RU2017137402A - Платформа для обнаружения и анализа терапевтических агентов - Google Patents

Платформа для обнаружения и анализа терапевтических агентов Download PDF

Info

Publication number
RU2017137402A
RU2017137402A RU2017137402A RU2017137402A RU2017137402A RU 2017137402 A RU2017137402 A RU 2017137402A RU 2017137402 A RU2017137402 A RU 2017137402A RU 2017137402 A RU2017137402 A RU 2017137402A RU 2017137402 A RU2017137402 A RU 2017137402A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
array
proteins
attached
library
marker
Prior art date
Application number
RU2017137402A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2724998C2 (ru
RU2017137402A3 (ru
Inventor
Молли ХЭ
Майкл ПРЕВИТ
Миша ГОЛЫНСКИЙ
Мэтью Уильям КЕЛЛИНГЕР
Серджио ПЕЙСАДЖОВИЧ
Джонатан Марк БОУТЕЛЛ
Original Assignee
Иллюмина, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Иллюмина, Инк. filed Critical Иллюмина, Инк.
Publication of RU2017137402A publication Critical patent/RU2017137402A/ru
Publication of RU2017137402A3 publication Critical patent/RU2017137402A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2724998C2 publication Critical patent/RU2724998C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/508—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes rigid containers not provided for above
    • B01L3/5085—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes rigid containers not provided for above for multiple samples, e.g. microtitration plates
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/54—Labware with identification means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1062—Isolating an individual clone by screening libraries mRNA-Display, e.g. polypeptide and encoding template are connected covalently
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1065—Preparation or screening of tagged libraries, e.g. tagged microorganisms by STM-mutagenesis, tagged polynucleotides, gene tags
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1068—Template (nucleic acid) mediated chemical library synthesis, e.g. chemical and enzymatical DNA-templated organic molecule synthesis, libraries prepared by non ribosomal polypeptide synthesis [NRPS], DNA/RNA-polymerase mediated polypeptide synthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1075—Isolating an individual clone by screening libraries by coupling phenotype to genotype, not provided for in other groups of this subclass
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
    • C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
    • C40B20/00—Methods specially adapted for identifying library members
    • C40B20/04—Identifying library members by means of a tag, label, or other readable or detectable entity associated with the library members, e.g. decoding processes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
    • C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
    • C40B50/00—Methods of creating libraries, e.g. combinatorial synthesis
    • C40B50/14—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support
    • C40B50/16—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support involving encoding steps
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
    • B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
    • B01J2219/00313—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels being formed by arrays of wells in blocks
    • B01J2219/00315—Microtiter plates
    • B01J2219/00317—Microwell devices, i.e. having large numbers of wells
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00457—Dispensing or evacuation of the solid phase support
    • B01J2219/00459—Beads
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
    • B01J2219/005—Beads
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
    • B01J2219/00527—Sheets
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/0054—Means for coding or tagging the apparatus or the reagents
    • B01J2219/00547—Bar codes
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/0054—Means for coding or tagging the apparatus or the reagents
    • B01J2219/00572—Chemical means
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
    • B01J2219/00623—Immobilisation or binding
    • B01J2219/00626—Covalent
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
    • B01J2219/0072—Organic compounds
    • B01J2219/0074—Biological products
    • B01J2219/00743—Cells
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2300/00—Additional constructional details
    • B01L2300/02—Identification, exchange or storage of information
    • B01L2300/021—Identification, e.g. bar codes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/131—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a member of a cognate binding pair, i.e. extends to antibodies, haptens, avidin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/179—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a nucleic acid
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
    • C12Q2565/50—Detection characterised by immobilisation to a surface
    • C12Q2565/514—Detection characterised by immobilisation to a surface characterised by the use of the arrayed oligonucleotides as identifier tags, e.g. universal addressable array, anti-tag or tag complement array
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
    • C12Q2565/50—Detection characterised by immobilisation to a surface
    • C12Q2565/515—Detection characterised by immobilisation to a surface characterised by the interaction between or sequential use of two or more arrays

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Clinical Laboratory Science (AREA)
  • Structural Engineering (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)

Claims (186)

