RU2010101093A - Способы диагностики и лечения рака - Google Patents

Способы диагностики и лечения рака Download PDF

Info

Publication number
RU2010101093A
RU2010101093A RU2010101093/10A RU2010101093A RU2010101093A RU 2010101093 A RU2010101093 A RU 2010101093A RU 2010101093/10 A RU2010101093/10 A RU 2010101093/10A RU 2010101093 A RU2010101093 A RU 2010101093A RU 2010101093 A RU2010101093 A RU 2010101093A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
subject
rrm1
cancer
expression
level
Prior art date
Application number
RU2010101093/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Джерольд БЕПЛЕР (US)
Джерольд БЕПЛЕР
Original Assignee
Юниверсити Оф Саут Флорида (Us)
Юниверсити Оф Саут Флорида
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Юниверсити Оф Саут Флорида (Us), Юниверсити Оф Саут Флорида filed Critical Юниверсити Оф Саут Флорида (Us)
Publication of RU2010101093A publication Critical patent/RU2010101093A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/15Medicinal preparations ; Physical properties thereof, e.g. dissolubility
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Способ выбора подходящей химиотерапии для субъекта, где способ включает: ! a) получение образца опухоли от субъекта; ! b) определение уровня экспрессии генов рибонуклеотидредуктазы M1 (RRM1) и тимидилатсинтазы (TS) в образце опухоли; и ! c) выбор подходящей химиотерапии на основании уровней экспрессии RRM1 и TS, где если уровни экспрессии RRM1 и TS являются меньшими или равными по сравнению с медианным уровнем экспрессии RRM1 в контрольной когорте, тогда выбирают химиотерапию, включающую гемцитабин и пеметрексед. ! 2. Способ по п.1, дополнительно включающий проведение подходящей химиотерапии для субъекта. ! 3. Способ по п.1, дополнительно включающий введение второго химиотерапевтического средства субъекту. ! 4. Способ по п.3, где второе химиотерапевтическое средство представляет собой антитубулиновое средство или содержащее платину средство. ! 5. Способ по п.1, где субъект имеет эпителиальное злокачественное новообразование. ! 6. Способ по п.1, где субъект имеет рак легкого, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак головы и шеи или рак яичника. ! 7. Способ по п.6, где рак легкого представляет собой немелкоклеточный рак легкого. ! 8. Способ предсказания ответа субъекта на лечение, включающее введение гемцитабина и пеметрекседа, где способ включает: ! a) получение образца опухоли от субъекта; ! b) определение уровня экспрессии генов рибонуклеотидредуктазы Ml (RRM1) и тимидилатсинтазы (TS) в образце опухоли; и ! c) предсказание ответа субъекта на лечение на основании уровня экспрессия генов RRM1 и TS в образце опухоли, где низкие уровни экспрессии RRM1 и TS указывают на то, что субъект, вероятно, может обладать положительным ответом на ле�

Claims (17)

