RU2013136402A - Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение - Google Patents

Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение Download PDF

Info

Publication number
RU2013136402A
RU2013136402A RU2013136402/10A RU2013136402A RU2013136402A RU 2013136402 A RU2013136402 A RU 2013136402A RU 2013136402/10 A RU2013136402/10 A RU 2013136402/10A RU 2013136402 A RU2013136402 A RU 2013136402A RU 2013136402 A RU2013136402 A RU 2013136402A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
plant
nucleic acid
seq
acid molecule
corn
Prior art date
Application number
RU2013136402/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2617958C2 (ru
Inventor
Вэй Чэнь
Натан Дж. ВАНОПДОРП
Сива П. КУМПАТЛА
Пэйчжун ЧЖЭН
Питер Д. ФРИДЕМАНН
Томас У. ГРИН
Деннис ФИТЦЛЬ
Original Assignee
Агридженетикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Агридженетикс, Инк. filed Critical Агридженетикс, Инк.
Publication of RU2013136402A publication Critical patent/RU2013136402A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2617958C2 publication Critical patent/RU2617958C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L13/00—Meat products; Meat meal; Preparation or treatment thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00—Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • A01H1/02—Methods or apparatus for hybridisation; Artificial pollination ; Fertility
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46—Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4684—Zea mays [maize]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23K—FODDER
    • A23K50/00—Feeding-stuffs specially adapted for particular animals
    • A23K50/10—Feeding-stuffs specially adapted for particular animals for ruminants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G, C10K; LIQUEFIED PETROLEUM GAS; ADDING MATERIALS TO FUELS OR FIRES TO REDUCE SMOKE OR UNDESIRABLE DEPOSITS OR TO FACILITATE SOOT REMOVAL; FIRELIGHTERS
    • C10L1/00—Liquid carbonaceous fuels
    • C10L1/02—Liquid carbonaceous fuels essentially based on components consisting of carbon, hydrogen, and oxygen only
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8209—Selection, visualisation of transformants, reporter constructs, e.g. antibiotic resistance markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8255—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving lignin biosynthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
    • C12Y101/01—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
    • C12Y101/01195—Cinnamyl-alcohol dehydrogenase (1.1.1.195)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2300/00—Aspects relating to hydrocarbon processing covered by groups C10G1/00 - C10G99/00
    • C10G2300/10—Feedstock materials
    • C10G2300/1011—Biomass
    • C10G2300/1014—Biomass of vegetal origin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P30/00—Technologies relating to oil refining and petrochemical industry
    • Y02P30/20—Technologies relating to oil refining and petrochemical industry using bio-feedstock

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Birds (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, обладающий по меньшей мере 90% аминокислотной идентичностью с SEQ ID NO:3.2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, обладающий по меньшей мере 90% аминокислотной идентичностью с SEQ ID NO: 25.3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 1.4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 23.5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 2.6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 24.7. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 62.8. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 63.9. Молекула нуклеиновой кислоты по п.7, дополнительно включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 63.10. Молекула нуклеиновой кислоты по п.7, где молекула нуклеиновой кислоты кодирует усеченный белок CAD2, не имеющий NADPH-связывающего и C-концевого каталитического доменов.11. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, состоящая из мутантног�

Claims (77)

