transposon repressor Proteins 0.000 claims description 4
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 claims description 3
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 claims description 3
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 3
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000000049 pigment Substances 0.000 claims description 2
- 238000012053 enzymatic serum creatinine assay Methods 0.000 claims 5
- 241001093575 Alma Species 0.000 claims 4
- 101100117236 Drosophila melanogaster speck gene Proteins 0.000 claims 4
- OPDFUQJBZZJZRG-WPJYNPJPSA-N (4r,4as,7r,7ar,12bs)-7-[2-[2-[2-[[(4r,4as,7r,7ar,12bs)-3-(cyclopropylmethyl)-4a,9-dihydroxy-1,2,4,5,6,7,7a,13-octahydro-4,12-methanobenzofuro[3,2-e]isoquinoline-7-yl]amino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-(cyclopropylmethyl)-1,2,4,5,6,7,7a,13-octahydro-4,12-me Chemical compound N1([C@@H]2CC3=CC=C(C=4O[C@@H]5[C@](C3=4)([C@]2(CC[C@H]5NCCOCCOCCN[C@H]2[C@@H]3OC=4C(O)=CC=C5C[C@@H]6[C@]([C@@]3(CCN6CC3CC3)C5=4)(O)CC2)O)CC1)O)CC1CC1 OPDFUQJBZZJZRG-WPJYNPJPSA-N 0.000 claims 3
- 244000201986 Cassia tora Species 0.000 claims 3
- 102100028255 Renin Human genes 0.000 claims 3
- NCAIGTHBQTXTLR-UHFFFAOYSA-N phentermine hydrochloride Chemical compound [Cl-].CC(C)([NH3+])CC1=CC=CC=C1 NCAIGTHBQTXTLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 229940081330 tena Drugs 0.000 claims 3
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims 2
- 208000009989 Posterior Leukoencephalopathy Syndrome Diseases 0.000 claims 2
- 229940096118 ella Drugs 0.000 claims 2
- HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N nifedipine Chemical compound COC(=O)C1=C(C)NC(C)=C(C(=O)OC)C1C1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000001216 nucleic acid method Methods 0.000 claims 2
- 239000004576 sand Substances 0.000 claims 2
- 238000004416 surface enhanced Raman spectroscopy Methods 0.000 claims 2
- MBYLVOKEDDQJDY-UHFFFAOYSA-N tris(2-aminoethyl)amine Chemical compound NCCN(CCN)CCN MBYLVOKEDDQJDY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- OOLLAFOLCSJHRE-ZHAKMVSLSA-N ulipristal acetate Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1[C@@H]1C2=C3CCC(=O)C=C3CC[C@H]2[C@H](CC[C@]2(OC(C)=O)C(C)=O)[C@]2(C)C1 OOLLAFOLCSJHRE-ZHAKMVSLSA-N 0.000 claims 2
- LKPZQKREAUELRB-UHFFFAOYSA-N 4,5-dihydroxy-3-methoxy-6-[(3,4,5,6-tetrahydroxyoxan-2-yl)methoxy]oxane-2-carboxylic acid Chemical compound COC1C(O)C(O)C(OCC2OC(O)C(O)C(O)C2O)OC1C(=O)O LKPZQKREAUELRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- MCNQUWLLXZZZAC-UHFFFAOYSA-N 4-cyano-1-(2,4-dichlorophenyl)-5-(4-methoxyphenyl)-n-piperidin-1-ylpyrazole-3-carboxamide Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C1=C(C#N)C(C(=O)NN2CCCCC2)=NN1C1=CC=C(Cl)C=C1Cl MCNQUWLLXZZZAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- CUARLQDWYSRQDF-UHFFFAOYSA-N 5-Nitroacenaphthene Chemical compound C1CC2=CC=CC3=C2C1=CC=C3[N+](=O)[O-] CUARLQDWYSRQDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 101150019464 ARAF gene Proteins 0.000 claims 1
- ORILYTVJVMAKLC-UHFFFAOYSA-N Adamantane Natural products C1C(C2)CC3CC1CC2C3 ORILYTVJVMAKLC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000554155 Andes Species 0.000 claims 1
- 241000252073 Anguilliformes Species 0.000 claims 1
- 101100138673 Arabidopsis thaliana NPF3.1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100152881 Arabidopsis thaliana THAL gene Proteins 0.000 claims 1
- 241001120493 Arene Species 0.000 claims 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 claims 1
- 101100324788 Caenorhabditis elegans atg-5 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100113692 Caenorhabditis elegans clk-2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100279438 Caenorhabditis elegans egg-3 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100074187 Caenorhabditis elegans lag-1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100351303 Caenorhabditis elegans pdfr-1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100426973 Caenorhabditis elegans ttr-3 gene Proteins 0.000 claims 1
- 240000005589 Calophyllum inophyllum Species 0.000 claims 1
- 244000068645 Carya illinoensis Species 0.000 claims 1
- 235000009025 Carya illinoensis Nutrition 0.000 claims 1
- 240000007681 Catha edulis Species 0.000 claims 1
- 235000006696 Catha edulis Nutrition 0.000 claims 1
- 244000182691 Echinochloa frumentacea Species 0.000 claims 1
- 235000008247 Echinochloa frumentacea Nutrition 0.000 claims 1
- 101710177846 Endothelin-1 receptor Proteins 0.000 claims 1
- 244000287680 Garcinia dulcis Species 0.000 claims 1
- 201000005569 Gout Diseases 0.000 claims 1
- 108010068250 Herpes Simplex Virus Protein Vmw65 Proteins 0.000 claims 1
- 241000257303 Hymenoptera Species 0.000 claims 1
- 241001580017 Jana Species 0.000 claims 1
- 101150037050 LE gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100030931 Ladinin-1 Human genes 0.000 claims 1
- 101710177601 Ladinin-1 Proteins 0.000 claims 1
- 101710196632 LexA repressor Proteins 0.000 claims 1
- 102100034184 Macrophage scavenger receptor types I and II Human genes 0.000 claims 1
- 101710134306 Macrophage scavenger receptor types I and II Proteins 0.000 claims 1
- 241001446467 Mama Species 0.000 claims 1
- 241000283898 Ovis Species 0.000 claims 1
- 240000002390 Pandanus odoratissimus Species 0.000 claims 1
- 235000005311 Pandanus odoratissimus Nutrition 0.000 claims 1
- 241001307210 Pene Species 0.000 claims 1
- 101710191547 Peptidyl-tRNA hydrolase 1 Proteins 0.000 claims 1
- 235000014676 Phragmites communis Nutrition 0.000 claims 1
- 101100209990 Rattus norvegicus Slc18a2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 108090000783 Renin Proteins 0.000 claims 1
- 241000033695 Sige Species 0.000 claims 1
- 241000079527 Ziziphus spina-christi Species 0.000 claims 1
- 238000001270 angle-resolved resonant Auger electron spectroscopy Methods 0.000 claims 1
- 150000004945 aromatic hydrocarbons Chemical class 0.000 claims 1
- 101150036080 at gene Proteins 0.000 claims 1
- 235000015278 beef Nutrition 0.000 claims 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 claims 1
- NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N ceftazidime pentahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C([O-])=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC(C)(C)C(O)=O)C=2N=C(N)SC=2)CC=1C[N+]1=CC=CC=C1 NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N 0.000 claims 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 claims 1
- 210000005069 ears Anatomy 0.000 claims 1
- 238000005430 electron energy loss spectroscopy Methods 0.000 claims 1
- 208000016139 endolymphatic sac tumor Diseases 0.000 claims 1
- 208000001901 epithelial recurrent erosion dystrophy Diseases 0.000 claims 1
- 150000003278 haem Chemical class 0.000 claims 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 claims 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims 1
- 244000145841 kine Species 0.000 claims 1
- 235000020131 mattha Nutrition 0.000 claims 1
- 238000007670 refining Methods 0.000 claims 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims 1
- 101150013726 spe-8 gene Proteins 0.000 claims 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 claims 1
- 239000004575 stone Substances 0.000 claims 1
- 210000002268 wool Anatomy 0.000 claims 1
- 230000004572 zinc-binding Effects 0.000 claims 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract description 14
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 abstract description 11
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 162
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 75
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 74
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 63
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 58
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 52
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 44
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 42
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 40
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 39
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 36
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 35
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 35
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 35
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 35
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 35
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 34
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 34
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 31
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 31
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 30
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 29
- 239000000047 product Substances 0.000 description 28
- UQXKXGWGFRWILX-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol dinitrate Chemical compound O=N(=O)OCCON(=O)=O UQXKXGWGFRWILX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 24
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 22
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 22
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 22
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 21
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 20
- 125000000393 L-methionino group Chemical group [H]OC(=O)[C@@]([H])(N([H])[*])C([H])([H])C(SC([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 description 20
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 19
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 19
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 19
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 18
- HGCNKOLVKRAVHD-UHFFFAOYSA-N L-Met-L-Phe Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HGCNKOLVKRAVHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 17
- 108010068488 methionylphenylalanine Proteins 0.000 description 17
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 17
- SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 16
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 16
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 15
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 14
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 14
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 14
- 230000006870 function Effects 0.000 description 13
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 12
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 12
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 12
- VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N Gly-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 12
- UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N Gly-Met-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 12
- LMMPTUVWHCFTOT-GARJFASQSA-N His-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)C(=O)O LMMPTUVWHCFTOT-GARJFASQSA-N 0.000 description 12
- HWNYVQMOLCYHEA-IHRRRGAJSA-N Val-Ser-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N HWNYVQMOLCYHEA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 12
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 12
- 108010000434 glycyl-alanyl-leucine Proteins 0.000 description 12
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 12
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 12
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 12
- 208000009889 Herpes Simplex Diseases 0.000 description 11
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 10
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 10
- 101710189714 Major cell-binding factor Proteins 0.000 description 10
- 102100030000 Recombining binding protein suppressor of hairless Human genes 0.000 description 10
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 10
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 10
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 description 10
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 description 10
- -1 polyethylene Polymers 0.000 description 10
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 10
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 9
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 9
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- JDUKCSSHWNIQQZ-IHRRRGAJSA-N Glu-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JDUKCSSHWNIQQZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 9
- 125000000510 L-tryptophano group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C2N([H])C([H])=C(C([H])([H])[C@@]([H])(C(O[H])=O)N([H])[*])C2=C1[H] 0.000 description 9
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 9
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 9
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Chemical compound O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 9
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 9
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 9
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 9
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 9
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 8
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 8
- 102100032049 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 Human genes 0.000 description 8
- HGCNKOLVKRAVHD-RYUDHWBXSA-N Met-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HGCNKOLVKRAVHD-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 8
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 8
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 8
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 7
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 7
- XMKXONRMGJXCJV-LAEOZQHASA-N Asp-Val-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XMKXONRMGJXCJV-LAEOZQHASA-N 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 7
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 7
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 7
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 7
- 239000000463 material Substances 0.000 description 7
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 7
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 7
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 7
- MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N Ala-Leu-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 6
- 208000001930 Autoimmune limbic encephalitis Diseases 0.000 description 6
- OYQBFWWQSVIHBN-FHWLQOOXSA-N Phe-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O OYQBFWWQSVIHBN-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 6
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 6
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 6
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 6
- 238000003877 atomic layer epitaxy Methods 0.000 description 6
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 6
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 6
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 6
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 6
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 6
- 241000894007 species Species 0.000 description 6
- ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4-[hydroxy(methyl)phosphoryl]butanoic acid;azane Chemical compound [NH4+].CP(O)(=O)CCC(N)C([O-])=O ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101150096316 5 gene Proteins 0.000 description 5
- 101150101112 7 gene Proteins 0.000 description 5
- WAEDSQFVZJUHLI-BYULHYEWSA-N Asp-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WAEDSQFVZJUHLI-BYULHYEWSA-N 0.000 description 5
- YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Asp Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 5
- ZGXGVBYEJGVJMV-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O ZGXGVBYEJGVJMV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 5
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 5
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 5
- 101150022366 ZEP gene Proteins 0.000 description 5
- 101710185494 Zinc finger protein Proteins 0.000 description 5
- 102100023597 Zinc finger protein 816 Human genes 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 5
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 5
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 5
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 5
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 5
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 4
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000011299 Brassica oleracea var botrytis Nutrition 0.000 description 4
- 240000003259 Brassica oleracea var. botrytis Species 0.000 description 4
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 4
- HUWSBFYAGXCXKC-CIUDSAMLSA-N Glu-Ala-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O HUWSBFYAGXCXKC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- GZWOBWMOMPFPCD-CIUDSAMLSA-N Glu-Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N GZWOBWMOMPFPCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N Glu-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- 239000005562 Glyphosate Substances 0.000 description 4
- 101150095974 MELT gene Proteins 0.000 description 4
- LQTGGXSOMDSWTQ-UNQGMJICSA-N Met-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O LQTGGXSOMDSWTQ-UNQGMJICSA-N 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 101100010147 Oryza sativa subsp. japonica DOF1 gene Proteins 0.000 description 4
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- 108010003581 Ribulose-bisphosphate carboxylase Proteins 0.000 description 4
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 4
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 4
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 4
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 4
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 4
- GPRBEKHLDVQUJE-VINNURBNSA-N cefotaxime Chemical compound N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(C)=O)CS[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)/C(=N/OC)C1=CSC(N)=N1 GPRBEKHLDVQUJE-VINNURBNSA-N 0.000 description 4
- 229960004261 cefotaxime Drugs 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 4
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 4
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 4
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 4
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 4
- XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N glyphosate Chemical compound OC(=O)CNCP(O)(O)=O XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940097068 glyphosate Drugs 0.000 description 4
- SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N indole-3-acetic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC(=O)O)=CNC2=C1 SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 4
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 4
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 4
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 4
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- SLCVBVWXLSEKPL-UHFFFAOYSA-N neopentyl glycol Chemical compound OCC(C)(C)CO SLCVBVWXLSEKPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 4
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 4
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 4
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 4
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 4
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101150090724 3 gene Proteins 0.000 description 3
- 108010020183 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase Proteins 0.000 description 3
- IFBHRQDFSNCLOZ-ZIQFBCGOSA-N 4-nitrophenyl alpha-D-glucoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 IFBHRQDFSNCLOZ-ZIQFBCGOSA-N 0.000 description 3
- DGLQWAFPIXDKRL-UBHSHLNASA-N Ala-Met-Phe Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N DGLQWAFPIXDKRL-UBHSHLNASA-N 0.000 description 3
- DXTYEWAQOXYRHZ-KKXDTOCCSA-N Ala-Phe-Tyr Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O)N DXTYEWAQOXYRHZ-KKXDTOCCSA-N 0.000 description 3
- GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N Asp-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 241001515826 Cassava vein mosaic virus Species 0.000 description 3
- 101710096438 DNA-binding protein Proteins 0.000 description 3
- 101150011769 ERF2 gene Proteins 0.000 description 3
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 3
- 101000718525 Homo sapiens Alpha-galactosidase A Proteins 0.000 description 3
- RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N Leu-Thr-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 3
- XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N Melanin Natural products O=C1C(=O)C(C2=CNC3=C(C(C(=O)C4=C32)=O)C)=C2C4=CNC2=C1C XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 3
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 3
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- FINLZXKJWTYYLC-ACRUOGEOSA-N Phe-His-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FINLZXKJWTYYLC-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 3
- 108010064851 Plant Proteins Proteins 0.000 description 3
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 3
- CGCMNOIQVAXYMA-UNQGMJICSA-N Thr-Met-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O CGCMNOIQVAXYMA-UNQGMJICSA-N 0.000 description 3
- 101710195626 Transcriptional activator protein Proteins 0.000 description 3
- IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N Trp-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 3
- 101710110895 Uncharacterized 7.3 kDa protein in cox-rep intergenic region Proteins 0.000 description 3
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091006088 activator proteins Proteins 0.000 description 3
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 3
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 3
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 3
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000021186 dishes Nutrition 0.000 description 3
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 3
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 3
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 3
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 3
- XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M lithium acetate Chemical compound [Li+].CC([O-])=O XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 108010058731 nopaline synthase Proteins 0.000 description 3
- YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N o-dihydroxy-benzene Natural products OC1=CC=CC=C1O YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 3
- 235000021118 plant-derived protein Nutrition 0.000 description 3
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 3
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- LWTDZKXXJRRKDG-KXBFYZLASA-N (-)-phaseollin Chemical compound C1OC2=CC(O)=CC=C2[C@H]2[C@@H]1C1=CC=C3OC(C)(C)C=CC3=C1O2 LWTDZKXXJRRKDG-KXBFYZLASA-N 0.000 description 2
- 150000005206 1,2-dihydroxybenzenes Chemical class 0.000 description 2
- 101150028074 2 gene Proteins 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150039504 6 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000589156 Agrobacterium rhizogenes Species 0.000 description 2
- HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N Ala-Phe-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 2
- 102100026277 Alpha-galactosidase A Human genes 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N Asp-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- NECWUSYTYSIFNC-DLOVCJGASA-N Asp-Ala-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 NECWUSYTYSIFNC-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010006654 Bleomycin Proteins 0.000 description 2
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 2
- 235000011293 Brassica napus Nutrition 0.000 description 2
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 2
- 235000003899 Brassica oleracea var acephala Nutrition 0.000 description 2
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 2
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 101150005393 CBF1 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100289888 Caenorhabditis elegans lys-5 gene Proteins 0.000 description 2
- 240000001829 Catharanthus roseus Species 0.000 description 2
- 229930186147 Cephalosporin Natural products 0.000 description 2
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 2
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000009854 Cucurbita moschata Nutrition 0.000 description 2
- XZKJEOMFLDVXJG-KATARQTJSA-N Cys-Leu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)N)O XZKJEOMFLDVXJG-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- QQOWCDCBFFBRQH-IXOXFDKPSA-N Cys-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CS)N)O QQOWCDCBFFBRQH-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- 230000007064 DNA hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 2
- 101150092880 DREB1A gene Proteins 0.000 description 2
- 244000000626 Daucus carota Species 0.000 description 2
- 235000002767 Daucus carota Nutrition 0.000 description 2
- AHMIDUVKSGCHAU-UHFFFAOYSA-N Dopaquinone Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC(=O)C(=O)C=C1 AHMIDUVKSGCHAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 108010093031 Galactosidases Proteins 0.000 description 2
- 102000002464 Galactosidases Human genes 0.000 description 2
- 102100032863 General transcription factor IIH subunit 3 Human genes 0.000 description 2
- RWQCWSGOOOEGPB-FXQIFTODSA-N Gln-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RWQCWSGOOOEGPB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- TZXOPHFCAATANZ-QEJZJMRPSA-N Glu-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N TZXOPHFCAATANZ-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 2
- QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N Glu-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- RLAOTFTXBFQJDV-KKUMJFAQSA-N His-Phe-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CN=CN1 RLAOTFTXBFQJDV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- 101000666405 Homo sapiens General transcription factor IIH subunit 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000655398 Homo sapiens General transcription factor IIH subunit 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000655391 Homo sapiens General transcription factor IIH subunit 3 Proteins 0.000 description 2
- 101000655406 Homo sapiens General transcription factor IIH subunit 4 Proteins 0.000 description 2
- 101000655402 Homo sapiens General transcription factor IIH subunit 5 Proteins 0.000 description 2
- 101001081567 Homo sapiens Insulin-like growth factor-binding protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 102100027636 Insulin-like growth factor-binding protein 1 Human genes 0.000 description 2
- AHMIDUVKSGCHAU-LURJTMIESA-N L-dopaquinone Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC(=O)C(=O)C=C1 AHMIDUVKSGCHAU-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- VCSBGUACOYUIGD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VCSBGUACOYUIGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- 208000007466 Male Infertility Diseases 0.000 description 2
- ONGCSGVHCSAATF-CIUDSAMLSA-N Met-Ala-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ONGCSGVHCSAATF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- GPAHWYRSHCKICP-GUBZILKMSA-N Met-Glu-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GPAHWYRSHCKICP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- OBCRZLRPJFNLAN-DCAQKATOSA-N Met-His-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OBCRZLRPJFNLAN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- CNTNPWWHFWAZGA-JYJNAYRXSA-N Met-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CNTNPWWHFWAZGA-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- FBLBCGLSRXBANI-KKUMJFAQSA-N Met-Phe-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N FBLBCGLSRXBANI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- ZACMJPCWVSLCNS-JYJNAYRXSA-N Met-Phe-Met Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZACMJPCWVSLCNS-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- 108010047956 Nucleosomes Proteins 0.000 description 2
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 101710163504 Phaseolin Proteins 0.000 description 2
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- OAOLATANIHTNCZ-IHRRRGAJSA-N Phe-Met-Asp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N OAOLATANIHTNCZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- RAGOJJCBGXARPO-XVSYOHENSA-N Phe-Thr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RAGOJJCBGXARPO-XVSYOHENSA-N 0.000 description 2
- XBCOOBCTVMMQSC-BVSLBCMMSA-N Phe-Val-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 XBCOOBCTVMMQSC-BVSLBCMMSA-N 0.000 description 2
- IFMDQWDAJUMMJC-DCAQKATOSA-N Pro-Ala-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IFMDQWDAJUMMJC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 2
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N Ser-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N Ser-Glu-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- UGTZYIPOBYXWRW-SRVKXCTJSA-N Ser-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UGTZYIPOBYXWRW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 2
- 244000062793 Sorghum vulgare Species 0.000 description 2
- 244000204900 Talipariti tiliaceum Species 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical class OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LMMDEZPNUTZJAY-GCJQMDKQSA-N Thr-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O LMMDEZPNUTZJAY-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- KZSYAEWQMJEGRZ-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O KZSYAEWQMJEGRZ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 2
- KCPFDGNYAMKZQP-KBPBESRZSA-N Tyr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KCPFDGNYAMKZQP-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N Tyr-Thr-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N 0.000 description 2
- HZYOWMGWKKRMBZ-BYULHYEWSA-N Val-Asp-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N HZYOWMGWKKRMBZ-BYULHYEWSA-N 0.000 description 2
- GUIYPEKUEMQBIK-JSGCOSHPSA-N Val-Tyr-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)NCC(O)=O GUIYPEKUEMQBIK-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- 241000607479 Yersinia pestis Species 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N acridine Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010021908 aspartyl-aspartyl-glutamyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 229960001561 bleomycin Drugs 0.000 description 2
- OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O bleomycin A2 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 2
- 229940124587 cephalosporin Drugs 0.000 description 2
- 150000001780 cephalosporins Chemical class 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- 238000009402 cross-breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 2
- 230000001667 episodic effect Effects 0.000 description 2
- 230000010502 episomal replication Effects 0.000 description 2
- 230000004129 fatty acid metabolism Effects 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 2
- 239000003862 glucocorticoid Substances 0.000 description 2
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 2
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010075431 glycyl-alanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 239000003630 growth substance Substances 0.000 description 2
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 2
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 2
- 239000003617 indole-3-acetic acid Substances 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000000749 insecticidal effect Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 2
- 210000001623 nucleosome Anatomy 0.000 description 2
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 2
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 2
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 230000010152 pollination Effects 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 2
- ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N psoralen Chemical compound C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OC=C2 ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000014493 regulation of gene expression Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- STUMEFJLAPRRME-JTQLQIEISA-N (2s)-2-amino-3-(3-fluoro-4-hydroxyphenyl)-2-methylpropanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@](N)(C)CC1=CC=C(O)C(F)=C1 STUMEFJLAPRRME-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- FCHBECOAGZMTFE-ZEQKJWHPSA-N (6r,7r)-3-[[2-[[4-(dimethylamino)phenyl]diazenyl]pyridin-1-ium-1-yl]methyl]-8-oxo-7-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1N=NC1=CC=CC=[N+]1CC1=C(C([O-])=O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)CC=3SC=CC=3)[C@H]2SC1 FCHBECOAGZMTFE-ZEQKJWHPSA-N 0.000 description 1
- 101150040471 19 gene Proteins 0.000 description 1
- WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 2-acetyloxypropanoic acid Chemical compound OC(=O)C(C)OC(C)=O WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 1
- UPMXNNIRAGDFEH-UHFFFAOYSA-N 3,5-dibromo-4-hydroxybenzonitrile Chemical compound OC1=C(Br)C=C(C#N)C=C1Br UPMXNNIRAGDFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CAAMSDWKXXPUJR-UHFFFAOYSA-N 3,5-dihydro-4H-imidazol-4-one Chemical compound O=C1CNC=N1 CAAMSDWKXXPUJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150033839 4 gene Proteins 0.000 description 1
- VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 4',5'-Dihydropsoralen Natural products C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OCC2 VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BHQCQFFYRZLCQQ-UHFFFAOYSA-N 4-(3,7,12-trihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl)pentanoic acid Chemical compound OC1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(CCC(O)=O)C)C1(C)C(O)C2 BHQCQFFYRZLCQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QUTYKIXIUDQOLK-PRJMDXOYSA-N 5-O-(1-carboxyvinyl)-3-phosphoshikimic acid Chemical compound O[C@H]1[C@H](OC(=C)C(O)=O)CC(C(O)=O)=C[C@H]1OP(O)(O)=O QUTYKIXIUDQOLK-PRJMDXOYSA-N 0.000 description 1
- 101150006508 82 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710197650 Actin-7 Proteins 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ZRGNRZLDMUACOW-HERUPUMHSA-N Ala-Cys-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N ZRGNRZLDMUACOW-HERUPUMHSA-N 0.000 description 1
- VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N Ala-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- 244000291564 Allium cepa Species 0.000 description 1
- 235000002732 Allium cepa var. cepa Nutrition 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 1
- 244000105975 Antidesma platyphyllum Species 0.000 description 1
- 240000007087 Apium graveolens Species 0.000 description 1
- 235000015849 Apium graveolens Dulce Group Nutrition 0.000 description 1
- 235000010591 Appio Nutrition 0.000 description 1
- 101100446215 Arabidopsis thaliana FAMT gene Proteins 0.000 description 1
- QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N Asn-Ala-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N Asn-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- VYLVOMUVLMGCRF-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asp-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VYLVOMUVLMGCRF-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LUVODTFFSXVOAG-ACZMJKKPSA-N Asn-Cys-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LUVODTFFSXVOAG-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N Asp-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SAKCBXNPWDRWPE-BQBZGAKWSA-N Asp-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N SAKCBXNPWDRWPE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HXVILZUZXFLVEN-DCAQKATOSA-N Asp-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXVILZUZXFLVEN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N Asp-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PWAIZUBWHRHYKS-MELADBBJSA-N Asp-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O PWAIZUBWHRHYKS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N Asp-Ser-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QSFHZPQUAAQHAQ-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QSFHZPQUAAQHAQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZQFRDAZBTSFGGW-SRVKXCTJSA-N Asp-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O ZQFRDAZBTSFGGW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N Asp-Thr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N Asp-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- AWPWHMVCSISSQK-QWRGUYRKSA-N Asp-Tyr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(O)=O AWPWHMVCSISSQK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- 235000000832 Ayote Nutrition 0.000 description 1
- 241000193388 Bacillus thuringiensis Species 0.000 description 1
- KHBQMWCZKVMBLN-UHFFFAOYSA-N Benzenesulfonamide Chemical compound NS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 KHBQMWCZKVMBLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 1
- 235000014698 Brassica juncea var multisecta Nutrition 0.000 description 1
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 description 1
- 235000017647 Brassica oleracea var italica Nutrition 0.000 description 1
- 235000010149 Brassica rapa subsp chinensis Nutrition 0.000 description 1
- 235000006618 Brassica rapa subsp oleifera Nutrition 0.000 description 1
- 235000000536 Brassica rapa subsp pekinensis Nutrition 0.000 description 1
- 235000000540 Brassica rapa subsp rapa Nutrition 0.000 description 1
- 241001301148 Brassica rapa subsp. oleifera Species 0.000 description 1
- 241000499436 Brassica rapa subsp. pekinensis Species 0.000 description 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 1
- 239000005489 Bromoxynil Substances 0.000 description 1
- 108091028026 C-DNA Proteins 0.000 description 1
- QCMYYKRYFNMIEC-UHFFFAOYSA-N COP(O)=O Chemical class COP(O)=O QCMYYKRYFNMIEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100228200 Caenorhabditis elegans gly-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150044789 Cap gene Proteins 0.000 description 1
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 101800001312 Capsid protein VP1 Proteins 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100027668 Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710134395 Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000001573 Cataplexy Diseases 0.000 description 1
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 description 1
- 241000701459 Caulimovirus Species 0.000 description 1
- 108020001540 Choline monooxygenase Proteins 0.000 description 1
- 244000241235 Citrullus lanatus Species 0.000 description 1
- 235000012828 Citrullus lanatus var citroides Nutrition 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- 241000219112 Cucumis Species 0.000 description 1
- 101000822161 Cucumis melo 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 235000015510 Cucumis melo subsp melo Nutrition 0.000 description 1
- 240000008067 Cucumis sativus Species 0.000 description 1
- 235000010799 Cucumis sativus var sativus Nutrition 0.000 description 1
- 240000004244 Cucurbita moschata Species 0.000 description 1
- 240000001980 Cucurbita pepo Species 0.000 description 1
- 235000009852 Cucurbita pepo Nutrition 0.000 description 1
- 235000009804 Cucurbita pepo subsp pepo Nutrition 0.000 description 1
- KCPOQGRVVXYLAC-KKUMJFAQSA-N Cys-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N KCPOQGRVVXYLAC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 108010066133 D-octopine dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 101150074155 DHFR gene Proteins 0.000 description 1
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 238000013382 DNA quantification Methods 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 108700020911 DNA-Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 101150069682 DOF1 gene Proteins 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010028143 Dioxygenases Proteins 0.000 description 1
- 102000016680 Dioxygenases Human genes 0.000 description 1
- 208000035240 Disease Resistance Diseases 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010014405 Electrocution Diseases 0.000 description 1
- 101100437498 Escherichia coli (strain K12) uidA gene Proteins 0.000 description 1
- 108091092566 Extrachromosomal DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000003875 Ferrochelatase Human genes 0.000 description 1
- 108010057394 Ferrochelatase Proteins 0.000 description 1
- 241000701484 Figwort mosaic virus Species 0.000 description 1
- 102000001390 Fructose-Bisphosphate Aldolase Human genes 0.000 description 1
- 108010068561 Fructose-Bisphosphate Aldolase Proteins 0.000 description 1
- 241000237858 Gastropoda Species 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- QYTKAVBFRUGYAU-ACZMJKKPSA-N Gln-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QYTKAVBFRUGYAU-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- AKJRHDMTEJXTPV-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(O)=O AKJRHDMTEJXTPV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CBEUFCJRFNZMCU-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CBEUFCJRFNZMCU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XEKAJTCACGEBOK-KKUMJFAQSA-N Glu-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N XEKAJTCACGEBOK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- UMHRCVCZUPBBQW-GARJFASQSA-N Glu-Met-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N UMHRCVCZUPBBQW-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- GQGAFTPXAPKSCF-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Cys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O GQGAFTPXAPKSCF-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- LXTRSHQLGYINON-DTWKUNHWSA-N Gly-Met-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN LXTRSHQLGYINON-DTWKUNHWSA-N 0.000 description 1
- ONSARSFSJHTMFJ-STQMWFEESA-N Gly-Trp-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONSARSFSJHTMFJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 1
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 1
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 241001539176 Hime Species 0.000 description 1
- RXVOMIADLXPJGW-GUBZILKMSA-N His-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RXVOMIADLXPJGW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YAEKRYQASVCDLK-JYJNAYRXSA-N His-Phe-Glu Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N YAEKRYQASVCDLK-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 1
- 206010021929 Infertility male Diseases 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N L-Dopa Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C(O)=C1 WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 description 1
- 240000008415 Lactuca sativa Species 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- DBVWMYGBVFCRBE-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O DBVWMYGBVFCRBE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZURHXHNAEJJRNU-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZURHXHNAEJJRNU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PRZVBIAOPFGAQF-SRVKXCTJSA-N Leu-Glu-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O PRZVBIAOPFGAQF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 1
- OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N Lincomycin Natural products CN1CC(CCC)CC1C(=O)NC(C(C)O)C1C(O)C(O)C(O)C(SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000010954 Link domains Human genes 0.000 description 1
- 108050001157 Link domains Proteins 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 1
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 1
- IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N Lys-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102000000490 Mediator Complex Human genes 0.000 description 1
- 108010080991 Mediator Complex Proteins 0.000 description 1
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 1
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 1
- 240000000233 Melia azedarach Species 0.000 description 1
- 241000970829 Mesorhizobium Species 0.000 description 1
- TUSOIZOVPJCMFC-FXQIFTODSA-N Met-Asp-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O TUSOIZOVPJCMFC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GODBLDDYHFTUAH-CIUDSAMLSA-N Met-Asp-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GODBLDDYHFTUAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XDGFFEZAZHRZFR-RHYQMDGZSA-N Met-Leu-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XDGFFEZAZHRZFR-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- USBFEVBHEQBWDD-AVGNSLFASA-N Met-Leu-Val Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O USBFEVBHEQBWDD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KRLKICLNEICJGV-STQMWFEESA-N Met-Phe-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KRLKICLNEICJGV-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- LUYURUYVNYGKGM-RCWTZXSCSA-N Met-Pro-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LUYURUYVNYGKGM-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 1
- 108010033272 Nitrilase Proteins 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 241001520808 Panicum virgatum Species 0.000 description 1
- 206010034133 Pathogen resistance Diseases 0.000 description 1
- 239000006002 Pepper Substances 0.000 description 1
- 240000007377 Petunia x hybrida Species 0.000 description 1
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 1
- KIAWKQJTSGRCSA-AVGNSLFASA-N Phe-Asn-Glu Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KIAWKQJTSGRCSA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IQXOZIDWLZYYAW-IHRRRGAJSA-N Phe-Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N IQXOZIDWLZYYAW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MGBRZXXGQBAULP-DRZSPHRISA-N Phe-Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 MGBRZXXGQBAULP-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- XXAOSEUPEMQJOF-KKUMJFAQSA-N Phe-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 XXAOSEUPEMQJOF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- VJLLEKDQJSMHRU-STQMWFEESA-N Phe-Gly-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O VJLLEKDQJSMHRU-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- OQTDZEJJWWAGJT-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OQTDZEJJWWAGJT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N Phe-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- ZTVSVSFBHUVYIN-UFYCRDLUSA-N Phe-Tyr-Met Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 ZTVSVSFBHUVYIN-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N Phosphinothricin Natural products CP(O)(=O)CCC(N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 235000016761 Piper aduncum Nutrition 0.000 description 1
- 240000003889 Piper guineense Species 0.000 description 1
- 235000017804 Piper guineense Nutrition 0.000 description 1
- 235000008184 Piper nigrum Nutrition 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 101150090155 R gene Proteins 0.000 description 1
- 238000013381 RNA quantification Methods 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N Raffinose Natural products O(C[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@@]2(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O1)[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N 0.000 description 1
- 244000088415 Raphanus sativus Species 0.000 description 1
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 1
- 241000589180 Rhizobium Species 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- KNZQGAUEYZJUSQ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N KNZQGAUEYZJUSQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N Ser-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JLKWJWPDXPKKHI-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Asn Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O JLKWJWPDXPKKHI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 241001243925 Sia Species 0.000 description 1
- 241001135312 Sinorhizobium Species 0.000 description 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 1
- 235000002597 Solanum melongena Nutrition 0.000 description 1
- 244000061458 Solanum melongena Species 0.000 description 1
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 1
- 235000009337 Spinacia oleracea Nutrition 0.000 description 1
- 244000300264 Spinacia oleracea Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 108010043934 Sucrose synthase Proteins 0.000 description 1
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 1
- 101710199392 TATA-box-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N Thr-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- 235000007303 Thymus vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 240000002657 Thymus vulgaris Species 0.000 description 1
- 108010083256 Transcription Factor TFIIH Proteins 0.000 description 1
- 102000006288 Transcription Factor TFIIH Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 235000019714 Triticale Nutrition 0.000 description 1
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 1
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- CXUFDWZBHKUGKK-CABZTGNLSA-N Trp-Ala-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 CXUFDWZBHKUGKK-CABZTGNLSA-N 0.000 description 1
- VUMCLPHXCBIJJB-PMVMPFDFSA-N Trp-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CNC4=CC=CC=C43)N VUMCLPHXCBIJJB-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- XGFOXYJQBRTJPO-PJODQICGSA-N Trp-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XGFOXYJQBRTJPO-PJODQICGSA-N 0.000 description 1
- GEGYPBOPIGNZIF-CWRNSKLLSA-N Trp-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)C(=O)O GEGYPBOPIGNZIF-CWRNSKLLSA-N 0.000 description 1
- LGEYOIQBBIPHQN-UWJYBYFXSA-N Tyr-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 LGEYOIQBBIPHQN-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XYNFFTNEQDWZNY-ULQDDVLXSA-N Tyr-Met-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N XYNFFTNEQDWZNY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 102000003425 Tyrosinase Human genes 0.000 description 1
- 108060008724 Tyrosinase Proteins 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N UNPD196149 Natural products OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1C(O)C(O)C(O)C(COC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700001038 Zea mays opaque-2 Proteins 0.000 description 1
- 108010023606 Zinc Finger E-box-Binding Homeobox 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100026457 Zinc finger E-box-binding homeobox 1 Human genes 0.000 description 1
- FJJCIZWZNKZHII-UHFFFAOYSA-N [4,6-bis(cyanoamino)-1,3,5-triazin-2-yl]cyanamide Chemical compound N#CNC1=NC(NC#N)=NC(NC#N)=N1 FJJCIZWZNKZHII-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N adenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 1
- 101150061753 alt gene Proteins 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 235000010208 anthocyanin Nutrition 0.000 description 1
- 239000004410 anthocyanin Substances 0.000 description 1
- 229930002877 anthocyanin Natural products 0.000 description 1
- 150000004636 anthocyanins Chemical class 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 1
- 229940097012 bacillus thuringiensis Drugs 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 101150103518 bar gene Proteins 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000440 benzylamino group Chemical group [H]N(*)C([H])([H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 235000013734 beta-carotene Nutrition 0.000 description 1
- 239000011648 beta-carotene Substances 0.000 description 1
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- 238000010256 biochemical assay Methods 0.000 description 1
- 239000003139 biocide Substances 0.000 description 1
- 239000007844 bleaching agent Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000032341 cell morphogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 229930002875 chlorophyll Natural products 0.000 description 1
- 235000019804 chlorophyll Nutrition 0.000 description 1
- ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M chlorophyll a Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M 0.000 description 1
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 1
- 210000003555 cloaca Anatomy 0.000 description 1
- 230000003021 clonogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003081 coactivator Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000019771 cognition Effects 0.000 description 1
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 230000010154 cross-pollination Effects 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000010432 diamond Substances 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- MHUWZNTUIIFHAS-CLFAGFIQSA-N dioleoyl phosphatidic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC MHUWZNTUIIFHAS-CLFAGFIQSA-N 0.000 description 1
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XGZRAKBCYZIBKP-UHFFFAOYSA-L disodium;dihydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[Na+].[Na+] XGZRAKBCYZIBKP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 230000024346 drought recovery Effects 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000009088 enzymatic function Effects 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 239000003797 essential amino acid Substances 0.000 description 1
- 235000020776 essential amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004744 fabric Substances 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical group 0.000 description 1
- 230000004720 fertilization Effects 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 108010060641 flavanone synthetase Proteins 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N glufosinate-P Chemical compound CP(O)(=O)CC[C@H](N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 102000005396 glutamine synthetase Human genes 0.000 description 1
- 108020002326 glutamine synthetase Proteins 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 101150054900 gus gene Proteins 0.000 description 1
- 235000009424 haa Nutrition 0.000 description 1
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N hydridophosphorus(.) (triplet) Chemical compound [PH] BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001165 hydrophobic group Chemical group 0.000 description 1
- 108010002685 hygromycin-B kinase Proteins 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000009399 inbreeding Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 239000000077 insect repellent Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 238000011005 laboratory method Methods 0.000 description 1
- 229960004502 levodopa Drugs 0.000 description 1
- OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N lincomycin Chemical compound CN1C[C@H](CCC)C[C@H]1C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N 0.000 description 1
- 229960005287 lincomycin Drugs 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000012976 mRNA stabilization Effects 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012269 metabolic engineering Methods 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N methylphosphonic acid Chemical class CP(O)(O)=O YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RSMUVYRMZCOLBH-UHFFFAOYSA-N metsulfuron methyl Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1S(=O)(=O)NC(=O)NC1=NC(C)=NC(OC)=N1 RSMUVYRMZCOLBH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019713 millet Nutrition 0.000 description 1
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 230000008450 motivation Effects 0.000 description 1
- 239000006870 ms-medium Substances 0.000 description 1
- 230000007886 mutagenicity Effects 0.000 description 1
- 231100000299 mutagenicity Toxicity 0.000 description 1
- PUPNJSIFIXXJCH-UHFFFAOYSA-N n-(4-hydroxyphenyl)-2-(1,1,3-trioxo-1,2-benzothiazol-2-yl)acetamide Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1NC(=O)CN1S(=O)(=O)C2=CC=CC=C2C1=O PUPNJSIFIXXJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000030648 nucleus localization Effects 0.000 description 1
- 229940099990 ogen Drugs 0.000 description 1
- 108010033653 omega-3 fatty acid desaturase Proteins 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 101150113864 pat gene Proteins 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- LWTDZKXXJRRKDG-UHFFFAOYSA-N phaseollin Natural products C1OC2=CC(O)=CC=C2C2C1C1=CC=C3OC(C)(C)C=CC3=C1O2 LWTDZKXXJRRKDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010082527 phosphinothricin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000029553 photosynthesis Effects 0.000 description 1
- 238000010672 photosynthesis Methods 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000005962 plant activator Substances 0.000 description 1
- 210000000745 plant chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000008635 plant growth Effects 0.000 description 1
- 238000004161 plant tissue culture Methods 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 210000002706 plastid Anatomy 0.000 description 1
- 101150066372 pld gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920002578 polythiourethane polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000037452 priming Effects 0.000 description 1
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 1
- 238000000751 protein extraction Methods 0.000 description 1
- 230000006916 protein interaction Effects 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 235000015136 pumpkin Nutrition 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N raffinose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N 0.000 description 1
- 230000007420 reactivation Effects 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 238000007634 remodeling Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000007320 rich medium Substances 0.000 description 1
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 description 1
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000009131 signaling function Effects 0.000 description 1
- HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N silicon carbide Chemical compound [Si+]#[C-] HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910010271 silicon carbide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 1
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 1
- 235000020354 squash Nutrition 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 239000003270 steroid hormone Substances 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 108020001568 subdomains Proteins 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- YUEDYKGJCNMJDQ-UHFFFAOYSA-N sulfonylurea;urea Chemical compound NC(N)=O.NC(=O)N=S(=O)=O YUEDYKGJCNMJDQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000005287 template synthesis Methods 0.000 description 1
- 150000003505 terpenes Chemical class 0.000 description 1
- 108010033670 threonyl-aspartyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 239000001585 thymus vulgaris Substances 0.000 description 1
- 239000003104 tissue culture media Substances 0.000 description 1
- 235000019505 tobacco product Nutrition 0.000 description 1
- 230000001256 tonic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 241001478887 unidentified soil bacteria Species 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 210000005167 vascular cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 108700026215 vpr Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010027345 wheylin-1 peptide Proteins 0.000 description 1
- 235000020985 whole grains Nutrition 0.000 description 1
- 241000228158 x Triticosecale Species 0.000 description 1
- 108010031403 zeaxanthin epoxidase Proteins 0.000 description 1
- OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N β-Carotene Chemical compound CC=1CCCC(C)(C)C=1\C=C\C(\C)=C\C=C\C(\C)=C\C=C\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
- C07K14/4705—Regulators; Modulating activity stimulating, promoting or activating activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
- C12N15/625—DNA sequences coding for fusion proteins containing a sequence coding for a signal sequence
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8217—Gene switch
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y203/00—Acyltransferases (2.3)
- C12Y203/01—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
- C12Y203/01183—Phosphinothricin acetyltransferase (2.3.1.183)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/71—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing domain for transcriptional activaation, e.g. VP16
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/80—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor
- C07K2319/81—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor containing a Zn-finger domain for DNA binding
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
- Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
- Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Botany (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Compounds Of Unknown Constitution (AREA)
- Hydroponics (AREA)
- Traffic Control Systems (AREA)
Abstract
يتعلق هذا الاختراع بتركيبات compositions وطرق methods لزيادة التعبير الجينى expression لعديد النيوكليوتيد polynucleotide ذو الأهمية. تتعلق بعض التجسيمات بعديدات ببتيد polypeptides جديدة لتنشيط التعبير الجينى وبدائل variants لها والتى تم تعريفها فى النباتات، وطرق لاستخدامها. تتعلق تجسيمات خاصة باستخدام عديد ببتيد polypeptide رابط لـ DNA واحد على الأقل فى بروتين اندماج fusion protein لاستهداف عديد ببتيد تنشيط تعبير جينى transactivation polypeptide واحد على الأقل أو بديل variant له لموقع ارتباط محدد specific binding site على حمض نووى nucleic acid يشتمل على عديد النيوكليوتيد ذو الأهمية، بحيث يمكن زيادة تعبيره الجينى expression.
Description
— \ — حوافز لتفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات واستخدامها Plant transactivation interaction motifs and uses thereof الوصف الكامل خلفية الاختراع يتمتع هذا الطلب بحق أسبقية استناداً لطلب البراءة المؤقتة الأمريكى رقم مسلسل 45 5.7 1/54 المودع فى ¥ فبراير؛ «Ye VY المعنون 800 “Plant Transactivation Interaction Motifs Uses Thereof.” © يتعلق الوصف الحالى بتكنولوجيا حيوية للنبات Wplant biotechnology تتعلق التجسيمات بعديدات ببتيد polypeptides (على سبيل «JE بروتين دمج (fusion protein تشتمل على حافز تفاعل interaction motif عامل استنساخ تركيبى synthetic transcription factor من منشط تعبير جينى للنبات transactivator 01801. تتعلق بعض التجسيمات باستخدام هذا البروتين protein للتعبير الجينى للحمض النووى ذو الأهمية أو لزيادة التعبير الجينى للحمض ٠ النووى acid 0001816 ذو الأهمية. تتعلق بعض التجسيمات بعديدات afin تقوم بترميز 9 بروتين تشتمل على حافز تفاعل عامل استنساخ تركيبى synthetic transcription 800] من منشط تعبير جينى نباتى. تتعلق أمثلة اخاصة (LA أنسجة tissues و/أو كائنات حية Organisms مضيفة تشتمل على عديد ببتيد polypeptide أو عديد نيوكليوتيد polynucleotide للاختراع. ١ يستخدم على نطاق واسع إدخال جينات مستنسخة ومعزولة فى WIA النبات plant cells (التحول transformation ual) 0606116))؛ والتجديد التالى للنباتات المعدلة جينياً transgenic plants لإجراء تعديلات وراثية genetic modifications للنباتات ومواد النبات plant 5 . التحول الجينى للنباتات لإدخال سمة مرغوب فيها (على سبيل المثال؛ تحسين نوعية الغذاء nutritional quality « زيادة الإنتاج؛ مقاومة الآفات pest resistance أو الأمراض؛ Yo تحمل الضغط stress tolerance ؛ ومقاومة مبيدات الأعشاب (herbicide resistance £Y14
ا تستخدم عادة الآن لإنتاج نباتات معدلة وراثياً جديدة ومحسنة للتعبير الجينى لسمة مرغوب فيها. يتم إدخال DNA عادة عشوائياً فى DNA النووى أو الصانع لخلية نبات حقيقية النواة eukaryotic plant cell ؛ وخلايا تحتوى على DNA مدمجة فى LAN DNA ثم عزلها واستخدامها لإنتاج LDA نباتية ثابتة التحول. وفى كثير من الأحيان؛ يكون من المرغوب فيه © الهندسة الوراثية genetically engineer لمجموعة مختلفة من نبات واحد للتعبير الجينى لأكثر من سمة مدخلة واحدة عن طريق إدخال تتابعات ترميز coding sequences متعددة؛ والتى قد تشتمل على عناصر تنظيمية متماثلة (أو متطابقة). يتم التحكم فى التعبير الجينى للجينات المحورة transgenes (بالإضافة إلى الجينات الذاتية (endogenous genes من خلال أليات mechanisms تتضمن تفاعلات ٠ 17161800005 بروتين multiple protein-DNA DNA- وبروتين — بروتين protein—protein عديدة. من خلال هذه التفاعلات؛ تستطيع العناصر التنظيمية regulatory elements للحمض النووى (Ao) سبيل (Jal محفزات promoters ومعززات (enhancers نقل أنماط للتعبير الجينى expression لتتابع ترميز coding sequence والتى تكون UW تأسيسية أو محددة. على سبيل المثال؛ قد يؤدى المحفز promoter إلى زيادة استنساخ تتابع الترميز فى أنسجة VO معينة؛ أثناء فترات تطور محددة؛ أو استجابة للمحفزات البيئية. وللأسف؛ فإن الصفات الأصيلة للمحفزات التقليدية للتعبير الجينى للترانسجين aad transgene expression من نطاق السيطرة على التعبير الجينى والتى قد تستخدم للبذل فى الخلية المضيفة host cell أحد القيود العملية للمحفزات التقليدية هى أنه من الصعب ضبط مستوى التعبير الجينى بدقة للجين المدخل بسبب القيود فى قوة المحفز ولإخماد التعبير الجينى للترانسجين عن طريق محفزات قوية بالأخص أو ٠ الاستخدام المتزامن فى نفس الخلية لنسخ عديدة من نفس المحفز. من المرغوب فيه أيضاً بدء أو زيادة التعبير الجينى للجينات الذاتية أو الأصلية. منشطات التعبير الجينى a Transactivators بروتينات proteins والتى تعمل عن طريق توظيف خلال تفاعلات بروتين- بروتين عدد من بروتينات مختلفة متضمنة فى استنساخ Ae) DNA transcription سبيل JB مركبات إعادة بناء النيوكليوسوم nucleosome— remodeling complexes Yo ؛ المركب الوسيط mediator complex ؛ وعوامل استنساخ £Y14
وه عامة؛ مثل (TFIIH «TBP (TFIIB لبدء أو تعزيز معدل الاستنساخ عن طريق التأثير على تجميع/تفكيك assembly [disassembly النيوكليوسوم nucleosome تكوين مركب ما قبل (dal تخليص المحفز «promoter clearance و/أو معدل الاستطالة elongation تتضمن تفاعلات البروتين- بروتين لمنشطات التعبير الجينى وشركاء الارتباط الخاصة بها عناصر تركيبية ٠ه داخلية منفصلة Jala discrete internal structural elements منشطات التعبير الجينى المعروفة ب "نطاقات تنشيط التعبير الجينى transactivation domains (نطاقات تنشيط التعبير الجينى).” نطاقات تنشيط التعبير الجينى يعتقد أنها تشارك فى تناظر التتابع الأولى القليل واعتماد التركيب المحدد فقط عند الارتباط بالهدف. 333:210-2 Sigler (1988) Nature ويعتقد أن الرواسب residues الحمضية acidic والكارهة للماء hydrophobic داخل نطاقات تنشيط ٠ التعبير الجينى المهمة (انظرء على سبيل المثال» (1991) Cress and Triezenberg (Science 251)4989(:87-0 ويعتقد أن مساهمة الرواسب الفردية فى التنشيط تكون صغيرة. 277:46043-50 .Hall and Struhl (2002) J.
Biol.
Chem. بروتين فيريون الهربس البسيط (VP16) ٠١ Herpes Simplex virion protein هو منشط تعبير جينى transactivator والذى يعمل على تحفيز استنساخ الجينات المبكرة الفورية Vo الفيروسية فى الخلايا المصابة cells 10160160 ب HSV وكما مع منشطات التعبير الجينى؛ ينشط بروتين فيريون الهربس البسيط الاستنساخ خلال سلسلة من تفاعلات بروتين- بروتين التى يتضمن نطاق تنشيط التعبير الجينى الخاص بهاء والتى تكون عالية الحموضة. وقد تبين أن نطاق تنشيط التعبير الجينى الحمضى الخاص ببروتين فيريون الهربس البسيط يتفاعل مع بروتينات شريكة مختلفة سواء فى المعمل أو فى خلايا الكائنات الحية. على سبيل (JUN يحتوى نطاق ٠ تنشيط التعبير الجينى لبروتين فيريون الهربس البسيط على حافز تفاعل والذى يتفاعل مباشرة مع الوحدة الفرعية 1761 ل Langlois et al. (2008) J.
Am.
Chem.
