RU2018140063A - Композиции и способы для избирательной экспрессии белка - Google Patents

Композиции и способы для избирательной экспрессии белка Download PDF

Info

Publication number
RU2018140063A
RU2018140063A RU2018140063A RU2018140063A RU2018140063A RU 2018140063 A RU2018140063 A RU 2018140063A RU 2018140063 A RU2018140063 A RU 2018140063A RU 2018140063 A RU2018140063 A RU 2018140063A RU 2018140063 A RU2018140063 A RU 2018140063A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cell
domain
protein
fusion protein
expression
Prior art date
Application number
RU2018140063A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2795467C2 (ru
RU2018140063A3 (ru
Inventor
Андрей Голосов
Карла Гимарэс
Грегори МОТЦ
Майкл МАЙЛОН
Кристоф Т. ЭЛЛЕБРЕХТ
Эми С. ПЭЙН
Original Assignee
Новартис Аг
Дзе Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Пенсильвания
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис Аг, Дзе Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Пенсильвания filed Critical Новартис Аг
Publication of RU2018140063A publication Critical patent/RU2018140063A/ru
Publication of RU2018140063A3 publication Critical patent/RU2018140063A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2795467C2 publication Critical patent/RU2795467C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • A61K35/14Blood; Artificial blood
    • A61K35/15Cells of the myeloid line, e.g. granulocytes, basophils, eosinophils, neutrophils, leucocytes, monocytes, macrophages or mast cells; Myeloid precursor cells; Antigen-presenting cells, e.g. dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • A61P21/04Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system for myasthenia gravis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P5/00Drugs for disorders of the endocrine system
    • A61P5/14Drugs for disorders of the endocrine system of the thyroid hormones, e.g. T3, T4
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/06Antianaemics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/12Antihypertensives
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70517CD8
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70575NGF/TNF-superfamily, e.g. CD70, CD95L, CD153, CD154
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/60Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
    • C07K2317/62Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
    • C07K2317/622Single chain antibody (scFv)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/50Fusion polypeptide containing protease site
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/70Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/95Fusion polypeptide containing a motif/fusion for degradation (ubiquitin fusions, PEST sequence)

Claims (192)

1. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен условной экспрессии и второй из указанных белковых доменов представляет собой трансмембранный белок, где домен условной экспрессии имеет первое состояние, связанное с первым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, и второе состояние, связанное со вторым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, где второй уровень повышен, например, по меньшей мере в 2, 3, 4, 5, 10, 20 или 30 раз повышен, относительно первого уровня, в присутствии экспрессионного соединения.
2. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен условной экспрессии и второй из указанных белковых доменов представляет собой трансмембранный белок, где гетерологичный сайт расщепления протеазы представляет собой сайт расщепления фурина, при условии, что сайт расщепления фурина не содержит аминокислотную последовательность SARNRQKR (SEQ ID NO: 981).
3. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен условной экспрессии и второй из указанных белковых доменов представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR).
4. Слитый белок по любому из пп. 1-3, где домен условной экспрессии представляет собой домен деградации.
5. Слитый белок по любому из пп. 1-3, где домен условной экспрессии представляет собой домен агрегации.
6. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен деградации и второй из указанных белковых доменов представляет собой интересующий белок.
7. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен деградации и второй из указанных белковых доменов представляет собой трансмембранный белок.
8. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен деградации и второй из указанных белковых доменов представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR).
9. Слитый белок по любому из пп. 6-8, где домен деградации выбирают из домена рецептора эстрогена (ER), домена белка FKB (FKBP) или дигидрофолатредуктазы (DHFR).
10. Слитый белок по любому из пп. 4 или 6-9, где домен деградации получен из рецептора эстрогена (ER).
11. Слитый белок по любому из пп. 4 или 6-10, где домен деградации получен из рецептора эстрогена (ER) и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 97, 98, 99 или 100% идентична любой из SEQ ID NOs: 58 или 121.
12. Слитый белок по любому из пп. 4 или 6-9, где домен деградации получен из белка FKB (FKBP).
13. Слитый белок по любому из пп. 4, 6-9 или 12, где домен деградации получен из белка FKB (FKBP) и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 97, 98, 99 или 100% идентична SEQ ID NO: 56.
14. Слитый белок по любому из пп. 4 или 6-9, где домен деградации получен из дигидрофолатредуктазы (DHFR).
15. Слитый белок по любому из пп. 4, 6-9 или 14, где домен деградации получен из дигидрофолатредуктазы (DHFR) и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 97, 98, 99 или 100% идентична SEQ ID NO: 57.
16. Слитый белок по любому из пп. 4 или 6-15, где домен деградации имеет первое состояние, связанное с первым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, и второе состояние, связанное со вторым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, где второй уровень повышен, например, по меньшей мере в 2, 3, 4, 5, 10, 20 или 30 раз повышен, относительно первого уровня, в присутствии стабилизирующего соединения.
17. Слитый белок по п. 16, где указанное стабилизирующее соединение выбирают из базедоксифена или 4-гидрокситамоксифена (4-OHT), когда слитый белок содержит домен деградации, полученный из рецептора эстрогена.
18. Слитый белок по п. 16, где указанное стабилизирующее соединение представляет собой Shield-1, когда слитый белок содержит домен деградации, полученный из белка FKB.
19. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен агрегации и второй из указанных белковых доменов представляет собой трансмембранный белок, где домен агрегации имеет первое состояние, связанное с первым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, и второе состояние, связанное со вторым уровнем поверхностной экспрессии и/или внеклеточной экспрессии слитого белка, где второй уровень повышен, например, по меньшей мере в 2, 3, 4, 5, 10, 20 или 30 раз повышен, относительно первого уровня, в присутствии дезагрегирующего соединения.
20. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен агрегации и второй из указанных белковых доменов представляет собой трансмембранный белок, где гетерологичный сайт расщепления протеазы представляет собой сайт расщепления фурина, при условии, что сайт расщепления фурина не содержит аминокислотную последовательность SARNRQKR (SEQ ID NO: 981).
21. Слитый белок, содержащий два белковых домена, разделенные гетерологичным сайтом расщепления протеазы, где первый из указанных белковых доменов представляет собой домен агрегации и второй из указанных белковых доменов представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR).
22. Слитый белок по любому из пп. 19-21, где домен агрегации содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 или более повторов домена димеризации, например, домена гомодимеризации или гетеродимеризации.
23. Слитый белок по любому из пп. 19-22, где домен агрегации получен из белка FKB (FKBP).
24. Слитый белок по любому из пп. 19-22, где домен агрегации представляет собой домен FKBP F36M.
25. Слитый белок по любому из пп. 19-22, где домен агрегации получен из белка FKB (FKBP) и содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 97, 98, 99 или 100% идентична любой из SEQ ID NOs: 975 или 976.
