RU2018140783A - Композиции и способы усиления экспрессии гена pklr - Google Patents

Композиции и способы усиления экспрессии гена pklr Download PDF

Info

Publication number
RU2018140783A
RU2018140783A RU2018140783A RU2018140783A RU2018140783A RU 2018140783 A RU2018140783 A RU 2018140783A RU 2018140783 A RU2018140783 A RU 2018140783A RU 2018140783 A RU2018140783 A RU 2018140783A RU 2018140783 A RU2018140783 A RU 2018140783A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
expression cassette
cell
paragraphs
sequence
cassette according
Prior art date
Application number
RU2018140783A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2773358C2 (ru
RU2018140783A3 (ru
Inventor
Хосе С. СЕГОВИЯ
Мария Г. ГОМЕС
Сусана НАВАРРО
Нестор МЕСА
Хуан БУЭРЕН
Мария Г. БРАВО
Original Assignee
Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П.
Фундасьон Институто Де Инвестигасьон Санитариа Фундасьон Хименес Диас
Консорсио Сентро Де Инвестигасьон Биомедика Эн Ред, М.П.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П., Фундасьон Институто Де Инвестигасьон Санитариа Фундасьон Хименес Диас, Консорсио Сентро Де Инвестигасьон Биомедика Эн Ред, М.П. filed Critical Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П.
Publication of RU2018140783A publication Critical patent/RU2018140783A/ru
Publication of RU2018140783A3 publication Critical patent/RU2018140783A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2773358C2 publication Critical patent/RU2773358C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • A61K35/28Bone marrow; Haematopoietic stem cells; Mesenchymal stem cells of any origin, e.g. adipose-derived stem cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/45Transferases (2)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/06Antianaemics
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0641Erythrocytes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1205Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y207/00Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/01Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1)
    • C12Y207/0104Pyruvate kinase (2.7.1.40)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16041Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2740/16043Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00Nucleic acids vectors
    • C12N2800/22Vectors comprising a coding region that has been codon optimised for expression in a respective host
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/48Vector systems having a special element relevant for transcription regulating transport or export of RNA, e.g. RRE, PRE, WPRE, CTE

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Claims (35)

1. Кассета экспрессии, содержащая полинуклеотидную последовательность, содержащую следующее в 5’-3’-направлении:
a) промоторную последовательность;
b) последовательность, кодирующую продукт гена; и
c) сигнал экспорта рибонуклеиновой кислоты (РНК),
где промоторная последовательность функционально связана с последовательностью, кодирующей полипептид пируваткиназы.
2. Кассета экспрессии по п. 1, где промотор представляет собой промотор фосфоглицераткиназы (PGK).
3. Кассета экспрессии по п. 1 или 2, где продукт гена представляет собой терапевтический продукт гена.
4. Кассета экспрессии по п. 3, где терапевтический продукт гена представляет собой полипептид пируваткиназы (PK), необязательно полипептид пируваткиназы печени и эритроцитов (PKLR).
5. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-4, где последовательность, кодирующая продукт гена, является кодон-оптимизированной.
6. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-5, где сигнал экспорта РНК представляет собой мутантный посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурков (Wpre).
7. Кассета экспрессии по п. 6, где мутантный Wpre представляет собой химерный Wpre, содержащий последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с SEQ ID NО: 1.
8. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-7, дополнительно содержащая одну или более энхансерных последовательностей.
9. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-8, дополнительно содержащая последовательность полипуринового тракта (PPT) или последовательность сигнала полиаденилирования (polyA).
10. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-9, дополнительно содержащая одну или более из следующих последовательностей:
i) последовательность сигнала упаковки;
ii) усеченную последовательность Gag;
iii) Rev-чувствительный элемент (RRE);
iv) центральный полипуриновый тракт (cPPT);
v) центральную терминальную последовательность (CTS) и
vi) элемент последовательности (USE), расположенный против хода транскрипции, необязательно из вируса обезьян 40 (SV40-USE).
11. Кассета экспрессии по любому из пп. 1-10, дополнительно содержащая последовательности длинного концевого повтора 5’- и 3’-конца.
12. Рекомбинантный вектор доставки гена, содержащий кассету экспрессии по любому из пп. 1-11.
13. Рекомбинантный вектор доставки гена по п. 12, где рекомбинантный вектор доставки гена представляет собой вирус или вирусный вектор.
14. Рекомбинантный вектор доставки гена по п. 13, где вирус или вирусный вектор представляет собой лентивирус (LV).
15. Клетка, содержащая кассету экспрессии по любому из пп. 1-11 или вектор доставки гена по любому из пп. 12-14.
16. Клетка по п. 15, где клетка представляет собой гемопоэтическую стволовую клетку.
17. Клетка по п. 15, где клетка представляет собой коммитированную гемопоэтическую эритроидную клетку-предшественник.
18. Фармацевтическая композиция, содержащая фармацевтически приемлемый наполнитель и рекомбинантный вектор доставки гена по любому из пп. 12-14 или клетку по любому из пп. 15-17.
19. Способ лечения или предупреждения заболевания или нарушения у субъекта, нуждающегося в этом, предусматривающий введение субъекту фармацевтической композиции по п. 18.
20. Способ по п. 19, где заболевание или нарушение представляет собой недостаточность пируваткиназы (PKD), а продукт гена представляет собой полипептид пируваткиназы (PK), необязательно полипептид пируваткиназы печени и эритроцитов (PKLR).
21. Способ по п. 19 или 20, где фармацевтическая композиция содержит рекомбинантный вектор доставки гена.
22. Способ по п. 19 или 20, где фармацевтическая композиция содержит клетку.
23. Способ по п. 22, где клетка является аутологической по отношению к субъекту.
24. Способ по п. 22, где клетка является аллогенной по отношению к субъекту.
25. Способ экспрессии трансгена в эритроидных клетках, предусматривающий приведение одной или более эритроидных клеток в контакт с эффективным количеством рекомбинантного вирусного вектора, где вектор содержит промотор гена фосфоглицераткиназы человека, кодон-оптимизированный вариант трансгена на основе кДНК пируваткиназы печени и эритроцитов (PKLR) человека и мутантный посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурков, где после указанного приведения в контакт PKLR экспрессируется на выявляемых уровнях в одной или более эритроидных клетках.
RU2018140783A 2016-04-20 2017-04-20 Композиции и способы усиления экспрессии гена pklr RU2773358C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662325397P 2016-04-20 2016-04-20
US62/325,397 2016-04-20
PCT/US2017/028695 WO2017184903A1 (en) 2016-04-20 2017-04-20 Compositions and methods for enhanced gene expression of pklr