1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, обладающий по меньшей мере 90% аминокислотной идентичностью с SEQ ID NO:3.
2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, обладающий по меньшей мере 90% аминокислотной идентичностью с SEQ ID NO: 25.
3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 1.
4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 23.
5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 2.
6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 24.
7. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 62.
8. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 63.
9. Молекула нуклеиновой кислоты по п.7, дополнительно включающая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична SEQ ID NO: 63.
10. Молекула нуклеиновой кислоты по п.7, где молекула нуклеиновой кислоты кодирует усеченный белок CAD2, не имеющий NADPH-связывающего и C-концевого каталитического доменов.
11. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, состоящая из мутантного гена циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2) SEQ ID NO: 1.
12. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, состоящая из мутантного гена циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2) SEQ ID NO: 23.
13. Мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, состоящий из аминокислотной последовательности, обладающей по меньшей мере 90% идентичностью с SEQ ID NO: 3.
14. Мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, состоящий из аминокислотной последовательности, обладающей по меньшей мере 90% идентичностью с SEQ ID NO: 25.
15. Мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, состоящий из SEQ ID NO: 3.
16. Мутантный белок циннамилалкогольдегидрогеназы 2, состоящий из SEQ ID NO: 25.
17. Способ создания трансгенного растения кукурузы, включающий введение преждевременного стоп-кодона в ген CAD2 в растении кукурузы.
18. Способ по п.16, где преждевременный стоп-кодон вводят путем введения вставки динуклеотида AC в экзон 3 гена CAD2 в растении кукурузы.
19. Способ по п.16, где преждевременный стоп-кодон вводят путем вставки в интрон 1 гена CAD2 в растении кукурузы.
20. Растение, включающее молекулу нуклеиновой кислоты по п.1.
21. Растение, включающее молекулу нуклеиновой кислоты по п.2.
22. Растение по п.20, где растением является Zea mays.
23. Растение по п.21, где растением является Zea mays.
24. Способ идентификации растения, включающего мутантный ген циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2), где способ включает:
выделение молекул нуклеиновых кислот из растения; и
скрининг выделенных молекул нуклеиновых кислот на предмет молекулы нуклеиновой кислоты, включающей вставку динуклеотида AC в положении, соответствующем нуклеотиду 3994 гена CAD2 дикого типа, где присутствие вставки динуклеотида AC в положении, соответствующем нуклеотиду 3994 гена CAD2 дикого типа, указывает на мутантный ген CAD2.
25. Способ идентификации растения, включающего мутантный ген циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2), где способ включает:
выделение молекул нуклеиновых кислот из растения; и
скрининг выделенных молекул нуклеиновых кислот на предмет молекулы нуклеиновой кислоты, включающей вставку транспозона в положении, соответствующем нуклеотиду 2786 гена CAD2 дикого типа, где присутствие вставки транспозона в положении, соответствующем нуклеотиду 2786 гена CAD2 дикого типа, указывает на мутантный ген CAD2.
26. Способ по п.24, где скрининг выделенных молекул нуклеиновых кислот включает полимеразную цепную реакцию.
27. Способ по п.25, где скрининг выделенных молекул нуклеиновых кислот включает полимеразную цепную реакцию.
28. Способ по п.26, где полимеразную цепную реакцию выполняют с использованием по меньшей мере двух праймеров, которые способны специфично связываться с SEQ ID NO: 1.
29. Способ по п.28, где праймеры включают праймеры, выбранные из группы, состоящей из SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 54 и SEQ ID NO: 55.
30. Способ по п.27, где полимеразную цепную реакцию выполняют с использованием по меньшей мере двух праймеров, которые способны специфично связываться с SEQ ID NO: 23.