Soc. ( TFIIH 130:10596-604(¢ ويرتبط هذا التفاعل بقدرة بروتين فيريون الهربس البسيط لتنشيط كل من مرحلة بدء واستطالة الاستتساخ للجينات المبكرة الفورية الفيروسية viral immediate early .genes Yo £Y14
الوصف العام للاختراع
موصوف هنا حوافز تفاعل بروتين - بروتين protein—protein interaction motifs نطاق تنشيط التعبير الجينى الجديدة التى تم عزلها عن البروتينات التى تقوم بتنشيط التعبير الجينى للنباتات» والأحماض النووية nucleic acids المرمزة لها. قد يتم استخدام حوافز التفاعل الجديدة © هذه فى TAD تركيبى لمنح خواض تنظيمية جينية gene regulatory properties على عديد ببتيد polypeptide يشتمل على نطاق تنشيط التعبير الجينى. على سبيل المثال؛ تتضمن بعض التجسيمات بروتين دمج منشط نسخى transcriptional activator الذى يشتمل على we ببتيد لنطاق رابط ل DNA وعديد ببتيد لنطاق تنشيط التعبير الجينى هذا. اعتماداً على النطاق الرابط ل DNA الخاص الذى يتم دمجه مع نطاق تنشيط التعبير الجينى فى بروتين الدمج المنشط النسخى؛ Ve قد يتم استخدام تنشيط التعبير الجينى لزيادة التعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام. على سبيل المثال؛ قد يتم ارتباط عديد نيوكليوتيد مغاير heterologous polynucleotide الذى يرتبط به النطاق الرابط ل DNA على نحو قابل للتشغيل بالجين pum se الاهتمام؛ وبالتالى استهداف بروتين الاندماج (ونطاق تنشيط التعبير الجينى الوظيفية الخاصة به)؛ سوف يزيد ارتباطه من التعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام. على نحو بديل؛ قد يتم هندسة النطاق الرابط ل DNA لربط عديد Vo النيوكليوتيد داخلى المنشاً الذى يرتبط على نحو قابل للتشغيل ب؛ أو قريب من؛ الجين موضوع الاهتمام. عند ارتباط بروتين الدمج المنشط النسخى transcriptional activator fusion 007 بموقع ارتباط DNA مستهدف؛ قد يتم تحفيز نسخ جين مرتبط على نحو قابل للتشغيل
بموقع ارتباط DNA المستهدف. كما يوصف هنا حوافز تفاعل بروتين- بروتين لنطاق تنشيط التعبير الجينى بديلة تركيبية؛ ٠ والأحماض النووية المرمزة لها. فى بعض الأمثلة؛ يتم هندسة حافز تفاعل بروتين- بروتين لنطاق تنشيط التعبير الجينى بديل تركيبى عن طريق إدخال طفرة واحدة أو أكثر (على سبيل المثال» طفرة محافظة «conservative mutation, أو طفرة محددة فى Bla لحافز التفاعل interaction (Motif) فى نطاق تنشيط التعبير الجينى للمنشط الجينى (على سبيل (JB منشط جينى نباتى transactivator 01801). بشكل مفاجئ؛ قد يمنح بديل تركيبى نطاق تنشيط التعبير الجينى مولد Yo بهذه الطريقة الذى يشتمل على حافز تفاعل بديل خواص تنظيمية جينية تختلف عن نطاق تنشيط
£Y14
-+- التعبير الجينى غير المعدل عند ازدواجه مع النطاق الرابط ل DNA فى بروتين دمج منشط نسخى. على سبيل المثال؛ قد يعزز البديل التركيبى الخاص نطاقات تنشيط التعبير الجينى الذى يشتمل على حافز تفاعل بديل مستوى التنشيط النسخى الذى يمنحه حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى الموجود فى الطبيعة عند التعبير الجينى له فى نفس الموضع فى بروتين دمج والذى يشتمل
© على نطاق رابط ل DNA
تتضمن بعض التجسيمات بروتين دمج منشط نسخى تركيبى. فى تجسيمات خاصة. قد يزيد بروتين الدمج من نسخ الجين موضوع الاهتمام» حيث يشتمل بروتين الدمج على عديد ببتيد أول يشتمل على نطاق رابط ل DNA مرتبط على نحو قابل للتشغيل بعديد ببتيد ثانى والذى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى. فى بعض الأمثلة؛ قد يتم اختيار حافز تفاعل
٠ نطاق تنشيط التعبير الجينى من مجموعة حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى التى تتكون من المتواليات أرقام: VT) على سبيل JB وبدون حصر؛ قد يوجد حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى داخل نطاق تنشيط التعبير الجينى الذى يشتمل على تتابع حمض أمينى amino sequence 8010 مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 7-+ والمتواليات أرقام: BY T=) os بعض الأمثلة؛ قد يكون حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى هو حافز
19 تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل يحتوى على؛ على سبيل المثال وبدون حصرء تتابع حمض أمينى مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 0A Y على سبيل JE وبدون حصرء قد يوجد حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل داخل نطاق تنشيط التعبير الجينى يشتمل على تتابع حمض أمينى مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: بذ الس د
١ تتضمن بعض التجسيمات عديد نيوكليوتيد والذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى يشتمل على عديد ببتيد أول يشتمل على نطاق رابط ل DNA مرتبط على نحو قابل للتشغيل بعديد ببتيد ثانى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى. قد يكون عديد الببتيد للنطاق الرابط ل DNA أى نطاق رابط ل DNA الذى يرتبط على وجه التحديد بموقع ارتباط DNA مستهدف خاص. على سبيل المثال وبدون حصرء قد يكون عديد الببتيد للنطاق الرابط ل DNA عديد ببتيد
YO مختار من المجموعة التى تتكون من نطاق رابط ل DNA إصبع خارصين zinc finger ؛ نطاق
—y—
رابط ل <LexA TAL ¢GAL4 «UPA DNA كاظم Lack ¢Tet repressor ومستقبل هرمون ستيرويد .steroid hormone receptor فى أمثلة خاصة؛ قد يتم اختيار التتابع المرمز للنطاق الرابط ل DNA من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: 17؛ المتوالية رقم: CIA والمتوالية رقم: 3.99 أمثلة خاصة؛ قد يشتمل عديد النيوكليوتيد على تتابع مرمز للبروتين الرابط ل DNA الذى يكون مطابقاً بنسبة 96860 AA 9695 9646 (AS أو 96٠00 على الأقل للتتابع المختار من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: CTY المتوالية رقم: TA و المتوالية
رقم: ادا فى بعض الأمثلة؛ قد يشتمل عديد النيوكليوتيد على تتابع مرمز لحافز تفاعل Glas تنشيط التعبير الجينى الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى أو حافز تفاعل نطاق تنشيط ٠ التعبير الجينى بديل؛ على سبيل (JE يحتوى على تتابع مختار من المتواليات أرقام: OA) تتضمن التجسيمات الخاصة عديد نيوكليوتيد الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى واحد على الأقل. تتضمن تجسيمات خاصة عديد نيوكليوتيد الذى Jan بروتين دمج منشط نسخى يشتمل على Glas رابط ل DNA واحد على الأقل. تتضمن الأمثلة على عديدات النيوكليوتيد التى ترمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى وفقاً Vo لبعض تجسيمات الاختراع عديدات النيوكليوتيد التى تشتمل على تتابع نيوكليوتيد واحد على الأقل لترميز نطاق رابط ل DNA وتتابع نيوكليوتيد واحد على الأقل لترميز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى (أو بديل لهما)؛ حيث يشتمل عديد النيوكليوتيد. على سبيل المثال وبدون حصر؛ تتابع نيوكليوتيد واحد على الأقل مختار من المجموعة التى تتكون من: المتواليات أرقام: 3-74؟1؛ تتابع نيوكليوتيد A يكون Gildas إلى حد كبير لواحد من المتواليات أرقام: 749-؟9؛ تتابع Yo نيوكليوتيد له تطابق تتابع 9686 على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 97-749؛ تتابع نيوكليوتيد له تطابق تتابع 9685 على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 97-1749؛ تتابع نيوكليوتيد له تطابق تتابع 9698 على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 97-749؛ تتابع نيوكليوتيد له تطابق تتابع 09 على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 93-174؛ تتابع نيوكليوتيد له تطابق تتابع 9697 على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 97-179؛ تتابع نيوكليوتيد له تطابق تتابع 9694 على الأقل andy Yo من المتواليات أرقام: 97-4؛ تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence له تطابق تتابع
—A— على الأقل لواحد من المتواليات أرقام: 97-1749؛ مكمل عديد النيوكليوتيد الذى يكون قابل 4 للتهجين على وجه التحديد لواحد على الأقل من المتواليات أرقام: 97-1749؛ والمكمل العكسى لعديد نيوكليوتيد الذى يكون قابل للتهجين على وجه التحديد لواحد على reverse complement
ATV الأقل من المتواليات أرقام: ° فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إدراج عديد نيوكليوتيد الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى فى ناقل معاد الاتحاد recombinant vector ؛ على سبيل (JU لتوفير التعبير الجينى للبروتين فى خلية مضيفة. وفقاً lA تتضمن بعض الأمثلة ناقل يشتمل على عديد نيوكليوتيد واحد على الأقل للاختراع؛ و/أو خلية مضيفة التى تم إدخال هذا الناقل فيها. موصوف هنا أيضاً وسائل لزيادة معدل التعبير الجينى transactivation للتعبير الجينى Ve النباتى 0 gene expression. 01801. كما هو مستخدم (la تتضمن 'وسائل لزيادة معدل التعبير الجينى للتعبير الجينى النباتى" عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: ١٠؛ المتوالية رقم: ١9؛ المتوالية رقم: ؛ 3 المتوالية رقم: 0 eV المتوالية رقم: ؟ ؟؛ المتوالية رقم: 8؟؛ المتوالية رقم: 7 ؛ والمتوالية رقم: .0Y فى بعض التجسيمات؛ قد يتم استخدام بروتين تركيبى synthetic protein يشتمل على واحدة على الأقل من وسائل زيادة معدل التعبير الجينى لللتعبير الجينى النباتى لتعديل التعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام فى خلية نباتية plant cell بالإضافة J) ذلك؛ موصوف هنا وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من 2 . كما هو مستخدم (lia تتضمن ” وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من "ERF2 عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 77-١١7 و المتوالية رقم؛: VY بالإضافة إلى ذلك موصوف وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من PTI4 Yo كما هو مستخدم lia تتضمن 'وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من "PTI4 عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 8-77؟ والمتوالية رقم: NYY بالإضافة إلى ذلك موصوف وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من 471اع88. كما هو مستخدم cla تتضمن 'وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من 811471" عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 4-749 ؟ والمتوالية رقم: YY بالإضافة Yo إلى ذلك موصوف وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من LORCA2 كما هو مستخدم £Y14
q —_ _ clin تتضمن 'وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من "ORCA2 عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: £070 والمتوالية رقم: YE بالإضافة إلى ذلك موصوف وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من /088581. كما هو مستخدم هناء تتضمن ”" وسائل لزيادة التعبير الجينى all يتم اشتقاقها من 'DREBIA عديد ببتيد مختار من © المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 41-4١ والمتوالية رقم: Yo بالإضافة إلى ذلك موصوف هنا وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من 08571. كما هو مستخدم هناء تتضمن 'وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من "CBF عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 497 oY والمتوالية رقم: YT بالإضافة إلى ذلك موصوف هنا وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من DOF كما هو مستخدم هناء ٠ تتضمن " وسائل لزيادة التعبير الجينى التى يتم اشتقاقها من 0051" عديد ببتيد مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 28-57 والمتوالية رقم: NYY
موصوف هنا أيضاً طرق لزيادة التعبير الجينى باستخدام بروتين دمج منشط نسخى تركيبى. فى GRY) قد يتم إدخال Jib تعبير جينى expression vector يشتمل على عديد نيوكليوتيد لترميز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى فى خلية مضيفة (على سبيل المثال؛ خلية Vo نباتية؛ خلية خميرة yeast cell ؛ خلية تديية mammalian cell « وخلية مخلدة (immortalized cell تشتمل على الجين موضوع الاهتمام المرتبط على نحو قابل للتشغيل بموقع ارتباط DNA مستهدف لبروتين الدمج. قد يؤدى التعبير الجينى لبروتين الدمج فى الخلية المضيفة؛ والارتباط اللاحق لبروتين الدمج بموقع ارتباط DNA المستهدف المرتبط على نحو قابل للتشغيل؛ إلى بدء النسخ أو زيادة النسخ للجين موضوع الاهتمام. فى Ald خاصة؛ قد يتم إدخال موقع ٠ ارتباط DNA المستهدف فى الخلية المضيفة؛ بحيث يتم ارتباط موقع ارتباط DNA المستهدف على نحو قابل للتشغيل بالجين موضوع الاهتمام. فى أمثلة أخرى, قد يشتمل بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى على عديد ببتيد لنطاق رابط ل DNA الذى يتم هندسته للارتباط بموقع ارتباط
DNA مستهدف الذى يكون مرتبط على نحو قابل للتشغيل بالجين موضوع الاهتمام. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إدخال ناقل يشتمل على عديد نيوكليوتيد لترميز بروتين YO دمج منشط نسخى تركيبى فى خلية مضيفة؛ بحيث يتم بعد ذلك تكامل عديد النيوكليوتيد فى DNA
=« \ — الجينومى genomic DNA للخلية المضيفة (على سبيل المثال؛ عبر sale) الاتحاد المتجانسة (homologous recombination وبالتالى» قد يكون بروتين دمج منشط نسخى تركيبى؛ وعلاوة على ذلك حمض نووى مرمز له؛ موجود داخل كائن حى معدل ih (على سبيل المثال؛ نبات معدل ly 5. (transgenic plant ays عليه؛ يتم أيضاً وصف هذه الكائنات الحية المعدلة o ورائياً transgenic organisms هنا. فى الأمثلة قد يكون حمض نووى مرمز لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى إما متكامل بشكل عشوائى»؛ أو فى مكان محدد مسبقاًء فى جينوم genome الخلية فى الكائن الحى المعدل وراثياً transgenic organism موصوف Loaf طرق للتعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام باستخدام بروتين دمج منشط نسخى تركيبى و/أو حمض نووى مرمز له. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إدخال ناقل يشتمل على ٠ عديد نيوكليوتيد مرمز لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى فى خلية مضيفة تشتمل على الجين موضوع الاهتمام المرتبط على نحو قابل للتشغيل بموقع ارتباط DNA مستهدف لبروتين الدمج. فى بعض ABN يشتمل بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى على وسائل لتنشيط التعبير الجينى للتعبير الجينى لنبات. بعد إدخال الناقل فى الخلية المضيفة؛ قد يبدأ أو يتزايد التعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام؛ وبالتالى إنتاج منتج التعبير الجينى للجين موضوع الاهتمام فى ١ الخلية المضيفة؛ على سبيل المثال؛ بكمية وفقاً للتحكم التنظيمى فى بروتين الدمج. قد يتم عزل منتجات التعبير الجينى هذه و/أو تنقيتها من الخلية المضيفة وفقاً لأى طريقة معروفة فى المجال. سوف تصبح المزايا السابقة وغيرها من المزايا أكثر وضوحاً من الوصف التفصيلى التالى للتجسيمات المتعددة؛ التى تسير بالإشارة إلى الأشكال المرفقة. Yo شر ح مختصر للرسومات شكل ١ يتضمن حافز تفاعل محدد لنطاق تنشيط التعبير الجينى لبروتين فيريون الهربس البسيط (نطاق تنشيط التعبير الجينى)؛ النطاق الفرعى IT (المتوالية رقم: 4). تشير العلامات النجمية إلى الأحماض الأمينية amino acids لنطاق تنشيط التعبير الجينى لبروتين فيريون الهربس البسيط؛ £Y14
— \ \ — النطاق الفرعى ell المقترح أن تتصل مباشرةً بالوحدة الفرعية 7001 ل 11114 على النحو المقترح بواسطة 130:10596-604 et al. (2008) J.
Am.
Chem.
Soc. كأواو0ها. شكل ¥ يتضمن محاذاة للنطاق الفرعى اا لتنشيط التعبير الجينى لبروتين فيريون الهربس البسيط مع النبات المحدد لنطاقات تنشيط التعبير الجينى. تحتوى نطاقات تنشيط التعبير الجينى © للنبات المذكور على حافز تفاعل. يتم إبراز حوافز التفاعل interaction motifs المنحازة. يتم وضع علامة نجمية (*) على رواسب حافز التفاعل للنطاق الفرعى اا من بروتين فيريون الهربس البسيط التى تم اقتراح أن تتصل بعوامل النسخ transcription factors شكل © يتضمن محاذاة تبين التعديلات التى قد يتم إدخالها إلى حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ل ERF2 لإنتاج حافز تفاعل ERF2 بديل. يتم إدراج تتابعات ERF2 الأصلى ٠ وحوافز تفاعل بروتين فيريون الهربس البسيط للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة. شكل ؛ يتضمن محاذاة تبين التعديلات التى قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ل 5114 لإنتاج حافز تفاعل 0114 بديل. يتم إدراج تتابعات 5114 الأصلى وحوافز تفاعل 7016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة. شكل © يتضمن محاذاة تبين التعديلات التى قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط Vo التعبير الجينى ل 81581 لإنتاج حافز تفاعل 81581 بديل. يتم إدراج تتابعات 1581م الأصلى وحوافز Jeli 7016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة. شكل + يتضمن محاذاة تبين التعديلات التى قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ل ORCA2 لإنتاج حافز تفاعل 060/82 بديل. يتم إدراج تتابعات 08082 الأصلى وحوافز Jeli 7016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة.
٠ شكل ١7 يتضمن محاذاة تبين التعديلات التى قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ل | DREBIA لإنتاج حافز تفاعل DREBIA بديل. يتم إدراج تتابعات DREBIA الأصلى وحوافز تفاعل 7016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة.
ARE
— \ \ — شكل A يتضمن محاذاة تبين التعديلات Al قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ل CBF1 لإنتاج حافز تفاعل CBF1 بديل. يتم إدراج تتابعات 0811 الأصلى وحوافز تفاعل 7/016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة. شكل 9 يتضمن محاذاة تبين التعديلات Al قد يتم إدخالها فى حافز تفاعل نطاق تنشيط © التعبير الجينى ل 0051 لإنتاج حافز تفاعل 0051 بديل. يتم إدراج تتابعات DOF الأصلى وحوافز تفاعل 7/016 للمقارنة. يتم إبراز الاتصالات المباشرة. شكل ٠١ يتضمن خريطة لناقل دمج للخميرة yeast integration vector « -10ام 1/-286؛ الذى يحتوى على مواقع ارتباط 4اع2 ل HAS (موقع عالى الانجذاب High (Affinity Site عكس اتجاه جين مراسل reporter gene 1ا11/ا. تم استهداف الناقل لموقع ¢S. cerevisiae ١10 واحتوى على الجين المقاوم ل KanMX للاختيار فى كل من الخميرة yeast والبكتيريا bacteria شكل ١١ يتضمن توضيح بيانى لمستويات التعبير الجينى للجين المراسل ل Mell الذى أنتج خميرة من التنشيط بواسطة حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات plant transactivation المختلفة. Yo شكل VY يتضمن خريطة بلازميد plasmid 0/89897م: معزز أكتين-١ 8010-2 Arabidopsis thaliana promoter containing يحتوى على A أزواج أساسية لمواقع ارتباط )£6( إصبع زنك ترادفية ١49-547 عكس اتجاه موقع البداية النسخى transcriptional start 6 الذى يدفع جين مراسل gus المستخدم لاختبار بروتينات الدمج الإصبعية للزنك 2006 finger fusion proteins لحوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات. يحتوى الناقل الثنائى binary vector ٠ أيضاً على معزز يوبيكويتين-١٠ A. thaliana ubiquitin—10 promoter الذى يدفع مؤشر قابل للاختيار pat لإنتاج حالة نبات مراسل reporter plant مستهدف. شكل ١١ يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107881 شكل VE يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107882 £Y14
١س شكل Yo يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107883 شكل ١١ يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107884 شكل VV يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107885 شكل YA يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107886 ° شكل ٠١9 يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB107887 شكل ٠١ يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106272 شكل VY يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106238 شكل YY يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106273 شكل YY يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106274 .PDAB106275 يتضمن خريطة لبلازميد YE شكل ٠١ شكل YO يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106276 شكل 776 يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106277 شكل YY يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106278 شكل YA يتضمن خريطة لبلازميد .PDAB106279 vo شكل YA يتضمن تمثيل بيانى للانحراف المتوسط والمعيارى (الماس) والشرائح الربعية (الخطوط والمربعات) لمستوى نسخ GUS الذى تم تطبيعه بواسطة مستوى التعبير الجينى داخلى endogenous gene expression المنشاً للمعالجات المختلفة لحافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات. تم مقارنة تنشيط الجين المرإسل QUS من حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات المختلفة بمكافحة ناقل فارغ empty vector وتنشيط الوحدة الفرعية للنطاق 11 لبروتين
VP16 ٠
— \ ¢ —
شكل ٠١0 يتضمن خريطة لبلازميد :pGalGUS يتم استخدام ستة مواقع ارتباط 814 ترادفية مدمجة مع معزز أكتين AL thaliana Y= الذى يدفع جين مراسل gus لاختبار حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات plant transactivation interaction motifs المدمجة مع البروتين الرابط binding protein ل .Galg يحتوى الناقل الثنائى أيضاً على معزز يوبيكويتين -
A. thaliana ٠١ © الذى يدفع مؤشر LE للاختيار pat لإنتاج Als النبات المراسل المستهدفة. شكل ١ يتضمن خريطة لبلازميد 5لا01/1-6: يتم استخدام ثمانية مواقع ارتباط UPA-Box consensus binding sitesi as; ترادفية مدمجة مع معزز أكتين-7 A. 38 الذى يدفع جين مراسل 915 لاختبار حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات المدمجة مع البروتين الرابط ل TAL يحتوى الناقل الثنائى أيضاً على Hime يوبيكويتين ٠١- .م ٠ 81808 الذى يدفع مؤشر قابل للاختيار pat لإنتاج Als النبات المراسل المستهدفة. الوصف ١ لتفصيلي: يتم توضيح تتابعات الحمض النووى nucleic acid sequences المدرجة فى قائمة التتابع المرفقة باستخدام اختصارات حروف معيارية لقواعد النيوكليوتيد nucleotide bases ؛ كما هو ١ محدد فى 1.822 5 C.F.R. 37. يتم إظهار شريط واحد فقط لكل تتابع حمض نووى nucleic cacid sequence ولكن من المفهوم أن الشريط المكمل complementary strand يجب تضمينه بأى إشارة إلى الشريط المعروض strand 60/ا015018. فى قائمة التتابع المرفقة: المتوالية رقم: ١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات VP16 يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVDDFEFEQMFTDALGIDDFGG Yo المتوالية رقم: ١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ERF2 يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): NDSEDMLVYGLLKDAFHFDTSSSDLSCLFDFPA المتوالية رقم: ؟ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات PTI4 يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): £Y14
اج \ — CLTETWGDLPLKVDDSEDMVIYGLLKDALSVGWSPFSFTAG المتوالية رقم: ؛ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات AIERFL يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): CFTESWGDLPLKENDSEDMLVYGILNDAFHGG المتوالية رقم: © يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 0140/2 يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): FNENCEEIISPNYASEDLSDIILTDIFKDQDNYEDE المتوالية رقم: 7 يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات DREBIA يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): GFDMEETLVEAIYTAEQSENAFYMHDEAMFEMPSLLANMAEGM Yo المتوالية رقم: ١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 0871 يحتوى على حافز تفاعل (تحته خط): 6 EQSEGAFYMDEETMFGMPTLLDNMAEG المتوالية رقم: A يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات DOF1 plant transactivation يحتوى على حائز ققفاعل motif 7 (تحته خطا): SAGKAVLDDEDSFVWPAASFDMGACWAGAGFAD Yo المتوالية رقم: 8 يبين نطاق فرعى I لنطاق تنشيط تعبير جينى VP16 الذى يمثل حافز Je lal) Jala المتوالية رقم: DDFEFEQMFTD ١ المتوالية رقم: ٠١ يبين Bla تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 2ع : DAFHFDTSSSD المتوالية رقم: ١١ يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات tPTI4 DDSEDMVIYGLLKD ٠ المتوالية رقم: VY يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 4.1 اغ2م: ENDSEDMLV
_ أ \ _ المتوالية رقم: VY يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 0840/82: EDLSDIILTD المتوالية رقم: VE يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات :DREBIA ENAFYMHDEAMFEMP © المتوالية رقم: V0 يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 08571: DEETMFGMP المتوالية رقم: ١6 يبين حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات :DOF1 EDSFVWPAASFD المتواليات أرقام: 77-١١7 تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ERF2 ٠ البديل. المتواليات أرقام: 78-77 تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات PTI4 البديل. المتواليات أرقام: 5-749 تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 1 AERF البديل. Vo المتواليات Yo lif -£0 تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ORCA2 البديل. المتواليات أرقام: )£18 تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات DREBIA البديل. المتواليات أرقام: 0Y—£Y تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات CBF1 YS البديل. المتواليات أرقام: 0A=0F تبين تتابعات حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات plant transactivation DOF] البديل. ARE
المتواليات أرقام: 11-09 تبين البادئات primers المستخدمة لتركيب البلازميد plasmid ؛ .pHO-zBG-MEL1 المتوالية رقم: TY يبين تتابع عديد نيوكليوتيد لنطاق ارتباط :Z6 DNA TGTGGTGGGAGAGGAGGGTGG 0 المتوالية رقم: TA يبين تتابع مكرر A مرات ترادفياً لنطاق ارتباط :Z6 DNA ggtgtggtgggagaggagggtgggagtgtggtgggagaggagggtggetetgtggtgggagaggag ggtggagatgtggtgggagaggagggtggtctigtggtgggagaggagggtggggatgtggtgggag aggagggtggccttgtggtgggagaggagggtggaggtgtggtgggagaggagggtggcettaagecy 6 ٠ المتواليات أرقام: 75-4 تبين البادئات والمسابر probes المستخدمة فى مقايسات pal spat HP المتواليات أرقام: tYA=Vo تبين البادئات المستخدمة لتحليل PCR ل PTUs بمنتجات التبغ tobacco المتوالية رقم: 79 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى Vo لنبات أصلى plant 0817/8 من VP16 الذى تم دمجه مع البروتين الرابط ل :Z6 Zinc Finger ggcatgacccatgatcctgtgtcttatggagccttggatgttgatgactttgagtttgagcagatgttcacaga tgcactgggcatcgatgactttggtgga المتوالية رقم: Av يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (v3) synthetic nucleotide sequence ٠ بروتين رابط ل :Z6 Zinc Finger aatgactctgaggacatgctggtgtatggtttgctcaaggatgcctttcactttgacacctccagctcagacce tctcctgcectctttgacttcccagec
م \ _ المتوالية AV iad) يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V3) مرمز لحافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى لنبات أصلى من 0114 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل :Z6 Zinc Finger tgcctgacagaaacttggggagacttgcctctcaaggttgatgactctgaggacatggtgatctatggtetg ttgaaggatgcactctcagtggggtggtccccattctctttcacggcetggt © المتوالية رقم:87/ يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V3) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير
الجينى لنبات أصلى من AtERFT الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 26: tgcttcacggaatcctggggagaccticctttgaaggagaatgactctgaggacatgttggtgtacggaat cctcaatgatgcttttcatggtggce المتوالية رقم: 87 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V3) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير
:26 Zinc Finger الجينى لنبات أصلى من 040/82 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل ٠ ttcaatgagaattgtgaagaaatcatctctccaaactacgcatcagaggacttgtctgacatcatcttgacg gacatcttcaaggaccaagacaactatgaggatgag مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير (V3) المتوالية رقم:84 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى الذى تم DREBIA من 1810/6 plant transactivation domain الجينى لنبات أصلى
:Z6 Zinc Finger ل Ly) دمجه مع بروتين VO ggctttgacatggaagaaacattggtggaggccatctacactgctgaacagagcgagaatgccttctac atgcatgatgaggcaatgtttgagatgccatctcttctggccaacatggctgagggaatg مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير (V3) المتوالية رقم:85 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى :26 Zinc Finger الجينى لنبات أصلى من 0871 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل gaacagtcagaaggtgctttctacatggatgaagagaccatgtttgggatgccaaccctictggataacat ٠ ggcagaggga
q —_ \ _ المتوالية رقم:87 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V3) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات أصلى من 0051 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 26: tcagctgggaaggcagtcttggatgatgaggacagctttgtttggcctgetgecatectttgacatgggtgect gctgggcetggagcetggctttgectgac © المتوالية رقم:7/ يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل تمثيلى من ERF2 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 126 aatgactctgaggacatgctggtgtatggtttgctcaaggatgatttccactttgagacaatgttctcagacct gtcctgcectctttgacttcccagec المتوالية AAza8) يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) synthetic nucleotide sequence مرمز Jalal ٠ تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل تمثيلى من 72114 cA ثم دمجه مع بروتين رابط ل :Z6 Zinc Finger tgcctgacagaaacttggggagacttgcctctcaaggttgatgactttgagtttgagatgatgttcacagat gcactctcagtggggtggtccccattctctttcacggcetggt المتوالية رقم: A يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) مرمز لحافز تفاعل interaction motif V0 نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل تمثيلى من 8858451 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل :Z6 Zinc Finger tgcttcacggaatcctggggagaccticctttgaaggagaatgactttgagtttgaaatgttcacagattacg gaatcctcaatgatgcttttcatggtggce المتوالية رقم: 960 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير ٠ - الجينى لنبات بديل تمثيلى من 040/82 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 26: ttcaatgagaattgtgaagaaatcatctctccaaactacgcatcagaggactttgatcttgagatgttgacg gacatcttcaaggaccaagacaactatgaggatgag
=« \ _ المتوالية رقم: 9١ يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل تمثيلى من DREBIA الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 26: ggctttgacatggaagaaacattggtggaggccatctacactgctgaacagagcgaggactttgagtttg aagcaatgttcatggattctctictggccaacatggctgagggaatg 0 المتوالية رقم: 97 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (V2) مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير
الجينى لنبات بديل تمثيلى من 0811 الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل Zinc Finger 26: gaacagtcagaaggtgctttctacatggatgactttgagttcgagacaatgttcatggacacccttctggat aacatggcagaggga المتوالية رقم: 97 يبين تتابع نيوكليوتيد تركيبى (v2) synthetic nucleotide sequence مرمز
Saad ٠ تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل تمثيلى من DOFT الذى تم دمجه مع بروتين رابط ل :Z6 Zinc Finger tcagctgggaaggcagtcttggatgatgaggactttgagtttgaagccatgttcacggacatgggtgectg ctgggctggagctggctttgctgac
المتواليات أرقام: 98-494 تبين البادئات والمسابر المستخدمة فى مقايسات 90/5 و
.BYEEF HP ٠ consensus binding المتوالية رقم: 99 يبين تتابع تكرار ترادفى مأخوذ من تتابع ارتباط التوافق بواسطة 1/4833 ويسمى نطاق 1700101016 genes للجينات القابلةٌ للتحريض sequence :UPA DNA ارتباط TATATAAACCTNNCCCTCT
exemplary synthetic يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى ٠٠١ المتوالية رقم: Ye تنشيط التعبير الجينى للنبات Glas يشتمل على حافز تفاعل transactivation domain (تحته خط): ERF2
— \ \ — GMTHDPVSYGALDVDAFHFDTSSSDALGIDDFGG المتوالية رقم ٠١: يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات PTI4 (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVDDSEDMVIYGLLKDALGIDDFGG المتوالية رقم ٠١: يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 811451 (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVENDSEDMLVALGIDDFGG المتوالية V8; + ) يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ORCA2 (تحته خط):
GMTHDPVSYGALDVEDLSDIILTDALGIDDFGG ٠ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل ٠1 المتوالية رقم plant transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى تلنبات interaction motif (تحته خط): DREBIA
GMTHDPVSYGALDVENAFYMHDEAMFEMPALGIDDFGG
Yo المتوالية رقم:5٠١٠ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 0811 (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVDEETMFGMPALGIDDFGG المتوالية )8 + ) يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات DOF] (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVEDSFVWPAASFDALGIDDFGG ٠٠ £Y14
— \ \ — المتوالية رقم:١١٠ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ERF2 (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVDDFHFETMFSDALGIDDFGG المتوالية Vo Ardy يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمتيلى exemplary synthetic Al transactivation domain © يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ERF2 بديل (تحته خط): NDSEDMLVYGLLKDDFHFETMFSDLSCLFDFPA المتوالية ;828 + ) يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 7114 بديل (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVDDFEFEMMFTDALGIDDFGG ٠ يشتمل على حافز تفاعل AT يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى ٠١١ المتوالية رقم: نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 2114 بديل (تحته خط):
CLTETWGDLPLKVDDFEFEMMFTDALSVGWSPFSFTAG
المتوالية رقم:١١١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق Vo تنشيط التعبير الجينى للنبات 8481471 بديل (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVENDFEFEMFTDALGIDDFGG المتوالية Yi) )) يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى AT يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 8481471 بديل (تحته خط): CFTESWGDLPLKENDFEFEMFTDYGILNDAFHGG YS المتوالية رقم:"١١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 040/82 بديل (تحته خط): £Y14
Ad — \ — GMTHDPVSYGALDVEDFDLEMLTDALGIDDFGG المتوالية رقم:؛ ١١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى AT يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 0140/2 بديل (تحته خط): FNENCEEIISPNYASEDFDLEMLTDIFKDQDNYEDE 5 المتوالية ,028 VV يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق
تنشيط التعبير الجينى للنبات 10142817 بديل (تحته خط): GMTHDPVSYGALDVEDFEFEAMFMDALGIDDFGG المتوالية رقم ١: يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى آخر يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 042817 بديل (تحته خط):
GFDMEETLVEAIYTAEQSEDFEFEAMFMDSLLANMAEGM ~~ ٠ المتوالية رقم:7١١١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل plant transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى تلنبات interaction motif
CBF] بديل (تحته خط):
GMTHDPVSYGALDVDDFEFETMFMDALGIDDFGG
٠ المتوالية رقم ١١: يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى آخر يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات CBF] بديل (تحته خط): EQSEGAFYMDDFEFETMFMDTLLDNMAEG المتوالية رقم:9١١ يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات DOF] بديل (تحته خط):
GMTHDPVSYGALDVEDFEFEAMFTDALGIDDFGG ٠
£Y14
— ¢ \ — المتوالية رقم YY ee يبين نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى آخر يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات 10011 بديل (تحته خط): SAGKAVLDDEDFEFEAMFTDMGACWAGAGFAD المتواليات أرقام: ١7-١١١ تبين تتابعات حافز تفاعل interaction motif sequences نطاق 0 تنشيط التعبير الجينى للنبات بديل.
طريقة (طرق) تنفيذ الاختراع نظرة عامة على التجسيمات المختلفة موصوف هنا نطاقات تنشيط تعبير جينى نباتى plant transactivation domains جديدة (نطاقات تنشيط التعبير الجينى)؛ حوافز تفاعل DNA وبدائل تركيبية لما سبق والتى قد تكون
Vo مفيدة كمنشطات نسخية transcriptional activators ؛ والتى قد يتم دمجها فى بروتين دمج منشط نسخى تركيبى مع عديد ببتيد رابط ل (DNA للتنشيط الاستتساخى transcriptional 07 للجين موضوع الاهتمام. حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى نباتية جديدة خاصة ونطاق تنشيط التعبير الجينى الموصوفة هنا يتم عزلها من البروتينات النباتية؛ ERF2; AtERF1; ORCA2; DREBIA; 1 :114 ؛ و DOF] يمكن استخدام بروتينات دمج
١ المنشط النسخى Synthetic transcriptional activator fusion proteinsi Sill التى تشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى نباتى جديد و/أو نطاق تنشيط التعبير الجينى كما هو موصوف هنا فى تجسيمات خاصة لزيادة (على سبيل المثال؛ بدء) التعبير الجينى فى أنواع عديدة من الخلايا (على سبيل المثال» خلايا yeast cells syed وخلايا نبات plant 5اا66)؛ وفعلياً أى جين gene
٠ نطاقات تنشيط التعبير الجينى Transactivation domains تكون مستقلة وظيفياً؛ أى؛ يستطيع نطاق تنشيط التعبير الجينى فردى تنظيم الاستنساخ عند دمجه مع إحدى النطاقات الرابطة ل DNA المتغايرة المختلفة العديدة؛ وعند ربطها فى مواقع مختلفة فى منطقة محفز. Halland (Struhl (2002) أعلاه. ويعتقد أن نطاقات تنشيط التعبير الجينى يشارك فى تناظر تتابع أولى قليل ويتخذ تركيب عند الارتباط فقط بهدف. )1988( (Sigler أعلاه. وعلى الرغم من أن
£Y14
ه0١" الرواسب الحمضية والكارهة للماء داخل نطاقات تنشيط التعبير الجينى يعتقد أنها هامة (انظرء على سبيل المثال» (1991) (Cress and Triezenberg أعلاه؛ ويعتقد أن مساهمة الرواسب الفردية blallindividual residues تكون صغيرة. )2002( (Hall and Struhl أعلاه. من الصعب التنبؤ مسبقاً إذا كان حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى التركيبى سيعمل على 0 بدء أو تعزيز التعبير الجينى فى خلية نبات plant cell تكون القدرة على عدم التنبؤ هذه جزئياً على الأقل نتيجة لحقيقة أن بعض نطاقات تنشيط التعبير الجينى تكون منشطات تعبير جينى قوية جداً والتى قد تؤدى إلى "إخماد" (على سبيل (Jha عن طريق مكونات معايرة للآلية النسخية الخلوية transcriptional machinery 81انااا66) كوظيفة لكل من تركيزها الخلوى intracellular concentration وقوة نطاقات تنشيط التعبير الجينى الخاصة hil le على Vo سبيل المثال؛ 6,271,341 U.S.
Patent ( 016/انطاقات تنشيط التعبير الجينى طافرة مع تنظيم جين متدرج .(graded gene regulation موصوف هنا الاكتشاف غير المتوقع أن حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى نباتية جديدة معينة ونطاق تنشيط التعبير الجينى تشارك فى تناظر التتابع مع 016/انطاق تنشيط التعبير الجينى تمنح مستويات مختلفة جداً من التنظيم عندما تضعها الجينات تحت سيطرتها. باستخدام Vo إبستراتيجية قابلة للتعميم ل "مبادلة swapping " نطاقات تنشيط التعبير الجينى لإنتاج بروتينات دمج لمنشط تعبير جينى نسخى تركيبى؛ وقد وجد بشكل مدهش أن حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى ونطاق تنشيط التعبير الجينى جديدة معزولة من 0114 (DREBI1A 2؛ اع CBF قادرة على توفير زيادات أكبر فى استنساخ الجين transcription 9616 فى خلية نباتية أكثر من المتوفر بواسطة 016/؛ والمعروف فى المجال بأنه منشط تعبير جينى transactivator ٠ جيد جداً. وقد وجد أيضاً أن حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى ونطاق تنشيط التعبير الجينى من 88585171 080/82؛ و0071 توفر زيادات أقل فى الاستنساخ الجينى .gene transcription موصوف هنا أيضاً الاكتشاف غير المتوقع أن حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى ونطاق تنشيط التعبير الجينى dha تشتمل على تغيرات حمض أمينى acid 807100 قليلة جداً وطفيفة Yo فيما يتعلق بالتتابع الأصلى قد توفر مزيد من التعزيز أو الضبط للخواص التنظيمية الجينية التى £Y14
-؟١'- تظهر بواسطة نطاق تنشيط التعبير الجينى الأصلى. على سبيل (JB وجد بشكل مدهش أن حوافز تفاعل ERF2 و 0871 نطاق تنشيط التعبير الجينى بديلة تؤدى إلى استنساخ أكبر بشكل ملحوظ للجين الواقع تحت سيطرتها أكثر من حافز التفاعل الأصلى المقابل فى النباتات. اختصارات Chs | جين إنزيم سينثاز كالكون chalcone synthase gene HAS موقع عالى الألفة HP مسبار تحلل مائى hydrolysis probe HSV فيروس الهربس البسيط Herpes Simplex Virus Murashige MS و Skoog —p PNPG ©. نيتروفنيل - الفا —D- جلوكوبيرانوسيد p—nitrophenyl— alpha—-D-glucopyranoside sas PTU استنساخية نباتية plant transcriptional unit SSC سترات صوديوم ملحى saline-sodium citrate Glas TAD تنشيط تعبير جينى transactivation domain TBP ١ بروتين رابط ل TATA-binding protein TATA DNA T-DNA ناتل transfer DNA TFIIB عامل استتساخ transcription factor [IB ١18 TFIIH عامل استنساخ IH 1 محرض ورم tumor—inducing (بلازميدات plasmids مشتقة ٠ من (A. tumefaciens £Y14
ا" UAS تتابع تنشيط المنطقة upstream activation sequence تجاه الطرف 70 من الشريط VP16 بروتين فيريون الهربس البسيط Herpes Simplex Virion Protein 1 \ o لتسهيل مراجعة التجسيمات المتنوعة للوصف, يتم dae) التوضيحات التالية للمصطلحات المحددة. داخلى: كما هو مستخدم هنا, المصطلح "JAI يشير إلى المواد (على سبيل المثال, جزيئات الحمض النووى acid molecules 71101616 وعديدات الببتيد) التى Lan من داخل كائن خاص, نسيج, أو خلية. وعلى سبيل المثال, قد يشير عديد الببتيد "LIAN المعبر عنه فى خلية ٠ نباتية إلى عديد الببتيد الذى يعبر عنه عادة فى خلايا من نفس النوع من النباتات التى أجرى عليها الهندسة الوراثية من نفس الأنواع. وبالمثل, قد يشير الحمض النووى 'الداخلى” الموجود فى خلية نباتية إلى حمض نووى (على سبيل المثال, DNA الجينومى) الذى يوجد عادة فى WIA من نفس النوع من النباتات التى لم يجرى عليها هندسة وراثية لنفس الأنواع. تعبير جينى: كما هو مستخدم هنا, "تعبير Cian لتتابع مرمز (على سبيل المثال, جين أو VO ترانسجين) يشير إلى العملية التى بواستطها يتم تحويل المعلومة المرمزة من وحدة استنساخ حمض نووى Nucleic acid transcriptional unit (متضمنة, على سبيل DNA, Jt أر cDNA الجينومى إلى جزء تشغيلى, غير تشغيلى, أو تركيبى لخلية (على سبيل JB بروتين). ويمكن التأثير على التعبير الجينى بواسطة إشارات خارجية external signals ؛ على سبيل المثال, تعرض الخلية, النسيج, أو الكائن الحى لعامل يزيد أو يقلل التعبير الجينى الموجود هنا ويمكن ٠ - تنظيم التعبير الجينى Lal أياً كان فى مسار من DNA إلى RNA إلى البروتين. ويحدث تنظيم التعبير الجينى, على سبيل المثال, من خلال التحكمات التى تتم على الاستنساخ, الترجمة, انتقال ومعالجة RNA تحلل الجزيئات المتوسطة of, Mina Jie من خلال التنشيط, الإخماد inactivation عمل حجيرات ,compartmentalization أو Jas جزيئات البروتين protein molecules المحددة بعد عملها, أو بواسطة اتحادات لأى مما سبق. ويمكن قياس التعبير الجينى £Y14
CY A-
عند مستوى RNA أو مستوى البروتين بواسطة الطرق المعروفة فى المجال, المتضمنة, دون
تحديد, مخطط RT-PCR Northern مخطط Western واختبار (ات) فاعلية البروتين فى
المعمل, فى موقعه, أو فى الجسم.
sal التعبير الجينى: كما هو مستخدم هنا, المصطلح 'زيادة التعبير الجينى” يشير إلى بدء
5 التعبير الجينى, بالإضافة إلى الزيادة الكمية فى مقدار منتج التعبير الجينى الناتج من تركيب قالب
.template construct وفى بعض التجسيمات, قد يستخدم عديد الببتيد المشتمل على نطاق
تنشيط التعبير الجينى 'لزيادة التعبير الجينى” من حمض نووى. وفى تلك التجسيمات, قد تحدد
الزيادة فى التعبير الجينى بالمقارنة مع مقدار منتج التعبير الجينى الناتج فى تحكم (على سبيل
المثال, من التركيب فى غياب البروتين المشتمل على نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات).
Ve بروتين الدمج: كما هو مستخدم هنا, المصطلح 'بروتين الدمج” يشير إلى جزئ يشتمل على اثنين على الأقل من عديدات الببتيد المرتبطة عملياً. وفى أمثلة معينة, قد يتم التعبير عن اثنين من عديدات الببتيد المرتبطة عملياً sale كجزء من المنتجات الوراثية gene products المختلفة (على سبيل المثال, فى الكائنات الحية المختلفة). وفى أمثلة أخرى, قد يشتق اثنين على الأقل من عديدات الببتيد المرتبطة عملياً فى بروتين الدمج الموصوف هنا المتفاعل بينياً عادة مع
5 _ بروتين مستهدف واحد على الأقل أو حمض نووى فى خلية وفيها يتم التعبير عن بروتين الدمج. les سبيل المثال, قد يتم التفاعل البينى لعديد الببتيد المرتبط عملياً مع واحدة أو أكثر من عامل (عوامل) الاستنساخ transcription factor أو عنصر (عناصر) بروتينى لآلية استنساخ خلوية, أو أنه قد يتفاعل بينياً مع بولى نيوكليوتيد محدد أو عنصر تركيبى element 51111010012 لحمض نووى.
Y. غير متجانس: كما هو مستخدم هنا, المصطلح "غير متجانس” يشير إلى المواد (على سبيل المثال, جزيئات الحمض النووى وعديدات الببتيد) التى لا Lam من داخل كائن خاص, نسيج, أو خلية. وعلى سبيل المثال, قد يشير عديد الببتيد "الغير متجانس” المعبر عنه فى خلية نباتية إلى عديد الببتيد الذى لم يعبر عنه عادة فى خلايا من نفس النوع من النباتات التى لم يجرى عليها الهندسة الوراثية من نفس الأنواع (على سبيل المثال, عديد الببتيد الذى يعبر عنه فى خلايا مختلفة
YO .من نفس الكائن al أو خلايا لكائن a مختلف).
—vq- "المعزول" (مثل حمض نووى أو biological component معزول: المكون البيولوجى بروتين) يتم فصله تماماً, ينتج بعيداً عن, أو ينقى بعيداً عن المكونات البيولوجية الأخرى فى خلية
RNA الكائن الحى التى يوجد فيها المكون بصورته الطبيعية (على سبيل المثال, ظملانا ,extra—chromosomal الأخرى وخارج الكروموسوم chromosomal الكروموسومية سبيل المثال, يمكن عزل le) والبروتينات), بينما يتم التغير الكيميائى أو الوظيفى فى المكون 0 chemical بواسطة كسر الروابط الكيميائية chromosome الحمض النووى من كروموسوم المتبقى فى الكروموسوم). وقد تتضمن جزيئات DNA التى توصل الحمض النووى ب 5 جزيئات الحمض النووى والبروتينات المنقاة بواسطة "elie! الحمض النووى والبروتينات التى يتم ويتضمن المصطلح الأحماض standard purification methods طرق التنقية القياسية recombinant النووى والبروتينات المحضرة بواسطة التعبير عن حامل الشفرة الوراثية - ٠ فى خلية عائل, بالإضافة إلى جزيئات الحمض النووى المخلقة كيميائياً, البروتينات, 0 peptides والببتيدات كما هو مستخدم هنا, المصطلح "جزئ :Nucleic acid molecule جزئ الحمض النووى للنيوكليوتيدات, والتى قد polymeric form ميرى Jo الحمض النووى" قد يشير إلى شكل جينومى, وأشكال مخلقة DNA cDNA RNA تتضمن كلاً من الأشرطة والأشرطة المكملة من VO ديوكسى ribonucleotide وبوليميرات مخلقة مما سبق. وقد يشير النيوكليوتيد إلى ريبونيوكليوتيد أو شكل معدل لأى نوع من النيوكليوتيد. ويعتبر 'جزئ , deoxyribonucleotide ريبونيوكليوتيد polynucleotide حمض نووى" كما هو مستخدم هنا مترادفاً مع "حمض نووى" و"بولى نيوكليوتيد قواعد على الأقل, ما لم يذكر غير ذلك. ويشتمل ٠١ ويكون طول جزئ الحمض النووى عادة ." المصطلح على أشكال أحادية ومزدوجة الشريط 0010016-50800©0 من ه8/لا0ا. ويمكن أن ٠ يتضمن جزئ الحمض النووى على أى من أو كل من النيوكليوتيدات الموجودة فى الطبيعة والمعدلة الموجودة بطبيعتها و/أو الغير NUCleotide linkages المرتبطة سوياً بواسطة روابط النيوكليوتيد موجودة بطبيعتها. جزئ "خارجى” يمثل الجزئ الذى لا يعتبر أصلى لنظام محدد (على سبيل المثال, المادة و/أو نبات) بالنسبة لتتابع النيوكليوتيد elite variety متنوع» تنوع زهرات germplasm الوراثية Yo £Y14
ل و/أو الموقع الخلوى لعديد الببتيد. وفى تجسيمات, قد تكون عديدات النيوكليوتيد أو عديدات الببتيد الخارجية أو الغير متجانسة عبارة عن جزيئات يتم إمدادها صناعياً إلى نظام بيولوجى biological 0 (على سبيل المثال, خلية نبات, جين نبات plantgene أنواع أو تنوع نبات خاص, و/أو كروموسوم نبات (plant chromosome ولا يكون أصلى لذلك النظام البيولوجى الخاص. © وبالتالى, قد يبين تحديد الحمض النووى بأنه 'خارجى” أن الحمض النووى الناتج من مصدر غير المصدر الموجود فى الطبيعة, أو أنه قد يبين أن الحمض النووى له تكوين غير طبيعى, موقع genetic location i) أو, ترتيب من العناصر. وعلى النقيض من ذلك, على سبيل المثال, يكون الحمض النووى "الأصلى" أو "الداخلى" عبارة عن حمض نووى (على سبيل المثال, جين) لا يحتوى على عنصر حمض نووى فضلاً lee ٠ هو موجود عادة فى الكروموسوم أو sale وراثية genetic material أخرى والتى يوجد عليها الحمض النووى عادة فى الطبيعة. ويتم ترميز نسخة وراثية داخلية endogenous gene transcript بواسطة تتابع نيوكليوتيد عند موقعه الكروموسومى chromosomal I0CUS الطبيعى, ولم يزود صناعياً للخلية. وقد تعدل جزيئات الحمض النووى Liles Nucleic acid molecules أو بطريقة ١ كيميائية حيوية, أو قد تحتوى على قواعد نيوكليوتيد غير طبيعية أو مشتقة, كما سيفهم بسهولة بواسطة ذوى الخبرة فى المجال. وتشتمل تلك التعديلات, على سبيل المثال, على علامات, إضافة مثيل, استبدال واحدة أو أكثر من النيوكليوتيدات الموجودة فى الطبيعة مع نظير, تعديلات نيوكليوتيد داخلى (على سبيل المثال, روابط غير مشحونة uncharged linkages على سبيل المثال, مثيل فوسفونات ,phosphotriesters ji.) JS sau é, methyl phosphonates ٠ فوسفوراميدات phosphoramidates كربامات ,carbamates الخ؛ روابط مشحونة charged Je :linkages سبيل المثال, فوسفوروثيوات ,phosphorothioates الخ؛ شقوق ملحقة pendent moieties ؛ على سبيل المثال, ببتيدات peptides ؛ كلابيات داخلية 65 1©0): على سبيل المثال, أكريدين acridine سورالين psoralen الخ؛ كلابيات chelators ¢ عوامل ألكلة alkylators ؛ وروابط معدلة :modified linkages على سبيل Yo المثال, ألفا أحماض نووية أنوميرية alpha anomeric nucleic acids, الخ). ويتضمن £Y14
“yy topological conformation شكل طوبوغرافى (of المصطلح "جزئ الحمض النووى" أيضاً المشتملة على أشكال أحادية الشريط 5171016-50300©0, مزدوجة الشريط, مزدوجة جزئياً دائرية, ومقفولة. hairpinned ثلاثية, دبوسية شعرية partially duplexed وتستخدم بعض التجسيمات شكل خاص من الحمض النووى, أوليجونيوكليوتيد عبارة عن جزيئات حمض Oligonucleotides وتكون الأوليجونيوكليوتيدات .0ligonucleotide © قاعدة نووية أو أقل (بالرغم من أن بعض ٠٠ نووى قصيرة نسبياً, متضمنة بصورة نموذجية ويمكن تشكيل الأوليجونيوكليوتيد بواسطة .)2 ٠ الأوليجونيوكليوتيدات قد تشتمل على ما يزيد عن لحمض نووى طويل متضمناً (restriction digestion انقسام (على سبيل المثال, تفتت التقييد أو قد يتم تخليقة كيميائياً , بطريقة ,oligonucleotide sequence تتابع الأ وليجونيو كليوتيد الفردية. nucleoside phosphoramidites محددة التتابع, من الفوسفوراميديت للنيوكليوسيد Vo لتحديد جزئ حمض probe sequence ويمكن استخدام الأوليجونيوكليوتيد كتتابع مسبار نووى متضمناً تتابع نيوكليوتيد خاص. ووفقاً لما سبق, قد يحضر مسبار أوليجونيوكليوتيد cloning تخليقياً أو بواسطة مستعمرة. وتعرف ناقلات المستعمرة oligonucleotide probe المناسبة لذوى الخبرة فى المجال. وقد يميز مسبار الأوليجونيوكليوتيد أو قد يكون غير +65 مميز. وتوجد تقنيات متنوعة لتمييز جزيئات الحمض النووى, متضمنة, على سبيل المثال وبدون VO ؛ بداية عشوائية؛ وتتبع ديوكسى nick translation تحديد, تمييز إشعاعى بواسطة ترجمة شق حيث تميز النيوكليوتيدات المستخدمة, على سبيل المثال, deoxytransferase ترانسفيريز وتتضمن العلامات الأخرى التى قد تستخدم, على سبيل المثال وبدون تحديد: . 32P بواسطة enzyme ؛ مواد أساسية للأنزيم enzymes ؛ أنزيمات fluorophores فلورو فور enzyme ؛ ومثبطات للأنزيم enzyme cofactors ؛ عوامل مساعدة للأنزيم Substrates ٠ للتحديد, بذاتها أو بالاتحاد مع ALE وبصورة بديلة, فإن استخدام علامة توفر إشارة inhibitors حيث receptors يرتبط بها مستقبلات ligands العوامل المتفاعلة الأخرى, قد يستبدل بليجاندات تميز المستقبلات (على سبيل المثال, بواسطة العلامات المبينة سابقاً) لتوفير الإشارات القابلة
Leary etal. للتحديد, إما بذاتها, أو بالارتباط مع كواشف أخرى. أنظر, على سبيل المثال, .)1983( Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:4045-9 Yo £Y14
دم وتشتمل بعض تجسيمات الاختراع على بولى نيوكليوتيد وهو "قابل للتهجين على وجه التحديد" أو 'مكمل على وجه التحديد” لتتابع هدف نيوكليوتيد. وتعتبر WE للتهجين على وجه التحديد' و'مكمل على وجه التحديد" مصطلحات تدل على درجة كافية من التكملة بحيث أن الارتباط الثابت والمحدد يحدث بين النيوكليوتيد وجزئ الحمض النووى المتضمن تتابع هدف 0 النيوكليوتيد الخاص. وقد لا يحتاج جزئ الحمض النووى 90٠٠١0 تكملة لتتابع هدفه حتى يكون قابلاً للتهجين بالتحديد. ويكون جزئ الحمض النووى قابلاً للتهجين بالتحديد عند وجود درجة كافية من التكملة لتجنب الارتباط الغير محدد للحمض النووى بتتابعات غير مستهدفة تحت ظروف يطل فيها الارتباط المحدد, على سبيل المثال, تحت ظروف التهجين hybridization conditions الشديدة. Ya وستتغير ظروف التهجين المؤدية إلى درجات خاصة من الشدة على أساس طبيعة طريقة التهجين المختارة وتركيبة وطول تتابعات الحمض النووى المهجنة hybridizing nucleic acid SEQUENCES. وبوجه عام, ستسهم درجة حرارة التهجين والشدة الأيونية ionic strength diay) خاصة تركيز Na+ و/أو (Mg++ لمنظم التهجين buffer 117/51101280010 فى شدة التهجين, برغم الغسيل عدة مرات المؤثرةٍ أيضاً على الشدة. وتعرف الحسابات المتعلقة بظروف ٠ _ التهجين المطلوبة للحصول على درجات خاصة من الشدة لذوى الخبرة فى المجال, وتناقش, على سبيل المثال, فى Sambrook et al. (ed.) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., vol. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989, chapters 9 and 11; and Hames and Higgins Nucleic Acid Hybridization, IRL Press, Oxford, 1985 (.605). وقد توجد تعليمات ٠ ودلالة تفصيلية أخرى بالنسبة لتهجين الأأحماض النووية, على سبيل المثال, فى Tijssen "نظرة عامة لمبادئ التهجين واستراتيجية اختبارات مسبار الحمض النووى probe 8610 7101616" , فى Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology — Hybridization with Nucleic Acid Probes, Part |, Chapter 2, Elsevier, NY, and Ausubel et al., Eds., Current Protocols in Molecular Biology, ;1993 .Chapter 2, Greene Publishing and Wiley —Interscience, NY, 1995 Yo £Y14
اا وكما هو مستخدم هنا, تشتمل "الظروف الصارمة" على ظروف Ally بها سيحدث فقط التهجين إذا وجد JB من 9675 عدم توافق بين جزئ التهجين وهدف DNA وتتضمن "الظروف الصارمة” مستويات خاصة Lal من الشدة. وبالتالى, كما هو مستخدم هنا تكون الظروف "خفيفة الصرامة” هى تلك التى بها لن تتهجن الجزيئات التى بها عدم توافق للتابع أكثر من ©967؛ وتكون © الظروف (متوسطة الصرامة) التى بها لن تتهجن الجزيئات التى بها عدم توافق للتتابع أكثر من 0 6؛ والظروف "عالية الصرامة” التى بها لن تتهجن التتابعات التى بها عدم توافق أكثر من + )%. وتكون الظروف "شديدة الصرامة جداً” هى تلك التى بها لن تتهجن التتابعات التى بها عدم توافق أكثر من 967. وفى تجسيمات خاصة, تكون الظروف الصارمة عبارة عن تهجين لمدة ١ ساعة عند ٠ 0 19م فى منظم التهجين ,PerfectHyb™ xii; (Sigma-Aldrich) hybridization buffer متبوعاً بغسيل متتالى لمدة f+ دقيقة عند 15م فى .0.1X 550/0.196 SDS تتابعات النيوكليوتيد المرتبطة عملياً: يعتبر تتابع النيوكليوتيد الأول 'مرتبط عمليا” مع أو بتتابع نيوكليوتيد ثانى عندما يكون تتابع النيوكليوتيد الأول فى علاقة وظيفية مع تتابع النيوكليوتيد الثانى. وعلى سبيل المثال, يتم ارتباط المنشط عملياً بتتابع مرمز لو أن المنشط يؤثر على ١ استنساخ أو تعبير التتابع المرمز. وعن الإنتاج بشكل حامل للشفرة الوراثية, تكون تتابعات النيوكليوتيد المرتبطة عملي مماسه بوجه عام و, عند الضرورة تربط منطقتين مرمزتين للبروتين protein—coding regions فى نفس إطار القراءة وعلى أية حال, لن تحتاج تتابعات النيوكليوتيد لأن تكون مماسه حتى ترتبط عملياً. ويقصد من المصطلح, 'مرتبط lee عند الاستخدام بالرجوع إلى تتابع منظم للجين gene regulatory sequence | ٠ وتتابع مرمز, أن التتبع المنظم يؤثر على تعبير تتابع الترميز المرتبط. وتشير "التتابعات المنظمة Regulatory sequences ", أو 'عناصر التحكم control LY)" elements تتابعات النيوكليوتيد Al تؤثر على توقيت ومستوى/مقدار الاستتساخ؛ معالجة وثبات RNA أو ترجمة التتابع المرمز المصاحب. وقد تتضمن التتابعات المنظمة التقليدية مناطق غير مترجمة *#'؛ منشطات؛ تتابعات أمامية للترجمة translation leader sequences ؛ © إنترونات introns ؛ محسنات enhancers ؛ تركيبات الساق - الحلقة stem-loop £Y14
ديه structures ¢ تتابعات الارتباط الكاظم repressor binding sequences ؛ تتابعات الانتهاء؛ تتابعات إدراك إضافة البولى أدينيل polyadenylation recognition sequences ؛ الخ. ويمكن وضع التتابعات المنظمة الخاصة ضد تيار و/أو فى نفس تيار تتابع الترميز المرتبط عملياً بها. أيضاً, قد توضع تتابعات منظمة خاصة مرتبطة عملياً بتتابع الترميز على الشريط المكمل complementary 50800 © المصاحب لجزئ الحمض النووى مزدوج الشريط double—
.stranded nucleic acid molecule ولم تكن العناصر التى قد تكون "مرتبطة Lee بتتابع الترميز محددة للمنشطات أو التتابعات المنظمة الأخرى التقليدية. وعلى سبيل المثال, فى بعض التجسيمات, قد يرتبط النطاق المرتبط ب DNA لبروتين المنشط العرضى transactivator 00 بتتابع نيوكليوتيد قريب من المنشط أو المنطقة المنظمة الأخرى, بحيث أن بروتين
٠ المنشط العرضى قد يتفاعل مع المنشط أو المنطقة المنظمة الأخرى, أو جزئ مرتبط به (على سبيل المثال, عامل استتنساخ (transcription factor إتمام الاستتنساخ. وفى تلك الأمثلة, يكون تتابع النيوكليوتيد الذى يرتبط به بروتين المنشط العرضى من خلال نطاق ارتباطه ب DNA 'مرتبط عملياً” بتتابع الترميز تحت تحكم المنشط أو التتابع الأخرى المنظم.
