RU2639122C1 - Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой - Google Patents

Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой Download PDF

Info

Publication number
RU2639122C1
RU2639122C1 RU2017106860A RU2017106860A RU2639122C1 RU 2639122 C1 RU2639122 C1 RU 2639122C1 RU 2017106860 A RU2017106860 A RU 2017106860A RU 2017106860 A RU2017106860 A RU 2017106860A RU 2639122 C1 RU2639122 C1 RU 2639122C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
patients
respiratory failure
bronchial asthma
asthma
tslp
Prior art date
Application number
RU2017106860A
Other languages
English (en)
Inventor
Гузель Фанисовна Мухаммадиева
Денис Олегович Каримов
Татьяна Георгиевна Кутлина
Яна Валерьевна Валова
Ахат Бариевич Бакиров
Альфия Узбековна Шагалина
Эльвира Филаретовна Идиятуллина
Original Assignee
Федеральное бюджетное учреждение науки "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное бюджетное учреждение науки "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека" filed Critical Федеральное бюджетное учреждение науки "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека"
Priority to RU2017106860A priority Critical patent/RU2639122C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2639122C1 publication Critical patent/RU2639122C1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858—Allele-specific amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/113—PCR
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
    • C12Q2561/113—Real time assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/12—Pulmonary diseases
    • G01N2800/125—Adult respiratory distress syndrome
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/56—Staging of a disease; Further complications associated with the disease
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области медицины, в частности к пульмонологии и аллергологии, и предназначено для прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой. Проводят генотипирование полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP методом ПЦР. При выявлении генотипа СС прогнозируют риск развития дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой. Изобретение обеспечивает получение критериев прогноза развития дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой. 1 табл., 2 пр.

