RU2014124974A - Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей - Google Patents
Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014124974A RU2014124974A RU2014124974A RU2014124974A RU2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- sample
- probe
- signal
- alkyl
- biological sample
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/52—Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
Abstract
1. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:(а) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;(б) обнаружение сигнала от по меньшей мере одного зонда, связанного на стадии (а);(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;(г) облучение образца со стадии (в);(д) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и(е) обнаружение сигнала от зонда, связанного на стадии (д).2. Способ по п. 1, где зонд на стадии (а) содержит генератор оптического сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой оптический сигнал.3. Способ по п. 2, где зонд на стадии (а) содержит генератор флуоресцентного сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой флуоресцентный сигнал.4. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют в присутствии буфера при рН 5-9.5. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны от 350 нм до 1,3 мкм.6. Способ по п. 5, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны 400-700 нм.7. Способ по п. 1, где реагент переноса электрона представляет собой боратную соль, представленную следующей структурной формулой:где каждый из R, Rи Rнезависимо представляет собой алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил, где указанный алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С-С)алкила, (C-C)алкокси, (C-C)алкиламино,
Claims (18)
1. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:
(а) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;
(б) обнаружение сигнала от по меньшей мере одного зонда, связанного на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и
(е) обнаружение сигнала от зонда, связанного на стадии (д).
2. Способ по п. 1, где зонд на стадии (а) содержит генератор оптического сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой оптический сигнал.
3. Способ по п. 2, где зонд на стадии (а) содержит генератор флуоресцентного сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой флуоресцентный сигнал.
4. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют в присутствии буфера при рН 5-9.
5. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны от 350 нм до 1,3 мкм.
6. Способ по п. 5, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны 400-700 нм.
7. Способ по п. 1, где реагент переноса электрона представляет собой боратную соль, представленную следующей структурной формулой:
где каждый из R1, R2 и R3 независимо представляет собой алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил, где указанный алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С1-С4)алкила, (C1-C4)алкокси, (C1-C4)алкиламино, амино, гидроксила, циано, галогена или нитро;
R4 представляет собой алкил, алкенил или алкинил, где указанный алкил, алкенил или алкинил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С1-С4)алкила, (C1-C4)алкокси, (C1-C4)алкиламино, амино, гидроксила, циано, галогена или нитро; и
M+ выбран из группы, состоящей из органических и неорганических катионов.
8. Способ по п. 7, где каждый из R1, R2 и R3 представляет собой возможно замещенный арил, и R4 представляет собой возможно замещенный алкил.
9. Способ по п. 8, где каждый из R1, R2 и R3 представляет собой незамещенный фенил, R4 представляет собой незамещенный бутил, и боратная соль представляет собой трифенилбутилборатную соль.
10. Способ по п. 7, где M+ представляет собой неорганический катион, выбранный из группы, состоящей из Li+, Na+ или K+.
11. Способ по п. 1, где стадии (в)-(е) повторяют один или более чем один раз.
12. Способ по п. 1, где и зонд на стадии (а) и зонд на стадии (д) содержат генератор сигнала, где генератор сигнала на стадии (а) отличается от генератора сигнала на стадии (д).
13. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:
(а) связывание множественных зондов с множественными мишенями, присутствующими в биологическом образце, где множественные зонды включают первый набор зондов и второй набор зондов;
(б) обнаружение первого набора сигналов от первого набора зондов, связанных на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) генерирование второго набора сигналов от второго набора зондов, связанных на стадии (а);
(е) обнаружение второго набора сигналов.
14. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) инициирует фотореакцию, по существу инактивирующую генератор сигнала путем фотоактивируемого химического обесцвечивания.
15. Способ по п. 1, где после стадии (г) не наблюдается обнаружимый сигнал.
16. Способ высокопроизводительного мультиплексного анализа биологического образца, включающий:
процесс циклирования сигнала, где в каждом цикле за окрашиванием и визуализацией следует нанесение реагента переноса электрона и облучение биологического образца.
17. Способ по п. 16, дающий возможность быстрого циклирования сигнала без значительного модифицирования компонентов биологического образца, отличных от зонда.
18. Серия из по меньшей мере двух изображений, показывающих оптически меченные биологические мишени, где:
изображения получены в процессе зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающем:
(а) связывание по меньшей мере одного оптического зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;
(б) наблюдение сигнала от оптического зонда, связанного на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный оптический зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) связывание по меньшей мере одного оптического зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и
(е) наблюдение сигнала от оптического зонда, связанного на стадии (д).
