RU2008109855A - Микроорганизмы с повышенной эффективностью синтеза метионина - Google Patents

Микроорганизмы с повышенной эффективностью синтеза метионина Download PDF

Info

Publication number
RU2008109855A
RU2008109855A RU2008109855/13A RU2008109855A RU2008109855A RU 2008109855 A RU2008109855 A RU 2008109855A RU 2008109855/13 A RU2008109855/13 A RU 2008109855/13A RU 2008109855 A RU2008109855 A RU 2008109855A RU 2008109855 A RU2008109855 A RU 2008109855A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
products
enhanced
attenuated
organism
methionine
Prior art date
Application number
RU2008109855/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Оскар ЦЕЛЬДЕР (DE)
Оскар Цельдер
Андреа ХЕРОЛЬД (DE)
Андреа ХЕРОЛЬД
Коринна КЛОППРОГГЕ (DE)
Коринна КЛОППРОГГЕ
Хартвиг ШРЕДЕР (DE)
Хартвиг ШРЕДЕР
Штефан ХЭФНЕР (DE)
Штефан ХЭФНЕР
Эльмар ХАЙНЦЛЕ (DE)
Эльмар ХАЙНЦЛЕ
Кристоф ВИТТМАНН (DE)
Кристоф ВИТТМАНН
Йенс КРЕМЕР (DE)
Йенс КРЕМЕР
Дженис ПЕРО (US)
Дженис ПЕРО
Роджерс ЙОКУМ (US)
Роджерс ЙОКУМ
Томас ПАТТЕРСОН (US)
Томас ПАТТЕРСОН
Марк УИЛЛИАМС (US)
Марк УИЛЛИАМС
Тэрон ХЕРМАН (US)
Тэрон ХЕРМАН
Original Assignee
Эвоник Дегусса ГмБх (DE)
Эвоник Дегусса Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Эвоник Дегусса ГмБх (DE), Эвоник Дегусса Гмбх filed Critical Эвоник Дегусса ГмБх (DE)
Publication of RU2008109855A publication Critical patent/RU2008109855A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/12—Methionine; Cysteine; Cystine

Landscapes

  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

1. Способ определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, причем способ предусматривает стадии ! а. параметризации метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина; ! b. определения теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма. ! 2. Устройство для определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, причем устройство содержит процессор, приспособленный к выполнению следующих стадий способа: ! а. параметризация метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма дикого типа с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина; ! b. определение теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма. ! 3. Машиночитаемый носитель, на котором записана компьютерная программа для определения организм

Claims (23)