عديدات الببتيد المرتبطة عملياً: كما هو مستخدم هما بالنسبة لعديد الببتيدات, يشير
Vo المصطلح 'مرتبط عملياً” إلى اثنين على الأقل من عديدات الببتيد التى يتم توصيلها فى جزء واحد (على سبيل المثال, بروتين الدمج), وبالطريقة التى يمكن أن يؤدى كل بولى ببتيد وظيفته المطلوبة. وعادة, يتم ارتباط اثنين على الأقل من عديدات الببتيد تساهمياً من خلال روابط الببتيد. وقد ينتج بروتين الدمج المتضمن بولى ببتيدات مرتبطة عملياً بواسطة تقنيات DNA حامل الشفرة الوراثية القياسية. وعلى سبيل المثال, قد يتم ارتباط جزئ DNA الذى يشفر عديد الببتيد الأول
٠ بجزئ DNA أخر الذى يشفر بولى ببتيد ثانى, وقد يعبر عن جزئ DNA الهاجين الناتج فى خلية مضيفة لإنتاج بروتين الدمج المشتمل على عديدات الببتيد الأولى والثانية. وفى أمثلة خاصة, قد يرتبط اثنين من جزيئات DNA ببعضهما البعض فى الاتجاه 0 إلى ", بحيث أن, بعد الارتباط, إطار الترجمة لعديد الببتيدات المرمزة لم يتبدل (أى أن, جزيئات DNA ترتبط ببعضها البعض فى إطار).
—yvo- التى قد تكون DNA المصطلح "المحفز" يشير إلى منطقة ls المحفز: كما هو مستخدم بوليميراز RNA ضد التيار من بداية الاستنساخ, والتى قد تكون ضمن إدراك وارتباط والبروتينات الأخرى لإتمام الاستتساخ. وقد يتم ارتباط المحفز عملياً بتتابع مرمز polymerase للتعبير الجينى فى خلية, أو قد يتم ارتباط المحفز عملياً بتتابع نيوكليوتيد مرمز لتتابع الإشارة الذى "plant promoter قد يرتبط عملياً بتتابع الترميز للتعبير فى خلية. وقد يكون"المحفز النباتى © عبارة عن محفز قادر على بدء الاستنساخ فى خلية نباتية. تفاضلياً fag وتشتمل أمثلة المحفزات تحت السيطرة المتطورة على المحفزات التى الاستنساخ فى أنسجة معينة, على سبيل المثال وبدون تحديد, الأوراق, الجذور, البذور, الألياف .sclerenchyma أو اللحاء tracheids التراكيد xylem vessels أوعية الزايليم fibers الاستنساخ فقط فى fag ويشار لتلك المنشطات بأنها 'مفضلة للنسيج”". ويشار للمنشطات التى ٠ أنسجة معينة بأنها " محددة للنسيج". ويؤثر المنشط "المحدد لنوع الخلية” مبدئياً على الاستنساخ فى أنواع خلية معينة فى واحدة أو أكثر من الأعضاء, على سبيل المثال وبدون تحديد, فى الخلايا فى الجذور أو الأوراق. وتتضمن المنشطات المحددة للنسيج المثالية vascular cells الحويصلية phaseolin أو المفضلة للنسيج, لكن دون تحديد: منشط مفضل للجذر, مثلاً من جين فازيولين أو روبيسكو 001500 ؛ منشط CAD ؛ منشط محدد للورقة ومحفز بالضوء مثلاً من كاب gene Vo من 152ه/ا؛ منشط محدد بحبوب اللقاح Sic anther-specific promoter محدد بالأنثر microspore— ومنشط مفضل للبوغ الدقيق ¢ZM13 مثلاً من pollen 6م5- 0116 promoter .apg من Si preferred promoter وقد يكون المحفز "القابل للتحريض” عبارة عن المنشط الذى قد يكون تحت تحكم بيئى. أمثلة الظروف yeni; Ward et al. (1993) Plant Mol.
Biol. 22:361-366 أنظر ٠ على ,inducible promoters الاستنساخ بواسطة المحفزات القابلة للتحريض fag البيئية التى قد inducible سبيل المثال وبدون تحديد, ظروف هوائية ووجود الضوء. ومع المحفز القابل للتحريض وتشتمل .170116109 agent معدل الاستنساخ استجابة لعامل التحريض Jay, promoter الذى ACEI المحفزات القابلة للتحريض التمثيلية, لكن دون تحديد على: محفزات من نظام الذى يستجيب لمؤمنات مبيد maize من نشا الذرة IN2 جين copper يستجيب للنحاس YO £Y14
1+ الأعشاب بنزين سلفوناميد benzenesulfonamide herbicide safeners ؛ كاظم Tet من 0 ؛والمحفز القابل للتحريض من جين هرمون إيسترويد steroid hormone gene النشاط النسخى transcriptional activity لها قد تحفز بواسطة هرمون الجلوكوكورتيكوستيرويد 612٠. (1991) Proc.
Natl.
Acad.
Sci. glucocorticosteroid hormone 50808) USA 88:0421) o ونجد أن المحفزات محددة النسيج, مفضلة النسيج, المحددة بنوع الخلية, والقابلة للتحريض تكون فئة من المحفزات "غير التأسيسية”. ويكون المحفز "التأسيسى 'constitutive’ promoter عبارة عن المحفز الذى قد يكون نشطاً فى معظم الظروف البيئية. وتتضمن المحفزات التأسيسية التمثيلية, لكن دون تحديد: محفزات من فيروسات نباتية viruses 01801, مثل محفز 355 من CaMV | ٠ محفزات من جينات أكتين الأرز rice actin genes ؛ محفزات يوبيكويتين ubiquitin promoters ؛ ¢MAS ¢pEMU محفز هيستون H3 histone promoter من نشا )33 ومحفز ALS شريط ١ Xbal /Ncol ' إلى الجين التركيبى Brassica napus structural gene ALS3 (أو تتابع نيوكليوتيد مشابه day pall المذكور (Xbal/Neol (نشرة PCT الدولية رقم 11/8 Yo وقد يتم استخدام أى من المحفزات التأسيسية وغير التأسيسية فى بعض تجسيمات الاختراع. وعلى سبيل المثال, قد يتم إعداد جين يراد تنظيمه بواسطة فاعلية بروتين دمج منشط الاستنساخ Gla (على سبيل المثال, فى خلية عائل), وفيها يتم ارتباط الجين عملياً بالمنشط. تطابق التتابع: المصطلح "تطابق التتابع” أو "التطابق", كما هو مستخدم هنا فى سياق اثنين من تتابعات الحمض النووى أو عديد الببتيد, قد يشير إلى الرواسب فى التتابعين المتشابهين ٠٠ عند التحاذى لأقصى مناظرة على نافذة مقارنة محددة. LS هو مستخدم هنا, المصطلح "النسبة المثوية لتطابق التتابع” قد تشير إلى القيمة المحددة بمقارنة تتابعين محاذيين بصورة مثالية (على سبيل المثال, تتابعات الحمض النووى, وتتابعات الحمض الأمينى) خلال إطار مقارنة, وفيها قد يتضمن جزء من التتابع فى إطار المقارنة إضافات أو محذوفات (أى, فجوات (gaps بالمقارنة بالتتابع المرجعى (والذى لا يشتمل على £Y14
الا إضافات أو حذوفات) للمحاذاة المثالية للتابعين. وتحسب النسبة المئوية بتحديد عدد المواضع والتى عندها يوجد النيوكليوتيد المطابق أو راسب الحمض الأمينى acid residue 80100 فى كل التتابعات لإنتاج عدد من المواضع المتوافقة, قسمة عدد المواضع المتوافقة على العدد الكلى للمواضع فى إطار المقارنة, وضرب الناتج فى ٠٠١ لإنتاج النسبة Ay idl) لتطابق التتابع. ° وتعرف طرق محاذاة التتابعات للمقارنة فى المجال. ويتم وصف برامج متنوعة وحسابات التحاذى فى, على سبيل المثال: Smith and Waterman (1981) Adv.
Appl.
Math. Needleman and Wunsch (1970) J.
Mol.
Biol. 48:443; Pearson and ;2:482 Lipman (1988) Proc.
Natl.
Acad.
Sci.
U.S.A. 85:2444; Higgins and Sharp Gene 73:237-44; Higgins and Sharp (1989) CABIOS 5:151-3; )1988( Corpet et al. (1988) Nucleic Acids Res. 16:10881-90; Huang et al. 1. Comp.
Appl.
Biosci. 8:155-65; Pearson et al. (1994) Methods )1992( Mol.
Biol. 24:307-31; Tatiana et al. (1999) FEMS Microbiol.
Lett. 174:247-0. ويمكن أن يوجد الاعتبار التفصيلى لطرق محاذاة التتابع وحسابات التماثل فى, على سبيل المثال, .215:403-10 Altschul et al. (1990) J.
Mol.
Biol. The National Center for Biotechnology Information (NCBI) Basic yo Local Alignment Search Tool (BLAST™; Altschul etal. (1990)) متاحاً من عدة مصادر, تتضمن the National Center for Biotechnology Information (Bethesda, MD) , وعلى الإنترنت, للاستخدام بالاتصال مع برامج تحليل التتابع المتعددة. ويعتبر وصف كيفية تحديد تطابق التتابع باستخدام هذا البرنامج متاحاً على الإنترنت تحت قسم "المساعدة" ل BLAST™ ٠ ولمقارنات تتابعات الحمض النووى, قد تستخدم وظيفة 'تتابعات2 Blast "من برنامج BLAST™ (Blastn) باستخدام المعايير الافتراضية. وستوضح تتابعات الحمض النووى مع التشابه الكبير للتتابعات المرجعية كيفية زيادة تعريف النسبة المثوية عند الاختبار بواسطة هذه الطريقة. LS, هو مستخدم هنا بالنسبة لتتابعات النيوكليوتيد قد يشير المصطلح 'مطابق olds Yo لللتتابعات Al تزيد عن 9085 تطابق. وعلى سبيل المثال, قد يكون تتابع النيوكليوتيد المطابق
م %A0,0 Lil على الأقل؛ 9687 على الأقل؛ %AY على الأقل؛ 96/808 على الأقل؛ 9689 على الأقل؛ 9690 على الأقل؛ 9691 على الأقل؛ 9697 على الأقل؛ 9697 على الأقل؛ 9694 على الأقل؛ 9695 على الأقل؛ 9697 على الأقل؛ 96997 على الأقل؛ 9698 على الأقل؛ 9699 على الأقل؛ 969,5 على الأقل مطابق للتتابع المرجعى.
2 الاستبدال التحفظى :Conservative substitution كما هو مستخدم هنا, يشير المصطلح "الاستبدال التحفظى” إلى استبدال يتم فيه استبدال راسب حمض أمينى amino acid residue بحمض أمينى AT فى نفس الفئة. ويكون استبدال الحمض الأمينى الغير محفوظ عبارة عن ذلك الاستبدال الذى فيه لا تقع الرواسب فى نفس الفئة, على سبيل المثال استبدال حمض أمينى قاعدى basic amino acid بحمض أمينى amino acid متعادل neutral أو غير
٠ قطبى +8ا0م-000. وتعرف فئات الأحماض الأمينية التى قد تعرف لغرض إجراء الاستبدال التحفظى فى المجال. وفى بعض التجسيمات, يتضمن الاستبدال التحفظى استبدال حمض أمينى اليفاتى aliphatic amino acid أول بحمض أمينى اليفاتى ثانى, مختلف. وعلى سبيل المثال, إذا كان الحمض الأمينى عبارة عن واحداً من Met «Val ¢Leu cle «Pro Ala «Gly , قد يستبدل الحمض ١ الأمينى الأول بالحمض الأمينى الثانى, المختلف المختار من «Val sLeu ¢lle «Pro ¢Ala «Gly Met . وفى أمثلة خاصة, إذا كان الحمض الأمينى الأول عبارة عن واحدة من (Ala (Gly Leu ¢lle «Pro 81/, فإن الحمض الأمينى الأول قد يستبدل بحمض أمينى ثانى مختلف مختار من .Val sLeu ¢lle «Pro ¢Ala «Gly وفى الأمثلة الخاصة المشتملة على استبدال الأحماض الأمينية الاليفاتية الكارهة للماء hydrophobic aliphatic amino acids إذا كان الحمض ٠ الأمينى الأول عبارة عن واحداً من 8ل/؛ seu dle (Pro وا8/ا, قد يستبدل الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى ثانى, مختلف مختار من 8ل/؛ dle Pro © ا؛ وا8/ا. وفى بعض التجسيمات, يشتمل الاستبدال التحفظى على استبدال الحمض الآروماتى الأول بحمض أمينى آروماتى aromatic amino acid ثانى, مختلف. وعلى سبيل المثال, إذا كان الحمض الأمينى الأول le عن واحداً من Tyr, «Trp Phe His , فإن الحمض الأمينى الأول قد يستبدل YO بحمض أمينى ثانى, مختلف مختار من Tyr, «Trp Phe ¢His . وفى الأمثلة الخاصة المشتملة
+4
على استبدال الأحماض الأمينية الآروماتية الغير مشحونة uncharged aromatic amino 5, إذا كان الحمض الأمينى الأول عبارة عن واحدة من Tyr «Trp Phe , فإن الحمض
الأمينى الأول قد يستبدل بحمض أمينى ثانى, مختلف مختار من «Trp Phe والا1 . فى بعض التجسيمات»؛ يتضمن الاستبدال التحفظى استبدال حمض أمينى كاره للماء hydrophobic amino acid © أول بحمض أمينى كاره للماء مختلف؛ ثانى. على سبيل (JE إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من Val; lle; Leu; Met; Phe; Tyr بعالط؛ 5 Trp قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Ala; Val; lle; Met; Phe; Tyr :(د©ا؛ Trp, . فى أمثلة خاصة تشمل استبدال الأحماض الأمينية الكارهة للماء hydrophobic amino acids « غير الأروماتية non—aromatic ؛ إذا كان الحمض ٠ الأمينى الأول هو واحد من Val; lle; Leu :18/؛ 5 Met قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول
بحمض أمينى مختلف»؛ ثانى مختار من Met, «Ala; Val; lle; Leu فى بعض التجسيمات؛ يتضمن الاستبدال التحفظى استبدال حمض أمينى قطبى polar amino acid أول بحمض أمينى قطبى مختلف؛ ثانى. على سبيل JED إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من ¢Ser; Thr; Asn; Gln; Cys; Gly; Pro; Arg; His; Lys; Asp Yo ونا6؛ قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ SB مختار من Ser; Thr, ¢Asn; 0: Cys; Gly; Pro; Arg; His; Lys; Asp و نا©. فى أمثلة خاصة تشمل استبدال الأحماض الأمينية القطبية polar amino acids ؛ غير المشحونة uncharged ؛ إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من Pro «Ser; Thr; Asn; Gin; Cys; Gly قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Ser; Thr; Asn; 60: Cys; .Pro «Gly ٠ فى أمثلة خاصة تشمل استبدال الأحماض الأمينية القطبية polar amino acids ٠ المشحونة charged ؛ إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من ¢His; Arg; Lys; Asp (Glu قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من His; Arg; Asp :8لاا؛ وا©. فى أمثلة أخرى تشمل استبدال الأحماض الأمينية القطبية؛ المشحونة؛ إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من <Arg; Lys; Asp و (Glu قد يتم استبدال الحمض Yo الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Arg; Lys; Asp وناا6. فى ibd £Y14
مو
خاصة Jods استبدال الأحماض الأمينية القطبية؛ موجبة الشحنة (قاعدية (basic إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من Lys 5 His; Arg قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى cabling ثانى مختار من Lys, His; Arg فى أمثلة أخرى تشمل استبدال الأحماض الأمينية القطبية؛ موجبة الشحنة؛ إذا كان الحمض الأمينى الأول هو JArg 5لا؛ قد © يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى آخر من Arg و5لاا. فى أمثلة خاصة تشمل استبدال الأحماض الأمينية القطبية polar amino acids ؛ سالبة الشحنة (حمضية «(acidic إذا كان الحمض الأمينى الأول هو Asp أو Glu قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى AT من م88 5.Glu أمثلة خاصة تشمل استبدال أحماض أمينية قطبية غير الأحماض الأمينية القطبية موجبة الشحنة positively charged polar amino acids » إذا كان الحمض ٠١ الأمينى الأول هو واحد من «Glu 5 «Ser; Thr; Asn; Gin; Cys; Gly; Pro; Asp قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Ser; Thr; Asn; GIn; Gly; Pro; Asp :5لا©؛ وا6©. فى أمثلة خاصة تشمل استبدال أحماض أمينية قطبية أخرى غير الأحماض الأمينية القطبية سالبة الشحنة negatively charged polaramino acids « إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من Ser; Thr; Asn; 60: Cys; Gly; Pro; Arg; Lys His ١ قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من
.Lys 5 «Ser; Thr; Asn; GIn; Cys; Gly; Pro; Arg; His فى بعض التجسيمات؛ يتضمن الاستبدال التحفظى استبدال حمض أمينى متعادل كهربائيا أول بحمض أمينى متعادل كهربائياً مختلف؛ ثانى. على electrically neutral amino acid «Gly; Ser; Thr; Cys; Asn; GIn إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من (JE سبيل Gly; Ser; قد يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Tyr, Yo
«Thr; Cys; Asn; GIn والاا. فى بعض التجسيمات؛ يتضمن الاستبدال التحفظى استبدال حمض أمينى غير قطبى amino acid +8ا0م-000 أول mess أمينى غير قطبى مختلف؛ ثانى. على سبيل Jal إذا كان الحمض الأمينى الأول هو واحد من Val; Leu; lle; Phe; Trp; Pro بواط؛ (Met; قد £Y14 gy يتم استبدال الحمض الأمينى الأول بحمض أمينى مختلف؛ ثانى مختار من Ala; Val; Leu; .Met , بعاا؛ Phe; Trp; Pro فى العديد من الأمثلة؛ قد يتم اختيار حمض أمينى ثانى خاص ليتم استخدامه فى الاستبدال التحفظى لاستبدال حمض أمينى أول من أجل زيادة عدد الفئات السابقة التى ينتمى إليها
Ser كل من الأحماض الأمينية الأول والثانى. وبالتالى؛ إذا كان الحمض الأمينى الأول هو ٠ (حمض أمينى قطبى؛ غير آروماتى؛ ومتعادل كهربائياً)؛ فإن الحمض الأمينى الثانى قد يكون أو «Thr; Asn; GIn; Cys; Gly; Pro; Arg; His; Lys; Asp حمض أمينى قطبى آخر (أى؛
Thr; Asn; آخر (أى non-aromatic amino acid les) حمض أمينى غير «(Glu أو ¢(Met ؛ أو 60: Cys; Gly; Pro; Arg; His; Lys; Asp; Glu; Ala; lle; Leu; Val ومع ذلك؛ قد (Tyr أو «Gly; Thr; Cys; Asn; GIn (أى؛ AT حمض أمينى متعادل كهربائياً Vo
Thr; Asn; يكون من المفضل أن يكون الحمض الأمينى الثانى فى هذه الحالة هو واحد من ولاا6؛ لأن هذه الأحماض الأمينية تشترك فى جميع التصنيفات وفقاً للقطبية؛» غير «Gin; Cys الآروماتية؛ والتعادلية الكهربائية. المعايير الإضافية التى قد يتم استخدامها اختيارياً لاختيار حمض أمينى ثانى خاص ليتم استخدامه فى الاستبدال التحفظى معروفة فى المجال. على سبيل المثال؛ قد (Ser متاحة للاستخدام فى الاستبدال التحفظى ل Gly 5 ¢Thr; Asn; 60: Cys عندما تكون Vo من الاختيار من أجل تجنب تكوين الروابط المشتركة غير المرغوب فيها و/أو Cys يتم إزالة من الاختيار» لأنها تفتقر إلى Gly قد يتم إزالة (Jilly disulfide 50005. روابط ثانى سلفيد على سبيل Thr فى هذه الحالة؛ قد يتم اختيار alkyl side chain سلسلة جانبية للالكيل side المثال» من أجل الحفاظ على الأداء الوظيفى لمجموعة الهيدروكسيل للسلسلة الجانبية اختيار الحمض الأمينى الثانى الخاص المطلوب استخدامه فى .chain hydroxyl group ٠ الاستبدال التحفظى يكون فى النهاية؛ مع ذلك ضمن صلاحيات الشخص الخبير. المصطلح "مشتق" كما هو مستخدم هنا Lod يتعلق بتتابع الحمض الأمينى يعنى التعديل الكيميائى لبروتين دمج للاختراع. بروتين تنشيط التعبير الجينى protein 118058017/81109: كما هو مستخدم (la يشير Yo المصطلح "بروتين تنشيط التعبير الجينى Ladi 5) " transcriptional activator protein £Y14
وه التعبير الجينى” أو "بروتين منشط نسخى" أو "بروتين دمج منشط نسخى") إلى عديد ببتيد الذى يرتبط بعنصر حمض نووى lagsnucleic acid element أو يعزز نسخ عديد النيوكليوتيد (على سبيل J) الجين موضوع الاهتمام) الذى يكون مرتبط على نحو قابل للتشغيل بعنصر الحمض النووى. تتضمن بروتينات تنشيط التعبير الجينى التى تكون أصلية لبعض الكائنات الحية؛ على © سبيل المثال وبدون حصر؛ البروتينات الرابطة ل DNA إصبع خارصين؛ النطاق الرابط ل DNA ¢GAL4 UPA وا /آ. تتضمن التجسيمات الخاصة للاختراع منشطات التعبير الجينى لبروتين الدمج التركيبى synthetic fusion protein transactivators التى تشتمل على نطاق رابط ل DNA واحد على الأقل من بروتين رابط ل DNA وحافز تفاعل من نطاق تنشيط التعبير الجينى لنيات.
IK ارتباط خاص: كما هو مستخدم هنا فيما يتعلق بعديدات الببتيد ونطاقات البروتين protein domains ؛ يشير المصطلح "ارتباط خاص” إلى تفاعل قوى بما فيه الكفاية بين عديد الببتيد أو نطاق البروتين protein domain وشريك (شركاء) ارتباطه Jo) سبيل المثال؛ عديد (عديدات) ببتيد يشتمل على تتابع حمض أمينى خاص؛ أو حمض نووى (أحماض نووية) يشتمل على تتابع نيوكليوتيد خاص) بحيث يحدث ارتباط ثابت وخاص مع شريك (شركاء) (LUE ولكن 0 ليس مع الجزيئات الأخرى التى تفتقر إلى تتابع حمض أمينى خاص أو تتابع نيوكليوتيد خاص التى يتم التعرف عليها بواسطة عديد ببتيد ارتباط محدد. قد يتم التحقق من الارتباط الثابت والخاص بواسطة التقنيات الروتينية لأولئك الخبراء فى المجال؛ مثل مقايسات “استخلاص البروتين البيوكيميائى” (على سبيل المثال؛ مقايسات استخلاص البروتين البيوكيميائى «(GST pulldowns مقايسات الخميرة-7- هجين yeast-2-hybrid assays مقايسات الخميرة-؟- (oad «ELISA ٠ الخ. يمكن القول ol الجزيئات التى لديها سمة "الارتباط المحدد" ببعضها البعض 'ترتبط
على وجه التحديد" ببعضها البعض. التحول Transformation كما هو مستخدم cls يشير المصطلح "تحول" إلى تحول جزئ حمض نووى واحد أو أكثر فى خلية. يتم Jad خلية بواسطة جزئ حمض نووى محول فى الخلية عندما يصبح جزئ الحمض النووى منسوخ بثبات بواسطة الخلية؛ إما عن طريق إدراج جزئ Yo الحمض النووى فى الجينوم الخلوى cellular genome ؛ أو عن طريق النسخ المتماثل
£Y14
اسه
الإيبوسومى .episomal replication كما هو مستخدم Jody cla المصطلح "تحول" جميع التقنيات التى بواسطتها يمكن إدخال جزئ حمض نووى فى هذه الخلية. تتضمن الأمثلة؛ لكنها لا تقتصر على: العدوى بواسطة النواقل الفيروسية viral vectors ؛ التحول بواسطة نواقل البلازميد plasmid vectors ؛ الصعق الكهربائى Fromm et al. (1986) ( electroporation ¢(Nature 319:791-3 © عدوى الليبوسوم Felgner et al. (1987) Proc. ) lipofection ¢(Natl.
Acad.
Sci.
USA 84:7413-7 الحقن Mueller etal. (1978) Cell ) 55 Sd) 15:579-5)؛ التحول بوساطة الأجرعية Fraley) Agrobacterium-mediated transfer ¢(et al. (1983) Proc.
Natl.
Acad.
Sci.
USA 80:4803-7 امتصاص DNA المباشر؛ وقصف 44,3 صغيرة Klein et al. (1987) ) microprojectile bombardment
.(Nature 327:70 ٠ exogenous nucleic تتابع حمض نووى خارجى المنشاً :Transgene الترانسجين فى بعض الأمثلة؛ قد يكون جين التحوير تتابع الذى يرمز عديد ببتيد يشتمل .8010 sequence على بروتين دمج منشط نسخى تركيبى واحد على الأقل. فى بعض الأمثلة؛ قد يرمز جين التحوير بروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات واحد على الأقل و/أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل واحد على الأقل. فى بعض الأمثلة؛ قد يرمز الترانسجين ٠5 الجين موضوع الاهتمام (على سبيل المثال» جين مراسل؛ جين يمتح مقاومة مبيدات الأعشاب يساهم فى سمة النباتات الهامة زراعياً). فى هذه الأمثلة (pay ؛ herbicide resistance محفز) «Jd قد يحتوى جين التحوير على تتابع تنظيمى واحد أو أكثر (على سبيل clayey مرتبط على نحو قابل للتشغيل بتتابع ترميز للترانسجين. لأغراض هذا الوصف؛ تم استخدام للإشارة إلى كائن حى (على سبيل المثال؛ نبات)؛ يشير transgenic Wh, المصطلح "معدل ٠ قد يكون ABN إلى كائن حى الذى يشتمل على تتابع حمض نووى خارجى المنشاً. فى بعض هو كائن حى الذى فيه تم Lidl الكائن الحى الذى يشتمل على تتابع الحمض النووى خارجى molecular transformation إدخال تتابع الحمض النووى بواسطة تقنيات التحول الجزيثى الذى يشتمل على تتابع الحمض النووى ad) قد يكون الكائن gyal فى أمثلة techniques
وه خارجى Laid) هو كائن a الذى فيه يتم إدخال تتابع الحمض النووى بواسطة؛ على سبيل المثال؛ انجبال داخلى introgression أو تلقيخ خلطى cross—pollination فى نبات. الناقل: كما هو مستخدم هناء المصطلح 'ناقل" يشير إلى جزئ حمض نووى حيث قد يتم إدخاله فى خلية؛ على سبيل (JB لإنتاج خلية متحولة (transformed cell قد يتضمن ناقل © تتابعات حمض نووى التى تسمح بنسخه فى خلية مضيفة؛ Jie أصل النسخ المتماثتل. تتضمن الأمثلة على النواقل؛ لكنها لا تقتصر على: البلازميدات plasmids ؛ الكوزميدات cosmids ؛ العاقيات bacteriophages ؛ والفيروسات التى تحمل DNA خارجى المنشاً إلى خلية. قد يتضمن الناقل أيضاً جين واحد أو أكثر؛ جزيئات مضادة للانتساخ antisense molecules ؛ و/أو جينات واصمة قابلة للاختيار والعناصر الجينية الأخرى المعروفة فى المجال. قد يعمل الناقل ٠ على تنبيغ؛ تحويل؛ أو إصابة خلية؛ مما يتسبب فى تعبير الخلية جينياً لجزيئات الحمض النووى و/أو البروتينات المرمزة بواسطة الناقل. يتضمن الناقل اختيارياً مواد للمساعدة فى تحقيق دخول جزئ الحمض النووى فى الخلية (على سبيل المثال؛ ليبوسوم 100500718 ؛ غلاف بروتين protein coating « الخ). مالم يرد أو يفهم ضمنياً على وجه التحديد؛ تعنى مصطلحات "التنكير” و"التعريف” 'واحد Vo على الأقل." كما هو مستخدم هنا. مالم يوضح خلاف ذلك على وجه التحديد؛ يكون لجميع المصطلحات التقنية والعلمية المستخدمة هنا نفس المعنى حسب المفهوم الشائع من قبل أولئك أصحاب الخبرة العادية فى المجال الذى ينتمى له هذا الوصف. يمكن الاطلاع على تعريفات المصطلحات الشائعة فى مجال البيولوجيا الجزيئية molecular biology فى؛ على سبيل المثال Lewin B., Genes V, Oxford University Press, 1994 (ISBN 0-19-854287-9); Kendrew et al.
Y. (eds.), The Encyclopedia of Molecular Biology, Blackwell Science Ltd., (ISBN 0-632-02182-9); and Meyers R.A. (ed.), Molecular Biology 1994 and Biotechnology: A Comprehensive Desk Reference, VCH Publishers, Inc., 1995 (ISBN 1-56081-569-8). £Y14
هه حوافز التفاعل من نطاقات تنشيط التعبير الجينى للنبات يوفر هذا الوصف نطاقات تنشيط التعبير الجينى لنبات جديدة وحوافز تفاعل بروتين - بروتين منهاء بالإضافة إلى الأحماض النووية المرمزة لها. تم استخدام نطاقات تنشيط التعبير الجينى التى تم تحديدها وعزلها من بروتينات النبات ERF2 (Arabidopsis « plant proteins thaliana); 114 (Solanum tuberosum); AtERF1 (A. thaliana); ORCA2 ٠ (Catharanthus roseus); DREB1A (A. thaliana); CBF1 (A. thaliana); DOF] (Zea mays) لتحديد حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات التى قد تكون فى بعض التجسميات 'متبادلة” فى نطاق تنشيط التعبير الجينى متغاير؛ أو تستخدم لإنتاج حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل. قد يتم استخدام نطاقات تنشيط التعبير الجينى للنبات ٠ المحددة حديثاً؛ حوافز التفاعل فيهاء و نطاقات تنشيط التعبير الجينالبديلة لها فى تجسيمات خاصة (على سبيل المثال؛ عن طريق تضمينها فى بروتين منشط نسخى تركيبى) لمنح تحكم تنظيمى فى التعبير الجينى جديد ومرغوب فيه للجين موضوع الاهتمام. تم توصيف نطاق تنشيط التعبير الجينى ل TAD) VP16 16/)؛ والمناطق التركيبية ل نطاقات تنشيط التعبير الجينى لنبات الجديدة السابقة ونطاقات التفاعل يشار إليها بالقياس Yo لللتركيبات المقابلة فى TAD 016/. يمكن تقسيم VP16 TAD إلى اثنين من النطاقات الفرعية؛ وكل نطاق فرعى يكون قادر على تنشيط النسخ على نحو مستقل وذاتياً عند ربطه بنطاق ارتباط هلا0. يشار إلى النطاقات الفرعية 1/016 فى بعض الأحيان بالنطاق الفرعى الأمينى amino subdomain (أو "النطاق الفرعى ١ لتنشيط التعبير الجينى transactivation subdomain ل 6 أو L('VP16412-456" يتفاعل VPL6 من خلال نطاقات تفاعله مع العديد من Yo البروتينات المستهدفة المتضمنة فى النسخ؛ Lay فى ذلك الوحدة الفرحية 062/1101 لعامل النسخ .(TF1IB) 8 لا يعتمد نشاط VP16 فقط على الرواسب الحمضية؛ ولكن أيضاً على الأحماض الأمينية الكارهة للماء والآرماتية داخل نطاق تنشيط التعبير الجينى. انظرء على سبيل Cress (Jul Triezenberg (1991) Science 251(4989):87-90 800. ومع ذلك؛ قد يكون ٠/016 Yo 180 الحمضى أكثر تحملاً لتولد الطفرات من العديد من تتابعات عديد الببتيد الأخرى؛ بسبب
الافتقار إلى تركيب ثانوى منتظم فى نطاقات تنشيط التعبير الجينى الحمضية. (1988) Sigler Nature 333:210-2 قد تساعد الطبيعة غير المنظمة للنطاقات VP16 TAD ici تفاعلات بروتين/بروتين المتعددة بوساطة نطاق تنشيط التعبير الجينى مع شركاء الارتباط المختلفة (Dyson and Wright (2002) Curr.
Opin.
Struct.
Biol. 12(1):54-60) وقد تتخذ النطاقات الفرعية نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيب أكثر ترتيباً (على سبيل المثال» حلزون -
#قصير (Langlois et al. (2008), supra) عند ربطها بالبروتينات المستهدفة مما تكون عليه عندما تكون حرة فى محلول. انظرء على سبيل Garza et al. (2009) Life Sci. «JB Jonker et al. (2005) Biochemistry 44(3):827-39; ;84(7-8):189-93 Langlois et al. (2008) أعلاه.
١ تتضمن بعض التجسيمات بروتين منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز Jeli نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حيث يتم اختيار حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: T=) تشتمل بعض البروتينات المنشطة النسخية التركيبية synthetic transcriptional activator proteins التمثيلية على نطاق تنشيط التعبير الجينى الذى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ وهذه البروتينات قد
Vo يكون لها تتابع يتضمن؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ المتواليات أرقام: AY والمتواليات أرقام:١ .٠١ 6-٠٠ تتضمن نطاقات تنشيط التعبير الجينى التمثيلية الإضافية التى تشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات تلك المصممة من خلال استبدال تتابع حافز تفاعل interaction motif sequence نطاق تنشيط التعبير الجينى أصلى موجود فى نطاق تنشيط التعبير الجينى المنشط للتعبير الجينى الأصلى بواحد من المتواليات NT) al
Ye تستفيد بعض تجسيمات الاختراع من الاكتشاف المدهش بأن حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة؛ التى تشتمل على استبدالات حمض أمينى تحفظية و/أو استبدالات بالأحماض الأمينية الموجودة فى الموضع المماثل فى حافز التفاعل المتجانس homologous le) interaction motif سبيل المثال؛ من مماثل للبروتين الأصلى native protein الذى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى المرجعى)؛ قد تحقق خواص تنظيمية جينية
YO جديدة وخاصة. هذه الخواص الخاصة قد تكون مطلوبة للتعبير الجينى لعديد نيوكليوتيد؛ حيث
£Y14
يكون مستوى معين من التعبير الجينى مطلوب. على سبيل المثال؛ قد يوفر حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل تعبير جينى معزز على حافز نطاق تنشيط التعبير الجينى مرجعى أصلى الذى يعزز التعبير الجينى فى حد ذاته؛ وبالتالى قد يكون مطلوب فى تركيب البروتين وتفاعلات dant حيث يكون الهدف غالباً هو التعبير الجينى الأقصى. فى أمثلة أخرى؛ قد يوفر © حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل تعبير جينى أقل من حافز نطاق تنشيط التعبير
الجينى المرجعى الأصلى حيث يكون المطلوب أقل من التعبير الجينى الأقصى. وبالتالى؛ تتضمن بعض التجسيمات بروتين منشط نسخى تركيبى synthetic transcriptional activator protein يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل. فى بعض الأمثلة؛ قد يكون حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديل هو بديل لواحد oe المتواليات أرقام: VT) تتضمن حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة عديدات ببتيد لها تتابع الحمض الأمينى لتتابع تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى الأصلى؛ ولكن فيها يتم تغيير حمض أمينى واحد أو أكثر فى التتابع إلى الحمض الأمينى الموجود فى الموضع المقابل فى نطاق تنشيط التعبير الجينى مختلف؛ متماثتل. تتضمن حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة أيضاً عديدات ببتيد لها تتابع الحمض الأمينى لتتابع تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى ٠ أصلىء ولكن فيها يتم إجراء استبدال تحفظى لحمض أمينى واحد أو أكثر فى التتابع. قد يكون حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ مطابق بنسبة على الأقل لتتابع حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى مرجعى (على سبيل المثال؛ تتابع مختار من المتواليات أرقام: ١٠-76١)؛ مطابق بنسبة 9646 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة 9685 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة %A على الأقل للتتابع ٠ المرجعى؛ مطابق بنسبة 9675 على الأقل للتتابع المرجعى؛ Gildas بنسبة 9670 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة 9665 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة 967680 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة 9655 على الأقل للتتابع المرجعى؛ مطابق بنسبة + 965
على الأقل للتتابع المرجعى؛ أو مطابق بنسبة أقل من ٠ 969 للتتابع المرجعى. تتضمن حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة؛ على سبيل المثال وبدون Yo حصرء المتواليات أرقام: 77-١١7 (حوافز تفاعل 472 انطاق تنشيط التعبير الجينى بديلة
A
تمثيلية)؛ المتواليات أرقام: 78-77 (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى 0114 بديلة تمثيلية)؛ المتواليات أرقام:74-؛؟ (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى 888811 بديلة بديلة 0860/82 all (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير £0-V0 تمثيلية)؛ المتواليات أرقام: بديلة DREBIA -7؛ (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى 4١ تمثيلية)؛ المتواليات أرقام:
Ay 6871 تمثيلية)؛ المتواليات أرقام: 7؛ -7© (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى © تمثيلية)؛ و المتواليات أرقام: 0-57 (حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى 0051 بديلة تمثيلية). تتضمن نطاقات تنشيط التعبير الجينى التمثيلية التى تشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل تلك المصممة من خلال استبدال تتابع حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى الموجود فى نطاق تنشيط التعبير الجينى منشط تعبير جينى أصلى بنطاق تنشيط على سبيل .58-١١7 التعبير الجينى بديل مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: ٠ تتضمن نطاقات تنشيط التعبير الجينى التمثيلية التى تشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط «JE
AY mV oY التعبير الجينى بديل المتواليات أرقام: يمكن التعرف على الأحماض النووية التى ترمز أى من وكل عديدات الببتيد السابقة od من تتابع الحمض الأمينى لعديد الببتيد. على سبيل المثال؛ قد يتم ترميز نطاق تنشيط التعبير ١ الجينى أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بواسطة عديد الببتيد الأصلى الذى يتم نسخه لتوليد MRNA الذى يتم نقله بعد ذلك إلى الأحماض الأمينية لنطاق تنشيط التعبير الجينى أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى. ومع ذلك سوف يدرك أحد الخبراء فى المجال أنه؛ بسبب انحلال الرمز الجينى genetic code توجد العديد من عديدات الببتيد المكافئة الأخرى التى سوف ترمز عديد ببتيد مطابق. قد يتم ترميز حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة ٠ (على سبيل (Ji) المتواليات أرقام: (OAV بواسطة عديدات النيوكليوتيد التى تكون ALE للتحديد بسهولة بالرجوع إلى جدول كودون RNA من تتابع الحمض الأمينى للبديل الخاص المطلوب. فى تجسيمات خاصة؛ قد يكون من المطلوب لتتابع النيوكليوتيد لعديد النيوكليوتيد الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى (أو بديل له) أن يتم تجميعه وفقاً لاستخدام الكودون للخلية المضيفة؛ على سبيل المثال؛ وذلك لتحقيق أقصى قدر أو تحسين التعبير الجينى لبروتين YO (على سبيل المثال؛ بروتين (med يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى.
المنتشطات النسخية transcriptional activators لبروتين الدمج يوفر هذا الوصف أيضاً بروتينات دمج منشطة نسخية تركيبية تشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل. فى بعض التجسيمات؛ يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى أيضاً على نطاق رابط ل DNA واحد على الأقل. يتم أيضاً توفير الأحماض النووية (على سبيل (DNA (JE التى ترمز بروتينات الدمج المنشطة النسخية التركيبية هذه. فى بعض التجسيمات؛ يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على عديد ببتيد أول على الأقل الذى يرتبط ب DNA بطريقة محددة التتابع (أى؛ Slay رابط ل ("DNA قد يرتبط عديد الببتيد للنطاق الرابط ل 01/8 الأول لبروتين دمج المنشط النسخى التركيبى بشكل فعال بعديد ببتيد ٠ ثانى على الأقل يشتمل على حافز تفاعل Glas تنشيط التعبير الجينى للنبات أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل. فى بعض الأمثلة؛ قد يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على عديدات ببتيد إضافية؛ مثل تتابع مفساح موضوع بين عديدات الببتيد الأول والثانى فى بروتين الدمج؛ ببتيد رئيسى leader peptide ؛ ببتيد الذى يستهدف بروتين الدمج لعضية organelle Je) سبيل (JE النواة ¢(nucleus عديدات الببتيد التى يتم شقها بواسطة إنزيم خلوى cellular enzyme Vo علامات ببتيد؛ وتتابعات الحمض الأمينى الأخرى التى لا تتعارض مع وظيفة عديدات asin الأول والثانى المرتبطة بشكل فعال. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم ارتباط عديدات الببتيد الأول والثانى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى بشكل فعال من خلال التعبير الجينى لها من عديد نيوكليوتيد واحد مرمز لعديدات الببتيد الأول والثانى المربوطة ببعضها البعض فى الإطارء وذلك لخلق جين وهمى chimeric Yo 9606 لترميز بروتين دمج. تتضمن الأمثلة على عديدات النيوكليوتيد المرمزة لبروتين دمج منشط نسخى الذى يشتمل على نطاق رابط ل DNA وحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى؛ بدون حصرء المتواليات أرقام: 97-179. فى تجسيمات بديلة؛ قد يتم ارتباط عديدات الببتيد الأول والثانى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى بشكل فعال بواسطة وسائل cg al مثل بواسطة الربط المتبادل لعديدات الببتيد الأول والثانى المعبر لها جينياً على نحو مستقل.
مه تتضمن حوافز تفاعل GUS تنشيط التعبير الجينى للنبات وحوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى البديلة الذى قد تكون موجودة داخل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى حوافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى وبدائلها الموصوفة فى قسم (IV أعلاه. على سبيل المثال؛ قد يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على عديد ببتيد polypeptide مختار من المجموعة التى 0 تتكون من المتواليات OA val)
تتضمن النطاقات الرابطة ل DNA الذى قد تكون موجودة فى بروتين دمج منشط نسخى تركيبى النطاقات الرابطة ل DNA إصبع الخارصين من بروتينات إصبع الخارصين zinc finger (على سبيل المثال؛ نطاق رابط ل DNA 26). قد يتم تصميم النطاقات الرابطة ل DNA إصبع الخارصين الفردية لاستهداف وربط مجموعة كبيرة من مواقع DNA انظرء؛ على سبيل (JE Wu et al. (2007) Cell.
Mol.
Life Sci. 64:2933-44 ٠ بروتينات إصبع الخارصين 2 المقبولة؛ بالإضافة إلى Cys3His غير المقبولة؛ تربط DNA من خلال إدخال حلزون- »0 فى الأخدود الرئيسى للحلزون المزدوج helix 16ا00005. إدراك DNA بواسطة نطاقات إصبع الخارصين يكون معيارى؛ يتصل كل إصبع فى المقام الأول بثلاثة أزواج قاعدة متتالية فى الهدف؛ ورواسب رئيسية ALE فى الإدراك بوساطة البروتين. من خلال تضمين النطاقات الرابطة ل DNA ١ إصبع الخارصين المتعددة فى بروتين دمج منشط نسخى تركيبى؛ قد يتم أيضاً زيادة خصوصية ارتباط DNA لبروتين ad) (وبالتالى قد يتم أيضاً زيادة خصوصية أى آثار تنظيمية جينية ممنوحة بذلك). انظرء على سبيل Urnov et al. (2005) Nature 435:646- «Jil 1. وبالتالى؛ قد يتم تصميم نطاق رابط ل DNA إصبع الخارصين واحد أو أكثر واستخدامه بحيث يتفاعل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى مدخل فى خلية مضيفة مع تتابع DNA الذى
Ye يكون فريد من نوعه داخل جينوم الخلية المضيفة. فى بعض الأمثلة؛ يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على نطاق رابط ل DNA من «GAL4 منشط تعبير جينى معيارى modular transactivator فى Saccharomyces cerevisiae ولكن الذى يعمل أيضاً كمنشط تعبير جينى فى العديد من الكائنات الحية الأخرى. انظرء على سبيل المثال» 335:563-4 .Sadowski et al. (1988) Nature فى هذا النظام التنظيمى؛ يتم تنظيم التعبير الجينى للجينات المرمزة لإنزيمات المسار الأيضى جالاكتوز
-ه- galactose metabolic pathway فى cerevisiae .5 بصرامة بواسطة مصدر الكربون carbon source المتاح. 51:458-76 .Johnston (1987) Microbiol.
Rev. التحكم النسخى فى هذه الإنزيمات الأيضية metabolic enzymes يكون بوساطة التفاعل بين البروتين التنظيمى الإيجابى positive regulatory protein ؛ 4ل/6؛ وتتابع DNA المتماثل في ١١ © زوج قاعدة الذى يرتبط به GALS على وجه التحديد (UAS)
يتكون GALS الأصلى من AM راسب حمض amino acid residues id » بوزن جزيثى molecular weight 44 كيلودالتون. يشتمل GAL4 على نطاقات مستقلة وظيفياً الأنشطة المتحدة لها تشكل نشاط GALS فى جسم الكائن الحى. (1987) Ma & Ptashne .Cell 48:847-53); Brent & Ptashne (1985) Cell 43(3 Pt 2(:729-6 يشتمل ٠ 15 حمض أمينى للطرف-لا من 6/14 على النطاق الرابط ل Keegan et .GAL4 DNA .al. (1986) Science 231:699-704; Johnston (1987) Nature 328:353-5 يتطلب الارتباط محدد التتابع وجود كاتيون ثنائى التكافؤ divalent cation منسق بواسطة + رواسب Cys موجودة فى النطاق الرابط ل 01/8. يتفاعل النطاق الذى يحتوى على كاتيون 007 منسق مع ويدرك ثلاثى CCG محفوظ فى كل طرف ل bp UAS 17 عبر الاتصالات Vo المباشرة مع الأخدود الرئيسى major groove تحلزون Marmorstein et al. (1992) .DNA Nature 356:408-14 وظيفة ارتباط DNA لنطاقات التنشيط النسخى transcriptional activating domains للطرف-9 لمواضع البروتين فى محيط المحفزء بحيث يمكن لنطاقات
التنشيط أن توجه النسخ. تتضمن النطاقات الرابطة ل DNA الإضافية AN قد تكون موجودة فى بروتين دمج منشط Vo نسخى تركيبى؛ على سبيل المثال وبدون حصرء تتابع ارتباط من جين قابل للتحريض inducible gene - 081/48853؛ تتابع ارتباط توافق من جين قابل للحث- AVRBS3 أو تتابع ارتباط تركيبى مصمم منهم (على سبيل (JE نطاق رابط ل ¢UPA DNA المتوالية رقم: 84)؛ TAL LexA (انظرء؛ على سبيل المثالء LacR ¢(Brent & Ptashne (1985), supra (انظرء على سبيل المثال» Labow et al. (1990) Mol.
Cell.
Biol. 10:3343-56; Baim et Proc.
Natl.
Acad.
Sci.
USA 88(12):5072-6 Ye )1991( .21)؛ مستقبل هرمون ستيرويد
ون Elliston et al. (1990) J.
Biol.
Chem. ( steroid hormone receptor 265:11517-121(¢ كاظم (U.S.
Patent 6,271,341) Tet وكاظم Tet طافر الذى يرتبط بتتابع مشغل ]16 فى وجود؛ ولكن ليس غياب؛ تتراسيكلين ¢(Tc) tetracycline ومكونات النظام التنظيمى المرصوف فى Wang et al. (1994) Proc.
Natl.
Acad.
Sci.
