KR20190043847A - 코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 - Google Patents
코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20190043847A KR20190043847A KR1020170135865A KR20170135865A KR20190043847A KR 20190043847 A KR20190043847 A KR 20190043847A KR 1020170135865 A KR1020170135865 A KR 1020170135865A KR 20170135865 A KR20170135865 A KR 20170135865A KR 20190043847 A KR20190043847 A KR 20190043847A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- leu
- ala
- gly
- val
- glu
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1205—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
- C12N15/69—Increasing the copy number of the vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/04—Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
- C12Y207/01—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1)
- C12Y207/01002—Glucokinase (2.7.1.2)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
- C12Y207/09—Phosphotransferases with paired acceptors (2.7.9)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y504/00—Intramolecular transferases (5.4)
- C12Y504/02—Phosphotransferases (phosphomutases) (5.4.2)
- C12Y504/02002—Phosphoglucomutase (5.4.2.2)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
증가된 셀룰로오스 생산능 및 수율을 갖는 코마가타에이박터 속 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법을 제공한다.
Description
코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법에 관한 것이다.
식물-기반 셀룰로오스(plant-based cellulose)는 많이 존재하고 저렴하여, 최근 관심이 증가하고 있다. 그러나, 리그노셀룰로오스성 생물질(lignocellulosic biomass) 중 리그닌, 헤미셀룰로오스 및 다른 분자의 존재로 인하여, 의료용을 위하여는 복잡한 공정을 필요하게 한다. 박테리아 셀룰로오스는(bacterial cellulose: BC)는 Acetobacter 속과 같은 박테리아에 의하여 생산되는 불용성 세포외폴리사카리드이다. 박테리아 셀룰로오스는 β-1,4 글루칸이라는 일차 구조로 존재하고, 이들이 여러 가닥의 피브릴(fibril)의 망상 구조를 이루고 있다. 박테리아 셀룰로오스는 미세한 나노-스케일 구조를 가진 셀룰로오스의 높은 순도(highly pure)를 가진 형태이다. 박테리아 셀룰로오스는 높은 기계적 인장 강도(mechanical tensile strength), 순도(purity), 생물분해성(biodegradability), 수분 유지능(water-holding capacity), 및 높은 내열성을 포함한, 우수한 물리 화학적 특성을 가지고 있다. 이런 특성 때문에 박테리아 셀룰로오스는 화장품, 의료용, 식이섬유, 음향기기 진동판, 기능성 필름 등의 다양한 산업에 응용되어 개발되고 있다.
박테리아 셀룰로오스 생산 균주로는 Acetobacter, Agrobacteria, Rhizobia, 또는 Sarcina이 보고되고 있으며 그 중에서 특히 우수한 균주는 Komagataeibacter xylinum ('Gluconacetobacter xylinum'이라고도 함)으로 알려져 있다. 호기적 조건에서 정치 배양하면 배양액 표면에 얇은 막 형태로 3차원 망상 조직의 셀룰로오스가 형성된다. 박테리아를 사용하여 박테리아 셀룰로오스를 생산하는 방법이 알려져 있다.
또한, 셀룰로오스 생산 균주에 다양한 변이를 유도하여 셀룰로오스 생산능을 향상시키는 연구가 진행중에 있다. 그러나, 상기한 종래 기술에 의하더라도 증가된 셀룰로오스 생산능을 갖는 재조합 코마가타에이박터(Komagataeibacter) 속 미생물에 대한 요구가 있다.
일 양상은 코마가타에이박터 속 재조합 미생물을 제공한다.
다른 양상은 상기 미생물을 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법을 제공한다.
다른 양상은 상기 미생물을 생산하는 방법을 제공한다.
본 명세서에서 사용된 용어 "활성 증가 (increase in activity)", 또는 "증가된 활성 (increased activity)"은 세포, 단백질, 또는 효소의 활성의 검출가능한 증가를 나타낼 수 있다. "활성 증가 (increase in activity)", 또는 "증가된 활성 (increased activity)"은 주어진 유전적 변형 (genetic modification)을 갖지 않은 세포, 단백질, 또는 효소 (예, 본래 또는 "야생형 (wild-type)" 세포, 단백질, 또는 효소)와 같은, 동일한 타입의 비교 세포, 단백질, 또는 효소의 수준보다 더 높은 변형된 (예, 유전적으로 조작된) 세포, 단백질, 또는 효소의 활성을 나타낼 수 있다. "세포의 활성"이란 세포의 특정 단백질 또는 효소의 활성을 나타낼 수 있다. 예를 들면, 상기 변형된 또는 조작된 세포의 활성은 동일 타입의 조작되지 않은 세포, 또는 모세포 예를 들면, 야생형 세포의 특정 단백질 또는 효소 활성보다 약 5% 이상, 약 10% 이상, 약 15% 이상, 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 또는 약 100% 이상 증가된 것일 수 있다. 단백질 또는 효소의 증가된 활성을 갖는 세포는 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 확인될 수 있다.
효소 또는 폴리펩티드의 활성 증가는 발현 증가 또는 비활성 (specific activity)의 증가에 의하여 얻을 수 있다. 상기 발현 증가는 효소 또는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 세포에 도입되거나 카피 수가 증가되거나, 또는 상기 폴리뉴클레오티드의 조절 영역의 변이에 의한 것일 수 있다. 상기 유전자가 도입되는 미생물은 자체적으로 상기 유전자를 포함하는 것, 또는 포함하고 있지 않은 것일 수 있다. 상기 유전자는 그의 발현을 가능하게 하는 조절 서열, 예를 들면, 프로모터, 폴리아데닐화 부위, 또는 그 조합과 작동가능하게 연결된 것일 수 있다. 외부에서 도입되거나 또는 카피 수가 증가되는 폴리뉴클레오티드는 내인성 (endogenous) 또는 외인성 (exogenous)일 수 있다. 상기 내인성 유전자는 미생물 내부에 포함된 유전물질 상에 존재하던 유전자를 말한다. 외인성 유전자는 외부로부터 세포 내로 도입되는 유전자를 의미하며, 도입되는 유전자는 도입되는 숙주세포에 대해 동종 (homologous) 또는 이종 (heterologous)일 수 있다. "이종성 (heterologous)"은 천연 (native)이 아닌 외인성 (foreign)을 의미할 수 있다.
용어 "카피 수 증가 (copy number increase)"는 상기 유전자의 도입 또는 증폭에 의한 것일 수 있으며, 조작되지 않은 세포에 존재하지 않는 유전자를 유전적 조작에 의해 갖게 되는 경우도 포함한다. 상기 유전자의 도입은 벡터와 같은 비히클을 매개하여 이루어질 수 있다. 상기 도입은 상기 유전자가 게놈에 통합되지 않은 임시적 (transient) 도입이거나 게놈에 삽입되는 것일 수 있다. 상기 도입은 예를 들면, 목적하는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 삽입된 벡터를 상기 세포로 도입한 후, 상기 벡터가 세포 내에서 복제되거나 상기 폴리뉴클레오티드가 게놈으로 통합됨으로써 이루어질 수 있다.
상기 유전자의 도입은 형질전환, 형질도입 (transfection), 전기천공 (electroporation)과 같은 알려진 방법에 의하여 수행될 수 있다. 상기 유전자는 운반체 (vehicle)를 통하여 도입되거나, 그 자체로서 도입될 수 있다. 본 명세서에 있어서, "운반체"란 연결되어 있는 다른 핵산을 전달할 수 있는 핵산 분자를 포함한다. 특정한 유전자의 도입을 매개하는 뉴클레오티드 서열이라는 관점에서, 본 명세서에서 운반체는, 벡터, 핵산 구조체, 및 카세트와 상호 교환 가능하게 사용될 수 있는 것으로 해석된다. 벡터에는 예를 들면 플라스미드 또는 바이러스 유래 벡터 등이 포함된다. 플라스미드란 추가의 DNA가 연결될 수 있는 원형의 이중가닥 DNA 고리를 포함한다. 벡터에는 예를 들면, 플라스미드 발현벡터, 바이러스 발현벡터, 또는 그 조합이 포함될 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 유전자의 조작은 당업계에 공지된 분자생물학적 방법에 의할 수 있다.
용어 "모세포 (parent cell)"는 본래 세포 (original cell), 예를 들면, 조작된 미생물에 대하여 동일 타입의 유전적으로 조작되지 않은 세포를 나타낸다. 특정한 유전적 변형에 대하여, 상기 "모세포"는 상기 특정 유전적 변형을 갖지 않은 세포이지만, 다른 상황에 대하여는 동일한 것일 수 있다. 따라서, 상기 모세포는 주어진 단백질 (예를 들면, 글루코키나제와 약 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 단백질)의 증가된 활성을 갖는 유전적으로 조작된 미생물을 생산하는데 출발 물질 (starting material)로 사용된 세포일 수 있다. 더 설명하면, 글루코키나제를 코딩하는 유전자가 유전적으로 변형되어 세포 중 글루코키나제 활성이 증가된 미생물에 대하여, 상기 모세포는 유전적으로 변형되지 않은 미생물일 수 있다. 동일한 비교가 다른 유전적 변형에도 적용된다.
본 명세서에서 사용된 용어 "유전자"는 특정 단백질을 발현하는 핵산 단편을 의미하며, 5'-비코딩 서열(5'-non coding sequence) 및/또는 3'-비코딩 서열(3'-non coding sequence)의 조절 서열(regulatory sequence)을 포함하거나 포함하지 않을 수 있다.
본 명세서에 있어서 핵산 또는 폴리펩티드의 "서열 동일성 (sequence identity)"은 특정 비교 영역에서 양 서열을 최대한 일치되도록 얼라인시킨 후 서열간의 염기 또는 아미노산 잔기의 동일한 정도를 의미한다. 서열 동일성은 특정 비교 영역에서 2개의 서열을 최적으로 얼라인하여 비교함으로써 측정되는 값으로서, 비교 영역 내에서 서열의 일부는 대조 서열 (reference sequence)과 비교하여 부가 또는 삭제되어 있을 수 있다. 서열 동일성 백분율은 예를 들면, 비교 영역 전체에서 두 개의 최적으로 정렬된 서열을 비교하는 단계, 두 서열 모두에서 동일한 아미노산 또는 뉴클레오티드가 나타나는 위치의 갯수를 결정하여 일치된 (matched) 위치의 갯수를 수득하는 단계, 상기 일치된 위치의 갯수를 비교 범위 내의 위치의 총 갯수 (즉, 범위 크기)로 나누는 단계, 및 상기 결과에 100을 곱하여 서열 동일성의 백분율을 수득하는 단계에 의해 계산될 수 있다. 상기 서열 동일성의 퍼센트는 공지의 서열 비교 프로그램을 사용하여 결정될 수 있으며, 상기 프로그램의 일례로 BLASTN(NCBI), BLASTP(NCBI), CLC Main Workbench (CLC bio), MegAlignTM (DNASTAR Inc) 등을 들 수 있다.
여러 종의 동일하거나 유사한 기능이나 활성을 가지는 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 확인하는데 있어서 여러 수준의 서열 동일성을 사용할 수 있다. 예를 들어, 50% 이상, 55% 이상, 60% 이상, 65% 이상, 70% 이상, 75% 이상, 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상 또는 100% 등을 포함하는 서열 동일성이다.
본 명세서에서 사용된 용어 "유전적 변형 (genetic modification)"이란 세포의 유전물질의 구성 또는 구조를 인위적으로 변경시키는 것을 포함한다.
일 양상은 글루코키나제 (glucokinase) 활성을 증가시키는 유전적 변형을 포함하는 재조합 미생물을 제공한다. 상기 재조합 미생물은 증가된 셀룰로오스 생산능을 갖는 것일 수 있다.
상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것일 수 있다. 상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 상기 폴리포스페이트 키나아제를 코딩하는 유전자의 발현조절 서열의 변형인 것일 수 있다.
상기 글루코키나제는 ATP + 글루코스를 ADP + 글루코스-6-포스페이트로 가역적으로 전환하는 활성을 갖는 것일 수 있다. 상기 글루코키나제는 EC 2.7.1.2에 속하는 것일 수 있다. 상기 글루코키나제는 서열번호 2, 4, 또는 6의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것일 수 있다. 이들 폴리펩티드는 각각 대장균, Saccharomyces cerevisiae, 및 Zymomonas mobilis 유래의 것이다. 상기 글루코키나제는 서열번호 1, 3, 또는 5의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 재조합 미생물은 글루코스 페르메아제 (glucose permease) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 포스포글루코뮤타제(phosphoglucomutase: PGM) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 및 UTP-글루코스 피로포스포릴라제(UTP-glucose pyrophosphorylase: UGP) 활성을 증가시키는 유전적 변형 중 하나 이상을 더 포함할 수 있다.
상기 유전적 변형은 각 효소를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것일 수 있다. 상기 유전적 변형은 각 효소를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 각 효소를 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형인 것일 수 있다.
상기 글루코스 페르메아제는 상기 글루코스 페르메아제는 세포 밖에 있는 글루코스를 세포 내부로의 수송을 촉매하는 활성을 갖는 것일 수 있다. 상기 글루코스 페르메아제는 서열번호 8의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 대장균 galP 산물이다. 상기 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 7의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 PGM은 글루코스의 1' 위치의 포스페이트를 6' 위치로 이동시키거나 그 반대방향으로 이동시키는 것을 촉매하는 것일 수 있다. 상기 PGM은 EC 5.4.2.2에 속하는 것일 수 있다. 상기 PGM은 서열번호 10, 12, 또는 14의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 9, 11 또는 13의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 서열번호 10, 12, 또는 14의 폴리펩티드는 각각 Xanthomonas campestris xanA, Bacillus subtilis pgca, 및 Komagataeibacter xylinus pgm 유전자 발현 산물이다.
상기 UGP는 하기 반응을 촉매하는 것일 수 있다.
글루코스-1-포스페이트+UTP ↔UDP-글루코스+피로포스페이트
상기 UGP는 EC 2.7.7.9에 속하는 것일 수 있다. 상기 UGP는 서열번호 16, 18, 또는 20의 의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 15, 17 또는 19의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 서열번호 16, 18, 또는 20의 폴리펩티드는 각각 E.coli galU, Mycobacterium tuberculosis ugp, 및 Xanthomonas campestris ugp 유전자의 발현 산물이다.
상기 미생물은 glcP 유전자; PGM 유전자; UGP 유전자; glcP 유전자 및 PGM 유전자; glcP 유전자 및 UGP 유전자; PGM 유전자 및 UGP 유전자; glcP 유전자 및 PGM 유전자 및 UGP 유전자의 발현을 증가시키는 유전적 변형을 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 유전적 변형은 glk, 및 glcP, PGM, UGP, 또는 이들을 조합을 각각 코딩하는 유전자가 도입된 것, 예를 들면 벡터와 같은 비히클을 통하여 도입된 것일 수 있다. 상기 glk를 코딩하는 유전자 및 및 glcP, PGM, UGP, 또는 이들을 조합을 코딩하는 유전자 중 하나 이상은 염색체 내 또는 염색체 외에 존재할 수 있다. 상기 유전자는 각각 복수 개, 예를 들면, 2 이상, 5 이상, 10 이상, 30 이상, 50 이상, 100 이상, 또는 1000 이상일 수 있다.
상기 미생물은 Komagataeibacter, Acetobacter, Gluconacetobacter, 또는 Enterobacter 속에 속하는 것과 같은 박테리아 셀룰로오스 생산능을 갖는 것일 수 있다. 상기 미생물은 Komagataeibacter 속에 속하는 것으로서 박테리아 셀룰로오스 생산능을 갖는 것일 수 있다. 상기 미생물은 K. xylinus ("G. xylinus"라고도 한다), K.rhaeticus, K. swingsii , K. kombuchae , K. nataicola , 또는 K. sucrofermentans 일 수 있다.
다른 양상은 상기한 글루코키나제 (glucokinase) 활성을 증가시키는 유전적 변형을 포함하는 재조합 미생물을 배지 중에서 배양하여 셀룰로오스를 생성하는 단계; 및 상기 배양물로부터 상기 셀룰로오스를 회수하는 단계를 포함하는 셀룰로오스를 생산하는 방법을 제공한다.
상기 방법에서, 재조합 미생물에 대하여는 상기한 바와 같다.
상기 배양은 탄소원, 예를 들면, 글루코스를 함유하는 배지에서 수행될 수 있다. 미생물 배양에 사용되는 배지는 적절한 보충물을 함유한 최소 또는 복합 배지와 같은, 숙주 세포의 성장에 적합한 임의의 통상적인 배지일 수 있다. 적합한 배지는 상업적인 판매자로부터 입수 가능하고 또는 공지된 제조법에 따라 제조될 수 있다.
상기 배양에 선택되는 산물에 따라 특정한 미생물의 요구조건을 만족시킬 수 있는 배지일 수 있다. 상기 배지는 탄소원, 질소원, 염, 미량 원소, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 배지일 수 있다.
상기 배양의 조건은 선택되는 산물, 예를 들면, 셀룰로오스 생산에 적합하게 적절히 조절될 수 있다. 상기 배양은 세포 증식을 위하여 호기성 조건에서 이루어질 수 있다. 상기 배양은 교반 배양 (spinner culture)하거나 또는 교반 없이 정치 배양 (static culture)하는 것일 수 있다. 상기 미생물의 농도는 셀룰로오스의 생성에 방해가 되지 않는 정도의 간격이 주어지도록 하는 농도일 수 있다.
