RU2012115468A - Клонирование и использование функционального r-гена из solanum chacoense - Google Patents
Клонирование и использование функционального r-гена из solanum chacoense Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012115468A RU2012115468A RU2012115468/10A RU2012115468A RU2012115468A RU 2012115468 A RU2012115468 A RU 2012115468A RU 2012115468/10 A RU2012115468/10 A RU 2012115468/10A RU 2012115468 A RU2012115468 A RU 2012115468A RU 2012115468 A RU2012115468 A RU 2012115468A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- plant
- nucleotide sequence
- amino acid
- tetraploid
- cell
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
- C12N15/8282—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for fungal resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
- A01H1/00—Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
- A01H1/12—Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield
- A01H1/122—Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- A01H1/1245—Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, e.g. pathogen, pest or disease resistance
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Botany (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Mycology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1 Способ придания, по меньшей мере, частичной устойчивости или повышения устойчивости растения против заражения оомицетом, включающий предоставление растению или его части нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность Rpi-che1 с фигуры 4, или ее функциональный фрагмент или функциональный гомолог, предпочтительно, при этом указанное растение представляет собой растение из семейства Solanaceae, предпочтительнее, Solanum tuberosum.2. Способ по п.1, при этом указанный оомицет включает Phytophtora, предпочтительно, Phytophtora infestans.3 Способ по п.1, при этом функциональный гомолог выбирают из группы аминокислотных последовательностей, состоящей из 493-7_G12, 543-5_C2, 849-1_M8_M18_M20, 487-1_I4_I6_I8, 94-2031_L4_L7_18, 561-2_К4_К14_К22, 324-2_J1_J3_J8, 852-5_Е14_Е23, 852-5_Е28, 493-9_H5_H30, 493-7_G14_G22, 561-2_К6_К30_К31 и 493-7_G21.4. Способ по п. 1-3, при этом нуклеотидная последовательность, определенная в п.1 включает нуклеотидную последовательность, отображенную на фигуре 7, или нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотные последовательности 493-7_G12, 543-5_C2, 849-1_M8_M18_M20, 487-1_I4_I6_I8, 94-2031_L4_L7_18, 561-2_K4_K14_K22, 324-2_J1_J3_J8, 852-5_E14_E23, 852-5_E28, 493-9_H5_H30, 493-7_G14_G22, 561-2_K6_K30_K31 и 493-7_G21, отображенные на фиг.13.5. Способ выведения тетраплоидного растения, устойчивого к оомицету, предпочтительно Phytophtora, включающийa) повышение уровня плоидности гамет диплоидного растения, которое уже содержит нуклеотидную последовательность, определенную в любом из пп.1-4:b) использование указанных гамет в скрещивании с гаметами тетраплоидного растения; иc) отбор потомства указанного скрещивания по наличию указанной нуклеотидной последовательности.6. Способ по п.5, при этом диплоидное растение на стадии a) представляет собой растение из рода S.c
Claims (21)
1 Способ придания, по меньшей мере, частичной устойчивости или повышения устойчивости растения против заражения оомицетом, включающий предоставление растению или его части нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность Rpi-che1 с фигуры 4, или ее функциональный фрагмент или функциональный гомолог, предпочтительно, при этом указанное растение представляет собой растение из семейства Solanaceae, предпочтительнее, Solanum tuberosum.
2. Способ по п.1, при этом указанный оомицет включает Phytophtora, предпочтительно, Phytophtora infestans.
3 Способ по п.1, при этом функциональный гомолог выбирают из группы аминокислотных последовательностей, состоящей из 493-7_G12, 543-5_C2, 849-1_M8_M18_M20, 487-1_I4_I6_I8, 94-2031_L4_L7_18, 561-2_К4_К14_К22, 324-2_J1_J3_J8, 852-5_Е14_Е23, 852-5_Е28, 493-9_H5_H30, 493-7_G14_G22, 561-2_К6_К30_К31 и 493-7_G21.
4. Способ по п. 1-3, при этом нуклеотидная последовательность, определенная в п.1 включает нуклеотидную последовательность, отображенную на фигуре 7, или нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотные последовательности 493-7_G12, 543-5_C2, 849-1_M8_M18_M20, 487-1_I4_I6_I8, 94-2031_L4_L7_18, 561-2_K4_K14_K22, 324-2_J1_J3_J8, 852-5_E14_E23, 852-5_E28, 493-9_H5_H30, 493-7_G14_G22, 561-2_K6_K30_K31 и 493-7_G21, отображенные на фиг.13.