Description

Изобретение относится к области медицины, а именно к пульмонологии и аллергологии, предназначено для прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой (БА).
БА - хроническое аллергическое воспалительное заболевание дыхательных путей. В развитии аллергической реакции участвует множество компонентов, одним из которых может являться полиморфизм генов, продукты которых задействованы в патогенезе развития атопии. Молекулярно-генетические маркеры могут помочь в дифференциальной диагностике аллергических заболеваний, предсказании развития осложнений этого заболевания.
Течение бронхиальной астмы может осложняться различными патологическими состояниями. Одним из видов осложнений бронхиальной астмы является дыхательная недостаточность, которая развивается вследствие бронхиальной обструкции, нарушения вентиляционно-перфузионных соотношений и истощения дыхательной мускулатуры. Степень тяжести дыхательной недостаточности зависит от особенностей течения патологического процесса. Недавние исследования показывают различия в генах, вовлеченных в начало развития астмы и в генах, вовлеченных в развитие осложнений заболевания [Dijk FN, de Jongste JC, Postma DS, Koppelman GH. Genetics of onset of asthma. Curr Opin Allergy Clin Immunol. 2013. 13(2): 193-202; Talukdar D, Chaudhry N, Sharma R et al. Recent Advances in Asthma Genetics and Antiasthma Therapy. Current Respiratory Medicine Reviews. 2013. 9(4): 261-267]. Поэтому необходимо изучение генетических особенностей различных осложнений БА.
Увеличение доли лиц с осложнениями БА, высокая распространенность и неуклонный рост заболеваемости БА во всем мире свидетельствуют об актуальности изучения сложных механизмов развития этого заболевания с целью разработки эффективных методов прогнозирования с учетом индивидуальных особенностей каждого больного.
Актуальность прогноза осложнения БА связана с необходимостью своевременного назначения адекватной терапии. При тяжелом осложнении БА требуется более интенсивная терапия. Оценка осложнений затруднительна на раннем его этапе, когда должна определяться тактика ведения больного.
К медиаторам, продуцируемым эпителием дыхательных путей, относится тимусный стромальный лимфопоэтин (TSLP). TSLP - это интерлейкин-7 - подобный цитокин, который стимулирует дендритные и тучные клетки для активации Т-хелперов 2 типа. Его экспрессия наблюдается в эпителиальных клетках легких, кожи и кишечника. Ряд исследований показал, что ген TSLP связан с патогенезом астмы [Hunninghake G.М., Soto-Quiros М.Е., Avila L. et al. TSLP polymorphisms are associated with asthma in a sex-specific fashion. Allergy. 2010, 65(12), pp. 1566-1575; Ying S., O’Connor В., Ratoff J. et al. Expression and cellular provenance of thymic stromal lymphopoietin and chemokines in patients with severe asthma and chronic obstructive pulmonary disease. J. Immunol. 2008, 181(4), pp. 2790-2798]. Роль гена TSLP в развитии осложнений БА требует уточнения.
Известен способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных хроническими бронхолегочными заболеваниями с использованием системы интегральных клинических факторов [В.А. Игнатьев. Принципы системного подхода при изучении формирования и эволюции дыхательной и сердечной недостаточности у больных хроническими бронхолегочными заболеваниями // Гериатрические аспекты клинической пульмонологииʺ. Л., 1990. - С. 103-107]. Способ заключается в том, что вычисляют сумму в условных единицах предикторных клинических факторов прогрессирования дыхательной недостаточности, сравнивают ее с условной шкалой и по результатам сравнения определяют прогноз. К недостаткам известного способа следует отнести то, что он основан на анализе только прогностических клинических факторов и их качественных характеристик и не учитывает индивидуальные генетические особенности больного, определяющие генетическую предрасположенность к развитию осложнения заболевания.
Известен способ прогноза тяжести обострения атонической бронхиальной астмы [патент RU 2190217, 2000 г.], где в начале обострения заболевания в лимфоцитах больных определяют показатели активности ферментов глицерол-3-фосфатдегидрогеназы и НАД-зависимой малатдегидрогеназы и при показателях ниже 0,297 мкЕ/10000 клеток для ГЗФДГ и 0,638 мкЕ/10000 клеток для НАДМДГ прогнозируют тяжелую степень обострения заболевания. Авторы патента исследовали биохимические показатели, имеющие значение в прогнозировании обострения и ремиссии БА, не касаясь оценки дыхательной недостаточности.
Известен способ прогнозирования посленаркозной дыхательной недостаточности у хирургических больных, заключающийся в том, что на предоперационном осмотре по клинико-неврологическим симптомам выделяют больных с шейным остеохондрозом и дополнительно назначают рентгенологическое исследование шейного отдела позвоночника для определения группы риска с возможными циркуляторными расстройствами в расстройствами в вертебробазилярном бассейне и последующим развитием посленаркозной дыхательной недостаточности; проводят лечебно-профилактические мероприятия, включающие дополнительную медикаментозную предоперационную подготовку препаратами, улучшающими мозговой кровоток и ограничение подвижности головы при проведении интубации трахеи во время анестезии [патент RU 2187806, 2000 г.]. Данный способ разработан для прогноза посленаркозной дыхательной недостаточности у хирургических больных и не предназначен для прогноза дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой.
Прототипом настоящего изобретения является метод, описанный Moffatt MF и др. [Moffatt MF, Gut IG, Demenais F et al. A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma. N Engl J Med. 2010; 363: 1211-1221], включающий генотипирование методом ПЦР полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP. На основании полученных данных авторы сделали предположение о возможной связи полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP с тяжелой формой БА. Данный метод разработан для прогноза тяжести течения БА, однако отдельно не рассматривает прогноз дыхательной недостаточности у больных БА.
Задачей изобретения стала разработка способа прогнозирования риска развития дыхательной недостаточности у больных БА.
Технический результат при использовании изобретения - получение критериев прогноза развития дыхательной недостаточности у больных БА.
Указанный технический результат достигается тем, что в способе прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой, включающем выделение ДНК из лимфоцитов периферической венозной крови, генотипирование методом ПЦР полиморфного локуса rs1837253 гена тимусного стромального лимфопоэтина (TSLP), согласно изобретению при выявлении генотипа СС прогнозируют высокий риск развития дыхательной недостаточности у больных БА.
