RU2014127300A - Ретроспективный отбор клинически релевантной информации из данных секвенирования пациента для поддержки принятия клинических решений - Google Patents

Ретроспективный отбор клинически релевантной информации из данных секвенирования пациента для поддержки принятия клинических решений Download PDF

Info

Publication number
RU2014127300A
RU2014127300A RU2014127300A RU2014127300A RU2014127300A RU 2014127300 A RU2014127300 A RU 2014127300A RU 2014127300 A RU2014127300 A RU 2014127300A RU 2014127300 A RU2014127300 A RU 2014127300A RU 2014127300 A RU2014127300 A RU 2014127300A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
patient
molecular marker
search
clinical
catalog
Prior art date
Application number
RU2014127300A
Other languages
English (en)
Inventor
Винай ВАРАДАН
Ситхартхан КАМАЛАКАРАН
Анхель ЯНЕВСКИ
Ниланджана БАНЕРДЖИ
Невенка ДИМИТРОВА
Original Assignee
Конинклейке Филипс Н.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Конинклейке Филипс Н.В. filed Critical Конинклейке Филипс Н.В.
Publication of RU2014127300A publication Critical patent/RU2014127300A/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/20—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G16B20/10—Ploidy or copy number detection
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
    • G16H10/60—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for patient-specific data, e.g. for electronic patient records

Abstract

1. Устройство, содержащее каталог тестов молекулярных маркеров, указывающий тесты молекулярных маркеров, снабжаемые примечаниями касательно клинической применимости;электронную медицинскую карту пациента, сохраняющую данные генетического секвенирования пациента; систему поддержки принятия клинических решений (CDS), выполненную с возможностью отслеживать клинический контекст пациента, при этом клинический контекст включает в себя, по меньшей мере, диагноз заболевания и текущую стадию ухода за пациентом; модуль поиска в каталоге, выполненный с возможностью осуществлять поиск в каталоге тестов молекулярных маркеров, чтобы идентифицировать тест молекулярных маркеров, имеющий клиническую применимость для пациента в клиническом контексте, отслеживаемом посредством CDS-системы, при этом поиск автоматически инициируется посредством возникновения инициирующего события, заданного посредством набора правил инициирования; и модуль тестирования, выполненный с возможностью осуществлять тест молекулярных маркеров, идентифицированный посредством модуля поиска в каталоге, в форме компьютерного моделирования с использованием данных генетического секвенирования пациента, сохраненных в электронной медицинской карте пациента; при этом CDS-система, модуль поиска в каталоге и модуль тестирования осуществляются посредством одного или более электронных устройств обработки данных.2. Устройство по п. 1, в котором набор правил инициирования включает в себя правила, инициирующие поиск в ответ на изменение в состоянии пациента, и правила, инициирующие поиск в ответ на изменение в контенте молекулярного каталога маркеров.3. Устройств

Claims (14)

