JP6085612B2 - 臨床判断支援のための患者シーケンシングデータからの臨床的に関連する情報の遡及的抽出 - Google Patents
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Description
臨床環境において(例えば、内科患者の症状の診断および/またはその患者向けの治療計画の策定、寛解期にあるがんの再発可能性の評価などのために)、所与の分子マーカー検査を使用することの適否は、疾病診断(利用可能な場合)および患者ケア段階(例えば、診断、予後、治療、寛解モニタリングなど)などの多数の要因に基づき得る。また、分子マーカー検査の根本にある臨床研究に関する治療担当医師の見解、ならびに検査に対して付与されていることがある様々な認証についても考慮される。例えば、米国において食品医薬品局(FDA)によって付与される認証または検証は、米国の医師にとっては説得力があるが、欧州を拠点とする医師にとっては説得力が弱いか、または説得力に欠けることがある。
1.臨床上の適用可能性の注釈が付された分子マーカー検査を特定する分子マーカー検査のカタログ(34)と、
電子データ処理デバイス(46)とを備え、電子データ処理デバイスが、
患者の臨床状況を追跡するステップと、
追跡中に臨床状況の変化を検出するステップと、
変化した臨床状況における患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査の検出に応答して、カタログ(34)を検索するステップとを含む方法を行うように構成された、装置。
2.管理者がカタログ(34)を編集して、分子マーカー検査を追加、削除、および編集することができるように構成される、管理者電子データ処理デバイス(52)をさらに備える、第1節に記載の装置。
3.電子データ処理デバイス(46)が、さらに、
カタログ(34)の編集を検出し、
追跡された臨床状況における患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査に関する編集の検出に応答して、カタログ(34)を検索するように構成される、第2節に記載の装置。
4.患者の全ゲノム配列(20)を格納する電子記憶装置をさらに備え、
電子データ処理デバイス(46)が、さらに、電子記憶装置に格納された患者の全ゲノム配列から抽出される遺伝子データを使用して、コンピュータ内で検索によって探索された分子マーカー検査を行うように構成される、第1〜3節のいずれか1つに記載の装置。
5.電子データ処理デバイス(46)が、さらに、
検索によって探索された分子マーカー検査を、患者の医療ケアを監督している医師に対して提案し、
検索によって探索された分子マーカー検査を行うために医師の指示を受信するように構成される、第1〜4節のいずれか1つに記載の装置。
6.電子データ処理デバイス(46)が、追跡を行う臨床判断支援(CDS)システム(30)を定義する、第1〜5節のいずれか1つに記載の装置。
7.電子データ処理デバイス(46)が、さらに、
患者の臨床状況を追跡する際にCDSシステム(30)によって使用される臨床ガイドラインの変化を検出し、
変化した臨床ガイドラインを使用して臨床状況が追跡される患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査に対する、臨床ガイドラインの変化の検出に応答して、カタログ(34)を検索するように構成される、第6節に記載の装置。
8.臨床上の適用可能性の注釈が付された分子マーカー検査を指定する分子マーカー検査のカタログ(34)が、各分子マーカー検査に関する項目を格納し、項目が、
分子マーカー検査が臨床上の適用可能性を有する1つまたは複数の疾病を示す、疾病状況の注釈と、
入力分子マーカーデータフィールドと、入力分子マーカーデータフィールドに対して動作して分子マーカー検査を行う分析アルゴリズムとを定義する、少なくとも1つの分子マーカー検査定義とを含む、第1〜7節のいずれか1つに記載の装置。
好ましい実施形態を参照して本発明について記載してきた。上述の詳細な説明を読み、理解することによって、改変および変更が他の人々に想起されることは明白である。本発明は、かかる全ての改変および変更が添付の請求項またはその均等物の範囲内にある限りにおいて、それらを含むと解釈されるものとする。
Claims (14)
- 臨床上の適用可能性の注釈が付された分子マーカー検査を指定する分子マーカー検査のカタログと、
患者の遺伝子シーケンシングデータを格納する電子患者診療記録と、
少なくとも疾病診断および現在の患者ケア段階を含む、前記患者の臨床状況を追跡するように構成された臨床判断支援(CDS)システムと、
前記CDSシステムによって追跡される前記臨床状況における前記患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査を特定するため、前記分子マーカー検査のカタログを検索するように構成されるカタログ検索モジュールであって、前記検索が、一連の始動規則によって定義されるトリガイベントの発生によって自動的に始動される、カタログ検索モジュールと、
前記電子患者診療記録に格納された前記患者の前記遺伝子シーケンシングデータを使用して、コンピュータ内で前記カタログ検索モジュールによって特定された分子マーカー検査を行うように構成された検査モジュールとを備え、