USA © 91(17):8180-4 الذى يستخدم دمج «GALS مستقبل هرمون hormone receptor « و VP16 فى بعض الأمثلة؛ يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على أكثر من حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى coals على سبيل المثال وبدون حصرء قد يشتمل بروتين دمج منشط A تركيبى على oF oY ؛ أو أكثر نطاقات Jeli نطاق تنشيط التعبير الجينى. فى بعض ٠ الأمثلة؛ يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على أكثر من نطاق رابط ل DNA واحد. على سبيل المثال وبدون pan قد يشتمل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى على 7 7 4 05 2 اء 9-8 ٠١ أو أكثر من النطاقات الرابطة ل DNA جزيئات الحمض النووى التى تشتمل على عديد نيوكليوتيد مرمز لمنشط نسخى لبروتين دمج فى بعض التجسيمات؛ يوفر هذا الوصف جزئ حمض نووى يشتمل على تتابع عديد Vo نيوكليوتيد واحد على الأقل Jape لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل. قد تشتمل جزيئات الحمض النووى هذه أيضاً على تتابع عديد نيوكليوتيد واحد على الأقل الذى يرمز نطاق رابط ل DNA على سبيل المثال؛ يشتمل حمض نووى فى بعض التجسيمات على تتابع عديد نيوكليوتيد أول مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ ٠٠ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ مدمج فى الإطار بتتابع عديد نيوكليوتيد ثانى الذى يرمز نطاق رابط ل «DNA بحيث يتم نسخ الاثنين من تتابعات عديد النيوكليوتيد كجزء من بروتين دمج فردى. فى جزيئات الحمض النووى المقدمة فى بعض تجسيمات الاختراع؛ قد يتم فصل الكودون الأخير لتتابع عديد النيوكليوتيد الأول الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛
سرع
حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ والكودون الأول لتتابع عديد النيوكليوتيد الثانى الذى يرمز النطاق الرابط ل DNA بواسطة أى عدد من ثلاثيات النيوكليوتيد nucleotide triplets ؛ على سبيل (JE بدون الترميز لإنترون intron أو STOP" . وبالمثل؛ قد يتم فصل الكودون codon 5 الأخير لتتابع نيوكليوتيد الذى Jap تتابع عديد نيوكليوتيد أول الذى يرمز النطاق الرابط ل DNA والكودون الأول لتتابع عديد النيوكليوتيد الثانى الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ بواسطة أى عدد من ثلاثيات النيوكليوتيد. فى هذه التجسيمات وغيرهاء قد يتم دمج الكودون الأخير من ol) AT أكثر ' فى تتابع الحمض النووى) تتابع عديد ٠ النيوكليوتيد الأول الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ وتتابع عديد النيوكليوتيد الثانى الذى يرمز نطاق رابط ل (DNA فى سجل المرحلة مع الكودون الأول لتتابع ترميز عديد نيوكليوتيد متصل مباشرةً به؛ أو فصله منه بما لا يزيد عن تتابع ببتيد قصيرء مثل ذلك المرمز بواسطة رابط نيوكليوتيد تركيبى (على سبيل المثال؛ رابط نيوكليوتيد Vo الذى قد يتم استخدامه لتحقيق الدمج). تتضمن الأمثلة على تتابعات عديد النيوكليوتيد الأخرى؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ العلامات؛ ببتيدات الاستهداف؛ ومواقع الانشقاق الإنزيمية cleavage 5 027/012106©. وبالمثل؛ قد يتم دمج الكودون الأول لأكثر To (فى تتابع الحمض النووى) من تتابعات عديد النيوكليوتيد الأول والثانى فى سجل المرحلة مع الكودون الأخير لتتابع ترميز عديد نيوكليوتيد AT متصل Hale به؛ أو يتم فصله die بما لا يزيد عن تتابع ببتيد
٠٠ قصير. قد يتكون تتابع فصل تتابع عديد النيوكليوتيد الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ وتتابع عديد النيوكليوتيد الذى يرمز نطاق رابط ل (DNA على سبيل المثال؛ من أى تتابع؛ بحيث لا يكون من المحتمل أن يغير تتابع الحمض Yo الأمينى المرمز بشكل كبير من نقل بروتين الدمج. نظراً للطبيعة المستقلة لنطاقات تفاعل نطاق
£Y14
يوه تنشيط التعبير الجينى (وبدائلها) المبينة هنا والنطاقات الرابطة ل DNA المعروفة؛ لن تتعارض التتابعات المتداخلة فى الأمثلة مع الوظائف الخاصة لهذه التركيبات. تتضمن بعض تجسيمات الاختراع أيضاً جزئ حمض نووى يشتمل على تتابع عديد نيوكليوتيد الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط 0 التعبير الجينى بديل؛ las تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ حيث لا يشتمل جزئ الحمض النووى على تتابع عديد نيوكليوتيد يرمز نطاق رابط ل DNA قد تكون جزيئات الحمض النووى هذه مفيدة؛ على سبيل المثال؛ فى تسهيل معالجة التتابع المرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى فى التقنيات البيولوجية الجزيئية. على سبيل المثال؛ فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إدخال التتابع المرمز lal تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى فى ناقل > مناسب للاستنساخ ed للتتابع فى Jib تعبير جينى؛ أو قد يتم إدخال تتابع مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى فى جزئ حمض نووى الذى يسهل إنتاج جزئ حمض نووى DAT يشتمل على تتابع مرمز لحافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى المرتبط عملياً بتتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام. جميع تتابعات النيوكليوتيد التى ترمزء على سبيل المثال؛ بروتين دمج الذى يشتمل على Vo حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات خاص واحد على الأقل؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى cay نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ ويشتمل أيضاً على نطاق رابط ل DNA خاص واحد على (JAY) ستكون ALE للإدراك فوراً بواسطة أولثك الخبراء فى المجال. يوفر انحلال الكود الجينى genetic code عدد محدود من تتابعات الترميز لتتابع حمض أمينى خاص. اختيار تتابع خاص لترميز بروتين دمج وفقاً لتجسيمات ٠ الاختراع يكون ضمن صلاحيات الممارس. قد تكون تتابعات الترميز المختلفة مطلوبة فى التطبيقات المختلفة. فى بعض التجسيمات؛ قد يكون من المطلوب تعديل نيوكليوتيدات تتابع عديد النيوكليوتيد الذى يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل (و/أو Yo نيوكليوتيدات التتابع المرمز للنطاق الرابط ل 8/ا/0)؛ على سبيل (JE لتعزيز التعبير الجينى
هه لتتابع عديد النيوكليوتيد فى مضيفة خاص. الرمز الجينى يكون لا لزوم له مع TE كودون ممكن؛ ولكن معظم الكائنات الحية تستخدم بشكل تفضيلى مجموعة فرعية من هذه الكودونات. الكودونات التى يتم استخدامها فى معظم الأحيان فى أنواع تسمى الكودونات المتلى optimal codons وتلك التى تكون غير مستخدمة فى معظم الأحيان تصنف على أنها كودونات نادرة أو © منخفضة الاستخدام. 105:61-72 et al. (1991) Gene 20809. قد يتم استبدال الكودونات لتعكس استخدام الكودون المفضل لمضيف خاص فى عملية يشار إليها أحياناً ب 'تحسين الكودون ".codon optimization قد يتم تحضير تتابعات الترميز المحسنة Al تحتوى على الكودونات المفضلة من قبل مضيف بدائى النواة prokaryotic أو حقيقى النواة eukaryotic خاص عن طريق؛ على سبيل المثال؛ زيادة معدل النقل أو إنتاج نسخ RNA معادة الاتحاد لها الخواص ٠ المطلوبة (على سبيل (JRA نصف عمر أطول؛ مقارنةٌ بالنسخ المنتجة من تتابع غير محسن). التعبير الجينى لمنشط نسخى لبروتين دمج فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إدخال جزئ (جزيئات) حمض نووى مرمز لبروتين دمج واحد على الأقل يشتمل على تتابع عديد نيوكليوتيد واحد على الأقل يرمز حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات (أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى cay نطاق تنشيط التعبير Vo الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل)؛ وتتابع عديد نيوكليوتيد واحد على الأقل يرمز نطاق رابط ل (DNA فى خلية؛ نسيج؛ أو كائن حى للتعبير الجينى لبروتين الدمج فيها. فى بعض التجسيمات؛ قد يكون جزئ الحمض النووى هذاء على سبيل المثال؛ نظام ناقل يتضمن؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ بلازميد خطى «linear plasmid وبلازميد دائرى مغلق closed circular plasmid فى الأمثلة الخاصة؛ قد يكون الناقل هو ناقل تعبير جينى expression vector | ٠ ؛ قد يتم إدخال تتابعات الحمض النووى وفقاً لتجسيمات خاصة؛ على سبيل المثال» فى ناقل؛ بحيث يتم ارتباط تتابع الحمض النووى عملياً بتتابع تنظيمى واحد أو أكثر. العديد من النواقل تكون متاحة لهذا الغرض؛ وقد يعتمد اختيار الناقل الخاص؛ على سبيل JE على حجم الحمض النووى المطلوب إدخاله فى الناقل؛ الخلية المضيفة الخاصة المطلوب تحويلها بواسطة الناقل؛ و/أو كمية بروتين الدمج المطلوب التعبير الجينى له. عادةً ما يحتوى الناقل على £Y14
-1ه- مكونات مختلفة؛ يعتمد تطابقها على وظيفة الناقل (على سبيل (JUBA تضخيم DNA والتعبير الجينى ل (DNA وخلية (خلايا) المضيف الخاصة التى يتوافق الناقل معها. قد تتضمن بعض التجسيمات ناقل تحويل نبات الذى يشتمل على تتابع نيوكليوتيد يشتمل على تتابع تنظيمى واحد على الأقل مرتبط عملياً بتتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر الذى يرمز بروتين دمج يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل؛ la تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل» مرتبط بشكل فعال بنطاق رابط ل DNA واحد على الأقل. قد يتم التعبير الجينى لواحد أو أكثر من تتابعات النيوكليوتيد. فى ظل تحكم التتابع التنظيمى (التتابعات التنظيمية)؛ فى خلية نباتية؛ نسيج؛ أو كائن حى لإنتاج بروتين الدمج. ١ فى بعض التجسيمات؛ التتابع التتظيمى المرتبط عملياً بتتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر الذى يرمز بروتين دمج يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل؛ حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات؛ أو نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل؛ مرتبط بشكل فعال بنطاق رابط ل DNA واحد على الأقل؛ قد يكون تتابع محفز الذى يعمل فى خلية مضيفة؛ مثل خلية بكتيرية bacterial cell حيث يكون من No المطلوب تضخيم جزئ الحمض النووى؛ أو خلية نبات حيث يكون من المطلوب التعبير الجينى لجزء الحمض النووى. المحفزات المناسبة للاستخدام فى جزيئات الحمض النووى وفقاً لبعض التجسيمات تتضمن تلك التى تكون قابلة للتحريض؛ فيروسية؛ تركيبية؛ أو تأسيسية؛ جميعها معروف جيداً فى المجال. يتم توفير ARG) غير المحدودة للمحفزات التى قد تكون مفيدة فى تجسيمات الاختراع من قبل: ¢((RS81 maize ~~ promoter براءة الاختراع الأمريكية أرقام 6.471.719 (محفز الذرة Yo (محفز الذرة 1.471.447 ¢(rice actin promoter (محفز أكتين الأرز 3 (محفز الذرة 4-1ا0)؛ 1.777.577 (محفز الذرة 3م)؛ 1.47.717 ¢(RS324 متخ تتاف ¢(constitutive maize promoters (محفزات 3,30 التأسيسية 1.77.71
L3 و 0.070.157 (محفز 355)؛ 1.17.707 (محفز الذرة 2.784.147 0.10.65 ؛)١ rice actin أكتين الأرز 101200 cp ils oF 80500ا0)؛ 1.479.757 (محفز أكتين الأرز Yo
—oy— 84 ؟. (محفزات ALE للتحريض VA ¢(light=inducible promoters ¢ sally £0 ).1 (محفزات ALE للتحريض بالملح T1.YOY. NYA ¢(salt-inducible promoters (محفزات ALE للتحريض بالممراض ¢(pathogen—inducible promoters 1.175.050 (محفزات ALE للتحريض promoters 100001016 بنقص الفوسفور ¢(phosphorous deficiency 8 1.788.970 (محفزات ثنائية الاتجاه ¢(bidirectional promoters 1.378.853 (محفز —coixin جاما (gamma وطلب براءة الاختراع الأمريكية برقم مسلسل +A YOY. AS (محفز .(maize chloroplast aldolase promoter الدولاز صانعة يخضور الذرة nopaline synthase تتضمن المحفزات التمثيلية الإضافية محفز سينثاز نوبالين ‘(Ebert et al. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84(16):5745-9) (NOS) (الذى يتم تنفيذه على البلازميدات (OCS) octopine synthase محفز سينثاز أوكتوبين ٠ محفزات (Agrobacterium tumefaciens من 11001-10001719 plasmids المحدثة للورم cauliflower محفز فيروس فسيفساء القرنبيط Jie caulimovirus promoters فيروس القرنبيط
Lawton et al. (1987) Plant Mol. Biol. 9:315-( 195 (CaMV) mosaic virus 35S - محفز Odell et al. (1985) Nature 313:810-2) CaMV 355 ؛ محفز 4 (Walkeretal. (1987) Proc. Natl. Acad. figwort mosaic virus فيروس الفسيفضاء ٠ sucrose synthase promoter محفز سينثاز السكروز «Sci. USA 84(19):6624-8) محفز ¢(Yang and Russell (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:4144-8)
Chandler et al. (1989) Plant Cell ( R gene complex promoter مركب الجين الرابط لكلوروفيل protein gene promoter محفز جين البروتين ¢(1:1175-83 .ذف 110 (O.FYY.AYA (براءة الاختراع الأمريكية أرقام 681/1/355 a/b chlorophyll. 2.051.787 (براءة الاختراع الأمريكية أرقام FMV35S و 07.195 5.)؛ 2.707
SCP1 و5.778.715)؛ محفز /00151 (براءة الاختراع الأمريكية رقم 0.0914 5.85)؛ محفز
GenBank ( 6400.005 (براءة الاختراع الأمريكية رقم 7+ 1.597/7.5)؛ ومحفزات
Accession No. V00087; Depicker et al. (1982) J. Mol. Appl. Genet. .(1:561-73; Bevan et al. (1983) Nature 304:184-7 +٠
—oA-
فى تجسيمات خاصة؛ قد تشتمل جزيئات الحمض النووى للاختراع على محفز محدد
النسيج. المحفز الخاص بالنسيج هو تتابع نيوكليوتيد الذى يوجه مستوى أعلى من نسخ تتابع نيوكليوتيد مرتبط عملياً فى النسيج الذى يتم تحديد المحفز له؛ بالنسبة لأنسجة أخرى للكائن الحى. تتضمن ARG) على المحفزات الخاصة بالنسيج؛ بدون حصر: المحفزات الخاصة بالبساط tapetum-specific promoters © ؛ المحفزات الخاصة بالمثبر؛ المحفزات الخاصة باللقاح (انظرء على سبيل Jia) براءة الاختراع الأمريكية رقم 401.476 دتو International PCT ¢(Publication No.
WO 99/042587 المحفزات الخاصة بالبويضة ovule-specific promoters ¢ (انظر؛ على سبيل المثال؛ U.S.
Patent Application No. Al 2001/047525)؛ المحفزات الخاصة بالفاكهة (انظرء على سبيل المثال؛ براءة الاختراع
٠ الأمريكية أرقام 5.947.714 5 Vor. £V0 .0(¢ والمحفزات الخاصة بالبذور hail) على سبيل Jl) براءة الاختراع الأمريكية أرقام 4 2.47080.07؛ و2.6000157). فى بعض التجسيمات؛ قد
يتم استخدام محفز خاص بالمرحلة التنموية Je) developmental stage سبيل المثال؛ محفز
نشط فى مرحلة لاحقة فى التنمية) فى تركيب أو طريقة الاختراع.
تتضمن التتابعات التنظيمية الإضافية التى قد تكون مرتبطة فى بعض التجسيمات عملياً
10 بجزئ حمض نووى UTRS 57 التى تقع بين تتابع محفز وتتابع ترميز الذى يعمل كتتابع رئيسى للنقل leader sequence 1805181100. يوجد التتابع الرئيسى للنقل فى MRNA المعالجة بالكامل؛ وقد يؤثر على معالجة النسخة الأولية؛ و/أو ثبات RNA تتضمن الأمثلة على التتابعات الرئيسية للنقل التتابعات الرئيسية translation leader sequences لبروتين الصدمة الحرارية shock protein 5681 للذرة و زهر البتونيا petunia (براءة الاختراع الأمريكية رقم
plant virus coat protein 2.77.825)؛ التتابعات الرئيسية لبروتين غطاء الفيروس النباتى Yo على سبيل «hail وغيرها. » plant rubisco leaders التتابعات الرئيسية لروبيسكو النباتى » يتم توفير Turner and Foster (1995) Molecular Biotech. 3)3(:225-36 المثال»
الأمثلة غير المحدودة على UTRs 55 من قبل: GmHsp (براءة الاختراع الأمريكية رقم 107 .2)؛ PhDnaK (براءة الاختراع الأمريكية رقم 717.8750.)؛ المخطلذ؛ TEV
-4ه- ¢(Carrington and Freed (1990) J.
Virol. 64:1590-7) و AGRtunos «GenBank Accession No.
VO0087; and Bevan et al. (1983)) أعلاه). تتضمن التتابعات التنظيمية الإضافية التى قد تكون مرتبطة فى بعض التجسيمات عملياً بجزئ حمض نووى Load التتابعات غير المنقولة '3؛ مناطق إنهاء النسخ 37( أو مناطق تذييل © بعديد الأدينيلات .poly—adenylation regions هذه هى العناصر الجينية الواقعة فى نفس اتجاه تتابع cad lS pal) وتتضمن عديدات النيوكليوتيد التى توفر إشارة تذييل بعديد الأدينيلات؛ و/أو الإشارات التنظيمية الأخرى القادرة على التأثير على النسخ أو معالجة (MRNA تعمل إشارة التذييل بعديد الأدينيلات فى النباتات لتسبب إضافة نيوكليوتيدات عديد أدينيلات polyadenylate nucleotides إلى النهاية :3 من نذير mRNA قد يتم اشتقاق تتابع التذييل بعديد الأدينيلات polyadenylation sequence ٠ من مجموعة من الجينات النباتية plant genes ؛ أو من جينات T-DNA مثال غير محدود على منطقة نهاية النسخ ”3 هو منطقة سينثاز نوبالين nos 3’; Fraley et al. (1983) Proc.
Natl.
Acad.
Sci. ) 3’ nopaline synthase (USA 80:4803-7 يتم تقديم مثال على استخدام مناطق غير منقولة 37 مختلفة فى et al. (1989) Plant Cell 1:671-80 109©108001. تتضمن الأمثلة غير المحدودة على Yo إشارات التذييل بعديد الأدينيلات polyadenylation signals واحد من جين Pisum sativum (Ps.RbcS2-E9; Coruzzi et al. (1984) EMBO J. 3:1671-9( 2 و .(GenBank Accession No.
EQ1312) AGRtu.nos يتم وصف معلومات إضافية حول التتابعات التنظيمية التى قد تكون مفيدة فى التجسيمات الخاصة؛ على سبيل المثال؛ فى Goeddel (1990) “Gene Expression Technology,” .Methods Enzymol. 185, Academic Press, San Diego, CA ٠ قد يشتمل جزئ حمض نووى معاد الاتحاد أو ناقل للاختراع الحالى على علامة قابلة للاختيار التى تمنح نمط ظاهرى قابل للاختيار على خلية محولة؛ مثل خلية نباتية. قد يتم أيضاً استخدام العلامات القابلة للاختيار لاختيار النباتات أو خلايا النبات التى تشتمل على جزئ حمض نووى للاختراع. قد ترمز العلامة مقاومة المبيد الحيوى biocide resistance ؛ مقاومة المضاد Yo الحيوى antibiotic resistance (على سبيل المثال؛ كاناميسين kanamycin ؛ جينيتيسين qa
((G418) Geneticin بليوميسين bleomycin ؛ وهيجروميسين «(hygromycin أو مقاومة مبيدات الأعشاب Je) herbicide resistance سبيل (JBL جليفوسات .(glyphosate تتضمن أمثلة على العلامات القابلة للاختيار» لكنها لا تقتصر على؛ جين حديث الذى يمنح مقاومة الكاناميسين kanamycin resistance وقد يتم اختياره لاستخدام» على سبيل (JB © الكاناميسين و6418 ؛ جين dll bar يمنح مقاومة tbialaphos جين synthase li. EPSP gene طافر الذى يمنح مقاومة الجليفوسات؛ جين نتريلادز nitrilase gene الذى يمنح مقاومة بروموزاينيل bromoxynil ؛ جين سينثاز أسيتولاكتات mutant acetolactate aU. (ALS) synthase gene الذى يمنح مقاومة الإيميدازولينون imidazolinone أو السلفونيل
يوريا ¢sulfonylurea وجين DHFR لمقاومة الميثوتريكسات .methotrexate-resistant ٠ العلامات المتعددة القابلة للاختيار تكون متاحة والتى تمنح مقاومة مقاومة للعوامل الكيميائية التى
تتضمن؛ على سبيل المثال وبدون حصرء أمبيسلين ampicillin ؛ بليوميسين bleomycin ؛ كلورامفينيكول chloramphenicol ؛ جنتاميسين gentamycin ؛ هيجروميسين hygromycin
؛ كاناميسين kanamycin ¢ لينكوميسين lincomycin ¢ ميثوتريكسات methotrexate ¢ فوسفينوثريمين Pphosphinothricin ؛ بوروميسين PUFOMYCIN ؛ سبيكتينوميسين
spectinomycin Vo ؛ ريفامبيسين rifampicin ؛ ستربتوميسين streptomycin ؛ وتتراسيكلين ©160807006. يتم توضيح أمثلة على هذه العلامات القابلة للاختيار فى؛ على سبيل JE
براءات الاختراع الأمريكية 5.250.731 7.475 17د ل لاخالاءه ولاك مغ لالت
قد يتضمن أيضاً جزئ حمض نووى أو ناقل للاختراع الحالى أو على نحو بديل علامة
ALE للفحص. قد يتم استخدام العلامات القابلة للفحص لمراقبة التعبير الجينى. تتضمن العلامات
٠ . القابلة للفحص التمثيلية م - جلوكورونيداز glucuronidase أو جين (GUS) uidA الذى يرمز إنزيم تكون الركائز المولدة للون chromogenic substrates المختلفة له معروفة ( Jefferson al. (1987) Plant Mol.
Biol.
Rep. 5:387-405 ©)؛ جين موضع -+ا؛ الذى Jap منتج الذى ينظم إنتاج أصباغ الأنثوسيانين anthocyanin pigments (اللون الأحمر) فى الأنسجة النباتية Dellaporta et al. )1988(( plant tissues "الاستنساخ الجزيئى Molecular R-nj J¥cloning Yo الذرة بواسطة علامات الينقول مع .86" فى 5 3a] 8th تنشيط التعبير
£Y14
-؟١- ler Genetics Symposium, P. Gustafson and R. Appels, eds., Plenum, الجينى Sutcliffe et al. (1978) ) lactamase gene لاكتاماز —f3 جين ¢NY (pp. 263-82) جين الذى يرمز إنزيم ركائز مولدات اللون (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75:3737-41 chromogenic سيفالوسبورين مولد اللون (PADAC المختلفة له معروفة (على سبيل المثال»
Ow et al. (1986) Science ) luciferase gene جين لوسفيراز ¢(cephalosporin © catechol dioxygenase الذى يرمز كاتيكول دى أوكسيجيناز XYIE جين ¢(234:856-9
Zukowski et al. ) chromogenic catechols الذى يحول الكاتيكولات المولدة للون lkatu et al. ) amylase gene Pld جين ¢((1983) Gene 46(2-3):247-55 الذى يرمز إنزيم tyrosinase gene جين تيروزيناز ¢((1990) BiofTechnol. 8:241-2 الذى بدوره « dopaquinone ودوباكوينون DOPA إلى tyrosine على أكسدة التيروزين jE Vs
Katz et al. (1983) J. Gen. Microbiol. 129:2703-( melanin يتكثف إلى ميلانين —ay ¢(14 جالاكتوزيداز .galactosidase تتضمن الطرق المناسبة لتحويل الخلايا المضيفة host cells أى طريقة التى بواسطتها يمكن إدخال DNA فى خلية؛ على سبيل JB وبدون حصر: عن طريق تحويل البروتوبلاستات protoplasts Vo (انظرء على سبيل المثال» براءة الاختراع الأمريكية ANAL 0.0( عن طريق امتصاص DNA بوساطة التجفيف/التثبيط (انظر؛ على سبيل Potrykus et al. Judi Mol. Gen. Genet. 199:183-8 )1985((¢ عن طريق الصعق الكهربائى electroporation (انظر؛ على سبيل المثال؛ براءة الاختراع الأمريكية 4.707 70.)؟ عن طريق الرج مع ألياف كربيد السيليكون silicon carbide fibers (انظرء على سبيل المثال؛ ٠ براءات الاختراع الأمريكية 0.307.577 و2.474.715)؛ عن طريق التحويل بوساطة Agrobacterium (انظرء على سبيل (JU) براءات الاختراع الأمريكية 0.071.100( 73 .م كام كتف للاخ تف كف 2.441 و٠0 1.745.7)؟ وعن طريق تسريع الجسيمات المغلفة ب DNA (انظرء على سبيل (JU) براءات الاختراع الأمريكية ...م لت 0000( ااا ف لات تالت ATO 5 CLV ATTY ب 1 YO .من خلال تطبيق Jie هذه التقنيات؛ قد يتم تحويل الخلايا من أى نوع فعلياً بشكل ثابت. فى بعض
١
التجسيمات؛ يتكامل تحويل DNA فى جينوم الخلية المضيفة. فى Alla الأنواع متعددة الخلاياء قد يتم إعادة توليد الخلايا المعدلة وراثياً transgenic cells فى كاثن a معدل جينياً. قد يتم استخدام أى من هذه التقنيات لإنتاج نبات معدل cia على سبيل المثال؛ يشتمل على تتابع
حمض نووى واحد أو أكثر للاختراع فى جينوم النبات المعدل جينياً transgenic plant > تعتمد الطريقة الأكثر استخداماً على نطاق واسع لإدخال ناقل تعبير جينى فى النباتات على نظام التحول الطبيعى ل rhizogenes ;A. tumefaciens .Agrobacterium .ا هى بكتيريا تربة مسببة للأمراض نباتية plant pathogenic soil bacteria التى تحول WIA النبات جينياً. بلازميدات Ti ولا ل A. rhizogenes A. tumefaciens ¢ على التوالى» تحمل الجينات المسئولة عن التحويل الجينى للنبات. تحتوى البلازميدات (المحدثة للورم tumor— Ti (inducing) على جزء كبير؛ معروف باسم (T-DNA الذى يتم تحويله إلى نباتات محولة. هناك جزءِ AT من بلازميد (Ti منطقة vir يكون مسئلاً عن تحويل T-DNA يتم حد منطقة T-DNA بالحدود اليسرى واليمنى التى يتألف كل منها من تتابعات نيوكليوتيد مكررة طرفية. فى بعض النواقل الثنائية binary vectors المعدلة؛ تم حذف الجينات المحدثة للورم tumor— genes 11000109 ويتم استخدام وظائف منطقة vir لتحويل DNA الخارجية التى تحدها Vo تتابعات الحدود T-DNA قد تحتوى منطقة-1 (Lad على سبيل JUN على علامة قابلة للاختيار لإيسترداد النباتات والخلايا المعدلة جينياً بكفاءة؛ وموقع استنساخ متعدد لإدخال التتابعات
لتحويل Jie حمض نووى مرمز لبروتين الدمج للاختراع. وبالتالى؛ فى بعض التجسيمات؛ يتم اشتقاق ناقل نحويل النبات plant transformation vector من بلازميد Ti ل A. tumefaciens (انظر؛ على سبيل المثال براءة الاختراع الأمريكية ٠ أرقام تمك لالاق تثتك ATY 5 (EL AATLAYY 1 £0.00 وبراءة الاختراع الأوروبية رقم ١77 VAY +( أو بلازميد أ ل WA. rhizogenes تتضمن ناقلات تحويل النبات plant transformation vectors الإضافية؛ على سبيل المثال وبدون حصرء تلك الموصوفة بواسطة «Herrera—Estrella et al. (1983) Nature 303:209-13; Bevan et al. (1983) أعلاه؛ 3:637-42 ¢Klee et al. (1985) Bio/Technol. وفى براءة الاختراع الأوروبية رقم ١٠7١ #١١ 5 ؛ وتلك المشتقة من أى مما سبق. البكتيريا الأخرى» Sinorhizobium, (Jie £Y14
اس Mesorhizobium (Rhizobium .؛ التى تتفاعل بشكل طبيعى مع النباتات يمكن تعديلها لتتوسط التحويل الجينى إلى عدد من النباتات المتنوعة. يمكن Jaa هذه البكتيريا التكافلية symbiotic bacteria المرتبطة بالنبات مختصة بالتحويل الجينى عن طريق اكتساب كل من بلازميد Ti مجرد وناقل ثنائى مناسب.
0 بعد توفير DNA خارجى المنشاً للخلايا المتلقية recipient cells ؛ يتم تحديد الخلايا المحولة بشكل عام لمزيد من زراعة وتجديد النبات. من أجل تحسين القدرةٍ على تحديد الخلايا المحولة؛ قد يرغب أحد فى استخدام جين علامة قابل للاختيار أو قابل للفحص؛ كما هو مبين سابقاً؛ مع الناقل المستخدم لتوليد كفاءة التحول. فى الحالة حيث يتم استخدام علامة قابلة للاختيار؛ يتم تحديد الخلايا المحولة داخل مجموعة الخلايا المحولة المحتملة من خلال تعريض
٠ الخلايا إلى عامل انتقائى selective agent أو عوامل انتقائية. فى الحالة حيث يتم استخدام علامة قابلة (asd قد يتم فحص الخلايا للسمة الجينية للعلامة المطلوبة. الخلايا التى تبقى حية عند التعرض للعامل الانتقائى؛ أو الخلايا التى تم تسجيلها ايجابية فى تحليل andl] قد يتم زراعتها فى الأوساط التى تدعم تجديد النباتات. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم تعديل أى وسط زراعة نسيج نبات plant tissue culture media مناسب (على سبيل ١ المثال؛ الأوساط MS و6!ا) عن طريق تضمين مواد أخرى,؛ مثل منظمات النمو | growth 635 . قد يتم إبقاء النسيج على أوساط قاعدية basic media مع منظمات النمو حتى يكون يتاح نسيج كافى لبدء جهود تجديد النبات؛ أو اتباع دورات متكررة للاختيار اليدوى» حتى تصبح مورفولوجيا النسيج مناسبة للتجديد (على سبيل المثال؛ على الأقل أسبوعين)؛ ثم نقله إلى أوساط تؤدى إلى تكوين برعم Shoot يتم نقل المزارع دورياً حتى يحدث تكوين براعم كافى. بمجرد ٠ تتكوين البراعم؛ يتم نقلها إلى أوساط تؤدى إلى تشكيل الجذور. ae تكون الجذور الكافية؛ يمكن نقل النباتات إلى التربة لمزيد من النمو والنضج. للتأكيد على وجود جزئ الحمض النووى موضوع الاهتمام (على سبيل المثال؛ تتابع نيوكليوتيد مرمز لعديد ببتيد يشتمل على بروتين دمج واحد على الأقل للاختراع) فى نبات تجديد؛ قد يتم إجراء العديد من المقايسات. تتضمن هذه المقايسات؛ على سبيل المثال: المقايسات © البيولوجية الجزيئية molecular biological assays ؛ مثل التلطيخ الجنوبى والشمالى £Y14
(PCR « Southern and Northem blotting وتتابع الحمض النووى؛ المقايسات البيولوجية الكيميائية biochemical assays ؛ مثل الكشف عن وجود منتج بروتين» على سبيل المثال؛ عن طريق الوسائل المناعية ELISA) immunological means و/أو البقع Western ap all (blots أو عن طريق الوظيفة الإنزيمية؛ مقايسات sia النبات؛ Jie مقايسات الأوراق أو الجذور؛ © وتحليل النمط الظاهرى للنبات المجدد بالكامل.
قد يتم تحليل حالات التكامل؛ على سبيل (JU عن طريق تضخيم PCR باستخدام؛ على سبيل المثال؛ بادئات قليل النيوكليوتيد oligonucleotide primers التى تكون محددة لتتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام. من المفهوم أن التنميط الجينى PCR يتضمن؛ لكنه لا يقتصر على؛ تفاعل سلسلة بوليميراز (PCR) polymerase—chain reaction تضخيم DNA ٠ الجينومى المشتق من نسيج النبات المضيف host plant tissue المعزول المتوقع أنه يحتوى على جزئ الحمض النووى موضوع الاهتمام المدمج فى الجينوم؛ متبوعاً بالاستنساخ المعيارى وتحليل التتابع لمنتجات تضخيم 4ا00. تم وصف طرق التنميط الجينى ل PCR جيداً (انظرء على سبيل المثال» 32:243-53 .ل (Rios, ©. etal. (2002) Plant وقد يتم تطبيقها على DNA الجينومى المشتق من أى نوع نبات أو نوع نسيج؛ Lay فى ذلك مزارع الخلية cell
.cultures ٠ عادةً ما يحتوى نبات معدل جينياً باستخدام طرق التحويل المعتمدة على معاد الاتحاد فردى مدخل فى كروموسوم واحد. يشار إلى DNA على تتابع Agrobacterium أو "حالة تكامل " transgenic event معاد الاتحاد الفردى ب "حالة معدلة جينياً DNA تتابع لتتابع heterozygous هذه النباتات المعدلة جينياً تكون متغايرة الزيجوت "integration event متماثل الزيجوت Lia المدخل. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم الحصول على نبات معدل DNA ٠ فيما يتعلق بجين تحوير عن طريق التزاوج الجنسى transgenic plant homozygous لنبات معدل جينياً معزول مستقل الذى يحتوى ) selfing (إخصاب ذاتى sexually mating فردى مع نفسه؛ على سبيل المثال؛ نبات €XOgeENoOUs gene Lad) على تتابع جين خارجى المنتجة سوف يكون متماثل الزيجوت بالنسبة للترانسجين. إنبات FI ربع بذرة Fl لإنتاج بذرة (FO أو SNP باستخدام مقايسة Sale ينتج النباتات التى يمكن اختبارها لتغاير الزيجوت؛ FI بذور Yo
£Y14
+ مقايسة تضخيم حرارى thermal amplification التى تسمح بالتمييز بين الزيجوت متغايرة heterozygotes الآلاثل والزيجوت متمائلة homozygotes الآلائل (أى؛ مقايسة تلقيح .(zygosity assay فى تجسيمات خاصة؛ يتم إنتاج نسخ من بروتين دمج منشط نسخى تركيبى واحد على الأقل يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز Joli نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل فى خلية؛ التى فيها تم إدخال جزئ حمض نووى واحد على الأقل يشتمل على تتابع نيوكليوتيد لترميز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى واحد على الأقل. قد يتم التعبير الجينى لكل بروتين دمج منشط نسخى تركيبى من تتابعات حمض نووى متعددة مدخلة فى حالات تحويل مختلفة؛ أو من تتابع حمض ٠ نووى واحد مدخل فى Alla تحويل واحدة. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم التعبير الجينى للعديد من بروتينات الدمج هذه تحت تحكم محفز واحد. فى تجسيمات (al قد يتم التعبير الجينى للعديد من بروتينات الدمج هذه تحت تحكم محفزات متعددة. بالإضافة إلى التحول المباشر لنبات أو خلية نبات بواسطة جزئ حمض نووى للاختراع؛ قد يتم تحضير النباتات المعدلة جينياً فى بعض التجسيمات عن طريق تهجين نبات أول يحتوى 0 على حالة معدلة جينياً واحدة على الأقل مع نبات ثانى يفتقر إلى هذه الحالة. على سبيل (JE قد يتم إدخال جزئ حمض نووى يشتمل على تتابع نيوكليوتيد مرمز لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل فى خط نبات أول الذى يكون قابل للتحويل. لإنتاج نبات معدل جينياً؛ قد يتم تهجين هذا النبات المعدل جينياً مع خط ols Yo ثانى للإنجبال الداخلى لتتابع النيوكليوتيد الذى يرمز بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى فى خط النبات الثانى. المواد النباتية التى تشتمل على منشط نسخى لبروتين دمج فى بعض التجسيمات؛ يتم توفير نبات؛ حيث يشتمل النبات على خلية نباتية تشتمل على تتابع نيوكليوتيد مرمز لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط
التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل. فى تجسيمات خاصة؛ قد يتم إنتاج هذا النبات عن طريق تحويل نسيج نبات أو خلية نبات؛ وتجديد النبات كله. فى تجسيمات أخرى؛ قد يتم الحصول على هذا النبات من خلال انجبال داخلى لحمض نووى يشتمل على تتابع نيوكليوتيد الذى يرمز بروتين © دمج منشط نسخى تركيبى فى بلازما جرثومية germplasm يتم Lad توفير المواد النباتية التى تشتمل على خلية النبات هذه. قد يتم الحصول على هذه المادة النباتية من نبات يشتمل على الخلية النباتية.
قد يظهر نبات معدل جينياً أو sale نباتية تشتمل على تتابع نيوكليوتيد مرمز لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى الذى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على ٠ الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل فى بعض التجسيمات واحدة أو أكثر من الخصائص التالية: التعبير الجينى لبروتين الدمج فى خلية النبات؛ التعبير الجينى لبروتين الدمج فى صانعة خلية النبات؛ التعبير الجينى لبروتين الدمج فى نواة خلية النبات؛ توضع بروتين الدمج فى خلية النبات؛ دمج تتابع النيوكليوتيد فى جينوم خلية النبات؛ وجود تتابع النيوكليوتيد فى DNA خارج الصبغى لخلية النبات؛ و/أو وجود نسخة RNA Vo مقابلة لتتابع النيوكليوتيد فى خلية النبات. قد يكون لهذا النبات إضافياً واحدة أو أكثر من السمات المرغوب فيها غير التعبير الجينى لبروتين الدمج المرمز .encoded fusion protein قد تتضمن هذه السمات تلك الناتجة من التعبير الجينى لتتابع نيوكليوتيد داخلى المنشاً أو معدل جينياً يتم تنظيم التعبير الجينى له بواسطة بروتين الدمج فى خلية النبات؛ على سبيل المثال وبدون حصر: مقاومة الحشرات؛ الآفات الأخرىء والعوامل المسببة للمرض؛ تحمل مبيدات الأعشاب؛ ٠ الثبات المعزز enhanced stability ؛ الإنتاج؛ أو العمر الافتراضى shelf-life ؛ التحملات
البيئية؛ الإنتاج الصيدلى؛ إنتاج المنتج الصناعى؛ والتعزيزات الغذائية. قد يكون النبات المعدل جينياً وفقاً للاختراع هو أى نبات قابل للتحويل بواسطة جزئ حمض نووى للاختراع. وعليه؛ قد يكون النبات ثنائى الفلقة أو أحادى الفلقة. تتضمن الأمثلة غير المحدودة على النباتات ذات الفلقتين dicotyledonous plants القابلة للاستخدام فى الطرق Yo الحالية Arabidopsis البرسيم alfalfa ؛ الفول beans ؛ البروكلى broccoli ؛ الملفوف
cabbage « الكانولا canola ؛ الجزر carrot ¢ القرتبيط cauliflower ؛ الكرفس celery ؛ الملفوف الصينى Chinese cabbage ؛ القطن cotton ؛ الخيار cucumber ؛ الباذنجان eggplant ؛ الخس lettuce ؛ البطيخ melon » البازلاء pea ؛ الفلفل pepper ء_الفول السودانى peanut ؛ البطاطا potato ؛ اليقطين pumpkin » الفجل radish اللفت
rapeseed © ؛ السبانخ spinach ؛ فول الصويا soybean ؛ الاسكواش 5001850 ؛ بنجر السكر sugarbeet ؛ عباد الشمس sunflower ؛ التبغ tobacco ؛ الطماطم tomato ؛ والبطيخ الأحمر watermelon تتضمن الأمظلة غير المحدودة على النباتات ذات الفلقة monocotyledonous plants الواحدة القابلة للاستخدام فى الطرق الحالية الذرة corn ؛ البصل 0000 » الأرز «rice السرغوم sorghum ؛ القمح wheat ؛ الجاودار rye ؛ الدخن millet «
« switchgrass ؛ التبن triticale التريتيكالى ¢ oat ؛ الشوفان sugarcane قصب السكر Vo قد يتم استخدام النباتات المعدلة جينياً وفقاً للاختراع أو زراعتها بأى طريقة. turfgrass والمروج
توفر أيضاً بعض التجسيمات المنتجات السلعية التى تحتوى على تتابع نيوكليوتيد واحد أو
أكثر الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط DNAS ١ واحد على الأقل؛ على سبيل المثال؛ منتج سلعى منتج من نبات معاد الاتحاد أو بذرة تحتوى على تتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر. تتضمن المنتجات السلعية التى تحتوى على تتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر التى ترمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل
نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل؛ على سبيل المثال وبدون حصر: المنتجات
٠ الغذائية؛ الوجبات؛ الزيوت؛ أو الحبوب المسحوقة أو الكاملة أو بذور نبات يشتمل على تتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر الذى يرمز بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى هذا. الكشف عن تتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى للاختراع فى واحدة أو أكثر
من السلع أو المنتجات السلعية هو دليل فعلى على أن السلعة أو المنتج السلعى قد تم إنتاجه على الأقل جزئياً من نبات يشتمل على تتابع نيوكليوتيد واحد أو أكثر الذى يرمز بروتين دمج منشط
Yo نسخى تركيبى للاختراع. فى تجسيمات خاصة؛ يشتمل منتج سلعى للاختراع على كمية قابلة
£Y14
A — أ — Jo lis نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم إنتاج هذه المنتجات السلعية؛ على سبيل (JB من خلال الحصول على نباتات معدلة جينياً transgenic plants © وتحضير الطعام أو الغذاء منها. فى بعض التجسيمات, النبات المعدل جينياً أو البذرة التى تشتمل على جين تحوير يشتمل على تتابع النيوكليوتيد الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى للاختراع قد يشتمل أيضاً على حالة معدلة جينياً أخرى واحدة على الأقل فى الجينوم الخاص به؛ بما فى ذلك وبدون حصر: حالة معدلة جينياً Ally منها يتم نسخ جزئ (RNA جين مرمز لبروتين مبيد للحشرات insecticidal Je) protein | ٠ سبيل (JB البروتين المبيد للحشرات ¢(Bacillus thuringiensis جين تحمل مبيد الأعشاب herbicide tolerance gene (على سبيل (JOB جين يوفر تحمل للجلايفوسات ¢(glyphosate وجين يساهم فى النمط الظاهرى المرغوب فيه فى النبات المعدل جينياً (على سبيل المثال؛ زيادة الإنتاج؛ استقلاب الحمض الدهنى المعدل | altered fatty acid metabolism ؛ أو شفاء عقم الذكور الهيولى .(cytoplasmic male sterility Ye فى بعض التجسيمات؛ قد يشتمل النبات المعدل جينياً أو البذرة التى تشتمل على جين تحوير يشتمل على تتابع نيوكليوتيد الذى يرمز بروتين دمج منشط نسخى تركيبى للاختراع على جين مستهدف داخلى المنشاً أو أصلى داخل جينوم النبات المعدل جينياً؛ بما فى ذلك وبدون حصر: جين داخلى Land) مستهدف لسمة استقلاب حمض دهنى معدل»؛ جين داخلى المنشأً مستهدف لسمة تحمل الجفاف»؛ جين داخلى Land) مستهدف لسمة كفاءة استخدام النيتروجين cnitrogen Y. أو أى جين آخر داخلى Land) مستهدف يساهم فى النمط الظاهرى المطلوب فى النبات المعدل جينياً (على سبيل المثال؛ زيادة الإنتاج؛ أو شفاء عقم الذكور الهيولى). قد يتم ارتباط الجين داخلى المنشاً أو الأصلى المستهدف عملياً بتتابع نيوكليوتيد الذى يرتبط به بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى على ang التحديد؛ مما يؤثر على نسخ الجين المستهدف. تنظيم التعبير الجينى بواسطة منشط نسخى لبروتين الدمج £Y14
فى بعض التجسيمات؛ قد يتم استخدام بروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل لزيادة (على سبيل المثال؛ بدء) التعبير الجينى لتتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام (على سبيل المثال؛ الجين موضوع الاهتمام) فى خلية. © قد يكون تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام فى بعض التجسيمات داخلى Land) لجينوم الخلية. فى تجسيمات (ial تم إدخال جزئ حمض نووى خارجى exogenous nucleic acid Lisl molecule واحد على الأقل يشتمل على تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام فى الخلية. وبشكل عام؛ سيتم التعرف على تتابع نيوكليوتيد ثانى مرتبط lee بتتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام بواسطة النطاق الرابط ل DNA لبروتين الدمج؛ بحيث يمكن أن يحدث ارتباط ثابت ومحدد بين ٠ تتابع النيوكليوتيد SE وبروتين الدمج. فى بعض الأمثلة؛ يشتمل جزئ الحمض النووى الواحد على الأقل الذى يشتمل على تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام أيضاً على تتابع النيوكليوتيد الثانى. فى بعض الأمثلة؛ يتم إدخال جزئ الحمض النووى الواحد على الأقل الذى يشتمل على تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام فى الخلية المضيفة؛ بحيث يتم ارتباط تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام عملياً بتتابع نيوكليوتيد ثانى الذى يكون داخلى Land) للخلية المضيفة. على سبيل المثال؛ VO قد يسهل جزئ الحمض النووى الذى يشتمل على تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام إعادة الاتحاد المتجانسة التى تدخل تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام فى جينوم الخلية المضيفة؛ بحيث يتم ارتباط تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام عملياً بتتابع داخلى المنشاً الذى يتم التعرف عليه بواسطة نطاق رابط ل 8/لا0. فى بعض AEN يكون جزئ الحمض النووى الواحد على الأقل الذى يشتمل على تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام داخلى Land أو أصلى داخل الخلية المضيفة؛ بحيث يتم ٠ ارتباط تتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام عملياً بتتابع النيوكليوتيد الثانى الذى يكون داخلى Land)
للخلية المضيفة host cell قد يتم التعبير الجينى لتتابع (تتابعات) النيوكليوتيد المتعددة موضوع الاهتمام التى يتم إدخالها فى حالات تحويل مختلفة تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج واحد فى بعض الأمثلة. وفى أمثلة og al يتم تنظيم تتابع نيوكليوتيد واحد موضوع الاهتمام (على سبيل المثال؛ Ala دمج Yo واحدة) والتعبير الجينى له. فى بعض التجسيمات؛ قد يتم تنظيم العديد من تتابعات النيوكليوتيد
١ «= موضوع الاهتمام عن طريق ارتباط بروتين الدمج للاختراع بموقع ارتباط حمض نووى واحد؛ على سبيل المثال؛ قد يتم ارتباط العديد من تتابعات النيوكليوتيد موضوع الاهتمام عملياً بنفس تتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence الثانى الذى يرتبط به النطاق الرابط ل DNA لبروتين الدمج على وجه التحديد. تتابعات النيوكليوتيد موضوع الاهتمام التى تشتمل على هذا التعدد ليست © بالضرورة هى نفسها فى أمثلة معينة. وبالتالى؛ قد يتم التعبير الجينى للعديد من منتجات الجين المختلفة تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج واحد.
فى تجسيمات خاصة؛ قد يكون منتج التعبير الجينى لتتابع النيوكليوتيد موضوع الاهتمام الذى يكون تحت التحكم التنظيمى لبروتين الدمج للاختراع هو منتج جين علامة؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ جزئ تألقى. قد توفر الملاحظات الكمية والنوعية فيما يتعلق بالتعبير الجينى aiid ٠ التعبير الجينى هذا نظام لتقييم الخواص التنظيمية الخاصة لحافز تفاعل نطاق تنشيط
التعبير الجينى خاص أو بديل حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى. قد يتم التعبير الجينى لأى منتج تعبير جينى (على سبيل المثال؛ بروتين؛ بروتين نذير precursor protein وجزئ RNA تثبيطى) تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على JN (و/أو حافز ١ تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل. فى Ad خاصة؛ قد يكون منتج التعبير الجينى تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى؛ بدون حصرء هو عديد ببتيد داخلى المنشأ أو أصلى الذى يتم التعبير الجينى له عادةً فى الخلية المضيفة التى فيها يتم إدخال حمض نووى مرمز لبروتين الدمج. فى أمثلة أخرى؛ قد يكون منتج التعبير الجينى تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى هو عديد ببتيد متغاير heterologous polypeptide ٠ الذى لا يتم التعبير الجينى له fale الخلية المضيفة. على سبيل المثال وبدون حصر » قد يكون منتج التعبير الجينى تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى هو عديد ببتيد مشارك فى مقاومة مبيدات الأعشضاب | herbicide resistance ؛ مقاومة الفيروسات virus resistance ؛ مقاومة البكتيريا الممرضة bacterial pathogen resistance ؛ مقاومة الحشرات insect resistance ؛ مقاومة النيماتودا nematode resistance Yo « أو مقاومة الفطريات fungal resistance انظرء على سبيل
£Y14
“vy مكف مكاي VY 2.67/70 52214877 المثال» براءة الاختراع الأمريكية قد يكون منتج التعبير الجينى تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى .1.777.47١و تركيبى على نحو بديل؛ على سبيل المثال وبدون حصر؛ هو عديد ببتيد مشارك فى قوة نمو النبات أو الإنتاج (بما فى ذلك عديدات الببتيد المشاركة فى تحمل درجات الحرارة القصوى» ظروف والبيئة الكيميائية)؛ أو عديد ببتيد الذى قد يتم استخدامه ld التربة؛ مستويات الضوء؛ مستويات 0 كعلامة لتحديد نبات يشتمل على السمة موضوع الاهتمام (على سبيل المثال؛ منتج جين علامة
قابل للاختيار؛ وعديد ببتيد مشارك فى لون البذور). تتضمن الأمثلة غير المحدودة على عديدات الببتيد التى قد تكون تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات ٠ واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل فى بعض تجسيمات الاختراع: أسيتولاكتاز acetolactase synthase jt. (5لم)؛ ALS طافرء نذائر ALS precursors (انظرء على سبيل المثال» براءة الاختراع الأمريكية 5..013.7549)؛ EPSPS (انظرء على سبيل (JU براءات الاختراع الأمريكية CP4 EPSPS is f(T.YVO VE 5 50/14١ أو EPSPS من الفئة الثالثة؛ الإنزيمات ١ التى تعدل العملية الفسيولوجية التى تحدث فى الصانعة plastid ؛ متضمنة على سبيل JU وبدون jas ¢ التمثيل الضوئى photosynthesis « وتركيب الأحماض الدهنية fatty acids « الأحماض الأمينية acids 207100 ؛ الزيوت؛ الأروتينويدات arotenoids ؛ التيربينويدات terpenoids ؛ والنشا 518+00. تتضمن AEN) غير المحدودة الأخرى على عديدات الببتيد التى قد تكون تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى فى التجسيمات الخاصة: ٠ زياكسانثين إيبوكسيداز zeaxanthin epoxidase ؛ كولين أكسيجيناز أحادية choline monooxygenase ؛ فيروكيلاتاز ferrochelatase ؛ نازع تشبع الحمض الدهنى أوميجا -؟ omega-3 fatty acid desaturase » سينثيتاز الجلوتامين glutamine synthetase ؛ إنزيمات تعديل النشا starch modifying enzymes ؛ عديدات الببتيد المشاركة فى تركيب الأحماض الأمينية الأساسية essential amino acids ؛ طليعة فيتامين provitamin A A ¢ Yo الهرمونات» توكسين «Bt toxin والبروتينات. تتابعات النيوكليوتيد التى ترمز الببتيدات السابقة
£Y14
تكون متاحة فى المجال؛ وقد يتم ارتباط تتابعات النيوكليوتيد هذه عملياً بموقع ارتباط محدد للنطاق الرابط ل DNA ليتم التعبير الجينى لها تحت التحكم التنظيمى لبروتين دمج منشط نسخى تركيبى يشتمل على حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى للنبات واحد على الأقل (و/أو حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل) ونطاق رابط ل DNA واحد على الأقل الذى يرتبط على وجه © التحديد بالموقع المرتبط عملياً. علاوة على ذلك؛ قد يتم تحديد تتابع نيوكليوتيد بديل موضوع ا لاهتمام dl) يرمز أى من عديدات الببتيد سابقة الذكر المطلوب وضعه تحت التحكم التنظيمى بواسطة أولئك الخبراء فى المجال (على سبيل (JE) عن طريق استنساخ الجينات عالية التماثل إلى جينات أخرى ترمز عديد الببتيد الخاص؛ أو عن طريق توليد التتابع فى بيئة افتراضية فى ضوء انحلال كودون (DNA) قد تكون هذه البدائل مطلوبة فى التجسيمات الخاصة؛ على سبيل JU لتتوافق مع استخدام الكودون المفضل للكائن الحى المضيف. بمجرد تحديد تتابع النيوكليوتيد البديل موضوع الاهتمام + قد يتم تصميم [gH حمض نووى لتوفير تحكم تنظيمى للتتابع dad gs عديد Ah منشط نسخى تركيبى وفقاً للاختراع» على سبيل JB عن طريق ارتباط تتابع النيوكليوتيد البديل موضوع الاهتمام فى جزئ الحمض النووى عملياً بموقع ارتباط معروف للنطاق الرابط ل DNA الموجود Vo داخل بروتين الدمج المنشط النسخى التركيبى الخاص الذى يتم استخدامه. فى التجسيمات الموصوفة هناء قد يتم ملاحظة زيادة مفاجئة فى التعبير الجينى لتتابع النيوكليوتيد البديل موضوع الاهتمام eo) سبيل (JU فى خلية نباتية مضيفة (host plant cell عندما يوجد جزئ الحمض النووى وأحد بروتينات الدمج المنشطة النسخية التركيبية الخاصة الموصوفة هنا فى خلية مضيفة فى نفس الوقت. Ye يتم توفير المراجع التى تم مناقشتها هنا فقط للوصف الخاص بها قبل تاريخ إيداع التطبيق الحالى. لا يوجد هنا أى شئ يمكن تفسيره بأنه إقرار بأن المخترزعون لا يحق لهم أن يؤرخوا هذا يتم تقديم الأمثلة التالية لتوضيح سمات و/أو تجسيمات خاصة معينة. لا يجب تفسير الأمثلة على أنها تحد من الوصف على السمات الخاصة أو التجسيمات الممثلة.
