RU2019103573A - Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии - Google Patents

Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии Download PDF

Info

Publication number
RU2019103573A
RU2019103573A RU2019103573A RU2019103573A RU2019103573A RU 2019103573 A RU2019103573 A RU 2019103573A RU 2019103573 A RU2019103573 A RU 2019103573A RU 2019103573 A RU2019103573 A RU 2019103573A RU 2019103573 A RU2019103573 A RU 2019103573A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
patient
lupus
levels
increased risk
control
Prior art date
Application number
RU2019103573A
Other languages
English (en)
Inventor
Джозеф М. АХЕРН
Чао-чин ЛЮ
Сьюзан М. МАНЗИ
Original Assignee
Аллегени-Сингер Рисерч Инститьют
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Аллегени-Сингер Рисерч Инститьют filed Critical Аллегени-Сингер Рисерч Инститьют
Publication of RU2019103573A publication Critical patent/RU2019103573A/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/483Physical analysis of biological material
    • G01N33/487Physical analysis of biological material of liquid biological material
    • G01N33/49Blood
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/564Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for pre-existing immune complex or autoimmune disease, i.e. systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, rheumatoid factors or complement components C1-C9
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/20ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112Disease subtyping, staging or classification
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/24Immunology or allergic disorders

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Ecology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Rehabilitation Therapy (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Primary Health Care (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (55)

