JP6208692B2 - 植物トランス活性化相互作用モチーフおよびその使用 - Google Patents
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Description
添付の配列表に収載されている核酸配列は、37C.F.R.§1.822に定義される通りに、ヌクレオチド塩基を表す標準文字省略形を使用して示されている。それぞれの核酸配列の1つの鎖のみが示されているが、その相補鎖は表示されている鎖への任意の参照により含まれると理解されている。添付の配列表では:
新規の植物トランス活性化ドメイン(TAD)、TAD相互作用モチーフならびに転写活性化因子として有用である可能性があり、対象の遺伝子の転写活性化のために合成転写活性化因子融合タンパク質においてDNA結合ポリペプチドと融合しうる前述の合成バリアントが本明細書で開示される。本明細書で開示される特定の新規の植物TADおよびTAD相互作用モチーフは、植物タンパク質であるERF2、PTI4、AtERF1、ORCA2、DREB1A、CBF1およびDOF1から単離された。本明細書に記載される新規の植物TADおよび/またはTAD相互作用モチーフを含む合成転写活性化因子融合タンパク質は、遺伝子発現を増加させる(例えば、開始させる)ために特定の実施形態において、種々の細胞(例えば、酵母細胞および植物細胞)において事実上どんな遺伝子のためにも利用することができる。
chs カルコンシンターゼ遺伝子
HAS 高親和性部位
HP 加水分解プローブ
HSV 単純ヘルペスウイルス(Herpes Simplex Virus)
MS ムラシゲおよびスクーグ
PNPG p−ニトロフェニル−アルファ−D−グルコピラノシド
PTU 植物転写ユニット
SSC 生理食塩水−クエン酸ナトリウム
TAD トランス活性化ドメイン
TBP TATA−結合タンパク質
T−DNA トランスファーDNA
TFIIB 転写因子IIB
TFIIH 転写因子IIH
Ti 腫瘍誘導(A.ツメファシエンス(A. tumefaciens)由来プラスミド)
UAS 上流活性化配列
VP16 単純ヘルペス(Herpes Simplex)ビリオンタンパク質16
本開示の様々な実施形態の概説を容易にするために、特定の用語について以下に説明する。
本開示は、新規の植物TADおよびそれ由来のタンパク質−タンパク質相互作用モチーフ、ならびにそれをコードする核酸を提供する。植物タンパク質であるERF2(シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana))、PTI4(ジャガイモ(Solanum tuberosum))、AtERF1(シロイヌナズナ(A. thaliana))、ORCA2(ニチニチソウ(Catharanthus roseus))、DREB1A(シロイヌナズナ(A. thaliana))、CBF1(シロイヌナズナ(A. thaliana))、およびDOF1(トウモロコシ(Zea mays))から同定され単離されたTADを使用して、いくつかの実施形態において異種TAD内に「交換(swap)」されうる植物TAD相互作用モチーフを同定した、またはこれらのTADを使用してバリアントTAD相互作用モチーフを産生させた。新たに同定された植物TAD、その中の相互作用モチーフ、およびそのバリアントTADを特定の実施形態において使用すれば(例えば、合成転写活性化因子タンパク質に包含することにより)、対象の遺伝子に新しく望ましい発現調節制御を与えることができる。
本開示は、植物TAD相互作用モチーフおよび/またはバリアントTAD相互作用モチーフを含む合成転写活性化因子融合タンパク質も提供する。いくつかの実施形態では、合成転写活性化因子融合タンパク質は少なくとも1つのDNA結合ドメインをさらに含む。そのような合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする核酸(例えば、DNA)も提供される。
いくつかの実施形態では、本開示は、植物TAD相互作用モチーフ、バリアントTAD相互作用モチーフ、植物TAD、またはバリアントTADをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチド配列を含む核酸分子を提供する。そのような核酸分子は、DNA結合ドメインをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチド配列をさらに含みうる。例えば、いくつかの実施形態における核酸は、2つのポリヌクレオチド配列が単一の融合タンパク質の一部として転写されるように、DNA結合ドメインをコードする第二のポリヌクレオチド配列にインフレームで融合されている、植物TAD相互作用モチーフ、バリアントTAD相互作用モチーフ、植物TAD、またはバリアントTADをコードする第一のポリヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、植物TAD相互作用モチーフ(または、バリアントTAD相互作用モチーフ、植物TAD、もしくはバリアントTAD)をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチド配列、およびDNA結合ドメインをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチド配列を含む少なくとも1つの融合タンパク質コード核酸分子(複数可)は、そこでの融合タンパク質の発現のために細胞、組織、または生物内に導入しうる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの植物TAD相互作用モチーフ(および/またはバリアントTAD相互作用モチーフ)および少なくとも1つのDNA結合ドメインを含む合成転写活性化因子融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む植物細胞を含む植物が提供される。特定の実施形態では、そのような植物は、植物組織または植物細胞の形質転換、および植物体全体の再生により生産することができる。追加の実施形態では、そのような植物は、合成転写活性化因子融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を生殖質内に移入することを通じて得られる。そのような植物細胞を含む植物材料も提供される。そのような植物材料はこの植物細胞を含む植物から得られる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの植物TAD相互作用モチーフ(および/またはバリアントTAD相互作用モチーフ)および少なくとも1つのDNA結合ドメインを含む合成転写活性化因子融合タンパク質を使用して、細胞において対象のヌクレオチド配列(例えば、対象の遺伝子)の発現を増加させる(例えば、開始する)ことができる。対象のヌクレオチド配列は、細胞のゲノムにとっていくつかの実施形態では内在性でありうる。他の実施形態では、対象のヌクレオチド配列を含む少なくとも1つの外来性核酸分子(複数可)が細胞内に導入されている。一般的には、対象のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている第二のヌクレオチド配列は、第二のヌクレオチド配列と融合タンパク質の間の安定で特異的な結合が起こるように、融合タンパク質のDNA結合ドメインにより認識されることになる。いくつかの例では、対象のヌクレオチド配列を含む少なくとも1つの核酸分子(複数可)はそのような第二のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの例では、対象のヌクレオチド配列を含む少なくとも1つの核酸分子(複数可)は、対象のヌクレオチド配列が宿主細胞にとって内在性である第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されるように、宿主細胞に導入される。例えば、対象のヌクレオチド配列を含む核酸分子は、対象のヌクレオチド配列がDNA結合ドメインにより認識される内在性配列に作動可能に連結されるように、対象のヌクレオチド配列を宿主細胞のゲノム内に挿入する相同組換えを促進しうる。いくつかの例では、対象のヌクレオチド配列を含む少なくとも1つの核酸分子(複数可)は、対象のヌクレオチド配列が宿主細胞にとって内在性である第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されるように、宿主細胞内では内在性であるまたは天然である。