용어, "배양 조건"은 미생물을 배양하기 위한 조건을 의미한다. 이러한 배양 조건은 예를 들어, 미생물이 이용하는 탄소원, 질소원 또는 산소 조건일 수 있다. 미생물이 이용할 수 있는 탄소원은 단당류, 이당류 또는 다당류를 포함할 수 있다. 상기 탄소원은 자화가능한 당으로서, 글루코스, 프럭토스, 만노스, 또는 갈락토스를 포함할 수 있다. 상기 질소원은 유기 질소 화합물, 또는 무기 질소 화합물일 수 있다. 상기 질소원은 아미노산, 아미드, 아민, 질산염, 또는 암모늄염 일 수 있다. 미생물을 배양하는 산소 조건에는 정상 산소 분압의 호기성 조건, 또는 대기중에 0.1% 내지 10%의 산소를 포함하는 저산소 조건이 있다. 대사 경로는 미생물가 실제로 이용 가능한 탄소원 및 질소원에 맞추어 수정될 수 있다.
상기 배지는 에탄올 또는 셀룰로오스를 포함할 수 있다. 상기 에탄올은 배지 부피에 대하여 0.1 내지 5%(v/v), 예를 들면, 0.3 내지 2.5%(v/v), 0.3 내지 2.0%(v/v), 0.3 내지 1.5%(v/v), 0.3 내지 1.25%(v/v), 0.3 내지 1.0%(v/v), 0.3 내지 0.7%(v/v), 또는 0.5 내지 3.0%(v/v)일 수 있다. 상기 셀룰로오스는 배지 중량에 대하여 0.5 내지 5%(w/v), 0.5 내지 2.5%(w/v), 0.5 내지 1.5%(w/v), 또는 0.7 내지 1.25%(w/v)일 수 있다. 상기 셀룰로오스는 카로복실화된 셀룰로오스일 수 있다. 상기 셀룰로오스는 CMC일 수 있다. 상기 CMC는 소듐CMC일수 있다.
상기 방법은 상기 배양물로부터 상기 셀룰로오스를 회수하는 단계를 포함한다. 상기 분리는 예를 들면 배지 상단에 형성된 셀룰로오스 박막(cellulose pellicle)을 회수하는 것일 수 있다. 상기 셀룰로오스 박막은 물리적으로 걷어내거나 배지를 제거함으로써 회수될 수 있다. 상기 분리는 셀룰로오스 박막의 모양을 훼손시키지 않고 유지한 채로 회수하는 것일 수 있다.
다른 양상은 셀룰로오스 생산능을 갖는 미생물에 글루코키나제를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계를 포함하는, 셀룰로오스 생산능이 증가된 미생물을 제조하는 방법을 제공한다. 상기 방법은 또한 상기 미생물에 글루코키나제를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계를 더 포함할 수 있다.
상기 유전자를 도입하는 단계는 상기 유전자를 포함하는 비히클을 상기 미생물에 도입하는 것일 수 있다. 상기 방법에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 유전자를 증폭하는 것, 상기 유전자의 조절 서열을 조작하는 것, 또는 상기 유전자 자체의 서열을 조작하는 것을 포함하는 것일 수 있다. 상기 조작은 뉴클레오티드의 삽입, 치환, 전환 또는 부가인 것일 수 있다.
상기 방법은 glcP 유전자; PGM 유전자; UGP 유전자 또는 이들의 조합을 도입하는 단계를 더 포함할 수 있다.
일 양상에 따른 재조합 미생물에 의하면, 셀룰로오스를 고효율로 생산하는데 사용할 수 있다.
다른 양상에 따른 셀룰로오스를 생산하는 방법에 의하면, 셀룰로오스를 효율적으로 생산할 수 있다.
다른 양상에 따른 셀룰로오스 생산능이 증가된 미생물을 제조하는 방법에 의하면, 셀룰로오스 생산능이 증가된 미생물을 효율적으로 제조할 수 있다.
도 1은 4개 유전자를 삽입하는데 사용하기 위한 벡터 pIN04를 나타낸 도면이다.
도 2는 유전자 4개를 포함하는 pIN04-galP-xanA-galU-glk를 나타낸 도면이다.
도 2는 유전자 4개를 포함하는 pIN04-galP-xanA-galU-glk를 나타낸 도면이다.
이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1.
글루코스
페르메아제
,
GLK1
,
PGM
, 및
UGP
유전자를 포함하는
K.xylinus
의 제작 및 셀룰로오스의 생산
본 실시예에서는 글루코스를 당원으로 하여 셀룰로오스 합성 경로에 작용하는 4개의 유전자 즉, 글루코스 페르메아제, GLK1, PGM, 및 UGP 유전자를 선정하였다. 선정된 4개의 유전자를 각각 또는 그 조합을 Komagataeibacter xylinus (한국 미생물보존센터 KCCM 41431) 및 GDH 유전자가 결실된 K. xylinus에 도입하여, 셀룰로오스 생산능에 미치는 영향을 확인하였다.
(1)
GDH
유전자가 결실된 K.
xylinus
의 제작
Komagataeibacter xylinus (한국 미생물보존센터 KCCM 41431) 중의 막 결합된 PQQ-의존성 글루코스 데히드로게나제(GDH) 유전자를 상동 재조합(homologous recombination)에 의하여 불활성화시켰다. 구체적 과정은 다음과 같다.
GDH 유전자를 상동성 재조합 방법으로 결실하기 위하여 GDH 유전자의 5' 말단과 3' 말단의 단편을 K.xylinus의 게놈 서열을 주형으로 하여 각각 GDH-5-F(서열번호 21)와 GHD-5-R(서열번호 22) 프라이머 세트와 GDH-3-F(서열번호 23)와 GHD-3-R(서열번호 24) 프라이머 세트를 이용하여 PCR 증폭에 의해 얻었다. 또한 Tn5 유래 카나마이신 내성 유전자인 neo 유전자(nptII) 단편을 서열번호 25와 서열번호 26 프라이머 세트를 이용하여 PCR 증폭에 의해 얻었다. 상기 GDH 유전자의 5' 말단 단편과 3' 말단 단편 및 카나마이신 저항성 유전자 단편 3종을 pGEM-3zf 벡터(#P2271, Promega Corp.)의 SacI과 XbaI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 pGz-dGDH를 제작하였다. 얻어진 벡터를 K.xylinus에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus 균주를 100 ㎍/ml의 카나마이신이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%) 배지에 도말하여 30℃에서 배양했다. 카나마이신 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 GDH 유전자가 결실되도록 하였다. 그 결과, GDH 유전자가 결실된 것을 확인하고, 이 균주를 K.xylinus(△gdh)로 명명하였다.
(2)
글루코스
페르메아제
유전자의 도입
K.xylinus(△gdh)에 Escherichia coli galP 유전자 즉, 서열번호 7의 뉴클레오티드 서열을 도입하였다. Escherichia coli galP는 갈락토스-프로톤 심포터(galactose-proton symporter)이다. 이 효소는 양이온의 수반된 수송과 함께 경계막(boundary membrane)을 가로질러 갈락토스 및 글루코스를 세포 내로 섭취하게 한다. 구체적인 도입 과정은 다음과 같다.
프라이머 세트 즉, Ec.galP-F(서열번호 17과 18)의 프라이머를 프라이머로 하고, E.coli의 각 게놈 서열을 주형으로 하여 PCR 함으로써 상기 미생물 유래의 글루코스 페르메아제 유전자를 얻었다.
이를 pCSa(서열번호 29)의 PstI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 Tac promoter 하에서 발현되도록 하였다. 얻어진 벡터를 K.xylinus(△gdh)에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus(△gdh) 균주를 100 ㎍/ml의 클로람페니콜이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%)에 도말하여 30℃에서 배양했다. 클로람페니콜 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 글루코스 페르메아제 유전자가 과발현된 균주를 제작하였다.
(3)
글루코키나제
유전자의 도입
K.xylinus(△gdh)에 Escherichia coli glk, Saccharomyces cerevisiae glk, 및 Zymomonas mobilis glk 유전자 즉, 각각 서열번호 1, 3, 또는 5의 뉴클레오티드 서열을 도입하였다. 구체적인 도입 과정은 다음과 같다.
3개 프라이머 세트 즉, 서열번호 30와 31; 서열번호 32와 33; 및 서열번호 34와 35;의 프라이머를 프라이머로 하고, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, 및 Zymomonas mobilis의 각 게놈 서열을 주형으로 하여 PCR 함으로써 상기 미생물 유래의 glk 유전자를 각각 얻었다.
이를 pCSa(서열번호 29)의 PstI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 Tac promoter 하에서 발현되도록 하였다. 얻어진 벡터를 K.xylinus(△gdh)에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus(△gdh) 균주를 100 ㎍/ml의 클로람페니콜이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%)에 도말하여 30℃에서 배양했다. 클로람페니콜 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 glk 유전자가 과발현된 균주를 제작하였다.
(4)
포스포글루코뮤타제
유전자의 도입
K.xylinus(△gdh)에 Xanthomonas campestris xanA, Bacillus subtilis pgca, 및 Komagataeibacter xylinus pgm 유전자 즉, 각각 서열번호 9, 11, 또는 13의 뉴클레오티드 서열을 도입하였다. 구체적인 도입 과정은 다음과 같다.
3개 프라이머 세트 즉, 서열번호 36과 37; 서열번호 38와 39; 서열번호 40와 41의 프라이머를 프라이머로 하고, Xanthomonas campestris, Bacillus subtilis, 및 K.xylinus의 각 게놈 서열을 주형으로 하여 PCR 함으로써 상기 미생물 유래의 pgm 유전자를 각각 얻었다.
이를 pCSa(서열번호 29)의 PstI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 Tac promoter 하에서 발현되도록 하였다. 얻어진 벡터를 K.xylinus에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus 균주를 100 ㎍/ml의 클로람페니콜이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%)에 도말하여 30℃에서 배양했다. 클로람페니콜 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 gpm 유전자가 과발현된 균주를 제작하였다.
(5) UTP-
글루코스
피로포스포릴라제
유전자의 도입
K.xylinus(△gdh)에 Escherichia coli galU, Mycobacterium tuberculosis galU, 또는 Xanthomonas campestris ugp 유전자 즉, 각각 서열번호 15, 42(코돈 최적화된 것), 또는 19의 뉴클레오티드 서열을 도입하였다. 구체적인 도입 과정은 다음과 같다.
3개 프라이머 세트 즉, 서열번호 43와 44; 서열번호 45와 46; 서열번호 47와 48의 프라이머를 프라이머로 하고, Escherichia coli의 게놈 서열, K.xylinus의 선호 코돈으로 최적화하여 합성한 Mycobacterium tuberculosis의 ugp 유전자, 또는 Xanthomonas campestris의 게놈 서열을 주형으로 하여 PCR 함으로써 상기 미생물 유래의 UTP-글루코스피로포스포릴라제 유전자를 각각 얻었다.
이를 pCSa(서열번호 29)의 PstI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 Tac promoter 하에서 발현되도록 하였다. 얻어진 벡터를 K.xylinus(△gdh)에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus(△gdh) 균주를 100 ㎍/ml의 클로람페니콜이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%)에 도말하여 30℃에서 배양했다. 클로람페니콜 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 ugp 유전자가 과발현된 균주를 제작하였다.
(6)
글루코키나제
,
글루코스
페르메아제
,
포스포글루코뮤타제
및 UTP-글루코스
피로포스포릴라제
유전자의 도입
Komagataeibacter xylinus (한국 미생물보존센터 KCCM 41431)에서, 4개 유전자를 상동 재조합(homologous recombination)에 의하여 게놈에 도입하였다. 상기 4개 유전자는 글루코스 페르메아제 활성을 갖고 있는 Escherichia coli galP, 글루코키나제 활성을 갖고 있는 Escherichia coli glk, 포스포글루코뮤타제 활성을 갖고 있는 Xanthomonas campestris xanA, 및 UTP-글루코스 피로포스포릴라제 활성을 갖고 있는 E.coli galU 유전자이다. 구체적 과정은 다음과 같다.
K.xylinus 게놈 삽입용 벡터를 제작하기 위하여, 게놈 중 Gene 00648에 상동성 재조합 방법으로 삽입하기 위하여 Gene 00648 유전자의 5' 말단과 3' 말단의 단편을 K.xylinus의 게놈 서열을 주형으로 하여, 테트라사이클린 내성 유전자, 프로모터, 및 터미네이터를 갖는 유전자를 합성하였다. 합성된 유전자를 주형으로 하여, 각각 서열번호 49와 서열번호 50의 프라이머 세트를 이용하여 PCR 증폭에 의해 얻은 유전자 단편을 pUC19 벡터 (#N3041S, NEB)의 EcoRI과 HindIII 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 pIN04(0648-tet-Ptac)(서열번호 52)을 제작하였다. 도 1은 4개 유전자를 삽입하는데 사용하기 위한 벡터 pIN04를 나타낸 도면이다.
Escherichia coli galP 유전자, E.coli glk 유전자, Xanthomonas campestris xanA 유전자, 및 E.coli galU 유전자 단편의 4 종을 합성하여 서열번호 51 및 52의 프라이머 세트를 이용하여 PCR 증폭에 의해 얻은 유전자 단편을 pIN04(0648-tet-Ptac) 벡터의 SacI과 XbaI 제한효소 위치에 In-fusion HD cloning kit(#PT5162-1, Clontech)를 이용하여 클로닝함으로써 pIN04-galP-xanA-galU-glk(서열번호 53)를 제작하였다.
도 2는 4개 유전자를 포함하는 pIN04-galP-xanA-galU-glk를 나타낸 도면이다. 도 2에서, galP는 Escherichia coli galP, glk는 Escherichia coli glk, galU는 Escherichia coli galU, 및 xanA는 Xanthomonas campestris xanA 유전자를 나타낸다.
얻어진 벡터를 K.xylinus에 전기충격(electroporation) 방법에 의하여 형질도입하였다. 형질도입된 K.xylinus 균주를 100 ㎍/ml의 테트라사이클린이 첨가된 HS-agar 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, glucose 2%, 및 박토-아가 1.5%) 배지에 도말하여 30℃에서 배양했다. 테트라사이클린 내성을 갖는 균주를 선별함으로써 유전자가 삽입되도록 하였다. 그 결과, 4개 유전자가 삽입된 것을 확인하고, 이 균주를 K.xylinus(+4G)로 명명하였다.
(7) 셀룰로오스 생산량의 확인
상기한 (2) 내지 (5)절에서 제작된 지정된 K. xylinus 균주를 HS 배지(peptone 0.5%, yeast extract 0.5%, Na2HPO4 0.27%, Citric acid 0.15%, 및 glucose 4%) 25ml를 함유한 125ml 플라스크(flask)에 접종하고 30℃에서 230rpm으로 교반하면서 5일 동안 배양하고, 셀룰로오스를 측정하였다. 글루코스 페르메아제, glk, pgm, 또는 ugp 유전자가 과발현된 재조합 균주의 경우, 배양시 클로람페니콜 100 ㎍/ml을 배지에 첨가하였다. 글루코스는 Aminex HPX-87H 컬럼 (Bio-Rad, USA)이 장착된 고성능액체크로마토그래피(HPLC)를 이용하여 분석하였으며, 셀룰로오스 생산량은 플라스크 내 형성된 셀룰로오스 고형물을 0.1 N 수산화나트륨 용액과 물로 세척하여 60℃ 오븐에서 건조 후 중량을 측정하였다. 표 1은 균주에 따른 셀룰로오스 생산량을 나타낸다.
균주 | 셀룰로오스 생산량(mg/L) |
대조군 | 524.0 |
Ec galP | 576.4 |
Xc xanA | 807.0 |
Ec galU | 979.88 |
Zc glk | 602.6 |
표 1에서, 대조군은 K.xylinus(△gdh)이고, Ec galP, Xc XanA, Ec galU 및 Ec glk는 각각 K.xylinus(△gdh) Escherichia coli galP, Xanthomonas campestris xanA, Escherichia coli galU, 및 Escherichia coli glk 유전자가 도입된 것을 나타낸다. 표 1에 나타낸 바와 같이, 각 재조합 균주는 대조군에 비하여 증가된 셀룰로오스 생산량을 보였다.
또한, (6)절에서 제작된 K.xylinus(+4G)에 대하여 배양하고 셀룰로오스 생산량을 측정하였다. 배양은 HE 배지에서 1.0(v/v)% 에탄올을 포함하는 HSE 배지를 사용하고, 50 mL 배지의 250 mL 플라스크를 사용하고, 5일 대신 6일 동안 배양한 것을 제외하고는 상기한 바와 동일하게 배양하고, 셀룰로오스를 측정하였다. 그 결과는 표 2에 기재되어 있다.
균주 | 셀룰로오스 생산량(g/L) |
야생형 K.xylinus | 5.092 |
K.xylinus(+4G) | 5.804 |
표 2에 나타낸 바와 같이, 야생형 대조군에 비하여 K.xylinus(+4G)는 현저하게 증가된 셀룰로오스를 생산하였다.