1. Способ характеристики потенциальных агентов, включающий
(a) предоставление библиотеки потенциальных агентов, в которой каждый потенциальный агент присоединен к маркеру-нуклеиновой кислоте, имеющей последовательность маркера;
(b) приведение библиотеки потенциальных агентов в контакт с твердой подложкой для присоединения потенциальных агентов к твердой подложке, в результате чего образуется массив потенциальных агентов, включающий индивидуальные элементы на твердой подложке, каждый из которых присоединен к индивидуальному потенциальному агенту из библиотеки;
(c) приведение массива потенциальных агентов в контакт с агентом для скрининга, при котором один или более из потенциальных агентов массива реагирует с агентом для скрининга;
(d) исследование массива во время или после контакта массива с агентом для скрининга для установления того, что по меньшей мере один потенциальный агент, находящийся в массиве, реагирует с агентом для скрининга;
(e) секвенирование маркеров-нуклеиновых кислот в массиве для определения последовательности маркера, который присоединен к каждому из потенциальных агентов; и
(f) идентификацию по меньшей мере одного потенциального агента в массиве, который реагирует с агентом для скрининга, на основании последовательности маркера, который присоединен к по меньшей мере одному потенциальному агенту.
2. Способ по п. 1, в котором потенциальные агенты выбраны из группы, состоящей из белков, нуклеиновых кислот, клеток и небольших молекул.
3. Способ по п. 2, в котором белки выбраны из группы, состоящей из антител, ферментов, рецепторов, киназ, фосфатаз, полимераз, протеаз, эстераз, ферментов, модифицирующих гистоны, и ядерных гормональных рецепторов.
4. Способ по п. 1, в котором клетки выбраны из группы, состоящей из генетически натуральных клеток, выделенных из многоклеточного организма, генетически натуральных клеток, которые включают одноклеточные организмы, генетически сконструированные клетки и культивируемые клетки.
5. Способ по п. 1 или 4, в котором клетки представляют собой стволовые клетки или иммунные клетки.
6. Способ по п. 2, в котором небольшие молекулы выбраны из группы, состоящей из потенциальных ингибиторов ферментов, потенциальных антибиотиков, потенциальных противовирусных агентов, потенциальных пестицидов, потенциальных гормонов, потенциальных активаторов клеточной сигнализации, потенциальных ингибиторов клеточной сигнализации и потенциальных активаторов ферментов.
7. Способ по п. 1, в котором этап (а) включает комбинаторный синтез библиотеки потенциальных агентов, при котором индивидуальные реакции комбинаторного синтеза, проводимые на каждом потенциальном агенте, отслеживают посредством добавления уникальной сигнатуры из одного или более нуклеотидов к маркеру-нуклеиновой кислоте, которая присоединена к каждому из потенциальных агентов, что приводит к образованию библиотеки потенциальных агентов, в которой каждый потенциальный агент присоединен к уникальному маркеру-нуклеиновой кислоте.
8. Способ по п. 1, в котором твердая подложка включает праймеры нуклеиновых кислот, и потенциальные агенты присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации маркеров-нуклеиновых кислот с праймерами нуклеиновых кислот.
9. Способ по п. 8, в котором маркеры-нуклеиновые кислоты включают последовательность, связывающую универсальный праймер, праймеры нуклеиновых кислот включают последовательность универсального праймера, и потенциальные агенты присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации последовательности, связывающей универсальный праймер, с последовательностью универсального праймера.
10. Способ по п. 1, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более потенциальными агентами посредством связывания с одним или более потенциальными агентами или блокировки связывания между потенциальным агентом и аналитом, имеющим сродство к потенциальному агенту.
11. Способ по п. 10, в котором исследование массива включает обнаружение агента для скрининга, который связан с одним или более потенциальными агентами.
12. Способ по п. 11, в котором агент для скрининга представляет собой люминесцентный объект, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
13. Способ по п. 1, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более потенциальными агентами посредством химической модификации одного или более потенциальных агентов.
14. Способ по п. 13, в котором исследование массива включает обнаружение одного или более модифицированного потенциального агента.
15. Способ по п. 14, в котором один или более модифицированных потенциальных агентов представляют собой люминесцентные объекты, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
16. Способ по п. 1, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более потенциальными агентами, в результате чего образуется анализируемый продукт.
17. Способ по п. 16, в котором исследование массива включает обнаружение анализируемого продукта.
18. Способ по п. 17, в котором анализируемый продукт представляет собой люминесцентный объект, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
19. Способ по п. 1, в котором исследование массива включает регистрацию в определенные моменты времени сигналов от одного или более индивидуальных элементов массива.
20. Способ по п. 1, в котором сигналы включают оптические сигналы.
21. Способ по п. 1, дополнительно включающий амплификацию маркеров-нуклеиновых кислот, в результате которой получают ампликоны маркеров-нуклеиновых кислот на индивидуальных элементах.
22. Способ по п. 21, в котором секвенирование маркеров-нуклеиновых кислот включает секвенирование ампликонов маркеров-нуклеиновых кислот на индивидуальных элементах.
23. Способ по п. 22, в котором секвенирование маркеров-нуклеиновых кислот включает обнаружение оптических сигналов, указывающих на последовательность.
24. Способ по п. 1, в котором твердая подложка находится в проточной ячейке.
25. Способ получения массива белков, включающий:
(a) предоставление библиотеки молекул мРНК, причем индивидуальные молекулы мРНК, содержащиеся в библиотеке, включают целевую последовательность и последовательность маркера;
(b) получение из библиотеки первой подбиблиотеки, где первая подбиблиотека включает нуклеиновые кислоты, содержащие последовательности маркера или их комплементы, причем нуклеиновые кислоты присоединены к индивидуальным элементам, находящимся на твердой подложке;
(c) получение из библиотеки второй подбиблиотеки, где вторая подбиблиотека включает нуклеиновые кислоты, содержащие целевые последовательности и последовательности маркера или их комплементы;
(d) приведение второй подбиблиотеки в контакт с первой подбиблиотекой и присоединение таким образом нуклеиновых кислот из второй подбиблиотеки к твердой подложке посредством гибридизации последовательностей маркера и их комплементов; и
(e) трансляцию целевых последовательностей на твердой подложке с целью получения массива белков, присоединенных к индивидуальным элементам.
26. Способ по п. 25, дополнительно включающий этап секвенирования последовательностей маркера или их комплементов на твердой подложке, что позволяет определить локализацию последовательностей маркера или их комплементов на индивидуальных элементах твердой подложки.
27. Способ по п. 25 или 26, в котором нуклеиновые кислоты первой подбиблиотеки дополнительно включают целевые последовательности.
28. Способ по п. 27, дополнительно включающий этап секвенирования целевых последовательностей на твердой подложке.
29. Способ скрининга белков, включающий:
(i) получение массива белков способом по п. 25;
(ii) приведение массива белков в контакт с агентом для скрининга, при котором один или более содержащихся в массиве белков реагируют с агентом для скрининга; и
(iii) анализ массива белков во время или после контакта с агентом для скрининга для определения того, что по меньшей мере один белок в массиве реагирует с агентом для скрининга.
30. Способ по п. 29, дополнительно включающий этап секвенирования последовательностей маркера или их комплементов на твердой подложке, что позволяет определить локализацию последовательностей маркера или их комплементов на индивидуальных элементах твердой подложки.
31. Способ по п. 30, дополнительно включающий этап идентификации в массиве по меньшей мере одного белка, который реагирует с агентом для скрининга, на основании последовательности маркера, который присоединен к по меньшей мере одному белку.
32. Способ по п. 29, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками путем связывания с одним или более белками или посредством блокировки связывания между одним или более белками и аналитом, имеющим сродство к одному или более белкам.
33. Способ по п. 32, в котором исследование массива включает обнаружение агента для скрининга, который связывается с одним или более белками.
34. Способ по п. 33, в котором агент для скрининга представляет собой люминесцентный объект, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
35. Способ по п. 32, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками, что приводит к химической модификации одного или более белков.
36. Способ по п. 35, в котором исследование массива включает обнаружение одного или более модифицированных белков.
37. Способ по п. 36, в котором один или более из модифицированных белков представляет собой люминесцентный объект, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
38. Способ по п. 32, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками с образованием анализируемого продукта.
39. Способ по п. 38, в котором исследование массива включает обнаружение анализируемого продукта.
40. Способ по п. 39, в котором анализируемый продукт представляет собой люминесцентный объект, а обнаружение включает обнаружение люминесценции от массива.
41. Способ по п. 32, в котором исследование массива включает регистрацию в определенные моменты времени сигналов от одного или более индивидуальных элементов массива.
42. Способ по п. 41, в котором сигналы включают оптические сигналы.
43. Способ по п. 25, в котором библиотека молекул мРНК включает множество вариантов одного гена.
