RU2011102818A - Прогнозирование ответа на противовирусную терапию - Google Patents

Прогнозирование ответа на противовирусную терапию Download PDF

Info

Publication number
RU2011102818A
RU2011102818A RU2011102818/10A RU2011102818A RU2011102818A RU 2011102818 A RU2011102818 A RU 2011102818A RU 2011102818/10 A RU2011102818/10 A RU 2011102818/10A RU 2011102818 A RU2011102818 A RU 2011102818A RU 2011102818 A RU2011102818 A RU 2011102818A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mir
subject
level
sample
mirna
Prior art date
Application number
RU2011102818/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Витольд ФИЛИПОВИЧ (CH)
Витольд ФИЛИПОВИЧ
Маркус ХАЙМ (CH)
Маркус ХАЙМ
Яцек КРОЛЬ (CH)
Яцек КРОЛЬ
Илона МАРКЕВИЧ (CH)
Илона МАРКЕВИЧ
Магдалена САРАСИН-ФИЛИПОВИЧ (CH)
Магдалена САРАСИН-ФИЛИПОВИЧ
Original Assignee
Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch)
Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч
Юниверсити Хоспитл Базель (Ch)
Юниверсити Хоспитл Базель
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch), Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч, Юниверсити Хоспитл Базель (Ch), Юниверсити Хоспитл Базель filed Critical Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch)
Publication of RU2011102818A publication Critical patent/RU2011102818A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
    • C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/15—Medicinal preparations ; Physical properties thereof, e.g. dissolubility
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA

Abstract

1. Способ определения вероятности ответа субъекта с вирусной инфекцией печени на противовирусную терапию, который предусматривает стимулирование действия интерферона (ИФН), включающий: ! (а) анализ в образце, полученном от субъекта, уровня экспрессии микроРНК, и ! (б) сравнение уровня экспрессии указанной микроРНК в образце, полученном от субъекта, с уровнями указанной микроРНК в контрольном образце. ! 2. Способ по п.1, в котором микроРНК является miR122 и в котором уровень miR-122 в образце, полученном от субъекта, ниже уровня miR-122 в контрольном образце, что свидетельствует о том, что субъект вероятно не отвечает на указанную противовирусную терапию. ! 3. Способ по п.1, в котором микроРНК является miR-296-5p и в котором повышенный уровень miR-296-5p в образце, полученном от субъекта, по сравнению с уровнем miR-296-5p в контрольном образце свидетельствует о том, что субъект вероятно не отвечает на указанную противовирусную терапию. ! 4. Способ по п.1, в котором неизменный или повышенный уровень miR-122, и/или неизменный или пониженный уровень miR-296-5p соответственно в образце, полученном от субъекта, по сравнению с уровнем miR-122 и/или miR-296-5p соответственно в контрольном образце свидетельствует о том, что субъект вероятно отвечает на указанную противовирусную терапию. ! 5. Способ по п.1, в котором противовирусная терапия включает пэгелированный ИФНα (пэгИФНα), необязательно комбинированный с рибавирином. ! 6. Способ по п.1, в котором вирусная инфекция вызвана вирусом гепатита В или вирусом гепатита С. ! 7. Способ по п.4, в котором вирус является вирусом гепатита С. ! 8. Способ по п.1, в котором образец представляет ткань печени. ! 9. Способ по п.1, в котором также

Claims (15)