(実施例)
7つのタンパク質、PTI4(GenBank受託番号ACF57857.1)、ERF2(GenBank受託番号NP_199533.1)、AtERF1(GenBank受託番号NP_567530.4)、ORCA2(GenBank受託番号CAB93940.1)、DREB1A(GenBank受託番号NP_567720.1)、CBF1(GenBank受託番号NP_567721.1)、およびDOF1(GenBank受託番号NP_001105709.1)がVP16トランス活性化ドメイン(配列番号1)に相同であると同定された。VP16トランス活性化ドメイン(配列番号1)のアミノ酸配列は、これらの推定植物転写活性化因子の領域と配列類似性を共有しており、VP16配列を使用してそれぞれの活性化因子内でトランス活性化ドメインを位置付けた。これらの植物活性化因子タンパク質の同定されたトランス活性化ドメインは、配列番号2(PTI4)、配列番号3(ERF2)、配列番号4(AtERF1)、配列番号5(ORCA2)、配列番号6(DREB1A)、配列番号7(CBF1)、および配列番号8(DOF1)である。次に、VP16トランス活性化サブドメインIIの相互作用モチーフ(図1、配列番号9)を使用して、植物トランス活性化ドメインから相互作用モチーフを位置付けた。図2は、VP16と植物トランス活性化ドメインのアライメントを示しており、新規の相互作用モチーフは反転されている。
同定された植物トランス活性化ドメインの相互作用モチーフが改変された。VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフのアミノ酸接触残基を含有する相互作用モチーフの新しいバリアントが産生された(Langlois et al. (2008) J. Am. Chem. Soc. 130:10596)。VP16トランス活性化ドメインの6つのアミノ酸接触残基は、転写因子TFIIHのサブユニットであるTfb1と直接相互作用すると提唱されている(図1)。アミノ酸は新たに同定された植物トランス活性化ドメインの相互作用モチーフ内に導入されて、バリアント配列を生成した。
VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIに対してアライメントされたERF2中のAsn53からAla85までの領域(図2)は、ERF2の植物トランス活性化ドメイン配列として同定された。VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフに一致することが分かった領域、すなわち、Asp66からAsp76に改変が導入された。VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフの6接触残基とは異なるアミノ酸残基が改変された。これらの変更によりVP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフに類似するERF2の例示的な改変相互作用モチーフ(すなわち、バリアント相互作用モチーフ配列)が生じた(図3)。
ERF2に導入された相互作用モチーフに類似するPTI4、AtERF1、ORCA2、DREB1A、CBF1、およびDOF1相互作用モチーフに改変が導入された。VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフの6直接接触残基とは異なる天然の配列のアミノ酸残基が改変され、それにより例示的なバリアント相互作用モチーフが生成した。これらの変化が導入され、植物バリアント相互作用モチーフはVP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフに類似する(例えば、機能的に類似する)ものになった。VP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの天然の相互作用モチーフ配列と比べた場合、これらのバリアントまたは改変相互作用モチーフの例示的な配列は図4〜9に収載されている。
出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)レポーター株
出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)レポーター株を産生して、天然またはバリアント相互作用モチーフのどちらかを含む植物活性化ドメインを試験した。3段階クローニング法により、酵母組込みベクターであるpHO−zBG−MEL1を構築した(図10)。
インフレームCCR5ジンクフィンガー結合タンパク質(CCR5−ZFP)−植物トランス活性化相互作用モチーフを含有するDNA構築物が構築された。配列番号80〜93に記載されている天然およびバリアント植物トランス活性化相互作用モチーフはBamHI/HindIII制限酵素断片として動員され、CCR5−ZFPドメインをコードする配列の下流に直接クローニングされた(Perez et al. (2008)、上記)。得られたZFP転写活性化因子発現カセットは、GAL1,10プロモーター(West et al. (1987) Genes Dev. 1:1118-31)およびCYC1ターミネーター(Osborne et al. (1988) Genes Dev. 2:766-72)を利用し、酵母pRS315シリーズベクターを基盤としていた。得られたベクターは、CCR5−ZFPとのインフレーム融合物として天然およびバリアント植物トランス活性化相互作用モチーフを含有していた。
BY4741レポーターライン株の一晩培養物はYPD+Geneticin(登録商標)において増殖され、ZFP転写活性化因子発現カセットを含有する1μgのベクターは、96ウェルフォーマットにおいて標準酵母形質転換プロトコールを使用して送達された。形質転換はすべて重複して行われた。形質転換された酵母細胞はロイシンを欠く合成デキストロース培地(SD−Leu)に回収されて、ZFP転写活性化因子発現カセットを含有するベクターを選択した。72時間後、酵母細胞はSD−Leu中形質転換体の1対10希釈により濃縮され、さらに24時間増殖させた。次に、酵母細胞はロイシンを欠く合成ラフィノース培地(SR−Leu)に1対10で希釈され、GAL1,10プロモーターを抑制解除した。24時間後、酵母細胞はペレット化され、ロイシンを欠く合成ガラクトース培地(SG−Leu)に再懸濁された。ガラクトース誘導の0、3、および6時間後の時点で、110μLの酵母細胞がMEL1アッセイのために収穫された。
レポーター構築物pDAB9897
