RU2019104496A - Udp-зависимая гликозилтрансфераза для высокоэффективного продуцирования ребаудиозидов - Google Patents

Udp-зависимая гликозилтрансфераза для высокоэффективного продуцирования ребаудиозидов Download PDF

Info

Publication number
RU2019104496A
RU2019104496A RU2019104496A RU2019104496A RU2019104496A RU 2019104496 A RU2019104496 A RU 2019104496A RU 2019104496 A RU2019104496 A RU 2019104496A RU 2019104496 A RU2019104496 A RU 2019104496A RU 2019104496 A RU2019104496 A RU 2019104496A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
genetically modified
modified host
host cell
amino acid
Prior art date
Application number
RU2019104496A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2777901C2 (ru
RU2019104496A3 (ru
Inventor
Лишань Чжао
Вэньцзун ЛИ
Гейл ВИЧМАНН
Адити КХАНКХОДЖЕ
Шанталь ГАРСИА ДЕ ГОНЗАЛО
Тина МАХАТДЕДЖКУЛ-МЕДОУС
Шаина ДЖЕКСОН
Майкл ЛЕАВЕЛЛ
Даррен ПЛАТТ
Original Assignee
Амирис, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Амирис, Инк. filed Critical Амирис, Инк.
Publication of RU2019104496A publication Critical patent/RU2019104496A/ru
Publication of RU2019104496A3 publication Critical patent/RU2019104496A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2777901C2 publication Critical patent/RU2777901C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L2/00Non-alcoholic beverages; Dry compositions or concentrates therefor; Their preparation
    • A23L2/52Adding ingredients
    • A23L2/60Sweeteners
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L27/00Spices; Flavouring agents or condiments; Artificial sweetening agents; Table salts; Dietetic salt substitutes; Preparation or treatment thereof
    • A23L27/30Artificial sweetening agents
    • A23L27/33Artificial sweetening agents containing sugars or derivatives
    • A23L27/36Terpene glycosides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/18Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a glycosyl transferase, e.g. alpha-, beta- or gamma-cyclodextrins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/44Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
    • C12P19/56Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen atom of the saccharide radical directly bound to a condensed ring system having three or more carbocyclic rings, e.g. daunomycin, adriamycin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y204/00Glycosyltransferases (2.4)
    • C12Y204/01Hexosyltransferases (2.4.1)
    • C12Y204/01017Glucuronosyltransferase (2.4.1.17)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L27/00Spices; Flavouring agents or condiments; Artificial sweetening agents; Table salts; Dietetic salt substitutes; Preparation or treatment thereof
    • A23L27/30Artificial sweetening agents
    • A23L27/33Artificial sweetening agents containing sugars or derivatives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2002/00Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2250/00Food ingredients
    • A23V2250/24Non-sugar sweeteners
    • A23V2250/262Stevioside

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Seasonings (AREA)

Claims (140)