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US13/336,409 US8568991B2 (en) | 2011-12-23 | 2011-12-23 | Photoactivated chemical bleaching of dyes |
| US13/336,409 | 2011-12-23 | ||
| PCT/US2012/067527 WO2013095896A1 (en) | 2011-12-23 | 2012-12-03 | Photoactivated chemical bleaching of dyes |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2014124974A true RU2014124974A (ru) | 2016-02-20 |
| RU2623880C2 RU2623880C2 (ru) | 2017-06-29 |
Family
ID=48655136
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014124974A RU2623880C2 (ru) | 2011-12-23 | 2012-12-03 | Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US8568991B2 (ru) |
| EP (1) | EP2794908B1 (ru) |
| JP (1) | JP6148682B2 (ru) |
| KR (1) | KR102046194B1 (ru) |
| CN (1) | CN104114713B (ru) |
| AU (1) | AU2012355736B2 (ru) |
| BR (1) | BR112014015603B1 (ru) |
| CA (1) | CA2860097C (ru) |
| RU (1) | RU2623880C2 (ru) |
| SG (1) | SG11201403460SA (ru) |
| WO (1) | WO2013095896A1 (ru) |
Families Citing this family (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US11573235B2 (en) | 2012-03-30 | 2023-02-07 | Leica Microsystems Cms Gmbh | Methods for generating an image of a biological sample |
| CA2893953A1 (en) * | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Clarient Diagnostic Services, Inc. | Photoactivated chemical bleaching of dyes |
| WO2014099222A1 (en) * | 2012-12-17 | 2014-06-26 | Clarient Diagnostic Services, Inc. | Chemical bleaching of dyes using radical photoinitiators |
| US9322051B2 (en) | 2013-10-07 | 2016-04-26 | General Electric Company | Probing of biological samples |
| WO2015123430A2 (en) * | 2014-02-12 | 2015-08-20 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Single molecule electronic multiplex snp assay and pcr analysis |
| EP3256857B1 (en) * | 2015-02-13 | 2019-07-24 | General Electric Company | Photoactivated chemical bleaching of dyes using borates |
| US10101322B2 (en) | 2015-02-13 | 2018-10-16 | General Electric Company | Photoactivated chemical bleaching of dyes using borates |
| US9708349B2 (en) | 2015-02-13 | 2017-07-18 | General Electric Company | Borates for photoactivated chemical bleaching |
| CN105044059B (zh) * | 2015-07-13 | 2017-08-29 | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 | 一种可用于减缓单分子荧光漂白现象的除氧试剂及其应用方法 |
| US20170241911A1 (en) * | 2016-02-22 | 2017-08-24 | Miltenyi Biotec Gmbh | Automated analysis tool for biological specimens |
| KR20170099739A (ko) | 2016-02-23 | 2017-09-01 | 노을 주식회사 | 접촉식 염색 보조 패치, 그 제조 방법 및 이를 이용하는 염색 방법 |
| US10371610B2 (en) | 2016-02-23 | 2019-08-06 | Noul Co., Ltd. | Contact-type patch, staining method using the same, and manufacturing method thereof |
| JP2020513796A (ja) | 2016-11-16 | 2020-05-21 | ユニバーシティ オブ ワシントンＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ | サイクリック蛍光イメージングのためのシステムおよび方法 |
| CZ309221B6 (cs) * | 2018-09-27 | 2022-06-01 | Mendelova Univerzita V Brně | Způsob identifikace přírodních vzorků, zejména kapalných |
| CA3237201A1 (en) | 2021-11-16 | 2023-05-25 | Sotio Biotech Inc. | Treatment of myxoid/round cell liposarcoma patients |
| US20230140613A1 (en) * | 2022-03-30 | 2023-05-04 | Hasan Bagheri | Colorimetric system for detection of covid-19 using exhaled breath metabolites |
Family Cites Families (29)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GR78065B (ru) | 1982-02-19 | 1984-09-26 | Unilever Nv | |
| DK39592D0 (da) | 1992-03-25 | 1992-03-25 | Safefood Micro Systsm As | Method of detecting microorganisms |
| US6451551B1 (en) | 1994-03-11 | 2002-09-17 | Biogenex Laboratories | Releasing embedding media from tissue specimens |
| EP0862648B1 (en) | 1995-11-22 | 2004-10-06 | Medtronic MiniMed, Inc. | Detection of biological molecules using chemical amplification and optical sensors |
| US6573043B1 (en) | 1998-10-07 | 2003-06-03 | Genentech, Inc. | Tissue analysis and kits therefor |
