RU2014124974A - Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей - Google Patents

Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей Download PDF

Info

Publication number
RU2014124974A
RU2014124974A RU2014124974A RU2014124974A RU2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A RU 2014124974 A RU2014124974 A RU 2014124974A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sample
probe
signal
alkyl
biological sample
Prior art date
Application number
RU2014124974A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2623880C2 (ru
Inventor
Арункумар НАТАРАДЖАН
Ануп СУД
Лакшми Сирееша КААНУМАЛЛЕ
Квок Пон ЧАН
Original Assignee
Дженерал Электрик Компани
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дженерал Электрик Компани filed Critical Дженерал Электрик Компани
Publication of RU2014124974A publication Critical patent/RU2014124974A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2623880C2 publication Critical patent/RU2623880C2/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/52Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/582Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64Fluorescence; Phosphorescence
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64Fluorescence; Phosphorescence
    • G01N21/6428Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)

Abstract

1. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:(а) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;(б) обнаружение сигнала от по меньшей мере одного зонда, связанного на стадии (а);(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;(г) облучение образца со стадии (в);(д) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и(е) обнаружение сигнала от зонда, связанного на стадии (д).2. Способ по п. 1, где зонд на стадии (а) содержит генератор оптического сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой оптический сигнал.3. Способ по п. 2, где зонд на стадии (а) содержит генератор флуоресцентного сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой флуоресцентный сигнал.4. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют в присутствии буфера при рН 5-9.5. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны от 350 нм до 1,3 мкм.6. Способ по п. 5, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны 400-700 нм.7. Способ по п. 1, где реагент переноса электрона представляет собой боратную соль, представленную следующей структурной формулой:где каждый из R, Rи Rнезависимо представляет собой алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил, где указанный алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С-С)алкила, (C-C)алкокси, (C-C)алкиламино,

Claims (18)

1. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:
(а) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;
(б) обнаружение сигнала от по меньшей мере одного зонда, связанного на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) связывание по меньшей мере одного зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и
(е) обнаружение сигнала от зонда, связанного на стадии (д).
2. Способ по п. 1, где зонд на стадии (а) содержит генератор оптического сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой оптический сигнал.
3. Способ по п. 2, где зонд на стадии (а) содержит генератор флуоресцентного сигнала, и сигнал, наблюдаемый на стадии (б), представляет собой флуоресцентный сигнал.
4. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют в присутствии буфера при рН 5-9.
5. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны от 350 нм до 1,3 мкм.
6. Способ по п. 5, где облучение образца на стадии (г) осуществляют посредством воздействия на образец светом с длиной волны 400-700 нм.
7. Способ по п. 1, где реагент переноса электрона представляет собой боратную соль, представленную следующей структурной формулой:
Figure 00000001
где каждый из R1, R2 и R3 независимо представляет собой алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил, где указанный алкил, алкенил, алкинил, арил или гетероарил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С14)алкила, (C1-C4)алкокси, (C1-C4)алкиламино, амино, гидроксила, циано, галогена или нитро;
R4 представляет собой алкил, алкенил или алкинил, где указанный алкил, алкенил или алкинил возможно замещен одним или более чем одним заместителем, выбранным из группы, состоящей из (С14)алкила, (C1-C4)алкокси, (C1-C4)алкиламино, амино, гидроксила, циано, галогена или нитро; и
M+ выбран из группы, состоящей из органических и неорганических катионов.
8. Способ по п. 7, где каждый из R1, R2 и R3 представляет собой возможно замещенный арил, и R4 представляет собой возможно замещенный алкил.
9. Способ по п. 8, где каждый из R1, R2 и R3 представляет собой незамещенный фенил, R4 представляет собой незамещенный бутил, и боратная соль представляет собой трифенилбутилборатную соль.
10. Способ по п. 7, где M+ представляет собой неорганический катион, выбранный из группы, состоящей из Li+, Na+ или K+.
11. Способ по п. 1, где стадии (в)-(е) повторяют один или более чем один раз.
12. Способ по п. 1, где и зонд на стадии (а) и зонд на стадии (д) содержат генератор сигнала, где генератор сигнала на стадии (а) отличается от генератора сигнала на стадии (д).
13. Способ зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающий:
(а) связывание множественных зондов с множественными мишенями, присутствующими в биологическом образце, где множественные зонды включают первый набор зондов и второй набор зондов;
(б) обнаружение первого набора сигналов от первого набора зондов, связанных на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) генерирование второго набора сигналов от второго набора зондов, связанных на стадии (а);
(е) обнаружение второго набора сигналов.
14. Способ по п. 1, где облучение образца на стадии (г) инициирует фотореакцию, по существу инактивирующую генератор сигнала путем фотоактивируемого химического обесцвечивания.
15. Способ по п. 1, где после стадии (г) не наблюдается обнаружимый сигнал.
16. Способ высокопроизводительного мультиплексного анализа биологического образца, включающий:
процесс циклирования сигнала, где в каждом цикле за окрашиванием и визуализацией следует нанесение реагента переноса электрона и облучение биологического образца.
17. Способ по п. 16, дающий возможность быстрого циклирования сигнала без значительного модифицирования компонентов биологического образца, отличных от зонда.
18. Серия из по меньшей мере двух изображений, показывающих оптически меченные биологические мишени, где:
изображения получены в процессе зондирования множественных мишеней в биологическом образце, включающем:
(а) связывание по меньшей мере одного оптического зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в биологическом образце, содержащем множественные мишени;
(б) наблюдение сигнала от оптического зонда, связанного на стадии (а);
(в) приведение образца, содержащего связанный оптический зонд со стадии (а), в контакт с реагентом переноса электрона;
(г) облучение образца со стадии (в);
(д) связывание по меньшей мере одного оптического зонда с одной или более чем одной мишенью, присутствующей в образце со стадии (г); и
(е) наблюдение сигнала от оптического зонда, связанного на стадии (д).
RU2014124974A 2011-12-23 2012-12-03 Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей RU2623880C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US13/336,409 US8568991B2 (en) 2011-12-23 2011-12-23 Photoactivated chemical bleaching of dyes
US13/336,409 2011-12-23
PCT/US2012/067527 WO2013095896A1 (en) 2011-12-23 2012-12-03 Photoactivated chemical bleaching of dyes

