KR910009928A - 전사 가능한 헤어핀 프로브를 이용한 핵산의 증폭 방법 - Google Patents

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Abstract

내용 없음

Description

전사 가능한 헤어핀 프로브를 이용한 핵산의 증폭 방법
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제1도 내지 3도는 헤어핀 형태 및 이들의 다이머를 함유하는 본 발명의 전사 가능한 프로브의 여러가지 상이한 형태를 예시한 도면임.

Claims (10)

  1. (a) 목적하는 핵산 서열을 액체 혼합물 중에서, (1) 혼성화 조건하에서 프로모터 기능 영역을 가지는 헤어핀 구조를 형성할 수 있는 단일 가닥으로 된 자기 상보성 서열, (2) 상기 헤어핀 형성 혼성화 조건 하에서 RNA 폴리머라제 및 필요한 리보뉴클레오시드 트리포스페이트의 존재 중에서 전사될 수 있고 상기 자기 상보성 서열의 5´ 말단으로부터 연장되는 전사 가능한 서열 및 (3)목적하는 상기 서열에 사실상 상보성인 단일 가닥으로 된 프로브서열로 이루어지는 전사 가능한 프로브와 혼성화시키는 단계, (b) 헤어핀 형성 혼성화 조건하에서, 사실상 어떤 비혼성화된 프로브도 전사시킴이 없이 목적하는 상기 서열과 혼성화된 상기 프로브를 전사시키는 단계 및 (c) 상기 혼성화된 프로브 중의 프로브 서열의 전사가 예정된 시간 동안에 일어나도록 하여 생성된 RNA 전사 생성물을 목적하는 상기 서열의 증폭화물로서 축적시키는 단계로 이루어짐을 특징으로 하는 특정 핵산 서열의 증폭 방법.
  2. 제1항에 있어서, 상기 프로브 서열이 상기 전사 가능한 5´ 서열 중에 함유됨을 특징으로 하는 방법.
  3. 제1항에 있어서, 상기 프로브 서열이 상기 자기 상보성 서열의 3´ 말단으로 부터 연장되는 서열 중에 함유되고 사실상 상기 5´ 전사 가능한 서열에 상보성이 아닌 것을 특징으로 하는 방법.
  4. 제1 내지 3항중 어느 한 항에 있어서, 상기 생성되는 RNA 전사 생성물을 제2의 증폭단계에서 추가 증폭시킴을 특징으로 하는 방법.
  5. 제1 내지 4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리머라제가 DNA 의존성 RNA 폴리머라제, 바람직하기로는 T7, T3 또는 SP6 박테리오파지 RNA 폴리머라제이고, 바람직하기로는 상기 프로모터 영역이 아래와 같은 헤어핀 형태를 갖는 염기 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
    (여기서 n은 2 내지 50의 정수임)
  6. (a) 목적하는 핵산 서열을 액체 혼합물 중에서, (1) 혼성화 조건하에서 프로모터 기능 영역을 가지는 헤어핀 구조를 형성할 수 있는 단일 가닥으로 된 자기 상보성 서열, (2) 상기 헤어핀 형성 혼성화 조건하에서 RNA 폴리머라제및 필요한 리보뉴클레오시드 트리포스페이트의 존재 중에서 전사될 수 있고, 상기 자기 상보성 서열의 5´ 말단으로부터 연장되는 전사 가능한 서열 및 (3) 목적하는 상기 서열에 사실상 상보성인 단일 가닥으로 된 프로브서열로 이루어지는 전사가능한 프로브와 혼성화시키는 단계, (b) 헤어핀 형성 혼성화 조건하 에서, 사실상 어떤 비혼성화된 프로브도 전사시킴이 없이 목적하는 상기 서열과 혼성화시킨 상기 프로브를 전사시키는 단계, (c) 상기 혼성화된 프로브 중의 프로브 서열의 전사가 예정된 시간동안 일어나도록 하여 생성된 RNA 전사 생성물을 목적하는 상기 서열의 증폭화물로서 축적시키는 단계 및 (d) 축적된 RAN전사 생성물을 검출하는 단계로 이루어짐을 특징으로 하는 시료 중의 특정 핵산 서열의 검출 방법.
  7. 제6항에 있어서, 상기 프로브 서열이 상기 전사 가능한 5´ 서열중에 함유됨을 특징으로 하는 방법.
  8. 제6항에 있어서, 상기 프로브 서열이 상기 자기 성보성 서열의 3´ 말단으로 부터연장되는 서열 중에 함유되고 상기 5´ 전사 가능한 서열에 사실상 상보성이 아닌 것을 특징으로 하는 방법.
  9. 제6 내지 8항 중 어느 한 항에 있어서, 생성된 RNA 전사 생성물을 제2의 증폭 단계에서 추가 증폭시킴을 특징으로 하는 방법.
  10. (a) (1) 혼성화 조건하에서 프로모터 기능 영역을 가지는 헤어핀 구조를 형성할 수 있는 단일 가닥으로된 자기 상보성 서열, (2) 상기 헤어핀 형성 혼성화 조건 하에서 RNA 폴리머라제 및 필요한 리보뉴클레오시드 트리포스페이트의 존재 중에서 전사될 수 있고 상기 자기 상보성 서열의 5´말단으로 부터 연장되는 전사 가능한 서열 및 (3) 목적하는 상기 서열에 사실상 상보성인 단일 가닥으로 된 프로브 서열로 이루어진 전사 가능한 헤어핀 프로브 및 (b) 상기 RNA 폴리머라제로 이루어짐을 특징으로 하는 특정 핵산 서열 증폭용 시약 키트.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
KR1019900018125A 1989-11-09 1990-11-09 전사 가능한 헤어핀 프로브를 이용한 핵산의 증폭 방법 KR910009928A (ko)

