RU2011152586A - ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН RelBE И MazEF ДЛЯ ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ - Google Patents

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН RelBE И MazEF ДЛЯ ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ Download PDF

Info

Publication number
RU2011152586A
RU2011152586A RU2011152586/10A RU2011152586A RU2011152586A RU 2011152586 A RU2011152586 A RU 2011152586A RU 2011152586/10 A RU2011152586/10 A RU 2011152586/10A RU 2011152586 A RU2011152586 A RU 2011152586A RU 2011152586 A RU2011152586 A RU 2011152586A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
species
oligonucleotides
pairs
relbe
mazef
Prior art date
Application number
RU2011152586/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2526576C2 (ru
Inventor
Мария Георгиевна Алексеева
Валерий Николаевич Даниленко
Ксения Михайловна Климина
Original Assignee
Автономная Некоммерческая Организация "Научно-Исследовательский Центр Биотехнологии Антибиотиков И Других Биологически Активных Веществ "Биоан"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Автономная Некоммерческая Организация "Научно-Исследовательский Центр Биотехнологии Антибиотиков И Других Биологически Активных Веществ "Биоан" filed Critical Автономная Некоммерческая Организация "Научно-Исследовательский Центр Биотехнологии Антибиотиков И Других Биологически Активных Веществ "Биоан"
Priority to RU2011152586/10A priority Critical patent/RU2526576C2/ru
Priority to PCT/RU2012/001048 priority patent/WO2013100810A2/ru
Publication of RU2011152586A publication Critical patent/RU2011152586A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2526576C2 publication Critical patent/RU2526576C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

1. Метод идентификации отличается от известных тем, что основан на комбинации и полиморфизме генов систем токсин-антитоксин семейств MazEF и RelBE у лактобацилл.2. Метод по п.1, отличающийся тем, что включает набор пар олигонуклеотидов для идентификации филогенетических групп и отдельных видов лактобацилл и набор пар олигонуклеотидов для идентификации штаммов вида Lactobacillus ramnosus.3. Метод по п.1, отличающийся тем, что проводят амплификацию с геномной ДНК с использованием предлагаемого набора пар олигонуклеотидов, что позволяет точно и быстро проводить видовую и штаммовую идентификацию.

Claims (3)

1. Метод идентификации отличается от известных тем, что основан на комбинации и полиморфизме генов систем токсин-антитоксин семейств MazEF и RelBE у лактобацилл.
2. Метод по п.1, отличающийся тем, что включает набор пар олигонуклеотидов для идентификации филогенетических групп и отдельных видов лактобацилл и набор пар олигонуклеотидов для идентификации штаммов вида Lactobacillus ramnosus.
3. Метод по п.1, отличающийся тем, что проводят амплификацию с геномной ДНК с использованием предлагаемого набора пар олигонуклеотидов, что позволяет точно и быстро проводить видовую и штаммовую идентификацию.
RU2011152586/10A 2011-12-23 2011-12-23 Способ идентификации лактобацилл RU2526576C2 (ru)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2011152586/10A RU2526576C2 (ru) 2011-12-23 2011-12-23 Способ идентификации лактобацилл
PCT/RU2012/001048 WO2013100810A2 (ru) 2011-12-23 2012-12-11 МЕТОД ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН II ТИПА СУПЕРСЕМЕЙСТВ ReIBE и MazEF

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2011152586/10A RU2526576C2 (ru) 2011-12-23 2011-12-23 Способ идентификации лактобацилл

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2011152586A true RU2011152586A (ru) 2013-06-27
RU2526576C2 RU2526576C2 (ru) 2014-08-27

Family

ID=48698761

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011152586/10A RU2526576C2 (ru) 2011-12-23 2011-12-23 Способ идентификации лактобацилл

Country Status (2)