| WO2001040454A1 (en) | 1999-11-30 | 2001-06-07 | Oncosis | Method and apparatus for selectively targeting specific cells within a cell population |
| DE10014685B4 (de) | 2000-03-24 | 2004-07-01 | Schubert, Walter, Dr. | Verfahren zur Identifizierung von zellspezifischen Zielstrukturen |
| WO2001075450A2 (en) | 2000-04-04 | 2001-10-11 | The Regents Of The University Of California | Fluorescent lifetime assays for non-invasive quantification of analytes |
| US6627177B2 (en) | 2000-12-05 | 2003-09-30 | The Regents Of The University Of California | Polyhydroxyl-substituted organic molecule sensing optical in vivo method utilizing a boronic acid adduct and the device thereof |
| US7470420B2 (en) * | 2000-12-05 | 2008-12-30 | The Regents Of The University Of California | Optical determination of glucose utilizing boronic acid adducts |
| DE10117430A1 (de) | 2001-04-06 | 2002-10-10 | Nicole Marme | Hochempfindlicher und hochspezifischer Enzymnachweis mit einer Nachweisgrenze bis in den femtomolaren Bereich |
| US7045361B2 (en) | 2001-09-12 | 2006-05-16 | Medtronic Minimed, Inc. | Analyte sensing via acridine-based boronate biosensors |
| US8062897B2 (en) | 2003-07-21 | 2011-11-22 | Aureon Laboratories, Inc. | Diagnostic histopathology using multiplex gene expression FISH |
| RU2305270C2 (ru) | 2005-05-18 | 2007-08-27 | Андрей Алексеевич Климов | Способ флуоресцентной наноскопии (варианты) |
| JP5406019B2 (ja) | 2006-05-17 | 2014-02-05 | セルーメン、インコーポレイテッド | 自動化組織分析のための方法 |
| US7993927B2 (en) | 2006-07-03 | 2011-08-09 | Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. | Histology methods |
| US8131476B2 (en) | 2006-08-07 | 2012-03-06 | General Electric Company | System and method for co-registering multi-channel images of a tissue micro array |
| US20080032321A1 (en) | 2006-08-07 | 2008-02-07 | General Electric Company | System and methods for analyzing images of tissue samples |
| US8060348B2 (en) | 2006-08-07 | 2011-11-15 | General Electric Company | Systems for analyzing tissue samples |
| US20080124310A1 (en) | 2006-11-01 | 2008-05-29 | Marshall John G | Bead based receptor biology |
| US7741045B2 (en) | 2006-11-16 | 2010-06-22 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
| US9201063B2 (en) | 2006-11-16 | 2015-12-01 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
| US7629125B2 (en) | 2006-11-16 | 2009-12-08 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
| WO2008133945A1 (en) | 2007-04-25 | 2008-11-06 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Low level fluorescence detection at the light microscopic level |
| US7714303B2 (en) | 2007-05-10 | 2010-05-11 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Methods and systems for analyzing fluorescent materials with reduced authofluorescence |
| US20090263612A1 (en) | 2008-04-18 | 2009-10-22 | Nbc Universal, Inc. | System and Method for Photobleaching of Optical Media |
| US9677125B2 (en) | 2009-10-21 | 2017-06-13 | General Electric Company | Detection of plurality of targets in biological samples |
| US9541504B2 (en) | 2010-08-05 | 2017-01-10 | Cambridge Research & Instrumentation, Inc. | Enhancing visual assessment of samples |
| US20140024024A1 (en) | 2012-07-17 | 2014-01-23 | General Electric Company | Methods of detecting dna, rna and protein in biological samples |
-
2011
- 2011-12-23 US US13/336,409 patent/US8568991B2/en active Active
-
2012
- 2012-12-03 WO PCT/US2012/067527 patent/WO2013095896A1/en active Application Filing
- 2012-12-03 CA CA2860097A patent/CA2860097C/en active Active
- 2012-12-03 SG SG11201403460SA patent/SG11201403460SA/en unknown
- 2012-12-03 EP EP12860159.8A patent/EP2794908B1/en active Active
- 2012-12-03 CN CN201280070449.4A patent/CN104114713B/zh active Active
- 2012-12-03 BR BR112014015603A patent/BR112014015603B1/pt not_active IP Right Cessation