الأمثلة مثال :١ تحديد حوافز تفاعل Interaction Motifs تنشيط تعبير جينى نباتى Plant Transactivation تم تحديد سبعة بروتينات كنظائر لنطاق تنشيط التعبير الجينى 7016 (المتوالية رقم: :)١ ٠ه GenBank Accession) ERF2 (GenBank Accession No.
ACF57857.1) PTI4 «(GenBank Accession No.
NP_567530.4) AtERF1 (No.
NP_199533.1 GenBank ) DREBIA (GenBank Accession No.
CAB93940.1) ORCA2 GenBank Accession No. )CBF1 «(Accession No.
NP_567720.1 1 طلا 5 .(GenBank Accession No.
NP_001105709.1) DOF1 ٠ شارك تتابع الحمض الأمينى لنطاق تنشيط التعبير الجينى 7016 (المتوالية رقم: )١ فى تتابع مماثل مع مناطق منشطات استنساخ النبات المفترضة oda وتم استخدام التتابع 016 لتحديد موقع نطاق تنشيط التعبير الجينى داخل كل منشط. نطاقات تنشيط التعبير الجينى المحددة لبروتينات منشط النبات هذه هى: المتوالية رقم: 114(7)؛_المتوالية رقم: ¥ ((ERF2) المتوالية رقم: ؛ ((AtERF]) المتوالية رقم: © ((ORCA2) المتوالية رقم: ((DREBLIA)T المتوالية رقم: ((CBF1) v ٠ و المتوالية رقم: A (0051). ثم؛ تم استخدام حافز التفاعل للنطاق ١١ esl) لتنشيط التعبير الجينى ١/016 (شكل 9؛ المتوالية رقم: 4( لتحديد موقع حافز التفاعل من نطاقات تنشيط التعبير الجينى النباتى. شكل ؟ يبين محاذاة 1/016 مع نطاقات تنشيط التعبير الجينى النباتى» حيث يتم تسليط الضوء على حوافز التفاعل الجديدة. مثال 7: تعديل حوافز التفاعل المحددة لنطاقات تنشيط التعبير الجينى النباتى 7 تم تعديل حوافز تفاعل نطاقات تنشيط التعبير الجينى النباتى المحددة. تم إنتاج بدائل جديدة لحوافز التفاعل Al احتوت على رواسب اتصال الحمض الأمينى amino acid contact لحافز تفاعل النطاق الفرحى ١| لنطاق تنشيط التعبير Langlois et .VP16 ual Lal. (2008) J.
Am.
Chem. 506. 06 تم اقتراح ست رواسب اتصال حمض أمينى لنطاق تنشيط التعبير الجينى 7/016 لتتفاعل مباشرة مع Tb] وحدة فرعية Jalal
لا الاستنساخ TRHH شكل .١ تم إدخال أحماض أمينية داخل حوافز التفاعل لنطاقات تنشيط التعبير الجينى النباتى المحددة حديثاً لإنتاج تتابعات بديلة. افترضنا أن تعديل حوافز التفاعل لتحتوى على ست رواسب اتصال حمض أمينى محددة من حافز تفاعل 016/ للنطاق الفرعى ١١ سينتج حوافز تفاعل معدلة للمنشطات النباتية plant activators © القادرة على التفاعل مع تنوع أكبر من عوامل الاستنساخ؛ مما يؤدى إلى مستويات أعلى من التعبير الجينى للبروتين. تعديلات ERF2 انحازت المنطقة من 5053 فى ERF2 للنطاق الفرعى 11 لنطاق تنشيط التعبير الجينى 6 (شكل ١)؛ وتم تحديدها كتتابع لنطاق تنشيط التعبير الجينى النباتى ل .ERF2 تم إدخال ٠ تعديلات فى المنطقة التى وجد أنها تقابل حافز تفاعل النطاق الفرعى ١| لنطاق تنشيط التعبير الجينى 016/؛ من 05066 إلى 05076. تم تعديل رواسب الحمض الأمينى التى كانت مختلفة عن رواسب الاتصال الست لحافز تفاعل النطاق الفرعى اا لنطاق تنشيط التعبير الجينى VP16 أدت هذه التغييرات إلى حافز تفاعل معدل exemplary modified interaction Lic ل of) ERF2 تتابع حافز تفاعل بديل) والذى يكون مماثل لذلك الذى للنطاق الفرعى Il لنطاق ١ تنشيط التعبير الجينى 016/.. شكل JF تعديلات علي حوافز تفاعل 6871 /04581 DOF1 ; 114, AtERF1, ORCA2, تم إدخال تعديلات علي حوافز تفاعل 08571 PTI4, AtERF1, ORCA2, DREBIA, و 0051 المماثلة لتلك المدخلة علي LERF2 لقد تم تعديل رواسب الحمض الأمينى للتتابعات الأصلية lly كانت مختلفة عن رواسب الاتصال المباشر الست لحافز التفاعل للنطاق الفرعى II Yo لنطاق تنشيط التعبير الجيني ل 7016 , وبالتالي إنتاج حوافز تفاعل مختلفة تمثيلية. تم إدخال هذه التغييرات لجعل حوافز التفاعل النبات المختلفة متماثلة lo) سبيل المثال؛ مماثلة وظيفياً) لتلك الخاصة بالنطاق الفرعى 1 لنطاق تنشيط التعبير الجيني 016/. التتابعات التمثيلية لحوافز التفاعل البديلة أو المعدلة؛ بالمقارنة بتتابع حافز التفاعل الأصلي للنطاق الفرعى I لنطاق تنشيط التعبير الجينى 016/» واردة فى الأشكال 4 -9.
١ اج مثال ؟ : اختبار حوافز تفاعل نطاقات تنشيط النبات في سلاظة مراسل Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae Reporter Strain سلالة مراسل تم )1 سلالة مراسل Saccharomyces cerevisiae لاختبار نطاقات تنشيط النبات التى © تشتمل إما على حوافز تفاعل أصلية أو بديلة. أسفر إجراء الاستنساخ ثلاثى الخطوات عن بناء ناقل تكامل الخميرة؛ 1 ا/0110-2586-1, (شكل .)٠١ أولاً , تم تكبير قطعتين منفصلتين من ناقل مراسل reporter vector الخميرة «SSA yeast «(Doyon et al. (2008) Nat. Biotechnol. 26)6(:702-8( pNorMEL1 من خلال 04. احتوت القطعة الأولى على كاسيت تعبير جينى للخميرة (KanMX وتم تكبيرها ٠ من pNorMELT باستخدام البادئات؛ KanMX-For (SEQ ID NO-59) ى KanMX-Rev (المتوالية رقم: 10)» Jy 1 | PY تضيف مواقع التقييد 5 EcoRI ; Spel,BamHI,Nhel,Pacl,Bglll,Kpnl '3« علي التوالي. احتوت القطعة الثانية Voth et al. (2001) Nucleic Acids ) موضع الخميرة J متجهة للخارج Allie علي أذرع (Res. 29(12):E59-9 مفصولة بواسطة الأصل البكتيرى bacterial origin للاستنساخ replication Yo ؛ وتم تكبيرها بواسطة البادئات» HO-For (المتوالية رقم )1( HO-Rev (المتوالية رقم: 17). تم هضم القطعتين بواسطة ECORI/Spel وربطهما لتوليد ناقل KanMX يستهدف موقع HO قابل للاختيار. ثم؛ تم تكبير كاسيت التعبير الجينى MELD من Melcher et al. (2000) ( PMEL1&2 247(1-2):53-61( بواسطة البادئات +0 +-1ا1/ا (المتوالية رقم: MEL 1-Rev (TV ٠ (المتوالية رقم: 14), واستنساخه في موقع ال Kpnl الخاص بناقل KanMX المستهدف لل HO القابل للاختيار. أخيرا , يتم تخليق موقع رابط لبروتين إصبع الخارصين (ZFP) Zinc Finger Protein (يشار إليه ب "HAS" للموقع le الألفة) من جديد عن طريق مورد خارجى (DNA2.0,Menlo Park, Zinc-Finger احتوي هذا الموقع علي مواقع ارتباط لبروتينات إصبع الخارصين (CA) £Y14
Yr
Perez et al. (2008) Nat. ) البشرى CCRS التى تستهدف جين (ZEPs) Proteins باستخدام PCR بواسطة HAS تم تكبير قطعة (Biotechnol. 26:808-6 (17 (المتوالية رقم: HAS-For-R1 (المتوالية رقم: 10( و HAS-For-F1 «clad الواقعة ضد (KanMX HO MEL 1 الخاصة بناقل BamHI-Pacl واستنساخها في مواقع ال
PHO-zBG— تم تسمية هذا الناقل النهائى .MEL] reporter gene اتجاه الجين المراسل © .)٠١ (شكل 1011-1 لتعريض الأذرع المتماثلة المحيطة لاستهداف Notl خطى مع pHO-ZBG-MEL1 تم جعل
Invitrogen, ) 874741 MATq 5. cerevisiae وتحويله إلى سلالة HO موضع الخميرة باستخدام البروتوكول المقترح للشركة المصنعة. باختصار , تم تحبيب ؟ مل (Carlsbad, CA أس Tris HCL مل مولار ٠ ) TEL من مزرعة 874741 للطبقة الفاصلة؛ وغسلها فى منظم Ve تم .(Lithium Acetate مل مولار أسيتات ليثيوم ٠٠١ (EDTA مل مولار ١ 8.٠ هيدروجينى 6851لا فى ١٠؟ ميكرو لتر محلول تحويل خميرة cell pellet تعليق كرية خلية الخميرة sale)
Sigma-Aldrich, St. ) 026-3350 %YY.Y) yeast transformation solution 58000 مجم/مل +.Y و (Sigma-Aldrich) آسيتات ليثيوم Nee 00) «(Louis, MO يحتوى على ؟ ميكرو جم من (IX TE فى Stratagene, La Jolla, CA)) Sperm DNA Yo دقيقة عند 57 درجة مثوية. تم تحبيب 5٠0 وصدمها بالحرارة لمدة ¢ ad pHO-ZBG-MEL1 غسلها ونموها فى وسط غنى لمدة ساعتين قبل الاختيار على (Yeast cells الخميرة LDA
Life Technologies, Carlsbad, ) Geneticin® مجم/لتر ١ تحتوى على YPD أطباق وتم استخدامها (Geneticin® + YPD تم إعادة تخطيط نسائل المقاومةعلى أطباق (CA لالتحويلات تالية. ٠ بناء كاسيت التعبير الجينى لمنشط استنساخ-270 للخميرة تحتوى على حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى لبروتين رابط DNA تم بناء تركيبات فى الإطار (0045-210). تم CCRS5 Zinc Finger Binding Protein لإصبع الخارصين -86 نقل حوافز تفاعل استنساخ النبات الأصلى والبديل الموصوف فى المتواليات أرقام: واستنساخها مباشرة BamHI/Hindlll restriction enzyme fragment كقطعة إنزيم تقييد 17 Yo
١/7 أعلاه). (Perez et al. )2008(( CCR5-ZFP تقوم بترميز نطاقات All في اتجاه التتابعات
West et al. ) 61,10 استخدم كاسيت التعبير الجينى لمنشط استنساخ-270 الناتج محفز الخميرة series vector (1987))؛ واعتمد على ناقل سلسلة Genes Dev. 1:1118-31 احتوت الناقلات الناتجة على حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى .045315 yeast .CCR5-ZFP الأصلية والبديلة كما هو الحال فى اندماجات الإطار مع oe بالإضافة إلى ذلك؛ تم تضمين ضوابط مختلفة؛ تم استخدام ضابط ناقل فارغ واثنين من (المتوالية 561/0 VP16-CCRS كاسيت التعبير الجينى لمنشط استنساخ 70-16 المختلفين فى الدراسة. تم دفع كل من كاسيتات التعبير الجينى /01672 CCRS5-CCRS5 5 (V4 رقم: عن طريق VP-16 transcription activator لمنشط الاستتساخ expression cassettes وتم الإنهاء بواسطة منهى. احتوى ضابط الناقل الفارغ فقط على النطاقات «GALLLO المحفز ٠ transactivation ولا يحتوى على حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى «CCRS5-ZFP .interaction motif فحص نشاط الخميرة. فى BY4741 reporter line strain تم إنماء مزارع طوال الليل من سلالة المراسل ميكرو جم من ناقل يحتوى على كاسيت تعبير جينى ١ وتم توصيل «Geneticin® + 000لا ١٠ باستخدام بروتوكول تحويل خميرة قياسى فى ZFP لمنشط استنساخ expression cassette شكل 96 فتحة. تم مضاعفة كل التحويلات. تم استرداد خلايا الخميرة المتحولة فى وسط (SD-Leu) leucine يفتقر إلى الليوسين Synthetic Dextrose medium ديكستروز تركيبى ساعة؛ تم VY بعد ZFP لاختيار الناقل الذى يحتوى على كاسيت التعبير الجينى لمنشط استنساخ
Yi والإنماء لمدة SD-Leu من مواد التحويل فى ٠٠١:١ تخصيب خلايا الخميرة بواسطة تخفيف Yo synthetic raffinose فى وسط رافينوز تركيبى ٠٠١:١ الخميرة LDA ساعة أخرى. ثم»؛ تم تخفيف ساعة؛ تم YE بعد (GALL 10 لإزالة ضغط المحفز (SR-Leu) يفتقر إلى الليوسين 0 synthetic galactose تكوير خلايا الخميرة؛ وتم إعادة التعليق فى وسط جالاكتوز تركيبى يفتقر إلى الليوسين (لا©-ا-56). عند القيم الزمنية صفرء ؟ و١ ساعات بعد حث 0
MELT ميكرو لتر من خلايا الخميرة لفحص ٠١ الجالاكتوز 081801056؛ تم جمع Yo £Y14
“VA ميكرو لتر ماء ٠٠١ ميكرو لتر من خلايا الخميرة فى ٠١ تم تخفيف (MELD فى فحص باستخدام مقياس (OD600) نانو متر ٠0١0 عند optical density وتم قياس الكثافة الضوئية الخميرة فى WIA ميكرو لتر المتبقية من ٠١ طيف ضوئى +50601000010071618. تم تحضين مل مولار حمض سيتريك ١١ (NaZHPO4 مل مولار VV) MELT ميكرو لتر منظم ٠ درجة مئوية. تم 7١ لمدة ساعة عند (Sigma-Aldrich) PNPG ؛ ؟ مجم/مل Citric 610 © ميكرو لتر كربونات صوديوم 2182003. تم تقييم نشاط ٠٠١ وقف التفاعل عن طريق إضافة 010504 باستخدام صيغة تعتمد على نسبة قياسات mU عند 000405؛ وتم حساب MEL] .(Doyon et al. (2008) Nat. Biotechnol. 26(6):702-8) و0600 الناتج من التنشيط بواسطة حوافز تفاعل Mell مستوى التعبير الجينى لجين المراسل تم مقارنة التعبير الجينى لبروتين .١١ تنشيط التعبير الجينى النباتى المختلفة مبين فى شكل ٠ الناتج من حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى المختلفة هذه بضابط الناقل الفارغ MEL] )١ لنطاق تنشيط التعبير الجينى 016 (المتوالية رقم: II من النطاق الفرعى Mell وتنشيط .(SGMO VP16-CCRS5) SGMO VP16 ; (VP16(v2-CCRS) المعدل مستويات تعبير ERF2 (v2) أنتج حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى بواسطة حافز Mell جحينى عالية على نحو غير متوقع؛ بالإضافة إلى ذلك؛ أدى التعبير الجينى ل VO تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى البديل هذا إلى زيادة عن النسخة الأصلية من حافز تفاعل
ERF2 (v3) تنشيط التعبير الجينى النباتى المعدل بالتعبير الجينى PTI4 (V2) قام حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى ومع ذلك؛ VP16 عند مستويات مماثلة لضابط نطاق تنشيط التعبير الجينى MELT لبروتين أعلى بشكل Mell إلى مستويات تعبير جينى ل PTI4 أدت التعديلات المدخلة إلى حافز تفاعل ٠٠
PTI4 (v3) ملحوظ؛ بالمقارنة بحافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى
AtERF1(v3), AAERF1(v2), لا تؤدى حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى
ORCA2(v3), ORCA2(v2), DOFI(v3), DOFI(v2), DREBIA(v3),
Mell إلى مستويات عالية من التعبير الجينى ل CBF1(v2) ; DREB1A(V2), CBF1(v3)
q — 7 — فى فحص الخميرة؛ بالمقارنة بضوابط 016/. ومع ذلك لا تدفع حوافز Je ld تنشيط التعبير الجينى النباتى (AtERF1, DREBIA و0871 التعبير الجينى ل Mell فى الخميرة. لا تؤدى حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى (73) ORCA2 و(2») 0071 فقط إلى أى تعبير جينى ل Mel] فى فحص الخميرة. ° مستويات MELT المنتجة بواسطة نطاق تنشيط التعبير الجينى النباتى لحوافر تفاعل تنشيط التعبير الجينى (v2) Stall البديلة المعدلة كانت أعلى بوجه عام بالمقارنة بحوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى (V3) الأصلية فى فحص الخميرة Mell حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى المعدل الوحيد الذى لم يدفع التعبير الجينى ل Mell فى فحص الخميرة كان حافز تفاعل (V2) 0071. لا ينتج حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى هذا أى تعبير جينى ل .yeast assay فحص الخميرة SMELL | ٠ مثال 4: وظيفة حوافز تفاعل نطاقات التنشيط النباتى فى تبغ يحتوى على تركيب مراسل إصبع الخارصين DNA يشتمل على نطاق رابط ل تركيب مراسل 089897ام. (المتوالية 26 DNA تم تخليق ثمان تكرارات ترادفية لتتابع بولى نيوكليوتيد النطاق الرابط ل
IDT, ( من جديد (67; Yokoi et al. (2007) Mol Ther. رقم:15)11(:1917-23 ٠ المضافة إلى النهايات 70 و؟” لتسهيل الاستنساخ. تم Sacll مع مواضع (Coralsville, ها على التوالى فى ناقل دخول (TA استنساخ نطاق ارتباط 826-26 بالكامل (المتوالية رقم: موجود مسبقاً يحتوى على عناصر التعبير الجينى النباتى المرغوبة. تم نقل مواقع Gateway®
Arabidopsis | على قطعة ١ا©58؛ واستنساخها فوراً عكس اتجاه المحفز 8X-Z6 ارتباط AtAct2 promoter v2; An et al. (1996) Plant J. 10:107-( thaliana actin-2 ا ٠ وعلى التوالى؛ تم backbone vector الوحيد فى الناقل الأساسى Sacll باستخدام موقع )1 فى هذا الناقل (GUS; Jefferson (1989) Nature 342:837-8) gus استنساخ الجين الوحيدة؛ مع Neol [Sac باستخدام مواقع Y— أكتين Al thaliana تحت السيطرة المباشرة للمحفز (إطار- Atu ORF23 37018 مكوناً كودون البدء. تم استخدام Neol للموقع ATG كودون
=« - YY مفتوح للقراءة» منطقة غير مترجمة ؟”؛ طلب البراءة الأوربى رقم 777497 أ١) slay الاستنساخ. ناقل التحويل النهائى final transformation vector « 01059897 (شكل «(VY كان النتيجة لربط Gateway® مع Jil تخصيص يحتوى على محفز يوبيويتين - ubiquitin— Promoter v2 (Callis et al. (1990) J.
Biol. ) A. thaliana ٠١10 | 0110لا At 1:(Chem. 265:12486-93) جين فوسفينوثريسين آسيتيل ترانسفيراز phosphinothricin pat v3 (Wohlleben et al. (1988) Gene 70:25-( acetyl transferase gene (37):: إطار ١- مفتوح للقراءة (A. tumefaciens كاسيت واصم قابل للاختيار لمنطقة غير مترجمة ¥’) AtuORF1 3014 v3 (Huang et al. (1990) J.
Bacteriol. ٠ 172:1814-22( لاختيار النبات. تم التأكيد على ناقل التحول النهائى من خلال التتابع» وتحويله إلى .(Invitrogen, Carlsbad, CA) LBA4404 (A. tumefaciens abu. J sail المتوسط ب Agrobacterium للتبغ بواسطة .PDAB98IT لإنتاج حالات نبات مراسل معدلة وراثياً transgenic reporter plant تم تحضين أقراص ورقية (Yau ١( مقطوعة من نباتات تبغ Petit Havana tobacco plants فى مزرعة Vo طوال الليل من سلالة (LBA4404 A. tumefaciens إيواء بلازميد 00/859897 النمو إلى ٠.١ ~ OD600 نانو مترء؛ التلطيخ الجاف blotted dry على ورقة مرشح معقمة sterile filter paper « ثم الوضع على وسط Phytotechnology Labs, Shawnee Mission, ( MS (KS و١٠ جم/لتر سكروز 5101058 مع إضافة ١ مجم/لتر حمض إندول خليك indoleacetic 0 و١ مجم/لتر بنزيل أمينو بيورين benzyamino purine فى أطباق 60 x 0 مم )2 ٠ أقراص لكل طبق) مغلقة ب Karlan Research Products Corporation, ) Nescofim® (Cottonwood, AZ بعد 58 ساعة من الزراعة المشتركة؛ تم نقل الأقراص الورقية إلى نفس الوسط مع YOu مجم/لتر سيفوتاكسيم ycephotaxime © مجم/لتر .BASTA® بعد §=Y أسابيع ؛ تم نقل الشتلات إلى وسط MS مع Yor مجم/لتر سيفوتاكسيم و١٠ مجم/لتر BASTA® فى sad PhytaTrays™ إضافية 7-؟ أسابيع قبل جمع الورق والتحليل الجزيئى molecular .analysis Yo £Y14
— \ - تحليل رقم النسخة 5 PTU لحالات المراسل عزل PCR DNA تم جمع نسيج نبات تبغ معدلة ورائياً Transgenic tobacco 1 من شتلات نامية حديثاً ومجمدة بالتجفيد Labconco, Kansas City, ) lyophilized (MO لمدة يومين على الأقل فى أطباق جمع 47 فتحة (Qiagen, Valencia, CA) ثم تم © عزل DNA باستخدام مجموعة استخلاص 46 فتحة ™ DNEasy (918980)؛ وفقاً لتعليمات الشركة المصنعة. تم استخدام طاحن أنسجة Garcia ) Model 2-968 Kleco™ (Manufacturing, Visalia, CA لتمزيق الأنسجة tissue disruption عزل DNA الجنوبى. تم جمع نسيج نبات تبغ معدل وراثياً من شتلات حديثة النمو ومجفدة (Labconco, Kansas City, MO) لمدة يومين على الأقل فى أنابيب مخروطية ¥ مل (Eppendorf) ٠ ثم تم DNA Jie باستخدام مجموعة استخااص DNEasy™ Plant Mini (Qiagen) وفقاً لتعليمات الشركة المصنعة. تم استخدام طاحن أنسجة Model 2-96A (Garcia Manufacturing) Kleco™ tissue pulverizer لتمزيق النسيج. تحديد كمية DNA تم تحديد كمية DNA الجينومى الناتج باستخدام مجموعة فحص Quant- .(Molecular Probes, Invitrogen, Carlsbad, CA) iT™ PicoGreen® DNA ثم ١ استخدام خمس معايير DNA محددة الكمية تتراوح من ٠١ نانو جم/ميكرو لتر إلى ٠١7٠© نانو جم/ميكرو لتر (مخففة بالتسلسل) لإنشاء منحنى قياسى. تم أولاً تخفيف العينات بتخفيفات Ven) أو 70:١ لتكون ضمن النطاق الخطى للفحص؛ وتم تعيين تركيزات DNA الجينومى وفقاً لتعليمات الشركة المصنعة. ثم تم تسجيل الوميض باستخدام قارئ أطباق Biotek, ) Synergy2™ (Winooski, VT تم تقدير تركيز DNA الجينومى من منحنى قياسى محسوب من تصحيحات Yo الوميض الأساسية. باستخدام TE أو ele ثم تم تخفيف DNA إلى تركيز مشترك ٠١ نانو جم/ميكرو لتر ل PCR باستخدام معالج سائل آلى —automated liquid handler .(Qiagen)Biorobot3000™ ترك DNA لتحليل Southern غير مخفف. تقدير رقم النسخة. تم تحليل حالات معدلة وراثياً مفترضة للتعقيد المتكامل باستخدام فحص مسبار تحلل مائى DNA hydrolysis probe assay متعدد Jil لفحص Applied ( TagMan® £Y14
A \ — — (Biosystems, Carlsbad, CA تم تقدير رقم النسخة لمدخل الترانسجين transgene insert باستخدام بادثات محددة التتابع ومسابر لكل من ترانسجين pat وجين مرجعى لتبغ ذاتى pal cendogenous tobacco (فنيل الانين أمونيوم phenylalanine ammonium ju! (GenBank Accesion No. 85008199 ¢ lyase تم تصميم فحوصات لكلا الجينات ٠ه باستخدام 2.0 Roche Applied Science, ) LightCycler® Probe Design Software (Indianapolis, IN تم تقدير PCR الزمن الحقيقى لكلا الجينات باستخدام نظام .(Roche Applied Science) LightCycler®480 للتكبير؛ تم تحضير خليط Roche Applied ) LightCycler®480 Probes Master 6 ) بتركيز نهائى 17 فى ٠١ ميكرو لتر تفاعل متعدد الحجم يحتوى على ١.4 ميكرو Vo ميلار لكل بادئ و7١ ميكرو مولار لكل مسبار. جدول .١ تم إجراء تفاعل تكبير من خطوتين بامتداد عند 0A درجة مئوية لمدة YA ثانية مع الحصول على الوميض fluorescence تم تشغيل كل العينات فى ثلاث نسخ؛ وتم استخدام قيم Ot المتوسطة لتحليل كل عينة. تم إجراء تحليل بيانات PCR للزمن الحقيقى باستخدام برنامج (LightCycler® من خلال الوحدة الكمية النسبية relative quant module « ويعتمد على طريقة AACE تم تضمين عينة طلاناو من Vo معاير أحادى النسخة لمعايرة النتائج. تم تحديد حالة المعاير أحادى النسخة سابقاً بواسطة تحليل (Southern وتم التأكيد على أنه يحتوى على مدخل واحد للجين pat جدول .١ تتابعات البادئات والمسابر المستخدمة فى كل من مقايسات مسبار التحلل pal spat (HP) hydrolysis probe Sl) حاتمة الفلورسنت fluorescent epitope لكل مسبار كانت مختلفة مما سمح بإجراء الفحوصات فى نفس الوقت كتفا عل متعدد . il كع ,| ٍّ ض ,1 ض ACAAGAGTGGATTGATGATCTAGAGAGGT Algal) | TQPATS رقم: 19( teal teal TQPATA ١ CTTTGATGCCTATGTGACACGTAAACAGT £Y14
i ne | | | ا CY5- GGTGTTGTGGCTGGTATTGCTTACGCTGG- BHQ2 TQPATF Q (المتوالية ١ tad) 0( مسبار Cy5 TACTATGACTTGATGTTGTGTGGTGACTGA TQPALS | (المتوالية رقم: (YY بادئ GAGCGGTCTAAATTCCGACCCTTATTTC TQPALA | (المتوالية رقم: (VY بادئ -الال ]6 AAACGATGGCAGGAGTGCCCTTTTTCTATC AAT-BHQ1 مسبار TQPALFQ | (المتوالية رقم: 6FAM (Ve PTU PCR. تم فحص حالات منخفضة النسخة على التوالى بواسطة PCR للوحداث النسخية النباتية السليمة plant transcriptional units (ل1). باستخدام البادئات Blu636 (المتوالية رقم: BIUG3T 5 (Vo (المتوالية رقم: (VT أدى التكبير الصحيح إلى منتج 3.7 كيلو بايت يتكون من Z6-Act2/GUS/AtORF23 PTU (/لا. 7 60). تم استخدام Phusion® GC Master Mix (New England Biolabs, Beverley, MA) ٠ مع ظروف التفاعل التالية: 4 درجة مثوية لمدة Vo ثانية؛ متبوعاً ب ٠0 دورة عند AA درجة مئوية لمدة ٠١ ثوانى؛ TV درجة مثوية لمدة Fe ثانية؛ VY درجة مئوية لمدة دقيقتين؛ والتمديد النهائى عند VY درجة مثوية لمدة ٠١ دقائق. بالإضافة إلى تفاعل PTU PCR المفصل سابقاً؛ تكبير الجين الذاتى» chs (سينثاز كالكون chalcone synthase ؛ «(Genbank Accession No.
FJ969391.1 & ٠ تضمينه Load لإثبات جودة قوالب DNA الجينومية. تم تضمين بادئات أمامية 30115 (المتوالية رقم: (VY وعكسية 30115 (المتوالية رقم: (VA فى التفاعل؛ والذى أنتج منتج تكبير Yor زوج
“AE ميكرو لترء؛ بتركيز نهائى 000 ميكرو مولار لبادئات الترانسجين ٠١ قاعدة. تم استخدام تفاعلات endogenous reference ميكرو مولار للجين المرجعى الذاتى ١.” و 118059606 primers .gene
DNA لكل عينة؛ تم هضم © ميكرر جم Southern Analysis التحليل الجنوبى
Asel (New England «restriction enzyme جينومى جيداً بواسطة إنزيم التقييد 0 المهضوم بواسطة DNA درجة مئوية طوال الليل. تم تركيز TY بالتحضين عند Biolabs) «Quick Precip ™ Solution (Edge Biosystems, Gaithersburg, MD) الترسيب مع ميكرو لتر Yo الجينومى فى DNA تعليق sale) وفقاً لبروتوكل الشركة المصنعة المقترح. ثم تم ماء عند 15 درجة مئوية لمدة ساعة. تم تحميل العينات معادة التحميل على 960.8 جل آجاروز 7؛ وتم معالجتها بالرحلان الكهربائى TAE محضر فى منظم 6 gel ٠ منظم Adal تم غمر .17 TAE فولت/سم فى ٠١١ طوال الليل بمعدل electrophoresed مولار كلوريد +. NaOH مولار هيدروكسيد صوديوم ١١7( denaturation buffer تمسخ لأس Tris—HCl دقيقة؛ متبوعاً بالغمر فى منظم معادلة )0.+ مولار Vo لمدة (NaCl صوديوم دقيقة. Te مولار كلوريد صوديوم) لمدة ٠.5/)7.5 هيدروجينى عن طريق منظم Nylon membranes إلى أغشية نايلون DNA تم إجراء نقل قطع Yo طوال الليل خلال الجل على غشاء 20X SSC passively wicking buffer التفتيل السلبى (Millipore, Billerica, MA) معالج Immobilon ™-NY+ transfer membrane (Js; 48); ومناشف chromatography paper wick باستخدام فتيلة ورقة تحليل كروماتوجرافى تشابكها مع 2X SSC بعد النقل؛ تم غسل الغشاء لفترة وجيزة بواسطة .paper towels درجة مثوية Av والخبر فى فراغ عند (Stratagene, LaJolla, CA) Stratalinker® 1800 ٠ لمدة ؟ ساعات. pre-hybridization solution تم تحضين البقع مع محلول ما قبل التهجين فى زجاجات دوارة Ashe لمدة ساعة عند 15 درجة (PerfectHyb™ plus, Sigma-Aldrich)
Robbins Scientific Model hybridization incubator باستخدام جهاز تحضين للتهجين تحتوى PCR تم تحضير مسابر من قطعة (Robbins Scientific, Sunnyvale, CA) 400 Yo £Y14
—Ao— استخلاص جل de sens باستخدام PCR amplicon على تتابع الترميز ككل. تم تنقية آمبليكون
Random RT من خلال مجموعة التوسيم [032P]Dctp وعنونته ب (Qiagen) Qiaex ١١© درجة To تم تهجين البقع طوال الليل عند .)50818906086, La Jolla, CA) Prime-iT® مباشرة إلى المحلول المهجن مسبقاً إلى عدد 060810560 probe مثوية وتم إضافة مسبار مشوب تقريباً. بعد التهجين؛ تم غسل البقع بالتعاقب عند 15 درجة مئوية mde ١-ةعقب ؟ مليون 0 تم تعريض البقع لتخزين شاشات yal دقيقة. 5٠ لمدة SDS 960.1١ [SSC Xv.) بواسطة ؛ وتصويرها باستخدام نظام storage phosphor imaging screens تصوير الفوسفور تم تأكيد حالات التكامل أحادى النسخة Molecular Dynamics™ Storm™ 860 تصوير الحقيقية عن طريق تحديد نطاق تهجين واحد. توليد نباتات مراسل 12 متماثل الجينات ٠١ نسخة 7-١( منها قليلة التعقيد YE وجد (BASTA® نبات مقاوم ل ©١ تم توليد إجمالى لعدد النسخ. من هذه hydrolysis probe على أساس تحليل مسبار التحلل المائى (pat من سليم؛ كما هو محدد بواسطة تحليل 06. بعد تحليل PTU ١8 الحالات منخفضة التعقيد؛ أظهر سليمة؛ أحادية النسخة PTU ؛ تم اختيار حالتى Southern blot analysis البقعة الجنوبية وانمائها للنضج فى الدفيئة؛ حيث تم السماح لها بالتلقيح الذاتى ©5617-0011081. ثم تم جمع بذور yo ؛ متبوعاً بعمليتى شطف بماء bleach مادة تبييض 967٠0 تعقيم السطح (لمدة © دقائق فى (T1
Phytotechnology ) MS معقم)؛ وانباتها على وسط « distilled water rinses مقطر PhytaTrays™ فى sucrose جم/لتر سكروز 5١ و (Labs, Shawnee Mission, KS تم اختيار pat بعد فحص التلقيح عن طريق تحليل عدد نسخ (Sigma, St. Louis, MO) ؛ greenhouse إنمائها حتى النضج فى الدفيئة chomozygous نباتات 11 متماظة الزيجوت Yo والسماح لها بالتلقيح الذ اتى. ثم تم جمع بذور 12 تعقيم السطح. وانباتها كما هو موصوف سابقاً؛ واستخدامها لتوليد نباتات مراسل لاختبار تنشيط التعبير الجينى النباتى 1804م transactivation testing
Transcription لمنشط استتساخ Expression Constructs تركيبات تعبير جينى نبات ZFP نباتى ل Activator Yo £Y14
“AY تم بناء تركيبات منشط استتساخ- 250 نبات تحتوى على حافز تفاعل تنشيط تعبير جينى نباتى بديل أو أصلى. تم تركيب حوافز تفاعل تنشيط تعبير جينى نباتى (سواء بدائل أصلية
DNA2.0, Menlo ( للاستتساخ من جديد BamHI /Sacl ومعدلة) محاطة بمواقع إنزيم التقييد
BamHI/Sacl Zaki حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى على Jo تم (Park, CA 701601 6] ( 26 إصبع الخارصين DNA واستنساخها فى نفس اتجاه النطاق الرابط ل fragment © وحيدة موجودة فى الناقل الأساسى BamHI [Sac] أعلاه) فوراً باستخدام مواقع cal. (2007) الموجود. عند اكتمال هذه الخطوة؛ تم وضع تركيبات منشط استتساخ-210 Gateway® Entry مدمج مع حافز تفاعل استتساخ 26 DNA (تحتوى على نطاق رابط لبروتين إصبع الخارصين التأسيسى (محفز /1/ا/ا05 72؛ Cassava Vein Mosaic Virus نباتى) تحت سيطرةٍ محفز 04723 والإنهاء ب (Verdaguer et al. (1996) Plant Mol. Biol. 31:1129-39 ٠
Final تم استخدام كاسيت ناقلات التحول النهائى A. tumefaciens من 314
Gateway® إ(جدول ؟)؛ ناتجة من الربط المتوسط ب 00 vectors مع ناقل تخصيص يحتوى على محفز يوبيكويتين-؟ (Invitrogen, Carlsbad, CA) 72؛ إطار -؛ ؟ القراءة المفتوح At (محفز 013لا A. thaliana ubiquitin-3 promoter
Callis et al. (1995) Genetics, 139(2):921-39))/hygromycin ١ phosphotransferase ١١ (HPTII v1; Gritz et al. (1983) Gene 25(2-3):179- لاختيار (Au 04724 3°UTR v2) °F منطقة غير مترجمة «88)/A. tumefaciens النيات. جدول WY تركيبات منشط استنساخ «ls ZEP transcription activator constructs Yo مختبرة فى تبغ. يوفر معرف التتابع تتابع DNA لحافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى والذى تم دمجه بالبروتين الرابط لإصبع الخارصين 26 ويتم تعبيره الجينى فى الناقل الثنائى. عط سد — £Y14
A 7 _ _ قم التركيب وتتابع حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النبات حافز تفاعل تنشيط التعيد رقم التركيب وتتابع حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى ست pDAB10788 اشكل ٠ شكل YY pDAB106274 AtERF1 2 المتوالية رقم: AY المتوالية AQ tad) pDAB10788 أاشكل yo شكل ؛٠ pDAB106275 ORCA2 3 المتوالية رقم: 8 المتوالية رقم: 960 pDAB10788 اشكل ٠١ شكل Yo pDAB106276 Drebla 4 المتوالية رقم: 4 IN المتوالية ١ tad) 9 pDAB10788 اشكل Vv شكل ٠7 pDAB106277 Dof1 المتوالية رقم: AT المتوالية tad) 7 9 8 هم اشكل YA شكل YV pDAB106278 ERF2 6 المتوالية رقم: A ٠ المتوالية AY tad) 8ه أشكل va شكل YA pDAB106279 Cbfl 7 المتوالية رقم: Ao المتوالية ay tad) pDAB10627 شكل A) VP16 2 المتوالية رقم: 9 7 ناقل فارخ- إصبع خارصين pDAB10623 EC فقط (بدون حافز تفاعل شكل 7١ 8 تم تأكيد الناقل الثنائى النهائى من خلال تتابع (DNA وتحويله إلى سلالة A. LLBA4404 (Invitrogen) (tumefaciens بالإضافة إلى ذلك؛ تم تضمين ناقل 7ت A p. لم Ua تحكم
—AA— والذى يحتوى على النطاق الرابط لإصبع الخارصين ولا يتضمن (YY ر(شكل 8 منشط يتألف من حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى. فى هذا التركيب» تم وضع النطاق الرابط
AtuMas التأسيسى (محفز A. tumefaciens MAS لإصبع الخارصين تحت سيطرة محفز 0823 و4 0.47 79.))» وإنهائها ب 0.0VF.ATY 48.0 Vue البراءة الأمريكية أرقام 4 بالإضافة إلى ذلك؛ يحتوى الناقل على إطار قراءة مفتوح-؛ ؟ ./. tumefaciens من 3’UTR © hygromycin phosphotransferase .خراا [A. thaliana Y— محفز يوبيكريتين لاختيار النبات. TY يستخدم كاسيت المنطقة غير المترجمة tumefaciens النبات؛ تم ZEP تحتوى على تركيبات منشطة لاستنساخ Al لإنتاج حالات النبات reporter tobacco plants مقطوعة من نباتات تبغ مراسل (Yau V) تحضين أقراص ورقية
Invitrogen, ( LBA4404 طوال الليلء A. tumefaciens فى مزرعة من سلالة 120 ١١ إيواء واحدة من oF بلازميد الواردين فى جدول ١١ إيواء واحدة من (Carlsbad, CA تلطيخها ببقعة جافة على ورقة cae ٠١١ - 00600 إنمائه إلى oF بلازميد الواردين فى جدول
Phytotechnology Labs, Shawnee Mission,) MS مرشح معقمة؛ ثم وضعها على روسط مجم/لتر حمض إندول خليك و١ مجم/لتر بنزيل أمينو ١ جم/لتر سكروز مع إضافة ٠١و (KS فى أطباق 70760 مم )0 أقراص لكل طبق) مغلقة ب 56022800100 purine بيورين ٠ بعد .(Karlan Research Products Corporation, Cottonwood, AZ) Nescofim® مجم/لتر You ساعة من الزراعة المشتركة؛ تم نقل أقراص ورقية إلى نفس الوسط مع £A بعد 2-7 أسابيع؛ ثم hygromycin مجم/لتر هيجرومايسين Vo scephotaxime سيفوتاكسيم مجم/لتر سيفوتاكسيم و١٠ مجم/لتر هيجرومايسين فى You مع MS نقل شتلات إلى وسط
US أسابيع إضافية؛ متبوعاً بجمع الأوراق وتحليل التعبير الجينى ل 7-7 sad "57لا72 18لا0 ٠ من حالات النباتات لكل الست عشر تركيبات المنشطة لاستنساخ 70-7١ تم توليد إجمالى النيات. gus ل Expression Analysis تحليل التعبير الجينى
Transgenic tobacco plant تم جمع نسيج نبات تبغ معدلة وراثياً MRNA عزل على flash frozen حديثاً ومجمدة بالوميض growing plantlets من شتلات نامية tissue © £Y14
-04- تلج جاف فى أطباق جمع 16 فتحة (Qiagen) .4 تم RNA Jie باستخدام مجموعة استخلاص 41 فتحة «(Qiagen) RNEasy® وفقاً لتعليمات الشركة المصنعة. تم استخدام طاحن أنسجة (Garcia Manufacturing) Model 2-96A Kleco™ لتمزيق الأنسجة. تحديد كمية RNA تم تحديد كمية MRNA الناتجة باستخدام مقياس الطيف الضوئى (Thermo Scientific, Wilmington, DE) © تم إفراغ كل خلية بواسطة ؛ ميكرو لتر slo خالى من RNase قبل التحميل وتحديد كمية ؛ ميكرو لتر من العينات غير المخففة. تم تقدير تركيز MRNA من برنامج 8000 (NanoDrop™ باستخدام طريقة قياس الحمض النووى RNA القياسى. تم تخفيف MRNA يدوياً بواسطة ماء JA من RNase إلى - AY نانو جم/ميكرو لثر. IK تحضير cDNA تم تحضير CDNA من MRNA مخفف باستخدام مجموعة (Qiagen, Carlsbad, CA) Quantitect® RT باتباع تعليمات الشركة المصنعة. تم استخدام ١ ميكرو جم من إجمالى MRNA فى كل تفاعل. عند اكتمال التفاعل؛ تم تخزين CDNA عند Yeo درجة مثوية حتى تم اكتمال التحليل. RT-PCR. تم تحليل حالات مختارة على هيجرومايسين hygromycin لمستويات نسخة جين gus باستخدام فحصين مسبار تحلل مائى DNA كل منها يكون نظير لفحوصات ©180/80. تم تقدير مستويات حالة الاستقرار ل MRNA 905 لكل من الحالات الفردية باستخدام بادثات خاصة بالتتابع ومسبار. تم معايرة MRNA باستخدام مستوى حالة استقرار MRNA لجين مرجعى لتبغ ذاتى BYEEF « endogenous tobacco reference gene (Genbank Accession No.
GI:927382) تم تصميم فحوصات لكل من الجينات ٠ باستخدام .LightCycler® Probe Design Software 2.0 (Roche Applied Science) تم تقييم الوقت الحقيقى PCR لكل الجينات باستخدام نظام 480 .LightCycler® لتكبير gus تم تحضير خليط LightCycler® 480 Probes Master عند تركيز نهائى #١ فى ٠١ ميكرو لتر حجم تفاعل متعدد يحتوى على ١.4 ميكرو مولار لكل بادئ و07 ميكرو مولار مسبار. جدول ؟. £Y14
q «= — تم إجراء تفاعل تكبير ثنائى الخطوة بامتداد عند 07 درجة مثوية لمدة fv ثانية مع الحصول على ومضان. تم تشغيل كل العينات غير مخففة بثلاث نسخ؛ وتم استخدام قيم Ct المتوسطة لتحليل كل عينة. لتكبير (BYEEF تم تحضير خليط LightCycler® 480 Probes Master بتركيز نهائى ل فى ٠١ ميكرو لتر تفاعل متعدد الحجم يحتوى على YO ميكرو © مولار من كل بادئ (جدول ؟) و v0) ميكرو مولار UPL مسبار Roche Applied ) ١١9 ©6666086). تم إجراء تفاعل تكبير AWE الخطوة بامتداد عند 0A درجة مئوية لمدة Ail YO مع الحصول على ومضان. تم تشغيل كل العينات مخففة ٠٠١:١ بثلاث نسخ؛ وتم استخدام قيم Ct المتوسطة لتحليل كل عينة. تم إجراء تحليل لبيانات POR للزمن الحقيقى باستخدام برنامج LightCycler® باستخدام الوحدة الكمية النسبية؛ ويعتمد على طريقة LAACE ثم تم مقارنة Ye مستويات التعبير الجينى النسبية من بين علاجات منشط الاستنساخ النباتى المختلفة. شكل YA جدول ؟. التتابعات والبادئات والمسابر المستخدمة فى كل من فحوصات مسبار التحليل المائى (HP) hydrolysis probe ل gus و .BYEEF FE il ,| ٍّ ض " ; AGACAGAGTGTGATATCTACCC TQGUSS (المتوالية رقم: (Yo بادئ CCATCAGCACGTTATCGAAT TQGUSA (المتوالية رقم: (YT بادئ 6FAM-CACAAACCGTTCTACTTTACTGGCTT- مسبار BHQI TQGUSFQ (المتوالية رقم: 6FAM (VY AGGCTCCCACTTCAGGATG 8710119 | (المتوالية رقم: (YA بادئ CACGACCAACAGGGACAGTA 8710119 | (المتوالية رقم: (V4 بادئ £Y14
q \ — — النتائج. شكل 9؟ يبين النسبة الناتجة لمستويات نسخة gus لحوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى المختلفة؛. حسب المعايرة بواسطة مستويات التعبير الجينى الذاتى ل +]87. تم مقارنة تنشيط جين 9005 من حوافز تفاعل interaction motifs تنشيط التعبير الجينى النباتى plant o 2007 المختلفة بضابط Jil فارغ cempty vector وحافز تفاعل النطاق الفرعى اا لنطاق تنشيط التعبير الجينى ل WWPL6 أظهرت العديد من حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى مستويات عالية بشكل غير متوقع للتعبير الجينى بالمقارنة بالنطاق الفرعى Il لمنشط التعبير الجينى 516/. على سبيل (JU قامت حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى (PTI4, DREBIA, 2 و 6871 بتعبير جينى ل gus MRNA أكثر من النطاق الفرعى ١١ ٠ لنطاق تنشيط استنساخ 016/. اختلفت مستويات MRNA المنتجة بواسطة حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى للبديل المعدل (72) بالمقارنة بالنسخة الأصلية (73) بين حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى. النسخة المعدلة لحافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى ERF2 أنتجث gus Mra أكثر بشكل ملحوظ عن حافز تفاعل التتابع الأصلى JERF2 وبطريقة مماثلة؛ أنتج حافز تفاعل ١ تنشيط التعبير الجينى النباتى 6811 المعدل MRNA أكثر من حافز تفاعل التتابع الأصلى (Lid) a, .CBF1 أدت التعديلات المدخلة فى حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى PTI4 DREB14 إلى إنتاج مستويات (Ji gus MRNA بالمقارنة بالنسخ الأصلية من حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى 0114© , .DREB14 مثال #: تفاعل وظيفة حافز فى تبغ يحتوى على تركيب مراسل GALA ADL Y. تبغ تحتوى على تركيب مراسل يتألف من نطاق رابط ل GAL4 تركيب المراسلء (pGalGUS يبنى باستخدام الاستراتيجية الموصوفة أدناه. يتم تخليق ست تكرارات ترادفية لتتابع رابط للخميرة 6/814 ومناطق مفساح LS) bp YY spacer regions هو موصوف فى 10:397-401 (Baleja et al. (1997) J.
Biomol.
NMR جديد (IDT) مع إضافة مواقع Sacll لتسهيل الاستنساخ. يتم نقل مواقع 6X Gald Lis) على قطعة £Y14
q \ — — Sacll ويتم استخدامها لاستبدال مواقع ارتباط Z6 من ناقل دخول €Ntry vector موجود مسبقاً والذى يتم هضمه أيضاً بواسطة ١ا©58. تضع خطوة الاستنساخ cloning step هذه مواقع ارتباط 4 مباشرة عكس اتجاه محفز 2 Arabidopsis Actin مما يدفع التعبير الجينى لجين 5. ناقل التحول النهائىء pGalGUS (شكل oY ٠ ينتج من تفاعل تحويل Gateway® مع 0 ناقل تخصيص يحتوى على كاسيت تعبير جينى لجين 081 محفز ب Arabidopsis 0 , والذى يستخدم لاختيار النبات. يتم تأكيد ناقل التحول النهائى من خلال التتابع؛ ويتم تحويله إلى .LBA4404 (Invitrogen) «A. tumefaciens ali. تحول للتبغ متوسط ب Agrobacterium براسطة PGALGUS يتم عمل نباتات مراسلة معدلة وراثياً باستخدام البروتوكول الموصوف سابقاً. انظر "تحول ٠ التبغ المتوسط ب Agrobacterium بواسطة .'PDAB9897 تحليل رقم النسخة 5 PTU لحالات المراسل يتم توليد نباتات معدلة وراثياً مقاومة ل (BASTA® بعدد نسخ منخفض التعقيد وتحديدها على أساس تحليل رقم نسخة ©1801/80. للحالات منخفضة التعقيد؛ تظهر مجموعة فرعية PTU سليم؛ كما هو محدد بواسطة تحليل PCR يتم تحليل هذه الحالات أكثر من خلال تحليل ١ بقعة جنوبية. بعد تحليل البقعة الجنوبية Southern blot analysis ؛ يتم اختيار حالة PTU سليمة؛ بنسخة مفردة واحدة على الأقل وانماءه حتى النضج فى الدفيئة؛ ويسمح له بالتلقيح الذاتى. يتم جمع بذور 11 PRY سطحهاء وانباتها ٠. بعد فحص التلقيح من خلال تحليل رقم نسخة (pat يتم اختيار نباتات 11 متماثلة الزيجوت؛ إنماءها حتى النضج فى الدفيثة؛ والسماح لها بالتلقيح الذاتى. ثم يتم جمع بذور 12؛ تعقيم سطحهاء؛ وانباتها (كما هو موصوف سابقاً)؛ ويتم استخدامها ٠ _ لتوليد نباتات مراسلة لتنشيط الاختبار. تركيبات تعبير جينى منشطة لاستنساخ GALS النبات يتم بناء تركيبات منشطة لاستنساخ GALS النبات تحتوى على Bla تفاعل تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل أو أصلى. يتم تعديل تركيبات التعبير الجينى المنشطة لاستنساخ ZEP النبات الموصوفة فى مثال ؛ (تركيبات التعبير الجينى لمنشط استنساخ نباتى ل ZEP نبات") عن طريق £Y14
سمو إدخال تتابع بولى نيوكليوتيد بروتين رابط ل GALA بدلاً من تتابع بولى نيوكليوتيد polynucleotide sequence البروتين الرابط لإصبع الخارصين Zinc Finger Binding Protein يتم إدخال تتابع بولى نيوكليوتيد نطاق رابط ل DNA 614 محسن بنبات أحادى الفلقة (Keegan et al. (1986) Science 231)4739(:699-704( hemicot plant Ya oo من تتابع بولى نيوكليوتيد البروتين الرابط لإصبع الخارصين كقطعة Neol BamHI عند اكتمال هذه الخطوة؛ يتم وضع تركيب منشط لاستتساخ GALS تحت سيطرة محفز Cassava Vein Mosaic Virus التأسيسىء وانهاءه ب 31014 ORF23 من A. tumefaciens تكتمل ناقلات التحول الثنائى النهائية Final binary transformation vectors « ناتجة من تحول Gateway® بواسطة ناقل تخصيص يحتوى على كاسيت Arabidopsis —Hptll Ubiquitin) لاختيار النبات. يتم تأكيد ناقل التحول النهائى من خلال التتابع؛ وتحويله إلى سلالة .(Invitrogen) LBA4404 (A. tumefaciens لإنتاج حالات نبات تحتوى على تركيب منشط استنساخ-6/1-4؛ يتم استخدام بروتوكول التحول المؤقت transient transformation protocol الموصوف فى مثال Lf يتم توليد إجمالى 0-7٠١ ؟ حالة للنبات لكل من تركيبات منشط استنساخ GALS الست de Vo تحليل التعبير الجينى ل gus يتم تحليل حالات مختارة على هيجرومايسين لمستويات نسخة جين 9005 باستخدام فحصين مسبار تحلل مائى ل DNA يتم تقدير مستويات Ala الاستقرار ل MRNA وناو لكل حالة فردية باستخدام بادئات محددة التتابع ومسبار. يتم معايرة MRNA لكل حالة باستخدام مستوى حالة الاستقرار ل MRNA لجين مرجعى لتبغ ذاتى؛ على سبيل المثال؛ BYEEF يتم ٠ تصميم فحوصات لكل الجينات باستخدام البروتوكول الموصوف فى مثال 4 . يتم إجراء تحليل بيانات PCR للزمن الحقيقى باستخدام برنامج LightCycler® باستخدام وحدة الكمية النسبية relative quant module ؛ ويعتمد على طريقة LAACE يتم مقارنة مستويات التعبير الجينى النسبية لتركيبات المنشط المختلفة. تشير النتائج إلى أن حوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى والبدائل المصممة لحوافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى النباتى هذه يمكن استخدامها كمنشطات © استنساخ؛ ويمكن دمجها مع بروتين ارتباط GALA للتنشيط النسخى للجين. £Y14
q ¢ — — مثال 27 تفاعل وظيفة حافز فى تبغ يحتوى على تركيب مراسل TAL ADL تبغ تحتوى على تركيب مراسل يتألف من نطاق ارتباط TAL تركيب (pTalGUS (Jubal يبنى باستخدام الاستراتيجية الموصوفة أدناه. يتم تخليق A تتابعات تكرار ترادفى TATATAAACCTNNCCCTCT) (المتوالية رقم: 349)) مأخوذة من © تتابع الارتباط التوافقى لجينات قابلة للتحريض بواسطة 1/4853 ews نطاق UPA DNA (Kay ©] al. (2009) Plant J. 59)6(:859-71( من جديد (IDT) مع إضافة مواقع 586١١ لتسهيل الاستنساخ. يتم نقل مواقع ارتباط 8X UPA على قطعة ١ا580؛ ويتم استخدامها لاستبدال مواقع ارتباط 26 من ناقل دخول موجود مسبقاً والذى يتم هضمه أيضاً بواسطة Sach تضع shad الاستتساخ هذه مواقع ارتباط UPA مباشرة عكس اتجاه محفز Arabidopsis Actin 2٠ مما يدفع التعبير الجينى لجين 9015. ناقل التحول النهائى» pGalGUS (شكل (TY ينتج من تفاعل تحويل Gateway® مع ناقل تخصيص يحتوى على كاسيت تعبير جينى لجين 081/محفز Arabidopsis 00 والذى يستخدم لاختيار النبات. يتم تأكيد ناقل التحول النهائى من خلال التتابع؛ ويتم تحويله إلى .LBA4404 (Invitrogen) «A. tumefaciens ali. تحول للتبغ متوسط ب Agrobacterium براسطة PTALGUS yo يتم عمل نباتات مراسلة معدلة وراثياً Transgenic reporter plants باستخدام البروتوكول الموصوف سابقاً. انظر "تحول التبغ المتوسط ب Agrobacterium بواسطة ."pDAB9897 تحليل رقم النسخة 5 PTU للحالات المراسلة. يتم توليد نباتات معدلة وراثياً» مقاومة ل (BASTA® برقم نسخة منخفض التعقيد وتحديدها ٠ باستخدام تحليل رقم نسخة Vl.
