RU2015145785A - Биологическое количественное определение пептидогликанов - Google Patents
Биологическое количественное определение пептидогликанов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015145785A RU2015145785A RU2015145785A RU2015145785A RU2015145785A RU 2015145785 A RU2015145785 A RU 2015145785A RU 2015145785 A RU2015145785 A RU 2015145785A RU 2015145785 A RU2015145785 A RU 2015145785A RU 2015145785 A RU2015145785 A RU 2015145785A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- pgn
- sample
- reporter gene
- calibration curve
- tlr2
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 14
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 claims 12
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 claims 8
- 102000008228 Toll-like receptor 2 Human genes 0.000 claims 7
- 108010060888 Toll-like receptor 2 Proteins 0.000 claims 7
- 101000831567 Homo sapiens Toll-like receptor 2 Proteins 0.000 claims 5
- 108010028921 Lipopeptides Proteins 0.000 claims 5
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims 5
- 102100024333 Toll-like receptor 2 Human genes 0.000 claims 5
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims 5
- 241000640374 Alicyclobacillus acidocaldarius Species 0.000 claims 4
- 241000191938 Micrococcus luteus Species 0.000 claims 4
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 claims 3
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 claims 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 3
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims 3
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 3
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 claims 2
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 claims 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 claims 2
- 238000000527 sonication Methods 0.000 claims 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 claims 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 claims 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 claims 1
- 229920002177 Icodextrin Polymers 0.000 claims 1
- 241000192041 Micrococcus Species 0.000 claims 1
- 108010084333 N-palmitoyl-S-(2,3-bis(palmitoyloxy)propyl)cysteinyl-seryl-lysyl-lysyl-lysyl-lysine Proteins 0.000 claims 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 claims 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 1
- 229940016836 icodextrin Drugs 0.000 claims 1
- 238000007781 pre-processing Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4722—Proteoglycans, e.g. aggreccan
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- G01N2333/70596—Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere in G01N2333/705
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- G01N2400/38—Heteroglycans, i.e. polysaccharides having more than one sugar residue in the main chain in either alternating or less regular sequence, e.g. gluco- or galactomannans, e.g. Konjac gum, Locust bean gum, Guar gum
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- G01N2400/38—Heteroglycans, i.e. polysaccharides having more than one sugar residue in the main chain in either alternating or less regular sequence, e.g. gluco- or galactomannans, e.g. Konjac gum, Locust bean gum, Guar gum
- G01N2400/40—Glycosaminoglycans, i.e. GAG or mucopolysaccharides, e.g. chondroitin sulfate, dermatan sulfate, hyaluronic acid, heparin, heparan sulfate, and related sulfated polysaccharides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (22)
1. Способ количественного определения пептидогликанов (PGN) в образце полимера глюкозы, включающий
a) обработку образца полимера глюкозы посредством обработки ультразвуком, нагревания и/или ощелачивания;
b) приведение обработанного образца или его разведения в контакт с рекомбинантной клеткой, экспрессирующей экзогенный рецептор TLR2 (Toll-подобный рецептор 2) и репортерный ген при прямой зависимости от сигнального пути, связанного с рецептором TLR2, причем указанный репортерный ген кодирует окрашенный или флуоресцирующий белок или белок, активность которого может быть измерена с субстратом или без него;
c) измерение сигнала репортерного гена и
d) определение количества PGN в образце с применением калибровочной кривой на основе зависимости количества PGN от интенсивности сигнала репортерного гена.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что обработка образца посредством обработки ультразвуком, нагревания и/или ощелачивания позволяет фрагментировать и дезинтегрировать PGN, содержащиеся в образце, в частности, для того, чтобы сделать их способными активировать рецептор TLR2.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что обработка образца делает возможным образование PGN преимущественно с размером приблизительно 120 кДа.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что репортерный ген представляет собой ген секретируемой щелочной фосфатазы.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку линии HEK-Blue™ hTLR2.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что калибровочная кривая на основе зависимости количества PGN от интенсивности сигнала репортерного гена была построена с применением PGN, полученных из бактерии, выбранной из Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis и Alicyclobacillus acidocaldarius, предпочтительно из Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus и Alicyclobacillus acidocaldarius.
7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что способ включает предварительную стадию построения калибровочной кривой с применением PGN, полученных из бактерии, выбранной из Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis и Alicyclobacillus acidocaldarius.
8. Способ по п. 6, отличающийся тем, что калибровочную кривую на основе зависимости количества PGN от интенсивности сигнала репортерного гена стандартизируют или калибруют с применением внутреннего стандарта, который представляет собой агонист TLR2, предпочтительно липопептид, в частности, трихлоргидрат PAM3Cys-Ser-(Lys)4.
9. Способ по любому из п.п. 1-5, отличающийся тем, что калибровочная кривая на основе
зависимости количества PGN от интенсивности сигнала репортерного гена была получена с применением внутреннего стандарта, который представляет собой агонист TLR2, предпочтительно липопептид, в частности, трихлоргидрат PAM3Cys-Ser-(Lys)4.
