RU2013148814A - Биомаркеры для прогнозирования чувствительности к противоопухолевой терапии - Google Patents

Биомаркеры для прогнозирования чувствительности к противоопухолевой терапии Download PDF

Info

Publication number
RU2013148814A
RU2013148814A RU2013148814/15A RU2013148814A RU2013148814A RU 2013148814 A RU2013148814 A RU 2013148814A RU 2013148814/15 A RU2013148814/15 A RU 2013148814/15A RU 2013148814 A RU2013148814 A RU 2013148814A RU 2013148814 A RU2013148814 A RU 2013148814A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
act
mutation
cell
inhibitor
sensitivity
Prior art date
Application number
RU2013148814/15A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2635193C2 (ru
Inventor
Куй ЛИНЬ
Элизабет ПУННУС
Сомасекар СЕШАГИРИ
Original Assignee
Дженентек, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дженентек, Инк. filed Critical Дженентек, Инк.
Publication of RU2013148814A publication Critical patent/RU2013148814A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2635193C2 publication Critical patent/RU2635193C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/517—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with carbocyclic ring systems, e.g. quinazoline, perimidine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/506—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim not condensed and containing further heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
    • A61K31/337—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having four-membered rings, e.g. taxol
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/56—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids
    • A61K31/58—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids containing heterocyclic rings, e.g. danazol, stanozolol, pancuronium or digitogenin
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/5748—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving oncogenic proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00—Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858—Allele-specific amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/113—PCR
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
    • C12Q2561/101—Taqman
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
    • C12Q2561/113—Real time assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
    • C12Q2565/10—Detection mode being characterised by the assay principle
    • C12Q2565/125—Electrophoretic separation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing

Abstract

1. Способ прогнозирования чувствительности роста опухолевой клетки к ингибитору АКТ, включающий определение присутствия мутации в АКТ, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с чувствительностью клетки к ингибитору АКТ.2. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с увеличенной чувствительностью клетки к АТФ-конкурентному ингибитору АКТ.3. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с уменьшенной чувствительностью клетки к аллостерическому ингибитору АКТ.4. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с уменьшенной чувствительностью клетки к пан-Р13К ингибитору АКТ.5. Способ по любому из пп.1-4, где мутация соответствует или совпадает с мутацией, представленной в таблице 1, таблице 2, на фиг.2, фиг.3, фиг.16 или фиг.17.6. Способ по п.5, где мутация соответствует или совпадает с L52, К189 или D323.7. Способ по п.1, где АКТ представляет собой АКТ1, АКТ2 или АКТ3.8. Способ по п.7, где АКТ представляет собой АКТ1.9. Способ по п.1, где мутация в АКТ нарушает взаимодействие между РН-доменом и киназным доменом АКТ.10. Способ по п.1, где мутация в АКТ увеличивает фосфорилирование АКТ.11. Способ по п.10, где увеличение фосфорилирования происходит вследствие конститутивного фосфорилирования.12. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение статуса PTEN клетки, где потеря PTEN коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибитору.13. Способ по п.12, где опухолевая клетка представляет собой клетку раковой опухоли яичников или предстательной железы.14. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение присутствия мутации PI3K клетки, где присутствие мутации PI3K коррелирует с увеличенной чувствительно�

Claims (30)