1. Способ определения, можно ли классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включающий, посредством обрабатывающего устройства
получение набора данных анализа крови для пациента, который, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, где указанные критерии представляют собой критерии Американской коллегии ревматологов (ACR) или Международной организации сотрудничества клиник системной красной волчанки (SLICC), где указанный набор данных анализа крови включает ряд уровней клеточно-связанных продуктов активации комплемента (CB-CAP) для пациента;
доступ к контрольному набору данных, включающему контрольный уровень для каждого CB-CAP;
сравнение уровней CB-CAP пациента с контрольными уровнями для определения количества CB-CAP, для которых уровни у пациента превышены по сравнению с контрольными уровнями;
если определенное количество превышает порог, классификацию указанного пациента, который, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки; и
генерацию отчета, включающего указание, классифицирован ли указанный пациент как демонстрирующий повышенный риск развития волчанки.
2. Способ по п. 1, где CB-CAP включают по меньшей мере восемь из следующих: E-C4d, E-C3d, R-C4d, R-C3d, T-C4d, T-C3d, B-C4d, B-C3d, М-C4d, М-C3d, G-C4d, G-C3d и P-C4d.
3. Способ по п. 1, дополнительно включающий
определение, демонстрирует ли пациент один или более критериев классификации; и
применение критериев классификации для установления вероятности того, что пациент как демонстрирует повышенный риск развития волчанки.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий
получение набора данных анализа крови для пациента, где указанный набор данных анализа крови включает ряд уровней CB-CAP для пациента, где указанные уровни CB-CAP представляют собой ряд из следующих: E-C4d, E-C3d, R-C4d, R-C3d, T-C4d, T-C3d, B-C4d, B-C3d, М-C4d, М-C3d, G-C4d, G-C3d и P-C4d;
сравнение уровней CB-CAP пациента с контрольными уровнями для определения количества CB-CAP, для которых уровни у пациента превышены по сравнению с контрольными уровнями;
если определенное количество CB-CAP, для которых уровни у пациента превышены по сравнению с контрольными уровнями, превышает порог, классификацию указанного пациента, который, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, но не имеющего волчанку.
5. Способ по п. 1 или 4, дополнительно включающий
определение, демонстрирует ли пациент пониженный уровень E-CR1 по сравнению с контрольной группой; и
классификацию пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, только если пациент также показывает пониженный уровень E-CR1 по сравнению с контрольными уровнями E-CR1 в контрольном наборе данных.
6. Способ по п. 1 или 4, дополнительно включающий
определение веса одного или более CB-CAP, для которых присутствует повышенный уровень; и
использование определенного веса для установления вероятности того, что пациент демонстрирует повышенный риск развития волчанки.
7. Способ по п. 1 или 4, дополнительно включающий
определение величины одного или более CB-CAP, для которым присутствует повышенный уровень; и
также использование определенной величины для одного или более CB-CAP для определения, можно ли классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки.
8. Система для определения, можно ли классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включающая
накопитель данных, содержащий контрольный набор данных анализа крови для контрольной выборки субъектов, где первая группа субъектов в выборке, как известно, имеет волчанку, и вторая группа субъектов в выборке, как известно, не имеет волчанки, и где данные анализа крови включают уровни клеточно-связанных продуктов активации комплемента (CB-CAP) для каждого из субъектов;
обрабатывающее устройство; и
машиночитаемый носитель, содержащий программные инструкции, предназначенные, чтобы предписывать обрабатывающему устройству
принимать набор данных анализа крови пациента, где набор данных анализа крови включает ряд уровней CB-CAP для пациента, где указанный пациент, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, и где указанные критерии представляют собой критерии Американской коллегии ревматологов (ACR) или Международной организации сотрудничества клиник системной красной волчанки (SLICC);
сравнивать уровни CB-CAP для пациента с контрольными уровнями для определения количества CB-CAP, для которых уровни пациента превышены по сравнению с контрольными уровнями;
если определенное количество превышает порог, классификацию указанного пациента, который, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки; и
генерировать отчет, включающий указание, классифицирован ли указанный пациент как демонстрирующий повышенный риск развития волчанки.
9. Система по п. 8, где инструкции, которые предписывают обрабатывающему устройству производить сравнение, включает инструкции для сравнения уровней по меньшей мере восьми из следующих CB-CAP: E-C4d, E-C3d, R-C4d, R-C3d, T-C4d, T-C3d, B-C4d, B-C3d, M-C4d, M-C3d, G-C4d, G-C3d и P-C4d.
10. Система по п. 8, дополнительно включающая дополнительные программные инструкции для
определения, демонстрирует ли пациент пониженный уровень E-CR1 по сравнению с контрольной группой; и
классификации пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, только если пациент также демонстрирует пониженный уровень E-CR1 по сравнению с контрольными уровнями E-CR1 в контрольном наборе данных.
11. Система по п. 8,
дополнительно включающая дополнительные инструкции, которые предназначены, чтобы предписывать обрабатывающему устройству определять, демонстрирует ли пациент один или более критериев классификации; и
где инструкции, которые предписывают обрабатывающему устройству классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включают инструкции также применять критерии классификации для определения, можно ли классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки.
12. Система по п. 8, включающая
накопитель данных, содержащий контрольный набор данных анализа крови для контрольной выборки субъектов, где первая группа субъектов в выборке, как известно, имеет волчанку, и вторая группа субъектов в выборке, как известно, не имеет волчанки, и где данные анализа крови включают уровни клеточно-связанных продуктов активации комплемента (CB-CAP) для каждого из субъектов;
обрабатывающее устройство; и
машиночитаемый носитель, содержащий программные инструкции, которые предназначены, чтобы предписывать обрабатывающему устройству:
принимать набор данных анализа крови пациента, где набор данных анализа крови включает ряд уровней CB-CAP пациента;
сравнивать уровни CB-CAP для пациента с контрольными уровнями для определения количества CB-CAP, для которых уровни пациента превышены по сравнению с контрольными уровнями;
определять, демонстрирует ли пациент пониженный уровень E-CR1 по сравнению с контрольной группой;
если определенное количество CB-CAP, для которых повышены уровни пациента, превышает порог, и пациент демонстрирует пониженный уровень E-CR1, классифицировать пациента, который, как было определено, соответствует по меньшей мере одному, но менее чем четырем критериям классификации волчанки, как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки; и
генерировать отчет, включающий указание относительно того, классифицирован ли пациент как демонстрирующий повышенный риск развития волчанки.
13. Система по п. 8 или 12, дополнительно включающая дополнительные инструкции, которые предназначены, чтобы предписывать обрабатывающему устройству определять вес одного или более CB-CAP, для которых присутствует повышенный уровень; и
где инструкции, которые предписывают обрабатывающему устройству классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включают инструкции также использовать определенный вес одного или более сравненных CB-CAP для определения, классифицировать ли пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки.
14. Система по п. 8 или 12,
дополнительно включающая дополнительные инструкции, которые предназначены, чтобы предписывать обрабатывающему устройству определять величину одного или более CB-CAP, для которых присутствует повышенный уровень; и
где инструкции, которые предписывают обрабатывающему устройству классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включают инструкции также использовать определенную величину одного или более сравненных CB-CAP для определения, классифицировать ли пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки.
15. Система по п. 12,
дополнительно включающая дополнительные инструкции, которые предназначены, чтобы предписывать обрабатывающему устройству определять, демонстрирует ли пациент один или более критериев классификации; и
где инструкции, которые предписывают обрабатывающему устройству классифицировать пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки, включают инструкции также применять критерии классификации для определения, классифицировать ли пациента как демонстрирующего повышенный риск развития волчанки.
RU2019103573A 2013-02-08 2014-02-06 Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии RU2019103573A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361762620P 2013-02-08 2013-02-08
US61/762,620 2013-02-08