<110> Samsung Electronics Co., Ltd.
<120> Komagataeibacter genus recombinant microorganism, method for
producing cellulose using the same, and method for producing the
microorganism
<130> PN118829kr
<160> 54
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 966
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 1
atgacaaagt atgcattagt cggtgatgtg ggcggcacca acgcacgtct tgctctgtgt 60
gatattgcca gtggtgaaat ctcgcaggct aagacctatt cagggcttga ttaccccagc 120
ctcgaagcgg tcattcgcgt ttatcttgaa gaacataagg tcgaggtgaa agacggctgt 180
attgccatcg cttgcccaat taccggtgac tgggtggcga tgaccaacca tacctgggcg 240
ttctcaattg ccgaaatgaa aaagaatctc ggttttagcc atctggaaat tattaacgat 300
tttaccgctg tatcgatggc gaacccgatg ctgaaaaaag agcatctgat tcagtttggt 360
ggcgcagaac cggtcgaagg taagcctatt gcggtttacg gtgccggaac ggggcttggg 420
gttgcgcatc tggtccatgt cgataagcgt tgggtaagct tgccaggcga aggcggtcac 480
gttgattttg cgccgaatag tgaagaagag gccattatcc tcgaaatatt gcgtgcggaa 540
attggtcatg tttcggcgga ggcgtgcctt tctggccctg ggctggtgaa tttgtatcgc 600
gcaattgtga aagctgacaa ccgcctgcca gaaaatctca agccaaaaga tattaccgaa 660
cgcgcgctgg ctgacagctg caccgattgc cgccgcgcat tgtcgctgtt ttgcgtcatt 720
atgggccgtt ttggcggcaa tctggcgctc aatctcggga catttggcgg cgtgtttatt 780
gcgggcggta tcgtgccgcg cttccttgag ttcttcaaag gctccggttt ccgtgccgca 840
tttgaagata aagggcgctt taaagaatat gtccatgata ttccggtgta tctcatcgtc 900
catgacaatc cgggccttct cggttccggt gcacatttac gccagacctt aggtcacatt 960
ctgtaa 966
<210> 2
<211> 321
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 2
Met Thr Lys Tyr Ala Leu Val Gly Asp Val Gly Gly Thr Asn Ala Arg
1 5 10 15
Leu Ala Leu Cys Asp Ile Ala Ser Gly Glu Ile Ser Gln Ala Lys Thr
20 25 30
Tyr Ser Gly Leu Asp Tyr Pro Ser Leu Glu Ala Val Ile Arg Val Tyr
35 40 45
Leu Glu Glu His Lys Val Glu Val Lys Asp Gly Cys Ile Ala Ile Ala
50 55 60
Cys Pro Ile Thr Gly Asp Trp Val Ala Met Thr Asn His Thr Trp Ala
65 70 75 80
Phe Ser Ile Ala Glu Met Lys Lys Asn Leu Gly Phe Ser His Leu Glu
85 90 95
Ile Ile Asn Asp Phe Thr Ala Val Ser Met Ala Asn Pro Met Leu Lys
100 105 110
Lys Glu His Leu Ile Gln Phe Gly Gly Ala Glu Pro Val Glu Gly Lys
115 120 125
Pro Ile Ala Val Tyr Gly Ala Gly Thr Gly Leu Gly Val Ala His Leu
130 135 140
Val His Val Asp Lys Arg Trp Val Ser Leu Pro Gly Glu Gly Gly His
145 150 155 160
Val Asp Phe Ala Pro Asn Ser Glu Glu Glu Ala Ile Ile Leu Glu Ile
165 170 175
Leu Arg Ala Glu Ile Gly His Val Ser Ala Glu Ala Cys Leu Ser Gly
180 185 190
Pro Gly Leu Val Asn Leu Tyr Arg Ala Ile Val Lys Ala Asp Asn Arg
195 200 205
Leu Pro Glu Asn Leu Lys Pro Lys Asp Ile Thr Glu Arg Ala Leu Ala
210 215 220
Asp Ser Cys Thr Asp Cys Arg Arg Ala Leu Ser Leu Phe Cys Val Ile
225 230 235 240
Met Gly Arg Phe Gly Gly Asn Leu Ala Leu Asn Leu Gly Thr Phe Gly
245 250 255
Gly Val Phe Ile Ala Gly Gly Ile Val Pro Arg Phe Leu Glu Phe Phe
260 265 270
Lys Gly Ser Gly Phe Arg Ala Ala Phe Glu Asp Lys Gly Arg Phe Lys
275 280 285
Glu Tyr Val His Asp Ile Pro Val Tyr Leu Ile Val His Asp Asn Pro
290 295 300
Gly Leu Leu Gly Ser Gly Ala His Leu Arg Gln Thr Leu Gly His Ile
305 310 315 320
Leu
<210> 3
<211> 1503
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 3
atgtcattcg acgacttaca caaagccact gagagagcgg tcatccaggc cgtggaccag 60
atctgcgacg atttcgaggt tacccccgag aagctggacg aattaactgc ttacttcatc 120
gaacaaatgg aaaaaggtct agctccacca aaggaaggcc acacattggc ctcggacaaa 180
ggtcttccta tgattccggc gttcgtcacc gggtcaccca acgggacgga gcgcggtgtt 240
ttactagccg ccgacctggg tggtaccaat ttccgtatat gttctgttaa cttgcatgga 300
gatcatactt tctccatgga gcaaatgaag tccaagattc ccgatgattt gctagacgat 360
gagaacgtca catctgacga cctgtttggg tttctagcac gtcgtacact ggcctttatg 420
aagaagtatc acccggacga gttggccaag ggtaaagacg ccaagcccat gaaactgggg 480
ttcactttct cataccctgt agaccagacc tctctaaact ccgggacatt gatccgttgg 540
accaagggtt tccgcatcgc ggacaccgtc ggaaaggatg tcgtgcaatt gtaccaggag 600
caattaagcg ctcagggtat gcctatgatc aaggttgttg cattaaccaa cgacaccgtc 660
ggaacgtacc tatcgcattg ctacacgtcc gataacacgg actcaatgac gtccggagaa 720
atctcggagc cggtcatcgg atgtattttc ggtaccggta ccaatgggtg ctatatggag 780
gagatcaaca agatcacgaa gttgccacag gagttgcgtg acaagttgat aaaggagggt 840
aagacacaca tgatcatcaa tgtcgaatgg gggtccttcg ataatgagct caagcacttg 900
cctactacta agtatgacgt cgtaattgac cagaaactgt caacgaaccc gggatttcac 960
ttgtttgaaa aacgtgtctc agggatgttc ttgggtgagg tgttgcgtaa cattttagtg 1020
gacttgcact cgcaaggctt gcttttgcaa cagtacaggt ccaaggaaca acttcctcgc 1080
cacttgacta cacctttcca gttgtcatcc gaagtgctgt cgcatattga aattgacgac 1140
tcgacaggtc tacgtgaaac agagttgtca ttattacaga gtctcagact gcccaccact 1200
ccaacagagc gtgttcaaat tcaaaaattg gtgcgcgcga tttctaggag atctgcgtat 1260
ttagccgccg tgccgcttgc cgcgatattg atcaagacaa atgctttgaa caagagatat 1320
catggtgaag tcgagatcgg ttgtgatggt tccgttgtgg aatactaccc cggtttcaga 1380
tctatgctga gacacgcctt agccttgtca cccttgggtg ccgagggtga gaggaaggtg 1440
cacttgaaga ttgccaagga tggttccgga gtgggtgccg ccttgtgtgc gcttgtagca 1500
tga 1503
<210> 4
<211> 500
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 4
Met Ser Phe Asp Asp Leu His Lys Ala Thr Glu Arg Ala Val Ile Gln
1 5 10 15
Ala Val Asp Gln Ile Cys Asp Asp Phe Glu Val Thr Pro Glu Lys Leu
20 25 30
Asp Glu Leu Thr Ala Tyr Phe Ile Glu Gln Met Glu Lys Gly Leu Ala
35 40 45
Pro Pro Lys Glu Gly His Thr Leu Ala Ser Asp Lys Gly Leu Pro Met
50 55 60
Ile Pro Ala Phe Val Thr Gly Ser Pro Asn Gly Thr Glu Arg Gly Val
65 70 75 80
Leu Leu Ala Ala Asp Leu Gly Gly Thr Asn Phe Arg Ile Cys Ser Val
85 90 95
Asn Leu His Gly Asp His Thr Phe Ser Met Glu Gln Met Lys Ser Lys
100 105 110
Ile Pro Asp Asp Leu Leu Asp Asp Glu Asn Val Thr Ser Asp Asp Leu
115 120 125
Phe Gly Phe Leu Ala Arg Arg Thr Leu Ala Phe Met Lys Lys Tyr His
130 135 140
Pro Asp Glu Leu Ala Lys Gly Lys Asp Ala Lys Pro Met Lys Leu Gly
145 150 155 160
Phe Thr Phe Ser Tyr Pro Val Asp Gln Thr Ser Leu Asn Ser Gly Thr
165 170 175
Leu Ile Arg Trp Thr Lys Gly Phe Arg Ile Ala Asp Thr Val Gly Lys
180 185 190
Asp Val Val Gln Leu Tyr Gln Glu Gln Leu Ser Ala Gln Gly Met Pro
195 200 205
Met Ile Lys Val Val Ala Leu Thr Asn Asp Thr Val Gly Thr Tyr Leu
210 215 220
Ser His Cys Tyr Thr Ser Asp Asn Thr Asp Ser Met Thr Ser Gly Glu
225 230 235 240
Ile Ser Glu Pro Val Ile Gly Cys Ile Phe Gly Thr Gly Thr Asn Gly
245 250 255
Cys Tyr Met Glu Glu Ile Asn Lys Ile Thr Lys Leu Pro Gln Glu Leu
260 265 270
Arg Asp Lys Leu Ile Lys Glu Gly Lys Thr His Met Ile Ile Asn Val
275 280 285
Glu Trp Gly Ser Phe Asp Asn Glu Leu Lys His Leu Pro Thr Thr Lys
290 295 300
Tyr Asp Val Val Ile Asp Gln Lys Leu Ser Thr Asn Pro Gly Phe His
305 310 315 320
Leu Phe Glu Lys Arg Val Ser Gly Met Phe Leu Gly Glu Val Leu Arg
325 330 335
Asn Ile Leu Val Asp Leu His Ser Gln Gly Leu Leu Leu Gln Gln Tyr
340 345 350
Arg Ser Lys Glu Gln Leu Pro Arg His Leu Thr Thr Pro Phe Gln Leu
355 360 365
Ser Ser Glu Val Leu Ser His Ile Glu Ile Asp Asp Ser Thr Gly Leu
370 375 380
Arg Glu Thr Glu Leu Ser Leu Leu Gln Ser Leu Arg Leu Pro Thr Thr
385 390 395 400
Pro Thr Glu Arg Val Gln Ile Gln Lys Leu Val Arg Ala Ile Ser Arg
405 410 415
Arg Ser Ala Tyr Leu Ala Ala Val Pro Leu Ala Ala Ile Leu Ile Lys
420 425 430
Thr Asn Ala Leu Asn Lys Arg Tyr His Gly Glu Val Glu Ile Gly Cys
435 440 445
Asp Gly Ser Val Val Glu Tyr Tyr Pro Gly Phe Arg Ser Met Leu Arg
450 455 460
His Ala Leu Ala Leu Ser Pro Leu Gly Ala Glu Gly Glu Arg Lys Val
465 470 475 480
His Leu Lys Ile Ala Lys Asp Gly Ser Gly Val Gly Ala Ala Leu Cys
485 490 495
Ala Leu Val Ala
500
<210> 5
<211> 984
<212> DNA
<213> Zymomonas mobilis
<400> 5
atggaaattg ttgcgattga catcggtgga acgcatgcgc gtttctctat tgcggaagta 60
agcaatggtc gggttctttc tcttggagaa gaaacaactt ttaaaacggc agaacatgct 120
agcttgcagt tagcttggga acgtttcggt gaaaaactgg gtcgtcctct gccacgtgcc 180
gcagctattg catgggctgg cccggttcat ggtgaagttt taaaacttac caataaccct 240
tgggtattaa gaccagctac tctgaatgaa aagctggaca tcgatacgca tgttctgatc 300
aatgacttcg gcgcggttgc ccacgcggtt gcgcatatgg attcttctta tctggatcat 360
atttgtggtc ctgatgaagc gcttcctagc gatggtgtta tcactattct tggtccggga 420
acgggcttgg gtgttgccca tctgttgcgg actgaaggcc gttatttcgt catcgaaact 480
gaaggcggtc atatcgactt tgctccgctt gacagacttg aagacaaaat tctggcacgt 540
ttacgtgaac gtttccgccg cgtttctatc gaacgcatta tttctggccc gggtcttggt 600
aatatctacg aagcactggc tgccattgaa ggcgttccgt tcagcttgct ggatgatatt 660
aaattatggc agatggcttt ggaaggtaaa gacaaccttg ctgaagccgc tttggatcgc 720
ttctgcttga gccttggcgc tatcgctggt gatcttgctt tggcacaggg tcgaaccagt 780
gttgttattg gcggtggtgt cggtcttcgt atcgcttccc atttgccaga atctggtttc 840
cgtcagcgct ttgtttcaaa aggacgcttt gaacgcgtca tgtccaagat tccggttaag 900
ttgattactt atccgcagcc tggactgttg ggtgcgcagc tgcctatgcc aacaaatatt 960
ctgaagttga ataatatttt ttaa 984
<210> 6
<211> 327
<212> PRT
<213> Zymomonas mobilis
<400> 6
Met Glu Ile Val Ala Ile Asp Ile Gly Gly Thr His Ala Arg Phe Ser
1 5 10 15
Ile Ala Glu Val Ser Asn Gly Arg Val Leu Ser Leu Gly Glu Glu Thr
20 25 30
Thr Phe Lys Thr Ala Glu His Ala Ser Leu Gln Leu Ala Trp Glu Arg
35 40 45
Phe Gly Glu Lys Leu Gly Arg Pro Leu Pro Arg Ala Ala Ala Ile Ala
50 55 60
Trp Ala Gly Pro Val His Gly Glu Val Leu Lys Leu Thr Asn Asn Pro
65 70 75 80
Trp Val Leu Arg Pro Ala Thr Leu Asn Glu Lys Leu Asp Ile Asp Thr
85 90 95
His Val Leu Ile Asn Asp Phe Gly Ala Val Ala His Ala Val Ala His
100 105 110
Met Asp Ser Ser Tyr Leu Asp His Ile Cys Gly Pro Asp Glu Ala Leu
115 120 125
Pro Ser Asp Gly Val Ile Thr Ile Leu Gly Pro Gly Thr Gly Leu Gly
130 135 140
Val Ala His Leu Leu Arg Thr Glu Gly Arg Tyr Phe Val Ile Glu Thr
145 150 155 160
Glu Gly Gly His Ile Asp Phe Ala Pro Leu Asp Arg Leu Glu Asp Lys
165 170 175
Ile Leu Ala Arg Leu Arg Glu Arg Phe Arg Arg Val Ser Ile Glu Arg
180 185 190
Ile Ile Ser Gly Pro Gly Leu Gly Asn Ile Tyr Glu Ala Leu Ala Ala
195 200 205
Ile Glu Gly Val Pro Phe Ser Leu Leu Asp Asp Ile Lys Leu Trp Gln
210 215 220
Met Ala Leu Glu Gly Lys Asp Asn Leu Ala Glu Ala Ala Leu Asp Arg
225 230 235 240
Phe Cys Leu Ser Leu Gly Ala Ile Ala Gly Asp Leu Ala Leu Ala Gln
245 250 255
Gly Arg Thr Ser Val Val Ile Gly Gly Gly Val Gly Leu Arg Ile Ala
260 265 270
Ser His Leu Pro Glu Ser Gly Phe Arg Gln Arg Phe Val Ser Lys Gly
275 280 285
Arg Phe Glu Arg Val Met Ser Lys Ile Pro Val Lys Leu Ile Thr Tyr
290 295 300
Pro Gln Pro Gly Leu Leu Gly Ala Gln Leu Pro Met Pro Thr Asn Ile
305 310 315 320
Leu Lys Leu Asn Asn Ile Phe
325
<210> 7
<211> 1395
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 7
atgcctgacg ctaaaaaaca ggggcggtca aacaaggcaa tgacgttttt cgtctgcttc 60
cttgccgctc tggcgggatt actctttggc ctggatatcg gtgtaattgc tggcgcactg 120
ccgtttattg cagatgaatt ccagattact tcgcacacgc aagaatgggt cgtaagctcc 180
atgatgttcg gtgcggcagt cggtgcggtg ggcagcggct ggctctcctt taaactcggg 240
cgcaaaaaga gcctgatgat cggcgcaatt ttgtttgttg ccggttcgct gttctctgcg 300
gctgcgccaa acgttgaagt actgattctt tcccgcgttc tactggggct ggcggtgggt 360
gtggcctctt ataccgcacc gctgtacctc tctgaaattg cgccggaaaa aattcgtggc 420
agtatgatct cgatgtatca gttgatgatc actatcggga tcctcggtgc ttatctttct 480
gataccgcct tcagctacac cggtgcatgg cgctggatgc tgggtgtgat tatcatcccg 540
gcaattttgc tgctgattgg tgtcttcttc ctgccagaca gcccacgttg gtttgccgcc 600
aaacgccgtt ttgttgatgc cgaacgcgtg ctgctacgcc tgcgtgacac cagcgcggaa 660
gcgaaacgcg aactggatga aatccgtgaa agtttgcagg ttaaacagag tggctgggcg 720
ctgtttaaag agaacagcaa cttccgccgc gcggtgttcc ttggcgtact gttgcaggta 780
atgcagcaat tcaccgggat gaacgtcatc atgtattacg cgccgaaaat cttcgaactg 840
gcgggttata ccaacactac cgagcaaatg tgggggaccg tgattgtcgg cctgaccaac 900
gtacttgcca cctttatcgc aatcggcctt gttgaccgct ggggacgtaa accaacgcta 960
acgctgggct tcctggtgat ggctgctggc atgggcgtac tcggtacaat gatgcatatc 1020
ggtattcact ctccgtcggc gcagtatttc gccatcgcca tgctgctgat gtttattgtc 1080
ggttttgcca tgagtgccgg tccgctgatt tgggtactgt gctccgaaat tcagccgctg 1140
aaaggccgcg attttggcat cacctgctcc actgccacca actggattgc caacatgatc 1200
gttggcgcaa cgttcctgac catgctcaac acgctgggta acgccaacac cttctgggtg 1260
