RU2012103277A - Метод видовой и штаммовой индентификации лактобацилл, основанный на использовании проксимального межгенного участка днк оперона f1f0 атф-синтазы - Google Patents
Метод видовой и штаммовой индентификации лактобацилл, основанный на использовании проксимального межгенного участка днк оперона f1f0 атф-синтазы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012103277A RU2012103277A RU2012103277/10A RU2012103277A RU2012103277A RU 2012103277 A RU2012103277 A RU 2012103277A RU 2012103277/10 A RU2012103277/10 A RU 2012103277/10A RU 2012103277 A RU2012103277 A RU 2012103277A RU 2012103277 A RU2012103277 A RU 2012103277A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- species
- operon
- fermentum
- casei
- plantarum
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 7
- 241000894007 species Species 0.000 title claims abstract 7
- 108091029795 Intergenic region Proteins 0.000 title claims abstract 5
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 title claims abstract 3
- 230000002407 ATP formation Effects 0.000 title 1
- 241000218588 Lactobacillus rhamnosus Species 0.000 claims abstract 8
- 241000186840 Lactobacillus fermentum Species 0.000 claims abstract 6
- 240000006024 Lactobacillus plantarum Species 0.000 claims abstract 6
- 108010004078 F1F0-ATP synthase Proteins 0.000 claims abstract 5
- 244000199866 Lactobacillus casei Species 0.000 claims abstract 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 4
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 claims abstract 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims abstract 2
- 101150026213 atpB gene Proteins 0.000 claims abstract 2
- 101150035600 atpD gene Proteins 0.000 claims abstract 2
- 101150038923 atpF gene Proteins 0.000 claims abstract 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims abstract 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims abstract 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims abstract 2
- 108091000036 uracil phosphoribosyltransferase Proteins 0.000 claims abstract 2
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ видовой и штаммовой идентификации лактобацилл, отличающийся тем, что он основан на использовании нового генетического маркера - межгенного района, предшествующего оперону F1F0 АТФ синтазы.2. Способ видовой идентификации L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus по п.1, отличающийся тем, что он основан на реакции ПЦР с видоспецифичными праймерами по гену субъединицы А оперона F1F0 АТФ синтазы (atpB) и предшествующего ему гена (урацилфосфорибозилтрансферазы у L.casei и L.rhamnosus; урацил транспортного белка у L.plantarum и L.fermentum).3. Способ штаммовой идентификации L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus no п.1, отличающийся тем, что он основан на определении нуклеотидной последовательности межгенного района, предшествующего оперону F1F0 АТФ синтазы.
Claims (3)
1. Способ видовой и штаммовой идентификации лактобацилл, отличающийся тем, что он основан на использовании нового генетического маркера - межгенного района, предшествующего оперону F1F0 АТФ синтазы.
2. Способ видовой идентификации L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus по п.1, отличающийся тем, что он основан на реакции ПЦР с видоспецифичными праймерами по гену субъединицы А оперона F1F0 АТФ синтазы (atpB) и предшествующего ему гена (урацилфосфорибозилтрансферазы у L.casei и L.rhamnosus; урацил транспортного белка у L.plantarum и L.fermentum).
3. Способ штаммовой идентификации L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus no п.1, отличающийся тем, что он основан на определении нуклеотидной последовательности межгенного района, предшествующего оперону F1F0 АТФ синтазы.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012103277/10A RU2508406C2 (ru) | 2012-02-01 | 2012-02-01 | СПОСОБ ВИДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum И L.rhamnosus |
| PCT/RU2013/000028 WO2013115682A2 (ru) | 2012-02-01 | 2013-01-15 | Метод видовой и штаммовой идентификации лактобацилл, основанный на использовании проксимального межгенного участка днк оперона f1f0 атф-синтазы |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012103277/10A RU2508406C2 (ru) | 2012-02-01 | 2012-02-01 | СПОСОБ ВИДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum И L.rhamnosus |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012103277A true RU2012103277A (ru) | 2013-08-20 |
| RU2508406C2 RU2508406C2 (ru) | 2014-02-27 |
Family
ID=48905996