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Families Citing this family (53)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5215899A (en) * 1989-11-09 1993-06-01 Miles Inc. Nucleic acid amplification employing ligatable hairpin probe and transcription
US6074818A (en) * 1990-08-24 2000-06-13 The University Of Tennessee Research Corporation Fingerprinting of nucleic acids, products and methods
US5683985A (en) * 1991-04-18 1997-11-04 The Salk Institute For Biological Studies Oligonucleotide decoys and methods relating thereto
DE4216134A1 (de) * 1991-06-20 1992-12-24 Europ Lab Molekularbiolog Synthetische katalytische oligonukleotidstrukturen
CA2118913C (en) * 1991-09-13 2008-08-19 Donald Leonard Nicholas Cardy Nucleic acids extension assay
DE4132133A1 (de) * 1991-09-26 1993-04-01 Boehringer Mannheim Gmbh Verfahren zur spezifischen herstellung von ribonukleinsaeuren
DE4213029A1 (de) * 1991-09-26 1993-04-01 Boehringer Mannheim Gmbh Verfahren zur spezifischen vervielfaeltigung von nukleins aeuresequenzen
US5424413A (en) * 1992-01-22 1995-06-13 Gen-Probe Incorporated Branched nucleic acid probes
WO1994003624A1 (en) * 1992-08-04 1994-02-17 Auerbach Jeffrey I Methods for the isothermal amplification of nucleic acid molecules
DE4236708A1 (de) * 1992-10-30 1994-05-05 Bayer Ag Spezifische Gensonden und Verfahren zur Diagnostik von Candida albicans
GB2273932A (en) * 1992-11-24 1994-07-06 Stiefel Laboratories Stable oligonucleotides
DE4302459A1 (de) * 1993-01-29 1994-08-04 Bayer Ag Sulfocumarinhaltige Nukleotide und deren Verwendung in Nachweisverfahren für Nukleinsäuren
FR2703053B1 (fr) * 1993-03-26 1995-06-16 Genset Sa Oligonucleotides agrafes et semi-agrafes, procede de preparation et applications .
IL105894A (en) * 1993-06-03 1997-02-18 Asher Nathan Method for the detection of nucleic acid sequence by using a detection ensemble and an amplification ensemble
DE4338119A1 (de) * 1993-11-08 1995-05-11 Bayer Ag Spezifische Gensonden und Verfahren zum quantitativen Nachweis von methicillinresistenten Staphylococcen
CA2185239C (en) * 1994-03-16 2002-12-17 Nanibhushan Dattagupta Isothermal strand displacement nucleic acid amplification
DE4421901A1 (de) * 1994-06-23 1996-01-04 Bayer Ag Ein DNA-Schnelltest zum Nachweis von chinolonresistenten Staphylococcus aureus Erregern in klinischem Probenmaterial
FR2721945B1 (fr) * 1994-07-04 1996-10-18 David Fabrice Accroissement genique, un procede d'amplicication genique isotherme et ses applications
FR2723591B1 (fr) * 1994-08-10 1996-09-20 Cis Bio Int Methode d'amplification et/ou de detection d'une sequence d'acide nucleique, reactif de detection et ses applications.
DE4428651C1 (de) * 1994-08-12 1996-02-29 Inst Molekulare Biotechnologie Verfahren zur Herstellung und Amplifikation von Nukleinsäuren
US5665545A (en) * 1994-11-28 1997-09-09 Akzo Nobel N.V. Terminal repeat amplification method
AU724922B2 (en) * 1995-06-07 2000-10-05 Invitrogen Corporation Recombinational cloning using engineered recombination sites
US6720140B1 (en) 1995-06-07 2004-04-13 Invitrogen Corporation Recombinational cloning using engineered recombination sites
US6964861B1 (en) 1998-11-13 2005-11-15 Invitrogen Corporation Enhanced in vitro recombinational cloning of using ribosomal proteins
US5914229A (en) * 1996-06-14 1999-06-22 Sarnoff Corporation Method for amplifying a polynucleotide
US6025133A (en) * 1996-12-30 2000-02-15 Gen-Probe Incorporated Promoter-sequestered oligonucleoside and method of use
CA2307016A1 (en) 1997-10-24 1999-05-06 Life Technologies, Inc. Recombinational cloning using nucleic acids having recombination sites
AU774643B2 (en) 1999-03-02 2004-07-01 Invitrogen Corporation Compositions and methods for use in recombinational cloning of nucleic acids
DE19916929A1 (de) 1999-04-15 2000-10-19 Bayer Ag Ein automatisierbarer Schnelltest zum Nachweis von Krebserkrankungen auf der Basis von Telomerase(hTC) mRNA mit spezifischen Primern und Sonden
