RU2019116216A - Способ очистки для удаления вариантов антител с сульфатированием тирозина; очищенные композиции - Google Patents

Способ очистки для удаления вариантов антител с сульфатированием тирозина; очищенные композиции Download PDF

Info

Publication number
RU2019116216A
RU2019116216A RU2019116216A RU2019116216A RU2019116216A RU 2019116216 A RU2019116216 A RU 2019116216A RU 2019116216 A RU2019116216 A RU 2019116216A RU 2019116216 A RU2019116216 A RU 2019116216A RU 2019116216 A RU2019116216 A RU 2019116216A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
amino acid
acid sequence
cdr
antibodies
Prior art date
Application number
RU2019116216A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2793400C2 (ru
RU2019116216A3 (ru
Inventor
Цзя ЧЖАО
Сандра РАЙОС
Светлана Дуклеска ШЮССЛЕР
Original Assignee
Мерк Шарп И Доум Корп.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Мерк Шарп И Доум Корп. filed Critical Мерк Шарп И Доум Корп.
Publication of RU2019116216A publication Critical patent/RU2019116216A/ru
Publication of RU2019116216A3 publication Critical patent/RU2019116216A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2793400C2 publication Critical patent/RU2793400C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J47/00Ion-exchange processes in general; Apparatus therefor
    • B01J47/02Column or bed processes
    • B01J47/026Column or bed processes using columns or beds of different ion exchange materials in series
    • B01J47/028Column or bed processes using columns or beds of different ion exchange materials in series with alternately arranged cationic and anionic exchangers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/06Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies from serum
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/10Immunoglobulins specific features characterized by their source of isolation or production
    • C07K2317/14Specific host cells or culture conditions, e.g. components, pH or temperature
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/40Immunoglobulins specific features characterized by post-translational modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (68)

