RU2012140458A - Генетический маркер для диагностики деменции с тельцами леви - Google Patents
Генетический маркер для диагностики деменции с тельцами леви Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012140458A RU2012140458A RU2012140458/10A RU2012140458A RU2012140458A RU 2012140458 A RU2012140458 A RU 2012140458A RU 2012140458/10 A RU2012140458/10 A RU 2012140458/10A RU 2012140458 A RU2012140458 A RU 2012140458A RU 2012140458 A RU2012140458 A RU 2012140458A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- polymorphic site
- positions
- genotype
- seq
- allele
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/172—Haplotypes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ диагностики деменции с тельцами Леви in vitro, который включает определение в биологическом образце субъекта генотипа следующих изменений в гене бутирилхолинэстеразы (BChE) или полиморфизмов в разбалансированной связи:полиморфного сайта в положении 68974, зарегистрированного в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть положение 934 в SEQ ID NO:28); иобласти политимина в положениях 4780-4786, зарегистрированной в NCBI под номером доступа NG 009031 (то есть положения 4780-4786 в SEQ ID NO:1).2. Способ по п.1, который включает определение генотипа:полиморфного сайта в положении 68974, зарегистрированного в NCBI под номером доступа NG 009031 (то есть положение 934 в SEQ ID NO:28); иобласти политимина в положениях 4780-4786, зарегистрированной в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть положения 4780-4786 в SEQ ID NO:1).3. Способ по любому из пп.1 и 2, который дополнительно включает определение генотипа следующих изменений в гене BChE или полиморфизмов в разбалансированной связи:полиморфного сайта в положении 3687,полиморфного сайта в положении 4206 иполиморфного сайта в положении 4443; указанные положения приведены со ссылкой на регистрацию в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть соответственно положения 3687, 4206 и 4443 в SEQ ID NO:1).4. Способ по п.3, который включает определение генотипа:полиморфного сайта в положении 3687,полиморфного сайта в положении 4206 иполиморфного сайта в положении 4443; указанные положения приведены со ссылкой на регистрацию в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть соответственно положения 3687, 4206 и 4443 в SEQ ID NO:1).5. Способ по любому из пп.1 и 2, в котором генотип представляет собой: семь тиминов в положениях 4780-4786 для обоих аллелей, гуанин для одного аллеля и аденин для другого аллеля в по�
Claims (16)
1. Способ диагностики деменции с тельцами Леви in vitro, который включает определение в биологическом образце субъекта генотипа следующих изменений в гене бутирилхолинэстеразы (BChE) или полиморфизмов в разбалансированной связи:
полиморфного сайта в положении 68974, зарегистрированного в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть положение 934 в SEQ ID NO:28); и
области политимина в положениях 4780-4786, зарегистрированной в NCBI под номером доступа NG 009031 (то есть положения 4780-4786 в SEQ ID NO:1).
2. Способ по п.1, который включает определение генотипа:
полиморфного сайта в положении 68974, зарегистрированного в NCBI под номером доступа NG 009031 (то есть положение 934 в SEQ ID NO:28); и
области политимина в положениях 4780-4786, зарегистрированной в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть положения 4780-4786 в SEQ ID NO:1).
3. Способ по любому из пп.1 и 2, который дополнительно включает определение генотипа следующих изменений в гене BChE или полиморфизмов в разбалансированной связи:
полиморфного сайта в положении 3687,
полиморфного сайта в положении 4206 и
полиморфного сайта в положении 4443; указанные положения приведены со ссылкой на регистрацию в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть соответственно положения 3687, 4206 и 4443 в SEQ ID NO:1).
4. Способ по п.3, который включает определение генотипа:
полиморфного сайта в положении 3687,
полиморфного сайта в положении 4206 и
полиморфного сайта в положении 4443; указанные положения приведены со ссылкой на регистрацию в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть соответственно положения 3687, 4206 и 4443 в SEQ ID NO:1).