44. Способ по п. 43, в котором варианты получены случайным мутагенезом.
45. Способ по п. 25 или 43, в котором библиотека молекул мРНК получена из рекомбинантных организмов.
46. Способ по п. 25, в котором белки выбраны из группы, состоящей из антител, ферментов, рецепторов, киназ, фосфатаз, полимераз, протеаз, эстераз, ферментов, модифицирующих гистоны, и ядерных гормональных рецепторов.
47. Способ по п. 25, в котором первая подбиблиотека получена способом, который включает приведение молекул мРНК библиотеки в контакт с твердой подложкой с целью присоединения молекул мРНК к твердой подложке.
48. Способ по п. 47, в котором молекулы мРНК подвергают амплификации на твердой подложке с целью получения комплементов последовательностей маркера.
49. Способ по п. 25, в котором твердая подложка включает праймеры нуклеиновых кислот, и молекулы мРНК присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации с праймерами нуклеиновых кислот.
50. Способ по п. 49, в котором молекулы мРНК включают последовательность, связывающую универсальный праймер, праймеры нуклеиновых кислот включают последовательность универсального праймера, и молекулы мРНК присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации последовательности, связывающей универсальный праймер, с последовательностью универсального праймера.
51. Способ по п. 25, в котором первая подбиблиотека получена способом, который включает обратную транскрипцию индивидуальных молекул мРНК или части индивидуальных молекул мРНК, включающей последовательность маркера.
52. Способ по п. 51, в котором молекулы мРНК или их части, прошедшие обратную транскрипцию, подвергают амплификации на твердой подложке для образования комплементов последовательностей маркера.
53. Способ по п. 25, в котором библиотека молекул мРНК предоставлена в виде образца жидкости, и в котором первая подбиблиотека и вторая подбиблиотека получены из отдельных фракций образца жидкости.
54. Способ по п. 25, в котором твердая подложка находится в проточной ячейке.
55. Способ по п. 25, в котором белки ковалентно присоединены к молекулам мРНК.
56. Способ по п. 25, дополнительно включающий этап селективного удаления молекул мРНК или белков, которые присоединены к одному или более элементам массива.
57. Способ по п. 56, в котором селективное удаление включает расщепление связи, которая присоединяет молекулы мРНК или белки к элементам, под действием лазера.
58. Способ по п. 25, в котором первая подбиблиотека включает нуклеиновые кислоты, содержащие комплементы последовательностей маркера,
при этом вторая подбиблиотека включает РНК молекулы, содержащие целевые последовательности и последовательности маркера, и
причем этап (d) включает приведение второй подбиблиотеки в контакт с первой подбиблиотекой, который приводит к присоединению молекул мРНК второй подбиблиотеки к твердой подложке посредством гибридизации последовательностей маркера и их комплементов.
59. Способ по п. 25, в котором первая подбиблиотека включает нуклеиновые кислоты, содержащие последовательности маркера,
при этом вторая подбиблиотека включает молекулы кДНК, содержащие целевые последовательности и комплементы последовательностей маркера,
причем этап (d) включает приведение второй подбиблиотеки в контакт с первой подбиблиотекой, который приводит к присоединению молекул кДНК второй подбиблиотеки к твердой подложке посредством гибридизации последовательностей маркера и их комплементов, и
при этом этап (е) включает обратную транскрипцию молекул кДНК, которая приводит к образованию молекул мРНК на твердой подложке, и трансляцию молекул мРНК на твердой подложке с образованием массива белков, присоединенных к индивидуальным элементам.
60. Способ по п. 25, в котором целевые последовательности транслируются с помощью рибосом на твердой подложке, и рибосомы обрабатывают пуромицином для получения массива белков, присоединенных к индивидуальным элементам.
61. Способ по п. 25, в котором твердая подложка включает по меньшей мере 1×106 элементов.
62. Способ по п. 25, в котором средний шаг между элементами на твердой подложке составляет менее 10 микрометров.
63. Способ по п. 25, в котором средняя площадь элементов составляет менее 100 квадратных микрометров.
64. Массив, включающий:
(a) библиотеку молекул мРНК, причем индивидуальные молекулы мРНК, содержащиеся в библиотеке, включают целевую последовательность и последовательность маркера;
(b) твердую подложку, включающую нуклеиновые кислоты, содержащие комплементы последовательностей маркера,
причем нуклеиновые кислоты присоединены к индивидуальным элементам, находящимся на твердой подложке,
где последовательности маркера индивидуальных молекул мРНК гибридизованы с соответствующими комплементарными последовательностями маркера на индивидуальных элементах, находящихся на твердой подложке, и
где белки, полученные трансляцией молекул мРНК, присоединены к соответствующим молекулам мРНК.
65. Массив по п. 64, в котором белки присоединены к соответствующим молекулам мРНК через рибосомы.
66. Массив по п. 65, в котором белки ковалентно присоединены к рибосомам.
67. Массив по п. 64, в котором белки помечены люминесцентной меткой.
68. Массив по п. 67, в котором помеченный люминесцентной меткой агент для скрининга специфично связан с сайтом связывания белка, в результате чего белок имеет люминесцентную метку.
69. Массив по п. 64, в котором твердая подложка включает по меньшей мере 1×106 элементов.
70. Массив по п. 64, в котором средний шаг между элементами на твердой подложке составляет менее 10 микрометров.
71. Массив по п. 64, в котором средняя площадь элементов составляет менее 100 квадратных микрометров.
72. Массив по п. 64, в котором библиотека молекул мРНК включает множество вариантов одного гена.
73. Массив по п. 64, в котором белки выбраны из группы, состоящей из антител, ферментов, рецепторов, киназ, фосфатаз, полимераз, протеаз, эстераз, ферментов, модифицирующих гистоны, и ядерных гормональных рецепторов.
74. Массив по п. 64, в котором твердая подложка находится в проточной ячейке.
75. Способ скрининга клеток, включающий:
(a) предоставление множества различных клеток, где каждая из различных клеток включает маркер-нуклеиновую кислоту, имеющую последовательность маркера;
(b) приведение смеси различных клеток в контакт твердой подложкой, приводящий к образованию массива клеток, присоединенных к твердой подложке;
(c) скрининг массива клеток на твердой подложке для определения по меньшей мере одной оптической характеристики, где реакция скрининга включает обнаружение индивидуальных клеток, которые присоединены к твердой подложке;
(d) секвенирование последовательностей маркера маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке; и
(e) идентификацию по меньшей мере одной клетки в массиве как клетки-кандидата на основании оптической характеристики и последовательности маркера клетки-кандидата.
76. Способ по п. 75, в котором клетки выбраны из группы, состоящей из природных клеток, выделенных из многоклеточного организма, природных клеток, которые включают одноклеточные организмы, генетически сконструированные клетки и культивируемые клетки.
77. Способ по п. 76, в котором клетки представляют собой стволовые клетки или иммунные клетки.
78. Способ по п. 75, в котором этап (а) включает помещение различных клеток по отдельности в отдельные емкости и добавление нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность маркера, в каждую из емкостей, в результате чего образуется множество различных клеток, где каждая из различных клеток находится в отдельной емкости и включает маркер-нуклеиновую кислоту, имеющую характерную последовательность маркера.
79. Способ по п. 75, в котором нуклеиновая кислота, имеющая последовательность маркера, присоединена к грануле, и гранула связывается с клеткой, относящейся к множеству различных клеток.
80. Способ по п. 79, в котором гранула включает антитело, обладающее специфичным сродством к связыванию, или клетку.
81. Способ по п. 75, в котором нуклеиновая кислота, имеющая последовательность маркера, присоединена к клетке, относящейся к множеству различных клеток, посредством ковалентного присоединения к липиду или жирной кислоте плазматической мембраны.
82. Способ по п. 75, в котором нуклеиновая кислота, имеющая последовательность маркера, присоединена к клетке, относящейся к множеству различных клеток, посредством ковалентного присоединения к белку, находящемуся в липиде плазматической мембраны.
83. Способ по п. 75, в котором твердая подложка включает праймеры нуклеиновых кислот, и клетки присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации маркеров-нуклеиновых кислот с праймерами нуклеиновых кислот.
84. Способ по п. 83, в котором маркеры-нуклеиновые кислоты включают последовательность, связывающую универсальный праймер, праймеры нуклеиновых кислот включают последовательность универсального праймера, и потенциальные агенты присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации последовательности, связывающей универсальный праймер, с последовательностью универсального праймера.
85. Способ по п. 75, в котором исследование массива включает регистрацию в определенные моменты времени сигналов от одного или более индивидуальных элементов массива.
86. Способ по п. 85, в котором сигналы включают оптические сигналы.
87. Способ по п. 75, дополнительно включающий амплификацию маркеров-нуклеиновых кислот, в результате которой получают ампликоны маркеров-нуклеиновых кислот на твердой подложке.
88. Способ по п. 87, в котором секвенирование маркера-нуклеиновой кислоты включает секвенирование ампликонов маркеров-нуклеиновых кислот.
89. Способ по п. 88, в котором секвенирование маркера-нуклеиновой кислоты включает обнаружение оптических сигналов, указывающих на последовательность.
90. Способ по п. 75, в котором твердая подложка находится в проточной ячейке.
91. Способ по п. 75, в котором клетки представляют собой живые клетки.
92. Способ по п. 90, дополнительно включающий удаление по меньшей мере одной клетки-кандидата с твердой подложки.
93. Способ по п. 92, дополнительно включающий культивирование по меньшей мере одной клетки-кандидата после удаления с твердой подложки, что приводит к репликации по меньшей мере одной клетки.
