RU2012124114A - Секреторные белковые биомаркеры для высокоэффективной экспрессии белка - Google Patents
Секреторные белковые биомаркеры для высокоэффективной экспрессии белка Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012124114A RU2012124114A RU2012124114/10A RU2012124114A RU2012124114A RU 2012124114 A RU2012124114 A RU 2012124114A RU 2012124114/10 A RU2012124114/10 A RU 2012124114/10A RU 2012124114 A RU2012124114 A RU 2012124114A RU 2012124114 A RU2012124114 A RU 2012124114A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- protein
- subunit
- cell
- factor
- biomarker
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract 34
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract 34
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title claims abstract 33
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract 28
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims abstract 28
- 102000040739 Secretory proteins Human genes 0.000 claims abstract 22
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 claims abstract 22
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 20
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims 21
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 claims 8
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 claims 8
- 102100039328 Endoplasmin Human genes 0.000 claims 8
- 108010022937 endoplasmin Proteins 0.000 claims 8
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 claims 6
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 claims 6
- 108700025784 N-myc downstream-regulated gene 1 Proteins 0.000 claims 6
- 102000010292 Peptide Elongation Factor 1 Human genes 0.000 claims 6
- 108010077524 Peptide Elongation Factor 1 Proteins 0.000 claims 6
- 108010030161 Serine-tRNA ligase Proteins 0.000 claims 6
- 102100040597 Serine-tRNA ligase, mitochondrial Human genes 0.000 claims 6
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 claims 6
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 claims 6
- 230000002438 mitochondrial effect Effects 0.000 claims 6
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 6
- 108700020469 14-3-3 Proteins 0.000 claims 5
- 102000004899 14-3-3 Proteins Human genes 0.000 claims 5
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 claims 5
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 claims 5
- 102000002278 Ribosomal Proteins Human genes 0.000 claims 5
- 108010000605 Ribosomal Proteins Proteins 0.000 claims 5
- 102100035071 Vimentin Human genes 0.000 claims 5
- 108010065472 Vimentin Proteins 0.000 claims 5
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 claims 5
- 210000005048 vimentin Anatomy 0.000 claims 5
- 102000003505 Myosin Human genes 0.000 claims 4
- 108060008487 Myosin Proteins 0.000 claims 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims 4
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 claims 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims 4
- YHPKGSLWSUCJQK-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[5-amino-2-[[2-[(2,4-diamino-4-oxobutanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino) Chemical compound NC(N)=NCCCC(C(=O)NC(C(C)C)C(O)=O)NC(=O)C(CC(O)=O)NC(=O)C(CCSC)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(N)CC(N)=O YHPKGSLWSUCJQK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 102100040962 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 Human genes 0.000 claims 3
- 108010027312 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 Proteins 0.000 claims 3
- 102100038222 60 kDa heat shock protein, mitochondrial Human genes 0.000 claims 3
- 101710154868 60 kDa heat shock protein, mitochondrial Proteins 0.000 claims 3
- 102100034613 Annexin A2 Human genes 0.000 claims 3
- 108090000668 Annexin A2 Proteins 0.000 claims 3
- 102000004121 Annexin A5 Human genes 0.000 claims 3
- 108090000672 Annexin A5 Proteins 0.000 claims 3
- 101000834552 Arabidopsis thaliana Alpha-glucosidase 2 Proteins 0.000 claims 3
- 101000914947 Bungarus multicinctus Long neurotoxin homolog TA-bm16 Proteins 0.000 claims 3
- 108700022408 Coatomer Proteins 0.000 claims 3
- 102000057710 Coatomer Human genes 0.000 claims 3
- 102100022086 GRB2-related adapter protein 2 Human genes 0.000 claims 3
- 108010045100 HSP27 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 claims 3
- 102100039165 Heat shock protein beta-1 Human genes 0.000 claims 3
- 102100034000 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F Human genes 0.000 claims 3
- 101710141316 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F Proteins 0.000 claims 3
- 108010084680 Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoprotein K Proteins 0.000 claims 3