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014124974A true RU2014124974A (ru) 2016-02-20
RU2623880C2 RU2623880C2 (ru) 2017-06-29

Family

ID=48655136

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014124974A RU2623880C2 (ru) 2011-12-23 2012-12-03 Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей

Country Status (11)

Country Link
US (2) US8568991B2 (ru)
EP (1) EP2794908B1 (ru)
JP (1) JP6148682B2 (ru)
KR (1) KR102046194B1 (ru)
CN (1) CN104114713B (ru)
AU (1) AU2012355736B2 (ru)
BR (1) BR112014015603B1 (ru)
CA (1) CA2860097C (ru)
RU (1) RU2623880C2 (ru)
SG (1) SG11201403460SA (ru)
WO (1) WO2013095896A1 (ru)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013148458A1 (en) 2012-03-30 2013-10-03 Clarient Diagnostic Services, Inc. Methods for generating an image of a biological sample
KR20150095755A (ko) * 2012-12-11 2015-08-21 클래리언트 다이아그노스틱 서비시즈, 인크. 염료의 광활성화 화학적 표백
WO2014099222A1 (en) * 2012-12-17 2014-06-26 Clarient Diagnostic Services, Inc. Chemical bleaching of dyes using radical photoinitiators
US9322051B2 (en) 2013-10-07 2016-04-26 General Electric Company Probing of biological samples
US10718011B2 (en) * 2014-02-12 2020-07-21 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Single molecule electronic multiplex SNP assay and PCR analysis
EP3256857B1 (en) * 2015-02-13 2019-07-24 General Electric Company Photoactivated chemical bleaching of dyes using borates
US9708349B2 (en) 2015-02-13 2017-07-18 General Electric Company Borates for photoactivated chemical bleaching
US10101322B2 (en) 2015-02-13 2018-10-16 General Electric Company Photoactivated chemical bleaching of dyes using borates
CN105044059B (zh) * 2015-07-13 2017-08-29 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 一种可用于减缓单分子荧光漂白现象的除氧试剂及其应用方法
US20170241911A1 (en) * 2016-02-22 2017-08-24 Miltenyi Biotec Gmbh Automated analysis tool for biological specimens
US10371610B2 (en) 2016-02-23 2019-08-06 Noul Co., Ltd. Contact-type patch, staining method using the same, and manufacturing method thereof
KR20170099737A (ko) 2016-02-23 2017-09-01 노을 주식회사 접촉식 염색 패치 및 이를 이용하는 염색 방법
JP2020513796A (ja) * 2016-11-16 2020-05-21 ユニバーシティ オブ ワシントンUniversity of Washington サイクリック蛍光イメージングのためのシステムおよび方法
CZ309221B6 (cs) * 2018-09-27 2022-06-01 Mendelova Univerzita V Brně Způsob identifikace přírodních vzorků, zejména kapalných
AU2022388928A1 (en) 2021-11-16 2024-05-16 Sotio Biotech Inc. Treatment of myxoid/round cell liposarcoma patients
US20230140613A1 (en) * 2022-03-30 2023-05-04 Hasan Bagheri Colorimetric system for detection of covid-19 using exhaled breath metabolites