1. Способ прогнозирования чувствительности роста опухолевой клетки к ингибитору АКТ, включающий определение присутствия мутации в АКТ, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с чувствительностью клетки к ингибитору АКТ.
2. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с увеличенной чувствительностью клетки к АТФ-конкурентному ингибитору АКТ.
3. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с уменьшенной чувствительностью клетки к аллостерическому ингибитору АКТ.
4. Способ по п.1, где присутствие мутации в АКТ коррелирует с уменьшенной чувствительностью клетки к пан-Р13К ингибитору АКТ.
5. Способ по любому из пп.1-4, где мутация соответствует или совпадает с мутацией, представленной в таблице 1, таблице 2, на фиг.2, фиг.3, фиг.16 или фиг.17.
6. Способ по п.5, где мутация соответствует или совпадает с L52, К189 или D323.
7. Способ по п.1, где АКТ представляет собой АКТ1, АКТ2 или АКТ3.
8. Способ по п.7, где АКТ представляет собой АКТ1.
9. Способ по п.1, где мутация в АКТ нарушает взаимодействие между РН-доменом и киназным доменом АКТ.
10. Способ по п.1, где мутация в АКТ увеличивает фосфорилирование АКТ.
11. Способ по п.10, где увеличение фосфорилирования происходит вследствие конститутивного фосфорилирования.
12. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение статуса PTEN клетки, где потеря PTEN коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибитору.
13. Способ по п.12, где опухолевая клетка представляет собой клетку раковой опухоли яичников или предстательной железы.
14. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение присутствия мутации PI3K клетки, где присутствие мутации PI3K коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибированию ингибитором.
15. Способ по п.14, где указанные мутации PI3K представляют собой одну или обе из H1047R и H1047L.
16. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение профиля рДКТ клетки, где высокий профиль активности рАКТ коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибированию ингибитором.
17. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение профиля рАКТ клетки, где низкий профиль активности рАКТ коррелирует с уменьшенной чувствительностью к ингибированию ингибитором.
18. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение Her2 и/или Her3 статуса клетки, где Her2+ и/или Her3+ статус клетки коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибированию ингибитором.
19. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение присутствия мутации Met киназы клетки, где присутствие мутации Met киназы коррелирует с чувствительностью клетки к ингибитору АКТ.
20. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение присутствия B-Raf или K-Ras мутации клетки, где присутствие B-Raf или K-Ras мутации коррелирует с уменьшением чувствительности клетки к ингибитору АКТ.
21. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение профиля локализации FOXO3a в клетке, где цитоплазматический профиль локализации FOXO3a коррелирует с чувствительностью клетки к ингибированию ингибитором Akt.
22. Способ по п.1, где опухолевая клетка представляет собой клетку рака предстательной железы, яичников, молочной железы, желудка или поджелудочной железы.
23. Способ по п.23, где опухолевая клетка представляет собой клетку гормонорезистентного рака молочной железы.
24. Способ по п.1, где способ дополнительно включает определение INPP4B, PHLPP и/или РР2А статуса клетки, где потеря INPP4B, PHLPP и/или РР2А коррелирует с увеличенной чувствительностью к ингибитору.
25. Способ по п.1, где ингибитор АКТ представляет собой (S)-2-(4-хлорфенил)-1-(4-((5R,7R)-7-гидрокси-5-метил-6,7-дигидро-5Н-циклопента[d]пиримидин-4-ил)пиперазин-1-ил)-3-(изопропиламино)пропан-1-он или его фармацевтически приемлемую соль.
26. Способ по п.1, дополнительно включающий получение физиологического образца от пациента для определения присутствия мутации в АКТ.
27. Способ по п.26, дополнительно включающий определение присутствия мутации в АКТ в физиологическом образце.
28. Способ по п.1, дополнительно включающий информирование пациента, у которого определяют присутствие мутации в АКТ, о том, что ингибитор АКТ следует ввести.
29. Способ по п.1, дополнительно включающий информирование пациента, у которого определяют присутствие мутации в АКТ, о том, что ингибитор АКТ не следует вводить.
30. Способ лечения раковой клетки, содержащей одну или более мутаций PI3k, PTEN и АКТ, включающий введение в клетку GDC-0068 или его соли.
RU2013148814A 2011-04-01 2012-03-30 Биомаркеры для прогнозирования чувствительности к противоопухолевой терапии RU2635193C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161471036P 2011-04-01 2011-04-01
US61/471,036 2011-04-01
PCT/US2012/031662 WO2012135749A2 (en) 2011-04-01 2012-03-30 Biomarkers for predicting sensitivity to cancer treatments

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013148814A true RU2013148814A (ru) 2015-05-10
RU2635193C2 RU2635193C2 (ru) 2017-11-09

Family

ID=46932419

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2013148814A RU2635193C2 (ru) 2011-04-01 2012-03-30 Биомаркеры для прогнозирования чувствительности к противоопухолевой терапии

Country Status (15)

Country Link
US (3) US20140031259A1 (ru)
EP (2) EP2694959B8 (ru)
JP (4) JP6293655B2 (ru)
KR (2) KR102016182B1 (ru)
CN (1) CN103858007B (ru)
AU (1) AU2012236134A1 (ru)
BR (1) BR112013025356B1 (ru)
CA (1) CA2850175C (ru)
ES (1) ES2768081T3 (ru)
IL (1) IL228636A0 (ru)
MX (1) MX348655B (ru)
PL (1) PL2694959T3 (ru)
RU (1) RU2635193C2 (ru)
SG (2) SG194050A1 (ru)
WO (1) WO2012135749A2 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2631240C2 (ru) * 2011-04-01 2017-09-20 Дженентек, Инк. Комбинации соединений-ингибиторов акт и абиратерона, и способы применения