5. Способ выведения тетраплоидного растения, устойчивого к оомицету, предпочтительно Phytophtora, включающий
a) повышение уровня плоидности гамет диплоидного растения, которое уже содержит нуклеотидную последовательность, определенную в любом из пп.1-4:
b) использование указанных гамет в скрещивании с гаметами тетраплоидного растения; и
c) отбор потомства указанного скрещивания по наличию указанной нуклеотидной последовательности.
6. Способ по п.5, при этом диплоидное растение на стадии a) представляет собой растение из рода S.chacoense, S.berthaultii, S.sucrense или S.tarijense.
7. Способ селекции растения или растительного материала или его потомства по его подверженности или устойчивости к заражению оомицетом, при этом указанный способ включает стадии испытания, по меньшей мере, части указанного растения или растительного материала или его потомства на присутствие или отсутствие нуклеиновой кислоты, определенной в любом из пп.1-4.
8. Способ по п.7, при этом указанное испытание включает обнаружение наличия одного или нескольких маркеров из таблицы 2 и выполняется с праймером или зондом, которые специфически связываются с указанной нуклеиновой кислотой.
9. Маркер для маркер опосредованной селекции при селекции растения для получения устойчивости против оомицетов, при этом указанный маркер выбирают из маркеров, представленных в таблице 2.
10. Изолированная или рекомбинантная нуклеотидная последовательность, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность Rpi-che1 с фигуры 4, или ее функциональный фрагмент, или нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность из 493-7_G12, 543-5_С2, 849-1_М8_М18_М20, 487-1_I4_I6_I8, 94-2031_L4_L7_18, 561-2_K4_K14_K22, 324-2_J1_J3_J8, 852-5_E14_E23, 852-5_E28, 493-9_H5_H30, 493-7_G14_G22,561-2_K6_K30_K31 и 493-7_G21 или ее функциональный фрагмент.
11. Изолированная или рекомбинантная нуклеотидная последовательность по п.10, при этом указанный фрагмент включает, по меньшей мере, домен LRR аминокислотной последовательности.
12. Изолированная или рекомбинантная нуклеотидная последовательность по п.10, включающая нуклеотидную последовательность, отображенную на фигуре 7 или на фигуре 13.
13. Трансгенная или тетраплоидная клетка, включающая нуклеотидную последовательность по любому из пп.10, 11 или 12.
14. Вектор, включающий нуклеотидную последовательность по любому из пп.10-12.
15. Вектор по п.14, также включающий промотор и/или терминатор, с которым ген естественно ассоциируется, предпочтительнее, укороченный промотор, имеющий менее 1000 нуклеотидов вверх от последовательности гена.
16. Трансгенная или тетраплоидная клетка-хозяин, включающая нуклеотидную последовательность по любому из пп.10-12 или вектор по п.14 или 15, предпочтительно клетка Agrobacterium или растительная клетка.
17. Трансгенная или тетраплоидная растительная клетка, включающая нуклеотидную последовательность по любому из пп.10-12 или вектор по п.14 или 15, предпочтительно, при этом указанная растительная клетка представляет собой клетку из Solanaceae, предпочтительнее, Solanum tuberosum, предпочтительнее, тетраплоидного Solanum tuberosum.
18. Трансгенное или тетраплоидное растение, включающее клетку по п.17.
19. Часть, происходящая от растения по п.18, предпочтительно, при этом указанная часть представляет собой клубень.
20. Белок, кодированный изолированной или рекомбинантной нуклеотидной последовательностью по любому из пп.10-12, или его функциональный фрагмент, предпочтительно, при этом указанный белок имеет аминокислотную последовательность Rpi-chc1, отображенную на фигуре 4.