- 102000005646 Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoprotein K Human genes 0.000 claims 3
- 102100022374 Homeobox protein DLX-4 Human genes 0.000 claims 3
- 101000900690 Homo sapiens GRB2-related adapter protein 2 Proteins 0.000 claims 3
- 101000901614 Homo sapiens Homeobox protein DLX-4 Proteins 0.000 claims 3
- 101000900711 Mus musculus GRB2-related adaptor protein 2 Proteins 0.000 claims 3
- 102100022678 Nucleophosmin Human genes 0.000 claims 3
- 108010025568 Nucleophosmin Proteins 0.000 claims 3
- 102000006010 Protein Disulfide-Isomerase Human genes 0.000 claims 3
- 102100023542 Ribosome-binding protein 1 Human genes 0.000 claims 3
- 101710132192 Ribosome-binding protein 1 Proteins 0.000 claims 3
- 102100027068 Septin-11 Human genes 0.000 claims 3
- 101710005686 Septin-11 Proteins 0.000 claims 3
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 claims 3
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 claims 3
- 108010058033 alcohol dehydrogenase (NADP+) Proteins 0.000 claims 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims 3
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 3
- 108020003519 protein disulfide isomerase Proteins 0.000 claims 3
- 210000002504 synaptic vesicle Anatomy 0.000 claims 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims 3
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 claims 3
- 238000005303 weighing Methods 0.000 claims 3
- 102100029968 Calreticulin Human genes 0.000 claims 2
- 108090000549 Calreticulin Proteins 0.000 claims 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims 2
- 101710161481 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain Proteins 0.000 claims 2
- 102000034286 G proteins Human genes 0.000 claims 2
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 claims 2
- 101710122170 Glutamate dehydrogenase 1 Proteins 0.000 claims 2
- 102100034009 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial Human genes 0.000 claims 2
- 101000916502 Homo sapiens COP9 signalosome complex subunit 8 Proteins 0.000 claims 2
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 claims 2
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 claims 2
- 101710181812 Methionine aminopeptidase Proteins 0.000 claims 2
- 101100372509 Mus musculus Vat1 gene Proteins 0.000 claims 2
- 102000016349 Myosin Light Chains Human genes 0.000 claims 2
- 108010067385 Myosin Light Chains Proteins 0.000 claims 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims 2
- 108010049395 Prokaryotic Initiation Factor-2 Proteins 0.000 claims 2
- 108010049404 Prokaryotic Initiation Factor-3 Proteins 0.000 claims 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims 2
- 108090000708 Proteasome Endopeptidase Complex Proteins 0.000 claims 2
- 102000004245 Proteasome Endopeptidase Complex Human genes 0.000 claims 2
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 claims 2
- 108050008861 SH3 domains Proteins 0.000 claims 2
- 102000000395 SH3 domains Human genes 0.000 claims 2
- 102000016562 Sorting nexin-6 Human genes 0.000 claims 2
- 108050006109 Sorting nexin-6 Proteins 0.000 claims 2
- 101710098580 Tubulin gamma-1 chain Proteins 0.000 claims 2
- 102100028979 Tubulin gamma-1 chain Human genes 0.000 claims 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 claims 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 claims 2
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 claims 2
- 108010022579 ATP dependent 26S protease Proteins 0.000 claims 1
- 108010070033 COP9 Signalosome Complex Proteins 0.000 claims 1
- 102000005643 COP9 Signalosome Complex Human genes 0.000 claims 1
- 102000005362 Cytoplasmic Dyneins Human genes 0.000 claims 1
- 108010070977 Cytoplasmic Dyneins Proteins 0.000 claims 1
- 102100020903 Ezrin Human genes 0.000 claims 1
- 102000021586 GTPase binding proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108091012400 GTPase binding proteins Proteins 0.000 claims 1
- 102100023174 Methionine aminopeptidase 2 Human genes 0.000 claims 1
- 108090000192 Methionyl aminopeptidases Proteins 0.000 claims 1
- 102000002067 Protein Subunits Human genes 0.000 claims 1
- 108010001267 Protein Subunits Proteins 0.000 claims 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 claims 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 claims 1
- 101710112367 Tubulin alpha-1B chain Proteins 0.000 claims 1
- 101710095791 Tubulin alpha-2 chain Proteins 0.000 claims 1
- 102100025235 Tubulin alpha-3C chain Human genes 0.000 claims 1
- -1 calreti culina Proteins 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 claims 1
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 claims 1
