KR20200040763A - 암 전이의 치료를 위한 키나제의 표적화 - Google Patents

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KR20200040763A
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kinase
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디후아 유
프랭크 로웨리
첸유 장
수닐 아차리아
핑 리
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Abstract

본 명세서에서는 생체내 키나제 스크린에 의해 확인된 전이-촉진 키나제에 표적화된 키나제 억제제의 투여에 의한 뇌 전이 치료 방법이 제공된다.

Description

암 전이의 치료를 위한 키나제의 표적화
본 출원은 2018년 8월 11일자로 출원된 미국 가출원 제 62/544,597호의 우선권을 주장하며, 상기 문헌의 전문은 본 명세서에 참조로 포함된다.
본 발명은 미국 국립 보건원에 의해 부여된 허가 번호 R01 CA112567 및 R01 CA184836 하에 미국 정부 지원으로 이루어졌다. 미국 정부는 본 발명에 일정 권리를 가진다.
본 발명은 일반적으로 분자 생물학 및 의약 분야에 관한 것이다. 더욱 구체적으로, 이는 암, 특히 뇌 전이의 치료를 위해 키나제를 표적화하는 방법에 관한 것이다.
뇌 전이는 수백만의 암 환자에서 발생하며, 그 수는 원발성 뇌종양보다 10 내지 1명 더 많다. 주요 신생물성 질병 (예를 들어, 흑색종, 폐암, 유방암 및 결장암)은 뇌 전이의 발생률이 높다. 뇌 전이 진단 후 1년 생존율은 20% 미만이다. 최근에, 표적화된 암 요법 (예를 들어, 트라스투주맙 (Trastuzumab), T-DM1)의 진보는 전신 질병의 더 나은 제어를 통해 환자의 생존을 연장시켰다. 그러나, 환자가 후에 재발하는 경우, 증가하는 비율 (예를 들어, 30% 초과)로 뇌 전이가 발생하며, 이는 성공적인 표적화 요법의 시점에 새로운 과제로 대두되고 있다. 현재의 치료 옵션은 제한적이며, 뇌 전이 환자에게는 완화성일뿐이다.
광범위한 효소 패밀리를 구성하는 키나제는 ATP의 γ-포스페이트의 단백질 기질로의 전달을 촉매한다. 가역적 인산화는 세포 신호전달 과정에서 가장 중요한 역할을 하며, 키나제 및 포스파타제에 의해 조절된다. 따라서, 키나제는 무수한 신호 변환 과정의 중요한 매개인자이다. 비정상적인 키나제 활성은 대사 장애, 면역 장애, 신경계 장애 및 기타 장애뿐만 아니라, 암과 관련이 있다. 결과적으로, 키나제는 인간 질병에 대한 중요한 약물 표적 클래스로 등장했다.
많은 키나제는 암세포 신호전달 네트워크의 중심 교점이다. 수 많은 노력에 의해 다양한 암 촉진 키나제에 대한 것으로, 놀라운 임상 효능을 가진 수종의 FDA 승인 억제제의 개발이 성공적으로 이루어졌다. 트라스투주맙 (ErbB2), 라파티닙 (Lapatinib) (ErbB2 및 EGFR), 이마티닙 (BCR-Abl), 게피티닙 (Gefitinib) (EGFR), 이브루티닙 (BTK), 및 베무라페닙 (Vemurafenib) (BRAF)을 포함하여, 이러한 암 촉진 키나제는 많은 질병 환경에서 신뢰할 수 있는 약물 표적임이 입증되었다. 그러나, 대부분의 기존 키나제 억제제는 원발성 종양 상의 표적을 기반으로 하여 개발되었으며; 전이-특이적, 특히 뇌 전이-특이적 약물성 분자 표적을 확인하기 위한 연구는 이루어지지 않았다. 따라서, 다양한 암 촉진 키나제에 대해 현재 FDA 승인된 억제제가 원발성 종양의 억제에 현저한 임상적 효능을 나타낼 수 있지만, 이는 뇌 전이를 억제하는 효능이 거의 없거나 전혀 없다. 따라서, 증가하는 뇌 전이의 임상적 도전에 대처하기 위해, 뇌 전이 환자의 생존을 연장하고, 삶의 질을 향상시키기 위해 그의 유도 인자를 확인하고 이를 치료적으로 표적화할 필요성이 충족되지 않은 상황이다.
제1 실시형태에서, 본 개시내용은 암을 가진 대상체에서 뇌 전이를 억제하기 위한 방법으로서, 유효량의 키나제 억제제를 대상체에 투여하는 단계를 포함하고, 키나제 억제제는 ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, LIMK2, PAK4, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCI, TSSK6, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 방법을 제공한다. 일부 양상에서, 대상체는 인간이다. 특정 양상에서, 키나제 억제제는 siRNA 또는 miRNA이다. 다른 양상에서, 키나제 억제제는 선택적 약리학적 억제제이다.
일부 양상에서, 암은 유방암이다. 특정 양상에서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정된다. 다른 양상에서, 암은 폐암이다.
특정 양상에서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않았다. 다른 양상에서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명되었다.
일부 양상에서, 키나제 억제제는 CDK5 또는 LIMK2를 표적화한다. 특정 양상에서, CDK5의 키나제 억제제는 디나시클립 (dinaciclib), 비스-인돌 인디루빈 (bis-indole indirubin), (S)-CR8, 켄파울론 (kenpaullone), PHA-793887, AT7519, 로스코비틴 (roscovitine), 밀시클립 (milciclib), SNS-032, 또는 올로모우신 (olomoucine)이다. 일부 양상에서, LIMK2의 키나제 억제제는 BMS-5, Pyr-1, 또는 T56-LIMKi이다.
일부 양상에서, BTK의 키나제 억제제는 이브루티닙 (ibrutinib), 아칼라브루티닙 (acalabrutinib), ONO-4059, 스페브루티닙 (spebrutinib), BGB-3111, 또는 HM71224이다. 특정 양상에서, CAMK4의 키나제 억제제는 KN-93이다. 일부 양상에서, MAP2K7의 키나제 억제제는 DTP3이다. 일부 양상에서, PMVK의 키나제 억제제는 CDDD_1633, CSDDD_2260, CSDDD_2419, 또는 루테올린 (luteolin)이다. 일부 양상에서, PRKCI의 키나제 억제제는 리다우라 (ridaura) 또는 RXDX-108이다.
일부 양상에서, 키나제 억제제는 경구, 국소, 정맥내, 복강내, 근육내, 내시경, 경피, 피하, 영역내, 또는 직접 주사에 의해 투여된다. 구체적 양상에서, 키나제 억제제는 정맥내 투여된다. 특정 양상에서, 키나제 억제제는 뇌로 직접 전달된다. 일부 양상에서, 키나제 억제제는 척수내 또는 비강내 투여된다.
추가의 양상에서, 상기 방법은 적어도 2차 치료제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 양상에서, 2차 치료제는 화학요법, 방사선요법, 유전자요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법이다. 특정 양상에서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법 및/또는 대사 조절이다. 일부 양상에서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 동시 투여된다. 특정 양상에서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 순차적으로 투여된다.
또 다른 실시형태에서, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이를 치료하기 위한 방법으로서, 유효량의 키나제 억제제를 적어도 2차 항암제와 조합하여, 이것이 필요한 대상체에 투여하는 단계를 포함하고, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, FRK, MAPK12, ERK5, MAP2K7, UCK2, DAK, 및 PRKCD로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 방법이 제공된다. 일부 양상에서, 암은 유방암이다. 특정 양상에서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정된다. 다른 양상에서, 암은 폐암이다. 일부 양상에서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않았다. 다른 양상에서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명되었다. 일부 양상에서, 대상체는 인간이다.
특정 양상에서, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, MAPK12, 또는 CDK5를 표적화한다. 일부 양상에서, MAPK12의 키나제 억제제는 SB 203580, 도라마피모드 (doramapimod), 또는 LY2228820이다. 특정 양상에서, PCTK1의 키나제 억제제는 인디루빈 E804, 다브라페닙 (dabrafenib), 또는 레바스티닙 (rebastinib)이다. 특정 양상에서, PCTK1의 키나제 억제제는 레바스티닙이다. 일부 양상에서, SPHK1의 키나제 억제제는 BML-258, SKI III, SKI 5C, MP A08, SKI 178, PF-543, 핑골리모드 (fingolimod), 또는 사핑골 (safingol)이다. 특정 양상에서, SPHK1의 키나제 억제제는 핑골리모드 또는 사핑골이다. 일부 양상에서, CDK5의 키나제 억제제는 디나시클립, PHA-793887, AT7519, CYC-065, 로코비틴 (rocovitine), 또는 DCAM-422이다. 특정 양상에서, CDK5의 키나제 억제제는 CYC-065 또는 DCAM-422이다.
일부 양상에서, ERK5의 키나제 억제제는 ERK5-IN-1, BIX 02189, XMD17-109, 또는 XMD 8-92이다. 특정 양상에서, FRK의 키나제 억제제는 다사티닙 (dasatinib), 모테사닙 (motesanib), 도라마피모드, 펠리티닙 (pelitinib), 소라페닙 (sorafenib), 반데타닙 (vandetanib), 카너티닙 (canertinib), 또는 이마티닙 (imatinib)이다. 특정 양상에서, PAK4의 키나제 억제제는 PF-3758309, LCH-7749944, 글라우카루비논 (glaucarubinone), KY-04031, KY-04045, 1-페난트릴-테트라하이드로이소퀴놀린 유도체, (-)-β-히드라스틴, Inka1, GL-1196, 또는 GNE-2861이다. 일부 양상에서, UCK2의 키나제 억제제는 플라보카와인 (flavokawain) B 또는 알피네틴 (alpinetin)이다.
특정 양상에서, 키나제 억제제는 경구, 국소, 정맥내, 복강내, 근육내, 내시경, 경피, 피하, 영역내, 또는 직접 주사에 의해 투여된다. 특정 양상에서, 키나제 억제제는 정맥내 투여된다. 일부 양상에서, 키나제 억제제는 뇌로의 직접 투여의 경우와 같이, 척수내 또는 비강내 투여된다.
일부 양상에서, 2차 치료제는 화학요법, 방사선요법, 유전자요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법이다. 특정 양상에서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법 및/또는 대사 조절이다. 일부 양상에서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 동시 투여된다. 다른 양상에서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 순차적으로 투여된다.
추가의 실시형태에서, 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 2개의 키나제의 활성이 증가된 것으로 확인되는 대상체에 키나제 억제제를 투여하는 단계를 포함하는 방법이 제공된다. 특정 양상에서, 증가된 활성은 증가된 발현 수준, 번역후 변형 또는 세포 이하 위치화(subcellular localization)의 결과이다. 특정 양상에서, 증가된 활성은 증가된 발현 수준에 의해 측정된다. 일부 양상에서, 대상체는 유방암 또는 폐암을 갖는다. 특정 양상에서, 전이는 뇌 전이로 추가로 규정된다.
일부 양상에서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 5개의 키나제 (예를 들어, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개의 키나제)의 활성이 증가된 것으로 확인된다. 특정 양상에서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 15개의 키나제의 발현이 증가된 것으로 확인된다. 일부 양상에서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 20개의 키나제의 발현이 증가된 것으로 확인된다.
또 다른 실시형태에서, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이의 치료를 위한 키나제 억제제의 유효량을 포함하는 조성물로서, 키나제 억제제는 ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, LIMK2, PAK4, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCI, TSSK6, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 조성물이 제공된다.
본 명세서에서는 암을 가진 대상체에서 뇌 전이의 치료를 위한 키나제 억제제 및 항암제의 유효량을 포함하는 조성물로서, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, FRK, MAPK12, ERK5, MAP2K7, UCK2, DAK, 및 PRKCD로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 조성물이 추가로 제공된다.
상기 실시형태의 특정 양상에서, 키나제 억제제는 디나시클립, 비스-인돌 인디루빈, (S)-CR8, 켄파울론, PHA-793887, AT7519, 로스코비틴, 밀시클립, SNS-032, 올로모우신, BMS-5, Pyr-1, T56-LIMKi, 이브루티닙, 아칼라브루티닙, ONO-4059, 스페브루티닙, BGB-3111, HM71224, DTP3, CDDD_1633, CSDDD_2260, CSDDD_2419, 루테올린, 리다우라 또는 RXDX-108, SB 203580, 도라마피모드, LY2228820, 인디루빈 E804, 다브라페닙, 레바스티닙, BML-258, SKI III, SKI 5C, MP A08, SKI 178, PF-543, 핑골리모드, 사핑골, 핑골리모드, 사핑골, 디나시클립, PHA-793887, AT7519, CYC-065, DCAM-422, CYC-065 또는 DCAM-422, ERK5-IN-1, BIX 02189, XMD17-109, XMD 8-92, 다사티닙, 모테사닙, 도라마피모드, 펠리티닙, 소라페닙, 반데타닙, 카너티닙, 이마티니 (imatini), PF-3758309, LCH-7749944, 글라우카루비논, KY-04031, KY-04045, 1-페난트릴-테트라하이드로이소퀴놀린 유도체, (-)-β-히드라스틴, Inka1, GL-1196, GNE-2861, 플라보카와인 B 또는 알피네틴이다.
상기 실시형태의 일부 양상에서, 암은 유방암이다. 특정 양상에서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정된다. 일부 양상에서, 암은 폐암이다. 특정 양상에서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않았다. 다른 양상에서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명되었다. 일부 양상에서, 대상체는 인간이다.
특정 양상에서, 상기 방법은 적어도 2차 항암제를 투여하는 단계를 포함한다. 일부 양상에서, 2차 항암제는 화학요법, 방사선요법, 유전자요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법이다. 특정 양상에서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법, 또는 대사 조절이다.
본 발명의 다른 목적, 특징 및 장점은 다음의 상세한 설명으로부터 명백해질 것이다. 그러나, 본 발명의 사상 및 범위 내에서 다양한 변화 및 변형이 상세한 설명으로부터 당업자에 자명할 것이므로, 본 발명의 바람직한 실시형태가 기술되었으나, 상세한 설명 및 구체적 실시예는 단지 예시의 목적으로 제공된 것임이 이해되어야 한다.
하기 도면은 본 명세서의 일부를 형성하며, 본 발명의 특정 양상을 추가로 설명하기 위해 포함된다. 본 발명은 본 명세서에 제시된 특정 실시형태의 상세한 설명과 조합하여, 이들 도면 중 하나 이상을 참조로 더 잘 이해될 수 있다.
도 1: 뇌 전이성 성장의 유도 인자에 대한 생체내 키놈 스크린의 개략도. 루시페라제, GFP 및 최대 24개의 키나제 풀을 안정하게 발현하는 MDA-MB-231 모 세포 (231p) (231p.루시퍼라제.GFP)를 빈 pWZL-Neo-Myr-플래그-DEST 벡터 및 TdTomato를 발현하는 231p 세포 (231p.TdTomato)와 혼합하였다. 세포를 3:1 비의 키나제 풀:벡터로 혼합하고, 2x106개의 세포를 누드 마우스의 경동맥에 주사하였다. 동물이 신경학적 증상을 나타내고, 그의 두부가 IVIS에 의해 현저하게 루시퍼라제-양성인 것으로 결정된 경우, 마우스를 희생시키고, GFP-양성을 기반으로 한 해부 현미경을 사용하여 뇌 병변을 단리하였다. 병변의 일부를 직접 RNA 추출에 적용하고, 나머지를 분리하고, 세포를 0 계대로 시험관내에서 배양하였다. gDNA를 회수된 세포로부터 추출하고, 표적화된 PCR에 의해 키나제 벡터 서열을 증폭시켰다. 이 DNA를 MiSeq에 의해 시퀀싱 (sequencing)하여, 생체내 선택의 정량적 판독 값을 생성하였다.
도 2: 생체내 선택 후 상대적 서열 강화의 예. 생체내 선택 이전 및 이후의 키나제 서열 판독 갯수의 비교에 의해 생체내 대부분의 서열이 현저하게 손실된 것으로 나타났으며, 이들 키나제의 현저한 양성 선택을 "히트 (hit)"로 고려하였다. MiSeq Reporter에 의해 커버리지 플롯 (Coverage plot)을 생성하였다.
도 3a-3b: 생체내 키나제 과발현-유도 뇌 전이 성장의 검증. 생체내 영상화 시스템 (IVIS)을 사용하여 루시페라제-발현 암세포에 의해 생성된 발광 신호를 정량화하였다. 0일에 동물당 1 x 105개의 세포를 주사하고, 루시페라제 신호를 1일에 정규화하였다. (A) 해당 벡터 대조군과 CDK5-, PCTK1-, MAPK12-, 및 MARK4-과발현 뇌 전이 성장을 비교하면, MARK4를 제외하고 모든 키나제가 뇌 전이의 유도 인자로 검증되는 것으로 나타난다. (B) 벡터 대조군 세포와 SPHK1-과발현 암세포를 비교하면, SPHK1이 실제로 뇌 전이 성장을 향상시키는 것으로 나타난다.