1. Способ определения вероятности ответа субъекта с вирусной инфекцией печени на противовирусную терапию, который предусматривает стимулирование действия интерферона (ИФН), включающий:
(а) анализ в образце, полученном от субъекта, уровня экспрессии микроРНК, и
(б) сравнение уровня экспрессии указанной микроРНК в образце, полученном от субъекта, с уровнями указанной микроРНК в контрольном образце.
2. Способ по п.1, в котором микроРНК является miR122 и в котором уровень miR-122 в образце, полученном от субъекта, ниже уровня miR-122 в контрольном образце, что свидетельствует о том, что субъект вероятно не отвечает на указанную противовирусную терапию.
3. Способ по п.1, в котором микроРНК является miR-296-5p и в котором повышенный уровень miR-296-5p в образце, полученном от субъекта, по сравнению с уровнем miR-296-5p в контрольном образце свидетельствует о том, что субъект вероятно не отвечает на указанную противовирусную терапию.
4. Способ по п.1, в котором неизменный или повышенный уровень miR-122, и/или неизменный или пониженный уровень miR-296-5p соответственно в образце, полученном от субъекта, по сравнению с уровнем miR-122 и/или miR-296-5p соответственно в контрольном образце свидетельствует о том, что субъект вероятно отвечает на указанную противовирусную терапию.
5. Способ по п.1, в котором противовирусная терапия включает пэгелированный ИФНα (пэгИФНα), необязательно комбинированный с рибавирином.
6. Способ по п.1, в котором вирусная инфекция вызвана вирусом гепатита В или вирусом гепатита С.
7. Способ по п.4, в котором вирус является вирусом гепатита С.
8. Способ по п.1, в котором образец представляет ткань печени.
9. Способ по п.1, в котором также анализируют экспрессию генов, которая может прогнозировать ответ субъекта на терапию.
10. Способ по п.9, в котором экспрессию гена определяют по измерению количества иРНК транскрипта гена в образце или количества комплементарной ДНК (кДНК), производной от указанной иРНК.
11. Способ по п.9, в котором экспрессию гена определяют по измерению количества пептида или полипептида, кодируемого геном в образце.
12. Способ по п.11, в котором определяют количество пептида или полипептида, используя специфическую связывающую молекулу.
13. Способ по п.1, в котором субъектом является человек.
14. Набор для осуществления способа по одному из пп.1-13, включающий:
(i) средства для анализа в образце, полученном от субъекта, уровня экспрессии микроРНК, например miR-122 или miR-296-5p; и необязательно
(ii) средства для сравнения уровня указанной микроРНК, например miR-122 или miR-296-5p в образце, полученном от субъекта, с уровнями указанной микроРНК, например miR-122 или miR-296-5p, в контрольном образце.
15. Набор по п.14, дополнительно включающий средства для анализа экспрессии по меньшей мере одного гена, который может быть прогностическим показателем ответа субъекта на терапию, в итоге включающий одну или несколько специфических связывающих молекул, целью которых могут служить молекулы, представляющие указанный по меньшей мере один ген, который может быть прогностическим показателем ответа субъекта на терапию, в котором указанная специфическая связывающая молекула является олигонуклеотидным зондом, антителом или аптамером, и необязательно средства для сравнения экспрессии генов в образце с экспрессией тех же генов в контрольном образце.
RU2011102818/10A 2008-06-27 2009-06-26 Прогнозирование ответа на противовирусную терапию RU2011102818A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP08159274.3 2008-06-27
EP08159274 2008-06-27

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2011102818A true RU2011102818A (ru) 2012-08-10

Family

ID=40163314

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011102818/10A RU2011102818A (ru) 2008-06-27 2009-06-26 Прогнозирование ответа на противовирусную терапию

Country Status (14)

Country Link
US (2) US20110256534A1 (ru)
EP (1) EP2297357B1 (ru)
JP (1) JP2011525799A (ru)
KR (1) KR20110056482A (ru)
CN (1) CN102159725A (ru)
AU (1) AU2009264170A1 (ru)
BR (1) BRPI0914316A2 (ru)
CA (1) CA2728816A1 (ru)
ES (1) ES2398500T3 (ru)
MX (1) MX2010014242A (ru)
PL (1) PL2297357T3 (ru)
PT (1) PT2297357E (ru)
RU (1) RU2011102818A (ru)
WO (1) WO2009156507A1 (ru)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102399852A (zh) * 2010-09-08 2012-04-04 上海市公共卫生临床中心 用于预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的血浆miRNA谱及检测试剂盒
CN102212555A (zh) * 2011-04-12 2011-10-12 武汉大学 一种可用于表达miR-122载体pSU6-miR-122的构建方法及用途
EP2751286A1 (en) * 2011-09-04 2014-07-09 Yissum Research Development Company of the Hebrew University of Jerusalem Ltd. Prognostic methods and compositions for predicting interferon treatment eficacy in a subject
US9168260B2 (en) * 2012-02-24 2015-10-27 Baruch S. Blumberg Institute Benzodiazepine compounds with anti-flavivirus activity
TWI454577B (zh) * 2012-12-19 2014-10-01 Univ Kaohsiung Medical 預測干擾素療效之方法及套組
PL405648A1 (pl) 2013-10-15 2015-04-27 Warszawski Uniwersytet Medyczny Sposób diagnozowania raka watrobowokomórkowego, zastosowanie markera mikroRNA do diagnozowania zmiany chorobowej w obrębie wątroby, oceny stopnia zaawansowania choroby oraz oceny podatności pacjenta i/lub choroby na zaproponowane leczenie oraz zawierający takie markery zestaw diagnostyczny
RU2017101174A (ru) 2014-06-18 2018-07-18 Торэй Индастриз, Инк. Набор или устройство для обнаружения рака печени и способ обнаружения
US20170369556A1 (en) * 2014-12-23 2017-12-28 Ralph A. Tripp RECOMBINANT CELLS COMPRISING miRNA MIMICS
CN106191293A (zh) * 2016-08-18 2016-12-07 成都仕康美生物科技有限公司 一种基于数字PCR平台的miRNA‑122检测试剂盒及其应用
CN111904973B (zh) * 2020-07-27 2021-12-03 中国农业科学院兰州兽医研究所 ssc-miR-122在制备调节猪繁殖与呼吸综合征病毒复制的药物中的应用
WO2023220584A2 (en) * 2022-05-09 2023-11-16 The Regents Of The University Ofcolorado A Body Corporate Regulation of type i ifn signaling by targeting a decoy receptor