TagMan® منخفضة التعقيد». تظهر مجموعة فرحية PTU سليم؛ كما هو محدد بواسطة تحليل PCR يتم تحليل هذه الحالات أكثر من خلال تحليل بقعة جنوبية. بعد تحليل البقعة الجنوبية؛ يتم اختيار حالة PTU سليمة؛ بنسخة مفردة واحدة على الأقل وانما ae حتى النضج فى الدفيئة ويسمح لها بالتلقيح الذاتى. يتم جمع بذور 11 تعقيم سطحهاء وانباتها. بعد فحص التلقيح من خلال تحليل رقم نسخة pat يتم اختيار نباتات 11 متماثلة
-ه4- الزيجوت؛ إنماءها حتى النضج فى الدفيئة؛ والسماح لها بالتلقيح الذاتى. ثم يتم جمع بذور 12؛ تعقيم سطحهاء وإنباتها (كما هو موصوف سابقاً)؛ ويتم استخدامها لتوليد نباتات مراسلة لاختبار المنشط. تركيبات تعبير جينى منشطة لاستتنساخ TAL النبات 2 يتم بناء تركيبات منشطة لاستنساخ TAL النبات تحتوى على حافز تفاعل تنشيط التعبير الجينى لنبات بديل أو أصلى. يتم تعديل تركيبات التعبير الجينى لمنشط استنساخ 250 النبات الموصوفة فى مثال ؛ عن طريق إدخال تتابع بولى نيوكليوتيد بروتين ارتباط TAL بدلاً من تتابع بولى نيوكليوتيد البروتين الرابط لإصبع الخارصين. يتم تخليق ١7.5 تكرار TAL المطلوبة لارتباط DNA من جديد؛ ودمجها مع تتابع تموضع نووى Van ) Zea mays Opaque-2 J et al. (2004) Metabolic Engineering 6:101-8 ٠ 806008810). يستخدم تتابع كل نطاق أحماض أمينية amino acids مختلفة عند الرواسب المتغيرة (الموضع (VY 5 ١١ لإملاء أمر الارتباط ب (DNA كما هو متوقع للتتابع التوافقى Boch et al. )2009( .UPA-box Science 326(5959):1509-12 يتم إدخال تتابع بولى نيوكليوتيد نطاق رابط ل TAL DNA محسن بنبات أحادى الفلقة بدلاً من تتابع بولى نيوكليوتيد البروتين الرابط لإصبع الخارصين ١ كقطعة .Ncol/BamHI عند اكتمال هذه الخطوة؛ يتم وضع تركيب منشط لاستنساخ TAL تحت سيطرة محفز «ill Cassava Vein Mosaic Virus وانهاءه ب 310114 ORF23 من LAL tumefaciens تكتمل ناقلات التحول النهائية؛ من تحول Gateway® بواسطة ناقل تخصيص يحتوى على كاسيت (.51901003-1101ل Arabidopsis لاختيار النبات. يتم تأكيد ناقل التحول النهائى من خلال التتابع؛ وتحويله إلى سلالة LBA4404 (A. tumefaciens .(Invitrogen) ٠ لإنتاج حالات نبات تحتوى على تركيب منشط استنساخ-181 نبات؛ يتم استخدام بروتوكول التحول المؤقت الموصوف فى مثال 4. يتم توليد إجمالى Alla 70-7١ للنبات لكل من تركيبات منشط استنساخ TAL الست عشر. تحليل التعبير الجينى Expression Analysis ل .gus qe يتم تحليل حالات مختارة على هيجرومايسين لمستويات نسخة جين 9005 باستخدام وناو لكل MRNA يتم تقدير مستويات حالة الاستقرار ل DNA فحصين مسبار تحلل مائى ل باستخدام مستوى حالة MRNA فردية باستخدام بادئات محددة التتابع ومسبار. يتم معايرة ls لجين مرجعى لتبغ ذاتى؛ على سبيل المثال؛ ]]87. يتم تصميم MRNA الاستقرار ل فحوصات لكل الجينات باستخدام البروتوكول الموصوف فى مثال 4 . يتم إجراء تحليل بيانات © باستخدام وحدة الكمية النسبية؛ ويعتمد LightCycler® للزمن الحقيقى باستخدام برنامج PCR على طريقة أل. يتم مقارنة مستويات التعبير الجينى النسبية لتركيبات المنشط المختلفة. قائمة التتابع
Dow Agrosciences, LLC >١١١<
Li,Jianquan ٠٠
Petolino, Joseph
Blue, Ryan
Evans, Steve
PLANT تنشيط التعبير الجينى للنبات INTERACTION MOTIFS حوافز لتفاعل <VY o> واستخدامها TRANSACTIVATION ١٠١ (P10810US 709ا69643-79) >١3١< ٠١٠ >١ا١<
Voge نسخة البراءة >١7.< ١ >7٠<
Ye <ااا> 0 ٠
PRT >؟١١<
—qy— herpes simplex virus فيروس الهربس البسيط <YYY> ١ <u>
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Asp
Vo ٠١ 2 ١ o
Phe Glu Phe Glu ماك Met Phe Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly
Y <YY.>
YY <ااا> 0٠
PRT >؟١١<
Arabidopsis thaliana >١١ ١<
Y ><
Asn Asp Ser Glu Asp Met Leu Val Tyr Gly Leu Leu Lys Asp Ala Phe
Vo ٠١ 2 ١ ١١
His Phe Asp Thr Ser Ser Ser Asp Leu Ser Cys Leu Phe Asp Phe Pro
Yo Yo Ye.
Ala
Y <Y\V.>
4 A— ؛١ <YW\ >
PRT <vyy>
Solanum tuberosum <Y\y> <¢ou> 0 ب Cys Leu Thr Glu Thr Trp Gly Asp Leu Pro Leu Lys Val Asp Asp Ser Vo ٠١ 2 ١ Glu Asp Met Val lle Tyr Gly Leu Leu Lys Asp Ala Leu Ser Val Gly Yo Yo Ye.
Trp Ser Pro Phe Ser Phe Thr Ala Gly ٠ 2 Yo ¢ <YV.>
YY <YW>
PRT <vyy>
Arabidopsis thaliana >< \o § <u>
Cys Phe Thr Glu Ser Trp Gly Asp Leu Pro Leu Lys Glu Asn Asp Ser
Vo ٠١ 2 ١
Glu Asp Met Leu Val Tyr Gly lle Leu Asn Asp Ala Phe His Gly Gly
Yo Yo Ye. <YY.> ه 7١ <YW> PRT <vyy> Catharanthus roseus <Y\y> © <> 0 Phe Asn Glu Asn Cys Glu Glu lle lle Ser Pro Asn Tyr Ala Ser Glu Vo ٠١ 2 ١ Asp Leu Ser Asp lle lle Leu Thr Asp lle Phe Lys Asp Gln Asp Asn Yo Yo ١ A
Tyr Glu Asp Glu vo 1 <YY.>
YY <YW>
PRT <yyy> ١١
Arabidopsis thaliana <Y\y>
T <g>
Gly Phe Asp Met Glu Glu Thr Leu Val Glu Ala lle Tyr Thr Ala Glu
Vo ٠١ 2 ١
Nam
Gln Ser Glu Asn Ala Phe Tyr Met His Asp Glu Ala Met Phe Glu Met
Yo Yo Ye.
Pro Ser Leu Leu Ala Asn Met Ala Glu Gly Met 2 Yo لا <YY.> ©
YV >”ا١ا<
PRT <vyy>
Arabidopsis thaliana <Y\y> <م.ء> لا
Glu GIn Ser Glu Gly Ala Phe Tyr Met Asp Glu Glu Thr Met Phe Gly ٠
Vo ٠١ 2 ١
Met Pro Thr Leu Leu Asp Asn Met Ala Glu Gly
Yo ٠١
A <YY.>
YY <ااا> ١
PRT >؟١١<
Zea mays >"١7<
A ><
Ser Ala Gly Lys Ala Val Leu Asp Asp Glu Asp Ser Phe Val Trp Pro
-١.١- ١١ oe ° ١
Ala Ala Ser Phe Asp Met Gly Ala Cys Trp Ala Gly Ala Gly Phe Ala
Yo Yo Ye.
Asp 4 <Y\V.> ° ١١ >”١ا١ا<
PRT >؟١١< herpes simplex virus فيروس الهربس البسيط >” ١< q <g>
Asp Asp Phe Glu Phe Glu GIn Met Phe Thr Asp ٠ ٠١ 2 ١ ٠١ >7٠<
YY >”١ا١ا<
PRT >؟١١<
Arabidopsis thaliana >< \o ٠١ <ga>
Asp Ala Phe His Phe Asp Thr Ser Ser Ser Asp ٠١ 2 ١
YY >”٠<
-١ ١,
Ye >”١ا١<
PRT >؟١١<
Solanum tuberosum <Y\y>
VY >..<
Asp Asp Ser Glu Asp Met Val lle Tyr Gly Leu Leu Lys Asp © ٠١ 2 ١ ١١ >”٠< >”١ا١<
PRT >؟١١<
Arabidopsis thaliana <y\yy> ٠ ١١ >..<
Glu Asn Asp Ser Glu Asp Met Leu Val ° ١ ٠١ >”7٠<
Yo <YVY> Yo
PRT <vyy>
Catharanthus roseus <Y\y>
VY >..<
Glu Asp Leu Ser Asp lle lle Leu Thr Asp
١, oe ° ١
Ye >”٠<
Yo >”١١<
PRT >؟١١<
Arabidopsis thaliana >< م VE >..<
Glu Asn Ala Phe Tyr Met His Asp Glu Ala Met Phe Glu Met Pro
Vo ٠١ 2 ١
Yo <Y\V.> 4 <ااا> 0٠
PRT >؟١١<
Arabidopsis thaliana >١١ ١<
Yo <..ء؛> Asp Glu Glu Thr Met Phe Gly Met Pro o ١ ١ ٠1١ >”٠< ١١ >”ا١ا<
PRT >؟١١<
Zea mays >"١7<
-١ ٠1١ >..<
Glu Asp Ser Phe Val Trp Pro Ala Ala Ser Phe Asp " 2 ١ ود الك د ١١ <اا”ا> 5
PRT >؟١١< اصطناعى >"؟١< <YY.>
VERF2 1 تنشيط التعبير الجينى بديل Glas حافز تفاعل <YYY> >
MISC FEATURE > ١< (£)--(%) <YYY>
His J Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ (V)--(Y) >” 77<
Thr أو Gln Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vyy\>
-١.ه- )4(..)4( <YYY>
Ser J Met يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> )١(..0( <YYY> oo
Ser أو Thr يمثل Xaa <vYY>
VV <¢vn>
Asp Asp Phe Xaa Phe Asp Xaa Xaa Phe Xaa Asp ٠١ 2 ١
YA سن للك Yo
YY >”١ا١ا<
PRT >؟١١< اصطناعى >"؟١< <YY.>
VERF2 2 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (Y)--(Y) <YYY>
Ala J Asp يمثل Xaa <YYY> yore <VY.>
MISC FEATURE <YY\> (£)--(%) <YYY>
His J Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.> م MISC FEATURE <YY\> )1(..)1( ><
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <YYy> ٠ )0..00( <YYY>
Thr أو Gln يمثل Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <YY\> )4(..)4( <YYY> ١
Ser أو Met يمثل Xaa >77 7< <VY.>
MISC FEATURE <YY\> (0 0.) ل <YYY>
-١ ل Ser أو Thr يمثل Xaa >” 77 <
YA >.
Asp Xaa Phe Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Phe Xaa Asp ٠١ 2 ١ ٠١ >ا٠< 5
YY >”١ا١ا<
PRT >؟١١< اصطناعى >"؟١< <YY.>
VERF2 3 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (Y)--(Y) <YYY>
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.> ١١
MISC FEATURE <vyy\> (£)--(%) <YYY>
His J ,Asp, Glu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
- ١م
MISC FEATURE >؟؟١< )1(..)6( <YYY>
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\y> ه )0..00( <YYY>
Thr أو Gln Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )4(..)4( <YYY> Ye
Met J Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )5(..)5( <YYY> Yo
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> (0 0.) ل <YYY>
-١.4-
Pro أو ,Ser, Thr, Asn, GIn, Cys, Gly يمثل Xaa ><
V4 >..<
Asp Xaa Phe Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp ٠١ 2 ١
Yo >ا٠< 0 ١١ >”١ا١ا<
PRT >؟١١< اصطناعى >"؟١< <YY.>
VERF2 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (Y)--(Y) <YYY>
Glu § ,Asp Jia Xaa <YYY> o <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (£)--(%) <YYY>
Glu أو His, Arg, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY> yy. <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )1(..)1( <YYY>
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.> ©
MISC FEATURE <YY\> (V)--(Y) >” 77<
Pro J ,Ser, Thr, Asn, Gln, Cys, Gly, Tyr يمثل Xaa >١7 3< <YY.>
MISC FEATURE <YYy> ٠ (A)--(A) <YYY>
Trp أو ,Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> 0 0 <TYY> Ye
Trp أو ,Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> (Ye).o(Y +) >< £Y14
-١١١-
Pro J ,Ser, Thr, Asn, Gln, Cys, Gly, Tyr يمثل Xaa >77 3<
Yo ><
Asp Xaa Phe Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp a ° ١
YY >ا٠< © ١١ >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >"؟١< >
VERF2 5 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (Y)--(Y) <YYY>
Glu § Ala, Asp Jia Xaa <YYY> Yo <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> (£)--(%) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jia Xaa <YYY> £Y14
-١١"- <YY.>
MISC FEATURE <vyy\> )1(..)1( <YYY>
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.> ©
MISC FEATURE <vyy\> (V)--(Y) >” 77< amino acid أى حمض أمينى Jia Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> 1. (A).-(M) <YYY>
Ser أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr, Trp يمتل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )5(..)5( <YYY> ١
Ser أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr, Trp يمتل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY>
YY >..<
Asp Xaa Phe Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp
Yo ° ١
YY >ا"٠١< oo
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VERF2 6 تنشيط التعبير الجينى بديل Glas _حافز تفاعل <YYY> ٠
YY >..<
Asp Asp Phe His Phe Glu Thr Met Phe Ser Asp
Yo ° ١
YY <Y\V.>
Ye <ااا> ١
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VPTL 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY>
-١١6- <VY.>
MISC FEATURE >؟١< (Y)..(Y) ><
Ser J Phe يمتثل Xaa <YYY> <YY.> م MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE >< ٠ )1(..)1( ><
Met J Gln يمثل Xaa >77 7< <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )0..00( <YYY> م Val J Met Jig Xaa >77 7< <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )5(..)5( <YYY>
-١١-
Tyr يمثل 008 أو Xaa >77 7< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١(..)١ ( <YYY>
Leu أر Thr Jig Xaa <YYY> o©
YY >..<
Asp Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa lle Xaa Gly Xaa Leu Lys Asp a ° ١
Y¢ >”٠<
Ye <ااا> 0٠
PRT >< <2١؟١> اصطناعى <YY.>
VPTI4 2 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.> ١١
MISC FEATURE >؟؟١< (7)--(Y) <YYV> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
-١١1-
MISC FEATURE >؟١< (°).-(°) ><
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <yvy> ه )1(..)1( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)oo(Y) <YYY> OY.
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A).-(M) <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> Vo <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )5(..)5( <YYY>
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY>
-١١/- <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> ©
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١(..)١ ( <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> 1. (\Y)--("Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (Y¥)..(\Y) >< ٠١ أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <م.> ءا
Asp Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp a ° ١
-١١ م Yo <Y\.>
VY >”١ا١ا<
PRT <vyy> اصطناعى <YVY> <YY.> ©
VPTIA 3 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) ><
Ser JPhe يمتل Xaa <YY¥> ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.> Yo
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY>
Met J 60 Jig Xaa <YYY> <YY.>
-١١4-
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Val J Met يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YYy> o (3)-.(3) <vYY>
Tyr يمثل 008 أو Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل >< 0٠
Leu J Thr يمثل Xaa >١7 77<
Yo ><
Asp Asp Xaa Glu Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp
Yo ° ١ 2١ >ا٠ا< Yo
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> yt
VPTIA 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) >< amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> ٠
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ (V)--(Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\>
-١؟١- (A).-(M) <YYY>
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )5(..)5( <YYY> ©
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 ..)١ ل <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> ٠ ١ <¢4>
Asp Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp a ° ١
YV <YV).>
YY <YYY> Yo
PRT <Yy\yvy> اصطناعى <YIT> <YY.>
VPTI4 5 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY>
-١77- <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (7)--(Y) <YYV> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.> ©
MISC FEATURE <vy\> (©).-(°) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE >< ٠ )1(..)1( ><
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) >< ١٠١ amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A)-o(A) <YYY> £Y14
ضف Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> أو Trp <YY.> <١؟؟> MISC FEATURE <YYY> (5(..)5) Xaa <YYY> ٠ يمثل Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr أو Trp <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777<
YV >»... Yo
Asp Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp a 2 ١
YA > ٠<
VY >”١ا١ا<
PRT ج<د> ١١ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VPTI4 6 تنشيط التعبير الجينى بديل Glas حافز تفاعل <YYY>
YA ><
-١4-
Asp Asp Phe Glu Phe Glu Met Met Phe Thr Asp a ° ١ ١ >”٠< >”١١<
PRT >< م اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VALERF1 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> 1. )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (£).-(%) <YYY> ١
Ser J Phe يمتثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )1(..)1( ><
—\Yo-
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Leu §Phe Jig Xaa <YYY> o© <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (3)-.(3) <vYY>
Val J Thr Jig Xaa <yYy> ١ <¢ve> Yo
Xaa Asn Asp Xaa Glu Xaa Met Xaa Xaa 2 ١
Ye >”7٠٠< >”١١<
PRT ج<د> ١١ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VALERF1 2 تنشيط التعبير الجينى بديل Glas حافز تفاعل <YYY> <YY.>
-١؟-
MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <yvy> ه (Y)--(Y) <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (£).-(%) >< 0٠ أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
Glu J Asp يمثل Xaa <YY¥> Yo <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A).-(M) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> £Y14
-١ /- <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )5(..)5( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777<
Ye <gvu> 0
Xaa Xaa Asp Xaa Glu Xaa Met Xaa Xaa 2 ١
YY >”٠<
VY >”١ا١ا<
PRT <yyv> ٠ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VALERF1 3 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١<
-١ م )0..)0( <YYY>
Ser أو 008 (iy Xaa >77 7< <YY.>
MISC FEATURE <vY\> (1)--(1) <YYY> م
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vY\> (3)--(3) <YYY>
Leu JPhe Jig Xaa <YY¥> 1. <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 ..)١ ل <YYY>
Val J Thr يمثل Xaa <Yyv>
YY <g> Yo
Xaa Asp Xaa Glu Phe Xaa GIn Met Xaa Xaa Asp
Ye 2 ١
YY >١٠٠<
YY >”١ا١<
Ave
PRT <Yy\yvy> <YVY> اصطناعى <YY.> VAERF1 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.> م MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY> Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE >< ٠ (Y).-(Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< ١ Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
CA
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) <YYV>
Pro J ,Ser, Thr, Asn, GIn, Cys, Gly, Tyr يمثل Xaa <YY¥> o© <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )5(..)5( <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> >
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ (0 ١ ٠.) ( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY>
YY <¢ve>
Xaa Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Met Xaa Xaa Xaa
-١1- " 2 ١
YY <vY.>
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >؟١< oo <YY.>
VALERF1 5 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )١(..)( <YYY> 0٠ amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (7)--(Y) <YYV> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> Vo <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (°).-(°) ><
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY>
-١©7- <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )1(..)1( <YYY>
Lys J ,Asp, Glu, His, Arg يمتل Xaa <YYY> <YY.> ©
MISC FEATURE <YY\> (V)--(¥) ><
Pro أو ,Ser, Thr, Asn, GIn, Cys, Gly, Tyr يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <Yy\y> ٠ )5(..)5( <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )١(..0( <YYY> ٠١ amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <YY\> (0 ١ ٠.) ( <YYY>
فضا Xaa <YYY> يمثل Glu J Asp YY <¢ve> Xaa Asp Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Met Xaa Xaa Xaa Yo ° ١ © <١٠ا> +
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VAERF1 6 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> ٠
YE <.م.> Glu Asn Asp Phe Glu Phe Glu Met Phe Thr Asp
Yo ° ١
Yo <YVY).> ٠١ <YVY> ١
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VORCA2 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY>
١6 <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> م MISC FEATURE >؟١< (Y)..(Y) ><
Leu §Phe يمثل Xaa <vYYY> <VY.>
MISC FEATURE >< ٠ (£).-(%) <YYY>
Ser أو Glu Jig Xaa >” 77 < <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< ١
Asp 28ل يمثل 006 أر >77 7< <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
—\yo- lle § Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) <YYV> lle J Met Jig Xaa <YYY> o© <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Leu §Phe يمثل Xaa <vYYY>
Yo د Vo
Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Asp a ° ١ 7١ >”٠٠< ٠١ <YVYV>
PRT ج<د> ١١ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VORCA2 2 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
١ 1-
MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <yvy> ه (Y).-(Y) <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (£).-(%) <YYY> Ye amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr Jiu Xaa <YYY> ١٠١ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> £Y14
١ لام <YY.> MISC FEATURE >؟١< (¥)--(¥) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YYY> o© <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A).-(M) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YY¥> 7١ <g> ١١
Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Asp ٠٠١ 2 ١ 7 >"٠<
YY >”١ا١<
PRT <vyy> ١١ اصطناعى <YIT> <YY.> 7080823 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY>
١م <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> م MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) ><
Leu §Phe يمثل Xaa <vYYY> <VY.>
MISC FEATURE >< ٠ (£).-(%) <YYY>
Ser أو Glu Jig Xaa >” 77 < <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< ١
Asp 28ل يمثل 006 أر >77 7< <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
-١؟4- lle § Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY> lle أو Met يمثل Xaa <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (3)-.(3) <vYY>
Leu §Phe يمثل Xaa <vYYY>
YY <¢ve> Yo
Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Gln Xaa Xaa Thr Asp a ° ١
YA > ٠<
VY >”١ا١ا<
PRT ج<د> ١١ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VORCA2 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
-١م2-
MISC FEATURE <YY\> )١(..)( <YYY>
Glu 4 His, Arg, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <yy\y> oo (Y)--(Y) ><
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> (£).-(%) >< 0٠ أو ,Ser, Thr, Asn, Gin, Cys, Gly, Pro, Arg, His, Lys, Asp يمثل Xaa ><
Glu <YY.>
MISC FEATURE <YY\> (°).-(°) >< ١
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <YY\> )1(..)1( <YYY> kA
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) <YYV> أو ,Ser, Thr, Asn, Gin, Cys, Gly, Pro, Arg, His, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY> ٠
Glu <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Met J,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YYY> ©. <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )5(..)5( <YYY>
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY>
YA <¢ve> ١
Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Asp
Yo ° ١ 7 >"”٠٠<
-١67-
VY >”١ا١ا<
PRT >؟١7< <YVY> اصطناعى <vY.> VORCA2 5 تنشيط التعبير الجينى بديل Glas حافز تفاعل <YYY> 0 <vY.> MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> 0٠ MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) >< Jig Xaa <YYY> أى حمض أمينى <vY.> MISC FEATURE >؟١« ١٠ (£).-(%) <YYY> Jig Xaa <YYY> أى حمض أمينى <vY.> MISC FEATURE <vy\> £Y14 ns (©).-(°) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( >< ©
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYV> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A)-o(A) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YY¥> <YY.> yo
MISC FEATURE <vy\> (2)--(3) <YYV>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr يمثل Xaa <YY¥> 71 <¢ve> £Y14
-١66-
Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Asp a 2 ١
Ev >١7٠< ٠١ <YVYV>
PRT <vyy> مه اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VORCA2 6 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> $v ><
Glu Asp Phe Asp Leu Glu Met Leu Thr م658 ٠ a 2 ١ ١ <YV.>
Yo <Y\V\>
PRT <vyy> اصطناعى >؟١< Yo <YY.>
VDREBIA 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< <YY.>
MISC FEATURE <vy\>
-١68- )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)--(Y) <YYY> oo
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Tyr JPhe يمثل Xaa <YYY> 1. <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 ..)١ ل <YYY>
Ala § GIn يمتل Xaa <YYY> <YY.> Vo
MISC FEATURE <vy\> (0 £)..() 3 <YYY>
Met J Thr يمثل Xaa <vyYY> <VY.>
EA
MISC FEATURE >؟؟١< (Yo)..(Yo) ><
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> £Y <..ء> Xaa Xaa Ala Phe Xaa Met His Asp Glu Xaa Met Phe Glu Xaa Xaa ©
Yo Yo هت ١
EY <YV.>
Yo <Y\V\>
PRT >< اصطناعى >؟١3< ٠ <YY.>
VDREBIA 2 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )١(..)( <YYY> ١ amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (Y)--(Y) <YYY>
-١/-
Glu J ,Asn, His, Arg, Lys, Asp Ji Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y).-(Y) <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Trp أو , 9028, Tyr يمثل Xaa <YYY> <YY> ٠
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ (V)--(Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >؟١< £Y14
-١6/- (A).-(M) <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )0(..0( <YYY> © أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (\¥)--('Y) <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 £)..() 3 <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.> yo
MISC FEATURE <vy\> (Yo)..(Yo) ><
Glu J ,Pro, His, Arg, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY>
EY <*ء؛> £Y14
-١؟4- 788 Xaa Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa 38
Yo Yo هت ١
YY <vY.>
VY >”١ا١ا<
PRT >< oo اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VDREBIA 3 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< >
MISC FEATURE >؟؟١< )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ (Y)--(Y) <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١<
“Nom (°).-(°) ><
Tyr يمثل 008 أو Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) >< ©
Ala J Gln يمتل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY>
Met J Thr Jia Xaa <YYY> ©. <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١(..)١ ( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> £Y <..؛> Yo
Xaa Xaa Phe Glu Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa
Yo ° ١ ؛ <YV.>
VY >”١ا١ا< yoy
PRT <Yy\yvy> <YVY> اصطناعى <YY.> VDREBIA 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.> م MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY> Glu 4 His, Arg, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE >< ٠ (Y)--(Y) <YYY> Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> (£).-(%) <YYY> Yo Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< £Y14
-١ م Tyr يمثل 008 أو Xaa >77 7< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) <YYV> ,Ser, Thr, Asn, Gin, Cys, Gly, Pro, Ala, Val, Leu, lle يمثل Xaa <YYY> o
Met J Phe, Tyr, Trp <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> ,Ser, Thr, Asn, Gln, Cys, Gly, Pro, Ala, Val, Leu, lle يمثل Xaa <YYY> ©.
Met J Phe, Tyr, Trp <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١ ٠.) ( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YY¥> Yo £¢ <مء> Xaa Xaa Phe Xaa Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa
Yo ° ١ to <Y\V.> yey
YY >”١ا١<
PRT <yyv> اصطناعى <YVY> <YY.>
VDREBIA 5 تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل ila <YYY> ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< جالاا> 0٠
MISC FEATURE >؟١< (Y)--(Y) <YYY>
Asn J Asp, Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ (£).-(%) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> voi (°).-(°) ><
Trp أو , 9028, Tyr يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY> م Jig Xaa <YYY> أى حمض أمينى <YY.> MISC FEATURE <vy\> <YYY> ل ..)١ 0( amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> ٠ <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 ١ ٠.) ( <YYY>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥> $0 <tt> Yo
Xaa Xaa Phe Xaa Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa
Ye 2 ١ £71 >”7٠<
YY >”١ا١<
—Voo—
PRT >< <2١؟١> اصطناعى <YY.> <> حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل 7 VDREBIA <g> 0 ¢1
Glu Asp Phe Glu Phe Glu Ala Met Phe Met Asp a ° ١
EY <Y\V.> 4 <YVYV>
PRT <yyv> ٠ <2١؟١> اصطناعى <YY.>
VCBF1 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ (£).-(%) <YYY>
Thr J Gln Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١<
-١ه1- (A).-(M) <YYY>
Met J Thr يمثل Xaa <vYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )5(..)5( <YYY> oo
Glu J Asp Jie Xaa <YYY>
EY <¢ve>
Asp Glu Glu Xaa Met Phe Gly Xaa Xaa 2 ١
EA لس الل Yo >؟”7١ا١ا<
PRT >؟١< اصطناعى <YIT> <YY.>
VCBF1 2 نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل Je lad حافز <YYY> Vo <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (£).-(%) <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> £Y14
-١ لاع <YY.> MISC FEATURE <vy\> (¥)--(¥) <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.> م MISC FEATURE <vy\> (A).-(M) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >< ٠ )5(..)5( <YYY>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥>
EA ><
Asp Glu Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa Xaa o ١ ١ £4 <YV.>
YY <YYY>
PRT <Yy\yvy> اصطناعى <YIT> £Y14
-١ مه <YY.> VCBF1 3 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) >< ©
Thr J Gln Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY>
Met J Thr Jia Xaa <YYY> ©. <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١(..)١ ( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> ¢4 <..؛> Vo
Asp Asp Phe Glu Phe Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa a ° ١ .هه >7ا١٠١<
VY >”١ا١ا<
-١ه4-
PRT >١7< <YVY> اصطناعى <YY.> 7081-4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.> م MISC FEATURE >؟١< (Y)--(Y) <YYY> Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE >< ٠ (Y).-(Y) <YYY> Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< ١ Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY>
Ate
Tyr أو ,Ser, Thr, Asn, GIn, Cys, Gly Jie Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> ,Ser, Thr, Asn, Gin, Cys, Gly, Pro, Ala, Val, Leu, lle يمثل Xaa <YYY> o
Met J Phe, Trp, Tyr <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١ ٠.) ( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YY¥> V.
Ov <§au>
Asp Xaa Xaa Glu Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa a 2 ١ ه١ >ا”٠ء< Yo
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
-١١1- 708] 5 تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل Bla <YYT> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)--(Y) <YYY>
Glu أر Asp يمثل Xaa <YYY> o© <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) >< amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> ٠
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ (V)--(Y) <YYY> Jig Xaa <YYY> أى حمض أمينى <YY.> MISC FEATURE <vy\>
-١؟7- (0 ..)١ ل <YYY> amino acid يمثل أى حمض أمينى Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ١(..)١ ( <YYY> oo
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥> ه١ <g>
Asp Xaa Xaa Glu Xaa Glu Xaa Met Phe Xaa Xaa
Yo ° ١ oY <YY.> ٠
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VCBF1 6 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> Vo
OY <g>
Asp Asp Phe Glu Phe Glu Thr Met Phe Met Asp
Yo ° ١ or >ا١٠١<
-١©- ١١ <اا”> PRT >؟١< اصطناعى <YVY> <YY.>
VDOF1 1 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> ٠
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Val J Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ )1(..)1( ><
Trp يمثل 006 أو Xaa >” 77< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> £Y14
)7(..)( <YYV>
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY> oo
Ala J Gln يمتل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (3)-.(3) <vYY>
Ala J Met Jig Xaa > <٠
OF <ءء؛> Xaa Asp Ser Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Phe Asp
Yo ° ١ 0¢ >ا”٠ء< Yo ١١ >”ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
-١؟8- 7001-2 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYT> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..)( <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <yYY> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)..(Y) >< amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> ٠
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< Jig Xaa <YYY> أى حمض أمينى <YY.> MISC FEATURE >؟١« ١٠ )1(..)1( >< Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\>
-١11- )7(..)( <YYV>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa >77 7< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY> oo amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )5(..)5( <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr Jiu Xaa <YYY> 1. <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> 0¢ >... Vo
Xaa Asp Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Phe Asp a 2 ١ هده <YY.>
VY >”١ا١ا<
-١/-
PRT >١7< <YVY> اصطناعى <YY.> VDOF1 3 تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل ola <YYT> <YY.> م MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY> Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE >< ٠ (£).-(%) <YYY> Val J Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.> MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) >< ١ Trp يمثل 006 أو Xaa >” 77< <YY.> MISC_FEATURE <YY)> (1)--(3) <YYY>
-١60-
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (V)--(Y) <YYV>
Ala أى GIn يمتل Xaa <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Ala J Met يمثل Xaa <YYY> 00 >. ف Xaa Asp Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Phe Thr Asp a ° ١ 07 >7ا7١٠١<
VY >”١ا١ا<
PRT ج<د> ١١ اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VDOF1 4 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
-١8-
MISC FEATURE >؟١< )١(..)( <YYY>
Glu 4 His, Arg, Lys, Asp يمثل Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <yvy> ه (£).-(%) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).(°) >< 1.
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <VY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( ><
Glu J Asp يمثل Xaa <YY¥> Yo <VY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777<
SAV
<YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.> ©
MISC FEATURE >؟؟١< (0 ..)١ ل <YYY>
Tyr أو ,Ser, Thr, Asn, 60, Cys, Gly, Pro يمتل Xaa <YYY> 07 <g>
Xaa Asp Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Phe Xaa Asp - ٠ a 2 ١ oy >7ا١١<
YY >اا١ا<
PRT >< ١ <3١؟> اصطناعى <YY.> <YYY> حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل 5 VDOF1 <YY.> <١؟؟> MISC FEATURE
-١9/1- )١(..)( <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (£).-(%) >< © أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> ©. <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥> <YY.> yo
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY> amino acid أى حمض أمينى Jig Xaa >777< <YY.> £Y14
—\VY-
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY>
Trp أو Ala, Val, lle, Leu, Met, Phe, Tyr (iy Xaa <YVvY> <YY.>
MISC FEATURE <YYy> o (0 ..)١ ل <YYY> أى حمض أمينى Jig Xaa <YYY> oF <g>
Xaa Asp Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Phe Xaa Asp
Yo ° ١ A
OA <YY.>
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> ١١
VDOF1 6 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY>
OA <g>
Glu Asp Phe Glu Phe Glu Ala Met Phe Thr Asp a 2 ١
—\VY- 04 <YYy.> ٠١ <YVWYV>
DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< <YY.> ©
KanMX-For بادئ <YYY> 04 <g> aagaaactag tggatccgct agcttaatta aagatctggt accgtttagc ttgectegtc 0
Te >”٠<
Yeo <YVY> 0٠
DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< <YY.>
KanMX-Rev بادئ <YYY>
Te >... Yo aagaaggaat tcagagctcg ttttcgacac 30 1١ >”7٠<
Yo <Y\V\>
DNA <Y\Y>
AN
اصطناعى >١؟١؟< <YY.>
HO-For بادئ <YYY>
TY <g> ttgcccgaat tectg 15 هه 17 >”٠<
YY <اا”> DNA ؟> ١ < اصطناعى >١؟١؟< <YY.> Y.
HO-Rev بادئ <YYY>
IY <.ء؛> aagaagacta gtcgtacgac gccattt 27 17 >٠<
YY <اا"> ١
DNA ؟> ١ < اصطناعى >١؟١؟< <YY.>
MEL1-For بادئ ><
-١ 8
TY <g> acggaacggg taccaagaag aaaggaagac atg 33 1¢ >”7٠<
YA ><
DNA <Y\Y> د اصطناعى <YYYT> <YY.>
MEL]1-Rev بادئ <YYY> 1 <g> ctaaagggaa caaaagct 18 ٠
To >؟٠٠١<
YA <YVV>
DNA <Y\Y> اصطناعى <YYYT> <YY.> ١١
HAS-For-F1 <؟؟؟> بادئ >). tagattggga 1]--1999990 0009336 28 11 >”٠< £Y14
-١716-
YY <Yy\>
DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١؟< <YY.>
HAS-For-R1 بادئى <YYY> © 17 <g> tagattgtta attaatggtc atcctcatcc tgc 33 7ر1 <¥YY.>
YY >اا١ا<
DNA > جر 1. اصطناعى >؟١؟< <YY.>
Z6 تتابع <YYY>
TY <g> tgtggtggga gaggaggatg g 21 ١٠
TA > ٠١<
Yo) <اا> DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١؟< £Y14
-YVYV- <YY.> 26 تتابع متكرر XA <YYY>
TA <¢4> ggtatggtag gagaggaggg 1999391919 gtgggagagg agggtggcte tgtggtggga 60 ه٠ gaggagggtg gagatgtggt gggagaggag 991991-09 9919993939 9 120 gatgtggtag gagaggaggg tggcecttgty gtgggagagg agggtggagg tgtggtggga 180 gaggagggtg gcttaagecg c 201 ٠ 14 <YY.>
Ya <yy\>
DNA ؟> ١ <؟ اصطناعى >"؟١< <YY.> Yo
TQPATS <؟ ؟> بادئى 14 <..ء؛> acaagagtgg attgatgatc tagagaggt 29
Ye >7١٠١<
Ya <ااا> Y.
-١١//0-
DNA ؟> ١ < <YYYT> اصطناعى <YY.> <؟ ؟> بادىئى TQPATA م <> إل ctttgatgcc tatgtgacac gtaaacagt 29 YY <Y).> ١ <ااا> DNA ؟> ١ < اصطناعى >؟١3< 0٠ <YY.> TQPATFQ بادئ <YYY> YY <¢ve> ggtgttgtgg ctggtattge ttacgctgg 29
YY <YY.> Yo Ye <YVYV> DNA ؟> ١ < <YYYT> اصطناعى <YY.>
-١١ل4-
TQPALS gab <؟ ؟>
YY <¢ve> tactatgact tgatgttgtg tggtgactga 30
YY <Y\.>
YA <YVY> oo
DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١؟< <YY.>
TQPALA <؟ ؟> بادئى
YY <g> Yo gagcggtcta aattccgacc cttatttc 28 كلا <YY.>
YY <Yy\>
DNA <Y\Y> <YV¥> 5 اصطناعى <YY.> FAMT <yYY> منبار TQPALFQ Ye <¢ve> aaacgatggc aggagtgccc tttttctatc aat 33 £Y14
CA A—
Yo <Y\).> ٠١ >اا١<
DNA >؟١< اصطناعى >؟١١3< <YY.> o
Blu636 بادئ <YYY>
Yo <¢ve> 9898998999 tggagatgt 19 خلا <Y\).> ٠١ <ااا> 0٠
DNA >؟١< اصطناعى >؟١١3< <YY.>
Blu637 بادئ <YYY>
Yi >... Yo accttggact cccatgttg 19
YY <Y\).>
YY >اا١ا<
DNA >؟١< £Y14
-١81- اصطناعى >؟١؟< <YY.> أمامى CHS'Y بادئ <vYY>
YY <¢ve> ctgatccaat tccagaggtc g 21 oo
YA <Y).>
Y¢ <¥VV\Y>
DNA ؟> ١ < اصطناعى >؟١؟< <YY.> Y. عكسى CHS'Y <؟؟؟> بادئ
YA >). <م acacacaagc actagacatg ttgc 24
Ya <Y\).> ٠١١ <YYY> ١
DNA ؟> ١ < اصطناعى >؟١؟< <YY.>
-١87- نطاق تنشيط التعبير interaction motif <؟؟>_تتابع تركيبى يقوم بترميز حافز تفاعل
Z6 DNA binding motif مدمج بحافز ارتباط VP16 الجينى Va <¢ve> ggcatgaccc atgatcctgt gtcttatgga gccttggatg ttgatgactt tgagtttgag 0 cagatgttca cagatgcact gggcatcgat gactttggtg ga 102 ه٠
Av >< 44 >؟”١١ا<
DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< > interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 DNA binding motif مدمج بحافز ارتباط ERF2 نطاق تنشيط التعبير الجينى لم >< aatgactctg aggacatgct ggtgtatggt ttgctcaagg atgcctttca ctttgacacc 0 yo tccagctcag acctctectg cctetttgac ttcccagece 99
AY ><
YYY >"١١٠<
DNA <Y\Y>
م 1- <2١؟١> اصطناعى <YY.> <YYY> تتابع تركيبى Synthetic sequence يقوم بترميز حافز تفاعل interaction motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0114 مدمج بحافز ارتباط Z6 DNA binding motif 0 7<..؛> AY tgcctgacag aaacttgggg agacttgect ctcaaggttg atgactctga ggacatggtg 0 atctatggtc tgttgaagga tgcactctca gtggggtggt ccccattete tttcacgget 0 ggt 123
AY <Y\V.>
AT <ااا> 0٠
DNA > ١١< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 DNA binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 811471 مدمج بحافز ارتباط ١
AY <م.> tgcttcacgg aatcctgggg agaccttcct ttgaaggaga atgactctga ggacatgttg 60 gtgtacggaa tcctcaatga tgcttttcat ggtggce 96
AY >7٠<
—\AE—
Ye A ><
DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY> ©
Z6 DNA binding motif مدمج بحافز ارتباط ORCA2 نطاق تنشيط التعبير الجينى
AY >..< ttcaatgaga attgtgaaga aatcatctct ccaaactacg catcagagga cttgtctgac 0 atcatcttga cggacatctt caaggaccaa gacaactatg aggatgag 108
AE ل الل Yo ١١ <YVYV>
DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY> Yo
Z6 DNA binding motif مدمج بحافز ارتباط DREBIA نطاق تنشيط التعبير الجينى
AE <م.> ggctttgaca tggaagaaac attggtggag gccatctaca ctgctgaaca gagcgagaat 60 gccttctaca tgcatgatga ggcaatgttt gagatgccat ctettctgge caacatgget 120 ٠
—\Ao— gagggaatg 129 عدم >< لم >”١١<
DNA > ١١< اصطناعى >؟١< oo <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 DNA binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0871 مدمج بحافز ارتباط
AO >< gaacagtcag aaggtgcttt ctacatggat gaagagacca tgtttgggat gccaaccctt 60 ٠٠ ctggataaca tggcagaggg a 81
AT >< 44 >؟”١١ا<
DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١3< ١ <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 DNA binding motif مدمج بحافز ارتباط DOF] نطاق تنشيط التعبير الجينى
AT >.
-١81- tcagctggga aggcagtctt ggatgatgag gacagctttg tttggcctge tgcatecttt 60 gacatgggtg cctgctggge tggagcetggc tttgctgac 99
AY > ٠١< 44 >؟”١١ا<
DNA > د | <؟ <2١؟١> اصطناعى <YY.> <VYY> تتابع تركيبى Synthetic sequence يقوم بترميز حافز تفاعل interaction motif نطاق تنشيط التعبير الجينى ERF2 بديل تمثيلى مدمج بحافز ارتباط Z6 binding motif
DNA ٠
AY >. aatgactctg aggacatgct ggtgtatggt ttgctcaagg atgatttcca ctttgagaca 0 atgttctcag acctgtcctg cctcetttgac ttcccagcece 99
AN ><
YYe <ااا> ١
DNA > ١١< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
-١ لام interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0114 بديل تمثيلى مدمج فى حافز ارتباط
DNA
AN >. tgcctgacag aaacttgggg agacttgcct ctcaaggttg atgactttga gtttgagatg 60 ه٠ atgttcacag atgcactctc agtggggtgg tccccattct ctttcacggce tggt 114 كم ><
YoY <YVYV>
DNA <Y\Y> ٠ <3١؟> اصطناعى <YY.> <VYY> تتابع تركيبى Synthetic sequence يقوم بترميز حافز تفاعل interaction motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 81471 بديل تمثيلى مدمج بحافز ارتباط Z6 binding motif DNA Yo ...> كم tgcttcacgg aatcctgggg agaccticct ttgaaggaga atgactttga gtttgaaatg 0 ttcacagatt acggaatcct caatgatgct tttcatggtg gc 102 Ar <YYV > Ye A >< DNA >< Y.
-١ حم اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0140/82 بديل تمثيلى مدمج بحافز ارتباط
DNA ه 1. <ءء؛> ttcaatgaga attgtgaaga aatcatctct ccaaactacg catcagagga ctttgatctt 60 gagatgttga cggacatctt caaggaccaa gacaactatg aggatgag 108 ١ >؟7٠<
IY <اا> 0 0٠
DNA > ١١< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 binding motif بديل تمثيلى مدمج بحافز ارتباط DREBIA all نطاق تنشيط التعبير ١
DNA
١ <g> ggctttgaca tggaagaaac attggtggag gccatctaca ctgctgaaca gagcgaggac 60 tttgagtttg aagcaatgtt catggattct cttctggcca acatggctga gggaatg 117 ٠
-١م4- ay ><
AY > ١<
DNA > ١١< اصطناعى >١؟١2< <YY.> © interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 DNA binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 1 +08 مدمج بحافز ارتباط
AY <g> gaacagtcag aaggtgcttt ctacatggat gactttgagt tcgagacaat gttcatggac 0 acccttctgg ataacatggc agaggga 87 ٠
AY <YV.> 47 <اا”؟> DNA <Y\Y> اصطناعى >١؟١2< <YY.> ١١ interaction motif يقوم بترميز حافز تفاعل Synthetic sequence تتابع تركيبى <YYY>
Z6 binding motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 10071 بديل تمثيلى مدمج بحافز ارتباط
DNA
7 <..؛> tcagctggga aggcagtctt ggatgatgag gactttgagt ttgaagccat عدووماو 60 ٠
Ng. atgggtgcct gctgggetgg agcetggcttt gectgac 96 1: <Y).>
YY <ااا>
DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١< oo <YY.>
TQGUSS بادئ <YYY> <.ء؛> :1 agacagagtg tgatatctac cc 22 <YY.> ٠
Yo <YVY>
DNA <Y\Y> <؟١؟> اصطناعى <YY.>
TQGUSA بادئى <YYY> ٠٠١ <..؛> 90 ccatcagcac gttatcgaat 20 76 <YY).>
Yi <ااا> £Y14
-١41-
DNA ؟> ١ < <؟١؟> اصطناعى <YY.>
TQGUSFQ jus FAM <YYY> 7 م <..؛> cacaaaccgt tctactttac tggctt 26 ay <YY).> ٠١ >اا١<
DNA ؟> ١ < اصطناعى >؟١3< 0٠ <YY.>
BYEEFU119F بادئ <YYY>
AY >) <.مء aggctcccac ttcaggatg 19
AN >< Yo
Yo <YVY>
DNA ؟> ١ < <؟١؟> اصطناعى <YY.>
-١7-
BYEEFU119R <؟؟> بادئ
AN <.ء؛> cacgaccaac agggacagta 20 49 <Y).> ٠١ <ااا> 5
DNA <Y\Y> اصطناعى >؟١؟< <YY.>
UPA DNA نطاق ارتباط <VYY> <YY.> Y. misc feature <YY\> (\¥)--("Y) <YYY> t أو ,8, ©, 9 ian <yyr> <.ء؛> ؟ tatataaacc tnnccctct 19 ١٠
Yeo <YVe>
Ye <Y\\>
PRT >< اصطناعى >؟١؟< £Y14
-6©- <YY.> interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif
ERF2 نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات
Yoo >... م Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Ala
Yo Yo ° ١
Phe His Phe Asp Thr Ser Ser Ser Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly ٠ ٠١١ <YVY.>
YY ><
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> ١١ interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif
PTI4 تنشيط التعبير الجينى لنبات Glas ٠١١٠ >..<
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Asp
Yo Yo ° ١
Ser Glu Asp Met Val lle Tyr Gly Leu Leu Lys Asp Ala Leu Gly lle
Yo Yo Ye.
Asp Asp Phe Gly Gly © vo ٠١١ <YVY.>
YY >"١<
PRT >< ٠ <3١؟> اصطناعى <YY.> Glas <YYY> تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز interaction Jel& motif نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات AtERFT YoY <..؛> No
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asn
Yo Yo ° ١
Asp Ser Glu Asp Met Leu Val Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe Gly Gly Yo Yo Ye.
—V40- ٠١١ <VY.>
YY >"١٠<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> © interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif
ORCA2 نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات ٠١١ <g>
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asp ٠
Yo Yo ° ١
Leu Ser Asp lle lle Leu Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe Gly
Yo Yo Ye.
Gly
Yet <YYe> Vo
YA ><
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
-١41- interaction تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif
DREBIA نطاق تنشيط التعبير الجينى لنبات
Yet >..<
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asn ©
Yo Yo ° ١
Ala Phe Tyr Met His Asp Glu Ala Met Phe Glu Met Pro Ala Leu Gly
Yo Yo Ye. lle Asp Asp Phe Gly Gly
Yo Yo
Yeo >7”١٠<
YY >"١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> ١١ interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif
CBF1 تنشيط التعبير الجينى لنبات Glas ٠.٠١ <..؛>
-١4-
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Glu
Yo Yo ° ١
Glu Thr Met Phe Gly Met Pro Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe Gly Gly
Yo Yo Ye. ٠١١ <YYe> ©
Yo >؟١١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> ٠ motif
DOF1 نطاق تنشيط التعبير الجينى نبات ٠١١ >..<
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asp
Yo Yo ° ١ ١١
Ser Phe Val Trp Pro Ala Ala Ser Phe Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp
Yo Yo Ye.
Phe Gly Gly vo
-١48- ٠١ال >7١٠١<
Ye >"”١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> © interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> motif -انطاق تنشيط التعبير الجينى بديل 2
YoV <م.>
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Asp ٠
Yo Yo ° ١
Phe His Phe Glu Thr Met Phe Ser Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly
YeA <YYe> Vo
YY >"١٠<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
-١44- interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif -انطاق تنشيط التعبير الجينى بديل 2
Ye A ><
Asn Asp Ser Glu Asp Met Leu Val Tyr Gly Leu Leu Lys Asp Asp Phe ©
Yo Yo ° ١
His Phe Glu Thr Met Phe Ser Asp Leu Ser Cys Leu Phe Asp Phe Pro
Yo Yo Ye.
Ala ٠١١ <YV.> Yo
Ye <YYY\>
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> ١ motif 4 انطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <م.> ٠١١ Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Asp
Yam
Yo Yo ° ١
Phe Glu Phe Glu Met Met Phe Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly ١٠١ <YVYe> 0
YA ><
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> ٠ motif بديل PTI4 نطاق تنشيط التعبير الجينى
ARIES
Cys Leu Thr Glu Thr Trp Gly Asp Leu Pro Leu Lys Val Asp Asp Phe
Yo Yo ° ١ ١١
Glu Phe Glu Met Met Phe Thr Asp Ala Leu Ser Val Gly Trp Ser Pro
Yo Yo Ye.
Phe Ser Phe Thr Ala Gly vo
-٠*.١- ١١١ <YY.>
Ye >"”١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> © interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 8151471 بديل ١١١ >..<
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asn ٠
Yo Yo ° ١
Asp Phe Glu Phe Glu Met Phe Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly
IY <YY.> Yo
Ye <YYY\>
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
د <YYY> نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل interaction motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 8151471 بديل IY >..< Cys Phe Thr Glu Ser Trp Gly Asp Leu Pro Leu Lys Glu Asn Asp Phe © Yo Yo ° ١ Glu Phe Glu Met Phe Thr Asp Tyr Gly lle Leu Asn Asp Ala Phe His Yo Yo Ye.
Gly Gly
IY <YYe> 0 0٠
YY >"١٠<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> ١ motif بديل ORCA2 نطاق تنشيط التعبير الجينى
IY <g>
ا Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asp Yo Yo ° ١ Phe Asp Leu Glu Met Leu Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe Gly Yo Yo Ye. Gly o Ye <YVY.> 7١ >"”١< PRT >< <2١؟١> اصطناعى > <YYY> نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل interaction motif نطاق تنشيط التعبير الجينى ORCA2 بديل YVYE >..< Phe Asn Glu Asn Cys Glu Glu lle lle Ser Pro Asn Tyr Ala Ser Glu ١٠ Yo Yo ° ١ Asp Phe Asp Leu Glu Met Leu Thr Asp lle Phe Lys Asp Gln Asp Asn Yo Yo Ye. Tyr Glu Asp Glu
VIP vo
YYo ><
Ye <YYY\>
PRT >< oo <١؟> اصطناعى <YY.> <YYY> نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز interaction Jel& motif نطاق تنشيط التعبير الجينى DREBIA بديل YYo <€ve> Vo
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asp
Yo Yo ° ١
Phe Glu Phe Glu Ala Met Phe Met Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe Yo Yo Ye. Gly Gly ٠١
YT <YY.e> 7 >"١١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2<
٠, <YY.> interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> motif بديل DREBIA نطاق تنشيط التعبير الجينى
WT <¢ee> 0
Gly Phe Asp Met Glu Glu Thr Leu Val Glu Ala lle Tyr Thr Ala Glu
Yo Yo ° ١
Gln Ser Glu Asp Phe Glu Phe Glu Ala Met Phe Met Asp Ser Leu Leu
Yo Yo Ye.