10. Способ по п. 9, отличающийся тем, что способ включает предварительную стадию построения калибровочной кривой с применением внутреннего стандарта, который представляет собой агонист TLR2, предпочтительно липопептид, в частности, трихлоргидрат PAM3Cys-Ser-(Lys)4.
11. Способ по п. 1, отличающийся тем, что образец разводят, при необходимости, таким образом, чтобы получать сигнал репортерного гена, соответствующий линейной части калибровочной кривой.
12. Способ по п. 1, отличающийся тем, что образец представляет собой образец раствора икодекстрина.
13. Набор для количественного определения пептидогликанов (PGN) в образце полимеров глюкозы, содержащий
- рекомбинантную клетку, экспрессирующую экзогенный рецептор TLR2 (Toll-подобный рецептор 2) и репортерный ген при прямой зависимости от сигнального пути, связанного с рецептором TLR2, причем указанный репортерный ген кодирует окрашенный или флуоресцирующий белок или белок, активность которого может быть измерена с субстратом или без него; и
- либо калибровочную кривую на основе зависимости количества PGN от интенсивности сигнала репортерного гена, либо стандарт PGN, предпочтительно полученный из бактерии, выбранной из Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis и Alicyclobacillus acidocaldarius, предпочтительно из Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus и Alicyclobacillus acidocaldarius, либо внутренний стандарт, который представляет собой агонист TLR2, предпочтительно липопептид, в частности, трихлоргидрат PAM3Cys-Ser-(Lys)4;
- необязательно инструкции по применению и раствор для предварительной обработки образца.
14. Набор по п. 13, дополнительно содержащий внутренний стандарт, который представляет собой агонист TLR2, предпочтительно липопептид, в частности, трихлоргидрат PAM3Cys-Ser-(Lys)4.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| FR1352732 | 2013-03-26 | ||
| FR1352732 | 2013-03-26 | ||
| FR1357197 | 2013-07-22 | ||
| FR1357197 | 2013-07-22 | ||
| PCT/EP2014/055888 WO2014154651A1 (fr) | 2013-03-26 | 2014-03-25 | Dosage biologique des peptidoglycanes |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015145785A true RU2015145785A (ru) | 2017-05-02 |
| RU2680885C2 RU2680885C2 (ru) | 2019-02-28 |
Family
ID=50397130
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015145785A RU2680885C2 (ru) | 2013-03-26 | 2014-03-25 | Биологическое количественное определение пептидогликанов |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US9857355B2 (ru) |
| EP (1) | EP2979091B1 (ru) |
| JP (1) | JP6454682B2 (ru) |
| KR (1) | KR102318190B1 (ru) |
| CN (1) | CN105122059B (ru) |
| AU (1) | AU2014243145B2 (ru) |
| BR (1) | BR112015024577A2 (ru) |
| CA (1) | CA2904965C (ru) |
| ES (1) | ES2679493T3 (ru) |
| MX (1) | MX2015013735A (ru) |
| RU (1) | RU2680885C2 (ru) |
| SG (1) | SG11201507708WA (ru) |
| WO (1) | WO2014154651A1 (ru) |
Families Citing this family (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| SG10201602761TA (en) * | 2011-04-08 | 2016-05-30 | Roquette Freres | Methods For Detecting Contaminants Of Glucose Polymers |
| CN105960464B (zh) | 2014-02-07 | 2020-01-10 | 罗盖特兄弟公司 | 肽聚糖的生物学剂量 |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2077723C1 (ru) * | 1993-02-11 | 1997-04-20 | Научно-исследовательский конструкторско-технологический институт биологически активных веществ Научно-производственного объединения "Вектор" | Способ определения липополисахаридов |
| US7118857B2 (en) | 2004-02-27 | 2006-10-10 | Baxter International Inc. | Methods and compositions for detection of microbial contaminants in peritoneal dialysis solutions |
| JP4455933B2 (ja) * | 2004-05-17 | 2010-04-21 | 株式会社タクマ | 汚泥の水素発酵方法 |
| US20090239819A1 (en) * | 2008-03-20 | 2009-09-24 | Run Wang | Peritoneal dialysis solution test method |
| GB2481267B (en) * | 2010-06-15 | 2016-04-20 | Univ Leicester | Assay for determining the risk of a toll-like receptor containing foodstuff for causing systemic inflammation in vivo |
| SG10201602761TA (en) | 2011-04-08 | 2016-05-30 | Roquette Freres | Methods For Detecting Contaminants Of Glucose Polymers |
| JP5821358B2 (ja) * | 2011-07-20 | 2015-11-24 | ソニー株式会社 | 核酸抽出方法及び核酸抽出用カートリッジ |