1. Устройство, содержащее каталог тестов молекулярных маркеров, указывающий тесты молекулярных маркеров, снабжаемые примечаниями касательно клинической применимости;электронную медицинскую карту пациента, сохраняющую данные генетического секвенирования пациента; систему поддержки принятия клинических решений (CDS), выполненную с возможностью отслеживать клинический контекст пациента, при этом клинический контекст включает в себя, по меньшей мере, диагноз заболевания и текущую стадию ухода за пациентом; модуль поиска в каталоге, выполненный с возможностью осуществлять поиск в каталоге тестов молекулярных маркеров, чтобы идентифицировать тест молекулярных маркеров, имеющий клиническую применимость для пациента в клиническом контексте, отслеживаемом посредством CDS-системы, при этом поиск автоматически инициируется посредством возникновения инициирующего события, заданного посредством набора правил инициирования; и модуль тестирования, выполненный с возможностью осуществлять тест молекулярных маркеров, идентифицированный посредством модуля поиска в каталоге, в форме компьютерного моделирования с использованием данных генетического секвенирования пациента, сохраненных в электронной медицинской карте пациента; при этом CDS-система, модуль поиска в каталоге и модуль тестирования осуществляются посредством одного или более электронных устройств обработки данных.
2. Устройство по п. 1, в котором набор правил инициирования включает в себя правила, инициирующие поиск в ответ на изменение в состоянии пациента, и правила, инициирующие поиск в ответ на изменение в контенте молекулярного каталога маркеров.
3. Устройство по п. 2, в котором CDS-система выполнена с возможностью отслеживать клинический контекст пациента посредством отслеживания местоположения пациента в клинических инструкциях, содержащих узлы и соединяющие ребра или пути, тесты молекулярных маркеров в каталоге снабжаются примечаниями касательно клинической применимости, дополнительно включающими в себя применимость стадии клинических инструкций, и набор правил инициирования дополнительно включает в себя правила, инициирующие поиск в ответ на изменение в клинических инструкциях.
4. Устройство по п. 1, дополнительно содержащее модуль запроса/приема предписаний, осуществленный посредством электронного устройства обработки и выполненный с возможностью предлагать тест молекулярных маркеров, идентифицированный посредством модуля идентификации, и принимать предписание врача касательно того, чтобы выполнять предложенный тест молекулярных маркеров; при этом модуль тестирования выполнен с возможностью проверять достоверность предписания врача до выполнения предложенного теста молекулярных маркеров в форме компьютерного моделирования с использованием данных генетического секвенирования пациента, сохраненных в электронной медицинской карте пациента.
5. Устройство по п. 1, дополнительно содержащее модуль редактирования каталогов, выполненный с возможностью позволять человеку-куратору редактировать каталог таким образом, чтобы добавлять, удалять и редактировать тесты молекулярных маркеров;
- при этом набор правил инициирования дополнительно включает в себя правила, инициирующие поиск в ответ на редактирование каталога таким образом, чтобы добавлять, удалять или редактировать тест молекулярных маркеров.
6. Устройство по п. 1, в котором модуль поиска в каталоге выполнен с возможностью автоматически определять изменение в текущей стадии ухода за пациентом, отслеживаемой посредством CDS-системы, и автоматически инициировать поиск в каталоге тестов молекулярных маркеров, чтобы идентифицировать тест молекулярных маркеров, имеющий клиническую применимость для пациента в клиническом контексте, отслеживаемом посредством CDS-системы в ответ на определение изменения.
7. Устройство по п. 1, в котором CDS-система выполнена с возможностью автоматически инициировать модуль поиска в каталоге, чтобы выполнять поиск в каталоге тестов молекулярных маркеров, чтобы идентифицировать тест молекулярных маркеров, имеющий клиническую применимость для пациента в клиническом контексте, отслеживаемом посредством CDS-системы, в ответ на отслеживание посредством CDS-системы изменения в текущей стадии ухода за пациентом.
8. Способ, работающий в сочетании с каталогом тестов молекулярных маркеров, указывающим тесты молекулярных маркеров, снабжаемые примечаниями касательно клинической применимости, и сохраненные данные генетического секвенирования пациента, при этом способ содержит этапы, на которых электронно отслеживают клинический контекст пациента с использованием системы (поддержки принятия клинических решений (CDS); во время электронного отслеживания автоматически определяют возникновение инициирующего события, заданного посредством набора правил инициирования; в ответ на определение автоматически инициируют электронный поиск в каталоге, чтобы идентифицировать тест молекулярных маркеров, имеющий клиническую применимость для пациента в клиническом контексте, отслеживаемом посредством CDS-системы; и выполняют идентифицированный тест молекулярных маркеров в форме компьютерного моделирования с использованием сохраненных данных генетического секвенирования.
9. Способ по п. 8, в котором набор правил инициирования включает в себя правила, инициирующие электронный поиск в каталоге в ответ на изменение в клинических инструкциях, используемых посредством CDS-системы;правила, инициирующие электронный поиск в каталоге в ответ на изменение в данных медицинской карты пациента, и правила, инициирующие электронный поиск в каталоге в ответ на обновление контента каталога тестов молекулярных маркеров.
10. Способ по п. 8, в котором идентифицированный тест молекулярных маркеров в форме компьютерного моделирования выполняется при условии приема предписания врача касательно того, чтобы выполнять тест молекулярных маркеров.
11. Способ по п. 8, в котором электронное выполнение поиска использует параметры поиска, задающие клинический контекст пациента, включающий в себя, по меньшей мере, диагноз заболевания и текущую стадию ухода за пациентом.
12. Способ по п. 8, дополнительно содержащий этапы, на которых получают данные генетического секвенирования, содержащие общегеномную последовательность пациента; и сохраняют общегеномную последовательность в электронной медицинской карте пациента, которая также сохраняет электронную историю (24) болезни пациента.
13. Способ по п. 8, дополнительно содержащий этапы, на которых принимают обновление каталога, содержащее добавление, модификацию или удаление теста молекулярных маркеров через пользовательское интерфейсное устройство; и обновляют каталог с помощью принимаемого обновления каталога; при этом обновление не модифицирует клинические инструкции, используемые посредством CDS-системы.
14. Носитель данных, сохраняющий инструкции, выполняемые посредством электронного устройства обработки, чтобы осуществлять способ по п. 8.
RU2014127300A 2011-12-05 2012-11-29 Ретроспективный отбор клинически релевантной информации из данных секвенирования пациента для поддержки принятия клинических решений RU2014127300A (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161566919P 2011-12-05 2011-12-05
US61/566,919 2011-12-05
EP11192475.9A EP2613278A2 (en) 2011-12-05 2011-12-07 Retroactive extraction of clinically relevant information from patient sequencing data for clinical decision support
EP11192475.9 2011-12-07
PCT/IB2012/056839 WO2013084121A2 (en) 2011-12-05 2012-11-29 Retroactive extraction of clinically relevant information from patient sequencing data for clinical decision support