- 2012-12-03 AU AU2012355736A patent/AU2012355736B2/en active Active
- 2012-12-03 RU RU2014124974A patent/RU2623880C2/ru active
- 2012-12-03 JP JP2014549074A patent/JP6148682B2/ja active Active
- 2012-12-03 KR KR1020147020366A patent/KR102046194B1/ko active IP Right Grant
-
2013
- 2013-08-27 US US14/010,889 patent/US9250245B2/en active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR20140103350A (ko) | 2014-08-26 |
| CA2860097A1 (en) | 2013-06-27 |
| BR112014015603A8 (pt) | 2017-07-04 |
| BR112014015603A2 (pt) | 2017-06-13 |
| CA2860097C (en) | 2020-07-07 |
| EP2794908B1 (en) | 2017-08-02 |
| JP6148682B2 (ja) | 2017-06-14 |
| EP2794908A1 (en) | 2014-10-29 |
| AU2012355736A2 (en) | 2014-09-18 |
| CN104114713B (zh) | 2018-04-03 |
| WO2013095896A1 (en) | 2013-06-27 |
| US20130165330A1 (en) | 2013-06-27 |
| AU2012355736B2 (en) | 2017-12-14 |
| RU2623880C2 (ru) | 2017-06-29 |
| JP2015506469A (ja) | 2015-03-02 |
| SG11201403460SA (en) | 2014-07-30 |
| CN104114713A (zh) | 2014-10-22 |
| US20130345089A1 (en) | 2013-12-26 |
| AU2012355736A1 (en) | 2014-07-17 |
| KR102046194B1 (ko) | 2019-11-18 |
| NZ626334A (en) | 2016-04-29 |
| EP2794908A4 (en) | 2015-05-06 |
| US9250245B2 (en) | 2016-02-02 |
| BR112014015603B1 (pt) | 2020-04-28 |
| US8568991B2 (en) | 2013-10-29 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2014124974A (ru) | Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей | |
| JP2015506469A5 (ru) | ||
| RU2015120176A (ru) | Фотоактивированное химическое обесцвечивание красителей | |
| JP2016508213A5 (ru) | ||
| AU2017248165B2 (en) | Ultra bright dimeric or polymeric dyes with spacing linker groups | |
| Kumar et al. | FLIM FRET technology for drug discovery: Automated multiwell‐plate high‐content analysis, multiplexed readouts and application in situ | |
| Grimm et al. | A general method to improve fluorophores for live-cell and single-molecule microscopy | |
| Cho et al. | Ultrasensitive optical imaging with lanthanide lumiphores | |
| JP2018515628A (ja) | 超明色ダイマーまたはポリマー染料 | |
| Matikonda et al. | Defining the basis of cyanine phototruncation enables a new approach to single-molecule localization microscopy | |
| US10267714B2 (en) | Composition for preparing biomaterial with excellent light-transmitting property, and use thereof | |
| Chen et al. | Modulated CMOS camera for fluorescence lifetime microscopy | |
| US20170247745A1 (en) | Multiplex optical detection | |
| BR112020026528A2 (pt) | Composto de cumarina substituída com amina exocíclicos, nucleotídeo ou oligonucleotídeo, kit, uso dos mesmos, método de sequenciamento e método para sintetizar um composto | |
| Yang et al. | Time-gated fluorescence imaging: Advances in technology and biological applications | |
| Talbot et al. | High speed unsupervised fluorescence lifetime imaging confocal multiwell plate reader for high content analysis | |
| Zhang et al. | Investigating single-molecule fluorescence spectral heterogeneity of rhodamines using high-throughput single-molecule spectroscopy | |
| CN109422758A (zh) | 一种近红外荧光比率荧光探针及其制备方法和应用 | |
| WO2023242661A2 (en) | Polymeric tandem dyes with spacing linker groups | |
| CN109369455A (zh) | 一种双光子近红外双大斯托克斯位移荧光染料及其合成方法与应用 | |
| CN107445946B (zh) | 一种线粒体靶向的氟离子荧光探针及其制备方法和应用 | |
| Kelly et al. | An automated multiwell plate reading FLIM microscope for live cell autofluorescence lifetime assays | |
| Warner et al. | Molecular fluorescence, phosphorescence, and chemiluminescence spectrometry | |
| Ha et al. | Fluorescence resonance energy transfer at the single-molecule level | |
| Sun et al. | Tunable PIE and synchronized gating detections by FastFLIM for quantitative microscopy measurements of fast dynamics of single molecules |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PC41 | Official registration of the transfer of exclusive right |
Effective date: 20210810 |