1. Способ определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, причем способ предусматривает стадии
а. параметризации метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина;
b. определения теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма.
2. Устройство для определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, причем устройство содержит процессор, приспособленный к выполнению следующих стадий способа:
а. параметризация метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма дикого типа с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина;
b. определение теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма.
3. Машиночитаемый носитель, на котором записана компьютерная программа для определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, которая при ее выполнении процессором приспособлена для реализации следующих стадий способа:
а. параметризация метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина;
b. определение теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма.
4. Программный элемент для определения организма с повышенной эффективностью синтеза метионина, который при его выполнении процессором приспособлен для реализации следующих стадий способа:
а. параметризация метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина;
b. определение теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма.
5. Способ получения организма, выбранного из группы прокариот, низших эукариот и растений, с повышенной эффективностью синтеза метионина по сравнению с исходными организмами, предусматривающий следующие стадии:
а. параметризация метаболического потока первичного синтезирующего метионин организма с помощью множества параметров, полученных на основании ранее известных метаболических путей, связанных с синтезом метионина;
b. определение теоретической модели организма с повышенной эффективностью синтеза метионина путем модификации, по меньшей мере, одного из множества параметров и/или введения, по меньшей мере, одного дополнительного такого параметра таким образом, чтобы повысить эффективность синтеза метионина по сравнению с эффективностью синтеза метионина первичного синтезирующего метионин организма;
с. генная модификация исходного организма таким образом, чтобы модифицировать, по меньшей мере, один имеющийся метаболический путь организма так, чтобы метаболический поток организма был приближен к теоретической модели организма, и/или
d. генная модификация исходного организма таким образом, чтобы ввести в организм, по меньшей мере, один экзогенный метаболический путь так, чтобы метаболический поток организма был приближен к теоретической модели организма, и/или
е. обеспечение наличия, по меньшей мере, одного внешнего метаболита в количестве, достаточном для направления метаболического потока через метаболические пути, модифицированные на стадии с и/или введенные на стадии d.
6. Способ по п.5, в котором
метаболический поток, по меньшей мере, через один из имеющихся метаболических путей, выбранных из группы, состоящей из
фосфотрансферазной системы (PTS),
пентозофосфатного пути (РРР),
гликолиза (ЕМР),
цикла трикарбоновых кислот (ТСА),
глиоксилатного шунта (GS),
анаплероза (АР),
дыхательной цепи (RC),
ассимиляции серы (SA),
синтеза метионина (MS),
синтеза серина/цистеина/глицина (SCGS),
системы катаболизма глицина (GCS),
трансгидрогеназной реакции (THGC),
пути 1 (Р1),
пути 2 (Р2),
пути 3 (Р3),
пути 4 (Р4),
пути 5 (Р5),
пути 6 (Р6),
пути 7 (Р7),
пути 8 (Р8),
модифицирован путем генной модификации организмов и/или
метаболический поток, по меньшей мере, через один из следующих экзогенных метаболических путей, выбранных из группы, состоящей из
системы катаболизма глицина (GCS),
трансгидрогеназной реакции (THGC),
тиосульфатредуктазной системы (TRS),
сульфитредуктазной системы (SRS),
сульфатредуктазной системы (SARS),
формиатконвертирующей системы (FCS),
метантиолконвертирующей системы (MCS),
введен путем генной модификации организмов и/или
организмы культивируют в присутствии внешних метаболитов, выбранных из группы, состоящей из
сульфата,
сульфита,
сульфида,
тиосульфата,
С1-метаболитов, таких как формиат, формальдегид, метанол, метантиол или его димер диметилдисульфид.
7. Способ получения организма, выбранного из группы прокариот, низших эукариот и растений, с повышенной эффективностью синтеза метионина по сравнению с исходными организмами, предусматривающий следующие стадии:
а. модификация метаболического потока, по меньшей мере, через один из метаболических путей, выбранных из группы, состоящей из
фосфотрансферазной системы (PTS),
пентозофосфатного пути (РРР),
гликолиза (ЕМР),
цикла трикарбоновых кислот (ТСА),
глиоксилатного шунта (GS),
анаплероза (АР),
дыхательной цепи (RC),
ассимиляции серы (SA),
синтеза метионина (MS),
синтеза серина/цистеина/глицина (SCGS),
системы катаболизма глицина (GCS),
трансгидрогеназной реакции (THGC),
пути 1 (Р1),
пути 2 (Р2),
пути 3 (Р3),
пути 4 (Р4),
пути 5 (Р5),
пути 6 (Р6),
пути 7 (Р7),
пути 8 (Р8),
путем генной модификации организма и/или
b. введение метаболического потока, по меньшей мере, через один из следующих экзогенных метаболических путей, выбранных из группы, состоящей из
системы катаболизма глицина (GCS),
трансгидрогеназной реакции (THGC),
тиосульфатредуктазной системы (TRS),
сульфитредуктазной системы (SRS),
сульфатредуктазной системы (SARS),
формиатконвертирующей системы (FCS),
метантиолконвертирующей системы (MCS),
путем генной модификации организма и/или
с. культивирование организмов в присутствии, по меньшей мере, одного внешнего метаболита, выбранного из группы, состоящей из
сульфата,
сульфита,
сульфида,
тиосульфата,
органических источников серы,
С1-метаболитов, таких как формиат, формальдегид, метанол, метантиол или его димер диметилдисульфид.
8. Организм, выбранный из группы прокариот, низших эукариот и растений, с повышенной эффективностью синтеза метионина по сравнению с исходными организмами, полученный в соответствии со способами по любому из пп.5-7.
9. Организм по п.8, причем организм выбран из группы, состоящей из микроорганизмов рода Corynebacterium, рода Brevibacterium, рода Escherichia, дрожжей и растений.
10. Способ получения микроорганизма рода Corynebacterium с повышенной эффективностью продукции метионина, предусматривающий следующие стадии:
а. усиление и/или введение метаболического потока, по меньшей мере, через один из путей, выбранных из группы, состоящей из
фосфотрансферазной системы (PTS) и/или
пентозофосфатного пути (РРР) и/или
ассимиляции серы (SA) и/или
анаплероза (АР) и/или
синтеза метионина (MS) и/или
синтеза серина/глицина (SCGS) и/или
системы катаболизма глицина (GCS) и/или
трансгидрогеназной реакции (THGC) и/или
пути 1 (Р1) и/или
пути 2 (Р2) и/или
тиосульфатредуктазной системы (TRS) и/или
сульфитредуктазной системы (SRS) и/или
сульфатредуктазной системы (SARS) и/или
формиатконвертирующей системы (FCS) и/или
метантиолконвертирующей системы (MCS),
по сравнению с исходным организмом путем его генной модификации, и/или
b. по меньшей мере, частичное ослабление метаболического потока, по меньшей мере, через один из путей, выбранных из группы, состоящей из
гликолиза (ЕМР) и/или
цикла трикарбоновых кислот (ТСА) и/или
глиоксилатного шунта (GS) и/или
дыхательной цепи (RC) и/или
R19 и/или
R35 и/или
R79 и/или
пути 3 (Р3) и/или
пути 4 (Р4) и/или
пути 7 (Р7),
по сравнению с исходным организмом путем его генной модификации.
11. Способ по п.10, в котором количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R1 для усиленной продукции G6P и/или
R3 для усиленной продукции GLC-LAC и/или
R4 для усиленной продукции 6-Р-глюконата и/или
R5 для усиленной продукции RIB-5P и/или
R6 для усиленной продукции XYL-5P и/или
R7 для усиленной продукции RIBO-5P и/или
R8 для усиленной продукции S7P и GA3P и/или
R9 для усиленной продукции Е-4р и F6P и/или
R10 для усиленной продукции F6P и GA3P и/или
R2 для усиленной продукции G6P и/или
R55 для усиленной продукции Н2SО3 и/или
R58 для усиленной продукции Н2S и/или
R71 для усиленной продукции M-HPL и/или
R72 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R70 для усиленной продукции NADPH и/или
R81 для усиленной продукции NADPH и/или
R25 для усиленной продукции Glu и/или
R33 и/или R36 для усиленной продукции ОАА и/или
R30 для усиленной продукции MAL и/или
R57 для усиленной продукции Pyr и/или
R73 для метаболизации тиосульфата в сульфид и сульфит и/или
R82 для транспорта большего количества внешнего тиосульфата в клетку и/или
R74 для метаболизации сульфита в сульфид и/или
R75 для усиленной продукции 10-формил-THF и/или
R76 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R78 для усиленной продукции метил-THF и/или
R77 для метилсульфгидрилирования O-ацетилгомосерина метантиолом и/или
R80 для метаболизации сульфата в сульфит и/или
R47 и/или
R48 и/или
R39 и/или
R46 и/или
R49 и/или
R52 и/или
R52 и/или
R54
увеличены и/или введены по сравнению с исходным организмом, и/или количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R11 для ослабленной продукции F-1,6-ВР и/или