- 239000000928 excitatory amino acid agonist Substances 0.000 claims 1
- 108010055671 ezrin Proteins 0.000 claims 1
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical class O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108700025647 major vault Proteins 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 claims 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 claims 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 claims 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 abstract 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
- G01N33/502—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing non-proliferative effects
- G01N33/5023—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing non-proliferative effects on expression patterns
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56966—Animal cells
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Virology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
1. Способ выявления высокоэффективной клетки или клеточной культуры, включающий:(a) определение уровня экспрессии биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре, и(b) сравнение уровня экспрессии этого биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре с уровнем экспрессии биомаркера в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре,где уровень экспрессии биомаркера более высокий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем высокоэффективной клетки или клеточной культуры, и уровень экспрессии биомаркера более низкий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем низкоэффективной клетки или клеточной культуры.2. Способ по п.1, где биомаркер представляет собой секреторный белок.3. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции эндоплазматического ретикулума.4. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции Гольджи.5. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера повышен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.6. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера понижен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.7. Способ по п.2, где определяют и сравнивают уровень множественных секреторных белковых биомаркеров.8. Способ по п.7, где уровни всех секреторных белковых биомаркеров понижены в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.9. Способ по п.7, где уровни всех секреторных б�
Claims (16)
1. Способ выявления высокоэффективной клетки или клеточной культуры, включающий:
(a) определение уровня экспрессии биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре, и
(b) сравнение уровня экспрессии этого биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре с уровнем экспрессии биомаркера в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре,
где уровень экспрессии биомаркера более высокий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем высокоэффективной клетки или клеточной культуры, и уровень экспрессии биомаркера более низкий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем низкоэффективной клетки или клеточной культуры.
2. Способ по п.1, где биомаркер представляет собой секреторный белок.
3. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции эндоплазматического ретикулума.
4. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции Гольджи.
5. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера повышен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
6. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера понижен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
7. Способ по п.2, где определяют и сравнивают уровень множественных секреторных белковых биомаркеров.
8. Способ по п.7, где уровни всех секреторных белковых биомаркеров понижены в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
9. Способ по п.7, где уровни всех секреторных белковых биомаркеров повышены в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
10. Способ по п.7, где уровень одного или нескольких секреторных белковых биомаркеров повышен, в то время как уровень одного или нескольких секреторных белковых биомаркеров понижен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
11. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер выбран из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид-изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
12. Набор для выявления изменений в экспрессии секреторного белкового биомаркера высокоэффективной экспрессии белка, включающий:
(a) детектируемое антитело, направленное против секреторного белкового биомаркера высокоэффективной экспрессии белка; и
(b) средство для детекции указанного антитела.
13. Набор по п.12, где секреторный белковый биомаркер высокоэффективной экспрессии белка выбран из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