前記CDSシステム、前記カタログ検索モジュール、および前記検査モジュールが、1つまたは複数の電子データ処理デバイスによって具体化される、装置。 - 前記一連の始動規則が、患者状態の変化に応答して検索を始動させる規則、および前記マーカーの分子カタログの内容の変化に応答して検索を始動させる規則を含む、請求項1に記載の装置。
- 前記CDSシステムが、ノードおよび接続エッジまたはパスを備える臨床ガイドラインにおいて前記患者の位置を追跡することによって、前記患者の前記臨床状況を追跡するように構成され、前記カタログ内の分子マーカー検査が、臨床ガイドラインの段階適用可能性をさらに含む臨床上の適用可能性の注釈を付され、前記一連の始動規則が、前記臨床ガイドラインの変化に応答して検索を始動させる規則をさらに含む、請求項2に記載の装置。
- 電子処理デバイスによって具体化されると共に、前記カタログ検索モジュールによって特定された分子マーカー検査を提案し、前記提案された分子マーカー検査を行うための医師の指示を受信するように構成された、指示要求/受信モジュールをさらに備え、
前記検査モジュールが、前記電子患者診療記録に格納された前記患者の前記遺伝子シーケンシングデータを使用して、コンピュータ内で前記提案された分子マーカー検査を行うのに先立って、前記医師の指示を検証するように構成された、請求項1から3のいずれか一項に記載の装置。 - 管理者が前記カタログを編集して、分子マーカー検査を追加、削除、および編集できるように構成された、カタログ編集モジュールをさらに備え、
前記一連の始動規則が、分子マーカー検査を追加、削除、または編集するため、前記カタログの編集に応答して検索を始動する規則をさらに含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の装置。 - 前記カタログ検索モジュールが、前記CDSシステムによって追跡される現在の患者ケア段階の変化を自動的に検出すると共に、前記変化の検出に応答して前記CDSシステムによって追跡される前記臨床状況において、前記患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査を特定するため、前記分子マーカー検査のカタログの検索を自動的に始動するように構成される、請求項1から5のいずれか一項に記載の装置。
- 前記CDSシステムが、前記分子マーカー検査のカタログを検索して、前記CDSシステムが現在の患者ケア段階の変化を追跡するのに応答して、前記CDSシステムによって追跡される前記臨床状況において、前記患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査を特定するため、前記カタログ検索モジュールを自動的に始動させるように構成される、請求項1から5のいずれか一項に記載の装置。
- 臨床上の適用可能性の注釈が付され、患者の遺伝子シーケンシングデータが格納された、分子マーカー検査を特定する分子マーカーのカタログと併せて動作可能である、方法であって、
臨床判断支援(CDS)システムを使用して、前記患者の臨床状況を電子的に追跡するステップと、
前記電子的な追跡中に、一連の始動規則によって定義されたる始動イベントの発生を自動的に検出するステップと、
前記検出に応答して、前記CDSシステムによって追跡される前記臨床状況における前記患者に対する臨床上の適用可能性を有する分子マーカー検査を特定するため、前記カタログの電子検索を自動的に始動するステップと、
格納された前記遺伝子シーケンシングデータを使用して、コンピュータ内で特定された前記分子マーカー検査を行うステップとを含む、方法。 - 前記一連の始動規則が、
前記CDSシステムによって使用される臨床ガイドラインの変化に応答して、前記カタログの電子探索を始動する規則と、
患者記録データの変化に応答して、前記カタログの電子探索を始動する規則と、
前記分子マーカー検査のカタログの内容の更新に応答して、前記カタログの電子探索を始動する規則とを含む、請求項8に記載の方法。 - コンピュータ内で前記特定された分子マーカー検査を行う前記ステップが、前記分子マーカー検査を行うという医師の指示を受信することを条件とする、請求項8または9に記載の方法。
- 前記電子検索が、少なくとも疾病診断および現在の患者ケア段階を含む前記患者の前記臨床状況を定義する検索パラメータを用いる、請求項8から10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記患者の全ゲノム配列を含む遺伝子シーケンシングデータを取得するステップと、
前記患者の電子病歴も格納する電子患者診療記録に前記全ゲノム配列を格納するステップとをさらに含む、請求項8から11のいずれか一項に記載の方法。 - ユーザインターフェースデバイスを介して、分子マーカー検査の追加、修正、または削除を含むカタログ更新を受信するステップと、
受信した前記カタログ更新を用いて前記カタログを更新するステップとをさらに含み、
前記更新が、前記CDSシステムによって使用されるいかなる臨床ガイドラインも修正しない、請求項8から12のいずれか一項に記載の方法。 - 請求項8から13のいずれか一項に記載の方法を行うため、電子処理デバイスによって実行可能な命令を格納する、非一時的な記憶媒体。
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