도 4a-4c: MDA-MB-231에서의 키나제 과발현은 실험 뇌 전이 모델에서 생존을 유의하게 단축시킨다. 키나제 과발현 세포 또는 해당 벡터 세포를 주사한 마우스를 그의 뇌 전이-특이적 생존에 대해 비교하였다. (A) PCTK1 과발현은 중앙값 생존 시간을 128일에서 60일로 단축시켰다. Mantel-Cox 로그-등위 시험에 따르면 생존 곡선은 유의하게 상이하였다 (p=0.0004). (B) SPHK1 과발현은 중앙값 생존 시간을 131일에서 102.5일로 단축시켰다. (C) CDK5 과발현은 중앙값 생존 시간을 128일에서 70일로 단축시켰다.
도 5a-5b: PCTK1 녹다운 (knock down)은 실험 뇌 전이의 HCC1954Br 모델에서 치사율을 유의하게 지연시킨다. (A) 경동맥내 주사 전에 PCTK1의 shRNA-매개 녹다운 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) 1 x 105개의 세포를 주사한 누드 마우스의 생존 분석에 의하면, PCTK1 녹다운이 중앙값 생존을 57.5일에서 91일로 연장시키는 것으로 나타난다.
도 6a-6b: SPHK1 녹다운은 실험 뇌 전이의 MDA-MB-435 모델에서 치사율을 유의하게 지연시킨다. (A) 경동맥내 주사 전의 SPHK1의 shRNA-매개 녹다운 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) 1 x 105개의 세포가 주사된 누드 마우스의 생존 분석에 의하면, SPHK1 녹다운은 중앙값 생존을 57.5일에서 77일로 연장시키는 것으로 나타난다.
도 7a-7c: MAPK12 녹다운은 실험 뇌 전이의 4T1 모델에서 초기 단계에서 뇌 전이 성장을 유의하게 지연시킨다. (A) 경동맥내 주사 전에 MAPK12의 shRNA-매개 녹다운 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) 벡터 제어 세포와 MAPK12 녹다운 암세포를 비교하면, MAPK12 녹다운이 뇌 전이 성장을 지연시키는 것으로 나타난다. (C) 4T1 세포가 주사된 BALB/c 마우스의 생존 분석에 의하면, MAPK12 녹다운은 중앙값 생존을 15일에서 19일로 연장시키는 것으로 나타난다. Mantel-Cox 로그-등위 시험에 따르면 생존 곡선은 유의하게 상이하였다 (p=0.02).
도 8a-8d: CDK5 녹다운은 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식을 감소시키고, CD8 T-세포 의존성 방식으로 실험 뇌 전이의 EO771 모델에서 치사율을 유의하게 지연시킨다. (A) EO771 세포에서 CDK5의 shRNA-매개 녹다운 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) MTT 분석에 의하면, 벡터 대조군 세포와 비교할 때, 저산소 조건에서 CDK5 녹다운 세포의 시험관내 세포 증식이 유의하게 감소하는 것으로 나타났다. (C) EO771 세포를 주사한 C57BL/6 마우스의 생존 분석에 의하면, CDK5 녹다운이 중앙값 생존을 19일에서 23.5일로 연장시키는 것으로 나타난다. (D) 대조군 또는 CDK5 녹다운 EO771 세포를 주사한 C57BL/6 마우스의 생존 분석에 의하면, αCD8 항체를 사용하여 CD8-T 세포를 고갈시킨 경우, 이들 두 그룹 사이에서 마우스 생존에 유의한 차이가 없는 것으로 나타난다.
도 9a-9b: EO771 세포에서 CDK5 녹다운은 이를 로스코비틴에 덜 감응성이 되도록 하고, T 세포 독성에 더 감응성이 되도록 한다. (A) EO771 세포에서의 CDK5 녹다운은 대조군 세포와 비교하여, 이를 CDK5 억제제인 로스코비틴에 대해 덜 감응성이 되도록 하는 것을 보여주는 세포 생존율 곡선. (B) 세포독성 T 세포 사멸 분석에 의하면, E0771 세포에서 CDK5 녹다운은 EO771 대조군 세포와 비교하여, 활성화된 T 세포 독성에 대해 더 감응성인 것으로 나타났다. T 세포를 CD3/CD28 항체 (100 ng/mL) 및 IL-2 (10 ng/mL)에 의해 활성화시킨 후, 종양 세포와 공동 배양하였다.
도 10a-10b: LIMK2 과발현은 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식을 촉진시킨다. (A) MDA-MB-231 세포에서 LIMK2의 과발현 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) MTT 분석에 의해, 벡터 대조군 세포와 비교하여, LIMK2가 과발현된 경우, 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식이 유의하게 증가하는 것으로 나타났다.
도 11a-11c: LKB1 과발현은 정상 산소 및 저산소 조건 둘 모두에서 시험관내 세포 증식을 촉진시킨다. (A) MDA-MB-231 세포에서 LKB1의 과발현 효율을 나타내는 웨스턴블롯. (B) LKB1로 과발현된 MDA-MB-231 세포는 본 발명자의 MTT 분석에서 나타난 바와 같이, 벡터 대조군 세포와 비교하여, 정상 산소 조건에서 시험관내 세포 증식이 유의하게 증가하는 것으로 나타났다. (C) LKB1로 과발현된 MDA-MB-231 세포는 본 발명자의 MTT 분석에서 나타난 바와 같이, 벡터 대조군 세포와 비교하여, 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식이 유의하게 증가하는 것으로 나타났다.
키나제의 약물성의 이점을 취함으로써, 뇌 전이의 치료에 사용하기 위한 뇌 전이의 유도 인자 키나제를 확인하기 위해, 본 연구는 유방암 뇌 전이를 촉진하는 신규 키나제를 밝혀내기 위해 인간 키놈 (kinome)의 무작위 생체내 스크린을 수행하였으며, 이는 뇌 전이의 효과적인 억제를 위한 치료 표적으로서 기능할 수 있다. 현재 이용 가능한 키나제 표적은 세포 배양 접시에서 암세포 성장을 촉진시키는 그의 역할에 의해 확인되었지만, 현재 확인된 키나제는 특히 동물에서 뇌 전이의 유도 인자를 확인하는 기능적 생체내 스크린으로부터 유도되었다. 따라서, 이 방법에 의해 확인된 표적은 뇌 전이의 성장에서 구체적인 역할을 한다.
구체적으로, 354-키나제 라이브러리를 MDA-MB-231 인간 삼중 음성 유방암 세포주에서 각각 21개의 키나제 풀 17개로 분류하고, 실험 뇌 전이를 유도하기 위해 누드 마우스의 경동맥에 생성된 세포를 주사하였다. 이들 키나제의 수 개의 풀은 231개의 벡터 대조군 세포와 비교하여 뇌 전이-특이적 치사율을 급격하게 증가시켰다. 차세대 시퀀싱 (NGS) 및 유전자 분석에 의해, 이러한 공격적인 뇌 전이가 생체내에서 특정 키나제에 의해 강화되는 것으로 확인되었다. 이러한 연구에 의해 ADCK4 (COQ8B), BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12 (p38γ), MAPK7 (ERK5), PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1을 포함하여, 20개 이상의 뇌 전이 촉진 키나제가 밝혀졌다 (표 1).
이들 키나제를 추가로 시험하기 위해, 일부 키나제를 유전자 녹다운시켜, 뇌 전이의 억제를 위해 이렇게 확인된 뇌 전이 유도 인자 키나제의 표적화 효과를 시험하였다. 실제로, 상위 히트의 일부의 녹다운은 실험 뇌 전이를 억제하고, 뇌 전이를 갖는 마우스의 생존을 유의하게 연장시켰다. 구체적으로, PCTK1, SPHK1, MAPK12, 및 CDK5와 같은 키나제의 녹다운은 인간 암세포 모델 및 실험 뇌 전이의 4T1 마우스 유선 종양 모델의 초기 단계에서 세포 증식의 감소 및 뇌 전이 성장 지연을 초래하였다.
뇌 전이를 억제하기 위해 스크린에서 확인된 이들 키나제 중 일부의 표적화 효능을 또한 본 연구에서 실험 뇌 전이 마우스 모델에서 키나제의 과발현에 의해 분석하였다. CDK5, PCTK1, MAPK12, LIMK2, 및 SPHK1의 과발현은 뇌 전이 성장을 증가시켰다. 특히, SPHK1, PCTK1, LIMK2 및 CDK5와 같은 키나제의 과발현은 실험 뇌 전이 마우스 모델에서 생존을 단축시켰다. 따라서, 본 명세서의 스크린에서 확인된 키나제는 유방암 뇌 전이와 같은 뇌 전이의 억제를 위해 표적화될 수 있다.
따라서, 특정 실시형태에서, 본 개시내용은 뇌 전이의 효과적인 억제를 위해 키놈 스크린으로부터 확인된 뇌 전이-유도 키나제를 표적화하는 방법을 제공한다. 본 명세서에서 확인된 키나제는 유전자, 화학적, 면역학적 및 대사 억제제를 포함하는 억제제에 의해 표적화될 수 있다. 키나제 억제제는 뇌 전이에 대한 현재 표준 치료법, 예를 들어 방사선 요법, 화학요법, 면역요법 및 대사 조절과 조합 사용될 수 있다.
I. 정의
본 명세서에 사용되는 바와 같이, 단수형 ("a" 또는 "an")은 하나 이상을 의미할 수 있다. 본 명세서의 청구항 (들)에 사용되는 바와 같이, 단어 "~를 포함하는"과 함께 사용될 때, 단수형 ("a" 또는 "an") 단어는 하나 이상을 의미할 수 있다.
청구범위에서 용어 "또는"의 사용은, 단지 양자택일만을 지칭하도록 명시적으로 지시되거나, 양자택일이 상호 배타적이지 않는 한, 본 개시내용이 단지 양자택일 및 "및/또는"을 지칭하는 정의를 뒷받침할지라도, "및/또는"을 의미하는 것으로 사용된다. 본 명세서에 사용되는 바와 같이, "또 다른"은 적어도 2번째 이상을 의미할 수 있다. 용어 "약", "실질적으로" 및 "대략"은 일반적으로 명시된 값 플러스 또는 마이너스 5%를 의미한다.
본 명세서에 사용되는 바와 같이, 용어 "환자" 또는 "대상체"는 살아있는 포유류 유기체, 예컨대 인간, 원숭이, 소, 양, 염소, 개, 고양이, 마우스, 랫트, 기니피그 또는 이들의 트랜스제닉 종을 지칭한다. 특정 실시형태에서, 환자 또는 대상체는 영장류이다. 인간 환자의 비 제한적인 예는 성인, 소아, 유아 및 태아이다.
질병 또는 병태를 "치료하는" 또는 그의 치료는 질병의 징후 또는 증상을 경감시키기 위한 노력으로 환자에게 하나 이상의 약물을 투여하는 단계를 포함할 수 있는 프로토콜을 실행하는 것을 지칭한다. 바람직한 치료 효과는 질병 진행률 감소, 질병 상태 호전 또는 완화, 및 예후 관해 또는 개선을 포함한다. 경감은 질병 또는 병태의 징후 또는 증상이 나타나기 전뿐만 아니라, 발현 후에 이루어질 수 있다. 따라서, "치료하는" 또는 "치료"는 질병 또는 부적절한 상태를 "예방하는" 또는 그의 "예방"을 포함할 수 있다. 또한, "치료하는" 또는 "치료"는 징후 또는 증상의 완전한 경감을 요하지 않고, 치유 단계가 필요하지 않으며, 특히 환자에게 단지 미미한 효과를 갖는 프로토콜을 포함한다.
본 명세서 및/또는 청구범위에서 사용되는 바와 같이, 용어 "유효한"은 적절하거나, 예상되거나, 의도된 결과를 달성하기에 적합한 것을 의미한다. "유효량", "치료적 유효량" 또는 "약제학적 유효량"은 환자 또는 대상체를 화합물로 치료하는 상황에 사용될 때, 질병의 치료 또는 예방을 위해 대상체 또는 환자에 투여되는 경우, 질병의 이러한 치료 또는 예방을 달성하기에 충분한 양의 화합물의 양을 의미한다.
"예방" 또는 "예방하는"은 다음을 포함한다: (1) 질병의 위험이 있고/거나, 질병의 소인이 있을 수 있지만, 아직 질병의 임의의 또는 모든 병리 또는 증상이 진행되지 않았거나, 나타나지 않은 대상체 또는 환자에서의 질병의 발병의 억제, 및/또는 (2) 질병의 위험이 있고/거나, 질병의 소인이 있을 수 있지만, 아직 질병의 임의의 또는 모든 병리 또는 증상이 진행되지 않았거나, 나타나지 않은 대상체 또는 환자에서의 질병의 병리 또는 증상의 발병의 지연.
본 명세서에 일반적으로 사용되는 바와 같이, "약제학적으로 허용 가능한"은 합리적인 의학적 판단의 범위 내에서, 합리적인 이익/위험 비율에 상응하는 과도한 독성, 자극, 알레르기 반응 또는 다른 문제 또는 합병증의 부재하에 인간 및 동물의 조직, 기관 및/또는 체액과 접촉하에 사용하기에 적합한 화합물, 재료, 조성물 및/또는 투여 형태를 지칭한다.
"약제학적으로 허용 가능한 염"은 상기 규정된 바와 같이 약제학적으로 허용 가능하고, 적절한 약리학적 활성을 갖는 본 명세서에 개시된 화합물의 염을 의미한다. 이러한 염은 무기산, 예컨대 염산, 브롬화수소산, 황산, 질산, 인산 등; 또는 유기산, 예컨대 1,2-에탄디술폰산, 2-하이드록시에탄술폰산, 2-나프탈렌술폰산, 3-페닐프로피온산, 4,4'-메틸렌비스(3-하이드록시-2-엔-1-카복실산), 4-메틸바이사이클로[2.2.2]옥트-2-엔-1-카복실산, 아세트산, 지방족 모노- 및 디카복실산, 지방족 황산, 방향족 황산, 벤젠술폰산, 벤조산, 캄포술폰산, 탄산, 신남산, 시트르산, 사이클로펜탄프로피온산, 에탄술폰산, 푸마르산, 글루코헵톤산, 글루콘산, 글루탐산, 글리콜산, 헵탄산, 헥산산, 하이드록시나프토산, 락트산, 라우릴황산, 말레산, 말산, 말론산, 만델산, 메탄술폰산, 뮤콘산, o-(4-하이드록시벤조일)벤조산, 옥살산, p-클로로벤젠술폰산, 페닐-치환 알칸산, 프로피온산, p-톨루엔술폰산, 피루브산, 살리실산, 스테아르산, 숙신산, 타르타르산, 3급부틸아세트산, 트리메틸아세트산 등과 형성된 산부가염을 포함한다. 약제학적으로 허용 가능한 염은 또한 존재하는 산 양성자가 무기 또는 유기 염기와 반응할 수 있을 때 형성될 수 있는 염기부가염을 포함한다. 허용 가능한 무기 염기는 수산화나트륨, 탄산나트륨, 수산화칼륨, 수산화알루미늄 및 수산화칼슘을 포함한다. 허용 가능한 유기 염기는 에탄올아민, 디에탄올아민, 트리에탄올아민, 트로메타민, N-메틸글루카민 등을 포함한다. 본 발명의 임의의 염의 일부를 형성하는 특정 음이온 또는 양이온은 상기 염이 전체적으로 약리학적으로 허용 가능한한 중요하지 않다는 것을 이해해야 한다. 약제학적으로 허용 가능한 염 및 그의 제조 및 사용 방법의 추가 예는 문헌[Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, and Use (P. H. Stahl & C. G. Wermuth eds., Verlag Helvetica Chimica Acta, 2002)]에 제시되어 있다.
"약제학적으로 허용 가능한 담체", "약물 담체" 또는 단순히 "담체"는 화학적 제제를 운반, 전달 및/또는 수송하는데 관여하는 활성 성분 의약과 함께 제형화된 약제학적으로 허용 가능한 물질이다. 약물 담체는, 예를 들어 약물 생체이용률을 조절하고, 약물 대사를 감소시키고/거나, 약물 독성을 감소시키는 제어 방출 기술을 포함하여 약물의 전달 및 효과를 개선하기 위해 사용될 수 있다. 일부 약물 담체는 특정 표적 부위로의 약물 전달의 효과를 증가시킬 수 있다. 담체의 예는 리포솜 (liposome), 마이크로스피어 (microsphere) (예를 들어, 폴리(락트-코-글리콜산) 산으로 제조됨), 알부민 마이크로스피어, 합성 중합체, 나노섬유, 단백질-DNA 복합체, 단백질 접합체, 적혈구, 비로솜 (virosome) 및 덴드리머 (dendrimer)를 포함한다.
"억제제" 또는 "길항제"는 키나제와 같은 소정의 표적의 활성을 감소시키거나 억제하는 화합물이다.