1. Генетически модифицированная клетка-хозяин, содержащая гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую UDP-гликозилтрансферазу, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
2. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 1, которая способна преобразовывать RebA в RebD с эффективностью, превышающей 90%, 95%, 96% или 97%.
3. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 1, в которой UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую последовательность SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11.
4. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой UDP-гликозилтрансфераза способна к бета 1,2-гликозилированию С2' позиции 19-O глюкозы стевиолового гликозида.
5. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза кодируется гетерологичной нуклеиновой кислотой, где гетерологичная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 13, по меньшей мере, 80%, 85%, 90% или 95%.
6. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой UDP-гликозилтрансфераза кодируется гетерологичной нуклеиновой кислотой, имеющей последовательность SEQ ID NO: 13.
7. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, которая способна преобразовывать RebA в RebD с эффективностью более 90%, 95%, 96% или 97%, и где UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 не менее 95%.
8. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза представляет собой полипептид, имеющий функциональный домен с идентичностью последовательности функционального домена SEQ ID. NO: 1 или SEQ ID NO: 11 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
9. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 8, в которой функциональный домен представляет собой акцепторный домен сахара.
10. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 9, где акцепторный домен сахара расположен на N-конце UDP-гликозилтрансферазы.
11. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит акцепторный домен сахара SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11.
12. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит акцепторный домен сахара, где аминокислотная последовательность акцепторного домена сахара имеет идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью акцепторного домена сахара SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 по меньшей мере, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%.
13. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 12, где UDP-гликозилтрансфераза содержит:
(a) аминокислотную последовательность loop1 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, последовательность SEQ ID NO: 28 или вариантную аминокислотную последовательность loop1, в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению loop1 в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 соответственно;
(b) аминокислотную последовательность lоор2 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, или вариантную аминокислотную последовательность lоор2, в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению loop 2 в SEQ ID NO: 1, или SEQ ID NO: 11 соответственно;
(c) аминокислотную последовательность lоор3_1 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, или вариантную аминокислотную последовательность lоор3_1, в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению loop 3_1 в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 соответственно;
(d) аминокислотную последовательность lоор2_2 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, или вариантную аминокислотную последовательность lоор3_2 в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению lоор3_2 в SEQ ID NO: 1, или SEQ ID NO: 11 соответственно;
(e) аминокислотную последовательность lоор4_1 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, или вариантную аминокислотную последовательность lоор4_1, в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению lоор4_1 в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 соответственно;
(f) аминокислотную последовательность lоор4_2 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 в позиции, которая соответствует местоположению lоор4_2 в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, соответственно; или
(g) любаую комбинацию от (а) до (f).
14. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 13, в которой любая из вариантной аминокислотной последовательности loop1, вариантной аминокислотной последовательности lоор2, вариантной аминокислотной последовательности lоор3_1, вариантной аминокислотной последовательности loop 3_2, и вариантной аминокислотной последовательности lоор4_1, получена из соответствующих им позиций петли другой UDP-гликозилтрансферазы, отличной от SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, где другая UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 не менее 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% или 95%.
15. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 14, где другая UDP-гликозилтрансфераза способна к бета-1,2-гликозилированию С'2 позиции 19-О-глюкозы стевиолового гликозида.
16. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 15, в которой другой UDP-гликозилтрансферазой является Os_UGT_91C1.
17. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит:
(a) акцепторный домен сахара другой UDP-гликозилтрансферазы, содержащей аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности не менее 61%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% или 95% по отношению к последовательности акцепторного домена сахара SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11; и
(b) аминокислотную последовательность lоор4_1 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 в местоположении другой UDP-гликозилтрансферазы, которое соответствует расположению lоор4_1 в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, соответственно.
18. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой UDP-гликозилтрансфераза содержит последовательность SEQ ID NO: 22 в качестве акцепторного домена сахара.
19. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, по меньшей мере, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% или 95%, и имеет аминокислотную последовательность lоор4_1 последовательности SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11 в позиции, которая соответствует местоположению lоор4_1 SEQ ID NO: 1, или SEQ ID NO: 11 соответственно.
20. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит последовательность SEQ ID NO: 25.
21. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит один или несколько из следующих аминокислотных остатков:
(a) валин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 11 в SEQ ID NO: 11;
(b) изолейцин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 12 в SEQ ID NO: 11;
(c) пролин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 55 в SEQ ID NO: 11;
(d) глутаминовая кислота в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 90 в SEQ ID NO: 11;
(e) серии в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 203 в SEQ ID NO: 11;
(f) глутаминовая кислота в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 223 в SEQ ID NO: 11; или
