MXPA03009954A - Agente antibacteriano. - Google Patents

Abstract

La invencion se refiere al uso de sustancias que se enlazan al factor de traslacion bacteriana EF-Tu, para prevenir la formacion de un citoesqueleto en las celulas bacterianas, y para la produccion de agentes antibacterianos. La invencion se refiere ademas a los agentes antibacterianos, que comprenden secciones parciales de las secuencias de aminoacidos de los dominios 2 y/o 3 de una proteina EF-Tu bacteriana, preferentemente con una longitud de 4 a 20 aminoacidos.

Description

AGENTE ANTIBACTERIANO DESCRIPCION La invención se refiere al uso de sustancias que se enlazan al factor de traslación bacteriano EF-Tu para inhibir la formación de un citoesqueleto en las células bacterianas, y para producir agentes antibacterianos. La invención también se refiere a los agentes antibacterianos que contienen secciones parciales de las secuencias de aminoácidos de los dominios 2 y/o 3 de una proteína EF-Tu bacteriana que tiene preferentemente una longitud de 4 a 20 aminoácidos . La penicilina u otros antibióticos que tienen un efecto inhibitorio específico sobre el crecimiento de células bacterianas han sido utilizados previamente, entre otros, como agentes antibacterianos. Este efecto está basado en una inhibición por estos antibióticos de la extensión del esqueleto de peptidoglicano que es necesario para el desarrollo celular. Las células en crecimiento son considerablemente debilitadas por esta desestabilización de la mureína. Las bacterias en la fase estacionaria no son inhibidas debido a que el esqueleto de la mureína no se extiende en esta fase.