Предлагаемый способ осуществляется следующим образом.
ДНК выделяют из лимфоцитов периферической крови. В качестве консерванта используют раствор следующего состава: 0.48% лимонной кислоты, 1.32% цитрата натрия, 1.47% глюкозы. При заборе крови к 1 мл консерванта добавляют 4 мл крови и хорошо перемешивают.
Для получения ДНК необходимой степени чистоты и достаточного молекулярного веса используется метод выделения ДНК из крови фенольно-хлороформной экстракцией, описанный Мэтью [Mathew С.С. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA // Methods in Molecular Biology. / Ed. Walker J.M., N.Y., L.: Human Press.; -1984.- V. 2. - P. 31-34].
1. Кровь в пробирке с консервантом тщательно перемешивается и переливается в центрифужный стакан на 100 мл, туда же добавляли 50 мл охлажденного лизирующего буфера, содержащего 320 мМ сахарозы, 1% раствор тритона Х-100, 5 мМ MgCl2, 10 мМ трисHCl (рН 7,6).
2. Смесь центрифугируется 20 мин при 4000 об/мин.
3. Надосадочную жидкость сливают, к получившемуся осадку приливают 8 мл 25 мМ ЭДТА, рН 8.0, суспендируют.
4. К суспензии добавляют 0,8 мл 10% SDS и протеиназу К (концентрация - 10 мг/мл). Смесь для лизиса оставляют на ночь в термостате при температуре 38°С.
Экстракцию ДНК осуществляют в следующем порядке.
1. Для депротеинизации к лизату добавляют 0,5 мл 5М перхлората натрия и 8 мл фенола, насыщенного 1М трисHCl до рН 7.8.
2. Смесь центрифугируют при 3000 об/мин в течение 10 мин.
3. Отбирают водную фазу, содержащую ДНК, РНК и неденатурированные белки.
4. Отобранную фазу обрабатывают смесью фенол-хлороформа (1:1), а затем - хлороформом.
5. Препараты осаждают двумя объемами 96% этанола.
6. Образовавшийся осадок ДНК растворяют в 1,5 мл деионизированной Н2O; раствор хранят при -20°С.
Анализ полиморфизма проводился методом полимеразной цепной реакции с детекцией накопления аллелей в реальном времени. Для проведения ПЦР использовались аликвоты исследуемых образцов ДНК. Амплификация проводилась с использованием прибора Rotor-GeneQ производства компании Quiagen. Условия амплификации были подобраны опытным путем. Температура отжига праймера рассчитывалась по формуле:
Figure 00000001
где А, Т, G и С - количество адениновых, тимидиновых, гуаниновых и цитозиновых остатков в последовательности праймера соответственно. Необходимое количество праймера рассчитывалось по формуле:
Figure 00000002
где ОЕ - количество оптических единиц праймера, L - длина праймера (п.о.).
Для генотипирования rs1837253 гена TSLP использовались праймеры: TSLP - F (5’-GCAAGAAATCTATTCАССТАС-3’) и TSLP - R (5’-ACACTCCAGATGAGAAATAA-3’). Для детекции накопления аллелей в реальном времени были использованы следующие олигонуклеотидные пробы, меченные флуорофором и гасителем: TSLP - G (R6G - ATTTGCTTCATAGTTTAGACACGTTGT- BHQ-1), TSLP - А (Су5.5 - ATTTGCTTCATAGTTTAGACACATTGT- BHQ-3). Режим амплификации следующий: денатурация (95°С, 7 мин); денатурация (95°С, 15 сек), отжиг (60°С, 20 сек) и элонгация (72°С, 15 сек).
Подбор праймеров и проб и подбор оптимальных условий проведения полимеразной цепной реакции осуществлялся с использованием программного обеспечения Primer-BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer_blast).
Интерпретацию результатов полимеразной цепной реакции в реальном времени проводили с помощью программных средств используемого реал-тайм амплификатора в автоматическом режиме.
При попарном сравнении частот аллелей и генотипов в группах больных использовали критерий χ2(р) для таблиц сопряженности 2×2. Для выявления факторов повышенного риска развития тяжелого течения БА, проводили оценку показателя соотношения шансов (OR - odds ratio), а также границ его 95% доверительного интервала (СI 95%). Степень ассоциаций оценивается в значениях показателя соотношения шансов по формуле:
Figure 00000003
где а и b - число лиц с наличием и отсутствием маркера среди больных; c и d - число лиц с наличием и отсутствием маркера среди здоровых.
При OR=l нет ассоциации, OR>l рассматривается как положительная ассоциация с аллелем или генотипом («фактор повышенного риска») и OR<1 - как отрицательная ассоциация («фактор устойчивости»).
Группу исследования составили 144 больных БА с дыхательной недостаточностью в возрасте от 18 до 50 лет. Пациенты наблюдались в иммунно-аллергологическом отделении клиники ФБУН «Уфимский НИИ медицины труда и экологии человека». В выборке пациентов было 81 мужчин и 63 женщины (М:Ж=1,3:1). Контрольная группа сформирована из 548 неродственных индивидов, не имеющих признаков профессиональных аллергических заболеваний на момент сбора материала, жителей Республики Башкортостан, подобранных по этнической принадлежности и половому составу.
При сравнении выборки больных БА и группы контроля выявлены достоверные различия по частотам генотипов полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP (таблица).
В группе больных БА с дыхательной недостаточностью достоверно чаще встречался генотип СС по сравнению с контрольной группой (65,28% и 53,83% соответственно, χ2=5,61; р=0,018). Рассчитанный коэффициент отношения шансов показал, что вероятность развития дыхательной недостаточности у больных БА повышается приблизительно в 2 раза (OR=1,61, CI: 1,10-2,36) при носительстве генотипа СС. Таким образом, наличие в генотипе варианта СС полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP является маркером для прогнозирования дыхательной недостаточности у больных БА.
Предлагаемый способ иллюстрируется следующими клиническими примерами.
Пример 1.
Больная В., 1977 г.р. Клинический диагноз: Бронхиальная астма, средней степени тяжести, стадия ремиссии. При молекулярно-генетическом тестировании у больной было взято 4 мл венозной крови, из которой выделена ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции. Исследование полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP проводилось с помощью ПЦР в реальном времени. На основании генотипирования полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP и выявления у больной В. генотипа СС дан прогноз о повышенном риске дыхательной недостаточности, что было подтверждено последующим клиническим наблюдением в течение года. У пациентки отмечено выраженное усиление клинических проявлений болезни, диагностирована дыхательная недостаточность.
Пример 2.
Больной М., 1980 г.р., Клинический диагноз: Бронхиальная астма, средней степени тяжести, стадия ремиссии. На основании исследования по предлагаемой методике у больного М. выявлен генотип ТТ, свидетельствующий о низком риске дыхательной недостаточности. При последующем клиническом наблюдении в течение года признаков дыхательной недостаточности не выявлено.
Figure 00000004