26. Слитый белок по любому из пп. 19-25, содержащий дополнительно 2-й, 3-й, 4-й, 5-й, 6-й, 7-й, 8-й, 9-й или 10-й домен агрегации.
27. Слитый белок по п. 26, где 2-й, 3-й, 4-й, 5-й, 6-й, 7-й, 8-й, 9-й или 10-й домен агрегации представляет собой домен агрегации того же типа, что и первый домен агрегации.
28. Слитый белок по любому из пп. 19-25, где домен агрегации образует гомодимеры с таким же доменом агрегации.
29. Слитый белок по любому из пп. 19-25, содержащий множество доменов агрегации, где множество включает домены агрегации более, чем одного, например, двух типов, и домен агрегации первого типа образует гетеродимеры с доменом агрегации второго типа.
30. Слитый белок по п. 29, содержащий 2, 4, 6, 8 или 10 доменов агрегации, где слитый белок содержит равные количества доменов агрегации первого типа и доменов агрегации второго типа.
31. Слитый белок по п. 30, где домены агрегации первого типа и второго типа расположены в чередующемся порядке, например, первый, второй, первый, второй, или второй, первый, второй, первый.
32. Слитый белок по п. 19, где указанное дезагрегирующее соединение выбирают из FK506, рапамицина, AP22542, AP21998 и Shield-1, если слитый белок содержит домен агрегации, полученный из белка FKB (FKBP), например, FKBP F36M.
33. Слитый белок по любому из предшествующих пунктов, где указанный гетерологичный сайт расщепления расщепляется внутриклеточной протеазой млекопитающих.
34. Слитый белок по п. 33, где указанный сайт расщепления расщепляется протеазой, выбранной из группы, состоящей из фурина, PCSK1, PCSK5, PCSK6, PCSK7, катепсина B, гранзима B, фактора XA, энтерокиназы, гененазы, сортазы, PreScission протеазы, тромбина, TEV-протеазы и эластазы 1.
35. Слитый белок по любому из предшествующих пунктов, где указанный сайт расщепления содержит полипептид, имеющий мотив расщепления, выбранный из группы, состоящей из консенсусного мотива RX(K/R)R, консенсусного мотива RXXX[KR]R, консенсусного мотива RRX, консенсусного мотива I-E-P-D-X (SEQ ID NO: 35), Glu/Asp-Gly-Arg, Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (SEQ ID NO: 36), Pro-Gly-Ala-Ala-His-Tyr (SEQ ID NO: 37), консенсусного мотива LPXTG/A, Leu-Glu-Val-Phe-Gln-Gly-Pro (SEQ ID NO: 38), Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser (SEQ ID NO: 40), E-N-L-Y-F-Q-G (SEQ ID NO: 41) и [AGSV]-x (SEQ ID NO: 42).
36. Слитый белок по п. 34 или 35, где указанный сайт расщепления расщепляется фурином.
37. Слитый белок по п. 36, содержащий сайт расщепления фурина, выбранный из RTKR (SEQ ID NO: 123); GTGAEDPRPSRKRRSLGDVG (SEQ ID NO: 125); GTGAEDPRPSRKRR (SEQ ID NO: 127); LQWLEQQVAKRRTKR (SEQ ID NO: 129); GTGAEDPRPSRKRRSLGG (SEQ ID NO: 131); GTGAEDPRPSRKRRSLG (SEQ ID NO: 133); SLNLTESHNSRKKR (SEQ ID NO: 135) или CKINGYPKRGRKRR (SEQ ID NO: 137).
38. Слитый белок по п. 36, содержащий сайт расщепления фурина GTGAEDPRPSRKRRSLGDVG (SEQ ID NO: 125).
39. Слитый белок по любому из пп. 1-32, где указанный гетерологичный сайт расщепления протеазы расщепляется внеклеточной протеазой млекопитающих.
40. Слитый белок по п. 39, где указанную внеклеточную протеазу млекопитающих выбирают из группы, состоящей из фактора XA, энтерокиназы, гененазы, сортазы, PreScission протеазы, тромбина, TEV-протеазы и эластазы 1.
41. Слитый белок по п. 39, где указанный сайт расщепления содержит полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из Glu/Asp-Gly-Arg, Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (SEQ ID NO: 36), Pro-Gly-Ala-Ala-His-Tyr (SEQ ID NO: 37), консенсусного мотива LPXTG/A, Leu-Glu-Val-Phe-Gln-Gly-Pro (SEQ ID NO: 38), Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser (SEQ ID NO: 40), E-N-L-Y-F-Q-G (SEQ ID NO: 41) и [AGSV]-x (SEQ ID NO: 42).
42. Слитый белок по любому из предшествующих пунктов, где указанный второй белковый домен представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR).
43. Слитый белок по п. 42, где указанный химерный антигенный рецептор (CAR) содержит, в направлении от N-конца к C-концу, антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и один или более внутриклеточных сигнальных доменов.
44. Слитый белок по п. 43, где указанный внутриклеточный сигнальный домен содержит один или более основных сигнальных доменов.
45. Слитый белок по п. 43 или 44, где указанный внутриклеточный сигнальный домен содержит один или более костимулирующих сигнальных доменов.
46. Слитый белок по п. 44, где один из указанных одного или более основных сигнальных доменов содержит стимулирующий домен CD3-дзета.
47. Слитый белок по п. 45, где один из указанных костимулирующих сигнальных доменов представляет собой внутриклеточный домен из костимулирующего белка, выбранного из группы, состоящей из CD27, CD28, 4-1BB (CD137), OX40, GITR, CD30, CD40, ICOS, BAFFR, HVEM, ICAM-1, антигена 1, ассоциированного с функцией лимфоцитов (LFA-1), CD2, CDS, CD7, CD287, LIGHT, NKG2C, NKG2D, SLAMF7, NKp80, NKp30, NKp44, NKp46, CD160, B7-H3 или лиганда, который специфически связывает CD83.
48. Слитый белок по п. 47, где указанный один или более из указанных костимулирующих сигнальных доменов содержит костимулирующий домен 4-1BB.
49. Слитый белок по п. 47, где указанный один или более из указанных костимулирующих доменов содержит костимулирующий домен CD28.
50. Слитый белок по любому из пп. 43-49, где указанный антигенсвязывающий домен представляет собой scFv.