본 명세서에 사용되는 바와 같이, 용어 "단백질 키나제" 또는 "키나제"는 그 일반적인 통상적 의미에 따라 사용되며, 아미노산 잔기, 예를 들어 단백질 또는 아미노 알콜 상의 아미노산 잔기의 인산화와 같이, 고 에너지 포스페이트-공여 분자로부터 특정 물질로의 포스페이트 기의 전달을 촉매할 수 있는 효소를 지칭한다. 통상적으로 특정 세린, 트레오닌 또는 티로신 잔기가 인산화된다. 따라서, 단백질 키나제는 세린 단백질 키나제, 트레오닌 단백질 키나제 및 티로신 단백질 키나제를 포함한다. "단백질 키나제의 억제제" 또는 "키나제 억제제"는 단백질 키나제의 활성을 감소시키는 화합물 또는 제제이다. 일부 실시형태에서, "키나제 억제제"는 단백질 키나제에 결합함으로써 단백질 키나제의 활성을 감소시키는 화합물이다. 따라서, "키나제 억제제"는 경쟁적 또는 비 경쟁적 방식으로 효소의 활성을 억제할 수 있다.
"대조군" 또는 "대조군 실험"은 그 일반적인 통상적 의미에 따라 사용되며, 실험 대상체 또는 시약이, 절차, 시약 또는 실험 변수의 생략을 제외하고, 병렬 실험에서와 같이 처리되는 실험을 지칭한다. 일부 경우에는 대조군은 실험 효과를 평가할 때 비교 표준으로 사용된다.
"접촉"은 그 일반적인 통상적 의미에 따라 사용되며, 적어도 2개의 별개의 종류 (예를 들어, 생체분자 또는 세포를 포함하는 화학적 화합물)가 반응, 상호작용 또는 물리적으로 접촉하기에 충분히 근접하여 위치할 수 있는 과정을 지칭한다. 그러나, 생성된 반응 산물은 반응 혼합물 중 생성될 수 있는 하나 이상의 첨가된 시약으로부터의 중간체 또는 첨가된 시약 사이의 반응으로부터 직접 생성될 수 있음을 이해해야 한다. 용어 "접촉"은 억제제를 키나제와 인큐베이션하는 단계를 포함한다.
본 명세서에 규정된 바와 같이, 키나제-억제제 상호작용과 관련하여 용어 "억제", "억제하다", "억제하는" 등은 억제제의 부재하에 키나제의 활성과 관련하여 키나제의 활성에 부정적인 영향을 미치는 (예를 들어, 이를 감소시키는) 것을 의미한다. 따라서, 억제는 적어도 부분적으로 자극의 일부 또는 전부 차단, 활성화의 감소, 방지 또는 지연, 또는 신호 변환의 불활성화, 탈감작화 또는 하향 조절을 포함한다. 유사하게, "억제제"는, 예를 들어, 결합에 의해 키나제 활성을 억제하거나, 자극을 일부 또는 전부 차단하거나, 활성화를 감소, 방지 또는 지연시키거나, 신호 변환을 불활성화, 탈감작화 또는 하향 조절하는 화합물이다.
"선택적"은 소정의 키나제에 대한 친화도가 다른 키나제에 대한 친화도보다 적어도 5배 내지 10배, 바람직하게는 25배, 더욱 바람직하게는 100배, 여전히 바람직하게는 150배 더 높은 것을 의미한다.
본 명세서에 사용되는 바와 같이, 어구 "ATP-결합 포켓 (ATP-binding pocket)"은 ATP에 결합하는 키나제의 활성 부위를 지칭한다. ATP가 결합하는 키나제의 활성 부위는 ATP 분자 또는 ATP 경쟁 억제제와 상호작용 및 결합할 수 있는 아미노산 잔기 세트이다.
본 명세서에 사용되는 바와 같이, 용어 "돌연변이된"은 비 천연 (예를 들어, 비 야생형) 아미노산 서열을 갖는 키나제를 지칭한다. 돌연변이된 키나제는 통상적으로 재조합 (예를 들어, 조작)된 것이다. 하기 기재된 바와 같은 일부 실시형태에서, 돌연변이된 키나제는 관문 아미노산 위치의 시스테인 잔기 치환을 갖는다. 본 명세서에 사용되는 바와 같이, 용어 "비 돌연변이된"은 돌연변이 (예를 들어, 시스테인 잔기가 관문 아미노산 위치로 치환됨)가 존재하지 않는 (예를 들어, 천연 또는 야생형 서열) 해당 키나제를 지칭한다. 따라서, 일부 경우에, 비 돌연변이된 것은 야생형 또는 천연 키나제를 지칭한다. 일부 다른 경우에, 해당 키나제는 유사하지만 별도의 치환을 갖는 또 다른 재조합 키나제이다.
"전이"는 원발성 종양으로부터 신체의 다른 부분으로의 암세포의 전파로 인한 원발성 종양 위치와 별도의 암세포의 영역이다. 원발성 종양 덩어리의 진단시, 전이의 존재에 대해 대상체를 모니터링할 수 있다. 전이는 가장 일반적으로는, 특정 증상의 모니터링 이외에, 자기 공명 영상 (MRI) 스캔, 컴퓨터 단층 촬영 (CT) 스캔, 혈액 및 혈소판 수, 간 기능 연구, 흉부 X-선 및 뼈 스캔의 단독 또는 조합을 통해 검출된다. "검출 가능한" 전이는 자기 공명 영상, 컴퓨터 단층 촬영 또는 양전자 방출 단층 촬영에 의해 확인될 수 있는 세포 클러스터이다. 특정한 비 제한적인 실시형태에서, 전이성 세포의 클러스터는 적어도 약 1 x 107개의 세포를 포함할 수 있다. 특정 실시형태에서, 검출 가능한 전이는 약 5 mm 또는 약 10 mm보다 더 큰 크기를 갖는 세포 클러스터를 포함할 수 있다.
용어 "소분자"는 당 업계의 용어이며, 약 1000 분자량 미만 또는 약 500 분자량 미만의 분자를 포함한다. 일 실시형태에서, 소분자는 배타적으로 펩타이드 결합을 포함하지 않는다. 다른 실시형태에서, 소분자는 올리고머가 아니다. 활성에 대해 스크리닝될 수 있는 예시적인 소분자 화합물은 다음에 제한되는 것은 아니나, 펩타이드, 펩티도미메틱 (peptidomimetic), 핵산, 탄수화물, 유기 소분자 (예를 들어, 폴리케타이드 (polyketide)) (문헌[Cane et al., 1998]) 및 천연 산물 추출물 라이브러리를 포함한다. 또 다른 실시형태에서, 화합물은 작은 유기 비 펩타이드성 화합물이다. 추가의 실시형태에서, 소분자는 생합성물이 아니다.
II. 표적 키나제
특정 실시형태에서, 본 개시내용은 본 연구의 생체내 키나제 스크린에 의해 전이 촉진 키나제 (표 1)로 확인된 키나제의 억제제를 투여함으로써 뇌 전이와 같은 전이를 치료하는 (예를 들어, 억제하거나 감소시키는) 방법을 제공한다. 치료는 전이, 특히 뇌 전이의 발생을 억제하기 위해 원발성 종양을 가진 대상체에서 이루어질 수 있다. 다른 양상에서, 대상체는 뇌 전이와 같은 전이성 종양으로 진단될 수 있고, 치료는 적어도 10%, 특히 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 100%만큼 뇌 전이를 감소시킨다.
전이-촉진 키나제의 수준을 감소시킬 수 있는 키나제 억제제와 같은 치료제는 안티센스 핵산, shRNA, siRNA, 소분자, 폴리펩타이드, 항체 또는 항체의 단편, 폴리뉴클레오타이드, 다당류를 포함하는 탄수화물, 지질, 약물뿐만 아니라, 모방체, 유도체 및 이들의 조합과 같은 당 업계에 일반적으로 공지된 것들을 포함한다. 특정 양상에서, 키나제는 특정 키나제에 대해 선택적인 키나제 억제제에 의해 억제된다. 표 1의 각 키나제에 대한 예시적인 선택적 키나제 억제제가 본 명세서에 개시되어 있으나; 당 업계에 공지된 임의의 선택적 키나제 억제제가 본 방법에 사용될 수 있다.
Figure pct00001
A. PCTK1 (CDK16)
사이클린 의존성 키나제 16 (CDK16)으로도 지칭되는 세린/트레오닌-단백질 키나제 PCTAIRE-1 (PCTK1) 유전자는 소포-매개 수송 과정 및 세포외 배출에 관여하는 키나제를 인코딩한다. 또한 뉴런 분화 및 수상 돌기 발달을 조절한다. PCTK1은 PCTK1에 대해 선택적인 RNAi 및/또는 약리학적 억제제에 의해 억제될 수 있다. 예를 들어, 본 방법에 사용될 수 있는 PCTK1에 대해 선택적인 하나의 억제제는 인디루빈 E804 또는 그의 유사체이다 (문헌[Hoessel et al., 1999; Cweik et al., 2015]; 상기 문헌 둘 모두 본 명세서에 참조로 포함됨). 억제제는 H-결합 상호작용을 통해 힌지 영역과 상호작용함으로써 ATP 부위에 결합한다. PCTK1을 억제하기 위해 사용될 수 있는 다른 억제제는 I형 키나제 억제제, 예컨대 트리아졸로-디아민 화합물 Cdk1/2 억제제 III, 알스터파울론 (Alsterpaullone), 2-시아노에틸, 인디루빈 E804 및 아미노피리미디닐 화합물 Cdk2/9 억제제를 포함한다. CDK2 억제제, 예컨대 옥신돌 GW300657X 및 GW416981X뿐만 아니라, 피라졸로[1,5-b]피리다진 화합물 GW779439X가 또한 PCTK1의 억제에 사용될 수 있다.
특정 양상에서, 다브라페닙 또는 레바스티닙이 PCTK1의 억제에 사용된다. 레바스티닙은 약물-내성 관문 돌연변이 ABL뿐만 아니라, BCR-ABL을 억제하기 위해 개발된 다중-표적화된 II형 키나제 억제제이다. 다브라페닙은 진행성 흑색종에서 임상적 사용을 위해 승인된 돌연변이 BRAFV600E의 ATP-경쟁적 I형 억제제이다. 하나의 특정 양상에서, PCTK1의 억제제는 레바스티닙이다.
인디루빈 E804는 하기 방법에 의해 합성될 수 있다. 간단히 말하면, 질소 하의 무수 메탄올 (70 mL) 중 인독실 아세테이트 2 (5.00 g, 28.5 mmol)의 용액에 이사틴 1 (4.20 g, 28.8 mmol) 및 탄산나트륨 (6.50 g, 61.3 mmol)을 첨가하였다. 30분 동안 교반하고, 24시간 동안 방치한 후, 슬러리를 여과하고, 저온 메탄올 및 저온수로 세척하였다. 획득된 인디루빈 3 (2.50 g, 9.5 mmol) 및 하이드록실아민 하이드로클로라이드 (1.7 g, 24.7 mmol)를 피리딘 (60 mL)에서 1.5시간 동안 함께 환류시켰다. 이어서, 혼합물을 1 M 염산 용액 (100 mL)에 부었다. 적색/주황색 침전물을 여과 제거하고, 1 M 수산화나트륨 (70 mL)에 재용해시키고, 1 M 염산 (150 mL)으로 재침전시켰다. 미정제 산물을 여과하고, 건조하여, 에탄올/물 (7:2)로부터 재결정화함으로써, 산물을 밝은 적색/주황색 결정으로서 제공한다. 마지막으로, 인디루빈-3'-옥시민 4 (55.4 mg, 0.20 mmol) 및 4-브로모부탄-1,2-디올 5 (40.1 mg, 0.24 mmol)를 무수 디메틸포름아미드 (1.5 mL)에 용해시킨다. 여기에 트리에틸아민 (33 μL, 0.24 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 질소하에 4 시간 동안 교반한 후, 용매를 진공에서 제거하여, 미정제 갈색 오일을 생성하고, 이를 컬럼 크로마토그래피를 통해 정제하여, 산물을 적색 고체로서 제공하였다 (36 mg, 41% 수율).
B. SPHK1
스핑고신 키나제 (SPHK1)는 세포 성장 및 생존을 촉진하고, S1P/세라마이드 레오스타트를 조절하는 주요 효소이다. L-트레오-디하이드로스핑고신 (사핑골) 및 N,N-디메틸스핑고신 (DMS)과 같은 SPHK의 비-이소자임 특이적 억제제를 본 방법에 사용할 수 있다. 일부 양상에서, SPHK1은 미국 특허 제 8,372,888호에 기재된 바와 같은 BML-258, 미국 특허 출원 제 20080167352호에 기재된 바와 같은 3-(4-클로로-페닐)-아다만탄-1-카복실산 (피리딘-4-일메틸)-아미드, [(2R)-1-[[4-[[3-(벤젠술포닐 메틸)-5-메틸페녹시]메틸]페닐]메틸]피롤리딘-2-일]메탄올 (PF-543), 스핑고신 키나제 억제제 2 (SKI II; 4-[[4-(4-클로로페닐)-2-티아졸릴]아미노]페놀), SKI 5C (CAY10621), N,N-디메틸스핑고신 ((2S,3R,4E)-2-(디메틸아미노)-4-옥타데센-1,3-디올), MP A08 (4-메틸-N-[2-[[[2-[[(4-메틸페닐)술포닐]아미노]페닐]이미노]메틸]페닐]벤젠술폰아미드), SKI 178 (N'-(1-(3,4-디메톡시페닐)에틸리덴)-3-(4-메톡시페닐)-1H-피라졸-5-카보히드라지드), 또는 그의 유사체, 유도체 또는 약제학적으로 허용 가능한 염에 의해 억제된다. 특정 양상에서, SPHK1의 억제제는 핑골리모드 (Gilenya) 또는 사핑골이다.
C. MAPK12 (p38γ)
세포외 신호 조절 키나제 6 (ERK6) 또는 스트레스 활성화 단백질 키나제 3 (SAPK3)으로도 공지된 미토겐-활성화 단백질 키나제 12 (MAP 키나제 12)는 인간에서 MAPK12 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. 미토겐-활성화 단백질 키나제 패밀리의 구성원의 활성화는 세포외 신호 변환을 위한 주요 메커니즘이다. 스트레스 활성화 단백질 키나제는 MAP 키나제의 하위 클래스이다. 이 유전자에 의해 인코딩된 단백질은 근아세포에서 근관으로의 분화 동안 신호 변환 인자로서 기능한다. MAPK12는 SB 203580, 도라마피모드 (BIRB 796), LY2228820 또는 당 업계에 공지된 MAPK12의 다른 억제제에 의해 억제될 수 있다.
D. CDK5 및 CDK5R1
세포 분열 단백질 키나제 5는 인간에서 CDK5 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. CDK5는 뇌의 적절한 발달과 활성화를 위해 필요하고, CDK5는 CDK5R1 또는 CDK5R2와 결합되어야 한다. CDK5 또는 CDK5R1은 본 방법에서 디나시클립 (SCH727965), 비스-인돌 인디루빈, (S)-CR8, 켄파울론, PHA-793887, AT7519, 로스코비틴 (셀리시클립 (seliciclib), CYC202), 밀시클립 (PHA-848125), SNS-032 (BMS-387032), 또는 올로모우신에 의해 억제될 수 있다. 특정 양상에서, CDK5의 억제제는 CYC-065 또는 DCAM-422이다.
E. LIMK2
LIM 키나제 2 (LIMK2)는 액틴 세포 골격의 조절 인자이다. LIMK2는 액틴 해중합 인자 (ADF) 패밀리의 구성원인 코필린 (cofilin)을 인산화함으로써, 이를 불활성화시킨다. LIMK2의 예시적인 억제제는 다음에 제한되는 것은 아니나, BMS-5 (CAS No. 1338247-35-0), Pyr-1 (LIMNIB), 담나칸탈 (damnacanthal), Par-3, T56-LIMKi, 및 LX7101을 포함한다. LX7101은 안내압의 조절과 관련된 키나제인 LIM 도메인 키나제 2 (LIMK2)의 피롤로피리미딘계 국소 전달 억제제이다.
F. ADCK4 (COQ8B)
코엔자임 Q8B (COQ8B) 또는 AarF 도메인-포함 단백질 키나제 4 (ADCK4)는 호기성 세포 호흡을 위한 지용성 전자 수송인자이다. ADCK4는 당 업계에 공지된 RNAi 또는 억제제에 의해 억제될 수 있다.
G. BTK
티로신-단백질 키나제 BTK로도 공지된 브루톤 티로신 키나제 (Bruton's tyrosine kinase) (Btk 또는 BTK)는 인간에서 BTK 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. BTK는 B-세포 발달에 관여하는 키나제이다. 비만 세포에서 B 세포 수용체 (BCR) 및 FCER1의 결합에 의해 활성화되는 신호전달 경로에서의 BTK의 기능은 잘 확립되어 있다. 인간에서 BTK의 기능적 돌연변이는 pro- 및 pre-B 세포 단계 사이의 차단으로 B 세포 발달의 결함을 특징으로 하는 일차 면역결핍 질병을 유발한다. BTK의 예시적인 억제제는 다음에 제한되는 것은 아니나, 이브루티닙 (PCI-32765), 아칼라브루티닙, ONO-4059, 스페브루티닙 (AVL-292, CC-292), BGB-3111, 및 HM71224를 포함한다.
