RU2019100495A - Детекция нуклеотидных последовательностей-мишеней с использованием разных температур детекции - Google Patents
Детекция нуклеотидных последовательностей-мишеней с использованием разных температур детекции Download PDFInfo
- Publication number
- RU2019100495A RU2019100495A RU2019100495A RU2019100495A RU2019100495A RU 2019100495 A RU2019100495 A RU 2019100495A RU 2019100495 A RU2019100495 A RU 2019100495A RU 2019100495 A RU2019100495 A RU 2019100495A RU 2019100495 A RU2019100495 A RU 2019100495A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- detection temperature
- signal
- target nucleotide
- nucleotide sequence
- temperature
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/682—Signal amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N25/00—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means
- G01N25/02—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means by investigating changes of state or changes of phase; by investigating sintering
- G01N25/04—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means by investigating changes of state or changes of phase; by investigating sintering of melting point; of freezing point; of softening point
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2527/00—Reactions demanding special reaction conditions
- C12Q2527/101—Temperature
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
- C12Q2561/113—Real time assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Claims (28)
1. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель, содержащий инструкции для конфигурирования процессора с целью осуществления способа определения присутствия двух нуклеотидных последовательностей-мишеней в образце с использованием разных температур детекции, где указанный способ включает:
(a) получение как сигнала, детектируемого при высокой температуре детекции, так и сигнала, детектируемого при низкой температуре детекции; при этом каждую из нуклеотидных последовательностей-мишеней детектируют с использованием соответствующего средства генерации сигнала, где указанное соответствующее средство генерации сигнала представляет собой соответствующее генерирующее сигнал вещество, содержащее олигонуклеотид, который специфически гибридизируется с соответствующей нуклеотидной последовательностью-мишенью; при этом генерируемые сигналы детектируют, используя детектор; при этом одна из двух нуклеотидных последовательностей-мишеней имеет высокую температуру детекции, а другая имеет низкую температуру детекции, определяемую с использованием соответствующего средства генерации сигнала; при этом высокая температура детекции представляет собой температуру, допускающую генерирование сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, а низкая температура детекции представляет собой температуру, допускающую генерирование как сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, так и сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции; и
(b) определение присутствия двух нуклеотидных последовательностей-мишеней на основе полученных сигналов; при этом (1) присутствие нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, определяют на основе сигнала, детектируемого при высокой температуре детекции, а (2) присутствие нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, определяют по разнице между сигналом, детектируемым при высокой температуре детекции, и сигналом, детектируемым при низкой температуре детекции.
2. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где средства генерации сигнала для каждой из нуклеотидных последовательностей-мишеней представляют собой средства генерации сигнала для генерирования сигнала способом, зависящим от образования дуплекса.
3. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где средства генерации сигнала для каждой из нуклеотидных последовательностей-мишеней представляют собой средства генерации сигнала с использованием образования дуплекса способом, зависящим от расщепления опосредующего олигонуклеотида, специфически гибридизованного с данной нуклеотидной последовательностью-мишенью.
4. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где средство генерации сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, представляет собой средство генерации сигнала с использованием расщепления детектирующего олигонуклеотида, содержащего по меньшей мере одну метку, а средство генерации сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, представляет собой средство генерации сигнала с использованием образования дуплекса; где указанная метка выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной метки, люминесцентной метки, хемилюминесцентной метки, электрохимической метки и металлической метки.
5. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где средство генерации сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, представляет собой средство генерации сигнала с использованием расщепления детектирующего олигонуклеотида, а средство генерации сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, представляет собой средство генерации сигнала с использованием образования дуплекса способом, зависящим от расщепления опосредующего олигонуклеотида, специфически гибридизованного с данной нуклеотидной последовательностью-мишенью.
6. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где два различных средства генерации сигнала содержат идентичную метку, и сигналы от этой метки не различаются детектором; где указанная метка выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной метки, люминесцентной метки, хемилюминесцентной метки, электрохимической метки и металлической метки.
7. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где указанная разница представляет собой разницу, получаемую в результате математической обработки сигнала, детектируемого при высокой температуре детекции, и сигнала, детектируемого при низкой температуре детекции.
8. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где, если сигнал не детектируется при высокой температуре детекции, то определение присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, проводят на основе сигнала, детектируемого при низкой температуре детекции, с учетом отсутствия детекции сигнала при высокой температуре детекции.
9. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где, если присутствует нуклеотидная последовательность-мишень, имеющая высокую температуру детекции, то для определения присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, используют референсное значение.
10. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 9, где для определения присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей низкую температуру детекции, в данном способе используют референсное значение, полученное посредством (1) инкубирования нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, со средством генерации сигнала для детекции нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей высокую температуру детекции, в другом реакционном сосуде, нежели реакционный сосуд на стадии (а), (2) детекции сигналов как при высокой температуре детекции, так и при низкой температуре детекции и (3) затем получения разницы между сигналом, детектируемым при высокой температуре детекции, и сигналом, детектируемым при низкой температуре детекции.
11. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, где две нуклеотидные последовательности-мишени содержат нуклеотидную вариацию, выбранную из группы, состоящей из SNP (однонуклеотидного полиморфизма), мутации, делеции, вставки, замены и транслокации, и одна из этих двух нуклеотидных последовательностей-мишеней содержит нуклеотидную вариацию одного типа, а другая содержит нуклеотидную вариацию другого типа.
12. Устройство для детекции нуклеотидной последовательности-мишени в образце с использованием разных температур детекции, содержащее (а) компьютерный процессор и (b) пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 1, соединенный с компьютерным процессором.
13. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель, содержащий инструкции для конфигурирования процессора с целью осуществления способа SNP-генотипирования нуклеотидной последовательности в образце с использованием разных температур детекции, где указанный способ включает:
(a) получение как сигнала, детектируемого при высокой температуре детекции, так и сигнала, детектируемого при низкой температуре детекции; при этом каждый из SNP-содержащих аллелей детектируют с использованием соответствующего средства генерации сигнала; где указанное соответствующее средство генерации сигнала представляет собой соответствующее генерирующее сигнал вещество, содержащее олигонуклеотид, который специфически гибридизируется с соответствующей SNP-содержащей аллелью; при этом один из SNP-содержащих аллелей имеет высокую температуру детекции, а другой имеет низкую температуру детекции, определяемую с использованием соответствующего средства генерации сигнала; при этом высокая температура детекции представляет собой температуру, допускающую генерирование сигнала для SNP-содержащего аллеля, имеющего высокую температуру детекции, а низкая температура детекции представляет собой температуру, допускающую генерирование как сигнала для SNP-содержащего аллеля, имеющего низкую температуру детекции, так и сигнала для SNP-содержащего аллеля, имеющего высокую температуру детекции;
(b) определение SNP-генотипа по разнице между полученными сигналами.
14. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель, содержащий инструкции для конфигурирования процессора с целью осуществления способа определения присутствия от 3 до 10 нуклеотидных последовательностей-мишеней в образце с использованием разных температур детекции, где указанный способ включает:
(а) получение сигналов, детектируемых при 3-10 температурах детекции; при этом каждую из указанных 3-10 нуклеотидных последовательностей-мишеней детектируют с использованием соответствующего средства генерации сигнала; где указанное соответствующее средство генерации сигнала представляет собой соответствующее генерирующее сигнал вещество, содержащее олигонуклеотид, который специфически гибридизируется с соответствующей нуклеотидной последовательностью-мишенью; при этом каждая из указанных 3-10 нуклеотидных последовательностей-мишеней имеет разную температуру детекции, определяемую с использованием соответствующего средства генерации сигнала; при этом температура детекции представляет собой температуру, допускающую генерирование не только сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей данную температуру детекции, но также и сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей более высокую температуру детекции, чем данная температура детекции; при этом детекцию осуществляют при каждой из разных температур детекции; и
(b) определение присутствия указанных 3-10 нуклеотидных последовательностей-мишеней на основе полученных сигналов; при этом, если определяют присутствие нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей конкретную температуру детекции, среди указанных 3-10 нуклеотидных последовательностей-мишеней, то присутствие нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей данную конкретную температуру детекции, определяют по разнице между сигналом, детектируемым при одной или более температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции, и сигналом, детектируемым при данной конкретной температуре детекции; при этом, если данная конкретная температура детекции является самой высокой температурой детекции среди температур детекции, то присутствие нуклеотидной последовательности-мишени определяют на основе сигнала, детектируемого при данной конкретной температуре детекции.
15. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где стадию (b) проводят, сначала определяя присутствие нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей самую высокую температуру детекции, а затем последовательно определяя присутствие нуклеотидных последовательностей-мишеней, имеющих более низкие температуры детекции, в порядке убывания.
16. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где средства генерации сигнала для каждой из нуклеотидных последовательностей-мишеней представляют собой средства генерации сигнала для генерирования сигнала способом, зависящим от образования дуплекса.
17. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где средство генерации сигнала для нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей самую высокую температуру детекции, представляет собой средство генерации сигнала с использованием расщепления детектирующего олигонуклеотида, а средство генерации сигнала для других нуклеотидных последовательностей-мишеней представляют собой средство генерации сигнала с использованием образования дуплекса.
18. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где указанные 3-10 различных средств генерации сигнала содержат идентичную метку, и сигналы от этой метки не различаются детектором; где указанная метка выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной метки, люминесцентной метки, хемилюминесцентной метки, электрохимической метки и металлической метки.
19. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где указанная разница включает разницу, получаемую в результате математической обработки сигнала, детектируемого при одной или более температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции, и сигнала, детектируемого при данной конкретной температуре детекции.
20. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где, если сигнал не детектируется при температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции, то определение присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей данную конкретную температуру детекции, проводят на основе сигнала, детектируемого при данной конкретной температуре детекции, с учетом отсутствия детекции сигнала при температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции.
21. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 14, где, если присутствует нуклеотидная последовательность-мишень, имеющая температуру детекции выше указанной конкретной температуры детекции, то в данном способе для определения присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей данную конкретную температуру детекции, используют по меньшей мере одно референсное значение.
22. Пригодный для ввода в компьютер информационный носитель по п. 21, где для определения присутствия нуклеотидной последовательности-мишени, имеющей конкретную температуру детекции, в данном способе используют по меньшей мере одно референсное значение из референсных значений, полученных посредством (1) инкубирования всех комбинаций нуклеотидных последовательностей-мишеней, имеющих более высокие температуры детекции, чем данная конкретная температура детекции, с соответствующими средствами генерации сигнала в другом реакционном сосуде, нежели реакционный сосуд на стадии (а), (2) детекции сигналов не только при одной или более температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции, но также и при данной конкретной температуре детекции, и (3) затем получения разницы между сигналом, детектируемым при одной или более температурах детекции, превышающих данную конкретную температуру детекции, и сигналом, детектируемым при данной конкретной температуре детекции.