51. Слитый белок по любому из пп. 43-49, где указанный антигенсвязывающий домен связывает антиген, выбранный из группы, состоящей из CD19; CD123; CD22; CD30; CD171; CS-1; подобной лектину C-типа молекулы 1, CD33; рецептора варианта III эпидермального фактора роста (EGFRvIII); ганглиозида G2 (GD2); ганглиозида GD3; представителя семейства TNF-рецепторов, антигена созревания B-клеток (BCMA); Tn-антигена ((Tn Ag) или (GalNAcα-Ser/Thr)); простатического специфического мембранного антигена (PSMA); подобного рецепторной тирозинкиназе рецептора-сироты 1 (ROR1); Fms-подобной тирозинкиназы 3 (FLT3); опухоль-ассоциированного гликопротеина 72 (TAG72); CD38; CD44v6; канцероэмбрионального антигена (CEA); молекулы адгезии эпителиальных клеток (EPCAM); B7H3 (CD276); KIT (CD117); субъединицы альфа-2 рецептора интерлейкина-13; мезотелина; субъединицы альфа рецептора интерлейкина-11 (IL-11Ra); антигена простатических стволовых клеток (PSCA); сериновой протеазы 21; рецептора 2 фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR2); Lewis(Y) антигена; CD24; рецептора бета фактора роста тромбоцитов (PDGFR-бета); стадиеспецифического эмбрионального антигена-4 (SSEA-4); CD20; фолатного рецептора альфа; рецепторной тирозин-специфической протеинкиназы ERBB2 (Her2/neu); муцина 1, связанного с клеточной поверхностью (MUC1); рецептора эпидермального фактора роста (EGFR); молекулы адгезии нейронов (NCAM); простазы; простатической кислой фосфатазы (PAP); мутантного фактора элонгации 2 (ELF2M); эфрина B2; белка альфа активации фибробластов (FAP); рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 (рецептора IGF-I), карбоангидразы IX (CAIX); субъединицы протеасомы (просома, макропаин), типа бета, 9 (LMP2); гликопротеина 100 (gp100); онкогенного слитого белка, включающего область локализации сайта инициации реаранжировки (BCR) и гомолог 1 вирусного онкогена лейкоза мышей Абельсона (Abl) (bcr-abl); тирозиназы; рецептора эфрина A2 (EphA2); фукозила GM1; молекулы адгезии сиалил-Льюис (sLe); ганглиозида GM3; трансглутаминазы 5 (TGS5); высокомолекулярного меланома-ассоциированного антигена (HMWMAA); o-ацетил-GD2 ганглиозида (OAcGD2); фолатного рецептора бета; опухолевого эндотелиального маркера 1 (TEM1/CD248); антигена, родственного опухолевому эндотелиальному маркеру 7 (TEM7R); клаудина-6 (CLDN6); рецептора тиреостимулирующего гормона (TSHR); связанных с G-белками рецепторов класса C, группы 5, представителя D (GPRC5D); открытой рамки считывания 61 хромосомы X (CXORF61); CD97; CD179a; киназы анапластической лимфомы (ALK); полисиаловой кислоты; плацента-специфического белка 1 (PLAC1); гексасахаридной части гликоцерамида globoH (GloboH); дифференцировочного антигена молочной железы (NY-BR-1); уроплакина 2 (UPK2); клеточного рецептора 1 вируса гепатита A (HAVCR1); адренорецептора бета-3 (ADRB3); паннексина 3 (PANX3); связанного с G-белками рецептора 20 (GPR20); комплекса лимфоцитарного антигена 6, локуса K9 (LY6K); ольфакторного рецептора 51E2 (OR51E2); белка TCR-гамма с альтернативной рамкой считывания (TARP); белка опухоли Вильмса (WT1); антигена 1 рака яичка (NY-ESO-1); антигена 2 рака яичка (LAGE-1a); меланома-ассоциированного антигена 1 (MAGE-A1); транслокационного варианта 6 гена ETS, расположенного на хромосоме 12p (ETV6-AML); белка спермы 17 (SPA17); семейства X антигенов, представителя 1A (XAGE1); ангиопоэтин-связывающего клеточного поверхностного рецептора 2 (Tie 2); антигена 1 меланомы яичка (MAD-CT-1); антигена 2 меланомы яичка (MAD-CT-2); Fos-родственного антигена 1; опухолевого белка p53 (p53); мутанта p53; простеина; сурвивина; теломеразы; опухолевого антигена 1 карциномы предстательной железы, узнаваемого T-клетками антигена меланомы 1; мутанта белка вируса крысиной саркомы (Ras); обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT); точек разрыва при транслокации в случае саркомы; ингибитора апоптоза из клеток меланомы (ML-IAP); ERG (слитого гена трансмембранной сериновой протеазы 2 (TMPRSS2) и ETS); N-ацетилглюкозамин трансферазы V (NA17); белка парного бокса Pax-3 (PAX3); рецептора андрогена; циклина B1; полученного из нейробластомы гомолога онкогена v-myc вируса птичьего миелоцитоматоза (MYCN); представителя C семейства гомологов Ras (RhoC); родственного тирозиназе белка 2 (TRP-2); цитохрома P450 1B1 (CYP1B1); белка, подобного CCCTC-связывающему фактору (белку «цинковый палец»), узнаваемого T-клетками антигена плоскоклеточной карциномы 3 (SART3); белка парного бокса Pax-5 (PAX5); проакрозин-связывающего белка sp32 (OY-TES1); лимфоцит-специфической протеинтирозинкиназы (LCK); якорного белка 4 A-киназы (AKAP-4); точки разрыва 2 в X при синовиальной саркоме (SSX2); рецептора для конечных продуктов усиленного гликозилирования (RAGE-1); почечного убиквитарного белка 1 (RU1); почечного убиквитарного белка 2 (RU2); легумаина; белка E6 вируса папилломы человека (HPV E6); белка E7 вируса папилломы человека (HPV E7); кишечной карбоксилэстеразы; мутантного белка теплового шока 70-2 (mut hsp70-2); CD79a; CD79b; CD72; связанного с лейкоцитами иммуноглобулиноподобного рецептора 1 (LAIR1); Fc-фрагмента рецептора IgA (FCAR или CD89); иммуноглобулиноподобных рецепторов лейкоцитов, подсемейства A, представителя 2 (LILRA2); семейства белков, подобных молекуле CD300, представителя f (CD300LF); семейства 12 доменных лектинов C-типа, представителя A (CLEC12A); антигена 2 стромальных клеток костного мозга (BST2); белка 2, подобного EGF-подобный домен-содержащему муциноподобному гормональному рецептору (EMR2); лимфоцитарного антигена 75 (LY75); глипикана-3 (GPC3); Fc-рецептор-подобного белка 5 (FCRL5) или подобного цепи лямбда иммуноглобулина полипептида 1 (IGLL1).
52. Слитый белок по п. 51, где указанный антиген представляет собой CD19.
53. Слитый белок по п. 52, содержащий антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 356-368 или 381.