R13 для ослабленной продукции DHAP и GA3P и/или
R14 для ослабленной продукции GA3P и/или
R15 для ослабленной продукции 1,3-PG и/или
R16 для ослабленной продукции 3-PG и/или
R17 для ослабленной продукции 2-PG и/или
R18 для ослабленной продукции PEP и/или
R19 для ослабленной продукции Pyr и/или
R20 для ослабленной продукции Ас-СоА и/или
R21 для ослабленной продукции CIT и/или
R22 для ослабленной продукции Cis-ACO и/или
R23 для ослабленной продукции ICI и/или
R24 для ослабленной продукции 2-OХO и/или
R26 для ослабленной продукции SUCC-CoA и/или
R27 для ослабленной продукции SUCC и/или
R28 для ослабленной продукции FUM и/или
R29 для ослабленной продукции MAL и/или
R30 для ослабленной продукции ОАА и/или
R21 для ослабленной продукции CIT и/или
R22 для ослабленной продукции Cis-ACO и/или
R23 для ослабленной продукции ICI и/или
R31 для ослабленной продукции GLYOXY и SUCC и/или
R32 для ослабленной продукции MAL и/или
R28 для ослабленной продукции FUM и/или
R29 для ослабленной продукции MAL и/или
R30 для ослабленной продукции ОАА и/или
R60 и/или
R56 и/или
R62 и/или
R61 и/или
R19 и/или
R35 и/или
R79,
по меньшей мере, частично уменьшены по сравнению с исходным организмом.
12. Способ по п.11, в котором количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R3 для усиленной продукции GLC-LAC и/или
R4 для усиленной продукции 6-Р-глюконата и/или
R5 для усиленной продукции RIB-5P и/или
R10 для усиленной продукции F6P и GA3P и/или
R2 для усиленной продукции G6P и/или
R55 для усиленной продукции Н2SО3 и/или
R58 для усиленной продукции H2S и/или
R71 для усиленной продукции M-HPL и/или
R72 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R70 для усиленной продукции NADPH и/или
R81 для усиленной продукции NADPH и/или
R25 для усиленной продукции Glu и/или
R33 и/или R36 для усиленной продукции ОАА и/или
R30 для усиленной продукции MAL и/или
R57 для усиленной продукции Pyr и/или
R73 для метаболизации тиосульфата в сульфид и сульфит и/или
R82 для транспорта большего количества внешнего тиосульфата в клетку и/или
R75 для продукции 10-формил-THF и/или
R76 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R78 для усиленной продукции метил-THF и/или
R77 для метилсульфгидрилирования O-ацетилгомосерина метантиолом и/или
R47 и/или
R48 и/или
R39 и/или
R46 и/или
R49 и/или
R52 и/или
R52 и/или
R54 и/или
R80 для метаболизации сульфата в сульфит
увеличены и/или введены по сравнению с исходным организмом, и/или
количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R11 для ослабленной продукции F-1,6-BP и/или
R19 для ослабленной продукции Pyr и/или
R20 для ослабленной продукции Ас-СоА и/или
R21 для ослабленной продукции CIT и/или
R24 для ослабленной продукции 2-OХO и/или
R26 для ослабленной продукции SUCC-CoA и/или
R27 для ослабленной продукции SUCC и/или
R31 для ослабленной продукции GLYOXY и SUCC и/или
R32 для ослабленной продукции MAL и/или
R19 для ослабленной продукции пирувата и/или
R35 для ослабленной продукции PEP и/или
R79 для ослабленной продукции THF,
по меньшей мере, частично уменьшены по сравнению с исходным организмом.
13. Способ по п.11, в котором количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R3 для усиленной продукции GLC-LAC и/или
R4 для усиленной продукции 6-Р-глюконата и/или
R5 для усиленной продукции RIB-5P и/или
R10 для усиленной продукции F6P и GA3P и/или
R2 для усиленной продукции G6P и/или
R55 для усиленной продукции Н2SО3 и/или
R58 для усиленной продукции H2S и/или
R71 для усиленной продукции M-HPL и/или
R72 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R78 для усиленной продукции метил-THF and
R70 для усиленной продукции NADPH и/или
R81 для усиленной продукции NADPH и/или
R25 для усиленной продукции Glu и/или
R33 и/или R36 для усиленной продукции ОАА и/или
R30 для усиленной продукции MAL и/или
R57 для усиленной продукции Pyr и/или
R73 для метаболизации тиосульфата в сульфид и сульфит и/или
R82 для транспорта большего количества внешнего тиосульфата в клетку и/или
R75 для продукции 10-формил-THF и/или
R76 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R77 для метилсульфгидрилирования О-ацетилгомосерина метантиолом и/или
R47 и/или
R48 и/или
R39 и/или
R46 и/или
R49 и/или
R52 и/или
R52 и/или
R54 и/или
R80 для метаболизации сульфата в сульфит
увеличены и/или введены по сравнению с исходным организмом, и/или
количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R11 для ослабленной продукции F-1,6-ВР и/или