1. Способ выбора подходящей химиотерапии для субъекта, где способ включает:
a) получение образца опухоли от субъекта;
b) определение уровня экспрессии генов рибонуклеотидредуктазы M1 (RRM1) и тимидилатсинтазы (TS) в образце опухоли; и
c) выбор подходящей химиотерапии на основании уровней экспрессии RRM1 и TS, где если уровни экспрессии RRM1 и TS являются меньшими или равными по сравнению с медианным уровнем экспрессии RRM1 в контрольной когорте, тогда выбирают химиотерапию, включающую гемцитабин и пеметрексед.
2. Способ по п.1, дополнительно включающий проведение подходящей химиотерапии для субъекта.
3. Способ по п.1, дополнительно включающий введение второго химиотерапевтического средства субъекту.
4. Способ по п.3, где второе химиотерапевтическое средство представляет собой антитубулиновое средство или содержащее платину средство.
5. Способ по п.1, где субъект имеет эпителиальное злокачественное новообразование.
6. Способ по п.1, где субъект имеет рак легкого, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак головы и шеи или рак яичника.
7. Способ по п.6, где рак легкого представляет собой немелкоклеточный рак легкого.
8. Способ предсказания ответа субъекта на лечение, включающее введение гемцитабина и пеметрекседа, где способ включает:
a) получение образца опухоли от субъекта;
b) определение уровня экспрессии генов рибонуклеотидредуктазы Ml (RRM1) и тимидилатсинтазы (TS) в образце опухоли; и
c) предсказание ответа субъекта на лечение на основании уровня экспрессия генов RRM1 и TS в образце опухоли, где низкие уровни экспрессии RRM1 и TS указывают на то, что субъект, вероятно, может обладать положительным ответом на лечение.
9. Способ по п.8, где субъект имеет эпителиальное злокачественное новообразование.
10. Способ по п.8, где субъект имеет рак легкого, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак головы и шеи или рак яичника.
11. Способ по п.10, где рак легкого представляет собой немелкоклеточный рак легкого.
12. Способ предоставления прогноза для субъекта с диагнозом немелкоклеточный рак легкого, где способ включает:
a) получение образца опухоли от субъекта;
b) определение уровня цитоплазматического белка тимидилатсинтазы (TS) в образце опухоли; и
c) сравнение уровня цитоплазматического белка TS в образце с контрольным уровнем цитоплазматического белка TS,
где высокий уровень цитоплазматического белка TS в образце по сравнению с контрольным уровнем является показателем благоприятного прогноза, а низкий уровень цитоплазматического белка TS по сравнению с контрольным уровнем является показателем неблагоприятного прогноза.
13. Способ по п.12, где уровень цитоплазматического белка TS определяют с использованием способа количественного анализа in situ.
14. Набор, содержащий:
a) реагент для анализа экспрессии RRM1 и TS в образце ткани от пациента, и
b) инструкцию.
15. Набор по п.14, где реагенты для анализа экспрессии RRM1 и TS содержат дозированные порции реагентов, выбранных из группы, выбранной из праймеров олиго-dT, прямых праймеров, гибридизующихся с кДНК RRM1 или TS, обратных праймеров, гибридизующихся с кДНК RRM1 или TS, обратных транскриптаз, ДНК полимераз, буферов и нуклеотидов.
16. Набор по п.14, где реагенты для анализа экспрессии RRM1 и TS содержат дозированные порции антител анти-RRM1 и анти-TS и буферы для проведения Вестерн-блоттинга или иммуногистохимического анализа.
17. Набор по п.14, дополнительно содержащий реагент для подготовки образца ткани от пациента.
RU2010101093/10A 2007-06-15 2008-06-13 Способы диагностики и лечения рака RU2010101093A (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US94415707P 2007-06-15 2007-06-15
US60/944,157 2007-06-15
US3955508P 2008-03-26 2008-03-26
US61/039,555 2008-03-26

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2010101093A true RU2010101093A (ru) 2011-07-20

Family

ID=40156627

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2010101093/10A RU2010101093A (ru) 2007-06-15 2008-06-13 Способы диагностики и лечения рака

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20090017012A1 (ru)
EP (1) EP2171086B1 (ru)
JP (1) JP5479332B2 (ru)
KR (1) KR20100044780A (ru)
CN (1) CN101815793A (ru)
AU (1) AU2008266048A1 (ru)
BR (1) BRPI0813364A2 (ru)
CA (1) CA2690865A1 (ru)
ES (1) ES2401475T3 (ru)
MX (1) MX2009013646A (ru)
RU (1) RU2010101093A (ru)
WO (1) WO2008157353A1 (ru)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20060252082A1 (en) * 2005-05-04 2006-11-09 University Of South Florida Predicting treatment response in cancer subjects
IL282783B2 (en) 2006-05-18 2023-09-01 Caris Mpi Inc A system and method for determining a personalized medical intervention for a disease stage
US8768629B2 (en) * 2009-02-11 2014-07-01 Caris Mpi, Inc. Molecular profiling of tumors
WO2010056337A2 (en) 2008-11-12 2010-05-20 Caris Mpi, Inc. Methods and systems of using exosomes for determining phenotypes
JP5024736B2 (ja) * 2009-10-15 2012-09-12 住友電気工業株式会社 発電システム
JP5808349B2 (ja) 2010-03-01 2015-11-10 カリス ライフ サイエンシズ スウィッツァーランド ホールディングスゲーエムベーハー セラノーシスのためのバイオマーカー
KR20130028727A (ko) 2010-03-29 2013-03-19 아브락시스 바이오사이언스, 엘엘씨 치료제의 약물 전달 및 유효성 향상 방법
WO2011123395A1 (en) * 2010-03-29 2011-10-06 Abraxis Bioscience, Llc Methods of treating cancer
BR112012025593A2 (pt) 2010-04-06 2019-06-25 Caris Life Sciences Luxembourg Holdings biomarcadores em circulação para doença
KR101602532B1 (ko) * 2013-08-29 2016-03-11 경북대학교 산학협력단 위암의 재발 가능성 예측을 위한 정보제공 방법
CN108475300B (zh) * 2015-10-26 2024-01-23 爱富体人 利用癌症患者的基因组碱基序列突变信息和生存信息的定制型药物选择方法及系统
AU2021305654A1 (en) * 2020-07-10 2023-03-02 Progenics Pharmaceuticals, Inc Methods of making prostate cancer treatment decisions
CN113957145B (zh) * 2021-10-19 2023-09-26 中国医学科学院肿瘤医院 m6A相关lncRNA在预测小细胞肺癌预后和化疗反应的应用

