RU2008133474A - Получение олигонуклеотидов с использованием фоторасщепляемых линкеров - Google Patents
Получение олигонуклеотидов с использованием фоторасщепляемых линкеров Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008133474A RU2008133474A RU2008133474/04A RU2008133474A RU2008133474A RU 2008133474 A RU2008133474 A RU 2008133474A RU 2008133474/04 A RU2008133474/04 A RU 2008133474/04A RU 2008133474 A RU2008133474 A RU 2008133474A RU 2008133474 A RU2008133474 A RU 2008133474A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- aryl
- lower alkyl
- group
- alkyls
- aryls
- Prior art date
Links
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 title claims abstract 18
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract 9
- 125000002877 alkyl aryl group Chemical group 0.000 claims abstract 114
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims abstract 36
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims abstract 36
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 21
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims abstract 17
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims abstract 17
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 claims abstract 13
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims abstract 9
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract 8
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims abstract 8
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 claims abstract 7
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims abstract 7
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims abstract 5
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 claims abstract 5
- 125000003808 silyl group Chemical group [H][Si]([H])([H])[*] 0.000 claims abstract 5
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims abstract 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract 4
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 claims abstract 2
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 claims abstract 2
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims abstract 2
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims abstract 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims abstract 2
- -1 CONR 'R'' Chemical group 0.000 claims 20
- 125000000896 monocarboxylic acid group Chemical group 0.000 claims 12
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims 12
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims 9
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims 8
- 125000000664 diazo group Chemical group [N-]=[N+]=[*] 0.000 claims 6
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims 4
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims 4
- 150000001733 carboxylic acid esters Chemical class 0.000 claims 4
- 239000012948 isocyanate Chemical class 0.000 claims 4
- 150000002513 isocyanates Chemical class 0.000 claims 4
- 150000002540 isothiocyanates Chemical class 0.000 claims 4
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 claims 4
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 4
- 150000003014 phosphoric acid esters Chemical class 0.000 claims 4
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M Carbamate Chemical compound NC([O-])=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 3
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M Thiocarbamate Chemical compound NC([S-])=O GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 3
- LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N teixobactin Chemical group C([C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H]1C(N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2NC(=N)NC2)C(=O)N[C@H](C(=O)O[C@H]1C)[C@@H](C)CC)=O)NC)C1=CC=CC=C1 LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N 0.000 claims 3
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims 2
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 claims 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 125000002993 cycloalkylene group Chemical group 0.000 claims 2
- 125000000018 nitroso group Chemical group N(=O)* 0.000 claims 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 claims 2
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 claims 2
- UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N thiourea Chemical compound NC(N)=S UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 claims 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/02—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
1. Способ получения олигомерного соединения, состоящего из двух или более индивидуальных олигомеров, в котором индивидуальные олигомеры разделены фоторасщепляемым линкером, и который включает стадию расщепления вышеупомянутого линкера. ! 2. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры независимо выбраны из группы, состоящей из олигонуклеотидов, олигосахаридов и олигопептидов. ! 3. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой олигонуклеотиды. ! 4. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигонуклеотиды. ! 5. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигорибонуклеотиды. ! 6. Способ по п.1, в котором линкер стабилен в условиях снятия защиты с каждого индивидуального олигомера. ! 7. Способ по п.1, в котором линкер расщепляют под действием УФ облучения или видимого света. ! 8. Способ по п.4, в котором вышеназванные олигонуклеотиды представляют собой олигорибонуклеотиды. ! 9. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы I, ! ! где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из ! СН3ОС6Н4- и С6Н5-. ! или PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-, ! где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси соединения; ! Х представляет собой О, N или S; ! R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN,
Claims (16)
1. Способ получения олигомерного соединения, состоящего из двух или более индивидуальных олигомеров, в котором индивидуальные олигомеры разделены фоторасщепляемым линкером, и который включает стадию расщепления вышеупомянутого линкера.
2. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры независимо выбраны из группы, состоящей из олигонуклеотидов, олигосахаридов и олигопептидов.
3. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой олигонуклеотиды.
4. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигонуклеотиды.
5. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигорибонуклеотиды.
6. Способ по п.1, в котором линкер стабилен в условиях снятия защиты с каждого индивидуального олигомера.
7. Способ по п.1, в котором линкер расщепляют под действием УФ облучения или видимого света.
8. Способ по п.4, в котором вышеназванные олигонуклеотиды представляют собой олигорибонуклеотиды.
9. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы I,
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
СН3ОС6Н4- и С6Н5-.
или PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси соединения;
Х представляет собой О, N или S;
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, O-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
по меньшей мере, один из заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
10. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы II
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из;
СН3ОС6Н4-, С6Н5-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси;
Х представляет собой О, N или S;
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
U, V, W образуют цепь, которая одним своим концом заменяет один из остатков R1-R5, а другим концом заменяет один из остатков R7-R11;
U, V, W независимо могут отсутствовать или представлять собой алкиленовую (-R-), циклоалкиленовую (-R-), или ариленовую (-Ar-) группу, -O-, -S-, -NR'-, -C(O)-, -C(O)O-, -C(O)NR'-, -OC(O)O-, -OC(O)NR'-, -NR'C(O)NR''-, -OC(S)NR'-, -NR'C(S)NR''-, -S(O)-, -S(O2)-, -S(O2)NR'-, -OP(O2)O-, и могут содержать метку или флуоресцентную группу, или группу, которая служит для улучшения фармакологического профиля олигонуклеотида;
R7, R8, R9, R10 и R11 могут быть независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R7-R11 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
R12 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
Y представляет собой О, N, или S;
Z представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, способные к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
11. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы I
где PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
R3 представляет собой -CH2-O-P(N[iPr]2)-O-CH2-CH2-CN);
R2, R4, R5 и R6 представляет собой водород;
12. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы II
где PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х и Y представляют собой О;
R1 и R7 представляют собой нитрогруппы;
R2, R4, R5, R6, R8, R10, R11 и R12 представляют собой водород;
U представляет собой кислород и замещает R3;
V представляет собой -СН2-СН2-СН2-;
W представляет собой кислород и замещает R9;
Z представляет собой -P(N[iPr]2)-O-CH2-CH2-CN).
13. Соединение формулы I
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)С-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
СН3ОС6Н4- и С6Н5-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси;
Х представляет собой О, N или S;
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
по меньшей мере один из заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью;
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
14. Соединение по п.13, где
PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
R3 представляет собой -CH2-O-P(N[iPr]2)-O-CH2-CH2-CN);
R2, R4, R5, и R6 представляют собой водород;
15. Соединение формулы II
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
CH3OC6H4- и С6Н5-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси соединения;
Х представляет собой О, N или S;
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляет собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
U, V, W образуют цепь, которая одним своим концом заменяет один из остатков R1-R5, а другим концом заменяет один из остатков R7-R11;