94. Способ по п. 75, в котором различные клетки включают генетически модифицированные клетки.
95. Способ по п. 94, в котором генетически модифицированные клетки имеют генетическую модификацию, выбранную из группы, состоящей из кодирования не встречающегося в природе рекомбинантного белка, кодирования мутантного рекомбинантного белка, наличия делеции встречающегося в природе белка, ингибирования экспрессии встречающегося в природе белка, усиления экспрессии встречающегося в природе белка, получения не встречающегося в природе аналита и ингибирования выработки природного аналита.
96. Способ по п. 75, в котором скрининг массива клеток включает обработку клеток агентом для скрининга.
97. Способ по п. 96, в котором агент для скрининга связывается с по меньшей мере одной клеткой-кандидатом.
98. Способ по п. 97, в котором агент для скрининга представляет собой люминесцентный объект, и в котором реакция скрининга включает обнаружение люминесценции по меньшей мере одной клетки-кандидата.
99. Способ по п. 96, в котором агент для скрининга модифицирует по меньшей мере одну клетку-кандидата.
100. Способ по п. 96, в котором агент для скрининга стимулирует по меньшей мере одну клетку-кандидата.
101. Способ по п. 99 или 100, в котором агент для скрининга повышает или понижает люминесценцию по меньшей мере одной клетки-кандидата, и в котором реакция скрининга включает обнаружение люминесценции по меньшей мере одной клетки-кандидата.
102. Способ по п. 75, дополнительно включающий амплификацию маркера-нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность маркера, с целью присоединения множества копий маркера-нуклеиновой кислоты на каждую из различных клеток.
103. Способ по п. 75, в котором этап (d) включает удаление индивидуальных клеток с твердой подложки в условиях, при которых маркер-нуклеиновые кислоты присоединяются к твердой подложке, и затем секвенирование последовательностей маркера маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке.
104. Способ по п. 75, в котором этап (d) включает копирование маркеров-нуклеиновых кислот, которое приводит к образованию копий маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке, и последующее секвенирование последовательностей маркера копий маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке.
105. Способ по п. 75, в котором этап (d) включает копирование маркеров-нуклеиновых кислот, которое приводит к образованию копий маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке, и последующее удаление индивидуальных клеток с твердой подложки в условиях, при которых маркер-нуклеиновые кислоты присоединяются к твердой подложке, и последующее секвенирование последовательностей маркера маркеров-нуклеиновых кислот, которые присоединены к твердой подложке.
106. Способ получения массива белков, включающий:
(a) предоставление библиотеки молекул кДНК, которые присоединены к твердой подложке;
(b) амплификацию молекул кДНК на твердой подложке, приводящую к образованию кластеров, где каждый кластер включает множество копий конкретной молекулы кДНК из библиотеки;
(c) транскрипцию множества копий на кластерах с целью получения множества молекул мРНК, присоединенных к каждому из кластеров; и
(d) трансляцию молекул мРНК на кластерах с целью получения множества белков, присоединенных к каждому из кластеров.
107. Способ по п. 106, дополнительно включающий этап секвенирования по меньшей мере части каждой молекулы мРНК на твердой подложке.
108. Способ скрининга белков, включающий:
(i) получение массива белков способом по п. 106;
(ii) приведение находящихся на твердой подложке белков в контакт с агентом для скрининга, при котором один или более белков реагируют с агентом для скрининга; и
(iii) обнаружение белков на твердой подложке во время или после контакта с агентом для скрининга для определения того, что по меньшей мере один белок реагирует с агентом для скрининга.
109. Способ по п. 108, дополнительно включающий этап секвенирования по меньшей мере части каждой молекулы мРНК на твердой подложке.
110. Способ по п. 109, дополнительно включающий этап идентификации в массиве по меньшей мере одного белка, который реагирует с агентом для скрининга, с помощью последовательности по меньшей мере части молекулы мРНК, которая присоединена к по меньшей мере одному белку.
111. Способ по п. 108, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками путем связывания с одним или более белками или посредством блокировки связывания между одним или более белками и аналитом, имеющим сродство к одному или более белкам.
112. Способ по п. 111, в котором обнаружение включает обнаружение агента для скрининга, который связывается с одним или более белками.
113. Способ по п. 112, в котором агент для скрининга представляет собой люминесцентный объект, и обнаружение включает обнаружение люминесценции.
114. Способ по п. 108, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками, в результате чего происходит химическая модификация одного или более белков.
115. Способ по п. 114, в котором обнаружение включает обнаружение одного или более модифицированных белков.
116. Способ по п. 115, в котором один или более из модифицированных белков представляет собой люминесцентный объект, и обнаружение включает обнаружение люминесценции.
117. Способ по п. 108, в котором агент для скрининга реагирует с одним или более белками, что приводит к получению анализируемого продукта.
118. Способ по п. 117, в котором обнаружение включает обнаружение анализируемого продукта.
119. Способ по п. 118, в котором анализируемый продукт представляет собой люминесцентный объект, и обнаружение включает обнаружение люминесценции.
120. Способ по п. 108, в котором исследование массива включает регистрацию в определенные моменты времени сигналов от одного или более индивидуальных кластеров.
121. Способ по п. 120, в котором сигналы включают оптические сигналы.
122. Способ по п. 106, в котором библиотека молекул мРНК включает множество вариантов одного гена.
123. Способ по п. 122, в котором варианты получены случайным мутагенезом.
124. Способ по п. 106 или 122, в котором библиотека молекул кДНК получена из рекомбинантных организмов.
125. Способ по п. 106, в котором белки выбраны из группы, состоящей из антител, ферментов, рецепторов, киназ, фосфатаз, полимераз, протеаз, эстераз, ферментов, модифицирующих гистоны, и ядерных гормональных рецепторов.
126. Способ по п. 106, в котором твердая подложка включает праймеры нуклеиновых кислот, и молекулы кДНК присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации с праймерами нуклеиновых кислот.
127. Способ по п. 126, в котором молекулы кДНК включают последовательность, связывающую универсальный праймер, праймеры нуклеиновых кислот включают последовательность универсального праймера, и молекулы кДНК присоединяются к твердой подложке посредством гибридизации последовательности, связывающей универсальный праймер, с последовательностью универсального праймера.
128. Способ по п. 106, в котором твердая подложка находится в проточной ячейке.
129. Способ по п. 106, дополнительно включающий этап селективного удаления белков, которые присоединены к одному или более кластерам.
130. Способ по п. 129, в котором селективное удаление включает расщепление связи, которая присоединяет молекулы белка к твердой подложке, под действием лазера.
131. Способ по п. 106, в котором молекулы мРНК транслируются с помощью рибосом, находящихся на твердой подложке, и для присоединения белков к молекулам мРНК рибосомы обрабатывают пуромицином.
132. Способ по п. 106, в котором твердая подложка включает по меньшей мере 1×106 кластеров.
133. Способ по п. 106, в котором средний шаг между кластерами на твердой подложке составляет менее 10 микрометров.
134. Способ по п. 106, в котором средняя площадь кластеров составляет менее 100 квадратных микрометров.
135. Массив, включающий:
(a) твердую подложку;
(b) библиотеку из различных молекул кДНК, присоединенных к твердой подложке, где каждая из различных молекул кДНК присоединена к индивидуальному элементу на твердой подложке, и где каждый элемент включает множество копий конкретной молекулы кДНК;
(c) молекулы мРНК, присоединенные к молекулам кДНК, где каждая молекула кДНК комплементарна соответствующей присоединенной молекуле мРНК; и
(d) молекулы белка, присоединенные к молекулам мРНК, где каждая молекула белка кодируется соответствующей присоединенной молекулой мРНК.
136. Массив по п. 135, в котором белки присоединены к соответствующим молекулам мРНК через рибосомы.
137. Массив по п. 136, в котором белки ковалентно присоединены к рибосомам.
138. Массив по п. 135, в котором молекулы мРНК присоединены к соответствующим молекулам кДНК через РНК-полимеразы.
139. Массив по п. 138, в котором молекулы мРНК ковалентно присоединены к молекулам кДНК.
140. Массив по п. 135, в котором белки помечены люминесцентной меткой.
141. Массив по п. 140, в котором помеченный люминесцентной меткой агент для скрининга специфично связан с сайтом связывания белка, в результате чего белок имеет люминесцентную метку.
142. Массив по п. 135, в котором твердая подложка включает по меньшей мере 1×106 элементов.
143. Массив по п. 135, в котором средний шаг между элементами на твердой подложке составляет менее 10 микрометров.
144. Массив по п. 135, в котором средняя площадь элементов составляет менее 100 квадратных микрометров.
145. Массив по п. 135, в котором библиотека молекул кДНК включает множество вариантов одного гена.
146. Массив по п. 135, в котором белки выбраны из группы, состоящей из антител, ферментов, рецепторов, киназ, фосфатаз, полимераз, протеаз, эстераз, ферментов, модифицирующих гистоны, и ядерных гормональных рецепторов.
RU2017137402A 2015-05-11 2016-05-09 Платформа для обнаружения и анализа терапевтических агентов RU2724998C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562159710P 2015-05-11 2015-05-11
US62/159,710 2015-05-11
PCT/US2016/031524 WO2016183029A1 (en) 2015-05-11 2016-05-09 Platform for discovery and analysis of therapeutic agents