21. Антитело, которое (специфически) связывается с белком по п.20.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP09170769.5 | 2009-09-18 | ||
| EP09170769 | 2009-09-18 | ||
| PCT/NL2010/050612 WO2011034433A1 (en) | 2009-09-18 | 2010-09-20 | Cloning and exploitation of a functional r-gene from solanum chacoense |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012115468A true RU2012115468A (ru) | 2013-10-27 |
| RU2586509C2 RU2586509C2 (ru) | 2016-06-10 |
Family
ID=41395074
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012115468/10A RU2586509C2 (ru) | 2009-09-18 | 2010-09-20 | Клонирование и использование функционального r-гена из solanum chacoense |
Country Status (8)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US9551007B2 (ru) |
| EP (1) | EP2478006A1 (ru) |
| CN (1) | CN102666572B (ru) |
| CA (1) | CA2774456C (ru) |
| RU (1) | RU2586509C2 (ru) |
| UA (1) | UA110021C2 (ru) |
| WO (1) | WO2011034433A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201202663B (ru) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2985458A1 (en) | 2015-05-09 | 2016-11-17 | Two Blades Foundation | Late blight resistance gene from solanum americanum and methods of use |
| WO2017034971A1 (en) * | 2015-08-21 | 2017-03-02 | Monsanto Technology Llc | Enhanced recombination of genomic loci |
| CA3047121A1 (en) | 2016-12-16 | 2018-06-21 | Two Blades Foundation | Late blight resistance genes and methods of use |
| CN114071993B (zh) | 2019-05-07 | 2023-12-22 | 艾格文册尔有限公司 | 栽培马铃薯的自交亲和性 |
Family Cites Families (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPH0714349B2 (ja) | 1983-01-17 | 1995-02-22 | モンサント カンパニ− | 植物細胞での発現に適したキメラ遺伝子 |
| CA1340766C (en) | 1984-12-24 | 1999-09-28 | Clive Waldron | Selectable marker for development of vectors and transformation systems in plants |
| ATE85360T1 (de) | 1985-08-07 | 1993-02-15 | Monsanto Co | Glyphosat resistente pflanzen. |
| CN87100603A (zh) | 1987-01-21 | 1988-08-10 | 昂科公司 | 抗黑素瘤疫苗 |
| US5302523A (en) | 1989-06-21 | 1994-04-12 | Zeneca Limited | Transformation of plant cells |
| US5550318A (en) | 1990-04-17 | 1996-08-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
| US5484956A (en) | 1990-01-22 | 1996-01-16 | Dekalb Genetics Corporation | Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin |
| US5384253A (en) | 1990-12-28 | 1995-01-24 | Dekalb Genetics Corporation | Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes |
| EP1279737A1 (en) | 2001-07-27 | 2003-01-29 | Coöperatieve Verkoop- en Productievereniging, van Aardappelmeel en Derivaten AVEBE B.A. | Transformation method for obtaining marker-free plants |
| EP1288301A1 (en) * | 2001-08-31 | 2003-03-05 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Berlin | Plant-derived resistance gene |
| EP1334979A1 (en) * | 2002-02-08 | 2003-08-13 | Kweek-en Researchbedrijf Agrico B.V. | Gene conferring resistance to Phytophthera infestans (late-blight) in Solanaceae |
| CN1289689C (zh) * | 2005-01-31 | 2006-12-13 | 重庆工学院 | 生物防治马铃薯晚疫病的内生细菌菌株的选择方法 |
| CN101679492A (zh) | 2007-01-26 | 2010-03-24 | 瓦赫宁根大学 | 来自球栗薯的功能性r基因 |
| GB0714241D0 (en) * | 2007-07-20 | 2007-08-29 | Univ Wageningen | Light blight resistances genes and methods |
| CN101250573B (zh) * | 2008-04-11 | 2011-07-20 | 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 | 诱导马铃薯晚疫病菌产生致病性分泌蛋白的方法 |
-
2010
- 2010-09-20 CN CN201080052138.6A patent/CN102666572B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2010-09-20 RU RU2012115468/10A patent/RU2586509C2/ru active
- 2010-09-20 WO PCT/NL2010/050612 patent/WO2011034433A1/en active Application Filing
- 2010-09-20 UA UAA201204883A patent/UA110021C2/ru unknown
- 2010-09-20 CA CA2774456A patent/CA2774456C/en active Active
- 2010-09-20 EP EP10760791A patent/EP2478006A1/en active Pending
- 2010-09-20 US US13/496,845 patent/US9551007B2/en active Active
-
2012
- 2012-04-12 ZA ZA2012/02663A patent/ZA201202663B/en unknown
-
2016
- 2016-10-14 US US15/294,220 patent/US10450581B2/en active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| UA110021C2 (uk) | 2015-11-10 |