U, V, W независимо могут отсутствовать или представлять собой алкиленовую (-R-), циклоалкиленовую (-R-), или ариленовую (-Ar-) группу, -O-, -S-, -NR'-, -C(O)-, -C(O)O-, -C(O)NR'-, -OC(O)O-, -OC(O)NR'-, -NR'C(O)NR''-, -OC(S)NR'-, -NR'C(S)NR''-, -S(O)-, -S(O2)-, -S(O2)NR'-, -OP(O2)O-, и могут содержать метку или флуоресцентную группу, или группу, которая служит для улучшения фармакологического профиля олигонуклеотида;
R7, R8, R9, R10, и R11 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', NH2, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R7-R11 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
R12 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SO3H, SO2O-низший алкил/арил, SO2NR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
Y представляет собой О, N, или S;
Z представляет собой фосфоамидит, фосфонат или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
16. Соединение по п.15, где
PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
R3 представляет собой -CH2-O-P(N[iPr]2)-O-CH2-CH2-CN);
R2, R4, R5, и R6 представляют собой водород.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GBGB0601031.8A GB0601031D0 (en) | 2006-01-18 | 2006-01-18 | Organic compounds |
| GB0601031.8 | 2006-01-18 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008133474A true RU2008133474A (ru) | 2010-02-27 |
Family
ID=36010544
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008133474/04A RU2008133474A (ru) | 2006-01-18 | 2007-01-16 | Получение олигонуклеотидов с использованием фоторасщепляемых линкеров |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20110092693A1 (ru) |
| EP (1) | EP1981899A1 (ru) |
| JP (1) | JP2009523746A (ru) |
| KR (1) | KR20080083668A (ru) |
| CN (1) | CN101374851A (ru) |
| AU (1) | AU2007207131A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0706586A2 (ru) |
| CA (1) | CA2637072A1 (ru) |
| GB (1) | GB0601031D0 (ru) |
| RU (1) | RU2008133474A (ru) |
| WO (1) | WO2007082713A1 (ru) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2532643A1 (en) | 2007-06-08 | 2012-12-12 | MannKind Corporation | IRE-1A Inhibitors |
| EP2238459B1 (en) | 2008-01-23 | 2019-05-08 | Roche Diagnostics GmbH | Integrated instrument performing synthesis and amplification |
| JP5457222B2 (ja) | 2009-02-25 | 2014-04-02 | エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 小型化ハイスループット核酸分析 |
| US9347092B2 (en) | 2009-02-25 | 2016-05-24 | Roche Molecular System, Inc. | Solid support for high-throughput nucleic acid analysis |
| WO2011008173A1 (en) * | 2009-07-15 | 2011-01-20 | Agency For Science, Technology And Research | Improved screening of biopolymers |
| JP6123096B2 (ja) * | 2012-10-04 | 2017-05-10 | ヴェンタナ メディカル システムズ， インク． | 一過性のバイオコンジュゲート合成のための、ジアリールスルフィド骨格を有する光開裂性リンカー分子 |
| CA2997120A1 (en) * | 2015-09-03 | 2017-03-09 | Nanostring Technologies, Inc. | Multivalent probes having single nucleotide resolution |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5296487A (en) * | 1990-01-02 | 1994-03-22 | Fujisawa Pharmaceutical Co., Ltd. | Quinazoline derivatives and their preparation |
| WO1996016077A2 (en) * | 1994-11-16 | 1996-05-30 | Agouron Pharmaceuticals, Inc. | Reagent for quantifying free amine groups |
| EP0799834A1 (en) * | 1996-04-04 | 1997-10-08 | Novartis AG | Modified nucleotides |
| US6630496B1 (en) * | 1996-08-26 | 2003-10-07 | Genetics Institute Llc | Inhibitors of phospholipase enzymes |
| GB9727186D0 (en) * | 1997-12-24 | 1998-02-25 | Du Pont Uk | Photoactive materials applicable to imaging systems |
| ATE358185T1 (de) * | 2002-02-01 | 2007-04-15 | Bruker Daltonik Gmbh | Mutationsanalyse mittels pcr und massenspektrometrie |
| US6822097B1 (en) * | 2002-02-07 | 2004-11-23 | Amgen, Inc. | Compounds and methods of uses |
| TW200420559A (en) * | 2002-11-19 | 2004-10-16 | Takeda Chemical Industries Ltd | Amine compounds and method for producing the same |
-
2006
- 2006-01-18 GB GBGB0601031.8A patent/GB0601031D0/en not_active Ceased
-
2007
- 2007-01-16 BR BRPI0706586-8A patent/BRPI0706586A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2007-01-16 WO PCT/EP2007/000337 patent/WO2007082713A1/en active Application Filing