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018140783A true RU2018140783A (ru) 2020-05-20
RU2018140783A3 RU2018140783A3 (ru) 2020-08-17
RU2773358C2 RU2773358C2 (ru) 2022-06-02

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
PT3445406T (pt) 2021-08-30
JP7045362B2 (ja) 2022-03-31
KR102440880B1 (ko) 2022-09-06
US20190284573A1 (en) 2019-09-19
CN109641063B (zh) 2022-11-15
JP2019514422A (ja) 2019-06-06
HUE055862T2 (hu) 2021-12-28
US20220177920A1 (en) 2022-06-09
EP3445406A1 (en) 2019-02-27
ES2885833T3 (es) 2021-12-15
PL3445406T3 (pl) 2022-02-07
WO2017184903A1 (en) 2017-10-26
AU2017254665C1 (en) 2021-03-11
CN116179580A (zh) 2023-05-30
EP3445406A4 (en) 2019-12-25
MX2018012872A (es) 2019-08-22
CN109641063A (zh) 2019-04-16
EP3445406B1 (en) 2021-05-26
KR20190053136A (ko) 2019-05-17
IL262459A (en) 2018-12-31
RU2018140783A3 (ru) 2020-08-17
DK3445406T3 (da) 2021-08-30
AU2017254665B2 (en) 2020-11-12
BR112018071695A2 (pt) 2019-02-19
SG11201809096VA (en) 2018-11-29
AU2017254665A1 (en) 2018-11-22
AU2021200872A1 (en) 2021-03-04
KR102673203B1 (ko) 2024-06-10
JP2022101543A (ja) 2022-07-06
US11286501B2 (en) 2022-03-29
AU2021200872B2 (en) 2024-04-04
CA3021572A1 (en) 2017-10-26
KR20220147607A (ko) 2022-11-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7340471B6 (ja) ウイルスベクター産生系
US11203768B2 (en) Lentiviral protein delivery system for RNA-guided genome editing
Lundstrom RNA viruses as tools in gene therapy and vaccine development
JP6143231B2 (ja) 副腎脳白質ジストロフィおよび副腎脊髄神経障害のための遺伝子療法ベクター
US10184136B2 (en) Retroviral vectors
JP2018502583A5 (ru)
US11813316B2 (en) Lentiviral vector for treating hemoglobin disorders
JP2022535745A (ja) 最適化されたフェニルアラニンヒドロキシラーゼ発現
WO2014016580A1 (en) Transgene expression
Serguera et al. Gene therapy of the central nervous system: general considerations on viral vectors for gene transfer into the brain
ES2744448T5 (es) Vectores para la expresión transgénica
US20230416777A1 (en) Moloney murine leukemia virus-based self-inactivating vector and applications thereof
RU2018140783A (ru) Композиции и способы усиления экспрессии гена pklr
RU2020114948A (ru) Лентивирусные векторы для доставки pklr для лечения дефицита пируваткиназы
JP2012110290A5 (ru)
ES2578903B1 (es) Vector lentiviral de expresión autolimitada
WO2024015803A2 (en) Encrypted rna and methods of its use
Binder et al. Lentivirus vectors
AU2014256388A1 (en) Gene therapy vectors for adrenoleukodystrophy and adrenomyeloneuropathy