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2014127300A true RU2014127300A (ru) 2016-02-10

Family

ID=45406427

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014127300A RU2014127300A (ru) 2011-12-05 2012-11-29 Ретроспективный отбор клинически релевантной информации из данных секвенирования пациента для поддержки принятия клинических решений

Country Status (7)

Country Link
US (1) US10541052B2 (ru)
EP (2) EP2613278A2 (ru)
JP (1) JP6085612B2 (ru)
CN (1) CN103975328B (ru)
BR (1) BR112014013353A2 (ru)
RU (1) RU2014127300A (ru)
WO (1) WO2013084121A2 (ru)

Families Citing this family (25)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL3068367T3 (pl) 2013-11-14 2021-01-25 Koninklijke Philips N.V. Układ i sposób nanoszenia środków do pielęgnacji jamy ustnej
US10658073B2 (en) 2014-08-15 2020-05-19 QIAGEN Redwood City, Inc. Methods and systems for interpretation and reporting of sequence-based genetic tests using pooled allele statistics
CN106796620A (zh) * 2014-06-30 2017-05-31 凯杰雷德伍德城公司 用于解释和报告基于序列的基因测试的方法和系统
US10665328B2 (en) 2014-06-30 2020-05-26 QIAGEN Redwood City, Inc. Methods and systems for interpretation and reporting of sequence-based genetic tests
CN105389618A (zh) * 2014-08-29 2016-03-09 皇家飞利浦有限公司 用于优化对临床过程的时间分配的装置和方法
US10198517B2 (en) * 2014-12-08 2019-02-05 Oath Inc. Pairing systems and methods for electronic communications
WO2016127089A1 (en) * 2015-02-08 2016-08-11 Sora Medical Solutions Llc Comprehensive diagnosis and care system
WO2016162767A1 (en) * 2015-04-08 2016-10-13 Koninklijke Philips N.V. System for laboratory values automated analysis and risk notification in intensive care unit
US10395759B2 (en) 2015-05-18 2019-08-27 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Methods and systems for copy number variant detection
JP6867959B2 (ja) * 2015-07-13 2021-05-12 コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェＫｏｎｉｎｋｌｉｊｋｅ Ｐｈｉｌｉｐｓ Ｎ．Ｖ． 病院環境における感染の追跡
US10950341B2 (en) * 2015-11-30 2021-03-16 Physio-Control, Inc. Integration of a point-of-care blood analyzer into a prehospital telemedicine system
EP3394775A1 (en) * 2015-12-21 2018-10-31 Koninklijke Philips N.V. Behavior trained clinical support
EP3249561A1 (de) * 2016-05-25 2017-11-29 Siemens Healthcare GmbH Verfahren und system zur dokumentation eines diagnostischen tests
EP3485495A1 (en) * 2016-07-15 2019-05-22 Koninklijke Philips N.V. Automated identification of salient finding codes in structured and narrative reports
EP3659148A1 (en) * 2017-07-28 2020-06-03 Koninklijke Philips N.V. System and method for expanding search queries using clinical context information
CA3036161C (en) * 2017-11-13 2023-03-28 The Multiple Myeloma Research Foundation, Inc. Integrated, molecular, omics, immunotherapy, metabolic, epigenetic, and clinical database
JP7017779B2 (ja) * 2018-02-26 2022-02-09 学校法人日本大学 分子検査支援装置及びプログラム
CN111837193A (zh) * 2018-03-09 2020-10-27 皇家飞利浦有限公司 路径信息