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2017137402A true RU2017137402A (ru) 2019-06-11
RU2017137402A3 RU2017137402A3 (ru) 2019-06-11
RU2724998C2 RU2724998C2 (ru) 2020-06-29

Family

ID=57248431

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017137402A RU2724998C2 (ru) 2015-05-11 2016-05-09 Платформа для обнаружения и анализа терапевтических агентов

Country Status (16)

Country Link
US (3) US20180142378A1 (ru)
EP (4) EP3294911B1 (ru)
JP (3) JP2018518157A (ru)
KR (2) KR102175826B1 (ru)
CN (2) CN107810415B (ru)
AU (1) AU2016261496B2 (ru)
BR (1) BR112017023188B1 (ru)
CA (2) CA3160383A1 (ru)
DK (3) DK3760737T3 (ru)
ES (3) ES2826880T3 (ru)
FI (2) FI3760737T3 (ru)
HK (1) HK1245340A1 (ru)
IL (3) IL290908B2 (ru)
RU (1) RU2724998C2 (ru)
SG (1) SG11201708689RA (ru)
WO (1) WO2016183029A1 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10788452B2 (en) * 2015-04-21 2020-09-29 General Automation Lab Technologies Inc. High resolution systems, kits, apparatus, and methods for bacterial community relationship determination and other high throughput microbiology applications
US11186836B2 (en) 2016-06-16 2021-11-30 Haystack Sciences Corporation Oligonucleotide directed and recorded combinatorial synthesis of encoded probe molecules
US11795580B2 (en) 2017-05-02 2023-10-24 Haystack Sciences Corporation Molecules for verifying oligonucleotide directed combinatorial synthesis and methods of making and using the same
WO2019060830A1 (en) 2017-09-25 2019-03-28 Plexium, Inc. CHEMICAL LIBRARIES CODED BY OLIGONUCLEOTIDES
CN109444425A (zh) * 2018-11-01 2019-03-08 上海交通大学 一种细胞水平蛋白高通量检测方法
JP7365022B2 (ja) * 2019-10-28 2023-10-19 日本電信電話株式会社 生体分子の支持体とその製造方法
EP4110795A4 (en) * 2020-02-28 2024-04-03 Synvitrobio, Inc. METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFYING CHARACTERISTICS USING A CELL-FREE SYSTEM
WO2022005450A1 (en) * 2020-06-29 2022-01-06 Google Llc Methods and compositions for making and using peptide arrays
US20230242983A1 (en) * 2020-07-06 2023-08-03 Sony Group Corporation Bioparticle analysis method and bioparticle analysis system
GB202112907D0 (en) 2021-09-10 2021-10-27 Res & Innovation Uk Methods of biomolecule display