- 2007-01-16 JP JP2008550677A patent/JP2009523746A/ja active Pending
- 2007-01-16 US US12/161,375 patent/US20110092693A1/en not_active Abandoned
- 2007-01-16 AU AU2007207131A patent/AU2007207131A1/en not_active Abandoned
- 2007-01-16 CA CA002637072A patent/CA2637072A1/en not_active Abandoned
- 2007-01-16 EP EP07702794A patent/EP1981899A1/en not_active Withdrawn
- 2007-01-16 CN CNA2007800032725A patent/CN101374851A/zh active Pending
- 2007-01-16 KR KR1020087017410A patent/KR20080083668A/ko not_active Application Discontinuation
- 2007-01-16 RU RU2008133474/04A patent/RU2008133474A/ru not_active Application Discontinuation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2007082713A1 (en) | 2007-07-26 |
| GB0601031D0 (en) | 2006-03-01 |
| CA2637072A1 (en) | 2007-07-26 |
| CN101374851A (zh) | 2009-02-25 |
| JP2009523746A (ja) | 2009-06-25 |
| EP1981899A1 (en) | 2008-10-22 |
| KR20080083668A (ko) | 2008-09-18 |
| BRPI0706586A2 (pt) | 2011-03-29 |
| AU2007207131A1 (en) | 2007-07-26 |
| US20110092693A1 (en) | 2011-04-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008133474A (ru) | Получение олигонуклеотидов с использованием фоторасщепляемых линкеров | |
| RU2007136535A (ru) | Пептидомиметические соединения и получение биологически активных производных | |
| CA2392033A1 (en) | Non-aggregating, non-quenching oligomers comprising nucleotide analogues; methods of synthesis and use thereof | |
| DE60213640D1 (de) | Verfahren zum Frakturieren einer unterirdischen Lagerstätten unter Verwendung von Geliersäuren | |
| RU2009132006A (ru) | Антитела и содержащие их фармацевтические композиции, подходящие для ингибирования активности металлопротеинов | |
| BRPI0618855A2 (pt) | reagente de marcação de polinucleotìdeo | |
| RU2008128853A (ru) | Катионные олигонуклеотиды, автоматизированные способы их получения и их применение | |
| BRPI0415855A (pt) | processo para preparação de ésteres de ácido 2-dihalogenacil-3-amino-acrìlico e ésteres de ácido 3-dihalogeno-metil-pirazol-4-carboxìlico | |
| RU2011140219A (ru) | Пролекарства интерферона альфа на носителе | |
| Porcheddu et al. | A practical and efficient approach to PNA monomers compatible with Fmoc‐mediated solid‐phase synthesis protocols | |
| DK0818460T3 (da) | Fastfasesyntese af oligonucleotider | |
| US8497398B1 (en) | Polyamine transporter selective compounds as anti-cancer agents | |
| US20230242567A1 (en) | Chiral phosphoramidite auxiliaries and methods of their use | |
| RU2011106570A (ru) | Азотсодержащие производные панкратистатина | |
| RU2009112407A (ru) | Способ получения оптически активных аминофосфинилбутановых кислот | |
| US11332489B2 (en) | Process for preparing imetelstat | |
| RU2007126972A (ru) | Способ получения n-замещенных салициламидов | |
| Lee et al. | Preparation of pilot library with tetrahydro-β-carboline alkaloid core skeleton using tandem intramolecular Pictet–Spengler cyclization | |
| ES2377263B1 (es) | Compuestos maleimido-furanilo útiles en un procedimiento general de preparación de derivados maleimido-oligonucleótido. | |
| US20040039189A1 (en) | Novel amidite derivates for synthesising polymers on surfaces | |
| US20080038783A1 (en) | Compositions and Methods Pertaining to Guanylation of PNA Oligomers | |
| RU2008115405A (ru) | Производные 5-гидрокси-4-аминометил-1-циклогексил (или циклогептил)-3-алкоксикарбонилиндолов, их фармацевтически приемлемые соли, обладающие противовирусной активностью, и способ из получения | |
| JP2008512451A5 (ru) | ||
| CN104684921B (zh) | 用于暂时性生物缀合物合成的具有二芳基硫化物骨架的光可裂解的衔接物分子 | |
| US7781582B2 (en) | Process for the preparation of 2-amino-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidines |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20110404 |
|
| FZ9A | Application not withdrawn (correction of the notice of withdrawal) |
Effective date: 20110818 |
|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20120503 |