R19 для ослабленной продукции Pyr и/или
R20 для ослабленной продукции Ас-СоА и/или
R21 для ослабленной продукции CIT и/или
R24 для ослабленной продукции 2-OХO и/или
R26 для ослабленной продукции SUCC-CoA и/или
R27 для ослабленной продукции SUCC и/или
R31 для ослабленной продукции GLYOXY и SUCC и/или
R32 для ослабленной продукции MAL и
R19 для ослабленной продукции пирувата и
R35 для ослабленной продукции PEP и
R79 для ослабленной продукции THF,
по меньшей мере, частично уменьшены по сравнению с исходным организмом.
14. Микроорганизм рода Corynebacterium, полученный в соответствии с любым из способов по пп.10-13, предпочтительно выбранный из группы, состоящей из Corynebacterium acetoacidophilum, С. acetoglutamicum, С. acetophilum, С. ammoniagenes, С. glutamicum, С. lilium, С. nitrilophilus или С. spec., и предпочтительно Corynebacterium glutamicum ATCC 13032, Corynebacterium acetoglutamicum ATCC 15806, Corynebacterium acetoacidophilum ATCC 13870, Corynebacterium thermoaminogenes FERM BP-1539, Corynebacterium melassecola ATCC 17965, Corynebacterium glutamicum KFCC 10065, Corynebacterium glutamicum ATCC 21608 и Corynebacterium glutamicum DSM 17322A.
15. Способ получения микроорганизма рода Escherichia с повышенной эффективностью продукции метионина, предусматривающий следующие стадии:
усиление и/или введение метаболического потока, по меньшей мере, через один из путей, выбранных из группы, состоящей из
фосфотрансферазной системы (PTS) и/или
гликолиза (ЕМР) и/или
цикла трикарбоновых кислот (ТСА) и/или
глиоксилатного шунта (GS) и/или
пути 1 (Р1) и/или
ассимиляции серы (SA) и/или
анаплероза (АР) и/или
синтеза метионина (MS) и/или
система синтеза серина/цистеина/глицина (SCGS) и/или
системы катаболизма глицина (GCS) и/или
трансгидрогеназной реакции (THGC) и/или
тиосульфатредуктазной системы (TRS) и/или
сульфитредуктазной системы (SRS) и/или
сульфатредуктазной системы (SARS) и/или
формиатконвертирующей системы (FCS) и/или
метантиолконвертирующей системы (MCS) и/или
система синтеза серина/цистеина/глицина (SCGS),
по сравнению с исходным организмом путем его генной модификации, и/или,
по меньшей мере, частичное ослабление метаболического потока, по меньшей мере, через один из путей, выбранных из группы, состоящей из
пентозофосфатного пути (РРР) и/или
R19 для ослабленной продукции пирувата и/или
R35 для ослабленной продукции PEP и/или
R79 для ослабленной продукции THF и/или
пути 3 (Р3) и/или
пути 4 (Р4) и/или
пути 7 (Р7),
по сравнению с исходным организмом путем его генной модификации.
16. Способ по п.15, в котором количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R1 для усиленной продукции G6P и/или
R2 для усиленной продукции F6P и/или
R11 для усиленной продукции F-1,6-BP и/или
R13 для усиленной продукции DHAP и GA3P и/или
R14 для усиленной продукции GA3P и/или
R15 для усиленной продукции 1,3-PG и/или
R16 для усиленной продукции 3-PG и/или
R17 для усиленной продукции 2-PG и/или
R18 для усиленной продукции PEP и/или
R19 для усиленной продукции Pyr и/или
R20 для усиленной продукции Ас-СоА и/или
R21 для усиленной продукции CIT и/или
R22 для усиленной продукции Cis-ACO и/или
R23 для усиленной продукции ICI и/или
R24 для усиленной продукции 2-OХO и/или
R26 для усиленной продукции SUCC-CoA и/или
R27 для усиленной продукции SUCC и/или
R28 для усиленной продукции FUM и/или
R29 для усиленной продукции MAL и/или
R30 для усиленной продукции ОАА и/или
R21 для усиленной продукции CIT и/или
R22 для усиленной продукции Cis-ACO и/или
R23 для усиленной продукции ICI и/или
R31 для усиленной продукции GLYOXY и SUCC и/или
R32 для усиленной продукции MAL и/или
R28 для усиленной продукции FUM и/или
R29 для усиленной продукции MAL и/или
R30 для усиленной продукции ОАА и/или
R25 для усиленной продукции Glu и/или
R55 для усиленной продукции Н2SO3 и/или
R58 для усиленной продукции H2S и/или
R71 для усиленной продукции M-HPL и/или
R72 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R78 для усиленной продукции метил-THF и/или
R70 для усиленной продукции NADPH и/или
R81 для усиленной продукции NADPH и/или
R73 для метаболизации тиосульфата в сульфид и сульфит и/или
R82 для транспорта большего количества внешнего тиосульфата в клетку и/или
R74 для метаболизации сульфита в сульфид и/или
R75 для усиленной продукции 10-формил-THF и/или
R76 для усиленной продукции метилен-THF из 10-формил-THF и/или
R77 для метилсульфгидрилирования O-ацетилгомосерина метантиолом и/или
