RU2016135962A - Выделенное антитело, способ его получения, выделенная нуклеиновая кислота, экспрессионная кассета, клетка-хозяин, фармацевтический и диагностический препараты, способ лечения больного, подверженного риску или страдающего от инфекции E.COLI, и способ диагностики определения инфекций E.COLI - Google Patents

Выделенное антитело, способ его получения, выделенная нуклеиновая кислота, экспрессионная кассета, клетка-хозяин, фармацевтический и диагностический препараты, способ лечения больного, подверженного риску или страдающего от инфекции E.COLI, и способ диагностики определения инфекций E.COLI Download PDF

Info

Publication number
RU2016135962A
RU2016135962A RU2016135962A RU2016135962A RU2016135962A RU 2016135962 A RU2016135962 A RU 2016135962A RU 2016135962 A RU2016135962 A RU 2016135962A RU 2016135962 A RU2016135962 A RU 2016135962A RU 2016135962 A RU2016135962 A RU 2016135962A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
amino acid
acid sequence
antibody
cdr6
Prior art date
Application number
RU2016135962A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016135962A3 (ru
RU2724530C2 (ru
Inventor
Максимилиано Васкес
Луис ГВЧАЛЬЯ
Габор НАДЬ
Эстер НАДЬ
Валерия СИЙЯРТО
Original Assignee
Арзанис Байэусайнсис ГмбХ
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Арзанис Байэусайнсис ГмбХ filed Critical Арзанис Байэусайнсис ГмбХ
Publication of RU2016135962A publication Critical patent/RU2016135962A/ru
Publication of RU2016135962A3 publication Critical patent/RU2016135962A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2724530C2 publication Critical patent/RU2724530C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
    • C07K16/1203—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria
    • C07K16/1228—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • C07K16/1232—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia from Escherichia (G)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • A61K39/39575—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from other living beings excluding bacteria and viruses, e.g. protozoa, fungi, plants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/02—Drugs for disorders of the urinary system of urine or of the urinary tract, e.g. urine acidifiers
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56911—Bacteria
    • G01N33/56916—Enterobacteria, e.g. shigella, salmonella, klebsiella, serratia
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/92—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving lipids, e.g. cholesterol, lipoproteins, or their receptors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/33—Crossreactivity, e.g. for species or epitope, or lack of said crossreactivity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/51—Complete heavy chain or Fd fragment, i.e. VH + CH1
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/515—Complete light chain, i.e. VL + CL
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/195—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria
    • G01N2333/24—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • G01N2333/245—Escherichia (G)
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
    • G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
    • G01N2400/50—Lipopolysaccharides; LPS
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)

Claims (281)