Z6 DNA結合ドメインポリヌクレオチド配列の8直列型反復(配列番号67;Yokoi et al. (2007) Mol Ther. 15(11):1917-23)は、クローニングを容易にするために、SacII部位を5’および3’末端に付加させて新規に合成された(IDT、Coralsville、IA)。全8X−Z6結合ドメイン(配列番号68)は続いて、所望の植物発現エレメントを含有する既存のGateway(登録商標)エントリーベクターにクローニングされた。8X−Z6結合部位はSacII断片上に動員され、バックボーンベクターに見出される独自のSacII部位を使用して、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)アクチン−2プロモーター(AtAct2プロモーターv2; An et al. (1996) Plant J. 10:107-21)の直ぐ上流にクローニングされた。それに続いて、gus遺伝子(GUS; Jefferson (1989) Nature 342:837-8)は、独自のNcoI/SacI部位を使用してシロイヌナズナ(A.thaliana)アクチン−2プロモーターの直接制御下でこのベクターにクローニングされ、NcoI部位のATGコドンが開始コドンを形成した。Atu ORF23 3’UTR(アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)オープンリーディングフレーム−23、3’非翻訳領域;欧州特許出願第222493 A1号)を使用して転写を終止させた。
トランスジェニックレポーター植物イベントを起こすため、プチハバナ(Petit Havana)タバコ植物から切り取った葉片(1cm2)を、プラスミドであるpDAB9897を宿すアグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)株であるLBA4404の一晩培養物中でインキュベートし、OD600約1.2nmまで増殖させ、無菌フィルターペーパー上で吸い取り乾燥させ、次に60×20mm皿(1皿あたり5片)中のMS培地(Phytotechnology Labs、Shawnee Mission、KS)および30g/Lスクロース上に置いて、1mg/Lのインドール酢酸および1mg/Lのベンジアミノプリン(benzyamino purine)を添加してNescofilm(登録商標)(Karlan Research Products Corporation、Cottonwood、AZ)で密封した。48時間の共培養に続いて、葉片は250mg/Lのセフォタキシム(cephotaxime)および5mg/LのBASTA(登録商標)を有する同じ培地に移された。3〜4週間後、小植物は、葉収穫および分子分析に先立ってさらに2〜3週間、PhytaTrays(商標)中の250mg/Lのセフォタキシムおよび10mg/LのBASTA(登録商標)を有するMS培地に移された。
PCR DNA単離。トランスジェニックタバコ植物組織は新たに生育させた小植物から収穫され、96ウェル収集プレート(Qiagen、Valencia、CA)において少なくとも2日間凍結乾燥させた(Labconco、Kansas City、MO)。次に、DNAは製造業者の説明書に従って、DNEasy(商標)96ウェル抽出キット(Qiagen)を使用して単離された。組織破壊にはModel 2−96A Kleco(商標)組織粉砕機(Garcia Manufacturing、Visalia、CA)が使用された。
合計で51のBASTA(登録商標)抵抗性植物が生成され、このうち24は、コピー数の加水分解プローブ分析に基づいて低コンプレキシティ(1〜2コピーのpat)であることが分かった。これらの低コンプレキシティイベントのうち、PCR分析により決定される場合、18が無傷のPTUを示した。サザンブロット分析に続いて、2つの単一コピー、無傷のPTUイベントが選択され、成熟するまで温室で生育され、そこで自家受粉させておいた。次にT1種子を収集し、表面殺菌し(20%漂白剤で3分間、続いて2回の無菌蒸留水すすぎ)、PhytaTrays(商標)(Sigma、St.Louis、MO)においてMS培地(Phytotechnology Labs、Shawnee Mission、KS)および30g/Lスクロース上で発芽させた。patコピー数分析による接合状態スクリーニングに続いて、ホモ接合型T1植物が選択され、成熟するまで温室で生育され、そこで自家受粉させておいた。次に、T2種子を収集し、表面殺菌し、前述と同じように発芽され、植物トランス活性化試験のためにレポーター植物を生成するのに使用された。
バリアントまたは天然植物トランス活性化相互作用モチーフを含有する植物ZFP−転写活性化因子構築物が構築された。クローニングのための制限酵素部位BamHI/SacIが隣接する植物トランス活性化相互作用モチーフ(天然と改変バリアントの両方)が新規に合成された(DNA2.0、Menlo Park、CA)。植物トランス活性化相互作用モチーフはBamHI/SacI断片上に動員され、既存のGateway(登録商標)Entryバックボーンベクターに見出される独自のBamHI/SacI部位を使用してZ6ジンクフィンガーDNA結合ドメインの直ぐ下流にクローニングされた(Yokoi et al. (2007)、上記)。この段階が完了すると、ZFP転写活性化因子構築物(植物トランス活性化相互作用モチーフに融合されたZ6 DNAジンクフィンガータンパク質結合ドメインを含有する)は、構成的キャッサバ葉脈モザイクウイルス(Cassava Vein Mosaic Virus)プロモーター(CsVMVプロモーターv2; Verdaguer et al. (1996) Plant Mol. Biol. 31:1129-39)の制御下に置かれ、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)由来のORF23 3’UTRを終端とした。最終形質転換ベクター(表2)は、植物選択のために、シロイヌナズナ(A. thaliana)ユビキチン−3プロモーター(At Ubi3プロモーターv2; Callis et al. (1995) Genetics, 139(2):921-39))/ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼII(HPTII v1; Gritz et al. (1983) Gene 25(2-3):179-88)/アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)オープンリーディングフレーム−24、3’非翻訳領域(Atu ORF24 3‘UTR v2)カセットを含有するデスティネーションベクターとのGateway(登録商標)媒介ライゲーション(Invitrogen、Carlsbad、CA)から生じた。
mRNA単離。トランスジェニックタバコ植物組織は新たに生育している小植物から収穫され、96ウェル収集プレート(Qiagen)においてドライアイス上で急速冷凍された。次に、RNAは、製造業者の使用説明書に従って、RNEasy(登録商標)96ウェル抽出キット(Qiagen)を使用して単離された。組織破壊にはModel 2−96A Kleco(商標)組織粉砕機(Garcia Manufacturing)が使用された。