1. Композиция, включающая антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое включает:
вариабельный домен легкой цепи, включающий:
CDR-L1, которая включает аминокислотную последовательность: KASQSLDYEGDSDMN (SEQ ID NO: 38);
CDR-L2, которая включает аминокислотную последовательность: GASNLES (SEQ ID NO: 39); и
CDR-L3, которая включает аминокислотную последовательность: QQSTEDPRT (SEQ ID NO: 40); и
вариабельный домен тяжелой цепи, включающий:
CDR-H1, которая включает аминокислотную последовательность: DYNVD (SEQ ID NO: 33);
CDR-H2, которая включает аминокислотную последовательность:
DINPNNGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 59);
DINPNSGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 60);
DINPNDGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 61);
DINPNQGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 62);
DINPNGGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 63); или
DINPNX1GGTIYX2QKFX3X4 (SEQ ID NO: 64), где X1= D,N,S или Q, X2= A или S, X3= Q или K, и X4= E или G; и
CDR-H3: NYRWFGAMDH (SEQ ID NO: 35); не содержащая определяемых уровней антител или фрагментов, которые включают сульфатированный тирозин на CDR-L1.
2. Композиция по п. 1, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент также не содержит определяемых уровней сульфатированного тирозина в одном или нескольких членах, выбранных из группы, включающей FR-L1, FR-L2, CDR-L2, FR-L3, CDR-L3, FR-L4, FR-H1, CDR-H1, FR-H2, CDR-H2, FR-H3, CDR-H3, FR-H4 и константный домен.
3. Композиция по любому из пп. 1-2, где антитело представляет собой Ab6, включающее аминокислотную последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 52 и аминокислотную последовательность легкой цепи SEQ ID NO: 51.
4. Композиция по любому из пп. 1-3, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент включает N-связанные гликаны CHO.
5. Композиция по любому из пп. 1-4, где антитело представляет собой Ab6, и композиция включает одну или несколько разновидностей гликозилированного антитела Ab6, имеющих молекулярные массы около 148590 Да, 148752 Да или 148914 Да.
6. Композиция по любому из пп. 1-5, где антитело представляет собой Ab6, в котором N-концевой глутамин в тяжелой цепи преобразован в пироглутамат и/или C-концевой лизин в тяжелой цепи удален.
7. Способ для удаления антител с сульфатированным тирозином или их антигенсвязывающих фрагментов из водной смеси, включающей антитела, в которых тирозин является сульфатированным и в которых тирозин не является сульфатированным, или их антигенсвязывающие фрагменты, включающий доведение pH смеси до около 6,5 - около 7,0, контактирование водной смеси с анионообменной смолой и сохранение не связанной со смолой водной фракции смеси из смолы.
8. Способ по п. 7, который дополнительно включает промывку смолы водной композицией в изократических условиях и удаление и сохранение промывочной композици из смолы.
9. Способ по любому из пп. 7, 8, включающий уравновешивание анионообменной хроматографической смолы, которая включает диметиламинопропильный анионообменный лиганд, в хроматографической колонке раствором 25 мМ фосфата натрия pH 6,5, доведение pH водной смеси до около 6,5, нанесение смеси на колонку, сбор проточной фракции из колонки, промывку смолы в колонке раствором 25 мМ фосфата натрия pH 6,5 и сбор проточной фракции из промывки.
10. Способ по любому из пп. 7, 8, включающий уравновешивание анионообменной хроматографической смолы, которая включает кватернизированный полиэтилениминовый анионообменный лиганд, в хроматографической колонке раствором 25 мМ фосфата натрия и 5 мМ NaCl pH 7,0, доведение pH водной смеси до около 7,0, нанесение смеси на колонку, сбор проточной фракции из колонки, промывку смолы в колонке раствором 25 мМ фосфата натрия и 5 мМ NaCl pH 7,0 и сбор проточной фракции из промывки.
11. Способ по любому из пп. 7-10, где осуществляют сбор проточной фракции анионообменной хроматографии при A280 поглощении, когда A280 сначала достигает по меньшей мере около 2,5 единиц оптической плотности/см, и продолжают до тех пор, пока A280 не падает ниже около 1,0 единиц оптической плотности/см.
12. Способ по любому из пп. 7-11, дополнительно включающий очистку антитела или антигенсвязывающего фрагмента катионообменной хроматографией, анионообменной хроматографией в режиме связывания-элюирования, хроматографией гидрофобных взаимодействий, хроматографией с протеином-A, хроматографией с протеином-L, хроматографией с протеином-G, хроматографией на гидроксиапатите, эксклюзионной хроматографией, фракционированным осаждением, фильтрованием, центрифугированием или вирусной инактивацией.
13. Способ по любому из пп. 7-12, где легкие цепи и тяжелые цепи иммуноглобулинов антител или антигенсвязывающих фрагментов экспрессированы в клетке яичника китайского хомячка.
14. Способ по любому из пп. 7-13, где антитела или антигенсвязывающие фрагменты включают:
вариабельный домен легкой цепи, включающий:
CDR-L1, которая включает аминокислотную последовательность: KASQSLDYEGDSDMN (SEQ ID NO: 38);
CDR-L2, которая включает аминокислотную последовательность: GASNLES (SEQ ID NO: 39); и
CDR-L3, которая включает аминокислотную последовательность: QQSTEDPRT (SEQ ID NO: 40); и
вариабельный домен тяжелой цепи, включающий:
CDR-H1, которая включает аминокислотную последовательность: DYNVD (SEQ ID NO: 33);
CDR-H2, которая включает аминокислотную последовательность:
DINPNNGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 59);
DINPNSGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 60);
DINPNDGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 61);
DINPNQGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 62);
DINPNGGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 63); или
DINPNX1GGTIYX2QKFX3X4 (SEQ ID NO: 64), где X1= D,N,S или Q, X2= A или S, X3= Q или K, и X4= E или G; и
CDR-H3: NYRWFGAMDH (SEQ ID NO: 35).
15. Способ по любому из пп. 7-14, где антитела или антигенсвязывающие фрагменты представляют собой антитела, и где антитела с отсутствием определяемых уровней сульфатированного тирозина представляют собой разновидности гликозилированного Ab6 антитела, имеющие молекулярные массы около 148590 Да, 148752 Да и/или 148914 Да.
16. Способ по любому из пп. 7-15, где антитела включают аминокислотную последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 52 и аминокислотную последовательность легкой цепи SEQ ID NO: 51.
17. Способ по любому из пп. 7-15, где антитела включают аминокислотную последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 52 и аминокислотную последовательность легкой цепи SEQ ID NO: 51, где N-концевой глутамин в тяжелой цепи преобразован в пироглутамат и/или C-концевой лизин в тяжелой цепи удален.
18. Композиция, которая является продуктом способа по любому из пп. 7-17.
19. Способ для удаления антител с сульфатированным тирозином или их антигенсвязывающих фрагментов из водной смеси, включающей антитела, в которых тирозин является сульфатированным и в которых тирозин не является сульфатированным, или их антигенсвязывающие фрагменты, включающий доведение pH водной смеси до около 6,5 - около 7,5, контактирование смеси с анионообменной смолой и сохранение не связанной со смолой водной фракции смеси из смолы.
20. Способ по п. 19, который дополнительно включает промывку смолы водной композицией в изократических условиях и удаление и сохранение промывочной композиции из смолы.
21. Способ по любому из пп. 19, 20, включающий уравновешивание анионообменной хроматографической смолы, которая включает анионообменный лиганд, в хроматографической колонке раствором фосфата натрия около 10-50 мМ pH около 6,5-7,5, доведение pH водной смеси до около 6,5-7,5, нанесение смеси на колонку, сбор проточной фракции из колонки, промывку смолы в колонке раствором фосфата натрия около 10-50 мМ pH около 6,5-7,5 и сбор проточной фракции из промывки.
22. Способ по любому из пп. 19-21, где легкие цепи и тяжелые цепи иммуноглобулинов антител или антигенсвязывающих фрагментов экспрессированы в клетках яичников китайского хомячка.
23. Способ по любому из пп. 19-22, где антитела или антигенсвязывающие фрагменты включают:
вариабельный домен легкой цепи, включающий:
CDR-L1, которая включает аминокислотную последовательность: KASQSLDYEGDSDMN (SEQ ID NO: 38);
CDR-L2, которая включает аминокислотную последовательность: GASNLES (SEQ ID NO: 39); и
CDR-L3, которая включает аминокислотную последовательность: QQSTEDPRT (SEQ ID NO: 40); и
вариабельный домен тяжелой цепи, включающий:
CDR-H1, которая включает аминокислотную последовательность: DYNVD (SEQ ID NO: 33);
CDR-H2, которая включает аминокислотную последовательность:
DINPNNGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 59);
DINPNSGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 60);
DINPNDGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 61);
DINPNQGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 62);
DINPNGGGTIYAQKFQE (SEQ ID NO: 63); или
DINPNX1GGTIYX2QKFX3X4 (SEQ ID NO: 64), где X1= D,N,S или Q, X2= A или S, X3= Q или K, и X4= E или G; и
CDR-H3: NYRWFGAMDH (SEQ ID NO: 35).
24. Способ по любому из пп. 19-23, где антитела включают аминокислотную последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 52 и аминокислотную последовательность легкой цепи SEQ ID NO: 51.
25. Способ по любому из пп. 19-23, где антитела включают аминокислотную последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 52 и аминокислотную последовательность легкой цепи SEQ ID NO: 51, где N-концевой глутамин в тяжелой цепи преобразован в пироглутамат и/или C-концевой лизин в тяжелой цепи удален.
26. Способ по п. 25, где антитела с отсутствием определяемых уровней сульфатированного тирозина представляют собой разновидности гликозилированных антител, имеющие молекулярные массы около 148590 Да, 148752 Да и/или 148914 Да.
RU2019116216A 2016-10-28 2017-10-26 Способ очистки для удаления вариантов антител с сульфатированием тирозина; очищенные композиции RU2793400C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662414209P 2016-10-28 2016-10-28
US62/414,209 2016-10-28
PCT/US2017/058386 WO2018081329A1 (en) 2016-10-28 2017-10-26 Purification process for removal of tyrosine sulfation antibody variants; purified compositions