54. Слитый белок по п. 52, содержащий химерный антигенный рецептор, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 897, 902, 907, 912, 917, 922, 927, 932, 937, 942, 947, 952, 956.
55. Слитый белок по п. 51, где указанный антиген представляет собой CD123.
56. Слитый белок по п. 55, содержащий антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 751, 756, 761 или 766.
57. Слитый белок по п. 55, содержащий химерный антигенный рецептор, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 750, 755, 760 или 765.
58. Слитый белок по п. 51, где указанный антиген представляет собой BCMA.
59. Слитый белок по п. 58, содержащий антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430, 434, 438, 442, 446, 450, 454, 458, 462, 466, 470, 474, 478, 482, 486, 490, 494, 498, 502, 506, 510, 514, 518, 522, 528, 531, 534 или 537.
60. Слитый белок по п. 58, содержащий химерный антигенный рецептор, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NOs: 789, 791, 793, 795, 797, 799, 801, 803, 805, 807, 809, 811, 813, 815, 817, 819, 821, 823, 825, 827, 829, 831, 833, 835, 837, 839, 841, 843, 845, 847, 849, 851, 853, 855, 857 или 859.
61. Слитый белок по п. 51, где указанный антиген представляет собой CD20.
62. Слитый белок по п. 61, содержащий антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность, занимающую положения 470-712 или 470-939 в SEQ ID NO: 3033.
63. Слитый белок по п. 61, содержащий химерный антигенный рецептор, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3033.
64. Слитый белок по любому из предшествующих пунктов, где домен условной экспрессии, например, домен агрегации или домен деградации, расположен в:
a) N-концевом направлении относительно указанного второго белкового домена; или
b) C-концевом направлении относительно указанного второго белкового домена.
65. Слитый белок по любому из пп. 1-64, дополнительно содержащий сигнальный пептид, например, содержащий сигнальный пептид в N-концевом направлении относительно указанного домена условной экспрессии, например, домена агрегации или домена деградации.
66. Слитый белок по п. 65, дополнительно содержащий линкер, расположенный между сигнальным пептидом и другим доменом слитого белка, например, расположенный между сигнальным пептидом и указанным доменом условной экспрессии, например, доменом агрегации или доменом деградации.
67. Слитый белок по п. 66, где линкер представляет собой линкер в любом слитом белке, приведенном в Таблицах 23 и 24.
68. Слитый белок, содержащий аминокислотную последовательность любого слитого белка, приведенного в Таблицах 22, 23 и 24.
69. Нуклеиновая кислота, кодирующая слитый белок по любому из пп. 1-68.
70. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п. 69.
71. Вектор по п. 70, представляющий собой вирусный вектор.
72. Вектор по п. 70, представляющий собой лентивирусный вектор.
73. Вирусная частица, содержащая вектор по любому из пп. 70-72.
74. Клетка, например, клетка-хозяин, содержащая слитый белок по любому из пп. 1-68, нуклеиновую кислоту по п. 69, или вектор по любому из пп. 70-72.
75. Клетка по п. 74, где указанная клетка, например, клетка-хозяин, представляет собой человеческую эффекторную клетку, например, человеческую T-клетку или человеческую NK-клетку.
76. Клетка по любому из пп. 74 или 75, где указанная клетка, например, клетка-хозяин, дополнительно содержит протеазу, способную расщеплять указанный гетерологичный сайт расщепления протеазы.
77. Клетка по любому из пп. 74-76, где в отсутствие экспрессионного соединения, например, стабилизирующего соединения, слитый белок деградирует в клеточных путях деградации, например, по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или более слитого белка деградирует.
78. Клетка по любому из пп. 74-76, где в отсутствие экспрессионного соединения, например, дезагрегирующего соединения, слитый белок находится в агрегированном состоянии в клетке, например, в эндоплазматическом ретикулуме или цитозоле, например, по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или более белка находится в агрегированном состоянии.
79. Клетка по любому из пп. 74-78, дополнительно содержащая экспрессионное соединение, например, стабилизирующее соединение.
80. Клетка по п. 79, в которой домен условной экспрессии, например, домен деградации, принимает конформацию, более устойчивую к деградации в клетке, в присутствии экспрессионного соединения, например, стабилизирующего соединения, в сравнении с конформацией в отсутствие экспрессионного соединения.
81. Клетка по любому из пп. 79 или 80, в которой конформация слитого белка является более подверженной расщеплению в гетерологичном сайте расщепления протеазы в присутствии экспрессионного соединения, например, стабилизирующего соединения, в сравнении с конформацией в отсутствие экспрессионного соединения.
82. Клетка по любому из пп. 79 или 80, в которой уровень клеточной поверхностной экспрессии или внеклеточной экспрессии слитого белка повышен, например, в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20 или 30 раз повышен, относительно уровня клеточной поверхностной экспрессии или внеклеточной экспрессии слитого белка в клетке, не содержащей экспрессионное соединение, например, стабилизирующее соединение.
83. Клетка по любому из пп. 74-78, дополнительно содержащая экспрессионное соединение, например, дезагрегирующее соединение.
84. Клетка по п. 83, в которой домен условной экспрессии, например, домен агрегации, принимает конформацию, более устойчивую к олигомеризации или агрегации, в присутствии экспрессионного соединения, например, дезагрегирующего соединения, в сравнении с конформацией в отсутствие экспрессионного соединения.
85. Клетка по любому из пп. 83 или 84, в которой конформация слитого белка является более подверженной расщеплению в гетерологичном сайте расщепления протеазы в присутствии экспрессионного соединения, например, дезагрегирующего соединения, в сравнении с конформацией в отсутствие экспрессионного соединения.
86. Клетка по любому из пп. 83 или 84, в которой уровень клеточной поверхностной экспрессии или внеклеточной экспрессии слитого белка повышен, например, в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20 или 30 раз повышен, относительно уровня клеточной поверхностной экспрессии или внеклеточной экспрессии слитого белка в клетке, не содержащей экспрессионное соединение, например, дезагрегирующее соединение.
87. Способ условной экспрессии интересующего белка, трансмембранного белка или CAR на поверхности клетки, включающий: создание контакта слитого белка по любому из пп. 1-68, или клетки, содержащей указанный слитый белок (например, клетки по любому из пп. 74-86), с экспрессионным соединением, при этом:
(a) в присутствии указанного экспрессионного соединения поверхностная экспрессия указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR повышена, например, в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20 или 30 раз повышена, относительно уровня поверхностной экспрессии указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR в отсутствие указанного экспрессионного соединения; и
(b) в отсутствие указанного экспрессионного соединения поверхностная экспрессия указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR существенно снижена, например, в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20 или 30 раз снижена, относительно уровня поверхностной экспрессии указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR в присутствии экспрессионного соединения.
