RU2010144839A - Обнаружение и подсчет микроорганизмов - Google Patents
Обнаружение и подсчет микроорганизмов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010144839A RU2010144839A RU2010144839/10A RU2010144839A RU2010144839A RU 2010144839 A RU2010144839 A RU 2010144839A RU 2010144839/10 A RU2010144839/10 A RU 2010144839/10A RU 2010144839 A RU2010144839 A RU 2010144839A RU 2010144839 A RU2010144839 A RU 2010144839A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- probe
- microorganisms
- sample
- power source
- nucleic acids
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6841—In situ hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/107—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties fluorescence
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
1. Способ для обнаружения и подсчета жизнеспособных микроорганизмов в образце, предположительно содержащем указанные микроорганизмы, предусматривающий: ! (1) контактирование указанного образца с источником питания для клеток и ингибитором клеточной пролиферации, ! (2) контактирование указанного образца по меньшей мере с одним флуоресцентно-меченым олигонуклеотидным зондом, способным гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов, ! (3) обнаружение и количественное определение флуоресцентного сигнала, где микроорганизмы представляют собой вид Legionella pneumophila, и где ингибитор клеточной пролиферации выбирается из группы, состоящей из ципрофлоксацина и цефалексина. ! 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит ростовую добавку, которая содержит антиоксидант, предпочтительно пировиноградную кислоту (или ее соль). ! 3. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит глутаминовую кислоту (или ее соль). ! 4. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит глутаминовую кислоту (или ее соль) и пировиноградную кислоту (или ее соль). ! 5. Способ по п.1, отличающийся тем, что олигонуклеотидный зонд выбирается из группы, состоящей из PNE 1 зонда, LEGPNE 1 зонда и LP2 зонда. ! 6. Способ по п.1, отличающийся тем, что на этапе (2) указанный образец контактирует по меньшей мере с первым зондом и вторым зондом, и тем, что первый зонд способен специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов, и второй зонд с�
Claims (11)
1. Способ для обнаружения и подсчета жизнеспособных микроорганизмов в образце, предположительно содержащем указанные микроорганизмы, предусматривающий:
(1) контактирование указанного образца с источником питания для клеток и ингибитором клеточной пролиферации,
(2) контактирование указанного образца по меньшей мере с одним флуоресцентно-меченым олигонуклеотидным зондом, способным гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов,
(3) обнаружение и количественное определение флуоресцентного сигнала, где микроорганизмы представляют собой вид Legionella pneumophila, и где ингибитор клеточной пролиферации выбирается из группы, состоящей из ципрофлоксацина и цефалексина.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит ростовую добавку, которая содержит антиоксидант, предпочтительно пировиноградную кислоту (или ее соль).
3. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит глутаминовую кислоту (или ее соль).
4. Способ по п.1, отличающийся тем, что источник питания для клеток на этапе 1) содержит глутаминовую кислоту (или ее соль) и пировиноградную кислоту (или ее соль).
5. Способ по п.1, отличающийся тем, что олигонуклеотидный зонд выбирается из группы, состоящей из PNE 1 зонда, LEGPNE 1 зонда и LP2 зонда.
6. Способ по п.1, отличающийся тем, что на этапе (2) указанный образец контактирует по меньшей мере с первым зондом и вторым зондом, и тем, что первый зонд способен специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов, и второй зонд способен специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним другим участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов.
7. Способ по п.1, отличающийся тем, что на этапе (2) указанный образец контактирует по меньшей мере с первым зондом и вторым зондом, и тем, что первый зонд способен специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот, при этом все кислоты принадлежат к роду Legionella, и тем, что второй зонд способен специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот, при этом все кислоты принадлежат к виду Legionella pneumophila.
8. Способ по п.7, отличающийся тем, что первый зонд выбирается из группы, состоящей из LEG705 зонда, LEG226 зонда, Legall11 зонда, Legall22 зонда и Legl20v зонда.
9. Способ по п.1, отличающийся тем, что этап (3) выполняется автоматически с применением эпифлуоресцентного микроскопа.
10. Способ по любому из пп.1-9, отличающийся тем, что образец отбирается из любой группы, выбранной из промышленных охлаждающих вод, питьевых вод и вод природного происхождения.