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012103277/10A RU2508406C2 (ru) | 2012-02-01 | 2012-02-01 | СПОСОБ ВИДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum И L.rhamnosus |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2508406C2 (ru) |
| WO (1) | WO2013115682A2 (ru) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN112029884A (zh) * | 2020-09-29 | 2020-12-04 | 广东省微生物研究所（广东省微生物分析检测中心） | 用于鉴定干酪乳杆菌类群的分子标记、检测引物和检测方法 |
| CN112813135A (zh) * | 2021-04-07 | 2021-05-18 | 河北一然生物科技有限公司 | 一种植物乳杆菌中混入干酪类菌株的检测方法 |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB201505364D0 (en) * | 2015-03-27 | 2015-05-13 | Genetic Analysis As | Method for determining gastrointestinal tract dysbiosis |
| CN106520518A (zh) * | 2016-10-14 | 2017-03-22 | 中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 一种物种检疫鉴定中心的运行模式 |
| WO2024231722A1 (en) | 2023-05-11 | 2024-11-14 | Nikolaev Fedor | Method of producing an autoprobiotic formulation and use thereof |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2388461C (en) * | 1999-09-28 | 2013-06-11 | Infectio Diagnostic (I.D.I.) Inc. | Highly conserved genes and their use to generate probes and primers for the detection of microorganisms |
-
2012
- 2012-02-01 RU RU2012103277/10A patent/RU2508406C2/ru not_active IP Right Cessation
-
2013
- 2013-01-15 WO PCT/RU2013/000028 patent/WO2013115682A2/ru not_active Ceased
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN112029884A (zh) * | 2020-09-29 | 2020-12-04 | 广东省微生物研究所（广东省微生物分析检测中心） | 用于鉴定干酪乳杆菌类群的分子标记、检测引物和检测方法 |
| CN112029884B (zh) * | 2020-09-29 | 2022-05-10 | 广东省微生物研究所（广东省微生物分析检测中心） | 用于鉴定干酪乳杆菌类群的分子标记、检测引物和检测方法 |
| CN112813135A (zh) * | 2021-04-07 | 2021-05-18 | 河北一然生物科技有限公司 | 一种植物乳杆菌中混入干酪类菌株的检测方法 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2013115682A3 (ru) | 2013-12-27 |
| WO2013115682A2 (ru) | 2013-08-08 |
| RU2508406C2 (ru) | 2014-02-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2012103277A (ru) | Метод видовой и штаммовой индентификации лактобацилл, основанный на использовании проксимального межгенного участка днк оперона f1f0 атф-синтазы | |
| JP2015501644A5 (ru) | ||
| WO2015081229A3 (en) | Selective amplification of nucleic acid sequences | |
| RU2017128034A (ru) | Новый промотор и пути его применения | |
| MX2015006220A (es) | Insercion de adn de tranferencia mediada por efectores tipo activadores de la transcripción (tal). | |
| BR112016029907A2 (pt) | enriquecimento geneticamente adaptado e reação em cadeia da polimerase para a rápida detecção de microrganismos". | |
| CN102757960B (zh) | 一种扩增未知序列的半随机pcr技术及其引物和试剂盒 | |
| MX2017000391A (es) | Tecnologia de amplificacion de adn. | |
| RU2010154822A (ru) | Способ получения пробиотического продукта, содержащего аутоштаммы лактобактерий | |
| WO2014102761A8 (es) | Cebadores para detección y tipificación de cepas bacterianas productoras de carbapenemasas, kit y método de detección | |
| WO2012151599A3 (de) | Lamp-verfahren zum nachweisen von erwinia amylovora | |
| RU2011152586A (ru) | ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН RelBE И MazEF ДЛЯ ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ | |
| IN2012DN00172A (ru) | ||
| Dong et al. | Draft genome sequence of cyanobacteria Arthrospira sp. TJSD091 isolated from seaside wetland | |
| MY184600A (en) | Real-time viral detection method and kit for infectious hypodermal and haematopoietic necrosis virus | |
| CN103074336B (zh) | 虾虎鱼类线粒体nd1基因全序列扩增引物及其设计和扩增方法 | |
| UA85804U (ru) | Способ экспресс-диагностики сальмонеллеза и генотипирования salmonella enterica enteritidis и salmonella enterica typhimurium с помощью мультиплексной пцр | |
| AR088313A1 (es) | Secuencias de nucleotidos, su mezcla de reaccion, metodo y kit | |
| Kiran et al. | Differentiation of Pediococcus acidilactici and Pediococcus pentosaceus strains by multiplex-PCR method | |
| WO2012177739A3 (en) | Reagents and methods for detecting hcv | |
| Li-mei et al. | PCR Efficiency of Short Repetitive Sequences (BmKb1) n in Tandem Expression Vector and Optimization of Its PCR Conditions | |
| RU2012105584A (ru) | Создание интегративной генетической конструкции для экспрессии гена релизинг фактора гормона роста в бактериях | |
| IN2014CH05786A (ru) | ||
| Finger et al. | Influence of codon usage on heterologous protein production in Bacillus megaterium | |
| Kiran et al. | Typing of the human and food origined Pediococcus strains by RAPD PCR |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20210202 |