Ala Asn Met Ala Glu Gly Met ٠ vo
YY <YY.>
Ye <YYY\>
PRT >< اصطناعى >؟١3< ١ <YY.> interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> motif بديل CBF1 نطاق تنشيط التعبير الجينى
RVI
١٠٠ <¢ve>
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Asp Asp
Yo Yo ° ١
Phe Glu Phe Glu Thr Met Phe Met Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo ١ 2
Gly Gly مالا >< ١ >”ا١ا<
PRT >< ٠ <3١؟> اصطناعى <YY.> <YYY> نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز interaction Jel& motif نطاق تنشيط التعبير الجينى CBF1 بديل No لسن ا را Glu GIn Ser Glu Gly Ala Phe Tyr Met Asp Asp Phe Glu Phe Glu Thr Yo Yo ° ١ Met Phe Met Asp Thr Leu Leu Asp Asn Met Ala Glu Gly Yo ٠١
"١ ل, ١٠١ <YY.>
Ye >"”١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.> © interaction Jel& نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز <YYY> motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0071 بديل ١٠١ ><
Gly Met Thr His Asp Pro Val Ser Tyr Gly Ala Leu Asp Val Glu Asp ٠
Yo Yo ° ١
Phe Glu Phe Glu Ala Met Phe Thr Asp Ala Leu Gly lle Asp Asp Phe
Yo Yo Ye.
Gly Gly
YY. <YYe> Vo
YY >"١<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
- م interaction نطاق تنشيط التعبير الجينى تركيبى تمثيلى يشتمل على حافز تفاعل <YYY> motif نطاق تنشيط التعبير الجينى 0071 بديل ١7١ <م.)> Ser Ala Gly Lys Ala Val Leu Asp Asp Glu Asp Phe Glu Phe Glu Ala ©
Yo Yo ° ١
Met Phe Thr Asp Met Gly Ala Cys Trp Ala Gly Ala Gly Phe Ala Asp
Yo Yo Ye. ١١7١ <YVY.>
YY <ااا> 0٠
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VERF2 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.> ١١
MISC FEATURE >؟؟١< (Y)--(Y) <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.> v4
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <yvy> ه (A).-(M) <YYY>
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )5(..)5( <YYY> Ye
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY>
YYY <g>
Asp Xaa Phe His Phe Xaa Thr Xaa Xaa Ser Asp a ° ١
YYY >١٠< Yo
YY <YYY>
PRT <Yy\yvy> اصطناعى <YIT> <YY.> £Y14 yy.
VPTIA 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y).-(Y) <YYY>
Ser JPhe يمتل Xaa <YY¥> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY> ٠
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟١« ١٠ (A).-(M) <YYY>
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> £Y14
-؟١١- )5(..)5( <YYY>
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< )0(..0( <YYY> ©
Leu J Thr يمثل Xaa <YYY>
YYY >..<
Asp Asp Xaa Glu Xaa Xaa Met Xaa Xaa Xaa Asp
Yo ° ١
YYY <YYe> 0٠
VY >”١ا١ا<
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VAERF1 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> Vo <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (£).-(%) <YYY>
Ser J Phe يمتثل Xaa <YYY>
<YY.>
MISC FEATURE <vy\> )1(..)1( <YYY>
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.> م
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY>
Glu J Asp Jie Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ٠ )5(..)5( <YYY>
Leu J ,Phe, Trp, Tyr Jie Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )١(..0( <YYY> ٠١
Val J Thr Jig Xaa >١7 77< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (0 ١(..)١ ( <YYY>
١١+
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY>
YYY >..<
Glu Asn Asp Xaa Glu Xaa Xaa Met Xaa Xaa Xaa
Yo ° ١ ا >اا٠ا< © ٠١ <YVYV>
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VORCA2 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> ٠ <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (7)--(Y) <YYV>
Leu §Phe يمثل Xaa <vYYY> <YY.> ١١
MISC FEATURE >؟؟١< (£).-(%) <YYY>
Asp J ,Phe, Tyr, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
—Yy¢-
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Leu J,Asp, Glu, lle Jie Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <yvy> ه )1(..)1( <YYY> و <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (V)--(Y) <YYY> ٠
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (A).-(M) <YYY>
Leu J ,Phe, Tyr, Trp يمثل Xaa <YYY> د YYE <g>
Glu Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Asp a 2 ١
YYo >١7 ٠١<
—Yyo-
YY <YYY>
PRT <Yy\yvy> اصطناعى <YIT> <YY.>
VDREBIA 7 تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل ila <YYY> © <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)--(Y) <YYY>
Asn J Asp, Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°).-(°) ><
Trp أو , 9028, Tyr يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC_FEATURE <YYy> مد )1(..)11( <vYY>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥>
Yo <t..>
Glu Xaa Phe Glu Xaa Glu Ala Met Phe Met Xaa £Y14
-؟١7- ve ° ١ ١7101 >١7٠<
YY >”١ا١<
PRT >١7< اصطناعى >؟١< oo <YY.>
VCBF1 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل >< <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (Y)--(Y) <YYY> 0 ٠١
Glu J Asp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE <vy\> (°)--(°) <YYY>
Tyr J ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> Yo <YY.>
MISC FEATURE <vy\> )11(..)11( <YYY>
Pro J Asp, Glu Jie Xaa <YY¥> £Y14
-؟1١١/- ٠7021 >..<
Asp Xaa Phe Glu Xaa Glu Thr Met Phe Met 38 a ° ١ ٠١١ <YY.>
VY <ااا> 5
PRT >< اصطناعى >١؟١2< <YY.>
VDOF1 7 حافز تفاعل نطاق تنشيط التعبير الجينى بديل <YYY> >
MISC FEATURE >؟؟١< (£).-(%) <YYY>
Val J Glu يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >< ١٠١ (°).-(°) ><
Tyr أو ,Phe, Trp يمثل Xaa <YYY> <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١<
)1(..)1( ><
Pro J Asp, Glu Jie Xaa >77 7< <YY.>
MISC FEATURE >؟؟١< (A).-(M) <YYY> oo
Met J ,Ala, Val, lle, Leu يمثل Xaa <YY¥>
YYV <¢ve>
Glu Asp Phe Xaa Xaa Xaa Ala Xaa Phe Thr Asp a 2 ١
Ye
Claims (8)
- -؟١؟- عناصر الحماية ١ بروتين اندماج fusion protein لمنشط نسخى تركيبى synthetic transcriptional activator يشتمل على: عديد ببتيد رابط ل DNA-binding polypeptide DNA ؛ و © عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى transactivation domain مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: NYSAR". بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر ١ حيث يتم اختيار عديد الببتيد الرابط ل DNA-binding DNA polypeptide | ٠ من المجموعة Al تتكون من نطاق رابط ل DNA-binding domain DNA أصبع الخارصين ezine finger تتابع ارتباط توافقى consensus binding sequence من جين LE للتحريض inducible gene بواسطة AVRBS3 أو تتابع ارتباط تركيبى synthetic binding sequence مصمم مته؛ ¢«GAL4; TAL; LexA كاظم tLacR ¢Tet repressor ومستقبل هرمون ستيرويد .steroid hormone receptor yo". بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر dua ١ يشتمل بروتين الاندماج fusion protein على we ببتيد رابط ل DNA-binding polypeptide DNA إضافى aly على الأقل. Yo 0 ؟. بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional la, activator لعنصر )¢ dus يشتمل بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى transcriptional activator على تتابع حمض أمينى amino acid sequence مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: AY والمتواليات أرقام: AY =v Yo © . بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif نطاق £Y14تتكون من Al من المجموعة transactivation domain polypeptide تنشيط التعبير الجينى المتوالية (VE المتوالية رقم: YA المتوالية رقم: YY المتوالية رقم: 16-٠١ nal المتواليات OA والمتوالية رقم: OF رقم: 460؛ المتوالية رقم: £7 المتوالية رقم: synthetic transcriptional المنشط النسخى التركيبى fusion protein بروتين اندماج .١ © نطاق interaction motif وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل activator تتكون من Al من المجموعة transactivation domain polypeptide تنشيط التعبير الجينى ١ المتوالية رقم: (Yo المتوالية رقم: (YA المتوالية رقم: 7 المتوالية رقم: VV المتوالية رقم: OV المتوالية رقم: 49 ؛ والمتوالية رقم: ye synthetic transcriptional activator fusion بروتين اندماج المنشط التسخى التركيبى WY interaction motif وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل protein من المجموعة التى transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى polypeptide المتوالية (VT المتوالية رقم: ٠0 المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: OA تتكون من المتوالية رقم: Of والمتوالية رقم: (EA المتوالية رقم: (EF رقم: Vo synthetic transcriptional المنشط النسخى التركيبى fusion protein بروتين اندماج A interaction motif وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل activator من المجموعة التى transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى polypeptide المتوالية (VV المتوالية رقم: FY المتوالية رقم: (Vo المتوالية رقم: VA تتكون من المتوالية رقم: ٠ .505 رقم: 47؛ المتوالية رقم: £9( والمتوالية رقم: synthetic transcriptional المنشط النسخى التركيبى fusion protein بروتين اندماج .4 interaction motif وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل activator من المجموعة التى transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى polypeptide Yo £Y14-١7؟- تتكون من المتوالية رقم: (Fo المتوالية رقم: (VT المتوالية رقم: (YY المتوالية رقم: (VA المتوالية رقم: 44؛ المتوالية رقم: ٠ ؛ والمتوالية رقم: OT. بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator o وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى transactivation domain من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: oY) المتوالية رقم: YY المتوالية رقم: FY المتوالية رقم: (FA المتوالية رقم: £0 المتوالية رقم: )0 والمتوالية رقم: OV.١١ Ve بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر ١؛ حيث يشتمل بروتين الاندماج fusion protein على عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط تعبير جينى transactivation ale) domain واحد على الأقل. NY | ٠5 بروتين اندماج fusion protein منشط نسخى تركيبى synthetic transcriptional activator والذى_يزيد التعبير الجينى expression _لتتابع النيوكليوتيد nucleotide 906 موضوع الاهتمام عندما يكون تتابع النيوكليوتيد NUCleotide sequence موضوع الاهتمام مرتبط بشكل Je بتتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence ثانى؛ يشتمل بروتين الاتدماج fusion protein على: ٠ عديد ببتيد رابط ل DNA-binding polypeptide DNA والذى يرتبط على وجه التحديد بتتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence Gl ؛ و عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى لبروتين protein transactivation domain مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 1-٠ المتوالية رقم: (YY المتوالية رقم: YA المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: ٠ 4؛ المتوالية Yo رقم: £7( المتوالية رقم: OY والمتوالية رقم: OA £Y14-؟؟؟- VY بروتين اندماج fusion protein منشط نسخى تركيبى synthetic transcriptional activator يشتمل على: عديد ain رابط ل DNA-binding polypeptide DNA ؛ و axe ببتد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى transactivation 0000810 © يحتوى على %A تطابق تتابع sequence identity مع تتابع حمض أمينى amino acid sequence مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 1-٠ المتوالية رقم: (YY المتوالية رقم: YA المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: ٠ 4؛ المتوالية رقم: 476 ؛ المتوالية رقم: OY والمتوالية رقم: OA NE Ve بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر (VY حيث يحتوى عديد ببتد تفاعل interaction polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى 0000810 transactivation على 70685 تطابق تتابع مع تتابع حمض أمينى amino acid sequence مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام:؛ -٠١ VT المتوالية رقم: (YY المتوالية رقم: VA المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: 560 المتوالية رقم: Vo 46؛ المتوالية رقم: oY والمتوالية رقم: OA Vo بروتين اندماج fusion protein المنشط النسخى التركيبى synthetic transcriptional activator وفقاً لعنصر (VY حيث يحتوى عديد ببتد تفاعل interaction polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى 0000810 transactivation على 706960 تطابق تتابع مع تتابع حمض ٠ أمينى amino acid sequence مختار من المجموعة Al تتكون من المتواليات أرقام: -٠ VT المتوالية رقم: (YY المتوالية رقم: VA المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: 560 المتوالية رقم: 7 المتوالية رقم: OY والمتوالية رقم: OA. بروتين اندماج fusion protein المنشط Ail التركيبى synthetic transcriptional activator ٠٠ وفقاً لعنصر (VY حيث يحتوى عديد ببتد تفاعل interaction polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى transactivation domain على 9098 تطابق تتابع sequence £Y14AAA تتكون Al مختار من المجموعة amino acid sequence مع تتابع حمض أمينى identity المتوالية رقم: 34 المتوالية YA المتوالية رقم: YY المتوالية رقم: ١6-٠١ من المتواليات أرقام: OA والمتوالية رقم: oY المتوالية رقم: a المتوالية رقم: ١ رقم: fusion protein بروتين اندماج encoding يقوم بترميز nucleic acid حمض نووى .١١7 0 _يشتمل الحمض النووى synthetic transcriptional activator تركيبى Aw منشط على: nucleic acid عديد الببتيد encoding أول يقوم بترميز polynucleotide sequence تتابع عديد نيوكليوتيد و {DNA-binding polypeptide DNA الرابط ل عديد ببتيد encoding يقوم بترميز AG polynucleotide sequence تتابع عديد نيوكليوتيد - transactivation نطاق تنشيط تعبير جينى interaction motif polypeptide حافز تفاعل WAY + مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: 0 الأول polynucleotide sequences حيث يتم التعبير الجينى لتتابعات عديد النيوكليوتيد .single transcript فى إطار وفى نسخة أحادية nucleic acid والثانى من الحمض النووى Vo nucleic حيث يشتمل الحمض النووى (VY وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى VA إضافى واحد على الأقل يقوم polynucleotide sequence على تتابع عديد نيوكليوتيد 0 .DNA-binding polypeptide DNA عديد ببتيد رابط ل encoding بترميز nucleic حيث يشتمل الحمض النووى (VY وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى .١19 Yo إضافى واحد على الأقل يقوم polynucleotide sequence على تتابع عديد نيوكليوتيد 0 نطاق تنشيط التعبير الجينى interaction polypeptide عديد ببتيد تفاعل encoding بترميز NYSAR مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: transactivation domain £Y14LY الحمض النووى acid ©61ا000 وفقاً لعنصر (VY حيث ترتبط تتابعات عديد النيوكليوتيد polynucleotide sequences الأول والثانى عملياً بعنصر تنظيمى جينى gene regulatory.element 0 ١؟. الحمض النووى acid 01101616 من عنصر VY حيث يتم فصل تتابعات عديد النيوكليوتيد polynucleotide sequences الأول All عن طريق AB عديد نيوكليوتيد polynucleotide sequence ثالث.". الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر VV حيث يتم دمج الحمض النووى nucleic host cell خلية مضيفة genome فى جينوم 8610 ٠ host cell حيث تكون الخلية المضيفة (YY وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى YY plant cell خلية نباتية YE No الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر OY حيث يتم اختيار عديد الببتيد الرابط ل DNA-binding polypeptide DNA من المجموعة التى تتكون من Glas رابط ل DNA- binding domain DNA أصبع الخارصين ezine finger تتابع ارتباط توافقى consensus binding sequence من جين قابل للتحريض inducible gene عن طريق AVRBS3 § تتابع ارتباط تركيبى synthetic binding sequence مصمم منه؛ tLexA (TAL ¢GAL4.steroid hormone receptor ومستقبل هرمون ستيرويد tLacR ¢Tet repressor كاظم ٠ DNA حيث يرتبط عديد الببتيد الرابط ل (VE وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى Yo على وجه التحديد بتتابع 5601160086 مختار من المجموعة التى DNA-binding polypeptide A والمتوالية رقم: TA المتوالية رقم: CTY تتكون من المتواليات أرقام: Yo AY وفقاً لعنصر nucleic acid يشتمل على حمض نووى vector ناقل . £Y14ه9١١".١ الناقل vector وفقاً لعنصر (YT حيث يشتمل الناقل vector على محدد قابل للاختيار selectable marker أو محدد قابل للفحص .screenable marker.YA © الناقل vector وفقاً لعنصر (YT حيث يكون الناقل vector ناقل تعبير جينى نباتى plant.expression vector fusion protein بروتين اندماج encoding يقوم بترميز Nucleic acid حمض نووى .4 يشتمل الحمض النووى synthetic transcriptional activator منشط نسخى تركيبى على: nucleic acid ٠ تتابع عديد نيوكليوتيد polynucleotide sequence أول يقوم بترميز encoding عديد ببتيد رابط ل DNA-binding polypeptide DNA ؛ و تتابع عديد نيوكليوتيد SG polynucleotide sequence يقوم بترميز عديد ببتيد حافز تفاعل interaction motif polypeptide نطاق تنشيط التعبير الجينى transactivation domain يحتوى على %A تطابق تتابع مع تتابع حمض أمينى amino acid sequence مختار من YY المتوالية رقم: ١6-٠١ والمتواليات أرقام: AY المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: Vo OF المتوالية رقم: 560؛ المتوالية رقم: £7( المتوالية رقم: (VE المتوالية رقم: YA المتوالية رقم: 170-1٠١ والمتوالية رقم: 8©؛ والمتواليات أرقام: الأول والثانى polynucleotide sequences حيث يتم التعبير الجينى لتتابعات عديد نيوكليوتيد 6ا5/09. transcript فى إطار وفى نسخة أحادية nucleic acid من الحمض النووى ٠ nucleic حيث يشتمل الحمض النووى (VA وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى .©٠ مع JN تطابق على 9068٠0 يحتوى على nucleotide sequence على تتابع نيوكليوتيد 0 تتكون من المتوالية رقم: Al مختار من المجموعة Nucleotide sequence تتابع نيوكليوتيد 1-٠ Yo £Y14YY الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر (VA حيث يشتمل الحمض النووى nucleic 0 على تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence يحتوى على 90685 تطابق على JN مع تتابع نيوكليوتيد sequence 010160106 مختار من المجموعة Al تتكون من المتوالية رقم: 1-٠ lo} YY الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر (VA حيث يشتمل الحمض النووى nucleic 0 على تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence يحتوى على 96960 تطابق على JN مع تتابع نيوكليوتيد sequence 0101601106 مختار من المجموعة Al تتكون من المتوالية رقم: 1-٠ 0 YY الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر (VA حيث يشتمل الحمض النووى nucleic 0 على تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence يحتوى على 90695 تطابق على JN مع تتابع نيوكليوتيد sequence 010160106 مختار من المجموعة Al تتكون من المتوالية رقم: 1-٠ Vo؛؟. الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر (VA حيث يشتمل الحمض النووى nucleic 0 على تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence يحتوى على 96997 تطابق على JN مع تتابع نيوكليوتيد sequence 010160106 مختار من المجموعة Al تتكون من المتوالية رقم: 1-٠Y. Yo الحمض النووى nucleic acid وفقاً لعنصر (VA حيث يشتمل الحمض النووى nucleic acid تتابع ذ تيد hucleotide sequence يحتوى 6 تطاية الأقل م بع نيوكليوتي يحنو: بق & تتابع نيوكليوتيد sequence 010160106 مختار من المجموعة Al تتكون من المتوالية رقم: 1-٠ Yo £Y14—YYV- nucleic حيث يشتمل الحمض النووى (VA وفقاً لعنصر nucleic acid الحمض النووى LY تتكون من A مختار من المجموعة nucleotide sequence على تتابع نيوكليوتيد 0 AY=A المتوالية رقم: DNA وفقاً لعنصر ١؛ حيث يتم اختيار عديد الببتيد الرابط ل nucleic acid الحمض النووى .7١7 © DNA- DNA من المجموعة التى تتكون من نطاق رابط ل DNA-binding polypeptide consensus ؛ تتابع ارتباط توافقى zine finger أصبع الخارصين binding domain أو تتابع AVRBS3 بواسطة inducible gene للتحريض LE من جين binding sequence كاظم ¢GAL4; TAL; LexA مصمم منه؛ synthetic binding sequence ارتباط تركيبى .steroid hormone receptor ومستقبل هرمون ستيرويد tack ¢Tet repressor ٠ منشط نسخى fusion protein يقوم بترميز بروتين اندماج Nucleic acid حمض نووى LFA الذى يشتمل nucleic acid الحمض النووى csynthetic transcriptional activator تركيبى واحد على الأقل مختار من المجموعة التى nucleotide sequence على تتابع نيوكليوتيد تشتمل على: ١ EV 6 المتواليات أرقام: والذى يكون مطابق إلى حد كبير لأحد من المتواليات nucleotide sequence تتابع نيوكليوتيد أرقام: 86/-17؛ الذى يكون قابل للتهجين على نحو polynucleotide عديد النيوكليوتيد complement مكمل لواحد على الأقل من المتواليات أرقام: -17؛و specifically hybridizable قابل للتحديد ٠ والذى nucleotide sequence لعديد النيوكليوتيد reverse complement المكمل العكسى لواحد على الأقل من specifically hybridizable يكون قابل للتهجين على وجه التحديد ATA المتواليات أرقام: NY لعنصر nucleic acid تشتمل على حمض نووى cell خلية .©* Yo £Y14—YYA- أو خلية خميرة plant cell خلية نباتية cell حيث تكون الخلية (Fa وفقاً لعنصر cell الخلية .٠ .yeast cell YA وفقاً لعنصر nucleic acid تشتمل على الحمض النووى cell 44a.) lo} أو خلية خميرة plant cell خلية نباتية cell وفقاً لعنصر )8( حيث تكون الخلية cell الخلية . 7 .yeast cell expression of لتتابع النيوكليوتيد expression لزيادة التعبير الجينى method طريقة . ¥ method تشتمل الطريقة « host cell ذو الأهمية فى خلية مضيفة nucleotide 56008008 ٠ على: تشتمل على host cell فى خلية مضيفة ١١7 وفقاً لعنصر 01001616 acid إدخال الحمض النووى ذو الأهمية؛ حيث يرتبط تتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence تتابع النيوكليوتيد iG nucleotide sequence ذو الأهمية عملياً بتتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence « DNA-binding polypeptide DNA والذى يرتبط على وجه التحديد بعديد الببتيد الرابط ل Vo > nucleotide sequence لتتابع النيوكليوتيد expression وبالتالى زيادة التعبير الجينى host cell الأهمية فى الخلية المضيفة فى nucleic acid وفقاً لعنصر £7( حيث يشتمل إدخال الحمض النووى method ؛؟. الطريقة nucleic acid يشتمل على الحمض النووى vector Jib على إدخال host cell الخلية المضيفة . ٠ host cell فى الخلية المضيفة بثبات nucleic acid يتم دمج الحمض النووى Cua وفقاً لعنصر 7؛؛ method الطريقة to host cell الخلية المضيفة genome فى جينوم Yo £Y14. الطريقة method وفقاً لعنصر (fF حيث يكون تتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence ذو الأهمية تتابع نيوكليوتيد خارجى exogenous nucleotide lawl.sequence LEV © الطريقة method وفقاً لعنصر 47 Ss Gua تتابع النيوكليوتيد nucleotide.endogenous nucleotide sequence ذو الأهمية تتابع نيوكليوتيد داخلى sequence فى nucleic acid الطريقة 011000 وفقاً لعنصر £7( حيث يشتمل إدخال الحمض النووى LEA nucleic على تهجين 02055179 نبات يشتمل على الحمض النووى host cell الخلية المضيفة host cell مع نبات يشتمل على الخلية المضيفة 800 Ve nucleotide لتتابع النيوكليوتيد expression لزيادة التعبير الجينى method طريقة .4 على: method ؛ تشتمل الطريقة host cell الأهمية فى خلية مضيفة 3 sequence AY وفقاً لعنصر 01001616 acid تشتمل على الحمض النووى host cell إدخال فى خلية مضيفة Ve تتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence ذو الأهمية؛ حيث يرتبط تتابع النيوكليوتيد sequence 700160106 ذو الأهمية عملياً مع تتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence ثانى والذى يرتبط على aay التحديد بعديد الببتيد الرابط binding polypeptide ل «DNA وبالتالى زيادة التعبير الجينى expression لعديد النيوكليوتيد nucleotide sequence ذو الأهمية فى الخلية المضيفة host cellY. nucleotide وفقاً لعنصر £9 حيث يشتمل إدخال تتابع النيوكليوتيد method الطريقة Lo. يشتمل على vector على إدخال ناقل host cell ذو الأهمية فى الخلية المضيفة sequence host cell ذو الأهمية فى الخلية المضيفة nucleotide sequence تتابع النيوكليوتيد Yo ١د. الطريقة method وفقاً لعنصر £9( حيث يتم دمج الحمض النووى nucleic acid بثبات فى جينوم genome الخلية المضيفة host cell £Y14A nucleotide وفقاً لعنصر £9( حيث يتم دمج تتابع النيوكليوتيد method الطريقة oY الثانى بثبات nucleotide sequence ذو الأهمية المرتبط عملياً بتتابع النيوكليوتيد 5©00600©© host cell الخلية المضيفة genome فى جينوم nucleotide وفقاً لعنصر £3( حيث يشتمل إدخال تتابع النيوكليوتيد method الطريقة Lov © نبات يشتمل crossing على تهجين host cell ذو الأهمية فى الخلية المضيفة sequence ذو الأهمية مع نبات يشتمل على الخلية nucleotide sequence على تتابع النيوكليوتيد host cell المضيفة nucleotide لتتابع النيوكليوتيد expression لزيادة التعبير الجينى method طريقة .4 00٠ على: method ؛ تشتمل الطريقة host cell ذو الأهمية فى خلية مضيفة sequence تشتمل على host cell فى خلية مضيفة ١١7 وفقاً لعنصر 01001616 acid إدخال الحمض النووى ذو الأهمية؛ حيث يرتبط تتابع النيوكليوتيد nucleotide sequence تتابع النيوكليوتيد iG nucleotide sequence ذو الأهمية عملياً بتتابع نيوكليوتيد nucleotide sequence « DNA-binding polypeptide DNA والذى يرتبط على وجه التحديد بعديد الببتيد الرابط ل Vo ذو الأهمية فى الخلية nucleotide sequence وبالتالى زيادة التعبير الجينى لتتابع النيوكليوتيد host cell المضيفة يقوم Nucleotide sequence يشتمل على تتابع نيوكليوتيد nucleic acid حمض نووى 00 نطاق تعبير interaction motif polypeptide عديد ببتيد حافز تفاعل encoding بترميز Yo مختار من المجموعة التى تتكون من المتواليات أرقام: transactivation domain جينى 7-١١١ للتهجين (LE والذى يكون nucleic acid الحمض النووى complement Js . على وجه التحديد مع الحمض النووى 0106166680610 وفقاً لعنصر specifically hybridizable Yoده. £Y14-١1؟ Lov المكمل العكسى complement 6176156 لحمض نووى nucleic acid والذى يكون قابل للتهجين على وجه التحديد specifically hybridizable مع الحمض النووى nucleic acid la, لعنصر 00 0A 0 الحمض النووى nucleic acid لعنصر 00 حيث يتم اختيار عديد ببتيد حافز تفاعلنطاق interaction motif polypeptide تنشيط التعبير الجينى transactivation domain من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: YY المتوالية رقم: «YA المتوالية رقم: رز المتوالية رقم: 2 المتوالية رقم: 1 المتوالية رقم: الح والمتوالية رقم: OA interaction motif يشتمل على عديد ببتيد حافز تفاعل polypeptide عديد ببتيد .4 000 ٠ مختار من المجموعة transactivation domain نطاق تنشيط تعبير جينى polypeptide AYY = ١7١ التى تتكون من المتواليات أرقام: حافز تفاعل afin وفقاً لعنصر 09 حيث يتم اختيار عديد polypeptide عديد الببتيد .transactivation domain نطاق تنشيط التعبير الجينى interaction motif polypeptide Yo المتوالية رقم: رز المتوالية «YA المتوالية رقم: YY من المجموعة التى تتكون من المتوالية رقم: OA رقم: 2 المتوالية رقم: 1 المتوالية رقم: الح والمتوالية رقم:473 480 VPI6TAD: DDFEFEQMFTD * C3 *ج* 0#SAAR GMTHD-PVSYG-A-LDV- تخا تش ان د و ل GIDD (0: ib مت VPIE 2005-0311 2-01 ا ا ا 15017 )7 af 4 زو ERF2 170-11 كفم عاو يا دع ا ووو SVG [ستوائية رقي PTH 71-25-03 (موالية رقي 4) 01737 ها و ا ل 1 0-11 (ستوائية رقب 3( 0و ORCAZ 015 إمترالية رق 1( ادم تكو ماوت لام لوا ااا دو عا لف7175 05 1 EQS~EGAFYM-. اثوالية رق 7 11174و كد لك 1 ا ا ا ا ا ا DDS ات MN CATA (8 (متوالية رقم 001 و7 ع1 SPFSFTAG DAFHGG- معاي تاقد ساعد {FAGFAD- ‘ شكلEps Lod مك— . 2 حرا : ا الا لا اا جا اا د ل لاما انيد الما اقم يا ىا - اه مص اج الج ا بداب كلاد I ب 2 a ER 5 ا قم Sei ont تاحت WELD .. i 2 : . الها تج اج ad 5 1 8 انب rE 0 وو a ot CES SE \ IERIE et tf seb 1 = NR 1 vy FR : mE Ig Th ONE TO BOB 3 {hr aS pea م {Asi BREENN . I : : ااي a 1 THR ال BER ا ا lB FEAR ازا يتا الوح الما A Lgl Ay pRB له لايم اد hg LHF pe سر ل Where ا CRE Ti: BG No BEN BY ov 73 دق Ad Gal ERED LENA TE ا ليخ CL OR اا كاد كاي رالوس ويا راون 1 ند دحي ذا JL ا و | ER SERA, Sk So) erm حوب © ا ل و IY RR TE eRe TS (RI ly Sh and EEN THRE TT, Res ب 5 Wands WT كو اذا SEEN I SN ere م EE 1 اا ال رد لد د اللا ا TA Hes XY كم ل pnt ound SRR Ta يه ال a EI a ا اا اي A ١ ah Snr ل ا wir ER جا خضب محلب الل حي از ااا اللا ا الات ا © JO لل ماود او (YY (لمتوالية دق SERED 5 a ارد ات El > ا 1: LS Fate ب ا ا دجي لب = : PY ar ala احج ورج 8 Ii PH OR ISR ل أي ا ا ا OO ad اج Raat RR ERT SRT J الخ رحب لكأم الا قا 8 ا لاا aR الاح rp اواج حا ا : ERE ا ا باط الي ب 0 1: Hag Flay هم Hay A Krad fal 13 يب راك he wn ف RRC pe 3 ee TE 7 Eom oe ir Pom مال ذا ا اجا ال لا تي اله = Mz ليج الى Fy =o ) 8 So : 2 5 لك = [SR 5 i Thom Waa = VOR = Ye 0 TT ع Ea LETS Xa at +e TT ل لض La 3 = ال اس ed ا ب Sel ا سي c جا i = تمد ل يج ؟ LE Ty لذ ل 7 ORT حي انبا ذا يط << لذ لق ان ois اع يذ لجو © ا اح dg وح 8 كول بح = ل 5 FT =H ال Wom Rid -< 2 Med يلي اه اا ا اص( in = ينض 7 0 Tod T ER حا ابا ان اا ا 5 = 8ج عا Nig sw لخ ا ليفط oF ow »لق A = As 5 اد ب ل ا ا >> لا اح Wa = TOM = Wa ) xX 1 تن اا ا £8 تي الا 2 = Xz a ال ay ¥ rar i nT k يب ذا الب بج توا مكعم الوا RRS الى DY ىا WE الو ed TE Na ir Fo ا ل ادا احا TY راب ا جيك -- نملا لجا نض = حم ب i = < or x : x ce wi = Ty I : الم سب الخ وه الل ةا أو مد« أ عط 5 a الا اج لخداو TUE ITE ا Wak ات تي لي م اال 0 م 8 > 8 ع = 2 0 8 FE اب يه EL ب ا ل ل ا 1 لج نماةا لأ ةي ا 1و جاء الع خا .و تت Ha be J OT SI يم od بن ا TUE الخد اه om . TF N OR 0 : x T x 3 0 8 2 جاح م حب !زر االدءج التو د NE لا لخ BE ERI J Sh ال طاءا «* 3 ad = os = Wool a LT UE TA Lb eT JF LT أن RF ul هد = Wan RY un شا i ny Lt BE 2 مدا ؟ at Eas 3 i x ¥ 5 EF ed = =n x = 3 = 3 Ne دا wm UE Ge ا 3 يج J, OY AY EE ما البد كاء لبر gt ا 3 اند El gh eal <-- يلحك hou ¥ Ty 3 Tem AT ا FER SLA JE ايا bd a EA RE TE TR ET: pe الماع gg = SEE 2 51 sid = Pile) 3 5 Bl ol 8 ا _- Was لين مشتخهة << Sms = © مك ا[ =[ كلخد ارد دخا [I : TOF تمك Ld B= Wan !و الاجم الوا Bd gE GF sD الو ed لج ed gb اذى gd WBF Hes i : 5 3 ال لحب ip H لد Pow H = : Lo 3 EEL الج نت Wy لوو A SE م opt ad تج SS J د ل ا ل Ce Kan : i ح داق متقهة ATT اتثى اط om Han اخ ذا التي اي Has الجن أ امج SE SRP بام اس ليه امد جد اا ا ال gl ow i 3 ed gd og SF AES 8 ; 3 . 1 يواج لع WaI. oad gt BF SRE : 0 ا : ا" IE) 1 8 HYوم ل اسيم .اج ماب Sa 3 - ب 0 5 oT 2 x الحا ل ا ا ااا بم poy oc Ra FL ا om Jw bs ادي THRE CAGES ml - = T= = 3 {7s faba}RR. 2a a NT > x . mmr A الا جم الغ قد SU 4 جب هم الك با rhc EE nr EOLA استيى I EK oases all gy هل I Mc 5 نان SHES A أبن نبال حي 0 ل SI د ل دا الا ا اج كيام | -- BET BE ا ا BEEF A eS SR بيخ :سيا قم 8 { Es Ng den Fo = بد أكاي Ha LECH هدم ل ب Se} wITTE 2 اللا Ny a EN SER ا را اد ار TERE SC. ا LEME RY KHER AT EEE A 1 TREE REN LER DN SIE i RIE I PREY js اا JR el fed اح ood tls wr TTY هنا Tr TE a Woo ل 72 1 an] To: الي hat wETIE 3 ا ا 1 3 ll 3 ا 1 ل TTT هي 1 ا wr J To x — — Air SRR ار .نه لوك لدان ا ا WET a شيع الب كم 10506 Kay Hag اد لا ل تح RR Lae: ae LL . 2% ل ركنا ون et ا اا د AVE GETTY 5 قي م ا ra I EGU وا RR fot Sag Vhs arenes WoL as Jo يا لاما ل ا LEE SEAN "٠7 . : 8 8 8 & الات ميت Al Ree من 1 اكد كد To 3 NE RE Ex om ال ال joo 8 الج اللاي IRF FIDE MH ¥ 85 : HE Noa Adi sie} TR THY TL اب . 3 1 2 oT OT ازيم الم قوم ام 1 لا لات DN. PE ب من ما ارايت TEE ب phi ged wETIL يم 137 Xs Hyp الاو cs جد El TaN To نت + i= © ُ = To اا 1 ot aim =e اي 0 SEE me = EAT RE TE لب =A gil لذ Seog Rs جع 1 & ادي يح 1 اج حا الا كب الج Toad Ty a=W ERT انمه أ الل a= LR حاط و ا LF و ااي 1 + 8 مض ا 7 نم تبصا لدجم للا ا ا ا fe TERE ! 2 8 217 ماكح الا ل الك SE 5% SL CE مج oF + H 7. 3 Tm NT = 2 جا لاما م ب og HE CR ¥ as Fly a BY = i bia) =k بذع oi LEY يقح 8 8 ب ft Tow = = ٍ ل : مج اج © 0 اي Xx & ! xr 21 ارح : LE J aaa gd of ل < 0 0 مب > : ب اتاج 5 mmr > 1 oT \ ~~ =i ل للج اب ل خا طن JW gd ل ال EES لذ 35 لمن Leila دوج أ Ladies a اا الت —T 3 الا 21 ig pi =e gl fwd ON LEE Saag لذي bpd ge 8 bi . . € = حر أ ال اااي اا a= on ليع Pea REG BE a IE AEF بن Leg RE 3 - : nT oT § © مدخ Er 8 TY : - لاخ الس 1 3 by 3 ا ا خط لج م 3 2 ا تل 03 لاج 1 5 3 5 RS Tr E - بج bs ب 8 ميخ ا KVL og H iE لو Died ade goa ey oS for] TRE UE اج = =e +ة ؟ = مد ترج Bon Dio Tigra SEE ا ا RS قد nN 1 7 . ل لاا ال د TAS تامع تهنا بن iT 0 + HE RI SC. : جح كبا اله 8 ا + + T 7 دارج HS FP لك مكاعم IS 3 بل 8 OE ملام ™M gd ناج لخر 5h = ا ما ais og Fn a3 يج H = 1 7 8 يخ oad FEL كع !قا Ed NG ph 8 4 : 08 ا تج ا WE OEE نوا تا ا اد ع“ 1 7 ب حي دي لج للا لو ات 5 =Es اط og! لاجر الدج § = 1 3 3 : 3 8 3 IF : 1 جّ ب 2 A ¥ fi Fix عا الج 3 لي شثاءا قث مج اتن ا < ا ا أ a HRT CREE الك كيبن متها > ذى متها FEAT ا ل ام i oT H TEL > عط UR BO لد اد الج كا الج اد اي اس ا SAVE E+ SVE SE SN pt + جا اخ اخ خا sik لو Floogfs ai gt wd gb ee للا ال 8 es 3 THF د كن ar ا + ل مرحي للا لج اط SEES ~ 3 .= 3 1 & ER eetالو سر ل ETEREEL FRY TR 5 ال“ + له 8 3 Sm سيج اا ا ا اح 0 دي يدج Fant 5 الإ يدم TT J. Dp Ls 216 لسو اليه رقم £7 ل FREER Yt 8 1 ES PEE. we a : = ل د 8 اند دون ايم :1 WT Tr y y ra RE ER _— 8 ات WT Tn ITE = DATE E £37 aly Selael ei ALERFL ا ا لط - 2 ب 5 = ag Ty : : : ب 1 5 ol | N ١ al ae FREEREL A قو Wi N Be. IESE hg 1 PER i Nam cal = FALSE OL :اد أن : BN BRST SU زلاI. kN 3 7 REE TI NUR 1 = :0 Co Wn Hs TEES nel cw NAY rene ET EY. a دا عله Set wii WOT EEE د قم 4:57 Ng KT MEER I le IE 1 RE ey ال J. _—. RECS SS STR - x الول الج ايو Co To + 4 9 ل 0 و ب > 7 4 of ب a tora Fema} 3 7 0 2 : ال ا ل ا م i 3 لج كي سم انيار كس 1107 | cE ا 7 الا 1 تي lt Na FE ER ns ل 1 :0 i 1 8 :1 Sa FETA TITTY 2 الذ ياي كا Ld TR x > EL Folk lk _— ب الل لاحك د JOBE HE (TY ad yaaa - حت ا ال SLT IE Ba St را لها الام (LRA 3h £1 ا اع 1 SN 8 ye الا الا 0S : Swe ٍ الاي م gay 0 دايح i 5 FEA TET 8 الجا ا 7 ل ا ل ا ماي srl 5 الما تح يدي EOE bs hE ITT Arle ا اذ om الود TE ERT ا SE اا اج ~ 0 rt 8 لح .ب جح ال LER aes) TAT RE RL on م 1 BE ON BF Fhe - aE ERED 7 دي ge) الف Co ICS 2 FREY GR و EN yo SEAT py VAL ERD LF ا وت و قا اا ا لاا By I No ححت: تدرا 10 ب انا اث ا wi =Hg Eat =H متها x + =a Sout Foray 1ج Pua aad 9 ا Ee ane AS FE B iS CE 8 = حا الل 1:0 = yon FREE ا TAR Ae oat Lo لى Lag dnd ال 7 حك بير اد ا الحا Ly 8 F =Xa مي خلا الى ع الات م 1 ped 0 SIS Sk o 8 <> 0 ™ B I. i T= . wy ey ل rt Loo > ااا لقا 8 ذال 0 الدج I لوا JRE SNE SRE 5 لخد [IEE CT DER 8 =H أت متها جين الا قد اج جد الح ان ايا مرت EA 35 ان oo pt Id =A a ET = ع © : R ديا ا So مي ا نه Co ا we CT د om “جا ل 8 a oT ir SUS + ال ج دبا اا 7 RE I os : LF 3 grt 3 ح باح ا oy) FOOTY = Waa T FE خيوش اذا لل اقم اح ذا لج Tr R Fon 4 a iE Fons ] AT H oT 3 FAT vz Bom nT = ¥ وا ميا t sod gd i EA Woy LA ل SANS تج SRE NO ما gd تمك 3 A اا 1 2 To : 1 : H ki 1 نال .»م ٍ اااي Fon 0 T o ب 3 جاع HIE. +.) HEE ا ا ل ey gn لد RE لجو سكع gt الى لثلة لج fi shad Rd Sand منهة wT اللا wn COTY سي ا I اس wt 5 : as الا omy on RS ede? FY TIE Lo FY fa CE =A T B bra 3 ب > =F = ب TE 0 Nw kd NE i od = a "0 آم الك 8 0 8 8 ا ات“ 5 . T FSET SEU SL Sh SF RET SS PR BE A CORN Ch Be 5 wd ad Fade end ey 4 = [ET ‘ w= pi NT LE) Ba. N 0 + 2 i] = 3 SP heme OP oat EELS ال 82 FCT ES CE H Sys حجر £3 ad i = 5 wT ¥ لحن ¥ =r 83 haa DTS »م الى SE ES AN RAN SUI IS NE SC تلو Y FORTE دا لكي 0 T رز 1 ا ا ا دا ا ادق ال SR ST SE eS Ty] تذة الج SCN BE CN BS SU المرائظة أن ELST SS N i ا 5 5 . : Paha wat Ean INCH ىع LEE FS 5 = pad SIR ri =E ne ood 2 ART =a اح Dg al 5 لقال كاه Be He ا wd EER a = Sa. للاخ 4 x ع =a ل ا Tv SEAT 3 تل م ال ل لاج م ب :8 I يراط ا SS RE أآلج عد ناملالا ل > =F الب ذا ١ل ال St لج 3 ام Booed Id 5 3% 3 . iN fet & لل 3 أل ree Foon RS RE oS) Bis 8 ب 0 RR wy 8 . RE اكد ا 1 ا 1 THR FR الا قد ana} WRITE Sie Ls [EEN © RT Ei BVO BYE 7 أي را RY ARR he Sd R ’ 1 ا اا ا الات = ١ on TE ا بط of ا ا مو ا أل + ا امل RR PRY <a SANTINI اد pL انا FREER 1 4 RE 1 ا AR 1 اللي RSLS Lo "22 0 اا : "8 ا ا ل ا ree wi eed ال ال a i ا ا ا Th لمعاو المت الا لي اما ا ا جد واس ايا THE {78 ad لاماي مايا § SR Si ou 1 IS 8 00 5 ال a ae Wa . ع ae ل ف الوا x 5 Ry bs “a EE A UAE الخ RE جحي wr Wa We WIRE الا Waa RET TO Ak الف Es) EEA = Sy BN امد ل 33 ار FEO TALE ال NIONGRA Neel OER RRL iy SON aE ا اله وج كي مان الك ER jE: ال الا ا 1 Le eT es LER RIS Rain. ool 1 للد ا ا ا 6 5 ل > 8 5 : :ل ل ا ا و5 a, : PR 5 8 امسا 5 A Qh nay جا ل en الي ما SHEER a ety تج = EES CORR حا ان El Mn Mai {Tal hab gay الام راي @ 3 3 0 1 ER ll WN ب اا SERN or SEER BR لاون لان كينا فا a TE ا ا الا 3 ya BE X oe ln) 1 ated Ne} RIAD 8 } a Bo - po 3 7. ian اند ا جح 2 ve ES i ov JES TH اتويت الا كوا wan 2 hart BS a RoR 7: : و ] 2 ا ا ey RANK FER ال C 7 TRE {300 AR CARE NEST ENE Ex 5 x FEE ب نل اك او احج SNL ل LER اوت ترات كما ينع ايد ال re SRS جم التاق لا ع اتا :كي ا 5 ا ا ا حت 5: ٍ 5 27 و Le wv الا د الاج me ال Bh ا ا اد E Lb bor mE 3 Si . wl 0 ad ا حب ل ER TaN ga +: FEA ال bor =H TEI كيدا IE EN tnt + 58 اليب اا a Ee REL تتية SIE wie دح اين ا : 34 a aa EE ا bs rod الع ام wa + W 7 + 8 الها مجع Nay Ww عا x داقع MM الى REE SE I NE SL CEN. yt 0 i REC boon = ETRE FRE SEE J x Fe en ge 8 بد ا ال ع SEAR ب« a ب 2 7 > 1 - x pars 5 اا > ا 5 a x wv 2 الج 4 a 5 NN a POY ايا BORING SEE I RI IN SE EOE ا ا م لات Pao 22 مت 33د اق ب & BER 3 5 ا : nd H 1% x Catt : : X 5 : 8 . : 5 8 < ce Ee 5X ar Toa اا الج 0ن داج x 0 wo LAGAN ال ل د 1 FS ل الا ل ا FE 3 EY AE EEE PET RCI ناد TNs EOI 2 اتج لجا كىن لخد ات انع ST UE. JE SE ERT LG ال Svat ow gh wept لوكت gE OFS ل ا LF ع. 8 Rh 5 Ty Ty 0: 2 ET AR ذا نهد بجا ا احج الله الها كنا هد RL wo اخ > اليا اا EL Wg ذا X لمعا ل TE (EC SI Papal Pad اذ الخ م << Bi 5 FS ان لان ا SUN Co SUE SHE تخ دج > اح ا لدي ا لس ا eed ا لد رخ wd og اي لم با نا اسل لخن لل ال ا I aN Ey ER 3 EH 3 3 SNe 3 سي 3 : 3 Eo] 3 [Ra 3 x 6 va bl = 5 3 oa 8 SHEE CI 3 = Zo اااي wes gh ow = EEE 04 ST SE oe aE & ا ph AM NY ا الحم ا الح اال Yor لوزن لكا Fees ل a AER fo 3 3 w x 3 ne Ww ل مجع اع Bog ار ايند الى ل ار ل ad يح الس = i ال ا ¥ جا خا اماد اذا لعجرد كنا ل لخد اعد اا RAT تكد لا pd الى اناعد REN لد BUA لاع ذا الاو Apt BL BEARD a TE + اللا الج ان Tae ay ّ وراضط bd مات ب MeV بك الوا : 0 ب لاد لان الل لعن اا > اع SF الا ا © > بام الا Bol الج د IN gy تداج للا لقا Iv ogy تدع اذ ا & S 3 ZF AE ne a 8 ال اي ال "م رمد جل !| الخو الا ىن ا F © i Sad كت aE سير وا الي ا Nin 8 5 x TR 2 awa Eee GE TEAR اجا اي ا ost Ris end ا يا خا الها الات لهل لخن اانه جا لوحا 0 الحجن اذ لهج > 5 Tra اج غضم لج الام اليد للا RU جمد لد خكة CY حي ذا ل متا 3 1 E 2 £ يي EH دم EE Boog DelayI. 5 Sed 3 5 bl LE PETES لاج ل لان ات ِ ٍ : Ee ا SARE ea En ا ايت اذ الا 2 2 0 ا ب ا الح هال ححا اي od x PN : ااا الي : FE y aE لج ماد ل ا Rt SSR الاي تخد لثامم LT SHR ذا ES ! الغ CRESS : 8 : Ey “a oT ع 1 5 : : ay By CoE Tal i ea i: hy 3 ry 3 aq جديا اليا الج ا 18 عا لسن pi A RE ا dw F0 ال ! انا 3 # كيم لجا ال ESN Se Seat BORER 0 0 1: ا N PI ام يا Eg i RE Bog LWT ل اال الا Ts Ee 30 بان ليد اتج 5 مب ل د ا لاي gs Uh SE + 1 SS = = SRE مان تاجيا جم اا الس ا الل Ro FEL a 2 = of So Po ¥ Fp BE Boat أو ءا wide لج wl pd ow WN + 3 “TI {vag 5 ا NS : : ان الاج ان الخ لي اللا ا أ ا الجاع انق الا ام Tat EE م ا 4 SASLاي احج دري و ا DRE: Fai = 0 ا TRIE de زفق TT be £5 aL AR لوق SU = = ل TF fH ات 1 IL SO Uh ااا 3 أو اويا اله 1 EXE EY Eb ا الس : 1 Ea : 3 8 . يه لخ ججح OY امن اله دا E CE TE م iT Re جا يج Nw =. Ae wa = د العامة ليطي ( مت ! نب I EEE RT EE ts aR 0 ل نج لق قا ال wom Hm Lo : ا 8 ع 5 : 8 ارا أي لاست ساي جا زا أ له CER الي 7 ا .7 a ثم + ليا سان I Jo ب 1 لد نع لزنا ited gad كمد اخ HOO FEW FENCE 21 لخ XE ا a 04 0 0 EE Eat a RE ~ 8 1 Bs الجا دي ا ا 2 ل ا ال 5 = اا حا اا اد ات ا د اتج إلا 2 dy Sh ka) WORSE LA LS نت ووو £3 )1 2 اا 3 1 Xa ba Sogn Fos 3 قوع جا dah as) قي ا Ae ا = ل الهج دج للا << ذه دح اا ا و ا الدب الجا ال 2 3 Ji Nghe SND TENOR ال Fa اماد الا اا aE RUE 2 ا ا أ اج On 3 مايا ااا > ATE aR ag) ااه > rR اا LX? bd Lo =r 7... a 4 ا الا ا i SR CEE ale) ا 5 KoA Eolas Eh Er Eg 7 EN Selita Mz I الا لاوج اج حب لمرو الت FEE aR م لوي اد ب بدا “CTS A. YREERLR 3 (صلم لبر 3%( Hah EEE 5 : Machol@— Soop ما ا وي 1 ل 1 AZ) ونا fe 2 لوه Oa eng - الف WE اا ب , Say 84 1 : k 7 o جا ا ad LE TE Tn ¥ مع = —— أيه & ال ل خط اناد (إسوالية قد 5 8 34 -قياب] 93ة EB - FE — - om 1 : ل SR وم 1 0 : A 1 = اح ص اج الل الا ا الي اي ا لاج = OL: ~~ ب = ا - لقا قرع دزي NN nn EN 7 : B= hbil— BD EEN (YT Ocal addi pa} fe RATT : 3 3 . امك الي = N SERS A ّ ارج اذا SE اي TAT الى Lod كينا TS ال تج i fi ¥ > he x Ct + 5 = اي اا ا ال لح د م عدا نا نا نان ذم SUR ال Et RE JR بر اميا ان B R بارج عا EE ¥ لضم :ان I x = 7 5 دما ا ب 5 ا 5< 3 7 ;¥= ليا boy F dha Howl لاة og ١ 8 1 5 Si SE ALT ma ياج TE اجاح ال لالد 1ح لجز هيه SN Ea ١ % a > ايت Ty 0070 اخ براك ال انر ان : ) ات بد الجخ اط TALE لخن ge د لاج 1 لقع ة Ha 2 ان ال Ts © ا Vala ont =X Fos: اا ir : 5 = 3 الب ااي ديا af a : : 5 والح Tyo تي ال HEE.PE ER oe ااي ا ا ا 24 er الل تلخ ام وح IF د mies ال EARS ال الج ال FATE :من Ladd ES Sh EE Cant Tre "0 ب . ب 8 0 = اال oy مج \ 33 1 ع : 3 : ب i = FAS اا لي لك اح A LP > SRR جالع ءا لو اناء أ اال Ea] Pe wl A - أي ad ب BM gi TT =e lo = SE N - % تجح ا Boyt i < 3 8 Th 3 J 3 * يحب : 0 ky اح دج KE A wd md د خا نع E a pa POT =a ال سس Fay PE Lr ايل H SE = fol] 0 oD —&28 AE 0 ro RRL J 7 5ج 2 s 8 2 3 3 $ + 3 5 كحت ته : SAY 3 mT 3 ا : ا : ب : = 8 5 << : T ما ارت al Pa 1 * 0 SL H SAE ed Ca 8 RE ot vw ا 7 و 01 ل CAN Ee : ATE ا ا ا mds oy للج ما« بجء SN ل كذةء الو عاط H Eo 3 : 2 TL Td 7 8 0 50 ايخ gd ا ل ال ed gd لج #*#هء الج ل“ 0 م - 8 8 i x 2 x wd <> H OE اي“ or IY egy الم 3 = 23 = 3 fb Tr : لس iN § FER RE ا الاي PIRI و رك اي لاج أي x i TL اتاج 1 تدا z قال 60 $ k J i pe ِ ما 3 < “ < تاج لى UF ال ال EF SI rs SE go [IS 207 م اح اداج a fo FY Pa =A 1:0 لا = IE 3 اي كاك FOI الحا : > 3 aE TAI ايد مهيا موتح 5 د نضا تح تخ 7ج جا 8 اا koa i = iE T= ا اماج 8 ب : 7 GbE أو bE أو ل معط wT pb ل لل Cy J ا لاي اا TY 3 = 3 En be PERN © SEH £0 FRRCEENS (EEN =X IE ne اج ب ا heed I Rr : op Jt wh a oy h] MOIS Meng AT دا SE SR A Ld 0 متك Logie cel Lae Rn gk te STAER اكات 3 5 : : الو 7 انها $i 5 3 اج" 58 RR omar ل غضاء Foogd ax ! ا bh SAE i 5ل د مطل oR اا tt الك كرا km Tite hrs bm FR.PEE ابر اعت راي تمك المغر hdd— TB {Nal الت داح © يا ا ee حا ل 1 BS J 1 ابر Adi gat رفس RC oi ست اذام - اا i : : 5 E | TT Fos الوا اا اي 8 RE 1 Lo ا seem ليق ec EN PERLE ea ليا FRc جا ل لش JR i لخر RE Els BEES BE EE حجن رحد اي لزع لاي 8 ما FOR TE ال Ex 1 RR TT SOREL © الم انيار قم ص RCE ل BE — BER Tq 3 ed] RI OR i —_ NT TN - ال a RR rr ِ wr Ee En I la ily {3% ad x ER TOBREL 3 لدبا TEE © ThE ل اسه رح يب الا 8 حي اج مام ERC -— ل اا اي ام F ا 4 ل ل wal لي قم ={ حا و ال كا يجي حي الا انا الام م ارا ود اخ WIERD 5 متو لير قم {RY بجوي دج — ER لامو شاد الس فو اب بام ارو ا ا الا < ل ل جنا SRY AVES seme نم اليم !الاح دا = 5 OBE © لمؤانية رقم ّ 1 ok BON الس در © Ii _ ُ ا اجا E go ب x rat As | ا ERIE Se RE ويا كرا الت AY ha] حا To. RGR IRS lid 11 Kaas {VY a debe OBERT ب “Diam اا يس الى = سم ال ل لامكا TEN ب ا ايج 2 مذ أل متها حك ا ادو ل ال H - UN RE TE ف وذ ؟ Ba مرج ل ال ل اود اي منهة ود 1 أو ل[ i : : 5 Eh اااي o TH em كي ليم 00+ Gey محا wo TH Lom لات قا wt متها Boat LF =X x 1 = ال J Ty 2 } = rei ar ead, TENT ال i go 5 fe OE EY ايا آذ الجن ا & اي اك : ا 8 bed مي اط لا .ا Toph با 2 ow : kee 8 ب aN ug « L =¥is 1 3 ws CTE - : 3 ٍ 0 6 0 wie 3 : : o : Ey - : or : = i og py gb dN Fb JT gb GE gr po ® gt iE =X Pa 3 La ب = wR = بم SH = — + 0 0 - % £ - 1 = £ Ey 4 * 1 Joi ol 3 Bak 1 5 = Rag 1 bred 1 a) B SU ama NE جلا جاه 5 :ب لج SPR 0 5ح ناءا تلج اذا أل نجاة PO EE الى اللء SE BE CR OR هذى rT p : ا b = az =X ~ oF po oF TTL 1 . ص od H Sm 3 fred 5 ke) * x + 1 ديا لج uF لج oe W ل eB الى لل ١ = Tom ne Bown bd oT r ا 5 — حبذ لق اط x = :2 رجحب 1 - N رمد اى متهية ا H Sr E Teme قنخ له ال Tog a =n مين Vo ha SEG بن eft EIS DRO x Sa oe CR Ln SE 5 2 -— a 3 دي E Fwy لق ا 05 Lo ad ب ا اح ا اج = L RS 3 ال الح fo 3 ص A i اد لد ا الال POR 2 لذن الها GE :و ط 2 خش 38 & لفل A 0: ١=« ¢ \ _ Pa EL FE OEE OO — BT $8 Ld ana Uns fa و Oo لحت لتحي لك ا ا لبي pel لو الى ال ac 7 بلا ادا المي ER EE RN x 8 اا . 8 ع . x 3 oT) ررغ لتنا . اشوا ا لالس اح > + ba TT i بج نا at لسو انيع قم (rv ةا 5 1 2 RBS FV BY £ Ad التجورححي ليق لمق لب حا Em— بت BE ب Ti. pad احا vo ارا [سوالةء RK PAAR لد دده Wo لخم Fo خم لد TR ٍ : ل ا اا 8 TRE J = i} = TN TE = مالا ا الات لظ وا 7 ل كشي و TTL Fo الاي با Hes Ths BODREE eERI, 12+ ad yh eet wD I اي ال 3 DT 1 BEAR 7 3 TERRE 3 3 ; N - ا ا 5 يي اب ا ا 1 rT > الله الما كما خا 1 Er rata ESE Beh ال اح 3 ةرت اناجة PRS ek phi pel اا اله 656 سا Flash TH 0 لاج يح جه الور الما TER SE كحت hE SE - BEd SI ايت SEI له (RR ak yay get THEE 7 7 7 ا ل ا ا الا ار ER 8 — انا الما 4 fet El عنما hy ا وات ات ل ب لح عي حي كم ENNN- | Told Sek 8 a ا k nr .= yo 3 EEN ae y يخاي لل — F ne, er RE — م ee} TINIEL OD اليد ركم 55 es Sl = BE ود واج aE 1) Rt 1 : مع ع ل ا دا ال an 1 : a wie AR EY gy LETTERS ca ب_ م R T 7 الا 5ه بج م Alta) wDOFL قم فت E B- rr © oN Fi EE اي الوا اناج اام م - . ch CW rr SE nd FRED Cah aE 2 rT TR الام + لكاي ؤضنع الي خب EI” ٍ {VEY الم الجا ا EE ا كن بج vo FEAT = TOT ERE Ad TAL 5 داك pa =X انها sm = لك أ CoeAa. = 2 ا 2 ب ا تي #نهاi. & . ع K Vos ra] = Ta FF =. ا Won! ادج I SE ST I i = £2 3 3 = ا 1 ايا راجا = ب م ني Tag الم ل انل ا ال ا اا EE at 2 5 Lr الح = TAT 3 = د = =ds لما TAY Aon tb قاد ان ES ا ممح Tomy = ل 0 OM = ل لد ديارج 5ج تنقيا is oF 5 8 : = © 2 3 3 w 1 ne 3 7 : TT i 7 i Br ==, 23 ليلج 5ج لأ ل ا لح اس !2 EL i 2 : = = 5 رج : = ha ox 52 با 2 = ل p ل : = Loa A oo TL 1X ا ا نل ان =X Ta ححا مهد ايكيا انح 1ن Ea ازاك قد ا الها : > ب ع 2 1 % . 5 با تكد اج :ل الج املاح كا ا : 5 : ا : = C2 = Bad PBs! =n ome £ = 7 ود ١ وا خاي £7 fad) + ® للا ال TT عام كك ين Poo FALE بل ل ان =X ا يمتها ل دكا الكت اث ال رد ا Tr ب Te py TC ا ب 1 3 = تارق م : PRY A 3 حت طرخ ان ال2 اج ا اا o EE =a قا ل ال خخخ دق ألا بط ا 2 £4 <٠. # he = - ع Poon 5 2 أي متها ماج اللي ا كت : ماكح ل 0 7< T 5 T i 3 8 8 :ىن gag ارح لضا ل“ KE * ads gt sad AEN) 8 ٍ BN 8 3 £3 ES 5 . < 7 5 امالك لأسا اتيك سب متا ل ا 1 H hes ب ا ا 1 Fo الحو EE ريسي wD 3 : LEE CE wd 41 ERAS 5 ERE 3 Ss EOE SE SI a 2 اا ام الي eB Ean ا 7 2 5 2 ل عا HE = د JR الوالط. لل © ساي كمض ا ا TARE لين Egan : 8 = 13 © 2 2< 3 وال الج 8 = داتع :5 o i aE خا اي 8 1 i SB TERE اتاج :4 بش gid بط ا 1 ل“ 8 ا جا اللا oF od 3 pd 3 eR : Ra 2 : =iag الى انعا ب رج IF RE Wout LE =Ess : 3 1 4 . ا تخ > ب : AF ا أ اللا #7 2 x 3 2% H x kK} . 0 oy =n 7 أل 2 Boyd 0 Fe 1 . ب - = Ty 39 ka oh IT 3 FR ta 1 ب 8 جرح وات ال 1 2 ما ل اشام 1 FH مت 4 fbx اا ¥ F ¢ 5 E ٍِ ها ] ا امالمت SINE § N HLM iia i 1 3 لممحا ل XC HEIN £2 : اا 5 8 : HR SY Eh Sei TSR 88 HN EE SEENRE. ES FEE a oy EE aE ال aa ER en, DER a, EB} 3 يي a : RE 8 ا a ANE SER rer } LS 5: = الس AER Ne ee ل al 0 § BEY : ال ا اا ا اا ل الا ا جا go TEE LGA N : PE RRR RT - ل ا et اهراج الحم 8 د لس BF shad 3 A Vi ا ا 8 Mi ا BREE 3 0% اح لض ته لقي اي ااا اا ا اا تع ما واج Bt اب WL ٍ ا اا 0 REC TE a SEER LTT اد TE Soca ا لي ل 4 رع a BSE بلس be EEF BARR 1 ا م ع ا > TR SE Lh ا ا Rn Sa NE 8 TER SE Chadd aad JR en pa oo ER we 4 RR NN ce ال ال ا ا 3 ah aw LEA احا 88 Ran ا ل ا 7 RE . SEE ao Eo 3 aE 8# CART B= 1 0 So 3 aR Th لا BE 1 a FS Rn hy SR . Sha emia Mek PRES EY a BE 5 لا و ا ارك 5 | 3 ممت TEE Sarasa i الالح Ae ARISE E اتح EOE FEE ع Te & EW | * ]VP16 مجالات نفاط مق BE FIA ض \ fo 1 N ال 8 N . wl 1 N cd i N <n \ oe i = \ = i T \ ا i a N oF 1 8 \
- 2 . fron إٍْ \ Rae \ ض ِ a \ N 8 0 mr ] 1 ا ا 9 1 . on \ YN . | ul ا F وا بلج ع EE ان ٍِ ب fo NUD من ND وب بت وا و mow ديج mom wom aon ERE ا د د ةد امات + « ذة د ات ذه © اذ ا "as TT OST هدو ؟؟ 2% o%3 © © Eg $f £32 لي £2 8 3:5 3ة[( SY £8 §& &§& FF OBE FF 83 3 gout Ls ل = = 3 E ٠١ كاA AIRES SUTRA 8 مب المسر مل تت UTR at ALR el 3 TRY all واد DET: 5 =a Hi Rh wt dao] deal ataning a ا : م" : Mk Ce ERE OF we Ny FAT & a y 4 TEL ain J i! sles WTR sel Atte12 off SABE : | 1 wo قل المدة NA YE alata | PLATES بشلا امد : weld افا 8 § 3 3 = x “ee onIN . 0 i Pel TDNA »عراف اليناف 87 4 Sha Bids ER HER : 8 : & J wad! TONA © ا $ Oo يتيج de pti lis ا A Vn Reg AN Fn SEER Sy ©" 881 Eo VY شكل i المج نب 1+7 NA y sold متاطة ES 3 SE 2 8 الا ا د اا إل مشاه اث ع speck 4 CS EN Ew wan انس ST UR Said N اتا RN : Sey AR % Fa ا ا aw Ek 2 es THR a Ea 0-1 م م 8843 ا 0 رٍ . oF Nevo . 4 : سوال الا جد 3 ا / ب 0823 3 UTR v1 i 3 1 0 00 َ 107 ا 0 pDAB107881 Ln 1 0 ا i FN SE 3 0 ل + 1# زرح فاصم الا Nos ا ل . ال 8 اننا 1 i ض = Eo Sak 5 ا ل 0 a ض ب "ل١ 1 Eh oN ay % Ori Re Malt E 0 ا wn F 8 Ren 8 8 ا ES RENIN Mg Saw a ; ا يي 8 NN Lid Sw 0 8 TH 8 i” ب ل الا 811 vi الاق 1 "© 0 1 808243 انا TONA سي وبا ram 183 0 Vind Th NA 3 ل ا ل“ Ted TONS ١٠؟ شكل يح { 3 build_ \ ¢ اج عاسم 3 TR wi AE rity ; t 28 oo مي لاقم خأ : hai a Eo 8 ¥ 2 oe ايالخ 1 ا Ji 0 ا de 0 0 الا ا م ا ) A 3 Zo ol A {Lib 8 CeVIMVE'UTR | ال ل الى ن" اذا EN 3 1: 8 الل TREN . uk N v2 المستر © 1 IN visas : a a a ei TNA i - رانس ا اليش الي اا ا 8 ف الحم يا لكا احا 1 — ER EE EN Ne جا HPT wi 0 ل كه CHS ام لم '/ لحت انا = ا RN BR AR PRES el] رةه ل spesR TY te ALON yoo i لرسقاعة VIER 1 : : ل 8 ARTY Li STTTTTTAMORFIE 2 UTR v2 3 قلام تان إل ES Sw ha RE rR in re i iS Erland TON AAE. اا ال ا ال 8 0 اال he الي Fad 8 ا حي 8 x Sn : iA a NON ori i. ES No Ori Rep 5 ; aril vo IRE H a i 3 8 2edad 1 1 : : ترز بناوج المسرغلا natal, : ا وي Ce Sk S$ LTR ! 5 بق ¥ R 8 0" HC eo ions © g & 58 EN Ser 3 TTT الا ا حي RE السو i A i ا د © i TTR 3 #ش ST EE WEA ٍ لب ا : 3 3 pr + EN 1 00823318 مسية 2 لمعن اح i EN EL No ai ةا ©“ 0 pe Wh ta 2 Ga HER سم Co ب BATTER : ا 3 i ay : ل ta SEE oh 2 Pee EEE Ma حي Yo SER Fix . 0 | | لانت SR EN مج veh لبنس بدأ La LOE RURI الاب ا Wa SY i Sy a Te RR Ee ) Sin : ay a ال ori ae Nae EES الخد ne Eee SRR wae maT 0 STN EE Seen Ori Rep Nii CBR HF TH v1 لخ نب Le Pas ال ا ا een ل : ع م ين ا اذا سا ا 8 ee UTR v2 لل عونم 2 oriV i ا ل a Ve en EH age amg: p.