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5705336A (en) * 1995-03-07 1998-01-06 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Assay for sensitivity of tumors to DNA-platinating chemotherapy
US20020090642A1 (en) * 1995-12-11 2002-07-11 Patrick G. Johnston Methods for determining the prognosis of breast cancer using antibodies specific for thymidylate synthase
WO1998033518A1 (en) * 1997-02-04 1998-08-06 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Mutants of thymidylate synthase and uses thereof
US6087489A (en) * 1998-06-02 2000-07-11 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense oligonucleotide modulation of human thymidylate synthase expression
CA2372696A1 (en) * 1999-06-28 2001-01-04 Takeda Chemical Industries, Ltd. Novel protein and dna thereof
US6248535B1 (en) * 1999-12-20 2001-06-19 University Of Southern California Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens
US6582919B2 (en) * 2001-06-11 2003-06-24 Response Genetics, Inc. Method of determining epidermal growth factor receptor and HER2-neu gene expression and correlation of levels thereof with survival rates
US6518416B1 (en) * 2000-12-01 2003-02-11 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 expression
US6602670B2 (en) * 2000-12-01 2003-08-05 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 expression
US7049059B2 (en) * 2000-12-01 2006-05-23 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 and TS expression
US6956111B2 (en) * 2001-03-02 2005-10-18 Response Genetics, Inc. Method of determining dihydropyrimidine dehydrogenase gene expression
US6686155B2 (en) * 2001-06-14 2004-02-03 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on glutathione-S-transferase pi expression
WO2004031408A1 (en) * 2002-09-30 2004-04-15 F.Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for genotyping thymidylate synthase gene
EP2469439A2 (en) * 2003-09-29 2012-06-27 Pathwork Diagnostics, Inc. Systems and methods for detecting biological features
US20060252082A1 (en) * 2005-05-04 2006-11-09 University Of South Florida Predicting treatment response in cancer subjects

Also Published As

Publication number Publication date
EP2171086A1 (en) 2010-04-07
ES2401475T3 (es) 2013-04-19
JP5479332B2 (ja) 2014-04-23
EP2171086A4 (en) 2010-10-13
CA2690865A1 (en) 2008-12-24
AU2008266048A1 (en) 2008-12-24
KR20100044780A (ko) 2010-04-30
JP2010530746A (ja) 2010-09-16
BRPI0813364A2 (pt) 2014-12-30
US20090017012A1 (en) 2009-01-15
EP2171086B1 (en) 2012-12-19
MX2009013646A (es) 2010-03-30
CN101815793A (zh) 2010-08-25
WO2008157353A1 (en) 2008-12-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2010101093A (ru) Способы диагностики и лечения рака
US8153380B2 (en) Gene expression markers for colorectal cancer prognosis
ES2488845T3 (es) Predicción de la probabilidad de recidiva de cáncer
US10179936B2 (en) Gene expression profile algorithm and test for likelihood of recurrence of colorectal cancer and response to chemotherapy
Pu et al. Circulating miR‐221 directly amplified from plasma is a potential diagnostic and prognostic marker of colorectal cancer and is correlated with p53 expression
US8067178B2 (en) Gene expression markers for prediction of patient response to chemotherapy
US20090258795A1 (en) Gene expression markers for prediction of patient response to chemotherapy
JP2010530746A5 (ru)
Supernat et al. Epithelial-mesenchymal transition and cancer stem cells in endometrial cancer
Zhang et al. Long non-coding RNA FEZF1-AS1 is up-regulated and associated with poor prognosis in patients with cervical cancer.
Laurenti et al. Comparison of ZAP-70/Syk mRNA levels with immunoglobulin heavy-chain gene mutation status and disease progression in chronic lymphocytic leukemia
ES2914727T3 (es) Algoritmos y métodos para evaluar los criterios clínicos tardíos en el cáncer de próstata
CN115521985A (zh) 浸润性cd8+t细胞的标志物组合及其应用
Ying et al. Distinguishing Acute Leukemia Subtypes: The Role of hsa_circ_0012152 and hsa_circ_0020093 in Peripheral Blood
Xu et al. Identification of an Excellent PCR-Based Classifier to Predict Tumor Relapse in Stage II/III Colorectal Cancer and Its Clinical Application Irrespective of Consensus Molecular Subtypes
CN112368399A (zh) miRNA用于高级别浆液性卵巢癌治疗护理的预测和预后用途
Wu et al. Preoperative Immune Cells Infiltration in the Tumor Microenvironment as a Prediction and Prognostic Factor for Postoperative Recurrence in Hepatocellular Carcinoma

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20130128