RU2015119768A - Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf - Google Patents

Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf Download PDF

Info

Publication number
RU2015119768A
RU2015119768A RU2015119768A RU2015119768A RU2015119768A RU 2015119768 A RU2015119768 A RU 2015119768A RU 2015119768 A RU2015119768 A RU 2015119768A RU 2015119768 A RU2015119768 A RU 2015119768A RU 2015119768 A RU2015119768 A RU 2015119768A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
coding region
deletion
gene
mrna
deletions
Prior art date
Application number
RU2015119768A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2612497C2 (ru
Inventor
Сергей Львович Киселев
Original Assignee
Общество с ограниченной ответственностью "НекстГен"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority to RU2015119768A priority Critical patent/RU2612497C2/ru
Application filed by Общество с ограниченной ответственностью "НекстГен" filed Critical Общество с ограниченной ответственностью "НекстГен"
Priority to PCT/RU2015/000852 priority patent/WO2016190774A1/ru
Priority to AU2015396177A priority patent/AU2015396177B2/en
Priority to CA2985608A priority patent/CA2985608C/en
Priority to EA201700456A priority patent/EA039395B1/ru
Priority to MX2017013206A priority patent/MX2017013206A/es
Priority to CN201580080399.1A priority patent/CN107614687B/zh
Priority to EP15893474.5A priority patent/EP3305901B1/en
Priority to BR112017023058-5A priority patent/BR112017023058B1/pt
Priority to US15/070,239 priority patent/US9896493B2/en
Publication of RU2015119768A publication Critical patent/RU2015119768A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2612497C2 publication Critical patent/RU2612497C2/ru
Priority to US15/819,157 priority patent/US10040837B2/en

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A61K48/0066Manipulation of the nucleic acid to modify its expression pattern, e.g. enhance its duration of expression, achieved by the presence of particular introns in the delivered nucleic acid
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/515Angiogenesic factors; Angiogenin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/50Vector systems having a special element relevant for transcription regulating RNA stability, not being an intron, e.g. poly A signal

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Способ продления времени жизни мРНК трансгена в клетке млекопитающего, трансфицированной генной конструкцией, предусматривающий проведение точечных делеций в 3′некодирующей области гена фактора роста эндотелия сосудов (vegf), при котором делетированный нуклеотид не заменяется, либо заменяется на цитозин в точках замещения гуанина или аденина, затем определяется время жизни мРНК при каждой делении, сведения анализируются и конструируется генная конструкция, содержащая 3′некодирующую область с совокупностью одиночных делеций и/или замен на цитозин, показавших наилучший результат по продлению жизни мРНК.2. Способ по п. 1, где трансфицированная генная конструкция позволяет увеличить количество кодируемого трансгеном белка.3. Способ по п. 1, где 3′-некодирующая область мРНК является некодирующей областью гена, выбранного из: vegf121, vegf145, vegf165, vegf185, и других возможных изоформ гена фактора роста эндотелия сосудов.4. Плазмидная ДНК с оптимизированной последовательностью 3′-некодирующей области гена фактора роста эндотелия сосудов, выбранного из изоформ: 121, 145, 165, 185 или других, содержащая в 3′-некодирующей области одну или несколько делеций и/или замен одиночных нуклеотидов, сконструированная для осуществления способа по п. 1.5. Плазмидная ДНК гена фактора роста эндотелия сосудов vegf165, представленная на Seq#11, пригодная для осуществления способа по п. 1, отличающаяся тем, что содержит следующие делеций и замещения: в положении 1079 - C-делеция, 1111 - T-делеция, 1144 - А/С-замена, 1148 - A-делеция, 1155 - C-делеция, 1173 - А-деления, 1185 - A-делеция, 1536 - G/C-замена.6. мРНК плазмидной ДНК по п. 4 или 5, содержащая 3′-некодирующую область, соответствующую одной или нескольким делециям и/или заменам одиночных нуклеотидов плазмидной ДНК по пп. 4

Claims (8)