1. Выделенное антитело, которое специфически связывается с антигеном O25b штаммов E. coli, включающее по крайней мере вариабельную область тяжелой цепи антитела (VH), которая включает любую из последовательностей CDR1-CDR3, перечисленных в таблице 1, которые обозначены в соответствии с номенклатурой Кэбота, или перечисленных в таблице 2, которые обозначены в соответствии с номенклатурой IMGT, или функционально активный вариант любой из этих CDR.
2. Антитело по п. 1, которое
А)
выбрано из группы, включающей элементы i-xiv, в которой
i)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 1, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 2, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 3;
ii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 7, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 8, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 9;
iii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 11, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 12, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 13;
iv)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 17, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 18, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 19;
v)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 23, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 24, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с
SEQ ID 25;
vi)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 29, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 30, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 31;
vii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 34, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 35, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 36;
viii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 29, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 40, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 41;
ix)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 44, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 45, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 46;
х)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 50, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 51, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 52;
xi)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 50, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 55, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 56;
xii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 57, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 58, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 59;
xiii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 61, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 62, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 63;
xiv)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 66, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 67, и
в) CDR3, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 68;
или
В) антитело, которое является функционально активным вариантом родительского антитела, являющегося любым из членов группы А, которая включает по крайней мере один функционально активный вариант любой из CDR1, CDR2 или CDR3 родительского антитела.
3. Антитело по п. 1, включающее
а) аминокислотную последовательность VH, выбранную из любой из последовательностей VH, как изображено на фигуре 2, предпочтительно аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 184 - SEQ ID 231 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315;
б) аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 184 - SEQ ID 231 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315; или
в) аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ), антитела, которая является любой из SEQ ID 184 - SEQ ID 231 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315 и которая далее содержит делецию С-концевой аминокислоты и/или точковую мутацию Q1E, если первой аминокислотой последовательности VH является Q.
4. Антитело по п. 1, которое далее включает вариабельную область легкой цепи антитела (VL), которая включает любую из последовательностей CDR4-CDR6, перечисленных в таблице 1, которые обозначены в соответствии с номенклатурой Кэбота, или перечисленных в таблице 2, которые обозначены в соответствии с номенклатурой IMGT, или функционально активный вариант любой из этих CDR.
5. Антитело по п. 4, которое
А)
выбрано из группы, включающей элементы i-xiv, в которой
i)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 4, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 5, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 6;
ii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 10, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 5, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 6;
iii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 14, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 15, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с
SEQ ID 16;
iv)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 20, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 21, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 22;
v)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 26, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 27, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 28;
vi)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 20, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 33;
vii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 37, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 27, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 38;
viii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 42, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 43;
ix)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 47, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 48, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 49;
х)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 53, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 54;
xi)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 57, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 54;
xii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 26, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 27, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 60;
xiii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 64, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 65, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 38;
xiv)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 69, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 70, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 71;
или
В) антитело, которое является функционально активным вариантом родительского антитела, являющегося любым из членов группы А, которая включает по крайней мере один функционально активный вариант любой из CDR4, CDR5 или CDR6 родительского антитела.
6. Антитело по п. 4, включающее аминокислотную последовательность VL, выбранную из любой из последовательностей VL, как изображено на фигуре 2, предпочтительно аминокислотную последовательность легкой цепи (ЛЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 248 - SEQ ID 295 или любой
из SEQ ID 316 - SEQ ID 319, или содержит аминокислотную последовательность легкой цепи (ЛЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 248 - SEQ ID 295 или любой из SEQ ID 316 - SEQ ID 319.
7. Антитело по п. 1, которое является перекрестно специфическим в отношении связывания с эпитопом, общим для антигенов O25a и O25b, в частности, которое предпочтительно связывается с антигеном O25b по отношению к антигену O25a E. coli или обладает по крайней мере равной аффинностью к обоим антигенам.
8. Антитело по п. 7, которое
А)
выбрано из группы, включающей элементы i-vii, в которой
i)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 72, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 73, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 74;
ii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 77, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 78, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 79;
iii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 81, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 82, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 83;
iv)
антитело, которое содержит
a) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 84, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 85, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 86;
v)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 77, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 89, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ
ID 90;
vi)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 92, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 93, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 94;
vii)
антитело, которое содержит
а) CDR1, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 95, и
б) CDR2, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 96, и