La proteína bacteriana EF-Tu contiene los dominios 1, 2 y 3 (Song, H., Parsons, M.R., Rowell, S., Leonard, G . , Phillips, E.V., J. Mol. Biol . 285, 1245-1256, 1999) . Las secuencias de la proteína EF-Tu y su gen que la codifica, han sido publicadas para Escherichia coli y un número de otras eubacterias, y son accesibles en las bases de datos. Se ha descrito también que el dominio 1 de EF-Tu juega un papel en la síntesis de proteínas. La posible existencia de un citoesqueleto procariótico permanente ha sido discutida en Naturwissensch. 85, 1998, 278-282 (Mayer et al . ) . No obstante, un involucramiento de la proteína bacteriana EF-Tu en la formación de tal citoesqueleto era desconocida. Con respecto a la localización de EF-Tu en las células bacterianas, se ha asumido previamente en la literatura (ver, por ejemplo, Schilstra, M.J., Slot., J.W. van der Meide, P.H., Posthuma, G., Cremers , A.F., Bosch, L.; Immunocytochemical localization of the elongation factor Tu in Escherichia. coli cells., Biochem. Biophys . Acta 1291, (1996), 122-130) que EF-Tu está distribuida casi homogéneamente en el citoplasma. No obstante, experimentos previos no tomaron en cuenta el hecho de que las fibrillas de EF-Tu artificialmente producidas pueden ser despolimerizadas in vi tro por bajas temperaturas. Se encontró sorprendentemente que existe un citoesqueleto en células procarióticas , que puede ser teñido con anticuerpos anti-EF-Tu. Este citoesqueleto comprende una red de fibrillas de proteína que están localizadas cerca de la superficie de la membrana citoplásmica que está de frente al citoplasma, y se extienden a través del citoplasma. La membrana citoplásmica y la parte periférica de esta red pueden ser consideradas como dos tubos huecos concéntricos donde la membrana citoplásmica representa la parte exterior de los dos tubos y la parte periférica de la red (citoesqueleto) representa el tubo interno. Las fibrillas que corren a través del citoplasma complementan y estabilizan el sistema y son sitos de enlace para los ribosomas . Los ribosomas han sido detectados en la parte periférica del citoesqueleto, orientados hacia el citoplasma. De aquí que el citoesqueleto procariótico tiene diversas variantes: variantes que son mediadoras de las funciones especiales que consisten de proteínas que son similares a la actina de células superiores y las cuales, en caso de las bacterias en forma de bacilos, define la longitud y el diámetro de la célula , variantes que consisten de proteínas que son similares a la tubulina de células superiores, y aseguran la división celular controlada y una variante que aparece en general en todos los procariotes (citoesqueleto básico) que consiste de una red de protofilamentos de la proteína EF-Tu (factor de alargamiento Tu) el cual utiliza la célula como elementos estructurales estabilizadores de forma y que actúan como una estructura de enlace o acoplamiento para los ribosomas y otros agregados moleculares complejos. La última variante también denominada en la presente como red citoesquelética . EF-Tu es una proteína que contiene tres dominios de los cuales el dominio 1 está involucrado en el proceso de traslación. Hasta ahora no se ha descrito ninguna función específica para los dominios 2 y 3. Se ha encontrado ahora que los epitopos lateralmente expuestos de los dominios 2 y 3 forman un ajuste en el cual una superficie es convexa y una superficie es cóncava. Se asume que estos ajustes pueden dar como resultado la formación de polímeros EF-Tu y especialmente un arreglo lineal de fibrillas in vitro, así como in vivo. Estas fibrillas son los componentes de la red que actúan como un citoesqueleto . Por lo tanto, las sustancias que se enlazan a EF-Tu especialmente en la región de los dominios 2 y/o 3 podrían ser utilizadas para inhibir la formación de un citoesqueleto en células bacterianas, y de este modo para producir un agente antibacteriano. Por lo tanto, la red citoesquelética podría ser utilizada así como un objetivo para una nueva clase de antibióticos. En particular EF-Tu puede ser utilizada como una proteína diana para nuevos agentes bacterianos que pueden ocupar los sitios de ajuste de los dominios 2 y/o 3 y de este modo prevenir la formación de polímeros de EF-Tu en la célula, que son esenciales para la estructura de la célula bacteriana. Este modo de acción es fundamentalmente diferente del modo de acción de otros antibióticos que actúan sobre EF-Tu (ver por ejemplo Vogeley, L . , Palm, G.J., Mesters, J.R., Hilgenfeld, R..- Conformational change of elongation factor Tu (EF-Tu) induced by antibiotic binding, J. Biol .. Chem. 276 (2001), 17149-17155) . Esta publicación muestra que la acción de los antibióticos previamente conocidos del tipo cirromicina es debida al hecho de que éstos previenen la reversibilidad de un cambio conformacional del dominio 1, dando como resultado una flexión del dominio 1 hacia el dominio 2, cuando GTP está enlazado. Este mecanismo es fundamentalmente diferente del mecanismo de acción descrito en la presente de una inhibición de la polimerización en la cual están involucrados los dominios 2 y 3. EF-Tu comprende 394 aminoácidos. Los aminoácidos 8-204 pertenecen al dominio 1 y los aminoácidos 172-204 forman una estructura de enlace hacia el dominio 2. Los aminoácidos 205-298 pertenecen al dominio 2, y el dominio 3 comprende los aminoácidos 299-394. Diferentes estructuras secundarias aparecen dentro de los dominios 