1. Способ продления времени жизни мРНК трансгена в клетке млекопитающего, трансфицированной генной конструкцией, предусматривающий проведение точечных делеций в 3′некодирующей области гена фактора роста эндотелия сосудов (vegf), при котором делетированный нуклеотид не заменяется, либо заменяется на цитозин в точках замещения гуанина или аденина, затем определяется время жизни мРНК при каждой делении, сведения анализируются и конструируется генная конструкция, содержащая 3′некодирующую область с совокупностью одиночных делеций и/или замен на цитозин, показавших наилучший результат по продлению жизни мРНК.
2. Способ по п. 1, где трансфицированная генная конструкция позволяет увеличить количество кодируемого трансгеном белка.
3. Способ по п. 1, где 3′-некодирующая область мРНК является некодирующей областью гена, выбранного из: vegf121, vegf145, vegf165, vegf185, и других возможных изоформ гена фактора роста эндотелия сосудов.
4. Плазмидная ДНК с оптимизированной последовательностью 3′-некодирующей области гена фактора роста эндотелия сосудов, выбранного из изоформ: 121, 145, 165, 185 или других, содержащая в 3′-некодирующей области одну или несколько делеций и/или замен одиночных нуклеотидов, сконструированная для осуществления способа по п. 1.
5. Плазмидная ДНК гена фактора роста эндотелия сосудов vegf165, представленная на Seq#11, пригодная для осуществления способа по п. 1, отличающаяся тем, что содержит следующие делеций и замещения: в положении 1079 - C-делеция, 1111 - T-делеция, 1144 - А/С-замена, 1148 - A-делеция, 1155 - C-делеция, 1173 - А-деления, 1185 - A-делеция, 1536 - G/C-замена.
6. мРНК плазмидной ДНК по п. 4 или 5, содержащая 3′-некодирующую область, соответствующую одной или нескольким делециям и/или заменам одиночных нуклеотидов плазмидной ДНК по пп. 4 или 5.
7. Фармацевтическая композиция для регенерации соединительной, мышечной, нервной тканей, включающая плазмидную ДНК по п. 4 или 5 и, по меньшей мере, один криопротектант и стабилизатор рН.
8. Применение плазмидной ДНК по п. 5 в регенерации соединительной, нервной, мышечной, костной тканей, тканей сердечно-сосудистой системы.
RU2015119768A 2015-05-26 2015-05-26 Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf RU2612497C2 (ru)

Priority Applications (11)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015119768A RU2612497C2 (ru) 2015-05-26 2015-05-26 Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf
AU2015396177A AU2015396177B2 (en) 2015-05-26 2015-12-07 Optimized nucleotide sequence and pharmaceutical composition based thereon with prolonged VEGF transgene expression
CA2985608A CA2985608C (en) 2015-05-26 2015-12-07 Optimized nucleotide sequence and pharmaceutical composition based thereon with prolonged vegf transgene expression
EA201700456A EA039395B1 (ru) 2015-05-26 2015-12-07 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННОЙ КОНСТРУКЦИИ И ПЛАЗМИДНАЯ ДНК С УВЕЛИЧЕННЫМ ВРЕМЕНЕМ ЖИЗНИ мРНК ТРАНСГЕНА VEGF В КЛЕТКЕ МЛЕКОПИТАЮЩЕГО, ПЛАЗМИДНАЯ ДНК ГЕНА VEGF165, мРНК, ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ И ПРИМЕНЕНИЕ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК
PCT/RU2015/000852 WO2016190774A1 (ru) 2015-05-26 2015-12-07 Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf
MX2017013206A MX2017013206A (es) 2015-05-26 2015-12-07 Secuencia de nucleotidos optimizada y composicion farmaceutica basada en la misma con expresion de transgen vegf prolongada.
CN201580080399.1A CN107614687B (zh) 2015-05-26 2015-12-07 具有延长的vegf转入基因表达的优化的核苷酸序列和基于它的药物组合物
EP15893474.5A EP3305901B1 (en) 2015-05-26 2015-12-07 Optimized nucleotide sequence and pharmaceutical composition based thereon with prolonged vegf transgene expression
BR112017023058-5A BR112017023058B1 (pt) 2015-05-26 2015-12-07 Método de triagem para mrnas de vegf com tempo de vida prolongado, dna plasmídico e seu uso, e composição farmacêutica para a regeneração de tecidos nervosos, conjuntivos e musculares
US15/070,239 US9896493B2 (en) 2015-05-26 2016-03-15 Nucleotide sequence and pharmaceutical composition based thereon with prolonged VEGF transgene expression
US15/819,157 US10040837B2 (en) 2015-05-26 2017-11-21 Nucleotide sequence and pharmaceutical composition based thereon with prolonged VEGF transgene expression