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015138144A Division RU2680270C2 (ru) 2013-02-08 2014-02-06 Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2019103573A true RU2019103573A (ru) 2019-03-15

Family

ID=51300123

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019103573A RU2019103573A (ru) 2013-02-08 2014-02-06 Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии
RU2015138144A RU2680270C2 (ru) 2013-02-08 2014-02-06 Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015138144A RU2680270C2 (ru) 2013-02-08 2014-02-06 Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии

Country Status (7)

Country Link
US (1) US9495517B2 (ru)
EP (2) EP2954071B1 (ru)
JP (1) JP6400604B2 (ru)
CN (2) CN111965358A (ru)
BR (1) BR112015018964B1 (ru)
RU (2) RU2019103573A (ru)
WO (1) WO2014124098A1 (ru)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2017528734A (ja) 2014-08-08 2017-09-28 アレゲーニー・シンガー リサーチ インスティチュート 診断用バイオマーカーとしての抗リンパ球自己抗体
JP6674543B2 (ja) * 2015-07-31 2020-04-01 アレゲーニー・シンガー リサーチ インスティチュート 抗体に基づく薬物のコンパニオン診断としての細胞結合補体活性化産物アッセイ
JP2019522785A (ja) * 2016-05-24 2019-08-15 アレゲーニー・シンガー リサーチ インスティチュート C4遺伝子コピー数及び細胞結合性補体活性化産物を用いてループス及びプレループスを同定する方法並びにシステム

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2350922T3 (es) 2001-09-10 2011-01-28 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Diagnóstico y monitorización del lupus eritematoso sistémico y de la escrerodermia.
AU2003298650B2 (en) * 2002-11-15 2010-03-11 Musc Foundation For Research Development Complement receptor 2 targeted complement modulators
ATE552501T1 (de) 2003-04-16 2012-04-15 Univ Pittsburgh Identifizierung und überwachung von systemischem lupus erythematodes
EP2194383A1 (en) * 2003-06-13 2010-06-09 University of Pittsburgh Monitoring immunologic, hematologic and inflammatory diseases
DK1756571T3 (da) * 2004-04-09 2010-12-13 Univ Pittsburgh Fremgangsmåde i realtid til detektering af akut inflammatoriske tilstande
EP1745287B1 (en) * 2004-05-11 2010-09-22 University of Pittsburgh - Of the Commonwealth System of Higher Education Diagnosing and monitoring inflammatory diseases by measuring complement components on white blood cells
RU2009143345A (ru) * 2007-04-24 2011-05-27 Диамид Терапьютикс Аб (Se) Лекарственные средства и способы для лечения аутоиммунного заболевания и рака
CN101376910B (zh) * 2007-08-27 2012-01-11 中国科学院上海生命科学研究院 微小rna基因在系统性红斑狼疮疾病诊断和治疗中的作用
EP2344674A4 (en) * 2008-09-26 2012-11-07 Hoffmann La Roche METHODS OF TREATING, DIAGNOSING, AND MONITORING LUPUS
CA2738952A1 (en) 2008-10-16 2010-04-22 Cypress Bioscience, Inc. Method for diagnosis and monitoring of disease activity and response to treatment in systemic lupus erythematosus (sle) and other autoimmune diseases
US20120052066A1 (en) * 2008-11-07 2012-03-01 Cesar Calderon Markers and methods for assessing and treating lupus patients susceptible to photoprovocation
AU2010248935B2 (en) * 2009-05-13 2016-12-15 Genzyme Corporation Methods and compositions for treating lupus
WO2011047337A2 (en) * 2009-10-16 2011-04-21 Exagen Diagnostics, Inc. Cell-based complement activation product algorithm for diagnosing systemic lupus erythematosus
JP5990542B2 (ja) * 2011-02-11 2016-09-14 エグザジェン ダイアグノスティクス インコーポレイテッドExagen Diagnostics, Inc. 全身性エリテマトーデスのリスクスコアを算出する方法
CN102605082A (zh) * 2012-03-28 2012-07-25 解码(上海)生物医药科技有限公司 系统性红斑狼疮检测试剂盒