в) CDR, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 97;
или
В) антитело, которое является функционально активным вариантом родительского антитела, являющегося любым из членов группы А, которая включает по крайней мере один функционально активный вариант любой из CDR1, CDR2 или CDR родительского антитела.
9. Антитело по п. 7, включающее
а) аминокислотную последовательность VH, выбранную из любой из последовательностей VH, как изображено на фигуре 2,
предпочтительно аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 232 - SEQ ID 247 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315;
б) аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 232 - SEQ ID 247 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315; или
в) аминокислотную последовательность тяжелой цепи (ТЦ), антитела, которая является любой из SEQ ID 232 - SEQ ID 247 или любой из SEQ ID 312 - SEQ ID 315 и которая далее содержит делецию С-концевой аминокислоты и/или точковую мутацию Q1E, если первой аминокислотой последовательности VH является Q.
10. Антитело по п. 7, которое дополнительно включает вариабельную область легкой цепи антитела (VL), которая включает любую из последовательностей CDR4-CDR6, перечисленных в таблице 1, которые обозначены в соответствии с номенклатурой Кэбота, или перечисленных в таблице 2, которые обозначены в соответствии с номенклатурой IMGT, или функционально активный вариант любой из этих CDR.
11. Антитело по п. 10, которое
А)
выбрано из группы, включающей элементы i-vi, в которой
i)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 75, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с
SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 76;
ii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 75, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 80;
iii)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 69, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 70, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 71;
iv)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 42, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 87, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 88;
v)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 37, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 27, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 91;
vi)
антитело, которое содержит
а) CDR4, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 42, и
б) CDR5, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 32, и
в) CDR6, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID 88;
или
В) антитело, которое является функционально активным вариантом родительского антитела, являющегося любым из членов группы А, которая включает по крайней мере один функционально активный вариант любой из CDR4, CDR5 или CDR6 родительского антитела.
12. Антитело по п. 10, включающее аминокислотную последовательность VL, выбранную из любой из последовательностей VL, как
изображено на фигуре 2, предпочтительно аминокислотную последовательность легкой цепи (ЛЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 296 - SEQ ID 311 или любой из SEQ ID 316 - SEQ ID 319, или содержит аминокислотную последовательность легкой цепи (ЛЦ) антитела, которая является любой из SEQ ID 296 - SEQ ID 311 или любой из SEQ ID 316 - SEQ ID 319.
13. Антитело по п. 1, которое включает
а) последовательности CDR1-CDR6 любого из антител, перечисленных в таблице 1, или
б) последовательности VH и VL любого из антител, приведенных на фигуре 2, или
в) последовательности ТЦ и ЛЦ любого из антител, приведенных на фигуре 2, или
г) которое является функционально активным вариантом родительского антитела, характеризующегося последовательностями а-в,
предпочтительно при этом
i. функционально активный вариант содержит по крайней мере один из функционально активных вариантов любой из CDR1-CDR6 родительского антитела, и/или
ii. функционально активный вариант содержит по крайней мере одну точковую мутацию в каркасной области любой из последовательностей VH и VL и/или последовательностей ТЦ и ЛЦ родительского
антитела, необязательно содержащих точковую мутацию Q1E, если первая аминокислота каркасной области VH (VH FR1) является Q;
и дополнительно при этом
iii. функционально активный вариант обладает специфичностью к связыванию того же эпитопа, что и родительское антитело, и/или
iv. функционально активный вариант является человеческим, гуманизированным, гибридным или мышиным вариантом и/или вариантом с созревшей аффинностью родительского антитела.
14. Антитело по п. 1, включающее функционально активный вариант CDR любой из последовательностей CDR, перечисленных в таблице 1, в котором функционально активный вариант CDR включает по крайней мере одно из следующего:
а) 1, 2 или 3 точковые мутации в родительской последовательности CDR и/или
б) 1 или 2 точковые мутации в любом из четырех С-концевых или четырех N-концевых, или четырех центральных положений аминокислот родительской последовательности CDR, и/или
в) по крайней мере 60% идентичность последовательности с родительской последовательностью CDR;
предпочтительно в котором функционально активный вариант CDR включает 1 или 2 точковые мутации в любой последовательности CDR, состоящей меньше чем из 4 или 5 аминокислот.
15. Антитело по п. 1, которое включает последовательности CDR и каркасные последовательности и в котором по крайней мере одна из последовательностей CDR и каркасных последовательностей включает человеческие, гуманизированные, гибридные, мышиные последовательности или последовательности с созревшей аффинностью, предпочтительно которое представляет собой полноразмерное моноклональное антитело, фрагмент данного антитела, включающий по крайней мере один домен антитела, содержащий антигенсвязывающий участок, или гибридный белок, включающий по крайней мере один домен антитела, содержащий антигенсвязывающий участок.
16. Антитело по любому из пп. 1-15, которое обладает аффинностью к связыванию с антигеном O25b с Kd меньше 10-6 М, предпочтительно меньше 10-7 М или меньше 10-8 М.
17. Применение антитела по любому из пп. 1-16 при лечении больного, подверженного риску или страдающего от инфекции Е. coli, включающего введение больному эффективного количество антитела для ограничения инфекции в организме больного или улучшения состояния заболевания, вызванного указанной инфекцией, предпочтительно для лечения или профилактики пиелонефрита, вторичной бактериемии, сепсиса, перитонита, менингита и ИВЛ-ассоциированной пневмонии.
18. Фармацевтический препарат, включающий антитело по любому из пп. 1-16, предпочтительно включающий лекарственную форму для парентерального применения или нанесения на слизистую оболочку, необязательно содержащий фармацевтически приемлемый носитель или наполнитель.
19. Применение антитела по любому из пп. 1-16 при диагностическом определении инфекции E. coli или бактериемии у больного, вызванной штаммом Е. coli, в частности инфекции верхних и нижних мочевых путей, в том числе цистит или уретрит, восходящий или гематогенный пиелонефрит, особенно у пациентов с диабетом, а также с бактериемией, сепсисом, перитонитом или желудочно-кишечной колонизацией.
20. Диагностический препарат антитела по любому из пп. 1-16, включающий антитело и дополнительный диагностический реактив в композиции или наборе частей, содержащей компоненты:
а) антитело,
б) дополнительный диагностический реактив
в) и необязательно твердую фазу для иммобилизации по крайней мере одного антитела и диагностического реактива.
21. Способ диагностирования инфекции E. coli или бактериемии у больного, вызванной штаммом E. coli, включающий
а) наличие антитела по любому из пп. 1-16 и
б) определение возможности специфической иммунной реакции антитела с антигеном O25b в испытываемом биологическом образце больного, предпочтительно с применением агглютинационной пробы, с диагностированием вызванной мультирезистентной E. coli инфекции или бактериемию.
22. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело по любому из пп. 1-16.
23. Экспрессионная кассета или плазмида, включающая кодирующую последовательность для экспрессии
а) VH и/или VL антитела по любому из пп. 1-16 или
б) ТЦ и/или ЛЦ антитела по любому из пп. 1-16.
24. Клетка-хозяин, содержащая экспрессионную кассету или плазмиду по п. 23.
25. Способ получения антитела по любому из пп. 1-16, в котором культивируют или поддерживают в условиях получения указанного антитела клетку-хозяина по п. 24.
RU2016135962A 2014-02-06 2014-12-19 Выделенное антитело (варианты), способ получения антитела, выделенная нуклеиновая кислота, экспрессионная кассета (варианты), плазмида (варианты), клетка-хозяин, фармацевтический препарат, набор, способ лечения больного, подверженного риску или страдающего от инфекции e.coli, и способ диагностики определения инфекций e.coli RU2724530C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP14154158 2014-02-06
EP14154158.1 2014-02-06
EP14166200 2014-04-28
EP14166200.7 2014-04-28
PCT/EP2014/078709 WO2015117711A1 (en) 2014-02-06 2014-12-19 E. coli specific antibody sequences