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015119768A RU2612497C2 (ru) 2015-05-26 2015-05-26 Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2015119768A true RU2015119768A (ru) 2016-12-20
RU2612497C2 RU2612497C2 (ru) 2017-03-09

Family

ID=57392933

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015119768A RU2612497C2 (ru) 2015-05-26 2015-05-26 Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf

Country Status (10)

Country Link
US (2) US9896493B2 (ru)
EP (1) EP3305901B1 (ru)
CN (1) CN107614687B (ru)
AU (1) AU2015396177B2 (ru)
BR (1) BR112017023058B1 (ru)
CA (1) CA2985608C (ru)
EA (1) EA039395B1 (ru)
MX (1) MX2017013206A (ru)
RU (1) RU2612497C2 (ru)
WO (1) WO2016190774A1 (ru)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114908089B (zh) * 2021-02-08 2024-03-15 上海细胞治疗集团有限公司 3’utr的构建方法和应用

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6153407A (en) 1992-07-28 2000-11-28 Beth Israel Deaconess Medical Center Erythropoietin DNA having modified 5' and 3' sequences and its use to prepare EPO therapeutics
US5587300A (en) * 1994-04-26 1996-12-24 Wisconsin Ulumni Research Foundation Method to increase regulatory molecule production
AU742365B2 (en) 1997-03-14 2002-01-03 Selective Genetics, Inc. Adenoviral vectors with modified tropism
US6627436B2 (en) 1997-10-31 2003-09-30 Stratagene Vector for gene expression in prokaryotic and eukaryotic systems
BR9908754A (pt) 1998-03-13 2000-11-28 American Home Prod Composições liofilizada e lìquida de polinucleotìdeo e farmacêutica, processos para tratar um paciente mamìfero e para preparar uma composição liofilizada de polinucleotìdeo, produto liofilizado de polinucleotìdeo, e, processo para liofilizar uma composição de polinucleotìdeo
US7598079B2 (en) * 1998-12-24 2009-10-06 Novation Pharmaceuticals, Inc. Assay for identifying compounds which affect stability of mRNA
AU5646300A (en) 1999-02-10 2000-08-29 Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services, The Methods of stimulating angiogenesis
US7087411B2 (en) 1999-06-08 2006-08-08 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Fusion protein capable of binding VEGF
US7288521B2 (en) 2000-04-06 2007-10-30 Franco Wayne P Growth factor therapy mobilization of stem cells into the peripheral blood
CN1351055A (zh) 2000-10-26 2002-05-29 上海博德基因开发有限公司 一种新的多肽——人的血管内皮生长因子165受体(vegf-165r)10.67和编码这种多肽的多核苷酸
CA2451311A1 (en) * 2001-06-20 2003-01-03 Ludwig Institute For Cancer Research Stimulation of vascularization with vegf-b
US7981863B2 (en) 2001-09-19 2011-07-19 Neuronova Ab Treatment of Parkinson's disease with PDGF
CN100431611C (zh) 2002-07-04 2008-11-12 朱静亚 多肽-脂质体与人血管内皮生长因子基因重组质粒复合物及用途
WO2004050126A2 (en) 2002-12-02 2004-06-17 Anges Mg, Inc. Compositions for treating or preventing angiogenesis-dependent symptoms
EP1791945A1 (en) 2004-09-17 2007-06-06 Centelion Stable liquid formulations of plasmid dna
RU2297848C2 (ru) 2005-05-11 2007-04-27 Александр Веньяминович Иткес Генно-инженерная конструкция vegf-ибмед (vegf-ibmed)
ES2338400B1 (es) 2008-05-06 2011-09-14 David Benet Ferrus Conjunto de moleculas antiangiogenicas y su uso.
JP5735927B2 (ja) 2009-02-24 2015-06-17 ザ スクリプス リサーチ インスティテュート タンパク質生産の増強のためのmRNAの一次構造の再操作
US8367350B2 (en) 2009-04-29 2013-02-05 Morehouse School Of Medicine Compositions and methods for diagnosis, prognosis and management of malaria
RU2431669C2 (ru) * 2009-06-23 2011-10-20 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Казанский государственный университет им. В.И. Ульянова-Ленина" Способ получения лекарственного препарата генетически модифицированных клеток
RU2542385C2 (ru) * 2012-08-31 2015-02-20 Общество с ограниченной ответственностью "НекстГен" Способ получения фармацевтической композиции для индукции развития кровеносных сосудов в тканях, фармацевтическая композиция, полученная этим способом, и способ лечения ишемии тканей и/или органов человека