Family Cites Families (125)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB8810400D0 (en) 1988-05-03 1988-06-08 Southern E Analysing polynucleotide sequences
US5130238A (en) 1988-06-24 1992-07-14 Cangene Corporation Enhanced nucleic acid amplification process
EP0450060A1 (en) 1989-10-26 1991-10-09 Sri International Dna sequencing
US5455166A (en) 1991-01-31 1995-10-03 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification
US5573905A (en) 1992-03-30 1996-11-12 The Scripps Research Institute Encoded combinatorial chemical libraries
US5565324A (en) 1992-10-01 1996-10-15 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Complex combinatorial chemical libraries encoded with tags
CA2185239C (en) 1994-03-16 2002-12-17 Nanibhushan Dattagupta Isothermal strand displacement nucleic acid amplification
US5552278A (en) 1994-04-04 1996-09-03 Spectragen, Inc. DNA sequencing by stepwise ligation and cleavage
US5641658A (en) 1994-08-03 1997-06-24 Mosaic Technologies, Inc. Method for performing amplification of nucleic acid with two primers bound to a single solid support
US5750341A (en) 1995-04-17 1998-05-12 Lynx Therapeutics, Inc. DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions
GB9620209D0 (en) 1996-09-27 1996-11-13 Cemu Bioteknik Ab Method of sequencing DNA
GB9626815D0 (en) 1996-12-23 1997-02-12 Cemu Bioteknik Ab Method of sequencing DNA
WO1998030575A1 (en) 1997-01-08 1998-07-16 Proligo Llc Bioconjugation of macromolecules
US6023540A (en) 1997-03-14 2000-02-08 Trustees Of Tufts College Fiber optic sensor with encoded microspheres
US7622294B2 (en) 1997-03-14 2009-11-24 Trustees Of Tufts College Methods for detecting target analytes and enzymatic reactions
US6327410B1 (en) 1997-03-14 2001-12-04 The Trustees Of Tufts College Target analyte sensors utilizing Microspheres
JP2001517948A (ja) 1997-04-01 2001-10-09 グラクソ、グループ、リミテッド 核酸配列決定法
US7427678B2 (en) 1998-01-08 2008-09-23 Sigma-Aldrich Co. Method for immobilizing oligonucleotides employing the cycloaddition bioconjugation method
AU3289199A (en) * 1998-02-11 1999-08-30 Maxygen, Inc. Antigen library immunization
WO1999055886A1 (en) * 1998-04-24 1999-11-04 Genova Pharmaceuticals Corporation Function-based gene discovery
EP1090293B2 (en) 1998-06-24 2019-01-23 Illumina, Inc. Decoding of array sensors with microspheres
AR021833A1 (es) 1998-09-30 2002-08-07 Applied Research Systems Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico
US6565727B1 (en) 1999-01-25 2003-05-20 Nanolytics, Inc. Actuators for microfluidics without moving parts
US6294063B1 (en) 1999-02-12 2001-09-25 Board Of Regents, The University Of Texas System Method and apparatus for programmable fluidic processing
US20060275782A1 (en) 1999-04-20 2006-12-07 Illumina, Inc. Detection of nucleic acid reactions on bead arrays
US6355431B1 (en) 1999-04-20 2002-03-12 Illumina, Inc. Detection of nucleic acid amplification reactions using bead arrays
ATE553219T1 (de) 1999-04-20 2012-04-15 Illumina Inc Erkennung von nukleinsäurereaktionen auf bead- arrays
US20050191698A1 (en) 1999-04-20 2005-09-01 Illumina, Inc. Nucleic acid sequencing using microsphere arrays
EP1212411A2 (en) * 1999-08-20 2002-06-12 The Johns Hopkins University School Of Medicine Methods and compositions for the construction and use of fusion libraries
US6274320B1 (en) 1999-09-16 2001-08-14 Curagen Corporation Method of sequencing a nucleic acid
US7244559B2 (en) 1999-09-16 2007-07-17 454 Life Sciences Corporation Method of sequencing a nucleic acid
WO2001036585A1 (en) * 1999-11-18 2001-05-25 Large Scale Proteomics Corporation Sequence tag microarray and method for detection of multiple proteins through dna methods
US7582420B2 (en) 2001-07-12 2009-09-01 Illumina, Inc. Multiplex nucleic acid reactions
US6770441B2 (en) 2000-02-10 2004-08-03 Illumina, Inc. Array compositions and methods of making same
US20040023231A1 (en) * 2000-04-12 2004-02-05 Abu-Khabar Khalid S. System for identifying and analyzing expression of are-containing genes
EP2100971A3 (en) 2000-07-07 2009-11-25 Visigen Biotechnologies, Inc. Real-time sequence determination
SG90149A1 (en) * 2000-07-18 2002-07-23 Government Of The Republic Of Diagnostic assay
US8529743B2 (en) 2000-07-25 2013-09-10 The Regents Of The University Of California Electrowetting-driven micropumping
US6773566B2 (en) 2000-08-31 2004-08-10 Nanolytics, Inc. Electrostatic actuators for microfluidics and methods for using same
US20020187482A1 (en) * 2000-09-25 2002-12-12 Zicai Liang Methods and means of RNA analysis
US20040018491A1 (en) * 2000-10-26 2004-01-29 Kevin Gunderson Detection of nucleic acid reactions on bead arrays
WO2002044425A2 (en) 2000-12-01 2002-06-06 Visigen Biotechnologies, Inc. Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity
AR031640A1 (es) 2000-12-08 2003-09-24 Applied Research Systems Amplificacion isotermica de acidos nucleicos en un soporte solido
EP1270740A1 (en) * 2001-06-29 2003-01-02 SIRS-Lab GmbH Biochip and its use for determining inflammation
RU2206575C2 (ru) * 2001-07-25 2003-06-20 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН Композиция для иммобилизации биологических макромолекул в гидрогелях, способ приготовления композиции, биочип, способ проведения пцр на биочипе
GB0127564D0 (en) 2001-11-16 2002-01-09 Medical Res Council Emulsion compositions
JP2005510347A (ja) 2001-11-26 2005-04-21 ケック グラデュエイト インスティテュート 化学、生化学、および生物学的アッセイ等のためにエレクトロウェッティングを介してマイクロ流体制御する方法、装置、および物
US7057026B2 (en) 2001-12-04 2006-06-06 Solexa Limited Labelled nucleotides
US20040002818A1 (en) * 2001-12-21 2004-01-01 Affymetrix, Inc. Method, system and computer software for providing microarray probe data
US20040002090A1 (en) 2002-03-05 2004-01-01 Pascal Mayer Methods for detecting genome-wide sequence variations associated with a phenotype
ES2346646T5 (es) 2002-05-30 2018-02-15 The Scripps Research Institute Ligación catalizada con cobre de azidas y acetilenos
FR2841063B1 (fr) 2002-06-18 2004-09-17 Commissariat Energie Atomique Dispositif de deplacement de petits volumes de liquide le long d'un micro-catenaire par des forces electrostatiques
JP2006509040A (ja) 2002-08-23 2006-03-16 ソレックサ リミテッド 修飾されたヌクレオチド
US7595883B1 (en) 2002-09-16 2009-09-29 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Biological analysis arrangement and approach therefor
US8349276B2 (en) 2002-09-24 2013-01-08 Duke University Apparatuses and methods for manipulating droplets on a printed circuit board
US6911132B2 (en) 2002-09-24 2005-06-28 Duke University Apparatus for manipulating droplets by electrowetting-based techniques
US7547380B2 (en) 2003-01-13 2009-06-16 North Carolina State University Droplet transportation devices and methods having a fluid surface
EP2159285B1 (en) 2003-01-29 2012-09-26 454 Life Sciences Corporation Methods of amplifying and sequencing nucleic acids
EP1636337A4 (en) 2003-06-20 2007-07-04 Illumina Inc METHODS AND COMPOSITIONS USEFUL FOR THE AMPLIFICATION AND GENOTYPING OF THE GENOME
EP1641809B2 (en) 2003-07-05 2018-10-03 The Johns Hopkins University Method and compositions for detection and enumeration of genetic variations
JP4773360B2 (ja) 2003-11-17 2011-09-14 コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ 流体を操作するためのシステム
US7259258B2 (en) 2003-12-17 2007-08-21 Illumina, Inc. Methods of attaching biological compounds to solid supports using triazine