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20140031259A1 (en) * 2011-04-01 2014-01-30 Genentech, Inc. Biomarkers for predicting sensitivity to cancer treatments
JP6669500B2 (ja) * 2013-02-25 2020-03-18 ジェネンテック， インコーポレイテッド 薬物耐性ａｋｔ変異体を検出し治療するための方法及び組成物
WO2016037194A1 (en) * 2014-09-05 2016-03-10 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Akt and shh pathway inhibitor combination therapy for treating basal cell carcinomas
EP3210144B1 (en) 2014-10-24 2020-10-21 Koninklijke Philips N.V. Medical prognosis and prediction of treatment response using multiple cellular signaling pathway activities
CN106783976A (zh) * 2016-12-12 2017-05-31 东莞市广信知识产权服务有限公司 一种GaN沟道MOS界面结构
KR102129532B1 (ko) * 2018-07-19 2020-07-02 조성은 Pten 억제제에 대한 췌장암 치료 반응성 예측용 바이오마커 및 이의 용도
CN113025713B (zh) * 2021-02-23 2022-11-22 浙江东睿生物科技有限公司 用于预测肿瘤患者对特定抗肿瘤药物的敏感性的生物标志物的应用

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4683203A (en) 1984-04-14 1987-07-28 Redco N.V. Immobilized enzymes, processes for preparing same, and use thereof
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
IE61148B1 (en) 1988-03-10 1994-10-05 Ici Plc Method of detecting nucleotide sequences
EP0730663B1 (en) * 1993-10-26 2003-09-24 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes on biological chips
EP2369007B1 (en) 1996-05-29 2015-07-29 Cornell Research Foundation, Inc. Detection of nucleic acid sequence differences using coupled ligase detection and polymerase chain reactions
AU2001265121A1 (en) 2000-05-30 2001-12-11 Applera Corporation Methods for detecting target nucleic acids using coupled ligation and amplification
US20030119004A1 (en) 2001-12-05 2003-06-26 Wenz H. Michael Methods for quantitating nucleic acids using coupled ligation and amplification
WO2003084473A2 (en) * 2002-04-08 2003-10-16 Merck & Co., Inc. Method of treating cancer
WO2004110356A2 (en) * 2003-05-15 2004-12-23 Cbr Institute For Biomedical Research, Inc. Methods for modulating cell-to-cell adhesion using an agonist of c1inh-type protein activity
UA95641C2 (en) * 2006-07-06 2011-08-25 Эррей Биофарма Инк. Hydroxylated cyclopenta [d] pyrimidines as akt protein kinase inhibitors
US8063050B2 (en) 2006-07-06 2011-11-22 Array Biopharma Inc. Hydroxylated and methoxylated pyrimidyl cyclopentanes as AKT protein kinase inhibitors
WO2008049022A2 (en) * 2006-10-18 2008-04-24 Translational Genomics Research Institute Methods for detection of cancer
TWI450720B (zh) 2007-07-05 2014-09-01 Array Biopharma Inc 作為ａｋｔ蛋白質激酶抑制劑之嘧啶環戊烷
AU2008274956B2 (en) * 2007-07-12 2014-08-21 University Of South Florida Inhibitors of Akt/PKB with anti-tumor activity
WO2009103790A2 (en) * 2008-02-21 2009-08-27 Universite Libre De Bruxelles Method and kit for the detection of genes associated with pik3ca mutation and involved in pi3k/akt pathway activation in the er-positive and her2-positive subtypes with clinical implications
US20140031259A1 (en) * 2011-04-01 2014-01-30 Genentech, Inc. Biomarkers for predicting sensitivity to cancer treatments

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2631240C2 (ru) * 2011-04-01 2017-09-20 Дженентек, Инк. Комбинации соединений-ингибиторов акт и абиратерона, и способы применения