R80 для метаболизации сульфата в сульфит и/или
R44 для усиленной продукции O-Ac-SER и/или
R45 для усиленной продукции CYS
увеличены и/или введены по сравнению с исходным организмом, и/или
количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R3 для ослабленной продукции GLC-LAC и/или
R4 для ослабленной продукции 6-Р-глюконата и/или
R5 для ослабленной продукции RIB-5P и/или
R6 для ослабленной продукции XYL-5P и/или
R7 для ослабленной продукции RIBO-5P и/или
R8 для ослабленной продукции S7P и GA3P и/или
R9 для ослабленной продукции Е-4р и F6P и/или
R10 для ослабленной продукции F6P и GA3P и/или
R2 для ослабленной продукции G6P и/или
R49 для ослабленной продукции HOMOCYS и/или
R19 для ослабленной продукции пирувата и/или
R35 для ослабленной продукции PEP и/или
R79 для ослабленной продукции THF и/или
R56 и/или
R62 и/или
R61,
по меньшей мере, частично уменьшены по сравнению с исходным организмом.
17. Способ по п.16, в котором количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R1 для усиленной продукции G6P и/или
R2 для усиленной продукции F6P и/или
R11 для усиленной продукции F-1,6-BP и/или
R19 для усиленной продукции Руr и/или
R20 для усиленной продукции Ас-СоА и/или
R21 для усиленной продукции CIT и/или
R24 для усиленной продукции 2-OХO и/или
R26 для усиленной продукции SUCC-CoA и/или
R31 для усиленной продукции GLYOXY и SUCC и/или
R32 для усиленной продукции MAL и/или
R25 для усиленной продукции Glu и/или
R55 для усиленной продукции Н2SО3 и/или
R58 для усиленной продукции H2S и/или
R71 для усиленной продукции M-HPL и/или
R72 для усиленной продукции метилен-THF и/или
R78 для усиленной продукции метил-THF и/или
R70 для усиленной продукции NADPH и/или
R81 для усиленной продукции NADPH и/или
R73 для метаболизации тиосульфата в сульфид и сульфит и/или
R82 для транспорта большего количества внешнего тиосульфата в клетку и/или
R74 для метаболизации сульфита в сульфид и/или
R75 для усиленной продукции 10-формил-THF и/или
R76 для усиленной продукции метилен-THF из 10-формил-THF и/или
R77 для метилсульфгидрилирования O-ацетилгомосерина метантиолом и/или
R80 для метаболизации сульфата в сульфит и/или
R44 для усиленной продукции O-Ac-SER и/или
R45 для усиленной продукции CYS
увеличены и/или введены по сравнению с исходным организмом, и/или
количество и/или активность ферментов, выбранных из группы, состоящей из
R3 для ослабленной продукции GLC-LAC и/или
R4 для ослабленной продукции 6-Р-глюконата и/или
R5 для ослабленной продукции RIB-5P и/или
R10 для ослабленной продукции F6P и GA3P и/или
R19 для ослабленной продукции пирувата и/или
R35 для ослабленной продукции PEP и/или
R79 для ослабленной продукции THF,
по меньшей мере, частично уменьшены по сравнению с исходным организмом.
18. Микроорганизм рода Escherichia, полученный в соответствии с любым из способов по пп.15-17, предпочтительно выбранный из группы, состоящей E. coli.
19. Организм по п.8 или 9, отличающийся тем, что метионин продуцируется с мольным отношением метионина к расходуемой глюкозе, составляющим, по меньшей мере, 10%, по меньшей мере, 20%, по меньшей мере, 30%, по меньшей мере, 40%, по меньшей мере, 45%, по меньшей мере, 50%, по меньшей мере, 55%, по меньшей мере, 60%, по меньшей мере, 65%, по меньшей мере, 70%, по меньшей мере, 75%, по меньшей мере, 80% или, по меньшей мере, 85%.
20. Организм по п.14 или 18, отличающийся тем, что метионин продуцируется с мольным отношением метионина к расходуемой глюкозе, составляющим, по меньшей мере, 10%, по меньшей мере, 20%, по меньшей мере, 30%, по меньшей мере, 40%, по меньшей мере, 45%, по меньшей мере, 50%, по меньшей мере, 55%, по меньшей мере, 60%, по меньшей мере, 65%, по меньшей мере, 70%, по меньшей мере, 75%, по меньшей мере, 80% или, по меньшей мере, 85%.
21. Применение любого из организмов по п.8, 9, 14, 18, 19 или 20 для производства метионина.
22. Способ производства метионина, предусматривающий следующие стадии:
а. культивирование организма по п.8, 9, 14, 18, 19 или 20,
b. выделение метионина.
23. Способ по п.22, в котором культивирование осуществляют в подходящей среде с добавлением при необходимости тиосульфата, сульфита, сульфида и/или С1-соединений, таких как формиат или метантиол.
RU2008109855/13A 2005-08-18 2006-08-18 Микроорганизмы с повышенной эффективностью синтеза метионина RU2008109855A (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP05107609 2005-08-18
EP05107609.9 2005-08-18
EP06114543 2006-05-24
EP06114543.9 2006-05-24