tatgcggctc tgaacgtact gtttatcctg ctgacattgt ggctggtacc ggaaaccaaa 1320
cacgtttcgc tggaacatat tgaacgtaat ctgatgaaag gtcgtaaact gcgcgaaata 1380
ggcgctcacg attaa 1395
<210> 8
<211> 464
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 8
Met Pro Asp Ala Lys Lys Gln Gly Arg Ser Asn Lys Ala Met Thr Phe
1 5 10 15
Phe Val Cys Phe Leu Ala Ala Leu Ala Gly Leu Leu Phe Gly Leu Asp
20 25 30
Ile Gly Val Ile Ala Gly Ala Leu Pro Phe Ile Ala Asp Glu Phe Gln
35 40 45
Ile Thr Ser His Thr Gln Glu Trp Val Val Ser Ser Met Met Phe Gly
50 55 60
Ala Ala Val Gly Ala Val Gly Ser Gly Trp Leu Ser Phe Lys Leu Gly
65 70 75 80
Arg Lys Lys Ser Leu Met Ile Gly Ala Ile Leu Phe Val Ala Gly Ser
85 90 95
Leu Phe Ser Ala Ala Ala Pro Asn Val Glu Val Leu Ile Leu Ser Arg
100 105 110
Val Leu Leu Gly Leu Ala Val Gly Val Ala Ser Tyr Thr Ala Pro Leu
115 120 125
Tyr Leu Ser Glu Ile Ala Pro Glu Lys Ile Arg Gly Ser Met Ile Ser
130 135 140
Met Tyr Gln Leu Met Ile Thr Ile Gly Ile Leu Gly Ala Tyr Leu Ser
145 150 155 160
Asp Thr Ala Phe Ser Tyr Thr Gly Ala Trp Arg Trp Met Leu Gly Val
165 170 175
Ile Ile Ile Pro Ala Ile Leu Leu Leu Ile Gly Val Phe Phe Leu Pro
180 185 190
Asp Ser Pro Arg Trp Phe Ala Ala Lys Arg Arg Phe Val Asp Ala Glu
195 200 205
Arg Val Leu Leu Arg Leu Arg Asp Thr Ser Ala Glu Ala Lys Arg Glu
210 215 220
Leu Asp Glu Ile Arg Glu Ser Leu Gln Val Lys Gln Ser Gly Trp Ala
225 230 235 240
Leu Phe Lys Glu Asn Ser Asn Phe Arg Arg Ala Val Phe Leu Gly Val
245 250 255
Leu Leu Gln Val Met Gln Gln Phe Thr Gly Met Asn Val Ile Met Tyr
260 265 270
Tyr Ala Pro Lys Ile Phe Glu Leu Ala Gly Tyr Thr Asn Thr Thr Glu
275 280 285
Gln Met Trp Gly Thr Val Ile Val Gly Leu Thr Asn Val Leu Ala Thr
290 295 300
Phe Ile Ala Ile Gly Leu Val Asp Arg Trp Gly Arg Lys Pro Thr Leu
305 310 315 320
Thr Leu Gly Phe Leu Val Met Ala Ala Gly Met Gly Val Leu Gly Thr
325 330 335
Met Met His Ile Gly Ile His Ser Pro Ser Ala Gln Tyr Phe Ala Ile
340 345 350
Ala Met Leu Leu Met Phe Ile Val Gly Phe Ala Met Ser Ala Gly Pro
355 360 365
Leu Ile Trp Val Leu Cys Ser Glu Ile Gln Pro Leu Lys Gly Arg Asp
370 375 380
Phe Gly Ile Thr Cys Ser Thr Ala Thr Asn Trp Ile Ala Asn Met Ile
385 390 395 400
Val Gly Ala Thr Phe Leu Thr Met Leu Asn Thr Leu Gly Asn Ala Asn
405 410 415
Thr Phe Trp Val Tyr Ala Ala Leu Asn Val Leu Phe Ile Leu Leu Thr
420 425 430
Leu Trp Leu Val Pro Glu Thr Lys His Val Ser Leu Glu His Ile Glu
435 440 445
Arg Asn Leu Met Lys Gly Arg Lys Leu Arg Glu Ile Gly Ala His Asp
450 455 460
<210> 9
<211> 1347
<212> DNA
<213> Xanthomonas campestris
<400> 9
atgacgctac ccgccttcaa ggcctacgat attcgcggcc gcgtgccgga tgaactcaac 60
gaggacttgg cccgccgcat cggcgtggca ctggcggcgc agctggatca agggcccgtg 120
gtcctgggcc acgatgtgcg cctggcgagc ccggcactgc aggaagccct gtctgccggc 180
ctgcgtgcca gcggccgcga ggtgatcgac atcggcctgt gtggcaccga ggaggtctat 240
ttccagaccg atcacctcaa ggccgccggc ggcgtgatgg tcaccgccag ccacaacccg 300
atggactaca acggcatgaa gctggtgcgt gaacaggcgc gaccgatcag ctccgatacc 360
ggcctgttcg ccatccgcga cacggtcgcg gccgacactg ctgctgcagg cgagcccacc 420
gctgccgagc acagccgcac cgacaagacc gcgtatctgg agcacctgct cagctacgtg 480
gaccgcagca cgctcaagcc gctcaagctg gtggtcaacg ccggcaacgg cggcgccggc 540
ctgatcgtcg acctgctggc accgcatctg ccattcgaat tcgtgcgcgt cttccacgag 600
cccgatggca acttccccaa cggcatcccc aacccgctgc tgcaggaaaa ccgcgacgcc 660
accgccaagg cggtcaagga acacggcgcc gacttcggga ttgcctggga tggcgacttc 720
gatcgttgct tcttcttcga tcacactggc cgcttcatcg agggctatta cctggtcggc 780
ctgctggcgc aagccatcct ggccaagcag cccggcggca aggtcgtgca cgacccgcgc 840
ctgacctgga acacggtgga gatggtggaa gacgccggcg gcattccggt gctgtgcaag 900
agtggccacg ccttcattaa ggaaaagatg cgcagcgaga acgccgtcta tggtggcgaa 960
atgagcgcgc accattactt ccgcgaattc gcctacgccg actcgggcat gattccatgg 1020
ctgctgatcg ccgagctggt ctcgcaatcg ggccgttcgc tggcggacct ggtcgaagcg 1080
cgcatgcaga agttcccatg cagcggcgag atcaacttca aggtcgacga cgccaaggct 1140
gcggtcgcac gcgtcatggc gcattacggt gatcagtcac cggagctgga ttacaccgac 1200
ggcatcagcg ccgacttcgg gcaatggcgc ttcaacctgc gcagctccaa caccgagccg 1260
ctgctgcgtc tgaacgtgga aacgcgcggc gatgctgcac tgctggagac gcgtacgcag 1320
gaaatttcca acctgttacg cggctga 1347
<210> 10
<211> 448
<212> PRT
<213> Xanthomonas campestris
<400> 10
Met Thr Leu Pro Ala Phe Lys Ala Tyr Asp Ile Arg Gly Arg Val Pro
1 5 10 15
Asp Glu Leu Asn Glu Asp Leu Ala Arg Arg Ile Gly Val Ala Leu Ala
20 25 30
Ala Gln Leu Asp Gln Gly Pro Val Val Leu Gly His Asp Val Arg Leu
35 40 45
Ala Ser Pro Ala Leu Gln Glu Ala Leu Ser Ala Gly Leu Arg Ala Ser
50 55 60
Gly Arg Glu Val Ile Asp Ile Gly Leu Cys Gly Thr Glu Glu Val Tyr
65 70 75 80
Phe Gln Thr Asp His Leu Lys Ala Ala Gly Gly Val Met Val Thr Ala
85 90 95
Ser His Asn Pro Met Asp Tyr Asn Gly Met Lys Leu Val Arg Glu Gln
100 105 110
Ala Arg Pro Ile Ser Ser Asp Thr Gly Leu Phe Ala Ile Arg Asp Thr
115 120 125
Val Ala Ala Asp Thr Ala Ala Ala Gly Glu Pro Thr Ala Ala Glu His
130 135 140
Ser Arg Thr Asp Lys Thr Ala Tyr Leu Glu His Leu Leu Ser Tyr Val
145 150 155 160
Asp Arg Ser Thr Leu Lys Pro Leu Lys Leu Val Val Asn Ala Gly Asn
165 170 175
Gly Gly Ala Gly Leu Ile Val Asp Leu Leu Ala Pro His Leu Pro Phe
180 185 190
Glu Phe Val Arg Val Phe His Glu Pro Asp Gly Asn Phe Pro Asn Gly
195 200 205
Ile Pro Asn Pro Leu Leu Gln Glu Asn Arg Asp Ala Thr Ala Lys Ala
210 215 220
Val Lys Glu His Gly Ala Asp Phe Gly Ile Ala Trp Asp Gly Asp Phe
225 230 235 240
Asp Arg Cys Phe Phe Phe Asp His Thr Gly Arg Phe Ile Glu Gly Tyr
245 250 255
Tyr Leu Val Gly Leu Leu Ala Gln Ala Ile Leu Ala Lys Gln Pro Gly
260 265 270
Gly Lys Val Val His Asp Pro Arg Leu Thr Trp Asn Thr Val Glu Met
275 280 285
Val Glu Asp Ala Gly Gly Ile Pro Val Leu Cys Lys Ser Gly His Ala
290 295 300
Phe Ile Lys Glu Lys Met Arg Ser Glu Asn Ala Val Tyr Gly Gly Glu
305 310 315 320
Met Ser Ala His His Tyr Phe Arg Glu Phe Ala Tyr Ala Asp Ser Gly
325 330 335
Met Ile Pro Trp Leu Leu Ile Ala Glu Leu Val Ser Gln Ser Gly Arg
340 345 350
Ser Leu Ala Asp Leu Val Glu Ala Arg Met Gln Lys Phe Pro Cys Ser
355 360 365
Gly Glu Ile Asn Phe Lys Val Asp Asp Ala Lys Ala Ala Val Ala Arg
370 375 380
Val Met Ala His Tyr Gly Asp Gln Ser Pro Glu Leu Asp Tyr Thr Asp
385 390 395 400
Gly Ile Ser Ala Asp Phe Gly Gln Trp Arg Phe Asn Leu Arg Ser Ser
405 410 415
Asn Thr Glu Pro Leu Leu Arg Leu Asn Val Glu Thr Arg Gly Asp Ala
420 425 430
Ala Leu Leu Glu Thr Arg Thr Gln Glu Ile Ser Asn Leu Leu Arg Gly
435 440 445
<210> 11
<211> 1746
<212> DNA
<213> Bacillus subtilis
<400> 11
atgacttgga gaaagagcta tgaacgctgg aaacagacag aacatttaga tctggaatta 60
aaagagcgcc ttattgaatt agagggagat gaacaggccc ttgaggactg tttctataaa 120
gaccttgaat tcggtaccgg cggaatgcgc ggggaaatcg gcgccgggac aaatcggatg 180
aatatttaca ctgtgcgcaa agcatcggcc gggtttgcgg catacatctc gaagcaaggt 240
gaggaagcga aaaaacgggg cgttgtcatt gcttatgatt cccgccataa gtctccggag 300
ttcgcgatgg aagcggcaaa aacacttgcg acacaaggca tccaaacata cgtgtttgat 360
gagcttcgcc cgacgccaga gctgtcattc gctgttagac agctgaacgc ttatggtgga 420
attgtggtaa cggcaagcca taacccgcct gaatataacg gctacaaagt atacggggat 480
gatggcggcc agctgcctcc aaaggaagcg gacatcgtca ttgagcaggt aaacgcgatt 540
gaaaatgagc tgacgatcac agtggacgaa gaaaataagt taaaagaaaa aggcttaatc 600
aaaatcatcg gtgaagatat tgataaagtt tatacagaaa aactgacgtc catttctgta 660
catcctgaat tatcggaaga agtagatgta aaggttgttt tcacaccgct gcatggaact 720
gcaaataaac cggtcagacg cggtcttgaa gcactcggct acaaaaatgt aacggttgtc 780
aaagaacagg aactgccgga ttcaaacttc tccactgtta catcgccgaa cccggaagag 840
catgcggcat tcgaatatgc cattaagctt ggggaggagc agaatgcaga tattctcatc 900
gcgacagatc ctgatgctga ccgcctcggc atcgcggtga aaaacgatca aggcaaatat 960
acagtgctga caggaaacca aaccggagcg ttgctgcttc attacctgct ttctgaaaag 1020
aaaaaacaag gcatcctgcc tgataacggt gttgttctca aaacgatcgt cacaagcgaa 1080
atcggccgtg ctgtagcttc ttcattcggc cttgatacga ttgatacgct gacaggcttt 1140
aagtttatcg gtgaaaagat taaggaatac gaagcatcag gccagtatac cttccaattc 1200
ggttatgaag agagctacgg ttatttaatc ggggattttg cccgcgataa ggacgccatt 1260
caggctgcgc ttttggcagt tgaagtttgc gcgttctata aaaaacaggg aatgtcattg 1320
tatgaggcgc tcatcaatct ctttaacgaa tatggttttt atcgtgaagg gctgaaatcc 1380
ctgacgctga aaggcaaaca aggagcagag caaattgaag cgattcttgc ttccttcaga 1440
caaaatccgc cgcagaaaat ggcgggcaaa caggttgtca cagcagaaga ttacgctgta 1500
agcaaacgga cgcttctgac tgaaagcaaa gaagaagcca tcgacttgcc aaaatcaaat 1560
gtattgaaat acttcctgga agacgggtct tggttctgtc tccgtccttc tggaactgag 1620
ccgaaggtta aattttattt cgccgtaaaa gggtcatctt tggaagacag tgaaaagcga 1680
cttgccgtcc tttctgaaga tgtaatgaag acggtggatg aaattgttga gtcaacagca 1740
aaataa 1746
<210> 12
<211> 581
<212> PRT
<213> Bacillus subtilis
<400> 12
Met Thr Trp Arg Lys Ser Tyr Glu Arg Trp Lys Gln Thr Glu His Leu
1 5 10 15
Asp Leu Glu Leu Lys Glu Arg Leu Ile Glu Leu Glu Gly Asp Glu Gln
20 25 30
Ala Leu Glu Asp Cys Phe Tyr Lys Asp Leu Glu Phe Gly Thr Gly Gly
35 40 45
Met Arg Gly Glu Ile Gly Ala Gly Thr Asn Arg Met Asn Ile Tyr Thr
50 55 60
Val Arg Lys Ala Ser Ala Gly Phe Ala Ala Tyr Ile Ser Lys Gln Gly
65 70 75 80
Glu Glu Ala Lys Lys Arg Gly Val Val Ile Ala Tyr Asp Ser Arg His
85 90 95
Lys Ser Pro Glu Phe Ala Met Glu Ala Ala Lys Thr Leu Ala Thr Gln
100 105 110
Gly Ile Gln Thr Tyr Val Phe Asp Glu Leu Arg Pro Thr Pro Glu Leu
115 120 125
Ser Phe Ala Val Arg Gln Leu Asn Ala Tyr Gly Gly Ile Val Val Thr
130 135 140
Ala Ser His Asn Pro Pro Glu Tyr Asn Gly Tyr Lys Val Tyr Gly Asp
145 150 155 160
Asp Gly Gly Gln Leu Pro Pro Lys Glu Ala Asp Ile Val Ile Glu Gln
165 170 175
Val Asn Ala Ile Glu Asn Glu Leu Thr Ile Thr Val Asp Glu Glu Asn
180 185 190
Lys Leu Lys Glu Lys Gly Leu Ile Lys Ile Ile Gly Glu Asp Ile Asp
195 200 205
Lys Val Tyr Thr Glu Lys Leu Thr Ser Ile Ser Val His Pro Glu Leu
210 215 220
Ser Glu Glu Val Asp Val Lys Val Val Phe Thr Pro Leu His Gly Thr
225 230 235 240
Ala Asn Lys Pro Val Arg Arg Gly Leu Glu Ala Leu Gly Tyr Lys Asn
245 250 255
Val Thr Val Val Lys Glu Gln Glu Leu Pro Asp Ser Asn Phe Ser Thr
260 265 270
Val Thr Ser Pro Asn Pro Glu Glu His Ala Ala Phe Glu Tyr Ala Ile
275 280 285
Lys Leu Gly Glu Glu Gln Asn Ala Asp Ile Leu Ile Ala Thr Asp Pro
290 295 300
Asp Ala Asp Arg Leu Gly Ile Ala Val Lys Asn Asp Gln Gly Lys Tyr
305 310 315 320
Thr Val Leu Thr Gly Asn Gln Thr Gly Ala Leu Leu Leu His Tyr Leu
325 330 335
Leu Ser Glu Lys Lys Lys Gln Gly Ile Leu Pro Asp Asn Gly Val Val
340 345 350
Leu Lys Thr Ile Val Thr Ser Glu Ile Gly Arg Ala Val Ala Ser Ser
355 360 365
Phe Gly Leu Asp Thr Ile Asp Thr Leu Thr Gly Phe Lys Phe Ile Gly
370 375 380
Glu Lys Ile Lys Glu Tyr Glu Ala Ser Gly Gln Tyr Thr Phe Gln Phe
385 390 395 400
Gly Tyr Glu Glu Ser Tyr Gly Tyr Leu Ile Gly Asp Phe Ala Arg Asp
405 410 415
Lys Asp Ala Ile Gln Ala Ala Leu Leu Ala Val Glu Val Cys Ala Phe
420 425 430
Tyr Lys Lys Gln Gly Met Ser Leu Tyr Glu Ala Leu Ile Asn Leu Phe
435 440 445
Asn Glu Tyr Gly Phe Tyr Arg Glu Gly Leu Lys Ser Leu Thr Leu Lys
450 455 460
Gly Lys Gln Gly Ala Glu Gln Ile Glu Ala Ile Leu Ala Ser Phe Arg
465 470 475 480
Gln Asn Pro Pro Gln Lys Met Ala Gly Lys Gln Val Val Thr Ala Glu
485 490 495
Asp Tyr Ala Val Ser Lys Arg Thr Leu Leu Thr Glu Ser Lys Glu Glu
500 505 510
Ala Ile Asp Leu Pro Lys Ser Asn Val Leu Lys Tyr Phe Leu Glu Asp
515 520 525
Gly Ser Trp Phe Cys Leu Arg Pro Ser Gly Thr Glu Pro Lys Val Lys
530 535 540
Phe Tyr Phe Ala Val Lys Gly Ser Ser Leu Glu Asp Ser Glu Lys Arg
545 550 555 560
Leu Ala Val Leu Ser Glu Asp Val Met Lys Thr Val Asp Glu Ile Val
565 570 575
Glu Ser Thr Ala Lys
580
<210> 13
<211> 1668
<212> DNA
<213> Komagataeibacter xylinus
<400> 13
atgcccagca taagcccatt tgccggcaag ccggtcgatc cggaccgtct tgtcaatatc 60
gacgccctgc ttgacgccta ttacacccgc aagcccgacc ccgccattgc aacgcagcgc 120
gtggcgtttg gcacgtcggg gcaccgtggt tcctcgctga ccaccagctt caacgaaaac 180
cacatcctgt cgatcagcca ggcgattgcc gactaccgca agggcgcggg cataaccggg 240
ccgctgttca tcggcattga cacccatgcg ctttcccgtc ccgcgctgaa atccgcgctg 300
gaagtgttcg cggccaatgg cgtggaagtc cgcatcgatg cgagggacgg ctataccccc 360