Also Published As

Publication number Publication date
AU2012236134A1 (en) 2013-11-21
AU2012236134A8 (en) 2013-12-19
WO2012135749A3 (en) 2012-11-22
US20180360835A1 (en) 2018-12-20
BR112013025356B1 (pt) 2022-11-16
CA2850175A1 (en) 2012-10-04
JP2018050625A (ja) 2018-04-05
SG194050A1 (en) 2013-11-29
JP7044746B2 (ja) 2022-03-30
RU2635193C2 (ru) 2017-11-09
ES2768081T3 (es) 2020-06-19
JP2022095670A (ja) 2022-06-28
CN103858007B (zh) 2017-03-29
MX2013011334A (es) 2014-08-22
CA2850175C (en) 2021-04-13
JP6293655B2 (ja) 2018-03-14
CN103858007A (zh) 2014-06-11
KR102165122B1 (ko) 2020-10-13
JP2014524009A (ja) 2014-09-18
IL228636A0 (en) 2013-12-31
WO2012135749A2 (en) 2012-10-04
NZ617242A (en) 2016-01-29
PL2694959T3 (pl) 2020-05-18
EP3617330C0 (en) 2023-12-27
EP2694959A2 (en) 2014-02-12
EP2694959B8 (en) 2019-12-25
EP3617330A1 (en) 2020-03-04
EP2694959B1 (en) 2019-11-13
EP3617330B1 (en) 2023-12-27
EP2694959A4 (en) 2014-12-31
KR20190011813A (ko) 2019-02-07
US20170065588A1 (en) 2017-03-09
KR20140023340A (ko) 2014-02-26
KR102016182B1 (ko) 2019-08-29
SG10201507582VA (en) 2015-10-29
JP2020022457A (ja) 2020-02-13
MX348655B (es) 2017-06-21
US20140031259A1 (en) 2014-01-30
BR112013025356A2 (pt) 2016-12-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2013148814A (ru) Биомаркеры для прогнозирования чувствительности к противоопухолевой терапии
Lin et al. Mechanisms of resistance to epidermal growth factor receptor inhibitors and novel therapeutic strategies to overcome resistance in NSCLC patients
Gadgeel et al. Preclinical rationale for PI3K/Akt/mTOR pathway inhibitors as therapy for epidermal growth factor receptor inhibitor-resistant non–small-cell lung cancer
Turke et al. MEK inhibition leads to PI3K/AKT activation by relieving a negative feedback on ERBB receptors
Klempner et al. What a tangled web we weave: emerging resistance mechanisms to inhibition of the phosphoinositide 3-kinase pathway
Mahajan et al. PI3K‐independent AKT activation in cancers: A treasure trove for novel therapeutics
Sun et al. Intrinsic resistance to MEK inhibition in KRAS mutant lung and colon cancer through transcriptional induction of ERBB3
McCleland et al. Lactate dehydrogenase B is required for the growth of KRAS-dependent lung adenocarcinomas
Girotti et al. Inhibiting EGF receptor or SRC family kinase signaling overcomes BRAF inhibitor resistance in melanoma
Suzuki et al. Identification of a lung adenocarcinoma cell line with CCDC 6‐RET fusion gene and the effect of RET inhibitors in vitro and in vivo
Black et al. NSCLC: an update of driver mutations, their role in pathogenesis and clinical significance
Giamas et al. Protein kinases as targets for cancer treatment
Cheung et al. Targeting therapeutic liabilities engendered by PIK3R1 mutations for cancer treatment
MX2013004086A (es) Metodos para inhibir proliferacion celular en cancers accionados por egfr.
NZ628078A (en) Methods of treating cancer using 3-(4-((4-(morpholinomethyl)benzyl)oxy)-1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione
WO2012016133A3 (en) Ros1 kinase inhibitors for the treatment of glioblastoma and other p53-deficient cancers
MX2012010226A (es) Uso de inhibidores de erbb3 en el tratamiento de canceres de mama triple negativos y de tipo basal.
Feng et al. Targeted radiosensitization with PARP1 inhibition: optimization of therapy and identification of biomarkers of response in breast cancer
NZ630416A (en) Inhibition of phosphorylation of pras40, gsk3-beta or p70s6k1 as a marker for tor kinase inhibitory activity
RU2012148699A (ru) Foxo3a как прогностический биомаркер для эффективности ингибитора пути киназы pi3k/акт
JP2014533960A5 (ru)
Lian et al. Anlotinib can overcome acquired resistance to EGFR‐TKIs via FGFR1 signaling in non‐small cell lung cancer without harboring EGFR T790M mutation
Nonami et al. Identification of novel therapeutic targets in acute leukemias with NRAS mutations using a pharmacologic approach
JP2014524009A5 (ru)
Gerson-Gurwitz et al. Zotatifin, an eIF4A-selective inhibitor, blocks tumor growth in receptor tyrosine kinase driven tumors