2 y 3. En este contexto las secuencias de aminoácidos del 317 al 328 y del 343 al 354 que están localizadas en el dominio 3 son de interés particular, ya que éstas forman rizos que se proyecta libremente hacia el espacio y son secuencias candidatas para una interacción con las secuencias de aminoácidos que están localizadas en una depresión sobre una posición correspondiente sobre la periferia del dominio 2, donde estas secuencias se extienden desde el aminoácido 218 hasta el 224. Se encontró sorprendentemente de acuerdo a la invención que en el caso del citoesqueleto bacteriano es básicamente posible dañar las células al inhibir la polimerización de EF-Tu. En particular, tal daño celular es también logrado en células bacterianas comunes que tienen una pared celular. La invención es particularmente aplicable a las eubacterias . Se puede utilizar una amplia variedad de sustancias para inhibir la formación de citoesqueletos , con la condición de que éstos sean capaces de inhibir la interacción entre el dominio 2 y el dominio 3 de dos moléculas EF-Tu vecinas. Las sustancias adecuadas pueden ser por ejemplo identificadas mediante un método que comprende : a) el poner en contacto una sustancia que va a ser probada con EF-Tu bacteriana o con un fragmento parcial de la misma, capaz de realizar la polimerización, tal como un fragmento que contiene los dominios 2 y 3 y b) determinar si la sustancia puede inhibir la formación de polímeros de EF-Tu. Este método puede ser llevado a cabo in vi tro así como in vivo. En un método in vitro las moléculas de EF-Tu purificadas o fragmentos parciales adecuados de las mismas, son preferentemente incubadas bajo condiciones en las cuales puede tener lugar la formación de fibrillas. El efecto de una sustancia de prueba sobre la formación de fibrillas puede ser determinada de una manera simple, por ejemplo por medio de tinción inmunológica utilizando anticuerpos anti-EF-Tu marcados, o mediante el uso de moléculas EF-Tu que llevan un grupo marcador, por e emplo un grupo marcador fluorescente. Por supuesto, el método puede también ser llevado a cabo in vivo, en cuyo caso el efecto de agregar una sustancia de prueba sobre la red de fibrillas en una célula puede ser determinado mediante métodos inmunológicos , por ejemplo inmunohistoquímicamente utilizando anticuerpos anti-EF-Tu marcados, y evaluación microscópica. Las sustancias que inhiben la formación de polímeros de EF-Tu y que pueden ser obtenidas mediante el método descrito anteriormente, así como las sustancias derivadas de éstas, por ejemplo, por medio de derivatización empírica y/o mediante modelación por computadora, pueden ser formuladas como una composición farmacéutica, opcionalmente junto con vehículos farmacéuticos comunes, sustancias auxiliares y/o diluyentes . La composición farmacéutica puede estar por ejemplo presente como una preparación líquida, preparación sólida, emulsión o dispersión. Dependiendo de la preparación ésta puede ser preparada mediante inyección u oralmente, rectalmente , nasalmente, tópicamente, etc. La dosis se selecciona dependiendo de la sustancia activa, la forma de administración y el tipo y severidad de la enfermedad, tal que es posible combatir las infecciones bacterianas. El agente antibacteriano puede tener una variedad de efectos. Por una parte, son utilizadas sustancias que pueden enlazarse directamente a los sitios de ajuste de los dominios 2 y/o 3 de EF-Tu. Por otra parte, es también posible utilizar sustancias que se enlazan a otras posiciones sobre la molécula EF-Tu, pero tienen un efecto inhibitorio sobre el ajuste y de este modo previenen la formación de fibrillas. Se utilizan agentes antibacterianos peptídicos en una modalidad preferida de la invención. Los agentes peptídicos están basados en oligopéptidos que se enlazan a EF-Tu, preferentemente en la región de los sitios de ajuste de los dominios 2 y/o 3. Estos oligopéptidos pueden contener secciones parciales de las secuencias de aminoácidos de los dominios 2 y/o 3 que tienen una longitud preferentemente de 4 a 20 aminoácidos, particularmente y de manera preferida de 5 a 15 aminoácidos y especialmente de manera preferida que tienen una longitud de 6 a 12 aminoácidos. Estas secciones parciales son capaces de enlazarse a las secuencias complementarias del otro dominio, por ejemplo secuencias provenientes del dominio 2 son capaces de .enlazarse al dominio 3, y las secuencias provenientes del dominio 3 son capaces de enlazarse al dominio 2. En otra modalidad preferida, las sustancias que se enlazan a EF-Tu contienen una sección parcial de las secuencias de aminoácidos provenientes del dominio 2 que tienen una longitud de al menos 4 y en particular de al menos 5 aminoácidos, en particular secciones parciales en la región del dominio 2 de los aminoácidos 218 al 224 y al mismo tiempo ninguna sección que corresponda a la región de los aminoácidos 317 al 328 y/o la región de los aminoácidos 343 a 354 del dominio 3 de EF-Tu. Alternativamente, son preferidas las sustancias que contienen secciones parciales de las secuencias de aminoácidos desde el dominio 3, que tienen una longitud de al menos 4 aminoácidos, en particular de al menos 5 aminoácidos y particularmente y de manera preferida de al menos 6 aminoácidos, y ausencia de secciones parciales correspondiente a los aminoácidos 218 al 224 del dominio 2. Tales secciones pueden ser por ejemplo una EF-Tu truncada que está compuesta