14. Набор по п.13, где набор включает множественные детектируемые антитела, и где каждое антитело специфически связывается с различным секреторным белковым биомаркером, выбранным из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
15. Набор по п.13, где набор содержит образец положительного контроля.
16. Набор по п.13, где набор содержит образец отрицательного контроля.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US25952709P | 2009-11-09 | 2009-11-09 | |
| US61/259,527 | 2009-11-09 | ||
| US12/941,347 US8524458B2 (en) | 2009-11-09 | 2010-11-08 | Secretory protein biomarkers for high efficiency protein expression |
| US12/941,347 | 2010-11-08 | ||
| PCT/US2010/055953 WO2011057239A2 (en) | 2009-11-09 | 2010-11-09 | Secretory protein biomarkers for high efficiency protein expression |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012124114A true RU2012124114A (ru) | 2013-12-20 |
Family
ID=43431809
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012124114/10A RU2012124114A (ru) | 2009-11-09 | 2010-11-09 | Секреторные белковые биомаркеры для высокоэффективной экспрессии белка |
Country Status (14)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US8524458B2 (ru) |
| EP (1) | EP2499254A2 (ru) |
| JP (1) | JP2013510324A (ru) |
| KR (1) | KR20120115494A (ru) |
| CN (1) | CN102666873A (ru) |
| AU (1) | AU2010314922A1 (ru) |
| BR (1) | BR112012010976A2 (ru) |
| CA (1) | CA2778254A1 (ru) |
| IL (1) | IL219518A0 (ru) |
| IN (1) | IN2012DN03358A (ru) |
| MX (1) | MX2012005380A (ru) |
| RU (1) | RU2012124114A (ru) |
| WO (1) | WO2011057239A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA201202966B (ru) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP6507542B2 (ja) * | 2014-09-22 | 2019-05-08 | 東洋紡株式会社 | バイオマーカーを用いた組換えタンパク質生産量の予測方法 |
| EP3255054A1 (en) | 2016-06-06 | 2017-12-13 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Method for the purification of biological macromolecular complexes |
| CN108467890A (zh) * | 2018-05-02 | 2018-08-31 | 首都医科大学附属北京天坛医院 | Vat1基因及vat1基因的干扰物的应用和应用vat1基因的产品 |
| CN109470756B (zh) * | 2018-10-11 | 2020-08-25 | 昆明理工大学 | 测定14-3-3蛋白与质膜H+-ATPase蛋白互作的电化学方法 |
Family Cites Families (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| USRE30985E (en) | 1978-01-01 | 1982-06-29 | Serum-free cell culture media | |
| US4560655A (en) | 1982-12-16 | 1985-12-24 | Immunex Corporation | Serum-free cell culture medium and process for making same |
| US4657866A (en) | 1982-12-21 | 1987-04-14 | Sudhir Kumar | Serum-free, synthetic, completely chemically defined tissue culture media |
| US4767704A (en) | 1983-10-07 | 1988-08-30 | Columbia University In The City Of New York | Protein-free culture medium |
| GB8516415D0 (en) | 1985-06-28 | 1985-07-31 | Celltech Ltd | Culture of animal cells |
| US4927762A (en) | 1986-04-01 | 1990-05-22 | Cell Enterprises, Inc. | Cell culture medium with antioxidant |
| US5302517A (en) * | 1987-06-16 | 1994-04-12 | The Board Of Regents Of The University Of Nebraska | Method of controlling the expression of a gene in a cell culture, cell culture vector used in the method and method of making the vector |
| ATE135397T1 (de) | 1988-09-23 | 1996-03-15 | Cetus Oncology Corp | Zellenzuchtmedium für erhöhtes zellenwachstum, zur erhöhung der langlebigkeit und expression der produkte |
| US5122469A (en) | 1990-10-03 | 1992-06-16 | Genentech, Inc. | Method for culturing Chinese hamster ovary cells to improve production of recombinant proteins |
| US20050272055A1 (en) * | 2000-02-01 | 2005-12-08 | Rina Das | Method of treating lethal shock induced by toxic agents and diagnosing exposure to toxic agents by measuring distinct pattern in the levels of expression of specific genes |
| AU2007314524A1 (en) * | 2006-04-21 | 2008-05-08 | Dublin City University | Differential expression profiling analysis of cell culture phenotypes and the uses thereof |
| US8242057B2 (en) * | 2006-06-26 | 2012-08-14 | Cleveland Biolabs, Inc. | Methods for identifying modulators of apoptosis |
| CA2726563A1 (en) * | 2008-06-04 | 2009-12-10 | Proteosys Ag | Protein biomarkers for in vitro testing of developmental toxicity and embryotoxicity of chemical substances |
-
2010
- 2010-11-08 US US12/941,347 patent/US8524458B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2010-11-09 KR KR1020127014730A patent/KR20120115494A/ko not_active Application Discontinuation
- 2010-11-09 CN CN2010800503369A patent/CN102666873A/zh active Pending
- 2010-11-09 CA CA2778254A patent/CA2778254A1/en not_active Abandoned
- 2010-11-09 IN IN3358DEN2012 patent/IN2012DN03358A/en unknown