図29は、BYEEF内在性遺伝子発現レベルにより正規化された場合の、様々な植物トランス活性化相互作用モチーフについてのgus転写物レベルの得られた比を示している。様々な植物トランス活性化相互作用モチーフのgus遺伝子の活性化は空ベクター対照およびVP16トランス活性化ドメインのサブドメインIIの相互作用モチーフと比較された。いくつかの植物トランス活性化相互作用モチーフは、VP16トランス活性化因子のサブドメインIIと比べた場合、予想外に高レベルの発現を示した。例えば、PTI4、DREB1A、ERF2、およびCBF1植物トランス活性化相互作用モチーフは、VP16転写活性化ドメインのサブドメインIIよりも多くのgus mRNAを発現した。
GAL4結合ドメインを含むレポーター構築物を含有するタバコ系統
レポーター構築物であるpGalGUSは、下に記載される戦略を使用して構築される。酵母GAL4結合配列および23bpスペーサー領域の6つの直列型繰り返し(Baleja et al. (1997) J. Biomol. NMR 10:397-401に記載されている)は、クローニングを容易にするためにSacII部位を加えて新規に合成される(IDT)。6×Gal4結合部位はSacII断片上に移動され、これを使用して、SacIIでも消化される既存のエントリーベクター由来のZ6結合部位を置き換える。このクローニング段階は、GAL4結合部位を、gus遺伝子の発現を推進するシロイヌナズナ(Arabidopsis)アクチン2プロモーターの直ぐ上流に置く。最終形質転換ベクターであるpGalGUS(図30)は、植物選択に使用されるシロイヌナズナ(Arabidopsis)ユビキチン10プロモーター−pat遺伝子発現カセットを含有するデスティネーションベクターでのGateway(登録商標)形質転換反応から生じる。最終形質転換ベクターは、塩基配列決定により確認され、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)株であるLBA4404(Invitrogen)中に形質転換される。
トランスジェニックレポーター植物は、上記のプロトコールを使用して作成される。「pDAB9897を用いたタバコのアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介形質転換」を参照されたい。
低コンプレキシティコピー数、BASTA(登録商標)抵抗性トランスジェニック植物が生成され、TaqMan(登録商標)コピー数分析に基づいて同定される。低コンプレキシティイベントのうち、PCR分析により決定される場合、サブセットが無傷のPTUを示す。これらのイベントはサザンブロット分析によりさらに分析される。サザンブロット分析に続いて、少なくとも1つの単一コピー、無傷のPTUイベントが選択され、温室で成熟するまで生育され、自家受粉させておく。T1種子が収集され、表面殺菌され、発芽させる。patコピー数分析による接合状態スクリーニングに続いて、ホモ接合型T1植物が選択され、温室で成熟するまで生育され、自家受粉させておく。次に、T2種子が収集され、表面殺菌され、発芽させ(既に記載されている通りに)、これを使用して活性化因子試験のためにレポーター植物を生成する。
バリアントまたは天然の植物トランス活性化相互作用モチーフを含有する植物GAL4−転写活性化因子構築物が構築される。実施例4(「植物ZFP−植物転写活性化因子発現構築物」)に記載される植物ZFP−転写活性化因子発現構築物は、ジンクフィンガー結合タンパク質ポリヌクレオチド配列の代わりにGAL4結合タンパク質ポリヌクレオチド配列を挿入することにより改変される。ヘミコット(hemicot)植物最適化GAL4 DNA結合ドメインポリヌクレオチド配列(Keegan et al. (1986) Science 231(4739):699-704)が、NcoI/BamHI断片としてジンクフィンガー結合タンパク質ポリヌクレオチド配列の代わりに挿入される。この段階が完了すると、GAL4−転写活性化因子構築物は構成的キャッサバ葉脈モザイクウイルス(Cassava Vein Mosaic Virus)プロモーターの制御下に置かれ、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)由来のORF23 3’UTRを終端とする。最終バイナリー形質転換ベクターは、植物選択のために、シロイヌナズナ(Arabidopsis)ユビキチン3−HptIIカセットを含有するデスティネーションベクターでのGateway(登録商標)形質転換から生じて、完成される。最終形質転換ベクターは塩基配列決定により確認され、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)株であるLBA4404(Invitrogen)中に形質転換される。
ハイグロマイシン上で選択されるイベントは、2つのDNA加水分解プローブアッセイを使用してgus遺伝子転写物レベルについて分析される。個々のイベントごとの定常状態レベルのgus mRNAは、配列特異的プライマーとプローブを使用して評価される。イベントごとのmRNAは、内在性タバコ基準遺伝子、例えば、BYEEFの定常状態レベルのmRNAを使用して正規化される。両遺伝子のアッセイは実施例4に記載されるプロトコールを使用して設計される。リアルタイムPCRデータの解析は、相対定量モジュールを使用するLightCycler(登録商標)ソフトウェアを使用して実施され、ΔΔCt法に基づいている。様々な活性化因子構築物の相対的発現レベルが比較される。その結果によれば、植物トランス活性化相互作用モチーフおよびこれらの植物トランス活性化相互作用モチーフの操作されたバリアントは転写活性化因子として使用することができ、遺伝子の転写活性化のためにGAL4結合タンパク質と融合することができることが示されている。
TAL結合ドメインを含むレポーター構築物を含有するタバコ系統
レポーター構築物であるpTalGUSは下記の戦略を使用して構築される。AVRBS3−誘導性遺伝子のコンセンサス結合配列から採取され、UPA DNA結合ドメインと名付けられた8つの直列型繰り返し配列(TATATAAACCTNNCCCTCT(配列番号99))(Kay et al. (2009) Plant J. 59(6):859-71)は、クローニングを容易にするためにSacII部位が付加されて新規に合成される(IDT)。8×UPA結合部位はSacII断片上に動員され、これを使用して、同様にSacIIで消化される既存のエントリーベクター由来のZ6結合部位を置き換える。このクローニング段階は、UPA結合部位を、gus遺伝子の発現を推進するシロイヌナズナ(Arabidopsis)アクチン2プロモーターの直ぐ上流に置く。最終形質転換ベクターであるpTalGUS(図31)は、植物選択に使用されるシロイヌナズナ(A. thaliana)ユビキチン10プロモーター/pat遺伝子発現カセットを含有するデスティネーションベクターでのGateway(登録商標)形質転換反応から生じる。最終形質転換ベクターは、塩基配列決定により確認され、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A. tumefaciens)株であるLBA4404(Invitrogen)中に形質転換される。
トランスジェニックレポーター植物は、上記のプロトコールを使用して作成される。「pDAB9897を用いたタバコのアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介形質転換」を参照されたい。