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2008109855A true RU2008109855A (ru) 2009-09-27

Family

ID=37460385

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008109855/13A RU2008109855A (ru) 2005-08-18 2006-08-18 Микроорганизмы с повышенной эффективностью синтеза метионина

Country Status (8)

Country Link
US (1) US20090191610A1 (ru)
EP (1) EP1931784A2 (ru)
JP (1) JP2009504172A (ru)
KR (1) KR20080039906A (ru)
BR (1) BRPI0614891A2 (ru)
CA (1) CA2620468A1 (ru)
RU (1) RU2008109855A (ru)
WO (1) WO2007020295A2 (ru)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2082045B1 (en) 2006-10-24 2015-03-18 Basf Se Method of reducing gene expression using modified codon usage
BRPI0807760A2 (pt) * 2007-02-19 2014-06-17 Evonik Degussa Gmbh Bactérias corineformes com atividade de formato-thf-sintetase e/ou atividade de clivagem de glicina
WO2009043372A1 (en) 2007-10-02 2009-04-09 Metabolic Explorer Increasing methionine yield
KR101048593B1 (ko) * 2009-02-27 2011-07-12 씨제이제일제당 (주) 메칠머캅탄과 디메칠설파이드의 혼합물을 사용하여 메치오닌 생산능을 증가시키는 방법
DE112010004851T5 (de) 2009-12-17 2012-09-20 Basf Se Verfahren und rekombinante Mikroorganismen für die Herstellung von Cadaverin
EP2519637A2 (en) 2009-12-30 2012-11-07 Metabolic Explorer Strains and method for the production of methionine
BR112012016274B1 (pt) 2009-12-30 2019-08-20 Evonik Degussa Gmbh Aumento da produção de metionina pela superexpressão da succinato desidrogenase
AR083468A1 (es) 2010-10-25 2013-02-27 Metabolic Explorer Sa Aumento de la disponibilidad de nadph para la produccion de metionina
WO2012090021A1 (en) 2010-12-30 2012-07-05 Metabolic Explorer Recombinant microorganism for the fermentative production of methionine
EP2479279A1 (de) 2011-01-20 2012-07-25 Evonik Degussa GmbH Verfahren zur fermentativen Herstellung schwefelhaltiger Aminosäuren
CN103492553B (zh) 2011-02-22 2018-06-12 巴斯夫欧洲公司 用于生产尸胺的方法和重组微生物
CA2862051A1 (en) 2012-01-30 2013-08-08 Myriant Corporation Production of muconic acid from genetically engineered microorganisms
RU2688486C2 (ru) * 2014-01-16 2019-05-21 Калиста, Инк. Микроорганизмы для повышенного продуцирования аминокислот и связанные с ними способы
JP6302073B2 (ja) * 2014-08-21 2018-03-28 公益財団法人地球環境産業技術研究機構 コリネ型細菌形質転換体、及びそれを用いる有機化合物の製造方法
CN109415684B (zh) 2016-03-02 2022-06-07 Ptt全球化学公众有限公司 从基因工程微生物改进的黏康酸生产
KR102472559B1 (ko) * 2019-06-28 2022-12-01 씨제이제일제당 주식회사 황 함유 아미노산 또는 그 유도체의 제조방법