| US20120240284A1 (en) | 2012-09-20 |
| US20170145437A1 (en) | 2017-05-25 |
| CN102666572A (zh) | 2012-09-12 |
| CA2774456C (en) | 2020-09-01 |
| CA2774456A1 (en) | 2011-03-24 |
| CN102666572B (zh) | 2016-08-10 |
| RU2586509C2 (ru) | 2016-06-10 |
| EP2478006A1 (en) | 2012-07-25 |
| US10450581B2 (en) | 2019-10-22 |
| WO2011034433A1 (en) | 2011-03-24 |
| US9551007B2 (en) | 2017-01-24 |
| ZA201202663B (en) | 2012-12-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Hayashi et al. | Durable panicle blast‐resistance gene Pb1 encodes an atypical CC‐NBS‐LRR protein and was generated by acquiring a promoter through local genome duplication | |
| Okuyama et al. | A multifaceted genomics approach allows the isolation of the rice Pia‐blast resistance gene consisting of two adjacent NBS‐LRR protein genes | |
| Reyes et al. | Resistance to Citrus psorosis virus in transgenic sweet orange plants is triggered by coat protein–RNA silencing | |
| Matoušek et al. | Accumulation of viroid-specific small RNAs and increase in nucleolytic activities linked to viroid-caused pathogenesis | |
| Fuentes et al. | Field trial and molecular characterization of RNAi-transgenic tomato plants that exhibit resistance to tomato yellow leaf curl geminivirus | |
| Song et al. | Broad taxonomic characterization of Verticillium wilt resistance genes reveals an ancient origin of the tomato Ve1 immune receptor | |
| Remigereau et al. | Cereal domestication and evolution of branching: evidence for soft selection in the Tb1 orthologue of pearl millet (Pennisetum glaucum [L.] R. Br.) | |
| Chen et al. | Durable field resistance to wheat yellow mosaic virus in transgenic wheat containing the antisense virus polymerase gene | |
| ES2702562T3 (es) | Genes que proporcionan resistencia al oídio en Cucumis melo | |
| RU2012115468A (ru) | Клонирование и использование функционального r-гена из solanum chacoense | |
| Spanò et al. | Grafting on a non-transgenic tolerant tomato variety confers resistance to the infection of a Sw5-breaking strain of tomato spotted wilt virus via RNA silencing | |
| Elbeshehy et al. | Antiviral activity of Thuja orientalis extracts against watermelon mosaic virus (WMV) on Citrullus lanatus | |
| Matoušek et al. | Propagation and some physiological effects of Citrus bark cracking viroid and Apple fruit crinkle viroid in multiple infected hop (Humulus lupulus L.) | |
| Bhardwaj et al. | Efficiency and reliability of marker assisted selection for resistance to major biotic stresses in potato | |
| Raji et al. | Multiple fungal diseases resistance induction in Cucumis melo through co-transformation of different pathogenesis related (PR) protein genes | |
| Ullah et al. | An analysis of the resistance of Gossypium arboreum to cotton leaf curl disease by grafting | |
| Xiao et al. | Pijx confers broad-spectrum seedling and panicle blast resistance by promoting the degradation of ATP β subunit and OsRbohC-mediated ROS burst in rice | |
| CA2872128C (en) | Dirigent gene eg261 and its orthologs and paralogs and their uses for pathogen resistance in plants | |
| CA2997847A1 (en) | Copy number variant leading to virus resistance | |
| Nie et al. | Recognition and molecular discrimination of severe and mild PVYO variants of Potato virus Y in potato in New Brunswick, Canada | |
| CN109134633A (zh) | 抗稻瘟病蛋白和基因、分离的核酸及其应用 | |
| Ghanbari et al. | Differential expression of MYB33 and AP2 genes and response of TY resistant plants to beet curly top Iran virus infection in tomato | |
| Cernák et al. | Development of a locus-specific marker and localization of the Rysto gene based on linkage to a catalase gene on chromosome XII in the tetraploid potato genome | |
| Moreira et al. | In planta RNAi targeting Meloidogyne incognita Minc16803 gene perturbs nematode parasitism and reduces plant susceptibility | |
| ES2698002T3 (es) | Genes que proporcionan resistencia al mildiú pulverulento en Cucumis Sativus |