31. Способ по п.30, где праймеры включают праймеры, выбранные из группы, состоящей из SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49 и SEQ ID NO: 50.
32. Растение, идентифицированное способом по п.24.
33. Растение по п.32, где растением является Zea mays.
34. Растение, идентифицированное способом по п.25.
35. Растение по п.34, где растением является Zea mays.
36. Растение по п.32, где растение имеет фенотип brown midrib.
37. Растение по п.34, где растение имеет фенотип brown midrib.
38. Растение по п.36, где растение Zea mays обладает по меньшей мере одним признаком, выбранным из группы, состоящей из пониженного содержания лигнина, повышенной перевариваемости и выхода этанола.
39. Растение по п.37, где растение Zea mays обладает по меньшей мере одним признаком, выбранным из группы, состоящей из пониженного содержания лигнина, повышенной перевариваемости и выхода этанола.
40. Способ введения фенотипа brown midrib 1 (bm1) в кукурузу, включающий:
скрещивание растения кукурузы, имеющего фенотип bm1, с растением кукурузы, не имеющим фенотипа bm1, с получением растений кукурузы F1;
применение селекции с использованием маркеров для идентификации растения кукурузы F1, включающего вставку динуклеотида AC в положении, соответствующем нуклеотиду 3994 гена CAD2 дикого типа; и
размножение идентифицированного растения кукурузы F1, с введением, таким образом, фенотипа brown midrib 1 (bm1) в кукурузу.
41. Способ введения фенотипа brown midrib 1 (bm1) в кукурузу, включающий:
скрещивание растения кукурузы, имеющего фенотип bm1, с растением кукурузы, не имеющим фенотипа bm1, с получением растений кукурузы F1;
применение селекции с использованием маркеров для идентификации растения кукурузы F1, включающего вставку транспозона в положении, соответствующем нуклеотиду 2786 гена CAD2 дикого типа; и
размножение идентифицированного растения кукурузы F1, с введением, таким образом, фенотипа brown midrib 1 (bm1) в кукурузу.
42. Способ получения генетически сконструированного организма, включающий введение молекулы нуклеиновой кислоты по п.1 в организм.
43. Способ по п.42, где организмом является растение.
44. Способ по п.43, где растением является Zea mays.
45. Способ по п.44, где молекулу нуклеиновой кислоты по п.1 вводят в растение Zea mays путем скрещивания с Zea mays растения, включающего молекулу нуклеиновой кислоты по п.1.
46. Способ по п.42, где молекулу нуклеиновой кислоты по п.1 вводят в организм с помощью генетической трансформации.
47. Способ по п.46, где нуклеиновая кислота по п.1 стабильно интегрирована в геном организма.
48. Способ по п.46, где организмом является растение.
49. Способ по п.48, где растением является Zea mays.
50. Способ создания генетически сконструированного организма, включающий введение молекулы нуклеиновой кислоты по п.2 в организм.
51. Способ по п.50, где организмом является растение.
52. Способ по п.51, где растением является Zea mays.
53. Способ по п.52, где молекулу нуклеиновой кислоты по п. 2 вводят в растение Zea mays путем скрещивания с Zea mays растения, включающего молекулу нуклеиновой кислоты по п.2.
54. Способ по п.50, где молекулу нуклеиновой кислоты по п.2 вводят в организм с помощью генетической трансформации.
55. Способ по п.54, где нуклеиновая кислота по п.2 стабильно интегрирована в геном организма.
56. Способ по п.54, где организмом является растение.
57. Способ по п.56, где растением является Zea mays.
58. Способ идентификации растения, включающего мутантный ген циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2), где способ включает:
выделение молекул нуклеиновых кислот из растения; и
контакт выделенных молекул нуклеиновых кислот со средствами для идентификации растений кукурузы, несущих мутантный ген CAD2, с генерацией детектируемого сигнала, который указывает на присутствие мутантного гена CAD2 в растении.
59. Способ переноса мутантного гена циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2) кукурузы, включающий:
(a) анализ с применением зондов, которые способны к специфичной гибридизации по меньшей мере с одним маркером, который сцеплен с геном CAD2, геномной ДНК первого растения и геномной ДНК второго растения;