Family Cites Families (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GR78065B (ru) 1982-02-19 1984-09-26 Unilever Nv
DK39592D0 (da) 1992-03-25 1992-03-25 Safefood Micro Systsm As Method of detecting microorganisms
US6451551B1 (en) 1994-03-11 2002-09-17 Biogenex Laboratories Releasing embedding media from tissue specimens
CA2235738C (en) 1995-11-22 2005-07-26 Minimed, Inc. Detection of biological molecules using chemical amplification and optical sensors
US6573043B1 (en) 1998-10-07 2003-06-03 Genentech, Inc. Tissue analysis and kits therefor
AU785290B2 (en) 1999-11-30 2006-12-21 Intrexon Corporation Method and apparatus for selectively targeting specific cells within a cell population
DE10014685B4 (de) 2000-03-24 2004-07-01 Schubert, Walter, Dr. Verfahren zur Identifizierung von zellspezifischen Zielstrukturen
WO2001075450A2 (en) 2000-04-04 2001-10-11 The Regents Of The University Of California Fluorescent lifetime assays for non-invasive quantification of analytes
US7470420B2 (en) * 2000-12-05 2008-12-30 The Regents Of The University Of California Optical determination of glucose utilizing boronic acid adducts
US6627177B2 (en) 2000-12-05 2003-09-30 The Regents Of The University Of California Polyhydroxyl-substituted organic molecule sensing optical in vivo method utilizing a boronic acid adduct and the device thereof
DE10117430A1 (de) 2001-04-06 2002-10-10 Nicole Marme Hochempfindlicher und hochspezifischer Enzymnachweis mit einer Nachweisgrenze bis in den femtomolaren Bereich
US7045361B2 (en) 2001-09-12 2006-05-16 Medtronic Minimed, Inc. Analyte sensing via acridine-based boronate biosensors
US8062897B2 (en) 2003-07-21 2011-11-22 Aureon Laboratories, Inc. Diagnostic histopathology using multiplex gene expression FISH
RU2305270C2 (ru) 2005-05-18 2007-08-27 Андрей Алексеевич Климов Способ флуоресцентной наноскопии (варианты)
CN101484806A (zh) 2006-05-17 2009-07-15 协乐民公司 一种对组织进行自动分析的方法
US7993927B2 (en) 2006-07-03 2011-08-09 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Histology methods
US8060348B2 (en) 2006-08-07 2011-11-15 General Electric Company Systems for analyzing tissue samples
US20080032321A1 (en) 2006-08-07 2008-02-07 General Electric Company System and methods for analyzing images of tissue samples
US8131476B2 (en) 2006-08-07 2012-03-06 General Electric Company System and method for co-registering multi-channel images of a tissue micro array
US20080124310A1 (en) 2006-11-01 2008-05-29 Marshall John G Bead based receptor biology
US9201063B2 (en) 2006-11-16 2015-12-01 General Electric Company Sequential analysis of biological samples
US7741045B2 (en) 2006-11-16 2010-06-22 General Electric Company Sequential analysis of biological samples
US7629125B2 (en) * 2006-11-16 2009-12-08 General Electric Company Sequential analysis of biological samples
US20100216652A1 (en) 2007-04-25 2010-08-26 The Trustees Of The Universit Of Pennsylvania Low Level Fluorescence Detection at the Light Microscopic Level
US7714303B2 (en) 2007-05-10 2010-05-11 Pacific Biosciences Of California, Inc. Methods and systems for analyzing fluorescent materials with reduced authofluorescence
US20090263612A1 (en) 2008-04-18 2009-10-22 Nbc Universal, Inc. System and Method for Photobleaching of Optical Media
US9677125B2 (en) 2009-10-21 2017-06-13 General Electric Company Detection of plurality of targets in biological samples
EP2601513B1 (en) 2010-08-05 2014-05-14 Cambridge Research & Instrumentation, Inc. Enhancing visual assessment of samples
US20140024024A1 (en) 2012-07-17 2014-01-23 General Electric Company Methods of detecting dna, rna and protein in biological samples