(g) валин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 413 в SEQ ID NO: 11,
где позиции аминокислот UDP-гликозилтрансферазы, которые соответствуют позициям аминокислот SEQ ID NO: 11, определяются выравниванием последовательности.
22. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую SEQ ID NO: 24.
23. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит донорный домен сахара, где донорный домен сахара содержит аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью домена донора сахара SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, по меньшей мере, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%.
24. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где донорный домен сахара расположен на С-конце UDP-гликозилтрансферазы.
25. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11, по меньшей мере, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%.
26. Генетически модифицированная клетка-хозяин, содержащая гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую UDP-гликозилтрансферазу, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 2 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
27. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 26, которая способна преобразовывать RebA в RebD с эффективностью более 50%.
28. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 26 или 27, где UDP-гликозилтрансфераза представляет собой полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 2.
29. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из пп. 26-28, в которой UDP-гликозилтрансфераза представляет собой полипептид, содержащий функциональный домен с идентичностью последовательности функционального домена SEQ ID NO: 2 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
30. Генетически модифицированная клетка-хозяин, содержащая гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую UDP-гликозилтрансферазу, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO: 5 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
31. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 30, которая способна преобразовывать RebA в RebD с эффективностью более 40%.
32. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 30 или 31, где UDP-гликозилтрансфераза содержит аминокислотную последовательность, имеющую последовательность SEQ ID NO: 5.
33. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из пп. 30-32, где UDP-гликозилтрансфераза содержит полипептид, имеющий функциональный домен с идентичностью последовательности функционального домена SEQ. ID NO: 5 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
34. Генетически модифицированная клетка-хозяин, содержащая гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую UDP-гликозилтрансферазу, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую идентичность последовательности с SEQ ID NO:6 не менее 85%, 90% или 95%.
35. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 34, которая способна преобразовывать RebA в RebD с эффективностью более 85% или 90%.
36. Генетически модифицированная клетка-хозяин по п. 34 или 35, где UDP-гликозилтрансфераза представляет собой полипептид, имеющий последовательность SEQ ID NO: 6.
37. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из пп. 34-36, в которой UDP-гликозилтрансфераза содержит полипептид, имеющий функциональный домен с идентичностью последовательности функционального домена SEQ ID NO: 6 не менее 80%, 85%, 90% или 95%.
38. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из пп. 29, 33 и 37, в которой функциональный домен представляет собой акцепторный домен сахара.
39. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, способная продуцировать RebD.
40. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, способная продуцировать RebM.
41. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, которая способна продуцировать в RebM и RebM2 в соотношении не менее 10:1, 100:1 или 1000:1.
42. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин продуцирует необнаружимый уровень RebM2.
43. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин способна преобразовывать стевиозид в RebE.
44. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин дополнительно содержит одну или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути для получения стевиола.
45. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин дополнительно содержит одну или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути для получения стевиолового гликозида.
46. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин дополнительно содержит одну или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути для получения RebA.
47. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин дополнительно содержит одну или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути для получения RebM.
48. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где генетически модифицированная клетка-хозяин дополнительно содержит одну или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути для получения RebE.
49. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают геранилгеранил-дифосфат синтазу.
50. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают копалил-дифосфат-синтазу.
51. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают энт-каурен-синтазу.
52. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути содержат кауреноксидазу.
53. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают гидроксилазу кауреновой кислоты.
54. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают цитохром Р450-редуктазу.
55. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают уридин-5'-дифосфо гликозилтрансферазу.
56. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой один или несколько ферментов пути включают UGT74G1, UGT76G1, UGT85C2, и UGT91D.
57. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают геранилгеранил-дифосфатсинтазу, копалил-дифосфат-синтазу, энт-каурен-синтазу, кауреноксидазу, гидроксилазу кауреновой кислоты, цитохром Р450 редуктазу, UGT74G1, UGT76G1, UGT85C2 и UGT91D.
58. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где один или несколько ферментов пути включают бифункциональную копалил-дифосфат-синтазу и кауренсинтазу.
59. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где одна или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути, находятся под контролем одного регулятора транскрипции.
60. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где одна или несколько гетерологичных нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько ферментов пути, находятся под контролем множества гетерологичных регуляторов транскрипции.
61. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, в которой клетка выбрана из группы, состоящей из бактериальной клетки, грибковой клетки, клетки водорослей, клетки насекомого, и клетки растения.
62. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где клетка представляет собой дрожжевую клетку.
63. Генетически модифицированная клетка-хозяин по любому из предшествующих пунктов, где дрожжи представляют собой Saccharomyces cerevisiae.