5. Способ по любому из пп.1 и 2, в котором генотип представляет собой: семь тиминов в положениях 4780-4786 для обоих аллелей, гуанин для одного аллеля и аденин для другого аллеля в положении 68974, при этом указанный генотип является показателем деменции с тельцами Леви и позволяет отличить деменцию с тельцами Леви от болезни Альцгеймера.
6. Способ по п.3, в котором генотип представляет собой:
аденин для одного аллеля в положении 68974;
восемь тиминов для одного аллеля в положениях 4780-4786;
аденин для обоих аллелей в положении 3687;
аденин для одного аллеля и гуанин для другого аллеля в положении 4206; и
цитозин для обоих аллелей в положении 4443;
при этом указанный генотип является показателем деменции с тельцами Леви и позволяет отличить деменцию с тельцами Леви от болезни Альцгеймера.
7. Способ по п.3, в котором генотип представляет собой:
аденин для одного аллеля и гуанин для другого аллеля в положении 68974;
семь тиминов для обоих аллелей в положениях 4780-4786;
аденин для обоих аллелей в положении 3687;
аденин для обоих аллелей в положении 4206; и
цитозин для одного аллеля в положении 4443;
при этом указанный генотип является показателем деменции с тельцами Леви и позволяет отличить деменцию с тельцами Леви от болезни Альцгеймера.
8. Способ по п.1, в котором генотип определяют одним из методов, выбираемым из группы, включающей мультиплексную ПЦР со специфичным праймером и последующим обнаружением, мультиплексное аллельспецифическое удлинение праймера, метод на основе микроматрицы и динамическую аллельспецифическую гибридизацию.
9. Способ по п.8, в котором генотип определяют путем амплификации при помощи мультиплексной ПЦР со специфичным праймером и последующим обнаружением.
10. Способ по п.1, в котором биологический образец является пробой крови.
11. Набор для выполнения способа по любому из пп.1-10, который включает соответствующее средство для определения генотипа изменений в гене BChE.
12. Набор по п.11, который включает соответствующее средство для выполнения мультиплексной ПЦР со специфичным праймером.
13. Применение набора по любому из пп.11 и 12 для диагностики деменции с тельцами Леви.
14. Применение полиморфного сайта в положении 68974, зарегистрированного в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть положение 934 в SEQ ID NO:28), в комбинации с одним или несколькими изменениями в гене BChE, выбираемыми из группы, состоящей из области политимина в положениях 4780-4786, полиморфного сайта в положении 3687, полиморфного сайта в положении 4206 и полиморфного сайта в положении 4443, в качестве маркера для диагностики деменции с тельцами Леви; указанные положения приведены со ссылкой на регистрацию в NCBI под номером доступа NG_009031 (то есть соответственно положения 3687, 4206, 4443 и 4780-4786 в SEQ ID NO:1).
15. Применение по п.14, в котором полиморфный сайт в положении 68974 использован в комбинации с областью политимина в положениях 4780-4786.
16. Применение по п.14, в котором полиморфный сайт в положении 68974 использован в комбинации с областью политимина в положениях 4780-4786, полиморфным сайтом в положении 3687, полиморфным сайтом в положении 4206 и полиморфным сайтом в положении 4443.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP10382042A EP2360280A1 (en) | 2010-02-24 | 2010-02-24 | Genetic marker for the diagnosis of dementia with Lewy bodies |
| EP10382042.9 | 2010-02-24 | ||
| PCT/EP2011/000903 WO2011104023A1 (en) | 2010-02-24 | 2011-02-24 | Genetic marker for the diagnosis of dementia with lewy bodies |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012140458A true RU2012140458A (ru) | 2014-03-27 |
Family
ID=42077915
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012140458/10A RU2012140458A (ru) | 2010-02-24 | 2011-02-24 | Генетический маркер для диагностики деменции с тельцами леви |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20130101997A1 (ru) |