Applications Claiming Priority (8)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR20140037310 | 2014-03-28 | ||
| KR10-2014-0037310 | 2014-03-28 | ||
| US201461979545P | 2014-04-15 | 2014-04-15 | |
| US61/979,545 | 2014-04-15 | ||
| PCT/KR2014/004173 WO2015147370A1 (en) | 2014-03-28 | 2014-05-09 | Detection of target nucleic acid sequences using different detection temperatures |
| KRPCT/KR2014/004173 | 2014-05-09 | ||
| KRPCT/KR2014/006714 | 2014-07-23 | ||
| PCT/KR2014/006714 WO2015147382A1 (en) | 2014-03-28 | 2014-07-23 | Detection of target nucleic acid sequences using different detection temperatures |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2016139287A Division RU2678403C2 (ru) | 2014-03-28 | 2014-12-09 | Детекция нуклеотидных последовательностей-мишеней с использованием разных температур детекции |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2019100495A true RU2019100495A (ru) | 2019-01-31 |
| RU2019100495A3 RU2019100495A3 (ru) | 2022-02-21 |
| RU2780587C2 RU2780587C2 (ru) | 2022-09-28 |
Family
ID=
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2799654C2 (ru) * | 2019-03-07 | 2023-07-07 | Иллумина, Инк. | Инструмент на основе графов последовательностей для определения вариаций в областях коротких тандемных повторов |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2799654C2 (ru) * | 2019-03-07 | 2023-07-07 | Иллумина, Инк. | Инструмент на основе графов последовательностей для определения вариаций в областях коротких тандемных повторов |
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2016139287A (ru) | Детекция нуклеотидных последовательностей-мишеней с использованием разных температур детекции | |
| Bohmann et al. | Strategies for sample labelling and library preparation in DNA metabarcoding studies | |
| Costa et al. | Variation of B1 gene and AF146527 repeat element copy numbers according to Toxoplasma gondii strains assessed using real-time quantitative PCR | |
| Lee et al. | High-throughput PCR assays to monitor Wolbachia infection in the dengue mosquito (Aedes aegypti) and Drosophila simulans | |
| Edgar | UNCROSS2: identification of cross-talk in 16S rRNA OTU tables | |
| WO2017040316A1 (en) | Sample analysis, presence determination of a target sequence | |
| Edgar | UNCROSS: filtering of high-frequency cross-talk in 16S amplicon reads | |
| SenGupta et al. | Whole-genome sequencing for high-resolution investigation of methicillin-resistant Staphylococcus aureus epidemiology and genome plasticity | |
| Pestechian et al. | Genetic diversity of Echinococcus granulosus in center of Iran | |
| KR102531008B1 (ko) | 증폭 데이터 표시 방법 및 장치 | |
| Miller et al. | Single-point mutations in the N gene of SARS-CoV-2 adversely impact detection by a commercial dual target diagnostic assay | |
| Kim et al. | Rapid and specific detection of apple stem grooving virus by reverse transcription-recombinase polymerase amplification | |
| Hou et al. | Gene expression profiling to predict and assess the consequences of therapy-induced virus eradication in chronic hepatitis C virus infection | |
| Kutnjak et al. | Time-sampled population sequencing reveals the interplay of selection and genetic drift in experimental evolution of potato virus Y | |
| Yu et al. | Rapid detection of azole-resistant Aspergillus fumigatus in clinical and environmental isolates by use of a lab-on-a-chip diagnostic system | |
| US20190284605A1 (en) | Detection of abnormal signal using two or more datasets | |
| Tamanaha et al. | Profiling RT-LAMP tolerance of sequence variation for SARS-CoV-2 RNA detection | |
| Zhang et al. | Rare variants of ATG5 are likely to be associated with Chinese patients with systemic lupus erythematosus | |
| Pérez-Bercoff et al. | Draft genome of Australian environmental strain WM 09.24 of the opportunistic human pathogen Scedosporium aurantiacum | |
| RU2012126088A (ru) | Детектирование aad-12-события 416 у сои | |
| JP2017501733A5 (ru) | ||
| Shivarov et al. | Rapid detection of DNMT3A R882 mutations in hematologic malignancies using a novel bead-based suspension assay with BNA (NC) probes | |
| Mitsunaga et al. | Improved loop-mediated isothermal amplification for HLA-DRB1 genotyping using RecA and a restriction enzyme for enhanced amplification specificity | |
| Zhang et al. | A universal oligonucleotide microarray with a minimal number of probes for the detection and identification of viroids at the genus level | |
| JP2013519395A5 (ru) |