- 2010-11-09 EP EP10778803A patent/EP2499254A2/en not_active Withdrawn
- 2010-11-09 BR BR112012010976A patent/BR112012010976A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2010-11-09 AU AU2010314922A patent/AU2010314922A1/en not_active Abandoned
- 2010-11-09 JP JP2012538076A patent/JP2013510324A/ja active Pending
- 2010-11-09 MX MX2012005380A patent/MX2012005380A/es not_active Application Discontinuation
- 2010-11-09 WO PCT/US2010/055953 patent/WO2011057239A2/en active Application Filing
- 2010-11-09 RU RU2012124114/10A patent/RU2012124114A/ru not_active Application Discontinuation
-
2012
- 2012-04-23 ZA ZA2012/02966A patent/ZA201202966B/en unknown
- 2012-05-01 IL IL219518A patent/IL219518A0/en unknown
-
2013
- 2013-08-30 US US14/016,035 patent/US20140004531A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US8524458B2 (en) | 2013-09-03 |
| WO2011057239A2 (en) | 2011-05-12 |
| EP2499254A2 (en) | 2012-09-19 |
| IL219518A0 (en) | 2012-06-28 |
| MX2012005380A (es) | 2012-05-29 |
| WO2011057239A3 (en) | 2011-06-30 |
| IN2012DN03358A (ru) | 2015-10-23 |
| AU2010314922A1 (en) | 2012-05-31 |
| CN102666873A (zh) | 2012-09-12 |
| KR20120115494A (ko) | 2012-10-18 |
| ZA201202966B (en) | 2012-12-27 |
| US20140004531A1 (en) | 2014-01-02 |
| BR112012010976A2 (pt) | 2016-08-16 |
| US20110236906A1 (en) | 2011-09-29 |
| JP2013510324A (ja) | 2013-03-21 |
| CA2778254A1 (en) | 2011-05-12 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Celegato et al. | Parallel protein and transcript profiles of FSHD patient muscles correlate to the D4Z4 arrangement and reveal a common impairment of slow to fast fibre differentiation and a general deregulation of MyoD‐dependent genes | |
| Wu et al. | Identification of collapsin response mediator protein‐2 as a potential marker of colorectal carcinoma by comparative analysis of cancer cell secretomes | |
| RU2012124114A (ru) | Секреторные белковые биомаркеры для высокоэффективной экспрессии белка | |
| Aiello et al. | Targeted proteomic approach in prostatic tissue: a panel of potential biomarkers for cancer detection | |
| EP2635707B1 (en) | Method of examining polycystic kidney disease and method of screening for therapeutic agent of the disease | |
| WO2008117067A8 (en) | Protein signature/markers for the detection of adenocarcinoma | |
| MX2008009592A (es) | Metodos y composiciones para identificar pacientes con una probabilidad incrementada de tener cancer de ovario. | |
| Naryzhny et al. | Development of barcode and proteome profiling of glioblastoma | |
| BR112012011230A2 (pt) | fatores de risco e previsão de infarto do miocárdio | |
| Calderón-González et al. | Determination of the protein expression profiles of breast cancer cell lines by quantitative proteomics using iTRAQ labelling and tandem mass spectrometry | |
| RU2009108662A (ru) | Способ выявления остеогенных средств и способ стимуляции остеогенеза (варианты) | |
| Caragata et al. | Enrichment and identification of glycoproteins in human saliva using lectin magnetic bead arrays | |
| Li et al. | Application of nanoLC–MS/MS to the shotgun proteomic analysis of the nematocyst proteins from jellyfish Stomolophus meleagris | |
| WO2017050939A3 (en) | Method and array for diagnosing pancreatic cancer in an individual | |
| Tassin et al. | FSHD myotubes with different phenotypes exhibit distinct proteomes | |
| EP3164715A2 (en) | Early prediction markers of diabetic nephropathy | |
| Thome‐Kromer et al. | Toward the identification of liver toxicity markers: a proteome study in human cell culture and rats | |
| Rolland et al. | Two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis analysis of spermatogenesis in the rat | |
| Filipović et al. | Social isolation stress-resilient rats reveal energy shift from glycolysis to oxidative phosphorylation in hippocampal nonsynaptic mitochondria | |
| CN107870245A (zh) | 基于唾液蛋白质组学的慢性肾炎生物标志物检测的方法 | |
| Bührens et al. | Protein expression in human non-small cell lung cancer: a systematic database | |
| Mori et al. | Determination of differential gene expression profiles in superficial and deeper zones of mature rat articular cartilage using RNA sequencing of laser microdissected tissue specimens | |
| Johnson et al. | Proteome analysis of DNA damage-induced neuronal death using high throughput mass spectrometry | |
| Valkova et al. | Constitutive and inducible stress proteins dominate the proteome of the murine inner medullary collecting duct-3 (mIMCD3) cell line | |
| Wen et al. | Comparative proteomic analysis of the esophageal squamous carcinoma cell line EC109 and its multi-drug resistant subline EC109/CDDP |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20150216 |