88. Способ по п. 87, где присутствие указанного экспрессионного соединения связано с, например, вызывает, изменением конформации домена условной экспрессии из первого свернутого состояния во второе свернутое состояние, где первое свернутое состояние более подвержено деградации, например, деградации в клетке, или агрегации, в сравнении со вторым свернутым состоянием.
89. Способ по любому из пп. 87 или 88, где присутствие указанного экспрессионного соединения приводит к экспонированию указанного сайта расщепления протеазы, например, в большей степени, например, в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20 или 30 раз большей, чем экспонирование сайта расщепления протеазы в отсутствие указанного экспрессионного соединения.
90. Способ условной экспрессии интересующего белка, трансмембранного белка или CAR, включающий создание контакта клетки, например, клетки по любому из пп. 74-86, с экспрессионным соединением, например, стабилизирующим соединением или дезагрегирующим соединением, при этом:
(a) в присутствии указанного экспрессионного соединения указанный домен условной экспрессии принимает конформацию, более подверженную расщеплению гетерологичного сайта расщепления протеазы, чем конформация в отсутствие экспрессионного соединения,
что приводит к отщеплению указанного домена условной экспрессии от интересующего белка, трансмембранного белка или CAR и экспрессии указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR; и
(b) в отсутствие указанного экспрессионного соединения указанный домен условной экспрессии принимает конформацию, более устойчивую к расщеплению гетерологичного сайта расщепления протеазы, чем конформация в присутствии экспрессионного соединения, что приводит к деградации или агрегации указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR.
91. Способ по п. 90, где указанная клетка контактирует с указанным экспрессионным соединением ex vivo.
92. Способ по п. 90, где указанная клетка контактирует с указанным экспрессионным соединением in vivo.
93. Способ условной экспрессии интересующего белка, трансмембранного белка или CAR, включающий создание контакта клетки, например, клетки по любому из пп. 74-86, со стабилизирующим соединением, при этом:
(a) в присутствии указанного стабилизирующего соединения
(i) указанный домен деградации принимает конформацию, более устойчивую к деградации в клетке в сравнении с конформацией в отсутствие стабилизирующего соединения,
что приводит к отщеплению указанного домена деградации от указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR и экспрессии указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR; и
(b) в отсутствие указанного стабилизирующего соединения указанный домен деградации принимает конформацию, более подверженную деградации в клетке в сравнении с конформацией в присутствии стабилизирующего соединения, что приводит к деградации указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR.
94. Способ по п. 93, где указанная клетка контактирует с указанным стабилизирующим соединением ex vivo.
95. Способ по п. 93, где указанная клетка контактирует с указанным стабилизирующим соединением in vivo.
96. Способ условной экспрессии интересующего белка, трансмембранного белка или CAR, включающий создание контакта клетки, например, клетки по любому из пп. 74-86, с дезагрегирующим соединением, при этом:
(a) в присутствии указанного дезагрегирующего соединения
(i) указанный домен агрегации принимает конформацию, более устойчивую к агрегации или олигомеризации в сравнении с конформацией в отсутствие дезагрегирующего соединения,
что приводит к отщеплению указанного домена агрегации от указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR и экспрессии указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR; и
(b) в отсутствие указанного дезагрегирующего соединения указанный домен агрегации принимает конформацию, более подверженную агрегации или олигомеризации в сравнении с конформацией в присутствии дезагрегирующего соединения, что приводит к агрегации указанного интересующего белка, трансмембранного белка или CAR.
97. Способ по п. 96, где указанная клетка контактирует с указанным дезагрегирующим соединением ex vivo.
98. Способ по п. 96, где указанная клетка контактирует с указанным дезагрегирующим соединением in vivo.
99. Способ лечения субъекта, имеющего заболевание, связанное с экспрессией опухолевого антигена, включающий введение субъекту эффективного количества клетки, например, клетки по любому из пп. 74-86, где указанный второй белок представляет собой химерный антигенный рецептор и содержит, в направлении от N-конца к C-концу, антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и один или более внутриклеточных сигнальных доменов, и указанный антигенсвязывающий домен специфически связывает указанный опухолевый антиген.
100. Способ лечения вызываемого аутоантителами или аллоантителами заболевания или состояния, включающий введение субъекту эффективного количества клетки, например, клетки по любому из пп. 74-86, где указанный второй белок представляет собой химерный антигенный рецептор и содержит, в направлении от N-конца к C-концу, антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и один или более внутриклеточных сигнальных доменов, и указанный антигенсвязывающий домен специфически связывает антиген, специфичный для указанного вызываемого аутоантителами или аллоантителами заболевания.
101. Способ по п. 99 или 100, где указанная клетка является аутологичной для указанного субъекта.
102. Способ по п. 99 или 100, где указанная клетка является аллогенной для указанного субъекта.
103. Способ по любому из пп. 99-102, где клетка контактирует с экспрессионным соединением и:
(a) в присутствии указанного экспрессионного соединения
(i) указанный домен условной экспрессии принимает конформацию, более устойчивую к деградации или агрегации в клетке в сравнении с конформацией в отсутствие указанного экспрессионного соединения, что приводит к отщеплению указанного домена условной экспрессии от указанного химерного антигенного рецептора (CAR) и экспрессии указанного CAR; и
(b) в отсутствие указанного экспрессионного соединения указанный домен условной экспрессии принимает конформацию, более подверженную деградации или агрегации в клетке в сравнении с конформацией в присутствии указанного экспрессионного соединения, что приводит к деградации или агрегации указанного слитого белка.
104. Способ по любому из пп. 99-102, где клетка, например, клетка-хозяин, контактирует со стабилизирующим соединением и:
(a) в присутствии указанного стабилизирующего соединения
(i) указанный домен деградации принимает конформацию, более устойчивую к деградации в клетке в сравнении с конформацией в отсутствие указанного стабилизирующего соединения,
что приводит к отщеплению указанного домена деградации от указанного химерного антигенного рецептора (CAR) и экспрессии указанного CAR; и
(b) в отсутствие указанного стабилизирующего соединения указанный домен деградации принимает конформацию, более подверженную деградации в клетке в сравнении с конформацией в присутствии указанного стабилизирующего соединения, что приводит к деградация указанного слитого белка.
105. Способ по любому из пп. 90-98 и 104, где указанное стабилизирующее соединение выбирают из базедоксифена или 4-гидрокситамоксифена (4-OHT), если слитый белок содержит домен деградации, полученный из рецептора эстрогена.
106. Способ по любому из пп. 90-98 и 104, где указанное стабилизирующее соединение представляет собой Shield-1, если слитый белок содержит домен деградации, полученный из белка FKB.