低コンプレキシティコピー数、BASTA(登録商標)抵抗性トランスジェニック植物が生成され、TaqMan(登録商標)コピー数分析を利用して同定される。低コンプレキシティイベントのうち、PCR分析により決定される場合、サブセットが無傷のPTUを示す。これらのイベントはサザンブロット分析によりさらに分析される。サザンブロット分析に続いて、少なくとも1つの単一コピー、無傷のPTUイベントが選択され、温室で成熟するまで生育され、自家受粉させておく。T1種子が収集され、表面殺菌され、発芽する。patコピー数分析による接合状態スクリーニングに続いて、ホモ接合型T1植物が選択され、温室で成熟するまで生育され、自家受粉させておく。次に、T2種子が収集され、表面殺菌され、発芽させ(既に記載されている通りに)、これを使用して活性化因子試験のためにレポーター植物を生成する。
バリアントまたは天然の植物トランス活性化相互作用モチーフを含有する植物TAL−転写活性化因子構築物が構築される。実施例4に記載される植物ZFP−転写活性化因子発現構築物は、ジンクフィンガー結合タンパク質ポリヌクレオチド配列の代わりにTAL結合タンパク質ポリヌクレオチド配列を挿入することにより改変される。DNA結合に必要な17.5 TAL繰り返しは新規に合成され、トウモロコシ(Zea mays)Opaque−2核局在化配列(nuclear localization sequence)(Van Eenennaam et al. (2004) Metabolic Engineering 6:101-8)に融合される。それぞれのドメインの配列は、UPA−ボックスコンセンサス配列について予測されるように、可変残基(12および13位)で異なるアミノ酸を利用してDNA結合を指令する(Boch et al. (2009) Science 326(5959):1509-12)。ヘミコット植物最適化TAL DNA結合ドメインポリヌクレオチド配列が、NcoI/BamHI断片としてジンクフィンガー結合タンパク質ポリヌクレオチド配列の代わりに挿入される。この段階が完了すると、TAL−転写活性化因子構築物は構成的キャッサバ葉脈モザイクウイルス(Cassava Vein Mosaic Virus)プロモーターの制御下に置かれ、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)由来のORF23 3’UTRを終端とする。最終形質転換ベクターは、植物選択のために、シロイヌナズナ(Arabidopsis)ユビキチン3−HptIIカセットを含有するデスティネーションベクターでのGateway(登録商標)形質転換から完成される。最終形質転換ベクターは塩基配列決定により確認され、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefaciens)株であるLBA4404(Invitrogen)中に形質転換される。
本発明は、以下の態様を含む。
[1]
DNA結合ポリペプチド、および 配列番号10〜58からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む合成転写活性化因子融合タンパク質。
[2]
DNA結合ポリペプチドが、ジンクフィンガーDNA結合ドメイン、AVRBS3誘導性遺伝子由来のコンセンサス結合配列またはそれから操作された合成結合配列、GAL4、TAL、LexA、Tetリプレッサー、LacR、およびステロイドホルモン受容体からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[3]
少なくとも1つの追加のDNA結合ポリペプチドを含む、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[4]
配列番号2〜8および配列番号100〜120からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[5]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[6]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号17、配列番号23、配列番号29、配列番号35、配列番号41、配列番号47、および配列番号53からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[7]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号18、配列番号24、配列番号30、配列番号36、配列番号42、配列番号48、および配列番号54からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[8]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号19、配列番号25、配列番号31、配列番号37、配列番号43、配列番号49、および配列番号55からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[9]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号20、配列番号26、配列番号32、配列番号38、配列番号44、配列番号50、および配列番号56からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[10]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号21、配列番号27、配列番号33、配列番号39、配列番号45、配列番号51、および配列番号57からなる群から選択される、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[11]
少なくとも1つの追加のトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む、[1]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[12]
対象のヌクレオチド配列が第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結している場合、対象のヌクレオチド配列の発現を増加させる合成転写活性化因子融合タンパク質であって、第二のヌクレオチド配列に特異的に結合するDNA結合ポリペプチド、および配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択されるタンパク質トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む融合タンパク質。
[13]
DNA結合ポリペプチド、および配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも80%の配列同一性を有するトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む合成転写活性化因子融合タンパク質。
[14]
トランス活性化ドメイン相互作用ポリペプチドが、配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも85%の配列同一性を有する、[13]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[15]
トランス活性化ドメイン相互作用ポリペプチドが、配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%の配列同一性を有する、[13]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[16]