H. CAMK4
칼슘/칼모둘린-의존성 단백질 키나제 IV형은 인간에서 CAMK4 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. 이 유전자의 산물은 세린/트레오닌 단백질 키나제 패밀리 및 Ca2+/칼모둘린-의존성 단백질 키나제 서브패밀리에 속한다. 이 효소는 림프구, 뉴런 및 남성 생식 세포에서 전사 조절에 관여하는 제한된 조직 분포를 갖는 다기능 세린/트레오닌 단백질 키나제이다. CAMK4의 예시적인 억제제는 KN-93 (N-[2-[[[3-(4-클로로페닐)-2-프로페닐]메틸아미노]메틸]페닐]-N-(2-하이드록시에틸)-4-메톡시벤젠술폰아미드)이다.
I. CLK3
CDC 유사 키나제 3 (CLK3)은 스플라이싱 인자의 세린/아르기닌-강화 (SR) 패밀리의 핵내 분포를 조절하는 핵 이중 특이성 키나제이다. CLK3의 예시적인 억제제는 KH-CB19이다. 사용될 수 있는 다른 억제제는 R547, A-674563, NVP-TAE684, 및 AT-7519를 포함한다.
J. DAK
트리오키나제/FMN 사이클라제 또는 디하이드록시아세톤 키나제 2 상동체 (DAK)는 인간에서 DAK 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. DAK는 디하이드록시아세톤을 인산화하고, FAD로부터 리보플라빈 4',5'-포스페이트 (일명 사이클린 FMN)의 형성을 촉매한다. DAK는 당 업계에 공지된 RNAi 또는 억제제에 의해 억제될 수 있다.
K. ERK5 (MAPK7)
MAP 키나제 7 및 ERK5로도 공지된 미토겐-활성화 단백질 키나제 7은 MAP 키나제 패밀리의 구성원이다. MAP 키나제는 다수의 생화학적 신호의 혼입 지점으로서 작용하고, 증식, 분화, 전사 조절 및 발달과 같은 광범위한 세포 과정에 관여한다. 이 키나제는 구체적으로 미토겐-활성화 단백질 키나제 키나제 5 (MAP2K5/MEK5)에 의해 활성화된다. 이는 수용체 티로신 키나제 및 G 단백질-연결 수용체를 포함하는 다양한 수용체 분자의 하류 신호전달 과정에 관여한다. 세포외 신호에 대한 반응으로, 이 키나제는 세포핵으로 이동하여, 다른 전사 인자를 인산화시켜, 활성화시킴으로써, 유전자 발현을 조절한다. ERK5의 예시적인 억제제는 다음에 제한되는 것은 아니나, ERK5-IN-1 (11-사이클로펜틸-2-[[2-에톡시-4-[[4-(4-메틸-1-피페라지닐)-1-피페리디닐]카보닐]페닐]아미노]-5,11-디하이드로-5-메틸-6H-피리미도[4,5-b] [1,4]벤조디아제핀-6-온), BIX 02189, XMD17-109, 및 XMD 8-92를 포함한다.
L. FRK (PTK5)
Fyn-관련 키나제 (FRK)는 단백질 키나제의 TYR 패밀리에 속한다. 이 티로신 키나제는 핵 단백질이며, 세포 주기의 G1 및 S 단계 동안 기능하고, 성장을 억제할 수 있다. FRK의 예시적인 억제제는 다음에 제한되는 것은 아니나, 티로신 키나제 억제제 예컨대 다사티닙, 모테사닙 (A1VIG-706), 도라마피모드 (BIRB 796), 펠리티닙 (EKB-569), 소라페닙, 반데타닙, 카너티닙 (CI-1033) 및 이마티닙 (STI-571)을 포함한다.
M. MAP2K7 (MKK7/GADD45b)
MAP 키나제 키나제 7 또는 MKK7로도 공지된 이중 특이성 미토겐-활성화 단백질 키나제 키나제 7은 인간에서 MAP2K7 유전자에 의해 인코딩되는 효소이다. 이 단백질은 미토겐-활성화 단백질 키나제 키나제 패밀리의 구성원이다. MKK7은 전 염증성 사이토카인 및 환경 스트레스에 대한 세포 반응을 매개하는 신호 변환에 관여한다. MAP2K7은 DTP3 ((R)-2-((R)-2-아세트아미도-3-(4-하이드록시페닐)프로파나미도)-N-((R)-1-아미노-1-옥소-3-페닐프로판)-2-일)-5-구아니딘펜탄아미드 트리플루오로아세테이트)에 의해 억제될 수 있다.
N. PAK4
세린/트레오닌-단백질 키나제 PAK 4는 세린/트레오닌 키나제의 PAK 패밀리의 6개 구성원 중 하나이다. PAK4는 세포질 및 핵의 세포 이하 도메인에 위치한다. PAK4는 세포 골격 리모델링, 표현형 신호전달 및 유전자 발현을 조절하고, 방향성 이동성, 침습, 전이 및 성장에 영향을 미친다. PAK4는 PF-3758309, LCH-7749944, 글라우카루비논, KY-04031, KY-04045, 1-페난트릴-테트라하이드로이소퀴놀린 유도체, (-)-β-히드라스틴, Inka1, GL-1196, GNE-2861, 및 마이크로RNA 예컨대 miR-145, miR-433, 및 miR-126에 의해 억제될 수 있다.
O. PMVK
포스포메발로네이트 키나제 (PMVK)는 메발로네이트 경로에 존재하고, 이는 메발로네이트 5-포스페이트에서 메발로네이트 5-디포스페이트로의 전환을 촉매하며, 상기 전환 단계는 이소프레노이드 생합성의 메발로네이트 경로의 제5 단계이다. 본 명세서에 참조로 포함되는 문헌[Boonsri et al., 2013]에 기재된 바와 같이, PMVK는 CSDDD_1633 (1,4-비스((2-((γ1-옥시다네일)디옥소-γ6-술파네일)-4-메틸페닐)아미노)-5,8-디하이드록시-4a,9a-디하이드로안트라센-9,10-디온), CSDDD_2260 (2,2'-((4-((2-(γ1-옥시다네일)-2-옥소에틸)티오)-[1,1'-바이페닐]-2,6-디일)비스(술파네디일))디아세테이트, CSDDD_2419 ((E)-4-((2,4-디하이드록시페닐)디아제닐)-5-메틸나프탈렌-2,7-디술포네이트) 또는 루테올린에 의해 억제될 수 있다.
P. PRKACB 및 PRKACG
cAMP-의존성 단백질 키나제 촉매 하위단위 베타 (PRKACB)는 다양한 세포 기능을 위한 신호전달 분자이다. cAMP는 단백질 키나제 A (PKA)를 활성화시켜 상이한 표적 단백질의 인산화를 통해 신호를 변환함으로써 그 효과를 발휘한다. PKA의 불활성 효소는 2개의 조절 및 2개의 촉매 하위단위로 구성된 사량체이다. cAMP는 4개의 cAMP에 결합된 조절 하위단위 및 2개의 유리 단량체 촉매 하위단위의 이량체로의 불활성 전효소의 해리를 유발한다. AMP 의존성 단백질 키나제 촉매 소 단위 감마 (PRKACG)는 대식세포의 CCR5 경로 및 갭 접합에서의 신호전달에 관여한다. PRKACB 또는 PRKACG는 당 업계에 공지된 RNAi 또는 억제제에 의해 억제될 수 있다.
Q. PRKCI 및 PRKCD
단백질 키나제 C 이오타형 (PRKCI) 및 단백질 키나제 C 델타 형 (PRKCD)은 세린/트레오닌 단백질 키나제의 단백질 키나제 C (PKC) 패밀리의 구성원이다. PKC 패밀리는 적어도 8개의 구성원을 포함하고, 이는 상이하게 발현되며, 다양한 세포 과정에 관여한다. 이 단백질 키나제는 칼슘 비의존성이며, 인지질 의존성이다. 이는 포르볼에스테르 또는 디아실글리세롤에 의해 활성화되지 않는다. 이 키나제는 작은 GTPase RAB2와의 직접적인 상호작용에 의해 소포관 클러스터 (VTC)로 집합할 수 있고, 여기서 이 키나제는 글리세르알데하이드-3-포스페이트 탈수소효소 (GAPD/GAPDH)를 인산화하며, 초기 분비 경로에서 미세소관 역학에 관여한다. 이 키나제는 약물-유도된 아폽토시스 (apoptosis)에 대한 BCL-ABL-매개 저항성에 필요하며, 이에 따라 약물-유도 아폽토시스로부터 백혈병 세포를 보호하는 것으로 나타났다. 이 키나제에 대한 예시적인 억제제는 다음에 제한되는 것은 아니나, 단백질 키나제 억제제 예컨대 비신돌릴말레이미드 II (Bisindolylmaleimide II), 칼포스틴 C (Calphostin C), 디하이드로스핑고신 (Dihydrosphingosine), 및 LY 333531 하이드로클로라이드를 포함한다. 구체적 양상에서, PRKCI의 억제제는 리다우라 (auranofin) 또는 RXDX-108이다.
R. TSSK6
인코딩된 키나제인 정소-특이적 세린 키나제 6 (TSSK6)은 광범위한 발현 패턴을 갖지만, 생식력에 대한 영향으로 인해 정소-특이적으로 기재된다. TSSK6은 당 업계에 공지된 RNAi 또는 억제제에 의해 억제될 수 있다.
S. UCK2
우리딘-시티딘 키나제 2 (UCK2)는 우리딘 및 시티딘에서 각각 우리딘 모노포스페이트 (UMP) 및 시티딘 모노포스페이트 (CMP)로의 인산화를 촉매한다. 이는 RNA 및 DNA 합성에 필요한 피리미딘 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 생성의 제1 단계이다. 일부 양상에서, UCK2의 억제제는 플라보카와인 B 또는 알피네틴이다 (문헌[Malami et al., 2016]).
T. ZC3HC1
아연 핑거 C3HC-형 단백질 1 (ZC3HC1)로도 공지된 ALK (NIPA)의 핵-상호작용 상대는 핵 세포 이하 위치에서 배타적으로 발현되지만, 많은 조직 및 세포 유형에서 무작위 발현된다. NIPA는 유사 분열로의 진입 조절에 관여하는 skp1 컬린 F-박스 (SCF)-형 유비퀴틴 E3 리가제 (skp1 cullin F-box (SCF)-type ubiquitin E3 ligase) (SCFNIPA) 복합 단백질이다. ZC3HC1은 당 업계에 공지된 RNAi 또는 억제제에 의해 억제될 수 있다.
U. RNA 간섭
일부 실시형태에서, 키나제는 siRNA 또는 miRNA와 같은 RNA 간섭에 의해 억제될 수 있다. RNA는 siRNA, shRNA, 플라스미드, mRNA, miRNA, 또는 ncRNA, 특히 siRNA 또는 miRNA 치료제일 수 있다. miRNA는 miRNA 모방체, 또는 miRNA 전구체일 수 있다. RNA의 크기는 100개 미만의 뉴클레오타이드 길이, 예컨대 75개 미만의 뉴클레오타이드, 특히 50개 미만의 뉴클레오타이드 길이일 수 있다. 예를 들어, RNA는 약 10 내지 100 뉴클레오타이드, 예컨대 20 내지 50 뉴클레오타이드, 특히 10 내지 20, 15 내지 25, 20 내지 30, 25 내지 35, 30 내지 40, 또는 45 내지 50 뉴클레오타이드의 길이를 가질 수 있다.
RNA는 변형되거나 변형되지 않을 수 있다. RNA는 하나 이상의 뉴클레오타이드의 변이를 포함할 수 있다. 이러한 변이는 예컨대, RNA의 말단 (들) 또는 내부 (RNA의 하나 이상의 뉴클레오타이드)에 비-뉴클레오타이드 물질의 첨가를 포함할 수 있다. 특정 양상에서, RNA 분자는 3'-하이드록실기를 포함한다. 본 개시내용의 RNA 분자의 뉴클레오타이드는 또한 비 천연 발생 뉴클레오타이드 또는 데옥시리보뉴클레오타이드를 포함하여, 비표준 뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 이중 가닥 올리고뉴클레오타이드는 변형된 백본, 예를 들어 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 또는 당 업계에 공지된 다른 변형된 백본을 포함할 수 있거나, 비 천연 뉴클레오사이드드 간 연결을 포함할 수 있다. siRNA의 추가 변형 (예를 들어, 2'-O-메틸 리보뉴클레오타이드, 2'-데옥시-2'-플루오로 리보뉴클레오타이드, "범용 염기" 뉴클레오타이드, 5-C-메틸 뉴클레오타이드, 하나 이상의 포스포로티오에이트 뉴클레오타이드간 연결 및 역위 데옥시무염기 잔기 혼입)은 미국 공개 제 20040019001호 및 미국 특허 제 6,673,611호 (각각 그 전문이 참조로 포함됨)에서 찾아 볼 수 있다. 총칭하여, 상기 기재된 이러한 모든 변이 핵산 또는 RNA는 변형된 siRNA로 지칭된다.
바람직하게는, RNAi는 단백질의 발현을 적어도 10%, 20%, 30%, 또는 40%, 더욱 바람직하게는 적어도 50%, 60%, 또는 70%, 및 훨씬 더욱 바람직하게는 적어도 75%, 80%, 90%, 95% 이상 감소시킬 수 있다.
본 명세서에 기재된 방법 또는 조성물에 사용되는 바와 같은 siRNA는 언급된 키나제에 대해 NCBI 참조 서열에 의해 인코딩되는 mRNA 서열에 상보적인 부분을 포함할 수 있다. 실시형태에서, siRNA는 이중 가닥 부분 (이중체)을 포함한다. 실시형태에서, siRNA는 20 내지 25개의 뉴클레오타이드 길이이다. 일 실시형태에서 siRNA는 독립적으로, 하나 또는 두 가닥에 하나 또는 2개의 뉴클레오타이드 3' 오버행을 가진 19 내지 21개의 코어 RNA 이중체를 포함한다. 일 실시형태에서, 오버행은 UU이다. siRNA는 5'이 인산화되거나 그렇지 않을 수 있고, 뉴클레아제 분해에 대한 효능 및/또는 내성을 향상시키기 위해 당 업계에 공지된 임의의 변형으로 변형될 수 있다. 비 제한적인 실시형태에서, siRNA를 하나 이상의 세포에 투여하여, 이를 형질감염시킬 수 있다. 일 실시형태에서, siRNA는 제1 및 제2 가닥을 포함하는 이중 가닥 RNA를 포함할 수 있으며, RNA의 하나의 가닥은 유전자의 RNA 전사체의 일부에 80, 85, 90, 95 또는 100% 상보적이다.
일 실시형태에서, 본 개시내용의 siRNA의 단일 가닥 구성성분은 14 내지 50개의 뉴클레오타이드 길이이다. 다른 실시형태에서, siRNA의 단일 가닥 구성성분은 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 또는 28개의 뉴클레오타이드 길이이다. 또 다른 실시형태에서, 본 개시내용의 siRNA의 단일 가닥 구성성분은 21개의 뉴클레오타이드 길이이다. 또 다른 실시형태에서, 본 개시내용의 siRNA의 단일 가닥 구성성분은 22개의 뉴클레오타이드 길이이다. 또 다른 실시형태에서, 본 개시내용의 siRNA의 단일 가닥 구성성분은 23개의 뉴클레오타이드 길이이다. 일 실시형태에서, 본 개시내용의 siRNA는 28 내지 56개의 뉴클레오타이드 길이이다.
III. 치료 방법
개체에서 암, 특히 암 전이를 치료 또는 지연시키는 방법으로서, 본 개시내용에서 확인된 전이-촉진 키나제 억제제와 같은 키나제 억제제의 유효량을 개체에 투여하는 단계를 포함하는 방법이 본 명세서에 제공된다 (표 1). 본 개시내용의 특정 실시형태는 대상체에서 질병을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 전이-촉진 키나제의 억제제의 투여를 포함하는 방법에 관한 것이다. 질병은 대상체에 발병할 수 있는 임의의 질병일 수 있다. 특정 실시형태에서, 질병은 과증식성 질병이다. 더욱 특정한 실시형태에서, 질병은 암이다.
일부 실시형태에서, 대상체의 뇌에서 전이성 암세포의 성장 및/또는 생존을 억제하는 방법으로서, 대상체를 표 1의 키나제 억제제의 치료 유효량으로 치료하는 단계를 포함하는 방법이 제공된다. 특정 실시형태에서, 대상체에서, 예컨대 상기 대상체의 혈액 중 상기 키나제의 발현을 측정함으로써, 대상체에서의 뇌종양 또는 전이성 뇌종양이 표 1의 키나제 억제제로의 치료로부터 치료 이점을 받을지 여부를 결정하는 방법이 제공된다.