107. Способ по любому из пп. 99-102, где клетка контактирует с дезагрегирующим соединением, и:
(a) в присутствии указанного дезагрегирующего соединения
(i) указанный домен агрегации принимает конформацию, более устойчивую к агрегации или олигомеризации в сравнении с конформацией в отсутствие указанного дезагрегирующего соединения,
что приводит к отщеплению указанного домена агрегации от указанного химерного антигенного рецептора (CAR) и экспрессии указанного CAR; и
(b) в отсутствие указанного дезагрегирующего соединения указанный домен агрегации принимает конформацию, более подверженную агрегации или олигомеризации в сравнении с конформацией в присутствии указанного дезагрегирующего соединения, что приводит к агрегации указанного слитого белка.
108. Способ по любому из пп. 90-98 и 107, где указанное дезагрегирующее соединение выбирают из FK506, рапамицина, AP22542 и AP21998, если слитый белок содержит домен агрегации, полученный из белка FKB (FKBP), например, FKBP F36M.
109. Способ по любому из пп. 100-108, где вызываемое аутоантителами заболевание или состояние выбирают из группы, состоящей из буллезного пемфигоида, приобретенного буллезного эпидермолиза, p200 пемфигоида, линеарного IgA-зависимого буллезного дерматоза, других заболеваний группы пемфигоидных заболеваний, герпетиформного дерматита, глютенчувствительной целиакии, миастении, синдрома Гудпасчера, гранулематоза с полиангиитом и других ANCA+ форм васкулита, аутоиммунного энцефалита с поражением лимбической системы, анти-NMDA-рецепторного энцефалита, нейромиелита зрительного нерва, аутоиммунной гемолитической анемии, вызываемого аутоантителами повреждения органов-мишеней при волчанке и других заболеваниях соединительной ткани (вызываемого анти-дцДНК, анти-Ro и другими аутоантителами), болезни Грейвса и тиреоидита Хашимото, продуцирования антител против инсулина при диабете, антител против инсулиновых рецепторов при аутоиммунной гипогликемии, криоглобулинемии, ревматоидного артрита, рассеянного склероза, синдрома Шегрена, дерматомиозита, продуцирования антител против рецепторов Fc-эпсилон при хронической идиопатической крапивнице, антител против фолатных рецепторов, антител против эндотелиальных рецепторов или против адренергических рецепторов при легочной артериальной гипертензии, рефрактерной гипертензии, расширенной кардиомиопатии и аутовоспалительного синдрома.
110. Способ по любому из пп. 100-108, где вызываемое аллоантителами заболевание или состояние представляет собой иммунную реакцию в ответ на трансплантацию органа, переливание крови, беременность или белковую заместительную терапию.
111. Способ по любому из пп. 99-108, где заболевание, связанное с экспрессией опухолевого антигена, представляет собой рак.
112. Способ по п. 111, где рак представляет собой мезотелиому (например, злокачественную мезотелиому плевры), например, у субъекта, у которого он прогрессировал при по меньшей мере одной предшествующей стандартной терапии; рак легкого (например, немелкоклеточный рак легкого, мелкоклеточный рак легкого, плоскоклеточный рак легкого или крупноклеточный рак легкого); рак поджелудочной железы (например, протоковую аденокарциному поджелудочной железы или метастатическую протоковую аденокарциному поджелудочной железы (PDA), например, у субъекта, у которого она прогрессировала при по меньшей мере одной предшествующей стандартной терапии); аденокарциному пищевода, рак яичника (например, серозный эпителиальный рак яичника, например, у субъекта, у которого он прогрессировал после по меньшей мере одной предшествующей схемы стандартной терапии), рак молочной железы, колоректальный рак, рак мочевого пузыря или любое их сочетание.
113. Способ по любому из пп. 99-111, где заболевание, связанное с экспрессией опухолевого антигена, представляет собой гематологический рак, например, гематологический рак, выбранный из лейкоза или лимфомы.
114. Способ по п. 111, где рак выбирают из: хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), лимфомы из клеток мантийной зоны (MCL), множественной миеломы, острого лимфоидного лейкоза (ALL), лимфомы Ходжкина, B-клеточного острого лимфоидного лейкоза (BALL), T-клеточного острого лимфоидного лейкоза (TALL), мелкоклеточной лимфоцитарной лимфомы (SLL), B-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, новообразования из бластных плазмацитоидных дендритных клеток, лимфомы Беркитта, диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (DLBCL), DLBCL, связанной с хроническим воспалением, хронического миелоидного лейкоза, миелопролиферативных новообразований, фолликулярной лимфомы, фолликулярной лимфомы у детей, волосатоклеточного лейкоза, мелкоклеточной или крупноклеточной фолликулярной лимфомы, злокачественных лимфопролиферативных состояний, лимфомы MALT-типа (экстранодальная лимфома маргинальной зоны, возникающая из лимфоидной ткани, ассоциированной со слизистыми оболочками), лимфомы маргинальной зоны, миелодисплазии, миелодиспластического синдрома, неходжскинской лимфомы, плазмабластной лимфомы, новообразования из плазмацитоидных дендритных клеток, макроглобулинемии Вальденстрема, лимфомы маргинальной зоны селезенки, лимфомы/лейкоза клеток селезенки, диффузной мелкоклеточной В-клеточной лимфомы красной пульпы селезенки, волосатоклеточного лейкоза - варианта, лимфоплазматической лимфомы, болезни тяжелых цепей, миеломы из плазматических клеток, одиночной плазмоцитомы кости, внекостной плазмоцитомы, нодальной лимфомы маргинальной зоны, нодальной лимфомы маргинальной зоны у детей, первичной кожной фолликулярной лимфомы, лимфогранулематоза, первичной медиастинальной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (тимуса), внутрисосудистой крупноклеточной В-клеточной лимфомы, ALK+ крупноклеточной В-клеточной лимфомы, крупноклеточной В-клеточной лимфомы, возникающей при HHV8-ассоциированной многоочаговой болезни Кастлемана, первичной эффузионной лимфомы, В-клеточной лимфомы, острого миелоидного лейкоза (AML) или неподдающейся классификации лимфомы.
115. Способ по п. 111, где рак выбирают из MCL, CLL, ALL, лимфомы Ходжкина, AML или множественной миеломы.
116. Слитый белок, нуклеиновая кислота, вектор, вирусная частица или клетка по любому из предшествующих пунктов для использования в качестве лекарственного средства.
117. Слитый белок, нуклеиновая кислота, вектор, клетка, композиция или способ по любому из предшествующих пунктов для использования в лечении заболевания, связанного с экспрессией опухолевого антигена, например, рака.