Also Published As

Publication number Publication date
AU2012355736B2 (en) 2017-12-14
CN104114713B (zh) 2018-04-03
EP2794908B1 (en) 2017-08-02
US20130345089A1 (en) 2013-12-26
CN104114713A (zh) 2014-10-22
AU2012355736A1 (en) 2014-07-17
BR112014015603A8 (pt) 2017-07-04
SG11201403460SA (en) 2014-07-30
BR112014015603A2 (pt) 2017-06-13
CA2860097A1 (en) 2013-06-27
EP2794908A1 (en) 2014-10-29
US8568991B2 (en) 2013-10-29
US9250245B2 (en) 2016-02-02
JP6148682B2 (ja) 2017-06-14
JP2015506469A (ja) 2015-03-02
RU2623880C2 (ru) 2017-06-29
US20130165330A1 (en) 2013-06-27
KR20140103350A (ko) 2014-08-26
KR102046194B1 (ko) 2019-11-18
AU2012355736A2 (en) 2014-09-18
BR112014015603B1 (pt) 2020-04-28
WO2013095896A1 (en) 2013-06-27
CA2860097C (en) 2020-07-07
EP2794908A4 (en) 2015-05-06
NZ626334A (en) 2016-04-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014124974A (ru) Фотоактивируемое химическое обесцвечивание красителей
JP2015506469A5 (ru)
RU2015120176A (ru) Фотоактивированное химическое обесцвечивание красителей
JP7432123B2 (ja) スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料
JP2016508213A5 (ru)
Kumar et al. FLIM FRET technology for drug discovery: Automated multiwell‐plate high‐content analysis, multiplexed readouts and application in situ
Cho et al. Ultrasensitive optical imaging with lanthanide lumiphores
JP2018515628A (ja) 超明色ダイマーまたはポリマー染料
Kang et al. Diversity-driven chemical probe development for biomolecules: beyond hypothesis-driven approach
US10267714B2 (en) Composition for preparing biomaterial with excellent light-transmitting property, and use thereof
KR20200135424A (ko) 형광 신호 향상을 위한 2가 금속의 사용
Chen et al. Modulated CMOS camera for fluorescence lifetime microscopy
Liu et al. A FRET chemosensor for hypochlorite with large Stokes shifts and long-lifetime emissions
BR112020026528A2 (pt) Composto de cumarina substituída com amina exocíclicos, nucleotídeo ou oligonucleotídeo, kit, uso dos mesmos, método de sequenciamento e método para sintetizar um composto
US20170247745A1 (en) Multiplex optical detection
CN104267009B (zh) 六色实时荧光定量pcr分析仪
KR20140002687A (ko) 자동화 분자 병리진단 시스템의 폐루프 모니터링
Capodilupo et al. A series of diphenylamine-fluorenone derivatives as potential fluorescent probes for neuroblastoma cell staining
CN109422758A (zh) 一种近红外荧光比率荧光探针及其制备方法和应用
WO2023242661A2 (en) Polymeric tandem dyes with spacing linker groups
CN109369455B (zh) 一种双光子近红外双大斯托克斯位移荧光染料及其合成方法与应用
Kelly et al. An automated multiwell plate reading FLIM microscope for live cell autofluorescence lifetime assays
Warner et al. Molecular fluorescence, phosphorescence, and chemiluminescence spectrometry
Sun et al. Tunable PIE and synchronized gating detections by FastFLIM for quantitative microscopy measurements of fast dynamics of single molecules
JP6321634B2 (ja) 光第二高調波発生化合物、光第二高調波発生色素組成物及び細胞検査方法

Legal Events

Date Code Title Description
PC41 Official registration of the transfer of exclusive right

Effective date: 20210810