암은 고형 종양, 전이성 암 또는 비-전이성 암일 수 있다. 특정 실시형태에서, 암은 방광, 혈액, 뼈, 골수, 뇌, 유방, 결장, 식도, 위장관, 치은, 두부, 신장, 간, 폐, 비인두, 경부, 난소, 전립선, 피부, 위, 고환, 혀 또는 자궁에서 유래할 수 있다. 특정 실시형태에서, 암은 인간 난소암 또는 유방암이다. 또한, 암은 구체적으로 하기 조직학적 유형일 수 있지만, 다음에 제한되지 않는다: 악성 신생물; 암종; 미분화 암종; 거대 및 방추 세포 암종; 소세포 암종; 유두 암종; 편평 세포 암종; 림프상피 암종; 기저 세포 암; 섬모기질 암종; 전이 세포 암종; 유두 전이 세포 암종; 선암종; 악성 위염; 담관암; 간세포암; 조합된 간세포 암종 및 담관암종; 육주상 선암종; 아데노이드 낭성 암종; 선종성 용종의 선암종; 가족성대장폴립증 선암종; 고형 암종; 악성 카르시노이드 종양; 기관지-폐포 선암종; 유두 선암종; 비염색성 세포 암종; 호산구 암종; 호산구 선암종; 호염기구 암종; 투명 세포 선암종; 과립 세포 암종; 여포성 선암종; 유두 및 여포성 선암종; 비포획성 경화성 암종 (nonencapsulating sclerosing carcinoma); 부신 피질 암종; 자궁내막 암종; 피부 부속기관 암종; 아포크린 선암종; 피지 선암종; 이구 선암종 (ceruminous adenocarcinoma); 점막 표피양 암종; 낭샘암종; 유두상 낭샘암종; 유두상 장액성 낭샘암종; 점액성 낭샘암종; 점액성 선암종; 반지세포 암종 (signet ring cell carcinoma); 침윤성 도관 암종; 수질 암종; 소엽 암종; 염증성 암종; 유방 파제트병 (paget's disease); 선포 세포 암종; 샘평편상피암종; 편평상피화생 선암종 (adenocarcinoma w/squamous metaplasia); 악성 흉선종; 악성 난소 기질 종양; 악성 포막종; 악성 과립막 세포 종양; 악성 남성아세포종; 세르톨리 세포 암종 (sertoli cell carcinoma); 악성 라이디히 세포 종양 (leydig cell tumor); 악성 지질 세포 종양; 악성 부신경절종; 악성 유방외 부신경절종; 갈색세포종; 사구맥관육종; 악성 흑색종; 멜라닌결핍흑색종; 표재 확산성 흑색종; 거대 색소 모반의 악성 흑색종; 상피 세포 흑색종; 악성 푸른 모반; 육종; 섬유육종; 악성 섬유성 조직구종; 점액육종; 지방육종; 평활근육종; 횡문근육종; 배아 횡문근육종; 폐포 횡문근육종; 기질 육종; 악성 혼합 종양; 뮬러관 혼합 종양 (mullerian mixed tumor); 신장아세포종; 간아세포종; 암육종; 악성 간엽종; 악성 브레너 종양 (Brenner tumor); 악성 엽상 종양; 활막 육종; 악성 중피종; 근긴장종; 배아 암종; 악성 기형종; 악성 난소갑상선종; 융모암; 악성 중신종; 혈관육종; 악성 혈관내피종; 카포시육종; 악성 혈관주위세포종; 림프관육종; 골육종; 피질 주위 골육종; 연골육종; 악성 연골아세포종; 중간엽 연골육종; 뼈의 거대 세포 종양; 유잉육종 (ewing's sarcoma); 악성 치성 종양; 사기질모세포 치아육종; 악성 사기질모세포종; 사기질모세포 섬유육종; 악성 송과종; 척색종; 악성 신경교종; 뇌실막종; 성상세포종; 원형질 성상세포종; 섬유성 성상세포종; 성아세포종; 교아세포종; 희소돌기아교세포종; 희소돌기아교모세포종; 원시 신경외배엽; 소뇌 육종; 신경절아세포종; 신경아세포종; 망막아세포종; 후각 신경인성 종양; 악성 수막종; 신경섬유육종; 악성 신경집종; 악성 과립 세포 종양; 악성 림프종; 호지킨병 (hodgkin's disease); 호지킨; 파라육아종 (paragranuloma); 소 림프구성 악성 림프종; 대세포 확산성 악성 림프종; 여포성 악성 림프종; 균상식육종; 다른 특정 비호지킨 림프종; 악성 조직구증; 다발성 골수종; 비만 세포 육종; 면역 증식성 소장 질병; 백혈병; 림프성 백혈병; 혈장 세포 백혈병; 적혈구혈증; 림프육종 세포 백혈병; 골수성 백혈병; 호염기성 백혈병; 호산구성 백혈병; 단핵구 백혈병; 비만 세포 백혈병; 거핵아구성 백혈병; 골수성 육종; 및 모발 세포 백혈병. 그럼에도 불구하고, 본 개시내용은 또한 비 암성 질병 (예를 들어, 진균 감염, 박테리아 감염, 바이러스 감염 및/또는 신경퇴행성 질병)을 치료하는데에 또한 사용될 수 있는 것으로 이해된다.
본 치료 방법이 유용한 종양은 고형 종양 또는 혈액학적 종양에서 발견되는 것과 같은 임의의 악성 세포 유형을 포함한다. 예시적 고형 종양은, 다음에 제한되는 것은 아니나, 췌장, 결장, 맹장, 위, 뇌, 두부, 경부, 난소, 신장, 후두, 육종, 폐, 방광, 흑색종, 전립선 및 유방으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기관의 종양을 포함할 수 있다. 예시적인 혈액학적 종양은 골수, T 또는 B 세포 악성종양, 백혈병, 림프종, 아세포종, 골수종 등의 종양을 포함한다. 본 명세서에 제공된 방법을 사용하여 치료될 수 있는 암의 추가 예는 다음에 제한되는 것은 아니나, 폐암 (소세포 폐암, 비소세포 폐암, 폐 선암종 및 폐의 편평세포 암종 포함), 복막 암, 위암 또는 위장암 (위장관암 및 위장관 기질 암 포함), 췌장암, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 유방암, 결장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁암종, 침선 암종, 신장 또는 신세포 암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 다양한 종류의 두경부암 및 흑색종을 포함한다.
본 발명의 방법에 대한 키나제 억제제는 과발현된 키나제의 수준을 감소시킬 수 있으며, 항체, 안티센스, shRNA, siRNA 또는 소분자 억제제와 같은 당 업계에 일반적으로 공지된 것들을 포함한다. 투여는 예를 들어 정맥내, 척수내, 근육내 또는 피하, 비강내 및 경구 주사에 의해 이루어질 수 있다. 많은 경우에, 특히 이미 뇌 전이가 검출된 경우, 혈액 뇌 장벽을 통과하거나 이러한 요건을 피하는 투여 (예를 들어, 척수내 또는 비강내)에 의한 치료 조성물의 사용이 바람직하다. 치료제의 전신 및 뇌 이용 가능성 둘 모두를 제공하는 치료의 조합이 또한 사용될 수 있다.
치료적 유효량의 치료제 (들)는 비경구 투여, 예를 들어 정맥내, 복강내, 근육내, 흉골내 또는 관절내 주사 또는 주입을 포함하는 다수의 경로에 의해 투여될 수 있다. 특정 양상에서, 치료제 (들)는 뇌와 같은 전이 부위에 직접 투여되거나, 혈액 뇌 장벽을 통과하는 방법, 예컨대 척수내 또는 비강내로 투여된다. 일부 양상에서, 치료제 (들)는 뇌와 같은 전이 부위에 직접 및 전신 투여 둘 모두에 의해 투여된다.
키나제 억제제의 치료 유효량은 치료되는 대상체에서 적절한 효과를 달성하는 양이다. 예를 들어, 이는 진행을 억제하거나, 암의 퇴행을 유발하는데 필요하거나, 암으로 인한 증상을 경감시킬 수 있는 키나제 억제제의 양일 수 있다.
키나제 억제제 (들)는 예를 들어, 질병 진행을 억제하고, 질병 재발을 방지하기 위해, 연장된 기간 동안 주기적 투여량에 의하거나, 질병 상태를 호전시키기 위해, 1일 내지 수 일 동안 단일 또는 수회 투여량에 의해, 질병에 적절한 치료 용법으로 투여될 수 있다. 제형에 사용되는 정확한 투여량은 또한 투여 경로 및 질병 또는 장애의 중증도에 따라 달라질 것이며, 의사의 판단 및 각 환자의 상황에 따라 결정되어야 한다. 치료적 유효량의 키나제 억제제 (들)는 치료되는 대상체, 질환의 중증도 및 유형, 및 투여 방식에 따라 달라질 것이다. 키나제 억제제 (들)의 정확한 양은 대상체의 연령, 체중, 성별 및 생리학적 상태를 기반으로 하여 당업자에 의해 용이하게 결정된다. 시험관내 또는 동물 모델 시험 시스템으로부터 유도된 투여량-반응 곡선으로부터 유효량을 추정할 수 있다.
A. 약제학적 조성물
본 명세서에 제시된 특정 방법은 본 개시내용에서 확인된 전이-촉진 키나제의 억제제 (들)를 포함하는 조성물의 약제학적 유효량의 투여를 포함하는 방법에 관한 것이다.
약제학적 활성 물질을 위한 매질 및 제제의 사용은 당 업계에 잘 공지되어 있다. 임의의 통상적인 매질 또는 제제가 활성 성분과 상용 가능하지 않는 한, 치료 조성물에서의 그의 사용이 고려된다. 보충 활성 성분이 또한 조성물에 혼입될 수 있으며, 이는 하기에서 더욱 상세하게 논의된다. 인간 투여의 경우, 제조물은 바람직하게는 FDA Office of Biologics standards에 의해 요구되는 멸균성, 발열원성, 일반적인 안전성 및 순도 표준을 충족시킨다.
본 개시내용은 하기에서 더욱 상세히 논의되는 바와 같이 임의의 다른 경로에 의한 주사 또는 적용을 위한 멸균 용액인 조성물을 사용하는 방법을 고려한다. 당업자는 임의의 다른 경로에 의한 주사 또는 적용을 위한 멸균 용액을 생성하는 기법에 익숙할 것이다. 당업자에게 친숙한 다양한 다른 성분과 함께 적절한 용매 중에 활성 화합물을 필요한 양으로 혼입함으로써 멸균 주사 용액을 제조한다.
조성물의 제형은 투여 경로에 따라 달라질 수 있다. 예를 들어, 수용액 중 비경구 투여를 위한 용액은 적절하게 완충되어야 하고, 액체 희석제는 먼저 충분한 식염수 또는 글루코스에 의해 등장액이 되어야 한다. 이와 관련하여, 사용될 수 있는 멸균 수성 매질은 본 개시내용에 비추어 당업자에게 인식될 것이다.
정맥내 또는 근육내 주사와 같은 비경구 투여를 위해 제형화된 화합물 이외에, 약제학적으로 허용 가능한 다른 형태에는 이식 가능한 약물 전달 장치를 통한 투여용 제형 및 임의의 다른 형태가 포함된다. 본 개시내용에서 비강 용액 또는 스프레이, 에어로졸 또는 흡입제가 또한 사용될 수 있다.
경구 제형은 예를 들어 약제학적 등급의 만니톨, 락토스, 전분, 스테아르산마그네슘, 사카린나트륨, 셀룰로스, 탄산마그네슘 등과 같은 통상적으로 사용되는 부형제를 포함한다. 이들 조성물에는 용액, 현탁액, 정제, 환제, 캡슐, 지속 방출 제형 또는 분말의 형태가 적용된다. 당업자는 경구 제형의 제조를 위한 널리 공지된 기법에 익숙할 것이다.
특정 실시형태에서, 약제학적 조성물은 적어도 약 0.1 중량%의 활성제를 포함한다. 조성물은 예를 들어 약 0.01%를 포함할 수 있다. 다른 실시형태에서, 약제학적 조성물은 조성물 중 약 2 중량% 내지 약 75 중량%, 또는 예를 들어 조성물 중 약 25 중량% 내지 약 60 중량%, 및 그 중 도출될 수 있는 임의의 범위를 차지한다.
약제학적 조성물은 하나 이상의 구성성분의 산화를 지연시키기 위해 다양한 항산화제를 포함할 수 있다. 또한, 미생물의 작용의 방지는 다음에 제한되는 것은 아니나, 파라벤 (예를 들어, 메틸파라벤, 프로필파라벤), 클로로부탄올, 페놀, 소르브산, 티메로살 또는 이들의 조합을 포함하는 다양한 항박테리아제 및 항진균제와 같은 보존제에 의해 유도될 수 있다. 조성물은 제조 및 저장 조건 하에서 안정할 수 있고, 박테리아 및 진균과 같은 미생물의 오염 작용에 대해 보존될 수 있다. 외독소 오염은 최소한의 안전한 수준, 예를 들어 0.5 ng/mg 미만의 단백질로 유지되어야 한다는 것이 이해될 것이다.
조성물이 액체 형태인 실시형태에서, 담체는 다음에 제한되는 것은 아니나, 물, 에탄올, 폴리올 (예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 지질 (예를 들어, 트리글리세리드, 식물성 오일, 리포솜) 및 이들의 조합을 포함하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다. 많은 경우에, 등장화제, 예를 들어 당, 염화나트륨 또는 이들의 조합을 포함하는 것이 바람직할 것이다.
다른 실시형태에서, 본 개시내용에서 비강 용액 또는 스프레이, 에어로졸 또는 흡입제가 사용될 수 있다. 비강 용액은 점적액 또는 스프레이로 비관에 투여되도록 설계된 수용액일 수 있다.
필요에 따라 상기 열거된 다양한 다른 성분과 함께 적절한 용매 중에 나노 입자를 필요한 양으로 혼입시킨 후 멸균시킴으로써 멸균 주사 용액을 제조한다.
2. 투여 경로
제형화시, 키나제 억제제 (들)는 투여 제형에 적합한 방식으로 치료 유효량으로 투여될 것이다.
키나제 억제제 (들)는 당업자에게 공지된 임의의 방법을 사용하여 대상체에게 투여될 수 있다. 예를 들어, 나노 입자를 포함하는 조성물의 약제학적 유효량은 당업자에게 공지된 바와 같이, 정맥내, 뇌내, 두개내, 척수내, 흑질내 또는 흑질 영역내, 피내, 동맥내, 복강내, 병변내, 기관내, 비강내, 국소, 근육내, 복강내, 피하, 경구, 국소, 국부, 흡입 (예를 들어, 에어로졸 흡입), 주사, 주입, 연속 주입, 국부 관류 배싱 (bathing) 표적 세포에 직접, 카테터를 통해, 세척을 통해, 크림 중, 지질 조성물 (예를 들어, 리포솜) 중, 또는 다른 방법 또는 상기 방법의 임의의 조합에 의해 투여될 수 있다 (문헌[Remington's, 1990]). 특정 실시형태에서, 조성물은 약물 전달 장치를 사용하여 대상체에 투여된다.
3. 투여
키나제 억제제 (들)의 약제학적 유효량은 의도된 목적, 예를 들어 세포 사멸의 억제를 기반으로 하여 결정된다. 치료 및 투여 횟수 둘 모두에 따라 투여되는 양은 치료 대상체, 대상체의 상태, 적절한 보호 및 투여 경로에 따라 달라진다. 치료제의 정확한 양은 또한 의사의 판단에 따르며, 각 개체에 따라 다르다.
예를 들어, 치료제의 투여량은 투여량당 약 0.0001 밀리그램 내지 약 1.0 밀리그램, 또는 약 0.001 밀리그램 내지 약 0.1 밀리그램, 또는 약 0.1 밀리그램 내지 약 1.0 밀리그램, 또는 심지어 약 10 밀리그램 등일 수 있다. 다회 투여량이 또한 투여될 수 있다. 일부 실시형태에서, 투여량은 적어도 약 0.0001 밀리그램이다. 추가의 실시형태에서, 투여량은 적어도 약 0.001 밀리그램이다. 추가의 실시형태에서, 투여량은 적어도 0.01 밀리그램이다. 추가의 실시형태에서, 투여량은 적어도 약 0.1 밀리그램이다. 더욱 특정한 실시형태에서, 투여량은 적어도 1.0 밀리그램일 수 있다. 더욱 특정한 실시형태에서, 투여량은 적어도 10 밀리그램일 수 있다. 추가의 실시형태에서, 투여량은 적어도 100 밀리그램 이상이다.
다른 비제한적 예에서, 투여량은 또한 투여당 약 1 마이크로그램/kg/체중, 약 5 마이크로그램/kg/체중, 약 10 마이크로그램/kg/체중, 약 50 마이크로그램/kg/체중, 약 100 마이크로그램/kg/체중, 약 200 마이크로그램/kg/체중, 약 350 마이크로그램/kg/체중, 약 500 마이크로그램/kg/체중, 약 1 밀리그램/kg/체중, 약 5 밀리그램/kg/체중, 약 10 밀리그램/kg/체중, 약 50 밀리그램/kg/체중, 약 100 밀리그램/kg/체중, 약 200 밀리그램/kg/체중, 약 350 밀리그램/kg/체중, 약 500 밀리그램/kg/체중, 내지 약 1000 mg/kg/체중 이상 및 그 중 도출될 수 있는 임의의 범위를 포함할 수 있다. 본 명세서에 열거된 수치로부터 도출 가능한 범위의 비 제한적 예에서, 약 5 mg/kg/체중 내지 약 100 mg/kg/체중, 약 5 마이크로그램/kg/체중 내지 약 500 밀리그램/kg/체중 등의 범위가 상기 기재된 수치에 따라 투여될 수 있다.
