RU2021132736A - Способ получения однонуклеотидных молекулярных маркеров для определения вероятного этногеографического происхождения человека методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК - Google Patents

Claims (10)

1. Способ получения молекулярных маркеров для определения вероятного этногеографического происхождения человека методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК, характеризующийся тем, что для генотипирования используется композиция из 55 пар оригинальных синтетических олигонуклеотидных праймеров для проведения мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР), выбранных из группы SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 110, фланкирующих участки ДНК, содержащие однонуклеотидные вариации (SNP), ПНР-продукты, соответствующие выбранным праймерам, представляют собой маркеры.

2. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека, включающий генетическое исследования биологического образца, содержащего ДНК, с использованием мультиплексной полимеразно-цепной реакции (мультиплексной ПЦР) и последующего определения нуклеотидной последовательности продуктов амплификации, содержащих SNP-маркеры определения вероятного этногеографического происхождения, полученные способом по п. 1.

3. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что олигонуклеотидные праймеры для мультиплексной ПЦР выбраны из композиции SEQ ID NO: 1- SEQ ID NO: 110.

4. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что размер полученных ПЦР-продуктов составляет не более 150 п. н.

5. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что полученные в результате мультиплексной амплификации ПЦР продукты, содержащие молекулярные SNP-маркеры определения вероятного этногеографического происхождения, используются в качестве матрицы для различных методов генетического определения нуклеотидной последовательности.

6. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что полученные в результате мультиплексной амплификации ПЦР продукты, содержащие молекулярные SNP-маркеры определения вероятного этногеографического происхождения, используются в качестве матрицы для приготовления геномных библиотек, предназначенных для определения нуклеотидной последовательности секвенированием по методу "массового параллельного секвенирования" (NGS).

7. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что определение нуклеотидной последовательности продуктов амплификации (ПЦР-продукте в) проводят секвенированием по методу "массового параллельного секвенирования" (NGS), секвенированием по методу Сэнгера, методом TaqMan Real-Time PCR, а также проводят любым доступным способом определения нуклеотидной последовательности.

8. Способ определения вероятного этногеографического происхождения человека по п. 2, отличающийся тем, что исследуемый биологический образец содержит деградированную ДНК.

9. Набор олигонуклеотдов для генотипирования индивида способом по п. 1, используемый для детектирования присутствия молекулярных SNP-маркеров, определяющий вероятное этногеографическое происхождение человека, включающий синтетические оригинальные олигонуклеотиды с нуклеотидными последовательностями SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 110.

10. Применение способа по п. 1 для определения вероятного этногеографического происхождения индивида, происходящего из российских популяций.