JP2021519479A (ja) * 2018-03-19 2021-08-10 アンブリー ジェネティクス コーポレーションＡｍｂｒｙ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ 遺伝子検査とゲノム検査を識別するための人工知能と機械学習プラットフォーム
EP3776381A4 (en) * 2018-04-13 2022-01-05 Freenome Holdings, Inc. IMPLEMENTATION OF MACHINE LEARNING FOR MULTI-ANALYTE TESTS OF BIOLOGICAL SAMPLES
EP3611695A1 (en) * 2018-08-15 2020-02-19 Koninklijke Philips N.V. Generating annotation data of tissue images
US11200975B2 (en) * 2018-11-06 2021-12-14 International Business Machines Corporation Framework for modeling collections and their management
CN109635197B (zh) * 2018-12-17 2021-08-24 北京百度网讯科技有限公司 搜索方法、装置、电子设备及存储介质
US11853359B1 (en) * 2019-01-31 2023-12-26 Veeva Systems Inc. System and method for reporting multiple objects in enterprise content management
CN110162779B (zh) * 2019-04-04 2023-08-04 北京百度网讯科技有限公司 病历质量的评估方法、装置及设备

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6099469A (en) * 1998-06-02 2000-08-08 Armstrong; E. Glenn Reflex algorithm for early and cost effective diagnosis of myocardial infractions suitable for automated diagnostic platforms
US20040122704A1 (en) * 2002-12-18 2004-06-24 Sabol John M. Integrated medical knowledge base interface system and method
JP2007505404A (ja) * 2003-09-12 2007-03-08 アクセス ビジネス グループ インターナショナル リミテッド ライアビリティ カンパニー 健康状態を整えるためのプログラム
JP2007507814A (ja) 2003-10-07 2007-03-29 エンテロス・インコーポレーテッド 患者に固有の結果のシミュレーション
US20060064247A1 (en) * 2004-07-14 2006-03-23 Shao-Min Yuan Methods and systems for in silico experimental design and for providing a biotechnology product to a customer
CN101443780A (zh) * 2004-12-30 2009-05-27 普罗文蒂斯公司 用于开发和使用用于预测多种医学结果、评价介入策略以及同时验证生物标志物诱因的预测模型的方法、系统和计算机程序产品
JP4866576B2 (ja) * 2005-07-11 2012-02-01 インフォコム株式会社 診療支援システム
US20070088509A1 (en) * 2005-10-14 2007-04-19 Siemens Aktiengesellschaft Method and system for selecting a marker molecule
US7702600B2 (en) * 2006-03-27 2010-04-20 General Electric Company Systems and methods for clinical decision crawler agent
WO2008017992A2 (en) * 2006-08-11 2008-02-14 Koninklijke Philips Electronics, N.V. Systems and methods for associating nucleic acid profiles and proteomic profiles with healthcare protocols and guidelines in a decision support system
EP2069990B1 (en) 2006-09-20 2019-03-13 Koninklijke Philips N.V. A molecular diagnostics decision support system
JP5038671B2 (ja) * 2006-09-25 2012-10-03 株式会社東芝 検査項目選定装置、検査項目選定方法、及び検査項目選定プログラム
US8122073B2 (en) * 2006-09-29 2012-02-21 The Invention Science Fund I Computational systems for biomedical data
JP2010521722A (ja) * 2007-02-14 2010-06-24 ザ・ジェネラル・ホスピタル・コーポレイション 医療研究所報告メッセージ・ゲートウェイ
WO2009097364A1 (en) * 2008-01-29 2009-08-06 Pergenix Llc Method and system for delivering clinical lab quality and professional interpretation to home and clinic testing
US9858392B2 (en) 2008-05-12 2018-01-02 Koninklijke Philips N.V. Medical analysis system
US20110301859A1 (en) 2010-06-04 2011-12-08 N-Of-One Therapeutics, Inc. Personalized molecular medicine