118. Способ лечения вызываемого аутоантителами или аллоантителами заболевания или состояния у субъекта, который нуждается в этом, включающий введение эффективного количества фармацевтической композиции, содержащей модифицированную T-клетку, субъекту, где модифицированная T-клетка содержит нуклеиновую кислоту, содержащую суицидный ген, и нуклеиновую кислоту, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
119. Способ лечения вызываемого аутоантителами или аллоантителами заболевания или состояния у субъекта, который нуждается в этом, включающий введение эффективного количества фармацевтической композиции, содержащей модифицированную T-клетку, субъекту, где модифицированная T-клетка содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую домен димеризации и химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
120. Способ по п. 118, где суицидный ген кодирует аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 3005-3007.
121. Способ по п. 118, где продукт суицидного гена также содержит домен димеризации, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3013 и 3014.
122. Способ по п. 119, где домен димеризации содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 980.
123. Способ по п. 121, где домен димеризации также содержит сайт расщепления фурина, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 980.
124. Способ по п. 119, где CAR также содержит сигнальный пептид.
125. Способ по п. 124, где сигнальный пептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3035.
126. Способ по любому из пп. 118 или 119, где введение эффективного количества включает активацию модифицированной T-клетки для оказания цитотоксического действия на B-клетки.
127. Способ по п. 118, дополнительно включающий активацию продукта суицидного гена для индукции клеточной гибели модифицированной T-клетки.
128. Способ по п. 127, где активация продукта суицидного гена также включает введение димеризующего средства для стимуляции димеризации продукта суицидного гена.
129. Способ по п. 127, где активация продукта суицидного гена происходит после того, как модифицированная T-клетка оказывает цитотоксическое действие на B-клетки.
130. Способ по п. 127, где активация продукта суицидного гена происходит после начала развития у субъекта неблагоприятной реакции на модифицированную T-клетку.
131. Способ по п. 118, дополнительно включающий подавление активации продукта суицидного гена для подавления клеточной гибели модифицированной T-клетки.
132. Способ по п. 131, где подавление активации продукта суицидного гена также включает введение солюбилизирующего средства для предотвращения димеризации продукта суицидного гена.
133. Способ по п. 132, где введение солюбилизирующего средства происходит одновременно с введением модифицированной T-клетки и продолжается, пока модифицированная T-клетка оказывает цитотоксическое действие на B-клетки.
134. Способ по п. 133, где введение солюбилизирующего средства прекращается после начала развития у субъекта неблагоприятной реакции на модифицированную T-клетку.
135. Способ по любому из пп. 118 или 119, где анти-B-клеточный связывающий домен CAR содержит антитело, выбранное из группы, состоящей из моноклонального антитела, поликлонального антитела, синтетического антитела, человеческого антитела, гуманизированного антитела, однодоменного антитела, одноцепочечного вариабельного фрагмента и их антигенсвязывающих фрагментов.
136. Способ по любому из пп. 118 или 119, где анти-B-клеточный связывающий домен CAR специфически связывает B-клеточный маркер, выбранный из группы, состоящей из CD19, BCMA, CD20, CD21, CD27, CD38, CD138, а также любого их сочетания.
137. Способ по любому из пп. 118 или 119, где анти-B-клеточный связывающий домен CAR специфически связывает B-клеточный маркер, выбранный из группы, состоящей из CD20, CD21, CD27, CD38, CD138, любого их сочетания, и по меньшей мере одного поверхностного маркера, находящегося исключительно на про-B-клетке, пре-B-клетке, незрелой B-клетке, зрелой B-клетке, B-клетке памяти и плазматической клетке.
138. Способ по любому из пп. 118 или 119, где внутриклеточный домен CAR содержит двойные сигнальные домены.
139. Способ по любому из пп. 118 или 119, где костимулирующий домен выбирают из группы, состоящей из CD3, CD27, CD28, CD83, CD86, CD127, 4-1BB, 4-1BBL, PD-1, PD-1L, T-клеточного рецептора (TCR), любого их производного или варианта, любой их синтетической последовательности, которая обладает такими же функциональными свойствами, а также любого их сочетания.
140. Способ по любому из пп. 119 или 139, дополнительно включающий введение солюбилизирующего средства для предотвращения димеризации CAR.
141. Способ по п. 140, где введение солюбилизирующего средства происходит одновременно с введением модифицированной T-клетки и продолжается, пока модифицированная T-клетка оказывает цитотоксическое действие на B-клетки.
142. Способ по п. 138, где введение солюбилизирующего средства прекращается после начала развития у субъекта неблагоприятной реакции на модифицированную T-клетку.
143. Способ по любому из пп. 118 или 119, где вызываемое аутоантителами заболевание или состояние выбирают из группы, состоящей из буллезного пемфигоида, приобретенного буллезного эпидермолиза, p200 пемфигоида, линеарного IgA-зависимого буллезного дерматоза, других заболеваний группы пемфигоидных заболеваний, герпетиформного дерматита, глютенчувствительной целиакии, миастении, синдрома Гудпасчера, гранулематоза с полиангиитом и других ANCA+ форм васкулита, аутоиммунного энцефалита с поражением лимбической системы, анти-NMDA-рецепторного энцефалита, нейромиелита зрительного нерва, аутоиммунной гемолитической анемии, вызываемого аутоантителами повреждения органов-мишеней при волчанке и других заболеваниях соединительной ткани (вызываемого анти-дцДНК, анти-Ro и другими аутоантителами), болезни Грейвса и тиреоидита Хашимото, продуцирования антител против инсулина при диабете, антител против инсулиновых рецепторов при аутоиммунной гипогликемии, криоглобулинемии, ревматоидного артрита, рассеянного склероза, синдрома Шегрена, дерматомиозита, продуцирования антител против рецепторов Fc-эпсилон при хронической идиопатической крапивнице, антител против фолатных рецепторов, антител против эндотелиальных рецепторов или против адренергических рецепторов при легочной артериальной гипертензии, рефрактерной гипертензии, расширенной кардиомиопатии, аутовоспалительного синдрома, нейромиелита зрительного нерва, синдрома Гудпасчера, анти-NMDAR энцефалита, AIHA, ITP, TTP, болезни Грейвса/Хашимото, первичного билиарного цирроза, неонатальной волчанки, продуцирования материнских аутоантител, вызывающих разрушение T-клеток, легочного альвеолярного протеиноза, продуцирования антител против фолатных рецепторов, хронической воспалительной демиелинизирующей полинейропатии и идиопатической мембранозной нефропатии.
144. Способ по любому из пп. 118 или 119, где вызываемое аллоантителами заболевание или состояние представляет собой иммунную реакцию в ответ на трансплантацию органа, переливание крови, беременность или белковую заместительную терапию.
145. Способ по любому из пп. 118 или 119, где модифицированную T-клетку дополнительно модифицируют путем делеции гена, выбранного из группы, состоящей из генов цепи T-клеточного рецептора (TCR), белка главного комплекса гистосовместимости, а также любых их сочетаний.