Claims (1)

  1. Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой, включающий выделение ДНК из лимфоцитов периферической венозной крови, генотипирование методом ПЦР полиморфного локуса rs1837253 гена тимусного стромального лимфопоэтина (TSLP), отличающийся тем, что при выявлении генотипа СС прогнозируют риск развития дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой.
RU2017106860A 2017-03-01 2017-03-01 Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой RU2639122C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017106860A RU2639122C1 (ru) 2017-03-01 2017-03-01 Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017106860A RU2639122C1 (ru) 2017-03-01 2017-03-01 Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2639122C1 true RU2639122C1 (ru) 2017-12-19

Family

ID=60718869

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017106860A RU2639122C1 (ru) 2017-03-01 2017-03-01 Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2639122C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2803263C1 (ru) * 2023-02-14 2023-09-11 Федеральное бюджетное учреждение науки "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека" Способ прогнозирования риска развития тяжёлой бронхиальной астмы

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2436091C1 (ru) * 2010-06-11 2011-12-10 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Астраханская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию" (ГОУ ВПО АГМА Росздрава) Способ оценки функционального состояния микрососудистого эндотелия у больных бронхиальной астмой

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2436091C1 (ru) * 2010-06-11 2011-12-10 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Астраханская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию" (ГОУ ВПО АГМА Росздрава) Способ оценки функционального состояния микрососудистого эндотелия у больных бронхиальной астмой