Also Published As

Publication number Publication date
US20150339449A1 (en) 2015-11-26
BR112015018964B1 (pt) 2022-08-02
US9495517B2 (en) 2016-11-15
EP3789497B1 (en) 2024-01-03
WO2014124098A1 (en) 2014-08-14
CN111965358A (zh) 2020-11-20
EP3789497A1 (en) 2021-03-10
EP2954071B1 (en) 2020-08-12
JP6400604B2 (ja) 2018-10-03
EP2954071A4 (en) 2016-09-28
CN105051210A (zh) 2015-11-11
JP2016513251A (ja) 2016-05-12
EP2954071A1 (en) 2015-12-16
RU2015138144A (ru) 2017-03-15
BR112015018964A2 (pt) 2017-07-18
RU2680270C2 (ru) 2019-02-19
CN105051210B (zh) 2020-07-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Bornmann et al. How to improve the prediction based on citation impact percentiles for years shortly after the publication date?
Liu Classification accuracy and cut point selection
Mehdi et al. Kernel smoothing for ROC curve and estimation for thyroid stimulating hormone
Ruscio et al. Performing taxometric analysis to distinguish categorical and dimensional variables
JP2019522774A5 (ru)
Thompson et al. The mean–variance relationship reveals two possible strategies for dynamic brain connectivity analysis in fMRI
BR112013030271A2 (pt) método e aparelho para classificar múltiplos estados de dispositivo
Liu et al. Automated fiber-type-specific cross-sectional area assessment and myonuclei counting in skeletal muscle
AU2014249011A8 (en) Imaging blood cells
RU2015136525A (ru) Процесс обработки медицинских изображений
RU2019103573A (ru) Клеточно-связанные продукты активации комплемента в качестве диагностических биомаркеров волчанки в доклинической стадии
Rostas et al. The validity of abdominal examination in blunt trauma patients with distracting injuries
Lee et al. DAFi: A directed recursive data filtering and clustering approach for improving and interpreting data clustering identification of cell populations from polychromatic flow cytometry data
Morbiducci et al. Predicting the metabolic condition after gestational diabetes mellitus from oral glucose tolerance test curves shape
US20160247081A1 (en) Worst-case execution time statistical tool
Kandavel et al. Mean corpuscular volume to white blood cell ratio for thiopurine monitoring in pediatric inflammatory bowel disease
Yarnold Standards for reporting UniODA findings expanded to include ESP and all possible aggregated confusion tables
Dong et al. Performance drift is a major barrier to the safe use of machine learning in cardiac surgery
Margam et al. Sex and side determination of human hip bone by metric parameters of its posterior border
Kim You cannot assess until you measure it: using psoas index for measuring frailty
Blum et al. Significant methodologic variations in calculating renal function changes following kidney tumor surgery: A quality reporting issue?
Chamberlin et al. A query taxonomy describes performance of patient-level retrieval from electronic health record data
Nazarinia et al. Serum homocystein level in patients with scleroderma
Buckler Responses of glomus cells to hypoxia and acidosis
Runk Exploring the relationship between personality and subjective cognitive impairment in older adults without dementia