146. Способ по п. 145, где модифицированную T-клетку дополнительно модифицируют перед введением субъекту, который нуждается в этом.
147. Способ по п. 145, где модифицированную T-клетку дополнительно модифицируют путем индукции системы CRISPR/Cas.
148. Фармацевтическая композиция, сформулированная для использования в способе по п. 118, содержащая модифицированную T-клетку, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую суицидный ген, и нуклеиновую кислоту, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
149. Фармацевтическая композиция, сформулированная для использования в способе по п. 119, содержащая модифицированную T-клетку, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую домен димеризации и химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
150. Композиция по п. 148, где суицидный ген кодирует аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 3005-3007.
151. Композиция по п. 148, где продукт суицидного гена также содержит домен димеризации, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 3013 и 3014.
152. Композиция по п. 148, где домен димеризации содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 980.
153. Композиция по п. 149, где домен димеризации также содержит сайт расщепления фурина, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 980.
154. Композиция по п. 149, где CAR также содержит сигнальный пептид.
155. Композиция по п. 154, где сигнальный пептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3035.
156. Композиция по п. 148, дополнительно содержащая индуцирующее средство для индукции активации суицидного гена.
157. Композиция по любому из п. 148 или 149, где модифицированная T-клетка лишена по меньшей мере одного гена, кодирующего цепь T-клеточного рецептора (TCR) и белок главного комплекса гистосовместимости.
158. Выделенная нуклеотидная последовательность, представляющая собой нуклеотидную последовательность, содержащую (i) суицидный ген, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 3001-3004, и (ii) нуклеотидную последовательность, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
159. Выделенная нуклеотидная последовательность по п. 158, содержащая SEQ ID NO: 3018, 3020, 3024, 3026, 3028 или 3030.
160. Выделенный полипептид, содержащий (i) аминокислотную последовательность, закодированную суицидным геном, где аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 3005-3007, и (ii) химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
161. Выделенный полипептид по п. 160, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3019, 3021, 3026, 3028, 3030 или 3034.
162. Выделенная нуклеотидная последовательность, содержащая (i) нуклеиновую кислоту, кодирующую домен димеризации и (ii) химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
163. Выделенная нуклеотидная последовательность по п. 162, где домен димеризации содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 980.
164. Выделенная нуклеотидная последовательность по п. 162, содержащая SEQ ID NO: 977 или 3032.
165. Выделенный полипептид, содержащий (i) домен димеризации и (ii) химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий анти-B-клеточный связывающий домен, трансмембранный домен, костимулирующий домен и внутриклеточный сигнальный домен.
166. Выделенный полипептид по п. 165, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 978 или 3033.
RU2018140063A 2016-04-15 2017-04-14 Композиции и способы для избирательной экспрессии белка RU2795467C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662322931P 2016-04-15 2016-04-15
US62/322,931 2016-04-15
US201762481094P 2017-04-03 2017-04-03
US62/481,094 2017-04-03
PCT/US2017/027778 WO2017181119A2 (en) 2016-04-15 2017-04-14 Compositions and methods for selective protein expression

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2022122433A Division RU2022122433A (ru) 2016-04-15 2017-04-14 Композиции и способы для избирательной экспрессии белка

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018140063A true RU2018140063A (ru) 2020-05-15
RU2018140063A3 RU2018140063A3 (ru) 2020-10-02
RU2795467C2 RU2795467C2 (ru) 2023-05-03

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
KR20220133318A (ko) 2022-10-04
WO2017181119A3 (en) 2018-01-04
MX2023000082A (es) 2023-02-09
IL262321A (en) 2018-11-29
CA3021027A1 (en) 2017-10-19
WO2017181119A2 (en) 2017-10-19
JP2019518424A (ja) 2019-07-04
EP4219721A3 (en) 2023-09-06
BR112018071096A2 (pt) 2019-02-26
JP2022160429A (ja) 2022-10-19
KR20180134385A (ko) 2018-12-18
AU2017250304B2 (en) 2023-08-17
PT3443096T (pt) 2023-05-30
SG11201809041TA (en) 2018-11-29
EP3443096B1 (en) 2023-03-01
AU2017250304A1 (en) 2018-11-08
US20230071283A1 (en) 2023-03-09
EP4219721A2 (en) 2023-08-02
MX2018012615A (es) 2019-05-30
PH12018502191A1 (en) 2019-09-09
RU2018140063A3 (ru) 2020-10-02
CN109715808A (zh) 2019-05-03
ES2944607T3 (es) 2023-06-22
DK3443096T3 (da) 2023-05-22
SI3443096T1 (sl) 2023-07-31
HRP20230457T1 (hr) 2023-07-21
EP3443096A2 (en) 2019-02-20
PL3443096T3 (pl) 2023-06-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2019518424A5 (ru)
JP2021501570A5 (ru)
HRP20230457T1 (hr) Pripravci i postupci za selektivnu ekspresiju kimernih antigenskih receptora
JP2020500530A5 (ru)
RU2018134771A (ru) Клетки, экспрессирующие множество молекул химерных антигенных рецепторов (car), и их применение
JP2019525956A5 (ru)
JP2022109915A (ja) Cd80バリアント免疫調節タンパク質およびその使用
JP2023058027A (ja) Cd80バリアント免疫調節タンパク質及びその使用
JP2019513347A5 (ru)
JP2017513818A5 (ru)
CN110121505A (zh) 嵌合抗原受体和表达其的自然杀伤细胞
KR20190005879A (ko) Icos 리간드 변이체 면역조절 단백질 및 그의 용도
RU2018122106A (ru) Буферы для стабилизации лентивирусных препаратов
WO2017176525A1 (en) Car having replicated binding motifs in a co-stimulatory domain
JP2024059628A (ja) Cd19指向性キメラ抗原受容体および免疫療法におけるその使用
JP2019531328A5 (ru)
JP2020511144A (ja) Pd−l2バリアント免疫調節タンパク質及びその使用
JP2022524906A (ja) 細胞免疫療法の組み合わせ
EP4148125A1 (en) Engineered immune cell for allotransplantation
JP2021528382A (ja) 免疫エフェクター細胞を腫瘍細胞へ誘引する方法及び手段
US20210079111A1 (en) Cd19-cd20 bispecific and dual passway car-t and methods for use thereof
US20230028399A1 (en) Bcma-directed cellular immunotherapy compositions and methods
RU2022122433A (ru) Композиции и способы для избирательной экспрессии белка
WO2020162452A1 (ja) CARライブラリおよびscFvの製造方法
AU2021338819A1 (en) Chimeric antigen receptor comprising novel co-stimulatory domain and use thereof