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016135962A true RU2016135962A (ru) 2018-03-13
RU2016135962A3 RU2016135962A3 (ru) 2018-08-24
RU2724530C2 RU2724530C2 (ru) 2020-06-23

Family

ID=52692587

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016135962A RU2724530C2 (ru) 2014-02-06 2014-12-19 Выделенное антитело (варианты), способ получения антитела, выделенная нуклеиновая кислота, экспрессионная кассета (варианты), плазмида (варианты), клетка-хозяин, фармацевтический препарат, набор, способ лечения больного, подверженного риску или страдающего от инфекции e.coli, и способ диагностики определения инфекций e.coli

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20170145079A1 (ru)
EP (1) EP3102599B1 (ru)
JP (2) JP6590413B2 (ru)
KR (1) KR102301188B1 (ru)
CN (2) CN106536551B (ru)
AU (2) AU2014381795B2 (ru)
BR (1) BR112016018116A2 (ru)
CA (1) CA2935532A1 (ru)
IL (1) IL246719B (ru)
MX (1) MX2016008794A (ru)
RU (1) RU2724530C2 (ru)
WO (1) WO2015117711A1 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MX365331B (es) 2013-01-17 2019-05-29 Arsanis Biosciences Gmbh Anticuerpo específico contra e. coli mdr.
AU2015220723C1 (en) 2014-02-24 2018-04-05 Glaxosmithkline Biologicals Sa Novel polysaccharide and uses thereof
TW201706312A (zh) * 2015-05-20 2017-02-16 免疫功坊股份有限公司 用以治療疾病的分子構建體
WO2017033121A1 (en) 2015-08-24 2017-03-02 Glaxosmithkline Intellectual Property (No. 2) Limited Biopharmaceutical compositions
TWI715617B (zh) 2015-08-24 2021-01-11 比利時商葛蘭素史密斯克藍生物品公司 對抗腸道外病原性大腸桿菌之免疫保護之方法及組合物
AR109621A1 (es) 2016-10-24 2018-12-26 Janssen Pharmaceuticals Inc Formulaciones de vacunas contra glucoconjugados de expec
US11446370B2 (en) 2019-03-18 2022-09-20 Janssen Pharmaceuticals, Inc. Bioconjugates of E. coli o-antigen polysaccharides, methods of production thereof, and methods of use thereof
JP2022525773A (ja) 2019-03-18 2022-05-19 ヤンセン ファーマシューティカルズ，インコーポレーテッド 大腸菌ｏ抗原多糖のバイオコンジュゲートを製造する方法、その組成物およびその使用方法
CA3133633A1 (en) * 2019-03-20 2020-09-24 Javelin Oncology, Inc. Anti-adam12 antibodies and chimeric antigen receptors, and compositions and methods comprising
WO2022163845A1 (ja) * 2021-01-31 2022-08-04 株式会社バランス・イースト 検査システム、検査方法、プログラム、およびコンピュータが読み取り可能な記憶媒体