acgccggtca tctcgcacgc gatcctgacc tataaccgcg accgcagcac ggaccttgcc 420
gatggcgtgg tgatcacccc gtcgcataac ccgccggaag atggcggcta caagtacaat 480
cccccccatg gtggcccggc ggataccgac atcaccaaag tggtggaaaa tgcggccaat 540
gactacatgg ccaaaaagat ggaaggcgtg aagcgtgtca gctttgagga tgcgctgaag 600
gcccccacca ccaggcgtca tgattacatc acgccgtatg tggatgatct ggccgccgtg 660
gtggacatgg acgtgatccg tgaatccggc gtgtcgatcg gcattgaccc gctgggcggg 720
gccgcggtgg attactggca gccgatcatc gacaaatacg gcatcaacgc cacgatcgtc 780
agcaaggaag tggacccgac cttccgcttc atgaccgccg actgggacgg gcagatccgc 840
atggactgtt cctcccccta cgccatggcg cgccttgtcg ggatgaagga caaattcgac 900
atcgccttcg ccaatgatac cgatgccgac cgccatggca tcgtgtcggg caaatacggg 960
cttatgaacc ccaaccacta tctggccgtc gcgattgaat acctgttcaa caaccgcgaa 1020
aactggaacg ccagcgcggg cgtgggcaag acggtggtca gcagcagcat gatcgatcgc 1080
gtggccaggg aaatcggccg caagctggtg gaagtgccgg tcgggttcaa gtggtttgtc 1140
gatgggctgt acaacggcac gctgggcttt ggcggggaag aaagtgctgg cgcgtccttc 1200
ctgcgccgtg ccggcacggt gtggagcacg gacaaggacg gtatcatcct tggcctgctg 1260
gcagccgaaa tcacggcccg caccaggcgc acccccggtg ctgcgtatga ggacatgacc 1320
aaacgcctgg gcacgccgta ctatgcgcgg atcgacgccc cggccgaccc ggaacagaag 1380
gccatcctga aaaacctctc gcccgagcag atcggcatga ccgaactggc gggtgagccg 1440
atcctcagca ccctgaccaa tgcaccgggc aacggggcgg ccattggcgg gctgaaggtt 1500
tcggcaaagg atggctggtt tgccgcacgc ccctcgggca cggaaaacgt ctacaagatc 1560
tacgccgaaa gcttcaagag cgaggcgcac ctcaaggcca tccagaccga ggcgcaggat 1620
gcgatttccg ccctgtttgc caaggccgcc aagaaaaagg ctggctga 1668
<210> 14
<211> 555
<212> PRT
<213> Komagataeibacter xylinus
<400> 14
Met Pro Ser Ile Ser Pro Phe Ala Gly Lys Pro Val Asp Pro Asp Arg
1 5 10 15
Leu Val Asn Ile Asp Ala Leu Leu Asp Ala Tyr Tyr Thr Arg Lys Pro
20 25 30
Asp Pro Ala Ile Ala Thr Gln Arg Val Ala Phe Gly Thr Ser Gly His
35 40 45
Arg Gly Ser Ser Leu Thr Thr Ser Phe Asn Glu Asn His Ile Leu Ser
50 55 60
Ile Ser Gln Ala Ile Ala Asp Tyr Arg Lys Gly Ala Gly Ile Thr Gly
65 70 75 80
Pro Leu Phe Ile Gly Ile Asp Thr His Ala Leu Ser Arg Pro Ala Leu
85 90 95
Lys Ser Ala Leu Glu Val Phe Ala Ala Asn Gly Val Glu Val Arg Ile
100 105 110
Asp Ala Arg Asp Gly Tyr Thr Pro Thr Pro Val Ile Ser His Ala Ile
115 120 125
Leu Thr Tyr Asn Arg Asp Arg Ser Thr Asp Leu Ala Asp Gly Val Val
130 135 140
Ile Thr Pro Ser His Asn Pro Pro Glu Asp Gly Gly Tyr Lys Tyr Asn
145 150 155 160
Pro Pro His Gly Gly Pro Ala Asp Thr Asp Ile Thr Lys Val Val Glu
165 170 175
Asn Ala Ala Asn Asp Tyr Met Ala Lys Lys Met Glu Gly Val Lys Arg
180 185 190
Val Ser Phe Glu Asp Ala Leu Lys Ala Pro Thr Thr Arg Arg His Asp
195 200 205
Tyr Ile Thr Pro Tyr Val Asp Asp Leu Ala Ala Val Val Asp Met Asp
210 215 220
Val Ile Arg Glu Ser Gly Val Ser Ile Gly Ile Asp Pro Leu Gly Gly
225 230 235 240
Ala Ala Val Asp Tyr Trp Gln Pro Ile Ile Asp Lys Tyr Gly Ile Asn
245 250 255
Ala Thr Ile Val Ser Lys Glu Val Asp Pro Thr Phe Arg Phe Met Thr
260 265 270
Ala Asp Trp Asp Gly Gln Ile Arg Met Asp Cys Ser Ser Pro Tyr Ala
275 280 285
Met Ala Arg Leu Val Gly Met Lys Asp Lys Phe Asp Ile Ala Phe Ala
290 295 300
Asn Asp Thr Asp Ala Asp Arg His Gly Ile Val Ser Gly Lys Tyr Gly
305 310 315 320
Leu Met Asn Pro Asn His Tyr Leu Ala Val Ala Ile Glu Tyr Leu Phe
325 330 335
Asn Asn Arg Glu Asn Trp Asn Ala Ser Ala Gly Val Gly Lys Thr Val
340 345 350
Val Ser Ser Ser Met Ile Asp Arg Val Ala Arg Glu Ile Gly Arg Lys
355 360 365
Leu Val Glu Val Pro Val Gly Phe Lys Trp Phe Val Asp Gly Leu Tyr
370 375 380
Asn Gly Thr Leu Gly Phe Gly Gly Glu Glu Ser Ala Gly Ala Ser Phe
385 390 395 400
Leu Arg Arg Ala Gly Thr Val Trp Ser Thr Asp Lys Asp Gly Ile Ile
405 410 415
Leu Gly Leu Leu Ala Ala Glu Ile Thr Ala Arg Thr Arg Arg Thr Pro
420 425 430
Gly Ala Ala Tyr Glu Asp Met Thr Lys Arg Leu Gly Thr Pro Tyr Tyr
435 440 445
Ala Arg Ile Asp Ala Pro Ala Asp Pro Glu Gln Lys Ala Ile Leu Lys
450 455 460
Asn Leu Ser Pro Glu Gln Ile Gly Met Thr Glu Leu Ala Gly Glu Pro
465 470 475 480
Ile Leu Ser Thr Leu Thr Asn Ala Pro Gly Asn Gly Ala Ala Ile Gly
485 490 495
Gly Leu Lys Val Ser Ala Lys Asp Gly Trp Phe Ala Ala Arg Pro Ser
500 505 510
Gly Thr Glu Asn Val Tyr Lys Ile Tyr Ala Glu Ser Phe Lys Ser Glu
515 520 525
Ala His Leu Lys Ala Ile Gln Thr Glu Ala Gln Asp Ala Ile Ser Ala
530 535 540
Leu Phe Ala Lys Ala Ala Lys Lys Lys Ala Gly
545 550 555
<210> 15
<211> 909
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 15
atggctgcca ttaatacgaa agtcaaaaaa gccgttatcc ccgttgcggg attaggaacc 60
aggatgttgc cggcgacgaa agccatcccg aaagagatgc tgccacttgt cgataagcca 120
ttaattcaat acgtcgtgaa tgaatgtatt gcggctggca ttactgaaat tgtgctggtt 180
acacactcat ctaaaaactc tattgaaaac cactttgata ccagttttga actggaagca 240
atgctggaaa aacgtgtaaa acgtcaactg cttgatgaag tgcagtctat ttgtccaccg 300
cacgtgacta ttatgcaagt tcgtcagggt ctggcgaaag gcctgggaca cgcggtattg 360
tgtgctcacc cggtagtggg tgatgaaccg gtagctgtta ttttgcctga tgttattctg 420
gatgaatatg aatccgattt gtcacaggat aacctggcag agatgatccg ccgctttgat 480
gaaacgggtc atagccagat catggttgaa ccggttgctg atgtgaccgc atatggcgtt 540
gtggattgca aaggcgttga attagcgccg ggtgaaagcg taccgatggt tggtgtggta 600
gaaaaaccga aagcggatgt tgcgccgtct aatctcgcta ttgtgggtcg ttacgtactt 660
agcgcggata tttggccgtt gctggcaaaa acccctccgg gagctggtga tgaaattcag 720
ctcaccgacg caattgatat gctgatcgaa aaagaaacgg tggaagccta tcatatgaaa 780
gggaagagcc atgactgcgg taataaatta ggttacatgc aggccttcgt tgaatacggt 840
attcgtcata acacccttgg cacggaattt aaagcctggc ttgaagaaga gatgggcatt 900
aagaagtaa 909
<210> 16
<211> 302
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 16
Met Ala Ala Ile Asn Thr Lys Val Lys Lys Ala Val Ile Pro Val Ala
1 5 10 15
Gly Leu Gly Thr Arg Met Leu Pro Ala Thr Lys Ala Ile Pro Lys Glu
20 25 30
Met Leu Pro Leu Val Asp Lys Pro Leu Ile Gln Tyr Val Val Asn Glu
35 40 45
Cys Ile Ala Ala Gly Ile Thr Glu Ile Val Leu Val Thr His Ser Ser
50 55 60
Lys Asn Ser Ile Glu Asn His Phe Asp Thr Ser Phe Glu Leu Glu Ala
65 70 75 80
Met Leu Glu Lys Arg Val Lys Arg Gln Leu Leu Asp Glu Val Gln Ser
85 90 95
Ile Cys Pro Pro His Val Thr Ile Met Gln Val Arg Gln Gly Leu Ala
100 105 110
Lys Gly Leu Gly His Ala Val Leu Cys Ala His Pro Val Val Gly Asp
115 120 125
Glu Pro Val Ala Val Ile Leu Pro Asp Val Ile Leu Asp Glu Tyr Glu
130 135 140
Ser Asp Leu Ser Gln Asp Asn Leu Ala Glu Met Ile Arg Arg Phe Asp
145 150 155 160
Glu Thr Gly His Ser Gln Ile Met Val Glu Pro Val Ala Asp Val Thr
165 170 175
Ala Tyr Gly Val Val Asp Cys Lys Gly Val Glu Leu Ala Pro Gly Glu
180 185 190
Ser Val Pro Met Val Gly Val Val Glu Lys Pro Lys Ala Asp Val Ala
195 200 205
Pro Ser Asn Leu Ala Ile Val Gly Arg Tyr Val Leu Ser Ala Asp Ile
210 215 220
Trp Pro Leu Leu Ala Lys Thr Pro Pro Gly Ala Gly Asp Glu Ile Gln
225 230 235 240
Leu Thr Asp Ala Ile Asp Met Leu Ile Glu Lys Glu Thr Val Glu Ala
245 250 255
Tyr His Met Lys Gly Lys Ser His Asp Cys Gly Asn Lys Leu Gly Tyr
260 265 270
Met Gln Ala Phe Val Glu Tyr Gly Ile Arg His Asn Thr Leu Gly Thr
275 280 285
Glu Phe Lys Ala Trp Leu Glu Glu Glu Met Gly Ile Lys Lys
290 295 300
<210> 17
<211> 921
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 17
atgagccgcc cggaggtgct gacgcctttc acggccatcg tgcctgccgc gggtctgggt 60
acgcgtttcc tgcctgcgac caagacggtg cccaaggagc tgctgcccgt ggtcgacacc 120
cccggtatcg agctggtggc agcagaggca gccgcggcgg gtgccgaacg tcttgttatc 180
gtcacctccg agggtaagga cggcgtggtc gcccacttcg tggaggacct ggtgctcgag 240
ggcacgctgg aggcccgtgg caagatcgcc atgctggcca aggtgcgtcg cgccccggcc 300
ctgatcaagg tcgaatccgt ggtgcaggcc gaaccgctgg ggctgggcca tgccatcggc 360
tgtgtggaac cgacgctgtc gcccgacgaa gacgcggtcg cggtgctgct gccggacgac 420
ctggtgctgc cgaccggcgt cctggagacg atgtcgaagg tgcgcgccag ccggggcggc 480
accgtgctgt gcgcgatcga ggtggcgcgc gaggaaatca gcgcctacgg ggtttttgat 540
gtcgaaccgg tccccgatgg cgactacacc gacgatccca acgtgctgaa ggtccggggc 600
atggtcgaaa agcccaaagc cgaaacggcg ccgtcgcggt atgcggcagc agggcggtac 660
gttcttgacc gcgcgatctt cgatgcgctc cgccgcattg accagggggc cggcggggaa 720
gtgcagctca ccgatgcgat tgcgctgctg attgcggaag gccatcccgt tcatgtggtc 780
gtccaccagg ggtcccgcca tgacctgggc aatccgggcg ggtatctcaa agcggcggtt 840
gattttgccc ttgatcgcga tgattatggc ccggatctcc ggcgctggct cgtggcgcgc 900
cttgggctta ccgaacagtg a 921
<210> 18
<211> 306
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 18
Met Ser Arg Pro Glu Val Leu Thr Pro Phe Thr Ala Ile Val Pro Ala
1 5 10 15
Ala Gly Leu Gly Thr Arg Phe Leu Pro Ala Thr Lys Thr Val Pro Lys
20 25 30
Glu Leu Leu Pro Val Val Asp Thr Pro Gly Ile Glu Leu Val Ala Ala
35 40 45
Glu Ala Ala Ala Ala Gly Ala Glu Arg Leu Val Ile Val Thr Ser Glu
50 55 60
Gly Lys Asp Gly Val Val Ala His Phe Val Glu Asp Leu Val Leu Glu
65 70 75 80
Gly Thr Leu Glu Ala Arg Gly Lys Ile Ala Met Leu Ala Lys Val Arg
85 90 95
Arg Ala Pro Ala Leu Ile Lys Val Glu Ser Val Val Gln Ala Glu Pro
100 105 110
Leu Gly Leu Gly His Ala Ile Gly Cys Val Glu Pro Thr Leu Ser Pro
115 120 125
Asp Glu Asp Ala Val Ala Val Leu Leu Pro Asp Asp Leu Val Leu Pro
130 135 140
Thr Gly Val Leu Glu Thr Met Ser Lys Val Arg Ala Ser Arg Gly Gly
145 150 155 160
Thr Val Leu Cys Ala Ile Glu Val Ala Arg Glu Glu Ile Ser Ala Tyr
165 170 175
Gly Val Phe Asp Val Glu Pro Val Pro Asp Gly Asp Tyr Thr Asp Asp
180 185 190
Pro Asn Val Leu Lys Val Arg Gly Met Val Glu Lys Pro Lys Ala Glu
195 200 205
Thr Ala Pro Ser Arg Tyr Ala Ala Ala Gly Arg Tyr Val Leu Asp Arg
210 215 220
Ala Ile Phe Asp Ala Leu Arg Arg Ile Asp Gln Gly Ala Gly Gly Glu
225 230 235 240
Val Gln Leu Thr Asp Ala Ile Ala Leu Leu Ile Ala Glu Gly His Pro
245 250 255
Val His Val Val Val His Gln Gly Ser Arg His Asp Leu Gly Asn Pro
260 265 270
Gly Gly Tyr Leu Lys Ala Ala Val Asp Phe Ala Leu Asp Arg Asp Asp
275 280 285
Tyr Gly Pro Asp Leu Arg Arg Trp Leu Val Ala Arg Leu Gly Leu Thr
290 295 300
Glu Gln
305
<210> 19
<211> 894
<212> DNA
<213> Xanthomonas campestris
<400> 19
atgagcaagc gtattcgcaa ggccgtattc cccgtcgcag gtcttgggac ccgctttctt 60
ccggcaacca agacggtgcc gaaggaaatg ctgccgatca tcgataaacc gcttatccag 120
tacgccgtgg acgaagccat ccaggccggt tgcgatacgc tgatcttcgt caccaatcgc 180
tacaagcact cgatcgccga ctacttcgac aaggcctatg agctggagca gaagctcgag 240
cgcgcaggca agctcgagca attggagctg gtgcgccatg cactgcccga aggcgtccgc 300
gccatttttg tgacgcaggc cgaagcgctc ggcctgggcc atgcggtgct gtgtgccaag 360
gccgtggtcg gtgacgaacc gttcgcagtg ctgctgcccg acgacctgat gtggaaccgc 420
ggcgatgcgg cgctgaccca gatggccgat gtggcagaag cctccggcgg cagcgtgatc 480
gccgtggaag atgtgccgca cgacaagacg gccagttatg gcatcgtgtc caccgatgcg 540
ttcgacggcc gcaagggccg catcaatgcc atcgtcgaaa agcccaagcc ggaagtggcg 600
ccgagcaatc tggcggtcgt cggtcgttac gtgctgagcc cgaagatctt cgagtacctg 660
gagtccacgg gcgccggtgc aggtggcgag atccagctca ccgatgcgat cgccgaactg 720
ctcaagcagg aacaggtcga tgcgttccgt ttcgagggcc gtcgcttcga ctgcggcgcg 780
cacatcggtt tgatcgaggc cacggtgcac tttgcgctcg agcacgagaa gcatggcgca 840
ccggcgaagg aaatcattcg cagcgccttg gccgcggccg acgcacgcgg ctga 894
<210> 20
<211> 297
<212> PRT
<213> Xanthomonas campestris
<400> 20
Met Ser Lys Arg Ile Arg Lys Ala Val Phe Pro Val Ala Gly Leu Gly
1 5 10 15
Thr Arg Phe Leu Pro Ala Thr Lys Thr Val Pro Lys Glu Met Leu Pro
20 25 30
Ile Ile Asp Lys Pro Leu Ile Gln Tyr Ala Val Asp Glu Ala Ile Gln
35 40 45
Ala Gly Cys Asp Thr Leu Ile Phe Val Thr Asn Arg Tyr Lys His Ser
50 55 60
Ile Ala Asp Tyr Phe Asp Lys Ala Tyr Glu Leu Glu Gln Lys Leu Glu
65 70 75 80
Arg Ala Gly Lys Leu Glu Gln Leu Glu Leu Val Arg His Ala Leu Pro
85 90 95
Glu Gly Val Arg Ala Ile Phe Val Thr Gln Ala Glu Ala Leu Gly Leu
100 105 110
Gly His Ala Val Leu Cys Ala Lys Ala Val Val Gly Asp Glu Pro Phe
115 120 125
Ala Val Leu Leu Pro Asp Asp Leu Met Trp Asn Arg Gly Asp Ala Ala
130 135 140
Leu Thr Gln Met Ala Asp Val Ala Glu Ala Ser Gly Gly Ser Val Ile
145 150 155 160
Ala Val Glu Asp Val Pro His Asp Lys Thr Ala Ser Tyr Gly Ile Val
165 170 175
Ser Thr Asp Ala Phe Asp Gly Arg Lys Gly Arg Ile Asn Ala Ile Val
180 185 190
Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Ala Pro Ser Asn Leu Ala Val Val Gly
195 200 205
Arg Tyr Val Leu Ser Pro Lys Ile Phe Glu Tyr Leu Glu Ser Thr Gly
210 215 220
Ala Gly Ala Gly Gly Glu Ile Gln Leu Thr Asp Ala Ile Ala Glu Leu
225 230 235 240
Leu Lys Gln Glu Gln Val Asp Ala Phe Arg Phe Glu Gly Arg Arg Phe
245 250 255
Asp Cys Gly Ala His Ile Gly Leu Ile Glu Ala Thr Val His Phe Ala
260 265 270
Leu Glu His Glu Lys His Gly Ala Pro Ala Lys Glu Ile Ile Arg Ser
275 280 285
Ala Leu Ala Ala Ala Asp Ala Arg Gly
290 295
<210> 21
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GDH-5-F primer
<400> 21
tagaatactc aagcttggag ctaccagacc gtcca 35
<210> 22
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GHD-5-R primer
<400> 22
tcagaccccg tagaacaaac atgccaaggt tgc 33
<210> 23
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 23
caacaccttc ttcacttgaa tggggtggcc ttg 33
<210> 24
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 24
tatagggcga attcgggcag gcggtcctgc cacag 35
<210> 25
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 25
tcacgccgcc ttcgcgtgaa gaaggtgttg ctga 34
<210> 26
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 26
aacaccagcg tgcccttcta cggggtctga cgc 33
<210> 27
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 27
tagagtcgac ctgcaatgcc tgacgctaaa aaacag 36
<210> 28
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 28
ccaagcttgc atgccttaat cgtgagcgcc tatttc 36
<210> 29
<211> 3128
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pCSa vector
<400> 29
gaattcagcc agcaagacag cgatagaggg tagttatcca cgtgaaaccg ctaatgcccc 60
gcaaagcctt gattcacggg gctttccggc ccgctccaaa aactatccac gtgaaatcgc 120
taatcagggt acgtgaaatc gctaatcgga gtacgtgaaa tcgctaataa ggtcacgtga 180
aatcgctaat caaaaaggca cgtgagaacg ctaatagccc tttcagatca acagcttgca 240
aacacccctc gctccggcaa gtagttacag caagtagtat gttcaattag cttttcaatt 300
atgaatatat atatcaatta ttggtcgccc ttggcttgtg gacaatgcgc tacgcgcacc 360
ggctccgccc gtggacaacc gcaagcggtt gcccaccgtc gagcgccagc gcctttgccc 420
acaacccggc ggccggccgc aacagatcgt tttataaatt tttttttttg aaaaagaaaa 480
agcccgaaag gcggcaacct ctcgggcttc tggatttccg atcacctgta agtcggacgc 540
gatgcgtccg gcgtagagga tccggagctt atcgactgca cggtgcacca atgcttctgg 600
cgtcaggcag ccatcggaag ctgtggtatg gctgtgcagg tcgtaaatca ctgcataatt 660
cgtgtcgctc aaggcgcact cccgttctgg ataatgtttt ttgcgccgac atcataacgg 720
ttctggcaaa tattctgaaa tgagctgttg acaattaatc atcggctcgt ataatgtgtg 780
gaattgtgag cggataacaa tttcacacag ggacgagcta ttgattgggt accgagctcg 840
aattcgtacc cggggatcct ctagagtcga cctgcaggca tgcaagcttg gctgttttgg 900
cggatgagag aagattttca gcctgataca gattaaatca gaacgcagaa gcggtctgat 960
aaaacagaat ttgcctggcg gcagtagcgc ggtggtccca cctgacccca tgccgaactc 1020
agaagtgaaa cgccgtagcg ccgatggtag tgtggggtct ccccatgcga gagtagggaa 1080
ctgccaggca tcaaataaaa cgaaaggctc agtcgaaaga ctgggccttt cgttttatct 1140
gttgtttgtc ggtgaacgct ctcctgagta ggacaaatcc gccgggagcg gatttgaacg 1200
ttgcgaagca acggcccgga gggtggcggg caggacgccc gccataaact gccaggcatc 1260
aaattaagca gaaggccatc ctgacggatg gcctttttgc cttccgcttc ctcgctcact 1320
gactcgctgc gctcggtcgt tcggctgcgg cgagcggtat cagctcactc aaaggcggta 1380
atacggttat ccacagaatc aggggataac gcaggaaaga acatgtgagc aaaaggccag 1440
caaaaggcca ggaaccgtaa aaaggccgcg ttgctggcgt ttttccatag gctccgcccc 1500
cctgacgagc atcacaaaaa tcgacgctca agtcagaggt ggcgaaaccc gacaggacta 1560
taaagatacc aggcgtttcc ccctggaagc tccctcgtgc gctctcctgt tccgaccctg 1620
ccgcttaccg gatacctgtc cgcctttctc ccttcgggaa gcgtggcgct ttctcatagc 1680
tcacgctgta ggtatctcag ttcggtgtag gtcgttcgct ccaagctggg ctgtgtgcac 1740
gaaccccccg ttcagcccga ccgctgcgcc ttatccggta actatcgtct tgagtccaac 1800
ccggtaagac acgacttatc gccactggca gcagccactg gtaacaggat tagcagagcg 1860
aggtatgtag gcggtgctac agagttcttg aagtggtggc ctaactacgg ctacactaga 1920
agaacagcat ttggtatctg cgctctgctg aagccagtta ccttcggaaa aagagttggt 1980
agctcttgat ccggcaaaca aaccaccgct ggtagcggtg gtttttttgt ttgcaagcag 2040
cagattacgc gcagaaaaaa aggatctcaa gaagatcctt tgatcttttc tacggggtct 2100
gacgctcagt ggaacgaaaa ctcacgttaa aggctgtgca ggtcgtaaat cactgcataa 2160
ttcgtgtcgc tcaaggcgca ctcccgttct ggataatgtt ttttgcgccg acatcataac 2220
ggttctggca aatattctga aatgagctgt tgacaattaa tcatcggctc gtataatgtg 2280
tggaattgtg agcggataac aatttcacac aggaaacata gatctcccgg gtaccgagct 2340
ctctagaaag aaggagggac gagctattga tggagaaaaa aatcactgga tataccaccg 2400
ttgatatatc ccaatggcat cgtaaagaac attttgaggc atttcagtca gttgctcaat 2460
gtacctataa ccagaccgtt cagctggata ttacggcctt tttaaagacc gtaaagaaaa 2520
ataagcacaa gttttatccg gcctttattc acattcttgc ccgcctgatg aatgctcatc 2580
cggaattccg tatggcaatg aaagacggtg agctggtgat atgggatagt gttcaccctt 2640
gttacaccgt tttccatgag caaactgaaa cgttttcatc gctctggagt gaataccacg 2700
acgatttccg gcagtttcta cacatatatt cgcaagatgt ggcgtgttac ggtgaaaacc 2760
tggcctattt ccctaaaggg tttattgaga atatgttttt cgtctcagcc aatccctggg 2820
tgagtttcac cagttttgat ttaaacgtgg ccaatatgga caacttcttc gcccccgttt 2880
tcaccatggg caaatattat acgcaaggcg acaaggtgct gatgccgctg gcgattcagg 2940
ttcatcatgc cgtttgtgat ggcttccatg tcggcagaat gcttaatgaa ttacaacagt 3000
actgcgatga gtggcagggc ggggcgtaat ttttttaagg cagtttttta aggcagttat 3060
tggtgccctt aaacgcctgg ttgctacgcc tgaataagtg ataataagcg gatgaatggc 3120
agaaattc 3128
<210> 30
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pCSa vector
<400> 30
tagagtcgac ctgcaatgac aaagtatgca ttagtc 36
<210> 31
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 31
ccaagcttgc atgccttaca gaatgtgacc taaggt 36
<210> 32
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 32
tagagtcgac ctgcaatgtc attcgacgac ttacac 36
<210> 33
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 33
ccaagcttgc atgcctcatg ctacaagcgc acacaa 36
<210> 34
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 34
tagagtcgac ctgcaatgga aattgttgcg attgac 36
<210> 35
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 35
ccaagcttgc atgccttaaa aaatattatt caactt 36
<210> 36
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 36
tagagtcgac ctgcaatgac gctacccgcc ttcaag 36
<210> 37
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 37
ccaagcttgc atgcctcagc cgcgtaacag gttgga 36
<210> 38
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 38
tagagtcgac ctgcaatgac ttggagaaag agctat 36
<210> 39
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 39
ccaagcttgc atgccttatt ttgctgttga ctcaac 36
<210> 40
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 40
tagagtcgac ctgcaatgcc cagcataagc ccattt 36
<210> 41
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 41
ccaagcttgc atgcctcagc cagccttttt cttggc 36
<210> 42
<211> 921
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Mycobacterium tuberculosis ugp
<400> 42
atgagccgcc cggaggtgct gacgcctttc acggccatcg tgcctgccgc gggtctgggt 60
acgcgtttcc tgcctgcgac caagacggtg cccaaggagc tgctgcccgt ggtcgacacc 120
cccggtatcg agctggtggc agcagaggca gccgcggcgg gtgccgaacg tcttgttatc 180
gtcacctccg agggtaagga cggcgtggtc gcccacttcg tggaggacct ggtgctcgag 240
ggcacgctgg aggcccgtgg caagatcgcc atgctggcca aggtgcgtcg cgccccggcc 300
ctgatcaagg tcgaatccgt ggtgcaggcc gaaccgctgg ggctgggcca tgccatcggc 360
tgtgtggaac cgacgctgtc gcccgacgaa gacgcggtcg cggtgctgct gccggacgac 420
ctggtgctgc cgaccggcgt cctggagacg atgtcgaagg tgcgcgccag ccggggcggc 480
accgtgctgt gcgcgatcga ggtggcgcgc gaggaaatca gcgcctacgg ggtttttgat 540
gtcgaaccgg tccccgatgg cgactacacc gacgatccca acgtgctgaa ggtccggggc 600
atggtcgaaa agcccaaagc cgaaacggcg ccgtcgcggt atgcggcagc agggcggtac 660
gttcttgacc gcgcgatctt cgatgcgctc cgccgcattg accagggggc cggcggggaa 720
gtgcagctca ccgatgcgat tgcgctgctg attgcggaag gccatcccgt tcatgtggtc 780
gtccaccagg ggtcccgcca tgacctgggc aatccgggcg ggtatctcaa agcggcggtt 840
gattttgccc ttgatcgcga tgattatggc ccggatctcc ggcgctggct cgtggcgcgc 900
cttgggctta ccgaacagtg a 921
<210> 43
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 43
tagagtcgac ctgcacaaaa cacgaacagt ccag 34
<210> 44
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 44
ccaagcttgc atgccgctat aaaaaaacgg cgtcg 35
<210> 45
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 45
tagagtcgac ctgcaatgag ccgcccggag gtgctg 36
<210> 46
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 46
ccaagcttgc atgcctcact gttcggtaag cccaag 36
<210> 47
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 47
tagagtcgac ctgcaatacg gtcgttccat tcc 33
<210> 48
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 48
ccaagcttgc atgccggacc caaaacgacg aac 33
<210> 49
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 49
gacggccagt gaatttggca ccatacattc cggtttccc 39
<210> 50
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 50
tgattacgcc aagctaatat ggcagccatc aataccccg 39
<210> 51
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 51
attgattggg taccgagctc gagctattga tgcctgacgc ta 42
<210> 52
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 52
gcctgcaggt cgactctaga ttacagaatg tgacctaagg tc 42
<210> 53
<211> 10750
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PIN04-galP-xanA-galU-glk
<400> 53
agcttggcgt aatcatggtc atagctgttt cctgtgtgaa attgttatcc gctcacaatt 60
ccacacaaca tacgagccgg aagcataaag tgtaaagcct ggggtgccta atgagtgagc 120
taactcacat taattgcgtt gcgctcactg cccgctttcc agtcgggaaa cctgtcgtgc 180
cagctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg gtttgcgtat tgggcgctct 240
tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc ggctgcggcg agcggtatca 300
gctcactcaa aggcggtaat acggttatcc acagaatcag gggataacgc aggaaagaac 360
atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa aggccgcgtt gctggcgttt 420
ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc gacgctcaag tcagaggtgg 480
cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc ctggaagctc cctcgtgcgc 540
tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg cctttctccc ttcgggaagc 600
gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt cggtgtaggt cgttcgctcc 660
aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc gctgcgcctt atccggtaac 720
tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc cactggcagc agccactggt 780
aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag agttcttgaa gtggtggcct 840
aactacggct acactagaag gacagtattt ggtatctgcg ctctgctgaa gccagttacc 900
ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa ccaccgctgg tagcggtggt 960
ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag gatctcaaga agatcctttg 1020
atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact cacgttaagg gattttggtc 1080
atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa attaaaaatg aagttttaaa 1140
tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt accaatgctt aatcagtgag 1200
gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag ttgcctgact ccccgtcgtg 1260
tagataacta cgatacggga gggcttacca tctggcccca gtgctgcaat gataccgcga 1320
gacccacgct caccggctcc agatttatca gcaataaacc agccagccgg aagggccgag 1380
cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt ctattaattg ttgccgggaa 1440
gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg ttgttgccat tgctacaggc 1500
atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca gctccggttc ccaacgatca 1560
aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg ttagctcctt cggtcctccg 1620
atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca tggttatggc agcactgcat 1680
aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg tgactggtga gtactcaacc 1740
aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct cttgcccggc gtcaatacgg 1800
gataataccg cgccacatag cagaacttta aaagtgctca tcattggaaa acgttcttcg 1860
gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca gttcgatgta acccactcgt 1920
gcacccaact gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg tttctgggtg agcaaaaaca 1980
ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac ggaaatgttg aatactcata 2040
ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt attgtctcat gagcggatac 2100
atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa 2160
gtgccacctg acgtctaaga aaccattatt atcatgacat taacctataa aaataggcgt 2220
atcacgaggc cctttcgtct cgcgcgtttc ggtgatgacg gtgaaaacct ctgacacatg 2280
cagctcccgg agacggtcac agcttgtctg taagcggatg ccgggagcag acaagcccgt 2340
cagggcgcgt cagcgggtgt tggcgggtgt cggggctggc ttaactatgc ggcatcagag 2400
cagattgtac tgagagtgca ccatatgcgg tgtgaaatac cgcacagatg cgtaaggaga 2460
aaataccgca tcaggcgcca ttcgccattc aggctgcgca actgttggga agggcgatcg 2520
gtgcgggcct cttcgctatt acgccagctg gcgaaagggg gatgtgctgc aaggcgatta 2580
agttgggtaa cgccagggtt ttcccagtca cgacgttgta aaacgacggc cagtgaattt 2640
ggcaccatac attccggttt ccccagctat tccgctgatg gccagcagat cgtgtaccgg 2700
gtgtgggggg aaaacaacat gggcctgcgc atactggacc tgcggacccg gcagacacgc 2760
gtgctgacca cggcatatga caatctgccc ggctggtcgc ccgatggcag ccggatcgtg 2820
ttcacgcgcc gggtcgatga cgaaaattat gatattttca ccatccgtcc cgacggaacc 2880
gggctgaagc ggctgaccac cagcggcgcc aatgacggcc atgccgtatg gaccgccgat 2940
ggccgcatca tgtggtcaag cggcgtatat ggcttccgtg acgaagcggc cctgtatgac 3000
aatacgttcc agccttacgg gcagatattc atcatgaatg ccgacggcag tcacaatcgg 3060
atcctgacgg acagcctgtg ggaggattcc atgccccttt atgtcccggc atgatgtcgc 3120
gatcatgcac gataacgggc aaggcatggt cttatgtttg acagcttatc atcgataagc 3180
tttaatgcgg tagtttatca cagttaaatt gctaacgcag tcaggcaccg tgtatgaaat 3240
ctaacaatgc gctcatcgtc atcctcggca ccgtcaccct ggatgctgta ggcataggct 3300
tggttatgcc ggtactgccg ggcctcttgc gggatatcgt ccattccgac agcatcgcca 3360
gtcactatgg cgtgctgcta gcgctatatg cgttgatgca atttctatgc gcacccgttc 3420
tcggagcact gtccgaccgc tttggccgcc gcccagtcct gctcgcttcg ctacttggag 3480
ccactatcga ctacgcgatc atggcgacca cacccgtcct gtggatcctc tacgccggac 3540
gcatcgtggc cggcatcacc ggcgccacag gtgcggttgc tggcgcctat atcgccgaca 3600
tcaccgatgg ggaagatcgg gctcgccact tcgggctcat gagcgcttgt ttcggcgtgg 3660
gtatggtggc aggccccgtg gccgggggac tgttgggcgc catctccttg catgcaccat 3720
tccttgcggc ggcggtgctc aacggcctca acctactact gggctgcttc ctaatgcagg 3780
agtcgcataa gggagagcgt cgaccgatgc ccttgagagc cttcaaccca gtcagctcct 3840
tccggtgggc gcggggcatg actatcgtcg ccgcacttat gactgtcttc tttatcatgc 3900
aactcgtagg acaggtgccg gcagcgctct gggtcatttt cggcgaggac cgctttcgct 3960
ggagcgcgac gatgatcggc ctgtcgcttg cggtattcgg aatcttgcac gccctcgctc 4020
aagccttcgt cactggtccc gccaccaaac gtttcggcga gaagcaggcc attatcgccg 4080
gcatggcggc cgacgcgctg ggctacgtct tgctggcgtt cgcgacgcga ggctggatgg 4140
ccttccccat tatgattctt ctcgcttccg gcggcatcgg gatgcccgcg ttgcaggcca 4200
tgctgtccag gcaggtagat gacgaccatc agggacagct tcaaggatcg ctcgcggctc 4260
ttaccagcct aacttcgatc actggaccgc tgatcgtcac ggcgatttat gccgcctcgg 4320
cgagcacatg gaacgggttg gcatggattg taggcgccgc cctatacctt gtctgcctcc 4380
ccgcgttgcg tcgcggtgca tggagccggg ccacctcgac ctgaatggaa gccggcggca 4440
cctcgctaac ggattcacca ctccaagaat tggagccaat ttttaaggca gttattggtg 4500
cccgcaacca tctcgggctt ctggatttcc gatcacctgt aagtcggacg cgatgcgtcc 4560
ggcgtagagg atccggagct tatcgactgc acggtgcacc aatgcttctg gcgtcaggca 4620
gccatcggaa gctgtggtat ggctgtgcag gtcgtaaatc actgcataat tcgtgtcgct 4680
caaggcgcac tcccgttctg gataatgttt tttgcgccga catcataacg gttctggcaa 4740
atattctgaa atgagctgtt gacaattaat catcggctcg tataatgtgt ggaattgtga 4800
gcggataaca atttcacaca gggacgagct attgattggg taccgagctc gagctattga 4860
tgcctgacgc taaaaaacag gggcggtcaa acaaggcaat gacgtttttc gtctgcttcc 4920
ttgccgctct ggcgggatta ctctttggcc tggatatcgg tgtaattgct ggcgcactgc 4980
cgtttattgc agatgaattc cagattactt cgcacacgca agaatgggtc gtaagctcca 5040
tgatgttcgg tgcggcagtc ggtgcggtgg gcagcggctg gctctccttt aaactcgggc 5100
gcaaaaagag cctgatgatc ggcgcaattt tgtttgttgc cggttcgctg ttctctgcgg 5160
ctgcgccaaa cgttgaagta ctgattcttt cccgcgttct actggggctg gcggtgggtg 5220
tggcctctta taccgcaccg ctgtacctct ctgaaattgc gccggaaaaa attcgtggca 5280
gtatgatctc gatgtatcag ttgatgatca ctatcgggat cctcggtgct tatctttctg 5340
ataccgcctt cagctacacc ggtgcatggc gctggatgct gggtgtgatt atcatcccgg 5400
caattttgct gctgattggt gtcttcttcc tgccagacag cccacgttgg tttgccgcca 5460
aacgccgttt tgttgatgcc gaacgcgtgc tgctacgcct gcgtgacacc agcgcggaag 5520
cgaaacgcga actggatgaa atccgtgaaa gtttgcaggt taaacagagt ggctgggcgc 5580
tgtttaaaga gaacagcaac ttccgccgcg cggtgttcct tggcgtactg ttgcaggtaa 5640
tgcagcaatt caccgggatg aacgtcatca tgtattacgc gccgaaaatc ttcgaactgg 5700
cgggttatac caacactacc gagcaaatgt gggggaccgt gattgtcggc ctgaccaacg 5760
tacttgccac ctttatcgca atcggccttg ttgaccgctg gggacgtaaa ccaacgctaa 5820
cgctgggctt cctggtgatg gctgctggca tgggcgtact cggtacaatg atgcatatcg 5880
gtattcactc tccgtcggcg cagtatttcg ccatcgccat gctgctgatg tttattgtcg 5940
gttttgccat gagtgccggt ccgctgattt gggtactgtg ctccgaaatt cagccgctga 6000
aaggccgcga ttttggcatc acctgctcca ctgccaccaa ctggattgcc aacatgatcg 6060
ttggcgcaac gttcctgacc atgctcaaca cgctgggtaa cgccaacacc ttctgggtgt 6120
atgcggctct gaacgtactg tttatcctgc tgacattgtg gctggtaccg gaaaccaaac 6180
acgtttcgct ggaacatatt gaacgtaatc tgatgaaagg tcgtaaactg cgcgaaatag 6240
gcgctcacga ttaacccgag ctattgatga cgctacccgc cttcaaggcc tacgatattc 6300
gcggccgcgt gccggatgaa ctcaacgagg acttggcccg ccgcatcggc gtggcactgg 6360
cggcgcagct ggatcaaggg cccgtggtcc tgggccacga tgtgcgcctg gcgagcccgg 6420
cactgcagga agccctgtct gccggcctgc gtgccagcgg ccgcgaggtg atcgacatcg 6480
gcctgtgtgg caccgaggag gtctatttcc agaccgatca cctcaaggcc gccggcggcg 6540
tgatggtcac cgccagccac aacccgatgg actacaacgg catgaagctg gtgcgtgaac 6600
aggcgcgacc gatcagctcc gataccggcc tgttcgccat ccgcgacacg gtcgcggccg 6660
acactgctgc tgcaggcgag cccaccgctg ccgagcacag ccgcaccgac aagaccgcgt 6720
atctggagca cctgctcagc tacgtggacc gcagcacgct caagccgctc aagctggtgg 6780
tcaacgccgg caacggcggc gccggcctga tcgtcgacct gctggcaccg catctgccat 6840
tcgaattcgt gcgcgtcttc cacgagcccg atggcaactt ccccaacggc atccccaacc 6900
cgctgctgca ggaaaaccgc gacgccaccg ccaaggcggt caaggaacac ggcgccgact 6960
tcgggattgc ctgggatggc gacttcgatc gttgcttctt cttcgatcac actggccgct 7020
tcatcgaggg ctattacctg gtcggcctgc tggcgcaagc catcctggcc aagcagcccg 7080
gcggcaaggt cgtgcacgac ccgcgcctga cctggaacac ggtggagatg gtggaagacg 7140
ccggcggcat tccggtgctg tgcaagagtg gccacgcctt cattaaggaa aagatgcgca 7200
gcgagaacgc cgtctatggt ggcgaaatga gcgcgcacca ttacttccgc gaattcgcct 7260
acgccgactc gggcatgatt ccatggctgc tgatcgccga gctggtctcg caatcgggcc 7320
gttcgctggc ggacctggtc gaagcgcgca tgcagaagtt cccatgcagc ggcgagatca 7380
acttcaaggt cgacgacgcc aaggctgcgg tcgcacgcgt catggcgcat tacggtgatc 7440
agtcaccgga gctggattac accgacggca tcagcgccga cttcgggcaa tggcgcttca 7500
acctgcgcag ctccaacacc gagccgctgc tgcgtctgaa cgtggaaacg cgcggcgatg 7560
ctgcactgct ggagacgcgt acgcaggaaa tttccaacct gttacgcggc tgacccgggg 7620
agctattgat ggctgccatt aatacgaaag tcaaaaaagc cgttatcccc gttgcgggat 7680
taggaaccag gatgttgccg gcgacgaaag ccatcccgaa agagatgctg ccacttgtcg 7740
ataagccatt aattcaatac gtcgtgaatg aatgtattgc ggctggcatt actgaaattg 7800
tgctggttac acactcatct aaaaactcta ttgaaaacca ctttgatacc agttttgaac 7860
tggaagcaat gctggaaaaa cgtgtaaaac gtcaactgct tgatgaagtg cagtctattt 7920
gtccaccgca cgtgactatt atgcaagttc gtcagggtct ggcgaaaggc ctgggacacg 7980
cggtattgtg tgctcacccg gtagtgggtg atgaaccggt agctgttatt ttgcctgatg 8040
ttattctgga tgaatatgaa tccgatttgt cacaggataa cctggcagag atgatccgcc 8100
gctttgatga aacgggtcat agccagatca tggttgaacc ggttgctgat gtgaccgcat 8160
atggcgttgt ggattgcaaa ggcgttgaat tagcgccggg tgaaagcgta ccgatggttg 8220
gtgtggtaga aaaaccgaaa gcggatgttg cgccgtctaa tctcgctatt gtgggtcgtt 8280
acgtacttag cgcggatatt tggccgttgc tggcaaaaac ccctccggga gctggtgatg 8340
aaattcagct caccgacgca attgatatgc tgatcgaaaa agaaacggtg gaagcctatc 8400
atatgaaagg gaagagccat gactgcggta ataaattagg ttacatgcag gccttcgttg 8460
aatacggtat tcgtcataac acccttggca cggaatttaa agcctggctt gaagaagaga 8520
tgggcattaa gaagtaaggg gagctattga tgacaaagta tgcattagtc ggtgatgtgg 8580
gcggcaccaa cgcacgtctt gctctgtgtg atattgccag tggtgaaatc tcgcaggcta 8640
agacctattc agggcttgat taccccagcc tcgaagcggt cattcgcgtt tatcttgaag 8700
aacataaggt cgaggtgaaa gacggctgta ttgccatcgc ttgcccaatt accggtgact 8760
gggtggcgat gaccaaccat acctgggcgt tctcaattgc cgaaatgaaa aagaatctcg 8820
gttttagcca tctggaaatt attaacgatt ttaccgctgt atcgatggcg aacccgatgc 8880
tgaaaaaaga gcatctgatt cagtttggtg gcgcagaacc ggtcgaaggt aagcctattg 8940
cggtttacgg tgccggaacg gggcttgggg ttgcgcatct ggtccatgtc gataagcgtt 9000
gggtaagctt gccaggcgaa ggcggtcacg ttgattttgc gccgaatagt gaagaagagg 9060
ccattatcct cgaaatattg cgtgcggaaa ttggtcatgt ttcggcggag gcgtgccttt 9120
ctggccctgg gctggtgaat ttgtatcgcg caattgtgaa agctgacaac cgcctgccag 9180
aaaatctcaa gccaaaagat attaccgaac gcgcgctggc tgacagctgc accgattgcc 9240
gccgcgcatt gtcgctgttt tgcgtcatta tgggccgttt tggcggcaat ctggcgctca 9300
atctcgggac atttggcggc gtgtttattg cgggcggtat cgtgccgcgc ttccttgagt 9360
tcttcaaagg ctccggtttc cgtgccgcat ttgaagataa agggcgcttt aaagaatatg 9420
tccatgatat tccggtgtat ctcatcgtcc atgacaatcc gggccttctc ggttccggtg 9480
cacatttacg ccagacctta ggtcacattc tgtaatctag agtcgacctg caggcatgca 9540
agcttggctg ttttggcgga tgagagaaga ttttcagcct gatacagatt aaatcagaac 9600
gcagaagcgg tctgataaaa cagaatttgc ctggcggcag tagcgcggtg gtcccacctg 9660
accccatgcc gaactcagaa gtgaaacgcc gtagcgccga tggtagtgtg gggtctcccc 9720
atgcgagagt agggaactgc caggcatcaa ataaaacgaa aggctcagtc gaaagactgg 9780
gcctttcgtt ttatctgttg tttgtcggtg aacgctctcc tgagtaggac aaatccgccg 9840
ggagcggatt tgaacgttgc gaagcaacgg cccggagggt ggcgggcagg acgcccgcca 9900
taaactgcca ggcatcaaat taagcagaag gccatcctga cggatggcct ttttgccttc 9960
cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc 10020
tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat 10080
gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt 10140
ccataggctc cgcccccctg acggatggcc tttttgcctt aggcatccgt tcgcacgata 10200
cctgccgcga caccgccgac agacaggcac gttgcgatta acacgcctgg cacagccgtg 10260
cggcactgat ccgtaccttt cgattacccg cagcttgctg gcaagttgaa accagaaata 10320
ttgattagat aatataatat atcataattt atttatcatc atggtatata gaaatgtaat 10380
ttaaattcat ggaacatgaa ttgatacaat ttgcttcaaa tatcgcgttg acacaactca 10440
gccgctaaca tagaagcccc aactattggg agatgaaaat gaagcaaata ttacaaaaat 10500
tcattatgaa acgacctcca caaaataatt ccgaatatgt tcataaaata aatgattata 10560
caatatttat agtttgtatg atggcatttt tttcatgcac cattcttacc ttatttcaaa 10620
taagatctat cgattacaat atagaaattt tcttaaattc attcgcaaga aaaagcaagt 10680
ttgtgaatgc actcctttca tccctgacat atgatagtat gaccgtcggg gtattgatgg 10740
ctgccatatt 10750
<210> 54
<211> 6105
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PIN04(648-tet-Ptac)
<400> 54
agcttggcgt aatcatggtc atagctgttt cctgtgtgaa attgttatcc gctcacaatt 60
ccacacaaca tacgagccgg aagcataaag tgtaaagcct ggggtgccta atgagtgagc 120
taactcacat taattgcgtt gcgctcactg cccgctttcc agtcgggaaa cctgtcgtgc 180
cagctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg gtttgcgtat tgggcgctct 240
tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc ggctgcggcg agcggtatca 300
gctcactcaa aggcggtaat acggttatcc acagaatcag gggataacgc aggaaagaac 360
atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa aggccgcgtt gctggcgttt 420
ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc gacgctcaag tcagaggtgg 480
cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc ctggaagctc cctcgtgcgc 540
tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg cctttctccc ttcgggaagc 600
gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt cggtgtaggt cgttcgctcc 660
aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc gctgcgcctt atccggtaac 720
tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc cactggcagc agccactggt 780
aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag agttcttgaa gtggtggcct 840
aactacggct acactagaag gacagtattt ggtatctgcg ctctgctgaa gccagttacc 900
ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa ccaccgctgg tagcggtggt 960
ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag gatctcaaga agatcctttg 1020
atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact cacgttaagg gattttggtc 1080
atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa attaaaaatg aagttttaaa 1140
tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt accaatgctt aatcagtgag 1200
gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag ttgcctgact ccccgtcgtg 1260
tagataacta cgatacggga gggcttacca tctggcccca gtgctgcaat gataccgcga 1320
gacccacgct caccggctcc agatttatca gcaataaacc agccagccgg aagggccgag 1380
cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt ctattaattg ttgccgggaa 1440
gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg ttgttgccat tgctacaggc 1500
atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca gctccggttc ccaacgatca 1560
aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg ttagctcctt cggtcctccg 1620
atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca tggttatggc agcactgcat 1680
aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg tgactggtga gtactcaacc 1740
aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct cttgcccggc gtcaatacgg 1800
gataataccg cgccacatag cagaacttta aaagtgctca tcattggaaa acgttcttcg 1860
gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca gttcgatgta acccactcgt 1920
gcacccaact gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg tttctgggtg agcaaaaaca 1980
ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac ggaaatgttg aatactcata 2040
ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt attgtctcat gagcggatac 2100
atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa 2160
gtgccacctg acgtctaaga aaccattatt atcatgacat taacctataa aaataggcgt 2220
atcacgaggc cctttcgtct cgcgcgtttc ggtgatgacg gtgaaaacct ctgacacatg 2280
cagctcccgg agacggtcac agcttgtctg taagcggatg ccgggagcag acaagcccgt 2340
cagggcgcgt cagcgggtgt tggcgggtgt cggggctggc ttaactatgc ggcatcagag 2400
cagattgtac tgagagtgca ccatatgcgg tgtgaaatac cgcacagatg cgtaaggaga 2460
aaataccgca tcaggcgcca ttcgccattc aggctgcgca actgttggga agggcgatcg 2520
gtgcgggcct cttcgctatt acgccagctg gcgaaagggg gatgtgctgc aaggcgatta 2580
agttgggtaa cgccagggtt ttcccagtca cgacgttgta aaacgacggc cagtgaattt 2640
ggcaccatac attccggttt ccccagctat tccgctgatg gccagcagat cgtgtaccgg 2700
gtgtgggggg aaaacaacat gggcctgcgc atactggacc tgcggacccg gcagacacgc 2760
gtgctgacca cggcatatga caatctgccc ggctggtcgc ccgatggcag ccggatcgtg 2820
ttcacgcgcc gggtcgatga cgaaaattat gatattttca ccatccgtcc cgacggaacc 2880
gggctgaagc ggctgaccac cagcggcgcc aatgacggcc atgccgtatg gaccgccgat 2940
ggccgcatca tgtggtcaag cggcgtatat ggcttccgtg acgaagcggc cctgtatgac 3000
aatacgttcc agccttacgg gcagatattc atcatgaatg ccgacggcag tcacaatcgg 3060
atcctgacgg acagcctgtg ggaggattcc atgccccttt atgtcccggc atgatgtcgc 3120
gatcatgcac gataacgggc aaggcatggt cttatgtttg acagcttatc atcgataagc 3180
tttaatgcgg tagtttatca cagttaaatt gctaacgcag tcaggcaccg tgtatgaaat 3240
ctaacaatgc gctcatcgtc atcctcggca ccgtcaccct ggatgctgta ggcataggct 3300
tggttatgcc ggtactgccg ggcctcttgc gggatatcgt ccattccgac agcatcgcca 3360
gtcactatgg cgtgctgcta gcgctatatg cgttgatgca atttctatgc gcacccgttc 3420
tcggagcact gtccgaccgc tttggccgcc gcccagtcct gctcgcttcg ctacttggag 3480
ccactatcga ctacgcgatc atggcgacca cacccgtcct gtggatcctc tacgccggac 3540
gcatcgtggc cggcatcacc ggcgccacag gtgcggttgc tggcgcctat atcgccgaca 3600
tcaccgatgg ggaagatcgg gctcgccact tcgggctcat gagcgcttgt ttcggcgtgg 3660
gtatggtggc aggccccgtg gccgggggac tgttgggcgc catctccttg catgcaccat 3720
tccttgcggc ggcggtgctc aacggcctca acctactact gggctgcttc ctaatgcagg 3780
agtcgcataa gggagagcgt cgaccgatgc ccttgagagc cttcaaccca gtcagctcct 3840
tccggtgggc gcggggcatg actatcgtcg ccgcacttat gactgtcttc tttatcatgc 3900
aactcgtagg acaggtgccg gcagcgctct gggtcatttt cggcgaggac cgctttcgct 3960
ggagcgcgac gatgatcggc ctgtcgcttg cggtattcgg aatcttgcac gccctcgctc 4020
aagccttcgt cactggtccc gccaccaaac gtttcggcga gaagcaggcc attatcgccg 4080
gcatggcggc cgacgcgctg ggctacgtct tgctggcgtt cgcgacgcga ggctggatgg 4140
ccttccccat tatgattctt ctcgcttccg gcggcatcgg gatgcccgcg ttgcaggcca 4200
tgctgtccag gcaggtagat gacgaccatc agggacagct tcaaggatcg ctcgcggctc 4260
ttaccagcct aacttcgatc actggaccgc tgatcgtcac ggcgatttat gccgcctcgg 4320
cgagcacatg gaacgggttg gcatggattg taggcgccgc cctatacctt gtctgcctcc 4380
ccgcgttgcg tcgcggtgca tggagccggg ccacctcgac ctgaatggaa gccggcggca 4440
cctcgctaac ggattcacca ctccaagaat tggagccaat ttttaaggca gttattggtg 4500
cccgcaacca tctcgggctt ctggatttcc gatcacctgt aagtcggacg cgatgcgtcc 4560
ggcgtagagg atccggagct tatcgactgc acggtgcacc aatgcttctg gcgtcaggca 4620
gccatcggaa gctgtggtat ggctgtgcag gtcgtaaatc actgcataat tcgtgtcgct 4680
caaggcgcac tcccgttctg gataatgttt tttgcgccga catcataacg gttctggcaa 4740
atattctgaa atgagctgtt gacaattaat catcggctcg tataatgtgt ggaattgtga 4800
gcggataaca atttcacaca gggacgagct attgattggg taccgagctc gaattcgtac 4860
ccggggatcc tctagagtcg acctgcaggc atgcaagctt ggctgttttg gcggatgaga 4920
gaagattttc agcctgatac agattaaatc agaacgcaga agcggtctga taaaacagaa 4980
tttgcctggc ggcagtagcg cggtggtccc acctgacccc atgccgaact cagaagtgaa 5040
acgccgtagc gccgatggta gtgtggggtc tccccatgcg agagtaggga actgccaggc 5100
atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc tgttgtttgt 5160
cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac gttgcgaagc 5220
aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggcat caaattaagc 5280
agaaggccat cctgacggat ggcctttttg ccttccgctt cctcgctcac tgactcgctg 5340
cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact caaaggcggt aatacggtta 5400
tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag caaaaggcca gcaaaaggcc 5460
aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata ggctccgccc ccctgacgga 5520
tggccttttt gccttaggca tccgttcgca cgatacctgc cgcgacaccg ccgacagaca 5580
ggcacgttgc gattaacacg cctggcacag ccgtgcggca ctgatccgta cctttcgatt 5640
acccgcagct tgctggcaag ttgaaaccag aaatattgat tagataatat aatatatcat 5700
aatttattta tcatcatggt atatagaaat gtaatttaaa ttcatggaac atgaattgat 5760
acaatttgct tcaaatatcg cgttgacaca actcagccgc taacatagaa gccccaacta 5820
ttgggagatg aaaatgaagc aaatattaca aaaattcatt atgaaacgac ctccacaaaa 5880
taattccgaa tatgttcata aaataaatga ttatacaata tttatagttt gtatgatggc 5940
atttttttca tgcaccattc ttaccttatt tcaaataaga tctatcgatt acaatataga 6000
aattttctta aattcattcg caagaaaaag caagtttgtg aatgcactcc tttcatccct 6060
gacatatgat agtatgaccg tcggggtatt gatggctgcc atatt 6105
Claims (20)
- 글루코키나제 (glucokinase) 활성을 증가시키는 유전적 변형을 포함하는 재조합 코마가타에이박터(Komagataeibacter) 속 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 상기 폴리포스페이트 키나아제를 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형인 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 글루코키나제는 EC 2.7.1.2에 속하는 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 글루코키나제는 ATP + 글루코스를 ADP + 글루코스-6-포스페이트로 가역적으로 전환하는 활성을 갖는 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 글루코키나제는 서열번호 11, 12, 또는 13의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 글루코스 페르메아제 (glucose permease) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 포스포글루코뮤타제(phosphoglucomutase: PGM) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 및 UTP-글루코스 피로포스포릴라제(UTP-glucose pyrophosphorylase: UGP) 활성을 증가시키는 유전적 변형 중 하나 이상을 더 포함하는 것인 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 유전적 변형은 각 효소를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것인 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 유전적 변형은 각 효소를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 각 효소를 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형인 것인 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 글루코스 페르메아제는 세포 밖에 있는 글루코스를 세포 내부로 수송하는 활성을 갖는 것이고, PGM, 및 UGP는 각각 EC 5.4.2.2, 및 EC 2.7.9에 속하는 것인 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 글루코스 페르메아제, PGM, 및 UGP는 각각 서열번호 1, 2, 및 3의 아미노산 서열과 85% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드인 것인 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 미생물은 Komagataeibacter xylinus인 것인 미생물.
- 청구항 1의 미생물을 배지 중에서 배양하여 셀룰로오스를 생성하는 단계; 및
상기 배양물로부터 상기 셀룰로오스를 회수하는 단계를 포함하는 셀룰로오스를 생산하는 방법. - 청구항 13에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것인 방법.
- 청구항 14에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 상기 글루코키나제를 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형인 것인 방법.
- 청구항 14에 있어서, 상기 미생물은 글루코스 페르메아제 (glucose permease) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 포스포글루코뮤타제(phosphoglucomutase: PGM) 활성을 증가시키는 유전적 변형, 및 UTP-글루코스 피로포스포릴라제(UTP-glucose pyrophosphorylase: UGP) 활성을 증가시키는 유전적 변형 중 하나 이상을 더 포함하는 것인 방법.
- 청구항 16에 있어서, 상기 유전적 변형은 상기 효소를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키는 것인 방법.
- 청구항 16에 있어서, 상기 유전적 변형은 각 효소를 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 각 효소를 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형인 것인 방법.
- 청구항 16에 있어서, 상기 글루코스 페르메아제는 세포 밖에 있는 글루코스를 세포 내부로 수송하는 활성을 갖는 것이고, PGM, 및 UGP는 각각 EC 5.4.2.2, 및 EC 2.7.9에 속하는 것인 방법.
- 셀룰로오스 생산능을 갖는 미생물에 글루코키나제를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계를 포함하는, 셀룰로오스 생산능이 증가된 미생물을 제조하는 방법.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170135865A KR20190043847A (ko) | 2017-10-19 | 2017-10-19 | 코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 |
US16/028,145 US20190119657A1 (en) | 2017-10-19 | 2018-07-05 | Genus komagataeibacter recombinant microorganism, method of producing cellulose using the same, and method of producing the microorganism |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170135865A KR20190043847A (ko) | 2017-10-19 | 2017-10-19 | 코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20190043847A true KR20190043847A (ko) | 2019-04-29 |
Family
ID=66171021
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020170135865A KR20190043847A (ko) | 2017-10-19 | 2017-10-19 | 코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20190119657A1 (ko) |
KR (1) | KR20190043847A (ko) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114703185B (zh) * | 2022-03-16 | 2023-10-27 | 天津科技大学 | 木葡萄糖醋杆菌来源的启动子在促进细菌纤维素合成中的应用 |
-
2017
- 2017-10-19 KR KR1020170135865A patent/KR20190043847A/ko unknown
-
2018
- 2018-07-05 US US16/028,145 patent/US20190119657A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20190119657A1 (en) | 2019-04-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN108546712B (zh) | 一种利用CRISPR/LbCpf1系统实现目的基因在植物中同源重组的方法 | |
KR101928688B1 (ko) | 유기산으로의 글리세롤의 발효 | |
KR20120083391A (ko) | 조작된 미생물 및 n-프로판올, 프로필렌 및 폴리프로필렌의 통합 제조방법 | |
KR102227976B1 (ko) | Nadh 데히드로게나제가 불활성화된 효모 세포 및 그를 이용한 락테이트를 생산하는 방법 | |
CA2774975C (en) | Production of fatty acid derivatives in recombinant bacterial cells expressing an ester synthase variant | |
CN109312296B (zh) | 重组酵母细胞 | |
CA2480277C (en) | Enhanced protein expression in bacillus | |
AU609783B2 (en) | Novel fusion proteins and their purification | |
DK1929025T3 (en) | Fermentative production OF ALCOHOLS WITH FOUR CARBON ATOMS | |
KR102303832B1 (ko) | 내산성을 갖는 효모 세포, 상기 효모 세포를 제조하는 방법 및 이의 용도 | |
CN109735480B (zh) | 一种合成乳酰-n-新四糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用 | |
CN101297042A (zh) | 四碳醇的发酵生产 | |
CN109825465B (zh) | 基于平衡udp-糖供给合成乳酰-n-新四糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用 | |
CN109810958B (zh) | 一种藏红花来源的ccd2突变体及其编码序列和应用以及生产藏红花酸的重组酵母菌株 | |
KR102311681B1 (ko) | 내산성을 갖는 효모 세포, 그를 이용하여 유기산을 생산하는 방법 및 상기 내산성 효모 세포를 생산하는 방법 | |
KR20190043847A (ko) | 코마가타에이박터 속 재조합 미생물, 그를 이용하여 셀룰로오스를 생산하는 방법 및 상기 미생물을 생산하는 방법 | |
KR102384227B1 (ko) | Nadph 생성이 증가된 유전적으로 조작된 효모 세포, 효모 세포 중 nadph 수준을 증가시키는 방법, 상기 효모 세포를 제조하는 방법 및 상기 효모 세포를 이용하여 락테이트를 생산하는 방법 | |
CN101432434B (zh) | 4碳醇的发酵生产 | |
CN113354718A (zh) | 一种哌尼生素前体、表达盒及其制备方法 | |
CN101525627A (zh) | 一种双基因共表达质粒、其转化的工程菌及其构建方法 | |
KR102287346B1 (ko) | Rgt1의 활성이 감소된 효모 세포, 그를 제조하는 방법 및 그를 사용하여 산물을 생산하는 방법 | |
KR102349954B1 (ko) | 산물 생산능이 향상된 효모 및 그를 이용한 산물을 생산하는 방법 | |
KR20200104367A (ko) | 클루이베로마이세스 락티스 효모를 기본으로 하는 보호성 1가- 및 다가 서브유닛 백신의 생산을 위한 최적화된 숙주/벡터 시스템 | |
CN101652482A (zh) | 由代谢工程化酵母进行的丁醇生产 | |
CN101517076B (zh) | 双歧杆菌中的遗传重建 |