투여는 당업자에 의해 결정된 바와 같이 반복하여 이루어질 수 있다. 따라서, 본 명세서에 제시된 방법의 일부 실시형태에서, 단일 투여가 고려된다. 다른 실시형태에서, 2회 이상의 투여가 고려된다. 1회 이상의 투여가 대상체에 투여되는 경우, 투여 사이의 시간 간격은 당업자에 의해 결정된 바와 같은 임의의 시간 간격일 수 있다. 예를 들어, 투여 사이의 시간 간격은 약 1시간 내지 약 2시간, 약 2시간 내지 약 6시간, 약 6시간 내지 약 10시간, 약 10시간 내지 약 24시간, 약 1일 내지 약 2일, 약 1주 내지 약 2주 이상, 또는 상기 열거된 임의의 범위 내에서 도출될 수 있는 임의의 시간 간격일 수 있다.
특정 실시형태에서, 상기 방법은 환자에 약제학적 조성물의 연속 공급을 제공할 수 있다. 이는 카테터 삽입 후 치료제의 연속 투여에 의해 달성될 수 있다. 투여는 수술 중 또는 수술 후 이루어질 수 있다.
B. 조합 치료
본 개시내용의 특정 실시형태는 질병의 치료 또는 예방을 위한 하나 이상의 2차 요법 형태의 투여 또는 적용을 제공한다. 예를 들어, 질병은 암과 같은 과증식성 질병일 수 있다.
2차 요법 형태는 암의 치료 또는 예방에 적용될 수 있는 하나 이상의 2차 약리학적 제제의 투여일 수 있다. 2차 요법이 약리학적 제제인 경우, 키나제 억제제 (들)의 투여 전, 그와 동시에 또는 그 후에 투여될 수 있다.
키나제 억제제 (들)의 투여와 2차 요법 사이의 간격은 당업자에 의해 결정된 바와 같은 임의의 간격일 수 있다. 예를 들어, 상기 간격은 수 분 내지 수 주일 수 있다. 제제가 개별적으로 투여되는 실시형태에서, 일반적으로 각 전달 시간 사이에 장기간의 시간이 경과되지 않도록 하여, 각 치료제가 대상체에 유리하게 조합된 효과를 발휘할 수 있도록 한다. 예를 들어, 치료제 사이의 간격은 서로 약 12시간 내지 약 24시간, 더욱 바람직하게는 서로 약 6시간 내지 약 12시간 내일 수 있다. 그러나 일부 상황에서는 치료 기간이 연장될 수 있으며, 수 일 (2, 3, 4, 5, 6 또는 7) 내지 수 주 (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8)가 각 투여 사이에 경과된다. 일부 실시형태에서, 2차 치료제의 투여 일정은 나노 입자에 대한 대상체의 반응을 기반으로 하여 결정된다.
다양한 조합이 사용될 수 있다. 아래의 예에서 키나제 억제제 조성물은 "A"이고, 항암 요법은 "B"이다:
A/B/A B/A/B B/B/A A/A/B A/B/B B/A/A A/B/B/B B/A/B/B
B/B/B/A B/B/A/B A/A/B/B A/B/A/B A/B/B/A B/B/A/A
B/A/B/A B/A/A/B A/A/A/B B/A/A/A A/B/A/A A/A/B/A
본 개시내용의 임의의 화합물 또는 요법의 환자에의 투여는 존재하는 경우, 제제의 독성을 고려하여, 이러한 화합물의 투여를 위한 일반적인 프로토콜을 따라 이루어질 것이다. 따라서, 일부 실시형태에서, 조합 요법으로 인한 독성을 모니터링하는 단계가 존재한다. 처리 주기가 반복될 수 있는 것으로 예상된다. 또한, 외과적 처치뿐만 아니라, 다양한 표준 요법이 기재된 요법과 조합하여 적용될 수 있는 것으로 고려된다.
구체적 양상에서, 표준 요법은 본 명세서에 기재된 바와 같이, 화학요법, 방사선요법, 면역요법, 수술 요법 또는 유전자 요법을 포함할 것이고, 유전자 발현 요법 억제제, 항암 요법 또는 유전자 발현 요법 억제제 및 항암 요법 둘 모두와 조합하여 사용될 수 있는 것으로 고려된다.
1. 화학요법
사용될 수 있는 화학요법제의 예는 알킬화제, 예컨대 티오테파 (thiotepa) 및 사이클로포스파미드 (cyclosphosphamide); 알킬 술포네이트 (alkyl sulfonates), 예컨대 부술판 (busulfan), 임프로술판 (improsulfan) 및 피포술판 (piposulfan); 아지리딘 (aziridines), 예컨대 벤조도파 (benzodopa), 카보쿠온 (carboquone), 메투레도파 (meturedopa) 및 우레도파 (uredopa); 알트레타민 (altretamine), 트리에틸렌멜라민 (triethylenemelamine), 트리에틸렌포스포르아미드 (trietylenephosphoramide), 트리에틸렌티오포스포르아미드 (triethiylenethiophosphoramide) 및 트리메틸올로멜라민 (trimethylolomelamine)을 포함하는 에틸렌이민 (ethylenimines) 및 메틸아멜아민 (methylamelamines); 아세트게닌 (acetogenin) (특히, 불라타신 (bullatacin) 및 불라타시논 (bullatacinone)); 캄프토테신 (camptothecin) (합성 유사체 토포테칸 (topotecan) 포함); 브리오스타틴 (bryostatin); 칼리스타틴 (callystatin); CC-1065 (아도젤레신 (adozelesin), 카젤레신 (carzelesin) 및 비젤레신 (bizelesin) 합성 유사체 포함); 크립토피신 (cryptophycin) (특히, 크립토피신 1 및 크립토피신 8); 돌라스타틴 (dolastatin); 듀오카마이신 (duocarmycin) (합성 유사체, KW-2189 및 CB1-TM1 포함); 엘레우테로빈 (eleutherobin); 판크라티스타틴 (pancratistatin); 사르코딕티인 (sarcodictyin); 스폰지스타틴 (spongistatin); 질소 머스타드 (nitrogen mustard), 예컨대 클로람부실 (chlorambucil), 클로르나파진 (chlornaphazine), 콜로포스파미드 (cholophosphamide), 에스트라무스틴 (estramustine), 이포스파미드 (ifosfamide), 메클로레타민 (mechlorethamine), 메클로레타민 옥사이드 하이드로클로라이드 (mechlorethamine oxide hydrochloride), 멜팔란 (melphalan), 노벰비친 (novembichin), 페네스테린 (phenesterine), 프레드니무스틴 (prednimustine), 트로포스파미드 (trofosfamide) 및 우라실 머스타드 (uracil mustard); 니트로슈레아 (nitrosurea), 예컨대 카르무스틴 (carmustine), 클로로조토신 (chlorozotocin), 포테무스틴 (fotemustine), 로무스틴 (lomustine), 니무스틴 (nimustine) 및 라님누스틴 (ranimnustine); 항생제, 예컨대 에네디인 항생제 (enediyne antibiotic) (예를 들어, 칼리케아마이신 (calicheamicin), 특히 칼리케아마이신 감마II 및 칼리케아마이신 오메가II); 다이네마이신 (dynemicin), 예컨대 다이네마이신 A; 비스포스포네이트 (bisphosphonate), 예컨대 클로드로네이트 (clodronate); 에스페라마이신 (esperamicin); 뿐만 아니라, 네오카르지노스타틴 발색단 (neocarzinostatin chromophore) 및 관련 색소단백질 에네디인 항생제 발색단 (chromoprotein enediyne antiobiotic chromophore), 아클라시노마이신 (aclacinomysin), 악티노마이신 (actinomycin), 아우트라르니신 (authrarnycin), 아자세린 (azaserine), 블레오마이신 (bleomycin), 칵티노마이신 (cactinomycin), 카라비신 (carabicin), 카르미노마이신 (carminomycin), 카르지노필린 (carzinophilin), 크로모마이시니스 (chromomycinis), 닥티노마이신 (dactinomycin), 다우노루비신 (daunorubicin), 데토루비신 (detorubicin), 6-디아조-5-옥소-L-노르류신 (6-diazo-5-oxo-L-norleucine), 독소루비신 (doxorubicin) (모르폴리노-독소루비신 (morpholino-doxorubicin), 시아노모르폴리노-독소루비신 (cyanomorpholino-doxorubicin), 2-피롤리노-독소루비신 (2-pyrrolino-doxorubicin) 및 데옥시독소루비신 (deoxydoxorubicin) 포함), 에피루비신 (epirubicin), 에소루비신 (esorubicin), 이다루비신 (idarubicin), 마셀로마이신 (marcellomycin), 미토마이신 (mitomycin), 예를 들어, 미토마이신 C, 미코페놀산 (mycophenolic acid), 노갈라르니신 (nogalarnycin), 올리보마이신 (olivomycins), 페플로마이신 (peplomycin), 포트피로마이신 (potfiromycin), 푸로마이신 (puromycin), 쿠엘라마이신 (quelamycin), 로도루비신 (rodorubicin), 스트렙토니그린 (streptonigrin), 스트렙토조신 (streptozocin), 투베르시딘 (tubercidin), 우베니멕스 (ubenimex), 지노스타틴 (zinostatin) 및 조루비신 (zorubicin); 항-대사제, 예컨대 메토트렉세이트 (methotrexate) 및 5-플루오로우라실 (5-fluorouracil) (5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린 (denopterin), 프테로프테린 (pteropterin) 및 트리메트렉세이트 (trimetrexate); 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈 (fludarabine), 6-머캅토퓨린 (6-mercaptopurine), 티아미프린 (thiamiprine) 및 티오구아닌 (thioguanine); 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈 (ancitabine), 아자시티딘 (azacitidine), 6-아자우리딘 (6-azauridine), 카모푸르 (carmofur), 시타라빈 (cytarabine), 디데옥시우리딘 (dideoxyuridine), 독시플루리딘 (doxifluridine), 에노시타빈 (enocitabine) 및 플록수리딘 (floxuridine); 안드로겐 (androgen), 예컨대 칼루스테론 (calusterone), 드로나놀론 프로피오네이트 (dronanolone propionate), 에피티오스타놀 (epitiostanol), 메피티오스탄 (mepitiostane) 및 테스토락톤 (testolactone); 항-아드레날린성 제제, 예컨대 미토탄 (mitotane) 및 트리로스탄 (trilostane); 엽산 보충제, 예컨대 프롤린산 (frolinic acid); 아세글라톤 (aceglatone); 알도포스파미드 글리코시드 (aldophosphamide glycoside); 아미노레불린산 (aminolevulinic acid); 에닐우라실 (eniluracil); 암사크린 (amsacrine); 베스트라부실 (bestrabucil); 비산트렌 (bisantrene); 에다트랙세이트 (edatraxate); 디포파민 (defofamine); 데메콜신 (demecolcine); 디아지쿠온 (diaziquone); 엘포르미틴 (elformithine); 엘립티늄 아세테이트 (elliptinium acetate); 에포틸론 (epothilone); 에토글루시드 (etoglucid); 질산갈륨; 하이드록시우레아; 렌티난 (lentinan); 로니다이닌 (lonidainine); 마이탄시노이드 (maytansinoid), 예컨대 마이탄신 (maytansine) 및 안사미토신 (ansamitocin); 미토구아존 (mitoguazone); 미톡산트론 (mitoxantrone); 모피단몰 (mopidanmol); 니트라에린 (nitraerine); 펜토스타틴 (pentostatin); 페나멧 (phenamet); 피라루비신 (pirarubicin); 로속산트론 (losoxantrone); 포도필린산 (podophyllinic acid); 2-에틸히드라지드; 프로카바진 (procarbazine); PSK 다당류 복합체; 라족산 (razoxane); 리족신 (rhizoxin); 시조피란 (sizofiran); 스피로게르마늄 (spirogermanium); 테누아존산 (tenuazonic acid); 트리아지쿠온 (triaziquone); 2,2',2"-트리클로로트리에틸아민; 트리코테센 (trichothecene) (특히 T-2 독소, 베르라쿠린 A (verracurin A), 로리딘 A (roridin A) 및 안구이딘 (anguidine)); 우레탄 (urethan); 빈데신 (vindesine); 다카바진 (dacarbazine); 만노무스틴 (mannomustine); 미토브로니톨 (mitobronitol); 미톨락톨 (mitolactol); 피포브로만 (pipobroman); 가시토신 (gacytosine); 아라비노사이드 (arabinoside) ("Ara-C"); 사이클로포스파미드 (cyclophosphamide); 탁소이드 (taxoid), 예를 들어 파클리탁셀 (paclitaxel) 및 도세탁셀 젬시타빈 (docetaxel gemcitabine); 6-티오구아닌 (6-thioguanine); 머캅토퓨린 (mercaptopurine); 백금 배위 착물, 예컨대 시스플라틴 (cisplatin), 옥살리플라틴 (oxaliplatin) 및 카보플라틴 (carboplatin); 빈블라스틴 (vinblastine); 백금; 에토포시드 (etoposide) (VP-16); 이포스파미드 (ifosfamide); 미톡산트론 (mitoxantrone); 빈크리스틴 (vincristine); 비노렐빈 (vinorelbine); 노반트론 (novantrone); 테니포시드 (teniposide); 에다트렉세이트 (edatrexate); 다우노마이신 (daunomycin); 아미노프테린 (aminopterin); 젤로다 (xeloda); 이반드로네이트 (ibandronate); 이리노테칸 (irinotecan) (예를 들어, CPT-11); 토포이소머라제 억제제 RFS 2000; 디플루오로메트릴로오르니틴 (difluorometlhylornithine) (DMFO); 레티노이드 (retinoid), 예컨대 레티노산 (retinoic acid); 카페시타빈 (capecitabine); 카보플라틴 (carboplatin), 프로카바진 (procarbazine), 플라이코마이신 (plicomycin), 젬시타비엔 (gemcitabien), 나벨빈 (navelbine), 파네실-단백질 탄스페라제 억제제 (farnesyl-protein tansferase inhibitor), 트랜스플라티늄 (transplatinum) 및 전술한 것 중 임의의 것의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체를 포함한다.
2. 방사선요법
DNA 손상을 유발하고, 광범위하게 사용되는 다른 인자는 일반적으로 γ-선, X-선 및/또는 종양 세포로의 방사성 동위원소의 유도 전달로 공지된 것을 포함한다. 또한, 마이크로파, 양성자 빔 조사 및 UV 조사와 같은 다른 형태의 DNA 손상 인자가 고려된다. 이러한 모든 인자들이 DNA, DNA의 전구체, DNA의 복제 및 복구, 염색체의 조립 및 유지에 대한 광범위한 손상에 영향을 미칠 가능성이 크다. X-선의 투여량 범위는 장기간 (3 내지 4주) 동안 50 내지 200 뢴트겐의 1일 투여량 내지 2000 내지 6000 뢴트겐의 단일 투여량의 범위이다. 방사성 동위원소의 투여량 범위는 광범위하며, 동위원소의 반감기, 방출되는 방사선의 강도 및 유형, 및 신생물 세포의 흡수에 따라 달라진다.
3. 면역요법
당업자는 면역요법이 본 실시형태의 방법과 함께 또는 조합하여 사용될 수 있음을 이해할 것이다. 암 치료와 관련하여, 면역요법제는 일반적으로 암세포를 표적화하여, 파괴하기 위해, 면역 효과기 세포 및 분자의 사용에 의존한다. 이러한 예에는 리툭시맙 (RITUXAN®)이 있다. 면역 효과기는 예를 들어 종양 세포 표면의 일부 마커에 특이적인 항체일 수 있다. 항체는 단독으로 요법의 효과기로서 기능할 수 있거나, 실제로 세포 사멸을 유발하기 위해 다른 세포를 집합시킬 수 있다. 항체는 또한 약물 또는 독소 (화학요법제, 방사성 핵종, 리신 A 사슬, 콜레라 독소, 백일해 독소 등)에 접합되어, 표적화제로서 기능할 수 있다. 대안적으로, 효과기는 종양 세포 표적과 직접 또는 간접적으로 상호작용하는 표면 분자를 보유하는 림프구일 수 있다. 다양한 효과기 세포는 세포독성 T 세포 및 NK 세포를 포함한다.
항체-약물 접합체 (ADC)는 세포-사멸 약물에 공유 결합된 단일클론 항체 (MAb)를 포함하고, 조합 요법으로 사용될 수 있다. 이 접근법은 매우 강력한 세포독성 약물과 항원 표적에 대한 MAb의 높은 특이성을 조합하여, 강화된 수준의 항원으로 페이로드 (payload) (약물)를 종양 세포에 전달하는 "무장된" MAb를 생성한다. 약물의 표적 전달은 또한 정상 조직에서의 그의 노출을 최소화하여 독성을 감소시키고, 치료 지표를 개선시킨다. 예시적인 ADC 약물은 ADCETRIS® (브렌툭시맙 베도틴 (brentuximab vedotin)) 및 KADCYLA® (트라스투주맙 엠탄신 또는 T-DM1)를 포함한다.