únicamente del dominio 3 sin los dominios 1 y 2, o únicamente de los dominios 1 y 2 sin el dominio 3. Tal fragmento de EF-Tu compite en la célula con las moléculas de la proteína EF-Tu naturales sintetizadas por la célula, y da como resultado la terminación de la cadena cuando ésta es incorporada en el protof ilamento de polime ización, ya que en cada caso el segundo dominio requerido para la extensión de la cadena, está ausente. Como resultado, ya no se forma más una red intacta. Esto es sinónimo con la pérdida de la viabilidad de la célula bacteriana. Un desorden en el desarrollo de la red en la célula bacteriana tiene un efecto adverso sobre la forma y comportamiento de la célula bacteriana, como es demostrado por los experimentos . El efecto adverso sobre la forma y comportamiento de la célula, indica la muerte celular esperada que ocurre cuando se utiliza el antibiótico de acuerdo a la invención. En vez del fragmento de EF-Tu truncado, descrito, es también posible utilizar un antibiótico que previene la polimerización de las moléculas de proteína de EF-Tu, por ejemplo una terminación de cadena, mediante otros medios, por e emplo debido a la presencia de secciones que previenen el enlace de moléculas de proteínas de EF-Tu adicionales. Una ventaja particular de los antibióticos de acuerdo a la invención, es que existe únicamente un ligero riesgo del desarrollo de resistencia bacteriana a esta nueva clase de antibióticos . Una resistencia podría significar que la bacteria pudiera degradar el péptido que ha sido transferido a la parte interna de la célula. Si esto ocurriera, la bacteria no sería capaz de evitar también la degradación de su propio péptido estructuralmente idéntico, que es un componente de la proteína EF-Tu de la célula, y que es de importancia principal para la traslación. Los agentes antibacterianos pueden comprender compuestos peptídicos lineales o cíclicos o peptidomiméticos . Los compuestos peptídicos pueden estar compuestos de L-a-aminoácídos naturales, pero también otros aminoácidos, por ejemplo D-a-aminoácidos , aza-aminoácidos , ß-aminoácidos , L- y/o D-a-aminoácidos no genéticamente codificados, etc., o combinaciones de los mismos. La preparación de los peptidomiméticos es descrita por ejemplo en RIPKA, A.S., RICH, D.H. (1998) Peptidomimetic design, Curr. Op . Chem. Biol. 2, 441-452. Además, los compuestos peptídicos o los peptidomiméticos pueden contener grupos hidrofóbicos enlazados que facilitan la transferencia a través de la membrana citoplásmica o grupos muy voluminosos que previenen el acoplamiento de moléculas EF-Tu adicionales y de este modo previenen la formación de un producto de polimerización. Los agentes antibacterianos pueden también llevar grupos que protegen contra la degradación. Los agentes an ibac erianos pueden ser utilizados contra cualesquiera organismos procarióticos y Archaebacteria , y especialmente a organismos patógenos. Las bacterias Gram-positivas , las bacterias Gram-negativas y microplasma tienen un citoesqueleto basado en EF-Tu, y pueden por lo tanto ser combatidas por el agente de acuerdo a la invención. Por ejemplo, pueden ser utilizados los agentes antibacterianos contra los microorganismos resistentes a la vancomicina, por ejemplo estafilococos. Por lo tanto, la nueva clase de antibióticos tiene un amplio espectro de aplicaciones. Se ha encontrado que las regiones que son responsables del enlace de los monómeros para formar los protofilamentos , tienen una secuencia de aminoácidos muy similar en todas las bacterias examinadas. EF-Tu está altamente conservada en esta región. También las distancias entre estas regiones en una molécula EF-Tu dada, por ejemplo las distancias entre las regiones expuestas de los dominios 2 y 3, son idénticas en términos del número de aminoácidos y existen siempre 126 aminoácidos entre las regiones conservadas. Los antibióticos de acuerdo a la invención están caracterizados por una alta especificidad y especialmente por bajos efectos colaterales. Las secuencias de EF-Tu grandes no aparecen en la célula humana, aparte de en las mitocondrias . Las secuencias similares a EF-Tu mitocondríales, están sustancialmente protegidas del antibiótico por la doble membrana de las mitocondrias . La invención es ilustrada por las siguientes figuras y ejemplos. La Figura 1 muestra la arquitectura macromolecular de la proteína bacteriana EF-Tu en la cual los dominios 1, 2 y 3 son descritos con mayor detalle. Esta proteína bacteriana EF-Tu puede asociarse durante la polimerización para formar fibrillas periódicamente estructuradas como se muestra en la Figura 2. La Figura 3 muestra una representación esquemática de la polimerización en las regiones de enlace reactivas de los dominios 2 y 3 marcados con + o La Figura 4 muestra una amplificación (amplificación de aproximadamente 1.5 millones) de una microfotografía electrónica de una fibrilla aislada, polimeri zada in vivo proveniente de las moléculas de proteína EF-Tu. Los dominios 1 están localizados por arriba de la línea discontinua y los dominios yuxtapuestos 2 y 3 están debajo. Si la polimerización de la proteína EF-Tu es reprimida en las regiones de enlace marcadas con + y -en la Figura 3 , mediante adición de un exceso de partículas que contienen secciones parciales de la secuencia de aminoácidos de los dominios 2 y 3 , la célula bacteriana afectada es incapaz de sobrevivir debido a que la estructura celular se rompe.