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
CA2857881A1 (en) 2004-11-12 2006-12-28 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving mirna and mirna inhibitor molecules
WO2007021896A2 (en) 2005-08-10 2007-02-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Chemically modified oligonucleotides for use in modulating micro rna and uses thereof
EP1984499B1 (en) 2006-01-27 2015-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of micrornas
CA2649045C (en) 2006-04-03 2019-06-11 Santaris Pharma A/S Pharmaceutical composition comprising anti-mirna antisense oligonucleotides
US8415323B2 (en) * 2007-08-27 2013-04-09 The Regents Of The University Of California MicroRNAs for inhibiting viral replication

Also Published As

Publication number Publication date
CN102159725A (zh) 2011-08-17
ES2398500T3 (es) 2013-03-19
WO2009156507A1 (en) 2009-12-30
EP2297357B1 (en) 2012-10-31
JP2011525799A (ja) 2011-09-29
BRPI0914316A2 (pt) 2015-10-13
MX2010014242A (es) 2011-06-24
AU2009264170A1 (en) 2009-12-30
KR20110056482A (ko) 2011-05-30
PT2297357E (pt) 2013-01-25
EP2297357A1 (en) 2011-03-23
US20130252233A1 (en) 2013-09-26
CA2728816A1 (en) 2009-12-30
US20110256534A1 (en) 2011-10-20
PL2297357T3 (pl) 2013-03-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2011102818A (ru) Прогнозирование ответа на противовирусную терапию
Zivcec et al. Validation of assays to monitor immune responses in the Syrian golden hamster (Mesocricetus auratus)
Bayo et al. IL-8, GRO and MCP-1 produced by hepatocellular carcinoma microenvironment determine the migratory capacity of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells without affecting tumor aggressiveness
Patel et al. High predictive accuracy of an unbiased proteomic profile for sustained virologic response in chronic hepatitis C patients
Mathieu et al. Lethal Nipah virus infection induces rapid overexpression of CXCL10
RU2011106957A (ru) Онкоген nrf2 и его применение
Kumar et al. Severity of hepatitis C virus (genotype-3) infection positively correlates with circulating microRNA-122 in patients sera
CN104450920A (zh) 基于指数级非酶扩增及电化学发光原理的microRNA痕量检测方法
Foka et al. Alterations in the iron homeostasis network: A driving force for macrophage-mediated hepatitis C virus persistency
Qiu et al. Roadmap of miR-122-related clinical application from bench to bedside
Shaker et al. MxA expression as marker for assessing the therapeutic response in HCV genotype 4 Egyptian patients
RU2014122607A (ru) Способы определения восприимчивости пациента к внутрибольничной инфекции и составления прогноза развития септического синдрома
CN103805715A (zh) 一种ToRCH检测的荧光标记基因芯片试剂制备方法及其应用
Tokumoto et al. Ribavirin regulates hepatitis C virus replication through enhancing interferon-stimulated genes and interleukin 8
Li et al. Extracellular HMGB1 promotes CD44 expression in hepatocellular carcinoma via regulating miR-21
Bai et al. Up-regulation of long non-coding RNA LOXL1-AS1 functions as an oncogene in cervical squamous cell carcinoma by sponging miR-21
Tan et al. Serum microRNAs predict response of patients with chronic hepatitis B to antiviral therapy
Wieland et al. Simultaneous detection of hepatitis C virus and interferon stimulated gene expression in infected human liver: 193
Thakur et al. NLRP3 inflammasome activation is a prognostic marker of recovery in HEV-infected patients
JP2006174827A5 (ru)
Nan et al. microRNA‑1273g‑3p is a useful non‑invasive test for the prediction of liver fibrosis in patients with chronic hepatitis C
Medrano et al. Genetic Polymorphisms Associated with Liver Disease Progression in HIV/HCV-Coinfected Patients.
Nagayama et al. Overexpression of Interferonγ-Inducible Protein 10 in The Liver of Patients With Type I Autoimmune Hepatitis Identified by Suppression Subtractive Hybridization
JP2009178057A (ja) インターフェロンとリバビリンとの併用治療効果の検出方法および検出キット
CN104328122A (zh) 一种针对人膜联蛋白A2受体基因的siRNA及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20131101