면역요법의 한 양상에서, 종양 세포는 표적화될 수 있는, 즉 대부분의 다른 세포에는 존재하지 않는 일부 마커를 보유해야 한다. 다수의 종양 마커가 존재하고, 본 실시형태와 관련하여 이들 중 임의의 것이 표적화에 적합할 수 있다. 일반적인 종양 마커는 CD20, 암종배아 항원, 티로시나제 (p97), gp68, TAG-72, HMFG, 시알릴 루이스 항원, MucA, MucB, PLAP, 라미닌 수용체, erb B 및 p155를 포함한다. 면역요법의 대안적 양상은 항암 효과와 면역 자극 효과를 조합시키는 것이다. 사이토카인, 예컨대 IL-2, IL-4, IL-12, GM-CSF, 감마-IFN, 케모카인, 예컨대 MIP-1, MCP-1, IL-8 및 성장 인자, 예컨대 FLT3 리간드를 포함하는 면역 자극 분자가 또한 존재한다.
면역요법의 예는 면역 애주번트, 예를 들어, 마이코박테리움 보비스 (Mycobacterium bovis), 플라스모듐 팔시파륨 (Plasmodium falciparum), 디니트로클로로벤젠 및 방향족 화합물; 사이토카인 요법, 예를 들어 인터페론 α, β, 및 γ, IL-1, GM-CSF, 및 TNF; 유전자 요법, 예를 들어, TNF, IL-1, IL-2, 및 p53; 및 단일클론 항체, 예를 들어, 항-CD20, 항-강글리오사이드 GM2 및 항-p185를 포함한다. 하나 이상의 항암 요법이 본 명세서에 기재된 항체 요법과 함께 사용될 수 있는 것으로 고려된다.
일부 실시형태에서, 면역요법은 면역 체크포인트 억제제일 수 있다. 면역 체크포인트는 신호 (예를 들어, 공자극 분자)를 증가시키거나, 신호를 감소시킨다. 면역 체크포인트 차단에 의해 표적화될 수 있는 억제 면역 체크포인트는 아데노신 A2A 수용체 (A2AR), B7-H3 (또한 CD276으로 공지됨), B 및 T 림프구 감쇠기 (BTLA), 세포독성 T-림프구 결합 단백질 4 (CTLA-4, 또한 CD152로 공지됨), 인돌레아민 2,3-디옥시게나제 (IDO), 킬러 세포 면역글로불린 (KIR), 림프구 활성화 유전자-3 (LAG3), 프로그래밍된 사멸 1 (PD-1), T-세포 면역글로불린 도메인 및 뮤신 도메인 3 (TIM-3) 및 T 세포 활성화의 V-도메인 Ig 억제제 (VISTA)를 포함한다. 특히, 면역 체크포인트 억제제는 PD-1 축 및/또는 CTLA-4를 표적화한다.
면역 체크포인트 억제제는 약물, 예컨대 소분자, 재조합 형태의 리간드 또는 수용체일 수 있거나, 특히 인간 항체와 같은 항체일 수 있다. 면역 체크포인트 단백질의 공지된 억제제 또는 그의 유사체가 사용될 수 있으며, 특히 키메라화, 인간화 또는 인간 형태의 항체가 사용될 수 있다. 당업자는 인식하는 바와 같이, 대안적 및/또는 균등한 명칭이 본 개시내용에 언급된 특정 항체에 사용될 수 있다. 이러한 대안적 및/또는 균등한 명칭은 본 개시내용의 상황에서 상호 교체 가능하다. 예를 들어, 람브롤리주맙 (lambrolizumab)은 또한 대안적이고 균등한 명칭 MK-3475 및 펨브롤리주맙 (pembrolizumab)으로 공지되어 있다.
일부 실시형태에서, PD-1 결합 길항제는 PD-1과 그의 리간드 결합 상대의 결합을 억제하는 분자이다. 특정 양상에서, PD-1 리간드 결합 상대는 PDL1 및/또는 PDL2이다. 또 다른 실시형태에서, PDL1 결합 길항제는 PDL1과 그 결합 상대의 결합을 억제하는 분자이다. 특정 양상에서, PDL1 결합 상대는 PD-1 및/또는 B7-1이다. 다른 실시형태에서, PDL2 결합 길항제는 PDL2와 그 결합 상대의 결합을 억제하는 분자이다. 특정 양상에서, PDL2 결합 상대는 PD-1이다. 길항제는 항체, 그의 항원 결합 단편, 면역 부착제, 융합 단백질 또는 올리고펩타이드일 수 있다.
일부 실시형태에서, PD-1 결합 길항제는 항-PD-1 항체 (예를 들어, 인간 항체, 인간화 항체 또는 키메라 항체)이다. 일부 실시형태에서, 항-PD-1 항체는 니볼루맙 (nivolumab), 펨브롤리주맙 및 CT-011로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일부 실시형태에서, PD-1 결합 길항제는 면역 부착제 (예를 들어, 면역글로불린 서열의 불변 영역 (예를 들어, Fc 영역)에 융합된 PDL1 또는 PDL2의 세포외 또는 PD-1 결합 부분을 포함하는 면역 부착제)이다. 일부 실시형태에서, PD-1 결합 길항제는 AMP-224이다. 사용될 수 있는 항-PD-1 항체는, 또한 MDX-1106-04, MDX-1106, ONO-4538, BMS-936558, 및 OPDIVO®로 공지된 니볼루맙이다. 예시적인 항-PD-1 항체는, 또한 MK-3475, Merck 3475, 람브롤리주맙, KEYTRUDA®, 및 SCH-900475로 공지된 펨브롤리주맙이다. 또한 항-PD-1 항체는 또한 hBAT 또는 hBAT-1로 공지된 CT-011이다. PDL2-Fc 융합 가용성 수용체는, 또한 B7-DCIg로 공지된 AMP-224이다.
본 명세서에 제공된 방법에서 표적화될 수 있는 또 다른 면역 체크포인트는 CD152로도 공지된 세포독성 T-림프구-결합 단백질 4 (CTLA-4)이다. 인간 CTLA-4의 완전한 cDNA 서열은 Genbank 수탁 번호 L15006을 갖는다. CTLA-4는 T 세포의 표면에 존재하며, 항원-제시 세포의 표면에서 CD80 또는 CD86에 결합될 때 "오프 (off)" 스위치로서 작용한다. CTLA4는 보조 T 세포의 표면에서 발현되고, 억제 신호를 T 세포에 전달하는 면역글로불린 슈퍼패밀리의 구성원이다. CTLA4는 T-세포 공자극 단백질, CD28과 유사하고, 두 분자 모두는 항원-제시 세포에서 각각 B7-1 및 B7-2로도 지칭되는 CD80 및 CD86에 결합한다. CTLA4는 억제 신호를 T 세포에 전달하며, CD28은 자극 신호를 전달한다. 세포내 CTLA4는 또한 조절 T 세포에 존재하며, 그 기능에 중요할 수 있다. T 세포 수용체 및 CD28을 통한 T 세포 활성화는 B7 분자에 대한 억제 수용체인 CTLA-4의 발현을 증가시킨다.
일부 실시형태에서, 면역 체크포인트 억제제는 항-CTLA-4 항체 (예를 들어, 인간 항체, 인간화 항체 또는 키메라 항체), 그의 항원 결합 단편, 면역 부착제, 융합 단백질, 또는 올리고펩타이드이다.
본 방법에 사용하기에 적합한 항-인간-CTLA-4 항체 (또는 이로부터 유래된 VH 및/또는 VL 도메인)는 당 업계에 공지된 방법을 사용하여 생성될 수 있다. 대안적으로, 당 업계에 공지된 항-CTLA-4 항체가 사용될 수 있다. 예시적인 항-CTLA-4 항체는 이필리무맙 (ipilimumab) (또한 10D1, MDX-010, MDX-101 및 Yervoy®로 공지됨) 또는 그의 항원 결합 단편 및 변이체이다. 다른 실시형태에서, 항체는 이필리무맙의 중쇄 및 경쇄 CDR 또는 VR을 포함한다. 따라서, 일 실시형태에서, 항체는 이필리무맙의 VH 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3 도메인, 및 이필리무맙의 VL 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3 도메인을 포함한다. 또 다른 실시형태에서, 항체는 상기 언급된 항체와 동일한 CTLA-4상의 에피토프와의 결합에 대해 경쟁하고/거나, 이에 결합한다. 또 다른 실시형태에서, 항체는 상기 언급된 항체와 적어도 약 90%의 가변 영역 아미노산 서열 동일성 (예를 들어, 이필리무맙과 적어도 약 90%, 95%, 또는 99%의 가변 영역 동일성)을 갖는다.
4. 수술
암 환자의 대략 60%는 예방, 진단 또는 병기 결정, 치료 및 완화 수술을 포함하는 일부 유형의 수술을 받을 것이다. 치료 수술은 암 조직의 전부 또는 일부가 물리적으로 제거, 절개 및/또는 파괴되는 절제술을 포함하고, 본 실시형태의 치료, 화학요법, 방사선요법, 호르몬 요법, 유전자 요법, 면역요법 및/또는 대안적 요법과 같은 다른 요법과 함께 사용될 수 있다. 종양 절제는 종양의 적어도 일부를 물리적으로 제거하는 것을 지칭한다. 종양 절제술 이외에도 수술에 의한 치료에는 레이저 수술, 저온 수술, 전기 수술 및 현미경 제어 수술 (Mohs 수술)이 포함된다.
암세포, 조직 또는 종양의 일부 또는 전부를 절개할 때, 체내에 공동이 형성될 수 있다. 추가 항암 요법과 함께 관류, 직접 주사 또는 국소 적용을 통해 치료를 수행할 수 있다. 이러한 치료는 예를 들어 1, 2, 3, 4, 5, 6, 또는 7일마다, 또는 1, 2, 3, 4, 및 5주마다 또는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 또는 12개월마다 반복될 수 있다. 이러한 치료는 또한 다양한 투여량으로 이루어질 수 있다.
5. 다른 제제
치료의 치료 효능을 향상시키기 위해 다른 제제가 본 실시형태의 특정 양상과 조합하여 사용될 수 있는 것으로 고려된다. 이들 추가 제제는 세포 표면 수용체 및 GAP 접합의 상향 조절을 유발하는 제제, 세포 활동 억제제 및 분화제, 세포 부착 억제제, 아폽토시스 유도제에 대한 과증식성 세포의 감응성을 증가시키는 제제, 또는 다른 생물학적 제제를 포함한다. GAP 접합의 수를 증가시킴에 의한 세포 간 신호전달의 증가는 인접 과증식성 세포 집합에 대해 항-과증식성 효과를 증가시킬 것이다. 다른 실시형태에서, 세포 활동 억제제 또는 분화제는 본 실시형태의 특정 양상과 조합하여 사용되어, 치료의 항-과증식성 효능을 향상시킬 수 있다. 본 실시형태의 효능을 향상시키기 위해 세포 부착 억제제가 고려된다. 세포 부착 억제제의 예는 국소 부착 키나제 (FAK) 억제제 및 로바스타틴 (Lovastatin)이다.
IV. 키트
실시형태의 다양한 양상에서, 치료제 및/또는 다른 치료제 및 전달제를 포함하는 키트가 구상된다. 일부 실시형태에서, 본 실시형태는 실시형태의 키나제 억제제 조성물을 제조 및/또는 투여하기 위한 키트를 고려한다. 키트는 본 실시형태의 임의의 약제학적 조성물을 포함하는 하나 이상의 밀봉된 바이알 (vial)을 포함할 수 있다. 키트는 예를 들어 키나제 억제제뿐만 아니라, 본 실시형태의 구성성분을 제조, 제형화 및/또는 투여하거나, 본 발명의 방법의 하나 이상의 단계를 수행하기 위한 시약을 포함할 수 있다. 일부 실시형태에서, 키트는 또한 적합한 용기를 포함할 수 있으며, 이는 에펜도르프 튜브 (eppendorf tube), 분석 플레이트, 주사기, 병 또는 튜브와 같은 키트의 구성성분과 반응하지 않는 용기이다. 용기는 플라스틱 또는 유리와 같은 멸균 가능한 재료로 제조될 수 있다.
키트는 본 명세서에 제시된 방법의 절차 단계를 개략적으로 설명하고, 본 명세서에 기재되어 있거나, 당업자에게 공지되어 있는 것과 실질적으로 동일한 절차를 따르는 설명서를 추가로 포함할 수 있다. 설명 정보는 컴퓨터를 사용하여 실행될 때 약제학적 유효량의 치료제를 전달하는 실제 또는 가상 절차의 표시를 유도하는 기계 판독 가능 설명을 포함하는 컴퓨터 판독 가능 매체에 존재할 수 있다.
V. 실시예
하기 실시예는 본 발명의 바람직한 실시형태를 설명하기 위해 포함된다. 하기 실시예에 개시된 기법은 본 발명의 실시시 적절하게 기능하는 것으로 본 발명자에 의해 발견된 기법을 나타내고, 따라서 그의 바람직한 실시 방식을 구성하는 것으로 고려될 수 있음을 당업자는 인식해야 한다. 그러나, 당업자는 본 개시내용에 비추어, 개시된 특정 실시형태에 많은 변경이 이루어질 수 있고, 본 발명의 사상 및 범위를 벗어나지 않으면서 근사하거나 유사한 결과를 여전히 획득할 수 있음을 이해해야 한다.
실시예 1- 유도 인자 키나제 스크린
뇌 전이의 신규한 유도 인자를 확인하기 위해 키나제 과발현 스크린을 생체내에서 수행하였다 (도 1). 키나제가 뇌 전이의 성장을 향상시켰는지를 결정하기 위한 분석을 수행하였다. 스크리닝된 17개의 키나제 풀 중 14개가 마우스 생존을 적어도 20% 감소시켰다.
스크리닝을 수행하기 위해, 활성화된 키나제 오픈 리딩 프레임 (open reading frame) (ORF)을 인코딩하는 레트로바이러스 플라스미드를 MDA-MB-2131 삼중 음성 유방 모 암세포 (231p)에서 안정적으로 과발현시키고, 세포를 면역 손상된 마우스의 경동맥에 주사하였다. 루시페라제, GFP 및 최대 24개의 키나제 풀을 안정하게 발현하는 MDA-MB-231 모 세포 (231p.루시퍼라제.GFP)를 빈 pWZL-Neo-Myr-플래그-DEST 벡터 및 TdTomato를 발현하는 231p 세포 (231p.TdTomato)와 혼합하였다. 세포를 3:1 비의 키나제 풀:벡터로 혼합하고, 2 x 106개의 세포를 누드 마우스의 경동맥에 주사하였다.
동물이 신경학적 증상을 나타내고, 그의 두부가 IVIS에 의해 현저하게 루시퍼라제-양성인 것으로 결정된 경우, 마우스를 희생시키고, GFP-양성을 기반으로 한 해부 현미경을 사용하여 뇌 병변을 단리하였다. 병변의 일부를 직접 RNA 추출에 적용하고, 나머지를 분리하고, 세포를 0 계대로 시험관내에서 배양하였다. gDNA를 회수된 세포로부터 추출하고, 표적화된 PCR에 의해 키나제 벡터 서열을 증폭시켰다. 이 DNA를 MiSeq에 의해 시퀀싱하여, 생체내 선택의 정량적 판독 값을 생성하였다.
어느 키나제가 뇌 전이의 가속화된 성장에 관여하는지를 결정하기 위해 빠르게 성장하는 뇌 전이로부터 종양 세포를 단리하고, 차세대 시퀀싱 (NGS)을 수행하였고, 생체내에 강화된 24개의 키나제를 확인하였다 (표 1). 인간 암에서 이종성을 모의하기 위해 풀링된 과발현 형식으로 스크리닝을 수행하였으므로, 그 후, 생체내 기능 획득 실험 뇌 전이 분석을 사용하여, 강화에 의해 확인된 개별 키나제가 실제로 뇌 전이의 성장을 가속화할 수 있음을 검증하였다.
새로 확인된 키나제 중 일부를 루시페라제-표지된 MDA-MB-231 모 세포에서 단독으로 과발현시켰다. 키나제 과발현 뇌 전이의 성장을 벡터 제어 세포에 대해 분석하였다 (도 3). 생체내 영상화 시스템 (IVIS)을 사용하여, 루시페라제-발현 암세포에 의해 생성된 발광 신호를 정량화하였다. 0일에 동물당 1 x 105개의 세포를 주사하고, 루시페라제 신호를 1일에 정규화하였다. CDK5, PCTKI, MAPK12, LIMK2 및 SPHK는 모두 뇌 전이의 성장을 유의하게 향상시켰으며, MARK4는 유의한 성장 이점을 유발하지 않음 (즉, 단일 키나제로서의 기능적 히트가 아님)을 검증하였다.