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2019116216A true RU2019116216A (ru) 2020-11-30
RU2019116216A3 RU2019116216A3 (ru) 2021-04-28
RU2793400C2 RU2793400C2 (ru) 2023-03-31

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
JP2019535676A (ja) 2019-12-12
CN109963560A (zh) 2019-07-02
BR112019007856A8 (pt) 2023-04-11
KR102617873B1 (ko) 2023-12-22
KR20190067898A (ko) 2019-06-17
WO2018081329A1 (en) 2018-05-03
AU2017347809A1 (en) 2019-05-09
RU2019116216A3 (ru) 2021-04-28
CA3039667A1 (en) 2018-05-03
EP3532046A1 (en) 2019-09-04
JP7229157B2 (ja) 2023-02-27
BR112019007856A2 (pt) 2019-10-01
EP3532046A4 (en) 2020-12-30
US20200123251A1 (en) 2020-04-23
JP2023011753A (ja) 2023-01-24
MX2019004957A (es) 2019-06-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11261238B2 (en) Immunoglobulin purification
US20230060770A1 (en) Cation exchange chromatography wash buffer
CN106103465A (zh) 使用预清洗步骤的免疫球蛋白纯化
AU2009331897A1 (en) Immunoglobulin purification
KR20210021542A (ko) 크로마토그래피를 사용하여 단백질을 정제하는 방법
CN111163804A (zh) 使用阳离子交换色谱法分离三轻链抗体
CN112851813A (zh) 一种抗pd-1抗体的纯化方法
JP2020531557A (ja) タンパク質の精製方法
US20160347833A1 (en) Antibody process
RU2019116216A (ru) Способ очистки для удаления вариантов антител с сульфатированием тирозина; очищенные композиции
CN114729003A (zh) 提高离子交换色谱过程中抗体产率的方法
EP4081554A1 (en) Method for the production of bispecific fcyriii x cd30 antibody construct
WO2020084503A1 (en) A composition comprising antibody with reduced level of basic variants thereof
RU2795432C2 (ru) Отделение антител с тремя легкими цепями при помощи катионообменной хроматографии
RU2019140335A (ru) Способ получения биспецифических антител, биспецифические антитела и терапевтическое применение таких антител
AU2022369694A1 (en) Method for purifying fusion protein having igg fc domain