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB8422653D0 (en) * 1984-09-07 1984-10-10 Technology Licence Co Ltd Monoclonal antibodies
US5370872A (en) * 1991-08-12 1994-12-06 Swiss Serum And Vaccine Institute Berne Escherichia coliO-polysaccharide-protein conjugate vaccine
WO2001012646A1 (en) * 1999-08-19 2001-02-22 Smithkline Beecham Corporation Sialoadhesin factor-1 agonist and antagonist antibodies
AU2003901008A0 (en) * 2003-03-04 2003-03-20 Anadis Ltd Composition for the treatment and prevention of bacterial infections
NZ556317A (en) * 2005-01-31 2011-01-28 Genentech Inc Anti-EphB2 antibodies and methods using same
US8790651B2 (en) * 2011-07-21 2014-07-29 Zoetis Llc Interleukin-31 monoclonal antibody
US9834823B2 (en) * 2012-07-02 2017-12-05 The Translational Genomics Research Institute Primers, assays and methods for detecting an E. coli subtype
MX365331B (es) * 2013-01-17 2019-05-29 Arsanis Biosciences Gmbh Anticuerpo específico contra e. coli mdr.

Also Published As

Publication number Publication date
RU2016135962A3 (ru) 2018-08-24
WO2015117711A1 (en) 2015-08-13
RU2724530C2 (ru) 2020-06-23
AU2020287970A1 (en) 2021-01-21
KR20160117467A (ko) 2016-10-10
JP2017511691A (ja) 2017-04-27
EP3102599A1 (en) 2016-12-14
CN106536551B (zh) 2021-04-16
CA2935532A1 (en) 2015-08-13
BR112016018116A2 (pt) 2018-02-20
AU2014381795B2 (en) 2020-09-17
IL246719B (en) 2020-09-30
JP2019213521A (ja) 2019-12-19
KR102301188B1 (ko) 2021-09-13
AU2014381795A1 (en) 2016-07-07
CN106536551A (zh) 2017-03-22
JP6590413B2 (ja) 2019-10-16
IL246719A0 (en) 2016-08-31
CN113388032A (zh) 2021-09-14
US20170145079A1 (en) 2017-05-25
MX2016008794A (es) 2016-10-13
EP3102599B1 (en) 2019-02-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016135962A (ru) Выделенное антитело, способ его получения, выделенная нуклеиновая кислота, экспрессионная кассета, клетка-хозяин, фармацевтический и диагностический препараты, способ лечения больного, подверженного риску или страдающего от инфекции E.COLI, и способ диагностики определения инфекций E.COLI
US11773157B2 (en) Compositions and methods for treating and preventing Staphylococcus aureus infections
US20220204621A1 (en) Bispecific antibodies to ror1 and cd3
EP2928919A2 (en) Blood-brain barrier (bbb) penetrating dual specific binding proteins
US20200347130A1 (en) CD96 Antibody, Antigen-Binding Fragment and Pharmaceutical use Thereof
JP2012518425A5 (ru)
JP2014534806A5 (ru)
TW201333033A (zh) 雙可變域免疫球蛋白及其用途
RU2018117651A (ru) Бактерицидное моноклональное антитело, нацеленное на klebsiella pneumoniae
RU2017132168A (ru) Антитела, нацеленные на о-антиген на основе галактана из к.pneumoniae
CN114729033A (zh) 抗α-溶血素的抗体及其应用
RU2016119052A (ru) Перекрестно-нейтрализующее антитело (варианты), способ его получения, фармацевтический и диагностический препараты, способы диагностики и лечения инфекций Staphylococcus aureus, выделенная нуклеиновая кислота, рекомбинантная экспрессионная кассета или плазмида, клетка-хозяин, способ получения функционально активных вариантов родительского антитела, кристалл (варианты), выделенный паратоп антитела, выделенный конформационный антигенный эпитоп, связывающая молекула, способ скрининга или анализа для определения связывающего соединения, иммуноген
JP2017526618A5 (ru)
TW202140547A (zh) 抗ａｎｇｐｔｌ３抗體及其應用
TWI734279B (zh) 抗α-突觸核蛋白抗體及其用途
RU2018119273A (ru) Антитела, нацеленные на основанный на маннане о-антиген к. pneumoniae
CN114591434B (zh) 抗Siglec15抗体及其制备方法和用途
US10093733B2 (en) LRP-8 binding dual variable domain immunoglobulin proteins
TWI685504B (zh) 抗gitr抗體、其抗原結合片段及其醫藥用途
EP2778173A1 (en) Antibody directed against anthrax toxins and its uses
CN115335402A (zh) 特异性抗原结合分子,其制备方法及医药用途
CN114437205A (zh) 抗冠状病毒抗体及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
HZ9A Changing address for correspondence with an applicant