(b) половое скрещивание первого и второго растений с получением популяции потомства;
(c) анализ популяции потомства на присутствие по меньшей мере одного маркера, который сцеплен с геном CAD2;
(d) обратное скрещивание индивидуального растения из популяции потомства, которое включает по меньшей мере один маркер, который сцеплен с геном CAD2, с первым или вторым растением, с получением популяции следующего поколения;
(e) определение, включает ли представитель популяции следующего поколения требуемый признак от первого или второго растения и ген CAD2; и
(f) если ни один представитель популяции следующего поколения не включает требуемый признак от первого или второго растения и ген CAD2, повтор этапов (d) и (e), пока не будет идентифицировано индивидуальное растение, которое включает требуемые признаки от первого или второго растения и ген CAD2.
60. Способ 59, где индивидуальное растение потомства, полученное в каждом этапе скрещивания и обратного скрещивания, отбирают с помощью анализа маркера CAD2 в каждом поколении.
61. Способ введения мутантного гена циннамилалкогольдегидрогеназы 2 (CAD2) кукурузы в организм-хозяин с помощью генетической трансформации, где способ включает:
анализ геномной ДНК растения кукурузы с применением зондов, которые способны к специфичной гибридизации с маркерами, сцепленными с мутантным геном CAD2, для идентификации мутантного гена CAD2 в растении кукурузы;
выделение сегмента геномной ДНК растения кукурузы, который специфично гибридизуется с зондами, которые способны к специфичной гибридизации с маркерами, сцепленными с мутантным геном CAD2;
введение выделенного сегмента геномной ДНК в организм-хозяин; и
анализ ДНК организма-хозяина с применением зондов, которые способны к специфичной гибридизации с маркерами, сцепленными с мутантным геном CAD2, для идентификации мутантного гена CAD2 в организме-хозяине.
62. Способ откорма животного, откармливаемого силосом, включающий:
предоставление силоса, произведенного из растения кукурузы по п.33; и
откорм животного силосом, произведенным из растения кукурузы по п.33.
63. Способ откорма животного, откармливаемого силосом, включающий:
предоставление силоса, произведенного из растения кукурузы по п.35; и
откорм животного с силосом, произведенным из растения кукурузы по п.35.
64. Способ по п.62, где откармливаемое силосом животное является жвачным.
65. Способ по п.64, где откармливаемое силосом животное является домашним быком.
66. Способ по п.63, где откармливаемое силосом животное является жвачным.
67. Способ по п.66, где откармливаемое силосом животное является домашним быком.
68. Способ по п.62, где силос, произведенный из растения кукурузы по п.33, составляет более 15% сухого вещества в рационе животного.
69. Способ по п.68, где силос, произведенный из растения кукурузы по п.33, составляет по меньшей мере приблизительно 25% сухого вещества в рационе животного.
70. Мясной продукт, приготовленный из животного, откармливаемого согласно способу по п.62.
71. Конечный рацион для мясных пород домашних быков, включающий кукурузный силос, произведенный из растения кукурузы по п.33.
72. Конечный рацион для мясных пород домашних быков по п.71, где кукурузный силос является силосом из кукурузы bm1.
73. Способ по п.63, где силос, произведенный из растения кукурузы по п.35, составляет более 15% сухого вещества в рационе животного.
74. Способ по п.73, где силос, произведенный из растения кукурузы по п.35, составляет по меньшей мере приблизительно 25% сухого вещества в рационе животного.
75. Мясной продукт, приготовленный из животного, откармливаемого согласно способу по п.63.
76. Конечный рацион для мясных пород домашних быков, включающий кукурузный силос, произведенный из растения кукурузы по п.35.
77. Конечный рацион для мясных пород домашних быков по п.76, где кукурузный силос является силосом из кукурузы bm1.
RU2013136402A 2011-01-03 2012-01-03 Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение RU2617958C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161429390P 2011-01-03 2011-01-03
US61/429,390 2011-01-03
PCT/US2012/020062 WO2012094307A2 (en) 2011-01-03 2012-01-03 Gene and variations associated with bm1 phenotype, molecular markers, and their use