Also Published As

Publication number Publication date
EP3305901A1 (en) 2018-04-11
EA201700456A1 (ru) 2018-06-29
CN107614687B (zh) 2021-05-28
CA2985608A1 (en) 2016-12-01
CN107614687A (zh) 2018-01-19
CA2985608C (en) 2021-06-15
EP3305901B1 (en) 2020-09-30
US20180086800A1 (en) 2018-03-29
MX2017013206A (es) 2018-02-15
BR112017023058A2 (pt) 2018-10-16
RU2612497C2 (ru) 2017-03-09
US20160347803A1 (en) 2016-12-01
US10040837B2 (en) 2018-08-07
EP3305901A4 (en) 2018-10-24
EA039395B1 (ru) 2022-01-21
AU2015396177B2 (en) 2019-02-28
AU2015396177A1 (en) 2017-11-02
US9896493B2 (en) 2018-02-20
WO2016190774A1 (ru) 2016-12-01
BR112017023058B1 (pt) 2024-03-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2962434T3 (es) Procedimientos y composiciones para editar ARN
AU2017313917B2 (en) CRISPR-Cas genome engineering via a modular AAV delivery system
Heyman et al. A quiescent path to plant longevity
Scott et al. Comparison of Dengue virus type 2-specific small RNAs from RNA interference-competent and–incompetent mosquito cells
RU2018112325A (ru) Последовательности 3'-utr для стабилизации рнк
WO2018058064A1 (en) Compositions and methods for gene editing
BR112017017867A2 (pt) métodos e composições para tratamento de doenças oculares genéticas
MX2020003092A (es) Vectores de adn no integrantes para la modificacion genetica de celulas.
RU2014138989A (ru) Способы и составы лечения болезни хантингтона
JP2015501637A5 (ru)
Zhou et al. Bat Mx1 and Oas1, but not Pkr are highly induced by bat interferon and viral infection
CY1121037T1 (el) Αντινοηματικα πολυνουκλεοτιδια για να διεγειρεται παραλειψη εξονιου και μεθοδοι θεραπειας δυστροφιων
WO2017010543A1 (ja) 改変されたFnCas9タンパク質及びその使用
EP3478828A1 (en) Materials and methods for treatment of friedreich ataxia and other related disorders
Wigner et al. Functional role of Runx3 in the regulation of aggrecan expression during cartilage development
Ru et al. Hydrostatic pressure induces osteogenic differentiation of adipose-derived mesenchymal stem cells through increasing lncRNA-PAGBC
WO2018002762A1 (en) Materials and methods for treatment of amyotrophic lateral sclerosis (als) and other related disorders
Lee et al. Acquisition of resistance to avian leukosis virus subgroup B through mutations on tvb cysteine-rich domains in DF-1 chicken fibroblasts
RU2377248C2 (ru) Устойчивые к грибкам растения и их использование
RU2015119768A (ru) Оптимизированная нуклеотидная последовательность и фармацевтическая композиция на ее основе с пролонгированной экспрессией трансгена vegf
US9284560B2 (en) Application of highly conserved domain sequences from viral genome as template to design therapeutic sliRNAs
Castillo et al. Insights into the organization of dorsal spinal cord pathways from an evolutionarily conserved raldh2 intronic enhancer
Bobick et al. High efficiency transfection of embryonic limb mesenchyme with plasmid DNA using square wave pulse electroporation and sucrose buffer
AR091964A1 (es) Proteina insecticida, gen que la codifica y sus usos
EA201600428A1 (ru) Способ стимуляции репаративного ангиогенеза и регенерации соединительной ткани, при ее повреждении, методом генной терапии с использованием видоспецифичных генов белковых факторов vegf и fgf2, в медицине, и генетическая конструкция для реализации заявленного способа