64. Способ производства RebD:
(a) культивирование популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebD; и
(b) извлечение указанного соединения RebD из среды.
65. Способ производства RebM:
(a) культивирование популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечение указанного соединения RebM из среды.
66. Способ производства RebD:
(a) контактирование RebA с глюкозой и UDP-гликозилтрансферазой по любому из предшествующих пунктов, способных преобразовывать RebA в RebD, в условиях, подходящих для образования RebD; и
(b) извлечение указанного соединения RebD из среды.
67. Способ производства RebM:
(а) контактирование в условиях, подходящих для образования RebM, субстрата с глюкозой или UDP-сахаром и:
(i) UDP-гликозилтрансферазой по любому из предшествующих пунктов, способной преобразовывать RebA в RebD; и
(ii) UDP-гликозилтрансферазой, способной преобразовывать RebD в RebM.
68. Способ получения RebD, включающий преобразование RebA в RebD с использованием любой из UDP-гликозилтрансферазы по любому из предшествующих пунктов, способной преобразовывать RebA в RebD.
69. Способ получения RebM, включающий:
(a) преобразование RebA в RebD с использованием любой из UDP-гликозилтрансферазы по любому из предшествующих пунктов, способной преобразовывать RebA в RebD; и
(b) преобразование RebD в RebM с использованием UDP-гликозилтрансферазы, способной преобразовывать RebD в RebM.
70. Ферментационная композиция, содержащая:
(a) генетически модифицированную клетку-хозяина, содержащую:
(i) гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую UDP-гликозилтрансферазу по любому из предшествующих пунктов, способную преобразовывать RebA в RebD; и
(b) стевиоловые гликозиды, полученные из генетически модифицированной клетки-хозяина.
71. Ферментационная композиция, произведенная генетически модифицированными клетками-хозяевами по любому из предшествующих пунктов, включающая стевиоловые гликозиды, где стевиоловые гликозиды включают RebA, RebD и RebM при соотношении RebA:RebD:RebM по меньшей мере 1:7:50.
72. Ферментационная композиция по п. 71, в которой стевиоловые гликозиды включают RebA, RebD и RebM при соотношении RebA:RebD:RebM, по меньшей мере, от 1:7:50 до 1:100:1000.
73. Ферментационная композиция по п. 71, в которой стевиоловые гликозиды включают RebA, RebD и RebM при соотношении RebA:RebD:RebM по меньшей мере от 1:7:50 до 1:200:2000.
74. Ферментационная композиция, произведенная генетически модифицированными клетками-хозяевами по любому из предшествующих пунктов, включающая стевиоловые гликозиды, где стевиоловые гликозиды включают RebD и RebM при соотношении RebD: RebM, по меньшей мере, 7:50.
75. Ферментационная композиция по п. 74, в которой стевиоловые гликозиды включают RebD и RebM при соотношении RebD:RebM по меньшей мере от 7:50 до 7:100.
76. Ферментационная композиция по п. 74, в которой стевиоловые гликозиды включают RebD и RebM при соотношении RebD:RebM по меньшей мере чем от 7:50 до 7:200.
77. Ферментационная композиция, произведенная генетически модифицированными клетками-хозяевами по любому из предшествующих пунктов, содержащая стевиоловые гликозиды, где стевиоловые гликозиды включают RebA и RebM при соотношении RebA: RebM, по меньшей мере, 1:50.
78. Ферментационная композиция по п. 77, в которой стевиоловые гликозиды включают RebA и RebM при соотношении RebA: RebM, по меньшей мере, от 1:50 до 1:1000.
79. Ферментационная композиция по п. 77, в которой стевиоловые гликозиды включают RebA и RebM при соотношении RebA: RebM, по меньшей мере, от 1:50 до 1:2000.
80. Не встречающаяся в природе UDP-гликозилтрансфераза, имеющая по меньшей мере 80%, 85%о, 90%, 95% идентичность последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11.
81. He встречающаяся в природе UDP-гликозилтрансфераза, способная преобразовывать RebA в RebD с эффективностью более 90%, 95%, 96% или 97% in vivo.
82. Не встречающаяся в природе UDP-гликозилтрансфераза, где UDP-гликозилтрансфераза:
(a) содержит аминокислотную последовательность lоор4_1, имеющую SEQ ID NO:22 в позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует местоположению lоор4_1 SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 11; и
(b) способна к бета-1,2-гликозилированию С2' позиции 19-О-глюкозы стевиолового гликозида.
83. Не встречающаяся в природе UDP-гликозилтрансфераза по любому из пп. 80-82, где UDP-гликозилтрансфераза содержит один или несколько следующих аминокислотных остатков;
(a) валин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 11 SEQ ID NO: 11;
(b) изолейцин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 12 SEQ ID NO: 11;
(c) пролин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 55 SEQ ID NO: 11;
(d) глутаминовая кислота в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 90 SEQ ID NO: 11;
(e) серии в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 203 SEQ ID NO: 11;
(f) глутаминовая кислота в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, которая соответствует аминокислотной позиции 223 SEQ ID NO: 11; или
(g) валин в аминокислотной позиции UDP-гликозилтрансферазы, который соответствует аминокислотной позиции 413 SEQ ID NO: 11,
где положения аминокислот UDP-гликозилтрансферазы, которые соответствуют положениям аминокислот SEQ ID NO:11, определяются выравниванием последовательности.
84. Не встречающаяся в природе нуклеиновая кислота, кодирующая не встречающуюся в природе UDP-гликозилтрансферазу по любому из пп. 80-82.
85. Подсластитель, содержащий RebM, полученный способом
(a) культивирования популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечения указанного соединения RebM из среды.
86. Композиция подсластителя, содержащая, по меньшей мере, одно другое вещество и RebM, полученные способом
(a) культивирования популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечения указанного соединения RebM из среды.
87. Подслащенная композиция, содержащая RebM, полученная способом
(a) культивирования популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечения указанного соединения RebM из среды.
88. Способ получения композиции подсластителя, включающий объединение по меньшей мере одного другого вещества с RebM, полученного способом
(a) культивирования популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечения указанного соединения RebM из среды.
89. Способ изготовления подслащенной композиции, включающий объединение по меньшей мере одной подслащенной композиции с RebM, полученной способом
(a) культивирования популяции генетически модифицированных клеток-хозяев по любому из предшествующих пунктов в среде с источником углерода в условиях, подходящих для получения RebM; и
(b) извлечения указанного соединения RebM из среды.
RU2019104496A 2016-08-12 2017-08-11 Udp-зависимая гликозилтрансфераза для высокоэффективного продуцирования ребаудиозидов RU2777901C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662374408P 2016-08-12 2016-08-12
US62/374,408 2016-08-12
PCT/US2017/046637 WO2018031955A2 (en) 2016-08-12 2017-08-11 Udp-dependent glycosyltransferase for high efficiency production of rebaudiosides