Country Link
RU (1) RU2526576C2 (ru)
WO (1) WO2013100810A2 (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
TWI648289B (zh) * 2015-08-28 2019-01-21 財團法人食品工業發展研究所 鑑別乾酪乳酸桿菌群之乳酸菌的種間關係與種內關係之方法
CN111286550A (zh) * 2019-07-18 2020-06-16 大连民族大学 一种用于扩增副干酪乳杆菌的特异性引物及其应用
CN114058692A (zh) * 2021-11-15 2022-02-18 无锡市人民医院 circ_RELB作为分子标记物在制备诊断糖尿病视网膜病变血管新生产品上的应用
CN113981116A (zh) * 2021-11-30 2022-01-28 广州舒客实业有限公司 用于快速鉴定唾液乳杆菌的特异性引物、试剂盒及其应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7919277B2 (en) * 2004-04-28 2011-04-05 Danisco A/S Detection and typing of bacterial strains
UA53337U (ru) * 2010-02-03 2010-10-11 Государственное Предприятие «Центр Иммунобиологических Препаратов» Способ определения штаммов бифидобактерий для создания эталонных образцов пробиотических препаратов

Also Published As

Publication number Publication date
WO2013100810A2 (ru) 2013-07-04
RU2526576C2 (ru) 2014-08-27
WO2013100810A3 (ru) 2013-10-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2016064894A3 (en) Compositions and methods for detecting an rna virus
EP4293125A3 (en) Methods for targeted genomic analysis
MY182415A (en) Methods and compositions for dna profiling
TW201614076A (en) Methods for pathogen detection and disease management on meats, plants, or plant parts
JP2013066474A5 (ru)
NZ723570A (en) Compositions and methods for quantifying a nucleic acid sequence in a sample
WO2015058008A3 (en) Enhanced nucleic acid identification and detection
WO2015114469A3 (en) Covered sequence conversion dna and detection methods
MY195854A (en) Primer Set for Pcr for Bacterial Dna Amplification, Kit For Detection and/or Identification of Bacterial Species, and, Method of Detection and/or Identification of Bacterial Species
MX346524B (es) Diagnostico de infecciones virales mediante la deteccion de adn viral genómico e infeccioso mediante compatibilización molecular.
CA2893941C (en) Method for detecting helicobacter pylori dna in a stool sample
BR112016029907A2 (pt) enriquecimento geneticamente adaptado e reação em cadeia da polimerase para a rápida detecção de microrganismos".
RU2011152586A (ru) ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН RelBE И MazEF ДЛЯ ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛАКТОБАЦИЛЛ
MY184632A (en) A method of identifying parentage in freshwater prawn macrobrachium rosenbergii
EA201491821A1 (ru) Модифицированные олигонуклеотиды, включающие тиольные функциональные группы, и их применение для детекции нуклеиновых кислот
WO2015127201A8 (en) Hiv-2 nucleic acids and methods of detection
WO2014102761A3 (es) Cebadores para detección y tipificación de cepas bacterianas productoras de carbapenemasas, kit y método de detección
RU2011145069A (ru) ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНОВ СИСТЕМЫ ТОКСИН-АНТИТОКСИН reiBE ДЛЯ ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ БИФИДОБАКТЕРИЙ
PL403996A1 (pl) Sposób jednoczesnej detekcji bakterii i grzybów w preparacie biologicznym metodą PCR, startery oraz zestaw do detekcji bakterii i grzybów
TIAN et al. Species identification of Cronobacter spp. based on recN gene
RU2552611C2 (ru) Способ подвидовой дифференциации штаммов возбудителя чумы методом полимеразной цепной реакции
RU2012139717A (ru) Способ дифференциации штаммов возбудителя чумы основного подвида средневекового и античного биоваров методом полимеразной цепной реакции
WO2013116503A3 (en) Exhaled nucleic acid detection for non-invasive assessment of the lung
RU2010127614A (ru) Способ идентификации микобактерий с помощью полимеразной цепной реакции
MY172448A (en) Detection of a specific fungal pathogen

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20201224