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KUROSAWA M. et al. Single Nucleotide Polymorphisms in Thymic Stromal Lymphopoietin Gene are not Associated with Aspirin-Exacerbated Respiratory Disease Susceptibility - A Pilot Study in a Japanese Population. J Allergy Ther. 2015; 6(4): 1-6 [Найдено 24.10.2017] [он-лайн]. Найдено из Интернет: URL: https://www.omicsonline.org/peer-reviewed/single-nucleotide-polymorphisms-in-thymic-stromal-lymphopoietin-gene-arenot-associated-with-aspirinexacerbated-respiratory-disease-54940.html. *
MOFFATT M.F. et al. A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma. N Engl J Med. 2010 Sep 23; 363(13): 1211-1221. *
MOFFATT M.F. et al. A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma. N Engl J Med. 2010 Sep 23; 363(13): 1211-1221. KUROSAWA M. et al. Single Nucleotide Polymorphisms in Thymic Stromal Lymphopoietin Gene are not Associated with Aspirin-Exacerbated Respiratory Disease Susceptibility - A Pilot Study in a Japanese Population. J Allergy Ther. 2015; 6(4): 1-6 [Найдено 24.10.2017] [он-лайн]. Найдено из Интернет: URL: https://www.omicsonline.org/peer-reviewed/single-nucleotide-polymorphisms-in-thymic-stromal-lymphopoietin-gene-arenot-associated-with-aspirinexacerbated-respiratory-disease-54940.html. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2803263C1 (ru) * 2023-02-14 2023-09-11 Федеральное бюджетное учреждение науки "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека" Способ прогнозирования риска развития тяжёлой бронхиальной астмы

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP3350345B1 (en) Biomarkers for heart failure
JP5934726B2 (ja) 疾患マーカーの存在を被験者の血液サンプルで分析する方法
JP2014508525A (ja) ヒトゲノムに対応するポリヌクレオチドの初期セットから患者の宿主応答の重症度をインビトロ決定するためのポリヌクレオチドのサブセットを同定するための方法
JP2018511339A (ja) ニューモシスチス肺炎を診断、予測又はモニタリングするための手段
JP6097388B2 (ja) インフルエンザにおけるリスクの階層化
ES2959778T3 (es) Método para detectar tuberculosis activa
US20220177982A1 (en) Methods Of Identifying Subjects Having An Increased Risk Of Developing A Coronavirus Infection And Treatment Thereof
EP2985351B1 (en) A circulating non-coding rna as predictor of mortality in patients with acute kidney injury
WO2014034685A1 (ja) マイクロrnaによる関節リウマチの診断
JP2017038553A (ja) 喘息の診断用マイクロｒｎａ
RU2639122C1 (ru) Способ прогнозирования дыхательной недостаточности у больных бронхиальной астмой
WO2015140793A1 (en) Markers for diagnosing multiple sclerosis and predicting responsiveness to interferon treatment
JP7392224B2 (ja) びまん性肺胞傷害型薬剤性間質性肺炎のｍｉＲＮＡ診断バイオマーカー
US11685950B2 (en) Method of diagnosing and treating acute rejection in kidney transplant patients
CN115605608A (zh) 帕金森氏病的检测方法
CN114651071A (zh) 用于确定患者发生卫生护理相关感染的风险的方法
RU2678441C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития гипертонической болезни с учетом генетических и средовых факторов
RU2801174C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития сахарного диабета 2 типа у лиц с ожирением и/или предиабетом
JP5676777B2 (ja) 関節リウマチ活動性指標を同定する方法及びそれに用いるバイオマーカー
JP7514458B2 (ja) 関節リウマチ治療薬の奏効を予測する方法及びそれに用いるバイオマーカー
JP2014514915A (ja) 関節リウマチとｓｓｔｒ２遺伝子の多型との間の遺伝的関連
RU2688208C1 (ru) Способ прогнозирования развития сахарного диабета 2 типа у населения башкортостана
RU2779085C1 (ru) Способ выявления предрасположенности к развитию метаболического синдрома в виде ожирения у школьников 7-10 лет
CN110373459B (zh) 基于STIP1基因rs2236647位点用于儿童哮喘病检测的试剂、试剂盒及应用
RU2510508C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития бронхиальной астмы

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190302