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017111331A Division RU2017111331A (ru) 2011-01-03 2012-01-03 Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013136402A true RU2013136402A (ru) 2015-02-10
RU2617958C2 RU2617958C2 (ru) 2017-04-28

Family

ID=46382056

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017111331A RU2017111331A (ru) 2011-01-03 2012-01-03 Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение
RU2013136402A RU2617958C2 (ru) 2011-01-03 2012-01-03 Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017111331A RU2017111331A (ru) 2011-01-03 2012-01-03 Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение

Country Status (14)

Country Link
US (1) US9131725B2 (ru)
EP (1) EP2661171A4 (ru)
JP (2) JP6101632B2 (ru)
KR (1) KR20140036140A (ru)
CN (2) CN106148365A (ru)
AR (1) AR084764A1 (ru)
AU (2) AU2012204487B2 (ru)
BR (1) BR102012000116B1 (ru)
CA (1) CA2822950A1 (ru)
MX (2) MX349339B (ru)
RU (2) RU2017111331A (ru)
UA (1) UA117335C2 (ru)
UY (1) UY33856A (ru)
WO (1) WO2012094307A2 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105229167A (zh) * 2012-12-10 2016-01-06 农业基因遗传学有限公司 从残余的经提取种子样品回收基因组dna
US20140288844A1 (en) * 2013-03-15 2014-09-25 Cosmosid Inc. Characterization of biological material in a sample or isolate using unassembled sequence information, probabilistic methods and trait-specific database catalogs
CN108866215B (zh) * 2017-12-01 2022-02-08 苏州百源基因技术有限公司 一种用于产气肠杆菌检测的实时荧光定量pcr试剂盒
CN108531482B (zh) * 2018-03-23 2021-08-10 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 与bm2表型相关的基因、变异及其分子标记物
EP3571925A1 (en) * 2018-05-24 2019-11-27 KWS SAAT SE & Co. KGaA Artificial marker allele
CN109880836B (zh) * 2019-01-15 2022-06-21 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 玉米brown midrib5（bm5）突变体的突变基因鉴定、变异及其分子标记物
CN110577960B (zh) * 2019-09-12 2022-09-13 南京农业大学 梨木质素合成基因PbMC1a/1b及其在果实品质遗传改良中的应用
CN110484647B (zh) * 2019-09-23 2020-08-07 齐鲁师范学院 与玉米细胞壁消化率相关的分子标记及其鉴别引物和应用
CN110862444B (zh) * 2019-12-18 2021-03-26 北京市农林科学院 一种玉米bm1基因突变体及该基因的分子标记和应用
CN112106651A (zh) * 2020-10-21 2020-12-22 山东省农业科学院作物研究所 一种bmr高粱杂交种的选育方法

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5767080A (en) 1996-05-01 1998-06-16 Cargill, Incorporated Enhanced milk production in dairy cattle
US5824842A (en) 1996-07-26 1998-10-20 North Carolina State University Method of altering lignin in trees
US6552249B1 (en) 1999-02-10 2003-04-22 E.I. Du Pont De Nemours And Company Plant cinnamyl-alcohol dehydrogenase
AUPQ815400A0 (en) 2000-06-14 2000-07-06 Dairy Research And Development Corporation Modification of lignin biosynthesis
US8921653B2 (en) * 2001-06-14 2014-12-30 Agriculture Victoria Services Pty Ltd Modification of lignin biosynthesis
US6921643B2 (en) * 2003-02-05 2005-07-26 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for detecting a sequence mutation in the cinnamyl alcohol dehydrogenase gene associated with altered lignification in loblolly pine
US7750207B2 (en) * 2004-09-01 2010-07-06 Monsanto Technology Llc Zea mays ribulose bisphosphate carboxylase activase promoter
EP1850656A4 (en) * 2005-01-12 2010-04-07 Monsanto Technology Llc GENES AND ITS USES FOR THE PLANT PROCESSING OF PLANTS
US7968764B2 (en) 2005-05-02 2011-06-28 Purdue Research Foundation Methods for increasing the yield of fermentable sugars from plant stover
FR2919465B1 (fr) * 2007-07-31 2009-10-30 Biogemma Soc Par Actions Simpl Mais presentant une digestibilite amelioree
WO2010099084A2 (en) * 2009-02-27 2010-09-02 Monsanto Technology Llc Isolated novel nucleic acid and protein molecules from corn and methods of using those molecules