Ej emplo : Se llevaron a cabo experimentos sobre la bacteria Gram-positiva Thermoanaerobacteríum thermosaccharolyticum EM1 (abreviada E 1 en lo subsiguiente) y la bacteria Micoplasma pneumoniae (abreviada Mp en lo subsiguiente) que carece de una pared celular, probando que estas bacterias tienen un citoesqueleto permanente que está basado en EF-Tu. Los experimentos incluyeron la identificación en la localización celular de las proteínas candidatas para tal citoesqueleto bacteriano mediante el uso de anticuerpos anti-actina (preparados contra la actina de células superiores, que reaccionan cruzadamente a un menor o mayor grado con las proteínas bacterianas debido al hecho de que se sabe que las bacterias tienen proteínas que pertenecen a la superfamilia de actina sin tener homologías de secuencias conspicuas con la actina de las células superiores. Los procariotes no tienen genes de actina distintos. Además de la microscopía inmunoelectrónica con los anticuerpos anteriormente mencionados sobre secciones ultradelgadas a través de las bacterias, se utilizaron también técnicas de montaje completo. Se encontró, mediante una combinación de estas técnicas, que una red de fibrillas de proteína está localizada cerca de la superficie de la membrana citoplasmica que enfrenta al citoplasma y se extienden a través del citoplasma. Los componentes de estas fibrillas reaccionan cruzadamente con los anticuerpos anti-actina. La membrana citoplásmica y la parte periférica de esta red forman dos tubos huecos concéntricos, donde la membrana citoplásmica forma la parte exterior de los dos tubos, y la parte periférica de la red (citoesqueleto) forma una parte interna. Las fibrillas que se extienden a través del citoplasma complementan y estabilizan el sistema y son sitios de acoplamiento para los ribosomas . Los ribosomas también se asientan sobre la periférica del citoesqueleto , orientados hacia el citoplasma. Las células de EM1 fueron desintegradas con la ayuda de una prensa French y el material obtenido (fracción soluble, fracción particulada), fue sometida a electroforesis en gel de SDS y transferencia de Western.' Varias bandas definidas fueron obtenidas en el gel de SDS de las cuales una banda (de aproximadamente 43 kDa) pudo ser teñida con anticuerpos anti-actina así como los anticuerpos anti-EF-Tu obtenidos contra EF -Tu de Mp . Esta banda fue particularmente pronunciada donde la fracción particulada de la lisis celular obtenida por centrifugación a baja velocidad había sido utilizada como el material para la electroforesis en gel de SDS. Fueron encontrados anticuerpos anti-EF-Tu debido a que EF-Tu es usualmente encontrada a 43 kDa (comprende aproximadamente 9% de la masa proteica de una bacteria, debido a que EF-Tu pertenece a la superfamilia de actina, y debido a que EF-Tu aparece en grandes cantidades en una célula procariótica. El papel de EF-Tu como un componente estructural de un citoesqueleto bacteriano es nuevo. Esta propiedad de EF-Tu como un componente estructural de una red compleja como aquella del citoesqueleto , infiere que la célula bacteriana tiene que utilizar una gran cantidad de proteína para este propósito. Una comparación de la estructura de este citoesqueleto bacteriano con aquel de las células superiores hace claro que el citoesqueleto bacteriano debe también estar compuesto de varios tipos de proteína EF-Tu como un componente principal . Aunque en las células superiores EF-Tu no está involucrada en la formación del citoesqueleto (la célula superior no tiene EF-Tu) se sabe, no obstante, que un gran número de diferentes proteínas contribuyen a la formación del citoesqueleto. En la sección y en el montaje completo fue posible mostrar que los componentes de la red anteriormente mencionada del citoesqueleto que reaccionan con los anticuerpos anti-actina, también reaccionaron intensamente con los anticuerpos anti-EF-Tu. Esta reacción ocurrió en el caso de p con la superficie completa originalmente cubierta que fue expuesta al ambiente mediante tratamiento con Tritón (eliminación de la membrana citoplásmica) . Un control que fue preparado utilizando células que no fueron tratadas con Tritón pero de otro modo tratadas idénticamente, y de este modo no perdieron su membrana citoplásmica , no mostraron marcación. Por lo tanto, en este experimento control la membrana citoplásmica enmascaró los sitios potenciales de enlace para EF-Tu. La superficie expuesta por la eliminación de la membrana citoplásmica es la parte periférica del citoesqueleto de la célula. No obstante, éste no expone los componentes celulares internos tales como los ribosomas que han mostrado que son los sitios de acoplamiento para EF-Tu que realizan una función auxiliar durante la traslación (dominio 1 de EF-Tu actúa en este caso) . Como resultado, se concluyó que durante el curso de la traslación, EF-Tu no va hacia el ribosoma sino que el ribosoma va hacia EF-Tu, la cual, debido a su propiedad como un componente del citoesqueleto, es espacialmente fijada sobre la periferia celular y sobre las fibrillas que corren transversalmente a través del citoplasma. La aparición de un citoesqueleto bacteriano permanente fue también detectada en las eubacterias Escherichia coli, Bacillus sp . , Ralstonia eutropha y Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes y en las Arcaebacterias Methanococcus jannaschii y Methanococcus vol tae . '