トランス活性化ドメイン相互作用ポリペプチドが、配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも95%の配列同一性を有する、[13]に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
[17]
合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする核酸であって、DNA結合ポリペプチドをコードする第一のポリヌクレオチド配列、および配列番号10〜58からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドをコードする第二のポリヌクレオチド配列を含み、第一および第二のポリヌクレオチド配列が前記核酸からインフレームでおよび単一転写物で発現される、核酸。
[18]
DNA結合ポリペプチドをコードする少なくとも1つの追加のポリヌクレオチド配列を含む、[17]に記載の核酸。
[19]
配列番号10〜58からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用ポリペプチドをコードする少なくとも1つの追加のポリヌクレオチド配列を含む、[17]に記載の核酸。
[20]
第一および第二のポリヌクレオチド配列が遺伝子調節エレメントに作動可能に連結されている、[17]に記載の核酸。
[21]
第一および第二のポリヌクレオチド配列が第三のポリヌクレオチド配列により分離されている、[17]に記載の核酸。
[22]
宿主細胞のゲノムに組み込まれている、[17]に記載の核酸。
[23]
宿主細胞が植物細胞である、[22]に記載の核酸。
[24]
DNA結合ポリペプチドが、ジンクフィンガーDNA結合ドメイン、AVRBS3誘導性遺伝子由来のコンセンサス結合配列またはそれから操作された合成結合配列、GAL4、TAL、LexA、Tetリプレッサー、LacR、およびステロイドホルモン受容体からなる群から選択される、[17]に記載の核酸。
[25]
DNA結合ポリペプチドが、配列番号67、配列番号68、および配列番号99からなる群から選択される配列に特異的に結合する、[24]に記載の核酸。
[26]
[17]に記載の核酸を含むベクター。
[27]
選択可能マーカーまたはスクリーニング可能マーカーを含む、[26]に記載のベクター。
[28]
植物発現ベクターである、[26]に記載のベクター。
[29]
合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする核酸であって、DNA結合ポリペプチドをコードする第一のポリヌクレオチド配列、および配列番号2〜8、配列番号10〜16、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、配列番号58、および配列番号100〜120からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも80%の配列同一性を有するトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドをコードする第二のポリヌクレオチド配列を含み、第一および第二のポリヌクレオチド配列が前記核酸からインフレームでおよび単一転写物で発現される、核酸。
[30]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも80%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[31]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[32]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[33]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも95%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[34]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも97%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[35]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列に少なくとも98%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[36]
配列番号80〜93からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、[29]に記載の核酸。
[37]
DNA結合ポリペプチドが、ジンクフィンガーDNA結合ドメイン、AVRBS3誘導性遺伝子由来のコンセンサス結合配列またはそれから操作された合成結合配列、GAL4、TAL、LexA、Tetリプレッサー、LacR、およびステロイドホルモン受容体からなる群から選択される、[29]に記載の核酸。
[38]
合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする核酸であって、配列番号80〜93、配列番号80〜93のうちの1つと実質的に同一であるヌクレオチド配列、配列番号80〜93のうちの少なくとも1つに特異的にハイブリダイズ可能であるポリヌクレオチドの相補体、および配列番号80〜93のうちの少なくとも1つに特異的にハイブリダイズ可能であるポリヌクレオチドの逆相補体からなる群から選択される少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む核酸。
[39]
[17]に記載の核酸を含む細胞。
[40]
植物細胞または酵母細胞である、[39]に記載の細胞。
[41]
[29に記載の核酸を含む細胞。
[42]
植物細胞または酵母細胞である、[41]に記載の細胞。
[43]
[39]に記載の細胞を含む植物組織、植物部分、植物商品生産物、または植物体全体。
[44]
[41]に記載の細胞を含む植物組織、植物部分、植物商品生産物、または植物体全体。
[45]
宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、DNA結合ポリペプチドに特異的に結合する第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列を含む宿主細胞に、[17]に記載の核酸を導入し、それによって宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。
[46]
前記核酸を宿主細胞に導入することが、前記核酸を含むベクターを宿主細胞に導入することを含む、[45]に記載の方法。
[47]
前記核酸が宿主細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、[45]に記載の方法。
[48]
対象のヌクレオチド配列が外来性ヌクレオチド配列である、[45]に記載の方法。
[49]
対象のヌクレオチド配列が内在性ヌクレオチド配列である、[45]に記載の方法。
[50]
前記核酸を宿主細胞に導入することが、前記核酸を含む植物を、宿主細胞を含む植物と交雑させることを含む、[45]に記載の方法。