Also Published As

Publication number Publication date
US20140365243A1 (en) 2014-12-11
WO2013084121A2 (en) 2013-06-13
JP6085612B2 (ja) 2017-02-22
EP2748748B1 (en) 2021-01-06
US10541052B2 (en) 2020-01-21
WO2013084121A3 (en) 2014-01-16
EP2613278A2 (en) 2013-07-10
BR112014013353A2 (pt) 2017-06-13
JP2015505079A (ja) 2015-02-16
EP2748748A2 (en) 2014-07-02
CN103975328A (zh) 2014-08-06
CN103975328B (zh) 2018-11-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014127300A (ru) Ретроспективный отбор клинически релевантной информации из данных секвенирования пациента для поддержки принятия клинических решений
EP2784665A1 (en) Program and version control method
CN111756575B (zh) 存储服务器的性能分析方法及装置、电子设备
WO2011079685A1 (zh) 一种回归测试的管理方法及装置
CN107346284B (zh) 一种应用程序的检测方法及检测装置
KR102213670B1 (ko) 약물-표적 상호 작용 예측을 위한 방법
CN104969181B (zh) 用于损坏的驱动器变量记录的修复系统、方法及存储设备
RU2010137352A (ru) Способ, компьютерный программный продукт и система обеспечения поддержки принятия клинического решения
WO2020172607A1 (en) Systems and methods for using deep learning to generate acuity scores for critically ill or injured patients
CN111816253A (zh) 一种基因检测解读方法及装置
US8108358B2 (en) File management method of server
CN104461880B (zh) 一种嵌入式系统中自动检测内存越界的方法及系统
JP2013200591A5 (ru)
JP2015022664A (ja) 表示処理プログラム、表示処理方法、及び、表示処理装置
CN108959454B (zh) 一种提示子句指定方法、装置、设备及存储介质
JP2013109597A (ja) 医用同義語辞書作成装置および医用同義語辞書作成方法
US20170212990A1 (en) System and method for optimizing electronic medical terminology post-coordination coding
KR101612635B1 (ko) 외부 리소스를 이용하여 증거 적응을 위한 임상의사결정지원 시스템 및 방법
WO2006118404A1 (en) An operating methods for patent information sysytem
CN113763345A (zh) 医学影像病灶位置查看方法、系统、设备及存储介质
JP7243837B2 (ja) 情報処理装置、情報処理システム、情報処理方法、及びプログラム
CN109243534A (zh) 基于ngs的突变基因的分析装置、设备及存储介质
Maranhão et al. Challenges in design and creation of genetic openEHR-archetype
JP2009026029A (ja) トランザクション制御装置、トランザクション制御方法、トランザクション制御プログラムおよびそのプログラムを記憶した記憶媒体
JP5712711B2 (ja) 管理プログラム，管理方法および管理装置

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20180410