Claims (21)

REIVINDICACIONES

1. Uso de sustancias que se enlazan a EF-Tu para producir un agente que inhibe la formación de un citoesqueleto en células bacterianas, en donde las sustancias se enlazan a EF-Tu en la región del dominio 2 (aminoácidos 205-298) y/o el dominio 3 (aminoácidos 299 al 394) .

2. Uso de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque las sustancias se enlazan a EF-Tu en la región de los aminoácidos 218 al 224 del dominio 2.

3. Uso de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizado porque las sustancias se enlazan a EF-Tu en la región de los aminoácidos 317 al 328 y/o 343 a 354 del dominio 3.

4. Uso de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque las sustancias contienen secciones parciales de las secuencias de aminoácidos de los dominios 2 y/o 3 que tienen una longitud de 4 a 20 aminoácidos.

5. Uso de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque las secciones parciales tienen una longitud de 5 a 15 aminoácidos en particular de 6 a 12 aminoácidos.

6. Uso de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, caracterizado porque las sustancias se seleccionan de compuestos peptidicos lineales cíclicos o peptidomiméticos .

7. Uso de conformidad con la reivindicación 6, caracterizado porque los compuestos peptidicos o peptidomiméticos contienen grupos hidrofóbicos enlazados, grupos muy voluminosos y/o grupos que protegen contra la degradación.

8. Uso de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, para producir un agente antibacteriano .

9. Uso de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado porque el agente antibacteriano es formulado como una composición farmacéutica opcionalmente junto con vehículos farmacéuticos comunes, diluyentes y/o sustancias auxiliares.

10. Uso de conformidad con la reivindicación 8 ó 9, para producir un agente contra bacterias Gram-positívas o Gram-negativas .

11. Uso de conformidad con la reivindicación 8 ó 9, para producir un agente contra micoplasma.

12. Agente antibacteriano que contiene secciones parciales de secuencias de aminoácidos de los dominios 2 y/o 3 de la proteína bacteriana EF-Tu que tiene una longitud de 4 a 20 aminoácidos.

13. Agente antibacteriano de conformidad con la reivindicación 12, que contiene secciones parciales que tienen una longitud de 5 a 15 aminoácidos .

14. Agente antibacteriano de conformidad con la reivindicación 12 ó 13, que contiene secciones parciales que tienen una longitud de 6 a 12 aminoácidos .

15. Agente antibacteriano de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14, caracterizado porque contiene grupos hidrofóbicos enlazados a las secciones parciales, grupos muy voluminosos y/o grupos que protegen contra la degradación .

16. Agente antibacteriano de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 12 a 15, formulado como una composición farmacéutica opcionalmente junto con vehículos, diluyentes y/o sustancias auxiliares, farmacéuticos y comunes.

17. Método para identificar nuevas sustancias antibacterianas que comprende: a) poner en contacto una sustancia que va a ser probada, con EF-Tu bacteriana o con un fragmento parcial de la misma, capaz de realizar la polimerización y; b) determinar si la sustancia puede inhibir la formación de polímeros de EF-Tu .

18. Método de conformidad con la reivindicación 17, caracterizado porque se lleva a cabo como una prueba in vi tro.

19. Método de conformidad con la reivindicación 17, caracterizado porque se lleva a cabo como una prueba in vivo.

20. Método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 17 a 19, caracterizado porque los anticuerpos marcados y/o las proteínas EF-Tu marcadas o los fragmentos polimerizables de los mismos, se utilizan para determinar la formación de polímeros de EF-Tu .

21. Método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 17 a 20, caracterizado porque una sustancia que inhibe la formación de polímeros de EF-Tu o una sustancia derivada de éstos es formulada como una composición farmacéutica opcionalmente junto con vehículos farmacéuticos, diluyentes y/o sustancias auxiliares, comunes.