[51]
宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、DNA結合ポリペプチドに特異的に結合する第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列を、[17]に記載の核酸を含む宿主細胞に導入し、それによって宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。
[52]
対象のヌクレオチド配列を宿主細胞に導入することが、対象のヌクレオチド配列を含むベクターを宿主細胞に導入することを含む、[51]に記載の方法。
[53]
前記核酸が宿主細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、[51]に記載の方法。
[54]
第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列が、宿主細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、[51]に記載の方法。
[55]
対象のヌクレオチド配列を宿主細胞に導入することが、対象のヌクレオチド配列を含む植物を、宿主細胞を含む植物と交雑させることを含む、[51]に記載の方法。
[56]
宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、DNA結合ポリペプチドに特異的に結合する第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列を含む宿主細胞に、[17]に記載の核酸を導入し、それによって宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。
[57]
合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする核酸であって、DNA結合ポリペプチドをコードする第一のポリヌクレオチド配列、および植物遺伝子発現のトランス活性化のための手段をコードする第二のポリヌクレオチド配列を含み、第一および第二のポリヌクレオチド配列が前記核酸からインフレームでおよび単一転写物で発現される、核酸。
[58]
宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、DNA結合ポリペプチドに特異的に結合する第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列を含む宿主細胞に、[57]に記載の核酸を導入し、それによって宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。
[59]
宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、DNA結合ポリペプチドに特異的に結合する第二のヌクレオチド配列に作動可能に連結されている対象のヌクレオチド配列を、[57]に記載の核酸を含む宿主細胞に導入し、それによって宿主細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。
[60]
配列番号121〜127からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
[61]
[60]に記載の核酸に特異的にハイブリダイズ可能である核酸の相補体。
[62]
[60]に記載の核酸に特異的にハイブリダイズ可能である核酸の逆相補体。
[63]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択される、[60]に記載の核酸。
[64]
配列番号121〜127からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含むポリペプチド。
[65]
トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが、配列番号22、配列番号28、配列番号34、配列番号40、配列番号46、配列番号52、および配列番号58からなる群から選択される、[64]に記載のポリペプチド。
Claims (44)
- ポリヌクレオチドに特異的に結合するDNA結合ポリペプチド、および 配列番号17〜22および121からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む合成転写活性化因子融合タンパク質であって、
前記ポリヌクレオチドが作動可能に第二のポリヌクレオチドに連結した際に、対象のポリペプチドをコードする前記第二のポリヌクレオチドの発現を増加させる、合成転写活性化因子融合タンパク質。 - 前記トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号10である、請求項1に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
- DNA結合ポリペプチドが、ジンクフィンガーDNA結合ドメイン、AVRBS3誘導性遺伝子由来のコンセンサス結合配列またはそれから操作された合成結合配列、GAL4、TAL、LexA、Tetリプレッサー、LacR、およびステロイドホルモン受容体からなる群から選択される、請求項1または2に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
- 少なくとも1つの追加のDNA結合ポリペプチドを含む、請求項1または2に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
- 少なくとも1つの追加のトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドを含む、請求項1または2に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
- 配列番号100、配列番号107および配列番号108からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の合成転写活性化因子融合タンパク質。
- 合成転写活性化因子融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子であって、前記ポリヌクレオチドが、
標的ポリヌクレオチドに特異的に結合するDNA結合ポリペプチドをコードする第一のヌクレオチド配列、および
配列番号17〜22および121からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドをコードする第二のヌクレオチド配列を含み、
第一および第二のヌクレオチド配列が前記ポリヌクレオチドからインフレームでおよび単一転写物で発現され、さらに