Also Published As

Publication number Publication date
RU2617958C2 (ru) 2017-04-28
BR102012000116B1 (pt) 2021-02-23
US20120174255A1 (en) 2012-07-05
CN103415203B (zh) 2016-08-17
JP6101632B2 (ja) 2017-03-22
MX349339B (es) 2017-07-21
JP2014504864A (ja) 2014-02-27
WO2012094307A3 (en) 2013-03-14
UA117335C2 (uk) 2018-07-25
AR084764A1 (es) 2013-06-26
NZ612808A (en) 2015-06-26
WO2012094307A8 (en) 2012-10-18
KR20140036140A (ko) 2014-03-25
MX369867B (es) 2019-11-25
BR102012000116A2 (pt) 2015-06-02
MX2013007814A (es) 2014-07-09
EP2661171A2 (en) 2013-11-13
AU2017206249B2 (en) 2018-09-06
AU2012204487B2 (en) 2017-04-20
AU2012204487A1 (en) 2013-07-25
RU2017111331A3 (ru) 2021-01-12
WO2012094307A2 (en) 2012-07-12
CN106148365A (zh) 2016-11-23
EP2661171A4 (en) 2014-09-17
AU2017206249A1 (en) 2017-08-10
JP2016165291A (ja) 2016-09-15
RU2017111331A (ru) 2019-01-24
CN103415203A (zh) 2013-11-27
US9131725B2 (en) 2015-09-15
UY33856A (es) 2012-08-31
CA2822950A1 (en) 2012-07-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2013136402A (ru) Ген и вариации, связанные с фенотипом bm1, молекулярные маркеры и их применение
KR100863376B1 (ko) 고(高)리신 옥수수 조성물 및 이의 검출방법
Marwal et al. Molecular markers: tool for genetic analysis
JP6483220B2 (ja) 豚の肉質形質判断用遺伝子マーカー及びその利用
Williams The use of marker-assisted selection in animal breeding and biotechnology
CN107580629B (zh) 芸苔属事件lbflfk和lbfdau及其检测方法
EA019578B1 (ru) Выделенная молекула нуклеиновой кислоты и ее применение
Naqvi Application of molecular genetic technologies in livestock production: potentials for developing countries
KR20150051171A (ko) 신규한 dna 표지인자 및 이를 이용한 선별방법
KR101998526B1 (ko) 배추 형질전환체 특이적 활성 전이인자인 pte-1 검출용 프라이머 세트
Mukherjee et al. Muscle transcriptome signature and gene regulatory network analysis in two divergent lines of a hilly bovine species Mithun (Bos frontalis)
CN105073994A (zh) 包含突变da1等位基因的芸苔属植物
Teneva et al. Molecular genetics and SSR markers as a new practice in farm animal genomic analysis for breeding and control of disease disorders
CN111944913A (zh) 一种半滑舌鳎抗病育种基因芯片及其应用
US20200063153A1 (en) Methods and compositions for improving forage production or quality in alfalfa plants
Singh et al. Valorizing faba bean for animal feed supplements via biotechnological approach: Opinion
CN110106275A (zh) 一种茶叶紫芽紧密连锁的InDel分子标记及其应用
CN108409844A (zh) 蛋白质TaNRT2.5在调控植物产量中的应用
Wu et al. Two novel linkage SNPs of VLDLR gene intron 11 are associated with laying traits in two quail populations
US20220017975A1 (en) Snp markers and selection of low fiber in brassica
KR101744591B1 (ko) 오이 유전자형 식별용 조성물 및 이를 이용한 식별 방법
CN108841840A (zh) 蛋白TaNADH-GoGAT在调控植物产量中的应用
Sikdar et al. Multi-OMICS and molecular biology perspective in Buffalo genome
CN113430283B (zh) 鸡bmp15基因在作为鸡睾丸性状分子标记方面的应用
RU2661110C2 (ru) Ген-специфический анализ на fluory2 в маисе для интрогрессии мучнистого признака (fl2)