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2019104496A true RU2019104496A (ru) 2020-09-14
RU2019104496A3 RU2019104496A3 (ru) 2021-04-09
RU2777901C2 RU2777901C2 (ru) 2022-08-11

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
US20210355458A1 (en) 2021-11-18
JP2022137061A (ja) 2022-09-21
WO2018031955A2 (en) 2018-02-15
PT3497222T (pt) 2022-02-09
US11091743B2 (en) 2021-08-17
BR112018074999A2 (pt) 2019-03-12
CN109804073A (zh) 2019-05-24
US20190185826A1 (en) 2019-06-20
EP3497222B1 (en) 2021-12-22
SG11201900930UA (en) 2019-02-27
JP2019524134A (ja) 2019-09-05
ES2906310T3 (es) 2022-04-18
US20240174987A1 (en) 2024-05-30
AU2017308143B2 (en) 2022-04-07
AU2017308143A1 (en) 2019-02-07
MX2019001631A (es) 2019-08-05
KR102331018B1 (ko) 2021-11-26
RU2019104496A3 (ru) 2021-04-09
CN109804073B (zh) 2023-05-16
WO2018031955A3 (en) 2018-03-15
KR20190038612A (ko) 2019-04-08
CA3031162A1 (en) 2018-02-15
US11866738B2 (en) 2024-01-09
EP3497222A2 (en) 2019-06-19
MY194280A (en) 2022-11-25
JP7404068B2 (ja) 2023-12-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Klähn et al. Compatible solute biosynthesis in cyanobacteria
JP2019524134A5 (ru)
US10000783B2 (en) Steviol glucosyltransferases and genes encoding the same
JP2013533736A5 (ru)
RU2676730C2 (ru) Способы и вещества для основанного на рекомбинации получения соединений шафрана
US20180132515A1 (en) Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
JP2014524247A5 (ru)
ES2660301T3 (es) Glicosiltransferasa que glicosila ácido flavokermésico y/o ácido kermésico
JP2019513392A5 (ru)
CA2867572C (en) Method for producing steviol glycoside
CN108300726B (zh) α-红没药醇合成质粒及其构建方法与大肠杆菌工程菌株
JP7318989B2 (ja) Udp-ラムノースの生合成生産
US10472661B2 (en) Method for increasing glycosylation of a composition comprising steviol glycosides
KR101502745B1 (ko) 수산화칼슘설탕액을 이용한 올리고당 제조방법
RU2019104496A (ru) Udp-зависимая гликозилтрансфераза для высокоэффективного продуцирования ребаудиозидов
US20190169664A1 (en) Microbial platform for production of glycosylated compounds
KR101669041B1 (ko) 스테비오사이드 생산능을 가지는 재조합 미생물 및 이를 이용한 스테비오사이드의 생산 방법
KR20140134636A (ko) 카우린 생성능을 가지는 재조합 미생물 및 이를 이용한 카우린의 제조 방법
CN115449514B (zh) 一种β-1,2-糖基转移酶及其应用
KR101669044B1 (ko) 스테비올바이오사이드 생산능을 가지는 재조합 미생물 및 이를 이용한 스테비올바이오사이드의 생산 방법
US9340809B2 (en) Microbial conversion of sugar acids and means therein
RU2020109765A (ru) Применение кауреноксидазы pisum sativum для высокоэффективного производства ребаудиозидов
KR101669057B1 (ko) 스테비올모노사이드 생산능을 가지는 재조합 미생물 및 이를 이용한 스테비올모노사이드의 생산 방법
US20220389043A1 (en) Improved isolation of steviol glycosides
RU2021112544A (ru) Гидроксилаза кауреновой кислоты stevia rebaudiana для высокоэффективного производства ребаудиозидов

Legal Events

Date Code Title Description
HE9A Changing address for correspondence with an applicant