| EP (2) | EP2360280A1 (ru) |
| JP (1) | JP2013520185A (ru) |
| KR (2) | KR20130043107A (ru) |
| CN (1) | CN102869786B (ru) |
| AU (1) | AU2011220065A1 (ru) |
| BR (1) | BR112012021260A2 (ru) |
| CA (1) | CA2789054A1 (ru) |
| CL (1) | CL2012002347A1 (ru) |
| IL (1) | IL221313A0 (ru) |
| MX (1) | MX2012009506A (ru) |
| NZ (1) | NZ602551A (ru) |
| RU (1) | RU2012140458A (ru) |
| SG (1) | SG183437A1 (ru) |
| WO (1) | WO2011104023A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201206975B (ru) |
Families Citing this family (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2360280A1 (en) * | 2010-02-24 | 2011-08-24 | Fundació Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol | Genetic marker for the diagnosis of dementia with Lewy bodies |
| EP2737087A1 (en) * | 2011-07-29 | 2014-06-04 | Universitat Autònoma De Barcelona | Genetic marker for the diagnosis of dementia with lewy bodies |
| EP2990800A1 (en) * | 2014-08-29 | 2016-03-02 | Fundació Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol | Neprilysin as heartfailure (HF) prognostic marker |
| WO2016164474A1 (en) * | 2015-04-06 | 2016-10-13 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Predictive value of combined genetic enzymatic and lipidomic data in disease risk for lewy body disease |
| WO2016180725A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Fundació Institut D'investigació En Ciències De La Salut Germans Trias I Pujol | Diagnosis of dementia with lewy bodies |
| EP3091087A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-09 | Fundació Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol | Method for in vitro diagnosis of synucleinopathies using alpha-synuclein gene transcripts |
| EP3385393A1 (de) * | 2017-04-05 | 2018-10-10 | Eckart Schnakenberg | In-vitro-verfahren zur diagnose des risikos einer person zur ausbildung eines aerotoxischen syndroms und kit zur durchführung des verfahrens |
| US12065701B2 (en) | 2018-07-19 | 2024-08-20 | Fundació Institut D'investigació En Ciències De La Salut Germans Trias I Pujol | In vitro method for the diagnosis of synucleinopathies |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6022683A (en) * | 1996-12-16 | 2000-02-08 | Nova Molecular Inc. | Methods for assessing the prognosis of a patient with a neurodegenerative disease |
| GB0323703D0 (en) * | 2003-10-09 | 2003-11-12 | Medical Res Council | Method |
| EP2650379B1 (en) * | 2007-07-31 | 2015-09-16 | Accera, Inc. | Use of genomic testing and ketogenic compounds for treatment of reduced cognitive function |
| EP2360280A1 (en) * | 2010-02-24 | 2011-08-24 | Fundació Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol | Genetic marker for the diagnosis of dementia with Lewy bodies |
-
2010
- 2010-02-24 EP EP10382042A patent/EP2360280A1/en not_active Withdrawn
-
2011
- 2011-02-24 MX MX2012009506A patent/MX2012009506A/es not_active Application Discontinuation
- 2011-02-24 CA CA2789054A patent/CA2789054A1/en not_active Abandoned
- 2011-02-24 JP JP2012554248A patent/JP2013520185A/ja active Pending
- 2011-02-24 BR BR112012021260A patent/BR112012021260A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2011-02-24 AU AU2011220065A patent/AU2011220065A1/en not_active Abandoned
- 2011-02-24 EP EP11708400.4A patent/EP2539461B1/en not_active Not-in-force
- 2011-02-24 NZ NZ602551A patent/NZ602551A/en not_active IP Right Cessation
- 2011-02-24 SG SG2012062063A patent/SG183437A1/en unknown
- 2011-02-24 KR KR1020127029377A patent/KR20130043107A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-02-24 CN CN201180011143.7A patent/CN102869786B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2011-02-24 US US13/578,987 patent/US20130101997A1/en not_active Abandoned