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
HUP9900864A3 (en) * 1995-05-31 2001-11-28 Pioneer Hi Bred Int Methods of increasing accumulation of essential amino acids in seeds
US7892798B2 (en) * 1999-06-25 2011-02-22 Evonik Degussa Gmbh Nucleic acid molecules encoding metabolic regulatory proteins from Corynebacterium glutamicum, useful for increasing the production of methionone by a microorganism
US8338141B2 (en) * 2003-07-08 2012-12-25 Novus International, Inc. Methionine recovery processes

Also Published As

Publication number Publication date
WO2007020295A3 (en) 2007-05-03
KR20080039906A (ko) 2008-05-07
WO2007020295A2 (en) 2007-02-22
BRPI0614891A2 (pt) 2012-12-25
EP1931784A2 (en) 2008-06-18
US20090191610A1 (en) 2009-07-30
CA2620468A1 (en) 2007-02-22
JP2009504172A (ja) 2009-02-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008109855A (ru) Микроорганизмы с повышенной эффективностью синтеза метионина
Krömer et al. Metabolic pathway analysis for rational design of L-methionine production by Escherichia coli and Corynebacterium glutamicum
Bartek et al. Importance of NADPH supply for improved L‐valine formation in Corynebacterium glutamicum
Yang et al. Metabolic flux analysis in Synechocystis using isotope distribution from 13C-labeled glucose
Chen et al. Deregulation of feedback inhibition of phosphoenolpyruvate carboxylase for improved lysine production in Corynebacterium glutamicum
Gage et al. A new route for synthesis of dimethylsulphoniopropionate in marine algae
BRPI0515035A (pt) bactéria corineforme produtora de ácido l-glutámico, método para produzir ácido l-glutámico, gene codificador de alfa-ceto-glutarato desidrogenase mutante, e, alfa-ceto-glutarato desidrogenase mutante
CN101978042A (zh) 利用合成气或其它气态碳源和甲醇的方法和有机体
Liu et al. Erythritol production by Yarrowia lipolytica mutant strain M53 generated through atmospheric and room temperature plasma mutagenesis
Xu et al. Microbial production of mevalonate by recombinant Escherichia coli using acetic acid as a carbon source
Hua et al. Effect of dissolved oxygen concentration on the intracellular flux distribution for pyruvate fermentation
Chen et al. Comparison of glucose and glycerol as carbon sources for ε-poly-l-lysine production by Streptomyces sp. M-Z18
d'Ippolito et al. Recycling of Carbon Dioxide and Acetate as Lactic Acid by the Hydrogen‐Producing Bacterium Thermotoga neapolitana
DE69931162D1 (de) Metabolisch veränderte mikrobiellen zelle mit veränderten metabolitherstellung
Bartsch et al. Glutathione amide and its perthiol in anaerobic sulfur bacteria
Buchanan et al. Oxygen intrusions sustain aerobic nitrite-oxidizing bacteria in anoxic marine zones
Ren et al. S-Adenosyl-l-methionine production by Saccharomyces cerevisiae SAM 0801 using dl-methionine mixture: from laboratory to pilot scale
Ping et al. Effect of oxygen supply on the intracellular flux distribution and a two‐stage OUR control strategy for enhancing the yield of sodium gluconate production by Aspergillus niger
Li et al. Genome-scale metabolic model analysis indicates low energy production efficiency in marine ammonia-oxidizing archaea
González‐Lergier et al. Analysis of the maximum theoretical yield for the synthesis of erythromycin precursors in Escherichia coli
Pablos et al. Toward efficient microaerobic processes using engineered Escherichia coli W3110 strains
Scholten et al. Growth of sulfate-reducing bacteria and methanogenic archaea with methylated sulfur compounds: a commentary on the thermodynamic aspects
Tanaka et al. Generation of hydrogen sulfide from sulfur assimilation in Escherichia coli
CN105255959B (zh) 一种促进利福霉素sv发酵合成效率的补料方法
Shu et al. Prediction of effects of amino acid supplementation on growth of E. coli B/r

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20100225