US7198924B2 (en) 2000-12-11 2007-04-03 Invitrogen Corporation Methods and compositions for synthesis of nucleic acid molecules using multiple recognition sites
US8137911B2 (en) 2001-05-22 2012-03-20 Cellscript, Inc. Preparation and use of single-stranded transcription substrates for synthesis of transcription products corresponding to target sequences
US7838270B2 (en) 2001-05-22 2010-11-23 The University Of Chicago Target-dependent transcription using deletion mutants of N4 RNA polymerase
WO2002103052A1 (en) * 2001-06-15 2002-12-27 Quiatech Ab Amplifiable probe
US20040197802A1 (en) 2002-11-21 2004-10-07 Dahl Gary A. Methods for using primers that encode one strand of a double-stranded promoter
ATE469984T1 (de) 2003-12-01 2010-06-15 Life Technologies Corp Rekombinationsstellen enthaltende nukleinsäuremoleküle und verfahren zur verwendung davon
EP1882036B1 (en) 2005-05-17 2012-02-15 Ozgene Pty Ltd Sequential cloning system
WO2009006438A2 (en) 2007-06-29 2009-01-08 Epicentre Technologies Corporation Copy dna and sense rna
EP2600901B1 (en) 2010-08-06 2019-03-27 ModernaTX, Inc. A pharmaceutical formulation comprising engineered nucleic acids and medical use thereof
ES2737960T3 (es) 2010-10-01 2020-01-17 Modernatx Inc Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos modificados y sus usos
AU2012236099A1 (en) 2011-03-31 2013-10-03 Moderna Therapeutics, Inc. Delivery and formulation of engineered nucleic acids
US9464124B2 (en) 2011-09-12 2016-10-11 Moderna Therapeutics, Inc. Engineered nucleic acids and methods of use thereof
EP3682905B1 (en) 2011-10-03 2021-12-01 ModernaTX, Inc. Modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and uses thereof
EP2791160B1 (en) 2011-12-16 2022-03-02 ModernaTX, Inc. Modified mrna compositions
US9283287B2 (en) 2012-04-02 2016-03-15 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of nuclear proteins
US9303079B2 (en) 2012-04-02 2016-04-05 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins
AU2013243948A1 (en) 2012-04-02 2014-10-30 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of proteins associated with human disease
US9572897B2 (en) 2012-04-02 2017-02-21 Modernatx, Inc. Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins
EP4074834A1 (en) 2012-11-26 2022-10-19 ModernaTX, Inc. Terminally modified rna
US8980864B2 (en) 2013-03-15 2015-03-17 Moderna Therapeutics, Inc. Compositions and methods of altering cholesterol levels
CN103383355B (zh) * 2013-07-12 2015-09-30 华南师范大学 基于非酶扩增及电化学发光原理的microRNA检测方法
WO2015048744A2 (en) 2013-09-30 2015-04-02 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides encoding immune modulating polypeptides
CA2926218A1 (en) 2013-10-03 2015-04-09 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides encoding low density lipoprotein receptor
WO2018031751A1 (en) * 2016-08-12 2018-02-15 The Regents Of The University Of California Constructs and methods for signal amplification

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4556643A (en) * 1982-07-26 1985-12-03 Agracetus Assay method and probe for polynucleotide sequences
WO1989001050A1 (en) * 1987-07-31 1989-02-09 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Selective amplification of target polynucleotide sequences
DE3726934A1 (de) * 1987-08-13 1989-02-23 Merck Patent Gmbh Verfahren zum nachweis von nukleinsaeure-sequenzen
CA2001110A1 (en) * 1988-11-18 1990-05-18 Zvi G. Loewy Compositions and process for amplifying and detecting nucleic acid sequences

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Publication number Publication date
IL96250A0 (en) 1991-08-16
AU6594990A (en) 1991-05-16
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PT95816A (pt) 1991-09-13
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EP0427074A3 (en) 1991-08-28
NO904633D0 (no) 1990-10-25
NO904633L (no) 1991-05-10
AU642922B2 (en) 1993-11-04

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