11. Набор для более быстрого детектирования и подсчета жизнеспособных микроорганизмов вида Legionella. pneumophila в образце, предположительно содержащем указанные микроорганизмы, содержащий:
(1) источник питания для клеток,
(2) ингибитор клеточной пролиферации,
(3) по меньшей мере один флуоресцентно-меченый олигонуклеотидный зонд, способный специфически гибридизироваться по меньшей мере с одним участком рибосомных нуклеиновых кислот указанных микроорганизмов,
(4) средство для обнаружения и количественного определения флуоресцентного сигнала,
где ингибитор клеточной пролиферации выбирается из группы, состоящей из ципрофлоксацина и цефалексина.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB0806136.8 | 2008-04-04 | ||
| GBGB0806136.8A GB0806136D0 (en) | 2008-04-04 | 2008-04-04 | Detection and enumeration of microorganisms |
| GB0900848A GB0900848D0 (en) | 2009-01-20 | 2009-01-20 | Detection and enumeration of microorganisms |
| GB0900848.3 | 2009-01-20 | ||
| PCT/EP2009/053299 WO2009121727A1 (en) | 2008-04-04 | 2009-03-20 | Detection and enumeration of microorganisms |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010144839A true RU2010144839A (ru) | 2012-05-20 |
| RU2477319C2 RU2477319C2 (ru) | 2013-03-10 |
Family
ID=40887000
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010144839/10A RU2477319C2 (ru) | 2008-04-04 | 2009-03-20 | Способ для обнаружения и подсчета жизнеспособных микроорганизмов вида legionella pneumophila и набор для его осуществления |
Country Status (18)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20110076686A1 (ru) |
| EP (1) | EP2262910B1 (ru) |
| JP (1) | JP5349579B2 (ru) |
| KR (1) | KR101265412B1 (ru) |
| CN (1) | CN101990579A (ru) |
| AU (1) | AU2009231362B2 (ru) |
| CA (1) | CA2719863C (ru) |
| CY (1) | CY1114785T1 (ru) |
| DK (1) | DK2262910T3 (ru) |
| ES (1) | ES2389861T3 (ru) |
| HR (1) | HRP20120553T1 (ru) |
| IL (1) | IL208158A0 (ru) |
| MX (1) | MX2010010385A (ru) |
| MY (1) | MY149655A (ru) |
| PT (1) | PT2262910E (ru) |
| RS (1) | RS52445B (ru) |
| RU (1) | RU2477319C2 (ru) |
| WO (1) | WO2009121727A1 (ru) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2554470C2 (ru) * | 2010-06-03 | 2015-06-27 | Басф Се | Обнаружение и подсчет микроорганизмов |
| CN105524974A (zh) * | 2016-02-24 | 2016-04-27 | 北京世纪阿姆斯生物技术有限公司 | 一种高浓度微生物制剂产品含菌量的检测方法 |
| CN107656056B (zh) * | 2017-08-29 | 2019-05-28 | 山东师范大学 | 一种基于细菌增长对细菌快速镜检的方法 |
| RU2699983C1 (ru) * | 2018-12-04 | 2019-09-11 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" (ФБУН ГНЦ ПМБ) Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | Штамм гибридных культивируемых клеток животных Mus musculus 1F11PAL - продуцент мышиных моноклональных антител, специфичных к пептидогликан-ассоциированному липопротеину (PAL) Legionella pneumophila |
| EP3904530A1 (en) * | 2020-04-27 | 2021-11-03 | Universidade de Évora | Method for collection, detection and/or identification of microorganisms from a natural stone and uses thereof |
Family Cites Families (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5834445A (en) * | 1989-08-11 | 1998-11-10 | Sikorski; Christopher | Process for preparing decolorized carotenoid-cyclodextrin complexes |
| FR2845097B1 (fr) * | 2002-10-01 | 2006-06-16 | Metis Biotechnologies | Procede de detection et de comptage de microorganismes dans un echantillon |
| JP4632839B2 (ja) * | 2005-03-31 | 2011-02-16 | アクアス株式会社 | レジオネラ検査用選択培地、及び、レジオネラ属菌の培養方法 |
| US20090239256A1 (en) * | 2005-06-09 | 2009-09-24 | South Australian Water Corporation | Detection of Micro-Organisms |
| ATE531818T1 (de) * | 2006-05-02 | 2011-11-15 | Univ Paris Curie | Methode zur bestimmung und auszählung von mikroorganismen |
-
2009
- 2009-03-20 CA CA2719863A patent/CA2719863C/en not_active Expired - Fee Related
- 2009-03-20 US US12/934,829 patent/US20110076686A1/en not_active Abandoned
- 2009-03-20 MX MX2010010385A patent/MX2010010385A/es active IP Right Grant
- 2009-03-20 RU RU2010144839/10A patent/RU2477319C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2009-03-20 RS RS20120365A patent/RS52445B/en unknown
- 2009-03-20 PT PT09727970T patent/PT2262910E/pt unknown
- 2009-03-20 CN CN2009801122963A patent/CN101990579A/zh active Pending
- 2009-03-20 KR KR1020107024739A patent/KR101265412B1/ko not_active IP Right Cessation
- 2009-03-20 AU AU2009231362A patent/AU2009231362B2/en not_active Ceased
- 2009-03-20 ES ES09727970T patent/ES2389861T3/es active Active
- 2009-03-20 DK DK09727970.7T patent/DK2262910T3/da active