前記合成転写活性化因子融合タンパク質が、標的ポリヌクレオチドに作動可能に連結している対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を増加させる、核酸分子。 - 前記トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号10である、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記標的ポリヌクレオチドが、配列番号67、配列番号68および配列番号99からなる群から選択される、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87と少なくとも80%同一である、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87と少なくとも90%同一である、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87である、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記DNA結合ポリペプチドが、ジンクフィンガーDNA結合ドメイン、AVRBS3誘導性遺伝子由来のコンセンサス結合配列またはそれから操作された合成結合配列、GAL4、TAL、LexA、Tetリプレッサー、LacR、およびステロイドホルモン受容体からなる群から選択される、請求項7または8に記載の核酸分子。
- 前記ポリヌクレオチドが、DNA結合ポリペプチドをコードする少なくとも1つの追加のヌクレオチド配列を含む、請求項7または8に記載の核酸分子。
- 前記ポリヌクレオチドが、トランス活性化ドメイン相互作用ポリペプチドをコードする少なくとも1つの追加のヌクレオチド配列を含む、請求項7または8に記載の核酸分子。
- 前記合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドが、遺伝子調節エレメントに作動可能に連結されている、請求項7または8に記載の核酸分子。
- 前記合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドにおいて、第一および第二のヌクレオチド配列が第三のヌクレオチド配列により分離されている、請求項7または8に記載の核酸分子。
- ベクターである、請求項7または8に記載の核酸分子。
- 選択可能マーカーまたはスクリーニング可能マーカーを含むベクターである、請求項18に記載の核酸分子。
- 植物発現ベクターである、請求項18に記載の核酸分子。
- 請求項7〜12のいずれか一項に記載の核酸分子を含む細胞。
- 酵母細胞である、請求項21に記載の細胞。
- 前記細胞が植物細胞であり、前記合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドが、前記植物細胞において機能的なプロモーターに作動可能に連結している、請求項21に記載の細胞。
- 前記核酸分子が前記植物細胞のゲノム内に組み込まれる、請求項23に記載の植物細胞。
- 請求項23に記載の植物細胞を含むトランスジェニック植物材料。
- 前記植物材料が、植物組織または植物部分である、請求項25に記載のトランスジェニック植物材料。
- 請求項23に記載の植物細胞を含む、植物商品生産物。
- 合成転写活性化因子融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むトランスジェニック植物であって、前記ポリヌクレオチドが、
標的ポリヌクレオチドに特異的に結合するDNA結合ポリペプチドをコードする第一のヌクレオチド配列、および
配列番号17〜22および121からなる群から選択されるトランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドをコードする第二のヌクレオチド配列を含み、
前記第一および第二のヌクレオチド配列が前記ポリヌクレオチドからインフレームでおよび単一転写物で発現され、さらに
前記合成転写活性化因子融合タンパク質が、標的ポリヌクレオチドに作動可能に連結している対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を増加させる、トランスジェニック植物。 - 前記トランス活性化ドメイン相互作用モチーフポリペプチドが配列番号10である、請求項28に記載のトランスジェニック植物。
- 前記標的ポリヌクレオチドが、配列番号67、配列番号68および配列番号99からなる群から選択される、請求項28に記載のトランスジェニック植物。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87と少なくとも80%同一である、請求項28に記載のトランスジェニック植物。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87と少なくとも90%同一である、請求項28に記載のトランスジェニック植物。
- 前記ポリヌクレオチドが配列番号80または配列番号87である、請求項28に記載のトランスジェニック植物。
- 植物細胞において対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を増加させるための方法であって、
前記標的ポリヌクレオチドに作動可能に連結した対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む宿主植物細胞に、請求項7〜12のいずれか一項に記載の核酸分子を導入し、
それによって前記植物細胞において対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を増加させることを含む方法。 - 前記核酸分子を植物細胞に導入することが、前記分子を用いて植物細胞を形質転換することを含み、前記分子がベクターである、請求項34に記載の方法。
- 前記合成転写活性化因子融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドが植物細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、請求項35に記載の方法。
- 対象のポリペプチドが、前記植物細胞に対して外来性のポリペプチドである、請求項34に記載の方法。
- 対象のポリペプチドが、前記植物細胞に対して内在性のポリペプチドである、請求項34に記載の方法。
- 前記核酸分子を植物細胞に導入することが、前記核酸分子を含む植物を、前記核酸分子を含まない植物と交雑させ、植物細胞を含む子孫植物を生産することを含む、請求項34に記載の方法。
- 植物細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させるための方法であって、
標的ポリヌクレオチドに作動可能に連結している対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子を請求項23に記載の植物細胞に導入し、
それによって植物細胞において対象のヌクレオチド配列の発現を増加させることを含む方法。 - 前記核酸分子を植物細胞に導入することが、前記分子によって前記植物を形質転換することを含み、前記分子がベクターである、請求項40に記載の方法。
- 前記合成転写活性化因子融合タンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドが植物細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、請求項40に記載の方法。
- 対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと作動可能に連結した標的ポリヌクレオチドが、植物細胞のゲノムに安定的に組み込まれる、請求項41に記載の方法。
- 前記核酸分子を植物細胞に導入することが、前記核酸分子を含む植物を前記核酸分子を含まない植物と交雑させて、植物細胞を含む子孫植物を産生することを含む、請求項40に記載の方法。
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