EP3673986A1 (en) 2004-01-07 2020-07-01 Illumina Cambridge Limited Improvements in or relating to molecular arrays
FR2866493B1 (fr) 2004-02-16 2010-08-20 Commissariat Energie Atomique Dispositif de controle du deplacement d'une goutte entre deux ou plusieurs substrats solides
FR2872715B1 (fr) 2004-07-08 2006-11-17 Commissariat Energie Atomique Microreacteur goutte
FR2872809B1 (fr) 2004-07-09 2006-09-15 Commissariat Energie Atomique Methode d'adressage d'electrodes
JP2006058031A (ja) 2004-08-17 2006-03-02 Hitachi High-Technologies Corp 化学分析装置
US7315019B2 (en) 2004-09-17 2008-01-01 Pacific Biosciences Of California, Inc. Arrays of optical confinements and uses thereof
US7458661B2 (en) 2005-01-25 2008-12-02 The Regents Of The University Of California Method and apparatus for promoting the complete transfer of liquid drops from a nozzle
EP3492602A1 (en) 2005-06-15 2019-06-05 Complete Genomics, Inc. Single molecule arrays for genetic and chemical analysis
US20070023292A1 (en) 2005-07-26 2007-02-01 The Regents Of The University Of California Small object moving on printed circuit board
US7405281B2 (en) 2005-09-29 2008-07-29 Pacific Biosciences Of California, Inc. Fluorescent nucleotide analogs and uses therefor
GB0522310D0 (en) 2005-11-01 2005-12-07 Solexa Ltd Methods of preparing libraries of template polynucleotides
CA2643700A1 (en) * 2006-02-24 2007-11-22 Callida Genomics, Inc. High throughput genome sequencing on dna arrays
WO2007107710A1 (en) 2006-03-17 2007-09-27 Solexa Limited Isothermal methods for creating clonal single molecule arrays
CN101460953B (zh) 2006-03-31 2012-05-30 索雷克萨公司 用于合成分析的序列的系统和装置
WO2007120241A2 (en) 2006-04-18 2007-10-25 Advanced Liquid Logic, Inc. Droplet-based biochemistry
CN101490562B (zh) 2006-07-10 2012-12-19 株式会社日立高新技术 液体输送设备
US8399188B2 (en) 2006-09-28 2013-03-19 Illumina, Inc. Compositions and methods for nucleotide sequencing
US7754429B2 (en) 2006-10-06 2010-07-13 Illumina Cambridge Limited Method for pair-wise sequencing a plurity of target polynucleotides
AU2007309504B2 (en) 2006-10-23 2012-09-13 Pacific Biosciences Of California, Inc. Polymerase enzymes and reagents for enhanced nucleic acid sequencing
US9266076B2 (en) 2006-11-02 2016-02-23 The Regents Of The University Of California Method and apparatus for real-time feedback control of electrical manipulation of droplets on chip
US8262900B2 (en) 2006-12-14 2012-09-11 Life Technologies Corporation Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays
EP2092322B1 (en) 2006-12-14 2016-02-17 Life Technologies Corporation Methods and apparatus for measuring analytes using large scale fet arrays
US8349167B2 (en) 2006-12-14 2013-01-08 Life Technologies Corporation Methods and apparatus for detecting molecular interactions using FET arrays
EP2121983A2 (en) 2007-02-02 2009-11-25 Illumina Cambridge Limited Methods for indexing samples and sequencing multiple nucleotide templates
US8772046B2 (en) 2007-02-06 2014-07-08 Brandeis University Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems
GB0706631D0 (en) * 2007-04-04 2007-05-16 King S College London Nucleic acids and libraries
CN101679932A (zh) 2007-06-27 2010-03-24 数字化生物系统 用于热交换化学过程的基于数字微流体的装置
GB0806562D0 (en) 2008-04-10 2008-05-14 Fermentas Uab Production of nucleic acid
US8093064B2 (en) 2008-05-15 2012-01-10 The Regents Of The University Of California Method for using magnetic particles in droplet microfluidics
US20100035249A1 (en) * 2008-08-05 2010-02-11 Kabushiki Kaisha Dnaform Rna sequencing and analysis using solid support
US20100137143A1 (en) 2008-10-22 2010-06-03 Ion Torrent Systems Incorporated Methods and apparatus for measuring analytes
EP2411148B1 (en) 2009-03-23 2018-02-21 Raindance Technologies, Inc. Manipulation of microfluidic droplets
CN102639716A (zh) * 2009-12-04 2012-08-15 株式会社日立制作所 使用二维cDNA文库的基因表达解析方法
EP2510127B1 (en) * 2009-12-07 2015-06-10 Prognosys Biosciences, Inc. Peptide display arrays
EP2525905B1 (en) 2010-01-19 2020-11-04 Illumina, Inc. Methods and compositions for processing chemical reactions
JP5759678B2 (ja) * 2010-04-14 2015-08-05 国立大学法人埼玉大学 核酸リンカー
WO2011143231A2 (en) * 2010-05-10 2011-11-17 The Broad Institute High throughput paired-end sequencing of large-insert clone libraries
EP2632593B1 (en) 2010-10-27 2021-09-29 Illumina, Inc. Flow cells for biological or chemical analysis
US8951781B2 (en) 2011-01-10 2015-02-10 Illumina, Inc. Systems, methods, and apparatuses to image a sample for biological or chemical analysis
WO2012139110A2 (en) * 2011-04-08 2012-10-11 Prognosys Biosciences, Inc. Peptide constructs and assay systems
WO2013063382A2 (en) 2011-10-28 2013-05-02 Illumina, Inc. Microarray fabrication system and method
EP2776165A2 (en) 2011-11-07 2014-09-17 Illumina, Inc. Integrated sequencing apparatuses and methods of use
DK2788499T3 (en) 2011-12-09 2016-03-21 Illumina Inc Enhanced root for polymer tags
WO2013096777A2 (en) * 2011-12-23 2013-06-27 Wake Forest University Health Sciences Integrated compound discovery systems and methods
GB2500243A (en) * 2012-03-15 2013-09-18 Isogenica Ltd Identifying members of immobilised peptide libraries comprising protein-DNA complexes
US9012022B2 (en) 2012-06-08 2015-04-21 Illumina, Inc. Polymer coatings
US8895249B2 (en) 2012-06-15 2014-11-25 Illumina, Inc. Kinetic exclusion amplification of nucleic acid libraries
EP2881465B1 (en) * 2012-07-30 2018-07-04 Hitachi, Ltd. Tag-sequence-attached two-dimensional cdna library device, and gene expression analysis method and gene expression analysis apparatus each utilizing same
US20140378322A1 (en) 2012-08-14 2014-12-25 10X Technologies, Inc. Compositions and methods for sample processing
WO2014028537A1 (en) 2012-08-14 2014-02-20 10X Technologies, Inc. Microcapsule compositions and methods
US9388465B2 (en) 2013-02-08 2016-07-12 10X Genomics, Inc. Polynucleotide barcode generation
WO2014059370A1 (en) * 2012-10-12 2014-04-17 Institute For Systems Biology Improved high throughput system for genetic studies
WO2014093676A1 (en) 2012-12-14 2014-06-19 10X Technologies, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US9512422B2 (en) 2013-02-26 2016-12-06 Illumina, Inc. Gel patterned surfaces
CA2898453C (en) 2013-03-13 2021-07-27 Illumina, Inc. Multilayer fluidic devices and methods for their fabrication
US9255265B2 (en) * 2013-03-15 2016-02-09 Illumina, Inc. Methods for producing stranded cDNA libraries
EP3415626B1 (en) * 2013-03-15 2020-01-22 Lineage Biosciences, Inc. Methods and compositions for tagging and analyzing samples
WO2014189768A1 (en) * 2013-05-19 2014-11-27 The Board Of Trustees Of The Leland Devices and methods for display of encoded peptides, polypeptides, and proteins on dna
EP2805769A1 (en) * 2013-05-24 2014-11-26 European Molecular Biology Laboratory Methods for nano-scale single cell analysis
ES2899618T3 (es) 2013-07-01 2022-03-14 Illumina Inc Funcionalización de superficie exenta de catalizador e injerto de polímero
SG10201806890VA (en) * 2013-08-28 2018-09-27 Cellular Res Inc Massively parallel single cell analysis
US10858698B2 (en) 2014-03-25 2020-12-08 President And Fellows Of Harvard College Barcoded protein array for multiplex single-molecule interaction profiling
EP3167061B1 (en) * 2014-07-07 2019-02-20 Astrego Diagnostics AB Phenotypic characterization and in situ genotyping of a library of genetically different cells