- 2009-03-20 JP JP2011502330A patent/JP5349579B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2009-03-20 WO PCT/EP2009/053299 patent/WO2009121727A1/en active Application Filing
- 2009-03-20 MY MYPI2010004332A patent/MY149655A/en unknown
- 2009-03-20 EP EP09727970A patent/EP2262910B1/en active Active
-
2010
- 2010-09-15 IL IL208158A patent/IL208158A0/en unknown
-
2012
- 2012-07-06 HR HRP20120553AT patent/HRP20120553T1/hr unknown
- 2012-07-17 CY CY20121100633T patent/CY1114785T1/el unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2011516052A (ja) | 2011-05-26 |
| HRP20120553T1 (hr) | 2012-10-31 |
| CY1114785T1 (el) | 2016-12-14 |
| MX2010010385A (es) | 2010-12-15 |
| CN101990579A (zh) | 2011-03-23 |
| RU2477319C2 (ru) | 2013-03-10 |
| WO2009121727A1 (en) | 2009-10-08 |
| MY149655A (en) | 2013-09-30 |
| DK2262910T3 (da) | 2012-09-17 |
| KR20100134093A (ko) | 2010-12-22 |
| EP2262910B1 (en) | 2012-06-06 |
| JP5349579B2 (ja) | 2013-11-20 |
| EP2262910A1 (en) | 2010-12-22 |
| US20110076686A1 (en) | 2011-03-31 |
| AU2009231362B2 (en) | 2012-07-05 |
| IL208158A0 (en) | 2010-12-30 |
| CA2719863C (en) | 2013-10-08 |
| CA2719863A1 (en) | 2009-10-08 |
| AU2009231362A1 (en) | 2009-10-08 |
| KR101265412B1 (ko) | 2013-05-16 |
| RS52445B (en) | 2013-02-28 |
| PT2262910E (pt) | 2012-07-18 |
| ES2389861T3 (es) | 2012-11-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Yoo et al. | Exploring the antibiotic resistome in activated sludge and anaerobic digestion sludge in an urban wastewater treatment plant via metagenomic analysis | |
| Luo et al. | New steady-state microbial community compositions and process performances in biogas reactors induced by temperature disturbances | |
| Yu et al. | Characteristics of extracellular polymeric substances and bacterial communities in an anaerobic membrane bioreactor coupled with online ultrasound equipment | |
| RU2012157541A (ru) | Обнаружение и подсчет микроорганизмов | |
| Owusu-Agyeman et al. | The study of structure of anaerobic granules and methane producing pathways of pilot-scale UASB reactors treating municipal wastewater under sub-mesophilic conditions | |
| Zhou et al. | Intermediate grazing intensities by sheep increase soil bacterial diversities in an Inner Mongolian steppe | |
| Da Silva et al. | Assessment of bacterial and archaeal community structure in swine wastewater treatment processes | |
| RU2010144839A (ru) | Обнаружение и подсчет микроорганизмов | |
| Su et al. | Application of biochar in a CIC reactor to relieve ammonia nitrogen stress and promote microbial community during food waste treatment | |
| IL173314A0 (en) | Determining the sequence of a polynucleotide | |
| Khan et al. | Feasibility study on anaerobic biodegradation of azo dye reactive orange 16 | |
| DE602004005711D1 (de) | Schnell-verfahren zur detektion von mikroorganismen in lebensmittelproben | |
| WO2007021250A3 (en) | Method and/or apparatus of oligonucleotide design and/or nucleic acid detection | |
| ATE505562T1 (de) | Doppel-oligonukleotid- nukleinsäurenachweisverfahren | |
| ATE445024T1 (de) | Verfahren zum nachweis von nukleinsäuren durch amplifikation auf einem array | |
| Li et al. | Performance, granule conductivity and microbial community analysis of upflow anaerobic sludge blanket (UASB) reactors from mesophilic to thermophilic operation | |
| CN103060429A (zh) | 一种天赋潜能评估的飞行质谱生物芯片及其检测方法 | |
| Lebuhn et al. | Microbiology and molecular biology tools for biogas process analysis, diagnosis and control | |
| Couras et al. | Effects of operational shocks on key microbial populations for biogas production in UASB (Upflow Anaerobic Sludge Blanket) reactors | |
| Tabatabaei et al. | PCR-based DGGE and FISH analysis of methanogens in an anaerobic closed digester tank for treating palm oil mill effluent | |
| Li et al. | Diversity and distribution of methanogenic archaea in an anaerobic baffled reactor (ABR) treating sugar refinery wastewater | |
| Trang et al. | Effect of ammonia load on microbial communities in mesophilic anaerobic digestion of propionic acid | |
| WO2007129182A3 (en) | Microorganisms detection and enumeration method | |
| RU2007114223A (ru) | СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ мРНК КАТАЛИТИЧЕСКОЙ СУБЪЕДИНИЦЫ ТЕЛОМЕРАЗЫ (hTERT) КАК ПОКАЗАТЕЛЯ УРОВНЯ АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТА | |
| Kolukirik et al. | Methanogenic community change in a full-scale UASB reactor operated at a low F/M ratio |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20150321 |