| ES2672980T3 (es) * | 2012-05-29 | 2018-06-19 | Roquette Frères | Métodos para descontaminar circuitos de producción de polímeros de glucosa e hidrolizados de polímeros de glucosa |
-
2014
- 2014-03-25 AU AU2014243145A patent/AU2014243145B2/en active Active
- 2014-03-25 JP JP2016504619A patent/JP6454682B2/ja active Active
- 2014-03-25 ES ES14714218.6T patent/ES2679493T3/es active Active
- 2014-03-25 SG SG11201507708WA patent/SG11201507708WA/en unknown
- 2014-03-25 US US14/779,353 patent/US9857355B2/en active Active
- 2014-03-25 BR BR112015024577A patent/BR112015024577A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2014-03-25 EP EP14714218.6A patent/EP2979091B1/fr not_active Revoked
- 2014-03-25 CA CA2904965A patent/CA2904965C/fr active Active
- 2014-03-25 RU RU2015145785A patent/RU2680885C2/ru active
- 2014-03-25 KR KR1020157026299A patent/KR102318190B1/ko active IP Right Grant
- 2014-03-25 CN CN201480018300.0A patent/CN105122059B/zh active Active
- 2014-03-25 WO PCT/EP2014/055888 patent/WO2014154651A1/fr active Application Filing
- 2014-03-25 MX MX2015013735A patent/MX2015013735A/es active IP Right Grant
-
2017
- 2017-11-02 US US15/801,854 patent/US20180188233A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP6454682B2 (ja) | 2019-01-16 |
| CA2904965C (fr) | 2021-11-16 |
| ES2679493T3 (es) | 2018-08-27 |
| CN105122059A (zh) | 2015-12-02 |
| BR112015024577A2 (pt) | 2017-07-18 |
| CA2904965A1 (fr) | 2014-10-02 |
| EP2979091B1 (fr) | 2018-04-25 |
| AU2014243145A1 (en) | 2015-10-08 |
| EP2979091A1 (fr) | 2016-02-03 |
| KR20150135302A (ko) | 2015-12-02 |
| RU2680885C2 (ru) | 2019-02-28 |
| MX2015013735A (es) | 2016-06-21 |
| AU2014243145A8 (en) | 2015-10-15 |
| CN105122059B (zh) | 2019-04-30 |
| SG11201507708WA (en) | 2015-10-29 |
| US9857355B2 (en) | 2018-01-02 |
| US20180188233A1 (en) | 2018-07-05 |
| AU2014243145B2 (en) | 2020-04-02 |
| US20160054301A1 (en) | 2016-02-25 |
| KR102318190B1 (ko) | 2021-10-28 |
| JP2016514468A (ja) | 2016-05-23 |
| WO2014154651A1 (fr) | 2014-10-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Schwarz et al. | Biological activity of masked endotoxin | |
| Cirelli et al. | Inflammasome sensor NLRP1 controls rat macrophage susceptibility to Toxoplasma gondii | |
| EA201990929A1 (ru) | In vitro и клеточные анализы измерения активности ботулинических нейротоксинов | |
| EA201891292A1 (ru) | Мультиспецифические антитела | |
| TR201809571T4 (tr) | Ll-22 polipeptidleri ile ıl-22 fc füzyon proteinleri ve kullanım yöntemleri. | |
| EA201891293A1 (ru) | Мультиспецифические антитела | |
| EP4292654A3 (en) | Detection of misfolded proteins | |
| WO2020055954A3 (en) | Methods for detecting liver diseases | |
| IN2015DN02565A (ru) | ||
| MX2020006728A (es) | Metodos para medir analito y/o proteina en muestras biologicas. | |
| EP4220158A3 (en) | Urine specimen analysis device and urine specimen analysis method | |
| PH12019500931A1 (en) | Sample-holding element, analysis set, and method for analyzing a liquid, in particular a cooling lubricant emulsion | |
| MX2020001809A (es) | Metodos para determinar acido desoxirribonucleico circulante de donante sin genotipo de donante. | |
| AR091783A1 (es) | Un metodo para elaborar un indice de diversidad e indice de viabilidad de microorganismos en muestras de proceso | |
| RU2015145785A (ru) | Биологическое количественное определение пептидогликанов | |
| AR105379A1 (es) | Dispositivo para detectar proteínas mal plegadas y sus métodos de uso | |
| PE20120592A1 (es) | Metodo con biomarcadores para el seguimiento de un tratamiento | |
| MX2020004336A (es) | Deteccion capacitiva accionada por pulsos para transistores de efecto campo. | |
| MX2015011369A (es) | Metodo y sistema para determinar una respuesta biologica de un objetivo a una substancia candidato soluble. | |
| MX2016004720A (es) | Determinacion mejorada de las composiciones de fluidos. | |
| PE20120793A1 (es) | Bioensayo de control de calidad para productos nutriceuticos y medicinales | |
| JP6370390B2 (ja) | ペプチドグリカンの生物検定 | |
| MX2016015531A (es) | Ensayo de inflamacion oral. | |
| EA201401101A1 (ru) | Способ лабораторной диагностики пневмонии | |
| Dubey et al. | Sterility-Independent Enhancement of Proteasome Function via Floxuridine-Triggered Detoxification in C. elegans |