RU2020108126A - Устройство для секвенирования днк на основе концентрации - Google Patents
Устройство для секвенирования днк на основе концентрации Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020108126A RU2020108126A RU2020108126A RU2020108126A RU2020108126A RU 2020108126 A RU2020108126 A RU 2020108126A RU 2020108126 A RU2020108126 A RU 2020108126A RU 2020108126 A RU2020108126 A RU 2020108126A RU 2020108126 A RU2020108126 A RU 2020108126A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- reaction chamber
- temperature
- sensors
- outside
- sample
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502715—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0647—Handling flowable solids, e.g. microscopic beads, cells, particles
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0647—Handling flowable solids, e.g. microscopic beads, cells, particles
- B01L2200/0663—Stretching or orienting elongated molecules or particles
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/18—Means for temperature control
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2537/00—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature
- C12Q2537/10—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature the purpose or use of
- C12Q2537/157—A reaction step characterised by the number of molecules incorporated or released
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2537/00—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature
- C12Q2537/10—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature the purpose or use of
- C12Q2537/165—Mathematical modelling, e.g. logarithm, ratio
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
- C12Q2565/607—Detection means characterised by use of a special device being a sensor, e.g. electrode
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Claims (8)
1. Устройство для секвенирования ДНК, содержащее держатель образца, выполненный с возможностью приема образца нуклеиновой кислоты; систему нагрева, выполненную с возможностью повышения температуры образца; систему охлаждения, выполненную с возможностью понижения температуры образца; и контроллер, выполненный с возможностью управления системой нагрева и системой охлаждения для циклического переключения устройства в заданном профиле температура-время, при этом датчики любого типа могут быть размещены в любой части внутри или снаружи реакционной камеры, обеспечивая информацию о концентрации dNTP до и после добавления каждого нуклеотида с использованием системы переноса соответствующей жидкости и воды.
2. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что датчики любого типа могут быть размещены в любой части внутри или снаружи реакционной камеры, обеспечивая информацию о состоянии образцов в реакционной камере, включая температуру и другие показатели.
3. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что блок управления для управления всеми процессами, выполняемыми в реакционной камере, соединен с блоком ввода в средства программирования и датчиками внутри и снаружи реакционной камеры, которые собирают данные и отправляют их в блок управления.
4. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что блок ввода размещен внутри устройства для программирования и выбора параметров.
5. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что температура реакционной камеры управляется любым типом систем нагрева и охлаждения для управления температурой реакционной камеры.
6. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что внутри реакционной камеры можно размещать много контрольных образцов для большей точности и воспроизводимости результатов.
7. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что датчики любого типа могут быть размещены в любой части внутри или снаружи реакционной камеры, обеспечивая информацию о концентрации до и после добавления каждого нуклеотида.
8. Устройство по п. 1, отличающееся тем, что в нем не определено конкретное количество образцов.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EG2017071237 | 2017-07-26 | ||
| EG2017071237 | 2017-07-26 | ||
| PCT/EG2018/000010 WO2019020153A2 (en) | 2017-07-26 | 2018-07-25 | DNA SEQUENCING MACHINE BASED ON CONCENTRATION |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2020108126A true RU2020108126A (ru) | 2021-08-27 |
| RU2020108126A3 RU2020108126A3 (ru) | 2022-03-09 |
| RU2806069C2 RU2806069C2 (ru) | 2023-10-25 |
Family
ID=
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN111315863A (zh) | 2020-06-19 |
| RU2020108126A3 (ru) | 2022-03-09 |
| US20200318176A1 (en) | 2020-10-08 |
| WO2019020153A3 (en) | 2019-11-28 |
| WO2019020153A2 (en) | 2019-01-31 |
| KR20200034774A (ko) | 2020-03-31 |
| JP2020529865A (ja) | 2020-10-15 |
| EP3658681A4 (en) | 2021-04-21 |
| EP3658681A2 (en) | 2020-06-03 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| HRP20190871T1 (hr) | Ručni mikro pcr uređaj | |
| US7851185B2 (en) | Combined thermal devices for thermal cycling | |
| Ho Kim et al. | Performance evaluation of thermal cyclers for PCR in a rapid cycling condition | |
| JP2012127975A5 (ru) | ||
| JP6216494B2 (ja) | 熱サイクル装置及び熱サイクル装置の制御方法 | |
| KR20130100361A (ko) | 열 사이클 장치 및 열 사이클 방법 | |
| SG10201811430SA (en) | Nucleic acid amplification device, nucleic acid amplification method, and chip for nucleic acid amplification | |
| JP2013208067A5 (ru) | ||
| US9206385B2 (en) | Thermal cycler | |
| EP3100027A1 (en) | Apparatus and method for thermocyclic biochemical operations | |
| RU2020108126A (ru) | Устройство для секвенирования днк на основе концентрации | |
| US11278894B2 (en) | Temperature-controlling microfluidic devices | |
| JP2016136973A (ja) | 熱サイクル装置 | |
| CN203425843U (zh) | 一种由plc控制的恒温振荡油浴箱 | |
| JP2016533746A5 (ru) | ||
| JP2015223112A (ja) | 核酸増幅反応装置 | |
| JP2013208065A (ja) | 熱サイクル装置及び熱サイクル装置の制御方法 | |
| CN210596085U (zh) | 快速实现数字pcr反应的微流控芯片组件及其集成设备 | |
| JP2015223130A (ja) | 物質増幅反応装置及び物質増幅方法 | |
| WO2010072790A1 (en) | Method for detecting the presence of liquids in a microfluidic device, detecting apparatus and corresponding microfluidic device | |
| JP2013208066A (ja) | 熱サイクル装置及び熱サイクル装置の制御方法 | |
| JP6120030B2 (ja) | 熱サイクル装置 | |
| CN104635801A (zh) | 一种pcr仪温度控制系统 | |
| JP2013252091A (ja) | 熱サイクル装置 | |
| US20220042085A1 (en) | System and method of nucleic acid amplification for point of collection |