Also Published As

Publication number Publication date
IL255188A0 (en) 2017-12-31
US20240003057A1 (en) 2024-01-04
CA2983932C (en) 2023-07-25
FI3822365T3 (fi) 2023-02-21
EP3760737B1 (en) 2023-02-15
JP2018518157A (ja) 2018-07-12
JP2020054350A (ja) 2020-04-09
EP3822365A1 (en) 2021-05-19
EP3294911A1 (en) 2018-03-21
BR112017023188A2 (pt) 2018-07-31
AU2016261496A1 (en) 2017-11-09
SG11201708689RA (en) 2017-11-29
CA3160383A1 (en) 2016-11-17
ES2938072T3 (es) 2023-04-04
FI3760737T3 (fi) 2023-07-17
ES2942572T3 (es) 2023-06-02
EP4190912A1 (en) 2023-06-07
DK3294911T3 (da) 2020-11-16
EP3822365B1 (en) 2022-11-30
CN113624953A (zh) 2021-11-09
ES2826880T3 (es) 2021-05-19
KR102333255B1 (ko) 2021-12-01
US20180142378A1 (en) 2018-05-24
DK3822365T3 (da) 2023-02-06
EP3760737A2 (en) 2021-01-06
IL290908A (en) 2022-04-01
IL290908B1 (en) 2023-08-01
JP7478174B2 (ja) 2024-05-02
IL255188B (en) 2022-04-01
IL304500A (en) 2023-09-01
CN107810415B (zh) 2021-06-22
AU2016261496B2 (en) 2019-10-10
EP3294911B1 (en) 2020-08-19
CA2983932A1 (en) 2016-11-17
IL290908B2 (en) 2023-12-01
KR102175826B1 (ko) 2020-11-06
WO2016183029A1 (en) 2016-11-17
EP3760737A3 (en) 2021-02-17
HK1245340A1 (zh) 2018-08-24
KR20200129164A (ko) 2020-11-17
RU2724998C2 (ru) 2020-06-29
EP3294911A4 (en) 2019-03-20
BR112017023188B1 (pt) 2023-11-14
DK3760737T3 (en) 2023-04-11
CN107810415A (zh) 2018-03-16
US20190112730A1 (en) 2019-04-18
JP7019656B2 (ja) 2022-02-15
US11795581B2 (en) 2023-10-24
RU2017137402A3 (ru) 2019-06-11
KR20180006407A (ko) 2018-01-17
JP2022068205A (ja) 2022-05-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2017137402A (ru) Платформа для обнаружения и анализа терапевтических агентов
JP6828007B2 (ja) 生物学的試料の空間識別されるマルチプレックスな核酸分析
EP2405272B1 (en) Detectable nucleic acid tag
CN102373288A (zh) 一种对目标区域进行测序的方法及试剂盒
CA3113841A1 (en) High-throughput single-nuclei and single-cell libraries and methods of making and of using
CN111801428B (zh) 一种获得单细胞mRNA序列的方法
McCreery Digoxigenin labeling
CN109439738A (zh) Abcb1、cyp3a5基因检测引物组、试剂盒及检测方法
US20240043913A1 (en) Materials and methods for localized detection of nucleic acids in a tissue sample
WO2023059935A1 (en) Fluorescent barcoding of microparticles
WO2024138050A1 (en) Single-nucleus high-resolution multi-modal spatial genomics
JP2007267650A (ja) 神経毒性を検出するための方法およびキット