키나제 과발현 세포 또는 해당 벡터 세포를 주사한 마우스를 그의 뇌 전이-특이적 생존에 대해 비교하였다. PCTK1 과발현은 중앙값 생존 시간을 128일에서 60일로 단축시켰다 (도 4a). Mantel-Cox 로그-등위 시험에 따르면 생존 곡선은 유의하게 상이하였다 (p=0.0004). SPHK1 과발현은 중앙값 생존 시간을 131일에서 102.5일로 단축시켰다 (도 4b). CDK5 과발현은 중앙값 생존 시간을 128일에서 70일로 단축시켰다 (도 4c).
새로 확인된 뇌 전이 성장의 키나제 유도 인자의 치료 가능성을 시험하기 위해, 4개의 유전자, PCTK.1, SPHK.l, 및 CDK5에 대해 기능 상실 실험 뇌 전이를 분석하였다. PCTK1의 경우, 공격적인 뇌 전이를 형성하고, 높은 내인성 PCTKI 발현을 갖는 HER2 양성 라인인 HCC1954.Br 뇌-확인 라인에서 PCTK1 유전자를 shRNA에 의해 안정적으로 녹다운시켰다. PCTK1-녹다운 HCC1954.Br 세포 및 대조군 shRNA-형질도입된 HCC1954.Br 세포를 각각 누드 마우스에 경동맥내 주사하고, 두 그룹의 마우스의 생존을 비교하였다. PCTK1 녹다운 그룹은 벡터 대조군 shRNA 그룹에 비해 중앙값 생존 시간이 57.5일에서 91일로 유의하게 연장되었다 (도 5b).
SPHK.1의 경우, 고도로 공격적인 뇌 전이 라인 MDA-MB-435가 높은 내인성 SPHK1 발현을 나타내므로, 이를 선택하였다. SPHK.1의 안정적인 shRNA-매개 녹다운 후, SPHK.1 녹다운 세포를 주사한 마우스를 대조군 MDA-MB-435 세포를 주사한 마우스에 비해 실험 뇌 전이-유도 치사율을 비교하였다. 실제로, SPHK1 녹다운은 대조군에 비해 중앙값 마우스 생존을 57.5일에서 77일로 연장시켰다 (도 6b). 따라서, PCTKI 및 SPHK1의 2개의 뇌 전이 유도 인자 키나제의 표적화는 뇌 전이를 효과적으로 억제하고, 뇌 전이를 보유하는 마우스의 생존을 연장시킨다는 것이 명백히 입증되었다.
또한, MAPK12 녹다운은 실험 뇌 전이의 4T1 모델에서 초기 단계에 뇌 전이 성장을 유의하게 지연시키는 것으로 나타났다. MAPK12 녹다운 암세포와 벡터 대조군 세포의 비교에 의해, MAPK12 녹다운이 뇌 전이 성장을 지연시키는 것으로 나타났다 (도 7b). 생체내 영상화 시스템 (IVIS)을 사용하여 루시페라제-발현 암세포에 의해 생성된 발광 신호를 정량화하였다. Balb/c 면역 감응 마우스 모델에서 동물당 1 x 105개의 세포를 주사하였다. (C) 4T1 세포를 주사한 BALB/c 마우스의 생존 분석에 의하면, MAPK12 녹다운이 중앙값 생존을 15일에서 19일로 연장시킨 것으로 나타났다 (도 7c).
또한, CDK5 녹다운은 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식을 감소시키고, CD8 T-세포 의존성 방식으로 실험 뇌 전이의 EO771 모델에서 치사율을 유의하게 지연시켰다. MTT 분석에 의하면, 벡터 대조군 세포와 비교할 때, 저산소 조건에서 CDK5 녹다운 세포의 시험관내 세포 증식이 유의하게 감소하는 것으로 나타났다 (도 8b). EO771 세포를 주사한 C57BL/6 마우스의 생존 분석에 의하면, CDK5 녹다운이 중앙값 생존을 19일에서 23.5일로 연장시키는 것으로 나타났다 (도 8c). 대조군 또는 CDK5 녹다운 EO771 세포를 주사한 C57BL/6 마우스의 생존 분석에 의하면, αCD8 항체를 사용하여 CD8-T 세포를 고갈시킨 경우, 이들 두 그룹 사이에서 마우스 생존에 유의한 차이가 없는 것으로 나타났으며, 이는 CDK5 유도 뇌 전이가 면역계, 특히 적응성 T 세포 구획을 통해 부분적으로 매개됨을 시사한다 (도 8d).
EO771 세포에서 CDK5 녹다운은 이를 로스코비틴에 대해 덜 감응성이 되도록 하였으며, T 세포 독성에 대해 더 감응성이 되도록 하였다. EO771 세포에서의 CDK5 녹다운은 대조군 세포와 비교하여, 이를 CDK5 억제제인 로스코비틴에 대해 덜 감응성이 되도록 하였다 (도 9a). 세포독성 T 세포 사멸 분석에 의하면, E0771 세포에서 CDK5 녹다운은 EO771 대조군 세포와 비교하여, 활성화된 T 세포 독성에 대해 더 감응성인 것으로 나타났다 (도 9b). T 세포를 CD3/CD28 항체 (100 ng/mL) 및 IL-2 (10 ng/mL)에 의해 활성화시킨 후, 종양 세포와 공동 배양하였다.
마지막으로, LIMK2 과발현은 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식을 촉진시켰다. MTT 분석에 의하면, 벡터 대조군 세포와 비교하여, LIMK2가 과발현된 경우, 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식이 유의하게 증가하는 것으로 나타났다 (도 10b). LKB1로 과발현된 MDA-MB-231 세포는 본 발명자의 MTT 분석에서 나타난 바와 같이, 벡터 대조군 세포와 비교하여, 저산소 조건에서 시험관내 세포 증식이 유의하게 증가하는 것으로 나타났다 (도 11b).
따라서, 스크리닝에 의해 확인된 키나제의 억제는 뇌 전이 관련 치사율을 유의하게 지연시켰으며, 뇌 전이에 대한 효과적인 치료 표적이다.
본 명세서에 개시되고 청구된 모든 방법은 본 개시내용에 비추어 과도한 실험없이 실시 및 구현될 수 있다. 본 발명의 조성물 및 방법이 바람직한 실시형태의 관점에서 설명되었지만, 본 발명의 개념, 사상 및 범위를 벗어나지 않으면서, 본 명세서에 기재된 방법 및 상기 방법의 단계 또는 단계의 순서로 변형이 적용될 수 있음이 당업자에게 명백할 것이다. 더욱 구체적으로, 화학적 및 생리학적으로 관련된 두 경우 모두의 특정 제제는 본 명세서에 기재된 제제로 대체될 수 있지만, 동일하거나 유사한 결과가 달성될 수 있음이 명백할 것이다. 당업자에게 명백한 이러한 모든 유사한 대체 및 변형은 첨부된 청구범위에 의해 규정된 바와 같은 본 발명의 사상, 범위 및 개념 내인 것으로 고려된다.
참조문헌
하기의 참조문헌은 이들이 본 명세서에 제시된 내용에 보충적인 예시적인 절차 또는 다른 세부사항을 제공하는 한, 본 명세서에 구체적으로 참조로 포함된다.
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Claims (76)

  1. 유효량의 키나제 억제제를 대상체에 투여하는 단계를 포함하는, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이를 억제하기 위한 방법으로서, 키나제 억제제는 ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, LIMK2, PAK4, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCI, TSSK6, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는, 방법.
  2. 제1항에 있어서, 암은 유방암인, 방법.
  3. 제2항에 있어서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정되는, 방법.
  4. 제1항에 있어서, 암은 폐암인, 방법.
  5. 제1항에 있어서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않은, 방법.
  6. 제1항에 있어서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명된, 방법.
  7. 제1항에 있어서, 대상체는 인간인, 방법.
  8. 제1항에 있어서, 키나제 억제제는 CDK5 또는 LIMK2를 표적화하는, 방법.
  9. 제1항에 있어서, 키나제 억제제는 CDK5를 표적화하는, 방법.
  10. 제1항에 있어서, 키나제 억제제는 LIMK2를 표적화하는, 방법.
  11. 제1항에 있어서, 키나제 억제제는 siRNA 또는 miRNA인, 방법.
  12. 제1항에 있어서, 키나제 억제제는 선택적 약리학적 억제제인, 방법.
  13. 제9항에 있어서, CDK5의 키나제 억제제는 디나시클립 (dinaciclib), 비스-인돌 인디루빈 (bis-indole indirubin), (S)-CR8, 켄파울론 (kenpaullone), PHA-793887, AT7519, 로스코비틴 (roscovitine), 밀시클립 (milciclib), SNS-032, 또는 올로모우신 (olomoucine)인, 방법.
  14. 제10항에 있어서, LIMK2의 키나제 억제제는 BMS-5, Pyr-1, 또는 T56-LIMKi인, 방법.
  15. 제1항에 있어서, BTK의 키나제 억제제는 이브루티닙 (ibrutinib), 아칼라브루티닙 (acalabrutinib), ONO-4059, 스페브루티닙 (spebrutinib), BGB-3111, 또는 HM71224인, 방법.
  16. 제1항에 있어서, CAMK4의 키나제 억제제는 KN-93인, 방법.
  17. 제1항에 있어서, MAP2K7의 키나제 억제제는 DTP3인, 방법.
  18. 제1항에 있어서, PMVK의 키나제 억제제는 CDDD_1633, CSDDD_2260, CSDDD_2419, 또는 루테올린 (luteolin)인, 방법.
  19. 제1항에 있어서, PRKCI의 키나제 억제제는 리다우라 (ridaura) 또는 RXDX-108인, 방법.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 뇌로 직접 전달되는, 방법.
  21. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 경구, 국소, 정맥내, 복강내, 근육내, 내시경, 경피, 피하, 영역내, 또는 직접 주사에 의해 투여되는, 방법.
  22. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 정맥내 투여되는, 방법.
  23. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 경막내 또는 비강내 투여되는, 방법.
  24. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 2차 치료제를 투여하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
  25. 제24항에 있어서, 2차 치료제는 화학요법, 방사선요법, 유전자 요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법인, 방법.
  26. 제24항에 있어서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법, 및/또는 대사 조절인, 방법.
  27. 제24항에 있어서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 동시 투여되는, 방법.
  28. 제24항에 있어서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 순차적으로 투여되는, 방법.
  29. 유효량의 키나제 억제제를 적어도 2차 항암제와 조합하여 이를 필요로 하는 대상체에 투여하는 단계를 포함하는, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이를 치료하기 위한 방법으로서, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, FRK, MAPK12, ERK5, MAP2K7, UCK2, DAK, 및 PRKCD로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는, 방법.
  30. 제29항에 있어서, 암은 유방암인, 방법.
  31. 제30항에 있어서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정되는, 방법.
  32. 제29항에 있어서, 암은 폐암인, 방법.
  33. 제1항에 있어서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않은, 방법.
  34. 제29항에 있어서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명된, 방법.
  35. 제29항에 있어서, 대상체는 인간인, 방법.
  36. 제29항에 있어서, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, MAPK12, 또는 CDK5를 표적화하는, 방법.
  37. 제29항에 있어서, 키나제 억제제는 PCTK1을 표적화하는, 방법.
  38. 제29항에 있어서, 키나제 억제제는 SPHK1을 표적화하는, 방법.
  39. 제29항에 있어서, 키나제 억제제는 MAPK12를 표적화하는, 방법.
  40. 제29항에 있어서, MAPK12의 키나제 억제제는 SB 203580, 도라마피모드 (doramapimod), 또는 LY2228820인, 방법.
  41. 제29항에 있어서, PCTK1의 키나제 억제제는 인디루빈 E804, 다브라페닙 (dabrafenib), 또는 레바스티닙 (rebastinib)인, 방법.
  42. 제29항에 있어서, PCTK1의 키나제 억제제는 레바스티닙인, 방법.
  43. 제29항에 있어서, SPHK1의 키나제 억제제는 BML-258, SKI III, SKI 5C, MP A08, SKI 178, PF-543, 핑골리모드 (fingolimod), 또는 사핑골 (safingol)인, 방법.
  44. 제29항에 있어서, SPHK1의 키나제 억제제는 핑골리모드 또는 사핑골인, 방법.
  45. 제29항에 있어서, CDK5의 키나제 억제제는 디나시클립, PHA-793887, AT7519, CYC-065, 또는 DCAM-422인, 방법.
  46. 제29항에 있어서, CDK5의 키나제 억제제는 CYC-065 또는 DCAM-422인, 방법.
  47. 제29항에 있어서, ERK5의 키나제 억제제는 ERK5-IN-1, BIX 02189, XMD17-109, 또는 XMD 8-92인, 방법.
  48. 제29항에 있어서, FRK의 키나제 억제제는 다사티닙 (dasatinib), 모테사닙 (motesanib), 도라마피모드, 펠리티닙 (pelitinib), 소라페닙 (sorafenib), 반데타닙 (vandetanib), 카너티닙 (canertinib), 또는 이마티닙 (imatinib)인, 방법.
  49. 제29항에 있어서, PAK4의 키나제 억제제는 PF-3758309, LCH-7749944, 글라우카루비논 (glaucarubinone), KY-04031, KY-04045, 1-페난트릴-테트라하이드로이소퀴놀린 유도체, (-)-β-히드라스틴, Inka1, GL-1196, 또는 GNE-2861인, 방법.
  50. 제29항에 있어서, UCK2의 키나제 억제제는 플라보카와인 (flavokawain) B 또는 알피네틴인 (alpinetin)인, 방법.
  51. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 경구, 국소, 정맥내, 복강내, 근육내, 내시경, 경피, 피하, 영역내, 또는 직접 주사에 의해 투여되는, 방법.
  52. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 정맥내 투여되는, 방법.
  53. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 키나제 억제제는 경막내 또는 비강내 투여되는, 방법.
  54. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 2차 치료제는 화학요법, 방사선요법, 유전자 요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법인, 방법.
  55. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법, 및/또는 대사 조절인, 방법.
  56. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 동시 투여되는, 방법.
  57. 제29항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 2차 치료제는 키나제 억제제와 순차적으로 투여되는, 방법.
  58. 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 2개의 키나제의 활성이 증가된 것으로 확인되는 대상체에 키나제 억제제를 투여하는 단계를 포함하는, 대상체에서 전이를 억제하기 위한 방법.
  59. 제58항에 있어서, 증가된 활성은 증가된 발현 수준, 번역후 변형 또는 세포 이하 위치화(sub-cellular localization)의 결과인, 방법.
  60. 제59항에 있어서, 증가된 활성은 증가된 발현 수준에 의해 측정되는, 방법.
  61. 제58항에 있어서, 대상체는 유방암 또는 폐암을 가진, 방법.
  62. 제58항에 있어서, 전이는 뇌 전이로 추가로 규정되는, 방법.
  63. 제58항에 있어서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 5개의 키나제의 활성이 증가된 것으로 확인되는, 방법.
  64. 제58항에 있어서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 15개의 키나제의 발현이 증가된 것으로 확인되는, 방법.
  65. 제58항에 있어서, 대상체는 대조군과 비교하는 경우, ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, DAK, FRK, LIMK2, MAP2K7, MAPK12, MAPK7, PAK4, PCTK1, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCD, PRKCI, SPHK1, TSSK6, UCK2, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 20개의 키나제의 발현이 증가된 것으로 확인되는, 방법.
  66. 키나제 억제제의 유효량을 포함하는, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이의 치료를 위한 조성물로서, 키나제 억제제는 ADCK4, BTK, CAMK4, CDK5, CDK5R1, CLK3, LIMK2, PAK4, PMVK, PRKACB, PRKACG, PRKCI, TSSK6, 및 ZC3HC1로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 조성물.
  67. 키나제 억제제 및 항암제의 유효량을 포함하는, 암을 가진 대상체에서 뇌 전이의 치료를 위한 조성물로서, 키나제 억제제는 PCTK1, SPHK1, FRK, MAPK12, ERK5, MAP2K7, UCK2, DAK, 및 PRKCD로 이루어진 군으로부터 선택되는 키나제를 표적화하는 조성물.
  68. 제66항 또는 제67항에 있어서, 암은 유방암인, 조성물.
  69. 제66항 또는 제67항에 있어서, 유방암은 삼중 음성 유방암으로 추가로 규정되는, 방법.
  70. 제66항 또는 제67항에 있어서, 암은 폐암인, 방법.
  71. 제66항 또는 제67항에 있어서, 대상체는 치료 전에 뇌 전이를 가진 것으로 판명되지 않은, 방법.
  72. 제66항 또는 제67항에 있어서, 대상체는 치료 전에 하나 이상의 뇌 전이를 가진 것으로 판명된, 방법.
  73. 제66항 또는 제67항에 있어서, 대상체는 인간인, 방법.
  74. 제66항에 있어서, 적어도 2차 항암제를 투여하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
  75. 제67항 또는 제74항에 있어서, 2차 항암제는 화학요법, 방사선요법, 유전자요법, 수술, 호르몬 요법, 항혈관신생 요법 또는 사이토카인 요법인, 방법.
  76. 제67항 또는 제74항에 있어서, 2차 치료제는 방사선 요법, 화학요법, 면역요법, 또는 대사 조절인, 방법.
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