- 2011-02-24 KR KR1020127024833A patent/KR20130049771A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-02-24 RU RU2012140458/10A patent/RU2012140458A/ru not_active Application Discontinuation
- 2011-02-24 WO PCT/EP2011/000903 patent/WO2011104023A1/en active Application Filing
-
2012
- 2012-08-05 IL IL221313A patent/IL221313A0/en unknown
- 2012-08-23 CL CL2012002347A patent/CL2012002347A1/es unknown
- 2012-09-17 ZA ZA2012/06975A patent/ZA201206975B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2013520185A (ja) | 2013-06-06 |
| EP2539461B1 (en) | 2015-01-07 |
| NZ602551A (en) | 2014-03-28 |
| CA2789054A1 (en) | 2011-09-01 |
| AU2011220065A1 (en) | 2012-10-11 |
| SG183437A1 (en) | 2012-09-27 |
| KR20130049771A (ko) | 2013-05-14 |
| BR112012021260A2 (pt) | 2017-11-14 |
| CN102869786B (zh) | 2014-12-24 |
| MX2012009506A (es) | 2012-09-12 |
| EP2539461A1 (en) | 2013-01-02 |
| IL221313A0 (en) | 2012-10-31 |
| CN102869786A (zh) | 2013-01-09 |
| ZA201206975B (en) | 2015-08-26 |
| US20130101997A1 (en) | 2013-04-25 |
| CL2012002347A1 (es) | 2013-12-13 |
| KR20130043107A (ko) | 2013-04-29 |
| EP2360280A1 (en) | 2011-08-24 |
| WO2011104023A1 (en) | 2011-09-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2012140458A (ru) | Генетический маркер для диагностики деменции с тельцами леви | |
| Huentelman et al. | Association of SNPs in EGR3 and ARC with schizophrenia supports a biological pathway for schizophrenia risk | |
| Nakajima et al. | Allelic variants in the interleukin-6 gene and essential hypertension in Japanese women | |
| EP2847593A1 (en) | Methods for predicting and detecting cancer risk | |
| JP2011517281A5 (ru) | ||
| NZ593628A (en) | Genetic variants useful for risk assessment of thyroid cancer using rs944289 | |
| CA2591840A1 (en) | Genetic variants predicting warfarin sensitivity | |
| White et al. | The population genomics of trans-specific inversion polymorphisms in Anopheles gambiae | |
| ES2744592T3 (es) | Marcadores mitocondriales de enfermedades neurodegenerativas | |
| RU2012118596A (ru) | Способы лечения, диагностики и мониторинга волчанки | |
| Nakaoka et al. | Distribution of HLA haplotypes across Japanese Archipelago: similarity, difference and admixture | |
| CN110699446B (zh) | 一种与非综合征型唇腭裂诊断相关的SNP标志物rs3174298及其应用 | |
| CN104894230A (zh) | 一种hla-dqb1基因分型的组特异性引物pcr-sbt方法及试剂 | |
| CN103525822B (zh) | 一种仔猪腹泻抗性相关的分子标记检测方法及应用 | |
| Zhang et al. | Validation of a mobile phone-assisted microarray decoding platform for signal-enhanced mutation detection | |
| JP2018529377A5 (ru) | ||
| Xue et al. | Haplotypes and effects on growth traits of bovine Wnt7a gene in Chinese Qinchuan cattle | |
| ES2445709T3 (es) | Método para la identificación por técnicas moleculares de variantes genéticas que no codifican antígeno D (D-) y codifican antígeno C alterado (C+W) | |
| Catsburg et al. | Analysis of multiple single nucleotide polymorphisms (SNP) on DNA traces from plasma and dried blood samples | |
| JP2010502205A (ja) | Ｇｔｐシクロヒドロラーゼ１遺伝子（ｇｃｈ１）中の疼痛保護的ハプロタイプの診断のためのｓｎｐの使用 | |
| Matsui et al. | Rapid discrimination of Acinetobacter baumannii international clone II lineage by pyrosequencing SNP analyses of blaOXA-51-like genes | |
| Nishi et al. | Detection of a novel X-chromosomal short tandem repeat marker in Xq28 in four ethnic groups | |
| Soejima et al. | TaqMan real-time polymerase chain reaction for detection of SEC1-FUT2 hybrid alleles: Identification of novel hybrid allele | |
| RU2014107505A (ru) | Генетический маркер для диагностики деменции с тельцами леви | |
| Turrina et al. | Polymorphism of four X-chromosomal STRs: DXS7423, DXS7424, DXS8378 and DXS6809 in a North Italian population sample and their use in kinship testing |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20150629 |