- 3 Fd 3 { 4 7 Fal TONA ١ atone 3[ i dad | THNA > شك ى| ل & 0
- —Yiv- StuORF2I UM wi Orebid v3 1 3 0 = 7 EN 1 لاا الا ا ا ا الا 25 Se Xe 3 الح dein EI EE ae SHEE Fa NE اد Ri CoVMY 8 UM ams 3 REN : PEN SEER ese SEE ان : 0 i He 2 Lu i YE re JCEM Lg L ei de oF Ne 0 انا ٠ ا lit RE ا A el RG ae Ny LL HPT a 0... اا «8 0 1 ا قفا ل اع 0788s ل“ اال ال fg 0: 0 sls Ts § 5 wa Roba A a} Toba § i Ee en 8 0 فقوو ل TUM v2 \ بج nn NN رج ER Eo se Tel BONA i : Ny ES Ee am aR NR %, sons Tal TONE go sama al ES Tit EE NE eR قلات الما ا ا اا ان ا EN Lon احج 7 SERRE TIE TR 8 i Ll فت TE Non eri : Nm vp iY ari 8 ضع oo 01 ا بن الله وا ا ٠١ شكل
- -0م؟1- و 3178 ثثعث0وة A ب و00 :0 3 :0 > 2 الي اج الوا ا nT ا 3 BN ا VE ell 8 ال | ا“ 20.20 a : ARNE ابكا الا 1 a Sal SEERA SE در SRE Cs ¥ Mh 3 u nm Fy 0 J.
- Eq 3 Sr HE fe or Ba on IRR RD” HI NE RE 1 . AUER الم 23 >3 ا V2 al COVE of مور > “نا التي وذ ا جنا Saal TORA = We ile RRS RCE - NaN NN | WN المشاطة pel o Ea Na SHAR ITER 0 جه 05 [قفطاط لب ا spec | Co a sand ar pd
- 7 Lo Ne § AORFI 3" UTR 7 RK IS ) )5 بل ب ااا وروي اوت الا نحا الا ا > قلاط SCN Tal 0 BTN Mum ,5 بل الا أ الثمم التي Tr ا اال اا ا an ال الأ ا Vi قلا Ili ا ا ال ال ججح حي ادا اخ TE الالح PC 4 0 الأو ا rik yo BIE الما 1 Qri Rap 0 الل 8:1 I< Be ٍ ب 0wi 3*7 بصي i ل 1 مضع SEER ل N \ i : Anh الما ¥ x bY = i So i RY Moy ANE 0 WERE 1 an در ال ا RE Re ov A TR, لاي CSM ل ا og NEE > ١ THER vial diag ف" vod APRA سس د & V2 jl ar م : ay : ا : ال ا pe a LH hic ENR ا saat TENA a Ny EL GER CL ا ا VT دا ا جا edd AQ as 4 i a a NE E AB 07888 Ll ike اناب با cc EE pos REE Xr 2 : 0 سي | speck ERY do 0 ريج فاججة Ei Wa TRA Se 0 وب UTR د AMOREZE 1 0 Me Ee : ب tad 1018 ل 3 Se ANG Ng ل pes ERR 5 : SR eg Ft ! SEER EY Tad TNs oie x, kik اال RN pi a 0 ey لدي 3 1 Wii, fay 8 ل Nine - Raw Lah SES EN تم % ia 8 ا POE SEE SY - ا - HA 8 Voy wy Yiu ١ OriRep i : 177 شكل VA Be “ا_ \ OW — AnQRF23 3" UR 1 eft wd \ : 8 1 BY Lo EE TREE 2 : A No الم 2ل BBG Ly : ET a CSVMNETUR حا الل خاي i ل aw EEN Gd al Raa VE God CoV ml ال ER Chass Rib Cees AF a ai all TOBA : fe Seta Aaa diode a E HFT 3 سي St ا اي a lend RE LE Fr ERE OTERT SEN spe 8 0 م ا أن الا قح 8 5 : Es J SEA EO UE § i a blip x VEER NE a M8 ” NE AgORFM FUR v2 = 8 1 3 جل 1 i RR: ل ا 1 = ملام ساس 0 ا ene wn الث الي Tal علاطا ميق > ل ا ا WRAY Wine BS han اا اذا اللاي ات لق Fadi TENA 0 ك5 سا ا نا اا ا مي ES 8 خش fi. oN 7 3 6 3 ~ J % OriRep 3 813 ARE— \ o \ — ALORFES FUR v 0 م20 YPIE 3 4 : . hy : 3 1 3 ik 2 ky Bi Ga RY i
- 8 . No ب ل ل x JRE 2 التي TSE بن SEV B' UTR SEER 4 SRR WR IAN جد TERE 0 8 8 اماي an, WZ لمحت | Ce = a 3 bh a ¥ 4 ا B 8 اميا @ ي«#0 لدب د ا ان “EN ا اما BES a a SR EE 3 اليا Ae peal المستراططة we E HPT ed > الخ a Sy ا Ea Caen ABI O8RT2 : 3 Lo NER Ra speech RET Pr {0 ia EE وج BEER NE: He ال SORES 3 UTR تدب NG 4 fy TR CE Sg 0 se. ON [ai FDNA Ug, sm SE ب اا : ٍ ON 0 Ie A ب STR] اي ا XB Er الا المي IaBTDHRA TER ; Ro RE SSR 5, Rada SRE ا ل ل TNE Tao Fadl TO NA 5 Sq ETRY : ل ا د ال سس ا اي NTN ا 18 34 حو 7 VN + OriRep 3 17 11 *#* ار“_ \ o \ —_ AWMORFEIZI UM wt 0 Bot 3 و He VR & & a : y A ا re 0 RR salt Atlld 18 ا الل ُ EE من ا م 0 ل اللي 188 ا حب : wi pe Eh 8 ا Ei SEER IEE che ‘ Vo Ras ol n whoo 3 ان الج اا ا ب 7 " 1 ا ا i RE wal ToNe OW ا : ا > Sa do dbo iss TN 0 HPT we i ا Sh ب م LEE سم سرس a له 8 تققطمع الا الا الح 7 WE 4a 1 oe 3 i SE she od Fle Nd $i } = SES 7 wR ا 0 صل أ ا 9و سس : : : 0 = أ + سوبي TUM vE EY Mee Wl gn PT 3 بذ لل tel 0 iE Si SN ب 0 ب oi Ri - ا ا الي Pr اا ل ل ay cole am ب ا aa RE REE Nb, Fe د Laat TH 8 TORRE RENN NG 8 تت با أ Bu N en 7 غت TR be Yo ¥ X No X Dei Rep 117 0 A 0 5 ! +١ 4 لل_ \ o Ad —_ AORFEZ 3 UTR v1 " bY الام EY . TE CELTS + Er RR a Pid ¥ 2. ا Se Lo ry ERE عل Sed 5ق 0 ع ل مج ا WA ا a لدج ١1 ١7 حو ْ لي ان SRE, : SE > ا i es ي i EEN gd SURE RR va eV a د م اال ل ' - = الدب 8 ba Neti : “nl pi يا TINE SER 8 ny 3 Th LL MPT ve i | = ah 1 os ا د : EEN a. قم 3 I spesR TTL so TERY : SE 3 8 vi aol pad م J Ta : & AMORF24 3 URv2 7 بد 3 ل : 0 مي ا لا 1 Cael ا Noe 1 ا , a" 5 LH TRUK aml gl ee EY SEE EERE LEE So i Nl, قلاط الا ا ا الس BEN or A - SRE 0 ke 7 il LS % Ye sri ب Cri Ray 4 oriT YY 8 RS 3 KI 2_ \ o ¢ —_ 2022 BUR v1 i a } KS AEE v2 A A i ا ا لا 1 8 ل 2 ا ين يج ا ند اا - مااع 5 UTR يي A ا نا نت - de Nin eon Chon : ١ ال ا ال PN الوا الا ل ا اد ا a LY wd deen Albi ir Sige I ا ns BF NER oui الاق f XU 1: جا 0 oT ovr Nn توا لوي ل Eaten EEN LER ااا de elt مضاعية ™ Ny خا 1 i FS ام a Ha Sa TT i Cor ba va قتاع لين 74 4# 1 NEAR : LEE spRER | ck yo Wl slg YI 3 Sri اه Ai Li 8 SE $d ARIORFI "UTR v2 0 : ل ا ان اح الا ا ب 0 «> الاي TONS i Si SH BN ep اوهو ب cls 8ل 0 اليد اذ ا مم ا 3 ا ا ل الكل جطاز | < ا EE LUNES Rk 9 Ta BR الحا FO NA aie SEER iene N i.TR ا مسو لاا ا ESN . AE ؟ + لفط ٠ ory الل A hi 3 Ca ١ LiRep اال 11 ان , a Y vr 0 ! 4 oo £Y14_ \ 00 — SteORF2I UM wi Oreav? No tem المسر لل 5 ل - 0 Cali SEE i d a: es a د ا The SH Sn 3 : > wn fe = ا ا ال اال باتك حا . ovis lading RE a Ase Ce PE Cf ER oy ER EN TONA EF oR 5 : حي 5 aN Eo TT السرحة nha ™ Ny _ذا 1 3 0 Sh Wa حم م ABR ESTE LL ie. ا 5 0 ا | لمع 2 مها زوج قاض ب I ا تح § 0 0 4004343078 «2 wn > wh 3 = 3 >< مع الح ب : Ci % 0 «> Bk \ anal 011 Ha on : SNE i TN . 5 ع الا RE wn pe a ب i all TENA hE. wl ay No We Te ad Bh hh. TW ’ [ Ey tall TOMA nN 0 اا ال ا tif 38 ا : x KS ا ااا ا ْ 0 07 اا #1 اا الي ¥, " », ١ Sl at— \ o أ — ARKRRII UTR v1 4 : Te 21] 3 0: "م ال ل Drab) 8 # 2[ٍ ا 1 الخ so NG =: 7 2 ل محش At Hh 8 ير ا ا PETTY hE 4 oy ل i RAR aE mT = TEN OE EERIE FR VE gaat ae 4 So 8س | Pil NEE eT FETE i a EE CA : 7 ا wal TOHR اا 2 ال اا ع HEN Ag wah ما Nw f 43 v1 a BSE an ry SEN fo ER AER ETERS HR 0 ل DARL OBITS ) speck - 0 .' $0 LL SEM ap HEEL J سس we FT AMOR UTR ve ا ل ne 3 WO Tad 8Ee . Th يذ J “i ادا د أب 4 Sa Ja ht Wd Prt Eo Se a Pl 8 NE RR Sink REE a > ae EE 8 بهذ 8 38 Ne لذن اال 17 Yo شرك_ \ o 7 _ ممععفيعد I UTR vi 7 1 fi 0 بن ا 2 weal Sx 0: 8 SRT TRE EET TT Gy VE ICV gd أ A نا ليه الأ ا الس 7 Re 1 للدت TORA = pe Li aad H To NA 5 8 نا EE Gein TEL eR TN 1 بل مشتانة السرعة | WN i SER لذ 0] ل pe wm انا 7 ااا الك ا speck - ia لوستاعة SHER 1 1 سس مس ا : : Ce La TTT AOR + UTR وب 8 8 a 3 hb REET لا ل 3 الحد ا 8 EE im Ny Ck Go a 0 Isl TDNA i = ل 5 Sa ” ER : . ial "x CRA. TTT Fl TONA BE RE NEN 5 Le aa II NE EN EN wR ا 5, SFR 3 ل cd 5 i Ori Rep 217 جا" ¥ 3 ب أ ١ اا ا_ \ o A —_ لت اقم I UTR v1 x 2 : 8 الما 2+ جع ا 8 و نات » مما ْ RR spe RY a 28 Se a Sin ee ا : ا ال : ا ,أ ال 7 ع2 ا 0 ال الدب TOHA ا 3 oo EY ha ا 0 Ae allt لاي ا بجا << مسا عه v1 : قرا EY hai دا eck Soo جب أربي جيردت VER Co a. plas DEITE bens speck © Sa ام ب sale HEAT J AE TE rsh ب § + 38044301 2 0 bh اال الا ا Tad DNA ES 8 LE : م ik % 8 0 ; : : Co” ان ااي NC الها 208 الما © 0س اتا ى| T-DNA رض 5 3 1 + ررح ¥ 1 N a \ OriRep % #171 YV شكل 0 AS 3 4_ \ o q — AORFIISTUR vi : KS “8 > 1 اج ا 0 : اي ee hs Wy 28 [SO EE ا bi } ki Sia ا اللا تحب ¥2 ا ب د الي ال Ey wi aot RtUbiR ? Basin) : «5 اا ا يي By 3 Chae od 1 B 0 SRR ب SEER Eee RE se ERR ا نحت تبي SE Nu REE 3 ا ال 088 الاب FRE el Sha حا HET vd i ال a ee J اودجي SER speck أتغفنام 95 4# م" | wale mad 3 i. سل 0 = + 401243 UTR w2 = 9 a 8 0 So اليا 8 ا : ب re a ES i 1 الم Th Ha i ales RR 0 : NE COR aaa > 3 Nn ال ل الل 8 BE Sh ِ Se SER NG ) : NEES ل Ni > > ب iA TE ooo eri 2 Yo 01 و 5 2 نر ا أ Te ل 0 { Sd é٠EE — EE EE ER ER EER ER ee) H bE pas = HE HEE 3 3 Wd Ty 1 5 won Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty wn 0 Ty As 0 تك ؟:: : HEH Vo : id RR : 5 HE Ty 1 ب won Ty 1 0 Ty 1 0 won Ty 1 0 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Vd 3 : HH Ty NY 0 Ty EE 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 won Ty 1 5 won :: : HEH3 8 3 HEE i id bE] 2) ¥ wo Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 bE] 2) ha won Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 Ty بم : FR VE م : id Ty 1 0 Ty 1 0 1d 3 : * wl bE 1 : EN HE Ty 1 0 Ty 1 0 Ty 1 0 0: : م ا 0: : ad HE bE] 2) 1 FR PERI 1 HE : ب ا ا 5 اح Tia 8 م NEES : a HE voy 1 Rs: HE Via od + 1 HH : : د نا ا ::* i HH VEY 3 fe 5 8 . id IY FS Re FR Ting I Li has od ب ا 8 Sol En FR HE 3 : fr a HE HEE 3 3 : EAE Wd HE : 8 - a HH HEE 3 N 3 : pd a Wd 13 : es i : he ¥ HE HE 3 3 : 3 H i 23 HE HE 3 8 : i > i ا H HE: 3 3 E 3 : 8 : HER 8 3 i 3 2: 3 FR oad iS i il : bY FR LE 0) H : bases x 8 FR bE 1 i 03 Ry : ا 3 2 wool 1d : 8 : 8 kb: 3 8 od Ty 3 age : mn 5 ا hd w HEH bE] 2) 5 8 0: on wn 2 : 2 HE HE 3 2 bs : Td wy joss 8 8 8 Wd bE] 2} B = Re) Tan ETL = ey a 2 HE 1d 3 : 3 دي WEE 20 ا ا Ty 8 Lng RASA حت i: Tay م لمحي 8 ا agent 1 cE ed a 2: AN pa wl bE] 8 £3 ad IRR REY TITTY a So ا اد هت رت اا wo 1d 3 : امك RE TIE ا i EN ام 8: : AR ب ا 2 ا any ال ا av ne 3 + RB: RY 1 -. Sy h rnd Rte ne ENE rN eT RENE won 1d 3 : ال - LE Rn 0 BR SR الت DI HE 3 SE BSI J : ص ل TE NL 1d »ضغاة_>'|ادا7©و7وىو7]وواو٠7ال+ف٠>©ض_>7لل>ل”7”دو©إ7ص7وإإاإواا#؛ل(ى“ ااا = بت لبظادد5ا'ا6”ا”ل,” a ال HEE 3 RETIRE المت 68 7 ee rN ) 1 ا ا a N Y EY TRH BREESE 1 3 EE RE Te AE Poo aE 1: on 5: 8 الله الل 3 3 1 SREYH 3 : بم ل الا« العا ا ا ا Te 3 ae R SN TE 3 i 1d 3 NL, pecan 3 ا لات تا 2 الوا مه واج ل ا ا الا HR 8 الل HE Ty BRL eee RRR 00) “الم اكب RRA ae اناا ا ال اعم أب = a od 0 B ARERR SRS ا ا ا سمس ا او الل Wo i 3 5 1 0 اا Ee a a FR vo nv RK a wo TR 3 wor 1d 3 Hh 1d 3 Hh TR 3 wor 1d 3 Hh 1d 3 Hh TR 3 wor 1d 3 Hh 1d 3 Hh VE ola id vo [RE Ha 1d 3 Hh TR 3 wor 1d 3 Hh 1d 3 Hh TR 3 wor 1d 3 Hh 1d 3 Hh TR 3 wor TR 3 wor TR 3 wor HE i HEN Ty indy Civ TTT TT TT ا :د جالعل هلول عله وتلل للع لعل لوتوتوتلاعله لعلعلهللولولللعلتوتعللعلللللللوتوتعلهلللللللوتوتوتعلهلهلولللوت لعلعلعللولللوتتوتعلعلعللولولاحللوتول لعلهللوللللعلهلوتوتوتهلولللللعلعلوتوتهل للللعل لع لعلهللولولللعل لع RS تحت تتح 8 HH HEE H & ب wo GE 58 5 8 HEBN 1 he « 1 يم نج 2 ام 8 0 * x E iw HE 3 = 8 2S 8 يداك الوا يج XL Daw Bd 8 BR Fos 5 Fas HEHN EN 8 on ba الي حا ا ا الجا 3 Woe aR 0 5 “3 ; Wn bE] 3 NF ig 80 8 Nak ER NE RR HE EARS Ww RS BY 5 8 a FEE Ty 1 po Ra wa FEE oS بح My ان SOR RN pn 2 ا 5 4 0: bE 1 بم ب ب ~ Hy Ny الوا ير ع الا pn ب ا ب ا ey x wg TR H ار الات احج تحب ا ا الم 8 اا 5 ب 3 ov WY =~ 8 = FEE HE H Gr = 4 > اليه Rw RE ا ال <5 & BA 2 2 5 FR By م ث5 3} RS RN Eas 3. 8 I wos HE H 0 ES ساق ب ةا : H HN H H H SERSRAR ا arr r RRA R RRA RR AAA RRA RRA RRR A ل ل لل ل > 4ه ak 2 3 بن 2 1CAS مااي اا ل الما د SX كاوق das رقع ا 1 0 ا > i Fd محف SES i محف oR, i AN NE د 3 0 : EY i NL i Cradle 5 UTR كم فق محف 3 i a RESTS LTR مخف Andes 3 be JE مسد ww Hoey 9 xX NEE تت ل i ee : am ال Rs يي vend Red 5 ا { pT RE RS CE NS Sear Lo a LAN SO AIA i iN Tel, REED dame No HE SHER TST EEE SER Ca Hn Sm 5 > 1 SEE ال الل en SEE Jo 1 ا ا a Lis 0" & 3 أ 0 ا ES aan Er SHEN ER SiN Sy iS So Sa ~ Sy mag RINE SEER Jy SRE Shy JEN SEI Rm SREY Sr 4 ب oy Labi aR 3 ; RE ok TREE, TEES By $ EY Ro ¥ Rt VEEN 8 FE FO.E . . LE 14 8 i x اا ا حا WN LEE ERE ] 3 1 ا قا HERR : SECT EYRE NITR wi cen > C—O or HEY لت ا ¢1 TR 1 ب ES ny FES x oan - 8 1 7 ا 0 EE Si ii pa Say on Ny Sma oY wat Se ET 1 Fas oi 1 ا : oy EERE SHEE ; ® + ممت Sri 1 & ان EE ER SE i aia, Sal EEE po TON جك Wate NRG > i > الي ا SER ا IE gE sid . RS aE EE rsd Neg 7 Hi م 3 PEA Ee pene Lona es SLR vise fd bin dl, Tate NER - 17 الدج ا od SEEN, : Five م الل ead لسراو الا EEE RN إل الح ge 8) اب سس مود ا ا > he TARR NEES 3 EE SE ال NEE | rE 5 Ot ضع re NEE ee 5, : لويم mT ا ا ا pT ب FAT 3 0 ei] N IY § LAT EN k Sn 3 3 ا ا SE Ey ' نايلم FAR 3٠23.2 شكل 1 3 Fe خاحضتا ال ا Disa Kets Bes Rs 1 x SR AE A sn 0 - عا 5 0 ال al TD ب 1 ف es 2 J RN : : 8 6 § 0 yf i 0 - 0 - To TH ~~ اله vr i nd 8 wR اللا الا اام us ا لات اريت ١ الس Ea § ل ١ = Te : 5 RR ةل ا 0 PER X Neen 1 الل ERE SE hE Sel SEEN ا Cw fe Re ب لمح ا لت اي Safad ا ال ل ال SE مك اا SET ee SR LEER FO > > any # Ce wg SEE Eat Re Fp SR a ب 0 GUS, aa ب لح "ع ل 0 ل Say E مت Ss RE ل SEE RE Ry TREN ا 0 boy AE نالحد 9 pe pTALG Us Han VEER ay بخ م 8 فا ااا i I 3 HR si 3 J ER ta EE FEY مت لا DAR A a 3A ال ل ; : i . ا SUEZ INR wi THEY َ 1 an i RY Eo RE Sh 2 اك fy aan “ا SE Sel a : aE a ا 5 ced الت م Baki محر ث2 Sa Tg ee إل SHES ON 1 ا ا SEER vo SR ho SRE a ai مالالا محف STUTR I ا NINE EY SRR ST TERE TIN She Sa . : 3 8 ل ON Wine لبج 0 Tina اطلام مطل Wha 4 ال [ey و "م ا 0 5 TES pal in 4 A AN BR انين ES FY 8 م تم ع XY EN § 2 tS) y 5 > DES 8 Nine fis الل رت المج ب ل وا ا حك را اا كير الما ATETEEL URS HE ON 8 RY اح ا 3 1 بلا 8 3 المح 1 % : ; ا : 3 rs < Ladi Dn Led 3 < ES للا LEE TNمدة سريان هذه البراءة عشرون سنة من تاريخ إيداع الطلب وذلك بشرط تسديد المقابل المالي السنوي للبراءة وعدم بطلانها أو سقوطها لمخالفتها لأي من أحكام نظام براءات الاختراع والتصميمات التخطيطية للدارات المتكاملة والأصناف النباتية والنماذج الصناعية أو لائحته التنفيذية صادرة عن مدينة الملك عبدالعزيز للعلوم والتقنية ؛ مكتب البراءات السعودي ص ب TAT الرياض 57؟؟١١ ¢ المملكة العربية السعودية بريد الكتروني: patents @kacst.edu.sa
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261594245P | 2012-02-02 | 2012-02-02 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SA113340251B1 true SA113340251B1 (ar) | 2015-08-16 |
Family
ID=48904103
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SA113340251A SA113340251B1 (ar) | 2012-02-02 | 2013-02-02 | حوافز لتفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات واستخدامها |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US10351610B2 (ar) |
EP (1) | EP2809146B1 (ar) |
JP (7) | JP6208692B2 (ar) |
KR (5) | KR102076728B1 (ar) |
CN (2) | CN107556389B (ar) |
AR (1) | AR089877A1 (ar) |
AU (1) | AU2013214814B2 (ar) |
BR (1) | BR102013002576B1 (ar) |
CA (2) | CA2863664C (ar) |
HK (1) | HK1204751A1 (ar) |
IL (1) | IL233806B (ar) |
RU (1) | RU2662672C2 (ar) |
SA (1) | SA113340251B1 (ar) |
TW (2) | TWI664193B (ar) |
UA (1) | UA117452C2 (ar) |
UY (1) | UY34609A (ar) |
WO (1) | WO2013116731A1 (ar) |
ZA (1) | ZA201406234B (ar) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1662005A1 (en) * | 2004-11-26 | 2006-05-31 | FrankGen Biotechnologie AG | Enhancer-containing gene trap vectors for random and targeted gene trapping |
CA2863664C (en) * | 2012-02-02 | 2022-07-05 | Dow Agrosciences Llc | Plant transactivation interaction motifs and uses thereof |
EP3128119A1 (en) | 2015-08-05 | 2017-02-08 | Hydril Company | Threaded tubular connection |
NL2018298B1 (en) | 2017-02-03 | 2018-08-28 | Hydril Co | Threaded tubular connection |
EP3578658A1 (en) * | 2018-06-08 | 2019-12-11 | Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt | Method for generating a gene editing vector with fixed guide rna pairs |
US20210062206A1 (en) * | 2019-07-08 | 2021-03-04 | The Regents Of The University Of California | Synthetic transcription factors |
Family Cites Families (85)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4693977A (en) | 1982-08-23 | 1987-09-15 | Queen's University At Kingston | Enzyme immobilization for producing cephalosporin antibiotics |
US4536475A (en) | 1982-10-05 | 1985-08-20 | Phytogen | Plant vector |
US5352605A (en) | 1983-01-17 | 1994-10-04 | Monsanto Company | Chimeric genes for transforming plant cells using viral promoters |
NL8300698A (nl) | 1983-02-24 | 1984-09-17 | Univ Leiden | Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van tweezaadlobbige planten; agrobacterium tumefaciens bacterien en werkwijze voor het produceren daarvan; planten en plantecellen met gewijzigde genetische eigenschappen; werkwijze voor het bereiden van chemische en/of farmaceutische produkten. |
NZ207765A (en) | 1983-04-15 | 1987-03-06 | Lubrizol Genetics Inc | Plant expression of transferred dna(t-dna)from plasmids associated with agrobacterium sp |
US5420034A (en) | 1986-07-31 | 1995-05-30 | Calgene, Inc. | Seed-specific transcriptional regulation |
US4943674A (en) | 1987-05-26 | 1990-07-24 | Calgene, Inc. | Fruit specific transcriptional factors |
US5753475A (en) | 1985-01-17 | 1998-05-19 | Calgene, Inc. | Methods and compositions for regulated transcription and expression of heterologous genes |
US4886937A (en) | 1985-05-20 | 1989-12-12 | North Carolina State University | Method for transforming pine |
EP0222493A1 (en) | 1985-10-04 | 1987-05-20 | Lubrizol Genetics Inc. | TR-based sub-TI plasmids |
US5013659A (en) | 1987-07-27 | 1991-05-07 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Nucleic acid fragment encoding herbicide resistant plant acetolactate synthase |
DE3784860D1 (de) | 1986-12-05 | 1993-04-22 | Ciba Geigy Ag | Verbessertes verfahren zur transformation von pflanzlichen protoplasten. |
US5015580A (en) | 1987-07-29 | 1991-05-14 | Agracetus | Particle-mediated transformation of soybean plants and lines |
US5322938A (en) | 1987-01-13 | 1994-06-21 | Monsanto Company | DNA sequence for enhancing the efficiency of transcription |
US5359142A (en) | 1987-01-13 | 1994-10-25 | Monsanto Company | Method for enhanced expression of a protein |
US5290924A (en) | 1987-02-06 | 1994-03-01 | Last David I | Recombinant promoter for gene expression in monocotyledonous plants |
ZA88319B (en) | 1987-02-06 | 1988-08-12 | Lubrizol Enterprises, Inc. | Ocs enhancer |
US5001060A (en) | 1987-02-06 | 1991-03-19 | Lubrizol Enterprises, Inc. | Plant anaerobic regulatory element |
TR27832A (tr) | 1987-04-29 | 1995-08-31 | Monsanto Co | Zararli ucucu hasarata mukavim bitkiler. |
US4971908A (en) | 1987-05-26 | 1990-11-20 | Monsanto Company | Glyphosate-tolerant 5-enolpyruvyl-3-phosphoshikimate synthase |
US5416011A (en) | 1988-07-22 | 1995-05-16 | Monsanto Company | Method for soybean transformation and regeneration |
US5302523A (en) | 1989-06-21 | 1994-04-12 | Zeneca Limited | Transformation of plant cells |
US5501967A (en) | 1989-07-26 | 1996-03-26 | Mogen International, N.V./Rijksuniversiteit Te Leiden | Process for the site-directed integration of DNA into the genome of plants |
US5550318A (en) | 1990-04-17 | 1996-08-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
US7705215B1 (en) | 1990-04-17 | 2010-04-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
US6051753A (en) | 1989-09-07 | 2000-04-18 | Calgene, Inc. | Figwort mosaic virus promoter and uses |
EP0426641B1 (en) | 1989-10-31 | 2000-09-13 | Monsanto Company | Promoter for transgenic plants |
US5641876A (en) | 1990-01-05 | 1997-06-24 | Cornell Research Foundation, Inc. | Rice actin gene and promoter |
HU220773B1 (hu) | 1990-01-22 | 2002-05-28 | Dekalb Genetics Corporation | Eljárás termő transzgenikus kukoricanövények előállítására |
US5484956A (en) | 1990-01-22 | 1996-01-16 | Dekalb Genetics Corporation | Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin |
US6403865B1 (en) | 1990-08-24 | 2002-06-11 | Syngenta Investment Corp. | Method of producing transgenic maize using direct transformation of commercially important genotypes |
US5633435A (en) | 1990-08-31 | 1997-05-27 | Monsanto Company | Glyphosate-tolerant 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthases |
US5866775A (en) | 1990-09-28 | 1999-02-02 | Monsanto Company | Glyphosate-tolerant 5-enolpyruvyl-3-phosphoshikimate synthases |
US5384253A (en) | 1990-12-28 | 1995-01-24 | Dekalb Genetics Corporation | Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes |
US5304730A (en) | 1991-09-03 | 1994-04-19 | Monsanto Company | Virus resistant plants and method therefore |
WO1994000977A1 (en) | 1992-07-07 | 1994-01-20 | Japan Tobacco Inc. | Method of transforming monocotyledon |
EP0652965A1 (en) | 1992-07-27 | 1995-05-17 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | An improved method of agrobacterium-mediated transformation of cultured soybean cells |
DE4317845A1 (de) | 1993-05-28 | 1994-12-01 | Bayer Ag | Desoxyribonukleinsäuren |
US6118047A (en) | 1993-08-25 | 2000-09-12 | Dekalb Genetic Corporation | Anthranilate synthase gene and method of use thereof for conferring tryptophan overproduction |
US5362865A (en) | 1993-09-02 | 1994-11-08 | Monsanto Company | Enhanced expression in plants using non-translated leader sequences |
US5623054A (en) * | 1994-06-23 | 1997-04-22 | The General Hospital Corporation | Crucifer AFT proteins and uses thereof |
ES2289743T3 (es) | 1994-12-30 | 2008-02-01 | Seminis Vegetable Seeds, Inc. | Plantas transgenicas expresando construcciones de adn comprendiendo una pluralidad de genes para impartir una resistencia viral. |
US6127606A (en) | 1995-02-08 | 2000-10-03 | University Of Warwick | Method of using transactivation proteins to control expression in transgenic plants |
AU703124B2 (en) | 1995-03-03 | 1999-03-18 | Syngenta Participations Ag | Control of gene expression in plants by receptor mediated transactivation in the presence of a chemical ligand |
US5659026A (en) | 1995-03-24 | 1997-08-19 | Pioneer Hi-Bred International | ALS3 promoter |
US5767379A (en) | 1995-11-06 | 1998-06-16 | John Howard | Commercial production of avidin in plants |
US5693512A (en) | 1996-03-01 | 1997-12-02 | The Ohio State Research Foundation | Method for transforming plant tissue by sonication |
EP0823480A1 (en) | 1996-08-06 | 1998-02-11 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Controlled gene expression in plants |
US5850019A (en) | 1996-08-06 | 1998-12-15 | University Of Kentucky Research Foundation | Promoter (FLt) for the full-length transcript of peanut chlorotic streak caulimovirus (PCLSV) and expression of chimeric genes in plants |
US6706866B1 (en) * | 1996-09-04 | 2004-03-16 | Michigan State University | Plant having altered environmental stress tolerance |
WO1998010080A1 (en) | 1996-09-05 | 1998-03-12 | Unilever N.V. | Salt-inducible promoter derivable from a lactic acid bacterium, and its use in a lactic acid bacterium for production of a desired protein |
US6121436A (en) | 1996-12-13 | 2000-09-19 | Monsanto Company | Antifungal polypeptide and methods for controlling plant pathogenic fungi |
HUP0000922A3 (en) | 1997-01-20 | 2002-03-28 | Plant Genetic Systems Nv | Pathogen-induced plant promoters |
US5981840A (en) | 1997-01-24 | 1999-11-09 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods for agrobacterium-mediated transformation |
US5922564A (en) | 1997-02-24 | 1999-07-13 | Performance Plants, Inc. | Phosphate-deficiency inducible promoter |
GB9713023D0 (en) | 1997-06-20 | 1997-08-27 | Reckitt & Colmann Prod Ltd | Improvements in or relating to the cleansing of surfaces |
US5968793A (en) | 1997-06-24 | 1999-10-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Specific gene activation by chimeric Gal4 transcription factors in stable transgenic plants |
US6087166A (en) | 1997-07-03 | 2000-07-11 | Basf Aktiengesellschaft | Transcriptional activators with graded transactivation potential |
EP1034267A1 (en) | 1997-12-04 | 2000-09-13 | Genzyme Corporation | Compositions and methods for inducing gene expression |
CN1301300A (zh) | 1998-02-20 | 2001-06-27 | 曾尼卡有限公司 | 花粉特异性启动子 |
CA2315549A1 (en) | 1998-02-26 | 1999-09-02 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Family of maize pr-1 genes and promoters |
AU762993C (en) | 1998-02-26 | 2004-06-10 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Constitutive maize promoters |
US6635806B1 (en) | 1998-05-14 | 2003-10-21 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for expression of transgenes in plants |
US6307123B1 (en) | 1998-05-18 | 2001-10-23 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for transgene identification |
JP2000083680A (ja) | 1998-07-16 | 2000-03-28 | Nippon Paper Industries Co Ltd | 光誘導型プロモ―タ―の制御下に置かれた不定芽再分化遺伝子を選抜マ―カ―遺伝子とする植物への遺伝子導入方法及びこれに用いる植物への遺伝子導入用ベクタ― |
EP1144665A1 (en) | 1998-11-25 | 2001-10-17 | Calgene LLC | Methods for transforming plastids |
EP1141346A2 (en) | 1999-01-14 | 2001-10-10 | Monsanto Co. | Soybean transformation method |
US7393946B1 (en) * | 1999-02-05 | 2008-07-01 | Rijksuniversiteit Leiden | Method of modulating metabolite biosynthesis in recombinant cells |
US6232526B1 (en) | 1999-05-14 | 2001-05-15 | Dekalb Genetics Corp. | Maize A3 promoter and methods for use thereof |
US6194636B1 (en) | 1999-05-14 | 2001-02-27 | Dekalb Genetics Corp. | Maize RS324 promoter and methods for use thereof |
US6207879B1 (en) | 1999-05-14 | 2001-03-27 | Dekalb Genetics Corporation | Maize RS81 promoter and methods for use thereof |
US6429357B1 (en) | 1999-05-14 | 2002-08-06 | Dekalb Genetics Corp. | Rice actin 2 promoter and intron and methods for use thereof |
US6677503B1 (en) | 1999-06-23 | 2004-01-13 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Sunflower anti-pathogene proteins and genes and their uses |
US7329728B1 (en) * | 1999-10-25 | 2008-02-12 | The Scripps Research Institute | Ligand activated transcriptional regulator proteins |
WO2001053502A2 (en) | 2000-01-21 | 2001-07-26 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Root-preferred promoter elements and methods of use |
US6388170B1 (en) | 2000-04-07 | 2002-05-14 | University Of Kentucky Research Foundation | Bidirectional promoters and methods related thereto |
US7273923B2 (en) * | 2001-01-22 | 2007-09-25 | Sangamo Biosciences, Inc. | Zinc finger proteins for DNA binding and gene regulation in plants |
KR100537955B1 (ko) | 2003-10-29 | 2005-12-20 | 학교법인고려중앙학원 | 꽃가루 특이적 유전자 발현 프로모터 |
WO2006033859A2 (en) * | 2004-09-16 | 2006-03-30 | Sangamo Biosciences, Inc. | Compositions and methods for protein production |
US20080104726A1 (en) * | 2006-10-05 | 2008-05-01 | Ceres, Inc. | Fruit regulatory regions |
BRPI0720048A8 (pt) | 2006-12-14 | 2023-02-07 | Dow Agrosciences Llc | Proteínas de dedo de zinco não-canônicas otimizadas |
CN101932701A (zh) | 2008-02-01 | 2010-12-29 | 阿森尼克斯公司 | Grg31和grg36 epsp合酶的定向进化 |
CA2722797A1 (en) * | 2008-04-28 | 2009-11-05 | Precision Biosciences, Inc. | Fusion molecules of rationally-designed dna-binding proteins and effector domains |
NZ599351A (en) | 2009-10-22 | 2014-02-28 | Dow Agrosciences Llc | Engineered zinc finger proteins targeting plant genes involved in fatty acid biosynthesis |
CA2863664C (en) * | 2012-02-02 | 2022-07-05 | Dow Agrosciences Llc | Plant transactivation interaction motifs and uses thereof |
-
2013
- 2013-02-01 CA CA2863664A patent/CA2863664C/en active Active
- 2013-02-01 CN CN201710979375.0A patent/CN107556389B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2013-02-01 BR BR102013002576-3A patent/BR102013002576B1/pt active IP Right Grant
- 2013-02-01 WO PCT/US2013/024452 patent/WO2013116731A1/en active Application Filing
- 2013-02-01 KR KR1020197024148A patent/KR102076728B1/ko active IP Right Grant
- 2013-02-01 EP EP13744193.7A patent/EP2809146B1/en active Active
- 2013-02-01 RU RU2014135518A patent/RU2662672C2/ru active
- 2013-02-01 KR KR1020147024639A patent/KR102076716B1/ko active IP Right Grant
- 2013-02-01 CA CA3151103A patent/CA3151103C/en active Active
- 2013-02-01 AU AU2013214814A patent/AU2013214814B2/en active Active
- 2013-02-01 UY UY0001034609A patent/UY34609A/es not_active Application Discontinuation
- 2013-02-01 TW TW102103992A patent/TWI664193B/zh not_active IP Right Cessation
- 2013-02-01 UA UAA201409616A patent/UA117452C2/uk unknown
- 2013-02-01 CN CN201380017031.1A patent/CN104202966B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2013-02-01 KR KR1020197024144A patent/KR102076719B1/ko active IP Right Grant
- 2013-02-01 US US13/757,674 patent/US10351610B2/en active Active
- 2013-02-01 AR ARP130100318A patent/AR089877A1/es unknown
- 2013-02-01 KR KR1020197024145A patent/KR102076725B1/ko active IP Right Grant
- 2013-02-01 JP JP2014555784A patent/JP6208692B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2013-02-01 KR KR1020197024147A patent/KR102076726B1/ko active IP Right Grant
- 2013-02-01 TW TW106132642A patent/TWI666222B/zh not_active IP Right Cessation
- 2013-02-02 SA SA113340251A patent/SA113340251B1/ar unknown
-
2014
- 2014-07-24 IL IL233806A patent/IL233806B/en active IP Right Grant
- 2014-08-25 ZA ZA2014/06234A patent/ZA201406234B/en unknown
-
2015
- 2015-06-05 HK HK15105369.5A patent/HK1204751A1/xx unknown
-
2017
- 2017-04-27 JP JP2017088179A patent/JP6483184B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2017-04-27 JP JP2017088180A patent/JP6483185B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2017-04-27 JP JP2017088176A patent/JP6473477B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2017-04-27 JP JP2017088181A patent/JP2017176185A/ja active Pending
- 2017-04-27 JP JP2017088177A patent/JP6470787B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2017-04-27 JP JP2017088178A patent/JP6615149B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2019
- 2019-05-02 US US16/401,246 patent/US10836804B2/en active Active
-
2020
- 2020-10-19 US US17/073,831 patent/US11603535B2/en active Active
-
2023
- 2023-01-20 US US18/157,187 patent/US20230272410A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2020110150A (ja) | Fad2性能座および標的化切断を誘導することができる対応する標的部位特異的結合タンパク質 | |
JP6505599B2 (ja) | 遺伝子標的化および形質スタッキングのための特別設計の導入遺伝子組み込みプラットフォーム(etip) | |
JP2018171074A (ja) | Fad3性能座および標的化切断を誘導可能である対応する標的部位特異的結合タンパク質 | |
CN111263810A (zh) | 使用多核苷酸指导的核酸内切酶的细胞器基因组修饰 | |
SA113340251B1 (ar) | حوافز لتفاعل تنشيط التعبير الجينى للنبات واستخدامها | |
CN102843904A (zh) | 在经遗传修饰的生物体中切除转基因 | |
CN101490267A (zh) | 人工植物微染色体 | |
US20170247711A1 (en) | Zea mays regulatory elements and uses thereof | |
AU2015375393B2 (en) | Brassica napus seed specific promoters identified by microarray analysis | |
US10428337B2 (en) | Brassica napus ACC OX promoter identified by microarray analysis | |
US20150101083A1 (en) | Zea mays metallothionein-like regulatory elements and uses thereof | |
CA3073050A1 (en) | Compositions and methods for expressing transgenes using regulatory elements from chlorophyll binding ab genes | |
AU2015375394B2 (en) | Brassica napus seed specific promoters identified by microarray analysis | |
CA2939112C (en) | Root specific expression conferred by chimeric gene regulatory elements | |
AU2014373771B2 (en) | Novel maize ubiquitin promoters | |
US20170137834A1 (en) | Zea mays regulatory elements and uses thereof | |
Palucki | The role of homologous recombination in the production of debilitating mitochondrial DNA rearrangements in plants |